KR20230023711A - 개선된 총채벌레 저항성을 갖는 캅시쿰 아누움 식물 - Google Patents

개선된 총채벌레 저항성을 갖는 캅시쿰 아누움 식물 Download PDF

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Abstract

본 발명은 정량적 형질 유전자좌 QTL8을 포함하는 염색체 8 상의 유전자이입 단편을 포함하는 캅시쿰 아누움(Capsicum annuum) 식물에 관한 것이며, 여기서 상기 QTL8은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스(Frankliniella occidentalis)에 대한 개선된 저항성을 부여한다. 본 발명은 추가로 본 발명에 따른 식물에 의해 생산된 종자, 본 발명에 따른 식물이 성장될 수 있는 종자, 본 발명에 따른 식물 및 본 발명에 따른 식물의 부분에 의해 생산된 과실에 관한 것이다. 본 발명은 추가로 본 발명에 따른 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 추가로 본 발명에 따른 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 갖는 캅시쿰 아누움 식물을 생산하는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 추가로 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 캅시쿰 아누움 식물의 저항성을 개선시키는 방법, 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 캅시쿰 아누움 식물의 저항성을 개선시키기 위한 본 발명에 따른 QTL8의 용도에 관한 것이다. 본 발명은 추가로 본 발명에 따른 QTL8에 특이적인 유전자 마커 및 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 갖는 캅시쿰 아누움 식물을 선택하기 위한 그의 용도에 관한 것이다.

Description

개선된 총채벌레 저항성을 갖는 캅시쿰 아누움 식물
본 발명은 식물 육종의 분야에 관한 것이다. 정량적 형질 유전자좌 QTL8을 포함하는 염색체 8 상의 유전자이입 단편을 포함하는 캅시쿰 아누움(Capsicum annuum) 식물이 제공되며, 여기서 상기 QTL8은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스(Frankliniella occidentalis)에 대한 개선된 저항성을 부여한다. 본 발명은 본 발명에 따른 식물에 의해 생산된 종자, 본 발명에 따른 식물이 성장될 수 있는 종자, 본 발명에 따른 식물 및 본 발명에 따른 식물의 부분에 의해 생산된 과실을 추가로 제공한다. 본 발명은 본 발명에 따른 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법을 추가로 제공한다. 본 발명은 본 발명에 따른 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 갖는 캅시쿰 아누움 식물을 생산하는 방법을 추가로 제공한다. 본 발명은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 캅시쿰 아누움 식물의 저항성을 개선시키는 방법, 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 캅시쿰 아누움 식물의 저항성을 개선시키기 위한 본 발명에 따른 QTL8을 추가로 제공한다. 본 발명은 본 발명에 따른 QTL8에 특이적인 유전자 마커 및 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 갖는 캅시쿰 아누움 식물을 선택하기 위한 그의 용도를 추가로 제공한다.
캅시쿰 아누움 식물은 솔라나세아에(Solanaceae) 과의 초본 식물이다. 식물은 약 0.5-1.5 미터 (20-60 인치)에 달한다. 단일 백색 꽃이 고추 과실을 맺고, 이는 미숙성 시 녹색이고, 주로 적색으로 변하지만, 일부 품종은 갈색 또는 자주색으로 숙성될 수 있다. 종은 대부분의 기후를 견딜 수 있지만, 이들은 따뜻하고 건조한 기후에서 특히 생산적이다. 캅시쿰 아누움 종의 재배된 고추 식물은 상이한 유형의 고추, 예컨대 피망, 카옌 고추, 파프리카, 및 할라페뇨를 포함한다.
상업적 고추 재배에서 주요 해충 중 하나는 꽃노랑총채벌레(western flower thrips) (프랭클리니엘라 옥시덴탈리스)이다. 총채벌레 기생충감염은 식물에 및 가장 중요하게는 수액을 빨아먹음으로써 과실에 직접적인 손상을 초래함으로써 고추 생산에 영향을 미친다. 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스는 또한 고추의 파괴적인 바이러스 질환인 토마토 반점 위조 바이러스 (TSWV)의 천연 벡터이다. 따라서 고추 재배에서의 총채벌레의 충분한 방제는 또한, 예를 들어 때때로 전체 농경학적 성능에서의 감소를 나타내는 TSWV 저항성 품종의 재배에 대한 대안으로서 TSWV 확산을 방제하는 중요한 조치이다.
곤충 해충, 예컨대 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 갖는 캅시쿰 아누움 식물은 선행 기술에 기재되었다.
WO 2008/135510 A1은 베미시아(Bemisia) 및/또는 총채벌레 기생충감염에 대해 중간 저항성인 재배된 캅시쿰 아누움 식물을 기재하며, 여기서 상기 식물은 염색체 3 상에 저항성 QTL 및/또는 염색체 5 상에 저항성 QTL을 함유한다. 상기 저항성 QTL은 대표적인 종자가 수탁 번호 NCIMB 41428 하에 기탁된 공여자 식물로부터 수득가능하다.
WO 2015/000992 A1은 고추 식물의 게놈에서의 염색체 1 상에 위치한 QTL1, 염색체 10 상에 위치한 QTL2 및 또한 염색체 10 상에 위치한 QTL3으로부터 선택된 적어도 1개의 QTL의 존재의 결과로서 테르페노이드의 증가된 총 함량을 갖는 과실을 생산하는 고추 식물을 기재하며, 여기서 QTL1은 대표적인 종자가 수탁 번호 NCIMB 42138 하에 기탁된 공여자 식물로부터 수득가능한 바와 같고, QTL2는 대표적인 종자가 수탁 번호 NCIMB 42140 하에 기탁된 공여자 식물로부터 수득가능한 바와 같고 QTL3은 또한 대표적인 종자가 수탁 번호 NCIMB 42138 하에 기탁된 공여자 식물로부터 수득가능한 바와 같다. WO 2015/000992 A1은 테르페노이드의 증가된 총 함량을 갖는 식물이 이러한 증가된 테르페노이드 함량을 갖지 않는 식물과 비교하여 병원체 기생충감염에 대한 이점을 갖는다는 것을 명시한다.
고추 (캅시쿰 아누움)의 염색체 7 상 총채벌레 저항성 (프랭클리니엘라 옥시덴탈리스)을 위한 추가 주요 QTL은 IP.com 번호 IPCOM000247917D 하에 IP.com 선행 기술 데이터베이스에 개시되었다.
살충제의 사용에 대한 환경 친화적인 대안으로서 숙주 식물의 곤충 저항성을 증가시키기 위해 새롭고 개선된 저항성 공급원을 개발할 지속적인 필요가 있다. 따라서 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 새로운 총채벌레 저항성 QTL을 제공하는 것이 본 발명의 목적이다. 이들의 게놈에 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여할 수 있는 1개 이상의 QTL을 포함하는 캅시쿰 아누움 식물, 및 이러한 식물의 세포, 조직, 과실 및 다른 부분을 제공하는 것이 본 발명의 추가 목적이다. 이들의 게놈에 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여할 수 있는 1개 이상의 QTL을 포함하는 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법을 제공하는 것이 본 발명의 추가 목적이다. 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 갖는 캅시쿰 아누움 식물을 생산하는 방법을 제공하는 것이 본 발명의 추가 목적이다. 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 캅시쿰 아누움 식물의 저항성을 개선시키는 방법을 제공하는 것이 본 발명의 추가 목적이다. 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여할 수 있는 QTL에 특이적인 유전자 마커를 제공하는 것이 본 발명의 추가 목적이다.
본 발명은 정량적 형질 유전자좌 QTL8을 포함하는 염색체 8 상의 유전자이입 단편을 포함하는 캅시쿰 아누움 식물을 제공하며, 여기서 상기는 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하고, 여기서 QTL8은 염색체 8 상에서 서열식별번호(SEQ ID NO): 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_21과 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_40 사이에 위치하고, 여기서 캅시쿰 아누움 식물은 QTL8이 이형접합 형태로 존재할 때 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물이다. 본 발명은 본원에 정의된 바와 같은 QTL8을 상기 캅시쿰 아누움 식물로 유전자이입하는 단계를 포함하는, 캅시쿰 아누움 식물의 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 증진시키는 방법을 추가로 제공한다. 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물에서 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 증진시키기 위한 본원에 정의된 바와 같은 QTL8의 용도를 추가로 제공한다.
또한, 본 발명은 전술한 청구항 중 어느 한 항에 따른 캅시쿰 아누움 식물에 의해 생산된 종자를 제공하며, 여기서 종자는 본원에 기재된 바와 같은 QTL8을 포함한다. 본 발명은 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물이 성장될 수 있는 종자를 추가로 제공한다. 본 발명은 본원에 기재된 바와 같은 QTL8을 포함하는, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물 또는 본 발명에 따른 종자의 식물 세포, 조직 또는 식물 부분을 추가로 제공한다.
또한, 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분이 그의 게놈에 본원에 기재된 바와 같은 QTL8을 포함하는 지 여부를 결정하는 단계를 포함하는, 상기 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 하기 단계(들)를 포함하는, 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 갖는 캅시쿰 아누움 식물을 생산하는 방법을 제공한다: (i) 제1 캅시쿰 아누움 식물과 제2 식물을 교배시키는 단계이며, 여기서 제1 캅시쿰 아누움 식물은 그의 게놈에 본원에 기재된 바와 같은 QTL8을 포함하는 것인 단계; (ii) 임의로 (i)의 교배로부터 종자를 수확하고 그의 게놈에 QTL8을 포함하는 종자를 선택하는 단계.
또한, 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분에서 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 QTL의 존재 또는 부재를 결정하기 위한 마커를 제공하며, 여기서 마커는 염색체 8 상에서 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_21과 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_40 사이에 위치한 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 부여 QTL에 연결된다. 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분에서 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 1개 이상의 QTL의 존재 또는 부재를 결정하기 위한 본 발명에 따른 마커의 용도를 추가로 제공한다. 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분에서 본 발명에 따른 1개 이상의 마커의 존재 또는 부재를 결정하는 단계를 포함하는, 상기 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법을 추가로 제공한다.
또한, 본 발명은 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 핵산을 제공한다: 서열식별번호: 1 또는 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 3 또는 서열식별번호: 3의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 5 또는 서열식별번호: 5의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 7 또는 서열식별번호: 7의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 9 또는 서열식별번호: 9의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 11 또는 서열식별번호: 11의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 13 또는 서열식별번호: 13의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 15 또는 서열식별번호: 15의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 17 또는 서열식별번호: 17의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 19 또는 서열식별번호: 19의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 21 또는 서열식별번호: 21의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 23 또는 서열식별번호: 23의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 25 또는 서열식별번호: 25의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 27 또는 서열식별번호: 27의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 29 또는 서열식별번호: 29의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 31 또는 서열식별번호: 31의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 33 또는 서열식별번호: 33의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 35 또는 서열식별번호: 35의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 37 또는 서열식별번호: 37의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 39 또는 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 41 또는 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 43 또는 서열식별번호: 43의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 45 또는 서열식별번호: 45의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 47 또는 서열식별번호: 47의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 49 또는 서열식별번호: 49의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 51 또는 서열식별번호: 51의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 53 또는 서열식별번호: 53의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 55 또는 서열식별번호: 55의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 57 또는 서열식별번호: 57의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 59 또는 서열식별번호: 59의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 61 또는 서열식별번호: 61의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 63 또는 서열식별번호: 63의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 65 또는 서열식별번호: 65의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 67 또는 서열식별번호: 67의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 69 또는 서열식별번호: 69의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 71 또는 서열식별번호: 71의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 73 또는 서열식별번호: 73의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 75 또는 서열식별번호: 75의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 77 또는 서열식별번호: 77의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 및 서열식별번호: 79 또는 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 또는 그의 상보성 뉴클레오티드 서열을 포함함. 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분의 마커 보조 선택을 위한 서열식별번호: 1-80 또는 그의 단편으로 이루어진 군으로부터 선택된 1개 이상의 뉴클레오티드 서열의 용도를 추가로 제공하며, 여기서 상기 단편은 서열식별번호: 1-80으로 이루어진 군으로부터 선택된 상기 뉴클레오티드 서열 또는 상기 1개 이상의 뉴클레오티드 서열의 상보성 서열의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진다.
도 1: 총채벌레에 대힌 F4 재조합체 저항성 수준. 표현형 (1= 감수성, 9= 저항성). 유전자형, A, B 및 H는 Ch_07 상 QTL (좌측) 및 Ch_08 상 QTL (우측)에 대한 플랭킹 및 피크 마커에 기반하는 감수성, 저항성 또는 이형접합 대립유전자 상태를 지칭한다.
일반적인 정의
본 발명이 특정 방법론 또는 프로토콜로 제한되지 않는다는 것이 이해되어야 한다. 또한, 본원에 사용된 용어가 단지 특정 실시양태를 기재하기 위한 목적이고 오직 첨부된 청구항에 의해 제한될 본 발명의 범주를 제한하는 것으로 의도되지 않는다는 것이 이해되어야 한다. 본원 및 첨부된 청구항에 사용된 바와 같이, 단수 형태가 문맥상 명백하게 달리 지시되지 않는 한 복수형을 포함한다는 것이 유의되어야 한다. 따라서, 예를 들어, "벡터"에 대한 언급은 하나 이상의 벡터에 대한 언급이고 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 공지된 그의 등가물 등을 포함한다. 용어 "약"은 본원에서 대략, 거의, 그 즈음 또는 그 정도를 의미하는 데 사용된다. 용어 "약"이 수치 범위와 함께 사용될 때, 이는 제시된 수치 값의 상한 및 하한을 연장시킴으로써 해당 범위를 변형시킨다. 일반적으로, 용어 "약"은 본원에서 20 퍼센트, 바람직하게는 10 퍼센트만큼 위로 또는 아래로 (높게 또는 낮게) 변동시킴으로써 명시된 값의 위 및 아래의 수치 값을 변형시키는 데 사용된다. 본원에 사용된 바와 같은, 단어 "또는"은 특정 목록의 임의의 한 구성원을 의미하고 또한 해당 목록의 구성원의 임의의 조합을 포함한다. 본 명세서 및 하기 청구항에 사용될 때 단어 "포함하다" 및 "포함하는"은 하나 이상의 명시된 특색, 정수, 성분, 또는 단계의 존재를 구체화하는 것으로 의도되지만, 이들은 그의 하나 이상의 다른 특색, 정수, 성분, 단계, 또는 그룹의 존재 또는 추가를 배제하지 않는다. 명확성을 위해, 본 명세서에 사용된 특정 용어는 하기와 같이 정의되고 사용된다:
용어 "게놈"은 유기체의 유전 물질에 관한 것이다. 이는 DNA로 이루어진다. 게놈은 유전자 및 DNA의 비-코딩 서열 둘 다를 포함한다.
용어 "유전자"는 세포에서 메신저 RNA 분자 (mRNA)로 전사되는 영역 (전사 영역), 및 작동가능하게 연결된 조절 영역 (또한 조절 서열, 예를 들어 프로모터로 본원에 기재됨)을 포함하는 (게놈) DNA 서열을 의미한다. 따라서, 유전자는 여러 작동가능하게 연결된 서열, 예컨대 프로모터, 번역 개시에 수반되는 서열을 예를 들어 포함하는 5' 리더 서열, (단백질) 코딩 영역 (cDNA 또는 게놈 DNA) 및 전사 종결 부위를 예를 들어 포함하는 3' 비-번역 서열을 포함할 수 있다. 따라서, 유전자의 상이한 대립유전자는 유전자의 상이한 대안적인 형태이며, 이는 예를 들어 게놈 DNA 서열 (예를 들어, 프로모터 서열, 엑손 서열, 인트론 서열 등)의 1개 이상의 뉴클레오티드, mRNA 및/또는 코딩된 단백질의 아미노산 서열에서의 차이가 있는 형태일 수 있다. 유전자는 내인성 유전자 (기원 종 내) 또는 키메라 유전자 (예를 들어 트랜스진 또는 시스-진)일 수 있다. 유전자 서열의 "프로모터"는 특정 유전자의 전사를 개시하는 DNA의 영역으로 정의된다. 프로모터는 이들이 전사하는 유전자 근처, 동일한 가닥 상에, 및 DNA의 상류에 위치한다. 프로모터는 약 100-1000개의 염기 쌍 길이일 수 있다. 한 측면에서 프로모터는 유전자에 의해 코딩되는 단백질의 시작 코돈 (즉 ATG)의 약 1000개 이상의 염기 쌍, 예를 들어 약 1500 또는 2000개 상류의 영역으로 정의된다.
"유전자의 발현"은 적절한 조절 영역, 특히 프로모터에 작동가능하게 연결되는 DNA 영역이 생물학적으로 활성인, 즉 생물학적으로 활성인 단백질 또는 펩티드로 번역될 수 있거나 또는 그 자체가 (예를 들어, 전사후 유전자 침묵화 또는 RNAi에서) 활성인 RNA로 전사되는 공정을 지칭한다. 코딩 서열은 센스-배향일 수 있고 목적하는, 생물학적으로 활성인 단백질 또는 펩티드를 코딩한다.
용어 "단백질" 및 "폴리펩티드"는 상호교환가능하게 사용되고 특정 작용 방식, 크기, 3차원 구조 또는 기원과 관계없이 아미노산의 사슬로 이루어진 분자를 지칭한다. 따라서 단백질의 "단편" 또는 "일부"가 여전히 "단백질"로 지칭될 수 있다. "단리된 단백질"은 더 이상 그의 천연 환경에 있지 않은, 예를 들어 시험관내 또는 재조합 박테리아 또는 식물 숙주 세포에 있는 단백질을 지칭하는 데 사용된다.
용어 "펩티드 서열" 및 "아미노산 서열"은 단백질 또는 폴리펩티드의 1차 아미노산 서열을 지칭한다.
