KR20230035524A - Covid-19 치료제로서 e 단백질 채널 차단제 및 orf3 억제제 - Google Patents

Covid-19 치료제로서 e 단백질 채널 차단제 및 orf3 억제제 Download PDF

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이샤아 아르킨
토마르 프라밧 프라탑 싱흐
미리암 크룩리악
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이슘 리서치 디벨롭먼트 컴퍼니 오브 더 히브루 유니버시티 오브 예루살렘 엘티디.
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Abstract

대상체에서 SARS-CoV-2 독성을 치료 또는 예방하기 위한 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제 및 ORF3 억제제를 포함하는 약학적 조성물이 제공된다. 추가로 SARS-CoV-2 세포 진입, 비코팅 및/또는 세포로부터의 방출을 방지하기 위한 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제 또는 ORF3 억제제를 포함하는 약학적 조성물이 제공된다.

Description

COVID-19 치료제로서 E 단백질 채널 차단제 및 ORF3 억제제
관련 출원에 대한 교차 참조
본 출원은 2020년 5월 1일에 출원된 "COVID-19 치료제로서 E 단백질 채널 차단제"라는 명칭의 미국 가특허 출원 번호 63/018,598 및 2020년 11월 24일에 출원된 "COVID-19 치료제로서 E 단백질 채널 차단제 및 ORF3 억제제"라는 명칭의 미국 가특허 출원 번호 63/117,619의 우선권의 이익을 주장하며, 양자의 내용은 그 전체가 참조로 본 명세서에 포함된다.
발명의 분야
본 발명은 항-바이러스 치료의 분야이다.
코로나바이러스는 종종 인간에서 경증 호흡기관 감염과 연관되는 포지티브-센스, 단일-가닥 RNA 바이러스이다. 그러나, 가족 중 3명은 그의 비정상적인 병독성으로 인해 악명을 떨쳤다: SARS-CoV-1은 2002/3년 겨울에 8,098건 사례 중 774건의 사망을 야기한 SARS 전염병의 병인이었다; MERS-CoV는 2012년부터 시작된 MERS 전염병에 대한 원인으로 2,506건 감염으로부터 862명이 사망했다; 마지막으로, SARS-CoV-2는 진행 중인 COVID-2019 대유행에 대한 원인으로 54,068,330건 사례 중 131만건의 사망을 초래했다(2020년 11월 15일 일요일 기준.
게놈 분석은 SARS-CoV-1과 SARS-CoV-2가 서로 매우 유사하지만(약 80%) 인간을 감염시키는 대부분의 다른 코로나바이러스과 구성원과는 구별된다는 것을 나타냈다. 두 바이러스 모두는 코로나바이러스과의 코로나바이러스아과 서브패밀리 내의 베타코로나바이러스 속에서의 하위 그룹 B에 배치되었다.
모든 코로나바이러스의 구조 단백질 중에서 E는 작용 메커니즘과 구조의 관점에서 가장 잘 이해되지 않는다. 기능적으로 E 단백질은 바이러스 어셈블리, 방출 및 병인과 관련되어 있다. 그럼에도 결정적으로, 코로나바이러스 E 단백질은 바이러스의 발병에 중요하고, 단백질을 결하는 약독화된 바이러스는 백신 후보로 기능하는 것이 제안되기도 했다.
개방 판독 프레임 3a(ORF3a)로도 알려진 SARS-CoV-2 3a 단백질은 동종사량체 칼륨 민감성 이온 채널(바이로포린)의 어셈블리에 관여되고 바이러스 방출을 조절할 수 있다. 부가적으로, 그것은 숙주 폐 상피 세포에서 피브리노겐 서브유닛 FGA, FGB 및 FGG의 발현의 상향-조절, 세포 배양에서 세포자멸사의 유도를 포함하는 병인에 연루되어 있다.
요약
제1 양태에 따르면, SARS-CoV-2 독성을 치료 또는 예방을 필요로 하는 대상체에서 이를 위한 방법이 제공되며, 상기 방법은 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제 및 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제 중 임의의 하나의 치료적으로 유효한 양을 대상체에서 투여하고, 이에 의해 대상체에서 SARS-CoV-2 독성을 치료하거나 예방하는 것을 포함한다.
또 다른 양태에 따르면, 치료 또는 예방을 필요로 하는 대상체에서 SARS-CoV-2 독성의 치료 또는 예방에 사용하기 위한 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제 및/또는 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제를 포함하는 약학적 조성물이 제공된다.
일부 실시형태에서, 예방하는 것은 대상체의 세포로 SARS-CoV-2 진입, 대상체의 세포에서 SARS-CoV-2의 비코팅, 대상체의 세포로부터 SARS-CoV-2의 방출, 및 이의 임의의 조합 중 임의의 하나를 예방하는 것을 포함한다.
일부 실시형태에서, 대상체는 SARS-CoV-2에 감염되었거나 감염된 것으로 의심된다.
일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 5-아자시티딘, 메만틴, 글리클라지드, 마보릭사포르, 사로글리타자르 마그네슘, 메브로페닌, 사이클렌, 카수가마이신, 플레릭사포르, 및 그의 염으로 구성된 군으로부터 선택된 적어도 하나의 분자이다.
일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 0.01 내지 500mg/kg의 일일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 진세노사이드이다.
일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 메만틴이다.
일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 카프레오마이신, 펜타미딘, 스펙티노마이신, 카수가마이신, 플레릭사포르, 플루마티닙, 리트로네십, 다라플라디브, 플록수리딘 및 플루다라빈으로 구성된 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 분자이다.
일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 카프레오마이신이다.
일부 실시형태에서, 예방은 대상체의 세포로 SARS-CoV-2 진입, SARS-CoV-2의 비코팅, 대상체의 세포로부터 SARS-CoV-2의 방출, 및 이의 임의의 조합 중 임의의 하나의 예방을 포함한다.
본 발명의 추가 실시형태 및 적용가능성의 전체 범주는 이하에 주어진 상세한 설명으로부터 명백해질 것이다. 그러나, 발명의 사상 및 범주 내에서 다양한 변경 및 변형이 이 상세한 설명으로부터 당업자에게 명백할 것이기 때문에, 상세한 설명 및 특정 실시예는 발명의 바람직한 실시형태를 나타내지만 단지 예시로서 주어진다는 것을 이해해야 한다.
도 1a-1b는 막 투과 검정을 나타내는 그래프를 포함한다. SARS-CoV-2 E 단백질 발현의 함수(1a, 오른쪽) 또는 SARS-CoV-2 3a 단백질 발현의 함수(1b)로서 박테리아의 성장 곡선(n=2). 접합된 바이러스 이온 채널 없이 말토스 결합 단백질을 발현하는 박테리아는 음성 대조군으로서 왼쪽 패널에 도시되어 있다. 양성 대조군으로, 인플루엔자 M2 바이로포린을 발현하는 박테리아는 중앙에 도시되어 있다. 상이한 IPTG 농도(표시된 바와 같음)에서의 유도는 박테리아 밀도가 0.2의 O.D.600nm에 도달할 때 일어난다. 성장 O.D.600nm 값은 15분마다 수집되었다. 도 1b는 SARS-CoV-3a 단백질 발현의 함수로서 박테리아의 성장 곡선을 나타낸다. 음성 대조군(무 채널; NC); 무 약물(ND).
도 2a-2b는 K+ 전도도 검정을 나타내는 그래프를 포함한다. K+-흡수 결핍 박테리아의 성장에 대한 바이러스 단백질 SARS-CoV-2 E 단백질의 영향(왼쪽 패널, 2a). 다른 단백질 발현 수준은 언급된 바와 같이 IPTG 유도제의 농도를 변화시킴에 의해 달성된다. [K+]의 함수로서의 박테리아 성장률은 오른쪽 패널(2a)에 플롯팅되어 있다. (2b)는 다양한 농도의 IPTG 유도제를 사용하여 K+-흡수 결핍 박테리아의 성장에 대한 SARS CoV-2 3a 단백질의 영향을 묘사한다.
도 3a-3b는 형광-기반 H+ 전도도 검정을 나타내는 그래프를 포함한다. pH-민감성 GFP22인 pHluorin을 담지하는 박테리아의 형광을 SARS CoV-2 E 단백질 발현의 함수(3a) 또는 SARS CoV-2 3a 단백질 발현의 함수(3b)로 조사했다. 단백질 수준은 지시된 바와 같이 유도제(IPTG)의 수준에 의해 좌우되었다. 결과는 표준 편차가 오차 막대로 묘사된 2개의 독립적인 실험의 평균이다.
