KR20240001181A

KR20240001181A - Covid-19 및 신종 변이의 치료 및 예방을 위한 항체

Info

Publication number: KR20240001181A
Application number: KR1020237040191A
Authority: KR
Inventors: 데이비드 디. 호; 야오싱 황; 마노즈 에스. 네어
Original assignee: 더 트러스티스 오브 컬럼비아 유니버시티 인 더 시티 오브 뉴욕
Priority date: 2021-04-28
Filing date: 2022-04-27
Publication date: 2024-01-03
Also published as: IL308042A; MX2023012879A; WO2022232262A2; WO2022232262A3; BR112023022493A2; AU2022267248A1; JP2024518151A; CN117616040A; WO2022232255A3; US20240228594A1; CA3218058A1; CL2023003208A1; WO2022232255A2; CO2023016033A2; EP4330279A2

Abstract

본 명세서에 개시된 주제는 SARS-CoV-2 바이러스의 B.1.351.2-7 변이로부터의 재조합 스파이크(S) 단백질, 재조합 B.1.351.2-7 스파이크 단백질을 부호화하는 DNA 및 RNA 뉴클레오티드 서열, 및 B.1.351.2-7 스파이크 단백질과 결합하여 B.1.351.2-7 바이러스를 중화하는 조작된 항체에 관한 것이다.

Description

COVID-19 및 신종 변이의 치료 및 예방을 위한 항체

본 출원은 2021년 4월 28일자로 출원된 미국 가특허출원 제63/181,138호의 이익 및 우선권을 주장하며, 해당 기초 출원의 내용은 그 전문이 참조로서 원용된다.

본 명세서에 인용된 모든 특허, 특허 출원 및 간행물은 그 전문이 참조로서 원용된다. 이들 간행물의 개시 내용은 그 전문이 본 출원에서 참조로서 원용된다.

코로나바이러스 감염증 2019(COVID-19)는 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스 2(SARS-CoV-2)에 의해 발생하는 감염성 질환이다. 이 질병은 폐를 포함한 신체의 여러 기관에 영향을 미친다. COVID-19를 치료하고 예방하기 위한 치료제 개발이 시급하다.

특정 양태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 조작된 항체 또는 이의 기능적 단편을 제공하며, 상기 항체 또는 이의 단편은 SARS-CoV-2 스파이크 단백질의 적어도 일부에 선택적으로 결합한다.

일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 4와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 5와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 6과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 7과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 8과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 9와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 12와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 13과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95% 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 16과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 17과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 18과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 19와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 20과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 21과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 22와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 23과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 24와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 25와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 26과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 27과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 32와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 33과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다.

일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 2와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 3과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95% 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 14와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 15와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 10과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 11과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 28과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 29와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 30과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 31과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 34와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 35와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함한다.

일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 4를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 5를 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 6을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 7을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 8을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 9를 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 12를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 13을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 16을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 17을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 18을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 19를 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 20을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 21을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 22를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 23을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 24를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 25를 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 26을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 27을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 32를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 33을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다.

일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 2를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 3을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 14를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 15를 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 10을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 11을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 28을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 29를 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 30을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 31을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 34를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 35를 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함한다.

일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 4의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 5의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 6의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 7의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 8의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 9의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 12의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 13의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 16의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 17의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 18의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 19의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 20의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 21의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 22의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 23의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 24의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 25의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 26의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 27의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 32의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 33의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다.

일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 2의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 3의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 14의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 15의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 10의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 11의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 28의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 29의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 30의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 31의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 34의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 35의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함한다.

일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 야생형 SARS-CoV-2 WA1 스파이크 단백질이다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 SARS-CoV-2 B.1.351 변이 스파이크 단백질이다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질이다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질이다.

일부 실시 형태에서, 상기 항체는 SARS-CoV-2 바이러스를 중화시킨다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체는 SARS-CoV-2 B.1.351 변이 바이러스를 중화시킨다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 바이러스를 중화시킨다.

특정 양태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 바이러스에 감염된 대상체를 치료하거나 대상체에서 바이러스 감염이 발생하는 것을 예방하기 위한 방법을 제공하며, 상기 방법은 상기 대상체에게 본 명세서에 기술된 임의의 조작된 단일클론 항체를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 투여하는 단계를 포함하고, 상기 항체 또는 단편은 SARS-CoV-2 스파이크 단백질의 적어도 일부에 선택적으로 결합한다.

일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 야생형 SARS-CoV-2 WA1 스파이크 단백질이다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 SARS-CoV-2 B.1.351 변이 스파이크 단백질이다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질이다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질이다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체는 SARS-CoV-2 바이러스를 중화시킨다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체는 SARS-CoV-2 B.1.351 변이 바이러스를 중화시킨다. 일부 실시 형태에서, 상기 항체는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 바이러스를 중화시킨다.

특정 양태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 정제된 단백질을 제공하며, 상기 단백질은 SARS-CoV-2 표면 단백질의 적어도 일부를 포함한다.

일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 표면 단백질의 적어도 일부는 B.1.351.2-7 변이 표면 단백질이다. 일부 실시 형태에서, 상기 B.1.351.2-7 변이 표면 단백질은 스파이크 단백질(S)이다. 일부 실시 형태에서, 상기 스파이크 단백질은 서열 번호 1과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 스파이크 단백질은 서열 번호 1을 포함한다.

특정 양태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 합성 핵산 서열을 제공한다.

일부 실시 형태에서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 상보적 데옥시리보핵산(cDNA)이다. 일부 실시 형태에서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 전령 리보핵산(mRNA)이다. 일부 실시 형태에서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화한다. 일부 실시 형태에서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화한다.

특정 양태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 서열 번호 1에 의해 정의되는 아미노산 서열에 의해 부호화된 정제된 스파이크 단백질 또는 그 일부 및 담체를 포함하는 약제학적 조성물을 제공하며, 상기 조성물은 이를 필요로 하는 대상체에서 면역 반응을 유도한다.

특정 양태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 (i) SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질 또는 그 일부를 부호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 합성 핵산 서열; 및 (ii) 담체를 포함하는 약제학적 조성물을 제공한다.

일부 실시 형태에서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 상보적 데옥시리보핵산(cDNA)이다. 일부 실시 형태에서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 전령 리보핵산(mRNA)이다. 일부 실시 형태에서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화한다. 일부 실시 형태에서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화한다. 일부 실시 형태에서, 상기 조성물은 면역 증강제를 더 포함한다.

특정 양태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 이를 필요로 하는 대상체에서 면역 반응을 유도하는 방법을 제공하며, 상기 방법은 본 명세서에 기술된 임의의 조성물을 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 대상체는 SARS-CoV-2 바이러스에 감염될 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 상기 SARS-CoV-2 바이러스는 WA1 변이주이다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 바이러스는B.1.351 변이주이다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 바이러스는 B.1.351.2-7 변이주이다. 일부 실시 형태에서, 상기 방법은 상기 조성물을 투여하는 프라임-부스트 요법을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 프라임 및 상기 부스트는 동일한 조성물을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 프라임 및 상기 부스트는 상이한 조성물을 포함한다.

