KR20010074487A

KR20010074487A - Ｍｈｃ 클래스 ⅰ과 ｍｈｃ 클래스 ⅱ 분자에 결합하는,ｎｙ-ｅｓｏ-1의 아미노산 서열에 상응하는 분리된펩티드, 및 그것의 사용

Info

Publication number: KR20010074487A
Application number: KR1020007011462A
Authority: KR
Inventors: 엘리자베스 스톡커트; 엘케 자게르; 야오-쳉 첸; 매튜 스칸란; 크누스 알렉산더; 로이드 제이. 올드; 알리 구어; 저드 리터; 잔 더블유. 드리으프하우트
Original assignee: 에드워드 에이. 맥더모 2세, 로이드 제이. 오울드; 루드빅 인스티튜트 포 캔서 리서치
Priority date: 1998-04-17
Filing date: 1999-03-24
Publication date: 2001-08-04
Also published as: EP1071443A1; WO1999053938A1; DE69931482D1; JP3995884B2; US7115729B2; ATE326981T1; JP2002538074A; CA2325605C; AU754961B2; CN1303300A; EP1071443B1; EP1071443A4; CA2325605A1; AU3370699A; DE69931482T2; US6723832B1; CN100378121C; KR100483480B1; US20040158044A1

Abstract

본 발명은 MHC 클래스 I, 그리고 MHC 클래스 Ⅱ 분자에 결합하는 펩티드들에 관한 것이다. 이 펩티드들은 다른 치료학적 및 진단학적 상황에서 유용하다.

Description

ＭＨＣ 클래스 Ⅰ과 ＭＨＣ 클래스 Ⅱ 분자에 결합하는, ＮＹ-ＥＳＯ-1의 아미노산 서열에 상응하는 분리된 펩티드, 및 그것의 사용{ISOLATED PEPTIDES CORRESPONDING TO AMINO ACID SEQUENCES OF NY-ESO-1, WHEREIN BIND TO MHC CLASS I AND MHC CLASS Ⅱ MOLECULES, AND USES THEREOF}

감염, 암, 자가면역질환 등과 같은 많은 병리학적인 질환이 어떤 분자의 부적절한 발현을 특징으로 한다는 것이 꽤 잘 확립되어 있다. 그러므로, 이 분자들은 특별한 병리학적 또는 비정상적 질환을 위하여 "마커"로서 이바지 한다. 진단상의 "표적", 즉 이 비정상적인 질환을 진단하기 위하여 확인될 물질로서의 사용과는 별도로, 분자들은 진단 및/또는 치료 약제를 생성하기 위하여 사용될 수 있는 시약으로서 이바지한다. 이것의 한정적이지 않은 예는 특별한 마커에 특이적인 항체를 생산하기 위한 암 마커의 사용이다. 그러나, 또하나의 비-한정적인 예는 MHC 분자와 복합체를 이루어, 비정상 세포에 대한 세포융해성 T 세포를 생성하게 하는 펩티드의 사용이다.

물론, 그러한 물질의 제조는 이것들을 생성하기 위하여 사용되는 시약의 공급원을 전제로 한다. 세포로부터의 정제는, 그렇게 하는 확실한 방법이기는 커녕, 힘이 든다. 또하나의 바람직한 방법은 특별한 마커를 코드화하는 핵산분자를 분리하고, 이어서 원하는 분자를 발현시키기 위하여 분리된 코드화 분자를 사용하는 것이다.

지금까지, 예를 들어 인간 종양에서, 그러한 항원을 탐지하기 위하여 두 전략이 사용되어 왔다. 이것들은 유전학적 접근방법 및 생화학적 접근방법이라고 불릴 것이다. 유전학적 접근방법은, 예를 들어, 참고에 의하여 연합된 dePlaen 등, Proc. Natl. Sci. USA 85:2275 (1988)에 의하여 예시된다. 이 접근방법에서, 종양으로부터 얻어진 cDNA 라이브러리의 플라스미드의 수백 풀(pool)이 COS 세포와 같은 수용자 세포안으로 트랜스펙션되거나, 특이적한 항원의 발현에 대하여 시험되는 종양 세포주의 항원-음성적인 변이체안으로 트랜스펙션된다. 예를 들어, 참고에 의하여 연합된 O. Mandelboim, 등, Nature 369:69(1994)에 의하여 예시되는 생화학적 접근방법은, 종양세포의 MHC-클래스 I 분자에 결합된 펩티드를 산성 용출에 이어서 역상 고성능 액체 크로마토그라피(HPLC)시키는 것에 기초한다. 항원성 펩티드는,그것이 항원 프로세싱에 결함이 있는 돌연변이체 세포주의 빈 MHC-클래스 I 분자에 결합하고, 세표융해성 T-림프구와의 특이적인 반응을 유도한 후에 확인된다. 이 반응은, MTT 분석 또는⁵¹Cr 방출분석에서 측정될 수 있는 CTL 증식, TNF 방출, 및 표적세포의 융해의 유도를 포함한다.

항원의 분자적 정의로의 이 두가지 접근방법은 다음의 단점을 가진다: 첫째, 그것은 매우 귀찮고 시간-소비적이고 고가이며; 둘째, 미리 정의된 특이성을 가진 세포융해성 T 세포주(CTL)의 확립에 의존한다.

항원의 확인과 분자적 정의를 위한 두가지 공지의 접근방법에 고유한 문제는, 둘다의 방법이 지금까지 인간 종양에서의 새로운 항원을 거의 정의하지 못했다는 사실에 의하여 잘 입증된다. 예를 들어, van der Bruggen 등, Science 254:1643-1647 (1991); Brichard 등, J. Exp. Med. 178:489-495 (1993); Coulie, 등, J. Exp. Med. 180:35-42(1994); Kawakami, 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:3515-3519 (1994)를 참조하라.

더우기, 기술된 방법론들은 고려중인 암 유형의 확립된, 영구적인 세포주의 이용가능성에 의존한다. Oettgen, 등, Immunol. Allerg. Clin. North. Am. 10:607-637 (1990)에 의하여 보여지듯이, 어떤 암 유형으로부터 세포주를 확립하는 것은 매우 어렵다. 어떤 상피세포 유형 암은 생체외에서 CTL에 불충분하게 감수성이어서 일상적인 분석을 배제시킨다는 것이 또한 알려져 있다. 이 문제들은 기술이 암연관 항원을 확인하기 위한 추가적인 방법론을 발달시키는 것을 자극해 왔다.

관련된 출원

본 출원은, 지금은 미국특허 번호 인 1996년 10월 3일에 제출된 일련번호 08/725,182의 부분연속출원인 1997년 9월 15일에 제출된 일련번호 08/937,263의 부분연속출원인 1998년 4월 17일에 제출된 일련번호 09/062,422의 부분연속출원이다.

기술분야

본 발명은 암과 연관된 항원으로부터 유도된 HLA 결합 펩티드에 관한 것이다. 이 펩티드는 클래스 I 및 클래스 Ⅱ MHC 분자에 결합한다.

도 1은, 다양한 조직에서의, NY-ESO-1 항원을 위한 RNA의 발현 패턴을 보여준다.

도 2는 NY-ESO-1 mRNA의 노던 블롯 분석을 보여주는데, 이것은 고환과 세포주 SK-MEL-19에서 찾아졌지만 다양한 다른 세포 및 조직 샘플에서는 찾아지지 않았다.

도 3은, NY-ESO-1의 추론된 아미노산 서열의 번형을 위한 잠재적인 부위들을 보여준다.

도 4는 NY-ESO-1의 친수성 플롯으로, 아미노 말단에서의 친수성 도메인과, 카르복시 말단에 가까운 긴 소수성 스트레치를 보여준다.

도 5는, HLA-A2 양성, NY-ESO-1 양성, 둘다에 대해 양성, 또는 어느쪽에 대해서도 양성이 아닌 다양한 세포들을 이용한, CTL 융해 연구의 결과를 보여준다.

도 6은, HLA-A2 분자가 SEQ ID NO: 1 유도된 펩티드의 제시를 위한 제공분자임을 확립하는 자료를 나타낸다.

한 중요한 방법론이, 참고에 의하여 연합된 Sahin, 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92:11810-11913 (1995)에 의하여 기술된다. 또한, 미국특허 제5,698,396호와 1996년 1월 3일에 제출된 특허출원 일련번호 08/479,328을 참조하라. 이 참고문헌 3개다는 참고에 의하여 연합되어 있다. 요약하면, 방법은 원핵 숙주에서의 cDNA 라이브러리의 발현을 수반한다. (라이브러리는 종양 샘플로부터 확보된다.) 그리고나서, 높은 역가 체액성 반응을 이끌어내는 그 항원들을 검출하기 위하여, 발현된 라이브러리를 흡수되고 희석된 혈청으로 면역스크리닝한다. 이 방법론은 SEREX 방법"(Serological identification of antigens byRecombinantExpression Cloning")이라 알려져 있다. 그 방법론은 새로운 종양 연관된 항원을 검출하는 것은 물론 이전에 확인된 종양 연관된 항원의 발현을 확인하기 위하여 사용되어 왔다. 상기에 참조된 특허출원 및 상기의 Sahin, 등과, 또한 Crew, 등, EMBO J 144:2333-2340 (1995)를 참조하라.

SEREX 방법론은, 식도암 샘플에 적용되어 왔고 항원이 이제 확인되어 있으며, 그것의 코드화 핵산분자가 분리되고 클로닝되었다. 이것은 몇몇의 특허출원의 주제인데 이중 어떤 것은 참고에 의하여 연합되어 있다. 항원 및 절단된 형태는 암환자의 혈청안에 있는 항체와 반응성이 있다고 밝혀졌다. 또한, 이 분자로부터 유도된 펩티드가 MHC 분자와 결합하여 세포융해성 T 세포 및 헬퍼 T 세포 반응 둘다를 불러일으킨다는 것이 밝혀졌다. 본 발명의 이 특질은 다음에 오는 개시에서 보여진다.

