KR20230138451A - 스핀필터를 사용하여 배양물의 배양 배지를 교환하는방법 - Google Patents

스핀필터를 사용하여 배양물의 배양 배지를 교환하는방법 Download PDF

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KR20230138451A
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율리아 훕펠트
율리아 ?g펠트
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사토리우스 스테딤 바이오테크 게엠베하
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Abstract

본 발명은 현탁 배양 교환 배양 배지에서 세포 응집체로서 배양된 줄기 세포를 확장시키는 방법, 및 스핀필터 장치와 같은 회전 메쉬를 사용하는 것을 특징으로 하는 이러한 세포의 배지 교환 방법에 관한 것이다. 본 발명은 또한 줄기 세포의 현탁 배양에서 배지 교환을 위한 회전 메쉬의 용도에 관한 것이다.

Description

스핀필터를 사용하여 배양물의 배양 배지를 교환하는 방법
관련 출원의 상호 참조
본 출원은 2021년 1월 21일에 출원된 유럽 특허 출원 제21 152 729.6호의 우선권의 이익을 주장하고, 그 내용은 모든 목적을 위해 본원에 전체가 참조에 의해 도입되어 있다.
발명의 기술 분야
본 개시는 현탁 배양 교환 배양 배지에서 세포 응집체로서 배양된 줄기 세포를 확장시키는 방법 및 스핀필터 장치(spinfilter device)와 같은 회전 메쉬(rotating mesh)의 사용을 특징으로 하는 배지 교환 방법에 관한 것이다. 본 개시는 추가로 줄기 세포의 현탁 배양에서 배지 교환을 위한 회전 메쉬의 용도에 관한 것이다.
대량의 세포에 대한 수요가 적은 기초 연구에서, PSC, iPSC 및 iPSC-유래 세포는 부착 세포 배양으로서 통상적으로 배양된다. 여기서, 세포는 배양 접시의 표면에 부착되고, 콜로니(colony) 또는 단층으로 성장한다. 그러나, iPSC의 부착 세포 배양은 임상 적용에 필요한 대량의 세포를 생성하는 데 적합하지 않다. 이는 재료- 및 노동-집약적이기 때문이다. 추가로, 일반적으로 프로세스(process)가 자동화되지 않고 모니터링 및 제어가 불충분하기 때문에, 세포 생산의 결과 및 품질은 작업자에 따라 크게 달라진다.
생물반응기 시스템의 사용은 대량의 PSC, iPSC 및 iPSC-유래 세포를 생산할 수 있는 것으로 보고되었다[참조: Kropp et al., 2017]. 이러한 시스템에서, iPSC 및 iPSC-유래 세포는 일반적으로 접시의 표면에 부착되지 않고 자유-부유 현탁액에서 성장되는데, 이는 PSC가 현탁액에서 배양되는 경우에 응집체를 형성하기 때문이다. 생물반응기 시스템에서의 현탁 배양은 세포 수가 많더라도 배양을 모니터링, 제어 및 자동화할 수 있고 필요한 재료 및 작업량이 적기 때문에 부착 배양보다 더 효율적인 것으로 기재되어 있다. 중요한 것은, 이러한 이유로, GMP-조절된 적용에서는 고정 배양보다 생물반응기 시스템을 사용하는 것이 바람직하다. PSC의 현탁 배양을 위해 상이한 생물반응기 시스템이 보고되었고, 교반 탱크 반응기(STR) 시스템이 최상의 기재된 시스템이다. STR 시스템에서 다수의 iPSC 및 iPSC-CM을 성공적으로 생성할 수 있는 것으로 밝혀졌다[참조: Chen et al., 2012; Halloin et al., 2019; Hemmi et al., 2014; Jiang et al., 2019; Kempf et al., 2015; Kropp et al., 2016].
대규모 PSC, iPSC 및 iPSC-CM 생산을 위한 생물반응기 시스템의 이점에도 불구하고, 현탁 배양은 몇 가지 새로운 과제를 야기한다. 예를 들면, 현탁 배양에서 배양 배지의 교환은 부착 세포 배양보다 더 정교한다. 세포 손실을 방지하기 위해 사용된 배지를 제거하는 동안 PSC를 배양에 유지해야 하기 때문이다. 반복 배치 공급 전략은 종종 배지 교환을 위한 STR에 기재되어 있다[참조: Kropp et al., 2017]. 여기서, 교반이 중단되고, 세포 응집체가 용기의 바닥에 침전한다. 그 후, 침전된 응집체를 방해하지 않고서 배지를 폐기한다. 신선한 배지를 추가하고, 교반을 계속한다. 이 전략은 침전된 응집체의 융합 및 이에 의해 iPSC의 자발적 분화를 유발할 수 있다. 응집체 융합의 정도는 진탕하지 않은 기간에 따라 달라진다. 특히, 대규모 시스템에서, 반복적 배치 공급 전략은, 용기의 높이에 따라 침전 시간이 증가하고 더 큰 용적의 배지를 교환하는 데 더 많은 시간이 걸릴 수 있기 때문에 융합된 응집체의 양이 많아질 가능성이 높다. 추가로, 대량의 배지의 1회 교환은 pH, 산소 농도, 대사산물, 영양소 및 신호전달 인자의 농도와 같은 배양 파라미터의 급격한 변화를 유발한다. 이는 PSC에 추가 스트레스를 유발하여 증식을 감소시킬 수 있다.
따라서, 줄기 세포를 포함하는 현탁 배양의 배양 배지를 변경하거나 세포를 확장하는 방법, 특히 세포 또는 응집체를 시스템으로부터 제거하지 않고 세포를 침전 및/또는 원심분리와 관련된 스트레스에 장시간 노출시키지 않고서 전체 프로세스를 수행할 수 있는 방법이 여전히 필요하다. 본 발명은 이러한 필요성을 해결하기 위한 것이다.
발명의 요약
이 과제는 청구범위에 정의된 주제에 의해 해결된다. 본원에는 줄기 세포가 현탁 배양에서 세포 응집체에 포함되어 있는 줄기 세포의 확장 방법, 현탁 배양의 배양 배지의 교환 방법, 배양 배지에 현탁된 줄기 세포의 세포 응집체를 포함하는 현탁 배양, 및 배양 배지에 현탁된 세포 응집체를 포함하는 현탁 배양에서 배지 교환을 위한 본원에 정의된 회전 메쉬의 용도가 제시되어 있다.
따라서, 본 발명은 줄기 세포의 확장 방법에 관한 것이며, 상기 줄기 세포는 현탁 배양에서 세포 응집체에 포함되고, 상기 방법은
(i) 줄기 세포의 증식을 가능하게 하는 조건하에 줄기 세포를 배양하는 단계; 및
(ii) 회전 메쉬를 통한 관류에 의해 배지 교환을 수행하는 단계
를 포함한다.
본 발명은 추가로 현탁 배양의 배양 배지를 교환하는 방법에 관한 것이고, 상기 현탁 배양은 배양 배지에 현탁된 다능성(pluripotent) 줄기 세포의 세포 응집체를 포함하고, 상기 방법은
(i) 회전 메쉬를 통한 관류에 의해 배지 교환을 수행하는 단계; 및
(ii) 임의로, 회전 메쉬를 통해 제거된 배지를 신선한 배지로 교환하는 단계
를 포함한다.
