NO891691L - Rekombinant gag-forloeper for hiv. - Google Patents
Rekombinant gag-forloeper for hiv.Info
- Publication number
- NO891691L NO891691L NO89891691A NO891691A NO891691L NO 891691 L NO891691 L NO 891691L NO 89891691 A NO89891691 A NO 89891691A NO 891691 A NO891691 A NO 891691A NO 891691 L NO891691 L NO 891691L
- Authority
- NO
- Norway
- Prior art keywords
- gag precursor
- gag
- yeast
- precursor
- recombinant
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 41
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims abstract description 144
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 claims abstract description 55
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 31
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims abstract description 29
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims abstract description 7
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 claims abstract description 4
- 208000037357 HIV infectious disease Diseases 0.000 claims abstract description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims abstract description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims abstract description 4
- 208000033519 human immunodeficiency virus infectious disease Diseases 0.000 claims abstract description 4
- 229940124718 AIDS vaccine Drugs 0.000 claims abstract description 3
- 239000008188 pellet Substances 0.000 claims description 60
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 44
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 37
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 claims description 26
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 claims description 19
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 18
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims description 16
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 claims description 15
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 claims description 15
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 claims description 14
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 12
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 claims description 11
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 claims description 11
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 9
- 239000012071 phase Substances 0.000 claims description 9
- 238000004191 hydrophobic interaction chromatography Methods 0.000 claims description 8
- 239000000243 solution Substances 0.000 claims description 8
- 238000005453 pelletization Methods 0.000 claims description 7
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 claims description 7
- 101710177291 Gag polyprotein Proteins 0.000 claims description 6
- 101710125418 Major capsid protein Proteins 0.000 claims description 6
- 239000000284 extract Substances 0.000 claims description 6
- 238000001641 gel filtration chromatography Methods 0.000 claims description 6
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 claims description 6
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 6
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 claims description 5
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 claims description 5
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 claims description 5
- 239000003443 antiviral agent Substances 0.000 claims description 5
- 238000007710 freezing Methods 0.000 claims description 5
- 230000008014 freezing Effects 0.000 claims description 5
- 238000002955 isolation Methods 0.000 claims description 5
- 238000002156 mixing Methods 0.000 claims description 5
- 239000002955 immunomodulating agent Substances 0.000 claims description 4
- 229940121354 immunomodulator Drugs 0.000 claims description 4
- 238000010257 thawing Methods 0.000 claims description 4
- 238000005406 washing Methods 0.000 claims description 4
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 claims description 3
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 claims description 2
- 230000002584 immunomodulator Effects 0.000 claims 2
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 claims 1
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 41
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 40
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 34
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 33
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 33
- ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N Guanidine Chemical compound NC(N)=N ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 26
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 21
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 21
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 21
- 229960004198 guanidine Drugs 0.000 description 20
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 20
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 18
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 17
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 16
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 16
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N triton Chemical compound [3H+] GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N 0.000 description 15
- 102100036089 Fascin Human genes 0.000 description 14
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 14
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 14
- CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N N-methyl-guanidine Natural products CNC(N)=N CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N dimethylaminoamidine Natural products CN(C)C(N)=N SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 239000000047 product Substances 0.000 description 13
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 10
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 10
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 10
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 9
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 9
- 108010027225 gag-pol Fusion Proteins Proteins 0.000 description 9
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 108010039627 Aprotinin Proteins 0.000 description 8
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 8
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 8
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 8
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 8
- 229960004405 aprotinin Drugs 0.000 description 8
- PXXJHWLDUBFPOL-UHFFFAOYSA-N benzamidine Chemical compound NC(=N)C1=CC=CC=C1 PXXJHWLDUBFPOL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- ZPNFWUPYTFPOJU-LPYSRVMUSA-N iniprol Chemical compound C([C@H]1C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@H]2CSSC[C@H]3C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@H](C(N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC(O)=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC(O)=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC=4C=CC=CC=4)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC2=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CC=2C=CC=CC=2)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H]2N(CCC2)C(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N3)C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@H](C(=O)N1)C(C)C)[C@@H](C)O)[C@@H](C)CC)=O)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 ZPNFWUPYTFPOJU-LPYSRVMUSA-N 0.000 description 8
- 108010091212 pepstatin Proteins 0.000 description 8
- FAXGPCHRFPCXOO-LXTPJMTPSA-N pepstatin A Chemical compound OC(=O)C[C@H](O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C[C@H](O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CC(C)C FAXGPCHRFPCXOO-LXTPJMTPSA-N 0.000 description 8
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 8
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 8
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 8
- 241000894007 species Species 0.000 description 8
- 206010001513 AIDS related complex Diseases 0.000 description 7
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 7
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 7
- 239000003398 denaturant Substances 0.000 description 7
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 7
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 7
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 7
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 6
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 6
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 6
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 6
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 6
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 description 6
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 6
- 238000011161 development Methods 0.000 description 6
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 6
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 6
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 5
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 5
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 5
- 239000012506 Sephacryl® Substances 0.000 description 5
- 229940037003 alum Drugs 0.000 description 5
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 5
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 5
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 5
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 5
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 5
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 5
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 5
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 5
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 5
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 5
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 5
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 5
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 4
- LTLYEAJONXGNFG-DCAQKATOSA-N E64 Chemical compound NC(=N)NCCCCNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]1O[C@@H]1C(O)=O LTLYEAJONXGNFG-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 4
- 241000282579 Pan Species 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000008366 buffered solution Substances 0.000 description 4
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 4
- 108700004026 gag Genes Proteins 0.000 description 4
- 101150098622 gag gene Proteins 0.000 description 4
- 238000000265 homogenisation Methods 0.000 description 4
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 4
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 4
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 4
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 4
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 4
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 238000005063 solubilization Methods 0.000 description 4
- 230000007928 solubilization Effects 0.000 description 4
- 239000002753 trypsin inhibitor Substances 0.000 description 4
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000005526 G1 to G0 transition Effects 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 3
- 208000001388 Opportunistic Infections Diseases 0.000 description 3
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 3
- 229940122618 Trypsin inhibitor Drugs 0.000 description 3
- 101710162629 Trypsin inhibitor Proteins 0.000 description 3
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 3
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 3
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 3
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 3
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 3
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 3
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 3
- 229940042399 direct acting antivirals protease inhibitors Drugs 0.000 description 3
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 3
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 3
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 3
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 3
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 3
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 3
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 3
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 3
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 3
- 229940068196 placebo Drugs 0.000 description 3
- 239000000902 placebo Substances 0.000 description 3
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 3
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 3
- 230000003381 solubilizing effect Effects 0.000 description 3
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 3
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 3
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 3
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 3
- LTLYEAJONXGNFG-HBNTYKKESA-N (2r,3r)-3-[[(2s)-1-[4-(diaminomethylideneamino)butylamino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]carbamoyl]oxirane-2-carboxylic acid Chemical compound NC(N)=NCCCCNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]1O[C@H]1C(O)=O LTLYEAJONXGNFG-HBNTYKKESA-N 0.000 description 2
- 102000004411 Antithrombin III Human genes 0.000 description 2
- 108090000935 Antithrombin III Proteins 0.000 description 2
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 description 2
- 101710132601 Capsid protein Proteins 0.000 description 2
- 241000282552 Chlorocebus aethiops Species 0.000 description 2
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- 102100038132 Endogenous retrovirus group K member 6 Pro protein Human genes 0.000 description 2
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 2
- 101150038242 GAL10 gene Proteins 0.000 description 2
- 102100024637 Galectin-10 Human genes 0.000 description 2
- 108010010369 HIV Protease Proteins 0.000 description 2
- 229940033330 HIV vaccine Drugs 0.000 description 2
- 208000007766 Kaposi sarcoma Diseases 0.000 description 2
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 2
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 2
- 206010049025 Persistent generalised lymphadenopathy Diseases 0.000 description 2
- 241000235648 Pichia Species 0.000 description 2
- 108010076039 Polyproteins Proteins 0.000 description 2
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 2
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 2
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 2
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 2
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 2
- DGEZNRSVGBDHLK-UHFFFAOYSA-N [1,10]phenanthroline Chemical compound C1=CN=C2C3=NC=CC=C3C=CC2=C1 DGEZNRSVGBDHLK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 2
- 239000011358 absorbing material Substances 0.000 description 2
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 2
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 2
- 229960005348 antithrombin iii Drugs 0.000 description 2
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 2
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 230000007969 cellular immunity Effects 0.000 description 2
- 230000003196 chaotropic effect Effects 0.000 description 2
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 2
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 2
- AGOYDEPGAOXOCK-KCBOHYOISA-N clarithromycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](C)C(=O)O[C@@H]([C@@]([C@H](O)[C@@H](C)C(=O)[C@H](C)C[C@](C)([C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@H](C[C@@H](C)O2)N(C)C)O)[C@H]1C)OC)(C)O)CC)[C@H]1C[C@@](C)(OC)[C@@H](O)[C@H](C)O1 AGOYDEPGAOXOCK-KCBOHYOISA-N 0.000 description 2
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 2
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 2
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- MUCZHBLJLSDCSD-UHFFFAOYSA-N diisopropyl fluorophosphate Chemical compound CC(C)OP(F)(=O)OC(C)C MUCZHBLJLSDCSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 2
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 2
- 229910001385 heavy metal Inorganic materials 0.000 description 2
- 229960002897 heparin Drugs 0.000 description 2
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 description 2
- 208000002672 hepatitis B Diseases 0.000 description 2
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 2
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 2
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 2
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 2
- 229960004592 isopropanol Drugs 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 2
- 229950000964 pepstatin Drugs 0.000 description 2
- 201000003450 persistent generalized lymphadenopathy Diseases 0.000 description 2
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 2
- -1 polyoxyethylene Polymers 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 2
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- SQGYOTSLMSWVJD-UHFFFAOYSA-N silver(1+) nitrate Chemical compound [Ag+].[O-]N(=O)=O SQGYOTSLMSWVJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 238000000638 solvent extraction Methods 0.000 description 2
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 2
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 2
- HEGSGKPQLMEBJL-RQICVUQASA-N (2r,3s,4s,5r)-2-(hydroxymethyl)-6-octoxyoxane-3,4,5-triol Chemical compound CCCCCCCCOC1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O HEGSGKPQLMEBJL-RQICVUQASA-N 0.000 description 1
- MRXDGVXSWIXTQL-HYHFHBMOSA-N (2s)-2-[[(1s)-1-(2-amino-1,4,5,6-tetrahydropyrimidin-6-yl)-2-[[(2s)-4-methyl-1-oxo-1-[[(2s)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]amino]pentan-2-yl]amino]-2-oxoethyl]carbamoylamino]-3-phenylpropanoic acid Chemical compound C([C@H](NC(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C=O)C1NC(N)=NCC1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 MRXDGVXSWIXTQL-HYHFHBMOSA-N 0.000 description 1
