NO313833B1 - FremgangsmÕte for fremstilling av substituerte N-etyl- glycinderivater og mellomprodukter - Google Patents
FremgangsmÕte for fremstilling av substituerte N-etyl- glycinderivater og mellomprodukter Download PDFInfo
- Publication number
- NO313833B1 NO313833B1 NO19963677A NO963677A NO313833B1 NO 313833 B1 NO313833 B1 NO 313833B1 NO 19963677 A NO19963677 A NO 19963677A NO 963677 A NO963677 A NO 963677A NO 313833 B1 NO313833 B1 NO 313833B1
- Authority
- NO
- Norway
- Prior art keywords
- formula
- compound
- acid
- stands
- tert
- Prior art date
Links
- YPIGGYHFMKJNKV-UHFFFAOYSA-N N-ethylglycine Chemical class CC[NH2+]CC([O-])=O YPIGGYHFMKJNKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims abstract description 9
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 10
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title claims description 7
- 230000008569 process Effects 0.000 title claims description 6
- 239000000543 intermediate Chemical class 0.000 title abstract description 3
- 239000002904 solvent Substances 0.000 claims abstract description 19
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims abstract description 16
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims abstract description 15
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 claims abstract description 10
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims abstract description 8
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims abstract description 7
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 claims abstract description 6
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 claims abstract description 5
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 4
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 4
- JOYRKODLDBILNP-UHFFFAOYSA-N Ethyl urethane Chemical compound CCOC(N)=O JOYRKODLDBILNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 3
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 claims abstract description 3
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 147
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 118
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 102
- -1 (4-methoxyphenyl)-diphenylmethyl Chemical group 0.000 claims description 69
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 36
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 32
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 28
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 23
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 claims description 23
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 20
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 8
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims description 8
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 claims description 7
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims description 7
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims description 7
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 6
- RDOXTESZEPMUJZ-UHFFFAOYSA-N anisole Chemical compound COC1=CC=CC=C1 RDOXTESZEPMUJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- RMVRSNDYEFQCLF-UHFFFAOYSA-N thiophenol Chemical compound SC1=CC=CC=C1 RMVRSNDYEFQCLF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 1,4-Dioxane Chemical compound C1COCCO1 RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N N-Methylpyrrolidone Chemical compound CN1CCCC1=O SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 5
- 125000005500 uronium group Chemical group 0.000 claims description 5
- AHVYPIQETPWLSZ-UHFFFAOYSA-N N-methyl-pyrrolidine Natural products CN1CC=CC1 AHVYPIQETPWLSZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 claims description 4
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 4
- LMBFAGIMSUYTBN-MPZNNTNKSA-N teixobactin Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H]1C(N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C[C@@H]2NC(=N)NC2)C(=O)N[C@H](C(=O)O[C@H]1C)[C@@H](C)CC)=O)NC)C1=CC=CC=C1 LMBFAGIMSUYTBN-MPZNNTNKSA-N 0.000 claims description 4
- AQRLNPVMDITEJU-UHFFFAOYSA-N triethylsilane Chemical compound CC[SiH](CC)CC AQRLNPVMDITEJU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- GSNUFIFRDBKVIE-UHFFFAOYSA-N DMF Natural products CC1=CC=C(C)O1 GSNUFIFRDBKVIE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 claims description 3
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 claims description 3
- 230000008878 coupling Effects 0.000 claims description 3
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 claims description 3
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 claims description 3
- 239000013067 intermediate product Substances 0.000 claims description 3
- UZKWTJUDCOPSNM-UHFFFAOYSA-N methoxybenzene Substances CCCCOC=C UZKWTJUDCOPSNM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-O phosphonium Chemical compound [PH4+] XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-O 0.000 claims description 3
- JBWKIWSBJXDJDT-UHFFFAOYSA-N triphenylmethyl chloride Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(C=1C=CC=CC=1)(Cl)C1=CC=CC=C1 JBWKIWSBJXDJDT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- VUTZFAOGDXUYEJ-UHFFFAOYSA-N 1-[chloro(diphenyl)methyl]-4-methylbenzene Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1C(Cl)(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 VUTZFAOGDXUYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- HDFGOPSGAURCEO-UHFFFAOYSA-N N-ethylmaleimide Chemical compound CCN1C(=O)C=CC1=O HDFGOPSGAURCEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 claims description 2
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 2
- 150000004820 halides Chemical class 0.000 claims description 2
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims description 2
- 125000005931 tert-butyloxycarbonyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(OC(*)=O)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 2
- KHWYSUBVXWWBRB-UHFFFAOYSA-N (+/-)-n-ethyl-1-phenyl-2-butylamine Chemical compound CCNC(CC)CC1=CC=CC=C1 KHWYSUBVXWWBRB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 125000004743 1-methylethoxycarbonyl group Chemical group CC(C)OC(=O)* 0.000 claims 1
- UFBJCMHMOXMLKC-UHFFFAOYSA-N 2,4-dinitrophenol Chemical compound OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1[N+]([O-])=O UFBJCMHMOXMLKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L Carbonate Chemical compound [O-]C([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims 1
- 238000009958 sewing Methods 0.000 claims 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N acetic acid Substances CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract description 42
- 108010065338 N-ethylglycine Proteins 0.000 abstract 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 abstract 1
- 239000007822 coupling agent Substances 0.000 abstract 1
- 238000005897 peptide coupling reaction Methods 0.000 abstract 1
- 239000002516 radical scavenger Substances 0.000 abstract 1
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 81
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 48
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 48
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 35
- 239000000047 product Substances 0.000 description 30
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 26
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 24
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 23
- 229910052938 sodium sulfate Inorganic materials 0.000 description 19
- 235000011152 sodium sulphate Nutrition 0.000 description 19
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- 239000012043 crude product Substances 0.000 description 16
- 125000001999 4-Methoxybenzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1OC([H])([H])[H])C(*)=O 0.000 description 14
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 14
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 14
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 13
- ZWEHNKRNPOVVGH-UHFFFAOYSA-N 2-Butanone Chemical compound CCC(C)=O ZWEHNKRNPOVVGH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- SJMDMGHPMLKLHQ-UHFFFAOYSA-N tert-butyl 2-aminoacetate Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)CN SJMDMGHPMLKLHQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- FPQVGDGSRVMNMR-JCTPKUEWSA-N [[(z)-(1-cyano-2-ethoxy-2-oxoethylidene)amino]oxy-(dimethylamino)methylidene]-dimethylazanium;tetrafluoroborate Chemical compound F[B-](F)(F)F.CCOC(=O)C(\C#N)=N/OC(N(C)C)=[N+](C)C FPQVGDGSRVMNMR-JCTPKUEWSA-N 0.000 description 11
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 11
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 10
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical class [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 10
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 9
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 9
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 8
- DYHSDKLCOJIUFX-UHFFFAOYSA-N tert-butoxycarbonyl anhydride Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)OC(=O)OC(C)(C)C DYHSDKLCOJIUFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N Methyl tert-butyl ether Chemical compound COC(C)(C)C BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 7
- 150000002596 lactones Chemical class 0.000 description 7
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 7
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 7
- LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N N-Butanol Chemical compound CCCCO LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- NLKNQRATVPKPDG-UHFFFAOYSA-M potassium iodide Chemical compound [K+].[I-] NLKNQRATVPKPDG-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 6
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 6
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 6
- KUYMVWXKHQSIAS-UHFFFAOYSA-N tert-butyl 2-chloroacetate Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)CCl KUYMVWXKHQSIAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N Ethylenediamine Chemical compound NCCN PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 5
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 5
- GQHTUMJGOHRCHB-UHFFFAOYSA-N 2,3,4,6,7,8,9,10-octahydropyrimido[1,2-a]azepine Chemical compound C1CCCCN2CCCN=C21 GQHTUMJGOHRCHB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- PAQZWJGSJMLPMG-UHFFFAOYSA-N 2,4,6-tripropyl-1,3,5,2$l^{5},4$l^{5},6$l^{5}-trioxatriphosphinane 2,4,6-trioxide Chemical compound CCCP1(=O)OP(=O)(CCC)OP(=O)(CCC)O1 PAQZWJGSJMLPMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoethan-1-ol Chemical compound NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N Palladium Chemical compound [Pd] KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 4
- KWGKDLIKAYFUFQ-UHFFFAOYSA-M lithium chloride Chemical compound [Li+].[Cl-] KWGKDLIKAYFUFQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 4
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 4
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 4
- FOUZISDNESEYLX-UHFFFAOYSA-N 2-(2-hydroxyethylazaniumyl)acetate Chemical class OCCNCC(O)=O FOUZISDNESEYLX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KBCRUFBERFZWQS-UHFFFAOYSA-N 2-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)acetic acid Chemical compound NC=1C=CN(CC(O)=O)C(=O)N=1 KBCRUFBERFZWQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- TZDMCKHDYUDRMB-UHFFFAOYSA-N 2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetic acid Chemical compound CC1=CN(CC(O)=O)C(=O)NC1=O TZDMCKHDYUDRMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KRHYYFGTRYWZRS-UHFFFAOYSA-M Fluoride anion Chemical compound [F-] KRHYYFGTRYWZRS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 239000007821 HATU Substances 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000012230 colorless oil Substances 0.000 description 3