본 특허 또는 출원 파일은 원본이 컬러로 작성된 적어도 하나의 도면을 포함한다. 본 명세서에 제시된 그림의 대부분은 PCT 특허 출원 요건을 준수하기 위해 컬러로 작성된 원본 이미지를 흑백으로 나타낸 것이다.
도 1a 내지 t는 B.1.351.2-7 스파이크 단백질(S)의 수용체 결합 도메인(RBD)에 대한 단일클론 항체(mAb)를 사용한 mAb 2-7 내성 SARS-CoV-2 B.1.351 바이러스 변이주(B.1.351.2-7)의 중화를 보여준다.도 1a는 mAb 2-7의 중화를 보여준다. 도 1b는 mAb REGN10987의 중화를 보여준다. 도 1c는 mAb 2-38의 중화를 보여준다. 도 1d는 mAb C135의 중화를 보여준다. 도 1e는 mAb CoV2-2130의 중화를 보여준다. 도 1f는 mAb 2-36의 중화를 보여준다. 도 1g는 mAb COVA 1-16의 중화를 보여준다. 도 1h는 mAb 1-20의 중화를 보여준다. 도 1i는 mAb 2-15의 중화를 보여준다. 도 1J는 mAb 2-43의 중화를 보여준다. 도 1k는 mAb C121의 중화를 보여준다. 도 1l은 mAb LY CoV 555의 중화를 보여준다. 도 1m은 mAb 2-30의 중화를 보여준다. 도 1n은 mAb REGN10985의 중화를 보여준다. 도 1o는 mAb CB6의 중화를 보여준다. 도 1p는 mAb 1-57의 중화를 보여준다. 도 1q는 mAb REGN10985의 중화를 보여준다. 도 1r은 mAb S309의 중화를 보여준다. 도 1s는 mAb CoV2-2196의 중화를 보여준다. 도 1t는 mAb CR3022의 중화를 보여준다.
도 2a 내지 j는 B.1.351.2-7 스파이크 단백질의 N-말단 도메인(NTD)에 대한 단일클론 항체를 사용한 mAb 2-7 내성 SARS-CoV-2B.1.351 바이러스 변이주(B.1.351.2-7)의 중화를 보여준다. 도 2a는 mAb 4A8의 중화를 보여준다. 도 2b는 mAb 4-8의 중화를 보여준다. 도 2c는 mAb 5-24의 중화를 보여준다. 도 2d는 mAb 1-68의 중화를 보여준다. 도 2e는 mAb 1-87의 중화를 보여준다. 도 2f는 mAb 2-51의 중화를 보여준다. 도 2g는 mAb 2-17의 중화를 보여준다. 도 2h는 mAb 4-18의 중화를 보여준다. 도 2i는 mAb 4-19의 중화를 보여준다. 도 2j는 mAb 5-7의 중화를 보여준다.
도 3은 SARS-CoV-2 WA1(야생형), B.1.351(베타 변이), 및B.1.351.2-7 바이러스 변이주에 대한 스파이크 단백질 RBD 특이적 mAb의 다양한 중화능(IC₅₀μg/ml)을 보여준다.
도 4는 WA1, B.1.351, 및 B.1.351.2-7 바이러스 변이주에 대한 스파이크 단백질 NTD 특이적 mAb의 중화능(IC₅₀μg/ml)을 보여준다.
도 5는 B.1.351.2-7 변이주 돌연변이의 도식적 표현을 보여준다.
도 6은 B.1.351.2-7 스파이크 단백질의 서열을 보여준다. 노란색 강조 표시는 NTD를 나타낸다. 녹색 글꼴은 RBD를 나타낸다. 진한 파란색 글꼴은 S1/S2 도메인을 나타낸다. 하늘색 글꼴은 FP 도메인이다. 주황색 글꼴은 HR1 도메인을 나타낸다. 갈색 글꼴은 HR2 도메인을 나타낸다. 보라색 글꼴은 TM 도메인이다. 분홍색 글꼴은 CT 도메인이다.

일부 실시 형태에서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 상보적 데옥시리보핵산(cDNA)이다. 일부 실시 형태에서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 전령 리보핵산(mRNA)이다. 일부 실시 형태에서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화다. 일부 실시 형태에서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화한다. 일부 실시 형태에서, 상기 조성물은 면역 증강제를 더 포함한다.

특정 양태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 이를 필요로 하는 대상체에서 면역 반응을 유도하는 방법을 제공하며, 상기 방법은 본 명세서에 기술된 임의의 조성물을 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 대상체는 SARS-CoV-2 바이러스에 감염될 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 상기 SARS-CoV-2 바이러스는 WA1 변이주이다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 바이러스는 B.1.351 변이주이다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 바이러스는 B.1.351.2-7 변이주이다. 일부 실시 형태에서, 상기 방법은 상기 조성물을 투여하는 프라임-부스트 요법을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 프라임 및 상기 부스트는 동일한 조성물을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 프라임 및 상기 부스트는 상이한 조성물을 포함한다.

일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 야생형 SAR-CoV-2(WA1), 및 SARS-CoV-2 B.1.351 또는 B.1.351.2-7을 포함하되 이에 국한되지 않는 변이주에 특이적인 단일클론 항체(mAb)에 관한 것이다. 일부 실시 형태에서, B.1.351.2-7 바이러스 변이주는 mAb 2-7의 중화 효과에 내성이 있다. 신종 COVID-19 변이를 연구하는 동안, 많은 단일클론 항체, FDA 긴급 사용 승인(EUA)을 위한 mAb 치료제, 및 많은 임상 개발 후보 물질의 중화 활성이 B.1.351.2-7로 지정된 SARS-CoV-2 범내성 바이러스 변이주에 의해 유의한 영향을 받는 것으로 관찰되었다. 이 내성 바이러스 변이주는 단일클론 항체 2-7 시험관 내 선택을 통해 확인되었다. 항체 2-7은 수용체 결합 도메인(RBD)으로, B.1.351 변이주를 포함한 여러 SARS-CoV-2 변이체에 대해 효과적인 중화 활성을 보이는 중화 단일클론 항체이다.

일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 내성 B.1.351.2-7 변이 바이러스의 분리 및 서열 분석에 관한 것이다. 스파이크 단백질 서열의 주요 돌연변이에는 도 5에 도시된 바와 같이 H66R, V445G 및 677-681 결실이 포함된다. 어떤 점 돌연변이 또는 돌연변이의 조합이 내성 표현형에 기여하는지 분석하기 위해 슈도바이러스 중화항체 검사가 수행된다. 일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 단일클론 항체 패널을 사용한 B.1.351.2-7 변이 바이러스 중화항체 검사에 관한 것이다. 일부 실시 형태에서, mAb는 B.1.351.2-7 변이 바이러스의 스파이크 단백질의 RBD에 특이적이다. 일부 실시 형태에서, mAb는 B.1.351.2-7 변이 바이러스의 스파이크 단백질의 NTD에 특이적이다. 현재 이용 가능한 치료법 및 백신에 대한 이 내성 바이러스의 영향 가능성을 평가하는 데 회복기 혈청 및 백신 접종자 혈청이 활용된다.

B.1.351.2-7 바이러스는 대부분의 중화 항체 및 현재 EUA 치료 항체에 대해 범내성을 가지고 있기 때문에 현재 COVID-19 치료제 및 백신의 유효성은 본 명세서에 개시된 범내성 바이러스 변이주와 유사한 서열을 공유하는 신종 변이에 의해 심각한 영향을 받을 수 있다. 일 실시 형태에서, 본 명세서에 개시된 주제는 B.1.351.2-7 변이주에 대항하여 대상체에게 접종하기 위한 백신 후보 물질의 개발에 관한 것이다. 일 실시 형태에서, 본 명세서에 개시된 주제는 B.1.351.2-7 내성 변이주에 대해 효과적인 항체 치료제의 분리에 관한 것이다. 일 실시 형태에서, 본 명세서에 개시된 주제는 내성 SARS-CoV-2 변이체에 의해 발생하는 향후 코로나19 발병의 예방 및 치료에 관한 것이다. 일 실시 형태에서, 본 명세서에 개시된 주제는 신종 SARS-CoV-2 변이체에 대한 백신의 설계에 관한 것이다. 일부 실시 형태에서, 본 명세서에 개시된 주제는 SARS-CoV-2의 B.1.351.2-7 내성 변이주 및 향후 범내성 변이에 대해 효과적인 및/또는 교차 반응성을 나타내는 중화 항체를 분리하기 위한 미끼 단백질의 설계에 관한 것이다. 일부 실시 형태에서, 상기 미끼 단백질은 B.1.351.2-7 바이러스 입자의 단백질의 적어도 일부로부터 설계된다. 일부 실시 형태에서, 본 명세서에 개시된 주제는 바이러스 변이체의 검출에 관한 것이다.

