RU2263145C2 - Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая лиганд cd86 кошки, диагностический олигонуклеотид, клонирующий вектор, вакцина, способы индукции или подавления иммунитета у кошки - Google Patents
Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая лиганд cd86 кошки, диагностический олигонуклеотид, клонирующий вектор, вакцина, способы индукции или подавления иммунитета у кошки Download PDFInfo
- Publication number
- RU2263145C2 RU2263145C2 RU2000130225/13A RU2000130225A RU2263145C2 RU 2263145 C2 RU2263145 C2 RU 2263145C2 RU 2000130225/13 A RU2000130225/13 A RU 2000130225/13A RU 2000130225 A RU2000130225 A RU 2000130225A RU 2263145 C2 RU2263145 C2 RU 2263145C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- feline
- cells
- cat
- ctla
- nucleic acid
- Prior art date
Links
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 title claims abstract description 244
- 241000282324 Felis Species 0.000 title claims abstract description 228
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 86
- 239000003446 ligand Substances 0.000 title claims abstract description 57
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 title claims abstract description 53
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims abstract description 50
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims abstract description 49
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims abstract description 49
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 title claims abstract description 15
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 title claims abstract description 14
- 230000036039 immunity Effects 0.000 title claims description 13
- 230000006698 induction Effects 0.000 title abstract description 12
- 230000001629 suppression Effects 0.000 title abstract description 10
- 230000028993 immune response Effects 0.000 claims abstract description 66
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 97
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims description 90
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 87
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 71
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 69
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 60
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 57
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 57
- 241000713800 Feline immunodeficiency virus Species 0.000 claims description 48
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 45
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 43
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 35
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 34
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 claims description 32
- 244000052769 pathogen Species 0.000 claims description 28
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 26
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims description 20
- 241000714165 Feline leukemia virus Species 0.000 claims description 18
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 claims description 13
- 230000037396 body weight Effects 0.000 claims description 10
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 9
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 claims description 8
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 claims description 6
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 claims description 6
- 241000711475 Feline infectious peritonitis virus Species 0.000 claims description 6
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 claims description 6
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 4
- 241000606161 Chlamydia Species 0.000 claims description 3
- 241000243988 Dirofilaria immitis Species 0.000 claims description 3
- 241000701087 Felid alphaherpesvirus 1 Species 0.000 claims description 3
- 241000714201 Feline calicivirus Species 0.000 claims description 3
- 241000701915 Feline panleukopenia virus Species 0.000 claims description 3
- 241000702679 Feline rotavirus Species 0.000 claims description 3
- 241000714174 Feline sarcoma virus Species 0.000 claims description 3
- 241000711798 Rabies lyssavirus Species 0.000 claims description 3
- 241000702263 Reovirus sp. Species 0.000 claims description 3
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 claims description 3
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 claims description 3
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 claims description 3
- 239000011616 biotin Substances 0.000 claims description 3
- 229940099686 dirofilaria immitis Drugs 0.000 claims description 3
- 208000005098 feline infectious peritonitis Diseases 0.000 claims description 3
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 claims description 3
- 241000223997 Toxoplasma gondii Species 0.000 claims description 2
- 244000045947 parasite Species 0.000 claims description 2
- 230000000241 respiratory effect Effects 0.000 claims description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 31
- 206010061598 Immunodeficiency Diseases 0.000 abstract description 6
- 208000029462 Immunodeficiency disease Diseases 0.000 abstract description 6
- 230000007813 immunodeficiency Effects 0.000 abstract description 6
- 206010034674 peritonitis Diseases 0.000 abstract description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 2
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 abstract 1
- 238000011321 prophylaxis Methods 0.000 abstract 1
- 102100027213 T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Human genes 0.000 description 376
- 101000914514 Homo sapiens T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Proteins 0.000 description 375
- 102100027222 T-lymphocyte activation antigen CD80 Human genes 0.000 description 350
- 101000914484 Homo sapiens T-lymphocyte activation antigen CD80 Proteins 0.000 description 347
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 269
- 108010021064 CTLA-4 Antigen Proteins 0.000 description 201
- 102000008203 CTLA-4 Antigen Human genes 0.000 description 194
- 229940045513 CTLA4 antagonist Drugs 0.000 description 191
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 174
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 138
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 129
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 107
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 94
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 89
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 89
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 75
- -1 CD86 Proteins 0.000 description 72
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 66
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 64
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 61
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 61
- 101000716102 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD4 Proteins 0.000 description 58
- 102100036011 T-cell surface glycoprotein CD4 Human genes 0.000 description 58
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 57
- 239000000047 product Substances 0.000 description 55
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 54
- 102100034922 T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain Human genes 0.000 description 51
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 50
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 50
- 238000001994 activation Methods 0.000 description 49
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 49
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 47
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 47
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 46
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 44
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 44
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 44
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 44
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 38
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 36
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 35
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 35
- 230000004044 response Effects 0.000 description 35
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 30
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 30
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 description 30
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 29
- 239000000463 material Substances 0.000 description 28
- 108010062580 Concanavalin A Proteins 0.000 description 27
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 27
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 27
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 27
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 27
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 26
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 description 26
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 26
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 description 25
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 25
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 24
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 23
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 23
- 238000011161 development Methods 0.000 description 23
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 23
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 23
- 230000008569 process Effects 0.000 description 23
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 22
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 21
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 description 21
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 19
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 19
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 19
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 19
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 18
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 description 18
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 18
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 18
- 229940044627 gamma-interferon Drugs 0.000 description 18
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 18
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 description 17
- 208000037357 HIV infectious disease Diseases 0.000 description 17
- 101710180188 T-lymphocyte activation antigen CD80 Proteins 0.000 description 17
- 208000033519 human immunodeficiency virus infectious disease Diseases 0.000 description 17
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 17
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 17
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 16
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 16
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 16
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 15
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 15
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 14
- 230000006870 function Effects 0.000 description 14
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 14
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 14
- 102000004388 Interleukin-4 Human genes 0.000 description 13
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 description 13
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 13
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 12
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 12
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 12
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 12
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 12
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 description 11
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 11
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 11
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 11
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 11
- 241000894007 species Species 0.000 description 11
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 10
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 10
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 10
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 description 10
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 10
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 9
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 9
- 102000003814 Interleukin-10 Human genes 0.000 description 9
- 108090000174 Interleukin-10 Proteins 0.000 description 9
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 9
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 9
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 9
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 9
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 9
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 8
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 8
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 8
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 8
- 230000005867 T cell response Effects 0.000 description 8
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 8
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 8
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 8
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 8
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 8
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 8
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 8
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 8
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 8
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 8
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 8
- 230000007727 signaling mechanism Effects 0.000 description 8
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 8
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 8
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 8
- 101150107690 CD80 gene Proteins 0.000 description 7
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 7
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 7
- 102100039620 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Human genes 0.000 description 7
- 101100166600 Homo sapiens CD28 gene Proteins 0.000 description 7
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 7
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 7
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 7
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 7
- 230000008859 change Effects 0.000 description 7
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 7
- 210000005220 cytoplasmic tail Anatomy 0.000 description 7
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 7
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 7
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 7
- 230000000284 resting effect Effects 0.000 description 7
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 7
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102100040245 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5 Human genes 0.000 description 6
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 6
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 6
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 6
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 6
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 6
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 6
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 6
- 230000008348 humoral response Effects 0.000 description 6
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 6
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 6
- 229920006008 lipopolysaccharide Polymers 0.000 description 6
- 230000015654 memory Effects 0.000 description 6
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 6
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 6
- 239000002356 single layer Substances 0.000 description 6
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 6
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 6
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 6
- 101150100936 CD28 gene Proteins 0.000 description 5
- 101150013553 CD40 gene Proteins 0.000 description 5
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 5
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 5
- 102000018713 Histocompatibility Antigens Class II Human genes 0.000 description 5
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 5
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 5
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 5
- 230000005809 anti-tumor immunity Effects 0.000 description 5
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 5
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 description 5
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 5
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 5
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 5
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 5
- 230000037451 immune surveillance Effects 0.000 description 5
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 5
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 5
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 5
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 5
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 5
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 5
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 5
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 5
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 5
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 5
- 210000001541 thymus gland Anatomy 0.000 description 5
- 108020005345 3' Untranslated Regions Proteins 0.000 description 4
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 4
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010071942 Colony-Stimulating Factors Proteins 0.000 description 4
- 108020001019 DNA Primers Proteins 0.000 description 4
- 102100033215 DNA nucleotidylexotransferase Human genes 0.000 description 4
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 4
- 241000725579 Feline coronavirus Species 0.000 description 4
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 4
- 102000008949 Histocompatibility Antigens Class I Human genes 0.000 description 4
- 102000016844 Immunoglobulin-like domains Human genes 0.000 description 4
- 108050006430 Immunoglobulin-like domains Proteins 0.000 description 4
- 108010002616 Interleukin-5 Proteins 0.000 description 4
- 102000000743 Interleukin-5 Human genes 0.000 description 4
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 4
- 102000004889 Interleukin-6 Human genes 0.000 description 4
- 108091054437 MHC class I family Proteins 0.000 description 4
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- 108700018351 Major Histocompatibility Complex Proteins 0.000 description 4
- 230000004988 N-glycosylation Effects 0.000 description 4
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 4
- 206010038997 Retroviral infections Diseases 0.000 description 4
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 4
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 4
- 206010053613 Type IV hypersensitivity reaction Diseases 0.000 description 4
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 4
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 4
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 4
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 4
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 4
- 150000001720 carbohydrates Chemical group 0.000 description 4
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 4
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 4
- 230000004940 costimulation Effects 0.000 description 4
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 4
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 4
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 4
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 4
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 4
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 4
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 4
- 102000054189 human CD80 Human genes 0.000 description 4
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 4
- 210000001821 langerhans cell Anatomy 0.000 description 4
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 4
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 4
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 4
- 210000004986 primary T-cell Anatomy 0.000 description 4
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 4
- 230000008054 signal transmission Effects 0.000 description 4
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 4
- 230000005951 type IV hypersensitivity Effects 0.000 description 4
- 208000027930 type IV hypersensitivity disease Diseases 0.000 description 4
- 230000003827 upregulation Effects 0.000 description 4
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 4
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 3
- 108010017533 Butyrophilins Proteins 0.000 description 3
- 102000004555 Butyrophilins Human genes 0.000 description 3
- 210000004366 CD4-positive T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 108010029697 CD40 Ligand Proteins 0.000 description 3
- 102100032937 CD40 ligand Human genes 0.000 description 3
- 210000001266 CD8-positive T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 101100322243 Caenorhabditis elegans deg-3 gene Proteins 0.000 description 3
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 3
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 3
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 3
- 206010011968 Decreased immune responsiveness Diseases 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000035240 Disease Resistance Diseases 0.000 description 3
- 238000012413 Fluorescence activated cell sorting analysis Methods 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101000611183 Homo sapiens Tumor necrosis factor Proteins 0.000 description 3
- 102000003816 Interleukin-13 Human genes 0.000 description 3
- 108090000176 Interleukin-13 Proteins 0.000 description 3
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 description 3
- 241000713869 Moloney murine leukemia virus Species 0.000 description 3
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 3
- 102000003993 Phosphatidylinositol 3-kinases Human genes 0.000 description 3
- 108090000430 Phosphatidylinositol 3-kinases Proteins 0.000 description 3
- 206010040047 Sepsis Diseases 0.000 description 3
- 230000006044 T cell activation Effects 0.000 description 3
- 102100040247 Tumor necrosis factor Human genes 0.000 description 3
- 108700005077 Viral Genes Proteins 0.000 description 3
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 3
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 3
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 3
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 3
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 3
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 3
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 3
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 3
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 3
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 3
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 3
- 238000013461 design Methods 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 3
- 201000002491 encephalomyelitis Diseases 0.000 description 3
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 3
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 3
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 3
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 3
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 3
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 3
- 230000004957 immunoregulator effect Effects 0.000 description 3
- 238000010874 in vitro model Methods 0.000 description 3
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 3
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 3
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 3
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 3
- 101150066555 lacZ gene Proteins 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 3
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 3
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 3
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 3
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 3
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 3
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 3
- 230000009131 signaling function Effects 0.000 description 3
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 3
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 3
- WHTVZRBIWZFKQO-AWEZNQCLSA-N (S)-chloroquine Chemical compound ClC1=CC=C2C(N[C@@H](C)CCCN(CC)CC)=CC=NC2=C1 WHTVZRBIWZFKQO-AWEZNQCLSA-N 0.000 description 2
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 108020004491 Antisense DNA Proteins 0.000 description 2
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 102100026189 Beta-galactosidase Human genes 0.000 description 2
- 101150001151 CD86 gene Proteins 0.000 description 2
- BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N Calcium cation Chemical compound [Ca+2] BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000016911 Deoxyribonucleases Human genes 0.000 description 2
- 108010053770 Deoxyribonucleases Proteins 0.000 description 2
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 2
- 241000701925 Feline parvovirus Species 0.000 description 2
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710177291 Gag polyprotein Proteins 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010027412 Histocompatibility Antigens Class II Proteins 0.000 description 2
- 101100166621 Homo sapiens CD80 gene Proteins 0.000 description 2
- 101000689224 Homo sapiens Src-like-adapter 2 Proteins 0.000 description 2
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 2
- 102100025390 Integrin beta-2 Human genes 0.000 description 2
- 108010064593 Intercellular Adhesion Molecule-1 Proteins 0.000 description 2
- 102100037877 Intercellular adhesion molecule 1 Human genes 0.000 description 2
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 2
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 2
- 102000013462 Interleukin-12 Human genes 0.000 description 2
- 108010065805 Interleukin-12 Proteins 0.000 description 2
- 108010002386 Interleukin-3 Proteins 0.000 description 2
- 102000000646 Interleukin-3 Human genes 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010064548 Lymphocyte Function-Associated Antigen-1 Proteins 0.000 description 2
- 206010025327 Lymphopenia Diseases 0.000 description 2
- 102000004083 Lymphotoxin-alpha Human genes 0.000 description 2
- 108090000542 Lymphotoxin-alpha Proteins 0.000 description 2
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 2
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 101710125418 Major capsid protein Proteins 0.000 description 2
- 102000012750 Membrane Glycoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108010090054 Membrane Glycoproteins Proteins 0.000 description 2
- 108090000143 Mouse Proteins Proteins 0.000 description 2
- 108091061960 Naked DNA Proteins 0.000 description 2
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 2
- 239000012124 Opti-MEM Substances 0.000 description 2
- 239000013614 RNA sample Substances 0.000 description 2
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 2
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 2
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 2
- 241000258242 Siphonaptera Species 0.000 description 2
- 102100024510 Src-like-adapter 2 Human genes 0.000 description 2
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 description 2
- 230000006052 T cell proliferation Effects 0.000 description 2
- 241000188156 Tamu Species 0.000 description 2
- 102100038126 Tenascin Human genes 0.000 description 2
- 108010008125 Tenascin Proteins 0.000 description 2
- 108091036066 Three prime untranslated region Proteins 0.000 description 2
- 108010001244 Tli polymerase Proteins 0.000 description 2
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 2
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 2
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 2
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 2
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 2
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 2
- 230000001070 adhesive effect Effects 0.000 description 2
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 2
- 230000030741 antigen processing and presentation Effects 0.000 description 2
- 239000003816 antisense DNA Substances 0.000 description 2
- 230000001363 autoimmune Effects 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 2
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 2
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 2
- 229910001424 calcium ion Inorganic materials 0.000 description 2
- 101150055766 cat gene Proteins 0.000 description 2
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 2
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 2
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 2
- 230000007969 cellular immunity Effects 0.000 description 2
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 2
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 2
- 229960003677 chloroquine Drugs 0.000 description 2
- WHTVZRBIWZFKQO-UHFFFAOYSA-N chloroquine Natural products ClC1=CC=C2C(NC(C)CCCN(CC)CC)=CC=NC2=C1 WHTVZRBIWZFKQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 2
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 2
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 2
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 2
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 2
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 2
- 230000034994 death Effects 0.000 description 2
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 2
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 2
- 230000002222 downregulating effect Effects 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 2
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 2
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 2
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 2
- 230000007274 generation of a signal involved in cell-cell signaling Effects 0.000 description 2
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 2
- 210000003714 granulocyte Anatomy 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- 238000007849 hot-start PCR Methods 0.000 description 2
- 230000028996 humoral immune response Effects 0.000 description 2
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 2
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 2
- 230000003308 immunostimulating effect Effects 0.000 description 2
- 239000012678 infectious agent Substances 0.000 description 2
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 2
- 238000013101 initial test Methods 0.000 description 2
- 230000015788 innate immune response Effects 0.000 description 2
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 description 2
- 230000004068 intracellular signaling Effects 0.000 description 2
- 230000007728 intracellular signaling mechanism Effects 0.000 description 2
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 2
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 2
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 2
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 2
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 2
- 231100000518 lethal Toxicity 0.000 description 2
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 231100001023 lymphopenia Toxicity 0.000 description 2
- 230000002101 lytic effect Effects 0.000 description 2
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 2
- 210000003071 memory t lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 206010061289 metastatic neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 2
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 2
- 210000005105 peripheral blood lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 229920002704 polyhistidine Polymers 0.000 description 2
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000009822 protein phosphorylation Effects 0.000 description 2
- 239000011535 reaction buffer Substances 0.000 description 2
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 2
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 2
- FGDZQCVHDSGLHJ-UHFFFAOYSA-M rubidium chloride Chemical compound [Cl-].[Rb+] FGDZQCVHDSGLHJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 2
- 210000004988 splenocyte Anatomy 0.000 description 2
- 239000007921 spray Substances 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 2
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 2
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 2
- 125000001493 tyrosinyl group Chemical group [H]OC1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 2
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 2
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 2
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 2
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 2
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 2
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 2
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- CKTSBUTUHBMZGZ-SHYZEUOFSA-N 2'‐deoxycytidine Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 CKTSBUTUHBMZGZ-SHYZEUOFSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- 108020005029 5' Flanking Region Proteins 0.000 description 1
- OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N 5-bromo-4-chloro-3-indolyl beta-D-galactoside Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CNC2=CC=C(Br)C(Cl)=C12 OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N 0.000 description 1
- 208000012124 AIDS-related disease Diseases 0.000 description 1
- 241001455214 Acinonyx jubatus Species 0.000 description 1
- 206010069754 Acquired gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 102100034540 Adenomatous polyposis coli protein Human genes 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 101150089247 B7 gene Proteins 0.000 description 1
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 description 1
- 108700031361 Brachyury Proteins 0.000 description 1
- 108010084313 CD58 Antigens Proteins 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 206010057248 Cell death Diseases 0.000 description 1
- 102000007644 Colony-Stimulating Factors Human genes 0.000 description 1
- 108010028773 Complement C5 Proteins 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 108010041986 DNA Vaccines Proteins 0.000 description 1
- 108010008286 DNA nucleotidylexotransferase Proteins 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 208000016192 Demyelinating disease Diseases 0.000 description 1
- 206010012305 Demyelination Diseases 0.000 description 1
- CKTSBUTUHBMZGZ-UHFFFAOYSA-N Deoxycytidine Natural products O=C1N=C(N)C=CN1C1OC(CO)C(O)C1 CKTSBUTUHBMZGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- 101100437498 Escherichia coli (strain K12) uidA gene Proteins 0.000 description 1
- 108010087819 Fc receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000009109 Fc receptors Human genes 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010093488 His-His-His-His-His-His Proteins 0.000 description 1
- 108010088652 Histocompatibility Antigens Class I Proteins 0.000 description 1
- 101000924577 Homo sapiens Adenomatous polyposis coli protein Proteins 0.000 description 1
- 101000946850 Homo sapiens T-lymphocyte activation antigen CD86 Proteins 0.000 description 1
- 101000651298 Homo sapiens TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A Proteins 0.000 description 1
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 description 1
- 206010062016 Immunosuppression Diseases 0.000 description 1
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 description 1
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 1
- 102000000589 Interleukin-1 Human genes 0.000 description 1
- 108010002586 Interleukin-7 Proteins 0.000 description 1
- 102000000704 Interleukin-7 Human genes 0.000 description 1
- 108090001007 Interleukin-8 Proteins 0.000 description 1
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 description 1
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 description 1
- 102100024319 Intestinal-type alkaline phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 101710184243 Intestinal-type alkaline phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 description 1
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 description 1
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 description 1
- 241001625930 Luria Species 0.000 description 1
- 208000008771 Lymphadenopathy Diseases 0.000 description 1
- 241000721701 Lynx Species 0.000 description 1
- 101150018665 MAPK3 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000043129 MHC class I family Human genes 0.000 description 1
- 108010046938 Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 1
- 102000007651 Macrophage Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 1
- 101150024075 Mapk1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000006386 Myelin Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010083674 Myelin Proteins Proteins 0.000 description 1
- 125000000729 N-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 1
- 108091007960 PI3Ks Proteins 0.000 description 1
- 241000282320 Panthera leo Species 0.000 description 1
- 241000282376 Panthera tigris Species 0.000 description 1
- KHGNFPUMBJSZSM-UHFFFAOYSA-N Perforine Natural products COC1=C2CCC(O)C(CCC(C)(C)O)(OC)C2=NC2=C1C=CO2 KHGNFPUMBJSZSM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000037581 Persistent Infection Diseases 0.000 description 1
- 108010010677 Phosphodiesterase I Proteins 0.000 description 1
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 1
- 208000007452 Plasmacytoma Diseases 0.000 description 1
- 102000003923 Protein Kinase C Human genes 0.000 description 1
- 108090000315 Protein Kinase C Proteins 0.000 description 1
- 102100029812 Protein S100-A12 Human genes 0.000 description 1
- 101710110949 Protein S100-A12 Proteins 0.000 description 1
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 1
- 108090000412 Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 description 1
- 102000004022 Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 description 1
- 241000125945 Protoparvovirus Species 0.000 description 1
- 240000005809 Prunus persica Species 0.000 description 1
- 235000006040 Prunus persica var persica Nutrition 0.000 description 1
- 201000004681 Psoriasis Diseases 0.000 description 1
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 description 1
- 108010065868 RNA polymerase SP6 Proteins 0.000 description 1
- 239000012979 RPMI medium Substances 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 1
- 241000725643 Respiratory syncytial virus Species 0.000 description 1
- 206010051497 Rhinotracheitis Diseases 0.000 description 1
- 108050003452 SH2 domains Proteins 0.000 description 1
- 102000014400 SH2 domains Human genes 0.000 description 1
- 241000710961 Semliki Forest virus Species 0.000 description 1
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 1
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 1
- 206010040070 Septic Shock Diseases 0.000 description 1
- 206010067723 Skin plaque Diseases 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000020385 T cell costimulation Effects 0.000 description 1
- 210000000173 T-lymphoid precursor cell Anatomy 0.000 description 1
- 102100027651 TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A Human genes 0.000 description 1
- 210000004241 Th2 cell Anatomy 0.000 description 1
- 201000005485 Toxoplasmosis Diseases 0.000 description 1
- 108700029229 Transcriptional Regulatory Elements Proteins 0.000 description 1
- 101710165474 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5 Proteins 0.000 description 1
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 description 1
- 241000700647 Variola virus Species 0.000 description 1
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 1
- HMNZFMSWFCAGGW-XPWSMXQVSA-N [3-[hydroxy(2-hydroxyethoxy)phosphoryl]oxy-2-[(e)-octadec-9-enoyl]oxypropyl] (e)-octadec-9-enoate Chemical compound CCCCCCCC\C=C\CCCCCCCC(=O)OCC(COP(O)(=O)OCCO)OC(=O)CCCCCCC\C=C\CCCCCCCC HMNZFMSWFCAGGW-XPWSMXQVSA-N 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 239000008186 active pharmaceutical agent Substances 0.000 description 1
- 239000000853 adhesive Substances 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- 230000000961 alloantigen Effects 0.000 description 1
- 230000003698 anagen phase Effects 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 230000003302 anti-idiotype Effects 0.000 description 1
- 230000000798 anti-retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 210000000628 antibody-producing cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000007416 antiviral immune response Effects 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000613 asparagine group Chemical group N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000003305 autocrine Effects 0.000 description 1
- 230000005784 autoimmunity Effects 0.000 description 1
- 238000000211 autoradiogram Methods 0.000 description 1
- 239000003899 bactericide agent Substances 0.000 description 1
- 108010058966 bacteriophage T7 induced DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 238000009534 blood test Methods 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N bromophenol blue Chemical compound C1=C(Br)C(O)=C(Br)C=C1C1(C=2C=C(Br)C(O)=C(Br)C=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 1
- DEGAKNSWVGKMLS-UHFFFAOYSA-N calcein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC(CN(CC(O)=O)CC(O)=O)=C(O)C=C1OC1=C2C=C(CN(CC(O)=O)CC(=O)O)C(O)=C1 DEGAKNSWVGKMLS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BQRGNLJZBFXNCZ-UHFFFAOYSA-N calcein am Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC(CN(CC(=O)OCOC(C)=O)CC(=O)OCOC(C)=O)=C(OC(C)=O)C=C1OC1=C2C=C(CN(CC(=O)OCOC(C)=O)CC(=O)OCOC(=O)C)C(OC(C)=O)=C1 BQRGNLJZBFXNCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 244000309466 calf Species 0.000 description 1
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 1
- 230000021164 cell adhesion Effects 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 230000022534 cell killing Effects 0.000 description 1
- 230000011748 cell maturation Effects 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000007248 cellular mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 239000005482 chemotactic factor Substances 0.000 description 1
- YTRQFSDWAXHJCC-UHFFFAOYSA-N chloroform;phenol Chemical compound ClC(Cl)Cl.OC1=CC=CC=C1 YTRQFSDWAXHJCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005352 clarification Methods 0.000 description 1
- 229940047120 colony stimulating factors Drugs 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 238000012875 competitive assay Methods 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 230000008602 contraction Effects 0.000 description 1
- 239000003246 corticosteroid Substances 0.000 description 1
- 229960001334 corticosteroids Drugs 0.000 description 1
- 108091008034 costimulatory receptors Proteins 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 230000016396 cytokine production Effects 0.000 description 1
- 108010057085 cytokine receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000003675 cytokine receptors Human genes 0.000 description 1
- 230000001461 cytolytic effect Effects 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 230000007402 cytotoxic response Effects 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N dATP Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N dATP Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1CC(O)C(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J dCTP(4-) Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)C1 RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J 0.000 description 1
- 230000000254 damaging effect Effects 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 230000003412 degenerative effect Effects 0.000 description 1
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 1
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 230000006806 disease prevention Effects 0.000 description 1
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 1
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 210000003162 effector t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 210000001671 embryonic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000012202 endocytosis Effects 0.000 description 1
- 230000003090 exacerbative effect Effects 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 210000003722 extracellular fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 238000011239 genetic vaccination Methods 0.000 description 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- 125000000404 glutamine group Chemical group N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 1
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 1
- 230000009931 harmful effect Effects 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 108060003552 hemocyanin Proteins 0.000 description 1
- 239000000833 heterodimer Substances 0.000 description 1
- 210000003630 histaminocyte Anatomy 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000487 histidyl group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C([H])=N1 0.000 description 1
- 230000001744 histochemical effect Effects 0.000 description 1
- 239000000710 homodimer Substances 0.000 description 1
- 102000049849 human CD86 Human genes 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000004727 humoral immunity Effects 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 230000008073 immune recognition Effects 0.000 description 1
- 229940088592 immunologic factor Drugs 0.000 description 1
- 239000000367 immunologic factor Substances 0.000 description 1
- 230000006054 immunological memory Effects 0.000 description 1
- 230000001506 immunosuppresive effect Effects 0.000 description 1
- 230000001024 immunotherapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 208000033065 inborn errors of immunity Diseases 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000006882 induction of apoptosis Effects 0.000 description 1
- 201000006747 infectious mononucleosis Diseases 0.000 description 1
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000013383 initial experiment Methods 0.000 description 1
- 239000003999 initiator Substances 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 230000008611 intercellular interaction Effects 0.000 description 1
- 229940076144 interleukin-10 Drugs 0.000 description 1
- 230000004073 interleukin-2 production Effects 0.000 description 1
- 108040006849 interleukin-2 receptor activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 229940028885 interleukin-4 Drugs 0.000 description 1
- 229940100994 interleukin-7 Drugs 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000001155 isoelectric focusing Methods 0.000 description 1
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 description 1
- 239000002523 lectin Substances 0.000 description 1
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 1
- 230000021633 leukocyte mediated immunity Effects 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 239000012160 loading buffer Substances 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 1
- 230000001050 lubricating effect Effects 0.000 description 1
- 206010025135 lupus erythematosus Diseases 0.000 description 1
- 208000018555 lymphatic system disease Diseases 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 206010025482 malaise Diseases 0.000 description 1
- 230000007257 malfunction Effects 0.000 description 1
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 230000008774 maternal effect Effects 0.000 description 1
- 210000003574 melanophore Anatomy 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 1
- 239000003226 mitogen Substances 0.000 description 1
- 230000002297 mitogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 238000003032 molecular docking Methods 0.000 description 1
- 239000003068 molecular probe Substances 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 201000006417 multiple sclerosis Diseases 0.000 description 1
- 210000005012 myelin Anatomy 0.000 description 1
- 210000000066 myeloid cell Anatomy 0.000 description 1
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- JCAFGYWSIWYMOX-UHFFFAOYSA-N n-(1h-indol-5-yl)benzamide Chemical compound C=1C=C2NC=CC2=CC=1NC(=O)C1=CC=CC=C1 JCAFGYWSIWYMOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940022007 naked DNA vaccine Drugs 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 201000008383 nephritis Diseases 0.000 description 1
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000000422 nocturnal effect Effects 0.000 description 1
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 1
- 229960002378 oftasceine Drugs 0.000 description 1
- 210000004248 oligodendroglia Anatomy 0.000 description 1
- 238000006384 oligomerization reaction Methods 0.000 description 1
- 231100000590 oncogenic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002246 oncogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 230000009340 pathogen transmission Effects 0.000 description 1
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 239000001814 pectin Substances 0.000 description 1
- 229920001277 pectin Polymers 0.000 description 1
- 235000010987 pectin Nutrition 0.000 description 1
- 229930192851 perforin Natural products 0.000 description 1
- 210000004976 peripheral blood cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 210000003024 peritoneal macrophage Anatomy 0.000 description 1
- 150000003905 phosphatidylinositols Chemical class 0.000 description 1
- DCWXELXMIBXGTH-UHFFFAOYSA-N phosphotyrosine Chemical compound OC(=O)C(N)CC1=CC=C(OP(O)(O)=O)C=C1 DCWXELXMIBXGTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004014 plasticizer Substances 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 208000028529 primary immunodeficiency disease Diseases 0.000 description 1
- 238000011809 primate model Methods 0.000 description 1
- 230000002035 prolonged effect Effects 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 1
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 1
- 230000004850 protein–protein interaction Effects 0.000 description 1
- 239000012264 purified product Substances 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 230000019908 regulation of T cell activation Effects 0.000 description 1
- 230000026267 regulation of growth Effects 0.000 description 1
- 230000007363 regulatory process Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 description 1
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000011808 rodent model Methods 0.000 description 1
- 238000009666 routine test Methods 0.000 description 1
- 229940102127 rubidium chloride Drugs 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 230000036303 septic shock Effects 0.000 description 1
- 125000003607 serino group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C(O[H])([H])[H] 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 230000005582 sexual transmission Effects 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 230000007781 signaling event Effects 0.000 description 1
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 230000037439 somatic mutation Effects 0.000 description 1
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 1
- 230000020382 suppression by virus of host antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I Effects 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
- 210000001550 testis Anatomy 0.000 description 1
- 125000000341 threoninyl group Chemical group [H]OC([H])(C([H])([H])[H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 1
- 230000014599 transmission of virus Effects 0.000 description 1
- 230000001228 trophic effect Effects 0.000 description 1
- 230000004565 tumor cell growth Effects 0.000 description 1
- 230000005748 tumor development Effects 0.000 description 1
- 231100000588 tumorigenic Toxicity 0.000 description 1
- 230000000381 tumorigenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000029069 type 2 immune response Effects 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 229960004854 viral vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000005727 virus proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000004580 weight loss Effects 0.000 description 1
- 238000002424 x-ray crystallography Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/70521—CD28, CD152
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/20—Antivirals for DNA viruses
- A61P31/22—Antivirals for DNA viruses for herpes viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P33/00—Antiparasitic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/06—Immunosuppressants, e.g. drugs for graft rejection
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/70532—B7 molecules, e.g. CD80, CD86
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Immunology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Virology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Transplantation (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Изобретение относится к области биотехнологии. Предложены выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая лиганд CD86 кошки; диагностический олигонуклеотид; клонирующий вектор; вакцина для модулирования иммунного ответа у кошки; способы индукции, усиления и подавления иммунного ответа у кошек. Предложенная группа изобретений позволяет создавать эффективные вакцины для профилактики иммунодефицита кошачьих и инфекционного перетонита у домашних кошек. Изобретение может быть использовано в ветеринарии. 7 н. и 20 з.п. ф-лы, 13 ил., 5 табл.
Description
Настоящая заявка имеет приоритет по патентной заявке США №09/071699, поданной 1 мая 1998 г., полное содержание которой включено в данную заявку в качестве ссылки. В тексте данной заявки ссылки на другие публикации приведены в скобках. Полную библиографию для этих ссылок можно найти в конце текста непосредственно перед списком последовательностей. Содержание этих публикаций в полном объеме включено в настоящую заявку в качестве ссылок с целью более полного описания состояния проблемы в той области техники, к которой относится настоящее изобретение.
Предпосылки изобретения
В настоящее время отсутствуют эффективные вакцины для профилактики иммунодефицита кошачьих и инфекционного перитонита кошачьих у домашних кошек. Сейчас доступны вакцины против вируса лейкоза кошачьих, однако их эффективность остается сомнительной, а в ряде случаев они могут вызывать заболевание. Следовательно, в данной области техники имеется потребность в агентах и композициях, которые бы защищали от этих и других заболеваний, против которых пока нет вакцин или уже существующие и обычно применяемые вакцины против которых требуется улучшить. Кроме того, затруднена вакцинация котят из-за невозможности противостоять материнским антителам у них. Значит, также есть необходимость в безопасных и эффективных агентах для преодоления таких барьеров.
Стимуляция в организме активации и пролиферации Т-лимфоцитов в ответ на заболевание, как считается, определяется двумя взаимодействиями: распознаванием Т-клеточного рецептора (TCR) иммуногенными пептидами с участием молекул класса I главного комплекса гистосовместимости (МНС) и вторичное взаимодействие вспомогательных лигандов, таких как CD80 и CD86, с соответствующими им рецепторами - CD28 и (или) CTLA-4 - на поверхности Т-лимфоцита. Эффективное взаимодействие этих двух механизмов обусловливает активацию и пролиферацию и CD4-позитивных, и CD-8-позитивных Т-клеток и увеличение выработки иммунорегуляторных цитокинов типов Th1 и Th2. В отсутствие адекватной костимуляции Т-клеток может развиваться анергическое состояние, при котором Т-клетки не способны пролиферировать и выделять цитокины. В течение многих лет ключевыми регуляторами Т-клеточных ответов считались две молекулы - рецептор CD28 и его лиганды CD80 и CD86. CD28 является первичным Т-клеточным костимуляторным рецептором, который по связыванию с CD80 и CD86 усиливает пролиферацию Т-клеток и синтез цитокинов, предотвращая гибель Т-клеток. CTLA-4 (также обозначаемый как CD152), являющийся гомологом CD28, также играет важную роль в процессе костимуляции. Хотя это точно не определено, предполагается, что он подавляет костимуляторные Т-клеточные ответы. Взаимодействие между CD28, CTLA-4 и их лигандами CD80 и CD86 в процессе костимуляции является ключом к индукции и супрессии иммунных ответов на заболевание в организме в целом. Путем манипулирования этими четырьмя костимуляторными молекулами по-видимому можно регулировать Т-клеточный ответ по пути активации, подавления или изменения направления, можно усиливать желаемый иммунный ответ в отношении конкретного патогена или заболевания. В частности, они могут быть использованы для вакцинации против инфекционных заболеваний, для лечения инфекционных заболеваний и лечения опухолевых дегенеративных, аутоиммунных и иммунодефицитных состояний.
