KR20220038606A - 타바코 식물에서 알칼로이드 함량을 조정하는 방법 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 식물 또는 이의 일부의 알칼로이드 함량을 조절하는 방법에 관한 것이며, 방법은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함한다. 본 발명은 또한 타바코에서 적어도 하나의 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 전구체의 함량을 감소시키는 방법에 관한 것이며, 방법은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하는 것을 포함한다.
Description
본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 세포 또는 세포 배양물의 알칼로이드 함량을 조절하는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 또한 식물 내 알칼로이드 함량을 조절하는 폴리펩티드의 발현 및/또는 활성을 조절하는 방법으로 확장된다. 대안적으로, 본 발명은 식물 내 알칼로이드 함량을 조절하는 폴리펩티드를 인코딩하는 유전자의 발현 및/또는 활성을 조절하는 방법을 제공한다. 본 발명은 또한 폴리펩티드를 조절하는데 사용될 수 있는 작제물로 확장된다. 본 발명은 또한 알칼로이드 함량의 조절을 달성하도록 변형된 식물 세포 및 식물에 관한 것이다. 본 발명은 또한 이러한 조절된 식물로부터 가공되고 수확된 잎 및 가연성 흡연 물품을 포함하는 타바코 산업 제품에서의 이의 용도에 관한 것이다.
알칼로이드는 기본 질소 원자를 대부분 함유하고, 박테리아, 진균류, 식물 및 동물을 포함한 다양한 유기체에 의해 생성되는 자연 발생 화합물의 군이다.
알칼로이드는 탄소 골격의 유사성에 따라 예를 들어, 인돌-, 이소퀴놀린- 및 피리딘-형으로 분류될 수 있다. 피리딘 유도체는 모노머 알칼로이드의 한 부류이다; 이러한 부류는 피리딘의 단순 유도체, 폴리시클릭 축합 및 비축합 피리딘 유도체 및 세스퀴테르펜 피리딘 유도체를 포함한다. 예는 니코틴, 노르니코틴, 슈도옥시니코틴, 아나바신, 미오스민 및 아나타빈이다.
알칼로이드의 알려진 생물학적 기능의 대부분은 보호와 관련이 있다. 카페인, 코카인, 모르핀 및 니코틴과 같은 신경활성 분자는 침입성 포식자에 대한 방어 화합물로서 작용한다. 이러한 알칼로이드의 축적은 유전자 발현, 효소 활성 및 알칼로이드 농도를 모니터링하는 신호 전달 캐스케이드의 결과이다. 식물에서 알칼로이드 함량의 미세 조정에는 부정적인 피드백 루프와 분해 경로를 포함한다.
니코틴은 여러 종류의 식물에서 자연적으로 발생하지만 타바코 식물에서 가장 높은 수준으로 발견된다. 재배된 타바코는 총 건조 중량의 2-4% 알칼로이드를 생성한다. 니코틴은 야생 및 재배된 니코티아나(Nicotiana) 종에서 생성되며, 초식 동물 및 곤충에 대한 식물 방어에서 중요한 역할을 한다(Voelckel et al. (2001) Oecologia 127(2): 274-280, 인용으로 본원에 포함됨). 이는 총 알칼로이드 함량의 ~90%를 차지한다. 알칼로이드 풀의 나머지 10%는 대부분 구조적으로 관련된 화합물인 노르니코틴, 아나타빈, 아나바신 및 슈도옥시니코틴(PON)으로 구성된다.
타바코에서 알칼로이드 함량 조절은 복잡한다. 유전자형, 환경, 시비 및 농경 관행(예를 들어, 토핑)을 포함한 여러 요인이 타바코 식물의 알칼로이드 수준에 영향을 미친다. 니코틴 생합성의 일부 주요 조절인자는 잘 특성규명되어 있으며, 예를 들어 이 경로에서 중추적인 역할을 하는 푸트레신 N-메틸트랜스퍼라제(PMT)는 타바코 게놈에서 가장 큰 전사 인자 패밀리인 에틸렌 반응성 인자(ERF) 슈퍼패밀리의 구성원에 의해 활성화된다(본원에 인용으로 포함된 문헌 [Rushton et al. (2008) Plant Physiol. 147(1): 280-295]). 알칼로이드 생합성을 유도하는 다른 전사 인자는 MYC2-유사 염기성 헬릭스-루프-헬릭스(bHLH) 패밀리에 속한다. MYC2-유사 bHLH는 알칼로이드 구조 유전자의 Gbox-매개된 결합 및 활성화를 통해 직접적으로 및 ERF의 활성화를 통해 간접적으로 알칼로이드 수준을 조절한다.
타바코 피리딘 알칼로이드는 수확 후 잎 경화 중에 형성되는 타바코-특이적 니트로사민(TSN)의 전구체이다. 경화된 타바코 잎에서 발견되는 4가지 주요 TSNA는 N'-니트로소노르니코틴(NNN), N'니트로소아나타빈(NAT), N'-니트로소아나바신(NAB) 및 4-(메틸 니트로사미노)-1-(3-피리딜)-1-부타논(NNK)이다. 수확 후 잎이 경화되는 동안, 피리딘 알칼로이드와 니트로화 종 사이의 반응은 타바코-특이적 니트로사민(TSNA)의 형성으로 이어진다. PON은 TSNA NNK의 합성에서 직접적인 전구체로 기능할 가능성이 높다(인용으로 본원에 포함된 Bush et al., 2001). TSNA의 생성 및 축적을 줄이는 것은 매우 중요한다. 니코틴 데메틸라제 유전자의 CYP82E 계열은 니코틴에서 노르니코틴으로의 전환의 주요 조절인자 중 하나이며, 활성 또는 축적을 변경하면 NNN 수준이 감소할 수 있다. 그러나 지금까지 PON 생성을 담당하는 효소나 유전자는 확인되지 않았다.
실시예에 기재된 바와 같이, 본 발명자들은 식물에서 알칼로이드 함량을 조절하는, 예를 들어 타바코에서 TSNA 함량을 감소시킬 목적으로 알칼로이드 및/또는 TSNA 전구체 합성을 담당하는 유전자를 조사하고자 하였다.
발명의 개요
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써 식물의 알칼로이드 함량 및/또는 TSNA 함량 또는 TSNA의 전구체 함량이 조절될 수 있음을 놀랍게도 발견하였다. BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 본원에 교시된 유전자(들), 예를 들어 Nitab4.5_0000868g0020.2는 재배된 타바코에서 알칼로이드 및 TSNA 전구체 함량의 조절인자이다. 특히, 본원에 교시된 유전자(들), 예를 들어 Nitab4.5_0000868g0020.2는 재배된 타바코에서 알칼로이드 함량의 조절인자이다. Nitab4.5_0000868g0020.2.는 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩한다. Nitab4.5_0000651g0020.2, Nitab4.5_0009137g0040.2, Nitab4.5_0001772g0090.2, Nitab4.5_0003312g0050.2, Nitab4.5_0003151g0080.2, Nitab4.5_0002641g0190.2, Nitab4.5_0001876g0030.2, Nitab4.5_0000048g0280.2 및 Nitab4.5_0002006g0070.2는 본 발명에 따른 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상동체이다.
본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인으로 지칭되는 보존된 도메인을 함유할 수 있다.
본 발명에 따르면, 조절된 알칼로이드 함량 및 타바코 산업 제품의 소비자가 추구하는 상업적으로 바람직한 특성을 갖는 타바코 산업 제품이 생산될 수 있다. 일부 경우에, 소비자는 알칼로이드 함량 수준이 낮은 제품, 예를 들어, TSNA 전구체 수준이 낮은 제품을 원할 수 있다.
본 발명은 식물 분자 농업 분야에서 특히 유용할 수 있으며, 여기서 식물(예컨대, 타바코 및 기타 니코티아나 종)은 예를 들어, 항생제, 바이러스 유사 입자, 또는 기능식품 또는 소분자와 같은 치료제 및 의약품의 생산을 위한 단백질, 펩티드 및 대사산물의 생산에 사용된다. 타바코는 PharmPlant and Medicago Inc.로 불리는 EU 자금 지원 프로젝트에서 HIV-중화 항체의 개발에 사용되었으며, 캐나다는 독감 백신 제조를 위한 바이러스-유사 입자의 생산을 위한 타바코-기반 플랫폼에서 작업하였다.
따라서, 본 발명에 따른 식물은 니코틴 알칼로이드의 존재를 감소 또는 제거하기 위해 분자 농업에 사용될 수 있다. 저 니코틴 식물 또는 뿌리의 사용은 분자 농업에 유익하며, 정제와 관련된 다운스트림 처리 비용을 줄일 것이다.
본 발명자들은 놀랍게도 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써(예를 들어, 감소시킴으로써) 식물(예를 들어, 타바코 식물)의 알칼로이드 함량을 조절하는(예를 들어, 감소시키는) 방법을 결정하였다. 식물(예를 들어, 타바코 식물)의 알칼로이드 함량(예를 들어, PON, 노르니코틴, 아나바신, 아나타빈 또는 미오스민 중 하나 이상의 함량)은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 감소시킴으로써 감소될 수 있거나, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 증가시킴으로써 증가될 수 있다. 본 발명 전에, 본원에 기술된 바와 같은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현의 조절이 특히 알칼로이드 함량을 조절하거나 PON 함량을 조절하는데 사용될 수 있다는 것은 알려지지 않았다.
일 양태에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 세포에서 알칼로이드 함량을 조절하는(예를 들어, 감소시키는) 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 타바코 식물 또는 이의 식물 일부 또는 세포에서 타바코-특이적 니트로사민(TSNA) 전구체의 함량을 조절하는(예를 들어, 감소시키는) 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써 상기 식물 또는 세포를 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
추가의 양태에서, 세포 또는 식물 또는 이의 일부의 알칼로이드 함량을 조절(예를 들어, 감소)하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 용도를 제공한다.
또 다른 양태에서, 조절된(예를 들어, 감소된) 알칼로이드 함량을 갖는 식물 또는 이의 일부, 세포, 식물 번식 물질, 잎, 절단된 수확된 잎, 가공된 잎 또는 절단되고 가공된 잎을 생성하기 위한 방법으로서, 상기 식물 또는 세포를 변형시켜 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하는, 방법이 제공된다.
적합하게는, 알칼로이드 함량은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하기 위해 변형되지 않은 식물 또는 세포와 비교하여 감소될 수 있다.
일 양태에서, 본 발명은 비변형된 식물과 비교하여 알칼로이드 함량의 조절(예를 들어, 감소)을 달성하기 위해 변형된 식물 또는 이의 일부 또는 세포로서, 여기서 변형은 타바코로부터의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현의 조절인, 변형된 식물 또는 이의 일부 또는 세포를 제공한다.
추가의 양태에서, 본 발명은 본 발명에 따른 방법에 의해 생성된 식물 또는 세포로부터 또는 본 발명에 따른 식물 또는 세포로부터 수득가능한 식물 번식 물질을 제공한다.
적합하게는, 적어도 하나의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 1, SEQ ID NO. 4, SEQ ID NO. 7, SEQ ID NO. 10, SEQ ID NO. 13, SEQ ID NO. 16, SEQ ID NO. 19, SEQ ID NO. 22, SEQ ID NO. 25, SEQ ID NO. 28로 제시된 아미노산 서열 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하거나; BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30으로 제시된 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함한다.
적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 추가적인 유전자가 변형될 수 있은데, 여기서 추가적인 유전자는 SEQ ID NO. 1, SEQ ID NO. 4, SEQ ID NO. 7, SEQ ID NO. 10, SEQ ID NO. 13, SEQ ID NO. 16, SEQ ID NO. 19, SEQ ID NO. 22, SEQ ID NO. 25, SEQ ID NO. 28 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열로부터 선택되는 적어도 하나이거나; BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함한다.
일 양태에서, 본 발명은 식물을 육종시키기 위한 본 발명에 따른 방법에 의해 생성된 식물 또는 본 발명에 따른 식물 또는 이의 일부의 용도를 제공한다.
일 양태에서, 본 발명은 제품의 생산을 위한 본 발명에 따른 방법에 의해 생성된 식물 또는 본 발명에 따른 식물 또는 이의 일부의 용도를 제공한다.
일 양태에서, 본 발명은 작물을 재배하기 위한 본 발명에 따른 방법에 의해 생성된 식물 또는 본 발명에 따른 식물 또는 이의 일부의 용도를 제공한다.
일 양태에서, 본 발명은 잎을 생성하기 위한 본 발명에 따른 방법에 의해 생성된 식물 또는 본 발명에 따른 식물 또는 이의 일부의 용도를 제공한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 본 발명에 따른 식물의 수확된 잎, 또는 본 발명에 따른 번식 물질로부터 번식된 식물로부터 수득가능한(예를 들어, 수득된), 또는 본 발명에 따른 용도에 의해 수득된 식물로부터 수득가능한(예를 들어, 수득된), 또는 본 발명에 따른 방법에 의해 생성된 식물로부터 수득가능한(예를 들어, 수득된) 식물의 수확된 잎을 제공한다.
적합하게는, 식물의 수확된 잎은 절단된 수확된 잎일 수 있다.
또 다른 양태에서, 본 발명은
본 발명에 따른 용도로부터 수득가능한(예를 들어, 수득된) 식물로부터 수득가능한(예를 들어, 수득된);
본 발명에 따른 식물을 가공함으로써 수득가능한(예를 들어, 수득된);
본 발명에 따른 식물 번식 물질로부터 번식된 식물로부터 수득가능한; 또는
본 발명에 따른 식물의 수확된 잎을 가공함으로써 수득가능한(예를 들어, 수득된); 또는
본 발명에 따른 방법에 의해 생성된 식물로부터 수득가능한(예를 들어, 수득된) 가공된 잎, 바람직하게는 가공된 타바코 잎, 바람직하게는 생육불가능한 가공된 타바코 잎을 제공한다.
적합하게는, 잎은 경화, 발효, 저온 살균 또는 이들의 조합에 의해 가공될 수 있으며, 바람직하게는 4-(메틸니트로사미노)-1-(3-피리딜)-1-부타논(NNK), N'-니트로소노르니코틴(NNN), N'-니트로소아나타빈(NAT) 및 N-니트로소아나바신(NAB)으로부터 선택되는 하나 이상의 TSNA의 함량이 감소되며, 바람직하게는 NNN 및/또는 NNK의 함량이 조절(감소)되고, 더욱 바람직하게는 NNK의 함량이 감소된다.
적합하게는, 가공된 잎은 절단된 가공된 잎일 수 있다.
추가의 양태에서, 본 발명은
본 발명에 따른 용도로부터 수득가능한 식물로부터 수득가능한(예를 들어, 수득된);
본 발명에 따른 식물을 가공함으로써 수득가능한(예를 들어, 수득된);
본 발명에 따른 식물 번식 물질로부터 번식된 식물로부터 수득가능한(예를 들어, 수득된); 또는
본 발명에 따른 식물의 수확된 잎을 가공함으로써 수득가능한(예를 들어, 수득된); 또는
본 발명에 따른 방법에 의해 생성된 식물로부터 수득가능한(예를 들어, 수득된) 식물 또는 이의 일부로부터 제조된 경화된 타바코 물질을 제공한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 본 발명에 따른 경화된 타바코 물질을 포함하는 타바코 블렌드를 제공한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은
본 발명에 따른 식물 또는 본 발명에 따른 이의 일부로서, 상기 식물이 타바코 식물인, 식물 또는 이의 일부;
본 발명에 따른 타바코 식물 번식 물질로부터 번식된 타바코 식물 또는 이의 일부;
본 발명에 따른 식물의 수확된 잎으로서, 상기 식물이 타바코 식물인 수확된 잎;
본 발명에 따른 가공된 잎으로서, 상기 식물이 타바코 식물인, 가공된 잎; 또는
본 발명의 방법에 의해 생성된 식물로부터 제조된 타바코 산업 제품을 제공한다.
적합하게는, 타바코 산업 제품은 가연성 흡연 물품일 수 있다.
적합하게는, 타바코 산업 제품은 무연 타바코 제품일 수 있다.
적합하게는, 타바코 제품은 타바코 가열 장치 또는 에어로졸-발생 장치와 같은 불연성 에어로졸 공급 시스템일 수 있다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 본 발명에 따른 식물 또는 이의 일부, 또는 세포 또는 이의 추출물(예를 들어, 타바코 추출물); 또는 본 발명에 따른 경화된 타바코 물질; 또는 본 발명에 따른 타바코 블렌드를 포함하는 가연성 흡연 물품, 불연성 에어로졸 공급 시스템, 무연 타바코 제품 또는 타바코 가열 장치를 제공한다.
본 발명은 조절된(예를 들어, 감소된) 알칼로이드 함량 및/또는 조절된(예를 들어, 감소된) 함량의 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 또는 TSNA의 전구체를 갖는 식물을 선택하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 뉴클레오티드 서열의 용도를 제공하며, 여기에서 적어도 하나의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 서열은 SEQ ID NO. 1, SEQ ID NO. 4, SEQ ID NO. 7, SEQ ID NO. 10, SEQ ID NO. 13, SEQ ID NO. 16, SEQ ID NO. 19, SEQ ID NO. 22, SEQ ID NO. 25, SEQ ID NO. 28 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28D에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열부터 선택되거나; BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30으로서 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 뉴클레오티드 서열에서 유전성 돌연변이를 수반하는 식물의 돌연변이체를 제공하며, 바람직하게는, 여기서 유전자는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열로부터 선택되며; 상기 유전성 돌연변이는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하며(예를 들어, 감소시키며), 돌연변이체 식물은 상기 유전성 돌연변이를 수반하지 않는 유사한 식물과 비교하여 조절된(예를 들어, 감소된) 알칼로이드 함량, 바람직하게는 니코틴 함량 및/또는 조절된 함량의 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 또는 TSNA의 전구체를 갖는다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 본 발명에 따른 유전성 돌연변이를 수반하는 돌연변이체 식물의 자손 또는 종자를 제공한다.
추가의 양태에서, 본 발명은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 뉴클레오티드 서열에서 변형을 포함하는 식물로부터 생성된, 수확된 잎, 가공된 잎 또는 경화된 타바코 물질을 제공하며, 여기서 적어도 하나의 유전자는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30; 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열로부터 선택되며; 상기 변형은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하며(예를 들어, 감소시키며), 상기 식물은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자에서 상기 변형을 수반하지 않는 유사한 식물과 비교하여 조절된(예를 들어, 감소된) 알칼로이드 함량, 바람직하게는 니코틴 함량, 및/또는 조절된 함량의 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 또는 TSNA의 전구체를 갖는다.
본 발명은 설명 및 도면을 참조하여 본원에 기재된 바와 같은 방법, 잎, 식물, 식물 번식 물질, 수확된 잎, 가공된 타바코, 타바코 제품, 용도 또는 이들의 조합을 제공한다 .
이제 본 발명의 구현예가 첨부 도면을 참조하여 단지 예로서 설명될 것이다.
도 1은 Nitab4.5_0000868g0020.2를 과발현하는 5주된 타바코 잎의 알칼로이드 함량을 보여준다. 알칼로이드 함량은 대조군과 관련하여 표시되며, 일원 ANOVA 및 Tukey의 다중 비교 사후 테스트로 분석된 두 가지 생물학적 복제를 나타낸다. 값은 평균 ± SEM으로 표시된다. 별표는 P 값 ≤ 0.05의 통계적 의미를 나타낸다.
도 2는 Nitab4.5_0000868g0020.2를 표적으로 하는 인공 miRNA를 발현하는 5주된 타바코 잎의 알칼로이드 함량을 보여준다. 알칼로이드 함량은 대조군과 관련하여 표시되며, 일원 ANOVA 및 Tukey의 다중 비교 사후 테스트로 분석된 세 가지 생물학적 복제를 포함한다. 값은 평균 ± SEM으로 표시된다. 별표는 P 값 ≤ 0.001의 통계적 의미를 나타낸다.
도 3은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 1 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰(Nicotiana tabacum)으로부터의 단백질을 보여준다.
도 4는 Nitab4.5_0000868g0020.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 2 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 5은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 3 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 6은 Nitab4.5_0000651g0020.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 4 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 7은 Nitab4.5_0000651g0020.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 5 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 8은 Nitab4.5_0000651g0020.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 6 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 9는 Nitab4.5_0009137g0040.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 7 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 10은 Nitab4.5_0009137g0040.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 8 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 11은 Nitab4.5_0009137g0040.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 9 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 12는 Nitab4.5_0001772g0090.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 10 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 13은 Nitab4.5_0001772g0090.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 11 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 14는 Nitab4.5_0001772g0090.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 12 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 15는 Nitab4.5_0003312g0050.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 13 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 16은 Nitab4.5_0003312g0050.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 14 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 17은 Nitab4.5_0003312g0050.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 15 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 18은 Nitab4.5_0003151g0080.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 16 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 19는 Nitab4.5_0003151g0080.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 17 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 20은 Nitab4.5_0003151g0080.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 18 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 21은 Nitab4.5_0002641g0190.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 19 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 22는 Nitab4.5_0002641g0190.2.의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 20 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 23은 Nitab4.5_0002641g0190.2.의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 21 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 24는 Nitab4.5_0001876g0030.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 22 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 25는 Nitab4.5_0001876g0030.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 23 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 26은 Nitab4.5_0001876g0030.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 24 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 27은 Nitab4.5_0000048g0280.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 25 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 28은 Nitab4.5_0000048g0280.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 26 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 29는 Nitab4.5_0000048g0280.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 27 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 30은 Nitab4.5_0002006g0070.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 28 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 31은 Nitab4.5_0002006g0070.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 29 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 32는 Nitab4.5_0002006g0070.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 30 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 33은 BTB/POZ 동종이량체 도메인의 아미노산 서열(SEQ ID NO. 1의 잔기 39-136)에 상응하는 SEQ ID NO. 31을 보여준다.
도 34는 NPH3 도메인의 아미노산 서열(SEQ ID NO. 1의 잔기 218-492)에 상응하는 SEQ ID NO. 32를 보여준다.
도 35는 Nitab4.5_0000868g0020.2의 녹아웃이 알칼로이드 함량의 현저한 감소로 이어짐을 보여준다. Nitab4.5_0000868g0020.2이 녹아웃된 세 가지 TN90 라인의 알칼로이드 함량을 보여준다. 알칼로이드 함량은 대조군과 비교하여 표시된다. 결과는 t-테스트로 분석되었다. 값은 평균 ± SEM으로 표시된다. 별표는 P 값 ≤ 0.001의 통계적 의미를 나타낸다.
도 36은 SEQ ID NO. 33; Nitab4.5_0000842g0110.2의 게놈 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 37은 SEQ ID NO. 34; Nitab4.5_0000842g0110.2의 게놈 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 38은 SEQ ID NO. 35; Nitab4.5_0000842g0110.2의 게놈 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 39는 SEQ ID NO. 36; Nitab4.5_0001620g0100.2의 아미노산 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 40은 SEQ ID NO. 37; Nitab4.5_0001620g0100.2의 코딩 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 41은 SEQ ID NO. 38; Nitab4.5_0001620g0100.2의 게놈 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 42는 SEQ ID NO. 39; Nitab4.5_0001200g0070.2의 아미노산 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 43은 SEQ ID NO. 40; Nitab4.5_0001200g0070.2의 코딩 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 44는 SEQ ID NO. 41; Nitab4.5_0001200g0070.2의 게놈 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 45는 SEQ ID NO. 42; Nitab4.5_0005803g0040.2의 아미노산 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 46은 SEQ ID NO. 43; Nitab4.5_0005803g0040.2의 코딩 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 47은 SEQ ID NO. 44; Nitab4.5_0005803g0040.2의 게놈 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 1은 Nitab4.5_0000868g0020.2를 과발현하는 5주된 타바코 잎의 알칼로이드 함량을 보여준다. 알칼로이드 함량은 대조군과 관련하여 표시되며, 일원 ANOVA 및 Tukey의 다중 비교 사후 테스트로 분석된 두 가지 생물학적 복제를 나타낸다. 값은 평균 ± SEM으로 표시된다. 별표는 P 값 ≤ 0.05의 통계적 의미를 나타낸다.
도 2는 Nitab4.5_0000868g0020.2를 표적으로 하는 인공 miRNA를 발현하는 5주된 타바코 잎의 알칼로이드 함량을 보여준다. 알칼로이드 함량은 대조군과 관련하여 표시되며, 일원 ANOVA 및 Tukey의 다중 비교 사후 테스트로 분석된 세 가지 생물학적 복제를 포함한다. 값은 평균 ± SEM으로 표시된다. 별표는 P 값 ≤ 0.001의 통계적 의미를 나타낸다.
도 3은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 1 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰(Nicotiana tabacum)으로부터의 단백질을 보여준다.
도 4는 Nitab4.5_0000868g0020.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 2 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 5은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 3 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 6은 Nitab4.5_0000651g0020.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 4 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 7은 Nitab4.5_0000651g0020.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 5 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 8은 Nitab4.5_0000651g0020.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 6 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 9는 Nitab4.5_0009137g0040.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 7 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 10은 Nitab4.5_0009137g0040.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 8 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 11은 Nitab4.5_0009137g0040.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 9 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 12는 Nitab4.5_0001772g0090.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 10 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 13은 Nitab4.5_0001772g0090.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 11 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 14는 Nitab4.5_0001772g0090.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 12 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 15는 Nitab4.5_0003312g0050.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 13 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 16은 Nitab4.5_0003312g0050.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 14 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 17은 Nitab4.5_0003312g0050.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 15 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 18은 Nitab4.5_0003151g0080.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 16 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 19는 Nitab4.5_0003151g0080.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 17 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 20은 Nitab4.5_0003151g0080.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 18 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 21은 Nitab4.5_0002641g0190.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 19 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 22는 Nitab4.5_0002641g0190.2.의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 20 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 23은 Nitab4.5_0002641g0190.2.의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 21 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 24는 Nitab4.5_0001876g0030.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 22 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 25는 Nitab4.5_0001876g0030.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 23 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 26은 Nitab4.5_0001876g0030.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 24 -를 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 27은 Nitab4.5_0000048g0280.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 25 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 28은 Nitab4.5_0000048g0280.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 26 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 29는 Nitab4.5_0000048g0280.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 27 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 30은 Nitab4.5_0002006g0070.2의 아미노산 서열 - SEQ ID NO. 28 - 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 보여준다.
도 31은 Nitab4.5_0002006g0070.2의 코딩 서열 - SEQ ID NO. 29 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 32는 Nitab4.5_0002006g0070.2의 게놈 서열 - SEQ ID NO. 30 -을 보여주며, 본 발명에 따른 니코티아나 타바쿰으로부터의 단백질을 인코딩한다.
도 33은 BTB/POZ 동종이량체 도메인의 아미노산 서열(SEQ ID NO. 1의 잔기 39-136)에 상응하는 SEQ ID NO. 31을 보여준다.
도 34는 NPH3 도메인의 아미노산 서열(SEQ ID NO. 1의 잔기 218-492)에 상응하는 SEQ ID NO. 32를 보여준다.
도 35는 Nitab4.5_0000868g0020.2의 녹아웃이 알칼로이드 함량의 현저한 감소로 이어짐을 보여준다. Nitab4.5_0000868g0020.2이 녹아웃된 세 가지 TN90 라인의 알칼로이드 함량을 보여준다. 알칼로이드 함량은 대조군과 비교하여 표시된다. 결과는 t-테스트로 분석되었다. 값은 평균 ± SEM으로 표시된다. 별표는 P 값 ≤ 0.001의 통계적 의미를 나타낸다.
도 36은 SEQ ID NO. 33; Nitab4.5_0000842g0110.2의 게놈 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 37은 SEQ ID NO. 34; Nitab4.5_0000842g0110.2의 게놈 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 38은 SEQ ID NO. 35; Nitab4.5_0000842g0110.2의 게놈 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 39는 SEQ ID NO. 36; Nitab4.5_0001620g0100.2의 아미노산 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 40은 SEQ ID NO. 37; Nitab4.5_0001620g0100.2의 코딩 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 41은 SEQ ID NO. 38; Nitab4.5_0001620g0100.2의 게놈 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 42는 SEQ ID NO. 39; Nitab4.5_0001200g0070.2의 아미노산 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 43은 SEQ ID NO. 40; Nitab4.5_0001200g0070.2의 코딩 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 44는 SEQ ID NO. 41; Nitab4.5_0001200g0070.2의 게놈 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 45는 SEQ ID NO. 42; Nitab4.5_0005803g0040.2의 아미노산 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 46은 SEQ ID NO. 43; Nitab4.5_0005803g0040.2의 코딩 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
도 47은 SEQ ID NO. 44; Nitab4.5_0005803g0040.2의 게놈 서열, Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 보여준다.
서열 목록
본 명세서 전체에 걸쳐 사용된 서열 식별자의 요약 및 대응하는 서열 목록이 제공된다.
SEQ ID NO. 1은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 2는 Nitab4.5_0000868g0020.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 3은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 4는 Nitab4.5_0000651g0020.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 5는 Nitab4.5_0000651g0020.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 6은 Nitab4.5_0000651g0020.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 7은 Nitab4.5_0009137g0040.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 8은 Nitab4.5_0009137g0040.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 9는 Nitab4.5_0009137g0040.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 10은 Nitab4.5_0001772g0090.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 11은 Nitab4.5_0001772g0090.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 12는 Nitab4.5_0001772g0090.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 13은 Nitab4.5_0003312g0050.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 14는 Nitab4.5_0003312g0050.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 15는 Nitab4.5_0003312g0050.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 16은 Nitab4.5_0003151g0080.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 17은 Nitab4.5_0003151g0080.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 18은 Nitab4.5_0003151g0080.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 19는 Nitab4.5_0002641g0190.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 20은 Nitab4.5_0002641g0190.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 21은 Nitab4.5_0002641g0190.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 22는 Nitab4.5_0001876g0030.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 23은 Nitab4.5_0001876g0030.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 24는 Nitab4.5_0001876g0030.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 25는 Nitab4.5_0000048g0280.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 26은 Nitab4.5_0000048g0280.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 27은 Nitab4.5_0000048g0280.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 28은 Nitab4.5_0002006g0070.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 29는 Nitab4.5_0002006g0070.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 30은 Nitab4.5_0002006g0070.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 31은 BTB/POZ 동종이량체 도메인의 아미노산 서열(SEQ ID NO. 1의 잔기 39-136)에 상응한다.
SEQ ID NO. 32는 NPH3 도메인의 아미노산 서열(SEQ ID NO. 1의 잔기 218-492)에 상응한다.
SEQ ID NO. 33은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자인 Nitab4.5_0000842g0110.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 34는 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자인 Nitab4.5_0000842g0110.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 35은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자인 Nitab4.5_0000842g0110.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 36은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자인 Nitab4.5_0001620g0100.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 37은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자인 Nitab4.5_0001620g0100.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 38은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자인 Nitab4.5_0001620g0100.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 39는 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자인 Nitab4.5_0001200g0070.2의 아미노산 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 40은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자인 Nitab4.5_0001200g0070.2의 코딩 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 41은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자인 Nitab4.5_0001200g0070.2의 게놈 서열에 상응한다.
SEQ ID NO. 42는 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자인 Nitab4.5_0005803g0040.2의 아미노산 서열에 상응한다
SEQ ID NO. 43은 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자인 Nitab4.5_0005803g0040.2의 코딩 서열에 상응한다
SEQ ID NO. 44는 Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자인 Nitab4.5_0005803g0040.2의 게놈 서열에 상응한다
본원에 개시된 일부 서열은 뉴클레오티드 서열에서 "X" 또는 "N"을 함유한다. "X" 또는 "N"은 임의의 뉴클레오티드일 수 있거나 하나 이상의 뉴클레오티드의 결실 또는 삽입일 수 있다. 예를 들어, 어떤 경우에는 "X" 또는 "N"의 문자열이 표시된다. "X" 또는 "N"의 수는 해당 위치의 실제 뉴클레오티드 수와 반드시 상관관계가 있는 것은 아니다. 서열에서 "X" 또는 "N"으로 표시된 것보다 더 많거나 더 적은 뉴클레오티드가 있을 수 있다.
상세한 설명
처음으로 본 발명자들은 식물(예를 들어, 타바코 식물)에서 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써 식물(또는 가공된 식물)의 알칼로이드 및/또는 TSNA 전구체 함량이 조절될 수 있음을 입증하였다.
본 발명은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써(예를 들어, 감소시킴으로써) 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 식물 또는 이의 일부의 알칼로이드 함량을 조절하는(예를 들어, 감소시키는) 방법을 제공한다.
또한, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써(예를 들어, 감소시킴으로써) 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 타바코 식물 또는 이의 식물 일부에서 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 전구체의 함량을 조절하는(예를 들어, 감소시키는) 방법을 제공한다.
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자로부터 선택될 수 있거나; BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 27 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 27 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 27 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함한다.
적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 일 구현예에서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 제시된 바와 같은 아미노산 서열 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하는 폴리펩티드를 인코딩하는 유전자의 군으로부터 선택되거나, BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 2개의 유전자는 변형된다.
일 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 3개, 예컨대 적어도 4개, 예컨대 적어도 5개, 예컨대 적어도 6개, 예컨대 적어도 7개, 예컨대 적어도 8개, 예컨대 적어도 9개, 예컨대 적어도 10개 유전자가 조절되는데, 여기서 유전자는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 제시된 바와 같은 아미노산 서열 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하는 폴리펩티드를 인코딩하는 것으로부터 선택되거나, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 27 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 27 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 27 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 일 양태에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자는 SEQ ID NO. 1에 제시된 바와 같은 아미노산 서열 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그 또는 SEQ ID NO.1에 대해 적어도 80%의 동일성을 갖는 서열을 포함하거나; BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2 또는 3에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2 또는 3의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그 또는 SEQ ID NO. 2 또는 3에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, 폴리펩티드를 인코딩한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
일 양태에서, 적어도 하나의 추가 유전자의 활성 또는 발현이 조절된다. 적합하게는, SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 27 또는 30, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 27 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 27 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열로부터 선택되는 적어도 2개(또는 적어도 3개 또는 적어도 4개 또는 적어도 5개 또는 적어도 6개 또는 적어도 7개 또는 적어도 8개 또는 적어도 9개)의 추가 유전자가 또한 조절될 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 "발현"은 전사, 번역, 즉 단백질 발현 수준을 지칭할 수 있다.
유전자 생성물의 수준 또는 양의 측정은 임의의 적합한 방법, 예를 들어 본 발명에 따른 변형된 식물과 변형되지 않는 유사한 식물 사이의 식물의 mRNA 전사 수준, 단백질 또는 펩티드 수준, 및/또는 표현형의 비교에 의해 수행될 수 있다.
본원에 정의된 바와 같은 용어 "유사한 생성물"은 본 발명에 따라 변형되지 않았지만, 모든 다른 관련 특징은 동일한(예를 들어, 식물 종, 성장 조건, 식물 예를 들어, 타바코 가공 방법, 등) 식물(예를 들어, 타바코 식물)로부터 유도된 것일 것이다. 본 발명에 따른 유사한 생성물은, 예를 들어, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 조절하기 위해 본 발명에 따라 변형되지 않은, 식물(예를 들어, 타바코 식물) 또는 이의 일부, 예컨대 잎(예를 들어, 타바코 잎), 수확된 잎(예를 들어, 수확된 타바코 잎), 절단된 수확된 잎(예를 들어, 절단된 수확된 타바코 잎), 가공된 잎(예를 들어, 가공된 타바코 잎) 또는 식물 번식 물질(예를 들어, 타바코 식물 번식 물질), 또는 상기 식물 또는 이의 일부를 포함하는 생성물, 예를 들어 식물로부터 수득가능하거나 수득된 타바코 산업 제품 또는 이의 조합물을 의미할 수 있다. 일 구현예에서, 유사한 생성물은 활성 또는 발현이 조절되지 않은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자를 포함하지 않는 것이다.
본원에 사용된 바와 같은 용어 "변형하는" 또는 "변형된"은 변경되거나 변화된 식물(예를 들어, 타바코 식물) 또는 핵산 서열을 의미한다. 본 발명은 식물의 유전자 변형 또는 식물의 비유전자 변형을 위한 기술을 사용하는 식물의 변형을 포함한다. 이러한 방법은 당업계에 잘 알려져 있으며, 유전자 변형 기술의 예는 형질전환, 유전자전이, 시스제닉 및 유전자 편집 방법을 포함한다. 비유전자 변형 기술의 예로는 고속 중성자 돌연변이 유발, 화학적 돌연변이 유발, 예를 들어, 에틸 메탄설포네이트(EMS) 돌연변이 유발 및 현대 집단 분석 접근 방식을 포함한다.
일 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 변형된 유전자를 갖는 천연 변이체가 선택되며, 그 형질 또는 유전자가 상업적으로 바람직한 형질을 가질 수 있는 제2 식물로 육종된다.
일 구현예에서, 본 발명에 따른 식물은 유전자전이 식물이다. 일 구현예에서, 본 발명에 따른 식물은 비-유전자전이 식물이다.
본원에 정의된 바와 같은 용어 "비변형된 식물"은 예를 들어, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 조절하기 위해 또는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 핵산 서열을 변형시키기 위해 본 발명에 따라 변형되지 않은 식물(예를 들어, 타바코 식물)일 것이며; 모든 다른 관련 특징은 동일하였다(예를 들어, 식물 종, 재배 조건, 타바코 가공 방법, 등). 일 구현예에서, 비변형된 식물은 활성 또는 발현이 조절된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자를 포함하지 않는 것이다. 일 구현예에서, 비변형된 식물은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자를 인코딩하는 변형된 핵산 서열을 포함하지 않는 것이다.
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질
본원에 사용된 바와 같은 "BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질"은 당업계의 통상적인 의미를 가지며, BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함하는 단백질을 나타낸다. 타바코로부터의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 예시적인 서열은 SEQ ID NO. 1에 제시된다.
본원에 사용된 바와 같은 "BTB/POZ 도메인"은 당업계의 통상적인 의미를 가지며, 공동의 단백질 구조 도메인을 나타낸다. BTB/POZ 도메인은 RNA 이량체화, 예컨대 동가동의 이량체화를 매개한다. BTB/POZ 단백질은 분자의 상단 및 하단에서 짧은 베타-시트에 측접한 알파-헬릭스의 클러스터를 포함한다.
BTB는 또한 bric a brac, Broad-Complex, 트램트랙(tramtrack), BR-C, ttk 및 bab로서 언급된다.
POZ는 또한 Pox 바이러스 및 아연 핑거로서 언급된다.
BTB 도메인은 전사 조절, 세포골격 역학, 이온 채널 어셈블리 및 유비퀴틴화를 위한 단백질 게이팅 및 표적화를 포함한 세포 기능에 참여하는 단백질-단백질 상호작용 모티프이다. BTB 폴드는 구조적으로 잘 보존된다.
BTB/POZ 도메인의 예시적인 서열은 SEQ ID NO. 1의 아미노산 39-136로 제시되며, SEQ ID NO. 31로서 또한 제공된다.
BTB/POZ 도메인은 해당 단백질을 SEQ ID NO. 31 및/또는 SEQ ID NO. 1과 비교함으로써 확인할 수 있다.
적합하게는, 본원에 사용된 바와 같은 BTB/POZ 도메인은 SEQ ID NO. 31에 제시된 서열 또는 그에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 나타낼 수 있다. 적합하게는, 본원에 사용된 바와 같은 BTB/POZ 도메인은 SEQ ID NO. 1과 정렬될 경우 SEQ ID NO. 1의 아미노산 39-156에 상응하는 서열을 나타낼 수 있다.
본원에 사용된 바와 같은 "NPH3 도메인"은 당업계의 통상의 의미를 가지며, 비-향광성 하이포코틸 3 도메인을 나타낸다. NPH3 도메인은 비향광성 하이포코틸 1 세린-트레오닌 단백질 키나제에 대한 어댑터 또는 스캐폴드 단백질로서 기능할 수 있다.
NPH3 도메인은 단백질-단백질 상호작용 모티프이다.
NPH3 도메인의 예시적인 서열은 SEQ ID NO. 1의 아미노산 218-492에 제시되며, 또한 SEQ ID NO. 32로서 제공된다.
NPH3 도메인은 해당 단백질을 SEQ ID NO. 32 및/또는 SEQ ID NO. 1과 비교함으로써 확인될 수 있다.
적합하게는, 본원에 사용된 바와 같은 NPH3 도메인은 SEQ ID NO. 32로 제시된 서열 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 나타낼 수 있다. 적합하게는, 본원에 사용된 바와 같은 NPH3 도메인은 SEQ ID NO. 1과 정렬될 경우 SEQ ID NO. 1의 아미노산 218-492에 상응하는 서열을 나타낼 수 있다.
