KR102614472B1 - 암 요법에 사용하기 위한 세마포린-4d 길항제 - Google Patents

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Abstract

본 개시 내용은 치료 전에 특정 환자 바이오마커 수준을 결정하는 단계를 포함하는 암 치료 방법에 관한 것이다.

Description

암 요법에 사용하기 위한 세마포린-4D 길항제
CD100으로도 알려진 세마포린 4D(SEMA4D)는 세마포린 유전자 패밀리에 속하는 막 횡단 단백질이다. SEMA4D는 세포 표면에 동종이량체로서 발현되지만, 세포 활성화 시 SEMA4D는 단백질 분해 절단을 통해 세포 표면으로부터 방출되어 단백질의 가용성 형태인 sSEMA4D를 생성할 수 있으며, 이는 또한 생물학적으로 활성적이다. 문헌[Suzuki et al., Nature Rev. Immunol. 3:159-167 (2003); Kikutani et al., Nature Immunol. 9:17-23 (2008)]을 참조한다.
SEMA4D는 비장, 흉선, 및 림프절을 포함하는 림프 기관에서와 뇌, 심장, 및 신장과 같은 비림프 기관에서 높은 수준으로 발현된다. 림프 기관에서, SEMA4D는 휴지 T 세포 상에 풍부하게 발현되지만 휴지 B 세포 및 항원 제시 세포(APC: antigen-presenting cell), 예컨대 수지상 세포(DC: dendritic cell) 상에는 약하게만 발현된다. 그러나 그 발현은 다양한 면역학적 자극에 의한 활성화 후 이들 세포에서 상향 조절된다. 면역 세포로부터 가용성 SEMA4D의 방출은 또한 세포 활성화에 의해 증가된다. SEMA4D는 특정 암의 발병과 관련되었다(Ch'ng et al., Cancer 110:164-72 (2007); Campos et al., Oncology Letters, 5:1527-35 (2013); Kato et al., Cancer Sci. 102:2029-37 (2011)).
본 발명자들은 이전에 항-SEMA4D 길항제 단클론 항체 VX15/2503(페피네맙)이 단독으로(예를 들어, 미국 특허 제9,605,055호 참조) 또는 체크포인트 차단제를 포함하는 다양한 다른 암 면역요법 치료와 조합하여(예를 들어, 미국 특허 제9,243,068호 참조) 다양한 암을 치료하는 데 효과적이라고 보고하였다. 이러한 결과는 임상으로 확장되었다. 예를 들어, 문헌[Patnaik, A., et al. Clin . Cancer Res. 22:827-836 (2016)]을 참조한다. 더욱이, 본 발명자들은 암을 가진 대상체가 치료 전에 T 세포, 예를 들어 CD8+ T 세포, B 세포, 또는 T 세포와 B 세포 모두의 수준이 상승했을 때 다른 암 환자에 비해 더 잘 지내는 경향이 있음을 보였다(예를 들어, 미국 특허 제9,243,068호 참조).
골수 유래 억제 세포(MDSC: myeloid-derived suppressor cell)는 종양 촉진 및/또는 면역억제 활성을 갖는 골수 기원 세포의 이종 그룹이다. 문헌[Lang, S., et al. Clin . Cancer Res. 24:4834-4844 (2018)]을 참조한다. 다양한 집단의 인간 MDSC은 서로 다른 표면 마커를 특징으로 한다. 예를 들어, 순환하는 다형핵 MDSC(PMN-MDSC; polymorphonuclear MDSC)는 CD15 및/또는 CD66b를 발현하고, 단핵구 마커 CD14가 없으며, CD33에 대해 양성이다. 단핵구 MDSC(M-MDSC: monocytic MDSC)는 전형적으로 PMN-MDSC에 비해 더 높은 수준의 CD33을 발현하고, CD14+이며, HLA-DR 수준이 낮거나 심지어 부재할 수도 있다. 동일 문헌. MDSC는 또한 다른 세포 계통의 전형적인 마커의 부재를 특징으로 할 수 있으며, 예를 들어 이들은 마커 CD3, CD19, 및/또는 CD56의 부재를 특징으로 할 수 있다. 예를 들어, 문헌[Gabrilovich et al. Cancer Immunol Res. 5:3-8 (2017)]을 참조한다.
단독 또는 다른 면역 치료제와 조합된 페피네맙에 의한 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 있는 암 환자 집단을 정의하는 추가 방법이 당 업계에 여전히 요구된다.
본 개시 내용은 암을 치료하고 치료를 위해 암을 가진 대상체를 선택하는 방법에 관한 것이다. 본 개시 내용은 대상체에게 악성 세포 성장의 치료, 억제, 지연, 또는 감소를 위해 암을 가진 대상체를 치료 및 선택하는 방법으로서, 세마포린-4D(SEMA4D)에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 투여를 포함하는 유효량의 암 면역치료 레지멘(regimen)을 투여하는 단계에 의한 방법을 제공한다. 방법은 대상체에서 순환 MDSC 수준을 결정하는 단계 및 MDSC 수준이 미리 결정된 임계 수준 미만인 경우 치료를 위해 대상체를 선택하는 단계를 포함한다. 특정 측면에서, 순환 MDSC 수준은 대상체로부터 혈액 샘플 또는 종양 생검과 같은 생물학적 샘플을 수득하는 또는 수득한 단계 및 생물학적 샘플 중의 MDSC 수준을 결정하기 위해 생물학적 샘플에 대해 면역표현형 분석과 같은 분석을 수행하는 또는 수행한 단계에 의해 결정된다. MDSC 수준이 미리 결정된 임계 수준 미만으로 결정되는 경우에 세마포린-4D(SEMA4D)에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 유효량의 암 면역치료 레지멘을 투여함으로써 대상체를 치료한다. 특정 측면에서, 항-SEMA4D 항체 또는 이의 단편은 SEMA4D와 이의 수용체, 예를 들어, 플렉신-B1, 플렉신-B2, CD72, 또는 이들의 임의의 조합의 상호작용을 억제한다. 특정 측면에서, 항체 또는 이의 단편의 투여는 SEMA4D 매개된 신호 전달을 억제한다. 특정 측면에서, 항체 또는 이의 단편은 각각 서열 번호 2, 3, 및 4를 포함하는 VH CDR 1-3을 포함하는 가변 중쇄(VH: variable heavy chain)), 및 각각 서열 번호 6, 7, 및 8을 포함하는 VL CDR 1-3을 포함하는 가변 경쇄(VL: variable light chain))를 포함한다. 특정 측면에서, VH 및 VL은 각각 아미노산 서열, 서열 번호 1 및 서열 번호 5, 또는 서열 번호 9 및 서열 번호 10을 포함한다.
특정 측면에서, 암 면역치료 레지멘은 추가의 암 면역치료제, 예를 들어 면역 체크포인트 차단제의 투여를 추가로 포함할 수 있다. 면역 체크포인트 차단제는 CTLA4, PD-1, PD-L1, LAG3, TIM3, B7-H3, 또는 이들의 임의의 조합에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함할 수 있다. 특정 측면에서, 암 면역치료 레지멘은 항-PD-L1 항체 아벨루맙의 투여를 추가로 포함한다.
특정 측면에서, MDSC는 단핵 MDSC(M-MDSC: mononuclear MDSC), 예를 들어 CD14+, HLA-DR-/low, CD11b+, CD33+, Ln- 표현형을 갖는 MDSC이며, 여기서 Ln은 비-MDSC를 정의하는 마커의 칵테일이며, 예를 들어 Ln 마커는 CD3, CD19, 또는 CD56 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 특정 측면에서, MDSC의 미리 결정된 임계 수준은 치료 전에 대상체의 총 말초 혈액 단핵 세포의 50% 미만, 40% 미만, 30% 미만, 20% 미만, 또는 10% 미만을 포함한다.
특정 측면에서, 암은 고형 종양, 혈액 악성 종양, 이들의 임의의 전이, 또는 이들의 임의의 조합일 수 있다. 특정 측면에서, 암은 비소세포 폐암이다.
[도 1a]는 연구 시작 시 대상체에서 CD14+, HLA-DRlow, CD11b+, CD33+, Ln- MDSC 세포 수준 대 연구 기간을 보여주며(각 대상체에 대해, 총 말초 혈액 림프구의 백분율로 표현된 스크리닝 방문 및 기준선 방문의 평균), 여기서 세포 집단에서 제외된 "Ln" 표현형에는 CD3, CD19, 및 CD56이 포함된다.
[도 1b]는 연구 시작 시 대상체에서 CD8+ T 세포 수준 대 연구 기간을 보여준다(각 대상체에 대해, ㎕당 세포로 표현된 스크리닝 방문 및 기준선 방문의 평균).
[도 1c]는 연구 시작 시 대상체에서 CD14+, HLA-DRlow, CD11b+, CD33+, Ln- MDSC 세포 수준 대 연구 시작 시 대상체에서 CD8+ T 세포 수준을 비교한다.
정의
용어 "하나의"("a" 또는 "an") 실재물은 그 실재물의 하나 이상을 지칭한다는 점에 유의해야 한다. 예를 들어, "하나의 결합 분자"는 하나 이상의 결합 분자를 나타내는 것으로 이해된다. 이와 같이, 용어 "하나의"("a" 또는 "an"), "하나 이상" 및 "적어도 하나"는 본원에서 상호 교환적으로 사용될 수 있다.
또한, 본원에서 사용되는 경우 "및/또는"은 다른 것과 함께 또는 다른 것 없이 2개의 지정된 특징 또는 구성요소 각각의 구체적인 개시로 간주되어야 한다. 따라서, 본원에서 "A 및/또는 B"와 같은 문구에서 사용되는 바와 같이 용어 "및/또는"은 "A 및 B", "A 또는 B", "A"(단독) 및 "B"(단독)를 포함하는 것으로 의도된다. 마찬가지로, "A, B, 및/또는 C"와 같은 문구에서 사용되는 바와 같이 용어 "및/또는"은 다음 실시 양태 각각을 포함하는 것으로 의도된다: A, B, 및 C; A, B, 또는 C; A 또는 C; A 또는 B; B 또는 C; A 및 C; A 및 B; B 및 C; A(단독); B(단독); 및 C(단독).
달리 정의되지 않는 한, 본원에서 사용되는 기술 및 과학 용어는 본 개시 내용이 관련된 기술 분야에서 통상의 기술자에 의해 일반적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 갖는다. 예를 들어, the Concise Dictionary of Biomedicine and Molecular Biology, Juo, Pei-Show, 2nd ed., 2002, CRC Press; The Dictionary of Cell and Molecular Biology, 5th ed., 2013, Academic Press; 및 the Oxford Dictionary of Biochemistry and Molecular Biology, 2d Edition, 2008, Oxford University Press는 기술자에게 본 개시 내용에 사용된 많은 용어의 일반 사전을 제공한다.
단위, 접두사, 및 기호는 국제 단위 기구(SI: Systme International de Unites) 허용 형식으로 표시된다. 숫자 범위에는 범위를 정의하는 숫자가 포함된다. 달리 지시되지 않는 한, 아미노산 서열은 아미노에서 카르복시 방향으로 왼쪽에서 오른쪽으로 작성된다. 본원에 제공된 표제는 명세서 전체를 참조하여 가질 수 있는 본 개시 내용의 다양한 측면 또는 측면들의 제한이 아니다. 따라서, 바로 아래에서 정의되는 용어는 본 명세서 전체를 참조하여 보다 완전하게 정의된다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "폴리펩티드"는 단수 "폴리펩티드"뿐만 아니라 복수의 "폴리펩티드"를 포함하는 것으로 의도되며, 아미드 결합(펩티드 결합으로도 알려짐)에 의해 선형으로 연결된 단량체(아미노산)로 구성된 분자를 지칭한다. 용어 "폴리펩티드"는 2개 이상의 아미노산의 임의의 사슬 또는 사슬들을 지칭하며 특정 길이의 생성물을 나타내지 않는다. 따라서, 펩티드, 디펩티드, 트리펩티드, 올리고펩티드, "단백질", "아미노산 사슬", 또는 2개 이상의 아미노산의 사슬 또는 사슬들을 지칭하기 위해 사용되는 임의의 다른 용어는 "폴리펩티드"의 정의 내에 포함되며, 용어 "폴리펩티드"는 임의의 이들 용어 대신에, 또는 이들과 상호 교환적으로 사용될 수 있다. 용어 "폴리펩티드"는 또한 글리코실화, 아세틸화, 인산화, 아미드화, 및 알려진 보호/차단 기에 의한 유도체화, 단백질 분해 절단, 또는 비-자연 발생 아미노산에 의한 변형을 제한 없이 포함하는 폴리펩티드의 발현 후 변형의 생성물을 지칭하는 것으로 의도된다. 폴리펩티드는 생물학적 공급원에서 유래하거나 재조합 기술에 의해 생성될 수 있지만 반드시 지정된 핵산 서열로부터 번역될 필요는 없다. 화학적 합성을 포함하여 어떤 방식으로든 생성될 수 있다.
폴리펩티드는 정의된 3차원 구조를 가질 수 있지만, 반드시 그러한 구조를 가질 필요는 없다. 본원에 사용되는 바와 같이, 용어 당단백질은 아미노산, 예를 들어 세린 또는 아스파라긴의 산소-함유 또는 질소-함유 측쇄를 통해 단백질에 부착되는 적어도 하나의 탄수화물 모이어티에 커플링된 단백질을 지칭한다.
"단리된" 폴리펩티드 또는 이의 단편, 변이체, 또는 유도체는 자연 환경에 존재하지 않는 폴리펩티드를 의미한다. 구체적인 정제 수준이 요구되지는 않는다. 예를 들어, 단리된 폴리펩티드는 천연 또는 자연 환경에서 제거될 수 있다. 숙주 세포에서 발현된 재조합으로 생성된 폴리펩티드 및 단백질은 임의의 적합한 기술에 의해 분리, 분획화되거나, 부분적으로 또는 실질적으로 정제된 천연 또는 재조합 폴리펩티드와 마찬가지로 본원에 개시된 바와 같이 단리된 것으로 간주된다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "비-자연 발생 폴리펩티드" 또는 이의 임의의 문법적 변형은 판사 또는 행정 또는 사법 기관에 의해 "자연 발생"적인 것으로 결정 또는 해석되는, 또는 결정 또는 해석될 수 있는 폴리펩티드의 형태를 명시적으로 배제하는, 그러나 단지 배제하는 조건부 정의이다.
본원에 개시된 다른 폴리펩티드는 전술한 폴리펩티드의 단편, 유도체, 유사체, 또는 변이체, 및 이들의 임의의 조합이다. 본원에 개시된 바와 같은 용어 "단편", "변이체", "유도체" 및 "유사체"는 예를 들어 항원에 특이적으로 결합하는 해당 천연 항체 또는 폴리펩티드의 특성 중 적어도 일부를 보유하는 임의의 폴리펩티드를 포함한다. 폴리펩티드의 단편은 예를 들어, 본원의 다른 곳에서 논의된 특정 항체 단편에 이외에 결실 단편뿐만 아니라 단백질 분해 단편을 포함한다. 예를 들어, 폴리펩티드의 변이체는 상기 기재된 바와 같은 단편, 그리고 또한 아미노산 치환, 결실, 또는 삽입으로 인해 아미노산 서열이 변경된 폴리펩티드를 포함한다. 변이체 폴리펩티드는 보존적 또는 비보존적 아미노산 치환, 결실 또는 첨가를 포함할 수 있다. 유도체는 원래의 폴리펩티드에서 발견되지 않는 추가 특징을 나타내도록 변경된 폴리펩티드이다. 예에는 융합 단백질이 포함된다.
