RU2006107565A - Специфичные в отношении прионов пептидные реагенты - Google Patents
Специфичные в отношении прионов пептидные реагенты Download PDFInfo
- Publication number
- RU2006107565A RU2006107565A RU2006107565/15A RU2006107565A RU2006107565A RU 2006107565 A RU2006107565 A RU 2006107565A RU 2006107565/15 A RU2006107565/15 A RU 2006107565/15A RU 2006107565 A RU2006107565 A RU 2006107565A RU 2006107565 A RU2006107565 A RU 2006107565A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- peptide reagent
- sample
- prion
- peptide
- pathogenic
- Prior art date
Links
Landscapes
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Claims (55)
1. Выделенный пептидный реагент, который преимущественно взаимодействует с патогенными формами белка конформационного заболевания по сравнению с непатогенными формами белка конформационного заболевания.
2. Пептидный реагент по п.1, где конформационное заболевание представляет собой прионное заболевание, а патогенный белок представляет собой PrPSc, и непатогенный белок представляет собой PrPС.
3. Пептидный реагент по п.2, где пептидный реагент получают из фрагмента пептидного белка.
4. Пептидный реагент по п.3, где пептидный реагент содержит полипролиновый спиральный мотив II типа.
5. Пептидный реагент по п.1, где пептидный реагент содержит мотив последовательности PXXP, в котором P представляет собой пролин или N-замещенный глицин, и X представляет собой любую аминокислоту.
6. Пептидный реагент по п.2, где пептидный реагент содержит мотив последовательности PXXP, в котором P представляет собой пролин или N-замещенный глицин, и X представляет собой любую аминокислоту.
7. Пептидный реагент по п.1, где указанный пептидный реагент кодируется генетически.
8. Пептидный реагент по п.2, где пептидный реагент получают из пептида, выбранного из группы, включающей пептиды с SEQ ID NO: 12-132.
9. Пептидный реагент по п.8, где пептидный реагент получают из пептида, выбранного из группы, включающей пептиды с SEQ ID NO: 66, 67, 68, 72, 81, 96, 97, 98, 107, 108, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 14, 35, 36, 37, 40, 50, 51, 77, 89, 100, 101, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 128, 129, 130, 131, 132, 56, 57, 65, 82 и 84.
10. Пептидный реагент по п.8, где пептидный реагент получают из пептида, выбранного из группы, включающей пептиды с SEQ ID NO: 66, 67, 68, 72, 81, 96, 97, 98, 107, 108, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126 и 127.
11. Пептидный реагент по п.8, где пептидный реагент включает в себя аминокислотную последовательность (G)n, где n = 1, 2, 3 или 4, с N-конца и/или C-конца.
12. Пептидный реагент по п.9 или 10, где пептидный реагент биотинилирован.
13. Пептидный реагент по п.8, где пептидный реагент получают из пептида, выбранного из группы, включающей пептиды с SEQ ID NO: 14, 35, 36, 37, 40, 50, 51, 77, 89, 100, 101, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 128, 129, 130, 131 и 132.
14. Пептидный реагент по п.13, где пептидный реагент включает в себя аминокислотную последовательность (G)n, где n = 1, 2, 3 или 4, с N-конца и/или C-конца.
15. Пептидный реагент по п.13 или 14, где пептидный реагент биотинилирован.
16. Пептидный реагент по п.8, где пептидный реагент получают из пептида, выбранного из группы, включающей пептиды с SEQ ID NO: 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 129, 130, 131, и 132.
17. Пептидный реагент по п.16, где пептидный реагент биотинилирован.
18. Пептидный реагент по п.8, где пептидный реагент получают из пептида, выбранного из группы, включающей пептиды с SEQ ID NO: 56, 57, 65, 82, и 84.
19. Пептидный реагент по п.18, где пептидный реагент биотинилирован.
20. Полинуклеотид, кодирующий пептидный реагент по п.7.
21. Комплекс, содержащий пептидный реагент по любому из пп.2-19 и патогенный прионный белок.
22. Способ обнаружения в образце патогенного приона, предусматривающий
(a) контакт образца, в котором предполагается наличие патогенного приона, с первым пептидным реагентом по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16, в условиях, которые обеспечивают связывание первого пептидного реагента с патогенным прионным белком, если он присутствует, с образованием первого комплекса; и
(b) обнаружение патогенного приона, если он есть, в образце путем его связывания с первым пептидным реагентом.
23. Способ по п.22, в котором указанный первый пептидный реагент является меченным и может быть обнаружен.
24. Способ по п.22, в котором указанный первый пептидный реагент биотинилирован.
25. Способ по п.22, в котором указанный первый пептидный реагент присоединен к твердой основе.