- RRONHWAVOYADJL-HNNXBMFYSA-N (2s)-3-phenyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)propanoic acid Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)OCC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 RRONHWAVOYADJL-HNNXBMFYSA-N 0.000 description 1
- FKJSFKCZZIXQIP-UHFFFAOYSA-N 2-bromo-1-(4-bromophenyl)ethanone Chemical compound BrCC(=O)C1=CC=C(Br)C=C1 FKJSFKCZZIXQIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GUPXYSSGJWIURR-UHFFFAOYSA-N 3-octoxypropane-1,2-diol Chemical compound CCCCCCCCOCC(O)CO GUPXYSSGJWIURR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IZZYABADQVQHLC-UHFFFAOYSA-N 4-methylbenzenesulfonyl fluoride Chemical compound CC1=CC=C(S(F)(=O)=O)C=C1 IZZYABADQVQHLC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QCVGEOXPDFCNHA-UHFFFAOYSA-N 5,5-dimethyl-2,4-dioxo-1,3-oxazolidine-3-carboxamide Chemical compound CC1(C)OC(=O)N(C(N)=O)C1=O QCVGEOXPDFCNHA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100034044 All-trans-retinol dehydrogenase [NAD(+)] ADH1B Human genes 0.000 description 1
- 101710193111 All-trans-retinol dehydrogenase [NAD(+)] ADH4 Proteins 0.000 description 1
- 208000002109 Argyria Diseases 0.000 description 1
- 241001203868 Autographa californica Species 0.000 description 1
- VGGGPCQERPFHOB-MCIONIFRSA-N Bestatin Chemical compound CC(C)C[C@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](O)[C@H](N)CC1=CC=CC=C1 VGGGPCQERPFHOB-MCIONIFRSA-N 0.000 description 1
- VGGGPCQERPFHOB-UHFFFAOYSA-N Bestatin Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(O)C(N)CC1=CC=CC=C1 VGGGPCQERPFHOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000004569 Blindness Diseases 0.000 description 1
- 239000012619 Butyl Sepharose® Substances 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 101100282116 Candida albicans (strain SC5314 / ATCC MYA-2876) GAP4 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- OLVPQBGMUGIKIW-UHFFFAOYSA-N Chymostatin Natural products C=1C=CC=CC=1CC(C=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C(C1NC(N)=NCC1)NC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OLVPQBGMUGIKIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 101710094648 Coat protein Proteins 0.000 description 1
- 241000490729 Cryptococcaceae Species 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 102000002322 Egg Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010000912 Egg Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 101710170658 Endogenous retrovirus group K member 10 Gag polyprotein Proteins 0.000 description 1
- 101710186314 Endogenous retrovirus group K member 21 Gag polyprotein Proteins 0.000 description 1
- 101710162093 Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein Proteins 0.000 description 1
- 101710094596 Endogenous retrovirus group K member 8 Gag polyprotein Proteins 0.000 description 1
- 101710177443 Endogenous retrovirus group K member 9 Gag polyprotein Proteins 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- KRHYYFGTRYWZRS-UHFFFAOYSA-M Fluoride anion Chemical compound [F-] KRHYYFGTRYWZRS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108010058643 Fungal Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 101710168592 Gag-Pol polyprotein Proteins 0.000 description 1
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 1
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 1
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 1
- 102100021181 Golgi phosphoprotein 3 Human genes 0.000 description 1
- HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N Heparin Chemical compound OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(COS(O)(=O)=O)C1OC1C(OS(O)(=O)=O)C(O)C(OC2C(C(OS(O)(=O)=O)C(OC3C(C(O)C(O)C(O3)C(O)=O)OS(O)(=O)=O)C(CO)O2)NS(O)(=O)=O)C(C(O)=O)O1 HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000007625 Hirudins Human genes 0.000 description 1
- 108010007267 Hirudins Proteins 0.000 description 1
- 108010048209 Human Immunodeficiency Virus Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000598436 Human T-cell lymphotropic virus Species 0.000 description 1
- 101710203526 Integrase Proteins 0.000 description 1
- 239000007836 KH2PO4 Substances 0.000 description 1
- 241000235649 Kluyveromyces Species 0.000 description 1
- GDBQQVLCIARPGH-UHFFFAOYSA-N Leupeptin Natural products CC(C)CC(NC(C)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(C=O)CCCN=C(N)N GDBQQVLCIARPGH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000008771 Lymphadenopathy Diseases 0.000 description 1
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 1
- MQUQNUAYKLCRME-INIZCTEOSA-N N-tosyl-L-phenylalanyl chloromethyl ketone Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1S(=O)(=O)N[C@H](C(=O)CCl)CC1=CC=CC=C1 MQUQNUAYKLCRME-INIZCTEOSA-N 0.000 description 1
- 241001045988 Neogene Species 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 1
- 108700020497 Nucleopolyhedrovirus polyhedrin Proteins 0.000 description 1
- 101710141454 Nucleoprotein Proteins 0.000 description 1
- 108010036939 Occlusion Body Matrix Proteins Proteins 0.000 description 1
- ADQPMQMBAODEJI-UHFFFAOYSA-H P(=O)([O-])([O-])[O-].[Ca+2].[C+4].P(=O)([O-])([O-])[O-] Chemical compound P(=O)([O-])([O-])[O-].[Ca+2].[C+4].P(=O)([O-])([O-])[O-] ADQPMQMBAODEJI-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 241000282577 Pan troglodytes Species 0.000 description 1
- ZPHBZEQOLSRPAK-UHFFFAOYSA-N Phosphoramidon Natural products C=1NC2=CC=CC=C2C=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NP(O)(=O)OC1OC(C)C(O)C(O)C1O ZPHBZEQOLSRPAK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010035664 Pneumonia Diseases 0.000 description 1
- 241000276498 Pollachius virens Species 0.000 description 1
- 229920003171 Poly (ethylene oxide) Polymers 0.000 description 1
- 101710083689 Probable capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 101710192141 Protein Nef Proteins 0.000 description 1
- 241000235344 Saccharomycetaceae Species 0.000 description 1
- 241000235003 Saccharomycopsis Species 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N Silver Chemical compound [Ag] BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000256251 Spodoptera frugiperda Species 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010046865 Vaccinia virus infection Diseases 0.000 description 1
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 description 1
- FJWGYAHXMCUOOM-QHOUIDNNSA-N [(2s,3r,4s,5r,6r)-2-[(2r,3r,4s,5r,6s)-4,5-dinitrooxy-2-(nitrooxymethyl)-6-[(2r,3r,4s,5r,6s)-4,5,6-trinitrooxy-2-(nitrooxymethyl)oxan-3-yl]oxyoxan-3-yl]oxy-3,5-dinitrooxy-6-(nitrooxymethyl)oxan-4-yl] nitrate Chemical compound O([C@@H]1O[C@@H]([C@H]([C@H](O[N+]([O-])=O)[C@H]1O[N+]([O-])=O)O[C@H]1[C@@H]([C@@H](O[N+]([O-])=O)[C@H](O[N+]([O-])=O)[C@@H](CO[N+]([O-])=O)O1)O[N+]([O-])=O)CO[N+](=O)[O-])[C@@H]1[C@@H](CO[N+]([O-])=O)O[C@@H](O[N+]([O-])=O)[C@H](O[N+]([O-])=O)[C@H]1O[N+]([O-])=O FJWGYAHXMCUOOM-QHOUIDNNSA-N 0.000 description 1
- PSDYQSWHANEKRV-UHFFFAOYSA-N [S]N Chemical group [S]N PSDYQSWHANEKRV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 230000003044 adaptive effect Effects 0.000 description 1
- 230000006154 adenylylation Effects 0.000 description 1
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 description 1
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004414 alkyl thio group Chemical group 0.000 description 1
- PNEYBMLMFCGWSK-UHFFFAOYSA-N aluminium oxide Inorganic materials [O-2].[O-2].[O-2].[Al+3].[Al+3] PNEYBMLMFCGWSK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 125000004103 aminoalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000000538 analytical sample Substances 0.000 description 1
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 239000011260 aqueous acid Substances 0.000 description 1
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical group [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OYHLRJGDELITAF-INIZCTEOSA-N benzyl n-[(2s)-4-chloro-3-oxo-1-phenylbutan-2-yl]carbamate Chemical compound C([C@@H](C(=O)CCl)NC(=O)OCC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 OYHLRJGDELITAF-INIZCTEOSA-N 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 238000004159 blood analysis Methods 0.000 description 1
- 238000010241 blood sampling Methods 0.000 description 1
- 239000001273 butane Substances 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 230000021523 carboxylation Effects 0.000 description 1
- 238000006473 carboxylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 210000000991 chicken egg Anatomy 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 108010086192 chymostatin Proteins 0.000 description 1
- 238000012761 co-transfection Methods 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 239000000287 crude extract Substances 0.000 description 1
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 description 1
- 230000008025 crystallization Effects 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000000432 density-gradient centrifugation Methods 0.000 description 1
- 229940009976 deoxycholate Drugs 0.000 description 1
- KXGVEGMKQFWNSR-LLQZFEROSA-N deoxycholic acid Chemical compound C([C@H]1CC2)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 KXGVEGMKQFWNSR-LLQZFEROSA-N 0.000 description 1
- 238000011026 diafiltration Methods 0.000 description 1
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-J diphosphate(4-) Chemical compound [O-]P([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 1
- 235000011180 diphosphates Nutrition 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 241001493065 dsRNA viruses Species 0.000 description 1
- 235000014103 egg white Nutrition 0.000 description 1
- 235000013601 eggs Nutrition 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N ethyl mercaptane Natural products CCS DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 231100000221 frame shift mutation induction Toxicity 0.000 description 1
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 description 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 1
- 101150047047 gag-pol gene Proteins 0.000 description 1
- 238000005227 gel permeation chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 102000006602 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- WQPDUTSPKFMPDP-OUMQNGNKSA-N hirudin Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(OS(O)(=O)=O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H]1NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H]2CSSC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N2)=O)CSSC1)C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]1NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C(C)C)[C@@H](C)O)CSSC1)C(C)C)[C@@H](C)O)[C@@H](C)O)C1=CC=CC=C1 WQPDUTSPKFMPDP-OUMQNGNKSA-N 0.000 description 1
- 229940006607 hirudin Drugs 0.000 description 1
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 1
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 1
- 230000033444 hydroxylation Effects 0.000 description 1
- 238000005805 hydroxylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000009390 immune abnormality Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 1
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N iodoacetic acid Chemical compound OC(=O)CI JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001155 isoelectric focusing Methods 0.000 description 1
- GDBQQVLCIARPGH-ULQDDVLXSA-N leupeptin Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(C)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C=O)CCCN=C(N)N GDBQQVLCIARPGH-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- 108010052968 leupeptin Proteins 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 208000018555 lymphatic system disease Diseases 0.000 description 1
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 229960002523 mercuric chloride Drugs 0.000 description 1
- LWJROJCJINYWOX-UHFFFAOYSA-L mercury dichloride Chemical compound Cl[Hg]Cl LWJROJCJINYWOX-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- 244000000010 microbial pathogen Species 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 239000002808 molecular sieve Substances 0.000 description 1
- 229910000402 monopotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019796 monopotassium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 230000007498 myristoylation Effects 0.000 description 1
- YFCUZWYIPBUQBD-ZOWNYOTGSA-N n-[(3s)-7-amino-1-chloro-2-oxoheptan-3-yl]-4-methylbenzenesulfonamide;hydron;chloride Chemical compound Cl.CC1=CC=C(S(=O)(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)CCl)C=C1 YFCUZWYIPBUQBD-ZOWNYOTGSA-N 0.000 description 1
- 101150091879 neo gene Proteins 0.000 description 1
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 1
- 229940079938 nitrocellulose Drugs 0.000 description 1
- 229920000847 nonoxynol Polymers 0.000 description 1
- UYDLBVPAAFVANX-UHFFFAOYSA-N octylphenoxy polyethoxyethanol Chemical compound CC(C)(C)CC(C)(C)C1=CC=C(OCCOCCOCCOCCO)C=C1 UYDLBVPAAFVANX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052760 oxygen Chemical group 0.000 description 1
- 239000001301 oxygen Chemical group 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 1
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 1
- MJRIZSDRKPPHTK-UHFFFAOYSA-N phenothiazine-10-carbonyl chloride Chemical compound C1=CC=C2N(C(=O)Cl)C3=CC=CC=C3SC2=C1 MJRIZSDRKPPHTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- BWSDNRQVTFZQQD-AYVHNPTNSA-N phosphoramidon Chemical compound O([P@@](O)(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CC=1[C]2C=CC=CC2=NC=1)C(O)=O)[C@H]1O[C@@H](C)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O BWSDNRQVTFZQQD-AYVHNPTNSA-N 0.000 description 1
- 108010072906 phosphoramidon Proteins 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 235000010482 polyoxyethylene sorbitan monooleate Nutrition 0.000 description 1
- 238000012809 post-inoculation Methods 0.000 description 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- 230000001323 posttranslational effect Effects 0.000 description 1
- GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M potassium dihydrogen phosphate Chemical compound [K+].OP(O)([O-])=O GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 230000009465 prokaryotic expression Effects 0.000 description 1
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011321 prophylaxis Methods 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 239000013014 purified material Substances 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000002390 rotary evaporation Methods 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000007423 screening assay Methods 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 239000013605 shuttle vector Substances 0.000 description 1
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 1
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910001961 silver nitrate Inorganic materials 0.000 description 1
- URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N sodium aluminosilicate Chemical compound [Na+].[Al+3].[O-][Si]([O-])=O.[O-][Si]([O-])=O URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 238000011146 sterile filtration Methods 0.000 description 1
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N tfa trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F.OC(=O)C(F)(F)F WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 229950009811 ubenimex Drugs 0.000 description 1
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 1
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 1
- 208000007089 vaccinia Diseases 0.000 description 1
- 210000003501 vero cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 1
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 description 1
- 238000011179 visual inspection Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
- C12N2740/00011—Details
- C12N2740/10011—Retroviridae
- C12N2740/16011—Human Immunodeficiency Virus, HIV
- C12N2740/16211—Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV gagpol
- C12N2740/16222—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Virology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Public Health (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
AIDS-vaksine omfattende gjær-rekombinant gag-forl*per ned en renhet over 95% i en egnet adjuvans, hvilken gag-forløper er blitt produsert fra gjær-ekspresjonssystea U9 nr. 5-1, hvilken vaksine skal anvendes for pre-eiler post-eksponering for å forhindre eller behandle HIV-infeksjon eller sykdom, hvilken vaksine er i stand til å produsere antistoffer spesifikke for gag p55 av HIV, serotype Hev York nr. 5.
Description
Ervervet immunsvekkende syndrom (AIDS) er den kliniske manifestasjon av den tilsynelatende infeksjon av CD4-hjelper-T-celler med humant immunsvekkende virus (HIV), også tidligere angitt som humant T-lymfotropisk virus type III (HTLV-III), lymfadenopati-assosiert virus (LAV) eller AIDS-beslektet virus (ARV) (heretter kollektivt angitt "HIV"). AIDS er en overførbar mangel på cellulær immunitetkarakterisertved opportunistiske infeksjoner og visse ondartetheter. En lign-
ende sykdom, AIDS-beslektet kompleks (ARC), deler mange av de epidemiologiske trekk og immun-unormaliteter med AIDS, og går ofte forut for de kliniske manifestasjoner av AIDS.
En vaksine mot AIDS og/eller ARC er en ideell profyl-aktisk behandling for å forhindre de nedbrytende effekter av infeksjon med HIV. Det er funnet et immunogen som er anvendbart for en slik vaksine såvel som metoder for rensing av rekombinante former av immunogenet. Immunogenet er gag-forløperpolypeptidet i rekombinant form.
