RO118451B1 - Polypeptide with dikinase orthophosphate pyruvate activity, dna encoding the same, recombinant vector with said dna and process for modifying a plant by means of said vector - Google Patents
Polypeptide with dikinase orthophosphate pyruvate activity, dna encoding the same, recombinant vector with said dna and process for modifying a plant by means of said vector Download PDFInfo
- Publication number
- RO118451B1 RO118451B1 RO96-00667A RO9600667A RO118451B1 RO 118451 B1 RO118451 B1 RO 118451B1 RO 9600667 A RO9600667 A RO 9600667A RO 118451 B1 RO118451 B1 RO 118451B1
- Authority
- RO
- Romania
- Prior art keywords
- amino acid
- gly
- ppdk
- arg
- sequence
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
- C12N9/1294—Phosphotransferases with paired acceptors (2.7.9)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
- C12N15/8273—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for drought, cold, salt resistance
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Description
RO 118451 ΒRO 118451 B
Prezenta invenție se referă la o polipeptidă cu activitate piruvat ortofosfat dikinazică (denumită în continuare ca “PPDK”), un ADN care o codifică, un vector recombinant conținând ADN-ul, și la un procedeu de transformare a unei plante de Flaveria bidentis sau de porumb, prin intermediul acestui vector.The present invention relates to a polypeptide with pyruvate orthophosphate dikinase activity (hereinafter referred to as "PPDK"), a DNA encoding it, a recombinant vector containing the DNA, and a process for transforming a Flaveria bidentis plant or corn, through this vector.
Plantele C4 au capacități înalte de fotosinteză, în condiții de lumină puternică, temperatură ridicată sau CO2 scăzut. Cu toate acestea, capacitățile lor de fotosinteză sunt mult mai reduse în condiții de temperatură scăzută, cu excepția celor care sunt adaptate la condiții de temperatură scăzută. Deși PPDK (EC 2.7.9.1, care catalizează reacția în care sunt produse AMP, fosfoenolpiruvat și pirofosfat de la ATP, piruvat și ortofosfat) este una dintre cele mai importante enzime din calea C4, activitatea sa nu este suficientă în conformitate cu rata de fotosinteză din țesutul frunzei, astfel că ea este una dintre enzimele care determină rata fixării CO2 în fotosinteză C4. Mai mult decât atât, s-a evidențiat, o dată cu descoperirea acestei enzime, că ea este sensibilă la temperatură scăzută. în cazul PPDK de la porumb, activitatea enzimei are un punct de inflexiune la 11,7°C. Această temperatură coincide cu temperatura limită de creștere a porumbului. Din acestea se consideră că PPDK este una din cauzele care reduc rata de fotosinteză a plantelor C4 la temperatură scăzută. Prin urmare, prin îmbunătățirea sensibilității la temperatură scăzută a PPDK, temperatura limită de creștere a porumbului poate fi scăzută.C 4 plants have high photosynthetic capacities, under strong light, high temperature or low CO 2 conditions. However, their photosynthetic capabilities are much reduced in low temperature conditions, except for those that are adapted to low temperature conditions. Although PPDK (EC 2.7.9.1, which catalyzes the reaction in which AMP, phosphoenolpyruvate and pyrophosphate are produced from ATP, pyruvate and orthophosphate) is one of the most important enzymes in the C 4 pathway, its activity is not sufficient according to the rate of photosynthesis from the leaf tissue, so it is one of the enzymes that determines the rate of CO 2 fixation in C 4 photosynthesis. Moreover, it was revealed, together with the discovery of this enzyme, that it is sensitive to low temperature. in the case of PPDK from maize, the enzyme activity has an inflection point at 11.7°C. This temperature coincides with the limiting temperature for corn growth. From these it is considered that PPDK is one of the causes that reduce the photosynthesis rate of C 4 plants at low temperature. Therefore, by improving the low temperature sensitivity of PPDK, the limiting growth temperature of maize can be lowered.
Flaveria brownii, care este o plantă aparținând familiei Compositae, este clasificată prin tipul intermediar C3/C4 și se știe că PPDK-ul său nu este inactivat substanțial prin tratament cu temperatură scăzută la 0°C (Burnell J.N. “A comparative studyofthe cold-sensitivity of pyruvate, Pi dikinase in Flaveria species”, Plant Ceti Physiol. 31,295-2987 (1990)).Flaveria brownii, which is a plant belonging to the Compositae family, is classified by the C 3 /C 4 intermediate type and its PPDK is known not to be substantially inactivated by low temperature treatment at 0°C (Burnell JN “A comparative study of the cold -sensitivity of pyruvate, Pi dikinase in Flaveria species", Plant Ceti Physiol. 31,295-2987 (1990)).
Prin donarea genei care codifică PPDK de Flaveria brownii, stabilă la temperatură scăzută, și prin transformarea unei plante cu gena, este de așteptat ca rezistența la temperaturi mai scăzute să poată fi atribuită plantei.By cloning the gene encoding the low-temperature-stable Flaveria brownii PPDK and transforming a plant with the gene, it is expected that resistance to lower temperatures can be assigned to the plant.
Invenția de față se referă la o polipeptidă cu activitate piruvat ortofosfat dikinazică, stabilă la temperaturi joase, care conține secvența aminoacidă de la restul aminoacid 832 până la restul aminoacid 955, al secvenței aminoacide nr. 5, cu excepția faptului că unul sau mai multe resturi aminoacide sunt adăugate, deletate sau substituite, aceasta conferind polipeptidei stabilitate la temperaturi joase.The present invention relates to a polypeptide with pyruvate orthophosphate dikinase activity, stable at low temperatures, containing the amino acid sequence from amino acid residue 832 to amino acid residue 955 of amino acid sequence no. 5, except that one or more amino acid residues are added, deleted or substituted, this giving the polypeptide stability at low temperatures.
De asemenea, invenția se referă la un ADN donat, ce codifică polipeptidă defintă mai sus, care are secvența nucleotidică prezentată în secv. nr. 5, cu excepția faptului că una sau mai multe nucleotide sunt adăugate, deletate sau substituite.Also, the invention relates to a cloned DNA, which encodes the polypeptide defined above, which has the nucleotide sequence shown in seq. no. 5, except that one or more nucleotides are added, deleted or substituted.
Acest ADN este introdus într-un vector recombinant, care are o structură prezentată în fig. 1 sau 3 și care poate să exprime, în celula gazdei, o polipeptidă având activitate piruvat ortofosfat dikinazică, stabilă la temperaturi joase.This DNA is inserted into a recombinant vector, which has a structure shown in fig. 1 or 3 and which can express, in the host cell, a polypeptide having pyruvate orthophosphate dikinase activity, stable at low temperatures.
Invenția prezintă un nou procedeu de transformare a unei plante de Flaveria bidentis sau porumb, în care, în calitate de agent transformator, este folosit vectorul recombinant definit mai sus.The invention presents a new process for transforming a Flaveria bidentis or corn plant, in which, as a transforming agent, the recombinant vector defined above is used.
Invenția prezintă avantajul că pune la îndemâna specialiștilor noi mijloace eficiente pentru atribuirea stabilității, la temperaturi scăzute, a plantelor.The invention presents the advantage that it puts at the disposal of specialists new effective means for attributing the stability, at low temperatures, of plants.
în continuare, invenția va fi descrisă în detaliu, cu referire și la fig. 1...3:in the following, the invention will be described in detail, with reference also to fig. 1...3:
- fig. 1 prezintă schematic o metodă de construcție a unui vector de expresie care conține un exemplu de genă PPDK, conform prezentei invenții;- fig. 1 schematically shows a method of constructing an expression vector containing an example PPDK gene, according to the present invention;
- fig. 2 prezintă schimbarea activității enzimei în funcție de timp, când PPDK-ul de Flaveria brownii, Flaveria bidentis și porumb, care s-au exprimat în Escherichia coli, s-au menținut la 0°C; și- fig. 2 shows the change in enzyme activity as a function of time when PPDK of Flaveria brownii, Flaveria bidentis and maize, which were expressed in Escherichia coli, was kept at 0°C; and
- fig. 3 prezintă schematic o metodă de construcție al unui vector de expresie care conține un exemplu de genă PPDK, conform prezentei invenții.- fig. 3 schematically shows a method of constructing an expression vector containing an example PPDK gene, according to the present invention.
RO 118451 ΒRO 118451 B
Pentru a reuși donarea genei complete, s-a studiat intensiv PPDK a Flaveria brownii, 50 determinând secvența nucleotidică a genei și secvența aminoacidă codificată prin aceasta și, pentru identificarea regiunii din gena PPDK care dă stabilitatea la temperatură scăzută, prin aceasta completând invenția de față.To succeed in cloning the complete gene, the Flaveria brownii PPDK was intensively studied, 50 determining the nucleotide sequence of the gene and the amino acid sequence encoded by it, and to identify the region of the PPDK gene that confers low temperature stability, thereby completing the present invention.
Astfel, prezenta invenție prezintă o polipeptidă având activitate PPDK stabilă la temperatură joasă, aceasta având o secvență aminoacidă care este la fel cu secvența amino- 55 acidă a regiunii 1/6 a regiunii întregi C-terminală a polipeptidelor (1) sau (2) care urmează, cu excepția faptului că, cel puțin un rest aminoacid al numitei regiunii 1/6 este substituit cu un alt rest aminoacid, (1) o PPDK având o secvență aminoacidă arătată în SECV ID NR.:1 la 4 din Lista de secvențe; și (2) o polipeptidă care are o secvență aminoacidă cu o omologie nu mai mică de 50%, cu secvență aminoacidă menționată (1), numita polipeptidă având activitate PPDK stabilă la temperatură scăzută.Thus, the present invention provides a polypeptide having stable low-temperature PPDK activity having an amino acid sequence that is the same as the amino acid sequence of the 1/6 region of the entire C-terminal region of polypeptides (1) or (2) which follows, except that at least one amino acid residue of said 1/6 region is substituted with another amino acid residue, (1) a PPDK having an amino acid sequence shown in SEQ ID NO:1 to 4 of the Sequence Listing ; and (2) a polypeptide having an amino acid sequence with no less than 50% homology with said amino acid sequence (1), said polypeptide having low temperature stable PPDK activity.
De asemenea, prezenta invenție prezintă un ADN donat, care codifică polipeptidă având activitate PPDK stabilă la temperatură scăzută conform prezentei invenții. Supli- 65 mentar, invenția de față furnizează date referitoare la un vector recombinant care conține ADN-ul, conform prezentei invenții, care poate exprima, într-o gazdă, o polipeptidă având activitate PPDK stabilă la temperatură scăzută. Suplimentar, invenția de față mai prezintă o plantă care este transformată cu ADN-ul, conform prezentei invenții.The present invention also provides a cloned DNA encoding a polypeptide having low temperature stable PPDK activity according to the present invention. Additionally, the present invention provides data relating to a recombinant vector containing the DNA of the present invention that can express, in a host, a polypeptide having stable PPDK activity at low temperature. Additionally, the present invention features a plant that is transformed with DNA according to the present invention.
Prin invenția de față, s-a donat și secvențat o genă care codifică PPDK având stabi- 70 litate la temperatură scăzută. în plus, s-a identificat, de asemenea, regiunea din genă care dă stabilitate la temperatură joasă. Prin urmare, prin transformarea unei plante având PPDK sensibilă la temperaturi scăzute, cu gena conform prezentei invenții, PPDK-ul sensibil la temperatură scăzută poate fi schimbat cu PPDK stabil la temperatură joasă. Pe lângă acestea, prin încorporarea regiunii menționată mai sus, care atribuie stabilitate la temperatură joasă 75 în regiunea corespunzătoare a PPDK sensibil la temperatură scăzută, PPDK-ul sensibil la temperatură scăzută poate fi schimat la PPDK stabil la temperatură joasă. Prin aceasta, planta poate fi cultivată într-o regiune friguroasă, în care planta nu ar putea fi cultivată altfel. Prin urmare, este de așteptat ca prezenta invenție să contribuie mult pentru agricultură.By the present invention, a gene encoding PPDK having stability at low temperature has been cloned and sequenced. In addition, the region in the gene conferring low temperature stability was also identified. Therefore, by transforming a plant having low-temperature-sensitive PPDK with the gene of the present invention, the low-temperature-sensitive PPDK can be exchanged for low-temperature-stable PPDK. In addition, by incorporating the above-mentioned region conferring low-temperature stability 75 into the corresponding region of the low-temperature-sensitive PPDK, the low-temperature-sensitive PPDK can be mapped to the low-temperature-stable PPDK. By this, the plant can be grown in a cold region, where the plant could not be grown otherwise. Therefore, it is expected that the present invention will contribute a lot to agriculture.
Prin prezenta invenție, gena PPDK, având stabilitate la temperatură scăzută de la 80 Flaveria brownii, s-a donat și s-au determinat secvența sa nucleotidică și secvența aminoacidă dedusă, codificată prin aceasta. Secvența nucleotidică și secvența aminoacidă sunt arătate în SECV ID NR.:5 din Lista de secvențe. Așa cum s-a descris în detaliu în exemplele care urmează, această secvență s-a determinat prin extracția ARN-urilor totale din frunze de Flaveria brownii; prepararea unei bănci cADN conform unei metode convenționale; rea- 85 lizarea unei metode de hibridizare de placă, folosind o sondă preparată prin referință la regiunea genei PPDK de Flaveria bidentis și regiunea genei PPDK de porumb, regiuni care au omologie ridicată; selectarea și donarea clonelor pozitive; și secvențarea genei prin metoda dideoxi. Secvența are omologie înaltă cu gena PPDK de Flaveria bidentis care aparține aceluiași gen și are o omologie relativ ridicată cu gena PPDK de porumb. Suplimentar, sec- 90 vențele regiunii N-terminale, regiunii C-terminale și regiunile interne, ale secvenței aminoacide, deduse, sunt în totalitate aceleași cu secvențele corespunzătoare ale PPDK de la Flaveria brownii, purificate direct din frunzele verzi ale acestei plante. Ga urmare, este aparent că gena donată este gena PPDK de la Flaveria brownii. Gena PPDK de Flaveria bidentis s-a secvențat prin realizarea hibridizării de placă, folosind ca sondă cADN de po- 95 rumb; donarea clonelor pozitive; și secvențarea genei prin metoda dideoxi.By the present invention, the low temperature stable PPDK gene from 80 Flaveria brownii was cloned and its nucleotide sequence and the deduced amino acid sequence encoded by it were determined. The nucleotide sequence and amino acid sequence are shown in SEQ ID NO:5 of the Sequence Listing. As described in detail in the following examples, this sequence was determined by extracting total RNAs from Flaveria brownii leaves; preparing a cDNA library according to a conventional method; carrying out a plate hybridization method, using a probe prepared by reference to the Flaveria bidentis PPDK gene region and the maize PPDK gene region, regions that have high homology; selection and donation of positive clones; and gene sequencing by the dideoxy method. The sequence has high homology with the PPDK gene of Flaveria bidentis which belongs to the same genus and has relatively high homology with the PPDK gene of maize. In addition, the sequences of the N-terminal region, the C-terminal region and the internal regions of the deduced amino acid sequence are completely the same as the corresponding sequences of PPDK from Flaveria brownii, directly purified from the green leaves of this plant. Therefore, it is apparent that the cloned gene is the PPDK gene from Flaveria brownii. The Flaveria bidentis PPDK gene was sequenced by plate hybridization, using maize cDNA as a probe; donation of positive clones; and gene sequencing by the dideoxy method.
