RU2010123381A - Способ и композиции для диагностического применения у раковых пациентов - Google Patents
Способ и композиции для диагностического применения у раковых пациентов Download PDFInfo
- Publication number
- RU2010123381A RU2010123381A RU2010123381/15A RU2010123381A RU2010123381A RU 2010123381 A RU2010123381 A RU 2010123381A RU 2010123381/15 A RU2010123381/15 A RU 2010123381/15A RU 2010123381 A RU2010123381 A RU 2010123381A RU 2010123381 A RU2010123381 A RU 2010123381A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- patient
- genes
- therapy
- addition
- gene products
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/15—Medicinal preparations ; Physical properties thereof, e.g. dissolubility
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Pathology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Oncology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Medical Treatment And Welfare Office Work (AREA)
Abstract
1. Способ идентификации пациента с раком почки, который может получить пользу от противораковой терапии помимо или в дополнение к антиангиогенной терапии, который предусматривает ! определение уровня экспрессии одного или нескольких генов или продуктов генов, перечисленных в таблице 1, в образце, полученном от пациента, ! в котором повышенные уровни экспрессии одного или нескольких генов или продуктов генов в образце, полученном от пациента, по сравнению с референсным образцом указывает на то, что пациент может получить пользу от противораковой терапии помимо или в дополнение к антиангиогенной терапии. ! 2. Способ предсказания восприимчивости пациента с раком почки к антиангиогенной терапии, предусматривающий ! определение уровня экспрессии одного или нескольких генов или продуктов генов, перечисленных в таблице 1, в образце, полученном от пациента, ! в котором повышенная экспрессия одного или нескольких генов или продуктов генов в образце, полученном от пациента, по сравнению с референсным образцом указывает на меньшую вероятность восприимчивости пациента к одной только антиангиогенной терапии. ! 3. Способ по п.1 или 2, в котором антиангиогенная терапия предусматривает введение VEGF-специфичного антагониста. ! 4. Способ по п.3, в котором VEGF-специфичным антагонистом является анти-VEGF антитело. ! 5. Способ по п.4, в котором анти-VEGF антителом является бевацизумаб. ! 6. Способ по п.1 или 2, в котором образец, полученный от пациента, представляет собой образец ткани или получен из плазмы. ! 7. Способ получения персонализированного геномного профиля для пациента с раком почки, предусматривающий ! определение уровней экспр�
Claims (24)
1. Способ идентификации пациента с раком почки, который может получить пользу от противораковой терапии помимо или в дополнение к антиангиогенной терапии, который предусматривает
определение уровня экспрессии одного или нескольких генов или продуктов генов, перечисленных в таблице 1, в образце, полученном от пациента,
в котором повышенные уровни экспрессии одного или нескольких генов или продуктов генов в образце, полученном от пациента, по сравнению с референсным образцом указывает на то, что пациент может получить пользу от противораковой терапии помимо или в дополнение к антиангиогенной терапии.
2. Способ предсказания восприимчивости пациента с раком почки к антиангиогенной терапии, предусматривающий
определение уровня экспрессии одного или нескольких генов или продуктов генов, перечисленных в таблице 1, в образце, полученном от пациента,
в котором повышенная экспрессия одного или нескольких генов или продуктов генов в образце, полученном от пациента, по сравнению с референсным образцом указывает на меньшую вероятность восприимчивости пациента к одной только антиангиогенной терапии.
3. Способ по п.1 или 2, в котором антиангиогенная терапия предусматривает введение VEGF-специфичного антагониста.
4. Способ по п.3, в котором VEGF-специфичным антагонистом является анти-VEGF антитело.
5. Способ по п.4, в котором анти-VEGF антителом является бевацизумаб.
6. Способ по п.1 или 2, в котором образец, полученный от пациента, представляет собой образец ткани или получен из плазмы.
7. Способ получения персонализированного геномного профиля для пациента с раком почки, предусматривающий
определение уровней экспрессии одного или нескольких генов или продуктов генов, перечисленных в таблице 1, в образце, полученном от указанного пациента;
сравнение уровней экспрессии с референсным образцом; и
создание отчета, суммирующего данные, полученные на указанной стадии определения и/или сравнения, в котором отчет включает предсказание вероятности клинического эффекта одной только антиангиогенной терапии для указанного пациента,
в котором повышенный уровень экспрессии одного или нескольких генов или продуктов генов в образце, полученном от пациента, по сравнению с референсным образцом указывает на увеличенную вероятность клинического эффекта противораковой терапии помимо или в дополнение к антиангиогенной терапии.