도 4a-4b는 양성 및 음성 유전자 검사를 사용한 화합물 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다. 박테리아의 성장 속도에 대한, 표시된 바와 같은, 다양한 약물 및 E 단백질 발현의 영향. (4a) SARS-CoV-2 E 단백질이 상승된 수준(40μM [IPTG])에서 발현되고 따라서 박테리아에 해로운 음성 유전자 검사. 이 경우에 억제 약물은 박테리아 성장을 향상시킨다. (4b) K+-흡수 결핍 박테리아에서 SARS-CoV-2 E 단백질이 낮은 수준(10μM[IPTG])에서 발현되는 양성 유전자 검사. 이 경우에 억제 약물은 박테리아 성장을 감소시킨다. 양 패널 모두에서 약물이 없는 성장과 비교하여 성장에 미치는 영향이 나열되어 있다.
도 5a-5c는 음성 검정을 사용한 마보릭사포르 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(5a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(5b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 E 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(5c).
도 6a-6c는 음성 검정을 사용한 사로글리타자르 마그네슘 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(6a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(6b), 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 E 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(6c).
도 7a-7c는 음성 검정을 사용한 메브로페닌 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(7a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(7b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 E 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(7c).
도 8a-8c는 음성 검정을 사용한 사이클렌 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(8a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(8b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 E 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(8c).
도 9a-9c는 음성 검정을 사용한 카수가마이신 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(9a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(9b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 E 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(9c).
도 10a-10c는 음성 검정을 사용한 5-아자시티딘 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(10a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(10b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 E 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(10c).
도 11a-11c는 음성 검정을 사용한 플레릭사포르(옥타하이드로클로라이드) 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(11a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(11b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 E 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(11c).
도 12a-12c는 음성 검정을 사용한 플레릭사포르 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(12a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(12b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 E 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(12c).
도 13a-13c는 음성 검정을 사용한 카프레오마이신(설페이트) 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(13a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(13b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 E 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(13c).
도 14a-14c는 음성 검정을 사용한 펜타미딘(이세티오네이트) 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(14a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(14b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 3a 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(14c).
도 15a-15c는 음성 검정을 사용한 스펙티노마이신(디하이드로클로라이드) 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(15a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(15b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 3a 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(15c).
도 16a-16c는 음성 검정을 사용한 카수가마이신(하이드로클로라이드 수화물) 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(16a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(16b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 3a 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(16c).
도 17a-17c는 음성 검정을 사용한 플레릭사포르 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(17a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(17b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 3a 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(17c).
도 18a-18c는 음성 검정을 사용한 플루마티닙 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(18a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(18b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 3a 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(18c).
도 19a-19c는 음성 검정을 사용한 리트로네십 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(19a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(19b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 3a 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(19c).
도 20a-20c는 음성 검정을 사용한 다라플라디브 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(20a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(20b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 3a 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(20c).
도 21a-21c는 음성 검정을 사용한 플록수리딘 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(21a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(21b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 3a 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(21c).
도 22a-22c는 음성 검정을 사용한 플루다라빈 스크리닝 결과를 나타내는 그래프를 포함한다: 차단제가 성장을 증가시키는 박테리아에 유해한 바이러스 채널(22a), 양성 검정: 차단제가 성장을 감소시키는 박테리아에 필수적인 바이러스 채널(22b) 및 형광 검정: 바이러스 채널은 형광을 변경하며, 여기서 차단제는 SARS-CoV-2 3a 단백질 발현 박테리아의 형광 변화를 감소시킨다(22c).
도 23은 0.01의 감염 다중도(MOI)에서 SARS-CoV-2로 감염된 Vero-E6 세포의 생존력에 대한 다양한 시험 약물의 효과를 나타내는 수직 막대 그래프를 포함한다.
일부 실시형태에서, 본 발명은 대상체에서 SARS-CoV-2 독성을 치료 또는 예방하기 위해 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제 및/또는 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제를 포함하는 조성물을 제공한다. 일부 실시형태에서, 본 발명은 SARS-CoV-2 2 세포 진입, 비코팅 및/또는 세포로부터 방출을 방지하기 위해 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제 및/또는 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제를 포함하는 조성물을 제공한다.
SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제
발명은 적어도 부분적으로 SARS-CoV-2 E 단백질이 이온 채널이라는 3가지 박테리아-기반 검정을 사용한 발견에 기반한다. 발명은 더욱이 적어도 부분적으로 글리클라지드, 메만틴, 마보릭사포르, 사로글리타자르 마그네슘, 메브로페닌, 사이클렌, 카수가마이신, 아자시티딘 및 플레릭사포르가 SARS-CoV-2 E 단백질을 억제하고 따라서 SARS-CoV-2 독성을 치료하고 예방하는데 사용될 수 있다는 발견에 기반한다.
SARS-CoV-2 E 단백질은 당업자에게 공지되어 있고 유전자은행 수탁 번호: QIH45055.1을 갖는다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질은 서열번호 1: MYSFVSEETGTLIVNSVLLFLAFVVFLLVTLAILTALRLCAYCCNIVNVSLVKPSFYVYSRVKNLNSSRVPDLLV에 제시된 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질은 서열번호: 1의 유사체, 예컨대 서열번호: 1과 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95% 동일성을 갖는 유사체를 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 치료적으로 유효한 양의 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제를 대상체에게 투여하고, 이에 의해 대상체에서 SARS-CoV-2 독성을 치료 또는 예방하는 것을 포함하는, 치료 또는 예방을 필요로 하는 대상체에서 SARS-CoV-2 독성을 치료 또는 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시형태에서, 발명은 대상체에게 치료적으로 유효한 양의 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제를 투여하고, 이에 의해 COVID-19를 치료 또는 예방하는 것을 포함하는, 치료 또는 예방을 필요로 하는 대상체에서 코로나바이러스 질환 2019 (COVID-19)를 치료 또는 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 세포로부터 SARS-CoV-2 방출을 방지하는 방법을 제공한다. 일부 실시형태에서, 방법은 세포를 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제와 접촉시키고, 이에 의해 세포로부터 SARS-CoV-2 방출을 방지하는 것을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 SARS-CoV-2 세포 진입을 방지하는 방법을 제공한다. 일부 실시형태에서, 방법은 세포를 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제와 접촉시키고, 이에 의해 SARS-CoV-2 세포 진입을 방지하는 것을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 SARS-CoV-2 비코팅을 방지하는 방법을 제공한다. 일부 실시형태에서, 방법은 세포를 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제와 접촉시키고, 이에 의해 SARS-CoV-2 비코팅을 방지하는 것을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 세포는 대상체의 세포이다. 일부 실시형태에 따르면, 접촉하는 것은 대상체에게 투여하는 것을 포함한다. 일부 실시형태에 따르면, 대상체는 SARS-CoV-2에 감염되었거나 감염된 것으로 의심되는 대상체이다.
일부 실시형태에 따르면, 대상체에게 치료적으로 유효한 양의 5-아자시티딘을 투여하고, 이에 의해 대상체에서 SARS-CoV-2 독성을 치료 또는 예방하는 것을 포함하는, 치료 또는 예방을 필요로 하는 대상체에서 SARS-CoV-2 독성을 치료 또는 예방하는 방법이 제공된다.
일부 실시형태에 따르면, 치료 또는 예방을 필요로 하는 대상체에서 SARS-CoV-2 독성의 치료 및/또는 예방에 사용하기 위한, 5-아자시티딘을 포함하는 약학적 조성물이 제공된다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 메만틴, 글리클라지드, 마보릭사포르, 사로글리타자르 마그네슘, 메브로페닌, 사이클렌, 카수가마이신, 아자시티딘, 플레릭사포르 또는 이의 임의의 염으로부터 선택되는 적어도 하나의 분자이다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 치료 또는 예방을 필요로 하는 대상체에서 SARS-CoV-2 독성을 치료 또는 예방하는데 사용하기 위한 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제를 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 세포로부터 SARS-CoV-2 방출을 방지하는데 사용하기 위한 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제를 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 약학적 조성물 내에 있다. 일부 실시형태에서, 약학적 조성물은 약학적으로 허용가능한 담체를 추가로 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한 아자시티딘, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 아자시티딘, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 5-아자시티딘이다.
본 명세서에서 사용되는 아자시티딘은 아자시티딘(CAS: 320-67-2; 4-아미노-1-β-D-리보푸라노실-s-트리아진-2(1H)-온)뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물, 또는 혼합물을 포함한다. 아자시티딘은 예를 들어 WO2012135405A1에 기재되어 있다. 용어 "5-아자시티딘" 및 "아자시티딘"은 본 명세서에서 상호교환적으로 사용된다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염의 치료에 사용하기 위한, 메만틴, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다. 일부 실시형태에서, 바이러스 감염은 코로나바이러스 감염을 포함한다. 일부 실시형태에서, 바이러스 감염은 이온 채널인 E 단백질을 갖는 바이러스에 의한 감염을 포함한다. 일부 실시형태에서, 바이러스 감염은 코로나바이러스 감염이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 메만틴, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 메만틴 하이드로클로라이드이다.