초기 계대에 대한 서열이 분석되고 현재 중화 항체에 대해 범내성을 가진 바이러스 서열이 분리된다. 내성 표현형에 기여하는 주요 돌연변이는 슈도바이러스 중화를 통해 확인된다. 이 내성 바이러스가 치료제 및 백신에 미치는 영향 가능성을 평가하기 위해 추가 항체 패널(RBD 및 NTD 모두), 회복기 혈청 및 백신 접종자 혈청에 대한 중화가 수행된다. 치료제로서 차세대 중화 항체를 생성하기 위해 인간화 마우스 시스템 또는 해당 분야에 공지된 다른 동물 모델에서의 구조적 특성 분석 및 면역화를 위한 내성 바이러스 서열을 기반으로 스파이크 삼량체가 생성된다.

서열 번호 1은 변이 B.1.351.2-7 전장 스파이크 단백질의 아미노산 서열로서 다음과 같다.

MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFRAIHVSGTNGTKRFANPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRGLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGNIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKGGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVKGFNCYFPLQSYGFQPTYGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTRRARSVASQSIIAYTMSLGVENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT*

일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 정제된 변이 B.1.351.2-7 스파이크 단백질에 관한 것이다. 일부 실시 형태에서, 변이 B.1.351.2-7 스파이크 단백질을 부호화하는 벡터가 세균 집단 내로 도입된다. 일부 실시 형태에서, 상기 단백질은 변이 B.1.351.2-7 스파이크 단백질을 부호화하는 벡터로 형질전환된 세균 집단을 포함하는 세균 배양물에서 생산된다. 일부 실시 형태에서, 상기 단백질은 세 배양물로부터 정제된다. 일부 실시 형태에서, 상기 벡터는 벡터 백본과 서열 번호 1과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 부호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 벡터는 벡터 백본과 서열 번호 1을 부호화하는 핵산 서열을 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 벡터 백본은 해당 분야에서 발현 벡터에 대해 사용되는 임의의 백본이다. 일부 실시 형태에서, 상기 단백질은 친화성 크로마토그래피를 사용하여 정제된다. 일부 실시 형태에서, 상기 단백질은 해당 분야에 공지된 임의의 적합한 방법을 사용하여 정제된다. 일부 실시 형태에서, 상기 정제된 변이 B.1.351.2-7 스파이크 단백질은 재조합 단백질이다.

SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질에 대한 mAb의 서열

하기 서열 번호에서 밑줄 친 이탤릭체로 표시된 아미노산은 각각의 상보성 결정 부위(CDR)를 나타낸다.

mAb 2-7의 서열

서열 번호 2는 항체 번호 2-7의 중쇄 가변 부위로 RBD를 특이적으로 인식한다.

SQITLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSG FSLSTSGVGVG WIRQPPGKALEWLA LIYWDDDKRYSPSL KSRLTITKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCAH HKIERIFDY WGQGTLVTVSSAS

서열 번호 3은 항체 번호 2-7의 경쇄 가변 부위로 RBD를 특이적으로 인식한다.

QSALAQPASVSGSPGQSITISC TGTSSDVGAYNYVS WYQQHPGKAPKLMIY DVSKRPS GVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYC SSYTTSSTV FGGGTKLTVL

mAb 2-38의 서열

서열 번호 4는 항체 번호 2-38의 중쇄 가변 부위이다.

EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASG FTFSSYSMN WVRQAPGKGLEWVS SISSSSSYIYYADSVKG RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCTR AGWELRLDAFDI WGQGTMVTVSS

서열 번호 5는 항체 번호 2-38의 경쇄 가변 부위이다.

SSELTQDPAVSVALGQTVRITC QGDSLRSSYAS WYQQKPGQAPILVIY DKNNRPS GIPDRFSGSSSGNTASLTITGAQAEDEADYYC NSRDSSGIL FGGGTKLTVL

mAb 2-36의 서열

서열 번호 6은 항체 번호 2-36의 중쇄 가변 부위로 RBD를 특이적으로 인식한다.

QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSG GSVSSSNYYWS WIRQPPGKGLEWIG YMYYSGSTKYNPSL KSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR EVYYYDRSGYYASDGFDI WGQGTMVTVSS

서열 번호 7은 항체 번호 2-36의 경쇄 가변 부위로 RBD를 특이적으로 인식한다.

EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC RASQSVSSSYLA WYQQKPGQAPRLLIY GASSRAT GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQYGSSPQT FGQGTKVEIK

mAb 1-20의 서열

서열 번호 8은 항체 번호 1-20의 중쇄 가변 부위로 RBD를 특이적으로 인식한다.

EVQLVESGGGLIQPGGSLRLSCAASG LTVSSNYMS WVRQAPGKGLEWVS VIYSGGSTFYADSV KGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR DLFYYGMDV WGQGTTVTVSS

서열 번호 9는 항체 번호 1-20의 경쇄 가변 부위로 RBD를 특이적으로 인식한다.

DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC RASQGISSYLA WYQQKPGKAPKLLIY AASTLQS GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC QQLNSYPC FGPGTKVDIK

mAb 2-15의 서열

서열 번호 10은 항체 번호 2-15의 중쇄 가변 부위이다.

QVQLVQSGAEVKKPGASVRVSCKASG YTFTGYYMH WVRQAPGQGLEWMG WINPISDGTNYAQ KFQGWVTMTRDTSISTVYMELSRLRSDDTAVYYCAR GGSRCSGGNCYGWAYDAFDI WGQGTMITVSS

서열 번호 11은 항체 번호 2-15의 경쇄 가변 부위이다.

QSALTQPASVSGSPGQSITISC TGTSSDVGGYNFVS WYQQHPGKAPKLMIY DVSKRPS GVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADCYC SSYTSSSTFV FGTGTKVTVL

mAb 2-43의 서열

서열 번호 12는 항체 번호 2-43의 중쇄 가변 부위로 RBD 또는 NTD 이외의 항원결정기를 인식한다.

QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASG YTFTGYYMH WVRQAPGQGLEWMG WINPNSGGTNYAQ KFQGRVTMTRDTSITTAYMELRRLRSDDTAVYYCAR GLGVGCSGGNCYLDYYY MDVWGKGTTVTVSS

서열 번호 13은 항체 번호 2-43의 경쇄 가변 부위로 RBD 또는 NTD 이외의 항원결정기를 인식한다.

QSALTQPASVSGSPGQSITISC TGTSSDVGGYNYVS WYQQHPGKAPKLMIY DVSKRPS GVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEGDYYC SSYTSSSTWV FGGGTKLTVL

mAb 1-57의 서열

서열 번호 14는 항체 번호 1-57의 중쇄 가변 부위로 RBD를 특이적으로 인식한다.

EVHLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG FTFSDHYMD WVRQAPGKGLEWVG RTRNKANSYTTEYAASV KGRFTISRDDAKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCAR VHRWAYCINGVCFGAYSDY WGQGTLVTVSS

서열 번호 15는 항체 번호 1-57의 경쇄 가변 부위로 RBD를 특이적으로 인식한다.

EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC RASQSVSSSYLA WYQQKPGQAPRLLIY GASSRAT GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQYGSSPST FGQGTKLEIK

mAb 2-30의 서열

서열 번호 16은 항체 번호 2-30의 중쇄 가변 부위로 RBD를 특이적으로 인식한다.

QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASG FTFSSYTMH WVRQAPGKGLEWVA AISYDGNNKYYADSV KGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR SILYGGGMDV WGQGTTVTVSS

서열 번호 17은 항체 번호 2-30의 경쇄 가변 부위로 RBD를 특이적으로 인식한다.

DIQLTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISSYLA WYQQKPGQAPKLLIY AASTLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQLNSYPLT FGGGTKVEIK

mAb 4-8의 서열

서열 번호 18은 항체 번호 4-8의 중쇄 가변 부위이다.

QVQLVQSGAEVKKAGSSVKVSCKASG GTFSSHTIT WVRQAPGQGLEWMG RIIPILGIANYAQKFQG RVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAS LQTVDTAIEKYYGMDV WGQGTTVTVSS

서열 번호 19는 항체 번호 4-8의 경쇄 가변 부위이다.

SYELTQPPSVSVSPGQTASITC SGDKLGDKYAC WYQQKPGQSPVLVIY QDNKRPS GIPERFSGSNSGNTATLTISGTQAMDEADYYC QAWDSSTAV FGGGTKLTVL

mAb 5-24의 서열

서열 번호 20은 항체 번호 5-24의 중쇄 가변 부위로 NTD를 특이적으로 인식한다.

QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASG LTFSSYVMH WVRQAPGKGLDWVG VIWYDGSK KYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR DPRDYYDFWSGYDYYYGLDV WGQGTTVTVSS

서열 번호 21은 항체 번호 5-24의 경쇄 가변 부위로 NTD를 특이적으로 인식한다.

EIVLTQSPGILSLSPGERATLSC RASQSVSSSYLA WYQQKPGQAPRLLIY GASSRAT GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQYGSSGALT FGGGTKVEIK

mAb 1-68의 서열

서열 번호 22는 항체 번호 1-68의 중쇄 가변 부위로 NTD를 특이적으로 인식한다.

QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSG YTLIELSMH WVRQAPGKG LEWMGGFDPEDAETIYAQ KFQGRVTMTEDTSTDTAYMELSSLRSEDTAVYYCAT GWAVAGSSDVWYYYYGMDV WGQGTTVTVSS

서열 번호 23은 항체 번호 1-68의 경쇄 가변 부위로 NTD를 특이적으로 인식한다.

QSALTQPPSVSGSPGQSVTISC TGTSSDVGSYNRVS WYQQPPGTAPKLMIY EVSNRPS GVPDRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYC SSYTSSSTYV FGTGTKVTVL

mAb 1-87의 서열

서열 번호 24는 항체 번호 1-87의 중쇄 가변 부위로 NTD를 특이적으로 인식한다.

QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSG YTLIELSMH WVRQAPGKGLEWMG GFDPEDAETIYAQ KFQGRVTMTEDTSTDTAYMELSSLRSEDTAVYYCAT GIAVIGPPPSTYYYYGMDV WGQGTTVTVSS

서열 번호 25는 항체 번호 1-87의 경쇄 가변 부위로 NTD를 특이적으로 인식한다.

QSALTQPASVSGSPGQSITISCTGTS SDVGGYNYVS WYQQHPGKAPKLMIY DVSKRPS GVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYC SSYTSSSTYV FGTGTKVTVL

mAb 2-51의 서열

서열 번호 26은 항체 번호 2-51의 중쇄 가변 부위이다.

QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSG YTLIELSMH WVRQAPGKGLEWMG GFDPEDVETIYAQQFQG RVTMTEDTSTDTAYMELSSLRSEDTAVYYCAT GWAYKSTWYFGY WGQGTLVTVSS

서열 번호 27은 항체 번호 2-51의 경쇄 가변 부위이다.

QSALTQPPSASGSPGQSVTISC TGTSSDVGGYNYVS WYQQHPGKAPKLMIY EVSKRPS GVPDRFSGSKSGNTASLTVSGLQAEDEADYYC SSYAGSRMG FGGGTKLTVL

mAb 2-17의 서열

서열 번호 28은 항체 번호 2-17의 중쇄 가변 부위로 RBD 또는 NTD 이외의 항원결정기를 인식한다.

QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASG GTFSSYAIS WVRQAPGQGLEWMG GNIPIFGTANYAQ KFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR GVGYRGVIPLNWFDP WGQGTVVTVSS

서열 번호 29는 항체 번호 2-17의 경쇄 가변 부위로 RBD 또는 NTD 이외의 항원결정기를 인식한다.

EIVMTQSPATLSVSPGERATLSC RASQSVSSDLA WYQHKPGQAPRLLIY GASTRAT GIPVRFSGSGSGTEFTLTISSLQSEDFAVYYC QQYNNWPPFT FGGGTKVEIK

mAb 4-18의 서열

서열 번호 30은 항체 번호 4-18의 중쇄 가변 부위로 NTD를 특이적으로 인식한다.

QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASG FTFSSYGMH WVRQAPGKGLEWVA VISYDGSNKHYADSV KGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK DSGYNYGYSWFDP WGQGTLVTVSS

서열 번호 31은 항체 번호 4-18의 경쇄 가변 부위로 NTD를 특이적으로 인식한다.

SYELTQPPSVSVSPGQTARITC SADALAKQYAY WYQQKPGQAPVLVIY KDSERPS GIPERFSGSSSGTTVTLTISGVQAEDEADYYC QSTDNSGTYPNWV FGGGTKLTVL

mAb 4-19의 서열

서열 번호 32는 항체 번호 4-19의 중쇄 가변 부위로 RBD 또는 NTD 이외의 항원결정기를 인식한다.

QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSG GSISNYYWS WIRQSPGKGLEWIG YIYYSGSTNYNPSL KSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR SAKHWLAPPGDYYYYMDV WGKGTTVTVSS

서열 번호 33은 항체 번호 4-19의 경쇄 가변 부위로 RBD 또는 NTD 이외의 항원결정기를 인식한다.

DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC RASQGISSYLA WYQQKPGKAPKLLIY AASTLQS GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC QQLNSYLT FGGGTKVEIK

mAb 5-7의 서열

서열 번호 34는 항체 번호 5-7의 중쇄 가변 부위로 NTD를 특이적으로 인식한다.

QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASG YTFTSYYMH WVRQAPGQGLEWMG VINPSGGSTSYAE KFRGRVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCAR DREPHSDSSGYWDSLKYYYYYALDV WGQGTTVTVSS

서열 번호 35는 항체 번호 5-7의 경쇄 가변 부위로 NTD를 특이적으로 인식한다.

AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISSYLA WYQQKPGKAPELLIY AASTLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQLNTYPFT FGPGTKVDIK

일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 SARS-CoV-2 및 B.1.351.2-7 변이체를 비롯한 변이체에 대해 효능이 있는 단일클론 항체(mAb)의 분리, 특성 분석 및 서열을 보고한다.mAb는 COVID-19 환자의 혈액 검체에서 분리될 수 있으며, 이들 검체에서 항체 서열이 획득되면 생체 외에서 mAb가 합성될 수 있다.

본 명세서에 기술된 SARS-CoV-2 중화 mAb는 SARS-CoV-2에 감염된 대상체의 치료에 사용될 수 있다.일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 mAb는 이를 필요로 하는 대상체에서 SARS-CoV-2 바이러스 수치를 감소시킨다.일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 mAb는 이를 필요로 하는 대상체에서 질병 중증도를 감소시킨다.일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 mAb는 이를 필요로 하는 대상체에서 COVID-19의 임상 결과를 개선한다. 일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 mAb는 고위험 대상체 및 개체가 SARS-CoV-2에 감염되는 것을 예방하기 위한 예방적 조치로서 사용될 수 있다.

본 명세서에 개시된 강력한 COVID-19 mAb에 대한 확인 프로세스의 흐름

1. COVID-19 환자의 혈장 검체를 분리하여 이 혈장 검체에 포함된 잠재적 항체가 생체 외에서 SARS-CoV-2 및 변이체를 중화하는 능력을 평가하였다.

2. 강력한 혈장 항바이러스 활성을 유빌할 수 있는 mAb 서열을 포함하는 단일 B 세포를 분리하기 위해 말초 혈액 단핵세포(PMBC)를 환자로부터 분리하였다. 고처리량 서열 분석에 의해 이들 단일 B 세포로부터 항체 서열을 회수하였다.

