KR20220005002A - 재조합 인플루엔자 항원 - Google Patents

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맨디 안토니아 카타리나 종에닐렌
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Abstract

본 발명은 재조합 인플루엔자 A 적혈구응집소(HA) 폴리펩티드로서, 인플루엔자 A 바이러스 HA의 HA1 및 HA2 도메인을 포함하고,
(a) 위치 355의 아미노산은 W이고;
(b) 위치 432의 아미노산은 I이고/이거나, 위치 380의 아미노산은 I인 아미노산 서열을 포함하고;
HA 폴리펩티드의 아미노산 서열의 아미노산 위치의 넘버링은 기준 H3N2 인플루엔자 균주, 특히 기준 균주 H3N2 A/아이치/2/68(서열번호 1)로부터의 HA의 아미노산 서열의 아미노산의 넘버링에 따르는 것인 폴리펩티드, 이의 면역원성 단편, 상기 폴리펩티드 또는 면역원성 단편을 암호화하는 핵산 분자, 및 이들의 용도를 제공한다.

Description

재조합 인플루엔자 항원
본 발명은 적어도 부분적으로, HHS가 수여한 계약 HHSO100201700018C에 따른 정부 지원으로 이루어졌다. 정부는 본 발명에 있어서 소정의 권리를 갖는다.
본 발명은 의약 분야에 관한 것이다. 재조합 인플루엔자 A 적혈구응집소(HA) 폴리펩티드, 상기 폴리펩티드를 암호화하는 핵산, 이를 포함하는 약제학적 조성물, 및 이들의 사용 방법이 본 명세서에서 제공된다.
인플루엔자 바이러스는 중증도가 준임상적 감염으로부터 사망을 야기할 수 있는 원발성 바이러스성 폐렴까지의 범위인 호흡기 질환(통상 "인플루엔자" 또는 "플루"로 지칭)을 야기하는 주요 인간 병원체이다. 감염의 임상 효과는 인플루엔자 균주의 발병력 및 숙주의 노출, 병력, 연령 및 면역 상태에 따라 달라진다. 매년 전 세계적으로 대략 10억 명의 사람들이 인플루엔자 바이러스로 감염을 겪어, 3백만 내지 5백만의 사례에서 중증의 병이 야기되고, 300,000 내지 500,000건의 인플루엔자 관련 사망이 발생하는 것으로 추정된다. 대부분의 이들 감염은 기여도가 보다 적은 인플루엔자 B 바이러스와 함께, H1 또는 H3 적혈구응집소 서브타입을 지니는 인플루엔자 A 바이러스에 기인할 수 있으며, 이에 따라, 대표적인 3가지 모두가 계절성 백신에 포함된다. 현행의 면역화 관행은 효과적인 계절성 인플루엔자 백신의 시기 적절한 생성을 가능하게 하기 위하여, 유행하는 인플루엔자 바이러스의 조기 확인에 의존한다. 다음 계절 동안 우세적일 균주를 예측함에 있어서 내재적인 어려움과 별개로, 항바이러스 내성 및 면역 회피 또한 현행의 백신이 이환 및 사망을 예방하지 못하게 한다. 이에 더하여, 동물 병원소로부터 비롯되고, 인간 대 인간 확산을 증가시키도록 재배열된(reassorted) 고도의 발병력의 바이러스 균주에 의해 야기되는 범유행의 가능성은 세계의 보건에 대하여 상당한 현실적인 위협을 제기한다.
인플루엔자 A 바이러스는 자연에서 널리 분포되어 있으며, 다양한 조류 및 포유동물을 감염시킬 수 있다. 인플루엔자 바이러스는 오르토믹소비리대(Orthomyxoviridae)의 과에 속하는 외피(enveloped) RNA 바이러스이다. 이들의 게놈은 11종의 상이한 단백질, 1종의 핵단백질(NP), 3종의 중합효소 단백질(PA, PB1 및 PB2), 2종의 기질 단백질(M1 및 M2), 3종의 비 구조 단백질(NS1, NS2 및 PB1-F2) 및 2종의 외부 당단백질: 적혈구응집소(HA) 및 뉴라미니다제(NA)를 암호화하는 8개의 단일 가닥 RNA 절편으로 구성된다. 바이러스는 HA 및 NA 단백질의 항원 구조의 차이를 기반으로 하여 분류되며, 이들의 상이한 조합은 특정 인플루엔자 바이러스 균주로 더 분류되는 독특한 바이러스 서브타입을 나타낸다. 모든 공지되어 있는 서브타입이 조류에서 관찰될 수 있지만, 현재 유행하는 인간 인플루엔자 A 서브타입은 H1N1 및 H3N2이다. 계통발생 분석에 의해, 다음과 같은 2개의 주요 그룹으로의 적혈구응집소의 세분이 증명되었다: 특히, 계통발생 그룹 1에서 H1, H2, H5 및 H9 서브타입, 그리고 특히, 계통발생 그룹 2에서 H3, H4 및 H7 서브타입.
인플루엔자 B형 바이러스 균주는 엄격하게 인간형이다. 인플루엔자 B형 바이러스 균주에서의 HA의 항원 변이는 A형 균주에서 관찰되는 것보다 더 작다. B/야마가타/16/88(B/야마가타로도 지칭) 및 B/빅토리아/2/87(B/빅토리아) 계통에 의해 대표되는 인플루엔자 B 바이러스의 2종의 유전적 및 항원적으로 별개의 계통이 인간에서 유행하고 있다. 인플루엔자 B 바이러스에 의해 야기되는 질환의 스펙트럼은 일반적으로 인플루엔자 A 바이러스에 의해 야기되는 것보다 더 경증이지만, 입원을 필요로 하는 중증의 병이 인플루엔자 B 감염에서 여전히 빈번하게 관찰된다.
인플루엔자 바이러스를 중화시키는 항체가 주로 적혈구응집소(HA)에 대해 유도되는 것이 알려져 있다. 적혈구응집소는 바이러스 코트에 고정되는 삼량체 당단백질이며 이중의 기능을 갖는다: 세포 표면 수용체 시알산으로의 결합을 담당하는 기능, 및 이것이 흡수 후에 바이러스 및 엔도솜 막의 융합을 매개하여 세포의 세포질 내의 바이러스 RNA의 방출을 야기하는 기능. HA는 소위 헤드 도메인(head domain) 및 스템 도메인(stem domain)을 포함한다. 바이러스 막으로의 부착은 스템 도메인에 연결된 C-말단 고정(anchoring) 서열(막횡단 도메인으로도 알려져 있음)에 의해 매개된다. 단백질은 지정된 루프에서 번역 후 절단되어, 2가지 폴리펩티드, HA1 및 HA2를 생성한다(전체 서열은 HA0으로 지칭). 막 원위 헤드 도메인은 주로 HA1으로부터 유래되며, 막 근위 스템 도메인은 주로 HA2로부터 유래된다(도 1).
인플루엔자 바이러스는 어디에나 존재하기 때문에, 바이러스에 의한 감염을 방지하는 것은 거의 불가능하다. 백신접종은 인플루엔자 유행병 및 범유행을 통제하는 데 중요한 역할을 한다. 많은 인플루엔자 백신은 달걀에서 바이러스의 재배열, 적응 및 성장을 포함하는 방법에 의해 제조된다. 그러나 이러한 기존 방법에는 한계가 있다. 모든 인플루엔자 바이러스 균주가 달걀에서 잘 자라는 것은 아니므로, 적응하거나 바이러스 재배열체를 구성해야 한다. 제조 중 HA의 변화는 순환하는 균주와 다르고 최적이 아닌 보호 수준을 제공할 수 있는 균주로 이어질 수 있다. 또 다른 단점은 달걀 알레르기가 있는 사람들이 달걀 기반 백신의 잔류 달걀 단백질에 과민반응을 보일 수 있다는 점이다. 더욱이, 달걀 기반 방법은 연속된 달걀의 공급에 의존하며, 이는 가금류의 질환의 경우에서와 같이 공급의 중단에 취약할 수 있다. 달걀 공급에 의존하지 않고 백신 단백질 제조가 달걀 기반 방법보다 더욱 엄격하게 통제되는 방법을 사용하여 백신을 제조할 필요가 있다. 세포 배양에서 제조된 HA의 재조합 형태(rHA)는 달걀에서 얻은 것에 대한 인플루엔자 백신의 대안적인 항원 공급원으로 사용된다. 그러나 이러한 방법을 사용하여 rHA의 면역원성 및 규칙적인 4차 구조를 유지하고 높은 수율의 삼량체 rHA를 보장하는 문제가 발생하였다. 따라서, 기존의 문제를 해결하는 인플루엔자 백신 또는 진단을 위한 대안적인 항원 공급 방법이 여전히 필요하다.
본 발명의 일부 양태가 아래에 요약된다. 추가 양태는 본 특허 출원의 발명의 상세한 설명, 실시예, 도면, 및 청구범위 섹션에 기술되어 있다.
제1 양태에서, 본 발명은 재조합 인플루엔자 A 적혈구응집소(HA) 폴리펩티드에 관한 것으로, 인플루엔자 A 바이러스 HA의 HA1 및 HA2 도메인을 포함하고,
(a) 위치 355의 아미노산은 트립토판(W)이고;
(b) 위치 432의 아미노산은 이소류신(I)이고/이거나, 위치 380의 아미노산은 I인 아미노산 서열을 포함하며;
HA 폴리펩티드의 아미노산 서열의 아미노산 위치의 넘버링은 기준 H3N2 인플루엔자 균주, 특히 기준 균주 H3N2 A/아이치/2/68(서열번호 1)로부터의 HA의 아미노산 서열의 아미노산의 넘버링에 따르는 것인 HA 폴리펩티드에 관한 것이다.
추가 양태에서, 본 발명은 적어도 2개의 HA 폴리펩티드를 포함하는 다량체 폴리펩티드, 특히 본원에 기술된 바와 같은 3개의 HA 폴리펩티드를 포함하는 삼량체 폴리펩티드에 관한 것이다.
본 발명에 따르면 놀랍게도 재조합 인플루엔자 HA 폴리펩티드, 특히 재조합 삼량체 HA 폴리펩티드가 야생형 HA 폴리펩티드와 비교하여 높은 수준으로 수득될 수 있고, 이종 아미노산 서열, 예컨대, 이종 삼량체화 도메인의 추가 없이 더 큰 안정성을 나타내는 증가된 용융 온도를 갖는 것으로 나타났다. 또한, 본 발명의 HA 폴리펩티드는 항체 CR9114, CR8020 및/또는 CR6261과 같은(그러나 이에 한정되지 않음) HA 폴리펩티드에 대한 항-HA 항체의 결합에 의해 제시된 바와 같이 정확하게 접힌다. 따라서, 폴리펩티드는 대상체, 특히 인간 대상체에게 투여되는 경우 HA에 대한 면역 반응을 유도할 수 있다. 삼량체 폴리펩티드는 야생형 천연 HA의 4차 구조를 포함하고, 따라서 HA 분자의 막 근위 줄기의 보존된 에피토프를 포함하는 천연 에피토프를 면역계에 제시한다.
추가의 양태에서, 본 발명은 재조합 인플루엔자 HA 폴리펩티드를 암호화하는 핵산 분자를 제공한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 인플루엔자 HA 폴리펩티드를 암호화하는 핵산 분자를 포함하는 벡터, 특히 재조합 아데노바이러스 벡터를 제공한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 본 발명에 따른 인플루엔자 HA 폴리펩티드, 핵산 분자 및/또는 벡터, 및 약제학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 면역원성 조성물을 제공한다.
추가의 양태에서, 본 발명은 의약으로서 사용하기 위한, 특히 인플루엔자 질환, 특히 계통발생 그룹 1 및/또는 2로부터의 인플루엔자 바이러스 A 균주에 의해 유발된 질환 또는 병태의 예방 및/또는 치료를 위한 백신으로서 사용하기 위한 인플루엔자 HA 폴리펩티드, 상기 인플루엔자 HA 폴리펩티드를 암호화하는 핵산 분자, 및/또는 상기 핵산 분자를 포함하는 벡터를 제공한다.
본 발명은 또한 필요로 하는 대상체에서 인플루엔자 HA에 대한 면역 반응의 유도 방법을 제공하며, 방법은 대상체에게 본 발명에 따른 인플루엔자 HA 폴리펩티드, 핵산 분자, 및/또는 벡터를 투여하는 단계를 포함한다. 또 다른 양태에서, 인플루엔자 질환 감염 위험이 있는 것으로 확인된 사람과 같이 필요로 하는 사람에게 전술한 바와 같은 폴리펩티드 또는 면역원성 조성물을 투여하는 단계를 포함하는 인플루엔자 질환에 대한 예방 및/또는 백신접종 방법이 제공된다.
또 다른 양태에서, 위에서 정의된 바와 같은 재조합 HA 폴리펩티드를 제조하는 방법으로서, 원핵생물 또는 진핵생물 세포, 예컨대, 포유동물 세포, 예를 들어, CHO 세포, 또는 곤충 세포에서 전술한 핵산 분자를 발현시키는 단계를 포함하고, 상기 세포로부터 rHA를 정제/단리하는 단계를 선택적으로 추가로 포함하는 방법이 제공된다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 연구 도구 또는 진단 도구로서, 또는 항체의 인플루엔자 억제제 생산을 위한 표적으로서 HA 폴리펩티드의 용도를 제공한다.
도 1. A. 표시된 돌연변이의 위치를 갖는 본 발명의 폴리펩티드 단량체의 3차원 표현. 암회색의 적혈구응집소(HA)의 헤드와 연회색의 스템; B. 표시된 돌연변이의 위치를 갖는 본 발명의 폴리펩티드 단량체의 개략도(검은색: 헤드; 연회색: 스템).
도 2. 도 2a. 인플루엔자 HA의 계통수. 인플루엔자 A 그룹 1 및 그룹 2 및 인플루엔자 B의 상이한 서브타입이 표시되어 있다; 도 2b. OCTET(항-His2 센서)에 의해 결정된 단백질 발현 수준. 마지막 컬럼은 야생형(WT) HA와 비교하여 본 발명의 안정화된 가용성 HA 삼량체의 발현 수준의 배수 증가를 나타낸다; 도 2c. 크기 배제 크로마토그래피(SEC) 프로파일 - 점선은 WT HA를 나타내고, 검은색의 실선은 본 발명에 따른 안정화된 HA 폴리펩티드를 나타낸다.
도 3. 도 3a. 본 발명의 정제된 삼량체(T) 폴리펩티드(검은색 선) 및 폴드온(Foldon) 삼량체화 도메인을 갖는 WT 폴리펩티드(회색 선)의 SEC 분석(UFV4239는 폴드온 도메인을 포함하지 않음에 유의함). WT-폴드온 정제된 폴리펩티드는 -80℃에서 보관 후 피크의 폭 넓어짐 및 다량체 형성(*)을 나타낸다. UFV4239의 누락된 삼량체화 도메인으로 인해, 단량체(M)만 발현되고 정제되었다; 도 3b 및 도 3c. 시차 주사 형광측정법(DSF)에 의한 정제된 폴리펩티드의 온도 안정성 분석(℃ 단위의 Tm50 값); 도 3d. 단일클론 항체(mAb) CR6261, CR8020, CT149, CR9114 및 다중도메인 항체 MD3606의 결합(ELISA, EC50 값).
도 4. A. OCTET(항-His2 센서)에 의해 결정된 단백질 발현 수준; B. EXPI-293 세포 배양 상청액의 SEC 분석. UFV181007은 돌연변이 K380I 및 E432I(검은색의 점선)를 포함한다. UFV181005은 돌연변이 H355W 및 M478I(회색의 점선)를 포함한다. 안정화 돌연변이의 조합(UFV1810009, 검은색 선).
도 5. A. OCTET(항-His2 센서)에 의해 결정된 단백질 발현 수준. 마지막 컬럼은 야생형(WT) HA와 비교하여 본 발명의 안정화된 가용성 HA 삼량체의 발현 수준의 배수 증가를 나타낸다; B. 크기 배제 크로마토그래피(SEC) 프로파일- 점선은 WT HA를 나타내고, 검은색의 실선은 본 발명에 따른 추가의 안정화된 HA 폴리펩티드를 나타낸다.
