KR20160020109A - 간흡충 단백질분해효소를 이용한 간흡충증 혈청학적 진단 방법 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 간흡충(Clonorchis sinensis) 단백질분해효소의 재조합 단백질 발현, 특이 항체 생산과 재조합 단백질의 특성 분석을 기초로 한 간흡충증 진단용 키트 및 진단 방법에 관한 것으로, 간흡충 단백질분해효소 중 5종류의 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소(cathepsin B cysteine proteases)와 2종류의 아스파틱 단백질분해효소(aspartic proteases)의 유전자를 발굴하여 재조합 단백질을 생산하였고, 이렇게 제조한 재조합 단백질이 간흡충증 환자 혈청에 대해 특이적인 항원성을 나타냄을 확인함으로써, 상기 간흡충 단백질분해효소를 포함하는 간흡충 단백질분해효소 재조합 단백질은 간흡충증 특이 혈청학적 진단에 유용하게 사용될 수 있다.
Description
본 발명은 간흡충(Clonorchis sinensis)의 5종류의 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소(cathepsin B cysteine proteases)(CsCB-1, CsCB-2, CsCB-3, CsCB-4, CsCB-5)와 2종류의 아스파틱 단백질분해효소(aspartic proteases)(CsAP-1, CsAP-2)를 암호화하는 유전자의 염기서열과 아미노산 서열을 포함하며 상기 단백질분해효소들의 재조합 단백질 발현, 특이 항체 생산과 재조합 단백질의 특성 분석을 기초로 한 간흡충증 진단용 키트 및 진단 방법에 관한 것이다.
간흡충증(clonorchiasis)은 간흡충(Clonorchis sinensis)의 감염에 의해 유발되는 기생충감염질환이다. 간흡충의 인체 감염은 간흡충의 피낭유충이 감염된 민물고기를 날로 먹거나 덜 익혀 먹었을 경우 발생하며 우리나라 전 국민의 약 2%(약 100만 명)가 간흡충에 감염되어 있는 것으로 추정된다. 특히 5대강 유역에 거주하는 주민들에서 감염률이 높은 것으로 알려져 있다. 간흡충은 전 세계적으로는 약 3,500만 명이 감염되어 있으며 중국, 타이완 그리고 베트남 북부에서 광범위하게 유행하고 있다. 간흡충증의 치료에는 프라지콴텔(praziquantel)이 매우 효과적이나 일반 세균성 또는 바이러스성 감염질환과는 달리 치료 후에도 지속적인 반복 감염이 가능하기 때문에 간흡충증의 관리 및 퇴치는 매우 어렵다. 간흡충이 경감염된 경우에는 특이적인 임상증상이 나타나지 않으나 중감염 또는 감염이 장기간 반복적으로 지속될 경우에는 다양한 합병증이 발생할 뿐 아니라 담관암을 유발하기도 한다. 간흡충 감염은 그 자체의 치료는 큰 문제가 되지 않으나, 감염상태가 오래 방치되었을 경우 그에 따른 합병증이 유발된다. 담관암, 담관내 결석, 화농성 담관염 등의 다양한 합병증은 간흡충 감염 자체에 비하여 대단히 심각한 질환이므로 이러한 중증 질환으로 발전하기 전에 조기에 감염 여부를 진단하고 치료의 시기를 앞당기는 것이 매우 중요하다.
간흡충 감염은 대변검사법으로 대변 내 충란을 현미경으로 직접 확인하여 진단한다. 대변검사법은 감염여부를 가장 정확하게 판별할 수 있을 뿐 아니라, 대변 내 충란 수를 측정하여 감염 강도를 추정할 수 있는 장점이 있지만, 대단위 기생충 감염을 조사하는 경우에는 대변수거의 어려움이 있고, 충체 부하가 낮은 간흡충 감염자의 경우에는 충란 검출율이 낮아져서 현미경대변검사를 반복해야 하기 때문에 확진까지 소요되는 시간이 길다. 보완적인 진단법으로 초음파검사와 역행성 내시경담도조영술 등의 영상진단법과 면역혈청학적 검사인 피부반응검사가 간흡충 감염의 진단에 활용될 수 있다. 간흡충 피내반응 검사는 대단위 간흡충증관리사업에 양성감염자 선별검사로 활용하기 용이하고 민감도가 높다는 장점이 있으나 특이도가 낮고, 현증과 과거 감염을 구분하지 못해 실효성이 떨어지며 알레르기 반응을 유발할 수 있다. 영상학적 진단방법인 초음파검사, 전산화 단층 촬영(CT), 자기공명영상(MRI), 내시경적 역행성 담관조영술은 간 내 담관이 불규칙적으로 확장된 소견을 확인하여 간흡충증을 의심해 볼 수 있고, 또 이차적인 합병증 즉 담낭, 담관, 간의 염증, 담관결석, 담관암 등을 알아볼 수 있지만, 이들 방법으로는 확진이 어렵고 고가의 진단장비와 전문가가 필요하여 비용적인 측면에서 일반적인 진단법으로 활용하기에 제한적인 면이 있다. 따라서 간흡충증 진단 후 적절한 치료가 요구되나 기존의 간흡충증 진단법은 대변 수거의 불편함, 검사의 복잡성, 숙달된 전문 인력과 장시간의 검사시간의 필요 등 다양한 문제점을 내포하고 있어 간편하고 신속한 혈청학적 진단법의 개발이 필요하다. 국내외에서 간흡충증을 특이적으로 진단하기 위한 다양한 혈청학적 진단법 개발 연구가 수행되어 왔으나 현재까지 유용한 진단법은 개발되지 않았으며 가장 중요한 원인은 간흡충 특이 항원의 부재이다. 따라서 간흡충 특이 항원 발굴 및 특성 분석 연구가 국내외에서 활발하게 진행되고 있다.
간흡충의 시스테인 단백질분해효소(cysteine proteases)인 카텝신(cathepsin) F(또는 cathepsin L)은 간흡충이 활발하게 충체 외부로 분비하는 주요 단백질 중 하나로서 강한 항원성을 나타내기 때문에 중요한 간흡충증 특이 진단 항원으로서 활발하게 연구되었다. 또한 간흡충의 아스파라기닐 엔도펩티다제(asparaginyl endopeptidase, legumain)와 글루타티온 S-전달효소(glutathione S-transferase, GST) 등의 다양한 간흡충 항원이 혈청학적 진단 항원으로 연구되었다. 그러나 기존에 연구된 간흡충 특이 항원으로는 만족할만한 민감도(sensitivity)와 특이도(specificity)를 가지는 간흡충증 혈청학적 진단법 개발이 어려우며 민감도와 특이도를 향상시킬 수 있는 새로운 진단 항원의 발굴 및 적용이 필요하다.
이에 본 발명자들은 간흡충증의 혈청학적 진단 항원으로 활용할 수 있는 간흡충 특이 항원을 발굴하고자 하였으며 간흡충의 시스테인 단백질분해효소(cystine proteases)의 발굴과 특성을 규명한 결과, 5종류의 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소(cathepsin B cysteine proteases)와 2종류의 아스파틱 단백질분해효소(aspartic proteases)의 유전자를 발굴하고 재조합 단백질을 생산하였으며 재조합 단백질이 간흡충증 환자 혈청에 대해 특이적인 항원성을 나타냄을 확인함으로써, 상기 간흡충 단백질분해효소들이 간흡충증 특이 혈청학적 진단용 항원으로서 사용될 수 있음을 밝힘으로써 본 발명을 완성하였다.
본 발명의 목적은 서열번호 1 내지 7로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 단백질로 구성된 군으로부터 선택된 간흡충증 특이적 항원 단백질, 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 및 상기 항체를 포함하는 간흡충증 진단용 키트를 제공하는 것이다.
본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1 내지 7로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 단백질로 구성된 군으로부터 선택된 간흡충증 특이적 항원 단백질을 제공한다.
또한, 본 발명은 간흡충증 특이적 항원 단백질을 암호화하는 서열번호 8 내지 14로 기재되는 염기서열을 갖는 간흡충증 특이적 항원 유전자를 제공한다.