Т-лимфоциты иммунной системы млекопитающих выполняют и регуляторные, и эффекторные функции. Предшественники Т-клеток возникают в костном мозге из стволовых клеток и мигрируют в тимус. В тимусе происходят процессы созревания и селекции с образованием популяции наивных иммунокомпетентных клеток, которые способны распознавать антиген при его презентации в сочетании с главным комплексом гистосовместимости (МНС), но при этом не являются аутореактивными. После созревания в тимусе каждая Т-клетка несет клональный Т-клеточный рецептор (TCR), который определяет ее антигенную специфичность. Кроме того, Т-клетки двух основных подклассов, обнаруживаемых у большинства взрослых млекопитающих - CD44+ и CD8+, несут TCR, составленный α- и β-субъединицами (Allison & Lanier, 1987).
Полипептидная и генная организация белка TCR сходна с таковой, характерной для молекул иммуноглобулина (Ig), и она проявляет многие сходные характеристики по сравнению с мембраносвязанными Ig В-лимфоцитов (Allison & Lanier, 1987). Как и молекула Ig, TCR потенциально должен распознавать огромное количество возможных антигенных последовательностей. С этой точки зрения организация и реаранжировка гена TCR сходна по своей сложности с таковыми в В-клетках (Davis & Bjorkman, 1988). Как и в случае с иммуноглобулинами В-клеток, образование идиотипического многообразия Т-клеток связано с наличием множественных копий генов вариабельных доменов (V) в линии половых клеток, происходящими случайным образом реаранжировками α- и β-субъединиц и с изменчивостью, обусловливаемой явлениями соединений и вставок (Davis & Bjorkman, 1988). Однако, в отличие от В-клеток, образование многообразия Т-клеток по-видимому не связано с соматическими мутациями, хотя потенциальный репертуар молекул TCR не уступает таковому молекул Ig (Lechler et al., 1990).
Молекула TCR хотя и отвечает за распознавание антигена, не способна к передаче сигнала (Allison & Lanier, 1987). Конформационные изменения TCR после связывания с участием антигена МНС, находящегося на антигенпрезентирующих клетках (АРС), обусловливает передачу сигнала через нековалентный комплекс поверхностных молекул, включающий CD3 и ζ-субъединицы (Clevers et al., 1988). Связывание на TCR обусловливает фосфорилирование СD3-комплекса, что косвенным образом приводит к внесению в клетку ионов кальция, в результате чего происходит инициация выработки IL-2 и IL-2R (Weiss & Littman, 1994). Этот каскад рассматривается как исходное событие в активации Т-клеток.
TCR распознает антиген только тогда, когда он презентирован с участием МНС. Известны два класса МНС-белков, которые связаны с процессом презентирования антигена на Т-клетке. Молекулы класса I МНС обнаруживаются практически на всех ядерных клетках тела, и их функцией является перенос эндогенных пептидов на поверхность клеток (Matasumura et al., 1992). Пептид, экспрессированный с участием МНС класса I, распознается Т-клетками, экспрессирующими CD8 в связи с TCR (Littman, 1987). CD8-позитивные Т-клетки выполняют функцию иммунного надзора за уничтожением клеток, зараженных вирусом, и опухолевых клеток. Распознавание Т-клеткой CD8+ "чужих" молекул (пептидов или измененных своих пептидов, что может свидетельствовать о развитии опухоли) обусловливает разрушение этой клетки, осуществляемое с участием цитотоксичных Т-лимфоцитов (CTL) (Berke, 1994).
Молекулы класса II МНС, представляющие вторую группу факторов главного комплекса гистосовместимости, в норме обнаруживаются только у специализированных антигенпрезентирующих клеток, включая В-лимфоциты, макрофаги/моноциты и дендритные клетки, хотя возможна их индукция и в некоторых других типах клеток в ответ на специфичные стимулы (Germain, 1993). Молекула класса II МНС отвечает за презентирование внешнего антигена на CD4-позитивную Т-клетку. Антиген, который был фагоцитирован, эндоцитирован или связан поверхностным Ig с последующим поглощением клеткой, претерпевает эндогенную обработку и связывается с молекулой класса II МНС (Unanue, 1987). Затем такая молекула выходит на поверхность клетки и становится доступной для распознавания ее CD4-позитивными Т-клетками αβ-TCR (Littman, 1987). Распознавание антигена Т-клетками CD4+ обусловливает выработку цитокинов и факторов роста, необходимых для инициации и распространения различных элементов активного иммунного ответа (Mosmann & Coffman, 1987).
Дифференцировка групп Т-клеток αβ-TCR определяется наличием CD4 и CD8, что связано с детерминацией функций каждой из этих групп. Одновременное присутствие CD4 и CD8 на Т-клетке исключено (Littman, 1987). Т.е. в процессе селекции и созревания в тимусе Т-клетки-αβ получают только CD4 либо CD8. Эти молекулы обеспечивают стабильность взаимодействия между TCR и МНС-связанным антигеном и определяют для данной Т-клетки то, каким классом молекул МНС (I или II) презентируется антиген (Littman, 1987). Связывающий домен молекулы CD4 или CD8 распознает соответствующий неполиморфный участок молекулы класса I или класса II (Clayberger et al., 1994). Связывание CD4 или CD8 с этими специфическими участками обеспечивает стабильность взаимодействия TCR и МНС-связанного антигена с точки зрения инициации Т-клеточной активации (Littman, 1987). Таким образом, CD4-позитивные Т-клетки функционально взаимодействуют только с клетками АРС, презентирующими антиген с помощью молекул класса II и инициирующими тем самым Т-хелперный ответ, в то время как CD8-позитивные Т-клетки распознают только антиген, презентируемый с участием молекул класса I, после связывания которого инициируется цитотоксический ответ (Germain, 1993). Два различающихся фенотипа - Т-хелперы и CTL - могут быть идентифицированы по поверхностно-клеточной экспрессии либо CD4, либо CD8.
Большинство CD4-позитивных Т-лимфоцитов в целом рассматриваются как Т-хелперная популяция, хотя имеется и предполагаемый CD4-позитивный CTL-подтип (Yasukawa et al., 1989). CD4-позитивные Т-хелперы являются основными регуляторами иммунного ответа за счет выработки серии стимуляторных и супрессорных цитокинов (Mosmann & Coffman, 1987). Вырабатываемые этими клетками факторы являются важными медиаторами инициации и гуморального, т.е. опосредованного антителами, и клеточного, т.е. гиперчувствительности замедленного типа (DTH), ответов (Mosmann & Coffman, 1987). Для того чтобы Т-клетки CD4+ активировались по выработке растворимых факторов роста, должен произойти сложный каскад процессов. Антиген выявляется и подвергается эндоцитозу специфическими АРС-клетками, которые в норме являются макрофагами (Unanue, 1984). АРС денатурируют антигенный белок и разделяют его на меньшие фрагменты, после чего 15-18-аминокислотные пептиды связываются молекулами МНС в эндоплазматическом ретикулюме и после этого переносятся на поверхность клетки (Rotzschke et al., 1994). Перенесенный на поверхность антиген становится в результате "видимым" для Т-клеток и может быть распознан группами Т-клеток, экспрессирующих CD4 и имеющих соответствующий TCR-идиотип (Germain, 1993). Когда происходит точное распознавание антигена Т-клеткой и образуются точные вспомогательные сигналы, происходит дифференцировка "наивного" лимфоцита и запускается его клональная пролиферация. По пока не установленным причинам происходит предпочтительное формирование ответа 1-го типа (клеточного) по отношению к ответу 2-го типа (гуморальному) (Mosmann & Coffman, 1989).
Участие Т-хелперов является необходимым для обеспечения активности и гуморального, и клеточного ответов. В зависимом от Т-клеток В-клеточном ответе, необходимом для выработки антител к большинству антигенов, Т-хелперы нужны для обеспечения правильного созревания В-клеток (Chesnut et al., 1986). После того как экспрессируемый. В-клеткой поверхностный Ig связал антиген, происходит интернализация, процессинг и вывод антигена на поверхность молекулами класса II МНС (Germain, 1993). Непосредственный межклеточный контакт между Т-клеткой CD4+, имеющей точный TCR-идиотип, и В-клеткой способствует активации и пролиферации этой Т-клетки (Chesnut et al., 1986). Активированный Т-хелпер может инициировать ответ 2-го типа за счет секреции факторов, необходимых для роста и дифференцировки В-клеток (Mosmann & Coffman, 1989). Этими факторами являются интерлейкины IL-4, IL-5 и IL-13, которые способны индуцировать активацию и пролиферацию В-клеток, а также важны в процессе изотипического переключения молекул антител, в то время как IL-10 предотвращает инициацию ответа 1-го типа, что в свою очередь является фактором негативной регуляции гуморального ответа (Mosmann & Coffman, 1989).
Клеточные, ответы (1-й тип) индуцируются не так, как гуморальные ответы (2-й тип) (Sher et al., 1992). После активации Т-клеток и их созревания для ответа 1-го типа этой Т-клеткой вырабатываются факторы, которые способствуют клеточному иммунитету. IL-2 является Т-клеточным фактором роста, который также активирует CTL-ответы, в то время как γ-интерферон активирует макрофаги, CTL и нейтрофилы (Wang et а1., 1993).
Таким образом, Т-хелперы способны опосредовать два принципиально взаимоисключающих ответа. Признак секреции цитокинов, связанный с инициацией гуморального ответа, включает факторы, которые являются супрессорами клеточного ответа, и наоборот (Mosmann & Coffman, 1989). Пока неясно, что заставляет Т-клетку проявлять либо признак 1-го типа (выработка IL-2, γ-интерферона и лимфотоксина), либо признак 2-го типа (IL-4, IL-5, IL-6, IL-10 и IL-13), хотя предполагается, что на формирующийся вариант цитокинового профиля могут влиять тип АРС, которая презентирует данный антиген, или растворимые факторы, вырабатываемые этой АРС (Mosmann & Coffman, 1989). В дополнение к хелперным клеткам 1-го и 2-го типов существует так называемый 0-й тип хелперов, который характеризуется параметрами цитокиновой секреции, промежуточными по отношению к 1-му и 2-му типам (Gajewski et al., 1989). Хотя типы хелперов в основном были охарактеризованы в экспериментах in vitro, т.е. могут отражать культуральные артефакты, они являются важными моделями той роли, которую Т-хелпер играет в контроле развития специфических ответов в ситуации in vivo.
В дополнение к CD4-позитивным Т-хелперным лимфоцитам вторая популяция Т-клеток-αβ составлена CD8-позитивными цитотоксическими лимфоцитами (CTL). Считается, что CTL-CD8+ играют ведущую роль в системе иммунного надзора, основная функция которой связана с разрушением клеток, инфицированных вирусами или внутриклеточными бактериями, а также опухолевых клеток (Berke, 1994). Эти клетки также способы вырабатывать цитокины, но, в целом, только такие, которые связаны с индукцией клеточных ответов (IL-2, γ-интерферон и TNF) (Fong & Mosmann, 1990). Рецептор TCR этих клеток с участием CD8 распознает антиген, презентированный с помощью молекул класса I MHC (Littman, 1987). В целом, все ядерные клетки характеризуются поверхностной экспрессией молекул класса I, презентирующих внутриклеточно синтезированные пептиды (Matasumara, 1992). Специфичные по иммунной активности участки, включая головной мозг и семенники, характеризуются низким уровнем белкового синтеза, хотя он и индуцируется в этих участках под воздействием интерферона (Moffett & Paden, 1994).
Белки, вырабатываемые в эндоплазматическом ретикулюме в ходе нормальной жизнедеятельности клетки, денатурируются, частично расщепляются и с помощью молекул класса I MHC выносятся на поверхность (Engelhard, 1994). Эти полипептиды протеолитически линеаризуются и связываются в виде 9-12-аминокислотных эпитопов молекулами класса I, которые затем выносятся на поверхность этой клетки (Engelhard, 1994). Теоретически таким образом на поверхности могут оказаться любые внутриклеточно синтезированные белки, поэтому в результате селекции в тимусе обусловливается идеальная элиминация всех аутореактивных Т-клеток, а система иммунного надзора может выявить присутствие инфицированных вирусом или трансформированных клеток (Berke, 1993). Распознавание чужеродных пептидов, экспрессируемых молекулами класса I, осуществляется антиген-специфичными Т-клеточными рецепторами на поверхности CTL-CD8+ (Lechler et al., 1990). Для активации необходим контакт между эффекторной клеткой и мишенью (Berke, 1994). Когда антиген, рассматриваемый как чужеродный, детектируется рецептором TCR, взаимодействие молекул стабилизируется за счет связывания CD8 с молекулой класса I на поверхности инфицированной клетки (Littman, 1987). После распознавания и активации Т-клетки образуется "конъюгат" между клеткой-мишенью и эффекторной Т-клеткой, после чего эффекторная клетка уничтожается (Taylor & Cohen, 1992). Таким образом, в таком механизме при изменении собственных белков или при нарушении клеточных механизмов в результате атаки патогена пептиды становятся распознаваемыми системой иммунного надзора, в результате чего данный элемент иммунной системы обеспечит уничтожение больной клетки (Berke, 1994).
Цитотоксичность, как считается, обусловливается одним из двух основных механизмов. Либо в клетке индуцируется апоптоз, либо она лизируется с участием цитотоксических гранул, секретируемых CTL (Berke, 1993). Апоптоз в клетках-мишенях индуцируется путем секреции клетками CTL факторов, которые индуцируют экспрессию генов, обусловливающих гибель клетки (Russel, 1983). Преимуществом этого механизма является отсутствие лизиса клетки, что снижает вероятность выхода потенциально инфекционно опасного содержимого этой клетки (Nagata & Golstein, 1995). Однако клеточный лизис может являться наиболее общим механизмом, в соответствии с которым происходит направленное уничтожение клеток. Основным компонентом вырабатываемых клетками CTL "цитотоксических гранул" является белок перфорин, который "протыкает" мембраны клеток-мишеней (Liu et al., 1995). Хотя существуют и другие типы клеток, вовлеченных в данную форму иммунного надзора, считается, что CTL являются основным компонентом противовирусного и противоопухолевого иммунитета и рассматриваются как необходимое звено в защите от конкретных патогенов (Kupfer & Singer, 1989).
Исходно поверхностно-клеточные белки использовались для разграничения конкретных клеточных популяций. Позже были установлены функциональные аспекты многих из этих молекул, а с учетом их значения для дифференцировки клеточных популяций стала более понятной их важная роль в функционировании многих клеток.
Различные вспомогательные молекулы и молекулы адгезии, которые участвуют в развитии иммунного ответа, экспрессируются Т-клетками и антиген-презентирующими клетками (van Seventer et al., 1991). Молекулы адгезии экспрессируются на определенном уровне большинством клеток иммунной системы. Они важны для сохранения клеток в определенном участке и для инициации и поддержания межклеточных контактов (Mescher, 1992).
Два комплекса молекул адгезии - CD2/LFA-3 (CD58) и LFA-1/ICAM-1 - участвуют в стабилизации взаимодействия Т-клеток и клеток АРС и усилении активности (Springer et al., 1987). CD2 является одним из первых маркеров, экспрессируемых предшественниками Т-лимфоцитов, и существует на протяжении всей жизни этой клетки, в то время как LFA-1 экспрессируется Т-клетками позже и позитивно регулируется в клетках памяти или по типу индуцибельности (Springer et al., 1987).
Комплексы вспомогательных молекул также проявляют адгезионные свойства, но их основной функцией, по-видимому, является передача межклеточного сигнала после связывания лиганда (Anderson et al., 1988). После установления взаимодействия между рецептором и его лигандом происходит такое изменение конформационной структуры молекулы, которое обусловливает передачу сигнала в цитоплазму одной или обеих клеток (Hutchcroft & Bierer, 1994). Передаваемые этими молекулами сигналы выполняют ряд функций по способствованию развитию Т-клеток, однако в отсутствие сигналов, опосредуемых этими молекулами, Т-клетки могут становиться анергическими (Leung & Lindsley, 1994).
Взаимодействие CD28/CD80 является основным компонентом интенсивного иммунного ответа, опосредуемого Т-клетками (Linsley et al., 1993a). Взаимодействие вспомогательных молекул CD28 с соответствующим им лигандом CD80 необходимо для полной активации и пролиферации "наивных" Т-клеток (Linsley et al., 1991a). Также это взаимодействие, как считается, играет ключевую роль в пролиферации активированных CD4-позитивных Т-клеток памяти и в предотвращении апоптотической гибели клеток (Linsley et al., 1991a). Установление такого взаимодействия и расшифровка его механизмов дает ключ к пониманию процессов иммунитета, опосредуемого Т-клетками.
Сущность изобретения
Настоящее изобретение относится к выделенной и очищенной ДНК, кодирующей лиганд CD80 (В7-1) кошки, лиганд CD86 (В7-2) кошки, рецептор CD28 кошки или рецептор CTLA-4 (CD152) кошки, а также к векторам, включающим нуклеиновую кислоту, кодирующую CD80 кошки, CD86 кошки, CD28 кошки или CTLA-4 кошки. Настоящее изобретение относится к клеткам-хозяевам, трансформированным CD80-кодирующими векторами, CD86-кодирующими векторами, CD28-кодирующими векторами или CTLA-4-кодирующими векторами. Настоящее изобретение относится к полипептидам, кодируемым нуклеиновой кислотой CD80 кошки, CD86 кошки, CD28 кошки или CTLA-4 кошки.
Настоящее изобретение относится к вакцине, содержащей эффективное количество полипептидов, кодируемых нуклеиновой кислотой CD80 кошки, CD86 кошки, CD28 кошки или CTLA-4 кошки. Также настоящее изобретение относится к вакцинам, которые дополнительно содержат иммуногены, производные от патогенов. Настоящее изобретение относится к вакцинам, способным усиливать иммунный ответ. Также настоящее изобретение относится к вакцинам, способным подавлять иммунный ответ.
Краткое описание чертежей
Фигура 1А. Нуклеотидная и аминокислотная последовательности CD80 (В7-1) кошки (TAMU) (SEQ ID NO: 1 и 2).
Фигура 1В. Спектр гидрофобности аминокислотной последовательности CD80 (В7-1) кошки (TAMU).
Фигура 2А. Нуклеотидная и аминокислотная последовательности CD80 (В7-1) кошки (SYNTRO) (SEQ ID NO: 3 и 4).
Фигура 2В. Спектр гидрофобности аминокислотной последовательности CD80 (В7-1) кошки (SYNTRO).
Фигура 3А. Нуклеотидная и аминокислотная последовательности CD86 (В7-2) кошки (SEQ ID NO: 5 и 6).
Фигура 3В. Спектр гидрофобности аминокислотной последовательности CD86 (В7-2) кошки.
Фигура 4А. Нуклеотидная и аминокислотная последовательности CD28 кошки (SEQ ID NO: 7 и 8).
Фигура 4В. Спектр гидрофобности аминокислотной последовательности CD28 кошки.
Фигура 5А. Нуклеотидная и аминокислотная последовательности CTLA-4 (CD152) кошки (SEQ ID NO: 9 и 10).
Фигура 5В. Спектр гидрофобности аминокислотной последовательности CTLA-4 (CD152) кошки.
Подробное описание изобретения
Настоящее изобретение представляет выделенную нуклеиновую кислоту, кодирующую лиганд CD80 кошки или растворимый лиганд CD80 кошки. Также настоящее изобретение представляет выделенную нуклеиновую кислоту, кодирующую лиганд CD86 кошки или растворимый лиганд CD86 кошки. Также настоящее изобретение представляет выделенную нуклеиновую кислоту, кодирующую рецептор CD28 кошки или растворимый рецептор CD28 кошки. Также настоящее изобретение представляет выделенную нуклеиновую кислоту, кодирующую рецептор CTLA-4 кошки или растворимый рецептор CTLA-4 кошки.
В одном из осуществлении настоящее изобретение представляет нуклеиновую кислоту, кодирующую лиганд CD80 кошки, который характеризуется аминокислотной последовательностью, показанной на фиг.1А, начиная с остатка метионина и заканчивая остатком треонина (SEQ ID NO: 1). В другом осуществлении настоящее изобретение представляет нуклеиновую кислоту, кодирующую лиганд CD86 кошки, который характеризуется аминокислотной последовательностью, показанной на фиг.3А, начиная с остатка метионина и заканчивая остатком глутамина (SEQ ID NO: 5). Еще в одном осуществлении настоящее изобретение представляет нуклеиновую кислоту, кодирующую рецептор CD28 кошки, который характеризуется аминокислотной последовательностью, показанной на фиг.4А, начиная с остатка метионина и заканчивая остатком серина (SEQ ID NO: 7). В другом осуществлении настоящее изобретение представляет нуклеиновую кислоту, кодирующую рецептор CTLA-4 кошки, который характеризуется аминокислотной последовательностью, показанной на фиг.5А, начиная с остатка метионина и заканчивая остатком аспарагина (SEQ ID NO: 9).
В осуществлении описывавшегося выше изобретения нуклеиновой кислотой является ДНК или РНК. В другом осуществлении ДНК является кДНК или геномной ДНК.
Настоящее изобретение представляет олигонуклеотид, состоящий по крайней мере из 12 нуклеотидов, характеризующийся комплементарностью по отношению к уникальной последовательности, имеющейся в составе нуклеиновой кислоты, кодирующей CD28, CD80, CD86 или CTLA-4, описанной выше. В другом осуществлении настоящего изобретения представляется олигонуклеотид, состоящий по крайней мере из 15 или 16 нуклеотидов, который характеризуется комплементарностью по отношению к уникальной последовательности, присутствующей в составе нуклеиновой кислоты, кодирующей CD28, CD80, CD86 или CTLA-4, описанной выше.
В другом осуществлении описываемого выше изобретения представляется олигонуклеотид, который помечен определяемой меткой. В одном из осуществлений выявляемой, меткой является радиоактивный изотоп, флуорофор или биотин. В другом осуществлении такой олигонуклеотид избирательно метилирован.
Настоящее изобретение представляет вектор, включающий нуклеиновую кислоту, кодирующую лиганд CD80 кошки или растворимый лиганд CD80 кошки. В другом осуществлении настоящего изобретения представляется плазмидный вектор, обозначенный PSI-B7-1/871-35 (Коллекция АТСС, депозитарный №209817). Эта плазмида была депонирована в Американскую коллекцию типовых культур (АТСС) 29 апреля 1998 года (адрес которой - 10801 University Boulevard, Manassas, VA 20108-0971, США) в соответствии с Будапештским соглашением о Международных правилах депонирования микроорганизмов для целей осуществления процедуры патентования.
Настоящее изобретение представляет вектор, включающий нуклеиновую кислоту, кодирующую лиганд CD86 кошки или растворимый лиганд CD86 кошки. В другом осуществлении настоящего изобретения представляется плазмидный вектор, обозначенный В7-2#19-2/011298 (АТСС, депозитарный №209821). Эта плазмида была депонирована в Американскую коллекцию типовых культур (АТСС) 29 апреля 1998 года (адрес которой - 10801 University Boulevard, Manassas, VA 20108-0971, США) в соответствии с Будапештским соглашением о Международных правилах депонирования микроорганизмов для целей осуществления процедуры патентования.
Настоящее изобретение представляет вектор, включающий нуклеиновую кислоту, кодирующую рецептор CD28 кошки или растворимый рецептор CD28 кошки. В другом осуществлении настоящего изобретения представляется плазмидный вектор, обозначенный PSI-CD28-#7/100296 (АТСС, депозитарный №209819). Эта плазмида была депонирована в Американскую коллекцию типовых культур (АТСС) 29 апреля 1998 года (адрес которой - 10801 University Boulevard, Manassas, VA 20108-0971, США) в соответствии с Будапештским соглашением о Международных правилах депонирования микроорганизмов для целей осуществления процедуры патентования.
Настоящее изобретение представляет вектор, включающий нуклеиновую кислоту, кодирующую рецептор CTLA-4 кошки или растворимый рецептор CTLA-4 кошки. В другом осуществлении настоящего изобретения представляется плазмидный вектор, обозначенный CTLA-4-#1/091997 (АТСС, депозитарный №209820). Эта плазмида была депонирована в Американскую коллекцию типовых культур (АТСС) 29 апреля 1998 года (адрес которой - 10801 University Boulevard, Manassas, VA 20108-0971, США) в соответствии с Будапештским соглашением о Международных правилах депонирования микроорганизмов для целей осуществления процедуры патентования.
Настоящее изобретение представляет описанный выше вектор, который дополнительно включает промотор, функционально присоединенный к нуклеиновой кислоте. В другом осуществлении настоящее изобретение представляет клетку-хозяина, которая несет любой из упоминавшихся выше векторов. В одном из осуществлений такой клеткой-хозяином, несущим один из упомянутых выше векторов, является эукариотическая или прокариотическая клетка. В другом осуществлении клеткой-хозяином являются клетки E.coli, клетки дрожжей, клетки COS, клетки РС12, клетки СНО или клетки GH4C1.
Настоящее изобретение представляет полипептид, кодируемый нуклеиновой кислотой лиганда CD80 кошки или растворимого лиганда CD80 кошки. В осуществлении настоящего изобретения представляется полипептид, кодируемый нуклеиновой кислотой лиганда CD86 кошки или растворимого лиганда CD86 кошки. В другом осуществлении настоящего изобретения представляется полипептид, кодируемый нуклеиновой кислотой рецептора CD28 кошки или растворимого рецептора CD28 кошки. Настоящее изобретение представляет полипептид, кодируемый нуклеиновой кислотой рецептора CTLA-4 кошки или растворимого рецептора CTLA-4 кошки.
В другом осуществлении настоящего изобретения представляется способ продукции упоминавшихся выше полипептидов путем культивирования клетки-хозяина, которая экспрессирует эти полипептиды, и выделения этих полипептидов, получаемых таким образом.
Настоящее изобретение представляет вакцину, содержащую эффективное количество упоминавшихся выше полипептидов и подходящий носитель. В другом осуществлении изобретения представляется вакцина, в составе которой эффективное количество упомянутого выше полипетида и подходящего носителя является количеством от примерно 0,01 мг до примерно 100 мг на 1 дозу. В другом осуществлении изобретения представляется вакцина, в которой эффективное количество упомянутого выше полипетида и подходящего носителя является количеством от примерно 0,25 мг на 1 кг веса тела кошки в день до примерно 25 мг на 1 кг веса тела кошки в день.
Далее настоящее изобретение представляет упоминавшуюся выше вакцину, которая дополнительно содержит иммуноген, производный от патогена. В другом осуществлении изобретения такой иммуноген в составе вакцины происходит от кошачьего патогена, вируса бешенства, хламидии, Toxoplasma gondii, Dirofilaria immitis, блох или бактериальных патогенов. В другом осуществлении изобретения представляется вакцина, в составе которой патогеном является вирус иммунодефицита кошачьих (FIV), вирус лейкоза кошачьих (FeLV), вирус инфекционного перитонита кошачьих (FIP), вирус панлейкопении кошачьих, калицивирус кошачьих, реовирус кошачьих 3-го типа, ротавирус кошачьих, коронавирус кошачьих, респираторно-синцитиальный вирус кошачьих, вирус саркомы кошачьих, герпесвирус кошачьих, вирус болезни Борна кошек или кошачий паразит.
Также настоящее изобретение представляет способ индукции иммунитета у кошек, который включает введение кошке дозы вакцины, содержащей любой из указывавшихся выше иммуногенов. Также настоящее изобретение представляет способ усиления иммунного ответа у кошки, который включает эффективную дозу полипептида, иммуногена и подходящего носителя. Настоящее изобретение представляет способ введения упомянутой выше вакцины подкожно, внутримышечно, системно, местно или перорально.
В другом осуществлении настоящего изобретения представляется способ подавления иммунного ответа у кошки, который включает введение этой кошке эффективного по подавлению иммунного ответа количества полипептида, кодируемого нуклеиновой кислотой CTLA-4 кошки. В другом осуществлении изобретения представляется способ подавления иммунного ответа у кошки, включающий введение этой кошке эффективного по подавлению иммунного ответа количества растворимого полипептида, кодируемого CD80 кошки, CD86 кошки или CD28 кошки.
В другом осуществлении настоящего изобретения представляется способ подавления иммунного ответа у кошки путем введения полипептида, кодируемого нуклеиновой кислотой CTLA-4 кошки, в количестве от примерно 0,25 мг на 1 кг веса тела в день до 25 мг на 1 кг веса тела в день. В другом осуществлении изобретения представляется способ подавления иммунного ответа у кошки путем введения полипептида, кодируемого CD80 кошки, CD 86 кошки или CD28 кошки, в количестве от примерно 0,25 мг на 1 кг веса тела в день до 25 мг на 1 кг веса тела в день.
Также настоящее изобретение представляет способ подавления иммунного ответа у кошки с диагнозом аутоиммунного заболевания или у кошки-реципиента пересадки ткани или органа путем введения этой кошке эффективного по подавлению иммунного ответа количества полипептида, кодируемого нуклеиновой кислотой CTLA-4 кошки.
Настоящее изобретение также представляет способ подавления иммунного ответа у кошки с диагнозом аутоиммунного заболевания или у кошки-реципиента пересадки ткани или органа путем введения этой кошке эффективного по подавлению иммунного ответа количества полипептида, кодируемого CD80 кошки, CD86 кошки или CD28 кошки.
Настоящее изобретение представляет выделенную и очищенную кДНК CD80 (В7-1) длиной примерно 941 нуклеотид. Изобретение также представляет выделенный и очищенный полипептид CD80 кошки, состоящий примерно из 292 аминокислот, являющийся связанной с мембранной или зрелой формой с молекулярной массой 33,485 кДа, изоэлектрической точкой примерно pI=9,1 и общим зарядом при рН 7,0 равным 10. Коэкспрессия CD80 с костимуляторной молекулой CD28 и с опухолевым антигеном или антигеном патогенного организма проявляет способность к активации или усилению активации Т-лимфоцитов, индуцируя тем самым выработку иммуностимулирующих цитокинов, и к регуляции роста других клеточных типов. Коэкспрессия CD80 с костимуляторной молекулой CTLA-4 проявляет способность к регуляции активации Т-лимфоцитов.
Настоящее изобретение представляет выделенную и очищенную кДНК CD86 (В7-2) длиной примерно 1176 нуклеотидов. Также изобретение представляет выделенный и очищенный полипептид CD86 кошки, состоящий примерно из 320 аминокислот, являющийся связанной с мембранной или зрелой формой с молекулярной массой 36,394 кДа, изоэлектрической точкой примерно pI=9,19 и общим зарядом при рН 7,0, равным 11,27. Коэкспрессия CD86 с костимуляторной молекулой CD28 и с опухолевым антигеном или антигеном патогенного организма проявляет способность к активации или усилению активации Т-лимфоцитов, индуцируя тем самым выработку иммуностимулирующих цитокинов, и к регуляции роста других клеточных типов. Коэкспрессия CD86 с костимуляторной молекулой CTLA-4 проявляет способность к регуляции активации Т-лимфоцитов.
CD80 или CD86 кошки по настоящему изобретению были получены из нативных или рекомбинантных источников. CD80 или CD86 кошки по настоящему изобретению включают нативную и связанную с мембраной форму или секретируемую форму, утратившую трансмембранный домен.
Настоящее изобретение представляет выделенную и очищенную кДНК CD28 длиной примерно 689 нуклеотидов. Также изобретение представляет выделенный и очищенный полипептид CD28 кошки, состоящий примерно из 221 аминокислоты, являющийся связанной с мембранной или зрелой формой с молекулярной массой 25,319 кДа, изоэлектрической точкой примерно pI=9,17 и суммарным зарядом при рН 7,0, равным 9,58.
Также настоящее представляет выделенную и очищенную кДНК CTLA-4 длиной примерно 749 нуклеотидов. Также изобретение представляет выделенный и очищенный полипептид CTLA-4 кошки, состоящий примерно из 223 аминокислот, являющийся связанной с мембранной или зрелой формой с молекулярной массой 24,381 кДа, изоэлектрической точкой примерно pI=6,34 и суммарным зарядом при рН 7,0, равным 0,99.
В другом аспекте настоящее изобретение представляет способ усиления иммунного ответа у кошки на иммуноген, что достигается введением этого иммуногена до, после или по существу одновременно с CD80 кошки или CD86 кошки вместе с CD28 кошки или CTLA-4 кошки или без них в количестве, эффективном по усилению иммунного ответа.
В другом аспекте настоящего изобретения представляется способ подавления иммунного ответа у кошки на иммуноген, что достигается введением этого иммуногена до, после или по существу одновременно с CD80 кошки или CD86 кошки вместе с CD28 кошки или CTLA-4 кошки или без них или с антисмысловой РНК или ДНК, частично или полностью кодирующих CD80 кошки, или CD86 кошки, или CD28 кошки, или CTLA-4 кошки, в количестве, эффективном по подавлению иммунного ответа.
В следующем аспекте настоящего изобретения представляется вакцина для индукции иммунного ответа у кошек на иммуноген, содержащая этот иммуноген и количество CD80, эффективное по усилению иммунного ответа. Иммуноген является производным, например, от кошачьих патогенов, таких как вирус иммунодефицита кошки, вирус лейкоза кошки, парвовирус кошки, коронавирус кошки, лептовирус кошки и подобное.
В другом аспекте настоящего изобретения представляется вакцина для индукции иммунного ответа у кошки на иммуноген, что достигается введением ДНК или РНК иммуногена и ДНК или РНК вспомогательных молекул CD80, CD86, CD28 кошки в любом сочетании, которые кодируют белки или белковые фрагменты, в количестве, эффективном по модуляции иммунного ответа.
Белок CD80 кошки характеризуется аминокислотной последовательностью, которая на 59% и 46% идентична полипептидам человека и мыши соответственно. Белок CD86 кошки характеризуется аминокислотной последовательностью, которая на 68% и 64% идентична таким белкам человека и кролика соответственно. Белок CD28 кошки характеризуется аминокислотной последовательностью, которая на 82% и 74% идентична полипептидам человека и мыши соответственно. Белок CTLA-4 кошки характеризуется аминокислотной последовательностью, которая на 88% и 78% идентична полипептидам человека и мыши соответственно. Белки CD80 или CD86 мыши или человека не могут функционально заменить кошачьи белки CD80 или CD86. Следовательно, белки CD80 кошки, CD86 кошки, CD28 кошки и CTLA-4 кошки являются новыми реагентами, необходимыми для контроля иммунитета у кошек.
Настоящее изобретение охватывает Т-клеточные регуляторные вспомогательные молекулы - CD80 (В7-1) или CD86 (В7-2), или CD28, или CTLA-4 (CD152) домашних кошек. Настоящее изобретение представляет выделенные и очищенные нуклеиновые кислоты, кодирующие частично или полностью CD80 кошки, CD86 кошки, CD28 кошки и CTLA-4 кошки, равно как и полипептиды CD80, CD86, CD28 или CTLA-4, очищенные либо из нативных, либо из рекомбинантных источников. Выработанные в соответствии с настоящим изобретением CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки используют для повышения эффективности кошачьих вакцин против опухолей и патогенных организмов, а также в качестве лекарственного средства для лечения вирусных и бактериальных болезней домашних кошек. Выработанные в соответствии с настоящим изобретением CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки также используют для ослабления заболевания за счет сверхактивных, гиперактивных или перенаправленных иммунных ответов.
