KR102595559B1 - 변이체 actriib 단백질 및 이의 용도 - Google Patents

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Abstract

특정 양태에서, 본 발명은 적혈구 또는 뼈, 연골, 근육, 지방 및/또는 신경 조직과 같은 조직의 성장을 조절 (촉진 또는 억제)하기 위한 조성물 및 방법을 제공한다. 본 발명은 또한 ActRIIB 단백질 및/또는 ActRIIB 리간드의 활성을 조절하는 화합물을 스크리닝하는 방법을 제공한다. 본원에서 제공된 조성물 및 방법은 ActRIIB 단백질 및/또는 ActRIIB 리간드의 비정상적인 활성과 관련된 질환을 치료하는데 유용하다.

Description

변이체 ACTRIIB 단백질 및 이의 용도
관련 출원들에 대한 교차-참조
본 출원은 2016년 10월 5일자로 제출된 미국 가출원 일련번호 62/404,718에 대한 우선권을 주장한다. 상기 출원 명세서는 이의 전문이 본 명세서의 참고자료에 편입된다.
발명의 배경
형질변환 성장 인자-베타 (TGF-베타) 슈퍼패밀리는 공통의 서열 요소들과 구조적 모티프를 공유하는 다양한 성장 인자들을 함유한다. 이들 단백질은 척추동물과 비척추동물 모두에서 대규모 다양한 세포 유형에서 생물학적 효과를 발휘하는 것으로 알려져 있다. 슈퍼패밀리의 구성원들은 패턴 형성 및 조직 특화에 있어서 배발달 동안 중요한 기능을 수행하고, 지질생성, 근육 형성, 연골 형성, 심장 형성, 조혈, 신경 발생 및 상피 세포 분화를 비롯한 다양한 분화 과정에 영향을 줄 수 있다. 이 패밀리는 BMP/GDF와 TGF-베타/액티빈/BMP10 브랜치로 두 가지로 크게 나뉘어 지는데, 그 구성원들은 다양하고 상보적인 효과를 지니고 있다. TGF-베타 패밀리의 구성요소의 활성을 조절함으로써, 유기체에서 유의적인 생리학적 변화를 야기시키는 것이 대개 가능하다. 예를 들면, 피에몬테(Piedmontese) 및 벨기에 푸른 소(Blue cattle) 품종은 근육량의 상당한 증가를 야기하는 GDF8 (미오스태틴으로도 불림) 유전에 기능-소실(loss-of-function) 돌연변이를 휴대한다. Grobet et al., Nat Genet. 1997, 17(1):71-4. 더욱이, 인간에 있어서, GDF8의 비활성 대립유전자는 증가된 근육량과 연관있으며, 보고에 따르면 예외적으로 강한 힘과 관련있다. Schuelke et al., N Engl J Med 2004, 350:2682-8.
적혈구 수준, 뼈, 연골 및 기타 조직의 변화는 적절한 TGF-베타 계열 구성원이 중재하는 신호를 항진하거나 또는 길항함으로써 이루어질 수 있다. 따라서, TGF-베타 신호생성의 강력한 조절제로서 작용하는 약제에 대한 필요성이 존재한다.
발명의 요약
특정 양태에서, 본 명세서는 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 구체적으로 변이체 ActRIIB 동종다량체 단백질 및 변이체 ActRIIB 이종다량체 단백질을 제시한다. 실시예들에 의해 증명된 바와 같이, 하나 또는 그 이상의 ActRIIB-결합 리간드에 대하여 변경된 결합친화력을 나타내는 여러 변형된 ActRIIB 폴리펩티드가 확인되었다. 리간드 결합 활성을 감소시키고, 증가시키는 ActRIIB 변이체들이 확인되었다. 이러한 변이체는 다양한 용도에서 상응하는 비변형된 ActRIIB 폴리펩티드에 비해 선택적으로 리간드를 증가 또는 감소 시키는데 특히 유용할 수 있다. 예를 들면, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드의 일부가 예를 들어, 적혈구 및 헤모글로빈 수준을 증가시킬 뿐만 아니라 체중 (예: 근육량)을 증가시키는 능력을 비롯한, 다양한 생체 내 효과를 갖는다는 것이 실시예들에서 추가로 입증된다. 따라서, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 예를 들어, 본원에 기술된 것을 포함하는 다양한 치료학적 적용에 유용해야 한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 서열 번호: 2의 아미노산 20-29중 어느 하나 (가령, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 또는 29)에서 시작하고, 그리고 서열 번호: 2의 아미노산 109-134중 어느 하나 (가령, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 또는 134)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 이때 상기 폴리펩티드는 K55, F82, L79, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, D80, 및 F82로 구성된 군에서 선택된 서열 번호: 2의 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함하는 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 뿐만 아니라 하나 또는 그 이상의 이러한 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체 복합체에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 29-109에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 25-131에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 20-134에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 53의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 12의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 5의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 K55에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K55A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K55E이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 L79에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 L79D이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 L79E이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 L79P이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 L79A이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 F82에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 F82I이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 F82K이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 F82A이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 A24에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 A24N이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 K74에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74F이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74I이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74Y이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 D80에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80F이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80K이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80G이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80M이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80I이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80N이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80R이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 R64에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 R64K이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 R64N이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 P129에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 P129S이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 P130에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 P130A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 P130R이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 E37에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 E37A이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 R40에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 R40AD54이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 D54에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D54AD54이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 R56에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 R56A이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 W78에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 W78A이다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 31의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 K55에 상응하는 아미노산 위치에서 알라닌을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 33의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 K55에 상응하는 아미노산 위치에서 알라닌을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 34의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 K55에 상응하는 아미노산 위치에서 글루탐산을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 36의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 K55에 상응하는 아미노산 위치에서 글루탐산을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 37의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 F82에 상응하는 아미노산 위치에서 이소류신을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 39의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 F82에 상응하는 아미노산 위치에서 이소류신을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 40의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 F82에 상응하는 아미노산 위치에서 리신을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 42의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 F82에 상응하는 아미노산 위치에서 리신을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 43의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 L79에 상응하는 아미노산 위치에서 글루탐산을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 45의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 L79에 상응하는 아미노산 위치에서 글루탐산을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 46의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 L79에 상응하는 아미노산 위치에서 글루탐산을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 48의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 L79에 상응하는 아미노산 위치에서 글루탐산을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 49의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 L79에 상응하는 아미노산 위치에서 글루탐산을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 50의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 L79에 상응하는 아미노산 위치에서 글루탐산을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 51의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 L79에 상응하는 아미노산 위치에서 글루탐산을 포함한다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 52의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 L79에 상응하는 아미노산 위치에서 글루탐산을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서의 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 동종이량체를 형성한다. 일부 구체예들에서, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 공유적 상호작용을 통하여 이종이량체를 형성할 수 있다. 일부 구체예들에서, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 비-공유적 상호작용을 통하여 이종이량체를 형성할 수 있다. 일부 구체예들에서, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 공유적 상호작용 및 비-공유적 상호작용 모두를 통하여 이종이량체를 형성할 수 있다.
특정 양태에서, 동종다량체(가령, 동종이량체)를 포함한, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드에 결합한다. 일부 구체예들에서, 동종다량체(가령, 동종이량체)를 포함한, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 적어도 1 x 10-7 M의 KD 로 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드에 결합한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드는 다음으로 구성된 군에서 선택된다: BMP6, BMP7, BMP9, BMP10, GDF3, GDF7, GDF8, GDF11, GDF15, 액티빈 A, 액티빈 B, 액티빈 C, 액티빈 E, 액티빈 AB, 액티빈 AC, 액티빈 AE, 액티빈 BC, 및 액티빈 BE.
특정 양태에서, 동종다량체(가령, 동종이량체)를 포함한, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드를 억제한다. 일부 구체예들에서, 동종다량체(가령, 동종이량체)를 포함한, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드의 Smad 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, 동종다량체(가령, 동종이량체)를 포함한, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 세포-기반 검정에서 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, 동종다량체(가령, 동종이량체)를 포함한, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 다음으로 구성된 군에서 선택된 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드를 억제한다: BMP6, BMP7, BMP9, BMP10, GDF3, GDF7, GDF8, GDF11, GDF15, 액티빈 A, 액티빈 B, 액티빈 C, 액티빈 E, 액티빈 AB, 액티빈 AC, 액티빈 AE, 액티빈 BC, 및 액티빈 BE.
특정 양태에서, 본 명세서는 적어도 하나의 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 (가령, 본 명세서에서 기술된 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 폴리펩티드)를 포함하는 이종다량체에 관계한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체 단백질은 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및 제 2 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하고, 이때 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 20-29중 어느 하나 (가령, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 또는 29)에서 시작하고, 그리고 서열 번호: 2의 아미노산 109-134중 어느 하나 (가령, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 또는 134)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하고, 그리고 A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, D80, 및 F82로 구성된 군에서 선택된 서열 번호: 2 아미노산에 상응하는 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함하며, 이때 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 20-29중 어느 하나 (가령, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 또는 29)에서 시작하고, 그리고 서열 번호: 2의 아미노산 109-134중 어느 하나 (가령, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 또는 134)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하고, 이때 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드와 비교하여 상이한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 29-109에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 29-109에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 25-131에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 25-131에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 20-134에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 25-131에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 53의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 서열 번호: 53의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 5의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 서열 번호: 5의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 12의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 서열 번호: 12의 아미노산 서열에 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 K55에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K55A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K55E이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 L79에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 L79D이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 L79E이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 L79P이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 L79A이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 F82에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 F82I이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 F82K이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 F82A이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 A24에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 A24N이다. 일부 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 K74에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74F이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74I이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 K74Y이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 D80에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80F이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80K이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80G이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80M이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80I이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80N이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D80R이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 R64에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 R64K이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 R64N이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 P129에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 P129S이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 P130에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 P130A이다. 일부 구체예들에서, 상기 치환은 P130R이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 E37에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 E37A이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 R40에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 R40AD54이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 D54에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 D54AD54이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 R56에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 R56A이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 W78에 상응하는 아미노산 위치에서 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 치환은 W78A이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, D80, 및 F82로 구성된 군에서 선택된 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 서열에 대하여 A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, L79A, L79D, L79E, L79P, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, K55A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, D80R, 및 F82A로 구성된 군에서 선택된 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 촉진시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 억제시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 촉진시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형과 이종다량체 형성을 억제시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 양태에서, 본 명세서의 ActRIIB 폴리펩티드는 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하여, ActRIIB 폴리펩티드 도메인과 하나 또는 그 이상의 이종성(heterologous) 도메인을 포함하는 융합 단백질이다. 일부 구체예들에서, ActRIIB 폴리펩티드는 ActRIIB-Fc 융합 단백질이다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc 융합 단백질은 상기 ActRIIB 폴리펩티드 도메인과 하나 또는 그 이상의 이종성 도메인 또는 Fc 도메인 사이에 위치한 링커 도메인을 더 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 링커 도메인은 다음으로부터 선택된다: TGGG, TGGGG, SGGGG, GGGGS, GGG, GGGG, SGGG, 및 GGGGS.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 13의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 13의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 14의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 14의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 15의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 15의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 16의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 16의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 17의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 17의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 18의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 19의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 19의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 18의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 20의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 21의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 21의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 20의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 22의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 23의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 23의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 22의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 22의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 25의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 25의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 24의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 26의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 27의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 27의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 26의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관계하며, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 28의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 29의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 Fc 도메인은 아미노산 위치 132에 시스테인, 아미노산 위치 138에 글루탐산, 아미노산 위치 144에 트립토판, 그리고 아미노산 위치 217에 아스파르트산을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질 Fc 도메인은 아미노산 위치 127에 시스테인, 아미노산 위치 144에 세린, 아미노산 위치 146에 알라닌, 아미노산 위치 162에 아르기닌, 아미노산 위치 179에 아르기닌, 그리고 아미노산 위치 185에 발린을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관한 것이며, 이때 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 28의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 29의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질 Fc 도메인은 아미노산 위치 132에 시스테인, 아미노산 위치 138에 글루탐산, 아미노산 위치 144에 트립토판, 그리고 아미노산 위치 217에 아스파르트산을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 Fc 도메인은 아미노산 위치 127에 시스테인, 아미노산 위치 144에 세린, 위치 146에 알라닌, 아미노산 위치 162에 아르기닌, 아미노산 위치 179에 아르기닌, 그리고 아미노산 위치 185에 발린을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관한 것이며, 이때 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질, 이때 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 30의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 23의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 Fc 도메인은 아미노산 위치 132에 시스테인, 아미노산 위치 144에 트립토판, 그리고 아미노산 위치 435에 아르기닌을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질 Fc 도메인은 아미노산 위치 127에 시스테인, 아미노산 위치 144에 세린, 아미노산 위치 146에 알라닌, 그리고 아미노산 위치 185에 발린을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 ActRIIB 이종다량체 단백질에 관한 것이며, 이때 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 30의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함하며, 그리고 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 23의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 Fc 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB-Fc 융합 단백질 Fc 도메인은 아미노산 위치 132에 시스테인, 아미노산 위치 144에 트립토판, 그리고 아미노산 위치 435에 아르기닌을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB-Fc 융합 단백질 Fc 도메인은 아미노산 위치 127에 시스테인, 아미노산 위치 144에 세린, 아미노산 위치 146에 알라닌, 그리고 아미노산 위치 185에 발린을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 서열 번호: 33의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 제 1 ActRIIB 폴리펩티드, 그리고 서열 번호: 5의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 제 2 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체에 관한 것이며, 이때 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드의 아미노산 서열을 포함하지 않는다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 55에 상응하는 아미노산 위치에 알라닌을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 55에 상응하는 아미노산 위치에 알라닌을 포함하지 않는다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 55에 상응하는 아미노산 위치에 리신을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2에서 F82, L79, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, D80, 및 F82중 어느 하나에 상응하는 아미노산 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환은 다음으로 구성된 군에서 독립적으로 선택된다: A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, L79A, L79D, L79E, L79P, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, D80R, 및 F82A. