MX2010012579A - Metodos para predecir respuesta de pacientes a modulacion de la via co-estimuladora. - Google Patents

Abstract

La invención descrita en la presente se refiere a métodos de diagnóstico y terapéuticos y a composiciones útiles para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a la administración de una cantidad farmacéuticamente aceptable de un activador del sistema inmunitario (por ejemplo, células T).

Description

METODOS PARA PREDECIR RESPUESTA DE PACIENTES A MODULACION DE LA VIA CO-ESTIMULADORA Campo de la Invención La invención descrita en la presente se refiere a métodos de diagnóstico y terapéuticos y a composiciones útiles para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a la administración de una cantidad farmacéuticamente aceptable de un activador del sistema inmunitario (por ejemplo, células T) .

Antecedentes de la Invención El Instituto Nacional del Cáncer ha calculado que tan sólo en los Estados Unidos, 1 de 3 personas . será atacada con cáncer durante su tiempo de vida. Además, aproximadamente 50% a 60% de las personas que contraen cáncer eventualmente sucumbirán a la enfermedad. La ocurrencia ampliamente dispersa de esta enfermedad subraya la necesidad de regímenes anticáncer mejorados para el tratamiento de malignidad.

Debido a la amplia variedad de cánceres actualmente observados, numerosos agentes anticáncer han sido desarrollados para destruir el cáncer dentro del cuerpo. Estos compuestos se administran a pacientes con cáncer con el objeto de destruir o de otra manera inhibir el crecimiento de células malignas mientras se deja a las células normales y REF . : 215224 saludables sin alterar. Los agentes anticáncer han sido clasificados con base en su mecanismo de acción, y comúnmente se conocen como quimioterapéuticos . La combinación de quimioterapéuticos con agentes inmunomoduladores ha obtenido cada vez mayor aceptación en el campo oncológico.

El sistema inmunitario de los vertebrados requiere de varias señales para lograr activación inmunitaria óptima; véase, por ejemplo, Janeway, Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol., 54:1-14 (1989); Paul, W.E., ed., Fundamental Immunology, 4a edición Raven Press, N.Y. (1998) , particularmente capítulos 12 y 13, páginas 411-478. Las interacciones entre linfocitos T (células T) y células presentadoras de antígenos (APC's) son esenciales para la respuesta inmunitaria. Niveles de muchas moléculas cohesivas encontrados en células T y APC's se incrementan durante una respuesta inmunitaria (Springer et al., Ann. Rev. Immunol . , 5:223-252 (1987); Shaw et al., Curr. Opin. Immunol., Kindt and Long, eds . , 1:92-97 (1988)); y Hemler, Immunology Today, 9:109-113 (1988)). Niveles incrementados de estas moléculas pueden ayudar a explicar por qué APC's activadas son más efectivas para estimular la proliferación de células T específicas de antígenos que las APC's en descanso (Kaiuchi et al., J. Immunol., 131:109-114 (1983); Kreiger et al., J. Immunol., 135:2937-2945 (1985); McKenzie, J. Immunol., 141:2907-2911 (1988); y Hawrylowicz et al., J. Immunol., 141:4083-4088 (1988) ) .

La respuesta inmunitaria de células T es un proceso complejo que implica interacciones entre células (Springer et al., Ann Rev. Immunol., 5:223-252 (1987)), particularmente entre células T y accesorias tales como APC's, y la producción de mediadores inmunes solubles (citocinas o linfocinas) (Dinarello, New Engl. J. Med. , 317:940-945 (1987); Sallusto, J. Exp. Med., 179:11094118 (1997)). Esta respuesta es regulada por varios receptores de superficie de células T, incluyendo el complejo de receptor de células T (Weiss, Ann Rev. Immunol., 4:593-619 (1986)) y otras moléculas de superficie "accesorias" (Allison, Curr. Opin. Immunol., 6:414-419 (1994); Springer (1987), citado arriba). Muchas de estas moléculas accesorias son antigenos de diferenciación de superficie (CD) celular de origen natural definidos por la reactividad de anticuerpos monoclonales sobre la superficie de células (McMichael, ed. , Leukocyte Typing Iff, Oxford Univ. Press, Oxford, N.Y. (1987)).

Estudios anteriores sugirieron que la activación de linfocitos B requiere de dos señales (Bretscher, Science, 169:1042-1049 (1970)) y se cree ahora que todos los linfocitos requieren de dos señales para su activación óptima, una señal especifica de antígeno o clonal, asi como una segunda señal no especifica de antígeno. (Janeway, citado arriba). Freeman {J. Immunol., 143:2714-2722 (1989)) aislaron y secuenciaron un clon de ADNc que codificaba para un antígeno de activación de células B reconocido por MAb B7 (Freeman, J. Immunol . , 13 8:3260 (1987)). Células COS transfectadas con este ADNc han mostrado teñir tanto MAb B7 marcado como MAb BB-1 (Clark, Human Immunol . , 16:100-113 (1986); Yokochi, J. Immunol., 128:823 (1981); Freeman et al. (1989), citado arriba; Freeman et al. (1987), citado arriba). Además, la expresión de este antígeno ha sido detectada en células de otros linajes, tales como monocitos (Freeman et al., (1989) citado arriba) .

La respuesta antigénica a células T auxiliares (Th) requiere señales provistas por APC's. La primera señal es iniciada por la interacción de complejo de receptor de células T (Weiss, J. Clin. Invest., 86:1015 (1990)) con antígeno presentado en el contexto de moléculas de complejo de histocompatibilidad mayor clase II (MHC) en la APC (Alien, Immunol. Today, 8:270 (1987)). Esta señal específica de antígenos no es suficiente para generar una respuesta completa, y en ausencia de una segunda señal podría en realidad llevar a inactivación clonal o anergia (Schwartz, Science, 248:1349 (1990)). La necesidad de una segunda señal "co-estimuladora" proporcionada por la MHC ha sido demostrada en un número de sistemas experimentales (Schwartz, citado arriba; Weaver et al., Immunol. Today, 11:49 (1990)).

El antígeno CD28, una glicoproteína homodimérica de la superfamilia de inmunoglobulinas (Aruffo et al., Proc. Nati. Acad. Sci. , 84:8573-8577 (1987)), es una molécula accesoria encontrada en la mayoría de las células T humanas maduras (Damle et al., J. Immunol . , 131:2296-2300 (1983)). Evidencia actual sugiere que esta molécula funciona en una vía de activación de células T alternativa distinta de aquella iniciada por el complejo del receptor de células T (June et al., Mol. Cell. Biol. , 7:4472-4481 (1987)). Los anticuerpos monoclonales (MAbs) reactivos con antígeno CD28 pueden incrementar las respuestas de células T iniciadas por varios estímulos policlonales (revisado por June et al., citado arriba) . Estos efectos estimuladores pueden ser el resultado de la producción de citocinas inducida por MAb (Thompson et al., Proc. Nati. Acad. Sci., 86:1333-1337 (1989); y Lindsten et al., Science, 244:339-343 (1989)) como una consecuencia de estabilización de ARNm incrementada (Lindsten et al. (1989), citado arriba). mABs anti-CD28 también pueden tener efectos inhibidores, es decir, pueden bloquear reacciones de linfocitos mixtos autólogas (Damle et al., Proc. Nati. Acad. Sci., 78:5096-6001 (1981)) y la activación de clones de células T específica de antígenos (Lesslauer et al., Eur. J. Immunol., 16:1289-1296 (1986)).

Algunos estudios han indicado que CD28 es un contra-receptor para el antígeno de activación de células B, B7/BB-1 (Linsley et al., Proc. Nati. Acad. Sci. E.U.A., 87:5031-5035 (1990)). El antígeno B7/BB-I es en adelante referido como el "antígeno B7" . Los ligandos B7 también son miembros de la superfamilia de inmunoglobulinas pero tienen, en contraste con CD28, dos dominios Ig en su región extracelular, un dominio tipo variable (V) N-terminal seguido por un dominio tipo (C) constante.

El suministro de ' una señal co-estimuladora no específica a la célula T requiere de al menos dos miembros de la familia B7 homólogos encontrados en APC's, B7-1 (también llamado B7, B7. 1, o CD80) y B7-2 (también llamado B7.2 o CD86) , ambos de los cuales pueden suministrar señales co-estimuladoras a células T por medio de CD28. La coestimulación a través de CD28 promueve la activación de células T.

CD28 tiene un solo dominio tipo (V) de región variable extracelular (Aruffo y Seed, citado arriba) . Una molécula homologa, CTLA-4, ha sido identificada por el tamizado diferencial de una biblioteca de ADNc de células T citolíticas de murino (Brunet, Nature, 328:267-270 (1987)).

CTLA-4 (CD152) es una molécula de superficie de células T que originalmente -fue identificada por tamizado diferencial de ADNc de células T citolíticas de murino (Brunet et al., Nature, 328:267-270 (1987)). CTLA-4 también es un miembro de la superfamilia de inmunoglobulina (Ig) ; CTLA-4 comprende un solo dominio de Ig extracelular. Los investigadores han reportado la clonación y mapeo de un gen para la contraparte humana de CTLA-4 (Dariavach et al., Eur. J. Immunol., 18:1901-1905 (1988)) a la misma región cromosómica (2q33-34) que CD28 (Lafage-Pochitaloff et al., Immunogenetics, 31:198-201 (1990)). La comparación de secuencias entre este ADN de CTLA-4 humano y aquél que codifica para proteínas CD28 revela una homología de secuencia significativa, con el mayor grado de homología en la yuxtamembrana y regiones citoplásmicas (Brunet et al . (1988), citado arriba; Dariavach et al. (1988), citado arriba) .

CTLA-4 es expresado de manera inducible por células T. Se une a la familia B7 de moléculas (principalmente CD80 y CD86) en células presentadoras de antígeno (Chambers et al., Ann. Rev. Immunol., 19:565-594 (2001)). Cuando es activada, inhibe la proliferación y función de células T. Ratones genéticamente deficientes en CTLA-4 desarrollan enfermedad linfoproliferativa y autoinmunidad (Tivol et al., Immunity, 3:541-547 (1995)). En modelos pre-clínicos , el bloqueo de CTLA-4 también aumenta la inmunidad antitumor (Leach et al., Science, 271:1734-1736 (1996); van Elsas et al., J. Exp. Med. , 190:355-366 (1999)). Estos descubrimientos llevaron al desarrollo de anticuerpos que bloquean CTLA-4 para usarse en inmunoterapia para el cáncer.

El bloqueo de CTLA-4 por anticuerpos monoclonales lleva a la expansión de todas las poblaciones de células T, con células T CD4+ y CD8+ activadas mediando la destrucción de células turaorales (Melero et al., Nat Rev Cáncer 2007; 7:95 - 106; Wolchok et al., The Oncologist 2008; 13 (suppl. 4): 2-9). La respuesta antitumoral que resulta de la administración de anticuerpos anti-CTLA-4 se cree que se debe a un incremento en la relación de células T efectoras a células T reguladoras dentro del microambiente del tumor, en lugar de simplemente de cambios en las poblaciones de células T en la sangre periférica (Quezada et al., J Clin Invest 2006;116:1935-45). Uno de estos agentes bajo investigación clínica es ipilimumab.

El ipilimumab (previamente MDX-010; Medarex Inc.) es un anticuerpo monoclonal anti-CTLA-4 humano completamente ¦ humano que bloquea la unión de CTLA-4 a CD80 y CD86 expresadas en células presentadoras de antígenos, de esta manera bloqueando la sub-regulación negativa de las respuestas inmunitarias desarrolladas por la interacción de estas moléculas. Estudios iniciales en pacientes con melanoma mostraron que ipilimumab podría causar regresiones de tumor durables objetivas (Phan et al., Proc. Nati. Acad. Sci. E.U.A., 100:8372-8377 (2003)). Asimismo, las reducciones de los marcadores de tumor en suero fueron vistas para algunos pacientes con cáncer ovárico o de próstata (Hodi et al., Proc. Nati. Acad. Sci. E.U.A. 100:4712-4717 (2003)).

Más recientemente, ipilimumab ha demostrado actividad antitumoral en pacientes con melanoma avanzado (Weber et al., J Clin Oncol 2008; 26:5950-56; Weber, Cáncer Immunol . Immunother 2009; 58:823-30). Sin embargo, un marcador de activación inmunitaria inicial con ipilimumab aún tiene que ser identificado. En consecuencia, existe la necesidad en la técnica por identificar pacientes que pudieran tener una respuesta favorable a la terapia con anti-CTLA-4.

Un candidato potencial es el recuento linfocítico absoluto (ALC). ALC es un parámetro de células sanguíneas estándar y clínicamente aceptado que se mide rutinariamente por médicos antes del tratamiento terapéutico de ciertas leucemias y linfornas. Recientemente, ALC ha estado asociado con patología clínica para varios tipos de leucemias y linfornas. Específicamente, Porrata et al. han mostrado que la recuperación de ALC post auto-trasplante en pacientes de linforna y mieloma es predictiva de recaída (Blood, 98:579-585 (2001)). Además, existe también cierta evidencia de que ALC en diagnóstico y antes de la terapia dirigida a anti-CD-20 puede ser un marcador prognóstico útil en linfoma folicular (Siddiqui et al., Br. J. Haematology, 134:596-601 (2006); Behl et al., Br. J". Haematology, 137:409-415 (2007)). Sin embargo, el valor predictivo del recuento linfocítico absoluto (ALC) ha sido un aspecto reciente de debate en linfoma no Hodgkin (Leukemia, 21:2227-2230 (2007)).

No obstante, el valor predictivo de ALC para leucemias ha estado ganando aceptación. Por ejemplo, De Angulo et al. muestran que ALC es un predictor independiente significativo de recaída y supervivencia en leucemia mieloblástica aguda (AML) y leucemia linfoblástica aguda (ALL) (Cáncer, 112 (2 ): 407-415 (2008)), lo cual se observó también por Behl et al., (Leukemia, 20(1): 29-34 (2006)).

Más recientemente, un bajo ALC en diagnóstico y/o momentos específicos después del tratamiento se ha encontrado que es un factor negativo para la supervivencia en un número de malignidades hematológicas y tumores sólidos, incluyendo linforna de células B grandes difuso (Cox et al., Leuk Lymphoma 2008;49: 1745-51), sarcoma de Ewing de alto riesgo (De Angulo et al., J Pediatr Hematol Oncol 2007;29:48-52), leucemia linfoblástica aguda y leucemia mieloblástica aguda (De Angulo et al., Cáncer 2008;112:407-15), mieloma múltiple (Ege et al., Br J Haematol 2008;141:792-98), y metástasis cerebrales de cáncer de mama (Claude et al., Radiother Oncol 2005;76:334-39) .

Sin embargo, el uso de ALC ha estado limitado a predecir la. supervivencia de pacientes, pero no ha mostrado previamente ser un indicador para predecir la respuesta de pacientes a .terapias específicas, mucho menos terapias inmunomoduladoras específicas.

Los presentes inventores han descubierto, por primera vez, que el cambio en el recuento linfocítico absoluto con el tiempo en pacientes que reciben terapia anti-CTLA-4 para cánceres no hemáticos, tales como melanoma, es útil para predecir la probabilidad de que un paciente logre una respuesta favorable a inmunoterapia.