Нуклеиновые кислоты, векторы, трансформанты
Последовательности кДНК, кодирующие CD80 кошки (SEQ ID NO: 1), CD86 кошки (SEQ ID NO: 5), CD28 кошки (SEQ ID NO: 7) или CTLA-4 кошки (SEQ ID NO: 9) показаны на фиг.1-5, а расшифрованные аминокислотные последовательности CD80 кошки (SEQ ID NO: 2), CD86 кошки (SEQ ID NO: 6), CD28 кошки (SEQ ID NO: 8) или CTLA-4 кошки (SEQ ID NO: 10) показаны на фиг.1-5. Идентификация этих кошачьих полипептидов как CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 основывается на определенном уровне гомологии аминокислотных последовательностей и гомологичных полипептидов человека или мыши, или кролика, и на способности полипептидов CD80 или CD86 связываться с рецептором CD28 кошки (см. ниже) или с CTLA-4 и активировать или стимулировать, или каким-либо иным образом регулировать активацию Т-лимфоцитов. Более того, не ограничиваясь какой-либо теорией, предсказывается, что полипептиды CD80 кошки или CD86 кошки также проявляют одну или большее число из следующих биологических активностей: активация клеток NK (нативные клетки-киллеры), стимуляция созревания В-клеток, активация ограниченных по МНС цитотоксических Т-лимфоцитов, пролиферация тучных клеток, взаимодействие с рецепторами цитокинов и индукция иммунорегулирующих цитокинов.
Из-за вырожденности генетического кода (т.е. наличия более одного кодона, кодирующих некоторые аминокислоты) последовательности ДНК, не совпадающие с показанными на фиг.1-5, также могут кодировать аминокислотные последовательности CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки, показанные на фиг.1-5. Такие "другие ДНК" включают те последовательности, которые включают "структурно консервативные" изменения, при которых изменение одного или большего числа нуклеотидов в составе данного кодона не приводит к изменению аминокислоты, кодируемой этим кодоном. Более того, данный аминокислотный остаток в полипептиде часто может быть изменен без изменения общей конформации и функций нативного полипептида. Такие "функционально консервативные" варианты включают, тем самым не ограничиваясь, замену аминокислоты на аминокислоту, характеризующуюся сходными физико-химическими параметрами, такими как, например, кислые, основные, гидрофобные, гидрофильные, ароматические и подобные свойства (например, замена лизина на аргинин, аспарагиновой кислоты на глутаминовую кислоту или глицина на аланин). Кроме того, аминокислотные последовательности добавляются или удаляются без нарушения биологической активности данной молекулы. Например, дополнительные аминокислотные последовательности добавляют либо с N-, либо с С-конца, которые служат метками для очистки данного белка, такими как полигистидиновые метки (т.е. для обеспечения одноэтапной очистки данного белка, после чего их удаляют химическим или каталитическим путем). С другой стороны, дополнительные последовательности предоставляют дополнительный сайт поверхностного связывания или каким-либо иным путем изменяют специфичность CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки в отношении клеток-мишеней, например, путем добавления антигенсвязывающего сайта для антител.
Попадающие в объем настоящего изобретения кДНК CD80 кошки или CD86 кошки, или CD28 кошки, или CTLA-4 кошки соответствуют последовательностям, показанным на фиг.1-5, структурно-консервативным вариантам ДНК, последовательностям ДНК, кодирующим функционально-консервативные варианты полипептидов, и их сочетаниям. Настоящее изобретение охватывает фрагменты CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки, которые проявляют эффективную степень биологической активности как по отдельности, так и в сочетании с другими последовательностями или компонентами. Как будет объяснено далее, в компетенции специалиста в данной области техники предсказать результаты манипуляций последовательностями CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 и установить, будет ли данный вариант CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки проявлять соответствующую стабильность и биологическую активность в отношении данного применения или определить параметры, которые нарушают активность по связыванию этих молекул, что обусловит повышение эффективности. Каждый из CD80 и CD86 кошки связывается с корецептором CD28 или корецептором CTLA-4. Этого можно достичь путем экспрессии и очистки вариантных полипептидов CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 в рекомбинантной системе и оценки их Т-стимуляторной активности и (или) активности по активации роста в клеточных культурах и у животных с последующим тестированием на возможное применение. Вариант CD80 тестируют по его биологической активности по функциональному связыванию с рецепторами CD28 или CTLA-4. Вариант CD86 тестируют по его биологической активности по функциональному связыванию с рецепторами CD28 или CTLA-4. Сходным образом вариант CD28 или вариант CTLA-4 тестируют по их биологической активности.
Также настоящее изобретение охватывает ДНК CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки (и полипептиды), производные от других видов кошачьих, включая, но тем самым не ограничиваясь, домашних кошек, львов, тигров, гепардов, рысей и т.д. Гомологи CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки по отношению к показанному на. фиг.1-5 могут быть легко идентифицированы путем скрининга библиотек кДНК или геномных клонотек с целью идентификации клонов, которые гибридизуются с зондами, включающими полностью или частично последовательность, показанную на фиг.1-5. С другой стороны, экспрессионные библиотеки подвергают скринингу с использованием антител, которые распознают CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки. Вне связи с какой-либо теорией можно считать, что гены CD80 или CD86 кошки других видов кошачьих будут по крайней мере на 70% гомологичны генам CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки. Также в объем настоящего изобретения попадают ДНК, которые кодируют гомологи CD80, CD86, CD28 или CTLA-4, определяемые как ДНК-кодируемые полипептиды, характеризующиеся по крайней мере примерно 25%-ным уровнем идентичности с аминокислотными последовательностями CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки.
В целом, в манипуляциях нуклеиновыми кислотами в соответствии с настоящим изобретением используются методы, которые хорошо известны в науке, такие как те, которые описаны, например, в руководствах Sambrook, Fritsch & Maniatis, 1989, "Molecular Cloning: A Laboratory Manual", 2nd ed.. Cold Spring Harbor или "Current Protocols in Molecular Biology", eds. Ausubel, Brent, Kingston, More, Feidman, Smith & Stuhl, Greene Publ. Assoc., Wiley-Interscience, NY, 1992.
Настоящее изобретение охватывает последовательности кДНК и РНК в смысловом и антисмысловом порядках. Также изобретение охватывает последовательности геномной ДНК CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки и фланкирующие последовательности, включая, но тем самым не ограничиваясь, регуляторные последовательности. Нуклеиновые последовательности, кодирующие полипептиды CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки, также связывают с гетерологичными последовательностями, включая промоторы, энхансеры, регуляторные элементы, сигнальные последовательности, сигналы полиаденилирования, интроны, 5'- и 3'-некодирующие сегменты и подобное. Транскрипционными регуляторными элементами, которые функционально связаны с последовательностями кДНК CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки, являются без каких-либо ограничений последовательности, способные контролировать экспрессию генов, производные от прокариотических клеток, эукариотических клеток, вирусов прокариот, вирусов эукариот и любых их сочетаний. Также в данной области техники известны и другие гетерологичные регуляторные последовательности.
Нуклеиновые кислоты по настоящему изобретению модифицируют с применением методов, известных в данной области техники, с целью изменения их стабильности, растворимости, аффинности связывания и специфичности. Например, последовательности метилируют селективным образом. Также нуклеотидные последовательности по настоящему изобретению модифицируют меткой, способной обеспечивать эффективный прямой или косвенный сигнал. Примерами меток являются радиоактивные изотопы, флуоресцентные молекулы, биотин и подобное.
Также настоящее изобретение представляет векторы, которые включают нуклеиновые кислоты, кодирующие полипептиды CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 частично или полностью. Такими векторами являются, например, плазмидные векторы, предназначенные для экспрессии в различных прокариотических и эукариотических, организмах-хозяевах. Предпочтительно векторы также включают промотор, функционально присоединенный к участкам, кодирующим CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки. Кодируемые кошачьи CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 экспрессируются с использованием любых подходящих векторов и клеток-хозяев в соответствии с описанным в данном тексте и в соответствии с известным специалистам в данной области техники.
Подходящими векторами для использования в практике настоящего изобретения являются, тем самым не ограничиваясь, YEp352, pcDNAI (Invitrogen, Carlsbad, CA), pRc/CMV (Invitrogen) и pSFV1 (Gibco BRL), Gaithersburg, MD). Одним из предпочтительных по использованию в настоящем изобретении вектором является pSFV1. Подходящими клетками-хозяевами являются клетки E.coli, клетки дрожжей, клетки COS, клетки РС12, клетки СНО, клетки GH4C1, клетки ВНК-21 и клетки меланофоров амфибий. Клетки ВНК-21 являются предпочтительными клетками-хозяевами с точки зрения использования в практике настоящего изобретения. Подходящими векторами для конструирования "голой" ДНК или для "генетической вакцинации" являются, тем самым не ограничиваясь, pTarget (Promega, Madison, WI), pSI (Promega, Madison, WI) и pcDNA (Invitrogen, Carlsbad, CA).
Нуклеиновые кислоты, кодирующие полипептиды CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки, также вносят в клетки с помощью рекомбинантных приемов. Например, такую последовательность вносят в клетку с помощью микроинъекции, обеспечивая гомологичную рекомбинацию по сайту локализации эндогенного гена, кодирующего такой полипептид, его аналог или псевдоген, или последовательности, характеризующейся существенным уровнем гомологии с геном, кодирующим CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки. Также могут быть использованы другие рекомбинантные методы, такие как обеспечение негомологичной рекомбинации и делегирование эндогенного гена путем гомологичной рекомбинации, особенно в геноме плюрипотентной клетки.
Настоящее изобретение представляет способ усиления у кошки иммунного ответа на иммуноген, что достигается введением иммуногена до, после или по существу одновременно с CD80 или CD86 кошки наряду с CD28 кошки или CTLA-4 кошки или без них в количестве, эффективном по усилению иммунного ответа.
Настоящее изобретение представляет способ усиления у кошки иммунного ответа на иммуноген, что достигается введением экспресирующего вектора, который включает производный от кошачьего патогена иммуноген, до, после или по существу одновременно с CD80 или CD86 кошки наряду с CD28 кошки или CTLA-4 кошки или без них, в количестве, эффективном по усилению иммунного ответа.
Настоящее изобретение представляет способ перенаправления у кошки иммунного ответа на иммуноген, что достигается введением экспресирующего вектора, который включает производный от кошачьего патогена иммуноген, до, после или по существу одновременно с CD80 или CD86 кошки наряду с CD28 кошки или CTLA-4 кошки или без них, в количестве, эффективном по усилению иммунного ответа.
Настоящее изобретение представляет способ подавления у кошки иммунного ответа на иммуноген, что достигается введением экспресирующего вектора, который включает производный от кошачьего патогена иммуноген, до, после или по существу одновременно с CD80 или CD86 кошки наряду с CD28 кошки или CTLA-4 кошки или с антисмысловой РНК или ДНК, кодирующей CD80 кошки, CD86 кошки, CD28 кошки или CTLA-4 кошки, в количестве, эффективном по подавлению иммунного ответа.
Настоящее изобретение представляет вакцину для индукции у кошки иммунного ответа на иммуноген(ы), содержащую иммуноген и эффективное количество CD80 кошки, или CD86 кошки вместе с CD28 кошки, или CTLA-4 кошки, или без них, для усиления иммунного ответа или CD80 кошки или CD86 кошки вместе с CTLA-4 кошки для подавления иммунного ответа. В другом осуществлении по настоящему изобретению представляется вакцина, содержащая экспрессирующий вектор, включающий гены, кодирующие иммуноген(ы) кошачьих патогенов, и гены CD80, CD86 вместе с CD28 кошки, или CTLA-4 кошки, или без них, для усиления или подавления иммунного ответа.
Полилептиды CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки
Ген CD80 кошки (кДНК и соответствующая ей аминокислотная последовательность показаны на фиг.1 и 2) кодирует полипептид, состоящий примерно из 292 аминокислот. Ген CD86 кошки (кДНК и соответствующая ей аминокислотная последовательность показаны на фиг.3) кодирует полипептид, состоящий примерно из 320 аминокислот. Ген CD28 кошки (кДНК и соответствующая ей аминокислотная последовательность показаны на фиг.4) кодирует полипептид, состоящий примерно из 221 аминокислоты. Ген CTLA-4 кошки (кДНК и соответствующая ей аминокислотная последовательность показаны на фиг.5) кодирует полипептид, состоящий примерно из 223 аминокислот.
Очистку CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки из натуральных или рекомбинантных источников проводят с применением методов, хорошо известных в данной области техники, включая, но тем самым не ограничиваясь, ионообменную хроматографию, обращенно-фазную хроматографию на колонках С4, гель-фильтрацию, изоэлектрическое фокусирование, аффинную хроматографию и подобное. В предпочтительном осуществлении большое количество биологически активного белка CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки получают путем конструирования рекомбинантной последовательности ДНК, включающей кодирующий участок CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки, которая в общей кодирующей рамке объединена с последовательностью, кодирующей 6 С-концевых остатков гистидина в репликоне pSFV1 (Gibco BRL). Кодируемую этой плазмидой мРНК синтезируют с применением методов, хорошо известных специалистам в данной области техники, и вносят в клетки линии ВНК-21 методом электропорации. Клетки вырабатывают и секретируют процессированные гликозилированные полипептиды CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки, включающие С-концевой гексагистидин. Модифицированные кошачьи полипептиды CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 очищают из клеточного супернатанта методом аффинной хроматографии с использованием гистидинсвязывающей смолы (His-bind: Novagen, Madison, WI).
Полипептиды CD80 кошки или CD86 кошки, выделенные из любых источников, модифицируют с применением методов, известных в данных области техники. Например, кошачьи CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 фосфорилируют или дефосфорилируют, гликозилируют или дегликозилируют и подобное. Наиболее применимыми модификациями являются те, которые изменяют растворимость, стабильность, а также специфичность и аффинность связывания у CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки.
Химерные молекулы CD80, CD86, CD28 геля CTLA-4 кошки
Настоящее изобретение охватывает получение химерных молекул, образуемых фрагментами кошачьих CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 в любом сочетании. Например, внесение сайта связывания CTLA-4 вместо сайта связывания CD28 должно повысить аффинность связывания CD28 с сохранением усиленного иммунного ответа.
В одном осуществлении сайты связывания CD80 или CD86 на молекулах CTLA-4 и CD28 заменяются таким образом, что сайт связывания на CD28 заменяется на сайт связывания CTLA-4. Влияние химерной молекулы CD28, включающей сайт связывания CTLA-4, связано с повышением аффинности CD28 в отношении CD80 или CD86 и повышением степени усиления иммунного ответа. В альтернативном осуществлении химерные молекулы CD80 и CD28, или CD86 и CD28, или их фрагменты являются связанными с мембранами формами и улучшают свойства этих молекул по усилению иммунного ответа. В другом осуществлении химерные молекулы CD80 и CTLA-4, или CD86 и CTLA-4, или их фрагменты являются связанными с мембранами формами, которые являются молекулами, более эффективными по подавлению иммунного ответа. В другом осуществлении химерные молекулы CD80 и CTLA-4 или CD86 и CTLA-4 или их фрагменты являются связанными с мембранами формами, которые перенаправляют иммунный ответ с достижением желаемого эффекта.
Антитела, специфичные в отношения CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки
Настоящее изобретение охватывает антитела, специфичные в отношении полипептидов CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки, идентифицированных в соответствии с описанным выше. Антителами являются поликлональные или моноклональные антитела, разделяющие CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки и другие белки, идентифицирующие их функциональные домены и подобное. Такие антитела получают стандартными способами с помощью методов и композиций, описанных у Harlow & Lane, 1988, ″Antibodies: A Laboratory Manual″, Cold Spring Harbor Lab., а также с использованием иммунологических и гибридомных методов, известных в данной области техники. В случае использования нативных или синтетических пептидов, производных от CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки, для индукции у кошки CD80-, CD86-, CD28- или CTLA-4-специфичного иммунного ответа эти пептиды стандартным образом соединяют с подходящим носителем, таким как гемоцианин слизня (KLH), и вводят с подходящим адъювантом, таким как адъюванты Фройнда.
Предпочтительно отобранные пептиды соединяют с носителем, имеющем "лизиновую сердцевину", по сути в соответствии с методами Tan, 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 85, 5409-5413. Такие антитела, особенно так называемые антиидиотипические антитела "внутреннего соответствия", также приготавливают с использованием известных методов.
В одном из осуществлений очищенные кошачьи CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 используют для иммунизации мышей, после чего у них удаляют селезенку и спленоциты используют для получения клеточных гибридов с миеломными клетками с целью получения клонов секретирующих антитело клеток в соответствии со стандартными методами данной области техники. Полученные в результате моноклональные антитела, секретируемые такими клетками, подвергают скринингу в тестах in vitro на следующие активности: связывание с кошачьими белками CD80, CD86, CD28 или CTLA-4, подавление активности CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 по связыванию рецепторов и подавление Т-клеточной стимуляторной активности CD80, CD86, CD28 или CTLA-4.
Антитела к CD80 кошки, к CD86 кошки,, к CD28 кошки и к CTLA-4 кошки используют для идентификации и количественного анализа кошачьих CD80, CD86, CD28 или CTLA-4, применяя такие иммунологические тесты, как ТИФА, РИА и подобное. Антитела к CD80 кошки, к CD86 кошки, к CD28 кошки и к CTLA-4 кошки также используют для иммунологического истощения экстрактов CD80 кошки, CD86 кошки, CD28 кошки или CTLA-4 кошки. Кроме того, эти антитела могут быть использованы для идентификации, выделения и очистки кошачьих CD80, CD86, CD28 или CTLA-4, происходящих из различных источников, и для исследований по субклеточному и гистохимическому картированию.
Применение
Лиганд CD80 (В7-1) кошки, лиганд CD86 (В7-2) кошки, рецептор CD28 кошки или рецептор CTLA-4 (CD152) кошки, выработанные в соответствии с настоящим изобретением, могут быть эффективно использованы в качестве вакцины для профилактики инфекционного заболевания или способствования росту у гомологичных или гетерологичных видов кошачьих. Например, коэкспрессия CD80 или CD86 с костимуляторными молекулами CD28 или CTLA-4 в любом сочетании с опухолевым антигеном или антигеном патогенного организма. Коэкспрессия CD80 или CD86 с кошки с рецептором CTLA-4 кошки обеспечивает способность подавлять активацию Т-лимфоцитов и подавлять иммунный ответ. Конкретным примером должна быть коэкспрессия CD80 или CD86 с иммуногенами, производными от вирусов FIV, FeLV или FIP, с вирусного вектора или ДНК-экспрессирующего вектора, который, в случае введения в виде вакцины, будет активировать, усиливать или регулировать пролиферацию CD4-позитивных и CD8-позитивных Т-лимфоцитов и индуцировать выработку иммунорегуляторных цитокинов, таких как IL-2, IFN-γ, IL-12, TNFα, IL-6 и т.п. Другим конкретным примером должна быть экспрессия CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 с вирусного вектора или ДНК-экспресирующего вектора, который, в случае введения в виде лекарственного средства, будет регулировать или перенаправлять иммунный ответ.
Усиление иммунитета за счет взаимодействия кошачьих CD80 или CD86 с CD28 или CTLA-4 или подавление иммунного ответа за счет взаимодействия кошачьих CD80 или CD86 с CTLA-4 обеспечивает преимущества в естественном процессе регуляции в большей степени, чем при добавлении чужеродных субстанций, которые бы оказывали множественные и даже вредные влияния на здоровье в целом или в течение длительного времени. Молекулы CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 вводят наряду с другими рекомбинантными молекулами, такими как те, которые кодируют антигены, являющиеся желательными с точки зрения индукции иммунитета. Ген CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки встраивают в состав экспрессирующего вектора и инфицируют им или трансфицируют клетку-мишень с последующей экспрессией генного продукта в этой клетке-мишени так, что он прикрепляется к плазмалемме этой клетки-мишени или антиген-презентирующей клетки или секретируется во внешнюю для этой клетки-мишени или антиген-презентирующей клетки среду. Экспрессирующий вектор, такой как плазмида, вирус Semliki Forest, поксивирус или герпесвирус, переносит ген в антиген-презентирующую клетку. Ген CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки или фрагменты этих генов в любом сочетании встраивают в состав ДНК- или РНК-экспрессирующего вектора и инъецируют кошке с экспрессией данного генного продукта у кошки в виде "голой" ДНК/РНК или генетической вакцины. Коэкспрессия иммуногена и CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 в клетке-мишени или в организме кошки обусловливает активацию, усиленную активацию или регуляцию Т-лимфоцитов, В-лимфоцитов и других клеток. С другой стороны, экспрессированный белок может быть введен после экспрессии с плазмиды. Кошачьи белки CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 в норме функционируют, будучи прикрепленными к мембране клетки, как вспомогательные молекулы клеточной мембраны, но могут быть презентированы и в других формах, в частности в отсутствие в их составе "мембранных якорей".
В одном осуществлении CD80 кошки и CD86 кошки растворимы ("свободны" в клеточных и внеклеточных жидкостях) за счет утраты трансмембранного домена или гидрофобного участка и взаимодействуют с костимуляторными молекулами CD28 или CTLA-4, находящимися либо в связанной с мембраной, либо в растворимой форме. В другом варианте CD80 кошки и CD86 кошки находятся в связанной с мембраной форме, а костимуляторные молекулы CD28 или CTLA-4 - в растворимой форме, т.е. не имеют трансмембранного домена или гидрофобного участка. Растворимые CD28 или CTLA-4, предпочтительно находящиеся в форме димеров, применяются для лечения кошек, связанного с иммуносупрессией, опосредуемой Т-клетками. Растворимые CD28 или CTLA-4 предотвращают отторжение пересаженной ткани и могут быть использованы для лечения аутоиммунного заболевания. Конкретные растворимые CD28 или CTLA-4 применяются для профилактики реакции "трансплантат против хозяина" при пересадках костного мозга. Растворимые CD28 или CTLA-4 предотвращают связывание клетки, несущей мембранные формы кошачьих лигандов CD80 или CD86.
Структурно консервативные и функционально консервативные варианты ДНК и полипептидов CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки или биологически активный фрагмент или субфрагмент CTLA-4 объединяют в общей рамке считывания с другой последовательностью, такой как цитокин, интерлейкин, интерферон, колониестимулирующий фактор, антиген патогенного микроорганизма, антитело или необходимая для очистки последовательность, такая как полигистидиновая метка, или ген-репортер, такой как гены lacZ и uidA E.coli, или зеленый флуоресцентный белок.
Вакцины
Настоящее изобретение охватывает способы и композиции для повышения эффективности иммунного ответа у домашних кошек. В этом осуществлении кошачьи CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 используют вместе с иммуногеном, в отношении которого желательно индуцировать иммунный ответ. Например, в состав вакцин для кошек, содержащих иммуногены таких патогенов, как вирус иммунодефицита кошачьих и вирус лейкоза кошачьих, и других патогенов, таких как парвовирус кошачьих, лептовирус кошачьих и коронавирус кошачьих, желательно включить CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки с целью регуляции степени и эффективности иммунного ответа. Для этой цели кошачьи CD80, CD86, CD28 или CTLA-4, очищенные из нативных или рекомбинантных источников в соответствии с описанным выше, включают в состав вакцинной композиции в концентрации, находящейся в диапазоне от примерно 0,01 до 100,0 мг на одну вакцинацию одной кошки.
Специалистам в данной области техники известны коммерческие источники вакцин для кошек (Compendium of Veterinary Pharmaceuticals, 1997), которые могут быть использованы в сочетании с настоящим изобретением для получения более эффективной вакцины.
Вакцина для индукции и регуляции у кошки иммунного ответа на иммуноген содержит иммуноген и эффективное количество CD80 кошки, или CD86 кошки вместе с CD28 кошки, или CTLA кошки, или без них для усиления иммунного ответа или CD80 кошки, или CD86 вместе с CNLA-4 кошки для подавления иммунного ответа.
Иммуноген выбирают из группы, которая включает, тем самым не ограничиваясь, кошачьи патогены, такие как вирус иммунодефицита кошачьих, вирус лейкоза кошачьих, вирус инфекционного перитонита кошачьих, вирус панлейкопении кошачьих (парвовирус), калицивирус кошачьих, реовирус 3-го типа кошачьих, ротавирус кошачьих, коронавирус кошачьих (инфекционный перитонит), вирус бешенства, респираторно-синцитиальный вирус кошачьих, вирус саркомы кошачьих, герпесвирус кошачьих (вирус ринотрахеита), вирус болезни Борна кошек, хламидии, Toxoplasmosis gondii, паразиты кошек, Dirofilaria immitis, блохи, бактериальные патогены и подобное.
Регуляция роста или регуляция активации клеточного типа, такого как Т-лимфоцит, определяет то, что регуляторный ответ либо стимулирует, либо подавляет рост клеток. Регуляция иммунного ответа у кошки определяет то, что этот иммунный ответ либо стимулируется, либо подавляется в связи с лечением заболевания или воздействием на инфекционный агент у кошки.
Экспрессия CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки по отдельности или в любом сочетании частей или целых в составе экспрессирующего вектора, включающего ген(ы) кошачьих иммуногенов для целей введения в виде генетической вакцины или "голой ДНК-вакцины". Векторами являются, тем самым не ограничиваясь, pTarget (Promega, Madison, WI), pcDNA (Invitrogen, Carlsbad, CA) (J.J. Donnelly et al., 1997; Hassett & Whitton, 1996).
Гены или фрагменты генов CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 по отдельности или в сочетании, полноразмерные или частичные, могут быть встроены или трансфицированы в геном кошки или другого млекопитающего. Такая интеграция генов или фрагментов этих генов, которая может быть достигнута с использованием ретровирусного вектора, может быть использована для целей генотерапии.
Настоящее изобретение представляет способы и композиции для повышения устойчивости к заболеванию у домашних кошек, для применения в медицинских и (или) коммерческих целях. В этом осуществлении CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки, экспрессируемые по отдельности или в любом сочетании, полноразмерные или частичные, и в сочетании с генами, кодирующими кошачьи иммуногены, или без этого вводят кошке с использованием подходящего способа введения. Для способствования росту или устойчивости к заболеванию кошачьи CD80, CD86, CD28 или CTLA-4, экспрессируемые по отдельности или в любом сочетании, вводят в виде композиции в концентрации, варьирующейся от примерно 0,01 до 100,0 мг на 1 дозу вакцины на 1 кошку, предпочтительно в композиции в концентрации от примерно 0,25 мг/кг в день до примерно 25 мг/кг в день. Должно быть понятно, что потребное количество CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки может быть определено с помощью рутинных тестов, хорошо известных в данной области техники, так чтобы установить схему дозировок и частот их введения и сравнить группы экспериментальных единиц или субъектов по каждой точке такой схемы.
В соответствии с настоящим изобретением нативные или рекомбинантные кошачьи CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 приготавливают с физиологически приемлемым носителем, таким как, например, фосфатно-солевой буфер или деионизированная вода. Данная композиция также может содержать наполнители, включая смазывающие компоненты, пластификаторы, усилители поглощения, бактерициды и подобное, что хорошо известно в данной области техники. Полипептиды CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 кошки по настоящему изобретению вводят любым эффективным путем, включая, тем самым не исчерпываясь, внутривенный, подкожный, внутримышечный, чрезмышечный, местный или пероральный пути. Для подкожного введения, например, доза включает кошачий CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 в стерильном физиологическом растворе. Для перорального или ингаляционного введения кошачьи CD80, CD86, CD28 или CTLA-4 упаковывают на микро- или макроуровнях, например, в липосомы или микросферы. Также могут быть использованы кожные бляшки (или другие формы с медленной секрецией).
ПРИМЕРЫ
Пример 1А
Клонирование кДНК CD80 (В7-1)-TAMU, CD86 (В7-2), CD28 и CTLA-4 кошки
Последовательности кошачьих CD80 (В7-1), CD86 (В7-2), CD28 и CTLA-4 клонировали сначала путем амплифицирования методом ОТ-ПЦР (полимеразная цепная реакция с ревертированием или с обратной транскриптазой) участка между двумя последовательностями, которые достаточно консервативны для того, чтобы сформировать вырожденные праймеры, взаимодействующие с кошачьей мРНК. Источником мРНК были моноядерные клетки периферической крови (РВМС), простимулированные конканавалином-А по крайней мере в течение 16 часов. Полученный ПЦР-продукт секвенировали. Полученную последовательность использовали для конструирования праймеров для RACE (быстрая амплификация кДНК-концов). 5'-Конец амплифицировали сначала с получением кДНК с обратным праймером, комплементарным заново секвенированному консервативному участку. Олигонуклеотид лигировали на 3'-конец кДНК (комплемент 5'-концу мРНК). Эта последовательность являлась сайтом связывания для прямого праймера, который совместим по ПЦР с обратным ПЦР-праймером, соответствующим другому участку нового секвенированного участка. Вырожденные праймеры использовали в неоднократных циклах "гнездовых" реакций для получения 3'-концевой последовательности. Этот прямой праймер для ПЦР конструировали для взаимодействия с последовательностью нового секвенированного сегмента. Продукты либо секвенировали напрямую, либо клонировали в клонирующий вектор ТА и секвенированы из полученной плазмиды. Полноразмерную кодирующую рамку (ORF) клонировали путем амплификации по всей ее длине с использованием праймеров, сконструированных по параметрам известных последовательностей. ORF клонировали и секвенировали трижды. ORF B7-1 субклонировали в плазмиду pSI, включающую промотор SV40, и плазмиду SFV. Плазмиду pSI использовали для установления функционального взаимодействия B7-1 с кошачьим CD28.
ДНК-праймеры, использовавшиеся для ОТ-ПЦР кДНК CD80 (B7-1) кошки, были такими:
Прямой праймер: 5'-CGCGGATCCGCACCATGGGTCACGCAGCAAAGTGGAAAAC-3' (SEQ ID NO: 11)
Обратный праймер: 5'-CCTAGTAGAGAAGAGCTAAAGAGGC-3' (SEQ ID NO: 12)
(см. выше полный перечень праймеров для кДНК CD28).
ДНК-праймеры, использовавшиеся для ОТ-ПЦР кДНК CD28 кошки, были такими:
Прямой праймер: 5'-CGCGGATCCACCGGTAGCACAATGATCCTCAGG-3' (SEQ ID NO: 13)
Обратный праймер: 5'-CGCGGATCCTCTGGATAGGGGTCCATGTCAG-3' (SEQ ID NO: 14)
(см. выше полный перечень праймеров для кДНК CD28).
ДНК-праймеры, использовавшиеся для ОТ-ПЦР кДНК CTLA-4 кошки, были такими:
1. Вырожденные праймеры для первого ПЦР-продукта (672 нуклеотида):
Deg-5'-P: 5'-ATGGCTT(C)GCCTTGGATTT(C)CAGC(A)GG-3' (SEQ ID NO: 15)
Deg-3'-P: 5'-TCAATTG(A)ATG(A)GGAATAAAATAAGGCTG-3' (SEQ ID NO: 16)
2. 5'-Концевая последовательность CTLA-4 (455 нуклеотидов): вырожденные ген-специфичные (GSP) "гнездовые" ген-специфичные (NGSP) праймеры:
Первый раунд ПЦР:
Deg-5'-P: 5'-TGTTGGGTTTC(Т)G(A)CTCTG(А)СТТ(С)CCTG-3' (SEQ ID NO: 17)
3'-GSP: 5'-GCATAGTAGGGTGGTGGGTACATG-3' (SEQ ID NO: 18)
"Гнездовая" ПЦР с ПЦР-продуктом, полученным в первом раунде:
Deg-5'-P: 5'-TGTTGGGTTTC(Т)G(А)CTCTG(А)СТТ(С)CCTG-3' (SEQ ID NO: 19)
3'-NGSP: 5'-ACATGAGCTCCACCTTGCAG-3' (SEQ ID NO: 20).
3. 3'-Концевая последовательность CTLA-4: адапторный праймер-1 (API; Clontech Lab. Inc., Palo Alto, CA); "гнездовой" адапторный праймер (АР2; Clontech Lab.), ген-специфичный праймер (GSP) и "гнездовой" ген-специфичный праймер (NGSP):
3'-RACE:
AP1: 5'-CCATCCTAATACGACTCACTATAGGGC-3' (SEQ ID NO: 21)
5'-GSP: 5'-GTGAATATGGGTCTTCAGGCAATG-3' (SEQ ID NO: 22)
3'-Гнездовая RACE с продуктом 3'-RACE:
АР2: 5'-ACTCACTATAGGGCTCGAGCGGC-3' (SEQ ID NO: 23)
5'-NGSP: 5'-GAAATCCGAGTGACTGTGCTGAG-3' (SEQ ID NO: 24).
4. Праймеры для полноразмерного гена CTLA-4:
Fel CTLA-4 5'-праймер: 5'-AACCTGAACACTGCTCCCATAAAG-3' (SEQ ID NO: 25)
Fel CTLA-4 3'-праймер: 5'-GCCTCAGCTCTTAGAAATTGGACAG-3' (SEQ ID NO: 26).
ДНК-праймеры, использовавшиеся для ОТ-ПЦР кДНК CD86 (В7-2) кошки, были такими:
1. Вырожденные праймеры для первого ПЦР-продукта (423 нуклеотида):
Deg-5'-P: 5'-TAGTATTTTGGCAGGACCAGG-3' (SEQ ID NO: 27)
Deg-3'-P: 5'-CTGTGACATTATCTTGAGATTTC-3' (SEQ ID NO: 28).
2. Вырожденные праймеры для второго ПЦР-продукта (574 нуклеотида):
Deg-5'-P: 5'-GA(G)CA(T)GCACT(A)ATGGGACTGAG-3' (SEQ ID NO: 29)
Deg-3'-P: 5'-CTGTGACATTATCTTGAGATTTC-3' (SEQ ID NO: 30).
3. 5'-Конец CD86: AP1, AP2 (Clontech Lab.), вырожденный 3'-ген-специфичный (GSP) и 3'-"гнездовой" ген-специфичный (NGSP) праймеры:
5'-RACE:
AP1: 5'-CCATCCTAATACGACTCACTATAGGGC-3' (SEQ ID NO: 31)
3'-GSP: 5'-TGGGTAACCTTGTATAGATGAGCAGGTC-3' (SEQ ID NO: 32).
"Гнездовая" 5'-RACE с ПЦР-продуктом 5'-RACE:
AP2: 5'-ACTCACTATAGGGCTCGAGCGGC-3' (SEQ ID NO: 33)
3'-NGSP: 5'-CAGGTTGACTGAAGTTAGCAAGCAC-3' (SEQ ID NO: 34).
4. 3'-Концевая последовательность В7-2: праймеры AP1, AP2, 5'-GSP и 5'-NGSP:
3'-RACE:
AP1: 5'-CCATCCTAATACGACTCACTATAGGGC-3' (SEQ ID NO: 35)
5'-GSP: 5'-GGACAAGGGCACATATCACTGTTTC-3' (SEQ ID NO: 36).
"Гнездовая" 3'-RACE с ПЦР-продуктом 3'-RACE:
AP2: 5'-ACTCACTATAGGGCTCGAGCGGC-3' (SEQ ID NO: 37)
5'-NGSP: 5'-CAGTGCTTGCTAACTTCAGTCAACC-3' (SEQ ID NO: 38).
Полноразмерный ген CD86:
Прямой праймер Fel-B72 (1): 5'-CGGGAATGTCACTGAGCTTATAG-3' (SEQ ID NO: 39)
Обратный праймер Fel-B72 (1176): 5'-GATCTTTTTCAGGTTAGCAGGGG-3' (SEQ ID NO: 40).
