RU2006122632A - Биомаркеры для оценки эффективности лечения кальцитонином и паратиреоидным гормоном - Google Patents

Биомаркеры для оценки эффективности лечения кальцитонином и паратиреоидным гормоном Download PDF

Info

Publication number
RU2006122632A
RU2006122632A RU2006122632/15A RU2006122632A RU2006122632A RU 2006122632 A RU2006122632 A RU 2006122632A RU 2006122632/15 A RU2006122632/15 A RU 2006122632/15A RU 2006122632 A RU2006122632 A RU 2006122632A RU 2006122632 A RU2006122632 A RU 2006122632A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
protein
kinase
type
alpha
gene expression
Prior art date
Application number
RU2006122632/15A
Other languages
English (en)
Inventor
Мари БОБАДИЛЛЬЯ (FR)
Мария БОБАДИЛЛЬЯ
Original Assignee
Новартис АГ (CH)
Новартис Аг
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Новартис АГ (CH), Новартис Аг filed Critical Новартис АГ (CH)
Publication of RU2006122632A publication Critical patent/RU2006122632A/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • A61K38/22—Hormones
    • A61K38/23—Calcitonins
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • A61K38/22—Hormones
    • A61K38/29—Parathyroid hormone (parathormone); Parathyroid hormone-related peptides
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/08—Drugs for skeletal disorders for bone diseases, e.g. rachitism, Paget's disease
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/08—Drugs for skeletal disorders for bone diseases, e.g. rachitism, Paget's disease
    • A61P19/10—Drugs for skeletal disorders for bone diseases, e.g. rachitism, Paget's disease for osteoporosis
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers

Claims (49)