단백질의 아미노산 서열 내의 도메인은 당업계에 공지된 도메인 예측 소프트웨어를 사용하여 확인될 수 있다. 도메인은 또한 UniprotKB와 같은 단백질 데이터베이스에도 설명되어 있다. 이론에 얽매이지 않으면서, 식물 세포에서 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 함량을 조절하거나 식물에서 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성, 예컨대 동종이량체화 또는 UDP-글리코실트랜스퍼라제 활성을 조절하면 알칼로이드 및 TSNA 전구체, 예컨대 PON을 생성하는 대사 경로가 변경되어, 조절된 알칼로이드 함량을 발생시킬 것으로 가정된다.
일 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 1로서 제시된 아미노산 서열 또는 이에 대해 적어도 80%의 동일성을 갖는 서열, 또는 이의 상동체를 포함한다. 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함한다. 적합하게는, SEQ ID NO. 1의 상동체는 SEQ ID NO. 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22 25 또는 28, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하는 군으로부터 선택될 수 있다. 적합하게는, SEQ ID NO. 1의 상동체는 SEQ ID NO. 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28(여기서 상기 서열은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함함), 또는 SEQ ID NO. 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하는 군으로부터 선택될 수 있으며, BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함한다.
일 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(바람직하게는, 이에 대해 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 일 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(바람직하게는, 이에 대해 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함하며, BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함한다.
적합하게는, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 1로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 4로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 7로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 10으로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 13으로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 16으로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 19로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 22로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 25로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
일 구현예에서, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로부터 선택된 아미노산 서열을 포함하거나 이로 구성된다.
적합하게는, 단백질은 니코티아나 타바쿰으로부터 유래될 수 있다.
일 구현예에서, 적어도 하나의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩되고, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30으로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 2로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 3으로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 5로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 6으로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 8로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 9로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 11로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 12로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 14로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 15로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 17로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 18로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 20으로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 21로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 23으로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 24로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 26으로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 27로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 29로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있으며, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 30으로서 제시된 서열; 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 적어도, 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일성)을 갖는 서열을 포함한다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
일 구현예에서, 적어도 하나의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩되고, 여기서 유전자(돌연변이 전)는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30으로부터 선택된다.
적합하게는, 본 발명에 따라 사용하기 위한 단백질은 니코티아나 타바쿰으로부터의 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있다.
일 양태에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 세포(예를 들어, 식물 세포)의 알칼로이드 함량을 감소시키는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 감소시키거나 억제시킴으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는 방법을 제공한다.
일 양태에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 식물 세포의 알칼로이드 함량을 감소시키는 방법으로서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하거나, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 감소시키거나 억제시킴으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다. 적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
일 양태에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부(예를 들어, 잎)에서 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 전구체의 함량을 감소시키는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 감소시키거나 억제시킴으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
일 양태에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부(예를 들어, 잎)에서 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 전구체의 함량을 감소시키는 방법으로서, SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30으로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하거나, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 감소시키거나 억제시킴으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다. 적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
일 양태에서, 본 발명은 경화된 잎과 같은 가공된 잎에서 TSNA의 함량을 감소시키는 방법으로서,
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 감소시키거나 억제시킴으로써 식물을 변형시키는 단계;
상기 식물로부터 잎을 수확하는 단계; 및
상기 수확된 잎을 경화하는 단계를 포함하는, 방법을 제공한다.
적합하게는, 가공된 잎에서 TSNA 함량을 감소시키는 방법은 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30으로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하거나, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 감소시키거나 억제시킴으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함한다. 적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
본원에 사용된 바와 같은 용어 "감소시키는" 또는 "억제시키는"(예를 들어, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 억제시키는)은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현이 유사 생성물 중 유전자의 활성 또는 발현과 비교하여 저하되거나 감소됨을 의미한다.
일 양태에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 세포(예를 들어, 식물 세포)의 알칼로이드 함량을 증가시키는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 증가시키거나 향상시킴으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
일 양태에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 식물 세포의 알칼로이드 함량을 증가시키는 방법으로서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하거나, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 증가시키거나 향상시킴으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다. 적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인을 포함할 수 있다. 적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 BTB/POZ 도메인 및 NPH3 도메인을 포함할 수 있다.
일 양태에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부(예를 들어, 잎)에서 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 전구체의 함량을 증가시키는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 증가시키거나 향상시킴으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
일 양태에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부(예를 들어, 잎)에서 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 전구체 함량을 증가시키는 방법으로서, SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30으로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하거나, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 증가시키거나 향상시킴으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
본원에 사용된 바와 같은 용어 "증가시키는" 또는 "향상시키는"(예를 들어, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 증가시키는)은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현이 유사 생성물에서의 유전자의 활성 또는 발현과 비교하여 높아지거나 증가됨을 의미한다.
본 발명에 따라, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현이 조절된다.
일 양태에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 세포(예를 들어, 식물 세포)의 알칼로이드 함량을 조절(즉, 증가 또는 감소)하는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성을 조절(즉, 증가 또는 감소)함으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
용어 "활성"은 적어도 하나의 유전자에 의해 인코딩된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 임의의 기능성을 나타낸다. 활성의 예는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 단백질:단백질 상호작용의 형성, 효소 활성 또는 국소화를 포함한다.
적합하게는, 활성은 또 다른 분자 또는 분자들과 상호작용하는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 능력일 수 있다. 일부 구현예에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 세포(예를 들어, 식물 세포)의 알칼로이드 함량을 조절(즉, 증가 또는 감소)하는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질이 또 다른 분자와 상호작용하는 능력을 조절(즉, 증가 또는 감소)함으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는 방법을 제공한다.
적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질이 다른 분자와 상호작용하는 능력은 다른 분자에 결합하는 능력일 수 있다. 다른 분자는 또 다른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질과 같은 단백질일 수 있다. 적합하게는, 다른 분자는 하나 초과의 분자, 예컨대 하나 이상의 분자, 예컨대 2개 이상의 분자, 예컨대 3개 이상의 분자일 수 있다. 다른 분자가 하나 초과의 분자인 경우, 다른 분자는 동일한 분자일 수 있거나 상이한 분자일 수 있다.
적합하게는, 활성은 동종이량체화하는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 능력일 수 있다. 일부 구현예에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 세포(예를 들어, 식물 세포)의 알칼로이드 함량을 조절(즉, 증가 또는 감소)하는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질이 동종이량체화하는 능력을 조절(즉, 증가 또는 감소)함으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
적합하게는, 활성은 UDP-글리코실트랜스퍼라제로서 기능하는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 능력일 수 있다. 일부 구현예에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 세포(예를 들어, 식물 세포)의 알칼로이드 함량을 조절(즉, 증가 또는 감소)하는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질이 UDP-글리코실트랜스퍼라제로서 기능하는 능력을 조절(즉, 증가 또는 감소)함으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성의 조절은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성을 증가 또는 감소시키는 것을 수반할 수 있다.
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성 증가는 본 발명에 따라 변형되지 않은 식물에서의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질과 비교하여 특정 기능을 수행하는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 능력을 향상 또는 증가시키는 것을 나타낸다.
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성 감소는 본 발명에 따라 변형되지 않은 식물에서의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질과 비교하여 특정 기능을 수행하는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 능력을 감소, 억제 또는 파괴하는 것을 나타낸다. BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성은 활성이 방지되거나 제거될 정도로 감소될 수 있다.
일부 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성은 본 발명에 따라 변형되지 않은 식물(예를 들어, 타바코 식물)에서의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성과 비교하여 적어도 약 10%, 20%, 30% 또는 40%, 적합하게는 적어도 약 50%, 60%, 70%, 더욱 적합하게는 적어도 약 80%, 90%, 95% 또는 100% 조절(즉, 증가 또는 감소)될 수 있다.
일부 구현예에서, 조절된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 비변형된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질과 비교하여 증가되거나 감소된 활성을 나타낸다. 조절된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 비변형된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질과 비교하여 적어도 약 1%, 적어도 약 3%, 적어도 약 5%, 적어도 약 10%, 적어도 약 20%, 적어도 약 30%, 적어도 약 40%, 적어도 약 50%, 적어도 약 60%, 적어도 약 70%, 적어도 약 80% 또는 적어도 약 90% 증가된 또는 감소된 활성을 나타낼 수 있다.
단백질 활성을 측정하기 위한 기술은 당업계에 알려져 있다. 예를 들어, 단백질의 효소 활성을 측정하기 위한 검정법은 알려져 있으며, 단백질의 국소화는 현미경 기술을 사용하여 확인될 수 있다.
특히, 또 다른 분자에 결합하는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 능력은 당업계에 공지된 기술을 사용하여 측정될 수 있다. 이러한 기술의 예로는 면역침전, 등온 열량계, 표면 플라즈몬 공명 및 마이크로규모 열영동을 포함한다. 예를 들어, 다른 분자에 결합하는 조절되거나 변이된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 능력은 예를 들어, 조절된 또는 변이된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질 및 상응하는 비변형된 또는 비변이된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 사용하여 공동-면역침전 실험을 수행함으로써 결정될 수 있다. BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 조절 또는 돌연변이가 다른 분자에 결합하는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 능력을 감소, 억제 또는 제거하는 경우, 공동-면역침전은 조절되거나 변이된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질이 더 적게 다른 분자에 결합한다는 것을 보여줄 것이다.
동종이량체화하는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 능력은 당업계에 공지된 기술을 사용하여 측정될 수 있다. 이러한 기술의 예는 천연 조건 하의 겔 전기 영동, 크기 배제 크로마토그래피, 확산 핵 자기 공명(NMR) 또는 분석적 초원심분리와 같은 기술을 포함한다. 본 발명에 따르면, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성 또는 발현은 조절된다.
일 양태에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 세포(예를 들어, 식물 세포)의 알칼로이드 함량을 조절(즉, 증가 또는 감소)하는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 발현을 조절(즉, 증가 또는 감소)함으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
유전자의 "발현"은 유전자에 인코딩된 정보가 기능으로 전환되는 정도를 나타낸다. 유전자의 발현 수준은 세포 또는 유기체에 존재하는 해당 유전자의 생성물의 양과 동등할 수 있다. 유전자의 발현을 조절(즉, 증가 또는 감소)하는 변형은 비변형된 식물 또는 세포와 비교하여 식물 또는 세포에서 해당 유전자의 생성물의 양을 증가시키는 변형이다.
일부 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 발현은 본 발명에 따라 변형되지 않은 식물(예를 들어, 타바코 식물)에서 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 발현과 비교하여 조절(즉, 증가 또는 감소)된다.
일부 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 발현은 본 발명에 따라 변형되지 않은 식물(예를 들어, 타바코 식물)에서 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 발현과 비교하여 적어도 약 10%, 20%, 30% 또는 40%, 적합하게는 적어도 약 50%, 60%, 70%, 더욱 적합하게는 적어도 약 80%, 90%, 95% 또는 100% 조절(즉, 증가 또는 감소)될 수 있다.
일부 구현예에서, 조절된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 비변형된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질과 비교하여 증가되거나 감소된 발현을 나타낸다. 조절된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 비변형된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질과 비교하여 적어도 약 1%, 적어도 약 3%, 적어도 약 5%, 적어도 약 10%, 적어도 약 20%, 적어도 약 30%, 적어도 약 40%, 적어도 약 50%, 적어도 약 60%, 적어도 약 70%, 적어도 약 80% 또는 적어도 약 90% 증가된 또는 감소된 발현을 나타낼 수 있다.
일반적으로, 유전자는 mRNA로 전사되고, 이는 최종 유전자 생성물인 단백질로 번역된다. 단백질은 세포 저장소에 격리되고/거나 분해될 수 있다. 유전자의 발현은 이들 단계 중 일부 또는 전부를 조절함으로써 조절될 수 있다. 따라서, 일부 구현예에서 변형은 하기 방식 중 하나로 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 발현을 조절한다:
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자로부터의 전사를 조절;
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자로부터 mRNA의 번역을 조절;
세포내 저장으로부터 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 방출 조절; 및/또는
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 분해 속도 조절.
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 특정 유전자의 발현은 유전자의 전사 및/또는 번역을 측정함으로써 측정될 수 있다. 전사 측정 방법은 당업계에 잘 알려져 있으며, 특히 노던 블롯, RNA-Seq, 원위 혼성화, DNA 마이크로어레이 및 RT-PCR을 포함한다. 대안적으로, 유전자의 발현은 유전자 생성물, 예를 들어 상기 유전자에 의해 인코딩된 단백질의 수준을 측정함으로써 간접적으로 측정될 수 있다. 예를 들어, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 발현은 웨스턴 블롯에 의해 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질에 특이적인 항체(예를 들어, BTB/POZ, NPH3 도메인에 특이적인 항체)를 사용하여 단백질의 존재를 측정함으로써 결정될 수 있다.
변형
식물 또는 세포는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하는 임의의 방식으로 변형될 수 있다. 유전자의 활성 또는 발현을 조절하는 식물 및 세포에 대한 변형 유형은 물론 이러한 변형을 달성하는 기술은 당업계에 공지되어 있다.
일부 구현예에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 세포(예를 들어, 식물 세포)의 알칼로이드 함량을 감소시키는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 감소시키거나 억제시킴으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 발명은 타바코 식물 또는 이의 식물 일부에서 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 또는 TSNA의 전구체의 함량을 감소시키는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 감소시킴으로써 상기 식물 또는 세포 배양물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
유전자의 활성 또는 발현을 감소시키거나 억제하기 위해 당업계에 공지된 임의의 방법이 본 발명에 따른 방법에 사용될 수 있다.
적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 단백질 활성, 발현 또는 기능이 검출가능하지 않도록 감소, 부분적으로 불활성화, 억제, 제거, 녹아웃 또는 손실될 수 있다.
일 양태에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자는 녹아웃된다. 다시 말해, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자는 완전히 작동하지 않게 되었다.
예를 들어, 본 방법은 다음을 포함할 수 있다:
· SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 핵산 서열에 돌연변이 제공;
· SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질의 발현 조절에 기여하는 조절 영역(예를 들어, 프로모터 또는 인핸서)에 돌연변이를 제공;
· SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 핵산 서열의 수준을 감소시키는 안티센스 RNA, siRNA 또는 miRNA 제공.
상기 접근법 각각은 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하거나, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, 단백질의 활성 또는 발현의 감소 또는 방지를 발생시킨다.
본원에 사용된 바와 같은 용어 "돌연변이"는 천연 유전자 변이체 또는 조작된 변이체를 포함한다. 특히, 용어 "돌연변이"는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 서열 또는 이에 대해 적어도 80%(바람직하게는 적어도 85%, 바람직하게는 적어도 90%, 바람직하게는 적어도 93%, 바람직하게는 적어도 95%, 바람직하게는 적어도 98%, 바람직하게는 적어도 99%) 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열과 비교하여 아미노산 서열에서 또는 아미노산 서열을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열에서의 변이를 나타낸다.
일 구현예에서, 돌연변이는 식물의 알칼로이드 함량을 감소시킨다. 또 다른 구현예에서, 돌연변이는 식물 또는 이의 일부, 또는 잎, 예컨대 수확된 또는 가공된 잎에서 적어도 하나의 TSNA 전구체의 함량을 감소시킨다. 일 구현예에서, 돌연변이는 NNK, NNN, NAT, NAB로부터 선택된 하나 이상의 TSNA의 함량을 감소시키고, 바람직하게는 NNK 함량은 가공된 잎에서 감소된다. 적합하게는, TSNA 함량은 유사한 생성물에 비해 감소된다.
일 구현예에서, 본 발명에 따른 방법은 핵산 서열을 식물 또는 이의 일부 또는 식물 세포에 제공하는 것을 포함할 수 있으며, 여기서 상기 핵산은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현의 감소 또는 제거를 발생시킨다.
일 구현예에서, 본 발명에 따른 방법은 핵산 서열을 식물 또는 이의 일부 또는 식물 세포에 제공하는 것을 포함할 수 있으며, 여기서 상기 핵산은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 핵산 서열의 변형을 발생시킨다.
적합하게는 상기 핵산 서열은 식물 또는 이의 일부 또는 세포에 도입될 수 있다. 적합하게는 식물 또는 이의 일부 또는 세포에서 내인성 핵산 서열이 본 발명에 따른 폴리펩티드를 인코딩하도록 변형될 수 있다(예를 들어, 유전자 편집에 의해). 예를 들어, 내인성 뉴클레오티드 서열은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 감소시키도록 변형될 수 있다.
바람직한 구현예에서, 식물에 존재하는, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 서열 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하거나, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, 단백질을 인코딩하는 핵산 서열을 각 복사체가 변형되며, 예를 들어, 본원에 정의된 바와 같이 변이된다(예를 들어, 식물에서 상기 단백질을 인코딩하는 유전자의 각 게놈 복사체가 변이된다). 예를 들어, 니코티아나 타바쿰의 이질사배체 게놈에 있는 유전자의 각 복사체가 변이될 수 있다.
바람직한 구현예에서, 본원에 기재된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 상동체의 일부 또는 전부가 변형, 예를 들어 억제 또는 변이된다. 적합하게는, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 상응하는 서열의 일부 또는 모두가 변형, 예를 들어 억제 또는 변이된다.
일부 구현예에서, 본 발명에 따른 식물 또는 식물 세포는 동형접합성이다. 적합하게는, 식물 또는 식물 세포는 변형, 예를 들어, 억제 또는 돌연변이에 대해 동형접합성일 수 있다.
일부 구현예에서, 본 발명에 따른 식물 또는 식물 세포는 단지 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 변형된, 예를 들어, 변이된 핵산만을 발현한다. 다시 말해서, 일부 구현예에서, 내인성(또는 내인성 및 기능성 단백질)은 본 발명에 따른 식물에 존재하지 않는다. 즉, 임의의 내인성 단백질이 존재하는 경우, 이는 바람직하게는 불활성 형태로 존재한다.
일 구현예에서, 본 방법은 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30으로서 제시된 핵산, 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열에 돌연변이를 제공하는 것을 포함할 수 있다.
돌연변이는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 핵산 서열이 완전하게 또는 부분적으로 제거되거나 달리 변형되어 동종이량체화하는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 능력을 억제하거나 결실되도록 식물 게놈을 변경시킬 수 있다. 일부 구현예에서, 돌연변이는 단백질의 수준 또는 발현을 변경하지 않지만, 동종이량체화하는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 능력을 감소, 억제 또는 제거한다. 발현 "억제 또는 제거"는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질이 모노머 형태에 우세하게 존재함을 의미한다.
적합하게는, 돌연변이는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 BTB/POZ 도메인에 있을 수 있다. 적합하게는, 돌연변이는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 NPH3 도메인에 있을 수 있다. 적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질은 각각 상이한 도메인에 다중 돌연변이를 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, BTB/POZ 도메인에서의 돌연변이는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질이 동종이량체화하는 능력을 변형시킨다. 적합하게는, 돌연변이는 동종이량체화를 방지하거나 감소시킬 수 있다. 적합하게는, BTB/POZ 도메인에서의 돌연변이는 동종이량체화를 방지하거나 감소시키고, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성을 감소시킨다.
돌연변이는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 하나 이상의 도메인, 예컨대 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인에 있을 수 있다. 일부 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 하나 이상의 도메인, 예컨대 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인은 변이되어 BTB/POZ NPH3가 동종이량체화하는 능력을 변형시킬 수 있다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 도메인, 예컨대 BTB/POZ 도메인 및/또는 NPH3 도메인은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질로부터 결실된다.
돌연변이는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 핵산 서열을 중단시킬 수 있다.
중단으로 인해 핵산 서열은 전사되고/거나 번역되지 않을 수 있다.
핵산 서열은 예를 들어, 단백질의 번역이 감소되거나 방지되도록 핵산 서열의 ATG 시작 코돈을 결실시키거나 달리 변형시킴으로써 중단될 수 있다.
핵산 서열은 단백질의 발현을 감소 또는 방지하거나 단백질 트래피킹에 영향을 미치는 하나 이상의 뉴클레오티드 변화(들)를 포함할 수 있다. 예를 들어, 단백질의 발현은 오픈 리딩 프레임에서 하나 이상의 미성숙 정지 코돈, 프레임 이동, 스플라이스 돌연변이 또는 비내성 아미노산 치환의 도입에 의해 감소되거나 방지될 수 있다.
미성숙 정지 코돈은 정지 코돈을 오픈 리딩 프레임에 도입하고 전체 아미노산 서열의 번역을 방지하는 돌연변이를 나타낸다. 조기 정지 코돈은 TAG("앰버"), TAA("오커"), 또는 TGA("오팔" 또는 "엠버") 코돈일 수 있다.
프레임-이동 돌연변이(또한, 프레임 오류 또는 리딩 프레임 이동으로 불림)는 3으로 나눌 수 없는 핵산 서열에서 다수의 뉴클레오티드의 삽입결실(삽입 또는 결실)로 인해 초래되는 돌연변이이다. 코돈에 의한 유전자 발현의 삼중항 특성으로 인해, 삽입 또는 결실은 리딩 프레임을 변경하여 원래의 것과 완전히 상이한 번역을 발생시킬 수 있다. 프레임이동 돌연변이는 종종 돌연변이 후 코돈의 판독을 초래하여 상이한 아미노산을 코딩하게 할 것이다. 프레임이동 돌연변이는 일반적으로 조기 정지 코돈의 도입을 발생시킬 것이다.
스플라이스 돌연변이는 전구체 메신저 RNA가 성숙한 메신저 RNA로 프로세싱되는 동안 스플라이싱이 발생하는 특정 부위에서 다수의 뉴클레오티드를 삽입, 결실 또는 교체시킨다. 스플라이싱 부위의 결실은 하나 이상의 인트론이 성숙한 mRNA에 남아있게 하고, 비정상 단백질의 생성으로 이어질 수 있다.
비-내성(non-tolerated) 아미노산 치환은 단백질의 기능을 감소시키거나 제거하는 단백질에서의 비-동의 아미노산 치환을 초래하여 돌연변이를 지칭한다.
핵산 서열에서 돌연변이를 제공하기 위해 당업계에 공지된 임의의 방법이 본 발명에 따른 방법에 사용될 수 있다. 예를 들어, 관련 핵산 서열(들)이 변이되고 식물 또는 식물 세포를 형질전환시키는데 사용되는 벡터가 생성되는 상동 재조합이 이용될 수 있다. 그 후, 변이된 서열을 발현하는 재조합 식물 또는 식물 세포가 선택될 수 있다.
일 구현예에서, 돌연변이는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하는 단백질에서 비-내성 아미노산 치환을 도입한다.
일부 구현예에서, BTB/POZ 도메인은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 발현을 감소시키는 돌연변이를 함유할 수 있다.
일부 구현예에서, NPH3 도메인은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 발현을 감소시키는 돌연변이를 함유할 수 있다.
돌연변이는 결실, 스플라이스 돌연변이체 또는 비-내성 아미노산 치환을 인코딩하는 코돈일 수 있다.
일 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 핵산 서열은 전체적으로 또는 부분적으로 결실될 수 있다. 결실은 연속적일 수 있거나 서열의 복수 절편을 포함할 수 있다. 결실은 바람직하게는 핵산 서열이 더 이상 기능성 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하지 않도록 충분한 양의 뉴클레오티드 서열을 제거한다. 결실은 전체일 수 있으며, 이 경우 유사한 비변형된 식물의 상응하는 게놈와 비교하여 핵산 서열의 코딩 부분의 100%가 부재한다. 예를 들어, 결실은 핵산 서열의 코딩 부분의 적어도 50, 60, 70, 80 또는 90%를 제거할 수 있다. 적합하게는, 단백질의 적어도 일부가 결실될 수 있다. 예를 들어, 결실은 단백질의 코딩 부분의 적어도 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80 또는 90%를 제거할 수 있다.
결실은 BTB/POZ 도메인의 적어도 일부를 제거할 수 있다. 예를 들어, 결실은 BTB/POZ 도메인의 적어도 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80 또는 90%를 제거할 수 있다. 적합하게는, 결실은 BTB/POZ 도메인의 적어도 5개 아미노산, 적어도 10개 아미노산, 적어도 15개, 적어도 20개, 적어도 25개, 적어도 30개 아미노산을 제거할 수 있다. 적합하게는, 결실은 NPH3 도메인의 적어도 5개 아미노산, 적어도 10개 아미노산, 적어도 15개, 적어도 20개, 적어도 25개, 적어도 30개 아미노산을 제거할 수 있다.
결실은 NPH3 도메인의 적어도 일부를 제거할 수 있다. 예를 들어, 결실은 NPH3 도메인의 적어도 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80 또는 90%를 제거할 수 있다. 적합하게는, 결실은 BTB/POZ 도메인의 적어도 5개 아미노산, 적어도 10개 아미노산, 적어도 15개, 적어도 20개, 적어도 25개, 적어도 30개 아미노산을 제거할 수 있다. 적합하게는, 결실은 NPH3 도메인의 적어도 5개 아미노산, 적어도 10개 아미노산, 적어도 15개, 적어도 20개, 적어도 25개, 적어도 30개 아미노산을 제거할 수 있다.
식물에서 핵산 서열을 결실시키는 방법은 당업계에 공지되어 있다. 예를 들어, 관련 핵산 서열(들)이 소실되고 식물 또는 식물 세포를 형질전환시키는데 사용되는 벡터가 생성되는 상동 재조합이 이용될 수 있다. 그 후, 서열의 새로분 부분을 발현하는 재조합 식물 또는 식물 세포가 선택될 수 있다.
본원에 기술된 바와 같은 벡터로 형질전환된 식물 세포는 잘 알려진 조직 배양 방법, 예컨대 필요 성장 인자 예컨대, 아미노산, 식물 호르몬, 비타민 등이 보충된 적합한 배양 배지에서 세포를 배양함으로써 성장하고 유지될 수 있다.
핵산 서열의 변형은 표적화된 돌연변이유발 방법(또한, 표적화된 뉴클레오티드 교환(TNE) 또는 올리고-선택적 돌연변이유발(ODM)로서 언급됨)을 이용하여 수행될 수 있다. 표적화된 돌연변이유발 방법은 비제한적으로, 아연 핑거 뉴클레아제, TALEN(WO2011/072246 및 WO2010/079430 참조), Cas9-유사, Cas9/crRNA/tracrRNA, Cas9/gRNA, 또는 기타 CRISPR 시스템(WO 2014/071006 및 WO2014/093622 참조), 메가뉴클레아제(WO2007/047859 및 WO2009/059195 참조)를 사용하는 방법, 또는 유전자에 대한 서열 상보성으로 돌연변이유발을 향상시키기 위해 가능하게는, 화학적으로 변형된 뉴클레오티드를 식물 원형질체에 함유하는 돌연변이유발성 올리고뉴클레오티드를 사용하는 표적화된 돌연변이유발 방법을 포함한다(예를 들어, KeyBase® 또는 TALEN).
대안적으로, 돌연변이유발 시스템 예컨대, TILLING (Targeting Induced Local Lesions IN Genomics; McCallum et al. (2000) Nat. Biotech. 18:455, and McCallum et al. (2000) Plant Physiol. 123, 439-442, 둘 모두 본원에 인용으로 통합됨)은 돌연변이를 갖는 단백질을 인코딩하는 유전자를 포함하는 식물 계통을 생성하는데 사용될 수 있다. TILLING는 전통적인 화학적 돌연변이유발(예를 들어, 무작위 돌연변이를 생성하는 에틸 메탄설포네이트(EMS) 돌연변이유발) 이어서, 돌연변이를 위한 고처리량 스크리닝을 사용한다. 따라서, 요망되는 돌연변이를 갖는 유전자를 포함하는 식물, 종자, 세포 및 조직이 수득될 수 있다.
방법은 식물 종자의 돌연변이유발(예를 들어, EMS 돌연변이유발), 식물 개체 또는 DNA의 풀링, 관심 영역의 PCR 증폭, 이종이중체 형성 및 고처리량 검출, 돌연변이체 식물의 확인, 돌연변이체 PCR 생성물의 시퀀싱의 단계를 포함할 수 있다. 다른 돌연변이유발 및 선택 방법이 이러한 변형된 식물을 생성하기 위해 동등하게 사용될 수 있음이 이해된다. 종자는 예를 들어, 방사선 조사되거나 화학적으로 처리될 수 있으며, 식물은 변형된 표현형에 대해 스크리닝될 수 있다.
고속 중성자 결실 돌연변이유발은 내인성 유전자에 결실이 있는 식물 계통을 확인하기 위해 역유전학 센스(즉, PCR 사용)에 사용될 수 있다. 예를 들어, 본원에 인용으로 통합된 문헌 [Ohshima et al. (1998) Virology 213:472-481; Okubara et al. (1994) Genetics 137:867-874; and Quesada et al. (2000) Genetics 154:421-4315] 참조.
또 다른 접근법에서, 우성 돌연변이체는 유전자 역전 및 복제된 유전자좌의 재조합으로 인한 RNA 침묵을 촉발하는 데 사용될 수 있다. 예를 들어, 문헌 [Kusaba et al. (2003) Plant Cell 15:1455-1467] 참조 (인용으로 본원에 통합됨).
변형된 식물은 DNA에 존재하는 돌연변이(들)와 같은 분자 방법에 의해 및 변형된 표현형 특징에 의해 비변형된 식물, 즉 야생형 식물로부터 구별될 수 있다. 변형된 식물은 변형에 대해 동형접합성 또는 이형접합성일 수 있다. 바람직하게는, 변형된 식물은 변형에 대해 동형접합성이다.
일 구현예에서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질의 활성 또는 발현을 감소시키거나 방지하는 방법은 식물을 확학물질(예를 들어, 농약)로 처리하는 것을 포함하지 않는다.
발현을 감소시키거나 방지하는 다른 방법은 당업자에게 명백할 것이며, 바이러스-유도된 유전자 침묵(VIG), 마이크로 RNA 침묵, RNAi, 안티센스, tDNA 삽입, 또는 우세한 음성 작제물(또는 반형 돌연변이)의 사용을 포함할 것이다.
일 구현예에서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 유전자의 발현은 바이러스 유도 유전자 침묵에 의해 감소 또는 제거될 수 있다.
일 구현예에서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 유전자의 발현은 마이크로RNA에 의해 감소 또는 제거될 수 있다.
일 구현예에서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 유전자의 발현은 RNAi에 의해 감소 또는 제거될 수 있다.
일 구현예에서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 유전자의 발현은 안티센스 억제에 의해 감소 또는 제거될 수 있다.
일 구현예에서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 유전자의 발현은 센스 억제에 의해 감소 또는 제거될 수 있다.
일 구현예에서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 유전자의 발현은 tDNA 삽입에 의해 감소 또는 제거될 수 있다.
일 구현예에서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 유전자의 발현은 우세한 음성 작제물(또는 반형 돌연변이)에 의해 감소 또는 제거될 수 있다.
일 구현예에서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 유전자의 발현은 표적화된 돌연변이유발 기반 시스템에 의해 감소 또는 제거될 수 있다.
일 구현예에서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 유전자의 발현은 CRISPR 기반 시스템에 의해 감소 또는 제거될 수 있다.
일 구현예에서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열, 또는 이에 대해 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질을 인코딩하는 유전자의 발현은 아연 핑거 뉴클레아제, TALEN, 메가뉴클레아제, 돌연변이유발 올리고뉴클레오티드 또는 TILLING에 의해 감소 또는 제거될 수 있다.
일부 구현예에서, 본 발명은 식물 또는 이의 일부 또는 세포(예를 들어, 식물 세포)의 알칼로이드 함량을 증가시키는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 증가시키거나 향상시킴으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는 방법을 제공한다.
유전자의 활성 또는 발현을 증가시키거나 향상시키기 위해 당업계에 공지된 임의의 방법이 본 발명에 따른 방법에 사용될 수 있다.
일부 구현예에서, 방법은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자를 과발현하는 것을 포함할 수 있다. 적합하게는, 방법은 식물 또는 세포에서 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 하나 이상의 추가의 복사체를 발현하는 것을 포함할 수 있다. 적합하게는, 방법은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 내인성 복사체를 변형시켜 이의 발현을 증가시키는 것을 포함할 수 있다. 방법은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 코딩 서열을 변이시키는 것을 포함할 수 있다. 방법은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 발현을 조절하는 조절 서열을 변이시키는 것을 포함할 수 있다.
적합하게는, 방법은 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하거나, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, 적어도 하나의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하거나; 적어도 하나의 내인성 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 촉진하거나 증가시킬 수 있는 단백질을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 유전자 작제물로 식물(예를 들어, 타바코 식물)의 세포를 형질전환시키는 것을 포함할 수 있다. 이러한 옵셕 각각은 적어도 하나의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질에 의해 인코딩된 폴리펩티드의 증가된 활성 및 발현을 발생시킬 것이라는 점이 이해될 것이다. 방법은 형질전환된 세포로부터 식물을 재생하는 것을 포함할 수 있다. 작제물로 형질전환된 식물 또는 이의 일부 또는 세포에서 알칼로이드 함량(예를 들어, 니코틴 함량)을 증가시키기 위해 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자에 의해 인코딩되는 폴리펩티드의 활성 및/또는 발현을 증가시킬 수 있는 유전자 작제물의 용도가 제공된다.
유전자 작제물은, 아미노산 서열 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28, 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하거나, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, 폴리펩티드를 인코딩할 수 있다.
또 다른 구현예에서, 본 발명은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성을 증가시킴으로써 상기 식물 또는 세포를 변형시키는 것을 포함하는, 식물 또는 이의 일부 또는 세포의 알칼로이드 함량을 증가시키는 방법에 관한 것이다.
일 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자에 돌연변이를 도입(또는 제공)함으로써 증가될 수 있다.
적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성은, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하거나; BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자에 돌연변이를 도입함으로써 증가될 수 있다.
일부 구현예에서, 변형은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 증가시키고 이에 의해 하기 중 하나에 의해 알칼로이드 함량을 증가시킨다:
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 코딩하는 적어도 하나의 유전자로부터의 전사 조절;
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자로부터 mRNA의 번역 조절;
세포내 저장으로부터 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 방출 조절; 및/또는
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 분해 속도 조절.
일 양태에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성 및/또는 발현은 상호작용인자 단백질의 활성 또는 발현을 조정함으로써 조절될 수 있으며, 예를 들어 감소될 수 있다.
이론에 얽매이지 않고, 일 양태에서, 상호작용인자 단백질은 상기 BTB/POZ NPH3 단백질의 활성 및/또는 발현을 감소 또는 차단할 수 있다. 예를 들어, 상호작용인자 단백질은 BTB/POZ NPH3 단백질에 결합되고/거나 격리할 수 있고; 따라서 상호작용인자 단백질의 활성 및/또는 발현을 증가시키는 것은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성 및/또는 발현을 감소시킬 수 있다.
대안적 양태에서, 상호작용인자 단백질은 BTB/POZ NPH3 단백질의 활성 및/또는 발현을 증가 또는 향상시킬 수 있다. 예를 들어, 상호작용인자 단백질은 BTB/POZ NPH3 단백질에 대한 공동-인자로서 작용할 수 있고; 따라서 상호작용인자 단백질의 활성 및/또는 발현을 감소시키는 것은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성 및/또는 발현을 감소시킬 수 있다.
일 양태에서, BTB/POZ NPH3 단백질의 활성 및/또는 발현은 상호작용인자 단백질의 활성 및/또는 발현을 조정함으로써 조절(예를 들어, 감소)될 수 있다.
적합하게는, 상호작용인자 단백질은 SEQ ID NO. 33, SEQ ID NO. 36, SEQ ID NO. 39, SEQ ID NO. 42 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(예컨대, 적어도 85% 동일성, 적어도 90% 동일성, 적어도 95% 동일성, 적어도 97% 동일성, 적어도 98% 동일성)을 갖는 이의 변이체로부터 선택될 수 있다.
적합하게는, 상호작용인자 단백질은 SEQ ID NO. 34, SEQ ID NO. 37. SEQ ID NO. 40, SEQ ID NO. 43 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(예컨대, 적어도 85% 동일성, 적어도 90% 동일성, 적어도 95% 동일성, 적어도 97% 동일성, 적어도 98% 동일성)을 갖는 이의 변이체로부터 선택되는 코딩 서열을 가질 수 있다.
적합하게는, 상호작용인자 단백질은 SEQ ID NO. 35, SEQ ID NO. 38. SEQ ID NO. 41, SEQ ID NO. 44 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성(예컨대, 적어도 85% 동일성, 적어도 90% 동일성, 적어도 95% 동일성, 적어도 97% 동일성, 적어도 98% 동일성)을 갖는 이의 변이체로부터 선택되는 뉴클레오티드 서열에 의해 인코딩될 수 있다.
알칼로이드 함량
일 구현예에서, 본 발명은 식물(예를 들어, 타바코 식물) 또는 이의 일부의 알칼로이드 함량을 조절하는 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는 방법을 제공한다.
용어 "조절"은 증가 또는 감소를 의미하기 위해 본원에서 사용된다.
용어 "알칼로이드 함량 증가"는 본 발명의 생성물(예를 들어, 식물, 이의 일부(예를 들어, 잎), 가공된 잎 또는 식물로부터 제조된 제품(예를 들어, 타바코 산업 제품))에서 알칼로이드 함량이 본 발명에 따라 변형되지 않은 유사한 생성물과 비교하여 더 높음을 의미하고자 본원에서 사용된다.
용어 "알칼로이드 함량 감소"는 본 발명의 생성물(예를 들어, 식물, 이의 일부(예를 들어, 잎), 가공된 잎 또는 식물로부터 제조된 제품(예를 들어, 타바코 산업 제품))에서 알칼로이드 함량이 본 발명에 따라 변형되지 않은 유사한 생성물과 비교하여 더 낮음을 의미하고자 본원에서 사용된다.
일부 구현예에서, 알칼로이드 함량의 조절은 알칼로이드 함량의 증가를 나타내며, 여기서 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현이 증가된다(또는 다른 말로, 단백질이 과발현된다).
일부 구현예에서, 알칼로이드 함량의 조절은 알칼로이드 함량의 감소를 나타내며, 여기서 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 발현은 감소되거나 억제되거나 제거된다.
추가의 양태에서, 알칼로이드 함량은 잎으로부터 측정된다. 일 양태에서, 알칼로이드 함량은 녹색 잎으로부터 측정된다. 추가의 양태에서, 알칼로이드 함량은 경화된 잎, 예를 들어 공기-경화된, 연도(flue)-경화된, 화염-경화된 또는 태양-경화된 잎으로부터 측정된다. 추가의 양태에서, 알칼로이드 함량은 연도-경화된 잎으로부터 측정된다. 추가의 양태에서, 알칼로이드 함량은 공기-경화된 잎으로부터 측정된다.
용어 "알칼로이드 함량"은 알칼로이드로 분류되는 화합물의 전체 그룹의 농도 및/또는 총량 또는 알칼로이드로 분류되는 하나 이상의 화합물의 농도 및/또는 총량을 의미하기 위해 본원에서 사용된다. 타바코에 일반적으로 존재하는 알칼로이드에는 니코틴, 노르니코틴, PON, 아나타빈, 아나바신 및 미오스민이 포함된다. 일부 구현예에서, 니코틴, 노르니코틴, PON, 아나타빈, 아나바신 및 미오스민으로부터 선택되는 하나 이상의 알칼로이드, 예컨대 2개 이상의 알칼로이드, 예컨대 3개 이상의 알칼로이드, 예컨대 4개 이상의 알칼로이드, 예컨대 5개 이상의 알칼로이드, 예컨대 모두 6개의 알칼로이드의 함량이 조절된다. 일부 구현예에서, 니코틴, 노르니코틴, PON, 아나타빈, 아나바신 및 미오스민으로부터 선택되는 하나 이상의 알칼로이드, 예컨대 2개 이상의 알칼로이드, 예컨대 3개 이상의 알칼로이드, 예컨대 4개 이상의 알칼로이드, 예컨대 5개 이상의 알칼로이드, 예컨대 모두 6개의 알칼로이드의 함량이 증가된다. 일부 구현예에서, 니코틴, 노르니코틴, PON, 아나타빈, 아나바신 및 미오스민으로부터 선택되는 하나 이상의 알칼로이드, 예컨대 2개 이상의 알칼로이드, 예컨대 3개 이상의 알칼로이드, 예컨대 4개 이상의 알칼로이드, 예컨대 5개 이상의 알칼로이드, 예컨대 모두 6개의 알칼로이드의 함량이 감소된다. 일부 구현예에서, 식물 또는 세포의 총 알칼로이드 함량은 조절된다. 일부 구현예에서, 총 알칼로이드 함량은 증가된다. 일부 구현예에서, 총 알칼로이드 함량은 증가된다.
일 구현예에서, 니코틴 함량은 실질적으로 감소되지 않으나, PON, 노르니코틴, 아나타빈, 아나바신 및 미오스민으로부터 선택되는 하나 이상의 알칼로이드의 함량은 조절된다.
일 구현예에서, 니코틴 함량은 실질적으로 감소되지 않으나, PON, 노르니코틴, 아나타빈 및 아나바신으로부터 선택되는 하나 이상의 알칼로이드의 함량은 조절된다. 적합하게는, 니코틴의 함량은 조절되지 않을 수 있으나, PON의 함량은 조절된다. 적합하게는, 니코틴 함량은 실질적으로 감소되지 않을 수 있으나, PON의 함량은 감소된다.