Пример 1В
Клонирование CD80 (В7-1)-Syntro/SPAH; плазмида 917-19-8/16
Отбирали клетки кошачьей селезенки и культивировали их с конканавалином-А в течение 5 часов. После этого клетки центрифугировали, промывали в ФСБ и использовали для выделения тотального пула РНК в системе RNeasy (Qiagen). Тотальную РНК обрабатывали ДНКазой-1 (Boehringer Mannheim) с целью удаления ДНК, загрязняющей препарат РНК. Затем из этих препаратов выделяли мРНК с использованием шариков Oligotex (Qiagen, Santa Clara, CA) и высокоскоростных колонок. С матриц мРНК синтезировали ДНК-копии в присутствии случайных гексамеров, dNTP, RNAsin, обратной транскриптазы (Promega) и обратнотранскриптазного буфера (Promega) с инкубацией в течение 30 минут при 42°С. Затем для получения двухцепочечных молекул полноразмерного кДНК-клона кодирующей рамки (ORF) В7-1 кошки применяли ПЦР со смысловым праймером 5/97.50 (5'-ATGGGTCACGCAGCAAAGTG-3') (SEQ ID NO: 41) и антисмысловым праймером 5/97.51 (5'-CTATGTAGACAGGTGAGATC-3') (SEQ ID NO: 42), dNTP, кДНК В7-1 (первая цепь), сульфатом магния, полимеразой Vent (Gibco BRL) и Vent-полимеразного буфера (Gibco BRL). Условия ПЦР: 1 цикл 15 секунд при 94°С; 35 циклов - 30 секунд при 94°С, 2 минуты при 48°С, 2 минуты при 72°С; 1 цикл достройки при 72°С в течение 10 минут. ПЦР осуществляли в 1%-ной низкоплавкой агарозе и выделяли ДНК-фрагменты, соответствующие ожидаемому размеру ORF В7-1, очищали в геле (набор реактивов для гель-очистки Qiagen, Santa Clara, CA) и клонировали в плазмиду pCR-BLUNT с использованием набора Zero Blunt PCR Cloning Kit (Invitrogen, San Diego, CA). ДНК, экстрагированную из резистентных к канамицину бактериальных колоний, подвергали предварительному скринингу на присутствие уникального NheI-сайта (имеющегося в составе CD80 [B7-13-TAMU кошки). Вставки размером 800-900 пар нуклеотидов (п.н.), включавшие NheI-сайт, секвенировали методом флуоресцентного автоматического секвенирования на соответствующем оборудовании фирмы Perkin-Elmer-Cetus (Applied Biosystems Inc.). Плазмидный вектор и В7-1, ген-специфичные праймеры, производные от ранее клонированного гена В7-1, использовали для получения последовательности pCR-Blunt: праймеры - 1/97.36 [5'-CAGGAAACAGCTATGAC-3') (SEQ ID NO: 43) и 1/97.37 (5'-AATACGACTCACTATAGG-3') (SEQ ID NO: 44). Специфичные для гена В7-1 праймеры - 12/96.22 (5'-ААСАССАТТТСАТСАТССТТТ-3') (SEQ ID NO: 45), 1/97.33 (5'-ATACAAGTGTATTTGCCATTGTC-3') (SEQ ID NO: 46), 12/96.20 (5'-AGСТСТGАССААТААСАТСА-3') (SEQ ID NO: 47), 12/96.21 (5'-ATTAGAAATCCAGTTCACTGCT-3') (SEQ ID NO: 48), 1/97.32 (5'-TCATGTCTGGCAAAGTACAAG-3') (SEQ ID NO: 49), 11/96.32 [5'-ATTCACTGACGTCACCGA-3') (SEQ ID NO: 50) 11/96.31 [5'-AAGGCTGTGGCTCTGA-3') (SEQ ID NO: 51). Были идентифицированы два клона, которые включают полноразмерную последовательность CD80, соответствующую исходной последовательности CD80, за исключением двух точковых мутаций. Одна такая мутация аминокислотную последовательность не изменяла. Другая мутация приводила к замене лейцина на изолейцин. Полученный в результате клон CD80 кошки был обозначен 917-19.8/16 (CD80-Syntro/SPAH).
Для облегчения клонирования гена CD80 (В7-1) кошки, находящегося за любым промотором вируса оспы (поксивируса), включающим EcoRI- и BamHI-сайты клонирования, два новых праймера были сконструированы таким образом, чтобы внести рестрикционные EcoRI- и BamHI-сайты клонирования по 5'- и 3'-концам кодирующей рамки CD80 соответственно. Эти два праймера были такими: прямой праймер 1/97.43 (SEQ ID NO: 52) и обратный праймер 1/97.6 (SEQ ID NO: 53). Полученный ПЦР-фрагмент расщепляли рестриктазами EcoRI и BamHI и клонировали в состав вектора O1L-SPV (по AccI-сайту в последовательности геномного HindIII-фрагмента М поксвируса свиней - SPV) с получением рекомбинантного вируса SPV. В результате была получена кассета 930-23.А1 - вектор O1L-SPV, включающий кодирующую рамку CD80 кошки, находящуюся за синтетическим "поздне-ранним" промотором LP2EP2 генома SPV и примыкающую к кассете маркерного гена lacZ E.coli, помещенного под контроль синтетического промотора позднего гена LP2. Плазмидный вектор 930-23.А1 котрансфицировали вместе с SPV-001 с получением рекомбинантного вируса SPV, экспрессирующего белок В7-1 кошки и β-галактозидазу E.coli.
Пример 1С
Субклонирование CD28 в гомологичный поксивирусному геному вектор
Кодирующий сегмент гена CD28 амплифидировали с помощью ПЦР с синтетическими праймерами, включающими стандартные сайты клонирования, что должно облегчить клонирование CD28 за любым промотором генома поксивируса в ходе конструирования специфичного вектора, гомологичного поксвирусу. Синтетические праймеры были сформированы так, чтобы внести EcoRI- и BglII-сайты клонирования по 5'- и 3'-концам ПЦР-фрагмента соответственно. Эти два праймера были такими: прямой праймер 7/97.1 (5'-GATGAATTCCATGATCCTCAGGCTGGGCTTCT-3') (SEQ ID NO: 54) и обратный праймер 7/97.2 (5'-GATCAGATCTCAGGAACGGTATGCCGCAA-3') (SEQ ID NO: 55). Полученный в результате проведения ПЦР ДНК-фрагмент расщепляли рестриктазами EcoRI и BglII и клонировали в состав вектора O1L-SPV с целью получения рекомбинантного поксвируса. Была получена кассета 930-26.А1 - вектор O1L-SPV, включающий (по AccI-сайту в последовательности геномного HindIII-фрагмента М поксвируса свиней) кодирующую рамку CD28 кошки, находящуюся за синтетическим "поздне-ранним" промотором LP2EP2 генома SPV и примыкающую к кассете маркерного гена lacZ E.coli, помещенного под контроль синтетического промотора позднего гена LP2. Гомологичный плазмидный вектор 930-26.А1 котрансфицировали вместе с SPV-001 с получением рекомбинантного вируса SPV, экспрессирующего белок CD28 кошки и β-галактозидазу E.coli.
Пример 2
Характеристика кДНК и полипептидов CD80 (В7-1)-TAMU, CD86 (В7-2), CD28, CTLA-4 и CD80 (В7-1)-Syntro/SPAH кожки
Выделенная и очищенная кДНК CD80 (В7-1) кошки длиной примерно 941 нуклеотид составляет открытую рамку, кодирующую кошачий полипептид CD80, состоящий примерно из 292 аминокислот, в виде нативной связанной с мембраной или зрелой формы с молекулярной массой примерно 33,485 кДа, изоэлектрической точкой 9,1 и суммарным зарядом 10,24 при рН 7,0. Трансмембранный домен этого белка ориентировочно приходится на аминокислоты 241-271.
Кошачьи CD80-TAMU и CD80-Syntro/SPAH - это кДНК и соответствующие полипептиды, которые были выделены независимо друг от друга из двух различных источников, и при этом их нуклеотидные и аминокислотные последовательности чуть-чуть различаются. Источником мРНК CD80-TAMU были моноядерные клетки периферической крови кошки, простимулированные конканавалином-А, а источником мРНК CD80-Syntro/SPAH были спленоциты кошки, простимулированные конканавалином-А. Различие по последовательности кДНК между CD80-TAMU и CD80-Syntro/SPAH связано с нуклеотидными заменами Т→С в 351-м положении и С→А в 670-м положении. По аминокислотной последовательности замена 351-го нуклеотида является несмысловой, а замена 670-го нуклеотида приводит к замене нейтральной аминокислоты на нейтральную - лейцина на изолейцин - в 224-м положении полипептида.
Выделенная и очищенная кДНК CD86 (В7-2) кошки состоит примерно из 1176 нуклеотидов, соответствуя открытой рамке, кодирующей полипептид CD86 кошки, состоящий из примерно 320 аминокислот, в виде нативной связанной с мембраной или зрелой формы с молекулярной массой примерно 36,394 кДа, изоэлектрической точкой 9,19 и суммарным зарядом 11,27 при рН 7,0.
Выделенная и очищенная кДНК CD28 кошки состоит примерно из 689 нуклеотидов, соответствуя открытой рамке, кодирующей полипептид CD28 кошки, состоящий из примерно 221 аминокислоты, в виде нативной связанной с мембраной или зрелой формы с молекулярной массой примерно 25,319 кДа, изоэлектрической точкой 9,17 и суммарным зарядом 9,58 при рН 7,0.
Выделенная и очищенная кДНК CTLA-4 кошки состоит примерно из 749 нуклеотидов, соответствуя открытой рамке, кодирующей полипептид CTLA-4 кошки, состоящий из примерно 223 аминокислот, в виде нативной связанной с мембраной или зрелой формы с молекулярной массой примерно 24,381 кДа, изоэлектрической точкой 6,34 и суммарным зарядом - 0,99 при рН 7,0.
Коэкспрессия CD80 с костимуляторной молекулой CD28 или CTLA-4 и с опухолевым антигеном или антигеном патогенного организма обусловливает способность активировать или усиливать активацию Т-лимфоцитов, в частности лимфоцитов пула Th-1, и активировать рост других типов клеток. Коэкспрессия CD80 с костимуляторной молекулой CTLA-4 обусловливает способность подавлять активацию Т-лимфоцитов, в частности лимфоцитов пула Th-1. Коэкспрессия CD86 с костимуляторной молекулой CD28 или CTLA-4 и с опухолевым антигеном или антигеном патогенного организма обусловливает способность активировать или усиливать активацию Т-лимфоцитов, в частности лимфоцитов Th-1, и активировать рост других типов клеток. Коэкспрессия CD86 с костимуляторной молекулой CTLA-4 обусловливает способность подавлять активацию Т-лимфоцитов, более конкретно лимфоцитов Th-1.
Таблица | ||||
Уровень идентичности нуклеотидных и аминокислотных последовательностей | CD80 кошки | CD86 кошки | CD28 кошки | CTLA-4 кошки |
1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
Гомолог человека (%идентичности нуклеотидной последовательности) | 77 | 72 | 85 | 88 |
Продолжение таблицы | ||||
1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
Гомолог человека (%идентичности аминокислотной последовательности) | 59 | 68 | 82 | 88 |
Гомолог мыши (%идентичности нуклеотидной последовательности) | 62 | - | 77 | 79 |
Гомолог мыши (%идентичности аминокислотной последовательности) | 46 | - | 74 | 78 |
Гомолог кролика (%идентичности нуклеотидной/аминокислотной последовательности) | - | 67/64 | 84/84 | - |
Гомолог курицы (%идентичности нуклеотидной/аминокислотной последовательности) | - | - | 59/50 | - |
Пример 3
Использование кошачьих CD80 (В7-1), CD86 (В7-2), CD28 и CTLA-4 в вакцинах
Следующие эксперименты были проведены с целью оценки усиливающей иммунитет активности кошачьих CD80, CD86, CD28 и CTLA-4 в составе вакцин для кошек.
В одной из процедур кошкам в возрасте 8 недель внутримышечно инъецировали по 100 мкг плазмиды, включающей кДНК, кодирующую кошачьи молекулы CD80, CD86, CD28 и CTLA-4, в смеси с плазмидой, включающей кДНК вирусных генов env и gag вируса FIV или env и gag вируса FeLV, или, с другой стороны, внутримышечно инъецировали по 100 мкг плазмиды, включающей кДНК, экспрессирующей попарные комбинации CD80/CD28 или CD80/CTLA-4, или CD86/CD28, или CD86/CTLA-4, в смеси с плазмидой, включающей кДНК вирусных генов env и gag (FIV) или env и gag (FeLV). Контрольные особи инъекций CD80, CD86, CD28 и CTLA-4 не получали. Кошек предварительно заражали вирулентными штаммами FeLV или FIV и анализировали симптомы заболевания в соответствии с описанным выше. В результате исходного инфицирования было установлено, что кошки, которым вводили вектор с кДНК кошачьих CD80, CD86, CD28 и CTLA-4 и вектор с кДНК генов FIV или генов FeLV, проявили 100%-ную защищенность от заболевания по сравнению с животными, которым вводили только вектор, включающий кДНК генов FIV или генов FeLV: в этой группе устойчивость к заболеванию составила 75%.
В другой процедуре кошкам в возрасте 8 недель внутримышечно инъецировали от 0,1 до 100 мг очищенного белка кошачьих молекул CD80, CD86, CD28 и CTLA-4 или, в другом варианте, - попарные комбинации CD80 или CD86 в сочетании с CD28 или CTLA-4, с использованием рекомбинантных векторов, включающих кДНК, описанных выше, а также внутримышечно инъецировали от 0,1 до 100 мкг вакцины, содержащей белки env и gag вируса FIV или белки env и gag вируса FeLV. Контрольным особям инъекций CD80, CD86, CD28 и CTLA-4 не проводили. Кошек предварительно заражали вирулентными штаммами FeLV или FIV и регулярно анализировали развитие заболевания у них. Полученные результаты показали существенно сниженную заболеваемость у кошек, которым вводили очищенный белок CD80, CD86, CD28 и CTLA-4 вместе с вирусной вакциной FIV или FeLV, по сравнению с кошками, получавшими вакцину, содержащую только белки FIV или FeLV.
Пример 4
Использование кошачьих CD80 (В7-1), CD86 (В7-2), CD28 и CTLA-4 для подавления и предотвращения роста опухолевых клеток
Опухолевые клетки кошки трансфицировали вектором, экспрессирующим CD80 или CD86 кошки в сочетании либо с CD28, либо с CTLA-4. Трансфицированные опухолевые клетки вновь вводили той же кошке, и присутствие CD80, CD86, CD28 и CTLA-4 на поверхности опухолевой клетки усиливало неспецифический иммунный ответ в отношении и трансфицированных, и нетрансфицированных опухолевых клеток, что приводило к уничтожению локализованных и метастазирующих опухолевых клеток. В другой процедуре векторы, экспрессирующие CD80 или CD86 кошки в сочетании либо с CD28, либо с CTLA-4, непосредственно инъецировали кошке в опухоль, в результате чего наблюдался неспецифический иммунный ответ в отношении опухолевых клеток, приводивший к уничтожению как локализованных, так и метастазирующих опухолевых клеток.
Пример 5
Клонирование и секвекирование кДНК CD 80 кошки
Введение
В дополнение к цитокинам некоторые поверхностно-клеточные молекулы, как было показано, могут усиливать или подавлять определенный иммунный ответ. CD80 (В7-1) является вспомогательной молекулой, которая связывается на соответствующем ей рецепторе на поверхности Т-лимфоцитов (Freeman et al., 1989). Такое взаимодействие обеспечивает доставку вторичных стимулов, что в сочетании с первичным сигналом, опосредуемым распознаванием Т-клеточным рецептором антигена, презентированного с участием молекул МНС, обусловливает активацию и пролиферацию Т-клеток (Allison & Lanier, 1994). Хотя белок CD80 впервые был описан как антиген В-лимфоцитов, затем было установлено, что он экспрессируется рядом клеточных типов, в основном обладающих свойством презентирования антигена (Freeman et al., 1989).
У приматов и грызунов молекула CD80 - полипептид с молекулярной массой 60 кДа, составленный приблизительно 290 аминокислотами (Freedman et al., 1987; Freeman et al., 1989). Подтверждение предполагаемой аминокислотной последовательности указывает на характеристики, в соответствии с которыми она является членом иммуноглобулинового суперсемейства (IgSF) (Peach et al., 1995). Она составлена двумя внеклеточными иммуноглобулиноподобными (IgSF) доменами, гидрофобным трансмембранным доменом и коротким цитоплазматическим "хвостом" (Freeman et al., 1989). Внеклеточный домен зрелого белка состоит из 124 N-концевых остатков вариабельного (V) IgSF-домена и затем из 100 аминокислот константного (С-подобного) IgSF-домена (Freeman et al., 1989). В составе гомолога CD80 человека имеется 8 потенциальных сайтов N-гликозилирования и, хотя зрелый белок характеризуется существенным уровнем гликозилирования, эти углеводные остатки, как считается, не связаны с процессами связывания с рецепторами CD28 или CTLA-4, потому что они ориентированы в противоположную от предполагаемого домена связывания сторону (Bajorath et al., 1994). Более того, удаление углеводных остатков, по-видимому, не влияет на способность к связыванию, в связи с чем предполагается, что их функции связаны с повышением растворимости внеклеточной части данной молекулы (Linsley et al., 1994a).
CD80 связывается на двух различных рецепторах, экспрессируемых в различное время процесса Т-клеточной активации. Рецептор CD28 обнаруживается у различных тимоцитов, "наивных" и активированных Т-клеток, и для него было продемонстрировано участие в активации и пролиферации Т-клеток (Aruffo, 1987). Второй рецептор для CD80 - CTLA-4 - обычно обнаруживается позже на полностью активированных Т-клетках (Linsley et al., 1991b). Хотя роль CTLA-4 пока точно не определена, предполагается, что эта молекула может действовать как фактор супрессии активного, уже имеющегося Т-клеточного ответа (Hutchcroft & Bierer, 1996).
Сама по себе молекула CD80 по-видимому не способна к передаче сигнала. Ее цитоплазматический сегмент относительно мал и не включает аминокислот, для которых была бы подтверждена сигнальная и каталитическая функция (Hathcock et al., 1994). Отсутствие консерватизма в структуре цитоплазматических участков у пептидов человека и мыши также согласуется с вероятным отсутствием сигнальных функций у белка CD80, который активен лишь по связыванию с рецепторами CD28 или CTLA-4 (Linsley et al., 1994a).
Взаимодействие между CD80 и CD28, как было показано, является необходимым для перехода "наивных" Т-клеток в активированное состояние, что инициирует первичный Т-клеточный ответ (Damle et al., 1988). Хотя CD80 был впервые найден на активированных В-клетках (Freedman et al., 1987), после этого он был обнаружен у большинства групп специфичных антигенпрезентирующих клеток, включая макрофаги и моноциты (Freedman et al., 1987), клетки Лангерганса (Symington et al., 1993), дендритные клетки (Liu et al., 1992), активированные Т-клетки (Razi-Wolf et al., 1992) и различные опухолевые клетки (Chen et al., 1992). Присутствие молекулы CD80 на клетках АРС, как было подтверждено, является важным для активации и CD4-позитивных, и CD8-позитивных Т-клеток (Allison & Lanier, 1994; Bellone et al., 1994). Хотя эта молекула в норме в значительном количестве присутствует только на специфичных АРС, в линиях клеток некоторых опухолей было установлено усиление выработки сигнальной молекулы (Chen et al., 1992).
Предполагается, что в результате трансформации в некоторых опухолеродных линиях имеет место усиление экспрессии CD80. В этих опухолевых линиях, производных не от антигенпрезентирующих клеток, равно как и в некоторых иммортализованных клеточных линиях CD80 является поверхностным белком, экспрессированным на таком уровне, который достаточен для обусловливания полной активации Т-клеток (Chen et al., 1992). Хотя кинетика экспрессии неясна, возможно, что происходящий от опухолевых клеток CD80 может быть ответом на "онкогенный шок" и отражать эволюционный механизм, с помощью которого иммунная система способна удалять трансформированные или опухолеродные клетки (Antonia et al., 1995).
Роль взаимодействия CD28-B7 считается ключевой в процессе первичной активации Т-клеток. Распознавание антигена с участием молекул МНС Т-клеточными рецепторами само по себе недостаточно для инициации оптимальной пролиферации и активации Т-клеток (Schwartz, 1992). TCR-стимуляция в отсутствие вспомогательных сигналов может приводить к анергии или снижению реактивности Т-клеточных популяций (Jenkins et al., 1987). Связывание молекулы CD28 на Т-клетке с молекулой CD80 на антигенпрезентирующей клетке рассматривается как передача второго сигнала, необходимого для Т-клеточной активации (Schwartz, 1992). Когда рецепторы TCR загружены, в отсутствие такого второго сигнала "наивные" клетки не активируются и могут стать анергическими (Lanier et al., 1995). Такая принципиальная роль взаимодействия CD28-CD80 была отчетливо выявлена не только для процесса активации "наивных" клеток CD4+, но также и в клонах CD4+ Th1 и Th2 и для "наивных" Т-клеток CD8+, производных от малых покоящихся лимфоцитов периферической крови (Linsley et al., 1993a).
Как и в случае с семейством рецепторов CTLA-4/CD28, также имеется по крайней мере еще один дополнительный рецептор, имеющий отношение к CD80. Исследования, в которых делалась попытка выявить значение CD80 для первичного иммунного ответа, поставили ряд вопросов из-за того, что, хотя внесение CTLA-4Ig подавляло иммунные ответы, напротив, добавление моноклонального антитела (mAb) к CD80, как казалось, не обусловливало сходного эффекта (Lenschow et al., 1993). При получении линии мышей, "выключенных" по гену CD80, неожиданно было установлено наличие второго рецептора CTLA-4/CD28 (Freeman et al., 1993). Предположили, что такие мыши должны иметь сходный фенотип с ранее полученными мышами, "выключенными" по CD28, у которых имелся неадекватный Т-клеточный ответ (Freeman et al., 1993). Однако было установлено, что "выключенные" по CD80 мыши формируют нормальный ответ, а их клетки АРС способны формировать вторичный сигнал, необходимый для созревания Т-клеток (Freeman et al., 1993). На основании этих данных было предположено существование второго рецептора, который в конечном счете и был выделен. Последующее обнаружение родственного рецептора CD86 (В7-2 или В7-0), как представляется, снимает то противоречие, которое возникло в анализе "выключенных" по CD80 мышей, а в сочетании со сходством структуры и параметров связывания оно указывает на возможность того, что эти молекулы характеризуются общностью функций и происхождения (Hathcock et al., 1994).
CD86 (В7-2) проявляет определенный уровень сходства с CD80, в частности по структуре внеклеточных доменов IgSF-V и IgSF-C (Freeman et al., 1993). Суммарный уровень гомологии этих молекул, однако, меньше 25%, при том, что консервативные остатки сосредоточены на противоположных концах обоих внеклеточных доменов (Bajorath et al., 1994). Хотя связывающий сегмент не был установлен ни для одной из этих молекул, гомология последовательностей позволила выделить участок, перспективный с точки зрения установления потенциального сайта взаимодействия (Linsley et al., 1994a). Несмотря на отсутствие консерватизма, CD80 и CD86 характеризуются сходными параметрами связывания на обоих рецепторах, хотя CD86 характеризуется более быстрым высвобождением с рецептора CTLA-4 (Linsley et al., 1995а).
CD86 по-видимому характеризуется сходными параметрами экспрессии по сравнению с CD80, будучи экспрессированным на активированных В-клетках, Т-клетках, макрофагах и моноцитах (Azuma et al., 1993a). Однако динамика экспрессии этих двух молекул в небольшой степени различается (Hathcock et al., 1994). В целом CD86 появляется раньше в процессе активного иммунного ответа по сравнению с CD80 и предположительно экспрессируется моноцитами по конститутивному типу (Freeman et al., 1991). Хотя CD80 может появляться спустя 24 часа после исходной стимуляции, CD86 появляется на раннем этапе ответа или вообще экспрессируется миелоидными клетками постоянно на невысоком уровне (Hathcock et al., 1994). Эти два поверхностных белка обусловливают сходные внутриклеточные реакции будучи связаны на соответствующих им рецепторах на поверхности Т-клеток как CD4+, так и CD8+ (Lanier et al., 1995). По-видимому отсутствуют какие-либо различия в способности каждой из этих молекул инициировать активацию и пролиферацию Т-клеток или индуцировать активность CTL (Hathcock et al., 1994). Таким образом, имеющиеся данные подтверждают, что обе молекулы инициируют сходный сигнальный каскад после их связывания рецепторами CD28 или CTLA-4, соответственно (Hathcock et al., 1994). Хотя, как представляется, кинетика связывания обеих этих молекул со своими рецепторами одинакова и при этом отсутствуют какие-либо различающиеся проявления этого, пока неясно эволюционное значение существования такой системы "пара лигандов/пара рецепторов" (Lanier et al., 1995).
CD80 вначале был описан как маркер В-клеток, и высокие уровни и CD80, и CD86 обнаруживаются на В-клетках, стимулированных липополисахаридом (ЛПС), анти-Ig, анти-СD40, конканавалином-А (Кон-А), цАМФ, IL-2 и IL-4 (Hathcock et al., 1994). Как было показано, в В-клетках мышей γ-интерферон и IL-5 усиливают выработку CD86, хотя пока нет аналогичных данных для человека или для CD80 в связи с указанными иммунорегуляторами (Azuma et al., 1993a). Динамика экспрессии в В-клетках у этих двух молекул несколько различна. CD86 экспрессируется почти сразу после стимуляции (6 часов), в то время как CD80 отсутствует почти 24 часа и вплоть до 48-го часа не достигает пика своей экспрессии (Lenschow et al., 1993). Считается, что позитивная регуляция CD80 на В-клетках находится под контролем сигнальных механизмов, опосредуемых молекулами класса II МНС (Nabavi et al., 1992). Два других поверхностно-клеточных рецептора также по-видимому важны в связи с экспрессией CD80. Перекрестное связывание CD40, экспрессированного на В-клетках, с Ig или Т-клетками, экспрессирующими соответствующий рецептор, обусловливает усиление экспрессии CD80 (Azuma et al., 1993b), в то время как перекрестное связывание Fc-рецептора обусловливает снижение экспрессии обеих молекул (Barcy et al., 1995).
CD40 и лиганд этого рецептора CD40L, как предполагалось, являются элементами механизма, участвующего в регуляции экспрессии CD80 на клетках АРС (Page et al., 1994). CD40 экспрессирован в различных типах клеток, включая В-лимфоциты, моноциты, дендритные клетки, фибробласты и эндотелиальные клетки человека, и может позитивно регулироваться на этих клетках в присутствие γ-итерферона (de Boer et al., 1993). Лиганд CD40 (CD40L) экпрессируется активированными CD4-позитивными Т-клетками. Связывание CD40 и CD40L, как было показано, усиливает экспрессию CD80 клетками АРС, хотя по-видимому это не индуцирует экспрессию в других типах клеток, экспрессирующих данный рецептор, включая эндотелиальные клетки (Page et al., 1994).
Молекулы CD80 и CD86, хотя и проявляют лишь 25%-ный уровень аминокислотного сходства друг с другом, обладают структурным сходством и рассматриваются как "отдаленно родственные" (Freeman et al., 1993). Гомологичные остатки сконцентрированы в составе иммуноглобулино-подобных доменов при небольшом количестве консервативных остатков в составе трансмембранного и цитоплазматического доменов (June et al., 1995). Предполагается, что семейство, включающее продукты генов В7, также, в дополнение к CD80 и CD86, охватывает бутирофилин (ВТ), гликопротеин миелин/олигодендроцитов (MOG), МНС-аналог курицы - B-G (Linsley et al., 1994b). ВТ, MOG и В-G кодируются генами, входящими в геномный комплекс МНС, что указывает на вероятную эволюционную связь между главным комплексом гистосовместимости и необходимыми костимуляторными молекулами (Linsley et al., 1994b).
Покоящиеся Т-лимфоциты мыши и человека на низком уровне экспрессируют CD86, в то время как Т-клетки мыши и человека (и Т-клеточные клоны), активированные действием антител к CD3, экспрессируют CD80 и CD86 на существенном уровне (Hathcock et al., 1994). Экспрессия и CD80, и CD86 на активированных Т-клетках может отражать способность этих Т-клеток пролиферировать по механизму аутокринной костимуляции (Azuma et al., 1993b). Интересно, что, как было показано, CD80 позитивно регулируется на ВИЧ-инфицированных CD4-позитивных Т-клетках при одновременной негативной регуляции CD28. Предполагается, что это является вероятным механизмом вирусной передачи в случае, когда неинфицированные Т-клетки CD4+ инициируют опосредованный взаимодействием CD28/CD80 контакт с инфицированными лимфоцитами (Haffar et al., 1993).
Моноциты периферической крови человека на низком уровне экспрессируют CD80 и на высоком уровне - CD86, в то время как обработка фактором GM-CSF или γ-интерфероном приводит к интенсификации поверхностной экспрессии и CD80, и CD86 (Barcy et al., 1995). ЛПС является мощным индуктором экспрессии CD80 в моноцитах периферической крови человека (Schmittel et al., 1994). Пока нет данных о брюшинных макрофагах человека, в то время как известно, что покоящиеся макрофаги мыши экспрессируют CD80 и CD86 на низких уровнях (Freeman et al., 1991; Hathcock et al., 1994). Стимуляция ЛПС и γ-интерфероном макрофагов мышей увеличивает уровень поверхностной экспрессии, хотя γ-интерферон в сочетании с интерлейкином-10 снижает уровень синтеза обоих этих рецепторов (Ding et al., 1993).
Дендритные клетки селезенки на низком уровне экспрессируют обе молекулы, а клетки Лангерганса на низком уровне экспрессируют CD86, хотя при культивировании имеется тенденция к усилению экспрессии в обоих типах клеток (Larsen et al., 1994). При культивировании дендритных клеток CD86 по-видимому подвержен более мощной, а также более ранней позитивной регуляции, что может играть важную роль в опосредовании сигнальных путей в этих клетках (Hathcock et al., 1994). Интересно, что, хотя IL-10 не влияет на экспрессию CD80 дендритными клетками, он активен по негативной регуляции экспрессии CD86 (Buelens et al., 1995). Сообщалось (O'Doherty et al., 1993), что, хотя исходные уровни CD80 в дендритных клетках очень низки, после их созревания имеющийся уровень CD80 повышается. Экспрессия CD80 клетками Лангерганса подавляется и IL-10, и γ-интерфероном, хотя обработка колониестимулирующим фактором гранулоцитов/макрофагов ревертирует подавление, вызванное γ-интерфероном, но не подавление, вызванное IL-10 (Ozawa et al., 1996).
Как было показано, у человека и мыши специфичные цитокины осуществляют контроль экспрессии и CD80, и CD86. Интерлейкин-4 является мощным индуктором CD86 и в меньшей степени индуктором CD80 в В-клетках (Stack et al., 1994), в то время как γ-интерферон усиливает экспрессию CD86 в различных типах клеток, включая В-клетки, моноциты и макрофаги (Hathcock et al., 1994). Хотя, как видно, γ-интерферон обусловливает усиление экспрессии CD80 в моноцитах, он может приводить к ослаблению экспрессии а макрофагах. IL-10, даже в присутствие γ-инферферона, ослабляет экспрессию CD80 и CD86 (Ding et al., 1993). Такое взаимодействие может отражать вероятный механизм переключения Th1-ответа (DTH) на Тh2-ответ (гуморальный). Однако IL-10 не влияет на экспрессию CD80 в дендритных клетках (Buelens et al., 1995). Это, кроме того, может отражать роль этих молекул в регуляции групп Т-хелперов, поскольку считается, что дендритные клетки играют важную роль в инициации иммунного ответа 2-го типа. Интерлейкин-7 усиливает экспрессию CD80 в Т-клетках, хотя его влияние в других типах клеток пока не определено (Yssel et al., 1993), в то время как было установлено, что экспрессия CD80 В-клетками опосредуется за счет перекрестного связывания с TNF-рецептором р75, а экспрессия может быть увеличена в присутствии IL-4 (Ranheim & Kipps, 1995). Интересно, что TNF принадлежит к тому же семейству молекул, что и CD40 - другой потенциальный инициатор экспрессии CD80. По-видимому, GM-CSF усиливает поверхностную экспрессию CD80 дендритными клетками и клетками Лангерганса, в то время как γ-интерферон обусловливает усиление выработки только CD86 в этих клетках (Larson et al., 1994).
Долгое время считалось, что распознавание, связывание и лизис трансформированных и инфицированных вирусом клеток-мишеней CD8-позитивными цитотоксичными Т-лимфоцитами (CTL) опосредуются только за счет TCR-распознавания чужеродных пептидов, экспрессируемых в связи с молекулами класса I MHC (Berke, 1993). Недавно было установлено, что ряд поверхностно-клеточных молекул, экспрессируемых и CTL, и клетками-мишенями, необходим для того, чтобы произошло полное взаимодействие (Mescher, 1992). Ключевым участником данного взаимодействия является CD80 и соответствующий ему рецептор CD28. Вспомогательный сигнал, генерируемый взаимодействием B7-CD28, необходим для того, чтобы малые покоящиеся CD8-позитивные лимфоциты дифференцировались в литическое состояние (Mescher, 1992). Интересно, что после дифференцировки CTL этот вторичный сигнал перестает быть необходимым для проявления литических свойств (Hodge et al., 1994).
Долгое время было известно, что CTL являются ключевыми медиаторами противовирусного иммунитета. У человека в случае заражения вирусом иммунодефицита (ВИЧ) долговременное отсутствие симптомов заболевания связывается с высокими уровнями CTL памяти CD8+, специфичными в отношении вирусных белков Gag, Pol и Env, и очень низким числом копий ВИЧ-ДНК и РНК в моноядерных клетках периферической крови (Rinaldo, 1995). Напротив, у больных на поздних стадиях СПИД число CTL памяти (mCTL) резко снижено (Zanussi et al., 1996). Согласованность этих данных указывает на то, что CTL памяти могут быть основным фактором контроля инфекции в организиме-реципиенте и могут играть ключевую роль в формировании иммунитета у неинфицированных лиц (Zanussi et al., 1996). Кроме того, патогенетические связи с ВИЧ-инфекцией отражают вероятную роль CD80 и CD28 в развитии СПИДа.
Также было высказано предположение о том, что CD80 участвует в патогенезе ВИЧ-инфекции (Haffar et al., 1993). В норме Т-клетки экспрессируют CD80, но на невысоком уровне и только после активации (Schwartz, 1992). В модельном анализе ВИЧ-инфекции in vitro в аллостимулированных линиях первичных Т-клеток было показано, что CD28 регулируется негативно, а экспрессия CD80 очевидно усиливается наряду с МНС CII (Haffar et al., 1993). Хотя точные механизмы этих процессов пока не определены, можно предположить существование двух механизмов возможного повреждающего действия. Присутствие CD80 на поверхности вместе с молекулами класса II может обусловливать интенсификацию контактов между инфицированными Т-клетками и неинфицированными CD4-позитивными клетками (Haffar et al., 1993). Хотя такое взаимодействие может приводить к повышению интенсивности обмена между этими Т-клетками, другой функцией может являться повышение CTL-опосредованного распознавания и уничтожения клеток за счет генерирования вторичного сигнала в результате взаимодействия CD80 на поверхности инфицированной клетки с рецептором CD28, экспрессируемым CD8-позитивной Т-клеткой (Haffar et al., 1993). Это может ускорять сокращение популяции лимфоцитов CD4+, что коррелирует с манифестацией заболеваний, связанных со СПИДом (Haffar et al., 1993).
И у мыши, и у человека экспрессия белков семейства В7 рассматривается как важный фактор иммунного распознавания трансформированных клеток (Chen et al., 1992). Хотя экспрессия была установлена в некоторых типах трансформированных клеток, большинство опухолей в норме не экспрессируют CD80 или CD86, что тем самым делает невероятным то, что в случае экспрессии потенциально иммуногенного опухолевого антигена будет иметь место полноценное его распознавание Т-клетками (Chen et al., 1993). Однако эксперименты по трансфекции с использованием молекулы CD80 с целью усиления цитолиза опухолевых клеток оказались успешными (Hodge et al., 1994).