Mange av detaljene ved den genetiske funksjon og virione struktur av HIV er ennå ikke blitt kartlagt. Imidlertid har visse generelle trekk kommet til syne. Et RNA-virus med et genom totalt på ca. 9 kilobaser (kb), og dets nucleo-tidsekvens inneholder syv hoved åpne leserammer (ORF) svar-ende til gag-, pol- og env-, sor-, tat-, art/ trs- og 3' orf-genene. Terminale gjentagelser i nucleotidsekvensen er vanlige for mange retrovirus som HIV, og er nødvendige for viral replikasjon og integrering i vertkromosomet. Mer nylige diskusjoner vedrørende den generelle art av HIV genomisk struktur, replikasjon og regulering finnes i Råtner, L. et al., "Human T-Lymphotropic Retroviruses", i 0'Brien, S;J. (red.), Genetic Maps 1987, Cold Spring Harbor 1987, s. 124-129; Franchini, G. et al., Nature 328, 539 (1987) og Chen, I.S.Y., Cell 47, 1 (1986).
HIV-proteinene som opprinnelig translateres fra
genene gag, pol og env, fremkommer som polyproteinfusjons-produkter. Etter følgende proteolytisk bearbeidelse resulterer i strukturelle proteiner av viruset såvel som virale enzymer. I visse stammer av HIV fremkommer gag-polyprotein-
fusjonsproduktet som en p55 gag-forløper som deretter proteolytisk spaltes med en virus-kodet protease i gag p24, gag pl7 og gag pl5 under virusets livssyklus. Det finnes bevis for at leilighetsvis rammeskifting under translasjon eller en annen mekanisme enkelte ganger fører til et gigantisk gag-pol-polyproteinfusjonsprodukt. I HIV koder det enzymatiske sete som katalyserer proteolytisk bearbeidelse av et strekk av nucleotider beliggende ca. 250-265 nucleotidbaser innen pol, nedstrøms og 3<1>av translasjonsstoppkodonet for gag-genet.
Tidlig interesse vedrørende gag-regionen av HIV-genomet ble sentrert om analyse av polyproteinfusjonsproduktet kodet derfra, såvel som konstruksjonen av en screenings-bestemmelse for AIDS antivirale forbindelser. For å syn-tetisere store mengder av substrat ble rekombinant gag-forløper uttrykt av foreliggende søkere i gjær uten produksjon av HIV-protease.
Foreliggende søkere er oppdagere av anvendelsen av gag-forløperproteindeterminanter som anvendbare immunogener. Denne oppdagelse står i motsetning til den vanlige oppfat-ning at overflateregioner av et patogen slik som et retrovirus, er det eneste sete som er effektivt for immunisering av verten mot en patogen mikroorganisme eller virus. HIV-gag-forløperen inneholder indre komponenter av viruset, og disse er ikke tilgjengelige for antistoff i motsetning til f.eks. omhyllingsproteinet på overflaten av HIV. Det var ikke forventet at gag-forløperdeterminanter i seg selv er anvendbare som en vaksine mot AIDS. Foreliggende søkere isolerte opprinnelig gag-forløperen ifølge oppfinnelsen for det fullstendig forskjellige formål å fremstille et substrat for en proteolytisk bearbeidelsesbestemmelse.
Hovedmålet med foreliggende oppfinnelse er anvendelse av rekombinant gag-forløperprotein som en AIDS-vaksine. Metoder er beskrevet for fremstilling av en ny, vannløselig form av det rekombinante protein i store mengder. Produktet av disse metoder er også anvendbart som et screenings-
middel i bestemmelser for antivirale midler.
Rensing av rekombinante proteiner krever hyppig nye metoder eller nye kombinasjoner av gamle metoder, da sammen-setningen av kilden for rekombinante former, f.eks. gjær,
er forskjellig fra konvensjonelle kilder, f.eks. serum. Man kan ikke forutsi hvilke metoder som er anvendbare for isolering av proteiner fra rekombinante cellekulturer på basis av kjennskap og know-how til metoder som er anvendbare for isolering av proteiner fra klassiske eller på annen måte konvensjonelle kilder. Renseprosesser konstruert for fremstilling av vaksiner, krever uvanlig renhet i produktet, en annen indikasjon på uforutsigeligheten innen faget. Se U.S. patentskrift 4.624.918 med hensyn til et lignende syns-punkt.
Oppfinnelsen angår gjærprotein-rekombinant gag-forløper med mer enn 95% renhet eller like ren variant derav. Forsøk viser at dette protein er myristoylert og derfor forskjellig i minst ett henseende fra E. coli-produsert rekombinant gag-forløper. Rekombinant gag-forløper uttrykkes alternativt i et rekombinant insekt-ekspresjonssystem. Den rensede gag-forløper er anvendbar som en vaksine og i kommersielle bestemmelser av AIDS viral protease.
Oppfinnelsen angår også en fremgangsmåte for rensing av gjærprotein-rekombinant gag-forløper eller variant derav, omfattende trinnene
(a) tilveiebringelse av en mengde av klaret gjærekstrakt, hvilken gjærekstrakt inneholder gjær-rekombinant gag-forløper eller variant derav, uttrykt i et rekombinant gjærekspresjonssytem, (b) utfelling av gag-forløperen ved frysing i en periode på minst 24 timer; (c) pelletisering ved sentrifugering av den dannede utfelte gag-forløper og deretter separering av pelleten fra supernatanten; (d) blanding av pelleten med en løsning som er effektiv for oppløseliggjøring av membraner og uønskede membranbundne proteiner; (e) repelletisering av gag-forløperen ved sentrifugering under dannelse av en andre pellet og deretter separering av den andre pellet fra supernatanten;
(f) oppløsning av pelleten fra det foregående trinn
i en løsning som er effektiv for å oppløse gag-forløperen, under dannelse av en denaturert pellet; og (g) den denaturerte pellet underkastes hydrofob interaksjonskromatografi og fraksjoner med gag-forløper deri isoleres, under dannelse av hovedsakelig renset gjær rekombinant gag-forløper eller renset variant derav. Gag-forløperen gjøres deretter vannløselig ved omvendt fase-høytrykksvæskekromatografi (RP-HPLC) eller gelfiltreringskromatografi i en organisk fase. Den rensede gag-forløper er anvendbar som en vaksine og i kommersielle bestemmelser av AIDS viral protease.
Kort beskrivelse av tegningene
Fig. 1: Renseskjema for rekombinant gag-forløper med omvendt
fase-høytrykksvæskekromatografi.
Fig. 2: Renseskjema for rekombinant gag-forløper med gelfiltreringskromatografi i den organiske fase.
Forkortelser og definisjoner
AIDS Ervervet immunsvekkende syndrom
ARC AIDS-beslektet kompleks
bp basepar
gag p55 Gag-forløperen av HIV, serotype
New York nr. 5, med en mobilitet på geler på ca. 55 KDa, også kjent som p55 gag.
gag-forløper Ethvert proteinprodukt av gag-genet av HIV, eller varianter derav. Som definert, inneholder gag-forløperen aldri den aminosyresekvens som virker
som en viral protease.
HIV Generisk uttrykk for det antatte etio-logiske middel av AIDS, også angitt
som stammer HTLV-III, LAV og ARV.
kDa Kilodalton
kb Kilobaser
ORF Åpen leseramme
Rekombinant
protein: Et polypeptid eller oligopeptid uttrykt av fremmed DNA i et rekombinant eukaryotisk eller prokaryotisk eks-presjonssytem, eksempelvis gjær-rekombinant gag-forløper av HIV. Rekombinant eukary-
otisk ekspresjons-
system: En eukaryotisk celle inneholdende et fremmed DNA som uttrykker et fremmed protein eller et fremmed oligopeptid, f.eks. U9 nr. 5-1 i foreliggende søknad.
Detaljert beskrivelse av oppfinnelsen
Gag- forløper, p55, og dens varianter
Det spesifikke protein anvendt for illustrative formål ved foreliggende oppfinnelse, er den rekombinante gag-forløper av HIV, serotype New York, nr. 5, uttrykt i et rekombinant gjærekspresjonssytem. Ifølge konvensjonelle regler er proteiner også angitt ved tilsynelatende mobilitet på denaturerende geler. I dette tilfelle vandrer den bestemte rekombinante gag-forløper til en posisjon tilnærmet lik 55 kDA slik at dens alternative betegnelse er p55, hvori "p" indikerer protein.
Det vil fremgå for fagmannen at foreliggende oppfinn-elses lære er lett å tilpasse til enhver gag-forløper av enhver stamme av HIV forutsatt at gag-forløperen ikke inneholder virale aminosyresekvenser som proteolytisk splitter seg selv.
Eksempelvis ble HIV-klonet ifølge oppfinnelsen splittet ved et innført Smal-sete umiddelbart nedstrøms gag-translasjonsstoppkodonet slik at HIV-aminosyresekvensene med proteolytisk aktivitet aldri fremkom i noen gag-forløper-ekspresjonssytem. Ved hjelp av samme prinsipp kan lokaliser-ingen av de virale proteasesekvenser som har proteolytisk aktivitet, fastslås ved analyse av nucleotidsekvensen av enhver HIV-stamme. DNA-klonet kan deretter kuttes for effektivt å eliminere enhver interfererende proteolytisk sekvens etter dens translasjon i et rekombinant ekspresjonssystem. Gag-forløperen ifølge oppfinnelsen er ikke avledet fra pol-eller env-regionene, bortsett fra for overlappingsregionen mellom gag og pol (ca. 230 bp).
Det skal forstås at de nye fremgangsmåter og prod-ukter ifølge oppfinnelsen omfatter et område av uttrykte, rekombinante gag-forløpere. Fremgangsmåtene og produktene ifølge foreliggende oppfinnelse er også konstruert til å tilveiebringe hurtige og effektive metoder for fremstilling av vaksiner inneholdende varianter av gag-forløper. Eksempelvis vil variasjoner med konservativ substitusjon i aminosyresekvensen [definert som angitt i tabell 1 i Taylor, W.R., J. Mol. Biol. 188, 233 (1986)] generelt ikke resultere i noen vesentlig eller ny modifikasjon av prinsipper og praksis ved foreliggende oppfinnelse. Alternativt vil ute-latelser innen de kodende regioner ikke generelt kreve noen modifikasjoner av fremgangsmåtene for fremstilling av vaksiner som diskutert her. Ytterligere andre variasjoner oppstår via post-translasjonelle modifikasjoner, og innbefatter proteolytisk bearbeidelse, adenylering, carboxyler-ing, glycosylering, hydroxylering, methylering, fosforylering eller myristoylering. Det skal forstås at gag-forløper eller variant derav ifølge oppfinnelsen innbefatter hvilke som helst slike variasjoner eller deler av aminosyresekvensen, enten denne er foretatt ved konservativ aminosyresubstitusjon, utelatelse, post-translasjonell bearbeidelse, ribosom-rammeskiftning eller andre prosesser, forutsatt at den resulterende gag-forløper eller variant derav er immunokjemisk reaktiv med antistoffer spesifikke for gag p55 av HIV, serotype New York nr. 5.
Eukaryotiske ekspresjonssystemer
Det er nå en relativt enkel teknologi å fremstille eukaryotiske celler som uttrykker et fremmed gen. Slike eukaryotiske celler virker som verter og innbefatter gjær, fungi, planteceller og dyreceller. Ekspresjonsvektorer for mange av disse vertceller er blitt isolert ogkarakterisertog anvendes som utgangsmaterialer ved konstruksjonen, via konvensjonelle rekombinante DNA-teknikker, av vektorer med et fremmed DNA-innskudd av interesse. Ethvert DNA er fremmed hvis det ikke naturlig er avledet fra vertcellene anvendt for å uttrykke DNA-innskuddet. Det fremmede DNA-innskudd kan uttrykkes på ekstrakromosomale plasmider eller etter integrering helt eller delvis i vertcellekromosomene, eller kan virkelig eksistere i vertcellen som en kombinasjon av mer enn én molekylær form. Valget av vertcelle og ekspresjonsvektor for ekspresjonen av et ønsket fremmed DNA avhenger i stor grad av tilgjengeligheten av vertcellen og hvor kresen den er, hvorvidt vertcellen vil understøtte replikasjonen av ekspresjonsvektoren, og andre faktorer velkjente av fagmannen, slik som spleising av sekretoriske sekvenser på det strukturelle geninnskudd med det formål å oppnå enklere måter for rensing av det ønskede rekombinante protein, eller innskudd i ekspresjonsvektoren av transaktiverende sekvenser.
Det fremmede DNA-innskudd av interesse omfatter en hvilken som helst DNA-sekvens som koder for gag-forløper eller varianter derav, innbefattende enhver syntetisk sekvens med denne kodende kapasitet eller enhver slik klonet sekvens eller kombinasjon derav. Eksempelvis er et gag-forløper- protein kodet og uttrykt av en fullstendig syntetisk DNA-sekvens omfattet av foreliggende oppfinnelse. Gag-forløper-DNA er nå tilgjengelig, f.eks. ATCC deponeringsnr. CRL 8543.
Ekspresjonsvektorer
Anvendbare vektorer for konstruksjon av eukaryotiske ekspresjonssystemer for produksjon av rekombinant gag-forløper omfatter DNA-sekvensen for gag-forløper eller variant derav, operativt kjedet dertil med egnede transkripsjonene aktiver-ings-DNA-sekvenser, slik som en promoter og/eller operator. Andre typiske trekk kan innbefatte egnede ribosombindings-seter, termineringskodoner, forøkere, terminatorer eller replikonelementer. Disse ytterligere trekk kan være innskudd i vektoren ved det egnede sete eller seter ved konvensjonelle spleiseteknikker slik som restriksjonsendonucleaseoppslutning og ligering.