RO 118451 ΒRO 118451 B
Secvența aminoacidă prezentată în SECV ID NR.:5 este nouă, și 40 de resturi aminoacide ale acesteia sunt diferite de secvența PPDK de Flaveria bidentis, care aparține aceluiași gen. Circa 180 resturi aminoacide ale acesteia sunt diferite de secvența aminoacidă a PPDK de porumb. Astfel, în ciuda faptului că secvența aminoacidă a PPDK de Flaveria brownii, prezentată SECV ID NR.:5 are omologie ridicată cu secvența aminoacidă a PPDK de Flaveria bidentis, care aparține aceluiași gen, PPDK de Flaveria bidentis este sensibilă la temperatură scăzută, în timp ce cea de Flaveria brownii este stabilă la frig. Astfel, mica diferență din resturile aminoacide aduce cu sine o diferență importantă a caracterului. Invenția de față asigură o genă PPDK donată, care codifică secvența aminoacidă prezentată SECV ID NR.:5. Așa cum s-a menționat mai sus, această secvență aminoacidă este nouă și are un efect pronunțat, care este stabilitatea la temperatura scăzută. Gena conform invenției prezente nu este restrictivă numai la cea care are secvența nucleotidică prezentată SECV ID NR.:5, ci la orice secvență nucleotidică care codifică această secvență aminoacidă, aceasta fiind în cuprinsul genei conform invenției de față.The amino acid sequence shown in SEQ ID NO:5 is novel, and 40 amino acid residues thereof are different from the PPDK sequence of Flaveria bidentis, which belongs to the same genus. About 180 amino acid residues of it differ from the amino acid sequence of maize PPDK. Thus, despite the fact that the amino acid sequence of Flaveria brownii PPDK, shown in SEQ ID NO:5 has high homology with the amino acid sequence of Flaveria bidentis PPDK, which belongs to the same genus, Flaveria bidentis PPDK is sensitive to low temperature, while that of Flaveria brownii is cold stable. Thus, the small difference in amino acid residues brings with it an important difference in character. The present invention provides a cloned PPDK gene encoding the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:5. As mentioned above, this amino acid sequence is novel and has a pronounced effect, which is stability at low temperature. The gene according to the present invention is not restricted only to the one having the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO:5, but to any nucleotide sequence encoding this amino acid sequence, which is included in the gene according to the present invention.
Pentru identificarea regiunii din gena PPDK de Flaveria browniiprezentată SECV ID NR.:5, inventatorii prezentei invenții au selectat regiunea care dă stabilitate la temperatură scăzută.For the identification of the region in the Flaveria brownii PPDK gene shown in SEQ ID NO:5, the inventors of the present invention selected the region that confers stability at low temperature.
Astfel, așa cum s-a descris în detaliu în exemplele care urmează, gena PPDK de Flaveria browniis-a împărțit în trei regiuni care au aproximativ aceeași mărime, prin enzime de restricție; fiecare dintre regiuni s-a schimbat cu regiunea corespunzătoare a genei PPDK de porumb, pentru a forma gene PPDK himerice; și s-a determinat dacă PPDK-urile codificate prin genele himerice obținute au sau nu stabilitate la temperatură joasă. Ca urmare, s-a confirmat că regiunea care dă stabilitate la temperatură joasă există în ultima 1/3 regiune a genei PPDK de Flaveria brownii. Suplimentar, această ultimă 1/3 regiune s-a împărțit printr-o enzimă de restricție în două regiuni care au aproximativ aceeași mărime și, prin aceeași metodă, s-au determinat regiunile care conțin regiunea care dă stabilitate la temperatură scăzută. Ca rezultat, s-a confirmat că funcția de a da stabilitate la temperatură joasă este codificată în regiunea din amonte a sitului Xhol a genei PPDK de Flaveria brownii, prezentată în SECV ID NR.:5. Astfel, s-a confirmat că funcția de a da stabilitate la frig este localizată în secvența aminoacidă între restul aminoacid arginină de la poziția 832 și restul aminoacid valină de la poziția 955, ale secvenței aminoacide prezentată în SECV ID NR.:5 (secvența aminoacidă de la cel de-al 836-lea rest aminoacid până la cel de-al 955-lea rest aminoacid poate fi denumită de aici înainte ca “secvența care dă stabilitate la temperatură joasă”).Thus, as described in detail in the examples that follow, the PPDK gene of Flaveria browniis split into three regions of approximately the same size by restriction enzymes; each of the regions was swapped with the corresponding region of the maize PPDK gene to form chimeric PPDK genes; and whether or not PPDKs encoded by the obtained chimeric genes have low temperature stability was determined. As a result, it was confirmed that the region conferring low temperature stability exists in the last 1/3 region of the Flaveria brownii PPDK gene. Additionally, this last 1/3 region was split by a restriction enzyme into two regions that are approximately the same size, and by the same method, the regions containing the low temperature stability region were determined. As a result, it was confirmed that the function of conferring low temperature stability is encoded in the upstream region of the Xhol site of the Flaveria brownii PPDK gene shown in SEQ ID NO:5. Thus, it was confirmed that the function of giving cold stability is located in the amino acid sequence between the arginine amino acid residue at position 832 and the valine amino acid residue at position 955, of the amino acid sequence presented in SEQ ID NO.:5 (amino acid sequence from the 836th amino acid residue to the 955th amino acid residue may hereinafter be referred to as "the sequence conferring low temperature stability").
Astfel, s-a dovedit că regiunea în legătură cu stabilitatea la frig a PPDK este localizată în regiunea 1/6 a întregii regiuni C-terminale. Pe de altă parte, în SECV ID NR:1 din Lista de secvențe sunt secvența nucleotidică a genei care codifică PPDK de Flaveria bidentis și secvența aminoacidă codificată prin aceasta, și în SECV ID NR:2 sunt secvența nucleotidică a genei care codifică PPDK de porumb și secvența aminoacidă dedusă, codificată prin aceasta {Biochemistry 29,10757-10765 (1990)). în SECV ID NR:4, sunt prezentate secvența nucleotidică a genei care codifică PPDK de Entamoeba histolytica, care este o bacterie, și secvența aminoacidă dedusă, codificată prin aceasta {MolecularandBiochemical Parasitology 62,153-156 (1993)). Așa cum s-a descris mai sus, s-a dovedit prin invenția de față că regiunea legată de stabilitatea la temperatură scăzută a PPDK este localizată în 1/6 regiunea întregii regiuni de la C-terminal; este posibil să se obțină PPDK stabil la temperatură scăzută, prin substituția a cel puțin unui rest aminoacid din 1/6 regiunea întregii regiuni C-terminal a secvenței aminoacide, arătată în SECV ID NR:1,2, 3 sau 4.Thus, the region related to cold stability of PPDK was shown to be located in region 1/6 of the entire C-terminal region. On the other hand, in SEQ ID NO:1 of the Sequence Listing are the nucleotide sequence of the Flaveria bidentis PPDK encoding gene and the amino acid sequence encoded thereby, and in SEQ ID NO:2 are the nucleotide sequence of the maize PPDK encoding gene and the deduced amino acid sequence encoded thereby {Biochemistry 29, 10757-10765 (1990)). in SEQ ID NO:4, the nucleotide sequence of the gene encoding PPDK of Entamoeba histolytica, which is a bacterium, and the deduced amino acid sequence encoded thereby {MolecularandBiochemical Parasitology 62,153-156 (1993)) are shown. As described above, it has been shown by the present invention that the region related to the low temperature stability of PPDK is located in the 1/6 region of the entire C-terminal region; it is possible to obtain PPDK stable at low temperature by substituting at least one amino acid residue in the 1/6 region of the entire C-terminal region of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:1,2, 3 or 4.
RO 118451 ΒRO 118451 B
Aici, termenul “stabil la temperatură joasă” înseamnă că activitatea enzimei după ce se lasă enzima să stea la 0°C, timp de 20 min, nu este mai mică de 60% din activitatea 145 inițială.Here, the term "stable at low temperature" means that the enzyme activity after allowing the enzyme to stand at 0°C for 20 min is not less than 60% of the initial 145 activity.
Așa cum s-a menționat mai sus, deoarece regiunea de la cel de-al 832-lea aminoacid, arginină, până la cel de-al 955-lea rest aminoacid, valina, din secvența aminaocidă prezentată în SECV ID NR:5 definește stabilitatea la frig, PPDK-urile sensibile la temperatură scăzută, având secvența aminaocidă prezentată în SECV ID NR:1-4, pot fi transfor- 150 mate în PPDK-urile stabile la temperaturi joase, prin substituirea regiunilor corespunzătoare a PPDK-urilor sensibile la frig cu secvența aminaocidă de la cel de-al 832-lea rest aminoacid, ariginină, până la cel de-al 955-lea rest aminoacid, valină, a secvenței aminaocide prezentată în SECV ID NR:5. Această constatare este foarte importantă, deoarece, prin utilizarea ei, orice PPDK sensibil la frig dorit poate fi transformat într-un PPDK stabil la frig. 155 Metoda de atribuire a stabilității la temperaturi joase unui PPDK nu este restricționată la metoda descrisă în exemplele de mai jos, în care secvența care dă stabilitate la temperatură joasă a PPDK de Flaveria brownii este schimbată cu regiunea corespunzătoare a PPDK, sensibilă la temperatură joasă, pentru a pregăti o genă himerică, ci stabilitatea la temperatură scăzută poate fi dată prin schimbarea regiunii corespunzătoare a PPDK, sensibilă la 160 temperatură scăzută, a unei plante, cu aceeași secvență ca care dă stabilitatea la frig a Flaveria brownii prin mutageneză dirijată in sit. Prin urmare, orice ADN care codifică o polipeptidă având activitate PPDK, care conține secvența care dă stabilitate la temperatură joasă, descrisă mai sus, este în cuprinsul prezentei invenții. în special PPDK în care al 869-lea rest aminoacid din secvența aminaocidă arătată în SECV ID NR:1 este substituit prin 165 prolină, și PPDK în care cel de-al 885-lea și cel de-al 952-lea rest aminoacid din secvența aminoaocidă arătată în SECV ID NR:1 este substituit prin leucină și, respectiv, valină, au stabilitate la temperatură scăzută.As noted above, because the region from the 832nd amino acid, arginine, to the 955th amino acid residue, valine, of the aminocidal sequence shown in SEQ ID NO:5 defines cold stability , the low-temperature-sensitive PPDKs having the aminicidal sequence shown in SEQ ID NO:1-4 can be transformed into the low-temperature-stable PPDKs by substituting the corresponding regions of the cold-sensitive PPDKs with the sequence aminoacid from the 832nd amino acid residue, ariginine, to the 955th amino acid residue, valine, of the aminoacidic sequence shown in SEQ ID NO:5. This finding is very important because by using it, any desired cold-sensitive PPDK can be converted into a cold-stable PPDK. 155 The method of conferring low temperature stability to a PPDK is not restricted to the method described in the examples below, in which the low temperature stability conferring sequence of the Flaveria brownii PPDK is exchanged with the corresponding low temperature sensitive region of the PPDK, to prepare a chimeric gene, but low-temperature stability can be conferred by changing the corresponding region of the low-temperature-sensitive PPDK of a plant with the same sequence as confers cold stability in Flaveria brownii by site-directed mutagenesis. Therefore, any DNA encoding a polypeptide having PPDK activity, which contains the sequence conferring low temperature stability, described above, is within the scope of the present invention. in particular PPDK in which the 869th amino acid residue of the aminicidal sequence shown in SEQ ID NO:1 is substituted by 165 proline, and PPDK in which the 885th and 952nd amino acid residue of the sequence amino acid shown in SEQ ID NO:1 is substituted by leucine and valine, respectively, have low temperature stability.
PPDK-urile la care poate fi dată stabilitate la temperatură joasă nu sunt limitate la cele arătate în SECV ID NR:1-4, putând fi oricare dintre cele care au omologii nu mai mici 170 de 50%, la secvențele prezentate în SECV ID NR:1-4. De preferință, secvența nucleotidică a genei care codifică PPDK, căreia îi poate fi atribuită stabilitatea la temperatură scăzută, are o omologie la gena PPDK de Flaveria browniiîntr-o cantitate nu mai mică de 48,5%, mai preferat, nu mai mică de 90%.The PPDKs that can be given low temperature stability are not limited to those shown in SEQ ID NO:1-4, and can be any of those that have no less than 170 homology to the sequences shown in SEQ ID NO: :1-4. Preferably, the nucleotide sequence of the gene encoding PPDK, to which low temperature stability can be attributed, has homology to the Flaveria brownii PPDK gene in an amount of not less than 48.5%, more preferably not less than 90 %.
Este binecunoscut în domeniu că există cazuri în care activitatea fiziologică a unei 175 peptide active fiziologic se menține chiar dacă secvența aminaocidă a peptidei se modifică până la o întindere mică și chiar dacă unul sau mai multi aminoacizi din secvența aminoacidă sunt substituiți sau deletați, sau chiar dacă se adaugă unul sau mai mulți aminoacizi la secvența aminoacidă. Prin urmare, polipeptidele care au aceeași secvență aminoacidă ca cea arătată în SECV ID NR:5, cu excepția faptului că polipeptidele au asemenea modifi- 180 cări, dar au activitate PPDK stabilă la temperatură scăzută, sunt incluse în cuprinsul invenției de față. Cu alte cuvinte, polipeptidele care au aceeași secvență aminoacidă ca cea prezentată în SECV ID NR:5, cu excepția faptului că unul sau mai mulți aminoacizi sunt adăugați, deletați sau substituiți, dar care au activitate PPDK stabilă la temperatură scăzută, sunt incluse în cuprinsul invenției de față. în mod similar, ADN-urile care au aceeași secvență nu- 185 cleotidică ca cea din SECV ID NR:5, cu excepția faptului că una sau mai multe nucleotide sunt adăugate, deletate sau substituite, și care codifică polipeptidele având activitate PPDK stabilă la temperatură scăzută, intră, de asemenea, în întinderea prezentei invenții.It is well known in the art that there are cases where the physiological activity of a physiologically active peptide is maintained even if the aminicidal sequence of the peptide is changed to a small extent and even if one or more amino acids in the amino acid sequence are substituted or deleted, or even if one or more amino acids are added to the amino acid sequence. Therefore, polypeptides having the same amino acid sequence as shown in SEQ ID NO:5, except that the polypeptides have such modifications but have stable PPDK activity at low temperature, are included within the scope of the present invention. In other words, polypeptides having the same amino acid sequence as that shown in SEQ ID NO:5, except that one or more amino acids are added, deleted or substituted, but having stable PPDK activity at low temperature, are included in of the present invention. similarly, DNAs having the same nucleotide sequence as that of SEQ ID NO:5, except that one or more nucleotides are added, deleted or substituted, and which encode polypeptides having temperature-stable PPDK activity low, also falls within the scope of the present invention.
RO 118451 ΒRO 118451 B
Modificările ADN-ului, care duc la adiția, deleția sau substituția secvenței aminoacide codificate prin acesta se pot obține prin mutageneze specifice in sit care sunt binecunoscute în domeniu (de exemplu, Nucleic Acid Research, voi. 10, nr. 20, p. 6487-6500,1982). în prezenta descriere, “unul sau mai mulți aminoacizi” înseamnă numărul aminoacizilor care pot fi adăugați, deletați sau substituiți prin mutageneză de sit specific.Modifications of DNA, resulting in the addition, deletion or substitution of the amino acid sequence encoded by it can be achieved by site-specific mutagenesis which are well known in the art (eg, Nucleic Acid Research, Vol. 10, No. 20, p. 6487 -6500, 1982). As used herein, "one or more amino acids" means the number of amino acids that may be added, deleted, or substituted by site-specific mutagenesis.