바람직한 구체예의 상세한 설명

실시예 1

잘 알려진 방법을 이용하여, 중간정도로 충분히 분화된 식도의 편평세포암의 스냅 냉동된 표본으로부터 총 RNA를 추출하였다. 그러한 방법 하나를 위하여, 예를 들어 Chomzynski, J. Analyt. Biochem. 162: 156-159 (1987)을 참조하라. 이 RNA를사용하여 cDNA 라이브러리를 제조한 다음, 이것을 제조자의 지침에 따라 λZAP 파지 벡터안으로 트랜스펙션하였다. 그리고나서, λZAP 라이브러리를E. coli안으로 트랜스펙션하여, 1.6x10⁶1차 분리주(isolates)를 얻었다.

그리고나서, 참고에 의하여 연합된 Sahin, 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92: 11810-11813 (1995)의 SEREX 방법론을 이용하였다. 간단히 말해서, 식도암세포로부터의 cDNA 클론을 포함하지 않는 파지 λZAP으로 트랜스펙션된E. coli의 용해질과 혈청을 조합함으로써,E. coli에 내생적인 분자에 대한 항체를 자기유래의 혈청으로부터 제거하였다.

그리고나서 고갈된 혈청을 희석하였고, 파지 플라크를 포함하는 니트로셀룰로스 막과 혼합시켰다. 플라크를 실온에서 밤새 인큐베이션하였다. 세척한 다음, 필터를 알칼리성 포스파타제 포합된 염소 항 인간 FCγ 2차항체와 함께 인큐베이션하고, 5-브로모-4-클로로-인돌릴 포스페이트와 니트로블루 테트라졸륨과 함께 인큐베이션함으로써 반응성있는 파지 플라크를 가시화하였다. 총 13개의 양성 클론이 발견되었다.

실시예 2

확인에 이어서, 인간 혈청을 이용한 희석 클로닝과 시험을 통하여 반응성있는 클론을 단일클론성(monoclonality)으로 하위클로닝하였다. 그리고나서 이 클론을 정제하였고, 생체외에서 잘라서 제조자의 지침을 이용하여 pBK-CMV 플라스미드 형태로 전환시켰다. 그후, 삽입된 DNA를 EcoRI-XbaI 제한 매핑을 이용하여 평가해서 상이한 삽입체들을 결정하였다. 8개의 상이한 삽입체들을 확인하였는데, 이들은 크기에 있어서 약 500 내지 약 1.3 킬로염기쌍의 범위에 미쳤다. ABI PRISM 자동화된 서열분석기를 이용하여 그 클론들을 서열분석하였다.

표 1은 결과를 요약한다. 한 유전자는 네개의 중복되는 클론들을 대표하였고 두번째는 세개의 중복되는 클론들을 대표하였고, 남은 여섯개는 한 클론에 의해서만 대표되었다.

상동성 조사는, NY-ESO-2, 3, 6, 7이라고 불리는 클론들이 이미 알려졌음을 드러냈다. Elisei, 등, J. Endocrin. Invest. 16: 533-540 (1993); Spritz, 등, Nucl. Acids Res. 15: 10373-10391 (1987); Rabbits, 등, Nature Genetics 4: 175-180 (1993); Crozat, 등, Nature 363: 640-644 (1993); GenBank H18368 및 D25606을 참조하라. 클론중 두개(NY-ESO-3 및 NY-ESO-6)는 이전에, 다양한 정상적인 인간조직에서 발현되는 것으로 보여졌다. 리니지 제한(lineage restriction)의 어떠한 증거도 밝혀진 바 없다. NY-ESO-6(cDNA)은 FUS/TLS 유전자의 3'-번역되지 않는 부분으로 보인다. 여기에 보고되지 않은 실험에서, NY-ESO-6의 서열분석과 서던 블롯 분석은, 암에서의 전위 또는 점 돌연변이의 어떠한 증거도 보여주지 않았다. 그 클론중의 네개, 즉 NY-ESO-1, 4, 5 및 8은 검사된 데이터베이스안의 서열에 대하여 강한 상동성을 보이지 않았고, 그래서 더 연구되었다.

실시예 3

NY-ESO 1, 4, 5 및 8 클론들의 mRNA 발현을 평가하기 위하여 연구를 수행하였다. 이것을 하기 위하여, 각각의 서열에 특이적인 올리고뉴클레오티드 프라이머를, 300-400개 염기쌍의 cDNA 분절이 증폭되고 프라이머 멜팅온도가 65-70℃ 범위내이도록 고안하였다. 그리고나서, 상업적으로 이용가능한 재료와 표준 프로토콜을 이용하여 역전사-PCR을 수행하였다. 다양한 정상 및 종양 세포유형들을 시험하였다. 클론 NY-ESO-4와 NY-ESO-8은 편재되어 있었고 더 연구되지 않았다. NY-ESO-5는 원래 종양(original tumor)에서 그리고 정상적인 식도조직에서 강한 수준 발현을 보여주어서, 그것이 분화 마커임을 제안하였다.

NY-ESO-1은 종양 mRNA와 고환에서 발현되지만, 정상적인 결장, 신장, 간 또는 뇌조직에서는 발현되지 않는 것으로 밝혀졌다. 이 발현패턴은 다른 종양 거부 항원 전구체와 일치한다.

실시예 4

상기에서 보여진 RT-PCR 분석을, 훨씬 더 완전한 세트의 정상 및 종양 조직에 있어서, NY-ESO-1에 대하여 수행하였다. 표 2, 3 및 4는 이 결과들을 보여준다. 간단히 말해서, NY-ESO-1은 정상적인 고환과 난소 세포에서 고도로 발현되는 것을 밝혀졌다. 소량의 RT-PCR 생산이 정상적인 자궁근육층에서 발견되고 자궁내막에서는 발견되지 않았지만, 양성 외관은 일치하지 않았다. 정상적인 식도와 피부를 포함하여 다양한 세포유형의 편평상피도 또한 음성적이었다.

관계없는 세포 리니지의 종양을 시험할 때, 11개의 흑색종 세포주중의 2개가 강한 발현을 보여주었고, 67개 흑색종 표본중 16개가 그러하였고, 33개의 유방암 표본중 6개가 그러하였고, 4개의 방광암중 4개가 그러하였다. 다른 종양유형에서는드문드문한 발현이 있었다.

추가적인 세트의 실험을 수행하여 암환자 혈청안의 항 NY-ESO-1 항체의 존재가 ELISA를 통하여 결정될 수 있을지를 확인하였다.

상세히 설명하면, 코팅 완충액의 용액(15mM Na₂CO₃, 30mM NaHCO₃, pH 9.6, 0.02% NaN₃)중의 재조합 NY-ESO-1을, 1ug/ml의 농도로 미세웰 플레이트에 흡착시키고 나서(웰당 10ul의 용액) 4℃에서 밤새 유지하였다. 플레이트를 인산완충식염수로 세척하고, 10ul/웰의 2% 소과 혈청알부민/인산완충식염수를 이용하여 4℃에서 밤새 봉쇄시켰다. 세척한 후에, 2% 소과 혈청알부민중의 희석된 혈청 10ul/웰을 웰에 첨가하였다. 실온에서 2시간동안 인큐베이션한 다음, 플레이트를 세척하였고 10ul/웰의 염소 항-인간 IgG-알칼리성 포스파타제 콘주게이트를 1:1500 희석에서 첨가하였다. 이 용액을 한시간동안 실온에서 인큐베이션한 다음, 세척하고 알칼리성 포스파타제를 위한 기질용액을 첨가하였다(10ul/웰). 실온에서의 25분후에, 형광 플레이트 판독기를 이용하여 웰들을 판독하였다. 다음의 식에서 결과들이 나타난다.

종양안에 있는 NY-ESO-1을 위한 mRNA의 발현과 NY-ESO-1 단백질에 대한 항체반응사이에 관계가 있는지를 결정하기 위하여, 62명의 흑색종 환자들로부터의 자료를 비교하였다. 혈청이 NY-ESO-1 단백질과 반응성이 있는(즉, NY-ESO-1에 대한 항체를 포함하는) 모든 환자들은 또한 NY-ESO-1 양성 종양을 가지는 한편, NY-ESO-1음성 종양을 가진 어떤 환자도 그의 혈청안에 NY-ESO-1에 대한 항체를 보여주지 않았다. 항체를 결핍한 NY-ESO-1 양성 환자의 백분율이 있었다. 흑색종의 약 20-40% 가 NY-ESO-1을 발현하고 NY-ESO-1 양성 종양을 가진 환자들만이 항체를 가지기 때문에, 그 자료는, NY-ESO-1 양성 종양을 가진 환자의 높은 백분율이 그 단백질에 대한 항체를 발달시킨다는 것을 제안하여서, 진단과 치료에 대한 반응성에 있어서 유용한 넓은 스케일 분석을 제안한다.

실시예 5

그리고나서 노던 블롯 분석을 수행하여 NY-ESO-1 전사체의 크기를 조사하였고 조직 발현 패턴을 확인하였다. Ausubel, 등,Current Protocols In Molecular Biology(John Wiley & Sons, 1995)의 방법론을 사용하였다. 명확하게 말하면, 레인당 20ug의 총 RNA를 포름아미드와 포름알데히드 포함 완충액에 용해시키고 65℃로 가열한 다음, 3% 포름알데히드를 함유한 1.2% 아가로스 겔상에서 분별하였고, 이어서 니트로셀룰로스 종이로 옮겼다. 그리고나서,³²P 표지된 프로브를 이용하여 혼성화를 수행한 다음, 높은 스트린전시 세척을 하였다. 최종의 세척은 0.1xSSC, 0.1% SDS, 60℃에서 15분동안 이었다.

이전의 분석에서 NY-ESO-1에 대하여 양성이었던 고환과 흑색종 세포주(SK-MEL-19)로부터의 RNA는, 약 0.8-0.9 kb의 RNA 전사체를 보여주었다. 식도암종 표본은 0.4-0.9 kb 범위에서 번짐을 보여주어서 부분적인 분해를 반영하였다. 시험된 추가적인 조직 또는 세포주로부터의 RNA는 아무런 전사체도 보여주지 않았다.