26. Способ обнаружения в образце патогенного приона, предусматривающий
(a) контактирование образца, в котором предполагается наличие патогенного приона, с первым пептидным реагентом по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16, в условиях, которые обеспечивают связывание первого пептидного реагента с патогенным прионом, если он присутствует, с образованием первого комплекса;
(b) контактирование указанного первого комплекса со вторым пептидным реагентом по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16, в условиях, которые обеспечивают связывание второго пептидного реагента с патогенным прионом в указанном первом комплексе, где указанный второй пептидный реагент включает в себя выявляемую метку; и
(c) обнаружение патогенного приона, если он есть, в образце путем его связывания со вторым пептидным реагентом.
27. Способ по п.26, в котором указанный первый пептидный реагент и указанный второй пептидный реагент различны.
28. Способ по п.26, в котором указанный первый пептидный реагент и указанный второй пептидный реагент одинаковы.
29. Способ по п.26, в котором указанный первый пептидный реагент присоединен к твердой основе.
30. Способ по п.26, в котором указанный первый пептид биотинилирован.
31. Способ обнаружения в образце патогенного приона, предусматривающий
(a) контактирование образца, в котором предполагается наличие патогенного приона, с первым пептидным реагентом по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16, в условиях, которые обеспечивают связывание первого пептидного реагента с патогенным прионом, если он присутствует, с образованием первого комплекса;
(b) удаление несвязанных материалов образца;
(c) диссоциацию указанного патогенного приона с указанного первого комплекса;
(d) контактирование указанного диссоциированного патогенного приона со вторым пептидным реагентом по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16, в условиях, которые обеспечивают связывание второго пептидного реагента с патогенным прионом, где указанный второй пептидный реагент включает в себя выявляемую метку; и
(e) обнаружение патогенного приона, если он есть, в образце за счет его связывания со вторым пептидным реагентом.
32. Способ обнаружения в образце патогенного приона, предусматривающий
(a) контактирование образца, в котором предполагается наличие патогенного приона, с первым пептидным реагентом по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16, в условиях, которые обеспечивают связывание первого пептидного реагента с патогенным прионом, если он присутствует, с образованием первого комплекса;
(b) удаление несвязанных материалов образца;
(c) диссоциацию указанного патогенного приона с указанного первого комплекса;
(d) контактирование указанного диссоциированного патогенного приона со связывающим прион реагентом в условиях, которые обеспечивают связывание связывающего прион реагента с патогенным прионом, где указанный связывающий прион реагент включает в себя выявляемую метку; и
(e) обнаружение патогенного приона, если он есть, в образце за счет его связывания со связывающим прион реагентом.
33. Способ по п.32, где связывающий прион реагент выбран из группы, включающей антитела против приона, гибридные полипептиды с привитым мотивом, катионные или анионные полимеры, катализаторы размножения и плазминоген.
34. Способ обнаружения в образце патогенного приона, предусматривающий
(a) контактирование образца, в котором предполагается наличие патогенного приона, со связывающим прион реагентом в условиях, которые обеспечивают связывание связывающего прион реагента с патогенным прионом, если он присутствует, с образованием первого комплекса;
(b) удаление несвязанных материалов образца;
(с) контактирование указанного первого комплекса с пептидным реагентом по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16, в условиях, которые обеспечивают связывание пептидного реагента с патогенным прионом, где указанный пептидный реагент включает в себя выявляемую метку; и
(d) обнаружение патогенного приона, если он есть, в образце за счет его связывания с пептидным реагентом.
35. Способ обнаружения в образце патогенного приона, предусматривающий
(a) получение твердой основы, содержащей первый пептидный реагент по любому из пп. 2, 8, 9, 10, 13 или 16;
(b) контактирование твердой основы с образцом в условиях, которые обеспечивают связывание патогенных прионов, если они присутствуют в данном образце, с первым пептидным реагентом; контактирование твердой основы с меченным и способным к визуализации вторым пептидным реагентом по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16, в условиях, которые обеспечивают связывание второго пептидного реагента с патогенными прионами, связанными с первым пептидным реагентом; и
(c) выявление комплексов, образованных между первым пептидным реагентом, патогенным прионом из образца и вторым пептидным реагентом, с обнаруджением за счет этого наличия патогенного приона в образце.
36. Способ обнаружения в образце патогенного приона, предусматривающий
(a) получение твердой основы, содержащей связывающий прион реагент;
(b) контактирование твердой основы с образцом в условиях, которые обеспечивают связывание прионных белков, если они присутствуют в данном образце, со связывающим прион реагентом;
(c) контактирование твердой основы с меченным и способным к визуализации вторым пептидным реагентом по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16; и
(d) выявление комплексов, образованных между связывающим прион реагентом, патогенным прионом из биологического образца, и вторым пептидным реагентом.
