KR970705643A - 마이코플라스마 뉴모니애 핵산을 표적으로 하는 핵산 혼성화 분석 프로브(Nucleic Acid Hybridization Assay Probes Targeted to Mycoplasma Pneumoniae Nucleic Acid) - Google Patents
마이코플라스마 뉴모니애 핵산을 표적으로 하는 핵산 혼성화 분석 프로브(Nucleic Acid Hybridization Assay Probes Targeted to Mycoplasma Pneumoniae Nucleic Acid)Info
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- KR970705643A KR970705643A KR1019970701275A KR19970701275A KR970705643A KR 970705643 A KR970705643 A KR 970705643A KR 1019970701275 A KR1019970701275 A KR 1019970701275A KR 19970701275 A KR19970701275 A KR 19970701275A KR 970705643 A KR970705643 A KR 970705643A
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Abstract
본 발명은 마이코플라스마 뉴모니애 검출을 돕는 데 특히 유용한, 마이코플라스마 뉴모니애 핵산 서열을 표적으로 한 올리고뉴클레오티드를 기술한다. 이 올리고뉴클레오티드는 혼성화 분석 프로브, 헬퍼 프로브 및(또는) 증폭 프라이머로 작용하는 것을 비롯한 여러 방법으로 마이코플라스마 뉴모니애 검출에 도움을 줄 수 있다.
Description
본 내용은 요부공개 건이므로 전문내용을 수록하지 않았음
Claims (37)
- SEQ. ID. NO. 2: CACACTCTAG ATTAATAGTT TCCAATGC,SEQ. ID. NO. 3: CATGCGCTTC CTAATGGTTA GC,SEQ. ID. NO. 4: GCTGTTTCCA ACTACCGGAT TGCTC,SEQ. ID. NO. 5: CCTACAACCC CTATCTAATC ATAAGTTTGG,SEQ. ID. NO. 6: GCTTCTTCTA TCGTTTTCAA GTCCAC,SEQ. ID. NO. 7: CCTTTTGCGC GCTGCTTTCC,SEQ. ID. NO. 8: CGTCTACCAC AAGATATAAA TCTTATCC,SEQ. ID. NO. 26: GCAUUGGAAA CUAUUAAUCU AGAGUGUG,SEQ. ID. NO. 29: GCUAACCAUU AGGAAGCGCA UG,SEQ. ID. NO. 32: GAGCAAUCCG GUAGUUGGAA ACAGC,SEQ. ID. NO. 35: CCAAACUUAU CAUUAGAUAG GGGUGUAGG,SEQ. ID. NO. 38: GUGGACUUGA AAACGAUAGA AGAAGC,SEQ. ID. NO. 41: GGAAAGCAGC GCGCAAAAGG,선택된 뉴클레오티드 서열을 갖는 뉴클레오티드 중합체의 적어도 일부분과 엄격한 혼성화 분석 조건 하에서 검출하기에 안정한 핵산 하이브리드를 형성할 수 있는 올리고뉴쿨레오티드로 이루어지며, 상기 엄격한 혼성화 분석 조건 하에서 마이코프라스마 제니탈리움(Mycoplasma genitalium)에 존재한 핵산보다 마이코르라스마 뉴모니애((Mycoplasma pneuminiae) 핵산에 우선적으로 혼성화하는 핵산 혼성화 분석 프로브.
- 제1항에 있어서, 상기 엄격한 혼성화 분석 조건 하에서 마이코플라스마 오랄((Mycoplasma orale), 마이코플라스마 파우시움((Mycoplasma faucium), 마이코플라스마 부칼((Mycoplasma buccale) 및 마이코플라스마 살리바리움((Mycoplasma salivarium)에 존재하는 핵산보다 마이코플라스마 뉴모니애 핵산에 우선적으로 혼성화할 수 있는 핵산 혼성화 분석 프로브.
- 제1항에 있어서, 마이코플라스마 뉴모니애 및 마이코플라스마 뉴모니애의 밀접하게 관련된 분류학적 이웃의 리보솜 RNA 또는 그 리보솜 RNA를 코딩하는 DNA의 서열 비교를 기초로 하여 화학적 또는 생물학적으로 합성된 것인 핵산 혼성화 분석 프로브.
