RU2017106891A - Биомаркеры поликистозной болезни почек и пути их применения - Google Patents

Биомаркеры поликистозной болезни почек и пути их применения Download PDF

Info

Publication number
RU2017106891A
RU2017106891A RU2017106891A RU2017106891A RU2017106891A RU 2017106891 A RU2017106891 A RU 2017106891A RU 2017106891 A RU2017106891 A RU 2017106891A RU 2017106891 A RU2017106891 A RU 2017106891A RU 2017106891 A RU2017106891 A RU 2017106891A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
pkd
patient
protein
cyclin
kinase
Prior art date
Application number
RU2017106891A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2017106891A3 (ru
Inventor
Оксана Бескровная
Николай БУКАНОВ
Сара МОРЕНО
Original Assignee
Джензим Корпорейшн
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Джензим Корпорейшн filed Critical Джензим Корпорейшн
Publication of RU2017106891A publication Critical patent/RU2017106891A/ru
Publication of RU2017106891A3 publication Critical patent/RU2017106891A3/ru

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6893Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P13/00Drugs for disorders of the urinary system
    • A61P13/12Drugs for disorders of the urinary system of the kidneys
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/483Physical analysis of biological material
    • G01N33/487Physical analysis of biological material of liquid biological material
    • G01N33/49Blood
    • G01N33/492Determining multiple analytes
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/34Genitourinary disorders
    • G01N2800/347Renal failures; Glomerular diseases; Tubulointerstitial diseases, e.g. nephritic syndrome, glomerulonephritis; Renovascular diseases, e.g. renal artery occlusion, nephropathy
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/52Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/56Staging of a disease; Further complications associated with the disease
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/60Complex ways of combining multiple protein biomarkers for diagnosis

Claims (61)

