RU2355769C1 - СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФУНКЦИОНАЛЬНО АКТИВНОГО РЕКОМБИНАНТНОГО БЕЛКА ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ (LF), РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pETGST-LFmin, КОДИРУЮЩАЯ АКТИВНЫЙ БЕЛОК LF, И ШТАММ Escherichia coli BL-GSTLFmin, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ АКТИВНЫЙ БЕЛОК ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ - Google Patents

СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФУНКЦИОНАЛЬНО АКТИВНОГО РЕКОМБИНАНТНОГО БЕЛКА ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ (LF), РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pETGST-LFmin, КОДИРУЮЩАЯ АКТИВНЫЙ БЕЛОК LF, И ШТАММ Escherichia coli BL-GSTLFmin, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ АКТИВНЫЙ БЕЛОК ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ Download PDF

Info

Publication number
RU2355769C1
RU2355769C1 RU2007143256/13A RU2007143256A RU2355769C1 RU 2355769 C1 RU2355769 C1 RU 2355769C1 RU 2007143256/13 A RU2007143256/13 A RU 2007143256/13A RU 2007143256 A RU2007143256 A RU 2007143256A RU 2355769 C1 RU2355769 C1 RU 2355769C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
protein
anthrax
recombinant
lethal factor
active
Prior art date
Application number
RU2007143256/13A
Other languages
English (en)
Inventor
Александр Владимирович Колесников (RU)
Александр Владимирович Колесников
Мария Юрьевна Захарова (RU)
Мария Юрьевна Захарова
Арина Владимировна Козырь (RU)
Арина Владимировна Козырь
Игорь Георгиевич Шемякин (RU)
Игорь Георгиевич Шемякин
Original Assignee
Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук filed Critical Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук
Priority to RU2007143256/13A priority Critical patent/RU2355769C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2355769C1 publication Critical patent/RU2355769C1/ru

Links

Images

Landscapes

  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

Сконструирована новая рекомбинантная плазмида pETGST-LFmin (7704 п.н.), содержащая каталитически активный фрагмент гена летального фактора (LF) сибирской язвы под контролем промотора бактериофага Т7, детерминанту устойчивости к ампициллину и последовательность глютатион-S-трансферазы для эффективной очистки рекомбинантного белка на сорбенте с иммобилизованным глютатионом. Плазмида обеспечивает эффективный синтез белка LF сибирской язвы, химеризованного с последовательностью глютатион-S-трансферазы для очистки на иммобилизованном глютатионе. Штамм Escherichia coli BL-LFminGST получен трансформацией указанных плазмидных ДНК в штамм E.coli BL21 (ВЕЗ), который обеспечивает выход синтезируемого белка LF не менее 90 мг/1 г сырой биомассы. Активный белок LF получен способом, предусматривающим культивирование указанного рекомбинантного штамма, разрушение бактериальных клеток в буферном растворе рН 7,4 в присутствии Тритона Х-100 и протеазного ингибитора, очистку на сорбенте с иммобилизованным глютатионом. Способ обеспечивает выход протеолитически активного рекомбинантного химерного очищенного белка LF сибирской язвы в количестве не менее 70 мг/1 г сырой биомассы. 3 н.п. ф-лы, 3 ил.

