RU2011154171A - MARKERS OF CARDIOVASCULAR DISEASE - Google Patents

MARKERS OF CARDIOVASCULAR DISEASE Download PDF

Info

Publication number
RU2011154171A
RU2011154171A RU2011154171/15A RU2011154171A RU2011154171A RU 2011154171 A RU2011154171 A RU 2011154171A RU 2011154171/15 A RU2011154171/15 A RU 2011154171/15A RU 2011154171 A RU2011154171 A RU 2011154171A RU 2011154171 A RU2011154171 A RU 2011154171A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
age
risk
individual
genetic
Prior art date
Application number
RU2011154171/15A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2524659C2 (en
Inventor
Перес-Расилья Эдуардо Салас
ДЕ ЛА ИГЛЕСИА Хауме МАРРУГАТ
ЛЬЯНОС Роберто ЭЛОСУА
ФЕРНАНДЕС Серхио КАСТИЛЬО
ГОМЕС Хоан САЛЬГАДО
МУНОС Хосе Мария ОРДОВАС
Original Assignee
Хендиаг.Эксе, С.Л.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from EP09162329.8A external-priority patent/EP2264183B1/en
Application filed by Хендиаг.Эксе, С.Л. filed Critical Хендиаг.Эксе, С.Л.
Publication of RU2011154171A publication Critical patent/RU2011154171A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2524659C2 publication Critical patent/RU2524659C2/en

Links

Claims (20)

