RU2011104431A - Конструкции и способы для продуцирования и секреции полипептидов - Google Patents
Конструкции и способы для продуцирования и секреции полипептидов Download PDFInfo
- Publication number
- RU2011104431A RU2011104431A RU2011104431/10A RU2011104431A RU2011104431A RU 2011104431 A RU2011104431 A RU 2011104431A RU 2011104431/10 A RU2011104431/10 A RU 2011104431/10A RU 2011104431 A RU2011104431 A RU 2011104431A RU 2011104431 A RU2011104431 A RU 2011104431A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- recombinant microorganism
- polypeptide
- interest
- module
- protein
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2434—Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2437—Cellulases (3.2.1.4; 3.2.1.74; 3.2.1.91; 3.2.1.150)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
- C12P21/02—Preparation of peptides or proteins having a known sequence of two or more amino acids, e.g. glutathione
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/20—Fusion polypeptide containing a tag with affinity for a non-protein ligand
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/70—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02E—REDUCTION OF GREENHOUSE GAS [GHG] EMISSIONS, RELATED TO ENERGY GENERATION, TRANSMISSION OR DISTRIBUTION
- Y02E50/00—Technologies for the production of fuel of non-fossil origin
- Y02E50/10—Biofuels, e.g. bio-diesel
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
- Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
- Y02P20/52—Improvements relating to the production of bulk chemicals using catalysts, e.g. selective catalysts
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Рекомбинантный микроорганизм, содержащий полинуклеиновую кислоту, кодирующую слитый белок, состоящий из полипептидной последовательности, которая включает в данном порядке: ! - по меньшей мере один сигнальный пептид; ! - домен-носитель, содержащий по меньшей мере один углевод-связывающий модуль (СВМ) целлюлосомного поддерживающего белка, слитый по меньшей мере с одним модулем Х целлюлосомного поддерживающего белка; ! - по меньшей мере один интересующий полипептид; ! - по меньшей мере один пептидный линкер для связывания домена-носителя с интересующим полипептидом, ! где микроорганизм секретирует указанный интересующий полипептид. ! 2. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, который принадлежит к классу Clostridia. ! 3. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, где указанная полипептидная последовательность включает два или более чем два модуля X. ! 4. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, где указанный сигнальный пептид указанного целлюлосомного поддерживающего белка представляет собой сигнальный пептид поддерживающего белка CipC С.cellulolyticum или сигнальный пептид поддерживающего белка CipA С.acetobutylicum. ! 5. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, где по меньшей мере один углевод-связывающий модуль представляет собой углевод-связывающий модуль типа 3а (СВМ3а). ! 6. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, где по меньшей мере один модуль Х представляет собой модуль Х2 поддерживающего белка CipC С.cellulolyticum или модуль Х2 поддерживающего белка CipA С.acetobutylicum. ! 7. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, где указанный по меньшей мере один интересующий полипептид представляет собой фермент, расщепляющий клеточную стенку. ! 8. Рекомбинантный микроорганизм
Claims (18)
1. Рекомбинантный микроорганизм, содержащий полинуклеиновую кислоту, кодирующую слитый белок, состоящий из полипептидной последовательности, которая включает в данном порядке:
- по меньшей мере один сигнальный пептид;
- домен-носитель, содержащий по меньшей мере один углевод-связывающий модуль (СВМ) целлюлосомного поддерживающего белка, слитый по меньшей мере с одним модулем Х целлюлосомного поддерживающего белка;
- по меньшей мере один интересующий полипептид;
- по меньшей мере один пептидный линкер для связывания домена-носителя с интересующим полипептидом,
где микроорганизм секретирует указанный интересующий полипептид.
2. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, который принадлежит к классу Clostridia.
3. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, где указанная полипептидная последовательность включает два или более чем два модуля X.
4. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, где указанный сигнальный пептид указанного целлюлосомного поддерживающего белка представляет собой сигнальный пептид поддерживающего белка CipC С.cellulolyticum или сигнальный пептид поддерживающего белка CipA С.acetobutylicum.
5. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, где по меньшей мере один углевод-связывающий модуль представляет собой углевод-связывающий модуль типа 3а (СВМ3а).
6. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, где по меньшей мере один модуль Х представляет собой модуль Х2 поддерживающего белка CipC С.cellulolyticum или модуль Х2 поддерживающего белка CipA С.acetobutylicum.
7. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, где указанный по меньшей мере один интересующий полипептид представляет собой фермент, расщепляющий клеточную стенку.