Mutageneza de sit specific se poate realiza, de exemplu, folosind un primer oligonucleotidic sintetic complementar la un fag ADN monocatenar, exceptând mutația dorită care urmează. Astfel, folosind oligonucleotida sintetică menționată mai sus ca primer, se produce de către un fag o catenă complementară și se transformă celule bacteriene-gazdă, cu ADN-ul dublu catenar obținut. Cultura de celule bacteriene transformate se depune pe agar și se formează plăci de la o celulă singulară, care conține fagul. Teoretic 50% din noile colonii conțin fagul, care are o catenă monobandă care poartă mutația, și 50% din coloniile rămase conțin fagul având secvența inițială. Plăcile obținute se supun apoi hibridizării cu o sondă sintetică, tratată cu kinază la o temperatură la care sonda se hibridizează cu ADN-ul care are exact aceeași secvență ca ADN-ul având mutatia dorită, dar nu cu secvența ADN inițială, care nu este complet complementară cu sonda. Apoi, se colectează plăcile la care s-a observat hibridizarea, se cultivă și se recuperează ADN-ul.Site-specific mutagenesis can be accomplished, for example, by using a synthetic oligonucleotide primer complementary to a single-stranded DNA phage, except for the desired mutation that follows. Thus, using the synthetic oligonucleotide mentioned above as a primer, a complementary strand is produced by a phage and bacterial-host cells are transformed with the double-stranded DNA obtained. The culture of transformed bacterial cells is plated on agar and plates are formed from a single cell, containing the phage. Theoretically 50% of the new colonies contain the phage, which has a single-stranded strand carrying the mutation, and 50% of the remaining colonies contain the phage having the original sequence. The plates obtained are then hybridized with a synthetic probe, treated with kinase at a temperature at which the probe hybridizes with DNA that has exactly the same sequence as the DNA with the desired mutation, but not with the original DNA sequence, which is not complete complementary to the probe. Plates where hybridization was observed are then collected, cultured, and DNA recovered.
în plus, la mutageneza în sit specific, menționată mai sus, metodele pentru substituirea, deleția sau adiția unuia sau mai mulți aminoacizi fără pierderea activității enzimatice includ o metodă în care gena se tratează cu un mutagen și o metodă în care gena este clivată selectiv, se recuperează o anumită nucleotidă, se adaugă sau se substituie și apoi gena este ligată.In addition, in the aforementioned site-specific mutagenesis, methods for the substitution, deletion or addition of one or more amino acids without loss of enzyme activity include a method in which the gene is treated with a mutagen and a method in which the gene is selectively cleaved, a specific nucleotide is retrieved, added or substituted, and then the gene is ligated.
Prin transformarea unei plante cu gena gena PPDK de Flaveria brownii sau cu un ADN care codifică o polipeptidă conținând secvența care dă stabilitate la temperatură scăzută, care are activitate PPDK, se poate obține o plantă rezistentă la frig. Exemple ale plantelor preferate care pot fi transformate includ, deși nu se limitează la acestea, porumb, trestie de zahăr, mei, iarbă de pășune și sorg.By transforming a plant with the PPDK gene of Flaveria brownii or with a DNA encoding a polypeptide containing the sequence conferring low temperature stability, which has PPDK activity, a cold-resistant plant can be obtained. Examples of preferred plants that can be transformed include, but are not limited to, corn, sugarcane, millet, pasture grass, and sorghum.
Au fost deja stabilite metode pentru transformarea plantelor, și metoda care utilizează Agrobacterium tumefaciens poate fi folosită în mod preferat. Metoda pentru transformarea plantelor utilizând Agrobacterium tumefaciens este binecunoscută în domeniu. Prin această metodă pot fi transformate atât dicotiledonate (de exemplu, cererea de brevet japoneză (Kokai) nr. 4-330234), cât și monodicotiledonate (WO 94/00977). Alternativ, ADN-ul se poate introduce în protoplaste de plante, prin metoda electroporării sau prin alte metode binecunoscute în domeniu. Suplimentar, transformarea se poate realiza, de asemenea, prin atașarea ADN-ului la particule de tungsten și alte asemenea metode, și prin implantarea particulelor în embrionul unei plante. Metode concrete de astfel de transformări sunt descrise în exemplele care se dau în continuare.Methods for transforming plants have already been established, and the method using Agrobacterium tumefaciens can be preferably used. The method for transforming plants using Agrobacterium tumefaciens is well known in the art. Both dicotyledonates (eg, Japanese Patent Application (Kokai) No. 4-330234) and monodicotyledonates (WO 94/00977) can be converted by this method. Alternatively, DNA can be introduced into plant protoplasts by electroporation or other methods well known in the art. Additionally, transformation can also be accomplished by attaching DNA to tungsten particles and other such methods, and by implanting the particles into a plant embryo. Concrete methods of such transformations are described in the following examples.
Prezenta invenție se va descrie acum concret, prin intermediul exemplelor. Totuși, prezenta invenție nu este limitată la exemplele de mai jos.The present invention will now be described concretely by means of examples. However, the present invention is not limited to the examples below.
Exemplul 1. donarea și secvențarea genei PPDK de Flaveria brownii (1) Prepararea băncii cADN și donarea cADN-ului de lungime totală (I) Prepararea băncii cADNExample 1. Flaveria brownii PPDK Gene Cloning and Sequencing (1) cDNA Bank Preparation and Full-Length cDNA Cloning (I) cDNA Bank Preparation
Prin metoda clorhidrat de guanidină/fenol, din frunze verzi (60 g) de Flaveria brownii s-au izolat ARN-uri totale. Prin această metodă s-au obținut 26,5 mg de ARN după precipitare cu litiu. Apoi, s-au obținut 118,9 pg de ARN poli(A)+ din 13,2 mg de ARN, conform uneiBy the guanidine hydrochloride/phenol method, total RNAs were isolated from green leaves (60 g) of Flaveria brownii. This method yielded 26.5 mg of RNA after lithium precipitation. Then, 118.9 µg of poly(A) + RNA was obtained from 13.2 mg of RNA, according to a
RO 118451 Β metode convenționale, folosind o coloană care conține Oligo dT celuloză Tip 7 (accesibilă comercial de la Pharmacia). Pentru prepararea băncii cADN s-au folosit TimeSaver cADN 235 Synthesis Kit (accesibil comercial de la Pharmacia), vector Lambda ZAPII (accesibil comercial de la STRATAGENE) și reactivul de împachetare atașat la sistemul de donare cADN Ăgtlo (accesibil comercial de la AMERSHAM). Folosind un linker EcoRI/Notl, s-a preparat o bancă cADN, în care fragmente ADN sunt inserate în situl EcoRI al vectorilor Lambda ZAPII.RO 118451 Β conventional methods, using a column containing Oligo dT cellulose Type 7 (commercially available from Pharmacia). The TimeSaver cDNA 235 Synthesis Kit (commercially available from Pharmacia), the Lambda ZAPII vector (commercially available from STRATAGENE) and the packaging reagent attached to the Ăgtlo cDNA cloning system (commercially available from AMERSHAM) were used to prepare the cDNA bank. Using an EcoRI/NotI linker, a cDNA library was prepared, in which DNA fragments are inserted into the EcoRI site of Lambda ZAPII vectors.
Mărimea băncii cADN preparată a fost 415000 pfu. Ca celule-gazdă, s-au folosit celule 240 XIII-Blue.The size of the prepared cDNA library was 415,000 pfu. As host cells, 240 XIII-Blue cells were used.
(ii) Prepararea sondei(ii) Probe preparation
Folosind un primer care are secvența 5': GACGGCTAAAAAGAGGGT (desemnat pe baza regiunilor PPDK de Flaveria bidentis și PPDK de porumb care au omologie înaltă) și un primer R care are secvența TATCGAGAAACCTTCTATAC (o parte a secvenței PPDK 245 de Flaveria bidentis, catena complementară), s-a amplificat un fragment ADN originar din ARN-ul de Flaveria brownii prin transcripție inversă PCR și fragmentul ADN amplificat s-a inserat în vectorul pCRII (accesibil comercial de la INVITROGEN). Folosind vectorul obținut ca matriță și folosind aceiași primeri ca cei menționați mai sus, s-a amplificat ADN-ul, și produsul PCR s-a supus la electroforeză urmată de recuperarea ADN-ului din gel, folosind 250 SUPREC-ol (accesibil comercial de la TAKARA SHUZO). Prin acest proces se poate obține un fragment ADN, care are o mărime de 428 bp începând de la cea de-a 24-a bp în amonte de N-terminal proteinei mature. Acest fragment s-a marcat cu 32P folosind sistemul de marcaj Multiprime DNA (accesibil comercial de la AMERSHAM) pentru a prepara o sondă.Using a primer that has the sequence 5': GACGGCTAAAAAGAGGGT (designated based on regions of Flaveria bidentis PPDK and maize PPDK that have high homology) and an R primer that has the sequence TATCGAGAAACCTTCTATAC (part of Flaveria bidentis PPDK 245 sequence, complementary strand) , a DNA fragment originating from Flaveria brownii RNA was amplified by reverse transcription PCR and the amplified DNA fragment was inserted into the pCRII vector (commercially available from INVITROGEN). Using the obtained vector as a template and using the same primers as mentioned above, the DNA was amplified, and the PCR product was subjected to electrophoresis followed by DNA recovery from the gel using 250 SUPREC-ol (commercially available from TAKARA SHUZO) . Through this process a DNA fragment can be obtained, which has a size of 428 bp starting from the 24th bp upstream of the N-terminus of the mature protein. This fragment was labeled with 32 P using the Multiprime DNA labeling system (commercially available from AMERSHAM) to prepare a probe.
(iii) Clonarea cADN-ului de lungime totală de la Flaveria brownii 255(iii) Cloning of full-length cDNA from Flaveria brownii 255
Biblioteca cADN s-a cercetat prin metoda hibridizării plăcii, folosind ca sondă fragmentul ADN menționat mai sus. Ca filtru de hibridizare, s-a folosit Hybond N+ (AMERSHAM), și hibridizarea s-a realizat în 6 x SSC care conține 5 x soluția lui Denhalt, 0,1% SDS și 100 pg/ml ADN din glande sexuale de salmon denaturat la 65°C peste noapte. Spălarea s-a realizat cu 2 x SSC care conține 0,1% SDS la temperatura camerei timp de 5 min; cu 260 2 x SSC care conține 0,1% SDS la temperatura camerei timp de 90 min; și 1 x SSC care conține 0,1% SDS la 68°C, timp de 90 min. Prin această operațiune s-au obținut 28 de clone independente pozitive. Din acestea, 11 plăci care au prezentat semnale puternice s-au selectat și s-au supus la un al 2-lea screening. Acesta s-a realizat în același mod ca și primul, cu excepția faptului că timpul celei de-a doua spălări a fost de 60 min. Ca rezultat, de la 6 265 clone s-au obținut plăci pozitive, independente, originare, de la un singur fag. Pentru verificarea mărimilor fragmentelor ADN inserate, s-a realizat PCR folosind primerul R, descris mai sus, M13PrimerM4 (GTTTTCCCAGTCACGAC, accesibil comercial de la TAKARA SHUZO), și M13PrimerRV (CAGGAAACAGCTATGAC, accesibil comercial de la TAKARA SHUZO), ca primeri, și folosind fagul ca matriță. Ca urmare, două clone au conținut cADN-ul de Iun- 270 gime totală. După aceasta, prin excizie in vivo, fragmentele ADN inserate s-au subclonat într-un vector plasmid pBluescriptIISK (accesibil comercial de la STRATAGENE). Plasmizii recombinați, obținuți prin subclonare, s-au numit p411 și p631.The cDNA library was screened by the plate hybridization method, using the aforementioned DNA fragment as a probe. Hybond N + (AMERSHAM) was used as the hybridization filter, and hybridization was performed in 6x SSC containing 5x Denhalt's solution, 0.1% SDS, and 100 µg/ml DNA from denatured salmon gonads at 65° C overnight. Washing was done with 2 x SSC containing 0.1% SDS at room temperature for 5 min; with 260 2 x SSC containing 0.1% SDS at room temperature for 90 min; and 1x SSC containing 0.1% SDS at 68°C for 90 min. This operation yielded 28 independent positive clones. From these, 11 plaques that showed strong signals were selected and subjected to a 2nd screening. This was done in the same way as the first, except that the time of the second wash was 60 min. As a result, positive, independent plaques originating from a single phage were obtained from 6,265 clones. To check the sizes of the inserted DNA fragments, PCR was performed using primer R, described above, M13PrimerM4 (GTTTTCCCAGTCACGAC, commercially available from TAKARA SHUZO), and M13PrimerRV (CAGGAAACAGCTATGAC, commercially available from TAKARA SHUZO) as primers, and using phage as matrix. As a result, two clones contained the total Iun-270 cDNA. After this, by in vivo excision, the inserted DNA fragments were subcloned into a plasmid vector pBluescriptIISK (commercially available from STRATAGENE). The recombinant plasmids obtained by subcloning were named p411 and p631.
Prin PCR descris mai sus, s-a dovedit că banca preparată așa cum s-a descris mai sus a fost o bancă conținând inserte suficient de lungi care a fost completă pentru căutarea 275 cADN. Astfel, pentru izolarea mARN-urilor de Flaveria brownii este avantajos să se folosească metoda descrisă mai sus și să se obțină o cantitate mare de mARN-uri prin tratarea o dată a unei cantități mari de ARN-uri așa cum s-a descris mai sus.By the PCR described above, it was shown that the library prepared as described above was a library containing sufficiently long inserts that was complete for the 275 cDNA search. Thus, for the isolation of Flaveria brownii mRNAs it is advantageous to use the method described above and to obtain a large amount of mRNAs by treating a large amount of RNAs at once as described above.
RO 118451 Β în plus, deoarece banca cADN descrisă mai sus conține un număr de inserte care sunt suficient de lungi, căutarea cADN de lungime totală a fost posibil să fie realizată cu ușurință prin prepararea unei sonde folosind un primer care hibridizează cu o regiune din vecinătatea regiunii de procesare a proteinei dorite.RO 118451 Β in addition, since the cDNA library described above contains a number of inserts that are sufficiently long, the search for full-length cDNA was possible to perform easily by preparing a probe using a primer that hybridizes to a region in the vicinity the processing region of the desired protein.
(2) Determinarea secvenței nucleotidice totale a cADN și compararea secvenței aminoacide deduse(2) Determination of the total nucleotide sequence of the cDNA and comparison of the deduced amino acid sequence
Pentru a determina secvența nucleotidică totală cADN inserat lui p631, s-au preparat mutante de deleție. Mutantele de deleție s-au preparat folosind Deletion-Kit pentru KiloSequence (accesibil comercial de la TAKARA SHUZO). Totuși, reacția prin exonuclează III s-a oprit prin transferarea amestecului de reacție la tampon Mung Bean Nuclease menținut la 65°C. Determinarea secvenței nucleotidice s-a realizat folosind un plasmid purificat, prin folosirea unui plasmid purificat Qiagen Plasmid Mini Kit (accesibil comercial de la Diagen), Taq Dydeoxy terminator Cycle Kit (accesibil comercial de la ABI) și Applied Biosystems 373A DNA Sequencer (ABI). S-au secvențat ambele catene, cu excepția unor părți ale acestora. Pe baza secvenței nucleotidice determinate, s-a determinat secvența aminoacidă. Secvența nucleotidică determinată și secvența aminoacidă sunt prezentate în SECV ID NR:5 din Lista de secvențe.To determine the total nucleotide sequence of the inserted p631 cDNA, deletion mutants were prepared. Deletion mutants were prepared using Deletion-Kit for KiloSequence (commercially available from TAKARA SHUZO). However, the exonuclease III reaction was stopped by transferring the reaction mixture to Mung Bean Nuclease buffer maintained at 65°C. Nucleotide sequence determination was performed using a purified plasmid using the Qiagen Plasmid Mini Kit (commercially available from Diagen), the Taq Dydeoxy terminator Cycle Kit (commercially available from ABI), and the Applied Biosystems 373A DNA Sequencer (ABI). Both strands were sequenced, except for parts of them. Based on the determined nucleotide sequence, the amino acid sequence was determined. The determined nucleotide sequence and amino acid sequence are shown in SEQ ID NO:5 of the Sequence Listing.
