PL212415B1 - Nowe peptydowe związki dendrymeryczne o strukturze amfifilowej - Google Patents
Nowe peptydowe związki dendrymeryczne o strukturze amfifilowejInfo
- Publication number
- PL212415B1 PL212415B1 PL383204A PL38320407A PL212415B1 PL 212415 B1 PL212415 B1 PL 212415B1 PL 383204 A PL383204 A PL 383204A PL 38320407 A PL38320407 A PL 38320407A PL 212415 B1 PL212415 B1 PL 212415B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- lys
- compound
- compounds
- phe
- group
- Prior art date
Links
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 title claims description 48
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims description 18
- OGQYPPBGSLZBEG-UHFFFAOYSA-N dimethyl(dioctadecyl)azanium Chemical group CCCCCCCCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)CCCCCCCCCCCCCCCCCC OGQYPPBGSLZBEG-UHFFFAOYSA-N 0.000 title 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 31
- -1 2-chlorobenzyloxycarbonyl Chemical group 0.000 claims description 10
- 230000003385 bacteriostatic effect Effects 0.000 claims description 9
- 230000000843 anti-fungal effect Effects 0.000 claims description 8
- QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N D-alanine Chemical compound C[C@@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N 0.000 claims description 4
- KDXKERNSBIXSRK-RXMQYKEDSA-N D-lysine Chemical compound NCCCC[C@@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-RXMQYKEDSA-N 0.000 claims description 4
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 4
- 125000001584 benzyloxycarbonyl group Chemical group C(=O)(OCC1=CC=CC=C1)* 0.000 claims description 4
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 claims description 4
- UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N phenylmethyl ester of formic acid Natural products O=COCC1=CC=CC=C1 UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- ONIBWKKTOPOVIA-SCSAIBSYSA-N D-Proline Chemical compound OC(=O)[C@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-SCSAIBSYSA-N 0.000 claims description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UWTATZPHSA-N D-Serine Chemical compound OC[C@@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UWTATZPHSA-N 0.000 claims description 2
- XPDXVDYUQZHFPV-UHFFFAOYSA-N Dansyl Chloride Chemical compound C1=CC=C2C(N(C)C)=CC=CC2=C1S(Cl)(=O)=O XPDXVDYUQZHFPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 125000001295 dansyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(N(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])=C2C([H])=C([H])C([H])=C(C2=C1[H])S(*)(=O)=O 0.000 claims description 2
- ZBCBWPMODOFKDW-UHFFFAOYSA-N diethanolamine Chemical group OCCNCCO ZBCBWPMODOFKDW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 150000002668 lysine derivatives Chemical class 0.000 claims description 2
- 125000001624 naphthyl group Chemical group 0.000 claims description 2
- 125000005146 naphthylsulfonyl group Chemical group C1(=CC=CC2=CC=CC=C12)S(=O)(=O)* 0.000 claims description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 8
- QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N Dicylcohexylcarbodiimide Chemical compound C1CCCCC1N=C=NC1CCCCC1 QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000000412 dendrimer Substances 0.000 description 8
- 229920000736 dendritic polymer Polymers 0.000 description 8
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 7
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 6
- 238000000034 method Methods 0.000 description 6
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 6
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 description 4
- NPZTUJOABDZTLV-UHFFFAOYSA-N hydroxybenzotriazole Substances O=C1C=CC=C2NNN=C12 NPZTUJOABDZTLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 description 3
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 3
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 3
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 3