완전한 전사체를 코드화하는 cDNA를 얻기 위하여, 식도의 cDNA 라이브러리를, 플라크 혼성화를 이용하고 혼성화 프로브로서 원래의 cDNA 클론을 이용하여 재스크리닝하였다. 3x10⁵개의 클론을 스크리닝했을 때, 6개의 양성이 발견되었다. 세개의 가장 긴 클론을 서열분석하였다. 오픈 리딩 프레임의 분석은, 이 세개 모두가 전체의 코딩영역과 다양한 크기의 5'-번역되지 않는 영역을 포함한다는 것을 보여주었다. 길이가 755개 염기쌍인(폴리A를 제외하고)가장 긴 클론은 543개 염기쌍의 코딩영역과, 5'끝에 있는 53개 번역되지 않는 염기들과 3'-끝에 있는 151개 번역되지 않는 염기쌍을 포함했다. SEQ ID NO: 1(또한, 도 3)을 참조하라.

긴 ORF는, NY-ESO-1 단백질의 추론된 서열이 180개 아미노산이라는 것을 나타낸다. 단일한 면역양성인 클론은 이중 173개를 코드화하는 서열을 포함했다. 추론된 분자질량은 17,995 달톤이다.

분석은, N-말단 부분에 풍부한 글리신 잔기들이 있음을 보여준다(처음 80개중의 30개, 나머지 100개중 4개). 친수성 분석은, 그분자의 N-말단 반쪽안에 친수성의 항원성 서열이 있고, 소수성 및 친수성 서열이 교대하고, 긴 C-말단의 소수성 미부(아미노산 152-172)로 끝나가고 짧은 친수성 미부로 이어진다는 것을 나타냈다. 이 패턴은 막투과 도메인을 제안한다. 몇가지의 잠재적인 N-미리스토릴화 부위, 3포스포릴화 부위가 있지만, N-글리코실화 부위의 증거는 없다.

실시예 6

악성흑색종에 걸린 환자로부터 흑색종 세포주 "NW-MEL-38"이 1995년에 확립되었다. 본원에 기술된 연구가 수행될 때까지 혈청샘플, 말초혈 림프구, 및 종양샘플을 피검자로부터 취하여 냉동시켰다. 이 환자에서의 항종양 T 세포반응을 평가할 것을 예상하여, 그 환자를 HLA-A1 및 HLA-A2로 HLA 유형화하였다.

이 환자로부터의 흑색종이 NY-ESO-1을 발현하는지를 결정하기 위하여, 표준 기술을 이용하여 종양샘플과 세포주 NW-MEL-38로부터 총 RNA를 분리하였다. 그리고나서, 각 샘플로부터의 2ug의 총 RNA로, 다시 표준 기술을 이용하여 cDNA 합성을 행하였다.

그리고나서 cDNA를, 다음의 프라이머들:

5'-CACACAGGAT CCATGGATGC TGCAGATGCG G'-3' (SEQ ID NO: 2) 및

CACACAAAGC TTGGCTTAGC GCCTCTGCCC TG-3' (SEQ ID NO: 3)

을 이용하여 RT-PCR 실험에서 사용하였다. 이 프라이머들을 뉴클레오티드 271에서 599에 이르는 SEQ ID NO: 1의 분절을 증폭해야 한다.

60℃의 어닐링온도를 이용하여 35회에 걸쳐서 증폭을 수행하였다. 1.5% 아가로스 겔상에서 에티디움 브로미드를 통하여 PCR 산물을 가시화하였다.

결과는, 그 종양과 세포주 둘다가 SEQ ID NO: 1을 발현한다는 것을 나타냈다. 그 세포주와 종양 샘플을 후속의 실험에 이용하였다.

실시예 7

그리고나서, 상기에서 논의된 분리된 cDNA 분자를 사용하여 재조합 단백질을 만들었다. 명확하게 말하면, 표준 기술을 이용하여 cDNA을 PCR 증폭시킨 다음, His 태그를 가진 상업적으로 이용가능한 플라스미드 벡터, 즉 pQE9안으로 클로닝하였다. 본원에서 상세하게 설명되지 않은 연구에서, 제2의 벡터, pQE9K를 또한 사용하였다. 이것은, 암피실린 저항성보다는 카나마이신 저항성이 pQE9K에 의하여 부여된다는 점에서 PQE9와 다르다.

플라스미드 벡터를 E. coli 균주 XL1-Blue안으로 형질전환시켰고, 양성의 형질전환체를 제한 매핑과 DNA 서열분석을 통하여 확인하였다. 잘 알려진 절차에 따라서, 이소프로필 β-D-티오갈락토시드를 이용하여 재조합 단백질의 생산을 유도하였고, Ni²⁺이온 크로마토그라피 컬럼상에서 단백질을 정제하였다. 15% SDS-PAGE와 은염색을 통하여 분석할 때, 단백질은 약 22킬로달톤의 분자량을 가지는 단백질로서 확인되었다. 이것은 그것의 서열로부터의 단백질의 예상 크기와 일치한다. 두개의 다른 형태의 재조합 단백질을 또한 확인하였다. 이것들은 SEQ ID NO: 1에서 보고된 아미노산 서열의 아미노산 10-180, 및 10-121로 구성되었다. 그것들은, 상기에서 수행된 대로의 SDS-PAGE상에서 각각 약 14kD과 20kD의 분자량을 가진다.

추가적인 세트의 실험을 수행하여, 바큘로바이러스안에서 NY-ESO-1을 발현시켰다. 상세히 설명하면, NY-ESO-1 cDNA 삽입체를, BamHI과 HindIII를 이용한 절단에 의하여 pQE9 벡터로부터 방출시켰다. 그리고나서 동일한 효소로 절단된 상업적으로 이용가능한 바큘로바이러스 벡터안으로 이 삽입체를 하위클로닝하였다. 표준방법을 이용하여 양성 클론들을 결정하였고, 양성 클론들을 수용자 Sf9 세포안으로 트랜스펙션하였다. 그리고나서, 10% 태아 송아지 혈청으로 보충된 표준 매질(IPL-41)을 이용하여, 재조합바이러스를 사용하여 곤충세포를 감염시켰다. 연구를 위한 감염의 다중성은 20이었다. 재조합 단백질의 발현은 상기에서 기술된 대로 결정되었다. 이 벡터에서 생산된 재조합 단백질은 His-태그를 가지고 있어서, 또한 상기에서 기술된 대로 Ni²⁺친화성 컬럼상에서 정제되었다. 그 단백질은 아미노산 10-180으로 구성되고 SDS-PAGE를 통해 볼때 20kD의 분자량을 가진다.

그리고나서, 추가적인 진핵의 트랜스펙션체들을 생산하였다. 이것을 하기 위하여, NY-ESO-1 코딩서열을 상기에서 기술된 pQE9 벡터로부터 분리한 다음, 진핵의 발현벡터 pcDNA 3.1의 BamHI-HindIII 부위안으로 클로닝하였다. 다음에, 상기에 논의된 플라스미드 150ng, 및 HLA-A2.1을 위한 cDNA 또는 HLA-A1을 위한 cDNA중의 하나를 포함하는 플라스미드 pcDNA 1 Amp 150ng과 세포 샘플을 접촉시킴으로써, COS-7 세포를 이 벡터로 트랜스펙션시켰다. 잘 알려진 DEAE-덱스트란 클로로퀸 방법을 사용하였다. 그리고나서, 세포를 37℃에서 48시간동안 인큐베이션한 다음, CTL 자극 분석에서 시험하였다. 명확하게 말하면, 분석은, 참고에 의하여 연합된 Traversari 등, Immunogenetics 35: 145-148 (1992)를 따랐다. 간단히 말해서, 100% 인간 혈청으로 보충된 100ul RPMI중의 2500 CTL들(NW38-IVS-1, 하기의 실시예 9를 참조하라)과 25U/ml의 재조합 IL-2를, COS-7 트랜스펙션체를 포함한 미세웰에 첨가하였다(20,000 세포/웰). 24시간후에, 50ul의 상청액을 각각의 웰로부터 수집하였고, 표준 분석, 즉 MTT를 이용하여 WEHI 164 클론 13 세포에 대한 세포독성을 시험하는 분석에서 TNF-α 수준을 결정하였다. 양성의 세포들은, 다음에 오는 실시예에서 기술된 웨스턴 블롯 분석에서 사용되었다.

사용된 CTL은, 참고에 의하여 연합된 Knuth 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA81: 3511-3515 (1984)에 따라 제조된 CTL NW38-IVS-1이었다. 명확하게 말하면, 10⁵개의 자기유래의 NW38 MEL-1 종양 세포, 및 피검자로부터 취한 10⁶개의 말초혈 림프구를 조합함으로써 혼합된 T 세포 배양물을 갖추었다. 사이토카인 IL-2를 첨가하였고, 혼합된 배양물을 37℃에서 한주동안 인큐베이션하였다. 종양세포를 제거하였고, 새 분액의 5x10⁴개 종양세포를 IL-2와 함께 첨가하였다.⁵¹Cr 표지된 NW-MEL-38 세포에 대하여 시험될 때 강한 반응이 보이기까지 이 과정을 매주 반복하였다. 응답 T 세포를 수집하였고 그이상의 실험에서 사용할 때까지 냉동시켜두었다.

실시예 8

그리고나서, 상기에서 기술된 혈청 샘플은 물론, 상기에서 기술된 세포주 NW-MEL-38와 상기에서 기술된 COS-7 트랜스펙션체로부터 취한 세포 용해질, 및 상기에서 또한 기술된 정제된 재조합 단백질을 이용하여, 웨스턴 블롯 분석을 수행하였다. 환자의 치료법의 다양한 지점으로부터 혈청 샘플을 취하였다. 결과에는 차이가 없었다.

이 분석에서, 1ug의 재조합 NY-ESO-1 단백질, 또는 둘중 한 유형의 세포 용해질 5ul을 SDS안에서 희석시켰고 5분동안 끓인 다음, 15% SDS 겔상에서 전기영동시켰다. 니트로셀룰로스(0.45um)상에 밤새 블롯팅하고 3% BSA로 봉쇄시킨 후에, 블롯을, 1:1000, 1:10,000, 및 1:100,000 희석된 혈청과 함께 인큐베이션하거나, 또는 양성대조군으로서 1:50으로 희석된 NY-ESO-1에 대한 모노클로날 항체와 함께 인큐베이션하였다. 모노클로날 항체는, 참고에 의하여 연합되고 다음과 같이 상세하게 설명된 Chen, 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 5915-5919 (1996)을 통하여 제조되었다. 2-3주 간격으로 재조합 NY-ESO-1 단백질을 5번 피하주사함으로써 BALB/C 마우스를 면역시켰다. 면역시키는 제제는 애주번트중의 50ug의 재조합 단백질을 포함했다. 최초의 주사는 완전한 프로인트애주번트를 사용하였고 그이후에는 불완전한 프로인트애주번트를 사용하였다. 면역된 마우스로부터 비장세포를 취하고, 그 세포를 마우스 골수종 세포주 SP2/0과 융합시켜 하이브리도마를 생성하였다. 대표적인 하이브리도마 E978을 mAbs의 생성을 위하여 사용하였다.