용어 "유전자좌" (복수형 유전자좌들)는 예를 들어 유전자 또는 유전자 마커가 발견되는 염색체 상의 특정 위치 또는 위치들 또는 부위를 의미한다.
본원에 사용된 바와 같이, QTL (정량적 형질 유전자좌)은 염색체 상 특정 위치를 차지하고 식물에서 특정 표현형 특징 또는 형질을 위한 유전적 지시를 함유하는 유전 단위이다 (보통 1개 이상의 분자 게놈 마커에 의해 표시됨). 유전자와 대조적으로, QTL의 정확한 경계는 공지되어 있지 않으나, 유전자 맵핑 및 후속 DNA 시퀀싱 공정의 관련 기술분야에 널리 공지된 미세 맵핑 기술을 사용함으로써 관련 기술분야의 통상의 기술자에 의해 과도한 부담 없이 발견될 수 있다. QTL은, 단독으로 또는 다른 유전자와 조합되어, 발현이 발현될 표현형 형질을 초래하는 적어도 하나의 유전자를 코딩하거나, 또는 단독으로 또는 다른 유전자와 조합되어, 발현이 발현될 표현형 형질을 초래하는 적어도 하나의 유전자의 발현을 제어하는 적어도 하나의 조절 영역을 코딩한다. QTL은 1개 이상의 분자 게놈 마커를 사용하여 QTL을 함유하는 유전자이입의 공여자의 게놈에서의 그의 유전자 위치를 나타냄으로써 정의될 수 있다. 결과적으로, 이들 1개 이상의 마커는 특정 유전자좌를 나타낸다.
유전자좌 사이의 거리는 통상적으로 동일한 염색체 상의 유전자좌 사이의 교차 빈도에 의해 측정된다. 2개의 유전자좌가 멀수록, 이들 사이에서 교차가 발생할 가능성은 더 크다. 반대로, 2개의 유전자좌가 서로 가까울 경우에, 이들 사이에서 교차가 발생할 가능성은 더 적다. 대체로, 1 센티모건 (cM)은 유전자좌 (마커) 사이의 1% 재조합과 동일하다. QTL이 다중 마커에 표시될 수 있을 때, 단부-지점 마커 사이의 유전자 거리는 QTL의 크기를 나타낸다. QTL을 정의하는 마커는 QTL에 연결된 마커 또는 QTL과 연결 불평형인 마커일 수 있다. 본원에 사용된 바와 같은, 마커 및/또는 게놈 영역의 맥락에서 사용될 때 용어 "연결된" 또는 "유전적으로 연결된"은 2개의 연결된 유전자좌 (예를 들어 마커 및 QTL)가 유전자 맵 상에서 10 cM 이하만큼 (즉 2개의 연결된 유전자좌 사이의 감수분열 재조합은 10% 이하의 빈도로 발생함), 보다 바람직하게는 9 cM 이하, 8 cM 이하, 7 cM 이하, 6 cM 이하, 5 cM 이하, 4 cM 이하, 3 cM 이하, 2 cM 이하, 1 cM 이하, 0.75 cM 이하, 0.5 cM 이하, 또는 심지어 0.25 cM 이하만큼 분리된 것을 의미한다. 본원에 사용된 바와 같은, 용어 "연결 불평형"은 유전자 유전자좌 또는 형질 (또는 둘 다)의 비-무작위 격리를 기재한다.
용어 "대립유전자(들)"는 특정 유전자좌에서의 유전자의 하나 이상의 대안적인 형태 중 임의의 것을 의미하고, 대립유전자 모두는 특정 유전자좌에서의 하나의 형질 또는 특징에 관한 것이다. 유기체의 이배체 세포에서, 제공된 유전자의 대립유전자는 염색체 상의 특정 위치, 또는 유전자좌 (복수형 유전자좌들)에 위치한다. 하나의 대립유전자가 상동성 염색체의 쌍의 각각의 염색체 상에 존재한다. 이배체 식물 종은 특정 유전자좌에서 다수의 상이한 대립유전자를 포함할 수 있다. 이들은 유전자의 동일한 대립유전자일 수 있거나 (동형접합) 또는 2개의 상이한 대립유전자일 수 있다 (이형접합).
대립성 테스트는 동일한 형질을 부여하는 2개의 유전자가 동일한 유전자좌에 위치하는 지 여부를 확인하는 데 사용될 수 있는 관련 기술분야에 공지된 테스트이다.
본 출원의 맥락에서 단어 "형질"은 식물의 표현형을 지칭한다. 식물이 본 발명의 형질을 나타낼 때, 그의 게놈은 본 발명의 형질을 초래하는 돌연변이체 대립유전자를 포함하고, 특히 본 발명에서 돌연변이체 대립유전자가 동형접합 형태일 때 그러하다. 따라서, 식물은 본 발명의 유전자 결정인자를 갖는다. 본 발명의 식물의 형질을 포함하는 식물을 지칭할 때, 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성의 형질을 포함하는 캅시쿰 아누움 식물을 언급하는 것으로 이해된다.
"평균"은 본원에서 산술 평균을 지칭한다.
본원에 사용된 바와 같은, 용어 "분자 게놈 마커" 또는 짧게 "마커"는 핵산 서열의 특징의 차이를 시각화하는 방법에 사용되는 지표를 지칭한다. 이러한 지표의 예는 제한 단편 길이 다형성 (RFLP) 마커, 증폭된 단편 길이 다형성 (AFLP) 마커, 단일 뉴클레오티드 다형성 (SNP), 삽입 돌연변이, 미세부수체 마커 (SSR), 서열-특징화 증폭된 영역 (SCAR), 절단된 증폭된 다형성 서열 (CAPS) 마커 또는 이소자임 마커 또는 특정 유전자 및 염색체의 위치를 정의하는 것으로 본원에 기재된 마커들의 조합이다.
"서열 동일성" 및 "서열 유사성"은 전체 또는 국소 정렬 알고리즘을 사용하는 2개의 펩티드 또는 2개의 뉴클레오티드 서열의 정렬에 의해 결정될 수 있다. 이어서, 서열은, 예를 들어, 프로그램 GAP 또는 BESTFIT 또는 Emboss 프로그램 "니들(Needle)" (디폴트 파라미터를 사용함, 하기 참조)에 의해 최적 정렬 후 이들이 적어도 특정 최소 백분율의 서열 동일성 (하기에 추가로 정의된 바와 같음)을 공유하면, "실질적으로 동일한" 또는 "본질적으로 유사한" 것으로 지칭될 수 있다. 이들 프로그램은 2개의 서열을 이들의 전체 길이에 걸쳐 정렬하기 위해 니들맨(Needleman) 및 운쉬(Wunsch) 전체 정렬 알고리즘을 사용하며, 매치의 수를 최대화하고 갭의 수를 최소화한다. 일반적으로, (뉴클레오티드 및 단백질 정렬 둘 다의 경우) 갭 생성 페널티 = 10 및 갭 연장 페널티 = 0.5로 디폴트 파라미터가 사용된다. 뉴클레오티드의 경우 사용된 디폴트 채점 행렬은 DNAFULL이고 단백질의 경우 디폴트 채점 행렬은 Blosum62이다 (Henikoff & Henikoff, 1992, PNAS 89, 10915- 10919). 서열 정렬 및 백분율 서열 동일성에 대한 점수는 예를 들어 컴퓨터 프로그램, 예컨대 EMBOSS (http://www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_needle/)를 사용하여 결정될 수 있다. 대안적으로, 서열 유사성 또는 동일성은 데이터베이스, 예컨대 FASTA, BLAST 등에 대한 검색에 의해 결정될 수 있다. 히트는 바람직하게는 서열 동일성을 비교하기 위해, 바람직하게는 서열의 전장에 걸쳐 쌍으로 정렬된다.
본원에 사용된 바와 같은, 2개의 뉴클레오티드 서열은 백분율 서열 동일성이 적어도 83%, 85%, 90%, 95%, 98%, 99% 또는 그 초과, 바람직하게는 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 초과, 바람직하게는 이들의 전체 길이에 걸쳐 결정된 바와 같은 (디폴트 파라미터, 즉 갭 생성 페널티 = 10, 갭 연장 페널티 = 0.5를 사용하고, 핵산의 경우 채점 행렬 DNAFULL을 사용하여 Emboss "니들"에 의해 결정된 바와 같음) 경우에 "실질적인 서열 동일성"을 갖는다
본원에 사용된 바와 같은 용어 "혼성화"는 프로브 서열 및 표적 서열의 성질에 따라 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 용이하게 명백할 적절한 엄격성 조건에서의 핵산의 혼성화를 나타내는 데 사용된다. 혼성화 및 세척 조건은 관련 기술분야에 널리 공지되어 있고, 인큐베이션 시간, 온도, 및/또는 용액의 이온 강도를 변화시킴으로써 목적하는 엄격성에 따른 조건의 조정이 용이하게 달성된다. 예를 들어, 문헌 [Sambrook, J. et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, New York, 1989]을 참조한다. 조건의 선택은 혼성화되는 서열의 길이, 특히, 프로브 서열의 길이, 핵산의 상대적인 G-C 함량 및 허용될 미스매치의 양에 의해 지시된다. 보다 적은 정도의 상보성을 갖는 가닥들 사이의 부분적인 혼성화를 목적하는 경우에 낮은 엄격성 조건이 바람직하다. 완전하거나 또는 거의 완전한 상보성을 목적하는 경우에, 높은 엄격성 조건이 바람직하다. 참조 서열에 대해 "실질적인 서열 동일성"을 갖거나 또는 참조 서열에 대해 적어도 80%, 예를 들어 적어도 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 99.2%, 99.5%, 99.9% 핵산 서열 동일성의 서열 동일성을 갖는 핵산 서열 (예를 들어 DNA 또는 게놈 DNA)을 언급할 때, 한 실시양태에서 상기 뉴클레오티드 서열은 제공된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 동일한 것으로 간주되고 엄격한 혼성화 조건을 사용하여 확인될 수 있다. 또 다른 실시양태에서, 핵산 서열은 제공된 뉴클레오티드 서열과 비교하여 1개 이상의 돌연변이를 포함하나, 여전히 엄격한 혼성화 조건을 사용하여 확인될 수 있다.
"엄격한 혼성화 조건"은 제공된 뉴클레오티드 서열과 실질적으로 동일한 뉴클레오티드 서열을 확인하는 데 사용될 수 있다. 엄격한 조건은 서열 의존적이고 상이한 상황에서 상이할 것이다. 일반적으로, 엄격한 조건은 정의된 이온 강도 및 pH에서 특정 서열에 대한 열 융점 (Tm)보다 약 5℃ 더 낮은 것으로 선택된다. Tm은 (정의된 이온 강도 및 pH 하에) 표적 서열의 50%가 완전히 매치된 프로브에 혼성화하는 온도이다. 전형적으로 염 농도가 pH 7에서 약 0.02 몰이고 온도가 적어도 60℃인 엄격한 조건이 선택될 것이다. 염 농도를 낮추고/거나 온도를 증가시키는 것은 엄격성을 증가시킨다. RNA-DNA 혼성화 (예를 들어 100개의 뉴클레오티드의 프로브를 사용하는 노던 블롯)를 위한 엄격한 조건은 예를 들어 63℃에서 20분 동안 0.2X SSC에서, 또는 동등한 조건에서 적어도 1회 세척을 포함하는 것이다. DNA-DNA 혼성화 (예를 들어 100개의 뉴클레오티드의 프로브를 사용하는 서던 블롯)를 위한 엄격한 조건은 예를 들어 적어도 50℃, 통상적으로 약 55℃의 온도에서, 20분 동안 0.2X SSC에서, 또는 동등한 조건에서 적어도 1회 세척 (통상적으로 2회)을 포함하는 것이다. 또한 문헌 [Sambrook et al. (1989) and Sambrook and Russell (2001)]을 참조한다.
본원에 사용된 바와 같은, 어구 DNA 또는 RNA 분자에 "혼성화한다"는 분자가 염기 쌍 형성에 의해 또 다른 핵산 분자를 인식하고 그에 혼성화하는 것을 나타내는 데 사용되며, 이는 적절한 조건 하에 혼성화를 실행하기에 충분한 2개의 핵산 분자 사이의 서열 유사성이 있다는 것을 의미한다.
본원에 사용된 바와 같은, 용어 "유전자이입", "유전자이입된" 및 "유전자이입하는"은 예를 들어 공여자와 수용자 양친을 교배시킴으로써 공여자 양친으로 불리는 하나의 종, 품종 또는 재배종의 게놈 단편이 수용자 양친으로 불리는 또 다른 종, 품종 또는 재배종의 게놈으로 형질도입되는 천연 및 인공 공정 둘 다를 지칭한다. 공정은 임의로 반복친으로 불리는 생성된 식물을 수용자 양친에 역교배시킴으로써 완료될 수 있다. 유전자이입 단편은 그의 천연 게놈 맥락의 외부에 존재하며, 이는 예를 들어 캅시쿰 차이니즈(Capsicum chinense)로부터의 유전자이입 단편을 보유하는 식물이 씨. 차이니즈 식물이 아니라는 것을 의미한다.
본원에 사용된 바와 같은, 용어 "식물"은 전체 식물 또는 그의 임의의 부분 또는 파생물, 예컨대 식물 기관 (예를 들어, 수확된 또는 수확되지 않은 과실, 잎, 종자, 꽃 등), 식물 세포, 식물 원형질체, 그로부터 전체 식물이 재생될 수 있는 식물 세포 또는 조직 배양물, 식물 캘러스, 식물 세포 덩어리, 및 식물에서 무손상인 식물 세포, 또는 식물의 부분, 예컨대 배, 화분, 배주, 씨방, 과실 (예를 들어, 수확된 조직 또는 기관, 예컨대 수확된 고추 과실 또는 그의 부분), 꽃, 잎, 종자, 클론 번식 식물, 뿌리, 근경, 줄기, 근단 등을 포함한다. 또한, 임의의 발달 단계, 예컨대 미성숙 및 성숙 모종 등이 포함된다.
"식물 계통" 또는 "육종 계통"은 식물 및 그의 자손을 지칭한다. 본원에 사용된 바와 같은, 용어 "근교 계통"은 반복적으로, 바람직하게는 3회 초과, 보다 바람직하게는 6회 초과 자가 수분된 식물 계통을 지칭한다.
용어 "재배종" (또는 "재배된" 식물)은 본원에서 "야생" 상태 이외의 생물학적 상태를 갖는 식물을 나타내는 데 사용되고, "야생" 상태는 식물 또는 수탁물의 원래의 비-재배된, 비-작물화된, 또는 천연 상태를 나타내고, 용어 재배된은 이러한 야생 또는 잡초성 식물을 포함하지 않는다. 용어 재배종은 우수한 농경학 특징을 갖는 물질, 예컨대 육종 물질, 연구 물질, 육종 계통, 엘리트 육종 계통, 합성 집단, 잡종, 파운더 스톡/베이스 집단, 근교 계통, 재배종 (방임 수분 잡종 재배종), 격리 집단, 돌연변이체/유전자 스톡, 및 진보/개선된 재배종을 포함한다. 소위 토종(heirloom) 품종 또는 재배종, 즉 통상적으로 인류 역사의 초기 동안 성장되고 종종 특정 지리적 영역에 대해 적응된 방임 수분 품종 또는 재배종은 본 발명의 한 측면에서 재배된 식물로서 본원에 포함된다. 한 실시양태에서 용어 재배종은 또한 원시품종, 즉 많은 해에 걸쳐 인간에 의해 국지적으로 선택되고 재배되고 특정 지리적 환경에 적응되고 공통의 유전자 풀을 공유하는 식물 (또는 집단)을 포함한다.
"식물 품종"은 공지된 최저 등급의 동일한 식물학적 분류군 내의 식물의 군이며, 이는 (식물 육종자의 권리의 승인에 대한 조건이 충족되었는 지 여부와 관계없이) 특정 유전자형 또는 유전자형의 조합으로부터 생성된 특징의 발현에 기반하여 정의될 수 있고, 이들 특징 중 적어도 1개의 발현에 의해 임의의 다른 군의 식물로부터 구별될 수 있고, 어떠한 변화도 없이 증식될 수 있기 때문에 독립체로서 간주될 수 있다. 따라서, 용어 "식물 품종"은 이들 모두가 1개의 유전자좌 또는 유전자 (또는 이 단일 유전자좌 또는 유전자로 인한 일련의 표현형적 특징)의 존재를 특징으로 하지만, 다른 면에서는 다른 유전자좌 또는 유전자와 관련하여 서로 엄청나게 상이할 수 있는 경우에, 이들이 동일한 종류의 것이더라도, 일군의 식물을 나타내는 데 사용될 수 없다.
"역교배"는 (단일) 형질, 예컨대 위단위결과성(stenospermocarpic) 과실 형성에 대한 능력이 하나의 유전적 배경 (또한 "공여자"로 지칭되고, 필수적이지는 않지만 일반적으로, 이는 열등한 유전적 배경임)으로부터 또 다른 유전적 배경 (또한 "반복친"으로 지칭되고; 필수적이지는 않지만 일반적으로, 이는 우월한 유전적 배경임)으로 전달될 수 있는 육종 방법을 지칭한다. 교배의 후손 (예를 들어 본 발명의 돌연변이체 대립유전자를 포함하는 특정 식물 종의 제1 식물을 동일한 식물 종 또는 상기 제1 식물 종과 교배될 수 있는 상이한 식물 종의 제2 식물과 교배시킴으로써 수득되고, 여기서 상기 제2 식물 종은 본 발명의 돌연변이체 대립유전자를 포함하지 않는 F1 식물; 또는 F1을 자가 수분시킴으로써 수득된 F2 식물 또는 F3 식물 등)은 상기 제2 식물 종의 양친 식물에 "역교배"된다. 반복된 역교배 후, 공여자 유전적 배경의 형질, 예를 들어 위단위결과성 과실 형성 형질을 부여하는 돌연변이체 대립유전자가 반복친 유전적 배경 내로 혼입되었을 것이다. 이 맥락에서 용어 "유전자 전환된" 또는 "전환 식물" 또는 "단일 유전자좌 전환"은 공여자 양친으로부터 전달된 하나 이상의 유전자에 더하여 반복친의 본질적으로 모든 목적하는 형태학적 및/또는 생리학적 특징이 회복된, 역교배에 의해 발생된 식물을 지칭한다. F1 식물과 제2 양친 식물 계통의 역교배에 의해 생산된 종자로부터 성장된 식물은 "BC1 세대"로 지칭된다. BC1 집단으로부터의 식물은 자가 수분되어 BC1F2 세대를 초래할 수 있거나 또는 재배된 양친 식물 계통과 다시 역교배되어 BC2 세대를 제공할 수 있다. "M1 집단"은 특정 식물 계통의 복수의 돌연변이된 종자 / 식물이다. "M2, M3, M4 등"은 제1 돌연변이된 종자 / 식물 (M1)의 자가 수분 후 수득된 연속적인 세대를 지칭한다.
