PL236059B1 - Grupa peptydów przeciwdrobnoustrojowych opartych o strukturę amidu Nε-L-lizyno-L-lizylo-L-arginylo-L-arginylo-L-argininy modyfikowaną kwasami karboksylowymi - Google Patents

Grupa peptydów przeciwdrobnoustrojowych opartych o strukturę amidu Nε-L-lizyno-L-lizylo-L-arginylo-L-arginylo-L-argininy modyfikowaną kwasami karboksylowymi Download PDF

Info

Publication number
PL236059B1
PL236059B1 PL419961A PL41996116A PL236059B1 PL 236059 B1 PL236059 B1 PL 236059B1 PL 419961 A PL419961 A PL 419961A PL 41996116 A PL41996116 A PL 41996116A PL 236059 B1 PL236059 B1 PL 236059B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
compound
resin
fmoc
deprotection
dcm
Prior art date
Application number
PL419961A
Other languages
English (en)
Other versions
PL419961A1 (pl
Inventor
Wojciech Kamysz
Damian Neubauer
Marta Bauer
Daria Grzywacz
Original Assignee
Kamysz Wojciech Lipopharm
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Kamysz Wojciech Lipopharm filed Critical Kamysz Wojciech Lipopharm
Priority to PL419961A priority Critical patent/PL236059B1/pl
Publication of PL419961A1 publication Critical patent/PL419961A1/pl
Publication of PL236059B1 publication Critical patent/PL236059B1/pl

Links

Landscapes

  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

Przedmiotem zgłoszenia są nowe związki o wzorze ogólnym 1 przedstawionym na rysunku, gdzie podstawnikami związku A są odpowiednio grupy R1 - C6H5, R2 - C6H5, R3 - C6H5 podstawnikami związku B są odpowiednio grupy R1 - C6H5, R2 - C6H5, R3 - CH3, a podstawnikami związku C są odpowiednio grupy R1 - CH = CH - C6H5, R2 - CH = CH - C6H5 R3 - CH = CH - C6H5. Zgłoszenie obejmuje też sposób otrzymywania przedmiotowych związków, który prowadzony jest w całości w fazie stałej. Ponadto przedmiotem zgłoszenia jest również zastosowanie przedmiotowych związków jako środka antybakteryjnego i przeciwgrzybiczego.

