NL192116C - Beta-urogastron genes, corresponding recombinant plasmids, corresponding transformants and their preparation, and of beta-urogastron. - Google Patents

Beta-urogastron genes, corresponding recombinant plasmids, corresponding transformants and their preparation, and of beta-urogastron. Download PDF

Info

Publication number
NL192116C
NL192116C NL8501880A NL8501880A NL192116C NL 192116 C NL192116 C NL 192116C NL 8501880 A NL8501880 A NL 8501880A NL 8501880 A NL8501880 A NL 8501880A NL 192116 C NL192116 C NL 192116C
Authority
NL
Netherlands
Prior art keywords
gene
urogastron
plasmid
tac
atg
Prior art date
Application number
NL8501880A
Other languages
Dutch (nl)
Other versions
NL192116B (en
NL8501880A (en
Original Assignee
Earth Chemical Co
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Earth Chemical Co filed Critical Earth Chemical Co
Publication of NL8501880A publication Critical patent/NL8501880A/en
Publication of NL192116B publication Critical patent/NL192116B/en
Application granted granted Critical
Publication of NL192116C publication Critical patent/NL192116C/en

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/70Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
    • C12N15/73Expression systems using phage (lambda) regulatory sequences
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475Growth factors; Growth regulators
    • C07K14/485Epidermal growth factor [EGF] (urogastrone)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/61Fusion polypeptide containing an enzyme fusion for detection (lacZ, luciferase)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/70Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
    • C07K2319/74Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor
    • C07K2319/75Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor containing a fusion for activation of a cell surface receptor, e.g. thrombopoeitin, NPY and other peptide hormones

Description

1 192116 β-urogastron-genen, overeenkomstige recombinant-plasmiden, overeenkomstige transformanten en de bereiding ervan en van β-urogastron1 192116 β-urogastron genes, corresponding recombinant plasmids, corresponding transformants and their preparation and of β-urogastron

De onderhavige uitvinding heeft betrekking op nieuwe β-urogastron-genen, overeenkomstige recombinant-5 plasmiden, overeenkomstige transformanten en de bereiding ervan en van β-urogastron.The present invention relates to novel β-urogastron genes, corresponding recombinant-5 plasmids, corresponding transformants and their preparation, and of β-urogastron.

β-urogastron is een polypeptide-hormoon, dat gesynthetiseerd wordt in de speekselklieren van mensen, enz. (zie bijvoorbeeld Heitz et al., Gut, 19,408-413 (1978)), en dat een primaire structuur met 53 aminozuren in de volgende volgorde bezit (zie H. Gregory et al., Int. J. Peptide Protein Res., 9, 107-118 (1977)).β-urogastrone is a polypeptide hormone, which is synthesized in the salivary glands of humans, etc. (see, e.g., Heitz et al., Gut, 19,408-413 (1978)), and has a primary structure with 53 amino acids in the following order (see H. Gregory et al., Int. J. Peptide Protein Res., 9, 107-118 (1977)).

Asn Ser Asp Ser Glu Cys Pro Leu Ser His Asp 10 Gly Tyr Cys Leu His Asp Gly Val Cys Met Tyr lie Glu Ala Leu Asp Lys Tyr Ala Cys Asn Cys Val Val Gly Tyr He Gly Glu Arg Cys Gin Tyr Arg Asp Leu Lys Trp Trp Glu Leu Arg.Asn Ser Asp Ser Glu Cys Pro Leu Ser His Asp 10 Gly Tyr Cys Leu His Asp Gly Val Cys Met Tyr lie Glu Ala Leu Asp Lys Tyr Ala Cys Asn Cys Val Val Gly Tyr He Gly Glu Arg Cys Gin Tyr Arg Asp Leu Lys Trp Trp Glu Leu Arg.

In de beschrijving worden aminozuren weergegeven door de volgende symbolen.In the description, amino acids are represented by the following symbols.

15 Asn: asparagine Ser: serine15 Asn: Asparagine Ser: Serine

Asp: asparaginezuur Glu: glutaminezuurAsp: Aspartic Acid Glu: Glutamic Acid

Leu: leucine His: histidineLeu: leucine His: histidine

Gly: glycine Tyr: tyrosineGly: glycine Tyr: tyrosine

Val: valine Met: methionine 20 lie: isoleucine Ala: alanineVal: valine With: methionine 20 lie: isoleucine Ala: alanine

Lys: lysine Gin: glutamineLys: lysine Gin: glutamine

Arg: arginine Trp: tryptofaanArg: arginine Trp: tryptophan

Phe: fenylalanine Cys: cysteinePhe: phenylalanine Cys: cysteine

Pro: proline 25 β-urogastron bezit fysiologische activiteiten zoals het onderdrukken van de afscheiding van maagzuur en het bevorderen van celgroei (zie Elder et al., Gut, 16, 887-893 (1975)) en is derhalve nuttig voor het behandelen van zweren en wonden.Pro: proline 25 β-urogastron has physiological activities such as suppressing gastric acid secretion and promoting cell growth (see Elder et al., Gut, 16, 887-893 (1975)) and is therefore useful for treating ulcers and wounds.

Aangezien β-urogastron in kleine hoeveelheden uitgescheiden wordt in menselijke urine, werd de verbinding vroeger door extractie, scheiding en zuivering uit urine bereid. Deze methode heeft echter het 30 bezwaar, dat niet gemakkelijk grote hoeveelheden van de verbinding verkregen kunnen worden, omdat de verbinding een gering bestanddeel van menselijke urine is.Since β-urogastron is excreted in human urine in small amounts, the compound was previously prepared from urine by extraction, separation and purification. However, this method has the drawback that large amounts of the compound cannot be easily obtained because the compound is a minor constituent of human urine.

De Europese octrooiaanvrage nr. 0.046.039 beschrijft de bereiding van β-urogastron onder toepassing van een synthetisch β-urogastron-gen met een specifieke nudeotide-volgonde, doch openbaart niet of er andere genen zijn, die in staat zijn om β-urogastron tot expressie te brengen. De in deze publicatie 35 beschreven nucleotide-volgorde verschilt ter plaatse van 30 triplet-codons van de nucleotide-volgonde van het nieuwe synthetische β-urogastron-gen volgens de uitvinding.European patent application No. 0.046.039 describes the preparation of β-urogastron using a synthetic β-urogastron gene with a specific nudeotide sequence, but does not disclose whether there are other genes capable of producing β-urogastron express. The nucleotide sequence described in this publication differs at 30 triplet codons from the nucleotide sequence of the novel synthetic β-urogastrone gene of the invention.

WO-A-8.304.030 beschrijft twee nucleotide-volgorden van een synthetisch urogastron-gen, waarvan de eerste ter plaatse van 20 triplet-codons en de tweede ter plaatse van 28 triplet-codons van de nucleotide-volgorde volgens de onderhavige uitvinding verschilt.WO-A-830430 describes two nucleotide sequences of a synthetic urogastron gene, the first of which differs from 20 triplet codons and the second from 28 triplet codons from the nucleotide sequence of the present invention.

40 Proceedings of the National Academy of Sciences of USA, vol. 80, no. 24, december 1983, blz.40 Proceedings of the National Academy of Sciences of USA, vol. 80, No. 24, December 1983, p.

7461-7465 beschrijft een synthetisch urogastron-gen met een nucleotide-volgorde, die ter plaatse van 25 triplet-codons van de nucleotide-volgorde volgens de uitvinding verschilt.7461-7465 describes a synthetic urogastrone gene with a nucleotide sequence, which differs from the nucleotide sequence of the invention at 25 triplet codons.

Een groot aantal nucleotide-volgorden kan coderen voor de aminozuurvolgorde van β-urogastron. Niettemin is het moeilijk te voorspellen welke van dergelijke nucleotide-volgorden in staat is om β-urogastron 45 tot expressie te brengen door middel van genmanipulatie, of welk gen het meest geschikt is voor de toepassing van genmanipulatietechnieken. Dientengevolge zijn vele proeven en inventieve inspanningen vereist om de meest geschikte nucleotide-volgorde te bepalen.A large number of nucleotide sequences can encode the amino acid sequence of β-urogastron. Nevertheless, it is difficult to predict which such nucleotide sequences are capable of expressing β-urogastron 45 by gene manipulation, or which gene is most suitable for the application of gene manipulation techniques. As a result, many tests and inventive efforts are required to determine the most appropriate nucleotide sequence.

Een oogmerk van de onderhavige uitvinding is het verschaffen van een nieuw β-urogastron-gen, dat totaal verschillend is van de in de bovengenoemde publicaties beschreven genen met betrekking tot de 50 nucleotide-volgorde en in staat is om β-urogastron tot expressie te brengen door middel van genmanipulatie.An object of the present invention is to provide a novel β-urogastron gene, which is completely different from the genes described in the above publications with respect to the 50 nucleotide sequence and is capable of expressing β-urogastron through gene manipulation.

Een ander oogmerk van de onderhavige uitvinding is het verschaffen van nieuwe recombinant-plasmiden en transformanten overeenkomende met het nieuwe β-urogastron-gen.Another object of the present invention is to provide new recombinant plasmids and transformants corresponding to the new β-urogastrone gene.

Nog een ander oogmerk van de onderhavige uitvinding is het verschaffen van een werkwijze, die de productie van β-urogastron in grote hoeveelheden met een hoge zuiverheid mogelijk maakt met behulp van 55 het nieuwe gen door middel van genmanipulatie.Yet another object of the present invention is to provide a method which allows for the production of β-urogastron in high purity, high-volume production using the new gene by gene manipulation.

Deze en andere oogmerken van de onderhavige uitvinding zullen toegelicht worden in de volgende beschrijving.These and other objects of the present invention will be explained in the following description.

192116 2192116 2

Door aanvraagster zijn vele proeven uitgevoerd en is gevonden, dat een gen I met de volgende nucleotide-volgorde het mogelijk maakt om de oogmerken van de uitvinding te bereiken:Many tests have been carried out by the applicant and it has been found that a gene I with the following nucleotide sequence makes it possible to achieve the objects of the invention:

Gen I:Gen I:

5' AAT AGC GAT TCT GAG TGC CCA CTG5 'AAT AGC GAT TCT GAG TGC CCA CTG

5 3' TT A TCG CTA AGA CTC ACG GGT GAC5 3 'TT A TCG CTA AGA CTC ACG GGT GAC

TCT CAC GAT GGC TAT TGT CTG CACTCT CAC GAT GGC TAT TGT CTG CAC

AGA GTG CTA CCG ATA ACA GAC GTGAGA GTG CTA CCG ATA ACA GAC GTG

10 GAC GGT GTT TGC ATG TAC ATC GAA10 GAC GGT GTT TGC ATG TAC ATC GAA

CTG CCA CAA ACG TAC ATG TAG CTTCTG CCA CAA ACG TAC ATG TAG CTT

GCT TTG GAT A A A TAC GCG TGT AACGCT TTG GAT A A A TAC GCG TGT AAC

CGA AAC CTA TT T ATG CGC ACA TTGCGA AAC CTA TT T ATG CGC ACA TTG

1515

TGT GTA GTG GGT TAT ATC GGT GAATGT GTA GTG GGT TAT ATC GGT GAA

ACA CAT CAC CCA ATA TAG CCA CTTACA CAT CAC CCA ATA TAG CCA CTT

CGC TGT CAA TAC CGT GAT CTG A A ACGC TGT CAA TAC CGT GAT CTG A A A

20 GCG ACA GTT ATG GCA CTA GAC TTT20 GCG ACA GTT ATG GCA CTA GAC TTT

TGG TGG GAA TTG CGT 3' ACC ACC CTT AAC GCA 5'TGG TGG GAA TTG CGT 3 'ACC ACC CTT AAC GCA 5'

De letters geven de purine- of pyrimidine-basen aan, die de nucleotide-volgorde vormen. De hierin voor 25 de basen toegepaste symbolen zijn als volgt: A voor adenine, G voor guanine, C voor cytosine en T voor thymine.The letters indicate the purine or pyrimidine bases, which form the nucleotide sequence. The symbols used herein for the bases are as follows: A for adenine, G for guanine, C for cytosine and T for thymine.

Het gen I is volledig nieuw en ligt als zodanig niet voor de hand en wordt verkregen door bepaling van de specifieke nucleotide-volgorde uit een zeer groot aantal mogelijke nucleotide-volgorden. Aan de voor-en/of achterzijde van deze sequentie kunnen nog andere sequenties aanwezig zijn.Gene I is completely new and as such is not obvious and is obtained by determining the specific nucleotide sequence from a very large number of possible nucleotide sequences. Other sequences may be present at the front and / or back of this sequence.

30 Het gen I heeft de volgende eigenschappen: 1. β-urogastron kan zeer volledig tot expressie gebracht worden door genmanipulatietechnieken.Gene I has the following properties: 1. β-urogastron can be very fully expressed by gene manipulation techniques.

2. De trinucleotide-codons, die het gen I vormen, zijn alle aanvaardbaar voor de gastheercellen, in het bijzonder Escherichia coli (E.coli), dat gemakkelijk met zekerheid verkrijgbaar is, waardoor een hoge mate van expressie gewaarborgd wordt.2. The trinucleotide codons, which make up the gene I, are all acceptable to the host cells, in particular Escherichia coli (E.coli), which are readily available with certainty, ensuring a high degree of expression.

35 3. Specifieke herkenningsplaatsen van het restrictie-enzym zijn in het gen aanwezig en kunnen aan beide uiteinden ervan gevormd worden en naar wens gemanipuleerd worden ter vergemakkelijking van de koppeling met een ander gen en de opname in de plasmidevector.3. Specific recognition sites of the restriction enzyme are present in the gene and can be generated at either end thereof and manipulated as desired to facilitate coupling with another gene and incorporation into the plasmid vector.

4. Voor de bereiding van het gen I kunnen de samenstellende oligonucleotiden gekoppeld worden tot blokken en kunnen de blokken gemakkelijk naar wens tot ondereenheden gekoppeld worden, die in 40 hoofdzaak vrij zijn van ongewenste koppeling.4. For the preparation of the gene I, the constituent oligonucleotides can be linked into blocks and the blocks can be easily linked into subunits, which are substantially free of undesired coupling, as desired.

5. Bij het tot expressie brengen van β-urogastron als een gefuseerd eiwit zijn middelen beschikbaar, waardoor een niet noodzakelijk gedeelte gemakkelijk verwijderd kan worden ter verkrijging van het gewenste β-urogastron.5. When expressing β-urogastrone as a fused protein, means are available, whereby an unnecessary portion can be easily removed to obtain the desired β-urogastron.

Wanneer β-urogastron feitelijk met behulp van het gen I tot expressie gebracht moet worden, kunnen 45 herkenningsplaatsen van het restrictie-enzym aangebracht worden aan de voorzijde en/of de achterzijde van het gen met het oog op de koppeling met de promotor, Shine-Dalgamo-volgorde (hierna aangeduid als SD-volgorde), vector, enz. die nodig zijn voor de expressie. Voorts kan, indien noodzakelijk, een start-codon en/of een stop-codon respectievelijk aan de voorzijde en achterzijde van het gen aangebracht worden. De herkenningsplaatsen, het start-codon en het stop-codon zijn niet bijzonder beperkt, doch kunnen naar wens 50 gekozen worden.When β-urogastron is actually to be expressed using the gene I, 45 recognition sites of the restriction enzyme can be placed on the front and / or back of the gene for coupling to the promoter, Shine- Dalgamo sequence (hereinafter referred to as SD sequence), vector, etc. required for the expression. Furthermore, if necessary, a start codon and / or a stop codon can be placed on the front and back of the gene, respectively. The recognition sites, the start codon and the stop codon are not particularly limited, but can be selected as desired.

Hierna wordt een voorbeeld van een gen met een uitgebreide volgorde (hierna aangeduid als gen II) gegeven, dat een aan de voorzijde van het gen I aangebrachte restrictie-enzym-herkenningsplaats en een start-codon en een aan de achterzijde van het gen I aangebrachte stop-codon en restrictie-enzym-herkenningsplaats bevat, waarbij de plaatsen en codons in de vermelde volgorde zijn aangebracht, en het 55 gen II voorts andere restrictie-enzym-herkenningsplaatsen bevat.Below is an example of an extended sequence gene (hereinafter referred to as gene II) which has a restriction enzyme recognition site located at the front of gene I and a start codon and a gene coded at the back of gene I stop codon and restriction enzyme recognition site, wherein the sites and codons are arranged in the order listed, and the 55 gene II further contains other restriction enzyme recognition sites.

Gen II: 3 192116Gen II: 3 192116

Start codon -15 -1, 1_Start codon -15 -1, 1_

5- Iaat t I c g a a 1g a t c tgc atgJaat agc 5 3- G cl T TC T A g| ACG T A [c TTA TCG5- Iaat t I c g a a 1g a t c tgc atgJaat agc 5 3- G cl T TC T A g | ACG T A [c TTA TCG

E Ta Bg(S) Mb 10 20 30E Ta Bg (S) Mb 10 20 30

10 G I A T T C T GAG TGC CCA CTG TCT CAC10 G I A T T C T GAG TGC CCA CTG TCT CAC

C T A A~|g A CTC ACG GGT GAC AGA GTGC T A A ~ | g A CTC ACG GGT GAC AGA GTG

Hf 15 40 50Chapter 15 40 50

GAT GGC TAT TGT CTG CAC GAC GGTHOLE GGC TAT TGT CTG CAC GAC GGT

CTA CCG ATA ACA GAC GTG CTG CCACTA CCG ATA ACA GAC GTG CTG CCA

60 70 8060 70 80

20 GTT TGC ATG TAC AT |_C_G A Ia G C T T T G20 GTT TGC ATG TAC AT | _C_G A Ia G C T T T G

CAA ACG TAC ATG TA G cl TT CGA AACCAA ACG TAC ATG TA G cl TT CGA AAC

Ta Hd 25 90 100Ta Hd 25 90 100

GAT AAA TA l C G C G TGT AAC TGT GTAHOLE AAA TA l C G C G TGT AAC TGT GTA

CTA TTT ATG CGC ACA TTG ACA CATCTA TTT ATG CGC ACA TTG ACA CAT

30 (Th) 110 12030 (Th) 110 120

GTG GGT TAT ATC GGT GAA CGC TGTGTG GGT TAT ATC GGT GAA CGC TGT

CAC CCA ATA TAG CCA CTT GCG ACACAC CCA ATA TAG CCA CTT GCG ACA

35 130 140 15035 130 140 150

CAA TAC CGT I G A T C T G AAA TGG TGGCAA TAC CGT I G A T C T G AAA TGG TGG

GTT ATG GCA CTA G~j A C TTT ACC ACCGTT ATG GCA CTA G ~ j A C TTT ACC ACC

40 S40 S

Stop codon 160 _ _ 170Stop codon 160 _ _ 170

gIa A T T G CGT TAA TAG TGA aIg A T C TgIa A T T G CGT TAA TAG TGA aIg A T C T

45 C T T A Ale GCA ATT ATC ACT TCT A G Ia E Bg(S) G |_ 3' 50 C C T A G 5'45 C T T A Ale GCA ATT ATC ACT TCT A G Ia E Bg (S) G | _ 3 '50 C C T A G 5'

Ba 55 192116 4Ba 55 192116 4

De symbolen, die de restrictie-enzymen in de bovenstaande volgorde vertegenwoordigen, hebben de volgende betekenissen: E: EcoRI, Ta: TaqlThe symbols, which represent the restriction enzymes in the above order, have the following meanings: E: EcoRI, Ta: Taql

Bg: Bglll, S: Sau3AIBg: Bglll, S: Sau3AI

5 Mb-.Mboll, Hf: HinFI5 Mb-.Mboll, Hf: HinFI

Ba: BamHI, Hd: HindlllBa: BamHI, Hd: Hindlll

Ml: Mlul, Th: ThaiMl: Mlul, Th: Thai

Meer in het bijzonder ter illustratie kan de eerste ondereenheid een ondereenheid A met de voorste helft van het gen II en een restrictie-enzym (BamHI) herkenningsplaats aan de achterzijde ervan en de 10 laatstgenoemde ondereenheid een ondereenheid B met de achterste helft van het gen II met een restrictie-enzym (Hindlll) herkenningsplaats aan de voorzijde ervan zijn. Deze ondereenheden zijn hierna weergegeven.More specifically by way of illustration, the first subunit may have a subunit A with the front half of gene II and a restriction enzyme (BamHI) recognition site at the back thereof, and the latter subunit may have a subunit B with the back half of gene II. with a restriction enzyme (Hindlll) recognition site at the front thereof. These subunits are shown below.

Ondereenheid A:Subunit A:

5' AAT TCG AAG ATC TGC AT G AAT AGC5 'AAT TCG AAG ATC TGC AT G AAT AGC

15 3' GC TT C TAG ACG TAC TT A TCG15 3 'GC TT C TAG ACG TAC TT A TCG

GAT TCT GAG TGC CCA CTG TCT CACHOLE TCT GAG TGC CCA CTG TCT CAC

CTA AGA CTC ACG GGT GAC AGA GTGCTA AGA CTC ACG GGT GAC AGA GTG

20 GAT GGC TAT TGT CTG CAC GAC GGT20 HOLE GGC TAT TGT CTG CAC GAC GGT

CTA CCG ATA ACA GAC GTG CTG CCACTA CCG ATA ACA GAC GTG CTG CCA

GTT TGC ATG TAC ATC GAA GCT TCGGTT TGC ATG TAC ATC GAA GCT TCG

CAA ACG TAC ATG TAG CTT CGA AGCCAA ACG TAC ATG TAG CTT CGA AGC

25 3' CTA G 5'25 3 'CTA G 5'

Ondereenheid B:Subunit B:

5' AGCT TTG GAT A A A TAC GCG TGT5 'AGCT TTG GAT A A A TAC GCG TGT

30 3' AAC CTA TTT ATG CGC ACA30 3 'AAC CTA TTT ATG CGC ACA

AAC TGT GTA GTG GGT TAT ATC GGTAAC TGT GTA GTG GGT TAT ATC GGT

TTG ACA CAT CAC CCA ATA TAG CCATTG ACA CAT CAC CCA ATA TAG CCA

35 GAA CGC TGT CAA TAC CGT GAT CTG35 GAA CGC TGT CAA TAC CGT GAT CTG

CTT GCG ACA GTT ATG GCA CTA GACCTT GCG ACA GTT ATG GCA CTA GAC

A A A TGG TGG GAA TTG CGT TAA TAGA A A TGG TGG GAA TTG CGT TAA TAG

TTT ACC ACC CTT AAC GCA ATT ATCTTT ACC ACC CTT AAC GCA ATT ATC

40 TGA AGA TCT G 3' ACT TCT AGA CCT AG 5'40 TGA AGA TCT G 3 'ACT TCT AGA CCT AG 5'

De ondereenheden A en B worden bijvoorbeeld op de volgende wijze bereid. Oligonucleotiden met 11, 13 of 15 basen worden bereid (A-1 tot A-16 en B-1 tot B-16, d.w.z. 32 oligonucleotiden). Vervolgens worden 45 4 tot 6 van deze oligonucleotiden samengevoegd en tot blokken gekoppeld (blok 1 tot blok 7, d.w.z. 7 blokken). Deze oligonucleotiden en blokken zijn hierna weergegeven.Subunits A and B are prepared, for example, in the following manner. 11, 13 or 15 base oligonucleotides are prepared (A-1 to A-16 and B-1 to B-16, i.e., 32 oligonucleotides). Then, 4 to 6 of these oligonucleotides are pooled and linked into blocks (block 1 to block 7, i.e. 7 blocks). These oligonucleotides and blocks are shown below.

Blok 1: (A-1) (A-2) (A-3) 5' AATTCGAAGAT CTGCATGAATAGC GATTCT G AGTG 3' 50 3' GCTTCTAGACGTA CTTATCGCTAA GACTCACGGGTGA 5' (A-16) (A-15) (A-14)Block 1: (A-1) (A-2) (A-3) 5 'AATTCGAAGAT CTGCATGAATAGC GATTCT G AGTG 3' 50 3 'GCTTCTAGACGTA CTTATCGCTAA GACTCACGGGTGA 5' (A-16) (A-15) (A-14)

Blok 2: (A-4) (A-5) (A-6) 55 5' CCCACTGTCTCAC GATGGCTATTG TCTGCACGACGGT 3' 3' CAGAGTGCTAC CGATAACAGACGT GCTGCCACAAA 5' (A-13) (A-12) (A-11) 5 192116Block 2: (A-4) (A-5) (A-6) 55 5 'CCCACTGTCTCAC GATGGCTATTG TCTGCACGACGGT 3' 3 'CAGAGTGCTAC CGATAACAGACGT GCTGCCACAAA 5' (A-13) (A-12) (A-11) 5 192116

Blok 3: (A-7) (A-8) 5' GTTTGCATGTA CATCGAAGCTTCG 3' 5 3' CGTACATGTAGCT TCGAAGCCTAG 5' (A-10) (A-9)Block 3: (A-7) (A-8) 5 'GTTTGCATGTA CATCGAAGCTTCG 3' 5 3 'CGTACATGTAGCT TCGAAGCCTAG 5' (A-10) (A-9)

Blok 4: m (B-1) (B-2) 5' AGCTTTGGATA AATACGCGTGTAACT 3' 3' AACCTATTTATGC GCACATTGACACA 5' (B-16) (B-15)Block 4: m (B-1) (B-2) 5 'AGCTTTGGATA AATACGCGTGTAACT 3' 3 'AACCTATTTATGC GCACATTGACACA 5' (B-16) (B-15)

Blok5: (B-3) (B-4) 5' GTGTAGTGGGT TATATCGGTGAACGC 3' 3' TCACCAATATAG CCACTTGCGACAG 5' (B-14) (B-13)Block5: (B-3) (B-4) 5 'GTGTAGTGGGT TATATCGGTGAACGC 3' 3 'TCACCAATATAG CCACTTGCGACAG 5' (B-14) (B-13)

Blok 6: (B-5) (B-6) 5' TGTCAATACCG TGATCTGAAATGGTG 3' 3' TTATGGCACTAGA CTTTACCACCCTT 5' (B-12) (B-11)Block 6: (B-5) (B-6) 5 'TGTCAATACCG TGATCTGAAATGGTG 3' 3 'TTATGGCACTAGA CTTTACCACCCTT 5' (B-12) (B-11)

Blok?: (B-7) (B-8) 5' GGAATTGCGTT AATAGTGAAGATCTG 3' 3' AACGCAATTAT CA CTTCTAGACCTAG 5' (B-10) (B-9) 30 Vervolgens worden de blokken 1 t/m 3 samengekoppeld tot de ondereenheid A en worden de blokken 4 t/m 7 samengekoppeld tot de ondereenheid B.Block ?: (B-7) (B-8) 5 'GGAATTGCGTT AATAGTGAAGATCTG 3' 3 'AACGCAATTAT CA CTTCTAGACCTAG 5' (B-10) (B-9) 30 Then blocks 1 to 3 are linked together to form the subunit A and the blocks 4 to 7 are coupled together to the subunit B.

De onderhavige uitvinding zal nader beschreven worden aan de hand van de tekeningen en foto’s.The present invention will be described in more detail with reference to the drawings and photos.