- ASOKPJOREAFHNY-UHFFFAOYSA-N 1-Hydroxybenzotriazole Chemical compound C1=CC=C2N(O)N=NC2=C1 ASOKPJOREAFHNY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000192125 Firmicutes Species 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- RJQXTJLFIWVMTO-TYNCELHUSA-N Methicillin Chemical compound COC1=CC=CC(OC)=C1C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2[C@@H](C(O)=O)C(C)(C)S[C@@H]21 RJQXTJLFIWVMTO-TYNCELHUSA-N 0.000 description 2
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 2
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 2
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 2
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 2
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 238000000119 electrospray ionisation mass spectrum Methods 0.000 description 2
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- XELZGAJCZANUQH-UHFFFAOYSA-N methyl 1-acetylthieno[3,2-c]pyrazole-5-carboxylate Chemical compound CC(=O)N1N=CC2=C1C=C(C(=O)OC)S2 XELZGAJCZANUQH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960003085 meticillin Drugs 0.000 description 2
- 238000000655 nuclear magnetic resonance spectrum Methods 0.000 description 2
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 238000002953 preparative HPLC Methods 0.000 description 2
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 208000037205 Bacterial Infections and Mycoses Diseases 0.000 description 1
- 108010016626 Dipeptides Proteins 0.000 description 1
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 241001360526 Escherichia coli ATCC 25922 Species 0.000 description 1
- OBSIQMZKFXFYLV-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine amide Chemical group NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 OBSIQMZKFXFYLV-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000201788 Staphylococcus aureus subsp. aureus Species 0.000 description 1
- 108010070741 Tachypleus tridentatus tachyplesin peptide Proteins 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 1
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 238000009635 antibiotic susceptibility testing Methods 0.000 description 1
- 229940121375 antifungal agent Drugs 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000013068 control sample Substances 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 238000003113 dilution method Methods 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 238000002330 electrospray ionisation mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- VSDUZFOSJDMAFZ-VIFPVBQESA-N methyl L-phenylalaninate Chemical compound COC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 VSDUZFOSJDMAFZ-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 229930014626 natural product Natural products 0.000 description 1
- IOQPZZOEVPZRBK-UHFFFAOYSA-N octan-1-amine Chemical compound CCCCCCCCN IOQPZZOEVPZRBK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- ZJQFYZCNRTZAIM-PMXBASNASA-N tachyplesin Chemical compound C([C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(N[C@H]2CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC=3C=CC=CC=3)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=3C4=CC=CC=C4NC=3)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)NC2=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(N)=O)C(=O)N1)=O)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 ZJQFYZCNRTZAIM-PMXBASNASA-N 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 1
Landscapes
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Description
Opis wynalazku
Przedmiotem wynalazku są nowe peptydowe związki dendrymeryczne o strukturze amfifilowej posiadające właściwości bakteriostatyczne i przeciwgrzybiczne.
Obecnie ogólnoświatowe trendy skierowane są na poszukiwania nowych związków służących do zwalczania infekcji bakteryjnych i grzybic, o nowych strukturach i innym sposobie działania niż stosowane dotychczas antybiotyki. W związku z powyższym, wiele grup badawczych na Świecie zainteresowanych jest naturalnymi peptydami przeciwbakteryjnymi. Lawinowo rosnąca liczba prac na ten temat wskazuje, ze peptydy te uważa się za perspektywiczne źródło inspiracji naukowej w poszukiwaniu nowych terapeutyków o działaniu przeciwbakteryjnym, przeciwwirusowym i przeciwgrzybicznym oraz przy eliminowaniu problemu lekooporności.