알칼로이드의 농도 및/또는 총 함량을 결정하기 위한 당업계에 공지된 임의의 방법이 사용될 수 있다. 알칼로이드 함량을 분석하기 위한 한 바람직한 방법은 가스 크로마토그래피-불꽃 이온화 검출 방법(GC-FID) 또는 탠덤 질량 분광법을 이용한 역상 고성능 액체 크로마토그래피(LC-MS/MS)에 의한 분석을 포함한다.
일 구현예에서, 식물(예를 들어, 타바코 식물) 또는 이의 일부, 식물 번식 물질(예를 들어, 타바코 식물 번식 물질), 세포(예를 들어, 타바코 세포), 잎(예를 들어, 타바코 잎), 수확된 잎(예를 들어, 수확된 타바코 잎), 절단된 수확된 잎(예를 들어, 절단된 수확된 타바코 잎), 가공된 잎(예를 들어, 가공된 담배 잎), 절단되고 가공된 잎(예를 들어, 절단되고 가공된 타바코 잎), 알칼로이드 함량이 조절된 본 발명의 식물에 의해 수득가득하거나 수득된 상기 식물 또는 이의 일부(예를 들어, 타바코 산업 제품) 또는 이의 조합물을 포함하는 생성물을 생성하는 방법으로서, 상기 식물을 변형하여 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 조절하는 것을 포함하는 방법이 제공된다. 조절된 알칼로이드 함량은 식물(예를 들어, 타바코 식물) 또는 이의 일부, 식물 번식 물질(예를 들어, 타바코 식물 번식 물질), 세포(예를 들어, 타바코 세포), 잎(예를 들어, 타바코 잎), 수확된 잎(예를 들어, 수확된 타바코 잎), 절단된 수확된 잎(예를 들어, 절단된 수확된 타바코 잎), 가공된 잎(예를 들어, 가공된 타바코 잎), 절단되고 가공된 잎(예를 들어, 절단되고 가공된 타바코 잎), 본 발명의 식물 또는 이의 일부를 포함하는 생성물, 예를 들어, 타바코 산업 제품, 또는 이들의 조합의 알칼로이드 함량을 유사한 생성물과 비교함으로써 결정될 수 있다.
적합하게는, 알칼로이드 함량은 식물, 예를 들어 타바코 식물, 예를 들어 변형된 타바코 식물에서 조절될 수 있다. 적합하게는, 알칼로이드 함량은 잎(예를 들어, 타바코 잎, 예를 들어 변형된 타바코 식물로부터의 타바코 잎)에서 조절될 수 있다. 적합하게는, 알칼로이드 함량은 수확된 잎(예를 들어, 변형된 타바코 식물로부터의 수확된 타바코 잎)에서 조절될 수 있다. 적합하게는, 알칼로이드 함량은 절단된 수확된 잎(예를 들어, 변형된 타바코 식물로부터의 절단된 수확된 타바코 잎)에서 조절될 수 있다. 적합하게는, 알칼로이드 함량은 가공된 잎(예를 들어, 가공된 타바코 잎, 예를 들어 변형된 타바코 식물의 가공된 타바코 잎)에서 조절될 수 있다. 적합하게는, 알칼로이드 함량은 절단되고 가공된 잎(예를 들어, 절단되고 가공된 타바코 잎, 예를 들어 변형된 타바코 식물로부터의 절단되고 가공된 타바코 잎)에서 조절될 수 있다. 적합하게는, 알칼로이드 함량은 경화된 잎(예를 들어, 변형된 타바코 식물로부터의 경화된 타바코 잎)에서 조절될 수 있다. 적합하게는, 알칼로이드 함량은 녹색 잎(예를 들어, 변형된 타바코 식물로부터의 녹색 타바코 잎)의 추출물에서 조절될 수 있다. 적합하게는, 알칼로이드 함량은 본 발명의 식물 또는 이의 일부를 포함하는 제품(예를 들어, 타바코 산업 제품, 예를 들어 변형된 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 생성된 타바코 산업 제품)에서 조절될 수 있다. 적합하게는, 알칼로이드 함량은 상기 제품 중 어느 하나 또는 이의 조합에서 조절될 수 있다. 적합하게는, 상기 기술된 알칼로이드 함량의 조절은 알칼로이드 함량의 증가일 수 있다. 적합하게는, 상기 기술된 알칼로이드 함량의 조절은 알칼로이드 함량의 감소(예를 들어, PON 함량의 감소)일 수 있다.
일 구현예에서, 노르니코틴, PON, 아나타빈 및 아나바신으로부터 선택되는 하나 이상의 알칼로이드의 함량이 감소된다. 일 구현예에서, PON의 함량이 감소된다. 일 구현예에서, 노르니코틴의 함량이 감소된다. 일 구현예에서, 아나타빈의 함량이 감소된다. 일 구현예에서, 아나바신의 함량이 감소된다.
일 구현예에서, 니코틴의 함량은 실질적으로 조절되지 않는다. 적합하게는, 상기 기술된 알칼로이드 함량의 조절은 노르니코틴, PON, 아나타빈 및 아나바신으로부터 선택된 하나 이상의 알칼로이드 함량의 감소일 수 있으나, 니코틴 함량의 감소는 아닐 수 있다.
일 구현예에서, 변형된 식물(예를 들어, 타바코 식물), 식물 번식 물질(예를 들어, 담배 식물 번식 물질), 잎(예를 들어, 타바코 잎), 수확된 잎(예를 들어, 수확된 타바코 잎), 절단된 수확된 잎(예를 들어, 절단된 수확된 타바코 잎), 가공된 잎(예를 들어, 가공된 타바코 잎), 절단되고 가공된 잎(예를 들어, 절단되고 가공된 타바코 잎) 또는 변형된 타바코 식물로부터의 담배 산업 제품의 니코틴 함량은 실질적으로 감소하지 않는다. 적합하게는, 니코틴 함량은 유사 생성물의 니코틴 함량의 적어도 85%(예컨대, 적어도 90%, 예컨대 적어도 95%, 예컨대 적어도 98%, 예컨대 적어도 99%)이다.
일 구현예에서, 식물(예를 들어, 타바코 식물) 또는 이의 일부의 알칼로이드 함량은, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하도록 변형되지 않으며, 유사한 성장 조건에서 성장한 식물(예를 들어, 타바코 식물) 또는 이의 일부의 알칼로이드 함량과 각각 비교할 경우 적어도 0.5, 1.5, 2, 3 또는 4배 조절될 수 있다. 적합하게는, 알칼로이드 함량은 약 0.5배 내지 약 4배 조절될 수 있다. 적합하게는, 알칼로이드 함량은 약 4배 조절될 수 있다. 적합하게는, 변형은 알칼로이드 함량의 증가 또는 감소일 수 있다. 적합하게는, 조절은 니코틴, 노르니코틴, PON, 아나타빈, 아나바신 및 미오스민으로부터 선택되는 하나 이상의 알칼로이드의 조절일 수 있다. 적합하게는, 조절은 니코틴, 노르니코틴, PON, 아나타빈 및 아나바신으로부터 선택되는 하나 이상의 알칼로이드의 조절일 수 있다. 적합하게는, 노르니코틴 함량이 감소될 수 있다. 적합하게는, PON 함량이 감소될 수 있다. 적합하게는, 아나타빈 함량이 감소될 수 있다. 적합하게는, 아나바신 함량이 감소될 수 있다.
본 발명의 일 구현예에서, 식물(예를 들어, 타바코 식물) 또는 이의 일부의 알칼로이드 함량은 본 발명에 따라 변형되지 않은 식물(예를 들어, 타바코 식물) 또는 이의 일부와 비교하여 적어도 1%, 2%, 5%, 8%, 10%, 12%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 100% 조절될 수 있다. 일 구현예에서, 알칼로이드 함량은 비변형된 식물 또는 이의 일부와 비교하여 적어도 30% 조절될 수 있다. 일 구현예에서, 알칼로이드 함량은 비변형된 식물 또는 이의 일부와 비교하여 적어도 40% 조절될 수 있다. 일 구현예에서, 알칼로이드 함량은 비변형된 식물 또는 이의 일부와 비교하여 적어도 50% 조절될 수 있다. 일 구현예에서, 알칼로이드 함량은 비변형된 식물 또는 이의 일부와 비교하여 적어도 60% 조절될 수 있다. 조절은 비변형된 식물(예를 들어, 타바코 식물) 또는 이의 일부와 비교할 경우 알칼로이드 함량의 증가 또는 감소일 수 있다.
적합하게는, 조절은 총 알칼로이드 함량의 조절일 수 있다. 적합하게는, 조절은 니코틴, 노르니코틴, PON, 아나타빈, 아나바신 및 미오스민으로부터 선택되는 하나 이상의 알칼로이드의 조절일 수 있다. 적합하게는, 조절은 노르니코틴, 니코틴, PON, 아나타빈 및 아나바신으로부터 선택되는 하나 이상의 알칼로이드의 조절일 수 있다. 적합하게는, 조절은 노르니코틴 함량의 감소와 같은 노르니코틴 함량의 조절일 수 있다. 적합하게는, 조절은 아나바신 함량의 감소와 같은 아나바신 함량의 조절일 수 있다. 적합하게는, 조절은 PON 함량의 감소와 같은 PON 함량의 조절일 수 있다. 적합하게는, 조절은 아나타빈 함량의 감소와 같은 아나타빈 함량의 조절일 수 있다.
적합하게는, 조절은 니코틴, 노르니코틴, PON, 아나타빈, 아나바신 및 미오스민으로부터 선택되는 하나 초과의 알칼로이드, 예컨대 2개 이상의 알칼로이드, 예컨대 3개 이상의 알칼로이드, 예컨대 4개 이상의 알칼로이드, 예컨대 5개 이상의 알칼로이드, 예컨대 모두 6개의 알칼로이드의 조절일 수 있다.
일부 구현예에서, 식물의 알칼로이드 함량은 약 5% 내지 약 100%, 약 10% 내지 약 90%, 약 20% 내지 약 80%, 약 30% 내지 약 70%, 약 40% 내지 60%, 약 40% 내지 50%, 또는 약 50% 내지 60% 조절될 수 있다.
타바코-특이적 니트로사민(TSNA) 함량
일 구현예에서, 본 발명은 식물(예를 들어, 타바코 식물) 또는 이의 일부에서 적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민(TSNA) 전구체의 함량을 감소시키는 방법을 제공한다. 적합하게는, 방법은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함할 수 있다. 일 구현예에서, 본 발명은 (예를 들어, 유사한 생성물과 비교하여) 감소된 TSNA 함량을 갖는 가공된 잎을 생성하는 방법을 제공한다. 감소된 TSNA 함량을 갖는 가공된 잎을 생성하는 방법은
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 감소시키거나 억제시킴으로써 식물을 변형시키는 단계;
상기 식물로부터 잎을 수확하는 단계; 및
상기 수확된 잎을 경화하는 단계를 포함할 수 있다.
TSNA는 가공된 타바코, 예를 들어 경화된 타바코 또는 재구성된 타바코에서 측정될 수 있다. 일 구현예에서, TSNA 함량은 경화된 타바코 식물 또는 이의 일부(예를 들어, 경화된 타바코 잎에서)에서 측정 및/또는 조정(예를 들어, 감소)된다.
본원에 사용된 바와 같은 용어 "타바코-특이적 니트로사민" 또는 "TSNA"는 당업계의 통상적인 의미를 가지며, 즉 타바코 산업 제품 또는 기타 니코틴-함유 제품에서만 발견되는 니트로사민을 의미한다. 적합하게는, 적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민은 4-(메틸니트로사미노)-1-(3-피리딜)-1-부타논(NNK), N'-니트로소노르니코틴(NNN), N'-니트로소아나타빈(NAT) 또는 N-니트로소아나바신(NAB)일 수 있다.
적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민과 관련하여 사용되는 경우 용어 "이에 대한 전구체"는 타바코-특이적 니트로사민의 형성을 발생시키거나 니트로소화 반응과 관련되어 타바코-특이적 니트로사민 생성으로 이어지는 타바코 식물의 하나 이상의 화학물질 또는 화합물을 나타낸다.
일 구현예에서, TSNA는 N'-니트로소노르니코틴(NNN), N'니트로소아나타빈(NAT), N'-니트로소아나바신(NAB) 및 4-(메틸 니트로사미노)-1-(3-피리딜)-1-부타논(NNK)로부터 선택되는 군 중 하나 이상일 수 있다. 적합하게는, 적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민은 NNK 또는 NNN일 수 있다. 일 구현예에서, 타바코-특이적 니트로사민은 NNK이다.
일 구현예에서, TSNA의 전구체는 노르니코틴, 아나바신, 아나타빈 및 니코틴의 산화된 유도체, 예컨대 슈도옥시니코틴(PON)으로부터 선택되는 군 중 하나 이상이다.
일 구현예에서, TSNA는 4-(메틸니트로사미노)-1-(3-피리딜)-1-부타논(NNK))이고/거나 전구체는 PON이다. 일 구현예에서, NNK의 함량은 감소된다. 일 구현예에서, PON의 함량은 감소된다. 일 구현예에서, NNK 및 PON의 함량은 감소된다.
일 구현예에서, TSNA는 N'니트로소노르니코틴(NNN)이고/거나 전구체는 노르니코틴이다.
일 구현예에서, TSNA는 N'니트로소아나타빈(NAT)이고/거나 전구체는 아나타빈이다.
일 구현예에서, TSNA는 N'-니트로소아나바신(NAB)이고/이거나 전구체는 아나바신이다.
TSNA의 전구체(예를 들어, NNK, NNN, NAB 및/또는 NAT)는 예를 들어 가공 전, 예를 들어 경화 전에 녹색 타바코 잎에서 측정될 수 있다. 일 구현예에서, TSNA의 전구체(예를 들어, NNK, NNN, NAB 및/또는 NAT)는 예를 들어 가공 전에, 예를 들어 경화 전에 녹색 타바코 잎에서 측정 및/또는 변형(예를 들어 감소)된다.
일 구현에에서, 본 발명의 방법 및/또는 사용을 수행하는 것은 본 발명에 따라 변형되지 않은 타바고 식물(또는 이의 일부)과 비교할 경우 변형된 타바코 식물(또는 이의 일부)에서 적어도 하나의 TSNA 또는 이에 대한 전구체의 감소를 발생시킨다.
용어 "적어도 하나의 TSNA 또는 이에 대한 전구체를 감소시키는" 또는 "적어도 하나의 TSNA 또는 이에 대한 전구체의 감소"는, 본 발명의 생성물, 방법 또는 용도에서 적어도 하나의 TSNA 또는 이에 대한 전구체의 농도 및/또는 총 함량이 유사한 생성물, 방법 또는 용도와 관련하여 낮아짐을 의미하는 것으로 본원에 사용된다. 예를 들어, 유사한 타바코 산업 제품은 본 발명에 따라 변형되지 않으며, 모든 다른 관련 특징(예를 들어, 식물 종, 성장 조건, 가공 타바코 방법 등)은 동일한 타바코 식물로부터 유래될 것이다.
적어도 하나의 TSNA 또는 이에 대한 전구체의 농도 및/또는 수준을 결정하기 위한 당업계에 공지된 임의의 방법이 사용될 수 있다. 특히, 이러한 방법은 중수소 표지된 내부 표준의 첨가, 수성 추출 및 여과를 포함할 수 있으며, 이어서 탠덤 질량 분광법(LC-MS/MS)을 이용한 역상 고성능 액체 크로마토그래피(LC-MS/MS)을 사용하는 분석법이 이용될 수 있다. 타바코-특이적 니트로사민에 대한 전구체의 농도 및/또는 수준을 결정하기 위한 한 예는 CORESTA 권장 방법 CRM-72: LC-MS/MS에 의한 타바코 및 타바코 생성물 중 타바코 특이적 니트로사민의 결정(CRM은 ISO/DIS 21766으로 개발중임) 또는 문헌 [Wagner et al. (2005) Analytical Chemistry 77(4), 1001-1006] (이들 모두는 본원에 인용으로 포함됨)에 상세히 설명된 것과 같은 방법을 포함한다.
적합하게는, 적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민 또는 이에 대한 전구체의 농도 및/또는 총 함량은 본 발명의 방법 및/또는 용도를 수행함으로써 감소될 수 있다. 적합하게는, 적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민 또는 이에 대한 전구체의 농도 및/또는 수준은 본 발명에 따라 변형되지 않은 타바코 식물에서 적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민(들) 또는 이에 대한 전구체의 농도 및/또는 수준과 비교할 경우 본 발명의 타바코 식물(예를 들어, 본 발명의 방법 및/또는 용도에 의해 수득가능하거나 수득됨)에서 감소될 수 있다.
적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민(들) 또는 이에 대한 전구체의 농도 및/또는 총 함량은 본 발명에 따라 변형되지 않은 타바코 식물(또는 타바코 식물의 일부 또는 타바코 세포 배양물)로부터 수득가능하거나 수득된 타바코 잎, 수확된 잎, 가공된 타바코 잎, 타바코 산업 제품 또는 이의 조합과 비교할 경우 본 발명의 타바코 식물(또는 타바코 식물의 일부 또는 타바코 세포 배양물)로부터 수득가능하거나 수득되는 타바코 잎, 수확된 잎, 가공된 타바코 잎, 타바코 산업 제품 또는 이의 조합에서 감소될 수 있다.
적합하게는, 적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민 또는 이에 대한 전구체의 농도 및/또는 총 함량은 가공된 타바코 잎에서 감소될 수 있다.
적합하게는, 적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민 또는 이에 대한 전구체의 농도 및/또는 수준은 타바코 산업 제품에서 감소될 수 있다.
일 구현예에서, 적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민 또는 이에 대한 전구체는 적어도 약 1%, 적어도 약 3%, 적어도 약 5%, 적어도 약 10%, 적어도 약 20%, 적어도 약 30%, 적어도 약 40% 또는 적어도 약 50% 감소될 수 있다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민 또는 이에 대한 전구체는 약 5% 내지 약 50%, 약 10% 내지 약 50%, 약 20% 내지 약 50%, 약 30% 내지 약 50% 또는 약 40% 내지 50% 감소될 수 있다.
가공된(예를 들어, 경화된) 타바코 잎(예를 들어, 경화되거나 재구성됨)과 관련하여, 적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민 또는 이에 대한 전구체는 약 5000 ng/g 내지 약 50 ng/g, 약 4000 ng/g 내지 약 100 ng/g, 약 3000 ng/g 내지 500 ng/g 또는 2000 ng/g 내지 1000 ng/g 감소될 수 있다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 타바코-특이적 니트로사민 또는 이에 대한 전구체는 적어도 약 5000 ng/g, 적어도 약 4000 ng/g, 적어도 약 3000 ng/g, 적어도 약 2000 ng/g, 적어도 약 1000 ng/g, 적어도 약 500 ng/g, 적어도 약 100 ng/g 또는 적어도 약 50 ng/g 감소될 수 있다.
바이오매스 생성
일부 경우에, 높은 알칼로이드 수준, 예를 들어 높은 수준의 니코틴 함량을 갖는 식물 또는 바이오매스를 생성하여 예를 들어, 니코틴이 액체 함유 니코틴(예를 들어, e-담배)을 사용하는 장치 또는 타바코 가열 장치를 사용에 사용하기 위한 순수한 니코틴 생성물을 생성하도록 정제될 수 있는 것이 바람직할 수 있다. 예를 들어, 이러한 방식의 니코틴 생성은 e-담배용 e-액체의 생성을 위한 니코틴 추출 비용을 줄일 수 있다.
일 양태에서, 본 발명은 바이오매스를 생성하기 위한 조건 하에 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 조절(예를 들어, 증가)하도록 조작된 세포를 성장시키는 것을 포함하는 바이오매스를 생성하는 방법을 제공한다. 적합하게는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성 또는 발현은 농도 및/또는 총 니코틴 함량을 증가시키기 위해 증가될 수 있다.
일 구현예에서, 본 발명은 니코틴의 변형된(예를 들어, 증가된) 농도 및/또는 총 함량을 갖는 바이오매스를 생성하는 방법으로서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하거나; BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 증가시키도록 조작된 세포를 성장시키는 것을 포함하는 방법을 제공한다.
세포는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조정하기 위해 당업계에 공지된 임의의 방법에 의해 조작될 수 있다. 적합하게는, 세포는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 외인성 유전자를 발현하도록 조작될 수 있다. 적합하게는, 세포는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자를 과발현하도록 조작될 수 있다. 적합하게는, 세포는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 감소하도록 조작될 수 있다.
적합하게는, 바이오매스는 본 발명에 따라 변형되지 않은 유사한 세포에 의해 생성된 바이오매스와 비교하여 더 높은 농도 및/또는 총 함량의 니코틴을 함유할 수 있다.
적합하게는, 바이오매스 생성에 사용하기 위한 세포는 식물 세포, 예컨대 타바코 세포일 수 있다.
적합하게는, 바이오매스 생성에 사용하기 위한 세포는 효모 세포일 수 있다.
일 구현예에서, 세포(예를 들어, 효모 세포)는 니코틴성 알칼로이드 생합성을 증가시키는 하나 이상의 서열을 포함하도록 추가로 변형될 수 있다. 적합하게는, 이들 하나 이상의 서열은 세포(예를 들어, 효모 세포) 형질전환에 적합한 핵산 작제물에 혼입될 수 있다. 하나 이상의 서열은 세포(예를 들어, 효모 세포)에서 과발현될 수 있다. 서열은 하기 유전자 중 하나 이상으로부터 선택될 수 있다: MPO (또는 메틸푸트레신 옥시다제 또는 MPO1 또는 MPO2); A622 (또는 이소플라본 환원효소-유사 단백질 또는 이소플라본 환원효소 동족체 또는 이소플라본 환원효소-유사 단백질); BBL (또는 베르베린 브릿지 효소 또는 베르베린 브릿지 효소-유사 또는 BBE 또는 NBB1); PMT(또는 푸트레신 N-메틸트랜스퍼라제 또는 푸트레신 메틸트랜스퍼라제 또는 S-아데노실-L-메티오닌:푸트레신 N-메틸트랜스퍼라제 또는 PMT 또는 PMT1 또는 PMT2 또는 PMT3 또는 PMT4) 및 QPT(또는 퀴놀리네이트 포스포리보실트랜스퍼라제). 일 구현예에서, 서열은 하기 유전자 중 하나 이상으로부터 선택될 수 있다: BBL, A622, PMT 및 MPO (MPO1 또는 MPO2). 이러한 방식의 변형에 적합한 유전자는 예를 들어, 본원에 인용으로 포함되는 US2016032299에 교시될 수 있다.
상업적으로 바람직한 특성
일 구현예에서, 본 발명의 식물은 조정(즉, 증가 또는 감소)된 총 알칼로이드 함량 및/또는 조정(즉, 증가 또는 감소)된 하나 이상의 알칼로이드의 함량을 갖는 반면, 풍미 특성 및/또는 기타 상업적으로 바람직한 특성이 적어도 유지된다. 적합하게는, 본 발명의 식물은 감소된 총 알칼로이드 함량 및/또는 하나 이상의 알칼로이드의 감소된 함량을 갖는 반면, 풍미 특성 및/또는 기타 상업적으로 바람직한 특성은 적어도 유지된다.
일 구현예에서, 본 발명의 식물은 본 발명에 따라 변형되지 않은 식물과 유사한 등급 및/또는 품질의 잎을 생성한다.
일 구현예에서, 본 발명의 식물은 (예를 들어, 본 발명에 따라 변형되지 않은 동일한 식물과 비교하여) 식물의 풍미 특성에 현저한 변화 없이 감소된 노르니코틴 및/또는 PON 및/또는 아나바신 및/또는 아나타빈 함량을 갖는다.
일 구현예에서, 본 발명의 식물은 (예를 들어, 본 발명에 따라 변형되지 않은 동일한 식물과 비교하여) 니코틴 함량의 현저한 변화 없이 감소된 총 알칼로이드 함량을 갖는다. 일 구현예에서, 본 발명의 식물은 (예를 들어, 본 발명에 따라 변형되지 않은 동일한 식물과 비교하여) 니코틴 함량의 현저한 변화 없이 감소된 노르니코틴 및/또는 PON 및/또는 아나바신 및/또는 아나타빈 함량을 갖는다.
적합하게는, 본 발명에 따른 식물의 니코틴 함량은 (예를 들어, 본 발명에 따라 변형되지 않은 동일한 식물과 비교하여) 유사한 식물에 존재하는 니코틴 함량의 적어도 85%이다. 적합하게는, 본 발명에 따른 식물의 니코틴 함량은 유사한 식물에 존재하는 니코틴 함량의 적어도 90%이다. 적합하게는, 본 발명에 따른 식물의 니코틴 함량은 유사한 식물에 존재하는 니코틴 함량의 적어도 95%이다. 적합하게는, 본 발명에 따른 식물의 니코틴 함량은 유사한 식물에 존재하는 니코틴 함량의 적어도 98%이다. 적합하게는, 본 발명에 따른 식물의 니코틴 함량은 유사한 식물에 존재하는 니코틴 함량의 적어도 99%이다.
일 구현예에서, 본 발명의 식물은 (예를 들어, 본 발명에 따라 변형되지 않은 동일한 식물과 비교하여) 식물의 다른 상업적으로 바람직한 특성에서 현저한 변화(예를 들어, 감소) 없이 감소된 TSNA 전구체 함량을 갖는다. 특히, 변형된 식물의 수율은 바람직하게는 본 발명에 따라 변형되지 않은 동일한 식물과 비교하여 감소되지 않는다.
따라서, 일 구현예에서, 본 발명의 방법 및 용도는 TSNA 전구체 함량을 감소시키면서 풍미 특성 및/또는 다른 상업적으로 바람직한 특성(예를 들어, 수율)은 유지시키는 것에 관한 것이다.
본원에 사용된 바와 같은 용어 "상업적으로 바람직한 특성"은 수율, 성숙한 식물 높이, 수확 가능한 잎 수, 평균 마디 길이, 절단 잎 길이, 절단 잎 너비, 품질(예를 들어, 잎 품질, 적절하게 경화된 잎 품질), 비생물적(예를 들어, 가뭄) 스트레스 내성, 제초제 내성 및/또는 생물학적(예를 들어, 곤충, 박테리아 또는 진균류) 스트레스 내성과 같은 특성을 포함할 것이다.
잎 품질은 예를 들어, 미국 농무부(USDA) 등급 및 표준에 따라 경화된 잎의 색상, 질감 및 향을 기준으로 측정될 수 있다.
타바코 등급은 비제한적으로, 잎자루 위치, 잎 크기, 잎 색깔, 잎 균일성 및 온전성, 성숙도, 질감, 탄력성, 광택(잎의 색상의 강도 및 깊이는 물론 광택과 관련됨), 흡습성(타바코 잎이 주변 습기를 흡수하고 유지하는 능력), 및 녹색 뉘앙스 또는 캐스트를 포함하는 인자를 기반으로 하여 평가된다.
잎 등급은 예를 들어, 미국 농무부(7 U.S.C. §511)의 농업 마케팅 서비스(Agricultural Marketing Service)에서 발행한 공식 표준 등급(Official Standard Grade)을 사용하여 당업계에 알려진 표준 방법을 사용하여 결정될 수 있다. 예를 들어, 1990년 11월 5일 발효된 벌리 타바코(Burley Tobacco)의 공식 표준 등급(미국 유형 31 및 외국 유형 93)(55 F.R. 40645); 1989년 3월 27일 발효된 연도 경화된 타바코에 대한 공식 표준 등급(미국 유형 11, 12, 13, 14 및 외국 유형 92) (54 F.R. 7925); 1965년 1월 8일 발효된 펜실바니아 시드리프 타바코(Pennsylvania Seedleaf Tobacco)의 공식 표준 등급(미국 유형 41)(29 F.R. 16854); 1963년 12월 8일 발효된 오하이오 시가-리프 타바코(Ohio Cigar-Leaf Tobacco)의 공식 표준 등급(미국 유형 42, 43 및 44)(28 F.R. 11719 및 28 F.R. 11926); 1969년 11월 20일 발효된 위스콘신 시가-바인더 타바코(Wisconsin Cigar-Binder Tobacco)의 공식 표준 등급(미국 유형 54 및 55)(34 F.R. 17061); 1969년 11월 20일 발효된 위스콘신 시가-바인더 타바코의 공식 표준 등급(미국 유형 54 및 55)(34 F.R. 17061); 1971년 4월 발효된 조지아 및 플로리다 쉐이드그로운 시가-랩퍼 타바코(ShadeGrown Cigar-Wrapper Tobacco)의 공식 표준 등급(미국 유형 62) 참조. USDA 등급 지수 값은 업계에서 허용되는 등급 지수에 따라 결정될 수 있다. 예를 들어, 문헌 [Bowman et al. (1988) Tobacco Science, 32:39-40; Legacy Tobacco Document Library (Bates Document #523267826-523267833, July 1, 1988, Memorandum on the Proposed Burley Tobacco Grade Index); and Miller et al. (1990) Tobacco Intern., 192:55-57] 참조(위의 모든 인용은 그 전체가 본원에 인용됨).
일 양태에서, USDA 등급 지수는 수신된 연방 등급의 0-100 수치 표현이고, 모든 줄기 위치의 가중 평균이다. 더 높은 등급 지수는 더 높은 품질을 나타낸다. 대안적으로, 잎 등급은 하이퍼-스펙트럼 이미징을 통해 결정될 수 있다. 예를 들어, WO 2011/027315(본원에 인용으로 포함됨) 참조.
일 구현예에서, 본 발명의 타바코 식물은 상업적으로 허용되는 등급의 타바코를 제공한다.
적합하게는, 본 발명의 타바코 식물은 상업적으로 허용되는 등급의 경화된 타바코를 제공한다.
일 구현예에서, 본 발명의 타바코 식물은 유사한 성장 조건에서 성장할 경우 유사한 식물의 잎의 USDA 등급 지수의 적어도 약 70%의 USDA 등급 지수 값을 갖는 잎을 생성할 수 있다. 적합하게는, 본원에 개시된 타바코 식물은 유사한 성장 조건에서 성장하는 경우 대조군 식물의 USDA 등급 지수 값의 적어도 약 65%, 적어도 약 70%, 적어도 약 75%, 적어도 약 80%, 적어도 약 85%, 적어도 약 90%, 적어도 약 95%, 또는 적어도 약 98%의 USDA 등급 지수 값을 갖는 잎을 생성할 수 있다. 적합하게는, 본원에 개시된 타바코 식물은 유사한 식물의 USDA 등급 지수 값의 65% 내지 130%, 70% 내지 130%, 75% 내지 130%, 80% 내지 130%, 85% 내지 130%, 90% 내지 130%, 95% 내지 130%, 100% 내지 130%, 105% 내지 130%, 110% 내지 130%, 115% 내지 130%, 또는 120% 내지 130%의 USDA 등급 지수 값을 갖는 잎을 생성할 수 있다.
일 양태에서, 본 발명의 타바코 식물은 적어도 50의 USDA 등급 지수 값을 갖는 잎을 생성할 수 있다. 적합하게는, 본원에 개시된 타바코 식물은 55 이상, 60 이상, 65 이상, 70 이상, 75 이상, 80 이상, 85 이상, 90 이상 및 95 이상의 USDA 등급 지수 값을 갖는 잎을 생성할 수 있다.
달리 명시되지 않는 한, 본원에 사용된 타바코 수율은 표준 농경학적 및 양생 관행에 따른 표준 현장 조건 하에 에이커 당 경화된 담배 잎의 중량을 기준으로 하여 계산된 경화된 잎 수율을 나타낸다.
일 양태에서, 본 발명의 식물(예를 들어, 타바코 식물)은 유사한 현장 조건에서 성장한 경우 유사한 식물의 수율의 50% 내지 150%, 55% 내지 145%, 60% 내지 140%, 65% 내지 135%, 70% 내지 130%, 75% 내지 125%, 80% 내지 120%, 85% 내지 115%, 90% 내지 110%, 95% 내지 105%, 50% 내지 100%, 55% 내지 100%, 60% 내지 100%, 65% 내지 100%, 70% 내지 100%, 75% 내지 100%, 80% 내지 100%, 85% 내지 100%, 90% 내지 100%, 95% 내지 100%, 100% 내지 150%, 105% 내지 150%, 110% 내지 150%, 115% 내지 150%, 120% 내지 150%, 125% 내지 150%, 130% 내지 150%, 135% 내지 150%, 140% 내지 150%, 또는 145% 내지 150%의 수율을 갖는다.
또 다른 양태에서, 본 발명의 식물(예를 들어, 담배 식물) 수율은 유사한 현장 조건에서 성장할 경우 유사한 식물의 수율의 약 1.5, 1.6, 1.7, 1.8, 1.9, 2.0, 2.1, 2.2, 2.3, 2.4, 2.5, 2.6, 2.7, 2.8, 2.9 또는 3.0배이다.
또 다른 양태에서, 본 발명의 타바코 식물의 수율은 유사한 현장 조건에서 성장할 경우 연도 경화된 유사한 식물의 수율과 유사하다.
일 양태에서, 본 발명의 타바코 식물은 약 1200 내지 3500, 1300 내지 3400, 1400 내지 3300, 1500 내지 3200, 1600 내지 3100, 1700 내지 3000, 1800 내지 2900, 1900 내지 2800, 2000 내지 2700, 2100 내지 2600, 2200 내지 2500, 및 2300 내지 2400 lbs/acre로 구성된 군으로부터 선택되는 수율을 제공한다.
또 다른 양태에서, 본 발명의 타바코 식물은 약 1200 내지 3500, 1300 내지 3500, 1400 내지 3500, 1500 내지 3500, 1600 내지 3500, 1700 내지 3500, 1800 내지 3500, 1900 내지 3500, 2000 내지 3500, 2100 내지 3500, 2200 내지 3500, 2300 내지 3500, 2400 내지 3500, 2500 내지 3500, 2600 내지 3500, 2700 내지 3500, 2800 내지 3500, 2900 내지 3500, 3000 내지 3500, 및 3100 내지 3500 lbs/acre로 구성된 군으로부터 선택된 수율을 제공한다.
추가 양태에서, 본 발명의 타바코 식물은 약 1200 내지 3500, 1200 내지 3400, 1200 내지 3300, 1200 내지 3200, 1200 내지 3100, 1200 내지 3000, 1200 내지 2900, 1200 내지 2800, 1200 내지 2700, 1200 내지 2600, 1200 내지 2500, 1200 내지 2400, 1200 내지 2300, 1200 내지 2200, 1200 내지 2100, 1200 내지 2000, 1200 내지 1900, 1200 내지 1800, 1200 내지 1700, 1200 내지 1600, 1200 내지 1500, 및 1200 내지 1400 lbs/acre로 구성된 군으로부터 선택되는 수율을 제공한다.
식물 육종
일 구현예에서, 본 발명은 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 전구체의 조정된 함량 및/또는 조정된 알칼로이드 함량을 갖는 식물을 생성하는 방법으로서:
a. 조정된 니코틴 함량 및/또는 조정된 함량의 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 전구체를 갖는 도너 식물을, 조정된 니코틴 함량 또는 조정된 함량의 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 전구체를 갖지 않으며, 상업적으로 바람직한 특성을 갖는 수령체 타바코 식물과 교배하는 단계로서, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현이 본 발명에 따른 도너 식물에서 조절되는, 단계;
b. 상기 수령체 식물과 교배된 상기 도너 식물의 자손으로부터 유전자 물질을 분리하는 단계; 및
c. i. a에서 정의된 단백질을 인코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열에서 돌연변이를 포함하는 유전자이입된 영역을 확인하는 것을 포함하는, 분자 마커를 이용하여 분자 마커 보조된 선택을 수행하는 단계를 포함하는 방법을 제공한다.
적합하게는, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하는 단백질; 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열에 의해 인코딩된 단백질의 활성 또는 발현이 유사한 식물과 비교할 경우 도너 식물에서 조절된다.
분자 마커 보조된 선택은 PCR을 수행하여 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28로서 제시된 아미노산 서열 또는 이에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질의 활성 또는 발현을 조절하는 돌연변이를 포함하는 교배된 핵산 서열을 확인하는 것을 포함할 수 있다.
식물
일 구현예에서, 본 발명은 식물, 또는 이의 일부 또는 식물 세포에서 알칼로이드 함량을 조절하는(예를 들어, 감소시키는) 방법에 관한 것이다.
본 발명에 따른 적합한 식물은 예를 들어, 짐슨 잡초, 가지, 맨드레이크, 데들리 나이트쉐이드(deadly nightshade)(벨라돈나(belladonna)), 캅시쿰(capsicum)(파프리카, 칠리 페퍼), 감자 및 타바코를 포함하는 가지과 식물을 포함한다.
일 구체예에서, 솔라나세애(Solanaceae)의 적합한 속은 니코티아나, 예를 들어, 니코티아나 타바쿰 또는 니코티아나 루스티카이다.
니코티아나의 적합한 종은 니코티아나 타바쿰일 수 있다. 니코티아나의 종은 본원에서 타바코 식물 또는 단순히 타바코로서 지칭될 수 있다.
타바코 식물
본 발명은 식물(예를 들어, 타바코 식물) 뿐만 아니라 세포(예를 들어, 타바코 세포)에 관한 방법, 용도, 식물(예를 들어, 타바코 식물) 및 식물 번식 물질을 제공한다.
본원에 사용된 바와 같은 용어 "타바코 식물"은 타바코 산업 제품의 생성에 사용되는 니코티아나 속의 식물을 나타낸다. 적합한 "타바코" 식물의 비제한적 예는 N. 타바쿰 및 N. 루스티카(N. rustica)(예를 들어, N. 타바쿰 L., LA B21, LN KY171, Tl 1406, Basma, Galpao, Perique, Beinhart 1000-1 및 Petico)를 포함한다.
일 양태에서, 본 발명에 따른 타바코 식물은 비-천연 발생 타바코 식물이다. 적합하게는, 타바코 식물은 돌연변이, 비-천연 발생 타바코 식물일 수 있다. 적합하게는, 타바코 식물은 유전자전이 타바코 식물일 수 있다.
일 양태에서, 본 발명에 따른 타바코 식물은 본원에 정의된 바와 같은 적어도 하나의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성 또는 발현을 조절(예를 들어, 감소)하는 비-천연 발생 돌연변이를 포함한다. 적합하게는, 타바코 식물은 도입된 돌연변이를 포함할 수 있다.
타바코 물질은 벌리 변종(Burley variety), 연도 또는 브라이트 변종 및 다크 변종으로 일반적으로 알려진 니코티아나 타바쿰 유형의 변종으로부터 유래되거나 수득될 수 있다. 일부 구현예에서, 타바코 물질은 벌리, 버지니아 또는 다크 타바코 식물로부터 유래된다. 타바코 식물은 벌리 타바코, 희귀 타바코, 특수 타바코, 확장 타바코 등으로부터 선택될 수 있다.
적합하게는, 식물은 니코티아나 벤타미아나(Nicotiana benthamiana)일 수 없다.
타바코 품종 및 엘리트 타바코 품종의 사용이 또한 본원에서 고려된다. 따라서, 본원에 사용하기 위한 타바코 식물은 타바코 변종 또는 엘리트 타바코 품종일 수 있다. 특히 유용한 니코티아나 타바쿰 변종은 연도-경화된 버지니아 유형, 벌리 유형 및 오리엔탈 유형을 포함한다.
일부 구현예에서, 타바코 식물은 예를 들어, 하기 변종 중 하나 이상으로부터 선택될 수 있다: L. cultivar(컬티바르) T.I. 1068, AA 37-1, B 13P, Xanthi(잔티) (미첼-모르(Mitchell-Mor)), KT D#3 하이브리드 107, Bel-W3, 79-615, 삼순 홀메스(Samsun Holmes) NN, 크로스 BU21 x 호야 파라도(Hoja Parado)로부터의 F4, 라인 97, KTRDC#2 하이브리드 49, KTRDC#4 하이브리드 1 10, 벌리(Burley) 21, PM016, KTRDC#5 KY 160 SI, KTRDC#7 FCA, KTRDC#6 TN 86 SI, PM021, K 149, K 326, K 346, K 358, K 394, K 399, K 730, KY 10, KY 14, KY 160, KY 17, KY 8959, KY 9, KY 907, MD 609, McNair 373, NC 2000, PG 01, PG 04, P01, P02, P03, RG 11, RG 17, RG 8, 스파이트(Speight) G-28, TN 86, TN 90, VA 509, AS44, 반케트(Banket) A1, 바스마 드라마(Basma Drama) B84/31, 바스마 I 지크나(Basma I Zichna) ZP4/B, 바스마 잔티 BX 2A, 바테크(Batek), 베수키 젬버(Besuki Jember), C104, 코커(Coker) 319, 코커 347, 크리올로 미시오네로(Criollo Misionero), PM092, 델크레스트(Delcrest), 드제벨(Djebel) 81, DVH 405, 갈파오 코뭄(Galpao Comum), HB04P, 힉스 브로드리프(Hicks Broadleaf), 카바쿠락 엘라스소나(Kabakulak Elassona), PM102, 쿠트세이지(Kutsage) E1 , KY 14 x L8, KY 171, LA BU 21, McNair 944, NC 2326, NC 71, NC 297, NC 3, PVH 03, PVH 09, PVH 19, PVH 21 10, 레드 러시안(Red Russian), 삼순, 사플락(Saplak), 심마바(Simmaba), 탈가르(Talgar) 28, PM132, 위슬리카(Wislica), 야얄닥(Yayaldag), NC 4, TR 마돌(TR Madole), 프릴렙(Prilep) HC-72, 프릴렙 P23, 프릴렙 PB 156/1, 프릴렙 P12-2/1, 야카(Yaka) JK-48, 야카 JB 125/3, TI-1068, KDH-960, TI-1070, TW136, PM204, PM205, 바스마, TKF 4028, L8, TKF 2002, TN 90, GR141, 바스마 잔티, GR149, GR153 및 페티트 하바나(Petit Havana).
