PL241130B1 - Szczepy bakteriofagów specyficzne wobec bakterii Escherichia coli oraz ich zastosowanie do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych - Google Patents

Szczepy bakteriofagów specyficzne wobec bakterii Escherichia coli oraz ich zastosowanie do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych Download PDF

Info

Publication number
PL241130B1
PL241130B1 PL430175A PL43017519A PL241130B1 PL 241130 B1 PL241130 B1 PL 241130B1 PL 430175 A PL430175 A PL 430175A PL 43017519 A PL43017519 A PL 43017519A PL 241130 B1 PL241130 B1 PL 241130B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
bacteriophage
escherichia coli
preparations
huff
use according
Prior art date
Application number
PL430175A
Other languages
English (en)
Other versions
PL430175A1 (pl
Inventor
Marta Kuźmińska-Bajor
Maciej Kuczkowski
Original Assignee
Wrocław University Of Environmental And Life Sciences
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Wrocław University Of Environmental And Life Sciences filed Critical Wrocław University Of Environmental And Life Sciences
Priority to PL430175A priority Critical patent/PL241130B1/pl
Publication of PL430175A1 publication Critical patent/PL430175A1/pl
Publication of PL241130B1 publication Critical patent/PL241130B1/pl

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K35/00Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
    • A61K35/66Microorganisms or materials therefrom
    • A61K35/76Viruses; Subviral particles; Bacteriophages
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2795/00Bacteriophages
    • C12N2795/00011Details
    • C12N2795/10011Details dsDNA Bacteriophages
    • C12N2795/10111Myoviridae
    • C12N2795/10121Viruses as such, e.g. new isolates, mutants or their genomic sequences
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2795/00Bacteriophages
    • C12N2795/00011Details
    • C12N2795/10011Details dsDNA Bacteriophages
    • C12N2795/10111Myoviridae
    • C12N2795/10132Use of virus as therapeutic agent, other than vaccine, e.g. as cytolytic agent
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)

Abstract

Wynalazek dotyczy nowego szczepu bakteriofaga specyficznego wobec bakterii należących do gatunku Escherichia coli, wybranego ze szczepów zdeponowanych w Polskiej Kolekcji Mikroorganizmów pod numerami depozytowymi: F/00119, F/00120, F/00121, F/00122. Wynalazek dotyczy także zastosowanie szczepu bakteriofaga, wybranego ze szczepów zdeponowanych w Polskiej Kolekcji Mikroorganizmów pod wskazanymi numerami, do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych, służących do zwalczania bakterii Escherichia coli.