Det rekombinante gjærekspresjonssystem eksemplifisert her, ble valgt av foreliggende søkere av hensiktsmessige grunner. Gjærvektor pKHl2-2 ble konstruert ved innføyelse av et 1.5 kb BamHI- Smal gag-fragment av DNA i gjærekspresjons-vektoren pCl/1-pGAP(B)tADHl. Smal-setet ble innført ved sete-rettet mutagenese ved en lokalisering 5 bp nedstrøms og 3<1>av termineringskodonet av gag-regionen. Således er det typiske rekombinante protein uttrykt i gjærcellen med denne spesifikke konstruksjon, en gag-forløper med full lengde som er ubearbeidet på grunn av fravær av HIV-proteaser i gjærcellen. Proteolytisk bearbeidelse kan finne sted ved nærvær av endogene gjærproteaser, og det er innlysende at foreliggende oppfinnelse omfatter de resulterende fragmenter utviklet dertil, forutsatt at de fremdeles er store nok til å immunokjemisk reagere med antistoffer spesifikke for en nativ eller naturlig form av gag-forløper.
Gjærekspresjonssystemer som er et utall av rekombinante eukaryotiske ekspresjonssystemer, anvender generelt Saccharomyces cerevisiae som den valgte art for ekspresjon av rekombinante proteiner. Imidlertid vil det være innlysende for fagmannen at for ekspresjon av gag-for- løperen vil valg av en vertstamme eller celle også strekke seg til arter fra andre slekter av gjær innen familiene Saccharomycetaceae og Cryptococcaceae, innbefattende, men ikke begrenset til Pichia, Candida, Hansenula, Torulopsis, Kluyveromyces og Saccharomycopsis. På lignende måte vil valg av en vertstamme eller celle også strekke seg til andre arter av slekten Saccharomyces. Mange av artene av denne slekt er i stand til å krysses med S. cerevisiae og utviser sannsynligvis promotorer som er analoge eller identiske med promotorer i S. cerevisiae, innbefattende, men ikke begrenset til, GAP491, GAL10, ADH2, og/eller alfa-tilpassende faktor-promotorer. Det vil således være innlysende for fagmannen at for ekspresjonen av rekombinante gag-forløper-polypeptider vil valg av vertstamme strekke seg ut til andre arter av slekten Saccharomyces, innbefattende, men ikke begrenset til carlsbergensis, uvarum, rouxii, montanus, kluyveri, elongisporus, norbensis, oviformis og diastaticus.
Gjærvektorer som er anvendbare for konstruksjon av rekombinante gjærekspresjonssystemer for ekspresjon av gag-forløper, innbefatter, men er ikke begrenset til, skyttel-vektorer, kosmidplasmider, chimere plasmider, og de med sekvenser avledet fra 2-mikrons sirkelplasmider. Et utall av promotorer og andre gjær-transkripsjonelle kontroll-sekvenser kan anvendes for å uttrykke den innskutte DNA-sekvens som koder for gag-forløper, innbefattende de av GAP491, GAL10, ADHI eller ADHII, PH05 og den alfa-tilpassende faktor. Følgende liste av gjærvektorer er bare angitt for illustrative formål:
pAAH5
pAH5
pAAR6
pFRPn
pGALlO-MFal
pJC197
pMA56
pABADE8
pAXall
pAH9
pAHIO
pAH21
pMAC561
pLG669
pMA91
pMA301
pYEHBs
pAM82.
Innføyning av den egnede DNA-sekvens som koder for gag-forløper eller variant derav, i disse vektorer, vil i prinsipp resultere i et anvendbart rekombinant gjærekspresjonssystem for gag-forløper hvor den modifiserte vektor er innskutt i den egnede vertcelle ved transformasjon eller andre midler.
Rekombinante pattedyrekspresjonssystemer er et annet middel for fremstilling av den rekombinante gag-forløper ifølge oppfinnelsen. Generelt kan en pattedyrvertcelle være en hvilken som helst celle som er blitt effektivt klonet i cellekultur. En ekspresjonsvektor for pattedyrceller skal ha en selekterbar markør, slik som neo-genet som bevirker resistens overfor visse antibiotika, slik at nærvær av vektoren i cellen kan påvises. DNA-formidlet transfeksjon, transveksjon eller transformasjon av cellen kan utføres ved f.eks. calciumfosfatteknikken, elektroporering eller mikro-injeksjon. Transaktiverende sekvenser kan være nødvendig for praktisk talt fullstendig ekspresjon, og deres innføy-else i egnede vektorer er en vanlig modifikasjon av foreliggende oppfinnelse.
Pattedyrvertceller som er anvendbare for det formål
å konstruere et rekombinant pattedyrekspresjonssystem, innbefatter, men er ikke begrenset til, Vero-celler, NIH3T3-, GH3-, COS-,murine C-127- eller muse-L-celler. Pattedyr-ekspres jonsvektorer kan være basert på virusvektorer, plasmid-vektorer som kan ha SV40, BPV eller andre virale replikoner, eller vektorer uten et replikon for animalske celler. Detaljerte diskusjoner vedrørende pattedyrekspresjonsvektorer
kan finnes i Gluzman, Y. (red.) "Eukaryotic Viral Vectors", Cold Spring Harbor Laboratory 1982; Pouwels, P.H. et al., "Cloning Vectors: A Laboratory Manual" Elsevier 1985;
Rigby, P.W.J., J. Gen. Virol. 6A, 255 (1983), Subramani, S.
et al., Anal. Biochem. 135, 1 (1983); og Glover, E.M. (red.) "DNA Cloning: A Practical Approach", IRL 1983, vol. I og II.
Rensing av gag- forløper
For å motvirke ustabilitet og nedbrytning av gag-forløperen under renseprosedyrene innbefatter buffere generelt proteaseinhibitorer slik som fenylmethylsulfonylfluorid (PMSF) eller EDTA. De foretrukne inhibitorer er EDTA
i kombinasjon med benzamidin, pepstatin, aprotinin, PMSF og E-64.
Typiske proteaseinhibitorer egnet for prosedyrer og protokoller ifølge oppfinnelsen, innbefatter metall-chelaterende midler, tungmetallioner, SH-blokkerende reagenser, substrat-lignende forbindelser av proteaser eller polypeptider som inhiberer proteaser. Enkelte anvendbare proteaseinhibitorer er som følger:
Ag++, Hg++, Cu++ og andre tungmetallioner
antithrombin III
antithrombin III - heparin
a-^-antitrypsin
aprotinin
basiske aminosyrer
benzamidin
bestatin
a,a 1-bipyridyl, Na-fluorid
4-brom-fenacylbromid
kyllingeggehvite-trypsininhibitor
chymostatin
citrat
cystein
4-dinitrofenol-diethylfosfat
DFP (diisopropylfosfofluoridat)
DTT (dithiothreitol)
E-64 [ trans-epoxysuccinyl-L-leucylamido-(4-guanidin)-butan, Boehringer Mannheim]
EDTA og andre chalterende midler
formaldehyd
guanidiniumklorid
heparin
hirudin
4-hydroxykvikksølvbenzoat
jodacetamid
jod-eddiksyre
leupeptin
c^-makroglobulin
mercaptoethanol
p-kvikksølvbenzoat
kvikksølvklorid
a-mikroglobulin
a-N-(p-nitrobenzyl-oxycarbonyl)-L-arginylklormethylketon oxalat
pepstatin fra et utall kilder, innbefattende Streptomyces 1,10-fenanthrolin
2-fenanthrolin
fenothiazin-N-carbonylklorid
fosforamidon
PMSF (fenylmethylsulfonylfluorid)
pyrofosfat
SH-blokkerende reagenser
sølvnitrat
soyabønne-trypsininhibitor
p-toluensulfonylfluorid
TLCK(L-l-klor-3-(4-tosylamido)-7-amino-2-heptanon-hydro-klorid)
Triton<®>X-100 og andre detergenter ved lave konsentrasjoner TPCK(L-l-klor-3-(4-tosylamido)-4-fenyl-2-butanon) trypsininhibitor fra hønseegg
ZPCK (benzyloxycarbonyl-L-fenylalanin)
Bufrede løsninger inneholdende én eller flere av de angitte inhibitorer, kan tilpasses ett eller flere trinn ved fremgangsmåten for rensing av gag-forløperen. En foretrukket buffer egnet for rensing av gag-forløperen, inneholder EDTA, benzamidin, pepstatin A, aprotinin, PMSF og E-64.
Gjærklaret ekstrakt
Gjærceller transformert med ekspresjonsvektorer som koder for gag-forløper, p55, eller varianter derav, dyrkes og høstes. Hvis lagring av cellene er ønskelig, vaskes cellene i buffer, f.eks. PBS [fosfatbufret saltvann bestående hovedsakelig av 1 mM CaCl2(vannfri), 2,7 mM KC1, 1,47 mM KH2P04, 0,5 mM MgCl2-6H20, 137 mM NaCl, 8,06 mM Na2HP04-7H20 i vann] under dannelse av en cellepasta. Lagring av cellepastaen foretas typisk ved frysing i flytende N2<Rensingen starter typisk som følger. En sats av fryst cellepasta tines og suspenderes i buffer inneholdende proteolytiske inhibitorer, f.eks. PBS i 2 mM PMSF, hypertoniske fosfatbuffere, fortrinnsvis reagens 3 [0,1 M HEPES pH 7,5, 10 mM EDTA, 10 mM benzamidin, 1,0 yg/ml pepstatin A, 0,13 trypsin-
Inhiberende Enheter (TIU)/ml aprotinin, 2 mM PMSF, 0,1 mM trans-epoxysucciny1-L-leucylamido-(4-guanidino)-butan].
Lave temperaturbetingelser, f.eks. 4°C, er også foretrukket for å nedsette til et minimum enhver rest endogen proteolytisk aktivitet. Cellene oppbrytes deretter, fortrinnsvis på mekanisk måte. Et utall av kommersielt tilgjengelige celleoppbrytere og fluidiserere er egnet og lett tilpassbare.
Gjærcelleoppbrytningen resulterer i et råekstrakt. Det er nødvendig ved dette punkt å klare ekstrakten ved fjerning av cellerester slik at mekanisk sammenklumpning i etterfølgende rensetrinn unngås. Sentrifugering ved ca. 14.000 x g i 45 minutter ved 4°C er blitt funnet å være tilstrekkelig, men det skal forstås at forskjellige sentri-fugeringshastigheter i forskjellige tidsrom ved forskjellige temperaturer også er mulig. Nærværet av gag-forløperen kan bestemmes ved denaturerende geler kombinert med immunoblotting.
Ytterligere trinn ved renseprosessen utføres på 14.000 x g supernatanten, også betegnet som klaret gjær ekstrakt. Pelleten kastes bortsett fra når prøvene bibeholdes for analytiske bestemmelser. Den klarede gjærekstrakt fryses rutinemessig ved -70°C. Foreliggende søkere har funnet at det totale utbytte forbedres hvis den klarede ekstrakt lagres ved -70°C i lange tidsperioder, dvs. minst 24 timer, fortrinnsvis minst 72 timer.
Denaturert pellet
Foreliggende søkere har også oppdaget at frysing av den klarede gjærekstrakt i minst 24 timer resulterer i spontant utfelt gag-forløper slik at enkel sentrifugering eller pelletisering av den tinede ekstrakt resulterer i hovedsakelig rensing. Etter tining av den fryste, klarede gjærekstrakt utføres suksessive trinn for pelletisering etterfulgt av homogenisering av pelleten i forskjellige buffere, med eller uten detergenter for å vaske den utfelte gag-forløper for å fjerne membraner, uønskede membranbundne proteiner og andre membranaktige materialer. Den resulterende vaskede pellet oppløseliggjøres deretter under dannelse av en denaturert pellet.
I det minste omfatter fremstilling av den denaturerte pellet som angitt i foregående avsnitt, følgende trinn: (a) tining av den fryste, klarede gjærekstrakt etter minst 24 timers frysing; (b) pelletisering av gag-forløperen ved sentrifugering ved mellom 10.000 x g og 100.000 x g i et tidsrom på mellom 10 minutter og 120 minutter, og deretter separering av supernatanten fra pelleten; og (c) blanding og homogenisering av pelleten med en bufret løsning som er effektiv for oppløseliggjøring av membraner og membranbundne proteiner. Løsningen omfatter typisk buffer med en detergent. (d) Repelletisering av gag-forløperen foretas deretter, og dette foretas ved sentrifugering ved mellom 10.000 x g og 100.000 x g i et tidsrom på mellom 10 minutter og 120 minutter, hvorpå supernatanten separeres fra pelleten, og (e) vasketrinnene i (c) og (d) supra gjentas 0-3 ganger med samme løsning, eller en forskjellig bufret detergent, eller buffer alene, eller en hvilken som helst kombinasjon derav. Produktet er en vasket pellet. (f) Den vaskede pellet oppløses i bufret denaturerende eller chaotropt middel under dannelse av en denaturert pellet som er klar for hydrofob interaksjonskromatografi.
Nærmere bestemt utføres tiningen som et første trinn [trinn (a) supra] generelt fortrinnsvis ved romtemperatur eller ved 37°C, men andre temperaturer i området 4 - 40°C er brukbare og innen oppfinnelsens ramme.
