RU2011150264A - Фосфодиэстераза 4d7 в качестве маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы - Google Patents

Фосфодиэстераза 4d7 в качестве маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы Download PDF

Info

Publication number
RU2011150264A
RU2011150264A RU2011150264/02A RU2011150264A RU2011150264A RU 2011150264 A RU2011150264 A RU 2011150264A RU 2011150264/02 A RU2011150264/02 A RU 2011150264/02A RU 2011150264 A RU2011150264 A RU 2011150264A RU 2011150264 A RU2011150264 A RU 2011150264A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
pde4d7
prostate cancer
expression
sensitive prostate
sample
Prior art date
Application number
RU2011150264/02A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2575076C2 (ru
Inventor
Ральф ХОФФМАНН
Майлз Д. ХАУСЛЭЙ
Дэвид Дж. П. ХЕНДЕРСОН
Original Assignee
Конинклейке Филипс Электроникс Н.В.
Дзе Юниверсити Корт Оф Дзе Юниверсити Оф Глазго
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Конинклейке Филипс Электроникс Н.В., Дзе Юниверсити Корт Оф Дзе Юниверсити Оф Глазго filed Critical Конинклейке Филипс Электроникс Н.В.
Publication of RU2011150264A publication Critical patent/RU2011150264A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2575076C2 publication Critical patent/RU2575076C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P13/00—Drugs for disorders of the urinary system
    • A61P13/08—Drugs for disorders of the urinary system of the prostate
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1137—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against enzymes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/115—Aptamers, i.e. nucleic acids binding a target molecule specifically and with high affinity without hybridising therewith ; Nucleic acids binding to non-nucleic acids, e.g. aptamers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
    • C12Q1/44—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase involving esterase
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y301/00—Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
    • C12Y301/04—Phosphoric diester hydrolases (3.1.4)
    • C12Y301/04017—3',5'-Cyclic-nucleotide phosphodiesterase (3.1.4.17)
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • G01N33/57434—Specifically defined cancers of prostate
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/11—Antisense
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering N.A.
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/16—Aptamers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/112—Disease subtyping, staging or classification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/118—Prognosis of disease development
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/34—Genitourinary disorders
    • G01N2800/342—Prostate diseases, e.g. BPH, prostatitis
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis

Abstract

1. Фосфодиэстераза 4D7 (PDE4D7) для применения в качестве маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, где экспрессия маркера увеличена при сравнении экспрессии в ткани агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы с экспрессией в нормальной ткани или ткани доброкачественной опухоли предстательной железы.2. Композиция для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, содержащая аффинный лиганд в виде нуклеиновой кислоты и/или пептидный аффинный лиганд для продукта экспрессии или белка PDE4D7.3. Композиция по п.2, где указанный аффинный лиганд в виде нуклеиновой кислоты или пептидный аффинный лиганд модифицированы, чтобы они функционировали в качестве контрастного средства.4. Композиция по п.2, где указанный аффинный лиганд представляет собой набор олигонуклеотидов, специфичных к продукту экспрессии PDE4D7, зонд, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7, аптамер, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7 или к белку PDE4D7, антитело, специфичное к белку PDE4D7, и/или вариант антитела, специфичный к белку PDE4D7.5. Применение PDE4D7 в качестве маркера для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы.6. Способ обнаружения, диагностики, монитор�

Claims (26)