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2에서 F82, L79, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, D80, 및 F82중 어느 하나에 상응하는 아미노산 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환은 다음으로 구성된 군에서 독립적으로 선택된다: A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, L79A, L79D, L79E, L79P, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, D80R, 및 F82A. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 촉진시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 억제시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 양태에서, 본 명세서는 서열 번호: 36의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 제 1 ActRIIB 폴리펩티드, 그리고 서열 번호: 5의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 제 2 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체에 관한 것이며, 이때 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드의 아미노산 서열을 포함하지 않는다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 55에 상응하는 아미노산 위치에 글루탐산을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 55에 상응하는 아미노산 위치에 글루탐산을 포함하지 않는다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 55에 상응하는 아미노산 위치에 리신을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2에서 F82, L79, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, D80, 및 F82중 어느 하나에 상응하는 아미노산 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환은 다음으로 구성된 군에서 독립적으로 선택된다: A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, L79A, L79D, L79E, L79P, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, D80R, 및 F82A. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2에서 F82, L79, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, D80, 및 F82중 어느 하나에 상응하는 아미노산 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환은 다음으로 구성된 군에서 독립적으로 선택된다: A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, L79A, L79D, L79E, L79P, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, D80R, 및 F82A. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 촉진시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 억제시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 양태에서, 본 명세서는 서열 번호: 39의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 제 1 ActRIIB 폴리펩티드, 그리고 서열 번호: 5의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 제 2 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체에 관한 것이며, 이때 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드의 아미노산 서열을 포함하지 않는다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 82에 상응하는 아미노산 위치에 이소류신을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 82에 상응하는 아미노산 위치에 이소류신을 포함하지 않는다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 55에 상응하는 아미노산 위치에 페닐알라닌을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2에서 L79, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78및 D80중 어느 하나에 상응하는 아미노산 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환은 다음으로 구성된 군에서 독립적으로 선택된다: A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, L79A, L79D, L79E, L79P, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, 그리고 D80R. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2에서 L79, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, 및 D80중 어느 하나에 상응하는 아미노산 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환은 다음으로 구성된 군에서 독립적으로 선택된다: A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, L79A, L79D, L79E, L79P, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, 그리고 D80R. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 촉진시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 억제시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 양태에서, 본 명세서는 서열 번호: 42의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 제 1 ActRIIB 폴리펩티드, 그리고 서열 번호: 5의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 제 2 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체에 관한 것이며, 이때 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드의 아미노산 서열을 포함하지 않는다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 82에 상응하는 아미노산 위치에 리신을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 82에 상응하는 아미노산 위치에 리신을 포함하지 않는다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 55에 상응하는 아미노산 위치에 페닐알라닌을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2에서 L79, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78및 D80중 어느 하나에 상응하는 아미노산 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환은 다음으로 구성된 군에서 독립적으로 선택된다: A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, L79A, L79D, L79E, L79P, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, 그리고 D80R. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2에서 L79, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, 및 D80중 어느 하나에 상응하는 아미노산 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환은 다음으로 구성된 군에서 독립적으로 선택된다: A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, L79A, L79D, L79E, L79P, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, 그리고 D80R. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 촉진시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 억제시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 양태에서, 본 명세서는 서열 번호: 45의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 제 1 ActRIIB 폴리펩티드, 그리고 서열 번호: 48의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 제 2 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체에 관한 것이며, 이때 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드의 아미노산 서열을 포함하지 않는다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 79에 상응하는 아미노산 위치에 산성 아미노산을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 산성 아미노산은 아스파르트산이다. 일부 구체예들에서, 상기 산성 아미노산은 글루탐산이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 79에 상응하는 아미노산 위치에 산성 아미노산 (가령, 아스파르트산 또는 글루탐산)을 포함하지 않는다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 79에 상응하는 아미노산 위치에 류신을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2에서 F82, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, D80, 및 F82중 어느 하나에 상응하는 아미노산 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환은 다음으로 구성된 군에서 독립적으로 선택된다: A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, L79P, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, D80R, 및 F82A. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2에서 F82, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, D80, 및 F82중 어느 하나에 상응하는 아미노산 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환은 다음으로 구성된 군에서 독립적으로 선택된다: A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, D80R, 및 F82A. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 촉진시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 이종다량체 형성을 억제시키는 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 양태에서, 본 명세서는 서열 번호: 50의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 제 1 ActRIIB 폴리펩티드, 그리고 서열 번호: 52의 아미노산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 제 2 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체에 관한 것이며, 이때 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드의 아미노산 서열을 포함하지 않는다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 79에 상응하는 아미노산 위치에 산성 아미노산을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 산성 아미노산은 아스파르트산이다. 일부 구체예들에서, 상기 산성 아미노산은 글루탐산이다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 79에 상응하는 아미노산 위치에 산성 아미노산 (가령, 아스파르트산 또는 글루탐산)을 포함하지 않는다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 위치 79에 상응하는 아미노산 위치에 류신을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 1 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2에서 F82, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, D80, 및 F82중 어느 하나에 상응하는 아미노산 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환은 다음으로 구성된 군에서 독립적으로 선택된다: A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, L79P, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, D80R, 및 F82A. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 2에서 F82, A24, K74, R64, P129, P130, E37, R40, D54, R56, W78, D80, 및 F82중 어느 하나에 상응하는 아미노산 위치에서 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환을 포함한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 아미노산 치환은 다음으로 구성된 군에서 독립적으로 선택된다: A24N, K74A, R64K, R64N, K74A, P129S, P130A, P130R, E37A, R40A, D54A, R56A, K74F, K74I, K74Y, W78A, D80A, D80F, D80G, D80I, D80K, D80M, D80M, D80N, D80R, 및 F82A.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 본원에 개시된 임의의 ActRIIB 폴리펩티드와 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된 제 2 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체 단백질을 제공한다: ALK1, ALK2, ALK3, ALK4, ALK5, ALK6, ALK7, ActRIIA, TGFBRII, BMPRII, 그리고 MISRII 폴리펩티드, 또는 이의 기능적 단편들. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK1 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK1 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 54에 대하여 최소한 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK1 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 54, 55, 56, 57, 60, 그리고 61중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK2 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK2 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 64 또는 65의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK2 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 64, 65, 66, 67, 70, 그리고 71중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK3 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK3 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 74의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK3 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 74, 75, 76, 77, 80, 또는 81의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK4 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK4 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 84 또는 85의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK4 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 84, 86, 85, 87, 88, 89, 92, 및 93의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK5 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK5 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 96 또는 97의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK5 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 96, 98, 97, 99, 100, 101, 104, 및 105의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK6 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK6 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 108 또는 110의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK6 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 108, 109, 110, 111, 112, 113, 116 및 117의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK7 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK7 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 120, 121, 또는 122의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK7 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 120, 123, 124, 125, 121, 126, 122, 127, 128, 129, 130, 133 및 134의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ActRIIA 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIA 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 137의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIA 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 137, 138, 139, 140, 141, 144 및 145의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 TGFBRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 TGFBRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 204의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 TGFBRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 161, 162, 160, 163, 164, 165, 166, 167, 172, 173, 174 및 175의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 BMPRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 BMPRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 148 또는 149의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 BMPRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 148, 150, 149, 151, 152, 153, 156, 그리고 157의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 MISRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 MISRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 180, 181, 또는 182의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 MISRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 180, 183, 181, 184, 182, 그리고 185145의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서의 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드에 결합한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 적어도 1 x 10-7 M의 KD 로 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드에 결합한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드는 다음으로 구성된 군에서 선택된다: BMP6, BMP7, BMP9, BMP10, GDF3, GDF7, GDF8, GDF11, GDF15, 액티빈 A, 액티빈 B, 액티빈 C, 액티빈 E, 액티빈 AB, 액티빈 AC, 액티빈 AE, 액티빈 BC, 및 액티빈 BE.
특정 양태에서, 본 명세서의 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드를 억제한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드의 Smad 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 세포-기반 검정에서 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 다음으로 구성된 군에서 선택된 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드를 억제한다: BMP6, BMP7, BMP9, BMP10, GDF3, GDF7, GDF8, GDF11, GDF15, 액티빈 A, 액티빈 B, 액티빈 C, 액티빈 E, 액티빈 AB, 액티빈 AC, 액티빈 AE, 액티빈 BC, 및 액티빈 BE.
특정 양태에서, 본 명세서는 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 포함한 ActRIIB 폴리펩티드, 뿐만 아니라 상기의 것을 포함하는 동종다량체 및 이종다량체에 관계하며, 이때 상기 폴리펩티드는 다음으로 구성된 군에서 선택된 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함한다: 당화된 아미노산, 페길화된 아미노산, 파르네실화된 아미노산, 아세틸화된 아미노산, 바이오티닐화된 아미노산, 그리고 지질 모이어티에 접합된 아미노산. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 ActRIIB 폴리펩티드는 당화되고, CHO 세포에서 폴리펩티드로부터 얻을 수 있는 당화 패턴을 갖는다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 본원에 개시된 임의의 ActRIIB 폴리펩티드와 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된 제 2 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체 단백질을 제공한다: ALK1, ALK2, ALK3, ALK4, ALK5, ALK6, ALK7, ActRIIA, TGFBRII, BMPRII, 그리고 MISRII 폴리펩티드, 또는 이의 기능적 단편들. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK1 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK1 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 54에 대하여 최소한 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK1 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 및 63중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK2 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK2 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 64 또는 65의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK2 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 및 73의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK3 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK3 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 74의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK3 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 74, 75, 76, 77, 80, 또는 81의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK4 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK4 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 84 또는 85의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK4 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 84, 86, 85, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94 및 95의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK5 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK5 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 96 또는 97의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK5 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 96, 98, 97, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 및 107의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK6 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK6 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 108 또는 110의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK6 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 및 119의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ALK7 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK7 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 120, 121, 또는 122의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK7 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 120, 123, 124, 125, 121, 126, 122, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 및 136의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 ActRIIA 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIA 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 137의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIA 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 및 147의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 TGFBRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 TGFBRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 204의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 TGFBRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 161, 162, 160, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 및 179의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 BMPRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 BMPRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 148 또는 149의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 BMPRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 148, 150, 149, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158 및 159의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 제 2 폴리펩티드는 MISRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편들이다. 일부 구체예들에서, 상기 MISRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 180, 181, 또는 182의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 MISRII 폴리펩티드 또는 이의 기능적 단편은 서열 번호: 180, 183, 181, 184, 182, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 및 193의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 기능적 단편들을 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 뿐만 아니라 상기 동일한 것을 포함하는 동종다량체 및 이종다량체를 포함하는, ActRIIB 폴리펩티드와 약학적으로 수용가능한 담체를 포함하는 약학 제제에 관계한다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 ActRIIB 이종이량체를 포함하는 약학 제제는 약 10%, 9%, 8%, 7%, 6%, 5%, 4%, 3%, 2% 미만, 또는 약 1% 미만의 동종다량체를 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 본 명세서에서 기술된 바와 같이 상기 하나 또는 그 이상의 ActRIIB 폴리펩티드(들)에 대한 코딩 서열을 포함하는 단리된 및/또는 재조합 핵산에 관계한다. 예를 들면, 일부 구체예들에서, 본 명세서는 서열 번호: 3, 10, 31, 35, 38, 41, 44, 또는 47중 어느 하나에 상응하는 핵산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 단리된 및/또는 재조합 핵산에 관계한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 단리된 및/또는 재조합 폴리뉴클레오티드 서열은 본 명세서에서 기술된 코딩 서열(가령, 서열 번호: 3, 10, 31, 35, 38, 41, 44, 또는 47중 어느 하나에 상응하는 핵산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 핵산)에 작동가능하도록 연계된 프로모터 서열을 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서는 본 명세서에서 기술된 단리된 및/또는 재조합 핵산(가령, 서열 번호: 3, 10, 31, 35, 38, 41, 44, 또는 47중 어느 하나에 상응하는 핵산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 핵산)을 포함하는 벡터에 관계한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서는 본 명세서에서 기술된 단리된 및/또는 재조합 폴리뉴클레오티드 서열 (가령, 서열 번호: 3, 10, 31, 35, 38, 41, 44, 또는 47중 어느 하나에 상응하는 핵산 서열에 대하여 적어도 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 핵산)을 포함하는 세포에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 세포는 CHO 세포다. 일부 구체예들에서, 상기 세포는 COS 세포다.