도 6. 온도 스트레스 전후의 정제된 안정화 HA의 크기 배제 크로마토그래피(SEC) 프로파일. 실험 전(점선)과 4℃(검은색 실선) 및 37℃(회색 실선)에서 60일의 인큐베이션 후 폴리펩티드에 대한 프로파일을 나타내었다.
정의
본 발명에서 사용되는 용어의 정의가 아래에 제공된다.
본 발명에 따른 아미노산은 20개의 자연 발생(또는 '표준' 아미노산) 또는 이의 변이체, 예를 들어, D-프롤린(프롤린의 D-거울상 이성질체), 또는 자연적으로 단백질에서 관찰되지 않는 임의의 변이체, 예를 들어, 노르류신 중 임의의 것일 수 있다. 표준 아미노산은 이들의 특성을 기반으로 몇 개의 군으로 분류될 수 있다. 중요한 인자는 전하, 친수성 또는 소수성, 크기 및 기능기이다. 이들 특성은 단백질 구조 및 단백질-단백질 상호작용에 중요하다. 다른 시스테인 잔기와 공유적 이황화 결합(또는 이황화 가교)을 형성할 수 있는 시스테인, 폴리펩티드 백본에 대하여 고리를 형성하는 프롤린, 및 다른 아미노산보다 더 유연한 글리신과 같이, 일부 아미노산은 특별한 특성을 갖는다. 표 3은 표준 아미노산의 약어 및 특성을 나타낸다.
본 명세서에서 사용되는 용어 "포함되는" 또는 "포함하는"은 용어 "제한 없이"가 뒤따르는 것으로 간주된다.
본 명세서에서 사용되는 용어 "감염"은 세포 또는 대상체 내의 바이러스의 증식 및/또는 존재에 의한 침습을 의미한다. 일 구현예에서, 감염은 "활성" 감염, 즉, 바이러스가 세포 또는 대상체에서 복제하고 있는 것이다. 이러한 감염은 바이러스에 의해 처음 감염된 세포, 조직 및/또는 기관으로부터 다른 세포, 조직 및/또는 기관으로의 바이러스의 확산을 특징으로 한다. 감염은 또한 잠복 감염, 즉, 바이러스가 복제하고 있지 않은 것일 수도 있다. 특정 구현예에서, 감염은 세포 또는 대상체에서의 바이러스의 존재로부터 야기되거나, 또는 바이러스에 의한 세포 또는 대상체의 침습에 의해 야기되는 병리적 상태를 지칭한다.
인플루엔자 바이러스는 전형적으로 속 A, B 및 C의 인플루엔자 바이러스 타입으로 분류된다. 본 명세서에서 사용되는 용어 "인플루엔자 바이러스 서브타입"은 헤마글루티닌(H) 및 뉴라미다제(N) 바이러스 표면 단백질의 조합을 특징으로 하는 인플루엔자 A 바이러스 변이체를 말한다. 본 발명에 따르면, 인플루엔자 바이러스 서브타입은 이들의 H 번호에 의해, 예를 들어, "H3 서브타입의 HA를 포함하는 인플루엔자 바이러스", "H3 서브타입의 인플루엔자 바이러스" 또는 "H3 인플루엔자"에 의해, 또는 H 번호 및 N 번호의 조합, 예를 들어, "인플루엔자 바이러스 서브타입 H3N2" 또는 "H3N2"에 의해 지칭될 수 있다. 용어 "서브타입"은 구체적으로 보통 돌연변이로부터 야기되는 각각의 서브타입 내의 모든 개별 "균주"를 포함하며, 천연 분리주 및 인공 돌연변이체 또는 재배열체 등을 포함하여, 상이한 병리학적 프로파일을 보인다. 이러한 균주는 또한 바이러스 서브타입의 다양한 "분리주"로 지칭될 수도 있다. 따라서, 본 명세서에서 사용되는 용어 "균주" 및 "분리주"는 상호교환 가능하게 사용될 수 있다. 인간 인플루엔자 바이러스 균주 또는 분리주에 대한 현행의 명명법은 예를 들어, A/모스크바/10/2000(H3N2)과 같이, 보통 괄호 안에 제공되는 HA 및 NA의 항원 설명과 함께, 바이러스의 타입(속), 즉, A, B 또는 C, 처음 분리한 지리학적 위치, 균주 번호 및 분리한 해를 포함한다. 비 인간 균주는 또한 명명에 있어 기원하는 숙주를 포함한다.
인플루엔자 A 바이러스 서브타입은 이들의 계통발생 그룹을 참조하여 더 분류될 수 있다. 계통발생 분석에 의해, 다음과 같은 2개의 주요 그룹으로의 적혈구응집소의 세분이 증명되었다: 특히, 계통발생 그룹 1("그룹 1" 인플루엔자 바이러스)의 H1, H2, H5 및 H9 서브타입 및 특히, 계통발생 그룹 2("그룹 2" 인플루엔자 바이러스)의 H3, H4, H7 및 H10 서브타입.
본 명세서에서 사용되는 용어 "인플루엔자 바이러스 질환" 또는 "인플루엔자"는 대상체에서의 인플루엔자 바이러스, 예를 들어, 인플루엔자 A 또는 B 바이러스의 존재로부터 야기되는 병리학적 상태를 지칭한다. 본 명세서에서 사용되는 용어 "질환" 및 "장애"는 상호교환 가능하게 사용된다. 특정 구현예에서, 이 용어는 인플루엔자 바이러스에 의한 대상체의 감염에 의해 야기되는 호흡기 병을 지칭한다.
본 명세서에서 사용되는 용어 "핵산" 또는 "핵산 분자"는 폴리뉴클레오티드, 예컨대, DNA 분자(예를 들어, cDNA 또는 게놈 DNA) 및 RNA 분자(예를 들어, mRNA) 및 뉴클레오티드 유사체를 사용하여 생성된 DNA 또는 RNA의 유사체를 포함하고자 한 것이다. 핵산은 단일 가닥 또는 이중 가닥일 수 있다. 핵산 분자는 화학적 또는 생화학적으로 변형될 수 있거나, 또는 당업자에 의해 용이하게 인정될 바와 같이, 비 천연 또는 유도체화된 뉴클레오티드 염기를 함유할 수 있다. 이러한 변형은 예를 들어, 표지, 메틸화, 하나 이상의 자연 발생 뉴클레오티드의 유사체로의 치환, 뉴클레오티드 사이 변형, 예를 들어, 비 하전 연결기(예를 들어, 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스테르, 포스포르아미데이트, 카르바메이트 등), 하전된 연결기(예를 들어, 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 등), 펜덴트 부분(예를 들어, 폴리펩티드), 인터칼레이터(intercalator)(예를 들어, 아크리딘, 소랄렌 등), 킬레이터, 알킬레이터 및 변형된 연결기(예를 들어, 알파 아노머 핵산 등)를 포함한다. 핵산 서열에 대한 언급은 달리 명시되지 않는 한 이의 상보체를 포함한다. 따라서, 특정 서열을 갖는 핵산 분자에 대한 언급은 이의 상보 서열을 지니는 이의 상보 가닥을 포함하는 것으로 이해되어야 한다. 상보 가닥은 또한 예를 들어, 안티-센스 치료법, 혼성화 프로브 및 PCR 프라이머에 유용하다.
본 명세서에서 사용되는 바와 같이, HA에서 아미노산의 넘버링은 문헌[Winter et al. (Nature 292: 72-75, 1981)]에 기술된 바와 같이, H3 넘버링에 기반한다. 따라서, 본 발명의 폴리펩티드의 아미노산 잔기 또는 아미노산 위치의 넘버링은 문헌[Winter et al. (1981)]의 도 2에서 기술되고 도시된 바와 같이, H3 HA의 아미노산의 넘버링(특히, A/아이치/2/68의 HA의 아미노산 위치의 넘버링)에 해당한다. 특히, 넘버링은 서열번호 1의 아미노산 위치의 넘버링에 해당한다. 예를 들어, 표현 "위치 355의 아미노산"은 문헌[Winter et al. (1981)]의 H3 넘버링에 따른 위치 355에 있는 아미노산 잔기, 즉, 서열번호 1의 위치 355에 있는 아미노산 잔기를 지칭한다. 다른 인플루엔자 바이러스 균주 및/또는 서브타입, 예컨대, 예를 들어, H1, H5, 또는 H7 HA에서 균등한 아미노산이 서열 정렬에 의해 결정될 수 있음을 당업자는 이해할 것이다. 따라서, 예를 들어, 서열번호 1과 비교하여 추가의 아미노산 잔기가 부가되거나 제거된 경우, 상이한 HA 서열이 상이한 넘버링 시스템을 가질 수 있음을 주목해야 하고, 이를 당업자는 이해할 것이다. 이와 같이, 특정 아미노산 잔기가 그 번호로 지칭될 경우, 이러한 설명은 주어진 아미노산 서열의 시작부터 셀 때 정확히 해당 번호가 매겨진 위치에 위치한 아미노산에만 한정되지 않고, 오히려 해당 잔기가 동일한 정확한 번호가 매겨진 위치에 있지 않더라도, 예를 들어, HA 서열이 서열번호 1보다 짧거다 긴 경우, 또는 서열번호 1과 비교하여 삽입 또는 결실이 있는 경우, 모든 HA 서열의 균등한/상응하는 아미노산 잔기가 의도되는 것으로 이해된다. 당업자는 예를 들어 주어진 HA 서열을 서열번호 1에 정렬함으로써, 본원에 인용된 특정 번호가 매겨진 잔기 중 임의의 것과 상응하는/동등한 아미노산 위치가 무엇인지 쉽게 결정할 수 있다. 따라서, 인플루엔자 HA 단백질의 특정 아미노산 잔기가 지칭되는 구현예에서, 본 발명은 오로지 정확한 번호가 매겨진 아미노산 위치에서만의 소정의 아미노산 잔기(예를 들어, 위치 355의 트립토판(W) 및/또는 위치 432 및/또는 380의 이소류신(I)의 존재)를 갖는 서열들로 한정되지 않음이 이해된다.
"폴리펩티드"는 당업자에게 공지된 바와 같이 아미드 결합에 의해 연결된 아미노산의 중합체를 지칭한다. 본 명세서에서 사용되는 용어는 공유적 아미드 결합에 의해 연결된 단일 폴리펩티드 사슬을 지칭할 수 있다. 이 용어는 또한 비 공유 상호작용, 예를 들어, 이온 접촉, 수소 결합, 반데르발스 접촉 및 소수성 접촉에 의해 회합된 다수의 폴리펩티드 사슬을 지칭할 수 있다. 당업자는 이 용어가 예를 들어, 번역 후 가공, 예를 들어, 신호 펩티드 절단, 이황화 결합 형성, 글리코실화(예를 들어, N-연결 및 O-연결 글리코실화), 프로테아제 절단 및 지질 변형(예를 들어, S-팔미토일화)에 의해 변형된 폴리펩티드를 포함함을 인식할 것이다.
본 명세서에서 사용되는 용어 "야생형"은 자연적으로 순환하는 인플루엔자 바이러스로부터의 HA를 지칭한다.
발명의 상세한 설명
인플루엔자 바이러스는 세계 공중 보건에 상당한 영향을 미치며, 매년 수백만의 중증의 병의 사례, 수천의 사망 및 상당한 경제적 손실을 야기한다. 현행의 3가 인플루엔자 백신은 백신 균주 및 밀접하게 관련된 분리주에 대하여 강력한 중화 항체 반응을 유도하나, 서브타입 내의 더욱 분기된 균주 또는 다른 서브타입으로 드물게 확대된다. 또한, 적절한 백신 균주의 선택은 많은 시험감염을 제시하며, 준최적의 보호를 빈번하게 야기한다. 추가로, 다음의 유행성 바이러스가 발생할 시기와 장소를 비롯하여 이의 서브타입을 예측하는 것은 현재 불가능하다.
적혈구응집소(HA)는 중화 항체의 주요 표적인 인플루엔자 A 바이러스 유래의 주요 외피 당단백질이다. 적혈구응집소는 유입 과정 동안 2가지 주요 기능을 갖는다. 먼저, 적혈구응집소는 시알산 수용체와의 상호작용을 통하여 표적 세포의 표면으로의 바이러스의 부착을 매개한다. 두 번째로, 바이러스의 세포내 이입 후에, 적혈구응집소는 이후에 바이러스 및 엔도솜 막의 융합을 매개하여, 이의 게놈을 표적 세포의 세포질로 방출시킨다.
HA는 단량체당 약 500개 아미노산의 엑토도메인을 포함하는 삼량체 단백질이고, 각각이 이황화 결합에 의해 연결되는 2개의 폴리펩티드 HA1 및 HA2를 함유하는 세 개의 동일한 서브유닛(단량체)을 포함한다. 각각의 단량체는 처음에는 HA0으로 발현되고, 이후에 상기 이황화 결합을 통해 연결되는 HA1 및 HA2 도메인으로 숙주 프로테아제에 의해 절단된다.
대다수의 N 말단 도메인(HA1 도메인, 약 320 내지 330개 아미노산 길이)은 바이러스 중화 항체에 의해 인식되는 대부분의 결정기 및 수용체 결합 부위를 함유하는 막-원위 구형 도메인(헤드 도메인)을 형성한다. 보다 작은 C 말단 도메인(HA2 도메인, 약 180개 아미노산 길이)은 세포 또는 바이러스 막에 구형 도메인을 고정시키는 스템 유사 구조(스템 도메인)를 형성한다. 가장 보존된 영역 중 하나는 절단 부위 근처의 서열, 특히 HA2 N 말단의 23개 아미노산(융합 단백질)이며, 이는 모든 인플루엔자 A 바이러스 서브타입 간에 보존된다. 이러한 영역의 부분은 HA 전구체 분자(HA0)에서 표면 루프로서 노출되나, HA0이 HA1 및 HA2로 절단되는 경우 접근 불가능하게 된다.
위에서 언급한 바와 같이, 인플루엔자 HA 단백질은 바이러스의 표면에서 발견되는 주요한 단백질이다. 비리온의 표면에서 발견되는 HA는 삼량체 형태이다. 삼량체는 3개의 단량체 각각의 카복시 말단 단부의 막횡단 스패닝 서열에 의해 바이러스 막에 고정되어 있다. 인플루엔자 백신의 주요 보호 효능은 HA 단백질에 대한 항-헤마글루티닌 항체에 기인한다. 이는 구조적으로 관련 있는 HA 단백질에 대한 면역 반응을 높이는 것의 중요성을 강조한다.
인플루엔자 A 바이러스 적혈구응집소(HA0)의 엑토도메인을 나타내는 가용성 폴리펩티드를 제조하기 위하여, HA는 고유의 막횡단 및 세포질 도메인 없이 발현될 필요가 있다. 안정적인 삼량체형 가용성 야생형(WT) HA의 발현은 종종 포유동물 세포에서 매우 빈약하다. 적어도 삼량체화 수준을 개선하기 위하여, 이종 삼량체화 도메인(예를 들어, 폴드온 삼량체화 도메인; 문헌[Stevens et al. Science 303(5665):1866-1870, 2004])은 종종 폴리펩티드의 C 말단에 유전적으로 융합된다. 불행히도, 이종 삼량체화 도메인의 부가는 원치 않는 네오에피토프를 도입하고 종종 발현 수준을 감소시키거나, 또는 폴리펩티드의 4차 구조를 변경할 수 있다.
본 발명은 안정적인 재조합 인플루엔자 A 적혈구응집소(HA) 폴리펩티드로서, 인플루엔자 A 바이러스 HA의 HA1 및 HA2 도메인을 포함하고,
(a) 위치 355의 아미노산은 W이고;
(b) 위치 432의 아미노산은 I이고/이거나, 위치 380의 아미노산은 I인 아미노산 서열을 포함하고;
HA 폴리펩티드의 아미노산 서열의 아미노산 위치의 넘버링은 기준 H3N2 인플루엔자 균주, 특히 기준 균주 H3N2 A/아이치/2/68(서열번호 1)로부터의 HA의 아미노산 서열의 아미노산의 넘버링에 따르는 것인 HA 폴리펩티드를 제공한다.