Ретровирусные и основанные на вирусе коровьей оспы векторы, экспрессирующие функциональную молекулу CD80, были использованы для трансфекции злокачественных клеток (Li et al., 1994; Hodge et al., 1994). Эти клетки, экспрессирующие CD80 в дополнение к плохо (в норме) распознаваемым опухолевым антигенам, после этого обратно вносили донору, что, как предполагалось, приведет к возникновению клеточного иммунного ответа в отношении опухолевых антигенов, экспрессируемых на клетках злокачественных опухолей (Townsend & Allison, 1993). Результаты этих экспериментов с различными формами опухолей оказались на удивление высокоэффективными. Во многих случаях организм-реципиент формировал мощный клеточный ответ против злокачественной опухоли, контролируя или уничтожая ее (Hodge et al., 1994). Последующая реинтродукция в организм донора опухолевых клеток, имеющих поверхностную молекулу CD80 или лишенных ее, обусловливает сходные уровни противоопухолевого иммунитета (Hodge et al., 1994). Таким образом, считается, что после установления иммунной памяти молекула CD80 не является необходимой для поддержания ответа или для инициации его в случае реинтродукции (Hodge et al., 1994). Эти эксперименты показали, что молекула CD80 является эффективным медиатором клеточного иммунитета и что в конкретных типах опухолей клеточные ответы могут быть индуцированы по вероятному контролю злокачественных новообразований и предотвращению рецидивов (Hodge et al., 1994).
Усиление экспрессии CD80 может иметь негативные последствия, что выявляется в развитии некоторых форм аутоиммунитета. Считается, что CD80 во взаимодействии с IL-12 является важным на ранних стадиях развития рассеянного склероза и обусловливает стимуляцию Т-клеток и развитие DTH (Windhagen et al., 1995). Экспериментально вызванный аутоиммунный энцефаломиелит (ЕАЕ) может быть отчасти подавлен введением немембранного CTLA-4Ig экспериментальному объекту. Подавление демиелинизации при блокировании взаимодействия CD28/CD80 отражает вероятную роль этого взаимодействия в обострении заболевания (Arima et al., 1996).
Важность молекулы CD80 в развитии эффективного иммунного ответа очевидна. Хотя кДНК, кодирующая этот белок, была выделена у грызунов и приматов, она не была ранее обнаружена в других таксономических группах млекопитающих. Кошка является распространенным домашним животным и потенциальной моделью ретровирусных заболеваний. Клонирование иммунологических факторов у кошек предоставляет важный инструмент ветеринарных исследований, в частности в связи с исследованиями развития и профилактики заболеваний у других видов организмов.
Материалы и методы
Выделение исходного фрагмента
мРНК была экстрагирована из моноядерных клеток периферической крови (РВМС), простимулированных в течение 16 часов Кон-А с использованием реагента для РНК-экстракции RNAzolB (Biotexc, Houston, TX). Исходно кДНК была синтезирована на матрице этой РНК с помощью обратной транскриптазы (ОТ), где в качестве обратного праймера использовали олиготимидин. Вкратце, РНК и олиго-dT нагревали до 75°С в течение 3 минут с целью удаления вторичных структур. Затем добавляли ОТ, dNTP, буфер и дистиллированную воду и полученную смесь инкубировали в течение 1 часа при 42°С. После этой инкубации образец нагревали до 95°С в течение 5 минут с целью инактивации ОТ. Вырожденные праймеры, производные от консенсусных участков в составе опубликованных нуклеотидных последовательностей CD80 человека и мыши (GeneBank, Gaithersburg, MA), использовали затем для исходной амплификации из состава данного гена 344-нуклеотидного фрагмента, кодирующего центральный сегмент в составе константного домена:
прямой праймер В7-2: GGC CCG AGT A(CT)A AGA ACC GGA С
Обратный праймер В7-3: CAG (AT)TT CAG GAT C(CT)T GGG ААА (CT)TG (SEQ ID NO: 56).
Для амплификации данного продукта использовали протокол полимеразной цепной реакции (ПЦР) с "горячим стартом" с Taq-полимеразой. Вначале реакционную смесь без Taq-полимеразы нагревали до 95°С в течение 5 минут (этап "горячего старта") с целью предотвращения образования димеров между праймерами. Полимеразу добавляли перед началом температурного цикла. Затем ПНР-реакцию нагревали до 95°С на 30 секунд с целью диссоциации двухцепочечной ДНК. Затем реакцию охлаждали до 42°С на 30 секунд для обеспечения отжига вырожденных праймеров. Относительно низкая температура отжига облегчала связывание праймеров в случае их не 100%-ной гомологичности с мишенью. Затем реакцию нагревали до 72°С на 45 секунд, что является оптимальной температурой для активности Taq-полимеразы, обеспечивающей достройку (удлинение цепи) праймера и копии противоположной цепи ДНК. Данный температурный цикл повторяли 30 раз. После этих 30 циклов заключительный этап проводили при 72°С в течение 7 минут с целью облегчения достройки любых неполных продуктов. После визуализации в 1%-ном агарозном геле полученный продукт лигировали в течение ночи при 16°С в состав клонирующего вектора ТА (InVitrogen, San Diego, CA) для последующего секвенирования. По 2 мкл лигационной реакции использовали для трансформации компетентных клеток InvαF'. Трансформированных бактерий наносили полосами на пластины LB (50 мкг/мл ампициллина), покрытые 40 мкл раствора 50 мкг/мл X-Gal. На следующий день отбирали колонии белого цвета и инокулировали их в 5 мл куль тураль ной среды LB, содержащей 100 мкг/мл ампициллина, и культивировали в течение ночи при 37°С при вращении со скоростью 225 об/мин.
Минипрепарирование проводили на материале ночных культур с целью выявления клонов, которые несут плазмиду со вставкой в правильной ориентации. Плазмиду экстрагировали из культур с использованием стандартной процедуры щелочного лизиса с последующей очисткой ДНК путем экстракции смесью фенола и хлороформа (Maniatis et al., 1982). ДНК осаждали 2 объемами этанола и затем расщепляли рестриктазой EcoRI. Результаты этого расщепления визуализовали в 1%-ном агарозном геле с целью идентификации колоний, несущих плазмиду, включающую вставку в правильной ориентации. Затем такую плазмиду очищали из позитивных клонов и секвенировали с использованием реактивов для секвенирования методом терминации цепи с 35S-мечением по Сэйнджеру (Sequenase®, US Biochemicals, Cleveland, ОН) или методом циклического секвенирования с концевой флуоресцентной меткой (Perkin Elmer, Norwalk, CT). По данным нуклеотидной последовательности кДНК специфичные обратные и прямые праймеры были сконструированы для использования в методе "быстрой амплификации концов кДНК" (5'-RACE) и для выделения 3'-последовательности в сочетании с вырожденными праймерами из состава 3'-нетранслируемого сегмента (UTR).
Выделение 5'-сегмента
Амплификационный протокол кДНК Marathon (Clontech, Palo Alto, CA) использовали для получения 5'-последовательности данного гена. мРНК была выделена из РВМС, простимулированных в течение 12 часов Кон-А и одновременно в течение 4 часов - липополисахаридом. мРНК экстрагировали с использованием реагента для экстракции РНК ULTRASPEC (Biotexc, Houston, TX). кДНК получили с использованием "якорного праймера" олиго-dT с вырожденными нуклеотидами по 5'-концу для облегчения связывания этого праймера с дальним 5'-концом полиаденилового "хвоста". Затем кДНК транскрибировали в соответствии с описанным выше. Специфичные линкеры лигировали на эту кДНК с использованием ДНК-лигазы фага Т4. ПЦР "вниз от точки лигирования" осуществляли на матрице кДНК с использованием внутреннего обратного праймера, специфичного в отношении исходно амплифицированного участка:
В7-284: ТТА ТАС TAG GGA CAG GGA AG (SEQ ID NO: 58)
В7-190: AGG CTT TGG AAA ACC TCC AG (SEQ ID NO: 59), -
и якорного праймера, комплементарного лигированной линкерной последовательности. Параметры ПЦР "вниз от точки" с химерной полимеразой KlenTaq (Clontech, Palo Alto, CA) были такими: 5 минут при 95°С - 1 цикл; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 72°С и 45 секунд при 68°С - 5 циклов; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 65°С и 45 секунд при 68°С - 5 циклов; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 60°С и 45 секунд при 68°С - 25 циклов. 1 мкл данной реакции разбавляли в 50 мкл воды и 5 мкл полученного разведения затем использовали для "гнездовой" ПЦР (5 минут при 95°С - 1 цикл; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 65°С и 45 секунд при 68°С - 30 циклов, с полимеразой KlenTaq) с линкер-специфичным якорным праймером и ген-специфичным обратным праймером, расположенным с 5'-стороны по отношению к исходному праймеру.
В7-20: TTG ТТА TCG GTG ACG ТСА GTG (SEQ ID NO: 60)
В7-135: САА ТАА CAT CAC CGA AGT CAG G (SEQ ID NO: 61).
По 20 мкл каждой реакции визуализовали в 1,5%-ном агарозном геле, и точный по размеру фрагмент вырезали из геля. кДНК экстрагировали и очищали из агарозы путем центрифугирования среза геля через распылитель геля и фильтр Micropure с порами 0,22 мкм (Amicon, Beverly, MA). Затем очищенную ДНК напрямую секвенировали с использованием секвенирования с концевой флуоресцентной меткой (Perkin Elmer, Norwalk, CN).
Выделение 3'-сегмента
3'-Сегмент данного гена выделяли путем отбора пяти генспецифичных праймеров по последовательности 344-нуклеотидного фрагмента ранее и секвенированного 5'-участка:
B7-s220: GTC ATG TCT GGC ААА GTA САА G (SEQ ID NO: 62)
В7-50: CAC TGA CGT CAC CGA ТАА ССА С (SEQ ID NO: 63)
В7-140: CTG ACT TCG GTG ATG TTA TTG G (SEQ ID NO: 64)
B7-550: GCC ATC AAC АСА АСА GTT TCC (SEQ ID NO: 65)
B7-620: TAT GAC AAA CAA CCA TAG CTT С (SEQ ID NO: 66).
Затем вырожденные обратные праймеры подбирали по консенсусным участкам 3'-UTR гена CD80 человека и мыши:
В7-1281: G(A/G)A AGA (A/T)TG CCT CAT GA(G/T) CC (SEQ ID NO: 67)
B7-1260: CA(C/T) (A/G)AT CCA АСА TAG GG (SEQ ID NO: 68).
кДНК были получены на материале РНК, экстрагированных с помощью ULTRASPEC (Biotexc, Houston, TX), выделенных из РВМС, простимулированных Кон-А и ЛПС в соответствии с описанным выше. Якорный праймер олиго-dT использовали в качестве исходного обратного праймера для транскрипции РНК в кДНК. ПЦР с полимеразой Taq проводили на матрице полученной кДНК с использованием специфичных прямых праймеров вырожденных обратных праймеров (5 минут при 95°С 1 цикл; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 42°С и 45 секунд при 72°С - 30 циклов; 72°С в течение 7 минут). Два раунда "гнездовых" ПЦР-реакций были необходимы для того, чтобы получить единственный фрагмент правильного размера. Полученный продукт вырезали из 1,5%-го агарозного геля, очищали в соответствии с описанным выше и секвенировали методом секвенирования с концевой флуоресцентной меткой (Perkin Elmer, Norwalk, CN).
По данным секвенирования 5'- и 3'-сегментов конструировали праймеры, которые бы позволили амплифицировать участок, кодирующий полноразмерную открытую рамку гена CD80 кошки:
B7-START: ATG GGT САС GCA GCA AAG TGG (SEQ ID NO: 69)
В7-960: ССТ AGT AGA GAA GAG СТА AAG AGG С (SEQ ID NO: 12).
Была использована ранее полученная на материале РВМС кДНК, для которой известно наличие в ней ДНК, кодирующей искомый ген. В этой реакции ПЦР (5 минут при 95°С - 1 цикл; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 42°С и 45 секунд при 72°С - 30 циклов; 72°С в течение 7 минут) использовали химерную полимеразу KlenTaq - этот "сборный" фермент сохраняет некоторую 5'-экзонуклеазную активность, что позволяет снизить частоту случайных ошибок, часто происходящих при проведении ПЦР с полимеразой Taq. В реакции амплифицировали 960-нуклеотидный фрагмент, который клонировали в состав клонирующего вектора ТА (InVitrogen, San Diego, CA) и секвенировали в соответствии с ранее описанным. В окончательной последовательности искомого гена были учтены кДНК от двух разных животных. Каждый нуклеотид в последовательности этого гена независимо проверяли по крайней мере по трем разным последовательностям, полученным в отдельных ПЦР-реакциях, с целью снижения вероятности неточностей, происходящих от ошибок, индуцируемых самой ПЦР.
Результаты
РНК, экстрагированную из тканей экспериментальной кошки НК5, использовали для исходных попыток амплифицировать ген CD80, однако эта кошка после этого была умерщвлена и последующие продукты брали от других животных. В исходной амплификации РНК клеток РВМС кошки НК5, про стимулированных Кон-А, получили 344-нуклеотидный продукт, проявлявший 70%-ный уровень идентичности с геном CD80 человека. Праймеры были специфичны в отношении участка в центре кодирующей последовательности, соответствующего константному иммуноглобулиноподобному домену. Хотя в этих исходных экспериментах использовали дополнительные вырожденные праймеры с целью амплификации участков, которые бы кодировали более значительный сегмент пептида, только при сочетании праймеров В7-2 (прямой) и В7-3 (обратный) получили продукт подходящего размера. Последующие эксперименты, в которых эти дополнительные вырожденные праймеры использовали наряду с ген-специфичными праймерами, оказались безуспешными. Следовательно, и 5'-, и 3'-участки должны быть выделены с применением иных методов.
Группу из шести новых ген-специфичных праймеров сформировали на материале данных секвенирования, проведенного на исходном продукте (прямые: В7-20, В7-135, В7-284, В7-190; обратные: В7-140, В7-50). Исходно обратные праймеры использовали в ПЦР-методе 5'-RACE, который в определенной степени сходен с методом, применявшимся для успешной амплификации 5'-сегмента молекулы CD28. Однако при использовании этого метода продукты не были получены.
В амплификационной системе для кДНК Marathon RACE (Clontech, Palo Alto, CA) успешно амплифицировали участок, который соответствует 5'-кодирующей последовательности. РНК, производная от клеток ЕК6, простимулированных Кон-А, была успешно амплифицирована с помощью данного протокола. Исходную амплификацию осуществили с праймерами В7-284 и В7-3 и якорным праймером AP1. В этой реакции не было получено отчетливого единого бэнда, поэтому с использованием этого продукта в качестве матрицы провели "гнездовые" реакции с использованием праймеров В7-20 и В7-135 как "гнездовых" (т.е. внутренних по отношению к предыдущим праймерам) обратных праймеров и якорного праймера AP1 в качестве прямого праймера. Продукт подходящей длины получили в каждой из этих реакций.
Данные, полученные при прямом секвенировании продуктов реакции RACE, позволили добиться полной идентичности на участках длиной 20 и 135 п.н., соответственно, которые перекрывались с исходным секвенированным продуктом длиной 344 п.н. Продукты удлиняли от известного 5'-участка через старт-кодон ATG гена кошки в сторону 5'-нетранслируемого сегмента. Идентичность 5'-кодирующей последовательности, производной от этих продуктов, и 5'-участка гена CD80 человека была меньшей, чем идентичность, определяемая между 344-нуклеотидным сегментом гена кошки и аналогичным участком гена человека. Было установлено, что сходная утрата гомологии обнаруживается между последовательностями человека и мыши по тем же самым сегментам. Сравнение данных по последовательностям участков за пределами кодирующего сегмента показало дальнейшее отчетливое снижение уровня консерватизма (данные не включены).
Новую группу вырожденных праймеров, кодирующих 3'-нетранслируемый участок, синтезировали по параметрам консенсусных участков в пределах 3'-UTR последовательностей человека и мыши. С помощью этих праймеров успешно амплифицировали кДНК, транскрибируемую с РНК, выделенной из РВМС, простимулированных Кон-А, взятых от кошки ED3. В отличие от исходной амплификации для получения конечного продукта необходимо было провести серию "гнездовых" реакций. В первичных реакциях ПЦР, в которых использовались эти вырожденные праймеры и якорные праймеры из пределов 344-нуклеотидной последовательности и 5'-сегмента, не удалось исходно получить отчетливые идентифицируемые бэнды. Однако "гнездовые" реакции при использовании разбавленного первичного продукта и дополнительных специфичных 5'-праймеров позволили получить продукт, который кодирует оставшийся 3'-участок.
После секвенирования 3'-продукта было установлено, что за пределами константного Ig-подобного домена уровень идентичности вновь снижался. Дистальный конец кодирующей последовательности указал на очень низкий уровень идентичности, который еще более снижался после стоп-кодона.
На материале 3'-последовательности сконструировали обратный праймер, выходивший за пределы кодирующей последовательности, начиная с 960-го нуклеотида. С этой конструкцией в сочетании с праймером, покрывающим старт-кодон, амплифицировали продукт ожидаемого размера. Секвенирование конечного продукта показало, что все ранее установленные участки действительно перекрываются, и полученный фрагмент представляет собой непрерывную и полную нуклеотидную последовательность гена CD80 кошки.
Для амплификации конечного продукта образцы амплифицировали на материале РНК, выделенной из РВМС, простимулированных Кон-А, взятых у животных ED3 и ЕК6. По крайней мере два продукта от каждого животного секвенировали полностью, а каждый из нуклеотидных сайтов был проверен и подтвержден по крайней мере по трем правильно считанным последовательностям. Продукт, полученный от животного ЕК6, затем клонировали в состав клонирующего вектора ТА для последующего манипулирования и в качестве эталона.
Фрагмент длиной 960 нуклеотидов включает старт-кодон по 1-му положению, стоп-кодон по положению 888 и дополнительно 72 нуклеотида 3'-нетранслируемого участка. Среди продуктов, которые получили и секвенировали в ходе установления полноразмерного фрагмента, были секвенированы дополнительные 5'- и 3'-участки (данные не показаны). Секвенирование участка, расположенного выше старт-кодона, на материале продуктов 5'-RACE, показало, что кодон ATG, определенный в положениях 1-3, является первым кодирующим сайтом (метионин) в рамке считывания и занимает аналогичное положение в последовательностях мыши и человека. Стоп-кодон, находящийся в положении 888, также, как подтверждается, находится в сходном положении в ранее секвенированных генах. Сопоставление последовательностей продемонстрировало уровни идентичности 77% и 62% с опубликованными нуклеотидными последовательностями генов CD80 человека и мыши соответственно. Уровень гомологии с последовательностями других приматов и грызунов сравним с уровнями, установленными для человека и мыши, соответственно. У каждого из видов уровень идентичности с геном CD86 был менее 25%.
С использованием компьютерного пакета программ для анализа ДНК MacVector (IBI, Rochester, NY) нуклеотидную последовательность "транслировали" в аминокислотную последовательность. В результате такой расшифровки определили 292-аминокислотный пептид, сходный по размеру с белками и мыши, и человека, хотя и не идентичный им. Сигнальный сегмент, как предполагается, охватывает первые 25 аминокислот. Внеклеточный домен данной молекулы составлен 115 аминокислотами домена, сходного с вариабельным иммуноглобулиновым доменом (до 139-го остатка), и 110 аминокислотами домена, сходного с константным иммуноглобулиновым доменом (примерно до 240-го остатка). Трансмембранный домен, который составлен остатками 241-271, переходит в короткий цитоплазматический "хвост", состоящий из 21 аминокислоты. Как и в молекуле человека, полипептид кошки включает 8 потенциальных сайтов N-гликозилирования, хотя их расположение не идентично. Уровень гомологии между белками кошки, человека и мыши существенно меньше, чем уровень идентичности соответствующих нуклеотидных последовательностей (табл.1).
Таблица 1 Сравнение уровней гомологии последовательностей CD80 кошки, мыши и человека |
||
Вид | Процент гомологии с последовательностью кошки | |
Нуклеотидная | Аминокислотная | |
Человек | 77% | 59% |
Мышь | 62% | 46% |
Сопоставление предполагаемой аминокислотной последовательности CD80 кошки с предполагаемой последовательностью человека указывает на то, что большая часть гомологичности этих двух молекул сосредоточена в константном домене (аминокислоты 140-240). Имеется незначительная гомология между этими пептидами по сигнальному сегменту и она отсутствует за пределами IgV-подобного домена. Как уже говорилось, консерватизм существен в последовательности константного домена, однако эта идентичность почти не выходит за его пределы, и очень низкий уровень гомологии обнаруживается по трансмембранному домену и цитоплазматическому "хвосту" пептида кошки и аналогичных участков в молекуле человека.
Сопоставление генов CD80 кошки, человека и мыши с генами CD86 мыши и человека показывает, что, хотя имеется весьма ограниченный уровень гомологии между этими двумя членами семейства В7, аминокислоты, которые рассматриваются как диагностические для генов семейства В7, сохраняются и в составе белка кошки. Эти молекулы включают остатки, которые предположительно участвуют в пространственной укладке ("фолдинге") и составляют сайт связывания.
Хотя уровень гомологии между последовательностями CD80 человека и кошки не столь велик, как уровень идентичности между молекулами CD28, сравнение полученных графиков гидрофобности показывает, что, хотя и имеется ряд замен аминокислот в конкретной аминокислотной последовательности, эти изменения часто являются гомологичными и по-видимому не изменяют поверхностных характеристик данного пептида.
Обсуждение
Уровни идентичности нуклеотидных последовательностей кошки и человека, а также кошки и мыши CD80 средние, хотя уровень такой гомологии не переносится на пептид. Предполагается, что, хотя генетический код и является вырожденным, в некоторых молекулах (например, в CD28) различия между нуклеотидными последовательностями в существенной степени не изменяют пептид, в случае же CD80 консерватизм аминокислотной последовательности в целом не столь критичен, а следовательно, изменения по длине этой молекулы в ходе эволюции "более допустимы".
Хотя в целом нуклеотидные последовательности весьма проявляют средний уровень идентичности, имеются определенные трудности в выделении полноразмерной последовательности. Исходный продукт CD80 был получен по константному домену этой молекулы - т.е. тому участку, который проявляет наивысший уровень консерватизма в последовательности кДНК данного вида. Праймеры, которые маркируют этот участок и позволяют эффективно амплифицировать продукт, получили простым образом, в результате чего 344-нуклеотидный фрагмент охватил наиболее консервативный участок IgC-сходства. К сожалению, из-за отсутствия гомологии в последовательностях сигнального сегмента, цитоплазматического домена и 3'-UTR для выделения последовательностей этих участков нужно приложить больше усилий. Наличие данных по секвенированию центрального участка белка, однако, позволяет определить отправную точку, от которой могут быть определены другие участки этой молекулы. CD80 кошки является отличным примером того, как путем получения короткого фрагмента искомой молекулы и применяя методы RACE и вырожденные праймеры в сочетании с якорными праймерами, соответствующими установленному сегменту, может быть достаточно легко получена полноразмерная последовательность этой молекулы.
Сравнение предполагаемой аминокислотной последовательности этих клонированных молекул CD80 показывает отсутствие общей гомологии. Полипептиды мыши и человека проявляли менее чем 50%-ный уровень гомологии по аминокислотным последовательностям. Это сопоставимо с 59%-ным уровнем идентичности при сравнении белков кошки и человека и 46%-ной идентичности полипептидов кошки и мыши, что возможно отражает эволюционное родство этих видов. Сравнение предсказываемых профилей гидрофильности аминокислот кошки и человека, которые позволяют определить те остатки, которые были затронуты или перемещены из-за их относительной гидрофильности, показало, что, хотя на уровне аминокислотной последовательности конкретные аминокислоты могли и не сохраниться, эти изменения по-видимому носили относительно консервативный характер. Это указывает на вероятное сохранение признака гидрофильности/гидрофобности данной молекулы, что, значит, может соответствовать сходному по структуре в целом полипептиду. Для поверхностно-клеточного белка, очевидно, характерно наличие конкретных аминокислот, которые непосредственно вовлечены в процесс связывания, а также других аминокислот, которые нужны только для того, чтобы поддерживать структуру, необходимую для обеспечения взаимодействия с сайтом связывания.
Хотя имеются несовпадения аминокислотных остатков в молекулах CD80 у примата, грызуна и кошки, тем не менее сохраняются признаки IgSF. Молекула CD80 кошки включает концевые IgC-подобный домен и IgV-подобный домен, расположенные проксимально по отношению к участку, ассоциированному с мембраной. Как и в случае с уровнем консерватизма при сравнении CD80 мыши и кошки, уровень идентичности константных участков выше, чем при сравнении вариабельных участков (Freeman et al., 1989). В целом консерватизм вариабельного домена превышает 50%, в то время как этот показатель для константного сегмента превышает 70%, при том что короткий участок аминокислот 164-198 (тот самый участок, по которому был выделен исходный 344-нуклеотидный фрагмент) характеризуется наибольшим уровнем идентичности. Этот центральный 56-аминокислотный участок (остатки 165-221) в составе константного домена проявляет 87%-ный уровень гомологии между последовательностями человека и кошки, при том что на 28-нуклеотидном участке (остатки 171-198) имеется только одно различие. Также этот участок кошачьей последовательности проявляет существенный уровень гомологии по сравнению с соответствующими остатками полипептида мыши. Гидрофильная природа аминокислот на этом участке указывает на высокую степень вероятности экспрессии на поверхности клеток, а с учетом определенного уровня консерватизма между видами - на вероятное участие во взаимодействиях "лиганд-рецептор". Было предположено, что IgC-часть данной молекулы напрямую вовлечена в презентирование связывающего домена к связыванию на рецепторе (Peach et al., 1995). Однако экспериментальным образом установили, что для осуществления эффективного связывания необходимы и константный, и вариабельный домены (Peach et al., 1995). Концентрация гомологичных остатков в IgC-участке внеклеточных доменов, наряду с высоким уровнем дивергенции трансмембранного и цитоплазматического доменов, рассматривается как дополнительное доказательство роли CD80 как лиганда в большей степени, нежели фактора, способного вырабатывать сигнал.
Как и у человека, и у мыши, CD80 кошки характеризуется высоким уровнем гликозилирования. Углеводные остатки, как считается, не участвуют напрямую в связывании, однако могут способствовать повышению растворимости внеклеточного сегмента этой молекулы (Peach et al., 1995). Из восьми потенциальных сайтов гликозилирования, обнаруживаемых в последовательности пептида человека, семь распложены в положениях, идентичных таковым в белке кошки. Сайт, расположенный в 39-м положении аминокислотной последовательности кошки, не воспроизведен в молекуле CD80 человека, в то время как имеется сайт в 232-м положении, отсутствующий в последовательности кошки (Freedman et al., 1987). В молекуле мыши имеется семь сайтов гликозилирования, только два из которых находятся в идентичных положениях, хотя в принципе они расположены в тех же участках молекулы, что и в молекулах кошки и человека (Freeman et al., 1989). Сходство в числе и положении сайтов гликозилирования, как можно считать, отражает важность соответствующих мотивов для функционирования данной молекулы.
Имеется широкий круг возможных способов применения молекулы CD80 кошки. В соответствии с обсуждавшимся выше, эта молекула является ключевым элементом обеспечения точности в развитии ответа зрелых Т-клеток. Контроль экспрессии данного гена и на уровне РНК, и на уровне белка должен помочь установить пути, по которым иммунная система кошки взаимодействует с инфекцией. Выяснение того, как эта система воздействует на конкретные патогены, с учетом данных, получаемых при исследованиях других модельных систем, прольет дополнительный свет на параметры иммунной системы человека. Кроме того, вклад в изучение возможностей манипуляции иммунной системой кошки, являющейся одним из наиболее распространенных видов домашних животных, придаст ветеринарии новые импульсы.
Важным перспективным применением, предполагаемым для молекулы CD80 у других видов, является индукция опухольспецифичного иммунитета путем внесения гена CD80 в трансформированные клетки с последующей реинтродукцией донору с целью индукции противоопухолевого иммунитета, опосредуемого лимфоцитами CTL (Townsend & Allison, 1993). Как обсуждалось выше, считается, что результатом поверхностной экспрессии CD80 опухолевыми клетками является специфический CTL-ответ, направленный на злокачественную опухоль (Hodge et al., 1994). Кроме того, у организма-хозяина образуется популяция клеток памяти, происходящая от CD8-позитивных Т-клеток (Hodge et al., 1994). Хотя данный подход в целом направлен на противоопухолевый иммунитет, по аналогии его также можно распространить на развитие противовирусного иммунитета.
Как обсуждалось выше, долговременное латентное состояние синдрома приобретенного иммунодефицита рассматривается как следствие исходного формирования мощного CTL-опосредованного иммунного ответа на БИЧ-инфекцию (Landay et al., 1994). Предполагается, что те больные, кто в течение долгого времени не проявляет симптомов СПИДа после заражения им, способны формировать и поддерживать сильный CTL-клеточный иммунитет, направленный против ВИЧ.
Хотя большинство современных вакцин направлено на формирование гуморального иммунного ответа, однако если вакцина способна индуцировать развитие популяции mCTL, направленной на вирусы ВИЧ и FIV, то эта популяция должна обеспечивать защиту, сходную с таковой, которая характерна для долговременного бессимптомного СПИДа. Введение новым индивидуумам "генной" вакцины, в составе которой белки FIV объединены с белком CD80, должно приводить к поверхностной экспрессии костимуляторной молекулы в сочетании с презентацией вирусных эпитопов FIV, обеспечиваемой молекулами МНС CI. В случае успеха это должно привести к пролиферации популяции FIV-специфичных лимфоцитов mCTL. После последующего воздействия вирулентного вируса у вакцинированных индивидуумов будет происходить индукция ответа на клетки, которые были инфицированы данным вирусом, уничтожая их до того, как этот вирус будет способен размножаться и начнет разрушать компоненты иммунной системы.
Пример 6
Клонирование и секвенирование кДНК CD28 кошки
Введение
CD28 является поверхностно-клеточным гликопротеином, который в норме экспрессирован в виде гомодимера, составленного идентичными субъединицами с молекулярной массой 44 кДа, соединенными дисульфидными связями. Он входит иммуноглобулиновое суперсемейство и характеризуется наличием единственного внеклеточного вариабельного (V) участка, трансмембранного домена и короткого цитоплазматического "хвоста" (Aruffo & Seed, 1987). Хотя эта молекула гликозилирована, углеводные составляющие по-видимому не участвуют в связывании и предположительно обеспечивают повышение растворимости внеклеточного домена (Peach et al., 1994). кДНК, кодирующая пептиды человека, крысы, мыши и кролика и аналогичная молекула курицы были ранее клонированы и секвенированы (Linsley et al., 1995a).
CD28 обнаруживается в большинстве тимоцитов CD4+/CD8+ и периферических Т-клеток CD4+/CD8+ и характеризуется усилением экспрессии в ответ на стимуляцию αντl-ХΔ3, ФГА и ФМА и подавлением ее в результате связывания с антителом к CD28 (Linsley et al., 1993b). Вскоре после открытия этого белка выяснилось, что CD28 играет важную роль в регуляции активации Т-клеток CD4+/CD8+ (June et al., 1990). В дополнение к стимулированию активации и пролиферации Т-клеток также было установлено, что формирование такого вторичного сигнала индуцирует цитолитическую активность CTL (Azuma et al., 1993 с).
CD28 экспрессируется на ранних этапах созревания Т-клеток. В то время как незрелые СD3-негативные клетки негативны и по CD28, промежуточные клетки CD4+/CD8+ экспрессируют этот белок на низком уровне, а зрелые CD3-позитивные тимоциты CD4+/CD8+ экспрессируют CD28 на высоком уровне (Turka et al., 1991). У человека после созревания данный рецептор обнаруживается почти во всех Т-клетках CD4+ и более чем у половины Т-клеток CD8+ (Turka et al., 1991), а также почти у всех Т-лимфоцитов мышей (June et al., 1990). После активации Т-клеток поверхностная экспрессия усиливается, в то время как связывание данной молекулы с соответствующим ей лигандом или специфичными моноклональными антителами обусловливает в активированных клетках негативную регуляцию данного гена. и на транскрипционном, и на трансляционном уровнях (Linsley et al., 1993a). Хотя CD28 обнаруживается в основном на лимфоцитах Т-клеточных популяций, этот белок, как сообщалось, выявляется в плазмацитомах костномозговых биопсийных проб (Kozber et al., 1987) и экспрессируется в культурах линии лейкозных клеток, сходных с натуральными клетками-киллерами (Azuma et al., 1992).
CD28 проявляет определенную степень структурной гомологии с другим В7-рецептором - CTLA-4: они оба относятся к подсемейству в группе белков IgSF (Linsley et al., 1995a). Эти две молекулы включают внеклеточный IgV-домен, единственный трансмембранный домен и короткий цитоплазматический сигнальный домен (Aruffo et al., 1987). Хотя суммарный уровень гомологии между этими двумя молекулами составляет только 31%, имеются два коротких участка и специфичные остатки, которые полностью инвариантны у этих двух молекул: это отражает вероятную важную роль данных мотивов в распознавании лигандов В7 и поддержании структурной целостности (Leung & Linsley, 1994). Гексапептидный мотив MYPPPY сохраняется у всех выделенных членов семейства рецепторов CD28/CTLA-4 (Peach et al., 1994). Он картируется в СD3-подобный выпетленный участок данных молекул; в случае его мутирования происходит снижение авидности по связыванию и у CD28, и у CTLA-4 (Peach et al., 1994). Этот участок, как предполагалось, служит потенциальным сайтом связывания лигандов в составе обоих белков - CD28 и CTLA-4, однако неизвестно, является ли этот участок прямым сайтом связывания лиганда В7 или же он представляет структурные мотивы, косвенным образом вовлеченные в связывание (Peach et al., 1994). Несмотря на консерватизм остатков в последовательностях CD28 и CTLA-4, CTLA-4 связывает CD80 и CD86 с более высокой авидностью, чем CD28 (Ellis et al., 1996). Таким образом, хотя в активированных Т-клетках in vitro CTLA-4 экспрессирован на уровне лишь 2-3% от такового у CD28, он связывает лиганды с большей в 20 раз авидностью (Linsley et al., 1995b).
Хотя молекулы CTLA-4 и CD28 эволюционно родственны и имеют общие лиганды, тем не менее их функции и сигнальные способности по-видимому дифференцированы (Balazano et al., 1992). Сравнение сигнальных участков в составе каждой из этих молекул не отражает существенный уровень идентичности: следовательно, эти молекулы инициируют разные сигнальные механизмы (Hutchcroft & Bierer, 1996).
В то время как CD28 экспрессирован в покоящихся Т-клетках и позитивно регулируется в начале ответа на активацию, экспрессия CTLA-4 достигает пика через 48 часов после активации и возвращается на исходный уровень через 96 часов после активации (Linsley et al., 1992a). Экспрессия CTLA-4, как предполагается, согласуется с негативной регуляцией CD28 (Lindsten et al., 1993). Кроме того, сигнальные механизмы, опосредуемые связыванием лигандов рецептором CD28 по-видимому играют важную роль в интенсификации экспрессии CTLA-4 (Linsley et al., 1993а). Т-клетки, которые негативны по CD28, не экспрессируют CTLA-4 в ответ на стимуляцию ФМА или источником ионов кальция (Lindsten et al., 1993).
Полная последовательность событий в опосредуемом CD28 сигнальном пути пока не определена, хотя имеется гипотеза о составе этого каскада процессов (Hutchcroft & Bierer, 1996).
Было высказано предположение о том, что сигнальный механизм CD28 вовлекает мобилизацию внутриклеточного кальция, метаболизм фосфатидилинозитола и индукцию фосфорилирования белков по остаткам тирозина (Hutchcroft & Bierer, 1996).