본 발명은 추가로 현탁 배양에서 배지 교환을 위한 본원에 정의된 회전 메쉬의 용도에 관한 것이고, 상기 현탁 배양은 배양 배지에 현탁된 세포 응집체를 포함하고, 상기 세포는 줄기 세포이다.
세포는 생물반응기에서 배양될 수 있으며, 생물반응기는 바람직하게는 교반 생물반응기, 로킹 모션 생물반응기 및/또는 다중 병렬 생물반응기이다.
배지 교환은 생물반응기 내부에서 수행할 수 있다.
회전 메쉬는 스핀-필터일 수 있고, 임의로 스핀-필터는 생물반응기의 교반기 또는 교반봉(stirring rod)에 부착될 수 있다.
배지 교환은 생물반응기 외부에서 수행될 수 있고, 바람직하게는 회전 메쉬를 수용하는 장치는 생물반응기와 유체적으로 결합되어 폐쇄 시스템을 형성한다.
회전 메쉬는 약 1㎛ 내지 약 50㎛, 약 5㎛ 내지 약 50㎛, 약 10㎛ 내지 약 50㎛, 약 5㎛ 내지 약 40㎛, 약 5㎛ 내지 약 30㎛, 약 5㎛ 내지 약 20㎛, 또는 약 5㎛ 내지 약 15㎛, 바람직하게는 약 10㎛의 기공 크기(pore size)를 가질 수 있다.
세포 응집체는 약 50 내지 약 300㎛, 약 80 내지 약 250㎛, 약 100 내지 약 220㎛ 또는 약 100㎛ 내지 약 200㎛의 평균 직경을 가질 수 있다.
줄기 세포는 다능성 줄기 세포, 제대혈 줄기 세포, 중간엽 줄기 세포 및/또는 조혈 줄기 세포; 및/또는 줄기 세포로부터 유래한 세포일 수 있다. 다능성 줄기 세포는 바람직하게는 유도 다능성 줄기 세포(iPSC), 배아 줄기 세포(ESC), 단위생식 줄기 세포(pPSC) 또는 핵 전달 유래 PSC(ntPSC), 가장 바람직하게는 iPSC이다. 줄기 세포는 바람직하게는 TC-1133, 깁코의 인간 에피솜 iPSC 라인 ATCC ACS-1004, ATCC ACS-1021, ATCC ACS-1025, ATCC ACS-1027, ATCC ACS-1030으로 이루어진 그룹으로부터 선택된다.
본 발명은 비제한적 실시예 및 첨부된 도면과 함께 고려할 때에 상세한 설명을 참조하여 더 잘 이해될 것이다:
1는, 세포 유지 장치로서 회전 메쉬(여기서는 예시적으로 스핀-필터)를 사용하여 흡인한 iPSC 현탁 배양 및 폐기된 배지의 광학 현미경 이미지를 나타낸다. 도 1A은 계대(passage) 0의 현탁 배양의 샘플을 나타내고, 도 1B은 동일한 계대의 폐기된 배지의 샘플을 나타낸다. 도 1C는 계대 1의 응집체 현탁 배양의 샘플을 나타내고, 여기서 응집체는 다양한 치수를 나타내며, 도 1D는 효율적 필터 능력을 입증하는 동일한 계대의 폐기된 배지의 샘플을 나타낸다. 스케일 바: 400㎛.
도 2는 회전 메쉬로 관류된 2개의 상이한 UniVessel 크기(0.5L 및 2L)에서 다양한 배양 일수에 따른 PSC 세포 응집체의 응집체 크기를 나타낸다.
도 3은 회전 메쉬로 관류된 UniVessel 2L(용기 2)에서 배양된 계대 0의 4일차의 iPSC에서 다능성-관련 유전자의 발현을 나타낸다.
도 4는 회전 메쉬로 관류된 UniVessel 0.5L(용기 3)에서 배양된 계대 0의 4일차의 iPSC에서 다능성-관련 유전자의 발현을 나타낸다.
본 발명은 이하에서 상세히 설명되며, 첨부된 실시예 및 도면에 의해 추가로 상세히 설명될 것이다.
생물반응기에서 현탁 배양, 특히 줄기 세포 응집체의 현탁 배양의 자동화 배지 교환은 여전히 과제로 남아 있다. 수동 배지 교환은 통상 생물반응기로부터 현탁 배양의 적어도 일부를 이동시키는 것을 수반하고, 예를 들면, 세포의 원심분리를 포함한다. 이러한 기계적 자극은 줄기 세포의 원치 않는 분화와 같은 세포 생존력 또는 기능에 악영향을 미칠 수 있다[참조: Lipsitz et al. 2018]. 생물반응기에서 현탁 배양의 자동화 배지 교환("용기 침전")의 하나의 추가의 가능성은 교반을 중단하여 세포를 생물반응기 바닥에 침전시키는 것이다. 이어서, 상청액을 흡인하고, 신선한 배지로 교체할 수 있다. 그러나, 이 방법은 세포의 기계적 자극을 유도하고, 이는 불규칙한 성장과 다능성의 상실을 유도할 수 있다. 이러한 문제는 본 발명의 방법에 의해 극복된다:
스핀필터 세포 유지 장치와 같은 회전 메쉬의 사용은 세포 배양에 대한 간섭을 최소화하면서 관류 배지 교환을 가능하게 하고, 이는 특히 GMP-가이드 프로세스에 바람직하다. 사용된 배지는, 놀랍게도, 줄기 세포를 전혀 방해하지 않고서, 배양 용기에서 직접 줄기 세포 응집체로부터 분리될 수 있다. 이와 대조적으로, 다른 세포 유지 장치의 적용은 종종 세포 현탁액을 배양 용기 외부로 옮길 필요가 있다. 배양 용기로부터 이러한 제거는 전단 응력의 증가, 응집체의 융합 및 단기적 세포 환경의 변화로 인해 줄기 세포 품질의 저하를 초래할 수 있다. 추가로, 외부 장치를 조작할 필요가 있고, 프로세스 중의 추가 오류의 원인이 될 수 있다. 세포 유지 장치로서 마이크로스파저의 적용이 설명되었고, 상기 설명한 것과 유사한 이점이 제안되었다. 그러나, 마이크로스파저는 세포 유지 장치로서 적용하도록 설계되지 않았고, 용이하게 막혀 현탁 배양의 실패를 유발할 수 있다. 이는 마이크로스파저의 표면이 작고 필터가 흡인 튜브의 바로 앞에 위치하기 때문이다. 추가로, 현탁 배양의 응집체는, 일단 흡인되면, 정적 마이크로스파저에 적극적으로 부착될 수 있다. 반면에, 스핀 필터는, 표면적이 넓기 때문에, 막힐 위험이 거의 없다. 스핀필터 장치의 회전 운동은 막힘의 위험을 추가로 감소시킨다.
실시예 1과 실시예 2에서 볼 수 있는 바와 같이, 세포 유지 장치로서 회전 메쉬의 적용은 다능성 줄기 세포의 세포 응집체를 완벽한 형태로 유지하면서 동시에 파편과 죽은 세포를 용이하게 제거할 수 있다. 상기 기재한 바와 같이 줄기 세포가 전단 응력에 민감하기 때문에, 줄기 세포 응집체도 줄기 세포를 손상시키지 않고서 배지 교환용 회전 메쉬를 사용하여 관류 현탁 배양에서 배양할 수 있다는 것은 놀라운 것이었다.