일단 하이브리도마가 생성되면, 그것을 클로닝하였고, 미세적정량 플레이트상의 표준적인 고체상 ELISA를 이용하여 그것의 상청액을 재조합 단백질에 대하여 스크리닝하였다. 분석은, 참고에 의하여 연합된 Dippold 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77: 6114-6118 (1980)에 따랐다. 재조합 NY-ESO-1을 이용하여, 일련의 음성대조군도 또한 참여시켰다. 상기에서 기술된 대로, E. coli에 의하여 생산된 재조합 단백질에 결합하는 혈청 단백질을, 알칼리성 포스파타제로 표지된 염소 항-인간 IgG을 1:10,000 희석으로 사용하여 가시화시킨 다음, NBT-포스페이트를 이용하여 가시화하였다. 트랜스펙션되지 않은 COS-7세포는 또한 대조군으로서 이용되었다. 건강한 개체로부터의 혈청도 또한 대조군으로서 이용되었다.

재조합 단백질에 대한 강한 반응성은 1:100,000까지 낮춰진 혈청 희석에서 발견되었고, 또한 NW-MEL-38의 용해물에 대한 반응성이 있었다. 트랜스펙션되지 않은 COS-7 세포에 대하여 아무런 반응성도 발견되지 않았고, 건강한 개체로부터의 혈청 또한 반응성을 보이지 않았다.

실시예 9

네가지 다른 형태의 NY-ESO-1이 상기에서 기술되었는데, 즉,E. coli안에서 SEQ ID NO: 1에 의하여 생산된 형태는 물론, 아미노산 10-180으로 구성된 형태, 아미노산 10-121로 구성된 형태, 및 아미노산 10-180으로 구성된 형태로 상기에서 논의된 바큘로바이러스 벡터 시스템안에서 발현되는 형태이다. 각각의 형태는, 상기에 기술된 프로토콜에 따라 ELISA에서 사용되었다. 그 단백질의 모든 형태들은, 다양한 환자로부터 취한 항체는 물론 상기에서 논의된 쥐과의 모노클로날 항체와 동등하게 반응성이 있는 것으로 밝혀졌다.

실시예 10

상기의 COS-7 트랜스펙션체의 시험 및 이 실시예에서 논의되는 분석에 있어서, 세포융해성 T 세포주 "NW38-IVS-1"을 사용하였다. 이 "CTL"은, 상기에 언급된 말초혈 림프구의 생체외 자극을 통하여, 종양 세포주 NW-MEL-38을 이용하여 생성되었다. 이것은 표준 기술을 이용하여 행해졌다.

CTL은, 세포독성 분석에서, NW-MEL-38(HLA-A1, A2 양성이고 NY-ESO-1 양성)과 함께, NY-ESO-1과 HLA-A2 양성(SK-MEL-37과 MZ-MEL-19)이었던 두개의 동종의 세포주(MHC 클래스 I 음성인 세포주(SK-MEL-19), HLA-A2 양성이지만 NY-ESO-1 음성인 세포주(NW-MEL-145))와 함께, 대조 세포주 K562와 자기유래의 식물성혈구응집소 자극된 모세포와 함께 사용되었다. 다양한 효과기/표적 비율이 사용되었고⁵¹Cr 표지된 표적세포의 융해가 측정된 매개변수였다. 도 5는 이것을 보여준다.

결과는, CTL NW38-IVS-1가 자기유래의 세포주 NW MEL-38, 및 HLA-A2와 ESO-1 양성인 동종의 세포주 둘다를 융해시켰다는 것을 나타낸다. 그러므로, CTL은 동종의 물질과 반응성이 있었다. 도 6을 참조하라.

실시예 11

환자 NW38은 HLA-A1과 HLA-A2 양성이기 때문에, 어떤 MHC 분자가 제공분자인지를 결정하기 위하여 실험을 수행하였다.

HLA-A1 cDNA 또는 HLA-A2 cDNA 둘다가 아니라 어느 하나로 형질전환된 공동형질전환체의 별개의 집단을 확보하기 위하여 이 실험에서 주의한 것을 제외하고는, COS-7 세포를 이용한 상기에 기술된 것과 동일한 실험을 수행하였다. 이 결과는, CTL NW38-IVS-1이 NY-ESO-1과 HLA-A2 둘다를 포함하는 COS-7 형질전환체만을 배타적으로 융해시킨다는 것을 보여준다. 도 6을 참조하라. 또한, 실시예 9에서 기술된 NY-ESO-1 음성, HLA-A2 양성인 세포가 HLA-A2 분자에 의하여 제공되는 펩티드로 프로세싱된다고 알려진 다른 분자에 대하여 양성이기 때문에, 이 연구는 CTL의 특이성을 확증하였다.

실시예 12

제공하는 MHC 분자가 HLA-A2로 확인되자, NY-ESO-1을 위한 아미노산 서열의 스크리닝을 수행하여, 참고에 의하여 연합된 D'Amaro 등, Human Immunol. 43: 13-18 (1995), 와 Drijfhout, 등, Human Immunol. 43: 1-12 (1995)에 의하여 보여진 모델을 이용하여 이 모티프를 충족시키는 모든 펩티드들을 확인하였다. 그것에 의하여 추론된 모든 아미노산 서열에 상응하는 펩티드를, 표준 기술을 이용하여 합성하였고, 그리고나서, 참고에 의하여 연합된 Knuth 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81: 3511-3515 (1984)에 따라서 세포독성 분석에 사용하였다. 명확하게 말하면, 세포주 CEMX721.174.T2 (이후로 "T2")를 사용하였는데, 이 세포주가 MHC 복합체를 이룬 펩티드로 항원을 프로세싱하지 않아서 본원에서 기술된 유형의 실험에 이상적이기 때문이다. T2 세포의 샘플을 표준방법을 이용하여 100 uCi의 Na(⁵¹Cr)O₄로 표지한 다음, 세번 세척하였고, 이어서 10ug/ml 펩티드와 2.5ug/ml의 β2-마이크로글로불린과 함께 인큐베이션하였다. 인큐베이션은 한시간동안 실온에서 였다. 그리고나서, 응답세포(CTL NW38-IVS-1의 현탁액 100ul)를, 90:1의 효과기/표적 비율로 첨가하였고, 37℃에서 5% CO₂를 포함한 수분포화된 공기중에서 4시간동안 인큐베이션하였다. 그리고나서, 플레이트를 200xg에서 5분동안 원심분리시키고, 100ul의 상청액을 제거하여 방사성을 측정하였다.⁵¹Cr 방출의 백분율은 알려진 전략에 따라 측정하였다. 펩티드 SLLMWITQCFL (SEQ ID NO: 4), SLLMWITQC (SEQ ID NO: 5), 및 QLSLLMWIT (SEQ ID NO:6)이 CTL의 세개의 가장 훌륭한 자극제임이 밝혀졌다. 상기에서 보여지듯이, NW-MEL-38과 세포주 SK-MEL-37과 MZ-MEL-19를 표적으로서 사용할 때 비교가능한 결과를 발견하였다.

실시예 13

SEQ ID NO: 1에 의하여 코드화되는 단백질의 아미노산 서열을, HLA 결합모티프에 상응하는 펩티드 서열에 대하여 분석하였다. 이것은, 참고에 의하여 연합된Parker 등, J. Immunol. 142: 163 (1994)에 의하여 가르쳐진 알고리즘을 이용하여 행하여졌다. 다음에 오는 표에서, 아미노산 서열, 그것이 아마도 결합하는 HLA 분자, 및 SEQ ID NO: 1에서의 위치가 주어진다. 결과적인 복합체는 세포융해성 T 세포 반응을 불러일으켜야 한다. 이것은, 예를 들어, 참고에 의하여 연합된 van der Bruggen, 등, J. Eur. J. Immunol. 24: 3038-3043 (1994)에 의하여 가르쳐진 방법에 따라서 당업자에 의하여 결정될 수 있을 것이다.

실시예 14

그이상의 실험을 수행하여 추가적인 적절한 펩티드들을 확인하였다. 이 실험에서, 안정한 종양 세포주, 즉 MZ-MEL-19를 사용하였다. 이 세포주는, 참고에 의하여 연합된 Jager, 등, J. Exp. Med 187:265-269 (1998)에 의하여 기술된 방법을 이용하여, MZ19라고 불리는 환자로부터 확립되었다. 상기 Jager 등은 물론, MZ-MEL-19와, 실시예 7에서 보여진 방법을 이용하여, 세포융해성 T 세포주, 즉 MZ2-MEL 19-IVS-1을 또한 확립하였다. 이 CTL은, HLA-A2 제한된 양식으로 자기유래의 종양 세포주를 융해시켰다. 이것은 표준방법을 이용하여 측정되었다. 상기의 D'Amaro, 등에 의하여 보여진 모델은, HLA-A2 결합모티프를 충족시키는 ESO-1안의 모든 서열을 확인하기 위하여 사용되었다. 이 방식으로 26개의 펩티드가 확인되었다. 표준방법에 따라서 모두를 합성하고, 정제하고, 완전에 대하여 시험하였다. 그리고나서, 펩티드를 합성하였고, 다음에 오는 실험들에서 시험하였다. 실시예 12에서 기술된 T2 세포와 함께 MZ19-IVS-1을 사용하였다. HLA 분자에 결합된 SEQ ID NO: ID NOS.: 4와 5의 펩티드가 CTL MZ19-IVS-1에 의하여 인식되었고, 이 CTL은 세포를 융해시켰다. 이 CTL은 또한, HLA-A2와 데카펩티드:

LLMWITQCFL

(SEQ ID NO.: 7)의 복합체를 인식하였고, 이 데카펩티드는 SEQ ID NO.: ID NO.1의 위치 156-167에서 발견된다.

