RU2016139491A - Способ обнаружения солидной злокачественной опухоли - Google Patents

Способ обнаружения солидной злокачественной опухоли Download PDF

Info

Publication number
RU2016139491A
RU2016139491A RU2016139491A RU2016139491A RU2016139491A RU 2016139491 A RU2016139491 A RU 2016139491A RU 2016139491 A RU2016139491 A RU 2016139491A RU 2016139491 A RU2016139491 A RU 2016139491A RU 2016139491 A RU2016139491 A RU 2016139491A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
biomarker
specified
time point
cancer
malignant tumor
Prior art date
Application number
RU2016139491A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2016139491A3 (ru
RU2720148C9 (ru
RU2720148C2 (ru
Inventor
Хенрик ГРЕНБЕРГ
Original Assignee
Пхадиа Аб
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Пхадиа Аб filed Critical Пхадиа Аб
Publication of RU2016139491A publication Critical patent/RU2016139491A/ru
Publication of RU2016139491A3 publication Critical patent/RU2016139491A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2720148C2 publication Critical patent/RU2720148C2/ru
Publication of RU2720148C9 publication Critical patent/RU2720148C9/ru

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • G01N33/57434—Specifically defined cancers of prostate
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57473—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving carcinoembryonic antigen, i.e. CEA
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57484—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
    • G16H20/00—ICT specially adapted for therapies or health-improving plans, e.g. for handling prescriptions, for steering therapy or for monitoring patient compliance
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
    • G16H50/00—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics
    • G16H50/20—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics for computer-aided diagnosis, e.g. based on medical expert systems
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/52—Assays involving cytokines
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/90—Enzymes; Proenzymes
    • G01N2333/914—Hydrolases (3)
    • G01N2333/948—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • G01N2333/95—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99)
    • G01N2333/964—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue
    • G01N2333/96425—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue from mammals
    • G01N2333/96427—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue from mammals in general
    • G01N2333/9643—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue from mammals in general with EC number
    • G01N2333/96433—Serine endopeptidases (3.4.21)
    • G01N2333/96441—Serine endopeptidases (3.4.21) with definite EC number
    • G01N2333/96455—Kallikrein (3.4.21.34; 3.4.21.35)

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Primary Health Care (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Data Mining & Analysis (AREA)
  • Databases & Information Systems (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Claims (48)