Цитоплазматический "хвост" молекулы CD28 включает определенные мотивы, для которых предполагается участие во внутриклеточных сигнальных процессах после связывания лигандов CD80 или CD86 (June et al., 1994). Состоящий из 41 аминокислоты внутрицитоплазматический участок не обладает выявляемой каталитической активностью, так как не включает внутриклеточных мотивов "тирозиновой активации" (как в последовательности TCR) или остатков цистеина, необходимых для связывания цитоплазматических тирозинкиназ семейства Src (June et al., 1994). Однако некоторые из сайтов потенциального гликозилирования в составе выделенных последовательностей консервативны (Hutchcroft & Bierer, 1996). Внутриклеточная каталитическая, активность и межбелковые взаимодействия часто регулируются по пути дифференцированного фосфорилирования белков, хотя ферменты, которые бы обеспечивали такую активность рецептора CD28, пока не определены (Lu et al., 1992). Консенсусный мотив YMXM, имеющийся в составе цитоплазматического домена, является предполагаемым сайтом Src-гомологии фосфотирозинового связывания (домен SH2), определяющего в свою очередь связывание фосфатидилинозитол-3-киназы (киназы PI3) (Prasad et al., 1995). Хотя это является лишь одним из возможных сигнальных механизмов для участия CD28, было показано, что активность киназы PI3 не коррелирует с активностью IL-2; но так как увеличение выработки IL-2 является первичным следствием сигнальной активности CD28, то представляется, что другие механизмы влияют на активность, обусловливаемую внутриклеточными сигнальными процессами (June et al., 1994).
Хотя значение этих процессов пока полностью не расшифровано, костимуляция CD28 приводит к усилению выработки цитокинов Т-клетками. В CD28-позитивных Т-клетках, активированных действием антител к CD3 или ФГА, анти-CD28 обусловливает превышение исходного уровня РНК ряда цитокинов, включая IL-1, IL-2, IL-3, IL-4, фактор некроза опухолей (TNFα), лимфотоксин, γ-интерферон и колониестимулирующий фактор гранулоцитов-моноцитов (GM-CSF), равно как и рецептор интерлейкина-2 (Lenschow et а1., 1996). Повышение исходного содержания мРНК обусловливается и повышением уровня транскриптов, и интенсификацией самой транскрипции (Hutchcroft & Bierer, 1996).
Хотя костимуляция CD28 впервые была описана в клонах CD4-позитивных Т-клеток (Martin et al., 1986), сейчас известно, что CD28 участвует в активации многих типов клеток. Костимуляция этого механизма, как было показано, регулирует в субпопуляциях "наивных" Т-клеток CD4+ выработку γ-интерферона, цитокинов Th1-ответа и выработку IL-4, являющегося цитокином Тh2-ответа (Seder et al., 1994). Костимуляторный механизм с участием CD28 также важен для активации CTL CD8+, хотя по-видимому он не является необходимым для эффекторной фазы уничтожения клеток с участием CTL (Hodge et al., 1994). Интересно, что CD28 также предположительно играет роль в процессах ВИЧ-инфекции. В культивируемых лимфоцитах, происходящих от некоторых пациентов с позитивной реакцией на СПИД, связывание CD28 с моноклональным антителом может усиливать размножение вируса ВИЧ (Asjo et al., 1993).
У приматов и грызунов вторичный сигнал, образуемый в результате связывания CD80 с CD28, отчетливо указывает на его роль в исходной активации Т-клеток (Aruffo & Seed, 1987). Недавно полученные данные, однако, позволяют предположить, что основное следствие такого взаимодействия может быть направлено на обеспечение пролиферации за счет подавления апоптоза (Lenschow et al., 1996). Покоящиеся Т-клетки, находящиеся в G0-фазе роста, могут активироваться путем образования комплекса TCR, однако они не способны пролиферировать или секретировать IL-2 в отсутствие связывания CD28: такой эффект называют анергией (Linsley et al., 1991a). Зрелые Т-клетки могут активироваться исключительно по связыванию TCR с молекулами МНС на поверхности клеток АРС, однако это в конечном счете приводит к активации индуцированной клеточной гибели, т.е. к апоптозу (Radvanyi et al., 1996). Хотя другие вторичные взаимодействия (например, костимуляция ICAM-1) могут формировать вспомогательные сигналы к пролиферации, предполагается, что CD28-опосредованная костимуляция является уникальным механизмом), предотвращающим последующее наступление клональной анергии и апоптоза (Linsley et al., 1993a). Было показано, что CD28 может участвовать в регуляции генов, для которых известна вовлеченность в защиту Т-лимфоцитов от апоптоза (Boise et al., 1995). Постоянное усиление экспрессии было выявлено в Т-клетках, костимулированных связыванием на рецепторе CD28 (Boise et al., 1995). Считается, что костимуляция CD28 может стабилизировать мРНК , с которой транслируется белок, предотвращающий апоптоз (Radvanyi et al., 1996).
Связывание на CD28, как было показано, способствует усилению выработки различных цитокинов Т-хелперами в ответах и 1-го, и 2-го типов (Lenschow et al., 1996). Также предполагается, что это взаимодействие участвует в формировании конкретных типов Т-хелперов. "Наивные" CD4-позитивные Т-лимфоциты должны в норме формировать фенотип Th1, если они активировались в отсутствие сигнального пути, опосредованного связыванием CD28/CD80 (Lenschow et al., 1996). Это может иметь косвенное значение в выработке IL-4, индуцированной добавлением экзогенного IL-2, в то время как роль сигналов CD28 в выработке IL-2 ранее уже была подтверждена (Seder et al., 1994). Проведенные исследования на мышах, "выключенных" по гену CD28, дополнительно подтвердили роль этого рецептора в дифференцировке клеток Th2.
Мыши, являющиеся гомозиготными нулевыми мутантными по CD28, были получены Шахиняном с соавторами с целью установления того, как животное адаптируется к инфекции в отсутствие вторичного сигнала, генерируемого CD28 (Shahinian et al., 1993). Этот ген был разрушен в эмбриональных стволовых клетках путем частичного замещения второго экзона геном резистентности к неомицину (Shahinian et al., 1993). Было показано, что мыши, гомозиготные по "выключенному" гену, не экспрессируют CD28 на своих Т-клетках, в то время как гетерозиготные особи CD28 (-/+), как было установлено, характеризуются сниженной поверхностной экспрессией этого рецептора (Shahinian et al., 1993). Стимуляция митогеном Т-клеток, производных от гомозиготных "выключенных" по CD28 мышей, ослабляет пролиферацию Т-клеток и выработку цитокинов, что может быть лишь частично восстановлено действием экзогенного IL-2 (Shahinian et al., 1993). Было показано, что высокоочищенные Т-клетки не активируются пектинами в отсутствие клеток АРС (Unanue, 1984). На материале названной "выключенной" линии было показано, что взаимодействие CD28/CD80 необходимо для проявления митогенной активности Т-клеточных лектинов (Shahinian et al., 1993). Также было обнаружено, что данное взаимодействие является важным для опосредования переключения изотипов В-клеток в ответ на действие антигена (Shahinian et al., 1993). В отличие от "выключенных" по CD80 мышей, функциональная роль CD28 может быть установлена с применением генно-инженерной технологии "выключения генов". О мышах, "выключенных" по гену CTLA-4, пока не сообщалось, однако мыши, сверхэкспрессирующие CTLA-4 1g, уже были исследованы (Lane et al., 1994). Как и следовало ожидать, фенотипические характеристики этой линии мышей сходны с признаками линий, дефицитных по CD28 (Lane et al., 1994). Хотя изолированные Т-клетки вырабатывают нормальное количество γ-интерферона, после стимуляции выявляется существенно меньшее количество IL-4 (Ronchese et al., 1994). Это приводит к неспособности В-клеток инициировать или поддерживать точный гуморальный иммунный ответ (Ronschese et al., 1994). Хотя известны различные предполагаемые пути дифференцировки Th1 и Th2, взаимодействие CD28/B7 отчетливо влияет на дифференцировку подгрупп Т-лимфоцитов.
Стабилизация мРНК интерлейкина-2 может играть ключевую роль в связывании на CD28, однако некоторые другие цитокины, как было показано, напрямую или опосредованно влияют на это взаимодействие (Linsley et al., 1991а). Медиаторы воспаления IL-1α, IL-6 и TNFα вырабатываются популяциями Т-клеток памяти в ответ на сигнал молекул CD28, в то время как в популяциях "наивных" клеток вырабатывается только IL-1α (Cerdan et al., 1991; van Kooten et al., 1991). Экспрессия IL-4 также регулируется с участием сигнального механизма CD28 (Seder et al., 1994). Также указанное взаимодействие обеспечивает позитивную регуляцию IL-5, IL-10 и IL-13, являющихся важными медиаторами гуморального ответа (deWaal Malefyt et al., 1993; Minty et al., 1993). Кроме того, колониестимулирующие факторы и факторы роста, включая GM-CSF, CSF-1 и IL-3, и хемотаксические факторы, включая IL-8, позитивно регулируются с участием сигнала, генерируемого рецептором CD28 (Harlan et al., 1995).
С учетом того, что выше обсуждалась вероятное использование CD80 в индукции противоопухолевого иммунитета, существует ряд других потенциальных способов клинического применения CD28 и CD80. Предотвращение взаимодействия между CD28 и CD80, как было показано в модельной системе грызунов, способствует профилактике или лечению ряда аутоиммунных заболеваний, профилактике отторжения органов или проявлению реакции "трансплантат против хозяина", а также профилактике секреции цитокинов, ассоциированной с сепсисом (Harlan et al., 1995; Nickoloff et al., 1993; Thomas et al., 1994; Zhou et al., 1994). Добавление CTLA-4 Ig с целью блокировки взаимодействия CD28/CD80 у мышей может предотвращать симптомы волчаночного типа у мышей линии NZB/NZW и частично защищать от летального ЕАЕ и от летального нефрита у крыс (Harlan et al., 1995). Хотя данный иммунотерапевтический подход в отношении аутоиммунных заболеваний для человека пока не применялся, было установлено, что в медицинской практике при биопсиях у пациентов с псориазом и ревматоидным артритом выявляется экспрессия CD80, в то время как в нормальных биопсийных пробах такая экспрессия отсутствует (Nickoloff et al., 1993; Thomas et al., 1994). При пересадках костного мозга и органов у мышей и в модельных экспериментах на человеке in vitro добавление CTLA-4 Ig и предотвращение взаимодействия CD28/B7 может обусловливать по крайней мере частичную защиту от отторжения органа, проявления реакции "ТПХ" или индукцию антиген-специфичной устойчивости (Harlan et al., 1995). Наконец, секреция цитокинов и проявление сепсиса, что может приводить к заражению крови и септическому шоку, могут быть предотвращены у мышей путем прижизненного введения CTLA-4 Ig (Zhou et al., 1994). Манипуляции взаимодействием CD28/CD80 позволяют глубже понять процессы Т-клеточной костимуляции и позволяют приблизиться к решению различных проблем.
Материалы и методы
Выделение исходного фрагмента CD28
мРНК экстрагировали из лимфоцитов периферический крови животного НК5, простимулированных в течение 16 часов Кон-А, с использованием реагента для РНК-экстракции RNAzolB (Biotexc, Houston, TX). Исходно кДНК синтезировали на матрице выделенной РНК с обратной транскриптазой (ОТ), используя в качестве 3'-праймера олиго-dT. Вкратце, РНК и олиго-dT нагревали до 75°С на 3 минуты для удаления вторичных структур. Затем добавляли ОТ, dNTP, буфер и дистиллированную воду и полученную смесь инкубировали в течение 1 часа при 42°С. После инкубации образец нагревали до 95°С на 5 минут с целью инактивации ОТ. Вырожденные праймеры, производные от консенсусных сегментов, найденных в опубликованных нуклеотидных последовательностях CD28 человека, мыши и кролика (GenBank, Bethesda, MD), затем использовали для исходной амплификации 673-нуклеотидного фрагмента, кодирующую большую часть открытой рамки:
CD28-113: САА ССТ TAG CTG CAA GTA САС (SEQ ID NO: 70)
CD28-768: GGC TTC TGG ATA GGG ATA GG (SEQ ID NO: 71).
Метод ПЦР "с горячим стартом" на основе использования Taq-полимераэы применяли для амплификации продукта (5 минут при 95°С - 1 цикл; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 48°С и 45 секунд при 72°С - 30 циклов; 7 минут при 72°С - 1 цикл). Затем полученный фрагмент визуализовали в 1%-ном агарозном геле и лигировали в состав клонирующего вектора ТА (InVitrogen, San Diego, CA) и секвенировали в соответствии с описанным выше. На основе последовательности кДНК были получены специфичные 3'-праймеры, которые синтезировали для использования в методе 5'-RACE:
CD28-190: CGG AGG TAG AAT TGC ACT GTC С (SEQ ID NO: 72)
CD28-239: ATT TTG CAG AAG TAA ATA TCC (SEQ ID NO: 73).
Выделение 5'-сегмента
Модифицированный по GIBCO протокол метода 5'-RACE (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) использовали для получения оставшейся 5'-последовательности молекулы CD28 кошки. РНК экстрагировали из РВМС, простимулированных в течение 16 часов Кон-А. Обратный ген-специфичный праймер использовали для синтеза первой цепи кДНК. РНК и этот праймер нагревали до 75°С на 5 минут с последующим добавлением других ОТ-реагентов. После денатурации полученную смесь охлаждали до 4°С и добавляли реакционный буфер, хлорид магния, dNTP, дитиотреитол и обратную транскриптазу SuperScript (Gibco BRL, Gaithersburg, MD). Смесь с ОТ инкубировали при 42°С в течение 30 минут и затем нагревали до 70°С в течение 15 минут с целью денатурации ОТ. Затем добавляли РНКазную смесь и реакцию инкубировали при 55°С в течение 10 минут с целью удаления остатков РНК и предотвращения неправильной достройки с участием терминальной трансферазы (TdT). Затем кДНК очищали с использованием центрифужной колонки GlassMax (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) с целью удаления не включившихся нуклеотидов и праймера. Затем очищенную кДНК, элюированную с данной колонки, замыкали с помощью TdT. TdT использовали для добавления 20-30-нуклеотидного дезоксицитидинового "хвоста" к кДНК. Этот фермент добавляли к смеси очищенной кДНК, хлорида магния, реакционного буфера и dCTP после 3-минутной денатурации кДНК при 95°С. Реакцию инкубировали при 37°С в течение 10 минут и фермент затем инактивировали нагреванием до 70°С в течение еще 10 минут. кДНК с присоединенным "хвостом" амплифицировали с использованием Taq-полимеразы в реакции ПЦР с "горячим стартом" (5 минут при 95°С; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 55°С и 45 секунд при 72°С - 35 циклов; 72°С в течение 7 минут). Праймерами для этой реакции являлись обратный праймер, соответствующий 5'-участку праймера для синтеза кДНК, и якорный праймер, специфичный для dC-линкера и состоящий в основном из остатков dG и небольшого числа dI. 1 мкл этой реакции разбавляли добавлением 50 мкл воды и 5 мкл полученной смеси затем использовали для "гнездовой" ПЦР (5 минут при 95°С - 1 цикл; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 55°С и 45 секунд при 72°С - 30 циклов; с химерной полимеразой KlenTaq) с якорным прямым праймером dG/dI и дополнительным верхним "гнездовым" ген-специфичным обратным праймером. 30 мкл "гнездовой" реакции затем визуализовали в 1,5%-ном агарозном геле и точный фрагмент вырезали из геля. кДНК очищали в соответствии с описанным выше с использованием гель-распылителя Amicon и фильтра Micropure (Amicon, Beverly, МА). Очищенный образец кДНК секвенировали методом секвенирования с концевой флуоресцентной меткой (Perkin Elmer, Norwalk, CN). На материале завершенных фрагментов определили консенсусную последовательность. На основе этой последовательности была синтезирована пара праймеров, соответствовавших полноразмерной кодирующей рамке гена CD28 кошки:
Прямой feCD28: CGC GGA TCC ACC GGT AGC АСА ATG АТС СТС AGG (SEQ ID NO: 13)
Обратный feCD28: CGC GGA TCC TCT GGA TAG GGG TCC ATG TCA G (SEQ ID NO: 14).
С использованием этих праймеров молекулу кДНК, включающую полноразмерный кодирующий участок, амплифицировали на материале кДНК, синтезированной на РНК из РВМС, взятых у животных ЕК6 и ED3 и простимулированных Кон-А. Эта производная от РВМС кДНК была получена ранее и, как было установлено, включала РНК, соответствующую данному гену. В данной ПЦР (5 минут при 95°С - 1 цикл; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 42°С и 45 секунд при 72°С - 30 циклов; 72°С в течение 7 минут) использовали ДНК-полимеразу KlenTaq, которая снижает случайные ошибки, обычно сопровождающие использование Taq-полимеразы, и в результате получили 754-нуклеотидный фрагмент, который клонировали в состав клонирующего вектора ТА и секвенировали в соответствии с описанным ранее. Как и в случае с молекулой CD80, каждый нуклеотид подтверждали по крайней мере по трем независимо полученным последователь ностям.
Результаты
Вырожденные праймеры, выбранные по параметрам консенсусных участков последовательностей кДНК CD28 мышей, человека и кролика, использовали в ПЦР с успешным получением продукта, который охватывает практически всю кодирующую последовательность кошки. Благодаря более высокой степени консерватизма, свойственного молекуле CD28, в результате исходной амплификации с использованием данных вырожденных праймеров получили виртуально полноразмерную молекулу. В отличие от молекулы CD80 кошки, в которой вначале был получен только небольшой центральный фрагмент, в кодирующей рамке кДНК CD28 не "хватало" лишь 113 "крайних" 5'-нуклеотидов. Этот исходный фрагмент последовательности проявлял 86%-ный уровень гомологии с аналогичным участком последовательности человека, 86%-ный уровень гомологии с кДНК кролика и 79%-ный уровень гомологии с кодирующей последовательностью мыши.
Старт-кодон ATG и дополнительные 110 нуклеотидов, а также некоторые 5'-фланкирующие последовательности были выделены с применением метода 5'-RACE (Gibco, Gaithersburg, МА). В реакции "присоединения хвоста" использовали кДНК, полученную на материале РНК клеток РВМС кошки ЕК6, простимулированных Кон-А. На этом материале в результате амплификации с праймером CD28-786 и якорным праймером dG получили небольшой различимый материал.
Хотя не было выявлено различимых бэндов при амплификации с комбинацией праймеров dG/CD28-786, разбавленную кДНК из этой реакции амплифицировали с использованием "гнездовых" праймеров для CD28 - CD28-182 и CD28-239. Отчетливый бэнд присутствовал в области примерно 600 пар нуклеотидов. Этот продукт выделили из агарозного геля и секвенировали с подтверждением наличия в нем 5'-фрагмента, включая старт-кодон и фланкирующую последовательность за его пределами.
На основе нуклеотидной последовательности этих продуктов был сформирован прямой праймер, который включал старт-кодон. Этот праймер в сочетании с 3'-конструкцией использовали для амплификации кДНК из экстрактов РНК клеток РВМС, взятых у животных ЕК6 и ED3 и простимулированных Кон-А, и получили 754-нуклеотидный фрагмент.
По крайней мере два продукта от каждого животного секвенировали полностью и каждый нуклеотид проверяли и подтверждали по крайней мере по трем независимым точно считанным последовательностям. После этого полноразмерный продукт секвенировали из состава клонирующего вектора ТА с целью подтверждения точности и воспроизводимости полученного продукта.
В окончательном 685-нуклеотидном фрагменте, составляющем полную открытую рамку, старт-кодон ATG находится в положении 1, стоп-кодон - в положении 664-666, а еще 19 нуклеотидов составляют 3'-UTR. Как и в случае с молекулой CD80 кошки, положение старт-кодона ATG подтвердили по параметрам секвенирования продуктов реакции 5'-RACE (данные не включены).
Ген CD28 кошки, будучи секвенирован, проявил наибольший уровень суммарной идентичности с последовательностями кролика и человека. Гомология с кДНК также была значительна, хотя идентичность с последовательностью курицы выражалась в меньшей степени и была сопоставима с уровнями сходства других генов, сравниваемых у курицы и млекопитающих (табл.2).
Таблица 2 Сравнение последовательностей CD28 кошки и CD28 мыши, человека, курицы и кролика |
||
Вид | Процент гомологии с последовательностью кошки | |
Аминокислотная | Нуклеотидная | |
Человек | 85% | 82% |
Мышь | 77% | 74% |
Кролик | 84% | 84% |
Курица | 59% | 50% |
Аминокислотная последовательность была расшифрована по нуклеотидной последовательности в соответствии с описанным выше. Величины идентичности расшифрованной аминокислотной последовательности с другими опубликованными последовательностями оказались сравнимы с идентичностью на уровне нуклеотидных последовательностей. Сигнальный сегмент пептида простирается от старт-остатка метионина до 19-й аминокислоты. Представляется, что, как и в других клонированных полипептидах CD28, в молекуле кошки единственный внеклеточный вариабельный иммуноглобулиноподобный домен приходится на остатки 19-153. Гидрофобный трансмембранный домен занимает следующие 27 остатков, а еще 41 аминокислота составляют цитоплазматический "хвост". Как и молекула CD28 человека, полипептид кошки включает пять сайтов потенциального N-гликозилирования.
Сравнение расшифрованной аминокислотной последовательности белков CD28 кошки и человека показало наличие участков гомологии при некоторых различиях. Большинство изменений приходятся на трансмембранный домен, сигнальный сегмент и N-концевой домен. Наивысший уровень гомологии характерен для центрального IgV-подобного домена и для цитоплазматического "хвоста".
Сравнение молекулы CD28 кошки с расшифрованными аминокислотными последовательностями членов семейства CD28/CTLA-4 человека и мыши показало, что, хотя общий уровень гомологии членов этой группы белков составляет лишь. 25%, сохраняются специфичные участки и аминокислоты. Мотив MYPPPY сохраняется у всех членов этой группы. В последовательности кошки предполагается наличие дополнительных остатков, важных для обеспечения структурной целостности, включая ряд консервативных остатков цистеина.
Цитоплазматический домен в молекуле СВ28 характеризуется консерватизмом средней степени по сравнению с другими опубликованными последовательностями, особенно последовательностями млекопитающих. Предполагается, что различные внутриклеточные сигнальные механизмы опосредуются перекрестным связыванием внеклеточного сегмента данного рецептора (Hutchcroft & Bierer, 1995).
Графики гидрофильности расшифрованной аминокислотной последовательности CD28 кошки при сравнении с такими же графиками полипептида человека дополнительно показывают вероятность того, что каждый из этих белков характеризуется сходной структурой. Однако при наличии замен аминокислот это, по-видимому, не приводит к существенным изменениям гидрофильности данной молекулы: это отражает в основном гомологичную природу таких замен аминокислот. Надо заметить, что очень высокий уровень сходства профилей гидрофильности характеризует трансмембранные домены пептидов кошки и человека, характеризующихся лишь 75%-ным уровнем гомологии.
Обсуждение
Все последовательности клонированных молекул CD28 проявляют средний уровень эволюционного консерватизма. Можно предположить, что участие этой молекулы в активации и опосредовании Т-клеточного иммунитета имеет место у различных высших позвоночных животных - от куриных птиц "через" грызунов и хищных млекопитающих до высших приматов.
Сравнение аминокислотнотных последовательностей каждой из этих молекул указывает на средний уровень гомологии участков внеклеточного домена, который предположительно вовлечен в связывание лиганда, а также внутриклеточных участков, предположительно участвующих в формировании внутриклеточных сигналов. В целом наивысший уровень гомологии обнаруживается в участке, окружающем предполагаемый сайт связывания лиганда - MYPPPY, - расположенный в составе IgV-подобного домена полипептида кошки, аминокислоты 118-123.
Предполагаемый сигнальный сегмент соответствует участку от начального метионина до 19-го остатка (Aruffo et al., 1987). Мономер CD28 составлен единственным внеклеточным вариабельным иммуноглобулиноподобным доменом, занимающим аминокислоты 19-153 (Aruffo et al., 1987). Гидрофобный трансмембранный домен приходится на следующие 27 остатков, после которого расположен 41-аминокислотный цитоплазматический домен (Aruffo et al., 1987). Белок кошки включает 5 сайтов потенциального N-гликозилирования в идентичных положениях по отношению к тому, что было найдено в полипептиде человека. Интересно, что сайтом гликозилирования, находящимся в остатке 105 белка кошки, является мотив NQS, в то время как в последовательности человека он - NQT. Такая аминокислотная дивергенция дополнительно подтверждает то, что, несмотря на наличие изменений в последовательностях, их общие структурные характеристики сохраняются.
Как можно было ожидать исходя из уровней гомологии, проявляемых этими белками, сравнение графиков гидрофильности CD28 кошки и человека показывает, что эти молекулы характеризуются в принципе сходными конформационными параметрами. Однако также ясно, что в случае замены аминокислоты результирующие изменения оказываются гомологичными. При том, что трансмембранный домен является областью данной молекулы, характеризующейся наименьшим уровнем консерватизма при простом сохранении им свойства гидрофобности, цитоплазматический домен молекулы CD28 кошки по сравнению с другими опубликованными последовательностями консервативен в средней степени. Предполагается существование ряда внутриклеточных сигнальных механизмов, опосредуемых связыванием на данном рецепторе, и, хотя внутриклеточный сегмент полипептида CD28 не обладает собственной каталитической активностью, тем не менее связывание им лиганда обусловливает активацию внутриклеточных эффекторных молекул (Aruffo et al., 1987). Имеются четыре консервативных остатка тирозина (положения 173, 188, 191 и 200), для которых предполагалось их фосфорилирование (Lu et al., 1992). С другой стороны, мотив MNM, начинающийся со 193-й аминокислоты молекулы кошки, рассматривается как сайт домена SH2 в белках человека и мыши (Prasad et al., 1995). Потенциальный сайт фосфорилирования с участием протеинкиназы-С остается в остатке серина-185, в то время как треонин-202 может быть мишенью для атаки пролинориентированной активности серин-треониновых протеинкиназ Erk1 или Erk2 (Hutchcroft & Bierer, 1996). Как обсуждалось выше, сигнальная функция рецептора CD28 является многообразной, поэтому вовсе неудивительно то, что его цитоплазматический домен включает несколько потенциальных сайтов атаки для сигнальных медиаторов.
Будущее использование молекулы CD28 кошки должно включать разработку способов выявления поверхностной экспрессии этого рецептора и контроля экспрессии CD28 после заражения вирусом, таким как FIV. Если такой способ может быть объединен с уже существующими способами выявления мРНК, то может быть получена ценная информация об уровне экспрессии в процессе инфицирования. Последующая связь параметров экспрессии CD28 в ходе хронической FIV-инфекции позволит рассматривать организм кошки как репрезентативную модель ВИЧ-инфекции человека, что позволит дать более точные данные об инфекционных процессах у обоих видов организмов.
Пример 7
Экспрессия белков CD28/CD80
Введение
При том, что связи в иммунной системе по большей части опосредованы "растворимыми" (немембранными) факторами, инициация первичного Т-клеточного ответа у приматов и грызунов, как было установлено, зависит от непосредственного межклеточного контакта (Mescher, 1992). Вначале считалось, что такое взаимодействие включает в себя лишь взаимодействие между TCR на поверхности Т-клетки и молекулой МНС на поверхности антиген-презентирующей клетки, однако затем стало ясно, что связывание между вспомогательными молекулами также необходимо для полной активации Т-клетки (Schwartz, 1992). Как обсуждалось выше, было получено доказательство взаимодействия между белками CD28 и CD80 как медиаторами такого вспомогательного сигнала (Linsley et al., 1991a).
Многие играющие важную роль рецепторы и лиганды у позвоночных животных относятся к суперсемейству иммуноглобулинов (Springer, 1990). Эти молекулы характеризуются присутствием иммуноглобулиноподобного участка - обычно во внеклеточной части данной молекулы (Buck, 1992). Хотя уровни консерватизма неодинаковы, часто он ограничен именно теми остатками, которые обеспечивают пространственную укладку белка по иммуноглобулиновому типу (Beale, 1985). Характеристикой Ig-домена является наличие двух тесно взаимодействующих антипараллельных (β-цепей, связанных петлей, обеспечивающей консервативную топологию (Williams & Barclay, 1988). Хотя имеются общие признаки структуры членов данного семейства, существует разнообразие в параметрах связывания и сигнальных свойствах у отдельных представителей данного семейства (Anderson et al., 1988).
Являясь членами семейства IgSF, и CD28, и CD80 в определенной степени сходны по структуре своих внеклеточных доменов. У CD28 имеется единственный V-подобный домен, хотя он и экспрессирован в виде гетеродимера, связанного дисульфидными "мостиками" (Aruffo et al., 1987). Внеклеточный участок молекулы CD80, однако, включает и V-, и С-подобные иммуноглобулиновые домены и экспрессируется как мономер (Freedman et al., 1989). Поскольку члены семейства IgSF характеризуются общими структурными параметрами, по крайней мере в ограниченной степени можно переносить некоторые шаблоны пространственной структуры на родственные молекулы, которые кристаллизовать не удается (Bajorath et al., 1993). Хотя кристаллизация ни CD28, ни CD80 не была осуществлена, методами рентгенографической кристаллографии были исследованы молекулы CD2 (Driscoll et al., 1991) и CD8 (Leathy et al., 1992), характеризующиеся аналогичными внеклеточными доменами, что позволило определить некоторые принципы структуры родственных молекул семейства IgSF (Linsley et al., 1995a).
Как обсуждалось выше, CD80 и CD86 проявляют сходные активности по связыванию на рецепторах CD28 и CTLA-4. Однако CD28 является менее аффинным рецептором для этих лигандов, в то время как CTLA-4 - более аффинен по отношению к обеим этим молекулам (Linsley et al., 1994a). Хотя вероятный механизм известен, пока неясно, как низкоаффинный рецептор, характеризующийся высокой скоростью отщепления лиганда, что характерно для CD28, способен обеспечивать необходимый костимуляторный сигнал в дифференцировку Т-клеток (Linsley et al., 1995a). Предполагается, что связывание CD80 на CD28 на поверхности Т-клеток может способствовать олигомеризации данного рецептора, что и обеспечивает эффективность связывания и выработки сигнала (Linsley et al., 1995a). Было показано, что CD28 равномерно распределен на поверхности активированных Т-клеток, т.е. предположительно эти молекулы перемещаются на мембрану после загрузки Т-клетки (Damie et al., 1994). Высокая концентрация олигомеризованного CD28 будет способствовать реассоциированности свободных CD28 в области межклеточного контакта и тем самым обеспечивать генерирование сигнала, несмотря на быстрое отщепление лиганда (Linsley et al., 1995a). Такой процесс, названный "взаимным кэпированием", хотя напрямую и не установлен при взаимодействии CD28/CD80, был подтвержден для других рецепторов, для которых необходим похожий инициирующий межклеточный контакт (Singer, 1992).
Хотя, как было показано, взаимодействие CD28/CD80 является ключевым в развитии Т-клеточного иммунного ответа, до сих пор остаются вопросы в выяснении точного механизма данного сигнального механизма (Linsley et al., 1993a). Существование двух рецепторов и двух лигандов в данном взаимодействии поднимает вопрос о роли каждого из них в активации Т-клеток (Linsley et al., 1992b). Хотя рецептор CTLA-4 проявляет более сильное связывание, он экспрессируется гораздо позже события активации, и хотя сигнальные механизмы связывались с CD28, так и не было определено, генерируется ли сигнал после связывания лиганда на рецепторе CTLA-4 (Linsley et al., 1995а).
Материалы и методы
Получение вставок
Следующие праймеры использовали для амплификации полноразмерной кодирующей рамки генов CD28 и CD80 кошки для встраивания его в экспрессирующие векторы:
Прямой feCD80: CGC GGA ТСС GCA ССА TGG GTC ACG CAG САА AGT GGA AAA С (SEQ ID NO: 11)
feCD80-960: CCT AGT AGA GAA GAG СТА AAG AGG С (SEQ ID NO: 12)
Прямой feCD28: CGC GGA TCC ACC GGT AGC АСА ATG ATC CTC AGG (SEQ ID NO: 13)
Обратный feCD28: CGC GGA TCC TCT GGA TAG GGG TCC ATG TCA G (SEQ ID NO: 14).
Прямой праймер для CD80 и оба праймера для CD28 были сконструированы с включением BamHI-сайтов и подходящими линкерами с целью облегчения встраивания по множественным сайтам клонирования. 3'-Расположенный BamHI-сайт вносили в последовательность CD80 путем расщепления клонирующего вектора ТА. Также прямые праймеры включали бокс Козака и старт-кодон ATG обоих генов. В каждом случае полученные праймеры использовали для амплификации с матрицы, кодирующей полноразмерную последовательность каждого гена, которые были предварительно внесены в состав клонирующего вектора ТА, описанного выше. Приблизительно 10 нг каждой такой плазмиды использовали в ПЦР с Taq-полимеразой (5 минут при 95°С - 1 цикл; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 60°С и 45 секунд при 68°С - 30 циклов; 7 минут при 68°С - 1 цикл). Амплифицированные продукты визуализовали методом электрофореза в агарозном геле и затем лигировали в состав клонирующего вектора ТА (InVitrogen, San Diego, CA) в соответствии с описанным выше. Реакцию лигирования использовали для трансформации компетентных клеток InvαF' и позитивные клоны скринировали и отбирали в соответствии с описанным выше.
Клонирование в плазмиду pSI
Для клонирования в состав вектора pSI, предназначенного для трансформации клеток COS-7, эту плазмиду расщепляли рестриктазой EcoRI и затем этот фермент удаляли с использованием центрифужной колонки Micropure EZ (Amicon, Beverly, MA). После удаления рестриктазы плазмиду обрабатывали смесью фенола и хлороформа с целью удаления остаточного белка и осаждали спиртом. Вставки отщепляли от 50 мкг очищенной реактивами QIAGEN плазмидной ДНК (Qiagen, Chatsworth, CA) тех клонов, которые включали клонирующий вектор ТА с правильными вставками, используя EcoRI-сайты, имеющиеся во фланкирующих вставку последовательностях вектора. 100 мкл отщепленного материала подвергали электрофорезу в 1,5%-ном агарозном геле и отщепленный фрагмент вырезали из геля. Вставку затем очищали из агарозы с использованием гель-распылителя и фильтра Microcon (Amicon, Beverly, MA). Обработку EcoRI-расщепленной плазмиды pSI щелочной фосфатазой использовали для снижения вероятности лигирования данного вектора самого на себя. Путем обработки в течение 1 часа при 37°С 0,1 ед./мкг щелочной фосфатазы кишечника теленка (ЩФКТ) дефосфорилировали расщепленные концы вектора. ЩФКТ удаляли путем тепловой денатурации при 65°С в течение 30 минут с последующей очисткой на центрифужной колонке Micropure EZ (Amicon, Beverly, MA). Вставки лигировали напрямую в разрезанный и дефосфорилированный вектор pSI в течение ночи при 16°С с использованием ДНК-лигазы фага Т4. Молярное отношение лиганда и вектора составляло приблизительно 3:1 при соотношении 0,05 мкг вставки CD28 или CD80 к 0,1 мкг pSI. Затем 1 мкл реакции лигирования использовали для трансформации компетентных клеток InvαF'. Эти клетки высевали полосами на пластины LB, содержащие 50 мкг/мл ампициллина. Пластины инкубировали в течение ночи при 37°С и на следующий день полученные колонии пересевали в 5 мл жидкой среды LB, содержащей 100 мкг/мл ампициллина. После инкубации в течение ночи при 37°С с вращением при 220 об/мин плазмидную ДНК экстрагировали методом щелочного лизиса, ДНК очищали путем экстракции фенолом-хлороформом и осаждали двумя объемами 95%-ного этанола. ДНК обрабатывали РНКазой и затем расщепляли обработкой 10 ед. рестриктазы EcoRI. Продукты расщепления визуализовали в 1%-ном агарозном геле с целью идентификации позитивных клонов. Затем плазмидную ДНК экстрагировали из ночной культуры позитивного клона объемом 5 мл с использованием центрифужных колонок QIAprep (Qiagen, Chatsworth, CA). Затем нуклеотидную последовательность очищенной ДНК определяли методом секвенирования с концевой флуоресцентной меткой с использованием внутреннего 3'-праймера, позволяющего определить ориентацию вставки в данной плазмиде. Расположение этого праймера таково, что секвенирование "пересекает" участок стыковки вектора и вставки, чтобы убедиться в правильности ее ориентации. Затем клон каждого гена в плазмиде с правильной ориентацией выращивали в 100-мл культуре и плазмиду экстрагировали на максипрепаративной колонке QIAGEN (Qiagen, Chatsworth, CA).