용어 솔라나세아에는 인간에 의해 재배되고 육종되는 과실 및 채소 종을 포함하는 속 (특히 솔라눔(Solanum) 속 및 캅시쿰 속)을 포함하는 식물 과, 예컨대 예를 들어 솔라눔 리코페르시쿰(Solanum lycopersicum) (토마토), 캅시쿰 아누움 (고추), 솔라눔 멜롱게나(Solanum melongena) (가지) 및 솔라눔 무리카툼(Solanum muricatum) (페피노)을 지칭한다. "가지과 식물" 또는 "솔라나세아에 과의 식물"은 야생형 가지과 식물 및 재배된 가지과 식물을 포함하는, 식물학적 솔라나세아에 과의 식물, 즉 솔라나세아에 과의 임의의 식물이다. 식물학적 솔라나세아에 과는 약 98개의 속으로 이루어지며, 그 중 속 솔라눔 및 캅시쿰이 널리 재배되고 높은 경제적 중요성을 갖는 식량 작물로서 사용되는 많은 작물화된 종을 포함하기 때문에 상업적으로 가장 관련된다.
캅시쿰 속은 20 내지 27개의 종으로 이루어지고, 그 중 5개가 작물화되어 있다: 씨. 아누움, 씨. 바카툼(C. baccatum), 씨. 차이니즈, 씨. 프루테센스(C. frutescens), 및 씨. 푸베센스(C. pubescens). 생물지리학적, 형태학적, 화학계통적, 혼성화 및 유전자 데이터를 사용하여 종 사이 계통발생적 관계가 조사되었다. "고추" 또는 "고추 과실"로 보통 명명되는 캅시쿰의 과실은 종 사이 및 종 내 둘 다에서 색상, 모양, 및 크기가 엄청나게 다를 수 있다. 화학계통적 연구가 품종과 종 사이의 차이를 구별하는 데 도움이 되었다.
캅시쿰 아누움 엘. 식물은 본 발명의 맥락에서 특히 관련성이 있는 솔라나세아에 과의 초본 식물이다. 캅시쿰 아누움 식물은 약 0.5-1.5 미터 (약 20-60 인치)에 달한다. 단일 백색 꽃이 고추 과실을 맺고, 이는 미숙성 시 녹색이고, 주로 적색으로 변하지만, 일부 품종은 갈색 또는 자주색으로 숙성될 수 있다. 종은 대부분의 기후를 견딜 수 있지만, 이들은 따뜻하고 건조한 기후에서 특히 생산적이다. 캅시쿰 아누움 종의 재배된 식물은 상이한 유형의 고추, 예컨대 피망, 카옌 고추, 파프리카, 및 할라페뇨를 포함한다. "캅시쿰 아누움 염색체 7"은 관련 기술분야에 공지된 바와 같은 캅시쿰 아누움 염색체 7을 지칭한다 (캅시쿰 아누움 cv CM334 게놈 염색체 (1.55 배포) 및 캅시쿰 아누움 UCD10X 게놈 염색체 (v1.0) 및 캅시쿰 아누움 준라(Capsicum annuum zunla) 게놈 염색체 (v2.0) 참조). "오솔로그 염색체 7"은 캅시쿰 아누움의 친족의 상응하는 염색체를 지칭한다. 유사체, "캅시쿰 아누움 염색체 8"은 관련 기술분야에 공지된 바와 같은 캅시쿰 아누움 염색체 8을 지칭한다 (캅시쿰 아누움 cv CM334 게놈 염색체 (1.55 배포) 및 캅시쿰 아누움 UCD10X 게놈 염색체 (v1.0) 및 캅시쿰 아누움 준라 게놈 염색체 (v2.0) 참조).
본원에 사용된 바와 같은 용어 "비-자극적 캅시쿰 아누움 식물"은 150 μg/g FW (생중량) 미만, 보다 바람직하게는 100 μg/g FW 미만, 가장 바람직하게는 50 μg/g FW 미만의 평균 총 캡사이시노이드 함량 (바람직하게는 캡사이신 및 디히드로캡사이신 함량)을 갖는 과실을 생산하는 캅시쿰 아누움 식물을 지칭한다. 바람직하게는, 과실의 캡사이신은 표준 방법을 사용하는 HPLC 분석을 사용하여 결정된다. 바람직하게는, 본 발명에 따른 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물은 Pun1 유전자의 돌연변이체 대립유전자를 포함하며, 여기서 상기 돌연변이체 대립유전자는 야생형 Pun1 유전자의 감소된 발현을 초래하거나 또는 발현을 초래하지 않고/거나 여기서 돌연변이체 대립유전자는 야생형 단백질과 비교하여 감소된 기능 또는 기능 상실을 갖는 단백질을 코딩하고 여기서 야생형 Pun1 유전자는 서열식별번호: 81에 대해 적어도 95% 서열 아미노산 서열 동일성을 포함하는 단백질을 코딩한다. 본원에 사용된 바와 같은 용어 "자극적 캅시쿰 아누움 식물"은 본원에 정의된 바와 같은 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물의 것보다 더 높은 평균 총 캡사이시노이드 함량을 갖는 과실을 생산하는 캅시쿰 아누움 식물을 지칭한다. 따라서, 본원에 사용된 바와 같은 용어 "자극적 캅시쿰 아누움 식물"은 바람직하게는 적어도 150 μg/g FW (생중량), 보다 바람직하게는 적어도 100 μg/g FW, 가장 바람직하게는 적어도 50 μg/g FW의 평균 총 캡사이시노이드 함량 (바람직하게는 캡사이신 및 디히드로캡사이신 함량)을 갖는 과실을 생산하는 캅시쿰 아누움 식물을 지칭한다.
용어 "식품"은 신체에 영양학적 지원을 제공하기 위해 소비되는 임의의 물질이다. 이는 통상적으로 식물 또는 동물 기원의 것이고, 필수 영양소, 예컨대 탄수화물, 지방, 단백질, 비타민 또는 무기질을 함유한다. 물질은 에너지를 생산하거나, 삶을 유지하거나, 또는 성장을 자극하기 위한 노력으로 유기체에 의해 섭취되고 유기체의 세포에 의해 동화된다. 용어 식품은 인간 및 동물 신체에 영양학적 지원을 제공하기 위해 소비되는 물질 둘 다를 포함한다.
"영양 번식" 또는 "클론 번식"은, 예를 들어 삽목물로부터 식물을 번식시킴으로써 또는 시험관내 번식에 의한 영양 조직으로부터의 식물의 번식을 지칭한다. 시험관내 번식은 시험관내 세포 또는 조직 배양 및 시험관내 배양으로부터의 전체 식물의 재생을 수반한다. 따라서, 원래의 식물의 클론 (즉 유전적으로 동일한 영양 번식물)이 시험관내 배양에 의해 생성될 수 있다. "세포 배양" 또는 "조직 배양"은 식물의 세포 또는 조직의 시험관내 배양을 지칭한다. "재생"은 세포 배양 또는 조직 배양 또는 영양 번식으로부터의 식물의 발달을 지칭한다. "비-번식 세포"는 전체 식물로 재생될 수 없는 세포를 지칭한다.
용어 "F1, F2 등"은 2개의 양친 식물 또는 양친 계통 사이의 교배 후 연속적인 관련된 세대를 지칭한다. 2개의 식물 또는 계통을 교배시킴으로써 생산된 종자로부터 성장된 식물은 F1 세대로 칭해진다. F1 식물의 자가 수분은 F2 세대 등을 초래한다. 용어 "잡종" 식물 (또는 잡종 종자)은 2개의 근교 양친 계통의 교배로부터 수득된 식물 또는 종자를 지칭한다. 용어 "F1 잡종" 식물 (또는 "F1 잡종" 종자 또는 "F1 종자")은 2개의 근교 양친 계통의 교배로부터 수득된 1-세대 식물 또는 종자를 지칭한다.
본원에 사용된 바와 같은, 용어 "자손", "자손들" 및 "후손"은 본원에 기재된 개선된 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 포함하는 본 발명의 식물로부터 유래될 수 있거나 또는 수득가능한 임의의 및 모든 후손을 지칭한다. 자손은 세포 배양에 의해 또는 조직 배양에 의해, 또는 식물의 종자를 생산함으로써 유래될 수 있다. 용어 자손은 또한 적어도 하나의 저항성 양친 식물과 동일한 또는 또 다른 품종 또는 (육종) 계통의 또 다른 식물의 교배로부터 유래된 식물을 포함할 수 있다. 자손은, 예를 들어, 전통적인 육종 방법 (자가 수분 및/또는 교배) 또는 재생 또는 형질전환에 의해 양친 식물로부터 직접적으로 유래되거나, 수득되거나, 수득가능하거나 또는 유래될 수 있다. 그러나, 용어 "자손"은 일반적으로 추가 세대, 예컨대 2세대, 3세대, 4세대, 5세대, 6세대, 7세대 이상, 즉, 예를 들어, 전통적인 육종 방법, 재생 또는 유전자 형질전환 기술에 의해 이전 세대로부터 유래되거나, 수득되거나, 수득가능하거나 또는 유래될 수 있는 식물의 세대를 포함한다. 예를 들어, 2-세대 자손은 상기 언급된 방법 중 임의의 것에 의해 1세대 자손으로부터 생산될 수 있다.
꽃노랑총채벌레 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스는 북아메리카에서 자생이고 남아메리카, 유럽 및 오스트레일리아를 포함하는 다른 대륙으로 확산된 침습성 식물 해충이다. 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스는 다수의 과실, 채소, 및 관상용 작물을 포함하는 500개 초과의 상이한 숙주 식물의 종을 섭식하는 것으로 기록되었다. 주요 손상은 식물 조직에서의 성체 산란에 의해 초래된다. 식물은 또한 식물이 곤충의 타액에 반응할 때 구멍 및 은색 변색의 영역을 초래하는 섭식에 의해 손상된다. 님프는 꽃으로부터 막 발생하기 시작한 새로운 과실을 심하게 섭식한다. 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스는 또한 식물 바이러스, 예컨대 토마토 반점 위조 바이러스의 주요 벡터이다.
식물은 총채벌레 콜로니생성에 전형적인 식물 손상 증상이 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 노출 후 대조군 식물과 비교하여 감소되는 경우에, 및/또는 식물이 상기 전형적인 식물 손상 증상이 없는 상태로 남아있는 경우에 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 갖는 것으로 언급된다. 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성의 평가는 바람직하게는 하기 본원 실시예에 기재된 바와 같이 식물 손상 증상학을 살펴보는 시각적 관측에 의해 수행된다. 다양한 총채벌레 저항성 검정은, 예를 들어 본 문헌의 실시예에서의 총채벌레 저항성 테스트에 기재된 바와 같이 가능하다. 일반적으로, 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 테스트는 복수의 성체 고추 식물을 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 적용시키는 것을 수반할 수 있으며, 여기서 성체 고추 식물은 개화하기 시작한 식물이다. 식물은 특정 수의 곤충을 온실 (예를 들어 플라스틱 터널) 내로 방출하고, 임의로 이어서 예를 들어 1주 후, 2주 후, 또는 3주 후 하나 이상의 후속 노출에 의해 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 적용된다. 식물은 후속적으로 적합한 조건 하에 특정 기간 동안, 예를 들어 적어도 2주 (예를 들어 적어도 3, 4, 5, 또는 심지어 적어도 6주) 동안 성장된다. 온실 내 임의의 다른 곤충의 존재뿐만 아니라 40 ℃ 초과의 온도는 피해야 한다. 평가 시기는 첫 번째 총채벌레 식물 손상 증상이 나타날 때 시작하고, 이는 제1 방출 후 약 4주이다. 평가는 전체 식물을 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 의해 초래된 식물 손상 증상, 예컨대 잎 은화에 대해 평가함으로써 수행된다. 평가는 바람직하게는 1회 초과의 평가, 예를 들어 2회의 평가를 포함하며, 여기서 제2 평가는 제1 평가 후 2주에 수행된다. 예를 들어, 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 테스트는 제1 방출 후 50, 65 및 75일에서의 3회의 평가를 포함한다. 감수성 대조군은 성공적이기 위해 테스트에 대해 고도로 감수성이어야 하며, 여기서 감수성 대조군 식물은 테스트에 포함된 식물의 총 수의 적어도 20%를 차지해야 한다. 바람직하게는 유전자형당 적어도 5개, 예를 들어 적어도 10개, 20개, 30개, 40개, 50개 또는 심지어 200개 초과의 식물이 각각의 복제에 포함되고 바람직하게는 여러 복제가 수행된다. 한 측면에서, 저항성을 시험할 때, 계통 또는 품종은 계통 또는 품종의 적어도 90%, 95% 또는 100%가 25% 미만 (예를 들어 20%, 15%, 10%, 5%, 또는 심지어 5% 미만 또는 보다 바람직하게는 증상의 부재 (0%))의 식물의 잎 은화를 나타내는 잎 면적을 나타내는 경우에 "저항성"인 것으로 간주되는 반면에, 감수성 대조군 계통 또는 품종의 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 그 초과의 식물은 25% 초과 (예를 들어 30%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 심지어 95% 초과 또는 보다 바람직하게는 저항성 없음 (100%))의 잎 은화를 나타내는 잎 면적을 나타낸다. 또 다른 측면에서, 식물은 본원에 기재된 바와 같은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 테스트 프로토콜에서 6점 이상, 예를 들어 7, 8, 또는 가장 바람직하게는 9점을 받을 때 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 높은 수준의 저항성을 나타내는 것으로 간주된다. 식물은 본원에 기재된 바와 같은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 테스트 프로토콜에서 4 또는 5점을 받을 때 중간 수준의 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성을 갖는 것으로 간주된다. 식물은 본원에 기재된 바와 같은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 테스트 프로토콜에서 2 또는 3점을 받을 때 낮은 수준의 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성을 갖는 것으로 간주된다. 식물은 본원에 기재된 바와 같은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 테스트 프로토콜에서 1점을 받을 때 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성을 갖지 않는 것으로 간주된다.
본원에 사용된 바와 같은, "프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성"을 갖는 식물 (또는 식물 계통 또는 품종)은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 테스트에서 적합한 대조군 식물 (또는 식물 계통 또는 품종)과 비교하여 개선된 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 나타내는 식물 (또는 식물 계통 또는 품종)에 관한 것이다. 이러한 적합한 (음성) 대조군 식물은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 노출 후 총채벌레 콜로니생성에 전형적인 식물 손상 증상을 나타내는 식물이다. 예를 들어, 적합한 (음성) 대조군 식물은 본원에 기재된 바와 같은 QTL7 및 QTL8을 포함하지 않는 캅시쿰 아누움 H19_020279-044 (NCIMB 43623)로부터 유래된 동질유전자형 식물일 수 있다. 일반적으로, 상이한 식물 또는 식물 계통 또는 품종 사이의 비교가 계통 (또는 품종)의 다수의 식물 (예를 들어 계통당 적어도 5개의 식물, 바람직하게는 적어도 10개의 식물)을 1개 이상의 대조군 식물 계통의 식물 (바람직하게는 야생형 식물)과 동일한 조건 하에 성장시키고 동일한 환경 조건 하에 성장될 때 식물 계통 사이의 차이, 바람직하게는 통계적으로 유의한 차이를 결정하는 것을 수반하는 것으로 이해된다. 바람직하게는 식물은 동일한 계통 또는 품종의 것이다. 보다 바람직하게는, 대조군 식물은 동질유전자형 식물이다. 용어 "동질유전자형 식물"은 관심 QTL 또는 관심 원인 유전자를 제외하고는 유전적으로 동일한 2개의 식물을 지칭한다.
본 발명의 식물
본 발명은 정량적 형질 유전자좌 QTL8을 포함하는 염색체 8 상의 유전자이입 단편을 포함하는 캅시쿰 아누움 식물을 제공하며, 여기서 상기 QTL8은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하고, 여기서 QTL8은 염색체 8 상에서 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_21과 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_40 사이에 위치하고, 여기서 캅시쿰 아누움 식물은 QTL8이 이형접합 형태로 존재할 때 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물이다.
본 발명자들은 본원에 추가로 기재된 바와 같은 QTL8을 포함하는 염색체 8 상의 유전자이입 단편을 포함하는 캅시쿰 아누움 식물이 상기 QTL8을 포함하지 않는 캅시쿰 아누움 식물과 비교하여 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 현저하게 개선된 저항성을 나타낸다는 것을 발견하였다. 이러한 염색체 8 상 곤충 저항성 QTL은 이전에 선행 기술에 기재되지 않았다. 더욱이, 본 발명에 의해 제공된 바와 같은 곤충 저항성 QTL이 선행 기술로부터 공지된 곤충 저항성 QTL과 비교하여 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 증가된 저항성을 부여할 수 있다는 것이 발견되었다.