Description

Opis wynalazku
Przedmiotem wynalazku są nowe związki oparte o strukturę amidu N^L-lizylo-L-lizylo-L-arginylo-L-arginylo-L-argininy, gdzie grupy a- i ε-aminowe reszt lizyny są związane wiązaniem amidowym z kwasami karboksylowymi, w tym z aromatycznymi kwasami karboksylowymi. Ponadto przedmiotem wynalazku jest sposób otrzymywania nowych związków oraz ich zastosowanie jako środek antybakteryjny, i środek przeciwgrzybiczy.
Peptydy o charakterze amfifilowym i wypadkowym ładunku dodatnim, wykazują często aktywność przeciwdrobnoustrojową, która jest efektem oddziaływań elektrostatycznych z ujemnie naładowaną błoną komórkową i prowadzi do jej permeabilizacji i utraty potencjału błonowego. Peptydy przeciwdrobnoustrojowe, w tym lipopeptydy, często wykazują także wysoką toksyczność względem ludzkich linii komórkowych oraz erytrocytów. ε-poli-L-lizyna jest produktem biosyntezy szczepu Streptomyces albulus złożonym z 25-30 reszt aminokwasowych i wykazującym szerokie spektrum aktywności przeciwdrobnoustrojowej. W niektórych krajach znajduje ona zastosowanie w konserwacji żywności. Jest obiektem badań ze względu na potencjalne jej wykorzystanie jako nośnika leków, biodegradowalnego biomateriału czy też hydrożelu. Ponadto nie wywołuje ona efektu toksycznego u ludzi. Wynalazek w istotnym stopniu opiera się o strukturę łańcucha złożonego z ε-poli-L-lizyny, ale jego kluczowym elementem są reszty kwasowe przyłączone do odpowiednich ugrupowań aminowych stanowiące o hydrofobowości tego fragmentu cząsteczki peptydu, a co za tym idzie jego aktywności biologicznej. Struktury te nie są więc ścisłym odwzorowaniem naturalnie występujących peptydów. Wykorzystanie ugrupowania ε-aminowego w reakcji kondensacji z grupą a-karboksylową lizyny oraz przyłączenie hydrofobowych kwasów karboksylowych do pozostałych wolnych grup aminowych reszt lizyny prowadzi do otrzymania związków o elastycznym i lipofilowym łańcuchu (udział alkilowego łańcucha bocznego lizyny). Znane są doniesienia o krótkich peptydach (4 reszty aminokwasowe) zawierających reszty kwasów aromatycznych i będących aktywnymi w stosunku do biofilmu przy jednocześnie niskiej toksyczności, co dodatkowo uzasadnia stosowanie proponowanej koncepcji.
Przedmiotem wynalazku jest grupa peptydów opartych o strukturę amidu N -L-lizylo-L-lizylo-L-arginylo-L-arginylo-L-argininy modyfikowaną kwasami karboksylowymi przy wykorzystaniu grupy a- i ε-aminowej reszt lizyny. Struktura realizowana jest poprzez wytworzenie wiązania peptydowego pomiędzy grupą ε-aminową lizyny znajdującej się na N-końcu sekwencji a grupą a-karboksylową przyłączanej reszty lizyny. Przy wykorzystaniu pochodnej Fmoc-Lys(Boc)-OH oraz żywicy amidowej (Fmoc-Rink Amide Resin) możliwe jest takie przeprowadzenie reakcji, które umożliwia otrzymanie peptydu zawierającego wiele reszt kwasu tłuszczowego, aromatycznego lub dowolnej innej struktury, która może wiązać się kowalencyjnie z ugrupowaniem aminowym. Rozwiązanie to może znaleźć zastosowanie do syntezy związków biologicznie czynnych. Jedną z możliwości jest otrzymanie peptydów przeciwdrobnoustrojowych o budowie amfifilowej. Przykładem są krótkie kationowe lipopeptydy wykazujące wysoką aktywność bakteriobójczą, grzybobójczą oraz przeciwnowotworową. Grupą lipopeptydów o wysokiej aktywności przeciwdrobnoustrojowej są te zawierające kilka reszt kwasu tłuszczowego. Fakt ten podkreśla istotę wynalazku, gdyż może on bezpośrednio posłużyć do otrzymywania peptydów tego typu.