또한, 본 발명은
1) 간흡충증 특이적 항원 단백질 중 어느 하나를 암호화하는 유전자를 포함하는 발현 벡터를 제조하는 단계;
2) 상기 단계 1)의 발현 벡터를 숙주세포에 형질전환하여 형질전환체를 제조하는 단계; 및
3) 상기 단계 2)의 형질전환체를 배양하여 재조합 단백질을 수득하는 단계를 포함하는 방법으로 제조된 간흡충증 특이적 항원 단백질 제조 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 간흡충증 특이적 항원 단백질 제조 방법으로 제조된 간흡충증 특이적 항원 재조합 단백질을 제공한다.
또한, 본 발명은 간흡충증 특이적 항원 단백질 또는 간흡충증 특이적 항원 재조합 단백질을 포함하는 간흡충증 진단용 키트를 제공한다.
또한, 본 발명은 서열번호 1 내지 7로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 단백질로 구성된 군으로부터 선택된 간흡충증 특이적 항원 단백질에 특이적으로 결합하는 항체를 제공한다.
또한, 본 발명은 간흡충증 특이적 항원 단백질 또는 간흡충증 특이적 항원 재조합 단백질에 특이적으로 결합하는 항체를 포함하는 간흡충증 진단용 키트를 제공한다.
또한, 본 발명은
1) 피검체로부터 분리된 시료를 간흡충증 특이적 항원 단백질 또는 간흡충증 특이적 항원 재조합 단백질과 접촉시키는 단계; 및
2) 상기 단계 1)의 시료 중 상기 단백질과 결합된 항체를 검출하는 단계를 포함하는 간흡충증 진단 방법을 제공한다.
본 발명은 간흡충(Clonorchis sinensis) 단백질분해효소의 재조합 단백질 발현, 특이 항체 생산과 재조합 단백질의 특성 분석을 기초로 한 간흡충증 진단용 키트 및 진단 방법에 관한 것으로, 간흡충 단백질분해효소 중 5종류의 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소(cathepsin B cysteine proteases)와 2종류의 아스파틱 단백질분해효소(aspartic proteases)의 유전자를 발굴하여 재조합 단백질을 생산하였고, 이렇게 제조한 재조합 단백질이 간흡충증 환자 혈청에 대해 특이적인 항원성을 나타냄을 확인함으로써, 상기 간흡충 단백질분해효소를 포함하는 간흡충 단백질분해효소 재조합 단백질은 간흡충증 특이 혈청학적 진단에 유용하게 사용될 수 있다.
도 1은 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소의 재조합 단백질 발현을 확인한 도이다.
도 2는 간흡충 아스파틱 단백질분해효소의 재조합 단백질 발현을 확인한 도이다:
(A)는 CsAP-1이고, (B)는 CsAP-2이다.
도 3은 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소의 항원성을 확인한 도이다.
도 4는 간흡충 아스파틱 단백질분해효소인 CsAP-2의 항원성을 확인한 도이다.
도 2는 간흡충 아스파틱 단백질분해효소의 재조합 단백질 발현을 확인한 도이다:
(A)는 CsAP-1이고, (B)는 CsAP-2이다.
도 3은 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소의 항원성을 확인한 도이다.
도 4는 간흡충 아스파틱 단백질분해효소인 CsAP-2의 항원성을 확인한 도이다.
이하, 본 발명을 상세히 설명한다.
본 발명은 서열번호 1 내지 7로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 단백질로 구성된 군으로부터 선택된 간흡충증 특이적 항원 단백질을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 간흡충증 특이적 항원 단백질을 암호화하는 서열번호 8 내지 14로 기재되는 염기서열을 갖는 간흡충증 특이적 항원 유전자를 제공한다.
상기 항원 단백질은 간흡충의 단백질분해효소인 것이 바람직하며, 상기 단백질분해효소는 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소(cathepsin B cysteine proteases) 또는 간흡충 아스파틱 단백질분해효소(aspartic proteases)인 것이 보다 바람직하다.
또한, 본 발명은
1) 상기 간흡충증 특이적 항원 단백질 중 어느 하나를 암호화하는 유전자를 포함하는 발현 벡터를 제조하는 단계;
2) 상기 단계 1)의 발현 벡터를 숙주세포에 형질전환하여 형질전환체를 제조하는 단계; 및
3) 상기 단계 2)의 형질전환체를 배양하여 재조합 단백질을 수득하는 단계를 포함하는 방법으로 제조된 간흡충증 특이적 항원 단백질 제조 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 간흡충증 특이적 항원 단백질 제조 방법으로 제조된 간흡충증 특이적 항원 재조합 단백질을 제공한다.
상기 단계 1)의 발현벡터의 제작 시에는, 상기 재조합 단백질을 생산하고자 하는 숙주세포의 종류에 따라 프로모터(promoter), 종결자(terminator), 인핸서(inhancer) 등과 같은 발현조절 서열, 막 표적화 또는 분비를 위한 서열 등을 적절히 선택하고 목적에 따라 다양하게 조합할 수 있다.
본 발명의 발현벡터는 플라스미드 벡터, 코즈미드 벡터, 박테리오 파아지 벡터 및 바이러스 벡터 등을 포함하나 이에 제한되지 않는다. 적합한 발현벡터는 프로모터, 오퍼레이터, 개시코돈, 종결코돈, 폴리아데닐화 시그널 및 인핸서 같은 발현 조절 엘리먼트 외에도 막 표적화 또는 분비를 위한 시그널 서열 또는 리더 서열을 포함하며 목적에 따라 다양하게 제조될 수 있다. 발현벡터의 프로모터는 구성적 또는 유도성일 수 있다. 상기 시그널 서열에는 숙주가 에쉐리키아속(Escherichia sp.)균인 경우에는 PhoA 시그널 서열, OmpA 시그널 서열 등이, 숙주가 바실러스속(Bacillus sp .)균인 경우에는 α-아밀라아제 시그널 서열, 서브틸리신 시그널 서열 등이, 숙주가 효모(yeast)인 경우에는 MF 시그널 서열, SUC2 시그널 서열 등이, 숙주가 동물세포인 경우에는 인슐린 시그널 서열, α-인터페론 시그널 서열, 항체 분자 시그널 서열 등을 이용할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. 또한 발현벡터는 벡터를 함유하는 숙주 세포를 선택하기 위한 선택 마커를 포함할 수 있고, 복제 가능한 발현벡터인 경우 복제 기원을 포함한다.
상기 단계 2)의 형질전환은 핵산을 유기체, 세포, 조직 또는 기관에 도입하는 어떤 방법도 포함되며, 당 분야에서 공지된 바와 같이 숙주세포에 따라 적합한 표준 기술을 선택하여 수행할 수 있다. 이런 방법에는 전기충격유전자전달법(electroporation), 원형질 융합, 인산 칼슘(CaPO4) 침전, 염화 칼슘(CaCl2) 침전, 실리콘 카바이드 섬유 이용한 교반, 아그로박테리아 매개된 형질전환, PEG, 덱스트란 설페이트, 리포펙타민 등이 포함되나 이에 제한되지 않는다.
상기 형질전환체는 상기 발현 벡터를 임의의 숙주세포에 도입시킴으로써 용이하게 제조될 수 있다. 본 발명의 바람직한 실시예에서는 발현 벡터 pQE-30을 대장균 균주 M15[pREP4]에 도입하여 형질전환체를 제조하였다.
본 발명의 구체적인 실시예에서, 본 발명자들은 간흡충증의 혈청학적 진단 항원으로 활용할 수 있는 간흡충 특이 항원을 발굴하고자 간흡충 성충에서 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소 5종류(CsCB-1, CsCB-2, CsCB-3, CsCB-4 및 CsCB-5)와 간흡충 아스파틱 단백질분해효소 2종류(CsAP-1 및 CsAP-2)의 유전자를 분리하고 이의 염기서열과 아미노산 서열을 확인한 결과, 상기 간흡충 단백질분해효소 모두 N-말단에 신호 펩타이드(signal peptide) 부위를 가지고 있었으며, 활성부위(active site)를 구성하는 아미노산들이 잘 보존되어있는 것을 확인하였고, 상기 7종류의 간흡충 단백질분해효소의 재조합 단백질 생산을 위해 각 유전자에서 신호 펩타이드가 제거된 발현 컨스트럭트(expression construct)를 제작한 결과, 간흡충 단백질분해효소의 재조합 단백질 모두 비수용성 단백질로 발현되며, 잘 발현하는 것을 확인하였다(도 1 내지 도 2 참조).
