RU2017109584A - Способы и композиции для получения оценки туберкулеза у субъекта - Google Patents
Способы и композиции для получения оценки туберкулеза у субъекта Download PDFInfo
- Publication number
- RU2017109584A RU2017109584A RU2017109584A RU2017109584A RU2017109584A RU 2017109584 A RU2017109584 A RU 2017109584A RU 2017109584 A RU2017109584 A RU 2017109584A RU 2017109584 A RU2017109584 A RU 2017109584A RU 2017109584 A RU2017109584 A RU 2017109584A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- tuberculosis
- expression level
- cell sample
- carrier
- subpopulation
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims 13
- 201000008827 tuberculosis Diseases 0.000 title claims 8
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title 1
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 claims 12
- 208000034309 Bacterial disease carrier Diseases 0.000 claims 10
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims 3
- 102100021260 Galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase 1 Human genes 0.000 claims 2
- 101000894906 Homo sapiens Galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase 1 Proteins 0.000 claims 2
- 101000599048 Homo sapiens Interleukin-6 receptor subunit alpha Proteins 0.000 claims 2
- 101001018097 Homo sapiens L-selectin Proteins 0.000 claims 2
- 101000801232 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B Proteins 0.000 claims 2
- 102100037792 Interleukin-6 receptor subunit alpha Human genes 0.000 claims 2
- 102100033467 L-selectin Human genes 0.000 claims 2
- PRQROPMIIGLWRP-UHFFFAOYSA-N N-formyl-methionyl-leucyl-phenylalanin Chemical compound CSCCC(NC=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PRQROPMIIGLWRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 102100033733 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B Human genes 0.000 claims 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims 2
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 claims 2
- 102100036301 C-C chemokine receptor type 7 Human genes 0.000 claims 1
- -1 CD11a Proteins 0.000 claims 1
- 102100036008 CD48 antigen Human genes 0.000 claims 1
- 102100027221 CD81 antigen Human genes 0.000 claims 1
- 101000716065 Homo sapiens C-C chemokine receptor type 7 Proteins 0.000 claims 1
- 101000716130 Homo sapiens CD48 antigen Proteins 0.000 claims 1
- 101000914479 Homo sapiens CD81 antigen Proteins 0.000 claims 1
- 101000935040 Homo sapiens Integrin beta-2 Proteins 0.000 claims 1
- 101000599862 Homo sapiens Intercellular adhesion molecule 3 Proteins 0.000 claims 1
- 101000980823 Homo sapiens Leukocyte surface antigen CD53 Proteins 0.000 claims 1
- 101001063392 Homo sapiens Lymphocyte function-associated antigen 3 Proteins 0.000 claims 1
- 101000581981 Homo sapiens Neural cell adhesion molecule 1 Proteins 0.000 claims 1
- 101000622137 Homo sapiens P-selectin Proteins 0.000 claims 1
- 101000716102 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD4 Proteins 0.000 claims 1
- 101000946843 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain Proteins 0.000 claims 1
- 102100025390 Integrin beta-2 Human genes 0.000 claims 1
- 102100037871 Intercellular adhesion molecule 3 Human genes 0.000 claims 1
- 102100024221 Leukocyte surface antigen CD53 Human genes 0.000 claims 1
- 208000019693 Lung disease Diseases 0.000 claims 1
- 102100030984 Lymphocyte function-associated antigen 3 Human genes 0.000 claims 1
- 102100027347 Neural cell adhesion molecule 1 Human genes 0.000 claims 1
- 102100023472 P-selectin Human genes 0.000 claims 1
- 102100036011 T-cell surface glycoprotein CD4 Human genes 0.000 claims 1
- 102100034922 T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain Human genes 0.000 claims 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 claims 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
- G01N33/56911—Bacteria
- G01N33/5695—Mycobacteria
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N15/00—Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
- G01N15/10—Investigating individual particles
- G01N15/14—Optical investigation techniques, e.g. flow cytometry
- G01N15/1456—Optical investigation techniques, e.g. flow cytometry without spatial resolution of the texture or inner structure of the particle, e.g. processing of pulse signals