Description

обретение относится к биотехнологии, конкретно - к области генной инженерии, касается способа получения активного рекомбинантного белка летального фактора сибирской язвы и представляет собой рекомбинантную плазмидную ДНК, определяющую синтез белка летального фактора сибирской язвы, штамм бактерий Escherichia coli, который может быть применен как продуцент данного белка, и методику выделения и очистки активного белка летального фактора сибирской язвы из бактериальной биомассы.
Летальный фактор сибирской язвы (LF) наряду с протективным антигеном (РА) представляет собой важнейший компонент летального токсина сибирской язвы и является основным фактором, определяющим летальный исход при сибиреязвенной инвазии. Основной областью применения активного белка LF являются биологические исследования, биомедицина и разработка лекарств, в частности разработка диагностических китов для раннего определения и фармацевтических препаратов для терапии сибиреязвенной инфекции и вакцинации против сибирской язвы. Это может иметь важное значение как для борьбы с локальными вспышками заболевания, так и для быстрой нейтрализации последствий возможных биотеррористических актов с использованием бактерий или спор бактерий сибирской язвы.
Сибирская язва - это инфекционное заболевание, вызываемое токсигенными штаммами грамположительной бактерии Bacillus anthracis. Вирулентность бактерии определяется капсулой, состоящей из поли-D-глютамовой кислоты, и экзотоксином, включающим в себя три компонента - летальный фактор (LF), протективный антиген (РА) и фактор отечности (EF). По отдельности эти белки не обладают токсическим эффектом, но комбинации LF+PA (летальный токсин) и EF+PA (токсин отечности) приводят к различным патологическим последствиям как у млекопитающих и человека, так и в культуре клеток. Функционально LF сибирской язвы представляет собой Zn2+-зависимую металлопротеазу, специфически расщепляющую белки семейства киназ митоген-акивируемых протеин киназ МАРКК (в частности, МЕК1), приводя к лизису клеток, подвергшихся действию токсина под воздействием макрофагов. Проводились исследования ферментативной активности LF, его субстратной специфичности, его трехмерной структуры.
Летальный фактор сибирской язвы является белком с молекулярной массой 90 кДа. Структурно составленным из четырех доменов с преимущественно спиральной структурой. Домен 1 состоит из 12 спиральных участков, уравновешивающих четырехцепочечный слой. Этот домен связывается с протективным антигеном. Домен 2 сходен со вторым доменом токсина VIP2 Bacillus cereus, однако не обладает его каталитическими радикалами. Внутри последовательности домена 2 находится последовательность домен 3. Этот домен составлен из повторов, которые возникли в результате дупликации последовательности, изначально принадлежавшей домену 2. Домен 4 - это каталитически активная протеаза. Бета-слой и шесть альфа-спиралей формируют структуру, сходную с той, которая существует у другой металлопротеазы, термолизина. Связывание субстратного белка семейства МАРКК происходит в углублении между доменами 3 и 4. Активный центр фермента составлен аминокислотным радикалом Glu687 за молекулой воды и атомом цинка, связанным с радикалами His686, His690, Tyr728 и Glu735 (Pannifer AD, Wong TY, Schwarzenbacher R, Renatus M, Petosa C, Bienkowska J, Lacy DB, Collier RJ, Park S, Leppla SH, Hanna P, Liddington RC. (2001) Nature, 414, 229-233).
Известен способ выделения рекомбинантного летального фактора сибирской язвы (Gupta P, Batra S, Chopra АР, Singh Y, Bhatnagar R. (1998) Infect Immun, 66(2), 862-865), в котором используют экспрессионную конструкцию на основе плазмиды pQE30, проэкспрессированную в штамме Е. coli SG 13009. Недостатком продукции белка с использованием этой конструкции является то, что более 40% белка находится в деградированном состоянии (видимо, в силу расщепления протеазами E.coli), что, безусловно, снижает выход белка при использовании данной конструкции. Большая исходная степень деградации белка приводит к тому, что требуется три стадии очистки белка для получения гомогенного продукта вместо двух, предлагаемых в настоящем изобретении. В используемой экспрессионной конструкции не содержится последовательностей для специфической детекции экспрессионного продукта.