한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물은 정량적 형질 유전자좌 QTL7을 포함하는 염색체 7 상의 유전자이입 단편을 추가로 포함하며, 여기서 상기 QTL7은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하고, 여기서 QTL7은 염색체 7 상에서 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_01과 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_20 사이에 위치한다.
본 발명자들은 본원에 추가로 기재된 바와 같은 QTL8을 포함하는 유전자이입 단편 염색체 8에 더하여 본원에 추가로 기재된 바와 같은 QTL7을 포함하는 염색체 7 상의 유전자이입 단편을 포함하는 캅시쿰 아누움 식물이 상기 QTL8을 포함하지 않는 캅시쿰 아누움 식물과 비교하여 또는 단지 상기 QTL8 또는 단지 상기 QTL7만을 포함하는 캅시쿰 아누움 식물과 비교하여 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 추가적으로 개선된 저항성을 나타낸다는 것을 발견하였다.
본 발명에 의해 제공된 바와 같고 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여할 수 있는 QTL7은 염색체 7 상에서 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_01과 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_20 사이에 위치한다. 이는 본 발명의 맥락에서 상기 염색체 7의 특정 영역에 대한 염색체 7 상에 포함된 바와 같은, 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 효과를 갖는 QTL의 유전자좌를 맵핑하는 것이 가능하였다는 것을 의미하며, 여기서 염색체 7의 상기 영역은 플랭킹 마커 SNP_01 및 SNP_20에 의해 정의되고, 여기서 SNP_01은 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치하고 SNP_20은 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한다.
본 발명에 의해 제공된 바와 같고 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여할 수 있는 QTL8은 염색체 8 상에서 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_21과 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_40 사이에 위치한다. 이는 본 발명의 맥락에서 염색체 8 상에 포함된 바와 같은, 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 효과를 갖는 QTL의 유전자좌를 맵핑하는 것이 가능하였다는 것을 의미하며, 여기서 염색체 8의 상기 영역은 플랭킹 마커 SNP_21 및 SNP_40에 의해 정의되고, 여기서 SNP_21은 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치하고 SNP_40은 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한다.
본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물은 QTL8이 이형접합 형태로 존재할 때 본원에 추가로 정의된 바와 같은 "비-자극적 캅시쿰 아누움 식물"이다.
따라서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물은 QTL8이 이형접합 형태로 존재할 때 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물이다. 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물은 QTL8이 동형접합 형태로 존재할 때 자극적 캅시쿰 아누움 식물 또는 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물일 수 있다. 한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물은 본원에 추가로 정의된 바와 같은 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물이다.
따라서 본 발명에 따른 저항성 QTL QTL7 및 QTL8은 상기 QTL7 및/또는 QTL8이 캅시쿰 아누움 식물의 게놈에 존재할 때 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 부여한다. 본원에 기재된 바와 같은 QTL7 및 QTL8을 포함하는 캅시쿰 아누움 종자의 대표적인 샘플은 기탁되었고 기탁물로부터, 또는 이 기탁물의 후손으로부터, 본 발명의 QTL7 및/또는 QTL8은 기탁된 종자로부터 성장된, 캅시쿰 아누움 식물, 또는 그의 후손과 교배될 수 있는 임의의 다른 식물로 용이하게 전달될 수 있다. 대안적으로, 다른 공여자는 동일한 QTL7 및/또는 QTL8을 포함하는 것, 예를 들어 QTL7 및/또는 QTL8에 대한 동일한 SNP 1배체형을 포함하는 것으로 확인될 수 있다. 한 측면에서, 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물을 제공하며, 여기서 본원에 기재된 바와 같은 QTL7 및 QTL8은 대표적인 수의 종자가 기탁 번호 NCIMB 43623 하에 기탁된 H19_020279-044로 지정된 캅시쿰 아누움 식물의 게놈에 존재하거나, 또는 그로부터 수득가능하거나, 또는 그로부터 수득되거나, 또는 그에 포함되는 바와 같다. 한 측면에서, 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물을 제공하며, 여기서 염색체 7 및/또는 염색체 8 상 유전자이입 단편은 수탁 번호 NCIMB 43623 하에 기탁된 종자에서의 염색체 7 및/또는 염색체 8 상에 발견된 바와 같은 단편, 또는 각각 본원에 기재된 바와 같은 QTL7 또는 QTL8을 포함하는, 그로부터 유래된 보다 작은 단편이다.
본원에 기재된 바와 같은 QTL7은 본원에 보다 상세하게 기재된 바와 같은 SNP 마커 SNP_1 내지 SNP_20 중 1개 이상의 존재를 특징으로 할 수 있는 1배체형을 포함한다. 한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물에 포함된 바와 같은 QTL7을 포함하는 유전자이입 단편은 하기로부터 선택된 적어도 1개의 마커의 1배체형을 포함한다: 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_01; 서열식별번호: 3의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 3에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_02; 서열식별번호: 5의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 5에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_03; 서열식별번호: 7의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 7에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_04; 서열식별번호: 9의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 9에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_05; 서열식별번호: 11의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 11에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_06; 서열식별번호: 13의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 13에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_07; 서열식별번호: 15의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 15에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_08; 서열식별번호: 17의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 17에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_09; 서열식별번호: 19의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 19에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_10; 서열식별번호: 21의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 21에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_11; 서열식별번호: 23의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 23에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_12; 서열식별번호: 25의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 25에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_13; 서열식별번호: 27의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 27에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_14; 서열식별번호: 29의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 29에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_15; 서열식별번호: 31의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 31에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_16; 서열식별번호: 33의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 33에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_17; 서열식별번호: 35의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 35에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_18; 서열식별번호: 37의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 37에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_19; 및 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_20. 바람직하게는, 본원에 기재된 바와 같은 QTL7은 본원에 기재된 바와 같은 SNP 마커 SNP_1 내지 SNP_20 중 2개 이상, 보다 바람직하게는 본원에 기재된 바와 같은 SNP 마커 SNP_1 내지 SNP_20 중 3개 이상, 더욱 더 바람직하게는 본원에 기재된 바와 같은 SNP 마커 SNP_1 내지 SNP_20 중 4개 이상, 및 특히 바람직하게는 본원에 기재된 바와 같은 SNP 마커 SNP_1 내지 SNP_20 중 5개 이상의 존재를 특징으로 할 수 있는 1배체형을 포함한다.
본원에 기재된 바와 같은 QTL8은 본원에 보다 상세하게 기재된 바와 같은 SNP 마커 SNP_21 내지 SNP_40 중 1개 이상의 존재를 특징으로 할 수 있는 1배체형을 포함한다. 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물에 포함된 바와 같은 QTL8을 포함하는 유전자이입 단편은 하기로부터 선택된 적어도 1개의 마커의 1배체형을 포함한다: 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_21; 서열식별번호: 43의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 43에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_22; 서열식별번호: 45의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 45에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_23; 서열식별번호: 47의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 47에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_24; 서열식별번호: 49의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 49에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_25; 서열식별번호: 51의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 51에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_26; 서열식별번호: 53의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 53에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_27; 서열식별번호: 55의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 55에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_28; 서열식별번호: 57의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 57에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_29; 서열식별번호: 59의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 59에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_30; 서열식별번호: 61의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 61에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_31; 서열식별번호: 63의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 63에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_32; 서열식별번호: 65의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 65에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_33; 서열식별번호: 67의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 67에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_34; 서열식별번호: 69의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 69에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_35; 서열식별번호: 71의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 71에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_36; 서열식별번호: 73의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 73에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_37; 서열식별번호: 75의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 75에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_38; 서열식별번호: 77의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 77에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_39; 및 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_40. 바람직하게는, 본원에 기재된 바와 같은 QTL8은 본원에 기재된 바와 같은 SNP 마커 SNP_21 내지 SNP_40 중 2개 이상, 보다 바람직하게는 본원에 기재된 바와 같은 SNP 마커 SNP_21 내지 SNP_40 중 3개 이상, 더욱 더 바람직하게는 본원에 기재된 바와 같은 SNP 마커 SNP_21 내지 SNP_40 중 4개 이상, 및 특히 바람직하게는 본원에 기재된 바와 같은 SNP 마커 SNP_21 내지 SNP_40 중 5개 이상의 존재를 특징으로 할 수 있는 1배체형을 포함한다.
따라서 본원에 기재된 바와 같은 QTL8을 포함하는 본 발명에 따른 식물은 QTL8의 적어도 1개의 카피 및 임의로 그에 더하여 QTL7의 적어도 1개의 카피를 포함한다. 따라서 이러한 식물은 QTL8에 대해 이형접합이거나 또는 QTL8에 대해 동형접합일 수 있다. 본원에 기재된 바와 같은 QTL8은 우성이다. 이는 QTL8의 적어도 1개의 카피가 상기 QTL8에 의해 부여되는 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 달성하기 위해 캅시쿰 아누움 식물의 게놈에 포함될 필요가 있다는 것을 의미한다. 본 발명에 따른 식물은 추가로 QTL7에 대해 이형접합이거나 또는 QTL7에 대해 동형접합일 수 있다. 본원에 기재된 바와 같은 QTL7은 우성이다. 이는 QTL7의 적어도 1개의 카피가 상기 QTL7에 의해 부여되는 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 달성하기 위해 캅시쿰 아누움 식물의 게놈에 포함될 필요가 있다는 것을 의미한다. 한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물에 포함된 QTL8 및 임의로 또한 QTL7은 동형접합 형태로 존재한다. 한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물은 QTL7 및 QTL8 둘 다를 포함한다. 한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물은 동형접합 형태의 QTL7 및 이형접합 형태의 QTL8을 포함한다. 한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물은 이형접합 형태의 QTL7 및 동형접합 형태의 QTL8을 포함한다. 한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물은 동형접합 형태의 QTL7 및 동형접합 형태의 QTL8을 포함한다.
한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물은 근교 식물, 이성반수체 식물 또는 잡종 식물이다. 한 실시양태에서, 본 발명은 추가로 근교 식물, 이성반수체 식물 또는 잡종 식물인 본원에 기재된 바와 같은 식물을 제공한다. 따라서, 한 측면에서, 본 발명은 본 발명의 식물이 근교 식물인 것을 제공한다. 예를 들어 반복된 자가 수분 교배 단계에 의해, 이러한 근교 식물은 고도의 동형접합이다. 이러한 근교 식물은 F1 잡종 종자의 생산을 위한 양친 식물로서 매우 유용할 수 있다. 한 측면에서, 본 개시내용은 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는, 본 발명의 식물의 반수체 식물 및/또는 이성반수체 (이중 반수체) 식물이 본원에 포함되는 것을 제공한다. 반수체 및 이성반수체 식물은 예를 들어 꽃밥 또는 화분립 배양 및 전체 식물로의 재생에 의해 생산될 수 있다. 이성반수체 생산의 경우, 염색체 배가가 공지된 방법, 예컨대 콜히친 처리 등을 사용하여 유도될 수 있다. 따라서, 한 측면에서, 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 캅시쿰 아누움 식물이 제공되며, 여기서 식물은 이성반수체 식물이다. 본 발명은 이점, 예컨대 개선된 균일성, 활력 및/또는 질환 내성을 가질 수 있는 잡종 식물을 추가로 제공한다. 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물은 바람직하게는 F1 잡종 식물, 보다 바람직하게는 단일 교배 F1 잡종 식물이다.
따라서 본 발명에 의해 제공된 식물은 과실을 생산하는 데 사용될 수 있다. 따라서 본 발명은 소비용 작물로서의 본원에 제공된 바와 같은 캅시쿰 아누움 식물의 용도를 제공한다. 특히, 본 발명의 식물에 의해 생산된 과실은 이들 과실이 전형적으로 총채벌레, 예컨대 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스로의 기생충감염 후에 발생하는 질환 증상을 나타낼 가능성이 더 적기 때문에 소비용 작물로서 유리하게 사용될 수 있다.
본 발명에 의해 제공된 식물은 번식 물질을 생산하는 데 사용될 수 있다. 이러한 번식 물질은 유성 생식에 적합하고/거나 그로부터 생성된 번식 물질, 예컨대 화분 및 종자를 포함한다. 이러한 번식 물질은 삽목물, 접목물, 덩이줄기, 세포 배양물 및 조직 배양물을 포함하나, 이에 제한되지는 않는, 무성 또는 영양 생식에 적합하고/거나 그로부터 생성된 번식 물질을 포함한다. 따라서 본 발명은 번식 물질의 공급원으로서의 본원에 제공된 바와 같은 캅시쿰 아누움 식물의 용도를 추가로 제공한다.
한 측면에서, 본 발명은 본원에 기재된 바와 같은 캅시쿰 아누움 식물에 의해 생산된 종자를 제공하며, 여기서 종자는 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함한다.
한 측면에서, 본 발명은 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물이 성장될 수 있는 종자를 제공한다.
더욱이, 본 발명은 본 발명에 따른 복수의 종자를 제공한다. 본 발명의 종자는, 표현형적으로 (본 발명의 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형에 기반함) 및/또는 세포 또는 조직에서의 QTL8 및 임의로 QTL7의 존재를 검출하는 분자적 방법, 예컨대 본 발명의 QTL8 및 임의로 QTL7을 검출하는 분자적 유전자형 결정 방법 또는 시퀀싱을 사용하여 QTL8 및/또는 본원에 기재된 바와 같은 것의 존재로 인해 다른 종자로부터 구별될 수 있다. 종자는 예를 들어 자가-수분 및 돌연변이체 대립유전자의 1개 또는 2개의 카피를 포함하는 이들 종자의 임의적인 선택 (예를 들어 비-파괴적 종자 샘플링 방법 및 QTL8 및 임의로 QTL7의 존재의 분석에 의함) 후에 돌연변이체 대립유전자에 대해 이형접합인 본 발명의 식물에 의해 생산된 종자, 또는 타가-수분, 예를 들어 본 발명의 식물과 또 다른 고추 식물, 바람직하게는 또 다른 캅시쿰 아누움 식물로부터의 화분의 수분, 또는 또 다른 캅시쿰 아누움 식물과 본 발명의 식물의 화분의 수분 후에 생산된 종자를 포함한다.
본 발명은 본원에 기재된 바와 같은 식물을 생산하는 방법으로부터 수득된 종자를 추가로 제공한다.
한 측면에서, 복수의 종자는 용기 (예를 들어, 봉투, 상자, 캔 등) 내로 패키징된다. 용기는 임의의 크기일 수 있다. 종자는 (환제 또는 펠릿을 형성하기 위해) 패키징 전에 펠릿화될 수 있고/거나 종자 코팅을 포함하는 다양한 화합물로 처리될 수 있다.
추가 측면에서 본 발명의 식물로부터 수득된 (수득가능한) 식물 부분, 및 상기 식물 부분을 포함하는 용기 또는 패키지가 본원에 제공된다. 한 측면에서, 본 발명은 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물 또는 본 발명에 따른 종자의 식물 세포, 조직 또는 식물 부분을 제공하며, 여기서 상기 식물 세포, 조직 또는 식물 부분은 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함한다.
추가 측면에서, 식물 부분은 식물 세포이다. 추가 측면에서, 식물 부분은 비-재생가능한 세포 또는 재생가능한 세포이다. 또 다른 측면에서, 식물 세포는 체세포이다.
비-재생가능한 세포는 시험관내 배양을 통해 전체 식물로 재생될 수 없는 세포이다. 비-재생가능한 세포는 본 발명의 식물 또는 식물 부분 (예를 들어 잎)에 있을 수 있다. 비-재생가능한 세포는 종자, 또는 상기 종자의 종피에 있을 수 있다. 성숙된 잎, 성숙된 줄기 또는 성숙된 뿌리를 포함하는 성숙된 식물 기관은 적어도 1개의 비-재생가능한 세포를 함유한다.
추가 측면에서 식물 세포는 생식 세포, 예컨대 배주 또는 화분의 일부인 세포이다. 한 측면에서, 화분 세포는 영양 (비-생식) 세포, 또는 정자 세포이다 (Tiezzi, Electron Microsc. Review, 1991). 이러한 생식 세포는 반수체이다. 그가 전체 식물로 재생되는 경우에, 이는 출발 식물의 반수체 게놈을 포함한다. (예를 들어 화학적 처리를 통해) 염색체 배가가 발생한 경우에, 이중 반수체 식물이 재생될 수 있다. 한 측면에서, 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 본 발명의 식물은 본 발명에 따른 반수체 또는 이중 반수체 캅시쿰 아누움 식물이다.
게다가, 세포- 또는 조직 배양물이 본원에 기재된 식물 부분, 예컨대, 예를 들어 및 제한 없이 잎, 화분, 배, 자엽, 배축, 캘러스, 뿌리, 근단, 꽃밥, 꽃, 종자 또는 줄기, 또는 이들 중 임의의 것의 부분, 또는 분열 세포, 체세포, 또는 생식 세포로부터 유래되는, 본 발명의 캅시쿰 아누움 식물의 시험관내 세포 배양물 또는 조직 배양물이 제공된다.
본 발명은 영양 번식 식물을 추가로 제공하며, 여기서 상기 식물은 본 발명에 따른 식물 부분으로부터 번식된다.
추가로, 각각의 세포에 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7의 적어도 1개의 카피를 포함하는 단리된 세포, 시험관내 세포 배양물 및 조직 배양물, 원형질체 배양물, 식물 부분, 수확된 물질 (예를 들어 수확된 고추 과실), 화분, 씨방, 꽃, 종자, 수술, 꽃 부분 등이 제공된다. 따라서, 상기 세포 또는 조직이 전체 캅시쿰 아누움 식물로 재생되거나 또는 성장될 때, 식물은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 부여할 수 있는 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함한다.
따라서, 본 발명의 식물의 세포 또는 조직의 시험관내 세포 배양물 및/또는 조직 배양물이 또한 제공된다. 세포 또는 조직 배양물은 출아 및/또는 발근 배지로 처리되어 캅시쿰 아누움 식물을 재생시킬 수 있다.