따라서, 본 발명은 줄기 세포의 확장 방법에 관한 것이고, 여기서 상기 줄기 세포는 현탁 배양에서 세포 응집체에 포함되고, 상기 방법은
(i) 줄기 세포의 증식을 가능하게 하는 조건하에 줄기 세포를 배양하는 단계; 및
(ii) 회전 메쉬를 통한 관류에 의해 배지 교환을 수행하는 단계
를 포함한다.
본 발명은 추가로 현탁 배양의 배양 배지를 교환하는 방법에 관한 것이고, 여기서 상기 현탁 배양은 배양 배지에 현탁된 줄기 세포의 세포 응집체를 포함하고, 상기 방법은
(i) 회전 메쉬를 통한 관류에 의해 배지 교환을 수행하는 단계; 및
(ii) 임의로, 회전 메쉬를 통해 제거된 배지를 신선한 배지로 교환하는 단계
를 포함한다.
관류는 특정 시스템에 의해 세포를 용기에 유지하면서 반응기로부터 신선한 배지로 배지를 연속적으로 교환하는 것을 특징으로 한다. 관류는 바이오의약품의 생산 프로세스에서 최고의 세포 밀도 및 생산성을 가능하게 하는 조작 모드이다. 관류에서 세포는 신선한 영양소와 성장 인자를 지속적으로 공급시킨다는 이점 외에도 잠재적으로 독성이 있는 폐기물을 세정하여 반응기에서 보다 균질한 상태로 유지된다는 이점이 있다. 또한, 반복 배치 프로세스와 비교하여, 관류 프로세스는 프로세스 자동화를 지원하고, DO(용존 산소), pH, 영양소 농도 등의 배양 환경의 피드백 제어를 개선한다. 관류 배양은 비교적 안정한 생리적 환경을 실현할 수 있고, 내인성 인자 분비에 의한 PSC의 자가 조절 능력을 지원하며, 따라서 최종적으로 고가의 배지 성분의 보충을 감소시킬 수 있다. 요약하면, 관류 배양은 세포의 수율과 품질의 향상을 유도한다.
본원에서 사용되는 "회전 메쉬"는 세포 유지 장치와 관련된다. 회전 메쉬는 죽은 세포와 같은 파편을 포함한 사용된 배지로부터의 유출을 가능하게 하지만 세포 응집체를 배양 용기에 유지하는 개구부가 존재하는 것을 특징으로 한다. 이것이 관류 배양의 원리이기도 하다. 따라서, "사용된" 배지는 생물반응기로부터 유출할 수 있다. 유출은 배지의 유입, 바람직하게는 유출과 실질적으로 동등한 속도로 유입에 의해 보상될 수 있고, 이에 의해 현탁 배양에 대한 최적 성장 조건을 장기간 유지할 수 있다. 회전 메쉬는 종종 원통 형태이고, 통상은 측면뿐만 아니라 때로는 상부 및/또는 하부에도 개구부가 있다. 회전 메쉬는 생물반응기의 교반기 또는 교반봉에 부착될 수 있다. 본원에 기재된 회전 메쉬의 한 가지 예는 스핀필터이다. 회전 메쉬는 플라스틱 또는 금속 등의 임의의 적절한 재료로 제조될 수 있다. 바람직하게는, 회전 메쉬는 스테인리스 강으로 제조된다. 회전 메쉬는 바람직하게는 오토클레이브가 가능하지만, (사전 멸균된) 1회용의 회전 메쉬의 형태로 제공될 수도 있다.
회전 메쉬에 의해, 배양 용기는 배양 배지에 현탁된 세포 응집체를 포함하는 "내부" 구획과 "외부" 구획의 2개의 구획으로 구분된다. 교반기 상에 회전 메쉬를 배치한 생물반응기에서, "외부"는, 회전 메쉬의 내부 구획으로, 이로부터 사용한 배지가 제거되는 구획이고, "내부" 구획은 회전 메쉬 외부에 있는 배양 용기의 부분을 의미한다. 내부 구획은, 유리하게는, 사용한 배지의 유출을 가능하게 하도록 설계된다. 예시적 회전 메쉬에는 스핀필터가 포함된다. 스핀필터는 당업자에게 공지되어 있고, 예를 들면, WO 제92/05242호에 기재되어 있다. 회전 메쉬는 생물반응기의 임펠러(impeller)에 장착될 수 있다. 이 경우, 회전 메쉬는 생물반응기의 임펠러와 동일한 회전 속도를 갖는다. 당업자라면, 줄기 세포의 성장과 회전 메쉬를 통한 배양 배지의 관류 모두에 적합한 적절한 회전 속도를 결정할 수 있다. 전형적 임펠러 회전 속도는 85 내지 140rpm이다.
회전 메쉬의 기공 크기는 바람직하게는 세포 응집체의 유지를 가능하게 하면서, 동시에 (세포) 파편을 포함한 사용된 배양 배지가 회전 메쉬를 통과하거나 "관류"할 수 있도록 선택된다. 최적의 기공 크기는 배양되는 세포 유형에 따라 상이할 수 있다. 일부 예에서, 회전 메쉬는 약 1㎛ 내지 약 50㎛, 약 5㎛ 내지 약 50㎛, 약 10㎛ 내지 약 50㎛, 약 5㎛ 내지 약 40㎛, 약 5㎛ 내지 약 30㎛, 약 5㎛ 내지 약 20㎛ 또는 약 5㎛ 내지 약 15㎛, 바람직하게는 약 10㎛의 기공 크기를 가질 수 있다. 이러한 맥락에서, 줄기 세포의 현탁 배양을 시작할 때(예를 들면, 생물반응기 내), 세포는 단일 세포로서 존재하거나, 회전 메쉬에 의해 유지되지 않는 작은 세포 응집체만 존재할 수 있다는 것은 유의할 필요가 있다. 초기 성장 단계에서는, 영양소의 수요가 여전히 낮기 때문에, 세포 응집체가 회전 메쉬에 의해 현탁 배양에 유지되는 크기에 도달하기 전에 줄기 세포가 손실되는 것을 방지하기 위해, 회전 메쉬를 통과하여 생물반응기 등의 배양 장치로부터 유출하는 임의의 액체 유동을 개시하지 않는 것이 바람직할 수 있다.
본원에서 사용되는 "현탁 배양"이라는 용어는 세포 배양의 일종이고, 단일 세포 또는 세포의 작은 응집체가 바람직하게는 교반된 성장 배지에서 기능하고 증식할 수 있고, 따라서 현탁액을 형성한다(화학에서의 정의 참조: "액체 중에 현탁된 작은 고체 입자"). 이는 세포가 세포외 매트릭스(ECM)의 단백질로 코팅될 수 있는 세포 배양 용기에 부착되는 부착 배양과는 대조적이다. 현탁 배양에서, 일 실시형태에서, ECM의 단백질은 세포 및/또는 배양 배지에 첨가되지 않는다. 현탁 배양은 바람직하게는 비드, 마이크로스피어, 마이크로캐리어 입자 등의 고체 입자를 실질적으로 포함하지 않고; 세포 또는 세포 응집체는 이러한 맥락에서 고체 입자가 아니다. 일 실시형태에서, 세포는 마이크로캐리어(현탁) 배양에서는 없다.
본원에서 사용되는 "확장" 또는 "세포 확장" 및 또한 "세포 증식"은 세포 성장 및 세포 분열의 결과로서의 세포 수의 증가와 관련이 있다.