실시예 15

CD4+ 헬퍼 T 세포가 MHC-클래스 Ⅱ 분자와 펩티드의 복합체를 인식하는지를 결정하기 위하여 그이상의 연구가 특정지워진다.

종양 세포주 MZ-MEL-19는 HLA-DR53 양성인 것으로 유형화되었다. 그러므로,NY-ESO-1은, 참고에 의하여 연합된 Futaki, 등, Immunogenetics 42:299-301 (1995)을 사용하여 스크리닝되었는데, 이것은 HLA-DR53을 위한 결합모티프를 가르쳐준다. 이론상 HLA-DR53에 결합할 총 28개의 펩티드와, 항원 제공 세포 단독.

말초혈 림프구("PBLs")가, HLA-DR53 양성으로서 유형화되어 있던 전이성 흑색종을 가진 두명의 환자로부터 분리되었다.

유형화는, 표준적인, 상업적으로 이용가능한 시약들을 이용하여 수행되었다. 한 환자는 HLA-DRB1(대립유전자 1501-05, 1601-1603, 1605 및 0701), HLA DRB^*(대립유전자 (0101-0103), 및 DRB5^*(대립유전자 0101)에 대하여 양성인 것으로 유형화된 한편, 두번째의 환자는 HLA-DRB1^*(대립유전자 1401, 1407, 1408 및 0901), HLA-DRB3^*(대립유전자 0201-0203), 및 DRB4^*(대립유전자 0101-0103)에 대하여 양성인 것으로 유형화되었다. HLA-DRB4^*의 모든 대립유전자는, 참고에 의하여 연합된 Bodmer, 등, Human Immunol 34:4-18 (1992)에 따라서 HLA-DR53이라 불린다.

PBL을 적당한 항체로 코팅된 자기구슬로 처리하여, CD4+와 CD8+ T 림프구를 고갈시켰다. 남아있는 세포를 24웰 플레이트에 4X10⁶개 세포/웰로 접종하였고, 웰의 플라스틱에 고착하도록 24시간동안 두었다. 비-고착 세포를 모두 제거하였고, 남은 세포를 항원 제공세포로 사용하였다. 5ug/ml의 항-감마 인터페론 항체로 4℃에서 밤새 코팅되어있는 96-웰, 편평바닥 니트로셀룰로스 플레이트안에서, GM-CSF(1000U/ml)과, IL-4 (1000U/ml)을 이용하여 5일동안 이 세포들을 자극하였다. 세포는 3.5x10⁵개 세포/웰로 접종되었다.

그리고나서, 이 세포들을 4ug/웰의 시험 펩티드로 펄스하거나, 대조군으로서 2ug/웰의 완전한 NY-ESO-1 단백질로 펄스하였다.

그리고나서, 10% 인간 혈청, L-아스파라긴(50mg/l), L-아르기닌(242mg/l) 및 L-글루타민(300mg/l)로 증강된 RPMI 1640 배지중의 CD4+ T 세포를, 2.5ng/ml의 IL-2와 함께, 100ul의 총 부피까지 (1x10⁵개) 세포/웰로 첨가하였다.

이 혼합물을 수분포화된 공기중에서 48시간동안 37℃에서 인큐베이션하였다. 그후, 0.05% Tween 20/PBS의 용액으로 6번 세포를 세척한 다음, 비오틴화된 항-인터페론 감마 항체를 0.5ug/ml로 첨가하였다. 항체를 2시간동안 37℃에서 인큐베이션한 다음, 플레이트를 표준 시약으로 한시간동안 전개시켰다. 기질 3-에틸-9-아미노 카르바졸을 첨가하고 5분동안 인큐베이션하여, 양성들이 붉은 점으로 나타났다. 붉은 점/웰의 수는, 펩티드와 HLA-DR53, 또는 HLA-DR53와, 재조합 NY-ESO-1으로부터 프로세싱된 펩티드의 복합체를 인식하는 CD4+ T 림프구의 빈도의 표시였다. 대조군으로서, 시약 단독(즉, CD4+ 세포 단독), 및 염색 단독을 이용한 분석을 참여시켰다.

다음의 펩티드는 CD4+ T 림프구를 민감화시켜서 감마 인터페론을 방출하도록 하는 것으로 밝혀졌다.

AADHRQLQLSISSCLQQL

VLLKEFTVSGNILTIRLT

PLPVPGVLLKEFTVSGNI

(SEQ ID NOS.: 8-10)

이 세개의 펩티드들은, 상기 Futaki, 등에 의하여 보여진 HLA-DR53에 결합하기 위한 모티프를 충족시키는데, 이것은 Tyr, Phe, Trp, 또는 Leu의 앵커 잔기와 그에 이은 하류의 Ala 또는 Ser 세개의 잔기이다.

HLA-DR53에 결합하는 추가적인 펩티드가 발견되었다.

이 펩티드들은:

GAASGLNGCCRCGARGPE

SRLLEFYLAMPFATPMEA

TVSGNILTIRLTAADHRQ

(SEQ ID NOS.: 11-13)이다.

앞서말한 실시예들은 식도암연관 항원을 코드화하는 핵산분자의 분리를 기술한다. "연관된"은, 그 적절한 분자가 식도암에 의하여 발현되는 것이 분명하지만, 흑색종, 유방, 전립선 및 폐와 같은 다른 암들도 또한 그 항원을 발현하기 때문에 본원에서 사용된다.

본 발명은, 기술된 대로의 항원을 코드화하고 스트린전트 조건하에서 기준서열 SEQ ID NO: 1에 혼성화하는 핵산분자들에 관한 것이다. 본원에서 사용될 때 "스트린전트 조건"는 미국특허 제5,342,774호에서 특정화된 것과 같은 조건, 즉 65℃에서 18시간동안 혼성화에 이은 2xSSC, 0.1% SDS에서의 네번의 한시간 세척 및0.2xSSC, 보다 바람직하게는 0.1xSSC, 0.1% SDS에서의 30분동안의 마지막 세척은 물론, 동일한 수준의 스트린전시를 초래하는 교호 조건, 및 보다 더 스트린전트 조건을 가리킨다.

또한 본 발명의 일부는 본 발명의 핵산분자를 작동가능한 연결로(즉, "작동가능하게 연결된") 프로모터에 연합시키는 발현벡터이다. 그러한 벡터의 제조는 당업계의 기술의 범위내에 충분히 들고, 관심있는 분자를 코드화하는 진핵 세포주 또는 원핵 세포균주를 생산하기 위한 세포의 형질전환 또는 트랜스펙션도 그러하다. 이 양식에서 사용될 수 있는 숙주세포의 모범은 COS 세포, CHO 세포, 효모세포, 곤충세포(예를 들어,Spodoptera frugiperda), NIH 3T3 세포 등이다.E. coli및 다른 박테리아와 같은 원핵세포도 또한 사용할 수 있을 것이다.

또한, 본발명의 일부는, 원래의 펩티드 형태인 본원에서 기술된 항원들 및 어떤 다른 번역후 변형된 형태이든지인 본원에서 기술된 항원 둘다는 물론, SEQ ID NO: 1에 의하여 코드화되는 단백질의 적어도 아미노산 10-121 그리고 불과 10-180으로 구성된 단백질이다. 분자는 어떤 번역후 변형 없이도 항원성일 정도로 충분히 크고, 그러므로, 그것은 전구체 및 번역후 변형된 형태 둘다로 애주번트와 함께 조합될 때(또는 애주번트 없이) 면역원으로서 유용하다. 이 단백질들은, 상기에서 보여진 바와 같이 혈청이나 혈액과 같은 샘플안에 항체가 있는지의 여부를 결정하기 위하여 사용될 수 있다. 이 항원을 이용하여 생산된 폴리 및 모노클로날 항체 둘다와, 모노클로날 항체를 만드는 하이브리도마도 또한 본발명의 일부이다. 이것들은, 하기에서 논의되는 대로, 전체의 분자로서 또는 부분으로 치료상으로 또는 진단상으로 사용될 수 있다. 또한 본 발명의 일부는, Fab, F(ab)₂' 및 다른 단편과 같은 반응성 단편과, 또한 키메라, 인체에 적응된(humanized) 항체, 재조합적으로 생산된 항체 등이다. 상보성 결정영역 "CDRS"를 제외한 전체 항체가 인간의 것이지만, CDRs가 쥐과의 것인 키메라가 특히 바람직하다.

본개시로부터 분명하듯이, 본발명의 단백질과 핵산분자는 진단상 사용될 수 있을 것이다. 본원에서 논의된 SEREX 방법론은, 병리 연관된 항원에 대한 면역반응을 전제로 한다. 그러므로, 예를 들어, 혈청과 같은 피검자의 체액 샘플을 항원 자체와의 반응성에 대하여 시험함으로써 적절한 병리에 대하여 분석할 수 있을 것이다. 반응성은 병리의 가능한 존재의 표시로 생각될 것이어서, 또한 당업계에 잘 알려지고 본원에서 면밀히 검토될 필요가 없는 표준적인 핵산 혼성화 분석중 어떤 것이든을 통해서 항원의 발현에 대하여 분석될 수 있을 것이다. 또한, 표준적인 면역분석을 이용하여 주제 분자에 대한 항체에 대하여 분석할 수 있을 것이다.

SEQ ID NO: 1의 분석은, 그안에 5' 및 3' 비-코딩 영역이 있다는 것을 보여줄 것이다. 본 발명은, 적어도 코딩분절, 즉 뉴클레오티드 54-593을 포함하고, SEQ ID NO: 1의 뉴클레오티드 1-53 및/또는 594-747중의 어느하나 또는 모두를 포함할 수 있을 분리된 핵산분자에 관한 것이다.