1. Способ определения наличия у пациента повышенного риска обладания нежелательным сердечно-сосудистым заболеванием или нарушением или определения ответа на терапию сердечно-сосудистого заболевания у пациента, включающий стадии определения в образце, выделенном у указанного пациента, присутствия полиморфизмов в положениях 27 в последовательностях нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:1-11, где присутствие C в SEQ ID NO:1, A в SEQ ID NO:2, C в SEQ ID NO:3, T в SEQ ID NO:4, C в SEQ ID NO:5, A в SEQ ID NO:6, T в SEQ ID NO:7, C в SEQ ID NO:8, C в SEQ ID NO:9, T в SEQ ID NO:10 и T в SEQ ID NO:11 в положении 27 указывает на повышенный риск обладания нежелательным сердечно-сосудистым заболеванием или нарушением или на слабый ответ на терапию сердечно-сосудистого заболевания.1. A method for determining whether a patient has an increased risk of having an unwanted cardiovascular disease or disorder, or determining a response to therapy for a cardiovascular disease in a patient, comprising the steps of determining in a sample isolated from said patient the presence of polymorphisms at positions 27 in the SEQ nucleic acid sequences ID NO: 1-11, where the presence of C in SEQ ID NO: 1, A in SEQ ID NO: 2, C in SEQ ID NO: 3, T in SEQ ID NO: 4, C in SEQ ID NO: 5, A in SEQ ID NO: 6, T in SEQ ID NO: 7, C in SEQ ID NO: 8, C in SEQ ID NO: 9, T in SEQ ID NO: 10 and T in SEQ ID NO: 11 at position 27 indicates on elevated the risk of having an unwanted cardiovascular disease or disorder, or a weak response to therapy for cardiovascular disease. 2. Способ определения наличия у пациента повышенного риска обладания нежелательным сердечно-сосудистым заболеванием или нарушением или определения ответа на терапию сердечно-сосудистого заболевания у пациента, включающий стадии определения в образце, выделенном у указанного пациента, присутствия одного или нескольких полиморфизмов, как определено в таблице 1A, в качестве указания на повышенный риск обладания нежелательным сердечно-сосудистым заболеванием или нарушением или на слабый ответ на терапию сердечно-сосудистого заболевания.2. A method for determining whether a patient has an increased risk of having an undesirable cardiovascular disease or disorder, or determining a response to therapy for a cardiovascular disease in a patient, comprising the steps of determining in the sample isolated from said patient the presence of one or more polymorphisms, as defined in the table 1A, as an indication of an increased risk of having an unwanted cardiovascular disease or disorder, or a weak response to therapy for cardiovascular disease . 3. Способ по п.1 или 2, где сердечно-сосудистое заболевание выбирают из группы инфаркта миокарда, инсульта, стенокардии, транзиторных ишемических атак, застойной сердечной недостаточности, аневризмы аорты или их сочетания.3. The method according to claim 1 or 2, where the cardiovascular disease is selected from the group of myocardial infarction, stroke, angina pectoris, transient ischemic attacks, congestive heart failure, aortic aneurysm, or a combination thereof. 4. Способ идентификации пациента, который нуждается в ранней и/или агрессивной терапии сердечно-сосудистого заболевания или в профилактической терапии сердечно-сосудистого заболевания, включающий стадии определения в образце, выделенном у указанного пациента, присутствия по меньшей мере в одном аллеле полиморфизмов в положениях 27 в последовательностях нуклеиновых кислот SEQ ID NO:1-11, где присутствие C в SEQ ID NO:1, A в SEQ ID NO:2, C в SEQ ID NO:3, T в SEQ ID NO:4, C в SEQ ID NO:5, A в SEQ ID NO:6, T в SEQ ID NO:7, C в SEQ ID NO:8, C в SEQ ID NO:9, T в SEQ ID NO:10 и T в SEQ ID NO:11 в положении 27 или присутствие одного или нескольких полиморфизмов, как определено в таблице 1A, указывает на обладание пониженным ответом на терапию сердечно-сосудистого заболевания, или на потребность ранней и агрессивной терапии сердечно-сосудистого заболевания, или потребность профилактического лечения сердечно-сосудистого заболевания.4. A method for identifying a patient who needs early and / or aggressive treatment of a cardiovascular disease or prophylactic therapy of a cardiovascular disease, comprising the steps of determining, in a sample isolated from said patient, the presence of at least one polymorphism allele at positions 27 in the nucleic acid sequences of SEQ ID NO: 1-11, where the presence of C in SEQ ID NO: 1, A in SEQ ID NO: 2, C in SEQ ID NO: 3, T in SEQ ID NO: 4, C in SEQ ID NO: 5, A in SEQ ID NO: 6, T in SEQ ID NO: 7, C in SEQ ID NO: 8, C in SEQ ID NO: 9, T in SEQ ID NO: 10 and T in SEQ ID NO: 11 at position 27 or the presence of od one or more polymorphisms, as defined in Table 1A, indicates a reduced response to the treatment of cardiovascular disease, or the need for early and aggressive treatment of cardiovascular disease, or the need for prophylactic treatment of cardiovascular disease. 5. Способ по п.1 или 2, который дополнительно включает обнаружение одного или нескольких факторов риска сердечно-сосудистых заболеваний или нарушений, выбранных из группы, состоящей из возраста, расы, пола, индекса массы тела, кровяного давления, статуса курения, уровня липопротеинов низкой плотности (ЛНП)- или липопротеинов высокой плотности (ЛВП)-холестерина, систолического кровяного давления, диастолического кровяного давления, анамнеза сердечной недостаточности, диабета, почечной недостаточности, гипертрофии левого желудочка, анамнеза употребления алкоголя, анамнеза курения, анамнеза тренировок, диеты и семейного анамнеза сердечно-сосудистых заболеваний или нарушений.5. The method according to claim 1 or 2, which further comprises detecting one or more risk factors for cardiovascular diseases or disorders selected from the group consisting of age, race, gender, body mass index, blood pressure, smoking status, lipoprotein levels low density (LDL) - or high density lipoprotein (HDL) cholesterol, systolic blood pressure, diastolic blood pressure, history of heart failure, diabetes, renal failure, left ventricular hypertrophy, medical history alcohol consumption, smoking history, history of training, diet, and family history of cardiovascular disease or disorder. 6. Способ по п.1 или 2, где образец представляет собой образец ткани ротовой полости, соскоб или смыв или образец биологической жидкости, предпочтительно слюны, мочи или крови.6. The method according to claim 1 or 2, where the sample is a tissue sample of the oral cavity, scraping or flushing, or a sample of biological fluid, preferably saliva, urine or blood. 7. Способ по п.1 или 2, где присутствие или отсутствие полинуклеотида идентифицируют посредством амплификации или ошибок при амплификации продукта амплификации по образцу, где продукт амплификации предпочтительно расщепляют рестрикционным ферментом перед анализом и/или где SNP идентифицируют посредством гибридизации образца нуклеиновой кислоты с меченым праймером, который представляет собой поддающийся обнаружению фрагмент.7. The method according to claim 1 or 2, where the presence or absence of the polynucleotide is identified by amplification or errors in amplification of the amplification product according to the sample, where the amplification product is preferably digested with restriction enzyme before analysis and / or where SNP is identified by hybridization of the nucleic acid sample with a labeled primer , which is a detectable fragment. 