RU2006105504A

RU2006105504A - Иммобилизация олигонуклеотидов и белков на гидрогелях, содержащих сахар

Info

Publication number: RU2006105504A
Application number: RU2006105504/13A
Authority: RU
Inventors: Марк СПЕКТОР (US); Марк СПЕКТОР; Дэйвид А. СТИНДЖЕР (US); Дэйвид А. СТИНДЖЕР; Чарльз А. ПАТТЕРСОН (US); Чарльз А. ПАТТЕРСОН; Бретт Д. МАРТИН (US); Бретт Д. МАРТИН; Пол Т. ЧАРЛЬЗ (US); Пол Т. ЧАРЛЬЗ
Original assignee: Те Гавернмент Оф Те Юнайтед Стейтс Оф Америка Эз Репризентед Бай Те Секретари Оф Те Нэви (Us); Те Гавернмент Оф Те Юнайтед Стейтс Оф Америка Эз Репризентед Бай Те Секретари Оф Те Нэви
Priority date: 2003-07-25
Filing date: 2004-05-20
Publication date: 2007-09-10
Also published as: WO2005017180A2; US7785769B2; WO2005017180A3; EP1649037A4; CA2533924A1; JP2006528778A; US20060246499A1; US7785770B2; WO2005017180A8; US20050019884A1; EP1649037A2

Claims

1. Композиция веществ, состоящая из гидрогеля-полимера, содержащего сахар, причем указанный гидрогель представляет собой продукт реакции полимеризации сахара, содержащего способную к полимеризации двойную связью, кросс-линкера, содержащего две или большее число способных к полимеризации двойных связей, и третьего соединения, содержащего способную к полимеризации двойную связью и группу, выбранную из группы, состоящей из амино- или карбоксильной групп.

2. Композиция по п.1, где указанный полимер представлен, вообще, структурой, изображенной на фигуре 1.

3. Композиция по п.1, где указанный кросс-линкер выбирают из группы, состоящей из бис-акриламида, бис-акрилата или бис-виниловых соединений.

4. Композиция по п.1, где указанное третье соединение представляет собой акрил-замещенный олигонуклеотид.

5. Композиция по п.1, где указанный сахар представляет собой сахар, выбранный из группы, состоящей из сахар-акрилата или сахар-метакрилата, представленных (1).

6. Композиция по п.1, где указанный сахар выбирают из группы, состоящей из акрил-моносахаридов, -дисахараидов, -олигосахаридов или -полисахаридов.

7. Композиция по п.1, где указанный сахар представляет собой акрилатное производное олигогидрокси-соединения.

8. Композиция по п.1, где указанный сахар представляет собой 6-акрилоил-β-О-метилгалактопиранозид.

9. Композиция по п.1, где указанный сахар выбирают из группы, состоящей из сахаров фуранозы и пиранозы.

10. Композиция по п.1, где указанный сахар представляет собой α- или β-аномер.

11. Композиция по п.5, где R₁ указанного сахар-акрилата (1) содержит заместитель, выбранный из группы, состоящей из Н, алифатической, ароматической, циклоалифатической группы или углеводного остатка.

12. Композиция по п.1, где указанный гидрогель-полимер имеет содержание воды, по меньшей мере, 90%.

13. Композиция по п.1, где указанный гидрогель-полимер имеет поры размером 0,1-10 мкм или больше.

14. Композиция по п.1, где указанный гидрогель-полимер имеет поры размером, допускающим диффузию в указанный гидрогель молекул размером два микрона.

15. Композиция по п.1, где указанное третье соединение выбирают из группы, состоящей из акриловых или метакриловых кислот, амидов или их производных.

16. Композиция по п.1, где указанное третье соединение выбирают из группы соединений, в которых R₉ на фигуре 1 представляет собой ОН, амино или аминоалкиламин.

17. Композиция по п.15, где указанное третье соединение выбирают из группы, состоящей из N-пропиламино-акриламида или N-пропиламино-метакриламида.

18. Композиция по п.1, где указанное третье соединение представляет собой 2-акриламидогликолевую кислоту.

19. Композиция веществ, состоящая из гидрогеля-полимера, содержащего сахар, причем указанный гидрогель представляет собой продукт реакции полимеризации сахар-акрилата, кросс-линкера бис-акриламида и третьего аминоакрил-содержащего соединения, выбранного из группы, приведенной в п.17.

20. Композиция веществ, состоящая из гидрогеля-полимера, содержащего сахар, причем указанный гидрогель представляет собой продукт реакции полимеризации сахар-акрилата, кросс-линкера бис-акриламида и акриламидогликолевой кислоты.

21. Композиция по п.1, где указанный гидрогель-полимер содержит аминогруппы на главной цепи полимера.

22. Композиция по п.1, где указанный гидрогель-полимер содержит карбоксильные группы на главной цепи полимера.

23. Композиция веществ, содержащая продукт реакции указанных аминогрупп на указанной главной цепи указанного полимера, названного в п.21, с представителем группы, состоящей из олигонуклеотидов или белков.

24. Композиция по п.23, где указанный олигонуклеотид содержит 5'-заместители, выбранные из группы, состоящей из амино-, альдегидной, карбоксильной или фосфорной групп.

25. Композиция по п.23, где указанный белок содержит меченный СY3 энтеротоксин В стафилококка (SEB).

26. Композиция веществ, содержащая продукт реакции указанных карбоксильных групп на указанной главной цепи указанного полимера, названного в п.22, с представителем группы, состоящей из олигонуклеотидов или белков.

27. Способ анализа биомолекул, включающий стадии

a) создания на подложке функциональных акрилатных групп;

b) взаимодействия указанных акрилатных групп указанной подложки с гидрогелем-полимером, выбранным из группы, состоящей из композиций по пп.1, 18 или 19, где указанный гидрогель связывается с указанной стеклянной пластиной через указанные акрилатные группы;

c) взаимодействия указанной анализируемой биомолекулы с указанным гидрогелем с образованием ковалентной связи между указанной биомолекулой и указанным гидрогелем;

d) анализа указанной биомолекулой, ковалентно связанной с указанным гидрогелем.

28. Способ по п.27, где указанная биомолекула представляет собой молекулу ДНК.

29. Способ по п.28, где указанная ДНК содержит до 100000 единиц нуклеотидных оснований.

30. Способ по п.27, где указанная биомолекула представляет собой белок.

31. Способ по п.27, где указанный анализ биомолекул имеет в своей основе биомолекулу, содержащую флуорофорную группу.

32. Способ по п.27, где указанная биомолекула представляет собой CY3-энтеротоксин В стафилококка (SEB).

33. Способ по п.27, где указанный анализ биомолекул имеет в своей основе обычно используемые флуоресцентные, ядерные, магнитные или оптические способы.