W 2003 r. zgłoszono do Urzędu Patentowego RP wyniki prac nad rozgałęzionymi analogami naturalnych związków peptydowych o strukturze dendrymeru (Jolanta Janiszewska, Zofia Lipkowska, „Nowe związki o strukturze dendrymeru posiadające właściwości bakteriostatyczne i przeciwgrzybiczne”, zgł. Pat. Nr P 361821). Związki te powstały na bazie koncepcji „niesekwencyjnego farmakoforu” (J. Janiszewska, Z. Urbanczyk-Lipkowska, Amphiphilic dendrimeric peptides as non-sequential pharmacophores with antimicriobial properties; Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology, 2007, 13, DOl:10.1159/000104751), która pozwala na odtworzenie struktury aktywnej naturalnego liniowego związku poprzez umieszczenie zasadowych i lipofilowych reszt aminokwasowych w przestrzeni dendrymeru. Otrzymane związki posiadały małe masy cząsteczkowe i charakteryzowały się dobrymi własnościami przeciwdrobnoustrojowymi. Jest to odmienne podejście niż znane z literatury zastosowanie dendrymerów lizynowych do multiplikowama bakteriostatycznych fragmentów peptydowych protegryny lub tachyplesyny (Tam J. P., Lu Y.A., i Yang, J. L.; European Journal of Biochemistry, 2002, 269, 923-932). Podobnie jak większość związków naturalnych, nie wykazywały one selektywności względem określonego typu patogenów (J. Janiszewska, J. Swieton, A. W. Lipkowski, Z.Urbanczyk-Lipkowska, Low molecular mass dendrimeric peptides that express antimicrobial properties; Bioorganic & Medicinal Chemistry Letłers 13 (2003), 3711-3713). Badanie oddziaływania tych dendrymerycznych peptydów z naturalnymi i modelowymi membranami sugeruje, że wbudowują się one w warstwę lipidową membrany co prowadzi do jej destrukcji (B. Klajnert, J. Janiszewska, Z. Urbanczyk-Lipkowska, M. Bryszewska, D. Shcharbin, M. Labieniec, Biological properties of Iow molecular mass peptide dendrimers; International Journal of Pharmaceutics, 309 (2006), 208-217).
Zgłaszający prowadził również badania własne właściwości bakteriostatycznych i przciwgrzybicznych różnych izomerycznych dendrymerów, posiadających długie hydrofobowe łańcuchy alifatyczne umieszczone na C-końcu dendrymerycznego peptydu.
Nieoczekiwanie okazało się, że grupa związków według wynalazku wykazuje lepsze niż dotychczas badane związki niemodyfikowane, właściwości bakteriostatyczne i przeciwgrzybiczne. W dalszych badaniach nieoczekiwanie stwierdzono, że najwyższe aktywności wykazują one przeciwko Gram - dodatnim bakteriom, w tym również przeciwko metycylinoopornemu szczepowi MRSA.
Przedmiotem wynalazku są nowe peptydowe związki dendrymeryczne o strukturze amfifilowej, posiadające właściwości bakteriostatyczne i przeciwgrzybiczne, o wzorach ogólnych:
R1
NH (CH2)n Q
R2 NH—CH—W— R3 (1)
PL 212 415 B1
w których:
n stanowi liczbę naturalną 2, 3 lub 4,
R1 i R2 są niezależnie wybrane z grupy obejmującej: H, benzyloksykarbonyl (Z), 2-chlorobenzyloksykarbonyl (2-CI-Z), dansyl (DNS), naftyl, naftylosulfonyl, podstawniki aromatyczne oraz pochodne lizyny, w tym Lizyna (Lys), D-Lizyna (D-Lys), Z-Lys, Z-D-Lys, Lys-fe-Z), D-Lys-fe-Z), (2-CI-Z)Lys, (2-CI-Z)-D-Lys, Lys-(s-2-CI-Z), D-Lys-(s-2-CI-Z), DNS- (Lys), Lys-(s-DNS),
R3 jest niezależnie wybrane z grupy obejmującej: amidy liniowych aminokwasów alifatycznych o długości łańcucha od 3 do 6 atomów węgla, a także reszty amin alifatycznych w tym zawierające reszty lipofilne składające się z 6 do 18 atomów węgla,
R4 i R5 są niezależnie wybrane z grupy obejmującej: Gly, Ala, D-Ala, Z-Arg, Z-D- Arg, (2-CI-Z)Arg, (2-CI-Z)-D-Arg,
R6 jest niezależnie wybrane z grupy obejmującej: Gly, Ala, D-Ala, Ser(Bzl), D- Ser(Bzl), Pro, D-Pro.