Figuur 1 toont schematisch de synthese van een oligonucleotide volgens de vaste fase-methode; 35 figuur 2 toont een werkwijze voor het koppelen van oligonucleotiden A-1 t/m A-16 tot een ondereenheid A en het opnemen van de ondereenheid in een plasmide pBR322 afkomstig van E.coli ter verkrijging van een recombinant-plasmide pUG1; figuur 3 toont een soortgelijke werkwijze voor het bereiden van een recombinant-plasmide pl)G2 door opnemen van een ondereenheid B in een plasmide pBP322; 40 figuur 4 toont een werkwijze voor het bereiden van een recombinant-plasmide pUG3 uit pUG1 en pUG2; figuur 5 toont het resultaat verkregen door analyseren van de nucleotidevolgorde van oligonucleotide A-3 door tweedimensionale fractionering door elektroforese en homochromatografie; figuur 6 toont een werkwijze voor het bereiden van een recombinant-plasmide pGH37; figuur 7 toont een werkwijze voor het bereiden van een recombinant-plasmide pGH35; 45 figuur 3 toont een werkwijze voor het bereiden van een recombinant-plasmide pEK28; figuur 9 toont werkwijzen voor het bereiden van recombinant-plasmiden pUG102 tot pUG122 en recombinantplasmiden pUG103-E en pUG117-E; figuur 10 toont werkwijzen voor het bereiden van recombinant-plasmiden pBRH02 en pBRH03; figuur 11 toont een Mboll restrictie-schema van pUG3 met een H-fragment (179 b.p.), dat het onderha-50 vige β-urogastron-gen bevat; figuur 12 toont een werkwijze voor het bereiden van recombinant-plasmiden pUG2301 t/m pUH2303; figuur 13 toont een werkwijze voor het bereiden van recombinant-plasmiden pUG2101 t/m pUG2105; figuur 14 toont een werkwijze voor het bereiden van recombinant-plasmiden pUG2701 t/m pUG2703; figuur 15 toont een werkwijze voor het bereiden van recombinant-plasmiden pUG1102 en pUG1105; 55 figuur 16 toont een werkwijze voor het bereiden van een recombinant-plasmide pUG1004; figuur 17 toont een werkwijze voor het bereiden van een recombinant-plasmide pUGl201; figuur 18 toont een werkwijze voor het bereiden van een recombinant-plasmide pUG1301; en 192116 6 de foto’s 1 t/m 5 tonen respectievelijk analytische resultaten van nucleotide-volgorden van recombinant-plasmiden, die bijvoorbeeld verkregen zijn volgens de Maxam-Gilbert-methode.Figure 1 schematically shows the synthesis of an oligonucleotide by the solid phase method; Figure 2 shows a method of coupling oligonucleotides A-1 to A-16 to a subunit A and incorporating the subunit into a plasmid pBR322 from E.coli to obtain a recombinant plasmid pUG1; Figure 3 shows a similar method of preparing a recombinant plasmid p1) G2 by incorporating a subunit B into a plasmid pBP322; Figure 4 shows a method for preparing a recombinant plasmid pUG3 from pUG1 and pUG2; Figure 5 shows the result obtained by analyzing the nucleotide sequence of oligonucleotide A-3 by two-dimensional fractionation by electrophoresis and homochromatography; Figure 6 shows a method of preparing a recombinant plasmid pGH37; Figure 7 shows a method of preparing a recombinant plasmid pGH35; Figure 3 shows a method of preparing a recombinant plasmid pEK28; Figure 9 shows methods of preparing recombinant plasmids pUG102 to pUG122 and recombinant plasmids pUG103-E and pUG117-E; Figure 10 shows methods for preparing recombinant plasmids pBRH02 and pBRH03; Figure 11 shows a Mboll restriction scheme of pUG3 with an H fragment (179 b.p.) containing the present β-urogastrone gene; Figure 12 shows a method of preparing recombinant plasmids pUG2301 through pUH2303; Figure 13 shows a method for preparing recombinant plasmids pUG2101 through pUG2105; Figure 14 shows a method of preparing recombinant plasmids pUG2701 through pUG2703; Figure 15 shows a method of preparing recombinant plasmids pUG1102 and pUG1105; Figure 16 shows a method of preparing a recombinant plasmid pUG1004; Figure 17 shows a method of preparing a recombinant plasmid pUG1201; Figure 18 shows a method of preparing a recombinant plasmid pUG1301; and 192116 6 photos 1 to 5 respectively show analytical results of nucleotide sequences of recombinant plasmids obtained, for example, by the Maxam-Gilbert method.

Oe procedures voor het opbouwen van het gen II van de onderhavige uitvinding zijn als zodanig bekend. De 5 oligonucleotiden voor het opbouwen van het gen II kunnen volgens bekende methoden bereid worden, bijvoorbeeld door de vaste fase-methode, die hierna in het kort beschreven zal worden (zie bijvoorbeeld H. Ito et al., Nucleic Acids Research, 10,1755-1769 (1982)).The procedures for building the gene II of the present invention are known per se. The 5 oligonucleotides for building the gene II can be prepared by known methods, for example, by the solid phase method, which will be briefly described below (see, e.g., H. Ito et al., Nucleic Acids Research, 10.1755 -1769 (1982)).

Wanneer gebruik gemaakt wordt van de vaste fase-methode, wordt het oligonucleotide zoals weergegeven in figuur 1 bereid door achtereenvolgens koppelen van mononucleotiden of dinudeotiden met een op 10 polystyreenhars gedragen nucleoside ter verkrijging van een vooraf bepaalde volgorde van nucleotiden.When using the solid phase method, the oligonucleotide as shown in Figure 1 is prepared by sequentially coupling mononucleotides or dinudeotides with a nucleoside supported on polystyrene resin to obtain a predetermined sequence of nucleotides.

Het hars voor het ondersteunen van het nucleoside kan bijvoorbeeld bereid worden met behulp van een gedeeltelijk verknoopt polystyreenhars door N-(chloormethyl)-ftaalimide met het hars te laten reageren, hydrazine met het product te laten reageren ter verkrijging van aminomethylgroepen bevattend polystyreenhars en aan de aminogroep ervan een nucleoside met de 5'-hydroxylgroep in vrije vorm en de aminogroep 15 beschermd te binden onder toepassing van bamsteenzuur als afstandhouder.For example, the resin for supporting the nucleoside can be prepared using a partially cross-linked polystyrene resin by reacting N- (chloromethyl) phthalimide with the resin, reacting hydrazine with the product to obtain aminomethyl-containing polystyrene resin, and amino group thereof to bind a nucleoside with the 5'-hydroxyl group in free form and the amino group 15 protected using succinic acid as spacer.

Anderzijds zijn verschillende werkwijzen voor de bereiding van mononucleotiden of dinudeotiden bekend (zie bijvoorbeeld C. Broka et al., Nucleic Adds Research, 8, 5461-5471 (1980)). Bijvoorbeeld kan een mononucleotide bereid worden door laten reageren van o-chloorfenylfosfordichloridaat, triazool en een nucleoside, waarvan de 5'-hydroxylgroep beschermd is met een dimethoxytritylgroep (DMTr) in aanwezig-20 heid van triethylamine, waarna men het verkregen monotriazolide laat reageren met β-cyaanethanol in aanwezigheid van 1 -methylimidazool als katalysator en het reactieproduct elueert met chloroform-methanol door kolomchromatografie op silicagel. Deze werkwijze levert een volledig beschermd mononucleotide.On the other hand, various methods of preparing mononucleotides or dinudeotides are known (see, e.g., C. Broka et al., Nucleic Adds Research, 8, 5461-5471 (1980)). For example, a mononucleotide can be prepared by reacting o-chlorophenylphosphorodichloridate, triazole and a nucleoside, the 5'-hydroxyl group of which is protected with a dimethoxytrityl group (DMTr) in the presence of triethylamine, and the resulting monotriazolide is reacted with β cyanoethanol in the presence of 1-methylimidazole as a catalyst and the reaction product elutes with chloroform-methanol by column chromatography over silica gel. This method produces a fully protected mononucleotide.

Een dinucleotide kan bereid worden door het hieiboven verkregen volledig beschermde mononucleotide te behandelen met benzeensulfonzuur of een soortgelijk zuur ter verkrijging van het mononucleotide met 25 een vrije 5'-hydroxylgroep, dat men laat reageren met het eerder verkregen monotriazolide, en het reactieproduct te elueren met chloroform-methanol door kolomchromatografie op silicagel. Deze werkwijze levert een volledig beschermd dinucleotide.A dinucleotide can be prepared by treating the fully protected mononucleotide obtained above with benzenesulfonic acid or a similar acid to obtain the mononucleotide with a free 5'-hydroxyl group, which is reacted with the previously obtained monotriazolide, and eluting the reaction product with chloroform-methanol by column chromatography on silica gel. This method produces a fully protected dinucleotide.

De synthese van oligonucleotiden in vaste fase wordt met voordeel uitgevoerd onder toepassing van een DNA-synthesemiddel, dat bijvoorbeeld als DNA-synthesemiddel verkrijgbaar is bij Bachem Inc., U.S.A. Het 30 hierboven verkregen nudeoside-ondersteunende hars wordt in een reactievat gebracht en met dichloormethaan-isopropanol gewassen, en een oplossing van zinkbromide in dichloormethaan-isopropanol wordt toegevoegd aan het hars om de dimethoxytritylgroep op de 5'-plaats te verwijderen. Deze procedure wordt verscheidene malen herhaald tot de kleur van de oplossing verdwijnt. Het hars wordt gewassen met dichloormethaan-isopropanol en vervolgens met een oplossing van triethylammoniumacetaat in dimethylfor-35 mamide ter verwijdering van het resterende Zn2*, en daarna gewassen met tetrahydnofuran en gedurende verscheidene minuten blootgesteld aan een stroom stikstofgas om het te drogen. Afzonderlijk wordt het volledig beschermde dinucleotide of mononucleotide opgelost in pyridine gevolgd door toevoeging van triethylamine en wordt de verkregen oplossing geschud, waarna men hem gedurende verscheidene uren bij kamertemperatuur laat staan en vervolgens onder verminderde druk indampt. Het verkregen triethyl-40 ammoniumzout wordt opgelost in pyridine en verscheidene malen met behulp van pyridine azeotropisch ingedampt om het te drogen. Het nucleotidezout wordt opgelost in een oplossing van mesityleensulfonyl-5-nitrotriazool (MSNT, condensatiemiddel) in pyridine. Men voegt de verkregen oplossing toe aan het gedroogde hars en laat bij kamertemperatuur staan. Men verwijdert het vloeibare gedeelte van het reactiemengsel en wast het harsgedeelte met pyridine en laat het vervolgens reageren met azijnzuuranhy-45 dride onder toepassing van methylaminopyridine als katalysator in tetrahydrofuran-pyridine om de niet omgezette hydroxylgroep te maskeren. Tenslotte wordt het hars met pyridine gewassen om één cyclus van de vaste fase-synthese te voltooien. Door één cyclus wordt de nucleotidevolgorde met een of twee ketenlengten verlengd. De bovenstaande procedure wordt herhaald om achtereenvolgens mononucleotiden of dinudeotiden met het hars te koppelen tot de gewenste lengte, waardoor een op het hars gedragen 50 volledig beschermd oligonucleotide verkregen kan worden.The synthesis of solid phase oligonucleotides is advantageously performed using a DNA synthesizer, which is available, for example, as a DNA synthesizer from Bachem Inc., U.S.A. The nudeoside supporting resin obtained above is placed in a reaction vessel and washed with dichloromethane isopropanol, and a solution of zinc bromide in dichloromethane isopropanol is added to the resin to remove the dimethoxytrityl group at the 5 'position. This procedure is repeated several times until the color of the solution disappears. The resin is washed with dichloromethane-isopropanol and then with a solution of triethylammonium acetate in dimethylfor-35 mamide to remove the remaining Zn2 *, then washed with tetrahydnofuran and exposed to a stream of nitrogen gas for several minutes to dry it. Separately, the fully protected dinucleotide or mononucleotide is dissolved in pyridine followed by addition of triethylamine and the resulting solution is shaken, left to stand at room temperature for several hours and then evaporated under reduced pressure. The resulting triethyl-40 ammonium salt is dissolved in pyridine and azeotroped several times with pyridine to dry it. The nucleotide salt is dissolved in a solution of mesitylene sulfonyl-5-nitrotriazole (MSNT, condensing agent) in pyridine. The resulting solution is added to the dried resin and left to stand at room temperature. The liquid portion of the reaction mixture is removed and the resin portion is washed with pyridine and then reacted with acetic anhydride using methyl aminopyridine as a catalyst in tetrahydrofuran pyridine to mask the unreacted hydroxyl group. Finally, the resin is washed with pyridine to complete one cycle of the solid phase synthesis. One cycle extends the nucleotide sequence by one or two chain lengths. The above procedure is repeated to successively couple mononucleotides or dinudeotides to the resin to the desired length, thereby obtaining a fully protected oligonucleotide supported on the resin.

Aan het verkregen hars wordt een oplossing van tetramethylguanidine-2-pyridinealdoximaat in pyridine-water toegevoegd en men laat het mengsel onder verwarming staan. Vervolgens wordt het hars afgefiltreerd en afwisselend met pyridine en ethanol gewassen. De wasvloeistoffen en het filtraat worden samengevoegd en onder verminderde druk geconcentreerd. Het concentraat wordt opgelost in een waterige oplossing van 55 triethylammoniumbicarbonaat (TEAB) gevolgd door wassen met ether. De waterige oplossing wordt onderworpen aan Sephadex G-50-kolomchromatografie onder toepassing van een TEAB-oplossing ais elutiemiddel. De fracties worden verzameld en de optische dichtheid van elke fractie wordt bij 260 nm 7 192116 bepaald. Een fractie met eerste elutiepiek wordt geconcentreerd. Het concentraat wordt gezuiverd, bijvoorbeeld door snelle vloeistofchromatografie, tot een enkele piek wordt verkregen. Het aldus verkregen oligonucleotide is op de 5'-plaats nog steeds beschermd door eéri dimethoxytritylgroep, zodat het product behandeld wordt met een waterige oplossing van azijnzuur ter verwijdering van de beschermende groep, 5 opnieuw gevolgd door snelle vloeistofchromatografie of dergelijke voor de zuivering tot een enkele piek wordt verkregen.A solution of tetramethylguanidine-2-pyridine aldoximate in pyridine water is added to the resulting resin and the mixture is allowed to stand under heating. The resin is then filtered off and washed alternately with pyridine and ethanol. The washings and the filtrate are combined and concentrated under reduced pressure. The concentrate is dissolved in an aqueous solution of 55 triethyl ammonium bicarbonate (TEAB) followed by washing with ether. The aqueous solution is subjected to Sephadex G-50 column chromatography using a TEAB solution as an eluent. The fractions are collected and the optical density of each fraction is determined at 260 nm 7 192116. A fraction with first elution peak is concentrated. The concentrate is purified, for example, by rapid liquid chromatography, until a single peak is obtained. The oligonucleotide thus obtained is still protected in the 5 'position by a dimethoxytrityl group, so that the product is treated with an aqueous solution of acetic acid to remove the protecting group, followed again by rapid liquid chromatography or the like for purification into a single peak is obtained.

De gewenste oligonucleotiden worden volgens de bovenbeschreven werkwijze bereid en vervolgens afzonderlijk onderzocht met betrekking tot de nucleotidevolgorde door middel van een tweedimensionale fractioneringsmethode onder toepassing van elektroforese en homochromatografie en (of) de Maxarrt-10 Gilbert-methode en daarna toegepast voor de bereiding van de blokken en ondereenheden.The desired oligonucleotides are prepared according to the method described above and then individually examined for the nucleotide sequence by a two-dimensional fractionation method using electrophoresis and homochromatography and (or) the Maxarrt-10 Gilbert method and then used to prepare the blocks and subunits.

De tweedimensionale fractioneringsmethode voor het bepalen van nucleotidevolgorde kan uitgevoerd worden volgens de methode van Wu et al. (E. Jay, R.A. Bambara, R. Padmanabhan en R. Wu, Nucleic Acids Res., 1, 331 (1974)).The two-dimensional fractionation method for determining nucleotide sequence can be performed according to the method of Wu et al. (E. Jay, R.A. Bambara, R. Padmanabhan and R. Wu, Nucleic Acids Res., 1, 331 (1974)).

Voor de uitvoering van deze methode wordt het oligonucleotide in gevriesdroogde toestand opgelost in 15 gedestilleerd water tot een concentratie van ongeveer 0.1 pg/μΙ. Een gedeelte van deze oplossing wordt behandeld met γ-32Ρ-ΑΤΡ en T4 polynucleotidekinase om het 5'-uiteinde te merken met 32P en vervolgens gedeeltelijk gedigereerd met slangengif-fosfordiesterase. Het product wordt op een cellulose-acetaatfilm gedruppeld en onderworpen aan elektroforese voor de eerste dimensionale ontwikkeling ter scheiding van het product aan de hand van het verschil in de basen. De ontwikkelde producten worden dan overgebracht 20 op een diethylaminoethylcellulose (DEAE cellulose) plaat en onderworpen aan de tweede dimensionale ontwikkeling onder toepassing van een oplossing van gedeeltelijk gehydrolyseerd RNA, homomengsel genaamd. (Deze procedure wordt homochromatografie genoemd.) Aldus wordt het oligonucleotide overeenkomstig de ketenlengte gescheiden. Vervolgens wordt de nucleotidevolgorde van het oligonucleotide vanaf het 5'-einde autoradiografisch bepaald.For the performance of this method, the oligonucleotide is dissolved in freeze-dried state in distilled water to a concentration of about 0.1 pg / μΙ. A portion of this solution is treated with γ-32Ρ-ΑΤΡ and T4 polynucleotide kinase to label the 5 'end with 32P and then partially digested with snake venom phosphodiesterase. The product is dripped onto a cellulose acetate film and subjected to first dimensional development electrophoresis to separate the product from the difference in bases. The developed products are then transferred to a diethylaminoethyl cellulose (DEAE cellulose) plate and subjected to the second dimensional development using a solution of partially hydrolysed RNA called homomix. (This procedure is called homochromatography.) Thus, the oligonucleotide is separated according to the chain length. The nucleotide sequence of the oligonucleotide is then determined from the 5 'end by autoradiography.

25 Wanneer het moeilijk is om de volgorde door deze methode te bepalen, wordt indien noodzakelijk gebruik gemaakt van de Maxam-Gilbert-methode. (A.M. Maxam and W. Gilbert, Proc. Natl. Acad. Set., USA, 74, 560 (1977), A.M. Maxam en W. Gilbert, Methods in Enzymol., Vol 65, blz. 499, Academie Press 1980.25 When it is difficult to determine the sequence by this method, the Maxam-Gilbert method is used if necessary. (A.M. Maxam and W. Gilbert, Proc. Natl. Acad. Set., USA, 74, 560 (1977), A.M. Maxam and W. Gilbert, Methods in Enzymol., Vol 65, p. 499, Academy Press 1980.

Deze methode, die eveneens een chemische ontledingsmethode wordt genoemd, maakt gebruik van een door een bepaalde base specifieke reactie om het oligonucleotide te splitsen op de plaats van de base, en 30 de door elektroforese getoonde banden dienen om de volgorde vanaf het 5'- of 3'-einde te bepalen. De voor de base specifieke reacties zijn als volgt. Guanine wordt specifiek cemethyleerd door dimethylsulfaat. Guanine en adenine ondergaan een depurineringsreactie in de aanwezigheid van een zuur. Thymine en cytosine reageren beide met hydrazine in een lage zoutconcentratie, doch cytosine reageert alleen met hydrazine in een hoge zoutconcentratie. Na de voltooiing van de reacties voor de vier basen laat men elk 35 reactiemengsel reageren met piperidine om de base, waar de ring geopend is, te vervangen, en de β-eliminatie van beide fosfaten uit de suiker te katalyseren, en ten slotte wordt de DNA-streng bij deze base gesplitst. De verkregen reactiemengsels worden respectievelijk onderworpen aan elektroforese met polyacrylamidegel om de nucleotidevolgorde vast te stellen afhankelijk van welke van de reacties elke band produceerde.This method, also referred to as a chemical decomposition method, uses a particular base-specific reaction to cleave the oligonucleotide at the site of the base, and the bands shown by electrophoresis serve to sequence from 5 'or 3 'end to be determined. The base specific reactions are as follows. Guanine is specifically methylated by dimethyl sulfate. Guanine and adenine undergo a depurination reaction in the presence of an acid. Thymine and cytosine both react with hydrazine in a low salt concentration, but cytosine only reacts with hydrazine in a high salt concentration. After the completion of the reactions for the four bases, each reaction mixture is reacted with piperidine to replace the base where the ring is opened, and to catalyze the β-elimination of both phosphates from the sugar, and finally the DNA strand spliced at this base. The resulting reaction mixtures are respectively subjected to polyacrylamide gel electrophoresis to determine the nucleotide sequence depending on which of the reactions each band produced.

40 Vervolgens worden de oligonucleotiden gekoppeld met behulp van een T4 DNA ligase zoals weergegeven in figuur 2. Voor de juiste koppeling worden de 16 oligonucleotiden A-1 t/m A-16 overeenkomende met de ondereenheid A verdeeld in drie stellen, d.w.z. het blok 1 met A-1, A-2, A-3, A-14, A-15 en A-16, het blok 2 met A-4, A-5, A-6, A-11, A-12 en A-13, en het blok 3 met A-7, A-8, A-9 en A-10 zoals weergegeven in figuur 2 gekoppeld. Door elektroforese worden de blokken 1 t/m 3 met de juiste volgorden verkregen en 45 voorts gekoppeld tot de ondereenheid A.40 Next, the oligonucleotides are coupled using a T4 DNA ligase as shown in figure 2. For proper coupling, the 16 oligonucleotides A-1 to A-16 corresponding to the subunit A are divided into three sets, ie the block 1 with A-1, A-2, A-3, A-14, A-15 and A-16, block 2 with A-4, A-5, A-6, A-11, A-12 and A -13, and the block 3 coupled with A-7, A-8, A-9 and A-10 as shown in Figure 2. By electrophoresis, blocks 1 to 3 are obtained with the correct sequences and 45 are further coupled to the subunit A.

Meer in het bijzonder worden sommige van de 5'-einden van de 16 oligonucleotiden A-1 t/m A-16 gemerkt met 32P met behulp van γ-32Ρ-ΑΤΡ en T4 polynucleotidekinase en worden de hydroxylgroepen van de resterende 5'-einden gefosforyleerd met ATP. Ter vorming van elk van de drie blokken worden de oligonucleotiden verenigd en gekoppeld met behulp van T4 DNA ligase, en het product wordt onderworpen 50 aan elektroforese op polyacrylamidegel om het gewenste blok te isoleren. De aldus verkregen drie btokken worden gekoppeld met behulp van T4 DNA ligase ter vorming van de ondereenheid A. Hoewel een dimeerstructuur gevormd kan worden bij de koppelingsreactie, wordt deze gemakkelijk gesplitst met de restrictie-enzymen EcoRI en BamHI ter verkrijging van de ondereenheid A. Vervolgens wordt, zoals weergegeven in figuur 2, een bekende plasmidevector, pBR322, die afkomstig is van E.coli en gemakkelijk 55 verkrijgbaar is, gesplitst met EcoRI en BamHI en wordt de ondereenheid A opgenomen in de vector ter verkrijging van een recombinant-plasmide pUG1.More specifically, some of the 5 'ends of the 16 oligonucleotides A-1 to A-16 are labeled with 32P using γ-32Ρ-ΑΤΡ and T4 polynucleotide kinase and the hydroxyl groups of the remaining 5' ends phosphorylated with ATP. To form each of the three blocks, the oligonucleotides are combined and coupled using T4 DNA ligase, and the product is subjected to polyacrylamide gel electrophoresis to isolate the desired block. The three btocks thus obtained are coupled using T4 DNA ligase to form the subunit A. Although a dimer structure can be formed in the coupling reaction, it is easily cleaved with the restriction enzymes EcoRI and BamHI to obtain the subunit A. Then As shown in Figure 2, a known plasmid vector, pBR322, which is from E. coli and is readily available 55, is cleaved with EcoRI and BamHI and Subunit A is included in the vector to obtain a recombinant plasmid pUG1.

Dezelfde procedure als hieivoor wordt eveneens toegepast voor de ondereenheid B. Evenals in tiet geval 192116 8 van de ondereenheid A worden de 16 oligonucleotiden B-1 t/m B-16 verdeeld in vier stellen zoals weergegeven in figuur 3 gekoppeld en worden de blokken samengekoppeld ter vorming van ondereenheid B. Het dimeer, indien gevormd, wordt gesplitst met de restrictie-enzymen Hindlll en BamHI ter verkrijging van de ondereenheid B. Een plasmidevector, pBR322, wordt gesplitst met Hindlll en BamHI en de ondereenheid B 5 wordt in de vector opgenomen ter verkrijging van een recombinant-plasmide pUG2 zoals weergegeven in figuur 3.The same procedure as hivivore is also applied for the subunit B. As in the case of 192116 8 of the subunit A, the 16 oligonucleotides B-1 to B-16 are divided into four pairs as shown in figure 3 coupled and the blocks are coupled together to form subunit B. The dimer, if formed, is cleaved with the restriction enzymes Hindlll and BamHI to obtain the subunit B. A plasmid vector, pBR322, is cleaved with Hindlll and BamHI and the subunit B5 is included in the vector to obtain a recombinant plasmid pUG2 as shown in Figure 3.

Voorts wordt, zoals weergegeven in figuur 4, pUG1 gesplitst met restrictie-enzymen Hindlll en Sail en wordt een met behulp van dezelfde restrictie-enzymen uit pUG2 verwijderd fragment opgenomen in pUG1 ter vorming van een recombinant-plasmide pUG3 met een β-urogastron-stmctureel gen (gen II).Furthermore, as shown in Figure 4, pUG1 is cleaved with restriction enzymes Hindlll and Sail and a fragment removed from pUG2 using the same restriction enzymes is incorporated into pUG1 to form a recombinant plasmid pUG3 with a β-urogastrone structure. gene (gene II).

10 pUG1, pUG2 en pUG3 zijn recombinant-plasmiden, die elk pBR322 en de ondereenheid A, die de voorste helft van het β-urogastron-structurele gen is, de ondereenheid B, die de achterste helft van het gen is, of het gehele structurele gen bevatten. Deze recombinant-plasmiden kunnen in grote hoeveelheden vermenigvuldigd worden door ze in een gastheer op te nemen zoals de stam HB101 van E.coli, die bekend en gemakkelijk verkrijgbaar is volgens de calciummethode als transformatiemethode (E. Lederberg and S.PUG1, pUG2 and pUG3 are recombinant plasmids, each of which is pBR322 and the subunit A, which is the front half of the β-urogastron structural gene, the subunit B, which is the back half of the gene, or all of the structural gene. These recombinant plasmids can be multiplied in large quantities by incorporating them into a host such as the E. coli strain HB101, which is known and readily available by the calcium method as transformation method (E. Lederberg and S.