변종 또는 품종의 비제한적인 예는 다음과 같다: BD 64, CC 101, CC 200, CC 27, CC 301, CC 400, CC 500, CC 600, CC 700, CC 800, CC 900, 코커(Coker) 176, 코커 319, 코커 371 골드, 코커 48, CD 263, DF911, DT 538 LC, 갈파오 타바코(Galpao tobacco), GL 26H, GL 350, GL 600, GL 737, GL 939, GL 973, HB 04P, HB 04P LC, HB3307PLC, 하이브리드 403LC, 하이브리드 404LC, 하이브리드 501 LC, K 149, K 326, K 346, K 358, K394, K 399, K 730, KDH 959, KT 200, KT204LC, KY10, KY14, KY 160, KY 17, KY 171, KY 907, KY907LC, KTY14xL8 LC, 리틀 크리텐덴(Little Crittenden), McNair 373, McNair 944, msKY 14xL8, 내로우 리프 마돌(Narrow Leaf Madole), 내로우 리프 마돌 LC, NBH 98, N-126, N-777LC, N-7371 LC, NC 100, NC 102, NC 2000, NC 291, NC 297, NC 299, NC 3, NC 4, NC 5, NC 6, NC7, NC 606, NC 71, NC 72, NC 810, NC BH 129, NC 2002, 닐 스미스 마돌(Neal Smith Madole), OXFORD 207, PD 7302 LC, PD 7309 LC, PD 7312 LC 'Periq'e' 타바코, PVH03, PVH09, PVH19, PVH50, PVH51, R 610, R 630, R 7-11, R 7-12, RG 17, RG 81, RG H51, RGH 4, RGH 51, RS 1410, 스파이트 168, 스파이트 172, 스파이트 179, 스파이트 210, 스파이트 220, 스파이트 225, 스파이트 227, 스파이트 234, 스파이트 G-28, 스파이트 G-70, 스파이트 H-6, 스파이트 H20, 스파이트 NF3, Tl 1406, Tl 1269, TN 86, TN86LC, TN 90, TN 97, TN97LC, TN D94, TN D950, TR (톰 로슨(Tom Rosson)) 마돌, VA 309, VA359, AA 37-1, B 13P, 잔티 (미첼-모르), Bel-W3, 79-615, 삼순 홀메스 NN, KTRDC 넘버 2 하이브리드 49, 벌리 21 , KY 8959, KY 9, MD 609, PG 01, PG 04, P01, P02, P03, RG 11, RG 8, VA 509, AS44, 반케트 A1, 바스마 드라마 B84/31, 바스마 I 지크나 ZP4/B, 바스마 잔티 BX 2A, 바테크, 베수키 젬버, C104, 코커 347, 크리올로 미시오네로, 델크레스트, 드제벨 81, DVH 405, 갈파오 코뭄, HB04P, 힉스 브로드리프, 카바쿠락 엘라스소나, 쿠트세이지 E1, LA BU 21, NC 2326, NC 297, PVH 21 10, 레드 러시안, 삼순, 사플락, 심마바, 탈가르 28, 위슬리카, 야얄닥, 프릴렙 HC-72, 프릴렙 P23, 프릴렙 PB 156/1, 프릴렙 P12-2/1 , 야카 JK-48, 야카 JB 125/3, TI-1068, KDH-960, Tl-1070, TW136, 바스마, TKF 4028, L8, TKF 2002, GR141, 바스마 잔티, GR149, GR153, 페티트 하바나. 본원에서 구체적으로 확인되지 않더라도 상기의 낮은 컨버터 아변종이 또한 고려된다.
타바코 식물은 벌리, 연도-경화된 버지니아 또는 오리엔탈일 수 있다.
일 구현예에서, 식물 번식 물질은 본 발명의 식물(예를 들어, 타바코 식물)로부터 수득가능할 수 있다.
본원에 사용된 바와 같은 "식물 번식 물질"은 추가의 식물이 생성될 수 있는 식물로부터 취해진 임의의 식물 물질을 나타낸다. 적합하게는, 식물 번식 물질은 종자, 식물 캘리(calli) 및 식물 덩어리로부터 선택될 수 있다. 적합하게는, 식물 번식 물질은 종자일 수 있다. 적합하게는, 식물 번식 물질은 식물 캘리일 수 있다. 적합하게는, 식물 번식 물질은 식물 무리일 수 있다.
일 구현예에서, 세포(예를 들어, 타바코 세포), 타바코 식물 및/또는 식물 번식 물질은 본 발명에 따른 방법에 의해 수득가능할 수 있다(예를 들어, 수득될 수 있다).
적합하게는, 본 발명에 따른 타바코 식물은 비변형된 타바코 식물과 비교할 경우 조절(예를 들어, 감소)된 니코틴 함량을 가질 수 있으며, 여기서 타바코 식물은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절(예를 들어, 감소)하도록 변형되었다.
적합하게는, 본 발명에 따른 타바코 식물은 비변형된 타바코 식물과 비교할 경우 조절(예를 들어, 감소)된 함량의 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 전구체를 가질 수 있으며, 여기서 타바코 식물은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절(예를 들어, 증가)하도록 변형되었다.
일 구현예에서, 본 발명에 따른 타바코 식물은 본 발명의 타바코 세포를 포함한다.
또 다른 구현예에서, 식물 번식 물질은 본 발명의 타바코 식물로부터 수득가능할 수 있다(예를 들어, 수득될 수 있다).
일 구현예에서, 타바코 식물을 육종하기 위해 본원에 기술된 바와 같은 타바코 식물의 용도가 제공된다.
본 발명은 또한 또 다른 구현예에서 타바코 산업 제품의 생성을 위한 상기 구현예의 타바코 식물의 용도를 제공한다.
또 다른 구현예에서, 작물을 재배하기 위한 본 발명의 타바코 식물의 용도가 제공된다.
일 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 조절된 활성 또는 발현을 갖는 세포, 예컨대 식물 세포, 예컨대 타바코 식물 세포가 제공된다. 적합하게는, 세포는 비-천연 발생 세포일 수 있다. 적합하게는, 세포는 돌연변이 세포일 수 있다. 적합하게는, 세포는 비-천연 발생 돌연변이 세포일 수 있다. 예를 들어, 세포는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하는(예를 들어, 감소시키는) 비-천연 발생 돌연변이를 포함할 수 있다.
일 구현예에서, 타바코 산업 제품의 생성을 위한 상기 구현예에서 제공된 바와 같은 세포의 사용이 제공된다.
일 구현예에서, 본 발명은 세포 배양물(예를 들어, 시험관내 배양물)을 제공한다.
타바코 세포 배양물은 세포 현탁 배양물일 수 있다. 시험관내 배양된 이들 세포는 예를 들어, 통상적인 타바코 입자, 조각, 미세 절단 또는 긴 절단 타바코 박판에 대한 대체물로서, 활성 성분으로서, 또는 대체물 및 첨가제 둘 모두로서 타바코 산업 제품에 포함될 수 있다. 적합하게는, 세포 배양물은 니코틴을 생성할 수 있다.
일 구현예에서, 타바코 산업 제품의 생성을 위한 본 발명에 따른 세포 배양물, 예를 들어 수확되고/거나 가공된 세포 배양물의 용도가 제공된다.
시험관내 배양물로부터 수확된 타바코 세포는 예를 들어, 분말을 생성하기 위해 건조, 예를 들어 동결-건조될 수 있다.
일 구현예에서, 세포 배양물은 타바코 세포 배양물이다. 당업자는 타바코 세포의 시험관내 배양물을 확립하기 위한 공지된 방법을 알고 있을 것이다. 단지 예로서, 다음과 같은 방법이 이용될 수 있다: 관심 타바코 식물에서 종자를 수집하고 원치 않는 유기체를 제거하기 위해 종자 외부를 살균하고, 관심 타바코 식물을 재배하기 위해 상기 종자를 심고, 외식편으로서 사용하기 위한 타바코 식물(예를 들어, 타바코 줄기)로부터 조직을 제거하고, 타바코 외식편으로부터 캘러스 배양물을 학립하고, 칼루스 배양물로부터 세포 현탁 배양물을 확립하고, 배양 물질(예를 들어, 타바코 세포 포함)을 수확하여 타바코 세포 배양물을 생성하기.
타바코 세포는 여과, 예를 들어 진공 여과를 포함하는 다양한 방법에 의해 수확될 수 있다. 샘플은 물을 추가로하여 필터에서 세척될 수 있으며, 잔여 액체는 여과, 예를 들어 진공 여과로 제거될 수 있다.
수확된 타바코 세포 배양물은 추가로 가공될 수 있으며, 예를 들어, 건조, 예컨대 공기-건조 및/또는 동결-건조될 수 있다. 수확된 타바코 세포 배양물 또는 건조된 수확된 타바코 세포 배양물 또는 이로부터의 추출물은 본 발명에 따른 타바코 산업 제품에 혼입될 수 있다.
일 구현예에서, 본 발명은 분자 농업에 사용하기 위한 식물(예를 들어, 타바코 식물) 또는 이의 일부를 제공한다. 적합하게는, 본 발명에 따라 변형된 식물 또는 이의 일부가 예컨대, 치료제, 예를 들어 항생제, 바이러스 유사 입자, 기능식품 또는 소분자와 같은 단백질의 제조에 사용될 수 있다.
일 구현예에서, 본 발명은 단백질(예를 들어, 치료학적 단백질)의 생성을 위한 방법으로서, SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 제시된 바와 같은 아미노산 서열, 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 갖거나; BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자가 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 핵산 서열을 포함하는, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써 상기 단백질(예를 들어, 치료학적 단백질)을 생성할 수 있는 식물 또는 이의 일부를 변형시키고, 상기 단백질(예를 들어, 치료학적 단백질)의 생성을 허용하기에 충분한 조건 하에서 식물을 배양하는 것을 포함하는, 방법을 제공한다.
생성물
본 발명은 또한 본 발명에 따른 식물로부터 수득가능하거나 수득된 생성물을 제공한다. BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현이 조절된 식물로부터 수득가능하거나 수득된 생성물이 제공된다.
일 구현예에서, 생성물은 본원에 정의된 바와 같은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하는 본 발명의 작제물을 포함할 수 있다. 일 구현예에서, 생성물은 본원에 정의된 바와 같은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 핵산 서열을 변형시키는 본 발명의 작제물을 포함할 수 있다.
본 발명은 또한 본 발명에 따른 타바코로부터 수득가능하거나 수득된 생성물을 제공한다.
일 구현예에서, 타바코 잎을 생성하기 위한 본 발명의 타바코 식물의 용도가 제공된다.
적합하게는, 타바코 잎은 가공과 같은 하류 적용으로 처리될 수 있다.
따라서, 일 구현예에서, 상기 구현예의 사용은 가공된 타바코 잎을 제공할 수 있다. 적합하게는, 타바코 잎은 경화, 발효, 저온살균 또는 이의 조합으로 처리될 수 있다. 또 다른 구현예에서, 타바코 잎은 절단될 수 있다. 일부 구현예에서, 타바코 잎은 경화, 발효, 저온 살균 또는 이의 조합으로 처리되기 전 또는 후에 절단될 수 있다.
일 구현예에서, 본 발명은 본 발명의 타바코 식물의 수확된 잎을 제공한다.
추가의 구현예에서, 수확된 잎은 본 발명의 번식 물질로부터 번식된 타바코 식물로부터 수득가능할 수 있다(예를 들어, 수득될 수 있다).
또 다른 구현예에서, 본 발명의 방법 또는 용도로부터 수득가능한 수확 잎이 제공된다.
적합하게는, 수확된 잎은 절단된 수확된 잎일 수 있다.
일부 구현예에서, 수확된 잎은 생존가능한 타바코 세포를 포함할 수 있다. 또 다른 구현예에서, 수확된 잎은 추가 가공으로 처리될 수 있다.
또한 가공된 타바코 잎이 제공된다.
가공된 타바코 잎은 본 발명의 타바코 식물로부터 수득가능할 수 있다. 적합하게는, 가공된 타바코 잎은 임의의 본 발명의 방법 및/또는 용도에 따라 수득된 타바코 식물로부터 수득가능할 수 있다.
적합하게는, 가공된 잎은 NNN, NNK, NAT 및 NAB로부터 선택된 하나 이상의 TSNA의 감소된 함량을 포함할 수 있다. 바람직하게는, NNK의 함량이 감소된다. 적합하게는, TSNA 함량 감소는 본 발명에 따라 변형되지 않은 유사한 생성물과 관련이 있다.
또 다른 구현예에서, 가공된 타바코 잎은 본 발명에 따른 타바코 식물 번식 물질로부터 번식된 타바코 식물로부터 수득가능할 수 있다.
본 발명의 가공된 타바코 잎은 본 발명의 수확된 잎을 가공함으로써 수득가능할 수 있다.
본원에 사용된 바와 같은 용어 "가공된 타바코 잎"은 타바코가 당업계에서 처리되는 하나 이상의 가공 단계를 거친 타바코 잎을 나타낸다. "가공된 타바코 잎"은 생존가능한 세포를 포함하지 않거나 실질적으로 포함하지 않는다.
용어 "생존가능한 세포"는 성장할 수 있고/있거나 대사적으로 활성인 세포를 나타낸다. 따라서, 세포가 생존할 수 없다고 한다면, 또한 "비생존"으로서 언급되는 경우, 세포는 생존 가능한 세포의 특성을 나타내지 않는다.
용어 "실질적으로 생존 가능한 세포가 없는"은 총 세포의 약 5% 미만이 생존가능함을 의미한다. 바람직하게는, 총 세포의 약 3% 미만, 더욱 바람직하게는 약 1% 미만, 더욱 더 바람직하게는 약 0.1% 미만이 생존가능하다.
일 구현예에서, 가공된 타바코 잎은 경화, 발효 및/또는 저온 살균 중 어느 하나에 의해 가공될 수 있다.
적합하게는, 가공된 타바코 잎은 경화에 의해 가공될 수 있다.
타바코 잎은 당업계에 공지된 임의의 방법에 의해 경화될 수 있다. 일 구현예어서, 타바코 잎은 공기 경화, 화염 경화, 연도 경화 및 태양 경화로 구성된 군으로부터 선택되는 경화 방법 중 하나 이상에 의해 경화될 수 있다.
적합하게는, 타바코 잎은 공기 경화될 수 있다.
전형적으로, 공기 경화는 통풍이 잘되는 창고에 타바코 잎을 매달아 건조시키는 방식으로 이루어진다. 이는 일반적으로 4주 내지 8주의 기간에 걸쳐 수행된다. 공기 경화는 특히 벌리 타바코에 적합하다.
적합하게는, 타바코 잎은 화염 경화될 수 있다. 화염 경화는 전형적으로 견목의 화염이 지속적으로 또는 간헐적으로 낮은 연기로 유지되는 대형 창고에서 타바코 잎을 매달아 놓아 달성되며, 일반적으로 공정 및 타바코에 따라 3일 내지 10주가 소요된다.
또 다른 구현예에서, 타바코 잎은 연도 경화될 수 있다. 연도 경화는 타바코 잎을 타바코 스틱에 묶고 경화 창고의 단층 기둥에 매달아 놓는 것을 포함할 수 있다. 창고는 일반적으로 외부 공급 화실로부터 나오는 굴뚝을 갖는다. 전형적으로, 이는 연기에 노출되지 않으면서 열-경화되는 타바코를 발생시킨다. 일반적으로, 온도는 경화 과정에 걸쳐 서서히 상승할 것이며, 전체 공정은 약 1주 소요된다.
적합하게는, 타바코 잎은 태양 경화될 수 있다. 이러한 방법은 전형적으로 덮개가 없는 타바코를 태양에 노출시키는 것을 포함한다.
적합하게는, 가공된 타바코 잎은 발효에 의해 가공될 수 있다.
발효는 당업계에 공지된 임의의 방식으로 수행될 수 있다. 전형적으로 발효 동안, 타바코 잎을 수분을 유지하기 위해 예를 들어, 삼베로 덮인 경화 타바코의 더미(벌크)에 쌓는다. 잎 내부에 남아있는 수분과 타바코의 무게의 조합은 타바코를 숙성시키는 천연 열을 발생시킨다. 벌크 중앙의 온도는 매일 모니터링된다. 일부 방법에서, 매주 전체 벌크가 개봉된다. 그 후, 잎을 제거하여 흔들어 축축하게 하고, 벌크를 회전시켜 내부 잎이 바깥으로 가고 바닥 잎은 벌크 상단에 놓이게 한다. 이는 벌크 전반에 걸쳐 균일한 발효를 보장한다. 잎에 추가적인 수분과 잎 자체의 실제 회전은 열을 발생시켜, 타바코의 천연 암모니아를 방출하고 니코틴을 감소시키면서 색상이 진해지게 하고 타바코의 향을 개선한다. 전형적으로, 발효 공정은 타바코의 변종, 잎의 줄기 위치, 잎의 두께 및 의도 용도에 따라 최대 6개월 동안 계속된다.
적합하게는, 가공된 타바코 잎은 저온살균에 의해 가공될 수 있다. 저온살균은 타바코 잎이 무연 타바코 산업 제품, 가장 바람직하게는 스누스를 만드는데 사용될 경우 특히 바람직할 수 있다.
타바코 잎 저온살균은 당업계에 공지된 임의의 방법에 의해 수행될 수 있다. 예를 들어, 저온살균은 문헌 [J Foulds, L Ramstrom, M Burke, K Fagerstrom. Effect of smokeless tobacco (snus) on smoking and public health in Sweden Tobacco Control (2003) 12: 349-359]에 자세히 설명된 대로 수행될 수 있으며, 이의 교시는 인용으로 본원에 포함된다.
스누스의 생성 동안, 저온살균은 전형적으로 타바코가 24-36시간 동안 스팀으로 열 처리되는 공정(약 100℃의 온도에 도달함)에 의해 수행된다. 이는 거의 멸균인 생성물을 발생시키고, 이론에 구속받지 않기를 바라면서, 이의 결과 중 하나는 추가 TSNA 형성의 제한으로 여겨진다.
일 구현예에서, 저온살균은 스팀 저온살균일 수 있다.
일부 구현예에서, 가공된 타바코 잎은 절단될 수 있다. 가공된 타바코 잎은 가공 전 또는 후에 절단될 수 있다. 적합하게는, 가공된 타바코 잎은 가공 후에 절단될 수 있다.
일 구현예에서, 상기 구현예의 사용은 재구성된 타바코를 제공할 수 있다.
일 구현예에서, 재구성된 타바코가 제공된다.
본원에 사용된 바와 같은 "재구성된"은 또한 레콘, 재활용 또는 균질화된 시트 타바코로서 언급될 수 있으며, 처리 후 타바코 잎의 잔여물로부터 생성된 타바코 물질을 나타낸다. 재구성된 타바코는 일관되고 고품질의 블렌드를 생성하게 하며, 개별 구성요소의 비율의 조정을 허용한다.
재구성된 타바코는 나노 섬유 레콘(나노섬유는 고체 또는 액체 형태로 추출될 수 있음), 제지 레콘(원료로서 줄기, 스크랩 및 주맥 등을 사용함) 또는 슬러리 유형 레콘(분말로 분쇄하고, 물과 식물성 결합제와 혼합된 타바코 줄기와 미세물의 혼합물을 사용; 물을 추출함으로써 가용성 잔류물이 시트로 형성됨)일 수 있다.
당업계에 공지된 임의의 방법은 재구성된 타바코를 제조하는데 사용될 수 있으며, 예를 들어, 문헌 [CORESTA Congress, Sapporo, 2012, Smoke Science/Product Technology Groups, SSPT 12](본원에 인용으로 포함됨)을 참조한다.
일부 구현예에서, 타바코 식물, 타바코 식물의 수확된 잎 및/또는 가공된 타바코 잎은 니코틴을 추출하는데 사용될 수 있다. 니코틴의 추출은 당업계에 공지된 임의의 방법을 이용하여 달성될 수 있다. 예를 들어, 타바코로부터 니코틴을 추출하기 위한 방법은 본원에 인용으로 포함되는 US 2,162,738에 교시된다.
일 양태에서, 본 발명은 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 제조된 경화된 타바코 물질을 제공한다.
적합하게는, 경화된 타바코는 NNK, NNN, NAT 및 NAB로부터 선택되는 하나 이상의 TSNA의 감소된 함량을 포함할 수 있다. 바람직하게는, NNK의 함량이 감소될 수 있다. 적합하게는, TSNA 함량 감소는 본 발명에 따라 변형되지 않은 유사한 생성물과 관련이 있다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부, 또는 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터 제조된 타바코 물질을 포함하는 타바코 블렌드를 제공한다. 일 양태에서, 본 발명은 본 발명에 따른 경화된 타바코 물질을 포함하는 타바코 블렌드를 제공한다.
적합하게는, 본 발명에 따른 타바코 블렌드는 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 또는 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% 또는 90% 타바코를 포함할 수 있다. 적합하게는, 타바코 블렌드는 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 또는 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터의 약 10% 타바코를 포함할 수 있다. 적합하게는, 타바코 블렌드는 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 또는 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터의 약 20% 타바코를 포함할 수 있다. 적합하게는, 타바코 블렌드는 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 또는 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터의 약 30% 타바코를 포함할 수 있다. 적합하게는, 타바코 블렌드는 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 또는 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터의 약 40% 타바코를 포함할 수 있다. 적합하게는, 타바코 블렌드는 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 또는 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터의 약 50% 타바코를 포함할 수 있다. 적합하게는, 타바코 블렌드는 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 또는 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터의 약 60% 타바코를 포함할 수 있다. 적합하게는, 타바코 블렌드는 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 또는 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터의 약 70% 타바코를 포함할 수 있다. 적합하게는, 타바코 블렌드는 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 또는 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터의 약 80% 타바코를 포함할 수 있다. 적합하게는, 타바코 블렌드는 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 또는 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터의 약 90% 타바코를 포함할 수 있다.
일 양태에서, 본 발명의 타바코 블렌드 생성물은 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 또는 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터 경화된 타바코를 건조 중량의 적어도 약 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 또는 95 퍼센트 포함한다.
적합하게는, 경화된 타바코 물질은 공기 경화될 수 있다. 적합하게는, 경화된 타바코 물질은 연도 경화될 수 있다. 적합하게는, 경화된 타바코 물질은 태양 경화될 수 있다. 적합하게는, 경화된 타바코 물질은 화염 경화될 수 있다.
본 발명에 따른 타바코 산업 제품 또는 흡연 물품은 본 발명에 따른 타바코 물질(예를 들어, 경화된 타바코 물질 또는 재구성된 타바코 물질)을 포함할 수 있다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 타바코 산업 제품을 제공한다.
일 구현예에서, 본 발명에 따른 타바코 산업 제품은 블렌딩된 타바코 산업 제품일 수 있다. 적합하게는, 타바코 블렌드는 본 발명에 따른 경화된 타바코 물질을 포함할 수 있다.
일 구현예에서, 타바코 산업 제품은 본 발명의 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 제조될 수 있다.
적합하게는, 타바코 식물 또는 이의 일부는 본 발명에 따른 타바코 식물 번식 물질로부터 번식될 수 있다.
타바코 식물과 관련하여 본원에 사용된 바와 같은 용어 "이의 일부"는 타바코 식물의 일부를 나타낸다. 적합하게는, "이의 일부"는 타바코 식물의 잎, 뿌리 또는 줄기 또는 꽃일 수 있다. 적합하게는, "이의 일부"는 타바코 식물의 잎, 뿌리 또는 줄기일 수 있다.
전달 시스템
본원에서 사용된 바와 같이 용어 "전달 시스템"은 사용자에게 적어도 하나의 물질을 전달하는 시스템을 포함하도록 의도되며, 다음을 포함한다:
가연성 에어로졸 공급 시스템, 예컨대 담배, 시가릴롤, 시가, 및 파이프용 또는 말아피는 담배 또는 수제 담배용 타바코(타바코, 타바코 유도체, 확장된 타바고, 재구성된 타바코, 타바코 치환체 또는 기타 흡연 물질을 기반으로 하는지에 무관함);
에어로졸-발생 물질의 조합물을 사용하여 에어로졸을 발생시키기 위해, 에어로졸-발생 물질을 연소시키지 않으면서 에어로졸-발생 물질로부터 화합물을 방출시키는 불연성 에어로졸 공급 시스템, 예컨대 전자 담배, 타바코 가열 제품 및 하이브리드 시스템; 및
비제한적으로, 로젠지, 검, 패치, 흡입 가능한 분말을 포함하는 물품, 및 스누스 또는 습한 스너프(snuff)를 포함하는 경구 제품, 예컨대 경구 타바코를 포함하는, 에어로졸을 형성하지 않으면서 적어도 하나의 물질을 사용자에게 경구, 비강, 경피 또는 또 다른 방식으로 전달하는 에어로졸 비함유 전달 시스템으로서, 적어도 하나의 물질은 니코틴을 포함할 수 있거나 포함하지 않을 수 있는, 에어로졸 비함유 전달 시스템.
본 개시내용에 따르면, "가연성" 에어로졸 공급 시스템은 사용자에게 적어도 하나의 물질의 전달을 촉진하기 위해 에어로졸 공급 시스템(또는 이의 구성요소)의 구성적 에어로졸-발생 물질이 사용 중에 연소되거나 태워지는 것이다.
일부 구현예에서, 전달 시스템은 담배, 시가릴로 및 시가로 구성된 군으로부터 선택되는 시스템과 같은 가연성 에어로졸 공급 시스템이다.
일부 구현예에서, 본 개시내용은 가연성 에어로졸 공급 시스템, 예컨대 필터, 필터 봉, 필터 세그먼트, 타바코 봉, 스필, 에어로졸-조절제 방출 구성요소, 예컨대 캡슐, 실 또는 비드, 또는 종이, 예컨대 플러그 랩, 팁핑 페이퍼 또는 담배 페이퍼에서 사용하기 위한 구성요소에 관한 것이다.
본 개시내용에 따르면, "불연성" 에어로졸 공급 시스템은 사용자에게 적어도 하나의 물질의 전달을 촉진하기 위해 에어로졸 공급 시스템(또는 이의 구성요소)의 구성적 에어로졸-발생 물질이 연소되지 않거나 태워지지 않는 것이다.
일부 구현예에서, 전달 시스템은 불연성 에어로졸 공급 시스템, 예컨대 동력 이용 불연성 에어로졸 공급 시스템이다.
일부 구현예에서, 불연성 에어로졸 공급 시스템은 또한, 베이핑 장치 또는 전자 니코틴 전달 시스템(END)로서 공지된 전자 담배이며, 그러나, 에어로졸-발생 물질 중 니코틴이 존재해야 하는 것은 아님이 주지된다.
일부 구현예에서, 불연성 에어로졸 공급 시스템은 또한 히트-낫-번(heat-not-burn) 시스템으로서 또한 공지된 에어로졸-발생 물질 가열 시스템이다. 이러한 시스템의 예는 타바코 가열 시스템이다.
일부 구현예에서, 불연성 에어로졸 공급 시스템은 하나 또는 복수의 에어로졸-발생 물질이 가열될 수 있는 에어로졸-발생 물질의 조합을 이용하여 에어로졸을 발생시키는 하이브리드 시스템이다. 에어로졸-발생 물질 각각은 예를 들어, 고체, 액체 또는 겔 형태로 존재할 수 있으며, 니코틴을 함유하거나 함유하지 않을 수 있다. 일부 구현예에서, 하이브리드 시스템은 액체 또는 겔-발생 물질 및 고체 에어로졸-발생 물질을 포함한다. 고체 에어로졸-발생 물질은 예를 들어, 타바코 또는 비-타바코 제품을 포함할 수 있다.
전형적으로, 불연성 에어로졸 공급 시스템은 불연성 에어로졸 공급 장치 및 불연성 에어로졸 공급 장치와 사용하기 위한 소모품을 포함할 수 있다.
일부 구현예에서, 본 개시내용은 에어로졸-발생 물질을 포함하고 불연성 에어로졸 공급 장치와 함께 사용되도록 구성된 소모품에 관한 것이다. 이러한 소모품은 종종 본 개시내용 전반에 걸쳐 물품으로서 언급된다.
일부 구현예에서, 불연성 에어로졸 공급 시스템, 예컨대 이의 불연성 에어로졸 공급 장치는 동력원 및 제어기를 포함할 수 있다. 동력원은 예를 들어, 전원 또는 발열 동력원일 수 있다. 일부 구현예에서, 발열 동력원은 열의 형태로 동력을 에어로졸-발생 물질 또는 발열 동력원에 근접한 열 전달 물질에 분배하도록 에너지를 공급받을 수 있는 탄소 기재를 포함한다.
일부 구현예에서, 불연성 에어로졸 공급 시스템은 소모품을 수용하기 위한 영역, 에어로졸 발생기, 에어로졸 발생 영역, 하우징, 마우스피스, 필터 및/또는 에어로졸-조절제를 포함할 수 있다.
일부 구현예에서, 불연성 에어로졸 공급 장치와 함께 사용하기 위한 소모품은 에어로졸-발생 물질, 에어로졸-발생 물질 저장 영역, 에어로졸-발생 물질 전달 구성요소, 에어로졸 발생기, 에어로졸 발생 영역, 하우징, 랩퍼, 필터, 마우스피스 및/또는 에어로졸-조절제를 포함할 수 있다.
적합하게는, 전달 시스템은 본 발명에 따른 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 제조될 수 있다(예를 들어, 이를 포함할 수 있다).
적합하게는, 전달 시스템은 본 발명에 따른 타바코 세포 배양물로부터 제조될 수 있다.
적합하게는, 전달 시스템은 본 발명에 따라 타바코 식물 번식 물질로부터 번식된 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 제조될 수 있다(예를 들어, 이를 포함할 수 있다).
적합하게는, 전달 시스템은 본 발명에 따른 타바코 식물의 수확된 잎으로부터 제조될 수 있다(예를 들어, 이를 포함할 수 있다).
적합하게는, 전달 시스템은 본 발명에 따른 가공된 타바코 잎으로부터 제조될 수 있다(예를 들어, 이를 포함할 수 있다).
적합하게는, 전달 시스템은 본 발명에 따른 경화된 타바코 물질로부터 제조될 수 있다(예를 들어, 이를 포함할 수 있다).
적합하게는, 전달 시스템은 본 발명에 따른 타바코 블렌드로부터 제조될 수 있다(예를 들어, 이를 포함할 수 있다).
일 구현예에서, 전달 시스템은 담배, 시가릴로 및 시가로 구성된 군으로부터 선택된 가연성 흡연 물품이다.
일 구현예에서, 전달 시스템은, 가연성 흡연 물품의 하나 이상의 구성요소, 예컨대 필터, 필터 봉, 필터 봉 세그먼트, 타바코, 타바코 봉, 타바코 봉 세그먼트, 스필, 첨가제 방출 구성요소, 예컨대 캡슐, 실, 비드, 페이퍼 예컨대, 플러그 랩, 팁핑 페이퍼 또는 담배 페이퍼를 포함한다.
일 구현예에서, 전달 시스템은 불연성 에어로졸 공급 시스템이다.
일 구현예에서, 전달 시스템은 불연성 에어로졸 공급 시스템의 하나 이상의 구성요소, 예컨대 히터 및 에어로졸화 가능한 기재를 포함한다.
일 구현예에서, 에어로졸 공급 시스템은 베이핑 장치로서 또한 공지된 전자 담배이다.
일 구현예에서, 전자 담배는 히터, 히터에 전력을 공급할 수 있는 전원, 에어로졸화 가능한 기재, 예컨대 액체 또는 겔, 하우징 및 선택적으로 마우스피스를 포함한다.
일 구현예에서, 에어로졸 가능한 기재는 기재 용기에 함유된다. 일 구현예에서, 기재 용기는 히터와 조합되거나 이를 포함한다.
일 구현예에서, 전달 시스템은 기재 물질을 가열하나 연소시키지 않음으로써 하나 이상의 화합물을 방출하는 가열 제품이다. 기재 물질은 예를 들어, 타바코 또는 다른 비-전달 시스템일 수 있는 에어로졸화 가능한 물질이며, 이는 니코틴을 함유할 수 있거나 없다. 일 구현예에서, 가열 제품은 타바코 가열 제품이다.
일 구현예에서, 가열 제품은 전자 장치이다.
일 구현예에서, 타바코 가열 제품은 히터, 히터에 전력을 공급할 수 있는 전원, 에어로졸화 가능한 기재, 예컨대 고체 또는 겔 물질을 포함한다.
일 구현예에서, 가열 제품은 비-전자 물품이다.
일 구현예에서, 가열 제품은 고체 또는 겔 물질과 같은 에어로졸화 가능한 기재, 및 목탄과 같은 가연성 물질 연소시키는 것과 같은 임의의 전자 수단 없이 에어로졸화 가능한 기재에 열 에너지를 공급할 수 있는 열원을 포함한다.
일 구현예에서, 가열 제품은 또한 에어로졸화 가능한 기재를 가열함으로써 생성된 에어로졸을 여과할 수 있는 필터를 포함한다.
일부 구현예에서, 에어로졸화 가능한 기재 물질은 증기 또는 에어로졸 발생제 또는 습윤제, 예컨대 글리세롤, 프로필렌 글리콜, 트리아세틴 또는 디에틸렌 글리콜을 포함할 수 있다.
일 구현예에서, 전달 시스템은 기재 물질의 조합물을 가열하지만 연소시키지 않음으로써 에어로졸을 발생시키는 하이브리드 시스템이다. 기재 물질은 예를 들어, 니코틴을 함유할 수 있거나 없는 고체, 액체 또는 겔을 포함할 수 있다. 일 구현예에서, 하이브리드 시스템은 액체 또는 겔 기재 및 고체 기재를 포함한다. 고체 기재는 예를 들어, 타바코 또는 기타 비-전달 시스템일 수 있으며, 니코틴을 함유할 수 있거나 없다. 일 구현예에서, 하이브리드 시스템은 액체 또는 겔 기재 및 타바코를 포함한다.
또 다른 구현예에서, 제품은 적어도 하나의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 활성 또는 발현을 조절하여 식물(예를 들어, 타바코 식물)에서 발현되는 경우 알칼로이드 함량을 감소시키는 본 발명의 작제물을 포함할 수 있다.
타바고 산업 제품
본원에 사용된 바와 같은 용어 "타바코 산업 제품"은 가연성 흡엽 물품, 예컨대 담배, 시가릴로, 시가, 파이프용 또는 롤 담배용 타바코(타바코, 타바코 유도체, 확장된 타바코, 재구성된 타바코, 타바코 치환물 또는 기타 흡연가능 물질을 기반으로 하든지), 불연성 에어로졸 공급 시스템, 연소 없이 기재 물질로부터 화합물을 방출하는 가열 제품, 예컨대 전자 담배, 타바코 가열 제품, 및 기재 물질의 조합물로부터 에어로졸을 생성하기 위한 하이브리드 시스템, 예를 들어 액체 또는 겔 또는 고체 기재를 함유하는 하이브리드 시스템은 물론 이들 에어로졸 공급 시스템 내에 사용되는 에어로졸화 가능한 기재 물질; 및 에어로졸 비함유 전달 물품, 예컨대 로젠지, 검, 패치, 호흡가능한 분말을 포함하는 물품 및 무연 타바코 산업 제품 예컨대, 스누스 및 스너프를 포함하는 것으로 의도되며, 에어로졸-비함유 전달 물품은 니코틴을 전달할 수 있거나 없다.
일 구현예에서, 타바코 산업 제품은 본 발명의 타바코 식물 또는 이의 일부로부터 제조될 수 있다(예를 들어, 포함할 수 있다).
적합하게는, 타바코 식물 또는 이의 일부는 본 발명에 따른 타바코 식물 번식 물질로부터 번식될 수 있다.
타바코 식물과 관련하여 본원에 사용된 바와 같은 용어 "이의 일부"는 타바코 식물의 일부를 나타낸다. 바람직하게는, "이의 일부"는 타바코 식물의 잎이다.
또 다른 구현예에서, 타바코 산업 제품은 본 발명의 수확된 잎으로부터 제조될 수 있다.
추가의 구현예에서, 타바코 산업 제품은 본 발명의 가공된 타바코 잎으로부터 제조될 수 있다.
적합하게는, 타바코 산업 제품은 경화, 발효 및/또는 저온살균 중 하나 이상에 의해 가공된 타바코 잎으로부터 제조될 수 있다.
적합하게는, 타바코 산업 제품은 임의적으로 상기 구현예에 따라 가공된 절단 타바코 잎을 포함할 수 있다.
또 다른 구현예에서, 타바코 산업 제품은 본 발명에 따라 타바코 세포 배양물로부터 제조될 수 있다.
또 다른 구현예에서, 타바코 산업 제품은 본 발명에 따른 경화된 타바코 물질로부터 제조될 수 있다(예를 들어, 이를 포함할 수 있다).
또 다른 구현예에서, 타바코 산업 제품은 본 발명에 따른 타바코 블렌드로부터 제조될 수 있다(예를 들어, 포함할 수 있다).
일 구현예에서, 타바코 산업 제품은 흡연 물품일 수 있다.
본원에 사용된 바와 같은 용어 "흡연 물품"은 타바코, 타바코 유도체, 확장된 타바고, 재구성된 타바코 또는 타바코 치환물을 기반으로 하든지 아니든지 흡연가능한 제품, 예컨대 롤링 타바코, 담배, 시가 및 시가릴로를 포함할 수 있다.
또 다른 구현예에서, 타바코 산업 제품은 무연 타바코 산업 제품일 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이 용어 "무연 타바코 산업 제품"은 흡연 및/또는 연소 처리로 의도되지 않은 타바코 산업 제품을 나타낸다.
무연 타바코 산업 제품(히트-낫-번 물질 포함)은 플레이크, 필름, 탭, 폼 또는 비드와 같은 임의의 형태로 증착되거나, 혼합되거나, 이에 의해 둘러싸이거나 다른 성분과 조합되는 건조된 입자, 조각, 과립, 분말 또는 슬러리를 포함하는 임의의 형태의 타바코를 함유할 수 있다.
일 구현예에서, 무연 타바코 산업 제품은 스너스, 스너프, 씹는 타바코 등을 포함할 수 있다.
일 구현예에서, 타바코 산업 제품은 담배, 시가릴로 및 시가로 구성된 군으로부터 선택되는 가연성 흡연 물품이다.
일 구현예에서, 타바코 산업 제품은, 가연성 흡연 물품의 하나 이상의 구성요소, 예컨대 필터, 필터 봉, 필터 봉 세그먼트, 타바코, 타바코 봉, 타바코 봉 세그먼트, 스필, 첨가제 방출 구성요소, 예컨대 캡슐, 실, 비드, 페이퍼 예컨대, 플러그 랩, 팁핑 페이퍼 또는 담배 페이퍼를 포함한다.
일 구현예에서, 타바코 산업 제품은 불연성 에어로졸 공급 시스템이다.
일 구현예에서, 타바코 산업 제품은 불연성 에어로졸 공급 시스템의 하나 이상의 구성요소, 예컨대 히터 및 에어로졸화 가능한 기재를 포함한다.
일 구현예에서, 에어로졸 공급 시스템은 베이핑 장치로서 또한 공지된 전자 담배이다.
일 구현예에서, 전자 담배는 히터, 히터에 전력을 공급할 수 있는 전원, 에어로졸화 가능한 기재, 예컨대 액체 또는 겔, 하우징 및 선택적으로 마우스피스를 포함한다.
일 구현예에서, 에어로졸 가능한 기재는 기재 용기에 함유된다. 일 구현예에서, 기재 용기는 히터와 조합되거나 이를 포함한다.