또한, 본 발명에 따른 식물의 영양 또는 클론 번식이 본원에 포함된다. 많은 상이한 영양 번식 기술이 존재한다. 예를 들어 삽목물 (마디, 출아물 단부, 줄기 등)이 상기 기재된 바와 같은 시험관내 배양에 사용될 수 있다. 또한, 다른 영양 번식 기술, 예컨대 접목, 또는 공중 취목이 존재하고 사용될 수 있다. 공중 취목에서, 줄기의 조각은 여전히 양친 식물에 부착되어 있는 동안 뿌리를 발달하도록 허용되고, 충분한 뿌리가 발달되었으면, 클론 식물은 양친으로부터 분리된다.
따라서, 한 측면에서 하기를 포함하는 방법이 제공된다:
(a) 본 발명의 식물의 부분 (예를 들어 세포 또는 조직, 예를 들어 삽목물)을 수득하는 단계,
(b) 상기 식물 부분을 영양 번식시켜, 식물 부분으로부터 동일한 식물을 생성하는 단계.
따라서, 또한 클론/영양 번식을 위한 본 발명의 식물의 영양 식물 부분의 용도가 본 발명의 측면이다. 한 측면에서, 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 본 발명의 캅시쿰 아누움 식물을 영양 생식시키는 방법이 제공된다. 또한, 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 영양 생산된 캅시쿰 아누움 식물이 제공된다.
또 다른 측면에서 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물은 체세포 배발생 기술에 의해 번식된다.
상기-기재된 식물 부분 중 임의의 것으로부터 재생되거나 또는 상기-기재된 세포 또는 조직 배양물로부터 재생된 캅시쿰 아누움 식물이 또한 제공되며, 상기 재생된 식물은 그의 게놈에 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함한다. 이 식물은 또한 본 발명의 식물의 영양 번식으로 지칭될 수 있다.
본 발명은 또한 본원에 기재된 식물 부분을 포함하거나 또는 그로 이루어진 식품 또는 사료 제품에 관한 것이다. 식품 또는 사료 제품은 신선할 수 있거나 또는 가공될 수 있고, 예를 들어, 이를 캔에 담고/거나, 찌고/거나, 삶고/거나, 튀기고/거나, 데치고/거나 냉동시킬 수 있는 등이다. 예는 본 발명의 식물의 과실 또는 과실의 부분을 포함하는 샌드위치, 샐러드, 주스, 소스, 과실 페이스트 또는 다른 식품이다.
한 측면에서 본 발명에 따른 식물, 식물 부분 및 세포는 기술적 방법, 예컨대 본원에 기재된 바와 같은 마커 보조 선택 방법에 의해 수득된다. 한 측면에서 본 발명에 따른 식물, 식물 부분 및 세포는 규칙 28(2) EPC에 의해 정의된 바와 같은 본질적으로 생물학적 공정에 의해 배타적으로 수득되지 않는다. 바람직하게는, 식물 또는 동물의 생산을 위한 공정은 규칙 26(5) EPC에 의해 정의된 바와 같은 천연 현상, 예컨대 교배 또는 선택으로 완전히 이루어진 경우에 본질적으로 생물학적이다.
식물 또는 식물 부분을 생산하거나 또는 확인하고/거나 선택하는 방법
본 발명은 본 발명의 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 본원에 기재된 바와 같은 캅시쿰 아누움 식물이 사용되고/거나 수득되는 방법을 추가로 제공한다. 본 발명의 QTL8 및 임의로 QTL7은 본 발명에 의해 제공된 식물의 맥락에서 보다 상세하게 기재된다. 한 측면에서, 따라서, 본 발명은 하기 단계(들)를 포함하는, 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 갖는 캅시쿰 아누움 식물을 생산하는 방법을 제공한다: (i) 제1 캅시쿰 아누움 식물과 제2 식물을 교배시키는 단계이며, 여기서 제1 캅시쿰 아누움 식물은 그의 게놈에 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 것인 단계; (ii) 임의로 (i)의 교배로부터 종자를 수확하고 그의 게놈에 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 종자를 선택하는 단계. 따라서, 본 발명은 하기 단계(들)를 포함하는, 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 갖는 캅시쿰 아누움 식물을 생산하는 방법을 추가로 제공한다: (i) 제1 캅시쿰 아누움 식물 및 제2 식물을 교배시키는 단계이며, 여기서 제1 캅시쿰 아누움 식물은 정량적 형질 유전자좌 QTL8을 포함하는 염색체 8 상의 유전자이입 단편을 포함하고 임의로 정량적 형질 유전자좌 QTL7을 포함하는 염색체 7 상의 유전자이입 단편을 추가로 포함하고, 여기서 상기 QTL7 및 QTL8은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하고, 여기서 QTL7은 염색체 7 상에서 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_01과 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_20 사이에 위치하고; QTL8은 염색체 8 상에서 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_21과 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_40 사이에 위치하는 것인 단계; (ii) 임의로 (i)의 교배로부터 종자를 수확하고 그의 게놈에 QTL7 및/또는 QTL8을 포함하는 종자를 선택하는 단계.
한 측면에서, 본 발명은 본원에 기재된 바와 같은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 갖는 캅시쿰 아누움 식물을 생산하는 방법을 제공하며, 여기서 단계 (i)에서 제1 캅시쿰 아누움 식물 및 제2 식물 둘 다는 본 발명에 따른 식물이다. 보다 바람직하게는, 본원에 제공된 바와 같은 캅시쿰 아누움 식물을 생산하는 방법의 단계 (i)에서의 제1 캅시쿰 아누움 식물 및 제2 캅시쿰 아누움 식물 둘 다는 이들의 게놈에 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 본 발명에 따른 식물이다.
한 측면에서, 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분이 그의 게놈에 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 지 여부를 결정하는 단계를 포함하는, 상기 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법을 제공한다. 따라서, 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분이 그의 게놈에 정량적 형질 유전자좌 QTL8을 포함하는 염색체 8 상의 유전자이입 단편을 포함하는 지 여부를 결정하는 단계를 포함하는, 상기 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법을 제공하며, 여기서 상기 QTL8은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하고, 여기서 QTL8은 염색체 8 상에서 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_21과 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_40 사이에 위치한다. 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법은 상기 식물 또는 식물 부분이 그의 게놈에 정량적 형질 유전자좌 TTL7을 포함하는 염색체 7 상의 유전자이입 단편을 포함하는 지 여부를 결정하는 단계를 추가적으로 포함할 수 있으며, 여기서 상기 QTL7은 염색체 7 상에서 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_01과 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_20 사이에 위치한다. 바람직하게는, 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 본 발명에 따른 방법은 상기 식물 또는 식물 부분에서 1개 이상 (예를 들어 2개)의 피크 마커(들), 바람직하게는 표 2에 기재된 바와 같은 1개 이상 (예를 들어 2개)의 피크 마커의 존재 또는 부재를 결정하는 단계를 포함한다. 본원에 사용된 바와 같은, 용어 "피크 마커"는, 바람직하게는 0%의 위양성율 및/또는 위음성율을 갖는, 가능한 한 정확한 것으로 발견되는 마커를 기재한다.
방법은 본 발명에 따른 QTL8 및 임의로 QTL7의 존재를 검출하기 위해, 공지된 방법을 사용하여 DNA, RNA (또는 cDNA) 또는 단백질 수준에서 스크리닝하는 단계를 포함할 수 있다. 본원에 기재된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 유전자이입 단편의 존재를 검출하는 많은 방법이 있다. 예를 들어, 관심 유전자 또는 관심 QTL (예컨대 QTL8 및 임의로 QTL7)을 포함하는 식물과 관심 유전자 또는 QTL을 포함하지 않는 식물 사이의 단일 뉴클레오티드 차이 (단일 뉴클레오티드 다형성, SNP)가 있는 경우에, SNP 유전자형 결정 검정이 식물 또는 식물 부분 또는 세포가 그의 게놈에 관심 유전자 또는 QTL을 포함하는 지 여부를 검출하는 데 사용될 수 있다. 예를 들어, SNP는 KASP-검정 (kpbioscience.co.uk의 월드 와이드 웹 참조) 또는 다른 SNP 유전자형 결정 검정을 사용하여 용이하게 검출될 수 있다. KASP-검정을 개발하기 위해, 예를 들어 SNP의 상류의 70개의 염기 쌍 및 하류의 70개의 염기 쌍이 선택될 수 있고 2개의 대립유전자-특이적 정방향 프라이머 및 1개의 대립유전자 특이적 역방향 프라이머가 설계될 수 있다. 예를 들어, KASP-검정 방법을 위해 문헌 [Allen et al. 2011, Plant Biotechnology J. 9, 1086-1099], 특히 p097-1098을 참조한다. 동등하게 다른 유전자형 결정 검정이 사용될 수 있다. 예를 들어, TaqMan SNP 유전자형 결정 검정, 고-분해능 용융 (HRM) 검정, SNP-유전자형 결정 어레이 (예를 들어 플루이다임(Fluidigm), 일루미나(Illumina) 등) 또는 DNA 시퀀싱이 동등하게 사용될 수 있다.
분자 마커가 또한 본 발명의 QTL8 및 임의로 QTL7을 함유하는 식물 (또는 그로부터 수득된 식물 부분 또는 핵산)의 확인을 돕는 데 사용될 수 있다. 예를 들어, QTL8 및 임의로 QTL7에 유전적으로 (및 바람직하게는 또한 물리적으로) 밀접하게 연결된 1개 이상의 적합한 분자 마커를 개발할 수 있다. 적합한 분자 마커는 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물 (바람직하게는 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 가짐)을 대조군 식물, 바람직하게는 동질유전자형 식물과 교배시키고, 해당 교배로부터 격리 집단 (예를 들어 F2 또는 역교배 집단)을 발생시킴으로써 개발될 수 있다. 이어서, 격리 집단은 본원에 기재된 바와 같은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형에 대해 표현형 결정되고 예를 들어 분자 마커 예컨대 SNP (단일 뉴클레오티드 다형성), AFLP (증폭된 단편 길이 다형성; 예를 들어, EP 534 858 참조) 등을 사용하여 유전자형 결정될 수 있고, 소프트웨어 분석에 의해, 격리 집단에서의 본 발명의 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형과 공동-격리되는 분자 마커가 확인될 수 있고 관심 QTL (또는 원인 유전자)의 유전자좌에 대한 이들의 순서 및 유전자 거리 (센티모건 거리, cM)가 확인될 수 있다. 이어서, 관심 유전자 또는 QTL에 밀접하게 연결된 분자 마커, 예를 들어 5 cM 이하의 거리의 마커가 (예를 들어 유전자이입 단편에서) 관심 유전자 또는 QTL을 포함하거나 또는 유지하는 식물 (예를 들어, 본 발명의 식물 또는 본 발명의 식물의 자손) 또는 식물 부분을 검출하고/거나 선택하는 데 사용될 수 있다. 이러한 밀접하게 연결된 분자 마커는 육종 프로그램에서, 즉 마커 보조 선택 (MAS)에서 표현형 선택을 대체할 수 있다 (또는 표현형 선택에 더하여 사용될 수 있다). 바람직하게는, 연결된 마커가 MAS에 사용된다. 보다 바람직하게는, 플랭킹 마커, 즉 관심 QTL의 유전자좌의 어느 한쪽 측면 상의 1개의 마커가 MAS에 사용된다.
한 측면에서, 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분에서 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 QTL의 존재 또는 부재를 결정하기 위한 마커를 제공하며, 여기서 마커는 하기로 이루어진 군으로부터 선택된다: 염색체 7 상에서 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_01과 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_20 사이에 위치한 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 부여 QTL에 연결된 마커; 및 염색체 8 상에서 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_21과 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_40 사이에 위치한 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 부여 QTL에 연결된 마커.
한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분에서 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 QTL의 존재 또는 부재를 결정하기 위한 마커는 SNP 마커이다.
한 측면에서, 본 발명에 따른 염색체 7 상에 위치한 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 부여 QTL에 연결된 마커는 하기로 이루어진 군으로부터 선택된다: 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_01; 서열식별번호: 3의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 3에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_02; 서열식별번호: 5의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 5에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_03; 서열식별번호: 7의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 7에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_04; 서열식별번호: 9의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 9에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_05; 서열식별번호: 11의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 11에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_06; 서열식별번호: 13의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 13에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_07; 서열식별번호: 15의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 15에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_08; 서열식별번호: 17의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 17에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_09; 서열식별번호: 19의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 19에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_10; 서열식별번호: 21의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 21에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_11; 서열식별번호: 23의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 23에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_12; 서열식별번호: 25의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 25에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_13; 서열식별번호: 27의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 27에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_14; 서열식별번호: 29의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 29에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_15; 서열식별번호: 31의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 31에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_16; 서열식별번호: 33의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 33에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_17; 서열식별번호: 35의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 35에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_18; 서열식별번호: 37의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 37에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_19; 및 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_20.
한 측면에서, 본 발명에 따른 염색체 7 상에 위치한 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 부여 QTL에 연결된 마커는 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 QTL의 존재를 결정하는 데 적합하고 여기서: SNP_01은 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고; SNP_02는 서열식별번호: 3의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 3에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고; SNP_03은 서열식별번호: 5의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 5에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고; SNP_04는 서열식별번호: 7의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 7에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하고; SNP_05는 서열식별번호: 9의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 9에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고; SNP_06은 서열식별번호: 11의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 11에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고; SNP_07은 서열식별번호: 13의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 13에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고; SNP_08은 서열식별번호: 15의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 15에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고; SNP_09는 서열식별번호: 17의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 17에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하고; SNP_10은 서열식별번호: 19의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 19에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고; SNP_11은 서열식별번호: 21의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 21에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고; SNP_12는 서열식별번호: 23의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 23에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고;
SNP_13은 서열식별번호: 25의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 25에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고; SNP_14는 서열식별번호: 27의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 27에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고; SNP_15는 서열식별번호: 29의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 29에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고; SNP_16은 서열식별번호: 31의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 31에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고; SNP_17은 서열식별번호: 33의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 33에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고; SNP_18은 서열식별번호: 35의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 35에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고; SNP_19는 서열식별번호: 37의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 37에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고; SNP_20은 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함한다.
한 측면에서, 본 발명에 따른 염색체 8 상에 위치한 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 부여 QTL에 연결된 마커는 하기로 이루어진 군으로부터 선택된다: 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_21; 서열식별번호: 43의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 43에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_22; 서열식별번호: 45의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 45에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_23; 서열식별번호: 47의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 47에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_24; 서열식별번호: 49의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 49에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_25; 서열식별번호: 51의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 51에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_26; 서열식별번호: 53의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 53에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_27; 서열식별번호: 55의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 55에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_28; 서열식별번호: 57의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 57에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_29; 서열식별번호: 59의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 59에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_30; 서열식별번호: 61의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 61에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_31; 서열식별번호: 63의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 63에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_32; 서열식별번호: 65의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 65에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_33; 서열식별번호: 67의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 67에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_34; 서열식별번호: 69의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 69에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_35; 서열식별번호: 71의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 71에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_36; 서열식별번호: 73의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 73에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_37; 서열식별번호: 75의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 75에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_38; 서열식별번호: 77의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 77에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_39; 및 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_40.
한 측면에서, 본 발명에 따른 염색체 8 상에 위치한 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 부여 QTL에 연결된 마커는 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 QTL의 존재를 결정하는 데 적합하고 여기서: SNP_21은 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고; SNP_22는 서열식별번호: 43의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 43에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고; SNP_23은 서열식별번호: 45의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 45에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고; SNP_24는 서열식별번호: 47의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 47에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고; SNP_25는 서열식별번호: 49의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 49에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고; SNP_26은 서열식별번호: 51의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 51에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고; SNP_27은 서열식별번호: 53의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 53에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고; SNP_28은 서열식별번호: 55의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 55에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고; SNP_29는 서열식별번호: 57의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 57에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고; SNP_30은 서열식별번호: 59의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 59에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고; SNP_31은 서열식별번호: 61의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 61에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하고; SNP_32는 서열식별번호: 63의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 63에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고; SNP_33은 서열식별번호: 65의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 65에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고; SNP_34는 서열식별번호: 67의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 67에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고; SNP_35는 서열식별번호: 69의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 69에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고; SNP_36은 서열식별번호: 71의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 71에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하고; SNP_37은 서열식별번호: 73의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 73에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고; SNP_38은 서열식별번호: 75의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 75에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고; SNP_39는 서열식별번호: 77의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 77에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하고; SNP_40은 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함한다.
한 측면에서, 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분에서 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 1개 이상의 QTL의 존재 또는 부재를 결정하기 위한 본 발명에 따른 마커의 용도를 제공하며, 여기서 상기 1개 이상의 QTL은 바람직하게는 본원에 기재된 바와 같은 QTL7 및/또는 QTL8이다.
한 측면에서, 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분에서 본 발명에 따른 1개 이상의 마커의 존재 또는 부재를 결정하는 단계를 포함하는, 상기 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법을 제공한다.