1. Применение кальцитонина для приготовления лекарственного средства, предназначенного для лечения состояния, для лечения которого показано применение анаболического агента.
2. Применение по п.1, где состояние представляет собой атеросклероз.
3. Применение по п.1 или 2, где кальцитонин представляет собой кальцитонин лосося.
4. Применение кальцитонина для приготовления лекарственного средства, предназначенного для лечения нарушений метаболизма кальция у выбранной популяции пациентов, где популяцию пациентов выбирают на основе профиля генной экспрессии, который является индикатором эффективности кальцитонина для пациента, которому вводят кальцитонин.
5. Применение по п.4, где кальцитонин представляет собой кальцитонин лосося.
6. Применение по п.4 или 5, где кальцитонин вводят в терапевтической дозе перед анализом профиля генной экспрессии у пациента.
7. Применение по п.4 или 5, где кальцитонин вводят в субтерапевтической дозе перед анализом профиля генной экспрессии у пациента.
8. Применение паратиреоидного гормона или аналога паратиреоидного гормона для приготовления лекарственного средства, предназначенного для лечения нарушений метаболизма кальция у выбранной популяции пациентов, где популяцию пациентов выбирают на основе профиля генной экспрессии, который является индикатором эффективности паратиреоидного гормона или аналога паратиреоидного гормона для пациента, которому вводят паратиреоидный гормон или аналог паратиреоидного гормона.
9. Применение по п.8, где аналог паратиреоидного гормона представляет собой PTS893.
10. Применение по п.8 или 9, где паратиреоидный гормон или аналог паратиреоидного гормона вводят в терапевтической дозе перед анализом профиля генной экспрессии у пациента.
11. Применение по п.8 или 9, где паратиреоидный гормон или аналог паратиреоидного гормона вводят в субтерапевтической дозе перед анализом профиля генной экспрессии у пациента.
12. Способ лечения состояния у индивидуума, для лечения которого показано введение кальцитонина, паратиреоидного гормона, аналога паратиреоидного гормона или их комбинации, заключающийся в том, что
(а) вводят соединение индивидууму;
(б) получают профиль генной экспрессии индивидуума, где профиль генной экспрессии представляет собой профиль генной экспрессии одного или нескольких генов, причем профили экспрессии одного или нескольких генов являются результатом введения соединения; и (в) сравнивают профиль генной экспрессии индивидуума, которому вводили соединение, с профилем генной экспрессии биомаркера, который является индикатором эффективности лечения кальцитонином, паратиреоидным гормоном, аналогом паратиреоидного гормона или их комбинацией, при этом сходство профиля генной экспрессии индивидуума, которому вводили соединение, с профилем генной экспрессии биомаркера является индикатором эффективности лечения соединением.
13. Способ по п.12, в котором состояние представляет собой состояние, при котором показано применение кальцитонина лосося.
14. Способ по п.12, в котором состояние представляет собой состояние, при котором показано применение PTS893.
15. Способ по одному из пп.12-14, в котором вводимое соединение представляет собой кальцитонин, паратиреоидный гормон, аналог паратиреоидного гормона или их комбинацию.
16. Способ по п.15, в котором кальцитонин представляет собой кальцитонин лосося.
17. Способ по п.15, в котором аналог паратиреоидного гормона представляет собой PTS893.
18. Способ по одному из пп.12-14, в котором индивидуум представляет собой млекопитающее.
19. Способ по п.18, в котором млекопитающее представляет собой примата.
20. Способ по п.19, в котором примат представляет собой яванского макака или человека.
21. Способ по одному из пп.12-14, в котором профиль генной экспрессии биомаркера представляет собой исходный профиль генной экспрессии индивидуума до введения соединения.
22. Способ по одному из пп.12-14, в котором профиль генной экспрессии биомаркера представляет собой профиль генной экспрессии или усредненные профили генной экспрессии позвоночного, которому уже был введен кальцитонин, паратиреоидный гормон, аналог паратиреоидного гормона или их комбинация.
23. Способ по одному из пп.12-14, в котором профиль генной экспрессии представляет собой профиль одного или нескольких генов, выбранных из группы генов, которые кодируют такие продукты как: изоформа а кислой фосфатазы 1; рецептор 1 активина А, подобный рецептору типа II; предшественник рецептора типа IIB активина А; С-цепь активина бета; гликопротеин альфа 2 HS; амелогенин; аннексии V; предшественник арилсульфатазы Е; вакуолярная АТФаза Н(+); субъединица вакуолярной АТФазы Н(+); АТФаза, Н+-транспортная, лизосомальная; АТФаза, Н+-транспортирующая, лизосомальная; АТФаза, Н+-транспортирующая, лизосомальная; бигликан; белок 1, участвующий в остеогенезе; белок 10, участвующий в остеогенезе; белок 2А, участвующий в остеогенезе; белок 5, участвующий в остеогенезе; предшественник белка 6, участвующего в остеогенезе; связывающий