1. Способ обнаружения наличия или отсутствия заранее определенной солидной злокачественной опухоли у субъекта, включающий:
А. Обеспечение, по меньшей мере, одного биологического образца, отобранного у указанного субъекта на первой временной точке.
В. Обеспечение, по меньшей мере, одного биологического образца, отобранного у указанного субъекта на второй временной точке.
С. Определение в указанных, по меньшей мере, двух биологических образцах присутствия или концентрации, по меньшей мере, одного биомаркера, связанного с указанной заранее определенной солидной злокачественной опухолью.
D. Комбинирование данных о присутствии или концентрации, по меньшей мере, одного биомаркера, для формирования динамического комбинированного показателя, который отражает изменение присутствия или концентрации биомаркера.
Е. Соотнесение динамического комбинированного показателя с наличием или отсутствием указанной заранее определенной солидной злокачественной опухоли у указанного субъекта сравнением динамического комбинированного показателя с заранее определенным пороговым значением, установленным с контрольными образцами с известным диагнозом заранее определенной солидной злокачественной опухоли и доброкачественной опухоли,
где
период времени между первой временной точкой и второй временной точкой находится в диапазоне от 0,5% до 25% от типичного времени удвоения объема опухоли для указанной заранее определенной солидной злокачественной опухоли; и также
по меньшей мере, один определяемый биомаркер является одним и тем же биомаркером в каждом из биологических образцов.
2. Способ по п. 1, где период времени между первой временной точкой и второй временной точкой находится в диапазоне примерно от 0,1% до 15% от типичного времени удвоения объема опухоли для указанной заранее определенной солидной злокачественной опухоли; например, примерно от 0,1% до 12,5% от типичного времени удвоения объема опухоли для указанной заранее определенной солидной злокачественной опухоли.
3. Способ по п. 1 или 2, где заранее определенное пороговое значение различается между (i) сильно изменчивым присутствием или концентрацией, по меньшей мере, одного биомаркера, который не связан с развитием заранее определенной солидной злокачественной опухоли, и (ii) менее изменчивым присутствием или концентрацией, по меньшей мере, одного биомаркера, который связан с развитием заранее определенной солидной злокачественной опухоли.
4. Способ под одному из пп. 1-3, где заранее определенная солидная злокачественная опухоль выбрана из группы, состоящей из рака мочевого пузыря, рака молочной железы, колоректального рака, рака эндометрия, рака почки, почечноклеточного рака, рака легкого, рака поджелудочной железы, рака предстательной железы и рака щитовидной железы.
5. Способ по одному из предшествующих пунктов, где указанная солидная злокачественная опухоль представляет рак предстательной железы (РПЖ).
6. Способ по п. 5, где указанная солидная злокачественная опухоль представляет агрессивную форму рака предстательной железы (АРПЖ).
7. Способ по п. 5 или 6, где период времени между первой временной точкой и второй временной точкой, составляет от 3 суток до 6 месяцев.
8. Способ по п. 5 или 6, где период времени между первой временной точкой и второй временной точкой, составляет от 1 суток до 3 месяцев.
9. Способ по п. 8, где период времени между первой временной точкой и второй временной точкой составляет от 1 суток до 7 недель и разница примерно 10% (увеличение или уменьшение) или более в концентрации или присутствии простат-специфического антигена (ПСА) в первом и втором биологическом образце, отобранных на первой и второй временной точке, рассматривается в качестве изменения, указывающего на более низкий риск наличия РПЖ, и изменение примерно на 10% или меньше в концентрации или присутствии простат-специфического антигена (ПСА) в первом и втором биологическом образце, отобранных на первой и второй временной точки, указывает на более высокий риск наличия рака предстательной железы.