Ar fi de remarcat că, în prepararea clonelor de deleție pentru secvențarea cADN-ukui izolat, a fost important să se încălzească înainte tamponul Mung Bean Nuclease la 65°C, deoarece reacția nu se putea opri numai prin transferarea amestecului de reacție la tamponul Mung Bean Nuclease. Suplimentar, deoarece secvența la regiunea de până la circa 600-900 bp din vectorul mai mare și insertul nu s-au putut determina numai prin deleția insertului din aval, a fost necesar să se realizeze deleția de la ambele capete.It should be noted that in preparing the deletion clones for sequencing the isolated cDNA, it was important to preheat the Mung Bean Nuclease buffer to 65°C, as the reaction could not be stopped by simply transferring the reaction mixture to the Mung Bean buffer Nucleases. Additionally, since the sequence up to about 600-900 bp of the larger vector and the insert could not be determined by deletion of the downstream insert alone, it was necessary to perform the deletion from both ends.
Pe de altă parte, s-a purificat PPDK direct din Flaveria brownii și s-au determinat secvențele aminaocide ale regiunilor sale N-terminale, C-terminale și interne. PPDK s-a purificat după cum urmează. S-au mărunții frunze verzi într-un volum triplu al tamponului de extracție. După centrifugare, s-a adăugat la supernatant sulfat de amoniu până la 30% saturare și s-au îndepărtat proteinele precipitate. Ulterior, s-a adăugat sulfat de amoniu până la 70% saturare și s-au recuperat proteinele precipitate. Proteinele recuperate s-au aplicat la Sephadex G25 (accesibil comercial de la PHARMACIA) pentru îndepărtarea sărurilor. Ceea ce a rezultat s-a aplicat în coloană DEAE-Sepharose (PHARMACIA) și proteinele adsorbite la coloană s-au eluat prin HCI, care are un gradient de 50-400 mM. Fracțiunile care au activitate PPDK s-au combinat și s-au concentrat prin sulfat de amoniu de saturație 70%, urmat de desalinizare prin Sephadex G25. Ceea ce a rezultat s-a aplicat apoi la o coloană hidroxiapatită. Proteinele adsorbite s-au eluat prin tampon fosfat, care are un gradient de fosfat de la 10 mM până la 40 mM. Fracțiunile care au activitate PPDK s-au combinat și s-au concentrat prin sulfat de amoniu de saturație 70%, urmat de desalinizare prin Sephadex G25. Ceea ce a rezultat s-a supus la SDS-PAGE, și banda PPDK s-a decupat. S-a recuperat proteina din gel prin electroeluție. Prin acest proces s-a obținut proba PPDK, purificată într-o cantitate de circa 5-10 nmol. PPDK-ul purificat, obținut în acest mod, a prezentat o bandă unică în SDS-PAGE.On the other hand, PPDK was purified directly from Flaveria brownii and the amino acid sequences of its N-terminal, C-terminal and internal regions were determined. PPDK was purified as follows. Green leaves were minced in a threefold volume of the extraction buffer. After centrifugation, ammonium sulfate was added to the supernatant to 30% saturation and the precipitated proteins were removed. Subsequently, ammonium sulfate was added to 70% saturation and the precipitated proteins were recovered. The recovered proteins were applied to Sephadex G25 (commercially available from PHARMACIA) to remove salts. The resulting was applied to a DEAE-Sepharose column (PHARMACIA) and proteins adsorbed to the column were eluted by HCl, which has a gradient of 50-400 mM. Fractions having PPDK activity were combined and concentrated by 70% saturation ammonium sulfate followed by desalting with Sephadex G25. The resulting was then applied to a hydroxyapatite column. Adsorbed proteins were eluted through phosphate buffer, which has a phosphate gradient from 10 mM to 40 mM. Fractions having PPDK activity were combined and concentrated by 70% saturation ammonium sulfate followed by desalting with Sephadex G25. The resulting was subjected to SDS-PAGE, and the PPDK band was excised. Protein was recovered from the gel by electroelution. Through this process, the PPDK sample was obtained, purified in an amount of about 5-10 nmol. The purified PPDK obtained in this way showed a single band in SDS-PAGE.
Apoi, s-au determinat secvențele aminoacide ale regiunilor N-terminală, C-terminală și interne ale PPDK purificat obținut astfel. Secvența aminoacidă a regiunii N-terminale s-a determinat prin transferarea proteinei pe o membrană PVDF și apoi determinarea secvenței folosind un secvențier de aminoacizi în fază gazoasă. Secvența aminoacidă a regiunii N-terminale s-a determinat prin digestia PPDK purificat cu carboxipeptidază și estimarea secvenței aminoacide pe baza relației dintre compoziția aminoacizilor eliberați și timpul de digestie.Next, the amino acid sequences of the N-terminal, C-terminal and internal regions of the thus obtained purified PPDK were determined. The amino acid sequence of the N-terminal region was determined by transferring the protein to a PVDF membrane and then determining the sequence using a gas-phase amino acid sequencer. The amino acid sequence of the N-terminal region was determined by digesting purified PPDK with carboxypeptidase and estimating the amino acid sequence based on the relationship between the composition of the released amino acids and the digestion time.
RO 118451 ΒRO 118451 B
Secvențele aminoacide ale regiunilor interne s-au determinat prin determinarea secvenței aminoacide de la N-terminal al peptidelor generate prin digestia proteinei cu o protează. Detaliile acestei metode sunt cele care urmează. Inițial, ca și în cazul determinării secvenței aminoacide a regiunii N-terminale, PPDK din frunze verzi de Flaveria browniia fost parțial purificată și supusă la un SDS-PAGE obișnuit. Gelul s-a colorat cu Coomassie Brilliant Blue R250 și s-a decupat banda PPDK. Gelul decupat s-a echilibrat într-un tampon de echilibrare (Tris-HCI pH 6,8,125 mM, EDTA 1 mM, 0,1% SDS) și s-a inserat într-un godeu, fiind urmat de un al doilea SDS-PAGE. Aici, împreună cu gelul echilibrat, s-au adăugat o soluție de acoperire (Tris-HCI pH 6,8, 125 mM, EDTA 1 mM, 0,1% SDS, 0,01% BPB, 20% glicerol) și o soluție enzimatică (Tris-HCI pH 6,8, 125 mM, EDTA 1 mM, 0,1% SDS, 0,01% BPB, 10% glicerol, lizil endopeptidază 1-5 pg sau proteaze V8 0,01-0,1 pg). După realizarea electroforezei, pentru același timp, în gelul concentrat s-a realizat digestia proteinei (s-a întrerup alimentarea elelctrică, și gelul a fost lăsat să stea 45 min). Apoi, s-a repornit electroforeza, și ceea ce a rezultat s-a transferat la o membrană PVDF în același mod ca la determinarea secvenței N-terminale, și secvențele aminaocide ale fragmentelor obținute prin digestie s-au determinat de la N-terminalele acestora, folosind secvențierul de aminoacizi în fază gazoasăThe amino acid sequences of the internal regions were determined by determining the N-terminal amino acid sequence of the peptides generated by digestion of the protein with a protease. The details of this method are as follows. Initially, as in the case of determining the amino acid sequence of the N-terminal region, PPDK from green leaves of Flaveria browniia was partially purified and subjected to a regular SDS-PAGE. The gel was stained with Coomassie Brilliant Blue R250 and the PPDK band excised. The excised gel was equilibrated in equilibration buffer (Tris-HCl pH 6.8, 125 mM, 1 mM EDTA, 0.1% SDS) and inserted into a well, followed by a second SDS-PAGE. Here, along with the equilibrated gel, a coating solution (Tris-HCl pH 6.8, 125 mM, 1 mM EDTA, 0.1% SDS, 0.01% BPB, 20% glycerol) and a enzymatic (Tris-HCl pH 6.8, 125 mM, EDTA 1 mM, 0.1% SDS, 0.01% BPB, 10% glycerol, lysyl endopeptidase 1-5 µg or V8 proteases 0.01-0.1 µg ). After performing the electrophoresis, for the same time, the protein digestion was performed in the concentrated gel (the electrical supply was interrupted, and the gel was left to stand for 45 min). Then, the electrophoresis was restarted, and the resulting was transferred to a PVDF membrane in the same way as for determining the N-terminal sequence, and the amino acid sequences of the digested fragments were determined from their N-termini using the sequencer amino acids in gas phase
Secvențele determinate ale regiunilor N-terminale, C-terminale și interne sunt precum urmează:The determined sequences of the N-terminal, C-terminal and internal regions are as follows:
330330
335335
340340
345345
350350
Asn Asp Leu Cis Gin Met Val Phe Gly - Ser (844-862) în secvențele aminoacide descrise mai sus înseamnă glutamină, dar nu s-a putut analiza prin analizatorul folosit, și înseamnă că rezultatul analizei a fost neclar. Numerele din paranteze indică numărul aminoacidului regiunii corespunzătoare din secvența aminoacidă prezentată în SECV ID nr: 5. Deși părți ale secvenețelor interne (2) și (4) sunt diferite de secvența aminoacidă prezentată în SECV ID nr: 5, se consideră că aceasta se datorează erorilor secvențierului de aminoacizi. Așa cum este bine cunoscut, erorile sunt produse de secvențele de aminoacizi cu o frecvență considerabilă, nefiind produse erori substanțiale prin secvențiere de ADN.Asn Asp Leu Cis Gin Met Val Phe Gly - Ser (844-862) in the amino acid sequences described above means glutamine, but it could not be analyzed by the analyzer used, and it means that the analysis result was unclear. The numbers in parentheses indicate the amino acid number of the corresponding region in the amino acid sequence shown in SEQ ID No: 5. Although parts of the internal sequences (2) and (4) are different from the amino acid sequence shown in SEQ ID No: 5, it is believed that this is due to amino acid sequencing errors. As is well known, errors are produced by amino acid sequences with considerable frequency, and no substantial errors are produced by DNA sequencing.
355355
360360
Deoarece secvența aminoacidă prezentată în SECV ID nr: 5 corespunde bine cu secvențele aminoacide parțiale, determinate direct în PPDK purificat, descris mai sus, s-a confirmat că secvența aminoacidă prezentată în SECV ID nr: 5 este secvența aminoacidă a PPDK. Secvența aminoacidă prezentată în SECV ID nr: 5 s-a comparat cu secvențele aminoacide ale PPDK-urilor cunoscute de Flaveria bidentis și porumb. Ca rezultat, în regiunea proteinei mature au fost diferite 40 resturi aminoacide {Flaveria bidentis) și respectiv, circa 180 resturi aminoacide (porumb). în plus, din rezultatele descrise mai sus, s-a considerat că în secvența aminoacidă prezentată în SECV ID nr: 5, secvența aminoacidă de la 1 până la 71-lea aminoacid nu există în proteina matură, dar există o peptidă tranzitorie, necesară pentru trecerea prin membrane, care este prelucrată după trecerea prin membrane. Diferențele dintre secvențele aminoacide ale proteinelor mature de Flaveria brownii și Flaveria bidentis sunt arătate în tabelul 1 de mai jos.Since the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 5 corresponds well with the partial amino acid sequences directly determined in the purified PPDK described above, it was confirmed that the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 5 is the amino acid sequence of PPDK. The amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 5 was compared to the amino acid sequences of known PPDKs from Flaveria bidentis and maize. As a result, 40 amino acid residues {Flaveria bidentis) and about 180 amino acid residues (maize) were different in the region of the mature protein. In addition, from the results described above, it was believed that in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 5, the amino acid sequence from the 1st to the 71st amino acid does not exist in the mature protein, but there is a transient peptide, necessary for passing through membranes, which is processed after passing through the membranes. The differences between the amino acid sequences of the mature Flaveria brownii and Flaveria bidentis proteins are shown in Table 1 below.
365365
370370
RO 118451 ΒRO 118451 B
Tabelul 1Table 1
375375
RO 118451 ΒRO 118451 B
Tabelul 1 (continuare)Table 1 (continued)
Exemplul 2. Producerea PPDK de Flaveria brownii în E.coli și măsurarea stabilității la temperatură scăzută 455 Example 2. Production of PPDK by Flaveria brownii in E.coli and measurement of stability at low temperature 4 55
Pentru a confirma faptul că enzima stabilă la temperatură scăzută este produsă în acest moment de la cADN al PPDK de Flaveria brownii, izolată cum s-a descris mai sus, s-a realizat expresia în E.coli după cum urmează.To confirm that the low-temperature stable enzyme is now produced from Flaveria brownii PPDK cDNA isolated as described above, expression in E.coli was performed as follows.