1. Способ определения эффективности лечения поликистозной болезни почек (PKD) у пациента с PKD, при этом способ включает:
(a) обеспечение первого образца, содержащего биологическую жидкость, полученную от пациента с PKD в первый момент времени;
(b) концентрирование экзосом в первом образце;
(c) определение уровня(уровней) по меньшей мере одного маркера, выбранного из группы, состоящей из ядерного антигена пролиферирующих клеток (PCNA), циклина D1, циклина D3, MAPK-ERK-киназы 1 (MEK), рибосомального белка S6 (S6), фосфорилированного рибосомального белка S6 (pS6), киназы, регулируемой внеклеточными сигналами (ERK), фосфорилированной киназы, регулируемой внеклеточными сигналами (pERK), протеинкиназы B (Akt), фосфорилированной протеинкиназы B (pAkt), каспазы-2, общего рибосомального белка S6 и белка, связывающегося с белком ретинобластомы (RBBP), в первом образце;
(d) введение средства для лечения PKD пациенту с PKD;
(e) обеспечение второго образца, содержащего биологическую жидкость, полученную от пациента с PKD во второй момент времени после стадии (d), и осуществление стадий (b) и (c) в отношении второго образца; и
(f) идентификацию вводимого средства для лечения в качестве эффективного, если уровень во второй момент времени снижен по сравнению с первым моментом времени.
2. Способ по п. 1, где введение средства для лечения представляет собой введение ингибитора глюкозилцерамидсинтазы (GCS).
3. Способ по п. 2, где ингибитор GCS выбран из группы, состоящей из:
(S)-хинуклидин-3-ил-(2-(4'-(2-метоксиэтокси)-[1,1'-бифенил]-4-ил)пропан-2-ил)карбамата;
4-фтор-1-(5-фтор-4-(4-((2-метоксиэтокси)метил)фенил)пиримидин-2-ил)-N-(4-метил-1-азабицикло[3.2.2]нонан-4-ил)пиперидин-4-карбоксамида;
4-фтор-1-(4-(4-((2-метоксиэтокси)метил)фенил)пиримидин-2-ил)-N-(3-метилхинуклидин-3-ил)пиперидин-4-карбоксамида;
4-фтор-1-(4-(4-((2-метоксиэтокси)метил)фенил)пиримидин-2-ил)-N-(4-метил-1-азабицикло[3.2.2]нонан-4-ил)пиперидин-4-карбоксамида;
4-фтор-1-(4-(4-(метоксиметил)фенил)пиримидин-2-ил)-N-(3-метилхинуклидин-3-ил)пиперидин-4-карбоксамида;
4-фтор-1-(4-(4-(метоксиметил)фенил)пиримидин-2-ил)-N-(4-метил-1-азабицикло[3.2.2]нонан-4-ил)пиперидин-4-карбоксамида;
4-фтор-1-(4-(4-(2-метоксиэтокси)фенил)пиримидин-2-ил)-N-(3-метилхинуклидин-3-ил)пиперидин-4-карбоксамида;
4-фтор-1-(4-(4-(2-метоксиэтокси)фенил)пиримидин-2-ил)-N-(4-метил-1-азабицикло[3.2.2]нонан-4-ил)пиперидин-4-карбоксамида;
4-фтор-1-(4-(4-(2-фторэтокси)фенил)пиримидин-2-ил)-N-(хинуклидин-3-ил)пиперидин-4-карбоксамида и
4-фтор-1-(4-(4-(2-фторэтокси)фенил)пиримидин-2-ил)-N-(4-метил-1-азабицикло[3.2.2]нонан-4-ил)пиперидин-4-карбоксамида.
4. Способ по п. 1, где стадии (c) и (e) включают определение уровней по меньшей мере двух маркеров, выбранных из группы, состоящей из PCNA, циклина D1, циклина D3, MEK, S6 и pS6, и при этом вводимое средство для лечения идентифицируют в качестве эффективного, если по меньшей мере один из двух уровней во второй момент времени снижен по сравнению с первым моментом времени.
5. Способ по п. 4, где вводимое средство для лечения идентифицируют в качестве эффективного, если оба уровня во второй момент времени снижены по сравнению с первым моментом времени.
6. Способ по п. 1, где введение средства для лечения представляет собой введение ингибитора CDK пациенту с PKD.
7. Способ по п. 6, где ингибитор CDK представляет собой R-росковитин.
8. Способ по п. 1, где первый и второй образцы содержат мочу.
9. Способ определения эффективности лечения у пациента, у которого идентифицировано наличие поликистозной болезни почек (PKD), при этом способ включает:
(a) обеспечение первого образца, содержащего биологическую жидкость, полученную от пациента с PKD в первый момент времени;
(b) определение уровня(уровней) по меньшей мере одного маркера, выбранного из группы, состоящей из ядерного антигена пролиферирующих клеток (PCNA), циклина D1, циклина D3, MAPK-ERK-киназы 1 (MEK), рибосомального белка S6 (S6), фосфорилированного рибосомального белка S6 (pS6), киназы, регулируемой внеклеточными сигналами (ERK), фосфорилированной киназы, регулируемой внеклеточными сигналами (pERK), протеинкиназы B (Akt), фосфорилированной протеинкиназы B (pAkt), каспазы-2, общего S6 и белка, связывающегося с белком ретинобластомы (RBBP), в первом образце;
(c) введение средства для лечения PKD пациенту с PKD;
(d) обеспечение второго образца, содержащего биологическую жидкость, полученную от пациента во второй момент времени после стадии (c), и осуществление стадии (b) в отношении второго образца; и
(e) идентификацию вводимого средства для лечения в качестве эффективного, если уровень во второй момент времени снижен по сравнению с уровнем в первый момент времени.
10. Способ по п. 9, где введение средства для лечения представляет собой введение ингибитора глюкозилцерамидсинтазы (GCS).
11. Способ диагностики поликистозной болезни почек (PKD) у пациента, включающий:
(a) обеспечение образца, содержащего биологическую жидкость от пациента с подозрением на наличие PKD;
(b) концентрирование экзосом в образце;
(c) определение уровня(уровней) по меньшей мере одного маркера, выбранного из группы, состоящей из ядерного антигена пролиферирующих клеток (PCNA), циклина D1, циклина D3, MAPK-ERK-киназы 1 (MEK), рибосомального белка S6 (S6), фосфорилированного рибосомального белка S6 (pS6), киназы, регулируемой внеклеточными сигналами (ERK), фосфорилированной киназы, регулируемой внеклеточными сигналами (pERK), протеинкиназы B (Akt), фосфорилированной протеинкиназы B (pAkt), каспазы-2, общего S6 и белка, связывающегося с белком ретинобластомы (RBBP), в образце и