10. Способ по одному из пп. 6-8, где указанный, по меньшей мере, один биомаркер выбран из группы, состоящей из простат-специфического антигена (ПСА), свободного ПСА, комплексного ПСА, про-ПСА, интактного ПСА, общего ПСА, простатической кислой фосфатазы человека (PAP), человеческого калликреина 2 (hK2), раннего антигена рака предстательной железы (EPCA), бета-микросемипротеина (MSMB), глутатион-S-трансферазы π (GSTP1), α-метилацилкоэнзим-рацемазы (AMACR), макрофагального ингибирующего цитокина 1 (MIC-1).
11. Способ по п. 10, где указанный, по меньшей мере, один биомаркер выбран из группы, состоящей из свободного ПСА, комплексного ПСА, общего ПСА, MSMB, MIC-1.
12. Способ по п. 10, где концентрацию или присутствие, по меньшей мере, одного биомаркера, выбранного из группы, состоящей из свободного ПСА, интактного ПСА, hK2, MIC-1 и MSMB, определяют в биологическом образце, полученном от указанного субъекта на первой и/или второй временной точке.
13. Способ по одному из пп. 1-4, где солидная злокачественная опухоль представляет рак яичника, и биомаркером является CA125.
14. Способ по одному из пп. 1-4, где солидная злокачественная опухоль представляет колоректальный рак, и биомаркером является CEA.
15. Способ по одному из пп. 1-4, где солидная злокачественная опухоль представляет рак молочной железы, и биомаркером является CA 15-3.
16. Способ по одному из пп. 1-4, где солидная злокачественная опухоль представляет рак поджелудочной железы, и, по меньшей мере, один биомаркер выбран из группы, состоящей из CA 19-9 и CEA.
17. Способ по одному из предшествующих пунктов, дополнительно включающий:
анализ в указанных, по меньшей мере, двух биологических образцах группу однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), связанных с указанной заранее определенной солидной злокачественной опухолью (SNPst), определением присутствия или отсутствия каждого из множества SNPst;
комбинирование данных, касающихся указанной группы SNPst, для формирования комбинированного показателя SNPst, представляющего SNPst-связанный риск развития заранее определенной солидной злокачественной опухоли;
комбинирование динамического комбинированного показателя и комбинированного показателя SNPst с получением общего комбинированного показателя; и
соотнесение указанного общего комбинированного показателя с наличием или отсутствием указанной заранее определенной солидной злокачественной опухоли у указанного субъекта сравнением указанного общего комбинированного показателя с заранее определенным пороговым значением, установленным с контрольными образцами с известным диагнозом заранее определенной солидной злокачественной опухоли и доброкачественной опухоли.
18. Способ по одному из предшествующих пунктов, где данные, касающиеся, по меньшей мере, одного биомаркера, комбинируются согласно заранее определенному уравнению с формированием указанного динамического комбинированного показателя.
19. Способ по п. 17 или 18, где данные, касающиеся указанной категории SNP, комбинируются согласно заранее определенному уравнению с формированием указанного комбинированного показателя SNPst.
20. Способ по одному из пп. 17-19, где указанный динамический комбинированный показатель и комбинированный показатель SNPst объединяются согласно заранее определенному уравнению с формированием указанного общего комбинированного показателя.
22. Компьютерный программный продукт, непосредственно загружаемый во внутреннюю память цифрового компьютера, отличающийся тем, что указанный компьютерный программный продукт включает средства программного кода, для осуществления, по меньшей мере, стадий D и Е по п. 1, таких как стадии А-Е по п. 1.
22. Компьютерный программный продукт по п. 21, дополнительно включающий средства программного кода, для осуществления способа по п. 17.
23. Способ обнаружения наличия или отсутствия РПЖ у субъекта, включающий:
А. Определение присутствия или концентрации, по меньшей мере, одного связанного с РПЖ биомаркера, такого как (общий) ПСА, в первом биологическом образце от субъекта, отобранном на первой временной точке.