кальций белок 1 (кальбраин); зависимая от кальция/кальмодулина протеинкиназа (СаМ-киназа) II гамма; кальретикулин; модулятор реактивного элемента цАМФ (CREM); угольная дегидрогеназа I; угольная дегидрогеназа II; предшественник хрящевого олигомерного матриксного белка; катепсин K; катепсин W; CDC-подобная киназа 1; изоформа hclk2/139 CDC-подобной киназы 2; хондроитинсульфатпротеогликан 2 (версикан); хондроитинсульфатпротеогликан 3 (нейрокан); хорионический соматомаммотропный гормон 1; химотрипсин С (кальдекрин); слитый транскрипт коллагена типа 1 и PDGFB; коллаген типа II, альфа 1; коллаген типа III, альфа 1; коллаген типа IV, альфа 2; коллаген типа IX, альфа 1; коллаген типа VI, альфа 1; коллаген типа VI, альфа 2 (АА 570998); коллаген типа XI, альфа 1; коллаген типа XI, альфа 2; коллаген типа XI, альфа 2; коллаген типа I, альфа 2; коллаген типа IV, альфа 1; коллаген типа IX, альфа 2; коллаген типа V, альфа 2; коллаген типа VI, альфа 1; предшественник коллагена типа VI, альфа 1; коллаген типа XVI, альфа 1; коллаген типа XVI, альфа 1; коллагеназа 3 (матриксная металлопротеиназа 13); фактор роста соединительной ткани; циклин А2; циклин В1; циклин D2; циклин Е2; зависимая от циклина киназа 5; регуляторная субъединица 1 зависимой от циклина киназы 5 (р35); зависимая от циклина киназа 6; ингибитор 1А зависимой от циклина киназы (р21, Cip1); цистатин В (стефин В); индуцируемая цитокином киназа; связанная с гибелью протеинкиназа 1; связанная с гибелью протеинкиназа 3; кислый фосфопротеин 1 дентинового матрикса (DMP1); фосфатаза 9 с двойной специфичностью; связанная с миотонической дистрофией протеинкиназа; эктонуклеотидная пирофосфатаза/фосфодиэстераза 1; эктонуклеотидная пирофосфатаза/фосфодиэстераза 1; предшественник связанного с рецептором 6 протеина G эндотелиальной дифференцировки; рецептор эстрогена; белок, связанный с рецептором эстрогена; реагирующий на эстроген белок В-бокса (ЕВВР); белок активации фибробластов; фактор 1 роста фибробластов (кислый); фактор 18 роста фибробластов; фактор 4 роста фибробластов; рецептор фактора роста фибробластов; фоллистатин типа 1; фоллистатин типа 1; глутаматный рецептор 1, метаботропный; компонент Gpi1 N-ацетилглюкозаминилтрансферазы GPI1; колониестимулирующий фактор гранулоцитов и макрофагов (CSF1); прекращающий рост и индуцируемый повреждением ДНК фактор альфа; белок 10, связанный с рецептором фактора роста; гепарансульфатпротеогликан 2 (перлекан); рецептор типа 1 инозит-1,4,5-трифосфата; рецептор типа 1 инозит-1,4,5-трифосфата; рецептор типа 2 инозит-1,4,5-трифосфата; изофермент инозит-1,4,5-трифосфат-3-киназы; инозитполифосфатат-4-фосфатаза типа I бета; инозитполифосфат-5-фосфатаза; инозит(мио) 1 (или 4)-монофосфатаза 1; инозит(мио) 1 (или 4)-монофосфатаза 2; инсулиноподобный фактор роста (IGF II); инсулиноподобный фактор роста 2 (соматомедин А); белок, связывающий инсулиноподобный фактор роста; белок 2, связывающий инсулиноподобный фактор роста; белок 3, связывающий инсулиноподобный фактор роста; белок 5, связывающий инсулиноподобный фактор роста; белок 2, связывающий инсулиноподобный фактор роста; предшественник инсулиноподобного фактора роста II; предшественник инсулиноподобного фактора роста II; субъединица интегрина альфа 10; киназа, ассоциированная с рецептором интерлейкина 1; киназа 3 Janus; LIM-белок (аналогичный неизвестному белку, связывающему крысиную протеинкиназу С); белок, подобный лизилоксидазе; MAD, направленный против материнского организма декапентаплегический гомолог 3; MAGUK (ассоциированные с мембраной гомологи гуанилаткиназы; МАР-киназа-киназа-киназа (МТК1); МАРК13: активируемая митогеном протеинкиназа 13; MAPK8IP1: белок 1, взаимодействующий с активируемой митогеном протеинкиназой 8; MEK-киназа; металлопротеиназа; активируемая митогеном протеинкиназа 1; активируемая митогеном протеинкиназа 8; активируемая митогеном протеинкиназа-киназа 1; активируемая митогеном протеинкиназа-киназа-киназа-киназа 4; активируемая протеинкиназой, активируемой митогеном, протеинкиназа 2; активируемая протеинкиназой, активируемой митогеном, протеинкиназа 3; MMD: фактор, ассоциированный с дифференцировкой моноцита в макрофаг; нейрохондрин; цитоплазматический, зависящий от кальцинеурина ядерный фактор 1 активированных Т-клеток; белок OS 4 (OS 4); специфический для остеобластов фактор 2, OSF 2os (периостин); фактор стимуляции остеокластов (OSF); РАK4; ассоциированный с PDGF белок; фосфатидилинозит-4-киназа, каталитическая, бета-полипептид; фосфатидилинозитгликан класса L; фосфатидилинозитполифосфат-5-фосфатаза, изоформа b; фосфатидилинозит-4-фосфатат-5-киназа, изоформа С (1); фосфатидилинозит-4-фосфатат-5-киназа, тип I, бета; фосфатидилинозит-4-фосфатат-5-киназа, тип II, бета; фосфатидилинозитгликан класса С (PIG С); фосфодиэстераза 4А, цАМФ-специфическая; фосфодиэстераза 4D, цАМФ-специфическая (гомолог кодируемой геном dunce (Drosophila) фосфодиэстеразы Е3); фосфодиэстераза