8. Набор, содержащий матрицу, включающую в себя полинуклеотиды, способные специфически гибридизоваться с одним или несколькими генами, перечисленным в таблице 1, где набор дополнительно содержит инструкции по использованию указанной матрицы для предсказания восприимчивости пациента с раком почки к одной только антиангиогенной терапии, в котором повышенная экспрессия одного или нескольких генов по сравнению с референсным образцом указывает на то, что пациент может получить пользу от противораковой терапии помимо или в дополнение к антиангиогенной терапии.
9. Набор соединений, с помощью которых можно детектировать уровни экспрессии двух или нескольких генов или продуктов генов, перечисленных в таблице 1, в котором повышенная экспрессия двух или нескольких генов или продуктов генов, определенных с использованием набора соединений в образце, полученном от пациента с раком почки, по сравнению с референсным образцом указывает на то, что пациент может получить пользу от противораковой терапии помимо или в дополнение к антиангиогенной терапии.
10. Набор соединений по п.9, в котором соединения являются полинуклеотидами.
11. Набор соединений по п.9, в котором соединения являются белками.
12. Набор соединений по п.9, в котором с помощью набора соединений можно детектировать все гены или продукты генов, перечисленные в таблице 1.
13. Способ мониторинга прогресса лечения у пациента с раком почки, получающего антиангиогенную терапию, предусматривющий
определение уровней экспрессии одного или нескольких генов или продуктов генов, перечисленных в таблице 2, в образце, полученном от пациента во время первой оценки опухоли,
в котором повышенные уровни экспрессии одного или нескольких генов или продуктов генов во время первой оценки опухоли по сравнению с образцом, полученным от пациента перед или в начале антиангиогенной терапии, указывает на предрасположенность пациента к сниженному клиническому эффекту при одной только антиангиогенной терапии.
14. Способ идентификации пациента с раком почки, который может получить пользу от противораковой терапии помимо или в дополнение к антиангиогенной терапии, предусматривающий
определение уровней экспрессии одного или нескольких генов или продуктов генов, перечисленных в таблице 2, в образце, полученном от пациента во время первой оценки опухоли,
в котором повышенный уровень экспрессии одного или нескольких генов или продуктов генов во время первой оценки опухоли по сравнению с образцом, полученным от пациента перед или в начале антиангиогенной терапии, указывает на то, что пациент может получить пользу от противораковой терапии помимо или в дополнение к антиангиогенной терапии.
15. Способ по п.13 или 14, в котором антиангиогенная терапия предусматривает введение VEGF-специфичного антагониста.
16. Способ по п.15, в котором VEGF-специфичным антагонистом является анти-VEGF антитело.
17. Способ по п.16, в котором анти-VEGF антителом является бевацизумаб.
18. Способ по п.13 или 14, в котором образец, полученный от пациента, представляет собой образец ткани или получен из плазмы.
19. Способ по п.13, в котором сниженный клинический эффект представляет собой короткую выживаемость без развития заболевания, низкую восприимчивость или низкую общую выживаемость.
20. Набор, содержащий матрицу, которая предусматривает полинуклеотиды, способные специфически гибридизоваться с одним или несколькими генами, перечисленным в таблице 2, где набор дополнительно содержит инструкции по использованию указанной матрицы для детекции восприимчивости пациента с раком почки к одной только антиангиогенной терапии, в котором повышенная экспрессия одного или нескольких генов в образце, полученном от пациента во время первой оценки опухоли, по сравнению с образцом, полученным от пациента перед или в начале антиангиогенной терапии, указывает на то, что пациент может получить пользу от противораковой терапии помимо или в дополнение к антиангиогенной терапии.
21. Набор соединений, с помощью которых можно детектировать уровни экспрессии двух или нескольких генов или продуктов генов, перечисленных в таблице 2, в котором повышенная экспрессия двух или нескольких генов или продуктов генов, определенных с использованием набора соединений в образце, полученном от пациента с раком почки во время первого обследования опухоли, по сравнению с образцом, полученным от пациента перед или в начале антиангиогенной терапии, указывает на то, что пациент может получить пользу от противораковой терапии помимо или в дополнение к антиангиогенной терапии.
22. Набор соединений по п.21, в котором соединения являются полинуклеотидами.
23. Набор соединений по п.21, в котором соединения являются белками.