한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법에 사용된 마커는 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 1개 이상의 QTL에 연결된 SNP 마커이다: 염색체 7 상에서 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_01; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_01; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 3의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 3에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_02; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 5의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 5에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 아데닌을 포함하는 SNP_03; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 7의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 7에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 시토신을 포함하는 SNP_04; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 9의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 9에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 아데닌을 포함하는 SNP_05; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 11의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 11에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 아데닌을 포함하는 SNP_06; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 13의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 13에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 구아닌을 포함하는 SNP_07; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 15의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 15에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 구아닌을 포함하는 SNP_08; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 17의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 17에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 시토신을 포함하는 SNP_09; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 19의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 19에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 구아닌을 포함하는 SNP_10; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 21의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 21에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 구아닌을 포함하는 SNP_11; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 23의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 23에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_12; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 25의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 25에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 아데닌을 포함하는 SNP_13; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 27의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 27에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_14; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 29의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 29에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_15; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 31의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 31에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 구아닌을 포함하는 SNP_16; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 33의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 33에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_17; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 35의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 35에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_18; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 37의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 37에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 아데닌을 포함하는 SNP_19; 염색체 7 상에서 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 구아닌을 포함하는 SNP_20; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 아데닌을 포함하는 SNP_21; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 43의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 43에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_22; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 45의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 45에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 구아닌을 포함하는 SNP_23; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 47의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 47에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 구아닌을 포함하는 SNP_24; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 49의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 49에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 구아닌을 포함하는 SNP_25; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 51의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 51에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 아데닌을 포함하는 SNP_26; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 53의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 53에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_27; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 55의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 55에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 아데닌을 포함하는 SNP_28; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 57의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 57에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_29; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 59의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 59에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 구아닌을 포함하는 SNP_30; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 61의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 61에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 시토신을 포함하는 SNP_31; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 63의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 63에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 구아닌을 포함하는 SNP_32; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 65의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 65에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 아데닌을 포함하는 SNP_33; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 67의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 67에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_34; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 69의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 69에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 구아닌을 포함하는 SNP_35; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 71의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 71에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 시토신을 포함하는 SNP_36; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 73의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 73에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_37; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 75의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 75에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 아데닌을 포함하는 SNP_38; 염색체 8 상에서 서열식별번호: 77의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 77에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 시토신을 포함하는 SNP_39; 및 염색체 8 상에서 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 아데닌을 포함하는 SNP_40.
한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법은 상기 식물 또는 식물 부분에서 염색체 7 상에 위치한 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성 부여 QTL에 연결된 적어도 1개의 마커 및/또는 염색체 8 상에 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성 부여 QTL에 연결된 적어도 1개의 마커의 존재 또는 부재를 결정하는 단계를 포함한다.
한 측면에서, 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법을 제공하며, 여기서 염색체 7 상 마커는 서열식별번호: 3의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 3에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_02이고; 염색체 8 상 마커는 서열식별번호: 73의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 73에 대해 적어도 95% (바람직하게는 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98% 및 가장 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에서 티민을 포함하는 SNP_37이다.
한 측면에서, 본 발명은 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 핵산을 제공한다: 서열식별번호: 1 또는 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 3 또는 서열식별번호: 3의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 5 또는 서열식별번호: 5의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 7 또는 서열식별번호: 7의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 9 또는 서열식별번호: 9의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 11 또는 서열식별번호: 11의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 13 또는 서열식별번호: 13의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 15 또는 서열식별번호: 15의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 17 또는 서열식별번호: 17의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 19 또는 서열식별번호: 19의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 21 또는 서열식별번호: 21의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 23 또는 서열식별번호: 23의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 25 또는 서열식별번호: 25의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 27 또는 서열식별번호: 27의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 29 또는 서열식별번호: 29의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 31 또는 서열식별번호: 31의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 33 또는 서열식별번호: 33의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 35 또는 서열식별번호: 35의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 37 또는 서열식별번호: 37의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 39 또는 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 41 또는 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 43 또는 서열식별번호: 43의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 45 또는 서열식별번호: 45의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 47 또는 서열식별번호: 47의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 49 또는 서열식별번호: 49의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 51 또는 서열식별번호: 51의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 53 또는 서열식별번호: 53의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 55 또는 서열식별번호: 55의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 57 또는 서열식별번호: 57의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 59 또는 서열식별번호: 59의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 61 또는 서열식별번호: 61의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 63 또는 서열식별번호: 63의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 65 또는 서열식별번호: 65의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 67 또는 서열식별번호: 67의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 69 또는 서열식별번호: 69의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 71 또는 서열식별번호: 71의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 73 또는 서열식별번호: 73의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 75 또는 서열식별번호: 75의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 서열식별번호: 77 또는 서열식별번호: 77의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 및 서열식별번호: 79 또는 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진 그의 단편; 또는 그의 상보성 뉴클레오티드 서열을 포함함.
한 측면에서, 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분의 마커 보조 선택을 위한 서열식별번호: 1-80 또는 그의 단편으로 이루어진 군으로부터 선택된 1개 이상의 뉴클레오티드 서열의 용도를 제공하며, 여기서 상기 단편은 서열식별번호: 1-80으로 이루어진 군으로부터 선택된 상기 뉴클레오티드 서열 또는 상기 1개 이상의 뉴클레오티드 서열의 상보성 서열의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진다.
한 측면에서, 본 발명은 본원에 기재된 바와 같은 QTL7 및/또는 QTL8을 포함하는 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분의 마커 보조 선택에 적합한 마커를 개발하기 위한 서열식별번호: 1-80 또는 그의 단편으로 이루어진 군으로부터 선택된 1개 이상의 뉴클레오티드 서열의 용도를 제공하며, 여기서 상기 단편은 서열식별번호: 1-80으로 이루어진 군으로부터 선택된 상기 뉴클레오티드 서열 또는 상기 1개 이상의 뉴클레오티드 서열의 상보성 서열의 뉴클레오티드 51을 포함하는 적어도 15개의 뉴클레오티드로 이루어진다.
한 측면에서, 본 발명은 본원에 기재된 바와 같은 QTL7 및/또는 QTL8을 캅시쿰 아누움 식물로 유전자이입하는 단계를 포함하는, 상기 캅시쿰 아누움 식물의 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 증진시키는 방법을 제공한다.
한 측면에서, 본 발명은 캅시쿰 아누움 식물에서 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 증진시키기 위한 본원에 기재된 바와 같은 QTL7 및/또는 QTL8의 용도를 제공한다.
본 발명의 다른 실시양태는 하기 실시양태에 관한 것이며, 이는 단독으로 보아서는 안 되나 본원에 기재된 다른 실시양태 중 임의의 것과 조합될 수 있다. 바람직하게는, 하기 본원에 기재된 세포 또는 세포들은 상기 본원에 정의된 바와 같은 비-재생가능한 세포이다. 대안적으로, 하기 본원에 기재된 세포 또는 세포들은 비-번식 세포이다. 본원에 사용된 바와 같은, 용어 "비-번식 식물 세포"는 광합성을 통해 무기 물질, 예컨대 물, 이산화탄소 및 미네랄 염 등으로부터 탄수화물 및 단백질을 합성함으로써 그의 삶을 유지할 수 없는 식물 세포이다.
한 실시양태에서 본 발명은 정량적 형질 유전자좌 QTL7을 포함하는 염색체 7 상의 유전자이입 단편을 포함하고/거나 정량적 형질 유전자좌 QTL8을 포함하는 염색체 8 상의 유전자이입 단편을 포함하는 캅시쿰 아누움 식물의 세포를 제공하며, 여기서 상기 QTL7 및 QTL8은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하고, 여기서
QTL7은 염색체 7 상에서 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_01과 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_20 사이에 위치하고;
QTL8은 염색체 8 상에서 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_21과 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_40 사이에 위치하고,
여기서 세포는 QTL7 및/또는 QTL8이 이형접합 형태로 존재하고 QTL7 또는 QTL8이 동형접합 형태로 존재하지 않을 때 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물의 것이다.
따라서 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물의 세포는 하기일 때 본원에 추가로 정의된 바와 같은 "비-자극적 캅시쿰 아누움 식물"의 세포이다:
QTL7 및/또는 QTL8이 이형접합 형태로 존재하고;
QTL7 또는 QTL8이 동형접합 형태로 존재하지 않음.
따라서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물의 세포는 하기일 때 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물의 것이다: QTL7이 이형접합 형태로 존재하고 QTL8은 존재하지 않음; QTL7이 이형접합 형태로 존재하고 QTL8이 이형접합 형태로 존재함; 및 QTL7은 존재하지 않고 QTL8이 이형접합 형태로 존재함. 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물의 세포는 하기일 때 자극적 캅시쿰 아누움 식물 또는 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물의 것일 수 있다: QTL 7이 동형접합 형태로 존재하고 QTL8이 이형접합 형태로 존재함; QTL 7이 동형접합 형태로 존재하고 QTL8은 존재하지 않음; QTL 7은 존재하지 않고 QTL8이 동형접합 형태로 존재함; QTL 7이 이형접합 형태로 존재하고 QTL8은 동형접합 형태로 존재함; 및 QTL7이 동형접합 형태로 존재하고 QTL8이 동형접합 형태로 존재함. 한 측면에서, 본 발명에 따른 캅시쿰 아누움 식물의 세포는 본원에 추가로 정의된 바와 같은 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물의 것이다.
QTL7 및 QTL8이 대표적인 수의 종자가 기탁 번호 NCIMB 43623 하에 기탁된 H19_020279-044로 지정된 캅시쿰 아누움 식물의 게놈에 존재하거나, 또는 그로부터 수득가능하거나, 또는 그로부터 수득되거나, 또는 그에 포함되는 바와 같은 것인 전술한 실시양태의 세포.
QTL7을 포함하는 유전자이입 단편이 하기로부터 선택된 적어도 1개의 마커의 1배체형을 포함하고:
서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_01;
서열식별번호: 3의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 3에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_02;
서열식별번호: 5의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 5에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_03;
서열식별번호: 7의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 7에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_04;
서열식별번호: 9의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 9에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_05;
서열식별번호: 11의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 11에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_06;
서열식별번호: 13의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 13에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_07;
서열식별번호: 15의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 15에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_08;
서열식별번호: 17의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 17에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_09;
서열식별번호: 19의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 19에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_10;
서열식별번호: 21의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 21에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_11;
서열식별번호: 23의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 23에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_12;
서열식별번호: 25의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 25에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_13;
서열식별번호: 27의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 27에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_14;
서열식별번호: 29의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 29에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_15;
서열식별번호: 31의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 31에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_16;
서열식별번호: 33의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 33에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_17;
서열식별번호: 35의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 35에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_18;
서열식별번호: 37의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 37에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_19; 및
서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_20;
QTL8을 포함하는 유전자이입 단편이 하기로부터 선택된 적어도 1개의 마커의 1배체형을 포함하는 것인 전술한 실시양태의 세포:
서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_21;
서열식별번호: 43의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 43에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_22;
서열식별번호: 45의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 45에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_23;
서열식별번호: 47의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 47에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_24;
서열식별번호: 49의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 49에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_25;
서열식별번호: 51의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 51에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_26;
서열식별번호: 53의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 53에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_27;
서열식별번호: 55의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 55에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_28;
서열식별번호: 57의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 57에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_29;
서열식별번호: 59의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 59에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_30;
서열식별번호: 61의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 61에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_31;
서열식별번호: 63의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 63에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_32;
서열식별번호: 65의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 65에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_33;
서열식별번호: 67의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 67에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_34;
서열식별번호: 69의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 69에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_35;
서열식별번호: 71의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 71에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_36;
서열식별번호: 73의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 73에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_37;
서열식별번호: 75의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 75에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_38;
서열식별번호: 77의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 77에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_39; 및
서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_40.
QTL7 및/또는 QTL8이 동형접합 형태로 존재하는 것인 전술한 실시양태의 세포.
세포가 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물의 것인 전술한 실시양태의 세포.
세포가 근교 식물, 이성반수체 식물 또는 잡종 식물의 것인 전술한 실시양태의 세포.
종자 기탁
정량적 형질 유전자좌 QTL7을 포함하는 염색체 7 상의 유전자이입 단편을 포함하고 정량적 형질 유전자좌 QTL8을 포함하는 염색체 8 상의 유전자이입 단편을 포함하는 캅시쿰 아누움 계통의 종자의 대표적인 샘플은 전문가 솔루션 (EPC 2000, 규칙 32(1)) 하에 부다페스트 조약에 따라 NCIMB 엘티디.(NCIMB Ltd.) (영국 에이비21 9와이에이 스코틀랜드 애버딘 벅스번 크레이브스톤 에스테이트 퍼거슨 빌딩)에 2020년 6월 1일에 넌헴스 비.브이.(Nunhems B.V.)에 의해 기탁되었다. 종자는 하기 기탁 번호가 제공되었다: NCIMB 43623 (캅시쿰 아누움 H19_020279-044).
본 출원인은 생물학적 물질 및 그로부터 유래된 임의의 물질의 샘플이, 특허의 허여가 언급될 때까지, 또는 출원이 거절되거나, 취하되거나 또는 취하된 것으로 간주되는 경우에 출원일로부터 20년 동안 규칙 32(1) EPC 또는 유사한 규칙 및 규정을 갖는 국가 또는 조약의 관련 제정법에 따라 오직 지정된 전문가에게만 양도될 것을 요구한다.
기탁물에 대한 접근은 본 출원이 계류되는 동안 요청 시 미국 특허청장에 의해 그에 대한 자격이 있는 것으로 결정된 사람에게 이용가능할 것이다. 37 C.F.R. § 1.808(b)에 따라, 기탁된 물질의 공중에 대한 이용가능성에 대해 기탁자에 의해 부과된 모든 제한은 특허의 허여 시 확정적으로 제거될 것이다. 기탁물은 30년, 또는 가장 최근의 요청 후 5년의 기간, 또는 본 특허의 실시 기간 중 더 긴 기간 동안 유지될 것이고 해당 기간 동안 생존할 수 없어지는 경우에 교체될 것이다. 본 출원인은 본 출원에 대한 본 특허 하에 또는 식물 품종 보호법 (7 USC 2321 이하 참조) 하에 부여된 어떠한 권리도 포기하지 않는다.
하기 비-제한적인 실시예는 QTL7 및/또는 QTL8을 포함하는 본 발명에 따른 식물을 수득할 수 있는 방법을 기재한다. 실시예에서 달리 명시되지 않는 한, 모든 재조합 DNA 기술은 문헌 [Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, and Sambrook and Russell (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Third Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY; and in Volumes 1 and 2 of Ausubel et al. (1994) Current Protocols in Molecular Biology, Current Protocols, USA]에 기재된 바와 같은 표준 프로토콜에 따라 수행된다. 식물 분자 작업을 위한 표준 물질 및 방법은 문헌 [Plant Molecular Biology Labfax (1993) by R.D.D. Croy, jointly published by BIOS Scientific Publications Ltd (UK) and Blackwell Scientific Publications, UK]에 기재되어 있다. 표준 육종 방법은 문헌 ['Principles of Plant breeding', Second Edition, Robert W. Allard (ISBN 0-471-02309-4)]에 기재되어 있다.
실시예
실시예 1
총채벌레 저항성 테스트
에프. 옥시덴탈리스를 사용한 고추 저항성 스크리닝은 플라스틱 터널에 이식된 성체 식물로 수행되고 최소 수준으로 감소된 화학적 처리에 특히 주의하면서 표준 방식으로 관리된다. 특히, 살곤충제 및 생물학적 방제의 사용은 정말로 필요한 경우에만 총채벌레에 대한 최소의 영향을 미치는 방법을 선택하면서 적용되었다. 온실 내 임의의 다른 곤충의 존재를 피할 뿐만 아니라 스크리닝 동안 온도를 최대 40 ℃로 제한하기 위해 특별히 조심하였다.
식물이 개화하기 시작하면, 특정 수의 에프. 옥시덴탈리스를 온실 내로 방출하였으며, 여기서 동일한 수의 곤충이 각각의 감수성 식물에 대해 방출된다 (감수성 플롯에서의 식물을 배제함). 방출을 식물이 콜로니생성된 것으로 보일 때까지 여러 번 반복하였다. 식물은 적어도 3-4마리의 곤충이 꽃 내에 가시적일 때 콜로니생성된 것으로 간주된다.
에프. 옥시덴탈리스 스크리닝에서, 평가 시기는 첫 번째 은화 증상이 나타날 때 시작하고, 이는 전형적으로 제1 방출 후 약 1개월이었다. 평가는 전체 식물을 총채벌레에 의해 초래된 식물 손상에 대해 평가함으로써 수행되었다. 56 DAT에서 1회 및 70 DAT에서 1회 2회의 평가를 수행하였다.
각각의 유전자형에 대해, 적어도 3회 반복을 수행하였다. 각각의 플롯은 3개의 식물을 포함하였으며, 여기서 각각의 플롯은 1회 반복이다. 1개의 감수성 식물이 6개의 테스트된 식물마다 포함되었다. 모든 반복은 완전히 무작위화되었다. 감수성 및 저항성 무작위 플롯은 식물의 총 수의 총 5%에 대해 존재하였다. 모든 감수성 식물은 총 식물의 20%를 차지하였다. F2 집단의 경우, 모든 식물을 위치 효과를 가능한 한 많이 피하기 위해 온실의 동일한 차단에 심었다. 모든 결과를 위치 효과를 최소화하고 유전자형 사이의 유전자 차이를 강조하기 위해 통계적으로 분석하였다.
개별 식물의 채점은 1-9의 척도를 사용하여 실현되었으며, 여기서 1은 완전한 잎 손상을 갖는 고도의 감수성을 의미하고 9는 잎 손상이 없는 고도의 저항성을 의미한다.
표 1: 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 분류
Figure pct00001
실시예 2
프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 식물의 육종
스크리닝 활성은 본원에 SOURCE01로 명명된 자극적 씨. 아누움 고추 잡종의 확인을 야기하였다. 본 발명자들은 꽃노랑총채벌레 (에프. 옥시덴탈리스)에 대한 주목할 만한 내성을 갖는 SOURCE01로부터 계통을 얻을 수 있었다. 이어서, SOURCE03으로 명명되고 SOURCE01로부터 유래된 하나의 F3 계통을 에프. 옥시덴탈리스에 대해 감수성인 내부 육종 프로그램으로부터 나온 씨. 아누움 "테핀" 유형 계통으로부터 유래된 사유 계통 82709-0과 교배시켰다.