- SEQ. ID. NO. 2: CACACTCTAG ATTAATAGTT TCCAATGC,SEQ. ID. NO. 3: CATGCGCTTC CTAATGGTTA GC,SEQ. ID. NO. 4: GCTGTTTCCA ACTACCGGAT TGCTC,SEQ. ID. NO. 5: CCTACAACCC CTATCTAATG ATAAGTTTGG,SEQ. ID. NO. 6: GCTTCTTCTA TCGTTTTCAA GTCCAC,SEQ. ID. NO. 7: CCTTTTGCGC GCTGCTTTCC,SEQ. ID. NO. 8: CGTCTACCAC AAGATATAAA TCTTATCC,SEQ. ID. NO. 24: GCATTGGAAA CTATTAATCT AGAGTGTG,SEQ. ID. NO. 27: GCTAACCATT AGGAAGCGCA TG,SEQ. ID. NO. 30: GAGCAATCCG GTAGTTGGAA ACAGC,SEQ. ID. NO. 33: CCAAACTTAT CATTAGATAG GGGTTGTAGG,SEQ. ID. NO. 36: GTGGACTTGA CATTAGATAG GGGTTGTAGG,SEQ. ID. NO. 39: GCAAAGCAGC GCGCAAAAGG,SEQ. ID. NO. 42: GGATAAGATT TATATCTTGT GGTAGACG, 로 이루어진 군에서선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 갖는 길이 18 내지 100 뉴클레오티드의 올리고뉴클레오티드로 이루어지며, 엄격한 혼성화 분석 조건 하에서 마이코플라스마 제니탈리움에 존재하는 핵산보다 마이코플라스마 뉴모니애 핵산에 우선적으로 혼성화할 수 있는, 마이코플라스마 뉴모미애를 검출할 수 있는 핵산 혼성화 분석 프로브.
- 제4항에 있어서,SEQ. ID. NO. 2: CACACTCTAG ATTAATAGTT TCCAATGC, 및SEQ. ID. NO. 24: GCATTGGAAA CTATTAATCT AGAGTGTG, 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 갖는 혼성화 분석 프로브.
- 제4항에 있어서,SEQ. ID. NO. 3: CATGCGCTTC CTAATGGTTA GC, 및SEQ. ID. NO. 27: GCTAACCATT AGGAAGCGCA TG, 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 갖는 혼성화 분석 프로브.
- 제 4항에 있어서,SEQ. ID. NO. 4: GCTGTTTCCA ACTACCGGAT TGCTC, 및SEQ. ID. NO. 30: GAGCAATCCG GTAGTTGGAA ACAGC, 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 갖는 혼성화 분석 프로브.
- 제4항에 있어서,SEQ. ID. NO. 5: CCTACAACCC CTATCTAATC ATAAGTTTGG, 및SEQ. ID. NO. 33: CCAAACTTAT CATTAGATAG GGGTTGTAGG,로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 갖는 혼성화 분석 프로브.
- 제4항에 있어서,SEQ. ID. NO. 6: GCTTCTTCTA TCGTTTTCAA GTCCAC, 및SEQ. ID. NO. 36: GTGGACTTGA CATTAGATAG GGGTTGTAGG,로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 갖는 혼성화 분석 프로브.
- 제4항에 있어서,SEQ. ID. NO. 7: CCTTTTGCGC GCTGCTTTCC, 및SEQ. ID. NO. 39: GCAAAGCAGC GCGCAAAAGG, 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 갖는 혼성화 분석 프로브.
- 제4항에 있어서,SEQ. ID. NO. 8: CGTCTACCAC AAGATATAAA TCTTATCC, 및SEQ. ID. NO. 42: GGATAAGATT TATATCTTGT GGTAGACG, 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 갖는 혼성화 분석 프로브.