- 239000002274 desiccant Substances 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- CHKVPAROMQMJNQ-UHFFFAOYSA-M potassium bisulfate Chemical compound [K+].OS([O-])(=O)=O CHKVPAROMQMJNQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- BNWCETAHAJSBFG-UHFFFAOYSA-N tert-butyl 2-bromoacetate Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)CBr BNWCETAHAJSBFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- AOCSUUGBCMTKJH-UHFFFAOYSA-N tert-butyl n-(2-aminoethyl)carbamate Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)NCCN AOCSUUGBCMTKJH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- PIINGYXNCHTJTF-UHFFFAOYSA-N 2-(2-azaniumylethylamino)acetate Chemical compound NCCNCC(O)=O PIINGYXNCHTJTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NGNBDVOYPDDBFK-UHFFFAOYSA-N 2-[2,4-di(pentan-2-yl)phenoxy]acetyl chloride Chemical compound CCCC(C)C1=CC=C(OCC(Cl)=O)C(C(C)CCC)=C1 NGNBDVOYPDDBFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SFYDWLYPIXHPML-UHFFFAOYSA-N 3-nitro-1-(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonyl-1,2,4-triazole Chemical compound CC1=CC(C)=CC(C)=C1S(=O)(=O)N1N=C([N+]([O-])=O)N=C1 SFYDWLYPIXHPML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UIVWXNPUCAHAJX-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxy-1,1-dioxo-2,5-diphenylthiophen-3-one Chemical compound O=S1(=O)C(C=2C=CC=CC=2)C(=O)C(O)=C1C1=CC=CC=C1 UIVWXNPUCAHAJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PNKUSGQVOMIXLU-UHFFFAOYSA-N Formamidine Chemical group NC=N PNKUSGQVOMIXLU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XSISQURPIRTMAY-UHFFFAOYSA-N Hydroxyethyl glycine Chemical compound NCC(=O)OCCO XSISQURPIRTMAY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- 239000012317 TBTU Substances 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CLZISMQKJZCZDN-UHFFFAOYSA-N [benzotriazol-1-yloxy(dimethylamino)methylidene]-dimethylazanium Chemical compound C1=CC=C2N(OC(N(C)C)=[N+](C)C)N=NC2=C1 CLZISMQKJZCZDN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000008064 anhydrides Chemical class 0.000 description 2
- 150000001540 azides Chemical class 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 125000003236 benzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)=O 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 description 2
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 2
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002147 dimethylamino group Chemical group [H]C([H])([H])N(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 239000006260 foam Substances 0.000 description 2
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000001601 guanosyl group Chemical group 0.000 description 2
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 229910000343 potassium bisulfate Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000006268 reductive amination reaction Methods 0.000 description 2
- BEOOHQFXGBMRKU-UHFFFAOYSA-N sodium cyanoborohydride Chemical compound [Na+].[B-]C#N BEOOHQFXGBMRKU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- WDPZTIFGRQKSEN-UHFFFAOYSA-N tert-butyl 2-oxoacetate Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)C=O WDPZTIFGRQKSEN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ACNRTYKOPZDRCO-UHFFFAOYSA-N tert-butyl n-(2-oxoethyl)carbamate Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)NCC=O ACNRTYKOPZDRCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 2
- 125000006529 (C3-C6) alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- BDNKZNFMNDZQMI-UHFFFAOYSA-N 1,3-diisopropylcarbodiimide Chemical compound CC(C)N=C=NC(C)C BDNKZNFMNDZQMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DFPYXQYWILNVAU-UHFFFAOYSA-N 1-hydroxybenzotriazole Chemical compound C1=CC=C2N(O)N=NC2=C1.C1=CC=C2N(O)N=NC2=C1 DFPYXQYWILNVAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AVFZOVWCLRSYKC-UHFFFAOYSA-N 1-methylpyrrolidine Chemical compound CN1CCCC1 AVFZOVWCLRSYKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AGAPCTWZXVFNAN-UHFFFAOYSA-N 2-[2-(n-benzhydryl-4-methoxyanilino)ethyl-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]amino]acetic acid Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1N(C(C=1C=CC=CC=1)C=1C=CC=CC=1)CCN(CC(O)=O)C(=O)CN1C(=O)NC(=O)C(C)=C1 AGAPCTWZXVFNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NSCRQJLBPSKCNK-UHFFFAOYSA-N 2-[2-aminoethyl-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]amino]acetic acid Chemical compound CC1=CN(CC(=O)N(CCN)CC(O)=O)C(=O)NC1=O NSCRQJLBPSKCNK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QBXHEEJKBUNDPT-UHFFFAOYSA-N 2-[2-hydroxyethyl-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]amino]acetic acid Chemical compound CC1=CN(CC(=O)N(CCO)CC(O)=O)C(=O)NC1=O QBXHEEJKBUNDPT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HJBLUNHMOKFZQX-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxy-1,2,3-benzotriazin-4-one Chemical compound C1=CC=C2C(=O)N(O)N=NC2=C1 HJBLUNHMOKFZQX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HVCNXQOWACZAFN-UHFFFAOYSA-N 4-ethylmorpholine Chemical compound CCN1CCOCC1 HVCNXQOWACZAFN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004172 4-methoxyphenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(OC([H])([H])[H])=C([H])C([H])=C1* 0.000 description 1
- LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 5-methylcytosine Chemical compound CC1=CNC(=O)N=C1N LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LOSIULRWFAEMFL-UHFFFAOYSA-N 7-deazaguanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1CC=N2 LOSIULRWFAEMFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PZASAAIJIFDWSB-CKPDSHCKSA-N 8-[(1S)-1-[8-(trifluoromethyl)-7-[4-(trifluoromethyl)cyclohexyl]oxynaphthalen-2-yl]ethyl]-8-azabicyclo[3.2.1]octane-3-carboxylic acid Chemical compound FC(F)(F)C=1C2=CC([C@@H](N3C4CCC3CC(C4)C(O)=O)C)=CC=C2C=CC=1OC1CCC(C(F)(F)F)CC1 PZASAAIJIFDWSB-CKPDSHCKSA-N 0.000 description 1
- MSSXOMSJDRHRMC-UHFFFAOYSA-N 9H-purine-2,6-diamine Chemical compound NC1=NC(N)=C2NC=NC2=N1 MSSXOMSJDRHRMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 1
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical compound [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KXDHJXZQYSOELW-UHFFFAOYSA-M Carbamate Chemical compound NC([O-])=O KXDHJXZQYSOELW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108090000994 Catalytic RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000053642 Catalytic RNA Human genes 0.000 description 1
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N Dicylcohexylcarbodiimide Chemical compound C1CCCCC1N=C=NC1CCCCC1 QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GHASVSINZRGABV-UHFFFAOYSA-N Fluorouracil Chemical compound FC1=CNC(=O)NC1=O GHASVSINZRGABV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical compound ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 1
- 239000005708 Sodium hypochlorite Substances 0.000 description 1
- PQLVXDKIJBQVDF-UHFFFAOYSA-N acetic acid;hydrate Chemical compound O.CC(O)=O PQLVXDKIJBQVDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000002152 alkylating effect Effects 0.000 description 1
- 230000029936 alkylation Effects 0.000 description 1
- 238000005804 alkylation reaction Methods 0.000 description 1
- BIVUUOPIAYRCAP-UHFFFAOYSA-N aminoazanium;chloride Chemical compound Cl.NN BIVUUOPIAYRCAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 1
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 description 1
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000001584 benzyloxycarbonyl group Chemical group C(=O)(OCC1=CC=CC=C1)* 0.000 description 1
- GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N bromine Substances BrBr GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 description 1
- 244000309464 bull Species 0.000 description 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 1
- FOCAUTSVDIKZOP-UHFFFAOYSA-N chloroacetic acid Chemical compound OC(=O)CCl FOCAUTSVDIKZOP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940106681 chloroacetic acid Drugs 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- DEZRYPDIMOWBDS-UHFFFAOYSA-N dcm dichloromethane Chemical compound ClCCl.ClCCl DEZRYPDIMOWBDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- BGRWYRAHAFMIBJ-UHFFFAOYSA-N diisopropylcarbodiimide Natural products CC(C)NC(=O)NC(C)C BGRWYRAHAFMIBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UXGNZZKBCMGWAZ-UHFFFAOYSA-N dimethylformamide dmf Chemical compound CN(C)C=O.CN(C)C=O UXGNZZKBCMGWAZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005982 diphenylmethyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])(*)C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- WBJINCZRORDGAQ-UHFFFAOYSA-N ethyl formate Chemical compound CCOC=O WBJINCZRORDGAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004992 fast atom bombardment mass spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical group O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960002949 fluorouracil Drugs 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 1
- 239000012362 glacial acetic acid Substances 0.000 description 1
- 125000003630 glycyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 125000002346 iodo group Chemical group I* 0.000 description 1
- JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N iodoacetic acid Chemical compound OC(=O)CI JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012452 mother liquor Substances 0.000 description 1
- XUZLXCQFXTZASF-UHFFFAOYSA-N nitro(phenyl)methanol Chemical compound [O-][N+](=O)C(O)C1=CC=CC=C1 XUZLXCQFXTZASF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 1
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 125000000636 p-nitrophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1*)[N+]([O-])=O 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N phenylmethyl ester of formic acid Natural products O=COCC1=CC=CC=C1 UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005373 porous glass Substances 0.000 description 1
- 239000001120 potassium sulphate Substances 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 238000010992 reflux Methods 0.000 description 1
- 108091092562 ribozyme Proteins 0.000 description 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 1
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- SUKJFIGYRHOWBL-UHFFFAOYSA-N sodium hypochlorite Chemical compound [Na+].Cl[O-] SUKJFIGYRHOWBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012321 sodium triacetoxyborohydride Substances 0.000 description 1
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- QNLGIOSWSAVMFI-UHFFFAOYSA-N tert-butyl 2,2-diaminopropanoate Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)C(C)(N)N QNLGIOSWSAVMFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UXWVQHXKKOGTSY-UHFFFAOYSA-N tert-butyl phenyl carbonate Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)OC1=CC=CC=C1 UXWVQHXKKOGTSY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WHRNULOCNSKMGB-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran thf Chemical compound C1CCOC1.C1CCOC1 WHRNULOCNSKMGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N tfa trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F.OC(=O)C(F)(F)F WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
- SIOVKLKJSOKLIF-HJWRWDBZSA-N trimethylsilyl (1z)-n-trimethylsilylethanimidate Chemical compound C[Si](C)(C)OC(/C)=N\[Si](C)(C)C SIOVKLKJSOKLIF-HJWRWDBZSA-N 0.000 description 1
- 125000001834 xanthenyl group Chemical group C1=CC=CC=2OC3=CC=CC=C3C(C12)* 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K5/00—Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K5/04—Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof containing only normal peptide links
- C07K5/06—Dipeptides
- C07K5/06139—Dipeptides with the first amino acid being heterocyclic
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/001—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof by chemical synthesis
- C07K14/003—Peptide-nucleic acids (PNAs)
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
- Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
- Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Description
Foreliggende oppfinnelse angår en ny, forbedret fremgangsmåte for fremstilling av substiturte N-etyl-glycinderivater for syntese av PNA og PNA-/DNA-hybrider, som er beskrevet i EP-A 672.661. Disse substituerte N-etyl-glycinderivatene tjener for fremstilling av PNA og PNA-/DNA-hybrider som er beskrevet i EP-A 672.677. Deres anvendelse angår anvendelsen som hemmer av genekspresjon (antisens oligonukleotider, ribozymer, sensoligonukleotider og tripleksdannede oligonukleotider), som sonder for påvisning av nukleinsyrer og som hjelpemiddel i molekylærbiologien. Videre angår oppfinnelsen mellomprodukter.
Målet for oppfinnelsen er å finne en enkel, kostnadsriktig fremgangsmåte for fremstilling av disse substituerte N-etyl-glycinderivatene.