본 발명에 따르면, 놀랍게도 안정적인 재조합 HA 폴리펩티드, 특히 가용성 HA 삼량체 폴리펩티드가 HA 폴리펩티드의 코어에서 특정 아미노산 돌연변이의 존재에 의해, 폴드온 도메인 또는 임의의 다른 이종 삼량체화 도메인의 부가 없이, 수득될 수 있음이 밝혀졌다.
따라서, 특정 양태에서, 본 발명은 재조합 인플루엔자 A 적혈구응집소(HA) 폴리펩티드에 관한 것으로, 인플루엔자 A 바이러스 HA의 HA1 및 HA2 도메인을 포함하고,
(a) 위치 355의 아미노산은 W로 돌연변이되고;
(b) 위치 432의 아미노산은 I로 돌연변이되고/되거나, 위치 380의 아미노산은 I로 돌연변이된 아미노산 서열을 포함하고;
HA 폴리펩티드의 아미노산 서열의 아미노산 위치의 넘버링은 기준 H3N2 인플루엔자 균주, 특히 기준 균주 H3N2 A/아이치/2/68(서열번호 1)로부터의 HA의 아미노산 서열의 아미노산의 넘버링에 따르는 것인 HA 폴리펩티드를 제공한다. 돌연변이는 "매립형" 돌연변이이기 때문에, 즉 이들 잔기의 측쇄가 단백질 표면에 노출되지 않으므로, HA 폴리펩티드의 항원성은 바뀌지 않을 것이다.
특정 구현예에서, 폴리펩티드는 위치 355의 아미노산, 특히 히스티딘(H)의 트립토판(W)으로의 돌연변이 및 위치 432 및/또는 380의 아미노산의 이소류신(I)으로의 돌연변이를 포함한다.
예를 들어, 위치 432의 아미노산의 I로의 돌연변이를 도입함으로써 위치 432의 아미노산 I와 조합하여, 예를 들어, 위치 355의 아미노산, 특히 H의 W로의 돌연변이를 도입함으로써 위치 355에 아미노산 잔기 W를 갖거나; 또는 예를 들어, 위치 432 및 380에서 I로의 돌연변이를 도입함으로써 위치 432의 I와 위치 380의 I의 조합을 갖는 본 발명의 HA 폴리펩티드는 이러한 아미노산 돌연변이가 없는 HA 폴리펩티드와 비교하여 포유동물 세포에서 증가된 발현 수준, 삼량체화 경향 증가(예를 들어, AlphaLISA, Octet 및 SEC에 의해 측정됨), 및/또는 증가된 수준의 열 안정성(예를 들어, 동적 주사 형광측정법/열량측정법(DSF/DSC)에 의해 측정됨)을 보여준다. 또한, 본 발명의 폴리펩티드에 대한 시험한 모든 항체의 결합 강도는 (Octet 및 ELISA에 의해 측정 시) 5 nM 미만이다. 이는 폴리펩티드가 (1차, 2차, 3차 및 4차 구조와 관련하여) 천연의 야생형 HA와 구조적으로 동일함을 분명히 보여준다. 신규한 HA 폴리펩티드는 나아가 링커, 태그, 또는 삼량체화 도메인 서열과 같은 임의의 인공 (이종) 서열의 존재를 필요로 하지 않는다.
특정 구현예에서, 폴리펩티드는 위치 355의 아미노산, 특히 히스티딘(H)의 트립토판(W)으로의 돌연변이 및 위치 432 및/또는 380의 아미노산의 이소류신(I)으로의 돌연변이를 포함한다.
특정 구현예에서, HA 폴리펩티드는
(a) 위치 388의 아미노산은 M이고/이거나;
(b) 위치 478의 아미노산은 I인 아미노산 서열을 포함한다.
이러한 돌연변이는 적어도 특정 HA 서브타입에서 HA 폴리펩티드의 안정성을 추가로 증가시키는 것으로 나타났다.
특정 구현예에서, 상기 HA 단량체는 프로테아제 절단 부위를 포함하지 않는다. 위에 기술된 바와 같이, (HA1 및 HA2의) 인플루엔자 HA0 단백질의 절단은 이의 활성에 요구되어, 숙주 엔도솜 막의 바이러스 막과의 융합을 초래하여 바이러스 게놈의 표적 세포로의 진입을 촉진한다. 특정 구현예에서, 본 발명의 폴리펩티드는 천연 프로테아제 절단 부위를 포함한다. 따라서, HA1 및 HA2에 걸쳐 이어지는 Arg(R) 내지 Gly(G) 서열(즉, 아미노산 위치 329 및 330)은 트립신 및 트립신 유사 프로테아제의 인식 부위이고, 전형적으로 적혈구응집소 활성화를 위하여 절단된다(도 1의 A). 특정 구현예에서, 프로테아제 절단 부위는 위치 329의 아미노산 잔기의 아르기닌(R) 또는 리신(K) 이외의 임의의 아미노산으로의 돌연변이에 의해 제거되었다. 특정 구현예에서, 위치 329의 아미노산 잔기는 아르기닌(R)이 아니다. 바람직한 구현예에서, 폴리펩티드는 위치 329의 아미노산의 글루타민(Q)으로의 돌연변이를 포함한다. 따라서, 특정 구현예에서, 본 발명의 폴리펩티드는 투여 후에 시험관 내 또는 생체 내에서 생산되는 동안 또는 그 이후에 분자의 추정상의 절단을 방지하기 위하여 절단 부위 녹아웃 돌연변이 R329Q를 포함한다. 이로써, 절단 부위 녹아웃 돌연변이, 예를 들어, R329Q 돌연변이는 낮은 pH에 의해 유발된 구조 변화에 대한 무감응을 보장하고 HA의 융합 전 구조를 보존한다.
본 발명에 따르면, HA1 및/또는 HA2 도메인은 인플루엔자 HA 폴리펩티드의 완전한(즉, 전장) HA1 및/또는 HA2 도메인을 포함할 수 있거나, 또는 이들은 HA1 및/또는 HA2 도메인의 적어도 일부를 포함할 수 있다.
분비된 (가용성) HA 폴리펩티드를 생성하기 위하여, 특정 구현예에서 HA 단량체는 절단된 HA2 도메인을 포함한다. 따라서, 특정 구현예에서 본 발명의 폴리펩티드 내의 HA 단량체는 막횡단 및 세포질 도메인을 포함하지 않는다. 특히, 특정 구현예에서, 폴리펩티드 단량체는 C 말단 단부에서 절단된 HA2 도메인을 포함한다. 따라서, 본 발명에 따른 절단된 HA2 도메인은 HA2 도메인의 C 말단 및/또는 N 말단 단부에서 하나 이상의 아미노산 잔기의 결실에 의해 전장 HA2 서열보다 짧다. 따라서, 본 발명은 또한 HA의 세포외 도메인(엑토도메인, ECD)을 포함하거나 이로 구성된 재조합 HA 폴리펩티드를 제공한다.
특정 구현예에서, 위치 515의 아미노산에 해당하는 아미노산으로 시작하는 HA2 도메인의 C 말단 부분이 결실되어, 실질적으로 전체 막횡단 및 세포질 도메인이 제거되었다.
특정 구현예에서, 엑토도메인의 C 말단의 하나 이상의 아미노산이 또한 결실되었다. 본 발명에 따르면, HA2 도메인의 더 큰 부분이 결실되는 경우에도, 안정적인 가용성 및 삼량체 HA 폴리펩티드가 제공될 수 있음이 밝혀졌다. 따라서, 특정 구현예에서, 위치 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 또는 514의 아미노산 서열에서 시작하는 HA2 도메인의 C 말단 부분이 결실되어(위의 문헌[Winter et al.]에서 기술된 바와 같은 H3 넘버링을 따름) 세포에서 발현된 후 가용성 폴리펩티드를 생성하였다.
유사하게, HA1 도메인은 완전할 수 있거나(즉, 전장 HA1 도메인), 또는 이의 적어도 일부일 수 있다. 특정 구현예에서, 폴리펩티드는 절단된 HA1 도메인을 포함한다. HA1 도메인은 HA1 도메인의 N 및/또는 C 말단 단부에서 절단될 수 있다.
특정 구현예에서, HA 폴리펩티드는 신호 서열을 포함하지 않는다. 신호 서열(때때로 신호 펩티드, 표적화 신호, 국소화 신호, 국소화 서열, 전달 펩티드, 리더 서열 또는 리더 펩티드라고도 함)은 분비 경로로 향하는 새로 합성된 단백질의 대부분의 N 말단에 존재하는 짧은 펩티드(보통 16 내지 30개 아미노산의 길이)이다. 신호 서열은 세포가 단백질, 일반적으로 세포막으로 전위하도록 자극하는 기능을 한다. 많은 경우에, 신호 펩티드를 포함하는 아미노산은 최종 목적지에 도달하면 단백질로부터 절단된다. 인플루엔자 HA에서, 신호 서열은 전형적으로 (H3 넘버링에 따라 위치 -6에서 위치 10까지의 아미노산에 해당하는) 전장 HA0의 아미노산 서열의 처음 16개의 아미노산을 포함한다.
또한, 본 발명은 HA 폴리펩티드의 면역원성 단편을 제공한다. 특정 구현예에서, 헤드 도메인을 구성하는 HA1 도메인의 적어도 일부가 결실되어 본 발명의 HA 폴리펩티드의 면역원성 단편, 예컨대, 무 헤드 HA 폴리펩티드(즉, 스템 단독 폴리펩티드)를 제공할 수 있다.
본 발명의 폴리펩티드는 인플루엔자 A 바이러스의 인플루엔자 바이러스 적혈구응집소(HA)를 나타낸다(그로부터 유래된다). 전술한 바와 같이, 인플루엔자 A는 그룹 1과 그룹 2의 두 개의 주요 그룹으로 나눌 수 있는 여러 서브타입의 HA를 함유한다(도 2a). 본 발명의 폴리펩티드의 안정화 돌연변이는 인플루엔자 A의 모든 적혈구응집소 유형에 적용될 수 있다.
특정 구현예에서, HA1 및 HA2 도메인은 그룹 1 또는 그룹 2 인플루엔자 A 바이러스로부터 유래된다. 특정 구현예에서, HA1 및 HA2 도메인은 동일한 그룹 1 또는 그룹 2 바이러스로부터 유래된다. 특정한 다른 구현예에서, HA1 및 HA2 도메인은 상이한 그룹 1 또는 상이한 그룹 2 바이러스로부터 유래되거나, 또는 HA1 및 HA2 도메인은 상이한 그룹으로부터의 인플루엔자 A 바이러스로부터 유래된다. 예를 들어, HA2 도메인은 그룹 1 바이러스로부터 유래되고, HA2 도메인은 그룹 2 바이러스로부터 유래되거나, 또는 그 반대의 경우도 마찬가지이다. 특정 구현예에서, 헤드 도메인(즉, 헤드 도메인을 형성하는 HA1 도메인의 적어도 일부는 스템 도메인과 상이한 인플루엔자 바이러스(즉, 인플루엔자 HA 폴리펩티드의 스템 도메인을 형성하는 HA2 도메인의 일부)로부터 유래된다.
일부 특정 구현예에서, HA1 및/또는 HA2 도메인은 다음으로 구성된 군으로부터 선택되는 인플루엔자 A 바이러스로부터 유래된다: H1 서브타입의 HA를 포함하는 인플루엔자 바이러스, 예를 들어, 인플루엔자 바이러스 A/캘리포니아/07/2009 또는 A/미시간/45/2015; H2 서브타입의 HA를 포함하는 인플루엔자 바이러스, 예를 들어, 인플루엔자 바이러스 A/Env/MPU3156/2005; H5 서브타입의 HA를 포함하는 인플루엔자 바이러스, 예를 들어, 인플루엔자 바이러스 A/붉은머리오리(Eurasian Wigeon)/MPF461/2007; H9 서브타입의 HA를 포함하는 인플루엔자 바이러스, 예를 들어, 인플루엔자 바이러스 A/홍콩/1073/1999; H3 서브타입의 HA를 포함하는 인플루엔자 바이러스, 예를 들어, 인플루엔자 바이러스 H/홍콩/1/1968 또는 A/파나마/2007/1999; H14 서브타입의 HA를 포함하는 인플루엔자 바이러스, 예를 들어, 인플루엔자 바이러스 A/청둥오리(Mallard)/아스트라칸/263/1982; H7 서브타입의 HA를 포함하는 인플루엔자 바이러스, 예를 들어, 인플루엔자 바이러스 A/청둥오리/네덜란드/12/2000; 및 H10 서브타입의 HA를 포함하는 인플루엔자 바이러스, 예를 들어, 인플루엔자 바이러스 A/닭/독일/N/1949. 당업자는 본 발명의 폴리펩티드가 또한 그룹 1 또는 그룹 2로부터의 다른 인플루엔자 A 바이러스 균주의 HA로부터 유래될 수 있음을 이해할 것이다.
특정 바람직한 구현예에서, HA 서브타입(즉, 그룹 1 또는 그룹 2)에 따라 HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편은 결합 분자 CR9114, CR6261, CR8020 및/또는 MD3606에 결합한다. 따라서, (서열번호 2의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 3의 경쇄 가변 영역을 포함하는) 항체 CR6261 및/또는 (서열번호 6의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 7의 경쇄 가변 영역을 포함하는) 항체 CR9114, 및/또는 (서열번호 4의 중쇄 가변 영역 및 서열번호 5의 경쇄 가변 영역을 포함하는) 항체 CR8020 및/또는 다중도메인 항체 MD3606(서열번호 8)의 특정 에피토프를 제시하는 신규한 HA 폴리펩티드가 제공된다. 본 발명의 폴리펩티드는 단독으로 또는 다른 예방적 및/또는 치료적 처치와 조합하여 생체 내 투여될 때 인플루엔자 바이러스 중화 항체를 유도하는 데 사용될 수 있다.
특정 구현예에서, 본 발명의 HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편은 예를 들어, 중합체, 리포솜, 바이로솜, 바이러스 유사 입자, 또는 자가 조립 나노입자와 같은 나노입자에 연결된다. 폴리펩티드는 나노입자와 조합되거나, 나노입자 내에 캡시드화되거나 나노입자에 접합(예를 들어, 공유적으로 연결되거나 흡착)될 수 있다.
본 발명은 추가로 전술한 바와 같이 적어도 2개의 HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편을 포함하는 다량체 폴리펩티드를 제공한다.
특정 바람직한 구현예에서, 다량체 폴리펩티드는 삼량체이고, 전술한 바와 같이 3개의 HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편을 포함한다.
따라서, 특정 구현예에서, 본 발명은 안정화된 재조합 안정화된 삼량체 인플루엔자 A 적혈구응집소(HA) 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편을 제공하며, 상기 폴리펩티드는 3개의 HA 단량체를 포함하고, 상기 HA 단량체는 각각 인플루엔자 A 바이러스 HA의 HA1 및 HA2 도메인을 포함하고,
(a) 위치 355의 아미노산은 W이고;
(b) 위치 432의 아미노산은 I이거나, 또는 위치 432의 아미노산이 I이고 위치 380의 아미노산이 I인 아미노산 서열을 포함하며;
HA 폴리펩티드의 아미노산 서열의 아미노산 위치의 넘버링은 기준 H3N2 인플루엔자 균주, 특히 기준 균주 H3N2 A/아이치/2/68(서열번호 1)로부터의 HA의 아미노산 서열의 아미노산의 넘버링에 따른다.
위에 언급한 바와 같이, 본 발명에 따르면, 예를 들어, 위치 432의 아미노산의 I로의 돌연변이를 도입함으로써 위치 432의 아미노산 I와 조합하여, 예를 들어, 위치 355의 아미노산의 W로의 돌연변이를 도입함으로써 위치 355에 아미노산 잔기 W를 가짐으로써; 또는 예를 들어, 위치 432 및 380에서 I로의 돌연변이를 도입함으로써 위치 432의 I와 위치 380의 I의 조합을 가짐으로써, 안정적인 HA 삼량체의 발현 수준 및 삼량체화 둘 다가 증가될 수 있음이 밝혀졌다. 따라서, 본 발명의 HA 폴리펩티드는 이러한 아미노산 돌연변이가 없는 HA 폴리펩티드와 비교하여 포유동물 세포에서 증가된 발현 수준, 삼량체화 경향 증가(예를 들어, AlphaLISA, Octet 및 SEC에 의해 측정됨), 및/또는 증가된 수준의 열 안정성(예를 들어, 동적 주사 형광측정법/열량측정법(DSF/DSC)에 의해 측정됨)을 보여준다.