특정 양태에서, 본 명세서는 본 명세서에서 기술된 바와 같이, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 비롯한 ActRIIB 폴리펩티드 뿐만 아니라 이와 같은 동일한 것들을 포함하는 동종다량체 및 이종다량체를 만드는 방법에 관계한다. 이런 방법은 본원에서 개시된 핵산 중에서 한 가지를 적합한 세포 (가령, CHO 세포 또는 COS 세포)에서 발현하는 것을 포함할 수 있다. 이러한 방법은 다음을 포함할 수 있다: a) 가용성 ActRIIB 폴리펩티드의 발현에 적합한 조건하에 세포를 배양하고, 이때 전술한 세포는 ActRIIB 폴리펩티드 발현 구조체를 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 방법은 발현된 ActRIIB 폴리펩티드를 회수하는 것을 더 포함한다. ActRIIB 폴리펩티드는 세포 배양액으로부터 단백질을 획득하기 위한 널리 공지된 기술 중에서 한 가지를 이용하여, 미가공, 부분적으로 정제된, 또는 고도로 정제된 분획물로서 회수될 수 있다.
일부 구체예들에서, 본 명세서는 환자에게서 적혈구 세포 수준 또는 헤모글로빈 수준을 증가시키는 방법에 관계하는데, 이 방법은 본 명세서에서 기술된 바와 같이, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 포함한, ActRIIB 폴리펩티드 뿐만 아니라 상기 동일한 것을 포함하는 동종다량체 및 이종다량체를 이를 필요로 하는 환자에게 투여하는 것을 포함한다.
일부 구체예들에서, 본 명세서는 환자에게서 빈혈 또는 빈혈과 연관된 장애 (가령, 본 명세서에서 기술된 것들)를 치료하는 방법에 관계하는데, 이 방법은 본 명세서에서 기술된 바와 같이, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 포함한, ActRIIB 폴리펩티드 뿐만 아니라 상기 동일한 것을 포함하는 동종다량체 및 이종다량체를 이를 필요로 하는 환자에게 투여하는 것을 포함한다.
일부 구체예들에서, 본 명세서는 환자에게서 근육량 및/또는 근육 강도를 증가시키는 방법에 관계하는데, 이 방법은 본 명세서에서 기술된 바와 같이, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 포함한, ActRIIB 폴리펩티드 뿐만 아니라 상기 동일한 것을 포함하는 동종다량체 및 이종다량체를 이를 필요로 하는 환자에게 투여하는 것을 포함한다.
일부 구체예들에서, 본 명세서는 환자에게서 근육-관련된 장애를 치료하는 방법에 관계하는데, 이 방법은 본 명세서에서 기술된 바와 같이, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 포함한, ActRIIB 뿐만 아니라 상기 동일한 것을 포함하는 동종다량체 및 이종다량체를 이를 필요로 하는 환자에게 투여하는 것을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 장애는 바람직하지 않는 수준의 낮은 근육 성장 및/또는 근력 약화와 관련된다. 이러한 장애는 근육 위축, 근이영양증, 근위축성 측삭 경화증 (ALS) 및 근육 소모 장애(가령, 악액질, 식욕 부진, DMD 증후군, BMD 증후군, AIDS 낭비 증후군, 근이영양증, 신경근 질환, 운동 신경 질환, 신경근 접합부 질환 및 염증성 근육병증))를 포함한다.
일부 구체예들에서, 본 명세서는 체지방 함량을 감소시키거나 체지방 함량의 증가율을 감소시키는 방법, 그리고 비만, 비-인슐린 의존성 진성 당뇨병 (NIDDM), 심혈관 질환, 암, 고혈압, 골관절염, 뇌졸중, 호흡기 질환 및 담낭 질환과 같은 바람직하지 못한 체중 증가와 연관된 질환 치료 방법에 관계하는데, 이 방법은 본 명세서에서 설명된 바와 같이, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 뿐만 아니라 상기 동일한 것을 포함하는 동종다량체 및 이종다량체를 포함하는 ActRIIB를 이를 필요로 하는 환자에게 투여하는 것을 포함한다.
도 1 은 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 ("X"로 나타냄)와 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 ("Y"로 나타냄) 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드 ("Y"로 나타냄)를 포함하는 이형(heteromeric) 단백질 복합체의 도식적 예시를 보여준다. 기술된 구체예에서, 상기 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 상호작용 쌍의 제1구성요소("C1")를 포함하는 융합 폴리펩티드의 일부이며, 그리고 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드는 상호작용 쌍의 제 2구성요소 ("C2")를 포함하는 융합 폴리펩티드의 일부다. 적합한 상호작용 쌍은 예를 들면, 중쇄 및/또는 경쇄 면역글로불린 상호작용 쌍, 절두(truncations), 및 본 명세서에서 설명된 바와 같은 이의 변이체들 [가령, Spiess et al (2015) Molecular Immunology 67(2A): 95-106]을 포함한다. 각 융합 폴리펩티드에서, 링커는 상기 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드 및 상호작용 쌍의 대응하는 구성요소 사이에 위치할 수 있다. 상호작용 쌍의 제1과 제2 구성요소들은 비유도될 수 있는데, 이것은 상기 쌍의 구성원들이 실제적인 선호 없이 서로 연관되거나 또는 자가-연관될 수 있고, 그리고 따라서, 이들은 동일하거나 상이한 아미노산 서열을 가질 수 있다는 것을 의미한다. 도 1a 참고. 대안으로, 상호작용 쌍의 첫 번째와 두 번째 구성원은 유도된(비대칭) 쌍일 수 있는데, 이것은 상기 쌍의 구성원들이 자가 연관보다는 서로에 선호적으로 연관된다는 것을 의미한다. 도 1b.
도 2은 다중 ActRIIB 및 ActRIIA 결정 구조의 복합 분석에 근거하여, 리간드(상자로 표시됨)와 직접 접촉하기 위하여, 본 명세서에서 추측된 잔기를 갖는 인간 ActRIIA의 세포외 도메인과 인간 ActRIIB의 세포외 도메인의 정렬을 나타낸다.
도 3은 세포 내 도메인이 없는 다양한 척추 동물 ActRIIB 전구체 단백질, 세포 내 도메인이 없는 인간 ActRIIA 전구체 단백질 및 콘센서스 ActRII 전구체 단백질의 다중 서열 정렬을 보여준다.
도 4는 Clustal 2.1을 이용하여 인간 IgG 아이소타입으로부터 Fc 도메인의 복수 서열 정렬을 보여준다. 힌지 영역은 점선 밑줄에 의해 표시된다. 이중 밑줄은 비대칭 사슬 짝짓기를 증진하기 위해 IgG1 Fc (서열 번호: 13)에서 조작될 수 있는 위치 및 다른 아이소타입 IgG4(서열 번호: 17), IgG2(서열 번호: 14)및 IgG3(서열 번호: 15)에 대하여 상응하는 위치의 실례를 나타낸다.
도 5 는 인간 ActRIIB 세포외 도메인 폴리펩티드 (서열 번호: 1)의 아미노산 서열을 나타내는데, 이때 번호매김은 천연 인간 ActRIIB 전구체 서열 (서열 번호: 2 참조)에 기초한다.
도 6 은 인간 ActRIIB 전구체 단백질의 아미도산 서열 (서열 번호: 2; NCBI 참조 서열 NP_001097.2)을 보여준다. 신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 도메인은 굵은 체로 표시되며(서열 번호: 1로도 지칭됨), 그리고 잠재적인 내인성 N-연계된 당화 부위는 박스로 표시된다.
도 7 은 인간 ActRIIB(20-134) 세포외 도메인 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산 서열을 보여준다.
도 8 은 인간 ActRIIB 전구체 단백질을 인코딩하는 핵산 서열을 보여준다. 서열 번호: 4는 NCBI 참조 서열 NM_001106의 뉴클레오티드 25-1560로 구성된다.
도 9 는 37℃에서 표면 플라스몬 공명으로 측정하였을 때, 변이체 또는 변형안된 ActRIIB 도메인을 포함하는동종이량체 Fc-융합 단백질의 리간드 별합 역동학에 대한 값을 나타낸다. 아미노산 번호매김은 서열 번호: 2에 기초한다.
도 10 은 25℃에서 표면 플라스몬 공명으로 측정하였을 때, 변이체 또는 변형안된 ActRIIB 도메인을 포함하는동종이량체 Fc-융합 단백질의 리간드 별합 역동학에 대한 값을 나타낸다. 아미노산 번호매김은 서열 번호: 2에 기초한다.
도 11은 비이클 또는 변이체 또는 변형안된 ActRIIB 도메인을 포함하는 동종이량체 Fc-융합 단백질로 처리된 야생형 마우스의 기선으로부터 체중 변화를 보여준다.
도 12는 비이클 또는 변이체 또는 변형안된 ActRIIB 도메인을 포함하는 동종이량체 Fc-융합 단백질로 처리된 야생형 마우스에서 헤모글로빈 농도를 나타낸다.
도 13은 ActRIIB-Fc, ActRIIA-Fc 또는 ActRIIB (F82I)-Fc로 1 일째 및 15 일째에 9 mg/kg (s.c.)으로 처리된 시노몰구스(cynomolgus) 원숭이에서 적혈구 수치를 나타낸다. ActRIIB (F82I)-Fc 처리는 ActRIIB-Fc (음성 대조군)에 비교하여, ActRIIA-Fc (양성 대조군)와 유사한 양으로 RBC 수치를 증가시켰다.
상세한 설명
1. 개요
특정 양태에서, 본 발명은 ActRIIB 폴리펩티드에 관계한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 임의의 종으로부터 유도된 액티빈 수용체 유형 IIB (ActRIIB) 단백질 및 ActRIIB-관련된 단백질의 패밀리를 나타낸다. ActRIIB 패밀리의 구성요소는 시스테인-풍부 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 및 예상 세린/트레오닌 키나제 특이성을 갖는 세포질 도메인을 포함하는 모든 막경유 단백질이다. ActRIIB 전구체 단백질의 아미도산 서열 (서열 번호: 2)은 도6에 나타낸다.
용어 "ActRIIB 폴리펩티드"는 ActRIIB 구성요소의 임의의 자연 발생성 폴리펩티드, 뿐만 아니라 유용한 활성을 보유하는 그의 임의의 변이체 (돌연변이체, 단편, 융합체 및 펩티드 유사체를 포함함)를 포함하는 폴리펩티드를 지칭할 때 사용된다. 예를 들면, ActRIIB 폴리펩티드는 ActRIIB 폴리펩티드의 서열에 최소한 약 80% 동일한, 그리고 바람직하게는 최소한 85%, 90%, 95%, 97%, 99% 또는 그 이상의 동일성을 갖는 임의 공지의 ActRIIB 서열로부터 유도된 폴리펩티드를 포함한다.