Description

PL 241 130 B1
Opis wynalazku
Bakterie Escherichia coli należą do Gram-ujemnych pałeczek z rodziny Enterobacteriaceae i stanowią powszechny czynnik etiologiczny zachorowań ludzi i zwierząt na całym świecie. Pałeczki E. coli charakteryzują się dużym zróżnicowaniem genetycznym i właściwościami, w tym zdolnością do zajmowania różnych środowisk. Gatunek E. coli obejmuje zarówno szczepy komensalne stanowiące prawidłową mikroflorę jelitową zarówno ludzi, jak i zwierząt stałocieplnych oraz szczepy patogenne [1]. Do czynników będącym jednym z największych zagrożeń chorobotwórczych u ludzi zdrowia u ludzi zalicza się enterokrwotoczne szczepy E. coli (ang. enterohemorrhagic Escherichia coli, EHEC), wywołujące biegunki krwotoczne, z dużym ryzykiem wystąpienia komplikacji w postaci zespołu hemolitycznomocznicowego (ang. haemolytic-uraemic syndrome, HUS), który prowadzi do uszkodzenia nerek [2]. Bakterie te zaliczane są do bezwzględnych patogenów jelitowych. W przeciwieństwie do nich, patogeny pozajelitowe ExPEC (ang. extraintestinal pathogenic E. coli) są fakultatywnymi patogenami, które wchodzą w skład prawidłowej flory jelitowej pewnej części zdrowej populacji organizmów gospodarzy jako mikroflora komensalna [3]. ExPEC związane są z wieloma chorobami zakaźnymi ludzi i zwierząt, powodując infekcje o różnym przebiegu, zarówno uogólnionym lub narządowym. Pozajelitowe patogenne szczepy E. coli są heterogenną grupą bakterii patogennych i obejmują zarówno szczepy uropatogenne E. coli (ang. uropathogenic E. coli, UPEC), które są czynnikiem etiologicznym infekcji układu moczowego u ludzi; E. coli wywołujące zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych u niemowląt (ang. neonatal menigitidis E. coli, NMEC); E. coli powodujące sepsę oraz E. coli wywołujące u ptactwa chorobę o uogólnionym przebiegu - kolibakteriozę (ang. avian pathogenic E. coli, APEC).
Ptasie patogenne szczepy E. coli APEC stanowią poważny problem w przemyśle drobiarskim, a infekcje powodowane przez nie są przyczyną znacznych strat ekonomicznych [4; 5; 6]. Infekcje wywołane przez APEC mogą pojawić się u kurcząt i indyków rzeźnych oraz u kur niosek. We wszystkich przypadkach, niezależnie od wieku ptactwa, infekcje powodowane przez APEC dają wyraźne objawy chorobowe. W przypadku brojlerów zakażenie tymi bakteriami prowadzi do kolibakteriozy, a do symptomów zalicza się infekcje dróg oddechowych, stanem zapalnym objęte są worki powietrzne i osierdzie, a do innych objawów zaliczyć można utratę apetytu, osowienie, biegunki, zahamowanie wzrostu, niedokrwistość i utrudnione poruszanie się, zapalenie wątroby, powiększenie śledziony oraz syndrom obrzęku głowy u kur. W przypadku zakażenia kur niosek zmiany zapalne dotyczą układu rozrodczego [7]. Ptasie patogenne szczepy E. coli wymieniane są jako jeden z najpoważniejszych czynników infekcyjnych w intensywnej produkcji drobiarskiej, a zwiększająca się częstotliwość tego typu infekcji odzwierciedla spadek stosowania czynników antybakteryjnych, głównie antybiotyków, w hodowli drobiu. Co więcej, bliskie pokrewieństwo pomiędzy APEC a pozostałymi przedstawicielami pozajelitowych patogennych E. coli związanymi z zachorowaniami u ludzi wpływa na zdolność do transmisji czynników wirulencji pomiędzy tymi szczepami. Prowadzi to do obaw, że stanowią one ryzyko chorób zoonotycznych [7]. Dodatkowo ptasie patogenne szczepy E. coli izolowane od drobiu często charakteryzują się opornością na antybiotyki i w związku z tym infekcje powodowane przez nie są trudne do leczenia, co z jednej strony pogłębia straty hodowców [8], z drugiej natomiast jedną z głównych przyczyn pojawienia się opornych szczepów. Dodatkowo, od kurcząt rzeźnych, niosek towarowych oraz indyków rzeźnych izolowano szczepy E. coli oporne na kolistynę, lek „ostatniej szansy” stosowany w medycynie ludzkiej w przypadku trudno leczących się infekcji. W analizie oporności szczepów E. coli izolowanych od drobiu, najwyższy odsetek opornych szczepów był izolowany od kurcząt rzeźnych i oporność na takie antybiotyki jak ciprofloksacyna, kwas nalidyksowy, ampicylina, sulfametoksazol i tetracyklina wykazana została dla ponad połowy z izolowanych szczepów [9].