IB, кальмодулинзависимая; фосфоинозитид-3-киназа; фосфоинозитид-3-киназа, каталитическая, гамма-полипептид; фосфоинозитид-3-киназа класса 3; фосфолипаза С b3; фосфолипаза С, бета 4; фосфолипаза D; белок-переносчик фосфотидилинозита; протеинкиназа D2, PKD2; препроколлаген типа I альфа 2; препроколлаген типа I, альфа 1; проколлаген альфа 1, типа II; проколлаген-лизин-5-диоксигеназа; проколлаген-пролин, 2-оксоглютарат-4-диоксигеназа (пролин-4-гидроксилаза), альфа-полипептид I; ассоциированный с прогестагеном эндометриальный белок (плацентарный белок 14, ассоциированный с беременностью, эндометриальный альфа 2-глобулин, маточный альфа-белок); пролидаза (имидодипептидаза) PEPD; ядерный антиген пролиферирующих клеток; пролил-4-гидроксилаза бета; протеаза, сериновая, 11 (IGF-связывающая); протеасомная (просома, макропаин) субъединица, бета типа, 10; белковый ингибитор активированных STAT X; протеинкиназа 1 PCTAIRE; субстрат 80К Н протеинкиназы С; протеинкиназа С, альфа; протеинкиназа, цАМФ-зависимая, каталитическая, гамма; протеинкиназа, цАМФ-зависимая, регуляторная, тип I, бета; протеинкиназа, цАМФ-зависимая, регуляторная, тип II, альфа; пуринергический рецептор P2Y, связанный с протеином G, 11; субстрат 2 связанного с Ras токсина ботулизма С3, RAC2 (семейство rho, малый связывающий ГТФ белок Rac2); рецептор тирозинкиназы DDR; рецептор ретиноида X, гамма; киназа рибосомного белка S6; киназа рибосомного белка S6, 90 кДа, полипептид 3; SCAMP1: секреторный мембранный белок-носитель 1 (везикулярный транспорт); секретируемый фосфопротеин 1 (остеопонтин, костный сиалопротеин I, белок 1 ранней активации Т-лимфоцитов); ингибитор сериновой (или цистеиновой) протеиназы, таксой Н (белок 47 теплового шока), представитель 2; сериновая/треониновая киназа 38; сериновая/треониновая протеинкиназа; SF 1: стероидогенный фактор 1; трансдуктор сигнала и активатор транскрипции 1; трансдуктор сигнала и активатор транскрипции 2, 113 кДа; трансдуктор сигнала и активатор транскрипции 5А; трансдуктор сигнала и активатор транскрипции 5А; трансдуктор сигнала и активатор транскрипции 6; (STAT6); Smad 3; «Smad-якорь» для рецепторной активации, изоформа 1; Smad5; SMAD6 (ингибирует ВМР/Smad1 (MADH1); связанная с SNF 1 киназа; фактор транскриции SpiB (связанный с SPI1/PU.1); Stat5b (stat5b); связанная с Ste20 сериновая/треониновая киназа; TEIG: индуцируемый TGFB фактор раннего ростового ответа; индуцируемый TGFB фактор раннего ростового ответа; TIEG: индуцируемый TGFB1 антиапоптозный фактор 1; индуцируемый TGF-бета белок 12 апоптоза; предшественник TGF-бета; белок из суперсемейства TGF-бета; Tob: подобная «ершику» киназа 1; рецептор III трансформирующего фактора роста, бета (бетагликан, 300 кДа); трансформирующий фактор роста бета 3 (TGF бета 3); TRIO: тройной функциональный домен (взаимодействующий с PTPRF); тубулин альфа 1; тубулин альфа 3; тубулин альфа изотипа Н2 альфа; тубулин бета 2; тубулин бета 3; тубулин бета 4; тубулин бета, кофактор D; предшественник типа VI цепи альфа-2-коллагена; белок-носитель Е2С убикитина; сосудистый эндотелиальный фактор роста; сосудистый эндотелиальный фактор роста; сосудистый эндотелиальный фактор роста В; и связывающий Y-бокс белок 1.
24. Способ по п.23, в котором профиль генной экспрессии включает повышение уровня одного или нескольких генов, выбранных из группы, включающей гены, которые кодируют белок 5, участвующий в остеогенезе; хрящевой олигомерный матриксный белок; катепсин K; препроколлаген типа I альфа-2; и белок, связывающий Y-бокс (костный и почечный).
25. Способ по п.23, в котором профиль генной экспрессии в костной ткани включает снижение уровня одного или нескольких генов, выбранных из группы, включающей гены, которые кодируют угольную дегидрогеназу II; Spi-B; и белок, связывающий Y-бокс (мышечный).
26. Способ по п.23, в котором профиль генной экспрессии в костной ткани включает один или несколько генов, выбранных из группы, которая включает PU.1 (SPI1; Spi-B); колониестимулирующий фактор гранулоцитов и макрофагов (CSF1) и белок, ассоциированный с дифференцировкой моноцита в макрофаг (MMD).
27. Способ по п.23, в котором профиль генной экспрессии в костной ткани включает изменение экспрессии фактора стимуляции остеокластов (OSF).
28. Способ по п.23, в котором профиль генной экспрессии в костной ткани включает изменение экспрессии сосудистого эндотелиального фактора роста (VEGF).
29. Способ по п.23, в котором профиль генной экспрессии в костной ткани включает изменение экспрессии гена, выбранного из группы, включающей гены, которые кодируют интегрины; коллагеназу; матриксные металлопротеиназы I и II; эндопептидазу/протеиназу проколлагена; лизилгидроксилазу; аггрекан; предшественник хрящевого олигомерного матриксного белка; коллагены типа I, типа II, типа III, типа IV, типа V, типа VI, типа IX, типа X, типа XI, типа XIII, типа XIV, типа XV и типа XVI; хондроитинсульфатпротеогликан; дерматопонтин; гепарансульфатпротеогликан и синдекан.