본 발명의 방법에서, 줄기 세포를 확장하는 방법 또는 현탁 배양의 배양 배지를 교환하는 방법에서, 세포는 생물반응기(달리 말하면, 배양 용기는 생물반응기일 수 있음)에서 배양될 수 있으며, 여기서 생물반응기는 바람직하게는 교반 생물반응기, 로킹 모션 생물반응기 및/또는 다중 병렬 생물반응기이다. 본원에서 사용되는 바와 같이, "반응기" 및 "생물반응기"라는 용어는 호환적으로 사용될 수 있으며, 세포 배양을 위한 동적 유체 환경을 제공하도록 구성된 폐쇄 배양 용기를 지칭한다. 생물반응기는 교반 및/또는 진탕될 수 있다. 진탕 반응기의 예에는 교반 탱크 생물반응기, 파동 혼합/로킹 생물반응기, 상하 진탕 생물반응기(즉, 피스톤 작용을 포함하는 진탕 반응기), 스피너 플라스크, 셰이커 플라스크, 진탕 생물반응기, 패들 믹서, 수직 휠 생물반응기가 포함되지만 이들로 한정되지 않는다. 진탕 반응기는 약 2mL 내지 20,000L의 세포 배양 용적을 수용하도록 구성될 수 있다. 바람직한 생물반응기는 최대 50L의 용적을 가질 수 있다. 본 발명의 방법에 적합한 예시적 생물반응기는 사토리우스 스테딤 바이오테크(Sartorius Stedim Biotech)로부터 입수할 수 있는 유니베셀 생물반응기(UniVessel bioreactor)이다. 생물반응기는 스테인리스 강 또는 일회용 생물반응기일 수 있다. 생물반응기는 단일 용기로 구성되거나, 복수의 생물반응기를 병렬로 구성할 수 있다. 일회용 생물반응기는 유리 또는 플라스틱으로 제조할 수 있다. 일회용 생물반응기는 교반 탱크 생물반응기 또는 로킹 모션 생물반응기일 수 있다. 예: Sartorius STR, RM, UniVessel. 배양 배지의 pH는 생물반응기에 의해 제어될 수 있고, 바람직하게는 CO2 공급에 의해 제어될 수 있으며, 6.6 내지 7.6 범위, 바람직하게는 약 7.4로 유지될 수 있다.
생물반응기는 교반 생물반응기(STR)일 수 있다. 예를 들면, STR은 사토리우스 스테딤 바이오테크로부터 입수가능하며, 바이오스탯® A/B/B-DCU/Cplus/D-DCU를 포함하지만 이들로 한정되지 않는다. 생물반응기는 로킹 모션 생물반응기(RM)일 수 있다. 예를 들면, RM은 사토리우스 스테딤 바이오테크로부터 입수가능하며, BIOSTAT® RM 및 BIOSTAT® RM TX를 포함하지만 이들로 한정되지 않는다. 생물반응기는 이하와 같이 다중 병렬 생물반응기일 수 있다.
일부 실시형태에서, 생물반응기 내의 배양 용기의 용적은 약 50mL 내지 약 20,000L이다. 일부 실시형태에서, 생물반응기 내의 배양 용기의 용적은 약 50mL 내지 약 2,000L이다. 일부 실시형태에서, 생물반응기 내의 배양 용기의 용적은 약 50mL 내지 약 200L이다. 일부 실시형태에서, 생물반응기 내의 배양 용기의 용적은 약 50mL 내지 약 100L이다. 일부 실시형태에서, 생물반응기 내의 배양 용기의 용적은 약 50mL 내지 약 50L이다. 일부 실시형태에서, 생물반응기 내의 배양 용기의 용적은 약 50mL 내지 약 20L이다. 일부 실시형태에서, 생물반응기 내의 배양 용기의 용적은 약 50mL 내지 약 10L이다. 일부 실시형태에서, 생물반응기 내의 배양 용기의 용적은 약 50mL 내지 약 1L이다. 일부 실시형태에서, 생물반응기 내의 배양 용기의 용적은 약 100mL 내지 약 10L이다. 일부 실시형태에서, 생물반응기 내의 배양 용기의 용적은 약 100mL 내지 약 5L이다. 일부 실시형태에서, 생물반응기 내의 배양 용기의 용적은 약 150mL 내지 약 1L이다. 일부 실시형태에서, 생물반응기 내의 배양 용기의 용적은 약 1L 내지 약 1,000L이다.
본 발명의 한 가지 이점은 세포를 폐쇄된 시스템에서 성장시킬 수 있다는 것, 즉 수동 상호작용 또는 배양 배지 외부에서의 세포의 임의의 상호작용 또는 조작이 불필요하다는 것이다. 따라서, 배지 교환은 배양 용기 또는 생물반응기 내부에서 실시할 수 있다. 따라서, 배양 용기/생물반응기 내에서, 연속적 배지 교환을 수행하면서, 세포 응집체를 현탁 배양 상태로 유지할 수 있으며, 현탁 배양과의 수동 상호작용을 최소화하거나 회피할 수 있다.
그러나, 배지 교환은 배양 용기(생물반응기) 외부에서 수행되고, 인간 상호작용의 필요 없이 폐쇄 시스템이 사용될 수도 있다. 이 경우, 회전 메쉬는 생물반응기 외부에 있는 장치 하우징에 배치된다. 생물반응기의 출구 중 하나는 장치 하우징의 "내부" 섹션에 결합되어 세포 응집체를 포함하는 현탁 배양물의 장치 하우징으로의 액체 유동을 가능하게 한다. 또한, 장치 하우징의 "내부" 섹션으로부터의 1개의 출구는 (생물반응기의) 배양 용기에 결합된다. 사용한 배지는 회전 메쉬를 통해 관류되고, 별도의 출구로부터 폐기된다. 폐기된 배지는 장치 하우징 내 또는 생물반응기 내에서 신선한 배지로 교환할 수 있다. 따라서, 배지 교환은 생물반응기 외부에서 수행될 수 있고, 바람직하게는 회전 메쉬를 수용하는 장치가 생물반응기와 유체적으로 결합하여 폐쇄 시스템을 형성한다.
본원에서 사용되는 "성장 배지", "배양 배지" 또는 단순히 "배지"는 미생물, 세포 또는 소형 식물의 성장을 지원하도록 설계된 액체이다. 상이한 유형의 배지는 상이한 유형의 세포를 성장시키기 위해 사용된다. 당업자라면, 어느 배양 배지가 특정 세포 유형에 가장 적합한지를 결정할 수 있다. 현탁(생물반응기에서) 배양된 줄기 세포는 배양 배지에서 배양된다. 줄기 세포의 확장을 가능하게 하는 배양 배지, 즉. "줄기 세포의 증식을 가능하게 하는 조건"중 일부를 정의하는 배양 배지는 당업자에게 공지되어 있고, IPS-Brew, iPS-Brew XF, E8, StemFlex, mTeSR1, PluriSTEM, StemMACS, TeSRTM2, 코닝(Corning) NutriStem hPSC XF 배지, Essential 8 배지(ThermoFisher Scientific), StemFit Basic02(Ajinomoto Co. Inc) 등이 포함되지만 이들로 한정되지 않는다. 한 가지 예시적 예에서, 배양 배지는 독일 밀테니 바이오테크(Miltenyi Biotec)으로부터 GMP 등급으로 입수가능한 IPS-Brew이다. 줄기 세포의 확장에 적합한 조건인지 여부를 결정하는 또 다른 조건에는 온도가 포함된다. 따라서, 배양 배지의 온도는 약 30 내지 약 50℃, 약 30 내지 약 43℃, 약 35 내지 약 40℃, 약 36 내지 약 38℃, 약 30 내지 약 37℃, 약 32 내지 약 36℃, 또는 약 37℃, 바람직하게는 37℃이다. 줄기 세포의 증식을 가능하게 하는 추가 조건에는 배지의 pH, 산소 공급 및/또는 교반 속도가 포함될 수 있다.
