RU2012131339A - Усиление прогностической ценности полиморфизма гена il 28b в комбинации с количественной оценкой ip-10 в сыворотке при ответе на пегинторферон и рибавирин по сравнению с каждым из этих биомаркеров в отдельности - Google Patents

Усиление прогностической ценности полиморфизма гена il 28b в комбинации с количественной оценкой ip-10 в сыворотке при ответе на пегинторферон и рибавирин по сравнению с каждым из этих биомаркеров в отдельности Download PDF

Info

Publication number
RU2012131339A
RU2012131339A RU2012131339/10A RU2012131339A RU2012131339A RU 2012131339 A RU2012131339 A RU 2012131339A RU 2012131339/10 A RU2012131339/10 A RU 2012131339/10A RU 2012131339 A RU2012131339 A RU 2012131339A RU 2012131339 A RU2012131339 A RU 2012131339A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
response
serum
hcv
ribavirin
peginterferon
Prior art date
Application number
RU2012131339/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2567806C2 (ru
Inventor
Ерун АРССЕНС
Грегори Чарльз ФЭННИНГ
Майкл У. ФРАЙД
Original Assignee
ЯНССЕН Ар ЭНД Ди АЙРЛЭНД
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ЯНССЕН Ар ЭНД Ди АЙРЛЭНД filed Critical ЯНССЕН Ар ЭНД Ди АЙРЛЭНД
Publication of RU2012131339A publication Critical patent/RU2012131339A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2567806C2 publication Critical patent/RU2567806C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701—Specific hybridization probes
    • C12Q1/706—Specific hybridization probes for hepatitis
    • C12Q1/707—Specific hybridization probes for hepatitis non-A, non-B Hepatitis, excluding hepatitis D
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

1. Способ комбинирования двух или более параметров, выбранных из группы, состоящей из измерения сывороточного уровня IP-10 до начала терапии, определения генотипа, расы или определения вирусной нагрузки гепатита С для прогнозирования получения устойчивого вирусологического ответа (SVR) или отсутствия ответа на пегинтерферон и рибавирин для индивидуальных пациентов, инфицированных HCV.2. Способ по п.1, в котором указанное определение генотипавместе с указанным измерением сывороточного уровня IP-10 скомбинированы для прогнозирования получения устойчивого вирусологического ответа (SVR) или отсутствия ответа на пегинтерферон и рибавирин для индивидуальных пациентов, инфицированных HCV.3. Способ по п.2, в котором добавлен параметр расы.4. Способ по п.2, в котором добавлено определением вирусной нагрузки гепатита C.5. Способ по п.2, в котором добавлены параметры расы и определение вирусной нагрузки гепатита C.6. Способ по любому из пп.1-5, в котором генотипсодержит полиморфный маркер rs12979860, rs12980275 и/или rs8099917, или какой-либо другой генетический маркер, который находится в неравновесном сцеплении с этими маркерами.7. Способ по п.6, в котором комбинация измерений дополнительно различает SVR и отсутствие ответа на пегинтерферон и рибавирин индивидуальных пациентов, инфицированных HCV, по сравнению с любым из этих двух индивидуальных маркеров (генотип, уровень сывороточного IP-10).8. Диагностический анализ для применения способом по любому из пп.1-7, включающий средства для, по меньшей мере, определения или измерения полиморфизмаи уровня IP-10 в сыворотке от пациентов, инфицированных HCV.9. Компьютерная система, содержащая программное обеспечени�

Claims (9)

