KR20100104753A - Fga 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 이를 이용한 검출 방법 - Google Patents
Fga 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 이를 이용한 검출 방법 Download PDFInfo
- Publication number
- KR20100104753A KR20100104753A KR1020090023379A KR20090023379A KR20100104753A KR 20100104753 A KR20100104753 A KR 20100104753A KR 1020090023379 A KR1020090023379 A KR 1020090023379A KR 20090023379 A KR20090023379 A KR 20090023379A KR 20100104753 A KR20100104753 A KR 20100104753A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- polynucleotide
- autism
- base
- seq
- sequence
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6834—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
- C12Q1/6837—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase using probe arrays or probe chips
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Pathology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
Abstract
Description
그룹 | 정상군 | 자폐증 환자군 | 총합계 |
조사인원 | 147 | 179 | 326 |
온도 | 각 온도에서의 시간 | |
1 사이클 |
37℃ | 10 min |
95℃ | 3 min | |
34 사이클 | 95℃ | 35 sec |
56℃ | 35 sec | |
72℃ | 2 min | |
1 사이클 | 72℃ | 10 min |
4℃ | 5 min |
서열번호 | Reference SNP ID | 대립인자 | 위치 | SNP역할 | 아미노산 변화 |
1 | rs2070025 | A>G | 155869429 | Ile(I)→Val(V) | 변화있음 |
2 | rs2070011 | A>G | 155869505 | 5'-UTR | 변화없음 |
서열번호 | Reference SNP ID | 대립인자형 빈도 | 유전 자형 |
유전자형 빈도(%) | ||
Major allele | Minor allele | 정상군 | 자폐증군* | |||
1 | rs2070025 | 576 (A) | 72 (G) | AA | 123 (83.67) | 134 (75.71) |
AG | 23 (15.65) | 39 (22.03) | ||||
GG | 1 (0.68) | 4 (2.26) | ||||
2 | rs2070011 | 331 (A) | 319 (G) | AA | 47 (31.97) | 38 (21.35) |
AG | 75 (51.02) | 86 (48.31) | ||||
GG | 25 (17.01) | 54 (30.34) |
서열번호 | Reference SNP ID | HWE | 분석모델 | OR (95% CI) | Logit p value | 위험대립인자 |
1 | rs2070025 | 0.912 | 대립인자 | 1.619(1.186-2.211) | 0.002 | G |
공우성 | 1.628(0.978-2.708) | 0.061 | ||||
우성 | 1.645(0.946-2.868) | 0.080 | ||||
열성 | 3.376(0.373-30.536) | 0.279 | ||||
2 | rs2070011 | 0.570 | 대립인자 | 1.647(0.987-2.749) | 0.054 | G |
공우성 | 1.623(1.183-2.228) | 0.003 | ||||
우성 | 1.732(1.052-2.851) | 0.031 | ||||
열성 | 2.125(1.243-3.631) | 0.006 |
Claims (11)
- 서열번호 1의 DNA 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서, 445번째 염기(다형성 부위)가 G이고, 상기 445번째 염기를 포함하는 10개 이상의 연속 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 (이하, "폴리뉴클레오티드 (a)"라 함); 및서열번호 2의 DNA 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서, 301번째 염기(다형성 부위)가 G이고, 상기 301번째 염기를 포함하는 10개 이상의 연속 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 (이하, "폴리뉴클레오티드 (b)"라 함)로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택된 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 뉴클레오티드.
- 제1항에 있어서, 길이가 10 내지 100 뉴클레오티드인 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드.
- 제1항 또는 제2항에 따른 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드로 이루어진, 자폐증 진단을 위한 증폭용 프라이머.
- 제1항 또는 제2항에 따른 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드로 이루어진, 자폐증 진단용 프로브.
- 제4항에 따른 자폐증 진단용 프로브를 포함하는 마이크로어레이.
- 제1항 또는 제2항에 따른 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드를 포함하는, 자폐증 진단용 키트.
- 자폐증 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여, (i) 검체로부터 핵산 시료를 얻는 단계; 및 (ii) 상기 핵산 시료로부터, 서열번호 1 및 2의 폴리뉴클레오티드로부터 하나 이상 선택된 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드의 다형성 부위의 염기 서열을 분석하는 단계 (단, 상기 다형성 부위는 서열번호 1의 DNA 서열의 경우 445번째 염기, 서열번호 2의 DNA 서열의 경우 301번째 염기를 각각 의미한다)를 포함하는, 검체 중의 단일염기다형을 검출하는 방법.
- 제7항에 있어서, 상기 다형성 부위의 염기 서열을 분석하는 단계가 서열번호 1 및 2의 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군으로부터 선택된 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드 서열로부터 유래된 서열로서 다형성 부위를 포함하는 서열(단, 상기 다형성 부위는 서열번호 1의 DNA 서열의 경우 445번째 염기, 서열번호 2의 DNA 서열의 경우 301번째 염기를 각각 의미한다)을 주형으로 하는 프라이머 또는 프로브를 이용하여 수행되는 것을 특징으로 하는, 검체 중의 단일염기다형을 검출하는 방법.
- 제7항에 있어서, 상기 다형성 부위의 염기 서열을 분석하는 단계가 폴리뉴클레오티드 (a) 및 (b)로 이루어진 군으로부터 선택된 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드가 고정된 마이크로어레이에 상기 핵산 시료를 혼성화시키는 단계 (단, 상기 폴리뉴클레오티드 (a) 및 (b)는 제1항에서 정의한 바와 같다); 및 얻어진 혼성화 결과를 분석하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는, 검체 중의 단일염기다형을 검출하는 방법.