30. Способ по п.23, в котором профиль генной экспрессии в костной ткани включает изменение экспрессии гена, выбранного из группы, включающей гены, которые кодируют амелогенин; дентин; эктонуклеотидные пирофосфатазы и VEGF.
31. Способ отбора индивидуумов для включения в клинический опыт для определения эффективности соединения в отношении лечения состояния, представляющего собой состояние, при котором показано введение кальцитонина, паратиреоидного гормона, аналога паратиреоидного гормона или их комбинации, заключающийся в том, что (а) вводят соединение индивидууму; (б) получают профиль генной экспрессии индивидуума, где профиль генной экспрессии включает схему генной экспрессии одного или нескольких генов, где схемы экспрессии одного или нескольких генов являются результатом введения соединения;
(в) сравнивают профиль генной экспрессии индивидуума, которому вводили соединение, и профиль генной экспрессии биомаркера; и (г) затем (I) включают индивидуума в клинический опыт, когда профиль генной экспрессии индивидуума, которому вводили соединение, сходен с профилем генной экспрессии биомаркера, который является индикатором эффективности обработки кальцитонином, паратиреоидным гормоном, аналогом паратиреоидного гормона или их комбинации; или
(II) исключают индивидуума из клинического опыта, когда профиль генной экспрессии у индивидуума, которому вводили соединение, несходен с профилем генной экспрессии биомаркера, который является индикатором эффективности лечения кальцитонином, паратиреоидным гормоном, аналогом паратиреоидного гормона или их комбинацией.
32. Способ по п.31, в котором соединение вводят индивидууму в субтерапевтической дозе.
33. Способ определения обладает ли соединение терапевтической эффективностью, сходной с эффективностью кальцитонина, заключающийся в том, что
(а) вводят соединение индивидууму; (б) получают профиль генной экспрессии индивидуума, где профиль генной экспрессии включает схему генной экспрессии одного или нескольких генов, где схемы экспрессии одного или нескольких генов являются результатом введения соединения;
(в) сравнивают профиль генной экспрессии индивидуума, которому вводили соединение, и профиль генной экспрессии биомаркера, который является индикатором эффективности обработки кальцитонином; и (г) затем (I) определяют, что соединение обладает терапевтической эффективностью, сходной с эффективностью кальцитонина, когда профиль генной экспрессии индивидуума, которому вводили соединение, сходен с профилем генной экспрессии биомаркера у индивидуума, которому вводят кальцитонин; или (II) определяют, что соединение обладает терапевтической эффективностью, отличной от эффективности кальцитонина, когда профиль генной экспрессии индивидуума, которому вводили соединение, отличен от профиля генной экспрессии биомаркера у индивидуума, которому вводят кальцитонин.
34. Способ по п.33, в котором кальцитонин представляет собой кальцитонин лосося.
35. Способ по п.33 или 34, в котором индивидуум представляет собой млекопитающее.
36. Способ по п.35, в котором млекопитающее представляет собой примата.
37. Способ по п.36, в котором примат представляет собой яванского макака или человека.
38. Способ по одному из пп.33 и 34, в котором соединение вводят индивидууму в субтерапевтической дозе.
39. Способ определения обладает ли соединение терапевтической эффективностью, сходной с эффективностью аналога паратиреоидного гормона, заключающийся в том, что
(а) вводят соединение индивидууму; (б) получают профиль генной экспрессии индивидуума, где профиль генной экспрессии включает схему генной экспрессии одного или нескольких генов, где схемы экспрессии одного или нескольких генов являются результатом введения соединения;
(в) сравнивают профиль генной экспрессии индивидуума, которому вводили соединение, и профиль генной экспрессии биомаркера, который является индикатором эффективности обработки аналогом паратиреоидного гормона; и (г) затем (I) определяют, что соединение обладает терапевтической эффективностью, сходной с эффективностью аналога паратиреоидного гормона, когда профиль генной экспрессии индивидуума, которому вводили соединение, сходен с профилем генной экспрессии биомаркера у индивидуума, которому вводят аналог паратиреоидного гормона; или
(II) определяют, что соединение обладает терапевтической эффективностью, отличной от эффективности аналога паратиреоидного гормона, когда профиль генной экспрессии индивидуума, которому вводили соединение, отличен от профиля генной экспрессии биомаркера у индивидуума, которому вводят аналог паратиреоидного гормона.
40. Способ по п.39, в котором аналог паратиреоидного гормона представляет собой PTS893.
41. Способ по п.39 или 40, в котором индивидуум представляет собой млекопитающее.
42. Способ по п.41, в котором млекопитающее представляет собой примата.
43. Способ по п.42, в котором примат представляет собой яванского макака или человека.
44. Способ по п.39, в котором соединение вводят индивидууму в субтерапевтической дозе.