"보존적 아미노산 치환"은 하나의 아미노산이 유사한 측쇄를 갖는 다른 아미노산으로 대체되는 것이다. 염기성 측쇄(예를 들어, 리신, 아르기닌, 히스티딘), 산성 측쇄(예를 들어, 아스파르트산, 글루타민산), 비하전 극성 측쇄(예를 들어, 아스파라긴, 글루타민, 세린, 트레오닌, 티로신, 시스테인), 비극성 측쇄(예를 들어, 글리신, 알라닌, 발린, 류신, 이소류신, 프롤린, 페닐알라닌, 메티오닌, 트립토판), 베타 분지형 측쇄(예를 들어, 트레오닌, 발린, 이소류신) 및 방향족 측쇄(예를 들어, 티로신, 페닐알라닌, 트립토판, 히스티딘)를 포함하여 유사한 측쇄를 갖는 아미노산 패밀리가 당 업계에 정의되어 있다. 예를 들어, 티로신에 대한 페닐알라닌의 치환은 보존적 치환이다. 특정 실시 양태에서, 본 개시 내용의 폴리펩티드 및 항체의 서열에서 보존적 치환은 결합 분자가 결합하는 항원에 대한 아미노산 서열을 함유하는 폴리펩티드 또는 항체의 결합을 제거하지 않는다. 항원 결합을 제거하지 않는 뉴클레오티드 및 아미노산 보존적 치환을 확인하는 방법은 당 업계에 잘 알려져 있다(예를 들어, Brummell et al., Biochem . 32: 1180-1 187 (1993); Kobayashi et al., Protein Eng . 12(10):879-884 (1999); 및 Burks et al., Proc . Natl . Acad . Sci . USA 94:.412-417 (1997) 참조).
용어 "폴리뉴클레오티드"는 단일 핵산 및 복수의 핵산을 포함하는 것으로 의도되고 단리된 핵산 분자 또는 구축물, 예를 들어 전령 RNA(mRNA), cDNA, 또는 플라스미드 DNA(pDNA)를 지칭한다. 폴리뉴클레오티드는 통상적인 포스포디에스테르 결합 또는 비-통상적인 결합(예를 들어, 펩티드 핵산(PNA: peptide nucleic acid)에서 발견되는 것과 같은 아미드 결합)을 포함할 수 있다. 용어 "핵산" 또는 "핵산 서열"은 폴리뉴클레오티드에 존재하는 임의의 하나 이상의 핵산 세그먼트, 예를 들어 DNA 또는 RNA 단편을 지칭한다.
"단리된" 핵산 또는 폴리뉴클레오티드는 그의 천연 환경으로부터 분리된 임의의 형태의 핵산 또는 폴리뉴클레오티드를 의미한다. 예를 들어, 겔 정제된 폴리뉴클레오티드, 또는 벡터에 포함된 폴리펩티드를 코딩하는 재조합 폴리뉴클레오티드는 "단리된" 것으로 간주된다. 또한, 클로닝을 위한 제한 부위를 갖도록 조작된 폴리뉴클레오티드 세그먼트, 예를 들어 PCR 산물은 "단리된" 것으로 간주된다. 단리된 폴리뉴클레오티드의 추가 예는 이종 숙주 세포에서 유지되는 재조합 폴리뉴클레오티드 또는 완충액 또는 식염수와 같은 비-천연 용액 중 정제된(부분적으로 또는 실질적으로) 폴리뉴클레오티드를 포함한다. 단리된 RNA 분자는 폴리뉴클레오티드의 생체 내 또는 시험관 내 RNA 전사체를 포함하며, 여기서 전사체는 자연에서 발견되는 것이 아니다. 단리된 폴리뉴클레오티드 또는 핵산은 합성에 의해 생성된 이러한 분자를 추가로 포함한다. 또한, 폴리뉴클레오티드 또는 핵산은 프로모터, 리보솜 결합 부위, 또는 전사 종결자와 같은 조절 요소일 수 있거나 이들을 포함할 수 있다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "비-자연 발생 폴리뉴클레오티드" 또는 그의 임의의 문법적 변형은 판사 또는 행정 또는 사법 기관에 의해 "자연 발생"적인 것으로 결정 또는 해석되는, 또는 결정 또는 해석될 수 있는 핵산 또는 폴리뉴클레오티드의 형태를 명시적으로 배제하는, 그러나 단지 배제하는 조건부 정의이다.
본원에 사용되는 바와 같이, "코딩 영역"은 아미노산으로 번역되는 코돈으로 이루어진 핵산의 일부이다. "정지 코돈"(TAG, TGA, 또는 TAA)은 아미노산으로 번역되지 않지만 코딩 영역의 일부로 간주될 수 있지만, 임의의 측면 서열, 예를 들어 프로모터, 리보솜 결합 부위, 전사 종결자, 인트론 등은 코딩 영역의 일부가 아니다.
특정 실시 양태에서, 폴리뉴클레오티드 또는 핵산은 DNA이다. DNA의 경우, 폴리펩티드를 코딩하는 핵산을 포함하는 폴리뉴클레오티드는 일반적으로 하나 이상의 코딩 영역과 작동 가능하게 연관된 프로모터 및/또는 다른 전사 또는 번역 조절 요소를 포함할 수 있다. 작동 가능한 연관은 유전자 산물, 예를 들어 폴리펩티드에 대한 코딩 영역이 조절 서열(들)의 영향 또는 조절 하에 유전자 산물의 발현을 배치하는 방식으로 하나 이상의 조절 서열과 연관되는 경우이다. 프로모터 기능의 유도가 원하는 유전자 산물을 코딩하는 mRNA의 전사를 초래하는 경우와 두 DNA 단편 사이의 연결 특성이 유전자 산물의 발현을 지시하는 발현 조절 서열의 능력을 방해하거나 전사되는 DNA 주형의 능력을 방해하지 않는 경우 두 DNA 단편(예컨대 폴리펩티드 코딩 영역 및 그와 연관된 프로모터)은 "작동 가능하게 연관된다". 따라서, 프로모터가 폴리펩티드를 코딩하는 핵산의 전사에 영향을 미칠 수 있다면 프로모터 영역은 그 핵산과 작동 가능하게 연관될 것이다. 프로모터는 미리 결정된 세포에서 DNA의 실질적인 전사를 지시하는 세포 특이적 프로모터일 수 있다. 프로모터 외에 다른 전사 제어 요소, 예를 들어 인핸서, 오퍼레이터, 리프레서, 및 전사 종결 신호는 세포 특이적 전사를 지시하기 위해 폴리뉴클레오티드와 작동 가능하게 연관될 수 있다.
다른 실시 양태에서, 폴리뉴클레오티드는 예를 들어 전령 RNA(mRNA), 전달 RNA, 또는 리보솜 RNA 형태의 RNA일 수 있다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "결합 분자"는 가장 넓은 의미에서 수용체에 특이적으로 결합하는 분자, 예를 들어 에피토프 또는 항원 결정기를 지칭한다. 본원에 추가로 기재되는 바와 같이, 결합 분자는 본원에 기재된 하나 이상의 "항원 결합 도메인"을 포함할 수 있다. 결합 분자의 비제한적인 예는 항원 특이적 결합을 보유하는 항체 또는 이의 단편이다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "결합 도메인" 또는 "항원 결합 도메인"은 에피토프에 특이적으로 결합하는 데 필요하고 충분한 결합 분자의 영역을 지칭한다. 예를 들어, "Fv", 예를 들어, 항체의 가변 중쇄 및 가변 경쇄는 2개의 개별 폴리펩티드 서브유닛으로서 또는 단일 사슬로서 "결합 도메인"으로 간주된다. 다른 결합 도메인은 제한 없이 낙타류 종으로부터 유래된 항체의 가변 중쇄(VHH), 또는 피브로넥틴 스캐폴드에서 발현되는 6개의 면역글로불린 상보성 결정 영역(CDR: complementarity determining region)을 포함한다.
항체(또는 본원에 개시된 바와 같은 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체, 또는 이의 다량체 단편, 변이체, 또는 유도체)는 적어도 (낙타류 종에 대한) 중쇄의 가변 도메인 또는 적어도 중쇄 및 경쇄의 가변 도메인을 포함한다. 척추동물계의 기본 면역글로불린 구조는 비교적 잘 알려져 있다. 예를 들어, 문헌[Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed. 1988]을 참조한다. 달리 언급되지 않는 한, 용어 "항체"는 항체의 작은 항원 결합 단편부터 완전한 크기의 항체, 예를 들어 2개의 완전한 중쇄 및 2개의 완전한 경쇄를 포함하는 IgG 항체에 이르는 모든 범위를 포함한다.
하기에서 더 상세히 논의되는 바와 같이, 용어 "면역글로불린"은 생화학적으로 구별될 수 있는 다양하고 광범위한 부류의 폴리펩티드를 포함한다. 당업자는 중쇄가 감마, 뮤, 알파, 델타, 또는 엡실론(γ, μ, α, δ, ε)으로 분류되며 그 중 일부 서브클래스(예를 들어, γ1-γ4 또는 α1-α2)가 있음을 이해할 것이다. 항체의 "아이소타입"을 각각 IgG, IgM, IgA, IgG, 또는 IgE로 결정하는 것은 이 사슬의 특성이다. 면역글로불린 서브클래스(아형), 예를 들어 IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, IgA2 등은 잘 특성화되어 있으며 기능적 전문화를 부여하는 것으로 알려져 있다. 이들 면역글로불린 각각의 변형된 형태는 본 개시 내용의 관점에서 당업자에 의해 용이하게 식별 가능하고, 따라서 본 개시 내용의 범위 내에 있다.
경쇄는 카파 또는 람다(κ, λ)로 분류된다. 각 중쇄 클래스는 카파 또는 람다 경쇄와 결합될 수 있다. 일반적으로, 경쇄와 중쇄는 서로 공유 결합되며, 면역글로불린이 예를 들어 하이브리도마, B 세포 또는 유전자 조작된 숙주 세포에 의해 발현될 때 두 중쇄의 "꼬리" 부분은 공유 이황화 결합 또는 비공유 결합에 의해 서로 결합된다. 중쇄에서, 아미노산 서열은 Y 배열의 갈라진 끝 부분에 있는 N-말단에서 각 사슬의 맨 아래에 있는 C-말단으로 이어진다. 특정 항체, 예를 들어, IgG 항체의 기본 구조는 이황화 결합을 통해 공유적으로 연결된 2개의 중쇄 서브유닛 및 2개의 경쇄 서브유닛을 포함하여 본원에서 "H2L2" 구조로도 지칭되는 "Y" 구조를 형성한다.
용어 "에피토프"는 항체에 특이적으로 결합할 수 있는 임의의 분자 결정기를 포함한다. 특정 측면에서, 에피토프는 아미노산, 당 측쇄, 포스포릴, 또는 설포닐과 같은 분자의 화학적 활성 표면 기를 포함할 수 있고, 특정 측면에서, 3차원 구조적 특성, 및/또는 특정 전하 특성을 가질 수 있다. 에피토프는 항체에 의해 결합되는 표적의 영역이다.
용어 "표적"은 결합 분자에 의해 결합될 수 있는 물질을 포함하는 가장 넓은 의미로 사용된다. 표적은 예를 들어 폴리펩티드, 핵산, 탄수화물, 지질, 또는 기타 분자일 수 있다. 더욱이, "표적"은 예를 들어 결합 분자에 의해 결합될 수 있는 결합된 에피토프를 포함하는 세포, 기관, 또는 유기체일 수 있다.
경쇄와 중쇄는 모두 구조적 및 기능적 상동성의 영역으로 나뉜다. 용어 "불변" 및 "가변"은 기능적으로 사용된다. 이와 관련하여, 가변 경쇄(VL) 및 가변 중쇄(VH) 부분 모두의 가변 도메인이 항원 인식 및 특이성을 결정한다는 것을 이해할 것이다. 반대로, 경쇄(CL) 및 중쇄(예를 들어, CH1, CH2, CH3, 또는 CH4(존재하는 경우))의 불변 도메인은 분비, 경태반 이동성, Fc 수용체 결합, 보체 결합 등과 같은 생물학적 특성을 부여한다. 관례에 따라 불변 영역 도메인의 넘버링은 항체의 항원 결합 부위 또는 아미노 말단에서 멀어질수록 증가한다. N-말단 부분은 가변 영역이고 C-말단 부분은 불변 영역이다. CH3 및 CL 도메인은 실제로 각각 중쇄 및 경쇄의 카르복시 말단을 포함한다.
상기 지시된 바와 같이, 가변 영역은 결합 분자가 항원 상의 에피토프를 선택적으로 인식하고 특이적으로 결합하도록 한다. 즉, 결합 분자, 예를 들어 항체의 VL 도메인 및 VH 도메인, 또는 상보성 결정 영역(CDR)의 서브세트가 결합하여 항원 결합 도메인을 형성한다. 보다 구체적으로, 항원 결합 도메인은 각각의 VH 및 VL 사슬 상의 3개의 CDR에 의해 정의될 수 있다.
항체 항원 결합 도메인에 존재하는 6개의 "상보성 결정 영역" 또는 "CDR"은 항체가 수성 환경 내 그의 3차원 배열을 가정할 때 결합 도메인을 형성하도록 특이적으로 배치된 아미노산의 짧은 비인접 서열이다. "프레임워크" 영역이라고 지칭되는 결합 도메인 내 나머지 아미노산은 더 낮은 분자 간 가변성을 보인다. 프레임워크 영역은 주로 β-시트 입체형태를 채택하고 CDR은 β-시트 구조를 연결하고 일부 경우에는 β-시트 구조의 일부를 형성하는 루프를 형성한다. 따라서, 프레임워크 영역은 사슬 간, 비공유 상호작용에 의해 정확한 방향으로 CDR을 배치시키기 위해 제공하는 스캐폴드를 형성하도록 작용한다. 배치된 CDR에 의해 형성된 결합 도메인은 면역 반응성 항원 상 에피토프에 상보성 표면을 정의한다. 이 상보성 표면은 항체의 그의 동족 에피토프에 대한 비공유 결합을 촉진한다. CDR 및 프레임워크 영역을 각각 구성하는 아미노산은 다양하고 상이한 방식으로 정의되었기 때문에 당업자에 의해 임의의 주어진 중쇄 또는 경쇄 가변 영역에 대해 용이하게 식별될 수 있다("Sequences of Proteins of Immunological Interest," Kabat, E., et al., U.S. Department of Health and Human Services, (1983); 및 Chothia and Lesk, J. Mol . Biol., 196:901-917 (1987)을 참조하며, 이들은 그 전체가 본원에 참고로 포함됨).
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "면역표현형 분석"은 세포에 의해 발현되는 단백질을 연구하는 데 사용되는 기술을 지칭한다. 이 기술은 조직 절편(신선한 조직 또는 고정된 조직), 세포 현탁액, 혈액 샘플 등에서 수행될 수 있다. 연구 및 임상 환경에서 사용되는 면역표현형 기술 및 응용 모음은 본원에 참고로 포함된 문헌[Immunophenotyping: Methods and Protocols, : McCoy, Jr., J. Philip (Ed.) (2019)]에 자세히 설명되어 있다.
당 업계에서 사용 및/또는 허용되는 용어의 정의가 2개 이상인 경우, 본원에서 사용되는 바와 같은 용어의 정의는 명시적으로 달리 언급되지 않는 한 이러한 모든 의미를 포함하도록 의도된다. 구체적인 예는 중쇄 및 경쇄 폴리펩티드 모두의 가변 영역 내에서 발견되는 비-인접 항원 결합 부위를 기술하기 위한 "상보성 결정 영역"("CDR")이라는 용어의 사용이다. 이러한 특정 영역은 예를 들어 본원에 참고로 포함된 문헌[Kabat et al., U.S. Dept. of Health and Human Services, "Sequences of Proteins of Immunological Interest" (1983)] 및 문헌[Chothia et al., J. Mol . Biol. 196:901-917 (1987)]에 의해 기술되었다. Kabat 및 Chothia 정의에는 서로에 대해 비교될 때 아미노산의 중복 또는 서브세트가 포함된다. 그럼에도 불구하고, 항체 또는 이의 변이체의 CDR을 지칭하기 위한 어느 하나의 정의(또는 당업자에게 공지된 다른 정의)의 적용은 달리 지시되지 않는 한, 본원에서 정의되고 사용되는 용어의 범위 내에 있는 것으로 의도된다. 상기 인용된 문헌 각각에 의해 정의된 바와 같은 CDR을 포함하는 적절한 아미노산은 비교로서 하기 표 1에 제시한다. 특정 CDR을 포함하는 정확한 아미노산 번호는 CDR의 서열 및 크기에 따라 달라질 것이다. 당업자는 항체의 가변 영역 아미노산 서열이 주어질 경우 어느 아미노산이 특정 CDR을 포함하는 지를 일상적으로 결정할 수 있다.