1. Фосфодиэстераза 4D7 (PDE4D7) для применения в качестве маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, где экспрессия маркера увеличена при сравнении экспрессии в ткани агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы с экспрессией в нормальной ткани или ткани доброкачественной опухоли предстательной железы.
2. Композиция для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, содержащая аффинный лиганд в виде нуклеиновой кислоты и/или пептидный аффинный лиганд для продукта экспрессии или белка PDE4D7.
3. Композиция по п.2, где указанный аффинный лиганд в виде нуклеиновой кислоты или пептидный аффинный лиганд модифицированы, чтобы они функционировали в качестве контрастного средства.
4. Композиция по п.2, где указанный аффинный лиганд представляет собой набор олигонуклеотидов, специфичных к продукту экспрессии PDE4D7, зонд, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7, аптамер, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7 или к белку PDE4D7, антитело, специфичное к белку PDE4D7, и/или вариант антитела, специфичный к белку PDE4D7.
5. Применение PDE4D7 в качестве маркера для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы.
6. Способ обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, включающий по меньшей мере стадию определения уровня PDE4D7 в образце.
7. Способ диагностики, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или диагностики, мониторинга или прогнозирования прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, где указанный способ различает между доброкачественной опухолью предстательной железы и агрессивным гормон-чувствительным раком предстательной железы, включающий
(a) определение уровня PDE4D7 в образце;
(b) определение уровня экспрессии эталонного гена в образце;
(c) нормализацию измеренного уровня экспрессии PDE4D7 к экспрессии эталонного гена; и
(d) сравнение нормализованного уровня экспрессии с заданной пороговой величиной, выбранной так, чтобы исключить доброкачественную опухоль предстательной железы, где нормализованный уровень экспрессии выше пороговой величины указывает на агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, где указанная пороговая величина составляет приблизительно от -2 до +2, предпочтительно приблизительно равна 0.
8. Способ сбора данных для обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, включающий по меньшей мере
(a) тестирование у индивидуума экспрессии PDE4D7; и
(b) сравнение экспрессии, определенной на стадии (а), с контрольным уровнем.
9. Иммуноанализ для обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или для обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, включающий по меньшей мере
(a) тестирование в образце, полученном от индивидуума, экспрессии PDE4D7,
(b) тестирование в контрольном образце экспрессии PDE4D7,
(c) определение отличий в экспрессии PDE4D7 на стадиях (а) и (b); и
(d) принятие решения о наличии агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или прогрессировании в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, исходя из результатов, полученных на стадии (с),
где указанные стадии тестирования основаны на применении антитела, специфично связывающегося с PDE4D7.
10. Иммуноанализ для различения между доброкачественной опухолью предстательной железы и агрессивным гормон-чувствительным раком предстательной железы, включающий
(a) определение уровня PDE4D7 в образце;
(b) определение уровня экспрессии эталонного гена в образце;
(c) нормализацию измеренного уровня экспрессии PDE4D7 к экспрессии эталонного гена; и
(d) сравнение нормализованного уровня экспрессии с заданной пороговой величиной, выбранной так, чтобы исключить доброкачественную опухоль предстательной железы, где нормализованный уровень экспрессии выше пороговой величины указывает на агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, где указанная пороговая величина составляет приблизительно от -2 до +2, предпочтительно приблизительно равна 0.
11. Способ идентификации индивидуума, подходящего для терапии агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, включающий
(a) тестирование в образце, полученном от индивидуума, экспрессии PDE4D7;
(b) тестирование в указанном образце экспрессии эталонного гена и/или в контрольном образце экспрессии PDE4D7;
(c) классификацию уровней экспрессии стадии (а) относительно уровней на стадии (b); и
(d) идентификацию индивидуума как подходящего для получения терапии агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, где образец индивидуума классифицирован как имеющий увеличенный уровень экспрессии PDE4D7.
12. Иммуноанализ для стратификации индивидуума или группы индивидуумов с агрессивным гормон-чувствительным раковым заболеванием предстательной железы, включающий
(a) тестирование в образце, полученном от индивидуума, экспрессии PDE4D7;
(b) тестирование в указанном образце экспрессии эталонного гена и/или в контрольном образце экспрессии PDE4D7;
(c) определение отличий в экспрессии PDE4D7 на стадиях (а) и экспрессии PDE4D7 и/или эталонного гена на стадии (b); и
(d) стратификацию индивидуума или группы индивидуумов для терапии агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, исходя из результатов, полученных на стадии (с), где образец индивидуума имеет повышенный уровень экспрессии PDE4D7.
13. Способ по п.6 или иммуноанализ по п.10, где указанное тестирование или определение экспрессии проводят или дополнительно проводят измерением уровней нуклеиновой кислоты или белка или путем определения биологической активности PDE4D7 или эталонного гена.