Breve Descripción de la Invención La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que active células T para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde los pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron una pendiente positiva y, en promedio, una pendiente positiva más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente efectiva de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para lograr una respuesta favorable .

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la inhibición de CTLA-4 para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde los pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron una pendiente positiva, y, en promedio, una pendiente positiva más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa podrían requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para lograr una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable' de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno.

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que active células T para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde los pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron una pendiente positiva y, en promedio, una pendiente positiva más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para lograr una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir un. régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno.

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la administración de un anticuerpo anti-CTLA-4 para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde los pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron una pendiente positiva, y, en promedio, una pendiente positiva más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa podrían requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para lograr una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno.

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la administración de ipilimumab para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto,' en donde los pacientes que tienen una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron una pendiente positiva, y, en promedio, una pendiente positiva más alta que pacientes que no recibieron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para lograr una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno.

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la modulación de la vía co-estimuladora para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron una pendiente positiva, y, en promedio, una pendiente positiva más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para lograr una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno, en donde el trastorno es melanoma.

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que active, células T para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas- de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde los pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que los pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno.

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la inhibición de CTLA-4 para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocitico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocitico absoluto, en donde los pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que los pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno.

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la administración de un anticuerpo anti-CTLA-4 para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde los pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que los pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno.

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la administración de ipilimumab para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde los pacientes que' tuvieron una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que los pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno .

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la modulación de la vía co-estimuladora para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde los pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que los pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno, en donde el trastorno es melanoma.

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la inhibición de CTLA-4 para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable, tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno, en donde el trastorno es melanoma.

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la administración de un anticuerpo anti-CTLA-4 para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno, en donde el trastorno es melanoma.

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la administración de ipilimumab para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable, de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno, en donde el trastorno es melanoma.

La presente invención proporciona un método para predecir la probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la inhibición de CTLA-4 para un trastorno,, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno, en donde el trastorno es melanoma, y en donde el otro agente se selecciona del grupo que consiste en: quimioterapia, un agente estabilizador de tubulina; pacitaxel; una epotilona; un taxano; Dacarbazina; PARAPLATIN*; Docetaxel; una o más vacunas péptidas; vacuna de péptido de melanoma MDX-1379; una o más vacunas de péptidos gplOO; vacuna fowlpox-PSA-TRICOM™ ; vacuna PSA-TRICOM™; antígeno MART-1; sargramostim; ticilimumab; y/o Terapia Ablasiva de Andrógenos en Combinación.

La presente invención proporciona un método para predecirla probabilidad de que un paciente tenga una respuesta favorable a terapia que incluya la inhibición de CTLA-4 para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno, en donde el trastorno es melanoma, y en donde el régimen de dosificación más agresivo incluye la administración de 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 ó 95% más que la dosis prescrita de la terapia, o 1.5x, 2x, 2.5x, 3x, 3.5x, 4x, 4.5x o 5x más que la dosis prescrita de la terapia, y como alternativa en donde la frecuencia de dosificación incrementada está en combinación con otro agente.

La presente invención proporciona un método para tratar un paciente con terapia que incluya la modulación de la vía co-estimuladora para un trastorno, que incluye cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde a pacientes que tengan una pendiente positiva se les puede administrar la terapia sola a la dosis recomendada, mientras que pacientes que tengan una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente efectiva de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno.

La presente, invención proporciona un método paira tratar un paciente con terapia que incluya la inhibición de CTLA-4 para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno.

La presente invención proporciona un método para tratar un paciente con administración terapéutica de un anticuerpo anti-CTLA-4 para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más ' agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno .

La presente invención proporciona un método para tratar un paciente con una terapia que comprende la administración de ipilimumab para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más. baja de lograr una respuesta favorable a la terapia. Los pacientes que lograron una respuesta favorable tuvieron, en promedio, una pendiente más alta que los pacientes que no lograron una respuesta favorable. En consecuencia, los pacientes con una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno, en donde el trastorno es melanoma.

La presente invención proporciona un método para tratar un paciente con una terapia que comprende la administración de un régimen de quimioterapia para un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas con el tiempo antes de, casi al mismo tiempo que y/o después de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, en donde pacientes que tengan una pendiente positiva tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta favorable a la terapia, mientras que pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia, los pacientes pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el trastorno, en donde el trastorno es melanoma y/o cáncer pulmonar.

La presente invención está dirigida también a un kit para usarse en determinar una estrategia de tratamiento para un individuo con un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende un medio para medir recuentos linfocíticos absolutos con el tiempo, y calcular una pendiente para los recuentos linfocíticos absolutos; y opcionalmente instrucciones para usar e interpretar los resultados del kit, en donde la estrategia del tratamiento comprende la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva de un modulador de la vía .co-estimuladora, o una sal, hidrato o solvato farmacéuticamente aceptable del mismo.

La presente invención también está dirigida a un kit para usarse en determinar una estrategia de tratamiento para un individuo con un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende un medio para medir los recuentos linfocíticos absolutos con el tiempo, y calcular una pendiente para los recuentos linfocíticos absolutos; y opcionalmente instrucciones para usar a interpretar los resultados del kit, en donde la estrategia del tratamiento comprende la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de CTLA-4, o una sal, hidrato o solvato farmacéuticamente aceptable del mismo.

La presente invención también está dirigida a un kit para usarse en determinar una estrategia de tratamiento para un individuo con un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende un medio para medir recuentos linfociticos absolutos con el tiempo, y calcular una pendiente para los recuentos linfociticos absolutos; y opcionalmente instrucciones para usar e interpretar los resultados del kit, en donde la estrategia de tratamiento comprende la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva de un anticuerpo anti-CTLA-4, o una sal, hidrato o solvato farmacéuticamente aceptable del mismo.

La presente invención también está dirigida a un kit para usarse en determinar una estrategia de tratamiento para un individuo con un trastorno, incluyendo cáncer, que comprende un medio para medir recuentos linfociticos absolutos con el tiempo, y calcular una pendiente para los recuentos linfociticos absolutos; y opcionalmente instrucciones para usar e interpretar los resultados del kit, en donde la estrategia del tratamiento comprende la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva de un ipilimumab, o una sal, hidrato o solvato farmacéuticamente aceptable del mismo.

Breve descripción de las figuras La Figura 1 muestra el ALC medio ajustado contra semanas desde primera dosis. Se muestra el ALC medio ajustado contra semanas desde la primera dosis, por dosis. Las curvas gruesas muestran medios ajustados; Las curvas delgadas son límites de bandas de 95% de confianza para la media. Las fechas de dosificación nominales fueron después de 0, 3, 6 y 9 semanas (líneas verticales punteadas) . Todos los pacientes en los estudios CA184-007, -008 y -022 fueron incluidos, excepto los 2 pacientes como se indica en el ejemplo 1 (n = 482 pacientes, 2715 puntos de datos totales) . Todos los puntos de tiempo entre 4 semanas antes de y 12 semanas después de la primera dosis fueron incluidos. Un modelo lineal extendido fue ajustado por REML, con estructura de correlación de pacientes dentro' de exponencial espacial (distancia Euclidiana) y con varianzas dentro de pacientes inversamente proporcionales al número de medidas ALC en un día determinado. El cambio en ALC con el tiempo fue modelado usando estrías con un nudo en 0: lineal antes de 0 y cúbico después. Como se muestra, la pendiente de ALC media para pacientes a los que se les administraron 10 mg/kg de ipilimumab fue mayor que, y estadísticamente significativamente diferente de, aquella para pacientes a los que se les administraron 3.0 mg/kg o 0.3 mg/kg.

La Figura 2 muestra el cambio estimado en ALC por semana (pendiente) contra ALC estimado en fecha de primera dosis para CA184-007, -008 y -022. Se muestra el cambio estimado en ALC por semana (pendiente) contra ALC estimado en la fecha de la primera dosis (ordenada en el origen de la recta de regresión) , por dosis, para los estudios CA184-007, -008 y -022. Cada punto es un paciente. Para cada paciente, la pendiente y ordenada en el origen de la recta de regresión fueron estimadas mediante regresión lineal simple. Las líneas horizontales continuas en cada panel dan 25°, 50° y 75°¦ percentiles de las pendientes en el panel. Incluye todos los pacientes con fecha de primera dosis conocida, al menos un valor ALC después de primera dosis y por lo menos dos valores ALC entre los días de estudio -28 y 84 (semanas -4 y 12), inclusive (n = 462) . Sólo los valores ALC entre los días de estudio -28 y 84, inclusive, se incluyeron en los análisis. Como se muestra, el cambio medio en ALC por semana (pendiente) para pacientes a los que se les administraron 10 mg/kg de ipilimumab fue mayor que, y estadísticamente significativamente diferente de, de los pacientes a quienes se les administraron 3.0 mg/kg o 0.3 mg/kg.

La Figura 3 muestra el cambio estimado en ALC por semana (pendiente) contra ALC estimado en fecha de primera dosis para estudio CA184-022 únicamente. Se muestra el cambio estimado en ALC por semana (pendiente) contra ALC estimado en la fecha de primera dosis (ordenada en el origen de la recta de regresión) por dosis, para el estudio CA184-022 solamente. Cada punto es un paciente. Para cada paciente, la pendiente y ordenada en el origen de la recta de regresión fueron calculadas mediante regresión lineal simple. Las líneas horizontales continuas en cada panel dan 25°, 50° y 75° percentiles de las pendientes en el panel. Incluye todos los pacientes con fecha de primera dosis conocida, al menos un valor ALC después de primera dosis, y al menos dos valores ALC entre los días de estudio -28 y 84 (semanas -4 y 12) , inclusive (n = 201) . Sólo los valores ALC entre los días de estudio -28 y 84, inclusive, fueron incluidos en los análisis. Incluso cuando se restringió a. este solo estudio, una asociación entre la pendiente de ALC y dosis fue aparente .

La Figura 4 muestra el cambio estimado en ALC por semana (pendiente) contra ALC estimado en la fecha de primera dosis por dosis y categoría de respuesta para CA184-007, -008 y -022. Se muestra el cambio estimado en ALC p'or semana (pendiente) contra ALC estimado en la fecha de primera dosis (ordenada en el origen de la recta de regresión) , por dosis y Categoría de Respuesta, para los estudios CA184-007, -008 y -022. Cada punto es un paciente. Para cada paciente, la pendiente y ordenada en el origen de la recta de regresión fueron estimadas mediante regresión lineal simple. Las líneas horizontales continuas en cada panel dan los percentiles 25, 50 y 75 de las pendientes en el panel. Incluye todos los pacientes evaluables por respuesta con fecha de primera dosis conocida, al menos un valor ALC después de primera dosis, y al menos 2 valores ALC entre los días de estudio -28 y 84 (semanas -4 y 12) , inclusive (n = 379). Sólo valores ALC entre los días de estudio -28 y 84, inclusive, fueron incluidos en los análisis. Como se muestra, la diferencia en pendiente media entre los grupos de beneficio y sin beneficio para pacientes que recibieron 10 m9/kg de ipilimumab fue altamente estadísticamente significativa .

La Figura 5 muestra el cambio estimado en ALC por semana (pendiente) contra ALC estimado en fecha de primera dosis por dosis y Categoría de irRespuesta para CA184-007, -008 y -022. Se muestra el cambio estimado en ALC por semana (pendiente) contra ALC .estimado en la fecha de primera dosis (ordenada en el origen de la recta de regresión) , por dosis y Categoría de irRespuesta, para los estudios CA184-007, -008 y -022. Cada punto es un paciente. Para cada paciente, la pendiente y ordenada en el origen de la recta de regresión fueron estimadas mediante regresión lineal simple. Las líneas horizontales continuas en cada panel dan los percentiles 25, 50 y 75 de las pendientes en el panel. Incluye todos los pacientes evaluables por respuesta con fecha de primera dosis conocida, al menos un valor ALC después de primera dosis y al menos 2 valores ALC de entre los días de estudio -28 y 84 (semanas -4 y 12) , inclusive (n = 379) . Sólo los valores ALC entre los días de estudio -28 y 84, inclusive, fueron incluidos en los análisis. Como se muestra, la diferencia en pendiente media entre las categorías irRespuesta para pacientes que recibieron 10 mg/kg de. ipilimumab fue altamente estadísticamente significativa.

La Figura 6 muestra el cambio estimado en ALC por semana (pendiente) contra ALC estimado en fecha de primera dosis, por dosis y categoría de respuesta, para el estudio CA184-004 únicamente. Se muestra el cambio estimado en ALC por semana (pendiente) contra ALC estimado en la fecha de primera dosis (ordenada en el origen de la recta de regresión) , por dosis y categoría de respuesta, para el estudio CA184-004 únicamente. Cada punto es un paciente. Paira cada paciente, la pendiente y ordenada en el origen de la recta de regresión fueron calculadas mediante regresión lineal simple. Las líneas horizontales continuas en cada panel dan los percentiles 25, 50 y 75 de las pendientes en el panel. Incluye todos los pacientes con fecha de primera dosis conocida, al menos un valor ALC después de primera dosis y al menos dos valores ALC entre los días de estudio -28 y 84 (semanas -4 y 12) , inclusive (n = 65) . Sólo los valores ALC entre los días de estudio -28 y 84, inclusive, fueron incluidos en los análisis. Las asociaciones positivas entre pendiente de ALC y dosis, y pendiente de ALC y categoría de respuesta, fueron observadas en este estudio, de manera similar, a aquellas observadas en el análisis combinado de los estudios CA184-Ó07, CA184-008 y CA184-022.

Las Figuras 7A y 7B muestran la relación entre respuesta antitumor y concentraciones a través de estado fijo de ipilimumab (Cminss) . En ambas Figuras 7A y 7B, . la línea continua y área sombreada representan valores medios de la predicción modelo y 90% de bootstrap CI (n=500) . Las gráficas de caja horizontal representan la distribución de Cminss en cada grupo de dosis: cajas (percentiles 25, 50 y 75) y bigotes (percentiles 5 y 95) . La Figura 7A muestra la probabilidad predicha por modelo con 90% CI de BOR (CR a PR) contra Cminss . La probabilidad de BOR se incrementó de 4.9% a 19.5% en los percentiles 5 y 95 de Cminss . Los resultados de una verificación predictiva indicaron una adecuada concordancia entre la probabilidad predicha por modelo de los respondedores a BOR y la proporción observada de respondedores a BOR (datos no mostrados) . La Figuras 7B muestra la probabilidad predicha por modelo con 90% CI de irCA contra Cminss . Las probabilidades de lograr irCA fueron más del doble que aquellas de BOR en los percentiles 25 y 75 de Cminss .

Descripción Detallada de la Invención La presente invención sé basa, en parte, en datos de cuatro pruebas clínicas fase II que demostraron que pacientes que exhibieron una pendiente positiva, para las mediciones que incluyen recuentos linfocíticos absolutos ("ALC" en la presente) como una función de tiempo después de la administración del anticuerpo anti-CTIiA-4 , ipilimumab, tuvieron una probabilidad más alta de lograr un beneficio clínico y/o respuesta inmuno-relacionada. Generalmente, los pacientes que exhibieron una pendiente negativa para el recuento linfocxtico absoluto como una función del tiempo después de la administración de ipilimumab, no pudieron lograr un beneficio clínico. Sin embargo, uno de los 91 pacientes que exhibieron una pendiente negativa sí logró un beneficio clínico.

