RU2013130607A - METHOD FOR DETECTING MYCOBACTERIA TUBERCULOSIS GENETIC CLUSTER Beijing B0 / W148 - Google Patents

METHOD FOR DETECTING MYCOBACTERIA TUBERCULOSIS GENETIC CLUSTER Beijing B0 / W148 Download PDF

Info

Publication number
RU2013130607A
RU2013130607A RU2013130607/10A RU2013130607A RU2013130607A RU 2013130607 A RU2013130607 A RU 2013130607A RU 2013130607/10 A RU2013130607/10 A RU 2013130607/10A RU 2013130607 A RU2013130607 A RU 2013130607A RU 2013130607 A RU2013130607 A RU 2013130607A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
beijing
sec
strains
cluster
mycobacteria tuberculosis
Prior art date
Application number
RU2013130607/10A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2551764C2 (en
Inventor
Елена Николаевна Ильина
Егор Александрович Шитиков
Юлия Андреевна Беспятых
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Научно-исследовательский институт физико-химической медицины Федерального медико-биологического агентства (ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Научно-исследовательский институт физико-химической медицины Федерального медико-биологического агентства (ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России) filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Научно-исследовательский институт физико-химической медицины Федерального медико-биологического агентства (ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России)
Priority to RU2013130607/10A priority Critical patent/RU2551764C2/en
Publication of RU2013130607A publication Critical patent/RU2013130607A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2551764C2 publication Critical patent/RU2551764C2/en

Links

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Способ идентификации микобактерий туберкулеза кластера Beijing B0/W148, отличающийся тем, что применяют полимеразную цепную реакцию для амплификации фрагментов ДНК М. tuberculosis с подобранными праймерами P1, P2 и РЗ, последовательности которых представлены SEQ ID NO 1, 2, 3, соответственно, в режиме амплификации 98°С - 10 мин., 30 циклов: 98°С - 30 сек., 64°С - 30 сек., 72°С - 50 сек., 72°С - 10 мин., 4°С, разделение продуктов амплификации проводят электрофорезом в 2% агарозном геле с получением фрагмента размером 1021 пн для штаммов Beijing B0/W148 или размером 320 пн - для штаммов, не относящихся к данному семейству.A method for identifying mycobacterium tuberculosis of the Beijing B0 / W148 cluster, characterized in that a polymerase chain reaction is used to amplify M. tuberculosis DNA fragments with selected primers P1, P2 and RE, the sequences of which are represented by SEQ ID NO 1, 2, 3, respectively, in the mode amplification 98 ° С - 10 min., 30 cycles: 98 ° С - 30 sec., 64 ° С - 30 sec., 72 ° С - 50 sec., 72 ° С - 10 min., 4 ° С, product separation amplifications are carried out by electrophoresis in a 2% agarose gel to obtain a fragment of 1021 bp for strains of Beijing B0 / W148 or 320 bp for strains without who are members of this family.

Claims (1)

Способ идентификации микобактерий туберкулеза кластера Beijing B0/W148, отличающийся тем, что применяют полимеразную цепную реакцию для амплификации фрагментов ДНК М. tuberculosis с подобранными праймерами P1, P2 и РЗ, последовательности которых представлены SEQ ID NO 1, 2, 3, соответственно, в режиме амплификации 98°С - 10 мин., 30 циклов: 98°С - 30 сек., 64°С - 30 сек., 72°С - 50 сек., 72°С - 10 мин., 4°С, разделение продуктов амплификации проводят электрофорезом в 2% агарозном геле с получением фрагмента размером 1021 пн для штаммов Beijing B0/W148 или размером 320 пн - для штаммов, не относящихся к данному семейству. A method for identifying mycobacterium tuberculosis of the Beijing B0 / W148 cluster, characterized in that a polymerase chain reaction is used to amplify M. tuberculosis DNA fragments with selected primers P1, P2 and RE, the sequences of which are represented by SEQ ID NO 1, 2, 3, respectively, in the mode amplification 98 ° С - 10 min., 30 cycles: 98 ° С - 30 sec., 64 ° С - 30 sec., 72 ° С - 50 sec., 72 ° С - 10 min., 4 ° С, product separation amplifications are carried out by electrophoresis in a 2% agarose gel to obtain a fragment of 1021 bp for strains of Beijing B0 / W148 or 320 bp for strains without who are members of this family.
RU2013130607/10A 2013-07-04 2013-07-04 METHOD FOR DETECTING TUBERCULOUSIS MYCOBACTERIA OF GENETIC CLUSTER Beijing B0/W148 RU2551764C2 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2013130607/10A RU2551764C2 (en) 2013-07-04 2013-07-04 METHOD FOR DETECTING TUBERCULOUSIS MYCOBACTERIA OF GENETIC CLUSTER Beijing B0/W148