특정 구현예에서, 본 발명의 HA 폴리펩티드는 40℃에서 적어도 3일 동안 안정적이다.
본 발명은 또한 본 발명의 인플루엔자 HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편을 암호화하는 핵산 분자를 제공한다. 유전자 코드의 축중(degeneracy)의 결과로 다수의 상이한 핵산 분자가 동일한 폴리펩티드를 암호화할 수 있다는 점은 당업자에 의해 이해된다. 당업자는 폴리펩티드가 발현될 임의의 특정한 숙주 유기체의 코돈 활용을 반영하기 위하여 통상적인 기법을 이용하여 기재된 폴리뉴클레오티드에 의하여 암호화된 폴리펩티드 서열에 영향을 주지 않는 뉴클레오티드 치환을 제조할 수 있다는 것도 알고 있다. 따라서, 달리 명시되지 않는 한, "아미노산 서열을 암호화하는 핵산 분자"는 서로의 축중 형태이면서 동일한 아미노산 서열을 암호화하는 모든 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
특정 구현예에서, 인플루엔자 HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편을 암호화하는 핵산 분자는 인간 세포와 같은 포유동물 세포에서의 발현을 위하여 코돈 최적화된다. 코돈 최적화의 방법은 공지되어 있고 이전에 기술된 바 있다(예를 들어, WO 96/09378).
본 발명은 추가로 위에서 정의된 바와 같은 재조합 HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편을 제조하는 방법을 제공하며, 이는 원핵생물(예를 들어, 대장균) 또는 진핵생물 세포(예를 들어, 포유동물 세포, 예컨대, CHO 또는 PER.C6)에서 전술한 핵산 분자를 발현시키는 단계를 포함하고, 상기 방법은 상기 세포로부터 재조합 HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편을 정제/단리하는 단계를 선택적으로 포함한다. 재조합 인플루엔자 HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편은 본원에 기술된 기술을 포함하여, 당업자에게 재조합 폴리펩티드를 제조하기에 적합한 것으로 간주되는 임의의 기술에 따라 제조될 수 있다. 따라서, 본 발명의 폴리펩티드는 당해 분야에 공지되어 있는 표준 방법에 의해 DNA 서열로서 합성되고, 적합한 제한 효소와 당해 분야에 공지되어 있는 방법을 사용하여 클로닝되고, 이후에 시험관 내 또는 생체 내에서 발현될 수 있다. 본 발명의 HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편을 암호화하는 뉴클레오티드 서열은 당업자에게 잘 알려진 기술에 따라 합성 및/또는 클로닝 및 발현될 수 있다. 예를 들어, 문헌[Sambrook, et al, Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Vols. 1-3, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989)] 참조. 인플루엔자 백신을 제조하기 위한 재조합 DNA 기술의 사용은 몇 가지 이점을 제공한다. 여기에는 달걀에서 감염성 바이러스의 적응 및 통과 단계를 피하는 것과 더 안전하고 엄격하게 통제되는 조건 하에서 더 고도로 정제된 단백질의 생산이 포함된다. 더욱이, 바이러스 불활성화 단계를 포함할 필요가 없다. 임의의 적합한 클로닝 및 발현 시스템을 사용하여 본 발명의 HA 폴리펩티드를 재조합적으로 생산할 수 있다.
바람직한 구현예에서, 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편은 포유동물 세포에서 생산된다. 특정 구현예에서, 폴리펩티드는 적합한 세포(예를 들어, 포유류 세포)에서 발현될 때 글리코실화된다. 따라서, 폴리펩티드는 1개 이상의 천연 및/또는 도입된(즉, 비 천연) 글리코실화 모티프를 함유할 수 있다.
적혈구응집소 서열은 중합효소 연쇄 반응(PCR) 또는 역전사효소 PCR, 역공학과 같은 당해 분야에 공지된 표준 재조합 방법에 의해 생산될 수 있거나, 또는 DNA가 합성될 수 있다. PCR의 경우, 공개적으로 이용 가능한 데이터베이스에서 이용할 수 있는 적혈구응집소 뉴클레오티드 서열을 사용하여 프라이머를 준비할 수 있다. 폴리뉴클레오티드 구축물은 PCR 카세트로부터 조립될 수 있고 숙주 세포에서 증식을 위한 선택 가능한 마커를 함유하는 벡터로 순차적으로 클로닝될 수 있다. 그런 다음, 재조합 벡터는 주사, 형질감염 또는 전기천공 또는 기타 방법(예를 들어, 인산칼슘 형질감염, DEAE-덱스트란 매개 형질감염, 양이온성 지질 매개 형질감염, 전기천공)에 의해 숙주 세포 내로 도입될 수 있다. 리포펙타민(Invitrogen, 미국 캘리포니아 주 칼스배드 소재)과 같은 상업적인 형질감염 시약도 이용 가능하다.
HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편은 음이온 및/또는 양이온 교환 크로마토그래피, 친화도 크로마토그래피를 포함하는 당해 분야에 공지된 방법에 의해 재조합 세포 배양물로부터 회수 및 단리/정제될 수 있다. SDS-PAGE와 같은 기술을 사용하여 이러한 분리/정제 기술에서 용리된 단백질 분획을 분석할 수 있다. 이러한 방법은 당업자에게 잘 알려져 있으므로, 여기에서는 상세하게 제시하지 않을 것이다. 또한, 정제된 폴리펩티드를 당해 분야에 공지된 분광학적 방법(예를 들어, 원편광 분광법, 푸리에 변환 적외 분광법 및 NMR 분광법 또는 X-선 결정학)에 의해 분석하여, 헬릭스 및 베타 시트와 같은 요망되는 구조의 존재를 조사할 수 있다. ELISA, AlphaLISA, 바이오층 간섭법(Octet) 및 FACS 등을 사용하여, CR6261 및/또는 CR9114와 같은 광범위 중화 항체에 대한 본 발명의 폴리펩티드의 결합을 조사할 수 있다. 따라서, 올바른 형태를 갖는 본 발명에 따른 폴리펩티드가 선택될 수 있다. 삼량체 함량은 예를 들어, 비 환원 조건 하에서의 SDS 겔 전기영동, CR6261 및/또는 CR9114와 같은 광범위 중화 항체의 항체 Fab 단편의 존재 하에서의 크기 배제 크로마토그래피 및 차등 표지된 항체를 이용한 AlphaLISA를 이용하여 분석할 수 있다. 폴리펩티드의 안정성은 온도 스트레스, 냉동-해동 주기, 증가된 단백질 농도, 또는 교반 후에 위에 기술된 바와 같이 평가할 수 있다. 폴리펩티드의 용융 온도는 시차 주사 형광측정법(DSF)에 의해 추가로 평가할 수 있다.
일부 구현예에서 본 발명은 서열번호 10, 서열번호 12, 서열번호 14, 서열번호 16, 서열번호 18, 서열번호 20, 서열번호 22, 서열번호 24, 서열번호 26, 서열번호 28, 서열번호 33, 서열번호 34, 서열번호 35, 서열번호 36, 서열번호 38, 서열번호 40, 서열번호 42, 서열번호 44, 서열번호 47, 서열번호 50, 서열번호 51 및 서열번호 52로 구성된 군으로부터 선택되는 인플루엔자 HA 아미노산 서열 중 임의의 하나 또는 이러한 아미노산 서열과 적어도 약 40% 또는 50% 또는 60% 또는 65% 또는 70% 또는 75% 또는 80% 또는 85% 또는 90% 또는 95% 또는 98% 또는 99%의 동일성을 갖는 이의 임의의 변이체 또는 단편으로부터 유래되거나, 이를 포함하거나, 이로 구성되는 재조합 인플루엔자 HA 폴리펩티드를 제공하며, 여기서, 인플루엔자 HA 폴리펩티드는 위치 355에 트립토판(W) 및 위치 432 및/또는 380에 이소류신(I)을 포함하고, 아미노산 넘버링은 서열번호 1의 서열에 기초하거나, 예를 들어 서열번호 1에 대한 HA 아미노산 서열의 정렬에 의해 결정된 바와 같이, 이러한 아미노산 위치에 상응하는 아미노산 위치에서 이루어진다.
특정 구현예에서 본 발명은 서열번호 10의 아미노산 잔기 18 내지 518, 서열번호 12의 아미노산 잔기 18 내지 518, 서열번호 14의 아미노산 잔기 16 내지 514, 서열번호 16의 아미노산 잔기 17 내지 516, 서열번호 18의 아미노산 잔기 19 내지 512, 서열번호 20의 아미노산 잔기 17 내지 521, 서열번호 22의 아미노산 잔기 17 내지 521, 서열번호 24의 아미노산 잔기 18 내지 523, 서열번호 26의 아미노산 잔기 19 내지 515, 서열번호 28의 아미노산 잔기 17 내지 515, 서열번호 33의 아미노산 잔기 17 내지 521, 서열번호 34의 아미노산 18 내지 518, 서열번호 35의 아미노산 18 내지 518, 서열번호 36의 아미노산 18 내지 517, 서열번호 38의 아미노산 18 내지 518, 서열번호 40의 아미노산 17 내지 521, 서열번호 42의 아미노산 17 내지 521, 서열번호 44의 아미노산 17 내지 521, 서열번호 47의 아미노산 17 내지 519, 서열번호 50의 아미노산 17 내지 521, 서열번호 51의 아미노산 19 내지 515, 또는 서열번호 52의 아미노산 17 내지 514로부터 유래되거나, 이를 포함하거나, 이로 구성되는 재조합 인플루엔자 HA 폴리펩티드를 제공한다.
특정 구현예에서, HA 폴리펩티드는 서열번호 10, 서열번호 12, 서열번호 14, 서열번호 16, 서열번호 18, 서열번호 20, 서열번호 22, 서열번호 24, 서열번호 26, 서열번호 28, 서열번호 33, 서열번호 34 or 서열번호 35, 서열번호 36, 서열번호 38, 서열번호 40, 서열번호 42, 서열번호 44, 서열번호 47, 서열번호 50, 서열번호 51 및 서열번호 52로부터 유래되거나, 이를 포함하거나, 이로 구성된 아미노산 서열을 포함한다.
본 발명은 추가로 본 발명의 HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편을 암호화하는 핵산 분자를 포함하는 벡터에 관한 것이다.
특정 구현예에서, 벡터는 인간 재조합 아데노바이러스이다. 따라서, 본 발명은 본 발명에 따른 HA 폴리펩티드 또는 이의 면역원성 단편을 암호화하는 핵산 분자를 포함하는 재조합 아데노바이러스 벡터를 제공한다. 재조합 아데노바이러스 벡터는 막결합 HA를 암호화할 수 있고, 따라서 HA2 도메인을 포함하고, 막횡단 및 세포질 도메인을 포함하는 HA 폴리펩티드를 암호화할 수 있다. 아데노벡터는 또한 가용성 폴리펩티드를 암호화할 수 있고, 따라서 절단된 HA2 도메인을 포함하는 HA 폴리펩티드를 암호화할 수 있다.
재조합 아데노바이러스 벡터의 제조는 당해 분야에 잘 알려져 있다. 본 명세서에서 사용되는 바와 같이, 아데노바이러스에 대한 '재조합'이라는 용어는 아데노바이러스가 인간의 손에 의해 변형되었고, 예컨대, 아데노바이러스가 그 안에 활발하게 클로닝된 변경된 말단부를 가지고/가지거나 이종 유전자를 포함함, 즉, 자연 발생적인 야생형 아데노바이러스가 아님을 내포한다. 특정 구현예에서, 본 발명에 따른 아데노바이러스 벡터는 바이러스 복제에 요구되는 아데노바이러스 게놈의 E1 영역, 예컨대, E1a 영역 및/또는 E1b 영역의 적어도 하나의 필수적인 유전자 기능이 결핍되어 있다. 특정 구현예에서, 본 발명에 따른 아데노바이러스 벡터는 필수적이지 않은 E3 영역의 적어도 일부가 결핍되어 있다. 특정 구현예에서, 벡터는 E1 영역의 적어도 하나의 필수 유전자 기능 및 필수적이지 않은 E3 영역의 적어도 일부가 결핍되어 있다. 아데노바이러스 벡터는 "다중적으로 결핍"될 수 있는데, 이는 아데노바이러스 벡터가 아데노바이러스 게놈의 둘 이상의 영역들 각각에서 하나 이상의 필수적인 유전자 기능이 결핍되어 있음을 의미한다. 예를 들면, 위에서 언급된 E1-결핍된 또는 E1-, E3-결핍된 아데노바이러스 벡터는 E4 영역의 적어도 하나의 필수적인 유전자 및/또는 E2 영역(예컨대, E2A 영역 및/또는 E2B 영역)의 적어도 하나의 필수적인 유전자가 더 결핍되어 있을 수 있다. 아데노바이러스 벡터, 이의 구축 방법 및 이의 증식 방법은 당해 분야에 잘 알려져 있고, 예를 들어, 미국 특허 번호 5,559,099, 5,837,511, 5,846,782, 5,851,806, 5,994,106, 5,994,128, 5,965,541, 5,981,225, 6,040,174, 6,020,191, 및 6,113,913에 기술되어 있다.
특정 구현예에서, 아데노바이러스는 혈청형 26의 인간 아데노바이러스이다.
본 발명은 본 발명에 따른 HA 폴리펩티드, 이의 면역원성 단편, 핵산, 및/또는 벡터, 및 약제학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 면역원성 조성물을 추가로 제공한다. 본 발명은 특히 치료적 유효량의 본 발명의 폴리펩티드, 면역원성 단편, 핵산, 및/또는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물에 관한 것이다. 약제학적 조성물은 약제학적으로 허용 가능한 담체를 더 포함한다. 본 발명의 문맥에서, 용어 "약제학적으로 허용 가능한"은 담체가, 사용되는 투여량 및 농도에서, 이들이 투여되는 대상체에게 원치 않는 또는 유해한 효과를 야기하지 않을 것을 의미한다. 이러한 약제학적으로 허용 가능한 담체 및 부형제는 당해 분야에 잘 알려져 있다(문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th edition, A. R. Gennaro, Ed., Mack Publishing Company [1990]]; 문헌[Pharmaceutical Formulation Development of Peptides and Proteins, S. Frokjaer and L. Hovgaard, Eds., Taylor & Francis [2000]]; 및 문헌[Handbook of Pharmaceutical Excipients, 3rd edition, A. Kibbe, Ed., Pharmaceutical Press [2000]] 참조). 용어 "담체"는 폴리펩티드, 핵산, 및/또는 벡터와 함께 투여되는 희석제, 부형제, 또는 비히클을 지칭한다. 염수 용액 및 덱스트로스 및 글리세롤 수용액이 특히 주사 가능한 용액을 위한 액체 담체로서 사용될 수 있다.
본 발명은 또한 의약으로서의 사용을 위한, 본 명세서에서 기술된 HA 폴리펩티드, 면역원성 단편, 핵산, 및/또는 벡터에 관한 것이다. 본 발명은 특히 인플루엔자 바이러스에 대해, 특히 인플루엔자 바이러스의 HA 분자에 대해, 바람직하게는 중화 항체를 이끌어내는 것을 포함하여, 면역 반응을 유도하는 데 사용하기 위한, 본 명세서에서 기술된 HA 폴리펩티드, 핵산, 및/또는 벡터에 관한 것이다. 바람직한 구현예에서, 본 발명은 인플루엔자 백신으로서의 사용을 위한, 본 명세서에서 기술된 HA 폴리펩티드, 면역원성 단편, 핵산, 및/또는 벡터에 관한 것이다.