En consecuencia, la pendiente de ALC está asociada positivamente con, y es entonces útil . como un indicador predictivo para, beneficio clínico y/o respuesta inmuno-relacionada para pacientes que reciben un modulador de la vía co-estimuladora, tal como por ejemplo, ipilimumab. Además, la pendiente de ALC también está asociada positivamente con, y es entonces útil como un indicador predictivo para, beneficio clínico y/o respuesta inmuno-relacionada para pacientes que reciben un inmunoestimulador y/o activador de células T, tal como por ejemplo, ipilimumab.

Para los propósitos de la presente invención, la frase "asociada positivamente" se refiere a una condición general en la que un valor de pendiente de ALC más alto para un paciente dado sugiere que el paciente tendrá una probabilidad correspondientemente más alta de lograr un beneficio clínico, en relación a un paciente que tenga un valor de pendiente a ALC más bajo.

Además, una pendiente negativa de ALC es útil como un indicador predictivo para identificar pacientes que pudieran tener una probabilidad más baja de responder a o de lograr beneficio clínico y/o respuesta inmuno-relacionada a la administración de un modulador de la vía co-estimuladora, tal como por ejemplo, ipilimumab. Además, una pendiente negativa de ALC podría ser útil para identificar pacientes quienes pudieran requerir de regímenes de dosificación más agresivos de un modulador de la vía co-estimuladora, o combinación con los mismos, para lograr así beneficio clínico y/o respuesta inmuno-relacionada con terapia de modulador de vía co-estimuladora.

La medición de la pendiente de ALC, tanto positiva como negativa, también puede ser útil como un indicador predictivo para identificar pacientes quienes pudieran responder a otros tipos de terapias más allá de simplemente moduladores de la vía co-estimuladora, los cuales incluyen, por ejemplo, pero no están limitadas a, quimioterapia.

El uso de la pendiente de ALC como un diagnóstico también es útil, entre otras cosas, ayudar a los profesionales del servicio de salud á desarrollar regímenes de tratamiento personalizados adecuados para las afecciones presentadas en la presente, particularmente para el tratamiento de melanoma.

Las enseñanzas de la presente invención se cree que son la primera asociación entre la pendiente de ALC y respuesta de paciente a una terapia específica, en general, y específicamente la respuesta a un modulador de la vía co-estimuladora, tal como ipilimumab. Aunque el uso de ALC (pero no pendiente) , como un indicador para predecir la supervivencia total para un número selecto y limitado de cánceres, incluyendo ciertas malignidades hematológicas , ALL, AML, sarcoma de Ewing de alto riesgo, mieloma múltiple y metástasis cerebrales de cáncer de mama se conoce, no se ha usado como un indicador predictivo para predecir las respuestas de pacientes a la intervención terapéutica de estos trastornos - más bien, sólo se ha usado para predecir la supervivencia. Además, el uso de la pendiente de ALC como un indicádor predictivo de la respuesta de pacientes a un agente inmunomodulador tampoco ha sido descrito previamente.

El uso de ALC como un indicador para predecir la supervivencia total para estos cánceres parece haber sido limitado a medir la ALC de línea base antes del tratamiento, y no incluyó medir ALC como una función de tiempo (por ejemplo, pendiente) durante el periodo de intervención terapéutica, mucho menos aplicar el valor de la pendiente para hacer una predicción de la probabilidad de que un paciente ' logre un beneficio clínico con base en si la pendiente es positiva o negativa, como se describe en la presente. El uso de ALC, pero no pendiente, después de la administración terapéutica ha sido aplicado para predecir la supervivencia de pacientes (véase DeAngelo et al., J. Pediatr. Hemat . Oncol., 29(l):48-52 (2007); DeAngelo et al., Cáncer, 112 (2) : 07-415 (2007), y Behl et al., . Br. J. Haematology, 137:409-415 (2007)), pero esta aplicación de ALC se ha basado en el valor de ALC en el momento de la medición como un umbral (es decir, ya sea que ALC estuviera por arriba o debajo de cierto límite numérico) - el cambio de ALC con el tiempo (por ejemplo, pendiente) no ha sido descrito anteriormente. La presente invención está dirigida al uso de la pendiente de ALC como un indicador predictivo de la respuesta de pacientes a terapia inmunomoduladora.

Para los propósitos de la presente invención, el valor del ALC de un paciente puede medirse empezando en o casi en el momento de la primera dosis terapéutica, y continuar a una frecuencia regular durante un periodo de tiempo, como se detalla en la presente o de otra manera como se solicite por un profesional del cuidado de la salud. El ALC de un paciente se puede medir opcionalmente antes de la primera dosis terapéutica también. En una modalidad de la presente invención, el valor de un ALC de paciente puede medirse mensualmente , y bisemanalmente , semanalmente, entre semanas o incluso tan frecuentemente como diariamente (en adelante referido como "frecuencia de medición de ALC" ) . Después de un intervalo de tiempo dado (en adelante referido como "intervalo de pendiente de ALC"), la pendiente puede ser entonces calculada usando dos o más puntos de tiempo que residan dentro del intervalo de la pendiente de ALC para usarse en hacer una predicción predictiva con respecto a la respuesta terapéutica de un paciente individual.

La longitud del intervalo de la pendiente de ALC puede depender, en parte, de la frecuencia de medición de ALC, con frecuencias más cortas permitiendo intervalos más cortos, en general. En una modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 24 semanas. En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 20 semanas. En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 18 semanas. Eh otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 15 semanas. En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 12 semanas. En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 11 semanas. En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 10 semanas. En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 9 semanas . En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 8 semanas . En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 7 semanas . En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 6 semanas . En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 5 semanas. En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 4 semanas. En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 3 semanas . En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 2 semanas . En otra modalidad de la presente invención, el intervalo de pendiente de ALC puede ser de aproximadamente 1 semanas. En este contexto, el término "aproximadamente" deberá considerarse que significa ± 1, 2, 3, ·4, 5, 6 ó 7 días más o menos que el intervalo de pendiente de ALC indicado.

En una modalidad, la asignación de la pendiente para que sea ya sea positiva o negativa puede hacerse después de que la pendiente de ALC para el intervalo de pendiente de ALC de interés haya sido calculada con base en si el valor de la pendiente está por arriba o debajo de un índice umbral de cambio (referida en la presente como "umbral de pendiente de ALC"). Para los propósitos de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC para que la asignación de la pendiente sea positiva es cero. Por ejemplo, si una pendiente para un paciente dado dentro de un intervalo de pendiente de ALC dado es cero, o si es mayor que cero, entonces ese paciente será asignado como teniendo una pendiente positiva. Asimismo, si una pendiente para un paciente dado dentro de un intervalo de pendiente de ALC dado es menor que cero, entonces a ese paciente se le asignará como teniendo una pendiente negativa. En una modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser aproximadamente 0. En otra modalidad de la presente invención, el umbral del pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.001. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC . puede ser de alrededor de 0.005. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.01. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.015. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.020. En otra modalidad de la' presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.025. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.030. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.035. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.040. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.045. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.050. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.055. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.060. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.065. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.070. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.075. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.080. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.085. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.090. En otra modalidad de la presente invención, el . umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.095. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.010. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.15. En otra modalidad de la presente invención, el umbral de pendiente de ALC puede ser de alrededor de 0.2. En este contexto, el término "aproximadamente" debe considerarse que significa + 0.001, ± 0.002, ± 0 .003 , ± 0.004 , ± 0.005, ± 0.006, ± 0.007, ± 0.008, ± 0.009, ± 0.01, ± 0.015, ± 0.02, ± 0.025, o ± 0.03 del valor umbral de pendiente de ALC indicado.

En otra modalidad, un estimado de la probabilidad de beneficio clínico puede basarse en la pendiente de ALC como una medida continua, sin referencia a un umbral de pendiente de' ALC, sino más bien usando la magnitud del valor positivo o negativo de la pendiente. Por ejemplo, un paciente que tenga un valor de pendiente de ALC más alto, en promedio, puede tener una probabilidad correspondientemente más alta de lograr un beneficio clínico, en relación con el paciente que tenga un valor de pendiente de ALC más bajo. En consecuencia, un paciente que tenga un valor de pendiente de ALC de aproximadamente 2.0 tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de 1.80; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de 1.60; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de 1.40; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de 1.20; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de 1.0; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de 0.80; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de 0.60; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de 0.40; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de 0.20; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de 0.0; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de -0.02; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de 0.04; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de -0.06; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de -0.08; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de -0.1; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de 0.2; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de -0.4; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de -0.6; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico' que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de -0.8; tiene una probabilidad más alta de lograr beneficio clínico que un paciente que tenga una pendiente de ALC de alrededor de -1.00. En este contexto, el término "aproximadamente" se debe considerar que significa ± 0.01, ± 0.02, + 0.03, ± 0.04, ± 0.05, ± 0.06, ± 0.07, ± 0.08, ± 0.09, ± 0.1, ± 0.15, ± 0.2, ± 0.25, ± 0.3, ± 0.35, ± 0.4, ± 0.45, o ± 0.5, del valor de pendiente de ALC indicado .

La presente invención contempla que cualquier respuesta de paciente dada a una terapia es compleja, y probablemente depende de un número de factores, incluyendo, pero no limitados al antecedente genético, dieta, estilo de vida de un paciente, o incluso puede depender de la presencia o ausencia de condiciones de paciente confusas tales como la presencia' de otros trastornos en el momento en que se administre la terapia, o que pudieran originarse debido al curso de administración terapéutica, etc. Estos factores pueden oscurecer o retrasar la presentación de una pendiente de ALC positiva real, de tal forma que la presencia de estos factores puede causar que el valor de la pendiente sea cero, o incluso sea ligeramente negativo dentro del intervalo de pendiente de ALC, lo cual de otra manera sería positivo en ausencia de estos factores. En consecuencia, para los propósitos de la presente invención, la definición de una pendiente de ALC positiva también puede incluir pendientes que estén ya sea en 0 o aproximadamente 0, o pendientes que sean negativas pero dentro de alrededor de ± 10%, aproximadamente ± 5% o incluso alrededor de ± 1% de estar aproximadamente en 0.

Además, en ciertas circunstancias en las que la frecuencia de medición de ALC es muy baja, o durante momentos en los que un profesional de servicios de salud- reconozca que factores de paciente o circunstancias confusos hayan afectado el valor del ALC de tal manera que pueda ser indeseable usar uno o más de los valores ALC que residan dentro del intervalo de pendiente de ALC, un número limitado de valores ALC puede usarse para calcular la pendiente de ALC durante el intervalo de pendiente de ALC aplicable.

La transformación de la pendiente de ALC de un paciente en una probabilidad para predecir la respuesta del paciente puede depender de un número de factores, incluyendo, pero no limitados a la salud del paciente, la afección para la cual esté siendo tratado el paciente, la terapia que se le haya administrado al paciente, la dosis de la terapia administrada, la frecuencia del régimen de dosificación o cualquier otra consideración que un profesional de cuidado de la salud pueda tomar en cuenta. No obstante, un valor de pendiente de ALC más grande puede transformarse en una probabilidad que prediga si un paciente tendrá una probabilidad incrementada de lograr un beneficio clínico; mientras que un valor de pendiente de ALC más bajo puede transformarse en una probabilidad que prediga si un paciente tendrá una probabilidad reducida de lograr beneficio clínico.

La presente invención contempla que la presente invención puede llevarse a cabo en un número de modos diferentes. Por ejemplo, en un modo, la presente invención contempla al menos una o más de las etapas del método de diagnóstico que se lleven a cabo por una computadora. Por ejemplo, el cálculo de una pendiente de ALC de un paciente, opcionalmente dentro del intervalo de pendiente de ALC, puede llevarse a cabo con una computadora. Además, la determinación de si la pendiente de ALC es positiva o negativa, y opcionalmente de si está por arriba o debajo del umbral de pendiente de ALC, puede llevarse a cabo por una computadora. Además, la transformación de la pendiente de ALC, opcionalmente en conjunto con el umbral de pendiente de ALC, en la probabilidad de que un paciente logre un beneficio clínico para una terapia se puede llevar a cabo por una computadora. Alguien de capacidad en las técnicas de programación de computadoras realmente podría diseñar software que lleve a cabo las etapas de la invención de manera algorítmica.

La computadora para llevar a cabo un modo de la presente invención puede comprender una CPU, ROM, I/O estándar para .recibir y enviar instrucciones y respuestas, algoritmos para llevar a cabo etapas específicas de la presente invención, software de sistema operativo y similares. La computadora también puede incluir un medio de presentación visual para transmitir información I/O al usuario (por ejemplo, monitor, LCD, CRT, etc.), y también puede incluir un medio de ingreso (por ejemplo, teclado, ratón, dispositivo de puntero, tablero táctil, etc.), para permitir la interacción con el usuario.

La frase "beneficio clínico" o "beneficio" se refiere a una condición en la que un paciente logra una respuesta completa; respuesta parcial; enfermedad estable o como se describa de otra manera en la presente.

La frase "recuento linfocítico absoluto" se refiere al número de linfocitos en una muestra de paciente, calculado á partir del porcentaje de linfocitos del número total de glóbulos blancos en una muestra de paciente multiplicado por el número total de glóbulos blancos para llegar al recuento linfocítico "absoluto" . El número y/o porcentaje absoluto de linfocitos en cualquier muestra dada puede determinarse usando un hemocitómetro, citometría de flujo u otros medios conocidos en la técnica.

. La frase "pendiente positiva" o "pendiente de ALC positiva" se refiere a la relación del número de unidades en que una línea se eleva o cae verticalmente (eje Y) en relación al número de unidades en que la línea se mueve horizontalmente (eje X) de izquierda a derecha lo cual resulta en ya sea un valor de cero o un valor positivo (un valor mayor que 0) , en donde el valor del eje Y se refiere a el recuento linfocítico absoluto de una muestra de paciente, y el valor del eje X se refiere a un punto en tiempo. El cálculo de la pendiente requiere mediciones ALC al menos para dos puntos de tiempo. Los puntos pueden incluir valores ALC antes de, durante y/o después de la administración de un modulador de la vía co-estimuladora, aunque de preferencia incluirá puntos empezando en o casi en la primera administración y continuando durante un intervalo de tiempo después de la administración.

La frase "pendiente negativa" o "pendiente de ALC negativa" se refiere al relación del número de unidades en que una línea se eleva o cae verticalmente en relación al número de unidades en que la línea se mueve horizontalmente de izquierda a derecha lo cual resulta en un valor negativo (un valor menor que cero) , en donde el valor del eje Y. se refiere a el recuento linfocítico absoluto de una muestra de paciente, y el valor del eje X se refiere a un punto en tiempo. Los puntos pueden incluir valores ALC antes de, durante y/o después de la administración de un modulador de la vía co-estimuladora, aunque de preferencia incluirán puntos empezando en o casi en la primera administración y continuando durante un intervalo de tiempo después de la administración.