- SEQ. ID. NO. 53: GGAUUGAAAA GUCUGGUGUU AAAGGCAGCUSEQ. ID. NO. 56: AGUUUUGGAA UUUCAUGUGG AAGCGGUAAA UGCGUAG,SEQ. ID. NO. 59: CCGCCCGUCA AACUAUGAAA GCUGGUAAUA UUUAAAAACG UGUU,SEQ. ID. NO. 63: AAGGAUAGCA CCGGUGAUUG GAGUGAAGUC G,SEQ. ID. NO. 66: GGUGGUAAGA ACCCUCAGAUC CGGAGAUUUC CGAAUG,SEQ. ID. NO. 69: GAUGAAUAAA UAGUCAUAUU AAAGCGAUAC GUG,SEQ. ID. NO. 72: CGUGUGUAGU GGCGAGCGAA AGCGGAACA,SEQ. ID. NO. 75: GUGAUAGCCC CGUAUUUGAA AUUGUUUUCA UACCUAGCGA G,SEQ. ID. NO. 78: GCGCCGAAGA UGUAACGGGG CUAAGUAUAU UACCGAAUUU AU, 및SEQ. ID. NO. 81: AGCGUUGUAU UGGAGUUGAA GUCAAAGCGU GAGC 로 이루어진 군에서 선택된 헬퍼 표적 뉴클레오티드 서열에 존재하는 10개 이상의 연속되는 핵산에 완전히 상보적인 뉴클레오티드 서열을 갖는 길이 12 내지 100 뉴클레오티드의 올리고뉴클레오티드로 이루어진 헬퍼 올리고뉴클레오티드.
- 제12항에 있어서,SEQ. ID. NO. 11: GACGCTGCCT TTAACACCAG ACTTTTCAAT CC,SEQ. ID. NO. 12: CTACGCATTT CACCGCTCCA CATGAAATTC CAAACT,SEQ. ID. NO. 13: AACACGTTTT TAAATATTAC CAGCTTTCAT AGTTTGACGG GCGG,SEQ. ID. NO. 14: CGACTTCACT CCAATCACCG GTGCTATCCTT T,SEQ. ID. NO. 15: CATTCGGAAA TCTCCGGATC TGAGGTTCTT ACCACC,SEQ. ID. NO. 16: CACGTATCGC TTTAATATGA CTATTTATTC ATC,SEQ. ID. NO. 17: TGTTCCGCTT TCGCTCGCCA CTACACACG,SEQ. ID. NO. 18: CTCGCTAGGT ATGAAAACAA TTTCAAATAC GGGGCTATCA C,SEQ. ID. NO. 19: ATAAATTCGG TAATATACTT TAATATACTT AGCCCCGTTACATCTTCGGC GC,SEQ. ID. NO. 20: GCTCACGCTT TGACTTCAAC TCCAATACAA CGCT; 및 이들의 RNA 균등물로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열을 갖는 헬퍼 올리고뉴클레오티드.
- a)SEQ. ID. NO. 2: CACACTCTAG ATTAATAGTT TCCAATGC,SEQ. ID. NO. 3: CATGCGCTTC CTAATGGTTA GC,SEQ. ID. NO. 4: GCTGTTTCCA ACTACCGGAT TGCTC,SEQ. ID. NO. 5: CCTACAACCC CTATCTAATG ATAAGTTTGG,SEQ. ID. NO. 6: GCTTCTTCTA TCGTTTTCAA GTCCAC,SEQ. ID. NO. 7: CCTTTTGCGC GCTGCTTTCC,SEQ. ID. NO. 8: CGTCTACCAC AAGATATAAA TCTTATCC,SEQ. ID. NO. 24: GCATTGGAAA CTATTAATCT AGAGTGTG,SEQ. ID. NO. 27: GCTAACCATT AGGAAGCGCA TG,SEQ. ID. NO. 30: GAGCAATCCG GTAGTTGGAA ACAGC,SEQ. ID. NO. 33: CCAAACTTAT CATTAGATAG GGGTTGTAGG,SEQ. ID. NO. 36: GTGGACTTGA CATTAGATAG GGGTTGTAGG,SEQ. ID. NO. 39: GCAAAGCAGC GCGCAAAAGG,SEQ. ID. NO. 42: GGATAAGATT TATATCTTGT GGTAGACG, 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 갖는 길이 18 내지 100 뉴클레오티드의 올리고뉴클레오티드로 이루어진, 엄격한 혼성화 분석 조건 하에서 마이코플라스마 뉴모니애를 검출할 수 있는 핵산 혼성화 분석 프로브; 및 b) 엄격한 혼성화 분석 조건 하에서 마이코플라스마 뉴모니애 핵산에 혼성화하고 상기 프로브와 마이코플라스마 뉴모니애 핵산 서열 영역간의 혼성화를 증진시키는 한가지 이상의 헬퍼 올리고뉴클레오티드로 이루어진 마이코플라스마 뉴모니애 검출용 프로브 혼합물.