1. Способ комбинирования двух или более параметров, выбранных из группы, состоящей из измерения сывороточного уровня IP-10 до начала терапии, определения генотипа IL28B, расы или определения вирусной нагрузки гепатита С для прогнозирования получения устойчивого вирусологического ответа (SVR) или отсутствия ответа на пегинтерферон и рибавирин для индивидуальных пациентов, инфицированных HCV.
2. Способ по п.1, в котором указанное определение генотипа IL28B вместе с указанным измерением сывороточного уровня IP-10 скомбинированы для прогнозирования получения устойчивого вирусологического ответа (SVR) или отсутствия ответа на пегинтерферон и рибавирин для индивидуальных пациентов, инфицированных HCV.
3. Способ по п.2, в котором добавлен параметр расы.
4. Способ по п.2, в котором добавлено определением вирусной нагрузки гепатита C.
5. Способ по п.2, в котором добавлены параметры расы и определение вирусной нагрузки гепатита C.
6. Способ по любому из пп.1-5, в котором генотип IL28B содержит полиморфный маркер rs12979860, rs12980275 и/или rs8099917, или какой-либо другой генетический маркер, который находится в неравновесном сцеплении с этими маркерами.
7. Способ по п.6, в котором комбинация измерений дополнительно различает SVR и отсутствие ответа на пегинтерферон и рибавирин индивидуальных пациентов, инфицированных HCV, по сравнению с любым из этих двух индивидуальных маркеров (генотип IL28B, уровень сывороточного IP-10).
8. Диагностический анализ для применения способом по любому из пп.1-7, включающий средства для, по меньшей мере, определения или измерения полиморфизма IL28B и уровня IP-10 в сыворотке от пациентов, инфицированных HCV.
9. Компьютерная система, содержащая программное обеспечение для моделирования, использующая информацию, полученную способом по любому из пп.1-7 для прогнозирования устойчивого вирусологического ответа (SVR) или отсутствия ответа на пегинтерферон и рибавирин для индивидуальных пациентов, инфицированных HCV.
RU2012131339/10A 2009-12-22 2010-12-21 Усиление прогностической ценности полиморфизма гена il28b в комбинации с количественной оценкой ip-10 в сыворотке при ответе на пегинторферон и рибавирин по сравнению с каждым из этих биомаркеров в отдельности RU2567806C2 (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP09180387.4 2009-12-22
EP09180387 2009-12-22
EP10175297 2010-09-03
EP10175297.0 2010-09-03
PCT/EP2010/070429 WO2011076814A1 (en) 2009-12-22 2010-12-21 Predictive value of il28b gene polymorphism combined with pretreatment serum ip-10 quantification for response to peginterferon and ribavirin is enhanced in comparison with any of these biomarkers alone

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2012131339A true RU2012131339A (ru) 2014-01-27
RU2567806C2 RU2567806C2 (ru) 2015-11-10

Family

ID=43566688

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2012131339/10A RU2567806C2 (ru) 2009-12-22 2010-12-21 Усиление прогностической ценности полиморфизма гена il28b в комбинации с количественной оценкой ip-10 в сыворотке при ответе на пегинторферон и рибавирин по сравнению с каждым из этих биомаркеров в отдельности

Country Status (11)

Country Link
US (1) US20120252695A1 (ru)
EP (1) EP2516673B1 (ru)
JP (2) JP5956347B2 (ru)
CN (1) CN102770557B (ru)
AU (1) AU2010334918B2 (ru)
BR (1) BR112012018342A2 (ru)
CA (1) CA2784781A1 (ru)
ES (1) ES2554359T3 (ru)
RU (1) RU2567806C2 (ru)
WO (1) WO2011076814A1 (ru)
ZA (1) ZA201204623B (ru)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013052862A1 (en) * 2011-10-05 2013-04-11 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Genetic marker for predicting prognosis in patients infected with hepatitis c virus
AU2013240301B2 (en) 2012-03-28 2017-10-05 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services A novel interferon-lambda4 (IFNL4) protein, related nucleic acid molecules, and uses thereof
CN102816838A (zh) * 2012-07-06 2012-12-12 吉林艾迪康医学检验所有限公司 用于检测丙型肝炎患者il28b snp12980275多态性的试剂盒
CN104178582A (zh) * 2014-06-12 2014-12-03 江崇才 一种丙型肝炎病毒的试剂盒及其检测方法
EP3935581A4 (en) 2019-03-04 2022-11-30 Iocurrents, Inc. DATA COMPRESSION AND COMMUNICATION USING MACHINE LEARNING

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20140014375A (ko) * 2009-05-21 2014-02-06 머크 샤프 앤드 돔 코포레이션 인터페론-알파 반응과 연관된 유전자 마커
EP2459210A1 (en) * 2009-07-31 2012-06-06 Centre Hospitalier Universitaire Vaudois (CHUV) Methods for diagnosing or predicting hepatitis c outcome in hcv infected patients