Narastająca lekooporność stwarza problem w doborze efektywnej terapii antybakteryjnej zarówno u zwierząt, jak i u ludzi. Dodatkowo, szczepy oporne mogą być transmitowane poprzez żywność pochodzenia zwierzęcego na ludzi. Warto podkreślić, że w produkcji drobiarskiej oraz medycynie ludzkiej wykorzystywane są te same grupy chemioterapeutyków (fluorochinolony, tetracykliny, aminoglikozydy), co dodatkowo stwarza zagrożenie dla zdrowia publicznego. Niepowodzenia antybiotykoterapii i chemioterapii jako następstwo pojawienia się szczepów bakteryjnych o wysokiej oporności, a nawet szczepów niewrażliwych na stosowane dotąd leki zmusza do poszukiwań innych metod zapobiegania i leczenia infekcji bakteryjnych. Wśród alternatywnych wobec antybiotyków i chemioterapeutyków sposobów zwalczania tego typu infekcji, w tym zakażeń szczepami wieloopornymi, w medycynie ludzkiej i weterynarii, coraz częściej wymienia się terapię z użyciem bakteriofagów [10, 11].
PL 241 130 B1
Bakteriofagi (fagi) są wirusami specyficznymi w stosunku do bakterii i używane są do ich zwalczania od momentu odkrycia na początku XX wieku. Niedługo po odkryciu tych bytów biologicznych bakteriofagi stały się kluczowym środkiem w walce z patogenami. Wynalezienie penicyliny i gwałtowny rozwój antybiotykoterapii sprawiły, że leczenie bakteriofagami zostało prawie całkowicie zastąpione leczeniem z użyciem antybiotyków, szczególnie w zachodniej Europie i Stanach Zjednoczonych. Wobec narastającego problemu lekooporności bakterii i kryzysu antybiotykoterapii, poszukiwanie skutecznych środków przeciwbakteryjnych stało się jednym z głównych obszarów badań współczesnej biotechnologii i medycyny, a jako jedną z najbardziej atrakcyjnych alternatyw do leczenia antybiotykami wskazywana jest terapia bakteriofagami. Bakteriofagi infekują komórkę bakteryjną, namnażają się w niej a następnie powodują jej rozpad i uwalnianie wirusów potomnych. Co ciekawe, charakteryzują się zdolnością do namnażania tylko w miejscu infekcji, gdzie zlokalizowane są bakterie wrażliwe na konkretnego wirusa. W momencie gdy wszystkie komórki bakteryjne zostaną zainfekowane, cała populacja zostaje wyeliminowana, a wraz z nią wirus, który traci swego gospodarza. Innymi cechami przyczyniającymi się do faktu, że bakteriofagi są doskonałym środkiem do walki z zakażeniami bakteryjnymi jest niska toksyczność, brak interakcji z komórkami ludzkimi i zwierzęcymi, brak powiązania z opornością na antybiotyki oraz istnienie różnych form aplikacji jako terapeutyków [12]. Bakteriofagi charakteryzują się wysoką specyficznością w stosunku do gospodarza, co w praktyce oznacza, że są zdolne zakażać pojedynczy gatunek bakterii lub nawet serotyp występujący w ramach gatunku [13] i są obojętne dla pozostałej mikroflory.
Dostępne dane literaturowe na temat bakteriofagów specyficznych względem pałeczek Escherichia coli wskazują na efektywne działanie bakteriofagów w terapii i prewencji zakażeń tymi bakteriami APEC u drobiu [8, 14, 15, 16, 17, 18]. Celem wynalazku było uzyskanie preparatów fagowych, które mogłyby być skutecznie wykorzystane do zapobiegania zakażeniom bakteryjnym jak i w leczeniu infekcji powodowanych pałeczkami Escherichia coli.
Celem wynalazku było uzyskanie preparatów fagowych, które mogłyby być skutecznie w ykorzystane do zapobiegania zakażeniom bakteryjnym jak i w leczeniu infekcji powodowanych przez pałeczki Escherichia coli.
Wynalazek dotyczy nowego szczepu bakteriofagowego specyficznego wobec bakterii należących do gatunku Escherichia coli, wybranego ze szczepów zdeponowanych w Polskiej Kolekcji Mikroorganizmów pod numerami depozytowymi: F/00119, F/00120, F/00121, F/00122.