상기에서 논의된 대로, 그이상의 연구는, 그 분자가 세포융해성 T 세포에 의한 융해를 불러일으키는 펩티드로 프로세싱된다는 것을 드러낸다. 실시예 7은 HLA-A2 분자를 위하여 어떻게 이 유형의 모티프 분석이 수행될 수 있는지를 보여주었다. 다양한 MHC 또는 HLA 분자를 위한 모티프에 있어서 많은 연구가 행해졌고, 이것은 여기에 적용가능하다. 그러므로, 본발명의 추가적인 양태는 진단상의 방법이고, 이때 환자의 종양세포의 표면상의 HLA 분자에 결합하는 하나이상의 펩티드가, 그 펩티드가 MHC/HLA 분자에 결합하고 T 세포에 의한 융해를 불러일으키기에 충분한 양으로 환자에게 투여된다. HLA-A2를 위하여 상기에서 주어진 예증은, 사용될 수 있는 이 투여의 유일한 유형이 결코 아니다. 상기에서 기술된 다른 HLA 분자를 위한 것들과 같은, 펩티드들의 어떤 조합이라도 사용될 수 있을 것이다. 전체의 단백질 또는 그것의 면역반응성 부분은 물론, 단독으로 또는 조합하여 사용될 수 있을 이 펩티드들이, 정맥내, 피내, 피하, 경구, 직장 및 경피적 투여와 같은 표준적인 투여 유형중 어떤 것을 사용해서든 그것을 필요로 하는 피검자에게 투여될 수 있을 것이다. 표준적인 약제학적 담체, 사포닌, GM-CSF, 및 인터루킨과 같은 애주번트 등이 또한 사용될 수 있을 것이다. 추가적으로, 이 펩티드와 단백질들은 열거된 물질과 함께 백신으로 제형될 수 있을 것이고, 수상세포 또는 적절한 MHC/펩티드 복합체를 제공하는 다른 세포도 그럴 수 있을 것이다. 이 펩티드들은 또한, 참고에 의하여 연합된 Dunbar, 등, Curr. Biol. 8: 413-416 (1998)에 의하여 기술된 것들과 같은 HLA/펩티드들의 멀티머 복합체를 형성하기 위하여 사용될 수 있을 것인데, 이때 네개의 펩티드/MHC/비오틴 복합체가 스트렙타비딘이나 아비딘 분자에 부착된다. 그러한 복합체는, T 세포 전구체를 확인하고/거나 자극하기 위하여 사용될 수 있다.

유사하게, 본발명은 치료법을 숙려하는데, 이 치료법에서, NY-ESO-1을 코드화하는 핵산분자가 아데노바이러스 기초한 벡터와 같은 벡터안으로 연합되어서, 인간세포와 같은 진핵세포안으로 트랜스펙션되게 된다. 유사하게, 그 펩티드의 하나이상을 코드화하는 핵산분자는 이 벡터들로 연합될 수 있을 것이고, 이것은 핵산 기초한 치료법의 주요한 구성요소이다.

이 분석중 어느 것이라도 진행/회귀 연구에서 또한 이용될 수 있다. 상기에저 보여진 방법들중 어느 것 또는 모두를 이용하여, 단백질, 그것의 발현 등의 수준을 모니터함으로써 단순히 NY-ESO-1의 발현을 수반하는 비정상성의 과정이 모니터될 수 있다.

이 방법론이 진단상 제도의 효능을 추적하기 위해서도 사용될 수 있을 것이 분명해야 한다. 본질적으로, 상기에서 논의된 어떤 분석이라도 이용하여 NY-ESO-1 단백질을 위한 기준치를 잡고, 주어진 치료제를 투여한 다음, 이후로 단백질의 수준을 모니터하여, 그 제도의 효능의 표시로서 ESO-1 수준에 있어서의 변화를 관찰할 수 있다.

상기에서 보여지듯이, 본발명은 그중에서도 NY-ESO 분자에 대한 "통합된" 면역반응의 인식을 수반한다. 이것의 하나의 분지는 암 치료법의 과정을 모니터하는 능력이다. 본발명의 일부인 이 방법에서, 그 치료법을 필요로하는 피검자는 본원에 기술된 유형의 백신접종을 받는다. 그런 백신접종의 결과, 세포상에 HLA/펩티드 복합체를 제공하는 세포에 대한 T 세포 반응이 생긴다. 반응은 또한, 아마도 T 세포에 의한 융해를 통한 항체자극 단백질 방출의 결과인 항체반응을 포함한다. 그러므로, 항체반응을 모니터함으로써 백신의 효과를 모니터할 수 있다. 상기에서 보여지듯이, 항체 역가 또는 T 세포수에 있어서의 증가는 백신에 의한 진행의 표시로서 취해질 수 있을 것이고, 역의 관계도 성립할 것이다. 그러므로, 본발명의 추가적인 양태는, 백신 그자체 또는 백신이 그 일부인 큰 분자에 특이적인 피검자안에서의 항체의 수준을 측정함으로써 그것의 투여에 이어서 백신의 효능을 모니터하는 방법이다.

백신의 효과는, 백신을 받은 피검자의 T 세포-반응을 모니터함으로써도 또한 측정될 수 있다. 이 생체외에서 자극된 T 세포의 전구체 빈도를 측정하기 위하여 많은 분석들을 사용할 수 있다. 이것들은, 크롬 방출분석, TNF 방출분석, IFNγ 방출분석, ELISPOT 분석 등을 포함하지만, 그것에 한정되지는 않는다. 전구체 T 세포 빈도에 있어서의 변화는 측정될 수 있고 백신의 효능에 연관될 수 있다. 사용될 수 있는 추가적인 방법은 MHC/펩티드의 멀티머 복합체의 사용을 포함한다. 그러한 복합체의 예는, 참고에 의하여 연합된 Dunbar, 등 Curr. Biol. 8: 413-416 (1998)의 테트라머 HLA/펩티드-비오틴-스트렙타비딘 시스템이다.

암과 같은 병리적인 질환에 연관되는 것으로서의 NY-ESO-1 단백질의 확인은 또한, 상기에 논의된 치료상 접근방법에 부가하여 많은 치료상 접근방법들을 제안한다. 상기에서 보여진 실험들은, 항체가 단백질의 발현에 반응하여 생산된다는 것을 확립한다. 그러므로, 본발명의 추가적인 구체예는, 인체에 적응된 항체, 항체 단편 등과 같은 항체의 투여를 통하여 NY-ESO-1 단백질의 이상하거나 비정상적인 수준을 특징으로 하는 질환을 치료하는 것이다. 이것들은 적당한 시스토스테이틱 시약(cystostatic reagent) 또는 세포독성제를 이용하여 태깅되거나 표지될 수 있을 것이다.

T 세포 또한 투여될 수 있을 것이다. T 세포는, 수상세포, 림프구 또는 다른 면역 반응성 세포와 같은 면역 반응성 세포를 이용하여 생체외에서 유도된 다음 치료되고 있는 피검자안으로 재관류(reperfused)될 수 있을 것임을 주목해야 한다.

T 세포 및/또는 항체의 생성이 세포, 바람직하게는 비-증식성으로 처리된 세포를 투여함으로써도 달성될 수 있고, 이 세포는 상기에서 논의된 에피토프와 같은, 반응을 위한 적절한 T 세포 또는 B 세포 에피토프를 제공한다는 것을 주목하라.

치료상 접근방법은 또한 안티센스 치료법을 포함할 수 있을 것인데, 이 치료법에서, 바람직하게는 길이가 10 내지 100 뉴클레오티드인 안티센스 분자가 "순수하게(neat)" 또는 세포안으로의 연합을 용이하게 하기 위해 리포솜과 같은 담체안에서 피검자로 투여되어, 이어서 그 단백질의 발현을 억제한다. 그러한 안티센스 서열은 또한, 예를 들어 바이러스 벡터(예를 들어, Vaccinia), 공지의 BCG 백신의 변이체와 같은 박테리아 구조물 등안에서 적당한 백신안으로 연합될 수 있을 것이다.

또한, 본발명의 일부는, 중심 서열:

LLMWIT (SEQ ID NO: 14)

을 가지는 것으로 정의된 노나머, 데카머, 또는 언데카머일 수 있는 펩티드인데, 이것들은 최초의 L 잔기에 말단인 적어도 하나의 추가적인 잔기, 바람직하게는 세린을 가지고 (많게는 세개를 가질 수 있을 것인데, 이때 세린은 L에 연결되어 -SL-을 형성하고), C-말단에 0-4개의 추가적인 아미노산을 가지는데, 이것들은 상기에서 보여진대로 HLA-A2 분자에 결합하여 CTL 반응을 불러일으킨다. 이 펩티드는, 진단상으로, 즉 HLA-A2 양성인 세포가 존재하는지 또는 적절한 CTL이 존재하는지 등을 측정하는 것은 물론, HLA-A2 양성이고 병리와 연결하여 NY-ESO-1을 발현하는 환자에게 투여함으로써, 치료상으로 사용될 수 있을 것이다.

HLA-A2 분자가 MHC 클래스 I 분자이고, 펩티드와 클래스 I 분자의 복합체에 반응하는 T 세포는 일반적으로 CD8⁺세포이다. T 세포의 또하나의 하위세트, CD4+ 세포은 MHC-클래스 Ⅱ 분자와 펩티드의 복합체에 반응하고, 자기유래의 배양된 수상세포에 의하여 제공된 재조합 NY-ESO-1에 대한 MHC-클래스 Ⅱ 제한된 CD4⁺T 세포 반응이 흑색종 환자에서 탐지되어 왔다. 명확하게 말하면, 본원에 기술되지 않은 결과에서, 잘 알려진 기술을 이용하여, CD4⁺세포를 PBLs 또는 혈청 샘플로부터의 다른 세포로부터 분별하였다. 그리고나서, CD4⁺세포를, NY-ESO-1 단백질로 펄스된 수상세포와 혼합하였다. CD4⁺세포의 증식을 관찰하여 본원에서 논의된 통합된 면역반응에 또하나의 면을 제기하였다. 그로므로, 이 발명의 그이상의 양태는 이 CD4⁺T 세포, MHC-클래스 Ⅱ 분자에 결합하는 펩티드, 및 치료법에서의 그것들의 사용이다.