Pentru îndepărtarea peptidei de tranzit și ligarea ADN-ului la un vector de expresie astfel încât cadrele de citire să coincidă, s-au introdus situri de restricție după cum urmează. 460To remove the transit peptide and ligate the DNA to an expression vector so that the reading frames coincide, restriction sites were introduced as follows. 460
S-a digerat p631 cu Saci și s-a reciclizat, pentru a obține p631Sacl (un plasmid la fel ca p631, cu excepția faptului că este deletată regiunea în aval a sitului Saci). S-a realizat PCR folosind p631Sacl ca matriță și folosind primer 4: GATATCAATCCGGTGTCTCCTCC, care conține situl EcoRV preparat pe baza secvenței din vecinătatea regiunii de prelucrarep631 was digested with Saci and recycled to obtain p631Sacl (a plasmid like p631 except that the region downstream of the Saci site is deleted). PCR was performed using p631Sacl as a template and using primer 4: GATATCAATCCGGTGTCTCCTCC, which contains the EcoRV site prepared based on the sequence in the vicinity of the processing region
RO 118451 Β și primer M13 RV (accesibil comercial de la TAKARA SHUZO) complementar la secvența vectorului și fragmentul amplificat s-a subclonat în pCRII. S-a decupat un fragment care conține regiunea N-terminală folosind enzimele de restricție EcoRV și Saci. Trei fragmente ADN, care sunt: fragmentul ADN astfel decupat, fragmentul Sacl-Hindlll din p631 (care conține regiunea rămasă a cADN de PPDK) și un fragment obținut prin digestia pKK233-2 cu Ncol, s-au ligat, după teșirea capetelor cu fragment Klenow și apoi digerarea a ceea ce a rezultat cu Hindlll (Fig. 1). S-a transformat E.coli MV1184 cu plasmidul obținut și s-a folosit pentru experimente de expresie. S-a diluat 1 ml dintr-un mediu precultivat cu 9 ml de mediu LB proaspăt (conținând 50 mg/l ampicilină) și rezultanta s-a cultivat cu agitare 3 h la 37°C. Apoi, s-a adăugat IPTG la o concentrație de 5 mM și s-a continuat cultura pentru alte 3 h urmat de colectarea celulelor prin centrifugare. Celulele s-au suspendat în 0,5 ml dintr-un tampon de extracție (50 mM Hepes-KOH pH 7,5,10 mM MgSO4, 1 mM EDTA, 5 mM DTT) și s-a adăugat lizozim la o concentrație de aproximativ 0,5 mg/ml. Suspensia s-a lăsat să stea în gheață 5 min și apoi s-a tratat cu un distructor de ultrasonare (Model UCD-130T (accesibil comercial de la COSMOBIO) pentru o perioadă de 30 s fiecare, în total 5 min, extrăgându-se enzima. Ceea ce a rezultat s-a centrifugat cu o microcentrifugă timp de 10 min, și supernatantul s-a aplicat la coloană Sephadex G25 echilibrată cu un tampon de coloană (50 mM Hepes-KOH pH 7,0,10 mM MgCI2, 2 mM EDTA, 10 mM DTT) pentru îndepărtarea substanțelor cu greutate moleculară scăzută. Ceea ce a rezultat s-a lăsat să stea la 25°C nu mai puțin de 30 min, prin aceasta realizându-se asocierea la tetramer, care s-a folosit apoi pentru măsurarea activității.RO 118451 Β and M13 RV primer (commercially available from TAKARA SHUZO) complementary to the vector sequence and the amplified fragment was subcloned into pCRII. A fragment containing the N-terminal region was excised using EcoRV and Saci restriction enzymes. Three DNA fragments, which are: the thus excised DNA fragment, the Sac1-HindIII fragment from p631 (containing the remaining region of the PPDK cDNA) and a fragment obtained by digesting pKK233-2 with NcoI, were ligated after blunting the ends with Klenow and then digesting the resulting Hindlll (Fig. 1). E.coli MV1184 was transformed with the resulting plasmid and used for expression experiments. 1 ml of a pre-cultured medium was diluted with 9 ml of fresh LB medium (containing 50 mg/l ampicillin) and the resultant cultured with shaking for 3 h at 37°C. Then, IPTG was added at a concentration of 5 mM and culture was continued for another 3 h followed by collection of cells by centrifugation. Cells were suspended in 0.5 ml of an extraction buffer (50 mM Hepes-KOH pH 7.5, 10 mM MgSO 4 , 1 mM EDTA, 5 mM DTT) and lysozyme was added at a concentration of approximately 0 .5 mg/ml. The suspension was left on ice for 5 min and then treated with an ultrasonic disruptor (Model UCD-130T (commercially available from COSMOBIO) for 30 s each for a total of 5 min, extracting the enzyme. the result was centrifuged with a microcentrifuge for 10 min, and the supernatant was applied to a Sephadex G25 column equilibrated with a column buffer (50 mM Hepes-KOH pH 7.0, 10 mM MgCl 2 , 2 mM EDTA, 10 mM DTT) to remove low molecular weight substances.The resulting was allowed to stand at 25°C for not less than 30 min, thereby making the association to the tetramer, which was then used to measure the activity.
PPDK-urile produse în celulele E.coli de la cADN-uri PPDK de Flaveria brownii, Flaveria bidentisși porumb (harvest Queen) au prezentat în principal aceeași mobilitate ca și enzimele originare din plante în SDS-PAGE. Deși greutățile moleculare ale enzimelor mature, care sunt așteptate de la cADN-urile respective, sunt aproximativ aceleași, greutățile moleculare aparente pe SDS-PAGE diferă substanțial. S-a dovedit că aceasta se datorează diferențelor din compozițiile aminoacide și nu prelucrării prin deleție a proteinelor sau modificărilor după translație, cum ar fi atașarea catenelor de zaharide. Stabilitatea la temperatură scăzută a fiecărui PPDK produs de E.coli a fost identică enzimei corespunzătoare, originară din fiecare plantă. Stabilitatea la temperatură scăzută a PPDK de Flaveria brownii este obținută fără un factor auxiliar specific plantei sau prelucrării după translație, astfel că este de așteptat ca PPDK stabil la temperatură scăzută să fie produs prin introducerea cADN-ului în porumb și exprimarea sa. Fig. 2 arată relația dintre intervalul de timp după plasarea enzimei la 0°C și activitatea relativă a PPDK.PPDKs produced in E.coli cells from Flaveria brownii, Flaveria bidentis, and maize (harvest Queen) PPDK cDNAs showed essentially the same mobility as plant-derived enzymes in SDS-PAGE. Although the molecular weights of the mature enzymes, which are expected from the respective cDNAs, are approximately the same, the apparent molecular weights on SDS-PAGE differ substantially. This has been shown to be due to differences in amino acid compositions and not to protein deletion processing or post-translational modifications such as the attachment of saccharide chains. The low-temperature stability of each PPDK produced by E.coli was identical to the corresponding enzyme originating from each plant. Low-temperature stability of Flaveria brownii PPDK is achieved without a plant-specific auxiliary factor or post-translational processing, so it is expected that low-temperature stable PPDK is produced by introducing the cDNA into maize and expressing it. Fig. 2 shows the relationship between the time interval after placing the enzyme at 0°C and the relative activity of PPDK.
în procesul descris mai sus pentru producerea de PPDK activă în E.coli, cADN-ul, din care s-a îndepărtat regiunea care codifică peptida de tranzit, s-a inserat în vectorul de expresie. Pentru aceasta a fost important să se împerecheze cu precizie situl de decupat cu situl corespunzător la N-terminal al enzimei originare din plantă.In the process described above for the production of active PPDK in E.coli, the cDNA, from which the region encoding the transit peptide was removed, was inserted into the expression vector. For this it was important to precisely pair the site to be cut with the corresponding site at the N-terminal of the enzyme originating from the plant.
RO 118451 ΒRO 118451 B
TabelTable
515515
520520
Mai precis, la momentul realizării experimentului de expresie a cADN de Flaveria brownii, expresia PPDK-urilor de porumb și Flaveria bidentis fuseseră reușite, cu referire la situl de tăiere la porumb în ambele cazuri. Astfel, în expresia cADN de Flaveria brownii, mai 525 întâi s-a tăiat ADN-ul la același sit, folosind primer 2, și el s-a ales pentru exprimarea cADN-ului după construcția unui vector de expresie care conține cADN. Cu toate acestea, nu s-a produs la toate PPDK. Apoi, pe baza secvenței regiunii N-terminale a enzimei originare din frunze s-a construit un vector de expresie în care cADN inserat conține o secvență suplimentară, care codifică extinderea enzimei spre direcția N-terminalului prin 7 resturi, folo- 530 sind primerul 3, și expresia s-a realizat folosind vectorul de expresie. Ca urmare, s-a confirmat producerea de PPDK. Cu toate acestea, chiar cu acest vector de expresie, cantitatea de enzimă produsă a fost mică, astfel că enzima obținută nu a fost într-o cantitate suficientă pentru măsurarea activității sale. Astfel, s-a construit folosind primerul 4, un vector de expresie în care cADN-ul inserat conține încă o secvență suplimentară care condifică extinderea 535 enzimei spre direcția N-terminal prin 1 rest, și s-a realizat expresia folosind vectorul de expresie. Ca urmare, s-a produs o cantitate mare de PPDK și s-a confirmat stabilitatea sa la temperatură scăzută. Secvențele nucleotidice ale primerului 2 și primerului 3 au fost precum urmează:More specifically, at the time of the Flaveria brownii cDNA expression experiment, the expression of the maize and Flaveria bidentis PPDKs had been successful, with reference to the maize cutting site in both cases. Thus, in Flaveria brownii cDNA expression, DNA was first cut at the same site using primer 2, and it was chosen for cDNA expression after construction of an expression vector containing the cDNA. However, it did not occur in all PPDKs. Then, based on the sequence of the N-terminal region of the enzyme originating from leaves, an expression vector was constructed in which the inserted cDNA contains an additional sequence, which encodes the extension of the enzyme towards the N-terminal direction by 7 residues, using primer 3, and expression was achieved using the expression vector. As a result, the production of PPDK was confirmed. However, even with this expression vector, the amount of enzyme produced was small, so the enzyme obtained was not in sufficient quantity to measure its activity. Thus, an expression vector was constructed using primer 4 in which the inserted cDNA still contains an additional sequence that conditions the extension of the 535 enzyme towards the N-terminal direction by 1 residue, and expression was performed using the expression vector. As a result, a large amount of PPDK was produced and its stability at low temperature was confirmed. The nucleotide sequences of primer 2 and primer 3 were as follows:
primer 2: CGGTGTCTCCTCCCGGATATCACGGCTAAAAAGAG 540 primer 3: TTGATATCCCGGTTGTCTCCTCCGGTA.primer 2: CGGTGTCTCCTCCCGGATATCACGGCTAAAAAGAG 540 primer 3: TTGATATCCCGGTTGTCTCCTCCGGTA.
Exemplul 3. Identificarea regiunilor care dau stabilitate la temperatură scăzută în gena PPDK de Flaveria brownii (1) Himere de Flaveria brownii și Flaveria bidentisExample 3. Identification of regions conferring low temperature stability in the PPDK gene of Flaveria brownii (1) Chimeras of Flaveria brownii and Flaveria bidentis
Vectorii de expresie s-au recombinat conform unei metode convenționale, folosind 545 enzime de restricție. Astfel, fragmentul EcoRI-Hindlll al pKK.-brownii s-a schimbat cu fragmentul corespunzător al pKK-bidentis (un plasmid obținut prin inserția cADN-ului de Flaveria bidentis în pKK 223-2 ca în construcția lui pKK-brownii) pentru a obține un plasmid pKK-011. Pe de altă parte, fragmentul EcoRI-Hindlll al pKK-bidentis s-a schimbat cu fragmentul corespunzător al pKK-browniipentru a obține un plasmid pKK-100. în mod similar s-au schimbat 550 fragmentele Ndel-Hindlll pentru a obține pKK-001 și pKK-110. în plus, fragmentul XhoHindlll al pKK-110 s-a schimbat cu fragmentul corespunzător al pKK-bidentis pentru a obține pKK-1101, și fragmentul Xhol-HindllI al pKK-bidentis s-a schimbat cu fragmentul corespunzător al p\<K-brownii pentru a obține pKK-1110. Pentru a recombina ulterior în mod fin fragmentele Xhol-Hindl11 fragmentele s-au lincat prin PCR (metoda POR de lineare). Astfel, s-au 555 preparat primerii complementari la secvența nucleotidică în fragmentul Xhal-Hindlll,The expression vectors recombined according to a conventional method using 545 restriction enzymes. Thus, the EcoRI-HindIII fragment of pKK.-brownii was exchanged with the corresponding fragment of pKK-bidentis (a plasmid obtained by inserting Flaveria bidentis cDNA into pKK 223-2 as in the construction of pKK-brownii) to obtain a plasmid pKK-011. On the other hand, the EcoRI-HindIII fragment of pKK-bidentis was exchanged with the corresponding fragment of pKK-brownii to obtain a plasmid pKK-100. similarly 550 changed the Ndel-HindIII fragments to obtain pKK-001 and pKK-110. In addition, the XhoHindllI fragment of pKK-110 was exchanged with the corresponding fragment of pKK-bidentis to obtain pKK-1101, and the XhoI-HindllI fragment of pKK-bidentis was exchanged with the corresponding fragment of pK-brownii to obtain pKK -1110. In order to subsequently finely recombine the Xhol-Hindl11 fragments, the fragments were ligated by PCR (linear POR method). Thus, primers complementary to the nucleotide sequence in the Xhal-Hindlll fragment were prepared,
RO 118451 Β secvență care este comună în bidentis și brownii, care este un primer link-F: GCAGAGATGATGTTGGCAAGși un primer link-R: CTTGCCAACATGATCTCTGC. Folosind fragmentul Xhol-Hindlll de browniisau bidentissubclonat în pBluescript SK(-) ca matriță, și folosind combinația de primeri link-F/RV sau M4/link-R s-a realizat primul POR. Fragmentele obținute (în total 4 tipuri) s-au purificat prin decuparrea lor din gel. Folosind amestecul de fragment care codifică fosta jumătate a brownii și fragmentul care codifică ultima jumătate de bidentis, sau amestecul fragmentului care codifică fosta jumătate a bidentis și fragmentului care codifică ultima jumătate a brownii ca matriță, și folosind primerii M4/RV, s-a realizat a doua POR. Fragmentele lincate amplificate s-au digerat cu Xhol și Hindlll, și rezultatele s-au schimbat cu regiunea corespunzătoare a pKK-bidentis, pentru a obține pKK-link01 și pKK-link10. Altă pereche de gene himerice s-a preparat folosind situl Pstl dintre situl de recombinare în lincajul PCR și situl Hindlll. Astfel, fragmentul Xhol-Pstl al pKK-link10 și fragmentul Pstl-Hindlll de pKK-bidentis s-au inserat în situl Xhol-Hindlll al pKK-bidentis (reacție de licăre a trei fragmente), pentru a obține pKK-link101. în mod similar, fragmentul Xhol-Pstl al pKK-bidentis și fragmentul Pstl-Hindlll al pKK-browniis-au inserat în situl Xhol-Hindlll al pKK-bidentis, pentru a obține pKK-link110.RO 118451 Β sequence that is common in bidentis and brownii, which is an F-link primer: GCAGAGATGATGTTGGCAAGand an R-link primer: CTTGCCAACATGATCCTGC. Using the browniisau bidentis Xhol-Hindlll fragment subcloned into pBluescript SK(-) as a template, and using the link-F/RV or M4/link-R primer combination the first POR was performed. The obtained fragments (4 types in total) were purified by cutting them out of the gel. Using the mixture of the fragment encoding the former half of brownia and the fragment encoding the latter half of bidentis, or the mixture of the fragment encoding the former half of bidentis and the fragment encoding the latter half of brownia as a template, and using primers M4/RV, a second POR. The amplified linked fragments were digested with XhoI and HindIII, and the results were swapped with the corresponding region of pKK-bidentis to obtain pKK-link01 and pKK-link10. Another chimeric gene pair was prepared using the Pstl site between the recombination site in the PCR ligation and the HindIII site. Thus, the XhoI-Pstl fragment of pKK-link10 and the Pstl-HindIII fragment of pKK-bidentis were inserted into the XhoI-HindIII site of pKK-bidentis (three-fragment annealing reaction), to obtain pKK-link101. similarly, the XhoI-Pstl fragment of pKK-bidentis and the Pstl-HindIII fragment of pKK-browniis inserted into the XhoI-HindIII site of pKK-bidentis, to obtain pKK-link110.