Istotą wynalazku jest również szczep bakteriofaga, wybrany ze szczepów zdeponowanych w Polskiej Kolekcji Mikroorganizmów pod numerami depozytowymi: F/00119, F/00120, F/00121, F/00122, do zastosowania jako preparat przeciwbakteryjny, służący do zwalczania bakterii Escherichia coli, korzystnie klasyfikowanych jako patogenne dla drobiu Escherichia coli (APEC).
Korzystnie jest, gdy do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych wykorzystuje się całe wiriony bakteriofaga wirulentnego w preparatach zawierających jednego faga, jak i w postaci mieszaniny, w skład której może wchodzić kilka lub kilkanaście aktywnych bakteriofagów.
Dodatkowo wynalazek dotyczy wykorzystania oczyszczonych fagowych białek, strukturalnych, jak i enzymatycznych, zwłaszcza enzymów litycznych w postaci lizozymu albo endolizyny, albo egzopolisacharydazy.
Korzystnie jest, gdy preparatami przeciwbakteryjnymi, są preparaty służące do leczenia zakażeń wywołanych przez pałeczki Escherichia coli.
Korzystnie także jest, gdy preparatami przeciwbakteryjnymi, są preparaty służące do zapobiegania zakażeniom wywołanym przez pałeczki Escherichia coli.
Korzystnie również jest, gdy preparatami przeciwbakteryjnymi, są preparaty służące do eliminowania pałeczek Escherichia coli z powierzchni biotycznych albo abiotycznych.
Istota wynalazku została zilustrowana poniższymi przykładami wykonania:
P r z y k ł a d 1: Fag Escherichia coli UPWr/E1
Bakteriofag wirulentny był izolowany ze ścieków z rowu melioracyjnego z okolic Taczanowa w województwie Wielkopolskim. Bakteriofaga izolowano bezpośrednio z płynnej próby środowiskowej, którą poddano filtracji przy użyciu filtra o średnicy porów 0,22 μm, a następnie analizowano w teście kroplowym (ang. spot on). W tym celu 18-sto godzinna hodowla bakteryjna szczepu Escherichia coli (E. coli) 158B prowadzona w 5 ml podłoża LB rozprowadzona została po powierzchni szalki Petriego z zestalonym podłożem LB i pozostawiona do wysuszenia powierzchni. Równocześnie przygotowano szereg rozcieńczeń dziesiętnych filtratu próby środowiskowej, które nakropiono na powierzchnię płytki Petriego z hodowlą E. coli 158B i inkubowano kolejne 18 godzin w temperaturze 37°C. Po uzyskaniu
PL 241 130 B1 pozytywnego wyniku, jakim jest całkowita liza bakterii w miejscu nakropienia filtratu i jego rozcieńczeń lub obecność pojedynczych łysinek bakteriofagowych na murawie bakteryjnej, wyprowadzono czysty szczep bakteriofagowy z pojedynczej łysinki, którą pobierano za pomocą sterylnej igły. Igłę umieszczano w 1 ml pożywki LB i inkubowano przez 10 minut z łagodnym wytrząsaniem. Następnie próbkę dodawano do 5 ml 5-cio godzinnej hodowli E. coli 158B i inkubowano 18 godzin w temperaturze 37°C z wytrząsaniem 180 rpm, wirowano i filtrowano przy użyciu filtra o średnicy 0,22 μm. Tak uzyskany filtrat wykorzystany został do kolejnej izolacji faga z pojedynczej łysinki. Reizolację powtórzono 4 krotnie.
W celu charakterystyki faga określono jego spektrum lityczne wobec wybranych izolatów pałeczek Escherichia coli, pochodzących z kolekcji szczepów Katedry Epizootiologii z Kliniką Ptaków i Zwierząt Egzotycznych Wydziału Medycyny Weterynaryjnej Uniwersytetu Przyrodniczego we Wrocławiu. Wrażliwość bakterii na faga, analizowano w teście kroplowym. Na 111 przebadanych szczepów Escherichia coli, dodatnie reakcje lityczne obserwowano dla 48 szczepów, które klasyfikowanych jako APEC.
Szczep bakteriofaga UPWr/E1 został zdeponowany 31-05-2019 roku w Polskiej Kolekcji Mikroorganizmów posiadającej status międzynarodowego ośrodka depozytowego do celów patentowych. Depozytowi nadano numer F/00119.
P r z y k ł a d 2: Fag Escherichia coli UPWr/E2