또한, 본 발명자들은 정제된 재조합 간흡충 단백질분해효소에 대한 특이 항체를 제작하여 발현 위치 및 발현 정도를 분석하였고, 항원성을 분석한 결과, 재조합 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소는 정상인 혈청과 달리 간흡충 감염 환자의 혈청에 대해 민감도 70~80%의 항원성을 나타내는 것을 확인하였고(도 3 참조), 재조합 간흡충 아스파틱 단백질분해효소는 간흡충을 인공 감염시킨 래트(rat)의 혈청에 대해 특이적인 항원성을 나타내며, 특히 감염 후 4주 후부터 항원성이 확연히 증가하는 것을 확인하였다(도 4 참조).
따라서, 본 발명의 간흡충 단백질분해효소는 5종류의 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소와 2종류의 아스파틱 단백질분해효소로, 상기 7종류의 간흡충 단백질분해효소로 재조합 단백질을 생산하였고, 이렇게 제조한 재조합 단백질이 간흡충증 환자 혈청에 대해 특이적인 항원성을 나타냄을 확인함으로써, 상기 간흡충 단백질분해효소는 간흡충증 특이 혈청학적 진단을 위한 항원으로 유용하게 사용할 수 있다.
또한, 본 발명은 서열번호 1 내지 7로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 단백질로 구성된 군으로부터 선택된 간흡충증 특이적 항원 단백질에 특이적으로 결합하는 항체를 제공한다.
상기 항체는 단일클론 또는 다클론 항체인 것이 바람직하나 이에 한정되지 않는다.
상기 단일클론 항체는 당업자에게 알려진 공지의 방법으로 제작하여도 무방하며, 당업자에게 알려진 종래 방법에 따라 본 발명의 재조합 단백질을 외부 숙주에 주사함으로써 제조될 수 있다. 외부 숙주는 마우스, 래트, 양, 토끼와 같은 포유동물을 포함한다. 면역원은 근내, 복강내 또는 피하 주사방법으로 주사되며, 일반적으로 항원성을 증가시키기 위한 보조제(adjuvant)와 함께 투여할 수 있다. 외부 숙주로부터 정기적으로 혈액을 채취하여 형상된 역가 및 항원에 대한 특이성을 보이는 혈청을 수거하여 항체를 분리할 수 있다.
상기 단일클론 항체는 본 발명의 항원 단백질을 특이적으로 인식하는 결합의 특성을 갖는 한, 2개의 중쇄와 2개의 경쇄의 전체 길이를 가지는 완전한 형태뿐만 아니라, 항체 분자의 기능적인 단편을 포함한다. 항체의 분자의 기능적인 단편이란, 적어도 항원 결합 기능을 보유하고 있는 단편을 뜻하며, Fab, F(ab'), F(ab'2) 및 Fv 등이 포함될 수 있으나, 이에 한정되지 않는다.
상기 항체는 간흡충 단백질분해효소를 인간을 제외한 포유류에 투여하는 단계를 포함하는 방법으로 제조되는 것이 바람직하나 이에 한정되지 않는다.
본 발명의 간흡충 단백질분해효소는 5종류의 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소와 2종류의 아스파틱 단백질분해효소로, 상기 7종류의 간흡충 단백질분해효소로 재조합 단백질을 생산하였고, 이렇게 제조한 재조합 단백질이 간흡충증 환자 혈청에 대해 특이적인 항원성을 나타냄을 확인함으로써, 상기 간흡충 단백질분해효소에 대해 특이적으로 결합하는 항체 및 이의 제조에 유용하게 사용할 수 있다.
또한, 본 발명은 간흡충증 특이적 항원 단백질 또는 간흡충증 특이적 항원 재조합 단백질을 포함하는 간흡충증 진단용 키트를 제공한다.
또한, 본 발명은 간흡충증 특이적 항원 단백질 또는 간흡충증 특이적 항원 재조합 단백질에 특이적으로 결합하는 항체를 포함하는 간흡충증 진단용 키트를 제공한다.
상기 간흡충증 특이적 항원 단백질은 서열번호 1 내지 서열번호 7로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 단백질로 구성된 군으로부터 선택된 것이 바람직하고, 상기 항원 단백질은 간흡충의 단백질분해효소인 것이 바람직하며, 상기 단백질 분해효소는 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소 또는 간흡충 아스파틱 단백질분해효소인 것이 보다 바람직하다.
본 발명의 간흡충 단백질분해효소는 5종류의 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소와 2종류의 아스파틱 단백질분해효소로, 상기 7종류의 간흡충 단백질분해효소로 재조합 단백질을 생산하였고, 이렇게 제조한 재조합 단백질이 간흡충증 환자 혈청에 대해 특이적인 항원성을 나타냄을 확인함으로써, 간흡충증 진단용 키트로 유용하게 사용할 수 있다.
또한, 본 발명은 1) 피검체로부터 분리된 시료를 간흡충증 특이적 항원 단백질 또는 간흡충증 특이적 항원 재조합 단백질과 접촉시키는 단계; 및
2) 상기 단계 1)의 시료 중 상기 단백질과 결합된 항체를 검출하는 단계를 포함하는 간흡충증 진단 방법을 제공한다.
상기 단계 1)의 시료는 혈청인 것이 바람직하나 이에 한정되지 않는다.
상기 단계 1)의 간흡충증 특이적 항원 단백질은 서열번호 1 내지 서열번호 7로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 단백질로 구성된 군으로부터 선택된 것이 바람직하다.
상기 항원 단백질은 간흡충의 단백질분해효소인 것이 바람직하며, 상기 단백질분해효소는 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소 또는 간흡충 아스파틱 단백질분해효소인 것이 보다 바람직하다.
상기 단계 2)의 검출은 면역블럿(immunoblot) 또는 ELISA를 이용하는 것이 바람직하나 이에 한정되지 않는다.
본 발명의 간흡충 단백질분해효소는 5종류의 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소와 2종류의 아스파틱 단백질분해효소로, 상기 7종류의 간흡충 단백질분해효소로 재조합 단백질을 생산하였고, 이렇게 제조한 재조합 단백질이 간흡충증 환자 혈청에 대해 특이적인 항원성을 나타냄을 확인함으로써, 상기 간흡충 단백질분해효소에 대해 특이적으로 결합하는 항체를 간흡충증 진단에 유용하게 사용할 수 있다.
이하, 본 발명을 실시예에 의하여 상세히 설명한다.
단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 의하여 한정되는 것은 아니다.
<
실시예
1>
간흡충
카텝신
B 시스테인 단백질분해효소(
cathepsin
B
cysteine
proteases) 유전자의
클로닝
(
cloning
) 및 서열분석
간흡충증의 혈청학적 진단 항원으로 활용할 수 있는 간흡충 특이 항원을 발굴하고자 간흡충 성충에서 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소(CsCB) 유전자를 분리하고 염기서열을 확인하였다.
구체적으로, 질병관리본부 PathOD(http://pathod.cdc.go.kr/index.jsp)의 간흡충 유전체 정보를 일부 활용하고, Rapid Amplification of cDNA Ends(RACE)법을 실시하여 5종류의 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소(CsCB-1, CsCB-2, CsCB-3, CsCB-4 및 CsCB-5) 유전자를 확보하였다. 5종류의 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소 유전자들의 염기서열을 확보한 후 간흡충 성충에서 분리한 cDNA를 주형으로, 각 유전자에 대해 특이적으로 제작한 하기 [표 1]의 올리고뉴클레오티드 프라이머(oligonucleotide primers)를 사용하여 하기 [표 2]의 조건으로 중합효소연쇄반응(polymerase chain reaction: PCR)을 수행하였다. 상기 증폭된 각각의 유전자 단편은 아가로즈 겔에서 전기영동하여 PCR 산물을 확인한 후, T&A 클로닝 벡터(T&A cloning vector, RBC) 내로 클로닝하였다. 클로닝된 각각의 유전자 단편을 Escherichia coli(E. coli) DH5α(Real Biotech Corporation)로 제조사의 절차에 따라 형질전환하고, 클로닝된 유전자의 염기서열은 자동 염기서열분석법으로 분석하였으며, 분석된 염기서열은 DNASTAR(Lagergene) 분석 프로그램을 이용하여 염기서열을 확인하였다.