15 Cohen, J. Bacteriol., 119, 1072 (1974)).Cohen, J. Bacteriol., 119, 1072 (1974)).

Of pUG1, pUG2 en pUG3 aanwezig zijn in de gastheer, zoals de stam HB101 van E.coli, kan door de volgende methoden nagegaan worden. Nadat de plasmiden verzameld zijn door de alkalische extractiemethode, worden pUG1 en pUG2 gecontroleerd op de aanwezigheid van de Bglll herkenningsplaats, die niet aanwezig is in de vector pBR322. Op soortgelijke wijze worden pUG2 en pUG3 erop gecontroleerd, of 20 ze afgesplitst kunnen worden met Mlul, dat niet aanwezig is in pBR322.Whether pUG1, pUG2 and pUG3 are present in the host, such as E.coli strain HB101, can be determined by the following methods. After the plasmids are collected by the alkaline extraction method, pUG1 and pUG2 are checked for the presence of the BglII recognition site, which is not present in the vector pBR322. Similarly, pUG2 and pUG3 are checked for whether they can be cleaved with Mlul, which is not present in pBR322.

Volgens de alkalische extractiemethode wordt E.coli, waarin het plasmide is gehuisvest, geïncubeerd, waarna de cellen verzameld worden en men er lysozym op laat inwerken om de celwand op te lossen. Een mengsel van natriumhydroxide en natriumlaurylsulfaat wordt toegepast om de cel te verbreken en het DNA vervolgens te denatureren, dat dan geneutraliseerd wordt met natriumacetaatbuffer. Hierbij blijft het 25 chromosoom-DNA gedenatureerd, doch hij krijgt het plasmide, dat een niet uit chromosomen afkomstig DNA is, de oorspronkelijke dubbele streng-vorm. Plasmiden worden verzameld door gebruikte maken van deze eigenschappen. De plasmiden worden voorts onderworpen aan ultracentrifugeren met een dichtheids-gradiënt met cesiumchloride en ethidiumbromide ter zuivering en vervolgens door een biogel A 50m kolom geleid om RNA te verwijderen. Zo kunnen plasmiden met een hoge zuiverheid in een grote hoeveelheid 30 verkregen worden. Op deze wijze kan het β-urogastron-gen van de uitvinding (gen II) verkregen worden.According to the alkaline extraction method, E. coli, in which the plasmid is housed, is incubated, after which the cells are collected and lysozyme is allowed to act to dissolve the cell wall. A mixture of sodium hydroxide and sodium lauryl sulfate is used to break the cell and then denature the DNA, which is then neutralized with sodium acetate buffer. Hereby, the chromosome DNA remains denatured, but it acquires the plasmid, which is a non-chromosome DNA, in its original double strand form. Plasmids are collected using these properties. The plasmids are further subjected to ultracentrifugation with a density gradient with cesium chloride and ethidium bromide for purification and then passed through a biogel A 50m column to remove RNA. For example, high purity plasmids can be obtained in a large amount. In this way, the β-urogastrone gene of the invention (gene II) can be obtained.

Vervolgens zal de methode voor het opnemen van het β-urogastron-gen in gastheercellen beschreven worden.Next, the method of incorporating the β-urogastrone gene into host cells will be described.

De bij de onderhavige uitvinding toe te passen gastheercellen zijn niet bijzonder beperkt en elk van de bekende cellen is bruikbaar, bijvoorbeeld die van E.coli, Bacillus, Pseudomonas, gisten, enz., waarvan de 35 voorkeur wordt gegeven aan E.coli-cellen.The host cells to be used in the present invention are not particularly limited and any of the known cells are useful, for example, those of E.coli, Bacillus, Pseudomonas, yeasts, etc., of which E.coli cells are preferred .

De wijzen voor het tot expressie brengen van het β-urogastron-gen met behulp van E.coli omvat een systeem voor het direct exprimeren van β-urogastron, en een systeem, waarin het geëxprimeerd wordt als een gefuseerd eiwit met β-lactamase of een ander eiwit.The ways of expressing the β-urogastron gene using E.coli includes a system for directly expressing β-urogastron, and a system in which it is expressed as a fused protein with β-lactamase or a other protein.

Voor de directe expressie van β-urogastron-gen is het nodig om bovenstrooms van het β-urogastron-gen 40 een promotor en een SD-volgorde in het recombinant-plasmide op te nemen. Omdat de promotor niet bijzonder beperkt is, zijn gewenste promotoren degene, die een hoge mate van expressie waarborgen, zoals XPL, dat de linkse promotor van γ-bacteriofaag is, lac UV5, dat bovenstrooms van β-galactosidase-gen van E.coli aanwezig is, enz. Wanneer XPL toegepast wordt als promotor, is de SD-volgorde niet bijzonder beperkt, doch het is gewenst om de vier-basen-volgorde van AGGA toe te passen. Voorts is het bij 45 toepassing van LAC UV5 als promotor gewenst om de SD-volgorde toe te passen, die bovenstrooms van de LAC UV5 promotor optreedt, of degene, die chemisch gesynthetiseerd is.For the direct expression of β-urogastron gene, it is necessary to include a promoter and an SD sequence upstream of the β-urogastron gene 40 in the recombinant plasmid. Because the promoter is not particularly limited, desirable promoters are those that ensure a high level of expression, such as XPL, which is the left promoter of γ bacteriophage, lac UV5, which is present upstream of β-galactosidase gene from E.coli. , etc. When XPL is used as a promoter, the SD sequence is not particularly limited, but it is desirable to use the four base sequence of AGGA. Furthermore, when using LAC UV5 as a promoter, it is desirable to use the SD sequence occurring upstream of the LAC UV5 promoter, or the one that is chemically synthesized.

Het systeem voor directe expressie van het β-urogastron-gen zal beschreven worden aan de hand van het geval, waarin XPL-SD volgorde^-urogastron-gen wordt toegepast. Hoewel λΡ,. een krachtige promotor is (J. Hedgpeth et al., Molecular and General Genetics, 163,197-203 (1978)) veroorzaakt de volledig 50 geactiveerde λΡ^ρΓοπιοίοΓ iethale uitwerkingen op de E.coli gastheercel, zodat het noodzakelijk is om de cel onder een van elke Iethale werking vrije omstandigheid te vermenigvuldigen en daarna de XPL te laten werken. Anderzijds is CI857, dat een gen in λ bacteriofaag is, een van de gemuteerde genen van Cl repressor, die inwerkt op de operator voor λΡί. Bij lage temperaturen (tot ongeveer 30°C) bindt de CI857 repressor zich aan de operator, waardoor de activiteit van λΡί als promotor volledig geremd wordt, en 55 dientengevolge de vermenigvuldiging van E.coli mogelijk gemaakt wordt. Dientengevolge laat men de gastheercellen zich in deze toestand vermenigvuldigen en brengt ze daarna op een hoge temperatuur (niet lager dan 37°C), waardoor het XPL in staat gesteld wordt om te werken. Voorts zijn de plasmidevectoren, θ 192116 zoals pSC101, dat bekend en gemakkelijk verkrijgbaar is, met een streng neplicatiemechanisme, en degene zoals pBR322 met een gematigd replicatiemechanisme, niet onverenigbaar met elkaar, doch kunnen ze tezamen in dezelfde E.coli-cel bestaan.The system for direct expression of the β-urogastron gene will be described using the case where XPL-SD sequence γ-urogastron gene is used. Although λΡ ,. is a potent promoter (J. Hedgpeth et al., Molecular and General Genetics, 163,197-203 (1978)) causes the fully 50 activated λΡ ^ ρΓοπιοίοΓ effects on the E.coli host cell so that it is necessary to place the cell under a of any Iethal operation, multiply free circumstance and then run the XPL. On the other hand, CI857, which is a gene in λ bacteriophage, is one of the mutated genes of Cl repressor, which acts on the operator for λΡί. At low temperatures (up to about 30 ° C), the CI857 repressor binds to the operator, completely inhibiting the activity of λΡί as a promoter, allowing 55 to multiply E.coli. As a result, the host cells are allowed to multiply in this state and then brought to a high temperature (not lower than 37 ° C), allowing the XPL to operate. Furthermore, the plasmid vectors, such as pSC101, which are known and readily available, with a strict replication mechanism, and those such as pBR322 with a moderate replication mechanism, are not incompatible with one another, but may coexist in the same E. coli cell.

Dientengevolge is het geschikt om een recombinant-plasmide pGH37 op te bouwen, waarin een 5 CI857-gen opgenomen is in een tetracycline-resistente plasmidevector pSC101 (met lac UV5-promotor bovenstrooms ervan aangebracht voor de efficiënte expressie van CI857) zoals weergegeven in figuur 6, en het recombinant-plasmide op te nemen in E.coli (stam HB101) ter verkrijging van een transformant (stam ECI-2) ter toepassing als gastheer voor de vector voor de expressie van β-urogastron onder leiding van de λΡ|_ promotor.As a result, it is suitable to build a recombinant plasmid pGH37, in which a 5 CI857 gene has been incorporated into a tetracycline resistant plasmid vector pSC101 (with lac UV5 promoter arranged upstream of it for efficient expression of CI857) as shown in Figure 6 , and incorporating the recombinant plasmid into E.coli (strain HB101) to obtain a transformant (strain ECI-2) to host the vector for the expression of β-urogastrone under the λΡ | _ promoter .

10 Volgens de onderhavige uitvinding wordt het \PL-SD-volgorde-p-urogastron-gen bijvoorbeeld opgenomen in pBR322 ter verkrijging van een β-urogastron exprimerende vector, die toegepast wondt voor de transformatie van de stam ECI-2, waardoor een zogenaamd twee-plasmidesysteem wordt verkregen, waarin twee bruikbare plasmiden coëxisteren in een E.coli-cel.For example, according to the present invention, the \ PL-SD sequence β-urogastron gene is incorporated into pBR322 to obtain a β-urogastron expressing vector, which is used for the transformation of the strain ECI-2, resulting in a so-called two plasmid system is obtained, in which two useful plasmids coexist in an E. coli cell.

Met dit systeem bindt de door pGH37 gecodeerde CI857 repressor zich aan de operator voor de 15 XPL-promotor op het tweede plasmide, wanneer de cel bijvoorbeeld bij 30°C wordt gekweekt, waardoor de vermenigvuldiging van de cel wordt mogelijk gemaakt. Nadat de cel in deze toestand volledig vermenigvuldigd is, wordt de temperatuur bijvoorbeeld tot 40°C verhoogd, waarop de CI857 repressor van de operator gescheiden wordt, waardoor de activiteit van de XPL-promotor voor de expressie van β-urogastron wordt mogelijk gemaakt.With this system, the pGH37 encoded CI857 repressor binds to the operator for the XPL promoter on the second plasmid when, for example, the cell is grown at 30 ° C, allowing the cell to multiply. For example, after the cell has fully multiplied in this state, the temperature is raised to 40 ° C, whereupon the operator's CI857 repressor is separated, allowing the activity of the XPL promoter for the expression of β-urogastrone.

20 Hoewel een soortgelijk ontwerp toegepast werd voor de expressie van fibroblast-interferon, SV-40 Small t-antigeen, enz. wordt in deze gevallen een λ-lysogeen toegepast als gastheer, waarin het DNA van λ-bacteriofaag met een CI857 gen opgenomen wordt in het gastheer-chromosoom (R. Derynck et af,Although a similar design has been used for the expression of fibroblast interferon, SV-40 Small t antigen, etc., in these cases a λ lysogen is used as a host, incorporating the DNA of λ bacteriophage with a CI857 gene. in the host chromosome (R. Derynck et af,

Nature, 287, 193-197 (1980), C. Derom et al, Gene, _17, 45-54 (1982), K. Küpper et al, Nature, 289, 555-559 (1981)).Nature, 287, 193-197 (1980), C. Derom et al, Gene, 17, 45-54 (1982), K. Küpper et al, Nature, 289, 555-559 (1981)).

25 Met het systeem van de onderhavige uitvinding wordt het CI857 gen echter opgenomen in een verschillend plasmide, dat resistent is voor tetracycline. Dientengevolge heeft het onderhavige systeem de voordelen, dat het niet waarschijnlijk is dat het in het gastheer-chromosoom opgenomen λ-bacteriofaag tot vermenigvuldiging zal worden gebracht en de stam gemakkelijk gecontroleerd kan worden. Vanzelfsprekend wordt het tweeplasmidesysteem voor de eerste maal toegepast voor systemen voor de expressie van 30 β-urogastron.However, with the system of the present invention, the CI857 gene is incorporated into a different plasmid resistant to tetracycline. Consequently, the present system has the advantages that it is unlikely that the λ bacteriophage contained in the host chromosome will be propagated and the strain can be easily monitored. Naturally, the two-plasmid system is used for the first time for systems for the expression of β-urogastrone.

Volgens een ander systeem wordt een gedeelte van een ander eiwit-gen zoals β-lactamase-gen gekoppeld aan het β-urogastron-gen om het β-urogastron-gen als een gefuseerd eiwit te exprimeren. Deze methode heeft het voordeel, dat het gefuseerde eiwit minder ontvankelijk is voor ontleding door het protease in het E.coli en dientengevolge bescherming voor het β-urogastron levert. Een ander voordeel is, dat het 35 gefuseerde eiwit migreert naar en zich ophoopt in het periplasma in de cel van E.coli (S.J. Chan et al, Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A., 78, 5401-5405 (1981)), plaatselijk aanwezig is, en dientengevolge gemakkelijk af te scheiden en te zuiveren is.According to another system, a portion of another protein gene such as β-lactamase gene is linked to the β-urogastron gene to express the β-urogastron gene as a fused protein. This method has the advantage that the fused protein is less susceptible to decomposition by the protease into the E. coli and consequently provides protection for the β-urogastrone. Another advantage is that the fused protein migrates to and accumulates in the periplasm in the E. coli cell (SJ Chan et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 78, 5401-5405 (1981). ), is locally present, and is therefore easy to separate and purify.

Meer in het bijzonder wordt een gen-codering voor twee basische aminozuren, die een splitsingsplaats kunnen leveren voor de verwijdering van β-urogastron uit het gefuseerde eiwit door splitsing met een 40 enzym, opgenomen in het β-lactamase-gen op een geschikte restrictie-enzym-splitsingsplaats, en wordt een β-urogastron-gen gekoppeld aan het β-lactamase-gen.More specifically, a gene coding for two basic amino acids, which can provide a cleavage site for the removal of β-urogastron from the fused protein by cleavage with an enzyme, is incorporated into the β-lactamase gene at an appropriate restriction. enzyme cleavage site, and a β-urogastron gene is linked to the β-lactamase gene.

Bij voorkeur is de volgorde van de twee basische aminozuren -Lys-Arg- of Arg-Lys-. Voorbeelden van enzymen voor het herkennen van de aminozuurvolgorde ter afsplitsing van β-urogastron uit het gefuseerde eiwit zijn kallikreïne, trypsine, enz. Voorbeelden van restrictie-enzymen voor het afsplitsen van het 45 β-lactamase-gen zijn Xmnl, Hindi, Seal, Pvul, Pstl, Bgll, Banl, enz.Preferably, the order of the two basic amino acids is -Lys-Arg- or Arg-Lys-. Examples of enzymes for recognizing the amino acid sequence for cleaving β-urogastron from the fused protein are kallikrein, trypsin, etc. Examples of restriction enzymes for cleaving the 45 β-lactamase gene are Xmnl, Hindi, Seal, Pvul , Pstl, Bgll, Banl, etc.

Het aldus bereide β-Ιθοίθπιββθ-β-υΗ^ββίΓοη recombinant-plasmide kan een gefuseerd eiwit exprimeren in E.coli voor de productie. Het verkregen gefuseerde eiwit wordt behandeld met kallikreïne of dergelijke, waardoor β-urogastron verkregen kan worden.The β-Ιθοίθπιββθ-β-υΗ ^ ββίΓοη recombinant plasmid thus prepared can express a fused protein in E.coli for production. The fused protein obtained is treated with kallikrein or the like, whereby β-urogastron can be obtained.

Het expressiesysteem kan gecontroleerd worden door directe analyse van de nucleotidevolgorde van het 50 gen volgens de Maxam-Gilbert-methode, door vaststellen van de opname van het gen en de richting ervan door de mini-bereidings- of ontwerpmethode (H.C. Bimboim et al., Nucleic Acids Research, 7, 1513-1523 (1979)), of door radio-immunologische bepaling van β-urogastron.The expression system can be checked by direct analysis of the nucleotide sequence of the 50 gene by the Maxam-Gilbert method, by determining the gene uptake and its direction by the mini-preparation or design method (HC Bimboim et al., Nucleic Acids Research, 7, 1513-1523 (1979)), or by radioimmunoassay of β-urogastrone.

De aldus verkregen transformant van de onderhavige uitvinding wordt volgens de gebruikelijke methode gekweekt, waardoor β-urogastron met een hoge zuiverheid in een grote hoeveelheid verkregen kan worden. 55 De onderhavige uitvinding zal nu nader beschreven worden aan de hand van het volgende voorbeeld, waartoe de uitvinding op generlei wijze beperkt is.The transformant of the present invention thus obtained is cultivated by the conventional method, whereby high purity β-urogastron can be obtained in a large amount. The present invention will now be further described by way of the following example, to which the invention is in no way limited.

192116 10192116 10

Voorbeeld 1. Bereiding van het nucleoside-dragende hars.Example 1. Preparation of the nucleoside bearing resin.

Verschillende nucleoside-dragende harsen werdén bereid volgens de volgende methode.Various nucleoside-bearing resins were prepared according to the following method.

Een hoeveelheid van 1 gew.% verknoopt polystyreenhars ”S-XI” (product van BIO.RAD Laboratories, 5 U.S.A., 200 tot 400 mesh) werd gemengd met 2,41 g N-(chloormethyl)-ftaalimide, 0,22 ml trifluorme-thaansulfonzuur en 50 ml dichloormethaan door 2 uur roeren bij kamertemperatuur. Na voltooiing van de reactie werd het hars afgefiltreerd, achtereenvolgens met dichloormethaan, ethanol en methanol gewassen, onder verminderde druk gedroogd en vervolgens gedurende 1 nacht door verwarming onder terugvloei-koeling gekookt met 50 ml van een 5 gew.%’s hydrazine-oplossing in ethanol. Het hars werd afgefiltreerd, 10 achtereenvolgens met ethanol, dichloormethaan en methanol gewassen en vervolgens onder verminderde druk gedroogd. Men liet het mengsel van aldus verkregen aminomethylgroepen bevattend polystyreenhars (2,5 g), 0,75 mmol monobamsteenzure ester van 5'-o-dimethoxytritylnucleoside, 1,23 mmol dicyclohexylcar-bodiimide en 1 mmol dimethylaminopyridine 1 nacht bij kamertemperatuur staan onder toevoeging van 30 ml dichlooimethaan. Het hars werd afgefiltreerd, achtereenvolgens met dichloormethaan, methanol en 15 pyridine gewassen en vervolgens ondergedompeld in pyridine-azijnzuuranhydride (volumeverhouding 90:10), waarna men het 30 minuten bij kamertemperatuur liet staan. Het verkregen nucleoside-dragende hars werd afgefiltreerd, gewassen met pyridine en dichloormethaan en onder verminderde druk gedroogd ter toepassing bij de synthesereactie in vaste fase.1% by weight of cross-linked polystyrene resin "S-XI" (product of BIO.RAD Laboratories, USA 5, 200 to 400 mesh) was mixed with 2.41 g of N- (chloromethyl) phthalimide, 0.22 ml of trifluorom -thanesulfonic acid and 50 ml of dichloromethane by stirring at room temperature for 2 hours. After the completion of the reaction, the resin was filtered off, washed successively with dichloromethane, ethanol and methanol, dried under reduced pressure and then refluxed overnight with 50 ml of a 5 wt% hydrazine solution in ethanol. The resin was filtered off, washed successively with ethanol, dichloromethane and methanol and then dried under reduced pressure. The mixture of polystyrene resin (2.5 g) containing aminomethyl groups thus obtained, 0.75 mmol of monobamic acid ester of 5'-o-dimethoxytrityl nucleoside, 1.23 mmol of dicyclohexylcarbodiimide and 1 mmol of dimethylaminopyridine was left overnight at room temperature with the addition of 30 ml of dichloromethane. The resin was filtered off, washed successively with dichloromethane, methanol and pyridine, then immersed in pyridine acetic anhydride (90:10 volume ratio) and left to stand at room temperature for 30 minutes. The resulting nucleoside-bearing resin was filtered off, washed with pyridine and dichloromethane and dried under reduced pressure for use in the solid phase synthesis reaction.

2. Synthese van dinucleotide.2. Synthesis of dinucleotide.

20 Bij wijze van voorbeeld zal de synthese van een volledig beschermd dinucleotide met de basevolgorde van TA beschreven worden. Adenosine (13,14 g) met de 5'-hydroxylgroep beschermd met een dimethoxytri-tyl (DMTr) groep en de aminogroep beschermd met een benzoylgroep, en 6,34 g triazool werden opgelost in watervrije dioxan. Onder koelen met ijs werd 8,35 ml triethylamine aan de oplossing toegevoegd, waarna gedurende 10 minuten druppelsgewijs 6,86 g o-chloorfenylfosfordichloridaat aan het mengsel werd 25 toegevoegd, en het verkregen mengsel werd 2,5 uur bij kamertemperatuur geroerd.For example, the synthesis of a fully protected dinucleotide with the base order of TA will be described. Adenosine (13.14 g) with the 5'-hydroxyl group protected with a dimethoxytriethyl (DMTr) group and the amino group protected with a benzoyl group, and 6.34 g triazole were dissolved in anhydrous dioxane. Under ice-cooling, 8.35 ml of triethylamine was added to the solution, after which 6.86 g of o-chlorophenylphosford dichloridate was added dropwise to the mixture over 10 minutes, and the resulting mixture was stirred at room temperature for 2.5 hours.

Het gevormde triethylamine-hydrochloride werd af gefiltreerd, het filtraat werd geconcentreerd tot ongeveer 2/3 van het volume en 3,6 g β-cyaanethanol en 4,8 g 1-methylimidazol werden met het concentraat gemengd door 3 uur roeren bij kamertemperatuur. Het reactiemengsel werd onder verminderde druk geconcentreerd. Het residu werd opgelost in ethylacetaat, driemaal gewassen met een 0,1 M waterige 30 oplossing van dibasisch natriumfosfaat en tweemaal met water en vervolgens onder verminderde druk geconcentreerd, waardoor 19,96 g ruw product werd verkregen. Het product werd gezuiverd door chromato-grafie op een silicagelkolom onder toepassing van chloroform-methanol (volumeverhouding 98:2) als elutiemiddel. De zuivering werd herhaald ter verkrijging van 15,12 g volledig beschermd adenosine-mononucleotide.The triethylamine hydrochloride formed was filtered off, the filtrate was concentrated to about 2/3 by volume and 3.6 g of β-cyanoethanol and 4.8 g of 1-methylimidazole were mixed with the concentrate by stirring at room temperature for 3 hours. The reaction mixture was concentrated under reduced pressure. The residue was dissolved in ethyl acetate, washed three times with a 0.1 M aqueous solution of dibasic sodium phosphate and twice with water and then concentrated under reduced pressure to obtain 19.96 g of crude product. The product was purified by silica gel column chromatography using chloroform-methanol (98: 2 volume ratio) as eluent. Purification was repeated to obtain 15.12 g of fully protected adenosine mononucleotide.

35 Het aldus verkregen adenosine-mononucleotide (7,81 g) werd toegevoegd aan een 2 gew.%’s oplossing van benzeensulfonzuur in chloroform-methanol (volumeverhouding 70:30) en het mengsel werd 20 minuten onder koelen met ijs geroerd en vervolgens geneutraliseerd met een waterige oplossing van natriumwaterstof-carbonaat. De afgescheiden chloroformlaag werd met water gewassen en onder verminderde druk geconcentreerd, waardoor 7,11 g ruw product werd verkregen. Het product werd onderworpen 40 aan kolomchromatografie op silicagel en geëlueerd met chloroform-methanol (volumeverhouding 97:3) ter verkrijging van 4,31 g adenosine-mononucleotide met een vrije 5'-hydroxylgroep.The adenosine mononucleotide (7.81 g) thus obtained was added to a 2 wt.% Solution of benzenesulfonic acid in chloroform-methanol (volume ratio 70:30) and the mixture was stirred under ice-cooling for 20 minutes and then neutralized with an aqueous solution of sodium hydrogen carbonate. The separated chloroform layer was washed with water and concentrated under reduced pressure to obtain 7.11 g of crude product. The product was subjected to silica gel column chromatography and eluted with chloroform-methanol (97: 3 by volume) to obtain 4.31 g of adenosine mononucleotide with a free 5'-hydroxyl group.

Thymidine (1,64 g) met de 5'-hydroxylgroep beschermd met een dimethoxytritylgroep en 0,95 g triazool werden opgelost in 21 ml watervrije dioxan, aan de oplossing werd 1,25 ml triethylamine toegevoegd en aan het mengsel werd gedurende 5 minuten onder roeren en koelen met ijs druppelsgewijs 0,69 ml 45 o-chloorfenylfosfordichloridaat toegevoegd. Het mengsel werd daarna 1 uur bij kamertemperatuur geroerd. Het bij de reactie verkregen triethylaminehydrochloride werd afgefiltreerd en het filtraat werd 10 minuten geroerd met 1,1 ml van een waterige pyridine-oplossing (1 M). Aan de oplossing werd een dioxanoplossing (10 ml) van 1,17 g van het op de bovenbeschreven wijze bereide adenosine-mononucleotide met de vrije 5'-hydroxylgroep en 0,72 ml 1-methylimidazool toegevoegd, en het mengsel werd 3 uur bij kamertempera-50 tuur geroerd. Het verkregen reactiemengsel werd onder verminderde druk geconcentreerd, het residu werd opgelost in ethylacetaat en de oplossing werd gewassen met een waterige oplossing van dibasisch natriumfosfaat (0,1 M) en vervolgens met water en onder verminderde druk geconcentreerd, waardoor 2,39 g ruw product werd verkregen. Het product werd onderworpen aan kolomchromatografie op silicagel en geëlueerd met chloroform-methanol (volumeverhouding 98:2) ter verkrijging van 2,39 g volledig beschermd 55 dinucleotide TA.Thymidine (1.64 g) with the 5'-hydroxyl group protected with a dimethoxytrityl group and 0.95 g of triazole were dissolved in 21 ml of anhydrous dioxane, 1.25 ml of triethylamine were added to the solution and the mixture was stirred for 5 minutes stirring and cooling with ice, 0.69 ml of 45 o-chlorophenylphosphorus dichloridate were added dropwise. The mixture was then stirred at room temperature for 1 hour. The triethylamine hydrochloride obtained in the reaction was filtered off and the filtrate was stirred with 1.1 ml of an aqueous pyridine solution (1 M) for 10 minutes. To the solution was added a dioxane solution (10 ml) of 1.17 g of the adenosine mononucleotide with the free 5'-hydroxyl group prepared as described above and 0.72 ml of 1-methylimidazole, and the mixture was stirred at room temperature for 3 hours. -50 stirred. The resulting reaction mixture was concentrated under reduced pressure, the residue was dissolved in ethyl acetate and the solution was washed with an aqueous solution of dibasic sodium phosphate (0.1 M) and then concentrated with water and under reduced pressure to give 2.39 g of crude product was obtained. The product was subjected to silica gel column chromatography and eluted with chloroform-methanol (98: 2 volume ratio) to obtain 2.39 g of fully protected 55 dinucleotide TA.

Op dezelfde wijze werden verschillende nucleotriden bereid.Different nucleotrides were prepared in the same manner.