Związki będące przedmiotem wynalazku oparte są o strukturę amidu N^L-lizylo-L-lizylo-L-arginylo-L-arginylo-L-argininy modyfikowaną kwasami karboksylowymi (w tym aromatycznymi kwasami karboksylowymi) przy wykorzystaniu grupy a- i ε-aminowej reszt lizyny.
PL 236 059 Β1
gdzie:
związek A, posiada Ri = -CeHs; R2 = -CeHs; R3 = -CeHs związek B, posiada R1 = -CeHs; R2 = -CeHs; R3 = -CH3 związek C, posiada R1 = -CH=CH-C6H5; R2 = -CH=CH-C6H5; Rs = -CH=CH-C6H5
Sposób otrzymywania nowych związków zdefiniowanych powyżej, który posiada następujące etapy:
a) deprotekcja Fmoc w 20% roztworze piperydyny (Fmoc-Rink Amidę Resin); 20 minut z wytrząsaniem,
b) przemywanie żywicy rozpuszczalnikami - dwukrotnie DMF, dwukrotnie DMF:DCM (1:1, v/v), dwukrotnie DCM,
c) wykonanie testu chloranilowego,
d) reakcja kondensacji, gdzie stosowano trzykrotny nadmiar reagentów (w odniesieniu do żywicy; osadzenie 0,9 mmol/g) - Fmoc-AA-OH:DIC:HOBt (stosunek równomolowy);
e) przemywanie żywicy oraz test chloranilowy,
f) w ten sam sposób przyłączono kolejne aminokwasy, gdzie po przyłączeniu trzech reszt L-argininy (Fmoc-L-Arg(Pbf)-OH), i jednej reszty L-lizyny (Fmoc-L-Lys(Boc)-OH), otrzymano następujący półprodukt - Fmoc-L-Lys(Boc)-[L-Arg(Pbf)-]3-linker-żywica,
g) następnie za pomocą roztworu piperydyny przeprowadzono deprotekcję grupy a-aminowej N-końcowego aminokwasu (usunięcie Fmoc), przemyto żywicę i wykonano test chloranilowy,
h) przeprowadzono reakcję kondensacji:
- dla związków A i B) z kwasem benzoesowym - kwas benzoesowy:DIC:HOBt (stosunek równomolowy) - stosując trzykrotny nadmiar reagentów, a następnie tak jak w pkt. b) i c);
- dla związku C) przeprowadzono reakcję kondensacji z kwasem cynamonowym - kwas cynamonowy:DIC:HOBt (stosunek równomolowy) - stosując trzykrotny nadmiar reagentów, a następnie tak jak w pkt. b) i c).
i) przeprowadzono deprotekcję grupy Ne-aminowej lizyny (ugrupowanie Boc) umieszczając peptydylo-żywicę w 10% roztworze TFA w DCM na 30 minut z wytrząsaniem, a następnie postępowano analogicznie jak po etapie deprotekcji pkt. b) i c),
j) do wolnej grupy ε-aminowej przyłączano kolejną resztę Fmoc-L-Lys(Boc)-OH i wykonano czynności z pkt. b) i c),
k) przeprowadzono deprotekcję ugrupowania N“-aminowego za pomocą roztworu piperydyny, a następnie kondensację z wykorzystaniem, dla związku A i B) kwasu benzoesowego, a dla związku C) kwasu cynamonowego; a następnie wykonano czynności z pkt. b) i c),
I) przeprowadzono deprotekcję ugrupowania Ne-aminowego N-końcowej reszty lizyny umieszczając peptydylo-żywicę w 10% TFA w DCM na 30 minut z wytrząsaniem, a następnie postępowano analogicznie jak po etapie deprotekcji pkt. b) i c),
m) do wolnej grupy Ne-aminowej przyłączano kolejną resztę:
- dla związku A) resztę kwasu benzoesowego;
PL 236 059 B1
- dla związku B) resztę kwasu octowego stosując bezwodnik octowy, reakcja ta była prowadzona przez 1 h, gdzie na 1 gram żywicy (osadzenie 0,9 mmol/g) przygotowywano 1 ml bezwodnika kwasu octowego i 1 ml DIPEA w 18 ml DCM;
- dla związku C) resztę kwasu cynamonowego, i dalej wykonano czynności z pkt. b) i c), n) peptyd odszczepiono od żywicy stosując - TFA:TIS:woda (96:2:2, v/v), z jednoczesnym mieszaniem przez 1,5 h,
o) surowy peptyd wytrącono za pomocą schłodzonego eteru dietylowego i odwirowano, supernatant zlano, zaś peptyd poddano liofilizacji,
p) peptyd został oczyszczony z wykorzystaniem wysokosprawnej chromatografii cieczowej w układzie faz odwróconych, gdzie jako fazę ruchomą zastosowano acetonitryl i wodę dejonizowaną zawierające 0,1% TFA.