В. В случае определения многих биомаркеров, комбинирование данных о присутствии или концентрации биомаркерных показателей в комбинированный показатель или биомаркерный показатель, и затем
i) если биомаркерный показатель (для измерения одного биомаркера) или комбинированный показатель (для измерения многих биомаркеров) в указанном первом биологическом образце ниже или равен заранее определенному низкому уровню риска, который отражает низкий риск развития рака предстательной железы, то рекомендуется провести еще один анализ в течение 3-10 лет (зеленый свет),
или
ii) если биомаркерный показатель (для измерения одного биомаркера) или комбинированный показатель (для измерения многих биомаркеров) в указанном первом биологическом образце выше или равен заранее определенному высокому уровню риска, который отражает высокий риск развития рака предстательной железы, то указанному субъекту рекомендуется выполнить подтверждающую диагностическую процедуру, такую как биопсия (красный свет), или
iii) если биомаркерный показатель (для измерения одного биомаркера) или комбинированный показатель (для измерения многих биомаркеров) в указанном первом биологическом образце, находится между низким уровнем риска и высоким уровнем риска, то указанный биологический образец подвергают дополнительной оценке в последующем периоде наблюдения или тестированию для определения того, насколько:
а) указанный субъект имеет высокий риск и должен быть направлен на подтверждающую диагностическую процедуру, такую как биопсия (красный свет), или
b) указанный субъект имеет средний риск в отношении рака предстательной железы, то рекомендуются провести еще один анализ в течение 1-3 лет (желтый свет),
где дополнительная оценка в последующем периоде наблюдения, проводимая с биологическим образцом, полученным на первой временной точке, включает измерение в указанном биологическом образце присутствия или концентрации одного или более биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из: ПСА, свободного ПСА, интактного ПСА, hK2, MIC-1 и MSMB и/или определение присутствия или отсутствия генетических SNP-маркеров, выбранных из группы, состоящей из: rs138213197, rs7818556, rs6983267, rs10993994, rs12793759, rs16901979, rs9911515, rs1016343, rs7106762, rs6579002, rs16860513, rs5945619, rs16902094, rs10896437, rs651164, rs7679673, rs13265330, rs2047408, rs10107982, rs620861, rs9297746, rs1992833, rs7213769, rs2710647, rs888507, rs17021918, rs12500426, rs2028900, rs7102758, rs16901922, rs6062509, rs2659051, rs17832285, rs12543663, rs4699312, rs11091768, rs3120137, rs6794467, rs10086908, rs7141529, rs2315654, rs12151618, rs747745, rs1009, rs2132276, rs2735839, rs11568818, rs684232, rs9364554, rs9830294, rs2660753, rs10807843, rs1933488, rs17467139, rs12947919, rs721048, rs385894, rs2331780, rs1894292, rs2107131, rs6545962, rs11649743, rs758643, rs2297434, rs902774, rs2647262, rs17224342, rs5918762, rs11672691, rs17138478, rs3019779, rs1873555, rs9457937, rs2838053, rs12946864, rs12475433, rs3765065, rs2018334, rs3771570, rs4871779, rs10875943, rs11601037, rs6489721, rs11168936, rs9297756, rs11900952, rs6569371, rs7752029, rs5934705, rs3745233, rs1482679, rs749264, rs6625760, rs5978944, rs2366711, rs5935063, rs10199796, rs2473057, rs4925094 и rs3096702, или их подгруппы, для определения того, имеет ли указанный субъект средний риск (желтый свет) или высокий риск (красный свет), комбинированием всех полученных результатов, относящихся к субъекту,