3. Synthese van oligonucleotide.3. Synthesis of oligonucleotide.

11 19211611 192116

De synthese in vaste fase van het oligonucleotide A-1, d.w.z. undecanucleotide AATTCGAAGAT zal beschreven worden.The solid phase synthesis of the oligonucleotide A-1, i.e. undecanucleotide AATTCGAAGAT will be described.

Een hars (40 mg) met het daarop aangebrachte en volgens de bovenstaande methode 1. bereide nucleoside T werd in een reactievat gebracht, driemaal met dichloormethaan-isopropanol (volumeverhouding 5 85:15) gewassen en vervolgens behandeld met een oplossing van zinkbromide (1M) in dichloormethaan-isopropanol om de dimethoxytritylgroep op de 5'-plaats te verwijderen. Deze procedure werd verscheidene malen herhaald tot de kleur van de oplossing verdwenen was. Het hars werd gewassen met dichloorme-thaan, vervolgens gewassen met een oplossing van triethylammoniumacetaat (0,5M) in dimethylformamide ter verwijdering van de resterende Zn2+, voorts gewassen met tetrahydrofuran en gedroogd door verschei-10 dene minuten stikstofgas door het reactievat te leiden.A resin (40 mg) with the nucleoside T prepared thereon and prepared according to Method 1 above was placed in a reaction vessel, washed three times with dichloromethane-isopropanol (volume ratio 5: 85:15) and then treated with a solution of zinc bromide (1M) in dichloromethane-isopropanol to remove the dimethoxytrityl group at the 5 'position. This procedure was repeated several times until the color of the solution disappeared. The resin was washed with dichloromethane, then washed with a solution of triethylammonium acetate (0.5M) in dimethylformamide to remove the remaining Zn2 +, further washed with tetrahydrofuran and dried by passing nitrogen gas through the reaction vessel for several minutes.

Het volledig beschermde en op de eerder beschreven wijze 2. bereide dinucleotide GA (50 mg) werd opgelost in 1 ml pyridine, geschud met 1 ml triethylamine en gedurende verscheidene uren bij kamertemperatuur met rust gelaten. De oplossing werd vervolgens onder verminderde druk ingedampt. Het residu werd verscheidene malen azeotropisch ingedampt met pyridine om het nucleotide om te zetten in een triethyl-15 ammoniumzout. Het zout werd opgelost in 0,3 ml van een 0,3 M oplossing van mesityleensulfonyl-5- nitrotriazool in pyridine. De oplossing werd toegevoegd aan het gedroogde hars, waarna men 60 minuten bij kamertemperatuur liet reageren. Het vloeibare gedeelte werd uit het reactiemengsel afgefiltreerd en het vaste gedeelte werd met pyridine gewassen, waarna men het 5 minuten liet staan in het mengsel van 0,2 ml azijnzuuranhydride en 0,8 ml van een 0,1 M oplossing van dimethylaminopyridine in tetrahydrofuranpyri-20 dine om de niet omgezette hydroxylgroep te maskeren. Tenslotte werd het hars gewassen met pyridine, waardoor een cyclus van de vaste fase-synthese voltooid werd. Eén cyclus verlengt de nucleotideketen met twee basen. Dezelfde procedure werd herhaald om achtereenvolgens de dinucleotiden AA, CG, TT en AA door condensatie met het verkregen nucleotide te koppelen, waardoor het volledig beschermde undecanucleotide AATTCGAAGAT gedragen door het hars werd bereid.The fully protected dinucleotide GA (50 mg) prepared as described above was dissolved in 1 ml pyridine, shaken with 1 ml triethylamine and left at room temperature for several hours. The solution was then evaporated under reduced pressure. The residue was azeotroped several times with pyridine to convert the nucleotide into a triethyl-15 ammonium salt. The salt was dissolved in 0.3 ml of a 0.3 M solution of mesitylene sulfonyl-5-nitrotriazole in pyridine. The solution was added to the dried resin and allowed to react at room temperature for 60 minutes. The liquid portion was filtered from the reaction mixture and the solid portion was washed with pyridine, then left to stand for 5 minutes in the mixture of 0.2 ml acetic anhydride and 0.8 ml 0.1M solution of dimethylaminopyridine in tetrahydrofuranpyridine. 20 dine to mask the unreacted hydroxyl group. Finally, the resin was washed with pyridine, completing a solid phase synthesis cycle. One cycle extends the nucleotide chain by two bases. The same procedure was repeated to successively couple dinucleotides AA, CG, TT and AA by condensation with the resulting nucleotide, thereby preparing the fully protected undecanucleotide AATTCGAAGAT carried by the resin.

25 Men liet het verkregen hars (20 mg) 1 uur bij 40°C staan met 0,6 ml van een 0,5 M oplossing van tetramethylguanidine-2-pyridinealdoximaat in pyridine-water (volumeverhouding 90:10). Het hars werd vervolgens door een met katoen gevulde pasteurpipet geleid en daardoor afgefiltreerd. Het hars werd afwisselend met pyridine en ethanol gewassen. De wasvloeistoffen en het filtraat werden bijeengevoegd en onder verminderde druk bij 40°C geconcentreerd. Het residu werd opgelost in 2 ml van een waterige 30 oplossing van triethylammoniumbicarbonaat (TEAB, 10 mmol). De oplossing werd driemaal met ether gewassen. De waterige fase werd overgebracht naar een Sephadex G-50 kolom (2 x 100 cm) en geëlueerd met 10 mM TEAB-oplossing. De fracties werden gecontroleerd op de absorptie bij 260 nm. De fractie met de eerste eluaatpiek werd geconcentreerd. Het residu werd onderworpen aan snelle vloeistofchromatografie (pomp: model 6000A, detector: model 440, producten van Waters Associates, U.S.A.) ter verkrijging van 35 een gezuiverde fractie met een enkele |»ek. De voor de snelle vloeistofchromatografie toegepaste kolom was μ-Bondapak C18 (product van Waters Associates, U.S.A.), en een 0,1 M oplossing van triethylammoniumacetaat in waterige acetonitril werd toegepast als elutiemiddel voor gradiënt-elutie (5 -» 40 vol.%). Het aldus gezuiverde undecanucleotide was nog steeds op de 5'-plaats beschermd met de dimethoxytritylgroep, zodat de verbinding gedurende 15 minuten behandeld werd met een 80 vol.%’s 40 waterige azijnzuuroplossing om de dimethoxytritylgroep te verwijderen en vervolgens opnieuw door snelle vloeistofchromatografie werd gezuiverd tot een enkele piek werd verkregen. Hiertoe werd gebruik gemaakt van dezelfde kolom als in het voorafgaande, en werd een 0,1 M oplossing van triethylammoniumacetaat in waterige acetonitril toegepast voor de gradiënt-elutie (5 -> 25 vol.%).The resulting resin (20 mg) was allowed to stand at 40 ° C for 1 hour with 0.6 ml of a 0.5 M solution of tetramethylguanidine-2-pyridine aldoximate in pyridine water (volume ratio 90:10). The resin was then passed through a cotton-filled pasteur pipette and filtered through it. The resin was washed alternately with pyridine and ethanol. The washings and filtrate were combined and concentrated under reduced pressure at 40 ° C. The residue was dissolved in 2 ml of an aqueous solution of triethylammonium bicarbonate (TEAB, 10 mmol). The solution was washed three times with ether. The aqueous phase was transferred to a Sephadex G-50 column (2 x 100 cm) and eluted with 10 mM TEAB solution. The fractions were checked for the absorbance at 260 nm. The fraction with the first eluate peak was concentrated. The residue was subjected to rapid liquid chromatography (pump: model 6000A, detector: model 440, products of Waters Associates, U.S.A.) to obtain a purified fraction with a single ek. The column used for the rapid liquid chromatography was μ-Bondapak C18 (product of Waters Associates, USA), and a 0.1 M solution of triethylammonium acetate in aqueous acetonitrile was used as eluent for gradient elution (5 - 40 vol%). . The undecanucleotide thus purified was still protected in the 5 'position with the dimethoxytrityl group, so that the compound was treated with an 80 vol.% 40 aqueous acetic acid solution for 15 minutes to remove the dimethoxytrityl group and then purified again by rapid liquid chromatography until a single peak was obtained. Use was made for this purpose of the same column as in the foregoing, and a 0.1 M solution of triethylammonium acetate in aqueous acetonitrile was used for the gradient elution (5 -> 25% by volume).

Op dezelfde wijze als in het voorafgaande werden oligonucleotiden A-2 t/m A-16 en B-1 t/m B-16 45 gesynthetiseerd.Oligonucleotides A-2 to A-16 and B-1 to B-16 were synthesized in the same manner as before.

Tabel 1 toont de opbrengst van elk oligonucleotide bepaald met behulp van 20 mg van het van de vaste fase-synthese verkregen hars, door het oligonucleotide van het hars te scheiden, gevolgd door verwijdering van de beschermende groep en zuivering.Table 1 shows the yield of each oligonucleotide determined using 20 mg of the solid phase synthesis resin, by separating the oligonucleotide from the resin, followed by deprotection and purification.

De opbrengst werd berekend uit de bepaling van de absorptie van het uiteindelijke gezuiverde product bij 50 260 nm en de som van de absorptiewaarden voor de nucleotide-basen.The yield was calculated from the determination of the absorbance of the final purified product at 50-260 nm and the sum of the absorbance values for the nucleotide bases.

TABEL 1 A-1 80 pg A-2 120 pg A-3 90 pg A-4 50 pg 55 A-5 140 pg A-6 70 pg A-7 80 pg A-8 90 pg A-9 100 pg A-10 90 pg A-11 110 pg A-12 40 pg 192116 12 TABEL 1 (vervolg) A-13 50 pg A-14 40 pg A-15 60 pg A-16 150 pg B-1 60 pg B-2 100 pg B-3 50 pg B-4 90 pg 5 B-5 100 pg B-6 90 pg B-7 130 pg B-8 100 pg B-9 110 pg B-10 100 pg B-11 110 pg B-12 110 pg B-13 130 pg B-14 60 pg B-15 70 pg B-16 50 pg 10 4. Controle van de volgorde van de oligonucleotidebasen.TABLE 1 A-1 80 pg A-2 120 pg A-3 90 pg A-4 50 pg 55 A-5 140 pg A-6 70 pg A-7 80 pg A-8 90 pg A-9 100 pg A- 10 90 pg A-11 110 pg A-12 40 pg 192116 12 TABLE 1 (continued) A-13 50 pg A-14 40 pg A-15 60 pg A-16 150 pg B-1 60 pg B-2 100 pg B-3 50 pg B-4 90 pg 5 B-5 100 pg B-6 90 pg B-7 130 pg B-8 100 pg B-9 110 pg B-10 100 pg B-11 110 pg B-12 110 pg B-13 130 pg B-14 60 pg B-15 70 pg B-16 50 pg 10 4. Checking the order of the oligonucleotide bases.

De volgorde werd gecontroleerd volgens de eerder genoemde tweedimensionale fractionering door elektroforese en homochromatografie van Wu et al.The sequence was checked according to the aforementioned two-dimensional fractionation by electrophoresis and homochromatography from Wu et al.

Gevonden werd, dat elk van de oligonucleotiden A-1 t/m A-16 en B-1 t/m B-16 de gewenste nucleotide-volgorde bezaten. Figuur 5 toont het door analyse van het oligonucleotide A-3 verkregen resultaat, waarbij 15 gevonden werd, dat A-3 gezien vanaf het 5'-einde de volgorde GATTCTGAGTG bezat.Each of oligonucleotides A-1 to A-16 and B-1 to B-16 was found to have the desired nucleotide sequence. Figure 5 shows the result obtained by analysis of the oligonucleotide A-3, where it was found that A-3 had the sequence GATTCTGAGTG seen from the 5 'end.

De nucleotidevolgorde van elk oligonucleotide werd eveneens gecontroleerd volgens de eerder genoemde Maxam-Gilbert-methode.The nucleotide sequence of each oligonucleotide was also checked by the aforementioned Maxam-Gilbert method.

Vastgesteld werd, dat de oligonucleotiden A-1 t/m A-16 en B-1 t/m B-16 elk de gewenste nucieotide-volgorde bezaten.Oligonucleotides A-1 to A-16 and B-1 to B-16 were each determined to have the desired nucleotide sequence.

20 5. Opbouw van oligonudeotideblokken en ondereenheden.20 5. Construction of oligonudeotide blocks and subunits.

De blokken en ondereenheden werden op de in figuur 2 toegelichte en hierna nader beschreven wijze bereid.The blocks and subunits were prepared in the manner illustrated in Figure 2 and described in more detail below.

Eerst werd ongeveer 5 pg van elk van de oligonucleotiden A-1, A-2, A-3, A-14, A-15 en A-16 opgelost in gedestilleerd water (50 pl) ter verkrijging van een oplossing met een concentratie van ongeveer 0,1 pg/pl.First, about 5 µg of each of the oligonucleotides A-1, A-2, A-3, A-14, A-15 and A-16 were dissolved in distilled water (50 µl) to give a solution of a concentration of about 0.1 pg / pl.

25 De zes soorten van waterige oplossingen werden elk in een hoeveelheid van 10 pl (1 pg berekend als DNA) afzonderlijk in zes Eppendorf-buizen gebracht. Een gemengde oplossing (6 pl) met 250 mM tris-HCI (pH 7,6), 50 mM magnesiumchloride, 10 mM spermine en 50 mM DTT werd in elke buis gebracht, gevolgd door toevoeging van 0,5 pl waterige y-32p-ATP-oplossing (product van Amersham International Ltd., Engeland), 0,5 pl T4 polynucleotidekinase (product van Takara Shuzo Co., Ltd., Japan) en 13 pl gedestilleerd water, ter 30 verkrijging van 30 pl mengsel. Men liet het mengsel 30 minuten bij 37°C reageren en vervolgens nog 30 minuten verder reageren onder toevoeging van 1 pl waterige 30 mM ATP oplossing. De reactie werd beëindigd door 2 minuten op 100°C te verhitten. Het reactiemengsel werd snel met ijs gekoeld. De oligonucleotiden A-1, A-2, A-3, A-14, A-15 en A-16 met hun aldus gefosforileerde 5'-plaatsen werden elk in een hoeveelheid van 10 pl in één enkele Eppendorf-buis van 1,5 ml gebracht. In de buis werd 40 pl van een 35 waterige 250 mM tris-HCI oplossing (pH 7,6), 40 pl 50 mM magnesiumchloride en 35 pl gedestilleerd water gebracht ter verkrijging van een totale hoeveelheid van 175 pl. Het mengsel werd 2 minuten op 90°C verhit en vervolgens geleidelijk tot kamertemperatuur afgekoeld. Onder toevoeging van 10 pl waterige 200 mM DTT-oplossing, 10 pl waterige 20 mM ATP oplossing en 5 pl (100 eenheden) T4 DNA ligase (product van Nippon GEne Co., Ltd., Japan) liet men het mengsel 1 nacht bij 4°C reageren, waardoor het blok 1 van 40 gekoppelde oligonucleotiden A-1, A-2, A-3, A-14, A-15 en A-16 werd bereid.The six kinds of aqueous solutions were each placed in six Eppendorf tubes in an amount of 10 µl (1 µg calculated as DNA). A mixed solution (6 µl) with 250 mM tris-HCl (pH 7.6), 50 mM magnesium chloride, 10 mM spermine and 50 mM DTT was placed in each tube, followed by addition of 0.5 µl aqueous γ-32p- ATP solution (product of Amersham International Ltd., England), 0.5 µl of T4 polynucleotide kinase (product of Takara Shuzo Co., Ltd., Japan) and 13 µl of distilled water, to give 30 µl of mixture. The mixture was allowed to react at 37 ° C for 30 minutes and then reacted for an additional 30 minutes adding 1 µl of aqueous 30 mM ATP solution. The reaction was stopped by heating at 100 ° C for 2 minutes. The reaction mixture was quickly cooled with ice. The oligonucleotides A-1, A-2, A-3, A-14, A-15 and A-16 with their thus phosphorilated 5 'sites were each in an amount of 10 µl in a single Eppendorf tube of 1, 5 ml. 40 µl of a 35 aqueous 250 mM tris-HCl solution (pH 7.6), 40 µl of 50 mM magnesium chloride and 35 µl of distilled water were introduced into the tube to give a total amount of 175 µl. The mixture was heated at 90 ° C for 2 minutes and then gradually cooled to room temperature. With the addition of 10 µl aqueous 200 mM DTT solution, 10 µl aqueous 20 mM ATP solution and 5 µl (100 units) T4 DNA ligase (product of Nippon GEne Co., Ltd., Japan) the mixture was left overnight at 4 ° C to prepare block 1 of 40 coupled oligonucleotides A-1, A-2, A-3, A-14, A-15 and A-16.

De blokken 2 en 3 werden op soortgelijke wijze gevormd door koppeling van A-4, A-5, A-6, A-11, A-12 en A-13 en door koppeling van A-7, A-8, A-9 en A-10.Blocks 2 and 3 were similarly formed by coupling A-4, A-5, A-6, A-11, A-12 and A-13 and by coupling A-7, A-8, A- 9 and A-10.

Ethanol werd in een tweemaal zo grote volumehoeveelheid toegevoegd aan het reactiemengsel van de aldus bereide blokken en men liet het mengsel 30 minuten bij -80°C staan om DNA neer te slaan, gevolgd 45 door elektroforese op een 12,5 gew.%’s polyacrylamidegel en autoradiografie. Dit leidde tot banden op de plaatsen van 72 b.p. (basenpaar) en 36 b.p. voor het blok 1, een band op de plaats van 36 b.p. voor het blok 2 en banden op de plaatsen van 48 b.p. en 24 b.p. voor het blok 3. Vervolgens werd elke band uitgesneden en werd een mengsel van 10 mM tris-HCI (pH 7,6) en 10 mM EDTA in waterige oplossing (tris-EDTA) eraan toegevoegd. Men liet het mengsel vervolgens 1 nacht bij kamertemperatuur staan ter 50 extractie. Het verkregen mengsel werd gecentrifugeerd, de bovenstaande vloeistof werd afgescheiden en de bovenstaande vloeistof werd grondig geschud met met tris-EDTA verzadigde fenol en vervolgens gecentrifugeerd om de onderste laag te verwijderen. Dezelfde procedure werd tweemaal herhaald met met tris-EDTA verzadigde fenol. Ten slotte werd de bovenste laag door een met Sephadex G-50 gepakte kolom met een diameter van 1 cm en een lengte van 20 cm geleid om de fenol en acrylamide te verwijderen. Het eluaat 55 werd vervolgens geconcentreerd tot 200 pl, waarna men het 30 minuten bij -80<’C liet staan met een tweemaal zo grote volumehoeveelheid ethanol om DNA neer te slaan.Ethanol was added in twice the volume by volume to the reaction mixture of the blocks thus prepared, and the mixture was allowed to stand at -80 ° C for 30 minutes to precipitate DNA, followed by electrophoresis at 12.5 wt% polyacrylamide gel and autoradiography. This led to 72 b.p. (base pair) and 36 b.p. for block 1, a band in place of 36 b.p. for block 2 and tires at the positions of 48 b.p. and 24 b.p. for block 3. Then, each band was cut and a mixture of 10 mM tris-HCl (pH 7.6) and 10 mM EDTA in aqueous solution (tris-EDTA) was added. The mixture was then left overnight at room temperature for extraction. The resulting mixture was centrifuged, the supernatant was separated and the supernatant was shaken thoroughly with tris-EDTA saturated phenol then centrifuged to remove the bottom layer. The same procedure was repeated twice with tris-EDTA saturated phenol. Finally, the top layer was passed through a Sephadex G-50 packed column with a diameter of 1 cm and a length of 20 cm to remove the phenol and acrylamide. The eluate 55 was then concentrated to 200 µl and left to stand at -80 ° C for 30 minutes with twice the volume of ethanol to precipitate DNA.

De drie verkregen blokken werden gecombineerd. Aan het mengsel werd 50 mM tris-HCI (pH 7,6) 10 mMThe three blocks obtained were combined. 50 mM tris-HCl (pH 7.6) 10 mM was added to the mixture

13 192116 magnesiumchloride, 20 mM DTT, 1 mM ATP en 5 μΙ (100 eenheden) T4 DNA ligase toegevoegd. Men liet het verkregen mengsel 1 nacht bij 4°C staan voor de koppeling. Aan het mengsel werd tweemaal het volume aan ethanol toegevoegd en men liet het mengsel 30 minuten bij -80eC staan om DNA neer te slaan, gevolgd door elektroforese op 8 gew.%’s polyacrylamidegel en autoradiografie, waardoor banden bjj 5 96 b.p. en 192 b.p. werden getoond. Elke band werd uitgesneden en tris-EDTA werd eraan toegevoegd, en men liet het mengsel 1 nacht bij kamertemperatuur staan ter extractie. Het mengsel werd gecentrifugeerd om de bovenstaande vloeistof af te scheiden, de bovenstaande vloeistof werd grondig geschud met met tris-EDTA verzadigde fenol, en de onderste laag werd weggegooid. Deze procedure werd tweemaal herhaald met verdere toevoeging van met tris-EDTA verzadigde fenol. De bovenste laag werd door een 10 Sephadex G-50 kolom geleid, het eluaat werd geconcentreerd en aan het concentraat werd tweemaal het volume aan ethanol toegevoegd, gevolgd door 30 minuten laten staan bij -80°C om DNA neer te slaan. Het verkregen product werd gesplitst met EcoRI en BamHI ter verkrijging van de ondereenheid A.13 192116 magnesium chloride, 20 mM DTT, 1 mM ATP and 5 μΙ (100 units) T4 DNA ligase were added. The resulting mixture was left overnight at 4 ° C for coupling. Twice the volume of ethanol was added to the mixture and the mixture was allowed to stand at -80 ° C for 30 minutes to precipitate DNA, followed by electrophoresis on 8 wt% polyacrylamide gel and autoradiography, yielding bands at 5 96 b.p. and 192 b.p. were shown. Each band was cut and tris-EDTA was added, and the mixture was left overnight at room temperature for extraction. The mixture was centrifuged to separate the supernatant, the supernatant was shaken thoroughly with tris-EDTA saturated phenol, and the bottom layer discarded. This procedure was repeated twice with further addition of tris-EDTA saturated phenol. The top layer was passed through a 10 Sephadex G-50 column, the eluate was concentrated and twice the volume of ethanol was added to the concentrate, followed by standing at -80 ° C for 30 minutes to precipitate DNA. The obtained product was cleaved with EcoRI and BamHI to obtain the subunit A.

Dezelfde procedure ais in het voorafgaande werd herhaald zoals getoond in figuur 3 om oligonudeotiden B-1, B-2, B-15 en B-16 te koppelen tot het blok 4, oligonudeotiden B-3, B-4, B-13 en B-15 te koppelen tot 15 het blok 5, oligonudeotiden B-5, B-6, B-11 en B-12 te koppelen tot het blok 6 en oligonudeotiden B-7, B-8, B-9 en B-10 te koppelen tot het blok 7. De blokken overeenkomende met 26 b.p. en 52 b.p. werden verzameld en op soortgelijke wijze gekoppeld ter vorming van producten met 104 b.p. en 208 b.p., die gesplitst werden met Hindlll en BamHI. Aldus werd de ondereenheid B verkregen.The same procedure as above was repeated as shown in Figure 3 to couple oligonudeotides B-1, B-2, B-15 and B-16 to block 4, oligonudeotides B-3, B-4, B-13 and B-15 to link to block 5, oligonudeotides B-5, B-6, B-11 and B-12 to link to block 6 and oligonudeotides B-7, B-8, B-9 and B-10 link to block 7. The blocks corresponding to 26 bp and 52 b.p. were collected and similarly coupled to form 104 b.p. products. and 208 b.p., which were split with Hind III and BamHI. Thus, the subunit B was obtained.

6. Cloneren van ondereenheden en analyse van recombinantplasmiden.6. Cloning of subunits and analysis of recombinant plasmids.

20 Onder verwijzing naar figuur 2 werd pBR322 gesplitst met EcoRI en BamHI en werden fosfaatgroepen met alkalisch fosfatase (product van Takara Shuzo Co., Ltd., Japan) verwijderd van de 5'-einden, om de oorspronkelijke toestand niet te herstellen. Vervolgens liet men het aldus gesplitste en gedefosforyleerde pBR322 en de ondereenheid A 1 nacht bij 4°C in een mengsel van 50 mM tris-HCI (pH 7,6), 10 mM magnesiumchloride, 20 mM DTT en 1 mM ATP met toevoeging van 5 μΙ T4 DNA ligase staan, waardoor ze 25 gekoppeld werden. Aan het reactiemengsel werd tweemaal het volume aan ethanol toegevoegd en men Bet het mengsel 30 minuten bij -80°C staan ter precipitatie. Het mengsel werd vervolgens gecentrifugeerd, het neerslag werd gedroogd en opgelost in 100 μΙ gedestilleerd water, waardoor een plasmide pUG1 werd verkregen, waarin de ondereenheid A opgenomen was in pBR322.Referring to Figure 2, pBR322 was cleaved with EcoRI and BamHI and phosphate groups with alkaline phosphatase (product of Takara Shuzo Co., Ltd., Japan) were removed from the 5 'ends so as not to restore the original state. Then the thus split and dephosphorylated pBR322 and the subunit A were left overnight at 4 ° C in a mixture of 50 mM tris-HCl (pH 7.6), 10 mM magnesium chloride, 20 mM DTT and 1 mM ATP with the addition of 5 μΙ T4 DNA ligase are standing, so they were linked. Twice volume of ethanol was added to the reaction mixture and the mixture was allowed to stand at -80 ° C for 30 minutes to precipitate. The mixture was then centrifuged, the precipitate dried and dissolved in 100 µl of distilled water to give a plasmid pUG1 in which the subunit A was contained in pBR322.

De E.coli stam HB101 werd getransformeerd met het plasmide pUG1 volgens de calcium-methode.The E.coli strain HB101 was transformed with the plasmid pUG1 according to the calcium method.

30 De als gastheer dienende stam HB101 werd bij 37°C gekweekt in 50 ml LB kweekmedium (1 gew.% bactotrypton, 0,5 gew.% gistextract en 0,5 gew.% natriumchloride). Wanneer de absorptie bij 610 nm 0,25 bereikte, werd een hoeveelheid van 40 ml van de kweekvloeistof overgebracht in een centrifugebuis en 10 minuten bij 4°C met 6000 rpm gecentrifugeerd. De bovenstaande vloeistof werd weggeworpen, het neerslag werd gesuspendeerd in 20 ml met ijs gekoelde 0,1 M magnesiumchlorideoplossing, de suspensie werd 35 opnieuw onder dezelfde omstandigheden gecentrifugeerd en de bovenstaande vloeistof werd weggeworpen.The host strain HB101 was grown at 37 ° C in 50 ml LB culture medium (1 wt% bactotrypton, 0.5 wt% yeast extract and 0.5 wt% sodium chloride). When the absorbance at 610 nm reached 0.25, 40 ml of the broth was transferred to a centrifuge tube and centrifuged at 6000 rpm for 10 minutes at 4 ° C. The supernatant was discarded, the precipitate was suspended in 20 ml of ice-cooled 0.1 M magnesium chloride solution, the suspension was centrifuged again under the same conditions and the supernatant was discarded.