- G01N15/1459—Optical investigation techniques, e.g. flow cytometry without spatial resolution of the texture or inner structure of the particle, e.g. processing of pulse signals the analysis being performed on a sample stream
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N15/00—Investigating characteristics of particles; Investigating permeability, pore-volume or surface-area of porous materials
- G01N15/10—Investigating individual particles
- G01N2015/1006—Investigating individual particles for cytology
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/705—Assays involving receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- G01N2333/70596—Molecules with a "CD"-designation not provided for elsewhere in G01N2333/705
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/26—Infectious diseases, e.g. generalised sepsis
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Virology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Dispersion Chemistry (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Claims (24)
1. Способ получения оценки туберкулеза у субъекта, включающий идентификацию субпопуляции из клеточного образца субъекта, которая
имеет уровень экспрессии биомаркера носителя туберкулеза ниже порогового уровня экспрессии, с получением сигнатуры биомаркеров для клеточного образца, где биомаркер носителя туберкулеза выбран из группы, состоящей из CD120b, CD126 и CD62L и их комбинаций; и
получение оценки туберкулеза у субъекта на основании сигнатуры биомаркеров.
2. Способ по п. 1, дополнительно включающий идентификацию субпопуляции из клеточного образца, которая имеет уровень экспрессии ниже порогового уровня экспрессии одного или нескольких дополнительных биомаркеров носителя туберкулеза, выбранных из CD4, CD8, CD56, CD57 и CCR7 и их комбинаций.
3. Способ по п. 1, где оценка туберкулеза представляет собой оценку лечения.
4. Способ по п. 3, дополнительно включающий идентификацию субпопуляции из клеточного образца, которая имеет уровень экспрессии выше порогового уровня экспрессии для CD58.
5. Способ по п. 1, где оценка туберкулеза представляет собой постановку диагноза.
6. Способ по п. 5, дополнительно включающий идентификацию субпопуляции из клеточного образца, которая имеет уровень экспрессии ниже порогового уровня экспрессии одного или нескольких биомаркеров носителя туберкулеза, выбранных из группы, состоящей из CD8 и CD57 и их комбинаций.
7. Способ по п. 5 или 6, дополнительно включающий идентификацию субпопуляции из клеточного образца, которая имеет уровень экспрессии ниже порогового уровня экспрессии fMLP r.
8. Способ по п. 5 или 6, где постановка диагноза включает получение диагноза туберкулеза в случае заболевания легких, не считающегося туберкулезом.
9. Способ по п. 1, где оценка туберкулеза включает предсказание вероятности положительного исхода лечения или отрицательного исхода лечения.
10. Способ по п. 9, дополнительно включающий идентификацию субпопуляции из клеточного образца, которая имеет уровень экспрессии ниже порогового уровня экспрессии одного или нескольких биомаркеров носителя туберкулеза, выбранных из группы, состоящей из CD18, CD11a, CD50, CD48, CD53, CD62P, CD81, CD45RO и CD4v4 и их комбинаций.
11. Способ по любому из пп. 1-10, где клеточный образец представляет собой образец крови.
12. Способ по любому из пп. 1-11, где идентификация включает проточную цитометрию.
13. Набор, содержащий
комплект из двух или более меченных детектируемой меткой компонентов связывания, специфических в отношении биомаркеров носителя туберкулеза, где биомаркеры носителя туберкулеза выбраны из группы, состоящей из CD120b, CD126, CD62L, fMLP r и их комбинаций.
14. Система для проточной цитометрии, содержащая
проточный цитометр, содержащий проточную ячейку;
источник света, выполненный с возможностью направления света в участок анализа проточной ячейки;
первый детектор, выполненный с возможностью получения света с первой длиной волны испускания, испускаемого первым меченным детектируемой меткой компонентом связывания, специфическим в отношении биомаркера носителя туберкулеза, который присутствует в клеточном образце в участке анализа; и
модуль обработки сигнала, выполненный с возможностью получения сигналов от первого детектора и вывода результата о том, присутствует ли в клеточном образце субпопуляция клеток, связанных с первым меченным детектируемой меткой компонентом связывания, специфическим в отношении биомаркера носителя туберкулеза.