14. Способ или иммуноанализ по п.13, где указанный способ или иммуноанализ включает дополнительную стадию сравнения измеренных уровней нуклеиновой кислоты или белка или измеренной биологической активности с контрольным уровнем.
15. Способ по п.7 или иммуноанализ по п.10, где указанный эталонный ген представляет собой другую фосфодиэстеразу, предпочтительно PDE4D5, или ген домашнего хозяйства, предпочтительно GAPDH или PBGD.
16. Способ по п.7 или иммуноанализ по п.12, где указанный способ или иммуноанализ включает дополнительную стадию определения уровня простатспецифического антигена (PSA).
17. Способ или иммуноанализ по п.16, где уровень PSA от 2,5 до 4 нг/мл указывает на агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы.
18. Способ по п.6 или иммуноанализ по п.9, где указанный образец представляет собой образец ткани, биоптат, образец мочи, образец осадка мочи, образец крови, образец слюны, образец семенной жидкости, образец, содержащий циркулирующие опухолевые клетки, или образец, содержащий секретируемые предстательной железой экзосомы.
19. Ингибиторная фармацевтическая композиция, содержащая по меньшей мере один элемент, выбранный из группы:
(a) соединение, непосредственно ингибирующее активность PDE4D7, предпочтительно антагонист ферментативной активности PDE4D7;
(b) соединение, косвенно ингибирующее активность PDE4D7;
(c) доминантно-негативная форма белка PDE4D7 или ее биологически активный эквивалент;
(d) нуклеиновая кислота, кодирующая и экспрессирующая доминантно-негативную форму PDE4D7;
(e) miPHK, специфичная к PDE4D7;
(f) антисмысловая молекула для PDE4D7;
(g) siPHK, специфичная к PDE4D7;
(h) аптамер, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7 или к белку PDE4D7;
(i) низкомолекулярное соединение или пептидомиметик, способные специфично связываться с белком PDE4D7; и
(j) антитело, специфичное к белку PDE4D7, и/или вариант антитела, специфичный к белку PDE4D7.
20. Ингибиторная фармацевтическая композиция для лечения или профилактики агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, содержащая по меньшей мере один элемент, выбранный из группы:
(a) соединение, непосредственно ингибирующее активность PDE4D7, предпочтительно антагонист ферментативной активности PDE4D7;
(b) соединение, косвенно ингибирующее активность PDE4D7;
(c) доминантно-негативная форма белка PDE4D7 или ее биологически активный эквивалент;
(d) нуклеиновая кислота, кодирующая и экспрессирующая доминантно-негативную форму PDE4D7;
(e) miPHK, специфичная к PDE4D7;
(f) антисмысловая молекула для PDE4D7;
(g) siPHK, специфичная к PDE4D7;
(h) аптамер, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7 или к белку PDE4D7;
(i) низкомолекулярное соединение или пептидомиметик, способные специфично связываться с белком PDE4D7; и
(j) антитело, специфичное к белку PDE4D7, и/или вариант антитела, специфичный к белку PDE4D7.
21. Стимулирующая фармацевтическая композиция, содержащая по меньшей мере один элемент, выбранный из группы:
(a) соединение, непосредственно стимулирующее или модулирующее активность PDE4D7, предпочтительно аллостерический агонист ферментативной активности PDE4D7;
(b) соединение, косвенно стимулирующее или модулирующее активность PDE4D7;
(c) белок PDE4D7 или его биологически активный эквивалент;
(d) нуклеиновая кислота, кодирующая и экспрессирующая PDE4D7;
(e) ингибитор miPHK, специфичный к miPHK PDE4D7;
(f) деметилирующий агент; и
(g) вытесняющий фосфодиэстеразу фактор.
22. Ингибиторная фармацевтическая композиция по п.19 или стимулирующая фармацевтическая композиция по п.21, где либо указанную ингибиторную либо указанную стимулирующую фармацевтическую композицию применяют для лечения рака предстательной железы в зависимости от уровня экспрессии PDE4D7, где указанный уровень экспрессии определяют и/или подвергают мониторингу согласно стадиям (а)-(с) п.7.
23. Фармацевтическая композиция по п.22, где в случае увеличенных и/или увеличивающихся уровней PDE4D7 вводят указанную ингибиторную фармацевтическую композицию, и в случае сниженных и/или снижающихся уровней PDE4D7 вводят указанную стимулирующую фармацевтическую композицию.
24. Способ по п.11 или иммуноанализ по п.12, где терапия рака предстательной железы включает введение фармацевтической композиции по п.19 или введение фармацевтической композиции по п.19 в комбинации с дополнительной терапией злокачественной опухоли, предпочтительно лучевой терапией или химиотерапией.
25. Применение антитела, специфичного к белку PDE4D7, и/или варианта антитела, специфичного к белку PDE4D7, для обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования злокачественной опухоли или для лечения рака предстательной железы, более предпочтительно агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы.
26. Фосфодиэстераза по п.1, композиция по п.2, применение по п.5, способ по п.6, иммуноанализ по п.9, ингибиторная фармацевтическая композиция по п.20, или применение по п.25, где указанный агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы представляет собой гормон-чувствительный рак предстательной железы стадии I-IV, гормон-чувствительный рецидивирующий рак предстательной железы или гормон-чувствительный метастазирующий рак предстательной железы.
RU2011150264/10A 2009-05-12 2010-05-11 Фосфодиэстераза 4d7 в качестве маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы RU2575076C2 (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP09159960.5 2009-05-12
EP09159960 2009-05-12
EP09169739.1 2009-09-08
EP09169739 2009-09-08
PCT/IB2010/052072 WO2010131194A1 (en) 2009-05-12 2010-05-11 Phosphodiesterase 4d7 as marker for malignant, hormone-sensitive prostate cancer