3. 이러한 mAb 서열을 부호화하는 단일 B 세포의 유전자를 합성하여 발현 벡터에 클로닝하였다. mAb를 생체 외에서 발현시키고 후속 분석 및 특성 분석을 위해 정제하였다.

4. 그런 다음생체 외에서 생산 및 정제된 mAb에 대해 SARS-CoV-2 또는 변이 바이러스로 인한 감염을 중화하는 능력이 있는지 테스트하였다.

일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 mAb는 COVID-19의 치료 및/또는 예방을 위해 사용될 수 있다.일부 실시 형태에서, mAb는 COVID-19 대상체 노출의 진단에 사용될 수 있다.일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 mAb는 실험실 연구 및 개발 활동에 활용될 수 있다.

면역글로불린 또는 항체는 아미노산 서열의 두 개의 동일한 경쇄(LC)와 두 개의 동일한 중쇄(HC)로 구성된 Y자형 단백질이다. 경쇄와 중쇄는 서로 결합하여 온전한 면역글로불린 이종이량체를 형성한다. 일부 실시 형태에서, 이종이량체의 HC와 LC는 이황화 결합을 통해 연결된다. 일부 실시 형태에서, 이종사량체의 두 개의 HC는 이황화 다리에 의해 연결된다. 인간 LC는 기능적으로 유사한 두 가지 유형인 κ 또는 λ 중 하나일 수 있다. 두 LC 유형 모두 불변 도메인(CL)과 가변 도메인(VL)이라는 두 개의 도메인이 있다. 인간 항체 HC는 IgA, IgD, IgE, IgG, 및 IgM의 다섯 가지 동종형 중 하나일 수 있다. IgA, IgD, 및 IgG에는 세 개의 불변(C) 도메인과 하나의 가변(V) 도메인이 있다. IgE와 IgM에는 하나의 가변 도메인과 네 개의 불변 도메인이 있다. IgA 및 IgM 동종형에는 추가 J-사슬이 있어 각각 이량체와 오량체를 형성할 수 있다.

항체 분자는 세 개의 기능적 구성 요소, 즉 두 개의 항원 결합 절편 도메인(Fab)과 절편 결정화 부위(Fc)를 가지고 있으며, 두 개의 Fab는 Fc에 비해 Fab가 큰 유연성을 가질 수 있게 하는 경첩 부위에 의해 Fc에 연결된다. 단일클론 항체에서 각 Fab는 특정 표적 항원에 결합하기 위한 동일한 항원 결합 부위를 가지고 있다. Fab의 Fv 부위는 중쇄(HC)와 경쇄(LC)가 기여하는 한 쌍의 가변 도메인(가변 중쇄(VH) 및 가변 경쇄(VL))으로 구성된다. 일부 실시 형태에서, 중쇄 및 경쇄 도메인은 대략 110개의 아미노산 잔기에 해당하는 길이이다. 표적 항원과 상호 작용하는 면역 글로불린 구조의 Fv 도메인은 HC 및 LC의 N-말단에 있다. 면역글로불린 분자의 Fab 영역은 LC의 VL 및 불변 경쇄 부위(CL)와 HC의 VH 및 첫 번째 불변 중쇄 부위(CH1)의 접합에 의해 형성된다. VL과 VH의 접합은 항원 결합 부위를 형성한다.

Fab 영역과 Fc 영역을 연결하는 폴리펩티드 영역을 경첩 부위라고 한다. 경첩 부위는 Fab가 Fc에 비해 기능적으로 높은 수준의 구조적 유연성을 갖게 한다. 항체 경첩은 상부 경첩, 중심부 경첩 및 하부 경첩의 세 부분으로 나눌 수 있으며 각각 다른 기능적 역할을 한다. 상부 경첩은 Fab의 이동과 회전을 가능하게 한다. 가운데의 중심부 경첩에는 이황화 결합을 형성하는 IgG 아형에 따라 다양한 수의 시스테인 잔기가 포함되어 있어 두 중쇄의 결합을 안정화시킨다. 하부 경첩은 Fab에 대한 Fc의 이동을 가능하게 한다.

실시예 1 - SARS-CoV-2 및 그 변이체에 대한 중화 항체

도 1a 내지 t는 B.1.351.2-7 스파이크 단백질의 수용체 결합 도메인(RBD)에 대한 단일클론 항체를 사용한 2-7 내성 B.1.351(B.1.351.2-7) 바이러스 변이주의 중화를 보여준다.도 1a는 mAb 2-7의 중화를 보여준다. 도 1b는 mAb REGN10987의 중화를 보여준다. 도 1c는 mAb 2-38의 중화를 보여준다. 도 1d는 mAb C135의 중화를 보여준다. 도 1e는 mAb CoV2-2130의 중화를 보여준다. 도 1f는 mAb 2-36의 중화를 보여준다. 도 1g는 mAb COVA 1-16의 중화를 보여준다. 도 1h는 mAb 1-20의 중화를 보여준다. 도 1I는 mAb 2-15의 중화를 보여준다. 도 1J는 mAb 2-43의 중화를 보여준다. 도 1k는 mAb C121의 중화를 보여준다. 도 1l은 mAb LY CoV 555의 중화를 보여준다. 도 1m은 mAb 2-30의 중화를 보여준다. 도 1n은 mAb REGN10985의 중화를 보여준다. 도 1o는 mAb CB6의 중화를 보여준다. 도 1p는 mAb 1-57의 중화를 보여준다. 도 1q는 mAb REGN10985의 중화를 보여준다. 도 1r은 mAb S309의 중화를 보여준다. 도 1s는 mAb CoV2-2196의 중화를 보여준다. 도 1t는 mAb CR3022의 중화를 보여준다. 또한 SARS-CoV-2 야생형 바이러스와 B.1.351 바이러스 변이에 대한 중화 곡선도 표시되어 있다.

도 2a 내지 j는 B.1.351.2-7 스파이크 단백질의 N-말단 도메인(NTD)에 대한 단일클론 항체(mAb)를 사용한 2-7 내성 B.1.351 (B.1.351.2-7) 바이러스 변이주의 중화를 보여준다. 도 2a는 mAb 4A8의 중화를 보여준다. 도 2b는 mAb 4-8의 중화를 보여준다. 도 2c는 mAb 5-24의 중화를 보여준다. 도 2d는 mAb 1-68의 중화를 보여준다. 도 2e는 mAb 1-87의 중화를 보여준다. 도 2f는 mAb 2-51의 중화를 보여준다. 도 2g는 mAb 2-17의 중화를 보여준다. 도 2h는 mAb 4-18의 중화를 보여준다. 도 2i는 mAb 4-19의 중화를 보여준다. 도 2j는 mAb 5-7의 중화를 보여준다. 또한 SARS-CoV-2 야생형 바이러스와 B.1.351 바이러스 변이에 대한 중화 곡선도 표시되어 있다.

도 3은 WA1, B.1.351, 및 B.1.351.2-7 바이러스 변이주에 대한 RBD mAb의 다양한 효능(IC₅₀μg/ml)을 보여준다.

도 4는 WA1, B.1.351, 및 B.1.351.2-7 바이러스 변이주에 대한 NTD mAb의 중화(IC₅₀μg/ml)를 보여준다.

도 5는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 돌연변이의 도식적 표현을 보여준다. 도 5는 또한 변이주 WA1 대비 변이주 B1.351 및 변이주 B.1.351.2-7의 스파이크 단백질 서열의 주요 차이를 보여준다. B.1.351.2-7 변이주의 스파이크 단백질 서열의 NTD에서 아미노산 L241, L242 및 A243이 결실되었으며 R66이 H66으로 치환되었다. B.1.351 변이주와 비교하여 B.1.351.2-7 변이주의 스파이크 단백질 서열의 RBD에서 V445가 아미노산 G445로 치환되었다. WA1 변이주와 비교하여 B.1.351.2-7 변이주의 스파이크 단백질 서열의 S1/S2 도메인에서 아미노산 677-681이 결실된 반면 D614가 G614로 치환되었다.