Клонирование в SFV
Для встраивания в состав вектора SFV вставки и плазмиду обрабатывали в основном таким же образом. 100 мкг вектора SFV расщепляли 120 ед. рестриктазы BamHI в течение 1 часа при 37°С. Рестриктазу удаляли от расщепленного продукта центрифугированием через фильтр Micropure EZ (Amicon, Beverly, MA). Затем плаэмиду обрабатывали ЩФКТ. ЩФКТ инактивировали нагреванием и затем плазмиду вновь очищали на фильтре Micropure EZ. Вставки экстрагировали из ДНК очищенного клонирующего вектора ТА путем обработки рестриктазой BamHI. Вставки очищали и лигировали в состав вектора в соответствии с описанным выше. После трансформации компетентных клеток InvαF' плазмидную вставку и ее ориентацию подтверждали методом секвенирования с концевой флуоресцентной меткой. Крупномасштабную выработку плазмиды проводили на материале позитивного клона каждого из генов.
Экспрессия белка с pSI
Для трансформации эукариотических клеток плазмидой pSI клетки COS-7 были получены из Американской коллекции типовых культур (АТСС). Замороженный блок ресуспендировали в 15 мл среды DMEM, дополненной 10% плодной телячьей сыворотки (ПТС). Культуры затем выращивали монослоем в колбах Т-75. Вечером накануне проведения трансфекции клетки удаляли из колб путем трипсинизации (0,25% в ЭДТА) с промывкой ФСБ. Клетки затем высевали при примерно 20%-ном уровне слияния на 100-мм чашки и оставляли расти до уровня слияния примерно 50% до следующего дня. Для каждой предназначенной для трансфекции чашки 5 мл DMEM-NuSerum (Collaborative Biomedical Products, Bedford, MA) смешивали с 0,2 мл раствора DEAE-декстрана и хлорохина. Затем к этой смеси добавляли 10 мкг/мл очищенной плазмиды pSI. Культуральную среду отсасывали из клеток COS и к этим клеткам добавляли раствор DMEM-NuSerum, DEAE-декстрана, хлорохина и ДНК. Культуру инкубировали в течение 3,5 часов в инкубаторе при 5% углекислоты с последующим удалением культуральной среды и заменой ее на 5 мл 10% ДМСО в ФСБ. Через 2 минуты этот раствор отсасывали и клетки культивировали в течение ночи в 5 мл среды DMEM с 10% ПТС. На следующий день клетки переливали в 100-мм культуральные чашки. Через 3 дня среду отсасывали и трансформированные клетки отбирали с использованием ФСБ с 0,5 мкМ ЭДТА. Смесь ФСБ/ЭДТА добавляли к клеткам, которые затем инкубировали в течение 15 минут при 37°С. Супернатанты отбирали и объединяли с последующими промывками в ФСБ. Супернатанты и промывки затем центрифугировали. Полученный в результате сгусток ресуспендировали в DMEM/ПТС и подсчитывали клетки COS.
Экспрессия белков с SFV
Трансфекцию вектором SFV осуществляли в отношении почечных клеток новорожденных хомячков (ВНК). 30 мкг очищенной плазмиды расщепляли рестриктазой SpeI в течение 1 часа при 37°С. Затем рестриктазу удаляли на фильтре Micropure EZ (Amicon, Beverly, МА) и ДНК осаждали 2,5 объемами 95%-ного этанола. Затем 1,5 мкг плазмиды использовали в качестве матрицы для Sр6-опосредованной транскрипции in vitro. Вкратце, ДНК инкубировали в течение 1 часа при 37°С с: транскрипционным буфером, 100 мМ дитиотреитола, 10 мМ G(5')ррр(5')G, смесью NTP, водой, RNasin и 60 ед. РНК-полимеразы Sp6. После транскрипции реакцию разделяли на аликвоты и образец визуализовали в 1%-ном агарозном геле. 45 мкл транскрипционной реакции использовали для трансфекции клеток ВНК при уровне слияния примерно 80% в колбах Т-75. Культуральную среду GMEM, дополненную 10% ПТС, отсасывали от клеток и заменяли на среду Opti-MEM. Через 2 минуты инкубации эту среду заменяли на среду Opti-MEM, 9 мкг/мл липофектина и транскрибированную РНК. Культуры инкубировали в течение 2 часов при 37°С при 5% CO2 с частым ручным встряхиванием. Через 2 часа культуральную среду удаляли и заменяли на GMEM + 10% ПТС. Культуры инкубировали в течение 7-9 часов и клетки затем отделяли путем обработки трипсином.
Клонирование в вектор pQE
Бактериальный экспрессионный вектор pQE также был сконструирован с включением генов CD80 и CD28 кошки. Расщепленную и обработанную ЩФКТ плазмиду pQE приготавливали и очищали в соответствии с описанным выше и лигировали с использованием ДНК-лигазы Т4 в молярном соотношении "вставка:плазмида=4:1" с 50 нг очищенного в геле CD28 или CD80. Реакцию лидирования инкубировали в течение 16 часов при 16°С. Затем 2 мкл этой реакции использовали для трансформации компетентных клеток INVαF'. Отбирали позитивные колонии и правильность ориентации вставки подтверждали путем прямого секвенирования. Проводили крупномасштабное получение очищенной плазмиды и полученное использовали для трансформации клеток M15 pREP4, которые делали компетентными по трансформации обработкой хлоридом рубидия. Трансформированные клетки культивировали на пластинах LB с содержанием по 50 мкг/мл канамицина и ампициллина с целью обеспечения того, чтобы обе плазмиды - pQE и плазмида-помощник pREP4 - сохранялись в этих колониях. Позитивные колонии затем подвергали скринингу путем минипрепарирования с щелочным лизисом и расщеплением рестриктазой BamHI. Колонии с подтвержденными вставками замораживали в маточном растворе 50% глицерина для дальнейшего использования.
Тест на связывание
Тесты на связывание в отношении трансфицированных клеток, экспрессирующих CD80 кошки и CD28 кошки, проводили в соответствии с протоколом, описанным Linsley et al., 1994a. Через 1 день после трансфекции клетки COS-7, экспрессирующие CD28, отбирали из колб Т-75 путем обработки трипсином в ЭДТА. Эти клетки оставляли прикрепляться к лункам 24-луночных планшетов при концентрации 105 клеток на 1 мл. Через 2 дня клетки COS-7, трансфицированные feCDSO/pSI, отбирали из колб Т-75 с использованием ФСБ с 0,5 мкМ ЭДТА. Эти клетки затем метили флуоресцентно с использованием раствора 5 мкМ Calcein AM (Molecular Probes, Eugene, OR) в стерильном ФСБ с 1% бычьего сывороточного альбумина (БСА) в течение 30 минут при 37°С (Akeson & Woods, 1993). Трансфицированные "пустышкой" клетки COS-7 помечали таким же образом. Помеченные клетки затем трижды промывали средой DMEM, содержащей 10% ПТС, с целью удаления неприсоединившейся метки, подсчитывали их и добавляли непосредственно к монослою. Эти две клеточные популяции составляли взаимодействовать друг с другом в течение 1 часа при 37°С. Прикрепившиеся клетки отбирали путем аккуратной трехкратной промывки монослоя средой DMEM с добавлением 10% ПТС. После промывки уровень флуоресценции каждой лунки определяли количественно с помощью планшетного микрофлуориметра. Уровень флуоресценции лунок, содержащих трансфицированные клеточные популяции, сравнивали с лунками, в которых клетки, экспрессирующие CD80, были добавлены к клеткам COS-7, трансфицированным только плазмидой pSI.
Тесты на конкурентное связывание с использованием химерных белков CTLA-4/Ig и CD80/Ig (любезно предоставленных P.Linsley, Bristol-Meyers Squibb) для подавления межклеточных взаимодействий выстраивали таким образом, чтобы продемонстрировать специфичность такого взаимодействия. После мечения кальцеином, но перед добавлением к монослою клеток, экспрессирующих CD80, химеру CTLA-4/Ig в среде DMEM/ПТС в концентрации 1 мкг/мл инкубировали с помеченными трансфицированными клетками в течение 30 минут. Клетки дважды промывали в DMEM/ПТС и добавляли к монослою. С другой стороны, клетки монослоя, экспрессирующие CD28, инкубировали в течение 30 минут с химерой CD80/Ig в концентрации 1 мкг/мл в среде DMEM/ПТС и затем промывали, после чего добавляли флуоресцентно помеченные клетки, экспрессирующие CD80. Подавление связывания химерными белками оценивали путем сравнения уровней флуоресценции в данных лунках с параметрами связывания в лунках, не содержащих конкурентных факторов.
ПЦР с ревертированием
Также трансфицированные клетки COS оценивали по транскрипции мРНК методом ПЦР с ревертированием. Через 3 дня РНК экстрагировали из клеток, трансфицированных плазмидой, несущей вставку feCD28, feCD80 или лишенную вставки. РНК обрабатывали ДНКазой, свободной от РНКазы, с целью удаления возможных загрязняющих ДНК. Затем 0,5 мкг РНК подвергали обратной транскрипции с получением кДНК с использованием праймера олиго-dT и обратной транскриптазы вируса MuMLV. Каждый образец кДНК затем амплифицировали с использованием наборов праймеров, специфичных для CD28, CD80 и G3PDH в следующих циклах: 5 минут при 95°С - 1 цикл; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 55°С, 30 секунд при 72°С - 30 циклов; 5 минут при 72°С - 1 цикл. Затем по 20 мкл каждой реакции визуализовали в 1%-ном агарозном геле.
Результаты
Гены кошачьих CD28 и CD80 были успешно встроены в состав "трехбелковых" экспрессирующих векторов (pSI, SFV и pQE). После лигирования в соответствующие векторы эти гены использовали для трансформации компетентных клеток INVαF'.
Тесты на связывание проводили для того, чтобы показать возможность экспрессии функционального белка. Исходные тесты осуществляли с целью определения отношений между связыванием клеток COS-7, трансфицированных CD28 и CD80, и клетками COS-7, трансфицированными CD28 и "пустышками". Уровень флуоресценции в лунках, в которые были добавлены флуоресцентно помеченные неслившиеся трансфицированные CD80 клетки, оказался выше по сравнению с контрольными лунками по двум исходным разведениям. Данное взаимодействие зависело от дозы и после двух исходных разведений уровни флуоресценции в лунках, в которых слившиеся клетки экспрессируют поверхностный белок, сохранялись такими же, как и в контролях, трансфицированных "пустышками".
Для того чтобы показать возможность подавления такого взаимодействия, линии трансфицированных клеток перед смешиванием инкубировали с растворимыми (немембранными) рецепторами. При концентрациях 5×105 и 1×105 клеток флуоресценция лунок, содержащих клетки COS, экспрессирующие CD28 и CD80, оказывается сходной с тем, что наблюдалось в предыдущем эксперименте. В лунках, в которых слившиеся клетки перед смешиванием проинкубировали с контррецептором CD80/Ig, сохранение флуоресценции было сравнимо с тем, которое обнаруживается в лунках с контрольными (трансфицированными "пустышками") клетками. Однако когда клетки COS, трансфицированные pSI с CD80, инкубировали с растворимым CTLA-4 перед их взаимодействием с клетками, трансфицированными pSI с CD28, флуоресценция полностью не подавлялась. Хотя эти уровни оказались не столь существенными, как те, которые выявлялись в неингибированной группе, тем не менее они были отчетливо больше, чем и в контроле, и в другой экспериментальной группе.
ПЦР с ревертированием проводили на материале РНК, производной от клеток COS-7, трансформированных конструкциями pSI-CD28, pSI-CD80 и "пустышками", с целью выявления присутствия мРНК, специфичной для каждого гена в этой клеточной линии. Ген глицеральдегид-3-фосфат-дегидрогеназы (G3PDH) амплифицировали в каждой группе, чтобы показать целостность РНК и в качестве позитивного контроля в группе "пустой" трансформации. Клетки COS-7, трансфицированные pSI-CDSO, экспрессировали мРНК CD80 и мРНК G3PDH, в то время как клетки COS-7, трансфицированные pSI-CD28, экспрессировали гены CD28 и G3PDH. Клетки, трансфицированные "пустышками", экспрессировали только G3PDH.
Обсуждение
Отсутствие подходящих антител объясняет то, что для выявления экспрессии пептида не может быть проведен прямой тест. Доступные на коммерческой основе антитела, специфичные в отношении CD28 и CD80 человека, были протестированы на материале изолированных лимфоцитов с целью установления их возможной перекрестной реактивности. Анализ клеток методом FACS с указанными антителами с использованием ПЦР для выявления экспрессии мРНК для обоих поверхностных белков, оказался безуспешным. Это, в сочетании с данными о том, что эти антитела не распознают поверхностную экспрессию в клетках, трансфицированных конструкциями pSI, позволило сделать вывод о том, что данные антитела перекрестной (гетерологичной) реактивностью не обладают. Но перекрестная активность антител к CD80 и не ожидалась. Ограниченная гомология CD80 человека и кошки должна ограничивать и потенциал по перекрестной активности моноклональных антител, специфичных для них. Однако было весьма удивительно, что и антитела, специфичные в отношении CD28 человека, также не были перекрестно реактивными. Хотя в этом случае уровень консерватизма между клонированными молекулами CD28 более существен, доступные на коммерческой основе антитела к CD28 человека, которые бы перекрестно реагировали с таким же белком мыши, найдены не были. Как и в случае с антителом к CD80 человека, тестирование моноклональных антител к CD28 человека оказалось безрезультатным. Следовательно, необходимо было разработать тест, который бы позволил продемонстрировать не только вероятность экспрессии данных белков, но также показал их функциональность и способность к взаимодействию.
кДНК CD80 и CD28 кошки были успешно встроены в группу экспрессирующих векторов. В то время как вектор pSI удовлетворял всем требованиям, необходимым для осуществления теста на связывание, дополнительные векторы, могли облегчить будущую экспрессию этих белков.
После трансфекции экспрессия мРНК CD28 и CD80 линиями трансформированных клеток COS-7 была подтверждена с применением метода ПЦР с ревертированием. Обработка РНК ДНКазой перед ПЦР резко снижала вероятность загрязнения геномной или плазмидной ДНК. Кроме того, не предполагалось, что клетки COS-7 будут исходно экспрессировать любой из лигандов, что было затем подтверждено по отсутствию мРНК для любого из этих поверхностных белков в контроле, трансфицированном "пустыми" векторами. Амплификация точной мРНК на материале РНК, выделенной из трансфицированных клеток, по-видимому отражает то, что в клетках роль матрицы выполняет вектор pSI и что мРНК, кодируемая этой плазмидой, действительно транскрибируется.
Проведенные тесты на связывание моделировали в соответствии с теми тестами, которые были осуществлены P.Linsley, продемонстрировавшим сходные параметры активности по связыванию для CD80 и CD28 человека (Linsley et al., 1994а). Модифицированный формат теста использовали для того, чтобы показать, что поверхностно экспрессированный CD28 кошки связывается с поверхностно экспрессированным CD80 кошки и что это взаимодействие может быть подавлено растворимым рецептором. Уровень связывания может быть определен по сохранению флуоресцентно помеченных клеток в конкретных лунках. Благодаря использованию автоматического флуоресцентного планшетного сканера не было необходимости в лизировании клеток перед измерением уровня флуоресценции.
В начальном тесте установили, что сохранение флуоресцентно помеченных клеток COS, трансфицированных CD80-pSI, было более интенсивным в лунках со слившимися клетками, которые трансфицировали CD28-pSI, по сравнению с лунками, содержащими слившиеся клетки, подвергнутые "пустой" трансформации. Контрольные клетки, т.е. клетки COS, трансформированные "пустышкой", т.е. вектором pSI, в котором не было вставки, подтвердили, что ни присутствие вектора (т.е. процесс трансфекции per se), ни адгезионные свойства клеток не обусловливают адгезии (слияния) клеток, опосредуемой взаимодействием между поверхностно экспрессированными CD80 и CD28. При исходном разведении в 1 млн. клеток уровень флуоресценции в лунках, в которых клетки экспрессировали CD28, был приблизительно в 5 раз выше по сравнении с лунками, в которые к клеткам, трансфицированным "пустышками", вносили флуоресцентно помеченные клетки, трансфицированные CD80. При концентрации 5×105 клеток уровень флуоресценции резко снижался из-за снижения числа клеток, однако этот уровень все же был достоверно выше флуоресценции в контроле. При концентрации 1×105 клеток различие между экспериментом и контролем статистически недостоверно, а при 1×104 клеток эти уровни практически идентичны. Данный тест показывает, что взаимодействие происходит между клетками COS, трансфицированными CD80, и клетками COS, трансфицированными CD28, что приводит к сохранению в данной лунке флуоресцентно помеченных клеток, трансфицированных CD80. Однако когда слившиеся клетки не экспрессируют поверхностно-клеточные белки, клетки, трансфицированные CD80, удаляются при тщательной промывке. Этот эффект может быть титрован, и при концентрации в 1×104 клеток уровень флуоресценции в лунках виртуально одинаков. Для подтверждения того, что взаимодействие имело место, растворимые рецепторы были внесены с целью подавления взаимодействия CD28/CD80.
Во втором тесте использовали включение растворимых форм соответствующих рецепторов для каждого из пептидов с целью подавления взаимодействия между адгезионными партнерами. Растворимые рецепторы для CD80 - huCTLA-4Ig, и для CD28 - huCD80-Ig, инкубировали с соответствующими трансфицированными клетками COS, экспрессирующими рецептор, соответствующий каждой из данных молекул, с последующим смешиванием клеток двух типов. Хотя растворимые белки происходили не от кошки, предположили, что благодаря определенному уровню консерватизма, обнаруживаемого между предполагаемыми сайтами связывания в молекулах человека и кошки, этого будет достаточно для достижения перекрестной реактивности. Более того, известно, что лиганды человека связываются с соответствующими рецепторами мыши (P.Linsley, уст. сообщ.). Исходя из количества клеток, необходимого для проведения данного теста, оказалось невозможно провести тест с 1×106 клеток. Исходная концентрация составила 5×105 клеток, при том, что сами по себе клетки, трансфицированные CD28/CD80, характеризовались средним уровнем флуоресценции, сходным с тем уровнем, который был определен в предыдущем эксперименте. Неясно, почему слившиеся клетки, проинкубированные со растворимым рецептором CD80, дают флуоресцентный сигнал, близкий к таковому у контроля с "пустой" трансфекцией, в то время как неслившиеся флуоресцентно помеченные клетки, трансфицированные CD80, проинкубированные со растворимым CTLA-4, проявляют в 2-3 раза более высокий уровень флуоресценции. Несмотря на различия, обусловленные типом растворимого рецептора, имелось отчетливое снижение уровня флуоресценции в лунках, в которых рецепторы отсутствовали. Данное взаимодействие, выявленное в предыдущем тесте, может быть подавлено внесением соответствующего растворимого рецептора перед смешиванием клеток.
Хотя моноклональные антитела, специфичные в отношении поверхностно-клеточных белков, в принципе выглядят предпочтительнее для тестов подобного типа, в отсутствие нужных реагентов описанный тест представляется эффективным подходом, в котором может быть продемонстрирована экспрессия функционального контррецептора. Данные исходного теста на связывание в сочетании с данными конкурентного теста подтверждают, что были выделены кДНК функциональных CD80 и CD28 кошки, а также то, что экспрессируемые в виде мРНК белки эффективно взаимодействуют. Хотя применимость подобного теста на связывание ограничена, он остается эффективной системой для установления вероятности функциональной поверхностной экспрессии и взаимодействия.
Пример 8
Инфекция
Введение
По определению Львова вирусы являются "строго внутриклеточными и потенциально патогенными элементами с инфекционной фазой, (1) проявляющими только один тип нуклеиновой кислоты, (2) размножающимися в форме своего генетического материала, (3) неспособными расти и проходить стадии деления, и (4) лишенными системы Липпмана" (Lwoff, 1957). Природные вирусы являются бесклеточными организмами, геном которых в форме РНК или ДНК контролирует синтез последующих вирусных частиц в процессе инфицирования клетки-хозяина (Luria & Darnell, 1968). Вирусные заболевания представляют интересную систему, в которой может быть продемонстрировано практическое применение сигнального комплекса B7/CD28. Заражение являющимися ретровирусами ВИЧ у человека и FIV (вирус иммунодефицита кошачьих) у кошек обусловливает нарушение нормального функционирования иммунной системы, что предположительно обусловлено элиминацией Т-клеток CD4+ (Fauci et al., 1984; Pedersen et al., 1987). Считается, что сигнальный комплекс CD28/CD80 играет важную роль в данном заболевании и что путем манипулирования экспрессией рецепторов можно обострить инфекцию (Harlan et al., 1995).
FIV является весьма актуальной клинической проблемой для домашних кошек, так как обусловливает ряд клинических и субклинических симптомов, которые очень сходны с ВИЧ-инфекцией человека (Pedersen et al., 1987). По мере накопления информации о FIV соответствие вызываемого им заболевания животной модели СПИДа человека становится все более очевидным, т.е. она является не связанной с приматами моделью, которая наиболее точно имитирует развитие данного заболевания у человека (Siebelink, 1990). Молекулярное, биологическое и патологическое сходство также подтверждает то, что большая часть информации, получаемой при исследованиях ВИЧ, может способствовать лучшему пониманию FIV-инфекции у кошек.
Вначале ВИЧ-инфекция проявляется в непостоянной лимфопении с развитием мононуклеозоподобного синдрома практически одновременно с сероконверсией (Clark et al., 1991). Происходит кратковременное снижение числа Т-клеток CD4+ и экспансия Т-клеток CD8+, что приводит к снижению отношения CD4:CD8, а в следующей бессимптомной фазе заболевания может происходить дальнейшее снижение данного соотношения (Cooper et al., 1984). При появлении связанных со СПИДом симптомов популяция Т-клеток CD4+ резко обедняется, а по мере развития заболевания и перехода его в заключительную стадию резко снижается и общее количество лимфоцитов (Fauci et al., 1984). При том что исходная лимфопения, по-видимому, обусловливается сдвигами в популяциях клеток иммунной системы, индуцируемыми кортикостероидами, что наблюдается и при других вирусных инфекциях, дальнейшие потеря Т-клеток CD4+ и экспансия Т-клеток CD8+, как считается, связаны с размножением вируса и патогенетическими процессами (Fauci & Dale, 1975; Fauci et al., 1984). Формирование информативных модельных систем является ключевым этапом в дальнейшем понимании механизмов инфекции и вызываемого вирусами заболевания.
FIV, являющийся Т-лимфотропным ретровирусом, впервые был описан в популяции домашних кошек в Калифорнии, в которой имели место многократные, часто встречающиеся хронические инфекции (Pedersen et al., 1987). Хотя данное заболевание само по себе манифестирует сходным с ВИЧ-инфекцией человека образом и таксономически вирусы относительно близки, по антигенным свойствами FIV отличается от возбудителя СПИДа человека (Siebelink et al., 1990). Передача патогена происходит при обмене жидкостями организма, как и ВИЧ, но, в отличие от ВИЧ, для которого преобладающей является передача половым путем, предполагается, что FIV в большинстве случаев передается через слюну при укусах (Yamamoto et al., 1989). Несмотря на различные пути передачи, итоговый синдром иммунодефицита является одной из лучших моделей родственного заболевания человека (Siebelink et al., 1990).
Клиническое развитие FIV сходно с ВИЧ-инфекцией: в частности, заболевание разделяют на пять клинических фаз. Начальная фаза характеризуется лихорадкой, недомоганием и лимфаденопатией, затем после заражения наступает долгая бессимптомная фаза, переходящая в три заключительные фазы, при которых наблюдаются потеря веса и возникают множественные вторичные и условно-патогенные инфекции (English et al., 1994). Хотя неясно, является ли механизм клеточной инфекции таким же, FIV оказывается трофическим и для СD4-позитивных, и для CD8-позитивных Т-клеток (Brown et al., 1991). У инфицированных этим вирусом животных наблюдается снижение активности Т-клеток CD4+ по-видимому в результате образования ими синцитиев и их лизиса (Siebelink et al., 1990). Наступление заключительной фазы инфекции совпадает с существенной потерей Т-клеток CD4+ и снижением отношения CD4:CD8 (Novotney et al., 1990). Хотя заболевания, вызываемые вирусами FIV и ВИЧ, могут опосредоваться разными механизмами снижения числа Т-клеток CD4+, итоговый фенотип и характер повреждений иммунной системы очевидно проявляются весьма сходным образом.
Хотя понятно, что инфицирование Т-клеток CD4+ вирусом ВИЧ негативно сказывается на развитии нормального иммунного ответа, точный механизм, приводящий к иммунодефициту, окончательно не определен. На поздних фазах инфекции процессы, приводящие к снижению числа Т-клеток CD4+, не установлены (Connor et al., 1993). Хотя при ВИЧ-инфекции было продемонстрировано формирование синцитиев, индукция апоптоза и элиминация с участием CTL, как факторы подавления популяции Т-клеток (Schattner & Laurence, 1994; Fouchier et al., 1996), также предполагалось наличие механизма, связанного с CD28 (Haffar et al., 1995). Как было показано, в линиях инфицированных Т-клеток под влиянием стимуляции аллоантигеном снижена экспрессия CD28 как на трансляционном, так и на транскрипционном уровнях (Haffar et al., 1995). Как обсуждалось выше, перекрестное связывание на рецепторе CD28 является ключевым сигналом для развития Т-клеточного ответа (Linsley et al., 1991а). Если ВИЧ-инфекция обусловливает подавление поверхностной экспрессии CD28, то инфицированные Т-клетки, распознающие присутствующий антиген, более вероятно вступают в апоптоз, нежели полностью активируются (Schattner & Laurence, 1994). Хотя апоптоз и является нормальным механизмом гибели ВИЧ-инфицированных клеток, данный механизм может обеспечивать дополнительный вклад в происходящую в этом случае элиминацию Т-клеток (Brinchmann et al., 1994).
Было указано на связь CD8-позитивных CTL с развитием долговременной жизнеспособности при ВИЧ-инфекции, при том что высокий уровень лимфоцитов CTL ассоциирован с длительным подавлением СПИДа у инфицированных лиц (Landay et al., 1994). Напротив, гуморальный иммунитет не только оказывается в целом неэффективен в контроле вызванных лентивирусами заболеваний, но, как было показано, антитела могут в действительности даже усиливать заболевание (Lombardi et al., 1994; Siebelink et al., 1995). Наступление заключительной клинической фазы ВИЧ-инфекции и сопровождающего его иммунодефицита у большинства больных коррелирует с переключением клеточного иммунного ответа (1-й тип) на гуморальный ответ (2-й тип) (Schattner & Laurence, 1994). Это согласуется с наблюдениями, согласно которым переход из здорового состояния в СПИД связан со снижением противовирусной активности, обеспечиваемой CTL CD8+ (Lewis et al., 1994). Экспрессия CD28 на поверхности CTL CD8+ также рассматривается как связанная с их противовирусной активностью, при том, что мощная CTL-опосредованная противовирусная активность ассоциирована с экспрессией CD28 CD8-позитивной популяцией лимфоцитов у инфицированного больного (Landay et al., 1993).
Поверхностная экспрессия CD28, хотя для нее и предполагалась функция медиатора резистентности к ВИЧ, подвергается негативному влиянию в присутствие ВИЧ как в инфицированных, так и неинфицированных Т-клетках (Caruso et al., 1994). Начиная с бессимптомных фаз ВИЧ-инфекции, происходит снижение доли Т-клеток CD4+ и CD8+, несущих CD28 (Lewis et al., 1994). Предполагается, что это может быть причиной нарушений секреции цитокинов, обнаруживаемых в ранних фазах инфекции (Caruso et al., 1994), равно как и измененных ответов с участием CD8-позитивных Т-клеток в поздних фазах (Zanussi et al., 1996). У ВИЧ-инфицированных больных снижение пролиферации Т-клеток CD8+ в ранней фазе заболевания, как предполагается, связано с негативной регуляцией CD28, поскольку только экспрессирующие CD28 Т-клетки CD8+ пролиферируют в ответ на IL-2 (Brinchmann et al., 1994). К сожалению, у инфицированных больных Т-клетки CD28-/CD8+ могут составлять до 75% CD8-позитивной популяции, в то время как у здоровых индивидуумов они составляют лишь 25% этой популяции (Saukkonen et al., 1993). Таким образом, хотя популяция клеток CD8+ может оставаться нормальной у инфицированных лиц, эффективность этой популяции по ее способности развивать действенный противовирусный иммунный ответ может быть нарушена даже на начальной фазе заболевания (Caruso et al., 1994).
Также проведенные исследования показали, что передача сигнала от CD28 может быть вовлечена в активность самогó вируса (Asjo et al., 1993; Smithgall et al., 1995). Костимуляция ВИЧ-инфицированных Т-клеток CD4+ периферической крови с участием анти-CD3 и анти-CD28 обусловливает интенсификацию размножения вирусов по сравнению со стимуляцией только анти-СD3 (Smithgall et al., 1995). Такой эффект может быть преодолен путем внесения CTLA-4 Ig, как растворимой формы рецептора, специфичного для CD80, а в меньшей степени - внесением анти-IL2 (Smithgall et al., 1995). В другом исследовании инфицированных Т-клеток CD4+ у 40% больных было установлено, что связывание только CD28 обусловливает позитивную регуляцию размножения вируса при отсутствии необходимости в каких-либо дополнительных стимулах (Asjo et al., 1993).
Предобработка популяций лимфоцитов поверхностным гликопротеином БИЧ - gp120 - обусловливает негативную регуляцию CD80 на поверхности антигенпрезентирующих клеток (Chirmule, 1995). Хотя экспрессия CD28 на Т-клетках снижается при ВИЧ-инфекции, на этих же клетках экспрессия CD80 интенсифицируется (Haffar et al., 1993). Это является предполагаемым механизмом, по которому инфекция может передаваться неинфицированным Т-клеткам, так как взаимодействие между CD28 на поверхности неинфицированных Т-клеток с CD80 на инфицированных Т-клетках может способствовать межклеточному контакту, обеспечивающему перенос вируса (Haffar et al., 1993).
В то время как роль CD28 в ВИЧ-инфекции была исследована, установить значение этого поверхностного белка для FIV пока не удалось. Если на кошках могут быть получены результаты, сходные с теми, которые были выявлены у человека, то это послужит дополнительным подтверждением применимости кошек в качестве модели ретровирусной инфекции.
Материалы и методы
Инфицирование in vivo
Трех взрослых свободных от конкретного патогена кошек инфицировали внутривенно 1×105 TCID50 вируса FIV штамма Maryland. Две похожие кошки являлись контролем, которым инъецировали не содержащую вируса сыворотку. Пробы крови брали непосредственно перед заражением и затем еженедельно в течение 7 недель. В первую неделю после заражения кошек осматривали дважды в день для того, чтобы убедиться в отсутствии исходной реакции на заражение. После развития заболевания животных контролировали ежедневно. В ходе острой клинической фазы заболевания еженедельно по 5-10 мл крови отбирали для СВС (клинический анализ крови) и выделения РВМС. СВС включал подсчет типов клеток на быстрых окрашенных мазках крови (Jorgensen Lab., Loveland, CO).
Клетки РВМС выделяли из крови путем ее сепарирования в градиенте Histopaque (Sigma, St. Louis, МО). После исходной промывки раствором Олсивера примерно 5×105 клеток отбирали и разделяли между 5 лунками 48-лучного планшета. Клетки ресуспендировали в 500 мкл полной среды RPMI и затем помечали с использованием антител, специфичных в отношении либо CD4, либо CD8. Через 1 час инкубации при комнатной температуре при аккуратном качании клетки дважды промывали ФСБ. После промывки добавляли второе антитело - козий антимышиный IgG (H+L), помеченный FITC (KP&L, Gaithersburg, MD) - в концентрации 1:500 и инкубировали при комнатной температуре в течение 1 часа при аккуратном качании. Затем клетки трижды промывали ФСБ и фиксировали 3,7%-ным формалином. Флуоресцентно помеченные популяции затем подвергали количественному анализу на проточном цитофотометре FACSCalibur.
Оставшиеся РВМС промывали дополнительно 10 мл раствора Олсивера. После центрифугирования супернатант удаляли и для проведения экстракции РНК добавляли 1 мл ULTRASPEC (Biotexc, Houston, TX). РНК очищали и преципитировали в соответствии с описанным выше. Затем спектрометрически определяли концентрацию по уровню поглощения при 260 нм. Затем РНК ресуспендировали в 50 мкл DEPC-обработанной воды и замораживали до -70°С для последующего использования.
Полуколичественная ПЦР с реверсированием
Перед проведением ПЦР-амплификации образца РНК 60 мл крови отбирали у умерщвленного животного. РВМС выделяли в соответствии с описанным выше. Клетки подсчитывали в гемоцитометре и разделяли между 4 колбами в концентрации 5×105 клеток на 1 мл. Клетки стимулировали конканавалином-А в течение 0, 8, 16 и 24 часов с последующим центрифугированием и экстракцией РНК из клеточного сгустка с использованием ULTRASPEC в соответствии с описанным выше. ПЦР с ревертированием проводили на материале 1,5 мкг РНК, транскрибируемой в кДНК с использованием обратной транскриптазы MMLV и обратного праймера олиго-dT. Смесь РНК, праймера олиго-dT и DEPC-обработанной дистиллированной воды инкубировали в течение 5 минут при 70°С с целью разрушения вторичной структуры РНК и обеспечения отжига праймера. Затем добавляли транскрипционный буфер, MgCl2, dNTP и DTT и полученную смесь инкубировали при 42°С в течение 2 минут. Затем добавляли 1 мкл обратной транскриптазы и реакцию оставляли на полчаса. Затем по 4 мкл из 25 мкл обратнотранскриптазной реакции добавляли в каждую из 3 пробирок для амплификации CD80 и трех пробирок для амплификации CD28. Затем к кДНК добавляли смесь ПЦР-буфера 10×, dNTP и праймеры, специфичные для CD28 или CD80. Праймеры для CD80 были такими:
прямой праймер B7-S220: CAT GTC TGG CAA AGT АСА AG (SEQ ID NO: 74),
обратный праймер В7-284: ТТА ТАС TAG GGA CAG GGA AG (SEQ ID NO: 75),
в то время как праймеры для CD28 были такими:
прямой CD28-start: CGC GGA ТСС АСС GGT AGC АСА ATG АТС СТС AGG (SEQ ID NO: 13),
обратный CD28-239: ATT TTG CAG AAG TAA ATA TCC (SEQ ID NO: 73).
Затем по три пробирки для каждого из продуктов инкубировали при 95°С в течение 5 минут и затем в каждую пробирку добавляли по 0,25 мкл Taq-полимеразы в 10 мкл воды. Реакции включали в такой температурный цикл: 95°С - 30 секунд, 55°С - 30 секунд, 72°С - 30 секунд. По одной пробирке изымали по прошествии 20, 25 и 30 циклов соответственно. По 20 мкл каждой реакции визуализовали в 1%-ном агарозном геле. Гели фотографировали и определяли число циклов, при котором появлялся искомый продукт. После этих предварительных экспериментов РНК, ранее экстрагированную из крови больных и здоровых животных, амплифицировали в сходном протоколе.
Инфицирование in vitro
Линии Т-клеток, инфицированные FIV in vitro, стимулировали Кон-А в течение 16 часов или не стимулировали вовсе, после чего экспрессию CD28 и CD80 оценивали методом полуколичественной ПЦР с ревертированием. Клеточная линия FETJ представляла собой смешанную популяцию Т-лимфоцитов и росла в отсутствие IL-2 в культуральной среде. Независимые субпопуляции этих клеток были подвергнуты инфицированию вирусом FIV штаммов Maryland и Petaluma. Примерно по 2×108 нормальных, Petaluma-инфицированных и Maryland-инфицированных клеток FETJ стимулировали в течение 16 часов Кон-А (8 мкг/мл) или не стимулировали вовсе. РНК экстрагировали из этих клеток после инкубации с реагентом ULTRASPEC (Biotexc, Houston, TX) и очищали в соответствии с описанным ранее.