Sposób gdzie reakcję kondensacji przeprowadza się przez 1,5 h w DCM:DMF (1:1, v/v) z wytrząsaniem.
Sposób gdzie w celu selektywnej deprotekcji ugrupowania ε-aminowego łańcucha bocznego lizyny zastosowano środowisko kwaśne.
Nowe związki zdefiniowane powyżej do zastosowania jako środek antybakteryjny. Nowe związki zdefiniowane powyżej do zastosowania jako środek przeciwgrzybiczy.
Opis figur:
Fig. 1 - przedstawia wyniki analizy chromatograficznej dla peptydu A (Kolumna: Waters, XBridge Shield RP 18, 3,5 um, 4,6 x 150 mm. Metoda: 20-80% ACN, 10 minut, przepływ - 1,2 ml/min, detektor UV-Vis, λ = 214 nm).
Fig. 2 - przedstawia wyniki analizy chromatograficznej dla peptydu B (Kolumna: Waters, XBridge Shield RP 18, 3,5 um, 4,6 x 150 mm. Metoda: 20-80% ACN, 10 minut, przepływ - 1,2 ml/min, detektor UV-Vis, λ = 214 nm).
Fig. 3 - przedstawia wyniki analizy chromatograficznej dla peptydu C (Kolumna: Waters, XBridge Shield RP 18, 3,5 um, 4,6 x 150 mm. Metoda: 20-80% ACN, 10 minut, przepływ - 1,2 ml/min, detektor UV-Vis, λ = 214 nm).
Fig. 4 - przedstawia widmo masowe peptydu A (związek A).
Fig. 5 - przedstawia widmo masowe peptydu B (związek B).
Fig. 6 - przedstawia widmo masowe peptydu C (związek C).
Wynalazek ilustrują następujące przykłady wykonania, nie stanowiące jego ograniczenia:
P r z v k ł a d 1
Syntezę przeprowadzono na nośniku stałym z zastosowaniem metody Fmoc/tBu. Wykorzystano żywicę amidową - Fmoc-Rink Amide (osadzenie 0,9 mmol/g, Amide AM Resin; ORPEGEN Peptide Chemicals GmbH, Heidelberg, Niemcy). Przed przystąpieniem do syntezy żywicę umieszczano w DCM (Chempur, Piekary Śląskie, Polska) na 1 h w celu jej spęcznienia. Synteza obejmowała następujące po sobie etapy:
1. Deprotekcja (usunięcie grupy ochronnej - Fmoc) w 20% roztworze piperydyny (Merck Millipore, Darmstadt, Niemcy) w DMF (Sigma Aldrich, Merck, Darmstadt, Niemcy).
2. Przemywanie żywicy rozpuszczalnikami w następującej serii - dwukrotnie DMF, dwukrotnie DMF:DCM (1:1, M/M), dwukrotnie DCM.
3. Wykonanie testu chloranilowego.
4. Reakcja kondensacji - sprzęganie. Stosowano trzykrotny nadmiar reagentów - Fmoc-AAOH:DIC:HOBt (stosunek równomolowy). Reakcję prowadzono przez 1,5 h w DCM:DMF (1:1, M/M) Z wytrząsaniem (DIC - Iris Biotech, Marktredwitz, Niemcy; HOBt - ORPEGEN Peptide Chemicals GmbH, Heidelberg, Niemcy).
5. Przemywanie żywicy oraz test chloranilowy - tak jak w pkt. 2 i 3.
Po przyłączeniu aminokwasu i wykonaniu testu chloranilowego następowało ponowne rozpoczęcie cyklu powyżej opisanych czynności (pkt. 1-5) w celu przyłączenia kolejnego aminokwasu. Po przyłączeniu trzech reszt L-argininy (Fmoc-L-Arg(Pbf)-OH, ORPEGEN Peptide Chemicals GmbH, Heidelberg, Niemcy) i jednej reszty L-lizyny (Fmoc-L-Lys(Boc)-OH, ORPEGEN Peptide Chemicals GmbH, Heidelberg, Niemcy) otrzymano następujący półprodukt - Fmoc-L-Lys(Boc)-[L-Arg(Pbf)-]3-linker-żywica. Następnie przeprowadzono deprotekcję grupy α-aminowej N-końcowego aminokwasu (usunięcie Fmoc), przemyto żywicę i wykonano test chloranilowy. Przeprowadzono reakcję kondensacji z kwasem benzoesowym (Sigma Aldrich, Merck, Darmstadt, Niemcy) - kwas benzoesowy:DIC:HOBt (stosunek równomolowy) - stosując trzykrotny nadmiar reagentów, a następnie tak jak