8. Способ лечения пациента, страдающего сердечно-сосудистым заболеванием, с использованием терапии сердечно-сосудистого заболевания, где пациента выбирают для указанной терапии на основе присутствия в образце, выделенном у указанного пациента, полиморфизма в положении 27 в нуклеотидных последовательностях SEQ ID NO:1-11, где указанный полиморфизм в указанном положении 27 представляет собой C в SEQ ID NO:1, A в SEQ ID NO:2, C в SEQ ID NO:3, T в SEQ ID NO:4, C в SEQ ID NO:5, A в SEQ ID NO:6, T в SEQ ID NO:7, C в SEQ ID NO:8, C в SEQ ID NO:9, T в SEQ ID NO:10 и T в SEQ ID NO:11.8. A method of treating a patient suffering from cardiovascular disease using cardiovascular disease therapy, wherein the patient is selected for said therapy based on the presence of polymorphism at position 27 in the nucleotide sequences of the sample isolated from said patient SEQ ID NO: 1- 11, wherein said polymorphism at the indicated position 27 is C in SEQ ID NO: 1, A in SEQ ID NO: 2, C in SEQ ID NO: 3, T in SEQ ID NO: 4, C in SEQ ID NO: 5 , A in SEQ ID NO: 6, T in SEQ ID NO: 7, C in SEQ ID NO: 8, C in SEQ ID NO: 9, T in SEQ ID NO: 10 and T in SEQ ID NO: 11. 9. Способ лечения пациента, страдающего сердечно-сосудистым заболеванием, с использованием терапии сердечно-сосудистого заболевания, где пациента выбирают для указанной терапии на основе присутствия в образце, выделенном у указанного пациента, одного или нескольких полиморфизмов, как определено в таблице 1A.9. A method of treating a patient suffering from a cardiovascular disease using cardiovascular disease therapy, wherein the patient is selected for said therapy based on the presence in the sample isolated from said patient of one or more polymorphisms as defined in Table 1A. 10. Способ по п.8 или 9, где сердечно-сосудистое заболевание выбирают из группы из инфаркта миокарда, инсульта, стенокардии, транзиторных ишемических атак, застойной сердечной недостаточности, аневризмы аорты или их сочетания.10. The method of claim 8 or 9, where the cardiovascular disease is selected from the group of myocardial infarction, stroke, angina pectoris, transient ischemic attacks, congestive heart failure, aortic aneurysm, or a combination thereof. 11. Способ определения вероятности присутствия у индивидуума фатального или нефатального инфаркта миокарда или стенокардии в 10-летнем периоде на основе присутствия от 1 до P классических факторов риска и от 1 до J полиморфизмов в положениях 27 в нуклеотидных последовательностях SEQ ID NO:1-11, где указанные полиморфизмы в указанных положениях 27 выбраны из группы из C в SEQ ID NO:1, A в SEQ ID NO:2, C в SEQ ID NO:3, T в SEQ ID NO:4, C в SEQ ID NO:5, A в SEQ ID NO:6, T в SEQ ID NO:7, C в SEQ ID NO:8, C в SEQ ID NO:9, T в SEQ ID NO:10 и T в SEQ ID NO:11, используя формулу11. A method for determining the likelihood of an individual having a fatal or non-fatal myocardial infarction or angina pectoris in a 10-year period based on the presence of 1 to P classical risk factors and 1 to J polymorphisms at positions 27 in the nucleotide sequences of SEQ ID NO: 1-11, where these polymorphisms at the indicated positions 27 are selected from the group from C to SEQ ID NO: 1, A to SEQ ID NO: 2, C to SEQ ID NO: 3, T to SEQ ID NO: 4, C to SEQ ID NO: 5 , A in SEQ ID NO: 6, T in SEQ ID NO: 7, C in SEQ ID NO: 8, C in SEQ ID NO: 9, T in SEQ ID NO: 10 and T in SEQ ID NO: 11, using the formula
Figure 00000001
Figure 00000001
 где
Figure 00000002
представляет собой среднее выживание без коронарных приступов в популяции,Where
Figure 00000002
represents the average survival without coronary seizures in a population,
Figure 00000003
представляет собой функцию суммирования по P классических факторов риска,
Figure 00000003
is a function of summing over P classical risk factors,
Figure 00000004
представляет собой логарифм отношения рисков, соответствующего классическому фактору коронарного риска «p», как показано в таблице A,
Figure 00000004
represents the logarithm of the risk ratio corresponding to the classic coronary risk factor "p", as shown in table A, CRFp,i представляет собой значение каждого фактора коронарного риска «p», включенное в уравнение для индивидуума «i»,CRF p, i represents the value of each coronary risk factor "p" included in the equation for the individual "i",
Figure 00000005
представляет собой функцию суммирования по J генетических вариантов,
Figure 00000005
is a summation function over J genetic variants,
Figure 00000006
представляет собой логарифм отношения рисков, соответствующего генетическому варианту «j», как показано в таблице B,
Figure 00000006
represents the logarithm of the risk ratio corresponding to the genetic variant "j", as shown in table B, SNPj,i представляет собой число аллелей риска (0, 1, 2) для конкретного генетического варианта «j», включенное в уравнение для индивидуума «i»,SNP j, i represents the number of risk alleles (0, 1, 2) for a particular genetic variant “j” included in the equation for an individual “i”,
Figure 00000007
представляет собой среднее значение для классического фактора риска «p» в популяции,
Figure 00000007
represents the average value for the classic risk factor "p" in the population,
Figure 00000008
представляет собой среднее число копий аллеля риска для генетического варианта «j» в популяции.
Figure 00000008
represents the average number of copies of the risk allele for the genetic variant "j" in the population. 12. Способ определения вероятности присутствия у индивидуума фатального или нефатального инфаркта миокарда или стенокардии в 10-летнем периоде на основе присутствия от 1 до P классических факторов риска и от 1 до J полиморфизмов, как определено в таблице 1A, используя формулу12. A method for determining the likelihood of an individual having a fatal or non-fatal myocardial infarction or angina pectoris in a 10-year period based on the presence of 1 to P classic risk factors and 1 to J polymorphisms, as defined in Table 1A, using the formula
Figure 00000009
Figure 00000009
 где
Figure 00000002
представляет собой среднее выживание без коронарных приступов в популяции,Where
Figure 00000002
represents the average survival without coronary seizures in a population,
Figure 00000003
представляет собой функцию суммирования по P классических факторов риска,
Figure 00000003
is a function of summing over P classical risk factors,
Figure 00000004
представляет собой логарифм отношения рисков, соответствующего классическому фактору коронарного риска «p», как показано в таблице A,
Figure 00000004
represents the logarithm of the risk ratio corresponding to the classic coronary risk factor "p", as shown in table A, CRFp,i представляет собой значение каждого фактора коронарного риска «p», включенное в уравнение для индивидуума «i»CRF p, i represents the value of each coronary risk factor "p" included in the equation for the individual "i"