МСН-5.4 - линия Т-клеток, производных от кошки из колонии, характеризовавшейся множественными FIV-инфекциями, хотя эта линия и не была хронически инфицирована. Приблизительно 2×108 клеток МСН-5.4 пеллетировали центрифугированием и ресуспендировали в 5 мл концентрированном по FIV супернатанте. Клетки при этой концентрации инкубировали в течение получаса в инкубаторе с 5% CO2 при 37°С с последующим доведением концентрации до примерно 5×105 и культивированием в течение 24 часов. После этого нормальные и инфицированные клетки МСН-5.4 стимулировали Кон-А (8 мкг/мл) в течение 16 часов или не стимулировали вовсе. РНК экстрагировали с использованием реагента ULTRASPEC (Biotexc, Houston, TX) и очищали в соответствии с описанным выше.
Нозерн-блоттинг
Для анализа методом Нозерн-блоттинга концентрацию РНК определяли спектрофотометрически при 260 нм. По 15 мкг каждого образца РНК концентрировали до 3 мкг/мкл и ресуспендировали в 3 объемах загрузочного буфера. Затем образцы нагревали до 70°С в течение 15 минут с целью денатурации РНК и разрушения ее вторичной структуры. Образцы в объеме 20 мкл загружали в 1%-ный денатурирующий агарозный гель и подвергали электрофорезу при напряжении 70 В в течение 2,5 часов до того момента, как край окрашивания бромфеноловым синим достигнет отметки 2 см над нижней кромкой геля. Затем РНК переносили из геля на нейлоновую мембрану Genescreen (Dupont NEN, Boston, MA) за счет капиллярного эффекта (блоттинг). РНК прикрепляли к мембране путем обработки низкоинтенсивным ультрафиолетом в течение 3 минут и затем дорожки визуализовали по четкости рибосомных бэндов методом УФ-экранирования.
Зонд, специфичный для CD28 кошки, был сконструирован с использованием мечения кДНК случайными праймерами. Полноразмерную молекулу CD28 вырезали из клонирующего вектора ТА по фланкирующим EcoRI-сайтам. Полученный фрагмент очищали методом гель-электрофореза и экстрагировали из агарозы с помощью гель-распылителя Amicon (Amicon, Beverly, MA). Затем 25 нг очищенного продукта инкубировали вместе со случайными декануклеотидами в течение 5 минут при 95°С с целью разрушения вторичных структур (Ambion, Austin, TX). Затем реакцию мгновенно замораживали на жидком азоте и к смеси добавляли dNTP (без dATP) и меченный нуклеотид 32P-αdATP. После инкубации в течение 1 минут при 37°С добавляли 1 мкл фрагмента Кленова и полученную смесь инкубировали в течение 30 минут. Реакцию останавливали добавлением 1 мкл 0,5 М ЭДТА и после этого очищали на вращающейся колонке Сефадекс G-50 (Sigma, St. Louis, МО) с целью удаления невключившегося радиоактивно помеченного нуклеотида. 1 мкл реакции разбавляли в 1 мл сцинтилляционной жидкости и активность зонда определяли с помощью счетчика сцинтилляций. Блоты прегибридизовали в течение 15 минут при 65°С в 5 мл реактива Rapid Hyb (Amersham Life Science, Cleveland, ОН). По 5 мкл зонда в концентрации 3-5 млн. имп/мин на 1 мкл добавляли к каждому блоту и инкубировали при вращении в течение 1,5 часов при 65°С. Затем зонд удаляли и блоты дважды промывали в 1% SSC + 0,1% SDS при комнатной температуре в течение 15 минут. Затем блоты сканировали с помощью счетчика Гейгера и при необходимости вновь промывали при 65°С. Результаты мечения оценивали количественно с помощью сканера Betagen. Проводили окончательную промывку при 65°С в течение 15 минут и блоты помещали на пленку на 16-24 часа при -70°С с использованием интенсифицирующего экрана. Авторадиограммы проявляли и количественно оценивали денситометрически. Для подтверждения целостности РНК и ее концентрации использовали специфичный для G3PDH зонд (любезно предоставленный проф. J.Piedrahita, Texas A&M University), который метили и гибридизовали аналогичным способом.
Полуколичественная ПЦР с реверсированием на материале in vitro инфицированных клеток
Далее для анализа присутствия CD28 применяли полуколичественную ПЦР. Как было описано выше, концентрацию экстрагированной РНК оценивали путем спектрофотометрического считывания при 260 нм. По 2 мкг (при конечном объеме 25 мкл) транскрибировали в кДНК с использованием праймера олиго-dT и обратной транскриптазы MMLV в соответствии с описанным выше. Затем 3,5 мкл обратнотранскриптазной реакции переносили в 7 пробирок для ПЦР. Три пробирки амплифицировали с использованием праймеров, специфичных для CD80, три пробирки - с использованием праймеров, специфичных для CD28, а оставшуюся пробирку - с праймерами, специфичными в отношении G3PDH:
прямой G3PDH: ССТ ТСА TTG АСС ТСА ACT АСА Т (SEQ ID NO: 76),
обратный G3PDH: ССА AAG TTG ТСА TGG ATG АСС (SEQ ID NO: 77).
Как описывалось выше, пробирки изымали из реакции через 20, 25 и 30 циклов. По 20 мкл каждого образца визуализовали в 1%-ном агарозном геле. Кроме того, сходным образом на материале клеток линий FETJ и МСН-5.4 тестировали присутствие некоторых других Т-клеточных цитокинов. Специфичные для них праймеры были такими:
прямой IL-2: САА ССС САА ACT CTC CAG GAT G (SEQ ID NO: 78),
обратный IL-2: GGT CAG CGT TGA GAA GAT GCT TTG (SEQ ID NO: 79),
прямой IL-4: TAT TAA TGG GTC ТСА ССТ АСС (SEQ ID NO: 80),
обратный IL-4: TTG GCT ТСА ТТС АСА GAA CAG (SEQ ID NO: 81),
прямой INFγ: GGG TCG CTT TTC GTA GAC ATT TTG (SEQ ID NO: 82),
обратный INFγ: CAG GCA GGA САА ССА ТТА ТТТ С (SEQ ID NO: 83),
и их использовали для амплификации кДНК, транскрибированной на материале 1,25 мкг РНК. Для каждого цитокина амплифицировали по 20% транскрипционной реакции. Оставшуюся кДНК амплифицировали с использованием праймеров для G3PDH. кДНК амплифицировали на протяжении 30 циклов в следующем режиме: 5 минут при 95°С - 1 цикл; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 55°С, 30 секунд при 72°С - 30 циклов; 5 минут при 72°С - 1 цикл. Затем 20 мкл реакции визуализовали в 1%-ном агарозном геле.
Определение инфекции методом ПЦР с реверсированием
Инфицированность клеток FETJ и МСН-5.4 была подтверждена путем амплификации в ОТ-ПЦР последовательности вирусного гена gag. РНК в количестве 1,25 мкг транскрибировали в кДНК в соответствии с описанными выше параметрами с использованием обратной транскриптазы MMLV и обратного праймера, специфичного для gag. 10 мкл обратнотранскриптазной реакции амплифицировали методом ПЦР с "горячим стартом" в следующем режиме: 5 минут при 95°С; 30 секунд при 95°С, 30 секунд при 55°С, 30 секунд при 72°С - 30 циклов; 5 минут при 72°С. После амплификации 20 мкл каждого образца визуализовали в 1%-ном агарозном геле.
Результаты
Для того чтобы определить влияние острой инфекции in vivo на экспрессию CD28, кошки AUO4, AUU3 и ОАС2 были заражены вирусом путем внутривенной инъекции, в то время как кошкам AWG3 и ОАЕ6 инъецировали "пустую" среду. Анализ методом FACS показал наличие некоторой дифференцировки отношения CD4:CD8 у экспериментальных и контрольных животных. В то время как в контроле в целом соблюдалось постоянное отношение на уровне 2:1, в экспериментальной группе имелись определенные колебания этого отношения, у одного животного снизившегося до 1:1 (табл.3).
Таблица 3 Отношение лимфоцитов CD4:CD8 среди РВМС у перенесших острую инфекцию и неинфицированных кошек |
|||||||
CD4:CD8 | нед-1 | нед-2 | нед-3 | нед-4 | нед-5 | нед-6 | нед-8 |
Инфицированные | |||||||
AUO4 | 4,5 | н/о | 1,9 | 1,2 | 1,0 | 1,5 | 1,6 |
AUU3 | н/о | 2,3 | 2,9 | 1,3 | 1,2 | 1,1 | 2,1 |
ОАС2 | 2,8 | 1,48 | 2,3 | 1,9 | 1,1 | 1,14 | 1,1 |
Неинфицированные | |||||||
AWG3 | 2,6 | 1,5 | 1,9 | 2,0 | 1,8 | 1,9 | 2,2 |
ОАЕ6 | 2,1 | 1,5 | 1,9 | 1,2 | 1,8 | 2,0 | 2,0 |
Анализ экспрессии РНК CD80 и CD28 во времени проводили для того, чтобы показать, что мРНК каждого белка присутствует и может быть амплифицирована методом ПЦР через 0, 8, 16 и 24 часа после стимуляции Кон-А. Данная процедура полуколичественной ПЦР была рассчитана на выявление визуализуемого бэнда при минимальном числе циклов амплификации, что можно было бы использовать в качестве относительного показателя количества данной мРНК. Отчетливый бэнд, специфичный для CD80, отсутствовал после 20 и 25 циклов через любое время после инфицирования, но после 30 циклов бэнд мРНК CD80 выявлялся в геле в каждой из экспериментальных групп. Также мРНК CD28 визуализовался на каждом временнóм этапе после 30 циклов амплификации, хотя на отрезке в 16 часов он также визуализовался (слабо) после 25 циклов.
Сходный подход был использован в отношении РНК, экстрагированной из РВМС FIV-инфицированных и неинфицированных кошек. Амплификацию методом ОТ-ПЦР специфичной для CD28 и CD80 РНК использовали для определения относительного количества транскрибируемой мРНК каждого из этих белков. Как это было осуществлено выше в эксперименте по временнóй динамике, образцы изымали по прошествии 20, 25 и 30 циклов. После 20 циклов мРНК не выявлялись, хотя оба продукта мРНК CD28 и CD80 визуализовались после 25 циклов (табл.4). Отсутствовали какие-либо отличия по экспрессии любой из этих мРНК между экспериментальной и контрольной группами. В обоих случаях имелись колебания признака числа циклов, при котором происходила визуализация продукта.
Таблица 4 Полуколичественное определение продуктов ОТ-ПЦР для CD80 и CD28, амплифицированных на материале РНК инфицированных и неинфицированных РВМС в интервалах острой фазы FIV-инфекции |
|||||||
Число циклов с визуализацией | до-инф | нед-1 | нед-3 | нед-4 | нед-6 | нед-8 | |
Инфицированные | |||||||
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | |
AUO4 | 30/30 | 30/30 | 30/30 | -/25 | 30/25 | 25/25 | |
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | |
AUU3 | 30/30 | 30/30 | 25/25 | -/25 | 30/25 | -/30 | |
ОАС2 | 30/30 | 30/30 | 30/30 | -/30 | 25/30 | 25/25 | |
Неинфицированные | |||||||
AWG3 | 25/30 | 30/30 | 30/25 | -/30 | 30/25 | 25/25 | |
ОАЕ6 | 30/30 | -/30 | -/30 | -/25 | 30/30 | 25/25 |
ПЦР-амплификация мРНК из клеток линий FETJ и МСН-5.4 с использованием FIV/gag-специфичных праймеров показала, что клеточная линия МСН-5.4 инфицируема и сохраняет активный инфекционный агент, в то время как клеточные линии FETJ не позволяют амплифицировать gag-специфичную РНК. FIV-специфичный продукт легко амплифицируется из РНК, экстрагированной из образцов клеток МСН-5.4, но не из РНК, экстрагированной из неинфицированного контроля. Сходные реакции, проведенные на материале клеточных линий FETJ, обработанных вирусом FIV штаммов Petaluma и Maryland, не позволили получить визуализуемый продукт при тех же условиях (данные не включены).
Нозерн-блоттинг и полуколичественную ПЦР проводили с целью выявления мРНК CD28 в нормальных клеточных линиях FETJ и МСН-5.4. Линия клеток МСН-5.4 была представлена инфицированной (экспериментальной) группой и неинфицированным контролем, в то время как клеточную линию FETJ использовали в качестве непермиссивных контрольных Т-клеток.
Результаты полуколичественной ПЦР показали, что каждая клеточная линия способна вырабатывать мРНК CD28. При амплификации неинфицированных FETJ были выявлены параметры экспрессии, сходные с теми, которые были выявлены в описанном выше эксперименте по временнóй динамике экспрессии. Если в 0 часов после стимуляции (по сути без нее) бэнд отсутствовал вплоть до проведения 30 циклов, то к 16-му часу после стимуляции бэнд выявлялся после 25 циклов. Сходные параметры выявили в неинфицированной линии клеток МСН-5.4 при том, что бэнд отсутствовал до 30-го цикла в 0-й час и визуализовался после 25 циклов через 16 часов инкубации. Интересно, что в инфицированных клетках МСН-5.4 эти параметры отличались от таковых у контрольных клеток. В экспериментальной группе мРНК не визуализовались вплоть до 30 циклов ни в 0-й, ни в 16-й час. Для подтверждения целостности экстрагированной РНК и ее концентрации проводили амплификацию мРНК G3PDH. Таким образом, инфицирование влияет на экспрессию РНК CD28.
Анализ методом Нозерн-блоттинга использовали для подтверждения данных, которые были получены с применением полуколичественной ОТ-ПЦР. Наиболее сильную гибридизацию с зондом установили для РНК из неинфицированных клеток МСН-5.4, простимулированных Кон-А в течение 16 часов. Непростимулированный образец неинфицированных клеток характеризовался более интенсивной гибридизацией по сравнению с любыми инфицированными (стимулированными или нет) клетками МСН-5.4.
В дополнение к авторадиографической оценке измеряли уровень радиоактивности с помощью счетчика BetaGen. Предварительные подсчеты по гибридизации CD28 стандартизовали по подсчетам, полученным для того же блота с зондом для G3PDH (табл.5).
Таблица 5 Нормализованный обсчет Нозерн-блотов по CD28 с помощью BetaGen |
|||
G3PDH | CD28 | CD28, норм. | |
МСН-5.4, без стимуляции | 14995 | 14921 | 14807 |
МСН-5.4, стимуляция Кон-А | 13336 | 13270 | 15430 |
МСН-5.4, инфицированные | 16700 | 10854 | 9867 |
МСН-5.4, инф. + стимуляция Кон-А | 15112 | 11077 | 10967 |
Амплификация методом ПЦР с ревертированием РНК цитокинов из клеточных линий МСН-5.4 показала амплифицируемость мРНК только для IL-2. Ни IL-4, ни IL-6, ни γ-интерферон не удалось амплифицировать в 30 циклах, хотя мРНК IL-2 выявлялась достаточно легко.
Обсуждение
мРНК CD28 анализировали при инфекциях in vivo и in vitro с целью определения того, может ли быть оценена экспрессия CD28 и изменяет ретровирусная инфекция экспрессию мРНК. Когда может быть выделено достаточное количество РНК, мРНК CD28 измеряли методом Нозерн-блоттинга, а при ограниченности такого выделения применяли полуколичественную ПЦР с ревертированием.
По результатам экспериментов in vivo по инфицированию трех животных вирусом FIV штамма Maryland в соответствии с объяснявшимся выше, мРНК, специфичные для CD28 и CD80, амплифицировали из пула РНК, экстрагированного из РВМС, выделенных из проб крови этих инфицированных животных и неинфицированного контроля. Хотя анализ методом Нозерн-блоттинга является предпочтительным, полуколичественную ПЦР с ревертированием использовали из-за ограниченности числа клеток и доступного количества РНК из них. У кошек брали кровь каждую неделю, поэтому для каждого эксперимента могло быть взято максимум 10 мл крови.
Анализ методом FACS отношений CD4:CD8 в РВМС инфицированных животных показал его снижение в течение 8 недель у инфицированных животных по сравнению с неинфицированными животными, у которых это отношение оставалось относительно постоянным. Имеются различия между двумя экспериментальными группами. Хотя отношение CD4:CD8 различается у инфицированных и неинфицированных животных, не было выявлено различий по параметрам СВС или экспрессии CD80 и CD28 (данные не включены).
Для оптимального выявления экспрессии CD28 необходимы очищенные пулы Т-клеток. В выделенных фракциях РВМС на самом деле примерно 40% являются Т-клетками. Среди этих клеток на разных этапах эксперимента до половины клеток были CD8-позитивными Т-клетками, которые не экспрессировали CD28 в той же концентрации, что и Т-клетки CD4+. Это согласуется с тем фактом, что, как и у других видов, покоящимися Т-клетками (которые в кровотоке составляют большинство Т-клеток) CD28 на высоком уровне не экспрессируется, и это объясняет необходимость применения ПЦР вместо Нозерн-блоттинга. Предварительные эксперименты, направленные на выявление мРНК CD28 на материале 20 мкг РНК, экстрагированной из РВМС, оказались безуспешными. В полуколичественной ПЦР с ревертированием было установлено присутствие РНК, кодирующей CD28. Этот метод также был применен для амплификации мРНК CD80.
На материале клеточных линий in vitro получили пулы РНК, в которых мРНК CD28 выявляли методом Нозерн-блоттинга. Клетки линии МСН-5.4 выбрали потому, что, будучи линией Т-клеток, они являлись потенциальным экспрессантом мРНК CD28, а также она происходила от линии, предварительно приобретшей хроническую вирусную инфекцию. Наконец, достоинством этой линии клеток была доступность значительного количества РНК по сравнению с лимфоцитами крови, взятыми от единственного животного.
Также предпринимались попытки выявить мРНК методом Нозерн-блоттинга. В то время как на покоящихся В-клетках и моноцитах CD80 присутствует в низкой концентрации, в стимулированных моноцитах и макрофагах отмечены наивысшие уровни его экспрессии. Линия антиген-презентирующих клеток кошки оказалась недоступной, а Т-клетки в норме экспрессируют этот белок только на низком уровне. Эксперименты по выявлению мРНК CD80 в пулах РНК, экстрагированных из РВМС, оказались безуспешными, по-видимому, по тем же причинам, о которых говорилось выше при обсуждении CD28. С другой стороны, при использовании полуколичественной ПЦР с ревертированием в отношении клеток, полученных от инфицированных животных, были выявлены мРНК CD80 и CD28. Хотя данный метод и не дает точной количественной оценки мРНК, тем не менее он указывает на присутствие мРНК и на относительное его количество.
Успешным оказался анализ методом Нозерн-блоттинга мРНК CD28 Т-клеточной линии кошки. При сравнении параметров мРНК CD28 для инфицированных и неинфицированных клеток установили различия в параметрах экспрессии. Наиболее многочисленной мРНК CD28 была в неинфицированных клетках, простимулированных конканавалином-А в течение 16 часов. Также мРНК выявили в нестимулированных и неинфицированных клетках. При том что данная мРНК обнаруживается в стимулированных и нестимулированных FIV-инфицированных клетках, эти уровни оказываются существенно меньшими по сравнению с неинфицированными клетками. Эти данные хорошо согласуются со сходными данными, полученными в методе ПЦР с ревертированием.
Выявление мРНК CD28 не затруднено теми же ограничениями, которые имели место в случае с молекулой CD80. Однако если может быть выделена крупная популяциях клеток, экспрессирующих CD80, то можно было бы легко выявить мРНК с применением Нозерн-блоттинга. Когда будут сформированы специфичные моноклональные антитела для данных поверхностно-клеточных белков, будет интересно сопоставить уровни мРНК с уровнем поверхностной экспрессии каждого из этих белков.
кДНК цитокинов амплифицировали для того, чтобы подтвердить отсутствие различий между инфицированными и неинфицированными линиями. Независимо от статуса инфицированности в каждой группе амплифицировали IL-2. мРНК каких-либо иных цитокинов амплифицировать не удалось.
Данные Нозерн-блоттинга показывают, что in vitro экспрессия CD28 на уровне мРНК негативно регулируется вирусом FIV. Хотя такая закономерность еще должна быть подтверждена путем измерения уровней поверхностной экспрессии, ясно, что FIV-инфекция in vitro может влиять на экспрессию CD28, что было ранее продемонстрировано для Т-клеток человека в случае ВИЧ-инфекции (Brinchmann et al., 1994).
Заключение
Клонирование и секвенирование кДНК, кодирующей сигнальный комплекс молекул CD28 и CD80 кошки, привело к получению продуктов, аналогичных молекулам, выделявшимся у других видов. Хотя расшифрованная аминокислотная последовательность белка кошки проявила относительно низкий уровень идентичности по отношению к полипептидам человека и мыши, данные сравнения с ранее клонированными молекулами, сохранение характерных аминокислотных остатков и тот факт, что данный поверхностный лиганд по-видимому лишен прямых сигнальных функций, позволили сделать вывод о том, что выделенный продукт действительно является кошачьим аналогом CD80. Напротив, молекула CD28 кошки характеризуется средним уровнем идентичности и на уровне нуклеотидных, и на уровне аминокислотных последовательностей, т.е. является аналогом молекул, клонированных у других видов.
Природу этих молекул далее исследовали путем выявления их взаимодействия в тестах на связывание. Моноклональные антитела, специфичные в отношении аналогичных белков других видов, не могут реагировать с экспрессируемыми белками кошки. С учетом этого был разработан ряд тестов на связывание, нацеленных на выявление взаимодействия, а также того, что такое взаимодействие подавляется растворимым рецептором. В этих тестах связывание определяли по сохранению флуоресцентно помеченных клеток, которые могут быть подавлены внесением соответствующих растворимых рецепторов. Данные тесты показали не только то, что белки CD80 и CD28 кошки могут быть экспрессированы, но также и то, что эти поверхностно-экспрессируемые молекулы могут взаимодействовать.
Также экспрессия этих молекул была охарактеризована в ходе активной инфекции. Экспрессию CD28 и CD80 исследовали в моделях in vivo и in vitro, подвергавшихся заражению вирусом FIV. Экспрессия CD28, которая изменяется в ВИЧ-инфицированных клетках человека (Asjo et al., 1993), также претерпевала негативные изменения вслед за FIV-инфекцией Т-клеток кошки. Последующая информация, касающаяся экспрессии каждой из этих молекул при развитии заболевания, должна дополнительно подтверждать то, что организм кошки является важной моделью ретровирусной инфекции.
Способы долговременного применения указанных молекул потенциально могут быть широкими. Изучение структуры иммунных систем, эволюционно обособленных от иммунной системы человека, может обусловить лишь еще большее понимание того, как иммунная система работает в организме человека. Более того, важность домашней кошки как модельного организма ретровирусной инфекции, убедительно подтверждена (Siebelink et al., 1990). Предполагается, что белок CD80, входя в состав противоретровирусных вакцин, является потенциальным адъювантом при индукции CTL памяти. Кошка может быть исключительно информативной моделью с точки зрения проверки эффективности данной закономерности.
Claims (27)
1. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая лиганд CD86 кошки, растворимый лиганд CD86 кошки или их фрагмент, причем лиганд CD86 кошки кодируется кодирующей последовательностью SEQ ID NO: 5.
2. Нуклеиновая кислота по п.1, где лиганд CD86 кошки содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6.
3. Нуклеиновая кислота по п.1 или 2, где нуклеиновая кислота является РНК.
4. Нуклеиновая кислота по п.1 или 2, где нуклеиновая кислота является ДНК.
5. Нуклеиновая кислота по п.4, где ДНК является кДНК.
6. Нуклеиновая кислота по п.4, где ДНК является геномной ДНК.
7. Диагностический олигонуклеотид, состоящий, по меньшей мере, из 12 нуклеотидов, который характеризуется последовательностью, комплементарной последовательности, уникально присутствующей в нуклеиновой кислоте по п.1 или 2, имеющей нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 5.
8. Диагностический олигонуклеотид по п.7, который состоит, по меньшей мере, из 15 или 16 нуклеотидов.
9. Диагностический олигонуклеотид по п.7 или 8, где олигонуклеотид помечен выявляемой меткой.
10. Диагностический олигонуклеотид по п.9, где выявляемая метка содержит радиоактивный изотоп, флуорофор или биотин.
11. Диагностический олигонуклеотид по п.7 или 8, где олигонуклеотид избирательно метилирован.
12. Клонирующий вектор, содержащий нуклеиновую кислоту по п.1 или 2.
13. Вектор по п.12, обозначенный В7-2#19-2/011298 (депозитарный № АТСС 209821).
14. Вектор по п.10 или 11, содержащий промотор, функционально присоединенный к указанной нуклеиновой кислоте.
15. Вакцина для модулирования иммунного ответа у кошки, содержащая эффективное количество полипептида, кодируемого нуклеиновой кислотой по п.1 или 2, и подходящий носитель.
16. Вакцина по п.15, где полипептид представляет собой лиганд CD86, растворимый лиганд CD86 кошки или их фрагмент.
17. Вакцина по п.15 или 16, где эффективным количеством является количество примерно от 0,01 до 100 мг на одну дозу.
18. Вакцина по п.15 или 16, где эффективным количеством является количество примерно от 0,25 мг/кг массы тела кошки в сутки примерно до 25 мг/кг массы тела кошки в сутки.
19. Вакцина по любому из пп.15-18, которая дополнительно содержит иммуноген, производный от патогена.
20. Вакцина по п.19, где патоген является патогеном кошки, вирусом бешенства, хламидией, Toxoplasma gondii, Dirofilaria immitis, патогеном блохи или бактериальным патогеном.
21. Вакцина по п.20, где патогеном кошки является вирус иммунодефицита кошачьих (FIV), вирус лейкоза кошачьих (FeLV), вирус инфекционного перитонита кошачьих (FIP), вирус панлейкопении кошачьих, калицивирус кошачьих, реовирус 3 типа кошачьих, ротавирус кошачьих, коронавирус кошачьих, респираторно-синцитиальный вирус кошачьих, вирус саркомы кошачьих, герпесвирус кошачьих, вирус болезни Борна кошек или паразит кошек.
22. Способ индукции иммунитета у кошки, предусматривающий введение кошке вакцины по любому из пп.15-21.
23. Способ усиления иммунного ответа у кошки, предусматривающий введение кошке вакцины по любому из пп.15-21.
24. Способ по п.22 или 23, где вакцину вводят подкожно, внутримышечно, системно, местно или перорально.
25. Способ подавления иммунного ответа у кошки, предусматривающий введение кошке эффективно подавляющего иммунный ответ количества растворимого полипептида, кодируемого нуклеиновой кислотой по п.1 или 2,
26. Способ по п.25, где указанное количество составляет примерно от 0,25 мг/кг массы тела в сутки примерно до 25 мг/кг массы тела в сутки.
27. Способ по п.25, где кошка страдает аутоиммунным заболеванием или является реципиентом при пересадке ткани или органа.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US7169998A | 1998-05-01 | 1998-05-01 | |
US09/071,699 | 1998-05-01 | ||
US09/071699 | 1998-05-01 |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2005108676/13A Division RU2377302C2 (ru) | 1998-05-01 | 1999-04-30 | Нуклеиновые кислоты, кодирующие рецептор ctla-4 кошки, вектор, клетки-хозяева, вакцины, олигонуклеотиды, полипептиды ctla-4 кошки и способы индукции и подавления иммунного ответа у кошки |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2000130225A RU2000130225A (ru) | 2003-08-20 |
RU2263145C2 true RU2263145C2 (ru) | 2005-10-27 |
Family
ID=22102998
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2005108676/13A RU2377302C2 (ru) | 1998-05-01 | 1999-04-30 | Нуклеиновые кислоты, кодирующие рецептор ctla-4 кошки, вектор, клетки-хозяева, вакцины, олигонуклеотиды, полипептиды ctla-4 кошки и способы индукции и подавления иммунного ответа у кошки |
RU2000130225/13A RU2263145C2 (ru) | 1998-05-01 | 1999-04-30 | Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая лиганд cd86 кошки, диагностический олигонуклеотид, клонирующий вектор, вакцина, способы индукции или подавления иммунитета у кошки |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2005108676/13A RU2377302C2 (ru) | 1998-05-01 | 1999-04-30 | Нуклеиновые кислоты, кодирующие рецептор ctla-4 кошки, вектор, клетки-хозяева, вакцины, олигонуклеотиды, полипептиды ctla-4 кошки и способы индукции и подавления иммунного ответа у кошки |
Country Status (21)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP1073741B1 (ru) |
JP (3) | JP2002513571A (ru) |
KR (2) | KR100869861B1 (ru) |
AT (1) | ATE481485T1 (ru) |
AU (1) | AU4070399A (ru) |
BR (1) | BR9910153A (ru) |
CA (1) | CA2327539A1 (ru) |
CZ (1) | CZ20003935A3 (ru) |
DE (1) | DE69942765D1 (ru) |
ES (1) | ES2352745T3 (ru) |
HK (1) | HK1034537A1 (ru) |
HU (1) | HUP0102806A3 (ru) |
IL (4) | IL139371A0 (ru) |
NO (1) | NO20005481L (ru) |
NZ (1) | NZ507794A (ru) |
PL (1) | PL199352B1 (ru) |
RU (2) | RU2377302C2 (ru) |
SK (1) | SK16172000A3 (ru) |
UA (2) | UA77382C2 (ru) |
WO (1) | WO1999057271A2 (ru) |
ZA (1) | ZA200006123B (ru) |
Families Citing this family (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7094874B2 (en) | 2000-05-26 | 2006-08-22 | Bristol-Myers Squibb Co. | Soluble CTLA4 mutant molecules |
US7183376B2 (en) | 2000-06-23 | 2007-02-27 | Maxygen, Inc. | Variant B7 co-stimulatory molecules |
US7094875B2 (en) | 2000-06-23 | 2006-08-22 | Maxygen, Inc. | Co-stimulatory polypeptides |
CN105142662B (zh) * | 2012-01-05 | 2017-07-07 | 德国癌症研究中心 | Idh1 r132h突变阳性癌症治疗或诊断的手段与方法 |
CN110184283A (zh) * | 2019-04-30 | 2019-08-30 | 吉林农业大学 | 一种检测虎细小病毒的lamp-lfd试剂盒 |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
FR2658669B1 (fr) * | 1990-02-20 | 1992-07-24 | Souriau & Cie | Connecteur a verrouillage par levier. |
AU7638894A (en) * | 1993-09-03 | 1995-03-22 | Miyuki Azuma | B70(b7-2):ctla-4 bonding protein |
DE69519521T2 (de) * | 1994-10-03 | 2001-06-28 | The Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary National Institute Of Health | Zusammensetzung enthaltend ein antigen exprimierendes rekombinantes virus und ein immunstimulierendes molekül exprimierendes rekombinantes virus |
JP4025400B2 (ja) * | 1997-04-16 | 2007-12-19 | 財団法人化学及血清療法研究所 | 新規免疫制御分子及びその製造方法 |
-
1999
- 1999-04-30 PL PL345975A patent/PL199352B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1999-04-30 UA UA2000116864A patent/UA77382C2/uk unknown
- 1999-04-30 IL IL13937199A patent/IL139371A0/xx unknown
- 1999-04-30 BR BR9910153-0A patent/BR9910153A/pt not_active Application Discontinuation
- 1999-04-30 NZ NZ507794A patent/NZ507794A/en unknown
- 1999-04-30 ES ES99924130T patent/ES2352745T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1999-04-30 AT AT99924130T patent/ATE481485T1/de not_active IP Right Cessation
- 1999-04-30 EP EP99924130A patent/EP1073741B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-04-30 SK SK1617-2000A patent/SK16172000A3/sk unknown
- 1999-04-30 DE DE69942765T patent/DE69942765D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1999-04-30 KR KR1020007012138A patent/KR100869861B1/ko not_active IP Right Cessation
- 1999-04-30 CZ CZ20003935A patent/CZ20003935A3/cs unknown
- 1999-04-30 RU RU2005108676/13A patent/RU2377302C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1999-04-30 HU HU0102806A patent/HUP0102806A3/hu not_active Application Discontinuation
- 1999-04-30 CA CA002327539A patent/CA2327539A1/en not_active Abandoned
- 1999-04-30 AU AU40703/99A patent/AU4070399A/en not_active Abandoned
- 1999-04-30 JP JP2000547226A patent/JP2002513571A/ja not_active Withdrawn
- 1999-04-30 KR KR10-2004-7006622A patent/KR20040053251A/ko not_active Application Discontinuation
- 1999-04-30 UA UAA200603428A patent/UA87470C2/ru unknown
- 1999-04-30 RU RU2000130225/13A patent/RU2263145C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1999-04-30 WO PCT/US1999/009502 patent/WO1999057271A2/en active Application Filing
-
2000
- 2000-10-30 IL IL139371A patent/IL139371A/en not_active IP Right Cessation
- 2000-10-30 ZA ZA200006123A patent/ZA200006123B/xx unknown
- 2000-10-31 NO NO20005481A patent/NO20005481L/no not_active Application Discontinuation
-
2001
- 2001-07-20 HK HK01105096.1A patent/HK1034537A1/xx not_active IP Right Cessation
-
2007
- 2007-06-25 IL IL184202A patent/IL184202A/en not_active IP Right Cessation
- 2007-06-25 IL IL184201A patent/IL184201A/en not_active IP Right Cessation
-
2009
- 2009-12-02 JP JP2009274978A patent/JP2010104369A/ja active Pending
-
2010
- 2010-07-16 JP JP2010161913A patent/JP2010252804A/ja active Pending
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
SIEGALL C.B. et al., "Prevention of immunotoxin-induced immunogenicity by coadministration with CTLA4Ig enhances antitumor efficacy", J Immunol. 1997 Nov 15; 159(10):5168-73. * |
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
DK1234031T3 (en) | B7-H1, AN UNKNOWN IMMUNE REGULATORY MOLECULE | |
CA2572239C (en) | B7-h5, a costimulatory polypeptide | |
US8071738B2 (en) | Feline CD86 polypeptides and nucleic acids | |
JP2010252804A (ja) | ネコcd80、ネコcd86、ネコcd28およびネコctla−4核酸およびポリペプチド | |
RU2244006C2 (ru) | Рекомбинантный вирус, экспрессирующий чужеродную днк, кодирующую кошачий cd80, кошачий ctla-4 или кошачий cd86, и его использование | |
EP1140153A2 (en) | Improvement of tolerance to a xenograft | |
US20130295133A1 (en) | Recombinant virus expressing foreign dna encoding feline cd80, feline cd86, feline cd28, or feline ctla-4 and uses thereof | |
KR20210084125A (ko) | 신규 사이토메갈로바이러스 dna 백신 컨스트럭트 및 그의 용도 | |
AU2007214286B2 (en) | Feline CD80, feline CD86, feline CD28 and feline CTLA-4 nucleic acid and polypeptides | |
MXPA00010618A (en) | Feline cd80, feline cd86, feline cd28, and feline ctla-4 nucleic acid and polypeptides | |
AU2003271367A1 (en) | Feline CD80, feline CD86, feline CD28, and feline CTLA-4 nucleic acid and polypeptides | |
CN116194475A (zh) | 对冠状病毒蛋白具有特异性的有蹄类动物源性多克隆免疫球蛋白和其用途 | |
Choi | Mechanisms of interactions between FIV-infected and FIV effector T lymphocytes | |
Peschon et al. | Analysis of 4-1BB Ligand (4-1BBL)-Deficient | |
MXPA00010613A (es) | Virus recombinante que expresa adn extraño que codifica para cd80 de felino, ctla-4 de felino o cd86 de felino y usos del mismo |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20050501 |
|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20120501 |