45. Набор для определения эффективности лечения состояния, для которого показано введение кальцитонина, паратиреоидного гормона или аналога паратиреоидного гормона, содержащий:
(а) реагент для обнаружения биомаркера эффективности лечения состояния, для которого показано введение кальцитонина, паратиреоидного гормона или аналога паратиреоидного гормона; (б) контейнер для реагента и (в) письменную инструкцию, находящуюся на контейнере или внутри него, в которой описано применение биомаркера для определения стратегии лечения состояния.
46. Набор по п.45, в котором реагент представляет собой генный чип.
47. Набор по п.45, в котором реагент представляет собой зонд для гибридизации.
48. Набор по п.45, в котором реагент представляет собой реагент для амплификации гена.
49. Набор по одному из пп.45-48, где биомаркер представляет собой один или несколько генов, выбранных из группы генов, кодирующий следующие продукты: изоформа а кислой фосфатазы 1; рецептор 1 активина А, подобный рецептору типа II; предшественник рецептора типа IIB активина А; С-цепь активина бета; альфа 2 HS-гликопротеин; амелогенин; аннексии V; предшественник арилсульфатазы Е; вакуолярная АТФаза Н(+); субъединица вакуолярной АТФазы Н(+); АТФаза, Н(+)-транспортная, лизосомальная; АТФаза, Н(+)-транспортирующая, лизосомальная; АТФаза, Н+-транспортирующая, лизосомальная; бигликан; белок 1, участвующий в остеогенезе; белок 10, участвующий в остеогенезе; белок 2А, участвующий в остеогенезе; белок 5, участвующий в остеогенезе; предшественник белка 6, участвующего в остеогенезе; связывающий кальций белок 1 (кальбраин); зависимая от кальция/кальмодулина протеинкиназа (СаМ-киназа) II гамма; кальретикулин; модулятор реактивного элемента цАМФ (CREM); угольная дегидрогеназа I; угольная дегидрогеназа II; предшественник хрящевого олигомерного матриксного белка; катепсин К; катепсин W; CDC-подобная киназа 1; изоформа hclk2/139 CDC-подобной киназы 2; хондроитинсульфатпротеогликан 2 (версикан); хондроитинсульфатпротеогликан 3 (нейрокан); хорионический соматомаммотропный гормон 1; химотрипсин С (кальдекрин); слитый транскрипт коллагена типа 1 и PDGFB; коллаген типа II, альфа 1; коллаген типа III, альфа 1; коллаген типа IV, альфа 2; коллаген типа IX, альфа 1; коллаген типа VI, альфа 1; коллаген типа VI, альфа 2 (АА 570998); коллаген типа XI, альфа 1; коллаген типа XI, альфа 2; коллаген типа XI, альфа 2; коллаген типа I, альфа 2; коллаген типа IV, альфа 1; коллаген типа IX, альфа 2; коллаген типа V, альфа 2; коллаген типа VI, альфа 1; предшественник коллагена типа VI, альфа 1; коллаген типа XVI, альфа 1; коллаген типа XVI, альфа 1; коллагеназа 3 (матриксная металлопротеиназа 13); фактор роста соединительной ткани; циклин А2; циклин В1; циклин D2; циклин Е2; зависимая от циклина киназа 5; регуляторная субъединица 1 зависимой от циклина киназы 5 (р35); зависимая от циклина киназа 6; ингибитор 1А зависимой от циклина киназы (р21, Cip1); цистатин В (стефин В); индуцируемая цитокином киназа; связанная с гибелью протеинкиназа 1; связанная с гибелью протеинкиназа 3; кислый фосфопротеин 1 дентинового матрикса (DMP1); фосфатаза 9 с двойной специфичностью; связанная с миотонической дистрофией протеинкиназа; эктонуклеотидная пирофосфатаза/фосфодиэстераза 1; эктонуклеотидная пирофосфатаза/фосфодиэстераза 1; предшественник связанного с рецептором 6 протеина G эндотелиальной дифференцировки; рецептор эстрогена; рецептор эстрогена; белок, связанный с рецептором эстрогена; реагирующий на эстроген белок В-бокса (ЕВВР); белок активации фибробластов; фактор 1 роста фибробластов (кислый); фактор 18 роста фибробластов; фактор 4 роста фибробластов; рецептор фактора роста фибробластов; фоллистатин типа 1; фоллистатин типа 1; глутаматный рецептор 1, метаботропный; компонент Gpi1 N-ацетилглюкозаминилтрансферазы GPI1; колониестимулирующий фактор гранулоцитов и макрофагов (CSF1); фактор альфа, прекращающий рост и индуцируемый повреждением ДНК; белок 10, связанный с рецептором фактора роста; гепарансульфатпротеогликан 2 (перлекан); рецептор типа 1 инозит-1,4,5-трифосфата; рецептор типа 1 инозит-1,4,5-трифосфата; рецептор типа 2 инозит-1,4,5-трифосфата; изофермент инозит-1,4,5-трифосфат-3-киназы; инозитполифосфатат-4-фосфатаза типа I бета; инозитполифосфат-5-фосфатаза; инозит(мио) 1 (или 4)-монофосфатаза 1; инозит(мио) 1 (или 4)-монофосфатаза 2; инсулиноподобный фактор роста (IGF II); инсулиноподобный фактор роста 2 (соматомедин А); белок, связывающий инсулиноподобный фактор роста; белок 2, связывающий инсулиноподобный фактор роста; белок 3, связывающий инсулиноподобный фактор роста; белок 5, связывающий инсулиноподобный фактор роста; белок 2, связывающий инсулиноподобный фактор роста; предшественник инсулиноподобного фактора роста II; предшественник инсулиноподобного фактора роста II; субъединица интегрина альфа 10; киназа, ассоциированная с рецептором интерлейкина 1; киназа 3 Janus; LIM-белок (аналогичный неизвестному белку, связывающему крысиную протеинкиназу С); белок, подобный