Bakteriofag wirulentny izolowany ze ścieków z Wrocławskiej Oczyszczalni ścieków Janówek. Bakteriofaga izolowano bezpośrednio z płynnej próby środowiskowej, którą poddano filtracji przy użyciu filtra o średnicy porów 0,22 μm, a następnie analizowano w teście kroplowym (ang. spot on). W tym celu 18-sto godzinna hodowla bakteryjna szczepu Escherichia coli (E. coli) 158B prowadzona w 5 ml podłoża LB rozprowadzona została po powierzchni szalki Petriego z zestalonym podłożem LB i pozostawiona do wysuszenia powierzchni. Równocześnie przygotowano szereg rozcieńczeń dziesiętnych filtratu próby środowiskowej, które nakropiono na powierzchnię płytki Petriego z hodowlą E. coli 158B i inkubowano kolejne 18 godzin w temperaturze 37°C. Po uzyskaniu pozytywnego wyniku, jakim jest całkowita liza bakterii w miejscu nakropienia filtratu i jego rozcieńczeń lub obecność pojedynczych łysinek bakteriofagowych na murawie bakteryjnej, wyprowadzono czysty szczep bakteriofagowy z pojedynczej łysinki, którą pobierano za pomocą sterylnej igły. Igłę umieszczano w 1 ml pożywki LB i inkubowano przez 10 minut z łagodnym wytrząsaniem. Następnie próbkę dodawano do 5 ml 5-cio godzinnej hodowli E. coli 158B i inkubowano 18 godzin w temperaturze 37°C z wytrząsaniem 180 rpm, wirowano i filtrowano przy użyciu filtra o średnicy 0,22 μm. Tak uzyskany filtrat wykorzystany został do kolejnej izolacji faga z pojedynczej łysinki. Reizolację powtórzono 4 krotnie.
W celu charakterystyki faga określono jego spektrum lityczne wobec wybranych izolatów pałeczek Escherichia coli, pochodzących z kolekcji szczepów Katedry Epizootiologii z Kliniką Ptaków i Zwierząt Egzotycznych Wydziału Medycyny Weterynaryjnej Uniwersytetu Przyrodniczego we Wrocławiu. Wrażliwość bakterii na faga, analizowano w teście kroplowym. Na 111 przebadanych szczepów Escherichia coli, dodatnie reakcje lityczne obserwowano dla 31 szczepów, które klasyfikowanych jako APEC.
Szczep bakteriofaga UPWr/E2 został zdeponowany 31-05-2019 roku w Polskiej Kolekcji Mikroorganizmów posiadającej status międzynarodowego ośrodka depozytowego do celów patentowych. Depozytowi nadano numer F/00120.
P r z y k ł a d 3: Fag Escherichia coli UPWr/E3
Bakteriofag wirulentny izolowany ze ścieków z Wrocławskiej Oczyszczalni ścieków Janówek. Bakteriofaga izolowano bezpośrednio z płynnej próby środowiskowej, którą poddano filtracji przy użyciu filtra o średnicy porów 0,22 μm, a następnie analizowano w teście kroplowym (ang. spot on). W tym celu 18-sto godzinna hodowla bakteryjna szczepu Escherichia coli (E. coli) 258 prowadzona w 5 ml podłoża LB rozprowadzona została po powierzchni szalki Petriego z zestalonym podłożem LB i pozostawiona do wysuszenia powierzchni. Równocześnie przygotowano szereg rozcieńczeń dziesiętnych filtratu próby środowiskowej, które nakropiono na powierzchnię płytki Petriego z hodowlą E. coli 258 i inkubowano kolejne 18 godzin w temperaturze 37°C. Po uzyskaniu pozytywnego wyniku, jakim jest całkowita liza bakterii w miejscu nakropienia filtratu i jego rozcieńczeń lub obecność pojedynczych łysinek bakteriofagowych na murawie bakteryjnej, wyprowadzono czysty szczep bakteriofagowy z pojedynczej łysinki, którą pobierano za pomocą sterylnej igły. Igłę umieszczano w 1 ml pożywki LB i inkubowano przez 10 minut z łagodnym wytrząsaniem. Następnie próbkę dodawano do 5 ml 5-cio godzinnej hodowli E. coli 258 i inkubowano 18 godzin w temperaturze 37°C z wytrząsaniem 180 rpm, wirowano i filtrowano przy użyciu filtra o średnicy 0,22 μm. Tak uzyskany filtrat wykorzystany został do kolejnej izolacji faga z pojedynczej łysinki. Reizolację powtórzono 4 krotnie.
PL 241 130 B1
W celu charakterystyki faga określono jego spektrum lityczne wobec wybranych izolatów pałeczek Escherichia coli, pochodzących z kolekcji szczepów Katedry Epizootiologii z Kliniką Ptaków i Zwierząt Egzotycznych Wydziału Medycyny Weterynaryjnej Uniwersytetu Przyrodniczego we Wrocławiu. Wrażliwość bakterii na faga, analizowano w teście kroplowym. Na 111 przebadanych szczepów Escherichia coli, dodatnie reakcje lityczne obserwowano dla 17 szczepów, klasyfikowanych jako APEC.