Związek według wynalazku korzystnie jest związkiem o wzorze 1, w którym n oznacza 4, R1 oznacza Z-Lys, R2 oznacza Z-Lys, a R3 oznacza -NH(CH2)7CH3.
Związek według wynalazku korzystnie jest związkiem o wzorze 2, w którym n oznacza 4, R4 oznacza Z-Lys, R5 oznacza Z-Lys, a R3 oznacza -NH(CH2)7CH3.
Związek według wynalazku korzystnie jest związkiem o wzorze 3, w którym n oznacza 4, R1 oznacza Lys-fe-2-CI-Z), R2 oznacza Lysfe-2-CI-Z), R3 oznacza - NH(CH2)7CH3 i R6 oznacza Phe.
Związek według wynalazku korzystnie jest związkiem o wzorze 4, w którym n oznacza 4, R1 oznacza Lys-fe-2-CI-Z), R2 oznacza Lysfe-2-CI-Z), a R3 oznacza - NH(CH2)7CH3 i R6 oznacza Phe.
PL 212 415 B1
Związki według wynalazku, dzięki korzystnym właściwościom mogą zostać zastosowane w terapii przeciwdrobnoustrojowej i przeciwgrzybiczej. W chwili obecnej, w początkowych etapach badań klinicznych znajdują się pierwsze związki z tej grupy.
Zaletą związków według wynalazku jest to, że dzięki amfifilowej strukturze niskocząsteczkowego dendrymeru, zapewniającej właściwe rozmieszczenie grup odpowiedzialnych za oddziaływanie z błoną komórkową bakterii, uzyskują one silne działanie bakteriostatyczne ukierunkowane w stosunku do bakterii Gram - dodatnich, łącznie ze szczepami metycylinoopornymi (MRSA).
Związki według wynalazku można otrzymać ogólnie znanymi metodami syntezy peptydów w roztworze, z zastosowaniem aminokwasów blokowanych na N-koń cu grupami benzyloksykarbonylowymi (Z) i/lub 2-chlorobenzyloksykarbonylowymi (2-CI-Z) i/lub t-butyloksykarbonylowymi, sprzęganych za pomocą N,N'-dicykloheksylokarbodiimidu (DCC) wobec N-hydroksybenzotriazolu (HOBt).
Otrzymane peptydy oczyszcza się chromatograficznie, korzystnie na kolumnie żelowej zawierającej Sephadex LH-20 (w metanolu), a następnie poprzez użycie preparatywnej wysokosprawnej chromatografii cieczowej HPLC. Właściwą budowę peptydu i jego czystość potwierdzano za pomocą analitycznej kolumny HPLC, przez wykonanie widma ESI-MS (electrospray ionization mass spectrometry) oraz widm NMR.
Syntezę związków oraz wyniki badania ich właściwości bakteriostatycznych zilustrowano w poniższych przykładach wykonania.
P r z y k ł a d y I - VII.
Wytwarzanie związków według wynalazku
Związki o wzorach 1, 2, 3 i 4 otrzymywano drogą dendrymeryzacji prowadząc cyklicznie następujące po sobie reakcje:
a) reakcja sprzęgania N-chronionych aminokwasów z utworzeniem wiązania peptydowego -CONH-, gdzie X oznacza element blokujący reaktywność grupy aminowej, a Y element blokujący reaktywność grupy kwasowej aminokwasu, (schemat I) χ-Νΐ......-αχΗ + ......-cd-y
Χ-Ν1......-OTSH......CD-Y schemat I
b) reakcja odblokowania grup aminowych celem odtworzenia reaktywnych, wolnych grup aminowych zdolnych do reakcji a)
Χ-ΝΗ-......-CONH-......-CO-Y
NB,-......-OONH-......OO-Y schemat II
Związki o wzorach 1, 2, 3 i 4 otrzymywano metodą syntezy peptydów jak wyżej w roztworze z zastosowaniem aminokwasów blokowanych na N-koń cu grupami benzyloksykarbonylowymi (Z) i/lub 2-Chlorobenzyloksykarbonylowymi (2-CI-Z) i/lub t-Butyloksykarbonylowymi sprzęganych za pomocą N,N'-dicykloheksylokarbodiimidu (DCC) wobec N-hydroksybenzotriazolu (HOBt).