특정 구체예에서, 본 발명은 가용성 ActRIIB 폴리펩티드에 관계한다. 본원에서 기술된 바와 같이, 용어 "가용성 ActRIIB 폴리펩티드"는 ActRIIB 단백질의 세포외 도메인을 포함하는 폴리펩티드를 일반적으로 지칭한다. 용어 "가용성 ActRIIB 폴리펩티드"는 본 명세서에서 사용된 바와 같이, ActRIIB 단백질의 임의의 자연 발생적 세포외 도미인, 뿐만 아니라 유용한 활성을 보유하는 이의 임의의 변이체 (돌연변이체, 단편, 및 펩티드 유사체를 포함함)를 포함한다. 예를 들면, ActRIIB 단백질의 세포외 도메인은 리간드에 결합하고, 일반적으로 가용성이다. 예시적인 가용성 ActRIIB 폴리펩티드는 도 5 뿐만 아니라 서열 번호: 53에 나타낸 ActRIIB 세포외 도메인 (서열 번호: 1)을 포함한다. 다른 예시적인 가용성 ActRIIB 폴리펩티드는 ActRIIB 단백질의 세포외 도메인에 추가하여, 신호 서열을 포함한다 (실시예 1 참고). 상기 신호 서열은 ActRIIB의 천연 신호 서열, 또는 조직 플라스 미노겐 활성제 (TPA) 신호 서열 또는 꿀벌 멜라틴 신호 서열과 같은 다른 단백질의 신호 서열일 수 있다.
TGF-β 신호는 리간드 자극 시 하류 SMAD 단백질을 인산화시키고, 활성화시키는 유형 I 및 유형 II 세린/트레오닌 키나제 수용체의 이형 복합체에 의해 매개된다(, 2000, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 1:169-178).이들 유형 I 및 유형 II 수용체는 모두 시스테인-풍부한 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 그리고 예측된 세린/트레오닌 특이성을 갖는 세포질 도메인으로 구성된 막경유 단백질이다. 유형 I 수용체는 신호생성에 필수적이며, 그리고 유형 II 수용체는 리간드의 결합에 필요하다. 유형 I 및 유형 II 액티빈 수용체는 리간드 결합 후 안정적 복합체를 형성하여, 유형 II 수용체에 의한 유형 I 수용체가 인산화된다.
2가지 관련된 유형 II 수용체, ActRIIA 및 ActRIIB는 액티빈의 유형 II 수용체로 확인되었다 (Mathews and Vale, 1991, Cell 65:973-982; Attisano et al., 1992, Cell 68: 97-108). 액티빈 외에도, ActRIIA와 ActRIIB는 BMP7, Nodal, GDF8, 및 GDF11을 비롯한 여러 다른 TGF-β 계열 단백질과 생화학적으로 상호작용할 수 있다 (Yamashita et al., 1995, J. Cell Biol. 130:217-226; Lee and McPherron, 2001, Proc. Natl. Acad. Sci. 98:9306-9311; Yeo and Whitman, 2001, Mol. Cell 7: 949-957; Oh et al., 2002, Genes Dev. 16:2749-54). 출원인은 가용성 ActRIIA-Fc 융합 단백질 및 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 생체 내에서 실질적으로 상이한 효과를 갖는다는 것을 발견하였는데, ActRIIB-Fc는 골격근에 대한 주요 효과를 갖고, ActRIIA-Fc는 뼈에 대한 주요 효과를 갖는다.
특정 구체예들에서, 본 발명은 대상 ActRIIB 폴리펩티드 (가령, 가용성 ActRIIB 폴리펩티드)로 ActRIIB 수용체의 리간드(또한 ActRIIB 리간드로 또한 지칭됨)를 길항하는 것에 관계한다. 따라서, 본 발명의 조성물 및 방법은 ActRIIB 수용체의 하나 또는 그 이상의 리간드의 비정상적 활성과 연합된 장애를 치료하는데 유용하다. ActRIIB 수용체의 예시적인 리간드는 일부 TGF-β 패밀리 구성요소, 이를 테면 액티빈, Nodal, GDF8, GDF11, 그리고 BMP7을 포함한다.
액티빈은 이량체 폴리펩티드 성장 인자이고, TGF-베타 수퍼 패밀리에 속한다. 2개의 밀접하게 관련된 β 소단위 (βAβA, βBβB, 및 βAβB)의 동형/이형이량체인 3가지 액티빈(A, B, 및 AB)가 있다. TGF-베타 슈퍼패밀리에서, 액티빈은 난소 및 태반 세포에서 호르몬 생성을 자극하고, 신경 세포 생존을 지원하고, 세포 유형에 따라 세포주기 진행에 긍정적 또는 부정적 영향을 미칠 수 있고, 그리고 적어도 양서류 태아에서 중배엽 분화를 유도할 수 있는 독특하고 다기능적 요소다 (DePaolo et al., 1991, Proc SocEp Biol Med. 198:500-512; Dyson et al., 1997, Curr Biol. 7:81-84; Woodruff, 1998, Biochem Pharmacol. 55:953-963). 더욱이, 자극된 인간 단핵구 백혈병 세포는 액티빈 A에 대해 동일한 것으로 밝혀졌다 (Murata et al., 1988, PNAS, 85:2434). 액티빈 A는 골수에서 적혈구 생성의 자연 조절 인자로 작용한다고 제안되었다. 몇몇 조직에서, 액티빈 신호전달은 이것의 관련된 이형이량체, 인히빈에 의해 길항된다. 예를 들면, 뇌하수체로부터 난포-자극 호르몬 (FSH) 분비 동안, 액티빈은 FSH 합성 및 분비를 촉진시키지만, 한편 인히빈은 FSH 합성 및 분비를 저해시킨다. 액티빈 생활성을 조절하고 및/또는 액티빈에 결합하는 다른 단백질은 폴리스태틴 (FS), 폴리스태틴-관련된 단백질 (FSRP), 및 α2-마크로글로블린, Cerberus, 그리고 엔도글린(endoglin)을 포함한다.
Nodal 단백질은 중배엽 및 내배엽 유도 그리고 형성, 뿐만 아니라 후속적인 축 구조의 조직화, 이를 테면, 조기 배발생에서 심장 및 위의 조직화에 기능을 한다. 발생중인 척추 배아의 배쪽 조직은 주변 세포를 모집하여 비-축척 배아 구조를 형성하는 동안, 척주 및 척추 전판의 축 구조에 주로 기여한다는 것이 증명되었다. Nodal은 타입 I 및 타입 II 수용체 모두와 SMAD 단백질로 알려진 세포내 작동체(effectors)를 통하여 신호생성을 하는 것으로 보인다. ActRIIA 및 ActRIIB는 nodal의 타입 II 수용체로 기능을 한다는 사상은 최근 연구에 의해 뒷받침된다(Sakuma et al., Genes Cells. 2002, 7:401-12). Nodal 리간드들은 Smad2를 인산화시키는 액티빈 타입 I 및 타입 II 수용체를 활성화시키는 이들의 공-인자들 (가령, cripto)과 상호작용한다고 제안되었다. Nodal 단백질은 중배엽 형성, 전방 패턴화 및 좌우 축 사양을 포함하여 초기 척추 배아에 중요한 여러 가지 사건에 연루되어 있다. 실험적 증거에 의하면, Nodal 신호생성은 이전에 액티빈 및 TGF-베타에 특이적으로 반응하는 것으로 보이는 루시퍼라제(luciferase) 리포터인 pAR3-Lux를 활성화시킨다는 사실이 입증되었다. 그러나, Nodal은 뼈 형성 단백질에 특이적으로 반응하는 리포터인, pTlx2-Lux는 유도할 수 없다. 최근 결과는 Nodal 신호생성은 액티빈-베타 경로 Smad2와 Smad3에 의해 중재된다는 직접적인 생화학적 증거를 제공한다. 추가 증거에서 나타낸 바와 같이, 세포외 cripto 단백질은 Nodal 신호생성에 필요하며, 이는 액티빈 또는 TGF-베타 신호생성과 구별된다.
성장 및 분화 인자-8 (GDF8)은 또한 미오스태틴으로 알려져 있다. GDF8은 골격근량의 음성 조절인자다. GDF8은 골발생중인 그리고 성인 골격근에서 상당히 발현된다. 유전자삽입 마우스에서 GDF8 null 돌연변이는 골격근의 눈에 띄는 비대 및다형성을 특징으로 한다(McPherron et al., Nature, 1997, 387:83-90). 소에서 GDF8의 자연 발생 돌연변이에서 골격근량의 비슷한 증가가 있고 (Ashmore et al., 1974, Growth, 38:501-507; Swatland and Kieffer, J. Anim. Sci., 1994, 38:752-757; McPherron and Lee, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997, 94:12457-12461; 그리고 Kambadur et al., Genome Res., 1997, 7:910-915), 그리고 인간에서 현저하게 나타난다(Schuelke et al., N Engl J Med 2004;350:2682-8). 연구에 따르면, 사람의 HIV 감염과 관련된 근육 소모는 GDF8 단백질 발현 증가를 수반한다(Gonzalez-Cadavid et al., PNAS, 1998, 95:14938-43). 또한, GDF8은 근육 특이적 효소 (예: 크레아틴 키나제)의 생산을 조절하고, 근섬유 세포 증식을 조절할 수 있다 (WO 00/43781). GDF8 프로펩티드(propeptide)는 성숙한 GDF8 도메인 이량체에 비공유 결합하여, 그 생물학적 활성을 불활성화시킬 수 있다. (Miyazono et al. (1988) J. Biol. Chem., 263: 6407-6415; Wakefield et al. (1988) J. Biol. Chem., 263; 7646-7654; 그리고 Brown et al. (1990) Growth Factors, 3: 35-43). GDF8 또는 구조적으로 관련된 단백질에 결합하고, 이들의 생물학적 활성을 억제시키는 다른 단백질은 폴리스태틴, 그리고 잠재적으로, 폴리스태틴-관련된 단백질을 포함한다(Gamer et al. (1999) Dev. Biol., 208: 222-232).
또한 MP11로 알려진, 성장 및 분화 인자-11 (GDF11)은 또한 분비된 단백질이다 (McPherron et al., 1999, Nat. Genet. 22: 260-264). GDF11은 마우스 발생 동안 꼬리싹(tail bud), 팔다리싹(limb bud), 상악 및 하악 아치, 그리고 후근 신경절에서 발현되는 분비 단백질이다(Nakashima et al., 1999, Mech. Dev. 80: 185-189). GDF11은 중배엽 및 신경 조직 모두에서 패턴화에 독특한 역할을 한다(Gamer et al., 1999, Dev Biol., 208:222-32). GDF11은 병아리 날개 발달에있어서 연골 형성 및 근형성의 음성 조절자인 것으로 나타났다(Gamer et al., 2001, Dev Biol. 229:407-20). 근육에서 GDF11의 발현은 GDF8과 유사한 방식으로 근육 성장을 조절하는 역할을 암시한다. 또한, 뇌에서 GDF11의 발현은 GDF11이 또한 신경계의 기능과 관련된 활성을 가질 수 있음을 시사한다. 흥미로운 것은, GDF11은 후각 상피의 신경 발생을 억제하는 것으로 밝혀졌다(Wu et al., 2003, Neuron. 37:197-207). 따라서, GDF11은 근육 질환 및 신경 퇴행성 질환(가령, 근위축성 측색 경화증)과 같은 질병의 치료에서 시험관내 및 생체내 적용될 수 있다.
골형성 단백질-1 (OP-1)로도 불리는 뼈 형태생성 단백질(BMP7)은 연골 및 뼈 형성을 유도하는 것으로 잘 알려져 있다. 또한, BMP7은 다양한 생리학적 과정을 조절한다. 예를 들면, BMP7은 상피 골 형성의 현상을 담당하는 골 유도 인자일 수 있다. BMP7은 칼슘 조절과 뼈 항상성(homeostasis)에 역할을 한다는 것을 발견했다. 액티빈과 마찬가지로, BMP7은 타입 II 수용체, ActRIIA 및 IIB에 결합한다. 그러나, BMP7 및 액티빈은 이형화학성 수용체 복합체 안으로 별개의 타입 I 수용체들을 모집한다. 관찰된 주요 BMP7 타입 I 수용체는 ALK2이었고, 액티빈은 ALK4 (ActRIIB)에 배타적으로 결합하였다. BMP7 및 액티빈은 별개의 생물학적 반응을 유도하였고, 상이한 Smad 경로들을 활성화시켰다 (Macias-Silva et al., 1998, J Biol Chem. 273:25628-36).