본 명세서에서 사용되는 메만틴은 메만틴(CAS: 19982-08-2; 1-아미노-3,5-디메틸아다만탄), 뿐만 아니라 그의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다. 메만틴은 예를 들어 미국 특허 3,391,142, 5,891,885, 5,919,826 및 6,187,338에 기술되어 있다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한 글리클라지드, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다. 일부 실시형태에서, 바이러스 감염은 이온 채널인 E 단백질을 갖는 바이러스에 의한 감염이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 글리클라지드 유사체 또는 이의 염이다.
본 명세서에서 사용되는 글리클라지드는 글리클라지드(CAS: 21187-98-4; 1-(3-아자비사이클로(3.3.0)옥트-3-일)-3-(p-톨릴술포닐)우레아) 뿐만 아니라 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 이들의 혼합물을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 진세노사이드를 포함하는 군으로부터 선택된다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한 마보릭사포르, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 마보릭사포르, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 마보릭사포르이다.
본 명세서에서 사용된 마보릭사포르는 마보릭사포르(CAS: 558447-26-0; N-(1H-벤즈이미다졸-2-일메틸)-N-[(8S)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴놀린-8-일]부탄-1,4-디아민), 뿐만 아니라 그의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다. 마보릭사포르는, 예를 들어, 미국 특허 US7332605에 기술되어 있고 WO2003055876에는 일련의 169 유사체로부터 화합물 89로 기술되어 있다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한 사로글리타자르, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 사로글리타자르, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 사로글리타자르 마그네슘이다.
본 명세서에 사용된 사로글리타자르는 사로글리타자르(CAS: 495399-09-2; (αS)-α-에톡시-4-[2-[2-메틸-5-[4-(메틸티오)페닐]-1H-피롤-1-일]에톡시]벤젠프로판산), 뿐만 아니라 그의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다. 사로글리타자르는, 예를 들어, WO2016181409에 기재되어 있다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한, 메브로페닌, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 메브로페닌, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 메브로페닌이다.
본 명세서에서 사용되는 메브로페닌은 메브로페닌(CAS: 78266-06-5; 2-[[2-(3-브로모-2,4,6-트리메틸아닐리노)-2-옥소에틸]-(카르복시메틸)아미노]아세트산), 뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다. 메브로페닌은, 예를 들어, US9,878,984에 기술되어 있다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한 사이클렌, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 사이클렌, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 사이클렌이다.
본 명세서에서 사용된 사이클렌은 사이클렌(CAS: 294-90-6; 1,4,7,10-테트라아자사이클로도데칸), 뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다. 사이클렌은, 예를 들어, US9421223B2에 기술되어 있다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한 카수가마이신, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 카수가마이신, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 카수가마이신 하이드로클로라이드 수화물(CAS: 19408-46-9)이다.
본 명세서에 사용된 카수가마이신은 카수가마이신(CAS: 6980-18-3; 2-아미노-2-[(2R,3S,5S,6R)-5-아미노-2-메틸-6-[(2R,3S,5S,6S)-2,3,4,5,6-펜타하이드록시사이클로헥실]옥시옥산-3-일]이미노아세트산)뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다. 카수가마이신은 예를 들어, US3358001A에 기재되어 있다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한, 플레릭사포르, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 플레릭사포르, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 플레릭사포르 옥타하이드로클로라이드이다.
본 명세서에서 사용되는 플레릭사포르는 플레릭사포르(CAS: 155148-31-5; 1-[[4-(1,4,8,11-테트라자사이클로테트라데크-1-일메틸)페닐]메틸]-1,4,8,11-테트라자사이클로테트라데칸)뿐만 아니라 그의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다. 플레릭사포르는, 예를 들어, WO2014125499A1에 기술되어 있다.
SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제
발명은 적어도 부분적으로 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제가 SARS-CoV-2 독성을 치료 및 예방하기 위한 효과적인 작용제로서 작용할 수 있다는 3가지 박테리아-기반 검정을 사용한 발견에 기반한다.
개방 판독 프레임 3a(ORF3a)로도 알려진 SARS-CoV-2 3a 단백질은 당업자에게 공지되어 있고 UniProt 수탁번호: P0DTC3을 갖는다.
용어 "3a 단백질" 및 "ORF3a"는 본 명세서에서 상호교환적으로 사용된다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질은 서열번호 2: MDLFMRIFTIGTVTLKQGEIKDATPSDFVRATATIPIQASLPFGWLIVGVALLAVFQSASKIITLKKRWQLALSKGVHFVCNLLLLFVTVYSHLLLVAAGLEAPFLYLYALVYFLQSINFVRIIMRLWLCWKCRSKNPLLYDANYFLCWHTNCYDYCIPYNSVTSSIVITSGDGTTSPISEHDYQIGGYTEKWESGVKDCVVLHSYFTSDYYQLYSTQLSTDTGVEHVTFFIYNKIVDEPEEHVQIHTIDGSSGVVNPVMEPIYDEPTTTTSVPL에 제시된 바와 같은 아미노산 서열을 포함한다 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질은 서열번호: 2와 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95% 동일성을 갖는 유사체와 같은, 서열번호: 2의 유사체를 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 치료적으로 유효한 양의 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제를 대상체에게 투여하고, 이에 의해 대상체에서 SARS-CoV-2 독성을 치료 또는 예방하는 것을 포함하는, 치료 또는 예방을 필요로 하는 대상체에서 SARS-CoV-2 독성을 치료 또는 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시형태에서, 발명은 치료적으로 유효한 양의 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제를 대상체에게 투여하고, 이에 의해 COVID-19를 치료 또는 예방하는 것을 포함하는, 치료 또는 예방을 필요로 하는 대상체에서 코로나바이러스 질환 2019 (COVID-19)를 치료 또는 예방하는 방법을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 세포로부터 SARS-CoV-2 방출을 방지하는 방법을 제공하며, 상기 방법은 세포를 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제와 접촉시키고, 이에 의해 세포로부터 SARS-CoV-2 방출을 방지하는 것을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 방법은 세포를 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제와 접촉시키고, 이에 의해 SARS-CoV-2 세포 진입을 방지하는 것을 포함한다.
일부 실시형태에서, 방법은 세포를 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제와 접촉시키고, 이에 의해 SARS-CoV-2 비코팅을 방지하는 것을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 대상체는 SARS-CoV-2에 감염되었거나 감염된 것으로 의심되는 대상체이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 카프레오마이신, 펜타미딘, 스펙티노마이신, 카수가마이신, 플레릭사포르, 플루마티닙, 리트로네십, 다라플라디브, 플록수리딘, 플루다라빈 또는 이의 염으로부터 선택되는 적어도 하나의 분자이다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 치료 또는 예방을 필요로 하는 대상체에서 SARS-CoV-2 독성의 치료 또는 예방에 사용하기 위한 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제를 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 세포로부터 SARS-CoV-2 방출의 방지에 사용하기 위한 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제를 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 약학적 조성물 내에 있다.
일부 실시형태에서, 바이러스 감염은 3a 단백질을 갖는 바이러스에 의한 감염이다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한, 카프레오마이신, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 카프레오마이신, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 카프레오마이신 설페이트이다.
본 명세서에서 사용되는 카프레오마이신은 카프레오마이신(CAS: 11003-38-6; IUPAC: (3S)-3,6-디아미노-N-[[(2S,5S,8E,11S,15S)-15-아미노-11-[(4R)-2-아미노-3,4,5,6-테트라하이드로피리미딘-4-일]-8-[(카르바모일아미노)메틸리덴]-2-(하이드록시메틸)-3,6,9,12,16-펜타옥소-1,4,7,10,13-펜타자사이클로헥사덱-5-일]메틸]헥산아미드; (3S)-3,6-디아미노-N-[[(2S,5S,8E,11S,15S)-15-아미노-11-[(4R)-2-아미노-3,4,5,6-테트라하이드로피리미딘-4-일]-8-[(카르바모일아미노)메틸리덴]-2-메틸-3,6,9,12,16-펜타옥소-1,4,7,10,13-펜타자사이클로헥사데크-5-일]메틸]헥산아미드), 뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한 펜타미딘, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 펜타미딘, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 펜타미딘 이세티오네이트이다.
본 명세서에서 사용되는 펜타미딘은 펜타미딘(CAS: 100-33-4; IUPAC: 4,4'-[펜탄-1,5-디일비스(옥시)]디벤젠카르복시미드아미드)뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물, 또는 혼합물을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한 스펙티노마이신, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 스펙티노마이신, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 스펙티노마이신 디하이드로클로라이드이다.
본 명세서에서 사용되는 스펙티노마이신은 스펙티노마이신(CAS: 1695-77-8; IUPAC: 1R,3S,5R,8R,10S,11S,12S,13R,14S)-8,12,14-트리하이드록시-5-메틸-11,13-비스(메틸아미노)-2,4,9-트리옥사트리사이클로[8.4.0.03,8]테트라데칸-7-온), 뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한, 카수가마이신, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 카스가마이신, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 카수가마이신 하이드로클로라이드 수화물이다.