[표 1]
또한, 예를 들어 IMGT 정보 시스템(www://imgt.cines.fr/) (IMGT®/V-Quest)을 사용하여 항체 가변 도메인을 분석하여 CDR을 포함하는 가변 영역 세그먼트를 식별할 수 있다(예를 들어, Brochet et al., Nucl. Acids Res., 36:W503-508, 2008 참조).
Kabat 연구자들은 또한 어느 항체에든 적용할 수 있는 가변 도메인 서열에 대한 넘버링 시스템을 정의하였다. 당업자는 서열 자체를 넘어선 실험 데이터에 전혀 의존하지 않고 이 "Kabat 넘버링" 시스템을 어떤 가변 도메인 서열에든 명확하게 할당할 수 있다. 본원에 사용되는 바와 같이, "Kabat 넘버링"은 문헌[Kabat et al., U.S. Dept. of Health and Human Services, "Sequence of Proteins of Immunological Interest"(1983)]에 의해 제시된 넘버링 시스템을 지칭한다. 그러나 Kabat 넘버링 시스템의 사용이 명시적으로 언급되지 않는 한, 본 개시 내용의 모든 아미노산 서열에 대해 연속적인 넘버링이 사용된다.
결합 분자, 예를 들어, 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체, 또는 이의 다량체 단편, 변이체, 또는 유도체는 다클론, 단클론, 인간, 인간화, 또는 키메라 항체, 단일 사슬 항체, 에피토프 결합 단편, 예를 들어 Fab, Fab' 및 F(ab')2, Fd, Fv, 단일 사슬 Fv(scFv), 단일 사슬 항체, 이황화 결합 Fv(sdFv), VL 또는 VH 도메인을 포함하는 단편, Fab 발현 라이브러리에 의해 생성된 단편을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. ScFv 분자는 당업계에 공지되어 있으며, 예를 들어 미국 특허 제5,892,019호에 기재되어 있다.
"특이적으로 결합한다"는 것은 일반적으로 결합 분자, 예를 들어 항체 또는 이의 단편, 변이체, 또는 유도체가 이의 항원 결합 도메인을 통해 에피토프에 결합한다는 것과 결합이 항원 결합 도메인과 에피토프 사이의 일부 상보성을 수반한다는 것을 의미한다. 이 정의에 따르면, 결합 분자가 무작위의 관련 없는 에피토프에 결합하는 것보다 그의 항원 결합 도메인을 통해 한 에피토프에 더 쉽게 결합할 때 결합 분자는 해당 에피토프에 "특이적으로 결합"한다고 한다. 용어 "특이성"은 특정 결합 분자가 특정 에피토프에 결합하는 상대적 친화도를 정량화하기 위해 본원에서 사용된다. 예를 들어, 결합 분자 "A"는 주어진 에피토프에 대해 결합 분자 "B"보다 더 높은 특이성을 갖는 것으로 간주될 수 있거나, 결합 분자 "A"는 관련 에피토프 "D"에 대해 갖는 것보다 에피토프 "C"에 대해 더 높은 특이성으로 결합한다고 할 수 있다.
본원에 개시된 결합 분자, 예를 들어, 항체 또는 이의 단편, 변이체, 또는 유도체는 5 X 10-2 sec-1, 10-2 sec-1, 5 X 10-3 sec-1, 10-3 sec-1, 5 X 10-4 sec-1, 10-4 sec-1, 5 X 10-5 sec-1, 또는 10-5 sec-1 5 X 10-6 sec-1, 10-6 sec-1, 5 X 10-7 sec-1 또는 10-7 sec-1 이하의 오프 레이트(off rate)(k(off))로 표적 항원에 결합한다고 할 수 있다.
본원에 개시된 결합 분자, 예를 들어, 항체 또는 이의 단편, 변이체, 또는 유도체는 103 M-1 sec-1, 5 X 103 M-1 sec-1, 104 M-1 sec-1, 5 X 104 M-1 sec-1, 105 M-1 sec-1, 5 X 105 M-1 sec-1, 106 M-1 sec-1, 또는 5 X 106 M-1 sec-1 또는 107 M-1 sec-1 이상의 온 레이트(on rate)(k(on))로 표적 항원에 결합한다고 할 수 있다.
결합 분자, 예를 들어, 항체 또는 이의 단편, 변이체, 또는 유도체는, 그가 주어진 에피토프에 대한 참조 항체 또는 항원 결합 단편의 결합을 어느 정도까지 차단하는 정도로 해당 에피토프에 우선적으로 결합하는 경우 그 에피토프에 대한 참조 항체 또는 항원 결합 단편의 결합을 경쟁적으로 억제한다고 한다. 경쟁적 억제는 당업계에 공지된 임의의 방법, 예를 들어 경쟁 ELISA 분석에 의해 결정될 수 있다. 결합 분자는 주어진 에피토프에 대한 참조 항체 또는 항원 결합 단편의 결합을 적어도 90%, 적어도 80%, 적어도 70%, 적어도 60%, 또는 적어도 50% 경쟁적으로 억제한다고 할 수 있다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "친화도"는 예를 들어 면역글로불린 분자의 하나 이상의 결합 도메인과 개별 에피토프의 결합 강도의 척도를 지칭한다. 예를 들어, 문헌[Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed. 1988) at pages 27-28]을 참조한다. 본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "결합력"은 결합 도메인 집단과 항원 사이의 복합체의 전체 안정성을 지칭한다. 예를 들어, 문헌[Harlow at pages 29-34]을 참조한다. 결합력은 특정 에피토프와 집단 내 개별 결합 도메인의 친화도, 그리고 또한 면역글로불린과 항원의 원자가와 모두 관련이 있다. 예를 들어, 2가 단클론 항체와 중합체와 같은 고도로 반복되는 에피토프 구조를 갖는 항원 사이의 상호작용은 높은 결합력 중 하나가 될 것이다. 세포 표면에 고밀도로 존재하는 수용체와 2가 단클론 항체 사이의 상호작용도 높은 결합력을 가질 것이다.
본원에 개시된 바와 같은 결합 분자, 예를 들어 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체는 또한 그의 교차-반응성 측면에서 기재되거나 특정될 수 있다. 본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "교차 반응성"은 하나의 항원에 특이적인 결합 분자, 예를 들어 항체 또는 이의 단편, 변이체, 또는 유도체가 제2 항원과 반응하는 능력; 2개의 서로 다른 항원 물질 사이의 관련성의 척도를 지칭한다. 따라서, 결합 분자가 그 형성을 유도한 에피토프가 아닌 다른 에피토프에 결합하는 경우 이는 교차 반응성이다. 교차 반응성 에피토프는 일반적으로 유도 에피토프와 동일한 상보성 구조적 특징을 많이 포함하며 일부 경우에는 실제로 원본보다 더 잘 맞을 수 있다.
결합 분자, 예를 들어 항체 또는 이의 단편, 변이체, 또는 유도체는 또한 항원에 대한 결합 친화성 측면에서 기재되거나 특정될 수 있다. 예를 들어, 결합 분자는 5 x 10-2 M, 10-2 M, 5 x 10-3 M, 10-3 M, 5 x 10-4 M, 10-4 M, 5 x 10-5 M, 10-5 M, 5 x 10-6 M, 10-6 M, 5 x 10-7 M, 10-7 M, 5 x 10-8 M, 10-8 M, 5 x 10-9 M, 10-9 M, 5 x 10-10 M, 10-10 M, 5 x 10-11 M, 10-11 M, 5 x 10-12 M, 10-12 M, 5 x 10-13 M, 10-13 M, 5 x 10-14 M, 10-14 M, 5 x 10-15 M, 또는 10-15 M 이하인 해리 상수 또는 KD로 항원에 결합할 수 있다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "서브유닛"은 결합 분자, 예를 들어, 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 생성하기 위해 다른 동일하거나 이종성인 폴리펩티드 사슬과 결합하는 단일 폴리펩티드 사슬을 지칭한다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "중쇄 서브유닛"은 면역글로불린 중쇄로부터 유래된 아미노산 서열을 포함하고, 결합 분자, 예를 들어, 중쇄 서브유닛을 포함하는 항체는 VH 도메인, CH1 도메인, 힌지(예를 들어, 상부, 중간, 및/또는 하부 힌지 영역) 도메인, CH2 도메인, CH3 도메인, CH4-tp 도메인, 또는 이의 변이체 또는 단편 중 적어도 하나를 포함할 수 있다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "경쇄 서브유닛"은 면역글로불린 경쇄로부터 유래된 아미노산 서열을 포함한다. 경쇄 서브유닛은 적어도 VL을 포함하고, CL(예를 들어, Cκ 또는 Cλ) 도메인을 추가로 포함할 수 있다.
결합 분자, 예를 들어 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체는 이들이 인식하거나 특이적으로 결합하는 항원의 에피토프(들) 또는 부분(들)의 관점에서 기재되거나 특정될 수 있다. 항체의 항원 결합 도메인과 특이적으로 상호작용하는 표적 항원의 부분은 "에피토프" 또는 "항원 결정기"이다. 표적 항원은 단일 에피토프 또는 적어도 2개의 에피토프를 포함할 수 있고, 항원의 크기, 입체구조, 및 유형에 따라 임의 개수의 에피토프를 포함할 수 있다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "암" 및 "암성"은 세포 집단이 조절되지 않은 세포 성장을 특징으로 하는 포유동물의 생리학적 상태를 지칭하거나 기술한다. 암은 예를 들어 고형 종양 또는 악성 종양, 또는 혈액 암 또는 악성 종양으로 분류될 수 있다. 두 유형 모두 전이로서 원격 부위로 이동할 수 있다. 고형 종양은 예를 들어 육종, 암종, 흑색종, 또는 이들의 전이로 분류될 수 있다.
용어 "증식성 장애" 및 "증식성 질환"은 암과 같은 비정상적인 세포 증식과 관련된 장애를 지칭한다. 본원에 사용되는 바와 같이, "종양" 및 "신생물"은 전암성 병변을 포함하는 양성(비암성) 또는 악성(암성)인 과도한 세포 성장 또는 증식으로 인해 발생하는 임의의 조직 덩어리를 지칭한다.
본원에 사용되는 바와 같이 용어 "전이", "전이들", "전이성" 및 기타 문법적 동의어는 기원(예를 들어, 원발성 종양) 부위로부터 신체의 다른 영역으로 퍼지거나 이동하여 새로운 위치에서 유사한 암 병변을 발생하는 암세포를 지칭한다. "전이성" 또는 "전이" 세포는 인접 세포와의 접착성 접촉을 상실하고 질환의 원발성 부위로부터 혈류 또는 림프를 통해 이동하여 인접하는 신체 구조를 침습하는 것이다. 이 용어는 또한 전이 과정을 의미하며, 여기에는 원발성 종양으로부터 암세포의 탈착, 순환으로 종양 세포의 혈관 내 침입, 원거리 부위로의 생존 및 이동, 순환으로부터 새로운 부위로의 부착 및 혈관 외 유출, 및 원거리 부위에서의 미세 집락화, 및 원거리 부위에서의 종양 성장 및 발병이 포함되지만 이에 제한되지는 않는다.
이러한 고형 종양의 예는 예를 들어 편평 세포 암종, 선암종, 기저 세포 암종, 신세포 암종, 유방의 유관암종, 연조직 육종, 골육종, 흑색종, 소세포 폐암, 비소세포 폐암(NSCLC: non-small cell lung cancer), 폐의 선암종, 복막암, 간세포 암종, 위장관암, 위암, 췌장암, 신경내분비암, 교모세포종, 자궁경부암, 난소암, 간암, 방광암, 뇌암, 간종양, 유방암, 결장암, 결장직장암, 자궁내막 또는 자궁 암종, 식도암, 타액선 암종, 신장암, 전립선암, 외음부암, 갑상선암, 두경부암, 이들의 임의의 전이, 또는 이들의 임의의 조합을 포함할 수 있다.
혈액 암 또는 악성 종양의 예는 백혈병, 림프종, 골수종, 급성 골수성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 급성 림프구성 백혈병, 만성 림프구성 백혈병, 털세포 백혈병, 호지킨 림프종, 비호지킨 림프종, 다발성 골수종, 이들의 임의의 전이, 또는 이들의 임의의 조합을 제한 없이 포함한다.
특정 실시 양태에서, 본원에 제공된 방법을 통해 치료할 수 있는 암은 육종, 유방 암종, 난소암, 자궁경부암, 두경부암, NSCLC, 식도암, 위암, 신장암, 간암, 방광암, 결장직장암, 및 췌장암을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다.
용어 "면역 조절제"는 면역요법의 활성제를 지칭한다. 면역 조절제는 다양한 재조합, 합성, 및 천연 제제를 포함한다. 면역 조절제의 예에는 IL-2, IL-7, IL-12와 같은 인터루킨; 과립구 집락 자극 인자(G-CSF: granulocyte colony-stimulating factor), 인터페론과 같은 사이토카인; CXCL13, CCL26, CXCL7과 같은 다양한 케모카인; 항-CTLA-4, 항-PD-1 또는 항-PD-L1(PD-1의 리간드), 항-LAG3, 항-B7-H3과 같은 면역 체크포인트 차단의 길항제, 합성 시토신 포스페이트-구아노신(CpG) 올리고뉴클레오티드, 글루칸 및 시클로포스파미드와 같은 조절 T 세포(Treg)의 조절제가 포함되지만 이에 제한되지는 않는다.
용어 "치료 유효량"은 대상체, 예를 들어 인간의 질환 또는 장애를 "치료"하거나 일부 경우에 "예방"하는 데 효과적인 항체, 폴리펩티드, 폴리뉴클레오티드, 작은 유기 분자, 또는 기타 약물의 양을 지칭한다. 암의 경우에, 약물의 치료 유효량은 암세포의 수의 감소; 암세포 분열의 지체 또는 중지, 종양 크기의 증가의 감소 또는 지체; 예를 들어, 연조직 및 뼈로의 암세포의 확산을 포함하는 말초 기관으로의 암세포 침윤의 억제, 예를 들어 저해, 지체, 예방, 중지, 지연, 또는 역전; 종양 전이의 억제, 예를 들어 저해, 지체, 예방, 축소, 중지, 지연, 또는 역전; 종양 성장의 억제, 예를 들어 저해, 지체, 예방, 중지, 지연, 또는 역전; 암과 관련된 하나 이상의 증상의 어느 정도의 완화, 이환율 및 사망률의 감소; 삶의 질 향상; 또는 이러한 효과의 조합을 가능하게 할 수 있다. 약물이 성장을 방지하고/거나 기존 암세포를 사멸시키는 정도까지, 이는 세포 증식 억제성 및/또는 세포독성이라고 할 수 있다.
"치료하는" 또는 "치료" 또는 "치료하다" 또는 "경감시키는" 또는 "경감시키다"와 같은 용어는 1) 진단된 병리학적 상태 또는 장애의 증상을 치료, 지연, 경감시키고 진단된 병리학적 상태 또는 장애의 진행을 역전, 및/또는 중단시키는 치료적 조치 및 2) 표적화 병리학적 상태 또는 장애의 발병을 예방 및/또는 지연시키는 예방적 또는 방어적 조치 모두를 지칭한다. 따라서, 치료를 필요로 하는 사람은 장애가 이미 있는 사람; 장애를 가질 경향이 있는 사람; 및 장애가 예방되어야 하는 사람을 포함한다. 환자가 다음 중 하나 이상을 나타내는 경우 대상체는 본 개시 내용의 방법에 따라 성공적으로 "치료"된다: 암세포 수의 감소 또는 암세포의 완전한 부재; 종양 크기의 감소; 또는 종양 성장의 지체 또는 역전, 전이, 예를 들어 암의 연조직 및 뼈로의 확산을 포함하는 말초 기관으로의 암세포 침윤의 억제, 예를 들어 저해, 예방, 지체, 축소, 지연, 또는 역전; 종양 전이의 억제, 예를 들어 저해, 지체, 예방, 축소, 역전, 지연 또는 부재; 종양 성장의 억제, 예를 들어 저해, 지체, 예방, 축소, 역전, 지연, 또는 부재; 특정 암과 관련된 하나 이상의 증상의 완화; 이환율 및 사망률 감소; 삶의 질 향상; 또는 효과의 일부 조합. 유익한 또는 원하는 임상 결과에는 증상 완화, 질환 정도의 감소, 질환 상태의 안정화(즉, 악화되지 않음), 질환 진행의 지연 또는 감속, 질환 상태의 개선 또는 완화, 및 관해(부분적이든 전체적이든)가, 검출 가능하든 검출 불가능하든 간에, 포함된다. "치료"는 또한 치료를 받지 않는 경우 예상되는 생존과 비교하여 생존을 연장하는 것을 의미할 수 있다. 치료를 필요로 하는 사람은 병태 또는 장애가 이미 있는 사람뿐만 아니라 병태 또는 장애를 가질 경향이 있는 사람 또는 병태 또는 장애가 예방되어야 하는 사람을 포함한다.