특정 양태에서, 본 발명은 ActRIIB 활성과 관련된 임의의 공정에서, 일반적으로 ActRIIB 리간드 신호생성을 길항하기 위하여 특정 ActRIIB 폴리펩티드 (가령, 가용성 ActRIIB 폴리펩티드)의 사용에 관계한다. 임의선택적으로, 본 발명의 ActRIIB 폴리펩티드는 ActRIIB 수용체의 하나 또는 그 이상의 리간드, 이를 테면 액티빈, Nodal, GDF8, 그리고 GDF11을 길항할 수 있고, 그리고 따라서 추가 장애의 치료에 유용할 수 있다.
따라서, 본 발명은 비정상 활성의 ActRIIB 또는 ActRIIB 리간드와 연관된 질병 또는 상태의 치료 또는 예방에서 ActRIIB 폴리펩티드의 사용을 고려한다. ActRIIB 또는 ActRIIB 리간드는 많은 중요한 생물학적 과정의 조절에 관여한다. 이러한 과정에서 주요 기능으로 인해 치료 개입의 바람직한 목표가 될 수 있다. 예를 들면, ActRIIB 폴리펩티드 (가령, 가용성 ActRIIB 폴리펩티드)는 인간 또는 동물의 장애 또는 상태를 치료하는 데 사용될 수 있다. 이러한 장애 또는 상태의 예로는 2 형 당뇨병, 내당능 장애, 대사 증후군 (예 : 증후군 X) 및 외상 (예 : 화상 또는 질소 불균형)에 의해 유도되는 인슐린 내성과 같은 대사 장애; 지방 조직 장애 (예를 들어, 비만); 근육 및 영양 장애, 예컨대 근이영양증 (Duchenne 근이영양증 포함); 근위축성 측삭 경화증 (ALS); 근육 위축; 장기 위축; 여림; 수근관 증후군; 울혈성 폐색성 폐 질환; 근육감소증, 악액질 (cachexia) 및 기타 근육 소모 증후군을 포함한다. 다른 예로는 골다공증, 특히 노인 및/또는 폐경 후 여성에서 골다공증; 글루코코르티코이드-유도된 골다공증; 골감감소증; 골관절염; 및 골다공증-관련 골절을 포함한다. 또 다른 예로는 만성 글루코코르티코이드 치료, 조기 성선 기능 부전, 안드로겐 억제, 비타민 D 결핍, 이차 부갑상선기능항진증, 영양 결핍 및 신경성 식욕 부진으로 인한 뼈 질량 감소를 포함한다. 이러한 장애 및 상태는 아래 "예시적 치료적 용도"에서 논의된다.
이 발명에서 사용된 용어는 일반적으로 본 개시 내용 및 각 용어가 사용되는 특정 상황에서 당해 분야의 통상적인 의미를 갖는다. 특정 용어는 발명의 구성 및 방법을 설명하고, 이를 작성하고 사용하는 방법에 대해 당업자에게 추가 지침을 제공하기 위해 아래 또는 다른 곳에서 논의된다. 어떤 용어의 사용의 범위나 의미는 그것이 사용되는 특정 상황에서 명백해질 것이다.
"약" 및 "대략적으로"는 일반적으로 측정의 성질 또는 정밀도를 고려하여 측정된 양에 대한 허용 오차를 의미한다. 전형적으로, 예시적인 오차도는 주어진 값 또는 값 범위의 20퍼센트(%) 이내, 바람직하게는 10 % 이내, 보다 바람직하게는 5 % 이내이다.
대안으로, 그리고 특히 생물학적 계통에서, 용어 "약" 및 "대략적으로"는 주어진 값의 크기의 차수, 바람직하게는 5 배 이내,보다 바람직하게는 2 배 이내의 값을 의미 할 수 있다. 본원에서 주어진 수치는 다르게 언급되지 않는 한, 대략적인 것이며, "약" 또는 "대략적으로"라는 용어는 명시적으로 언급되지 않은 경우, 유추될 수 있음을 의미한다.
본 발명의 방법은 하나 이상의 돌연변이체 (서열 변이체)와 비-변형 (야생형) 서열을 포함하는 서열을 서로 비교하는 단계를 포함할 수 있다. 이러한 비교는 전형적으로, 예를 들어, 당해 분야에 잘 공지된 서열 정렬 프로그램 및/또는 알고리즘 (예를 들어, BLAST, FASTA 및 MEGALIGN 그리고 다수)을 사용하여 중합체 서열의 정렬을 포함한다. 숙련된 당업자는 돌연변이가 잔기 삽입 또는 결실을 포함하는 그러한 정렬에서, 서열 정렬은 삽입되거나 결실된 잔기를 함유하지 않는 중합체 서열에서 "갭" (전형적으로-또는 "A"로 표시됨)을 도입할 수 있음을 인지할 것이다.
모든 문법적 형태 및 단어 변이에서 "상동성(Homologous)"이란 동일한 유기체 종에서 슈퍼패밀리의 단백질을 포함하는 "공통적인 진화 기원"을 포함하는 두개 단백질간의 상관관계를 지칭하거나, 뿐만 아니라 상이한 유기체 종의 상동성 단백질을 지칭한다. 이러한 단백질 (및 이의 인코딩 핵산)은 서열 상동성을 갖고, 동일성 (%) 또는 특정 잔기 또는 모티프 및 보존된 위치의 존재 여부와 관계없이, 서열 유사성에 의해 반영되는 바와 같은 서열 상동성을 갖는다.
용어 "서열 유사성(sequence similarity)"은 모든 문법적 형태에서 일반적인 진화론적 기원을 공유하거나 공유하지 않을 수 있는 핵산 또는 아미노산 서열 간의 동일성 또는 일치 정도를 의미한다.
그러나, 일반적인 용도 및 당해 출원에서, "상동성"이라는 용어는 "매우"와 같은 부사로 수식될 때 서열 유사성을 지칭할 수 있고, 일반적인 진화적 기원과 관련 될 수도 있고 또는 그렇지 않을 수 도 있다.
"항진하다(agonize)"는 모든 문법적 형태로 단백질 및/또는 유전자를 활성화 (예 : 단백질의 유전자 발현을 활성화 또는 증폭하거나 비활성 단백질을 활성화 상태로 유도함으로써)하거나 단백질 및 단백질을 증가시키는 과정을 의미한다.
"길항하다(antagonize)"는 모든 문법적 형태로 단백질 및/또는 유전자를 억제(예 : 단백질의 유전자 발현을 억제 또는 감소시키거나 활성 단백질을 비활성화 상태로 유도함으로써)하거나 단백질 및 단백질을 감소시키는 과정을 의미한다.
명세서 및 청구 범위에 걸쳐 수치와 관련하여 사용되는 용어 "약(about)" 및 "대략적으로(approximately)"이란 당업자에게 친숙하고 수용가능한 정확도의 구간을 나타낸다. 일반적으로 이러한 정확도 간격은 ± 10 %이며, 대안으로, 그리고 특히 생물학적 계통에서, 용어 "약" 및 "대략"은 주어진 값의 크기의 차수, 바람직하게는 ≤5 배,보다 바람직하게는 ≤2 배 이내의 값을 의미 할 수 있다.
여기에 개시된 수치 범위는 범위를 정의하는 수치를 포함한다.
용어 "a" 및 "an"은 용어가 사용된 문맥이 명확하게 달리 지시하지 않는 한, 복수형을 포함한다. 용어 "하나 또는 이상의" 및 "최소 하나의 "는 물론 호환할 수 있는 용어로 "하나"(또는 "하나")라는 용어를 사용할 수 있다. 더욱이, 본 명세서에서 사용된 "및/또는"이란 둘 또는 그 이상의 특정 특징 또는 구성 요소의 각각의 구체적인 설명으로서 취해질 것이다. 따라서, 구절에서 사용된 용어 "및/또는", 이를 테면 "A 및/또는 B"는 "A와 B", "A 또는 B", "A" (단독), 및 "B" (단독)을 포함한다. 마찬가지로, "A, B, 및/또는 C"와 같은 문구에 사용된 "및/또는"이라는 용어는 다음 각 측면을 포함하는 것으로 의도된다: A, B, 및 C; A, B, 또는 C; A 또는 C; A 또는 B; B 또는 C; A와 C; A와 B; B와 C; A (단독); B (단독); 및 C (단독).
2. ActRIIB 폴리펩티드
특정 양태에서, 본 발명은 ActRIIB 변이체 폴리펩티드 (가령, 가용성 ActRIIB 폴리펩티드)에 관계한다. 임의선택적으로, 단편, 기능적 변이체 및 변형된 형태는 상응하는 야생형 ActRIIB 폴리펩티드와 유사하거나 또는 동일한 생물학적 활성을 갖는다. 예를 들면, 본 발명의 ActRIIB 변이체는 ActRIIB 리간드 (가령, 액티빈 A, 액티빈 AB, 액티빈 B, Nodal, GDF8, GDF11 또는 BMP7)에 결합하고, 이의 기능을 억제할 수 있다. 임의선택적으로, ActRIIB 폴리펩티드는 뼈, 연골, 근육 또는 지방과 같은 조직의 성장을 조절한다. 예시적인 ActRIIB 폴리펩티드는 인간 ActRIIB 전구체 폴리펩티드 (서열 번호: 2), 그리고 가용성 인간 ActRIIB 폴리펩티드 (가령, 서열 번호: 1, 5, 6 및 12)를 포함한다.
본 명세서는 ActRIIB의 기능적으로 활성인 부분 및 변종을 확인한다. 본 출원인은 Hilden 등(Blood. 1994 Apr 15; 83 (8) : 2163-70)이 개시한 서열을 갖는 Fc 융합 단백질은 서열 번호: 2의 아미노산 64에 상응하는 위치에 알라닌을 갖고, 액티빈 및 GDF11에 대하여 상대적으로 낮은 친화도를 갖는다는 것을 확인하였다. 대조적으로, 위치 64에 아르기닌 (R64)을 갖는 동일한 Fc 융합 단백질은 액티빈과 GDF-11에 대하여 낮은 나노몰에서 높은 피코몰 범위의 친화력을 갖는다. 따라서, R64를 갖는 서열은 본 명세서에서 인간 ActRIIB의 야생형 기준 서열로 이용된다.
Attisano et al. (Cell. 1992 Jan 10;68(1):97-108)는 ActRIIB의 세포외 도메인의 C-말단에서 프롤린 매듭의 결손은 액티빈에 대한 수용체의 친화력을 감소 시킨다는 것을 보여 주었다. WO2008097541에서 개시된 데이터에서 서열 번호: 2의 아미노산 20-119을 함유하는 ActRIIB-Fc 융합 단백질, "ActRIIB(20-119)-Fc"는 ActRIIB(20-134)-Fc와 비교하여 GDF11 및 액티빈에 감소된 결합을 가지며, 이는 프롤린 매듭 영역과 완벽한 막에 인접한(juxtamembrane) 도메인을 포함한다. 그러나, ActRIIB(20-129)-Fc 단백질은 비록 프롤린 매듭 영역이 파괴되었지만, 야생형에 비교하여 유사하지만, 다소 감소된 활성을 유지한다. 따라서, 아미노산 134, 133, 132, 131, 130 및 129에서 종료되는 ActRIIB 세포외 도메인은 모두 활성인 것으로 예상되지만, 134 또는 133에서 종료되는 구조체는 대부분 활성일 것이다. 유사하게, 잔기 129-134중 임의의 위치에서 돌연변이는 큰 폭으로 리간드 결합 친화력을 변경시키지 않을 것으로 예상된다. 이를 뒷받침하는 것으로, P129 및 P130의 돌연변이는 실질적으로 리간드 결합을 감소시키지 않는다. 따라서, ActRIIB-Fc 융합 단백질은 아미노산 109 (최종 시스테인)와 같이 빨리 종료될 수 있지만, 그러나, 109와 119에서, 또는 그 사이에서 종료되는 형태는 감소된 리간드 결합을 갖는 것으로 예상된다. 아미노산 119는 잘 보존되지 않고, 따라서 용이하게 변경 또는 절두된다. 128 또는 그 이후에 끝나는 형태는 리간드 결합 활성을 유지한다. 119 또는 127에서 또는 이들 사이에서 끝나는 양식은 중간수준의 결합 기능을 갖는다. 이들중 임의의 것은 임상 또는 실험 환경에 따라 바람직하게 사용될 수 있다.