사유 계통 82709-0과 SOURCE03 사이의 육종 교배로부터 유래된 TPS50021로 명명된 발생 교배를 발생시켰다. 여러 다른 유래된 근교 계통과 함께 TPS50021은 감미 고추 프로그램에서 시작된 총채벌레 육종 프로젝트에 대한 육종 시작을 나타내었다. 감미 고추 총채벌레 프로그램은 총채벌레 저항성 생체내 선택 스크리닝에 의해 지지된 종래의 정방향 육종을 통해 주도되었다. 82709-0 및 TPS50021 계통을 생체내 총채벌레 시험에서 후속 4년 동안 평가한 반면에, SOURCE01 잡종을 후속 2년 동안 평가하였으며 총채벌레 손상에 대한 높은 내성을 나타냈다. 생체내 총채벌레 시험에서, 통계적 보정으로 구성된 식물병리학 프로토콜에 따라, 식물을 이들의 잎 은화 손상에 기반하여 채점하였으며 값은 1 (완전한 잎 손상을 갖는 고도의 감수성) 내지 9 (잎 손상이 없는 고도의 저항성)의 범위이고 표 1을 참조한다.
TPS500021, 또는 그의 유래된 근교 계통을 상이한 씨. 아누움 매운/감미 육종 분절로부터의 육종 계통 (뎀레(Demre), 찰리스턴(Charliston), 왁시(Waxy), 카피아(Kapia), 애나하임(Anaheim), 할라페뇨, 블록키 벨(Blocky Bell), 라무요(Lamuyo), 둘체 이탈리아노(Dulce Italiano))과 교배시킴으로써 수득된 여러 유전자이입된 계통을 생성하였고 이들 중 일부를 생체내 총채벌레 시험에서 후속 2년 동안 평가하였으며 높은 수준의 내성을 나타냈다. 대표적인 종자가 본 발명의 맥락에서 기탁 번호 NCIMB 43623 하에 기탁된 캅시쿰 아누움 H19_020279-044로 명명된 비-자극적 계통을 근교 계통으로부터 유래된 TPS500021과 사유 비-자극적 근교 계통 사이의 교배로부터 수득하였다.
실시예 3
QTL 맵핑 및 SNP 마커 개발
총채벌레 저항성에 연결된 분자 마커는 연결 맵핑에 의해 개발되었다 (Doerge, 2002; Koornneef et al., 2004). 간단하게, 저항성과 감수성 양친 사이의 전장 게놈 다형성 SNP 마커를 선택하고 저항성과 감수성 양친 사이의 교배로부터의 F1 식물을 자가 수분시킴으로써 수득된 600개의 개체의 F2 집단에 대해 스크리닝하였다.
마커-형질 연관을 문헌 [Rqtl (Doerge, 2002)]에 시행된 구간 맵핑을 사용하여 확인하였다. 먼저 전장 게놈 맵핑 (GW)을 15 cM마다 대략 1개의 마커의 마커 밀도를 사용하여 수행하였다. QTL을 확인하면 맵핑 또는 포화 맵핑의 제2 라운드를 GW 맵핑에 의해 확인된 QTL 구간 내에 추가 SNP 마커를 부가함으로써 수행하였다. 연결 맵핑은 상이한 계절에 여러 평가에 걸쳐 일관되게 총채벌레 저항성과 연관된 2개의 영역을 확인하였으며, ch7 상 하나 및 ch8 상 하나는 각각 표현형 분산의 15% 및 30%를 설명한다.
미세 맵핑의 2회 라운드를 Ch7 및 Ch8 상 영역 내 768개의 F3 및 185개의 F4 재조합체를 평가함으로써 수행하였다. 피크 마커 및 플랭킹 마커는 표 2에 요약된다. 플랭킹 마커는 2 lod 점수 하락을 나타내며, 이는 QTL의 위치에 대한 95 % 신뢰 구간을 나타낸다.
표 2: QTL7 및 QTL8에 대한 피크 및 플랭킹 마커의 명칭
Figure pct00002
QTL 영역에서의 저항성 및 감수성 1배체형은 또한 도 1에 표시된다.
플랭킹 및 피크 마커에 기반하여 식물을 감수성 (A) 및 저항성 (B)로서 분류하는 것이 가능하다. 도 1에서, 염색체 7 상 QTL 및 염색체 8 상 QTL에 대한 대립유전자 상태를 나타낸다. H의 대립유전자 상태를 디스플레이하는 식물이 QTL 영역에서의 재조합체이다.
표 3. QTL7에 대해 확인된 SNP 마커
Figure pct00003
Figure pct00004
표 4. QTL8에 대해 확인된 SNP 마커
Figure pct00005
Figure pct00006
실시예 4
프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형 특징화
추가적인 고추 계통을 실시예 2에 기재된 바와 같은 방법을 사용하여 수득하였다. 상기 언급된 근교 계통 H20_002409, H20_002410은 계통 82709-0과 SOURCE03 사이의 교배로부터 원래 수득되었던 반면에, H20_002474는 라무요 유형 F7 근교 사유 계통과 SOURCE03 사이의 교배에 이어, 이어서 자가 수분의 적어도 하나의 세대에 의해 수득되었다. 이어서 자가 수분된 격리 집단을 각각 동형접합 형태로 상이한 QTL 조성을 갖는 근교를 선택할 목적으로 마커 선택에 제출하였다. 따라서 수득된 고추 계통을 본원에 기재된 바와 같은 QTL7 및 QTL8 둘 다를 포함하는 H20_002409, 본원에 기재된 바와 같은 QTL8을 포함하나 QTL7을 포함하지 않는 H20_002410 및 본원에 기재된 바와 같은 QTL7을 포함하나 QTL8을 포함하지 않는 H20_002474로 명명하였다.
따라서 수득된 고추 계통의 식물을 실시예 1에 기재된 바와 같은 총채벌레 저항성 테스트에 적용하였다. 이 총채벌레 저항성 테스트는 양성 대조군 (체크 S로 명명됨) 및 음성 대조군 (체크 R로 명명됨)을 포함하였다. S 체크는 왁시 유형 F6 근교 사유 계통이고 R 체크는 82709-0과 SOURCE03 사이의 원래의 교배, 따라서 TPS50021로부터 유래된 뎀레 유형 F6 근교 사유 계통이며, 이어서 또 다른 사유 근교 계통과 조합되고 자가 수분의 적어도 5회 사이클이 이어진다. 총채벌레 저항성 테스트의 결과가 하기 본원에 제공된 바와 같은 표 5에 제공된다.
표 5: QTL7 및/또는 QTL8을 포함하는 고추 계통을 사용한 총채벌레 저항성 테스트의 결과
Figure pct00007
따라서 QTL7과 비교하여 QTL8이 개선된 총채벌레 저항성 수준을 제공한다는 것이 발견되었다. 더욱이, QTL7 및 QTL8 둘 다를 포함하는 식물이 오직 QTL7만을 포함하고 QTL8을 포함하지 않는 식물과 비교하여 및 오직 QTL8만을 포함하고 QTL7을 포함하지 않는 식물과 비교하여 추가 개선된 총채벌레 저항성 수준을 나타낸다는 것이 발견되었다.
NCIMB LTD. NCIMB43623 20200601
SEQUENCE LISTING <110> Nunhems B.V. <120> Capsicum annuum plants having improved thrips resistance <130> 202363WO01 <150> EP20179345.2 <151> 2000-06-10 <160> 81 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 1 aggcacggac gaagccagcc actattgtca ttaagcatat ttcatgagtt taatatctgt 60 tggattaaga aacataccca ttcaagtact gctcctttct g 101 <210> 2 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 2 aggcacggac gaagccagcc actattgtca ttaagcatat ttcatgagtt caatatctgt 60 tggattaaga aacataccca ttcaagtact gctcctttct g 101 <210> 3 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 3 tatggttcag cgtttaagat ttgatcaaat tttagtgttg tttgcatgta tatattgttc 60 cctttttaaa gatactagtt caattgaacg ctcatagatt g 101 <210> 4 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 4 tatggttcag cgtttaagat ttgatcaaat tttagtgttg tttgcatgta catattgttc 60 cctttttaaa gatactagtt caattgaacg ctcatagatt g 101 <210> 5 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 5 gaataacaaa tatatagaag taggagactt atcaatttta ctccttttta ataaaaaaat 60 aaataaataa atattatagt aacttcatta atgatactga t 101 <210> 6 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 6 gaataacaaa tatatagaag taggagactt atcaatttta ctccttttta gtaaaaaaat 60 aaataaataa atattatagt aacttcatta atgatactga t 101 <210> 7 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 7 gttactcccg ccgtttgctt ttacttgtca ctaatttcct aattgtattt ctatttttac 60 ttatcatttt tgacatatca agaaaagaca acttcttttt t 101 <210> 8 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 8 gttactcccg ccgtttgctt ttacttgtca ctaatttcct aattgtattt ttatttttac 60 ttatcatttt tgacatatca agaaaagaca acttcttttt t 101 <210> 9 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 9 tataagaagt gtcctgttac tgtccttcat caggtcatat gtgttgatct aattgagata 60 gatatagttg attttgatgt cattctgggt atagattggt t 101 <210> 10 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 10 tataagaagt gtcctgttac tgtccttcat caggtcatat gtgttgatct gattgagata 60 gatatagttg attttgatgt cattctgggt atagattggt t 101 <210> 11 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 11 gttctgaaca tattatacac ataaattgaa ttattcttgc attggtctct atcttctcaa 60 tgaacaaaga aagaaggtat taagggatca tttggtagta g 101 <210> 12 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 12 gttctgaaca tattatacac ataaattgaa ttattcttgc attggtctct gtcttctcaa 60 tgaacaaaga aagaaggtat taagggatca tttggtagta g 101 <210> 13 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 13 aaaatggact gttcacgcac aaacaatcat gcaaatggcc aaccacataa gcatcgtcga 60 tcaacgatcg cagaatttgc tgttatcggg gtatcatacg c 101 <210> 14 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 14 aaaatggact gttcacgcac aaacaatcat gcaaatggcc aaccacataa ccatcgtcga 60 tcaacgatcg cagaatttgc tgttatcggg gtatcatacg c 101 <210> 15 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 15 caagtctagt agatcctttt gatcctcaag ttcaactgaa ctactaccca ggtccttcaa 60 caatccactc tctttcatca gtgttcgaat tttctctgca t 101 <210> 16 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 16 caagtctagt agatcctttt gatcctcaag ttcaactgaa ctactaccca agtccttcaa 60 caatccactc tctttcatca gtgttcgaat tttctctgca t 101 <210> 17 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 17 cattaaccga attaccataa caagaatcat cattctcatg aaatgaaaca caaacttcca 60 acaatgctct atacacattt tgtgaaatct tgaaatcttt t 101 <210> 18 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 18 cattaaccga attaccataa caagaatcat cattctcatg aaatgaaaca taaacttcca 60 acaatgctct atacacattt tgtgaaatct tgaaatcttt t 101 <210> 19 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 19 acgcaaatga aagatttgat gatttcgagg tcggaaatgt ggccaagaat gttgcagatc 60 atatctacaa atatttcccw caagctgctt tacttctggt a 101 <210> 20 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 20 acgcaaatga aagatttgat gatttcgagg tcggaaatgt ggccaagaat attgcagatc 60 atatctacaa atatttcccw caagctgctt tacttctggt a 101 <210> 21 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 21 tagtgttacc aggcctggaa ctatgaatgc tcaagcacga acaaaacatc gacaacgtgt 60 gcyagatgaa tcatccacat tggagctgtc ctctacatct g 101 <210> 22 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 22 tagtgttacc aggcctggaa ctatgaatgc tcaagcacga acaaaacatc aacaacgtgt 60 gcyagatgaa tcatccacat tggagctgtc ctctacatct g 101 <210> 23 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 23 ataaaatata aaagggtgta aaataaaaga accccataaa gcaaagaaaa tgaatttgcc 60 tcagaatcaa caagatttcc agaaagtcca gggccaccag g 101 <210> 24 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 24 ataaaatata aaagggtgta aaataaaaga accccataaa gcaaagaaaa ggaatttgcc 60 tcagaatcaa caagatttcc agaaagtcca gggccaccag g 101 <210> 25 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 25 gagattgagg tctatgtaga tgatgtgatt caaagagtca ggctgaccat attaaagatt 60 taaaaaagtt ctttgaaagg cttcgcaggt ataatctcaa a 101 <210> 26 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 26 gagattgagg tctatgtaga tgatgtgatt caaagagtca ggctgaccat gttaaagatt 60 taaaaaagtt ctttgaaagg cttcgcaggt ataatctcaa a 101 <210> 27 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 27 ttattcagtt ccttagattt cccttgtgtc ttgcaaaaca gaagcttaac taactcttca 60 tgtccatcaa gaatgtgaag taggctttcc tccaagtacg g 101 <210> 28 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 28 ttattcagtt ccttagattt cccttgtgtc ttgcaaaaca gaagcttaac caactcttca 60 tgtccatcaa gaatgtgaag taggctttcc tccaagtacg g 101 <210> 29 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 29 tgaagaggag gaccgcagag ctgagcattg ccactatagg atgatctatc gaaactctgg 60 agttgagtgc ttgttggaat tctccctgat aagtggttgt t 101 <210> 30 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 30 tgaagaggag gaccgcagag ctgagcattg ccactatagg atgatctatc aaaactctgg 60 agttgagtgc ttgttggaat tctccctgat aagtggttgt t 101 <210> 31 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 31 gccggtgctg agatggacgg cgtcagccat ggatgccgat gggggtcgtt gggttggtcg 60 ctggtgaagt ttgttgagag agagagtgag agtctagaga g 101 <210> 32 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 32 gccggtgctg agatggacgg cgtcagccat ggatgccgat gggggtcgtt tggttggtcg 60 ctggtgaagt ttgttgagag agagagtgag agtctagaga g 101 <210> 33 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 33 aatatgtgga tagcttgaca tgtgctattt ctcagagagc acggagttgt tggtgatatg 60 agagatgctt ggccaaacgc tcgtgtgagg aaaaatgtat c 101 <210> 34 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 34 aatatgtgga tagcttgaca tgtgctattt ctcagagagc acggagttgt cggtgatatg 60 agagatgctt ggccaaacgc tcgtgtgagg aaaaatgtat c 101 <210> 35 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 35 ggtcatgtcc tcagtcagct gtaactgctc catgtcacgt ttaatcactt tcctccagta 60 tttcttcggt ctacccctgc cccgcttgaa accgtccaag g 101 <210> 36 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 36 ggtcatgtcc tcagtcagct gtaactgctc catgtcacgt ttaatcactt ccctccagta 60 tttcttcggt ctacccctgc cccgcttgaa accgtccaag g 101 <210> 37 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 37 gaataatatt attatttttt ggtagaaagg acatgcatta atataaaaga aaacgcagtt 60 taagtttcaa tttttgacga ttagtcaggg ttcaaaaagg a 101 <210> 38 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 38 gaataatatt attatttttt ggtagaaagg acatgcatta atataaaaga gaacgcagtt 60 taagtttcaa tttttgacga ttagtcaggg ttcaaaaagg a 101 <210> 39 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 39 agactgagtt ggggaaagta aaatcaagag ggctgttctg taaatgagtc gtcgtttccg 60 ttgaactatc ttgaggcaaa tggctgctaa tgaaggattg a 101 <210> 40 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 40 agactgagtt ggggaaagta aaatcaagag ggctgttctg taaatgagtc atcgtttccg 60 ttgaactatc ttgaggcaaa tggctgctaa tgaaggattg a 101 <210> 41 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 41 aagggccgaa ctgcaaggat ctatcatgca cggtcatacc ctgcatttct acgagagact 60 gtttcatttc ctgcatttct gcaagagatt gtatccacac c 101 <210> 42 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 42 aagggccgaa ctgcaaggat ctatcatgca cggtcatacc ctgcatttct gcgagagact 60 gtttcatttc ctgcatttct gcaagagatt gtatccacac c 101 <210> 43 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 43 cccctgcctc rtactagtag agtaattata cgtacctctt tgctatgatt tctttggaag 60 taagtcacca gtaatttgat cacaatccgc ctgtatatca c 101 <210> 44 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 44 cccctgcctc rtactagtag agtaattata cgtacctctt tgctatgatt cctttggaag 60 taagtcacca gtaatttgat cacaatccgc ctgtatatca c 101 <210> 45 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 45 cgaggcaagt tgccacttat ctttggaaca acttcttggg gggacggtca gcaaatcgtc 60 cacttggtga tgccgtttta gatggaatag actttgatat t 101 <210> 46 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 46 cgaggcaagt tgccacttat ctttggaaca acttcttggg gggacggtca acaaatcgtc 60 cacttggtga tgccgtttta gatggaatag actttgatat t 101 <210> 47 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 47 atatggacag agatcatcac tgttgtggtt gtccaaatca tctatctagt ggtaagaaag 60 gagggagcag tgtcaagata gawgaacatg accaggataa c 101 <210> 48 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 48 atatggacag agatcatcac tgttgtggtt gtccaaatca tctatctagt agtaagaaag 60 gagggagcag tgtcaagata gawgaacatg accaggataa c 101 <210> 49 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 49 atgataagag gctgcaacct gttggaacag taaacctkct agcaagagtc gacaattctg 60 gttcctccga tagaacaaat gaggagggtg aagtttatga g 101 <210> 50 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 50 atgataagag gctgcaacct gttggaacag taaacctkct agcaagagtc aacaattctg 60 gttcctccga tagaacaaat gaggagggtg aagtttatga g 101 <210> 51 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 51 gataactgtt gctggtggga gatgacaggt atctcgtaga gttggtcgag atgcgcaagc 60 tggccccgat accatggtta tcaaaagaaa tagaagctag a 101 <210> 52 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 52 gataactgtt gctggtggga gatgacaggt atctcgtaga gttggtcgag gtgcgcaagc 60 tggccccgat accatggtta tcaaaagaaa tagaagctag a 101 <210> 53 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 53 ataatatcag gataacttat cccagaacaa ctaatcccag cataactaat tccggtataa 60 tttcagggta aaataacagt cccgggataa actttcaaaa a 101 <210> 54 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 54 ataatatcag gataacttat cccagaacaa ctaatcccag cataactaat cccggtataa 60 tttcagggta aaataacagt cccgggataa actttcaaaa a 101 <210> 55 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 55 tctgttaatg gagctcggaa gattcaatgt ccatgaagct attcaatctt acgttaatgg 60 aactcggaag attcaatttc cattaatgga actcgggatt a 101 <210> 56 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 56 tctgttaatg gagctcggaa gattcaatgt ccatgaagct attcaatctt ccgttaatgg 60 aactcggaag attcaatttc cattaatgga actcgggatt a 101 <210> 57 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 57 ggaagctgaa atcaaattat tagacgggtt taggccaacg cgatctcaaa tattccagtc 60 attttcttgg acaaaattta aaatgacaat gcaagcttga t 101 <210> 58 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 58 ggaagctgaa atcaaattat tagacgggtt taggccaacg cgatctcaaa gattccagtc 60 attttcttgg acaaaattta aaatgacaat gcaagcttga t 101 <210> 59 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 59 ctatccagaa aataattcaa agttcaaatg tgaatcggag caaaaaggac ggaaaagctg 60 tagaaattgg tactgtagaa cttccttgtg tgattatata c 101 <210> 60 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 60 ctatccagaa aataattcaa agttcaaatg tgaatcggag caaaaaggac agaaaagctg 60 tagaaattgg tactgtagaa cttccttgtg tgattatata c 101 <210> 61 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 61 aagaatagtt gctccatcaa crcgtacctr catgttgcca ataagagagg caaacagaaa 60 cagcccataa atgcagatta agatggctaa gagaatctcc c 101 <210> 62 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 62 aagaatagtt gctccatcaa crcgtacctr catgttgcca ataagagagg taaacagaaa 60 cagcccataa atgcagatta agatggctaa gagaatctcc c 101 <210> 63 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 63 atcaaatgat ttataagcca aatgaaaaag aaaagcagga ccatacacct gaaatttcgc 60 agcccccacc agaagcaata taagagtttg gaccaaaagt t 101 <210> 64 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 64 atcaaatgat ttataagcca aatgaaaaag aaaagcagga ccatacacct taaatttcgc 60 agcccccacc agaagcaata taagagtttg gaccaaaagt t 101 <210> 65 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 65 atagctgctt aaaagtattt tttaaatcga ttagttgaac ttgaacacaa acacaaacta 60 attctaatca agctgatttt aaaatcttgg ccaaataaac a 101 <210> 66 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 66 atagctgctt aaaagtattt tttaaatcga ttagttgaac ttgaacacaa gcacaaacta 60 attctaatca agctgatttt aaaatcttgg ccaaataaac a 101 <210> 67 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 67 ctttcagatt cagagacaac atcttaatca ttcagatgtg cattcagttt tagacctctg 60 aatcttaaaa aaaaacaaat gcagccgaac atattgttat t 101 <210> 68 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 68 ctttcagatt cagagacaac atcttaatca ttcagatgtg cattcagttt cagacctctg 60 aatcttaaaa aaaaacaaat gcagccgaac atattgttat t 101 <210> 69 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 69 aggttgatct agaccagcta gaaactttat atagacctct tattgcaaat gtccttgcaa 60 aaagacattg ttcacatcaa attgggaaat atcccacctt t 101 <210> 70 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 70 aggttgatct agaccagcta gaaactttat atagacctct tattgcaaat ttccttgcaa 60 aaagacattg ttcacatcaa attgggaaat atcccacctt t 101 <210> 71 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 71 ggagaaggtt tcattgaaat caatcccttc cttttgaatg tcacctcgaa ccaccaatct 60 agcctttagt ctctcaagag taccatttgc atgttgttta a 101 <210> 72 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 72 ggagaaggtt tcattgaaat caatcccttc cttttgaatg tcacctcgaa tcaccaatct 60 agcctttagt ctctcaagag taccatttgc atgttgttta a 101 <210> 73 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 73 acacactgct ggaaattact cgacgacttg attgcatcag aggataatga tattggtgtt 60 caggtgagag tgatggatcc acggtgtaaa ttccatgaca t 101 <210> 74 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 74 acacactgct ggaaattact cgacgacttg attgcatcag aggataatga cattggtgtt 60 caggtgagag tgatggatcc acggtgtaaa ttccatgaca t 101 <210> 75 