Sentrifugeringskrefter for pelletisering av gag-forløperen i henhold til trinn (b), (d) eller (e) kan varieres, såvel som rotasjonstid og temperatur. Det skal forstås at modifikasjoner i slike variabler ved pelletiseringsprosessen lett kan foretas, vanligvis ved visuell inspeksjon. I
trinn (c) supra er detergenten i den bufrede løsning for opp-løseligg jøring av membraner og membranbundne proteiner, en hvilken som helst egnet ikke-ionisk eller ionisk detergent, eller en hvilken som helst egnet kombinasjon derav, innbefattende detergenter av nonoxynolseriene, octoxynylseriene, polyoxyethylenalkoholseriene, polyoxyethylen (20)-sorbitan-mono-oleatseriene, deoxycholat eller octylglucopyranosid og lignende. Zwitterioniske detergenter er også anvendbare og egnede midler. Fortrinnsvis skal tilstrekkelig bufret løsning med detergent tilsettes til pelleten i trinn (c) under dannelse av en sluttkonsentrasjon på mellom 1% (w/v) og 10%
(w/v) octylfenoxypolyethoxyethanol (markedsført under vare-merket Triton<®>X-100). Fortrinnsvis er sluttkonsentrasjonen 5% (w/v) Triton<®>X-100, i reagens 3.
Så snart den vaskede pellet fra trinn (d) eller (e) er fremstilt, denatureres den i trinn (f) med et denatureringsmiddel eller chaotropt middel for å gjøre den egnet for neste trinn for hydrofob interaksjonskromatografi. Generelt er et hvilket som helst denatureringsmiddel av formel I egnet for denatureringsformål:
hvori
R er amino, lavere alkylthio, lavere alkyloxy eller svovel;
X er amino, svovel eller oxygen; og
Y er hydrogen eller amino.
Denne formel innbefatter guanidin«HC1hvori R er amino, X er amino og Y er hydrogen. Det foretrukne middel for denaturering av den vaskede pellet i trinn (f) er guanidin-HC1 ved konsentrasjoner mellom 2M og 8M i reagens 3, fortrinnsvis 6M. Etterfølgende fortynning av denaturerings-midlet kan utføres umiddelbart før hydrofob interaksjons-kromatograf i .
Hydrofob interaksjonskromatografi
Gag-forløperen i den denaturerte pellet renses nå ytterligere ved hydrofob interaksjon i kolonnekromatografi. Den foretrukne harpiks for dette formål er Fenyl-Sepharose<®>
(Pharmacia). Andre harpikser er også egnet og innbefatter f.eks. Octyl-Sepharose<®>(Pharmacia), Butyl-Sepharose<®>
(Pharmacia) og lignende derivater av agarose, slik som amino-alkylagarose fra Miles Research eller hexyl-agarose. Denatureringsmidler av formel I anvendes, fortrinnsvis guanidin HC1.
I en typisk protokoll ekvilibreres kolonnen i buffer eller fortrinnsvis bufret 2M guanidin HC1, hvoretter den denaturerte pellet innføres, kolonnen vaskes i buffer inntil elueringen når en grunnlinje med hensyn til absorbans. Kolonnen inneholdende gag-forløperen bundet dertil, fremkalles med en gradient av buffer i økende konsentrasjon av denatureringsmidler. Ettersom konsentrasjonen øker, finner det sted selektiv oppløseliggjøring. Fraksjoner fra kolonnen oppsamles og overvåkes med hensyn til nærvær av gag-forløper, f.eks. ved SDS-polyacrylamidgelelektroforese eller Western blotting. Oppsamlede fraksjoner inneholder gag-forløper. På
Fenyl-Sepharose<®>elueres gjær-rekombinant gag-forløper ved ca. 3M guanidin HC1.
Vannløselig rekombinant gjær- gag- forløper
En annen oppdagelse er at bearbeidelse av proteinet ved dette trinn via omvendt fase-høytrykksvæskekromatografi (RP-HPLC) under bestemte betingelser resulterer i et vann-løselig gag-forløperprodukt. Det er også funnet at en erstatningsprotokoll med gelfiltrering under bestemte betingelser resulterer i et vannløselig gag-forløperprodukt.
A. RP-HPLC
Generelt kan en hvilken som helst omvendt fase-høytrykksvæskekromatografimetode under anvendelse av gradienteluering anvendes, forutsatt at kolonnen pakkes med egnede porøse partikler belagt med alkyl- eller fenylgrupper som virker som en ikke-polar stasjonær fase. C^, Cg, C-^g eller fenylgrupper er egnet for oppfinnelsens formål. C^g er den foretrukne gruppe.
Kolonnen ekvilibreres i en stasjonær fase på ca. 0,1%
(v/v) trifluoreddiksyre (TFA) i 20% (v/v) acetonitril i vann, som er typiske betingelser for RP-HPLC. Etter at prøven av oppsamlede fraksjoner er konsentrert og tilført kolonnen, fremkalles kolonnen med en mobil fase av samme konstitusjon som den stasjonære fase, men med en gradient av økende acetonitrilkonsentrasjon. Fraksjoner identifisert til å inneholde gag-forløper, oppsamles og tørkes deretter i vakuum og resuspenderes i sterilt destillert vann. Det resulterende protein er gag-forløper (^95%) som er løselig i vann eller IM urea.
Andre egnede stasjonære fase-mobile fasebetingelser innbefatter fosforsyre med acetonitrilgradienter på 10-40%; fosforsyre eller TFA med isopropanolgradienter. Andre modifikasjoner av HPLC som er anvendbare for fremstilling av vannløselig gag-forløper, erkjennes lett av fagmannen, og innbefatter følgende: anvendelse av andre kolonner, mobile faser, organiske faser; bestemmelse av vanninnhold i den mobile fase, ionestyrke, pH, temperatur; og vurdering av ione-par og ione-utvekslingseffekter. Se f.eks. Waterfield, M.D., "Separation of Mixtures of Proteins and Peptides by HPLC",
i Darbre, A. (red.), Practical Protein Chemistry, Wiley 1986, s. 181-205).
B. Gelfitrering i organiske løsningsmidler
Vannløselig gag-forløper kan også fremstilles ved gelfiltreringskromatografi i organiske løsningsmidler istedenfor RP-HPLC. Gelfiltreringsmatrisen må være forenlig med de anvendte organiske løsningsmidler. Enkelte av de egnede matriser innbefatter Sepharose<®>(Pharmacia), Sepharose<®>CL (Pharmacia), Sephacryl<®->baserte harpikser (Pharmacia), Sephadex<®>LH (Pharmacia), Sephasorb<®>(Pharmacia) og "Bio-Beads" S-X (Bio-Rad). De foretrukne matriser er Sephadex<®>LH eller enhver Sephacryl<®->basert harpiks, innbefattende Sephacryl<®>S-300 eller Sephacryl<®>S-200HR, hvor den sistnevnte har de mest foretrukne karakteristika for til-fredsstillende separering av protein fra guanidin HCl-salt-forurensninger.
I prinsippet kan et hvilket som helst organisk løs-ningsmiddel anvendes. Typisk innbefatter løsningsmidlet lave konsentrasjoner av en vandig syre slik som TFA eller fosforsyre, i organiske løsningsmidler slik som acetonitril, iso-propanol, methanol eller methylenklorid. Et foretrukket område for løsningsmiddelsystemer er 0,1% (v/v) TFA/>_30% acetonitril/H20. Det mest foretrukne løsningsmiddelsystem er ca. 0,1% (v/v) TFA/70% acetonitril/H20.
Ytterligere trinn
Andre konvensjonelle eller kjente trinn som normalt anvendes ved rensing av rekombinante proteiner, kan tilføyes fremgangsmåten for rensing av gag-forløperen. Disse trinn innbefatter: (a) selektiv adsorpsjon eller fordeling på en fast-fase, f.eks. silicagel, calciumfosfatcarbon, eller celitt-alumina; (b) selektiv ekstraksjon med løsningsmidler eller reagenser. Ekstraksjon med andre løsningsmidler eller reagenser for andre formål kan være nød-vendig i forskjellige trinn. (c) Utfelling er et annet trinn som er anvendbart for isolering av gag-forløper og kan utføres med salter slik som ammoniumsulfat, eller på en pH-gradient ved isoelektrisk utfelling. Andre metoder innbefatter (d) kromatografi ved en hvilken som helst standard-metode, innbefattende papir, tynnskikts-, molekylær sikt, molekylær eksklusjon, ionebytter, ligandaffinitet, immunoaffinitet eller ved elektroforese; (e) høytrykksvæskekromatografi ved størrelses-eksklusjon, adsorpsjon eller fordeling i den normale fase; (f) løsningsmiddeltraksjonering med to-fase-ekstrak-sjoner, f.eks. med PEG og dextran [Anderson, E. et al., Ann. N.Y. Acad. Sei. 413, 115 (1983)], (g) dialyse, ultrafiltrering, konsentrering eller diafiltrering; (h) densitetsgradientsentrifugering; (i) elektrofokusering;
(j) frysetørking, lyofilisering; eller (k) krystallisering.
Denne liste er på ingen måte utfyllende. Dens rekke-følge er ikke en indikasjon på den foretrukne rekkefølge for rensetrinn. Det skal forstås at en vellykket rensing av gag-forløperen kan utføres med et hvilket som helst eller alle trinn av (a)-(k) i forbindelse med utfelling ved frysing, hydrofob interaksjonskromatografi og vannoppløseliggjøring ved enten RP-HPLC eller gelfiltreringskromatografi i organiske faser. Trinn (a)-(k), såvel som andre renseteknikker, kan til-føyes som et ytterligere trinn ved et hvilket som helst punkt eller punkter ved høyrenseprosessen.
Vaksinene ifølge oppfinnelsen kan effektivt adminis-treres, enten ved perioder med preeksponering og/eller post-eksponering, i kombinasjon med effektive mengder AIDS-antivirale midler, immunmodulatorer, antibiotika eller vaksiner som angitt i etterfølgende tabell I [kilde: Market Letter,
30. nov. 1987, s. 26-27; Genetic Engineering News, jan. 1988, vol. 8, s. 23 ] .
"'"Forkortelser: AIDS (ervervet immunsvekkende syndrom); ARC (AIDS-beslektet kompleks); CMV (cytomegalovirus som forår-saker en opportunistisk infeksjon resulterende i blindhet eller død i AIDS-pasienter; HIV (humant immunsvekkende virus, tidligere kjent som LAV, HTLV-III eller ARV); KS (Kaposis sarcoma); PCP (Pneumonocystis carinii pneumonia, en opportunistisk infeksjon); PGL (vedvarende generalisert lymfadenopati).
D. Vaksiner
Hvilke som helst av et utall av AIDS- eller HIV-vaksiner som for tiden er til undersøkelse og utvikling, kan anvendes i kombinasjon med vaksinene ifølge oppfinnelsen ved behandling eller forhindring av AIDS og sykdommer av lignende karakter forårsaket av HIV.
Det skal forstås at rammen for kombinasjoner av vaksinene ifølge oppfinnelsen med AIDS-antivirale midler, immunmodulatorer, antibiotika eller vaksiner, ikke er begrenset til listen i den foregående tabell, men innbefatter i prinsipp enhver kombinasjon med et hvilket som helst farma-søytisk preparat anvendbart for behandling av AIDS. AIDS-eller HIV-vaksinene ifølge oppfinnelsen innbefatter vaksiner for å anvendes til pre- eller post-eksponering eller for å behandle HIV-infeksjon eller sykdom, og er i stand til å produsere en immunrespons som er spesifikk for immunogenet.
Formen av immunogenet innen vaksinen antar forskjellige molekylære konfigurasjoner, og en bærer, vektor eller adjuvans kan tilsettes som en immunologisk bærer i henhold til konvensjonell immunologisk testing og praksis. Eksempelvis er en utførelsesform av foreliggende oppfinnelse den profylaktiske vaksinasjon av pasienter med en suspensjon av alunadjuvans som bærer og rekombinant gjær-gag-forløper (eller variant derav) som immunogen.
Det vil fremgå for fagmannen at immunogenet alternativt kan bestå av gag-forløper-aminosyresekvenser (eller variant derav) bundet, enten covalent eller ikke-covalent, til determinanter kjent for å forøke immunogenisitet. Slike determinanter er typisk aminosyresekvenser som fremkaller hjelper-T-celle, cytolytisk T-celle- eller B-celle-immunitet. Det er ønskelig å utelate aminosyresekvenser som fremkaller suppressor T-celleimmunitet. Et eksempel på disse determinanter er den Hepatitis B preS2 aminosyresekvens som er kjent for å forøke hjelper-T-celle- og B-celle-immunitet.
Så snart det er bestemt ved konvensjonell immunologisk praksis at en determinant for forøkning av immunogeni sitet er ønskelig, kan den fusjoneres covalent til antigenet (Ag), f.eks. kan carboxyenden av det hele Hepatitis B-kjerne-antigen eller del derav fusjoneres via en peptidbinding eller annen covalent binding til aminoenden av rekombinant p55, eller rekombinant gjær Ty:Ag-partikler. Disse fusjonskon-struksjoner fremstilles lett, f.eks. ved spleising av DNA som koder for de tilsvarende strukturelle proteiner, ekspresjon av det spleisede DNA og isolering av fusjonsproteinproduktet. Alternativt eller i tillegg kan ikke-covalente interaksjoner som binder antigen til slike determinanter, danne partikulære former med varierende størrelser eller enkle aggregater hvor hvilke som helst av disse er anvendbare ved forøkning av immunogenisiteten. Det skal også nevnes andre vaksineformer: peptidcocktailen inneholdende et bredt spektrum av MHC-begrensede peptider, og DNA-rekombinanter av DNA-sekvenser for Ag og vacciniavektor.