"대상체" 또는 "개체" 또는 "동물" 또는 "환자" 또는 "포유동물"은 진단, 예후, 또는 치료가 필요한 임의의 대상체, 특히 포유동물 대상체를 의미한다. 포유동물 대상체는 인간, 가축, 농장 동물, 및 동물원, 스포츠, 또는 애완 동물, 예컨대 개, 고양이, 기니피그, 토끼, 랫트, 마우스, 말, 돼지, 소, 곰 등을 포함한다.
본원에서 사용되는 바와 같이, "치료로부터 이익을 얻을 대상체" 및 "치료를 필요로 하는 동물"과 같은 문구는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 항체와 같은 결합 분자의 투여로부터 이익을 얻을 대상체, 예컨대 포유동물 대상체를 포함한다. 이러한 결합 분자, 예를 들어 항체는 예를 들어 진단 절차 및/또는 질환의 치료 또는 예방을 위해 사용될 수 있다.
표적 폴리펩티드 설명 - SEMA4D
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "세마포린-4D", "SEMA4D" 및 "SEMA4D 폴리펩티드"는 "SEMA4D" 및 "Sema4D"와 같이 상호 교환적으로 사용된다. 특정 실시 양태에서, SEMA4D는 막 결합된다. 다른 실시 양태에서, SEMA4D는 가용성, 예를 들어 sSEMA4D이다. 다른 실시 양태에서, SEMA4D는 전체 크기 SEMA4D 또는 이의 단편, 또는 SEMA4D 변이체 폴리펩티드를 포함할 수 있으며, 여기서 SEMA4D의 단편 또는 SEMA4D 변이체 폴리펩티드는 전체 크기 SEMA4D의 일부 또는 모든 기능적 특성을 보유한다.
전체 크기의 인간 SEMA4D 단백질은 150 kDa의 2개의 폴리펩티드 사슬로 이루어진 동종이량체 막 횡단 단백질이다. SEMA4D는 세포 표면 수용체의 세마포린 패밀리에 속하며 CD100이라고도 한다. 인간 및 마우스 SEMA4D/Sema4D 둘 모두는 이들의 막 횡단 형태로부터 단백질 분해에 의해 절단되어 120-kDa 가용성 형태를 생성하여 2개의 Sema4D 아이소형을 생성한다(Kumanogoh et al., J. Cell Science 116(7):3464 (2003)). 세마포린은 원래 뉴런과 그의 적절한 표적 사이의 정확한 연결을 확립하는 데 중요한 역할을 하는 축삭 유도 인자로 정의된 가용성 및 막 결합 단백질로 이루어진다.
SEMA4D는 적어도 3개의 기능적 수용체, 플렉신-B1, 플렉신-B2 및 CD72를 갖는 것으로 알려져 있다. 플렉신-B1은 비림프 조직에서 발현되고 SEMA4D에 대한 높은 친화도(1 nM) 수용체인 것으로 나타났다(Tamagnone et al., Cell 99:71-80 (1999)). 플렉신-B2는 SEMA4D에 대해 중간 친화도를 가지며 최근 보고서에 따르면 PLXNB2가 각질형성세포에서 발현되고 SEMA4D 양성 γδ T 세포를 활성화하여 상피 복구에 기여함을 나타낸다(Witherden et al., Immunity I(2):314-25 (2012)). 림프 조직에서, CD72는 낮은 친화도(300 nM) SEMA4D 수용체로서 활용된다(Kumanogoh et al., Immunity 13:621-631 (2000)).
SEMA4D는 비장, 흉선, 및 림프절을 포함하는 림프 기관에서와 뇌, 심장, 및 신장과 같은 비림프 기관에서 높은 수준으로 발현된다. 림프 기관에서, SEMA4D는 휴지 T 세포 상에 풍부하게 발현되지만 휴지 B 세포 및 항원 제시 세포(APC), 예컨대 수지상 세포(DC) 상에는 약하게만 발현된다. 세포 활성화는 SEMA4D의 표면 발현과 가용성 SEMA4D(sSEMA4D)의 생성을 증가시킨다.
항-SEMA4D 항체
SEMA4D에 결합하는 항체는 당 업계에 기재되어 있다. 예를 들어, 미국 특허 제7,919,594호, 제8,496,938호, 제8,816,058호, 제9,605,055호, 제9,676,840호, 제9,243,068호, 및 제9,828,435호, 국제 특허 출원 WO93/14125, 및 문헌[Herold et al., Int. Immunol. 7(1): 1-8 (1995)]에 기재되어 있으며, 이들 각각은 그 전체가 본원에 참고로 포함된다.
본 개시 내용은 일반적으로 대상체, 예를 들어, 인간 암 환자에서 종양 성장 또는 전이를 억제, 지연, 또는 감소시키기 위한 치료를 위해 암을 가진 대상체를 치료 및 선택하는 방법으로서, 대상체에서 순환 MDSC 수준을 결정하는 단계 및 MDSC 수준이 미리 결정된 임계 수준 미만인 경우 치료를 위해 대상체를 선택하는 단계를 포함하는 방법에 관한 것이다. 순환 MDSC 수준은 대상체로부터 혈액 샘플 또는 종양 생검과 같은 생물학적 샘플을 수득하는 또는 수득한 단계, 및 생물학적 샘플 중의 MDSC 수준을 결정하기 위해 생물학적 샘플에 대해 면역표현형 분석과 같은 분석을 수행하는 또는 수행한 단계에 의해 결정될 수 있다. MDSC 수준이 미리 결정된 임계 수준 미만으로 결정되는 경우에 세마포린-4D(SEMA4D)에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체를 포함하는 유효량의 암 면역치료 레지멘을 대상체에 투여함으로써 대상체를 치료한다. 특정 실시 양태에서, 항체는 SEMA4D와 하나 이상의 그의 수용체, 예를 들어, 플렉신-B1 및/또는 플렉신-B2의 상호작용을 차단한다. 특정 실시 양태에서 암세포는 플렉신-B1 및/또는 플렉신-B2를 발현한다. 이러한 특성을 갖는 항-SEMA4D 항체는 본원에 제공된 방법에 사용될 수 있다. 사용될 수 있는 항체는 예를 들어, 미국 특허 제8,496,938호에 완전히 기재된 MAb VX15/2503, 67, 76, 2282 및 이들의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체를 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 본원에 제공된 방법에 사용될 수 있는 추가 항체에는 US 2006/0233793 A1에 기재된 BD16 항체 및 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체; 또는 미국 특허 제7,919,594호에 기재된 바와 같은 MAb 301, MAb 1893, MAb 657, MAb 1807, MAb 1656, MAb 1808, Mab 59, MAb 2191, MAb 2274, MAb 2275, MAb 2276, MAb 2277, MAb 2278, MAb 2279, MAb 2280, MAb 2281, MAb 2282, MAb 2283, MAb 2284, 및 MAb 2285 중 어느 하나뿐만 아니라 이들의 임의의 단편, 변이체, 또는 유도체가 포함된다. 특정 실시 양태에서, 본원에 제공된 방법에 사용하기 위한 항-SEMA4D 항체는 인간, 뮤린, 또는 인간 및 뮤린 둘 다의 SEMA4D에 결합한다. 또한, 전술한 임의의 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체 및/또는 전술한 임의의 항체의 결합 또는 활성을 경쟁적으로 억제하는 항체가 유용하다.
특정 측면에서, 항-SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 뮤린 항체 MAb 67 및 인간화 항체 VX15/2503의 6개의 CDR을 포함하며, 이는 인간 IgG4 항체로서 당 업계에서 페피네맙으로 지칭된다. 이들 항체의 가변 중쇄(VH)는 각각 서열 번호 2, 3 및 4를 포함하는 VH CDR 1-3을 포함하고, 가변 경쇄(VL)는 각각 서열 번호 6, 7, 및 8을 포함하는 VL CDR 1-3을 포함한다. 특정 측면에서, 항체는 각각 아미노산 서열, 서열 번호 1 및 서열 번호 5를 포함하는 인간화 VH 및 VL 영역을 포함한다. 특정 측면에서, 항체는 아미노산 서열, 서열 번호 9 및 서열 번호 10을 각각 포함하는 뮤린 VH 및 VL 영역을 포함한다.
치료용 항-SEMA4D 항체를 단일 작용제로서 또는 적어도 하나의 면역 조절 요법과 조합하여 사용하는 치료 방법
본 개시 내용의 방법은 종양 성장 또는 전이의 억제, 지연, 또는 감소를 필요로 하는 대상체, 예를 들어 암 환자에서 이를 억제, 지연, 또는 감소시키기 위해 단일 작용제로서 또는 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 SEMA4D 길항제, 예를 들어, 항-SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 및 유도체를 사용하는 것에 관한 것이다. 본원에 제공된 특정 측면에서, 치료될 대상체는 예를 들어, 말초 혈액 또는 종양 미세환경에서, 치료 전에 MDSC 수준이 감소된, MDSC 수준이 특정 임계 수준 미만인 대상체를 포함한다.
한 측면에서, 본 개시 내용은 대상체에서 악성 세포 성장을 치료, 억제, 지연, 또는 감소시키기 위한 암을 가진 대상체를 선택하는 방법으로서, 대상체의 순환 골수 유래 억제 세포(MDSC) 수준을 결정하는 단계 및 MDSC 수준이 미리 결정된 임계 수준 미만인 경우 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 유효량의 암 면역치료 레지멘을 대상체에 투여함으로써 대상체를 치료하는 단계를 포함하는 방법을 제공한다.
MDSC는 임의의 공지된 방법에 의해 측정될 수 있고, 그 수준은 예를 들어, 말초혈액 또는 종양 미세환경에서 절대 세포 수로서, 또는 말초 혈액 세포의 백분율로서, 또는 말초 혈액 세포의 하위 집단의 백분율로서 표현될 수 있다. 세포는 전형적으로 본원의 다른 곳에서 기재된 바와 같이 유세포 분석에 의해 측정된다. "미리 결정된 임계 수준"은 대상체에서 측정된 MDSC 세포 수준이 정의된 수준 미만, 예를 들어 비교 가능한 암 환자에서 관찰되는 평균 수준 미만 또는 정상의 건강한 공여자에서 전형적으로 측정되는 수준 이하임을 의미한다. 특정 측면에서 "미리 결정된 임계 수준"은 예를 들어 말초 혈액 또는 종양 미세 환경에서 MDSC의 구체적인 절대 수, 또는 세포 집단의 백분율, 예를 들어 총 말초 혈액 단핵 세포 중의 MDSC의 백분율일 수 있다. 특정 측면에서, MDSC의 미리 결정된 임계 수준은 치료 전에 대상체의 총 말초 혈액 단핵 세포의 50% 미만, 40% 미만, 30% 미만, 20% 미만, 또는 10% 미만을 포함한다.
특정 측면에서, MDSC는 단핵 MDSC(M-MDSC)이다. 특정 측면에서, M-MDSC는 세포 표면 마커의 표현형을 포함한다. 예를 들어, M-MDSC의 특정 집단은 CD14, CD11b, 및 CD33을 발현하지만, HLA-DR 마커는 발현하지 않거나 낮은 수준만 발현한다. 특정 세포 표면 마커, 예를 들어 CD3, CD19, 및 CD56를 발현하는 세포는 MDSC 집단에서 제외될 수 있다. 특정 측면에서, M-MDSC는 CD14+, HLA-DR-/low, CD11b+, CD33+, Ln- 표현형을 포함하며, 여기서 Ln은 비-MDSC를 정의하는 마커의 칵테일이다. 전형적인 칵테일에는 CD3, CD19, 및/또는 CD56의 임의의 조합이 포함되지만 이에 제한되지는 않는다. 특정 측면에서, M-MDSC는 CD14 및 높은 수준의 HLA-DR을 발현하지만, CD16은 발현하지 않는다(Krieg et al., Nature Med . 24:144-154 (2018) 참조). 특정 측면에서, MDSC는 CD15 CD66b, 및/또는 CD33을 발현하지만 CD14는 발현하지 않는 다형핵 MDSC(PMN-MDSC)이다. 다른 MDSC 표현형은 당업자에게 용이하게 명백할 것이다.
특정 측면에서, 암 면역치료 레지멘의 일부로서 투여되는 항-SEMA4D 항체 또는 이의 단편은 SEMA4D와 이의 수용체, 예를 들어, 플렉신-B1, 플렉신-B2, CD72, 또는 이들의 임의의 조합의 상호작용을 억제한다. 특정 측면에서, 암 면역치료 레지멘의 일부로서 투여되는 항-SEMA4D 항체 또는 이의 단편은 SEMA4D 매개된 신호 전달을 억제한다. 적합한 항-SEMA4D 항체는 본원의 다른 곳에 개시되어 있으며 페피니맙을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다.
특정 측면에서, 암 면역치료 레지멘은 조합 치료이고, 예를 들어 적어도 하나의 면역 조절제일 수 있는 추가의 암 면역치료제의 투여를 추가로 포함한다. 적합한 면역요법 및 면역조절제는 본원의 다른 곳에서 기재된다. 특정 측면에서, 추가의 암 면역치료제는 면역 체크포인트 차단제, 예를 들어 CTLA4, PD-1, PD-L1, LAG3, TIM3, B7-H3, 또는 이들의 임의의 조합에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편이다. 특정 측면에서 체크포인트 차단 항체는 항-PD-L1 항체 아벨루맙이다.
제공된 방법은 임의의 암, 예를 들어, 고형 종양, 혈액 악성 종양, 이들의 임의의 전이, 또는 이들의 임의의 조합을 갖는 대상체를 선택하고 치료하는 데 사용될 수 있다. 특정 측면에서, 고형 종양은 육종, 암종, 흑색종, 이들의 임의의 전이, 또는 이들의 임의의 조합이다. 특정 측면에서, 고형 종양은 편평 세포 암종, 선암종, 기저 세포 암종, 신세포 암종, 유방의 유관암종, 연조직 육종, 골육종, 흑색종, 소세포 폐암, 비소세포 폐암, 폐의 선암종, 복막암, 간세포 암종, 위장관암, 위암, 췌장암, 신경내분비암, 교모세포종, 자궁경부암, 난소암, 간암, 방광암, 뇌암, 간종양, 유방암, 결장암, 결장직장암, 자궁내막 또는 자궁 암종, 식도암, 타액선 암종, 신장암, 간암, 전립선암, 외음부암, 갑상선암, 두경부암, 이들의 임의의 전이, 또는 이들의 조합일 수 있다. 특정 측면에서 암은 비소세포 폐암이다. 특정 측면에서 혈액 악성 종양은 백혈병, 림프종, 골수종, 급성 골수성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 급성 림프구성 백혈병, 만성 림프구성 백혈병, 털세포 백혈병, 호지킨 림프종, 비호지킨 림프종, 다발성 골수종, 또는 이들의 임의의 전이, 또는 이들의 임의의 조합이다.
본 개시 내용에 의해 제공되는 방법은 수술, 화학요법, 방사선 요법, 암 백신의 투여, 면역자극제의 투여, 입양 T 세포 요법, 조절 T 세포(Treg) 조절제의 투여, 또는 이들의 임의의 조합을 포함하지만 이에 제한되지 않는 추가의 암 요법의 투여를 추가로 포함할 수 있다.