본원에 개시된 배양 배지 교환 방법은 사용된 배지를 동일한 (종류의) 배지로 교환하기 위해 사용될 수 있고, 예를 들면, 유도성 프로모터의 제어하에 목적 단백질의 분화 또는 발현을 유도하기 위해, 상이한 배지로 배지 교환을 수행하기 위해 사용될 수도 있다.
본원에 설명된 바와 같이, 현탁 배양 중의 세포는 바람직하게는 침전되지 않고, 배양 배지 중에 분포한다. 따라서, 현탁 배양은 바람직하게는 교반된다. 연속적 교반은 배양 배지/현탁 배양물 중의 세포의 본질적으로 균질한 분포를 유도할 수 있고, 줄기 세포, 특히 iPSC 등의 PSC가 다능성을 유지하는 것을 보조할 가능성이 있다. 따라서, 세포는 바람직하게는 배양 배지 중에 본질적으로 균질하게 분포되어 있다.
본 발명의 방법은, 일반적으로, 세포 배양에서 배양될 수 있는 임의의 세포, 즉 부착 세포 배양에도 사용될 수 있다. 유리하게는, 본 방법은 배양 배지로부터 세포의 분리가 본질인 현탁 배양의 배양 배지를 교환하기 위해 사용된다. 본 문맥에서, "배양 배지 중에 현탁된"은, 실제로 현탁 세포인지 여부에 관계없이, 현탁 상태로 배양되는 세포를 지칭한다. 따라서, 본 발명의 방법은, 배양 배지에 현탁되어 있는 세포라면, 부착 세포에도 사용될 수 있다. 따라서, 세포는 현탁액에서 배양되는 부착 세포일 수 있다.
현탁액에서 배양된, 즉 배양 용기에 부착할 수 없는 부착 세포는 세포 응집체를 형성할 수 있다. 이는 본원에 기재된 용도 및 방법에서 배양된 줄기 세포에도 적용된다. 본원에서 사용되는 바와 같이, "응집체" 및 "세포 응집체"라는 용어는 호환적으로 사용될 수 있고, (유도) 다능성 줄기 세포 등의 복수의 세포를 지칭하며, 세포 사이의 연관성이 세포-세포 상호작용(예를 들면, 서로에 대한 생물학적 부착에 의해)에 의해 유발된다. 생물학적 부착은, 예를 들면, 인테그린, 면역글로불린, 카드헤린, 셀렉틴 또는 기타 세포 부착 분자와 같은 표면 단백질을 통해 이루어질 수 있다. 예를 들면, 세포는 현탁액 중에서 자발적으로 회합하고, 세포-세포 부착물(예를 들면, 자가 조립)을 형성하고, 이에 의해 응집체를 형성할 수 있다. 일부 실시형태에서, 세포 응집체는 실질적으로 균질할 수 있다(즉, 대부분 동일한 유형의 세포를 포함함). 다른 실시형태에서, 세포 응집체는 이종성일 수 있다(즉, 하나 이상의 유형의 세포를 포함함).
본 발명의 방법은 세포 응집체에 적합하다. 세포 응집체는 크기가 다양할 수 있다. 줄기 세포의 경우, 세포는 세포 응집체를 형성하며, 이의 평균 직경은 일반적으로 파종 1일 후에 약 100㎛와 같이 약 50 내지 약 150㎛(또한 실시예 2 참조)이다. 따라서, 초기 평균 직경은 바람직하게는 약 50 내지 약 150㎛, 더 바람직하게는 약 100㎛이다. 4일 후, 세포 응집체는 통상 약 200 내지 약 220㎛의 평균 직경을 갖는다(또한 실시예 2 참조). 따라서, 세포 응집체의 최종 평균 직경은 바람직하게는 약 200 내지 약 200 ㎛이다. 이 직경에서, 줄기 세포 응집체는 이상적으로 해리되는데, 직경이 약 300㎛를 초과하면, 조직/응집체 중심으로의 영양소 및 가스 확산이 제한되기 때문에, 세포 괴사가 발생할 수 있다. 최종적으로, 특히 큰 줄기 세포 응집체에서, 제어되지 않은 분화가 발생할 수도 있다. 따라서, 세포 응집체는 바람직하게는 약 180 내지 약 250㎛, 바람직하게는 약 200 내지 약 220㎛, 이상적으로는 약 200㎛의 평균 직경을 갖는 경우에 해리된다. 따라서, 세포 응집체는 약 50 내지 약 300㎛, 약 80 내지 약 250㎛, 약 100 내지 약 220㎛ 또는 약 100㎛ 내지 약 200㎛ 사이의 평균 직경을 가질 수 있다. 바람직하게는, 세포 응집체의 평균 직경은 약 50㎛ 내지 약 220㎛ 사이, 더 바람직하게는 약 100㎛ 내지 약 200㎛ 사이이다. 세포 응집체는 약 50 내지 800㎛, 약 150 내지 800㎛, 적어도 약 800㎛, 적어도 약 600㎛, 적어도 약 500㎛, 적어도 약 400㎛, 적어도 약 300㎛, 적어도 약 200㎛, 적어도 약 150㎛, 약 300 내지 500㎛, 약 150 내지 300㎛, 약 50 내지 150㎛, 약 80 내지 100㎛, 약 180 내지 250㎛ 또는 약 200 내지 250㎛ 사이의 평균 직경을 가질 수 있다.