Adjuvanser kan eventuelt tilsettes under fremstilling av vaksinene ifølge oppfinnelsen. Alun er den typiske og foretrukne adjuvans i humane vaksiner. Andre innbefatter Freunds ufullstendige adjuvans eller liposomer.
Fremstilling, formulering og testing av disse vaksiner med forøket kapasitet til å utvikle spesifikk immunitet under anvendelse av determinanter som fremkaller T-celle-immunitet, cytolytisk T-celle-eller B-celle-immunitet, krever generelt konvensjonell og rutinemessig kunnskap innen immuno-logi, rekombinant DNA og beslektede fag.
I eksemplene ble følgende materialer erholdt fra kommersielle kilder: guanidin»HCl, International Biotechno-logies, Inc.; Triton<®>X-100, Boehringer Mannheim.
I foreliggende beskrivelse kan gag-forløperen eller HIV p55 overvåkes ved denaturerende geler slik som elektroforese på SDS polyacrylamidgeler, ved Western blotting [Burnette, W.N. , Anal. Biochem. 112, 192 (1981)] eller begge deler.
Eksempel 1
Konstruksjon av gjær-ekspresjonsvektor for HIV gag-forløper med et innført stoppkodon umiddelbart nedstrøms av gag-forløper- stoppkodonet
Plasmid pBL4-3-2 (alternativt pNL4-3) er pUC18 med et ca. 22 kb innskudd omfattende 9,7 kb av HIV DNA, bestående av 5'-halvdelen av New York HIV-isolat nr. 5 fusjonert til 3'-halvdelen av LAV-isolatet [A. Adachi et al., J. Virol. 59, 284-291 (1986)]. Et utall av andre plasmider inneholdende AIDS-virale sekvenser, kan anvendes istedenfor pBL4-3-2 (eller pNL4-3) ved denne prosedyre for konstruksjon av gjær-ekspres jonsvektor for HIV gag-forløper, og valget av de egnede genetiske konstruksjonsprosedyrer med et hvilket som helst slikt plasmid faller innenfor fagmannens kunnskapsområde.
Plasmid pBL4-3-2 (alternativt pNL4-3) ble oppsluttet med Hindlll under dannelse av en delvis oppslutning, og det resulterende 5,7 kb HindiII-fragment som bærer de gag- pol-kodende regioner, ble subklonet i pUC13 under dannelse av to identiske plasmider, betegnet Pl og P2. Begge plasmider ble deretter bearbeidet separat på identisk måte som beskrevet i det etterfølgende. Plasmid Pl (eller P2) ble deretter oppsluttet med Hgal pluss Ndel. Det resulterende 4,4 kb Hgal- Ndel gag- pol-fragment ble gjort stump-endet med Klenow-fragmentet av DNA polymerase I. (Det innfylte Hgal-sete utvikler en stumpe-ende ved stilling +3 av den gag-kodende sekvens). Det 4,4 kb stump-endede fragment ble ligert med en syntetisk oligonucleotidadapter med strukturen:
Ligering av adapteren til det glatt-endede Hgal-sete gjenoppbygger ATG-initieringskodonet for gag-genet og til-føyer en gjær-lignende ikke-translatert mRNA-leder pluss Hindlll- og BamHI-klonende seter. Ligering av denne adapter til det glatt-endede Ndel-sete resulterer i addisjon av et translasjons-stoppkodon pluss BamHI- og Hindlll-klonende seter 27 bp nedstrøms av det naturlige pol-translasjons-stoppkodon. Ligeringsblandingen ble deretter oppsluttet med Hindlll, og 4,4 kb HindiII-fragmentet som bærer gag- pol-kodende regioner, ble gelrenset og deretter klonet i Hindlll-setet av pAAH5 [G. Ammerer Methods in Enzymology 101, 192-201 (1983)]. Etter transformasjon i E. coli ble plasmid p64-30 erholdt fra det opprinnelige plasmid Pl, og p50-81 ble avledet fra plasmid P2.
Plasmidet p64-30 ble oppsluttet med BamHI pluss HincII, og 1760 bp BamHI- HincII-fragmentet (som bærer den gag-kodende region) ble gelrenset og deretter subklonet i BamHI pluss HincII som på forhånd var blitt oppsluttet med BamHI pluss HincII. Under anvendelse av teknikken for oligo-nucleotid-rettet mutagenese [M.J. Zoller et al., Methods in Enzymology 100, 468-500 (1983)] ble et Smal-sete innført
5 bp nedstrøms av c[ac[-trans las jons-stoppkodonet. Oligo-nucleotidet anvendt i mutagenesen, hadde følgende struktur:
Det mutageniserte plasmid ble oppsluttet med Bglll pluss HincII, og 0,44 kb Bglll- HindlI-fragmentet inneholdende 3'-enden av den gag-kodende region, ble gelrenset. Plasmidet p50-81 ble oppsluttet med BamHI pluss Bglll, og
1,3 kb BamHI- BgllI-fragmentet inneholdende 5'-enden av den gag-kodende region ble gelrenset. De ovenfor angitte 0,44 kb og 1,3 kb fragmenter ble ligert sammen med vektoren pGEM-4 som på forhånd var blitt oppsluttet med BamHI pluss HincII. Det resulterende plasmid, pKH-GAG (4,6 kb), inneholder et rekonstruert gag-gen med en gjærlignende 5' ikke-translatert ledersekvens og et Smal-sete 5 bp nedstrøms translasjonsstoppkodonet .
pKH-GAG ble oppsluttet med BamHI pluss Smal. Det resulterende 1,5 kb BamHI- Smal gag-fragment ble glatt-endet med Klenow-fragmentet av DNA-polymerase I og gelrenset. Gjær-ekspresjonsvektoren pCl/l-pGAP(B)tADHl inneholder den konsti-tutive promotor for gjær-glyceraldehyd-3-fosfat-dehydrogenase-
genet (GAP491) pluss den transkripsjonene terminator for gjær- ADHI-genet. Et særegent BamHI-sete er lokalisert mellom promotoren og terminatorelementene. Denne vektor er funk-sjonelt identisk med GAP4 91-ekspresjonsvektoren tidligere beskrevet av P. Kniskern et al., Gene £6, 135-141 (1986). pCl/l-pGAP(B)tADHl ble oppsluttet med BamHI og gjort glatt-endet med Klenow-fragmentet av DNA-polymerase I. Vektor-fragmentet og 1,5 kb gag-fragmentet ble ligert sammen under dannelse av pKH12-2. Dette rekombinante plasmid ble deretter transformert inn i Saccharomyces cerevisiae stamme U9 (MATa, leu2-04, adel, ura3, cir°). Stamme U9 er et spontant ura3-isolat avledet fra S. cerevisiae stamme 2150-2-3 ( MATa, leu2-04, adel, cir°).
Transformante kloner ble utvalgt og forsterket. Cellelysater ble fremstilt, elektroforesebehandlet i polyacrylamidgeler og ble underkastet Western blotting til nitro-cellulose. Immunoblotting med HIV-positive humane sera viste nærværet av et HIV-spesifikt 55 kilodalton protein i trans-formantene. Dette 55-kDa protein reagerte også med anti-p24 antistoffer ved RIA som bekrefter dets identitet som HIV
gag p55-proteinet.
Det klonale isolat U9 nr. 5-1 ble utvalgt for å fremstille en Master Seed (PF413) for alle ytterligere fermen-terings- og proteinrensingsstudier. Hovedsæden ble lagret fryst ved -60 til -80°C i nærvær av 17% (v/v) glycerol.
Prøver av U9 nr. 5-1, Pl og P2 ble deponert ved eller før innleveringsdatoen for foreliggende søknad ved American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville,
MD 20852, med deponeringsnr. 20876, 67669 og 67670.
Eksempel 2
Fremstilling av klaret gjærekstrakt
Fryste rekombinante gjærceller ifølge eksempel 1 ble tint. Oppbrytningsbuffer [0,1 M HEPES pH 7,5, 10 mM EDTA,
10 mM benzamidin, 1Mg/ml pepstatin A, 0,13 TIU/ml aprotinin, 2 mM PMSF, 0,1 mM transepoxysucciny1-2-leucylamido-(4-guanidino)-butan] ble tilsatt for å fremstille en tilnærmet 25% (w/v) cellesuspensjon. Celler ble oppbrutt ved trykk-fremkalt lyse ved 4°C. Etter sentrifugering ved 14.000 x g i 45 minutter ved 4°C ble pelleten kastet. Supernatanten var klaret gjærekstrakt og ble fryst rutinemessig ved -70°C i minst 72 timer.
Eksempel 3
Rensing av klaret gjærekstrakt, første variant
A. Denaturert pellet
En 800 ml aliquot av fryst, klaret gjærekstrakt ifølge eksempel 2 ble tint i et vannbad ved romtemperatur og ble deretter sentrifugert ved 30.000 opm (105.000 x g) i 60 minutter ved 4°C. Supernatanten ble fjernet, og en pellet i hvert sentrifugerør ble bibeholdt. Mengder på 5 ml 5% (w/v) Triton<®>X-100 (Boehringer Mannheim) i reagens 3 [0,1 M HEPES (pH 7,5), 10 mM EDTA, 10 ug/ml pepstatin A, 0,13 TIU/ml aprotinin, 10 mM benzamidin•HC1, 25 uM transepoxysuccinyl-L-leucylamido-(4-guanidino)-butan, 0,1% (w/v) 2-mercaptoethanol] ble tilsatt til pelleten i hvert sentrifugerør for å oppløseliggjøre pelletmembranene og assosierte membranbundne proteiner. Pelleten ble homogenisert, resulterende i en suspensjon i ca. 2,5% (w/v) Triton<®>X-100. Suspensjonen ble repelletisert ved 30.000 opm pr. minutt i 30 minutter ved 4°C. Den resulterende Triton® supernatant I ble fjernet, men pelleten i hvert sentrifugerør ble bibeholdt. Hver pellet ble deretter oppløseliggjort igjen ved tilsetning til hver pellet av 5 ml reagens 4 [6 M guanidin•HCl, 0,1 M HEPES
(pH 7,5), 10 mM EDTA, 10 ug/ml pepstatin A, 0,13 TIU/ml aprotinin, 10 mM benzamidin•HCl, 25 MM transepoxysuccinyl-L-leucylamido-(4-guanidino)-butan og 0,1% (w/v) 2-mercaptoethanol], etterfulgt av homogenisering og sluttelig blanding over natten på en "end-over-end"-blander under avkjøling.
Den resulterende blanding var den denaturerte pellet som kan lagres ved -20°C eller ved -70°C etter 15 x fortynning i reagens 4.
B. Hydrofob interaksjonskromatografi
En kolonne ble fremstilt fra Fenyl-Sepharose<®>
(Pharmacia) pakket i reagens 3. Etter fylling av den denaturerte pellet ble kolonnen fremkalt med reagens 3. Den store avbrytelse via toppen av 280 nm absorberende materiale ble oppsamlet og fjernet. Kolonnen ble underkastet en lineær gradienteluering med reagens 3 til reagens 4. Ettersom guanidin•HCl-konsentrasjonen øker oppstår selektiv oppløselig-gjøring på kolonnen. Fraksjoner ble oppsamlet, og de som inneholdt rekombinant p55 gag-protein (eluering ved ca. 3 M guanidin•HCl) ble identifisert ved SDS polyacrylamidgelelektroforese under dannelse av Fenyl-Sepharose<®->oppsamlingen. Analytiske prøver ble fremstilt for elektroforese ved MeOH-utfelling i nærvær av bærer-BSA for å fjerne det denaturerte guanidin•HCl. Guanidin*HCl-konsentrasjonen ble overvåket og standardisert ved elektriske ledningsevnemålinger. Fenyl-Sepharose<®->oppsamlingen kan ved dette punkt dialyseres mot 10 mM HEPES som kvantitativt utfeller p55 (85-90% rent). Utfellingen kan oppløseliggjøres i en løsning av 6 M guanidin «HCl og 6% 6-mercaptoethanol.
C. Vannløselig, rekombinant gjær gag- forløperprotein Fenyl-Sepharose<®->ansamlingen ble konsentrert, deretter gjort vannløselig ved bearbeidelse gjennom et C-^g omvendt fase HPLC-(høytrykksvæskekromatografi) system. HPLC-kolonnen ble ekvilibrert med blanding 1 inneholdende ett volum av reagens 5 [1,0 ml trifluoreddiksyre i 999 ml acetonitril] og fire volumer reagens 6 [1,0 ml trifluoreddiksyre i 999 ml vann]. Den konsentrerte Fenyl-Sepharose<®->ansamling ble fremstilt ved oppvarming til 95°C i 10 minutter og ble deretter sentrifugert i 10 minutter ved 14.000 x g for å fjerne cellerester. En prøve av supernatanten inneholdende gag-forløperen oppløst i reagens 4 ble injisert i den ekvilibrerte HPLC-kolonne. Løsningsmiddelutløpssystemet vasket deretter kolonnen ved suksessive vasketrinn med blanding 1, eluering med en buffergradient av blanding 1 til blanding 2 [fire volumer av reagens 5 og ett volum av reagens 6], og sluttelig vasking med blanding 3 [ni volumer av reagens 5 og ett volum av reagens 6]. Hovedtoppen som absorberte ved 260 nm, ble funnet å være en vannløselig gjær-rekombinant gag-forløper i hovedsakelig ren form (>_95%), som bedømt ved sølvbeising på SDS-geler etter elektroforese eller Western blotting. Løsningsmidlet ble fjernet ved rotasjonsfordampning, hvorpå sterilt destillert vann ble tilsatt. Denne HPLC-rensede gag-forløper ble funnet å være fullstendig løselig i vann eller i 1 M urea, i motsetning til det aggregerte materiale funnet etter cellelyse, hvilket materiale bare var løselig i sterke denatureringsmidler. Totalt utbytte etter HPLC var i området på 2 til 4 mg protein fra hver 50 ml av en 20% suspensjon av celler.