PL 236 059 Β1 w pkt. 2 i 3. W celu selektywnej deprotekcji ugrupowania ε-aminowego łańcucha bocznego lizyny zastosowano środowisko kwaśne. Umieszczano peptydylo-żywicę w 10% TFA (Apollo Scientific, Bredbury, Wielka Brytania) w DCM na 30 minut z wytrząsaniem, a następnie postępowano analogicznie jak po etapie deprotekcji (pkt. 2 i 3). W warunkach tych nie dochodzi do odszczepienia peptydu od żywicy, ani do deprotekcji ugrupowania guanidynowego łańcuchów bocznych argininy chronionego Pbf. Do wolnej grupy ε-aminowej przyłączano zgodnie z opisaną procedurą kolejną resztę Fmoc-L-Lys(Boc)-OH. Przeprowadzono deprotekcję za pomocą roztworu piperydyny, a następnie kondensację z wykorzystaniem kwasu benzoesowego pamiętając o wykonaniu czynności z pkt. 2 i 3. Dokonano deprotekcji grupy ε-aminowej oraz przyłączono resztę kwasu benzoesowego analogicznie względem opisanych powyżej czynności. Peptyd odszczepiono od żywicy stosując - TFA:TIS:woda (96:2:2, v/v), z jednoczesnym mieszaniem przez 1,5 h (TIS; Iris Biotech, Marktredwitz, Niemcy). Surowy peptyd wytrącono za pomocą schłodzonego eteru dietylowego (Chempur, Piekary Śląskie, Polska) i odwirowano. Supernatant zlano, zaś peptyd poddano liofilizacji. Peptyd został oczyszczony z wykorzystaniem wysokosprawnej chromatografii cieczowej w układzie faz odwróconych (RP-HPLC). Jako fazę ruchomą zastosowano acetonitryl (Sigma Aldrich, Merck, Darmstadt, Niemcy) i wodę dejonizowaną zawierające 0,1% TFA. Czystość i tożsamość związku potwierdzono przeprowadzając analizę chromatograficzną (RP-HPLC) oraz wykorzystując spektrometrię mas (ESI-MS). Poniżej (ryc. 2) przedstawiono wzór strukturalny otrzymanego związku (A).
Ryc. 1. Związek (A) z przykładu 1.
Przykład 2
Synteza tak jak dla związku A, z tą różnicą, że po deprotekcji ugrupowania Ne-aminowego drugiej reszty lizyny w 10% TFA w DCM przeprowadzono reakcję z bezwodnikiem kwasu octowego (Chempur, Piekary Śląskie, Polska). Reakcja ta była prowadzona przez 1 h. Na 1 gram żywicy (osadzenie 0,9 mmol/g) przygotowywano 1 ml bezwodnika kwasu octowego i 1 ml DIPEA (Iris Biotech, Marktredwitz, Niemcy) w 18 ml DCM. Następnie wykonano serię przemywać żywicy, test chloranilowy. Kolejnym etapem było odszczepianie peptydu od żywicy, wytrącanie, liofilizacja oraz oczyszczanie -takjak uprzednio opisano (przykład 1).
PL 236 059 Β1
Ryc. 2. Związek (B) z przykładu 2.
Przykład 3
Analogicznie jak dla przykładu 1, z tą różnicą, że w miejsce kwasu benzoesowego wykorzystano kwas cynamonowy (kwas (E)-3-fenyloprop-2-enowy; Sigma Aldrich, Merck, Darmstadt, Miemcy).
Ryc. 3. Związek (C) z przykładu 3.
Badania mikrobiologiczne
Badania aktywności przeciwdrobnoustrojowej przeprowadzono z wykorzystaniem metody seryjnych mikrorozcieńczeń związku w pożywce płynnej na polistyrenowej płytce 96-dołkowej, zgodnie z wytycznymi CLSI. Oznaczaną aktywnością było minimalne stężenie związku powodujące całkowite zahamowanie wzrostu drobnoustroju (MIC). Gęstość zawiesiny bakteryjnej w każdym z dołków wynosiła 5 x 105 CFU/ml, zaś w przypadku szczepów z rodzaju Candida było to 4 χ 103 CFU/ml. Płytki inkubowano w 37°C przez 24 h. Oceny wzrostu dokonano za pomocą czytnika mikropłytek (Multiskan
PL 236 059 Β1
GO Thermo Scientific) mierząc absorbancję przy długości fali równej 600 nm. Aktywność wyznaczono wobec następujących szczepów referencyjnych: Staphylococcus aureus ATCC 25923, Staphylococcus epidermidis ATCC 14990, Escherichia coli ATCC 25922, Candida albicans ATCC 10231, Candida glabrata ATCC 15126, Candida tropicalis PCM 2709-FY. W przypadku szczepów bakteryjnych zastosowano pożywkę Mueller Hinton II Broth (Becton Dickinson, Le Pont de Claix Cedex, Francja), zaś w przypadku szczepów Candida było to RPMI-1640 (Sigma Aldrich, Merck, Darmstadt, Niemcy). Wyniki przedstawiono w tabeli 1 i 2.
Badanie aktywności hemolitycznei