Известен генно-инженерный способ получения мутантного белка LF с использованием конструкции на основе рЕТ30 под контролем промотора фага Т5 в экспрессионных штаммах E.coli (патент РФ 2287581, опубл. 20.11.2006). Полученный таким образом белок и его мутанты используют для разработки вакцин против сибирской язвы. Однако известно, что рекомбинантный белок LF, синтезируемый с применением использованной конструкции, имеет до 40% деградации в отличие от 10%, наблюдаемых при использовании заявленной конструкции. В запатентованной экспрессионной конструкции не содержится последовательностей для специфической детекции экспрессионного продукта в отличие от заявленной.
Известен наиболее близкий к заявленному способ, в котором применяют экспрессию полноразмерного летального фактора сибирской язвы, химеризованного с глютатион-S-трансферазой (Kim J., Kim Y.-M., Koo B.-S., Chae Y.-K., Yoon M.-Y. (2003) Prot. Expr. Purif., 30(2), 293-300). По этой методике получают достаточно чистый белок в одну стадию очистки, но выход его сравнительно невысок по сравнению с выходом белка в заявленном способе и не превышает 5 мг с литра культуры. Конструкцию для получения рекомбинантного белка в описанной работе создают на основе плазмиды pGEX-KG под управлением синтетического Тас-промотора, что приводит к деградации части белка в процессе наработки. Кроме того, в экспрессионной конструкции не содержится последовательностей для специфической детекции экспрессионного продукта.
Изобретение решает задачу создания продуцента и получения активного рекомбинантного белка летального фактора сибирской язвы с высоким выходом и низкой степенью деградации.
Поставленная задача решается за счет рекомбинантной плазмидной ДНК pETGST-LFmin, обеспечивающей синтез гибридного рекомбинантного активного белка летального фактора сибирской язвы в клетках Escherichia coli, имеющей молекулярную массу 5,08 МДа, состоящей из BamHI-NdeI фрагмента ДНК коммерческой плазмиды pET22b(+); фрагмента глютатион-S-трансферазы и пептида с-myc, а также BamHI/SalI фрагмента ДНК, содержащего адаптированную к этим сайтам последовательность фрагмента гена летального фактора сибирской язвы без домена, содержащая в качестве генетического маркера ген β-лактамазы, детерминирующий устойчивость клеток Escherichia coli BL21(DE3), трансформированных плазмидой pETGST-LFmin, к антибиотикам пенициллинового ряда; уникальные сайты узнавания эндонуклеаз рестрикции, расположенные на следующем расстоянии влево от сайта BamHI:
XhoII 657 пн, EcoRI 683 пн, StuI 748 пн, XhoI 801 пн, BcoI 801 пн.
Также за счет штамма Escherichia coli BL-GSTLFmin, продуцирующего гибридный полипептид, содержащий летальный фактор сибирской язвы, химеризованный с глютатион-S-трансферазой и пептидом с-myc.
А также за счет способа получения рекомбинантного летального фактора сибирской язвы, включающего трансформацию клеток Escherichia coli BL21(DE3) экспрессионной плазмидной ДНК pETGST-LFmin, кодирующей рекомбинантный белок летального фактора сибирской язвы, культивирование полученного штамма, разрушение бактериальных клеток добавлением Тритона X-100 в буферном растворе рН 7.4, содержащем протеазный ингибитор, с последующей очисткой целевого продукта на сорбенте с иммобилизованным глютатионом.
Техническим результатом изобретения является получение в очищенном виде и с высоким выходом (до 95% чистоты, до 100 мг с литра культуры) гомогенного рекомбинантного белка летального фактора сибирской язвы.
Для повышения уровня продукции и снижения степени деградации белка LF в качестве базовой конструкции применяют плазмиду с промотором Т7 полимеразы, содержащую в своем составе последовательность, соответствующую пептиду с-myc для детекции продукта и глютатион-S-трансферазы для эффективной очистки синтезируемого белка. Для получения базовой векторной конструкции pETNHIS в плазмиду pET22b(+) (Novagen), не содержащую сайта BglII (последовательность сайта рестрикции нарушают обработкой плазмиды эндонуклеазой рестрикции BglII с последующей достройкой концов фрагментом Кленова ДНК-полимеразы I и лигированием достроенных концов) по сайтам эндонуклеаз рестрикции NdeI и BamHI вводят последовательность, содержащую фрагмент гена глютатион-S-трансферазы и пептид с-myc.
Фрагмент гена глютатион-S-трансферазы получают прямым ПЦР с ДНК плазмиды pDS473a (ATCC #87616) со специфических праймеров, очищают полученный фрагмент элюцией из агарозного геля и при помощи ПЦР к 3'-концу полученного фрагмента достраивают последовательность, кодирующую пептид с-myc, а на концы полученного фрагмента вносят сайты эндонуклеаз рестрикции NdeI и BamHI. Полученный фрагмент клонируют в вектор pET22b(+) по сайтам NdeI и BamHI.
В полученную описанным способом плазмиду pETGST по сайтам эндонуклеаз рестрикции BamHI и XhoI клонируют фрагмент гена летального фактора сибирской язвы, не содержащий домен I.