Figure 00000005
представляет собой функцию суммирования по J генетических вариантов.
Figure 00000005
is a summation function over J genetic variants.
Figure 00000006
представляет собой логарифм отношения рисков, соответствующего генетическому варианту «j», как показано в таблице B,
Figure 00000006
represents the logarithm of the risk ratio corresponding to the genetic variant "j", as shown in table B, SNPj,i представляет собой число аллелей риска (0, 1, 2) для конкретного генетического варианта «j», включенное в уравнение для индивидуума «i»,SNP j, i represents the number of risk alleles (0, 1, 2) for a particular genetic variant “j” included in the equation for an individual “i”,
Figure 00000007
представляет собой среднее значение для классического фактора риска «p» в популяции,
Figure 00000007
represents the average value for the classic risk factor "p" in the population,
Figure 00000008
представляет собой среднее число копий аллеля риска для генетического варианта «j» в популяции.
Figure 00000008
represents the average number of copies of the risk allele for the genetic variant "j" in the population. 13. Способ определения вероятности присутствия у индивидуума фатального или нефатального инфаркта миокарда или стенокардии в 10-летнем периоде на основе присутствия от 1 до P различных классических факторов риска и от 1 до Q различных генетических вариантов, где указанный генетический вариант представляет собой полиморфизм в положениях 27 в нуклеотидных последовательностях SEQ ID NO:1-11, где указанный полиморфизм в указанном положении 27 выбран из группы из C в SEQ ID NO:1, A в SEQ ID NO:2, C в SEQ ID NO:3, T в SEQ ID NO:4, C в SEQ ID NO:5, A в SEQ ID NO:6, T в SEQ ID NO:7, C в SEQ ID NO:8, C в SEQ ID NO:9, T в SEQ ID NO:10 и T в SEQ ID NO:11, используя формулу13. A method for determining the likelihood of an individual having a fatal or non-fatal myocardial infarction or angina pectoris in a 10-year period based on the presence of 1 to P different classic risk factors and 1 to Q different genetic variants, where the genetic variant is a polymorphism at positions 27 in the nucleotide sequences of SEQ ID NO: 1-11, where the specified polymorphism at the specified position 27 is selected from the group from C to SEQ ID NO: 1, A in SEQ ID NO: 2, C in SEQ ID NO: 3, T in SEQ ID NO: 4, C in SEQ ID NO: 5, A in SEQ ID NO: 6, T in SEQ ID NO: 7, C in SEQ ID NO: 8, C in SEQ ID NO: 9, T SEQ ID NO: 10 and T in SEQ ID NO: 11 using the formula
Figure 00000010
Figure 00000010
 где
Figure 00000011
представляет собой среднее выживание без коронарных приступов в популяции; это выживание следует адаптировать к региональным или национальным показателям,Where
Figure 00000011
represents the average survival without coronary seizures in a population; this survival should be adapted to regional or national indicators,
Figure 00000012
представляет собой функцию суммирования по P классических факторов риска,
Figure 00000012
is a function of summing over P classical risk factors,
Figure 00000004
представляет собой логарифм отношения рисков, соответствующего классическому фактору коронарного риска «p», как показано в таблице C,
Figure 00000004
represents the logarithm of the risk ratio corresponding to the classic coronary risk factor "p", as shown in table C, CRFp,i представляет собой значение каждого фактора коронарного риска «p», включенное в уравнение для индивидуума «i»,CRF p, i represents the value of each coronary risk factor "p" included in the equation for the individual "i",
Figure 00000013
представляет собой функцию суммирования по Q (5) квантилей.
Figure 00000013
is a summation function over Q (5) quantiles.
Figure 00000014
представляет собой логарифм отношения рисков, соответствующего различным квантилям генетической оценки (GSQ) «q», как показано в таблице D,
Figure 00000014
represents the logarithm of the risk ratio corresponding to the various quantiles of the genetic assessment (GSQ) “q”, as shown in table D, GSQq,i представляет собой квантиль генетической оценки «q» в соответствии с распределением числа аллелей риска (0, 1, 2) для генетических вариантов, включенный в уравнение при популяционном уровне для индивидуума «i», построенный в соответствии с аллельными частотами генетических вариантов,GSQ q, i is the quantile of the genetic score “q” in accordance with the distribution of the number of risk alleles (0, 1, 2) for genetic variants, included in the equation at the population level for the individual “i”, constructed in accordance with the allelic frequencies of genetic variants ,
Figure 00000015
представляет собой среднее значение для классического фактора риска «p» в популяции,
Figure 00000015
represents the average value for the classic risk factor "p" in the population,
Figure 00000016
представляет собой значения от 1 до 5 различных квантилей для квантиля генетической оценки «q» в популяции.
Figure 00000016
represents values from 1 to 5 different quantiles for the quantile of the genetic estimate of "q" in a population. 14. Способ определения вероятности присутствия у индивидуума фатального или нефатального инфаркта миокарда или стенокардии в 10-летнем периоде на основе присутствия от 1 до P различных классических факторов риска и от 1 до Q различных генетических вариантов, где указанный генетический вариант представляет собой полиморфизм, как определено в таблице 1A, используя формулу:14. A method for determining the likelihood of an individual having a fatal or non-fatal myocardial infarction or angina pectoris in a 10-year period based on the presence of 1 to P different classic risk factors and 1 to Q different genetic options, where the specified genetic variant is a polymorphism, as defined in table 1A using the formula:
Figure 00000017
Figure 00000017
 где
Figure 00000011
представляет собой среднее выживание без коронарных приступов в популяции; это выживание следует адаптировать к региональным или национальным показателям,Where
Figure 00000011
represents the average survival without coronary seizures in a population; this survival should be adapted to regional or national indicators,
Figure 00000012
представляет собой функцию суммирования по P классических факторов риска,
Figure 00000012
represents the function of summing over P classical risk factors,
Figure 00000004
представляет собой логарифм отношения рисков, соответствующего классическому фактору коронарного риска «p», как показано в таблице C,
Figure 00000004
represents the logarithm of the risk ratio corresponding to the classic coronary risk factor "p", as shown in table C, CRFp,i представляет собой значение каждого фактора коронарного риска «p», включенное в уравнение для индивидуума «i»,CRF p, i represents the value of each coronary risk factor "p" included in the equation for the individual "i",
Figure 00000018
представляет собой функцию суммирования по Q (5) квантилей,
Figure 00000018
is a summation function over Q (5) quantiles,
Figure 00000014
представляет собой логарифм отношения рисков, соответствующего различным квантилям генетической оценки (GSQ) «q», как показано в таблице D,