- 제14항에 있어서, 상기 헬퍼 프로브가 길이가 12뉴클레오티드 이상이고 상기 엄격한 혼성화 분석 조건하에서SEQ. ID. NO. 53: GGAUUGAAAA GUCUGGUGUU AAAGGCAGCU GC,SEQ. ID. NO. 56: AGUUUUGGAA UUUCAUGUGG AGCGGUGAAA UGCGUAG,SEQ. ID. NO. 59: CCGCCCGUCA CCGGUGAUUG GAGUGAAGUAUUUAAAAACG UGUU,SEQ. ID. NO. 63: GGUGGUAAGA ACCUCACAUC GAGUGAAGUC G,SEQ. ID. NO. 66: GGUGGUAAGA ACCUCAGAUC CGGAGAUUUC CGAAUG,SEQ. ID. NO. 69: GAUGAAUAAA UAGUCAUAUU AAAGCGAUAC GUG,SEQ. ID. NO. 72: CGUGUGUAGU GGCGAGCGAA AGCGGAACA,SEQ. ID. NO. 75: GUGAUAGCCC CGUAUUUGAA AUUGUUUUCA AUCCUAGCGA G,SEQ. ID. NO. 78: GCGCCGAAGA UGUAACGGGG CUAAGUAUAUUACCGAAUUU AU, 및SEQ. ID. NO. 81: AGCGUUGUAU UGGAGUUGAA GUCAAAGCGU GAGC 로 이루어진 군에서 선택된 표적 뉴클레오티드 서열에 존재하는 10개 이상의 연속되는 뉴클레오티드를 갖는 헬러 표적 영역으로 검출하기에 안정한 하이브리드를 형성하는 것인 프로브 혼합물.
- 제15항에 있어서, 상기 헬퍼 올리고뉴클레오티드가SEQ. ID. NO. 11: GCAGCTGCCT TTAACACCAG ACTTTTCAAT CC,SEQ. ID. NO. 12: CTACGCATTT CACCGCTCCA CATGAAATTC CAAAACT,SEQ. ID. NO. 13: AACACGTTTT TAAATATTAC CAGCTTTCAT AGTTGACGG GCGG,SEQ. ID. NO. 14: CGACTTCACT CCAATCACCG GTGCTATCCTT T,SEQ. ID. NO. 15: CATTCGGAAA TCTCCGGATC TGAGGTTCTT ACCACC,SEQ. ID. NO. 16: CACGTATCGC TTTAATATGA CTATTTATTC ATC,SEQ. ID. NO. 17: TGTTCCGCTT TCGCTCGCCA CTACACACG,SEQ. ID. NO. 18: CTCGCTAGGT ATGAAAACAA TTTCAAATCA GGGCTATCA C,SEQ. ID. NO. 19: ATAAATTCGG TAATATACTT AGCCCCGTTA CATCTTCGGC GC,SEQ. ID. NO. 20: GCTCACGCTT TGACTTCAAC TCCAATACAA CGCT; 및 이들의 RNA 균등물로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열을 갖는 것인 프로브 혼합물.
- 제15항에 있어서, 상기 혼성화 분석 프로브는SEQ. ID. NO. 2: CACACTCTAG ATTAATAGTT TCCAATGC, 및SEQ. ID. NO. 24: GCATTGGAAA CTATTAATCT AGAGTGTG 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 가지며, 상기 헬퍼 표적 뉴클레오티드 서열은SEQ. ID. NO. 53: GGAUUGAAAA GUCUGGUGUU AAAGGCAGCU GC,SEQ. ID. NO. 56: AGUUUUGGAA UUUCAUGUGG AGCGGUGAAA UGCGUAG, 로 이루어진 군에서 선택되는 프로브 혼합물.
- 제15항에 있어서, 상기 혼성화 분석 프로브는SEQ. ID. NO. 3: CATGCGCTTC CTAATGGTTA GC, 및SEQ. ID. NO. 27: GCTAACCATT AGGAAGCGCA TG 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 가지며, 상기 헬퍼 표적 뉴클레오티드 서열은SEQ. ID. NO. 59: CCGCCCGUCA AACUAUGAAA GCUGGUAAUA UUUAAAAACG UGUU,SEQ. ID. NO. 63: AAGGAUAGCA CCGGUGAUUG GAGUGAAGUC G, 로 이루어진 군에서 선택된 프로브 혼합물.