24. Набор соединений по п.21, в котором с помощью набора соединений можно детектировать все гены или продукты генов, перечисленные в таблице 2.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US98688407P | 2007-11-09 | 2007-11-09 | |
| US60/986,884 | 2007-11-09 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2010123381A true RU2010123381A (ru) | 2011-12-20 |
Family
ID=40342593
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2010123381/15A RU2010123381A (ru) | 2007-11-09 | 2008-11-05 | Способ и композиции для диагностического применения у раковых пациентов |
Country Status (13)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US20090123930A1 (ru) |
| EP (1) | EP2222874A2 (ru) |
| JP (1) | JP2011502513A (ru) |
| KR (1) | KR20100095571A (ru) |
| CN (1) | CN101910416A (ru) |
| AU (1) | AU2008324782A1 (ru) |
| BR (1) | BRPI0817158A2 (ru) |
| CA (1) | CA2703258A1 (ru) |
| IL (1) | IL205246A0 (ru) |
| MX (1) | MX2010005057A (ru) |
| RU (1) | RU2010123381A (ru) |
| WO (1) | WO2009061800A2 (ru) |
| ZA (1) | ZA201002808B (ru) |
Families Citing this family (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| MX2012000620A (es) * | 2009-07-13 | 2012-01-27 | Genentech Inc | Metodos diagnostico y composiciones para tratamiento de cancer. |
| CN102612566B (zh) * | 2009-09-17 | 2016-02-17 | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 | 用于癌症患者中诊断学用途的方法和组合物 |
| WO2012010548A1 (en) * | 2010-07-19 | 2012-01-26 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Method to identify a patient with an increased likelihood of responding to an anti-cancer therapy |
| BR112012033162A2 (pt) * | 2010-07-19 | 2016-10-25 | Hoffmann La Roche | método de identificação de pacientes, método de previsão da capacidade de reação de pacientes, método de determinação da probabilidade de um paciente com câncer exibir benefícios de terapia anticâncer, método de otimização da eficácia terapêutica, método de tratamento de câncer, kit e conjunto de compostos |
| SG10201604497UA (en) | 2011-06-02 | 2016-07-28 | Almac Diagnostics Ltd | Molecular Diagnostic Test For Cancer |
| WO2013106765A1 (en) * | 2012-01-13 | 2013-07-18 | Genentech, Inc. | Biological markers for identifying patients for treatment with vegf antagonists |
| KR20150024342A (ko) * | 2012-06-26 | 2015-03-06 | 에프. 호프만-라 로슈 아게 | 유방암을 치료하기 위한 베바시주맙 조합 요법에 대한 혈장 바이오마커 |
| WO2014087156A1 (en) * | 2012-12-03 | 2014-06-12 | Almac Diagnostics Limited | Molecular diagnostic test for cancer |
| US11015190B2 (en) | 2013-09-17 | 2021-05-25 | Lucence Life Sciences Pte Ltd | Method of treating a patient having renal cancer |
| GB201409479D0 (en) | 2014-05-28 | 2014-07-09 | Almac Diagnostics Ltd | Molecular diagnostic test for cancer |
| CA2968406A1 (en) * | 2014-12-09 | 2016-06-16 | Mark D. Ayers | System and methods for deriving gene signature biomarkers of response to pd-1 antagonists |
| KR101903522B1 (ko) * | 2015-11-25 | 2018-11-23 | 한국전자통신연구원 | 다차원 건강데이터에 대한 유사사례 검색 방법 및 그 장치 |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20030027216A1 (en) * | 2001-07-02 | 2003-02-06 | Kiernan Urban A. | Analysis of proteins from biological fluids using mass spectrometric immunoassay |
| US8691506B2 (en) * | 2005-04-13 | 2014-04-08 | Oncotest Gmbh | Gene expression profiles being predictive for the response of tumors to pharmaceutically effective compounds |
| CA2648106A1 (en) * | 2006-03-31 | 2007-11-01 | Bayer Healthcare Llc | Methods for prediction and prognosis of cancer, and monitoring cancer therapy |
-
2008
- 2008-11-05 JP JP2010533204A patent/JP2011502513A/ja not_active Withdrawn
- 2008-11-05 US US12/265,143 patent/US20090123930A1/en not_active Abandoned
- 2008-11-05 BR BRPI0817158 patent/BRPI0817158A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2008-11-05 CN CN2008801243215A patent/CN101910416A/zh active Pending
- 2008-11-05 KR KR1020107012551A patent/KR20100095571A/ko not_active Application Discontinuation
- 2008-11-05 AU AU2008324782A patent/AU2008324782A1/en not_active Abandoned
- 2008-11-05 MX MX2010005057A patent/MX2010005057A/es not_active Application Discontinuation
- 2008-11-05 CA CA2703258A patent/CA2703258A1/en not_active Abandoned