특정 양태에서, 암세포, 또는 암세포 부근의 세포는 SEMA4D 수용체를 발현하고, 특정 실시 양태에서 수용체는 플렉신-B1이다. 다음 논의는 항-SEMA4D 항체의 투여에 관한 것이지만, 본원에 기재된 방법은 예를 들어 본 개시 내용의 항체의 원하는 특성을 보유하는, EMA4D, 예를 들어 인간, 마우스, 또는 인간 및 마우스 SEMA4D에 특이적으로 결합하고/거나, SEMA4D 중화/길항제 활성을 갖고/거나, SEMA4D와 이의 임의의 하나 이상의 수용체의 상호작용을 차단할 수 있는 항-SEMA4D 항체의 항원 결합 단편, 변이체, 및 유도체를 포함하는 임의의 SEMA4D 길항제, 즉, SEMA4D와 이의 수용체의 상호작용을 억제하는 작용제에 동등하게 적용 가능하다. 본원에 기재된 방법은 또한 SEMA4D 길항체의 원하는 특성을 보유하는, 예를 들어 SEMA4D, 예를 들어 인간, 마우스, 또는 인간 및 마우스 SEMA4D에 특이적으로 결합하고/거나, SEMA4D 중화/길항제 활성을 갖고/거나, SEMA4D와 이의 수용체의 상호작용을 차단할 수 있는 다른 생물학적 생성물 또는 소분자 약물에 적용 가능하다.
한 실시 양태에서, SEMA4D 길항제, 예를 들어 항-SEMA4D 항체 또는 이의 단편, 변이체, 또는 유도체는 종양 성장의 억제, 지연, 또는 감소를 필요로 하는 대상체, 예를 들어 암 환자에서 종양 성장을 억제, 지연, 또는 감소시키기 위해 단일 작용제로서 사용될 수 있으며, 여기서 특정 측면에서, 대상체는 치료 전에 MDSC가 특정 임계 수준 미만인 대상체로서 식별된다. 다른 측면에서, SEMA4D 길항제, 예를 들어 항-SEMA4D 항체 또는 이의 단편, 변이체, 또는 유도체는 암 백신, 면역 자극제, 입양 T 세포 또는 항체 요법, 및 면역 체크포인트 억제제와 같은, 그러나 이에 제한되지 않는 암 면역요법을 포함하는 다른 암 요법과 조합하여 투여될 수 있다.
암 백신 . 암 백신은 암과 같은 비정상적인 세포에 대해 신체의 면역계와 자연적인 내성을 활성화하여 질병을 근절하거나 통제한다. 암 백신은 일반적으로 종양 항원 특이적 헬퍼 세포 및/또는 CTL 및 B 세포를 활성화하는 면역원성 제제 내의 종양 항원으로 이루어진다. 백신은 수지상 세포, 특히 종양 세포 또는 종양 항원으로 펄스된 자가 수지상 세포, GM-CSF와 같은 면역 자극제로 형질감염된 이종 종양 세포, 재조합 바이러스, 또는 일반적으로 CpG와 같은 강력한 면역 보조제와 함께 투여되는 단백질 또는 펩티드를 포함하지만 이에 제한되지 않는 다양한 제제일 수 있다.
면역 자극제 . 면역 자극제는 다양한 기전을 통해 많은 암 환자에서 억제되는 종양에 대한 면역 반응을 향상 또는 증가시키는 작용을 한다. 면역 조절 요법은 림프구, 대식세포, 수지상 세포, 자연 살해 세포(NK 세포), 또는 이들 세포의 서브세트, 예컨대 세포독성 T 림프구(CTL) 또는 자연 살해 T(NKT) 세포를 표적화할 수 있다. 상호 작용하는 면역 캐스케이드 때문에, 한 세트의 면역 세포에 대한 효과는 종종 다른 세포로 확산되어 증폭된다. 예를 들어, 향상된 항원 제시 세포 활성은 T 및 B 림프구의 반응을 촉진한다. 면역 자극제의 예로는 HER2, 사이토카인, 예컨대 G-CSF, GM-CSF 및 IL-2, 박테리아로부터의 세포막 분획, 자연 살해 T(NKT) 세포를 활성화하기 위해 CD1d와 결합하는 당지질, CpG 올리고뉴클레오티드가 포함되지만 이에 제한되지는 않는다.
면역계의 골수 식세포인 대식세포는 T 세포 동원 및 활성화를 유도하여 특이적 면역을 촉진할 수 있는 선천적 방어 기전의 기본적인 부분이다. 그럼에도 불구하고, 종양 미세 환경 내에서의 이들의 존재는 향상된 종양 진행과 연관되었으며 암 세포 성장 및 확산, 혈관 신생 및 면역 억제를 촉진하는 것으로 나타났다. 그들의 표현형 설정에 중요한 역할을 하는 것은 대식세포가 노출되는 미세환경 신호이며, 이는 M1(종양 억제 대식세포) 및 M2(종양 촉진 대식세포) 양극단을 포함하는 기능적 스펙트럼 내에서 그들의 기능을 선택적으로 조정한다. Sica et al., Seminars in Cancer Biol . 18:349-355 (2008). 암 동안 증가된 대식세포 수는 일반적으로 불량한 예후와 상관관계가 있다(Qualls and Murray, Curr . Topics in Develop. Biol . 94:309-328 (2011)). 고형 종양에 공통적인 여러 고유한 기질 세포 유형 중에서 종양 관련 대식세포(TAM: tumor-associated macrophage)는 종양 진행을 촉진하는 데 중요하다. TAM 분극화를 조절하는 표적화 분자 경로는 항암 요법에 큰 가능성을 갖는다. Ruffell et al., Trends in Immunol. 33:119-126 (2012).
입양 세포 전달 . 입양 세포 전달은 암세포를 공격하기 위해 T 세포 기반 세포 독성 반응을 사용할 수 있다. 환자의 암에 대해 자연적 또는 유전적으로 조작된 반응성을 갖는 자가 T 세포는 시험관 내에서 생성 및 확장된 다음 암 환자에게 다시 전달된다. 한 연구에서는 시험관 내 확장된 자가 종양 침윤 림프구의 입양 전달이 전이성 흑색종 환자에게 효과적인 치료법임을 입증하였다(Rosenberg SA, Restifo NP, Yang JC, Morgan RA, Dudley ME (April 2008). Nat. Rev. Cancer 8 (4): 299-308). 이것은 절제된 환자 종양 내에서 발견되는 T 세포를 취함으로써 달성될 수 있다. 이러한 T 세포를 종양 침윤 림프구(TIL: tumor-infiltrating lymphocyte)라고 하며 종양 항원에 대한 특이성으로 인해 종양으로 수송된 것으로 추정된다. 이러한 T 세포는 고농도의 IL-2, 항-CD3 및 동종-반응성 피더(feeder) 세포를 사용하여 시험관 내에서 증식하도록 유도될 수 있다. 그런 다음 이 T 세포는 항암 활성을 더욱 높이기 위해 IL-2의 외인성 투여와 함께 환자에게 다시 전달된다. 다른 연구에서, 자가 T 세포는 표적화된 종양 항원에 반응성이 되게 하는 키메라 항원 수용체("CAR-T 세포")로 형질도입되었다(예를 들어, Liddy et al., Nature Med . 18:980-7, (2012); Grupp et al., New England J. Med . 368:1509-18, (2013); Petitt, et al., Mol Ther. 26:342-353 (2018) 참조).
다른 입양 세포 전달 요법은 환자에게 재주입되는 생체 외에서 천연 또는 변형된 종양 항원에 노출된 자가 수지상 세포를 사용한다. Provenge는 전립선 종양 환자를 치료하기 위해 자가 세포를 전립선 산 포스파타제 및 GM-CSF의 융합 단백질과 함께 인큐베이션하는 FDA 승인 요법이다. GM-CSF는 항원 제시 수지상 세포의 분화 및 활성을 촉진하는 것으로 생각된다(Small et al., J. Clin. Oncol. 18: 3894-903(2000); 미국 특허 제7,414,108호).
면역 체크포인트 억제제 . 면역 체크포인트 억제제 요법은 진행 중인 면역 반응을 제한하는 음성 피드백 제어를 제거하여 T 세포 면역을 향상시킨다. 이러한 유형의 치료법은 말초 조직(항-CTLA4)에서 또는 PD-L1을 발현하는 종양 조직(항-PD-1 또는 항-PD-L1)에서 부수적인 조직 손상을 최소화하기 위해 생리학적 면역 반응의 기간과 진폭을 조절하는 데 중요한 면역계에서의 억제 경로를 표적화한다. 종양은 종양 항원에 특이적인 T 세포에 대한 면역 내성의 주요 기전으로서 특정 면역 체크포인트 경로를 이용하도록 진화할 수 있다. 많은 면역 체크포인트가 리간드-수용체 상호작용에 의해 개시되기 때문에, 이러한 체크포인트는 수용체 또는 리간드에 대한 항체에 의해 차단될 수 있거나 리간드 또는 수용체의 가용성 재조합 형태에 의해 조절될 수 있다. 면역 체크포인트의 중화는 종양 특이적 T 세포가 다른 면역 억제성 종양 미세 환경에서 계속 기능을 할 수 있도록 허용한다. 면역 체크포인트 차단 요법의 예는 세포독성 T 림프구 관련 항원 4(CTLA-4), PD-1, 이의 리간드 PD-L1, LAG3 및 B7-H3을 표적화하는 것들이다.
시클로포스파미드 . 일반적으로 사용되는 화학요법제인 시클로포스파미드는 면역 반응을 향상시킬 수 있다. 시클로포스파미드는 이펙터 T 세포에 비해 조절 T 세포(Treg)의 기능을 차등적으로 억제한다. Treg는 항암 면역 반응을 조절하는 데 중요하다. 종양 침윤 Treg는 이전에 불량한 예후와 관련이 있어 왔다. Treg를 표적화하는 작용제는 현재 이용할 수 없지만, 시클로포스파미드는 다른 T 세포에 비해 Treg를 우선적으로 억제할 수 있고 따라서 항종양 면역 반응의 더 효과적인 유도를 허용하는 임상적으로 실현 가능한 작용제로 부상하였다.
기타 면역 조절 요법 . 또 다른 실시 양태에서, SEMA4D 길항제, 예를 들어 SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체를 사용한 요법은 저용량 화학요법 또는 방사선 요법과 조합될 수 있다. 표준 화학요법은 종종 면역억제적이지만, 저용량의 화학요법제, 예컨대 시클로포스파미드, 독소루비신, 및 파클리탁셀은 암을 위한 백신 요법에 대한 반응을 향상시키는 것으로 나타났다(Machiels et al., Cancer Res. 61:3689-3697 (2001)). 일부 경우에, 화학 요법이 종양 환경에서 면역 반응을 음성적으로 조절하는 T 조절 세포(Treg)와 골수 유래 억제 세포(MDSC)를 차등적으로 비활성화할 수 있다. 방사선 요법은 일반적으로 이온화 방사선의 직접적인 살종양 효과를 이용하기 위해 사용되었다. 실제로, 고선량 방사선은 화학요법과 마찬가지로 면역억제성이 될 수 있다. 그러나 많은 관찰에 따르면 선량 분할 및 순서의 적절한 조건하에서 방사선 요법은 종양 특이적 면역 반응과 면역 조절제의 효과를 향상시킬 수 있다. 이 효과에 기여하는 여러 기전 중 하나는 방사선 유도 종양 세포 사멸에 의해 방출된 종양 항원의 수지상 세포 및 기타 항원 제시 세포에 의한 교차 제시이다(Higgins et al., Cancer Biol. Ther. 8:1440-1449 (2009)). 실제로, 방사선 요법은 종양에 대한 제자리 백신 접종을 유도할 수 있으며(Ma et al., Seminar Immunol. 22:113-124 (2010)) 이는 SEMA4D 길항제, 예를 들어 SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체를 이용한 요법과 조합하여 증폭될 수 있다.
한 실시 양태에서, 면역 조절 요법은 IL-2, IL-7, IL-12와 같은 인터루킨; 과립구-대식세포 집락 자극 인자(GM-CSF), 인터페론과 같은 사이토카인; CXCL13, CCL26, CXCL7과 같은 다양한 케모카인; 항-CTLA-4, 항-PD-1, 항-PD-L1, 항-LAG3 및 항-B7-H3과 같은 면역 체크포인트 차단의 길항제; 합성 시토신 포스페이트-구아노신(CpG), 올리고데옥시뉴클레오티드, 글루칸, 시클로포스파미드와 같은 조절 T 세포(Treg)의 조절제, 또는 기타 면역 조절제를 포함하지만 이에 제한되지 않는 면역 조절제일 수 있다. 한 실시 양태에서, 면역 조절제는 4-1BB(CD137)에 대한 아고니스트 항체이다. 최근 보고된 바와 같이, 4-1BB에 대한 이러한 아고니스트 항체는 종양에 대해 높은 세포독성을 갖는 신규 부류의 KLRG1+ T 세포를 생성할 수 있다(Curran et al., J. Exp. Med . 210:743-755 (2013)). 모든 경우에, 추가의 면역 조절 요법은 SEMA4D 길항제, 예를 들어 항-SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체 요법 전, 중 또는 후에 투여된다. 조합 요법이 항-SEMA4D 결합 분자, 예를 들어 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체의 투여를 또 다른 면역 조절제의 투여와 조합하여 포함하는 경우, 본 개시 내용의 방법은 동시에 또는 어느 순서로든 연속 투여되는 별도의 제제 또는 단일 약학 제제를 사용하는 공동-투여를 포함한다.
한 실시 양태에서, 면역 조절 요법은 수술 또는 외과적 절차(예를 들어, 비장절제술, 간 절제술, 림프절 절제술, 백혈구 성분 채집술, 골수 이식 등); 방사선 요법; 경우에 따라 자가 골수 이식, 또는 기타 암 요법과 조합된, 화학요법을 포함하지만 이에 제한되지 않는 암 치료제일 수 있으며; 이 경우 추가의 암 요법은 SEMA4D 길항제, 예를 들어 항-SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체 요법 전, 중 또는 이후에 투여된다. 조합 요법이 항-SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체의 투여를 또 다른 치료제의 투여와 조합하여 포함하는 경우, 본 개시 내용의 방법은 동시에 또는 어떤 순서로든 연속 투여되는 별도의 제제 또는 단일 약학 제제를 사용하는 공동-투여를 포함한다.
또 다른 실시 양태에서, 본 개시 내용은 뇌, 폐, 난소, 유방, 결장에서 발견되는 것과 같은 고형 종양이 있는 다른 환자, 또는 혈액암이 있는 다른 환자와 비교할 때 치료 전에 순환 중인 MDSC 수준이 감소된, 예를 들어 미리 결정된 임계 수준 미만인 암 환자를 치료하기 위한 단일 작용제로서 또는 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 SEMA4D 길항제, 예를 들어, 항-SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체의 용도에 관한 것이다. 본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "감소된"은 다른 암 환자보다 순환 중인 평균 MDSC 수가 90% 미만, 80% 미만, 70% 미만, 60% 미만, 50% 미만, 40% 미만, 30% 미만, 또는 20% 미만인 암 환자를 지칭한다. MDSC의 수는 MDSC인, 예를 들어 말초 혈액에서 절대 수(예를 들어, ㎕당 세포로 측정됨)로서, 또는 말초 혈액에서 총 세포 집단의 백분율(예를 들어, 단핵 세포의 백분율 또는 다형핵 세포의 백분율)로서 측정될 수 있다. MDSC의 수는 또한 환자의 종양 미세 환경에서 측정될 수 있다(총 세포로서 또는 세포 집단의 백분율로서). MDSC는 M-MDSC, 예를 들어 CD14+, HLA-DR-/low, CD11b+, CD33+, Ln- 표현형을 갖는 MDSC일 수 있으며, 여기서 Ln은 비-MDSC을 정의하는 마커, 예를 들어 CD3, CD19, 및/또는 CD56 중 하나 이상의 칵테일이다.