Generalmente, alguien experto en la técnica apreciará cómo calcular la pendiente de cualquier línea dada usando métodos bien conocidos en la técnica. En su forma más simple, una pendiente de ALC de dos puntos puede calcularse de acuerdo con la siguiente fórmula: en donde yi representa el valor de eje Y de un primer punto a lo largo de una coordenada cartesiana, y2 representa el valor del eje Y de un segundo punto a lo largo de una coordenada cartesiana, ?? representa el valor de eje X de un primer punto a lo largo de una coordenada cartesiana, x2 representa el valor del eje X de un segundo punto a 16 largo de una coordenada cartesiana. El cálculo de una pendiente para cualquier linea dada que contenga más de dos puntos individuales está dentro del conocimiento de alguien experto en la técnica de matemáticas y ciencia básica.

La frase "modulador de la vía co-estimuladora" , se refiere generalmente a un inmunoestimulador o activador de células T, y también abarca cualquier agente que sea capaz de interrumpir la capacidad del antíg'eno CD28 para unirse a su ligando cognado, para inhibir la capacidad de CTLA-4 para unirse a su ligando cognado, para aumentar las respuestas de células T mediante la vía co-estimuladora, para interrumpir la capacidad de B7 para unirse a CD28 y/o CTLA-4, para interrumpir la capacidad de B7 para activar la vía co-estimuladora, para interrumpir la capacidad de CD80 para unirse a CD28 y/o CTLA-4, para interrumpir la capacidad de CD80 para activar la vía co-estimuladora, para interrumpir la capacidad de CD86 para unirse a CD28 y/o CTLA-4, para interrumpirla capacidad de CD86 para activar la vía co-estimuladora, y para impedir en general que la vía co-estimuladora sea activada. Esto necesariamente incluye que los inhibidores de molécula pequeña de CD28, CD80,. CD86, CTLA-4, entre otros miembros de la vía co-estimuladora; anticuerpos dirigidos a CD28, CD80, CD86, CTLA-4, entre otros miembros de la vía co-estimuladora; moléculas antisentido dirigidas contra CD28, CD80, CD86, CTLA-4, entre otros miembros de la vía co-estimuladora; adnectinas dirigidas contra CD28, CD80, CD86, CTLA-4, entre otros miembros de la vía co-estimuladora, inhibidores de RNAi (tanto de una sola como de doble hebra) de CD28, CD80, CD86, CTLA-4, entre otros miembros de la vía co-estimuladora, entre otros antagonistas anti-CTLA-4.

Los agentes antagonistas de anti-CTLA-4 adecuados para usarse en los métodos de la invención incluyen, sin limitación, anticuerpos anti-CTLA-4, anticuerpos anti-CTLA-4 humanos, anticuerpos anti-CTLA-4 de ratón, anticuerpos anti-CTLA-4 de mamífero, anticuerpos anti-CTLA-4 humanizados, anticuerpos anti-CTLA-4 monoclonales , anticuerpos anti-CTLA-4 policlonales, anticuerpos anti-CTLA-4 quiméricos, MDX-010 (ipilimumab) , tremelimumab, anticuerpos anti-CD28, adnectinas anti-CTLA-4, anticuerpos anti-dominio CTLA-4, fragmentos anti-CTLA-4 de cadena individual, fragmentos anti-CTLA-4 de cadena pesada, fragmentos anti-CTLA-4 de la cadena ligera, moduladores de la vía co-estimuladora, los anticuerpos descritos en la publicación de PCT No. WO2001/014424 , los anticuerpos descritos en la publicación de PCT No. WO2004/035607 , los anticuerpos descritos en la solicitud de E.U.A. publicada No. US2005/0201994 , y los anticuerpos descritos en la patente europea concedida No. EP1212422B1. Los anticuerpos CTLA-4 adicionales se describen en las patentes de E.U.A. Nos. 5,811,097, 5,855,887, 6,051,227 y 6,984,720; en las publicaciones de PCT Nos. WO.01/14424 y WO 00/37504; y en las publicaciones de E.U.A. Nos. 2002/0039581 y 2002/086014. Otros anticuerpos anti-CTLA-4 que pueden usarse en un método de la presente invención incluyen, por ejemplo, aquellos descritos en: WO 98/42752; patentes de E.U.A. Nos. 6,682,736 y 6,207,156; Hurwitz et al., Proc. Nati. Acad. Sci. E.U.A. 95(17) :10067- 10071 (1998); Camacho et al., J. Clin. Oncology, 22(145): resumen no. 2505 (2004) (anticuerpo CP-675206) ; Mokyr et al., Cáncer Res., 58:5301-5304 (1998), patente de E.U.A. No. 5,977,318, patente de E.U.A. No. 6,682,736, patente de E.U.A. No. 7,109,003 y patente de E.U.A. No. 7,132,281. Cada una de estas referencias se incorpora específicamente en la presente a manera de referencia para los propósitos de descripción de anticuerpos CTLA-4. Un anticuerpo CTLA-4 clínico que se prefiere es anticuerpo monoclonal humano 10D1 (conocido también como MDX-010 e ipilimumab y disponible de Medarex, Inc., Bloomsbury, NJ) , descrita en WO 01/14424.

Como se conoce en la técnica, ipilimumab se refiere a un anticuerpo anti-CTLA-4, y es un anticuerpo IgGi*-completamente humano derivado de ratones transgénicos que tienen genes humanos que codifican para las cadenas pesada y ligera para generar un repertorio humano funcional. Ipilimumab también se puede referir por su registro CAS No. 477202-00-9, y se describe como anticuerpo 10DI en la publicación de PCT No. WOOl/14424, incorporada en la presente a manera de referencia en su totalidad y para todos los propósitos. Específicamente, ipilimumab describe un anticuerpo monoclonal humano o porción de unión a antígeno del mismo que se une específicamente a CTLA-4, que comprende una región variable de la cadena ligera y una región variable de la cadena pesada que tiene una región variable de la cadena ligera comprendida de SEQ ID NO: 5, y que comprende una región de la cadena pesada comprendida de SEQ ID NO: 6: Las composiciones farmacéuticas de ipilimumab incluyen todas las composiciones farmacéuticamente aceptables que comprenden ipilimumab y uno o más diluyentes, vehículos y/o excipientes. Ejemplos de una composición farmacéutica que comprende ipilimumab se proporcionan en la publicación de PCT No. WO2007/67959. El ipilimumab puede administrarse intravenosamente .

Región variable de la cadena ligera para ipilimumab: EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVGSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYGAFSRATGIPD RFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYGSSPWTFGQGTKVEIK (SEQ ID NO:l) Región variable de la cadena pesada para ipilimumab: QVQLVESGGGWQPGRSLRLSCAASGFTFSSYTMHWVRQAPGKGLEWVTFISYDGNNKYYA DSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAIYYCARTG LGPFDYWGQGTLVTSVSS (SEQ ID NO: 2) Como se indica en cualquier lado en la presente, la pendiente de ALC puede ser útil como un indicador predictivo de la respuesta de pacientes a la administración de uno o más antagonistas anti-CTLA-4, ya sea solos o en combinación con un antígeno péptido (por ejemplo, gplOO) , además de o en conjunto con un agente anti-proliferativo descrito en la presente. Un ejemplo no limitativo de un antígeno péptido sería un péptido gplOO que comprende, o como alternativa consiste en, la secuencia seleccionada del grupo que consiste en: IMDQVPFSV (SEQ ID NO : 3 ) y YLEPGPVTV (SEQ ID NO : ) . Este péptido puede ser administrado oralmente, o de preferencia a 1 mg emulsionado en adyuvante de Freund incompleto (IFA) inyectado s.c. en una extremidad, y 1 mg ya sea del mismo o diferente péptido emulsionado en IFA puede inyectarse en otra extremidad.

Los trastornos para los cuales la presente invención podría ser útil para predecir respuestas de pacientes a inmunoterapia y/o en modulación de la vía co-estimuladora, por ejemplo, a través de la administración de ipilimumab, incluyen, pero no están limitados a melanoma, melanoma primario, melanoma maligno etapa III o IV no resecable, cáncer pulmonar, cáncer pulmonar no microcítico, cáncer pulmonar microcítico y cáncer de próstata.

Trastornos adicionales para los cuales la presente invención podría ser útil para predecir las respuestas de pacientes a inmunoterapia y/o modulación de la vía co-estimuladora, por ejemplo, a través de la administración de ipilimumab, incluyen, pero no están limitados a glioma, cáncer gastrointestinal, cáncer renal, cáncer ovárico, cáncer hepático, cáncer colorrectal, cáncer endometrial, cáncer renal, cáncer de tiroides, neuroblastoma, cáncer pancreático, glioblastoma multiforme, cáncer cervical, cáncer de estómago, cáncer de vejiga, hepatoma, cáncer de seno, carcinoma de colon y cáncer de cabeza y cuello, cáncer gástrico, tumor de células germinales, cáncer de hueso, tumores óseos, histiocitoma fibroso maligno de hueso adulto; histiocitoma fibroso maligno de hueso de niñez, sarcoma, sarcoma pediátrico, asesino natural senonasal, neoplasmas, neoplasma de células plasmáticas; síndromes mielodisplásicos; neuroblastoma; tumor de células germinales testicular, melanoma intraocular, síndromes mielodisplásicos; enfermedades mielodisplásicas/mieloproliferativas , sarcoma sinovial, leucemia mieloide crónica, leucemia linfoblástica aguda, leucemia linfoblástica aguda positiva a cromosoma Filadelfia (Ph+ALL) , mieloma múltiple, leucemia mielógena aguda, leucemia linfocítica crónica, mastocitosis y cualquier síntoma asociado con mastocitosis, y cualquier metástasis de los mismos. Además, los trastornos incluyen urticaria pigmentosa, mastocitosis tales como mastocitosis cutánea difusa, mastocitoma solitario en humano, así como mastocitoma de perro y algunos subtipos raros tales como mastocitosis bullosa, eritrodérmica y teleangiectácica, mastocitosis con un trastorno hematológico asociado, tal como un síndrome mieloproliferativo o mielodisplásico, o leucemia aguda, trastorno mieloproliferativo asociado con mastocitosis, leucemia de células cebadas, además de otros cánceres. Otros cánceres también están incluidos dentro . del alcance de trastornos incluyendo, pero no están limitados a, los siguientes: carcinoma, incluyendo aquél de la vejiga, carcinoma urotelial, cáncer de seno, colon, riñon, hígado, pulmón, ovario, páncreas, estómago, cérvix, tiroides, testículos, particularmente seminomas testiculares , y piel; incluyendo carcinoma de células escamosas; tumores estromales gastrointestinales ( "GIST" ) ; tumores hematopoyéticos de linaje linfoide, incluyendo leucemia, leucemia linfocítica aguda, leucemia linfoblástica aguda, linfoma de células B, linfoma de células T, linfoma de Hodgkin, linfoma no Hodgkin, linfoma de células pilosas, linfoma de Burketts; tumores hematopoyéticos de linaje mieloide, incluyendo leucemias mielógenas agudas y crónicas ¦ y leucemia promielocítica; tumores de origen mesenquimático, ' incluyendo fibrosarcoma y rabdomiosarcoma; otros tumores, incluyendo melamona, seminoma, teratocarcinoma, neuroblastoma y glioma; tumores del sistema nervioso central y periférico, incluyendo astrocitoma, neuroblastoma, glioma y schwannomas; tumores de origen mesenquimático, incluyendo fibrosarcoma, rabdomiosarcoma y osteosarcoma; y otros tumores, incluyendo melanoma, xenoderma pigmentoso, queratoacantoma, seminoma, cáncer folicular tiroides, teratocarcinoma, quimioterapia refractaria y tumores de células germinales no seminomatosos refractarios a quimioterapia, y sarcoma de Kaposi y cualquier metástasis de los mismos.

Los términos "tratando", "tratamiento" y "terapia" según se usan en la presente se refieren a terapia curativa, terapia profiláctica, terapia preventiva y terapia de mitigación de enfermedad.

La frase "régimen de dosificación más agresivo" o "régimen de frecuencia de dosificación incrementado", según se usa en la presente se refiere a un régimen de dosificación que necesariamente extiende el régimen de dosificación básico y/o prescrito de un modulador de la vía co-estimuladora, de preferencia ipilimumab, ya sea debido a una frecuencia de dosificación incrementada (aproximadamente una vez a la semana, alrededor de dos veces por semana, aproximadamente una vez al día, alrededor de dos veces al día, etc.), dosis incrementada o escalada (alrededor de 11, aproximadamente 12, alrededor de 13, aproximadamente 14, alrededor de 15, aproximadamente 16, alrededor de 17, aproximadamente 18, alrededor de 19, aproximadamente 20, alrededor de 21, aproximadamente 22, alrededor de 23, aproximadamente 24, alrededor de 25, aproximadamente 26, alrededor de 27, aproximadamente 28, alrededor de 29, aproximadamente 30, alrededor de 35, aproximadamente 40 mg/ml) , o la ruta de administración que puede resultar en un nivel bio-disponible incrementado del modulador co-estimulador .

Se debe entender que esta invención no está limitada a métodos, reactivos, compuestos, composiciones o sistemas, biológicos particulares, los cuales pueden, por supuesto, variar. También se debe entender que la terminología usada en la presente tiene el propósito de describir aspectos particulares únicamente, y no se intenta que sea limitativa. Según se usa en esta descripción y las reivindicaciones anexas, las formas singulares "uno", "un" y "una" , "el" , "la" incluyen referentes plurales a menos que el contexto claramente dicte lo contrario. Así, por ejemplo, la referencia a "un péptido" incluye una combinación de dos o más péptidos, y similares.

"Aproximadamente" según se usa en la presente cuando se hace referencia a un valor mesurable tal como una cantidad, una duración temporal y similares, intenta abarcar variaciones de ± 20% o ± 10%, de preferencia ± 5% o ± 1%, o tan poco como ± 0.1% a partir del valor especificado, ya que estas variaciones son adecuadas para llevar a cabo los métodos descritos.

Los regímenes de tratamiento pueden establecerse con base en determinar si un paciente exhibe ya sea una pendiente de ALC positiva o negativa después de la administración de un modulador de la vía co-estimuladora, tal como ipilimumab, u otra terapia descrita en la presente, tal como quimioterapia. Si una pendiente de ALC positiva o negativa se detecta en la muestra del * paciente, los regímenes de tratamiento .pueden desarrollarse adecuadamente. Por ejemplo, la presencia de una pendiente de ALC positiva puede indicar que el paciente tiene una probabilidad incrementada de lograr un beneficio clínico y/o respuesta inmuno-relacionada con la terapia del modulador de vía co-estimuladora, y de esta manera garantiza la continuación del régimen terapéutico prescrito. Como alternativa, si se detecta una pendiente de ALC negativa, puede indicar que el paciente tiene una probabilidad reducida de lograr un beneficio clínico y/o respuesta inmuno-relacionada a la terapia con modulador de la vía co-estimuladora, y esto entonces puede sugerir que ya sea dosis más altas de la terapia del modulador de vía co-estimuladora deben administrarse o regímenes de dosificación más agresivos o terapia en combinación se garantizan. En un aspecto, un nivel de dosificación incrementado de un modulador de la vía co-estimuladora, tal como ipilimumab, sería de aproximadamente 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 ó 95% más que la dosis típica de modulador de la vía co-estimuladora para una indicación o individuo particular (por ejemplo, alrededor de 0.3 mg/kg, aproximadamente 3 mg/kg, alrededor de 10 mg/kg, aproximadamente 15 mg/kg, alrededor de 20 mg/kg, aproximadamente 25 mg/kg, alrededor de 30mg/kg) , o aproximadamente 1.5x, 2x, 2.5x, 3x, 3.5x, 4x, 4.5x, 5x, 6x, 7x, 8x, 9x o lOx más modulador de la vía co-estimuladora que la dosis típica de modulador de la vía co-estimuladora para una indicación particular o para individual.