- 제15항에 있어서, 상기 혼성화 분석 프로브는SEQ. ID. NO. 4: GCTGTTTCCA ACTACCGGAT TGCTC, 및SEQ. ID. NO. 30: GAGCAATCCG GTAGTTGGAA ACAGC 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 가지며, 상기 헬퍼 표적 뉴클레오티드 서열은SEQ. ID. NO. 66: GGUGGUAAGA ACCUCAGAUC CGGAGAUUUC CGAAUG, 및SEQ. ID. NO. 69: GACGAAUAAA UAGUCAUAUU AAAGCGAUAC GUG 로 이루어진 군에서 선택되는 프로브 혼합물.
- 제15항에 있어서, 상기 혼성화 분석 프로브는SEQ. ID. NO. 5: CCTACAACCC CTATCTAATG ATAAGTTTGG, 및SEQ. ID. NO. 33: CCAAACTTAT CATTAGATAG GGGTTGTAGG 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유산한 핵산 서열을 가지며, 상기 헬퍼 표적 뉴클레오티드 서열은SEQ. ID. NO. 38: GUGGACUUGA AAACGAUAGA AGAAGC,및SEQ. ID. NO. 72: CGUGUGUAGU GGCGAGCGAA AGCGGAACA 로 이루어진 군에서선택되는 프로브 혼합물.
- 제15항에 있어서, 상기 혼성화 분석 프로브는SEQ. ID. NO. 6: GCTTCTTCTA TCGTTTTCAA GTCCAC, 및SEQ. ID. NO. 36: GTGGACTTGA AAACGATAGA AGAAGC 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 가지며, 상기 헬퍼 표적 뉴클레오티드 서열은SEQ. ID. NO. 35: CCAAACUUAU CAUUAGAUAG GGGUUGUAGG, 및SEQ. ID. NO. 41: GGAAAGCAGC GCGCAAAAGG 로 이루어진 군에서 선택되는 프로브 혼합물.
- 제15항에 있어서, 상기 혼성화 분석 프로브는SEQ. ID. NO. 7: CCCTTTGCGC GCTGCTTTCC, 및SEQ. ID. NO. 39: GGAAAGCAGC GCGCAAAAGG 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 가지며, 상기 헬퍼 표적 클레오티드 서열은SEQ. ID. NO. 38: GUGGACUUGA AAACGAUAGA AGAAGC, 및SEQ. ID. NO. 75: GUGAUAGCCC CGUAUUUGAA AUUGUUUUCA UACCUAGCGA G 로 이루어진 군에서 선택되는 프로브 혼합물.
- 제15항에 있어서, 상기 혼성화 분석 프로브는SEQ. ID. NO. 8: CGTCTACCAC AAGATATAAA TCTTATCC, 및SEQ. ID. NO. 42: GGATAAGATT TATATCTTGT GGTAGACT 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 가지며, 상기 헬퍼 표적 클레오티드 서열은SEQ. ID. NO. 78: GCGCCGAAGA UGUAACGGGG CUAAGUAUAU UACCGAAUUU AU, 및SEQ. ID. NO. 81: AGCGUUGUAU UGGAGUUGAA GUCAAAGCGU GAGC 로 이루어진군에서 선택되는 프로브 혼합물.
- SEQ. ID. NO. 25: CACACUCUAG AUUAAUAGUU UCCAAUGC,SEQ. ID. NO. 26: GCAUUGGAAA CUAUUAAUCU AGAGUGUG,SEQ. ID. NO. 28: CAUGCGCUUC CUAAUGGUUA GC,SEQ. ID. NO. 29: GCUAACCAUU AGGAAGCGCA UG,SEQ. ID. NO. 31: GCUGUUUCCA ACUACCGGAU UGCUC,SEQ. ID. NO. 32: GAGCAAUCCG GUAGUUGGAA ACAGC,SEQ. ID. NO. 34: CCUACAACCC CUAUCUAAUG AUAAGUUUGG,SEQ. ID. NO. 35: CCAAACUUAU CAUUAGAUAG GGGUUGUAGG,SEQ. ID. NO. 37: GCUUCUUCUA UCGUUUUCAA GUCCAC,SEQ. ID. NO. 38: GUGGACUUGA AAACGAUAGA AGAAGC,SEQ. ID. NO. 40: CCUUUUGCGC GCUGCUUUCC,SEQ. ID. NO. 41: GGAAAGCAGC GCGCAAAAGG,SEQ. ID. NO. 43: CGUCUACCAC AAGAUAUAAA UCUUAUCC,SEQ. ID. NO. 44: GGAUAAGAUU UAUAUCUUGU GGUAGACG, 및 우라실 대신에 티민을 갖는 상기 서열의 DNA 균등물로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열로 이루어진 뉴클레오티드 중합체의 적어도 일부분과 올리고튜클레오티드 혼성화 분석 프로브 사이에 엄격한 혼성화 분석 조건 하에서 형성된 핵산 하이브리드를 함유하며, 상기 프로브는 상기 엄격한 혼선화 분석 조건 하에서 마이크플라스마 제니탈리움, 마이코플라스마 오랄, 마이코플라스마 파우시움, 마이코플라스마 부칼 및 마이코플라스마 살리바리움에 존재하는 핵산보다 마이코플라스마 뉴모니애 핵산에 우선적으로 혼성화하는 것인 조성물.