Szczep bakteriofaga UPWr/E3 został zdeponowany 31-05-2019 roku w Polskiej Kolekcji Mikroorganizmów posiadającej status międzynarodowego ośrodka depozytowego do celów patentowych. Depozytowi nadano numer F/00121.
P r z y k ł a d 4: Fag Escherichia coli UPWr/E4
Bakteriofag wirulentny izolowany ze ścieków z rowu melioracyjnego z okolic Taczanowa w województwie Wielkopolskim. Bakteriofaga izolowano bezpośrednio z płynnej próby środowiskowej, którą poddano filtracji przy użyciu filtra o średnicy porów 0,22 μm, a następnie analizowano w teście kroplowym (ang. spot on). W tym celu 18-sto godzinna hodowla bakteryjna szczepu Escherichia coli (E. coli) 158B prowadzona w 5 ml podłoża LB rozprowadzona została po powierzchni szalki Petriego z zestalonym podłożem LB i pozostawiona do wysuszenia powierzchni. Równocześnie przygotowano szereg rozcieńczeń dziesiętnych filtratu próby środowiskowej, które nakropiono na powierzchnię płytki Petriego z hodowlą E. coli 158B i inkubowano kolejne 18 godzin w temperaturze 37°C. Po uzyskaniu pozytywnego wyniku, jakim jest całkowita liza bakterii w miejscu nakropienia filtratu i jego rozcieńczeń lub obecność pojedynczych łysinek bakteriofagowych na murawie bakteryjnej, wyprowadzono czysty szczep bakteriofagowy z pojedynczej łysinki, którą pobierano za pomocą sterylnej igły. Igłę umieszczano w 1 ml pożywki LB i inkubowano przez 10 minut z łagodnym wytrząsaniem. Następnie próbkę dodawano do 5 ml 5-cio godzinnej hodowli E. coli 158B i inkubowano 18 godzin w temperaturze 37°C z wytrząsaniem 180 rpm, wirowano i filtrowano przy użyciu filtra o średnicy 0,22 μm. Tak uzyskany filtrat wykorzystany został do kolejnej izolacji faga z pojedynczej łysinki. Reizolację powtórzono 4 krotnie.
W celu charakterystyki faga określono jego spektrum lityczne wobec wybranych izolatów pałeczek Escherichia coli, pochodzących z kolekcji szczepów Katedry Epizootiologii z Kliniką Ptaków i Zwierząt Egzotycznych Wydziału Medycyny Weterynaryjnej Uniwersytetu Przyrodniczego we Wrocławiu. Wrażliwość bakterii na faga, analizowano w teście kroplowym. Na 111 przebadanych szczepów Escherichia coli, dodatnie reakcje lityczne obserwowano dla 26 szczepów, klasyfikowanych jako APEC.
Szczep bakteriofaga UPWr/E4 został zdeponowany 31-05-2019 roku w Polskiej Kolekcji Mikroorganizmów posiadającej status międzynarodowego ośrodka depozytowego do celów patentowych. Depozytowi nadano numer F/00122.
Literatura
1. Conway T, Cohen PS. 2015. Commensal and Pathogenic Escherichia coli Metabolism in the Gut. Microbiol. Spectr., 3.
2. Nguyen Y, Sperandio V. 2012. Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) pathogenesis. Front
Cell Infect Microbiol. 2: 90.
3. Baldy-Chudzik K, Bok E, Mazurek J. 2015. Znane i nowe warianty patogennych Esche- richia coli jako konsekwencja plastycznego genomu. Postępy Hig Med Dosw. 69: 345-361.
4. Barnes HJ, Nolan LK, Vaillancourt JP. 2008. Colibacillosis, p 691-732 In Saif YM, Fadly
AM, Glisson JR, McDougald LR, Nolan LK, Swayne DE, editors., Diseases of poultry, 12th ed. Blackwell Publishing, Ames, IA.
5. Baudry B, Savarino SJ, Vial P, Kaper JB, Levine MM. 1990. A sensitive and specific
DNA probe to identify enteroaggregative E. coli, a recently discovered diarrheal pathogen. J. Infect. Dis., 161(6), 1249-1251.
6. Nakazato G, de Campos TA, Stehling EG, Brocchi M, da Silveir WD. 2009. Virulence factors of avian pathogenic Escherichia coli (APEC). Pesquisa Veterinaria Brasileira, 29, 479-486.
7. Collingwood C, Kemmett K, Williams N, Wigley P. 2014. Is the concept of avian patho- genic Escherichia coli as a single pathotype fundamentally flawed? Front. Vet. Sci. 1: 5.
8. Oliveira A, Sereno R, Nicolau A, Azeredo J. 2009. The Influence of the mode of admini- stration in the dissemination of three coliphages in chickens. Poult. Sci. 88, 728-733.