8. Рекомбинантный микроорганизм по п.1, где указанный по меньшей мере один интересующий полипептид представляет собой целлюлазу.
9. Рекомбинантный микроорганизм по п.8, где указанный фермент представляет собой целлюлазу С.cellulolyticum.
10. Рекомбинантный микроорганизм по п.8, где указанный фермент представляет собой Cel48F или Cel9G.
11. Рекомбинантный микроорганизм по п.8, где указанный фермент представляет собой целлюлазу Cel5H S.degradans штамм 2-40.
12. Рекомбинантный микроорганизм по любому из пп.1-6, где по меньшей мере один интересующий полипептид представляет собой терапевтический белок, выбранный из группы, включающей терапевтические ферменты, цитокины и антитела.
13. Рекомбинантный микроорганизм по п.12, где указанный терапевтический белок представляет собой IL-2.
14. Рекомбинантный микроорганизм по п.2, который принадлежит к штамму Clostridium, выбранному из группы, включающей С.acetobutylicum и С.beijerinckii.
15. Способ продуцирования и секреции рекомбинантным микроорганизмом по меньшей мере одного интересующего гетерологичного или гомологичного полипептида, включающий введение в этот микроорганизм полинуклеиновой кислоты, кодирующей слитый белок, состоящий из полипептидной последовательности, которая включает:
- домен-носитель, содержащий по меньшей мере один углевод-связывающий модуль (СВМ) целлюлосомного поддерживающего белка, слитый по меньшей мере с одним модулем Х целлюлосомного поддерживающего белка;
- по меньшей мере один интересующий полипептид;
- по меньшей мере один пептидный линкер для связывания домена-носителя с интересующим полипептидом и
- по меньшей мере один сигнальный пептид;
в условиях, эффективных, чтобы вызвать экспрессию кодируемого слитого белка, где кодируемый слитый белок секретируется рекомбинантным микроорганизмом в окружающую среду этого рекомбинантного микроорганизма.
16. Способ по п.15, где рекомбинантный микроорганизм принадлежит к классу Clostridia.
17. Полинуклеиновая кислота, кодирующая слитый белок, состоящая из полипептидной последовательности, которая включает:
- домен-носитель, содержащий по меньшей мере один углевод-связывающий модуль (СВМ) целлюлосомного поддерживающего белка, слитый по меньшей мере с одним модулем Х целлюлосомного поддерживающего белка;
- по меньшей мере один интересующий полипептид;
- по меньшей мере один пептидный линкер для связывания домена-носителя с интересующим полипептидом, и
- по меньшей мере один сигнальный пептид;
18. Полинуклеиновая кислота по п.17, где указанная полипептидная последовательность включает два или более чем два модуля X.
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP08290739.5 | 2008-07-31 | ||
| EP08290739 | 2008-07-31 | ||
| EP08291120.7 | 2008-11-28 | ||
| EP08291120A EP2192177A1 (en) | 2008-11-28 | 2008-11-28 | Cellulase Cel5H related reagents and their use in microorganisms |
| PCT/EP2009/059875 WO2010012805A1 (en) | 2008-07-31 | 2009-07-30 | Constructs and methods for the production and secretion of polypeptides |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2011104431A true RU2011104431A (ru) | 2012-09-10 |
| RU2525194C2 RU2525194C2 (ru) | 2014-08-10 |
Family
ID=41328872
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2011104431/10A RU2525194C2 (ru) | 2008-07-31 | 2009-07-30 | Конструкции и способы для продуцирования и секреции ферментов, расщепляющих клеточную стенку |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US8735133B2 (ru) |
| EP (1) | EP2318524B1 (ru) |
| JP (1) | JP2011529336A (ru) |
| CN (1) | CN102112606A (ru) |
| AU (1) | AU2009275846B2 (ru) |
| BR (1) | BRPI0916615A2 (ru) |
| CA (1) | CA2731203C (ru) |
| NZ (1) | NZ590294A (ru) |
| RU (1) | RU2525194C2 (ru) |
| WO (1) | WO2010012805A1 (ru) |