Полученную плазмиду pETGST-LFmin трансформируют в штамм E.coli BL21(DE3) и экспрессируют в среде 2xYT. Выход рекомбинантного белка летального фактора сибирской язвы высокой степени чистоты (97%) после хроматографической очистки на глютатион-сефарозе (Pharmacia) составляет 15% относительно суммарного белка клетки.
В предлагаемом техническом решении используют штамм-продуцент Escherichia coli BL-LFminGST, содержащие плазмидную ДНК pETGST-LFmin, суперпродуцент рекомбинантного белка LF.
Конструкция рекомбинантной плазмидной ДНК pETGST-LFmin обеспечивает высокий уровень экспрессии клонированного в них гена летального фактора сибирской язвы или его фрагмента без домена I.
Фрагмент гена летального фактора сибирской язвы получен полимеразной цепной реакцией с ДНК бактерии сибирской язвы в Государственном Научном Центре Прикладной микробиологии РАМН.
Концевые участки гена и его фрагмента, содержащие соответствующие примененным векторам сайты эндонуклеаз рестрикции BamHI и SalI вводят с помощью полимеразной цепной реакции с синтетическими олигонуклеотидными праймерами LFminBamHI и LFSalI (фиг.1), а затем ген или его фрагмент клонируют в векторную плазмиду pETGST.
Предлагаемый штамм-продуцент Escherichia coli BL-GSTLFmin характеризуется следующими признаками:
Морфологические признаки. Клетки палочковидной формы, неспороносные, грамотрицательные.
Культуральные признаки. Бактериальные клетки хорошо растут на простых питательных средах. При выращивании на агаре образуют круглые, мутные желто-серые колонии со слегка неровным краем, диаметром до 3 мм. При росте на жидких средах (LB, 2xYT) образуют интенсивную муть.
Физико-биологические признаки. Клетки растут при температуре от 4 до 40°С при оптимуме 37°С и оптимальных значениях рН от 7 до 7.5. В качестве источника углерода используют аминокислоты, углеводы, глицерин. В качестве источника азота могут использовать как органические соединения (аминокислоты, дрожжевой экстракт, триптон и др.), так и неорганические минеральные соли в аммонийной форме.
Устойчивость к антибиотикам. Клетки проявляют устойчивость к антибиотикам пенициллинового ряда (до 200 мкг/мл).
Штамм-продуцент получают путем трансформации компетентных клеток E.coli соответствующей рекомбинантной плазмидной ДНК.
Штамм BL-GSTLFmin является суперпродуцентом. При индукции изопропилтио-β-галактозидом происходит эффективный синтез целевого белка LF, который накапливается в цитоплазме клеток в растворимом состоянии и составляет до 50% суммарного белка клетки.
Изобретение осуществляют следующим образом.
Конструируют рекомбинантную плазмидную ДНК pETGST-LFmin, для чего фрагмент гена летального фактора сибирской язвы без первого домена получают ПЦР с синтетическими олигонуклеотидными праймерами (фиг.1). Праймеры содержат сайты эндонуклеаз рестрикции BamHI (N-конец гена, праймер LFminBamHI) и SalI (С-конец гена, праймер LFXhoI). Полученную ДНК расщепляют соответствующими эндонуклеазами рестрикции и затем лигируют с расщепленной по сайтам BamHI и XhoI векторной плазмидной ДНК pETGST. На фиг.2 представлена последовательность фрамента гена летального фактора сибирской язвы, не содержащего первого домена. На фиг.3 изображена последовательность экспрессионной конструкции плазмиды pETGST-LFmin.
Лигазной смесью трансформируют компетентные клетки E.coli DH12S или другие клетки, не содержащие DE3 лизогена и собственной устойчивости к антибиотикам пенициллинового ряда, и высевают на 2xYT-агар, содержащий 100 мкг/мл ампициллина или другого пенициллинового антибиотика. Полученные клоны анализируют ПЦР с праймеров LFminBamHI и LFSalI, и из клонов, ПЦР которых приводит к образованию фрагмента нужной длины при анализе смеси агарозным гель-электрофорезом, выделяют плазмидную ДНК методом щелочного лизиса. Правильность встраивания фрагмента подтверждают секвенированием плазмидной ДНК. Полученные рекомбинантные плазмидные ДНК трансформируют в компетентные клетки штамма E.coli BL21(DE3), полученные клоны анализируют на уровень экспрессии целевого белка и отбирают штаммы-продуценты.
Штамм-продуцент E.coli BL-LFminGST выращивают на богатой среде (2xYT, Terrific Broth и др.) до достижения оптической плотности культуры 0.6-1.2 ОЕ и индуцируют 1 мМ изопропилтио-β-D-галактозидом. Экспрессию проводят 6 часов при температуре 25°С.