도 6은 B.1.351.2-7 스파이크 단백질의 서열을 보여준다. 노란색 강조 표시는 NTD를 나타낸다. 녹색 글꼴은 RBD를 나타낸다. 진한 파란색 글꼴은 S1/S2 도메인을 나타낸다. 하늘색 글꼴은 FP 도메인이다. 주황색 글꼴은 HR1 도메인을 나타낸다. 갈색 글꼴은 HR2 도메인을 나타낸다. 보라색 글꼴은 TM 도메인이다. 분홍색 글꼴은 CT 도메인이다. 각 도메인의 라벨은 해당 아미노산 서열 옆에서 찾을 수 있다. FP 도메인의 서열은 해당 라인의 중앙에 있다.

실시예 2 - B.1.351.2-7에 대한 DNA 기반 백신

일부 실시 형태에서, 본 명세서에 개시된 주제는 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스(SARS-CoV-2)에 대한 면역반응을 유도하는 백신에 관한 것이다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 SARS-CoV-2 바이러스에 대한 예방적 조치로서 투여되며, 이는 감수성 숙주 유기체에 침범하여 그 안에서 질병을 유발할 수 있다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 감염으로 인한 질병을 치료하기 위해 투여된다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 SARS-CoV-2 스파이크 단백질의 적어도 일부를 부호화하는 핵산 서열을 함유한다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질이다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 서열 번호 1에 의해 정의되는 아미노산 서열의 적어도 일부를 부호화하는 핵산 서열을 함유한다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 서열 번호 1에 의해 정의되는 아미노산 서열과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95% 동일한 아미노산 서열을 부호화하는 핵산 서열을 함유한다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 서열 번호 1에 의해 정의되는 아미노산 서열을 부호화하는 핵산 서열을 함유한다.

일부 실시 형태에서, 본 명세서에 개시된 백신이 SARS-CoV-2에 대한 면역 반응을 유도할 수 있는 숙주 동물은 포유류 또는 조류, 예를 들어, 인간, 개, 고양이, 돼지, 말, 닭, 오리, 칠면조, 흰족제비 등을 포함하되 이에 국한되지 않는다.

본 명세서에 기술된 백신은 용매, 면역 증강제 및/또는 첨가제로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 성분을 더 함유할 수 있으나, 이에 국한되지는 않는다. 상기 용매는 생리식염수 또는 증류수를 포함할 수 있다. 상기 보조제는 프로인트 불완전 또는 완전 면역 증강제, 수산화알루미늄 겔, 식물성 및 미네랄 오일을 포함할 수 있다. 상기 첨가제는 인산알루미늄, 수산화알루미늄 또는 황산알루미늄칼륨을 포함할 수 있다. 일부 실시 형태에서, 본 명세서에 개시된 백신은 백신 제제에 사용되는 적어도 하나의 물질을 함유하며, 이는 해당 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 주지되어 있다.

일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 백신의 조성은 대상체의 체중, 연령, 증상의 중증도, 또는 다른 신체적 특성에 따라 투여할 수 있도록 조절된다. 일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 백신은 경구 또는 비경구 제형으로 제조될 수 있다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 피내, 근육 내, 복강 내, 비강 내 또는 경막 외 경로를 통해 투여될 수 있다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 해당 분야에 공지된 임의의 적절한 경로에 의해 투여된다.

일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 주제는 하나 이상의 대상체에게 본 명세서에 기술된 백신을 투여함으로써 SARS-CoV-2 또는 변이 SARS-CoV-2 감염을 예방하거나 치료하는 방법에 관한 것이다. 이러한 감염은 대상체에게 COVID-19 증상 또는 질병을 유발할 수 있다. 본 명세서에서 사용되는 용어 "대상체"는 SARS-CoV-2 바이러스 또는 변이 바이러스에 이미 감염되었거나 감염될 수 있는 인간을 포함한 모든 동물을 의미한다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 변이체는 야생형 SARS-CoV-1과 비교하여 SARS-CoV-2의 스파이크 단백질을 부호화하는 서열에 적어도 하나의 아미노산 돌연변이를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 백신은 단독으로 또는 임의의 COVID-19 치료제와 병용하여 투여될 수 있다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 감염을 치료하기 위해 해당 분야에서 사용되는 임의의 제제와 함께 투여될 수 있다.

본 명세서에서 사용되는 용어 "예방"은 본 명세서에 기술된 백신의 투여를 통해 SARS-CoV-2 또는 변이주에 의한 감염을 억제하거나, 감염으로 인한 질병의 발생을 지연시키거나 중증도를 감소시키는 모든 행위를 의미한다.

본 명세서에서 사용되는 용어 "치료"는 본 명세서에 기술된 백신의 투여를 통해 SARS-CoV-2 또는 변이주 감염으로 인한 증상이 감소되거나 유리하게 변경되게 하는 모든 행위를 의미한다.

일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 백신은 개별 치료제로서 투여되거나 다른 치료제와 병용하여 투여된다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 종래의 치료제와 순차적으로 또는 동시에 투여될 수 있다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 단회 또는 다회 방식으로 투여될 수 있다.

일 실시 형태에서, 본 명세서에 개시된 주제는 SARS-CoV-2 바이러스의 B.1.351.2-7 변이 또는 기타 신종 SARS-CoV-2 변이에 대한 백신의 생성 및 검증에 관한 것이다. 일 실시 형태에서, 상기 백신은 B.1.351.2-7 스파이크 단백질의 적어도 일부를 부호화하는 DNA 뉴클레오티드 서열(서열 번호 1)을 기반으로 한다.

일 실시 형태에서, B.1.351.2-7에 대한 DNA 기반 백신은 B.1.351.2-7 스파이크 단백질의 적어도 일부를 부호화하는 DNA 서열(서열 번호 1)을 함유하는 유전적으로 조작된 플라스미드를 이를 필요로 하는 대상체에게 도입한다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 SARS-CoV-2 스파이크 단백질의 적어도 일부를 부호화하는 DNA 핵산 서열을 함유한다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질이다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 서열 번호 1에 의해 정의되는 아미노산 서열의 적어도 일부를 부호화하는 핵산 서열을 함유한다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 서열 번호 1에 의해 정의되는 아미노산 서열과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95% 동일한 아미노산 서열을 부호화하는 핵산 서열을 함유한다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 서열 번호 1에 의해 정의되는 아미노산 서열을 부호화하는 핵산 서열을 함유한다. 일부 실시 형태에서, 상기 도입은 주사를 통해 이루어진다. 일부 실시 형태에서, 상기 도입은 비강 스프레이를 통해 이루어진다. 일부 실시 형태에서, 상기 도입은 해당 분야에서 공지된 임의의 적합한 방법을 통해 이루어진다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신접종은 B.1.351.2-7 변이의 확산을 방지하기 위한 것이다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신접종은 B.1.351.2-7에 대해 양성 반응을 보인 대상체를 치료하기 위한 것이다. 일부 실시 형태에서, 상기 대상체는 B.1.351.2-7에 노출된 적이 있다. 일부 실시 형태에서, 상기 대상체 COVID-19 증상을 나타낸다. 일부 실시 형태에서, 상기 대상체는 COVID-19로 진단된 적이 있다.