일 구현예에서, 타바코 산업 제품은 기재 물질을 가열하나 연소시키지 않음으로써 하나 이상의 화합물을 방출하는 가열 제품이다. 기재 물질은 예를 들어, 니코틴을 함유할 수 있거나 없는 타바코 또는 다른 비-타바코 생성물일 수 있는 에어로졸화 가능한 물질이다. 일 구현예에서, 가열 제품은 타바코 가열 제품이다.
일 구현예에서, 가열 제품은 전자 장치이다.
일 구현예에서, 타바코 가열 제품은 히터, 히터에 전력을 공급할 수 있는 전원, 에어로졸화 가능한 기재, 예컨대 고체 또는 겔 물질을 포함한다.
일 구현예에서, 가열 제품은 비-전자 물품이다.
일 구현예에서, 가열 제품은 고체 또는 겔 물질과 같은 에어로졸화 가능한 기재, 및 목탄과 같은 가연성 물질 연소시키는 것과 같은 임의의 전자 수단 없이 에어로졸화 가능한 기재에 열 에너지를 공급할 수 있는 열원을 포함한다.
일 구현예에서, 가열 제품은 또한 에어로졸화 가능한 기재를 가열함으로써 생성된 에어로졸을 여과할 수 있는 필터를 포함한다.
일부 구현예에서, 에어로졸화 가능한 기재 물질은 증기 또는 에어로졸 발생제 또는 습윤제, 예컨대 글리세롤, 프로필렌 글리콜, 트리아세틴 또는 디에틸렌 글리콜을 포함할 수 있다.
일 구현예에서, 타바코 산업 제품은 기재 물질의 조합물을 가열하지만 연소시키지 않음으로써 에어로졸을 발생시키는 하이브리드 시스템이다. 기재 물질은 예를 들어, 니코틴을 함유하거나 함유하지 않을 수 있는 고체, 액체 또는 겔을 포함할 수 있다. 일 구현예에서, 하이브리드 시스템은 액체 또는 겔 기재 및 고체 기재를 포함한다. 고체 기재는 예를 들어, 타바코 또는 기타 비-타바코 제품일 수 있으며, 이는 니코틴을 함유할 수 있거나 없다. 일 구현예에서, 하이브리드 시스템은 액체 또는 겔 기재 및 타바코를 포함한다.
추가 구현예에서, 타바코 산업 제품은 타바코 가열 장치 또는 하이브리드 장치 또는 전자 담배 등일 수 있다.
전형적으로, 타바코 가열 장치 또는 하이브리드 장치에서 에어로졸은 열원으로부터 물리적으로 분리된 에어로졸-형성 기재 또는 물질로의 열 전달에 의해 생성되며, 이는 열원 내부, 주변 또는 하류에 위치할 수 있다. 흡연 동안, 휘발성 화합물은 열원으로부터의 열 전달에 의해 에어로졸-형성 기재로부터 방출되고, 흡연 물품을 통해 끌어당겨진 공기에 동반된다. 방출된 화합물이 냉각되면, 이들은 응축되어 사용자에 의해 흡입되는 에어로졸을 형성한다.
타바코 가열 장치를 소비하거나 흡연하기 위한 에어로졸-발생 물품 및 장치는 당업계에 공지되어 있다. 이들은 예를 들어, 전기 가열된 에어로졸-발생 장치를 포함할 수 있으며, 여기에서 에어로졸은 에어로졸-발생 장치의 하나 이상의 전기 가열 요소로부터 타바코 가열 장치의 에어로졸-형성 기재로의 열 전달에 의해 발생된다.
적합하게는, 타바코 가열 장치는 에어로졸-발생 장치일 수 있다.
바람직하게는, 타바코 가열 장치는 히트-낫-번 장치일 수 있다. 히트-낫-번 장치는 당업계에 공지되어 있으며, 타바코를 가열하지만 연소하지 않음으로써 화합물을 방출시킨다.
적합한 히트-낫-번 장치의 예는 인용으로 본원에 포함된 WO2013/034459 또는 GB2515502에 교시된 것일 수 있다.
일 구현예에서, 타바코 가열 장치의 에어로졸-형성 기재는 본 발명에 따른 담배 산업 제품일 수 있다.
일 구현예에서, 타바코 가열 장치는 하이브리드 장치일 수 있다.
폴리뉴클레오티드/폴리펩티드/작제물
본 발명의 특정 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 유전자의 활성 또는 발현을 조절하는 작제물은 적합하게는 프로모터의 지시 하에 식물 세포로 형질전환될 수 있다.
본 발명의 특정 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 감소(즉, 억제)시키는 작제물은 프로모터의 지시 하에 식물 세포로 형질전환될 수 있다. 예를 들어, 유전자 작제물은 유전자 편집 작제물일 수 있거나 RNAi 분자를 포함할 수 있으며, 이는 작은 간섭 RNA(siRNA) 분자 또는 짧은 헤어핀 루프(shRNA) 분자를 포함할 수 있다.
본 발명의 특정 구현예에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 증가시키는 작제물은 적합하게는 내인성 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질과 같은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자를 인코딩하는 프로모터, 예를 들어 작제물의 지시 하에 식물 세포로 형질전환될 수 있다.
작제물은 적합한 벡터, 예를 들어 식물 형질전환 벡터에 의해 본 발명에 따라 식물 내에 도입될 수 있다. 식물 형질전환 벡터는 5'-3' 전사 방향으로 프로모터 서열, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자를 표적으로 하는 작제물 서열, 및 임의적으로, RNA 중합효소를 위한 정지 신호 및 폴리아데닐라제를 위한 폴리아데닐화 신호를 포함하는 3' 비번역된 종결인자 서열을 포함하는 발현 카세트를 포함할 수 있다. 프로모터 서열은 하나 이상의 복사체에 존재할 수 있으며, 이러한 복사체는 상기 기재된 바와 같은 프로모터 서열과 동일할 수 있거나 이의 변이체일 수 있다. 종결인자 서열은 식물, 박테리아 또는 바이러스 유전자로부터 수득될 수 있다. 적합한 종결인자 서열은 예를 들어, 완두콩 rbcS E9 종결인자 서열, 아그로박테리움 투메파시엔스(Agrobacterium tumefaciens)의 노팔린 신타제 유전자로부터 유도된 nos 종결인자 서열 및 칼리플라워 모자이크 바이러스로부터의 35S 종결인자 서열이다. 당업자는 다른 적합한 종결인자 서열을 쉽게 알 것이다.
본 발명의 작제물은 또한 프로모터의 강도를 증가시키기 위해 유전자 발현 증강 메카니즘을 포함할 수 있다. 이러한 인핸서 요소의 예는 완두콩 플라스토시아닌(plastocyanin) 유전자의 프로모터의 일부로부터 유래된 것이며, 이는 본원에 인용으로 포함된 국제 특허 출원 번호 WO 97/20056의 대상이다. 적합한 인핸서 요소는 예를 들어, 아그로박테리움 투메파시엔스의 노팔린 신타제 유전자로부터 유래된 nos 인핸서 요소 및 콜리플라워 모자이크 바이러스로부터의 35S 인핸서 요소일 수 있다.
이들 조절 영역은 니코티아나 타바쿰 또는 기타 유기체, 예를 들어 솔라나세애 과 식물 또는 세스트로이데애(Cestroideae) 아과 식물로부터 프로모터 DNA 서열과 동일한 유전자로부터 유도될 수 있거나 상이한 유전자로부터 유도될 수 있다. 모든 조절 영역은 형질전환될 조직의 세포에서 작동될 수 있어야 한다.
프로모터 DNA 서열은 관심 유전자, 예를 들어 프로모터가 지시하는 유전자, 예를 들어, 본 발명에 사용되는 코딩 서열인 상이한 유전자, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자와 동일한 유전자로부터 유도될 수 있거나, 니코티아나 타바쿰 또는 또 다른 유기체, 예를 들어 솔라나세애 과 또는 세스트로이데애 아과의 식물로부터 유도될 수 있다.
발현 카세트는 기본 식물 형질전환 벡터, 예컨대 pBIN 19 Plus, pBI 101, pKYLX71:35S2, pCAMBIA2300 또는 당업계에 공지된 다른 적합한 식물 형질전환 벡터 내에 혼입될 수 있다. 발현 카세트에 더하여, 식물 형질전환 벡터는 형질전환 과정에 필요한 서열을 함유할 것이다. 이들은 아그로박테리움 vir 유전자, 하나 이상의 T-DNA 경계 서열 및 선택가능한 마커 또는 이식유전자 식물 세포를 확인하는 다른 수단을 포함할 수 있다.
용어 "발현 벡터 또는 식물 형질전환 벡터"는 생체내 또는 시험관내 발현이 가능한 작제물을 의미한다. 바람직하게는, 발현 벡터는 유기체의 게놈에 혼입된다. 일 구현예에서, 본 발명의 벡터는 단백질, 예를 들어 본원에 기재된 바와 같은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 발현한다. 용어 "혼입된"은 바람직하게는 게놈으로의 안정적인 통합을 포함한다.
식물을 형질전환시키는 기술은 당업계에 잘 알려져 있으며, 예를 들어, 아그로박테리움-매개된 형질전환을 포함한다. 유전자 변형된 식물의 작제물에서 기본 원리는 삽입된 유전자 물질이 안정적으로 유지될 수 있도록 식물 게놈에 유전자 정보를 삽입하는 것이다. 일반 기술에 대한 검토는 본원에 인용으로 포함된 [Potrykus (Annu Rev Plant Physiol Plant Mol Biol [1991] 42:205-225) and Christon (AgroFood-Industry Hi-Tech March/April1994 17-27)]의 기사에서 찾아볼 수 있다.
전형적으로, 아그로박테리움-매개된 형질전환에서 관심 이종 DNA를 수반하는 바이너리 벡터, 즉 본 발명에 따른 작제물은 표적 식물로부터의 외식편과 아그로박테리움의 공동-배양에 의해 적절한 아그로박테리움 균주로부터 표적 식물로 전달된다. 그 후, 형질전환된 식물 조직은 선택 배지에서 재생되며, 이 선택 배지는 선택 가능한 마커 및 식물 성장 호르몬을 포함한다. 대안은 플로랄 딥(floral dip) 방법(Clough & Bent, 1998 Plant J. 1998 Dec;16(6):735-43, 본원에 인용으로 포함됨)이며, 이에 의해 온전한 식물의 꽃눈은 키메라 유전자를 함유하는 아그로박테리움 균주의 현탁액과 접촉되게 하며, 종자 세팅 후, 형질전환된 개체는 발아되고 선택 배지에서의 성장에 의해 확인된다. 아그로박테리움에 의한 식물 조직의 직접 감염은 본원에 인용으로 포함된 문헌 [Butcher et al. (1980) Tissue Culture Methods for Plant Pathologists, eds.: D. S. Ingrams and J.P. Helgeson, 203-208]에 기술되며 광범위하게 사용되는 단순한 기술이다.
추가의 적합한 형질전환 방법은 예를 들어, 폴리에틸렌 글리콜 또는 전기천공 기술, 입자 충격, 미세주입 및 탄화규소 섬유의 사용을 이용하여 원형질체로의 직접적인 유전자 전달을 포함한다. 충돌식 형질전환(ballistic transformation)을 이용한 식물 형질전환 및 탄화규소 휘스커-매개된 형질전환에 의한 비옥한 유전자전이 옥수수 식물의 생성은 본원에 인용으로 포함된 문헌 [Frame et al. (1994) The Plant Journal 6(6): 941-948]에 교시되어 있으며, 바이러스 형질전환 기술은 예를 들어, 본원에 인용으로 포함된 문헌 [Meyer et al. (1992) Mol. Gen. Genet. 231(3): 345-352]에 교시된다. 식물을 위한 벡터 시스템으로서 카사바 모자이크 바이러스의 사용은 본원에 인용으로 포함된 문헌 [Meyer et al. (1992) Gene 110: 213-217]에 교시된다. 식물 형질전환에 대한 추가 교시는 본원에 인용으로 포함된 EP-A-0449375에서 찾아볼 수 있다.
추가의 양태에서, 본 발명은 작제물을 운반하고, 이를 유기체, 예컨대 식물, 적합하게는 타바코 식물의 게놈 내로 도입하는 벡터 시스템에 관한 것이다. 벡터 시스템은 하나의 벡터를 포함할 수 있으나, 이는 2개의 벡터를 포함할 수 있다. 2개 벡터의 경우, 벡터 시스템은 일반적으로 바이너리 벡터 시스템으로 언급된다. 바이너리 벡터 시스템은 본원에 인용으로 포함된 문헌 [Gynheung et al. (1980) Binary Vectors, Plant Molecular Biology Manual A3, 1-19]에 추가로 상세히 기술된다.
식물 세포의 형질전환을 위해 광범위하게 사용되는 한 시스템은 본원에 인용으로 통합된 문헌 [An et al. (1986) Plant Physiol. 81, 301-305 and Butcher et al. (1980) Tissue Culture Methods for Plant Pathologists eds.: D. S. Ingrams and J.P. Helgeson, 203-208]에 기술된 아그로박테리움 리조게네스(Agrobacterium rhizogenes)로부터의 Ri 플라스미드 또는 아그로박테리움 투메파시엔스로부터의 Ti 플라스미드를 사용한다. 식물에서 본 발명에 따른 원하는 외인성 유전자의 각 도입 방법 후에, 추가 DNA 서열의 존재 및/또는 삽입이 필요할 수 있다. 식물 세포의 형질전환을 위한 T-DNA의 사용이 집중적으로 연구되었으며, 문헌 [EP-A-120516; Hoekema (1985) The Binary Plant Vector System, Offset-drukkerij Kanters B. B., Amsterdam Chapter V; Fraley et al. Crit. Rev. Plant Sci. 4:1-46; and An et al. (1985) EMBO J 4: 277-284]에 기술되며, 이들 모두는 본원에 인용으로 포함된다.
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하는 작제물(들)로 형질전환된 식물 세포는 잘 공지된 조직 배양 방법에 따라, 예컨대 필요한 성장 인자, 예컨대 아미노산, 식물 호르몬, 비타민 등이 보충된 적합한 배양 배지에서 세포를 배양함으로써 성장되고 유지될 수 있다.
본 발명과 관련하여 용어 "유전자전이 식물"은 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하는 작제물을 포함하는 임의의 식물을 포함한다. 따라서, 유전자전이 식물은 본 발명에 따른 작제물로 형질전환된 식물이다. 바람직하게는, 유전자전이 식물은 본 발명에 따라 조절된 알칼로이드 함량 및/또는 조절된 TSNA 전구체 함량을 나타낸다. 용어 "유전자전이 식물"은 이의 자연 환경에 있는 또한 이들 고유의 프로모터의 제어 하에 있을 때 이들의 자연 환경에 있는 천연 뉴클레오티드 코딩 서열을 포괄하지 않는다.
일 양태에서, 본 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질, 작제물, 식물 형질전환 벡터 또는 식물 세포를 인코딩하는 유전자는 단리된 형태이다. 용어 "단리된"은 서열에 서열이 자연에서 발견되는 바와 같이 자연에서 자연적으로 연관되어 있는 적어도 하나의 다른 성분이 적어도 실질적으로 없다는 것을 의미한다.
일 양태에서, 발명에 따른 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자, 작제물, 식물 형질전환 벡터 또는 식물 세포는 정제된 형태이다. 용어 "정제된"은 비교적 순수한 상태, 예를 들어 적어도 약 90% 순수, 또는 적어도 약 95% 순수 또는 적어도 약 98% 순수 상태를 의미한다.
본원에 사용된 바와 같은 용어 "뉴클레오티드 서열"은 올리고뉴클레오티드 서열 또는 폴리뉴클레오티드 서열, 및 이의 변이체, 상동체, 단편 및 유도체(예컨대, 이의 일부)를 나타낸다. 뉴클레오티드 서열은 게놈 또는 합성 또는 재조합 기원일 수 있으며, 이는 센스 또는 안티-센스 가닥을 나타내는지의 여부와 무관하게 이중 가닥 또는 단일 가닥일 수 있다.
본 발명와 관련하여 용어 "뉴클레오티드 서열"은 게놈 DNA, cDNA, 합성 DNA 및 RNA를 포함한다. 바람직하게는, 이는 본 발명을 코딩하는 DNA, 더욱 바람직하게는 cDNA 서열을 의미한다.
바람직한 구현예에서, 본 발명의 범위와 관련이 있으며 이에 포함될 경우 뉴클레오티드 서열, 즉 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자는 이의 자연 환경에서 및 또한, 자연 환경에 있는 천연적으로 관련된 서열(들)에 연결되는 경우 천연 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 참조의 편의를 위해, 본 발명자들은 이러한 바람직한 구현예를 "천연 뉴클레오티드 서열"이라고 부를 것이다. 이와 관련하여, 용어 "천연 뉴클레오티드 서열"은 천연 환경에 있고, 자연적으로 연관되어 있으며, 프로모터 또한 이의 천연 환경에 있는 전체 프로모터에 작동 가능하게 연결될 때 전체 뉴클레오티드 서열을 의미한다.
본 발명에 사용하기 위한 뉴클레오티드 서열은 벡터에 존재할 수 있으며, 여기에서 뉴클레오티드 서열은 적합한 숙주 유기체에 의해 뉴클레오티드 서열의 발현을 제공할 수 있는 조절 서열에 작동가능하게 연결된다. 본 발명에서 사용하기 위한 작제물은 본 발명의 폴리펩티드의 발현을 제공하기 위해 본원에 기재된 바와 같은 적합한 숙주 세포로 형질전환될 수 있다. 벡터, 예를 들어 플라스미드, 코스미드, 또는 파지 벡터의 선택은 종종 그것이 도입되는 숙주 세포에 의존적일 것이다. 벡터는 예를 들어, RNA의 생성을 위해 시험관 내에서 사용될 수 있거나, 숙주 세포를 형질감염, 형질전환, 형질도입 또는 감염시키는데 사용될 수 있다.
일부 적용에서, 본 발명에 사용하기 위한 뉴클레오티드 서열은 예컨대, 선택된 숙주 세포에 의해 뉴클레오티드 서열의 발현을 위해 제공될 수 있는 조절 서열에 작동가능하게 연결된다. 예로서, 본 발명은 이러한 조절 서열에 작동가능하게 연결된 본원에 기재된 바와 같은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 벡터로서, 즉 발현 벡터인 벡터를 포함한다.
용어 "작동가능하게 연결된"은 설명된 구성요소가 의도된 방식으로 기능하도록 허용하는 관계에 있는 병치를 나타낸다. 코딩 서열에 "작동가능하게 연결된" 조절 서열은 코딩 서열의 발현이 조절 서열과 양립가능한 조건 하에 달성되는 방식으로 결찰된다.
용어 "조절 서열"은 프로모터 및 인핸서 및 기타 발현 조절 신호를 포함한다. 용어 "프로모터"는 예를 들어 RNA 폴리머라제 결합 부위와 같은 당업계의 통상적인 의미로 사용된다. BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자를 인코딩하는 작제물 내의 뉴클레오티드 서열은 적어도 프로모터에 작동가능하게 연결될 수 있다.
용어 "카세트" 또는 "벡터"와 동의어인 용어 "작제물"은 프로모터에 직접적으로 또는 간접적으로 부착된 본 발명에 따라 사용하기 위한 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
간접 부착의 예는 본 발명의 뉴클레오티드 서열과 프로모터를 매개하는 인트론 서열, 예컨대 Sh1-인트론 또는 ADH 인트론과 같은 적절한 스페이서 그룹을 제공한다. 직접 또는 간접 부착을 포함하는 본 발명과 관련하여 용어 "융합된"에 대해서도 마찬가지이다. 일부 경우에, 이 용어는 보통 야생형 유전자 프로모터와 연관된 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열의 자연적 조합 및 이 둘 모두가 자연 환경에 있을 때를 포괄하지 않는다. 작제물은 유전자 작제물의 선택을 허용하는 마커를 함유하거나 발현할 수도 있다.
일부 구현예에서, 프로모터는 세포 또는 세포 배양물 또는 타바코 식물 또는 이의 일부에서 니코틴의 농도 및/또는 총 함량을 조절하는 데 사용되는 작제물 또는 벡터에서 뉴클레오티드 서열에 작동가능하게 연결될 수 있다.
일부 구현예에서, 프로모터는 항시적 프로모터, 조직-특이적 프로모터, 발달적으로 조절되는 프로모터 및 유도성 프로모터로 구성된 군으로부터 선택될 수 있다.
일 구현예에서, 프로모터는 항시적 프로모터일 수 있다.
항시적 프로모터는 모든 세포 유형에서 유전자가 동일한 수준으로 발현되지 않을 수 있지만 식물 발달 동안 지속적으로 식물의 다양한 부분에 걸쳐 유전자의 발현을 지시한다. 공지된 항시적 프로모터의 예는 콜리플라워 모자이크 바이러스 35S 전사체(Odell JT, Nagy F, Chua NH. (1985). Identification of DNA sequences required for activity of the cauliflower mosaic virus 35S promoter. Nature. 313 810-2), 쌀 액틴 1 유전자(Zhang W, McElroy D, Wu R. (1991). Analysis of rice Act1 5' region activity in transgenic rice plants. Plant Cell 3 1155-65) 및 옥수수 유비퀴틴 1 유전자(Cornejo MJ, Luth D, Blankenship KM, Anderson OD, Blechl AE. (1993). Activity of a maize ubiquitin promoter in transgenic rice. Plant Molec. Biol. 23 567-81)와 관련된 프로모터를 포함한다. 항시적 프로모터, 예컨대 카네이션 에칭 링 바이러스(CERV) 프로모터(Hull R, Sadler J, LongstaffM(1986)(CaMV/35S), 무화과 모자이크 바이러스 35S 프로모터. 카네이션 에칭 링 바이러스 DNA의 서열: 콜리플라워 모자이크 바이러스 및 레트로바이러스와의 비교(EMBO Journal, 5(2):3083-3090).
항시적 프로모터는 카네이션 에칭 고리 바이러스(CERV) 프로모터, 콜리플라워 모자이크 바이러스(CaMV 35S 프로모터), 쌀 액틴 1 유전자 또는 옥수수 유비퀴틴 1 유전자로부터의 프로모터로부터 선택될 수 있다.
프로모터는 조직 특이적 프로모터일 수 있다. 조직 특이적 프로모터는 일반적으로 식물 부분의 일생 동안 식물의 한 (또는 몇) 부분에서 유전자 발현을 지시하는 프로모터이다. 조직 특이적 프로모터의 범주에는 또한, 일반적으로 특이성이 절대적이지 않은 프로모터도 포함되며, 즉, 선호하는 조직 이외의 조직에서 더 낮은 수준으로 발현을 지시할 수도 있다. 조직 특이적 프로모터에는 파세올린-프로모터, 레구민 b4-프로모터, usp-프로모터, sbp-프로모터, ST-LS1 프로모터, B33(파타틴 클래스 I 프로모터)이 포함된다.
또 다른 구현예에서, 프로모터는 발달 조절되는 프로모터일 수 있다.
발달 조절되는 프로모터는 식물 발달 중 특정 시간에 식물의 하나 이상의 부분에서 유전자 발현의 변화를 지시한다. 유전자는 다른 시간에 다른(보통 더 낮은) 수준으로 해당 식물 부분에서 발현될 수 있으며, 다른 식물 부분에서도 발현될 수 있다.
일 구현예에서, 프로모터는 유도성 프로모터일 수 있다.
유도성 프로모터는 유도인자에 대한 반응으로 유전자의 발현을 지시할 수 있다. 유도인자의 부재하에서는 유전자가 발현되지 않을 것이다. 유도인자는 프로모터 서열에 직접 작용할 수 있거나, 억제인자 분자의 효과를 중화하여 작용할 수 있다. 유도인자는 화학 제제, 예컨대 대사산물, 단백질, 성장 조절인자(예컨대, OCS 프로모터를 활성화시키는 옥신 및 살리실산), 또는 독성 요소, 생리적 스트레스 예컨대, 열, 빛(예컨대, 소이빈 SSU 프로모터), 상처(예를 들어, nos, 노팔린 신타제 프로모터), 또는 삼투압, 또는 병원체 또는 해충 작용의 간접적인 결과일 수 있다. 발달 조절되는 프로모터는 식물에 의해 생성된 내인성 유도인자 또는 식물의 수명 주기의 특정 지점에서 환경 자극에 반응하는 특정 유형의 유도성 프로모터로서 기술될 수 있다. 공지된 유도성 프로모터의 예는 문헌 [Warner SA, Scott R, Draper J. ((1993) Plant J. 3 191-201)]에 기술된 바와 같은 상처 반응와 관련된 것들, 문헌 [Benfey & Chua (1989) (Benfey, P.N., and Chua, N-H. ((1989) Science 244 174-181)]에 기재된 바와 같은 온도 반응, 및 문헌 [Gatz ((1995) Methods in Cell Biol. 50 411-424)]에 기재된 바와 같은 화학적으로 유도된 것들을 포함한다.
본원에 정의된 바와 같은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자로서 특이적 특성을 갖는 단백질 또는 변형에 적합한 단백질을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열은 상기 단백질을 생성하는 임의의 세포 또는 유기체로부터 확인되고/거나 분리되고/거나 정제될 수 있다. 뉴클레오티드 서열의 확인 및/또는 분리 및/또는 정제를 위한 다양한 방법이 당업계에 잘 알려져 있다. 예로서, 적합한 서열이 확인되고/거나 분리되고/거나 정제되면 더 많은 서열을 제조하기 위한 PCR 증폭 기술이 사용될 수 있다.
추가의 또 다른 대안에서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 뉴클레오티드 서열은 확립된 표준 방법, 예를 들어 본원에 인용으로 포함된 문헌 [Beucage et al. (1981) Tetrahedron Letters 22, 1859-1869]에 기술된 포스포로아미디트 방법, 또는 본원에 인용으로 포함된 문헌 [Matthes et al. (1984) EMBO J. 3, 801-805]에 기술된 방법에 의해 합성에 의해 제조될 수 있다. 포스포로아미다이트 방법에서 올리고뉴클레오티드는 예를 들어 자동 DNA 합성기에서 합성되고, 정제되고, 어닐링되고, 결찰되고 적절한 벡터에서 클로닝된다.
본원에 사용된 바와 같은 용어 "아미노산 서열"은 용어 "폴리펩티드" 및/또는 용어 "단백질"과 동의어이다. 일부 경우에, 용어 "아미노산 서열"은 용어 "펩티드"와 동의어이다. 일부 경우에, 용어 "아미노산 서열"은 용어 "효소"와 동의어이다.
본 발명은 또한 본원에 정의된 특정 특성을 갖는 폴리펩티드의 아미노산 서열(들)과의 서열 동일성 또는 서열 상동성의 정도를 갖는 서열의 용도, 또는 임의의 뉴클레오티드 서열 즉, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자(이하에서는 "상동성 서열(들)"로 언급됨)의 용도를 포함한다. 여기서 용어 "상동체"는 대상 아미노산 서열 및 대상 뉴클레오티드 서열과 특정한 상동성을 갖는 실체를 의미한다. 여기서 용어 "상동성"은 "동일성"과 동일할 수 있다.
상동 아미노산 서열 및/또는 뉴클레오티드 서열 및/또는 단편은 기능적 활성을 유지하고/거나 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 유전자의 활성을 향상시키는 폴리펩티드를 제공하고/거나 인코딩해야 할 것이다. 전형적으로, 상동 서열은 예를 들어, 대상 아미노산 서열로서 동일한 활성 부위 등을 포함하거나 동일한 활성 부위를 인코딩할 것이다. 상동성은 또한 유사성(즉, 유사한 화학적 특성/기능을 갖는 아미노산 잔기)의 관점에서 고려될 수 있지만, 본 발명의 맥락에 있어서, 서열 동일성의 관점에서 상동성을 표현하는 것이 바람직하다. 상동 서열은 일반적으로 기능성 도메인 또는 모티프를 유지한다.
일 구현예에서, 상동 서열은 대상 서열과 비교하여 1, 2 또는 수개의 추가, 결실 및/또는 치환을 갖는 아미노산 서열 또는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 것으로 간주된다.
서열 동일성
서열 동일성 비교는 육안으로 또는 더욱 일반적으로는, 용이하게 입수가능한 서열 비교 프로그램의 도움으로 수행될 수 있다. 이러한 시중에서 입수가능한 컴퓨터 프로그램은 2개 이상의 서열 간의 상동성 %을 계산할 수 있다. 상동성 % 또는 동일성 %은 연속 서열에 대해 계산될 수 있으며, 즉 하나의 서열은 다른 서열과 정렬되고, 한 서열의 각 아미노산은 한 번에 하나의 잔기씩 다른 서열의 상응하는 아미노산과 직접 비교된다. 이는 "갭핑되지 않은" 정렬로 불린다. 전형적으로, 이러한 갭이 없는 정렬은 상대적으로 적은 수의 잔기에 대해서만 수행된다.
이는 매우 단순하고 일관된 방법이지만, 예를 들어, 다른 동일한 서열 쌍에서, 하나의 삽입 또는 결실은 다음의 아미노산 잔기가 정렬되지 않게 하고, 따라서 전체 정렬이 수행될 때 잠재적으로 상동성 %의 큰 감소를 발생시킨다는 것을 고려하지 못한다. 결과적으로, 대부분의 서열 비교 방법은 전체 상동성 스코어에 부당한 불이익을 주지 않으면서 가능한 삽입 및 결실을 고려하는 최적의 정렬을 생성하도록 설계된다. 이는 국소 상동성을 최대화하고자 하기 위해 서열 정렬에 "갭"을 삽입함으로써 달성된다.
그러나, 이러한 더 복잡한 방법은 정렬에서 발생하는 각 갭에 "갭 패널티"를 할당하여, 동일한 수의 동일한 아미노산에 있어서, 2개의 비교된 서열 사이의 더 높은 관련성을 반영하는 가능한 한 적은 갭을 갖는 서열 정렬이 많은 갭을 갖는 것보다 더 높은 스코어를 달성할 것이다. "아핀 갭 비용"은 일반적으로 갭의 존재에 대해 상대적으로 높은 비용을 부과하고 갭의 각 후속 잔류물에 대해 더 작은 패널티를 부과하는데 사용된다. 이는 가장 일반적으로 사용되는 갭 스코어링 시스템이다. 높은 갭 패널티는 물론 더 적은 갭을 갖는 최적화된 정렬을 생성할 것이다. 대부분의 정렬 프로그램은 갭 패널티를 수정하게 한다. 그러나, 서열 비교에 이러한 소프트웨어를 사용할 경우 기본 값을 사용하는 것이 바람직하다.
따라서, 최대 상동성 %의 계산은 먼저 갭 페널티를 고려하여 최적의 정렬 생성을 필요로 한다. 이러한 정렬을 수행하는 데 적합한 컴퓨터 프로그램은 Vector NTI(Invitrogen Corp.)이다. 서열 비교를 수행할 수 있는 소프트웨어의 예에는 비제한적으로, 예를 들어 BLAST 패키지(Ausubel et al.(1999) Short Protocols in Molecular Biology, 4th Ed - Chapter 18 참조), BLAST 2(FEMS Microbiol Lett 1999 174(2): 247-50; FEMS Microbiol Lett 1999 177(1): 187-8 and tatiana@ncbi.nlm.nih.gov 참조), FASTA(Altschul et al. 1990 J. Mol. Biol. 403-410) 및 AlignX를 포함한다. 적어도, BLAST, BLAST2 및 FASTA는 오프라인 및 온라인 검색에 사용가능하다(문헌 [Ausubel et al. (1999), pages 7-58 to 7-60] 참조).
최종 상동성 %는 동일성 측면에서 측정될 수 있지만, 정렬 프로세스 자체는 전형적으로 모두 또는 전무 쌍 비교를 기반으로 하지 않는다. 대신에, 화학적 유사성 또는 진화적 거리를 기반으로 하는 각 쌍별 비교에 스코어를 할당하는 스케일링된 유사성 스코어 매트릭스가 일반적으로 사용된다. 일반적으로 사용되는 이러한 매트릭스의 예는 BLOSUM62 매트릭스이다 - BLAST 프로그램 세트에 대한 기본 매트릭스. 벡터 NTI 프로그램은 일반적으로 공개 기본값 또는 제공되는 경우 사용자 지정 기호 비교 표를 사용한다(자세한 내용은 사용자 설명서 참조). 일부 응용 프로그램의 경우 Vector NTI 패키지에 대한 기본값을 사용하는 것이 바람직하다.
대안적으로, CLUSTAL(Higgins DG & Sharp PM(1988), Gene 73(1), 237-244)과 유사한 알고리즘을 기반으로 하는 벡터 NTI(Invitrogen Corp.)의 다중 정렬 특성을 사용하여 상동성 백분율을 계산할 수 있다. 소프트웨어가 최적의 정렬을 생성한다면, 상동성 %, 바람직하게는 서열 동일성 %를 계산하는 것이 가능하다. 소프트웨어는 전형적으로 서열 비교의 일부로서 이를 수행하고 수치 결과를 생성한다.
서열 동일성을 결정할 때 갭 패널티가 사용되어야 하는 경우, 바람직하게는 쌍별 정렬을 위해 다음 매개변수가 사용된다:
일 구현예에서, CLUSTAL은 상기에서 정의된 바와 같은 갭 패널티 및 갭 확장 세트와 함께 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, BLAST 또는 CLUSTAL 정렬에 사용되는 갭 패널티는 상기 상세히 설명된 것과 상이할 수 있다. 당업자는, BLAST 및 CLUSTAL 정렬을 수행하기 위해 표준 파라미터가 주기적으로 변경될 수 있으며, 당시 BLAST 또는 CLUSTAL 정렬 알고리즘에 대해 상세히 설명된 표준 파라미터를 기반으로 하는 적절한 파라미터를 선택할 수 있을 것으로 이해할 것이다.
적합하게는, 뉴클레오티드 서열에 관한 동일성 정도는 적어도 50개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 60개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 70개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 80개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 90개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 100개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 150개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 200개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 250개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 300개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 350개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 400개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 450개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 500개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 550개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 600개 연속 뉴클레오티드, 바람직하게는 적어도 650개 연속 뉴클레오티드, 또는 바람직하게는 적어도 700개 연속 뉴클레오티드에 걸쳐 결정된다.
적합하게는, 뉴클레오티드, cDNA, cds 또는 아미노산 서열에 관한 동일성 정도는 전체 서열에 걸쳐 결정될 수 있다.
서열은 또한 침묵 변화를 생성하는 아미노산 잔기의 결실, 삽입 또는 치환을 가질 수 있으며, 기능적으로 동등한 물질을 발생시킬 수 있다. 의도적인 아미노산 치환은 물질의 이차 결합 활성이 유지되는 한 잔기의 극성, 전하, 용해도, 소수성, 친수성 및/또는 양친매성 성질의 유사성에 기초하여 이루어질 수 있다. 예를 들어, 음으로 하전된 아미노산은 아스파르트산 및 글루탐산을 포함하며; 양으로 하전된 아미노산은 리신 및 아르기닌을 포함하며; 유사한 친수성 값을 갖는 비하전된 극성 헤드 기를 갖는 아미노산은 류신, 이소류신, 발린, 글리신, 알라닌, 아스파라긴, 글루타민, 세린, 트레오닌, 페닐알라닌 및 티로신을 포함한다.
예를 들어, 하기 표에 따라 보존적 치환이 이루어질 수 있다. 제2 열의 동일한 블록 및 바람직하게는, 제3 열의 동일한 라인에 있는 아미노산은 서로 치환될 수 있다:
본 발명은 또한 발생할 수 있는 상동성 치환(치환 및 대체는 모두 기존 아미노산 잔기의 대체 잔기로의 상호교환을 의미하기 위해 본원에 사용됨), 즉, 같은 것으로의 치환(like-for-like substitution), 예컨대 염기성을 염기성으로, 산성을 산성으로, 극성을 극성으로의 치환, 기타 등등을 포함한다. 비-상동성 치환은 또한 즉, 한 부류의 잔기로부터 또 다른 부류의 잔기로 발생할 수 있거나, 대안적으로 비천연 아미노산, 예컨대 오르니틴(이하에서는 Z로 지칭됨), 디아미노부티르산 오르니틴(이하에서는 B로 지칭됨), 노르류신 오르니틴(이하에서는 O로 지칭됨), 피릴알라닌, 티에닐알라닌, 나프틸알라닌 및 페닐글리신의 포함을 포함한다.
대체는 또한 하기를 포함하는 비천연 아미노산에 의해 이루어질 수 있다; 알파* 및 알파-이치환된* 아미노산, N-알킬 아미노산*, 락트산*, 천연 아미노산의 할라이드 유도체, 예컨대 트리플루오로티로신*, p-Cl-페닐알라닌*, p-Br-페닐알라닌*, p-I-페닐알라닌*, L-알릴-글리신*, β-알라닌*, L-α-아미노 부티르산*, L-γ-아미노 부티르산*, L-α-아미노 이소부티르산*, L-ε-아미노 카프로산#, 7-아미노 헵타노산*, L-메티오닌 설폰#*, L-노르류신*, L-노르발린*, p-니트로-L-페닐알라닌*, L-하이드록시프롤린#, L-티오프롤린*, 페닐알라닌(Phe)의 메틸 유도체, 예컨대 4-메틸-Phe*, 펜타메틸-Phe*, L-Phe (4-아미노)#, L-Tyr (메틸)*, L-Phe (4-이소프로필)*, L-Tic (1,2,3,4-테트라하이드로이소퀴놀린-3-카르복실산)*, L-디아미노프로피온산# 및 L-Phe (4-벤질)*을 포함한다. 표기법 *은 유도체의 소수성 성질을 나타내기 위해 상기 논의(상종 또는 비-상동 치환과 관련하여)의 목적으로 사용된 반면, #은 유도체의 친수성 성질을 나타내기 위해 사용되었으며, #*는 양친매성 특성을 나타낸다.
변이체 아미노산 서열은 글리신 또는 β-알라닌 잔기와 같은 아미노산 스페이서에 더하여 메틸, 에틸 또는 프로필 기와 같은 알킬 기를 포함하는 서열의 임의의 2개의 아미노산 잔기 사이에 삽입될 수 있는 적합한 스페이서 기를 포함할 수 있다. 추가 형태의 변형은 펩토이드 형태의 하나 이상의 아미노산 잔기의 존재를 포함하며, 이는 당업자에 의해 잘 이해될 것이다. 의심의 여지를 피하기 위해, "펩토이드 형태"는 α-탄소 치환기가 α-탄소보다는 잔기 질소 원자에 있는 변이체 아미노산 잔기를 나타내는데 사용된다. 펩토이드 형태의 펩티드를 제조하기 위한 방법은 당업계 예를 들어, 문헌 [Simon et al. (1992) PNAS 89(20), 9367-9371 and Horwell (1995) Trends Biotechnol. 13(4), 132-134]에 공지되어 있다.
본 발명에 사용하기 위한 뉴클레오티드 서열은 합성 또는 변형된 뉴클레오티드를 그 안에 포함할 수 있다. 올리고뉴클레오티드에 대한 다수의 상이한 유형의 변형이 당업계에 공지되어 있다. 이들로는 분자의 3' 및/또는 5' 말단에서 메틸포스포네이트 및 포스포로티오에이트 백본 및/또는 아크리딘 또는 폴리리신 사슬의 첨가를 포함한다. 본 발명의 목적에 있어서, 본원에 기재된 뉴클레오티드 서열은 당업계에 이용가능한 임의의 방법에 의해 변형될 수 있음을 이해해야 한다. 이러한 변형은 본 발명의 뉴클레오티드 서열의 생체내 활성 또는 수명을 향상시키기 위해 수행될 수 있다.
본 발명은 또한 본 발명의 핵산 서열에 상보적인 서열 또는 본 발명의 서열에 대해 혼성화될 수 있는 서열, 또는 이에 대해 상보적인 서열을 포함한다. 본원에 사용된 바와 같은 용어 "혼성화"는 "핵산 가닥이 염기 쌍을 통해 상보적 가닥과 연결되는 과정"은 물론 중합효소 연쇄 반응(PCR) 기술에서 수행되는 증폭 과정을 포함할 것이다.
본 발명은 또한 본 발명의 뉴클레오티드 서열에 혼성화될 수 있는 뉴클레오티드 서열(본원에 제시된 것들의 상보적 서열 포함)에 관한 것이다. 바람직하게는, 혼성화는 엄격한 조건(예를 들어, 50℃ 및 0.2xSSC {1xSSC = 0.15M NaCl, 0.015M Na3시트레이트 pH 7.0})에서 결정된다. 더욱 바람직하게는, 혼성화는 매우 엄격한 조건(예를 들어, 65℃ 및 0.1xSSC {1xSSC = 0.15M NaCl, 0.015M Na3시트레이트 pH 7.0})에서 결정된다.