Den nye fremgangsmåten for fremstilling av de substituerte N-etyl-glycinderivatene med formel I
hvor
PG er en beskyttelsesgruppe av uretantypen som er labil overfor svake syrer og er valgt fra l-(l-adamantyl)l-metyletoksykarbonyl (Adpoc), l-(3,5-di-tert-butylfenyl)l-metyletoksykarbonyl (t-Bumeoc), 3,5-dimetoksyfenyl-2-propyl-2-oksykarbonyl (Ddz) og 1-metyl-l-(4-bifenyl)etyloksykarbonyl (Bpoc), eller en beskyttelsesgruppe av trityltypen som er labil overfor svake syrer, og er valgt fra trifenylmetyl (Trt), (4-metoksyfenyl)-difenylmetyl) (Mmt), (4-metylfenyl)-difenylmetyl (Mtt), di-(4-metoksyfenyl)-fenylmetyl (Dmt) og 9-(9-fenyl)-xantenyl (piksyl),
X står for NH eller O, og
B' står for i nukleotidkjemien vanlige baser hvis eksocykliske amin- hhv.
hydroksygrupper er beskyttet av egnede beskyttelsesgrupper, eksempelvis står B' for de naturlige basene som adenin, cytosin, buanin, tymin og uracil eller unaturlige baser som purin, 2,6-diaminopurin, 7-deazadenin eller 7-deazaguanin, som begge eventuelt er substituert i 7-posisjonen med en av substituentene fra rekken halogen, (Ci-Cio)-alkyl> (C2-Cio)-<a>lkenyl eller (C3-C6)-alkenyl eller (C3-C6)-alkynyl, fortrinnsvis klor, brom eller jod, (C3-C6)-alkyl, (C3-C6)-
alkenyl eller (C3-C6)-alkynyl, N4N4-etanocytosin, N<6>N6-etano-2,6-diaminopurin, 5-metylcytosin, 5-((C3-C6)-alkynyl-uracil, 5-((C3-Cf5)-alkynylcytosin, 5-fluor-uracil eller pseudoisocytosin, hvor deres eksocykliske amino- hhv. hydroksygrupper er beskyttet med egnede kjente beskyttelsesgrupper som benzoyl-, isobutanoyl-, acetyl-, fenoksyacetyl-, 4-(t-butyl)-benzoyl-, 4-(t-butyl)-fenoksyacetyl-, 4-(metoksy)-benzoyl-, 2-(4-nitrofenyl)etyloksykarbonyl-, 2-(2,4-dinitrofenyl)etyl-oksykarbonyl-, 9-fluorenylmetoksykarbonyl-difenylkarbamoyl eller formamidingrupper, fortrinnsvis benzoyl-, isobutanoyl-, acetyl-, fenoksyacetyl-, 4-(t-butyl)-benzoyl-, 4-(metoksy)-benzoylgrupper og for guanin også for en kombinasjon av 2-N-acetyl med 6-O-difenylkarbamoyl, såvel som deres salter, fortrinnsvis deres salter med tert. organiske baser, som f.eks. trietylamin eller pyridin,
er kjennetegnet ved at man
a) omsetter en forbindelse med formel II
hvor
R står for hydrogen eller, når X = NH, en syrelabil beskyttelsesgruppe som f.eks.
B. Boe, Ddz, Trt, foretrukket Boe, og
R.<1> står for en mot syrer labil og mot aminer stabil beskyttelsesgruppe, som f.eks.
tert.butyl og (2-klorfenyl)difenylmetyl, fortrinnsvis tert.-butyl, og
X er som ovenfor definert,
med en forbindelse med formel HI
hvor
B' er som ovenfor definert, ved 0-45°C, fortrinnsvis ved romtemperatur, i et egnet oppløsningsmiddel, som f.eks. DMF, acetonitril, diklormetan eller blandinger av dette oppløsningsmiddel under anvendelse av et i peptidkjemien vanlig koblingsreagens, som f.eks. karbodiimider, fosfoniumreagenser, uroniumreagenser, syrehalogenider eller aktiverte estere,
til en forbindelse med formelen IV
hvor
R, X, B' og Ri er som ovenfor definert,
b) deretter overfører forbindelsen med formel IV ved avspalting av den syrelabile esterbeskyttelsesgruppen R<*> hhv. hvor X = NH med samtidig avspalting av den syrelabile beskyttelsesgruppen R under egnede sure betingelser med f.eks. trifluoreddiksyre i et egnet oppløsningsmiddel som f.eks. diklormetan, etylacetat, dioksan etc., eventuelt under tilsetning av kationfangere som f.eks. anisol, tiofenol, trietylsilan etc,
til en forbindelse med formel V, hvor forbindelsen med formel IV hvor X = O i løpet av denne avspaltingen til en viss grad også kan opptre som lakton med formelen Va, men som ved behandling med baser, som f.eks. NaOH eller trietylamin i vandig medium på enkel måte kan bli overført til det åpenkjedige derivat med formel V,
hvor
X og B<1> er som ovenfor definert,
c) forbindelsen med formel V blir med et egnet reagens som f.eks. t-Bumeoc-fluorid, Adpoc-azid, Bpoc-azid, Ddz-(fenyl)karbonyl, Trt-Cl, Mtt-Cl, Mmt-Cl, Dmt-Cl
eller Pixyl-Cl, i et egnet oppløsningsmiddel, som f.eks. DMF, NMP, acetonitril, diklormetan eller blandinger av dette oppløsningsmiddel under anvendelse av en hjelpebase f.eks. NEM, DIPEA, pyridin, trietylamin til forbindelsen med formel I og deretter eventuelt overført til deres salter.
Vanlige aktiveringsmetoder i peptidsyntesen er eksempelvis beskrevet i Houben-Weyl,
Methoden der organischen Chemie, bind 15/2 eller videre reagenser som f.eks. BOP (B. Castro, J.R. Dormoy, G. Evin og C. Selve, Tetrahedron Lett. 1975,1219-1222), PyBOP (J. Coste, D. Le-Nguyen og B. Castro, Tetrahedron Lett. 1990, 205-208), BroP (J. Coste, M.-N.- Dufour, A. Pantaloni og B. Castro, Tetrahedron Lett. 1990, 669-672), ByBroP (J. Coste, E. Frerot, P. Jouin og B. Castro, Tetrahedron Lett. 1991, 1967-1970) og Uroniumuroniumregenser, som f.eks. HBTU (V. Dourtoglou, B. Gross, V. Lambropou-lou, C. Sioudrou, Synthesis 1984, 572-574), TBTI, TPTU, TSTU, TNTU, (R. Knorr, A. Trzeciak, W. Bannwarth og D. Gillessen, Tetrahedron letters 1989,1927-19930), TOTU (EP-A-0.460.446), HATU (K.A. Carpino, J. Am. Chem. Soc. 1993,115, 4397-4398), HAPyU, YAPipU (A. Ehrlich, S. Rothemund, M. Brudel, M. Beyermann, L.A. Caprino og M. Bienert, Tetrahedron Lett. 1993, 4781-4784), BOI (K. Akaji, N. Kuriyama, T. Kimura, Y. Fujiware og Y. Kiso, Tetrahedron Lett. 1992, 3177-3180), propanfosfon-syreanhydrid (PPA) (H. Wissmann, H.J.Kleiner, Angew. Chem. 92,129-130,1990) eller syreklorid hhv. syrefluorid (L.A.Carpino, H.G.Chao, M. Beyermann og M. Bienert, J. Org. Chem., 56 (1991), 2635; J.N. Bertho, A. Loffet, C. Pinel, F. Reuther og G. Sennyey i E. Giralt og D. Andreu (Eds.) Peptides 1990, Escom Science Publishers B. V. 1991, s. 53-54; J. Green og K. Bradley, Tetrahedron 1993, 4141-4146), 2,4,6-mesitylensulfonyl-3-nitro-l,2,4-triazolid (MSNT) (B. Blankemeyer-Mengde, M. Nimitz og R. Frank, Tetrahedron Lett. 1990,1701-1704), 2,5-difenyl-2,3-dihydro-3-okso-4-hydroksytiofendioksyd (TDO) (R. Kirstgen, R.C. Sheppard, W. Steglich, J. Chem. Soc. Chem. Commun. 1987, 1870-1871) eller aktivert ester (D. Hudson Peptide Res. 1990, 51-55).
Videre beskriver S.A. Thomson et al., Tetrahedron 1995, 6179-6194 en syntese av peptidnukleinsyrer.
Foretrukket er anvendelsen av karbodiimider, f.eks. dicykloheksylkarbodiimid eller di-isopropylkarbodiimid. Foretrukket blir det også anvendt fosfoniumregenser som f.eks. PyBOP eller PyBroP, Uronium-reagenser, som f.eks. HBTU, TBTU, TPTU, TSTU, TNTU, TOTU eller HATU, BOI eller syreklorid hhv. syrefluorid såvel som propanfos-fonsyreanhydrid (PP A).
Fordelen ved den nye fremgangsmåte for fremstilling av forbindelsene med formel I hvor X = NH, ligger i at det fra mellomproduktet med formelen rv ved innvirkning av et enkelt reagens, f.eks. trifluoreddiksyre avspaltes samtidig beskyttelsesgrupper for den primære aminofunksjonen og karboksylgruppen til aminoetylglycinet. Ved innføring av beskyttelsesgruppen PG dannes så direkte forbindelsen med formelen I. For fremstillingen av forbindelsen i tittelen med formel I hvor X = O, ligger fordelen i at ved beskyttelsen av karboksylgruppen, forbedrer oppløseligheten til hydroksyetylglycin-derivatet seg i organiske oppløsningsmidler, og for det annet letter det sammenbind-ingen med forbindelsen med formel HI.
Syntesen av forbindelsen med formel II skjer f.eks. ved omsetningen av kommersielt tilgjengelige 1,2-diaminoetan eller aminoetanol med de tilsvarende halogeneddiksyreestere som f.eks. kommersielt tilgjengelig kloreddiksyre-tert.-butylester, bromeddiksyre-tert.-butylester. For X = NH og R = syrelabil beskyttelsesgruppe skjer omsetningen av aminoetylglycinesteret med et egnet beskyttelsesgruppereagens som f.eks. Ddz-(fenyl)-karbonat, Trt-Cl, Di-tert.-butyldikarbonat, Boc-ONSu, tert.-butylfenylkarbonat. En ytterligere fremgangsmåte består i at omsetningen av monobeskyttet 1,2-diaminoetan, som f.eks. mono-Boc-diaminoetan med halogeneddiksyreestere som f.eks. kloreddiksyre-tert.-butylester eller bromeddiksyre-tert.-butylester.
En ytterligere fremgangsmåte for fremstilling av forbindelsene med formel II med R = Boe og Ri = tert.-butyl, består i den reduktive amineringen av glyoksylsyre-tert.-butylester med etylendiamin, mono-Boc-etylendiamin (for X = NH) hhv. aminoetanol (for X = O) med hydrogen på palladium på karbon eller med natriumcyanoborhydrid eller na-trium-triacetoksy-borhydrid som reduksjonsmiddel. Den for denne reaksjonen nødven-dige glyoksylsyre-tert.-butylesteren kan f.eks. bli fremstilt som beskrevet i J.E. Bishop, J.F. 0'Connell, H. Rapport, J. Org. Chem. 1991, 5079-5091. Syntesen av mono-Boc.-etylendiamin er f.eks. beskrevet i Kapcho, A.P.; Kuell, C.S.; Synth Commun. (1990), 2559-2564.