본 명세서에 기술된 DNA 기반 백신을 대상체에게 접종하면 상기 대상체의 세포는 B.1.351.2-7 스파이크 단백질 또는 적어도 DNA에 의해 부호화된 부분을 직접 생산한다. 이로 인해 상기 대상체의 시스템에서 보호 면역 반응이 생성된다. 백신접종을 받은 대상체가 B.1.351.2-7 바이러스에 감염된 경우 중증 질환을 피할 수 있다. 일부 실시 형태에서, B.1.351.2-7에 감염된, 백신접종을 받은 대상체는 질병의 증상이 없거나 매우 경미한 증상을 보인다. 일부 실시 형태에서, 백신접종을 받은 대상체는 다른 대상체에게 바이러스를 전파하지 않는다. 일부 실시 형태에서, DNA 백신은 광범위한 면역 반응 유형을 유도할 수 있다.

일부 실시 형태에서, 상기 백신접종 요법은 B.1.351.2-7 DNA를 대상체에게 도입하는 하나 이상의 이벤트를 포함한다. 일부 실시 형태에서, 상기 도입 이벤트는 시간이 지남에 따라 확산된다. 일부 실시 형태에서, 최초 백신접종 후 1개월 이내에 적어도 1회의 추가 접종이 뒤따른다. 일부 실시 형태에서, 상기 최초 백신접종 및 추가 접종은 B.1.351.2-7 스파이크 단백질의 적어도 일부를 부호화하는 동일한 B.1.351.2-7 DNA 스파이크 단백질 서열을 기반으로 한다. 일부 실시 형태에서, 상기 초기 백신접종 및 추가 접종은 각각 B.1.351.2-7 스파이크 단백질의 적어도 일부를 부호화하는 상이한 B.1.351.2-7 DNA 스파이크 단백질 서열을 기반으로 한다.

실시예 3 - B.1.351.2-7에 대한 RNA 백신

일부 실시 형태에서, 본 명세서에 기술된 백신은 B.1.351.2-7 스파이크 단백질의 적어도 일부를 부호화하는 mRNA 뉴클레오티드 서열(서열 번호 1)을 기반으로 한다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 SARS-CoV-2 스파이크 단백질의 적어도 일부를 부호화하는 mRNA 핵산을 함유한다. 일부 실시 형태에서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질이다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 서열 번호 1에 의해 정의되는 아미노산의 적어도 일부를 부호화하는 mRNA 핵산을 함유한다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 서열 번호 1에 의해 정의되는 아미노산 서열과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95% 동일한 아미노산 서열을 부호화하는 mRNA 핵산을 함유한다. 일부 실시 형태에서, 상기 백신은 서열 번호 1에 의해 정의되는 아미노산 서열을 부호화하는 핵산 서열을 함유한다.

대상체에게 도입된 mRNA 가닥은 신체의 세포로 들어가며 상기 세포는 상기 mRNA에 의해 부호화된 유전 정보를 사용하여 B.1.351.2-7 스파이크 단백질 또는 이의 부호화된 부분을 생성한다. 그러면 대상체의 면역 체계가 단백질을 인식하는 법을 배우게 된다. RNA 백신은 바늘이 있는 주사기를 통한 주사 또는 바늘 없이 피부에 주입; 혈액, 근육, 림프절 또는 장기에 직접 주사; 또는 비강 스프레이를 포함하되 이에 국한되지 않는 다양한 방법으로 전달될 수 있다.

일부 실시 형태에서, 상기 백신접종 요법은 B.1.351.2-7 RNA를 전달하는 하나 이상의 이벤트를 포함하며, 상기 이벤트는 시간이 지남에 따라 확산된다. 일부 실시 형태에서, 최초 백신접종 후 1개월 이내에 적어도 1회의 추가 접종이 뒤따른다. 일부 실시 형태에서, 상기 최초 백신접종 및 추가 접종은 B.1.351.2-7 스파이크 단백질의 적어도 일부를 부호화하는 동일한 B.1.351.2-7 RNA 서열을 기반으로 한다. 일부 실시 형태에서, 상기 초기 백신접종 및 추가 접종은 각각 B.1.351.2-7 스파이크 단백질의 적어도 일부를 부호화하는 상이한 B.1.351.2-7 RNA 서열을 기반으로 한다.

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of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 13 Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln 1 5 10 15 Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr 20 25 30 Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu 35 40 45 Met Ile Tyr Asp Val Ser Lys Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe 50 55 60 Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu 65 70 75 80 Gln Ala Glu Asp Glu Gly Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser 85 90 95 Ser Thr Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu 100 105 110 <210> 14 <211> 130 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 14 Glu Val His Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp His 20 25 30 Tyr Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Gly Arg Thr Arg Asn Lys Ala Asn Ser Tyr Thr Thr Glu Tyr Ala Ala 50 55 60 Ser Val 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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 16 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr 20 25 30 Thr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Ala Ile Ser Tyr Asp Gly Asn Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Ser Ile Leu Tyr Gly Gly Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly 100 105 110 Thr Thr Val Thr Val Ser Ser 115 <210> 17 <211> 107 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 17 Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Tyr 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Ala Ala Ser Thr Leu 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Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser 115 120 125 <210> 25 <211> 110 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 25 Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln 1 5 10 15 Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr 20 25 30 Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu 35 40 45 Met Ile Tyr Asp Val Ser Lys Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe 50 55 60 Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu 65 70 75 80 Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser 85 90 95 Ser Thr Tyr Val Phe Gly Thr Gly Thr Lys Val Thr Val Leu 100 105 110 <210> 26 <211> 121 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 26 Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 1 5 10 15 Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Val Ser Gly Tyr Thr Leu Ile Glu Leu 20 25 30 Ser Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met 35 40 45 Gly Gly Phe Asp Pro Glu Asp Val Glu Thr Ile Tyr Ala Gln Gln Phe 50 55 60 Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Glu Asp Thr Ser Thr Asp Thr Ala Tyr 65 70 75 80 Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Thr Gly Trp Ala Tyr Lys Ser Thr Trp Tyr Phe Gly Tyr Trp Gly 100 105 110 Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 115 120 <210> 27 <211> 109 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 27 Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Ser Pro Gly Gln 1 5 10 15 Ser Val Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr 20 25 30 Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu 35 40 45 Met Ile Tyr Glu Val Ser Lys Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe 50 55 60 Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Val Ser Gly Leu 65 70 75 80 Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Ala Gly Ser 85 90 95 Arg Met Gly Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu 100 105 <210> 28 <211> 124 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 28 Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser 1 5 10 15 Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Phe Ser Ser Tyr 20 25 30 Ala Ile Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met 35 40 45 Gly Gly Asn Ile Pro Ile Phe Gly Thr Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe 50 55 60 Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Glu Ser Thr Ser Thr Ala Tyr 65 70 75 80 Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Gly Val Gly Tyr Arg Gly Val Ile Pro Leu Asn Trp Phe Asp 100 105 110 Pro Trp Gly Gln Gly Thr Val Val Thr Val Ser Ser 115 120 <210> 29 <211> 108 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 29 Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly 1 5 10 15 Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Asp 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln His Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Gly Ala Ser Thr Arg Ala Thr Gly Ile Pro Val Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Asn Asn Trp Pro Pro 85 90 95 Phe Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 30 <211> 122 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 30 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr 20 25 30 Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys His Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Lys Asp Ser Gly Tyr Asn Tyr Gly Tyr Ser Trp Phe Asp Pro Trp 100 105 110 Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 115 120 <210> 31 <211> 110 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 31 Ser Tyr Glu Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ser Pro Gly Gln 1 5 10 15 Thr Ala Arg Ile Thr Cys Ser Ala Asp Ala Leu Ala Lys Gln Tyr Ala 20 25 30 Tyr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Tyr 35 40 45 Lys Asp Ser Glu Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser 50 55 60 Ser Ser Gly Thr Thr Val Thr Leu Thr Ile Ser Gly Val Gln Ala Glu 65 70 75 80 Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Ser Thr Asp Asn Ser Gly Thr Tyr 85 90 95 Pro Asn Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu 100 105 110 <210> 32 <211> 126 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 32 Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu 1 5 10 15 Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Asn Tyr 20 25 30 Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile 35 40 45 Gly Tyr Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Asn Tyr Asn Pro Ser Leu Lys 50 55 60 Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser Leu 65 70 75 80 Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala 85 90 95 Arg Ser Ala Lys His Trp Leu Ala Pro Pro Gly Asp Tyr Tyr Tyr Tyr 100 105 110 Met Asp Val Trp Gly Lys Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser 115 120 125 <210> 33 <211> 106 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 33 Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Tyr 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Ala Ala Ser Thr Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Leu Asn Ser Tyr Leu Thr 85 90 95 Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 34 <211> 134 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 34 Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 1 5 10 15 Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr 20 25 30 Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met 35 40 45 Gly Val Ile Asn Pro Ser Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Glu Lys Phe 50 55 60 Arg Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr 65 70 75 80 Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Asp Arg Glu Pro His Ser Asp Ser Ser Gly Tyr Trp Asp Ser 100 105 110 Leu Lys Tyr Tyr Tyr Tyr Tyr Ala Leu Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr 115 120 125 Thr Val Thr Val Ser Ser 130 <210> 35 <211> 107 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 35 Ala Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Tyr 20 25 30 Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Glu Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Ala Ala Ser Thr Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Leu Asn Thr Tyr Pro Phe 85 90 95 Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys 100 105 <210> 36 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <220> <221> MOD_RES <222> (8)..(12) <223> Any amino acid <400> 36 Ile Cys Ala Ser Tyr Gln Thr Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Arg Arg Ala Arg 1 5 10 15 Ser Val Ala Ser Gln 20 <210> 37 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 37 Ile Cys Ala Ser Tyr Gln Thr Gln Thr Asn Ser Pro Arg Arg Ala Arg 1 5 10 15 Ser Val Ala Ser Gln 20 <210> 38 <211> 16 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 38 Ile Cys Ala Ser Tyr Gln Thr Arg Arg Ala Arg Ser Val Ala Ser Gln 1 5 10 15 <210> 39 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 39 Gln Thr Asn Ser Pro Arg Arg Ala Arg 1 5