SEQ ID NO: ID NO.: 14의 중심서열에 의하여 정의된 펩티드의 모범은 SEQ IDNO: ID NO.: 7에 의하여 정의된 펩티드이다. 지적되었듯이, 이 펩티드는 HLA-A2 분자들에 결합한다. 그러므로, 상기에서 기술되었듯이, 이 펩티드는 HLA-A2를 위한 "마커"이고, 또한 CTL의 증식을 자극하는 펩티드/MHC 복합체의 성분이다. 실시예들이 지적하듯이, ESO-1은 또한, MHC 클래스 Ⅱ 분자, 특히 HLA-DR53에 복합체를 이루는 펩티드로 프로세싱된다. 이 분자들은 상기의 Futaki, 등에 의하여 기술된 모티프, 즉, Tyr, Phe, Trp, 또는 Leu, 이어서 3개의 아미노산, 다음에 Ala 또는 Ser을 충족시킨다. 그러한 펩티드는 길이가 적어도 18개 아미노산이어야 하고, 바람직하게는 불과 25개 아미노산 길이이다. 바람직하게는, 그것들은, SEQ ID NOS.:8, 9, 10, 11, 12, 및 13과 같이 18개의 아미노산으로 구성된다. 이 펩티드들은 HLA-DR53 양성 세포를 확인하는데 이바지한다. 더욱이, SEQ ID NOS.: 8, 9 및 10과 같은 펩티드의 경우에, 이것들은, 실시예들이 보여주듯이 헬퍼 T 세포의 증식을 불러일으키기 위하여 사용될 수 있다. MHC 클래스 I 제한된 펩티드를 위하여 상기에 주어진 모든 적용은 이 MHC 클래스 Ⅱ 제한된 펩티드에 적용가능하다. 추가적으로, 면역반응의 성질은, MHC-클래스 Ⅱ/펩티드 복합체에 비교하여 MHC-클래스 I/펩티드 복합체에 있어서 다르기 때문에, 면역조성물에서와 같이 펩티드의 두 유형 다를 조합하여 조합된 면역반응을 생성시킬 수 있을 것이다. 그러므로, 기술된 모든 적용은, 클래스 I 제한된 펩티드만과 함께, 클래스 Ⅱ 제한된 펩티드만과 함께, 또는 이것들의 조합과 함께 사용될 수 있다.

본발명의 다른 특질과 적용은 당업자에게는 자명할 것이고 본원에서 보여질 필요가 없다.

사용된 용어와 표현은 설명의 용어이지 한정의 용어가 아니고, 그러한 용어와 표현을 사용하는데 있어서 보여지거나 기술된 특질의 어떤 등가물 또는 그것의 부분도 배제하려는 의도가 없으며, 다양한 변형이 본발명의 범위내에서 가능하다는 것이 인정된다.

Claims

MHC-클래스 Ⅱ HLA-DR53 분자에 결합하는 분리된 폴리펩티드로, 18개 이상 이고 25개 이하의 아미노산으로 구성되고, 적어도 하나의 HLA-DR53 결합모티프를 가지고, 상기 모티프는 네개의 아미노산으로 구성되고, 이때 첫번째 아미노산은 Tyr, Phe, Trp 또는 Leu이고 네번째 아미노산이 Ala 또는 Ser인 것을 특징으로 하는 분리된 폴리펩티드.
제 1 항에 있어서, 상기 펩티드가, 상기 펩티드와 HLA-DR53 분자의 복합체에 특이적인 CD4⁺세포의 인식과 증식을 자극하는 것을 특징으로 하는 분리된 펩티드.
제 1 항에 있어서, 18개의 아미노산으로 구성되는 것을 특징으로 하는 분리된 펩티드.
제 1 항에 있어서, SEQ IN NOS.: 8, 9, 10, 11, 12, 및 13으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 분리된 펩티드.
제 4 항에 있어서, SEQ ID NOS.: 8, 9, 및 10으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 분리된 펩티드.
MHC 클래스 Ⅱ 분자 HLA-DR53과 SEQ ID NOS.: 8, 9, 또는 10의 복합체에 특이적인 분리된 세포융해성 T 세포.
MHC 클래스 Ⅱ 분자 HLA-DR53과 제 1 항의 폴리펩티드의 분리된 복합체.
제 6 항에 있어서, 상기 펩티드가 SEQ ID NOS.: 8, 9, 10, 11, 12, 또는 13인 것을 특징으로 하는 분리된 복합체.
제 1 항의 분리된 폴리펩티드와 적어도 하나의 애주번트로 이루어지는 조성물.
제 9 항에 있어서, 상기 폴리펩티드가 SEQ ID NOS.: 8, 9, 또는 10인 것을 특징으로 하는 조성물.
제 1 항의 분리된 폴리펩티드를 코드화하는 뉴클레오티드 서열로 구성되는 분리된 핵산분자.
제 11 항에 있어서, 상기 분리된 폴리펩티드가 SEQ ID NOS.: 8, 9, 10, 11, 12 또는 13인 것을 특징으로 하는 분리된 핵산분자.
프로모터에 작동가능하게 연결된, 제 11 항의 분리된 핵산분자를 포함하는 발현벡터.
SEQ ID NOS.: 8, 9 및 10에 의하여 정의된 폴리펩티드 중 적어도 두개의 혼합물로 이루어지는 조성물.
제 14 항에 있어서, 애주번트를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 조성물.
(i) 제 1 항의 분리된 펩티드를 코드화하는 분리된 핵산분자, 및