- 제24항에 있어서, 상기 프로브가 마이코플라스마 뉴모니애 및 마이코플라스마 뉴모니애의 밀접하게 관련된 분류학적 이웃의 리보솜 RNA 또는 그 리보솜 RNA를 코팅하는 DNA의 서열 비교를 기초로 하여 화학적 또는 생물학적으로 합성된 것인 조성물.
- SEQ. ID. NO. 2: CACACTCTAG ATTAATAGTT TCCAATGC,SEQ. ID. NO. 3: CATGCGCTTC CTAATGGTTA GC,SEQ. ID. NO. 4: GCTGTTTCCA ACTACCGGAT TGCTC,SEQ. ID. NO. 5: CCTACAACCC CTATCTAATG ATAAGTTTGG,SEQ. ID. NO. 6: GCTTCTTCTA TCGTTTTCAA GTCCAC,SEQ. ID. NO. 7: CCTTTTGCGC GCTGCTTTCC,SEQ. ID. NO. 8: CGTCTACCAC AAGATATAAA TCTTATCC,SEQ. ID. NO. 24: GCATTGGAAA CTATTAATCT AGAGTGTG,SEQ. ID. NO. 27: GCTAACCATT AGGAAGCGCA TG,SEQ. ID. NO. 30: GAGCAATCCG GTAGTTGGAA ACAGC,SEQ. ID. NO. 33: CCAAACTTAT CATTAGATAG GGGTTGTAGG,SEQ. ID. NO. 36: GTGGACTTGA CATTAGATAG GGGTTGTAGG,SEQ. ID. NO. 39: GCAAAGCAGC GCGCAAAAGG,SEQ. ID. NO. 42: GGATAAGATT TATATCTTGT GGTAGACG, 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 가지며 마이코플라스마 제니탈리움에 존재하는 핵산보다 마이코플라스마 뉴모니애 핵산에 우선적으로 혼성화하는 길이 18 내지 100 뉴클레오티드의 올리고뉴클레오티드 혼성화 분석 프로브와 마이코플라스마 뉴모니애 핵산 사이에 형성된 핵산 하이브리드를 함유하는 조성물.
- 제26항에 있어서, 상기 프로브가 마이코플라스마 뉴모니애 및 마이코플라스마 뉴모니애의 밀접하게 관련된 분류학적 이웃의 리보솜 RNA 또는 그 리보솜 RNA를 코팅하는 DNA의 서열 비교를 기초로 하여 화학적 또는 생물학적으로 합성된 것인 조성물.
- SEQ. ID. NO. 51: GGATTGAAAA GTCTGGTGTT AAAGGCAGCT GC,SEQ. ID. NO. 82: CGCCACTGGT GTTCCTTCAT ATATCTACGC,SEQ. ID. NO. 83: ATCAAAGTTG AAAGGACCTG CAAGGGTTGG T, 및SEQ. ID. NO. 84: CTGCTGGCAC ATAGTTACTC GTC; 및 이들의 RNA 균등물로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열을 갖는 길이 18 내지 100 뉴클레오티드의 증폭 올리고뉴클리오티드.