Sterilfiltrering av alunadsorpsjon ble rutinemessig utført for å fremstille den egnede vaksine.
Eksempel 4
Rensing av klaret gjærekstrakt, andre variant
A. Denaturert pellet
En 800 ml aliquot av fryst, klaret gjærekstrakt fra eksempel 2 ble tint i et vannbad ved romtemperatur og ble deretter fortynnet til et volum på 1600 ml med reagens 3 for å redusere uønsket utfelling. Den resulterende blanding ble sentrifugert ved 14.000 opm (30.000 x g) i 30 minutter ved 4°C. Supernatanten ble fryst ved -20°C (supernatant I), og pelleten i hvert sentrifugerør ble tatt vare på. Et volum på 10 ml av en 5% (w/v) Triton<®>X-100 (Boehringer Mannheim)
i reagens 3 ble tilsatt til pelleten i hvert sentrifugerør for å oppløseliggjøre pelletmembranene og assosierte membranbundne proteiner. Pelletene ble homogenisert, resulterende i en suspensjon på ca. 5% (w/v) Triton<®>X-100. Suspensjonen ble deretter fryst ved -20°C (fryst pellet).
Ytterligere operasjoner på den fryste supernatant I ble funnet å øke utbytte på ca. 50% i stor skala som følger. Fryst supernatant I ble tint i et vannbad ved romtemperatur, ble sentrifugert ved 14.000 opm (30.000 x g) i 30 minutter ved 4°C, og pelletene ble behandlet hver med ytterligere 10 ml volum av 5% (w/v) Triton<®>X-100 i reagens 3 og ble deretter homogenisert under dannelse av homogeniserte restpelleter.
Fryste pelleter ble tint i et vannbad ved romtemperatur og ble kombinert med restpelleter i en beholder. Den kombinerte pellet ble deretter brakt til et volum på ca.
200 ml med 5% (w/v) Triton<®>X-100 i reagens 3, og blandingen ble homogenisert og deretter sentrifugert ved 14.000 opm i 30 minutter ved 4°C. Den resulterende Triton<®>supernatant I ble kastet, hvorpå 20 ml 5% (w/v) Triton<®>X-100 i reagens 3 ble tilsatt etterfulgt av homogenisering. Blandingen ble brakt til et volum på ca. 200 ml med 5% (w/v) Triton<®>X-100 i reagens 3, homogenisering ble utført og sentrifugeringen gjentatt ved 14.000 x g i 30 minutter ved 4°C. Den resulterende Triton<®>supernatant II ble kastet, pelleten ble deretter behandlet med 25 ml av reagens 4, ble homogenisert og blandet over natten på en "end-over-end"-blander under avkjøling.
Den resulterende blanding er den denaturerte pellet som kan lagres ved -20°C eller ved -70°C etter 15 x fortynning i reagens 4.
B. Hydrofob interaksjonskromatografi
En kolonne ble fremstilt av Fenyl-Sepharose<®>pakket i kolonnebuffer [to volumer reagens 3 og ett volum reagens 4]. Kolonnen ble således ekvilibrert i buffer inneholdende 2 M guanidin«HCl istedenfor bare buffer (som i eksempel 3). Før fylling av kolonnen ble den denaturerte pellet sentrifugert ved 30.000 opm (105.000 x g) i 30 minutter ved 4°C for å fjerne cellerester, og supernatanten ble brakt til 2 M guanidin*HClved tilsetning av beregnede mengder av reagens 3. Etter fylling ble kolonnen fremkalt i kolonnebuffer, en 2 M guanidin*HCl-buffer. Den store gjennombrytningstopp av 260 nm absorberende materiale ble oppsamlet og fjernet.
Kolonnen ble deretter underkastet lineær gradienteluering av kolonnebuffer til reagens 4, dvs. en 2 M til 6 M guanidin*HCl-gradient. Ettersom guanidin*HCl-konsentrasjonen øker, finner det sted selektiv oppløseliggjøring. Da gag-forløperproteinet ikke eluerer i 2 M guanidin*HCl med det hule volum, er hydrofob interaksjon den sannsynlige forklaring for bindingen av proteinet til Feny1-Sepharose<®>.
Fraksjoner som kom ut av kolonnen, ble oppsamlet, og de som inneholdt rekombinant gag-forløperprotein, ble deretter identifisert ved SDS polyacrylamidgelelektroforese som etter hensiktsmessig oppsamling ga Fenyl-Sepharose<®->ansam-lingen. Gag-forløperprotein eluerte ved ca. 3 M guanidin.HCl. Guanidin•HCl-konsentrasjonen ble overvåket og standardisert ved elektriske ledningsevnemålinger.
C. Vannløselig, rekombinant gjær p55 gag-forløper-protein
Fenyl-Sepharose<®->ansamlingen ble konsentrert og deretter gjort vannløselig ved å gjenta HPLC-prosedyren beskrevet i eksempel 3C.
Eksempel 5
Rensing av klaret gjærekstrakt, tredje variant.
Gelkromatografi som sluttrinn
Fenyl-Sepharose<®->ansamlingen fra eksempel 4B ble konsentrert og deretter anbrakt på en kolonne av Sephacryl<®>S-200HR ekvilibrert i 70% CH3CN/0,1% TFA/H20. Kolonnen ble fremkalt i samme løsningsmiddel, og fraksjoner ble oppsamlet, tørket i vakuum og resuspendert i vann. Gag-forløper-holdige fraksjoner ble identifisert ved elektroforese på polyacrylamidgeler. De resulterende gag-forløperpreparater var >_ 95% i renhet og var ikke skilbare fra RP-HPLC-renset materiale med hensyn til vannløselighet.
Eksempel 6
In vivo immunogenisitet
A. Afrikanske grønnaper
Alun-adsorbert, rekombinant gjær-gag-forløper renset
i henhold til eksempel 2, ble inokulert i afrikanske grønn-aper ved flere dosenivåer. Hver dose ble avgitt intramuskulært ved 0 og 1 måned. Dosenivåene var 0, 1,0, 10,0 og 100,0 ug, og tre dyr ble anvendt for hvert dosenivå; Apene
ble tappet for blod 2 uker etter den andre dose, og utvikling av anti-gag-forløper-antistoff ble bestemt ved spesifikk enzymkjedet immunoadsorbentbestemmelse (ELISA). Alle dyrene inokulert med enten to 10,0 Mg eller to 100,0 ug dose^utviklet signifikante anti-gag-forløper-antistoffnivåer. Positive nivåer ble også oppnådd i to av tre dyr som mottok to 1,0 Mg doser. Ingen av dyrene inokulert med 0 Mg doser (alun-placebo), utviklet anti-gag-forløpertitere. Se tabell II.
B. Mus
Alun-adsorbert, rekombinant gjær-gag-forløper, renset i henhold til eksempel 2, ble inokulert i mus (stamme ICR) ved flere dosenivåer. Hver dose ble gitt én gang intraperitonealt. Dosenivåene var 0,1, 1,0, 10,0 og 100,0 Mg. 10 mus ble anvendt for hvert dosenivå. Dyrene ble tappet for blod 28 dager etter inokulering, og utvikling av anti-gag-forløper ble bestemt ved spesifikk enzymkjedet immunoadsorbentbestemmelse (ELISA). Antall individuelle antistoff-positive dyr ved hvert dosenivå ble anvendt til å beregne en 50% effektiv dose (EDr^) for antigenet. Dette var det dosenivå
DU
som var forventet å seroomdanne, ved induksjon av anti-gag-f orløper-antistof f , halvparten av de inokulerte mus. ED5q for gag-forløperen var 1,5 ug.
C. Sjimpanser
Alun-adsorbert, rekombinant gjær-gag-forløper, renset ifølge eksempel 2, ble inokulert intramuskulært i to sjimpanser i 100,0 yg doser ved 0, 1 og 6 måneder. En ytterligere sjimpanse ble inokulert på lignende måte med alun-placebo. Dyrene ble undersøkt med hensyn til utvikling av anti-gag-forløper-antistoff etter et skjema for blodtagninger og analyse ved ELISA. Dyrene ble også undersøkt med hensyn til utvikling av en hvilken som helst immunologisk unormalitet.
Fire uker etter siste inokulering ble alle tre sjimpanser utfordret med en titrert dose av intakt HIV, omfattende 25,0 sjimpanse-infektiøse doser gitt intravenøst. Etter utfordring ble sjimpansene undersøkt med hensyn til vedvarende HIV-infeksjon, såvel som spesifikt antistoff og enhver immunologisk unormalitet.
D. Ytterligere testing på mus
For å vise at gag-forløperproteiner primer immun-systemet for hurtig respons på HIV-omhyllingsprotein etter utfordring av det primede dyr med intakt HIV, ble følgende for-søksplan fulgt. Mus ble inokulert intraperitonealt på forskjellige dager med 10,0 Mg doser av alun-adsorbert, rekombinant gjær-gag-forløper, renset i henhold til eksempel 2. Hver mus ble utfordret med en enkel sub-immunogenisk dose av intakt HIV. Hvert dyr ble undersøkt med hensyn til utvikling av antistoffer spesifikke for HIV-omhyllingsproteinet for å vise hvorvidt musen inokulert med gag-forløperen, utviklet spesifikke anti-omhyllings-antistoffer mens alun-placebo-musen ikke utviklet dette.
Eksempel 7
Gjær- rekombinant gag- forløper myristoyleres
Gjærceller som uttrykker gag-forløper ifølge eksempel 1, såvel som kontroll-ikke-uttrykkende gjærceller,
ble merket med<3>H-myristinsyre (New England Nuclear) i henhold til Towler, D. et al., Proe. Nat'1. Acad. Sei., £3, 2812-2816
(1986). Merkede cellepelleter ble lysert i HEPES pH 7,5
(100 mM), EDTA (10 mM), pepstatin A (10 uM), benzamidin (10 mM), aprotinin (0,13 TIU/ml), E-64 (25MM), NaCl (150 mM), NP-40 (1%), nadeoxycholat (1%) og SDS (0,1%) under anvendelse av 0,5 mm glassperler og under risting. Etter sentrifugering for å fjerne ubrutte cellerester ble monoklonalt antistoff spesifikt for p55, tilsatt til begge ekstrakter og inkubert over natten ved 4°C. Antistoffkomplekset ble høstet ved tilsetning av geite-anti-muse-IgG-^-antistoff koblet til Sepharose<®>. Antistoffkomplekset fjernet med Sepharose<®>, ble eluert under anvendelse av 0,5 M eddiksyre, ble tørket i vakuum, analysert ved SDS-PAGE og autoradiografert.
Et klart bånd som co-vandrer med HPLC-renset gag-forløper og et ytterligere 41 kDa bånd, var de eneste merkede arter som ble observert. Intet merket bånd var til stede i kontroll-sporet av gelen.
Eksempel 8
Konstruksjon av insekt- ekspresjonsvektor for HIV- gag- forløper
Et baculovirus-genekspresjonssystem [Summers, M.D.
et al., A Manual of Methods for Baculovirus Vectors and Insect Cell Culture Procedures, Texas Agricultural Experiment
Station, bulletin nr. 1555, mai 1987] ble anvendt for ekspresjon av HIV gag- pol-genene som følger. Fra plasmidklon Pl ifølge eksempel 1 ble 4,4 kb Hgal- Ndel-fragmentet inneholdende gag-pol-genene, skåret ut. Endene av denne 4,4 kb dupleks ble "fylt inn" med Klenow DNA-polymerase, og følgende syntetiske oligonucleotidduplekser ble ligert til de resulterende stump-ender:
De gjenværende "klebrige" ender skapte således inn-satte BamHI-restriksjonsendonuclease-gj enkjennelsesseter,
mens resten av den ligerte sekvens innbefatter en gjær-translasjons-gjenkjennelsessekvens. Det symmetriske linker-modifiserte 4,4 kb fragment ble subklonet i plasmid AH5, fra hvilket det kunne gjenvinnes som et BamHI-fragment. Dette gjenvundne BamHI-fragment ble innskutt i det særegne BamHI-sete av baculovirus-ekspresjonsplasmidet pAc373 [Summers,
M.D. et al., supra]. Kloner som bærer genet innskutt i den riktige orientering i forhold til baculovirus-polyhedrin-promotoren i pAc373, ble identifisert ved restriksjonsanalyse. I tillegg til den native gag-pol pAc373-ekspresjonsvektor
ble et andre pAc373-klon, hvori gag-pol-sekvensen var modifisert til å inneholde en' rammeskiftet mutasjon med Klenow DNA-polymerase-innfylling av et indre Bglll-sete, også fremstilt.