Het neerslag werd gesuspendeerd in 20 ml van een met ijs gekoelde oplossing van 0,1 M calciumchloride en 0,05M magnesiumchloride en 1 uur met ijs gekoeld. De suspensie werd gecentrifugeerd, de bovenstaande vloeistof werd verwijderd en het neerslag werd gesuspendeerd in 2 ml van een met ijs gekoelde oplossing van 0,1 M calciumchloride en 0,05M magnesiumchloride. Aan een hoeveelheid van 200 μΙ van de 40 suspensie werd 10 μΙ waterige oplossing van pUG1 toegevoegd en het mengsel werd 1 uur met ijs gekoeld en vervolgens 30 seconden in een waterbad op 43,5°C verwarmd. Vervolgens werd 2,8 ml LB kweekmedium aan het mengsel toegevoegd, gevolgd door 1 uur incubatie bij 37°C. De kweek werd vervolgens uitgespreid over een LB plaat met 50 pg/ml ampicilline in een hoeveelheid van 200 μΙ/schaal en 1 nacht b$ 37°C geïncubeerd. De groeiende kolonies werden gecontroleerd door verdere transplantatie op een LB plaat 45 met 50 pg/ml ampicilline en eveneens op een LB plaat met 20 pg/ml tetracycline en werden 1 nacht bij 37°C geïncubeerd. Alleen de ampicilline-resistente kolonies werden afgescheiden ter verkrijging van een getransformeerde cel.The precipitate was suspended in 20 ml of an ice-cooled solution of 0.1 M calcium chloride and 0.05 M magnesium chloride and cooled for 1 hour with ice. The suspension was centrifuged, the supernatant was removed and the precipitate was suspended in 2 ml of an ice-cooled solution of 0.1 M calcium chloride and 0.05M magnesium chloride. To an amount of 200 μΙ of the 40 suspension was added 10 μΙ of an aqueous solution of pUG1 and the mixture was cooled with ice for 1 hour and then heated at 43.5 ° C in a water bath for 30 seconds. 2.8 ml of LB culture medium was then added to the mixture, followed by incubation at 37 ° C for 1 hour. The culture was then spread on an LB plate containing 50 µg / ml ampicillin at 200 µl / dish and incubated overnight at $ 37 ° C. The growing colonies were checked by further transplantation on an LB plate 45 with 50 µg / ml ampicillin and also on an LB plate with 20 µg / ml tetracycline and incubated overnight at 37 ° C. Only the ampicillin-resistant colonies were separated to obtain a transformed cell.

Plasmiden werden uit de cel verzameld op kleine schaal door middel van de alkalische extractiemethode en gecontroleerd op de aanwezigheid van een BGIII splitsingsplaats. Een van de cellen met het plasmide 50 met een Bglll splitsingsplaats werd op grote schaal gekweekt om op soortgelijke wijze gezuiverd plasmide pUG1 met behulp van de alkalische extractiemethode te verkrijgen.Plasmids were collected from the cell on a small scale by the alkaline extraction method and checked for the presence of a BGIII cleavage site. One of the cells containing the plasmid 50 with a BglII cleavage site was grown extensively to obtain similarly purified plasmid pUG1 using the alkaline extraction method.

De nucleotidevolgorde van de in het verkregen pUG1 opgenomen ondereenheid A werd aan beide strengen geanalyseerd met behulp van de eerder genoemde Maxam-Gilbert-methode.The nucleotide sequence of the subunit A incorporated in the resulting pUG1 was analyzed on both strands using the aforementioned Maxam-Gilbert method.

De foto’s 1 en 2 tonen de resultaten van de analyse. De banen 1 t/m 4 zijn het resultaat van de 55 elektroforese voor het EcoRI-Sall fragment en de banen 5 t/m 8 voor het BamHI-Pstl fragment. De banen 1 en 5 tonen de reactieproducten voor guanine, de banen 2 en 6 de reactieproducten voor guanine + adenine, de banen 3 en 7 tonen de reactieproducten voor thymine + cytosine en de banen 4 en 8 tonen de 192116 14 reactieproducten voor cytosine. Foto 2 toont de met behulp van dezelfde monsters verkregen resultaten, waarin een gebied van het gedeelte met een hoger moleculegewicht (overeenkomende met het bovenste gedeelte van foto 1) is vergroot. Aldus werd de nucleotidevolgorde van de ondereenheid A vastgesteld.Photos 1 and 2 show the results of the analysis. Lanes 1 through 4 are the result of the 55 electrophoresis for the EcoRI-Sall fragment and lanes 5 through 8 for the BamHI-Pstl fragment. Lanes 1 and 5 show the reaction products for guanine, lanes 2 and 6 show the reaction products for guanine + adenine, lanes 3 and 7 show the reaction products for thymine + cytosine, and lanes 4 and 8 show the reaction products for cytosine. Photo 2 shows the results obtained using the same samples, in which an area of the higher molecular weight portion (corresponding to the top portion of photo 1) is enlarged. Thus, the nucleotide sequence of the subunit A was determined.

Onder verwijzing naar figuur 3 werd het plasmide pBR322 gesplitst met Hindlll en BamHI en werd het 5 grotere fragment met behulp van elektroforese geïsoleerd en aan de ondereenheid B gekoppeld. Aldus werd een plasmide p(JG2 verkregen, waarin ondereenheid B op soortgelijke wijze als in het geval van pUG1 opgenomen was in pBR322. Onder toepassing van het verkregen plasmide p(JG2 werd de stam HB101 getransformeerd en werden uitsluitend de ampicilline-resistente kolonies geselecteerd. Plasmiden werden uit de kolonies verzameld en vervolgens gecontroleerd op de aanwezigheid van een Bglll splitsingsplaats en 10 een Mlul splitsingsplaats. De cellen met het plasmide met beide plaatsen werden geselecteerd. Eén van de geselecteerde cellen werd op grote schaal gekweekt ter verkrijging van gezuiverd plasmide pUG2. De nucleotidevolgorde van de ondereenheid B in pUG2 werd aan beide strengen geanalyseerd met behulp van de Maxam-Gilbert-methode.Referring to Figure 3, the plasmid pBR322 was cleaved with HindIII and BamHI and the larger fragment was isolated by electrophoresis and coupled to the subunit B. Thus, a plasmid p (JG2 was obtained, in which subunit B was incorporated into pBR322 in a similar manner as in the case of pUG1. Using the obtained plasmid p (JG2, the strain HB101 was transformed and only the ampicillin resistant colonies were selected. Plasmids were collected from the colonies and then checked for the presence of a BglII cleavage site and a Mlul cleavage site Cells containing the plasmid with both sites were selected One of the selected cells was grown widely to obtain purified plasmid pUG2. The nucleotide sequence of the subunit B in pUG2 was analyzed on both strands using the Maxam-Gilbert method.

Foto 3 toont de resultaten van de analyse. De banen 1 t/m 4 tonen het door het Hindlll-Sall fragment 15 verkregen resultaat. De banen 5 t/m 8 tonen het met hetzelfde monster verkregen resultaat, waarin een gebied van het gedeelte met hoger moleculegewicht (overeenkomende met het bovenste gedeelte van banen 1 t/m 4) op vergrote schaal is getoond. Elke baan toont hetzelfde overeenkomende reactieproduct als op foto 1. Aldus werd de nucleotidevolgorde van de ondereenheid B vastgesteld.Photo 3 shows the results of the analysis. Lanes 1 through 4 show the result obtained by the Hindll-Sall fragment 15. Lanes 5 through 8 show the result obtained with the same sample, in which an area of the higher molecular weight portion (corresponding to the upper portion of lanes 1 through 4) is shown in an enlarged scale. Each lane shows the same corresponding reaction product as in photo 1. Thus, the nucleotide sequence of the subunit B was determined.

Vervolgens werd onder verwijzing naar figuur 4 pUG1 gesplitst met Hindlll en Sail en werd een groter 20 fragment afgescheiden met behulp van een biogelkolom van 1,5 m. pUG2 werd gesplitst met Hindlll en Sail, gevolgd door elektroforese ter verkrijging van een kleiner fragment. De twee fragmenten werden gecombineerd en behandeld met T4 DNA ligase voor de koppeling, waardoor het plasmide pUG3 werd verkregen, waarin de ondereenheden A plus B, d.w.z. β-urogastron-gen, opgenomen was in pBR322. De E.ooli stam HB101 werd met behulp van het plasmide pUG3 getransformeerd. De transformant is gedeponeerd volgens 25 het verdrag van Budapest met betrekking tot internationale erkenning van depots onder het nummer FERM BP 543 bij het Fermentation Research Institute, Agency of Industrial Science and Technology, Ministry of International Trade and Industry, Japan.Then, referring to Figure 4, pUG1 was cleaved with Hindlll and Sail and a larger fragment was separated using a 1.5m biogol column. PUG2 was cleaved with Hindlll and Sail, followed by electrophoresis to obtain a smaller fragment. The two fragments were combined and treated with T4 DNA ligase before coupling to obtain the plasmid pUG3, in which the subunits A plus B, i.e., β-urogastron gene, were contained in pBR322. The E.ooli strain HB101 was transformed using the plasmid pUG3. The transformant has been deposited under the Budapest Treaty regarding international recognition of filings under the number FERM BP 543 with the Fermentation Research Institute, Agency of Industrial Science and Technology, Ministry of International Trade and Industry, Japan.

In het bovenstaande geval werden eveneens de cellen, die uitsluitend ampicilline-resistentplasmide pUG3 . met een Mlul splitsingsplaats huisvesten, geselecteerd. Eén van de geselecteerde cellen werden op grote 30 schaal gekweekt ter verkrijging van gezuiverd plasmide pUG3. De nucleotidevolgorde van het β-urogastron-gen in pUG3 werd aan beide strengen geanalyseerd met behulp van de Maxam-Gilbert-methode.In the above case, cells containing only ampicillin resistant plasmid pUG3 were also used. with a Mlul housing splitting site, selected. One of the selected cells were grown widely to obtain purified plasmid pUG3. The nucleotide sequence of the β-urogastrone gene in pUG3 was analyzed on both strands using the Maxam-Gilbert method.

Foto 4 toont de resultaten van de analyse. De banen 1 t/m 4 tonen het met het BamHI-Pstl fragment veikregen resultaat. De banen 5 t/m 8 tonen het met hetzelfde monster verkregen resultaat, waarin een gebied van het gedeelte met hoger moleculegewicht (overeenkomende met het bovengedeelte van de 35 banen 1 t/m 4) op grote schaal getoond is. De reactieproducten van de banen zijn dezelfde als de overeenkomstige producten op foto 1. De analyse bevestigde de nucleotidevolgorde van het β-urogastron-gen.Photo 4 shows the results of the analysis. Lanes 1 to 4 show the result obtained with the BamHI-Pstl fragment. Lanes 5 to 8 show the result obtained with the same sample, in which a region of the higher molecular weight portion (corresponding to the upper portion of lanes 1 to 4) is shown in large scale. The reaction products of the lanes are the same as the corresponding products in photo 1. The analysis confirmed the nucleotide sequence of the β-urogastron gene.

7. Expressievector met XPL-promotor.7. Expression vector with XPL promoter.

De XPL-promotor, de linkse promotor van λ-bacteriofaag, werd toegepast voor het exprimeren van 40 β-urogastron, zoals hierna nader beschreven zal worden.The XPL promoter, the left promoter of λ bacteriophage, was used to express 40 β-urogastron, as will be further described below.

Eerst zal de bereiding van een stam ECI-2 afgeleid van E.coli-stam HB101 beschreven worden. ECI-2 diende als gastheer voor λ-PL expressieplasmiden. Vervolgens zal het doneren van een DNA fragment met XPL promotor vanuit het DNA van λ-0Ι85737, dat een mutant van λ-bacteriofaag is, en de opbouw van expressieplasmiden uit het gedoneerde DNA beschreven worden. Voorts zal de expressie van 45 β-urogastron-gen in de ECI-2 gastheerstam door de λΡί-ρπ>ιηοΙοΓ beschreven worden.First, the preparation of a strain ECI-2 derived from E.coli strain HB101 will be described. ECI-2 hosted λ-PL expression plasmids. Next, donating a DNA fragment with XPL promoter from the DNA of λ-0Ι85737, which is a mutant of λ bacteriophage, and the construction of expression plasmids from the donated DNA will be described. Furthermore, the expression of 45 β-urogastron gene in the ECI-2 host strain will be described by the λΡί-ρπ> ιηοΙοΓ.

7-1. Opbouw van de stam ECI-2.7-1. Construction of the strain ECI-2.

De stam ECI-2 is E.coli HB101, dat een plasmide pGH37 voor de expressie van CI857-gen huisvest. pGH37 werd volgens de in figuur 6 getoonde werkwijze bereid. Eerst werd DNA van λΟΙ85737 gesplitst met Bglll. Vervolgens werden de samenhangende uiteinden op de splitsingsplaats gedigereerd met behulp van 50 S1 nudease. Men liet 1 pg met Bglll gesplitst DNA van XCI857S7 30 minuten bij 20°C reageren met 200 eenheden S1 nuclease in 100 pl van een waterige oplossing (pH 4,5) die 200 mM natriumchloride, 30 mM natriumacetaat en 5 mM zinksulfaat bevatte. De aldus verkregen DNA fragmenten met stompe uiteinden werden onderworpen aan een elektroforese met 1,0 gew.% agarosegel om daaruit een fragment met 2385 b.p. met het gehele CI857 structurele gen te isoleren. Het fragment werd opgenomen op de Pvull splitsings-55 plaats van plasmiden pGL101 ter vorming van een plasmide pGH36, dat het CI857-gen exprimeert onder leiding van een promotor, lac UV5. Vervolgens wordt pGH36 gesplitst met twee restrictie-enzymen, EcoRI en Pstl, ter verkrijging van een fragment met 1193 b.p., dat opgenomen werd in een plasmide pSC101 15 192116 tussen de EcoRI en Pstl splitsingsplaatsen ter voiming van een plasmide pGH37.The strain ECI-2 is E.coli HB101, which houses a plasmid pGH37 for the expression of CI857 gene. pGH37 was prepared according to the method shown in Figure 6. First, DNA from λΟΙ85737 was cleaved with Bglll. Then, the cohesive ends were digested at the cleavage site using 50 S1 nudease. 1 µg of BglII cleaved DNA from XCI857S7 was reacted for 30 minutes at 20 ° C with 200 units of S1 nuclease in 100 µl of an aqueous solution (pH 4.5) containing 200 mM sodium chloride, 30 mM sodium acetate and 5 mM zinc sulfate. The blunt-ended DNA fragments thus obtained were subjected to an electrophoresis with 1.0 wt.% Agarose gel to obtain a fragment of 2385 b.p. with the entire CI857 structural gene. The fragment was recorded at the Pvull cleavage-55 site of plasmids pGL101 to form a plasmid pGH36, which expresses the CI857 gene under the direction of a promoter, lac UV5. Then pGH36 is cleaved with two restriction enzymes, EcoRI and Pstl, to obtain a fragment containing 1193 b.p., which was introduced into a plasmid pSC101 192116 between the EcoRI and Pstl cleavage sites to form a plasmid pGH37.

Vervolgens werd de stam HB101 van E.coli getransformeerd met pGH37 volgens de eerder genoemde calcium-methode. Een van de verkregen stammen werd ECI-2 genoemd. De stam ECI-2 is volgens het verdrag van Budapest met betrekking tot internationale erkenning van depots onder nummer FERM BP 542 5 gedeponeerd bij het Fermentation Research Institute, Agency of Industrial Science and Technology, Ministry of International Trade and Industry, Japan. Deze stam is resistent voor tetracycline, exprimeert het CI857 gen en maakt een gelijktijdige aanwezigheid, door transformatie, van andere plasmiden mogelijk, die bijvoorbeeld afgeleid zijn uit pBR322. Dientengevolge werd de stam ECI-2 vervolgens als gastheer voor XPL-expressieplasmiden toegepast.Then the E. coli strain HB101 was transformed with pGH37 according to the aforementioned calcium method. One of the strains obtained was named ECI-2. The ECI-2 strain has been deposited with the Fermentation Research Institute, Agency of Industrial Science and Technology, Ministry of International Trade and Industry, Japan, under number FERM BP 542 5, under the Budapest Convention on International Recognition of Depots. This strain is resistant to tetracycline, expresses the CI857 gene and allows for the simultaneous presence, by transformation, of other plasmids derived, for example, from pBR322. As a result, the ECI-2 strain was then used as a host for XPL expression plasmids.

10 7-2. Cloneren van λΡ^ρΓοπκΛοΓ en bereiding van expiessieplasmiden.10 7-2. Cloning of λΡ ^ ρΓοπκΛοΓ and preparation of expansion plasmids.

Zoals toegelicht in figuur 7 werd eerst pGH35 gevormd. DNA van CI857S7 werd gesplitst met EcoRI en Sail ter verkrijging van een fragment met 5925 b.p., dat de XPL-promotor en het CI857 gen alsmede \PR-promotor bevat. Het fragment werd opgenomen in het plasmide pBR322 tussen de EcoRI en Sail splitsingsplaatsen ter vorming van een plasmide pGH25.As illustrated in Figure 7, pGH35 was first formed. DNA of CI857S7 was cleaved with EcoRI and Sail to obtain a 5925 b.p. fragment containing the XPL promoter and the CI857 gene as well as PR promoter. The fragment was included in the plasmid pBR322 between the EcoRI and Sail cleavage sites to form a plasmid pGH25.

15 Vervolgens werd pGH25 gesplitst met BamHI en gekoppeld aan op soortgelijke wijze met BamHI gesplitst pBR322 ter verkrijging van pGH34.Subsequently, pGH25 was cleaved with BamHI and coupled to pBR322 similarly cleaved with BamHI to give pGH34.

Vervolgens werd pGH34 gesplitst met Aval en BGIII en daarna behandeld met S1 nuclease ter vorming van een fragment met een stomp uiteinde van ongeveer 4500 b.p. Het fragment werd tot een ring gevormd met T4 DNA ligase ter vorming van een plasmide pGH35.Then pGH34 was cleaved with Aval and BGIII and then treated with S1 nuclease to form a blunt-ended fragment of approximately 4500 b.p. The fragment was ringed with T4 DNA ligase to form a plasmid pGH35.

20 Vervolgens werd zoals weergegeven in figuur 8 pEK28 opgebouwd. Synthetische oligonucleotiden C-1-1 en C-1-2 als adaptor, die een SD-volgorde en de hierna vermelde nucleotidevolgorde bevatten, werden gekoppeld aan het fragment, dat verkregen was door splitsing van pGH35 en Hpal. De combinatie werd voorts gekoppeld aan het met BamHI gesplitste plasmide pMC1403 ter verkrijging van plasmide pEG2. Het pEG2 bezit twee ampicilline-resistente genen en exprimeert van pMC1403 afgeleid β-galactosidase-gen 25 onder leiding van XPL-promotor onder toepassing van een startcodon alsmede de SD-volgorde in de adaptor.Then, as shown in figure 8, pEK28 was built up. Synthetic oligonucleotides C-1-1 and C-1-2 as an adapter, containing an SD sequence and the nucleotide sequence listed below, were coupled to the fragment obtained by cleavage of pGH35 and Hpal. The combination was further coupled to the BamHI cleaved plasmid pMC1403 to obtain plasmid pEG2. The pEG2 has two ampicillin resistant genes and expresses pMC1403 derived β-galactosidase gene under the direction of XPL promoter using a start codon as well as the SD sequence in the adapter.

De fragmenten C-1-1 en C-1-2 bezitten de volgende nucleotide-volgorde.Fragments C-1-1 and C-1-2 have the following nucleotide sequence.

SD-volgorde Start-codon.SD order Start codon.

30 C-1-1: 5' A G G A A C A I G A T C T A T G 3' C-1-2: 3'TCCTTGTCTAGATACCTAG 5'30 C-1-1: 5 'A G G A A C A I G A T C T A T G 3' C-1-2: 3'TCCTTGTCTAGATACCTAG 5 '

Bglll 35 De methode van Miller werd toegepast om de expressie van β-galactosidase in de gastheer ECI-2 van het plasmide pEG2 vast te stellen (Miller, J. (1972) ’’Experiments in Molecular Genetics” New York, Cold Spring Harbor Laboratory pp352-355). Deze methode is gebaseerd op de reactie van β-galactosidase met een synthetisch substraat ONPG (o-nitrofenylgalactoside) om een gele verbinding o-nitrofenol vrij te maken. De methode van Miller zal nader beschreven worden. Een hoeveelheid van 0,1 ml van een kweek van een 40 bacteriesoort, waarvan de absorptie gemeten is bij 610 nm, wordt gemengd met 1,9 ml van een proefbuffer (0,1 M natriumfosfaat, pH 7,0,1 mM magnesiumsulfaat en 0,1 M β-mercapto-ethanol) en 15 seconden krachtig geschud met 0,1 ml tolueen om de permeabiliteit van de bacteriesoort te verhogen. De tolueen wordt daarna afgedampt door middel van een aanzuiger. Met toevoeging van 0,2 ml ONPG oplossing (oplossing van 400 mg ONPG in 100 ml proefbuffer) wordt het mengsel bij 30°C geincubeerd tot zich een 45 gele kleur ontwikkelt, waarna 0,5 ml 1 M natriumcaibonaat toegevoegd wordt om de enzymreactie te stoppen. De absorptie van het reactiemengsel wordt bij 420 nm en 550 nm gemeten.Bglll 35 The Miller method was used to determine the expression of β-galactosidase in the host ECI-2 of the plasmid pEG2 (Miller, J. (1972) "Experiments in Molecular Genetics" New York, Cold Spring Harbor Laboratory pp352-355). This method is based on the reaction of β-galactosidase with a synthetic substrate ONPG (o-nitrophenylgalactoside) to release a yellow compound o-nitrophenol. Miller's method will be described in more detail. 0.1 ml of a culture of a 40 bacterial species, the absorbance of which is measured at 610 nm, is mixed with 1.9 ml of a test buffer (0.1 M sodium phosphate, pH 7.1 mM magnesium sulfate and 0.1 M β-mercaptoethanol) and shake vigorously with 0.1 ml toluene for 15 seconds to increase the permeability of the bacterial species. The toluene is then evaporated by means of an aspirator. With the addition of 0.2 ml ONPG solution (solution of 400 mg ONPG in 100 ml test buffer), the mixture is incubated at 30 ° C until a 45 yellow color develops, after which 0.5 ml 1 M sodium caibonate is added to react the enzyme reaction. stop. The absorbance of the reaction mixture is measured at 420 nm and 550 nm.

De activiteit van β-galactosidase wordt gedefinieerd door de eenheden in 1 ml van de kweekvloeistof volgens de onderstaande vergelijking, waarbij de absorptie bij 610 nm berekend is als 1,0.The activity of β-galactosidase is defined by the units in 1 ml of the broth according to the equation below, the absorbance at 610 nm being calculated as 1.0.

Activiteit van β-galactosidase 35 (eenheden) = Q.l^Pf20 ~~ x 9^55° x 1000 50 txvxOD610 t: incubatietijd (minuten) v: aan het reactiesysteem toegevoegde hoeveelheden monster (0,1 ml) OD610: absorptie bij 610 nm van het monster.Activity of β-galactosidase 35 (units) = Ql ^ Pf20 ~~ x 9 ^ 55 ° x 1000 50 txvxOD610 t: incubation time (minutes) v: aliquots added to the reaction system (0.1 ml) OD610: absorbance at 610 nm of the sample.

Bij uitvoering van de bovenstaande methode werd het volgende resultaat verkregen. Wanneer de pEG2 55 herbergende stam ECI-2 bij 30°C werd geincubeerd, bedroeg de β-galactosidase-activiteit 98 eenheden. Wanneer de kweek echter verder gedurende 1 uur bij 42°C werd geincubeerd, werd de XPL-promotor geactiveerd met als resultaat een β-galactosidase-activiteit van 9637 eenheden. Dit bevestigt, dat de 19211$ 16 volgorde van de λΡ,,-promotor tot β-galactosidase de gewenste volgorde is.When the above method was carried out, the following result was obtained. When the pEG2 55 harboring strain ECI-2 was incubated at 30 ° C, the β-galactosidase activity was 98 units. However, when the culture was further incubated for 1 hour at 42 ° C, the XPL promoter was activated resulting in a β-galactosidase activity of 9637 units. This confirms that the 19211 $ 16 sequence from the promoter to β-galactosidase is the desired sequence.

Hoewel pEG2 twee Bglll splitsingsplaatsen bezit, is slechts de onmiddellijk na de SD-volgorde van β-galactosidase aanwezige Bglll plaats noodzakelijk, terwijl de andere plaats ongewenst is. Dientengevolge werd het plasmide met BamHI gesplitst en opnieuw gekoppeld ter verwijdering van een fragment met 5 ongeveer 770 b.p. Aldus werd de opbouw van pEK28, dat een expressieplasmide met toepassing van XPL-promotor is, voltooid.Although pEG2 has two BglII cleavage sites, only the BglII site present immediately after the SD sequence of β-galactosidase is necessary, while the other site is undesirable. As a result, the plasmid was cleaved with BamHI and coupled again to remove a fragment containing approximately 770 b.p. Thus, the construction of pEK28, which is an expression plasmid using XPL promoter, was completed.

7-3. Expressie van gefuseerd gen van de voorste helft van β-urogastron en β-galactosidase.7-3. Expression of fused gene from the anterior half of β-urogastrone and β-galactosidase.

Figuur 9 toont schematisch de reeks van de hierna beschreven procedures.Figure 9 schematically shows the sequence of the procedures described below.

Een plasmide pUG101 werd op de volgende wijze opgebouwd. Dit plasmide is een gefuseerd gen van de 10 voorste helft van β-urogastron en een β-galactosidase. Meer in het bijzonder werd pUG1, dat de voorste helft van β-urogastron-gen bevat, en pMC1403 met een β-galactosidase-gen gesplitst met BamHI en vervolgens gekoppeld ter vorming van pUG101. Met dit plasmide zijn de voorste helft van het β-urogastron-gen en het β-galactosidase-gen in hetzelfde frame gekoppeld. Dientengevolge exprimeert het plasmide de aminozuurvolgorde van de twee als een gefuseerd eiwit.A plasmid pUG101 was constructed in the following manner. This plasmid is a fused front half gene of β-urogastron and a β-galactosidase. More specifically, pUG1, which contains the front half of β-urogastron gene, and pMC1403 with a β-galactosidase gene was cleaved with BamHI and then coupled to form pUG101. The front half of the β-urogastron gene and the β-galactosidase gene are linked to this plasmid in the same frame. As a result, the plasmid expresses the amino acid sequence of the two as a fused protein.

15 Voor de expressie met dit plasmide onder leiding van de λΡι/ριοιηοΙοΓ, werden pUG101 en pEK28 elk gesplitst met Bglll.For expression with this plasmid under the direction of the λΡι / ριοιηοΙοΓ, pUG101 and pEK28 were each split with BglII.