Cele 40 de situri, la care resturile aminoacide sunt diferite între proteinele PPDK de Flaveria brownii și de Flaveria bidentis, există în principal în regiunea N-terminală și C-terminală, și nu sunt atât de numeroase în regiunea centrală, cu alte cuvinte, în situl activ. Astfel, cADN-urile s-au divizat în trei regiuni care sunt regiunile frontală, mediană și din spate, utilizând situri EcoRI- și situri Ndel, care există în mod obișnuit în ambele gene, și aceste fragmente interschimbabile s-au schimbat pentru a prepara gene himerice. Prin verificarea acestor gene himerice s-a determinat care regiune este legată de stabilitatea la temperatură scăzută. Ca urmare, stabilitatea la temperatură scăzută este dobândită când proteina conține regiunea 1/3 din spate a cADN-ului de Flaveria brownii. Când proteina conține regiunea 1/3 din spate a cADN-ului de Flaveria bidentis, proteina a fost sensibilă la temperatură scăzută. Apoi, regiunea 1/3 din spate s-a divizat în 2 regiuni prin enzima de restricție, și fragmentele respective s-au introdus în regiunile corespunzătoare ale pKK-bidentis și s-a verificat stabilitatea la temperatură scăzută. Ca urmare, regiunea din amontele sitului Xhol (cu alte cuvinte, regiunea 1/6 de la C-terminal) a fost necesară și suficientă pentru obținerea stabilității la temperatură scăzută. Apoi, s-a preparat o genă himerică, care conține regiunea 1/6 din spate (fragmentul Xhaol-Hindl11 care conține 7 substituții de resturi aminoacide), prin metoda de lineare PCR și gena amplificată s-a introdus în pKK-bidentis, urmată de măsurarea stabilității la temperatură scăzută, a acestora. Ca urmare, o enzimă himerică pKK-link10, având majoritatea regiunii din spate conținând 4 substituții, a fost stabilă la temperatură scăzută, în timp ce o enzimă himerică pKK-link01, care are fosta jumătate a regiunii din spate care conține 3 substituții, a fost sensibilă la temperatură joasă. Apoi, regiunea din spate s-a recombinat folosind o enzimă de restricție Pstl pentru a prepara gene himerice care au două substituții aminoacide per genă și s-a verificat stabilitatea la temperatură scăzută a genei obținute. Ca urmare, toate genele himerice au prezentat stabilitate la temperatură scăzută. Astfel, s-a acceptat că sunt două sau mai multe regiuni în legătură cu stabilitatea la temperatură scăzută.The 40 sites, where the amino acid residues are different between Flaveria brownii and Flaveria bidentis PPDK proteins, exist mainly in the N-terminal and C-terminal region, and are not so numerous in the central region, in other words, in active site. Thus, the cDNAs were divided into three regions which are the front, middle and back regions using EcoRI- and Ndel-sites, which are commonly present in both genes, and these exchangeable fragments were swapped to prepare chimeric genes. By checking these chimeric genes it was determined which region is related to low temperature stability. As a result, low temperature stability is acquired when the protein contains the posterior 1/3 region of the Flaveria brownii cDNA. When the protein contains the back 1/3 region of the Flaveria bidentis cDNA, the protein was sensitive to low temperature. Then, the back 1/3 region was split into 2 regions by restriction enzyme, and the respective fragments were inserted into the corresponding regions of pKK-bidentis and checked for low temperature stability. As a result, the region upstream of the Xhol site (ie, the 1/6 region from the C-terminus) was both necessary and sufficient to achieve low-temperature stability. Then, a chimeric gene containing the 1/6 back region (Xhaol-Hindl11 fragment containing 7 amino acid residue substitutions) was prepared by the PCR linearization method and the amplified gene was inserted into pKK-bidentis, followed by stability measurement at their low temperature. As a result, a pKK-link10 chimeric enzyme, having most of the back region containing 4 substitutions, was stable at low temperature, while a pKK-link01 chimeric enzyme, having the former half of the back region containing 3 substitutions, a was sensitive to low temperature. Then, the back region was recombined using a PstI restriction enzyme to prepare chimeric genes having two amino acid substitutions per gene, and the low temperature stability of the resulting gene was checked. As a result, all chimeric genes exhibited low temperature stability. Thus, it has been accepted that there are two or more regions related to low temperature stability.
(2) Himere de porumb și Flaveria brownii(2) Maize chimeras and Flaveria brownii
Folosind un primer PPDK-F: CTCACTGTTCGAAGAGAAGC și un primer mNdel: CATATGCTCTGTCCGGCATAATC (catena laterală complementară) conținând sit Ndel ca primeri și cADN al PPDK de porumb ca matriță, s-a realizat PCR și fragmentul amplificat s-a subclonat în pCR II. Acest fragment s-a decupat din pCR II prin Saci și Ndel. Acest fragment, fragmentul Sacl-Smal (fragment vector) al pKK-PPDK, obținut prin digestia cADN alUsing a PPDK-F primer: CTCACTGTTCGAAGAGAAGC and an mNdel primer: CATATGCTCTGTCCGGCATAATC (complementary side chain) containing Ndel site as primers and maize PPDK cDNA as template, PCR was performed and the amplified fragment was subcloned into pCR II. This fragment was excised from pCR II by Saci and NdeI. This fragment, the Sac1-SmaI fragment (vector fragment) of pKK-PPDK, obtained by cDNA digestion of
RO 118451 ΒRO 118451 B
PPDK de Flaveria brownii, teșind rezultanta cu fragment Klenow și apoi digerând ceea ce a rezultat cu Ndel, s-au licat prin reacția de lineare a trei fragmente (fig. 3), pentru a obține pKK-mz/bro(Nde). S-a realizat PCR folosind primer PPDK și un primer mXho: CTCGAGGGATCTCAATCATTG (catenă complementară), și PPDK de porumb ca matriță. Fragmentul obținut s-a subclonat în pCR II, și insertul s-a decupat prin Saci și Xhol din pCR II. Fragmentul decupat s-a ligat cu fragmentul Sacl-Xhol (fragment vector) al pKK-mz/bro(Nde), pentru a obține pKK-mz/bro(Xho).PPDK of Flaveria brownii, cleaving the resultant with the Klenow fragment and then digesting the resulting with NdeI, were lysed by the linearization reaction of three fragments (Fig. 3), to obtain pKK-mz/bro(Nde). PCR was performed using primer PPDK and an mXho primer: CTCGAGGGATCTCAATCATTG (complementary strand), and maize PPDK as template. The resulting fragment was subcloned into pCR II, and the insert excised by Sac and XhoI from pCR II. The excised fragment was ligated with the Sac1-XhoI fragment (vector fragment) of pKK-mz/bro(Nde), to obtain pKK-mz/bro(Xho).
Ambele enzime himerice, care conțin regiunea 1/3 C-terminală (fragment NdelHindlll) a PPDK brownii în PPDK de porumb și enzima himerică care conține regiunea 1/6C-terminală (fragment Xhol-Hindl11) al PPDK brownii în PPDK de porumb au prezentat stabilitate la temperatură scăzută la fel de puternică ca cea a brownii. Astfel, deoarece stabilitatea la temperatură scăzută a putut fi atribuită PPDK de porumb prin acea secvență aminoacidă considerabil diferită de cea a F.brownii, s-a considerat că stabilitatea la temperatură scăzută poate fi dată la PPDK de la diverse plante prin introducerea regiunii 1/3 din spate sau regiunii 1/6 C-terminale. Deoarece PPDK himeric porumb/F.brownii preparat în acest fel conține peptida de tranzit a PPDK de porumb așa cum este, dacă o plantă are o problemă în legătură cu transportul PPDK spre cloroplaste, în care peptida de tranzit este, de asemenea, originară de la Flaveria brownii se apreciază că această problemă poate fi depășită prin introducerea acestei gene himerice în locul genei originare din F.brownii.Both chimeric enzymes containing the 1/3 C-terminal region (NdelHindlll fragment) of brownii PPDK in maize PPDK and the chimeric enzyme containing the 1/6C-terminal region (Xhol-Hindl11 fragment) of brownii PPDK in maize PPDK showed low temperature stability as strong as that of brownie. Thus, since low-temperature stability could be assigned to maize PPDK by that amino acid sequence considerably different from that of F.brownii, it was considered that low-temperature stability could be given to PPDK from various plants by introducing the 1/3 region of back or the 1/6 C-terminal region. Because the maize/F.brownii chimeric PPDK prepared in this way contains the transit peptide of the maize PPDK as it is, if a plant has a problem with the transport of PPDK to chloroplasts, where the transit peptide is also originating from in Flaveria brownii it is appreciated that this problem can be overcome by introducing this chimeric gene instead of the original gene from F. brownii.
(3) Clone mutate punctual(3) Point-mutated clones
Resturile aminoacide ale fragmentului Xhol-Hindlll ale PPDK browniis-au schimbat unul câte unul de la tipul brownii la tipul bidentis. în mod similar, resturile aminoacide ale fragmentului Xhol-Hindlll ale PPDK-bidentis s-au schimat unul câte unul de la tipul bidentis la tipul brownii. Introducerea mutației s-a realizat prin subclonarea fragmentelor Xhol-Hindlll ale cADN-urilor PPDK de F.browniiși F.bidentis în pBluescript IISK(-), și apoi substituirea nucleotidelor prin metoda Kunkel folosind Megalabel kit (accesibil comercial de la TAKARA SHUZO) și Mutan-K kit (accesibil comercial de la TAKARA SHUZO). Secvența primerilor folosiți pentru introducerea mutanților s-a prezentat în tabelul 2. După confirmarea secvenței nucleotidice mutate printr-un secvențer ADN, aceste fragmente s-au inserat în situl XholHindlll al PPDK-bidentis.The amino acid residues of the Xhol-HindIII fragment of PPDK browniis changed one by one from the brownii type to the bidentis type. Similarly, the amino acid residues of the Xhol-HindIII fragment of PPDK-bidentis shifted one by one from the bidentis type to the brownii type. The introduction of the mutation was achieved by subcloning the XhoI-HindIII fragments of the PPDK cDNAs of F. brownii and F. bidentis into pBluescript IISK(-), and then nucleotide substitution by the Kunkel method using the Megalabel kit (commercially available from TAKARA SHUZO) and Mutan- K kit (commercially available from TAKARA SHUZO). The sequence of the primers used to introduce the mutants was shown in Table 2. After confirming the mutated nucleotide sequence by a DNA sequencer, these fragments were inserted into the XholHindlll site of PPDK-bidentis.
605 §§ 605
610610
615615
620620
625625
630630
635635
Tabelul 2Table 2
Primeri folosiți pentru prepararea clonelor mutate punctualPrimers used to prepare point-mutated clones
640640
645645
RO 118451 ΒRO 118451 B
Tabelul 2 (continuare)Table 2 (continued)
Toate enzimele în care un rest aminaocid din regiunea Xhol-Hindl 11 a pKK-1110, aminoacid care este diferit între F.brownii și F.bidentis, s-a substituit la restul aminoacid corespunzător al tipului bidentis prezintă stabilitate la temperatură scăzută. Astfel, se consideră că există o multitudine de mutații care dau stabilitate la temperatură scăzută (deoarece stabilitatea la temperatură scăzută nu se pierde numai prin schimbarea unui rest aminoacid). Apoi, enzimele în care un rest aminoacid din regiunea Xhol-HindllI a pKK-bidentis, rest aminoacid care este diferit între F.brownii și F.bidentis, s-a substituit la restul aminoacid corespunzător al tipului browniis-au verificat dacă au dobândit stabilitate la temperatură scăzută. Astfel, s-a măsurat activitatea enzimei după tratament la 0°C, după 20 min. Ca un rezultat, prin mutația lui 860Gln—►Pro, enzima a dobândit stabilitate la temperatură scăzută (activitatea după tratament la frig este 60..70% din activitatea inițială). Cu mutația lui 885lle-+Leu sau 952lle->Val, pierderea de activitate la temperatură scăzută a fost puțin prevenită. Luând în considerare aceste rezultate și rezultatele enzimei himerice descrise la (1) (pKK-link110), s-a admis că enzima dobândește stabilitate la temperatură scăzută, când aceste mutații coexistă. Din aceste rezultate, s-a ajuns la concluzia că cele trei resturi aminoacide, 869Pro, 185Leu și 952Val sunt legate de stabilitatea la temperatură scăzută. Cu toate acestea, printre aceste resturi în legătură cu stabilitatea la temperatură scăzută a brownii, ca pentru 869Pro și 885Leu aceste resturi sunt ale tipului browniiale PPDK de la porumb. Prin urmare, stabilitatea la temperatură scăzută nu este în mod necesar obținută doar prin faptul că aceste resturi sunt ale tipului brownii, ci se consideră că aceste resturi dau stabilitate termică completă în secvența PPDK a brownii sau bidentis. Prin urmare, în cazurile în care stabilitatea la temperatură scăzută trebuie să fie dată unui PPDK originar de la o specie diferită, a cărui secvență aminoacidă este considerabil diferită de cea a brownii sau bidentis, este de preferat să nu se introducă mutații punctuale și să se prepare o genă himerică în care regiunea care dă stabilitatea la temperatură scăzută să fie introdusă așa cum s-a realizat pentru PPDK de porumb.All enzymes in which an amino acid residue in the Xhol-Hindl 11 region of pKK-1110, an amino acid that is different between F.brownii and F.bidentis, has been substituted for the corresponding amino acid residue of the bidentis type show stability at low temperature. Thus, it is believed that there are a multitude of mutations that confer low-temperature stability (since low-temperature stability is not lost only by changing one amino acid residue). Then, enzymes in which an amino acid residue from the Xhol-HindllI region of pKK-bidentis, an amino acid residue that is different between F.brownii and F.bidentis, was substituted for the corresponding browniis-type amino acid residue, were checked to see if they acquired temperature stability low. Thus, the enzyme activity was measured after treatment at 0°C, after 20 min. As a result, by mutating 860Gln—►Pro, the enzyme acquired stability at low temperature (the activity after cold treatment is 60..70% of the initial activity). With the mutation of 885lle-+Leu or 952lle->Val, the loss of activity at low temperature was slightly prevented. Considering these results and the results of the chimeric enzyme described in (1) (pKK-link110), it was assumed that the enzyme acquires stability at low temperature when these mutations coexist. From these results, it was concluded that the three amino acid residues, 869Pro, 185Leu and 952Val are related to low temperature stability. However, among these residues related to the low temperature stability of the brownie, as for 869Pro and 885Leu these residues are of the PPDK brownie type from corn. Therefore, the low temperature stability is not necessarily achieved only by these residues being of brownii type, but these residues are considered to confer complete thermal stability in the PPDK sequence of brownii or bidentis. Therefore, in cases where low-temperature stability must be given to a PPDK originating from a different species, whose amino acid sequence is considerably different from that of brownii or bidentis, it is preferable not to introduce point mutations and prepare a chimeric gene in which the region conferring low temperature stability is inserted as was done for maize PPDK.
Exemplul 4. Tratarea porumbului cu gena PPDK de Flaveria brownii în conformitate cu metoda lui Gordon-Kamm W.J. et al. (The plant Cell 2:603-618, 1990) sau Kosier M.G. et al. (Bio/Technology 11:194-200, 1993) particule fine de aur sau tungsten se învelesc cu pKK-browniiși particulele învelite se implantează în embrion imatur de porumb sau în culturi de celule în suspensie. De la celulele tratate, se selectează transformanții, și călușurile obținute ale transformanților se cultivă conform unei metode convenționale, după care se regenerează plante din călușuri. Metoda de transformare nu este limitată la metoda bombardamentului cu particule, putându-se folosi metode de transformare care includ electroporări (Rhodes C.A. et al., Science 240: 204-207, 1988), metoda PEGExample 4. Treatment of maize with the PPDK gene of Flaveria brownii according to the method of Gordon-Kamm W.J. et al. (The plant Cell 2:603-618, 1990) or Kosier M.G. et al. (Bio/Technology 11:194-200, 1993) fine gold or tungsten particles are coated with pKK-brownies and the coated particles are implanted into immature maize embryo or suspension cell cultures. From the treated cells, the transformants are selected, and the obtained calluses of the transformants are cultivated according to a conventional method, after which plants are regenerated from the calluses. The transformation method is not limited to the particle bombardment method, transformation methods including electroporation (Rhodes C.A. et al., Science 240: 204-207, 1988), the PEG method can be used
RO 118451 Β (Amstrong C.L. et al., Plant Cell reports 9: 335-339,1990), metoda de electroporare a țesutului (D’Halluin K. Et al., The Plant Cell 4: 1495-1505,1992), metoda Agrobacterium (Hiei V. și Komari T. WO 9400977) și altele asemenea. De la plantele obținute se recuperează semințe care germinează pentru a regenera plante. Se izolează PPDK din frunzele plantelor 695 obținute și se verifică stabilitatea la temperatură joasă. La plantele transformate și netransformate se verifică efectul temperaturii asupra ratei de fotosinteză. Stabilitatea transformării se păstrează prin proliferarea plantelor de porumb care prezintă rate ridicate ale fotosintezei pentru mai multe generații și măsurarea ratelor fotosintezei la diferite temperaturi, precum și măsurarea stabilității la temperatură scăzută a PPDK-urilor izolate din plante. 700RO 118451 Β (Amstrong C.L. et al., Plant Cell reports 9: 335-339,1990), tissue electroporation method (D'Halluin K. Et al., The Plant Cell 4: 1495-1505,1992), method Agrobacterium (Hiei V. and Komari T. WO 9400977) and the like. From the obtained plants, seeds are recovered that germinate to regenerate plants. PPDK is isolated from the leaves of the obtained 695 plants and checked for stability at low temperature. In transformed and non-transformed plants, the effect of temperature on the rate of photosynthesis is verified. Transformation stability is maintained by propagating maize plants exhibiting high photosynthetic rates for several generations and measuring photosynthetic rates at different temperatures, as well as measuring the low-temperature stability of PPDKs isolated from plants. 700
Exemplul 5. Transformarea Flaveria bidentis cu gena PPDK de Flaveria browniiExample 5. Transformation of Flaveria bidentis with the Flaveria brownii PPDK gene
Se introduce într-un plasmid Ti nevirulent al Agrobacterium tumefaciens un vector intermediar care conține cADN-ul de lungime totală prezentat în SECV ID NR: 5 și o genă raportor. Aceasta poate fi realizată prin metoda descrisă în Draper J. et al., editori Plant Genetic Transformation and Gene Expression-a laboratory manual, Blackwell Scientific 705 Publication (ISBN O-632-02172-1).An intermediate vector containing the full-length cDNA shown in SEQ ID NO: 5 and a reporter gene is inserted into a non-virulent Ti plasmid of Agrobacterium tumefaciens. This can be accomplished by the method described in Draper J. et al., editors Plant Genetic Transformation and Gene Expression-a laboratory manual, Blackwell Scientific 705 Publication (ISBN O-632-02172-1).