Figure 00000014
represents the logarithm of the risk ratio corresponding to the various quantiles of the genetic assessment (GSQ) “q”, as shown in table D, GSQq,i представляет собой квантиль генетической оценки «q» в соответствии с распределением числа аллелей риска (0, 1, 2) для генетических вариантов, включенный в уравнение при популяционном уровне для индивидуума «i», построенный в соответствии с аллельными частотами генетических вариантов,GSQ q, i is the quantile of the genetic score “q” in accordance with the distribution of the number of risk alleles (0, 1, 2) for genetic variants, included in the equation at the population level for the individual “i”, constructed in accordance with the allelic frequencies of genetic variants ,
Figure 00000015
представляет собой среднее значение для классического фактора риска «p» в популяции,
Figure 00000015
represents the average value for the classic risk factor "p" in the population,
Figure 00000016
значения от 1 до 5 различных квантилей для квантиля генетической оценки «q» в популяции.
Figure 00000016
values from 1 to 5 different quantiles for the quantile of the genetic estimate of "q" in the population. 15. Способ определения вероятности присутствия у индивидуума фатального или нефатального инфаркта миокарда или стенокардии в 10-летнем периоде на основе присутствия от 1 до P различных классических факторов риска и от 1 до Q различных генетических вариантов, где указанный генетический вариант представляет собой полиморфизм в положениях 27 в нуклеотидных последовательностях SEQ ID NO:1-11, где указанный полиморфизм в указанном положении 27 выбирают из группы из C в SEQ ID NO:1, A в SEQ ID NO:2, C в SEQ ID NO:3, T в SEQ ID NO:4, C в SEQ ID NO:5, A в SEQ ID NO:6, T в SEQ ID NO:7, C в SEQ ID NO:8, C в SEQ ID NO:9, T в SEQ ID NO:10 и T в SEQ ID NO:11, используя стадии:15. A method for determining the likelihood of an individual having a fatal or non-fatal myocardial infarction or angina pectoris in a 10-year period based on the presence of 1 to P different classical risk factors and 1 to Q different genetic variants, where the genetic variant is a polymorphism at positions 27 in the nucleotide sequences of SEQ ID NO: 1-11, where the indicated polymorphism at the indicated position 27 is selected from the group from C to SEQ ID NO: 1, A in SEQ ID NO: 2, C in SEQ ID NO: 3, T in SEQ ID NO: 4, C in SEQ ID NO: 5, A in SEQ ID NO: 6, T in SEQ ID NO: 7, C in SEQ ID NO: 8, C in SEQ ID NO: 9, T in SEQ ID NO: 10 and T in SEQ ID NO: 11 using the steps: вычисление линейной комбинации факторов риска wi, используя функциюcalculating a linear combination of risk factors w i using the function
Figure 00000019
Figure 00000019
 где cholesteroli - уровень холестерина для индивидуума «i», ммоль/л,where cholesterol i is the level of cholesterol for the individual "i", mmol / l, βchol - логарифм отношения рисков, соответствующего холестерину (таблица E),β chol - the logarithm of the risk ratio corresponding to cholesterol (table E), SBPi - систолическое кровяное давление для индивидуума «i», мм рт. ст.,SBP i - systolic blood pressure for the individual "i", mm RT. Art. βSBP - логарифм отношения рисков, соответствующего систолическому кровяному давлению (таблица E),β SBP is the logarithm of the risk ratio corresponding to systolic blood pressure (table E), currenti - текущий статус курения для индивидуума «i» (1: действительный, 0: бывший/никогда не курил),current i - current smoking status for the individual “i” (1: valid, 0: former / never smoked), βsmoker - логарифм отношения рисков, соответствующего систолическому кровяному давлению (таблица E),β smoker - the logarithm of the risk ratio corresponding to systolic blood pressure (table E),
Figure 00000020
Figure 00000020
Figure 00000021
- функция суммирования по J генетических вариантов,
Figure 00000021
- summation function over J genetic variants,
Figure 00000006
- логарифм отношения рисков, соответствующего генетическому варианту «j», возможный диапазон значений β для каждого генетического варианта «j» представлен в таблице B,
Figure 00000006
- the logarithm of the risk ratio corresponding to the genetic variant "j", the possible range of β values for each genetic variant "j" is presented in table B, SNPj,i - число аллелей риска (0, 1, 2) для конкретного генетического варианта «j», включенное в уравнение для индивидуума «i»,SNP j, i - the number of risk alleles (0, 1, 2) for a particular genetic variant "j", included in the equation for the individual "i",
Figure 00000022
- среднее число копий аллеля риска для генетического варианта «j» в популяции; это среднее значение следует адаптировать к региональной или национальной распространенности;
Figure 00000022
- the average number of copies of the risk allele for the genetic variant "j" in the population; this average should be adapted to regional or national prevalence; вычислить базовое выживание S0 для данного возраста, используя функциюcalculate the base survival S 0 for a given age using the function S0(возраст)=exp{-exp(α)×(возраст-20)p};S 0 (age) = exp {-exp (α) × (age-20) p }; S0(возраст+10)=exp{-exp(α)×(возраст-10)p},S 0 (age + 10) = exp {-exp (α) × (age-10) p }, где α, p - параметры формы и масштаба распределения Вейбулла; их значения представлены в таблице F (параметры);where α, p are the parameters of the shape and scale of the Weibull distribution; their values are presented in table F (parameters); exp - возведение в натуральную степень;exp - raising to natural degree; вычислить выживание за 10 лет S10(возраст), используя функциюcalculate 10 year survival S10 (age) using the function S(возраст)={S0(возраст)}exp(w);S (age) = {S 0 (age)} exp (w) ; S(возраст+10)={S0(возраст+10)}exp(w);S (age + 10) = {S 0 (age + 10)} exp (w) ; S10(возраст)=S(возраст+10)/S(возраст);S 10 (age) = S (age + 10) / S (age); вычислить вероятность наличия приступа во время 10-летнего наблюдения Risk10(возраст), используя функциюcalculate the probability of having an attack during a 10-year follow-up of Risk 10 (age) using the function Risk10(возраст)=1-S10(возраст)Risk 10 (age) = 1-S 10 (age) иand вычислить вероятность наличия сердечно-сосудистого приступа во время 10-летнего наблюдения CVDRisk10 как сумму коронарного и некоронарного сердечно-сосудистого риска, используя функциюcalculate the probability of having a cardiovascular attack during a 10-year follow-up of CVDRisk10 as the sum of coronary and non-coronary cardiovascular risk using the function CVDRisk10=[CHDRisk10(возраст)]+[Non-CHDRisk10(возраст)].CVDRisk 10 = [CHDRisk 10 (age)] + [Non-CHDRisk 10 (age)]. 16. Способ определения вероятности присутствия у индивидуума фатального или нефатального инфаркта миокарда или стенокардии в 10-летнем периоде на основе присутствия от 1 до P различных классических факторов риска и от 1 до Q различных генетических вариантов, где указанный генетический вариант представляет собой полиморфизм, как определено в таблице 1A, используя стадии:16. A method for determining the likelihood of an individual having a fatal or non-fatal myocardial infarction or angina pectoris in a 10-year period based on the presence of 1 to P different classic risk factors and 1 to Q different genetic options, where the specified genetic option is a polymorphism, as defined in table 1A, using the stages: вычислить линейную комбинацию факторов риска wi, используя функциюcalculate a linear combination of risk factors w i using the function
