RU2017115212A - Гуманизация антител на основе междоменного угла vh-vl - Google Patents
Гуманизация антител на основе междоменного угла vh-vl Download PDFInfo
- Publication number
- RU2017115212A RU2017115212A RU2017115212A RU2017115212A RU2017115212A RU 2017115212 A RU2017115212 A RU 2017115212A RU 2017115212 A RU2017115212 A RU 2017115212A RU 2017115212 A RU2017115212 A RU 2017115212A RU 2017115212 A RU2017115212 A RU 2017115212A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- antibody
- fragment
- variants
- paragraphs
- orientation
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/2803—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/2896—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against molecules with a "CD"-designation, not provided for elsewhere
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/40—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against enzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y304/00—Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
- C12Y304/21—Serine endopeptidases (3.4.21)
- C12Y304/21106—Hepsin (3.4.21.106)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/20—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
- C07K2317/24—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin containing regions, domains or residues from different species, e.g. chimeric, humanized or veneered
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/90—Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
- C07K2317/92—Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Claims (29)
1. Гуманизированное антитело, которое содержит аминокислотные остатки антитела-донора, не являющегося человеческим, в позициях аминокислот Н26-Н32, Н33, Н35, Н37, Н39, Н43, Н44, Н45, Н46, Н47, Н50, Н53-Н55, Н56, Н58, Н60, Н61, Н62, Н89, Н91, Н95, Н96-Н101, Н102, Н103 Н105, L26-L32, L34, L36, L38, L41, L42, L43, L44, L45, L46, L49, L50-L52, L53, L55, L56, L85, L87, L89, L91-L96, L97, L100 (нумерация согласно системе нумерации Chothia), и в оставшихся позициях вариабельных доменов легкой и тяжелой цепи остатки человеческого или гуманизированного антитела-акцептора или акцепторной аминокислотной последовательности первичного антитела человека.
2. Способ отбора одного или нескольких вариантов Fv фрагмента антитела, происходящих от Fv фрагмента родительского антитела, включающий следующие стадии:
создание множества вариантов Fv фрагмента антитела путем пересадки/переноса одного или нескольких определяющих специфичность остатков Fv фрагмента родительского антитела на Fv фрагмент антитела-акцептора, где каждый вариант Fv фрагмента антитела из множества вариантов Fv фрагмента антитела отличается от других вариантов Fv фрагмента антитела по меньшей мере одним аминокислотным остатком,
определение ориентации VH-VL родительского Fv фрагмента и каждого из вариантов Fv фрагмента антитела из множества вариантов Fv фрагмента антитела на основе «дактилоскопического отпечатка» последовательности Fv фрагмента антитела,
отбор таких вариантов Fv фрагмента антитела, у которых ориентация VH-VL меньше всего отличается от ориентации VH-VL родительского антитела, и таким образом, отбор одного или нескольких вариантов Fv фрагмента антитела, происходящих от Fv фрагмента родительского антитела,
где один или несколько вариантов Fv фрагмента антитела связываются с тем же антигеном, что и Fv фрагмент родительского антитела.
3. Способ согласно п. 2, включающий следующую стадию:
отбор таких вариантов Fv фрагмента антитела, которые имеют наибольшее сходство междоменного угла VH-VL с междоменным углом VH-VL родительского антитела, и таким образом, отбор одного или нескольких вариантов Fv фрагмента антитела, происходящих от Fv фрагмента родительского антитела.
4. Способ согласно любому из пп. 2 и 3, где Fv фрагмент родительского антитела представляет собой Fv фрагмент антитела, не являющегося человеческим.
5. Способ согласно любому из пп. 2-4, где Fv фрагмент антитела-акцептора представляет собой Fv фрагмент человеческого или гуманизированного антитела, или аминокислотную последовательность Fv фрагмента первичного человеческого антитела.
6. Способ согласно любому из пп. 2-5, где «дактилоскопический отпечаток» последовательности представляет собой набор остатков поверхности контакта VH-VL.
7. Способ согласно п. 6, где набор остатков поверхности контакта VH-VL содержит остатки L44, L46, L87, Н45, Н62 (нумерация согласно системе нумерации Chothia).
8. Способ согласно любому из пп. 6 и 7, где набор остатков поверхности контакта VH-VL содержит остатки Н33, Н35, Н37, Н39, Н43, Н44, Н45, Н46, Н47, Н50, Н55, Н56, Н58, Н60, Н61, Н62, Н89, Н91, Н95, Н96, Н98, Н99, H100x-2, H100x-1, H100x, Н101, Н102, Н103, Н105, L32, L34, L36, L38, L41, L42, L43, L44, L45, L46, L49, L50, L53, L55, L56, L85, L87, L89, L91, L93, L94/L95x-1, L95x, L96, L97, L100 (нумерация согласно системе нумерации Chothia).