본 명세서에서 사용된 카수가마이신은 카수가마이신(CAS:6980-18-3; IUPAC: 2-아미노-2-[(2R,3S,5S,6R)-5-아미노-2-메틸-6-[(2R,3S,5S,6S)-2,3,4,5,6-펜타하이드록시사이클로헥실]옥시옥산-3-일]이미노아세트산)뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한, 플레릭사포르, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 플레릭사포르, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 플레릭사포르이다.
본 명세서에서 사용되는 플레릭사포르는 플레릭사포르(CAS: 155148-31-5; IUPAC: 1,1'-(1,4-페닐렌비스메틸렌)비스(1,4,8,11-테트라아자사이클로테트라데칸))뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한 플루마티닙, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 플루마티닙, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 플루마티닙이다.
본 명세서에서 사용된 플루마티닙은 플루마티닙(CAS: 895519-90-1; IUPAC: 4-[(4-메틸피페라진-1-일)메틸]-N-[6-메틸-5-[(4-피리딘-3-일피리미딘-2-일)아미노]피리딘-3-일]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드)뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한, 리트로네십, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 리트로네십, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 리트로네십이다.
본 명세서에 사용된 리트로네십은 리트로네십(CAS: 910634-41-2; IUPAC: N-[(5R)-4-(2,2-디메틸프로파노일)-5-[[2-(에틸아미노)에틸술포닐아미노]메틸]-5-페닐-1,3,4-티아디아졸-2-일]-2,2-디메틸프로판아미드)뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한 다라플라디브, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 다라플라디브, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 다라플라디브이다.
본 명세서에 사용된 다라플라디브는 다라플라디브(CAS: 356057-34-6; IUPAC: N-(2-디에틸아미노에틸)-2-[2-[(4-플루오로페닐)메틸설파닐]-4-옥소-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-1-일]-N-[[4-[4-(트리플루오로메틸)페닐]페닐]메틸]아세트아미드), 뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물, 또는 혼합물을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한 플록수리딘, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 플록수리딘, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 플록수리딘이다.
본 명세서에 사용된 플록수리딘은 플록수리딘(CAS: 50-91-9; IUPAC: 5-플루오로-1-[4-하이드록시-5-(하이드록시메틸)테트라하이드로퓨란-2-일]-1H-피리미딘-2,4-디온)뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명은 바이러스 감염을 치료하기 위한 플루다라빈, 이의 유사체 또는 염을 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 플루다라빈, 이의 유사체 또는 염이다. 일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 플루다라빈이다.
본 명세서에서 사용된 플루다라빈은 플루다라빈(CAS: 21679-14-1; IUPAC: [(2R,3S,4S,5R)-5-(6-아미노-2-플루오로-퓨린-9-일)-3,4-디하이드록시-옥솔란-2-일]메톡시포스폰산)뿐만 아니라 이의 약학적으로 허용가능한 염, 용매화물, 수화물 또는 혼합물을 포함한다.
약학적 조성물
본 명세서에서 사용된 용어 질환, 장애 또는 병태의 "치료" 또는 "치료하는"은 적어도 하나의 그의 증상의 경감, 그의 중증도의 감소, 또는 그의 진행의 억제를 포괄한다. 치료는 질환, 장애 또는 병태가 완전히 치유되었음을 의미할 필요는 없다. 효과적인 치료가 되기 위해, 본 명세서에서 유용한 조성물은 질환, 장애 또는 병태의 중증도를 감소시키거나, 그와 관련된 증상의 중증도를 감소시키거나, 환자 또는 대상체의 삶의 질을 개선시키는 것만을 필요로 한다.
본 명세서에서 사용된 용어 질환, 장애 또는 병태의 "예방"은 질환, 장애 또는 병태의 개시의 지연, 예방, 억압 또는 억제를 포괄한다. 현재 개시된 주제에 따라 사용되는 바와 같이, 용어 "예방"은 질환/장애 과정의 유도 또는 개시 이전에 대상체가 현재 개시된 조성물 또는 제형에 노출되는 예방의 과정에 관한 것이다. 용어 "억제"는 질환/장애 과정이 이미 시작되었지만 병태의 명백한 증상이 아직 실현되지 않은 병태를 기술하는데 사용된다. 따라서, 개체의 세포는 질환/장애를 가질 수 있지만 질환/장애의 외부 징후는 아직 임상적으로 인식되지 않았다. 어느 경우에서나 용어 예방은 예방과 억제 둘 모두를 포괄하는데 적용될 수 있다. 역으로, 용어 "치료"는 그 임상 증상이 환자에서 이미 실현된 이미 존재하는 병태를 퇴치하기 위한 활성제의 임상적 적용을 지칭한다.
일부 실시형태에서, 예방은 질환 중증도 감소, 질환 발현 지연, 질환 누적 발병률 감소, 또는 이의 임의의 조합을 포함한다.
본 명세서에 사용된 용어 "투여하는", "투여" 및 유사 용어는 건전한 의료 관행에서 치료적 효과를 제공하는 방식으로 대상체에게 활성제를 함유하는 조성물을 전달하는 임의의 방법을 지칭한다.
본 명세서에 사용된 용어 "대상체" 또는 "개체" 또는 "동물" 또는 "환자" 또는 "포유동물"은 임의의 대상체, 특히 요법이 요구되는 포유동물 대상체, 예를 들어 인간을 지칭한다.
일부 실시형태에서, 발명의 조성물의 치료적으로 유효한 용량이 투여된다. 용어 "치료적으로 유효한 양"은 포유동물에서 질환 또는 장애를 치료하는데 효과적인 약물의 양을 지칭한다. 용어 "치료적으로 유효한 양"은 원하는 치료적 또는 예방적 결과를 달성하기 위해 필요한 기간 동안에 복용량에서 효과적인 양을 지칭한다. 정확한 복용량 형태와 요법은 환자의 병태에 따라 의사에 의해 결정된다.
투여되는 복용량은 수령체의 연령, 건강 및 체중, 있는 경우 동시 치료의 종류, 치료의 빈도 및 원하는 효과의 성질에 따라 달라질 것이다. 약학적 조성물의 투여의 경로는 치료할 질환 또는 병태에 따라 달라질 것이다. 적합한 투여의 경로는 비경구 주사, 예를 들어 피내, 정맥내, 근육내, 병소내, 피하, 척수강내 및 당업계에 공지된 임의의 다른 주사 방식을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 다른 경로에 의해 투여된 펩티드의 생체이용률은 비경구 주사를 통해 투여될 때보다 낮을 수 있지만, 적절한 조성물을 사용함에 의해 경피, 경구, 직장, 질, 국소, 비강, 흡입 및 안구 모드의 치료를 통해 발명의 조성물을 투여하는 것이 가능할 것으로 예상된다. 부가하여, 발명의 약학적 조성물을 뇌실내 및 척수강내 주사를 포함하는 임의의 적합한 경로에 의해 도입하는 것이 바람직할 수 있으며; 뇌실내 주사는 예를 들어 저장소에 부착된 뇌실내 카테터에 의해 촉진될 수 있다.
일부 실시형태에서, 발명의 조성물은 경구로 전달된다. 일부 실시형태에서, 발명의 조성물은 경구용 조성물이다. 일부 실시형태에서, 발명의 조성물은 경구적으로 허용가능한 담체, 부형제 또는 희석제를 추가로 포함한다.
일부 실시형태에 따르면, 발명의 활성제(예를 들어, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제 또는 단백질 3a 억제제)는 0.01 내지 500mg/kg의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 메만틴 또는 이의 염이고 약 1mg/일 내지 약 50mg/일, 약 1mg/일 내지 45mg/일, 및 5mg/일 내지 3 5mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 글리클라지드 또는 이의 염이고 약 1mg/일 내지 350mg/일, 10mg/일 내지 350mg/일, 50mg/일 내지 350mg/일, 1mg/일 내지 300mg/일, 10mg/일 내지 300mg/일, 및 50mg/일 내지 250mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 마보릭사포르 또는 이의 염이고 약 50mg/일 내지 약 100mg/일, 약 50mg/일 내지 200mg/일, 및 50mg/일 내지 400mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 사로글리타자르 또는 이의 염이고 약 0.1mg/일 내지 약 5mg/일, 약 1mg/일 내지 4mg/일, 및 1.5mg/일 내지 4.5mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 메브로페닌 또는 이의 염이고 약 1mg/일 내지 약 50mg/일, 약 1mg/일 내지 45mg/일, 및 5mg/일 내지 35mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 사이클렌 또는 이의 염이고 약 0.01mg/일 내지 약 0.5mg/일, 약 0.1mg/일 내지 0.5mg/일, 및 0.05mg/일 내지 0.3mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제 또는 둘 모두는 카수가마이신 또는 이의 염이고 약 1mg/일 내지 약 500mg/일, 약 5mg/일 내지 250mg/일, 및 10mg/일 내지 350mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 아자시티딘 또는 이의 염이고 약 1mg/일 내지 약 100mg/일, 약 1mg/일 내지 200mg/일, 및 1mg/일 내지 300mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제 또는 둘 모두는 플레릭사포르 또는 이의 염이고 약 1mg/일 내지 약 50mg/일, 약 1mg/일 내지 45mg/일, 및 5mg/일 내지 35mg/일의 일일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 카프레오마이신 또는 이의 염이고 약 50mg/일 내지 약 1,000mg/일, 약 10mg/일 내지 700mg/일, 및 20mg/일 내지 800mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 펜타미딘 또는 이의 염이고 약 50mg/일 내지 약 500mg/일, 약 30mg/일 내지 400mg/일, 및 100mg/일 내지 300mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 스펙티노마이신 또는 이의 염이고 약 500mg/일 내지 약 5,000mg/일, 약 250mg/일 내지 2,500mg/일, 및 100mg/일 내지 4,500mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 플루마티닙 또는 이의 염이고 약 50mg/일 내지 약 1,000mg/일, 약 100mg/일 내지 1,500mg/일, 및 50mg/일 내지 5,000mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 리트로네십 또는 이의 염이고 약 10mg/일 내지 약 3,000mg/일, 약 50mg/일 내지 2,500mg/일, 및 20mg/일 내지 2,000mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 다라플라디브 또는 이의 염이고 약 10mg/일 내지 약 1,000mg/일, 약 50mg/일 내지 500mg/일, 및 100mg/일 내지 800mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 플록수리딘 또는 이의 염이고 약 1mg/일 내지 약 100mg/일, 약 5mg/일 내지 80mg/일, 및 10mg/일 내지 100mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에 따르면, SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 플루다라빈 또는 이의 염이고 약 1mg/일 내지 약 100mg/일, 약 2mg/일 내지 80mg/일, 및 5mg/일 내지 60mg/일의 1일 용량으로 사용하기 위한 것이다.