(d) идентификацию у пациента наличия PKD, если данный уровень повышен по сравнению с контрольным уровнем.
12. Способ по п. 11, где стадия (c) включает определение уровней по меньшей мере двух маркеров, выбранных из группы, состоящей из PCNA, циклина D1, циклина D3, MEK, S6 и pS6, и при этом у пациента идентифицируют наличие PKD, если по меньшей мере один из двух уровней повышен по сравнению с контрольным(контрольными) уровнем(уровнями).
13. Способ по п. 12, где у пациента идентифицируют наличие PKD, если оба уровня повышены по сравнению с контрольными уровнями.
14. Способ по п. 11, где образец содержит мочу.
15. Способ диагностики поликистозной болезни почек (PKD) у пациента, включающий:
(a) обеспечение образца, содержащего ткань почки от пациента с подозрением на наличие PKD;
(b) определение уровня(уровней) по меньшей мере одного маркера, выбранного из группы, состоящей из ядерного антигена пролиферирующих клеток (PCNA), циклина D1, циклина D3, MAPK-ERK-киназы 1 (MEK), рибосомального белка S6 (S6), фосфорилированного рибосомального белка S6 (pS6), киназы, регулируемой внеклеточными сигналами (ERK), фосфорилированной киназы, регулируемой внеклеточными сигналами (pERK), протеинкиназы B (Akt), фосфорилированной протеинкиназы B (pAkt), каспазы-2, общего S6 и белка, связывающегося с белком ретинобластомы (RBBP), в образце и
(c) идентификацию у пациента наличия PKD, если данный уровень повышен по сравнению с контрольным уровнем.
16. Способ по п. 15, где стадия (b) включает определение уровней по меньшей мере двух маркеров, выбранных из группы, состоящей из PCNA, циклина D1, циклина D3, MEK, S6 и pS6, и при этом у пациента идентифицируют наличие PKD, если по меньшей мере один из двух уровней повышен по сравнению с контрольным(контрольными) уровнем(уровнями).
17. Способ по п. 16, где у пациента идентифицируют наличие PKD, если оба уровня повышены по сравнению с контрольными уровнями.
18. Способ определения стадии поликистозной болезни почек (PKD) у пациента, включающий:
(a) обеспечение образца, содержащего биологическую жидкость от пациента с подозрением на наличие PKD или у которого идентифицировано наличие PKD;
(b) концентрирование экзосом в образце;
(c) определение уровня(уровней) по меньшей мере одного маркера, выбранного из группы, состоящей из ядерного антигена пролиферирующих клеток (PCNA), циклина D1, циклина D3, MAPK-ERK-киназы 1 (MEK), рибосомального белка S6 (S6), фосфорилированного рибосомального белка S6 (pS6), киназы, регулируемой внеклеточными сигналами (ERK), фосфорилированной киназы, регулируемой внеклеточными сигналами (pERK), протеинкиназы B (Akt), фосфорилированной протеинкиназы B (pAkt), каспазы-2, общего S6 и белка, связывающегося с белком ретинобластомы (RBBP), в образце и
(d) определение стадии PKD у пациента на основании данного уровня.
19. Способ по п. 18, где стадия (c) включает определение уровней по меньшей мере двух маркеров, выбранных из группы, состоящей из PCNA, циклина D1, циклина D3, MEK, S6 и pS6, и при этом стадию PKD у пациента определяют на основании по меньшей мере одного из двух уровней.
20. Способ по п. 19, где стадию PKD у пациента определяют на основании обоих уровней.
21. Способ по п. 18, где образец содержит мочу.
22. Способ мониторинга пациента с поликистозной болезнью почек (PKD), при этом способ включает:
(a) обеспечение первого образца, содержащего биологическую жидкость, полученную от пациента с PKD в первый момент времени;
(b) концентрирование экзосом в первом образце;
(c) определение уровня(уровней) по меньшей мере одного маркера, выбранного из группы, состоящей из ядерного антигена пролиферирующих клеток (PCNA), циклина D1, циклина D3, MAPK-ERK-киназы 1 (MEK), рибосомального белка S6 (S6), фосфорилированного рибосомального белка S6 (pS6), киназы, регулируемой внеклеточными сигналами (ERK), фосфорилированной киназы, регулируемой внеклеточными сигналами (pERK), протеинкиназы B (Akt), фосфорилированной протеинкиназы B (pAkt), каспазы-2, общего S6 и белка, связывающегося с белком ретинобластомы (RBBP), в первом образце;
(d) обеспечение второго образца, содержащего биологическую жидкость, полученную от пациента с PKD во второй момент времени после первого момента времени, и осуществление стадий (b) и (c) в отношении второго образца; и
(e) идентификацию у пациента наличия улучшения или стабилизации течения PKD, если уровень во второй момент времени не повышен по сравнению с уровнем в первый момент времени.
23. Способ по п. 22, где стадии (c) и (d) включают определение уровней по меньшей мере двух маркеров, выбранных из группы, состоящей из PCNA, циклина D1, циклина D3, MEK, S6 и pS6, и при этом у пациента идентифицируют наличие улучшения или стабилизации течения PKD, если по меньшей мере один из двух уровней во второй момент времени не повышен по сравнению с первым моментом времени.
24. Способ по п. 22, где первый и второй образцы содержат мочу.
RU2017106891A 2014-08-04 2015-08-03 Биомаркеры поликистозной болезни почек и пути их применения RU2017106891A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201462033031P 2014-08-04 2014-08-04
US62/033,031 2014-08-04
PCT/US2015/043497 WO2016022500A2 (en) 2014-08-04 2015-08-03 Biomarkers of polycystic kidney disease and uses thereof