세포는 현탁액 중에서 배양할 수 있는 모든 세포일 수 있고, 바람직하게는 세포는 줄기 세포이다. 다세포 생물에서, 줄기 세포는, 다양한 유형의 세포로 분화할 수 있고 무한으로 증식하여 동일한 줄기 세포를 추가로 생산할 수 있는 미분화 또는 부분적으로 분화된 세포이다. 통상, 무한으로 분열할 수 없는 전구세포, 및 통상 1개의 세포 유형으로 분화하기 위해 전념하는 전구세포 또는 블라스트 세포와 구별된다. 따라서, 줄기 세포라는 용어에는 다능성 줄기 세포뿐만 아니라, 다능성(다수의 세포 유형으로 분화할 수 있지만, 밀접하게 관련된 세포 패밀리의 세포로만 분화), 진능성 줄기 세포(림프계 또는 골수계 줄기 세포 등의 소수의 세포 유형으로만 분화) 또는 위성 세포 등의 일능성 줄기 세포도 포함된다.  줄기 세포의 예에는 다능성 줄기 세포, 제대혈 줄기 세포, 중간엽 줄기 세포 및/또는 조혈 줄기 세포, 바람직하게는 다능성 줄기 세포가 포함되지만, 이들로 한정되지 않는다. 특히 바람직한 것은, 유도 다능성 줄기 세포(iPSC)이다. 본 발명의 맥락에서, 줄기 세포는 또한 줄기 세포로부터 유래된 세포, 특히 (i) PSC로부터 유래된 세포와 관련될 수 있다. "줄기 세포로부터 유래된 세포"는 분화된 세포 또는 특정 세포 유형으로 분화된 세포로서, 더 이상 신체의 임의의 세포 유형으로 분화할 수 없는 세포와 관련된다. 상기 줄기 세포로부터 유래된 세포는 본 발명의 방법 및 용도에 사용되는 (다능성) 줄기 세포로부터 유래된 세포와 관련되며, 따라서 바람직하게는 자연적으로 발생하는 분화 세포를 포함하지 않는다. PSC와 같은 줄기 세포로부터 출발하여 상이한 세포 유형으로 분화시키는 방법은 당업자에게 공지되어 있다. "줄기 세포로부터 유래된 세포"는 심장 세포 및/또는 조직, 간 세포 및/또는 조직, 신장 세포 및/또는 조직, 뇌 세포 및/또는 조직, 췌장 세포 및/또는 조직, 폐 세포 및/또는 조직, 골격근 세포 및/또는 조직, 위장 세포 및/또는 조직, 신경 세포 및/또는 조직, 피부 세포 및/또는 조직, 골 세포 및/또는 조직, 골수, 지방 세포 및/또는 조직, 결합 세포 및/또는 조직, 망막 세포 및/또는 조직, 혈관 세포 및/또는 조직, 스트로마 세포 또는 심근세포와 관련될 수 있다. 심장 조직을 생성하는 방법은 WO 제2015/025030호 및 WO 제2015/040142호에 공지되어 있다. 세포는 또한 생물반응기 내에서 또는 생물반응기 외부에서, 예를 들면, 심근세포 또는 스트로마 세포로 분화시킬 수도 있다. 이러한 분화된 세포는 또한 본 발명의 방법을 이용하여 생물반응기에서 배양될 수 있다. 조직 또는 기관으로부터 수득된 세포는 심장 세포 및/또는 조직, 간 세포 및/또는 조직, 신장 세포 및/또는 조직, 뇌 세포 및/또는 조직, 췌장 세포 및/또는 조직, 폐 세포 및/또는 조직, 골격근 세포 및/또는 조직, 위장 세포 및/또는 조직, 신경 세포 및/또는 조직, 피부 세포 및/또는 조직, 골 세포 및/또는 조직, 골수, 지방 세포 및/또는 조직, 결합 세포 및/또는 조직, 망막 세포 및/또는 조직, 혈관 세포 및/또는 조직, 스트로마 세포 또는 심근세포로부터 수득할 수 있다.
세포는, 몇 가지 예를 들면, 인간, 개, 마우스, 랫트(rat), 돼지 등의 포유류, 붉은털원숭이, 개코원숭이, 시노몰구스 원숭이 또는 일반 마모셋과 같은 비인간 영장류의 세포일 수 있다. 바람직하게는, 세포는 인간이다.
본원에서 사용되는 "다능성 줄기 세포"(PSC)라는 용어는 신체의 모든 세포 유형으로 분화할 수 있는 세포를 지칭한다. 따라서, 다능성 줄기 세포는 본질적으로 임의의 조직이나 기관으로 분화할 수 있는 독특한 기회를 제공한다. 현재, 가장 많이 활용되는 다능성 줄기 세포는 배아 줄기 세포(ESC) 또는 유도 다능성 줄기 세포(iPSC)이다. 다능성 줄기 세포의 추가의 예는 단위생식 줄기 세포(pPSC) 또는 핵 전달 유래 PSC(ntPSC)이다. 인간 ESC-라인은 톰슨(Thomson)과 동료들에 의해 최초로 확립되었다[참조: Thomson et al. (1998), Science 282:1145-1147]. 인간 ESC의 연구에 의해, 최근, 신체의 세포를 ES-유사 세포로 재프로그래밍하는 신기술이 개발되었다. 이 기술은 2006년과 2007년에 야마나카(Yamanaka)와 동료들에 의해 개척되었다[참조: Takahashi & Yamanaka (2006), Cell, 126:663-676 and Takahashi et al. (2007), Cell, 131(5):861-72]. 수득된 유도 다능성 세포(iPSC)는 ESC와 매우 유사한 거동을 나타내고, 중요하게는, 신체의 모든 세포로 분화할 수 있다. 따라서, 일 실시형태에서, iPSC라는 용어는 ESC를 포함한다. 그러나, 본 발명의 맥락에서, 이러한 다능성 줄기 세포는 인간의 생식세포 계열의 유전적 동일성을 변형하거나, 산업적 또는 상업적 목적을 위해 인간 배아의 사용을 수반하는 프로세스를 사용하여 생산되지 않는 것이 바람직하다. 바람직하게는, 다능성 줄기 세포는 영장류 유래이고, 더 바람직하게는 인간 유래이다.
적합한 유도 PSC는, 예를 들면, NIH 인간 배아 줄기 세포 레지스트리, 유럽 유도 다능성 줄기 세포 은행(EBiSC), 독일 심혈관 연구센터(DZHK)의 줄기 세포 레포지토리, 인간 다능성 줄기 세포 레지스트리(hPSCreg) 또는 ATCC 등 몇몇 공급원으로부터 수득될 수 있다. 유도 다능성 줄기 세포는 또한, 예를 들면, 미국 국립신경 장애 및 뇌졸중 연구소(NINDS)가 운영하고 인간 세포 자원을 학계 및 산업계 연구자들에게 광범위하게 배포하는 NINDS 인간 서열 및 세포 레포지토리(https://stemcells.nindsgenetics.org)로부터도 상업용으로 이용할 수 있다. 본 발명에 사용될 수 있는 적합한 세포주의 한 가지 예시적 예는 제대혈 줄기 세포로부터 유래한 (편집되지 않은) 다능성 줄기 세포인 세포주 TC-1133이다. 이 세포주는, 예를 들면, 미국 NINDS로부터 직접 입수할 수 있다. 바람직하게는, TC-1133은 GMP를 준수한다. 추가로, 본 발명에 사용될 수 있는  예시적 iPSC 세포주는, 예를 들면, 깁코(GibcoTM)(주문 번호 A18945, Thermo Fisher Scientific)의 인간 에피솜 iPSC 라인, 또는 ATTC로부터 입수가능한 iPSC 세포주 ATCC ACS-1004, ATCC ACS-1021, ATCC ACS-1025, ATCC ACS-1027 또는 ATCC ACS-1030을 포함하지만 이들로 한정되지 않는다. 또는, 재프로그래밍 기술에서 당업자는 문헌[참조: Okita et al, "A more efficient method to generate integration-free human iPS cells" Nature Methods, Vol.8 No.5, May 2011, pages 409-411 or by Lu et al "A defined xeno-free and feeder-free culture system for the derivation, expansion and direct differentiation of transgene-free patient-specific induced pluripotent stem cells", Biomaterials 35 (2014) 2816e2826]에 기재된 것과 같은 공지된 프로토콜에 의해 적합한 iPSC 라인을 용이하게 생성할 수 있다.
줄기 세포는 TC-1133, 깁코의 인간 에피솜 iPSC 라인, ATCC ACS-1004, ATCC ACS-1021, ATCC ACS-1025, ATCC ACS-1027, ATCC ACS-1030으로 이루어진 그룹으로부터 선택할 수 있다.