일부 실시형태에서, 약학적 조성물은 약학적으로 허용가능한 담체, 보조제 또는 부형제를 포함한다.
본 명세서에서 사용된 용어 "담체", "보조제" 또는 "부형제"는 활성제가 아닌 약학적 조성물의 임의의 성분을 지칭한다. 본 명세서에서 사용된 용어 "약학적으로 허용가능한 담체"는 비-독성, 불활성 고체, 반-고체 액체 충전제, 희석제, 캡슐화 물질, 임의 유형의 제형 보조물, 또는 단순히 멸균 수성 매질 예컨대 식염수를 지칭한다. 약학적으로 허용가능한 담체로 역할을 할 수 있는 물질의 일부 예는 락토스, 글루코스 및 수크로스와 같은 당, 옥수수 전분 및 감자 전분과 같은 전분, 카르복시메틸 셀룰로오스 나트륨, 에틸 셀룰로오스 및 셀룰로오스 아세테이트와 같은 셀룰로오스 및 그의 유도체; 분말화된 트라가칸트; 맥아, 젤라틴, 활석; 코코아 버터 및 좌약 왁스와 같은 부형제; 낙화생유, 면실유, 홍화유, 참기름, 올리브유, 옥수수유, 및 대두유와 같은 오일; 프로필렌 글리콜과 같은 글리콜, 글리세린, 소르비톨, 만니톨 및 폴리에틸렌 글리콜과 같은 폴리올; 에틸 올레이트 및 에틸 라우레이트와 같은 에스테르, 한천; 수산화마그네슘 및 수산화알루미늄과 같은 완충제; 알긴산; 발열원-없는 물; 등장 식염수, 링거 용액; 에틸알코올 및 인산염 완충 용액뿐만 아니라 약학적 제형에 사용되는 기타 비-독성 호환 물질이다. 본 명세서에서 담체로 작용할 수 있는 물질의 일부 비-제한적 예는 설탕, 전분, 셀룰로스 및 이의 유도체, 분말화된 트라가칸트, 맥아, 젤라틴, 활석, 스테아르산, 스테아르산마그네슘, 황산칼슘, 식물성 오일, 폴리올, 알긴산, 발열원-없는 물, 등장 식염수, 인산염 완충 용액, 코코아 버터(좌약 베이스), 유화제뿐만 아니라 기타 약학적 제형에 사용되는 기타 비-독성 약학적 호환 물질을 포함한다. 나트륨 라우릴 설페이트와 같은 습윤제 및 윤활제뿐만 아니라 착색제, 향미제, 부형제, 안정제, 항산화제 및 보존제가 또한 존재할 수 있다. 임의의 비-독성, 불활성 및 효과적인 담체를 사용하여 본 명세서에서 고려되는 조성물을 제형화할 수 있다. 이와 관련하여 적합한 약학적으로 허용가능한 담체, 부형제 및 희석제는 The Merck Index, Thirteenth Edition, Budavari et al., Eds., Merck & Co., Inc., Rahway, N.J. (2001); CTFA (Cosmetic, Toiletry, and Fragrance Association) International Cosmetic Ingredient Dictionary and Handbook, Tenth Edition (2004); 및 "Inactive Ingredient Guide", U.S. Food and Drug Administration (FDA) Center for Drug Evaluation and Research (CDER) Office of Management에 기술된 것들과 같이 당업계의 통상인에게 잘 알려져 있으며, 그의 모든 내용은 그 전체가 참조로 본 명세서에 포함된다. 본 조성물에 유용한 약학적으로 허용가능한 부형제, 담체 및 희석제의 예는 증류수, 생리 식염수, 링거액, 덱스트로스 용액, 행크액 및 DMSO를 포함한다. 이들 추가적인 불활성 성분, 뿐만 아니라 효과적인 제형 및 투여 절차는 당업계에 잘 알려져 있고 표준 교과서, 예컨대 Goodman and Gillman's: The Pharmacological Bases of Therapeutics, 8th Ed., Gilman et al. Eds. Pergamon Press (1990); Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed., Mack Publishing Co., Easton, Pa. (1990); 및 Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 21st Ed., Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, Pa., (2005)에 기술되어 있으며, 이들 각각은 그 전체가 참조로 본 명세서에 포함된다. 현재 개시된 조성물은 또한 리포좀, ISCOMS, 서방성 입자, 및 혈청에서 펩티드 또는 폴리펩티드의 반감기를 증가시키는 다른 비히클과 같은 인위적으로 생성된 구조에 함유될 수 있다. 리포솜은 에멀젼, 폼, 미셀, 불용성 단층, 액정, 인지질 분산액, 라멜라층 등을 포함한다. 현재 기술된 펩티드와 함께 사용하기 위한 리포솜은 일반적으로 중성 및 음으로 하전된 인지질 및 스테롤 예컨대 콜레스테롤을 포함하는 표준 소포-형성 지질로부터 형성된다. 지질의 선택은 일반적으로 리포좀 크기 및 혈액 내 안정성과 같은 고려사항에 의해 결정된다. 예를 들어, Coligan, J. E. et al, Current Protocols in Protein Science, 1999, John Wiley & Sons, Inc., New York에 의해 검토된 바와 같이 리포솜을 제조하기 위한 다양한 방법이 이용가능하고, 또한 미국 특허 번호 4,235,871, 4,501,728, 4,837,028 및 5,019,369를 참고한다.
담체는 전체에서 본 명세서에 제시된 약학적 조성물 약 0.1 내지 약 99.99999 중량%를 포함할 수 있다.
스크리닝 검정
일부 실시형태에 따르면, 코로나바이러스 감염을 치료하거나 예방하는데 작용제의 유효성을 스크리닝하는 방법이 제공되며, 상기 방법은 막투과성 코로나바이러스 E 또는 3a 단백질을 포함하는 세포를 제공하는 것, 세포를 작용제와 접촉시키는 것, 및 세포의 성장에 대한 작용제의 효과를 결정하는 것을 포함하며, 여기서 세포 성장에 대한 작용제의 실질적인 효과는 작용제가 코로나바이러스 감염을 치료하거나 예방하고, 이에 의해 코로나바이러스 감염을 치료하거나 예방하는데 있어 작용제의 유효성을 스크리닝하는데 효과적이라는 것을 나타낸다.
일부 실시형태에서, 방법은 음성 검정이다. 일부 실시형태에서, 세포는 막투과성 E 단백질 또는 3a 단백질에 기인한 성장 지연을 특징으로 한다. 일부 실시형태에서, 성장 지연을 완화하는 작용제는 코로나바이러스 감염을 치료하거나 예방하는데 효과적인 것으로 나타난다.
일부 실시형태에서, 방법은 양성 검정이다. 일부 실시형태에서, 세포는 E 단백질 또는 3a 단백질에 의해 형성된 채널에 기인하여 낮은 [K+] 배지 경험 성장에서 성장한 K+-흡수 결핍 세포이다. 일부 실시형태에서, 성장 지연을 유도하는 작용제는 코로나바이러스 감염을 치료하거나 예방하는 데 효과적인 것으로 나타난다.
일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 SARS-CoV이다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV는 SARS-CoV-1 및 SARS-CoV-2 중 임의의 하나이다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 E 단백질 또는 3a 단백질은 각각 SARS-CoV-1 E 단백질 또는 3a 단백질이다. 일부 실시예에서, 코로나바이러스 E 단백질 또는 3a 단백질은 각각 SARS-CoV-2 E 단백질 또는 3a 단백질이다.