Hver av de to vektorer ble anvendt for separate co-transfeksjoner med Autographa californica Nuclear Polyhedrosis viral DNA av Spodoptera frugiperda-cellelinje Sf9 i henhold til metodene ifølge Summers, M.D. et al., supra. Rekombinante virale plakker av hver vektor hvori viruset var blitt modifisert ved homolog rekombinasjon til å inneholde gag-pol-genet under transkripsjonen regulering av den siste virale polyhedrinpromotor, ble identifisert ved plakkmorfologi, og de utskårne agaroseplugger (fra plakkplaten) inneholdende det tilsvarende virus, ble deretter eluert over natten i vekst-medium og anvendt for å infisere mikrotiterplatekulturer av Sf9-celler. Infiserte celler ble i sin tur undersøkt med hensyn til gag-ekspresjon ved immunodot blot med HIV-positivt antiserum i henhold til Whang, Y. et al., J. Virol. 61, 1796
(1987). Positive virale ansamlinger ble "plakkrenset" og undersøkt på nytt med hensyn til ekspresjon ved Western blot. Det native gag-pol virale vektor-ekspresjonssystem (AcGAG-A-15-3) ble funnet å uttrykke en hoved immunoreaktiv polypeptidart ved ca. 55 kDa og en mindre art ved ca. 40 kDa. Det rammeskiftede gag-pol-virale vektor-ekspresjonssystem (AcGAG-B-1-3) akkumulerte primært en ca. 40 kd art. Disse resultater er kvalitativt lik resultatene erholdt ved ekspresjon av de samme to åpne leserammer i gjær.
Eksempel 9
Gag- forløpersekvenser
Nucleotidsekvensering av pKH12-2 ifølge eksempel 1 ble utført ved dideoxytermineringsmetoden med modifisert T7-polymerase. Den utledede aminosyresekvens er angitt i etter-følgende tabell III.
TABELL III
Claims (17)
1. Gjær-rekombinant gag-forløper med mer enn 95% renhet eller like ren variant derav.
2. Gag-forløper ifølge krav 1, karakterisert ved at forløperen er myristoylert.
3. Insekt-rekombinant gag-forløper.
4. Gag-forløper ifølge krav 1 eller 2 eller 3, med sekvens som angitt i tabell III i eksempel 9.
5. Gag-forløper ifølge krav 1 eller 2 eller 3, i kombinasjon med hvilke som helst av antivirale midler, immuno-modulatorer, antibiotika eller vaksiner ifølge tabell I.
6. Gag-forløper ifølge krav 1 eller 2 eller 3, i kombinasjon med hvilke som helst av de antivirale midler, immuno-modulatorer, antibiotika eller vaksiner ifølge tabell I, hvilken gag-forløper har sekvensene angitt i tabell III ifølge eksempel 9.
7. Gjær-rekombinant gag-forløper eller variant derav anvendbare som en vaksine overfor AIDS.
8. Insekt-rekombinant gag-forløper eller variant derav, anvendbare som en vaksine overfor AIDS.
9. AIDS-vaksine omfattende mer enn 95% ren gjær-rekombinant gag-forløper i en egnet adjuvans, hvilken gag-forløper er blitt fremstilt fra gjær-ekspresjonssystem U9 nr. 5-1, hvilken vaksine skal anvendes for pre- eller post-eksponering for å forhindre eller behandle HIV-infeksjon eller sykdom, hvilken vaksine er i stand til å produsere antistoffer spesifikke for gag p55 av HIV, serotype New York nr. 5.
10. Fremgangsmåte for fremstilling av en protein-gjær-rekombinant gag-forløper med mer enn 95% renhet, eller variant derav, omfattende trinnene:
(a) tining av en mengde av fryst, klaret gjærekstrakt, hvilken ekstrakt inneholder gjær-rekombinant gag-protein-forløper eller variant derav, uttrykt i et rekombinant gjær-ekspresjonssystem;
(b) utfelling av gag-forløperen ved frysing i et tidsrom på minst 24 timer;
(c) pelletisering ved sentrifugering av den dannede gag-forløperutfelling, og deretter separering av pelleten fra supernatanten;
(d) blanding av pelleten med en løsning som er effektiv for å oppløse membraner og uønskede membranbundne proteiner;
(e) repelletisering av gag-forløperen ved sentrifugering under dannelse av en andre pellet, og deretter separering av den andre pellet fra supernatanten;
(f) oppløsning av pelleten fra det foregående trinn i en løsning som er effektiv til å oppløse gag-protein-forløperen under dannelse av denaturert pellet; og
(g) den denaturerte pellet underkastes hydrofob interaksjonskromatografi, og isolering av fraksjoner med gag-forløper deri, under dannelse av gjær-rekombinant gag-forløper med renhet større enn 95%, eller en like ren variant derav.
11. Fremgangsmåte ifølge krav 10, omfattende ytterligere vasketrinn mellom trinn (e) og trinn (f) ifølge krav 10, omfattende
(el) blanding av den andre pellet med en bufferløsning eller en løsning som er effektiv til å oppløseliggjøre membraner og uønskede membranbundne proteiner; og
(e2) repelletisering av gag-forløper ved sentrifugering under dannelse av en tredje pellet, og deretter separering av den tredje pellet fra supernatanten.
12. Fremgangsmåte for fremstilling av vannløselige preparater av gjær-rekombinant gag-forløper eller variant derav, omfattende trinnene:
(a) uttagning av en del av hovedsakelig rent, aggregert gag-protein eller variant derav; og
(b) underkastelse av proteinet for omvendt fase-høytrykksvæskekromatografi under dannelse av hovedsakelig ren vannløselig gjær-rekombinant gag-forløper eller like ren vannløselig variant derav.
13. Fremgangsmåte ifølge krav 10, omfattende det ytterligere trinn etter trinn (g) ifølge krav 10, omfattende (h) oppsamling av fraksjonene fra trinn (g); og (i) de oppsamlede fraksjoner underkastes omvendt fase-høytrykksvæskekromatografi under dannelse av vannløselig gjær-rekombinant gag-forløper med en renhet over 95% eller en like ren vannløselig variant derav.
14. Fremgangsmåte for fremstilling av vannløselige preparater av gjær-rekombinant gag-forløper eller variant derav, omfattende trinnene:
(a) opptagelse av en del av hovedsakelig rent, aggregert gag-protein eller variant derav; og
(b) proteinet underkastes gelfiltreringskromatografi i organisk fase, under dannelse av hovedsakelig ren, vann-løselig gjær-rekombinant gag-forløper eller like ren vann-løselig variant derav.
15. Fremgangsmåte ifølge krav 10, omfattende det ytterligere trinn etter trinn (g) ifølge krav 10, omfattende (h) oppsamling av fraksjonene fra trinn (g); og (i) de oppsamlede fraksjoner underkastes gelfiltreringskromatografi i organisk fase, under dannelse av vannløse-lig gjær-rekombinant gag-forløper med renhet over 95% eller like ren, vannløselig variant derav.
16. Renset gjær-rekombinant gag-forløper med en renhet større enn 95%, eller like ren variant derav, som renset ved fremgangsmåten ifølge krav 10 eller 11 eller 12 eller 13 eller 14 eller 15.
17. Renset gjær-rekombinant gag-forløper eller fragment derav med en renhet på mer enn 95%, som renset ved fremgangsmåten ifølge krav 10-15, og med aminosyresekvensen ifølge tabell III i eksempel 9.
Applications Claiming Priority (6)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US18562688A | 1988-04-25 | 1988-04-25 | |
US18557288A | 1988-04-25 | 1988-04-25 | |
US18571188A | 1988-04-25 | 1988-04-25 | |
US28214488A | 1988-12-09 | 1988-12-09 | |
US28214688A | 1988-12-09 | 1988-12-09 | |
US28214588A | 1988-12-09 | 1988-12-09 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
NO891691D0 NO891691D0 (no) | 1989-04-24 |
NO891691L true NO891691L (no) | 1989-10-26 |
Family
ID=27558760
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
NO89891691A NO891691L (no) | 1988-04-25 | 1989-04-24 | Rekombinant gag-forloeper for hiv. |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0340837A1 (no) |
JP (1) | JPH0213391A (no) |
AU (1) | AU3335689A (no) |
DK (1) | DK192389A (no) |
FI (1) | FI891917A (no) |
IL (1) | IL90048A0 (no) |
NO (1) | NO891691L (no) |
PT (1) | PT90354A (no) |
Families Citing this family (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AP129A (en) * | 1988-06-03 | 1991-04-17 | Smithkline Biologicals S A | Expression of retrovirus gag protein eukaryotic cells |
ATE199394T1 (de) * | 1992-06-04 | 2001-03-15 | Univ Osaka Res Found | Gag-env fusion-antigen aus hiv |
US20050112139A1 (en) * | 2003-10-23 | 2005-05-26 | Nmk Research, Llc | Immunogenic composition and method of developing a vaccine based on factor H binding sites |
JP6199533B2 (ja) | 2006-07-13 | 2017-09-20 | インスティチュート フォー アドバンスド スタディ | ウイルス阻害性ヌクレオチド配列およびワクチン |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU6713287A (en) * | 1986-01-06 | 1987-07-09 | F. Hoffmann-La Roche & Co. | Expression of htlv-iii gag-gene |
NZ221440A (en) * | 1986-08-20 | 1991-11-26 | Genetic Systems Corp | Composition containing monoclonal antibodies/peptides useful in treating and diagnosing hiv infections |
IL84154A0 (en) * | 1986-10-16 | 1988-03-31 | Microgenesys Inc | Polypeptides derived from the envelope gene of human immunodeficiency virus in recombinant baculovirus infected insect cells and vaccines against acquired immune deficiency syndrome containing the same |
-
1989
- 1989-04-19 IL IL90048A patent/IL90048A0/xx unknown
- 1989-04-20 DK DK192389A patent/DK192389A/da unknown
- 1989-04-21 EP EP89201037A patent/EP0340837A1/en not_active Withdrawn
- 1989-04-21 FI FI891917A patent/FI891917A/fi not_active Application Discontinuation
- 1989-04-24 AU AU33356/89A patent/AU3335689A/en not_active Abandoned
- 1989-04-24 NO NO89891691A patent/NO891691L/no unknown
- 1989-04-24 PT PT90354A patent/PT90354A/pt not_active Application Discontinuation
- 1989-04-25 JP JP1103573A patent/JPH0213391A/ja active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
FI891917A0 (fi) | 1989-04-21 |
AU3335689A (en) | 1989-11-23 |
DK192389D0 (da) | 1989-04-20 |
PT90354A (pt) | 1989-11-10 |
FI891917A (fi) | 1989-10-26 |
DK192389A (da) | 1989-10-26 |
JPH0213391A (ja) | 1990-01-17 |
IL90048A0 (en) | 1989-12-15 |
EP0340837A1 (en) | 1989-11-08 |
NO891691D0 (no) | 1989-04-24 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US6140059A (en) | Methods for the obtention of human immunodeficiency virsus Type 1 envelope glycoproteins in native and oligomeric form employing recombinant chimeric antigens containing collagenase recognition sites. | |
Henderson et al. | Gag proteins of the highly replicative MN strain of human immunodeficiency virus type 1: posttranslational modifications, proteolytic processings, and complete amino acid sequences | |
Henderson et al. | Molecular characterization of gag proteins from simian immunodeficiency virus (SIVMne) | |
CA1340896C (en) | Synthetic peptides which induce cellular immunity to the aids virus and aids viral proteins | |
DK174910B1 (da) | Antigen, fremgangsmåde til fremstilling af antigenet, fremgangsmåde til diagnosticering samt immunogene præparater | |
Zhang et al. | Effects of nucleocapsid mutations on human immunodeficiency virus assembly and RNA encapsidation | |
Hansen et al. | Characterization of a transpositionally active Ty3 element and identification of the Ty3 integrase protein | |
US5795577A (en) | Viral vector coding for a glycoprotein of the virus responsible for A.I.D.S. | |
JP2023529432A (ja) | 新型コロナウイルス感染症の経口ワクチン及びその調製と応用 | |
NO328824B1 (no) | Vaksinesammensetninger som omfatter fusjonsproteiner av HIV-1 NEF-proteiner, fremgangsmate for fremstilling av vaksinesammensetning og protein samt nukleinsyre, proteiner og vert. | |
US11773144B2 (en) | Mosaic HIV-1 envelopes to induce ADCC responses | |
US20060281075A1 (en) | Purification of viruses, proteins and nucleic acids | |
JP2719917B2 (ja) | Aidsの原因ウィルスの糖蛋白質、該糖蛋白質の製造方法及びワクチン | |
US5081226A (en) | Synthetic peptides sharing sequence homology with the HIV envelope protein | |
Morikawa | HIV capsid assembly | |
AU596154B2 (en) | Fusion proteins | |
NO891691L (no) | Rekombinant gag-forloeper for hiv. | |
WO1989012095A1 (en) | A method of evaluating recombinant vaccines against immunodeficiency virus | |
US5130247A (en) | Expression of fusion protein of HIV envelope and HBsAG | |
CA2593864C (en) | Synthesis using peptide intermediate fragments iii | |
WO1998041536A9 (en) | Glycosylation deficient siv and hiv envelope glycoproteins | |
WO2005010033A1 (en) | New soluble and stabilized trimeric form of gp41 polypeptides | |
WO1988002757A1 (en) | Hybrid proteins or polypeptides | |
WO2022006095A2 (en) | Mosaic hiv-1 envelopes to induce adcc responses | |
EP0421626A1 (en) | Vaccine for aids and hepatitis B |