Også egnet for fremstilling av forbindelsen med formel II hvor X = NH, er den reduktive amineringen av Boc-glycinal med glycin-tert.-butylester med hydrogen på palladium på karbon eller med natriumcyanoborhydrid eller natrium-tiracetoksy-borhydrid som reduksjonsmiddel. Det for dette nødvendige Boc-glycinal blir f.eks. fremstilt som beskrevet av A. Evidente, G. Picalli, A. sisto, M.Ohba, K. Honda, T. Fujii, Chem. Pharm. Bull. 1992, 1937-1939, glycin-tert.-butylester er kommersielt tilgjengelig-
Nukleobase-eddiksyrederivatet med formel HI kan bli fremstilt ved alkylering av den tilsvarende nukleobasen eller den i den eksocykliske hydroksy- eller aminofunksjonen beskyttede nukleobasen med kloreddiksyre, bromeddiksyre, jodeddiksyre eller deres estere. Eventuelt blir her for selektiv alkylering ytterligere temporære beskyttelsesgrupper innført på nukleobasen. Som beskyttelsesgruppe for nukleobasen kan alle beskyttelsesgrupper som er forenelige med den mot svake syrer labile beskyttelsesgruppen PG, bli benyttet. For den eksocykliske aminofunksjonen ble det fortrinnsvis anvendt beskyttelsesgrupper som benzoyl-, isobutanoyl-, acetyl-, fenoksyacetyl-, 4-(t-butyl)-benzoyl-, 4-(t-butyl)-fenoksyacetyl-, 4-(metoksy)-benzoyl-, 2-(4-nitrofenyl)etyl-oksykarbo-nyl-, 2-(2,4-dinitrofenyl)etyloksykarbonyl-, 9-fluorenylmetoksykarbonyl- eller form-amidingruppene. Spesielt foretrukket er benzoyl-, isobutanoyl-, 4-(t-butyl)-benzoyl-, 2-(4-nitrofenyl)etyl-oksykarbonyl-, 2-(2,4-dinitrofenyl)etyloksykarbonyl-, 9-fluorenylmetoksykarbonyl-, 4-(metoksy)-benzoyl- eller para-(t-butyl)-fenoksyacetyl-, para-nitro-fenyl-2-etyl-oksykarbonyl-gruppene.
Gjenstand for oppfinnelsen er dessuten verdifulle mellomprodukter med formelen IV, hvor R, X, B' og Ri er som ovenfor definert, hvor imidlertid R er hydrogen eller når X = NH, står for Boe og R* står for tert.-butyl.
EKSEMPLER:
Eksempel 1:
Hydroksyetylglycin-tert-butylester
(H-Oeg-OtBu)
30,2 ml (0,5 mol) aminoetanol ble oppløst i 200 ml DMF, 17 ml (0,1 mol) diisopropyletylamin tilsatt og 14,8 ml (0,1 mol) bromeddiksyre-tert.-butylester ble dryppet til. Blandingen ble omrørt i 24 timer ved romtemperatur og så ble oppløsningsmidlet avdampet i rotasjonsfordamper i vakuum. Resten ble tatt opp i 100 ml vann, ekstrahert
med mettet natriumklorid og tre ganger med 100 ml etylacetat. Den organiske fasen ble vasket med litt NaCl-oppløsning, tørket over natriumsulfat og så inndampet til tørrhet. Man fikk 11,96 g av produktet som farveløs olje.
MS/ES<+>): 176,2 (M + H)<+>
Rf = 0,51 (2-butanon:vann:pyridin:eddiksyre/70:15:15:2)
Eksempel la:
Hydroksyetylglycin-tert.-butylester
(H-Oeg-OtBu)
3 ml (0,05 mol) aminoetanol ble opløst i 20 ml DMF tilsatt 1,7 ml (0,01 mol) diisopropyletylamin og 1,4 ml (0,01 mol) kloreddiksyre-tert.-butylester dryppet til. Blandingen ble omrørt i 24 timer ved romtemperatur og så ble oppløsningsmidlet avdampet på rotasjonsfordamper under vakuum. Resten ble tatt opp i 20 ml vann tilsatt natriumklorid og ekstrahert tre ganger med 20 ml etylacetat. Den organiske fasen ble vasket med litt mettet Na-Cl-oppløsmng og tørket over natriumsulfat og så inndampet til tørrhet. Man fikk 1,9 g av produktet som farveløs olje.
MS(ES<+>): 176,1 (M + H)<+>
Rf = 0,51 (2-butanon:vann:pyridin:eddiksyre/70:15:15:15:2)
Eksempel 2:
N-(hydroksy)etyl-N-(( 1 -tyminyl)acetyl)glycin-tert. -butylester
(H-Oeg(T)-OtBu)
8,9 g (53 mmol) H-Oeg-OtBu ble oppløst i 100 ml DMF, så ble etter hverandre 8,8 g (48 mmol) tyminyleddiksyre, 19,4 ml (106 mmol) trietylamin og 17,4 g (53 mmol) TOTU tilsatt. Det ble omrørt i 3 timer ved romtemperatur, så ble oppløsningsmidlet avdampet under vakuum i rotasjonsfordamperen. Resten ble omrørt med litt etylacetat, hvorved produktet begynte å falle ut. Man lot blandingen stå over natten ved 4°C, filtrerte det utfelte produktet fra, vasket med litt etylacetat og tørket under vakuum. Utbytte: 11,8 g farveløst stoff.
MS(ES<+>): 342,2 (M + H)<+>
Rf = 0,75 (2-butanon:vann:pyridin:eddiksyre/70:15:15:2)
o
Eksempel 3:
N-(hydroksy)etyl-N-(( 1 -tyminyl)acetyl)glycin
(H-Oeg(T)-OH)
9,47 g (28 mmol) H.Oeg(T)-OtBu ble suspendert i 150 ml diklormetan og tilsatt 100 ml 95% trifluoreddiksyre (5% vann). Det ble dannet en klar oppløsning som ble omrørt i 3 timer ved romtemperatur. Reaksjonsbladningen ble så dryppet opp i 11 kald (0°C) godt omrørt metyl-tert.butyleter, hvorved produktet felte ut. Det utfelte råproduktet (det ble
også oppnådd noe lakton) ble oppløst i en blanding av 170 ml dioksan, 170 ml vann og 6,5 ml trietylamin og omrørt i 2 timer ved romtemperatur, hvorved laktonet ble åpnet og det ble dannet trietylammoniumsalt. Så ble blandingen inndampet til tørrhet og resten tørket under vakuum.
Utbytte: 10,51 g amorft faststoff
MS(ES<+>): 286,2 (M + H)<+>
Rf = 0,12 (diklormetan:metanol:etylacetat/l0:2:1 og 1% trietylamin)
Eksempel 4:
N-(di-(4-metoksyfenyl)-fenylmetyloksy)etyl-N-((l-tymidyl)acetyl)glycin (Dmt-Oeg(T)-OH)
1,0 g (2,6 mmol) H-Oeg(T)-OH • NEt3 ble oppløst i 10 ml DMF og 1,4 ml (10 mml) trietylamin tilsatt. Så ble 1,8 g (5,2 mmol) Dmt-Cl i 10 ml diklormetan dryppet til og blandingen ble omrørt i 16 timer ved romtemperatur. Så ble oppløsningsmidlet avdampet i rotasjonsfordamper under vakkum, resten ble tatt opp i diklormetan, vasket med vann, den organiske fasene tørket over natriumsulfat og så inndampet. Det dannede råproduktet ble renset ved kolonnekromatografi på kieselgel med diklormetan/metan-ol/etylacetat 15:1:1 med 1% trietylamin som elueringsmiddel. De produktinneholdende fraksjonene ble slått sammen og inndampet. Man fikk 960 mg av produktet som skum.
MS(FAB, MeOH/NBA): 587,3 (M)<+>
Rf = 0,29 (diklormetan:metanol:etylacetat/10:2:l og 1% trietylamin)
Eksempel 5: N-(hyd^oksy)etyl-N-((l-(N<4->(4-tert.-butylbenzoyl)-cytosyl)acetyl)glycin-tert.-butylester (H-Oeg(CtBuBz)-OtBu)
1,8 g (11 mmol) H-Oeg-OtBu ble oppløst i 100 ml DMF, så ble etterhverandre 3,0 g (10 mmol) N<4->(4-metoksybenzoyl)-Nl<->karboksymetyl-cytosin, 3 ml trietylamin og 3,6 g (11
mmol) TOTU tilsatt. Det ble omrørt i 4 timer ved romtemperatur, så ble oppløsnings-midlet avdampet i rotasjonsfordamperen under vakuum. Resten ble tatt opp i etylacetat og to ganger vasket med natriumhydrogenkarbonatoppløsning. Produktet falt ut i etylacetatfasen. Det utfelte produktet ble filtrert fra, vasket med litt etylacetat og tørket under vakuum. Utbytte: 3,06 g farveløst stoff.
MS(FAB, MeOH/NBA): 461,3 (M + H)<+>
% = 0,81 (2-butanon:vann:pyridin:eddiksyre/70:15:15:2)
Eksempel 6:
N-(hydroksy)etyl-N-((l-(N<4->(4-tert.-butylbenzoyl)-cytosyl)acetyl)glycin (H-Oeg(C<tBuBz>)-OH)
1,5 g (3,4 mmol) H-Oeg(C<MeOBz>)-OtBu ble oppløst i en blanding av 30 ml diklormetan og 20 ml 95% trifluoreddiksyre (5% vann) som inneholdt 2,5 ml anisol. Den klare oppløsningen ble omrørt i 5 timer ved romtemperatur og så dryppet opp i 500 ml kald (0°C) godt omrørt metyl-tert.butyleter, hvorved produktet ble dannet. Det dannede råproduktet (det ble også oppnådd noe lakton) ble oppløst i en blanding av 25 ml dioksan, 25 ml vann og 0,44 ml trietylamin og omrørt i 3 timer ved romtemepratur, hvorved laktonet ble åpnet og trietylammoniumsaltet ble dannet. Så ble blandingen inndampet til tørrhet og resten ble renset ved kolonnekromatografi på kiselgel med diklormetan/metanol/etylacetat) 10:3:2 med 1% trietylamin som elueringsmiddel.
MS(ES<+>): 405,2 (M + H)<+>
Rf = 0,16 (diklormetan:metanol:etylacetat/l0:3:2 og 1% trietylamin)
Eksempel 7: N-(di-(4-metoksyfenyl)-fenylmetyloksy)etyl-N-((l-(N<4->(4-metoksylbenzoyl)-cyto-syl)acetyl)glycin
(Dmt-Oeg(CMeOBz)-OH)
920 mg (1,8 mmol) H-Oeg(CMeoBz)-OH ■ NEt3 ble oppløst i 10 ml DMF og 1 ml (7,2 mmol) trietylamin ble tilsatt. Så ble 1,2 g (3,6 mmol) Dmt-Cl i 10 ml diklormetan dryppet til og blandingen ble omrørt i 16 timer ved romtemperatur. Så ble oppløsningsmidlet avdampet i rotasjonsfordamperen under vakuum, resten tatt opp i diklormetan, vasket
med vann, den organiske fasen tørket over natriumsulfat og så inndampet. Det dannede råproduktet ble renset ved hjelp av kolonnekromatografi på kieselgel med diklormetan/- metanol/etylacetat 15:1:1 med 1% trietylamin som elueringsmiddel. De produktinne-
holdende fraksjonene ble slått sammen og inndampet. Man fikk 900 mg produkt som skum.