일부 실시형태에서, 방법은 음성 검정 및 양성 검정 둘 모두를 수행하는 것을 포함한다.
일부 실시형태에서, 세포는 박테리아 세포이다. 일부 실시형태에서, 세포는 외인성으로 제공된(예를 들어, 발현된) 막투과성 SARS-CoV E 단백질 또는 3a 단백질 외에 내인성 칼륨 흡수가 없다.
본 명세서에 제공된 스크리닝 방법에 이용가능한 박테리아 세포를 성장시키기 위한 비-제한적 예는 다음을 포함한다: Astrahan, P. et al., Acta 1808, 394-8 (2011); Santner, P. et al. Biochemistry 57, 5949-5956 (2018), 및 Taube, R., Alhadeff, R., Assa, D., Krugliak, M. & Arkin, I. T. PLoS One 9, e105387 (2014).
일부 실시형태에서, 검정은 작용제에 대한 내성을 발생시키는 바이러스의 민감성을 결정하기 위한 것이다.
본 명세서에서 사용된 용어 "약"은 값과 조합될 때 기준 값의 플러스 및 마이너스 10%를 지칭한다. 예를 들어, 약 1,000나노미터(nm)의 길이는 1000nm±100nm의 길이를 지칭한다.
본 명세서 및 첨부된 청구범위에서 사용되는 단수 형태 "a", "an" 및 "the"는 문맥상 명백하게 달리 지시하지 않는 한 복수의 지시대상을 포함함을 주지한다. 따라서, 예를 들어 "폴리뉴클레오티드"에 대한 언급은 복수의 이러한 폴리뉴클레오티드를 포함하고 "폴리펩티드"에 대한 언급은 하나 이상의 폴리펩티드 및 당업자에게 공지된 이의 등가물에 대한 언급 등을 포함한다. 청구항은 임의의 선택적 요소를 배제하도록 작성될 수 있음을 추가로 주지한다. 이와 같이, 이 진술은 청구항 요소의 인용 또는 "부정적" 제한의 사용과 관련하여 "오로지", "오직" 등과 같은 이러한 배타적 용어를 사용하기 위한 선행 근거로 역할을 하기 위한 것이다.
"A, B, C 등 중 적어도 하나"와 유사한 관례가 사용되는 이들 경우에, 일반적으로 이러한 구성은 당업자가 관례를 이해할 것이라는 관점에서 의도된다(예를 들어, "A, B 및 C 중 적어도 하나를 갖는 시스템"은 A 단독, B 단독, C 단독, A와 B 함께, A와 C 함께, B와 C 함께, 및/또는 A, B, C 함께 등을 갖는 시스템을 포함하지만 이에 제한되지는 않다. 설명, 청구항 또는 도면에 있든 관계없이 2개 이상의 대체 용어를 제시하는 거의 모든 분리 단어 및/또는 구는 용어 중 하나, 용어 중 하나 또는 용어 둘 모두를 포함할 가능성을 고려하는 것으로 이해되어야 한다는 것을 당업자는 추가로 이해할 것이다. 예를 들어, "A 또는 B"라는 문구는 "A" 또는 "B" 또는 "A 및 B"의 가능성을 포함하는 것으로 이해될 것이다.
명료함을 위해 별도의 실시형태의 맥락에서 기술된 발명의 특정 특징은 또한 단일 실시형태에서 조합되어 제공될 수 있음이 이해된다. 역으로, 간결함을 위해 단일 실시형태의 맥락에서 기술된 발명의 다양한 특징은 또한 별도로 또는 임의의 적합한 하위-조합으로 제공될 수 있다. 발명에 관한 실시형태의 모든 조합은 본 발명에 의해 구체적으로 포될되고 각각의 및 모든 조합이 개별적으로 명시적으로 개시된 것처럼 본 명세서에 개시된다. 부가하여, 다양한 실시형태의 모든 하위-조합 및 그 요소는 본 발명에 의해 구체적으로 포괄되고, 마치 각각의 및 모든 이러한 하위-조합이 개별적으로 그리고 명시적으로 본 명세서에 개시된 것처럼 본 명세서에 개시된다.
본 발명의 추가적인 목적, 이점 및 신규한 특징은 제한하려는 의도가 아닌 하기 실시예를 검토함으로써 당업자에게 명백해질 것이다. 부가적으로, 상기 본 명세서에 기술되고 하기 청구범위 섹션에서 청구된 바와 같은 본 발명의 다양한 실시형태 및 양태의 각각은 다음 실시예에서 실험적 뒷받침을 발견한다.
상기 본 명세서에 기술되고 하기 청구범위 섹션에서 청구된 바와 같은 본 발명의 다양한 실시형태 및 양태는 다음 실시예에서 실험적 뒷받침을 발견한다.
실시예
일반적으로, 본 명세서에서 사용되는 명명법 및 본 발명에서 이용되는 실험실 절차는 분자, 생화학적, 미생물 및 재조합 DNA 기술을 포함한다. 이러한 기술은 문헌에 철저히 설명되어 있다. 예를 들어, "Molecular Cloning: A laboratory Manual" Sambrook et al., (1989); "Current Protocols in Molecular Biology" Volumes I-III Ausubel, R. M., ed. (1994); Ausubel et al., "Current Protocols in Molecular Biology", John Wiley and Sons, Baltimore, Maryland (1989); Perbal, "A Practical Guide to Molecular Cloning", John Wiley & Sons, New York (1988); Watson et al., "Recombinant DNA", Scientific American Books, New York; Birren et al. (eds) "Genome Analysis: A Laboratory Manual Series", Vols. 1-4, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York (1998); 미국 특허 번호 4,666,828; 4,683,202; 4,801,531; 5,192,659 및 5,272,057에 제시된 바와 같은 방법론; "Cell Biology: A Laboratory Handbook", Volumes I-III Cellis, J. E., ed. (1994); "Culture of Animal Cells - A Manual of Basic Technique" by Freshney, Wiley-Liss, N. Y. (1994), Third Edition; "Current Protocols in Immunology" Volumes I-III Coligan J. E., ed. (1994); Stites et al. (eds), "Basic and Clinical Immunology" (8th Edition), Appleton & Lange, Norwalk, CT (1994); Mishell and Shiigi (eds), "Strategies for Protein Purification and Characterization - A Laboratory Course Manual" CSHL Press (1996)를 참조하며; 이들 모두는 참고로 포함된다. 기타 일반 참조는 이 문서 전반에 걸쳐 제공된다.
재료 및 방법
박테리아 균주
K12 대장균의 3가지 균주가 현행 연구에 사용되었다: DH10B, LB650 및 LR1. DH10B 세포는 Invitrogen(캘리포니아주 칼즈배드 소재)에서 구입했다. LB650 박테리아(ΔtrkG, ΔtrkH, 및 ΔkdpABC5 시스템)는 칼륨 흡수와 관련된 유전자에 결실을 함유한다(Stumpe, S. & Bakker, E. P. Arch Microbiol 167, 126-36 (1997)). LR1 박테리아는 pHluorin이라고 하는 pH 민감성 녹색 형광 단백질(GFP)의 염색체 카피를 함유하고 있다(Miesenbock, G and De Angelis, D A and Rothman, J E. Nature 394, 192-5 (1998)).
플라스미드
SARS-CoV-2 E 단백질, 3a 단백질 및 인플루엔자 M2 채널은 pMAL-p2X 플라스미드(New England Biolabs, 매사추세츠주 입스위치 소재)를 사용하여 말토스 결합 단백질에 대한 융합 단백질로 발현되었다. 바이러스 단백질에 대한 유전자는 7개 아미노산, 6개 히스티딘 및 3' 말단의 정지 코돈의 링커에 대해 코딩하는 뉴클레오티드 서열과 함께 추가되었다. EcoRI 및 XbaI 제한 부위는 각각 5' 및 3' 말단에 위치되었다. 서열은 GenScript(뉴저지주 피스카타웨이 소재)에 의해 합성되었다. 단백질 발현은 표시된 바와 같이 성장 배지에 이소프로필 β-D-1-티오갈락토피라노시드(IPTG)를 첨가함에 의해 달성되었다.
화학물질
IPTG는 Biochemika-Fluka(스위스 부크스 소재)에서 구입했다. 다른 모든 화학물질은 Sigma-Aldrich 연구소(이스라엘 레호보트 소재)에서 구입했다.
성장 배지
리소제니 브로쓰(LB)는 다른 언급이 없는 한 모든 박테리아 성장에 사용되었다(Bertani, G. J Bacteriol 62, 293-300 (1951)). LBK는 KCl이 10 gr/L에서 NaCl을 대체한다는 LB 예상과 유사했다. 모든 배지는 50μg/ml의 암피실린을 함유했다.
