RU2020130880A - Варианты свиного трипсина - Google Patents

Варианты свиного трипсина Download PDF

Info

Publication number
RU2020130880A
RU2020130880A RU2020130880A RU2020130880A RU2020130880A RU 2020130880 A RU2020130880 A RU 2020130880A RU 2020130880 A RU2020130880 A RU 2020130880A RU 2020130880 A RU2020130880 A RU 2020130880A RU 2020130880 A RU2020130880 A RU 2020130880A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
amino acid
group
variant
thr
Prior art date
Application number
RU2020130880A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2020130880A3 (ru
RU2783315C2 (ru
Inventor
Томас ШТИЛЛГЕР
Себастьян РИССОМ
Клаудиа ФЕЛЛЕР
Андреас ФОГЕЛЬ
Original Assignee
Санофи-Авентис Дойчланд Гмбх
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Санофи-Авентис Дойчланд Гмбх filed Critical Санофи-Авентис Дойчланд Гмбх
Publication of RU2020130880A3 publication Critical patent/RU2020130880A3/ru
Publication of RU2020130880A publication Critical patent/RU2020130880A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2783315C2 publication Critical patent/RU2783315C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/64Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
    • C12N9/6421Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
    • C12N9/6424Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12N9/6427Chymotrypsins (3.4.21.1; 3.4.21.2); Trypsin (3.4.21.4)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/575Hormones
    • C07K14/62Insulins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y304/00Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
    • C12Y304/21Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12Y304/21004Trypsin (3.4.21.4)

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Meat, Egg Or Seafood Products (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Fodder In General (AREA)
  • Coloring Foods And Improving Nutritive Qualities (AREA)

Claims (57)