MS(FAB, MeOH/NBA): 707,3 (M + H)<+>
Rf = 0,24 (diklormetan:metanol;etylacetat/l0:3:2 og 1% trietylamin)
Eksempel 8: N-(hydroksy)etyl-N-(9-(N<6->(4-metoksybenzoyl)-adenosyl)acetyl)glycin-tert.-butylester (H-Oeg(AMeOBz)-OtBu)
534 mg (3,3 mmol) H-Oeg-OtBu ble oppløst i 10 ml DMF, så ble etterhverandre 1,0 g (3,1 mmol) N<6->(4-metoksybenzoyl)-N<9->karboksymetyladenin, 0,77 ml (4,5 mmol) N-etylmorfolin og 1,0 g (3,1 mmol) TOTU tilsatt. Det ble omrørt over natten ved romtemperatur, så ble oppløsningsmidlet avdampet under vakuum i rotasjonsfordamperen. Resten ble tatt opp i etylacetat og to ganger vasket med natriumhydrogenkarbonatopp-løsning og vann. Den organiske fasen ble tørket over natriumsulfat og så inndampet. Man fikk 1,33 g av produktet.
MS(FAB, MeOH/NBS): 485,3 (M + H)<+>
Rf= 0,63 (n-butanol:vann:eddiksyre/3:l:l)
Eksempel 9:
N-(hydroksy)etyl-N-(9-(N<6->(4-metoksybenzoyl)-adenosyl)acetyl)glycin (H-Oeg(AMe<OBz>)-OH)
1,3 g (2,7 mmol) H.Oeg(A<MeOBz>)_0tBu ble oppløst i 15 ml 95% trifluoreddiksyre (5% vann). Den klare oppløsningen ble omrørt i 1 time ved romtemperatur og så dryppet i 250 ml kald (0°C) godt omrørt dietyleter, hvorved produktet utfelte. Det utfelte råproduktet (det ble også dannet noe lakton) ble oppløst i en blanding av 15 ml dioksan, 15 ml vann og 0,4 ml trietylamin og omrørt i 2 timer ved romtemperatur, hvorved laktonet ble åpnet og trietylammoniumsaltet dannet. Så ble blandingen inndampet til tørrhet og 3 ganger omrørt med pyridin. Resten ble direkte tilsatt til den neste reaksjonen.
MS(FAB, NBA/MeOH/LiCl): 435,2 (M + Li)<+>
Rf = 0,37 (n-butanol:vann:eddiksyre/3:l:l)
Eksempel 10: N-(di-(4-metoksyfenyl)-fenylmetyloksy)etyl-N-(9-(N^-(4-metoksybenzoyl)-adenosyl)acetyl)glycin
(Dmt-Oeg(AMeOBz)-OH
Det i den forrige reaksjonen dannede H-Oeg(A<MeOBz>)-OH • NEt3 ble oppløst i 10 ml pyridin. Så ble 1,7 g (5 mmol) Dmt-Cl tilsatt og blandingen ble omrørt i 16 timer ved romtemperatur. Så ble oppløsningsmidlet inndampet på rotasjonsfordamperen under vakuum, resten tatt opp i diklormetan. Det ble vasket med 5% vandig sitronsyre og mettet vandig NaCl-oppløsning, den organiske fasen tørket over natriumsulfat og inndampet til tørrhet. Det dannede råproduktet ble renset ved kolonnekromatografi på dieselgel med diklormetan med en gradient fra 1-10% metanol 1% trietylamin som elueringsmiddel. De produktinneholdende fraksjonene ble slått sammen og inndampet. Resten ble oppløst i 5 ml diklormetan og så dryppet opp i 100 ml godt omrørt dietyleter, hvorved produktet ble utfelt. Man fikk 580 mg av produktet som pulver.
MS(FAB, MeOH/NBA): 731,3 (M + H)<+>
Rf = 0,70 (n-butanol:vann:eddiksyre/3:1:1)
Eksempel 11:
N-(tert.butyloksykarbonylaminoetyl)glycin-tert.butylester
Boc-Aeg-OtBu
Trinn 1:
I en trehalset kolbe med rører, tilbakeløpskjøler og tilsetningstrakt, ble det tilsatt 120 ml (1,8 mol) 1,2-diaminoetan i 300 ml diklormetan. Til den godt omrørte oppløsningen ble det i løpet av ca. 2,5 time dryppet til 42,7 ml (0,3 mol) kloreddiksyre-tert.-butylester i 100 ml diklormetan. Reaksjonen var lett eksoterm. Etter ca. 15 min. inntrådte en blak-king, og det dannede diaminhydrokloridet felte seg ut som en oljefase. For fullføring av reaksjonen ble det omrørt i ytterligere 2 timer ved romtemperatur (DC-kontroll i etyl-metylketon/pyridin/vann/iseddik 70:15:15:2) og så ble reaksjonsblandingen tilsatt 200 ml vann. Den organiske fasen ble skilt fra og vannfasen igjen ekstrahert to ganger med 100 ml diklormetan. De sammenslåtte organiske fasene ble så igjen tilbake-ekstrahert en gang med 100 ml vann og tørket over natriumsulfat. Etter avfiltrering av tørkemidlet ble den organiske fasen fylt opp til 800 ml og for bestemmelse av råutbyttet, ble 40 ml inndampet til tørrhet. Resten, 2,28 g, tilsvarende totalmengde på 45,6 g (86%). Denne diklormetanoppløsningen av råproduktet ble som nedenfor beskrevet direkte videre omsatt til Boc.Aeg-OtBu.
MS(ES<+>): 189,1 (M + H)<+>
Rf = 0,36 (2-butanon:vann:pyridin:eddiksyre/70:15:15:2)
Trinn 2:
0,26 mol H-Aeg-OtBu (oppløsning i 800 ml diklormetan) ble tilsatt 38 ml (0,27 mol) trietylamin og så under god omrøring langsomt i løpet av 45 min. drypptet til en opp-løsning på 54,5 g (0,25 mol) di-tert.-butyldikarbonat i 100 ml diklormetan. Reaksjons-oppløsningen ble derved tyktflytende ved det dannede karbamat (fra CO2) og deretter fortynnet med 100 ml diklormetan. Etter avsluttet reaksjon ble oppløsningen tyntflyten-de og kun svakt blakket. Det ble tilsatt 100 ml vann, den organiske fasen skilt fra og den vandige fasen igjen ekstrahert med 100 ml diklormetan. Den organiske fasen ble tørket over natriumsulfat og så inndampet under vakuum. Råprodukt: 77,6 g av en farveløs olje. Dette råproduktet ble renset ved kolonnekromatografi på kieselgel med etylacetat som elueringsmiddel. Utbytte: 48,1 g
MS(ES<+>): 275,2 (M + H)<+>
Rf= 0,46 (etylacetat)
Eksempel 12: N-(tert.butyloksykarbonylaminoetyl)-N-((l-tyminyl)acetyl)glycin-tert.butylester Boc-Aeg(T)-OtBu
1,375 g (5 mmol) Boc-Aeg-OtBu ble oppløst i 20 ml DMF og så etterhverandre tilsatt 921 mg (5 mmol) tyminyleddiksyre, 1,64 g (5 mmol) TOTU og 1,7 ml (10 mmol) diisopropyletylamin. Blandingen ble omrørt over natten ved romtemperatur og så inndampet under vakuum. Den oljeaktige resten ble tatt opp i 70 ml etylacetat og ekstrahert 5 ganger hver med 5 ml natriumhydrogenkarbonatoppløsning hhv. kaliumhydrogensul-fatoppløsning. Så ble det vasket tre ganger hver med 5 ml vann. Den organiske fasen ble tørket over natriumsulfat og så inndampet til tørrhet. Den gjenværende rest ble malt med dietyleter, filtrert og tørket. Utbytte: 1,82 g
MS(ES<+>): 441,3 8M + H)<+>
Rf = 0,55 (diklormetan:metanol:trietylamin/100:10:l)
Eksempel 12a: N-(tert.butyloksykarbonylaminoetyl)-N-((l-tyminyl)acetyl)glycin-tert.butylester Boc-Aeg(T)-OtBu
6,875 g (25 mmol) Boc-Aeg-OtBu ble oppløst i 100 ml DMF og så etterhverandre satt til 4,6 g (25 mmol) tyminyleddiksyre, 8,2 g (25 mmol) TOTU og 8,5 ml (100 mmol) diisopropyletylamin. Blandingen ble omrørt i 4 timer ved romtemperatur og så inndampet under vakuum. Den oljeaktige resten ble tatt opp i 350 ml etylacetat og vasket 5
ganger hver med 5 ml natriumhyckogenkarbonatoppløsning hhv. kaliumhydrogensulfat-oppløsning. Så ble det vasket tre ganger hver med 5 ml vann. Produktet falt herved ut i den organiske fasen, og ble filtrert fra. Den organiske fasen av filtratet ble skilt fra, tør-ket over natriumsulfat og så inndampet til tørrhet. Den gjenværende resten ble målt med dietyleter, filtrert og tørket. De sammenslåtte råproduktene ble omkrystallisert fra etylacetat.
Utbytte: 9,71 g
MS(ES<+>): 441,3 (M + H)<+>
Rf = 0,55 (diklormetan:metanol:trietylamin/100:10:l)
Eksempel 13: N-(tert.butyloksykarbonylaminoetyl)-N-((l-(N<4->(4-metoksylbenzoyl)-cyto-syl)acetyl)glycin-tert.butylester
Boc-Aeg(CMeOBz)-OtBu
1,375 g (5 mmol) Boc-Aeg-OtBu ble oppløst i 20 ml DMF og så etterhverandre tilsatt 1,515 g (5 mmol) N<4->(4-metoksybenzoyl)-Nl<->karboksymetylcytosin, 1,64 g (5 mmol) TOTU og 1,7 ml (10 mmol) diisopropyletylamin. Blandingen ble over natten omrørt ved romtemperatur og så inndampet under vakuum. Den halvfaste resten ble tatt opp i diklormetan, filtrert og filtratet inndampet. Resten ble finfordelt med etylacetat, hvorved produktet falt ut som faststoff. Det ble omkrystallisert fra litt etylacetat, filtrert, vasket med etylacetet og tørket under vakuum.
Utbytte: 1,89 g
MS(ES<+>): 560,3 (M + H)<+>
Rf = 0,53 (diklormetan:metanol:trietylamin/100:10:l)
Eksempel 14: N-(tert.butyloksykarbonylaminoetyl)-N-((9-(N^-4-metoksybenzoyl)-adenosyl)acetyl)glycin-tert.butylester
Boc-Aeg(AMeOBz)_0tBu
549 mg (2 mmol) Boc-Aeg-OtBu ble oppløst i 10 ml DMF g så etterhverandre tilsatt 655 mg (2 mmol) N^-(4-metoksybenzoyl)-N<9->karboksymetyladenin, 656 mg (2 mmol) TOTU og 0,68 ml (4 mmol) diisopropyletylamin. Blandingen ble omrørt over natten ved romtemperatur og så inndampet under vakuum. Resten ble tatt opp i 30 ml etylacetat og vasket 2 ganger hver med 5 ml natriurnhydrogenkarbonatoppløsning hhv. vann. Den
organiske fasen ble tørket over natriumsulfat og så inndampet til tørrhet. Den gjenværende faste resten ble finfordelt med dietyleter, filtrert og tørket. Utbytte: 730 mg MS(FAB, MeOH/NBA): 584,2 (M + H)<+>
Rf = 0,74 (diklormetan:metanol/10:l og 1% trietylamin)
Eksempel 15:
N-(amino)etyl-N-(( 1 -tyminyl)acetyl)glycin
(H-Aeg(T)-OH)
11,0 g (25 mmol) Boc-Aeg(T)-OtBu ble tilsatt 110 ml 95% trifluoreddiksyre (5% vann). Det ble dannet en klar oppløsning som ble omrørt i 2 timer ved romtemperatur. Reaksjonsblandingen ble så inndampet og malt med dietyleter. Det utfelte råproduktet ble så direkte tilsatt i det neste syntestrinnet.