목적 유전자 |
primer | |||
명칭 | 서열 | 방향 | 서열번호 | |
CsCB-1 |
CsCB1_F | ATGGATTCGATTTGGACCCTGATAATG | 정방향 | 서열번호 : 15 |
CsCB1_R | TCACAGTTTTGGATGACCAGCATTGGC | 역방향 | 서열번호 : 16 | |
CsCB-2 |
CsCB2_F | ATGTTACCGTCGTTCGTACTATACGGT | 정방향 | 서열번호 : 17 |
CsCB2_R | TCAAAAATGCGGAATGGTGGAAAGATC | 역방향 | 서열번호 : 18 | |
CsCB-3 |
CsCB3_F | ATGCTGTGGTTGATACTAGTTTTCGGT | 정방향 | 서열번호 : 19 |
CsCB3_R | TCACTTAAGTGGGATGCTGGACAATTC | 역방향 | 서열번호 : 20 | |
CsCB-4 |
CsCB4_F | ATGAGGGCAACGACATTCTTATGTGCT | 정방향 | 서열번호 : 21 |
CsCB4_R | TCACGAAAAGGATTCATGATTAACTGG | 역방향 | 서열번호 : 22 | |
CsCB-5 |
CsCB5_F | ATGATACCGCTGTTTACAGCATACAAT | 정방향 | 서열번호 : 23 |
CsCB5_R | TCAATACTGTGGAATGATGGGAAGATA | 역방향 | 서열번호 : 24 |
PCR 조건 | |||
변성(denaturation) | 95℃ | 5분 | 1회 |
변성(denaturation) | 95℃ | 1분 | 25회 |
결합(annealing) | 50℃ | 1분 | |
신장(extension) | 72℃ | 1분30초 | |
최종 신장(final extension) | 72℃ | 10분 | 1회 |
그 결과, 5종류의 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소(CsCB-1, CsCB-2, CsCB-3, CsCB-4 및 CsCB-5) 유전자를 발굴하였으며 각각의 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소의 염기서열과 아미노산서열은 하기 [표 3]에 나타낸 바와 같이 서열목록을 입력하였다. 5종류의 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소 모두 N-말단에 신호 펩타이드(signal peptide) 부위를 가지고 있었으며, 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소의 활성부위(active site)를 구성하는 아미노산들이 잘 보존되어있는 것을 확인하였다.
유전자 | 종류 | 서열번호 |
CsCB-1 | 아미노산서열 | 서열번호 : 1 |
염기서열 | 서열번호 : 8 | |
CsCB-2 | 아미노산서열 | 서열번호 : 2 |
염기서열 | 서열번호 : 9 | |
CsCB-3 | 아미노산서열 | 서열번호 : 3 |
염기서열 | 서열번호 : 10 | |
CsCB-4 | 아미노산서열 | 서열번호 : 4 |
염기서열 | 서열번호 : 11 | |
CsCB-5 | 아미노산서열 | 서열번호 : 5 |
염기서열 | 서열번호 : 12 |
<
실시예
2>
간흡충
아스파틱
단백질분해효소(
aspartic
proteases
) 유전자의
클로닝
및 서열분석
간흡충증의 혈청학적 진단 항원으로 활용할 수 있는 간흡충 특이 항원을 발굴하고자 간흡충 성충에서 간흡충 아스파틱 단백질분해효소(CsAP) 유전자를 분리하고 염기서열을 확인하였다.
구체적으로, 상기 <실시예 1>과 동일한 방법으로 하기 [표 4]의 올리고뉴클레오티드 프라이머를 이용하여 실험하였다.
목적 유전자 |
primer | |||
명칭 | 서열 | 방향 | 서열번호 | |
CsAP-1 |
CsAP1_F | ATGATTCATCTGGGCTTGTTGTTTTGG | 정방향 | 서열번호 : 25 |
CsAP1_R | TCACCATCCGAATCCGAACAATCTGGA | 역방향 | 서열번호 : 26 | |
CsAP-2 |
CsAP2_F | ATGCGATTTTACGCCATCTTGCTGCTT | 정방향 | 서열번호 : 27 |
CsAP2_R | CTAAGTGGACCTTGCAAAGCCAACACG | 역방향 | 서열번호 : 28 |
그 결과 2종류의 간흡충 아스파틱 단백질분해효소(CsAP-1 및 CsAP-2) 유전자를 발굴하였으며 각각의 간흡충 아스파틱 단백질분해효소의 염기서열과 아미노산서열은 하기 [표 5]에 나타낸 바와 같이 서열목록을 입력하였다. 2종류의 간흡충 아스파틱 단백질분해효소 모두 N-말단에 신호 펩타이드 부위를 가지고 있었으며, 간흡충 아스파틱 단백질분해효소의 활성부위를 구성하는 아미노산들이 잘 보존되어있는 것을 확인하였다.
유전자 | 종류 | 서열번호 |
CsAP-1 | 아미노산서열 | 서열번호 : 6 |
염기서열 | 서열번호 : 13 | |
CsAP-2 | 아미노산서열 | 서열번호 : 7 |
염기서열 | 서열번호 : 14 |
<
실시예
3>
간흡충
단백질분해효소 재조합 단백질의 생산 및 정제
간흡충 단백질분해효소(5종류의 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소와 2종류의 간흡충 아스파틱 단백질분해효소)의 재조합 단백질 생산을 위해 각 유전자에서 신호 펩타이드가 제거된 발현 컨스트럭트(expression construct)를 제작하였다.
구체적으로, 발현 컨스트럭트를 제작하기 위한 각 유전자의 증폭은 제한효소(restriction enzyme) 절단부위를 첨가한 하기 [표 6]의 올리고뉴클레오티드 프라이머를 사용하여 상기 <실시예 1>과 동일한 방법으로 PCR 및 형질전환하였고, 각각의 유전자를 함유하는 플라스미드(plasmid)는 정제한 후 해당 제한효소로 절단한 후 동일한 제한효소를 처리한 pQE-30 발현벡터(Qiagen)에 클로닝하고 E. coli M15[pREP4](Qiagen)에 형질전환하였다. 상기 E. coli는 100 ug/ml 암피실린과 50 ug/ml 카나마이신이 첨가된 LB 고체배지에 도말하여 37℃ 항온기에서 하룻밤 배양하고, 형질전환된 E. coli를 선별하였다. 재조합 단백질의 발현은 E. coli를 1 mM IPTG(isopropyl-1-thio-β-D-galactoside)(Duchefa)가 첨가된 LB 액체배지에 접종하여 37℃에서 3시간 배양하며 유도하였다. 배양한 E. coli 세포는 10,000 rpm에서 20분간 원심분리하여 수집한 다음 네이티브(native) 용해 완충용액(lysis buffer)(50 mM NaH2PO4, 300 mM NaCl, 10 mM 이미다졸(imidazole), pH 8.0)에 부유하여 극초음파 분쇄기(ultra sonicator)로 파쇄하고 12,000 rpm에서 20분간 4℃에서 원심분리 하였다. 원심분리 후 얻어진 상층액은 수집하고 침전물(pellet)은 변형(denatured) 용해 완충용액(8 M Urea, 100 mM NaH2PO4, 10 mM Tris-HCl, pH 8.0)에 부유한 후 실온에서 하룻밤 방치한 후 12,000 rpm에서 20분간 4℃에서 원심분리 하고 상층액을 수집하였다. Native 및 denatured 시료에서 재조합 단백질의 발현은 SDS-PAGE와 anti-6×His antibody(Qiagen)를 이용한 면역블럿(immunoblot)을 실시하여 확인하였고, 발현이 확인된 재조합 단백질은 Ni-NTA 친화성 컬럼(affinity column)(Qiagen)을 이용하여 제조사의 방법에 따라 정제하였다. 정제 후, SDS-PAGE로 확인하였다.
