RU2009124227A - Олигонуклеотид и его конъюгат для детекции белков в амилоидном состоянии и способ детекции белков в амилоидном состоянии - Google Patents
Олигонуклеотид и его конъюгат для детекции белков в амилоидном состоянии и способ детекции белков в амилоидном состоянии Download PDFInfo
- Publication number
- RU2009124227A RU2009124227A RU2009124227/10A RU2009124227A RU2009124227A RU 2009124227 A RU2009124227 A RU 2009124227A RU 2009124227/10 A RU2009124227/10 A RU 2009124227/10A RU 2009124227 A RU2009124227 A RU 2009124227A RU 2009124227 A RU2009124227 A RU 2009124227A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- oligonucleotide
- proteins
- amyloid
- yeast
- conjugate
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/115—Aptamers, i.e. nucleic acids binding a target molecule specifically and with high affinity without hybridising therewith ; Nucleic acids binding to non-nucleic acids, e.g. aptamers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/16—Aptamers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/46—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
- G01N2333/47—Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
- G01N2333/4701—Details
- G01N2333/4709—Amyloid plaque core protein
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/28—Neurological disorders
- G01N2800/2814—Dementia; Cognitive disorders
- G01N2800/2821—Alzheimer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/28—Neurological disorders
- G01N2800/2814—Dementia; Cognitive disorders
- G01N2800/2828—Prion diseases
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
1. Олигонуклеотид для детекции белков в амилоидном состоянии, содержащий нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей, приведенных в Перечне последовательностей под номерами SEQ ID NO: 1-4. ! 2. Олигонуклеотид по п.1, отличающийся тем, что белками в амилоидном состоянии являются прионогенные белки дрожжей и млекопитающих. ! 3. Конъюгат олигонуклеотида по п.1 с молекулой, позволяющей детектировать связывание олигонуклеотида с прионами дрожжей и млекопитающих. ! 4. Конъюгат олигонуклеотида по п.3, отличающийся тем, что в качестве указанной молекулы используют флуоресцирующий реагент или фермент, выбранный из группы, состоящей из пероскидаз и люцифераз. ! 5. Конъюгат олигонуклеотида по п.3, отличающийся тем, что используют конъюгат олигонуклеотида с биотином, а в качестве молекулы, позволяющей детектировать связывание олигонуклеотида с прионами дрожжей и млекопитающих, используют фермент, выбранный из группы, состоящей из пероскидаз и люцифераз, слитой со стрептовидином или авидином. ! 6. Способ детекции белков в амилоидном состоянии, включающий стадии получения образца культуры дрожжей или ткани млекопитающего и изучения связывания олигонуклеотидов по п.1 или конъюгата олигонуклеотида по п.3 с указанным образцом. ! 7. Способ по п.6, отличающийся тем, что белками в амилоидном состоянии являются прионогенные белки дрожжей и млекопитающих. ! 8. Способ по п.6, отличающийся тем, что детектируют амилоид или прион дрожжей Sup35. ! 9. Способ по п.6, отличающийся тем, что детектируют прион коров PrP. ! 10. Способ по п.6, отличающийся тем, что детектируют амилоид, образованный полиглутаминовыми белка
Claims (13)
1. Олигонуклеотид для детекции белков в амилоидном состоянии, содержащий нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей, приведенных в Перечне последовательностей под номерами SEQ ID NO: 1-4.
2. Олигонуклеотид по п.1, отличающийся тем, что белками в амилоидном состоянии являются прионогенные белки дрожжей и млекопитающих.
3. Конъюгат олигонуклеотида по п.1 с молекулой, позволяющей детектировать связывание олигонуклеотида с прионами дрожжей и млекопитающих.
4. Конъюгат олигонуклеотида по п.3, отличающийся тем, что в качестве указанной молекулы используют флуоресцирующий реагент или фермент, выбранный из группы, состоящей из пероскидаз и люцифераз.
5. Конъюгат олигонуклеотида по п.3, отличающийся тем, что используют конъюгат олигонуклеотида с биотином, а в качестве молекулы, позволяющей детектировать связывание олигонуклеотида с прионами дрожжей и млекопитающих, используют фермент, выбранный из группы, состоящей из пероскидаз и люцифераз, слитой со стрептовидином или авидином.
6. Способ детекции белков в амилоидном состоянии, включающий стадии получения образца культуры дрожжей или ткани млекопитающего и изучения связывания олигонуклеотидов по п.1 или конъюгата олигонуклеотида по п.3 с указанным образцом.
7. Способ по п.6, отличающийся тем, что белками в амилоидном состоянии являются прионогенные белки дрожжей и млекопитающих.
8. Способ по п.6, отличающийся тем, что детектируют амилоид или прион дрожжей Sup35.
9. Способ по п.6, отличающийся тем, что детектируют прион коров PrP.
10. Способ по п.6, отличающийся тем, что детектируют амилоид, образованный полиглутаминовыми белками, в частности гентингтином.
11. Способ по п.6, отличающийся тем, что связывание олигонуклеотидов по п.1 с указанным образцом определяют методом гибридизации или методом ПЦР, в частности ПЦР в реальном времени.
12. Способ по п.6, отличающийся тем, что связывание конъюгата олигонуклеотида по п.2 с указанным образцом определяют методом флуориметрии.