Utbytte: 7,1 g amorft faststoff
MS(ES<+>); 285,2 (M + H)<+>
Rf = 0,14 (2-butanon:vann:pyridin:eddiksyre/70:15:15:2)
Eksempel 16: N-((4-metoksyfenyl)-difenylmetylamino)etyl-N-(( 1 -tyminyl)acetyl)glycin (Mmt-Aeg(T))-OH
7,1 g H-Aeg(T)-OH av det ovenfor beskrevne produktet ble oppløst i 300 ml DMF, så tilsatt 13,9 ml (100 mmol) trietylamin fulgt av 8,9 g (29,2 mmol) Mmt-Cl i 5 porsjoner. Blandingen ble omrørt over natten og filtrert fra uoppløst (ikke-omsatt H-Aeg(T)-OH, 2,78 g) og filtratet inndampet under vakuum. Resten ble tatt opp i 300 ml diklormetan og vasket tre ganger med 30 ml vann. Den organiske fasen ble tørket over natriumsulfat og så inndampet til tørrhet. Den gjenværende faste resten ble oppløst i litt etylacetat, tilsatt litt trietylamin og innrørt i 200 ml dietyleter. Det utfelte produktet ble filtrert fra, vasket med litt eter og tørket under vakuum.
Utbytte: 7,3 g
MS(FAB, MeOH/NBA/LiCl): 569,5 (M + Li)<+>
Rf = 0,25 (diklormetan:metanol:trietylamin/100:10:l)
Eksempel 17:
N-(amino)etyl-N-(( 1 -(N4-(4-metoksylbenzoyl)-cytosyl)acetyl)glycin (H-Aeg(CMe<OBz>)-OH)
1,6 g (2,9 mmol) Boc-Aeg(C<MeOBz>)-OtBu ble tilsatt en blanding av 30 ml diklormetan og 16 ml 95% trifluoreddiksyre (5% vann). Det ble dannet en klar oppløsning, som ble omrørt ved romtemperatur. Reaksjonsblandingen ble så inndampet og malt med dietyleter. Det utfelte råproduktet ble direkte tilsatt i det neste syntesetrinn. Utbytte: 1,86 g
amorft faststoff
Rf = 0,34 (2-butanon:vann:pyridin:eddiksyre/70:15:15:2)
Eksempel 18: N-((4-metoksyfenyl)-difenylmetylamino)etyl-N-((l-(N<4->(4-metoksylbenzoyl)-cytosyl)acetyl)glycin
(Mmt-Aeg(C<MeOBz>))-OH
1,26 g H-Aeg(C<MeOBz>)-OH fra reaksjonen over ble oppløst i 50 ml DMF, så tilsatt 2,1 ml (15 mmol) trietylamin fulgt av 1,06 (3,5 mmol) Mmt-Cl i 3 porsjoner. Blandingen ble omrørt over natten, så fra filtrert litt uoppløst stoff, og filtratet inndampet under vakuum. Resten ble tatt opp i 50 ml diklormetan og vasket tre ganger med 10 ml vann. Den organiske fasen ble tørket over natten, så inndampet til ca. 10 ml og innrørt i 80 ml dietyleter. Det utfelte produktet ble filtrert av, vasket med litt eter og tørket under vakuum.
Utbytte: 1,35 g
MS(FAB, MeOH/NBA): 676,4 (M + H)
Rf = 0,62 (2-butanon:vann:pyridin:eddiksyre/70:15:15:2)
Eksempel 19:
N-(amino)etyl-N-((9-(N<6->4-metoksybenzoyl)-adenosyl)acetyl)glycin (H-Aeg(AMe<OBz>)_OH)
725 mg (1,2 mmol) Boc-Aeg(A<MeOBz>)-OtBu ble tilsatt 10 ml 95% trifluoreddiksyre (5% vann). Det ble dannet en klar oppløsning, som ble omrørt i 3 timer ved romtemperatur. Reaksjonsblandingen ble så inndampet og malt med dietyleter. Det utfelte råproduktet ble så direkte benyttet i neste syntesetrinn.
Utbytte: 830 mg amorft faststoff
Eksempel 20: N-((4-metoksyfenyl)-difenylm adenosyl)acetyl)glycin
(Mmt-Aeg(AMe<OBz>)).0H
690 mg H-Aeg(A^<eOBz>)-OH av den ovenfor fremstilte reaksjonen ble oppløst i 25 ml DMF, så ble 0,88 ml (6,5 mmol) trietylamin tilsatt fulgt av 494 mg (1,6 mmol) Mmt-Cl i 3 porsjoner. Blandingen ble omrørt over natten, så ble litt uoppløst stoff filtrert fra og filtratet ble inndampet under vakuum. Resten ble tatt opp i 20 ml diklormetan og vasket tre ganger med 5 ml vann. Den organiske fasen ble tørket over natriumsulfat, så inndampet og resten malt med dietyleter. Det utfelte produktet ble filtrert fra, vasket med litt eter og tørket under vakuum.
Utbytte: 440 mg
MS(ES<+>): 700,3 (M + H)<+>
Rf = 0,59 (2-butanon:vann:pyridin:eddiksyre/70:15:15:2)
Eksempel 21: N-(tert.butyloksykarbonylaminoetyl)-N-((9-(N2.acetyi.o4-difenylkarbamoyl)-(guanosyl)acetyl)-glycin-tert.butylester
Boc-Aeg(G2-Ac><4-D>P<c>)-OtBu
1,375 g (5 mmol) Boc-Aeg-OtBu ble oppløst i 30 ml DMF og så etterhverandre tilsatt 2,23 g (5 mmol) N<2->acetyl-0<4->difenylkarbamoyl-9-karboksymetyl-guanin, 1,64 g (5 mmol) TOTU og 1,7 ml (10 mmol) diisopropyletylamin. Blandingen ble omrørt over natten ved romtemperatur og så inndampet under vakuum. Resten ble tatt opp i 50 ml etylacetat, og ekstrahert 4 ganger hver med 3 ml natriumhydrogenkarbonatoppløsning, 3 ml kaliumhydrogensulfatoppløsning og 3 ml vann. Den organiske fasen ble tørket over natriumsulfat, tørkemidlet filtrert fra og filtratet inndampet. Resten ble finfordelt med eter, hvorved produktet ble igjen som harpiksaktig faststoff. Dette produktet ble uten ytterligere rensing benyttet i den etterfølgende reaksjonen.
Utbytte: 3,14 g
MS(FAB, NBA(MeOH): 703,3 (M + H)<+>
Rf = 0,80 (diklormetan:metanol:trietylamin/100;10:l)
Eksempel 22:
N-(aminoetyl)-N-((9-(N<2->acetyl)guanosyl)acetyl)-glycin
H-Aeg(G2"Ac)-OH
2,08 g (2,96 mmol) Boc-Aeg(G2-Ac><4-D>P<c>))-OtBu ble tilsatt 20 ml 95% trifluoreddiksyre (5% vann). Det ble dannet en klar oppløsning, som ble omrørt ved romtemperatur i 30 min. Reaksjonsblandingen ble så inndampet og finfordelt med dietyleter. Det utfelte råproduktet ble direkte tilsatt i det neste syntesetrinn.
Utbytte: 1,46 g amorft faststoff
Rf = 0,15 (2-butanon:vann:pyridin:eddiksyre/70:15:15:2)
Eksempel 23:
Mmt-Aeg(G2"A<c>)-OH
1,46 g H-Aeg(G<2_Ac>)-OH av det foregående reaksjonsproduktet ble oppløst i 30 ml DMF, så tilsatt 2,1 ml (15 mmol) trietylamin fulgt av 939 mg (3,04 mmol) Mm-Cl i 3 porsjoner. Blandingen ble omrørt over natten, så filtrert fra litt uoppløselig stoff og filtratet ble inndampet under vakuum. Resten ble tatt opp i 30 ml etylacetat, og ekstrahert 3 ganger hver med 3 ml natriurnhydrogenkarbonatoppløsning og 3 ml vann. Den organiske fasen ble tørket over natriumsulfat, tørkemidlet filtrert fra og filtratet inndampet. Resten ble finfordelt med eter. Det utfelte produktet ble filtrert fra, vasket med litt eter og tørket under vakuum.
Utbytte: 1,10 g
MS(ES<+>): 624,3 (M + H)<+>
Rf = 0,14 (diklormetan:metanol:trietylamin/100:10:l)
Eksempel 24: N-(tert.butyloksykarbonylaminoetyl)-N-((l-(N<4->(4-metoksylbenzoyl)cytosyl)-acetyl)glycin-tert.butylester
Boc-Aeg(CMeOBz)-OtBu
114,6 g (0,418 mol) Boc-Aeg-OtBu og 127 g (0,418 mol) N^-metoksybenzoyfj.N<1->karboksymetylcytosin ble tilsatt 1,5 1 etylacetat og tilsatt en omrørt suspensjon av 115 ml (0,836 mol) trietylamin. Så ble 400 ml (ca. 0,628 mol) tilsatt en 50% propanfosfon-syreanhydridoppløsning i etylacetat i løpet av 2 min. Herved steg temperaturen svakt. Blandingen ble ved tilsetting av ytterligere 65 ml (0,469 mol) trietylamin innstilt til pH 8 og omrørt i 2,5 timer. Bunnfallet ble filtrert fra, først vasket med 500 ml etylacetat og
så vasket med 11 vann. Fra morluten falt det ut ytterligere produkt. Begge utfellingene ble påny omrørt i 500 ml vann, filtrert, vasket med 500 ml vann og tørket under vakuum.