식물 형질전환에 사용되는 일반적인 기술에 대한 검토는 기사, 예컨대 문헌 [Potrykus et al. (1991) Annu Rev Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 42:205-225 and Christou et al. (1994) Agro-Food-Industry Hi-Tech March/April 17-27]에서 찾아볼 수 있으며, 이는 본원에 인용으로 포함된다. 식물 형질전환에 대한 추가 교시는 본원에 인용으로 포함된 EP-A-0449375에서 찾아볼 수 있다.
달리 정의되지 않는 한, 본원에서 사용되는 모든 기술 및 과학 용어는 본 개시내용이 속하는 분야의 당업자에 의해 일반적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 갖는다. 문헌 [Singleton, et al., DICTIONARY OF MICROBIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY, 20 ED., John Wiley and Sons, New York (1994), and Hale & Marham, THE HARPER COLLINS DICTIONARY OF BIOLOGY, Harper Perennial, NY (1991)]은 본 개시내용에 사용된 많은 용어의 일반적인 사전을 숙련자에게 제공한다.
본 개시내용은 본원에 개시된 예시적인 방법 및 재료에 의해 제한되지 않으며, 본원에 기재된 것과 유사하거나 등가인 임의의 방법 및 재료는 본 개시내용의 구체예의 실시 또는 시험에서 사용될 수 있다. 숫자 범위에는 범위를 정의하는 숫자가 포함된다. 달리 표시되지 않는 한, 임의의 핵산 서열은 5'에서 3' 방향으로 왼쪽에서 오른쪽으로 작성된다; 아미노산 서열은 각각 아미노에서 카르복시 방향으로 왼쪽에서 오른쪽으로 작성된다.
본원에 제공된 표제는 전체로서 명세서를 참조하여 본 개시내용의 다양한 양태 또는 구현예의 제한이 아니다. 따라서, 바로 아래에 정의되는 용어는 전체로서 명세서를 참조하여 보다 완전하게 정의된다.
아미노산은 아미노산의 명칭, 세 글자 약어 또는 한 글자 약어를 사용하여 본원에서 언급된다. 본원에 사용된 용어 "단백질"은 단백질, 폴리펩티드 및 펩티드를 포함한다. 본원에 사용된 바와 같은 용어 "아미노산 서열"은 용어 "폴리펩티드" 및/또는 용어 "단백질"과 동의어이다. 일부 경우에, 용어 "아미노산 서열"은 용어 "펩티드"와 동의어이다. 일부 경우에, 용어 "아미노산 서열"은 용어 "효소"와 동의어이다.
본 개시내용 및 청구범위에서, 아미노산 잔기에 대한 통상적인 한 글자 및 세 글자 코드가 사용될 수 있다. IUPACIUB Joint Commission on Biochemical Nomenclature(JCBN)에 따라 정의된 아미노산에 대한 3-글자 코드이다. 또한, 폴리펩티드는 유전자 코드의 축퇴성으로 인해 하나 초과의 뉴클레오티드 서열에 의해 코드화될 수 있는 것으로 이해된다.
용어의 다른 정의는 본 명세서 전반에 걸쳐 나타날 수 있다. 예시적인 구현예가 더 상세하게 설명되기 전에, 본 개시내용은 설명된 특정 구현예로 제한되지 않고, 물론 변할 수 있음을 이해해야 한다. 또한, 본원에 사용된 용어는 단지 특정 구현예를 설명하기 위한 목적이며, 본 개시내용의 범위는 단지 첨부된 청구범위에 의해서만 제한될 것이기 때문에 제한하려는 의도가 아님을 이해해야 한다.
값의 범위가 제공되는 경우, 문맥에서 명확하게 달리 지시하지 않는 한 해당 범위의 상한과 하한 사이의 각 중간 값이 하한 단위의 10분의 1까지 또한 구체적으로 개시되는 것으로 이해된다. 언급된 범위의 임의의 언급된 값 또는 중간 값과 해당 언급된 범위의 임의의 다른 언급된 또는 중간 값 사이의 각각의 더 작은 범위는 본 개시내용 내에 포함된다. 이러한 더 작은 범위의 상한 및 하한은 독립적으로 그 범위에 포함되거나 제외될 수 있으며, 더 작은 범위에 어느 하나의 한계가 포함되거나 어느 한계도 포함되지 않거나 두 한계 모두가 포함되는 각 범위 또한 본 개시내용 내에 포함되며, 상기 언급된 범위에서 임의의 구체적으로 배제된 한계가 적용된다. 언급된 범위가 한계 중 하나 또는 둘 모두를 포함하는 경우, 포함된 한계 중 하나 또는 둘 모두를 제외하는 범위도 본 개시내용에 포함된다.
본 명세서 및 첨부된 청구범위에서 사용된 바와 같이, 단수 형태("a", "an" 및 "the")는 문맥이 명백히 달리 지시하지 않는 한 복수의 지시대상을 포함하는 것으로 주지되어야 한다. 따라서, 예를 들어, "효소" 또는 "니트레이트 환원효소"에 대한 언급은 당해 분야의 숙련가에게 공지된 복수의 이러한 후보 제제 및 이의 등가물, 등등을 포함한다.
이점
놀랍게도 타바코에서 알칼로이드 함량의 양성 조절인자로서 작용하는 본원에 교시된 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써, 식물의 알칼로이드 및/또는 TSNA 전구체 함량이 조절될 수 있음이 발견되었다. 이에 의해, 조절(예를 들어, 감소)된 알칼로이드 함량 및/또는 감소된 TSNA 전구체 함량을 가지며, 타바코 산업 제품의 소비자가 추구하는 상업적으로 바람직한 특성을 갖는 타바코 산업 제품이 생성될 수 있다.
본 발명자들은 놀랍게도 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써 식물(예를 들어, 타바코 식물)의 알칼로이드 함량 및/또는 TSNA 전구체 함량을 조절하기 위한 방법을 결정하였다. 식물(예를 들어, 타바코 식물)의 알칼로이드 또는 TSNA 전구체 함량은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현을 감소 또는 억제함으로써 감소될 수 있다. 본 발명 전에, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 유전자의 활성 또는 발현의 조절이 알칼로이드(및/또는 식물의 TSNA 전구체 함량(예를 들어, 타바코 식물)를 조절하는데 사용될 수 있다는 것은 알려지지 않았다.
본원에서 논의된 간행물은 본 출원의 출원일 이전에 그들의 개시를 위해서만 제공된다. 본원에 있는 어떤 것도 상기 출판물이 본원에 첨부된 청구범위에 대한 선행 기술을 구성한다는 것을 인정하는 것으로 해석되어서는 안된다.
실시예
실시예 1 - BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 일시적인 과발현은 잎의 알칼로이드 함량을 증가시킨다
방법 및 재료
BTB/POZ NPH3 도메인-함유 발현 벡터의 클로닝
Nitab4.5_0000868g0020.2 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질 유전자 서열(SEQ ID NO. 3)은 유전자 서열에 측접하는 제한 부위 외부에 위치한 프라이머를 사용하여 Gateway™ 호환 cDNA 라이브러리로부터 증폭하였다.
생성된 플라스미드는 열 충격에 의해 시퀀싱하고, 아그로박테리움 투메파시엔스 GV3101pMP90으로 형질전환시키고, 타바코 잎에서 일시적으로 발현시켰다.
일시적인 유전자 발현
관심 작제물을 수반하는 아그로박테리움 투메파시엔스 GV3101 균주를 적절한 항생제가 보충된 Luria-Bertani(LB) 배지에서 밤새 성장시켰다. 배양물을 회전시키고 OD600 = 0.6까지 10 mM MgCl2, 10 mM MES pH 5.6 및 100 μM 아세토시링곤을 함유하는 완충액에 재현탁하고, 실온에서 1시간 동안 인큐베이션하였다. 바늘 없는 주사기를 사용하여 타바코 잎에 침윤을 수행하였다. 샘플은 침윤 5일 후에 채취하였다.
테스트는 두 가지 생물학적 복제물에서 수행하였다.
알칼로이드 측정
피리딘 알칼로이드의 상대 함량은 탠덤 질량 분광법(LC-MS/MS)을 이용하여 역상 고성능 액체 크로마토그래피에 의해 결정하였다. Gemini-NX 컬럼(100 mm Х 3.0 mm, 입자 크기 3μm, Phenomenex)을 사용하여 크로마토그래피 분리를 달성하고, 구배 크로마토그래피 분리를 6.5 mM 암모늄 아세테이트 완충액(aq)(pH10) 및 메탄올을 사용하여 달성하였다.
질량 분광기는 예정된 MRM 데이터 수집을 사용하여 전자 분무(ESI) 양성 모드에서 작동한다. 두 개의 MRM 전이는 각 분석물에 대해 모니터링하고, 하나는 동위원소 표지된 내부 표준에 대해 모니터링하였다.
결과
Nitab4.5_0000868g0020.2 작제물을 발현하는 5주된 타바코 잎의 알칼로이드 함량은 도 1에 도시된다. 알칼로이드 함량은 대조군과 비교하여 표시되며, 일원 t-테스트로 분석된 2개의 생물학적 복제물을 포함한다. 값은 평균 ± SEM으로 표시된다. 별표는 P 값 ≤ 0.001의 통계적 의미를 나타낸다.
Nitab4.5_0000868g0020.2의 과발현은 잎의 알칼로이드 함량의 현저한 증가로 이어진다.
도 35는 Nitab4.5_0000868g0020.2의 녹아웃이 알칼로이드 함량의 유의한 감소로 이어짐을 보여준다. 녹아웃된 Nitab4.5_0000868g0020.2를 갖는 3개의 TN90 라인의 알칼로이드 함량이 도시된다. 알칼로이드 함량은 대조군과 비교하여 표시된다. 결과는 t-테스트로 분석하였다. 값은 평균 ± SEM으로 표시된다. 별표는 P 값 ≤ 0.001의 통계적 의미를 나타낸다.
결론
Nitab4.5_0000868g0020은 알칼로이드 함량의 양성 조절인자이며, 타바코의 피리딘 알칼로이드의 조절인자이다.
실시예 2 - Nitab4.5_0000868g0020.2를 표적으로 하는 안티센스 RNA의 일시적인 발현은 잎에서 알칼로이드 함량을 감소시킨다
재료 및 방법
Nitab4.5_0000868g0020.2 코딩 서열을 CERV 프로모터에 의해 구동되는 식물 발현 벡터에 역방향으로 클로닝하였다.
결과
Nitab4.5_0000868g0020.2 안티센스 RNA를 발현하는 5주된 타바코 잎의 알칼로이드 함량은 도 2에 도시된다. 알칼로이드 함량은 대조군과 비교하여 표시되며 t-테스트로 분석된 3개의 생물학적 복제물을 포함한다. 값은 평균 ± SEM으로 표시된다. 별표는 P 값 ≤ 0.001의 통계적 의미를 나타낸다.
안티센스 RNA를 사용하여 Nitab4.5_0000868g0020.2 발현을 억제하면 잎에서 알칼로이드 함량의 감소로 이어지며, 특히 PON, 노르니코틴, 아나바신 및 아나타빈 함량 감소로 이어진다.
결론
Nitab4.5_0000868g0020.2는 알칼로이드 함량, 특히 잎에서 알칼로이드 함량의 양성 조절인자이며, 타바코에서 피리딘 알칼로이드의 조절인자이다.
실시예 3 - 상동성 테스트
SEQ ID NO. 3의 상동체의 효과, 즉 SEQ ID NO 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27 및 30을 실시예 1 및 2에 기재된 바와 같은 검정법으로 시험하였다.
실시예 4 - Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자 연구
방법:
Nitab4.5_0000868g0020.2의 삼중 공동-면역침전 샘플을 질량 분광 분석에 제공하였다. 샘플을 트립신으로 분해하고 Thermo Scientific™ Orbitrap Fusion™ 질량 분광기에서 분석하였다. 데이터는 5%의 잘못된 발견률을 사용하여 BAT 타바코 단백질체 데이터베이스 및 일반 오염물질 데이터베이스에 대해 Proteome Discoverer 2.1로 분석하였다. 단백질은 다음을 기준으로 분류하였다: 후보 샘플의 모든 복제물에서 확인; 후보 샘플에서 확인된 펩티드의 수; 및 대조군(GFP) 또는 다른 후보 샘플에는 존재하지 않음. 이러한 기준을 사용하여 Nitab4.5_0000868g0020.2에 대한 후보 상호작용인자 목록을 생성하였다.
결과 및 결론:
Nitab4.5_0000868g0020.2의 상호작용인자를 특성규명하였다(데이터 미도시됨). 가장 강력한 상호작용인자(SEQ ID NO)는 엽록체 또는 엽록체 막에 위치하며, 이는 가장 가까운 아라비돕시스 탈리아나(Arabidopsis thaliana) 동족체(AT5G67385, NCH1)와 마찬가지로 Nitab4.5_0000868g0020.2가 엽록체 운동 조절에 관여함을 시사한다. 엽록체 신호전달 경로는 옥신에 의해 엄격하게 조절되며, 이는 싹에서 타바코 식물의 장거리 신호 전달에 관여하고 뿌리에서 니코틴 합성을 조절한다. 이러한 발견은 타바코에서 니코틴 및 니코틴 알칼로이드 수준의 조절에 Nitab4.5_0000868g0020.2의 관련성에 대한 기작론적 통찰을 제공한다.
SEQUENCE LISTING
<110> British American Tobacco (Investments) Limited
<120> METHOD
<130> P117234PCT
<150> GB 1909562.9
<151> 2019-07-03
<160> 44
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 620
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0000868g0020.2 amino acid sequence
<400> 1
Met Val Asp Leu Asp Ser Glu Gly Thr Glu Gln Pro Ser Thr Val Asn
1 5 10 15
Asn Met Ser Thr Lys Lys Lys Glu Leu Leu Ser Thr Ala Met Lys Arg
20 25 30
Thr Ser Asp Trp Ile Phe Ser Gln Glu Ile Pro Ser Asp Val Thr Val
35 40 45
Asn Ala Gly Gly Ser Ala Phe Ser Leu His Lys Phe Pro Leu Val Ser
50 55 60
Lys Ser Gly Tyr Ile Arg Lys Ile Ile Ser Glu Ser Asn Asp Ala Asp
65 70 75 80
Val Ser Ile Val Glu Ile Pro Asp Ile Pro Gly Gly Ser Asp Ala Phe
85 90 95
Glu Leu Ala Ala Lys Phe Cys Tyr Gly Ile Asn Phe Glu Ile Ser Thr
100 105 110
Glu Asn Ile Ala Leu Leu Arg Cys Thr Ala Glu Tyr Leu Glu Met Thr
115 120 125
Glu Asp Tyr Ala Val Gly Asn Leu Val Gly Arg Thr Glu Ala Tyr Leu
130 135 140
Asn Glu Val Ala Leu Lys Ser Leu Ala Gly Ala Val Ser Ile Leu His
145 150 155 160
Ser Ser Glu Ser Leu Leu Pro Ile Ala Glu Lys Val Lys Met Val Ser
165 170 175
Arg Cys Ile Asp Thr Ile Ala Tyr Ile Ala Cys Lys Asp Asn Gln Phe
180 185 190
Cys Thr Ser Gly Arg Ala Glu Ala Gly Thr Asn Gly Leu Asn Ser Ser
195 200 205
Thr Phe Ser Asn Pro Lys Pro Met Val Asp Trp Trp Ala Glu Asp Leu
210 215 220
Ala Val Leu Arg Ile Asp Phe Phe Gln Arg Val Leu Ile Ala Met Met
225 230 235 240
Gly Arg Gly Phe Lys Gln Tyr Ala Leu Gly Pro Ile Leu Met Leu Tyr
245 250 255
Ala Gln Lys Ser Leu Arg Gly Leu Glu Ile Phe Gly Lys Gly Arg Lys
260 265 270
Lys Ile Glu Pro Lys Gln Glu His Glu Lys Arg Val Val Leu Glu Thr
275 280 285
Ile Val Ser Leu Leu Pro Arg Glu Lys Asn Ala Leu Ser Val Ser Phe
290 295 300
Leu Ser Met Leu Leu Arg Ala Ala Ile Tyr Leu Glu Thr Thr Val Ala
305 310 315 320
Cys Arg Leu Asp Leu Glu Lys Arg Met Ala Leu Gln Leu Gly Gln Ala
325 330 335
Val Leu Asp Asp Leu Leu Ile Pro Ser Tyr Ser Phe Thr Gly Asp Thr
340 345 350
Leu Phe Asp Val Glu Thr Val Gln Arg Ile Ile Met Asn Phe Leu Asp
355 360 365
Asn Glu Met Asp Gly Ser Arg Leu Gly Asp Glu Glu Tyr Val Ser Pro
370 375 380
Ser Leu Ser Asp Met Glu Arg Val Gly Lys Leu Met Glu Asn Tyr Leu
385 390 395 400
Ala Glu Ile Ala Ser Asp Arg Asn Leu Ser Val Ser Lys Phe Ile Ser
405 410 415
Leu Ala Glu Val Ile Pro Glu Gln Ala Lys Ile Thr Glu Asp Gly Met
420 425 430
Tyr Arg Ala Ile Asp Ile Tyr Leu Lys Ala His Pro Ala Leu Ser Asp
435 440 445
Met Glu Arg Lys Lys Val Cys Gly Val Met Asp Cys Gln Lys Leu Ser
450 455 460
Arg Glu Ala Cys Ala His Ala Ala Gln Asn Asp Arg Leu Pro Val Gln
465 470 475 480
Thr Val Val Gln Val Leu Tyr Tyr Glu Gln Gln Arg Leu Arg Glu Val
485 490 495
Met Asp Gly Ser Gln Leu Val Ala Thr Glu Pro Pro Ala Leu Ile Pro
500 505 510
Ser Lys Thr Asn Gln Phe Ser Thr Asp Ile Arg Pro Ile Ser Asp Glu
515 520 525
Val Ser Ser Leu Lys Arg Glu Asn Gln Glu Leu Lys Phe Glu Leu Leu
530 535 540
Lys Met Lys Met Arg Leu Lys Glu Ile Glu Lys Pro Ser Asn Lys Ser
545 550 555 560
Ala Thr Ser Ser Pro Leu Val Ile Thr His Pro Ser Ala Asp Lys Pro
565 570 575
Pro Leu Pro Arg Lys Pro Ser Asn Phe Ile Ser Ser Val Ser Lys Lys
580 585 590
Leu Gly Lys Phe Ile Arg Ala Asp Gly Leu Thr Ala Asn Lys Gly Arg
595 600 605
Asn Lys Pro Ser Lys Asp Arg Arg His Ser Ile Ser
610 615 620
<210> 2
<211> 1863
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0000868g0020.2 coding sequence
<400> 2
atggtggatc ttgattcaga ggggactgaa caaccctcta ctgttaacaa tatgtccact 60
aaaaagaagg agcttctttc cactgctatg aagaggacct ctgattggat tttctcccaa 120
gagatcccaa gtgatgtaac tgtaaatgca ggcggatccg ccttttcact gcacaagttc 180
cctttagttt caaagagtgg ctacataagg aagattatct cagaatccaa tgatgctgat 240
gtttctatag tcgaaatccc tgatataccc ggtggatcag atgcatttga acttgctgca 300
aaattttgtt atggaataaa ttttgagata agcacagaaa acattgcctt gctgagatgc 360
acagcggaat atcttgagat gacagaagac tatgcagttg ggaatttggt tggaagaact 420
gaggcctact taaatgaagt agctcttaaa agcctagctg gtgcagtttc aattttgcat 480
tcttcagaaa gccttcttcc cattgcagag aaagtaaaaa tggttagtcg atgcatcgac 540
acaattgcat atattgcatg caaggataac caattctgca catcaggtag agcagaggct 600
ggtactaacg gattgaattc gtccacgttt tcaaacccga agcctatggt tgattggtgg 660
gctgaggatt tagctgtcct tagaattgat tttttccaaa gggttctaat tgcaatgatg 720
ggaagaggat tcaagcagta tgcacttgga ccaatattaa tgctatatgc acagaagtct 780
cttcgaggtt tggaaatatt tggaaaggga aggaaaaaaa ttgagccaaa acaagaacat 840
gaaaagaggg ttgttttaga aacaattgtt agtcttctgc caagggagaa aaatgcattg 900
tcagttagct ttctgtcaat gctgctccga gctgcaatat atctagaaac cacagttgct 960
tgcaggcttg acttggagaa gaggatggca ttgcagcttg gacaggctgt gttagatgat 1020
ttattgattc cttcatattc cttcacaggg gacacattgt ttgatgttga aaccgtgcag 1080
cgtatcatca tgaatttcct tgacaatgaa atggatggaa gtcgattggg agatgaggag 1140
tatgtgtctc cttcattaag tgacatggag cgggttggga aacttatgga aaattacctt 1200
gctgaaatag cctcagaccg taatctatcc gtttcaaaat tcattagtct agctgaagtc 1260
atcccagagc aagcaaagat cactgaagat gggatgtaca gggcaattga tatttatttg 1320
aaggcacatc cagctctaag tgatatggaa agaaaaaaag tttgcggtgt tatggactgt 1380
caaaagctat ctagagaggc ttgtgctcat gctgctcaaa atgataggct ccctgttcag 1440
acagttgtgc aagtacttta ctacgagcag caacgccttc gtgaggtcat ggacgggagc 1500
caacttgtag caactgaacc tccagctcta attccttcta aaactaatca gttctccact 1560
gatatccgtc ctatttcaga tgaggtctct agtctaaaac gagaaaatca ggagctgaaa 1620
tttgagttgc taaagatgaa aatgaggttg aaagaaattg aaaaaccttc aaacaaatca 1680
gctactagca gccctttggt catcactcat ccatctgctg ataaacctcc tttgccaaga 1740
aaaccatcta atttcataag ctcagtatcc aaaaagcttg gaaaatttat tcgagcagat 1800
ggactcacag ccaacaaagg ccgaaataaa ccaagtaaag acaggcgtca ttctatatcc 1860
tga 1863
<210> 3
<211> 6688
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0000868g0020.2 genomic sequence
<220>
<221> misc_feature
<222> (5212)..(5405)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 3
ctgagctaaa tccttttcta ctctatttaa ccccaatcat tcacataata cctttaatac 60
cactcacatt tctgctgtag gggctcctca aacatgatct ttgttctgct aacattaagg 120
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gaaaagaaca tgtctttctg gtttttgctc cataaggaaa cagcttaaga gaaacctcta 300
ccgtagaccg aatgtgatgg acatggttaa gaccctttaa agtttcaatc atggtggatc 360
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tgctacatgg taattggcat gctaaactta gtaatcttga ttgaaatgcc ttctacaaca 2280
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gttttagcta agggatatgg tatgttagga agaagaacat tcctcatttc aaatggactt 2700
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Arg Leu Pro Val Gln Thr Val Val Gln Val Leu Tyr Phe Glu Gln Gln
485 490 495
Arg Leu Arg Gln Val Met Asp Gly Ser Leu Asp Gly Ala Asp Glu Ser
500 505 510
Ser Thr Asp Asn Asn Pro Val Thr Asp Glu Val Ser Ser Leu Lys Arg
515 520 525
Glu Asn Gln Asp Leu Lys Phe Glu Leu Val Lys Met Lys Thr Arg Leu
530 535 540
Asn Glu Ile Glu Lys Cys Gly Asp Ile Ser Ala Thr Ser Thr Pro Val
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Glu Ile Thr Thr Pro Ile Ser Ser Asp Lys Pro Arg Leu Arg Arg Lys
565 570 575
Ser Phe Ile Ser Ser Val Ser Glu Thr Leu Gly Lys Leu Tyr Pro Ile
580 585 590
Ser Phe Gly Ala Asp His Val Ile Met Pro Ser Ala Ser Lys Gly Arg
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Tyr Lys Pro Ile Ser Arg Asp Arg Arg Tyr Ser Ile Ser
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0009137g0040.2 coding sequence
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tcatga 1866
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0009137g0040.2 genomic sequence
<400> 9
ctatatccta atatatttaa ccccagtacc ttcacataaa catatgtaac actactcgtg 60
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Cys Gly Tyr Ile Arg Lys Leu Val Ala Lys Ser Asn Asp Ala Asn Leu
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Ser Glu Ile Glu Ile Pro Asp Ile Pro Gly Gly Ala Glu Ala Phe Glu
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Phe Ala Ala Lys Phe Cys Tyr Gly Ile Asn Phe Glu Ile Ser Ser Gly
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Asn Ile Ala Leu Leu Arg Cys Val Ala Glu Tyr Leu Asp Met Thr Asp
100 105 110
Asp Tyr Ala Val Gly Asn Leu Val Gly Leu Ser Glu Ser Tyr Leu Asn
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Ser Glu Lys Leu Leu Pro Ile Ala Glu Asn Ile Lys Leu Val Asn Arg
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Ser Ile Asp Thr Ile Ala Tyr Ile Val Cys Lys Asp Ser His Phe Cys
165 170 175
Lys Ser Gly Arg Ile Glu Val Asp Ala Asn Ser Leu Met Asn Ser Ser
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Met Ala Arg Gly Cys Lys Gln Tyr Ala Leu Gly Pro Val Leu Met Leu
225 230 235 240
Tyr Ser Gln Lys Ser Leu Gln Asn Leu Glu Ile Ser Gly Lys Glu Arg
245 250 255
Lys Leu Thr Glu Gln Arg Gln Val His Glu Lys Arg Val Val Val Glu
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Ala Ala Gln Asn Glu Arg Leu Pro Val Gln Thr Val Val Gln Val Leu
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Tyr His Glu Gln Gln Arg Leu Arg Gln Val Met Asp Gly Ser Leu Ala
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Asp Ala Asp Gln Ser Ser Ala Asp Asn Asn Pro Val Thr Asp Glu Phe
485 490 495
Ser Ser Leu Lys Arg Glu Asn Gln Asp Leu Lys Phe Glu Leu Val Lys
500 505 510
Met Lys Thr Arg Leu Lys Glu Ile Glu Lys Cys Gly Asp Lys Ser Ala
515 520 525
Ala Ser Thr Pro Leu Glu Ile Thr Thr Pro Ile Ser Ser Asp Lys Pro
530 535 540
Arg Leu Arg Arg Lys Ser Phe Ile Ser Ser Val Tyr Glu Lys Leu Gly
545 550 555 560
Lys Leu Tyr Pro Ile Ser Phe Gly Ala Asp His Val Val Met Pro Ser
565 570 575
Ala Ser Lys Gly Arg Tyr Lys Pro Ile Asn Arg Tyr Arg Arg Tyr Ser
580 585 590
Ile Ser
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<211> 1785
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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atgttcacta agaaaaaaga gcttctttcg aatgttatga aaaggacctc cgaatggatt 60
ttatcccagg agatcccaag tgatataact gttcatgttg caggaacttc ctttgctctg 120
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ag 4142
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Arg Ile Leu Val Asn Phe Ser Gln Gln Glu Gly Asp Ser Asp Glu Asp
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tctgcgtaca taatacactt tccagacctt acttgtggag ttacattggg tatgttgtcg 840
ttgttgttgt acacatagtc cgagcctaag acagtgaatg cacgtgctac cactacctct 900
atgttaaatc ttaccctaga agagaaagat caaaatgtta gtctttctgc taattggttg 960
atttgtatgt tatagggtat ttcgagatgt tcctagtgat ataacaatag aagtggatgg 1020
tggcatattt tcattacaca aggtaattct ctccattctc tattatctta taatcaattt 1080
ggccaagctt ctccaatcct agaaatactt tttttcaaag tttaattgtt tggcaatctt 1140
ttgtaaggaa aaaaattgtt tttgatgaga atcagaagct ttttttggaa aagcagaaaa 1200
aagtaggctc tccataaaaa cactttttta aagcactttt gataaaaaaa atatatttac 1260
gagcagtttt taaaagtttg gccaaatact aattgttgct cagaaatgtt tttcaaatta 1320
attagccaaa cacaaactct ttcttgccaa aagtacgttt gaaaaagcac ttttgagaaa 1380
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atgcactact tttagtggat caaacatgca tgtgttggca tttctgaaga gcatgaacaa 1500
cataaactgc ttagtagtat tgctcactat gtcttgtttt cacacatttt atattgaagt 1560
gtttgaaatt tttaaaattt catgcctatg agttagttca gagaccataa tgtaatagaa 1620
aattccctaa catagaataa ttatgatgca gtttcccctt gtttcgagaa gcggacgaat 1680
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gatcacagca gcaaatgttg ctcagctttg ttgtgtatcc gattacctcg agatgtcaga 1860
ggactactca aaaaacaatc ttggctccag agctgaagaa tatcttgaca gcattgtttg 1920
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ggttgcttgt aggcttgatc ttgagaggcg gataggatct caattggata cggctactct 2460
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<213> Artificial Sequence
<220>
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165 170 175
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Leu Phe Cys Ser Tyr Pro Asp Asp Asp Ile Lys Pro Met His Gln Ser
485 490 495
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500 505 510
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0002641g0190.2 coding sequence
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<211> 4552
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0002641g0190.2 genomic sequence
<400> 21
caaaatctct cctattgtgt ctctgtcccc ttattttctt gtcttcttta acaaaccttt 60
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gaaacgcctt gttttgttca taccctgatg atgacattaa gccaatgcac caatcctgga 3840
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<223> Nitab4.5_0001876g0030.2 amino acid sequence
<400> 22
Met Val Ser Pro Tyr Asn Ser Phe Thr Thr Arg Thr Ile Phe Ser Glu
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Val Ala Gly Asp Ile Thr Ile Ala Ala Asn Gly Glu Ser Phe Leu Leu
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His Lys Phe Pro Leu Val Ser Leu Ser Gly Lys Ile Arg Lys Met Val
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Ala Asp Ala Asn Asp Pro Asn Leu Ser Glu Leu Asp Leu Asn His Val
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100 105 110
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450 455 460
Phe Glu Gln Leu Arg Leu Lys Asn Ala Leu Ser Gly Ser Cys Gly Asp
465 470 475 480
Thr Phe Val Ser Gln Lys Ile Ser Ser Gly Leu Thr Ser Ala Ala Met
485 490 495
Ser Pro Arg Asp Thr Tyr Ala Ser Leu Arg Arg Glu Asn Arg Glu Leu
500 505 510
Lys Leu Glu Ile Ser Arg Met Arg Val Arg Leu Ser Asp Leu Glu Lys
515 520 525
Glu Gln Val Phe Met Lys Gln Gly Met Met Asp Lys Thr Gly His Gly
530 535 540
Lys Thr Phe Leu Thr Ser Leu Ser Arg Gly Ile Gly Arg Ile Gly Ile
545 550 555 560
Phe Gly Ser Pro Ser Gly Glu Lys His His Lys Ser Gly Arg Lys Ser
565 570 575
Arg Thr Ser Glu Gly Lys Thr Gly Arg Ser Arg Arg Tyr Ser Leu Ser
580 585 590
<210> 23
<211> 1779
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0001876g0030.2 coding sequence
<400> 23
atggtgtctc cttacaactc atttaccact cgcactatat tctctgaagt tgctggggat 60
attacaattg ctgcaaatgg agagtctttc ctactgcata agtttcccct ggtatctttg 120
agtggaaaga tccggaagat ggtggcagat gccaacgatc caaatctctc agaattggat 180
ttgaatcacg taccaggagg acctgaaaca tttgaactgg ctgcaaagtt ttgttatggc 240
atgaactttg agatcacaac cacaaacgta gcacgtttgc gctgtgtggc agaatacttg 300
gaaatgacag aagattatcg tgaagagaat ctcattgcaa gaacagaaac tttccttgat 360
gaagttgtct ctccaagtct tgaaaaatcc gtgcaagtac tttcttcctg tgaagctctt 420
cttcctactg cagaggaggt tggtattcca gatagatgca ttgatgccat tgccaggaat 480
gcttgtcaag agcaacttgt atccagtcta tctcgtttag attgtgatag tggatctttg 540
gaacttaagg acaggtgtct tgaatggtgg gtcgaagatt tttctgttct gagtattgat 600
ttttatcgca gagttatcat ggcaatggga catgctgggg tacacataga cagcattatt 660
gcgtccttga tgcattatgc ccaggtctct ctaaagggta ttgggaaacc gcaaatttgg 720
aatccagcca gatcgtatcc ttgtaaggga gaaaaggggc agagaacaat aatagaaact 780
cttgttagtc tattgcctcc agaaaagagt tcatctgttc ctctgaattt tctttttggg 840
atgttgagga taggtatcat ggtggatgcc acgctagcct gcaggcttga aattgagagg 900
aggattgcct tccggctgga aatggtctta cttgatgatt tgcttatacc atctgtccag 960
actacaggtg attctttgtt tgatgttgac acggtcaagc ggatattgat acatttcctc 1020
caaaggattg accaggaaga aaatgaagat tgtggatatg aatcagaagg tattgattct 1080
ccaagccatg gcgctctatt gaaagttgga cggctgatag acacatatct tgctgaaata 1140
gctcctgatc catatttgag tctcgacaaa ttcactgcta tgatatcaat gttgcctgat 1200
tatgctcgtg taattgatga cggactttac agagctattg atgtttattt gaaggcccat 1260
ccaacgctaa gtgagcatgg cgcgaagaag ctgtgcaagt tcatagattg ccagaagctc 1320
tctcaagaag catgcaatca tgcagcacag aatgagagac tcccagttca aatgactgtc 1380
cgagttctct actttgagca gctccgcctt aagaatgctc tatctggaag ttgtggagat 1440
acttttgtat cacaaaagat cagtagtggt cttacaagtg cagctatgtc gcctagagat 1500
acttacgctt ctttaaggag agagaaccga gaactgaagc tggagatatc aagaatgagg 1560
gtaaggctca gtgacctgga gaaggaacaa gtgttcatga aacaaggtat gatggataaa 1620
acaggacatg ggaaaacatt cttaacttcc ctttctagag gcataggaag aattggtata 1680
tttggcagtc cttctggaga aaaacatcac aagtcgggtc gcaaatccag gacatcagaa 1740
ggtaaaactg gtaggagtag gaggtattct ctttcctag 1779
<210> 24
<211> 4139
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0001876g0030.2 genomic sequence
<220>
<221> misc_feature
<222> (4114)..(4139)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 24
ataagatcaa gcctttcctt gattttaata atattagaat agaattaagc aaagcatgca 60
cataccttcc aatattttac tactcaatca aataactagg ttttaatcct gaattagtta 120
gatgattatc tatatctgct tcacttgact ctactaatgt ttaaaagaat tcatcaaaat 180
ttgatactag tagattatag tttcgataat ggtgaatagg atgacaatat tggtaaggta 240
gagacaaagg aataaaaagc aaaaggggaa aaggtatttt gtgttgcagt agaacacttc 300
acatggccac ccatttctgt attctttagc tttttctctt tgcattattt atgtatcacc 360
attcctatgt cacactttcc cttttaggtc ttcttattgt tgcttgtatt gggatttgac 420
tgcaagagtg cttcatcaga tggtgctgct gctctaaagt ctaaagtgaa gctcatacaa 480
gaatggtgtc tccttacaac tcatttacca ctcggtaatc tccatcttct gggctacaca 540
tatataactg ttgatcaaga attattcggt tacagtatca aagacagttt ttttactgcg 600
aattatgtgt tggccttggt ttttgatcat catattctga atgacatgtt tgatgaatgt 660
acattttcaa tgaatttagt ctttcagctt gatttgagct accccacccc ctccagcagc 720
ccatcttggc tgccctgctt gatgattcat gctatgatta tattgtttcc tctctccaat 780
tattattttt tcagtacgca ttgcacctta caaacattat ccttataggg attacttaac 840
attatccttt ccaaattccc tccagtgaat agttacagga aggccttgtt agagtaactc 900
tttcttctga catttgaagg gtagccttgg cgcaattggt aaagttgctt ccatgtgacc 960
atgaggtcac gggttcgagc cgtggaaaca gcctcttgca gaaatgcagg gtaagactgc 1020
gaacgataga cccttccccg gacccgcgca tagtgggagc ttagttcacc ggaccaccct 1080
ttttttcttc tgacatttat atgctttctt tgcgtatgtc atactctctt tagtatacta 1140
tttcacataa tttgtcaaac atgtcaaagt gctactactg tgaacttgag tattggtgtc 1200
ctttcttatc atcttcttcg ttttcatcga taaacttgat ctgtcatgtc agtaggagga 1260
aatgcatcac tttacccccc aacacttcct aattcatctg ttatttcatg aataatgaac 1320
aaaacaccat aaaagcgtta atacttttta tgacatggta aatttattaa ggcaaataaa 1380
tactttgtca tgtcaaaatc attgcgataa atcaacttat tcgtgatgat attgatcagc 1440
actatattct ctgaagttgc tggggatatt acaattgctg caaatggaga gtctttccta 1500
ctgcataagg tactttcctg ttttcagaaa ctttctgcct ttggataatt taagaacgtt 1560
tgaacttcaa ataaggttag aaatatatat aaattatcag gatcatgcta aaggttcaag 1620
atcatgcata gtgggagagg gtggggtttt gtttaaagac acttgtttct ttcgtcttgg 1680
ttactaacta gatagattga gattgtgatg gtggtaaaat ttgaaattca gaggattatc 1740
agacttggtt gagaatgttc ctgtagtttg atagattatt aagattgaaa aaccaaagtt 1800
tccattaatg gtgtatttgg ctatcaagaa aaaaaaagca acaattgttg tagtgatggt 1860
atacgtaatg taagctaact ttaagatcac aattctggaa cacattgtag tttgaaaaga 1920
actccatctg ggcatgtaat gcagctaaaa ataatgacag tgaagtctgt catattaagg 1980
atactttagc aaatgattga aatggtcatt cttctaggag tagcattgcg acaaatgctt 2040
tccagaaatc aattttatga ttataacatg tgaatcttag ccttgtctag gcgtttcatc 2100
gtgaactatt taataattaa cttatctctt ccttattcga cattatactt cattcttgaa 2160
gttgataatt atgtgatgtt tacaatagtt tcccctggta tctttgagtg gaaagatccg 2220
gaagatggtg gcagatgcca acgatccaaa tctctcagaa ttggatttga atcacgtacc 2280
aggaggacct gaaacatttg aactggctgc aaagttttgt tatggcatga actttgagat 2340
cacaaccaca aacgtagcac gtttgcgctg tgtggcagaa tacttggaaa tgacagaaga 2400
ttatcgtgaa gagaatctca ttgcaagaac agaaactttc cttgatgaag ttgtctctcc 2460
aagtcttgaa aaatccgtgc aagtactttc ttcctgtgaa gctcttcttc ctactgcaga 2520
ggaggttggt attccagata gatgcattga tgccattgcc aggaatgctt gtcaagagca 2580
acttgtatcc agtctatctc gtttagattg tgatagtgga tctttggaac ttaaggacag 2640
gtgtcttgaa tggtgggtcg aagatttttc tgttctgagt attgattttt atcgcagagt 2700
tatcatggca atgggacatg ctggggtaca catagacagc attattgcgt ccttgatgca 2760
ttatgcccag gtctctctaa agggtattgg gaaaccgcaa atttggaatc cagccagatc 2820
gtatccttgt aagggagaaa aggggcagag aacaataata gaaactcttg ttagtctatt 2880
gcctccagaa aagagttcat ctgttcctct gaattttctt tttgggatgt tgaggatagg 2940
tatcatggtg gatgccacgc tagcctgcag gcttgaaatt gagaggagga ttgccttccg 3000
gctggaaatg gtcttacttg atgatttgct tataccatct gtccagacta caggtgattc 3060
tttgtttgat gttgacacgg tcaagcggat attgatacat ttcctccaaa ggattgacca 3120
ggaagaaaat gaagattgtg gatatgaatc agaaggtatt gattctccaa gccatggcgc 3180
tctattgaaa gttggacggc tgatagacac atatcttgct gaaatagctc ctgatccata 3240
tttgagtctc gacaaattca ctgctatgat atcaatgttg cctgattatg ctcgtgtaat 3300
tgatgacgga ctttacagag ctattgatgt ttatttgaag gtgaattttc aagtttttag 3360
ttatagacct gtatattgtt ctagcaatgc cttctaatga taacatgttc tttatattgg 3420
tggtttgaat attcttcttt gcgcatataa tgttgtgttt aaccctgaaa gctgtttaat 3480
gcttttagta aaatcacatc tcaacccctt ataaacatag ttttagttga atctgccatt 3540
tatctctttg tgaactttac taggcccatc caacgctaag tgagcatggc gcgaagaagc 3600
tgtgcaagtt catagattgc cagaagctct ctcaagaagc atgcaatcat gcagcacaga 3660
atgagagact cccagttcaa atgactgtcc gagttctcta ctttgagcag ctccgcctta 3720
agaatgctct atctggaagt tgtggagata cttttgtatc acaaaagatc agtagtggtc 3780
ttacaagtgc agctatgtcg cctagagata cttacgcttc tttaaggaga gagaaccgag 3840
aactgaagct ggagatatca agaatgaggg taaggctcag tgacctggag aaggaacaag 3900
tgttcatgaa acaaggtatg atggataaaa caggacatgg gaaaacattc ttaacttccc 3960
tttctagagg cataggaaga attggtatat ttggcagtcc ttctggagaa aaacatcaca 4020
agtcgggtcg caaatccagg acatcagaag gtaaaactgg taggagtagg aggtattctc 4080
tttcctagaa aaggttgtat gccacaatgt aaannnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnn 4139
<210> 25
<211> 663
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0000048g0280.2 amino acid sequence
<400> 25
Met Ala Met His Pro Ser Ala Lys Cys Ala His Phe Cys Ile Asn Ser
1 5 10 15
Leu Ala Phe Ser Leu Cys Ile Ile Tyr His Ser His Phe Pro Phe Leu
20 25 30
Val Phe Phe Gln Arg Leu Leu Leu Leu Val Leu Gly Phe Asp Cys Lys
35 40 45
Ser Ala Ala Asp Gly Ala Ala Ala Leu Lys Ser Lys Val Lys Leu Lys
50 55 60
Phe Leu Thr Thr His Thr Arg Met Val Ser Pro Tyr Asn Ser Phe Thr
65 70 75 80
Thr Arg Thr Ile Phe Ser Glu Val Ala Gly Asp Ile Thr Ile Ala Ala