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2017106891A true RU2017106891A (ru) 2018-09-06
RU2017106891A3 RU2017106891A3 (ru) 2019-03-14

Family

ID=54035292

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017106891A RU2017106891A (ru) 2014-08-04 2015-08-03 Биомаркеры поликистозной болезни почек и пути их применения

Country Status (12)

Country Link
US (1) US10871495B2 (ru)
EP (1) EP3177932B1 (ru)
JP (2) JP6730252B2 (ru)
KR (1) KR20170033436A (ru)
CN (1) CN106716136B (ru)
AU (1) AU2015301278A1 (ru)
BR (1) BR112017002003A2 (ru)
CO (1) CO2017001596A2 (ru)
MX (1) MX2017001648A (ru)
RU (1) RU2017106891A (ru)
SG (1) SG11201700290SA (ru)
WO (1) WO2016022500A2 (ru)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11116755B2 (en) 2015-11-18 2021-09-14 Genzyme Corporation Biomarker of polycystic kidney disease and uses thereof
GB201719520D0 (en) * 2017-11-24 2018-01-10 Univ College Cardiff Consultants Ltd Neuroprotectvie peptide

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR100708573B1 (ko) 1999-05-24 2007-04-18 에이브이아이 바이오파마 인코포레이티드 다낭 신장 질환의 치료를 위한 c-myc에 대한 안티센스
US9006181B2 (en) 2004-07-21 2015-04-14 The Administrators Of The Tulane Educational Fund Treatment of renal dysfunction and multiple myeloma using PACAP compounds
EP1808694A1 (en) 2006-01-17 2007-07-18 Universitätsklinikum Freiburg Method for diagnosing polycystic kidney disease
WO2010141862A2 (en) 2009-06-05 2010-12-09 Mayo Foundation For Medical Education And Research Methods and materials for isolating exosomes
CN102018702B (zh) 2009-09-16 2012-07-18 北京大学 银杏内酯b的一种用途
ES2606140T3 (es) 2010-10-01 2017-03-22 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Métodos para predecir la progresión y tratar una enfermedad renal crónica en un paciente
US20130276513A1 (en) * 2010-10-14 2013-10-24 The Regents Of The University Of California Methods for diagnosing and assessing kidney disease
WO2014006093A1 (en) 2012-07-03 2014-01-09 Boletta Alessandra Compounds for use in polycystic kidney disease
MA37975B2 (fr) 2012-09-11 2021-03-31 Genzyme Corp Inhibiteurs de synthase de glucosylcéramide