박테리아 성장
바이러스 키메라를 담지하거나 결하는(참조로서) 대장균 DH10B 박테리아를 37℃에서 LB에서 밤새 성장시켰다. 그 후, 성장 배양물을 희석하고 박테리아를 그의 O.D.600이 0.2에 도달할 때까지 성장시켰다. 오십(50)μl의 박테리아 배양액을 이어서 50μl의 상이한 처리를 함유하는 96-웰 평평한-바닥 플레이트(Nunc, 덴마크 로스킬레 소재) 안으로 분배했다. 달리 명시되지 않는 한, IPTG는 0에서 100μM의 범위인 최종 농도로 세포에 첨가되었다. D-글루코스는 1%의 농도로 첨가되었다. 구십육(96)-웰 플레이트를 Tecan Group(스위스 메네도르프 소재)으로부터의 Infinite 200에서 16시간 동안 37℃에서 일정한 고속 진탕 속도로 인큐베이션했다. O.D.600 판독값을 15분마다 기록했다. 모든 측정에 대해 이중 또는 삼중을 수행했다.
대장균 LB650 박테리아의 경우, 성장이 LBK에서 밤새 이루어졌다는 점을 제외하고는 동일한 프로토콜이 사용되었다. 그 후, 성장 배지를 LB로 교체하고 박테리아를 희석하여 그의 O.D.600이 0.2에 도달할 때까지 성장시키고 각 웰에서 다양한 처리로 2배로 희석하였다. 달리 명시되지 않는 한 IPTG를 LB650 박테리아에 최종 농도 10μM으로 첨가했다.
pHlux 검정
형질전환된 LR1 세포를 1% 글루코스 및 50μM 암피실린을 함유하는 LB 배지에서 밤새 배양하였다. 2차 배양물은 LB 배지에서 1:500으로 1차 배양물을 희석하고 0.6-0.8의 O.D.600으로 성장하도록 함에 의해 준비되었다. 2시간 동안 50μM IPTG의 첨가에 의해 단백질 합성을 유도하였다. IPTG 유도가 없는 배양물을 대조군으로 사용했다. 유도 2시간 후, 모든 세포의 O.D.600을 측정하고, 3,500g에서 10분 동안 펠릿화한 후 박테리아를 600nm에서 0.25의 광학 밀도로 McIlvaine 완충액(200mM Na2HPO4, 0.1M 시트르산으로 pH 7.6으로 조정된 0.9% NaCl, 0.9% Nacl)에 재현탁시켰다. 이어서 200μl의 세포 현탁액을 30μl의 McIlvaine 완충액과 함께 96웰 플레이트로 옮겼다. 플레이트에는 검정 버퍼만 있는 행과 유도가 없는 배양물이 포함되어 있다. 형광 측정은, 여기가 390nm와 466nm 사이에서 이동하면서 520nm로 설정된 방출을 갖는 마이크로플레이트 판독기(Infinite F200 pro, Tecan)에서 수행되었다.
액체 취급 시스템(Tecan)을 사용하여 0.9% NaCl을 갖는 70μl의 300mM 시트르산을 박테리아에 첨가했다. 산의 첨가 후 각 웰의 형광 방출은 50초 동안 두 필터 쌍을 번갈아 판독하여 측정했다. 2개의 다르게 여기된 방출에 대한 비율인,
Figure pct00001
를 계산하고 다음 방정식을 사용하여 양성자 농도로 변환했다:
Figure pct00002
Vero-E6 세포를 테스트된 화합물(그 농도를 포함한 약물은 도 23에 기술되어 있음)로 20시간 동안 전처리하고 표시된 바와 같은 화합물의 존재에서 감염 다중도(MOI) 0.001 및 0.01에서 SARS-CoV-2로 감염시켰다. 동일한 DMSO 농도를 갖는 배지를 무-약물 대조군으로 사용하였다. 대조군에서 독성의 약물 효능은 MTT 검정에 의해 감염 후 24시간에 평가되었다. 모든 감염 실험은 BSL-3 시설에서 수행되었다.
결과
3가지 최근에 개발된 박테리아-기반 검정(Astrahan, P. et al. Biochim Biophys Acta 1808, 394-8 (2011); Santner, P. et al. Biochemistry 57, 5949-5956 (2018); Taube, R., Alhadeff, R., Assa, D., Krugliak, M. & Arkin, I. T. PLoS One 9, e105387 (2014); Tomar, P. P. S., Oren, R., Krugliak, M. & Arkin, I. T. Viruses 11 (2019))이 SARS-CoV-2 E 단백질이 이온 채널인지 조사하도록 맞춤화되었다.
이들 검정은 정량적이고 신속하게 구현하기 쉽고 억제제 식별을 위한 고처리량 스크리닝에 잘 따른다. 더욱이, 각각의 이들 검정은 공지된 바이로포린에 사용되었고 비-전도성 막관통 도메인을 구별하는 것으로 나타났다(Tomar, P. P. S., Oren, R., Krugliak, M. & Arkin, I. T., Viruses 11 (2019)). 마지막으로, 검정 중 하나는 임상 사용 이전에 바이러스가 채널의 임의의 특정 억제제에 대한 내성을 발달시켜야 하는 옵션을 예측하는 데에도 사용할 수 있다(Assa, D., Alhadeff, R., Krugliak, M. & Arkin, I. T., J. Mol Biol 428, 4209-4217 (2016)).
적절한 막 혼입을 보장하기 위해, 발명자들은 pMAL 단백질 융합 및 정제 시스템(New England Biolabs)을 사용하였다. 다중 바이로포린과 함께 성공적으로 사용된 이 작제물에서 SARS-CoV-2 E 단백질 또는 3a 단백질은 주변 세포질 말토즈 결합 단백질의 카르복실 말단에 융합된다. 양성 대조군으로서, 발명자들은 인플루엔자 A 바이러스, 아미노아다만탄에 의해 억제될 수 있는 전형적인 바이로포린으로부터의 M2 채널에 대한 단백질의 활성을 비교하였다(Pinto, L. H., Holsinger, L. J. & Lamb, R. A. Cell 69, 517-28 (1992)).
수행된 첫 번째 테스트는 SARS-CoV-2 E 및 3a 단백질의 채널 활성이 막 투과성을 유도하고 이에 의해 박테리아 성장에 부정적인 영향을 미칠 수 있는지 여부를 조사하는 것이었다(음성 유전 테스트). 수많은 다른 바이로포린에서 볼 수 있듯이, 증가하는 수준에서 발현될 때 채널 활성은 양성자 구동력에 대한 그의 유해한 영향으로 인해 성장을 방해한다. 결과적으로 채널-차단 약물은 성장 지연을 완화하는 그 능력으로 인해 용이하게 식별될 수 있다. 도 1의 데이터는 SARS-CoV-2 E 또는 3a 단백질의 발현이 단백질의 발현 수준에 비례하여 유의한 박테리아 성장 지연을 야기한다는 것을 보여준다. 이 거동은 알려진 양성자 채널인 M2 인플루엔자 A 단백질의 것과 유사하다.
발명자들은 성장 지연이 박테리아에서 이종 단백질 발현의 드문 결과가 아님을 인식하였다. 환언하여, 의사 요인은 채널 활성에 부가하여 박테리아의 사멸로 이어질 수 있다. 따라서 발명자들은 박테리아 사멸이 다음 3가지 방식으로 단백질 채널 활성에 기인함을 입증한다: (i) 발명자들은 E 및 3a 단백질 채널 차단제를 식별하고 그들이 박테리아의 성장을 소생시킬 수 있음을 보여준다; (ii) 발명자들은 채널 활성이 성장에 필수적인 보완적인 박테리아의 성장 검정을 개발했다(양성 유전 테스트); 그리고 (iii) 발명자들은 단백질 발현이 pH 민감성 GFP를 포함하는 검정에서 H+ 전도도를 증가시킨다는 것을 보여준다(Santner, P. et al. Biochemistry 57, 5949-5956 (2018)).
발명자들이 수행한 두 번째 실험 테스트는 K+ 전도도를 조사한다. 구체적으로, K+-흡수 결핍 박테리아(Stumpe, S. & Bakker, E. P. Arch Microbiol 167, 126-36 (1997))는 배지가 K+로 보충되지 않는 한 성장할 수 없다. 그러나, K+ 수송이 가능한 채널이 이종적으로 발현될 때, 박테리아는 낮은 K+ 배지 하에서도 번성할 수 있다(Taube, R. et al. PLoS One 9, e105387 (2014); Tomar, P. P. S., Oren, R., Krugliak, M. & Arkin, I. T. Viruses 11 (2019)). 따라서 이 경우에 바이러스 채널은 박테리아 성장에 필수적이다(양성 유전 테스트). 마지막으로, 도 2에 도시된 결과는 SARS-CoV-2 E 또는 3a 단백질의 발현이 그렇지 않으면 제한 조건(즉, 낮은 [K+])에서 K+-흡수 결핍 박테리아의 성장률을 증가시킬 수 있음을 나타낸다.