Клетки из экспрессионной культуры собирают центрифугированием при 5000 об/мин и обрабатывают лизоцимом (0.5 мг/мл) при 4°С в буфере, содержащем 30 мМ трис-HCl рН 7.4, 150 мМ NaCl, дополненном протеазным ингибитором (Complete EDTA-free protease inhibitor cocktail, Roches) с добавлением Triton X-100 до концентрации 0.5%. К лизату добавляют MgCl2 до концентрации 5 мМ и разрушают ДНК ДНКазой (10 мкг/мл). Полученный лизат центрифугируют 20 минут при 18000 g и наносят на колонку. Хроматографическую очистку проводят на сорбенте, несущем иммобилизованный глютатион (GST-Sepharose, Pharmacia) в буферном растворе рН 7.5. Элюцию осуществляют раствором 10 мМ глютатиона на том же буфере. Диализуют очищенный белок LF в буфер, содержащий 20 мМ Трис-HCl рН 8, 2 мМ EDTA и 10% глицерина. Чистоту полученного препарата LF определяют денатурирующим электрофорезом в полиакриламидном геле и препарат замораживают для хранения на -70°С.
Детекцию продукта осуществляют с помощью иммуноблота с антителами, специфичными к пептиду с-myc.
Активность полученного рекомбинантного летального фактора сибирской язвы измеряют с использованием специфического субстрата для летального фактора сибирской язвы и содержащего хромометку (Lethal Factor Protease Substrate 2, фирма Biotrend, Германия) по возрастанию поглощения в растворе при длине волны 405 нм на спектрофотометре. Кинетические измерения проводятся в течение 30 минут при 37°С.
Изобретение иллюстрируют графические материалы:
Фиг.1. Праймеры для амплификации фрагмента гена летального фактора сибирской язвы без домена I.
Фиг.2. Последовательность фрагмента гена летального фактора сибирской язвы без домена I.
Фиг.3. Последовательность экспрессионной конструкции плазмиды pETGST-LFmin.
Изобретение иллюстрируют примеры.
Пример 1.
Конструирование рекомбинантной плазмидной ДНК pETGST-LFmin
Химический синтез олигонуклеотидов выполняют твердофазным фосфоамидитным методом на ДНК-синтезаторе ASM-102U (БИОССЕТ, Новосибирск) с наращиванием олигонуклеотидной цепи в направлении от 3' к 5' концу с помощью защищенных фосфоамидитов (5'диметокситритил-N-ацил-2'-дезоксинуклеозид-3'-O-(β-цианэтил-диизопропиламино)-фосфитов), активированных тетразолом. Синтез проводят в масштабе 0.5-0.7 мкМ, используя в качестве носителя пористое стекло (размер пор 500 А), к которому через 3'-сукцинатную связь присоединяют первое нуклеозидное звено (нагрузка 20-30 мкМ/г). Используют синтетический цикл стандартного фосфоамидитного метода.
Для приготовления вектора ДНК 3 мкг плазмиды pETGST-LFmin обрабатывают в 20 мкл буфера для BamHI (фирма New England Biolabs) 10 единицами эндонуклеазы рестрикции BamHI, а затем в 20 мкл буфера 2 (New England Biolabs) 10 единицами эндонуклеазы XhoI. Рестрикция проводится 1 час при 37°С. Векторный фрагмент длиной 6,06 т.п.о. после электрофореза в агарозном геле помещают в диализный мешочек с максимальной пропускной способностью 12-14 кДа и элюируют под действием тока в трис-боратном буфере для электрофореза, а затем обрабатывают смесью фенол-хлороформ (1:1) и осаждают ДНК из раствора этанолом.
Для приготовления фрагмента гена LF проводят ПЦР-амплификацию, используя в качестве матрицы бактериальную ДНК сибирской язвы и (0.05 мкг в образце), а в качестве праймеров - синтетические олигонуклеотиды А и В (по 20 рМ каждого). ПЦР проводят в ДНК-амплификаторе, в буферном растворе, содержащем каждый из четырех dNTP в концентрации 0.5 мМ и 1 ед активности Pfu-полимеразы (фирма Promega). ПЦР проводят в режиме, предусматривающем 1 минуту денатурации при 95°С, отжиг 30 секунд при 57°С, элонгацию - 40 секунд при 72°С, 25 циклов ПЦР. После этого реакционную смесь депротеинизируют смесью фенол-хлороформ (1:2) и осаждают этанолом. Осадок растворяют в 20 мкл воды и расщепляют эндонуклеазами рестрикции BamHI и SalI (реакция с эндонуклеазой рестрикции SalI производства Fermentas проводится в буфере О Fermentas). Целевой фрагмент выделяют элюцией из агарозного геля.
0.5 мкг полученного синтетического фрагмента гена рекомбинантного летального фактора сибирской язвы прибавляют к раствору 0.3 мкг описанного выше векторного фрагмента и лигируют в 10 мкл буфера, содержащего 20 мМ трис-HCl рН 7.6, 10 мМ MgCl2, 0.2 мМ АТР, 10 мМ дитиотрейтита и 10 ед. активности Т4-ДНК лигазы в течение 4 часов при 16°С.
Аликвоту реакционной смеси используют для трансформации электропорацией (прибор ВТХ 600, режим 129 Ом, 2,5 KB) электрокомпетентных клеток E.coli DH12S. Трансформанты высевают на чашки с 2xYT-агаром, содержащим 50 мкг/мл ампициллина. Скрининг рекомбинантов проводят с помощью ПЦР-амплификации с праймеров LFminBamHI и LFSalI в тех же условиях, что и получение фрагмента ДНК для клонирования, используя в качестве матрицы плазмидную ДНК единичной бактериальной колонии. Положительные клоны идентифицируются по наличию фрагмента длиной 1606 пн при анализе ПЦР-смеси электрофорезом в агарозном геле. Из положительных клонов выделяют ДНК плазмиды pETGST-LFmin методом щелочного лизиса.