또 다른 실시 양태에서, 본 개시 내용은 치료 전에 순환 중인 MDSC 수준이 정상 개체 범위 이내 또는 그 미만에 속하는 암 환자를 치료하기 위한 단일 작용제로서 또는 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 SEMA4D 길항제, 예를 들어 항-SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체의 용도에 관한 것이다. 본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "정상"은 건강한 비암 환자에서 발견되는 MDSC 또는 임의의 특정 MDSC 집단의 수준을 지칭한다. 본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "이내"는 MDSC 수준에서 십(10)% 차이를 의미한다. 물론, 당업자는 MDSC 수준이 다양한 인자, 예를 들어 암의 유형, 암의 단계 등에 따라 달라질 수 있고, 따라서 상기에 제공된 수준보다 높은 수준이 또한 암의 특정 유형 또는 단계에 대한 감소된 수준을 구성할 수 있음을 이해할 것이다. MDSC의 수는 MDSC인, 예를 들어 말초 혈액에서 절대 수(예를 들어, ㎕당 세포로 측정됨)로서, 또는 말초 혈액에서 총 세포 집단의 백분율(예를 들어, 단핵 세포의 백분율 또는 다형핵 세포의 백분율)로서 측정될 수 있다. MDSC의 수는 또한 환자의 종양 미세 환경에서 측정될 수 있다(총 세포로서 또는 세포 집단의 백분율로서). MDSC는 M-MDSC, 예를 들어 CD14+, HLA-DR-/low, CD11b+, CD33+, Ln- 표현형을 갖는 MDSC일 수 있으며, 여기서 Ln은 비-MDSC를 정의하는 마커, 예를 들어 CD3, CD19, 및/또는 CD56 중 하나 이상의 칵테일이다. 일부 실시 양태에서, 절대적 또는 상대적 MDSC 세포 카운트는 표준 유세포 측정 기반 면역표현형 분석과 같은 면역표현형 분석을 사용하여 측정될 수 있다.
본원에 기재된 방법은 예를 들어 항-플렉신-B1 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함한 임의의 SEMA4D 길항제에 적용 가능하며, 여기서 항-플렉신-B1 항체는 플렉신-B1에 대한 SEMA4D의 결합을 차단하고/거나 SEMA4D에 의한 플렉신-B1의 활성화를 방지함으로써 SEMA4D와 플렉신-B1의 상호작용을 억제하는 데 사용될 수 있다. 본원에 기재된 방법은 SEMA4D 또는 플렉신-B1의 활성을 억제하는 소분자 SEMA4D 길항제 또는 기타 생물학적 생성물의 사용에도 적용 가능하다. 일부 실시 양태에서, 항-SEMA4D 결합 분자 이외의 소분자 약물 또는 생물학적 생성물은 플렉신-B1에 대한 SEMA4D의 결합을 차단하고/거나 SEMA4D에 의한 플렉신-B1의 활성화를 방지함으로써 SEMA4D와 플렉신-B1의 상호작용을 억제하는 데 사용될 수 있다.
한 실시 양태에서, 치료는 환자가 암세포의 전이를 갖거나 이를 발병할 위험이 있는 경우, 단일 작용제로서 또는 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 본원에 기재된 바와 같은 항-SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 환자에 대한 적용 또는 투여, 또는 단일 작용제로서 또는 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 항-SEMA4D 항체의 환자로부터 단리된 조직 또는 세포주에 대한 적용 또는 투여를 포함한다. 특정 측면에서, 치료 전에 환자는 MDSC 수준이 감소된, 예를 들어 미리 결정된 임계 수준 미만이다. 또 다른 실시 양태에서, 치료는 또한 환자가 암세포의 전이를 갖거나 이를 발병할 위험이 있는 경우, 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 항-SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 약학 조성물을 환자에 대한 적용 또는 투여, 또는 항-SEMA4D 항체를 포함하는 약학 조성물 및 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법의 환자로부터 단리된 조직 또는 세포주에 대한 적용 또는 투여를 포함하는 것으로 의도된다.
단일 작용제로서 또는 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 본원에 기재된 바와 같은 항-SEMA4D 항체 또는 이의 결합 단편은 다양한 악성 및 비-악성 종양의 치료에 유용하다. 특정 측면에서, 치료 전에 환자는 MDSC 수준이 감소된, 예를 들어 미리 결정된 임계 수준 미만이다. "항종양 활성"은 직접적으로는 종양과 또는 간접적으로는 종양 환경의 기질 세포와 관련된 SEMA4D 생성 또는 축적 속도의 감소, 따라서 기존 종양 또는 치료 중에 발생하는 종양의 성장 속도 감소, 및/또는 기존 신생물(종양) 세포 또는 새로 형성된 신생물 세포의 파괴, 따라서 요법 중에 종양의 전체 크기 및/또는 전이 부위 수의 감소를 의미한다. 예를 들어, 단일 작용제로서 또는 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 적어도 하나의 항-SEMA4D 항체를 이용한 요법은 인간에서 SEMA4D 발현 세포와 관련된 질환 상태의 치료와 관련하여 유익한 생리학적 반응, 예를 들어 전이 감소를 유발한다.
한 실시 양태에서, 본 개시 내용은 암의 치료 또는 예방에 있어 또는 종양 세포의 성장 또는 전이를 억제, 감소, 예방, 지연, 또는 최소화하기 위해 전암 상태 또는 병변에 사용하기 위한 의약으로서, 단일 작용제로서 또는 적어도 하나 이상의 다른 면역 조절 요법과 조합된 항-SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체의 용도에 관한 것이다. 특정 측면에서, 치료 전에 환자는 MDSC 수준이 감소된, 예를 들어 미리 결정된 임계 수준 미만이다.
본 개시 내용의 방법에 따르면, 단일 작용제로서 또는 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 적어도 하나의 항-SEMA4D 결합 분자, 예를 들어, 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체는 악성 인간 세포에 대한 양성 치료 반응을 촉진하는 데 사용될 수 있다. 암 치료와 관련하여 "양성 치료 반응"은 이들 결합 분자, 예를 들어 항체 또는 이의 단편의 항종양 활성과 관련된 질환의 개선, 및/또는 질환과 관련된 증상의 개선을 의미한다. 특히, 본원에 제공된 방법은 환자에서 종양의 성장 및/또는 원발성 종양의 전이 발생을 억제, 예방, 감소, 경감, 지연, 또는 약화시키는 것에 관한 것이다. 즉, 원위부 종양 성장의 예방을 관찰할 수 있다. 따라서, 예를 들어 질환의 개선은 완전 반응으로서 특성화될 수 있다. "완전 반응"이란 예를 들어 원발성 종양 부위 또는 골수에 종양 전이의 존재에서 임의의 이전에 비정상적이었던 방사선학적 연구가 정상화된 임상적으로 검출 가능한 전이의 부재를 의미한다. 대안적으로, 질환의 개선은 부분 반응으로서 분류될 수 있다. "부분 반응"이란 모든 측정 가능한 전이(즉, 대상체에서 원발성 종양으로부터 원격 부위에 존재하는 종양 세포의 수)에서 적어도 약 50% 감소를 의미한다. 대안적으로, 질환의 개선은 무재발 생존 또는 "무진행 생존"으로서 분류될 수 있다. "무재발 생존"이란 임의의 부위에서 종양이 재발할 때까지의 기간을 의미한다. "무진행 생존"은 모니터링되고 있는 부위에서 종양의 추가 성장이 검출될 수 있기 전의 기간이다.
전이의 억제, 지연, 또는 감소는 영상화, 예를 들어 형광 항체 영상화, 뼈 스캔 영상화, 및 골수 흡인(BMA: bone marrow aspiration)을 포함하는 종양 생검 샘플링, 또는 면역조직화학과 같은 스크리닝 기술을 사용하여 평가할 수 있다. 이러한 양성 치료 반응 이외에, 항-SEMA4D 결합 분자, 예를 들어, 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체로 치료를 받는 대상체는 질환과 관련된 증상의 개선의 유익한 효과를 경험할 수 있다.
임상 반응은 자기 공명 영상(MRI: magnetic resonance imaging) 스캔, x-방사선 영상화, 컴퓨터 단층 촬영(CT: computed tomographic) 스캔, 유세포 분석 또는 형광 활성화 세포 분류기(FACS: fluorescence-activated cell sorter) 분석, 조직학, 육안 병리, 및 혈액 화학(ELISA, RIA, 크로마토그래피 등에 의해 검출 가능한 변화를 포함하지만 이에 제한되지는 않음)과 같은 스크리닝 기술을 사용하여 평가할 수 있다.
특정 실시 양태에서 본 개시 내용의 방법 및 시스템을 적용하기 위해, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 유효량의 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 요법의 고형 종양 또는 혈액암이 있는 대상체에 투여 전 또는 후에 환자로부터 샘플을 수득할 수 있다. 샘플은, 본원의 다른 곳에서 제공된 방법에 따라 특정 바이오마커, 예를 들어 MDSC 수준에 대해 스크리닝할 수 있다. 일부 경우에, 요법이 시작된 후 또는 요법이 중단된 후에 환자로부터 연속적인 샘플을 수득할 수 있으며, 이러한 샘플은 마찬가지로 특정 바이오마커, 예를 들어 MDSC 수준에 대해 스크리닝할 수 있다. 샘플은 예를 들어 의료 제공자(예를 들어, 의사) 또는 의료 혜택 제공자에 의해 요청될 수 있으며, 동일하거나 상이한 의료 제공자(예를 들어, 간호사, 병원) 또는 임상 검사실에 의해 수득되고/거나 처리될 수 있으며, 처리 후 결과는 또 다른 의료 제공자, 의료 혜택 제공자 또는 환자에게 전달될 수 있다. 유사하게, 하나 이상의 점수의 측정/결정, 점수 간의 비교, 점수의 평가 및 치료 결정은 하나 이상의 의료 제공자, 의료 혜택 제공자, 및/또는 임상 실험실에 의해 수행될 수 있다.
본원에 사용되는 바와 같이, 용어 "의료 제공자"는 살아있는 대상체, 예를 들어 인간 환자에게 직접 상호작용하고 투여하는 개인 또는 기관을 지칭한다. 의료 제공자의 비제한적 예에는 의사, 간호사, 기술자, 치료사, 약사, 상담사, 대체 의학 의사, 의료 시설, 의원, 병원, 응급실, 진료소, 응급 의료 센터, 대체 의학 진료소/시설, 및 일반 및/또는 전문 치료, 평가, 유지, 요법, 약물치료, 및/또는 환자의 건강 상태의 전부 또는 어느 일부와 관련된 권고(일반 의료, 전문 의료, 외과적, 및/또는 임의의 다른 유형의 치료, 평가, 유지, 요법, 약물치료 및/또는 권고를 포함하지만 이에 제한되지는 않음)를 제공하는 기타 모든 것이 포함된다.
일부 측면에서, 의료 제공자는 대상체가 암에 걸렸거나 암을 가진 것으로 의심되는 경우, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 유효량의 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 요법을 투여하거나 투여하도록 다른 의료 제공자에게 지시할 수 있다. 의료 제공자는 다음 작업을 수행하거나 수행하도록 다른 의료 제공자 또는 환자에게 지시할 수 있다: 샘플 수득, 샘플 처리, 샘플 제출, 샘플 수령, 샘플 전송, 샘플 분석 또는 측정, 샘플 정량화, 샘플을 분석/측정/정량화한 후 얻은 결과 제공, 샘플을 분석/측정/정량화한 후 얻은 결과 수신, 하나 이상의 샘플을 분석/측정/정량화한 후 얻은 결과 비교/채점, 하나 이상의 샘플로부터의 비교/점수 제공, 하나 이상의 샘플로부터의 비교/점수 획득, 대상체가 암에 걸렸거나 암을 가진 것으로 의심되는 경우, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 요법(예를 들어, 유효량의 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편)의 대상체에 투여, 요법 투여의 시작, 요법 투여의 중단, 요법 투여의 지속, 요법 투여의 일시적 중단, 투여되는 치료제의 증량, 투여되는 치료제의 감량, 일정량의 치료제 투여의 지속, 치료제의 투여 빈도 증가, 치료제의 투여 빈도 감소, 치료제에 대해 동일한 투여 빈도 유지, 요법 또는 치료제를 적어도 다른 요법 또는 치료제로 교체, 요법 또는 치료제를 적어도 다른 요법 또는 추가 치료제와 조합. 일부 측면에서, 의료 혜택 제공자는 예를 들어 샘플 수집, 샘플 처리, 샘플 제출, 샘플 수령, 샘플 전송, 샘플 분석 또는 측정, 샘플 정량화, 샘플을 분석/측정/정량화한 후 얻은 결과 제공, 샘플을 분석/측정/정량화한 후 얻은 결과 전송, 하나 이상의 샘플을 분석/측정/정량화한 후 결과 비교/채점, 하나 이상의 샘플로부터의 비교/점수 전송, 요법 또는 치료제의 투여, 요법 또는 치료제 투여의 시작, 요법 또는 치료제 투여의 중단, 요법 또는 치료제 투여의 지속, 요법 또는 치료제 투여의 일시적인 중단, 투여되는 치료제의 증량, 투여되는 치료제의 감량, 일정량의 치료제 투여의 지속, 치료제의 투여 빈도 증가, 치료제의 투여 빈도 감소, 치료제에 대해 동일한 투여 빈도 유지, 요법 또는 치료제를 적어도 다른 요법 또는 치료제로 교체, 또는 요법 또는 치료제를 적어도 다른 요법 또는 추가 치료제와 조합을 승인 또는 거부할 수 있다.
추가로, 의료 혜택 제공자는 예를 들어, 요법의 처방을 승인 또는 거부하고, 요법에 대한 보장을 승인 또는 거부하고, 요법 비용에 대한 상환을 승인 또는 거부하고, 요법에 대한 적격성을 결정 또는 거부할 수 있다.
일부 측면에서, 임상 검사실은 예를 들어 샘플을 수집 또는 수득하고, 샘플을 처리하고, 샘플을 제출하고, 샘플을 수령하고, 샘플을 전송하고, 샘플을 분석 또는 측정하고, 샘플을 정량화하고, 샘플을 분석/측정/정량화한 후 얻은 결과를 제공하고, 샘플을 분석/측정/정량화한 후 얻은 결과를 수신하고, 하나 이상의 샘플을 분석/측정/정량화한 후 얻은 결과를 비교/채점하고, 하나 이상의 샘플로부터 비교/점수를 제공하고, 하나 이상의 샘플, 또는 기타 관련 활성으로부터 비교/점수를 얻을 수 있다.
진단 및 치료 방법
특정 실시 양태에서, 본 개시 내용은 대상체가 MDSC 수준이 미리 정해진 임계 수준 미만인 경우, 대상체, 예를 들어 암 환자를 치료하는 방법으로서, 대상체의 MDSC 수준이 미리 정해진 임계 수준 미만이거나 다른 암환자 또는 건강한 비암성 환자로부터의 샘플을 포함할 수 있지만 이에 제한되지 않는 하나 이상의 대조군 샘플에서의 MDSC 수준 이하인 경우, 단독 또는 본원에 다른 곳에 제공된 바와 같은 적어도 하나의 다른 면역 조절제와 조합하여 SEMA4D 길항제, 예를 들어, 항-SEMA4D 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체를 투여하는 단계를 포함하는 방법을 제공한다. 절대 수준 또는 다른 세포 집단의 백분율인 MDSC 수준은 의료 제공자에 의해 또는 임상 실험실에 의해 측정될 수 있으며, 여기서 샘플, 예를 들어 혈액 샘플 또는 종양 생검은 의료 제공자 또는 임상 실험실에서 의해 환자로부터 수득된다. 한 측면에서, 환자의 MDSC 수준은 세포측정 기반 면역표현형 분석과 같은 면역표현형 분석으로 측정될 수 있다.