85 90 95
Asn Gly Glu Ser Phe Leu Leu His Lys Phe Pro Leu Val Ser Leu Ser
100 105 110
Gly Lys Ile Gln Lys Met Val Ala Asp Ala Asn Asp Pro Asn Leu Pro
115 120 125
Glu Leu Asp Leu Thr His Val Pro Gly Gly Pro Glu Thr Phe Glu Leu
130 135 140
Ala Ala Lys Phe Cys Tyr Gly Met Asn Phe Glu Ile Thr Thr Thr Asn
145 150 155 160
Val Ala Arg Leu Arg Cys Val Ala Glu Tyr Leu Glu Met Thr Glu Asp
165 170 175
Tyr Arg Glu Glu Asn Leu Ile Ala Arg Thr Glu Thr Phe Leu Asp Glu
180 185 190
Val Val Ser Pro Ser Leu Glu Lys Ser Val Gln Val Leu Ser Ser Cys
195 200 205
Glu Ala Leu Leu Pro Thr Ala Glu Glu Val Gly Ile Pro Asp Arg Cys
210 215 220
Ile Asp Ala Ile Ala Arg Asn Ala Cys Gln Glu Gln Leu Val Ser Gly
225 230 235 240
Leu Ser Arg Leu Asp Cys Asp Thr Gly Ser Leu Glu Leu Lys Asp Arg
245 250 255
Cys Leu Glu Trp Trp Val Glu Asp Leu Ser Ala Leu Ser Ile Asp Phe
260 265 270
Tyr Arg Arg Val Ile Met Ala Met Gly His Val Gly Val His Ile Asp
275 280 285
Ser Ile Ile Ala Ser Leu Met His Tyr Ala Gln Val Ser Leu Lys Gly
290 295 300
Ile Gly Lys Pro Gln Ile Trp Asn Pro Ala Arg Ser Tyr Pro Cys Lys
305 310 315 320
Gly Glu Lys Gly Gln Arg Thr Ile Ile Glu Thr Leu Val Ser Leu Leu
325 330 335
Pro Pro Glu Lys Ser Ser Ser Val Pro Leu Asn Phe Leu Phe Gly Val
340 345 350
Leu Arg Ile Gly Ile Met Val Asp Ala Thr Leu Ala Cys Arg Leu Glu
355 360 365
Ile Glu Arg Arg Ile Ala Phe Arg Leu Glu Met Val Leu Leu Asp Asp
370 375 380
Leu Leu Ile Pro Ser Val Gln Thr Thr Gly Asp Ser Leu Phe Asp Val
385 390 395 400
Asp Thr Val Lys Arg Ile Leu Ile His Phe Leu Gln Arg Ile Asp Gln
405 410 415
Glu Glu Asn Glu Asp Cys Gly Tyr Glu Ser Gln Gly Ile Asp Ser Pro
420 425 430
Ser His Gly Ala Leu Leu Lys Val Gly Arg Leu Ile Asp Thr Tyr Leu
435 440 445
Ala Glu Ile Ala Pro Asp Pro Tyr Leu Ser Leu Asp Lys Phe Thr Ala
450 455 460
Met Ile Ser Val Leu Pro Glu Tyr Ala Arg Val Ile Asp Asp Gly Leu
465 470 475 480
Tyr Arg Ala Ile Asp Val Tyr Leu Lys Ala His Pro Thr Leu Ser Glu
485 490 495
His Glu Ala Lys Lys Leu Cys Lys Phe Ile Asp Cys Gln Lys Leu Ser
500 505 510
Gln Glu Ala Cys Asn His Ala Ala Arg Asn Asp Arg Leu Pro Val Gln
515 520 525
Met Thr Val Arg Val Leu Tyr Phe Glu Gln Leu Arg Leu Lys Asn Ala
530 535 540
Leu Ser Gly Ser Cys Gly Asp Thr Phe Val Ser Gln Lys Ile Ser Ser
545 550 555 560
Gly Leu Thr Ser Ala Ala Met Ser Pro Arg Asp Thr Tyr Ala Ser Leu
565 570 575
Arg Arg Glu Asn Arg Glu Leu Lys Leu Glu Ile Ser Arg Met Arg Val
580 585 590
Arg Leu Ser Asp Leu Glu Lys Glu Gln Val Phe Met Lys Gln Gly Met
595 600 605
Met Asp Lys Thr Gly His Gly Lys Thr Phe Leu Thr Ser Leu Ser Arg
610 615 620
Gly Ile Gly Arg Ile Gly Ile Phe Ser Ser Pro Ser Gly Glu Lys His
625 630 635 640
His Lys Ser Gly Arg Lys Ser Arg Thr Ser Glu Gly Lys Thr Gly Arg
645 650 655
Ser Arg Lys Tyr Ser Leu Ser
660
<210> 26
<211> 1992
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0000048g0280.2 coding sequence
<400> 26
atggccatgc acccttctgc caaatgtgcc catttctgta ttaattcttt agctttttct 60
ctttgtatta tttatcactc acatttcccc tttttggtct tctttcaacg cttattgttg 120
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ttcctactgc ataagtttcc cctggtatct ttgagtggaa agatccagaa gatggtggcg 360
gatgccaacg atccaaatct cccagaattg gatttgactc acgtaccagg aggacctgaa 420
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ggagaaaagg ggcagagaac aataatagaa actcttgtta gtctattgcc tccagaaaag 1020
agttcatctg ttccgctgaa ttttcttttt ggggtgttga ggataggtat catggtggat 1080
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ttacttgatg atttgcttat accatctgtc cagactacag gtgattcttt gtttgatgtt 1200
gacactgtca agcggatatt gatacatttc ctccaaagga ttgaccagga agaaaatgaa 1260
gattgtggat atgaatcaca aggtattgat tctccaagcc atggcgctct attgaaagtt 1320
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aaattcactg ctatgatatc agtgttgcct gagtatgctc gtgtaattga tgacggactt 1440
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ggtcttacaa gtgcagctat gtcgcctaga gatacttatg cttctttaag gagagagaac 1740
cgagaactaa agctggagat atcaagaatg agggtaaggc tcagtgacct ggagaaggaa 1800
caagtgttca tgaaacaagg tatgatggat aaaacaggac atggaaaaac attcttaact 1860
tccctttcaa gaggtatagg aagaattggt atatttagca gtccttctgg agaaaaacat 1920
cacaagtcgg gtcgcaaatc caggacatca gaaggtaaaa ctggtaggag taggaagtat 1980
tctctttcct ag 1992
<210> 27
<211> 4246
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0000048g0280.2 genomic sequence
<400> 27
caattaacta cgttttaatc ctaaaatagt tggatgatta tatgaattat ctatatctgc 60
ttcactctag ctactaatgt gtaaagaatt catcaaaatt tgatactagt ctactagtat 120
tagactaagt agattagagt ttcgataata taatgatgat ataaacattg gtaaggtaga 180
gacaaaggaa taaaaagcaa aaggggaaaa ggtattttgt gttgcagtaa aacacttcac 240
atggccatgc acccttctgc caaatgtgcc catttctgta ttaattcttt agctttttct 300
ctttgtatta tttatcactc acatttcccc tttttggtct tctttcaacg cttattgttg 360
cttgtcttgg gatttgactg caagagtgct gcagatggtg ctgctgctct aaagtctaaa 420
gtgaagctca agtttcttac aactcataca agaatggtgt ctccttacaa ctcatttacc 480
actcggtaat ctccatcttc atgtctctat gtggtacaca tgactgttga tcatcccttt 540
agaatttcaa gaattattcg gctacagtaa taaatagttt aacagagtaa tttgtttgga 600
taaatagttt aaaagaccta tttactgcaa attatgagtt ggccatggtt tttgatcatc 660
atattctgaa tgtccatttt caatgaattt agtctttgag cttgatttga gctaccccac 720
ctcctccagt agcccatctt ggctgccctg cttgatgatt catgctatga ttatattgtt 780
tcctcactcc aattattata ttttcagtat tcattgcacc ttacgaaaat ctctcttttg 840
ttttttttcc acggaatatt acttataggg attacttaac attatccttt ccaaattccc 900
tcctgtgaat agttacagga aggccttgct tatggaagta actctttctt ctgacattta 960
tatgctttct ttgagtatgt cattgtctct ttagtatgct atttcacata atttgaaagt 1020
gctactactg tgaacttgaa tatttgtgtc ctatcttatc atcttcttca ttttcaccga 1080
taaacttgat ctgtcattag gaggaaatgc atcactttac ccaagacttc ctaattcatc 1140
tgttatttca tgaataatta ataaaatacc acaaatttat gacatggtaa atttattatg 1200
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aaagctacaa tacaattgtt gtagtgatgg tatacgtaat gtaagctaac tttaagatca 1740
caattttgga acaaattgaa gtttgaaaag aactccagct ggcatgtaat gcagctaaaa 1800
ataattctgt atctagaagc aagccccttg taacttgttg ttgtctttag accaacttta 1860
tcatgcctcg tcaagggcac tactagatga gatgacgcat cttatacatt gaaactttta 1920
attcaagcac ccagtggtaa tgacagtgaa gtctgtcata ttaaggacac tttagcaaat 1980
gattgaaatg gtcattcttt taggagtagc attgcgacaa atgctttcca gaaatcaatt 2040
ttatgattat aacatgtgaa tcttagcctt gtctgggcgt ttcatcatga actatttaat 2100
aattaactta tctcttcctt attcgacatt attagttaat tgcatacatc attcttgaag 2160
ttgataatta tgtgatgttt acaatagttt cccctggtat ctttgagtgg aaagatccag 2220
aagatggtgg cggatgccaa cgatccaaat ctcccagaat tggatttgac tcacgtacca 2280
ggaggacctg aaacatttga actggctgca aagttttgtt atggcatgaa ctttgagatc 2340
acaaccacaa acgtagcacg tttgcgctgt gtggcagaat acttggaaat gacagaagat 2400
tatcgtgaag agaatctcat tgcaagaaca gaaactttcc ttgatgaagt tgtctctcca 2460
agtcttgaaa aatccgtgca agtactttct tcctgtgaag ccctgcttcc tactgcagag 2520
gaggttggta ttccagatag atgcattgat gccattgcca ggaatgcttg tcaggagcaa 2580
cttgtatccg gtctatctcg tttagattgt gatactggat ctttggaact taaggacagg 2640
tgtcttgaat ggtgggtcga agatctatct gctctgagta ttgattttta tcgcagagtt 2700
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cctccagaaa agagttcatc tgttccgctg aattttcttt ttggggtgtt gaggataggt 2940
atcatggtgg atgccacgct agcctgcagg cttgaaattg agaggaggat tgccttcagg 3000
ctggaaatgg tcttacttga tgatttgctt ataccatctg tccagactac aggtgattct 3060
ttgtttgatg ttgacactgt caagcggata ttgatacatt tcctccaaag gattgaccag 3120
gaagaaaatg aagattgtgg atatgaatca caaggtattg attctccaag ccatggcgct 3180
ctattgaaag ttggacggct gatagacaca tatcttgctg aaatagctcc tgatccatat 3240
ttgagtcttg acaaattcac tgctatgata tcagtgttgc ctgagtatgc tcgtgtaatt 3300
gatgacggac tttacagagc tattgatgtt tatttgaagg tgaattttca agtttttagt 3360
tatagacctg tatattattc tagcaatccc tgctaatgat aacatgttct ttatattggt 3420
ggtctgaata ttcttctttg cgcatataaa gtgcacaaaa agaatatgtt gtgttttaac 3480
cctgcaagct gtttaatgct ttaagtaaaa tcacatctca accccttata aacatagttt 3540
tagttgattc tgccatttat ctctttgtga acttcactag gcccatccaa cgctaagtga 3600
gcatgaagcg aagaagctgt gcaagttcat agattgccag aagctctctc aagaagcatg 3660
caatcatgca gcacggaatg acagactccc agttcaaatg actgtccgag ttctctactt 3720
tgagcagctc cgccttaaga atgctctatc cggaagttgt ggagatactt ttgtatcaca 3780
aaagatcagt agtggtctta caagtgcagc tatgtcgcct agagatactt atgcttcttt 3840
aaggagagag aaccgagaac taaagctgga gatatcaaga atgagggtaa ggctcagtga 3900
cctggagaag gaacaagtgt tcatgaaaca aggtatgatg gataaaacag gacatggaaa 3960
aacattctta acttcccttt caagaggtat aggaagaatt ggtatattta gcagtccttc 4020
tggagaaaaa catcacaagt cgggtcgcaa atccaggaca tcagaaggta aaactggtag 4080
gagtaggaag tattctcttt cctagaaaag cttgtatgcc acaatgtaaa ttaatgcatg 4140
actcaagagt tttgcaaaag tggctaatta ttggtgagtg ctcgtttaat ttcttgctgt 4200
cctagccaat ctcttagata tcatgcttca cattgttgaa cttgtt 4246
<210> 28
<211> 629
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0002006g0070.2 amino acid sequence
<400> 28
Met Gly Val Val Thr Val Ser Glu Leu Lys Pro Ser Ile Ser Gly Lys
1 5 10 15
Arg Ser Phe Arg Pro Ser Ser Ser Ala Arg His Ile Thr Glu Trp Pro
20 25 30
Ile Ser Asp Val Ser Ser Asp Leu Thr Ile Glu Val Gly Ala Ala Ser
35 40 45
Phe Ala Leu His Lys Phe Pro Leu Val Ser Arg Ser Gly Arg Ile Arg
50 55 60
Lys Leu Leu Leu Glu Ala Lys Asp Thr Lys Ile Ser Arg Leu Asn Leu
65 70 75 80
Thr Gly Leu Pro Gly Gly Ser Asp Ala Phe Glu Leu Ala Ala Lys Phe
85 90 95
Cys Tyr Gly Val Asn Val Glu Ile Thr Ile Ser Asn Val Ala Met Leu
100 105 110
Arg Cys Ala Ser Lys Phe Met Glu Met Asn Glu Asp Ile Ser Glu Lys
115 120 125
Asn Leu Glu Ile Arg Thr Glu Val Phe Leu Lys Asp Thr Val Phe Thr
130 135 140
Asn Ile Ser Asn Ser Ile Ser Val Leu His Arg Cys Glu Thr Leu Leu
145 150 155 160
Pro Val Ser Glu Glu Val Asn Leu Val Ser Arg Leu Ile Asn Ala Ile
165 170 175
Ala Asn Asn Ala Cys Lys Glu Gln Leu Thr Ser Gly Leu Ser Lys Leu
180 185 190
Glu His Asn Phe Pro Pro Lys Pro Val Gln Ser Leu Asp Ser Glu Thr
195 200 205
Pro Ile Asp Trp Trp Gly Lys Ser Leu Thr Val Leu Asn Leu Asp Phe
210 215 220
Phe Gln Arg Val Val Ser Val Val Lys Ser Lys Gly Leu Lys Gln Asp
225 230 235 240
Ile Ile Ser Arg Ile Leu Ile Asn Tyr Ala Lys Asn Ser Leu Gln Gly
245 250 255
Leu Phe Ile Lys Asp Pro Gln Leu Val Lys Gly Ser Phe Leu Asp Leu
260 265 270
Asp Leu Gln Lys Arg Gln Arg Val Ile Val Glu Thr Ile Ala Ser Leu
275 280 285
Leu Pro Thr Gln Ser Arg Lys Ser Thr Val Pro Met Ala Phe Leu Ser
290 295 300
Ser Leu Leu Lys Ser Ala Ile Ala Ala Ser Ala Ser Thr Ser Cys Arg
305 310 315 320
Ser Asp Leu Glu Arg Arg Ile Gly Leu Gln Leu Asp Gln Ala Ile Leu
325 330 335
Glu Asp Ile Leu Ile Pro Ala Asn Pro His Gly Asn Asn His Ser Pro
340 345 350
Leu Tyr Asp Ile Asp Ser Ile Leu Arg Ile Phe Ser Phe Phe Leu Asn
355 360 365
Leu Asp Glu Asp Asp Glu Glu Asp Asn Thr Leu Arg Asp Glu Ser Glu
370 375 380
Met Val Tyr Asp Phe Asp Ser Pro Gly Ser Pro Lys His Ser Ser Ile
385 390 395 400
Val Lys Val Ser Lys Leu Leu Asp Asn Tyr Leu Ala Glu Val Ala Leu
405 410 415
Asp Ser Asn Leu Thr Pro Ser Lys Tyr Ile Ala Leu Ala Glu Leu Leu
420 425 430
Pro Asp His Ala Arg Leu Val Tyr Asp Gly Leu Tyr Arg Ala Val Asp
435 440 445
Ile Phe Leu Lys Val His Pro Asn Ile Lys Asp Ser Glu Arg Tyr Arg
450 455 460
Leu Cys Lys Thr Ile Asp Cys Gln Lys Leu Ser Gln Glu Ala Cys Ser
465 470 475 480
His Ala Ala Gln Asn Glu Arg Leu Pro Val Gln Met Ala Val Gln Val
485 490 495
Leu Tyr Phe Glu Gln Ile Arg Leu Arg Asn Ala Met Asn Gly Gly His
500 505 510
Asn Gln Phe Phe Gly Met Asn Asn Gln Phe Pro Gln Arg Ser Gly Ser
515 520 525
Gly Ala Gly Ser Gly Cys Ile Ser Pro Arg Asp Asn Tyr Ala Ser Val
530 535 540
Arg Arg Glu Asn Arg Glu Leu Lys Leu Glu Val Ala Arg Met Arg Met
545 550 555 560
Arg Leu Thr Asp Leu Glu Lys Asp His Val Ser Met Lys Gln Glu Leu
565 570 575
Val Lys Ser His Pro Ala Asn Lys Leu Phe Lys Ser Phe Thr Lys Lys
580 585 590
Leu Ser Lys Leu Asn Ala Leu Phe Arg Ile Lys Asp Leu Lys Pro Ile
595 600 605
Gly Gly Lys Ala Asn Ser Glu Ser Arg Leu Leu Phe Gln Lys Arg Arg
610 615 620
Arg His Ser Val Ser
625
<210> 29
<211> 1890
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0002006g0070.2 coding sequence
<400> 29
atgggagttg tcactgtttc tgaactgaag ccaagcatat ctgggaaaag gtcttttcgt 60
ccaagttcca gtgccagaca tattactgaa tggccaatat ctgatgtttc tagtgatctt 120
acaatagaag taggagctgc cagttttgct cttcacaagt ttcctctagt ttcccgaagc 180
ggaagaatta gaaagctgct gctagaggca aaggatacaa agatttcaag actcaatctt 240
accggtcttc ctggcggatc tgatgcattt gaacttgctg ctaagttctg ttatggcgtg 300
aacgttgaga ttaccatatc aaacgtggcg atgctaagat gtgcatccaa gttcatggaa 360
atgaacgaag acatctccga gaaaaacctg gaaattcgta ctgaagtatt ccttaaagat 420
acagtattca caaacatatc caactcgata tctgttcttc atcgctgtga aacactacta 480
ccggtatctg aagaagtcaa tctcgttagt cgattaatca atgcaattgc aaacaatgct 540
tgtaaagagc aactaacatc tggtttgtca aagctggagc ataacttccc acccaaacct 600
gttcaaagcc ttgattctga gacaccaata gactggtggg gaaaatcatt gactgtgcta 660
aatctagatt ttttccagag agttgtatct gtagtgaagt caaaaggtct taaacaagac 720
attatcagca gaattttgat aaattatgcc aaaaattcac ttcagggact tttcatcaag 780
gatcctcagt tggttaaagg aagtttcttg gatttggatt tgcagaaaag gcaaagggtt 840
atcgtcgaaa caatagctag cttactacca acacaatcca ggaaaagtac agtcccaatg 900
gcttttcttt caagtttgtt aaaatctgca atagcagcat cagcatccac ttcttgcaga 960
tctgatctag agaggcgcat tggtctgcag ctagatcagg caattctaga agatattctc 1020
atacctgcaa atccacatgg gaacaaccac agccctctct acgacataga ttctattttg 1080
aggatctttt cctttttctt gaatttggat gaggatgatg aagaggacaa cacactaaga 1140
gatgaaagcg aaatggttta cgactttgat agtcctggat ctcccaaaca tagctcaatt 1200
gttaaggtgt caaagttatt ggacaattat ctagcagaag ttgcactcga ttctaacctc 1260
acgccatcga agtatatagc actggctgag ttacttccag accacgcgcg tctagtttat 1320
gatggattat atcgagctgt agatattttc ctcaaggttc atcccaacat taaggactcg 1380
gaacgctatc gtctctgtaa aactattgat tgccagaaac tatcacaaga agcttgcagt 1440
catgcagcac aaaatgaacg gttgcctgtg caaatggcgg tccaagtgct atacttcgaa 1500
caaatcaggc tgagaaatgc gatgaacggg ggacataacc aattctttgg aatgaataat 1560
cagttccccc agcgttcagg cagcggagca ggaagcggat gcatctctcc gagagataac 1620
tacgcatcag tcaggagaga aaatagagaa ctgaagctcg aggttgcaag aatgagaatg 1680
aggcttacag atttagagaa agatcatgtt tccatgaaac aggagctagt aaagtcacat 1740
cctgccaata agttattcaa gtcatttaca aagaaattaa gcaagctgaa tgcactattc 1800
cgaataaaag atttaaaacc aataggaggg aaagctaact cagaaagccg gttacttttt 1860
cagaagagaa ggcgccattc ggtttcttga 1890
<210> 30
<211> 4787
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nitab4.5_0002006g0070.2 genomic sequence
<220>
<221> misc_feature
<222> (1228)..(1241)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (1245)..(1245)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (1247)..(1247)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 30
ggagtggtta atggttttgg ggaagttgag attctgctga gagaagatgg gagttgtcac 60
tgtttctgaa ctgaagccaa gcatatctgg gaaaaggtct tttcgtccaa gttccagtgc 120
cagacatatt actgaatggt atatttactc tctcttctat ctcaccaaac aactgctact 180
ttcacattac taatatttta tgcccagctt ttcatttgtg tcatattttc ttaaaagaat 240
ttacatggat agtactgtaa ggatattcca cagaccattt tgatgatgta tcaatttcta 300
caattaatat ttcctacaac acttaagacg tggaaaagtc catattggta tagctagatg 360
atagcatgaa ttcttgttag ttgggtactt gtgattgtca attatgctga gttctaataa 420
aaggctcagt cctagacaaa ggatacatct tttcttttgg catagtaaaa ttagctaact 480
tggttccccc cccccccccc agatactaat actatgagat tataaaaagg gagtttctgc 540
aatttatcac taaaagttcc acttagagga agaagtttac tggtaacaac taaatggatc 600
atagaagaat taatgcaagg aaaaaactaa actcttcaac caccaaagta tctgaattta 660
tgagttaggt gattggacag aatttagttt ccaacattta tgacaaacca tgttcaggtg 720
ctgactaagt ggaaatggca atatacttat agctttagaa attgattgtg atggaactta 780
tcttaaaatc taagaatcta aagttattat cagatcctaa agtaaataaa agaaaacagc 840
agagtatgag tatacatgag cagtttctag ggctgcaatc attgaaaatg acaaatcaaa 900
tatttgactt tttaccacct acaacaaatg atagtggccc tgattccaat gtgttcaagt 960
ttcttgtttc aacatgtggt gtgaacggtg tagacagcta ctccctccgt ttcaatttat 1020
gtgaacccat ttgagtgggc acgaaattta agaaaagaga gaacttttaa actgtgttgt 1080
aaaatgaggg cacatatatt ttgtgtggct ataaatcatt gcataaaggt aaataaacgg 1140
aggtagtata ttatttccct agttttcaac atatgtatct aatgagggcc ctctaccaag 1200
tacagatgag tcctgcaatt atctgttnnn nnnnnnnnnn naaangncac atatattttg 1260
tgtggctata aatcattgca taaaggtaaa ttgtttccaa ataaggaaag gtgtcattct 1320
ttttggcacg gaccaaaaag gaaataagtt cacataaatt gaaacggagg tagtatatta 1380
tttccctagt tttcaacata tgtatctaat gagggccctc taccaagtac agatgagtcc 1440
tgcaattatc tgttagatta ctacagacca caagataaat cacaaccagg aataaatttc 1500
aaagaaacca gaatatgact accacttgct atgttggatc taaacacatt gaataatctt 1560
tgtatccatt caagatattt gttttgagct tttccactca tagtgtccta tgatactttt 1620
ggtcgtaaat tgtggccgta tgtacaagcg ctagagcacg ataacatatg ctccccgaac 1680
cgttaaggtt tcatccgctt gaatttggat agctttaagg ttccaatatc cagcattaca 1740
gtgttgagat gtaagttgca ccatgtattg aaacttaggc taaaaatata aacagagaag 1800
tttattagta tatgtttttt tctcgacaca tttcctgttt ccggctttta atcattgacc 1860
atatattcta ttgcaggcca atatctgatg tttctagtga tcttacaata gaagtaggag 1920
ctgccagttt tgctcttcac aaggtacaaa tatgaagtat tagatcattc gtcttctcgt 1980
gtattttgat ctaccaatct tttcaaaatt ggaatgctca agtctatcaa aagcataaat 2040
tttgcaaaga aatggctgtc taatgtagct tgaaaatgat ttataagtta gctgttataa 2100
gtaggcaact gatattagga cagtcgtgtc cacatcggaa tttatttcat ggtgtcaaaa 2160
tagggaggga aaagaaaagt aaaaaggcag atgtaaaaac agaacttaag catcagtctg 2220
aaggtcagaa acaacagctg aagttgtttc aatgtagtgg atcttagact aagttatgtg 2280
cttcctgtta aaattaagaa aaatgaagga agaatacctt ggaaacattt ctaatgtgat 2340
tgctaatatc acactgtttg cagtttcctc tagtttcccg aagcggaaga attagaaagc 2400
tgctgctaga ggcaaaggat acaaagattt caagactcaa tcttaccggt cttcctggcg 2460
gatctgatgc atttgaactt gctgctaagt tctgttatgg cgtgaacgtt gagattacca 2520
tatcaaacgt ggcgatgcta agatgtgcat ccaagttcat ggaaatgaac gaagacatct 2580
ccgagaaaaa cctggaaatt cgtactgaag tattccttaa agatacagta ttcacaaaca 2640
tatccaactc gatatctgtt cttcatcgct gtgaaacact actaccggta tctgaagaag 2700
tcaatctcgt tagtcgatta atcaatgcaa ttgcaaacaa tgcttgtaaa gagcaactaa 2760
catctggttt gtcaaagctg gagcataact tcccacccaa acctgttcaa agccttgatt 2820
ctgagacacc aatagactgg tggggaaaat cattgactgt gctaaatcta gattttttcc 2880
agagagttgt atctgtagtg aagtcaaaag gtcttaaaca agacattatc agcagaattt 2940
tgataaatta tgccaaaaat tcacttcagg gacttttcat caaggatcct cagttggtta 3000
aaggaagttt cttggatttg gatttgcaga aaaggcaaag ggttatcgtc gaaacaatag 3060
ctagcttact accaacacaa tccaggaaaa gtacagtccc aatggctttt ctttcaagtt 3120
tgttaaaatc tgcaatagca gcatcagcat ccacttcttg cagatctgat ctagagaggc 3180
gcattggtct gcagctagat caggcaattc tagaagatat tctcatacct gcaaatccac 3240
atgggaacaa ccacagccct ctctacgaca tagattctat tttgaggatc ttttcctttt 3300
tcttgaattt ggatgaggat gatgaagagg acaacacact aagagatgaa agcgaaatgg 3360
tttacgactt tgatagtcct ggatctccca aacatagctc aattgttaag gtgtcaaagt 3420
tattggacaa ttatctagca gaagttgcac tcgattctaa cctcacgcca tcgaagtata 3480
tagcactggc tgagttactt ccagaccacg cgcgtctagt ttatgatgga ttatatcgag 3540
ctgtagatat tttcctcaag gtaagctgct taacctcatc cacattatct cactcacctg 3600
ttcaaaacaa ttagtatttc tcatatgagt agtctaacaa tggaaactac acatatacta 3660
ttttttatac ttttcgtata aataatagcc gacaaaatat atatttttta tatattaaca 3720
tgtaatatac atgttttata cataattagt atatactttt cgtatatttg gttagtcata 3780
aagttgctgc catgtgacca ggagatcacg ggttcgagcc gtggaagcaa cctcttgcag 3840
aaatgcaggg caaggctgtg tacaatagac ccttgtggtc cggccctttt ccagaccttg 3900
cgcgtagcgg gagcttaact gcccttttta tatttagcta gcggatgtaa ttatttttgg 3960
ctgatcggcc aaatgtgttt taatacaatg catgacattc tcacggcagg ttcatcccaa 4020
cattaaggac tcggaacgct atcgtctctg taaaactatt gattgccaga aactatcaca 4080
agaagcttgc agtcatgcag cacaaaatga acggttgcct gtgcaaatgg cggtccaagt 4140
gctatacttc gaacaaatca ggctgagaaa tgcgatgaac gggggacata accaattctt 4200
tggaatgaat aatcagttcc cccagcgttc aggcagcgga gcaggaagcg gatgcatctc 4260
tccgagagat aactacgcat cagtcaggag agaaaataga gaactgaagc tcgaggttgc 4320
aagaatgaga atgaggctta cagatttaga gaaagatcat gtttccatga aacaggagct 4380
agtaaagtca catcctgcca ataagttatt caagtcattt acaaagaaat taagcaagct 4440
gaatgcacta ttccgaataa aagatttaaa accaatagga gggaaagcta actcagaaag 4500
ccggttactt tttcagaaga gaaggcgcca ttcggtttct tgatgctcta ctctaatgtg 4560
aataagaaag agtatacagt gtttcacatt gctgaatttg gatgtgttga gagtgaagtt 4620
attgctttgc gttttgatcg tatccttgaa agaagagact cactcaaact tttactataa 4680
aggtatataa acaagtgtga gtttttttag cttcatgtag tttgcactac acgatcatcg 4740
agaaaatttt acaattgctc tttcccaata tttcttgtac tcatttg 4787
<210> 31
<211> 98
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> BTB/POZ homodimerization domain
<400> 31
Ser Gln Glu Ile Pro Ser Asp Val Thr Val Asn Ala Gly Gly Ser Ala
1 5 10 15
Phe Ser Leu His Lys Phe Pro Leu Val Ser Lys Ser Gly Tyr Ile Arg
20 25 30
Lys Ile Ile Ser Glu Ser Asn Asp Ala Asp Val Ser Ile Val Glu Ile
35 40 45
Pro Asp Ile Pro Gly Gly Ser Asp Ala Phe Glu Leu Ala Ala Lys Phe
50 55 60
Cys Tyr Gly Ile Asn Phe Glu Ile Ser Thr Glu Asn Ile Ala Leu Leu
65 70 75 80
Arg Cys Thr Ala Glu Tyr Leu Glu Met Thr Glu Asp Tyr Ala Val Gly
85 90 95
Asn Leu
<210> 32
<211> 275
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> NPH3 domain sequence
<400> 32
Asp Trp Trp Ala Glu Asp Leu Ala Val Leu Arg Ile Asp Phe Phe Gln
1 5 10 15
Arg Val Leu Ile Ala Met Met Gly Arg Gly Phe Lys Gln Tyr Ala Leu
20 25 30
Gly Pro Ile Leu Met Leu Tyr Ala Gln Lys Ser Leu Arg Gly Leu Glu
35 40 45
Ile Phe Gly Lys Gly Arg Lys Lys Ile Glu Pro Lys Gln Glu His Glu
50 55 60
Lys Arg Val Val Leu Glu Thr Ile Val Ser Leu Leu Pro Arg Glu Lys
65 70 75 80
Asn Ala Leu Ser Val Ser Phe Leu Ser Met Leu Leu Arg Ala Ala Ile
85 90 95
Tyr Leu Glu Thr Thr Val Ala Cys Arg Leu Asp Leu Glu Lys Arg Met
100 105 110
Ala Leu Gln Leu Gly Gln Ala Val Leu Asp Asp Leu Leu Ile Pro Ser
115 120 125
Tyr Ser Phe Thr Gly Asp Thr Leu Phe Asp Val Glu Thr Val Gln Arg
130 135 140
Ile Ile Met Asn Phe Leu Asp Asn Glu Met Asp Gly Ser Arg Leu Gly
145 150 155 160
Asp Glu Glu Tyr Val Ser Pro Ser Leu Ser Asp Met Glu Arg Val Gly
165 170 175
Lys Leu Met Glu Asn Tyr Leu Ala Glu Ile Ala Ser Asp Arg Asn Leu
180 185 190
Ser Val Ser Lys Phe Ile Ser Leu Ala Glu Val Ile Pro Glu Gln Ala
195 200 205
Lys Ile Thr Glu Asp Gly Met Tyr Arg Ala Ile Asp Ile Tyr Leu Lys
210 215 220
Ala His Pro Ala Leu Ser Asp Met Glu Arg Lys Lys Val Cys Gly Val
225 230 235 240
Met Asp Cys Gln Lys Leu Ser Arg Glu Ala Cys Ala His Ala Ala Gln
245 250 255
Asn Asp Arg Leu Pro Val Gln Thr Val Val Gln Val Leu Tyr Tyr Glu
260 265 270
Gln Gln Arg
275
<210> 33
<211> 374
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> interactor, Nitab4.5_0000842g0110.2 protein sequence
<400> 33
Met Ala Ser Ser Ala Ile Phe His Phe Leu Pro Ser Ser Ser Ser Ser
1 5 10 15
Leu Thr Ser Leu Ser Phe Arg Asn Ser Arg Thr His Leu Ser Gln Thr
20 25 30
Pro Asn Phe Tyr Lys Pro Leu Leu Val Lys Ala Ser Thr Ser Val Asn
35 40 45
Phe Ser Ser Pro Ser Lys Ser Pro Thr Leu Thr Lys Asn Asn Asn Trp
50 55 60
Leu Trp Lys Tyr Lys Asp Asn Ser Val Asn Ile Tyr Tyr Glu Glu His
65 70 75 80
Asp Lys Gly Ser Asp Glu Pro Cys Lys Asn Val Leu Leu Ile Pro Thr
85 90 95
Ile Ser Asp Val Ser Thr Val Glu Glu Trp Arg Ser Val Ala Lys Asp
100 105 110
Ile Ala Gly Arg Ser Gly Lys Val Asn Tyr Arg Thr Thr Ile Val Asp
115 120 125
Trp Pro Gly Leu Gly Tyr Ser Asp Arg Pro Lys Leu Asp Tyr Asn Ala
130 135 140
Asp Val Met Glu Lys Phe Leu Ala Asp Phe Ile Asn Ala Pro Asn Ser
145 150 155 160
Pro Val Asn Asn Ser Asp Lys Asp Leu Val Val Phe Gly Gly Gly His
165 170 175
Ala Ala Thr Ile Ala Val Arg Ala Ala Lys Lys Gly Leu Val Lys Pro
180 185 190
Thr Ala Ile Ala Ala Ile Ala Pro Thr Trp Ala Gly Pro Leu Pro Ile
195 200 205
Val Phe Gly Arg Asp Ser Ser Met Glu Thr Arg Tyr Gly Leu Leu Arg
210 215 220
Gly Thr Leu Arg Ala Pro Ala Val Gly Trp Met Met Tyr Asn Val Leu
225 230 235 240
Val Ser Asn Glu Lys Ser Ile Gln Ser Gln Tyr Lys Ser His Val Tyr
245 250 255
Ser Asp Pro Glu Lys Val Thr Pro Asp Ile Ile Glu Ser Arg Tyr Ala
260 265 270
Leu Thr Lys Arg Gln Gly Ala Arg Tyr Val Pro Ala Ala Phe Leu Thr
275 280 285
Gly Leu Leu Asp Pro Val Lys Ser Arg Glu Glu Phe Val Gln Leu Phe
290 295 300
Ala Glu Leu Glu Gly Arg Ile Pro Val Leu Val Leu Ala Thr Ala Gly
305 310 315 320
Ser Pro Lys Arg Ser Lys Ala Glu Met Glu Ala Leu Met Glu Ala Lys
325 330 335
Gly Val Ser Lys Tyr Ile Glu Val Pro Gly Ala Leu Leu Pro Gln Glu
340 345 350
Glu Tyr Pro Glu Ile Val Ala Glu Gln Leu Tyr Arg Phe Leu Gln Glu
355 360 365
Lys Phe Glu Leu Gln Ala
370
<210> 34
<211> 1125
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> interactor, Nita4.5_0000842g0110.2 coding sequence
<400> 34
atggcatcct ctgctatttt ccactttctt ccatcatcat cttcttcctt gacttctctt 60
tccttcagaa acagcagaac ccatctttct caaaccccaa atttttacaa acccctttta 120
gtaaaagctt ctacttctgt caatttttct tccccctcca aatcacctac attgacaaag 180
aataataact ggctatggaa atacaaggac aattctgtga atatttatta cgaggaacac 240
gataagggaa gcgatgagcc ttgtaagaac gttttgctga ttcctactat ttcagatgtt 300
agtactgtgg aggaatggag atcagtggct aaagacattg ctggacgaag tggtaaagtt 360
aattacagaa ctaccattgt agattggcct ggtttaggct actctgatag acccaagctt 420
gattacaatg ctgatgtcat ggaaaaattc ttggccgact tcattaatgc tcctaatagt 480
ccagtgaaca attcggataa ggacttggtg gtgttcggag gaggacatgc tgctacaata 540
gcagttcgtg ctgcaaagaa gggcttggtg aagccaacag cgattgctgc tattgctccc 600
acctgggctg gtccacttcc tattgttttt ggaagagatt ccagcatgga aacgaggtat 660
ggtctcctta gagggacctt aagggcccct gctgttggtt ggatgatgta taatgtactt 720
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<210> 35
<211> 6057
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> interactor, Nitab4.5_0000842g0110.2 genomic sequence
<400> 35
gagatttcac aaaaatatcc ggaaaaaaaa aagtttctcc aaaaatcatt taattattta 60
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gtaaatccag aaatagagat gttgaactta tgagtgctag gacatatttc caaaaaattt 1200
gtgaagttgg taaaaatgat gaactggaga agagaccaca actatgatca agatgttgaa 1260
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ttctgagcta aaagctgtct ttatagcata ttacttggtg aactgcttac tgttcacggg 2280
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Arg Leu Gly Lys Arg Leu Lys Arg Ser Val Ala Cys Ser Asp Asn Ser
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Leu Ala Tyr Ser Arg Ile Arg Phe Asn Cys Ala Leu Trp Lys Ser Asp
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Ser Ser Gly Asn Leu Met Arg Arg Lys Ala Ser Arg Gly Val Lys Leu
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Pro Arg Cys Gln Gly Asn Asp Ser Val Ala Phe Ile Asp Gly Asn Gly
100 105 110
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Leu Leu Gln Lys Ala Leu Lys Asp Leu Glu Val Ala Gln Leu Asn Ser
165 170 175
Thr Met Phe Glu Glu Lys Ala Gln Lys Ile Ser Glu Ala Ala Ile Ala
180 185 190
Leu Lys Asp Glu Ala Ala Asn Ala Trp Asp Asp Val Asn Lys Gln Leu
195 200 205
Asp Ser Val Gln Glu Ile Val Ser Glu Glu Met Val Ala Lys Glu Ala
210 215 220
Val Gln Lys Ala Thr Met Ala Leu Ser Phe Ala Glu Ala Arg Leu Gln
225 230 235 240
Val Ala Leu Asp Ser Val Gln Ala Ala Lys Gln Arg Ile Met Ser Ser
245 250 255
Glu Thr Ser Glu Asp Ser Lys Gly Glu Asp Ser Thr Ser Leu Met Glu
260 265 270
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275 280 285
Asp Arg Phe Gly Ser Cys Glu Ala Glu Leu Arg Arg Leu Gln Asn Lys
290 295 300
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Gln Ala Gln Asn Asn Ala Leu Lys Ala Glu Glu Asp Val Ala Asn Ile
325 330 335
Met Leu Leu Ala Glu Gln Ala Val Ala Tyr Glu Leu Glu Ala Thr Gln
340 345 350
Arg Val Ser Asp Ala Glu Ile Ala Leu Gln Lys Ala Glu Lys Asn Leu
355 360 365
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370 375 380
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Glu Val Leu Pro Arg Asn Ser Val Asp Ser Val Ile Glu Ile Asp Arg
405 410 415
Glu Val Gln Leu Glu Asp Ala Trp Ala Ala Ser Gly Pro Leu Ser Thr
420 425 430
Glu Glu Ser Arg Ile Ser Asp Glu Ser Asp Glu Glu Asp Arg Lys Leu
435 440 445
Val Leu Asp Ser Ser Lys Asp Ser Asp Ser Asp Thr Glu Lys Pro Lys
450 455 460
