RU2014128454A - Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы - Google Patents

Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы Download PDF

Info

Publication number
RU2014128454A
RU2014128454A RU2014128454A RU2014128454A RU2014128454A RU 2014128454 A RU2014128454 A RU 2014128454A RU 2014128454 A RU2014128454 A RU 2014128454A RU 2014128454 A RU2014128454 A RU 2014128454A RU 2014128454 A RU2014128454 A RU 2014128454A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
value
recurrence rate
recurrence
subject
ndrg1
Prior art date
Application number
RU2014128454A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2609199C2 (ru
Inventor
Владимир Константинович Боженко
Сергей Николаевич Карбаинов
Original Assignee
Общество С Ограниченной Ответственностью "Гамма Глобал Рд"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Общество С Ограниченной Ответственностью "Гамма Глобал Рд" filed Critical Общество С Ограниченной Ответственностью "Гамма Глобал Рд"
Priority to RU2014128454A priority Critical patent/RU2609199C2/ru
Priority to PCT/RU2015/000293 priority patent/WO2015178804A1/ru
Publication of RU2014128454A publication Critical patent/RU2014128454A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2609199C2 publication Critical patent/RU2609199C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6881—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for tissue or cell typing, e.g. human leukocyte antigen [HLA] probes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2531/00—Reactions of nucleic acids characterised by
    • C12Q2531/10—Reactions of nucleic acids characterised by the purpose being amplify/increase the copy number of target nucleic acid
    • C12Q2531/113—PCR
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2561/00—Nucleic acid detection characterised by assay method
    • C12Q2561/113—Real time assay
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/118—Prognosis of disease development
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/166—Oligonucleotides used as internal standards, controls or normalisation probes
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • G01N33/57415—Specifically defined cancers of breast

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

1. Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы у субъекта-млекопитающего, включающий:(a) измерение относительного уровня экспрессии РНК-транскриптов KI67, CCND1, PTEN, NDRG1, TERT в биологическом образце, содержащем опухолевые клетки, полученном от указанного субъекта;(b) определение показателя рецидивирования для указанного субъекта с учетом измеренных уровней экспрессии генов;(c) использование указанного показателя рецидивирования для определения вероятности рецидивирования рака молочной железы; и(d) составление отчета, в котором приведен результат указанного определения.2. Способ по п. 1, где в качестве референсного значения определялся уровень экспрессии генов GUSB, В2М, HPRT.3. Способ по п. 1, где указанный субъект представляет собой человека.4. Способ по п. 1, где индивидуальный вклад каждого гена оценивают отдельно.5. Способ по п. 1, включающий определение показателя рецидивирования как точки на графике с двумя координатами X и Y.6. Способ по п. 1, где для вычисления значения координаты X каждое значение экспрессии гена умножают на соответствующий коэффициент, далее из суммы полученных значений вычитают 3,17:X=KI67·2,33+CCND1·(-1,26)+PTEN·0,91+NDRG1·(-1,33)+TERT·(-0,45)-3,17.7. Способ по п. 1, где для вычисления значения координаты Y каждое значение экспрессии гена умножают на соответствующий коэффициент, далее из суммы полученных значений вычитают 1,33:Y=KI67·0,54+CCND1·0,99+PTEN·(-1,08)+NDRG1·(-0,33)+TERT·0,008-1,33.8. Способ по п. 1, где значение показателя рецидивирования, находящееся в пределах X<0,9; Y<-0,2, связано с максимальным риском рецидива через 0-30 месяцев.9. Способ по п. 1, где значение показателя рецидивирования, находящееся в пределах X<0,3; Y>-0,1, связано с риск�

Claims (16)

1. Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы у субъекта-млекопитающего, включающий:
(a) измерение относительного уровня экспрессии РНК-транскриптов KI67, CCND1, PTEN, NDRG1, TERT в биологическом образце, содержащем опухолевые клетки, полученном от указанного субъекта;
(b) определение показателя рецидивирования для указанного субъекта с учетом измеренных уровней экспрессии генов;
(c) использование указанного показателя рецидивирования для определения вероятности рецидивирования рака молочной железы; и
(d) составление отчета, в котором приведен результат указанного определения.
2. Способ по п. 1, где в качестве референсного значения определялся уровень экспрессии генов GUSB, В2М, HPRT.
3. Способ по п. 1, где указанный субъект представляет собой человека.
4. Способ по п. 1, где индивидуальный вклад каждого гена оценивают отдельно.
5. Способ по п. 1, включающий определение показателя рецидивирования как точки на графике с двумя координатами X и Y.
6. Способ по п. 1, где для вычисления значения координаты X каждое значение экспрессии гена умножают на соответствующий коэффициент, далее из суммы полученных значений вычитают 3,17:
X=KI67·2,33+CCND1·(-1,26)+PTEN·0,91+NDRG1·(-1,33)+TERT·(-0,45)-3,17.
7. Способ по п. 1, где для вычисления значения координаты Y каждое значение экспрессии гена умножают на соответствующий коэффициент, далее из суммы полученных значений вычитают 1,33:
Y=KI67·0,54+CCND1·0,99+PTEN·(-1,08)+NDRG1·(-0,33)+TERT·0,008-1,33.
8. Способ по п. 1, где значение показателя рецидивирования, находящееся в пределах X<0,9; Y<-0,2, связано с максимальным риском рецидива через 0-30 месяцев.
9. Способ по п. 1, где значение показателя рецидивирования, находящееся в пределах X<0,3; Y>-0,1, связано с риском рецидива через 30-60 месяцев.
10. Способ по п. 1, где значение показателя рецидивирования, находящееся в пределах X>-0,3; Y>-0,2 или X>1; Y - любое, связано с минимальным риском рецидива.
11. Способ по п. 1, где указанный биологический образец выбран из группы, состоящей из свежей опухолевой ткани, тонкоигольных аспиратов, перитониальной жидкости, протокового лаважа и плевральной жидкости.
12. Способ по п. 1, где указанный биологический образец представляет собой образец опухоли.
13. Способ по п. 12, где указанный образец опухоли получен из фиксированной заключенной в парафин опухолевой ткани.
14. Способ по п. 13, где указанная ткань была получена биопсией.
15. Способ по п. 13, где уровни экспрессии указанных РНК-транскриптов определены посредством RT-PCR.
16. Способ по п. 13, где указанная РНК фрагментирована.
RU2014128454A 2014-05-19 2014-07-11 Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы RU2609199C2 (ru)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2014128454A RU2609199C2 (ru) 2014-07-11 2014-07-11 Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы
PCT/RU2015/000293 WO2015178804A1 (ru) 2014-05-19 2015-05-07 Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2014128454A RU2609199C2 (ru) 2014-07-11 2014-07-11 Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2014128454A true RU2014128454A (ru) 2016-01-27
RU2609199C2 RU2609199C2 (ru) 2017-01-30

Family

ID=55237251

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014128454A RU2609199C2 (ru) 2014-05-19 2014-07-11 Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2609199C2 (ru)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2748684C1 (ru) * 2020-09-30 2021-05-28 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Уральский научно-исследовательский институт охраны материнства и младенчества" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "НИИ ОММ" Минздрава России) Способ оценки экспрессии Phosphatase and Tensin Homolog (PTEN) в железах и строме эндометрия
RU2763839C1 (ru) * 2021-04-27 2022-01-11 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова" Минздрава России) Способ многофакторного прогноза рака молочной железы

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20130012409A1 (en) * 2009-10-08 2013-01-10 M Frank Diagnostic and Prognostic Markers for Cancer

Also Published As

Publication number Publication date
RU2609199C2 (ru) 2017-01-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
NZ600268A (en) Method to use gene expression to determine likelihood of clinical outcome of renal cancer
Wang et al. Next generation sequencing of pancreatic cyst fluid microRNAs from low grade-benign and high grade-invasive lesions
MX2019000091A (es) Metodo para el pronostico y tratamiento de cancer metastasico de los huesos originado de cancer de mama.
MX2015011362A (es) Metodo para el pronostico y tratamiento de metastasis de cancer.
EA201500327A1 (ru) Неинвазивное определение метилома плода или опухоли по плазме
SG10201908277TA (en) Method of determining the risk of developing breast cancer by detecting the expression levels of micrornas (mirnas)
CY1121916T1 (el) Βιοδεικτες micro-rna για την ταυτοποιηση του κινδυνου και/ή τη διαγνωση του ογκου στον πνευμονα
Ning et al. Characterization of the Merkel cell carcinoma miRNome
Mo et al. miR-1290 is a potential prognostic biomarker in non-small cell lung cancer
MX368513B (es) Métodos in vitro para el pronóstico, diagnóstico y diseño de una terapia de metástasis de cáncer de pulmón.
MX2013003880A (es) Metodo para diagnostico, pronostico y tratamiento de la metastasis de carcer de mama.
Zhao et al. Role of EZH2 in oral squamous cell carcinoma carcinogenesis
JP2014533960A5 (ru)
MX365421B (es) Método in-vitro para diagnóstico, pronóstico y tratamiento de metástasis de cáncer de próstata usando c-maf.
CN104805197A (zh) 分子标志物用于乳腺癌诊断和预后评估的方法
JP2016521979A5 (ru)
WO2015091575A3 (en) Different levels in blood cell samples of emt-markers for the diagnosis of cancer, in particular of colorectal (crc) and pancreatic (pc) cancer
MX369911B (es) Método basado en expresión génica para clasificar pacientes con cãncer de riñón de acuerdo al riesgo de recurrencia.
RU2014128454A (ru) Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы
JP2017529852A5 (ru)
PH12020551982A1 (en) Tumor marker, methylation detection reagent, kit and use thereof
RU2014119964A (ru) Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы
Nymoen et al. MiR-29a is a candidate biomarker of better survival in metastatic high-grade serous carcinoma
EA201690354A1 (ru) Уровни экспрессии иммуноглобулинов в качестве биологического маркера для реакции на ингибитор протеасом
EA202190962A2 (ru) Уровни экспрессии иммуноглобулинов в качестве биологического маркера для реакции на ингибитор протеасом

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20180712

NF4A Reinstatement of patent

Effective date: 20190312

MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20200712