ActRIIB의 N-말단에서, 아미노산 29 또는 그 전에 시작하는 단백질은 리간드 결합 활성을 보유하는 것으로 예상된다. 아미노산 29는 초기 시스테인을 나타낸다. 위치 24에서 알라닌-에서-아스파라긴으로의 돌연변이는 리간드 결합에 실질적인 영향없이 N-연계된 당화 서열을 도입한다. 이로써 신호 절단(cleavage) 펩티드와 아미노산 20-29에 상응하는 시스테인 교차(cross)-연계된 영역에서 돌연변이는 잘 용인된다는 것이 확인된다. 특히, 위치 20, 21, 22, 23 및 24에서 시작하는 구조체는 활성을 유지할 것이고, 위치 25, 26, 27, 28 및 29에서 시작하는 구조체 또한 활성을 유지할 것으로 예상된다. WO2008097541의 데이터에서 22, 23, 24 또는 25에서 시작하는 구조체가 최고 활성을 갖게 될 것이라는 놀라는 것을 증명한다.
이와 함께, ActRIIB의 활성 부분은 서열 번호:2의 아미노산 29-109를 포함하며, 그리고 구조체들은 예를 들면, 아미노산 20-29에 상응하는 잔기에서 시작하고, 아미노산 109-134에 상응하는 위치에서 종료될 수 있다. 다른 예들은 위치 20-29 또는 21-29에서 시작하고, 119-134, 119-133 또는 129-134, 129-133의 위치에서 종료되는 구조체들을 포함한다. 다른 예들은 20-24 (또는 21-24, 또는 22-25)의 위치에서 시작하고, 109-134 (또는 109-133), 119-134 (또는 119-133) 또는 129-134 (또는 129-133)의 위치에서 종료되는 구조체들을 포함한다. 이 범위 안에 변이체들, 특히, 서열 번호: 4의 대응하는 부분에 최소한 80%, 85%, 90%, 95% 또는 99% 동일성을 갖는 변이체들이 특히 고려된다.
본 명세서는 도 2에서 나타낸 것과 같이, 복합(composite) ActRIIB의 분석 결과를 포함하는데, 상기 리간드 결합 포켓은 잔기 Y31, N33, N35, L38 내지 T41, E47, E50, Q53 내지 K55, L57, H58, Y60, S62, K74, W78 내지 N83, Y85, R87, A92, 및 E94 내지 F101에 의해 부분적으로 한정됨을 나타낸다. 이들 위치에서, 비록 K74A 돌연변이는 R40A, K55A, F82A 및 L79 위치의 돌연변이와 마찬가지로 잘 용인되지만, 보존 돌연변이가 용인될 것으로 예상된다. R40은 제노푸스(Xenopus)에서 K이며, 이 위치에서 염기성 아미노산이 용인됨을 나타낸다. Q53은 소의 ActRIIB에서 R이며, 제노푸스 ActRIIB에서 K이고, 따라서 R, K, Q, N 및 H를 포함하는 아미노산이 이 위치에서 용인될 것이다. 따라서, 활성 ActRIIB 변이체 단백질의 일반 형태는 아미노산 29-109를 포함하지만, 그러나 임의선택적으로 20-24 또는 22-25의 범위 위치에서 시작하고, 129-134의 범위 위치에서 종료되며, 그리고 리간드 결합 포켓에서 단지 1, 2, 5, 10 또는 15개의 보존적 아미노산 변화를 포함하며, 그리고 리간드 결합 포켓의 위치 40, 53, 55, 74, 79 및/또는 82에서 0, 1 또는 그 이상의 비-보존적 변경(alterations)을 포함하는 것이다. 이러한 단백질은 서열 번호: 2의 아미노산 29-109의 서열과 80 %, 90 %, 95 % 또는 99% 이상의 서열 동일성을 보유할 수 있다. 가변성이 특히 잘 용인될 수 있는 결합 포켓 외부의 위치는 세포외 도메인의 아미노 및 카르복시 말단 (상기 언급 한 바와 같음), 그리고 위치 42-46 및 65-73을 함한다. 위치 65에서 아스파라긴에서-알라닌으로의 변경(N65A)은 A64 배경에서 리간드 결합을 실질적으로 개선시키고, 따라서 R64 베경에서 리간드 결합에 유해한 효과를 가지지 않는 것으로 예상된다. 이 변화는 아마도 A64 배경에서 N65의 당화를 제거하여, 이 영역에서의 중요한 변화가 용인될 수 있음을 보여준다. R64A 변화가 잘 용인되지는 않지만, R64K는 잘 용인되고, 따라서 H와 같은 또 다른 염기성 잔기는 64 번 위치에서 용인될 수 있다.
ActRIIB는 거의 모든 동물간에 잘-보존되며, 세포외 도메인의 큰 스트레취(stretches)는 완벽하게 보존된다. 도 3 참고 ActRIIB에 결합하는 많은 리간드들이 매우 보존되어 있다. 따라서, 다양한 척추 동물로부터의 ActRIIB 서열의 비교는 잔류 물에 대한 통찰력을 제공한다. 따라서, 활성을 가진 인간 ActRIIB 변이체 폴리펩티드는 다른 척추 동물 ActRIIB의 서열의 상응하는 위치에 하나 또는 그 이상의 아미노산을 포함할 수 있거나, 또는 인간 또는 다른 척추 동물 서열에서와 유사한 잔기를 포함할 수 있다. 다음 실시예들은 활성 ActRIIB 변이체를 정의하는 접근법을 설명한다. L46은 제노푸스 ActRIIB에서 발린이며, 따라서 이 위치는 변경될 수 있고, 임의선택적으로 또다른 소수성 잔기, 이를 테면 V, I 또는 F로 변경될 수 있거나, 또는 비-극성 잔기, 이를 테면 A로 변경될 수 있다. E52는 제노푸스에서 K이며, 이것은 이 부위가 다양한 광범위한 변화, 가령, 극성 잔기, 이를 테면 E, D, K, R, H, S, T, P, G, Y 그리고 아마도 A를 포함하는 변화를 용인할 것임을 나타낸다. T93은 제노푸스에서 K이며, 이것은 이 위치에서 다양한 구조적 변이를 용인하는데, 극성 잔기, 이를 테면 S, K, R, E, D, H, G, P, G 및 Y를 선호함을 나타낸다. F108은 제노푸스에서 Y이며, 따라서 Y 또는 다른 소수성 기, 이를 테면 I, V 또는 L이 용인되어야 함을 나타낸다. E111은 제노푸스에서 K이며, 이것은 이 위치에서 D, R, K 및 H, 뿐만 아니라 Q와 N을 포함하는 하전된 잔기가 용인될 수 있음을 나타낸다. R112는 제노푸스에서 K이며, 이것은 이 위치에서 R 및 H를 포함하는 염기성 잔기가 용인됨을 나타낸다. 위치 119의 A는 상대적으로 덜 보존되며, 설치류에서는 P이고, 제노푸스에서는 V이며, 따라서 이 위치는 기본적으로 임의의 아미노산이 용인되어야 함을 나타낸다.
WO2008097541에서 개시된 데이터는 추가적인 N-연계된 당화 부위 (N-X-S/T)의 추가로 상기 ActRIIB(R64)-Fc 형태와 비교하여, ActRIIB-Fc 융합 단백질의 활성에 영향을 미치지 않는다는 것을 입증한다. 다른 NX (T/S) 서열은 42-44 (NQS) 및 65-67 (NSS)에서 발견되지만, 후자는 64 위치에서 R로 효율적으로 당화되지 않을 수 있다. N-X-S/T 서열은 일반적으로 도 2에 정의된 리간드 결합 포켓 외부의 위치에 도입될 수 있다. 비-내인성 N-X-S/T 서열의 도입에 특히 적합한 부위는 아미노산 20-29, 20-24, 22-25, 109-134, 120-134 또는 129-134를 포함한다. N-X-S/T 서열은 또한 ActRIIB 서열과 Fc 또는 다른 융합 성분 사이의 링커 내로 도입될 수 있다. 이러한 부위는 기존 S 또는 T에 대하여 올바른 위치에 N을 도입하거나, 또는 기존 N에 대응하는 위치에 S 또는 T를 도입함으로써, 최소한의 노력으로 도입될 수 있다. 따라서, 따라서, N-연계된 당화 부위를 생성시키는 바람직한 변경은 다음과 같다: A24N, R64N, S67N (N65A 변경과 복합 가능), E106N, R112N, G120N, E123N, P129N, A132N, R112S 및 R112T. 당화될 것으로 예측되는 임의의 S는 당화로 인한 보호 때문에, 면역원성 부위를 생성하지 않고 T로 변형될 수 있다. 마찬가지로, 당화될 것으로 예측되는 임의의 T는 S로 변형될 수 있다 따라서, 변경 S67T 및 S44T가 고려된다. 마찬가지로, A24N 변이체에서 S26T 변경이 이용될 수 있다. 따라서, ActRIIB 변이체는 하나 또는 그 이상의 추가적인, 비-내인성 N-연계된 당화 콘센수스 서열을 포함할 수 있다.
위치 L79는 액티빈-미오스태틴 (GDF-11) 변경된 결합 성질을 부여하기 위해 변경될 수 있다. L79A 또는 L79P는 GDF-11 결합을 액틴빈 결합보다 더 많이 감소시킨다. L79E 또는 L79D는 GDF-11 결합을 유지한다. 놀라운 것은, 상기 L79E 및 L79D 변이체는 상당히 감소된 액티빈 결합을 보유한다. 생체 내 실험은 이러한 비-액티빈 수용체가 근육 질량을 증가시키는 중요한 능력을 보유하지만, 다른 조직에 대한 영향을 감소시키는 것을 나타낸다. 이들 데이터는 액티빈에 대한 영향이 감소된 폴리펩티드를 수득하기 위한 바람직함 및 실현 가능성을 입증한다.
설명된 변형은 다양한 방식으로 결합될 수 있다. 추가적으로, 본 명세서에서 기술된 돌연변이 유발 프로그램의 결과는 ActRIIB에서 종종 보존에 유익한 아미노산 위치들이 있음을 나타낸다. 이들은 위치 64 (염기성 아미노산), 위치 80 (산성 또는 소수성 아미노산), 위치 78 (소수성, 특히 트립토판), 위치 37 (산성, 특히 아스파르트산 또는 글루탐산), 위치 56 (염기성 아미노산), 위치 60 (소수성 아미노산, 특히 페닐알라닌 또는 티로신)을 포함한다. 따라서, 본 명세서에서 기술된 각 변이체에서, 본 명세서는 보존될 수 있는 아미노산 틀(framework)을 제공한다. 보존되는 것이 바람직할 수 있는 기타 위치는 다음과 같다: 위치 52 (산성 아미노산), 위치 55 (염기성 아미노산), 위치 81 (산성), 98 (극성 또는 하전된, 특히 E, D, R 또는 K).
특정 구체예들에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드의 단리된 단편은 ActRIIB 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 (가령, 서열 번호: 3 및 4)의 상응하는 단편으로부터 재조합적으로 생산된 폴리펩티드를 스크리닝함으로써 수득할 수 있다. 또한, 단편은 통상의 Merrifield 고체상 f-Moc 또는 t-Boc 화학과 같은 당업계에 공지된 기술을 사용하여 화학적으로 합성될 수 있다. 단편은 (재조합 또는 화학 합성에 의해) 생성될 수 있고, 예를 들어, ActRIIB 단백질 또는 ActRIIB 리간드의 길항제 (억제제) 또는 항진제 (활성화제)로서 기능할 수 있는 펩티드 단편을 동정하기 위해 시험될 수 있다.
특정 구체예들에서, ActRIIB 폴리펩티드의 기능적 변이체는 서열 번호: 1, 2 및 53에서 선택된 아미노산 서열과 적어도 75 % 동일한 아미노산 서열을 갖는다. 특정 경우, 기능적 변이체는 서열 번호: 1, 2 및 53으로부터 선택되는 아미노산 서열과 적어도 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 97 %, 98 %, 99 % 또는 100 % 동일한 아미노산 서열을 갖는다.