15. Машиночитаемый носитель, содержащий программную часть для выполнения посредством компьютера, содержащую
инструкции для анализа сигналов, вырабатываемых детектором, выполненным с возможностью получения света с некоторой длиной волны испускания, испускаемого меченным детектируемой меткой компонентом связывания, специфическим в отношении биомаркера носителя туберкулеза, с получением данных;
инструкции для хранения данных на машиночитаемом носителе и инструкции для вывода данных.
Applications Claiming Priority (9)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201462044045P | 2014-08-29 | 2014-08-29 | |
| US62/044,045 | 2014-08-29 | ||
| US201462085032P | 2014-11-26 | 2014-11-26 | |
| US62/085,032 | 2014-11-26 | ||
| US201562115958P | 2015-02-13 | 2015-02-13 | |
| US62/115,958 | 2015-02-13 | ||
| US201562154996P | 2015-04-30 | 2015-04-30 | |
| US62/154,996 | 2015-04-30 | ||
| PCT/US2015/046570 WO2016032967A1 (en) | 2014-08-29 | 2015-08-24 | Methods and compositions for obtaining a tuberculosis assessment in a subject |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2017109584A true RU2017109584A (ru) | 2018-10-01 |
| RU2017109584A3 RU2017109584A3 (ru) | 2019-03-28 |
Family
ID=55400411
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2017109584A RU2017109584A (ru) | 2014-08-29 | 2015-08-24 | Способы и композиции для получения оценки туберкулеза у субъекта |
Country Status (7)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20170248596A1 (ru) |
| EP (1) | EP3186614A4 (ru) |
| CN (1) | CN107076745A (ru) |
| BR (1) | BR112017004179A2 (ru) |
| RU (1) | RU2017109584A (ru) |
| WO (1) | WO2016032967A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA201701661B (ru) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2022509847A (ja) * | 2018-11-28 | 2022-01-24 | ナショナル ユニバーシティ オブ シンガポール | がん及び／又は結核の検出方法 |
Family Cites Families (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2002033377A2 (en) * | 2000-09-20 | 2002-04-25 | Surromed, Inc. | Biological markers for evaluating therapeutic treatment of inflammatory and autoimmune disorders |
| US20030077576A1 (en) * | 2001-03-20 | 2003-04-24 | Joann Trial | Use of monoclonal antibodies and functional assays for prediction of risk of opportunistic infection |
| EP1730529A4 (en) * | 2004-02-17 | 2008-05-21 | Univ Rochester | METHODS FOR EVALUATING THE EFFECTIVENESS OF AN IMMUNE RESPONSE BY EVALUATING EXPRESSION OF INTEGRIN ALPHA-1 |
| US20050221399A1 (en) * | 2004-03-30 | 2005-10-06 | Sysmex Corporation | Method for screening cervical cancer |
| AU2009262112A1 (en) * | 2008-06-25 | 2009-12-30 | Baylor Research Institute | Blood transcriptional signature of mycobacterium tuberculosis infection |
| DK2729562T3 (en) * | 2011-07-06 | 2018-07-23 | Cell Therapy Ltd | Progenitor cells of mesodermal origin |
| US9702886B2 (en) * | 2012-05-24 | 2017-07-11 | The Broad Institute, Inc. | Methods and devices for tuberculosis diagnosis using biomarker profiles |
| GB201213567D0 (en) * | 2012-07-31 | 2012-09-12 | Proteinlogic Ltd | Biomarkers |
-
2015
- 2015-08-24 EP EP15835121.3A patent/EP3186614A4/en not_active Withdrawn
- 2015-08-24 RU RU2017109584A patent/RU2017109584A/ru not_active Application Discontinuation
- 2015-08-24 BR BR112017004179A patent/BR112017004179A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2015-08-24 WO PCT/US2015/046570 patent/WO2016032967A1/en active Application Filing
- 2015-08-24 CN CN201580051447.4A patent/CN107076745A/zh active Pending