Families Citing this family (21)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP2192177A1 (en) * | 2008-11-28 | 2010-06-02 | Total S.A. | Cellulase Cel5H related reagents and their use in microorganisms |
| EP2194120A1 (en) * | 2008-12-02 | 2010-06-09 | Total S.A. | Bioprocessing ligno-cellulose into ethanol with recombinant clostridium |
| WO2011053545A1 (en) * | 2009-10-30 | 2011-05-05 | Merck Sharp & Dohme Corp. | Granulocyte-colony stimulating factor produced in glycoengineered pichia pastoris |
| US8431371B2 (en) * | 2009-11-19 | 2013-04-30 | Academia Sinica | Expression system for producing multi-enzyme complexes and uses thereof |
| JP5434689B2 (ja) * | 2010-03-05 | 2014-03-05 | 株式会社豊田中央研究所 | セルラーゼ複合体及びその利用 |
| JP5628544B2 (ja) * | 2010-04-07 | 2014-11-19 | 株式会社豊田中央研究所 | クロストリジウム・サーモセラム由来のタンパク質複合体を構築するためのタンパク質及びその利用 |
| EP2410061A1 (en) * | 2010-07-20 | 2012-01-25 | Wolfgang Schwarz | Artificial cellulosome and the use of the same for enzymatic breakdown of resilient substrates |
| US9528132B2 (en) | 2012-06-04 | 2016-12-27 | Carbios | Recombinant cellulosome complex and uses thereof |
| JPWO2015147318A1 (ja) * | 2014-03-28 | 2017-04-13 | 国立大学法人三重大学 | アルコールの製造方法 |
| PT3143075T (pt) | 2014-05-16 | 2022-08-12 | Carbios | Processo de reciclagem de artigos de plástico pet mistos |
| DK3209771T3 (da) | 2014-10-21 | 2021-01-11 | Carbios | Polypeptid med en polyester-nedbrydende aktivitet og anvendelser deraf |
| EP3233995B1 (en) | 2014-12-19 | 2023-08-09 | Carbios | Plastic compound and preparation process |
| US10508269B2 (en) | 2015-03-13 | 2019-12-17 | Carbios | Polypeptide having a polyester degrading activity and uses thereof |
| JP6907132B2 (ja) | 2015-06-12 | 2021-07-21 | キャルビオスＣａｒｂｉｏｓ | 生分解性ポリエステル組成物及びその使用 |
| WO2017108577A1 (en) | 2015-12-21 | 2017-06-29 | Carbios | Recombinant yeast cells producing polylactic acid and uses thereof |
| WO2017198786A1 (en) | 2016-05-19 | 2017-11-23 | Carbios | A process for degrading plastic products |
| CN107841510B (zh) * | 2016-09-20 | 2021-02-09 | 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 | 一种原核细胞转录后水平控制不同基因表达比例的方法 |
| CN108977421B (zh) * | 2018-08-17 | 2021-04-13 | 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 | 用于催化木质纤维素糖化的全菌酶制剂 |
| EP3647425A1 (en) * | 2018-11-02 | 2020-05-06 | Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Recombinant modified microorganisms displaying membrane functionalization for various biotechnological applications |
| CN112035094B (zh) * | 2020-09-02 | 2024-04-16 | 中国银行股份有限公司 | 基于Vuetify框架的穿梭框实现方法及装置 |
| CN112481282B (zh) * | 2020-11-26 | 2024-02-02 | 李宪臻 | 一种特异性识别黄原胶侧链的碳水化合物结合模块cbm6b蛋白质及应用 |
Family Cites Families (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| PT1084146E (pt) * | 1998-05-13 | 2003-02-28 | Biotecon Gesells Biotec Entwic | Proteina hibrida para inibicao de desgranulacao de mastocitos e seu uso |
| WO2005023981A2 (en) * | 2003-09-09 | 2005-03-17 | Zephyr Proteomix Ltd. | Libraries of chimeric cellulose binding proteins and methods of use thereof |
-
2009
- 2009-07-30 AU AU2009275846A patent/AU2009275846B2/en not_active Ceased
- 2009-07-30 US US13/056,352 patent/US8735133B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2009-07-30 RU RU2011104431/10A patent/RU2525194C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2009-07-30 CA CA2731203A patent/CA2731203C/en not_active Expired - Fee Related
- 2009-07-30 JP JP2011520518A patent/JP2011529336A/ja active Pending
- 2009-07-30 BR BRPI0916615-7A patent/BRPI0916615A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2009-07-30 NZ NZ590294A patent/NZ590294A/xx not_active IP Right Cessation
- 2009-07-30 EP EP09781293.7A patent/EP2318524B1/en active Active
- 2009-07-30 CN CN2009801306844A patent/CN102112606A/zh active Pending
- 2009-07-30 WO PCT/EP2009/059875 patent/WO2010012805A1/en active Application Filing
-
2014