- a)SEQ. ID. NO. 2: CACACTCTAG ATTAATAGTT TCCAATGC,SEQ. ID. NO. 3: CATGCGCTTC CTAATGGTTA GC,SEQ. ID. NO. 4: GCTGTTTCCA ACTACCGGAT TGCTC,SEQ. ID. NO. 5: CCTACAACCC CTATCTAATG ATAAGTTTGG,SEQ. ID. NO. 6: GCTTCTTCTA TCGTTTTCAA GTCCAC,SEQ. ID. NO. 7: CCTTTTGCGC GCTGCTTTCC,SEQ. ID. NO. 8: CGTCTACCAC AAGATATAAA TCTTATCC,SEQ. ID. NO. 26: GCAUUGGAAA CUAUUAAUCU AGAGUGUG,SEQ. ID. NO. 29: GCUAACCAUU AGGAAGCGCA UG,SEQ. ID. NO. 32: GAGCAAUCCG GUAGUUGGAA ACAGC,SEQ. ID. NO. 35: CCAAACUUAU CAUUAGAUAG GGGUUGUAGG,SEQ. ID. NO. 38: GUGGACUUGA AAACGAUAGA AGAAGC,SEQ. ID. NO. 41: GGAAAGCAGC GCGCAAAAGG,SEQ. ID. NO. 44: GGAUAAGAUU UAUAUCUUGU GGUAGACG, 로 이루어진 군에서 선택된 서열을 갖는 뉴클레오티드 중합체의 적어도 일부분과 엄격한 혼성화 조건하에서 검출하기에 안정한 하이브리드를 형성하며, 상기 조건하에서 마이코플라스마 제니탈리움, 마이코플라스마 오랄, 마이코플라스마 파우시움, 마이코플라스마 부칼 또는 마이코플라스마 사릴바리움에 존재하는 핵산보다 마이코플라스마 뉴모니애 핵산에 우선적으로 혼성화하는 핵산 혼성화 분석 프로브와 시험시료를 엄격한 혼성하 분석 조건 하에 접촉시키는 단계; 및 b) 상기 시험 시료 중의 상기 혼성화된 프로브의 존재 또는 양을 측정하는 단계로 이루어진, 마이코플라스마 뉴모니애의 존재를 검출하고 상기 마이코플라스마 뉴모니애를 마이코플라스마 제니탈리움, 마이코 플라스마 오랄, 마이코플라스마 파우시움, 마이코플라스마 부칼 또는 마이코플라스마 살리바리움과 구별하는 방법.
- a)SEQ. ID. NO. 2: CACACTCTAG ATTAATAGTT TCCAATGC,SEQ. ID. NO. 3: CATGCGCTTC CTAATGGTTA GC,SEQ. ID. NO. 4: GCTGTTTCCA ACTACCGGAT TGCTC,SEQ. ID. NO. 5: CCTACAACCC CTATCTAATG ATAAGTTTGG,SEQ. ID. NO. 6: GCTTCTTCTA TCGTTTTCAA GTCCAC,SEQ. ID. NO. 7: CCTTTTGCGC GCTGCTTTCC,SEQ. ID. NO. 8: CGTCTACCAC AAGATATAAA TCTTATCC,SEQ. ID. NO. 24: GCATTGGAAA CTATTAATCT AGAGTGTG,SEQ. ID. NO. 27: GCTAACCATT AGGAAGCGCA TG,SEQ. ID. NO. 30: GAGCAATCCG GTATTGGAA ACAGC,SEQ. ID. NO. 33: CCAAACTTAT CATTAGATAG GGGTTGTAGG,SEQ. ID. NO. 36: GTGGACTTGA AAACGATAGA AGAAGC,SEQ. ID. NO. 39: GCAAAGCAGC GCGCAAAAGG,SEQ. ID. NO. 42: GGATAAGATT TATATCTTGT GGTAGACG, 로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 유사한 핵산 서열을 가지며 상기 혼성화 분석 조건 하에서 마이코플라스마 제니탈리움에 존재하는 핵산서열 영역보다 마이코플라스마 뉴모니애 표적 핵산서열 영역에 우선적으로 혼성화할 수 있는 핵산 혼성화 분석 프로브와 시험 시료를 엄격한 혼성화 분석 조건 하에 접촉시키는 단계, 및 b) 상기 시럼 시료 중의 혼성화된 프로브의 존재 또는 양을 측정하는 단계로 이루어진, 마이코플라스마 뉴모니애의 존재를 검출하고, 상기 마이코플라스마 뉴모니애를 다른 마이코플라스마와 구별하는 방법.