- 2015-08-24 US US15/507,222 patent/US20170248596A1/en not_active Abandoned
-
2017
- 2017-03-08 ZA ZA2017/01661A patent/ZA201701661B/en unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP3186614A1 (en) | 2017-07-05 |
| EP3186614A4 (en) | 2018-03-21 |
| WO2016032967A1 (en) | 2016-03-03 |
| US20170248596A1 (en) | 2017-08-31 |
| CN107076745A (zh) | 2017-08-18 |
| BR112017004179A2 (pt) | 2017-12-12 |
| RU2017109584A3 (ru) | 2019-03-28 |
| ZA201701661B (en) | 2018-11-28 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Truong et al. | Killer-like receptors and GPR56 progressive expression defines cytokine production of human CD4+ memory T cells | |
| JP6791598B2 (ja) | 異なる細胞サブセットの比率の決定方法およびシステム | |
| AU2018304381A1 (en) | Systems and methods for analyzing mixed cell populations | |
| BR112018015913A2 (pt) | método para determinar uma variação no número de cópia de uma sequência de ácido nucleico de interesse, e, sistema para avaliar o número de cópia de uma sequência de ácido nucleico de interesse. | |
| Zhang et al. | Tumor-selective replication herpes simplex virus-based technology significantly improves clinical detection and prognostication of viable circulating tumor cells | |
| AR048506A1 (es) | Metodo y aparato y dispositivo de almacenamiento de programa adaptado para la valoracion cualitativa y cuantitativa de riesgos en base al diseno tecnico del agujero de pozo y propiedades de la tierra | |
| HRP20190209T4 (hr) | Detekcija i kvantifikacija acelularne dnk darivatelja u krvotoku primatelja presađivanja organa | |
| GB2534067A (en) | Methods and systems for genomic analysis | |
| EA201691505A1 (ru) | Детектирование экспрессии простатического специфического мембранного антигена (psma) на циркулирующих опухолевых клетках (ctc) | |
| Alachkar et al. | Quantitative characterization of T-cell repertoire and biomarkers in kidney transplant rejection | |
| MX2017005750A (es) | Ensayos para detectar subgrupos inmunes de células t y sus métodos de uso. | |
| IN2014DN03407A (ru) | ||
| RU2016139491A (ru) | Способ обнаружения солидной злокачественной опухоли | |
| Buccisano et al. | Minimal residual disease as a biomarker for outcome prediction and therapy optimization in acute myeloid leukemia | |
| WO2021077063A1 (en) | Methods and systems for measuring cell states | |
| Gravelle et al. | EBV infection determines the immune hallmarks of plasmablastic lymphoma | |
| Gurjao et al. | Limited evidence of tumour mutational burden as a biomarker of response to immunotherapy | |
| Santoferrara et al. | Integrating dimensions of biodiversity in choreotrichs and oligotrichs of marine plankton | |
| JP2017535841A (ja) | 非侵襲性出生前検査用デジタルｐｃｒの設計 | |
| EA201691497A1 (ru) | Способы детектирования и количественного определения имитаторов циркулирующих опухолевых клеток | |
| Allegra et al. | Circulating tumour cells, cell free DNA and tumour-educated platelets as reliable prognostic and management biomarkers for the liquid biopsy in multiple myeloma | |
| RU2017109584A (ru) | Способы и композиции для получения оценки туберкулеза у субъекта | |
| NZ602929A (en) | Improvements in and relating to the consideration of evidence | |
| MX363693B (es) | Metodos para determinar el pronostico de cancer colorrectal. | |
| WO2020123880A3 (en) | Genomic rearrangements associated with prostate cancer and methods of using the same |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20191111 |