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 75 tgtcattaac tttaattctt atgcaaaatt tggtaggtga gggcaggaaa aacaaaggag 60 caacagagaa aaccaataat ctcccttgca acrtaagact t 101 <210> 76 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 76 tgtcattaac tttaattctt atgcaaaatt tggtaggtga gggcaggaaa gacaaaggag 60 caacagagaa aaccaataat ctcccttgca acrtaagact t 101 <210> 77 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 77 ggaatgcaaa agctatgcag gcatcctgta tttcaactga gtaagccagt caagaagagc 60 agacttatcg ggattgtaaa tagtaggaga ggaggcggag a 101 <210> 78 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 78 ggaatgcaaa agctatgcag gcatcctgta tttcaactga gtaagccagt gaagaagagc 60 agacttatcg ggattgtaaa tagtaggaga ggaggcggag a 101 <210> 79 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 79 ctggcagaga agattcagag aaatgtgtga cactgaaacc agattagatc agcctacaca 60 tctaccataa ttagtgcaag atatggcctt tcaaacaatc t 101 <210> 80 <211> 101 <212> DNA <213> Capsicum annuum <400> 80 ctggcagaga agattcagag aaatgtgtga cactgaaacc agattagatc ggcctacaca 60 tctaccataa ttagtgcaag atatggcctt tcaaacaatc t 101 <210> 81 <211> 440 <212> PRT <213> Capsicum annuum <400> 81 Met Ala Phe Ala Leu Pro Ser Ser Leu Val Ser Val Cys Asn Lys Ser 1 5 10 15 Phe Ile Lys Pro Ser Ser Leu Thr Pro Ser Thr Leu Arg Phe His Lys 20 25 30 Leu Ser Phe Ile Asp Gln Ser Leu Ser Asn Met Tyr Ile Pro Cys Ala 35 40 45 Phe Phe Tyr Pro Lys Val Gln Gln Arg Leu Glu Asp Ser Lys Asn Ser 50 55 60 Asp Glu Leu Ser His Ile Ala His Leu Leu Gln Thr Ser Leu Ser Gln 65 70 75 80 Thr Leu Val Ser Tyr Tyr Pro Tyr Ala Gly Lys Leu Lys Asp Asn Ala 85 90 95 Thr Val Asp Cys Asn Asp Met Gly Ala Glu Phe Leu Ser Val Arg Ile 100 105 110 Lys Cys Ser Met Ser Glu Ile Leu Asp His Pro His Ala Ser Leu Ala 115 120 125 Glu Ser Ile Val Leu Pro Lys Asp Leu Pro Trp Ala Asn Asn Cys Glu 130 135 140 Gly Gly Asn Leu Leu Val Val Gln Val Ser Lys Phe Asp Cys Gly Gly 145 150 155 160 Ile Ala Ile Ser Val Cys Phe Ser His Lys Ile Gly Asp Gly Cys Ser 165 170 175 Leu Leu Asn Phe Leu Asn Asp Trp Ser Ser Val Thr Arg Asp His Thr 180 185 190 Thr Thr Thr Leu Val Pro Ser Pro Arg Phe Val Gly Asp Ser Val Phe 195 200 205 Ser Thr Gln Lys Tyr Gly Ser Leu Ile Thr Pro Gln Ile Leu Ser Asp 210 215 220 Leu Asn Gln Cys Val Gln Lys Arg Leu Ile Phe Pro Thr Asp Lys Leu 225 230 235 240 Asp Ala Leu Arg Ala Lys Val Ala Glu Glu Ser Gly Val Lys Asn Pro 245 250 255 Thr Arg Ala Glu Val Val Ser Ala Leu Leu Phe Lys Cys Ala Thr Lys 260 265 270 Ala Ser Ser Ser Met Leu Pro Ser Lys Leu Val His Phe Leu Asn Ile 275 280 285 Arg Thr Met Ile Lys Pro Arg Leu Pro Arg Asn Ala Ile Gly Asn Leu 290 295 300 Ser Ser Ile Phe Ser Ile Glu Ala Thr Asn Met Gln Asp Met Glu Leu 305 310 315 320 Pro Thr Leu Val Arg Asn Leu Arg Lys Glu Val Glu Val Ala Tyr Lys 325 330 335 Lys Asp Gln Val Glu Gln Asn Glu Leu Ile Leu Glu Val Val Glu Ser 340 345 350 Met Arg Glu Gly Lys Leu Pro Phe Glu Asn Met Asp Gly Tyr Lys Asn 355 360 365 Val Tyr Thr Cys Ser Asn Leu Cys Lys Tyr Pro Tyr Tyr Thr Val Asp 370 375 380 Phe Gly Trp Gly Arg Pro Glu Arg Val Cys Leu Gly Asn Gly Pro Ser 385 390 395 400 Lys Asn Ala Phe Phe Leu Lys Asp Tyr Lys Ala Gly Gln Gly Val Glu 405 410 415 Ala Arg Val Met Leu His Lys Gln Gln Met Ser Glu Phe Glu Arg Asn 420 425 430 Glu Glu Leu Phe Glu Phe Ile Ala 435 440

Claims (18)

  1. 정량적 형질 유전자좌 QTL8을 포함하는 염색체 8 상의 유전자이입 단편을 포함하는 캅시쿰 아누움(Capsicum annuum) 식물이며, 여기서 상기 QTL8은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스(Frankliniella occidentalis)에 대한 개선된 저항성을 부여하고, 여기서 QTL8은 염색체 8 상에서 서열식별번호(SEQ ID NO): 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_21과 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_40 사이에 위치하고,
    여기서 캅시쿰 아누움 식물은 QTL8이 이형접합 형태로 존재할 때 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물인 캅시쿰 아누움 식물.
  2. 제1항에 있어서, QTL8을 포함하는 유전자이입 단편이 하기로부터 선택된 적어도 1개의 마커의 1배체형을 포함하는 것인 캅시쿰 아누움 식물:
    서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_21;
    서열식별번호: 43의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 43에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_22;
    서열식별번호: 45의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 45에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_23;
    서열식별번호: 47의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 47에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_24;
    서열식별번호: 49의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 49에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_25;
    서열식별번호: 51의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 51에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_26;
    서열식별번호: 53의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 53에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_27;
    서열식별번호: 55의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 55에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_28;
    서열식별번호: 57의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 57에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_29;
    서열식별번호: 59의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 59에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_30;
    서열식별번호: 61의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 61에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_31;
    서열식별번호: 63의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 63에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_32;
    서열식별번호: 65의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 65에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_33;
    서열식별번호: 67의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 67에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_34;
    서열식별번호: 69의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 69에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_35;
    서열식별번호: 71의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 71에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_36;
    서열식별번호: 73의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 73에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_37;
    서열식별번호: 75의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 75에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_38;
    서열식별번호: 77의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 77에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_39; 및
    서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_40.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 식물이 정량적 형질 유전자좌 QTL7을 포함하는 염색체 7 상의 유전자이입 단편을 추가로 포함하며, 여기서 상기 QTL7은 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하고, 여기서 QTL7은 염색체 7 상에서 서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_01과 서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_20 사이에 위치하는 것인 캅시쿰 아누움 식물.
  4. 제3항에 있어서, QTL7을 포함하는 유전자이입 단편이 하기로부터 선택된 적어도 1개의 마커의 1배체형을 포함하는 것인 캅시쿰 아누움 식물:
    서열식별번호: 1의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 1에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_01;
    서열식별번호: 3의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 3에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_02;
    서열식별번호: 5의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 5에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_03;
    서열식별번호: 7의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 7에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_04;
    서열식별번호: 9의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 9에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_05;
    서열식별번호: 11의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 11에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_06;
    서열식별번호: 13의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 13에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_07;
    서열식별번호: 15의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 15에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_08;
    서열식별번호: 17의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 17에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하는 SNP_09;
    서열식별번호: 19의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 19에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_10;
    서열식별번호: 21의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 21에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_11;
    서열식별번호: 23의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 23에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_12;
    서열식별번호: 25의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 25에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_13;
    서열식별번호: 27의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 27에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_14;
    서열식별번호: 29의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 29에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_15;
    서열식별번호: 31의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 31에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_16;
    서열식별번호: 33의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 33에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_17;
    서열식별번호: 35의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 35에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하는 SNP_18;
    서열식별번호: 37의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 37에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 SNP_19; 및
    서열식별번호: 39의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 39에 대해 적어도 95% 서열 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하는 SNP_20.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, QTL8 및 임의로 QTL 7이 대표적인 수의 종자가 기탁 번호 NCIMB 43623 하에 기탁된 H19_020279-044로 지정된 캅시쿰 아누움 식물의 게놈에 존재하거나, 또는 그로부터 수득가능하거나, 또는 그로부터 수득되거나, 또는 그에 포함되는 바와 같은 것인 캅시쿰 아누움 식물.
  6. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, QTL7 및/또는 QTL8이 동형접합 형태로 존재하는 것인 캅시쿰 아누움 식물.
  7. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 비-자극적 캅시쿰 아누움 식물인 캅시쿰 아누움 식물.
  8. 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 근교 식물, 이성반수체 식물 또는 잡종 식물인 캅시쿰 아누움 식물.
  9. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 정의된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는, 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 따른 캅시쿰 아누움 식물에 의해 생산된 종자.
  10. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 따른 캅시쿰 아누움 식물이 성장될 수 있는 종자.
  11. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 정의된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는, 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 따른 캅시쿰 아누움 식물 또는 제9항 또는 제10항에 따른 종자의 식물 세포, 조직 또는 식물 부분.
  12. 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분이 그의 게놈에 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 정의된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 지 여부를 결정하는 단계를 포함하는, 상기 식물 또는 식물 부분을 확인하고/거나 선택하는 방법.
  13. 하기 단계(들)를 포함하는, 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 저항성 표현형을 갖는 캅시쿰 아누움 식물을 생산하는 방법:
    (i) 제1 캅시쿰 아누움 식물과 제2 식물을 교배시키는 단계이며, 여기서 제1 캅시쿰 아누움 식물은 그의 게놈에 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 정의된 바와 같은 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 것인 단계;
    (ii) 임의로 (i)의 교배로부터 종자를 수확하고 그의 게놈에 QTL8 및 임의로 QTL7을 포함하는 종자를 선택하는 단계.
  14. 제13항에 있어서, 단계 (i)에서 제1 캅시쿰 아누움 식물 및 제2 식물 둘 다가 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 따른 식물인 방법.
  15. 캅시쿰 아누움 식물 또는 식물 부분에서 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 QTL의 존재 또는 부재를 결정하기 위한 마커이며, 염색체 8 상에서 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_21과 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_40 사이에 위치한 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 부여 QTL에 연결된 마커.
  16. 제15항에 있어서, SNP 마커인 마커.
  17. 제15항 또는 제16항에 있어서, 염색체 8 상에 위치한 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스 부여 QTL에 연결된 마커는 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 것인 마커:
    서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_21;
    서열식별번호: 43의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 43에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_22;
    서열식별번호: 45의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 45에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_23;
    서열식별번호: 47의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 47에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_24;
    서열식별번호: 49의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 49에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_25;
    서열식별번호: 51의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 51에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_26;
    서열식별번호: 53의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 53에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_27;
    서열식별번호: 55의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 55에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_28;
    서열식별번호: 57의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 57에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_29;
    서열식별번호: 59의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 59에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_30;
    서열식별번호: 61의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 61에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_31;
    서열식별번호: 63의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 63에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_32;
    서열식별번호: 65의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 65에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_33;
    서열식별번호: 67의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 67에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_34;
    서열식별번호: 69의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 69에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_35;
    서열식별번호: 71의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 71에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_36;
    서열식별번호: 73의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 73에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_37;
    서열식별번호: 75의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 75에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_38;
    서열식별번호: 77의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 77에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_39; 및
    서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 SNP_40.
  18. 제17항에 있어서, 프랭클리니엘라 옥시덴탈리스에 대한 개선된 저항성을 부여하는 QTL의 존재를 결정하기 위한 것이고, 여기서:
    SNP_21은 서열식별번호: 41의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 41에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고;
    SNP_22는 서열식별번호: 43의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 43에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고;
    SNP_23은 서열식별번호: 45의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 45에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고;
    SNP_24는 서열식별번호: 47의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 47에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고;
    SNP_25는 서열식별번호: 49의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 49에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고;
    SNP_26은 서열식별번호: 51의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 51에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고;
    SNP_27은 서열식별번호: 53의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 53에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고;
    SNP_28은 서열식별번호: 55의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 55에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고;
    SNP_29는 서열식별번호: 57의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 57에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고;
    SNP_30은 서열식별번호: 59의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 59에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고;
    SNP_31은 서열식별번호: 61의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 61에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하고;
    SNP_32는 서열식별번호: 63의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 63에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고;
    SNP_33은 서열식별번호: 65의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 65에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고;
    SNP_34는 서열식별번호: 67의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 67에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고;
    SNP_35는 서열식별번호: 69의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 69에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 구아닌을 포함하고;
    SNP_36은 서열식별번호: 71의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 71에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하고;
    SNP_37은 서열식별번호: 73의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 73에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 티민을 포함하고;
    SNP_38은 서열식별번호: 75의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 75에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하고;
    SNP_39는 서열식별번호: 77의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 77에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 시토신을 포함하고;
    SNP_40은 서열식별번호: 79의 뉴클레오티드 51 또는 서열식별번호: 79에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 서열의 뉴클레오티드 51에 위치한 아데닌을 포함하는 것인
    마커.
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