목적 유전자 |
primer | |||
명칭 | 서열 | 방향 | 서열번호 | |
CsCB-1 | rCsCB1_F | GGATCC CTTTCGGATGAAATTGTCCAT | 정방향 | 서열번호 : 29 |
rCsCB1_R | AAGCTT TCACAGTTTTGGATGACCAGC | 역방향 | 서열번호 : 30 | |
CsCB-2 | rCsCB2_F | GGATCC GAACATGTACATCCGACTGCA | 정방향 | 서열번호 : 31 |
rCsCB2_R | GAGCTC TCAAAAATGCGGAATGGTGGA | 역방향 | 서열번호 : 32 | |
CsCB-3 | rCsCB3_F | GGATCC TATGTTGATTCAAAGTCGGGC | 정방향 | 서열번호 : 33 |
rCsCB3_R | AAGCTT TCACTTAAGTGGGATGCTGGA | 역방향 | 서열번호 : 34 | |
CsCB-4 | rCsCB4_F | GTCGAC AAACCAAAGCACGAAGCCTTG | 정방향 | 서열번호 : 35 |
rCsCB4_R | AAGCTT TCACGAAAAGGATTCATGATT | 역방향 | 서열번호 : 36 | |
CsCB-5 | rCsCB5_F | GGATCC GAACAAACAGCAAATGTAGGA | 정방향 | 서열번호 : 37 |
rCsCB5_R | AAGCTT TCAATACTGTGGAATGATGGG | 역방향 | 서열번호 : 38 | |
CsAP-1 | rCsAP1_F | GAGCTC AGTGTTATTCGGATTCCTCTA | 정방향 | 서열번호 : 39 |
rCsAP1_R | GTCGAC TCACCATCCGAATCCGAACAA | 역방향 | 서열번호 : 40 | |
CsAP-2 | rCsAP2_F | GGATCC GTTTTGAGAGTTCCGCTCAAA | 정방향 | 서열번호 : 41 |
rCsAP2_R | GTCGAC CTAAGTGGACCTTGCAAAGCC | 역방향 | 서열번호 : 42 |
그 결과 도 1 내지 도 2에 나타낸 바와 같이, 5종류의 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소의 재조합 단백질 모두 비수용성 단백질로 발현되었으며 재조합 단백질이 잘 발현하는 것을 확인하였고(도 1), 2종류의 간흡충 아스파틱 단백질분해효소의 재조합 단백질 역시 비수용성 단백질로 발현되었으며 재조합 단백질이 잘 발현하는 것을 확인하였다(도 2).
<
실시예
4>
간흡충
단백질분해효소 특이 항체 생산
정제된 재조합 간흡충 단백질분해효소에 대한 특이 항체를 제작하였다.
구체적으로, 정제한 재조합 단백질 50 ug을 balb/c 마우스 또는 래트(rat)에 2주 간격으로 3회 복강 면역시켰으며 보조제(adjuvant)로는 완전프로인트항원보조제(Freund's Complete adjuvant)와 불완전프로인트항원보조제(Freund's Incomplete adjuvant)(Sigma)를 사용하였다. 최종 면역 후 마우스 또는 래트를 희생하고 혈액을 채혈한 다음 혈청을 분리하여 Protein G affinity column(Amersham Biosciences)을 이용하여 제조사의 방법에 따라 항체를 추가 정제하였다. 제작한 항체는 면역블럿을 실시하여 특이성을 확인하였다.
<
실시예
5> 항원성 분석
<5-1> 재조합
간흡충
카텝신
B 시스테인 단백질분해효소의 항원성 분석
정제한 재조합 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소의 항원성을 분석하기 위하여, 면역블럿을 수행하였다.
구체적으로, 각각의 재조합 단백질을 SDS-PAGE로 분리하고 니트로셀룰로오스 막(nitrocellulose membrane)(Bio-Rad)으로 이동시킨 후 막을 여러 개의 스트립(strip)으로 자른 다음 3% 스킴밀크(skim milk)를 포함하는 PBST(0.05% Tween 20/PBS, pH 7.4)로 블로킹(blocking)하였다. 각각의 스트립은 3% 스킴 밀크가 첨가된 PBST에 1:100으로 희석한 간흡충증 환자(n=25) 혈청 또는 정상인(n=5) 혈청에 첨가하여 실온에서 3시간 반응하였다. 반응 후 각각의 스트립은 PBST로 3회 세척하고 3% 스킴 밀크가 첨가된 PBST에 1:1,000으로 희석한 호스라디시-퍼옥시데이즈(horseradish-peroxidase, HRP)-접합된 항-인간 IgG(Sigma)에 첨가하여 실온에서 3시간 추가 반응하였다. 반응 후 각각의 스트립은 PBST로 3회 세척하고 기질 용액(0.05% 4-클로로-1-나프톨(4-chloro-1-naphtol), 0.05% 과산화수소(hydrogen peroxide)/100 mM PBS, pH 7.0)에 첨가하여 암실에서 10분간 발색시킨 후 증류수로 수차례 세척하여 반응을 종결시켰다.
그 결과 도 3에 나타낸 바와 같이, 재조합 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소는 정상인 혈청과 달리 간흡충 감염 환자의 혈청에 대해 항원성(민감도: 70~80%)을 나타내는 것을 확인하였다(도 3).
<5-2> 재조합
간흡충
아스파틱
단백질분해효소의 항원성 분석
정제한 재조합 간흡충 아스파틱 단백질분해효소의 항원성을 분석하기 위하여, 면역블럿을 수행하였다.
구체적으로, 간흡충을 인공 감염시킨 래트에서 간흡충 단백질분해효소 특이 항체의 생성을 주기적으로 분석하기 위해, 간흡충의 피낭유충 100개를 래트에 인공 감염시키고 감염 전, 그리고 감염 후 2, 4, 6, 9 및 12주에 혈액을 채혈하였다. 채혈한 혈액은 원심분리하여 혈청을 수집하였다. 상기 실시예 <5-1>과 동일한 방법으로 간흡충증 환자 혈청 대신 래트 혈청을 첨가하고, 호스라디시-퍼옥시데이즈-접합된 항-래트 IgG(Sigma)를 사용하여 실험하였다.
그 결과 도 4에 나타낸 바와 같이, 재조합 간흡충 아스파틱 단백질분해효소인 CsAP-2는 간흡충을 인공 감염시킨 래트의 혈청에 대해 특이적인 항원성을 나타내며, 감염 후 4주 후부터 항원성이 확연히 증가하는 것을 확인하였다(도 4).
따라서, 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소와 간흡충 아스파틱 단백질분해효소는 간흡충증 특이 혈청학적 진단을 위한 항원으로 활용이 가능한 것을 확인하였다.