Peptyd według przykładu V otrzymano sprzęgając odpowiednio ester metylowy fenyloalaniny PheOCH3 z lizyną blokowaną na N-końcu grupami t-butyloksykarbonylowymi a-Boc-Lys^-Boc) metodą karbodiimidową. Po odblokowaniu grup aminowych na N-końcu, dwupeptyd sprzęgnięto z a-Z-Lys(e-Boc) metodą karbodiimidową. Po selektywnym odblokowaniu grup ε-aminowych otrzymany związek przekształcono w amid traktując go amoniakiem. Otrzymano produkt stanowiący związek opisany wzorem 1, gdzie R1=Z-Lys, R2=Z-Lys, R3=PheNH2.
Peptyd według przykładu VI otrzymano sprzęgając odpowiednio n-oktyloaminę NH2-(CH2)7CH3 Z N-blokowaną fenyloalaniną Boc-Phe metodą karbodiimidową. Otrzymany związek, po odblokowaniu grup aminowych, sprzęgnięto z α-Boc-Lys^-Boc). Po uwolnieniu grup aminowych produkt sprzęgnięto
PL 212 415 B1 z α-Z-Lys^-Boc). Po selektywnym odblokowaniu grup ε-aminowych uzyskano produkt stanowiący związek opisany wzorem 3, gdzie R1=Z-Lys, R2=Z-Lys, R3=NH-(CH2)7CH3, R6=Phe.
Otrzymane peptydy oczyszczano chromatograficznie na kolumnie żelowej zawierającej Sephadex LH-20 (w metanolu), a następnie poprzez użycie preparatywnej kolumny HPLC. Właściwą budowę peptydu i jego czystość potwierdzano przez zastosowanie analitycznej kolumny HPLC, wykonanie widma ESI-MS (electrospray jonization mass spectrometry) oraz widm NMR.
Wzory związków oraz charakterystykę widm potwierdzających ich strukturę opisano w Tabeli 1. Tabela 1
| Nr przykł. | Związek | Wzór sumaryczny | m/z |
| I | wzór 1: R1=Lys(e-2-CI-Z), R2= Lys(e-2-CIZ), R3=PheNH2 HCl*Lys(2-Q-Z)-Lys-Phe-NI^ | C43HsgOgNgCI2 | 443.2 1/2[M+2H]+ 885.4 [M+Hf |
| II | wzór 3: R1=Lys(e-2-CI-Z), R2=Lys(e-2-CI-Z), R3=NH-(CH2)7CH3, R6=Phe IICrLys(2-a-Z) I HQ*Lys(2-Q-Z)-Lys-Phe-NH-(CI^)7CI^ | C51H74O8N8CI2 | 499.4 1/2[M+2Hf 997.7 [M+Hf 1019.7 [M+Na]+ |
| III | wzór 3: R1=Lys(e-2-CI-Z), R2=Lys(s-2-CI-Z), R3=NH-(CH2)9CH3, R6=Phe HQ*Lys(2-Q-Z) I Ha*Lys(2-a-Z)-Lys-PhepNB<CHz)9CH3 | C53H78O8N8CI2 | 513.3 1/2[M+2Hf 1025.6 [M+Hf |
| IV | wzór 3: R1=Lys(e-2-CI-Z), R2=Lys(e-2-CI-Z), R3=NH-(CH2)1iCH3, R6=Phe HCI*Lys(2-a-Z) I HQ*Lys(2-CI-Z)-Lys-Phe-NH-(CHj)11CHj | C55H82O8N8CI2 | 527.4 1/2[M+2H]+ 1053.7 [M+Hf |
| V | wzór 1: R1=Z-Lys, R2=Z-Lys, R3=PheNH2 Z-I.\s(HCI) I Z-LysfHGO-Lys-Phe-NI^ | C43H60O8N8 | 409.2 1/2[M+2Hf 818.4 [M+Hf |