Ser Val Gln Ser Leu Arg Gln Glu Val Asn Lys Glu Ser Ala Arg Asp
465 470 475 480
Ser Ser Leu Asn Ala Pro Lys Ala Leu Leu Lys Lys Ser Ser Arg Phe
485 490 495
Leu Pro Ala Ser Phe Phe Ser Phe Pro Thr Asp Gly Glu Glu Phe Thr
500 505 510
Pro Ala Ser Val Phe His Asn Leu Met Glu Ser Ala Arg Lys Gln Leu
515 520 525
Pro Lys Leu Val Val Gly Ser Leu Leu Met Gly Ala Gly Ile Ala Phe
530 535 540
Tyr Val Asn Arg Ser Glu Arg Ile Ser Gln Ser Phe Gln Gln Pro Asp
545 550 555 560
Ile Ile Thr Thr Ser Ile Asp Glu Val Ser Thr Asn Ala Arg Pro Leu
565 570 575
Val Arg Gln Ile Arg Lys Leu Pro Lys Lys Leu Lys Thr Leu Met Glu
580 585 590
Met Leu Pro His Gln Glu Ile Asn Glu Glu Glu Ala Ser Leu Phe Asp
595 600 605
Met Leu Trp Leu Leu Leu Ala Ser Val Ile Phe Val Pro Ile Phe Gln
610 615 620
Lys Ile Pro Gly Gly Ser Pro Val Leu Gly Tyr Leu Ala Ala Gly Ile
625 630 635 640
Leu Ile Gly Pro Tyr Gly Leu Ser Ile Ile Arg His Val His Gly Thr
645 650 655
Lys Ala Ile Ala Glu Phe Gly Val Val Phe Leu Leu Phe Asn Ile Gly
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Leu Glu Leu Ser Val Glu Arg Leu Ser Ser Met Lys Lys Tyr Val Phe
675 680 685
Gly Leu Gly Thr Ala Gln Val Leu Val Thr Ala Val Val Val Gly Leu
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Val Ala His Phe Val Ala Gly Gln Ala Gly Pro Ala Ala Ile Val Ile
705 710 715 720
Gly Asn Gly Leu Ala Leu Ser Ser Thr Ala Val Val Leu Gln Val Leu
725 730 735
Gln Glu Arg Gly Glu Ser Thr Ser Arg His Gly Arg Ala Thr Phe Ser
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Val Leu Leu Phe Gln Asp Leu Ala Val Val Val Leu Leu Ile Leu Ile
755 760 765
Pro Leu Ile Ser Pro Asn Ser Ser Lys Gly Gly Val Gly Phe Arg Ala
770 775 780
Ile Ala Glu Ala Leu Gly Leu Ala Ala Val Lys Ala Ile Val Ala Ile
785 790 795 800
Thr Ala Ile Ile Ala Gly Gly Arg Leu Leu Leu Arg Pro Ile Tyr Lys
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Leu Val Ile Leu Gly Thr Ser Leu Leu Thr Ala Arg Ala Gly Leu Ser
835 840 845
Met Ala Leu Gly Ala Phe Leu Ala Gly Leu Leu Leu Ala Glu Thr Glu
850 855 860
Phe Ser Leu Gln Val Glu Ser Asp Ile Ala Pro Tyr Arg Gly Leu Leu
865 870 875 880
Leu Gly Leu Phe Phe Met Thr Val Gly Met Ser Ile Asp Pro Lys Leu
885 890 895
Leu Leu Ser Asn Phe Pro Val Ile Met Gly Ser Leu Gly Leu Leu Ile
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945 950 955 960
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Val Ala Leu Asp Val Arg Ser Glu Arg Val Ala Val Gly Arg Ala
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Leu Asp Thr Pro Gly Ala Asn Tyr Arg Thr Val Trp Ala Leu Ser
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<220>
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> interactor, Nitab4.5_0001200g0070.2 protein sequence
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165 170 175
Asp Gly Ser Asp Ile Val Val Glu Gly Pro Arg Cys Ser Leu Arg Ser
180 185 190
Arg Lys Val Tyr Ser Asp Leu Ser Val Asp Tyr Leu Lys Met Phe Leu
195 200 205
Leu Asn Val Pro Ala Ala Val Val Ala Leu Gly Leu Phe Phe Phe Leu
210 215 220
Asp Asp Leu Thr Gly Phe Glu Ile Thr Tyr Leu Leu Glu Leu Pro Glu
225 230 235 240
Pro Phe Ser Phe Ile Phe Thr Trp Phe Ala Ala Leu Pro Leu Ile Leu
245 250 255
Tyr Leu Ser Phe Thr Ile Thr Asn Val Val Val Lys Asp Phe Leu Ile
260 265 270
Leu Lys Gly Pro Cys Pro Asn Cys Gly Ala Glu Asn Thr Ser Phe Phe
275 280 285
Gly Thr Ile Leu Ser Val Ser Ser Gly Gly Ser Thr Asn Lys Ile Lys
290 295 300
Cys Ser Gly Cys Gly Thr Asp Leu Val Tyr Asp Ser Asp Thr Arg Leu
305 310 315 320
Ile Thr Leu Pro Glu Gly Ile Ser Gly
325
<210> 40
<211> 990
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> interactor, Nitab4.5_0001200g0070.2 coding sequence
<400> 40
atggccacta aatttggatt tactataact agccctcgcc tttttcatgg ccctttcagg 60
aaaaaaccaa tattttcttc atcttcagct tctttagaag atgtttcatt ctgttcttca 120
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agtaaaatca tgcaatattg tagcattgac gggaaaggaa agaaatcttt aggagaaatg 300
gagcaagagt ttcttcaagc actgcaatca ttctattatg aaggaaaggc gaccatgtca 360
aatgaagaat ttgataacct taaggaagaa ttaatgtggg aagggagcag cgtcgtcatg 420
ctaagcactg atgaacagaa gtttctggaa gcttctatgg cttatgtatc tgggaatcca 480
attatgactg ataaagagta tgacaagctg aagatgaaac ttaagaggga tggcagtgat 540
attgtggttg agggtcctcg gtgcagtctt cgaagtagaa aggtttatag cgatctttct 600
gttgattatc tgaagatgtt cttgttaaat gtccctgctg ctgttgttgc tcttggattg 660
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<210> 41
<211> 5491
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> interactor, Nitab4.5_0001200g0070.2 genomic sequence
<400> 41
tcaaaaaaca gttaaaaccg ggaaacgatt ttcttgaatt caaaaaaatc aagacaaaag 60
cttttcaaca ttcaacactc tccacacatt catacacata accttatctt catctcttat 120
caaaactcat caaattctcc atttttcagt tttttcacaa atgcaatatt cacttccact 180
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gtttaaaaga taaatcattt atcactatgg taattaaatg tgcttgaaaa aggtggaatg 960
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ctttttctat aactcaaaga aagcaattat tatgtatcat tgatttattg caaggccaac 1200
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gaaatggagc aagagtttct tcaagcactg caagtaatga agcagaatca gttactaatt 1800
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tgtttatgtc tcattggcac ttaaaatagg tatagtaaga gcaaattcct aacaatgcag 2040
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tgactgataa agagtatgac aagctgaaga tgaaacttaa ggtacttggt tattagcatt 2160
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agttttttta tggaatcaat ttttatatta tactataata tatgttctct ataacaccac 2280
ttcgttatat caaccaataa aattcggaac aaataaggct gttatagaga ggtttgactg 2340
tattatttat tgttcttgat aagataagag aagatccaat aaatgaaaaa gatttgttat 2400
tttgacagtt ttttcaaaaa aagcaactga ttttactgta taatactgaa tgtgttgtac 2460
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gggtcctcgg tgcagtcttc gaagtagaaa ggtttgtact acttttctgc tcaatgagac 2760
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tccaatatat tatgtaatgt gtgagtataa gtatatcaat acaaaaaatt aacaaccttt 5460
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<211> 989
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> interactor, Nitab4.5_0005803g0040.2 protein sequence
<400> 42
Met Ile Val Arg Val Gly Leu Val Val Ala Ala Ser Ile Ala Ala Tyr
1 5 10 15
Ala Val Lys Gln Ile Asn Val Lys Pro Ser Lys Pro Ser Glu Asn Gly
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Asp Ser Leu Pro Glu Lys Arg Ser Asp Glu Gly Asp Glu Lys Glu Glu
35 40 45
Gln Leu Leu Tyr Ser Thr Asp Gly Pro Lys Glu Val Val Asp Glu Glu
50 55 60
Glu Glu Lys Glu Glu Val Lys Leu Met Asn Gly Ile Ile Asn Pro Ala
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Gln Gly Asn Gln Leu Asp Leu Asp Asp Asp Leu Phe Pro Glu Phe Glu
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Asp Leu Leu Ser Gly Glu Ile Glu Phe Pro Leu Pro Ser Asp Lys Tyr
100 105 110
Asp Thr Glu Arg Glu Glu Arg Glu Lys Val Tyr Gln Asn Glu Met Ala
115 120 125
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130 135 140
Glu Glu Arg Glu Val Lys Leu Glu Gly Glu Leu Leu Glu Tyr Tyr Gly
145 150 155 160
Leu Lys Glu Gln Glu Ser Asp Ile Ile Glu Leu Gln Lys Gln Leu Arg
165 170 175
Ile Lys Ser Val Glu Ile Asp Met Leu Asn Ile Thr Ile Asn Thr Leu
180 185 190
Gln Ala Glu Lys Gln Lys Leu Gln Glu Glu Val Phe Asn Gly Thr Thr
195 200 205
Ala Arg Lys Glu Leu Glu Ala Ala Arg Ser Lys Ile Lys Glu Leu Gln
210 215 220
Arg Gln Met Gln Leu Glu Ala Asn Gln Thr Lys Ala Gln Leu Leu Leu
225 230 235 240
Leu Lys Gln His Val Ser Gly Leu Gln Glu Lys Glu Glu Asp Ala Phe
245 250 255
Lys Arg Asp Val Glu Val Asp Lys Lys Leu Arg Leu Val Lys Glu Leu
260 265 270
Glu Val Glu Val Met Glu Leu Lys Arg Lys Asn Lys Glu Leu Gln His
275 280 285
Glu Lys Arg Glu Leu Val Ile Lys Leu Asp Ala Ala Glu Ser Lys Val
290 295 300
Ala Asn Leu Ser Asn Met Thr Glu Asn Glu Met Val Ala Gln Val Arg
305 310 315 320
Glu Glu Val Thr Asn Leu Lys His Thr Asn Glu Asp Leu Leu Lys Gln
325 330 335
Val Glu Gly Leu Gln Met Asn Arg Phe Ser Glu Val Glu Glu Leu Val
340 345 350
Tyr Leu Arg Trp Val Asn Ala Cys Leu Arg Phe Glu Leu Arg Asn Tyr
355 360 365
Gln Thr Pro Gln Gly Lys Val Ser Ala Arg Asp Leu Ser Lys Asn Leu
370 375 380
Ser Pro Arg Ser Gln Gln Lys Ala Lys Gln Leu Met Leu Glu Tyr Ala
385 390 395 400
Gly Ser Glu Arg Gly Gln Gly Asp Thr Asp Leu Glu Ser Asn Phe Ser
405 410 415
Gln Pro Ser Ser Pro Gly Ser Glu Asp Phe Asp Asn Ala Ser Ile Asp
420 425 430
Ser Ser Thr Ser Arg Phe Ser Ala Phe Ser Lys Lys Pro Gly Leu Ile
435 440 445
Gln Lys Leu Lys Arg Trp Gly Lys Ser Lys Asp Asp Ser Ser Val Met
450 455 460
Ser Ser Pro Ala Arg Ser Leu Gly Gly Ala Ser Pro Gly Arg Thr Ser
465 470 475 480
Val Ser Phe Arg Ser Arg Gly Pro Leu Glu Ser Leu Met Leu Arg Asn
485 490 495
Ala Gly Asp Gly Val Ala Ile Thr Ser Phe Gly Thr Ala Glu Gln Glu
500 505 510
Tyr Asp Ser Pro Glu Thr Pro Arg Leu Pro Pro Ile Arg Thr Gln Asp
515 520 525
Ser Ser Ala Glu Pro Leu Asn Ser Val Ala Ser Ser Phe Gln Leu Met
530 535 540
Ser Lys Ser Val Glu Gly Val Leu Asp Glu Lys Tyr Pro Ala Phe Lys
545 550 555 560
Asp Arg His Lys Leu Ala Val Glu Arg Glu Lys Gln Ile Lys Val Lys
565 570 575
Ala Glu Gln Ala Arg Ala Ala Arg Phe Glu Lys Ser Leu Pro Pro Lys
580 585 590
Leu Ser Gln Leu Lys Glu Lys Arg Val Ser Val Ser Ala Ser Ala Ser
595 600 605
Ala Pro Val Val Ser Ala Ser Gly Asp Ser Val Glu Gln Ser Gly Asp
610 615 620
Ser Lys Thr Asp Ser Gln Ala Val Ser Lys Met Lys Pro Ile Asn Ile
625 630 635 640
Glu Lys Arg Pro Pro Arg Thr Pro Arg Pro Pro Pro Thr Arg Ser Ala
645 650 655
Gly Gly Pro Ala Pro Ala Gly Asn Asn Val Thr Gly Gly Ala Pro Gly
660 665 670
Gly Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Gly Ala Pro Pro Pro Pro Pro
675 680 685
Pro Pro Gly Gly Gly Ala Pro Arg Pro Pro Pro Pro Pro Gly Ser Leu
690 695 700
Met Lys Gly Gly Ala Gly Gly Asp Lys Val His Arg Ala Pro Glu Leu
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Asn Met Ile Gly Glu Ile Glu Asn Arg Ser Thr Phe Leu Leu Ala Val
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Lys Ala Asp Val Glu Ser Gln Gly Glu Phe Val Glu Ser Leu Ala Thr
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Glu Val Arg Ala Ala Ser Phe Thr Asn Ile Glu Asp Leu Val Ser Phe
785 790 795 800
Val Asn Trp Leu Asp Glu Glu Leu Ser Phe Leu Val Asp Glu Arg Ala
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Val Leu Lys His Phe Asp Trp Pro Glu Gly Lys Ala Asp Ala Leu Arg
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Glu Ala Ala Phe Glu Tyr Gln Asp Leu Met Lys Leu Glu Lys His Val
835 840 845
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885 890 895
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<213> Artificial Sequence
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gaggttgaca agaagcttag acttgtgaag gaattagaag tggaggttat ggagcttaag 840
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agtaaaaacc tgagcccaag atctcaacag aaggccaaac agttgatgtt agaatacgca 1200
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agagcagcaa ggtttgagaa gtccttgccc ccgaaacttt ctcaattgaa agagaagcga 1800
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ccagctggta ataatgttac aggtggggca cctggtggtc cacccccacc acctcctccg 2040
cctggtgctc caccaccgcc gccgccacct ggtggaggag ctcctagacc acctcctcct 2100
cctggatctc taatgaaagg aggagctgga ggtgataagg tccatcgcgc tcctgaatta 2160
gttgaattct accaatcatt gatgaaacgc gaggcgaaga aggatacatc atcacctttg 2220
atatcctcta cttcaaacac atcagatgca agaagcaaca tgatcggaga gatagagaac 2280
agatccacat tcctgttagc tgtgaaagct gatgtggaaa gtcaaggtga atttgtcgag 2340
tcattggcaa ctgaagttcg tgctgcttca tttaccaata tcgaggatct agtgtcattt 2400
gtgaactggc tagatgaaga actctccttc ttggttgatg aacgagctgt cctcaagcac 2460
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gctgctttga aaaagatgta caagttgctt gagaaggtgg aacaaagtgt ttatgcacta 2640
ttgcgtactc gcgacatggc tgcatcaaga tacagagaat ttggcattcc tactaattgg 2700
ttgcaagatt caggtgttgt tggcaagatc aagctttcgt cggtacaatt ggcgaggaag 2760
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<210> 44
<211> 5952
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> interactor, Nitab4.5_0005803g0040.2 genomic sequence
<400> 44
agaatttcaa tcttgtttgg acaaagactg accactcaag aaattggtgg ttcttgtgcc 60
ctctatgtgt tcgacaattt gtctattaga ctttctagtt atcaacaaca ctttgcacat 120
aaccaaactt tttttttctt gataagatga tatagccatt aagttattca tagtgtccac 180
tttttaaaga attgtctaaa actgataatt ctctttcaag aattgcacct tttttgccat 240
ttttgatgag gccatgattt gagttttgag ctatggggtt tgagaaaaaa tgggtgggga 300
ttattttatg ttagtaaatg atttgaagct tcaatatttt ccattgaaaa tacctacatg 360
atagtcaggg taggtttagt ggttgctgct tctatagcag cctatgcagt taagcagata 420
aatgtaaaac cctcaaagcc ttcaggtaat tttctgtagt cagttgtatt tggactgttt 480
tattaaagtt gcaaataagt aaagaggctg ctaaattagt ataattggtt ttagacatat 540
tgataaaaca gtgtctataa agtttcaatt tttaatggag aaaatcatcc aagtgagtga 600
ctagagtgtt tttttgtggc taaattgtgt ttatcttatt gttttatgaa cgttggtgaa 660
cagaaaatgg tgactcattg cctgaaaaac gaagcgatga aggggatgaa aaggaggagc 720
agcttttgta ttctacagat ggccccaaag aagtggttgt aagtatttgt gtatagagaa 780
atttgtgtgc tttagaaaca aaaatttgtt agtcatttgg aaatttgttt aatatatgac 840
aacttgtagg atgaggaaga ggagaaagaa gaagtgaaat taatgaatgg aattataaat 900
ccagcacagg gtaaccagct tgatcttgat gatgatcttt tccctgaatt cgaagatctt 960
ttatctgggg aaattgaatt tccattacca agtgacaagt atgatacaga aagagaagag 1020
agagagaagg tgtaccaaaa tgagatggcc aacaatgaaa aagaacttga aagattgcga 1080
aatcttgtta aggagctcga ggaaagggag gtgaaacttg aaggggagtt gttggaatat 1140
tatggtttga aggaacaaga atcagatatc atcgagttac aaaagcagct caggattaag 1200
tctgtagaga tcgacatgct caacatcact ataaatactt tacaggccga gaaacaaaag 1260
cttcaagagg aggttttcaa tggaactact gctcggaaag agctagaagc agcaaggagc 1320
aagatcaagg agttgcagag gcagatgcag cttgaagcta accaaacgaa agctcagttg 1380
ttgttgctga agcaacatgt tagtggactt caagaaaagg aagaggatgc tttcaagaga 1440
gatgtcgagg ttgacaagaa gcttagactt gtgaaggaat tagaagtgga ggttatggag 1500
cttaagagga agaacaaaga acttcagcat gaaaagagag agttggttat aaaattggat 1560
gccgctgaat ctaaagtagc aaacttatcc aatatgacag aggtaaattt aactcctgat 1620
accagtattt ttcatgtaat tgatctttag gacaatcttt gtgtgtttcc tgcgtatagc 1680
ttttctttct ttaagcatct tctttctact tttcaagtct gcaaaaatgt tttggaaatg 1740
tagagccgac tctgagcacc ttattgaccc cctttttctg attacttccc tttttacgcc 1800
acgctcataa ggtagttgag tccgttgaat actccagtga aacatgccca cattatggtt 1860
tcttgtaatt atcgtaattg tcattgctat gttttgctgt ttattatgct cattaatttc 1920
ttctatgtta attatcgtgt tgagctccca ccacttaacc attggagatt cttagcttct 1980
gaagagcttc atttggtgat gcgtttggtt ggtgtgtgaa ctgatgctat ttaattactg 2040
acttgtcttt ggcatgctgc ttcagaatga aatggttgcc caggtcaggg aagaggtaac 2100
taatttgaag catacaaatg aggatcttct aaaacaagta gaaggacttc aaatgaacag 2160
attcagtgaa gttgaagagc tagtgtatct tcgttgggtc aatgcatgct taagatttga 2220
acttcggaac taccaaacac ctcaaggaaa ggtatcagct cgtgatctca gtaaaaacct 2280
gagcccaaga tctcaacaga aggccaaaca gttgatgtta gaatacgcag gatcagaacg 2340
tggccaagga gatacagatc ttgaaagcaa tttttcgcag ccatcttctc ccggtagtga 2400
agactttgat aatgcttcta ttgacagttc cacaagcaga tttagtgctt tcagtaaaaa 2460
gcctggccta atccagaagt tgaagagatg gggcaaaagt aaagacgatt ccagtgttat 2520
gtcttcacca gcaagatctc ttgggggagc atctccgggc cggacaagtg taagttttag 2580
atcaaggggt cctctggaat cactaatgct cagaaatgca ggtgatggtg tagccatcac 2640
tagttttgga acagctgagc aggaatatga ttcccctgaa acaccgcggc ttccaccgat 2700
taggacacaa gattcttctg ctgagccact gaactcagtt gcatcatcct tccagctaat 2760
gtctaaatca gttgaaggag ttctagatga gaagtatcct gcattcaaag ataggcataa 2820
gctggcagta gagcgagaga agcaaattaa ggtaaaggcc gagcaagcaa gagcagcaag 2880
gtttgagaag tccttgcccc cgaaactttc tcaattgaaa gagaagcgag tatcagtatc 2940
agcatcagca tcagcgccag tggtctctgc ctctggtgac tcagttgagc agtccggtga 3000
tagcaaaact gactctcaag cagttagcaa aatgaaacca attaatattg agaaaagacc 3060
tcctaggact cctcgtccac ctcctacacg atcagcaggt ggtcccgctc cagctggtaa 3120
taatgttaca ggtggggcac ctggtggtcc acccccacca cctcctccgc ctggtgctcc 3180
accaccgccg ccgccacctg gtggaggagc tcctagacca cctcctcctc ctggatctct 3240
aatgaaagga ggagctggag gtgataaggt ccatcgcgct cctgaattag ttgaattcta 3300
ccaatcattg atgaaacgcg aggcgaagaa ggatacatca tcacctttga tatcctctac 3360
ttcaaacaca tcagatgcaa gaagcaacat gatcggagag atagagaaca gatccacatt 3420
cctgttagct gtatgtacaa cttctctttt actcctttga ataatgcatg tgcttattaa 3480
cctattctga ctcaatggag acttgtgcaa aaccaggtga aagctgatgt ggaaagtcaa 3540
ggtgaatttg tcgagtcatt ggcaactgaa gttcgtgctg cttcatttac caatatcgag 3600
gatctagtgt catttgtgaa ctggctagat gaagaactct ccttcttggt atttcctctt 3660
accattatac cttcaagttc ctcttcctta aataggacat gaatatacct atattcttaa 3720
tcatactttt atatgaaaat tgttgcttac attaatcttg ctcgagcgac aaggaccatg 3780
cagtttctgc attaaatacc tggagcattc attaacattg tatcccgttg attcttttca 3840
aggttgatga acgagctgtc ctcaagcact ttgactggcc agagggaaaa gcagatgcac 3900
tgagagaggc tgccttcgaa taccaagatc taatgaaact agaaaagcat gtaacctcct 3960
ttgttgatga cccaaatctt ccatgtgatg ctgctttgaa aaagatgtac aagttgcttg 4020
agaagtaagt ctctactgat atctttatct cttgtcttta aactagagaa tttcagtcag 4080
gtaggatgtg aaaatggttg aatcttaaat caaactattt tcagaccata tttaaacttc 4140
cacttatttg gaattggtac cctttcattt catgtgtagt tgttccttct tatcatttct 4200
gtcttgtcta tcgctagctc attttttgtt actcctaagt cttaaaccct ttaatcttcg 4260
ggatgccagg gtggaacaaa gtgtttatgc actattgcgt actcgcgaca tggctgcatc 4320
aagatacaga gaatttggca ttcctactaa ttggttgcaa gattcaggtg ttgttggcaa 4380
ggtatgttct catatagaaa ctttgctatg ttgttctttg tgaaattgct tgaaccacaa 4440
taataaaaga aaaagaaaca aaataatcac actgcaagaa aaccttagaa tgtgatgttt 4500
tacttcatat tacttagaaa ttaggaaaac ttaccaacct ctttaactaa catgtactcc 4560
ctctatttca aaaagaacga acctatttga ttaggcaccg agtttaaaaa gaatgaaaga 4620
cttagatatt tgtgcggcat aaatcatctt attaggggta aaatgaaaag tttaaagtta 4680
cattatttcc aaatttagaa aggagtcaat ctatttgaat cgagttaaaa aggaaatagg 4740
ttcattcttt ttgaaacaga gggagtaaat ataatttctc ttcatcgtac ggacaataga 4800
aggaaaaaaa aaaggaagtg tgcagagaga tgatctatct atggcgtata agtatcgctg 4860
ttttcttctg cagatcaagc tttcgtcggt acaattggcg aggaagtaca tgaaacgtgt 4920
agcatcagag cttgatgcca tgggtggacc tgagaaggaa ccaaacagag aattcttgat 4980
tctacaaggg gttcgttttg cttttagagt tcatcaggta tacacacagc acctgcattt 5040
tgttcactta ccaaatctaa aaacaatacc aatctattta acaaattaaa catgttttag 5100
tagagttaca gattaatgaa tttacaactt tttctttttc ttttcagttt gctggaggat 5160
ttgatgctga aagcatgaag gcttttgaag aattaaggag tcgtgtcaaa agttcacaaa 5220
cagaagagac tacacaagaa caatgagaat atctgtattt tggttttggt cattgtaaat 5280
ttcatcattt tcttttctcc aagtatagca aacttactct atcttggact tctgtacaat 5340
tcaaaaggtg aataactcga ggagaatatc agatagcaca gattagttaa aagaaagttt 5400
aaaggataaa cattgtattg gaaaacacag agaaaactac attaaacaat gagtgaaatt 5460
tggaactgca taatcatgaa ttcacgagaa ggaaaaaatg cagcaagttg tcaaggtgtt 5520
ggatcatttg ttctgctttt ggggcaaaag tgaaaacctg tccctcttct ggggcctagt 5580
tgtactaggc aaaaaatcct catttctgtg aaatttaagt atattcatcc tagtacattt 5640
cagggtacaa gcattgtgca atagcaaaaa gaaaagaaga gaaactcata aaactgagtg 5700
ttcagcagct gctgtgaagt gactctctgt atgctcgtcg atgaacatgc aggtgaaggt 5760
tcttgatttc atctgttatc gcattgtaat aatgagattt ctgtctgcaa atttggcacc 5820
tccaaccttc ccttgaagtt gagatggtag acgaatgaca cgtctctgat caccagcctc 5880
taccaacaac tcagaccctc ctctaaactg caataaccag aattctgatt aatttcacct 5940
tttaatttga tt 5952
Claims (36)
- 식물 또는 이의 일부, 또는 세포의 알칼로이드 함량을 조절하는(예를 들어, 감소시키는) 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써 상기 식물을 변형시키는 것을 포함하는, 방법.
- 타바코 식물 또는 이의 식물 일부, 또는 세포의 타바코-특이적 니트로사민(TSNA) 전구체의 함량을 조절하는(예를 들어, 감소시키는) 방법으로서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절함으로써 상기 식물 또는 세포를 변형시키는 것을 포함하는, 방법.
- 세포 또는 식물 또는 이의 일부의 알칼로이드 함량을 조절하기(예를 들어, 감소시키기) 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 용도.
- 조절된(예를 들어, 감소된) 알칼로이드 함량을 갖는 식물 또는 이의 일부, 세포, 식물 번식 물질(plant propagation material), 잎, 절단된 수확 잎, 가공된 잎 또는 절단되고 가공된 잎을 생성하기 위한 방법으로서, 상기 식물 또는 세포를 변형시켜 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하는 것을 포함하는, 방법.
- 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 알칼로이드 함량이 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하도록 변형되지 않은 식물 또는 세포와 비교하여 조절되는(예를 들어, 감소되는), 방법 또는 용도.
- 비변형된 식물과 비교하여 알칼로이드 함량의 조절(예를 들어, 감소)을 달성하기 위해 변형된 식물 또는 이의 일부 또는 세포로서, 변형은 타바코로부터의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현의 조절인, 식물 또는 이의 일부 또는 세포.
- 제6항에 따른 식물 또는 세포 또는 제4항 또는 제5항의 방법에 의해 생성된 식물 또는 세포로부터 수득가능한 식물 번식 물질.
- 제1항 내지 제4항, 제6항 또는 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 식물의 알칼로이드 함량이 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하도록 변형되지 않은 식물과 비교하여 감소되는, 방법 또는 용도, 식물 또는 이의 일부 또는 세포, 또는 식물 번식 물질.
- 제8항에 있어서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현이 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하도록 변형되지 않은 식물 또는 세포와 비교하여 감소되는, 방법 또는 용도, 식물 또는 이의 일부, 또는 식물 번식 물질.
- 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 식물의 알칼로이드 함량이 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하도록 변형되지 않은 식물 또는 세포와 비교하여 증가되는, 방법 또는 용도, 또는 식물 또는 이의 일부 또는 세포, 또는 식물 번식 물질.
- 제10항에 있어서, 식물이 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 증가시키도록 변형되며, 식물 또는 세포는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하도록 변형되지 않은 식물과 비교하여 증가된 알칼로이드 함량을 나타내는, 방법 또는 용도, 식물 또는 이의 일부 또는 세포, 또는 식물 번식 물질.
- 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 식물의 총 알칼로이드 함량이 조절되는(예를 들어, 감소되는), 방법 또는 용도, 식물 또는 이의 일부 또는 세포, 또는 식물 번식 물질.
- 제1항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, 노르니코틴, PON, 아나바신 및 아나타빈으로부터 선택되는 하나 이상의 알칼로이드의 함량이 조절되며(예를 들어, 감소되며), 바람직하게는 노르니코틴 및/또는 PON 및/또는 아나바신의 함량이 조절되는(예를 들어, 감소되는), 방법 또는 용도, 식물 또는 이의 일부, 또는 식물 번식 물질.
- 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 적어도 하나의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질이 SEQ ID NO. 1, SEQ ID NO. 4, SEQ ID NO. 7, SEQ ID NO. 10, SEQ ID NO. 13, SEQ ID NO. 16, SEQ ID NO. 19, SEQ ID NO. 22, SEQ ID NO. 25, SEQ ID NO. 28로 제시된 아미노산 서열 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하거나; BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30으로 제시된 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그, 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하는, 방법 또는 용도, 식물 또는 이의 일부 또는 세포, 또는 식물 번식 물질.
- 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 추가적인 유전자가 변형되는데, 여기서 추가적인 유전자는 SEQ ID NO. 1, SEQ ID NO. 4, SEQ ID NO. 7, SEQ ID NO. 10, SEQ ID NO. 13, SEQ ID NO. 16, SEQ ID NO. 19, SEQ ID NO. 22, SEQ ID NO. 25, SEQ ID NO. 28 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열로부터 선택되는 적어도 하나이거나; BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열 또는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하는, 방법 또는 용도, 식물 또는 이의 일부, 또는 식물 번식 물질.
- 식물을 육종하기 위한 제6항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 식물 또는 이의 일부, 또는 제4항, 제5항 또는 제8항 내지 제19항 중 어느 한 항의 방법에 의해 생성된 식물의 용도.
- 제품을 생성하기 위한 제6항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 식물 또는 이의 일부, 또는 제4항, 제5항 또는 제8항 내지 제19항 중 어느 한 항의 방법에 의해 생성된 식물의 용도.
- 작물을 성장시키기 위한 제6항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 식물 또는 이의 일부, 또는 제4항, 제5항 또는 제8항 내지 제19항 중 어느 한 항의 방법에 의해 생성된 식물의 용도.
- 잎을 생성하기 위한 제6항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 식물 또는 이의 일부, 또는 제4항, 제5항 또는 제8항 내지 제19항 중 어느 한 항의 방법에 의해 생성된 식물의 용도.
- 제6항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 식물의 수확된 잎, 또는 제6항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 번식 물질로부터 번식된 식물로부터 수득가능하거나, 제2항 또는 제16항 내지 제19항 중 어느 한 항에 따른 용도에 의해 수득된 식물로부터 수득가능하거나, 제1항, 제2항, 제4항, 제5항, 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항의 방법에 의해 생성된 식물로부터 수득가능한 수확된 잎.
- 제20항에 있어서, 식물의 수확된 잎이 절단된 수확된 잎인, 식물의 수확된 잎.
- 제2항 또는 제16항 내지 제19항 중 어느 한 항에 따른 용도로부터 수득가능한(예를 들어, 수득된) 식물로부터 수득가능하거나(예를 들어, 수득되거나);
제6항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 식물을 가공함으로써 수득가능하거나(예를 들어, 수득되거나);
제7항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 식물 번식 물질로부터 번식된 식물로부터 수득가능하거나;
제20항 또는 제21항에 따른 식물의 수확된 잎을 가공함으로써 수득가능하거나(예를 들어, 수득되거나);
제1항, 제2항, 제4항, 제5항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항의 방법에 의해 생성된 식물로부터 수득가능한(예를 들어, 수득된)
가공된 잎, 바람직하게는 가공된 타바코 잎, 바람직하게는 생육불가능한 가공된 타바코 잎. - 제22항에 있어서, 잎이 경화, 발효, 저온살균 또는 이들의 조합에 의해 가공되며, 바람직하게는, 4-(메틸니트로사미노)-1-(3-피리딜)-1-부타논(NNK), N'-니트로소노르니코틴(NNN), N'-니트로소아나타빈(NAT) 및 N-니트로소아나바신(NAB)으로부터 선택되는 하나 이상의 TSNA의 함량이 감소되고, 바람직하게는 NNK 및/또는 NNN의 함량이 조절되고(예를 들어, 감소되고), 더욱 바람직하게는 NNK의 함량이 감소되는, 가공된 잎.
- 제22항 또는 제23항에 있어서, 가공된 잎이 절단된 가공된 잎인, 가공된 잎.
- 제2항 또는 제16항 내지 제19항 중 어느 한 항에 따른 용도로부터 수득가능한 식물로부터 수득가능하거나(예를 들어, 수득되거나);
제6항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 식물을 가공함으로써 수득가능하거나(예를 들어, 수득되거나);
제7항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 식물 번식 물질로부터 번식된 식물로부터 수득가능하거나(예를 들어, 수득되거나);
제20항 또는 제21항에 따른 식물의 수확된 잎을 가공함으로써 수득가능하거나(예를 들어, 수득되거나);
제1항, 제2항, 제4항, 제5항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항의 방법에 의해 생성된 식물로부터 수득가능한(예를 들어, 수득된)
식물 또는 이의 일부로부터 제조된 경화된 타바코 물질. - 제25항의 상기 경화된 타바코 물질을 포함하는 타바코 블렌드.
- 제6항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 식물 또는 제6항 또는 제8항 내지 제13항 중 어느 한 항에 따른 이의 일부로서, 상기 식물이 타바코 식물인, 식물 또는 이의 일부;
제7항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 타바코 식물 번식 물질로부터 번식된 타바코 식물 또는 이의 일부;
제20항 또는 제21항에 따른 식물의 수확된 잎으로서, 상기 식물이 타바코 식물인, 수확된 잎;
제26항 내지 제28항 중 어느 한 항에 따른 가공된 잎으로서, 상기 식물이 타바코 식물인, 가공된 잎; 또는
제1항, 제2항, 제4항, 제5항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항의 방법에 의해 생성된 식물로부터 제조된 전달 시스템. - 제27항에 있어서, 시스템이 가연성 흡연 물품인, 전달 시스템.
- 제27항에 있어서, 시스템이 무연 타바코 산업 제품인, 전달 시스템.
- 제27항에 있어서, 시스템이 불연성 에어로졸 공급 시스템, 예컨대 타바코 가열 장치 또는 에어로졸 발생 장치인, 전달 시스템.
- 제6항 또는 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따른 식물 또는 이의 일부 또는 세포, 또는 이의 추출물(예를 들어, 타바코 추출물) 또는 제25항에 따른 경화된 타바코 물질, 또는 제26항에 따른 타바코 블렌드를 포함하는 가연성 흡연 물품, 불연성 에어로졸 공급 시스템, 무연 타바코 시스템 또는 타바코 가열 장치.
- 조절된(예를 들어, 감소된) 알칼로이드 함량 및/또는 조절된(예를 들어, 감소된) 함량의 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 또는 TSNA의 전구체를 갖는 식물을 선택하기 위한 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 뉴클레오티드 서열의 용도로서, 바람직하게는 적어도 하나의 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질의 서열은 SEQ ID NO. 1, SEQ ID NO. 4, SEQ ID NO. 7, SEQ ID NO. 10, SEQ ID NO. 13, SEQ ID NO. 16, SEQ ID NO. 19, SEQ ID NO. 22, SEQ ID NO. 25, SEQ ID NO. 28 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그 또는 SEQ ID NO. 1, 4, 7, 10, 13, 16, 19, 22, 25 또는 28에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열로부터 선택되거나, BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30에 제시된 바와 같은 뉴클레오티드 서열, 또는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열을 포함하는, 용도.
- BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 뉴클레오티드 서열에서 유전성 돌연변이를 수반하는 식물의 돌연변이체로서, 바람직하게는 유전자는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열로부터 선택되며, 상기 유전성 돌연변이는 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하며(예를 들어, 감소시키며), 돌연변이체 식물은 상기 유전성 돌연변이를 수반하지 않는 유사한 식물과 비교하여 조절된(예를 들어, 감소된) 알칼로이드 함량, 바람직하게는 니코틴 함량 및/또는 조절된 함량의 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 또는 TSNA의 전구체를 갖는, 식물의 돌연변이체.
- 제33항에 따른 유전성 돌연변이를 수반하는 돌연변이체 식물의 자손 또는 종자.
- BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 뉴클레오티드 서열에서 변형을 포함하는 식물로부터 생성된 수확된 잎, 가공된 잎 또는 경화된 타바코 물질로서, 적어도 하나의 유전자는 SEQ ID NO. 2, SEQ ID NO. 3, SEQ ID NO. 5, SEQ ID NO. 6, SEQ ID NO. 8, SEQ ID NO. 9, SEQ ID NO. 11, SEQ ID NO. 12, SEQ ID NO. 14, SEQ ID NO. 15, SEQ ID NO. 17, SEQ ID NO. 18, SEQ ID NO. 20, SEQ ID NO. 21, SEQ ID NO. 23, SEQ ID NO. 24, SEQ ID NO. 26, SEQ ID NO. 27, SEQ ID NO. 29, SEQ ID NO. 30 또는 이의 기능성 변이체 또는 기능성 단편 또는 오솔로그 또는 SEQ ID NO. 2, 3, 5, 6, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29 또는 30에 대해 적어도 80% 동일성을 갖는 서열로부터 선택되며, 상기 변형은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자의 활성 또는 발현을 조절하며(예를 들어, 감소시키며), 상기 식물은 BTB/POZ NPH3 도메인-함유 단백질을 인코딩하는 적어도 하나의 유전자에서 상기 변형을 수반하지 않는 유사한 식물과 비교하여 조절된(예를 들어, 감소된) 알칼로이드 함량, 바람직하게는 니코틴 함량 및/또는 조절된 함량의 타바코 특이적 니트로사민(TSNA) 또는 TSNA의 전구체를 갖는, 수확된 잎, 가공된 잎 또는 경화된 타바코 물질.
- 설명 및 도면을 참조하여 본원에 기재된 바와 같은 방법, 잎, 식물, 식물 번식 물질, 수확된 잎, 가공된 타바코, 타바코 산업 제품, 용도 또는 이들의 조합.
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