본 발명은 또한 필요로 하는 대상체에서 인플루엔자 A 바이러스에 대한 면역 반응의 유도 방법, 특히 항체를 이끌어내는 방법에 관한 것으로, 방법은 상기 대상체에게 위에서 기술된 HA 폴리펩티드, 면역원성 단편, 핵산 분자 및/또는 벡터를 투여하는 단계를 포함한다. 본 발명에 따른 대상체는 바람직하게는 인플루엔자 바이러스에 감염될 수 있거나, 다르게는 인플루엔자 바이러스에 대한 면역 반응의 유도로부터 이익을 얻을 수 있는 포유류이며, 예를 들어, 이러한 대상체는 설치류, 예를 들어, 마우스, 페럿, 애완동물 또는 가축, 또는 비 인간 영장류 또는 인간이다. 바람직하게는, 대상체는 인간 대상체, 예컨대, 인플루엔자 질환 감염 위험이 있는 것으로 확인된 사람이다.
특정 구현예에서, 본 발명의 HA 폴리펩티드, 면역원성 단편, 핵산 분자 및/또는 벡터는 보강제와 조합하여 투여된다. 보강제는 본 발명의 폴리펩티드, 핵산 분자 및/또는 벡터의 투여 전에, 투여와 동시에, 또는 투여 후에 투여될 수 있다. 적합한 보강제의 예에는 알루미늄 염, 예를 들어, 수산화알루미늄 및/또는 인산알루미늄; 스쿠알렌-물 에멀젼, 예를 들어, MF59를 비롯한 오일-에멀젼 조성물(또는 수중유 조성물)(예를 들어, WO 90/14837 참조); 사포닌 제형, 예를 들어, QS21 및 면역자극 복합체(ISCOMS)(예를 들어, US 5,057,540; WO 90/03184, WO 96/11711, WO 2004/004762, WO 2005/002620 참조); 예로서, 모노포스포릴 지질 A(MPL), 3-O-데아실화 MPL(3dMPL), CpG-모티프 함유 올리고뉴클레오티드, ADP-리보실화 박테리아 독소 또는 이의 돌연변이체, 예를 들어, E. 콜라이 이열성 장독소 LT, 콜레라 독소 CT, 백일해 독소 PT 또는 파상풍 톡소이드 TT, 매트릭스 M, 또는 이의 조합이 있는, 박테리아 또는 미생물 유도체가 포함된다. 또한, 공지되어 있는 면역증강 기술, 예를 들어, 본 발명의 폴리펩티드를 면역 반응을 향상시키는 것으로 당해 분야에 공지되어 있는 단백질(예를 들어, 파상풍 톡소이드, CRM197, rCTB, 박테리아 플라젤린 또는 기타의 것)에 융합시키는 것, 또는 폴리펩티드를 바이로솜에 포함시키는 것, 또는 이의 조합이 사용될 수 있다. 또한, 예를 들어, 동일한 아데노벡터에 의해 공동 전달되거나 암호화되는 유전적 보강제가 사용될 수 있다.
본 발명에 따른 HA 폴리펩티드, 면역원성 단편, 핵산 분자, 및/또는 벡터의 투여는 표준 투여 경로를 사용하여 수행될 수 있다. 비 제한적인 예에는 비경구 투여, 예를 들어, 정맥내, 피내, 경피, 근육내, 피하 등 또는 점막 투여, 예를 들어, 비내, 구강 등이 포함된다. 당업자는 면역 반응을 유도하기 위하여 본 발명에 따른 폴리펩티드, 핵산 분자 및/또는 벡터를 투여하는 다양한 가능성을 결정할 수 있을 것이다.
본 발명은 추가로 필요로 하는 대상체에서 인플루엔자 바이러스 질환의 예방 및/또는 치료, 바람직하게는 예방 방법을 제공하며, 방법은 상기 대상체에게 본 명세서에 기술된 치료적 유효량의 HA 폴리펩티드, 면역원성 단편, 핵산 분자 및/또는 벡터를 투여하는 단계를 포함한다. 치료적 유효량은 인플루엔자 바이러스에 의한 감염으로부터 야기되는 질환 또는 병태를 예방, 완화 및/또는 치료하는 데 유효한 폴리펩티드, 면역원성 단편, 핵산 분자, 및/또는 벡터의 양을 지칭한다. 예방은 인플루엔자 바이러스의 확산의 억제 또는 감소, 또는 인플루엔자 바이러스에 의한 감염과 관련된 증상 중 하나 이상의 발병, 발생 또는 진행의 억제 또는 감소를 포함한다. 본 명세서에서 사용되는 바와 같이, 개선은 인플루엔자 감염의 가시적이거나 또는 감지 가능한 질환 증상, 바이러스 혈증, 또는 임의의 다른 측정 가능한 징후의 감소를 의미할 수 있다.
치료를 필요로 하는 대상체는 인플루엔자 바이러스 감염에 기인한 병태로 이미 고통 받는 대상체뿐만 아니라, 인플루엔자 바이러스 감염이 예방되어야 하는 대상체도 포함한다. 따라서, 본 발명의 폴리펩티드, 면역원성 단편, 핵산 및/또는 벡터는 미경험 대상체, 즉, 인플루엔자 바이러스 감염에 의해 야기되는 질환을 갖지 않거나, 인플루엔자 바이러스 감염으로 감염된 적이 없으며 현재 감염되지 않은 대상체, 또는 인플루엔자 바이러스에 이미 감염된 적이 있는 대상체에게 투여될 수 있다.
일 구현예에서, 예방 및/또는 치료는 인플루엔자 바이러스 감염에 민감한 환자군에서 표적화될 수 있다. 이러한 환자군은, 예를 들어 노인(예를 들어, 50세 이상, 60세 이상, 그리고 바람직하게는 65세 이상), 어린이(예를 들어, 5세 이하, 1세 이하), 입원 환자, 면역손상 대상체, 및 항바이러스 화합물 치료를 받았으나 부적절한 항바이러스 반응을 나타낸 환자를 포함하나, 이에 한정되지 않는다.
본 발명의 폴리펩티드, 면역원성 단편, 핵산 분자 및/또는 벡터는 하나 이상의 다른 활성제, 예컨대, 대안적인 인플루엔자 백신, 단일클론 항체, 항바이러스제, 항박테리아제, 및/또는 면역조절제와 병용하여 대상체에게 투여될 수 있다. 하나 이상의 다른 활성제는 인플루엔자 바이러스 질환의 치료 및/또는 예방에 유리할 수 있거나 인플루엔자 바이러스 질환과 관련된 증상 또는 병태를 개선할 수 있다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 다른 활성제는 진통제, 해열 약제 또는 호흡을 완화하거나 보조하는 치료제이다.
또한, 본 발명의 HA 폴리펩티드 또는 이의 단편은 연구 도구로서, 진단 도구로서, 또는 항체 시약 또는 치료 항체의 생산을 위한 표적으로서 사용될 수 있다. 예를 들어, 일부 구현예에서 HA 폴리펩티드는 예를 들어, ELISA 분석, 비아코어(Biacore)/SPR 결합 분석 및/또는 당해 분야에 공지된 항체 결합에 대한 임의의 기타 분석에서 항-HA 항체의 분석, 이의 결합 및/또는 이의 역가의 측정을 위한 분석물로서 유용할 수 있다. 또 다른 예로서, 본 발명의 HA 폴리펩티드는 항-HA 항체의 효능을 분석 및/또는 비교하는 데 사용될 수 있다.
본 발명의 HA 폴리펩티드 또는 이의 단편은 또한 치료 항체 및/또는 연구 도구로서 또는 임의의 기타 원하는 용도에 사용될 수 있는 항체의 생성에 유용할 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 HA 폴리펩티드는 연구 도구 및/또는 치료제로서 사용하기 위한 HA 단백질에 대한 항체를 얻기 위하여 비 인간 동물의 면역화에 사용될 수 있다. 그러면 단일클론성 또는 다클론성일 수 있는 이러한 항체 및/또는 이러한 항체를 생성하는 세포를 이러한 동물로부터 얻을 수 있다.
진단 도구로서 사용하기 위한 본 발명의 폴리펩티드는 주어진 분석에 적합한 임의의 검출 기술에 유용한 태그를 포함할 수 있다. 사용된 태그는 사용된 특정 검출/분석/진단 기술 및/또는 방법에 따라 달라질 것이다. 방법은 용액에서 수행될 수 있거나, 또는 본 발명의 폴리펩티드(들)는 담체 또는 기질, 예를 들어, 미세역가 플레이트(예를 들어, ELISA용), 막 및 비드 등에 결합되거나 부착될 수 있다.
본 발명을 다음의 실시예 및 도면에서 추가로 설명한다. 실시예는 본 발명의 범주를 어떠한 방식으로든 제한하고자 하지 않는다.
실시예
실시예 1: 가용성 HA 폴리펩티드 - 본 발명의 폴리펩티드의 구조 및 설계 요소
인플루엔자 A 바이러스 적혈구응집소(HA0)의 엑토도메인을 나타내는 가용성 폴리펩티드를 제조하기 위하여, HA는 고유의 막횡단 및 세포질 도메인 없이 발현될 필요가 있다. 안정적인 삼량체형 가용성 야생형(WT) HA의 발현은 종종 포유동물 세포에서 매우 빈약하다. 적어도 삼량체화 수준을 개선하기 위하여, 폴드온 삼량체화 도메인은 종종 폴리펩티드의 C 말단에 유전적으로 융합된다. 불행히도, 폴드온 도메인의 부가는 원치 않는 네오에피토프를 도입하고 종종 발현 수준을 감소시키거나, 또는 폴리펩티드의 구조를 변경할 수 있다. 본 발명에 따르면, 가용성의 안정적인 HA 삼량체의 발현 및 삼량체화 수준은 폴드온 또는 임의의 기타 비 천연 삼량체화 서열의 부가 없이 HA 폴리펩티드의 코어에, 특히 아미노산 위치 355 및 432에서, 또는 아미노산 위치 355 및 380 및 432에서, 특정 아미노산 돌연변이를 도입함으로써 증가될 수 있음이 밝혀졌다. 본 발명의 HA 단량체에서 아미노산 위치의 넘버링에 대해서는 문헌[Winter et al. 1981]에 의한 H3 넘버링이 사용됨을 유의한다(위 참조). 따라서, 본 발명의 HA 폴리펩티드 단량체에서 아미노산 위치의 넘버링은 기준 H3N2 인플루엔자 균주, 특히 (서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는) 기준 H3N2 균주 A/아이치/2/68로부터의 HA 내 아미노산 위치의 넘버링에 따른다.
본 발명에 따른 주요 돌연변이의 주요 구조적 요소 및 위치는 인플루엔자 A H1A/캘리포니아/07/2009 균주의 HA에서 도 1의 A에 도시되어 있다(도 1의 A). 도시된 바와 같이, HA 단량체는 절단된 HA2 도메인(특히 HA2 도메인은 아미노산 위치 514 다음에 절단됨(즉, HA2 도메인의 C 말단 부분이 위치 515의 아미노산으로부터 시작하여 결실됨)을 포함하여, 막횡단 및 세포질 도메인을 결실시키고 HA의 가용성 엑토도메인을 생성한다(도 1의 B).
본 발명의 폴리펩티드는 위치 329(도 1의 B)에서 천연 일염기성 절단 부위인 아미노산 아르기닌(R)의 예를 들어, 글루타민(Q)으로의 돌연변이에 의해 프로테아제 절단에 대해 저항성이 되도록 만들어질 수 있다. 천연의 전장 HA와 대조적으로, R329Q 돌연변이를 포함하는 폴리펩티드는 세린 프로테아제(예를 들어, 트립신)에 의해 절단될 수 없다. HA의 절단은 단백질이 막 융합 및 바이러스 진입에 필요한 구조적 변화를 겪을 수 있도록 한다.
실시예 2: 상이한 서브타입에서 야생형 HA와 비교하여 가용성의 안정화된 HA의 발현
이 실시예에서, 그룹 1 및 그룹 2 둘 다로부터의 인플루엔자 바이러스로부터의 몇몇 HA를 선택하고 안정화된 가용성 삼량체 HA 폴리펩티드로서 발현시키고, 이들의 각각의 야생형 가용성 HA 엑토도메인(즉, 막횡단 및 세포질내 도메인이 없음)과 비교하였다. 본 발명에 따르면, 위치 355의 트립토판(W) 및 위치 380 및 432의 이소류신(I)은, 이들 아미노산이 HA 아미노 서열에 아직 존재하지 않은 경우, 인간에서의 8개의 가장 많은 순환 서브타입(도 2a)을 포함한 5개의 상이한 그룹 1 균주 및 5개의 상이한 그룹 2 균주의 HA의 아미노산 서열에 도입되었다. 또한, 일부 폴리펩티드의 위치 388에서 A-나선의 상단에 메티오닌(M)이 도입되었다. A/청둥오리/네덜란드/12/200(UFV181146) 및 A/닭/독일/N/1949(UFV181147)로부터 유래된 폴리펩티드를 제외하고 위치 478에서 이소류신이 도입되거나 WT 서열에 이미 존재하는 경우 유지되었다. Expi293F 배양 상청액에서 본 발명의 폴리펩티드의 발현 수준 및 삼량체화를 본 발명의 돌연변이가 없는 각각의 가용성 WT 폴리펩티드와 비교하였다.
표 1은 제조된 본 발명에 따른 폴리펩티드를 나타낸다.
[표 1]
본 발명의 폴리펩티드
Figure pct00001
+는 상기 위치에서 상기 아미노산의 존재를 의미하고; 빈 세포는 상기 아미노산의 부재(즉, 야생형 아미노산 잔기의 존재)를 의미한다.
도 2 및 표 1에 열거된 폴리펩티드를 암호화하는 DNA 단편을 합성하고(Genscript) pcDNA2004 발현 벡터(증진된 CMV 프로모터가 있는 변형된 pcDNA3 플라스미드)에 클로닝하였다. 본 발명의 폴리펩티드는 부위 특이적 비오틴화, 스크리닝 및 정제 목적을 위한 C 말단 링커-소르타제(Sortase)-링커-His 태그를 포함하였고, 진핵생물 Expi293F 현탁 세포주에서 마이크로 규모(200 μL)로 생산되었다. 야생형(WT) 전장(FL) HA 폴리펩티드는 스크리닝 목적을 위한 링커-His 태그를 함유하였다.
세포를 ExpiFectamine 293 형질감염 키트(Gibco , ThermoFisher Scientific)를 이용하여 2.5E+06vc/mL의 세포 밀도에서 96-하프 딥 웰 플레이트(System Duetz)에서 산업 등급의 DNA(0.01 EU/μg 이하의 내독소 수준 및 90% 이상의 초나선 함량)로 일시적으로 형질감염시키고, 37℃, 250 rpm, 8% CO2 및 75%의 습도에서 Expi293 발현 배지(Gibco, ThermoFisher Scientific)를 함유하는 진탕 플라스크에서 인큐베이션하였다. 분비된 폴리펩티드를 함유하는 세포 배양 상청액을 제3일에 수확하고, 원심분리(400xg에서 10분) 후 여과(96웰 필터 플레이트, 0.22 μm PVDF 막, Corning)하여 정화하였다.
수확된 배양 상청액의 발현된 가용성 HA 폴리펩티드의 수준을 OCTET 플랫폼(ForteBio)을 이용한 바이오층 간섭법에 의해 평가하였다. 요컨대, 항-HIS(HIS2) 바이오센서(ForteBio)를 사용하여, 정제된 폴리펩티드 UFV180436의 잘 정의된 기준 배치의 희석물 계열의 결합 이동을 측정하여 표준 곡선을 확립하였다. 이어서, 본 발명의 폴리펩티드를 함유하는 (동역학 완충액(ForteBio)에) 사전 희석된 세포 배양 상청액의 결합 이동을 측정하고, 폴리펩티드의 농도를 확립된 표준 곡선을 사용하여 계산하였다.
Expi293F 세포 배양 수확물에서 발현된 폴리펩티드의 존재 및 이의 4차 구조(폴리펩티드가 단량체, 삼량체 또는 다량체인지를 나타냄)는 BEH 200A 컬럼(Waters, 주입 부피 40 μL, 유속 0.35 mL/분)을 구비한 Vanquish 시스템(ThermoFisher Scientific)을 사용하여 초고성능 액체 크로마토그래피(UHPLC)에서 분석적 크기 배제 크로마토그래피(SEC)에 의해 평가하였다. 용리는 Helios 광산란 검출기(Wyatt Technologies)에 의해 모니터링하였다. SEC 프로파일을 Astra 6 소프트웨어 패키지(Wyatt Technology)로 분석하였다.