9. Способ согласно любому из пп. 2-8, где ориентацию VH-VL определяют путем расчета шести параметров ABangle ориентации VH-VL.
10. Способ согласно любому из пп. 2-9, где ориентацию VH-VL определяют путем расчета параметров ABangle ориентации VH-VL с помощью построения одного «случайного леса» для каждого ABangle.
11. Способ согласно любому из пп. 2-10, где ориентацию VH-VL определяют путем расчета торсионного угла, четырех углов изгиба (по два на вариабельный домен) и длины оси поворота VH и VL (HL, НС1, LC1, НС2, LC2, dc) с использованием модели «случайный лес».
12. Способ согласно любому из пп. 10 и 11, где модель «случайный лес» обучают только на данных структур комплексов антитела.
13. Способ согласно любому из пп. 2-12, где наименьшее различие представляет собой наибольшее значение Q2.
14. Способ согласно любому из пп. 2-13, где наибольшее сходство представляет собой наименьшее среднеквадратичное отклонение (RMSD).
15. Способ согласно любому из пп. 2-14, где для определения ориентации VH-VL применяют модель, построенную по структурным матрицам, выровненным с консенсусной каркасной областью VH или VL, с последующей переориентацией VH-VL по структурной матрице ориентации VH-VL, выбранной на основе сходства.
16. Способ получения антитела, включающий следующие стадии:
отбор одного или нескольких антител, или Fv фрагментов антитела, включающий следующие стадии:
создание множества вариантов антитела путем пересадки/переноса одного или нескольких определяющих специфичность остатков от антитела, не являющегося человеческим, на человеческое или гуманизированное антитело-акцептор, или последовательность первичного антитела, где каждый вариант антитела из множества вариантов антитела отличается от других вариантов антитела по меньшей мере одним аминокислотным остатком,
определение ориентации VH-VL Fv фрагмента антитела, не являющегося человеческим, и каждого варианта Fv фрагмента антитела из множества вариантов антитела путем расчета характерного торсионного угла, четырех углов изгиба (по два на вариабельный домен) и длины оси поворота VH и VL (HL, НС1, LC1, НС2, LC2, dc) с помощью модели «случайный лес», построенной на основе набора остатков поверхности контакта VH-VL, состоящей из остатков Fv фрагмента антитела Н33, Н35, Н37, Н39, Н43, Н44, Н45, Н46, Н47, Н50, Н55, Н56, Н58, Н60, Н61, Н62, Н89, Н91, Н95, Н96, Н98, Н99, Н100х-2, Н100х-1, H100x, Н101, Н102, Н103, Н105, L32, L34, L36, L38, L41, L42, L43, L44, L45, L46, L49, L50, L53, L55, L56, L85, L87, L89, L91, L93, L94/L95x-1, L95x, L96, L97, L100 (нумерация согласно системе нумерации Chothia),
отбор таких вариантов Fv фрагмента антитела, которые имеют наименьшее среднеквадратичное отклонение (RMSD), определенное для всех пар соответствующих Сальфа атомов Fv фрагмента антитела, не являющегося человеческим, и варианта Fv фрагмента антитела,
отбор из одного или нескольких антител единственного антитела на основании его связывающих свойств,
клонирование нуклеиновых кислот, кодирующих VH и VL, в один или несколько экспрессирующих векторов,
трансфекцию клетки экспрессирующими векторами, полученными на предыдущей стадии,
культивирование трансфицированной клетки и, таким образом, получение антитела.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP14190307.0 | 2014-10-24 | ||
| EP14190307 | 2014-10-24 | ||
| PCT/EP2015/074294 WO2016062734A1 (en) | 2014-10-24 | 2015-10-21 | Vh-vl-interdomain angle based antibody humanization |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2017115212A true RU2017115212A (ru) | 2018-11-26 |
| RU2017115212A3 RU2017115212A3 (ru) | 2019-04-24 |
Family