Figure 00000023
Figure 00000023
 где cholesteroli - уровень холестерина для индивидуума «i», ммоль/л,where cholesterol i is the level of cholesterol for the individual "i", mmol / l, βchol - логарифм отношения рисков, соответствующего холестерину (таблица E),β chol - the logarithm of the risk ratio corresponding to cholesterol (table E), SBPi - систолическое кровяное давление для индивидуума «i», мм рт. ст.,SBP i - systolic blood pressure for the individual "i", mm RT. Art. βSBP - логарифм отношения рисков, соответствующего систолическому кровяному давлению (таблица E),β SBP is the logarithm of the risk ratio corresponding to systolic blood pressure (table E), currenti - текущий статус курения для индивидуума «i» (1: действительный, 0: бывший/никогда не курил),current i - current smoking status for the individual “i” (1: valid, 0: former / never smoked), βsmoker - логарифм отношения рисков, соответствующего систолическому кровяному давлению (таблица E),β smoker - the logarithm of the risk ratio corresponding to systolic blood pressure (table E),
Figure 00000024
Figure 00000024
Figure 00000025
- функция суммирования по J генетических вариантов,
Figure 00000025
- summation function over J genetic variants,
Figure 00000006
- логарифм отношения рисков, соответствующего генетическому варианту «j»; возможный диапазон значений β для каждого генетического варианта «j» представлен в таблице B,
Figure 00000006
- the logarithm of the risk ratio corresponding to the genetic variant “j”; the possible range of β values for each genetic variant "j" is presented in table B, SNPj,i - число аллелей риска (0, 1, 2) для конкретного генетического варианта «j», включенное в уравнение для индивидуума «i»,SNP j, i - the number of risk alleles (0, 1, 2) for a particular genetic variant "j", included in the equation for the individual "i",
Figure 00000026
- среднее число копий аллеля риска для генетического варианта «j» в популяции; это среднее значение следует адаптировать к региональной или национальной распространенности;
Figure 00000026
- the average number of copies of the risk allele for the genetic variant "j" in the population; this average should be adapted to regional or national prevalence; вычислить базовое выживание S0 для данного возраста, используя функциюcalculate the base survival S 0 for a given age using the function S0(возраст)=exp{-exp(α)·(возраст-20)p};S 0 (age) = exp {-exp (α) · (age-20) p }; S0(возраст+10)=exp{-exp(α)·(возраст-10)p},S 0 (age + 10) = exp {-exp (α) · (age-10) p }, где α, p - параметры формы и масштаба распределения Вейбулла; их значения представлены в таблице F (параметры);where α, p are the parameters of the shape and scale of the Weibull distribution; their values are presented in table F (parameters); exp - возведение в натуральную степень;exp - raising to natural degree; вычислить выживание за 10 лет S10(возраст), используя функциюcalculate 10 year survival S10 (age) using the function S(возраст)={S0(возраст)}exp(w);S (age) = {S 0 (age)} exp (w) ; S(возраст+10)={S0(возраст+10)}exp(w);S (age + 10) = {S 0 (age + 10)} exp (w) ; S10(возраст)=S(возраст+10)/S(возраст);S 10 (age) = S (age + 10) / S (age); вычислить вероятность наличия приступа во время 10-летнего наблюдения Risk10(возраст), используя функциюcalculate the probability of having an attack during a 10-year follow-up of Risk 10 (age) using the function Risk10(возраст)=1-S10(возраст)Risk 10 (age) = 1-S 10 (age) иand вычислить вероятность наличия сердечно-сосудистого приступа во время 10-летнего наблюдения CVDRisk10 как сумму коронарного и некоронарного сердечно-сосудистого риска, используя функциюcalculate the probability of having a cardiovascular attack during a 10-year follow-up of CVDRisk10 as the sum of coronary and non-coronary cardiovascular risk using the function CVDRisk10=[CHDRisk10(возраст)]+[Non-CHDRisk10(возраст)].CVDRisk 10 = [CHDRisk 10 (age)] + [Non-CHDRisk 10 (age)]. 17. Способ по пп.13-16, где используют множество классических факторов риска «p», указанное множество выбрано из группы:17. The method according to claims 13-16, wherein a plurality of classical risk factors “p” are used, said plurality is selected from the group: пол, возраст, общий холестерин, ЛВП-холестерин, кровяное давление, диабет и курение,gender, age, total cholesterol, HDL cholesterol, blood pressure, diabetes and smoking, возраст, ЛНП-холестерин, ЛВП-холестерин, триглицериды, систолическое кровяное давление, семейный анамнез инфаркта миокарда и диабета,age, LDL-cholesterol, HDL-cholesterol, triglycerides, systolic blood pressure, family history of myocardial infarction and diabetes, пол, Log(возраст/10), общий холестерин/ЛВП-холестерин, индекс массы тела, семейный анамнез ранних CVD, курение,gender, Log (age / 10), total cholesterol / HDL-cholesterol, body mass index, family history of early CVD, smoking, оценка Таунсенда для области вывода, систолическое кровяное давление, лечение гипертензии и взаимодействие лечения SBP×ΗTN.Townsend's score for the output area, systolic blood pressure, hypertension treatment, and SBP × ΗTN treatment interaction. 18. Компьютерная программа или машиночитаемый носитель, содержащий средство для осуществления способа по любому из пп.1-17.18. A computer program or computer-readable medium containing means for implementing the method according to any one of claims 1 to 17. 19. Набор, содержащий реактивы для определения идентичности нуклеотида в положении 27 в последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы SEQ ID NO:1-11, или для определения идентичности полиморфизмов, как определено в таблице 1A.19. A kit containing reagents for determining the identity of the nucleotide at position 27 in a nucleic acid sequence selected from the group of SEQ ID NO: 1-11, or for determining the identity of polymorphisms, as defined in table 1A. 20. Набор по п.19, который содержит один или несколько пар праймеров для специфической амплификации участка, содержащего по меньшей мере положение 27 в последовательности нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:1-12, или обладающих специфичностью к полиморфизмам, как определено в таблице 1A. 20. The kit according to claim 19, which contains one or more pairs of primers for specific amplification of the plot containing at least position 27 in the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1-12, or having specificity for polymorphisms, as defined in table 1A.
RU2011154171/15A 2009-06-09 2010-06-09 Markers of risk of cardiovascular disease RU2524659C2 (en)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP09162329.8 2009-06-09
EP09162329.8A EP2264183B1 (en) 2009-06-09 2009-06-09 Risk markers for cardiovascular disease
PCT/EP2010/058064 WO2010142713A1 (en) 2009-06-09 2010-06-09 Risk markers for cardiovascular disease