| VI | wzór 3: R1=Z-Lys, R2=Z-Lys, R3=NH(CH2)7CH3, R6=Phe Z-Lys(HCl) I Z-Lys(Ha)-Lys-Phe-NH-(CH2)7CHj | C51H76O8N8 | 465.3 1/2[M+2Hf 929.6 [M+Hf |
| VII | wzór 3: R1=Z-Lys, R2=Z-Lys, R3=NH(CH2)7CH3, R6=Phe Z-Lys(HCI) I Z-Lys(HCI)-Lys-Phe-NH-(CH,)11CH3 | C55H84O8N8 | 493.4 1/2[M+2Hf 985.8 [M+Hf 1007.7 [M+Naf |
PL 212 415 B1
P r z y k ł a d y VIII -XIV
Wartości MIC (Minimal Inhibitory Concentration) związków otrzymanych w przykładach I - VII dla bakterii a-d oznaczano przy użyciu standardowej metody mikrorozcieńczeń w podłożu płynnym (Clinical and Laboratory Standards Institute 2007. Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically. Approved Standard - Seventh Edition. M7-A7. Clinical and Laboratory Standards Institute, Wayne, PA, USA).
Przygotowano szereg podwójnych rozcieńczeń badanych związków w DMSO. Następnie rozcieńczano je 95x w CAMHB (Cation Adjusted Mueller - Hinton Broth). Hodowle bakterii prowadzono 24 godz. w 35°C w warunkach tlenowych na podłożu stałym TSA (Triptic Soy Agar). Objętość próby właściwej wynosiła 0,1 ml i składała się z: 0,005 ml zawiesiny bakterii w soli fizjologicznej o gęstości
107 CFU/ml (ostateczna ilość bakterii 5x105/ml) oraz 0,095 ml roztworu badanego związku w CAMHB.
Końcowe stężenia związków w próbie właściwej wynosiły ^g/ml): 128, 64, 32, 16, 8, 4, 2, 1.
Próba ślepa składała się z: 0,005 ml podłoża CAMHB oraz 0,095 ml roztworu badanego związku w CAMHB.
Próba kontrolna składała się z: 0,005 ml zawiesiny bakterii w soli fizjologicznej o gęstości 107 CFU/ml (ostateczna ilość bakterii 5x105/ml) oraz 0,095 ml CAMHB.
Płytki titracyjne ze szczepami a, b, d inkubowano 18 h w 35°C w warunkach tlenowych, zaś szczep c inkubowano 18 h w 33°C w warunkach tlenowych.
W Tabeli 2 przedstawiono uzyskane wyniki badania aktywności przeciwbakteryjnej związków według wynalazku otrzymanych w przykładach wykonania I - VII, o strukturze dendrymeru, na szczepy bakterii:
a) Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853,
b) Staphylococus aureus subsp. aureus ATCC 25923,
c) Staphylococus aureus subsp. aureus ATCC 43300,
d) Escherichia coli ATCC 25922.
Dla porównania podano aktywność opatentowanych wcześniej izomerycznych związków odnośnych o numerach przykładu I i V, zmierzoną w naszych warunkach eksperymentalnych.