1. Вариант свиного трипсина, содержащий или состоящий из аминокислотной последовательности, которая характеризуется по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с SEQ ID NO: 1,
где указанная аминокислотная последовательность отличается от SEQ ID NO: 1 по меньшей мере одной или несколькими аминокислотными заменами в одном или нескольких положениях, соответствующих F24, S44, D56, G78, Y131, S172 и W193 нативного свиного трипсина в соответствии с SEQ ID NO: 1,
при условии, что указанная аминокислотная последовательность не представляет собой нативный свиной трипсин в соответствии с SEQ ID NO: 1; и
при условии, что указанная аминокислотная последовательность не представляет собой вариант свиного трипсина S172A в соответствии с SEQ ID NO: 2.
2. Вариант свиного трипсина по п. 1,
где аминокислота в положении, соответствующем F24, заменена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из Ala, Asn, Arg, Gln, Ile, Leu, Lys, Met, Ser, Thr и Val;
где аминокислота в положении, соответствующем S44, заменена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из Leu и Pro;
где аминокислота в положении, соответствующем D56, заменена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из Ala, Asn, His и Trp;
где аминокислота в положении, соответствующем G78, заменена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из Ala, Glu; Pro, Ser и Tyr;
где аминокислота в положении, соответствующем Y131, заменена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из Ala, Asn, Asp, Cys, Gln; Glu, Gly, His, Ile, Leu, Met, Ser, Thr, Trp, Val;
где аминокислота в положении, соответствующем S172, заменена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из Ala, Cys и Thr; и/или
где аминокислота в положении, соответствующем W193, заменена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из Phe, Ser, Thr и Tyr.
3. Вариант свиного трипсина по любому из пп. 1, 2, где указанная аминокислотная последовательность дополнительно отличается от SEQ ID NO: 1 по меньшей мере одной или несколькими аминокислотными заменами в одном или нескольких положениях, соответствующих R99, R107, K125 и K170 нативного свиного трипсина в соответствии с SEQ ID NO: 1.
4. Вариант свиного трипсина по п. 3,
где аминокислота в положении, соответствующем R99, заменена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из Ala, Asn, Asp, Glu, Gly, His, Leu, Phe, Thr, Trp и Tyr;
где аминокислота в положении, соответствующем R107, заменена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из Asp, Gly, Pro, Ser и Thr;
где аминокислота в положении, соответствующем K125, заменена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из Ala, Cys, Gln, Glu, Gly, His, Leu, Ser и Tyr; и/или
где аминокислота в положении, соответствующем K170, заменена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из Ala, Asn, Gly и Tyr.
5. Вариант свиного трипсина по любому из пп. 1-4, где указанная аминокислотная последовательность представляет собой SEQ ID NO: 3,
где
- Xaa24 представляет собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из Ala, Asn, Arg, Gln, Ile, Leu, Lys, Met, Phe, Ser, Thr и Val;
- Xaa44 представляет собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из Leu, Pro и Ser;
- Xaa56 представляет собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из Ala, Asn, Asp, His и Trp;
- Xaa78 представляет собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из Ala, Glu, Gly, Pro, Ser и Tyr;
- Xaa99 представляет собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из Ala, Arg, Asn, Asp, Glu, Gly, His, Leu, Phe, Thr, Trp и Tyr;
- Xaa107 представляет собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из Arg, Asp, Gly, Pro, Ser и Thr;
- Xaa125 представляет собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из Ala, Cys, Gln, Glu, Gly, His, Leu, Lys, Ser и Tyr;
- Xaa131 представляет собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из Ala, Asn, Asp, Cys, Gln; Glu, Gly, His, Ile, Leu, Met, Ser, Thr, Trp, Tyr и Val;
- Xaa170 представляет собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из Ala, Asn, Gly, Lys и Tyr;
- Xaa172 представляет собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из Ala, Cys, Ser и Thr; и/или
- Xaa193 представляет собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из Phe, Ser, Thr, Trp и Tyr;
при условии, что SEQ ID NO: 3 не представляет собой свиной трипсин дикого типа в соответствии с SEQ ID NO: 1; и
при условии, что SEQ ID NO: 3 не представляет собой вариант свиного трипсина S172A в соответствии с SEQ ID NO: 2.
6. Вариант свиного трипсина по любому из пп. 1-5, где указанная аминокислотная последовательность выбрана из группы, состоящей из SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO:, 60, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 70, SEQ ID NO: 71, SEQ ID NO: 72, SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 75, SEQ ID NO: 76, SEQ ID NO: 77, SEQ ID NO: 78, SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 83, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86, SEQ ID NO: 87, SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 108, SEQ ID NO: 109, SEQ ID NO: 110, SEQ ID NO: 111, SEQ ID NO: 112, SEQ ID NO: 113, SEQ ID NO: 114, SEQ ID NO: 115, SEQ ID NO: 116, SEQ ID NO: 117, SEQ ID NO: 118 и SEQ ID NO: 119.
7. Вариант свиного трипсина по любому из пп. 1-6, где
(i) указанный вариант способен к расщеплению пептида с общей формулой A-Lys-Thr-Arg-Arg-B с получением продукта расщепления с общей формулой A-Lys-Thr-Arg-Arg с выходом, составляющим по меньшей мере 80%,
где A представляет собой аминокислотную последовательность, состоящую из одной или нескольких аминокислот; и
где B представляет собой аминокислотную последовательность, состоящую из одной или нескольких аминокислот;
и/или
(ii) вариант проявляет повышенную селективность в отношении расщепления человеческого препроинсулина, препроинсулина гларгина, препроинсулина лизпро, препроинсулина аспарта или препроинсулина глулизина в C-концевом положении относительно положения B32-Arg по сравнению с вариантом свиного трипсина S172A в соответствии с SEQ ID NO: 2.
8. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая
- вариант свиного трипсина по любому из пп. 1-7 или
- молекулу-предшественника, представляющую собой трипсиноген, варианта свиного трипсина по любому из пп. 1-7,
где указанная молекула нуклеиновой кислоты необязательно содержится в векторе или необязательно интегрирована в геном.
9. Клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты по п. 8.
10. Способ получения варианта свиного трипсина по любому из пп. 1-7, включающий стадии:
культивирования клетки-хозяина по п. 9 и
выделения молекулы-предшественника, представляющей собой трипсиноген, варианта свиного трипсина из культуральной среды или из клетки-хозяина; и
необязательно активации молекулы-предшественника, представляющей собой трипсиноген, с получением таким образом указанного варианта свиного трипсина.
11. Вариант свиного трипсина по любому из пп. 1-7, или молекула нуклеиновой кислоты по п. 8, или клетка-хозяин по п. 9 для применения в способе изготовления пищевого ингредиента или кормового ингредиента.
12. Применение варианта свиного трипсина по любому из пп. 1-7 в способе получения человеческого инсулина, аналога инсулина или производного инсулина.
13. Применение по п. 12, где аналог инсулина выбран из группы, состоящей из инсулина аспарта, инсулина лизпро, инсулина глулизина и инсулина гларгина.
14. Применение варианта свиного трипсина по любому из пп. 1-7 для расщепления белка или пептида с общей формулой A-Lys-Thr-Arg-Arg-B,
где A представляет собой аминокислотную последовательность, состоящую из одной или нескольких аминокислот; и
где B представляет собой аминокислотную последовательность, состоящую из одной или нескольких аминокислот.
15. Применение по п. 14, где расщепление приводит к получению продукта расщепления A-Lys-Thr-Arg-Arg.
16. Применение по п. 15, где расщепление приводит к получению продукта расщепления A-Lys-Thr-Arg-Arg с выходом, составляющим по меньшей мере 80.
RU2020130880A 2018-02-22 2019-02-22 Варианты свиного трипсина RU2783315C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP18158034.1 2018-02-22
EP18158034 2018-02-22
PCT/EP2019/054400 WO2019162423A1 (en) 2018-02-22 2019-02-22 Variants of porcine trypsin