Пример 2.
Получение штамма-продуцента E.coli BL-GSTLFmin и определение его продуктивности
Штамм-продуцент E.coli BL-GSTLFmin получают трансформацией компетентных клеток E.coli BL21(DE3) плазмидой pETGST-LFmin, как описано в примере 1. Единичные клоны BL21(DE3), несущие плазмиду pETGST-LFmin, экспрессируют в аналитическом количестве (по 5 мл) согласно протоколу, описанному для препаративной экспрессии, и анализируют уровень экспрессии белка летального фактора сибирской язвы денатурирующим электрофорезом в полиакриламидном геле и иммуноблотом с антителами против пептида с-myc. Для проведения электрофореза равные аликвоты клеток разных клонов центрифугируют при 5000 об/мин 5 минут, осажденные клетки растворяют в 100 мкл лизирующего буфера с красителем бромфеноловым синим, обрабатывают 20 секунд ультразвуком, нагревают 3 минуты при 100°С и наносят на гель. После прохождения электрофореза гель окрашивают кумасси R-250 по стандартной методике и сканируют с помощью денситометра Shimadzu CS-930. Для постановки иммуноблота мембрану Hybond C+ и гель на 10 минут замачивают в буфере, содержащем 38.6 мМ глицина, 47.9 мМ трис-основание, 0,0385% додецилсульфата натрия, 20% метанола. Перенос ведут при силе тока 1 мА на см геля. Блокировка мембраны после переноса осуществляется 3% раствором бычьего сывороточного альбумина в PBS рН 7,4, содержащим 0.05% Tween. Блокированную мембрану инкубируют с антителами с-myc (клон CRL-1725, АТСС) при комнатной температуре в течение 2 часов в том же PBS, содержащем 0.5% БСА, и после отмывки первичного антитела смесью PBS-0.05% Tween 20 мембрану инкубируют ночь с пероксидазным конъюгатом антитела к мышиным антителам. Отмытый блот проявляют с использованием пероксидазного субстрата ТМВ по стандартному протоколу. Клоны, дающие наибольший выход белка, являются суперпродуцентами, их выращивают на богатой среде (2xYT) в течение ночи, добавляют глицерин до 15% и замораживают на -70°С для хранения.
Для препаративной экспрессии штаммы суперпродуцента E.coli BL-GSTLFmin выращивают в течение ночи при 37°С с добавлением 2% глюкозы, помещают 10 мл ночной культуры в 1000 мл среды 2xYT, содержащей 0.1% глюкозы и 50 мкг/мл ампициллина, и выращивают при 37°С до оптической плотности 1 ОЕ. Выросшую культуру охлаждают до 25°С, добавляют ИПТГ до 1 мМ и проводят экспрессию 6 часов при 25°С. Далее клетки собирают центрифугированием при 5000 об/мин 10 минут и хранят в виде замороженных осадков при температуре -70°С.
Пример 3.
Очистка белка летального фактора, полученного с использованием конструкции pETGST-LFmin, и определение его активности.
Клетки из экспрессионной культуры суспендируют в буфере, содержащем 30 мМ трис-HCl рН 7.4, 150 мМ NaCl, дополненном протеазным ингибитором (Complete EDTA-free protease inhibitor cocktail, Roches), и обрабатывают лизоцимом (0.5 мг/мл) при +4°С в течение 30 минут. Лизируют клетки добавлением Triton X-100 до концентрации 0.5%. К лизату добавляют MgCl2 до концентрации 5 мМ и разрушают геномную ДНК E.coli ДНКазой (10 мкг/мл). Полученный лизат центрифугируют 20 минут при 18000 g и наносят на колонку с сорбентом, несущим иммобилизованный глютатион (GST-Sepharose, Pharmacia) в буфере, содержащем 30 мМ трис-HCl рН 7.5 и 70 мМ NaCl. Колонку промывают 10 объемами того же буфера и элюируют белок раствором, содержащим 10 мМ глютатиона в том же буфере. Диализуют очищенный белок LF в буфер, содержащий 20 мМ Трис-HCl рН 8, 2 мМ EDTA и 10% глицерина. Чистоту препарата LF определяют денатурирующим электрофорезом в полиакриламидном геле, как описано в примере 2, и замораживают для хранения на -70°С. Выход рекомбинантного белка летального фактора составляет 70 мг с литра культуры после полной процедуры очистки.
Протеолитическая активность полученного препарата оценивается по расщеплению специфического субстрата для летального фактора сибирской язвы, содержащего хромометку (Lethal Factor Protease Substrate 2, фирма Biotrend, Германия), по возрастанию поглощения в растворе при длине волны 405 нм на спектрофотометре (Tecan). Кинетические измерения проводятся в течение 30 минут при 37°С. Кинетические параметры щепления субстрата полученным летальным фактором сибирской язвы составляют kcatM=4.12±0.8 с-1 мкМ-1.