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2011150264A true RU2011150264A (ru) 2013-06-20
RU2575076C2 RU2575076C2 (ru) 2016-02-10

Family

ID=

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2766885C2 (ru) * 2016-12-01 2022-03-16 Конинклейке Филипс Н.В. Оценки риска на основе экспрессии варианта 7 фосфодиэстеразы 4d человека

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2766885C2 (ru) * 2016-12-01 2022-03-16 Конинклейке Филипс Н.В. Оценки риска на основе экспрессии варианта 7 фосфодиэстеразы 4d человека

Also Published As

Publication number Publication date
KR102110469B1 (ko) 2020-05-14
JP2019205431A (ja) 2019-12-05
CN102439176A (zh) 2012-05-02
CN102439176B (zh) 2018-11-23
JP6588496B2 (ja) 2019-10-09
KR20180002900A (ko) 2018-01-08
JP2017212973A (ja) 2017-12-07
JP2012526544A (ja) 2012-11-01
BRPI1007704A2 (pt) 2019-12-03
JP6246167B2 (ja) 2017-12-13
ES2707598T3 (es) 2019-04-04
EP2430190A1 (en) 2012-03-21
EP2430190B1 (en) 2018-11-21
WO2010131194A1 (en) 2010-11-18
US20120129788A1 (en) 2012-05-24
JP2016028245A (ja) 2016-02-25
DK2430190T3 (en) 2019-02-18
US8778621B2 (en) 2014-07-15
KR20120036842A (ko) 2012-04-18

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2011150279A (ru) Фосфодиэстераза 4d7 как маркер рака предстательной железы
RU2485974C2 (ru) Идентификация опухолевых антигенов для диагностики и терапии
JP2012526544A5 (ru)
Paek et al. Prognostic significance of human epididymis protein 4 in epithelial ovarian cancer
JP5224309B2 (ja) 卵巣明細胞腺癌に特異的に発現しているタンパク質とその応用
AU2009216910A1 (en) Small cell lung carcinoma biomarker panel
CN106662543B (zh) 肺癌患者中的非侵入性基因突变检测
Angel et al. Extracellular matrix alterations in low‐grade lung adenocarcinoma compared with normal lung tissue by imaging mass spectrometry
Hofer et al. Expression of the platelet-derived growth factor receptor in prostate cancer and treatment implications with tyrosine kinase inhibitors
Webber et al. Prostate stromal cell proteomics analysis discriminates normal from tumour reactive stromal phenotypes
Xu et al. Identification of blood protein biomarkers that aid in the clinical assessment of patients with malignant glioma
RU2011150291A (ru) Фосфодиэстераза-9а в качестве маркера злокачественной опухоли предстательной железы
WO2019158825A1 (en) Xrcc5 as biomarker for prostate cancer
JP2012526543A5 (ru)
US20120171225A1 (en) Diagnostic Method for Predicting the Risk of Cancer Recurrence Based on Histone Macroh2A Isoforms
Liu et al. Relationship of biglycan and decorin expression with clinicopathological features and prognosis in patients with oral squamous cell carcinoma
JP5736947B2 (ja) 新規胆道癌バイオマーカー
US10627413B2 (en) Method of cancer diagnosis, progression and response to therapy using a primary xenograft mouse model for cancer serum biomarker discovery
RU2011150264A (ru) Фосфодиэстераза 4d7 в качестве маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы
KR102164525B1 (ko) Gdf 15를 포함하는 갑상선 암 진단 또는 갑상선 암 예후 예측용 바이오마커 조성물
CN111254195B (zh) 一种用于预测大肠癌化疗效果的生物标志物、试剂盒及其应用
WO2023022200A1 (ja) 免疫チェックポイント阻害剤に対する応答性の予測用バイオマーカー
EP4177608A1 (en) Biomarker panel for diagnosing pulmonary dysfunction
JP6898617B2 (ja) Ｐｒｄｍ１４発現を確認する方法
Tesařová et al. Characterization of vestibular schwannoma tissues using liquid chromatography‐tandem mass spectrometry analysis of specific peptide fragments separated by in‐sample tryptic protein digestion followed by mathematical analysis