<110> University-Industry Cooperation Croup of Gyeongsang National University
<120> Serodiagnostic method of clonorchiasis using Clonorchis sinensis
proteases as serodiagnostic antigens
<130> 2014P-05-026
<160> 42
<170> KopatentIn 2.0
<210> 1
<211> 339
<212> PRT
<213> Clonorchis sinensis
<400> 1
Met Asp Ser Ile Trp Thr Leu Ile Met Tyr Ala Leu Leu Cys Ala Glu
1 5 10 15
Ser Phe Arg Ala Glu Tyr Ile Pro Ser Phe Glu Ser Leu Ser Asp Glu
20 25 30
Ile Val His Tyr Ile Asn His Lys Ala Asn Thr Thr Trp Lys Ala Ala
35 40 45
Lys Tyr Gln Arg Phe Lys Thr Ile Ser Asp Val Arg Arg Val Leu Gly
50 55 60
Ala Val Pro Asp Pro Asn Gly Phe Gly Leu Glu Lys Arg Cys Leu Leu
65 70 75 80
Ser Thr Ile Arg Glu Gln Glu Leu Pro Glu Ser Phe Asp Ala Arg Glu
85 90 95
Lys Trp Pro Tyr Cys Ser Ser Ile Ala Glu Ile Arg Asp Gln Ser Asn
100 105 110
Cys Gly Ser Cys Trp Ala Phe Gly Ala Ala Gly Ala Ile Ser Asp Arg
115 120 125
Ile Cys Ile Ala Ser Gly Gly Lys His Gln Pro Arg Ile Ser Pro Glu
130 135 140
Asp Leu Val Asp Cys Cys Ala Asp Cys Gly Met Gly Cys Gln Gly Gly
145 150 155 160
Tyr Pro Ala Gln Ala Trp Glu Tyr Trp Val Arg Asn Gly Leu Val Thr
165 170 175
Gly Asp Leu Tyr Asn Thr Thr Asp Thr Cys Arg Pro Tyr Ser Phe Pro
180 185 190
Pro Cys Glu His His Val Val Gly Pro Arg Lys Pro Cys Thr Gly Asp
195 200 205
Pro Thr Thr Pro Gln Cys Val Lys Lys Cys Gln Pro Glu Tyr Pro Lys
210 215 220
Thr Tyr Glu Asn Asp Lys Trp Tyr Gly Leu Lys Ala Tyr Ser Ile His
225 230 235 240
Ser Asp Gln Glu Ala Ile Met Arg Asp Leu Met Thr Tyr Gly Pro Leu
245 250 255
Glu Val Asp Phe Glu Val Tyr Ala Asp Phe Pro Ser Tyr Ser Ser Gly
260 265 270
Val Tyr Arg His Val Ala Gly Gly Leu Leu Gly Gly His Ala Val Arg
275 280 285
Leu Val Gly Trp Gly Val Glu Asp Gly Ala Asp Tyr Trp Leu Ile Ala
290 295 300
Asn Ser Trp Asn Thr Asp Trp Gly Asp Gly Gly Tyr Phe Lys Ile Arg
305 310 315 320
Arg Gly Val Asn Glu Cys Gly Ile Glu Ser Asp Ala Asn Ala Gly His
325 330 335
Pro Lys Leu
<210> 2
<211> 343
<212> PRT
<213> Clonorchis sinensis
<400> 2
Met Leu Pro Ser Phe Val Leu Tyr Gly Leu Leu Phe Phe Ile Tyr Ser
1 5 10 15
Phe Glu Val Thr His Cys Glu Asn Leu Gly Ser Val Gly Val Arg Glu
20 25 30
His Val His Pro Thr Ala Gly Ala Arg Trp Ile Ser Val Arg Tyr Pro
35 40 45
Lys Pro Phe Glu Ser Asp Asn Lys Leu His His Phe Gly Ala Ile Arg
50 55 60
Glu Pro Val Glu Gln Arg Ala Gln Arg Ser Thr Val Arg His Glu Asp
65 70 75 80
Phe Asp Ser Lys Leu Ile Pro Lys Ser Phe Asp Ala Arg Ala Thr Trp
85 90 95
Pro His Cys Pro Ser Ile Ser Glu Ile Arg Asp Gln Ser Ser Cys Gly
100 105 110
Ser Cys Trp Ala Phe Gly Ala Val Glu Ala Met Ser Asp Arg Leu Cys
115 120 125
Ile His Ser Ser Gly Ala Phe Asn Lys Ser Leu Ser Ala Val Asp Leu
130 135 140
Leu Ser Cys Cys Lys Asp Cys Gly Asp Gly Cys Asp Gly Gly Phe Pro
145 150 155 160
Pro Met Ala Trp Asp Phe Trp Lys Thr His Gly Ile Val Thr Gly Gly
165 170 175
Ser Lys Glu Glu Pro Thr Gly Cys Arg Pro Tyr Pro Phe Pro Lys Cys
180 185 190
Gln His His Ser Gln Gly His Tyr Pro Pro Cys Pro Arg Arg Ile Tyr
195 200 205
Pro Thr Pro Lys Cys Val Lys His Cys Asp Thr Pro Lys Ile Asp Tyr
210 215 220
Gln Lys Asp Lys Thr Arg Ala Asn Thr Ser Tyr Asn Val His Gln Ser
225 230 235 240
Glu Val Ala Ile Met Lys Glu Ile Leu Leu Asn Gly Pro Val Glu Ala
245 250 255
Thr Phe Glu Val His Glu Asp Phe Pro Glu Tyr Lys Ser Gly Ile Tyr
260 265 270
Phe His Ala Trp Gly Gly Ser Val Gly Gly His Ala Ile Arg Ile Leu
275 280 285
Gly Trp Gly Glu Glu Asn Gly Val Pro Tyr Trp Leu Ile Ala Asn Ser
290 295 300
Trp Asn Glu Asp Trp Gly Glu Lys Gly Tyr Leu Arg Phe Leu Arg Gly
305 310 315 320
His Asn Glu Cys Gly Ile Glu Glu Glu Ala Thr Ala Gly Leu Pro Asp
325 330 335
Leu Ser Thr Ile Pro His Phe
340
<210> 3
<211> 337
<212> PRT
<213> Clonorchis sinensis
<400> 3
Met Leu Trp Leu Ile Leu Val Phe Gly Thr Val Phe Ala Ala Ala Ser
1 5 10 15
Lys Gly Thr Glu Ser Ile Gly Leu Arg Glu Tyr Val Asp Ser Lys Ser
20 25 30
Gly Ala Arg Trp Ile Tyr Ala Glu Pro Pro Glu Arg Phe Gln Pro Gly
35 40 45
Asn Phe Gln Leu Met Phe Gly Ala Leu Arg Glu Pro Glu Glu Gln Arg
50 55 60
Ser Lys Arg Pro Thr Val Ser His Glu Ser Phe Ser Asp Glu His Ile
65 70 75 80
Pro Lys Ala Phe Asp Ala Arg Lys Gln Trp Pro His Cys Pro Thr Ile
85 90 95
Gly Glu Ile Arg Asp Gln Ser Ser Cys Gly Ser Cys Trp Ala Phe Gly
100 105 110
Ala Val Glu Ala Met Ser Asp Arg Leu Cys Ile His Thr Asn Gly Thr
115 120 125
Phe Thr Lys Arg Ile Ser Ala Val Asp Leu Ile Ser Cys Cys Gly Tyr
130 135 140
Cys Gly Phe Gly Cys Gln Gly Gly Phe Pro Pro Thr Ala Trp Asp Phe
145 150 155 160
Trp Gln Thr Glu Gly Ile Val Thr Gly Gly Ser Lys Glu Asn Pro Thr
165 170 175
Gly Cys Arg Ser Tyr Pro Phe Pro Arg Cys Ser His His Gly Ser Lys
180 185 190
Lys Tyr Pro Pro Cys Ser His Arg Ile Tyr Asp Thr Pro Asn Cys Val
195 200 205
Gln Lys Cys Asp Thr Pro Asp Thr Asp Tyr Ala Thr Asp Lys Thr Arg
210 215 220
Ala Asn Ile Thr Tyr Asn Val Lys Ala Lys Gln Asn Ala Ile Met Lys
225 230 235 240
Glu Ile Met Ile Asn Gly Pro Val Glu Ala Ala Phe Gln Val Tyr Glu
245 250 255
Asp Phe Leu Gly Tyr Lys Ser Gly Val Tyr Phe His Ser Asp Gly Thr
260 265 270
Leu Leu Gly Gly His Ala Ile Arg Ile Leu Gly Trp Gly Glu Glu Asn
275 280 285
Gly Val Ala Tyr Trp Leu Ile Ala Asn Ser Trp Asn Asp Gly Trp Gly
290 295 300
Glu Asp Gly Tyr Phe Lys Met Leu Arg Gly Lys Asn Glu Cys Gly Ile
305 310 315 320
Glu Asp Glu Val Thr Ala Gly Leu Pro Glu Leu Ser Ser Ile Pro Leu
325 330 335
Lys
<210> 4
<211> 347
<212> PRT
<213> Clonorchis sinensis
<400> 4
Met Arg Ala Thr Thr Phe Leu Cys Ala Ile Ala Ile Leu Leu Asp Gly
1 5 10 15
Ser Asn Gly Lys Pro Lys His Glu Ala Leu Ser Asp Glu Leu Val Asp
20 25 30
Tyr Val Asn Ser Gln Val Asp Ala Thr Trp Lys Ala Ala Lys Ser Glu
35 40 45
Arg Phe Lys Thr Leu Glu Glu Ile Arg Ser Val Leu Gly Thr Met Arg
50 55 60
Glu Asp Gln Asn Val Lys Glu Phe Arg Arg Pro Thr Ile Ser His Glu
65 70 75 80
Asp Ile Thr Leu Glu Leu Pro Ser Glu Phe Asp Ala Arg Glu His Trp
85 90 95
Pro Glu Cys Arg Thr Ile Pro Gln Ile Arg Asp Gln Ser Gly Cys Gly
100 105 110
Ser Cys Trp Ala Phe Ala Ala Val Thr Ala Met Ser Asp Arg Val Cys
115 120 125
Ile His Ser Asn Gln Thr Leu Val Asn Val Gln Leu Ser Ala Thr Asp
130 135 140
Leu Leu Ala Cys Cys Thr Thr Cys Gly Phe Gly Cys Val Gly Gly Trp
145 150 155 160
Gly Gly Met Ala Trp Asp Tyr Trp Arg Asp Asn Gly Ile Val Thr Gly
165 170 175
Gly Glu Tyr Lys Asp Ser His Thr Cys Leu Pro Tyr Pro Phe Pro Pro
180 185 190
Cys Arg His His Gly Ala Lys Gly Ser Glu Tyr Pro Pro Cys Pro Glu
195 200 205
Lys Met Tyr Ser Thr Pro Gln Cys Val Ser Glu Cys Gln Lys Gly Tyr