채널 활성을 검사하기 위한 최종 테스트는 pH-민감성 녹색 형광 단백질을 발현하는 박테리아에서 단백질-매개된 H+ 플럭스를 검출하는 것을 기반으로 했다(Santner, P. et al. Biochemistry 57, 5949-5956 (2018)). 배지에 산성 용액의 추가는 박테리아가 H+ 이송이 가능한 채널을 발현하는 경우 세포질 산성화를 초래할 것이다. 결과적으로, 도 3에 도시된 바와 같이 SARS-CoV-2로부터 E 또는 3a 단백질의 발현은 양성자를 수송하는 그 능력을 나타내는 상당한 세포질 산성화를 초래한다. 유사한 산성화가 인플루엔자 A M2 채널과 같은 다른 바이로포린에서 검출되었다.
3가지 박테리아 검정 모두 SARS-CoV-2 E 및 3a 단백질이 잠재적 바이로포린인 것으로 나타났음을 고려하여, 발명자들은 공지된 채널 차단제의 작은 데이터 세트를 스크리닝하는 것을 제시했다. 첫째, "막 트랜스포터/이온 채널"의 영역에서 MedChemExpress(미국 뉴저지 소재)로부터의 372개 화합물의 라이브러리. 이들 각각의 화학물질은 E 단백질에 대해 상기에 기술된 양성 및 음성 유전 테스트에서 시험되었다.
음성 검정에서, 박테리아는 상승된 수준에서 SARS-CoV-2 E 단백질의 발현으로 인해 상당한 성장 지연을 경험한다(도 1). 따라서, 채널 차단제는 이 성장 지연을 완화하기 때문에 용이하게 식별될 수 있다. 이 스크린은 본질적으로 박테리아에 독성이 없는 화학물질을 선택하기 때문에 잠재적인 독성을 감소시킨다는 것을 인지한다. 구체적으로 파일럿 라이브러리에서 각각의 화학물질을 배지에 추가한 다음 성장을 기록하고 임의의 처리를 받지 않은 박테리아와 비교했다. 372개 화합물 약물 라이브러리 중에서 여러 화학물질이 SARS-CoV-2 E 단백질 활성으로 인해 박테리아가 겪는 성장 억제를 완화했다. 특히 주의할 점은 도 4a에 도시된 바와 같이 박테리아 성장을 향상시키는 글리클라지드와 메만틴이다.
양성 검정 스크리닝에서, 상호 사진(reciprocal picture)이 수득된다. 낮은 [K+] 배지에서 자란 K+-흡수 결핍 박테리아는 SARS-CoV-2 E 단백질의 (낮은 수준) 발현으로 인해 성장 증강을 경험헌다(도 2). 따라서, 채널 차단제는 성장 지연을 초래하기 때문에 식별될 수 있다. 음성 검정과 유사한 방식으로, 파일럿 라이브러리에서 각각의 화학물질을 배지에 추가한 다음 성장을 기록했다. 다시 한 번, 글리클라지드 및 메만틴은 둘 모두 성장을 억제한다는 점에서 테스트에서 긍정적으로 점수를 받았다(도 4b).
동일한 화학물질이 상호 검정에서 긍정적으로 점수를 받았기 때문에 상기 결과는 고무적이다. 양 검정 모두에서 긍정적으로 점수를 받으면 임의의 의사 요인이 배제된다. E 단백질이 박테리아에 해로울 때 화학물질은 성장을 향상시켰다. 그러나, E 단백질이 박테리아에 필수적인 경우, 동일한 화합물이 성장에 해로웠다.
본 발명자들의 결과는 SARS-CoV-2 E 단백질이 이온 채널임을 입증한다. 코로나바이러스 E 단백질은 독성에 필수적이기 때문에 매력적인 약물 표적을 나타낸다. 본 발명자들의 스크리닝 노력은 E 단백질 채널 활성을 차단하는 2가지 억제제를 식별했다. 약물 둘 모두 다른 적응증에 대한 인간 사용이 승인되었으므로, 그것은 COVID-19 위기를 신속하게 완화할 수 있는 후보를 나타낸다.
더욱이, 스크린을 확장하고 SARS-CoV-2 E 단백질에 대해 3000개 분자를 스크리닝하고 SARS-CoV-2 3a 단백질에 대해 3,000개 분자를 스크리닝했다.
결과는 메만틴, 글리클라지드, 마보릭사포르, 사로글리타자르 마그네슘, 메브로페닌, 사이클렌, 카수가마이신, 아자시티딘 및 플레릭사포르 중 임의의 하나가 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제로 사용될 수 있고 따라서 매력적인 COVID-19 약물로 사용될 수 있다는 것을 나타낸다.
결과는 더욱이 카프레오마이신, 펜타미딘, 스펙티노마이신, 카수가마이신, 플레릭사포르, 플루마티닙, 리트로네십, 다라플라디브, 플록수리딘 및 플루다라빈 중 임의의 하나가 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제로 사용될 수 있고 따라서 매력적인 COVID-19 약물로 사용될 수 있다는 것을 나타낸다.
더욱이, 발명자들은 SARS-CoV-2 바이러스로 감염된 세포의 생존력에 대한 본 명세서에서 테스트된 화합물의 효과를 나타냈다. 구체적으로, 결과는 SARS-CoV-2로 감염되었을 때 0.01의 감염 다중도(MOI)에서 Vero-E6 세포의 세포 생존력에서 ~60% 감소가 있었던 반면, 약물로 사전처리된 세포는 바이러스로 감염된 후 세포 생존율의 ~10-50% 감소를 나타냈다는 것을 나타낸다(도 23).
발명이 그의 특정 실시형태와 관련하여 기술되었지만, 많은 대안, 변형 및 변경이 당업자에게 명백할 것이라는 것이 분명하다. 따라서, 첨부된 특허청구범위의 사상 및 넓은 범주 내에 속하는 이러한 모든 대안, 변형 및 변경을 포괄하는 것으로 의도된다.
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Claims (14)

  1. SARS-CoV-2 독성의 치료 또는 예방을 필요로 하는 대상체에서 SARS-CoV-2 독성을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 대상체에게 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제 및 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제 중 하나의 치료적으로 유효한 양을 투여하고, 이에 의해 상기 대상체에서 SARS-CoV-2 독성을 치료 또는 예방하는 것을 포함하는, 방법.
  2. 제1항에 있어서, 상기 예방하는 것은 상기 대상체의 세포로 SARS-CoV-2 진입, 상기 대상체의 세포에서 상기 SARS-CoV-2의 비코팅, 상기 대상체의 세포로부터 상기 SARS-CoV-2의 방출, 및 이의 임의의 조합 중 하나를 예방하는 것을 포함하는, 방법.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 대상체는 SARS-CoV-2에 감염되었거나 감염된 것으로 의심되는, 방법.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 5-아자시티딘, 메만틴, 글리클라지드, 마보릭사포르, 사로글리타자르 마그네슘, 메브로페닌, 사이클렌, 카수가마이신, 플레릭사포르 및 이의 임의의 염으로 구성된 군으로부터 선택된 적어도 하나의 분자인, 방법.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 0.01 내지 500mg/kg의 1일 용량으로 사용하기 위한 것인, 방법.
  6. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 진세노사이드인, 방법.
  7. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 메만틴인, 방법.
  8. 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 카프레오마이신, 펜타미딘, 스펙티노마이신, 카수가마이신, 플레릭사포르, 플루마티닙, 리트로네십, 다라플라디브, 플록수리딘 및 플루다라빈으로 구성된 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 분자인. 방법.
  9. 제8항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 카프레오마이신인, 방법.
  10. SARS-CoV-2 독성의 치료 또는 예방을 필요로 하는 대상체에서 SARS-CoV-2 독성의 치료 또는 예방에 사용하기 위한 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제 및/또는 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제를 포함하는 약학적 조성물.
  11. 제10항에 있어서, 상기 예방은 상기 대상체의 세포로 SARS-CoV-2 진입, 상기 SARS-CoV-2의 비코팅, 상기 대상체의 세포로부터 상기 SARS-CoV-2의 방출, 및 이의 임의의 조합 중 하나의 예방을 포함하는, 약학적 조성물.
  12. 제10항 또는 제11항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 5-아자시티딘 메만틴, 글리클라지드, 마보릭사포르, 사로글리타자르 마그네슘, 메브로페닌, 사이클렌, 카수가마이신, 플레릭사포르 및 이의 임의의 염으로 구성된 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 분자인, 약학적 조성물.
  13. 제10항 또는 제11항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 E 단백질 채널 차단제는 진세노사이드인, 약학적 조성물.
  14. 제10항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 SARS-CoV-2 3a 단백질 억제제는 카프레오마이신, 펜타미딘, 스펙티노마이신, 카수가마이신, 플레릭사포르, 플루마티닙, 리트로네십, 다라플라디브, 플록수리딘 및 플루다라빈으로 구성된 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 분자인, 약학적 조성물.
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