Utbytte: 196,6 g
Eksempel 25: N-(tert.butyloksykarbonylaminoetyl)-N-((9-(N<6->4-metoksybenzoyl)-adenosyl)acetyl)-glycin-tert.butylester
Boc-Aeg(AMeOBz)-OtBu
300,0 g (1,094 mol) Boc-Aeg-OtBu ble oppløst i 2,8 1 DMF og så etterhverandre tilsatt 358,2 g (1,094 mol) N<6->(4-metoksybenzoyl)-N<9->karboksymetyladenin, 360,5 g (2 mmol) TOTU og 373,9 ml (2,184 mol) diisopropyletylamin. Blandingen ble omrørt ved romtemperatur i ytterligere 2 timer og så dryppet til i en omrørt iskald oppløsning av 214,29 g natriumhydrogenkarbonat i 2,2 1 vann, hvorved produktet falt ut. Deretter ble det tilsatt ytterligere 2 1 metyl-tert.butyleter. Denne blandingen ble latt stå over natten. Bunnfallet ble så filtrert fra, og etterhverandre omrørt hver gang med 2 1 vann og 2 1 metyl-tert.butyleter, på nytt filtrert og bunnfallet tørket under vakuum. Utbytte: 437,7g
Eksempel 26:
N-(tert.butyloksykarbonylaminoetyl)glycin-tert.butylester
Boc-Aeg-OtBu
Trinn 1: N-Boc-1,2-diaminoetan
535 ml (8 mol) 1,2-diaminoetan ble oppløst i 2 1 diklormetan. Under omrøring og avkjøling ble en oppløsning av 218,5 g (1 mol) di-tert.-butyl-dikarbonat i 500 ml diklormetan dryppet til i løpet av 1,5 time. Blandingen ble omrørt i ytterligere 20 timer, så ble 1 1 wann tilsatt og det hele kraftig gjennomrørt. Fasene ble skilt, og vannfasen ble igjen to ganger ekstrahert med 500 ml diklormetan. De sammenslåtte organiske fasene ble vasket med halvmettet natriumkloirdoppløsning og tørket over natriumsulfat. Den organiske fasen ble inndampet til et volum på 11.
Trinn 2: Boc- Aeg- OtBu
Til den ovenfor oppnådde oppløsning ble det tilsatt 138 ml (0,97 mol) trietylamin og en spatelspiss kaliumjodid. Så ble under omrøring en oppløsning av 149,5 ml kloreddiksyre-tert.-butylester dryppet til og denne blandingen ble omrørt ved 40°C i 50 timer. Så ble det tilsatt 500 ml vann, blandingen kraftig omrørt og den organiske fasen skilt fra, tørket over natriumsulfat og inndampet. Det dannede råproduktet ble renset kromato-grafisk på kieselgel med etylacetat:metanol, 95:5, som elueringsmiddel. Man oppnådde 78 g av det ønskede produkt.
Eksempel 27:
N-(tert.butyloksykarbonylaminoetyl)glycin-tert.butylester
Boc-Aeg-OtBu
Trinn 1: N- Boc- 1, 2- diaminoetan
4,8 1 (72 mol) 1,2-diaminoetan ble oppløst i 18 1 diklormetan. Under omrøring og avkjøling ble en oppløsning av 1,97 kg (9,03 mol) di-tert.-butyl-dikarboant i 4,5 1 diklormetan dryppet til i løpet av 2 timer. Blandingen ble videre omrørt i 20 timer, så tilsatt 9 1 vann og kraftig omrørt. Fasen ble skilt og vannfasen ble igjen to ganger ekstrahert hver med 4,5 1 diklormetan. De sammenslåtte organiske fasene ble vasket med halvmettet natriumkloirdoppløsning og tørket over natriumsulfat. Den organiske fasen ble inndampet til et volum på 9 1.
Trinn 2: Boc- Aeg- OtBu
Til den ovenfor oppnådde oppløsningen tilsatt man 1,241 trietylamin og 5 g kaliumjodid. Så ble det under omrøring dryppet til en oppløsning av 1,245 1 kloreddiksyre-tert.-butylester i 4,5 1 diklormetan og denne blandingen ble omrørt i 50 timer ved 40°C. Så ble det tilsatt 5 1 vann, blandingen kraftig omrørt og den organiske fasen skilt fra, tørket over natriumsulfat og inndampet. Det dannede råproduktet ble renset på kieselgel med etylacetat:metanol, 95:5 som elueringsmiddel. Man fikk 1,03 kg av det ønskede produktet.
De anvendte forkortelsene er listet opp nedenfor:
Aeg N-(2-aminoetyl)glycyl, -NH-CH2-CH2-NH-CH2-CO-Aeg(AMe0Bz) N-(2-aminoetyl)-N-((9-(N<6->4-metoksybenzoyl)-adenosyl)acetyl)-
glycyl
Aeg(C<Bz>) N-(2-aminoetyl)-N-(( 1 -N4-benzoyl)-cytosyl)acetyl)-glycyl
Aeg(C<MeOBz>) N-(2-arninoetyl)-N-((l-N4-4-metoksybenzoyl)-cytosyl)acetyl)-glycyl
AegCC<®1182>) N-2-aminoetyl)-N-(( 1 -(N4-4-tert.butylbenzoyl)-cytocyl)acetyl)-glycyl
Aeg(G*Bu) N-(2-aminoetyl)-N-((9-(N<2->isobutanoyl)-guanosyl)acetyl)-glycyl
Aeg(G2-Ac>4"DPc)) N-(2-aminoetyl)-N-((9-(N<2->acetyl-04--difenylkarbamoyl)guanosyl)acetyl)-glycyl
Aeg(G2~Ac) N-(2-arninoetyl)-N-((9-(N2-acetyl)-guanosyl)acetyl)-glycyl Aeg(T) N-(2-aminoetyl)-N-(( 1 -tyminyl)acetyl)-glycyl
Bnpeoc 2,2-[bis(4-nitrofenyl)]-etoksykarbonyl)
Boe tert.-butyloksykarbonyl
BOI 2-(benzotriazol-1 -yl)oksy-1,3-dimetyl-imidazolidinium-heksafluorfosfat
BOP benzotriazolyl-1 -oksy-tris(dimetylamino)-fosfonium-heksafluorfosfat
BroP brom-tris(dimetylamino)-fosfoiuum-heksafl^
BSA N,0-bis-(trimetylsilyl)-acetamid
But tert.-butyl
Bz benzoyl
Bzl benzyl
Cl-Z 4-klor-benzyloksykarbonyl
CPG kontrollert poreglass
DBU 1,8-diazabicyklo[5.4.0]undec-7-en
DCM diklormetan
Ddz 3,5-dimetoksyfenyl-2-propyl-2-oksykarbonyl
DMF dimetylformamid
Dmt di-(4-metoksyfenyl)fenylmetyl
Dnpeoc 2-(2,4-dinitrofenyl)-etoksykarbonyl
Dpc difenylkarbamoyl
FAM fluorescein-rest
Fm 9-fluorenylmetyl
Fmoc 9-fluorenylmetyloksykarbonyl
H-Aeg-OH N-(2-aminoetyl)glycin
HAPyU 0-(7-azabeiizotriazol-l-yl)-l,1,3,3-bis(tetrametylen)uronium-heksafluorfosfat
HATU 0-(7-azabenzotriazol-1 -yl)-1,1,3,3-tetrametyluroiuum-
heksafluorfosfat
HBTU 0-(benzotriazol-1 -<y>l)-1,1,3,3-tetrametyluromurn-heksafluorfosfat
HOBt 1-hydroksybenzotriazol
HONSu N-hydroksysuksinimid
HOObt 3-hydroksy-4-okso-3,4-dihydrobenzotriazin
IBu isobutanoyl
MeOBz 4-metoksybenzoyl
Mmt 4-metoksytirfenylmetyl
Moz 4-metoksybenzyloksykarbonyl
MSNT 2,4,6-mesitylensulfonyl-3-nitro-1,2,4-triazolid
Mtt 4-(metylfenyl)difenylmetyl
NMP N-metylpyrrolidin
Oeg N-(2-oksyetyl)glycyl, -0-CH2-CH2-NH-CH2-CO-Pixyl 9-(9-fenyl)xantenyl
PyBOP benzotriazolyl-1 -oksy-tirpyrrolidinofosfonium-heksafluorfosfat
PyBroP brom-tripyrrolidinofosfoiuum-heksafiuorfosfat TAPipU 0-(7-azabenzotriazol-1 -yl)-1,1,3,3 ,-bis(pentarnetylen)uronium-tetrafluoroborat
TBTU 0-(benzotriazol-1 -yl)-1,1,3,3-tetrametyluronium-tetrafluoroborat
tBu tert.-butyl
tBuBz 4-tert.butylbenzoyl
TDBTU 0-(3,4-dihydro-4-okso-l,2,3-benzotriazin-3-yl)-l,1,3,3-tetrametyluronium-tetrafluoroborat
TDO 2,5-difenyl-2,3-dihydro-3-okso-4-hydroksytiofendioksyd TFA trifluoreddiksyre
THF tetrahydrofuran
TNTU 0-[(5-norbonen-2,3-dikarboksimido]-l, 1,3,3-tetrametyluronium-tetrafluoroborat
TOTU 0-[(cyano(etoksykarbonyl)metylen)amino]-l, 1,3,3-tetrametyluronium-tetrafluoroborat
TPTU 0-(l ,2-dihydro-2-okso-1 -pyridyl)-1,1,3,3'-tetrametyluronium-tetrafluoroborat
Trt trityl
TSTU 0-(N-sukcinimidyl)-1,1,3,3-tetrametyluronium-
tetrafluoroborat
Z benzyloksykarbonyl
MS(ES<+>) elektrospray massespektrum (positivt ion) MS(ES") elektrospray massespektrum (negativt ion) MS(DCI) direkte-ioniserings-massespektrum MS(FAB) Fast-Atom-Bombardement-massespektrum NBA nitrobenzylalkohol
Claims (4)
1.
Fremgangsmåte for fremstilling av substituerte N-etyl-glycinderivater med formel I
hvor
PG er en beskyttelsesgruppe av uretantypen som er labil overfor svake syrer og er
valgt fra l-(l-adamantyl)l-metyletoksykarbonyl (Adpoc), l-(3,5-di-tert-butylfenyl) 1 -metyletoksykarbonyl (t-Bumeoc), 3,5-dimetoksyfenyl-2-propyl-2-oksykarbonyl (Ddz) og 1-metyl-l-(4-bifenyl)etyloksykarbonyl (Bpoc), eller en beskyttelsesgruppe av trityltypen som er labil overfor svake syrer, og er valgt fra trifenylmetyl (Trt), (4-metoksyfenyl)-difenylmetyl) (Mmt), (4-metylfenyl)-difenylmetyl (Mtt), di-(4-metoksyfenyl)-fenylmetyl (Dmt) og 9-(9-fenyl)-
xantenyl (piksyl),
X står for NH eller O, og B' står for i nukleotidkjemien vanlige baser, hvis eksocykliske amin- hhv. hydrok
sygrupper er beskyttet av egnede, kjente beskyttelsesgrupper,
såvel som deres salter,
karakterisert ved atman a) omsetter en forbindelse med formel II
hvor
R står for hydrogen eller, når X = NH, står for en syrelabil beskyttelsesgruppe og R* står for en mot syrer labil og mot aminer stabil beskyttelsesgruppe og X er som ovenfor definert, med en forbindelse med formel HI
hvor B' er som ovenfor definert,
ved 0-45°C i et egnet oppløsningsmiddel under anvendelse av et i peptidkjemien vanlig koblingsreagens,
til en forbindelse med formelen IV
hvor
R, X, B' og R<1> er som ovenfor definert, b) deretter overfører forbindelsen med formel IV ved avspalting av den syrelabile esterbeskyttelsesgruppen Ri hhv. hvor X = NH med samtidig avspalting av den syrelabile beskyttelsesgruppen R under egnede sure betingelser i et egnet oppløsnings-middel, eventuelt under tilsetning av kationfangere til en forbindelse med formel V, hvor forbindelsen med formel IV hvor X = O eventuelt ytterligere behandlet med baser i vandig medium,
hvor
X og B' er som ovenfor definert, c) overfører forbindelsen med formel V med et egnet reagens i et egnet oppløs-ningsmiddel under anvendelse av en hjelpebase til forbindelsen med formel I og deretter eventuelt overfører dem til deres salter.