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2020130880A3 RU2020130880A3 (ru) 2022-03-22
RU2020130880A true RU2020130880A (ru) 2022-03-22
RU2783315C2 RU2783315C2 (ru) 2022-11-11

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
US11952602B2 (en) 2024-04-09
JP7432516B2 (ja) 2024-02-16
CN111989401A (zh) 2020-11-24
RU2020130880A3 (ru) 2022-03-22
IL276799A (en) 2020-10-29
US11518988B2 (en) 2022-12-06
JP2024038140A (ja) 2024-03-19
AU2019225972A1 (en) 2020-10-15
US20200377873A1 (en) 2020-12-03
CA3091943A1 (en) 2019-08-29
US20230303994A1 (en) 2023-09-28
MX2020008766A (es) 2020-12-07
KR20200124255A (ko) 2020-11-02
WO2019162423A1 (en) 2019-08-29
EP3755794A1 (en) 2020-12-30
JP2021514194A (ja) 2021-06-10
SG11202008026WA (en) 2020-09-29
BR112020016954A2 (pt) 2020-12-29

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN101432296B (zh) 聚乙二醇化的突变的肉毒梭菌毒素
EP3319634B1 (en) Stabilized soluble pre-fusion rsv f polypeptides
George-Nascimento et al. Characterization of recombinant human epidermal growth factor produced in yeast
EP3821906A1 (en) Vaccine against rsv comprising modified f polypeptide
IL184112A0 (en) A method for producing polypeptides or proteins in a disulfide-bridged two-chain form
KR890003802A (ko) 재조합 dna 기술에 의해 제조된 소의 췌장 트립신 억제제, 그 제조 방법, 발현 벡터 및 재조합 숙주 및 그의 제약적 용도
US11759514B2 (en) Stabilized pre-fusion RSV F proteins
IL278014B1 (en) Anti-myostatin antibodies, polypeptides containing variable fc regions and methods of use
RU2011153239A (ru) Улучшенные аминокислотные последовательности, направленные против респираторно-синцитиального вируса человека (hrsv), и полипептиды, включающие такие последовательности, для профилактики и/или лечения инфекций дыхательных путей
CN102083855A (zh) 活性延长的新胰岛素类似物
CN102816785A (zh) 一种甘精胰岛素及其类似物的制备方法
WO2017207477A1 (en) Stabilized pre-fusion rsv f proteins
JP2024038140A (ja) ブタトリプシンの変異体
JPH05508775A (ja) プロテアーゼ耐性pdgf及び使用法
Canova-Davis et al. Transpeptidation during the analytical proteolysis of proteins
RU2020128190A (ru) Кодон-оптимизированный ген предшественника и ген сигнального пептида аналога человеческого инсулина
CN109400695A (zh) 一种多肽的修饰方法及应用
Chunxiao et al. Study on preparation and activity of a novel recombinant human parathyroid hormone (1–34) analog with N-terminal Pro–Pro extension
KR20090009839A (ko) 면역조절 올리고펩티드
CN101671390A (zh) 人干扰素α衍生物及其聚乙二醇化修饰物的制备和用途
CN104558148A (zh) 睫状神经营养因子突变体及其修饰型突变体和用途
CN108084247B (zh) 一种合成多肽及其合成方法和应用
US11261228B2 (en) Insulin derivatives with a terminal LPXT motif
CA2947255A1 (en) Variants of dr3 and use thereof
CN1532289A (zh) 用重组大肠杆菌制备N-末端乙酰化修饰的胸腺素α的方法