Claims (3)

1. Рекомбинантная плазмидная ДНК pETGST-LFmin, обеспечивающая синтез гибридного рекомбинантного активного белка летального фактора сибирской язвы в клетках Escherichia coli, имеющая молекулярную массу 5,08 МДа, состоящая из BamHI-NdeI фрагмента ДНК коммерческой плазмиды pET22b(+); фрагмента глютатион-5-трансферазы и пептида c-myc, а также BamHI/SalI фрагмента ДНК, содержащего адаптированную к этим сайтам последовательность фрагмента гена летального фактора сибирской язвы без домена, содержащая в качестве генетического маркера ген β-лактамазы, детерминирующий устойчивость клеток Escherichia coli BL21 (DE3), трансформированных плазмидой pETGST-LFmin, к антибиотикам пенициллинового ряда; уникальные сайты узнавания эндонуклеаз рестрикции, расположенные на следующем расстоянии влево от сайта BamHI: XhoII 657 пн, EcoRI 683 пн, StuI 748 пн, Xhol 801 пн, BcoI 801 пн.
2. Штамм Escherichia coli BL-GSTLFmin, продуцирующий гибридный полипептид, содержащий летальный фактор сибирской язвы, химеризованный с глютатион-S-трансферазой и пептидом с-myc.
3. Способ получения рекомбинантного летального фактора сибирской язвы, включающий трансформацию клеток Escherichia coli BL21 (DE3) экспрессионной плазмидной ДНК pETGST-LFmin, кодирующей рекомбинантный белок летального фактора сибирской язвы, культивирование полученного штамма, разрушение бактериальных клеток добавлением Тритона Х-100 в буферном растворе рН 7,4, содержащем протеазный ингибитор, с последующей очисткой целевого продукта на сорбенте с иммобилизованным глютатионом.
RU2007143256/13A 2007-11-23 2007-11-23 СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФУНКЦИОНАЛЬНО АКТИВНОГО РЕКОМБИНАНТНОГО БЕЛКА ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ (LF), РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pETGST-LFmin, КОДИРУЮЩАЯ АКТИВНЫЙ БЕЛОК LF, И ШТАММ Escherichia coli BL-GSTLFmin, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ АКТИВНЫЙ БЕЛОК ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ RU2355769C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2007143256/13A RU2355769C1 (ru) 2007-11-23 2007-11-23 СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФУНКЦИОНАЛЬНО АКТИВНОГО РЕКОМБИНАНТНОГО БЕЛКА ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ (LF), РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pETGST-LFmin, КОДИРУЮЩАЯ АКТИВНЫЙ БЕЛОК LF, И ШТАММ Escherichia coli BL-GSTLFmin, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ АКТИВНЫЙ БЕЛОК ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2007143256/13A RU2355769C1 (ru) 2007-11-23 2007-11-23 СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФУНКЦИОНАЛЬНО АКТИВНОГО РЕКОМБИНАНТНОГО БЕЛКА ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ (LF), РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pETGST-LFmin, КОДИРУЮЩАЯ АКТИВНЫЙ БЕЛОК LF, И ШТАММ Escherichia coli BL-GSTLFmin, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ АКТИВНЫЙ БЕЛОК ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2355769C1 true RU2355769C1 (ru) 2009-05-20