(ii) HCA-DR53 분자를 코드화하는 분리된 핵산분자

각각의 별개의 부분으로 이루어지는 발현키트.
제 11 항의 분리된 핵산분자를 포함하는 재조합 세포.
제 13 항의 발현벡터를 포함하는 재조합 세포.
헬퍼 T 세포의 증식을 자극하는 방법으로서, T 세포 포함 샘플을, MHC-클래스 Ⅱ 분자 HLA-DR53과 제 5 항의 펩티드의 복합체와, 상기 복합체를 인식하는 헬퍼 T 세포의 증식을 자극하기에 충분한 양으로 접촉시키는 것으로 이루어지는 것을특징으로 하는 방법.
제 19 항에 있어서, 상기 복합체가 세포의 표면상에 있는 것을 특징으로 하는 방법.
제 20 항에 있어서, 상기 세포가 상기 세포가 투여되는 피검자의 자기유래인 것을 특징으로 하는 방법.
제 20 항에 있어서, 상기 세포가 비-증식성인 것을 특징으로 하는 방법.
제 20 항에 있어서, 상기 세포가 재조합 세포인 것을 특징으로 하는 방법.
제 19 항에 있어서, 상기 복합체가 유리형태인 것을 특징으로 하는 방법.
헬퍼 T 세포의 증식을 자극하는 방법으로서, 제 5 항의 적어도 하나의 펩티드의 양을, HLA-DR53 양성인 피검자에게, 상기 펩티드와 HLA-DR53의 충분한 복합체를 형성하여 거기에 특이적인 헬퍼 T 세포의 증식을 자극하기에 충분한 양으로 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
제 25 항에 있어서, 상기 적어도 하나의 펩티드를 국소 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
제 25 항에 있어서, 상기 적어도 하나의 펩티드를, 적어도 하나의 애주번트를 포함하는 조성물의 형태로 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
피검자에서 헬퍼 T 세포의 증식을 자극하는 방법으로서, 아미노산 서열이 SEQ ID NOS: 8, 9, 또는 10중 적어도 하나로 이루어지는 폴리펩티드 또는 단백질의 양을, 피검자에게, 상기 피검자의 MHC 클래스 Ⅱ 분자에 의하여 제공되는 적어도 하나의 펩티드로 프로세싱되기에 충분한 양으로, MHC 클래스 Ⅱ 분자와 상기 적어도 하나의 펩티드의 복합체의 충분한 수를 형성하여 상기 복합체에 특이적인 헬퍼 T 세포의 증식을 자극하기에 충분한 양으로, 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
제 28 항에 있어서, 상기 피검자가 HLA-DR53 양성인 것을 특징으로 하는 방법.
제 28 항에 있어서, 상기 단백질이 SEQ ID NO.: 1에 의하여 코드화되는 단백질인 것을 특징으로 하는 방법.
제 28 항에 있어서, 상기 폴리펩티드가 SEQ ID NOS.: 8, 9, 또는 10의 다수의 복사체로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
피검자에서 헬퍼 T 세포의 증식을 자극하는 방법으로서, 상기 암질환을 완화시키기에 충분한, (i)NY-ESO-1을 코드하는 핵산서열과 (ii)NY-ESO-1로부터 유도된 펩티드를 제공하는 MHC 클래스 Ⅱ 분자을 코드하는 핵산서열로 트랜스펙션된 세포의 양을, 상기 피검자에게 투여하는 것으로 이루어지고, 상기 펩티드가 상기 암질환과 연관된 세포에 의하여 제공되는 것을 특징으로 하는 방법.
제 32 항에 있어서, 상기 세포를 비-증식성이 되도록 처리하는 것을 더 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
피검자에서 헬퍼 T 세포의 증식을 자극하는 방법으로서, MHC-클래스 Ⅱ 분자와, ESO-1으로부터 유도된 펩티드의 비-공유 복합체을 표면상에 발현하고 있는 비-증식성 세포로 본질적으로 구성되는 시약의 양을 상기 피검자에게 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
암질환에 걸린 피검자를 치료하는 방법으로서, 상기 질환과 연관된 암성세포상에 발현된 ESO-1 유도된 펩티드에 특이적으로 결합하는 항체를, 상기 암질환을 치료하기에 충분한 양으로 상기 피검자에게 투여하는 것으로 이루어지고, 상기 항체가 항암제에 결합되어 있는 것을 특징으로 하는 방법.
피검자에서 암질환의 발병을 예방하는 방법으로서, 제 9 항의 조성물의 양을, 상기 피검자에서 상기 암질환의 발병을 예방하기에 충분한 양으로 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
피검자에서 암질환의 발병을 예방하는 방법으로서, 제 10 항의 조성물의 양을, 상기 피검자에서 상기 암질환의 발병을 예방하기에 충분한 양으로 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
피검자에서 암질환의 발병을 예방하는 방법으로서, 제 14 항의 조성물의 양을, 상기 피검자에서 상기 암질환의 발병을 예방하기에 충분한 양으로 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
피검자에서 암질환의 발병을 예방하는 방법으로서, 제 13 항의 발현벡터의 양을, 상기 피검자에서 상기 암질환의 발병을 예방하기에 충분한 양으로 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
피검자에서 암질환의 발병을 예방하는 방법으로서, 제 15 항의 조성물의 양을, 상기 피검자에서 상기 암질환의 발병을 예방하기에 충분한 양으로 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
피검자에서 암질환의 발병을 예방하는 방법으로서, 제 17 항의 재조합 세포의 양을, 상기 피검자에서 상기 암질환의 발병을 예방하기에 충분한 양으로 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
피검자에서 암을 스크리닝하는 방법으로, 상기 피검자로부터 취한 샘플을 (i)MHC-클래스 Ⅱ 분자와, SEQ ID NO.: 1에 의하여 코드화되는 단백질로부터 유도된 펩티드의 복합체, 또는 (ii)상기 복합체에 특이적인 T 헬퍼 세포에 대하여 분석하는 것으로 이루어지고, (i) 또는 (ii)의 존재가 상기 피검자에서 암의 가능성의 표시인 것을 특징으로 하는 방법.
제 42 항에 있어서, 상기 펩티드가 SEQ ID NOS.: 8, 9, 또는 10에 의하여 정의된 펩티드인 것을 특징으로 하는 방법.
피검자에서 암질환을 진단하는 방법으로서, 제 1 항의 폴리펩티드를 코드화하는 분리된 핵산분자로 트랜스펙션된 세포주에, 상기 피검자의 면역반응성 세포 함유 샘플을 접촉시키는 단계와, 상기 트랜스펙션된 세포주의 상기 면역반응성 세포와의 상호작용을 측정하는 단계로 이루어지고, 상기 상호작용이 상기 암질환의 표시인 것을 특징으로 하는 방법.
제 44 항에 있어서, 상기 면역반응성 세포가 헬퍼 T 세포인 것을 특징으로 하는 방법.
제 44 항에 있어서, 상기 폴리펩티드가 SEQ ID NOS.: 8, 9, 또는 10에 의하여 정의되는 것을 특징으로 하는 방법.
암질환의 진행, 회귀 또는 발병을 결정하는 방법으로서, 상기 암질환을 가진 환자로부터의 샘플을, (i)NY-ESO-1 단백질로부터 유도된 펩티드와 MHC-클래스 Ⅱ 분자와 복합체, 및 (ii)복합체에 특이적인 헬퍼 T 세포로 구성된 군으로부터 선택된 매개변수에 대하여 모니터하는 것으로 이루어지고, 상기 매개변수의 양이 상기 암질환의 진행 또는 회귀 또는 발병의 표시인 것을 특징으로 하는 방법.
제 47 항에 있어서, 상기 샘플이 체액 또는 삼출물인 것을 특징으로 하는 방법.
제 47 항에 있어서, 상기 샘플이 조직인 것을 특징으로 하는 방법.
제 47 항에 있어서, 상기 샘플을, 상기 복합체와 특이적으로 결합하는 항체와 접촉시키는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
제 50 항에 있어서, 상기 항체가 방사성 표지 또는 효소로 표지되는 것을 특징으로 하는 방법.
제 50 항에 있어서, 상기 항체가 모노클로날 항체인 것을 특징으로 하는 방법.
암질환을 진단하는 방법으로서, 피검자로부터 취한 샘플을, MHC-클래스 Ⅱ 분자에 복합체 형성된, NY-ESO-1으로부터 유도된 펩티드에 특이적인 세포에 대하여 분석하는 것으로 이루어지고, 상기 면역반응성 세포의 존재가 상기 암질환의 표시인 것을 특징으로 하는 방법.
제 53 항에 있어서, 상기 면역반응성 세포가 헬퍼 T 세포인 것을 특징으로 하는 방법.
SEQ ID NO.: 7의 아미노산 서열의 아미노산 서열로 구성되는 분리된 펩티드.
제 55 항의 분리된 펩티드와 애주번트로 이루어지는 조성물.
제 55 항의 분리된 펩티드와, SEQ ID NO.: 1에 의하여 코드화되는 단백질에서 발견되고 MHC 분자와 복합체를 형성하는 아미노산 서열을 가진 적어도 하나의 다른 펩티드로 이루어지는 조성물.
제 57 항에 있어서, 상기 MHC 분자가 클래스 I 분자인 것을 특징으로 하는 조성물.
제 57 항에 있어서, 상기 MHC 분자가 클래스 Ⅱ 분자인 것을 특징으로 하는 조성물.
제 57 항에 있어서, 상기 적어도 하나의 다른 펩티드가 SEQ ID NOS.: 4, 5, 6, 8, 9, 또는 10에 의하여 정의된 펩티드인 것을 특징으로 하는 조성물.
제 55 항의 분리된 펩티드를 코드화하는 뉴클레오티드 서열로 구성되는 분리된 핵산분자.
프로모터에 작동가능하게 연결된, 제 61 항의 분리된 핵산분자를 포함하는 발현벡터.
제 55 항의 분리된 펩티드와 HLA-A2 분자의 복합체.
제 61 항의 분리된 핵산분자를 포함하는 재조합 세포.
제 62 항의 발현벡터를 포함하는 재조합 세포.
제 63 항의 복합체를 표면상에 발현하는 비-증식성 세포.
제 66 항의 비-증식성 세포와 애주번트로 이루어지는 조성물.
세포융해성 T 세포 증식을 자극하는 방법으로서, 제 55 항의 펩티드와 HLA-A2 분자의 복합체에 특이적인 세포융해성 T 세포를, 상기 세포융해성 T 세포의 증식을 자극하기에 충분한 양으로 접촉시키는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
제 68 항에 있어서, 상기 복합체가 조성물의 형태로 투여되는 것을 특징으로 하는 방법.
제 68 항에 있어서, 상기 복합체를 표면상에 제공하는 비-증식성 세포의 형태로 상기 복합체를 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
세포융해성 T 세포의 증식을 자극하는 방법으로서, 상기 펩티드와 HLA-A2 분자의 복합체의 충분한 수를 생산하여 세포융해성 T 세포 증식을 불러일으키기에 충분한 양의 제 55 항의 펩티드를 HLA-A2 양성 세포에 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
제 71 항에 있어서, 애주번트를 더 포함하는 조성물중의 상기 펩티드를 투여하는 것으로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
제 71 항에 있어서, 상기 조성물이 적어도 하나의 추가적인 펩티드를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
상보적인 서열이 SEQ ID NO: 1의 뉴클레오티드 54-593으로 이루어지는 핵산분자에 스트린전트 조건하에서 혼성화하는 분리된 핵산분자에 의하여 코드화되는 단백질과 결합하는 분리된 항체 또는 항체의 결합단편.
제 74 항에 있어서, 상기 항체가 모노클로날 항체인 것을 특징으로 하는 분리된 항체.
제 74 항에 있어서, 상기 항체가 키메라 항체인 것을 특징으로 하는 분리된 항체.
제 76 항에 있어서, 상기 키메라 항체가 쥐과의 CDR 영역을 가진 인체에 적응된 항체로 이루어지는 것을 특징으로 하는 분리된 항체.
제 75 항의 모노클로날 항체를 생산하는 하이브리도마 세포주.
샘플에서 암을 스크리닝하는 방법으로서, 상기 샘플을 제 74 항의 분리된 항체와 접촉시키는 단계와, 암의 표지로서 표적에 대한 상기 항체의 결합을 측정하는 단계로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
제 79 항에 있어서, 상기 암이 흑색종, 유방암, 전립선암, 폐암, 간암, 난소암, 갑상선암, 방광암, 또는 림프종인 것을 특징으로 하는 방법.
샘플에서 암연관 항원에 대한 항체의 존재를 측정하는 방법으로서, 상기 샘플을, SEQ ID NO: 1의 뉴클레오티드 54-593으로 이루어지는 핵산분자에 의하여 코드화되는 분리된 단백질과 접촉시키는 단계와, 상기 샘플안에 있는 암연관 항원에 대한 항체의 측정으로서 거기에 대한 항체의 결합을 측정하는 단계로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.
암질환의 회귀, 진행 또는 발병을 측정하는 방법으로서, 상기 암질환을 가진 환자로부터의 샘플을, (i)NY-ESO-1 단백질, 및 (ii)NY-ESO-1 단백질로부터 유도된펩티드로 구성된 군으로부터 선택된 매개변수에 대하여, (i) 또는 (ii)에 결합하는 항체를 이용하여 모니터하는 것으로 이루어지고, 상기 매개변수의 양은 상기 암질환의 진행 또는 회귀 또는 발병의 표시인 것을 특징으로 하는 방법.
제 82 항에 있어서, 상기 샘플이 체액 또는 삼출물인 것을 특징으로 하는 방법.
제 82 항에 있어서, 상기 샘플이 조직인 것을 특징으로 하는 방법.
제 84 항에 있어서, 상기 항체가 방사성 표지 또는 효소로 표지되는 것을 특징으로 하는 방법.
제 84 항에 있어서, 상기 항체가 모노클로날 항체인 것을 특징으로 하는 방법.
암질환에 걸린 피검자를 치료하는 방법으로서, NY-ESO-1 단백질에, 또는 상기 암질환과 연관된 암성세포상에서 발현되는 ESO-1 유도된 펩티드에 특이적으로 결합하는 항체를, 상기 암질환을 치료하기에 충분한 양으로 상기 피검자에게 투여하는 것으로 이루어지고, 상기 항체가 항암제에 결합되어 있는 것을 특징으로 하는 방법.
암질환에 걸린 피검자를 치료하는 방법으로서, 상기 피검자에게, NY-ESO-1에 특이적으로 결합하는 항체를, 상기 암질환을 치료하기에 충분한 양으로 투여하는 것으로 이루어지고, 상기 항체가 항암제에 결합되어 있는 것을 특징으로 하는 방법.
SEQ ID NO: 1에서 보여지는 뉴클레오티드 서열을 가지는 분리된 핵산분자에 의하여 코드화되는 단백질의 적어도 아미노산 10-121 이상이고 아미노산 10-180 이하로 이루어지는 분리된 단백질.
제 89 항에 있어서, 아미노산 10-121로 구성되는 것을 특징으로 하는 분리된 단백질.
제 89 항에 있어서, 아미노산 10-180으로 구성되는 것을 특징으로 하는 분리된 단백질.
제 89 항에 있어서, 상기 단백질이 글리코실화되어 있는 것을 특징으로 하는 분리된 단백질.
제 89 항의 분리된 단백질과 담체로 이루어지는 면역원성 조성물.
샘플에서 암연관 항원에 대한 항체의 존재를 측정하는 방법으로서, 상기 샘플을 제 89 항의 분리된 단백질과 접촉시키는 단계와, 상기 샘플안에 있는 암연관 항원에 대한 항체의 측정으로서 상기 단백질에 대한 결합을 측정하는 단계로 이루어지는 것을 특징으로 하는 방법.