Tabela 2
| Nr przykładu | Związek | MIC (μΜ/L) | |||
| Pseudomona s aeruginosa ATCC 27853 | S. aureus subsp. aureus ATCC 25923 | S. aureus subsp. Aureus ATCC 43300 | E. coli. ATCC 25922 | ||
| VIII | HCl*Lys(2-Cl-Z) HCl*Lys(2-CI-Z)-Lys-Phe-NII2 | 67 | 33 | 17 | 33 |
| IX | HCl*Lys(2-Cl-Z) IICl*Lys(2-Cl-Z)-Lys-Phe-NH-(CH2)7CH3 | 128 | 8 | 8 | 8 |
| X | HCl*Lys(2-CI-Z) t HCl*Lys(2-Cl-Z)-Lys-Phe-NH-(CH2),CH, | 124 | 117 | 14 | 117 |
| XI | HCI*Lys(2-CI-Z) 1 HCI*Lys(2-Cl-Z)-Lys-Phe-NH-(CH2)nCH3 | 113 | 28 | 28 | 56 |
| XII | Z-Lys(HCl) 1 Z-Lys(HCl)-Lys-Phe-NH2 | >144 | >144 | >144 | >144 |
| XIII | Z-Lys(HCl) 1 Z-Lys(HCI)-Lys-Phe-NH-(CH2)7CH3 | 64 | 32 | 16 | 32 |
| XIV | Z-Lys(IICI) 1 Z-Lys(HCI)-Lys-Phc-NH-(CH2)nCH3 | 65 | 15 | 8 | 30 |
PL 212 415 B1
Claims (5)
1. Nowe peptydowe związki dendrymeryczne o strukturze amfifilowej, posiadające właściwości bakteriostatyczne i przeciwgrzybiczne, o wzorach ogólnych:
w których:
n stanowi liczbę naturalną 2, 3 lub 4,
R1 i R2 są niezależnie wybrane z grupy obejmującej: H, benzyloksykarbonyl (Z), 2-chlorobenzyloksykarbonyl (2-CI-Z), dansyl (DNS), naftyl, naftylosulfonyl, podstawniki aromatyczne oraz po8
PL 212 415 B1 chodne lizyny, w tym Lizyna (Lys), D-Lizyna (D-Lys), Z-Lys, Z-D-Lys, Lys-fe-Z), D-Lys-fe-Z), (2-Cl-Z)-Lys, (2-CI-Z)-D-Lys, Lys-(s-2-CI-Z), D-Lys-(s-2-CI-Z), DNS-(Lys), Lys-(s-DNS),
R3 jest niezależnie wybrane z grupy obejmującej: amidy liniowych aminokwasów alifatycznych o długości łańcucha od 3 do 6 atomów węgla, a także reszty amin alifatycznych w tym zawierające reszty lipofilne składające się z 6 do 18 atomów węgla,
R4 i R5 są niezależnie wybrane z grupy obejmującej: Gly, Ala, D-Ala, Z-Arg, Z-D-Arg, (2-CI-Z)-Arg, (2-Cl-Z)-D-Arg,
R6 jest niezależnie wybrane z grupy obejmującej: Gly, Ala, D-Ala, Ser(Bzl), D-Ser(Bzl), Pro,
D-Pro.
2. Związek według zastrz. 1, znamienny tym, że jest związkiem o wzorze 1, w którym n oznacza 4, R1 oznacza Z-Lys, R2 oznacza Z-Lys, a R3 oznacza -NH(CH2)7CH3.
3. Związek według zastrz. 1, znamienny tym, że jest związkiem o wzorze 2, w którym n oznacza 4, R4 oznacza Z-Lys, R5 oznacza Z-Lys, a R3 oznacza -NH(CH2)7CH3.
4. Związek według zastrz. 1, znamienny tym, że jest związkiem o wzorze 3, w którym n oznacza 4, R1 oznacza Lys-fe-2-CI-Z), R2 oznacza Lysfe-2-CI-Z), R3 oznacza -NH(CH2)7CH3 i R6 oznacza Phe.