본원에 설명된 바와 같이, 본 발명에 사용되는 (유도) 다능성 줄기 세포는 임의의 적합한 세포 유형(예를 들면, 중간엽 줄기 세포, 상피 줄기 세포 등의 줄기 세포 또는 섬유아세포 등의 분화 세포) 및 임의의 적합한 공급원(체액 또는 조직)으로부터 유래될 수 있다. 이러한 공급원(체액 또는 조직)의 예에는 제대혈, 피부, 치육, 소변, 혈액, 골수, 제대의 모든 구획(예: 제대의 양막 또는 와튼 젤리), 제대-태반 접합부, 태반 또는 지방 조직 등이 있다. 한 가지 예시적 예에서, 예를 들면, 문헌[참조: Chou et al. (2011), Cell Research, 21:518-529]에 기재된 바와 같이, CD34에 특이적으로 지시된 항체를 사용한 자기 세포 선별, 이어서 재프로그래밍에 의해 제대혈로부터 CD34 양성 세포를 단리하는 것이다. 문헌[참조: Baghbaderani et al. (2015), Stem Cell Reports, 5(4):647-659]은 세포주 ND50039를 생성하기 위해 iPSC 생성 프로세스가 양호한 제조 관행의 규제를 준수할 수 있음을 나타낸다.
따라서, 줄기 세포는 바람직하게는 양호한 제조 관행의 요건을 충족한다.
본 발명은 또한 현탁 배양에서 배지 교환을 위해 본원에 정의된 회전 메쉬의 용도에 관한 것이고, 현탁 배양은 배양 배지에 현탁된 세포 응집체를 포함하며, 여기서 세포는 줄기 세포이다.
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본원에서 사용되는 바와 같이, 단수형 "a", "an" 및 "the"는, 문맥이 달리 명시하지 않는 한, 복수의 참조를 포함한다는 것에 유의한다. 따라서, 예를 들면, "시약"에 대한 언급은 이러한 상이한 시약 중 하나 이상을 포함하고, "방법"에 대한 언급은 본원에 기재된 방법을 변경하거나 치환할 수 있는 당업자에게 공지된 동등한 단계 및 방법에 대한 언급을 포함한다.
달리 명시되지 않는 한, 일련의 요소들 앞에 있는 "적어도"라는 용어는 이러한 일련의 모든 요소를 지칭하는 것으로 이해되어야 한다. 당업자라면, 본원에 기재된 본 발명의 특정 실시형태에 대한 다수의 균등물을 인식하거나, 또는 일상적 실험만을 통해서 확인할 수 있을 것이다. 이러한 균등물은 본 발명에 의해 포함되도록 의도되었다.
본원에 사용되는 "및/또는"이라는 용어는 "및", "또는" 및 "상기 용어에 의해 접속된 요소의 전부 또는 기타 임의의 조합"의 의미를 포함한다.
"미만" 또는 "이상"이라는 용어에는 구체적 수치가 포함되지 않는다.
예를 들면, 20 미만은 지시된 수치 미만을 의미한다. 유사하게는, 이상 또는 초과는 표시된 수치 이상 또는 초과를 의미한다(예: 80% 이상은 표시된 수치 80% 이상 또는 초과를 의미한다).
본 명세서 및 이에 계속되는 청구범위 전체에서, 문맥상 달리 요구되지 않는 한, "포함하다(comprise)"라는 단어 및 "포함한다(comprises)" 및 "포함하는(comprising)"과 같은 변형은 기재된 정수 또는 단계 또는 정수 또는 단계의 그룹을 포함하는 것을 의미하고, 다른 정수 또는 단계 또는 정수 또는 단계의 그룹을 배제하지 않는 것으로 이해될 것이다. 본원에서 사용되는 경우, "포함하는(comprising)"이라는 용어는 "함유하는(containing)" 또는 "포함하는(including)"이라는 용어로 치환될 수 있으며, 본원에서 사용되는 경우, 때로는 "갖는(having)"이라는 용어로 치환될 수 있다. 본원에서 사용되는 경우, "이루어진"이라는 용어는 지정되지 않은 요소, 단계 또는 성분을 제외한다.
"포함하는(including)"이라는 용어는 "포함하지만 이들로 한정되지 않는"을 의미한다. "포함하는" 및 "포함하지만 이들로 한정되지 않는"은 호환적으로 사용된다.
본원에서 사용되는 바와 같이, "약", "대략" 또는 "본질적으로"라는 용어는 소정 값 또는 범위의 20% 이내, 바람직하게는 15% 이내, 바람직하게는 10% 이내, 및 더 바람직하게는 5% 이내를 의미한다. 또한, 구체적 수치를 포함하며, 예를 들면, "약 20"은 20이라는 수치를 포함한다.
본 발명은, 본원에 기재된 특정 방법론, 프로토콜, 재료, 시약 및 물질 등에 한정되지 않으며, 따라서 달라질 수 있음을 이해해야 한다. 본원에서 사용된 용어는 특정 실시형태를 설명하기 위한 것이며, 청구범위에 의해서만 정의되는 본 발명의 범위를 한정하는 것을 의도하는 것은 아니다.
본 명세서의 본문 전체에 인용된 모든 간행물(모든 특허, 특허 출원, 과학 간행물, 설명서 등 포함)은 상기 또는 하기에 관계없이 참조에 의해 그 전체가 도입된다. 본원의 어떠한 내용도 본 발명이 선행 발명에 의해 이러한 공개에 선행할 자격이 없다는 것을 인정하는 것으로 해석되어서는 안 된다. 참조에 의해 도입된 자료가 본 명세서와 모순되거나, 또는 일치하지 않는 범위 내에서, 본 명세서는 이러한 자료에 우선한다.
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실시예
본 발명과 이의 이점에 대한 더 양호한 이해는 예시적 목적으로만 제공되는 하기의 실시예로부터 명백해질 것이다. 실시예는 본 발명의 범위를 어떠한 방식으로든 한정하는 것을 의도하지 않는다.
실시예 1: 스핀필터를 적용함으로써, PSC 응집체의 형태를 변경하지 않고서 자동화 배지 교환이 가능하다.
하기의 재료 및 장비(표 1 참조)를 제조업체의 지시에 따라 사용했다:
세포-단독 응집체 현탁 배양은 하기 기재된 바와 같이 수행되었다. 세포를 2.5 × 10+6 세포/ml의 농도로 파종하고, StemMACS iPS-Brew XF, 기본 배지에서 배양했다. 스핀필터를 통한 관류에 의한 배지 교환은 2일차에 개시했다. 하기 표 2는 배양 파라미터를 나타낸다.
스핀필터는, 90-140rpm의 교반 속도 및 5-100% 펌프 속도(약 0.1 내지 2.2mL/min에 상응)에서 사용하면, 약 70-300㎛ 크기의 iPSC 응집체를 성공적으로 유지했다. 1일당 60 내지 100%의 배지 교환율의 관류 배지 교환은 300 내지 500mL의 배양 용적에서 성공적으로 수행된다. 스핀필터를 사용하여 제거된 사용한 배지에는 iPSC 응집체가 없고, 단일 세포와 파편만이 포함되어 있으며(도 1B 및 D), 배양 중의 iPSC 응집체는 전형적 형태를 갖는다(도 1A 및 C).
요약하면, 본 발명자들은 회전 메쉬(여기서는 스핀필터)의 적용이 iPSC 응집체를 손상시키지 않고 연속적 관류 배양을 가능하게 하는 것을 놀랍게도 나타낼 수 있었다.