2.
Fremgangsmåte for fremstilling av substituerte N-etyl-glycinderivater med formel I ifølge krav 1, karakterisert ved atman a) omsetter en forbindelse med formel n,
hvor
R står for hydrogen eller, når X = NH, står for Boe, Ddz eller Tit og Ri står for tert.butyl eller (2-klorfenyl)difenylmetyl, og
X er som ovenfor definert,
med en forbindelse med formel HI,
hvor B' er som ovenfor definert,
ved romtemperatur, i DMF, acetonitril, diklormetan eller blandinger av disse oppløsningsmidler under anvendelse av karbodiimider, fosfoniumreagenser, uroniumreagenser, syrehalogenider eller aktiverte estere,
til en forbindelse med formel IV
hvor
R, X, B' og R<1> er som ovenfor definert, b) deretter overfører forbindelsen med formel IV ved avspalting av den syrelabile esterbeskyttelsesgruppen R<*> hhv. for X = NH ved samtidig avspalting av den syrelabile beskyttelsesgruppen R med trifluoreddiksyre i diklormetan, etylacetat eller dioksan eventuelt under tilsetning av anisol, tiofenol eller trietylsilan,
til en forbindelse med formel V,
hvor
X og B" er som ovenfor definert, og
hvor forbindelsene med formel IV hvor X = O eventuelt ytterligere blir behandlet med NaOH eller trietylamin i vandig medium, c) forbindelsen med formel V blir med t-Bumeoc-fluorid, Adpoc-azid, Bpoc-azid, Ddz-(fenyl)karbonat, Trt-Cl, Mtt-Cl, Mmt-Cl, Dmt-Cl eller piksyl-Cl i DNF, NMP, acetonitril, diklormetan eller blandinger av disse oppløsningsmidlene under anvendelse av NEM, DEPEA, pyridin, trietylamin, overført til forbindelsen med formel I og deretter eventuelt overført til deres salter.
3.
Fremgangsmåte for fremstilling av subsittuerte N-etyl-glycinderivater med formel I ifølge krav 2, karakterisert ved at i forbindelsen med formel II er R hydrogen eller, når X = NH, er den Boe og R<*> tert.butyl.
4.
Mellomprodukt, karakterisert ved at det har formel IV,
hvor
X står for NH eller O, B' står for i nukleotidkjemien vanlige baser, hvis eksocykliske amino- hhv.
hydroksygrupper er beskyttet av egnede kjente beskyttelsesgrupper,
R står for hydrogen eller, når X = NH, for tert-butyloksykarbonyl og R1 står for tert-butyl.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DE19532553A DE19532553A1 (de) | 1995-09-04 | 1995-09-04 | Verfahren zur Herstellung substituierter N-Ethyl-Glycinderivate |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| NO963677D0 NO963677D0 (no) | 1996-09-03 |
| NO963677L NO963677L (no) | 1997-03-05 |
| NO313833B1 true NO313833B1 (no) | 2002-12-09 |
Family
ID=7771182
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| NO19963677A NO313833B1 (no) | 1995-09-04 | 1996-09-03 | FremgangsmÕte for fremstilling av substituerte N-etyl- glycinderivater og mellomprodukter |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US5817811A (no) |
| EP (1) | EP0761681B1 (no) |
| JP (1) | JP3934708B2 (no) |
| AT (1) | ATE214398T1 (no) |
| AU (1) | AU708034B2 (no) |
| CA (1) | CA2184681C (no) |
| DE (2) | DE19532553A1 (no) |
| DK (1) | DK0761681T3 (no) |
| ES (1) | ES2173230T3 (no) |
| NO (1) | NO313833B1 (no) |
| PT (1) | PT761681E (no) |
Families Citing this family (18)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6710164B1 (en) | 1993-11-22 | 2004-03-23 | Peter E. Nielsen | Peptide nucleic acids having enhanced binding affinity, sequence specificity and solubility |
| US5855911A (en) * | 1995-08-29 | 1999-01-05 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Liposomal phosphodiester, phosphorothioate, and P-ethoxy oligonucleotides |
| US6043353A (en) * | 1995-12-22 | 2000-03-28 | University Technologies International, Inc. | Reusable solid support for oligonucleotide synthesis, process for production thereof and process for use thereof |
| ATE252109T1 (de) * | 1995-12-22 | 2003-11-15 | Univ Technologies Int | Kupplungsarm für festträger oligonukleotid- synthese und verfahren zur herstellung davon |
| AU717387B2 (en) * | 1996-07-24 | 2000-03-23 | Rolf H. Berg | Peptide nucleic acids having enhanced binding affinity, sequence specificity and solubility |
| US6977244B2 (en) * | 1996-10-04 | 2005-12-20 | Board Of Regents, The University Of Texas Systems | Inhibition of Bcl-2 protein expression by liposomal antisense oligodeoxynucleotides |
| DE19640974A1 (de) * | 1996-10-04 | 1998-04-16 | Bayer Ag | Bausteine für DNA/PNA-Cooligomere |
| DK0983290T3 (da) * | 1997-05-14 | 2004-06-14 | Morphochem Ag | Fremgangsmåde til fremstilling af polymerer, der har nukleobaser som sidegrupper |
| US7704962B1 (en) | 1997-10-03 | 2010-04-27 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Small oligonucleotides with anti-tumor activity |
| US7285288B1 (en) | 1997-10-03 | 2007-10-23 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Inhibition of Bcl-2 protein expression by liposomal antisense oligodeoxynucleotides |
| US7135564B1 (en) * | 1998-07-02 | 2006-11-14 | University Technologies International Inc. | Reusable solid support for oligonucleotide synthesis |
| WO2000002899A1 (en) | 1998-07-09 | 2000-01-20 | Biocept, Inc. | Method of using an improved peptide nucleic acid universal library to optimize dna sequence hybridation |
| US7125883B1 (en) * | 1999-04-13 | 2006-10-24 | Abbott Gmbh & Co. Kg | Integrin receptor ligands |
| DE60216468T2 (de) * | 2001-03-09 | 2007-09-27 | Boston Probes, Inc., Bedford | Kombinationsoligomere betreffende verfahren, kits und zusammensetzungen |
| US6541626B2 (en) * | 2001-04-17 | 2003-04-01 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Process for selective N-acylation of purine nucleosides |
| KR20030084444A (ko) * | 2002-04-26 | 2003-11-01 | 주식회사 파나진 | Ｐｎａ 올리고머를 합성하기 위한 신규한 단량체 및 그의제조방법 |
| WO2004048594A2 (en) | 2002-11-21 | 2004-06-10 | Epicentre Technologies | Preparation and use of single-stranded transcription substrates for synthesis of transcription products corresponding to target sequences |
| KR101354692B1 (ko) * | 2010-11-26 | 2014-02-06 | 서울대학교산학협력단 | 올리고머 및 그 제조 방법 |
Family Cites Families (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DE4408534A1 (de) * | 1994-03-14 | 1995-09-28 | Hoechst Ag | Substituierte N-Ethyl-Glycinderivate zur Herstellung von PNA und PNA-/DNA-Hybriden |
| DE4408528A1 (de) * | 1994-03-14 | 1995-09-28 | Hoechst Ag | Peptid-Oligonucleotid-Derivate, deren Herstellung und Verwendung |
| DE4421536A1 (de) * | 1994-06-20 | 1995-12-21 | Hoechst Ag | Perfluoralkylgruppen tragende phenylsubstituierte Alkenylcarbonsäure-guanidine, Verfahren zu ihrer Herstellung, ihre Verwendung als Medikament oder Diagnostikum sowie sie enthaltendes Medikament |
| EP0840741B1 (en) * | 1995-06-07 | 2004-04-28 | Perseptive Biosystems, Inc. | Pna-dna chimeras and pna synthons for their preparation |
-
1995
- 1995-09-04 DE DE19532553A patent/DE19532553A1/de not_active Withdrawn
-
1996
- 1996-08-22 ES ES96113530T patent/ES2173230T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1996-08-22 EP EP96113530A patent/EP0761681B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1996-08-22 AT AT96113530T patent/ATE214398T1/de active
- 1996-08-22 DK DK96113530T patent/DK0761681T3/da active
- 1996-08-22 DE DE59608867T patent/DE59608867D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1996-08-22 PT PT96113530T patent/PT761681E/pt unknown
- 1996-09-02 AU AU64408/96A patent/AU708034B2/en not_active Ceased
- 1996-09-03 US US08/707,149 patent/US5817811A/en not_active Expired - Lifetime
- 1996-09-03 NO NO19963677A patent/NO313833B1/no not_active IP Right Cessation
- 1996-09-03 CA CA002184681A patent/CA2184681C/en not_active Expired - Fee Related
- 1996-09-03 JP JP23269296A patent/JP3934708B2/ja not_active Expired - Fee Related
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| NO963677L (no) | 1997-03-05 |
| DE19532553A1 (de) | 1997-03-06 |
| CA2184681A1 (en) | 1997-03-05 |
| CA2184681C (en) | 2010-01-05 |
| DK0761681T3 (da) | 2002-07-08 |
| ATE214398T1 (de) | 2002-03-15 |
| US5817811A (en) | 1998-10-06 |
| DE59608867D1 (de) | 2002-04-18 |
| EP0761681A2 (de) | 1997-03-12 |
| JPH09124572A (ja) | 1997-05-13 |
| EP0761681A3 (de) | 1997-07-09 |
| EP0761681B1 (de) | 2002-03-13 |
| JP3934708B2 (ja) | 2007-06-20 |
| PT761681E (pt) | 2002-08-30 |
| ES2173230T3 (es) | 2002-10-16 |
| AU708034B2 (en) | 1999-07-29 |
| AU6440896A (en) | 1997-03-06 |
| NO963677D0 (no) | 1996-09-03 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| NO313833B1 (no) | FremgangsmÕte for fremstilling av substituerte N-etyl- glycinderivater og mellomprodukter | |
| US6046306A (en) | PNA synthesis using an amino protecting group which is labile to weak acids | |
| US5874553A (en) | Phosphonomonoester nucleic acids, process for their preparation, and their use | |
| US6713603B2 (en) | Chiral peptide nucleic acids | |
| US6075143A (en) | Substituted N-ethylglycine derivatives for preparing PNA and PNA/DNA hybrids | |
| EP0672701B1 (de) | PNA-Synthese unter Verwendung einer basenlabilen Amino-Schutzgruppe | |
| US6388061B1 (en) | Monomeric building blocks for labeling peptide nucleic acids | |
| DE19543865A1 (de) | Phosphonomonoesternukleinsäuren, Verfahren zu ihrer Herstellung und ihre Verwendung |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM1K | Lapsed by not paying the annual fees |