Una cantidad terapéuticamente efectiva de modulador de la vía co-estimuladora, de preferencia ipilimumab, puede ser administrada oralmente si es un modulador de molécula pequeña, por ejemplo, o inyectarse de preferencia en el paciente. La dosis real empleada puede variar dependiendo de los requerimientos del paciente y la severidad de la afección que se esté tratando, incluyendo consideración de la pendiente de ALC. La determinación de la dosis de inicio adecuada para una situación particular está dentro de la capacidad de la técnica, aunque la asignación de un régimen de tratamiento se beneficiará de tomar en consideración la pendiente de ALC. No obstante, se entenderá que el nivel de dosis específico y frecuencia dé dosificación para un paciente particular puede variar y dependerá de una variedad de factores incluyendo la actividad del compuesto específico empleado, la estabilidad metabólica y longitud de acción de ese compuesto, la especie, edad, peso corporal, salud general, sexo y dieta del paciente, el modo y tiempo de administración, velocidad de excreción, combinación de fármaco y severidad de la afección particular. Los pacientes preferidos para r tratamiento incluyen animales, muy preferiblemente especies de mamíferos tales como humanos, y animales domésticos tales como perros, gatos y similares, pacientes de cáncer.

Los términos "combinación" y "combinaciones" según se usan en la presente se refieren a una combinación de un modulador de la vía co-estimuladora, de preferencia un agonista, con otro modulador de la vía coTestimuladora, de preferencia un agonista (es decir, inmuno-estimulador) PROVENGE*, un agente estabilizador de tubulina (por ejemplo, pacitaxol, epotilona, taxano, etc.), Bevacizumab, IXEMPRA™, Dacarbazina, PARAPLATI 8 , Docetaxel, una o más vacunas péptidas, vacuna de péptido de melanoma MDX-1379, una o más vacunas de péptido gplOO, vacuna fowlpox-PSA-TRICOM™, vacuna vaccinia-PSA-TRICOM™, antígeno MART-1, sargramostim, ticilimumab, Terapia Ablasiva de Andrógenós en Combinación, la combinación de ipilimumab y otro modulador de la vía co-estimuladora; combinación de ipilimumab y un agente estabilizador de tubulina (por ejemplo, pacitaxol, epotilona, taxano, etc.); combinación de ipilimumab y IXEMPRA™ la combinación de ipilimumab con Dacarbazina, la combinación de ipilimumab con PARAPLATIN* , la combinación de ipilimumab con Docetaxel, la combinación de ipilimumab con una o más vacunas péptidas, la combinación de ipilimumab con vacuna de péptido de melanoma MDX-1379, la combinación de ipilimumab con una o más vacunas de péptido gplOO, la combinación de ipilimumab con vacuna fowlpox-PSA-TRICOM™,, la combinación de ipilimumab con vacuna vaccinia-PSA-TRICOM™, la combinación de ipilimumab con antígeno MART-1, la combinación de ipilimumab con sargramostim, la combinación de ipilimumab con ticilimumab, y/o la combinación de ipilimumab con terapia abrasiva de andrógeno en combinación. Las combinaciones de la presente invención también se pueden usar en conjunto con otras terapias bien conocidas que se seleccionen para su utilidad particular contra la afección que se esté tratando. Estas combinaciones pueden proporcionar opciones terapéuticas a aquellos pacientes que presenten una pendiente de ALC negativa durante el intervalo de pendiente, de ALC.

En otra modalidad de la presente invención, la combinación entre un modulador de la vía co-estimuladora y al menos otro agente puede comprender una o más de las siguientes combinaciones. Ipilimumab y Taxol y Paraplatino (administración concurrente) ; ipilimumab y Taxol y Paraplatino (administración secuencial) ; ipilimumab y Dacarbazina; ipilimumab y Bevacizumab; ipilimumab y Budesonida; ipilimumab y un inhibidor de CD137 e ipilimumab y esteroides (corticoesteroides y similares) .

La pendiente de ALC puede ser útil como un indicador predictivo de la respuesta del paciente a otros moduladores de la vía co-estimuladora solos, o la respuesta a moduladores de la vía co-estimuladora en combinación con otros moduladores de la vía co-estimuladora descritos en la •presente, o la respuesta a la combinación con otros compuestos descritos en la presente, los cuales incluyen, pero no están limitados a, lo siguiente: agatolimod, belatacept, blinatumomab, ligando CD40, anticuerpo anti-B7-l, anticuerpo anti-.B7-2, anticuerpo anti-B7-H4, AG4263, eritoran, anticuerpos monoclonales anti-CD137, anticuerpo anti-OX40, ISF-154 y SGN-70.

Una variedad de quimioterapéuticos se conocen en la técnica, algunos de los cuales se describen en la presente. Un tipo de quimioterapéutico se conoce como un complejo de coordinación de metal. Se cree que este tipo de quimioterapéutico forma entrelazamientos de . ADN predominantemente entre hebras en los núcleos de las células, evitando así la replicación celular. Como resultado, el crecimiento del tumor es inicialmente reprimido, y luego revertido. Otro tipo de quimioterapéutico se conoce como un agente alquilante. Estos compuestos funcionan al insertar composiciones o moléculas extrañas en el ADN de células cancerosas en división. Como resultado de estas porciones extrañas, las funciones normales de células cancerosas son interrumpidas y se impide la proliferación. Otro tipo de qui ioterapéutico es un agente antineoplásico . Este tipo de agente previene, mata o bloquea el crecimiento y dispersión de células cancerosas. Aún otros tipos de agentes anticáncer incluyen inhibidores de aromatasa no esteroides, agentes alquilantes bifuncionales , etc.

La inmunoterapia, en combinación con quimioterapia, es un enfoque novedoso para el tratamiento de cáncer que combina los efectos de agentes que atacan directamente células tumorales produciendo necrosis o apoptosis de células tumorales, y agentes que modulan respuestas inmunitarias del huésped al tumor. Los agentes quimioterapéuticos podrían incrementar el efecto de inmunoterapia al generar antígenos de tumor que serán presentados por células presentadoras de antígenos creando una vacuna de células tumorales (polivalente) , y al distorsionar la arquitectura del tumor, facilitando así la penetración de los agentes inmunoterapéuticos así como la población inmune expandida.

La pendiente de ALC puede ser útil como un indicador predictivo de la respuesta del paciente a agentes de estabilización de microtúbulos , tales como ixabepilona ( IXEMPRA™) y paclitaxel (TAXOL*) , los cuales se usan comúnmente para el tratamiento de muchos tipos de cáncer y representan una clase atractiva de agentes para combinarse con el bloqueo de CTLA-4.

La frase "agente modulador de microtubulina" intenta referirse a agentes que ya sea estabilizan la microbutulina o desestabilizan síntesis de microtubulina y/o polimerización.

Un agente modulador de microtubulina es paclitaxel (comercializado como TAXOL*) , el cual se sabe que causa anormalidades mitóticas y detención, y promueve el ensamble de microtúbulos en estructuras agregadas estables a calcio dando como resultado la inhibición de la replicación celular.

Las epotilonas imitan los efectos biológicos de TAXOL8 (Bollag, et al., Cáncer. Res., 55:2325-2333 (1995), y en estudios de competencia . actúan como inhibidores competitivos de la unión de TAXOL* a microtúbulos. Sin embargo, las epotilonas disfrutan de una ventaja significativa sobre TAXOL* ya que las epotilonas exhiben una caída mucho más baja en potencia en comparación con TAXOL* contra una línea de células resistente a varios fármacos (Bollag et al. (1995)). Además, las epotilonas son considerablemente menos eficientemente exportadas de las células por P-glicoproteína que TAXOL* (Gerth et al. (1996)). Ejemplos adicionales de epotilonas se proporcionan en la solicitud de PCT en copropiedad No. PCT/US2009/030291, presentada el 7 de enero de 2009, la cual se incorpora en la presente a manera de referencia en su totalidad para todos los propósitos.

La ixabepilona es un análogo de lactama semi-sintético de patupilona que se une a tubulina y promueve la polimerización de tubulina y estabilización de microtúbulos , deteniendo de esta manera a las células en la fase G2/M del ciclo celular e induciendo apoptosis de células tumorales.

Ejemplos · adicionales de agentes moduladores de microtúbulos útiles en combinación con inmunoterapia incluyen, pero no están limitados a, alocolchicina (NSC 406042), Halicondrina B (NSC 609395), colchicina (NSC 757), derivados de colchicina (por ejemplo, NSC 33410) , dolastatina 10 (NSC 376128), maitansina (NSC 153858), rizoxina (NSC 332598), paclitaxel (TAXOL®, NSC 125973), derivados de TAXOL* (por ejemplo, derivados (por ejemplo, NSC 608832) , tiocolchicina NSC 361792) , tritil cisteína (NSC 83265) , sulfato de vinblastina (NSC 49842) , sulfato de vincristina (NSC 67574) , epotilonas naturales y sintéticas incluyendo pero no limitadas a epotilona A, epotilona B., epotilona C, epotilona D, desoxiepotilona A, desoxiepotilona B, [1S- [1R*, 3R* (E) , 7R* , IOS* , 11R* , 12R* , 16S*] ] -7 - 11-dihidroxi-8, 8, 10, 12, 16 pentametil-3- [l-metil-2- (2-metil-4-tiazolil) etenil] -4-aza-17-oxabiciclo [14.1.0] heptadecan-5 , 9-diona (descrita en la patente de E.U.A. 6,262,094, expedida el 17 de julio del 2001) , [1S- [IR*, 3R* (E) , 7R* , IOS* , 11R* , 12R* , 16S*] ] -3- [2- [2- (aminometil) -4-tiazolil] -1-raetiletenil] -7 , ll-dihidroxi-8 , 8 , 10 , 12 , 16-pentaraetil-4-17-dioxabiciclo [14.1.0] -heptadecan-5 , 9-diona (descrita en USSN 09/506,481 presentada el 17 de febrero de 2000, y ejemplos 7 y 8 en la presente) , y derivados de las mismas; y otros agentes interruptores de microtúbulos . Los agentes antineoplásicos adicionales incluyen, discodermolida (véase Service, Science, 274:2009 (1996)) estramustina, nocodazol, MAP4 y similares. Ejemplos de estos agentes también se describen en la literatura científica de patente, véase, por ejemplo, Bulinski, J. Cell Sci., 110:3055-3064 (1997); Panda, Proc. Nati. Acad. Sci. E.U.A., 94:10560-10564 (1997); Muhlradt, Cáncer Res., 57:3344-3346 (1997); Nicolaou, Nature, 387:268-272 (1997); Vásquez, Mol. Biol . Cell., 8:973-985 (1997); Panda, J. Biol. Chem. , 271:29807-29812 (1996).

A continuación se muestran las combinaciones terapéuticas preferidas y dosis ejemplares para usarse en los métodos de la presente invención.

Aunque esta tabla proporciona escalas de dosificación ejemplares de moduladores de la vía co-estimuladora y ciertos agentes anticáncer de la invención, cuando se formulan las composiciones farmacéuticas de la invención el médico puede utilizar dosis preferidas según lo garantice la afección del paciente que esté siendo tratado. Por ejemplo, ixabepilona puede de preferencia administrarse a aproximadamente 40 mg/m2 cada 3 semanas. Paclitaxel puede administrarse de preferencia alrededor de 135-175 mg/m2 cada tres semanas .

El anticuerpo anti-CTLA-4 puede administrarse de preferencia a aproximadamente 0.3-10 mg/kg, o la dosis tolerada máxima. En una modalidad de la invención, una dosis de anticuerpo CTLA-4 se administra aproximadamente cada tres semanas. Como alternativa, el anticuerpo CTLA-4 puede administrarse por un régimen de dosificación en escalada que incluye administrar una primera dosis de anticuerpo CTLA-4 a aproximadamente 3 mg/kg, una segunda dosis de anticuerpo CTLA-4 a alrededor de 5 mg/kg y una tercera dosis de anticuerpo CTLA-4 a alrededor de 9 mg/kg.

En otra modalidad específica, el régimen de dosificación en escalada incluye administrar una primera dosis de anticuerpo CTLA-4 a alrededor de 5 mg/kg y una segunda dosis de anticuerpo CTLA-4 a aproximadamente 9 mg/kg.

Además, la presente invención proporciona un régimen de dosificación en escalada que incluye administrar una dosis cada vez más alta de anticuerpo CTLA-4 aproximadamente cada seis semanas En un aspecto de la invención, un régimen de dosificación en escalada por pasos es provista, el cual incluye administrar una primera dosis de anticuerpo CTLA-4 de alrededor de 3 mg/kg, una segunda dosis de anticuerpo CTLA-4 de aproximadamente 3 mg/kg, una tercera dosis de anticuerpo CTLA-4 de aproximadamente 5 mg/kg, una cuarta dosis de anticuerpo CTLA-4 de alrededor de 5 mg/kg y una quinta dosis de anticuerpo CTLA-4 de aproximadamente 9 mg/kg. En otro aspecto de la presente invención, se proporciona un régimen de dosificación en escalada por pasos, que incluye administrar una primera dosis de 5 mg/kg, una segunda dosis de 5 mg/kg y una tercera dosis de 9 mg/kg.

La dosis. real empleada puede variar dependiendo del requerimiento del paciente y la severidad de la afección que esté siendo tratada, lo cual se puede determinar mediante la consideración de la pendiente de ALC de acuerdo con la presente invención. Generalmente, el tratamiento es iniciado con dosis más pequeñas que son menos que la dosis óptima del compuesto. Posteriormente, la dosis se incrementa en cantidades pequeñas hasta que se alcance el efecto óptimo bajo las circunstancias. Por motivo de conveniencia, la dosis diaria total puede dividirse y administrarse en porciones durante el día si se desea. También se puede usar terapia intermitente (por ejemplo, una semana de tres semanas o tres de cuatro semanas) .

Al llevar a la práctica los diferentes aspectos de la invención, las muestras biológicas pueden seleccionarse de preferencia de sangre, células sanguíneas (glóbulos rojos o glóbulos blancos) . Células de una muestra pueden usarse, o se puede usar un lisado de una muestra de células. En ciertas modalidades, la muestra biológica comprende células hemáticas .

Las composiciones farmacéuticas para usarse en la presente invención pueden incluir composiciones que comprendan una o una combinación de moduladores de la vía co-estimuladora en una cantidad efectiva para lograr el propósito deseado. Una dosis terapéuticamente efectiva se refiere a la cantidad de ingrediente activo que reduce los síntomas o afección, y debe tomar en consideración la pendiente de ALC de acuerdo con la presente invención. La eficacia terapéutica y toxicidad en humanos puede predecirse mediante procedimientos farmacéuticos estándares en cultivos de células o animales experimentales, por ejemplo la ED50 (la dosis terapéuticamente efectiva en 50% de la población) y LD50 (la dosis letal a 50% de la población) .