결과 및 결론
상이한 균주의 야생형 HA에서 위치 355의 트립토판 및 위치 380 및/또는 432의 이소류신의 도입은 OCTET에 의해 결정된 바와 같이 본 발명의 테스트한 모든 폴리펩티드에 대해 발현의 증가를 초래하였다(도 2b).
조 세포 배양 상청액의 SEC 분석은 본 발명의 폴리펩티드에 안정화 돌연변이를 도입할 때 모든 가용성의 안정화된 HA에 대해, 각각의 야생형 HA 엑토도메인에 대해 관찰된 삼량체 피크보다 더 긴 6분에서 7분 사이의 체류 시간에 뚜렷한 삼량체(T) 피크가 나타남을 보여주었다(도 2c). 상이한 인플루엔자 HA 서브타입 간의 체류 시간의 차이는 글리코실화 수준 및 복잡성의 차이로 인한 것일 수 있음을 주목한다.
종합하면, 데이터는 본 발명의 HA 폴리펩티드로의 돌연변이 355W, 380I 및/또는 432I의 도입은 안정적인 가용성 삼량체 HA의 증가된 발현 및 형성을 초래함을 확인시켜 준다.
실시예 3: 폴드온 삼량체화 도메인을 함유하는 야생형 HA와 비교한 정제된 삼량체 전장 HA의 시험관 내 특성화
중요한 안정화 돌연변이 355W, 380I 및/또는 432I의 기여를 추가로 특성화하기 위하여, 돌연변이를 H1 균주 A/캘리포니아/07/2009(UFV181009), A/미시간/45/2015((UFV181091), 및 H3 균주 A/홍콩/1/1968(UFV180660) 및 A/인디애나/11/2011(UFV181099)로부터 유래된 HA 엑토도메인 폴리펩티드(즉, TM 및 IC 도메인 제외)에 도입하고, 폴드온 삼량체화 도메인을 함유하는 야생형(WT) HA 엑토도메인과 비교하였다(폴드온 삼량체화 도메인이 결여된 UFV4239(서열번호 29)는 제외). 폴리펩티드는 표 2에 나타낸 바와 같은 아미노산을 포함하였다. 모든 폴리펩티드는 정제 및 스크리닝 목적을 위한 His 태그를 추가로 포함하고, ExpiCHO 세포에서 생산된 후, 정제 및 특성화되었다.
본 발명의 폴리펩티드를 암호화하는 DNA 단편을 실시예 2에 기술된 바와 같이 합성하였다. 폴리펩티드를 ExpiCHO 현탁 세포(350 mL 규모)에서 생산하였고, 제조업체의 프로토콜에 따라 ExpiFectamine 형질감염 시약(Gibco, ThermoFisher Scientific)을 사용하여 각각의 산업 등급의 DNA로 일시적 형질감염에 의해 ExpiCHO 발현 배지에서 배양하였다. ExpiFectamine CHO 증진제 및 ExpiCHO 피드(Gibco, ThermoFisher Scientific)를 제조업체의 프로토콜에 따라 형질감염 1일 후 세포 배양물에 첨가하였다. ExpiCHO 형질감염된 세포 현탁액을 32℃, 5% CO2에서 인큐베이션하고, 분비된 폴리펩티드를 함유하는 배양 상청액을 7 내지 11일 사이에 수확하였다. 배양 상청액을 원심분리에 이어, 0.2 μm 보틀 탑 필터(Corning)를 이용한 여과에 의해 정화하였다.
수확된 배양 상청액으로부터, 본 발명의 his 태그가 붙은 폴리펩티드 및 폴드온 삼량체화 도메인을 함유하는 각각의 야생형 균주를
Figure pct00002
KTA Avant 25 시스템(GE Healthcare Life Sciences)을 사용하여 2단계 프로토콜에 따라 정제하였다. 먼저, 사전 패킹된 cOmplete His-태그 정제 컬럼(Roche)을 사용하여 고정화된 금속 친화도 크로마토그래피를 수행하고, 1 mM의 이미다졸로 세척하고, 300 mM의 이미다졸로 용리시켰다. 두 번째로, HiLoad Superdex 200 pg 26/600 컬럼(GE Healthcare Life Sciences)을 사용하여 크기 배제 크로마토그래피를 수행하였다. 삼량체 피크 분획을 모아 냉동하고 -80℃에서 보관하였다(1개월 및 6개월).
본 발명의 정제된 폴리펩티드의 삼량체 함량을 실시예 2에 기술된 바와 같이 초고성능 액체 크로마토그래피(UHPLC)에서 분석적 SEC에 의해 평가하였다. 각각의 정제된 폴리펩티드 20 μg을 주입하고, 컬럼에 흘려보냈다.
정제된 폴리펩티드의 열 안정성을 6 μg의 폴리펩티드 용액에 첨가된 Sypro Orange 염료(ThermoFisher Scientific)의 형광 발광을 모니터링함으로써 시차 주사 형광측정법(DSF)에 의해 결정하였다. 온도가 25℃에서 95℃(시간당 60℃)로 점진적으로 증가하면, 폴리펩티드가 펼쳐지고 형광 염료가 노출된 소수성 잔기에 결합하여 특징적인 발광 변화를 초래한다. 용융 곡선을 ViiA7 실시간 PCR 장치(Applied BioSystems)를 사용하여 측정하고, Tm50 값을 Spotfire suite(Tibco Software Inc.)에 의해 계산하였다. Tm50 값은 단백질의 50%가 펼쳐지는 온도를 나타내며, 따라서 폴리펩티드의 온도 안정성에 대한 척도이다.
정제된 폴리펩티드의 3차원 입체형태를 ELISA에서 항원성을 테스트함으로써 평가하였다(항체 결합의 EC50 값). 이를 위하여, 폴리펩티드를 10 nM의 농도로 코팅하고, 출발 농도로서 70 nM을 사용하여, 일련의 단일클론 항체(mAb) 희석액: 특히 CR6261(그룹 1 특이적), CR8020(그룹 2 특이적), CR9114(그룹 1 및 2 모두 특이적), 및 MD3606(그룹 1 및 2 특이적 다중도메인 항체)과 인큐베이션하였다. 항체 결합을 2차 항체 항-인간 Fc HRP(마우스 항 인간 IgG, Jackson ImmunoResearch)와의 인큐베이션에 의해 결정하였고, POD 기질의 첨가에 의해 가시화하였다. EnSight™ 다중모드 플레이트 판독기(PerkinElmer)를 사용하여 판독을 수행하였다. 두 가지 독립적인 실험의 EC50 값을 Spotfire 제품군(Tibco Software Inc.)과 도 3d에 열거된 평균 및 표준 편차를 이용하여 계산하였다.
결과 및 결론
[표 2]
본 발명의 폴리펩티드
Figure pct00003
SEC 분석 결과는 상이한 인플루엔자 HA 균주의 본 발명의 폴리펩티드 내로의 (안정화) 아미노산의 존재(또는 동시 도입)가 고도로 순수하고 안정적인 가용성 삼량체 HA 폴리펩티드의 정제를 가능하게 함을 확인시켜 주었다. 아미노산의 안정화 효과는 H1A/캘리포니아/07/2009(UFV181009)에서 유래된 정제된 폴리펩티드의 경우 가장 잘 관찰되었으며, 여기서 상응하는 야생형 구축물(UFV4239, 서열번호 29)은 폴드온 삼량체화 도메인을 보유하지 않았고 단량체 피크만을 생성하였으나, 본 발명의 안정화된 폴리펩티드는 고순도 삼량체 피크를 보여준다(도 3a). 다른 H1 균주 A/미시간/45/2015의 야생형 HA 분자와 H3 균주 A/홍콩/1/1968 및 A/인디애나/11/2011은 추가적인 C 말단 폴드온 도메인을 가지고 발현되었고 삼량체 HA를 형성하였다. 그러나 본 발명의 각각의 안정화된 폴리펩티드와 달리, 폴드온 도메인을 갖는 야생형 HA의 삼량체 피크는 더 넓고 비대칭적이며, 바람직하지 않은 형태(*) 또는 덜 컴팩트한 접힘의 대안적인 고분자량 및/또는 저분자량의 폴리펩티드의 존재를 시사하는 숄더(shoulder)를 보여주었다(Seok et al., Sci. Cell Rep. 8;7:1-7540, 2017]).
모든 폴리펩티드의 추가 특성화는 안정화 아미노산을 포함하는 본 발명의 폴리펩티드가 폴드온 삼량체화 도메인이 있거나 없는(UFV4239, 서열번호 29) WT 폴리펩티드와 비교하여 상당히 더 높은 열 안정성을 나타냄을 보여주었다(도 3b 및 3c).
도입된 안정화 돌연변이는 매립형 돌연변이(즉, 표면이 아니라 HA 폴리펩티드 내부에 있음)이므로, 단량체 또는 삼량체 HA의 표면에 영향을 미치지 않을 것이다. HA 표면의 무결성을 확인하기 위하여, 널리 알려진 폭넓게 중화하는 항체 패널의 폴리펩티드에 대한 결합을 ELISA로 평가하였다. 본 발명의 야생형 및 안정화된 폴리펩티드는 이들의 예상되는 결합 폭에 따라 모든 항체에 대해 낮은 nM 범위의 EC50 값으로 비슷한 결합을 나타내었다. 본 발명의 H3 A/홍콩/1/1968 및 H3 A/인디애나/11/2011 유래 HA 폴리펩티드에 대한 CR9114 결합의 개선(약 4 내지 8배)이 관찰되었다(도 3d).
결론적으로, 본 실시예에 기술된 본 발명의 폴리펩티드는 고순도 삼량체 폴리펩티드로서 세포 배양 상청액으로부터 정제되었고, (폴드온 삼량체화 도메인이 있거나 없는) WT HA와 비교하여 개선된 열 안정성을 나타내었고 적절하게 접혔다.
실시예 4: 안정화 돌연변이의 조합의 특성화
본 발명의 폴리펩티드에서 안정화 돌연변이를 조합하는 것의 유익한 효과를 평가하기 위하여, 조합 355W + 478I 및 조합 380I + 432I를 H1 균주 A/캘리포니아/07/2009의 HA 엑토도메인에 단계적으로 도입하였다(도 4의 A, '.'는 첫 번째 줄에 열거된 H1 야생형(WT) 잔기의 변경되지 않은 존재를 나타낸다).
본 발명의 폴리펩티드를 암호화하는 DNA 단편을 실시예 2에 기술된 바와 같이 합성하였다. 부위 특이적 비오틴화 및 스크리닝 및 정제 목적을 위한 C 말단 링커-소르타제-링커-His 태그를 포함하는 폴리펩티드를 실시예 2에 기술된 바와 같이 진핵생물 Expi293F 세포에서 마이크로 규모(200 μL)로 생산하였다. 발현된 폴리펩티드의 수준을 OCTET에 의해 결정하였고, 삼량체 함량을 실시예 2에 기술된 바와 같이 분석적 SEC에 의해 분석하였다.
결과 및 결론
안정화 돌연변이의 상이한 조합을 갖는 본 발명의 폴리펩티드의 발현 수준의 평가는 UFV181007(서열번호 35)에 존재하는 돌연변이 380I 및 432I가 발현에 영향을 미치지 않았지만 WT 구축물과 비교하여 유의하게 삼량체의 수준을 증가시켰음을 보여주었다(도 4의 B). 돌연변이 355W 및 478I(예를 들어, UFV181005: 서열번호 34)의 부가는 현저한 발현의 증가를 초래하지만(도 4의 A), 삼량체의 형성은 관찰되지 않았다(도 4의 B). 355W, 478I, 380I 및 432I(예를 들어, UFV181009: 서열번호 10)를 조합할 때 발현 수준이 모두 증가되었고(도 4의 A), 삼량체 함량은 세포 배양 상청액에서 유의하게 개선되었다(도 4의 B).
결론적으로, 돌연변이 355W 및 478I는 본 발명의 폴리펩티드의 발현 수준을 증가시킨 반면, 돌연변이 380I 및 432I는 삼량체 형성을 개선하였다. 안정화 돌연변이의 조합은 본 발명의 폴리펩티드의 발현 및 삼량체 수준을 상승적으로 증가시켰다.
실시예 5: 다양한 HA 서브타입에서 야생형 HA와 비교하여 추가적인 가용성의 안정화된 HA의 발현
이 실시예에서, 추가로 안정화된 HA를 발현시키고, 각각의 야생형 가용성 HA 엑토도메인과 비교하였다(도 5의 A). 위치 355의 트립토판(W) 및 위치 380 및 432의 이소류신(I)이 2개의 추가 그룹 1 균주 및 4개의 추가 그룹 2 균주의 HA의 아미노산 서열에 도입되었다. 형질감염 3일 후 Expi293F 배양 상청액에서 폴리펩티드의 발현 수준 및 삼량체화를 본 발명의 돌연변이가 없는 각각의 가용성 WT 폴리펩티드와 비교하였다. 표 4는 제조된 본 발명에 따른 추가의 폴리펩티드를 나타낸다.
본 발명의 폴리펩티드를 암호화하는 DNA 단편을 실시예 2에 기술된 바와 같이 합성하였다. 플라스미드를 실시예 2에 기술된 바와 같이 진핵생물 Expi293F 세포에서 마이크로 규모(200 μL)로 형질감염시켰다. 스크리닝 및 정제 목적을 위한 C 말단 링커 His-태그를 포함한 모든 폴리펩티드가 발현된 반면, 안정화된 폴리펩티드는 부위 특이적 비오틴화를 위한 His 태그 앞에 추가의 소르타제-링커 서열을 포함한다. 발현된 폴리펩티드의 수준을 OCTET에 의해 결정하였고, 삼량체 함량을 실시예 2에 기술된 바와 같이 분석적 SEC에 의해 분석하였다.
결과 및 결론
실시예 2에서 관찰된 바와 같이, 상이한 균주의 야생형 HA에서 위치 355의 트립토판 및 위치 380 및 432의 이소류신의 도입은 OCTET 측정에 기초하여 추가로 테스트한 이러한 모든 폴리펩티드의 발현의 증가를 초래하였다. 하나의 예외는 H1 A/사우스캐롤라이나/1/1918 (UFV181084) 유래 HA에 대해 관찰되었는데, 이는 OCTET에 의해 결정된 바와 같이 약간의 감소를 보였지만(도 5의 A), SEC의 곡선 아래 면적을 기초로 하지 않았다(도 5의 B).
조 세포 배양 상청액의 SEC 분석은 모든 추가적인 가용성의 안정화된 HA에 안정화 돌연변이를 도입할 때, 각각의 야생형 HA 엑토도메인과 비교하여 더 많은 삼량체 폴리펩티드(T) 및 더 적은 단량체 폴리펩티드(M) 및 고분자량 종이 관찰되었음을 보여주었다(도 5의 B). 실시예 2에서 주목한 바와 같이, 상이한 인플루엔자 HA 서브타입 간의 체류 시간의 차이는 글리코실화 수준 및 복잡성의 차이로 인한 것일 가능성이 높다.
종합하면, 데이터는 본 발명의 추가적인 HA 폴리펩티드로의 돌연변이 355W, 380I 및/또는 432I의 도입이 안정적인 가용성 삼량체 HA의 증가된 발현 및 형성을 초래함을 확인시켜 준다.
실시예 6: 정제된 삼량체 전장 HA의 시험관 내 특성화(추가 데이터)
이 실시예에서는 추가적인 안정화된 HA를 발현시키고, 정제하고, 장기간 온도 스트레스에 노출시켰다. 이들 HA, UFV190839(서열번호 50), UFV190068(서열번호 51) 및 UFV190841(서열번호 52)은 각각 H3 A/홍콩/1/1968 H7 A/청둥오리/NL/12/2000, 및 H10 A/닭/독일/N/1949에서 유래되었다. 요컨대, 정제된 삼량체 폴리펩티드를 4℃(냉장고) 및 37℃(인큐베이터)에서 60일 동안 보관한 후, 분석적 SEC에 의해 단백질 무결성을 평가하였다.