210 215 220
Ala Thr Lys Tyr Glu Asp Asp Lys Ile Arg Ala Ser Thr Ser Tyr Asn
225 230 235 240
Leu Tyr Arg Ser Val Thr Ala Ile Gln Lys Glu Ile Trp Met Arg Gly
245 250 255
Pro Val Glu Ala Thr Met Asn Val Tyr Thr Asp Phe Ala Asn Tyr Ala
260 265 270
Gly Gly Val Tyr Lys His Thr Thr Gly Glu Leu Leu Gly Gly His Ala
275 280 285
Ile Arg Leu Leu Gly Trp Gly Val Glu Glu Asp Gly Thr Pro Tyr Trp
290 295 300
Leu Ala Ala Asn Ser Trp Asn Pro Ser Trp Gly Glu Lys Gly Phe Phe
305 310 315 320
Arg Ile Leu Arg Gly Ser Asp His Cys Gly Ile Glu Ser Asp Val Ser
325 330 335
Ala Gly Leu Pro Val Asn His Glu Ser Phe Ser
340 345
<210> 5
<211> 343
<212> PRT
<213> Clonorchis sinensis
<400> 5
Met Ile Pro Leu Phe Thr Ala Tyr Asn Ile Leu Leu Leu Ala Asn Asn
1 5 10 15
Phe Gln Asp Ala Gln Cys Glu Gln Thr Ala Asn Val Gly Val Arg Glu
20 25 30
His Val His Ser Ile Thr Gly Ala Arg Trp Ile Ser Gly Arg Leu Pro
35 40 45
Lys Arg Phe Glu Ser Gly Asp Leu Ile His Met Phe Gly Ala Lys Arg
50 55 60
Glu Thr Arg Glu Gln Lys Ala Gln Arg Pro Thr Leu Arg His Asp Gly
65 70 75 80
Phe Asp Asn Met Arg Leu Pro Lys Asn Phe Asp Ala Arg Lys Thr Trp
85 90 95
Pro His Cys Ser Ser Ile Ser Glu Ile Arg Asp Gln Ser Ser Cys Gly
100 105 110
Ser Cys Trp Ala Phe Gly Ala Val Glu Ala Met Ser Asp Arg Leu Cys
115 120 125
Ile His Ser Asn Gly Ala Phe Asn Lys Ser Leu Ser Ala Val Asp Leu
130 135 140
Leu Ser Cys Cys Lys Asp Cys Gly Phe Gly Cys Arg Gly Gly Tyr Pro
145 150 155 160
Ala Val Ala Trp Asp Tyr Trp Lys Thr His Gly Ile Val Thr Gly Gly
165 170 175
Ser Lys Glu Asp Pro Ser Gly Cys Arg Ser Tyr Pro Phe Pro Lys Cys
180 185 190
Glu His His Val Gln Gly His Tyr Pro Pro Cys Pro Arg Glu Leu Tyr
195 200 205
Pro Thr Pro Glu Cys Val Gln Gln Cys Asp Thr Pro Asp Val Gly Tyr
210 215 220
Leu Glu Asp Lys Thr Arg Ala Asn Met Ser Tyr Asn Ile Tyr Ala Ser
225 230 235 240
Glu Ile Ser Ile Met Lys Glu Ile Met Leu Arg Gly Pro Val Glu Ala
245 250 255
Ile Phe Thr Met Tyr Glu Asp Phe Leu Arg Tyr Ser Ser Gly Val Tyr
260 265 270
Phe His Ala Leu Gly Ala Pro Met Ser Gly His Ala Val Arg Ile Leu
275 280 285
Gly Trp Gly Glu Leu Gly Asn Val Pro Tyr Trp Leu Ile Ala Asn Ser
290 295 300
Trp Asn Glu Asp Trp Gly Glu Glu Gly Tyr Met Lys Phe Leu Arg Gly
305 310 315 320
Tyr Asn Glu Cys Gly Ile Glu Asp Asp Val Thr Ala Gly Leu Pro Tyr
325 330 335
Leu Pro Ile Ile Pro Gln Tyr
340
<210> 6
<211> 425
<212> PRT
<213> Clonorchis sinensis
<400> 6
Met Ile His Leu Gly Leu Leu Phe Trp Val Leu Leu Thr Thr Ser Glu
1 5 10 15
Cys Ser Val Ile Arg Ile Pro Leu Ile Gly Phe Lys Asn Val Arg Arg
20 25 30
Arg Leu Met Glu Val Gly Thr Pro Val Glu Gln Leu Asn Phe Thr Ser
35 40 45
Ile Arg Phe Val Gly Asn Gly Ser Ile Pro Glu Ile Leu Asn Asn Tyr
50 55 60
Leu Asp Ala Gln Tyr Tyr Gly Glu Ile Gly Ile Gly Thr Pro Pro Gln
65 70 75 80
Ser Phe Glu Val Val Phe Asp Thr Gly Ser Ser Asn Leu Trp Val Pro
85 90 95
Ser Lys His Cys Ser Ile Phe Ser Ile Ala Cys Trp Leu His His Lys
100 105 110
Tyr Asp Ser Ala Lys Ser Ser Thr Tyr Met Ala Asn Gly Thr Glu Phe
115 120 125
Ser Ile Arg Tyr Gly Ser Gly Ser Val Ser Gly Ile Leu Ser Thr Asp
130 135 140
Tyr Val Ser Val Gly Thr Val Thr Val Lys Asn Gln Thr Phe Gly Glu
145 150 155 160
Ala Met Lys Glu Pro Gly Ile Ala Phe Val Ala Ala Lys Phe Asp Gly
165 170 175
Ile Leu Gly Met Gly Phe Lys Thr Ile Ser Val Asp Gly Val Pro Thr
180 185 190
Leu Phe Asp Asn Met Ile Ser Gln Gly Leu Val Ser Glu Pro Val Phe
195 200 205
Ser Phe Tyr Leu Asp Arg Asn Ala Ser Asp Pro Val Gly Gly Glu Leu
210 215 220
Leu Leu Gly Gly Thr Asp Pro Lys Tyr Tyr Lys Gly Glu Ile Leu Trp
225 230 235 240
Ala Pro Leu Thr His Glu Ala Tyr Trp Gln Phe Lys Val Asp Gly Met
245 250 255
Asn Val Gly Ser Met Lys Leu Cys Glu Asn Gly Cys Gln Ala Ile Ala
260 265 270
Asp Thr Gly Thr Ser Leu Ile Ala Gly Pro Ser Glu Glu Val Gly Lys
275 280 285
Leu Asn Asp Ala Leu Gly Ala Ile Lys Ile Pro Gly Gly Thr Tyr Tyr
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Ile Asp Cys Ser Arg Val Ser Thr Leu Pro Pro Val Gln Phe Ser Ile
305 310 315 320
Ser Gly Lys Leu Met Gln Leu Asp Pro Ser Asp Tyr Ile Leu Arg Met
325 330 335
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340 345 350
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355 360 365
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Arg Thr Arg Ile Glu Arg Phe Lys Arg Pro Pro Lys Ser Ser Phe Val
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<212> PRT
<213> Clonorchis sinensis
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Ile Gln Tyr Gly Thr Gly Ser Val Ser Gly Val Leu Ser Thr Asp Val
130 135 140
Val Thr Val Ser Ser Ala Lys Val Gln Asp Gln Thr Phe Gly Glu Ala
145 150 155 160
Ile Asn Glu Pro Gly Leu Val Phe Val Val Ala Lys Phe Asp Gly Ile
165 170 175
Leu Gly Leu Ala Phe Gln Ser Ile Ala Val Asp Asn Val Val Pro Val
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Val Thr Ser Leu Thr Leu Cys Ala Gln Gly Cys Gln Ala Ile Val Asp
260 265 270
Thr Gly Thr Thr Leu Ile Val Gly Pro Thr Ala Asp Val Asn Gln Leu
275 280 285
Asn Glu Ala Leu Gly Ala Val Ser Ile Glu Gly Gly Leu Ser Val Leu
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Thr
385
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<213> Clonorchis sinensis
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atggattcga tttggaccct gataatgtac gctctgcttt gtgcggaatc gtttagagca 60
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gctaatacca cctggaaggc agcgaaatac cagcgtttca aaacaatatc tgatgtgcgc 180
cgtgtgcttg gagctgttcc cgacccaaac ggattcggcc tggaaaaacg ttgtttgcta 240
tccaccatac gagaacaaga actaccagaa tcttttgatg cacgtgagaa gtggccgtat 300
tgcagttcaa tagcagaaat tcgtgatcag tcaaactgcg gatcgtgttg ggctttcgga 360
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1020
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<211> 1032
<212> DNA
<213> Clonorchis sinensis
<400> 9
atgttaccgt cgttcgtact atacggtctc ttgtttttta tctacagctt cgaagtcaca 60
cattgtgaaa atctggggag cgtgggagtg cgagaacatg tacatccgac tgcaggggca 120
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ccgcattttt ga 1032
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<212> DNA
<213> Clonorchis sinensis
<400> 10
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<210> 11
<211> 1044
<212> DNA
<213> Clonorchis sinensis
<400> 11
atgagggcaa cgacattctt atgtgctatt gcgatcctcc tcgatggctc taacgggaaa 60
ccaaagcacg aagccttgtc ggacgaactg gttgactacg tgaacagtca ggtggacgct 120
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gttaatcatg aatccttttc gtga 1044