ID=51799006
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2017115212A RU2017115212A (ru) | 2014-10-24 | 2015-10-21 | Гуманизация антител на основе междоменного угла vh-vl |
Country Status (12)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US20170204182A1 (ru) |
| EP (1) | EP3209684B1 (ru) |
| JP (1) | JP6829194B2 (ru) |
| KR (1) | KR20170070070A (ru) |
| CN (1) | CN107074933B (ru) |
| BR (1) | BR112017005451A2 (ru) |
| CA (1) | CA2960445A1 (ru) |
| DK (1) | DK3209684T3 (ru) |
| ES (1) | ES2857553T3 (ru) |
| MX (1) | MX2017004001A (ru) |
| RU (1) | RU2017115212A (ru) |
| WO (1) | WO2016062734A1 (ru) |
Families Citing this family (15)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| TW201829463A (zh) | 2016-11-18 | 2018-08-16 | 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 | 抗hla-g抗體及其用途 |
| CA3053358A1 (en) | 2017-04-04 | 2018-10-11 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Novel bispecific antigen binding molecules capable of specific binding to cd40 and to fap |
| EP3625254B1 (en) | 2017-07-31 | 2023-12-13 | F. Hoffmann-La Roche AG | Three-dimensional structure-based humanization method |
| TWI829667B (zh) | 2018-02-09 | 2024-01-21 | 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 | 結合gprc5d之抗體 |
| AR114789A1 (es) | 2018-04-18 | 2020-10-14 | Hoffmann La Roche | Anticuerpos anti-hla-g y uso de los mismos |
| AR115052A1 (es) | 2018-04-18 | 2020-11-25 | Hoffmann La Roche | Anticuerpos multiespecíficos y utilización de los mismos |
| KR20210069675A (ko) | 2018-10-01 | 2021-06-11 | 에프. 호프만-라 로슈 아게 | 항-fap 클론 212를 포함하는 이중특이적 항원 결합 분자 |
| EP3861025A1 (en) | 2018-10-01 | 2021-08-11 | F. Hoffmann-La Roche AG | Bispecific antigen binding molecules with trivalent binding to cd40 |
| WO2020260326A1 (en) | 2019-06-27 | 2020-12-30 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Novel icos antibodies and tumor-targeted antigen binding molecules comprising them |
| AR119382A1 (es) | 2019-07-12 | 2021-12-15 | Hoffmann La Roche | Anticuerpos de pre-direccionamiento y métodos de uso |
| JP2022543551A (ja) | 2019-07-31 | 2022-10-13 | エフ・ホフマン－ラ・ロシュ・アクチェンゲゼルシャフト | Ｇｐｒｃ５ｄに結合する抗体 |
| PE20220394A1 (es) | 2019-07-31 | 2022-03-18 | Hoffmann La Roche | Anticuerpos que se fijan a gprc5d |
| AR121706A1 (es) | 2020-04-01 | 2022-06-29 | Hoffmann La Roche | Moléculas de unión a antígeno biespecíficas dirigidas a ox40 y fap |
| AR126009A1 (es) | 2021-06-02 | 2023-08-30 | Hoffmann La Roche | Moléculas agonistas de unión al antígeno cd28 que se dirigen a epcam |
| CN118176208A (zh) * | 2021-11-04 | 2024-06-11 | 信华生物药业(广州)有限公司 | 抗体优化方法 |
Family Cites Families (9)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5530101A (en) * | 1988-12-28 | 1996-06-25 | Protein Design Labs, Inc. | Humanized immunoglobulins |
| US6849425B1 (en) * | 1999-10-14 | 2005-02-01 | Ixsys, Inc. | Methods of optimizing antibody variable region binding affinity |
| EP2298809A3 (en) * | 2001-07-12 | 2012-02-15 | FOOTE, Jefferson | Super humanized antibodies |
| CN1829806A (zh) * | 2003-02-01 | 2006-09-06 | 唐纳士公司 | 产生高亲和力抗体的方法 |
| GB0613209D0 (en) * | 2006-07-03 | 2006-08-09 | Ucb Sa | Methods |
| AP2010005354A0 (en) * | 2008-01-23 | 2010-08-31 | Acharya Subrat K | A humanized high affinity recombinant antibody against hepatitis B surface antigen |
| GB0914691D0 (en) * | 2009-08-21 | 2009-09-30 | Lonza Biologics Plc | Immunoglobulin variants |
| US8680241B2 (en) * | 2009-09-06 | 2014-03-25 | Protab Ltd. | Humanized antibodies specific for HSP65-derived peptide-6 methods and uses thereof |
| US20130108641A1 (en) * | 2011-09-14 | 2013-05-02 | Sanofi | Anti-gitr antibodies |