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2013130607/10A RU2551764C2 (en) 2013-07-04 2013-07-04 METHOD FOR DETECTING TUBERCULOUSIS MYCOBACTERIA OF GENETIC CLUSTER Beijing B0/W148

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2013130607A true RU2013130607A (en) 2015-01-10
RU2551764C2 RU2551764C2 (en) 2015-05-27

Family

ID=53279064

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2013130607/10A RU2551764C2 (en) 2013-07-04 2013-07-04 METHOD FOR DETECTING TUBERCULOUSIS MYCOBACTERIA OF GENETIC CLUSTER Beijing B0/W148

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2551764C2 (en)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2684314C2 (en) * 2017-06-30 2019-04-05 федеральное государственное бюджетное учреждение "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии" Министерства здравоохранения Российской Федерации Method of identification of mycobacteria of tuberculosis of the beijing genotype b0 cluster in real time format

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2405836C2 (en) * 2008-05-12 2010-12-10 Федеральное государственное учреждение "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии Федерального агентства по высокотехнологичной медицинской помощи" Method for mycobacterium tuberculosis beijing genotype detection

Also Published As

Publication number Publication date
RU2551764C2 (en) 2015-05-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP4303314A3 (en) Polypeptide tagged nucleotides and use thereof in nucleic acid sequencing by nanopore detection
MX2017005159A (en) Compositions and methods for detecting an rna virus.
MX2017003228A (en) Methods for pathogen detection and disease management on meats, plants, or plant parts.
WO2015081229A3 (en) Selective amplification of nucleic acid sequences
SA516371691B1 (en) Methods and compositions for dna profiling
EP3216867A4 (en) Method for modifying genome sequence to introduce specific mutation to targeted dna sequence by base-removal reaction, and molecular complex used therein
WO2014116729A3 (en) Haplotying of hla loci with ultra-deep shotgun sequencing
MX2016007541A (en) Modified nucleic acid molecules and uses thereof.
BR112016016916A2 (en) hereditary angiodema treatment method (hae)
WO2018170614A8 (en) New technique for genomic large fragment direct cloning and dna multi-molecular assembly
WO2015058008A3 (en) Enhanced nucleic acid identification and detection
WO2014143714A3 (en) Methods for one step nucleic acid amplification of non-eluted samples
SG10201806000YA (en) Primer set for pcr for bacterial dna amplification, kit for detection and/or identification of bacterial species, and, method of detection and/or identification of bacterial species
BR112016029907A2 (en) genetically adapted enrichment and polymerase chain reaction for rapid detection of microorganisms ".
GB2519465A (en) Solid matrix for one step nucleic acid amplification
EA038921B9 (en) Detection of target nucleic acid and variants thereof
MY184632A (en) A method of identifying parentage in freshwater prawn macrobrachium rosenbergii
MX2016006602A (en) Nucleic Acid Amplification.
CA2869033C (en) Nucleic acids for nucleic acid amplification
MX2017003473A (en) Hybrid multi-step nucleic acid amplification.
RU2013130607A (en) METHOD FOR DETECTING MYCOBACTERIA TUBERCULOSIS GENETIC CLUSTER Beijing B0 / W148
MY182547A (en) Polymerase chain reaction detection system
WO2014136124A3 (en) Multiplex real time pcr testing kit for the simultaneous detection of hepatitis virus
WO2012151599A3 (en) Lamp method for detecting erwinia amylovora
EA202190758A1 (en) COMPOSITION FOR INDUCTION OF CELL DEATH HAVING MUTATED GENE, AND METHOD FOR INDUCTION OF CELL DEATH HAVING MUTATED GENE USING COMPOSITION

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20150705