Family

ID=41021715

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2007143256/13A RU2355769C1 (ru) 2007-11-23 2007-11-23 СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФУНКЦИОНАЛЬНО АКТИВНОГО РЕКОМБИНАНТНОГО БЕЛКА ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ (LF), РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pETGST-LFmin, КОДИРУЮЩАЯ АКТИВНЫЙ БЕЛОК LF, И ШТАММ Escherichia coli BL-GSTLFmin, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ АКТИВНЫЙ БЕЛОК ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2355769C1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2558295C1 (ru) * 2014-01-20 2015-07-27 Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии (ФБУН ГНЦ ПМБ) РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pGST/ART/X, КОДИРУЮЩАЯ СЛИТНЫЙ ХИМЕРНЫЙ ПОЛИПЕПТИД GST/ART/X ДЛЯ ВЫСОКОСПЕЦИФИЧНОЙ СЕЛЕКЦИИ АПТАМЕРОВ К БЕЛКУ-МИШЕНИ X В СОСТАВЕ ПОЛИПЕПТИДА

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2558295C1 (ru) * 2014-01-20 2015-07-27 Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии (ФБУН ГНЦ ПМБ) РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pGST/ART/X, КОДИРУЮЩАЯ СЛИТНЫЙ ХИМЕРНЫЙ ПОЛИПЕПТИД GST/ART/X ДЛЯ ВЫСОКОСПЕЦИФИЧНОЙ СЕЛЕКЦИИ АПТАМЕРОВ К БЕЛКУ-МИШЕНИ X В СОСТАВЕ ПОЛИПЕПТИДА

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Abajy et al. A type IV-secretion-like system is required for conjugative DNA transport of broad-host-range plasmid pIP501 in gram-positive bacteria
Maseko et al. Purification and characterization of naturally occurring HIV-1 (South African subtype C) protease mutants from inclusion bodies
JP2010011852A (ja) 細菌フェロモンおよびその使用
Pilehchian et al. Fusion of Clostridium perfringens type D and B epsilon and beta toxin genes and it’s cloning in E. coli
Li et al. McvR, a single domain response regulator regulates motility and virulence in the plant pathogen Xanthomonas campestris
EP1619208B1 (en) Chaperonine-target protein complex, method of producing the same, method of stabilizing target protein, method of immobilizing target protein, method of analyzing the structure of target protein, sustained-release preparation and method of producing antibody against target protein
Marino et al. Translation-dependent downregulation of Cas12a mRNA by an anti-CRISPR protein
CN106834252B (zh) 一种高稳定型MazF突变体及其应用
RU2355769C1 (ru) СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФУНКЦИОНАЛЬНО АКТИВНОГО РЕКОМБИНАНТНОГО БЕЛКА ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ (LF), РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pETGST-LFmin, КОДИРУЮЩАЯ АКТИВНЫЙ БЕЛОК LF, И ШТАММ Escherichia coli BL-GSTLFmin, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ АКТИВНЫЙ БЕЛОК ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ
RU2361921C1 (ru) СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФУНКЦИОНАЛЬНО АКТИВНОГО РЕКОМБИНАНТНОГО БЕЛКА ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА ЯЗВЫ (LF), РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pETHIS-LF, КОДИРУЮЩАЯ АКТИВНЫЙ БЕЛОК LF И ШТАММ ESCHERICHIA COLI BL-HISLF, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ АКТИВНЫЙ БЕЛОК ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ
US6696268B1 (en) Production and use of antimicrobial agents
JP7166244B2 (ja) 改変バクテリオファージ
An et al. Cloning, expression and purification of penicillin-binding protein 3 from Pseudomonas aeruginosa CMCC 10104
KR101728365B1 (ko) 3h7 항체와의 친화성이 향상된 펩티드 태그 및 이의 용도
RU2416637C1 (ru) РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pPHOFus, КОДИРУЮЩАЯ СУБСТРАТ ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ, СЛИТЫЙ СО ЩЕЛОЧНОЙ ФОСФАТАЗОЙ Escherichia coli, И ШТАММ Escherichia coli BL-PHOFus, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ БЕЛОК - СУБСТРАТ ЛЕТАЛЬНОГО ФАКТОРА СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ В СОСТАВЕ ЩЕЛОЧНОЙ ФОСФАТАЗЫ Escherichia coli
De Leon et al. Production and purification of the penicillin-binding protein 3 from Pseudomonas aeruginosa
JP2004535796A (ja) エルシニア・ペスティス(yersiniapestis)及びシュードモナス・エルギノーサ(pseudomonasaeruginosa)のdna複製をブロックする薬剤の開発のためのシステム
CN112359060B (zh) 含有靶向突变型kras融合基因的重组载体、融合蛋白及蛋白质复合物及其构建方法和应用
Ubeidat et al. Expression and one-step purification of a developmentally regulated protein from Dictyostelium discoideum
Lorenzo-Diaz et al. Complete labelling of pneumococcal DNA-binding proteins with seleno-L-methionine
US7271005B2 (en) Modulation of bacterial membrane permeability
US6511816B1 (en) DNA gyrase-inhibiting proteins
RU2156299C1 (ru) Рекомбинантная плазмидная днк, кодирующая полную последовательность стафилокиназы, штамм escherichia coli sa 9325 - продуцент рекомбинантного белка
KR20230084737A (ko) 클로스트리디움 퍼프린젠스에 대해 용해능과 결합 친화성을 갖는 키메릭 엔도라이신 ClyY
KR100408634B1 (ko) 결핵균 알엠엘씨 단백질의 대량 제조방법 및 이에 의하여정제된 알엠엘씨 단백질

Legal Events

Date Code Title Description
PC4A Invention patent assignment

Effective date: 20100416

MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20171124