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2011154171A true RU2011154171A (en) 2013-07-20
RU2524659C2 RU2524659C2 (en) 2014-07-27

Family

ID=41061079

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2011154171/15A RU2524659C2 (en) 2009-06-09 2010-06-09 Markers of risk of cardiovascular disease

Country Status (14)

Country Link
US (1) US9957565B2 (en)
EP (2) EP2264183B1 (en)
AR (1) AR077026A1 (en)
AU (1) AU2010257482B2 (en)
BR (1) BRPI1013082A2 (en)
CA (1) CA2764693C (en)
CL (1) CL2011003129A1 (en)
ES (2) ES2623633T3 (en)
MX (1) MX2011013243A (en)
PE (1) PE20121029A1 (en)
PT (2) PT2264183T (en)
RU (1) RU2524659C2 (en)
UY (1) UY32698A (en)
WO (1) WO2010142713A1 (en)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2656148C2 (en) * 2013-08-30 2018-05-31 Хендиаг.Эксе, С.Л. Risk markers for cardiovascular diseases in patients with chronic kidney disease

Families Citing this family (23)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10359425B2 (en) 2008-09-09 2019-07-23 Somalogic, Inc. Lung cancer biomarkers and uses thereof
AU2011274422B2 (en) 2010-07-09 2016-02-11 Somalogic Operating Co., Inc. Lung cancer biomarkers and uses thereof
WO2012021795A2 (en) 2010-08-13 2012-02-16 Somalogic, Inc. Pancreatic cancer biomarkers and uses thereof
EP2554679B1 (en) * 2011-08-05 2016-03-02 Gendiag.exe, S.L. Genetic markers for cardiovascular disease risk assessment
SG11201400904SA (en) * 2011-09-30 2014-04-28 Somalogic Inc Cardiovascular risk event prediction and uses thereof
RU2547575C1 (en) * 2014-02-06 2015-04-10 Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Ярославская государственная медицинская академия" Министерства здравоохранения Российской Федерации Method for predicting clinical course of chronic cardiac failure
RU2602451C1 (en) * 2015-08-28 2016-11-20 Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого" Министерства здравоохранения Российской Федерации Diagnostic technique for genetic predisposition to ischemic stroke development in patients with atrial fibrillation
EP3360067A4 (en) * 2015-10-07 2019-06-12 The Board Of Trustees Of The University Of the Leland Stanford Junior University Techniques for determining whether an individual is included in ensemble genomic data
RU2624859C1 (en) * 2016-06-15 2017-07-07 Общество с ограниченной ответственностью "Меднорд-Техника" (ООО "Меднорд-Техника") Method for estimation of increased risk of phlebothromboses formation in patients with ischemic heart disease
CN106250524A (en) * 2016-08-04 2016-12-21 浪潮软件集团有限公司 Organization name extraction method and device based on semantic information
US10451544B2 (en) 2016-10-11 2019-10-22 Genotox Laboratories Methods of characterizing a urine sample
WO2019191010A1 (en) * 2018-03-27 2019-10-03 Aardvark Therapeutics Inc. Personalized treatment method for congestive heart failure
US11308325B2 (en) * 2018-10-16 2022-04-19 Duke University Systems and methods for predicting real-time behavioral risks using everyday images
CN110229882A (en) * 2019-07-03 2019-09-13 贵州省临床检验中心 One kind mthfr gene molecular labeling relevant to cardiovascular disease and its application
CN110229881A (en) * 2019-07-03 2019-09-13 贵州省临床检验中心 One kind SNP marker relevant to adult cardiovascular disease and its application
CN112210598A (en) * 2019-07-11 2021-01-12 合肥中科普瑞昇生物医药科技有限公司 Primer group and kit for detecting polymorphism of gene related to metabolism of hyperglycemia drug and application of primer group and kit
CN110607360A (en) * 2019-09-19 2019-12-24 华中科技大学同济医学院附属同济医院 Primer group and kit for assessing chronic heart failure prognosis and method for assessing chronic heart failure prognosis
WO2021207587A1 (en) * 2020-04-11 2021-10-14 Geneticure Inc. Genetic method for diagnosis and treatment of pre and post coronavirus infections
US11610645B2 (en) * 2020-04-30 2023-03-21 Optum Services (Ireland) Limited Cross-variant polygenic predictive data analysis
US11967430B2 (en) 2020-04-30 2024-04-23 Optum Services (Ireland) Limited Cross-variant polygenic predictive data analysis
US11574738B2 (en) 2020-04-30 2023-02-07 Optum Services (Ireland) Limited Cross-variant polygenic predictive data analysis
US11978532B2 (en) 2020-04-30 2024-05-07 Optum Services (Ireland) Limited Cross-variant polygenic predictive data analysis
US11482302B2 (en) 2020-04-30 2022-10-25 Optum Services (Ireland) Limited Cross-variant polygenic predictive data analysis