Pe de altă parte, țesut de frunză sau calus de Flaveria bidentis se infectează cu Agrobacterium tumefaciens menționat mai sus. Aceasta se poate realiza cultivând țesutul sau călușul împreună cu Agrobacterium tumefaciens. Celulele infectate sunt selectate pe baza rezistenței la medicament. Din călușul selectat se regenerează plante întregi prin me- 710 tode convenționale. De la plantele obținute se recuperează semințe și se germinează pentru regenerarea plantelor. Se izolează PPDK din frunzele plantelor obținute și se verifică stabilitatea la temperatură scăzută. Se verifică la plantele transformate și netransformate efectul temperaturii asupra ratei de fotosinteză. Stabilitatea transformării se menține prin proliferarea plantelor care prezintă rate ridicate la temperatură scăzută mai multe generații și prin 715 măsurarea ratelor fotosintezei la diferite temperaturi precum și a stabilității la temperatură scăzută, a PPDK-urilor izolate din plante.On the other hand, leaf tissue or callus of Flaveria bidentis becomes infected with Agrobacterium tumefaciens mentioned above. This can be done by culturing the tissue or callus with Agrobacterium tumefaciens. Infected cells are selected based on drug resistance. Whole plants are regenerated from the selected stem by conventional methods. From the obtained plants, seeds are recovered and germinated for plant regeneration. PPDK is isolated from the leaves of the obtained plants and the stability at low temperature is checked. The effect of temperature on the rate of photosynthesis is checked in transformed and non-transformed plants. Transformation stability is maintained by propagating plants exhibiting high rates at low temperature for several generations and by 715 measuring the photosynthetic rates at different temperatures, as well as the low temperature stability, of PPDKs isolated from plants.
RO 118451 ΒRO 118451 B
LISTA DE SECVENȚELIST OF SEQUENCES
SECV IO NR: 1SEQ ID NO: 1
LUNGIMEA SECVENȚEI: 2915SEQUENCE LENGTH: 2915
TIPUL SECVENȚEI: acid nucleicSEQUENCE TYPE: nucleic acid
DESCRIEREA SECVENȚEI:SEQUENCE DESCRIPTION:
CGATCTCCTT CTGCTATTGC TGATATCTCA AXTTCACAGG TGAAGAAGG ATG ATG ACT 58CGATCTCCTT CTGCTATTGC TGATATCTCA AXTTCACAGG TGAAGAAGG ATG ATG ACT 58
Met Met SerMet Met Ser
RO 118451 ΒRO 118451 B
800800
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
ATG ACA TCA CATATG ACA TCA CAT
GCA GCG GTG GTG GCT CGC GGA TGG GGC AAA TGT TGTGCA GCG GTG GTG GCT CGC GGA TGG GGC AAA TGT TGT
16901690
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
Leu Pro Tyr Gin Arg Ser Asp Phe Glu Gly lle Phe Arg Ala Met Asp 680 685 690=Leu Pro Tyr Gin Arg Ser Asp Phe Glu Gly lle Phe Arg Ala Met Asp 680 685 690=
GGA CTT CCT GTA ACT ATC CGC CTT CTA GAC CCT CCA CTT CAT GAG TTT 2170GGA CTT CCT GTA ACT ATC CGC CTT CTA GAC CCT CCA CTT CAT GAG TTT 2170
Gly Leu Pro Val Thr lle Arg Leu Leu Asp Pro Pro Leu His Glu Phe 695 700705Gly Leu Pro Val Thr lle Arg Leu Leu Asp Pro Pro Leu His Glu Phe 695 700705
TTA CCC GAA GCT GAT CTA GAA CAC ATA CTG AAC GAA CTT GCA GTC GAC 2218 935TTA CCC GAA GCT GAT CTA GAA CAC ATA CTG AAC GAA CTT GCA GTC GAC 2218 935
Leu Pro Glu Gly Asp Leu Glu His Xle Val Aan Glu Leu Ala Val Aap 710 715720Leu Pro Glu Gly Asp Leu Glu His Xle Val Aan Glu Leu Ala Val Aap 710 715720
ACA GGC ATG ACT GCA GAT GAA ATC TAT TCA AAA ATC GAA AAT CTA TCT2266ACA GGC ATG ACT GCA GAT GAA ATC TAT TCA AAA ATC GAA AAT CTA TCT2266
Thr Gly Met Ser Ala Aap Glu lle Tyr Ser Lys lle Glu Asn Leu Ser940Thr Gly Met Ser Ala Aap Glu lle Tyr Ser Lys lle Glu Asn Leu Ser940
725 730735725 730735
GAA GTG AAC CCT ATG CTT GGT TTC CGT GGT TGC AGA TTA GGG ATT TCA2314GAA GTG AAC CCT ATG CTT GGT TTC CGT GGT TGC AGA TTA GGG ATT TCA2314
Glu Val Asn Pro Met Leu Gly Phe Arg Gly Cys Arg Leu Gly lleSerGlu Val Asn Pro Met Leu Gly Phe Arg Gly Cys Arg Leu Gly lleSer
945945
740 745 750755740 745 750755
TAC CCC GAG CTA ACA GAA ATG CAA GTT CGT GCG ATC TTT CAA GCT GCA2362TAC CCC GAG CTA ACA GAA ATG CAA GTT CGT GCG ATC TTT CAA GCT GCA2362
Tyr Pro Glu Leu Thr Glu Met Gin Val Arg Ala lle Phe Gin AlaAlaTyr Pro Glu Leu Thr Glu Met Gin Val Arg Ala lle Phe Gin AlaAla
950 760 765770950 760 765770
GTG TCT ATG ACC AAT CAG GGG GTG ACT GTA ATA CCA GAG ATC ATG CTT2410GTG TCT ATG ACC AAT CAG GGG GTG ACT GTA ATA CCA GAG ATC ATG CTT2410
Val Ser Met Thr Aan Gin Gly Val Thr Val Xle Pro Glu lle Met ValVal Ser Met Thr Aan Gin Gly Val Thr Val Xle Pro Glu lle Met Val
775 780 785955775 780 785955
CCG TTA CTG GGG ACA CCT CAG GAA TTA CCT CAT CAA ATC AGT GTA ATT2458CCG TTA CTG GGG ACA CCT CAG GAA TTA CCT CAT CAA ATC AGT GTA ATT2458
Pro Leu Val Gly Thr Pro Gin Glu Leu Arg His Gin lle Ser Val XlePro Leu Val Gly Thr Pro Gin Glu Leu Arg His Gin lle Ser Val Xle
790 795800790 795800
960960
CGT GGA CTA GCT GCA AAT GTG TTT GCT GAA ATG GGG GTG ACA TTG GAA 2506CGT GGA CTA GCT GCA AAT GTG TTT GCT GAA ATG GGG GTG ACA TTG GAA 2506
Arg Gly Val Ala Ala Asn Val Phe Ala Glu Met Gly Val Thr Leu Glu ®05 810815Arg Gly Val Ala Ala Asn Val Phe Ala Glu Met Gly Val Thr Leu Glu ®05 810815
965965
TAT AAA CTG GGA ACG ATG ATT GAG ATT CCT CGA GCT GCT TTA ATA GCT 2554TAT AAA CTG GGA ACG ATG ATT GAG ATT CCT CGA GCT GCT TTA ATA GCT 2554
RO 118451 ΒRO 118451 B
950950
RO 118451 ΒRO 118451 B
SECV ID NR: 2SEQ ID NO: 2
LUNGIMEA SECVENȚEI: 288o 1010SEQUENCE LENGTH: 288o 1010
TIPUL SECVENȚEI: acid nucleicSEQUENCE TYPE: nucleic acid
DESCRIEREA SECVENȚEI:SEQUENCE DESCRIPTION:
CGGCGCAGTA GGGGATCGGA AGG ATG GCG GCA TCG GTT TCC AGG GCC ATC TGC 53CGGCGCAGTA GGGGATCGGA AGG ATG GCG GCA TCG GTT TCC AGG GCC ATC TGC 53
Met Ala Ala Ser Val Ser Arg Ala Ile CysMet Ala Ala Ser Val Ser Arg Ala Ile Cys
10501050
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 Β 1135 395 400 405 410RO 118451 Β 1135 395 400 405 410
Η AGG ACA GGG AAA COT ACG GGC AAA AGT GCC OTG AAG ATC GCC GTG GAC 1301 Arg Thr Gly Lys Arg Thr Gly Lys Ser Ala Val Lys lle Ala Val Asp 1140 415 420 425 j ATG GTT AAC GAG GGC CTT GTT GAG CCC CGC TCA GCG ATC AAG ATG OTA 1349Η AGG ACA GGG AAA COT ACG GGC AAA AGT GCC OTG AAG ATC GCC GTG GAC 1301 Arg Thr Gly Lys Arg Thr Gly Lys Ser Ala Val Lys lle Ala Val Asp 1140 415 420 425 j ATG GTT AAC GAG GGC CTT GTT GAG CCC CGC TCA GCG ATC AAG ATG OTA 1349
Met Val Asn Glu Gly Leu Val Glu Pro Arg Ser Ala lle Lys Met Val j 1145 430 435440Met Val Asn Glu Gly Leu Val Glu Pro Arg Ser Ala lle Lys Met Val j 1145 430 435440
GAG CCA GGC CAC CTG GAC CAG CTT CTT CAT CCT CAG TTT GAG AAC CCG1397GAG CCA GGC CAC CTG GAC CAG CTT CTT CAT CCT CAG TTT GAG AAC CCG1397
Glu Pro Gly His Leu Asp Gin Leu Leu His Pro Gin Phe Glu AsnProGlu Pro Gly His Leu Asp Gin Leu Leu His Pro Gin Phe Glu AsnPro
1150 445 450455 1150 445 450455
TCG GCG TAC AAG GAT CAA GTC ATT GCC ACT GOT CTG CCA GCC TCA CCT1445 j Ser Ala Tyr Lys Asp Gin Val lle Ala Thr Gly Leu Pro Ala Ser ProTCG GCG TAC AAG GAT CAA GTC ATT GCC ACT GOT CTG CCA GCC TCA CCT1445 j Ser Ala Tyr Lys Asp Gin Val lle Ala Thr Gly Leu Pro Ala Ser Pro
460 465470460 465470
1155 j GGG GCT GCT GTG GGC CAG GTT OTG TTC ACT GCT GAA GAT GCT GAA GCA 14931155 j GGG GCT GCT GTG GGC CAG GTT OTG TTC ACT GCT GAA GAT GCT GAA GCA 1493
Gly Ala Ala Val Gly Gin Val Val Phe Thr Ala Glu Asp Ala Glu Ala *75 480 485490Gly Ala Ala Val Gly Gin Val Val Phe Thr Ala Glu Asp Ala Glu Ala *75 480 485490
1160 TGG CAT TCC CAA GGG AAA GCT GCT ATT CTG OTA AGG GCG GAG ACC AGC 1541 Trp His Ser Gin Gly Lys Ala Ala lle Leu Val Arg Ala Glu Thr Ser 495 5005051160 TGG CAT TCC CAA GGG AAA GCT GCT ATT CTG OTA AGG GCG GAG ACC AGC 1541 Trp His Ser Gin Gly Lys Ala Ala lle Leu Val Arg Ala Glu Thr Ser 495 500505
CCT GAG GAC GTT GOT GGC ATG CAC GCT GCT GTG GGG ATT CTT ACA GAG 1589 1103 Pro Glu Asp Val Gly Gly Met His Ala Ala Val Gly lle Leu Thr Glu 510 515 520CCT GAG GAC GTT GOT GGC ATG CAC GCT GCT GTG GGG ATT CTT ACA GAG 1589 1103 Pro Glu Asp Val Gly Gly Met His Ala Ala Val Gly lle Leu Thr Glu 510 515 520
AGG GGT GGC ATG ACT TCC CAC GCT GCT GTG GTC GCA CGT TGG TGG GGG 1637 1170 Arg Gly Gly Met Thr Ser His Ala Ala Val Val Ala Arg Trp Trp Gly i 525 530 535AGG GGT GGC ATG ACT TCC CAC GCT GCT GTG GTC GCA CGT TGG TGG GGG 1637 1170 Arg Gly Gly Met Thr Ser His Ala Ala Val Val Ala Arg Trp Trp Gly i 525 530 535
AAA TGC TGC GTC TCG GGA TGC TCA GGC ATT CGC OTA AAC GAT GCG GAG 1685AAA TGC TGC GTC TCG GGA TGC TCA GGC ATT CGC OTA AAC GAT GCG GAG 1685
11751175
Lys Cys Cys Val Ser Gly Cys Ser Gly lle Arg Val Asn Asp Ala GluLys Cys Cys Val Ser Gly Cys Ser Gly lle Arg Val Asn Asp Ala Glu
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
ί Iи I
RO 118451 ΒRO 118451 B
SECV ID NR: 3SEQ ID NO: 3
LUNGIMEA SECVENȚEI: 261oSEQUENCE LENGTH: 261o
TIPUL SECVENȚEI; acid nucleicSEQUENCE TYPE; nucleic acid
BESCRIEREA SECVENȚEI:SEQUENCE DESCRIPTION:
RO 118451 ΒRO 118451 B
GAATTCTCAA TCCTTTGCTC ATCGCAGCAT ATCAATGTTA ACACATAAAC TTTAGGAGGA 60GAATTCTCAA TCCTTTGCTC ATCGCAGCAT ATCAATGTTA ACACATAAAC TTTAGGAGGA 60
AGAAAACTT ATG GCA AAA TGG GTT TAT AAG TTC GAA GAA GGC AAT GCA TCT 111AGAAAACTT ATG GCA AAA TGG GTT TAT AAG TTC GAA GAA GGC AAT GCA TCT 111
Met Ala Lys Trp Val Tyr Lys Phe Glu Glu Gly Asn Ala SerMet Ala Lys Trp Val Tyr Lys Phe Glu Glu Gly Asn Ala Ser
Arg Phe Ala Tyr Asp Ser Tyr Arg Arg Phe Ile Gin Met Tyr Ser AapArg Phe Ala Tyr Asp Ser Tyr Arg Arg Phe Ile Gin Met Tyr Ser Aap
RO 118451 ΒRO 118451 B
130130
135135
140140
13401340
Glu Tyr Leu Ile Asn Ala Gin Gly Glu Asp Val Val Ala Gly Val ArgGlu Tyr Leu Ile Asn Ala Gin Gly Glu Asp Val Val Ala Gly Val Arg
13801380
RO 118451 ΒRO 118451 B
275275
280280
285285
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
lle Met lle Pro Leu Val Gly Glu Lys Lys Glu Leu Lys Phe Val Lyslle Met lle Pro Leu Val Gly Glu Lys Lys Glu Leu Lys Phe Val Lys
RO 118451 ΒRO 118451 B
835 840835 840
15051505
15101510
15151515
15201520
15251525
15301530
15351535
15401540
26102610
RO 118451 ΒRO 118451 B
SECV ID NR: 4SEQ ID NO: 4
LUNGIMEA SECVEJTEIE: 2722SEQUEL LENGTH: 2722
TIPUL SECVENȚEI: acid nuci eicSEQUENCE TYPE: nut eic acid
DESCRIEREA SECVENȚEI:SEQUENCE DESCRIPTION:
Gly Met Met Asp Thr Ile Leu Asn Leu Gly Leu Asn Asp Lys Thr ValGly Met Met Asp Thr Ile Leu Asn Leu Gly Leu Asn Asp Lys Thr Val
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
390 395390 395
RO 118451 ΒRO 118451 B
Leu Gly Thr Thr Asn Pro Glu Ile Tyr Glu Met Gin Ile Arg Ala PheLeu Gly Thr Thr Asn Pro Glu Ile Tyr Glu Met Gin Ile Arg Ala Phe
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
870 875 880870 875 880
GAA AAT TAAATTAACT TTTTTGGTTT 2722GAA AAT TAAATTAACT TTTTTGGTTT 2722
Glu AsnGlu Asn
885885
SECV ID NRs 5SEQ ID NOs 5
LUNGIMEA SECVENȚEI: 318o TIPUL SECVENȚEI: acid nucleic DESCRIEREA SECVENȚEI:SEQUENCE LENGTH: 318o SEQUENCE TYPE: nucleic acid SEQUENCE DESCRIPTION:
CTGAAATTCC CGTAATCTAT CATCATTTAC ACCACAAATC GATTCACATC CTCACCGAATCTGAAATTCC CGTAATCTAT CATCATTTAC ACCACAAATC GATTCACATC CTCACCGAAT
AGAAATCAAA TATCATTTAC TCCATCTCAC GATCTCCTTT TGCTATTGCT GATACCTCAAAGAAATCAAA TATCATTTAC TCCATTCCAC GATCTCCTTT TGCTATTGCT GATACCTCAA
120120
171171
219219
267267
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
CTT CAT CCA CAG TTT GAG AAT CCG TCT GCT TAC AAA AGC CAT GTG GTA 1563CTT CAT CCA CAG TTT GAG AAT CCG TCT GCT TAC AAA AGC CAT GTG GTA 1563
19551955
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
GGG GTG GGT CAA TTG ATC AAG ATG GCC ACG GAG AAA GGT CGT GCA GCC 2859GGG GTG GGT CAA TTG ATC AAG ATG GCC ACG GAG AAA GGT CGT GCA GCC 2859
RO 118451 ΒRO 118451 B
TAAGCTTTGA AAGGAGGATG GCTTATTTGC TTCATCTTTT CCGCCATTCT3056TAAGCTTTGA AAGGAGGATG GCTTATTTGC TTCATCTTTT CCGCCATCT3056
Val 9552100Wave 955 2100
ΑΤΆΤΤΑΤΤΤΤ GGTTTCATCC TTATTOTAAT GCTGAAAATG AACGATGTTT AAACAAAACA 3116ΑΤΆΤΤΑΤΤΤΤ GGTTTCATCC TTATTOTAAT GCTGAAAATG AACGATGTTT AAACAAAACA 3116
ACCCATTATA TTTTGCTTTG OTATGCAATA ATCTACTTTT CAAACAAAAA ΆΑΑΑΑΆΆΑΑΑ 3176ACCCATTATA TTTTGCTTTG OTATGCAATA ATCTACTTTT CAAACAAAAAA ΆΑΑΑΑΆΆΑΑΑ 3176
ΛΛΛΑ3180ΛΛΛΑ3180
21052105
SECV ID NRî 6SEQ ID NO 6
LUNGIMEA SECVENȚEI: 18LENGTH OF SEQUENCE: 18
TIPUL SECVENȚEI: acid nucleic 2110SEQUENCE TYPE: Nucleic acid 2110
DESCRIEREA SECVENȚEI:SEQUENCE DESCRIPTION:
GACGGCTAAA AAGAGGGT 18 GACGGCTAAA AAGAGGGT 18
SECV OI NR: 7 2115SECV OI NO: 7 2115
LUNGIMEA SECVENȚEI: 2oSEQUENCE LENGTH: 2o
TIPUL SECVENȚEI: acid nucleicSEQUENCE TYPE: nucleic acid
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
SECV ID NR; 13SEQ ID NO; 13
LUNGIMEA SECVENȚEI: 2o TIPUL SECVENȚEI; acid nucleic DESCRIEREA SECVENȚEI: GCAGAGATGA TGTTGGCAAGSEQUENCE LENGTH: 2o SEQUENCE TYPE; nucleic acid SEQUENCE DESCRIPTION: GCAGAGATGA TGTTGGCAAG
SECV ID NR: 14SEQ ID NO: 14
LUNGIMEA SECVENȚEI : 2o TIPUL SECVENȚEI : acid nucleic DESCRIEREA SECVENȚEI: CTTGCCAACA TCATCTCTGCSEQUENCE LENGTH: 2o SEQUENCE TYPE: nucleic acid SEQUENCE DESCRIPTION: CTTGCCAACA TCATCTCTGC
SECV ID NR: LSSEQ ID NO: LS
LUNGIMEA SECVENȚEI : 2o TIPUL SECVENȚEI : acid nucleic DESCRIEREA SECVENȚEI;SEQUENCE LENGTH: 2o SEQUENCE TYPE: nucleic acid SEQUENCE DESCRIPTION;
CTCACTGTTC GAAGAGAAGCCTCACTGTTC GAAGAGAAGC
SECV ID NR: 16SEQ ID NO: 16
LUNGIMEA SECVENȚEI ; 23 TIPUL SECVENȚEI ; acid nucleic DESCRIEREA SECVENȚEI: CATATGCTCT GTCCGGCATA ATCSEQUENCE LENGTH ; 23 SEQUENCE TYPE ; nucleic acid SEQUENCE DESCRIPTION: CATATGCTCT GTCCGGCATA ATC
SECV ID NR; 17SEQ ID NO; 17
LUNGIMEA SECVENȚEI: 21 TIPUL SECVENȚEI : acid nucleic DESCRIEREA SECVENȚEI;SEQUENCE LENGTH: 21 SEQUENCE TYPE: nucleic acid SEQUENCE DESCRIPTION;
CTCGAGGGAT CTCAATCATT GCTCGAGGGAT CTCAATCATT G
SECV ID NR: 18SEQ ID NO: 18
LUNGIMEA SECVENȚEI; 18 TIPUL SECVENȚEI ; acid nucleic DESCRIEREA SECVENȚEI:SEQUENCE LENGTH; 18 SEQUENCE TYPE ; nucleic acid SEQUENCE DESCRIPTION:
21702170
2o2o
2o2o
2o2o
21752175
21802180
21852185
21902190
21952195
22002200
22052205
22102210
RO 118451 ΒRO 118451 B
RO 118451 ΒRO 118451 B
TIPUL SECVENTcI: acid nucleicSEQUENCE TYPE: nucleic acid
DcSCRIEREA SECVENȚE®;DcWRITING SEQUENCES®;
GCTTAAACAA TGACTTGTGCGCTTAAACAA TGACTTGTGC
3ECV ID NR: 253ECV ID NO: 25
LUNGIMEA SECVENȚEI : 22SEQUENCE LENGTH : 22
TIPUL SECVENȚEI : acid nucleic □ESCRIREA SECVENȚEI:TYPE OF SEQUENCE: nucleic acid □WRITING OF THE SEQUENCE:
CCĂATCTCAT CAGCTATTAA agCCĂATCTCAT CAGCTATTAA ag
SECV ID NR; 26SEQ ID NO; 26
LUNGIMEA SECVENȚEI: 2oSEQUENCE LENGTH: 2o
TIPUL SECVENȚEI: acid nucleicSEQUENCE TYPE: nucleic acid
DESCRIEREA SECVENȚEI;SEQUENCE DESCRIPTION;
GCTTCTTTTG CAATCTCTTCGCTTCTTTTG CAATCTCTTC
SECV IO NR: 27SEQ ID NO: 27
LUNGIMEA SECVENȚEI: 18LENGTH OF SEQUENCE: 18
TIPUL SECVENȚEI : acid nucleicSEQUENCE TYPE: nucleic acid
DESCRIEREA SECVENȚEI»SEQUENCE DESCRIPTION»
CGAAAAGAAC TCAGCTTCCGAAAAAAGAC TCAGCTTC
SECV ID NR; 28SEQ ID NO; 28
LUNGIMEA SECVENȚEI; 23SEQUENCE LENGTH; 2. 3
TIPUL SECVENȚEI; acid nucleicSEQUENCE TYPE; nucleic acid
DESCRIEREA SECVENȚEI:SEQUENCE DESCRIPTION:
CAAGATAAAT CGGCAAAAAC TTGCAAGATAAAT CGGCAAAAC TTG
SECV ID NR: 29SEQ ID NO: 29
LUNGIMEA SECVENȚEI; 23SEQUENCE LENGTH; 2. 3
TIPUL SECVENȚEI ; acid nucleicSEQUENCE TYPE ; nucleic acid
DESCRIEREA SECVENȚEI;SEQUENCE DESCRIPTION;
GAATGCCTTG AGAAAGATAA ATCGAATGCCTTG AGAAAGATAA ATC
22652265
2o2o
22702270
22752275
22802280
2o2o
22852285
22902290
22952295
23002300
23052305
23102310
Claims (7)
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP19778094 | 1994-07-29 | ||
PCT/JP1994/002022 WO1995015385A1 (en) | 1993-12-03 | 1994-12-01 | Polypeptide having cold-resistant pyruvate phosphate dikinase activity, dna coding for the same, and recombinant vector and transformed plant both containing said dna |
PCT/JP1995/001040 WO1996004369A1 (en) | 1994-07-29 | 1995-05-30 | Polypeptide having cold-resistant pyruvate phosphate dikinase activity, dna coding for the polypeptide, recombinant vector containing the dna, and transformed plant |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RO118451B1 true RO118451B1 (en) | 2003-05-30 |
Family
ID=16380231
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RO96-00667A RO118451B1 (en) | 1994-07-29 | 1995-05-30 | Polypeptide with dikinase orthophosphate pyruvate activity, dna encoding the same, recombinant vector with said dna and process for modifying a plant by means of said vector |
Country Status (6)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN1174093C (en) |
BR (1) | BR9506291A (en) |
RO (1) | RO118451B1 (en) |
RU (1) | RU2136748C1 (en) |
UA (1) | UA28003C2 (en) |
WO (1) | WO1996004369A1 (en) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0690128A4 (en) * | 1993-12-03 | 2004-03-03 | Japan Tobacco Inc | Polypeptide having cold-resistant pyruvate phosphate dikinase activity, dna coding for the same, and recombinant vector and transformed plant both containing said dna |
CN102653727A (en) * | 2012-01-18 | 2012-09-05 | 江南大学 | Construction method and application of pyruvic acid-phosphoric acid double-kinase recombinant expression strain |
-
1995
- 1995-05-30 RO RO96-00667A patent/RO118451B1/en unknown
- 1995-05-30 UA UA96031191A patent/UA28003C2/en unknown
- 1995-05-30 WO PCT/JP1995/001040 patent/WO1996004369A1/en active Application Filing
- 1995-05-30 CN CNB95190941XA patent/CN1174093C/en not_active Expired - Fee Related
- 1995-05-30 BR BR9506291A patent/BR9506291A/en not_active Application Discontinuation
- 1995-05-30 RU RU96108242A patent/RU2136748C1/en not_active IP Right Cessation
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO1996004369A1 (en) | 1996-02-15 |
CN1174093C (en) | 2004-11-03 |
BR9506291A (en) | 1997-08-05 |
MX9601212A (en) | 1997-09-30 |
CN1135770A (en) | 1996-11-13 |
UA28003C2 (en) | 2000-10-16 |
RU2136748C1 (en) | 1999-09-10 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CA2106960C (en) | Plant promoter involved in controlling lipid biosynthesis in seeds | |
AU2002333434B2 (en) | Coffee plant with reduced alpha-D-galactosidase activity | |
Higgins et al. | The sequence of a pea vicilin gene and its expression in transgenic tobacco plants | |
ES2275302T3 (en) | NUCLEIC ACID MOLECULES FROM ARTICHOKE (CYNARA SCOLYMUS) CODIFYING ENZYMES THAT HAVE FRUCTOSIPOLIMERASE ACTIVITY. | |
JPH10501972A (en) | Plant virus resistance gene and method | |
JPH05508774A (en) | Increased starch content in plants | |
HU218048B (en) | Process for producing transgenic plants altered in habitus and yeald with utilyzing plasmides | |
ES2265956T3 (en) | MODIFIED PLANTS. | |
JPH06502759A (en) | Recombinant ACC synthase | |
WO2009021448A1 (en) | A plant height regulatory gene and uses thereof | |
US20040019933A1 (en) | Application of aspen MADS-box genes to alter reproduction and development in trees | |
CN106834305B (en) | Rice male fertility regulation gene OsSTRL2 and application thereof | |
JP2001512322A (en) | Protein complementation in transgenic plants | |
AU737542B2 (en) | Genes controlling floral development and apical dominance in plants | |
CZ136196A3 (en) | Polypeptide nucleotide chain, dna vector, process for preparing such polypeptide and a plant obtained by genetic engineering method | |
AU2011273569A1 (en) | Gene involved in the development of the seed | |
US20040111764A1 (en) | Composition and method for increased meiotic recombination in plants | |
JP3329820B2 (en) | Polypeptide having low-temperature-resistant pyruvate phosphate dikinase activity, DNA encoding the same, recombinant vector containing the DNA, and transformed plant | |
CA2258571A1 (en) | Plant sterol reductases and uses thereof | |
US20030093835A1 (en) | Chimeric genes controlling flowering | |
RO118451B1 (en) | Polypeptide with dikinase orthophosphate pyruvate activity, dna encoding the same, recombinant vector with said dna and process for modifying a plant by means of said vector | |
HUT73740A (en) | Debranching enzymes and dna sequences coding them, suitable for changing the degree of branching of amylopectin starch in plants | |
CN111788216B (en) | Agent for controlling formation of salt vesicle cell and plant body into which the agent is introduced | |
JPH10512451A (en) | Deoxyribonucleic acid encoding glutathione S-transferase and use thereof | |
JP3513192B2 (en) | A novel rice starch branching enzyme gene |