-
2015
- 2015-10-21 EP EP15784344.2A patent/EP3209684B1/en active Active
- 2015-10-21 WO PCT/EP2015/074294 patent/WO2016062734A1/en active Application Filing
- 2015-10-21 JP JP2017522101A patent/JP6829194B2/ja active Active
- 2015-10-21 DK DK15784344.2T patent/DK3209684T3/da active
- 2015-10-21 CN CN201580056696.2A patent/CN107074933B/zh active Active
- 2015-10-21 KR KR1020177010887A patent/KR20170070070A/ko unknown
- 2015-10-21 RU RU2017115212A patent/RU2017115212A/ru not_active Application Discontinuation
- 2015-10-21 ES ES15784344T patent/ES2857553T3/es active Active
- 2015-10-21 CA CA2960445A patent/CA2960445A1/en not_active Abandoned
- 2015-10-21 BR BR112017005451A patent/BR112017005451A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2015-10-21 MX MX2017004001A patent/MX2017004001A/es unknown
-
2017
- 2017-03-31 US US15/475,440 patent/US20170204182A1/en not_active Abandoned
-
2020
- 2020-03-16 US US16/820,094 patent/US20200377590A1/en active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CA2960445A1 (en) | 2016-04-28 |
| EP3209684B1 (en) | 2020-12-23 |
| US20200377590A1 (en) | 2020-12-03 |
| KR20170070070A (ko) | 2017-06-21 |
| DK3209684T3 (da) | 2021-02-22 |
| EP3209684A1 (en) | 2017-08-30 |
| BR112017005451A2 (pt) | 2018-01-02 |
| US20170204182A1 (en) | 2017-07-20 |
| WO2016062734A1 (en) | 2016-04-28 |
| JP6829194B2 (ja) | 2021-02-10 |
| JP2017531443A (ja) | 2017-10-26 |
| CN107074933A (zh) | 2017-08-18 |
| RU2017115212A3 (ru) | 2019-04-24 |
| MX2017004001A (es) | 2017-06-30 |
| ES2857553T3 (es) | 2021-09-29 |
| CN107074933B (zh) | 2021-03-19 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2017115212A (ru) | Гуманизация антител на основе междоменного угла vh-vl | |
| AR106184A1 (es) | Proteínas de unión a pd-1 y sus métodos de uso | |
| ES2617283T3 (es) | Inmunoconjugados contra el receptor 1 de folato y usos de los mismos | |
| PE20231958A1 (es) | Moleculas de union a pd-1 y metodos de uso de las mismas | |
| JP2009153527A5 (ru) | ||
| JP2015501814A5 (ru) | ||
| HRP20210517T1 (hr) | Pripravci i postupci za protutijela usmjerena na epo | |
| AR080501A1 (es) | Anticuerpos anti factor determinante antigenico de la muerte programada 1 (anti-pd1) | |
| IL258215B (en) | An anti-mesothelin antibody, encoding said nucleic acid, a vector consisting of said nucleic acid, a host cell consisting of said vector, a preparation method of said antibody, and a pharmaceutical antibody | |
| AR109298A1 (es) | Anticuerpos multiepitópicos y multivalentes que tienen actividad agonista y métodos de uso | |
| JP2015503909A5 (ru) | ||
| JP2018521638A5 (ru) | ||
| PE20040947A1 (es) | MOLECULAS DE ANTICUERPOS QUE TIENEN ESPECIFICIDAD PARA IL-1ß HUMANA | |
| JP2013538057A5 (ru) | ||
| JP2016536322A5 (ru) | ||
| JP2014534242A5 (ru) | ||
| JP2016537966A5 (ru) | ||
| AR085984A1 (es) | Moleculas de union biespecificas que se unen al factor de crecimiento endotelial (vegf) y a la angiopoyetina 2 (ang2) | |
| WO2009000099A3 (en) | Methods of modifying antibodies, and modified antibodies with improved functional properties | |
| HRP20210736T1 (hr) | Protutijela anti-htra1 i načini njihove uporabe | |
| JP2014519317A5 (ru) | ||
| NZ714482A (en) | Composition and method for diagnosis and treatment of diseases associated with neurite degeneration | |
| AR085091A1 (es) | Anticuerpos anti-kit y sus usos | |
| PE20220575A1 (es) | Anticuerpos multiespecificos de cadena pesada que se unen a cd22 y cd3 | |
| RU2018135371A (ru) | АНТИТЕЛА К ФАКТОРУ КОМПЛЕМЕНТА Bb |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20200805 |