본 개시 내용은 대상체가 암에 걸렸거나 암을 가진 것으로 의심되는 경우, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 유효량의 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 의한 치료로부터 대상체, 예를 들어 암 환자가 이익을 얻을 지 여부에 대한 의료 제공자, 의료 혜택 제공자, 또는 임상 실험실에 의한 결정을 용이하게 하는 방법, 분석, 및 키트를 또한 제공한다. 본원에 제공된 방법, 분석, 및 키트는 또한 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 유효량의 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 의한 치료로부터 대상체, 예를 들어 암 환자가 이익을 얻을 지 여부에 대한 의료 제공자, 의료 혜택 제공자, 또는 임상 실험실에 의한 결정을 용이하게 할 것이다.
본 개시 내용은 대상체, 예를 들어 암 환자를 치료하는 방법으로서, 치료 전에 환자로부터 채취한 샘플에서 대상체의 MDSC 수준이 미리 정해진 임계 수준 미만이거나, 하나 이상의 대조군 샘플에서의 MDSC 수준 이하인 경우, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 유효량의 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 투여하는 단계를 포함하는 방법을 제공한다. 특정 측면에서, 샘플은 환자로부터 수득되고 샘플에서 MDSC 수준 측정을 위해 예를 들어 임상 실험실에 제출된다.
또한, 대상체, 예를 들어 암 환자를 치료하는 방법으로서, (a) 샘플 중의 MDSC 수준 측정을 위해 대상체로부터 채취한 샘플을 제출하는 단계; 및 대상체의 MDSC 수준이 미리 정해진 임계 수준 미만이거나, 하나 이상의 대조군 샘플에서의 MDSC 수준 이하인 경우, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 유효량의 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 투여하는 단계를 포함하는 방법이 제공된다.
또한, 본 개시 내용은 대상체, 예를 들어 암 환자를 치료하는 방법으로서, (a) 대상체, 예를 들어 암 환자로부터 수득된 샘플 중의 MDSC 수준을 측정하는 단계로서, 샘플에서 대상체의 MDSC 수준은 예를 들어 세포측정 기반 면역표현형 분석으로 측정되는 것인 단계; (b) 샘플 중의 MDSC 수준이 미리 결정된 임계 수준 미만이거나, 하나 이상의 대조군 샘플에서의 MDSC 수준 이하인지 여부를 결정하는 단계; 및 (c) 대상체의 MDSC 수준이 미리 결정된 임계 수준 미만이거나, 하나 이상의 대조군 샘플에서의 MDSC 수준 이하인 경우, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 유효량의 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 투여하도록 의료 제공자에게 권고, 지시, 또는 승인하는 단계를 포함하는 방법을 제공한다.
특정 측면에서, 대상체의 MDSC 수준은 세포측정 기반 면역표현형 분석으로 측정될 수 있다. 특정 측면에서, 분석은 예를 들어 "현장 진료(point of care)" 진단 키트로서 제제화된 본원에 기재된 바와 같은 분석을 사용하여 환자를 치료하는 의료 전문가에 의해 대상체로부터 수득된 샘플에 대해 수행될 수 있다. 특정 측면에서, 샘플은 대상체로부터 수득될 수 있고, 본원에 기재된 바와 같이 세포측정 기반 면역표현형 분석을 사용하여(이를 포함하지만 이에 제한되지는 않음) 의료 전문가의 지시에 따라 샘플 중의 MDSC 수준 측정을 위해, 예를 들어, 임상 실험실에 제출될 수 있다. 특정 측면에서, 분석을 수행하는 임상 실험실은 대상체의 MDSC 수준이 미리 결정된 임계 수준 미만이거나, 하나 이상의 대조군 샘플에서의 MDSC 수준 이하인 경우, 세마포린-4D(SEMA4D)에 특이적으로 결합하는 유효량의 단리된 결합 단편 및 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법에 의한 치료로부터 대상체가 이익을 얻을 수 있는 지 여부에 대하여 의료 제공자 또는 의료 혜택 제공자에게 권고할 수 있다.
특정 측면에서, 본원에 제공된 바와 같은 면역분석의 결과는 환자의 보험이 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 유효량의 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 의한 치료를 포함할 지 여부의 결정을 위해 의료 혜택 제공자에게 제출될 수 있다.
약학 조성물 및 투여 방법
단일 작용제로서 또는 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 SEMA4D 길항제, 예를 들어 항-SEMA4D 항체, 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체를 이를 필요로 하는 대상체에 투여하는 방법 및 이를 제조하는 방법은 당업자에게 잘 알려져 있거나 쉽게 결정된다. 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 투여 경로는 각각의 치료제에 대해 동시에 또는 상이한 시간에 예를 들어 경구, 비경구, 흡입 또는 국소적일 수 있다. 본원에 사용되는 바와 같이 용어 비경구는 예를 들어 정맥 내, 동맥 내, 복강 내, 근육 내, 피하, 직장, 또는 질 투여를 포함한다. 이러한 모든 투여 형태가 본 개시 내용의 범위 내에 있는 것으로 명백히 고려되지만, 투여를 위한 형태의 예는 주사용 용액, 특히 정맥 내 또는 동맥 내 주사 또는 점적 주입일 수 있다. 주사용으로 적합한 약학 조성물은 완충제(예를 들어, 아세테이트, 포스페이트 또는 시트레이트 완충제), 계면활성제(예를 들어, 폴리소르베이트), 경우에 따라 안정화제(예를 들어, 인간 알부민) 등을 포함할 수 있다. 그러나 본원의 교시와 호환되는 다른 방법에서, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 유해한 세포 집단의 부위에 직접 전달되어 치료제에 대한 질환 조직의 노출을 증가시킬 수 있다.
본원에서 논의된 바와 같이, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 고형 종양을 포함한 신생물병과 같은 질환의 생체 내 치료를 위한 약학적 유효량으로 투여될 수 있다. 개시된 작용제는 투여를 용이하게 하고 활성제의 안정성을 촉진하도록 제제화될 수 있다. 특정 실시 양태에서, 본 개시 내용에 따른 약학 조성물은 약학적으로 허용 가능한, 무독성, 멸균 담체, 예컨대 생리 식염수, 무독성 완충제, 보존제 등을 포함한다. 본 출원의 목적을 위해, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 약학적 유효량의 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 표적에 대한 효과적인 결합을 달성하고 이점을 달성하는 데, 즉 암 환자에서 전이를 억제, 지연, 또는 감소시키는 데 충분한 양을 의미하는 것으로 간주되어야 한다.
본 개시 내용에 사용되는 약학 조성물은 예를 들어, 이온 교환체, 알루미나, 알루미늄 스테아레이트, 레시틴, 혈청 단백질, 예컨대 인간 혈청 알부민, 완충 물질, 예컨대 포스페이트, 글리신, 소르브산, 소르브산 칼륨, 포화 식물성 지방산의 부분 글리세리드 혼합물, 물, 염 또는 전해질, 예컨대 프로타민 설페이트, 인산수소이나트륨, 인산수소칼륨, 염화나트륨, 아연 염, 콜로이드 실리카, 삼규산마그네슘, 폴리비닐 피롤리돈, 셀룰로오스계 물질, 폴리에틸렌 글리콜, 나트륨 카르복시메틸셀룰로오스, 폴리아크릴레이트, 왁스, 폴리에틸렌-폴리옥시프로필렌-블록 중합체, 폴리에틸렌 글리콜, 및 양모 지방을 포함하는 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함한다
비경구 투여를 위한 제제는 멸균된 수성 또는 비수성 용액, 현탁액, 및 에멀젼을 포함한다. 비수성 용매의 예는 프로필렌 글리콜, 폴리에틸렌 글리콜, 올리브 오일과 같은 식물성 오일, 및 에틸 올레이트와 같은 주사 가능한 유기 에스테르이다. 수성 담체는 예를 들어 식염수 및 완충 매질을 포함하는 물, 알코올성/수성 용액, 에멀젼 또는 현탁액을 포함한다. 약학적으로 허용 가능한 담체는 0.01-0.1M, 또는 0.05M 포스페이트 완충액 또는 0.8% 식염수를 포함할 수 있지만 이에 제한되지는 않는다. 다른 일반적인 비경구 비히클에는 인산나트륨 용액, 링거 덱스트로스, 덱스트로스 및 염화나트륨, 젖산 링거, 또는 고정유가 포함된다. 정맥 내 비히클은 유체 및 영양 보충제, 전해질 보충제, 예컨대 링거 덱스트로스를 기반으로 하는 것 등을 포함한다. 예를 들어 항균제, 항산화제, 킬레이트제, 및 불활성 기체 등과 같은 방부제 및 기타 첨가제도 존재할 수 있다.
더 구체적으로, 주사용으로 적합한 약학 조성물은 멸균 수용액(수용성인 경우) 또는 분산액 또는 멸균 주사 용액 및 분산액의 즉석 제조를 위한 멸균 분말을 포함한다. 그런 경우에, 조성물은 무균적일 수 있고 용이한 주사 가능성이 존재하는 정도로 유동적이어야 한다. 제조 및 보관 조건하에서 안정해야 하며 세균 및 진균과 같은 미생물의 오염 작용에 대해 보존될 수 있어야 한다. 담체는 예를 들어 물, 에탄올, 폴리올(예를 들어, 글리세롤, 프로필렌 글리콜, 및 액체 폴리에틸렌 글리콜 등), 및 이들의 적합한 혼합물을 함유하는 용매 또는 분산 매질일 수 있다. 적절한 유동성은 예를 들어 레시틴과 같은 코팅의 사용에 의해, 분산액의 경우 특정 입자 크기의 유지에 의해 그리고 계면활성제의 사용에 의해 유지될 수 있다. 본원에 개시된 치료 방법에 사용하기에 적합한 제제는 문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences (Mack Publishing Co.) 21st ed. (2005)]에 기재되어 있다.
미생물 작용의 방지는 다양한 항균제 및 항진균제, 예를 들어 파라벤, 클로로부탄올, 페놀, 아스코르브산, 티메로살 등에 의해 달성될 수 있다. 특정 실시 양태에서, 등장화제, 예를 들어 당, 다가 알코올, 예컨대 만니톨, 소르비톨, 또는 염화나트륨이 조성물에 포함될 수 있다. 조성물에 흡수를 지연시키는 제제, 예를 들어 알루미늄 모노스테아레이트 및 젤라틴을 포함함으로써 주사 가능한 조성물의 흡수를 연장할 수 있다.
임의의 경우에, 멸균 주사 용액은 활성 화합물(예를 들어, 단독 또는 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 항-SEMA4D 항체, 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체)을 본원에 열거된 성분의 하나 또는 조합과 함께 적절한 용매에 일정량 혼입한 후 여과 멸균함으로써 제조될 수 있다. 일반적으로, 분산액은 활성 화합물을 염기성 분산 매질 및 상기에 열거된 것들로부터의 기타 성분을 포함하는 멸균 비히클에 혼입하여 제조된다. 멸균 주사 용액의 제조를 위한 멸균 분말의 경우, 제조 방법은 진공 건조 또는 동결 건조를 포함할 수 있으며, 이는 사전에 멸균 여과된 용액으로부터 활성 성분과 임의의 추가의 원하는 성분의 분말을 생성할 수 있다. 주사용 제제는 가공되고, 앰플, 백, 병, 주사기 또는 바이알과 같은 용기에 채워지고 당 업계에 공지된 방법에 따라 무균 조건하에 밀봉된다. 또한, 제제는 키트 형태로 포장되고 판매될 수 있다. 이러한 제조 물품은 관련 조성물이 질환 또는 장애를 앓고 있거나 이에 걸리기 쉬운 대상체를 치료하는 데 유용함을 나타내는 라벨 또는 패키지 삽입물을 가질 수 있다.
비경구 제제는 단일 볼루스 용량, 주입 또는 로딩 볼루스 용량 이어서 유지 용량일 수 있다. 이들 조성물은 특정의 고정 또는 가변 간격으로, 예를 들어 하루에 한 번, 또는 "필요에 따라" 투여될 수 있다.
특정 약학 조성물은 예를 들어 캡슐, 정제, 수성 현탁액 또는 용액을 포함하는 허용 가능한 제형으로 경구 투여될 수 있다. 특정 약학 조성물은 또한 비강 에어로졸 또는 흡입에 의해 투여될 수 있다. 이러한 조성물은 벤질 알코올 또는 기타 적합한 방부제, 생체이용률을 향상시키기 위한 흡수 촉진제, 및/또는 기타 통상적인 가용화제 또는 분산제를 사용하여 식염수에 용액으로서 제조될 수 있다.
담체 물질과 조합하여 단일 제형을 생성하기 위해서, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 양은 치료되는 숙주 및 구체적인 투여 방식에 따라 달라질 것이다. 조성물은 단일 용량, 다회 용량 또는 주입으로 확립된 기간에 걸쳐 투여될 수 있다. 최적의 원하는 반응(예를 들어, 치료적 또는 예방적 반응)을 제공하기 위해 투여 요법은 또한 조정될 수 있다.
본 개시 내용의 범위를 유지하면서, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 치료 효과를 생성하기에 충분한 양으로 앞서 언급된 치료 방법에 따라 인간 또는 다른 동물에 투여될 수 있다. 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 공지된 기술에 따라서 본원에 제공된 항체를 통상적인 약학적으로 허용 가능한 담체 또는 희석제와 조합함으로써 제조된 통상적인 제형으로 이러한 인간 또는 다른 동물에 투여될 수 있다. 약학적으로 허용 가능한 담체 또는 희석제의 형태 및 특성은 조합되어야 하는 활성 성분의 양, 투여 경로 및 기타 잘 알려진 변수에 의해 결정된다는 것을 당업자는 인식할 것이다. 당업자는 본원에 제공되는 바와 같은 하나 이상의 종의 항-SEMA4D 항체, 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체를 포함하는 칵테일이 사용될 수 있음을 또한 이해할 것이다.
"치료 유효 용량 또는 양" 또는 "유효량"은 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 양으로, 투여될 때 치료될 질환 환자의 치료와 관련하여 양성 치료 반응, 예를 들어 환자에서 전이의 억제, 지연, 또는 감소를 초래하는 양을 의미한다.
종양 성장 또는 전이의 억제, 지연, 또는 감소를 위한 본 개시 내용의 조성물의 치료 유효 용량은 투여 수단, 표적 부위, 환자의 생리학적 상태, 환자가 인간 또는 동물인지 여부, 투여되는 다른 약물, 그리고 치료가 예방적 또는 치료적인지 여부를 포함하는 많은 서로 다른 요인에 따라 달라진다. 특정 실시 양태에서, 환자는 인간이지만, 트랜스제닉 포유동물을 포함한 비-인간 포유동물도 치료될 수 있다. 치료 투여량은 안전성 및 효능을 최적화하기 위해 당업자에게 공지된 일상적인 방법을 사용하여 적정될 수 있다.
단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 양은 본 발명의 개시 내용을 감안할 때 과도한 실험 없이 당업자에 의해 용이하게 결정된다. 투여 방식 및 치료제 각각의 양에 영향을 미치는 요인에는 질환의 중증도, 질환의 병력, 전이 가능성 및 치료를 받고 있는 개체의 연령, 신장, 체중, 건강, 및 신체 상태가 포함되지만 이에 제한되지는 않는다. 유사하게, 투여될 치료제의 양은 투여 방식 및 대상체가 이 작용제의 단일 용량 또는 다회 용량을 받을 것인지에 따라 결정될 것이다.