특정 구체예들에서, 본 발명은 치료 효과 또는 안정성을 강화시킬 목적으로(가령, 생체외 반감기 및/또는 단백질분해에 대한 저항성), ActRIIB폴리펩티드의 구조를 변경시켜 기능적 변이체의 제조를 고려한다. 변형된 ActRIIB 폴리펩티드는 또한 예를 들어, 아미노산 치환, 결실 또는 첨가에 의해 생산될 수 있다. 예를 들면, 류신을 이소류신 또는 발린으로 치환, 아스파르테이트를 글루탐산염으로 치환, 트레오닌을 세린으로 치환, 또는 아미노산을 구조적으로 관련된 아미노산 (가령, 보존 돌연변이)으로 단리된 치환은 생성 분자의 생물학적 활성에 주요한 영향을 주지 않을 것으로 합리적으로 예측할 수 있다. 보존 치환은 아미노산 측쇄가 관련된 아미노산 패밀리 안에서 일어나는 것이다. 본 명세서의 ActRIIB 폴리펩티드의 아미노산 서열의 변화로 기능적 동소체가 생성되는 지의 여부는 변이체 ActRIIB 폴리펩티드가 이의 야생형 ActRIIB 폴리펩티드와 유사한 방식으로 세포 안에서 반응을 만드는 능력, 또는 하나 또는 그 이상의 리간드, 예를 들면, 액티빈, GDF11, 또는 GDF8에 야생형과 유사한 방식으로 결합하는 능력을 평가함으로써 용이하게 결정될 수 있다.
특정 특이적 구체예들에서, 본 발명은 ActRIIB 폴리펩티드의 세포외 도메인 (리간드-결합 도메인으로도 지칭됨)에서 돌연변이를 만들어, 상기 변이체 (또는 돌연변이체) ActRIIB 폴리펩티드가 변경된리간드-결합 활성 (가령, 결합 친화력 또는 결합 선택성)을 갖도록 하는 것을 고려한다. 특정 경우에, 이러한 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 특이적 리간드에 대하여 변경된(상승된 또는 감소된) 결합 친화력을 보유한다. 다른 경우에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 이들 리간드에 대하여 변경된 결합 선택성을 갖는다.
특정 구체예들에서, 본 발명은 상기 폴리펩티드의 당화를 변경시키기 위하여, 상기 ActRIIB 폴리펩티드의 특이적 돌연변이를 고려한다. ActRIIB 폴리펩티드에서 예시적인 당화 부위는 도 6에 기술된다. 이러한 돌연변이는 하나 또는 그 이상의 당화 부위, 이를 테면 O-연계된 또는 N-연계된 당화 부위를 도입 또는 제거하도록 선택될 수 있다. 아스파라긴-연계된 당화 인지 부위는 일반적으로 적절한 세포의 당화 효소에 의해 특이적으로 인지되는 삼펩티드 서열, 아스파라긴-X-트레오닌 (여기에서 "X"는 임의의 아미노산임)이다. 이러한 변형은 하나 또는 그 이상의 세린 또는 트레오닌 잔기를 상기 야생형 ActRIIB 폴리펩티드(O-연계된 당화 부위의 경우)에 추가 또는 치환시켜 만들 수도 있다 . 당화 인지 부위의 제1 또는 제3 아미노산 위치중 하나 또는 둘 모두에서 다양한 아미노산 치환 또는 결손 (및/또는 제 2 위치에서 아미노산 결손)으로 변형된 삼펩티드 서열에서 비-당화가 초래된다. ActRIIB 폴리펩티드의 탄소화물 모이어티의 수를 증가시키는 다른 수단은 상기 단백질에 화학 또는 효소적으로 글리코시드를 결합시키는 것이다 . 이용되는 결합 방식에 따라, 이들 당(들)은 (a) 아르기닌 및 히스티딘; (b) 자유 카르복실기; (c) 자유 술포히드릴기, 이를 테면 시스테인의 기; (d) 자유 히드록실 기, 이를 테면 세린, 트레오닌, 또는 히드록시프롤린; (e) 방향족 잔기, 이를 테면 페닐알라닌, 티로신, 또는 트립토탄의 기; 또는 (f) 글루타민의 아미드 기에 부착될 수 있다. 이 방법은 1987년 9월 11일자로 공개된 WO 87/05330, 그리고 Aplin and Wriston (1981) CRC Crit. Rev. Biochem., pp. 259-306에서 기술되며, 이들은 본 명세서에 참고자료에 편입된다. ActRIIB 폴리펩티드 상에 있는 하나 또는 그 이상의 탄수화물 모이어티는 화학적 및/또는 효소적으로 제거될 수 있다 . 화학적 탈당화는 예를 들면, 트리플루오로메탄설폰산 또는 이에 등가의 화합물에 대한 ActRIIB 폴리펩티드의 노출을 필요할 수 있다. 이 처리는 아미노산 서열을 손상시키지 않으면서, 연계당 (N-아세틸 글루코사민 또는 N-아세틸 갈락토사민)을 제외한 대부분 또는 모든 당을 절단하게 된다. 화학적 탈당화는 다음에 추가로 기술된다:Hakimuddin et al. (1987) Arch. Biochem. Biophys. 259:52 및 Edge et al. (1981) Anal. Biochem. 118:131. ActRIIB 폴리펩티드상의 탄수화물 모이어티의 효소 절단은 Thotakura et al. (1987) Meth. Enzymol. 138:350에서 설명된 바와 같이, 다양한 엔도-및 엑소-글리코시다제의 사용에 의해 이루어질 수 있다. 포유류, 효모, 곤충 및 식물 세포는 모두 펩티드의 아미노산 서열에 의해 영향을 받을 수 있는 상이한 당화 패턴을 도입시킬 수 있기 때문에 ActRIIB 폴리펩티드의 서열은 이용되는 발현계 유형에 따라 적절하게 조정될 수 있다. 일반적으로, ActRIIB 폴리펩티드는 적절한 당화를 제공하는 포유류 세포계, 이를 테면 HEK293 또는 CHO 세포계에서 발현될 수 있지만, 다른 포유류 발현 세포계 또한 마찬가지로 유용할 것으로 예상된다.
본의 개시는 변이체, 선택적으로 절두 변이체를 포함하는 ActRIIB 폴리펩티드의 복합 변이체의 세트를 생성하는 방법을 추가로 고려하고; 복합 돌연변이체의 풀(pool)은 기능적 변이체 서열을 확인하는데 특히 유용하다. 이러한 복합 라이브러리들을 스크리닝하는 목적은 변경된 성질, 이를 테면 변경된 약동학적 또는 변경된 리간드 결합을 갖는 ActRIIB 폴리펩티드들 변이체를 만들기 위함을 수도 있다. 다양한 스크리닝 분석이 하기에 제공되며, 이러한 분석을 이용하여 변이체들을 평가할 수 있다. 예를 들면, ActRIIB 폴리펩티드 변이체는 ActRIIB 폴리펩티드에 결합하는 능력, ActRIIB 리간드가 ActRIIB 폴리펩티드에 결합을 방해하는 능력에 대하여 스크리닝될 수 있다.
ActRIIB 폴리펩티드 또는 이의 변이체의 활성은 세포-기반 또는 생체내 분석에서 또한 테스트될 수 있다. 예를 들면, 골아세포 또는 전구체에서 골 생산에 관련된 유전자의 발현에 있어서 ActRIIB 폴리펩티드 변이체의 효과가 평가될 수 있다. 이는 필요에 따라 하나 또는 그 이상의 재조합 ActRIIB 리간드 단백질 (가령, BMP7) 존재하에 실행될 수 있고, 그리고 세포는 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 이의 변이체, 그리고 임의선택적으로, ActRIIB 리간드를 만들기 위하여 형질감염될 수 있다. 마찬가지로, ActRIIB 폴리펩티드 는 마우스 또는 다른 동물에 투여되고, 그리고 하나 또는 그 이상의 뼈 특징, 이를 테면 밀도 또는 체적이 평가될 수 있다. 뼈 골절의 치유율도 평가할 수 있다. 유사하게, 상기 활성 of ActRIIB 폴리펩티드 또는 이의 변이체의 활성은 근육 세포, 지방 세포 및 신경 세포에서 이들 세포의 성장에 대한 임의의 효과, 예를 들어 하기 기재된 분석에 의해 시험 될 수 있다. 이러한 검정은 당업계에 잘 알려져 있고, 통상적이다. SMAD-반응성 리포터 유전자를 이러한 세포계에서 이용하여 하류 신호생성에 대한 효과를 모니터할 수 있다.
복합적으로-유도된 변이체는 자연 발생적 ActRIIB 폴리펩티드에 비교하여 선택적 능력을 보유하도록 만들어질 수 있다. 이러한 변이체 단백질은 재조합 DNA 구조체로부터 발현될 때, 유전자 요법 프로토콜에 이용될 수 있다. 마찬가지로, 돌연변이유발은 대응하는 야생형 ActRIIB 폴리펩티드와 상당히 상이한 세포내 반감기를 갖는 변이체를 만들 수 있다. 예를 들면, 변경된 단백질은 고유 ActRIIB 폴리펩티드의 파괴 또는 그렇지 않으면 불활성화를 초래하는 단백질분해 또는 다른 과정에 더 안정적이거나 덜 안정적이 될 수 있다. 이러한 변이체 및 이들을 코딩하는 유전자는 ActRIIB 폴리펩티드의 반감기를 조절함으로써 ActRIIB 폴리펩티드 복합체 수준을 변경 시키는데 이용될 수 있다. 예를 들면, 짧은 반감기는 더욱 일시적인 생물학적 효과를 일으킬 수 있고, 유도성 발현 시스템의 일부는 세포 안에 재조합 ActRIIB 폴리펩티드 수준을 더 엄밀하게 조절할 수 있다.
특정 구체예들에서, 상기 본 발명의 ActRIIB 폴리펩티드는 ActRIIB 폴리펩티드 내에 자연적으로 존재하는 것에 더하여 번역후 변형을 더욱 포함할 수 있다. 이러한 변형은 아세틸화, 카르복실화, 당화, 인산화, 지질화 및 아실화를 포함하나 이에 한정되지 않는다. 그 결과 변형된 ActRIIB 폴리펩티드는 비-아미노산 원소, 예를 들어 폴리에틸렌 글리콜, 지질, 다당류 또는 단당류 및 인산염을 포함할 수 있다. ActRIIB 폴리펩티드의 기능에 대하여 본 명세서에 기재된 바와 같이 다른 ActRIIB 폴리펩티드 변이체에서 이러한 비-아미노산 요소들의 효과를 테스트할 수 있다. ActRIIB 폴리펩티드가 초기 형태의 ActRIIB 폴리펩티드를 절단함으로써 세포에서 생산되는 경우, 해독 후 가공은 또한 단백질의 정확한 폴딩 및/또는 기능에 중요할 수 있다. 상이한 세포들 (가령, CHO, HeLa, MDCK, 293, WI38, NIH-3T3 또는 HEK293)은 이러한 해독후 활성에 대하여 특이적 세포 기전 및 특징들을 보유하고, 그리고 ActRIIB 폴리펩티드의 정확한 변형 및 프로세싱을 확보하도록 선택될 수 있다.