лизилоксидазе; MAD, направленный против материнского организма декапентаплегический гомолог 3; MAGUK (ассоциированные с мембраной гомологи гуанилаткиназы; МАР-киназа-киназа-киназа (МТК1); МАРК13: активируемая митогеном протеинкиназа 13; MAPK8IP1: белок 1, взаимодействующий с активируемой митогеном протеинкиназой 8; МЕК-киназа; металлопротеиназа; активируемая митогеном протеинкиназа 1; активируемая митогеном протеинкиназа 8; активируемая митогеном протеинкиназа-киназа 1; активируемая митогеном протеинкиназа-киназа-киназа-киназа 4; активируемая протеинкиназой, активируемой митогеном, протеинкиназа 2; активируемая протеинкиназой, активируемой митогеном, протеинкиназа 3; MMD: фактор, ассоциированный с дифференцировкой моноцита в макрофаг; нейрохондрин; цитоплазматический, зависящий от кальцинеурина ядерный фактор 1 активированных Т-клеток; белок OS 4 (OS 4); специфический для остеобластов фактор 2, OSF 2os (периостин); фактор стимуляции остеокластов (OSF); PAK4; белок, ассоциированный с PDGF; фосфатидилинозит-4-киназа, каталитическая, бета-полипептид; фосфатидилинозитгликан класса L; фосфатидилинозитполифосфат-5-фосфатаза, изоформа b; фосфатидилинозит-4-фосфатат-5-киназа, изоформа С (1); фосфатидилинозит-4-фосфатат-5-киназа, тип I, бета; фосфатидилинозит-4-фосфатат-5-киназа, тип II, бета; фосфатидилинозитгликан класса С (PIG С); фосфодиэстераза 4А, цАМФ-специфическая; фосфодиэстераза 4D, цАМФ-специфическая (гомолог кодируемой геном dunce (Drosophila) фосфодиэстеразы Е3); фосфодиэстераза IB, кальмодулинзависимая; фосфоинозитид-3-киназа; фосфоинозитид-3-киназа, каталитическая, гамма-полипептид; фосфоинозитид-3-киназа класса 3; фосфолипаза С b3; фосфолипаза С, бета 4; фосфолипаза D; белок-переносчик фосфотидилинозита; протеинкиназа D2, PKD2; препроколлаген типа I альфа 2; препроколлаген типа I, альфа 1; проколлаген альфа 1, тип II; проколлаген-лизин-5-диоксигеназа; проколлаген-пролин, 2-оксоглютарат-4-диоксигеназа (пролин-4-гидроксилаза), альфа-полипептид I; ассоциированный с прогестагеном эндометриальный белок (плацентарный белок 14, ассоциированный с беременностью, эндометриальный альфа 2-глобулин, маточный альфа-белок); пролидаза (имидодипептидаза) PEPD; ядерный антиген пролиферирующих клеток; пролил-4-гидроксилаза бета; протеаза, сериновая, 11 (IGF-связывающая); протеасомная (просома, макропаин) субъединица, бета тип, 10; белковый ингибитор активированных STAT X; протеинкиназа 1 PCTAIRE; субстрат 80К Н протеинкиназы С; протеинкиназа С, альфа; протеинкиназа, цАМФ-зависимая, каталитическая, гамма; протеинкиназа, цАМФ-зависимая, регуляторная, тип I, бета; протеинкиназа, цАМФ-зависимая, регуляторная, тип II, альфа; пуринергический рецептор P2Y, связанный с G-протеином, 11; субстрат 2 связанного с Ras токсина ботулизма С3, RAC2 (семейство rho, малый связывающий ГТФ белок Rac2); рецептор тирозинкиназы DDR; рецептор ретиноида X, гамма; киназа рибосомного белка S6; киназа рибосомного белка S6, 90 кДа, полипептид 3; SCAMP1: секреторный мембранный белок-носитель 1 (везикулярный транспорт); секретируемый фосфопротеин 1 (остеопонтин, костный сиалопротеин I, белок 1 ранней активации Т-лимфоцитов); ингибитор сериновой (или цистеиновой) протеиназы, таксой Н (белок 47 теплового шока), представитель 2; сериновая/треониновая киназа 38; сериновая/треониновая протеинкиназа; SF 1: стероидогенный фактор 1; трансдуктор сигнала активатор транскрипции 1; трансдуктор сигнала и активатор транскрипции 2, 113 кДа; трансдуктор сигнала и активатор транскрипции 5А; трансдуктор сигнала и активатор транскрипции 5А; трансдуктор сигнала и активатор транскрипции 6; (STAT6); Smad 3; «Smad-якорь» для рецепторной активации, изоформа 1; Smad5; SMAD6 (ингибирует ВМР/Smad1 (MADH1); связанная с SNF 1 киназа; фактор транскриции SpiB (связанный с SPI1/PU.1); Stat5b (stat5b); связанная с Ste20 сериновая/треониновая киназа; TEIG: индуцируемый TGFB фактор раннего ростового ответа; индуцируемый TGFB фактор раннего ростового ответа; TIEG: индуцируемый TGFB1 антиапоптозный фактор 1; индуцируемый TGF-бета белок 12 апоптоза; предшественник TGF-бета; белок из суперсемейства TGF-бета; Tob: подобная «ершику» киназа 1; рецептор III трансформирующего фактора роста, бета (бетагликан, 300 кДа); трансформирующий фактор роста бета 3 (TGF бета 3); TRIO: тройной функциональный домен (взаимодействующий с PTPRF); тубулин альфа 1; тубулин альфа 3; тубулин альфа изотипа Н2 альфа; тубулин бета 2; тубулин бета 3; тубулин бета 4; кофактор D тубулина бета; предшественник типа VI цепи альфа-2-коллагена; белок-носитель Е2С убикитина; сосудистый эндотелиальный фактор роста; сосудистый эндотелиальный фактор роста; сосудистый эндотелиальный фактор роста В и связывающий Y-бокс белок 1.
RU2006122632/15A 2003-11-25 2004-11-24 Биомаркеры для оценки эффективности лечения кальцитонином и паратиреоидным гормоном RU2006122632A (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US52502503P 2003-11-25 2003-11-25
US60/525,025 2003-11-25