Una "cantidad terapéuticamente efectiva" de un modulador de la vía co-estimuladora puede ser una función de si un paciente exhibe una pendiente de ALC positiva o negativa. Una dosis terapéuticamente relevante de un modulador de la vía co-estimuladora para pacientes que tengan una pendiente de ALC negativa, por ejemplo, podría variar en cualquier lado de 1 a 14 veces o más alta que la dosis típica. En consecuencia, dosis terapéuticamente relevantes de un modulador de la vía co-estimuladora, tal como ipilimumab, para cualquier trastorno descrito en la presente, de preferencia melanoma, pueden ser de, por ejemplo, aproximadamente 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 125, 150, 175, 200, 225, 250 ó 300 veces más altas que la dosis prescrita o estándar. Como alternativa, las dosis terapéuticamente relevantes de un modulador de la vía co-estimuladora, tal como ipilimumab, pueden ser, por ejemplo, aproximadamente l.Ox, alrededor de 0.9x, 0.8x, 0.7x, 0.6x, 0.5x, 0.4x, 0.3x, 0.2x, O.lx, 0.09x, 0.08x, 0.07x, 0.06x, 0.05x, 0.04x, 0.03x, 0.02x o O.Olx de la dosis prescrita para individuos que exhiban una pendiente de ALC positiva..

La presente invención proporciona métodos para determinar la respuesta de un individuo que tenga un trastorno a cierto régimen de . tratamiento y métodos para tratar un individuo que tenga un trastorno con base en determinar si un paciente exhibe una pendiente de ALC positiva o negativa después de la administración del régimen de tratamiento durante un intervalo de tiempo dado.

Los trastornos para los cuales la pendiente de ALC puede ser útil como un indicador predictivo de la respuesta del paciente más allá de simplemente melanoma, cáncer de próstata y cáncer de pulmón, por ejemplo, también incluyen leucemias, incluyendo, por ejemplo, leucemia mieloide crónica (CML) , leucemia linfoblástica aguda y leucemia linfoblástica aguda positiva a cromosoma Filadelfia (Ph+ ALL) , carcinoma de células escamosas, cáncer pulmonar microcítico, cáncer pulmonar no microcítico, glioma, cáncer gastrointestinal, cáncer renal, cáncer ovárico, cáncer de hígado, cáncer colorrectal, cáncer endometrial, cáncer de riñon, cáncer de próstata, cáncer de tiroides, neuroblastoma, cáncer pancreático, glioblastoma multiforme, cáncer cervical, cáncer de estómago, cáncer de vejiga, hepatoma, cáncer de seno, carcinoma de colon y cáncer de cabeza y cuello, cáncer gástrico, tumor' de células germinales, sarcoma pediátrico, asesino natural sinonasal, mieloma múltiple, leucemia mielógena aguda, leucemia linfocítica crónica, mastocitosis y cualquier síntoma asociado con mastocitosis. Además, los trastornos incluyen urticaria pigmentosa, mastocitosis tales como mastocitosis cutánea difusa, mastocitoma solitario en humanos, así como mastocitoma de perros y algunos subtipos raros tales como mastocitosis bullosa, eritrodérmica y teleangiectásica, mastocitosis con un trastorno hematológico asociado, tal como un síndrome mieloproliferativo o mielodisplásico, o leucemia aguda, trastorno mieloproliferativo asociado con mastocitosis , y leucemia de células cebadas. Varios cánceres adicionales . también están incluidos dentro del alcance de trastornos asociados a proteína tirosina cinasa incluyendo, por ejemplo, los siguientes: carcinoma, incluyendo aquél de la vejiga, seno, colon, riñon, hígado, pulmón, ovario, páncreas, estómago, cérvix, tiroides, testículos, particularmente seminomas testiculares y piel; incluyendo carcinoma de células escamosas; tumores estromaies gastrointestinales ( "GIST" ) ; tumores hematopoyéticos de linaje linfoide, incluyendo leucemia, leucemia linfocítica aguda, leucemia linfoblástica aguda, linforna de células B, linforna de células T, linforna de Hodgkin, linfoma no Hodgkin, linfoma de células pilosas y linforna de Burketts; tumores hematopoyéticos de linaje mieloide, incluyendo leucemias mielógenas agudas y crónicas y leucemia promieloscítica; tumores de origen mesenquimático, incluyendo fibrosarcoma y rabdomiosarcoma; otros tumores, incluyendo melanoma, seminoma, teratocarcinoma, neuroblastoma y glioma; tumores del sistema nervioso central y periférico, incluyendo astrocitoma, neuroblastoma, glioma y schwannomas ; tumores de origen mesenquimático, incluyendo fibrosarcoma, rabdomiosarcoma y osteosarcoma; y otros tumores, incluyendo melanoma, xenoderma pigmentoso, queratoactantoma, seminoma, cáncer folicular de tiroides, teratocarcinoma, tumores de células germinales no seminomatosos refractarios de quimioterapia y sarcoma de Kaposi. En ciertas modalidades preferidas, el trastorno es leucemia, cáncer de seno, cáncer de próstata, cáncer pulmonar, cáncer de colon, melanoma o tumores sólidos. En ciertas modalidades preferidas, la leucemia es leucemia mieloide crónica (CML) , Ph+ ALL, AML, CML resistente a imatinib, CML intolerante a imatinib, CML acelerada, CML en fase de blastos linfoides.

Los términos "cáncer", "canceroso" o "maligno" se refieren a o describen la afección fisiológica en mamíferos, u otros organismos, que se caracterizan típicamente por crecimiento de células desregulado. Ejemplos de cáncer incluyen, por ejemplo, tumores sólidos, melanoma, leucemia, linfoma, blastoma, carcinoma y sarcoma. Ejemplos más particulares de estos cánceres incluyen leucemia mieloide crónica, leucemia linfoblástica aguda, leucemia linfoblástica aguda positiva a cromosoma Filadelfia (Ph+ ALL) , carcinoma de células escamosas, cáncer de pulmón microcítico, cáncer pulmonar no microcítico, . glioma, cáncer gastrointestinal, cáncer renal, cáncer ovárico, cáncer de hígado, cáncer colorrectal, cáncer endometrial, cáncer de riñon, cáncer de próstata, cáncer de tiroides, neuroblastoma, cáncer pancreático, glioblastoma multiforme, cáncer cervical, cáncer de estómago, cáncer de vejiga, hepatoma, cáncer de seno, carcinoma de colon y cáncer de cabeza y cuello, tumor de células germinales, sarcoma pediátrico, asesino natural sinonasal, mieloma múltiple, leucemia mielógena aguda (AML) , y leucemia linfocítica crónica (CML) .

Un "tumor sólido" incluye, por ejemplo, sarcoma, melanoma, carcinoma de colon, carcinoma de seno, carcinoma de próstata u otro cáncer de tumor sólido.

"Leucemia" se refiere a enfermedades malignas y progresivas de los órganos for adores de sangre y se caracteriza generalmente por una proliferación y desarrollo distorsionados de leucocitos y sus precursores en la sangre y médula ósea. La leucemia se clasifica clínicamente en forma general sobre la base de (1) la duración y carácter de la enfermedad - aguda o crónica; (2) el tipo de célula implicado; mieloide (mielógena) , linfoide (linfógena) o monocítica; y (3) el incremento o no incremento en el número de células anormales en leucémicos de sangre o aleucémicos ( subleucémicos ) . La leucemia incluye, por ejemplo, leucemia no linfocítica aguda, leucemia linfocítica crónica, leucemia granulocítica aguda, leucemia granulocítica crónica, leucemia promielocítica aguda, leucemia de células T de adultos, leucemia aleucémica, leucemia leucocitémica, leucemia basofílica, leucemia de células de blasto, leucemia bovina, leucemia mielocítica crónica, leucemia cutis, leucemia embrionaria, leucemia eosinofílica, leucemia de Gross, leucemia de células pilosas, leucemia hemoblástica, leucemia hemocitoblástica, leucemia histiocítica, leucemia de células madre, leucemia monocítica aguda, leucemia leucopénica, leucemia linfática, leucemia linfoblástica, leucemia linfocítica, leucemia linfógena, leucemia linfoide, leucemia de células de linfosarcoma, leucemia de células cebadas, leucemia megacariocítica, leucemia micromieloblástica, leucemia monocítica, leucemia mieloblástica, leucemia mielocítica, leucemia granulocítica mieloide, leucemia mielomonocítica, leucemia de Naegeli,. leucemia de células plasmácias, leucemia plasmacítica, leucemia promielocítica, leucemia de células de Rieder, leucemia de Schilling, leucemia de células madre, leucemia subleucémica y leucemia de células no diferenciadas. En ciertos aspectos, la presente invención proporciona tratamiento para leucemia mieloide crónica, leucemia linfoblástica aguda y/o leucemia linfoblástica aguda positiva a cromosoma Filadelfia (Ph+ ALL) .

Anticuerpos La pendiente de ALC puede ser útil como un indicador predictivo de la respuesta de un paciente a anticuerpos que puedan unirse específicamente a polipéptidos de la vía co-estimuladora, tales como CTLA-4, CD28, CD80 y CD86. El término "anticuerpo" se usa en el sentido más amplio y cubre específicamente anticuerpos monoclonales , anticuerpos policlonales , composiciones de anticuerpos con especificidad poliepitópica, anticuerpos biespecíficos , dicuerpos, anticuerpos quiméricos, de cadena individual y humanizados, así como fragmentos de anticuerpo (por ejemplo, Fab, F(ab' )2 y Fv) , siempre y cuando exhiban la actividad biológica deseada. Los anticuerpos pueden ser marcados para usarse en ensayos biológicos (por ejemplo, marcadores radioisotópicos , marcadores fluorescentes) para ayudar a la detección del anticuerpo.

Los anticuerpos que se unen a polipéptidos de la vía co-estimuladora pueden prepararse usando, por ejemplo, polipéptidos intactos de fragmentos que contengan péptidos de interés pequeños, los cuales pueden prepararse en forma recombinante para usarse como el antígeno de inmunización. El polipéptido u oligopéptido usado para inmunizar un animal puede derivarse de la traducción de AR o sintetizarse químicamente, y se puede conjugar a una proteína portadora, si se desea. Los portadores usados comúnmente que son acoplados químicamente a péptidos incluyen, por ejemplo, albúmina de suero bovino (BSA) , hemocianina de lapa en forma de cerradura (KLH) y tiroglobulina . El péptido acoplado es luego usado para inmunizar el animal (por ejemplo, un ratón, una rata o un conejo) .

El término "determinante antigénico" se refiere a la porción de una molécula que hace contacto con un anticuerpo particular (por ejemplo, un epítopo) . Cuando una proteína o fragmento de una proteína se usa para . inmunizar un animal hospedero, numerosas regiones de la proteína pueden inducir la producción de anticuerpos que se unan específicamente a una región o estructura tridimensional dada en la proteína; cada una de estas regiones o estructuras se conoce como un determinante antigénico. Un determinante antigénico puede competir con el antígeno intacto (es decir, el inmunógeno usado para desarrollar la respuesta inmunitaria) para la unión a un anticuerpo.

La frase "se une específicamente a" se refiere a una reacción de unión que es determinante de la presencia de un objetivo en presencia de una población heterogénea de otros biológicos. Así, bajo condiciones de ensayo designadas, la región de unión especificada se une de preferencia a un objetivo particular y no se une en una cantidad . significativa a otros componentes presentes en una muestra de prueba. La unión específica a un objetivo bajo estas condiciones puede requerir una porción de unión que se seleccione para su especificidad para un objetivo particular. Se puede usar una variedad de formatos de ensayo para seleccionar regiones de unión que sean específicamente reactivas con un analito particular. Típicamente una reacción específica o selectiva será al menos el doble de la señal de fondo o ruido y más típicamente más de 10 veces de fondo. Para los motivos de la presente invención, los compuestos, por ejemplo moléculas pequeñas, pueden considerarse para su capacidad para unirse específicamente a polipéptidos de la vía co-estimuladora descritos en la presente.

Kits Para usarse en las aplicaciones de diagnóstico y terapéuticas descritas o sugeridas arriba, también se proporcionan kits por la presente invención. Estos kits pueden, por ejemplo, comprender un medio portador que tenga compartimientos para recibir en confinamiento cerrado con uno o más medios recipientes tales como viales, tubos y similares, cada uno de los medios recipientes comprendiendo uno de los elementos separados que se usarán en el método. Por ejemplo, uno de los medios recipientes puede comprender un medio para llevar a cabo un recuento linfocitico absoluto en una muestra de paciente y/o instrucciones para interpretar el valor ALC obtenido. Otro ejemplo de un medio recipiente puede comprender uno o más viales que contengan una cantidad farmacéuticamente aceptable de un modulador de la vía co-estimuladora .

El kit de la invención comprenderá típicamente el recipiente descrito arriba y uno o más de otros recipientes que comprenden materiales deseables desde un punto de vista comercial y de usuario, incluyendo reguladores de pH, diluyentes, filtros, agujas, jeringas e insertos de base con instrucciones para uso. Una etiqueta puede estar presente en el recipiente para indicar que la composición se usa para una terapia específica o aplicación no terapéutica, y también puede indicar instrucciones ya sea para uso in vivo o in vitro, tales como aquellos descritos arriba.

Los kits útiles para llevar a la práctica los métodos terapéuticos descritos en la presente también pueden contener un compuesto que sea capaz de inhibir la vía co-estimuladora . Se contempla específicamente por la invención un kit que comprende un anticuerpo anti-CTLA-4, ya sea solo o en combinación con otro agente de inmunoterapia, tal como PROVENGE0,- un agente estabilizador de tubulina (por ejemplo, pacitaxol, epotilona, taxano, etc.); y/o un segundo modulador de la vía co-estimuladora, tal como, tremelimumab. Además, la presente invención contempla un kit que comprende una dosis incrementada y/o régimen de frecuencia de dosificación de un modulador de la vía co-estimuladora, y cualquier otra combinación o régimen de dosificación que comprenda un agente estabilizador de tubulina (por ejemplo, pacitaxol, epotilona, taxano, etc.); y/o un segundo modulador de la vía co-estimuladora, tal como, tremelimumab.

Además, los kits pueden incluir materiales instructivos que contengan instrucciones (por ejemplo, protocolos) para la práctica de los métodos de esta invención. Aunque los materiales instructivos comprenden típicamente materiales escritos o impresos no están limitados a éstos . Cualquier medio capaz de almacenar estas instrucciones y de comunicárselas a un usuario final se contempla por esta invención. Estos medios incluyen, pero no están limitados a medios de almacenamiento electrónicos (por ejemplo, discos magnéticos, cintas, cartuchos, chips y similares), medios ópticos (por ejemplo, CD ROM) y similares. Estos medios pueden incluir direcciones para sitios de internet que proporcionen estos materiales instructivos.

El kit también puede comprender, por ejemplo, un medio para obtener una muestra biológica de un individuo. Los medios para obtener muestras biológicas de individuos se conocen bien en la técnica, por ejemplo, catéteres, jeringas y similares, y no se describen en la presente en detalle.