и затем проведение дополнительной оценки в последующем периоде наблюдения, проводимой на второй временной точке, для определения уровня риска, где указанная оценка, проводимая на второй временной точке, включает одно или более из следующего: пальцевое ректальное обследование (DRE), определение объема предстательной железы, сбор истории болезни пациента; и/или определение присутствия или концентрации биомаркера в биологическом образце, отобранном на указанной второй временной точке, и затем комбинирование всех полученных результатов, связанных с субъектом, например, комбинированием данных, основанных на: присутствии или концентрации, по меньшей мере, одного биомаркера в первом биологическом образце, отобранном на первой временной точке, и/или одного или более результатов оценки в последующем периоде наблюдения, для формирования комбинированного показателя и сравнение его с заранее определенным пороговым значением, установленным с контрольными образцами с известным диагнозом заранее определенной солидной злокачественной опухоли предстательной железы и доброкачественной опухоли, отражающим высокий риск или средний риск рака предстательной железы (красный свет или желтый свет), где, по меньшей мере, один биомаркер является одним и тем же биомаркером в каждом из биологических образцов.
24. Способ по п. 23, где дополнительная оценка в последующем периоде наблюдения дополнительно включает определение присутствия или отсутствия одного или более генетических SNP-маркеров, выбранных из группы, состоящей из rs12490248, rs4245739, rs10094059, rs306801, rs2823118, rs2025645, rs9359428, rs10178804, rs6090461, rs2270785, rs16901841, rs2465796, rs17256058, rs16849146, rs2269640, rs8044335, rs6530238, rs712242, rs9267911, rs11134144, rs12880777, rs7090755, rs132774, rs17779822, rs398146, rs4844228, rs4237185, rs7125415, rs1439024, rs6770955, rs11253002, rs4822763, rs2162185, rs12640320, rs5945637, rs3818714, rs6762443, rs10508678, rs2272668, rs2227270, rs6437715, rs3759129, rs1891158, rs7358335, rs12988652, rs3796547, rs7234917, rs6509345, rs966304, rs1515542, rs11631109, rs871688, s4382847, rs9972541, rs13113975, rs4119478, rs1380862, rs7529518, rs785437, rs1140809, rs4830488, rs10458360, rs2738571, rs11634741, rs1950198, rs539357, rs16887736, rs7658048, rs11222496, rs2207790, rs12506850, rs4512641, rs2813532, rs6934898, rs582598, rs10191478, rs10486562, rs17395631, rs7525167, rs12637074, rs10887926, rs7485441, rs1944047, rs7178085, rs17318620, rs10489871, rs2691274, rs6962297, rs1827611, rs4806120, rs7164364, rs2293710, rs13017302, rs4570588, rs2386841, rs40485, rs524908, rs10795841, rs4273907, rs12612891, rs10496470, rs6755901, rs1943821, rs13319878, rs6957416, rs12552397, rs6489794, rs4346531, rs7777631, rs1046011, rs16988279, rs986472, rs10508422, rs9456490, rs1295683, rs2449600, rs7075945, rs9358913, rs1477886, rs753032, rs409558, rs4246742, rs10060513, rs17070292, rs10826398, rs17744022, rs7801918, rs885479, rs1863610, rs3805284, rs10832514, rs2509867, rs2070874, rs2339654, rs12903579, rs11610799, rs2272316, rs6961773, rs2078277, rs17324573, rs6760417, rs2911756, rs12233245, rs896615, rs4760442, rs2087724, rs439378, rs4833103, rs6539333, rs4423250, rs12594014, rs17123359, rs12505546 и rs585197, или их подгруппы.
25. Способ по п. 23 или 24, где подгруппа SNP, составляет, по меньшей мере, 90%, например, по меньшей мере, 95% SNP в данном списке.
26. Способ по одному из пп. 23-25, где дополнительная оценка в периоде последующего наблюдения, проводимая на второй временной точке, также включает оценку риска, включающую комбинирование данных относительно присутствия или концентрации, по меньшей мере, одного биомаркера в указанных биологических образцах, отобранных на первой и второй временной точке, для формирования динамического комбинированного показателя, который отражает изменение присутствия или концентрации биомаркера в указанных биологических образцах между первой и второй временной точками, где указанный, по меньшей мере, один биомаркер представляет один и тот же биомаркер в каждом из биологических образцов, и где период времени между первым и вторым биологическим образцом, составляет примерно три месяца.
RU2016139491A 2014-03-11 2015-03-11 Способ обнаружения солидной злокачественной опухоли RU2720148C9 (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
SE1450274-4 2014-03-11
SE1450274 2014-03-11
SE1450420 2014-04-04
SE1450420-3 2014-04-04
PCT/SE2015/050272 WO2015137870A1 (en) 2014-03-11 2015-03-11 Method for detecting a solid tumor cancer