실시예 2: 스핀필터의 적용이 PSC 응집체의 품질에 영향을 미치지 않는다
본 발명자들은 0.5L 및 2L UniVessel을 사용하여 실시예 1에 제시된 실험을 반복하여, PSC 세포 응집체 현탁 배양의 배지 교환에서 스핀필터의 적용성을 응집체 크기, 확장 속도 및 다능성과 관련하여 추가로 명확히 하였다.
재료 및 방법은 실시예 1에 상응하고, 표 3에 개설하는 하기 배양 파라미터를 갖는다. iPSC는 "용기 2"(Sartorius UniVessel 2L의 내부 지정)에서 배양되었고, "용기 3"(Sartorius UniVessel 0.5L의 내부 지정)에서도 배양되었다.
응집체 크기
계대 0의 1일차에 UniVessel 0.5L의 응집체는 129㎛로 컸다(도 2). 계대 0의 1일차에 UniVessel 2L의 응집체는 0.5L 용기의 응집체보다 작았다. 계대 0의 4일차에는 양 용기의 응집체가 필적하는 크기였다.
확장 속도
계대 0에서 4일간 배양 후의 확장 속도는 0.5L 및 2L UniVessel 모두에서 약 8배였다(표 4).
다능성
다능성-관련 유전자의 발현은 양 용기 모두의 접종물에서 높았다(도 3 및 4). 2L 및 0.5L UniVessel의 양쪽 iPSC는 계대 0의 4일차에 다능성-관련 마커의 높은 발현을 나타냈다. 현탁액 중의 iPSC에서의 발현은 접종시의 발현과 필적했다.
분석
실시예 2에서, iPSC는 상이한 크기(0.5L 및 2L)의 2개의 UniVessel에서 배양되었다. 양쪽 용기 모두에서, 계대 0의 4일차에 양호한 품질의 iPSC가 수득되었다. 따라서, 본 발명의 방법을 사용하면, 바람직한 성장 속도 및 관련 응집체 크기에서 보다 바람직한 품질이 유도될 수 있다.
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Claims (16)

  1. 줄기 세포를 확장시키는 방법으로서,
    상기 줄기 세포는 현탁 배양(suspension culture)에서 세포 응집체에 포함되고, 상기 방법은
    (i) 줄기 세포의 증식을 가능하게 하는 조건하에 줄기 세포를 배양하는 단계; 및
    (ii) 회전 메쉬(rotating mesh)를 통한 관류(perfusion)에 의해 배지 교환(medium exchange)을 수행하는 단계
    를 포함하는, 방법.
  2. 현탁 배양의 배양 배지를 교환하는 방법으로서, 상기 현탁 배양은 배양 배지에 현탁된 줄기 세포의 세포 응집체를 포함하고, 상기 방법은
    (i) 회전 메쉬를 통한 관류에 의해 배지 교환을 수행하는 단계; 및
    (ii) 임의로, 회전 메쉬를 통해 제거된 배지를 신선한 배지로 교환하는 단계
    를 포함하는, 방법.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 줄기 세포가 생물반응기(bioreactor)에서 배양되고, 상기 생물반응기가 바람직하게는 교반 생물반응기, 로킹 모션(rocking motion) 생물반응기 및/또는 다중 병렬 생물반응기인, 방법.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 배지 교환이 생물반응기 내부에서 수행되는, 방법.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 회전 메쉬가 스핀-필터(spin-filter)이고, 임의로, 상기 스핀-필터가 생물반응기의 교반기 또는 교반봉(sirring rod)에 부착되어 있는, 방법.
  6. 제1항 내지 제3항 및 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 배지 교환이 생물반응기의 외부에서 수행되고, 바람직하게는 회전 메쉬를 수용하는 장치가 생물반응기와 유체적으로 결합되어 폐쇄 시스템을 형성하는, 방법.
  7. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 회전 메쉬가 약 1㎛ 내지 약 50㎛, 약 5㎛ 내지 약 50㎛, 약 10㎛ 내지 약 50㎛, 약 5㎛ 내지 약 40㎛, 약 5㎛ 내지 약 30㎛, 약 5㎛ 내지 약 20㎛, 또는 약 5㎛ 내지 약 15㎛, 바람직하게는 약 10㎛의 기공 크기(pore size)를 갖는, 방법.
  8. 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 세포 응집체가 약 50 내지 약 300㎛, 약 80 내지 약 250㎛, 약 100 내지 약 220㎛ 또는 약 100㎛ 내지 약 200㎛의 평균 직경을 갖는, 방법.
  9. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 줄기 세포가 다능성(pluripotent) 줄기 세포, 제대혈 줄기 세포, 중간엽 줄기 세포 및/또는 조혈 줄기 세포; 및/또는 줄기 세포로부터 유래된 세포이고, 상기 다능성 줄기 세포가 유도 다능성 줄기 세포(iPSC), 배아 줄기 세포(ESC), 단위생식 줄기 세포(pPSC) 또는 핵 전달 유래 PSC(ntPSC), 가장 바람직하게는 iPSC인, 방법.
  10. 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 줄기 세포가 TC-1133, 깁코(Gibco)의 인간 에피솜 iPSC 라인 ATCC ACS-1004, ATCC ACS-1021, ATCC ACS-1025, ATCC ACS-1027 및 ATCC ACS-1030으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 방법.
  11. 현탁 배양에서 배지 교환을 위한 회전 메쉬의 용도로서,
    상기 현탁 배양은 배양 배지에 현탁된 세포 응집체를 포함하고, 상기 세포는 줄기 세포인, 용도.
  12. 제11항에 있어서, 상기 줄기 세포가 다능성 줄기 세포, 제대혈 줄기 세포, 중간엽 줄기 세포 및/또는 조혈 줄기 세포; 및/또는 줄기 세포로부터 유래된 세포이고, 상기 다능성 줄기 세포가 바람직하게는 유도 다능성 줄기 세포(iPSC), 배아 줄기 세포(ESC), 단위생식 줄기 세포(pPSC) 또는 핵 전달 유래 PSC(ntPSC), 가장 바람직하게는 iPSC인, 용도.
  13. 제11항 또는 제12항에 있어서, 상기 줄기 세포가 TC-1133, 깁코의 인간 에피솜 iPSC 라인 ATCC ACS-1004, ATCC ACS-1021, ATCC ACS-1025, ATCC ACS-1027, 및 ATCC ACS-1030으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 용도.
  14. 제11항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 세포 응집체가 약 50 내지 약 300㎛, 약 80 내지 약 250㎛, 약 100 내지 약 220㎛ 또는 약 100㎛ 내지 약 200㎛의 평균 직경을 갖는, 용도.
  15. 제11항에 있어서, 상기 회전 메쉬가 스핀-필터이고, 임의로, 상기 스핀-필터가 생물반응기의 교반기 또는 교반봉에 부착되어 있는, 용도.
  16. 제11항 또는 제15항에 있어서, 상기 회전 메쉬가 약 1㎛ 내지 약 50㎛, 약 5㎛ 내지 약 50㎛, 약 10㎛ 내지 약 50㎛, 약 5㎛ 내지 약 40㎛, 약 5㎛ 내지 약 30㎛, 약 5㎛ 내지 약 20㎛, 또는 약 5㎛ 내지 약 15㎛, 바람직하게는 약 10㎛의 기공 크기를 갖는, 용도.
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