La presente invención no debe limitarse en alcance por las modalidades descritas en la presente, las cuales intentan ser ilustraciones individuales de aspectos únicos de la invención, y cualquiera que sean funcionalmente equivalentes están dentro del alcance de la invención. Varias modificaciones a los modelos y métodos de la invención, además de aquellas descritas en la presente, se harán aparentes para aquellos expertos en la técnica a partir de la anterior descripción y enseñanzas, y se intenta que similarmente que estén dentro del alcance de la invención. Estas modificaciones u otras modalidades pueden llevarse a la práctica sin alejarse del verdadero alcance y espíritu de la invención .

Los siguientes ejemplos representativos contienen información, ejemplificación y guía adicional importante que se puede adaptar a la práctica de esta invención en sus diferentes modalidades y los equivalentes de las mismas. Estos ejemplos intentan ayudar a ilustrar la invención, y no se intenta que, ni debe considerarse que, limiten su alcance.

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Ejemplos Ejemplo 1 Métodos usados para asociar recuento linfocítico absoluto con respuesta benéfica a inhibición de la vía co-estimuladora para tres estudios de fase II CTLA-4 es un regulador negativo de la activación de linfocitos de células T. Al bloquear CTLA-4, ipilimumab activa el linfocito de células T llevando a actividad antitumoral incrementada y proliferación de células T. A través de tres estudios fase II en pacientes con melanoma, linfocitos circulantes (recuento linfocítico absoluto, ALC) se midieron en línea de base y a través de las primeras 12 semanas después de la primera dosis de ipilimumab (dosificación de periodo de inducción) . Se midió el cambio en ALC con el tiempo (pendiente de ALC) . Ipilimumab indujo un incremento dependiente de dosis en los linfocitos circulantes con 10 mg/kg de inducción de índices promedio más grandes de incremento (pendientes) que 3 ó 0.3 mg/kg. La ALC es un parámetro de células hemáticas rutinaria y clínicamente aceptado que se mide por oncólogos y laboratorios antes de la administración de terapia. Se cree que la presente invención es la primera aplicación del uso de la pendiente de ALC como un factor para predecir beneficio clínico para un régimen terapéutico .

Los resultados demuestran que ningún paciente con una reducción en ALC durante el periodo de dosificación de inducción experimentó Beneficio Clínico (definido por respuesta objetiva o enfermedad estable prolongada). Los pacientes que sí tuvieron Beneficio Clínico tuvieron, en promedio, una velocidad de incremento más alta en ALC con el tiempo, que los pacientes sin beneficio clínico. Por lo tanto, los inventores proponen que el cambio en células inmunitarias circulantes (es decir, ALC para ipilimumab u otros activadores de linfocitos) con el tiempo se puede usar para predecir beneficio clínico y posiblemente supervivencia incrementada. Una velocidad de cambio umbral en ALC con el tiempo se puede usar para identificar pacientes que sea probable o poco probable que experimenten beneficio clínico. Este biomarcador podría usarse para enriquecimiento negativo (es decir, detención posible recomendada de tratamiento porque estos pacientes tengan una probabilidad más baja de lograr una respuesta benéfica) o enriquecimiento positivo (es decir, continuación de tratamiento recomendada debido a que los pacientes tienen una probabilidad más alta de lograr una respuesta benéfica) .

Métodos Se tomaron datos de pacientes con melanoma en etapa III o IV no resecable que participaron en tres pruebas clínicas fase II: CA184-008 (NCT00289627 ) fue un estudio de un solo brazo multicéntrico de monoterapia con ipilimumab en pacientes previamente tratados; CA184-022 (NCT00289640 ) fue un estudio de dosis fija aleatorizado, de doble ceguera, multicéntrico de dosis múltiples de monoterapia con ipilimumab en pacientes previamente tratados; CA184-007 (NCT00135408 ) fue un estudio aleatorizado, de doble ceguera y controlado con placebo que comparaba la seguridad de epilimumab administrado con o sin budesonida oral profiláctica en pacientes no tratados y previamente tratados. Los detalles completos de estos detalles clínicos están disponibles en el sitio web de Pruebas Clínicas del Gobierno de E.U.A. Todos los protocolos fueron aprobados por una Mesa de Revisión Institucional o Comité de Ética Independiente; todos los estudios se llevaron a cabo de acuerdo con los principios éticos de la Declaración de Helsinki y la Conferencia Internacional sobre Armonización de la Buena Práctica Clínica.

Ipilimumab se administró a 0.3, 3 ó 10 mg/kg como una infusión intravenosa de paciente externo de 90 minutos cada tres semanas durante cuatro dosis separadas (semanas 1, 4, 7 y 10) durante la fase de inducción. Los pacientes con enfermedad progresiva (PD) antes de la semana 12 (de acuerdo con los criterios modificados de la Organización Mundial de la Salud; en adelante referidos como criterios mWHO) continuaron recibiendo ipilimumab siempre y cuando no experimentaran un rápido deterioro clínico. Los pacientes elegibles continuarían recibiendo ipilimumab cada 12 semanas empezando en la semana 24 (fase de mantenimiento) .

La respuesta antitumor de ipilimumab en estudios clínicos fue evaluada por un comité de revisión independiente (IRC) usando criterios mWHO. La primera evaluación de tumor programada fue en la semana 12, y cualquier evaluación de CR o PR se tenía que confirmar al menos cuatro semanas después de que los criterios de respuesta se satisficieron primero. Los pacientes evaluables por respuesta se clasificaron en una categoría , de respuesta por la presencia o ausencia de beneficio clínico. La Categoría de Respuesta (RESPONSE) de acuerdo con los criterios mWHO, se determinó como sigue: en donde BORIRC = Mejor Respuesta Total según se evalúa por un comité de revisión independiente (IRC) ; CR = Respuesta Completa; PR = Respuesta Parcial; SD = Enfermedad Estable y PD = Enfermedad Progresiva. Si BORIRC es igual a cualquier valor no en la categoría CR, PR, SD o PD, RESPONSE = "Desconocido" . Si BORIRC es igual a CR o PR, RESPONSE = "Beneficio". Si BORIRC es igual a PD, RESPONSE = "Sin beneficio". Si BORIRC es igual a SD, entonces la respuesta fue asignada con base en uno de los siguientes criterios: (i) si el día del estudio para el final de SD está ausente, RESPONSE = "Desconocido"; (ii) Si el día del estudio para el final de SD >= 168, RESPONSE = "Beneficio" (es decir, SD prolongada) ; (iii) si el día del estudio para el final de SD <168 y el estado de censura para la relación de SD está ausente, RESPONSE = "Desconocido"; (iv) si el día del estudio para el final de SD <168 y duración SD no es censurado, RESPONSE = "Sin beneficio" ; (v) si el día del estudio para el final de SD <168 y duración SD es censurado y la fecha de muerte no está ausente y la fecha de muerte <168, RESPONSE = "Sin beneficio" y (vi) si el día del estudio para el 'final de SD < 168 y duración SD se censura y la fecha de muerte está ya sea ausente o >=168, RESPONSE = "Desconocido".

Los Criterios de Respuesta inmuno-relacionada (irRC) novedosos también se usaron para evaluar respuestas antitumor, los cuales capturan los patrones de respuesta antitumor únicos que han sido observados con ipilimumab en estudios clínicos (Hodi et al., J Clin Oncol 2008;26 (19s) :abstr 3008). Los irRC determinan la carga tumoral total como la suma de los productos de los dos diámetros perpendiculares más grandes de lesiones de índice mesurables (línea de base) y lesiones nuevas mesurables, con base en las mediciones IRC (Wolchok et al., manuscrito en preparación) . La determinación de irBOR se basa por lo tanto en una reducción en carga tumoral total, no obstante cualquier incremento inicial en carga tumoral y/o la aparición de lesiones nuevas que pudieran caracterizar a un paciente como PD por los criterios de la mWHO.

Los criterios de irRC fueron definidos como sigue: reducción de la carga tumoral total a partir de la línea de base en 100%, irCR; reducción de la línea de base de >50% en carga tumoral total, irPR; reducción en carg tumoral total de >25% pero menos del 50%, irSD. Un paciente con lesiones nuevas qué sobrepasó cualquier reducción en el tamaño de lesiones de índice existente, lo cual dio como resultado un incremento de >25% en la carga tumoral total, se consideró un irPD. Un criterio de eficacia compuesto, actividad clínica relacionada inmune (irCA) , se usó para describir la actividad antitumoral medible total de ipilimumab (irCR, irPR o irSD) .

Muestras de suero para análisis farmacocinéticos se tomaron de acuerdo con el siguiente programa: pre-dosis en los días de estudio 1 y 43; 90 minutos después de infusión los días de estudio 1 y 43; entre 3-7 días después de la dosis los días 45-49 y entre 10-15 días después de dosis los días 52-57. En todos los tres estudios en fase II, las concentraciones séricas de ipilimumab se midieron usando un ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas cuantitativo desarrollado por Bristol-Myers. Un análisis farmacocinético sérico no de compartimientos de ipilimumab se derivó a partir de concentración sérica contra datos de tiempo por un programa de análisis farmacocinético validado (KineticaTM Basic Versión 4.02, InnaPhase Corporation, 2002).

ALC periféricos de estudios de laboratorios, de seguridad rutinarios se tomó de 482 pacientes a través de los tres estudios fase II. El ALC medio estimado se obtuvo a partir de un ajuste de. modelo lineal extendido por REML, con estructura de correlación dentro de paciente exponencial espacial (distancia euclidiana) , y dentro de varianzas de pacientes inversamente proporcionales en número de medidas ALC en un día dado. Los efectos fijos fueron dosis, tiempo y una interacción aditiva entre dosis y tiempo. El cambio en ALC con el tiempo se modeló usando estrías con un nudo en 0 : lineal antes de 0 y cúbico después. Esto permitió que la pendiente antes de la primera dosis posiblemente difiriera de la pendiente después de la primera dosis..

Se excluyeron dos pacientes de todos los análisis presentados aquí. Un paciente con una fecha incierta de primera dosis y un paciente con un incremento extremadamente grande en ALC con el tiempo.

Los detalles de modelado se delinean en las simbologías de las figuras 1, 2, 3, 4, 5 y 6.

Análisis de respuesta a exposición (E-R) para BOR de CR o PR e irCA La exposición a ipilimumab en pacientes con melanoma avanzado se caracterizó por un modelo farmacocinético de compartimientos de efectos mixtos no lineal (modelo de población PK) . Los datos de concentración en suero-tiempo de ipilimumab se caracterizaron por un modelo de infusión IV de orden cero de dos compartimientos lineal con eliminación de primer orden.

Los estimados individuales de Cminss se definieron como las concentraciones en estado fijo el día 21 (3 semanas) después de la infusión y se obtuvieron a partir de predicciones de observaciones, en estado fijo usando los estimados MAP bayesianos de todos los parámetros PK. Las relaciones E-R se caracterizaron para BOR determinado por IRC de CR o PR por los criterios mWHO e irCA. Esta última es un criterio de eficacia compuesto derivado de irRC, de tal manera que los respondedores a irCA son pacientes que lograron una respuesta de IR total mejor de irCR, irPR o respuesta tardía (irCR ó irPR o irSD después de progresión de tumor), o irSD con >25% de reducción en carga tumoral total.

La relación E-R tanto para BOR como' para irCA se caracterizaron por modelos de regresión logística que relacionaron la Cminss de ipilimumab con la probabilidad de BOR o irCA. La existencia y forma funcional de la relación E-R se estableció por un modelo base y el efecto de las siguientes co-varianzas fue evaluado: peso corporal, edad, género, LDH, estado ECOG, budesonida concomitante, etapa metastásica, genotipo HLA.A2*201, inmunoterapia anterior, terapia con IL-2 anterior y terapia anticáncer sistémica anterior. La magnitud y significado estadístico de cada covariante se evaluó por un método de inclusión hacia adelante y eliminación hacia atrás.

Las covariantes que fueron significativas a 0.05 de nivel por la prueba de relación de probabilidades logarítmicas (LRT) en la etapa de tamizado se incluyeron en un modelo covariante, el cual se simplificó por la eliminación hacia atrás sólo para conservar covariantes que fueron significativas a nivel de 0.001 por la LRT (Dai et al., J. Clin. Pharmacol . 48, 1254-1269 (2008)). El intervalo de confianza de la probabilidad predicha por modelo se obtuvieron mediante bootstrap (n = 500) y la evaluación del modelo se llevó a cabo con verificación predictiva. El modelo final se evaluó al comparar la proporción observada de pacientes que lograban BOR o irCA con el intervalo de predicción de 90% de la proporción, para cada grupo de dosis en el conjunto de datos E-R. El intervalo de predicción de 90% se obtuvo por 500 estimulaciones con el modelo E-R final. Todos los análisis se llevaron a cabo usando el programa de computadora NO MEM en Linux (versión VI, GloboMax, Hanover, MD) .

Resultados Para los pacientes combinados durante los estudios CA184-007, -008 y -022, 10 mg/kg de ipilimumab indujeron un índice de promedio más grande de incremento en ALC que 3.0 mg/kg o 0.3 mg/kg (figuras 1 y 2, tabla 1) . La diferencia en la pendiente media entre los grupos de 0.3 mg/kg y 10 mg/kg fue estadísticamente significativa (prueba de interacción tiempo por dosis a partir del modelo de estría lineal extendido mostrado en la figura 2: t = 2.10, p = 0.036; una prueba similar a partir de un modelo lineal extendido con efecto en tiempo cúbico pero sin estrías dio t = 4.09, p = 4.4 x 10e-5) .

Todos los pacientes en los grupos de 0.3 mg/kg y 3 mg/kg provenían del estudio CA184-022. De esta manera, la tendencia de incrementar la pendiente de ALC con una dosis cada vez más alta potencialmente podría reflejar una diferencia desconocida entre los estudios, en lugar de la dosis per se. Sin embargo, esta tendencia también estuvo presente para pacientes del estudio CA184-022 solo (figura 3) . Esto argumenta contra la explicación alternativa potencial, sugiriendo que la asociación entre la pendiente de ALC y la dosis de ipilimumab vista para los tres estudios combinados no fue el resultado de la diferencia y distribución de las dosis entre estudios .

El criterio primario de actividad antitumor se basó en la definición de Beneficio Clínico usando los criterios modificados de WHO (mWHO) . Ningún paciente con una pendiente de ALC negativa - es decir, una reducción en ALC sobre el periodo de dosificación de inducción - experimentó Beneficio Clínico (figura 4) , tabla 1) . Los pacientes que sí tuvieron Beneficio Clínico tuvieron, en promedio, un índice de incremento con el tiempo más alto (pendiente) que los pacientes sin Beneficio Clínico (figura 4, tabla 1) . La diferencia en la pendiente media entre los grupos de Beneficio y No Beneficio para pacientes que recibieron 10 mg/kg de ipilimumab fue altamente estadísticamente significativa (prueba t de 2 muestras modificada por Welch de los estimados de pendiente por paciente: t = 3.52, df = 110, p = 6 x 10e-04) . La diferencia similar para pacientes que recibieron 3 mg/kg de ipilimumab no fue estadísticamente significativa.

