KR950700408A - 인접한 촉진제 올리고누클레오티드에 의한 리보자임 촉매활성의 증강(enhancement of ribozyme catalytic activity by a neighboring facilitator oligonucleotide) - Google Patents

인접한 촉진제 올리고누클레오티드에 의한 리보자임 촉매활성의 증강(enhancement of ribozyme catalytic activity by a neighboring facilitator oligonucleotide)

Info

Publication number
KR950700408A
KR950700408A KR1019940702678A KR19940702678A KR950700408A KR 950700408 A KR950700408 A KR 950700408A KR 1019940702678 A KR1019940702678 A KR 1019940702678A KR 19940702678 A KR19940702678 A KR 19940702678A KR 950700408 A KR950700408 A KR 950700408A
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
target rna
promoter
sequence
ribozymes
nucleotides
Prior art date
Application number
KR1019940702678A
Other languages
English (en)
Inventor
굳칠드 죤
Original Assignee
토루페터슨
워세스터 파운데이션 포 익스페리멘탈 바이올로지
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 토루페터슨, 워세스터 파운데이션 포 익스페리멘탈 바이올로지 filed Critical 토루페터슨
Priority claimed from PCT/US1993/000783 external-priority patent/WO1993015194A1/en
Publication of KR950700408A publication Critical patent/KR950700408A/ko

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1131Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against viruses
    • C12N15/1132Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against viruses against retroviridae, e.g. HIV
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/11Antisense
    • C12N2310/111Antisense spanning the whole gene, or a large part of it
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/12Type of nucleic acid catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes
    • C12N2310/121Hammerhead
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/16011Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16022New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes

Abstract

본 발명에서는 RNA 분자를 리보자임 및 촉진제 올리고누클레오티드와 접촉 시키는 것으로 이루어지는, 특이성을 감소시키지 않으면서 리보자임 촉매적 활성을 증가시키는 방법들이 발표된다. 본 발명은 또한 리보자임과 유효량의 촉진제 올리고 누클레오티드를 포함하는 조성물을 제공한다. 또한 리보자임이 촉매적으로 표적 RNA를 절단하는데 필요한 Mg2+및 Mn2+의 농도를 감소시키기 위한 방법들이 발표된다.

Description

인접한 촉진제 올리고누클레오티드에 의한 리보자임 촉매활성의 증강 (ENHANCEMENT OF RIBOZYME CATALYTIC ACTIVITY BY A NEIGHBORING FACILITATOR OLIGONUCLEOTIDE)
본 내용은 요부공개 건이므로 전문내용을 수록하지 않았음
제 1 도는 기질 RNA(S1), 리보자임(R) 및 촉진제 올리고데옥시누클레오티드 F1, F2, F3촉진제 리보누클레오티드 F4및 촉진제 올리고데옥시누클레오티드 F5의 누클레오티드 서열을 도시한다. 기질의 절단부위는 화살표로 표시되어 있다. 제2A도는 촉진제 올리고누클레오티드 없이 리보자임 R에 의해 방사성 표시된 기질 S1이 절단된 결과, 각각 20 및 13누클레오티드를 함유하는 P1및 P2가 생성되는 것을 보여주는 자동 방사선 사진이다.제 2B도는 촉진제 올리고누클레오티드 F1의 존재하에 리보자임 R에 의해 방사성 표지된 기질이 S1이 절단된 결과, 각각 20 및 13누클레오티드를 함유하는 P1및 P2가 생성되는 것을 보여주는 자동 방사선 사진이다.제 3 도는 촉진제 올리고누클레오티드 F1, F2, F3을 사용하는 절단속도에 미치는 사슬길이의 효과 및 촉진제 올리고누클레오티드가 없을 때의 대조반응을 보여주는 그래프도이다.

Claims (19)