<210> 12
<211> 1032
<212> DNA
<213> Clonorchis sinensis
<400> 12
atgataccgc tgtttacagc atacaatatc ctgcttttgg ccaacaattt ccaagacgct 60
cagtgcgaac aaacagcaaa tgtaggagtg cgggaacatg tacactcaat tactggggca 120
cgatggatat ctggaagact tccgaaaaga ttcgaatctg gcgacctgat tcacatgttt 180
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ttcgacaata tgcgccttcc aaagaacttt gatgcacgga agacctggcc gcattgctct 300
tccatcagtg aaatcagaga tcaatccagt tgtggatcat gttgggcgtt cggggctgtg 360
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ccacagtatt ga 1032
<210> 13
<211> 1278
<212> DNA
<213> Clonorchis sinensis
<400> 13
atgattcatc tgggcttgtt gttttgggtg cttctcacca ccagcgaatg cagtgttatt 60
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<210> 14
<211> 1158
<212> DNA
<213> Clonorchis sinensis
<400> 14
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tttcagtcaa tagcggtcga taatgttgtt ccggtgttcg ataacatgat ttcccaaggt 600
ctggttgaaa agccattgtt ttctgtttgg ctggatcgca acgacgttca agacattggt 660
ggagaaatca tgtttggagg aataaataag gaacattaca tgggcgacat gtactttgtt 720
ccattgagtt cggaaacata ctggcagatt gacctggacg gcattcaagt gactagtctg 780
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cccactgctg atgtcaatca actcaacgag gcacttggag ctgtttcaat agagggtgga 900
ctgagcgttc tagaatgttc acaaatatat acgttaccac caatagagtt ttcaatcaat 960
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<213> Artificial Sequence
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<212> DNA
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<220>
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<212> DNA
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<220>
<223> CsCB2_R
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<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CsCB3_R
<400> 20
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<210> 22
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CsCB4_R
<400> 22
tcacgaaaag gattcatgat taactgg 27
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 23
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<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CsCB5_R
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<210> 25
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
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<220>
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tcaccatccg aatccgaaca atctgga 27
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<220>
<223> CsAP2_F
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<212> DNA
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<220>
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<220>
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<210> 31
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<220>
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<400> 31
ggatccgaac atgtacatcc gactgca 27
<210> 32
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rCsCB2_R
<400> 32
gagctctcaa aaatgcggaa tggtgga 27
<210> 33
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rCsCB3_F
<400> 33
ggatcctatg ttgattcaaa gtcgggc 27
<210> 34
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rCsCB3_R
<400> 34
aagctttcac ttaagtggga tgctgga 27
<210> 35
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rCsCB4_F
<400> 35
gtcgacaaac caaagcacga agccttg 27
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<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rCsCB4_R
<400> 36
aagctttcac gaaaaggatt catgatt 27
<210> 37
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rCsCB5_F
<400> 37
ggatccgaac aaacagcaaa tgtagga 27
<210> 38
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rCsCB5_R
<400> 38
aagctttcaa tactgtggaa tgatggg 27
<210> 39
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rCsAP1_F
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gagctcagtg ttattcggat tcctcta 27
<210> 40
<211> 27
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<220>
<223> rCsAP1_R
<400> 40
gtcgactcac catccgaatc cgaacaa 27
<210> 41
<211> 27
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rCsAP2_F
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ggatccgttt tgagagttcc gctcaaa 27
<210> 42
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rCsAP2_R
<400> 42
gtcgacctaa gtggaccttg caaagcc 27
Claims (12)
- 서열번호 1 내지 7로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 단백질로 구성된 군으로부터 선택된 간흡충증 특이적 항원 단백질.
- 제 1항에 있어서, 상기 항원 단백질은 간흡충의 단백질분해효소인 것을 특징으로 하는 간흡충증 특이적 항원 단백질.
- 제 2항에 있어서, 상기 단백질분해효소는 간흡충 카텝신 B 시스테인 단백질분해효소(cathepsin B cysteine proteases) 또는 간흡충 아스파틱 단백질분해효소(aspartic proteases)인 것을 특징으로 하는 간흡충증 특이적 항원 단백질.
- 제 1항의 단백질을 각각 암호화하는 서열번호 8 내지 14로 기재되는 염기서열을 갖는 간흡충증 특이적 항원 유전자.
- 1) 제 1항의 간흡충증 특이적 항원 단백질 중 어느 하나를 암호화하는 유전자를 포함하는 발현 벡터를 제조하는 단계;
2) 상기 단계 1)의 발현 벡터를 숙주세포에 형질전환하여 형질전환체를 제조하는 단계; 및
3) 상기 단계 2)의 형질전환체를 배양하여 재조합 단백질을 수득하는 단계를 포함하는 방법으로 제조된 간흡충증 특이적 항원 단백질 제조 방법.
- 제 5항의 방법으로 제조된 간흡충증 특이적 항원 재조합 단백질.
- 제 1항 또는 제 6항의 단백질을 포함하는 간흡충증 진단용 키트.
- 서열번호 1 내지 7로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 단백질로 구성된 군으로부터 선택된 간흡충증 특이적 항원 단백질에 특이적으로 결합하는 항체.
- 제 8항에 있어서, 상기 항체는 단일클론 또는 다클론 항체인 것을 특징으로 하는 간흡충증 특이적 항원 단백질에 특이적으로 결합하는 항체.
- 제 7항의 항체를 포함하는 간흡충증 진단용 키트.
- 1) 피검체로부터 분리된 시료를 제 1항 또는 제 6항의 단백질과 접촉시키는 단계; 및
2) 상기 단계 1)의 시료 중 상기 단백질과 결합된 항체를 검출하는 단계를 포함하는 간흡충증 진단 방법.
- 제 11항에 있어서, 상기 단계 1)의 시료는 혈청인 것을 특징으로 하는 간흡충증 진단 방법.
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KR1020140105016A KR20160020109A (ko) | 2014-08-13 | 2014-08-13 | 간흡충 단백질분해효소를 이용한 간흡충증 혈청학적 진단 방법 |
Applications Claiming Priority (1)
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Publications (1)
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KR20160020109A true KR20160020109A (ko) | 2016-02-23 |
Family
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Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
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KR1020140105016A KR20160020109A (ko) | 2014-08-13 | 2014-08-13 | 간흡충 단백질분해효소를 이용한 간흡충증 혈청학적 진단 방법 |
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Country | Link |
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KR (1) | KR20160020109A (ko) |
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2014
- 2014-08-13 KR KR1020140105016A patent/KR20160020109A/ko not_active Application Discontinuation
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