13. Способ по п.6, отличающийся тем, что связывание конъюгата олигонуклеотида по п.4 или 5 с указанным образцом определяют путем измерения активности фермента.
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2009124227/10A RU2009124227A (ru) | 2009-06-25 | 2009-06-25 | Олигонуклеотид и его конъюгат для детекции белков в амилоидном состоянии и способ детекции белков в амилоидном состоянии |
| PCT/RU2009/000435 WO2010151169A1 (ru) | 2009-06-25 | 2009-08-28 | Олигонуклеотид и его конъюгат для детекции белков в амилоидном состоянии и способ детекции белков в амилоидном состоянии |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2009124227/10A RU2009124227A (ru) | 2009-06-25 | 2009-06-25 | Олигонуклеотид и его конъюгат для детекции белков в амилоидном состоянии и способ детекции белков в амилоидном состоянии |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2009124227A true RU2009124227A (ru) | 2010-12-27 |
Family
ID=43386745
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2009124227/10A RU2009124227A (ru) | 2009-06-25 | 2009-06-25 | Олигонуклеотид и его конъюгат для детекции белков в амилоидном состоянии и способ детекции белков в амилоидном состоянии |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2009124227A (ru) |
| WO (1) | WO2010151169A1 (ru) |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2003001211A1 (en) * | 2001-06-22 | 2003-01-03 | MAX-PLANCK-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. | Method for testing the presence of prion proteins in tissue and culture samples |
| JP2009511023A (ja) * | 2005-10-06 | 2009-03-19 | ユニバーシティー、オブ、デラウェア | ハンチントン病の治療のためのｇに富むポリヌクレオチド |
| WO2008033451A2 (en) * | 2006-09-13 | 2008-03-20 | Whitehead Institute For Biomedical Research | Protein aggregation domains from prions and methods of use thereof |
-
2009
- 2009-06-25 RU RU2009124227/10A patent/RU2009124227A/ru not_active Application Discontinuation
- 2009-08-28 WO PCT/RU2009/000435 patent/WO2010151169A1/ru active Application Filing
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2010151169A1 (ru) | 2010-12-29 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Jiang et al. | G-quadruplex fluorescent probe-mediated real-time rolling circle amplification strategy for highly sensitive microRNA detection | |
| AU2010242867B2 (en) | A non-target amplification method for detection of RNA splice-forms in a sample | |
| CN109207567B (zh) | 一种基于适配体和链置换扩增反应对金黄色葡萄球菌的测定方法 | |
| DK2500436T3 (en) | A method, probe and kit for in situ hybridization of DNA and use thereof | |
| DK2836607T3 (en) | DETECTION OF IMMUNOGLOBULIN LIGHT CHAIN RESTRICTION BY RNA IN SITU HYBRIDIZATION | |
| RU2014122607A (ru) | Способы определения восприимчивости пациента к внутрибольничной инфекции и составления прогноза развития септического синдрома | |
| US10018633B2 (en) | Multi-aptamer-based, cell-specific, one-step tumor cell detection assays | |
| CN111073892A (zh) | 一种识别石斑鱼虹彩病毒感染细胞的核酸适配体及其构建方法和应用 | |
| ES2608313T3 (es) | Identificación de resistencia antibiótica en microorganismos | |
| CN111073891A (zh) | 一种检测石斑鱼虹彩病毒的核酸适配体及其构建方法和应用 | |
| CN110643611A (zh) | 一种核酸适配体及其构建方法和其在检测石斑鱼虹彩病毒中的应用 | |
| US10751359B2 (en) | Nucleic acid aptamer specifically binding to avian influenza virus subtype H5 and method of detecting avian ifluenza virus subtype H5 using the same | |
| Rohde et al. | Detection of foodborne bacterial zoonoses by fluorescence in situ hybridization | |
| JP6623572B2 (ja) | 微生物の検査方法、微生物の検査キット、及び微生物検査用マイクロアレイ | |
| KR101438531B1 (ko) | 대장균에 특이적으로 결합하는 단일가닥핵산 앱타머 및 이를 이용한 대장균 검출방법 | |
| RU2014102106A (ru) | Композиции, способы и наборы для гибридизации нуклеиновой кислоты | |
| RU2009124227A (ru) | Олигонуклеотид и его конъюгат для детекции белков в амилоидном состоянии и способ детекции белков в амилоидном состоянии | |
| US11279971B2 (en) | In situ cell analysis in cell culture system | |
| MY149655A (en) | Detection and enumeration of microorganisms | |
| RU2010125875A (ru) | Олигонуклеотид и его конъюгат для детекции белков в амилоидном состоянии и способ детекции белков в амилоидном состоянии | |
| CN111118014B (zh) | 一种抗虹彩病毒的核酸适配体及其构建方法和应用 | |
| RU2011137486A (ru) | Аберрантная митохондриальная днк, ассоциированные с ней слитые транскрипты, продукты трансляции и гибрадизационные зонды | |
| CN102808022B (zh) | 特异识别沙门氏菌的寡核苷酸适配子的用途 | |
| CN106053403B (zh) | 一种蛋白定量检测方法 | |
| WO2006116303A3 (en) | Fluorescent multiplex hpv pcr assays |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA93 | Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination) |
Effective date: 20120626 |