Krew od zdrowego dawcy została pobrana do fiolek zawierających EDTA - czynnik przeciwzakrzepowy. Krew wirowano przez 10 minut przy 500 x g, a następnie oddzielono erytrocyty. Przemyto je trzykrotnie roztworem PBS (Sigma Aldrich, Merck, Darmstadt, Niemcy) każdorazowo wirując - warunki jak wyżej. Wykonano serię rozcieńczeń badanych związków w PBS na polistyrenowej płytce 96-dołkowej, przy czym każdy związek badano trzykrotnie. Stężenie erytrocytów w każdym z dołków wynosiło 4% (v/v). Następnie płytki inkubowano w temperaturze 37°C przez 1 h. Krwinki odwirowano (10 minut, 500 x g), zaś supernatant przeniesiono na nową płytkę uważając by nie naruszyć osadu. W celu zbadania stopnia hemolizy dokonano odczytu spektrofotometrycznego za pomocą czytnika mikropłytek (Multiskan GO Thermo Scientific) przy długości fali równej 540 nm. Aktywność hemolityczna związków została odniesiona do całkowitej lizy komórek wywołanej 1% roztworem TritonuX-100 (SigmaAldrich, Darmstadt, Niemcy). Uzyskane rezultaty - HC50, przedstawiono w tabeli 2.
Wyniki badań aktywności przeciwdrobnoustrojowej i hemolitycznei
Odpowiednie dane zostały zamieszczone w tabelach poniżej (tabela 1 i 2).
T a b e I a 1
Wartości MIC [pg/ml] wobec szczepów bakteryjnych.
Związek S. aureus 5. epidermidis E. coli
A 256 2 >512
B 512 8 >512
C 16 4 256
Tabela 2
Wartości MIC wobec szczepów grzybowych oraz wartości HC50 [pg/ml].
Związek S. aureus S. epidermidis E. coli
A 256 2 >512
B 512 8 >512
C 16 4 256
Potwierdzenie tożsamości związków (ESI-MS)
W tabeli 3 zamieszczono obliczone masy monoizotopowe peptydów.
Tabela 3
Zestawienie obliczonych mas monoizotopowych peptydów
Peptyd Peptyd A Peptyd B Peptyd C
Masa monoizotopowa [Da] 1053,598 991,583 1131,645
PL 236 059 Β1
W tabeli 4 zamieszczono obliczone i zmierzone wartości m/z (jonizacja dodatnia).
Tabela 4
Wynik analizy (ESI-MS).
glOOBIS
Obliczona wartość Zmierzona wartość Obliczona wartość BlliOiie Zmierzona wartość Obliczona wartość Zmierzona wartość
1 1054,61 1054,64 992,59 992,60 1132,65 1132,72
2 527,81 528,09 496,80 497,02 566,83 567,21
3 352,21 352,45 331,54 331,73 378,22 378,48
z - ładunek
Zastosowanie wynalazku
Ze względu na wykazywaną aktywnością przeciwbakteryjną i przeciwgrzybową oraz niską toksycznością w stosunku do ludzkich erytrocytów związki będące przedmiotem niniejszego patentu mogą być potencjalnymi środkami leczniczymi. Ponadto istnieje przypuszczenie o możliwości ich wykorzystania do konserwacji kosmetyków, leków, żywności, produkcji opakowań i powlekania materiałów.
Wykaz stosowanych skrótów:
ATCC - ang. American Type Culture Collection; Amerykańska Kolekcja Hodowli Komórkowych
Boc - tert-butyloksykarbonyl
CLSI - ang. Clinical and Laboratory Standards Institute
DCM - dichlorometan
DIC - Λ/,Λ/’-diizopropylokarbodiimid
DIPEA - diizopropyloetyloamina
DMF - Λ/,Λ/’-dimetyloformamid
ESI-MS - ang. Electrospray lonisation Mass Spectrometry; Spektrometria mas z jonizacją poprzez elektrorozpylanie
Fmoc - 9-fluorenylometoksykarbonyl
Fmoc-AA-OH - aminokwas, którego grupa α-aminowa chroniona jest grupą Fmoc
HCso - ang. 50% Hemolytic Concentration; stężenie związku powodujące lizę połowy erytrocytów
HOBt - 1-hydroksybenzotriazol
MIC - ang. Minimal Inhibitory Concentration; Minimalne stężenie hamujące wzrost drobnoustrojów
Pbf - 2,2,4,6,7- pentametylodihydrobenzofuran-5-sulfonyl
PCM - ang. Polish Collection of Microorganisms; Polska kolekcja mikroorganizmów tBu - tert-butyl
TFA - kwas trifluorooctowy
TIS - triizopropylosilan