De splitsing met Bglll levert een DNA-fragment met uitstekende 5'-einden in de vorm van ( jcTAg)-Wanneer men het DNA-fragment echter laat reageren met een groot fragment van E.coli DNA polymerase I (Klenow fragment) in aanwezigheid van de vier soorten deoxribonucleotide-trifosfaten dGTP, dATP, dTTP en dCTP, wordt een stomp uiteinde verkregen door opvullen met de overeenkomstige nucleotiden, die het uiteinde (" jctag) νοΓΤΤ1θη· Wanneer alleen dGTP wordt toegevoegd als nucleotidebestanddeel, wordt het uiteinde ( "jctag) ver^re9®n tengevolge van de beëindiging van de reactie. Vervolgens, wanneer 2^ S1 -nuclease wordt toegepast voor het digereren van de resterende enkele streng, wordt een stomp uiteinde in de vorm van (" jq) verkregen. Op soortgelijke wijze wordt, wanneer dGTP en dATP toegevoegd worden bij de Klenow-reactie, gevolgd door digereren met S1-nuclease, (” jqj) verkregen. Wanneer de Klenow-reactie uitgevoerd wordt door toevoeging van dGTP, dATP en dTTP, gevolgd door digereren met (AGAT\ TCTA/ veri<r®9en· Voorts wordt, wanneer alleen het digereren met S1-nucleaseThe BglII cleavage yields a DNA fragment with protruding 5 'ends in the form of (jcTAg). However, when the DNA fragment is reacted with a large fragment of E.coli DNA polymerase I (Klenow fragment) in the presence of the four types of deoxribonucleotide triphosphates dGTP, dATP, dTTP and dCTP, a blunt end is obtained by padding with the corresponding nucleotides, which is the end ("jctag) νοΓΤΤ1θη · When only dGTP is added as a nucleotide constituent, the end (" jctag) due to the termination of the reaction. Then, when 2 ^ S1 nuclease is used to digest the remaining single strand, a blunt end in the form of ("jq) is obtained. Similarly, when dGTP and dATP are added in the Klenow reaction, followed by digestion with S1 nuclease, ("jqj) obtained. When Klenow reaction is performed by addition of dGTP, dATP and dTTP, followed by digestion with (AGAT \ TCTA / veri <r®9en · Furthermore, when only digestion with S1 nuclease

wordt uitgevoerd zonder uitvoering van de Klenow-reactie, ("’j) verkregen. Wanneer derhalve het DNAis performed without performing the Klenow reaction, ("j"). Therefore, when the DNA

fragment met het uiteinde ( "jctag) ond®rworpen wordt aan de Klenow-reactie met gebruik van verschillende nucleotiden en/of aan de S1-nuclease-reactie, worden vijf soorten stompe uiteinden verkregen, die 35 van elkaar verschillen door de lengte van een basenpaar.fragment with the end ("jctag) is subjected to the Klenow reaction using different nucleotides and / or to the S1 nuclease reaction, five kinds of blunt ends are obtained, differing from each other by the length of a base pair.

De Klenow-reactie en S1-nuclease-reactie werden onder de volgende omstandigheden uitgevoerd. xKlenow-reactie:The Klenow reaction and S1 nuclease reaction were performed under the following conditions. xKlenow response:

Men liet 1 pg DNA als substraat reageren met 1 mM van elk desoxyribonucleotidetrifosfaat gedurende 30 minuten bij 12°C in aanwezigheid van 1 eenheid van het enzym (Klenow-fragment) en 1 mM ATP in 50 40 pi van een reactiemedium, dat 40 mM kaliumfosfaatbuffer (pH 7,4), 1 mM β-mercapto-ethanol en 10 mM magnesiumchloride bevat.1 µg of DNA as substrate was reacted with 1 mM of each deoxyribonucleotide triphosphate for 30 minutes at 12 ° C in the presence of 1 unit of the enzyme (Klenow fragment) and 1 mM ATP in 50 µl of a reaction medium containing 40 mM potassium phosphate buffer (pH 7.4), contains 1 mM β-mercaptoethanol and 10 mM magnesium chloride.

XS1 -nuclease-reactie:XS1 nuclease reaction:

Men liet 1 pg DNA als substraat en 200 eenheden van het enzym gedurende 30 minuten bij 20°C reageren in 100 pl van een reactiemedium, dat 200 mM natriumchloride, 30 mM natriumacetaat en 5 mM 45 zinksulfaat bevat (pH 4,5).1 µg of DNA as substrate and 200 units of the enzyme were reacted for 30 minutes at 20 ° C in 100 µl of a reaction medium containing 200 mM sodium chloride, 30 mM sodium acetate and 5 mM 45 zinc sulfate (pH 4.5).

pEK28 en pUG101 werden elk gesplitst met Bglll en vervolgens onderworpen aan verschillende combinaties van de Klenow-reactie en de S1-nuclease-reactie, waardoor fragmenten met vijf soorten stompe uiteinden verkregen werden. Bij combinatie van de twee typen van deze fragmenten werden 21 combinaties verkregen, die van elkaar verschilde in het aantal en de volgorde van de nucleotiden tussen de 50 SD-volgorde en het startcodon van het gefuseerde eiwit, zoals vermeld in tabel 2.pEK28 and pUG101 were each cleaved with BglII and then subjected to different combinations of the Klenow reaction and the S1 nuclease reaction, yielding fragments with five kinds of blunt ends. Combining the two types of these fragments, 21 combinations were obtained, which differed in the number and sequence of the nucleotides between the 50 SD sequence and the starting codon of the fused protein, as listed in Table 2.

In de praktijk werden de aldus verkregen DNA-fragmenten gesplitst met Sail ter isolatie van fragmenten, die het gen bevatten, dat codeert voor gefuseerd eiwit van de voorste β-urogastronhelft en β-galactosidase uit pUG101, en fragmenten met λ-Ρ^-promotor uit pEK28. Deze fragmenten werden gekoppeld door T4 DNA ligase in de in tabel 2 vermelde combinaties.In practice, the DNA fragments thus obtained were cleaved with Sail to isolate fragments containing the gene encoding fused protein of the front β-urogastron half and β-galactosidase from pUG101, and fragments with λ-Ρ ^ promoter. from pEK28. These fragments were coupled by T4 DNA ligase in the combinations listed in Table 2.

55 Dientengevolge werden de recombinant-plasmiden in tabel 3 verkregen. De β-galactosidase-activiteit van de geëxprimeerde gefuseerde eiwitten werd gemeten volgens methode van Miller. Tabel 3 toont, dat alle geëxprimeerde plasmiden een betrekkelijk hoog niveau van β-galactosidase-activiteit bezitten. In het 17 192116 bijzonder pUG103, pUG104 en pUG117 bereikten opmerkelijke resultaten.As a result, the recombinant plasmids in Table 3 were obtained. The β-galactosidase activity of the expressed fused proteins was measured by Miller method. Table 3 shows that all expressed plasmids have a relatively high level of β-galactosidase activity. In particular pUG103, pUG104 and pUG117, 192116 achieved remarkable results.

TABEL 2 5 Nucleotide-volgorde bovenstrooms van het start-codon (ATG)TABLE 2 5 Nucleotide Sequence Upstream of the Start Codon (ATG)

ATCTGC- GATCTGCATCTGC- GATCTGC

Nucleotide- -ACA -ACAATCTGC- -ACAGATCTGC- volgorde (pUG105) (pUG106) 10 benedenstrooms -ACAG - -ACAGGATCTGC- van SD-volgorde (pUG110) (AGGA) -ACAGA -ACAGAATCTGC- -ACAGAGATCTGC- (pUG113) (pUG114) -ACAGAT -ACAG ATATCTGC- -ACAGATGATCTGC- 15 (pUG117) (pUG118) -ACAGATC -ACAGATCATCTGC- -ACAGATCGATCTGC- (pUG121) (pUG122)Nucleotide -ACA -ACAATCTGC- -ACAGATCTGC order (pUG105) (pUG106) 10 downstream -ACAG - -ACAGGATCTGC- of SD order (pUG110) (AGGA) -ACAGA -ACAGAATCTGC- -ACAGAGATCTGC- (pUG114) - ACAGAT -ACAG ATATCTGC- -ACAGATGATCTGC- 15 (pUG117) (pUG118) -ACAGATC -ACAGATCATCTGC- -ACAGATCGATCTGC- (pUG122)

Nucleotide-volgorde bovenstrooms van het start-oodon (ATG) 20 - TGC- CTGC- TCTGC-Nucleotide sequence upstream of the start oodon (ATG) 20 - TGC- CTGC- TCTGC-

Nucleotide- -ACA -ACATGC- -ACACTGC- -ACATCTGC- volgorde (pUG102) (pUG103) (pUG104) benedenstrooms -ACAG -ACAGTGC- -ACAGCTGC- -ACAGTCTGC- 25 van de SD-volgorde <PUG107> <PUG108> (PUG109> (AGGA) -ACAGA -ACAGATGC- -ACAGACT GC- (pUG111) (pUG112) -ACAGAT -ACAGATTGC- - -ACAGATTCTGC- 30 (pUG115) (pUG116) -ACAGATC - -ACAGATCCTGC- -ACAGATCTCTGC- (pUG119) (pUG120) 35 TABEL 3Nucleotide -ACA -ACATGC- -ACACTGC- -ACATCTGC order (pUG102) (pUG103) (pUG104) downstream -ACAG -ACAGTGC- -ACAGCTGC- -ACAGTCTGC- 25 of the SD order <PUG107> <PUG109> (PUG109> (AGGA) -ACAGA -ACAGATGC- -ACAGACT GC- (pUG111) (pUG112) -ACAGAT -ACAGATTGC- - -ACAGATTCTGC- 30 (pUG115) (pUG116) -ACAGATC - -ACAGATCCTGC- -ACAGATCTCTGC- (pUG119) TABLE 3

Aantal nucleotiden tussen de SD-volgorde en het Recombinantplasmide β-Galactosidase startcodon (eenheden) 40 6 pUG102 1674 7 pUG103 2533 7 pUG107 2260 8 pUG104 2802 8 pUG108 1835 45 9 pUG105 1018 9 pUG109 1942 10 pUG106 973 11 pUG110 1764 11 pUG113 1950 50 11 pUG119 1862 12 pUG114 946 12 pUG117 2332 12 pUG120 1374 13 pUG118 2041 55 13 pUG121 1678 14 pUG122 1814 192116 18Number of nucleotides between the SD sequence and the Recombinant plasmid β-Galactosidase start codon (units) 40 6 pUG102 1674 7 pUG103 2533 7 pUG107 2260 8 pUG104 2802 8 pUG108 1835 45 9 pUG105 1018 9 pUG109 1942 10 pUG106 973 11 pUG110 1764 11 11 pUG119 1862 12 pUG114 946 12 pUG117 2332 12 pUG120 1374 13 pUG118 2041 55 13 pUG121 1678 14 pUG122 1814 192116 18

Vervolgens werd een vector voor de expressie van β-urogastron bereid uit pUG103 of pUG117. Het plasmide (pUG103 of pUG117) werd gesplitst met Hindlll en Pvull ter verkrijging van een fragment van 1,2 kb, dat het gebied van XPL-promotor tot de voorste helft van β-urogastron-gen bevatte. Voorts werd pUG2 gesplitst met EcoRI, aangevuld met een Klenow-fragment en gesplitst met Hindlll ter verkrijging van een 5 fragment van 4,1 kb. De twee fragmenten werden gekoppeld met T4 DNA ligase, en de stam ECI-2 van E.coli werd getransformeerd volgens de eerder genoemde calcium-methode ter verkrijging van een recombinant, die het plasmide pUG103-E of pUG117-E bevat voor de expressie van de combinatie van de voorste helft en de achterste helft van het β-urogastron-gen, d.w.z. het gehele β-urogastron-gen, onder leiding van APL-promotor.Then a vector for the expression of β-urogastron was prepared from pUG103 or pUG117. The plasmid (pUG103 or pUG117) was cleaved with Hindlll and Pvull to obtain a 1.2 kb fragment containing the region of XPL promoter to the front half of β-urogastron gene. Furthermore, pUG2 was cleaved with EcoRI supplemented with a Klenow fragment and cleaved with HindIII to give a 4.1 kb fragment. The two fragments were coupled with T4 DNA ligase, and the E.coli strain ECI-2 was transformed according to the aforementioned calcium method to obtain a recombinant containing the plasmid pUG103-E or pUG117-E for the expression of the combination of the anterior and posterior halves of the β-urogastron gene, ie the entire β-urogastron gene, under the direction of APL promoter.

10 8. Vector voor de expressie van gefuseerd eiwit.10 8. Vector for the expression of fused protein.

Een β-lactamase-gen op het plasmide pBR322 en een β-urogastron-gen werden gekoppeld voor het exprimeren van β-urogastron als gefuseerd eiwit, zoals hierna beschreven zal worden.A β-lactamase gene on the plasmid pBR322 and a β-urogastron gene were linked to express β-urogastron as a fused protein, as will be described below.

8-1. Donor van β-lactamase-gen.8-1. Donor of β-lactamase gene.

pBRH02 wordt verkregen door splitsen van pBR322 met Aval en Pvull, gevolgd door de Klenow-reactie 15 en koppeling door T4 DNA ligase. Dit plasmide bezit genen voor ampicilline-resistentie (ApR) en tetracycline-resistentie (TcR) als markeringen. pBRH03 wordt verkregen door splitsen van pBR325 met Aval en Hindlll, gevolgd door de Klenow-reactie en koppeling en bevat ApR en chloorampfenicol-resistentie (CmR) als markeringen. Figuur 10 toont deze plasmiden.pBRH02 is obtained by cleavage of pBR322 with Aval and Pvull followed by the Klenow reaction and coupling by T4 DNA ligase. This plasmid has ampicillin resistance (ApR) and tetracycline resistance (TcR) genes as markers. pBRH03 is obtained by cleaving pBR325 with Aval and Hindll1 followed by the Klenow reaction and coupling and contains ApR and chloramphenicol resistance (CmR) as markers. Figure 10 shows these plasmids.

8-2. Donor van β-urogastron-gen.8-2. Donor of β-urogastron gene.

20 Op de reeds beschreven wijze bereid pUG3 werd gesplitst met Mboll ter verkrijging van 13 soorten DNA-fragmenten, die A t/m M genoemd werden in de volgorde van afmeting zoals weergegeven in figuur 11. Van deze DNA-fragmenten werd gevonden, dat het H-fragment bestond uit 179 b.p. beginnend met een voor asparaginecoderend nucleotide aan het N-uiteinde van β-urogastron en eindigend met 16 basen benedenstrooms van het stopcodon, waarbij het fragment het gehele structurele gen van β-urogastron 25 bevat. Om het H-fragment te isoleren werden de fragmenten onderworpen aan elektroforese met 6 gew.%’s polyacrylamidegel en werd het fragment gezuiverd.PUG3 prepared in the manner already described was cleaved with Mboll to obtain 13 kinds of DNA fragments, named A to M in the order of size shown in Figure 11. These DNA fragments were found to H fragment was 179 bp starting with an asparagine-encoding nucleotide at the N-terminus of β-urogastron and ending with 16 bases downstream of the stop codon, the fragment containing the entire structural gene of β-urogastron. To isolate the H fragment, the fragments were electrophoresed with 6 wt% polyacrylamide gel and the fragment purified.

8-3. Adaptor.8-3. Adapter.

Als adapteren werden de in tabel 4 vermelde oligonucleotiden op de reeds eerder beschreven wijze bereid. Deze adaptoren werden zo ontworpen, dat ze coderen voor het basische aminozuurpaar van 30 Lys-Arg of Arg-Lys voor het enzymatisch afsplitsen van β-urogastron uit het geèxprimeerde gefuseerde eiwit.As adapters, the oligonucleotides listed in Table 4 were prepared in the manner previously described. These adapters were designed to encode the basic amino acid pair of Lys-Arg or Arg-Lys for the enzymatic cleavage of β-urogastron from the expressed fused protein.

TABEL 4 35 Adaptor 5'-einde — 3'-eindeTABLE 4 35 Adapter 5 'end - 3' end

D-1-3 CCGTAAGD-1-3 CCG TAAG

D-1-4 TTACGGD-1-4 TTACGG

D-2-1 CGTAAGD-2-1 CGTAAG

40 D-2-2 TTACG40 D-2-2 TTACG

D-3-2 TTACGGATD-3-2 TTACGGAT

D-4-2 TTACGTGCAD-4-2 TTACGTGCA

E-1 CGCTAAACGGE-1 CGCTAAACGG

E-2 CGTTTAGCGE-2 CGTTTAGCG

45 E-3 GACAAACGG45 E-3 GACAAACGG

E-4 CGTTTGTCE-4 CGTTTGTC

E-5 CGTTTAGCGATE-5 CGTTTAGCGAT

E-6 CGTTTGTCTGCAE-6 CGTTTGTCTGCA

E-7 CGGCTAAACGGE-7 CGGCTAAACGG

50 E-8 CGTTTAGCCG50 E-8 CGTTTAGCCG

E-9 CAAACGGE-9 CAAACGG

E-10 CGTTTGE-10 CGTTTG

55 8-4. Systeem voor de expressie van gefuseerd eiwit van β-lactamase en β-urogastron verbonden door Lys-Arg.55 8-4. System for the expression of fused protein of β-lactamase and β-urogastron linked by Lys-Arg.

Een vector voor de expressie van β-Ιβοίθητοβθ-β-υιχχϊθείΐΌη^θίυβθθκΙ eiwit werd zodanig bereid, dat 19 192116 een herkenningsvolgorde voor restrictie-enzym gevormd zou worden in het gebied, dat een adaptor bevat.A vector for the expression of β-Ιβοίθητοβθ-β-υιχχϊθείΐΌη ^ θίυβθθκΙ protein was prepared such that 19 192116 would form a restriction enzyme recognition sequence in the region containing an adapter.

8-4-a. Opbouw van pUG2301 t/m pUG2303.8-4-a. Construction of pUG2301 to pUG2303.

De in figuur 12 weergegeven werkwijze werd uitgevoerd.The procedure shown in Figure 12 was performed.

Het plasmide pBRH02 werd gedurende 3 uur bij 37°C volledig gesplitst met Xmnl. Vervolgens werden 3 5 pg van de vector, ongeveer 0,1 pg β-urogastronfragment van 179 b.p. en ongeveer 1 pg van zowel E-1 als E-2 (met niet-gefosforyleerd 5'-uiteinde) als adaptor in een enkele trap gedurende 15 uur bij 12°C gekoppeld ter verkrijging van plasmiden als expressievector. De stam HB101 werd getransformeerd met behulp van de plasmiden volgens de calcium-methode.The plasmid pBRH02 was cleaved completely with Xmnl for 3 hours at 37 ° C. Then, 3 µg of the vector, approximately 0.1 µg of β-urogastrone fragment of 179 b.p. and coupled about 1 µg of both E-1 and E-2 (with nonphosphorylated 5 'end) as a single stage adapter for 15 hours at 12 ° C to obtain plasmids as expression vector. The strain HB101 was transformed using the plasmids according to the calcium method.

Van de verkregen 499 TcR kolonies waren 168 kolonies (33,7%) Aps. Deze kolonies werden door 10 mini-bereiding gecontroleerd op de afmeting van het plasmide DNA. Dertien plasmiden waren ongeveer 200 b.p. groter dan de vector en werden verondersteld een daarin opgenomen β-urogastron-gen te bevatten.Of the 499 TcR colonies obtained, 168 colonies (33.7%) were Aps. These colonies were mini-checked for the size of the plasmid DNA. Thirteen plasmids were approximately 200 b.p. larger than the vector and were believed to contain a β-urogastrone gene contained therein.

Alle plasmiden met een Mlul-plaats werden gesplitst met Hinfl en gecontroleerd op de oriëntatie van de opname van het β-urogastron-gen door middel van elektroforese met 1,5 gew.% agarose-gel. Drie van de gecontroleerde plasmiden gaven fragmenten van ongeveer 1050 b.p. en ongeveer 800 b.p. Dit toonde, dat 15 het β-urogastron-gen opgenomen was met dezelfde oriëntatie als β-lactamase. Deze drie plasmiden werden pUG2301 t/m pUG2303 genoemd.All plasmids with a Mlul site were cleaved with Hinfl and checked for the orientation of the β-urogastron gene uptake by electrophoresis with 1.5 wt% agarose gel. Three of the controlled plasmids gave fragments of about 1050 b.p. and about 800 b.p. This showed that the β-urogastron gene was included with the same orientation as β-lactamase. These three plasmids were designated pUG2301 through pUG2303.

8-4-b. Opbouw van pUG2101 t/m pUG2105.8-4-b. Construction of pUG2101 to pUG2105.

De in figuur 13 weergegeven werkwijze werd uitgevoerd.The procedure shown in Figure 13 was performed.

Het plasmide pBR322 werd toegepast als plasmidevector met een enkele Pvul plaats in het β-lactamase-20 gen. Volgens de in 8-4-a beschreven werkwijze werd een expressievector gevormd onder toepassing van E-1 en E-5 als adaptor.The plasmid pBR322 was used as a single Pvul plasmid vector site in the β-lactamase-20 gene. According to the method described in 8-4-a, an expression vector was generated using E-1 and E-5 as an adapter.

Wanneer de verkregen 1626 TcR-kolonies gecontroleerd werden op Ap-gevoeligheid, waren 31 kolonies (1,9%) Aps. Een minibereiding werd uitgevoerd voor de 22 TcR en Aps kolonies en de plasmiden werden gecontroleerd op de opname van β-urogastron-gen door splitsing van Mlul. Gevonden werd, dat twintig 25 plasmiden een Mlul plaats bezaten. De oriëntatie werd gecontroleerd door splitsen met Hinfl of BamHI. Gevonden werd, dat de plasmiden pUG2101 t/m pUG2105 een daarin opgenomen β-urogastron-gen met dezelfde oriëntatie als het β-lactamase-gen bevatten.When the obtained 1626 TcR colonies were checked for Ap sensitivity, 31 colonies (1.9%) were Aps. A mini preparation was performed for the 22 TcR and Aps colonies and the plasmids were checked for the uptake of β-urogastron gene by cleavage of Mlul. Twenty plasmids were found to have an Mlul site. The orientation was checked by splitting with Hinfl or BamHI. The plasmids pUG2101 through pUG2105 were found to contain a β-urogastrone gene contained therein with the same orientation as the β-lactamase gene.

8-4-c. Opbouw van pUG2701 t/m pUG2703.8-4-c. Construction of pUG2701 to pUG2703.

Expressieplasmiden werden gevormd volgens dezelfde methode als 8-4-a onder toepassing van 30 pBR322 als vector en E-7 en E-8 als adaptor, zoals weergegeven in figuur 14.Expression plasmids were generated by the same method as 8-4-a using pBR322 as vector and E-7 and E-8 as adapter as shown in Figure 14.

Van de verkregen 217 TcR kolonies waren 106 kolonies (48,8%) Aps. Een minibereiding werd urtgevoerd voor 25 van deze kolonies. Acht van de plasmiden waren ongeveer 200 b.p. groter dan de vector en bleken een daarin opgenomen β-urogastron-gen te bevatten, zodat deze acht plasmiden gesplitst werden met BamHI en gecontroleerd werden op de oriëntatie van het gen. Gevonden werd, dat drie plasmiden het 35 β-urogastron-gen met dezelfde oriëntatie als β-lactamase bevatten en deze werden pUG2701 t/m 2703 genoemd.Of the 217 TcR colonies obtained, 106 colonies (48.8%) were Aps. A mini preparation was carried out for 25 of these colonies. Eight of the plasmids were approximately 200 b.p. larger than the vector and were found to contain an β-urogastron gene contained therein, so that these eight plasmids were cleaved with BamHI and checked for gene orientation. Three plasmids were found to contain the β-urogastrone gene with the same orientation as β-lactamase and were designated pUG2701 through 2703.

Het volgens de bovenstaande methode 8-4-a verkregen plasmide pUG2301 levert een gefuseerd «wit van een gedeelte van β-lactamase en β-urogastron. De voorspelde aminozuurvolgorde en de overeenkomstige nucleotide-volgorde zijn hierna vermeld.The plasmid pUG2301 obtained by the above method 8-4-a yields a fused white of a portion of β-lactamase and β-urogastrone. The predicted amino acid sequence and the corresponding nucleotide sequence are listed below.

40 Met Ser He Gin His Phe Arg Val40 With Ser He Gin His Phe Arg Val

ATG AGT ATT CAA CAT TTC CGT GTCATG AGT ATT CAA CAT TTC CGT GTC

Ala Leu lie Pro Phe Phe Ala AlaAla Leu lie Pro Phe Phe Ala Ala

GCC CTT ATT CCC TTT TTT GCG GCAGCC CTT ATT CCC TTT TTT GCG GCA

4545

Phe Cys Leu Pro Val Phe Ala HisPhe Cys Leu Pro Val Phe Ala His

TTT TGC CTT CCT GTT TTT GCT CACTTT TGC CTT CCT GTT TTT GCT CAC

Pro Glu Thr Leu Val Lys Val LysPro Glu Thr Leu Val Lys Val Lys

50 CCA GAA ACG CTG GTG AAA GTA AAA50 CCA GAA ACG CTG GTG AAA GTA AAA

Asp Ala Glu Asp Gin Leu Gly AlaAsp Ala Glu Asp Gin Leu Gly Ala

GAT GCT GAA GAT CAG TTG GGT GCAHOLE GCT GAA HOLE CAG TTG GGT GCA

55 Arg Val Gly Tyr He Glu Leu Asp55 Arg Val Gly Tyr He Glu Leu Asp

CGA GTG GGT TAC ATC GAA CTG GATCGA GTG GGT TAC ATC GAA CTG GAT

192116 20192116 20

Leu Asn Ser Gly Lys lie Leu GluLeu Asn Ser Gly Lys lie Leu Glu

CTC AAC AGC GGT AAG ATC CTT GAGCTC AAC AGC GGT AAG ATC CTT GAG

Ser Phe Arg Pro Glu Glu Arg AlaSer Phe Arg Pro Glu Glu Arg Ala

5 AGT TTT CGC CCC GAA GAA CGC GCT5 AGT TTT CGC CCC GAA GAA CGC GCT

Lys Arg Asn Ser Asp Ser Glu CysLys Arg Asn Ser Asp Ser Glu Cys

AAA_ CGG AAT AGC GAT TCT GAG TGCAAA_ CGG AAT AGC GAT TCT GAG TGC

10 Pro Leu Ser His Asp Gly Tyr Cys10 Pro Leu Ser His Asp Gly Tyr Cys

CCA CTG TCT CAC GAT GGC TAT TGTCCA CTG TCT CAC GAT GGC TAT TGT

Leu His Asp Gly Val Cys Met TyrLeu His Asp Gly Val Cys Met Tyr

CTG CAC GAC GGT GTT TGC ATG TACCTG CAC GAC GGT GTT TGC ATG TAC

1515

He Glu Ala Leu Asp Lys Tyr AlaHe Glu Ala Leu Asp Lys Tyr Ala

ATC GAA GCT TTG GAT AAA TAC GCGATC GAA GCT TTG GAT AAA TAC GCG

Cys Asn Cys Val Val Gly Tyr lieCys Asn Cys Val Val Gly Tyr lie

20 TGT AAC TGT GTA GTG GGT TAT ATC20 TGT AAC TGT GTA GTG GGT TAT ATC

Gyl Glu Arg Cys Gin Tyr Arg AspGyl Glu Arg Cys Gin Tyr Arg Asp

GGT GAA CGC TGT CAA TAC CGT GATGGT GAA CGC TGT CAA TAC CGT GAT

25 Leu Lys Trp Trp Glu Leu Arg (stop)25 Leu Lys Trp Trp Glu Leu Arg (stop)

CTG AAA TGG TGG GAA TTG CGT TAACTG AAA TGG TGG GAA TTG CGT TAA

TAGTGAAGATCTGGATCCGTTTAGCGTTTTCCATAGTGAAGATCTGGATCCGTTTAGCGTTTTCCA

ATGATGAGCACTTTTAAAGTTCTGCTATGTGGCATGATGAGCACTTTTAAAGTTCTGCTATGTGGC

30 GCGGTATTATCCCGTGTTGACGCCGGGCAAGAG30 GCGGTATTATCCCGTGTTGACGCCGGGCAAGAG

CAACTCGGTCGCCG CATACCAACTCGGTCGCCG CATAC

Op soortgelijke wijze vormt het volgens de methode 8-4-b verkregen plasmide pUG2101 een gefuseerd 35 eiwit met de volgende primaire structuur.Similarly, the plasmid pUG2101 obtained by the method 8-4-b forms a fused protein with the following primary structure.