- 2014-04-09 US US14/249,065 patent/US9441213B2/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP2318524A1 (en) | 2011-05-11 |
| NZ590294A (en) | 2012-09-28 |
| US20110129876A1 (en) | 2011-06-02 |
| US8735133B2 (en) | 2014-05-27 |
| EP2318524B1 (en) | 2016-02-24 |
| AU2009275846B2 (en) | 2014-09-25 |
| RU2525194C2 (ru) | 2014-08-10 |
| CN102112606A (zh) | 2011-06-29 |
| BRPI0916615A2 (pt) | 2015-08-04 |
| JP2011529336A (ja) | 2011-12-08 |
| CA2731203A1 (en) | 2010-02-04 |
| WO2010012805A1 (en) | 2010-02-04 |
| US20140220656A1 (en) | 2014-08-07 |
| AU2009275846A1 (en) | 2010-02-04 |
| US9441213B2 (en) | 2016-09-13 |
| CA2731203C (en) | 2017-01-03 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2011104431A (ru) | Конструкции и способы для продуцирования и секреции полипептидов | |
| Mingardon et al. | The issue of secretion in heterologous expression of Clostridium cellulolyticum cellulase-encoding genes in Clostridium acetobutylicum ATCC 824 | |
| Doi et al. | The Clostridium cellulovorans cellulosome: an enzyme complex with plant cell wall degrading activity | |
| Lambertz et al. | Challenges and advances in the heterologous expression of cellulolytic enzymes: a review | |
| Tsai et al. | Functional display of complex cellulosomes on the yeast surface via adaptive assembly | |
| Jung et al. | Heterologous expression of plant cell wall degrading enzymes for effective production of cellulosic biofuels | |
| Tanaka et al. | Cell surface engineering of industrial microorganisms for biorefining applications | |
| Mazzoli | DEVELOPMENT OF MICROORGANISMS FOR CELLULOSE-BIOFUEL CONSOLIDATED BIOPROCESSINGS: METABOLIC ENGINEERS'TRICKS | |
| KR101120359B1 (ko) | 섬유소를 효과적으로 분해할 수 있는 유전자가 삽입된 재조합 벡터, 그 재조합벡터를 포함하는 형질전환체, 및 그 형질전환체를 이용한 에탄올 생산방법 | |
| US20110294184A1 (en) | Cellulolytic polypeptides and their use in micro-organisms for the production of solvents and fuels | |
| Currie et al. | Functional heterologous expression of an engineered full length CipA from Clostridium thermocellum in Thermoanaerobacterium saccharolyticum | |
| RU2015120576A (ru) | Бета-глюкозидаза из magnaporthe grisea | |
| Jeon et al. | Production of cellulosic ethanol in Saccharomyces cerevisiae heterologous expressing Clostridium thermocellum endoglucanase and Saccharomycopsis fibuligera β-glucosidase genes | |
| Lee et al. | Production of ethanol from agarose by unified enzymatic saccharification and fermentation in recombinant yeast | |
| Fierobe et al. | Engineering cellulase activity into Clostridium acetobutylicum | |
| US8354266B2 (en) | Method for producing extracellular multi-enzyme complexes in host cells | |
| CN104312933B (zh) | 一种优化信号肽提高胰蛋白酶胞外分泌表达的方法 | |
| EP2633060B1 (en) | Covalent cellulosomes and uses thereof | |
| van Rensburg et al. | Expression of the Ruminococcus flavefaciens cellodextrinase gene in Saccharomyces cerevisiae | |
| JP2012039966A (ja) | セルロース結合ドメインが不活性化されたセロビオヒドロラーゼ活性を有するタンパク質 | |
| CN116970591B (zh) | 一种嗜热内切纤维素酶突变体及制备方法 | |
| TWI444477B (zh) | 製造纖維素水解酶複合體之多順反子表現卡匣及其應用 | |
| Sanusi | Identification and enzyme production of a cellulolytic Bacillus-strain isolated from moose (Alces alces) rumen | |
| O'Malley | Engineering Anaerobic Gut Fungi for Lignocellulose Breakdown | |
| De Chellis | Supercharging of a Family-5 Glycoside Hydrolase Cel5a from Thermobifida fusca to Improve Cellulose Hydrolysis |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| HZ9A | Changing address for correspondence with an applicant | ||
| HZ9A | Changing address for correspondence with an applicant | ||
| HZ9A | Changing address for correspondence with an applicant | ||
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20150731 |
|
| NF4A | Reinstatement of patent |
Effective date: 20160620 |
|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20180731 |