Publications (4)

Publication Number Publication Date
RU2016139491A true RU2016139491A (ru) 2018-04-16
RU2016139491A3 RU2016139491A3 (ru) 2018-10-15
RU2720148C2 RU2720148C2 (ru) 2020-04-24
RU2720148C9 RU2720148C9 (ru) 2020-09-28

Family

ID=52829276

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016139491A RU2720148C9 (ru) 2014-03-11 2015-03-11 Способ обнаружения солидной злокачественной опухоли

Country Status (10)

Country Link
US (1) US10451626B2 (ru)
EP (2) EP4220170A3 (ru)
JP (1) JP6625061B2 (ru)
AU (2) AU2015230017B2 (ru)
CA (2) CA3134289A1 (ru)
DK (1) DK3117216T3 (ru)
FI (1) FI3117216T3 (ru)
HK (1) HK1231559A1 (ru)
RU (1) RU2720148C9 (ru)
WO (1) WO2015137870A1 (ru)

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114740202A (zh) 2014-03-28 2022-07-12 欧普科诊断有限责任公司 与前列腺癌的诊断有关的组合物和方法
WO2016160545A1 (en) 2015-03-27 2016-10-06 Opko Diagnostics, Llc Prostate antigen standards and uses thereof
US11479878B2 (en) 2016-03-16 2022-10-25 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Methods for genome characterization
DK3270163T3 (en) * 2016-07-15 2018-11-19 Proteomedix Ag PROCEDURE FOR DETECTING PROTEINS IN HUMAN SAMPLES AND APPLICATIONS OF SUCH PROCEDURES
CN110382718A (zh) * 2017-02-01 2019-10-25 法迪亚股份有限公司 用于指示具有特定特征的个体中的前列腺癌的存在或不存在的方法
EP3577215A4 (en) * 2017-02-03 2020-12-30 The Johns Hopkins University USE OF MINI-CANCERS FOR PERSONALIZED ANTI-CANCER DRUG PROTOCOLS
RU2664706C2 (ru) * 2017-06-02 2018-08-21 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский радиологический центр" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "НМИРЦ" Минздрава России) Способ прогнозирования клинического статуса рака предстательной железы
JP7127422B2 (ja) * 2017-08-30 2022-08-30 東ソー株式会社 癌を検出する方法及び検出試薬
WO2020205204A1 (en) * 2019-04-03 2020-10-08 Opko Diagnostics, Llc Methods for the detection of prostate cancer
IT202000029948A1 (it) * 2020-12-04 2022-06-04 Nib Biotec S R L Metodo per la diagnosi di tumore alla prostata in pazienti in differente fascia di età
WO2024092138A1 (en) * 2022-10-27 2024-05-02 Myome, Inc. Approach for early detection of disease combining multiple data sources
WO2024092136A2 (en) * 2022-10-28 2024-05-02 Memorial Sloan-Kettering Cancer Center Machine learning modeling for inpatient prediction

Family Cites Families (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030219840A1 (en) 2002-05-24 2003-11-27 Mikolajczyk Stephen D. Method of analyzing proenzyme forms of prostate specific antigen in serum to improve prostate cancer detection
US20050277137A1 (en) 2003-08-15 2005-12-15 University Of Pittsburgh Diagnostic multimarker serological profiling
KR100830811B1 (ko) * 2006-09-18 2008-05-20 충북대학교 산학협력단 종양표시인자 검출용 바이오센서
FR2934698B1 (fr) 2008-08-01 2011-11-18 Commissariat Energie Atomique Procede de prediction pour le pronostic ou le diagnostic ou la reponse therapeutique d'une maladie et notamment du cancer de la prostate et dispositif permettant la mise en oeuvre du procede.
US20120021925A1 (en) 2009-01-19 2012-01-26 Miraculins, Inc. Diagnostic assays for prostate cancer using psp94 and psa biomarkers
WO2010093939A2 (en) 2009-02-12 2010-08-19 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Predicting and treating prostate cancer
EP2407555A1 (en) * 2010-07-14 2012-01-18 Fundació Institut de Recerca Hospital Universitari Vall d'Hebron, Fundació Privada Methods and kits for the diagnosis of prostate cancer
WO2012031207A2 (en) 2010-09-03 2012-03-08 Wake Forest University Health Sciences Methods and compositions for correlating genetic markers with prostate cancer risk
US20120202888A1 (en) 2010-10-08 2012-08-09 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Biomarkers of prostate cancer and predicting mortality
US20120150032A1 (en) 2010-12-13 2012-06-14 Julius Gudmundsson Sequence Variants Associated with Prostate Specific Antigen Levels
WO2012092336A2 (en) 2010-12-28 2012-07-05 Caris Mpi, Inc. Molecular profiling for cancer
US9753043B2 (en) * 2011-12-18 2017-09-05 20/20 Genesystems, Inc. Methods and algorithms for aiding in the detection of cancer
EP2850432A2 (en) * 2012-05-16 2015-03-25 Phadia AB Method for indicating the presence or non-presence of prostate cancer
AU2013349721B2 (en) * 2012-11-20 2019-03-28 Phadia Ab Prognostic method for individuals with prostate cancer
KR20150110477A (ko) 2012-11-20 2015-10-02 파디아 에이비 공격적인 전립선 암의 존재 또는 부존재를 나타내는 방법