본 발명에 따르면, 위치 355의 트립토판(W) 및 위치 380 및 432의 이소류신(I)이 3개의 상이한 그룹 2 균주의 HA의 아미노산 서열에 도입되었다.
본 발명의 폴리펩티드를 암호화하는 DNA 단편을 실시예 2에 기술된 바와 같이 합성하였다. 폴리펩티드를 실시예 3에 기술된 바와 같이 진핵생물 ExpiCHO 세포에서 중간 규모(30 mL)로 생산하였고, 5일째에 수확하였다. 부위 특이적 비오틴화, 스크리닝 및 정제 목적을 위한 C 말단 링커-소르타제-링커 His-태그를 포함하는 모든 폴리펩티드를 발현시켰다. 단백질을 실시예 3에 기술된 바와 같이 2단계 공정에 의해 정제하였으나, 이제는 HiLoad Superdex 200 16/600 컬럼이 사용되었다(GE Healthcare Life Sciences). 발현된 폴리펩티드의 수준을 OCTET에 의해 결정하였고, 현재 Unix-C 300 A 컬럼(Sepax Technologies)이 사용되었다는 일탈과 함께 실시예 2에 기술된 바와 같이 삼량체 함량을 분석적 SEC에 의해 분석하였다.
결과 및 결론
SEC 분석 결과는 정제 후 수득된 안정화 아미노산을 포함하는 본 발명의 폴리펩티드가 고도로 순수하고 삼량체임을 나타내었다. 나아가, 가용성 HA 폴리펩티드는 온도 스트레스에 저항적이었다. 4℃ 및 37℃에서 60일의 인큐베이션은 스트레스 전 물질에 대해 관찰된 것과 비교하여 단백질의 양 및 삼량체 상태에 영향을 미치지 않았으며(도 6), 37℃에서 인큐베이션 후 H10 유래 HA에 대해 오로지 소량의 삼량체 이외의 폴리펩티드가 관찰되었다(약 4.75분의 체류 시간).
실시예 2에서 주목한 바와 같이, 상이한 인플루엔자 HA 서브타입 간의 체류 시간의 차이는 글리코실화 수준 및 복잡성의 차이로 인한 것일 가능성이 높다. 또한, 60일 동안 스트레스를 가한 물질과 비교하여 출발 물질에 대해 관찰된 체류 시간의 작은 차이는 컬럼 노화로 인한 것일 가능성이 높다(즉, 유사한 이동이 내부 대조군에 대해 관찰됨).
결론적으로, 본 실시예에 기술된 본 발명의 폴리펩티드는 고순도 삼량체 폴리펩티드로서 배양 상청액으로부터 정제되었고, 60일의 기간 동안 온도 스트레스에 대해 고도로 불활성인 것으로 나타났다.
[표 3]
표준 아미노산, 약어 및 특성
Figure pct00004
서열
서열번호 1 CAA24269.1 적혈구응집소(인플루엔자 A 바이러스(A/아이치/2/1968(H3N2) (신호 서열 제외))
QDLPGNDNST ATLCLGHHAV PNGTLVKTIT DDQIEVTNAT ELVQSSSTGK 50
ICNNPHRILD GIDCTLIDAL LGDPHCDVFQ NETWDLFVER SKAFSNCYPY 100
DVPDYASLRS LVASSGTLEF ITEGFTWTGV TQNGGSNACK RGPGSGFFSR 150
LNWLTKSGST YPVLNVTMPN NDNFDKLYIW GIHHPSTNQE QTSLYVQASG 200
RVTVSTRRSQ QTIIPNIGSR PWVRGLSSRI SIYWTIVKPG DVLVINSNGN 250
LIAPRGYFKM RTGKSSIMRS DAPIDTCISE CITPNGSIPN DKPFQNVNKI 300
TYGACPKYVK QNTLKLATGM RNVPEKQTRG LFGAIAGFIE NGWEGMIDGW 350
YGFRHQNSEG TGQAADLKST QAAIDQINGK LNRVIEKTNE KFHQIEKEFS 400
EVEGRIQDLE KYVEDTKIDL WSYNAELLVA LENQHTIDLT DSEMNKLFEK 450
TRRQLRENAE EMGNGCFKIY HKCDNACIES IRNGTYDHDV YRDEALNNRF 500
QIKGVELKSG YKDWILWISF AISCFLLCVV LLGFIMWACQ RGNIRCNICI 550
CR6261 VH 단백질(서열번호 2)
EVQLVESGAEVKKPGSSVKVSCKASGGPFRSYAISWVRQAPGQGPEWMGGIIPIFGTTKYAPKFQGRVTITADDFAGTVYMELSSLRSEDTAMYYCAKHMGYQVRETMDVWGKGTTVTVSS
CR6261 VL 단백질(서열번호 3)
QSVLTQPPSVSAAPGQKVTISCSGSSSNIGNDYVSWYQQLPGTAPKLLIYDNNKRPSGIPDRFSGSKSGTSATLGITGLQTGDEANYYCATWDRRPTAYVVFGGGTKLTVL
CR8020 VH 단백질(서열번호 4)
QVQLQQSGAEVKTPGASVKVSCKASGYTFTSFGVSWIRQAPGQGLEWIGWISAYNGDTYYAQKFQARVTMTTDTSTTTAYMEMRSLRSDDTAVYYCAREPPLFYSSWSLDNWGQGTLVTVSS
CR8020 VL 단백질(서열번호 5)
EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVSMNYLAWFQQKPGQAPRLLIYGASRRATGIPDRISGSGSGTDFTLTISRLEPADFAVYYCQQYGTSPRTFGQGAKVEIK
CR9114 VH 단백질(서열번호 6)
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKSSGGTSNNYAISWVRQAPGQGLDWMGGISPIFGSTAYAQKFQGRVTISADIFSNTAYMELNSLTSEDTAVYFCARHGNYYYYSGMDVWGQGTTVTVSS
CR9114 VL 단백질(서열번호 7)
SYVLTQPPAVSGTPGQRVTISCSGSDSNIGRRSVNWYQQFPGTAPKLLIYSNDQRPSVVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEAEYYCAAWDDSLKGAVFGGGTQLTVL
MD3606 단백질(서열번호 8)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAVSISIFDIYAMDWYRQAPGKQRDLVATSFRDGSTNYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAVYLCHVSLYRDPLGVAGGMGVYWGKGALVTVSSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGGSLKLSCAASGRTYAMGWFRQAPGKEREFVAHINALGTRTYYSDSVKGRFTISRDNAKNTEYLEMNNLKPEDTAVYYCTAQGQWRAAPVAVAAEYEFWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAATGFTLENKAIGWFRQTPGSEREGVLCISKSGSWTYYTDSMRGRFTISRDNAENTVYLQMDSLKPEDTAVYYCATTTAGGGLCWDGTTFSRLASSWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFSTSWMYWLRQAPGKGLEWVSVINTDGGTYYADSVKDRFTISRDNAKDTLYLQMSSLKSEDTAVYYCAKDWGGPEPTRGQGTQVTVSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
서열번호 9: UFV181157(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MKAILVVLLYTFATANADTLCIGYHANNSTDTVDTVLEKNVTVTHSVNLLEDKHNGKLCKLRGVAPLHLGKCNIAGWILGNPECESLSTASSWSYIVETPSSDNGTCYPGDFIDYEELREQLSSVSSFERFEIFPKTSSWPNHDSNKGVTAACPHAGAKSFYKNLIWLVKKGNSYPKLSKSYINDKGKEVLVLWGIHHPSTSADQQSLYQNADAYVFVGSSRYSKKFKPEIAIRPKVRDQEGRMNYYWTLVEPGDKITFEATGNLVVPRYAFAMERNAGSGIIISDTPVHDCNTTCQTPKGAINTSLPFQNIHPITIGKCPKYVKSTKLRLATGLRNIPSIQSRGLFGAIAGFIEGGWTGMVDGWYGYHHQNEQGSGYAADLKSTQNAIDEITNKVNSVIEKMNTQFTAVGKEFNHLEKRIENLNKKVDDGFLDIWTYNAELLVLLENERTLDYHDSNVKNLYEKVRSQLKNNAKEIGNGCFEFYHKCDNTCMESVKNGTYDYPKYSEEAKLNREEIDGSHHHHHH
서열번호 10: UFV181009(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MKAILVVLLYTFATANADTLCIGYHANNSTDTVDTVLEKNVTVTHSVNLLEDKHNGKLCKLRGVAPLHLGKCNIAGWILGNPECESLSTASSWSYIVETPSSDNGTCYPGDFIDYEELREQLSSVSSFERFEIFPKTSSWPNHDSNKGVTAACPHAGAKSFYKNLIWLVKKGNSYPKLSKSYINDKGKEVLVLWGIHHPSTSADQQSLYQNADAYVFVGSSRYSKKFKPEIAIRPKVRDQEGRMNYYWTLVEPGDKITFEATGNLVVPRYAFAMERNAGSGIIISDTPVHDCNTTCQTPKGAINTSLPFQNIHPITIGKCPKYVKSTKLRLATGLRNIPSIQSRGLFGAIAGFIEGGWTGMVDGWYGYHWQNEQGSGYAADLKSTQNAIDEITNIVNSVIEKMNTQFTAVGKEFNHLEKRIENLNKKVDDGFLDIWTYNAELLVLLINERTLDYHDSNVKNLYEKVRSQLKNNAKEIGNGCFEFYHKCDNTCIESVKNGTYDYPKYSEEAKLNREEIDSGSLPETGGGSHHHHHH
서열번호 11: UFV181134(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MKAILVVLLYTFTTANADTLCIGYHANNSTDTVDTVLEKNVTVTHSVNLLEDKHNGKLCKLRGVAPLHLGKCNIAGWILGNPECESLSTASSWSYIVETSNSDNGTCYPGDFINYEELREQLSSVSSFERFEIFPKTSSWPNHDSNKGVTAACPHAGAKSFYKNLIWLVKKGNSYPKLNQSYINDKGKEVLVLWGIHHPSTTADQQSLYQNADAYVFVGTSRYSKKFKPEIATRPKVRDQEGRMNYYWTLVEPGDKITFEATGNLVVPRYAFTMERNAGSGIIISDTPVHDCNTTCQTPEGAINTSLPFQNIHPITIGKCPKYVKSTKLRLATGLRNVPSIQSRGLFGAIAGFIEGGWTGMVDGWYGYHHQNEQGSGYAADLKSTQNAIDKITNKVNSVIEKMNTQFTAVGKEFNHLEKRIENLNKKVDDGFLDIWTYNAELLVLLENERTLDYHDSNVKNLYEKVRNQLKNNAKEIGNGCFEFYHKCDNTCMESVKNGTYDYPKYSEEAKLNREKIDGSHHHHHH
서열번호 12: UFV181091(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MKAILVVLLYTFTTANADTLCIGYHANNSTDTVDTVLEKNVTVTHSVNLLEDKHNGKLCKLRGVAPLHLGKCNIAGWILGNPECESLSTASSWSYIVETSNSDNGTCYPGDFINYEELREQLSSVSSFERFEIFPKTSSWPNHDSNKGVTAACPHAGAKSFYKNLIWLVKKGNSYPKLNQSYINDKGKEVLVLWGIHHPSTTADQQSLYQNADAYVFVGTSRYSKKFKPEIATRPKVRDQEGRMNYYWTLVEPGDKITFEATGNLVVPRYAFTMERNAGSGIIISDTPVHDCNTTCQTPEGAINTSLPFQNIHPITIGKCPKYVKSTKLRLATGLRNVPSIQSRGLFGAIAGFIEGGWTGMVDGWYGYHWQNEQGSGYAADLKSTQNAIDKITNIVNSVIEKMNTQFTAVGKEFNHLEKRIENLNKKVDDGFLDIWTYNAELLVLLINERTLDYHDSNVKNLYEKVRNQLKNNAKEIGNGCFEFYHKCDNTCIESVKNGTYDYPKYSEEAKLNREKIDSGSLPETGGGSHHHHHH
서열번호 13: UFV181153(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MAIIYLILLFAAVRGDQICIGYHSNNSTEKVDTILERNVTVTHAQDILEKTHNGKLCKLNGIPPLELGDCSIAGWLLGNPECDRLLTVPEWSYIMEKENPRNGLCYPGSFNDYEELKHLLSSVTHFEKVKILPRDRWTQHTTTGGSRACAVSGNPSFFRNMVWLTKKGSNYPIAKGSYNNTSGEQMLIIWGVHHPNDDAEQRTLYQNVGTYVSVGTSTLNKRSVPEIATRPKVNGQGGRMEFSWTILDMLDTINFESTGNLIAPEYGFRISKRGSSGIMKTEGTLENCETKCQTPLGAINTTLPFHNIHPLTIGECPKYVKSERLVLATGLRNVPQIESRGLFGAIAGFIEGGWQGMVDGWYGYHHSNDQGSGYAADKESTQRAIDGITNKVNSVIEKMNTQFEAVGKEFNNLEKRLENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLDFHDSNVKNLYDKVRMQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDDECMNSVKNGTYDYPKYEEESKLNRNEIKGSHHHHHH
서열번호 14: UFV181154(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MAIIYLILLFAAVRGDQICIGYHSNNSTEKVDTILERNVTVTHAQDILEKTHNGKLCKLNGIPPLELGDCSIAGWLLGNPECDRLLTVPEWSYIMEKENPRNGLCYPGSFNDYEELKHLLSSVTHFEKVKILPRDRWTQHTTTGGSRACAVSGNPSFFRNMVWLTKKGSNYPIAKGSYNNTSGEQMLIIWGVHHPNDDAEQRTLYQNVGTYVSVGTSTLNKRSVPEIATRPKVNGQGGRMEFSWTILDMLDTINFESTGNLIAPEYGFRISKRGSSGIMKTEGTLENCETKCQTPLGAINTTLPFHNIHPLTIGECPKYVKSERLVLATGLRNVPQIESRGLFGAIAGFIEGGWQGMVDGWYGYHWSNDQGSGYAADKESTQRAIDGITNIVNSVIEKMNTQFEAVGKEFNNLEKRLENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMINERTLDFHDSNVKNLYDKVRMQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDDECINSVKNGTYDYPKYEEESKLNRNEIKSGSLPETGGGSHHHHHH
서열번호 15: UFV181158(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MEKIVLLFAIVSLVQSDQICIGYHANNSTEQVDTIMEKNVTVTHAQDILEKTHNGKLCSLNGVKPLILRDCSVAGWLLGNPMCDEFLNVPEWSYIVEKDSPINGLCYPGDFNDYEELKHLLSSTNHFEKIQIIPRSSWSNHDASSGVSSACPYNGRSSFFRNVVWLIKKNNAYPTIKRSYNNTNQEDLLVLWGIHHPNDAAEQTKLYQNPTTYVSVGTSTLNQRSVPEIATRPKVNGQSGRMEFFWTILKPNDAINFESNGNFIAPEYAYKIVKKGDSAIMKSGLEYGNCNTKCQTPMGAINSSMPFHNIHPLTIGECPKYVKSDRLVLATGLRNVPQRETRGLFGAIAGFIEGGWQGMVDGWYGYLHSNEQGSGYAADKESTQKAIDGITNKINSIIDKMNTQFEAVGKEFNNLERRIENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLDFHDSNVKNLYDKVRLQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDDECMESVRNGTYDYPQYSEEARLNREEISGSHHHHHH
서열번호 16: UFV181159(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MEKIVLLFAIVSLVQSDQICIGYHANNSTEQVDTIMEKNVTVTHAQDILEKTHNGKLCSLNGVKPLILRDCSVAGWLLGNPMCDEFLNVPEWSYIVEKDSPINGLCYPGDFNDYEELKHLLSSTNHFEKIQIIPRSSWSNHDASSGVSSACPYNGRSSFFRNVVWLIKKNNAYPTIKRSYNNTNQEDLLVLWGIHHPNDAAEQTKLYQNPTTYVSVGTSTLNQRSVPEIATRPKVNGQSGRMEFFWTILKPNDAINFESNGNFIAPEYAYKIVKKGDSAIMKSGLEYGNCNTKCQTPMGAINSSMPFHNIHPLTIGECPKYVKSDRLVLATGLRNVPQRETRGLFGAIAGFIEGGWQGMVDGWYGYLWSNEQGSGYAADKESTQKAIDGITNIINSIIDKMNTQFEAVGKEFNNLERRIENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMINERTLDFHDSNVKNLYDKVRLQLRDNAKELGNGCFEFYHKCDDECIESVRNGTYDYPQYSEEARLNREEISSGSLPETGGGSHHHHHH
서열번호 17: UFV181155(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
METISLITILLVVTASNADKICIGHQSTNSTETVDTLTETNVPVTHAKELLHTEHNGMLCATSLGHPLILDTCTIEGLVYGNPSCDLLLGGREWSYIVERSSAVNGTCYPGNVENLEELRTLFSSASSYQRIQIFPDTTWNVTYTGTSRACSGSFYRSMRWLTQKSGFYPVQDAQYTNNRGKSILFVWGIHHPPTYTEQTNLYIRNDTTTSVTTEDLNRTFKPVIGPRPLVNGLQGRIDYYWSVLKPGQTLRVRSNGNLIAPWYGHVLSGGSHGRILKTDLKGGNCVVQCQTEKGGLNSTLPFHNISKYAFGTCPKYVRVNSLKLAVGLRNVPARSSRGLFGAIAGFIEGGWPGLVAGWYGFQHSNDQGVGMAADRDSTQKAIDKITSKVNNIVDKMNKQYEIIDHEFSEVETRLNMINNKIDDQIQDVWAYNAELLVLLENQKTLDEHDANVNNLYNKVKRALGSNAMEDGKGCFELYHKCDDQCMETIRNGTYNRRKYREESRLERQKIEGSHHHHHH
서열번호 18: UFV181156(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