Also Published As

Publication number Publication date
AU2015301278A1 (en) 2017-02-09
EP3177932A2 (en) 2017-06-14
MX2017001648A (es) 2017-04-27
CN106716136B (zh) 2020-06-23
RU2017106891A3 (ru) 2019-03-14
JP7005695B2 (ja) 2022-02-04
SG11201700290SA (en) 2017-02-27
WO2016022500A3 (en) 2016-04-07
CN106716136A (zh) 2017-05-24
KR20170033436A (ko) 2017-03-24
WO2016022500A2 (en) 2016-02-11
JP6730252B2 (ja) 2020-07-29
US10871495B2 (en) 2020-12-22
BR112017002003A2 (pt) 2017-12-12
EP3177932B1 (en) 2021-07-14
JP2017525955A (ja) 2017-09-07
JP2020170013A (ja) 2020-10-15
US20170227551A1 (en) 2017-08-10
CO2017001596A2 (es) 2017-05-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Brissot et al. Tyrosine kinase inhibitors improve long-term outcome of allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for adult patients with Philadelphia chromosome positive acute lymphoblastic leukemia
Chen et al. Clinical, molecular, and immune analysis of dabrafenib-trametinib combination treatment for BRAF inhibitor–refractory metastatic melanoma: a phase 2 clinical trial
Palmerini et al. Risk of stroke with percutaneous coronary intervention compared with on-pump and off-pump coronary artery bypass graft surgery: Evidence from a comprehensive network meta-analysis
BR112015020235A2 (pt) fragmento biologicamente ativo de proteína csf-1 ou um seu homólogo, ácido nucléico, proteína de fusão, ácido nucléico isolado, vetor, célula hospedeira, método de realização da proteína de fusão do primeiro aspeto da invenção, composição, utilização de uma proteína de fusão, método de tratamento para um indivíduo sofrendo de cancro do fígado e que irá ser submetido a cirurgia, método de tratamento para um indivíduo que irá ser submetido a cirurgia de transplante de fígado, e, kit
Amajoyi et al. Neoadjuvant therapy for rectal cancer decreases the number of lymph nodes harvested in operative specimens
WO2013083098A3 (en) Method of determination of cancer cell drug sensitivity towards aurora kinase inhibitors
Fogelman et al. Does IGFR1 inhibition result in increased muscle mass loss in patients undergoing treatment for pancreatic cancer?
RU2016109646A (ru) Способы применения клеток, происходящих из жировой ткани, при модуляции боли и/или фиброза
EA201790563A1 (ru) Применение реслизумаба для лечения эозинофильной астмы со степенью тяжести от умеренной до тяжелой
JP2016528914A5 (ru)
RU2017106891A (ru) Биомаркеры поликистозной болезни почек и пути их применения
EA201892542A1 (ru) Способы прогнозирования у пациентов терапевтического эффекта терапии с использованием антител к cd19
Saleh et al. Neoadjuvant endocrine treatment for breast cancer: from bedside to bench and back again?
JP2017525955A5 (ru)
Shoushtari et al. Overall survival and response to systemic therapy in metastatic extrauterine leiomyosarcoma
RU2016102202A (ru) Биологический маркер опухоли
Zhao et al. Population pharmacokinetics of valnemulin in swine
Wang et al. Differential vascular endothelial cell toxicity of established and novel BCR-ABL tyrosine kinase inhibitors
KR102598667B1 (ko) 강직성 척추염 환자에 대한 생물학적제제의 반응성 예측 방법 및 분석 장치
Wilcken The'enablers': Inhibitors of mTOR, PI3K and CDK that prolong endocrine sensitivity
Leclerc et al. Persistence of antibodies to infliximab for more than two months predicts loss of response to infliximab in inflammatory bowel diseases
AU2016357720A1 (en) Biomarker of polycystic kidney disease and uses thereof
Giordano et al. Metronomic Chemotherapy With Daily Low Dose Temozolomide and Celecoxib in Elderly Patients With Newly Diagnosed Glioblastoma Multiforme: A Retrospective Analysis
BR112017007592A2 (pt) polipeptídeo, composição de polipeptídeos, métodos de produção de polipeptídeo e de detecção de anticorpos, uso de polipeptídeo e kit de reagentes
RU2015130730A (ru) Способ прогнозирования чувствительности к химиотерапии у больных с лимфопролиферативными заболеваниями

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20190627