Claims (9)

  1. PL 241 130 B1
    9. EFSA: 2018. Scientific report: The European Union summary report on antimicrobial resistance in zoonotic and indicator bacteria from humans, animals and food in 2016.
    10. Thiel K. 2004. Old dogma, new tricks--21 st Century phage therapy. Nat Biotechnol. Jan; 22(1): 31-6.
    11. Dixon B. 2004. New dawn for phage therapy. Lancet Infect Dis. Mar; 4(3): 186.
    12. Loc-Carrillo C., Abedon ST. 2011. Pros and Cons of Phage Therapy. Bacteriophage 1:
    111-114.
    13. Ackermann HW, Audurier A, Berthiaume L., Jones LA, Mayo JA, Vidaver AK. 1978. Guidelines for bacteriophage characterization. Adv. Virus Res. 23, 1-24.
    14. W. E. Huff,2 G. R. Huff, N. C. Rath, and A. M. Donoghue. Evaluation of the Influence of Bacteriophage Titer on the Treatment of Colibacillosis in Broiler Chickens1.
    15. Huff WE, Huff GR, Rath NC, Balog JM, Donoghue AM. 2002a. “Prevention of Escherichia coli infection in broiler chickens with a bacteriophage aerosol spray,” Poultry Science, vol. 81, no. 10, pp. 1486-1491.
    16. Huff WE, Huff GR, Rath NC, Balog JM, Xie H, Moore PA Jr, Donoghue AM. 2002b. “Prevention of Escherichia coli respiratory infection in broiler chickens with bacteriophage (SPR02),” Poultry Science, vol. 81, no. 4, 437-441.
    17. Huff WE, Huff GR, Rath NC, Balog JM, Donoghue AM. 2003. “Evaluation of aerosol spray and intramuscular injection of bacteriophage to treat an Escherichia coli respiratory infection” Poultry Science, vol. 82, no. 7, pp. 1108-1112, 2003.
    18. Lau GL, Sieo CC, Tan WS, Hair-Bejo M, Jalila A, Ho YW. 2010. Efficacy of a bacteriophage isolated from chickens as a therapeutic agent for colibacillosis in broiler chickens. Poult Sci. Dec; 89(12): 2589-96.
    Zastrzeżenia patentowe
    1. Szczep bakteriofaga specyficzny wobec bakterii należących do gatunku Escherichia coli, wybrany ze szczepów zdeponowanych w Polskiej Kolekcji Mikroorganizmów pod numerami depozytowymi: F/00119, F/00120, F/00121, F/00122.
  2. 2. Szczep bakteriofaga, wybranego ze szczepów zdeponowanych w Polskiej Kolekcji Mikroorganizmów pod numerami depozytowymi: F/00119, F/00120, F/00121, F/00122, do zastosowania jako preparat przeciwbakteryjny, służący do zwalczania bakterii Escherichia coli.
  3. 3. Szczep bakteriofaga do zastosowania według zastrz. 3, znamienny tym, że zwalczane bakterie klasyfikowane są jako patogenne dla drobiu Escherichia coli (APEC).
  4. 4. Szczep bakteriofaga do zastosowania według zastrz. 2, znamienny tym, że do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych wykorzystuje się całe wiriony bakteriofaga wirulentnego w preparatach zawierających jednego faga.
  5. 5. Szczep bakteriofaga do zastosowania według zastrz. 2, znamienny tym, że do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych wykorzystuje się koktajl zawierający kilka lub kilkanaście aktywnych bakteriofagów.
  6. 6. Szczep bakteriofaga do zastosowania według zastrz. 2, znamienny tym, że do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych wykorzystuje się oczyszczone fagowe białka strukturalne, jak i enzymatyczne, zwłaszcza enzymy lityczne w postaci lizozymu albo endolizyny, albo egzopolisacharydazy.
  7. 7. Szczep bakteriofaga do zastosowania według zastrz. 2, znamienny tym, że preparatami przeciwbakteryjnymi, są preparaty służące do leczenia zakażeń wywołanych przez pałeczki Escherichia coli.
  8. 8. Szczep bakteriofaga do zastosowania według zastrz. 2, znamienny tym, że preparatami przeciwbakteryjnymi, są preparaty służące do zapobiegania zakażeniom wywołanym przez pałeczki Escherichia coli.
  9. 9. Szczep bakteriofaga do zastosowania według zastrz. 2, znamienny tym, że preparatami przeciwbakteryjnymi, są preparaty służące do eliminowania pałeczek Escherichia coli z powierzchni biotycznych albo abiotycznych.
PL430175A 2019-06-07 2019-06-07 Szczepy bakteriofagów specyficzne wobec bakterii Escherichia coli oraz ich zastosowanie do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych PL241130B1 (pl)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL430175A PL241130B1 (pl) 2019-06-07 2019-06-07 Szczepy bakteriofagów specyficzne wobec bakterii Escherichia coli oraz ich zastosowanie do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL430175A PL241130B1 (pl) 2019-06-07 2019-06-07 Szczepy bakteriofagów specyficzne wobec bakterii Escherichia coli oraz ich zastosowanie do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL430175A1 PL430175A1 (pl) 2020-12-14
PL241130B1 true PL241130B1 (pl) 2022-08-08