Claims

조작된 항체 또는 이의 기능적 단편으로서, SARS-CoV-2 스파이크 단백질의 적어도 일부에 선택적으로 결합하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 이의 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 4와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 5와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 6과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 7과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 8과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 9와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 12와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 13과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 16과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 17과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 18과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 19와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 20과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 21과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 22와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 23과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 24와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 25와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 26과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 27과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 32와 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 33과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 4를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 5를 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 6을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 7을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 8을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 9를 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 12를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 13을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 16을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 17을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 18을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 19를 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 20을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 21을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 22를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 23을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 24를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 25를 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 26을 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 27을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 32를 포함하는 제1 아미노산 서열 및 서열 번호 33을 포함하는 제2 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 4의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 5의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 6의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 7의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 8의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 9의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 12의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 13의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 16의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 17의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 18의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 19의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 20의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 21의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 22의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 23의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 24의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 25의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 26의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 27의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항에 있어서, 상기 항체 또는 단편은 서열 번호 32의 상보성 결정 부위(CDR) 및 서열 번호 33의 상보성 결정 부위(CDR)를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항 내지 제34항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 야생형 SARS-CoV-2 WA1 스파이크 단백질인 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항 내지 제34항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 SARS-CoV-2 B.1.351 변이 스파이크 단백질인 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항 내지 제34항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질인 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항 내지 제34항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질인 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항 내지 제34항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항체는 SARS-CoV-2 바이러스를 중화시키는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항 내지 제34항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항체는 SARS-CoV-2 B.1.351 변이 바이러스를 중화시키는 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
제1항 내지 제34항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항체는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 바이러스인 것을 특징으로 하는 항체 또는 단편.
바이러스에 감염된 대상체를 치료하거나 대상체에서 바이러스 감염이 발생하는 것을 예방하기 위한 방법으로서, 상기 대상체에게 제1항 내지 제34항 중 어느 하나의 조작된 단일클론 항체를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 투여하는 단계를 포함하고, 상기 항체 또는 단편은 SARS-CoV-2 스파이크 단백질의 적어도 일부에 선택적으로 결합하는 것을 특징으로 하는 방법.
제42항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 야생형 SARS-CoV-2 WA1 스파이크 단백질인 것을 특징으로 하는 방법.
제42항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 SARS-CoV-2 B.1.351 변이 스파이크 단백질인 것을 특징으로 하는 방법.
제42항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질인 것을 특징으로 하는 방법.
제42항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 스파이크 단백질은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질인 것을 특징으로 하는 방법.
제42항에 있어서, 상기 항체는 SARS-CoV-2 바이러스를 중화시키는 것을 특징으로 하는 방법.
제42항에 있어서, 상기 항체는 SARS-CoV-2 B.1.351 변이 바이러스를 중화시키는 것을 특징으로 하는 방법.
제42항에 있어서, 상기 항체는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 바이러스를 중화시키는 것을 특징으로 하는 방법.
정제된 단백질로서, SARS-CoV-2 표면 단백질의 적어도 일부를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질.
제50항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 표면 단백질의 적어도 일부는 B.1.351.2-7 변이 표면 단백질인 것을 특징으로 하는 단백질.
제51항에 있어서, 상기 B.1.351.2-7 변이 표면 단백질은 스파이크 단백질(S)인 것을 특징으로 하는 단백질.
제52항에 있어서, 상기 스파이크 단백질은 서열 번호 1과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질.
제52항에 있어서, 상기 스파이크 단백질은 서열 번호 1을 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질.
합성 핵산 서열로서, SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 핵산.
제55항에 있어서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 상보적 데옥시리보핵산(cDNA)인 것을 특징으로 하는 핵산.
제55항에 있어서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 전령 리보핵산(mNA)인 것을 특징으로 하는 핵산.
제55항에 있어서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 것을 특징으로 하는 핵산.
제55항에 있어서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 것을 특징으로 하는 핵산.
약제학적 조성물로서, 서열 번호 1에 의해 정의되는 아미노산 서열에 의해 부호화된 정제된 스파이크 단백질 또는 그 일부 및 담체를 포함하고, 이를 필요로 하는 대상체에서 면역 반응을 유도하는 것을 특징으로 하는 약제학적 조성물.
약제학적 조성물로서,
(i) SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 뉴클레오티드 서열 또는 그 일부를 포함하는 합성 핵산 서열; 및
(ii) 담체를 포함하는 조성물.
제61항에 있어서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 상보적 데옥시리보핵산(cDNA)인 것을 특징으로 하는 조성물.
제61항에 있어서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 SARS-CoV-2 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 전령 리보핵산(mRNA)인 것을 특징으로 하는 조성물.
제61항에 있어서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1과 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 또는 95%의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 것을 특징으로 하는 조성물.
제61항에 있어서, 상기 핵산 서열은 서열 번호 1을 포함하는 B.1.351.2-7 변이 스파이크 단백질을 부호화하는 것을 특징으로 하는 조성물.
제61항 내지 제65항 중 어느 한 항에 있어서, 면역 증강제를 더 포함하는 조성물.
이를 필요로 하는 대상체에서 면역 반응을 유도하는 방법으로서, 청구항 61 내지 62 중 어느 하나의 조성물을 상기 대상체에게 투여하는 단계를 포함하는 방법.
제67항에 있어서, 상기 대상체는 SARS-CoV-2 바이러스에 감염될 위험이 있는 것을 특징으로 하는 방법.
제68항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 바이러스는 WA1 변이주인 것을 특징으로 하는 방법.
제68항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 바이러스는B.1.351 변이주인 것을 특징으로 하는 방법.
제68항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 바이러스는 B.1.351.2-7 변이주인 것을 특징으로 하는 방법.
제67항에 있어서, 상기 방법은 조성물을 투여하는 프라임-부스트 요법을 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
제69항에 있어서, 상기 프라임 및 상기 부스트는 동일한 조성물을 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
제69항에 있어서, 상기 프라임 및 상기 부스트는 상이한 조성물을 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.