Also Published As

Publication number Publication date
JP2016136965A (ja) 2016-08-04
AU2010334918A1 (en) 2012-06-21
CN102770557B (zh) 2015-08-19
RU2567806C2 (ru) 2015-11-10
EP2516673A1 (en) 2012-10-31
JP5956347B2 (ja) 2016-07-27
ES2554359T3 (es) 2015-12-18
EP2516673B1 (en) 2015-09-23
AU2010334918B2 (en) 2015-04-02
WO2011076814A1 (en) 2011-06-30
BR112012018342A2 (pt) 2017-01-10
ZA201204623B (en) 2014-11-26
JP2013514796A (ja) 2013-05-02
CN102770557A (zh) 2012-11-07
CA2784781A1 (en) 2011-06-30
US20120252695A1 (en) 2012-10-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Thomson et al. Comparison of next-generation sequencing technologies for comprehensive assessment of full-length hepatitis C viral genomes
Chevaliez et al. New virologic tools for management of chronic hepatitis B and C
Reiberger et al. Portal pressure predicts outcome and safety of antiviral therapy in cirrhotic patients with hepatitis C virus infection
Huang et al. Interleukin-28B genetic variants in identification of hepatitis C virus genotype 1 patients responding to 24 weeks peginterferon/ribavirin
RU2012131339A (ru) Усиление прогностической ценности полиморфизма гена il 28b в комбинации с количественной оценкой ip-10 в сыворотке при ответе на пегинторферон и рибавирин по сравнению с каждым из этих биомаркеров в отдельности
JP2010507388A5 (ru)
Chueca et al. Using NS5B sequencing for hepatitis C virus genotyping reveals discordances with commercial platforms
JP2010518848A5 (ru)
JP2013500713A5 (ru)
JP2010520745A5 (ru)
Mallory et al. Evaluation of the Abbott RealTime HCV genotype II RUO (GT II) assay with reference to 5′ UTR, core and NS5B sequencing
McCormick et al. Evaluation of sequencing of HCV core/E1, NS5A and NS5B as a genotype predictive tool in comparison with commercial assays targeting 5′ UTR
Yoshimi et al. Rapid, sensitive, and accurate evaluation of drug resistant mutant (NS5A-Y93H) strain frequency in genotype 1b HCV by invader assay
Alborzi et al. Role of serum level and genetic variation of IL-28B in interferon responsiveness and advanced liver disease in chronic hepatitis C patients
Hernandez et al. Impact of pre-existing NS5A-L31 or-Y93H minor variants on response rates in patients infected with HCV genotype-1b treated with daclatasvir/asunaprevir
Paolucci et al. Development and persistence of DAA resistance associated mutations in patients failing HCV treatment
Kessler et al. Genotype impact on HCV RNA levels determined with the VERSANT HCV RNA 1.0 assay (kPCR)
Schønning et al. Analytical and clinical performance of the Hologic Aptima HCV Quant Dx assay for the quantification of HCV RNA in plasma samples
Pollicita et al. Nucleotide polymorphisms in the 5′-UTR region of HCV can affect the ability of two widely used assays to assign an HCV genotype
Buti et al. Hepatitis C virus Core Antigen as a predictor of non-response in genotype 1 chronic hepatitis C patients treated with peginterferon α-2b plus ribavirin
Saludes et al. Relevance of baseline viral genetic heterogeneity and host factors for treatment outcome prediction in hepatitis C virus 1b-infected patients
Goedel et al. Hepatitis B virus (HBV) genotype determination by the COBAS® AmpliPrep/COBAS® TaqMan® HBV Test, v2. 0 in serum and plasma matrices
Dietz et al. Investigation of NS3 protease resistance-associated variants and phenotypes for the prediction of treatment response to HCV triple therapy
Rallon et al. Interferon-stimulated genes are associated with peginterferon/ribavirin treatment response regardless of IL28B alleles in hepatitis C virus/HIV-coinfected patients
JPWO2017191720A1 (ja) Ｃ型肝炎ウイルス排除後の肝細胞癌発症の予測

Legal Events

Date Code Title Description
PC41 Official registration of the transfer of exclusive right

Effective date: 20161128

MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20181222