Family

ID=73727730

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL430175A PL241130B1 (pl) 2019-06-07 2019-06-07 Szczepy bakteriofagów specyficzne wobec bakterii Escherichia coli oraz ich zastosowanie do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych

Country Status (1)

Country Link
PL (1) PL241130B1 (pl)

Also Published As

Publication number Publication date
PL430175A1 (pl) 2020-12-14

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Culot et al. Overcoming the challenges of phage therapy for industrial aquaculture: A review
KR101151516B1 (ko) 신규한 박테리오파지 및 이를 포함하는 항균 조성물
KR101070938B1 (ko) 신규한 박테리오파지 및 이를 포함하는 항균 조성물
KR101151532B1 (ko) 신규한 박테리오파지 및 이를 포함하는 항균 조성물
JP5613767B2 (ja) 新規なバクテリオファージ及びそれを含む抗菌組成物
KR101335825B1 (ko) 신규 박테리오파지 및 이를 포함하는 항균 조성물
KR101381797B1 (ko) 신규 박테리오파지 및 이를 포함하는 항균 조성물
JP5872700B2 (ja) 新規バクテリオファージ及びそれを含む抗菌組成物
KR101381798B1 (ko) 신규 박테리오파지 및 이를 포함하는 항균 조성물
CA3075434A1 (en) Bacteriophage composition and method of preventing bacterial infections in livestock
KR101381793B1 (ko) 신규 박테리오파지 및 이를 포함하는 항균 조성물
CN112143709B (zh) 一株嗜水气单胞菌噬菌体及其应用
Ma et al. The antagonistic interactions between a polyvalent phage SaP7 and β-lactam antibiotics on combined therapies
CN111363724B (zh) 一种新型噬菌体、噬菌体混合制剂及其在防治水貂出血性肺炎的药物中的应用
Cruz-Papa et al. Aeromonas hydrophila bacteriophage UP87: an alternative to antibiotic treatment for motile aeromonas septicemia in Nile Tilapia (Oreochromis niloticus)
US11826391B2 (en) Antibacterial formulation comprising a mixture of bacteriophages; use and method for preventing or treating diseases caused by salmonella spp. in farm animals by oral administration of the formulation
CN113444696B (zh) 一种嗜水气单胞菌噬菌体及其应用
PL241130B1 (pl) Szczepy bakteriofagów specyficzne wobec bakterii Escherichia coli oraz ich zastosowanie do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych
CN117264910B (zh) 耐高温广谱沙门氏菌的噬菌体及其临床应用
CN117431221B (zh) 一种鲍曼不动杆菌噬菌体、其噬菌体组合物及其应用
Jumaniyazova et al. Isolation and characterization of a novel Salmonella polyvalent bacteriophage ‘MediPhag’in Uzbekistan
KR102244979B1 (ko) 박테리오파아지 c2를 포함하는 가금티푸스의 예방 또는 치료용 약학적 조성물 및 이의용도
US20240182869A1 (en) Bacteriophage compositions for treating clostridium perfringens infections
BR112022006931B1 (pt) Formulação antibacteriana compreendendo uma mistura de bacteriófagos; uso e método de prevenção ou tratamento de doenças causadas por salmonella spp. em animais de fazenda por administração oral da formulação
PL241129B1 (pl) Szczepy bakteriofagów specyficzne wobec bakterii należących do rodzaju Salmonella oraz ich zastosowanie do wytwarzania preparatów przeciwbakteryjnych