본 개시 내용은 또한 암 환자를 치료하기 위한 의약의 제조에 있어 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합된 유효량의 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 용도를 제공한다. 특정 측면에서, 의약은 적어도 하나의 다른 요법으로 사전 치료받은 대상체에서 사용된다. "사전 치료받은" 또는 "사전 치료"는 대상체가 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 의약을 받기 전에 하나 이상의 다른 요법을 받은(예를 들어, 적어도 하나의 다른 암 요법으로 치료받은) 것을 의미한다. "사전 치료받은" 또는 "사전 치료"는 단일 작용제로서 또는 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 항-SEMA4D 항체, 예를 들어 본원에 개시된 단클론 항체 페피네맙, 또는 이의 항원 결합 단편, 변이체, 또는 유도체를 포함하는 의약으로 치료 개시 전 2년 이내, 18개월 이내, 1년 이내, 6개월 이내, 2개월 이내, 6주 이내, 1개월 이내, 4주 이내, 3주 이내, 2주 이내, 1주 이내, 6일 이내, 5일 이내, 4일 이내, 3일 이내, 2일 이내, 또는 심지어 1일 이내에 적어도 하나의 다른 요법으로 치료받은 대상체를 포함한다. 대상체는 사전 요법 또는 요법들로 사전 치료에 반드시 반응자였을 필요는 없다. 따라서, 단독 또는 유효량의 적어도 하나의 다른 면역 조절 요법과 조합하여 SEMA4D 길항제, 예를 들어, SEMA4D에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 의약을 받은 대상체는 선행 요법으로 사전 치료, 또는 사전 치료가 다중 요법을 포함한 경우 하나 이상의 선행 요법에 대해 반응했을 수 있거나, 반응하지 못 했을 수 있다(예를 들어, 암이 불응성이었음). 대상체가 제공된 치료제를 포함하는 의약을 받기 전에 사전 치료를 받을 수 있는 다른 암 요법의 예는 수술; 방사선 요법; 경우에 따라 자가 골수 이식과 조합된 화학요법(여기서 적합한 화학요법제는 상기 본원에 열거된 것들을 포함하지만 이에 제한되지는 않음); 다른 항암 단클론 항체 요법; 소분자 기반 암 요법(상기 본원에 열거된 소분자를 포함하지만 이에 제한되지는 않음); 백신/면역요법 기반 암 요법; 스테로이드 요법; 기타 암 요법; 또는 이들의 임의의 조합을 포함지만 이에 제한되지는 않는다.
본 개시 내용은 달리 지시되지 않는 한, 당해 분야의 기술 내에 있는 세포 생물학, 세포 배양, 분자 생물학, 트랜스제닉 생물학, 미생물학, 재조합 DNA, 및 면역학의 통상적인 기술을 사용한다. 이러한 기술은 문헌에 완전히 설명되어 있다. 예를 들어, 문헌[Green and Sambrook, ed. (2012) Molecular Cloning A Laboratory Manual (4th ed.; Cold Spring Harbor Laboratory Press); Sambrook et al., ed. (1992) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, (Cold Springs Harbor Laboratory, NY); D. N. Glover and B.D. Hames, eds., (1995) DNA Cloning 2d Edition (IRL Press), Volumes 1-4; Gait, ed. (1990) Oligonucleotide Synthesis (IRL Press); Mullis et al. 미국 특허 제4,683,195호; Hames and Higgins, eds. (1985) Nucleic Acid Hybridization (IRL Press); Hames and Higgins, eds. (1984) Transcription And Translation (IRL Press); Freshney (2016) Culture Of Animal Cells, 7th Edition (Wiley-Blackwell); Woodward, J., Immobilized Cells And Enzymes (IRL Press) (1985); Perbal (1988) A Practical Guide To Molecular Cloning; 2d Edition (Wiley-Interscience); Miller and Calos eds. (1987) Gene Transfer Vectors For Mammalian Cells, (Cold Spring Harbor Laboratory); S.C. Makrides (2003) Gene Transfer and Expression in Mammalian Cells (Elsevier Science); Methods in Enzymology, Vols. 151-155 (Academic Press, Inc., N.Y.); Mayer and Walker, eds. (1987) Immunochemical Methods in Cell and Molecular Biology (Academic Press, London); Weir and Blackwell, eds.; 및 in Ausubel et al. (1995) Current Protocols in Molecular Biology (John Wiley and Sons)]을 참조한다.
항체 조작의 일반 원리는 예를 들어 문헌[Strohl, W.R., and L.M. Strohl (2012), Therapeutic Antibody Engineering (Woodhead Publishing)]에 설명되어 있다. 단백질 조작의 일반 원리는 예를 들어 문헌[Park and Cochran, eds. (2009), Protein Engineering and Design (CDC Press)]에 설명되어 있다. 면역학의 일반 원리는 예를 들어 문헌[Abbas and Lichtman (2017) Cellular and Molecular Immunology 9th Edition (Elsevier)]에 설명되어 있다. 추가로, 예를 들어, 문헌[Current Protocols in Immunology (Wiley Online Library); Wild, D. (2013), The Immunoassay Handbook 4th Edition (Elsevier Science); Greenfield, ed. (2013), Antibodies, a Laboratory Manual, 2d Edition (Cold Spring Harbor Press); 및 Ossipow and Fischer, eds., (2014), Monoclonal Antibodies: Methods and Protocols (Humana Press)]에서의 당 업계에 공지된 면역학의 표준 방법을 따를 수 있다.
상기에 인용된 모든 참고 문헌 뿐만 아니라 본원에 인용된 모든 참고 문헌은 그 전체가 본원에 참고로 포함된다.
하기 실시예는 제한이 아니라 예시로써 제공된다.
실시예
실시예 1: SEMA4D 기반 암 면역요법을 위한 바이오마커로서 MDSC 수준
PD-1/PD-L1 경로의 차단은 NSCLC에 대해 효과적인 면역요법이지만, 내성 기전을 극복하기 위해서는 합리적인 조합 요법이 필요하다. CLASSICAL-Lung 임상 시험은 체크포인트 억제를 통한 면역 활성화와 페피네맙을 통한 종양 면역 미세 환경의 유익한 변형을 결합하기 위해 페피네맙과 아벨루맙의 조합을 테스트하고 있다.
진행성(IIIB/IV) NSCLC가 있는 62명의 대상체에서 아벨루맙과 조합된 페피네맙의 안전성, 내약성 및 효능을 평가하기 위한 1b/2상, 공개 라벨, 단일 아암, 인간 최초 조합 연구가 현재 진행 중이다.
페피네맙(VX15/2503)은 세마포린 4D(SEMA4D, CD100)를 표적화하는 IgG4 인간화 단클론 항체이다. VH는 서열 번호 1의 아미노산 서열을 포함하고 VL은 서열 번호 5의 아미노산 서열을 포함한다. 생체 내 전임상 모델은 SEMA4D의 항체 차단이 CD8+ T 세포 및 수지상 세포의 침윤을 촉진하고, 종양 내 면역억제성 골수 및 조절 T 세포(Treg)의 기능 및 동원을 감소시켰음을 입증하였다. 중요하게는, 항-SEMA4D와 다양한 면역요법의 전임상 조합은 T 세포 활성과 종양 퇴행을 향상시켰다. 예를 들어, 미국 특허 제9,243,068호를 참조하며, 이는 그 전체가 본원에 참고로 포함된다.
아벨루맙은 메르켈 세포 및 요로 상피 암종 모두의 치료에 대해 승인받은 완전 인간 항-PD-L1 IgG1 항체이다. 아벨루맙은 PD-L1-PD-1 상호작용을 억제하고 ADCC를 유도할 가능성도 있다. 아벨루맙의 중쇄 및 경쇄는 서열 번호 11 및 서열 번호 12로 나타낸다.
연구 설계
시험은 용량 증량(n=12) 및 용량 확장(n=50) 단계로 분할한다. 용량 증량 부분에는 면역요법 경험이 없고 표준 1차 또는 2차 전신 항암 요법을 진행했거나 거부한 환자가 포함된다. 용량 증량 코호트의 환자들은 증가하는 용량의 페피네맙(5, 10, 20 mg/kg, 2주마다)을 아벨루맙(10 mg/kg, 2주마다)과 조합하여 받았다.
확장 단계는 유사한 환자 코호트 뿐만 아니라 면역요법 중에 또는 후에 종양이 진행된 환자의 제2 코호트를 포함한다.
인구 통계학적 특성
모든 대상체는 기준선에서 IV기 암종을 갖는 것으로 나타났다. 선암종과 편평 세포 암종 대상체가 균등하게 분포되었다. 대상체의 67%가 이전에 전신 치료를 받았다.
연구 기간과 면역 세포의 기준선 수준의 상관관계
연구 기간(주)에 대한 기준선에서의 말초 혈액 면역 세포 서브세트의 초기 분석은 더 높은 수준의 T 세포와 더 낮은 수준의 MDSC가 연구 기간과 상관관계가 있음을 시사한다.
치료 전에, 대상체를 CD8+ T 세포 및 CD14+, HLA-DRlow, CD11b+, CD33+, Ln- 표현형 MDSC 세포의 초기 수준에 대해 평가하였다. "Ln"은 세포 집단에서 배제되고 CD3, CD19, CD56을 포함하는 마커 군이다. 이 예비 연구 시점에서 "연구 기간"은 사망, 자발적 철회 또는 질환 진행을 기반으로 한다. 기준선에서의 세포 서브세트와 연구 기간(주) 사이에서 Spearman 순위 상관 관계. 상관관계 그래프의 마감일은 2019년 1월 28일이었다.
중앙 실험실에서 유세포 분석에 의해 말초 혈액 내 세포 서브세트의 절대치 또는 % 중 하나를 기준선에서 측정하였다. 질환 진행까지 페피네맙 용량을 투여받은 주수를 기준선(선별 방문 및 기준선 방문의 평균)에서 말초 혈액 서브세트 중 절대치(세포/㎕)(도 1a, CD8+ T 세포에 대해) 또는 MDSC(단핵 세포 중)의 %(도 1b)에 대해 플로팅한다. [도 1c]는 말초 혈액에서 초기 CD8+ T 세포 대 초기 MDSC의 백분율을 플롯팅한다. 각 분석에 대한 각각의 Spearman 순위 상관 계수(r) 및 p 값을 제공한다. "연구 기간(주)"는 첫 번째 투여부터 치료 종료 또는 분석을 위한 마감 날짜, 2019년 1월 25일까지의 기간으로 정의한다.
[표 2]
SEQUENCE LISTING <110> VACCINEX, INC. <120> SEMAPHORIN-4D ANTAGONISTS FOR USE IN CANCER THERAPY <130> 8555.033 <140> <141> <150> 62/825,536 <151> 2019-03-28 <160> 12 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 118 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 1 Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser 1 5 10 15 Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Ser Asp Tyr 20 25 30 Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met 35 40 45 Gly Gln Ile Asn Pro Thr Thr Gly Gly Ala Ser Tyr Asn Gln Lys Phe 50 55 60 Lys Gly Lys Ala Thr Ile Thr Val Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr 65 70 75 80 Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Tyr Tyr Tyr Gly Arg His Phe Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr 100 105 110 Thr Val Thr Val Ser Ser 115 <210> 2 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 2 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Claims (25)

  1. 세마포린-4D(SEMA4D)에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 유효량의 암 면역치료 레지멘(regimen)으로 암을 가진 대상체에서의 악성 세포 성장을 치료, 억제, 지연, 또는 감소시키기 위한 암을 가진 대상체를 선택하는 방법으로서,
    (a) 상기 대상체로부터 수득된 샘플에서 대상체의 순환 골수 유래 억제 세포(MDSC: myeloid-derived suppressor cell) 수준 및 CD8+ T 세포의 수를 결정하는 단계; 및
    (b) 상기 샘플 중의 MDSC 수준이 대상체의 총 말초 혈액 단핵 세포의 30% 미만인 경우 및 CD8+ T 세포의 수준이 200 세포/μL를 초과하는 경우 치료를 위해 상기 대상체를 선택하는 단계
    를 포함하는 방법.
  2. 제1항에 있어서, 항-SEMA4D 항체 또는 이의 단편은 SEMA4D와 이의 수용체의 상호작용을 억제하는 것인 방법.
  3. 제2항에 있어서, 수용체는 플렉신-B1, 플렉신-B2, CD72, 또는 이들의 임의의 조합인 방법.
  4. 제1항에 있어서, 항체 또는 이의 단편은 SEMA4D 매개된 신호 전달을 억제하는 것인 방법.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 하나의 항에 있어서, 항체 또는 이의 단편은 각각 서열 번호 2, 3, 및 4를 포함하는 VH CDR 1-3을 포함하는 가변 중쇄(VH), 및 각각 서열 번호 6, 7, 및 8을 포함하는 VL CDR 1-3을 포함하는 가변 경쇄(VL)를 포함하는 것인 방법.
  6. 제5항에 있어서, VH 및 VL은 각각 서열 번호 1 및 서열 번호 5, 또는 서열 번호 9 및 서열 번호 10을 포함하는 것인 방법.
  7. 제5항에 있어서, 암 면역치료 레지멘은 추가의 암 면역치료제의 투여를 추가로 포함하는 것인 방법.
  8. 제7항에 있어서, 추가의 암 면역치료제는 면역 체크포인트 차단제를 포함하는 것인 방법.
  9. 제8항에 있어서, 면역 체크포인트 차단제는 CTLA4, PD-1, PD-L1, LAG3, TIM3, B7-H3, 또는 이들의 임의의 조합에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 것인 방법.
  10. 제9항에 있어서, 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 항-PD-L1 항체 아벨루맙을 포함하는 것인 방법.
  11. 제7항에 있어서, 추가의 암 면역치료제는 순환 MDSC 수준을 감소시키는 작용제를 포함하는 것인 방법.
  12. 제11항에 있어서, MDSC는 단핵 MDSC(M-MDSC)인 방법.
  13. 제12항에 있어서, M-MDSC는 CD14+, HLA-DR-/low, CD11b+, CD33+, Ln- 표현형을 포함하며, 여기서 Ln은 비-MDSC를 정의하는 마커의 칵테일인 방법.
  14. 제13항에 있어서, Ln 마커는 CD3, CD19, 또는 CD56 중 하나 이상을 포함하는 것인 방법.
  15. 제1항에 있어서, 암은 고형 종양, 혈액 악성 종양, 이들의 임의의 전이, 또는 이들의 임의의 조합을 포함하는 것인 방법.
  16. 제15항에 있어서, 암은 고형 종양 또는 이의 전이인 방법.
  17. 제16항에 있어서, 고형 종양은 육종, 암종, 흑색종, 이들의 임의의 전이, 또는 이들의 임의의 조합인 방법.
  18. 제17항에 있어서, 고형 종양은 편평 세포 암종, 선암종, 기저 세포 암종, 신세포 암종, 유방의 유관암종, 연조직 육종, 골육종, 흑색종, 소세포 폐암, 비소세포 폐암, 폐의 선암종, 복막암, 간세포 암종, 위장관암, 위암, 췌장암, 신경내분비암, 교모세포종, 자궁경부암, 난소암, 간암, 방광암, 뇌암, 간종양, 유방암, 결장암, 결장직장암, 자궁내막 또는 자궁 암종, 식도암, 타액선 암종, 신장암, 간암, 전립선암, 외음부암, 갑상선암, 두경부암, 이들의 임의의 전이, 또는 이들의 임의의 조합인 방법.
  19. 제18항에 있어서, 고형 종양은 비소세포 폐암인 방법.
  20. 제15항에 있어서, 암은 혈액 악성 종양 또는 이의 전이인 방법.
  21. 제20항에 있어서, 혈액 악성 종양은 백혈병, 림프종, 골수종, 급성 골수성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 급성 림프구성 백혈병, 만성 림프구성 백혈병, 털세포 백혈병, 호지킨 림프종, 비호지킨 림프종, 다발성 골수종, 이들의 임의의 전이, 또는 이들의 임의의 조합인 방법.
  22. 제1항에 있어서, 추가의 암 요법의 실시를 추가로 포함하는 방법.
  23. 제22항에 있어서, 추가의 요법은 수술, 화학요법, 방사선 요법, 암 백신, 면역자극제의 투여, 입양 T 세포 요법, 조절 T 세포(Treg) 조절제의 투여, 또는 이들의 임의의 조합을 포함하는 것인 방법.
  24. 암을 가진 대상체가 세마포린-4D(SEMA4D)에 특이적으로 결합하는 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 암 면역치료 레지멘에 의한 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 지 여부를 결정하는 방법으로서, (a) 상기 대상체로부터 수득된 샘플에서 순환 골수 유래 억제 세포(MDSC) 및 CD8+ T 세포 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 상기 샘플 중의 MDSC 수준이 MDSC 수준이 대상체의 총 말초 혈액 단핵 세포의 30% 미만인 경우 및 CD8+ T 세포의 수준이 200 세포/μL를 초과하는 경우 상기 대상체가 상기 치료로부터 이익을 얻을 수 있는 것으로 결정하는 단계를 포함하는 방법.
  25. 삭제
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