5. Związek według zastrz. 1, znamienny tym, że jest związkiem o wzorze 4, w którym n oznacza 4, R1 oznacza Lys-fe-2-CI-Z), R2 oznacza Lysfe-2-CI-Z), a R3 oznacza -NH(CH2)7CH3 i R6 oznacza Phe.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PL383204A PL212415B1 (pl) | 2007-08-28 | 2007-08-28 | Nowe peptydowe związki dendrymeryczne o strukturze amfifilowej |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PL383204A PL212415B1 (pl) | 2007-08-28 | 2007-08-28 | Nowe peptydowe związki dendrymeryczne o strukturze amfifilowej |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL383204A1 PL383204A1 (pl) | 2009-03-02 |
| PL212415B1 true PL212415B1 (pl) | 2012-09-28 |
Family
ID=42984724
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL383204A PL212415B1 (pl) | 2007-08-28 | 2007-08-28 | Nowe peptydowe związki dendrymeryczne o strukturze amfifilowej |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| PL (1) | PL212415B1 (pl) |
-
2007
- 2007-08-28 PL PL383204A patent/PL212415B1/pl unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| PL383204A1 (pl) | 2009-03-02 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2472805C2 (ru) | Антибиотические пептиды | |
| Ahn et al. | Pyrazole derived ultra-short antimicrobial peptidomimetics with potent anti-biofilm activity | |
| EP2213680B1 (en) | Peptides having pharmacological activity for treating disorders associated with altered cell migration, such as cancer | |
| JP6917887B2 (ja) | ベータ−ヘアピンペプチド模倣体 | |
| JP2011511077A (ja) | 選択的ポリ−ｎ−置換グリシン抗生物質 | |
| US11046730B2 (en) | Antimicrobial compositions | |
| Azoulay et al. | Assembly of cationic and amphiphilic β-sheet FKF tripeptide confers antibacterial activity | |
| JP6785651B2 (ja) | ベータ−ヘアピンペプチド模倣体 | |
| Wan et al. | β, γ-diamino acids as building blocks for new analogues of Gramicidin S: Synthesis and biological activity | |
| WO2010029196A1 (es) | Compuestos peptídicos antibacterianos | |
| EP2331497B1 (en) | Dendrimeric compounds comprising amino acids, hyperbranched core compound, process for preparation of dendrimeric compounds comprising amino acids and hyperbranched core compound, and use thereof | |
| Dahiya | Synthesis of a phenylalanine-rich peptide as potential anthelmintic and cytotoxic agent | |
| Dahiya et al. | First total synthesis and biological evaluation of halolitoralin A | |
| US8026219B2 (en) | Antimicrobial linear peptides | |
| Janiszewska et al. | Amphiphilic dendrimeric peptides as model non-sequential pharmacophores with antimicrobial properties | |
| Lima et al. | Design, synthesis and valued properties of surfactin oversimplified analogues | |
| Dahiya | Total synthesis and biological potential of psammosilenin A | |
| PL212415B1 (pl) | Nowe peptydowe związki dendrymeryczne o strukturze amfifilowej | |
| Ahn et al. | Substitution of the GalNAc-α-O-Thr11 residue in drosocin with O-linked glyco-peptoid residue: Effect on antibacterial activity and conformational change | |
| ES2525645T3 (es) | Péptidos cíclicos que contienen como mínimo un resto aza-beta-3 aminoacilado y sus usos. | |
| DE60226351T2 (de) | Matrizenfixierte peptidomimetika mit antimikrobieller wirkung | |
| Dahiya et al. | Synthesis, characterization and biological evaluation of cyclomontanin D | |
| JP7312167B2 (ja) | ベータヘアピンペプチド模倣物 | |
| Dahiya et al. | Synthetic and pharmacological studies on a natural cyclopeptide from Gypsophila arabica | |
| Gill et al. | Synthesis, characterization and antimicrobial activity of protected dipeptides and their deprotected analogs |