  1. 리보자임 및 촉진제 올리고누클레오티와 표격 RNA 분자를 반응시키는 것으로 이루어지며, 촉진제 올리고누클레오티드가 리보자임이 혼성화하는 RNA로부터 약 5개의 누클레오티드 이하의 거리만큼 떨어져 있는 표적 RNA 내의 서열과 혼성화 하는 것을 특징으로 하는 리보자임의 촉매활성을 증가시키는 방법.
  2. 제 1 항에 있어서, 촉진제 올리고누클레오티드가 약 5 내지 약 50누클레오티드로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
  3. 제 2 항에 있어서, 촉진제 올리고누클레오티드가 약 5 내지 약 15누클레오티드로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
  4. 리보자임 및 유효량의 촉진제를 올리고누클레오티드를 포함하는 조성물.
  5. 제 4 항에 있어서, 촉진제 올리고누클레오티드가 리보자임이 혼성화하는 표적 RNA로 부터 약 5개 올리고누클레오티드 이하의 거리만큼 떨어져 있는 표적 RNA내의 서열과 혼성화하는 것을 특징으로 하는 조성물.
  6. 제 5항에 있어서, 촉진제 올리누클레오티드가 약 5 내지 약 50누클레오티드로 이루어지는 것을 특징으로 하는 조성물.
  7. 제 6항에 있어서, 촉진제 올리누클레오티드가 약 5 내지 약 15누클레오티드로 이루어지는 것을 특징으로 하는 조성물.
  8. 리보자임이 혼성화하는 표적 RNA내의 서열에 인접한 표적 RNA의 서열에 결합하는 구조 AGGGTC를 가지는 촉진제 올리고누클레오티드.
  9. 리보자임이 혼성화하는 표적 RNA내의 서열에 인접한 표적 RNA의 서열에 결합하는 구조 AGGGTCTGTT를 가지는 촉진제 올리고누클레오티드.
  10. 리보자임이 혼성화하는 표적 RNA내의 서열에 인접한 표적 RNA의 서열에 결합하는 구조 AGGTCTGTTTTC를 가지는 촉진제 올리고누클레오티드.
  11. 제 1 항에 있어서, 촉진제 올리누클레티드가 변형된 누클레오티드간 포스페이트를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
  12. 제11항에 있어서, 변형된 누클레오티드간 포스페이트가 포스포로티오에이트, 알킬포스포로티오에이트, 알킬포스포네이트, 포스포라미데이트, 및 포스포 트리에스테르로 이루어지는 군으로 부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법.
  13. 제 4 항에 있어서, 촉진제 올리고누클레오티드가 변형된 누클레오티드간 포스페이트를 포함하는 것을 특징으로 하는 조성물.
  14. 제13항에 있어서, 변형된 누클레오티드간 포스페이트가 포스포로티오에이트, 메틸포스포네이트, 포스포라미데이트, 포스포트리에스테르를 포함하는 것을 특징으로 하는 조성물.
  15. 표적 RNA를 절단하기에 효과적인 양의 리보자임 및 촉진제 올리고누클레오티드를 병원성 유기체에 감염된 포유동물에 투여하는 것으로 이루어지며, 촉진제 올리고누클레오티오가 리보자임이 혼성화하는 표적RNA로 부터 약 5개의 누클레오티드 이하의 거리만큼 떨어져있는 표적 RNA내의 서열과 혼성화하는 것을 특징으로 하는 상기 포유동물의 치료방법.
  16. 제15항에 있어서, 촉진제 올리고누클레오티드가 표적 RNA와 화학양론적 양으로 투여되는 것을 특징으로 하는 방법.
  17. 리보자임이 혼성화하는 표적 RNA서열로 부터 약 5누클레오티드 이하의 거리만큼 떨어져 있는 표적 RNA내의 서열과 혼성화하는 촉진제 올리고누클레오티드 및 리보자임으로 표적 RNA를 처리하는 것으로 이루어지는, 표적 RNA의 촉매적 절단을 위해 리보자임이 필요로 하는 Mg2+및 Mn2+의 농도를 감소시키기 위한 방법
  18. 리보자임이 혼성화하는 표적 RNA 서열로 부터 약 5누클레오티드 이하의 거리만큼 떨어져 있는 표적 RNA내의 서열과 혼성화하는 촉진제 올리고누클레오티드의 존재하에 리보자임으로 표적 RNA를 처리함에 의해 Mg2+와 Mn2+로 이루어지는 군으로부터 선택된 이온의 농도를 감소시키는 것으로 이루어지는, 리보자임으로 표적 RNA를 절단하는 방법.
  19. 리보자임이 혼성화하는 표적 RNA 서열로 부터 약 5누클레오티드 이하의 거리만큼 떨어져 있는 표적 RNA내의 서열과 혼성화하는 촉진제 올리고누클레오티드 및 리보자임과 표적 RNA를 반응시키는 것으로 이루어지는, 표적 레트로바이러스 RNA의 복제를 억제하는 방법.
    ※ 참고사항 : 최초출원 내용에 의하여 공개하는 것임.
KR1019940702678A 1992-02-04 1993-02-04 인접한 촉진제 올리고누클레오티드에 의한 리보자임 촉매활성의 증강(enhancement of ribozyme catalytic activity by a neighboring facilitator oligonucleotide) KR950700408A (ko)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US83071392A 1992-02-04 1992-02-04
US07/830,713 1992-02-04
PCT/US1993/000783 WO1993015194A1 (en) 1992-02-04 1993-02-04 Enhancement of ribozyme catalytic activity by a neighboring facilitator oligonucleotide

Publications (1)

Publication Number Publication Date
KR950700408A true KR950700408A (ko) 1995-01-16

Family

ID=26836668

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1019940702678A KR950700408A (ko) 1992-02-04 1993-02-04 인접한 촉진제 올리고누클레오티드에 의한 리보자임 촉매활성의 증강(enhancement of ribozyme catalytic activity by a neighboring facilitator oligonucleotide)

Country Status (2)

Country Link
US (1) US5612469A (ko)
KR (1) KR950700408A (ko)