Met Ser lie Gin His Phe Arg ValWith Ser lie Gin His Phe Arg Val

ATG AGT ATT CAA CAT TTC CGT GTCATG AGT ATT CAA CAT TTC CGT GTC

40 Ala Leu lie Pro Phe Phe Ala Ala40 Ala Leu lie Pro Phe Phe Ala Ala

GCC CTT ATT CCC TTT TTT GCG GCAGCC CTT ATT CCC TTT TTT GCG GCA

Phe Cys Leu Pro Val Phe Ala HisPhe Cys Leu Pro Val Phe Ala His

TTT TGC CTT CCT GTT TTT GCT CACTTT TGC CTT CCT GTT TTT GCT CAC

4545

Pro Glu Thr Leu Val Lys Val LysPro Glu Thr Leu Val Lys Val Lys

CCA GAA ACG CTG GTG AAA GTA AAACCA GAA ACG CTG GTG AAA GTA AAA

Asp Ala Glu Asp Gin Leu Gly AlaAsp Ala Glu Asp Gin Leu Gly Ala

50 GAT GCT GAA GAT CAG TTG GGT GCA50 HOLE GCT GOA HOLE CAG TTG GGT GCA

Arg Val Gly Tyr He Glu Leu AspArg Val Gly Tyr He Glu Leu Asp

CGA GTG GGT TAC ATC GAA CTG GATCGA GTG GGT TAC ATC GAA CTG GAT

55 Leu Asn Ser Gly Lys He Leu Glu55 Leu Asn Ser Gly Lys He Leu Glu

CTC AAC AGC GGT AAG ATC CTT GAGCTC AAC AGC GGT AAG ATC CTT GAG

21 19211621 192116

Ser Phe Arg Pro Glu Glu Arg PheSer Phe Arg Pro Glu Glu Arg Phe

AGT TTT CGC CCC GAA GAA CGT TTTAGT TTT CGC CCC GAA GAA CGT TTT

Pro Met Met Ser Thr Phe Lys VaiPro With With Ser Thr Phe Lys Vai

5 CCA ATG ATG AGC ACT TTT AAA GTT5 CCA ATG ATG AGC ACT TTT AAA GTT

Leu Leu Cys Gly Ala Val Leu SerLeu Leu Cys Gly Ala Val Leu Ser

CTG CTA TGT GGC GCG GTA TTA TCCCTG CTA TGT GGC GCG GTA TTA TCC

10 Arg Val Asp Ala Gly Gin Glu Gin10 Arg Val Asp Ala Gly Gin Glu Gin

CGT GTT GAC GCC GGG CAA GAG CAACGT GTT GAC GCC GGG CAA GAG CAA

Leu Gly Arg Arg He His Tyr SerLeu Gly Arg Arg He His Tyr Ser

CTC GGT CGC CGC ATA CAC TAT TCTCTC GGT CGC CGC ATA CAC TAT TCT

1515

Gin Asn Asp lie Val Glu Tyr SerGin Asn Asp lie Val Glu Tyr Ser

CAG AAT GAC TTG GTT GAG TAC TCACAG AT GAC TTG GTT GAG TAC TCA

Pro Val Thr Glu Lys His Leu ThrPro Val Thr Glu Lys His Leu Thr

20 CCA GTC ACA GAA AAG CAT CTT ACG20 CCA GTC ACA GAA AAG CAT CTT ACG

Asp Gly Met Thr Val Arg Glu LeuAsp Gly With Thr Val Arg Glu Leu

GAT GGC ATG ACA GTA AGA GAA TTAHOLE GGC ATG ACA GTA AGA GAA TTA

25 Cys Ser Ala Ala lie Thr Met Ser25 Cys Ser Ala Ala lie Thr Met Ser

TGC AGT GCT GCC ATA ACC ATG AGTTGC AGT GCT GCC ATA ACC ATG AGT

Asp Asn Thr Ala Ala Asn Leu LeuAsp Asn Thr Ala Ala Asn Leu Leu

GAT AAC ACT GCG GCC AAC TTA CTTHOLE AAC ACT GCG GCC AAC TTA CTT

3030

Leu Thr Thr lie Ala Lys Arg AsnLeu Thr Thr lie Ala Lys Arg Asn

CTG ACA ACG ATC_GCT_AAA_CGG AATCTG ACA ACG ATC_GCT_AAA_CGG ATH

Ser Asp Ser Glu Cys Pro Leu SerSer Asp Ser Glu Cys Pro Leu Ser

35 AGC GAT TCT GAG TGC CCA CTG TCT35 AGC GAT TCT GAG TGC CCA CTG TCT

His Asp Gly Tyr Cys Leu His AspHis Asp Gly Tyr Cys Leu His Asp

CAC GAT GGC TAT TGT CTG CAC GACCAC GAT GGC TAT TGT CTG CAC GAC

40 Gly Val Cys Met Tyr lie Glu Ala40 Gly Val Cys With Tyr lie Glu Ala

GGT GTT TGC ATG TAC ATC GAA GCTGGT GTT TGC ATG TAC ATC GAA GCT

Leu Asp Lys Tyr Ala Cys Asn CysLeu Asp Lys Tyr Ala Cys Asn Cys

TTG GAT AAA TAC GCG TGT AAC TGTTTG HOLE AAA TAC GCG TGT AAC TGT

4545

Val Val Gly Tyr lie Gly Glu ArgVal Val Gly Tyr lie Gly Glu Arg

GTA GTG GGT TAT ATC GGT GAA CGCGTA GTG GGT TAT ATC GGT GAA CGC

Cys Gin Tyr Arg Asp Leu Lys TrpCys Gin Tyr Arg Asp Leu Lys Trp

50 TGT CAA TAC CGT GAT CTG AAA TGG50 TGT CAA TAC CGT GAT CTG AAA TGG

Trp Glu Leu Arg (stop)Trp Glu Leu Arg (stop)

TGG GAA TTG CGT TAA TAGTGAAG AT CTGG GAA TTG CGT TAA TAGTGAAG AT C

192116 22192116 22

TGGATCCGTTTAGCGATCGGAGGACCGAAGGTGGATCCGTTTAGCGATCGGAGGACCGAAGG

AGCTAACCGCTTTTTTGCACAAGCTAACCGCTTTTTTGCACA

Op soortgelijke wijze vormt het volgens de methode 8-4-c verkregen plasmide pUG2701 een gefuseerd eiwit met de volgende primaire structuur.Similarly, the plasmid pUG2701 obtained by the method 8-4-c forms a fused protein with the following primary structure.

55

Met Ser lie Gin His Phe Arg ValWith Ser lie Gin His Phe Arg Val

ATG AGT ATT CAA CAT TTC CGT GTCATG AGT ATT CAA CAT TTC CGT GTC

Ala Leu lie Pro Phe Phe Ala AlaAla Leu lie Pro Phe Phe Ala Ala

10 GCC CTT ATT CCC TTT TTT GCG GCA10 GCC CTT ATT CCC TTT TTT GCG GCA

Phe Cys Leu Pro Val Phe Ala HisPhe Cys Leu Pro Val Phe Ala His

TTT TGC CTT CCT GTT TTT GCT CACTTT TGC CTT CCT GTT TTT GCT CAC

15 Pro Glu Thr Leu Val Lys Val Lys15 Pro Glu Thr Leu Val Lys Val Lys

CCA GAA ACG CTG GTG AAA GTA AAACCA GAA ACG CTG GTG AAA GTA AAA

Asp Ala Glu Asp Gin Leu Gly AlaAsp Ala Glu Asp Gin Leu Gly Ala

GAT GCT GAA GAT CAG TTG GGT GCAHOLE GCT GAA HOLE CAG TTG GGT GCA

2020

Arg Val Gly Tyr lie Glu Leu AspArg Val Gly Tyr lie Glu Leu Asp

CGA GTG GGT TAC ATC GAA CTG GATCGA GTG GGT TAC ATC GAA CTG GAT

Leu Asn Ser Gly Lys He Leu GluLeu Asn Ser Gly Lys He Leu Glu

25 CTC AAC AGC GGT AAG ATC CTT GAG25 CTC AAC AGC GGT AAG ATC CTT GAG

Ser Phe Arg Pro Glu Glu Arg PheSer Phe Arg Pro Glu Glu Arg Phe

AGT TTT CGC CCC GAA GAA CGT TTTAGT TTT CGC CCC GAA GAA CGT TTT

30 Pro Met Met Ser Thr Phe Lys Val30 Pro With With Ser Thr Phe Lys Val

CCA ATG ATG AGC ACT TTT AAA GTTCCA ATG ATG AGC ACT TTT AAA GTT

Leu Leu Cys Gly Ala Val Leu SerLeu Leu Cys Gly Ala Val Leu Ser

CTG CTA TGT GGC GCG GTA TTA TCCCTG CTA TGT GGC GCG GTA TTA TCC

3535

Arg Val Asp Ala Gly Gin Glu GinArg Val Asp Ala Gly Gin Glu Gin

CGT GTT GAC GCC GGG CAA GAG CAACGT GTT GAC GCC GGG CAA GAG CAA

Leu Gly Arg Arg He His Tyr SerLeu Gly Arg Arg He His Tyr Ser

40 CTC GGT CGC CGC ATA CAC TAT TCT40 CTC GGT CGC CGC ATA CAC TAT TCT

Gin Asn Asp He Val Glu Ser AlaGin Asn Asp He Val Glu Ser Ala

CAG AAT GAC TTG GTT GAG TCG_GCTCAG AT GAC TTG GTT GAG TCG_GCT

45 Lys Arg Asn Ser Asp Ser Glu Cys45 Lys Arg Asn Ser Asp Ser Glu Cys

AAA_CGG AAT AGC GAT TCT GAG TGCAAA_CGG AT AGC GAT TCT GAG TGC

Pro Leu Ser His Asp Gly Tyr CysPro Leu Ser His Asp Gly Tyr Cys

CCA CTG TCT CAC GAT GGC TAT TGTCCA CTG TCT CAC GAT GGC TAT TGT

5050

Leu His Asp Gly Val Cys Met TyrLeu His Asp Gly Val Cys Met Tyr

CTG CAC GAC GGT GTT TGC ATG TACCTG CAC GAC GGT GTT TGC ATG TAC

He Glu Ala Leu Asp Lys Tyr AlaHe Glu Ala Leu Asp Lys Tyr Ala

55 ATC GAA GCT TTG GAT AAA TAC GCG55 ATC GAA GCT TTG GAT AAA TAC GCG

23 19211623 192116

Cys Asn Cys Val Val Gly Tyr lieCys Asn Cys Val Val Gly Tyr lie

TGT AAC TGT GTA GTG GGT TAT ATCTGT AAC TGT GTA GTG GGT TAT ATC

Gly Glu Arg Cys Gin Tyr Arg AspGly Glu Arg Cys Gin Tyr Arg Asp

5 GGT GAA CGC TGT CAA TAC CGT GAT5 GGT GAA CGC TGT CAA TAC CGT GAT

Leu Lys Tip Tip Glu Leu Arg (stop)Leu Lys Tip Tip Glu Leu Arg (stop)

CTG AAA TGG TGG GAA TTG CGT TAACTG AAA TGG TGG GAA TTG CGT TAA

10 TAGTGAAGATCTGGATCCGTTTAGCCGACTCAC10 TAGTGAAGATCTGGATCCGTTTAGCCGACTCAC

CAGT CAC AGAAAAGCATCTTACGGATCAGT CAC AGAAAAGCATCTTACGGAT

De voor de gefuseerde eiwitten coderende nucleotide-volgorden in de plasmiden pUG2101, pUG2301 en pUG2701 werden geanalyseerd volgens de Maxam-Gilbert-methode.The nucleotide sequences encoding the fused proteins in the plasmids pUG2101, pUG2301 and pUG2701 were analyzed according to the Maxam-Gilbert method.

15 Foto 5 toont de resultaten van de analyse. In foto 5 tonen de banen 1 t/m 4 het met het Mlul-Pstl-fragment (224 b.p.) van pUG2101 verkregen resultaat, tonen de banen 5 t/m 8 het met het Mlul-EcoRI-fragment (721 b.p.) van pUG2101 verkregen resultaat, tonen de banen 9 t/m 12 het met het Mlul-BamHI-fragment (452 b.p.) van p(JG2301 verkregen resultaat, de banen 13 t/m 16 het met het Mlul-Pstl-fragment (335 b.p.) van pUG2701 verkregen resultaat en de banen 17 t/m 20 het met het Mlul-EcoRI-fragment (610 20 b.p.) van pUG2701 verkregen resultaat. De banen 1,5,9,13 en 17 tonen de reactieproducten voor guanide, de banen 2, 6, 10, 14 en 18 de reactieproducten voor guanine plus adenine, de banen 3, 7, 11,15 en 19 de reactieproducten voor thymine plus cytosine en de banen 4, 8,12, 16 en 20 de reactieproducten voor cytosine. Het met} gemarkeerde gedeelte is een adaptor.15 Photo 5 shows the results of the analysis. In photo 5, lanes 1 through 4 show the result obtained with the Mlul-Pstl fragment (224 bp) of pUG2101, lanes 5 through 8 show the result with the Mlul-EcoRI fragment (721 bp) of pUG2101 result obtained, lanes 9-12 show the result obtained with the Mlul-BamHI fragment (452 bp) of p (JG2301, lanes 13-16 show it with the Mlul-Pstl fragment (335 bp) of pUG2701 obtained and lanes 17 to 20 obtained with the Mlul-EcoRI fragment (610 20 bp) of pUG2701 Lanes 1,5,9,13 and 17 show the reaction products for guanide lanes 2, 6, 10, 14 and 18 the reaction products for guanine plus adenine, lanes 3, 7, 11, 15 and 19 the reaction products for thymine plus cytosine and lanes 4, 8, 12, 16 and 20, the reaction products for cytosine. } highlighted section is an adapter.

8-5. Systeem voor de expressie van gefuseerd eiwit van β-lactamase en β-urogastron verbonden door 25 Arg-Lys.8-5. System for the expression of fused protein of β-lactamase and β-urogastron linked by Arg-Lys.

8- 5-a. Bereiding van pUG1102 en pUG1105.8-5-a. Preparation of pUG1102 and pUG1105.

β-urogastron-gen werd opgenomen in het β-lactamase-gen van pBR322 op de enige Pvul-restrictie-plaats ter verkrijging van vectoren voor de expressie van gefuseerd eiwit van β-lactamase en β-urogastron, zoals weergegeven in figuur 15.β-urogastron gene was included in the β-lactamase gene of pBR322 at the only Pvul restriction site to obtain vectors for the expression of fused protein of β-lactamase and β-urogastron, as shown in Figure 15.

30 Het plasmide pBR322 werd gedurende 3 uur bij 37°C gesplitst met Pvul. Sommige van de plasmiden werden gecontroleerd door elektroforese met 1 gew.% agarosegel om te bevestigen, dat ze volledig gesplitst zijn. De adaptoren D-1-3 en D-3-2 werden gedurende 15 uur bij 12°C aan het fragment gekoppeld en het gekoppelde product werd vervolgens onderworpen aan elektroforese met 1 gew.%’s agarose-gel om een DNA-fragment te isoleren. Vervolgens werden het β-urogastronfragment en de vector gemengd met een 35 molaire verhouding van ongeveer 5:1 en gedurende 15 uur bij 12°C gekoppeld. Na de koppeling werd de stam HB101 met het verkregen plasmide getransformeerd en werden de kolonies gekozen met betrekking tot TcR.The plasmid pBR322 was cleaved with Pvul at 37 ° C for 3 hours. Some of the plasmids were checked by electrophoresis with 1 wt% agarose gel to confirm that they are completely cleaved. Adapters D-1-3 and D-3-2 were coupled to the fragment at 12 ° C for 15 hours and the coupled product was then electrophoresed with 1% w / w agarose gel to generate a DNA fragment isolate. Then, the β-urogastrone fragment and the vector were mixed at a molar ratio of about 5: 1 and coupled at 12 ° C for 15 hours. After coupling, the strain HB101 was transformed with the resulting plasmid and the colonies were selected for TcR.

Een en zeventig TcR getransformeerde kolonies werden verkregen en vervolgens gecontroleerd op hun Ap-gevoeligheid. Plasmide DNA werd bereid uit 20 APs-kolonies (28,2%) en vervolgens gecontroleerd op de 40 aanwezigheid van Mlul-restrictieplaats ter bevestiging van de opname van β-urogastron-gen. Gevonden werd, dat vijf van de 20 plasmiden de Mlul-plaats van β-urogastron-gen bevatten. Het DNA werd gesplitst met Hinfl en vervolgens onderworpen aan elektroforese met 1,5 gew.%’s agarosegel om de oriëntatie van de opname te controleren. Gevonden werd, dat twee van de plasmiden, n.l. pUG1102 en pUG1105 het gen in de juiste oriëntatie bevatten.Seventy one TcR transformed colonies were obtained and then checked for their Aβ sensitivity. Plasmid DNA was prepared from 20 APs colonies (28.2%) and then checked for the presence of Mlul restriction site to confirm the uptake of β-urogastrone gene. Five of the 20 plasmids were found to contain the Mlul site of β-urogastron gene. The DNA was cleaved with Hinfl and then electrophoresed with 1.5 wt% agarose gel to check the orientation of the recording. It was found that two of the plasmids, i.e. pUG1102 and pUG1105 contain the gene in the correct orientation.

45 8-5-b. Bereiding van pUG1004, pUG 1201 en pUG1301.45 8-5-b. Preparation of pUG1004, pUG 1201 and pUG1301.

De procedure 8-5-a werd herhaald onder toepassing van Pstl, Hindi en Xmnl in plaats van Puvl ter verkrijging van respectievelijk pUG1004, pUG1201 en pUG1301 zoals weergegeven in de figuren 16,17 en 18.The procedure 8-5-a was repeated using Pstl, Hindi and Xmnl instead of Puvl to obtain pUG1004, pUG1201 and pUG1301 as shown in Figures 16.17 and 18, respectively.

9. Bevestiging van de expressie van β-urogastron.9. Confirmation of the expression of β-urogastron.

50 De aldus opgebouwde expressieplasmiden werden toegepast voor het transformeren van E.coli, HB101 of ECI-2, en de cellen werden gekweekt volgens de onderstaande methode, gevolgd door extradie en radio-immunologisch onderzoek ter bevestiging van de expressie.The expression plasmids thus constructed were used to transform E. coli, HB101 or ECI-2, and the cells were cultured according to the method below, followed by extradie and radioimmunoassay to confirm expression.

9- 1. Kweek van recombinant-micro-organismen met β-urogastron-gen en extradie van eiwitten.9-1. Culture of recombinant microorganisms with β-urogastrone gene and protein extradie.

9-1-a. Expressiesysteem onder toepassing van PL-promotor.9-1-a. Expression system using PL promoter.

55 De stam ECI-2 met het expressieplasmide pUG103-E en dezelfde stam met het expressieplasmide55 The strain ECI-2 with the expression plasmid pUG103-E and the same strain with the expression plasmid

pUG117-E werden elk bij 25°C gekweekt in twee kolven, die elk 1 liter LB kweekmedium bevatten. Wanneer de kweek in een van de kolven een absorptie van 0,3 bij 660 nm vertoonde, werd de kweek 1 uur bij 42°CpUG117-E were each grown at 25 ° C in two flasks, each containing 1 liter of LB culture medium. When the culture in one of the flasks showed an absorbance of 0.3 at 660 nm, the culture was maintained at 42 ° C for 1 hour

192116 24 onderworpen aan warmte-inductie. De kweek in de andere kolf werd voortdurend bij 25°C geïncubeerd tot de absorptie 0,4 bedroeg. De cellen in elke kolf werden verzameld, gewassen met PBS-buffer (137 mM natriumchloride, 2,7 mM kaliumchloride, 8,1 mMdibasisch natriumfosfaat en 1,5 mM monobasisch natriumfosfaat (pH 7,0», vervolgens opnieuw gesuspendeerd in PBS-buffer in 3 vol% van de hoeveelheid 5 van de oorspronkelijke kweek en vernietigd (gedurende 30 seconden bij 100 W, driemaal) door een sonicator (model 5202, product van Ohtake Works Co., Ltd., Japan) onder koelen met ijs. De door ultracentrifugeren (1 uur bij 40.000 g) van de celresten gescheiden bovenstaande vloeistof werd gediali-seerd tegen 0,01 N waterige azijnzuuroplossing en het dialysaat werd gevriesdroogd en vervolgens onderworpen aan radio-immunologisch onderzoek (hierna aangeduid als RIA).192116 24 subject to heat induction. The culture in the other flask was incubated continuously at 25 ° C until the absorbance was 0.4. The cells in each flask were collected, washed with PBS buffer (137 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 8.1 mM dibasic sodium phosphate and 1.5 mM monobasic sodium phosphate (pH 7.0 »), then resuspended in PBS buffer in 3 vol% of the amount of the original culture and destroyed (for 30 seconds at 100 W, three times) by a sonicator (model 5202, product of Ohtake Works Co., Ltd., Japan) under ice cooling. ultracentrifugation (1 hour at 40,000 g) of the cell debris separated supernatant was dialialized against 0.01 N aqueous acetic acid solution and the dialysate was lyophilized and then subjected to radioimmunoassay (hereinafter referred to as RIA).

10 9-1 -b. Systeem voorde expressie van gefuseerd eiwit.10 9-1 -b. System for the expression of fused protein.

De E.coli-stam HB101 met plasmiden pUG1004,1301,2101, 2303 of 2703 werd vooraf geïncubeerd bij 37°C in een kweekmedium, dat 50 pg/ml tetracycline bevat, vervolgens verdund tot een volumeverhouding van 1:100 met hetzelfde medium en gekweekt tot de absorptie bij 660 nm 0,4 bedroeg. De cellen werden verzameld, gewassen met PBS-buffer, vervolgens opnieuw gesuspendeerd in PBS-buffer in 3 vol% van de 15 hoeveelheid van de oorspronkelijke kweek en onderworpen aan sonische trillingen (bij 100 W gedurende 30 seconden, driemaal) met behulp van dezelfde sonicator als eerder vermeld onder koelen met ijs. De door ultracentrifugeren (1 uur bij 40.000 g) van de celresten gescheiden bovenstaande vloeistof werd gediali· seerd tegen 0,01 N waterige azijnzuuroplossing, gevriesdroogd en vervolgens onderworpen aan RIA.The E.coli strain HB101 with plasmids pUG1004,1301,2101, 2303 or 2703 was preincubated at 37 ° C in a culture medium containing 50 µg / ml tetracycline, then diluted to a volume ratio of 1: 100 with the same medium and grown until the absorbance at 660 nm was 0.4. The cells were collected, washed with PBS buffer, then resuspended in PBS buffer in 3% by volume of the original culture and subjected to sonic vibrations (at 100 W for 30 seconds, three times) using the same sonicator as previously mentioned under ice cooling. The supernatant separated from the cell debris by ultracentrifugation (1 hour at 40,000 g) was dialized against 0.01 N aqueous acetic acid solution, lyophilized and then subjected to RIA.

Ter bevestiging van de ophoping van gefuseerd eiwit in het periplasma werd de periplasma-fractie bereid 20 volgens S.J. Chan et al. (Chan, S.J. et al., Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A., 78, 5401-5405 (1981)). Een gedeelte van de kweek werd verdund tot een volumeverhouding van 1:100 met vers E kweekmedium (1 liter waterige oplossing van 10 g dibasisch kaliumfosfaat, 3,5 g natriumammoniumwaterstoffosfaat, 0,2 g magnesiumsulfaatheptahydraat, 2 g citroenzuur, 2 g glucose, 0,23 g L-proline, 39,5 mg L-leucine, 16,85 mg thiamine en 20 mg tetracyclinehydrochloride) en vervolgens bij 37°C gekweekt tot de absorptie bij 660 nm 25 0,4 bedroeg. De cellen werden verzameld (6000 r.p.m., 10 min.) en tweemaal gewassen met een mengsel van 10 mM tris-HCI (pH 8,0) en 30 mM natriumchloride. De cellen (1 g) werden opnieuw gesuspendeerd in 80 ml 20 gew.%’s saccharose-30 mM tris-HSI (pH 8,0), waarna EDTA aan de suspensie werd toegevoegd in een concentratie van 1 mM. Het mengsel werd 10 minuten bij 180 r.p.m. (24°C) geschud met een roterend schudapparaat en vervolgens gecentrifugeerd (13.000 g, 10 minuten) om de cellen te verzamelen, 30 die opnieuw gesuspendeerd werden in 80 ml gedestilleerd water. De suspensie werd onder af en toe roeren gedurende 10 minuten in ijs gehouden en vervolgens gecentrifugeerd (13.000 g, 10 minuten). De bovenstaande vloeistof werd verzameld als periplasma-fractie (0-Sup). Het bezinksel werd gesuspendeerd in een mengsel van 10 mM tris-HCI (pH 8,0) en 30 mM natriumchloride en behandeld met dezelfde sonicator als in het voorafgaande ter verkrijging van een cytoplasma-fractie (0-Ppt). Deze monsters werden onderworpen 35 aan RIA.To confirm the accumulation of fused protein in the periplasm, the periplasma fraction was prepared according to S.J. Chan et al. (Chan, S.J. et al., Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A., 78, 5401-5405 (1981)). A portion of the culture was diluted to a volume ratio of 1: 100 with fresh E culture medium (1 liter aqueous solution of 10 g dibasic potassium phosphate, 3.5 g sodium ammonium hydrogen phosphate, 0.2 g magnesium sulfate heptahydrate, 2 g citric acid, 2 g glucose, 0 , 23 g L-proline, 39.5 mg L-leucine, 16.85 mg thiamine and 20 mg tetracycline hydrochloride) and then grown at 37 ° C until the absorbance at 660 nm was 0.4. The cells were collected (6000 rpm, 10 min) and washed twice with a mixture of 10 mM tris-HCl (pH 8.0) and 30 mM sodium chloride. The cells (1 g) were resuspended in 80 ml of 20 wt% sucrose-30 mM tris-HSI (pH 8.0) and EDTA was added to the suspension at a concentration of 1 mM. The mixture was run at 180 rpm for 10 minutes. (24 ° C) shaken with a rotary shaker and then centrifuged (13,000 g, 10 minutes) to collect the cells, which were resuspended in 80 ml of distilled water. The suspension was kept in ice for 10 minutes with occasional stirring and then centrifuged (13,000 g, 10 minutes). The supernatant was collected as a periplasmic fraction (0-Sup). The sediment was suspended in a mixture of 10 mM tris-HCl (pH 8.0) and 30 mM sodium chloride and treated with the same sonicator as before to obtain a cytoplasmic fraction (0-Ppt). These samples were subjected to RIA.