37. Способ обнаружения в образце патогенного приона, предусматривающий
(a) получение твердой основы, содержащей первый пептидный реагент по любому из пп. 2, 8, 9, 10, 13 или 16;
(b) контактирование твердой основы с меченным и способным к визуализации первым лигандом, причем сродство связывания первого пептидного реагента с меченным и способным к визуализации первым лигандом слабее, чем сродство связывания первого пептидного реагента с патогенным прионом;
(c) комбинирование образца с твердой основой в условиях, которые позволяют патогенному приону, когда он присутствует в образце, связываться с первым пептидным реагентом и вытеснять первый лиганд; и
(d) выявление комплексов, образованных между первым пептидным реагентом и патогенным прионом из образца.
38. Способ по п.25, в котором твердая основа выбрана из группы, включающей нитроцеллюлозу, полистирольный латекс, поливинилфторид, диазотированную бумагу, нейлоновые мембраны, активированные гранулы и отвечающие на магнитное поле гранулы.
39. Способ по п.22, в котором образец представляет собой биологический образец.
40. Способ по п.39, в котором биологический образец выбран из группы, включающей органы, цельную кровь, фракцию крови, компоненты крови, плазму, тромбоциты, сыворотку, цереброспинальную жидкость (ЦСЖ), ткань головного мозга, ткань нервной системы, мышечную ткань, костный мозг, мочу, слезы, не относящиеся к ткани нервной системы, органы и/или продукты биопсии или некропсии.
41. Способ по п.40, в котором биологический образец представляет собой цельную кровь, плазму, тромбоциты, фракции крови или сыворотку.
42. Твердую основу, содержащую по меньшей мере один пептидный реагент по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16.
43. Набор для обнаружения в образце патогенного приона, содержащий
(a) твердую основу по п.42, и другие необходимые реагенты и, необязательно, положительные и отрицательные контроли.
44. Композиция, содержащая пептидный реагент по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16.
45. Композиция, содержащая полинуклеотид по п.20.
46. Способ лечения или профилактики прионного заболевания, предусматривающий введение животному одной или нескольких композиций по п.44.
47. Способ по п.46, где индивидуум представляет собой млекопитающее.
48. Способ по п.47, в котором млекопитающее представляет собой человека.
49. Способ по п.46, в котором композиция вводится внутримышечно, через слизистую оболочку, интраназально, подкожно, внутрикожно, чрезкожно, интравагинально, интраректально, перорально или внутривенно.
50. Способ лечения или профилактики прионного заболевания, предусматривающий
(a) введение первой композиции, содержащей композицию по любому из п.44, на первичной стадии; и
(b) введение второй композиции, содержащей композицию по любому из п.44, в качестве стимулирующей стадии, в количестве, достаточном для индукции иммунного ответа индивидууму.
51. Способ выделения из образца патогенного прионного белка, предусматривающий
(a) получение твердой основы, содержащей пептидный реагент по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16;
(b) контактирование указанного образца с указанной твердой основой в условиях, которые обеспечивают связывание патогенного прионного белка, если он присутствует в указанном образце, с указанным первым пептидным реагентом, для образования первого комплекса; и
(c) удаление несвязанных материалов образца.
52. Способ по п.51, дополнительно предусматривающий стадию диссоциации указанного патогенного прионного белка с указанного первого комплекса.
53. Способ элиминации из образца патогенных прионных белков, включающий в себя
(a) получение твердой основы, содержащей пептидный реагент по любому из пп.2, 8, 9, 10, 13 или 16;
(b) контактирование указанной твердой основы с образцом, в котором предполагается наличие патогенных прионных белков, в условиях, которые обеспечивают связывание патогенных прионных белков, если они присутствуют, с пептидным реагентом; и
(c) получение несвязанных материалов образца.
54. Способ получения продукта крови, который, по существу, лишен патогенных прионов, причем указанный продукт крови включает в себя цельную кровь, плазму, тромбоциты или сыворотку, указанный способ предусматривает
(a) скрининг аликвот цельной крови, плазмы, тромбоцитов или сыворотки из собранных образцов крови способом по п.22;
(b) элиминацию образцов, в которых обнаружены патогенные прионы; и
(c) комбинирование образцов, в которых не обнаружены патогенные прионы, для получения продукта крови, по существу, лишенного патогенных прионов.
55. Способ получения продукта питания, который по существу лишен патогенных прионов, причем указанный способ предусматривает
(a) скрининг образца, взятого из живых организмов, которые пойдут на продукты питания, или образца, взятого из пищи, предназначенного для снабжения питанием, способом по п.22;
(b) элиминацию образцов, в которых обнаружены патогенные прионы; и
(c) комбинирование образцов, в которых не обнаружены патогенные прионы, для предоставления продукта питания, по существу, лишенного патогенных прионов.