Families Citing this family (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0674707A4 (en) * 1992-12-04 1998-01-14 Apollon Inc COMPOUNDS AND METHODS FOR THE TREATMENT OF LEUCOMA.
US20050053976A1 (en) * 1996-06-06 2005-03-10 Baker Brenda F. Chimeric oligomeric compounds and their use in gene modulation
US20040171031A1 (en) * 1996-06-06 2004-09-02 Baker Brenda F. Sugar surrogate-containing oligomeric compounds and compositions for use in gene modulation
US9096636B2 (en) 1996-06-06 2015-08-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Chimeric oligomeric compounds and their use in gene modulation
US20040147022A1 (en) * 1996-06-06 2004-07-29 Baker Brenda F. 2'-methoxy substituted oligomeric compounds and compositions for use in gene modulations
US5898031A (en) * 1996-06-06 1999-04-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligoribonucleotides for cleaving RNA
US20040203024A1 (en) * 1996-06-06 2004-10-14 Baker Brenda F. Modified oligonucleotides for use in RNA interference
US7812149B2 (en) * 1996-06-06 2010-10-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2′-Fluoro substituted oligomeric compounds and compositions for use in gene modulations
AU2003290596B2 (en) * 2002-11-05 2011-05-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Sugar surrogate-containing oligomeric compounds and compositions for use in gene modulation
EP1636342A4 (en) * 2003-06-20 2008-10-08 Isis Pharmaceuticals Inc OLIGOMERIC COMPOUNDS FOR GENE MODULATION
US8569474B2 (en) * 2004-03-09 2013-10-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Double stranded constructs comprising one or more short strands hybridized to a longer strand
CA2568735A1 (en) * 2004-06-03 2005-12-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. Double strand compositions comprising differentially modified strands for use in gene modulation
US8394947B2 (en) * 2004-06-03 2013-03-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Positionally modified siRNA constructs
US7884086B2 (en) * 2004-09-08 2011-02-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. Conjugates for use in hepatocyte free uptake assays

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE3933384A1 (de) * 1989-10-06 1991-04-18 Hoechst Ag Multifunktionelle rna mit selbstprozessierungsaktivitaet, ihre herstellung und ihre verwendung

Also Published As

Publication number Publication date
US5612469A (en) 1997-03-18

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR950700408A (ko) 인접한 촉진제 올리고누클레오티드에 의한 리보자임 촉매활성의 증강(enhancement of ribozyme catalytic activity by a neighboring facilitator oligonucleotide)
Crooke et al. Kinetic characteristics of Escherichia coli RNase H1: cleavage of various antisense oligonucleotide-RNA duplexes
US5652094A (en) Nucleozymes
US6573072B1 (en) Ribozymes having 2′-O substituted nucleotides in the flanking sequences
CA2266748C (en) Three component chimeric antisense oligonucleotides
CA1339935C (en) Dna and rna molecules stabilized by modifications of the 3'-terminal phosphodiester linkage and their use as nucleic acid probes and as therapeutic agents to block the expression of specifically targeted genes
US6958239B2 (en) Three component chimeric antisense oligonucleotides
KR950704482A (ko) 치료용 항-hiv 올리고누클레오티드 및 이것을 함유하는 약제학적 제형(therapeutic anti-hiv oligonucleotide and pharmaceutical)
DeStefano et al. Quantitative analysis of RNA cleavage during RNAdirected DNA synthesis by human immunodeficiency and avian myeloblastosis virus reverse transcriptases
KR890701768A (ko) 핵산 혼성체 형성을 증강하기 위한 수단 및 방법
JP2003012688A (ja) オリゴヌクレオチドn3’→p5’ホスホルアミデート:合成および化合物;ハイブリダイゼーションおよびヌクレアーゼ耐性特性
Lawn et al. The gene-size DNA molecules in Oxytricha
Saran et al. Phosphorothioate nucleic acids for probing metal binding, biosensing and nanotechnology
US6087484A (en) Enhancement of ribozyme catalytic activity by A 2'-O-substituted facilitator oligonucleotide
Daniher et al. Precise control of RNA cleavage by ribozyme mimics
Mironova et al. Sequence-specific RNA cleavage by oligonucleotide-peptide conjugates
AU661124B2 (en) Enhancement of ribozyme catalytic activity by a neighboring facilitator oligonucleotide
Sergeyev et al. Catalytic site-specific cleavage of a DNA-target by an oligonucleotide carrying bleomycin A5
Reichel et al. Small nuclear RNAs are encoded in the nontranscribed region of ribosomal spacer DNA.
Western et al. A novel DNA joining activity catalyzed by T4 DNA ligase
RU2008130901A (ru) iPHK-ОПОСРЕДОВАНННОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ IGFR ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ ГЛАЗНОГО АНГИОГЕНЕЗА
JPWO2020171149A1 (ja) ヘテロ核酸の最適ps修飾パターン
KR20010072475A (ko) 재발협착증을 치료하기 위한 dna자임 및 치료 방법
Boiziau et al. Antisense oligonucleotides inhibit in vitro cDNA synthesis by HIV-1 reverse transcriptase
Carter et al. Metal-catalyzed RNA strand scission

Legal Events

Date Code Title Description
WITN Application deemed withdrawn, e.g. because no request for examination was filed or no examination fee was paid