METISLITILLVVTASNADKICIGHQSTNSTETVDTLTETNVPVTHAKELLHTEHNGMLCATSLGHPLILDTCTIEGLVYGNPSCDLLLGGREWSYIVERSSAVNGTCYPGNVENLEELRTLFSSASSYQRIQIFPDTTWNVTYTGTSRACSGSFYRSMRWLTQKSGFYPVQDAQYTNNRGKSILFVWGIHHPPTYTEQTNLYIRNDTTTSVTTEDLNRTFKPVIGPRPLVNGLQGRIDYYWSVLKPGQTLRVRSNGNLIAPWYGHVLSGGSHGRILKTDLKGGNCVVQCQTEKGGLNSTLPFHNISKYAFGTCPKYVRVNSLKLAVGLRNVPARSSRGLFGAIAGFIEGGWPGLVAGWYGFQWSNDQGVGMAADRDSTQKAIDKITSIVNNIVDKMNKQYEIIDHEFSEVETRLNMINNKIDDQIQDVWAYNAELLVLLINQKTLDEHDANVNNLYNKVKRALGSNAMEDGKGCFELYHKCDDQCIETIRNGTYNRRKYREESRLERQKIESGSLPETGGGSHHHHHH
서열번호 19: UFV181141(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MKTIIALSYIFCLALGQDLPGNDNSTATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIGSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTRGLFGAIAGFIENGWEGMIDGWYGFRHQNSEGTGQAADLKSTQAAIDQINGKLNRVIEKTNEKFHQIEKEFSEVEGRIQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHTIDLTDSEMNKLFEKTRRQLRENAEDMGNGCFKIYHKCDNACIESIRNGTYDHDVYRDEALNNRFQIKGVGSHHHHHH
서열번호 20: UFV180660(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MKTIIALSYIFCLALGQDLPGNDNSTATLCLGHHAVPNGTLVKTITDDQIEVTNATELVQSSSTGKICNNPHRILDGIDCTLIDALLGDPHCDVFQNETWDLFVERSKAFSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFITEGFTWTGVTQNGGSNACKRGPGSGFFSRLNWLTKSGSTYPVLNVTMPNNDNFDKLYIWGVHHPSTNQEQTSLYVQASGRVTVSTRRSQQTIIPNIWSRPWVRGLSSRISIYWTIVKPGDVLVINSNGNLIAPRGYFKMRTGKSSIMRSDAPIDTCISECITPNGSIPNDKPFQNVNKITYGACPKYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTRGLFGAIAGFIENGWEGMIDGWYGFRWQNSEGTGQAADLKSTQAAIDQINGILNRVIEKMNEKFHQIEKEFSEVEGRIQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALINQHTIDLTDSEMNKLFEKTRRQLRENAEDMGNGCFKIYHKCDNACIESIRNGNYDHDVYRDEALNNRFQIKGVSGSLPETGGGSHHHHHH
서열번호 21: UFV181137(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MKTIIALSYILCLVFAQKLPGNDNSTATLCLGHHAVSNGTLVKTITNDQIEVTNATELVQSSSTGRICDSPHQILDGENCTLIDALLGDPHCDGFQNKEWDLFVERSKAYSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFNNESFNWTGVAQNGTSSACKRRSNKSFFSRLNWLHQLKYKYPALNVTMPNNEKFDKLYIWGVHHPSTDSDQISIYAQASGRVTVSTKRSQQTVIPNIGSSPWVRGVSSRISIYWTIVKPGDILLINSTGNLIAPRGYFKIRSGKSSIMRSDAPIGKCNSECITPNGSIPNDKPFQNVNRITYGACPRYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTRGIFGAIAGFIENGWEGMVDGWYGFRHQNSEGTGQAADLKSTQAAINQINGKLNRLIEKTNEKFHQIEKEFSEVEGRIQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHTIDLTDSEMNKLFERTKKQLRENAEDMGNGCFKIYHKCDNACIGSIRNGTYDHDVYRDEALNNRFQIKGVGSHHHHHH
서열번호 22: UFV181096(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MKTIIALSYILCLVFAQKLPGNDNSTATLCLGHHAVSNGTLVKTITNDQIEVTNATELVQSSSTGRICDSPHQILDGENCTLIDALLGDPHCDGFQNKEWDLFVERSKAYSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFNNESFNWTGVAQNGTSSACKRRSNKSFFSRLNWLHQLKYKYPALNVTMPNNEKFDKLYIWGVHHPSTDSDQISIYAQASGRVTVSTKRSQQTVIPNIGSSPWVRGVSSRISIYWTIVKPGDILLINSTGNLIAPRGYFKIRSGKSSIMRSDAPIGKCNSECITPNGSIPNDKPFQNVNRITYGACPRYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTRGIFGAIAGFIENGWEGMVDGWYGFRWQNSEGTGQAADLKSTQAAINQINGILNRLIEKTNEKFHQIEKEFSEVEGRIQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALINQHTIDLTDSEMNKLFERTKKQLRENAEDMGNGCFKIYHKCDNACIGSIRNGTYDHDVYRDEALNNRFQIKGVSGSLPETGGGSHHHHHH
서열번호 23: UFV181145(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MIALILVALALSHTAYSQITNGTTGNPIICLGHHAVENGTSVKTLTDNHVEVVSAKELVETNHTDELCPSPLKLVDGQDCDLINGALGSPGCDRLQDTTWDVFIERPTAVDTCYPFDVPDYQSLRSILASSGSLEFIAEQFTWNGVKVDGSSSACLRGGRNSFFSRLNWLTKETNGNYGPINVTKENTGSYVRLYLWGVHHPSSDNEQTDLYKVATGRVTVSTRSDQISIVPNIGSRPRVRNQSGRISIYWTLVNPGDSIIFNSIGNLIAPRGHYKISKSTKSTVLKSDKRIGSCTSPCLTDKGSIQSDKPFQNVSRIAIGNCPKYVKQGSLMLATGMRNIPGKQAKGLFGAIAGFIENGWQGLIDGWYGFRHQNAEGTGTAADLKSTQAAIDQINGKLNRLIEKTNEKYHQIEKEFEQVEGRIQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHTIDVTDSEMNKLFERVRRQLRENAEDQGNGCFEIFHQCDNNCIESIRNGTYDHNIYRDEAINNRIKINPVGSHHHHHH
서열번호 24: UFV180661(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
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서열번호 25: UFV181146(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
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서열번호 26: UFV180664(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
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서열번호 27: UFV181147(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
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서열번호 28: UFV180662(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
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서열번호 29: UFV4239(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
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서열번호 30: UFV180843(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
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서열번호 31: UFV180436(신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
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서열번호 50: UFV190839 (신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨
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서열번호 51: UFV190068 (신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨) MNTQILVFALMAIIPTNADKICLGHHAVSNGTKVNTLTERGVEVVNATETVERTNVPRICSKGKRTVDLGQCGLLGTITGPPQCDQFLEFSADLIIERREGSDVCYPGKFVNEEALRQILRESGGIDKETMGFTYSGIRTNGATSACRRSGSSFYAEMKWLLSNTDNAAFPQMTKSYKNTRKDPALIIWGIHHSGSTTEQTKLYGSGNKLITVGSSNYQQSFVPSPGARPQVNGQSGRIDFHWLILNPNDTVTFSFNGAFIAPDRASFLRGKSMGIQSGVQVDANCEGDCYHSGGTIISNLPFQNINSRAVGKCPRYVKQESLLLATGMKNVPEIPKGRGLFGAIAGFIENGWEGLIDGWYGFRWQNAQGEGTAADYKSTQSAIDQITGILNRLIEKTNQQFELIDNEFTEVEKQIGNVINWTRDSMTEVWSYNAELLVAMINQHTIDLADSEMNKLYERVKRQLRENAEEDGTGCFEIFHKCDDDCMASIRNNTYDHSKYREEAMQNRIQIDPVSGSLPETGGGSHHHHHH
서열번호 52: UFV190841 (신호 펩티드 및 태그는 밑줄 표시됨)
MYKVVVIIALLGAVKGDRICLGHHAVANGTIVKTLTNEQEEVTNATETVESTNLNKLCMKGRSYKDLGNCHPVGMLIGTPVCDPHLTGTWDTLIERENAIAHCYPGATINEEALRQKIMESGGISKMSTGFTYGSSINSAGTTKACMRNGGDSFYAELKWLVSKTKGQNFPQTTNTYRNTDTAEHLIIWGIHHPSSTQEKNDLYGTQSLSISVESSTYQNNFVPVVGARPQVNGQSGRIDFHWTLVQPGDNITFSHNGGLIAPSRVSKLTGRGLGIQSEALIDNSCESKCFWRGGSINTKLPFQNLSPRTVGQCPKYVNQRSLLLATGMRNVPEVVQGRGLFGAIAGFIENGWEGMVDGWYGFRWQNAQGTGQAADYKSTQAAIDQITGILNRLIEKTNTEFESIESEFSETEHQIGNVINWTKDSITDIWTYQAELLVAMINQHTIDMADSEMLNLYERVRKQLRQNAEEDGKGCFEIYHTCDDSCMESIRNNTYDHSQYREEALLNRLNINSSGSLPETGGGSHHHHHH
SEQUENCE LISTING <110> Janssen Vaccines & Prevention B.V. <120> RECOMBINANT INFLUENZA ANTIGENS <130> CRU6016WOPCT1 <140> PCT/EP2020/061335 <141> 2020-04-23 <150> US 62/838,690 <151> 2019-04-25 <160> 52 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 550 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> CAA24269.1 haemagglutinin (Influenza A virus (A/Aichi/2/1968(H3N2) (excluding signal sequence) <400> 1 Gln Asp Leu Pro Gly Asn Asp Asn Ser Thr Ala Thr Leu Cys Leu Gly 1 5 10 15 His His Ala Val Pro Asn Gly Thr Leu Val Lys Thr Ile Thr Asp Asp 20 25 30 Gln Ile Glu Val Thr Asn Ala Thr Glu Leu Val Gln Ser Ser Ser Thr 35 40 45 Gly Lys Ile Cys Asn Asn Pro His Arg Ile Leu Asp Gly Ile Asp Cys 50 55 60 Thr Leu Ile Asp Ala Leu Leu Gly Asp Pro His Cys Asp Val Phe Gln 65 70 75 80 Asn Glu Thr Trp Asp Leu Phe Val Glu Arg Ser Lys Ala Phe Ser Asn 85 90 95 Cys Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala Ser Leu Arg Ser Leu Val 100 105 110 Ala Ser Ser Gly Thr Leu Glu Phe Ile Thr Glu Gly Phe Thr Trp Thr 115 120 125 Gly Val 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Claims (18)

  1. 재조합 인플루엔자 A 적혈구응집소(HA) 폴리펩티드로서, 인플루엔자 A 바이러스 HA의 HA1 및 HA2 도메인을 포함하고,
    (a) 위치 355의 아미노산은 W이고;
    (b) 위치 432의 아미노산은 I이고/이거나, 위치 380의 아미노산은 I인 아미노산 서열을 포함하고;
    HA 폴리펩티드의 아미노산 서열의 아미노산 위치의 넘버링은 기준 H3N2 인플루엔자 균주, 특히 기준 균주 H3N2 A/아이치/2/68(서열번호 1)로부터의 HA의 아미노산 서열의 아미노산의 넘버링에 따르는 것인 HA 폴리펩티드.
  2. 제1항에 있어서,
    (a) 위치 388의 아미노산은 M이고/이거나;
    (b) 위치 478의 아미노산은 I인 아미노산 서열을 포함하는 것인 HA 폴리펩티드.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, HA1 및 HA2 도메인 사이에 프로테아제 절단 부위를 포함하지 않는 것인 HA 폴리펩티드.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, HA1 및 HA2 도메인은 그룹 1 및/또는 그룹 2 인플루엔자 A 바이러스로부터 유래되는 것인 HA 폴리펩티드.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 절단된 HA1 및/또는 HA2 도메인을 포함하는 것인 HA 폴리펩티드.
  6. 제5항에 있어서, 막횡단 및 세포질내 도메인이 HA2 도메인으로부터 결실된 것인 HA 폴리펩티드.
  7. 제5항 또는 제6항에 있어서, 위치 515의 아미노산에 해당하는 아미노산으로 시작하는 HA2 도메인의 적어도 C 말단 부분은 결실된 것인 HA 폴리펩티드.
  8. 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, (절단된) HA2 도메인의 C 말단에 위치한 검출 및/또는 정제 태그를 포함하는 것인 HA 폴리펩티드.
  9. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항의 폴리펩티드의 면역원성 단편.
  10. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항의 적어도 두 개의 HA 폴리펩티드, 또는 제9항의 면역원성 단편을 포함하는 다량체 폴리펩티드.
  11. 제10항에 있어서, 폴리펩티드는 삼량체이고, 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항의 세 개의 HA 폴리펩티드를 포함하는 것인 다량체 폴리펩티드.
  12. 제1항 내지 제8항, 제10항, 또는 제11항 중 어느 한 항의 HA 폴리펩티드, 또는 제9항의 면역원성 단편을 암호화하는 핵산.
  13. 제11항의 핵산 분자를 포함하는 벡터.
  14. 제12항에 있어서, 재조합 아데노바이러스 벡터인 것인, 벡터.
  15. 제1항 내지 제8항, 제10항, 또는 제11항 중 어느 한 항의 재조합 HA 폴리펩티드, 또는 제9항의 면역원성 단편을 제조하는 방법으로서, 원핵생물 또는 진핵생물 세포에서 제12항의 핵산 분자를 발현시키는 단계를 포함하고, 상기 세포로부터 HA 폴리펩티드 또는 이의 단편을 단리하는 단계를 추가로 선택적으로 포함하는 방법.
  16. 제1항 내지 제8항, 제10항 또는 제11항 중 어느 한 항의 HA 폴리펩티드, 제9항의 면역원성 단편, 제12항의 핵산, 및/또는 제13항 또는 제14항의 벡터, 및 약제학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 면역원성 조성물.
  17. 인플루엔자 바이러스에 대한 면역 반응을 유도하는 데 사용하기 위한, 제1항 내지 제8항, 제10항 또는 제11항 중 어느 한 항의 HA 폴리펩티드, 제9항의 면역원성 단편, 제12항의 핵산, 및/또는 제13항 또는 제14항의 벡터.
  18. 백신으로서 사용하기 위한, 제1항 내지 제8항, 제10항 또는 제11항 중 어느 한 항의 HA 폴리펩티드, 제9항의 면역원성 단편, 제12항의 핵산, 및/또는 제13항 또는 제14항의 벡터.
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