- 2008-11-05 RU RU2010123381/15A patent/RU2010123381A/ru not_active Application Discontinuation
- 2008-11-05 WO PCT/US2008/082456 patent/WO2009061800A2/en active Application Filing
- 2008-11-05 EP EP08846956A patent/EP2222874A2/en not_active Withdrawn
-
2010
- 2010-04-21 ZA ZA2010/02808A patent/ZA201002808B/en unknown
- 2010-04-22 IL IL205246A patent/IL205246A0/en unknown
- 2010-11-19 US US12/950,824 patent/US20110151468A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| BRPI0817158A2 (pt) | 2015-04-14 |
| IL205246A0 (en) | 2010-12-30 |
| ZA201002808B (en) | 2011-07-27 |
| US20110151468A1 (en) | 2011-06-23 |
| CA2703258A1 (en) | 2009-05-14 |
| WO2009061800A2 (en) | 2009-05-14 |
| EP2222874A2 (en) | 2010-09-01 |
| CN101910416A (zh) | 2010-12-08 |
| WO2009061800A3 (en) | 2009-07-16 |
| JP2011502513A (ja) | 2011-01-27 |
| KR20100095571A (ko) | 2010-08-31 |
| US20090123930A1 (en) | 2009-05-14 |
| MX2010005057A (es) | 2010-05-19 |
| AU2008324782A1 (en) | 2009-05-14 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2010123381A (ru) | Способ и композиции для диагностического применения у раковых пациентов | |
| Heppt et al. | Prognostic factors and treatment outcomes in 444 patients with mucosal melanoma | |
| Keysar et al. | Regulation of head and neck squamous cancer stem cells by PI3K and SOX2 | |
| Lambrechts et al. | Markers of response for the antiangiogenic agent bevacizumab | |
| Tan et al. | Predicting the response to neoadjuvant therapy for early-stage breast cancer: tumor-, blood-, and imaging-related biomarkers | |
| WO2009121031A4 (en) | Methods of novel therapeutic candidate identification through gene expression analysis in vascular-related diseases | |
| JP2011502513A5 (ru) | ||
| Pepin et al. | Gene-expression profiling of microdissected breast cancer microvasculature identifies distinct tumor vascular subtypes | |
| Nishiwaki et al. | Impact of post-transplant imatinib administration on Philadelphia chromosome-positive acute lymphoblastic leukaemia | |
| Cowey et al. | The loss of radiographic enhancement in primary renal cell carcinoma tumors following multitargeted receptor tyrosine kinase therapy is an additional indicator of response | |
| Hsu et al. | A four-gene signature from NCI-60 cell line for survival prediction in non–small cell lung cancer | |
| WO2017210699A1 (en) | Methods for predicting risk of recurrence and/or metastasis in soft tissue sarcoma | |
| Ring et al. | Clinical and biological aspects of disseminated tumor cells and dormancy in breast cancer | |
| Au et al. | Expression of ankyrin repeat and SOCS box containing 4 (ASB4) confers migration and invasion properties of hepatocellular carcinoma cells | |
| Stangl-Kremser et al. | Development of a prognostic model for survival time prediction in castration-resistant prostate cancer patients | |
| van Soest et al. | The natural history and outcome predictors of metastatic castration-resistant prostate Cancer | |
| Puente et al. | Novel potential predictive markers of sunitinib outcomes in long-term responders versus primary refractory patients with metastatic clear-cell renal cell carcinoma | |
| Tang et al. | Epidemiologic characteristics, prognostic factors, and treatment outcomes in primary central nervous system lymphoma: a SEER-based study | |
| Kim et al. | Effect of fibroblast growth factor-2 and its receptor gene polymorphisms on the survival of patients with hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma | |
| JP2011527575A5 (ru) | ||
| Cobb et al. | Obesity and altered angiogenic-related gene expression in endometrial cancer | |
| Yan et al. | Molecular biomarker‐guided anti‐angiogenic targeted therapy for malignant glioma | |
| Wu et al. | Down-regulation of EGFL8: a novel prognostic biomarker for patients with colorectal cancer | |
| Napoletano et al. | Immunological and clinical impact of cancer stem cells in vulvar cancer: role of CD133/CD24/ABCG2-expressing cells | |
| Wu et al. | Down-regulation of EGFL8: a novel biomarker for advanced gastric cancer |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20130729 |