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US49496203P | 2003-08-13 | 2003-08-13 | |
| US60/494,962 | 2003-08-13 | ||
| US57036804P | 2004-05-12 | 2004-05-12 | |
| US60/570,368 | 2004-05-12 | ||
| US60/586,509 | 2004-07-09 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2006107565A true RU2006107565A (ru) | 2006-08-27 |
| RU2381033C2 RU2381033C2 (ru) | 2010-02-10 |
Family
ID=37061179
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2006107565/15A RU2381033C2 (ru) | 2003-08-13 | 2004-08-13 | Специфичные в отношении прионов пептидные реагенты |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2381033C2 (ru) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2486517C1 (ru) * | 2012-02-27 | 2013-06-27 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Кемеровский технологический институт пищевой промышленности" | Способ диагностики инфекционной губчатой энцефалопатии животных методом иммуно-пцр |
-
2004
- 2004-08-13 RU RU2006107565/15A patent/RU2381033C2/ru not_active IP Right Cessation
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2381033C2 (ru) | 2010-02-10 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP2008529537A5 (ru) | ||
| JP2012080899A5 (ru) | ||
| DE69434117T2 (de) | Verfahren zur typisierung von hepatitis c viren und dafür zu verwendende reagenzien | |
| WO2001055364A8 (en) | Nucleic acids, proteins, and antibodies | |
| WO2002086070A2 (en) | Binding molecules for fc-region polypeptides | |
| AU2002254683A1 (en) | Binding molecules for Fc-region polypeptides | |
| EP1117686A4 (en) | METHOD AND MATERIALS FOR DETECTING AND MEASURING DAMAGE CAUSED BY FREE RADICAL DAMAGE | |
| JPH1130615A (ja) | スペクトリン又はその崩壊生成物の分析による細胞壊死検出 | |
| Addeo et al. | Gel electrophoresis and immunoblotting for the detection of casein proteolysis in cheese | |
| JP2017038566A (ja) | エクソソームの精製用組成物 | |
| JP2004154141A (ja) | リステリア検出のための方法および試薬 | |
| JPH05501113A (ja) | ボレリア ブルグドルフェリの抗原性タンパク質 | |
| JP2011520108A5 (ru) | ||
| DE102007025291A1 (de) | Verfahren und Immunabsorbentien zur spezifischen Detektion und Absorption Zöliakie- und Dermatitis herpetiformis assoziierter Antikörper | |
| Rihs et al. | Recombinant Hev b 1: large‐scale production and immunological characterization | |
| RU2006107565A (ru) | Специфичные в отношении прионов пептидные реагенты | |
| KR20000006190A (ko) | 사람장애진단용마커 | |
| WO2002026930A3 (en) | Nucleic acids, proteins, and antibodies | |
| Williams et al. | The dimerization of half-molecule fragments of transferrin | |
| WO2002033420A3 (en) | A urine test for the diagnosis of prion diseases | |
| DE69106141T2 (de) | Non-a non-b sequenzen. | |
| JP2726264B2 (ja) | Ｎ‐ｍｙｃタンパク質のためのアッセイ及び抗体 | |
| RU2572343C2 (ru) | РЕКОМБИНАНТНАЯ ДНК pA4, РЕКОМБИНАНТНАЯ ДНК pQE 30-pA4, ОБЕСПЕЧИВАЮЩИЕ ПОЛУЧЕНИЕ ПОЛИПЕПТИДА A4, ШТАММ Esherichia coli M 15-A4, ТРАНСФОРМИРОВАННЫЙ РЕКОМБИНАНТНОЙ ПЛАЗМИДНОЙ ДНК pQE 30-pA4 И ЭКСПРЕССИРУЮЩИЙ РЕКОМБИНАНТНЫЙ ПОЛИПЕПТИД A4, РЕКОМБИНАНТНЫЙ ПОЛИПЕПТИД A4, ОБЛАДАЮЩИЙ СПОСОБНОСТЬЮ СЕЛЕКТИВНО СВЯЗЫВАТЬ ЧСА, АФФИННЫЕ СОРБЕНТЫ (ВАРИАНТЫ) И СПОСОБЫ УДАЛЕНИЯ ЧСА И IgG ИЗ СЫВОРОТКИ КРОВИ (ВАРИАНТЫ) | |
| EP1068303B1 (en) | Peptide for use in the diagnosis of schizophrenia | |
| RU2203679C2 (ru) | Пептиды tlp комплекса мочеполовой карциномы и их антитела |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20140814 |
|
| NF4A | Reinstatement of patent |
Effective date: 20150827 |
|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20180814 |