Claims (6)

  1. Zastrzeżenia patentowe
    1. Nowe związki o wzorze ogólnym:
    gdzie:
    związek A, posiada Ri = -CeHs; R2 = -CeHs; R3 = -CeHs związek B, posiada R1 = -CeHs; R2 = -CeHs; R3 = -CH3 związek C, posiada R1 = -CH=CH-C6H5; R2 = -CH=CH-C6H5; R3 = -CH=CH-C6H5
  2. 2. Sposób otrzymywania nowych związków zdefiniowanych w zastrzeżeniu 1, znamienny tym, że posiada następujące etapy:
    a) deprotekcja Fmoc w 20% roztworze piperydyny (Fmoc-Rink Amidę Resin); 20 minut z wytrząsaniem,
    b) przemywanie żywicy rozpuszczalnikami - dwukrotnie DMF, dwukrotnie DMF:DCM, (1:1, v/v), dwukrotnie DCM,
    c) wykonanie testu chloranilowego,
    d) reakcja kondensacji, gdzie stosowano trzykrotny nadmiar reagentów - Fmoc-AA-OH:DIC:HOBt (stosunek równomolowy),
    e) przemywanie żywicy oraz test chloranilowy,
    f) w ten sam sposób przyłączono kolejne aminokwasy, gdzie po przyłączeniu trzech reszt L-argininy (Fmoc-L-Arg(Pbf)-OH), i jednej reszty L-lizyny (Fmoc-L-Lys(Boc)-OH), otrzymano następujący półprodukt - Fmoc-L-Lys(Boc)-[L-Arg(Pbf)-]3-linker-żywica,
    g) następnie za pomocą roztworu piperydyny przeprowadzono deprotekcję grupy «.-aminowej N-końcowego aminokwasu (usunięcie Fmoc), przemyto żywicę i wykonano test chloranilowy,
    h) przeprowadzono reakcję kondensacji:
    - dla związków A i B) z kwasem benzoesowym - kwas benzoesowy:DIC:HOBt (stosunek równomolowy) - stosując trzykrotny nadmiar reagentów, a następnie tak jak w pkt. b) i c);
    - dla związku C) przeprowadzono reakcję kondensacji z kwasem cynamonowym - kwas cynamonowy:DIC:HOBt (stosunek równomolowy) - stosując trzykrotny nadmiar reagentów, a następnie tak jak w pkt. b) i c).
    i) przeprowadzono deprotekcję grupy Ne-aminowej lizyny (ugrupowanie Boc) umieszczając peptydylo-żywicę w 10% roztworze TFA w DCM na 30 minut z wytrząsaniem, a następnie postępowano analogicznie jak po etapie deprotekcji pkt. b) i c),
    j) do wolnej grupy ε-aminowej przyłączano kolejną resztę Fmoc-L-Lys(Boc)-OH, i wykonano czynności z pkt. b) i c),
    k) przeprowadzono deprotekcję ugrupowania ISP-aminowego za pomocą roztworu piperydyny, a następnie kondensację z wykorzystaniem, dla związku A i B ) kwasu benzoesowego, a dla związku C) kwasu cynamonowego; a następnie wykonano czynności z pkt. b) i c),
    PL 236 059 B1
    l) przeprowadzono deprotekcję ugrupowania Ne-aminowego N-końcowej reszty lizyny umieszczając peptydylo-żywicę w 10% TFA w DCM na 30 minut z wytrząsaniem, a następnie postępowano analogicznie jak po etapie deprotekcji pkt. b) i c),
    m) do wolnej grupy ε-aminowej przyłączano kolejną resztę:
    - dla związku A) resztę kwasu benzoesowego;
    - dla związku B) resztę kwasu octowego stosując bezwodnik octowy, reakcja ta była prowadzona przez 1 h, gdzie na 1 gram żywicy (osadzenie 0,9 mmol/g) przygotowywano 1 ml bezwodnika kwasu octowego i 1 ml DIPEA w 18 ml DCM;
    - dla związku C) resztę kwasu cynamonowego, i dalej wykonano czynności z pkt. b) i c), n) peptyd odszczepiono od żywicy stosując - TFA:TIS:woda (96:2:2, v/v), z jednoczesnym mieszaniem przez 1,5 h,
    o) surowy peptyd wytrącono za pomocą schłodzonego eteru dietylowego i odwirowano, supernatant zlano, zaś peptyd poddano liofilizacji,
    p) peptyd został oczyszczony z wykorzystaniem wysokosprawnej chromatografii cieczowej w układzie faz odwróconych, gdzie jako fazę ruchomą zastosowano acetonitryl i wodę dejonizowaną zawierające 0,1% TFA.
  3. 3. Sposób według zastrz. 2, znamienny tym, że reakcję kondensacji przeprowadza się przez 1,5 h w DCM:DMF (1:1, v/v) z wytrząsaniem.
  4. 4. Sposób według zastrz. 2, znamienny tym, że w celu selektywnej deprotekcji ugrupowania ε-aminowego łańcucha bocznego lizyny zastosowano środowisko kwaśne.
  5. 5. Nowe związki określone w zastrzeżeniu 1 do zastosowania jako środek antybakteryjny.
  6. 6. Nowe związki określone w zastrzeżeniu 1 do zastosowania jako środek przeciwgrzybiczy.
PL419961A 2016-12-22 2016-12-22 Grupa peptydów przeciwdrobnoustrojowych opartych o strukturę amidu Nε-L-lizyno-L-lizylo-L-arginylo-L-arginylo-L-argininy modyfikowaną kwasami karboksylowymi PL236059B1 (pl)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL419961A PL236059B1 (pl) 2016-12-22 2016-12-22 Grupa peptydów przeciwdrobnoustrojowych opartych o strukturę amidu Nε-L-lizyno-L-lizylo-L-arginylo-L-arginylo-L-argininy modyfikowaną kwasami karboksylowymi