La irRespuesta es una medida exploratoria de la actividad antitumor de ipilimumab y aún no ha sido validada. Como se observa para beneficio clínico, los pacientes con una irRespuesta tuvieron, ,en promedio, una velocidad de incremento con el tiempo más alta (pendiente) , que los pacientes que no (figura 5, tabla 1) . La diferencia en la pendiente media entre las categorías de irRespuesta para pacientes que recibieron 10 mg/kg de ipilimumab fue altamente estadísticamente significativa (prueba t de dos muestras modificada de Welch de los estimados de pendiente por paciente: t = 3.69, df = 138, p = 3 x 10e-04) . La diferencia similar para pacientes que recibieron 3 mg/kg de ipilimumab no fue estadísticamente significativa. Pocos (7/89) pacientes con pendientes ALC negativas - es decir, una reducción en ALC sobre el periodo de dosificación de inducción - experimentaron respuesta relacionada inmune (irRespuesta) (figura 5, tabla 1) . Se cree que estos individuos pueden haber logrado o estuvieron a punto de lograr una pendiente positiva, pero la inclinación positiva de la pendiente no se observó debido a que el análisis se limita a un periodo de 12 semanas. Periodos de análisis más largos serán evaluados para determinar si estos individuos de hecho lograron una pendiente positiva.

La tabla 1 proporciona un resumen del Cambio por Semana (pendiente) del Recuento Linfocítico Absoluto (ALC) Por Paciente durante el periodo de dosificación de inducción, para todos los pacientes con fecha de primera dosis conocida, al menos 1 valor ALC después de primera dosis, y al menos 2 valores ALC entre los días de estudio -28 y 84, inclusive (n = 462) . N = número de pacientes en grupo, SD = Desviación Estándar, total = todos los pacientes en conjunto de datos, beneficio = pacientes con IRC BOR de CR o PR, o PR, o SD prolongada, con una duración de al menos 24 semanas a partir de la fecha de la primera dosis; Sin Beneficio = pacientes con IRC BOR de PD, o SD no prolongada; desconocido = pacientes no en grupos de Beneficio o Sin Beneficio. Todos los grupos excepto "Total" incluyen sólo pacientes evaluables por respuesta.

Tabla 1 Métodos usados para asociar recuento linfocítico absoluto con respuesta benéfica a inhibición de la vía co-estimuladora para el estudio CA184-004 La relación entre la pendiente de ALC y la respuesta de pacientes a ipilimumab se evaluó más en un estudio de fase II adicional, CA184-004.

Los datos fueron recabados de pacientes con. melanoma en etapa III o IV no reseccionalbe que participaron en la prueba clínica fase II: CA184-004. CA184-004 (NCT00261365) fue un estudio de dosis fija aleatorizado, de doble ceguera y multicéntrico de varias dosis de inmunoterapia de ipilimumab en pacientes previamente tratados. Los detalles completos de estos detalles clínicos están disponibles en el sitio web de pruebas clínicas del Gobierno de Estados Unidos. Todos los protocolos fueron aprobados por una Mesa de Revisión Institucional o Comité de Ética Independiente. Todos los estudios se llevaron a cabo de acuerdo con los principios éticos de la Declaración de Helsinki y la Conferencia Internacional sobre la Armonización de la Buena Práctica Clínica.

Métodos Los métodos usados se llevaron a cabo de acuerdo con los métodos delineados en el ejemplo 1 en la presente.

Resultados de 004 y resultados de estudios combinados totales En el análisis de los datos independientes del estudio CA184-004 (n=65) , los inventores confirmaron que la pendiente de ALC está asociada con beneficio clínico (figura 6) . A través de todos los 4 estudios, el porcentaje de pacientes con una ALC negativa fue de 58% (37/64) a 0.3 mg/kg [estudio CA184-022] , 28% (29/104) a 3 mg/kg [estudios CA184-022 y -004], y 19% (71/365) a 10 mg/kg [estudios CA184-007, -008, -022 y -004]. En los grupos de 0.3 y 3 mg/kg, el porcentaje relativamente alto de pacientes con una pendiente de ALC negativa fue muy probablemente debido a exposición insuficiente de ipilimumab.

Un resumen de los resultados obtenidos para el análisis del estudio CA184-004 se muestra en la tabla 2. El análisis de los resultados combinados mostrados en las tablas 1 y 2 muestra un incremento dependiente de dosis en el porcentaje de .pacientes con una pendiente de ALC positiva, favoreciendo la dosis de 10 mg/kg, y concuerda con la observación de que más de 90% de los pacientes tratados con esta dosis tuvo una Cminss más alta que el valor objetivo definido para el bloqueo de CTLA-4. A través de los estudios 007, 008 y 022, los pacientes con beneficio clínico tuviero un índice medio de cambio ALC (pendiente) más grande que los pacientes sin beneficio clínico (P = 0.0013). De manera importante, en estos tres estudios, ningún paciente con una pendiente de ALC negativa sobre el periodo de dosificación de inducción tuvo beneficio clínico. Estas asociaciones fueron confirmadas en el estudio independiente, CA184-004: los pacientes con beneficio tuvieron una pendiente media más grande (P = 00042) y sólo un paciente con 1 pendiente de ALC (ligeramente) negativa tuvo beneficio clínico. ALC de línea de base no estuvo asociada con beneficio clínico en ninguno de los análisis.

Conclusión Ipilimumab ha demostrado efectos antitumor en pacientes con melanoma avanzado en pruebas clínicas fase II (Hamid et al., J Clin Oncol 2008; 26 (19s) : abstr 9025; O'Day et al., J Clin Oncol 2008 ; 26 (19s) : res. 9021). Con criterios de índice BOR y supervivencia total, los resultados del estudio CA184-022 proporcionan evidencia que una dosis de ipilimumab de 10' mg/kg ofrece la relación beneficio a riesgo más alta (Hamid et al., J Clin Oncol 2008 ; 26 (19s) : res. 9025) . El análisis de farmacocinética de población presentado en este reporte confirma además que, con base en la concentración de paso objetivo, .10 mg/kg es una dosis de ipilimumab efectiva. Aunque el número de eventos de respuesta a Cminss más alta es bajo, la forma de las curvas sugiere que dosis más altas de 10 mg/kg se pueden traducir sólo en incrementos graduales en la probabilidad de BOR (véase figuras 7A y 7B) . Sobre todo, estos resultados soportan la selección de 10 mg/kg de ipilimumab como la dosis paira pruebas clínicas fase III, Los biomarcadores periféricos de la activación inmune son más fáciles de medir, no obstante no es claro si son representativos del microambiente del tumor y pueden por lo tanto usarse para predecir beneficio clínico con ipilimumab u otros agentes inmunoterapéuticos . Por ejemplo, altos niveles de células T CD8+ específicas para antígeno de tumor periférico no predicen na respuesta antitumor después de vacunación para cáncer en pacientes con melanoma (Rosenberg et al., J Immunol 2005;175:6169-76). Resultados inconsistentes han sido reportados en cuanto a si ALC más alta en la línea de base es predictiva de beneficio a partir de terapia con anticuerpos anti-CD20 (rituximab) en linfomas no Hodgkin (Behl et al . , Br J Haematol 2007;137:409-15, Oki et al., Eur J Haematol 2008;81:448-53), pero ALC más alta ha sido observada en pacientes con melanoma avanzado que mostraron respuestas antitumor después de inmunoterapia intralesional (Ridolfi . et al., Hepatogastroenterology 2002; 49, 335-39). Cómo los cambios inducidos por ipilimumab en ALC de sangre periférica se relacionan con los cambios en la frecuencia de células T en el microambiente del tumor está más allá del alcance de los estudios actuales.

Aunque se han generado preguntas en cuanto a si los biomarcadores periféricos pueden usarse para predecir qué pacientes se beneficiarán de inmunoterapia, nuestros resultados proporcionan evidencia de que los cambios en ALC están asociados con la actividad clínica de ipilimumab en melanoma. A partir de un análisis de estudio cruzado de tres pruebas clínicas fase II multinacionales en pacientes con melanoma avanzado, los inventores han demostrado: (i) un incremento en probabilidad de una respuesta antitumor al incrementarse la exposición de ipilimumab (por ejemplo Cmin) y (ii) una asociación positiva entre la velocidad de cambio en ALC y beneficio clínico a partir de ipilimumab a 10 mg/kg. Aunque parámetros farmacocinéticos no han sido evaluados a partir del cuarto estudio, CA184-004, la asociación entre ALC y beneficio clínico fue confirmada.

Nuestros resultados muestran además que los pacientes con una pendiente de ALC negativa es poco probable que experimenten un beneficio clínico. Así, una pendiente de ALC negativa podría usarse para enriquecimiento negativo, es decir, para identificar aquellos pacientes que sea poco probable que se beneficien de terapia continua con ipilimumab (y en los cuales el tratamiento pudiera ser terminado) o para identificar aquellos pacientes que pudieran beneficiarse a partir de dosis más altas de ipilimumab o combinaciones de otras terapias con ipilimumab. Este resultado es consistente con otro estudio que demuestra que bajos recuentos linfocíticos en pacientes con cáncer avanzado son un factor negativo para supervivencia (Viganó et al., Arch Intern Med 2000; 160:861-68). Estudios futuros determinarán si . existe una asociación entre cambios en ALC y supervivencia en pacientes tratados con ipilimumab con melanoma avanzado. En resumen, ALC es una medición derivada de estudios de laboratorio de seguridad de rutina y podría por lo tanto ser fácilmente integrada en cualquier programa de tratamiento con ipilimumab, y debe explorarse más como un biomarcador predictivo para agentes inmunoterapéuticos .

Tabla 2 Ejemplo 3 Métodos para medir recuento linfocítico absoluto en un paciente Un número de métodos se conoce en la técnica para medir recuentos linfocíticos absolutos. Se proporciona un ejemplo no limitativo. Brévemente, muestras de sangre de pacientes se obtienen y el número total de glóbulos blancos se cuenta por microlitro. El porcentaje de linfocitos a partir del número total de glóbulos blancos se determina (usando hemocitómetro, citometría de flujo u otros métodos conocidos en la técnica) , y se multiplica por el número total de glóbulos blancos para llegar al recuento linfocítico "absoluto" .

La descripción completa de cada documento citado (incluyendo patentes, solicitudes de patente, artículos de revista, resúmenes, manuales de laboratorio, libros, números de registro en GENBANK8, números de registro en SWISS-PROT® u otras descripciones) en los antecedentes de la invención, descripción detallada, breve descripción de las figuras y ejemplos se incorporan en la presente a manera de referencia en su totalidad. Además, la copia dura del listado de secuencias presentada con la presente, además de su forma legible por computadora correspondiente, se incorporan en la presente a manera de referencia en sus totalidades.

La presente invención no se debe limitar en alcance por las modalidades descritas en la presente, las cuales intentan ser ilustraciones individuales de aspectos únicos de la invención, y cualesquiera sean funcionalmente equivalentes están dentro del alcance de la invención. Varias modificaciones de los modelos y métodos de la invención, además de aquellas descritas en la presente, serán aparentes para aquellos capacitados en la técnica ' a partir de la anterior descripción y enseñanzas, y similarmente se intenta que estén dentro del alcance de la invención. Estas modificaciones u otras modalidades pueden llevarse a la práctica sin alejarse del verdadero alcance y espíritu de la invención .

Se hace constar que con relación a esta fecha, el mejor método conocido por la solicitante para llevar a la práctica la citada invención, es el que resulta claro de la presente descripción de la invención.

Claims (14)

REIVINDICACIONES Habiéndose descrito la invención como antecede, se reclama como propiedad lo contenido en las siguientes reivindicaciones :

1. Un método para predecir la probabilidad de que un paciente con cáncer tenga una respuesta favorable a terapia con un modulador de la vía co-estimuladora, caracterizado porque comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes tomadas durante el tiempo después, y opcionalmente antes, de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente . del recuento linfocítico absoluto, en donde los pacientes que tengan una pendiente negativa tienen una probabilidad más baja de lograr una respuesta favorable a la terapia.

2. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque el cáncer es un tumor sólido.

3. El método de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado porque el cáncer se selecciona del grupo que consiste en: melanoma, cáncer de próstata, cáncer de pulmón, cáncer de pulmón no microcítico y cáncer de pulmón microcítico.

4. El método de conformidad con la reivindicación 1, 2 ó 3, caracterizado porque el modulador de la vía co-estimuladora es un antagonista de CTLA-4.

5. El método de conformidad con la reivindicación 4, caracterizado porque el antagonista de CTLA-4 se selecciona del grupo que consiste en: ipilimumab y tremelimumab .

6. Uso de una terapia con un modulador de la vía co-estimuladora, que comprende las etapas de: (i) medir el recuento linfocítico absoluto de muestras de pacientes- tomadas durante el tiempo después, y opcionalmente antes, de la administración de la terapia; y (ii) calcular una pendiente del recuento linfocítico absoluto, para tratamiento del cáncer en un paciente; en donde los pacientes que tengan una pendiente negativa pueden requerir de un régimen de dosificación más agresivo de una cantidad terapéuticamente aceptable de la terapia, ya sea sola o en combinación con otros agentes para tratar el cáncer.

7. El Uso de conformidad con la reivindicación 6, en donde el cáncer es un tumor sólido.

8. El Uso de conformidad con la reivindicación 7, en donde el cáncer se selecciona del grupo que consiste en: melanoma, cáncer de próstata, cáncer de pulmón, cáncer de pulmón no microcítico y cáncer de pulmón microcítico.

9. El Uso de conformidad con la reivindicación 6, 7 u 8, en donde el modulador de la vía co-estimuladora es un antagonista de CTLA-4.

10. El Uso de conformidad con la reivindicación 9, en donde el antagonista de CTLA-4 se selecciona del grupo que consiste en: ipilimumab y tremelimuma .

11. El Uso de conformidad con la reivindicación 10, en donde una dosis recomendada para el modulador de la vía co-estimuladora se administra a una dosificación de alrededor de 0.1 a 15 mg/kg una vez cada tres semanas, y en donde el régimen de dosificación más agresivo se administra a una dosis mayor que la dosis recomendada o mayor que aproximadamente 10 mg/kg una vez cada tres semanas.

12. El Uso de conformidad con la reivindicación 10, en donde el otro agente se selecciona del grupo que consiste en: un agente estabilizador de tubulina, un segundo modulador de la vía co-estimuladora, un taxano, paclitaxel, una epotilona, IXEMPRA™, PROVENGE®, Bevacizumab, Dacarbazina, Paraplatino; Budesonida; un inhibidor de CD137 y esteroides .

13. Un kit para usarse en determinar un régimen de tratamiento para un individuo con un cáncer, caracterizado porque comprende : (i) un medio para medir recuentos linfocíticos absolutos durante el tiempo, y (ii) un medio para calcular una pendiente para los recuentos linfocíticos absolutos; y opcionalmente instrucciones para el uso e interpretación de los resultados del kit, en donde la estrategia de tratamiento comprende la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva de un modulador de la vía co-estimulador .

14. El kit de conformidad con la reivindicación 13, caracterizado porque el régimen de tratamiento comprende la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva de una terapia seleccionada del grupo que consiste en: ipilimumab y tremelimumab .