- 제9항에 있어서, 상기 마이크로어레이에 고정되는 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드의 DNA 서열의 길이가 각각 10 내지 100 뉴클레오티드인 것을 특징으로 하는, 검체 중의 단일염기다형을 검출하는 방법.
- 제7항에 있어서, 상기 다형성 부위의 염기 서열을 분석하는 단계가 서열번호 1의 DNA 서열의 445번째 염기의 대립인자형 분석에 의해 수행되거나 서열번호 2의 DNA 서열의 301번째 염기의 유전자형(genotype) 분석에 의해 수행되는 것을 특징으로 하는, 검체 중의 단일염기다형을 검출하는 방법.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020090023379A KR101075392B1 (ko) | 2009-03-19 | 2009-03-19 | Fga 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 이를 이용한 검출 방법 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020090023379A KR101075392B1 (ko) | 2009-03-19 | 2009-03-19 | Fga 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 이를 이용한 검출 방법 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20100104753A true KR20100104753A (ko) | 2010-09-29 |
KR101075392B1 KR101075392B1 (ko) | 2011-10-24 |
Family
ID=43008970
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020090023379A KR101075392B1 (ko) | 2009-03-19 | 2009-03-19 | Fga 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 이를 이용한 검출 방법 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
KR (1) | KR101075392B1 (ko) |
-
2009
- 2009-03-19 KR KR1020090023379A patent/KR101075392B1/ko active IP Right Grant
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
KR101075392B1 (ko) | 2011-10-24 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
EP2707498B1 (en) | Method for discovering pharmacogenomic biomarkers | |
JP5662293B2 (ja) | 注意欠陥多動性障害の診断用snpとそれを含むマイクロアレイ及びキット | |
KR20110034297A (ko) | 내인성 아토피 피부염 진단용 마커 및 그의 용도 | |
KR101167945B1 (ko) | Atg16l1 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 및 이를 이용한 자폐 스펙트럼 장애 분석방법 | |
KR101075392B1 (ko) | Fga 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 이를 이용한 검출 방법 | |
KR101071081B1 (ko) | Defa4 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 이를 이용한 검출 방법 | |
KR101167942B1 (ko) | Alg12 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 및 이를 이용한 자폐 스펙트럼 장애 분석방법 | |
KR101167934B1 (ko) | Ticam1 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 및 이를 이용한 자폐 스펙트럼 장애 분석방법 | |
KR101167940B1 (ko) | Fmn2 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 및 이를 이용한 자폐 스펙트럼 장애 분석방법 | |
KR101100323B1 (ko) | Pcmt1 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 및 이를 이용한 분석방법 | |
KR101061540B1 (ko) | 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는마이크로어레이 및 진단키트, 이를 이용한 검출 방법 | |
KR100803258B1 (ko) | 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 그를 포함하는마이크로어레이 및 진단키트, 그를 이용한 b형 간염백신에 대한 항체-무반응 진단방법 | |
KR101095850B1 (ko) | 검체 중의 단일염기다형을 검출하는 방법 | |
KR101095852B1 (ko) | 검체 중의 단일염기다형을 검출하는 방법 | |
KR101061542B1 (ko) | 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 이를 이용한 검출 방법 | |
KR101168737B1 (ko) | Fanca 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 및 이를 이용한 분석방법 | |
KR100841556B1 (ko) | 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드 및 그를 포함하는 진단키트 | |
KR101168734B1 (ko) | Lamc1 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 및 이를 이용한 분석방법 | |
KR101196239B1 (ko) | Tg 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 조기폐경 진단용 키트 및 이를 이용한 분석방법 | |
KR100768685B1 (ko) | 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 그를 포함하는마이크로어레이 및 진단키트, 및 그를 이용한 조기폐경진단방법 | |
KR101196241B1 (ko) | Hsd17b4 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드를 이용한 조기폐경 진단을 위한 분석방법 및 이를 위한 분석용 키트 | |
KR101168735B1 (ko) | Cyp19a1 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 및 이를 이용한 분석방법 | |
KR100695147B1 (ko) | 다중좌 마커를 이용한 2형 당뇨병의 진단방법, 2형당뇨병과 연관된 마커를 포함하는 폴리뉴클레오티드 및마이크로어레이 | |
KR100909372B1 (ko) | 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드를 이용한조기폐경 진단방법 | |
JP2021073993A (ja) | イヌ白内障の検査方法、イヌ白内障の検査をするための試薬、及びイヌ白内障の検査キット |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A201 | Request for examination | ||
E902 | Notification of reason for refusal | ||
E701 | Decision to grant or registration of patent right | ||
GRNT | Written decision to grant | ||
FPAY | Annual fee payment |
Payment date: 20140929 Year of fee payment: 4 |
|
FPAY | Annual fee payment |
Payment date: 20151005 Year of fee payment: 5 |
|
FPAY | Annual fee payment |
Payment date: 20160928 Year of fee payment: 6 |
|
FPAY | Annual fee payment |
Payment date: 20170928 Year of fee payment: 7 |
|
FPAY | Annual fee payment |
Payment date: 20180918 Year of fee payment: 8 |
|
FPAY | Annual fee payment |
Payment date: 20191001 Year of fee payment: 9 |