9-2. Radio-immunologische proef.9-2. Radioimmunological test.

9-2-a. Tot stand brengen van het RIA-systeem.9-2-a. Establishing the RIA system.

Konijnen werden geïmmuniseerd met gezuiverd menselijk β-urogastron als antigeen ter verkrijging van antiserum. Het β-urogastron (300 pg) werd opgelost in 0,2 ml gedestilleerd water, aan de oplossing werd 40 1,5 ml 50%’s polyvinylpyrrolidonoplossing toegevoegd en het mengsel werd 2 uur bij kamertemperatuur geroerd. Volledig Freund’s adjuvans (2,0 ml) werd aan het mengsel toegevoegd ter verkrijging van een emulsie, die subcutaan geïnjecteerd werd in het borstgedeelte van drie konijnen. Na viermaal elke 2 weken herhalen van de immunisatie werd voorts 50 pg van het antigeen intraveneus geïnjecteerd, het gehele bloed 3 dagen daarna verzameld en het serum afgescheiden.Rabbits were immunized with purified human β-urogastrone as an antigen to obtain antiserum. The β-urogastrone (300 µg) was dissolved in 0.2 ml of distilled water, 1.5 ml of 50% polyvinylpyrrolidone solution was added to the solution and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours. Complete Freund's adjuvant (2.0 ml) was added to the mixture to obtain an emulsion, which was injected subcutaneously into the breast portion of three rabbits. After repeating the immunization four times every 2 weeks, 50 µg of the antigen was further injected intravenously, the whole blood collected 3 days later and the serum separated.

45 Vervolgens werden de volgende RIA omstandigheden bepaald met het oog op de titratiekromme voor de bepaling van de verdunningsgraad van het antiserum voor de proef, de incubatietijd voor het optimaliseren van de proefomstandigheden, de methode voor het scheiden van het gebonden radio-actief gemerkte antigeen (gebonden) van het vrije radio-actief gemerkte antigeen (vrij), enz.45 Next, the following RIA conditions were determined in view of the titration curve for determining the degree of dilution of the antiserum for the test, the incubation time for optimizing the test conditions, the method of separating the bound radiolabeled antigen ( bound) of the free radiolabeled antigen (free), etc.

De toegepaste verdunningsoplossing was een fosfaatbuffer (10 mM, pH 7,4) die 0,5 gew.% runderserum-50 albumine (BSA), 140 mM natriumchloride en 25 mM dinatrium-EDTA bevatte. De verdunningsoplossing (400 μΙ), 100 μΙ van het monster of standaard menselijk β-urogastron en 100 μΙ antimenselijk β-urogastron-serum werden gemengd. Nadat het mengsel 24 uur bij 4°C was geïncubeerd werd 100 μΙ van een 125,-gemerkt menselijk β-urogastron-oplossing (ongeveer 5000 cpm) aan het mengsel toegevoegd. Nadat het mengsel verder 48 uur bij 4°C was geïncubeerd, werden 100 μΙ van een tweede antilichaam (anti-55 konijnen γ-globuline geitenserum) (20-voudige verdunning met PBS-buffer), 100 μΙ normaal konijnenserum (200-voudige verdunning met PBS-buffer) en 900 μ110 mM PBS-buffer met 5 gew.% polyethyleenglycol aan het verkregen mengsel toegevoegd, waarna het nog 3 uur bij 4°C werd geïncubeerd. De kweek werd 30 25 192116 minuten bij 3000 r.p.m. gecentrifugeerd, de bovenstaande vloeistof werd afgescheiden en het neerslag werd geteld. Het gehalte aan immunoreactieve stof als menselijk β-urogastron in het monster werd bepaald uit de met behulp van standaard menselijk β-urogastron verkregen standaardkromme.The dilution solution used was a phosphate buffer (10 mM, pH 7.4) containing 0.5 wt% bovine serum-50 albumin (BSA), 140 mM sodium chloride and 25 mM disodium EDTA. The dilution solution (400 μΙ), 100 μΙ of the sample or standard human β-urogastron and 100 μΙ anti-human β-urogastron serum were mixed. After the mixture was incubated at 4 ° C for 24 hours, 100 µl of a 125 labeled human β-urogastrone solution (approximately 5000 cpm) was added to the mixture. After the mixture was further incubated at 4 ° C for 48 hours, 100 μΙ of a second antibody (anti-55 rabbit γ-globulin goat serum) (20-fold dilution with PBS buffer), 100 μΙ normal rabbit serum (200-fold dilution with PBS buffer) and 900 μ110 mM PBS buffer with 5 wt% polyethylene glycol added to the resulting mixture and incubated for an additional 3 hours at 4 ° C. The culture was maintained at 3000 rpm for 30 minutes. centrifuged, the supernatant was separated and the precipitate was counted. The immunoreactive content as human β-urogastrone in the sample was determined from the standard curve obtained using standard human β-urogastron.

9-2-b. Bevestiging van β-urogastron-productiviteit van het recombinant-micro-organisme.9-2-b. Confirmation of β-urogastrone productivity of the recombinant microorganism.

5 Tabel 5 toont het resultaat van RIA voor het expressiesysteem met toepassing van XPL-promotor.Table 5 shows the result of RIA for the expression system using XPL promoter.

TABEL 5TABLE 5

Expressieplasmide Warmte-inductie Geproduceerde hoeveelheid 10 β-urogastron (n g/l van de kweek) pUG103-E ja 450,2 pUG103-E nee 3,2 pUG117-E ja 388,4 15 pUG117-E nee 3,2Expression plasmid Heat induction Amount produced 10 β-urogastrone (n g / l of culture) pUG103-E yes 450.2 pUG103-E no 3.2 pUG117-E yes 388.4 15 pUG117-E no 3.2

Controle (pBR322) nee niet waarneembaarControl (pBR322) no imperceptible

Tabel 6 toont het resultaat van RIA voor gefuseerde eiwit-expressiesystemen.Table 6 shows the result of RIA for fused protein expression systems.

20 TABEL 620 TABLE 6

Expressieplasmide Geproduceerde hoeveelheid β-urogastron (pg/l van de kweek) 25 - pUG1004 729,6 pUG1301 650,7 pUG2101 31,3 PUG2301 125,2 30 pUG2701 119,2Expression plasmid Amount of β-urogastrone produced (pg / l from culture) 25 - pUG1004 729.6 pUG1301 650.7 pUG2101 31.3 PUG2301 125.2 30 pUG2701 119.2

Tabel 7 toont de lokalisatie van het geëxprimeerde gefuseerde eiwit.Table 7 shows the localization of the expressed fused protein.

35 TABEL 735 TABLE 7

Expressieplasmide Geproduceerde hoeveelheid β-urogastron (pg/l van de kweek) 40 Periplasma-fractie Cytoplasma-fractie (0-Sup) (0-Ppt) PÜG1004 326,0 4,0 pUG1301 347,4 2,8 45 pUR2101 79,9 10,2 pUG2301 118,8 4,1 pUG2701 65,7 3,6 50 De tabellen 5 en 6 tonen, dat het X-PL-promotorsysteem voor directe expressie van β-urogastron en het systeem voor expressie van de verbinding als een gefuseerd eiwit beiden β-urogastron-immunoreactiviteit in E.coli exprimeerden. Tabel 7 toont, dat in het geval van gefuseerd eiwit, de geëxprimeerde β-urogastron-immunoreactiviteit vrijwel gelokaliseerd is in het periplasma.Expression plasmid Amount of β-urogastrone produced (pg / l from culture) 40 Periplasma fraction Cytoplasma fraction (0-Sup) (0-Ppt) PÜG1004 326.0 4.0 pUG1301 347.4 2.8 45 pUR2101 79.9 10.2 pUG2301 118.8 4.1 pUG2701 65.7 3.6 50 Tables 5 and 6 show that the X-PL promoter system for direct expression of β-urogastrone and the system for expression of the compound as a fused protein both expressed β-urogastrone immunoreactivity in E. coli. Table 7 shows that in the case of fused protein, the expressed β-urogastron immunoreactivity is almost localized in the periplasm.

Claims (18)

192116 26 1. β-urogastron-genen met de volgende nucleotide-volgorde: 5' AAT AGC GAT TCT GAG T G C CCA CTG 5 3' T T A TCG CTA AGA CTC ACG GGT GAC TCT CAC GAT GGC TAT TGT CTG CAC AGA GTG CTA CCG ATA ACA GAC GTG192116 26 1. β-urogastron genes with the following nucleotide sequence: 5 'AAT AGC GAT TCT GAG TGC CCA CTG 5 3' TTA TCG CTA AGA CTC ACG GGT GAC TCT CAC GAT GGC TAT TGT CTG CAC AGA GTG CTA CCG ATA ACA GAC GTG 2. Een gen volgens conclusie 1, dat een herkenningsplaats voor restrictie-enzym bevestigd aan de voorzijde en/of achterzijde van het gen bevat.A gene according to claim 1, which contains a restriction enzyme recognition site attached to the front and / or back of the gene. 3. Een gen volgens conclusie 2, dat een herkenningsplaats voor restrictie-enzym en een startcodon aan de voorzijde van het gen en/of een stopcodon en een herkenningsplaats voor restrictie-enzym aan de achterzijde van het gen bevat, waarbij de codons en de herkenningsplaatsen in de aangegeven volgorde 30 zijn opgesteld.A gene according to claim 2, which contains a restriction enzyme recognition site and a start codon at the front of the gene and / or a stop codon and a restriction enzyme recognition site at the back of the gene, wherein the codons and the recognition sites 30 are arranged in the order shown. 4. Een gen volgens conclusie 3, dat de volgende nucleotide-volgorde bezit: -15 -1, 1 5' AAT TCG AAG ATC TGC ATG AAT AGC 3' GC TTC TAG ACG TAC TTA TCG 35 10 20 30 GAT TCT GAG TGC CCA CTG TCT CAC CTA AGA CTC ACG GGT GAC AGA GTG 40 40 50 GAT GGC TAT TGT CTG CAC GAC GGT CTA CCG ATA ACA GAC GTG CTG CCA 60 70 80A gene according to claim 3, having the following nucleotide sequence: -15 -1.1 1 'AAT TCG AAG ATC TGC ATG AAT AGC 3' GC TTC TAG ACG TAC TTA TCG 35 10 20 30 GAT TCT GAG TGC CCA CTG TCT CAC CTA AGA CTC ACG GGT GAC AGA GTG 40 40 50 GAT GGC TAT TGT CTG CAC GAC GGT CTA CCG ATA ACA GAC GTG CTG CCA 60 70 80 45 GTT TGC ATG TAC ATC GAA GCT TTG CAA ACG TAC ATG TAG CTT CGA AAC 90 100 GAT A A A TAC GCG TGT AAC TGT GTA45 GTT TGC ATG TAC ATC GAA GCT TTG CAA ACG TAC ATG TAG CTT CGA AAC 90 100 GAT A A A TAC GCG TGT AAC TGT GTA 50 CTA TTT ATG CGC ACA TTG ACA CAT 110 120 GTG GGT TAT ATC GGT GAA CGC TGT CAC CCA ATA TAG CCA CTT GCG ACA 55 27 192116 130 140 150 CAA TAC CGT GAT CTG AAA TGG TGG GTT ATG GCA C T A GAC TTT ACC ACC 5 160 170 G A A TTG CGT T A A TAG T G A AGA TCT CTT AAC GCA ATT ATC ACT TCT AGA G 3'50 CTA TTT ATG CGC ACA TTG ACA CAT 110 120 GTG GGT TAT ATC GGT GAA CGC TGT CAC CCA ATA TAG CCA CTT GCG ACA 55 27 192 116 130 140 150 CAA TAC CGT GAT CTG AAA TGG TGG GTT ATG GCA CTA GAC TTT ACC ACC 5 160 170 GAA TTG CGT TAA TAG TGA AGA TCT CTT AAC GCA ATT ATC ACT TCT AGA G 3 ' 5. Een recombinant-plasmide met het in conclusie 4 gedefinieerde gen.A recombinant plasmid with the gene defined in claim 4. 6. Werkwijze voor de bereiding van het recombinant-plasmide volgens conclusie 5, met het kenmerk, dat men de ondereenheid met de nudeotidevolgorde: 15 5' AAT TCG AAG ATC TGC ATG AAT AGC 3' GC TT C TAG ACG TAC TT A TCG GAT TCT GAG TGC CCA CTG TCT CAC CTA AGA CTC ACG GGT GAC AGA GTG 20 GAT GGC TAT TGT CTG CAC GAC GGT CTA CCG ATA ACA GAC GTG CTG CCA GTT TGC ATG TAC ATC GAA GCT TCGProcess for the preparation of the recombinant plasmid according to claim 5, characterized in that the subunit with the nudeotide sequence is: 5 'AAT TCG AAG ATC TGC ATG AAT AGC 3' GC TT C TAG ACG TAC TT A TCG GAT TCT GAG TGC CCA CTG TCT CAC CTA AGA CTC ACG GGT GAC AGA GTG 20 GAT GGC TAT TGT CTG CAC GAC GGT CTA CCG ATA ACA GAC GTG CTG CCA GTT TGC ATG TAC ATC GAA GCT TCG 25 CAA ACG TAC ATG TAG CTT CGA AGC 3' CTA G 5' 30 en de ondereenheid met de nudeotidevolgorde: 5' A GCT TTG GAT A A A TAC GCG TGT AAC CTA TTT ATG CGC ACA AAC TGT GTA GTG GGT TAT ATC GGT25 CAA ACG TAC ATG TAG CTT CGA AGC 3 'CTA G 5' 30 and the subunit with the nudeotide sequence: 5 'A GCT TTG GAT A A A TAC GCG TGT AAC CTA TTT ATG CGC ACA AAC TGT GTA GTG GGT TAT ATC GGT 35 TTG ACA CAT CAC CCA ATA TAG CCA GAA CGC TGT CAA TAC CGT GAT CTG CTT GCG ACA GTT ATG GCA CTA GAC35 TTG ACA CAT CAC CCA ATA TAG CCA GAA CGC TGT CAA TAC CGT GAT CTG CTT GCG ACA GTT ATG GCA CTA GAC 40. A A TGG TGG GAA TTG CGT TAA TAG TTT ACC ACC CTT AAC GCA ATT ATC TGA AGA TCT G 3' ACT TCT AGA CCT AG 5' 45 opneemt op een geschikte opnameplaats van een geschikte plasmidevector.40. A A TGG TGG GAA TTG CGT TAA TAG TTT ACC ACC CTT AAC GCA ATT ATC TGA AGA TCT G 3 'ACT TCT AGA CCT AG 5' 45 record at a suitable recording site of a suitable plasmid vector. 7. Een recombinant-plasmide, dat een plasmidevector met daarin opgenomen het in conclusie 4 gedefinieerde p-urogastron-gen bevat, waarbij in de plasmidevector voorts aan de voorzijde van het p-urogastron-gen een promotor voor de regeling van de expressie van het gen en een met de promotor verbondenA recombinant plasmid, which contains a plasmid vector containing the p-urogastron gene defined in claim 4, wherein in the plasmid vector further at the front of the p-urogastron gene a promoter for controlling the expression of the gene and one linked to the promoter 50 SD-volgorde zijn opgenomen.50 SD order are included. 8. Een recombinant-plasmide, dat een plasmidevector met de volgorde van de vierde en volgende basenparen van het in conclusie 4 gedefinieerde p-urogastron-gen bevat, waarbij in de plasmidevector de combinatie van een promotor, een SD-volgorde en een ander gen aan de voorzijde van het p-urogastron-gen is opgenomen.A recombinant plasmid containing a plasmid vector of the sequence of the fourth and subsequent base pairs of the p-urogastron gene defined in claim 4, wherein in the plasmid vector the combination of a promoter, an SD sequence and another gene has been included on the front of the p-urogastron gene. 9. Een recombinant-plasmide zoals gedefinieerd in conclusie 8, waarin het andere gen een p-lactamase-gen is.A recombinant plasmid as defined in claim 8, wherein the other gene is a β-lactamase gene. 10. Een recombinant-plasmide zoals gedefinieerd in conclusie 7 of 8, waarin de promotor λΡι. of lac UV5 is. 192116 28A recombinant plasmid as defined in claim 7 or 8, wherein the promoter λΡι. or lac is UV5. 192116 28 10 CCT AG 5'10 CCT AG 5 ' 10 GAC GGT G TT TGC ATG TAC ATC GAA CTG CCA CAA ACG TAC ATG TAG CTT GCT TTG GAT A A A TAC GCG TGT AAC CGA AAC CTA TTT ATG CGC ACA TTG 15 TGT GTA GTG GGT TAT ATC GGT GAA ACA CAT CAC CCA ATA TAG CCA CTT CGC TGT CAA TAC CGT GAT CTG A A A10 GAC GGT G TT TGC ATG TAC ATC GAA CTG CCA CAA ACG TAC ATG TAG CTT GCT TTG GAT AAA TAC GCG TGT AAC CGA AAC CTA TTT ATG CGC ACA TTG 15 TGT GTA GTG GGT TAT ATC GGT GAA ACA CAT CAC CCA ATA TAG CCA CTT CGC TGT CAA TAC CGT GAT CTG AAA 20 GCG ACA G TT ATG GCA CTA GAC TTT TGG TGG GAA TTG CGT 3' ACC ACC CTT AAC GCA 5', waarbij aan de voor- en/of achterzijde van deze sequentie nog andere sequenties aanwezig kunnen zijn.GCG ACA G TT ATG GCA CTA GAC TTT TGG TGG GAA TTG CGT 3 'ACC ACC CTT AAC GCA 5', where other sequences may be present at the front and / or back of this sequence. 11. Een recombinant-plasmide zoals gedefinieerd in conclusie 7 of 8, waarin de plasmidevector pBR322 is.A recombinant plasmid as defined in claim 7 or 8, wherein the plasmid vector is pBR322. 12. Een transformant, die een gastheercel met een recombinant-plasmide bevat, dat in staat is om het in conclusie 1 gedefinieerde β-urogastron-gen tot expressie te brengen.A transformant containing a host cell with a recombinant plasmid capable of expressing the β-urogastron gene defined in claim 1. 13. Een transformant zoals gedefinieerd in conclusie 12, waarin het recombinant-plasmide het in conclusie 5 7 gedefinieerde recombinant-plasmide is.A transformant as defined in claim 12, wherein the recombinant plasmid is the recombinant plasmid defined in claim 5. 14. Een transformant zoals gedefinieerd in conclusie 12, waarin het recombinant-plasmide het in conclusie 8 gedefinieerde recombinant-plasmide is.A transformant as defined in claim 12, wherein the recombinant plasmid is the recombinant plasmid defined in claim 8. 15. Een transformant zoals gedefinieerd in conclusie 12, waarin de gastheercel E.coli is.A transformant as defined in claim 12, wherein the host cell is E. coli. 16. Een transformant zoals gedefinieerd in conclusie 12, waarin de gastheercel getransformeerd is met een 10 recombinant-plasmide met een TcR-gen en een CI857-gen.16. A transformant as defined in claim 12, wherein the host cell is transformed with a recombinant plasmid containing a TcR gene and a CI857 gene. 17. Werkwijze voor de vorming van een transformant, met het kenmerk, dat men een gastheercel transformeert met een recombinant-plasmide, dat in staat is om het in conclusie 1 gedefinieerde β-urogastron-gen tot expressie te brengen.A transformant formation method, characterized in that a host cell is transformed with a recombinant plasmid capable of expressing the β-urogastron gene defined in claim 1. 18. Werkwijze voor de vorming van β-urogastron, met het kenmerk, dat men de in conclusie 12 gedefini-15 eerde transformant kweekt en het tot expressie gebrachte β-urogastron verzamelt. Hierbij 23 bladen tekening18. A process for the formation of β-urogastron, characterized in that the transformant defined in claim 12 is grown and the expressed β-urogastron is collected. Hereby 23 sheets of drawing
NL8501880A 1984-07-02 1985-06-28 Beta-urogastron genes, corresponding recombinant plasmids, corresponding transformants and their preparation, and of beta-urogastron. NL192116C (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP59137691A JP2554459B2 (en) 1984-07-02 1984-07-02 β-urogastron gene, corresponding plasmid recombinant and corresponding transformant
JP13769184 1984-07-02

Publications (3)

Publication Number Publication Date
NL8501880A NL8501880A (en) 1986-02-03
NL192116B NL192116B (en) 1996-10-01
NL192116C true NL192116C (en) 1997-02-04

Family

ID=15204546

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
NL8501880A NL192116C (en) 1984-07-02 1985-06-28 Beta-urogastron genes, corresponding recombinant plasmids, corresponding transformants and their preparation, and of beta-urogastron.

Country Status (12)

Country Link
JP (1) JP2554459B2 (en)
KR (1) KR920009543B1 (en)
AU (1) AU599003B2 (en)
CA (1) CA1304023C (en)
CH (1) CH670654A5 (en)
DE (1) DE3523634A1 (en)
DK (1) DK291885A (en)
FR (1) FR2566799B1 (en)
GB (1) GB2162851B (en)
IT (1) IT1210142B (en)
NL (1) NL192116C (en)
SE (1) SE8503228L (en)

Families Citing this family (17)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4870008A (en) * 1983-08-12 1989-09-26 Chiron Corporation Secretory expression in eukaryotes
GB8507666D0 (en) * 1985-03-25 1985-05-01 Wellcome Found Epidermal growth factor production
US4743679A (en) * 1986-02-24 1988-05-10 Creative Biomolecules, Inc. Process for producing human epidermal growth factor and analogs thereof
US5366081A (en) 1987-08-26 1994-11-22 United States Surgical Corporation Packaged synthetic absorbable surgical elements
US5226912A (en) 1987-08-26 1993-07-13 United States Surgical Corporation Combined surgical needle-braided suture device
US5306289A (en) 1987-08-26 1994-04-26 United States Surgical Corporation Braided suture of improved characteristics
US5472702A (en) * 1987-08-26 1995-12-05 United States Surgical Corporation Sterilization of growth factors
US5222978A (en) 1987-08-26 1993-06-29 United States Surgical Corporation Packaged synthetic absorbable surgical elements
GB2210618B (en) * 1987-10-08 1991-10-16 British Bio Technology Synthetic egf gene
FI891308A (en) * 1988-03-24 1989-09-25 Oncogen NYA POLYPEPTIDER MED TILLVAEXTFAKTORAKTIVITET OCH DESSA KODANDE NUCLEIN SYRASE SEQUENTOR.
US5102789A (en) * 1989-03-15 1992-04-07 The Salk Institute Biotechnology/Industrial Associates, Inc. Production of epideramal growth factor in pichia pastoris yeast cells
US5359831A (en) 1989-08-01 1994-11-01 United States Surgical Corporation Molded suture retainer
CA2059245C (en) * 1991-02-08 2004-07-06 Michael P. Chesterfield Method and apparatus for calendering and coating/filling sutures
WO1994025592A1 (en) * 1993-04-26 1994-11-10 Daewoong Pharmaceutical Co., Ltd. A novel gene coding human epidermal growth factor and process for preparing the same
US5904716A (en) * 1995-04-26 1999-05-18 Gendler; El Method for reconstituting cartilage tissue using demineralized bone and product thereof
JP4057846B2 (en) 2002-06-07 2008-03-05 株式会社アステア Bumper structural material
US20090192554A1 (en) 2008-01-29 2009-07-30 Confluent Surgical, Inc. Bioabsorbable block copolymer

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DK339781A (en) * 1980-08-05 1982-02-06 Searle & Co SYNTHETIC GEN
FR2488557A1 (en) * 1980-08-13 1982-02-19 Ducellier & Cie DEVICE FOR TILTING PROJECTORS OF A MOTOR VEHICLE
US4532207A (en) * 1982-03-19 1985-07-30 G. D. Searle & Co. Process for the preparation of polypeptides utilizing a charged amino acid polymer and exopeptidase
WO1983004030A1 (en) * 1982-05-06 1983-11-24 Applied Molecular Genetics, Inc. The manufacture and expression of genes for urogastrone and polypeptide analogs thereof

Also Published As

Publication number Publication date
DK291885D0 (en) 1985-06-27
NL192116B (en) 1996-10-01
FR2566799A1 (en) 1986-01-03
FR2566799B1 (en) 1989-10-20
CA1304023C (en) 1992-06-23
CH670654A5 (en) 1989-06-30
SE8503228L (en) 1986-01-03
JPS6115691A (en) 1986-01-23
DE3523634C2 (en) 1993-07-08
AU599003B2 (en) 1990-07-12
SE8503228D0 (en) 1985-06-28
GB2162851A (en) 1986-02-12
JP2554459B2 (en) 1996-11-13
DE3523634A1 (en) 1986-01-09
GB8516591D0 (en) 1985-08-07
IT1210142B (en) 1989-09-06
IT8505195A0 (en) 1985-07-01
DK291885A (en) 1986-01-03
AU4411185A (en) 1986-01-09
KR860001186A (en) 1986-02-24
KR920009543B1 (en) 1992-10-19
NL8501880A (en) 1986-02-03
GB2162851B (en) 1989-05-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
NL192116C (en) Beta-urogastron genes, corresponding recombinant plasmids, corresponding transformants and their preparation, and of beta-urogastron.
KR960002874B1 (en) Preparation process of recombinant human endothelial cell growth factor
KR920009522B1 (en) Process for the manufacture of thrombin inhibitors
US4839293A (en) DNA encoding streptavidin, streptavidin produced therefrom, fused polypeptides which include amino acid sequences present in streptavidin and uses thereof
KR950000299B1 (en) Fusion proteins method for their production and their use
CA1339205C (en) Oligonucleotide-polyamide conjugates
EP0238101A1 (en) Microbial expression of interleukin II
NZ213049A (en) Peptides with desulfatohirudin activity produced by genetic engineering
US5028531A (en) IGF-I fusion proteins; protection of IGF-I from degradation by host cell; and processes for the production thereof
Larsson et al. A general bacterial expression system for functional analysis of cDNA-encoded proteins
JPS59162887A (en) Dual chain polydeoxynucleotide containing growth hormone discharge factor grf code structured gene
IE57664B1 (en) The preparation of polypeptides having an amide carboxyl terminal end
CA1339464C (en) ¬leu13| motilin, dnas coding for same and methods for producing same
JPS63304987A (en) Gene engineering production of angiogenins
JPH0730119B2 (en) Egulin, method for producing the same, and medicament containing the same
JP2002500042A (en) Non-identical genes and their application in improved molecular adjuvants
US5545564A (en) Vector for expression and secretion of polypeptide microorganism transformed by the vector and production of polypeptide with the same microorganism
KR960015745B1 (en) A modified human psti
JP3350533B2 (en) DNA-containing plasmid
US4857470A (en) Method for the preparation of bacterial clones carrying optimal genetic information for the production of the factor for release of human growth hormone in Escherichia coli
WO1991019741A1 (en) Albumin binding proteins
JP2538200B2 (en) Polypeptide secretion expression vector and transformed microorganism
JP2665338B2 (en) Methods for creating site-specific mutants
JPH0691823B2 (en) Novel DNA and method for producing the same
JPS61181380A (en) Novel dna and use thereof

Legal Events

Date Code Title Description
BA A request for search or an international-type search has been filed
BB A search report has been drawn up
BC A request for examination has been filed
V1 Lapsed because of non-payment of the annual fee

Effective date: 20050101