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2006122632A true RU2006122632A (ru) 2008-02-10

Family

ID=34652293

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2006122632/15A RU2006122632A (ru) 2003-11-25 2004-11-24 Биомаркеры для оценки эффективности лечения кальцитонином и паратиреоидным гормоном

Country Status (12)

Country Link
US (1) US20070099828A1 (ru)
EP (1) EP1689427A1 (ru)
JP (1) JP2007522100A (ru)
KR (1) KR20060110304A (ru)
CN (1) CN1905894A (ru)
AU (1) AU2004294268A1 (ru)
BR (1) BRPI0416945A (ru)
CA (1) CA2546111A1 (ru)
IL (1) IL175575A0 (ru)
MX (1) MXPA06005950A (ru)
RU (1) RU2006122632A (ru)
WO (1) WO2005053731A1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2012125914A1 (en) * 2011-03-16 2012-09-20 University Of Delaware Injectable delivery system for heparan sulfate binding growth factors

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP5528461B2 (ja) * 2008-10-17 2014-06-25 エフ．ホフマン−ラ ロシュ アーゲー 心不全の評価におけるビグリカンの使用
EP2496948B1 (en) * 2009-11-05 2018-01-10 University of Virginia Patent Foundation Compositions and methods for detecting plectin-1 as a biomarker for cancer
CN112748241A (zh) * 2019-10-16 2021-05-04 浙江中医药大学附属第二医院 一种用于检测i型骨质疏松症的蛋白芯片及其制作方法与应用
CN112574991B (zh) * 2020-12-17 2023-03-17 安徽师范大学 一种寡核苷酸、载体及制备方法和应用

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS59175437A (ja) * 1983-03-25 1984-10-04 Teikoku Hormone Mfg Co Ltd 高コレステロ−ル血症改善剤
US4692433A (en) * 1983-10-12 1987-09-08 The Regents Of The University Of California Method and composition for regulating serum calcium levels of mammals
US5514365A (en) * 1988-10-11 1996-05-07 Schiapparelli Salute S.P.A. Pharmaceutical compositions comprising calcitonin for intranasal administration
JPH02229119A (ja) * 1989-02-28 1990-09-11 Toyo Jozo Co Ltd 動脈硬化予防および治療剤
AU2001292905A1 (en) * 2000-09-19 2002-04-02 Curagen Corporation Method of identifying osteoregenerative agents using differential gene expression
CN1526025A (zh) * 2001-05-16 2004-09-01 ��˹��ŵ�� 作为预后和治疗靶标的乳腺癌中表达的基因
US7384736B2 (en) * 2001-09-06 2008-06-10 Decode Genetics Ehf. Methods for predicting drug sensitivity in patients afflicted with an inflammatory disease
EP1470246A2 (en) * 2001-10-31 2004-10-27 Novartis AG Methods to treat diabetes and related conditions based on polymorphisms in the tcf1 gene

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2012125914A1 (en) * 2011-03-16 2012-09-20 University Of Delaware Injectable delivery system for heparan sulfate binding growth factors
US9597412B2 (en) 2011-03-16 2017-03-21 University Of Delaware Injectable delivery system for heparan-binding growth factors

Also Published As

Publication number Publication date
BRPI0416945A (pt) 2007-02-13
US20070099828A1 (en) 2007-05-03
WO2005053731A1 (en) 2005-06-16
IL175575A0 (en) 2006-09-05
CA2546111A1 (en) 2005-06-16
AU2004294268A1 (en) 2005-06-16
JP2007522100A (ja) 2007-08-09
CN1905894A (zh) 2007-01-31
KR20060110304A (ko) 2006-10-24
EP1689427A1 (en) 2006-08-16
MXPA06005950A (es) 2006-07-06

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Ozmeric Advances in periodontal disease markers
Carinci et al. Zirconium oxide: analysis of MG63 osteoblast-like cell response by means of a microarray technology
Graham et al. The effect of calcium hydroxide on solubilisation of bio-active dentine matrix components
Soter Mastocytosis and the skin
Dahlen Role of suspected periodontopathogens in microbiological monitoring of periodontitis
Boushell et al. Immunohistochemical localization of matrixmetalloproteinase-2 in human coronal dentin
Ibrahim et al. Gene-expression profile of collagen-induced arthritis
EP1402068A2 (en) Evaluation of ultraviolet radiation damage to skin using new genemarkers, methods and compositions related thereto
Ingman et al. Salivary collagenase, elastase‐and trypsin‐like proteases as biochemical markers of periodontal tissue destruction in adult and localized juvenile periodontitis
Kadkhodazadeh et al. Analysis of RANKL gene polymorphism (rs9533156 and rs2277438) in Iranian patients with chronic periodontitis and periimplantitis
Tsai et al. The upregulation of insulin-like growth factor-1 in oral submucous fibrosis
Popat et al. Gingival crevicular fluid levels of Matrix Metalloproteinase-1 (MMP-1) and Tissue Inhibitor of Metalloproteinase-1 (TIMP-1) in periodontal health and disease
Qu et al. Effect of enamel matrix derivative on proliferation and differentiation of osteoblast cells grown on the titanium implant surface
RU2006122632A (ru) Биомаркеры для оценки эффективности лечения кальцитонином и паратиреоидным гормоном
Elżbieta et al. Salivary enzyme activity in anorexic persons—a controlled clinical trial
TWI481870B (zh) 用於軟組織疾病診斷及作為用於口腔保健干預的標靶之蛋白質生物標記
US20050244448A1 (en) Diagnosis and treatment of disorders of collagen and elastin metabolism
Ballo et al. Duchenne and Becker muscular dystrophy prevalence in South Africa and molecular findings in 128 persons affected
Hannig et al. Intrinsic enzymatic crosslinking and maturation of the in situ pellicle
Sugano et al. Detection of Streptococcus anginosus and 8-hydroxy-deoxyguanosine in saliva
Dhahbi et al. Hepatic gene expression profiling of streptozotocin-induced diabetes
Koria et al. Gene expression profile of tissue engineered skin subjected to acute barrier disruption
Sharipovna et al. Etiopatogenetic factors in the development of parodontal diseases in post-menopasis women
Parlak et al. Statherin and alpha-amylase levels in saliva from patients with gingivitis and periodontitis
Shimizu et al. Microarray and quantitative RT-PCR analyses in calcium-channel blockers induced gingival overgrowth tissues of periodontitis patients

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20090518