Family Cites Families (25)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US723961A (en) 1902-10-01 1903-03-31 Nelson W Clark Lady's belt, collar, or the like.
US4883750A (en) 1984-12-13 1989-11-28 Applied Biosystems, Inc. Detection of specific sequences in nucleic acids
US4683195A (en) 1986-01-30 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences
US4683202A (en) 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
US4800159A (en) 1986-02-07 1989-01-24 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences
US5004565A (en) 1986-07-17 1991-04-02 The Board Of Governors Of Wayne State University Method and compositions providing enhanced chemiluminescence from 1,2-dioxetanes
US5856522A (en) 1995-05-04 1999-01-05 Tropix, Inc. Method of using synthesis of 1,2-dioxetanes and kits therefore
US5994073A (en) 1990-08-30 1999-11-30 Tropix, Inc. Enhancement of chemiluminescent assays
US5837832A (en) 1993-06-25 1998-11-17 Affymetrix, Inc. Arrays of nucleic acid probes on biological chips
AU8126694A (en) 1993-10-26 1995-05-22 Affymax Technologies N.V. Arrays of nucleic acid probes on biological chips
US6015880A (en) 1994-03-16 2000-01-18 California Institute Of Technology Method and substrate for performing multiple sequential reactions on a matrix
US5807522A (en) 1994-06-17 1998-09-15 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods for fabricating microarrays of biological samples
US5773628A (en) 1994-11-14 1998-06-30 Tropix, Inc. 1,2-dioxetane compounds with haloalkoxy groups, methods preparation and use
US5591591A (en) 1995-02-09 1997-01-07 Tropix, Inc. Dioxetane compounds for the chemiluminescent detection of proteases, methods of use and kits therefore
US5589136A (en) 1995-06-20 1996-12-31 Regents Of The University Of California Silicon-based sleeve devices for chemical reactions
US5679803A (en) 1995-10-25 1997-10-21 Tropix, Inc. 1,2 chemiluminescent dioxetanes of improved performance
US5885470A (en) 1997-04-14 1999-03-23 Caliper Technologies Corporation Controlled fluid transport in microfabricated polymeric substrates
US5800999A (en) 1996-12-16 1998-09-01 Tropix, Inc. Dioxetane-precursor-labeled probes and detection assays employing the same
CN1105914C (en) 1997-04-25 2003-04-16 卡钳技术有限公司 Microfluidic devices incorporating improved channel geometries
US6159693A (en) 1998-03-13 2000-12-12 Promega Corporation Nucleic acid detection
WO2002072889A2 (en) 2001-01-12 2002-09-19 Applera Corporation Methods and compositions for microarray control
US20070015170A1 (en) * 2005-07-12 2007-01-18 Oy Jurilab Ltd Method and kit for detecting a risk of coronary heart disease
RU2322193C1 (en) 2006-12-04 2008-04-20 Федеральное государственное учреждение "Учебно-научный медицинский центр" Управления делами Президента Российской Федерации Method for evaluating genetic cardiovascular disease risk in sportsmen
NZ579445A (en) * 2007-02-21 2012-02-24 Decode Genetics Ehf Genetic susceptibility variants associated with cardiovascular disease
US7883851B2 (en) 2007-05-02 2011-02-08 Board Of Regents, The University Of Texas System Common allele on chromosome 9 associated with coronary heart disease

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2656148C2 (en) * 2013-08-30 2018-05-31 Хендиаг.Эксе, С.Л. Risk markers for cardiovascular diseases in patients with chronic kidney disease

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2011154171A (en) MARKERS OF CARDIOVASCULAR DISEASE
CA2764693C (en) Risk markers for cardiovascular disease
CN115917001A (en) Method for detecting donor-derived free DNA
KR101545258B1 (en) Biomarker for predicting of sensitivity to exercise
US20140094381A1 (en) Predictive Biomarkers for Response to Exercise
Luk et al. Predictive role of polymorphisms in interleukin-5 receptor alpha-subunit, lipoprotein lipase, integrin A2 and nitric oxide synthase genes on ischemic stroke in type 2 diabetes—an 8-year prospective cohort analysis of 1327 Chinese patients
WO2013020870A4 (en) Cardiovascular disease
KR101722107B1 (en) Diabetes diagnosis and prediction methods using single nucleotide polymorphism based-Genetic Risk Score in Korean
KR101536213B1 (en) SNP markers for abdominal obesity and use thereof
WO2012094366A1 (en) Circulating mirnas as biomarkers for coronary artery disease
KR101532308B1 (en) SNP markers for abdominal obesity and use thereof
US20230383349A1 (en) Methods of assessing risk of developing a disease
CN104404044B (en) Detection method and its application with the susceptible relevant ANRIL gene extrons sub-district mononucleotide polymorphic site of myocardial infarction
JP6810834B2 (en) How to Predict Response to Continuous Positive Pressure Respiratory Therapy
CN105200131A (en) Kit based on 14 SNP loci for evaluating peripheral arterial disease prevalence risk
Gupta et al. β-T594M epithelial sodium channel gene polymorphism and essential hypertension in individuals of Indo-Aryan ancestry in Northern India
KR20210081188A (en) Biomarker for predicting skin moisturizing risk and use thereof
KR101543774B1 (en) SNP markers for abdominal obesity and use thereof
WO2022247903A1 (en) Polygenic risk score for coronary heart disease, construction method therefor, and application thereof in combination with clinical risk assessment
KR101673162B1 (en) Biomarker for predicting of sensitivity to exercise
KR101673148B1 (en) Biomarker for predicting of sensitivity to exercise
KR101673156B1 (en) Biomarker for predicting of sensitivity to exercise
JP2017006074A (en) Peripheral arterial disease inspection method and inspection reagent
Marchiori et al. Identification of epigenetic biomarkers associated with the development of diabetic kidney disease in individuals with type 2 diabetes: a nested cohort study
WO2019234045A1 (en) Method for evaluating risk of cardiovascular disease