Also Published As

Publication number Publication date
AU2021232712A1 (en) 2021-10-14
AU2015230017A1 (en) 2016-09-08
CA2940445A1 (en) 2015-09-17
EP3117216B1 (en) 2023-01-11
CA2940445C (en) 2021-11-30
RU2016139491A3 (ru) 2018-10-15
DK3117216T3 (da) 2023-04-03
EP4220170A2 (en) 2023-08-02
US10451626B2 (en) 2019-10-22
EP3117216A1 (en) 2017-01-18
JP2017508970A (ja) 2017-03-30
RU2720148C9 (ru) 2020-09-28
WO2015137870A1 (en) 2015-09-17
RU2720148C2 (ru) 2020-04-24
HK1231559A1 (zh) 2017-12-22
AU2015230017B2 (en) 2021-06-17
JP6625061B2 (ja) 2019-12-25
FI3117216T3 (fi) 2023-04-27
EP4220170A3 (en) 2023-12-13
CA3134289A1 (en) 2015-09-17
AU2021232712B2 (en) 2024-10-03
US20170108501A1 (en) 2017-04-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2016139491A (ru) Способ обнаружения солидной злокачественной опухоли
Fredsøe et al. Diagnostic and prognostic microRNA biomarkers for prostate cancer in cell-free urine
Biswas et al. A clonal expression biomarker associates with lung cancer mortality
Peneder et al. Multimodal analysis of cell-free DNA whole-genome sequencing for pediatric cancers with low mutational burden
Tomlins et al. Characterization of 1577 primary prostate cancers reveals novel biological and clinicopathologic insights into molecular subtypes
Sharma et al. Prostate cancer diagnostics: Clinical challenges and the ongoing need for disruptive and effective diagnostic tools
Harbeck et al. Molecular and protein markers for clinical decision making in breast cancer: today and tomorrow
Prensner et al. RNA biomarkers associated with metastatic progression in prostate cancer: a multi-institutional high-throughput analysis of SChLAP1
JP7228896B2 (ja) 乳がん患者の予後の予測方法
JP2017508970A5 (ru)
CN113366577A (zh) 通过片段尺寸分析增强的对靶dna的检测
CN105102636B (zh) 用于检测和测定前列腺癌预后的组合物和方法
Jantus-Lewintre et al. Update on biomarkers for the detection of lung cancer
Jia et al. Expression changes in the stroma of prostate cancer predict subsequent relapse
Kawaguchi et al. Gene Expression Signature–Based Prognostic Risk Score in Patients with Primary Central Nervous System Lymphoma
Bosschieter et al. A two-gene methylation signature for the diagnosis of bladder cancer in urine
Izquierdo et al. Molecular characterization of upper urinary tract tumours
Marín-Aguilera et al. Molecular profiling of peripheral blood is associated with circulating tumor cells content and poor survival in metastatic castration-resistant prostate cancer
US20240053343A1 (en) Biomarkers signature(s) for the prevention and early detection of gastric cancer
Kanyong et al. Immunochemical assays and nucleic-acid detection techniques for clinical diagnosis of prostate cancer
Sun et al. Diagnostic and prognostic value of microRNAs in cholangiocarcinoma: a systematic review and meta-analysis
Schmidt et al. Diagnostic and prognostic value of bladder cancer-related transcript markers in urine
CN114613502A (zh) 鼻咽癌患者生存预测模型、构建方法、设备及存储介质
Guo et al. Screening and identification of specific markers for bladder transitional cell carcinoma from urine urothelial cells with suppressive subtractive hybridization and cDNA microarray
Browne et al. MicroRNA expression profiles in upper tract urothelial carcinoma differentiate tumor grade, stage, and survival: Implications for clinical decision-making

Legal Events

Date Code Title Description
TH4A Reissue of patent specification