- 제30항에 있어서, 한가지 이상의 헬퍼 올리고튜클레오티드의 사용을 더 포함하는 방법.
- a)SEQ. ID. NO. 51: GGATTGAAAA GTCTGGTGTT AAAGGCAGCT GC,SEQ. ID. NO. 82: CGCCACTGGT GTTCCTTCAT ATATCTACGC,SEQ. ID. NO. 83: ATCAAAGTTG AAAGGACCTG CAAGGGTTGG T, 및SEQ. ID. NO. 84: CTGCTGGCAC ATAGTTACTC GTC; 및 이들의 RNA 균등물로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열을 갖는 한가지 이상의 증폭 올리고뉴클리오티드와 마이코플라스마 뉴모니애 핵산 주형으로 이루어진 하이브리드를 형성시키는 단계, b) 상기 주형을 증폭시키는 단계, 및 c) 엄격한 혼성화 조건 하에서 마이코플라스마 제니탈리움 핵산보다 마이코플라스마 뉴모니애 핵산에 우선적으로 혼성화할 수 있는 올리고뉴클레오티드 혼성화 분석 프로브를 사용하여 증폭된 핵산을 검출하는 단계로 이루어지는 마이코플라스마 뉴모니애 핵산의 검출 방법.
- 제32항에 있어서, 상기 증폭 올리고뉴클레오티드가 RNA 폴리머라아제에 의해 인식되거나 RNA 폴리머라아제에 의한 개시 또는 신장을 증진시키는 핵산 서열을 더 함유하는 것인 방법.
- a)SEQ. ID. NO. 51: GGATTGAAAA GTCTGGTGTT AAAGGCAGCT GC,SEQ. ID. NO. 82: CGCCACTGGT GTTCCTTCAT ATATCTACGC,SEQ. ID. NO. 83: ATCAAAGTTG AAAGGACCTG CAAGGGTTGG T, 및SEQ. ID. NO. 84: CTGCTGGCAC ATAGTTACTC GTC; 및 이들의 RNA 균등물로이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열로 주로 이루어지는 한가지 이상의 증폭 올리고뉴클리오티드와 마이코플라스마 뉴모니애 핵산 주형으로 이루어진 하이브리드를 형성시키는 단계, b) 상기 주형을 증폭시키는 단계, 및 c) 엄격한 혼성화 조건 하에서 마이코플라스마 제니탈리움 핵산보다 마이코플라스마 뉴모니애 핵산에 우선적으로 혼성화할 수 있는 올리고뉴클레오티드 혼성화 분석 프로브를 사용하여 증폭된 핵산을 검출하는 단계로 이루어지는 마이코플라스마 뉴모니애 핵산의 검출 방법.
- 제34항에 있어서, 상기 증폭 올리고뉴클레오티드가 RNA 폴리머라아제에 의해 인식되거나 RNA 폴리머라아제에 의한 개시 또는 신장을 증진시키는 핵산 서열을 더 함유하는 것인 방법.
- a)SEQ. ID. NO. 83: ATCAAAGTTG AAAGGACCTG CAAGGGTTGG T,SEQ. ID. NO. 84: CTGCTGGCAC ATAGTTACTC GTC,SEQ. ID. NO. 51: GGATTGAAAA GTCTGGTGTT AAAGGCAGCT GC,SEQ. ID. NO. 82: CGCCACTGGT GTTCCTTCAT ATATCTACGC; 및 이들의 RNA 균등물로 이루어진 군에서 선택된 뉴클레오티드 서열을 갖는 한가지 이상의 증폭 올리고뉴클리오티드와 마이코플라스마 뉴모니애 또는 마이코플라스마 제니탈리움 핵산 주형으로 이루어진 하이브리드를 형성시키는 단계, 및 b) 상기 주형을 증폭시키는 단계로 이루어지는 시험 시료 중의 마이코플라스마 뉴모니애 또는 마이코플라스마 제니탈리움 핵산의 증폭 방법.
- 제36항에 있어서, 상기 증폭 올리고뉴클레오티드가 RNA 폴리마라아제에 의해 인식되거나 RNA 폴리머라아제에 의한 개시 또는 신장을 증진시키는 핵산 서열을 더 함유하는 것인 방법.※ 참고사항 : 최초출원 내용에 의하여 공개하는 것임.
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