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL419961A PL236059B1 (pl) 2016-12-22 2016-12-22 Grupa peptydów przeciwdrobnoustrojowych opartych o strukturę amidu Nε-L-lizyno-L-lizylo-L-arginylo-L-arginylo-L-argininy modyfikowaną kwasami karboksylowymi

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL419961A1 PL419961A1 (pl) 2018-07-02
PL236059B1 true PL236059B1 (pl) 2020-11-30

Family

ID=62705245

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL419961A PL236059B1 (pl) 2016-12-22 2016-12-22 Grupa peptydów przeciwdrobnoustrojowych opartych o strukturę amidu Nε-L-lizyno-L-lizylo-L-arginylo-L-arginylo-L-argininy modyfikowaną kwasami karboksylowymi

Country Status (1)

Country Link
PL (1) PL236059B1 (pl)

Also Published As

Publication number Publication date
PL419961A1 (pl) 2018-07-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Tam et al. Antimicrobial dendrimeric peptides
Arvidsson et al. Exploring the Antibacterial and Hemolytic Activity of Shorter‐and Longer‐Chain β‐, α, β‐, and γ‐Peptides, and of β‐Peptides from β2‐3‐Aza‐and β3‐2‐Methylidene‐amino Acids Bearing Proteinogenic Side Chains–A Survey
Kwon et al. Structure-activity analysis of brevinin 1E amide, an antimicrobial peptide from Rana esculenta
Monroc et al. De novo designed cyclic cationic peptides as inhibitors of plant pathogenic bacteria
DE102007036128A1 (de) Antibiotische Peptide
Oliveras et al. Antimicrobial activity of linear lipopeptides derived from BP100 towards plant pathogens
Bisht et al. Antimicrobial activity of rationally designed amino terminal modified peptides
Comegna et al. Design, synthesis and antimicrobial properties of non-hemolytic cationic α-cyclopeptoids
Wu et al. Design and synthesis of unprecedented cyclic γ-AApeptides for antimicrobial development
CN108276485A (zh) 能抑制和杀灭革兰氏阴性菌的抗菌肽hv2及制备方法
Wang et al. Antimicrobial specificity and mechanism of action of disulfide-removed linear analogs of the plant-derived Cys-rich antimicrobial peptide Ib-AMP1
EP3122763A1 (en) Antimicrobial peptide dendrimers
CN113185576A (zh) 一类具有RRRF转角的β-发卡型低毒广谱抗菌肽及其应用
US8541365B2 (en) Dendrimeric compounds comprising amino acids, hyperbranched core compound, process for preparation of dendrimeric compounds comprising amino acids and hyperbranched core compound, and use thereof
RU2415868C1 (ru) Производные гемина, обладающие антимикробной активностью, или их фармацевтически приемлемые соли, способ получения, фармкомпозиция и применение
KR100438416B1 (ko) Ca-ma 펩타이드의 아미노산 중 하나 또는 그 이상을치환하여 + 전극과 소수성 영역이 증가된 신규한펩타이드 및 그를 포함하는 약학적 조성물
US8026219B2 (en) Antimicrobial linear peptides
Sikora et al. Quaternary Ammonium Salts of Cationic Lipopeptides with Lysine Residues—Synthesis, Antimicrobial, Hemolytic and Cytotoxic Activities
Janiszewska et al. Amphiphilic dendrimeric peptides as model non-sequential pharmacophores with antimicrobial properties
PL236059B1 (pl) Grupa peptydów przeciwdrobnoustrojowych opartych o strukturę amidu Nε-L-lizyno-L-lizylo-L-arginylo-L-arginylo-L-argininy modyfikowaną kwasami karboksylowymi
Sato et al. Novel des-fatty acyl-polymyxin B derivatives with Pseudomonas aeruginosa-specific antimicrobial activity
Glossop et al. Fluorinated O-phenylserine residues enhance the broad-spectrum antimicrobial activity of ultrashort cationic lipopeptides
Lamba et al. Homo and hetero-branched lipopeptide Dendrimers: Synthesis and antimicrobial activity
Sharma et al. Synthesis and biological evaluation of natural cyclic peptide
KR100547565B1 (ko) 개구린 5로부터 합성 및 제조된 항생 펩타이드 유도체