특정 양태에서, 상기 ActRIIB 폴리펩티드의 기능적 변이체 또는 변형된 형태는 상기 ActRIIB 폴리펩티드의 적어도 일부분을 포함하는 융합 단백질 및 하나 또는 그 이상의 융합 도메인을 포함한다. 이러한 융합 도메인의 잘 알려진 예로는 폴리히스티딘, Glu-Glu, 글루타티온 S-전달효소 (GST), 티오레독신, 단백질 A, 단백질 G,면역글로불린 중쇄 불변 영역 (가령, Fc), 말토즈 결합 단백질 (MBP), 또는 인간 혈청 알부민을 포함하나, 이에 국한되지 않는다. 융합 도메인은 원하는 특성을 부여하도록 선택될 수 있다. 예를 들면, 일부 융합 도메인은 친화력 크로마토그래피에 의한 융합 단백질의 단리에 특히 유용하다. 친화력 정제를 목적으로, 친화력 크로마토그래피를 위한 관련 매트릭스, 이를 테면 글루타티온-, 아밀라제-, 및 니켈-또는 코발트-접합된 수지가 이용된다. 이러한 매트릭스중 많은 것들이 '키트' 형태로 이용가능한데, 이를 테면 Pharmacia GST 정제 시스템 및 (HIS6) 융합 짝과 함께 유용한 QIAexpressTM 시스템(Qiagen)이 있다. 또다른 예로써, ActRIIB 폴리펩티드들의 탐지를 용이하게 하기 위하여 융합 도메인이 선택될 수 있다. 이러한 탐지 도메인의 예로는 다양한 형광 단백질 (가령, GFP) 뿐만 아니라 "에피토프 테그"를 포함하는데, 특이적 항체가 이용가능한 짧은 펩티드 서열이 일반적이다. 특정 단클론 항체에 용이하게 이용되는 잘 공지된 에피토프 테그는 FLAG, 인플루엔자 바이러스 헤마글루티닌 (HA), 및 c-myc 테그를 포함한다. 일부 경우에서 융합 도메인은 프로테아제 절단 부위, 이를 테면 인자(factor) Xa 또는 트롬빈에 대한 절단부위를 가지고, 이에 의해 관련 프로테아제가 이 융합 단백질을 부분적으로 절단하고, 이로 인하여 이로부터 재조합 단백질이 유리된다. 유리된 단백질은 후속 크로마토그래피 분리에 의해 융합 단백질로부터 단리될 수 있다. 특정 바람직한 구체예에서, ActRIIB 폴리펩티드는 생체 내에서 ActRIIB 폴리펩티드를 안정화시키는 도메인 ("안정화제" 도메인)과 융합된다. 안정화"란 파괴의 감소, 신장의 제거 감소 또는 다른 약동학 효과 때문인지 여부와 관계없이, 혈청 반감기를 증가시키는 모든 것을 의미한다. 면역글로불린의 Fc 부분과의 융합은 광범위한 단백질에 바람직한 약물 동력학적 특성을 부여하는 것으로 알려져 있다. 마찬가지로, 인간 혈청 알부민과의 융합은 바람직한 성질을 부여 할 수 있다. 선택될 수 있는 다른 유형의 융합 도메인은 다량체화 도메인(예 : 이합체화, 사량체화 등), 기능화 도메인 (근육 성장의 추가 자극과 같은 부가적인 생물학적 기능을 부여하는)을 포함한다.
특정 양태에서 본 명세서에서 기술된 폴리펩티드는 동종체(homomeric) 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 형태일 수 있는데, 이는 단백질 복합체 내의 각각의 융합 폴리펩티드 사슬이 복합체 내의 임의의 다른 사슬과 동일한 ActRIIB 변이체를 포함한다는 것을 의미한다. 특정 양태에서, 본 명세서에서 기술된 폴리펩티드는 적어도 하나의 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드 또는 상기 제 1 ActRIIB 변이체와 상이한 적어도 하나의 변이체와 공유적으로 또는 비-공유적으로 연합된 적어도 하나의 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체를 형성할 수 있다. 특정 양태에서, 본 명세서에서 기술된 폴리펩티드는 적어도 하나의 TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 I 세린/트레오닌 키나제 수용체 폴리펩티드 (가령, ALK1, ALK2, ALK3, ALK4, ALK5, ALK6, 그리고 ALK7 폴리펩티드)-이들의 단편 및 변이체를 포함하여-와 공유적으로 또는 비-공유적으로 적어도 하나의 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체를 형성할 수 있다. 특정 양태에서, 본 명세서에서 기술된 폴리펩티드는 적어도 하나의 TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 II 세린/트레오닌 키나제 수용체 폴리펩티드 (가령, ActRIIA, TGFBRII, BMPRII, 그리고 MISRII)-이들의 단편 및 변이체를 포함하여-와 공유적으로 또는 비-공유적으로 적어도 하나의 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체를 형성할 수 있다. 바람직하게는 본 명세서의 폴리펩티드들은 이형이량체를 형성하지만, 더욱 고차의 이형이량체들, 이를 테면, 이형삼량체, 이형사량체, 및 추가 올리고머 구조를 포함하나, 이에 한정되지 않은 것들이 포함된다. 일부 구체예들에서, 변이체 본 명세서의 ActRIIB 폴리펩티드는 적어도 하나의 다량체화 도메인을 포함한다. 본 명세서에서 공개된 바와 같이, 용어 "다량체화 도메인(multimerization domain)"은 최소한 제 1 폴리펩티드와 최소한 제 2 폴리펩티드 사이에 공유 또는 비-공유 상호작용을 촉진시키는 아미노산 또는 아미노산 서열을 지칭한다. 변이체 ActRIIB 폴리펩티드들은 다량체화 도메인에 공유적 또는 비-공유적으로 결합될 수 있다. 바람직하게는, 이형다량체 형성 (가령, 이형이량체 형성)을 촉진시키고, 임의선택적으로 동형다량체 형성 (가령, 동형이량체 형성)을 방해 또는 그렇지 않으면 이의 형성을 선호하지 않고, 이로 인하여 원하는 이형다량체가 증가되도록 하기 위하여, 다량체화 도메인은 제 1 폴리펩티드 (가령, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드)와 제 2 폴리펩티드 (가령, 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드 또는 상기 제 1 폴리펩티드에 존재하는 것과는 상이한 변이체 ActRIIB 폴리펩티드)간의 상호작용을 촉진시킨다(가령, 도 1 참고).
특정 구체예들에서, 본 명세서는 적어도 하나의 ALK1-Fc 융합 단백질 및 적어도 하나의 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, ALK1-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들에 결합한다. 일부 구체예들에서, ALK1-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, ALK1-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 적어도 하나의 ALK2-Fc 융합 단백질 및 적어도 하나의 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, ALK2-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들에 결합한다. 일부 구체예들에서, ALK2-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, ALK2-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 적어도 하나의 ALK3-Fc 융합 단백질 및 적어도 하나의 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, ALK3-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들에 결합한다. 일부 구체예들에서, ALK3-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, ALK3-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 적어도 하나의 ALK4-Fc 융합 단백질 및 적어도 하나의 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, ALK4-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들에 결합한다. 일부 구체예들에서, ALK4-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, ALK4-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 적어도 하나의 ALK5-Fc 융합 단백질 및 적어도 하나의 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, ALK5-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들에 결합한다. 일부 구체예들에서, ALK5-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, ALK5-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 적어도 하나의 ALK6-Fc 융합 단백질 및 적어도 하나의 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, ALK6-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들에 결합한다. 일부 구체예들에서, ALK6-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, ALK6-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 적어도 하나의 ALK7-Fc 융합 단백질 및 적어도 하나의 ActRIIB-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, ALK7-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들에 결합한다. 일부 구체예들에서, ALK7-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, ALK7-Fc:ActRIIB-Fc 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 적어도 하나의 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 적어도 하나의 ActRIIA-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc:ActRIIA-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들에 결합한다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc:ActRIIA-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc:ActRIIA-Fc 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 적어도 하나의 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 적어도 하나의 BMPRII-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc:BMPRII-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들에 결합한다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc:BMPRII-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc:BMPRII-Fc 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 적어도 하나의 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 적어도 하나의 TGFBRII-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc:TGFBRII-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들에 결합한다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc:TGFBRII-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc:TGFBRII-Fc 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 적어도 하나의 ActRIIB-Fc 융합 단백질 및 적어도 하나의 MISRII-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc:MISRII-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들에 결합한다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc:MISRII-Fc 이종다량체는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드, 이를 테면 본 명세서에서 기술된 것들의 신호생성을 억제한다. 일부 구체예들에서, ActRIIB-Fc:MISRII-Fc 이종다량체는 이종이량체이다.
특정 양태에서, 본 명세서는 ALK1-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK1-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 54의 아미노산 22-34중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 그리고 34)에서 시작하고, 서열 번호: 54의 아미노산 95-118중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 그리고 118)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK1 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK1-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 54의 아미노산 22-118에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK1 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK1-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 54의 아미노산 34-95에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK1 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK1-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 그리고 63중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK1 도메인을 포함한다.
대표적인 ALK1-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 60)는 다음과 같다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다.
성숙 ALK1-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 61)은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
일부 구체예들에서, 상기 ALK1-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 56)는 다음과 같다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 본원에서 개시된 특정Fc 융합 폴리펩티드와 이종이량체 형성을 유도하기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (리신이 아스파르트산으로 대체됨)이 ALK1-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단에 리신이 추가된, 서열 번호: 56의 아미노산 서열이 제공될 수 있다.
ALK1-Fc 융합 단백질은 다음 핵산 (서열 번호: 258)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCGACCCTGT GAAGCCGTCT CGGGGCCCGC
101 TGGTGACCTG CACGTGTGAG AGCCCACATT GCAAGGGGCC TACCTGCCGG
151 GGGGCCTGGT GCACAGTAGT GCTGGTGCGG GAGGAGGGGA GGCACCCCCA
201 GGAACATCGG GGCTGCGGGA ACTTGCACAG GGAGCTCTGC AGGGGCCGCC
251 CCACCGAGTT CGTCAACCAC TACTGCTGCG ACAGCCACCT CTGCAACCAC
301 AACGTGTCCC TGGTGCTGGA GGCCACCCAA CCTCCTTCGG AGCAGCCGGG
351 AACAGATGGC CAGCTGGCCA CCGGTGGTGG AACTCACACA TGCCCACCGT
401 GCCCAGCACC TGAACTCCTG GGGGGACCGT CAGTCTTCCT CTTCCCCCCA
451 AAACCCAAGG ACACCCTCAT GATCTCCCGG ACCCCTGAGG TCACATGCGT
501 GGTGGTGGAC GTGAGCCACG AAGACCCTGA GGTCAAGTTC AACTGGTACG
551 TGGACGGCGT GGAGGTGCAT AATGCCAAGA CAAAGCCGCG GGAGGAGCAG
601 TACAACAGCA CGTACCGTGT GGTCAGCGTC CTCACCGTCC TGCACCAGGA
651 CTGGCTGAAT GGCAAGGAGT ACAAGTGCAA GGTCTCCAAC AAAGCCCTCC
701 CAGCCCCCAT CGAGAAAACC ATCTCCAAAG CCAAAGGGCA GCCCCGAGAA
751 CCACAGGTGT ACACCCTGCC CCCATCCCGG GAGGAGATGA CCAAGAACCA
801 GGTCAGCCTG ACCTGCCTGG TCAAAGGCTT CTATCCCAGC GACATCGCCG
851 TGGAGTGGGA GAGCAATGGG CAGCCGGAGA ACAACTACGA CACCACGCCT
901 CCCGTGCTGG ACTCCGACGG CTCCTTCTTC CTCTATAGCG ACCTCACCGT
951 GGACAAGAGC AGGTGGCAGC AGGGGAACGT CTTCTCATGC TCCGTGATGC
1001 ATGAGGCTCT GCACAACCAC TACACGCAGA AGAGCCTCTC CCTGTCTCCG
1051 GGT (서열 번호: 258)
성숙 ALK1-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 57)은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 추가될 수 있다.
특정 양태에서, 본 명세서는 ALK2 폴리펩티드를 포함하는 단백질 복합체들에 관계한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "ALK2"는 임의의 종으로부터 그리고 돌연변이 유발 또는 다른 변형에 의해 그러한 ALK2 단백질로부터 유래된 변이체로부터 액티빈 수용체-유사 키나제-2 단백질의 패밀리를 나타낸다. ALK2에 대한 언급은 현재 확인된 형태중 하나를 참조로 한다. ALK2 패밀리의 구성요소는 시스테인-풍부 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 및 예상 세린/트레오닌 키나제 활성을 갖는 세포질 도메인을 포함하는 막경유 단백질이다.
용어 "ALK2 폴리펩티드"는 뿐만 아니라 ALK2 패밀리 구성원의 자연 발생적 폴리펩티드를 포함하는 폴리펩티드 뿐만 아니라, 유용한 활성을 보유하는 그의 임의의 변이체 (돌연변이 체, 단편, 융합체 및 펩티드 유사체를 포함함)를 포함한다.
인간 ALK2 전구체 단백질 서열 (NCBI Ref Seq NP_001096.1)은 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 ALK2 폴리펩티드 서열은 다음과 같다:
MEDEKPKVNPKLYMCVCEGLSCGNEDHCEGQQCFSSLSINDGFHVYQKGCFQVYEQGKMTCKTPPSPGQAVECCQGDWCNRNITAQLPTKGKSFPGTQNFHLE (서열 번호: 65)
인간 ALK2 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 217에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_001105.4의 뉴클레오티드 431-1957에 상응한다. 세포외 ALK2 폴리펩티드를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 218과 같다.
특정 구체예들에 있어서, 본 명세서는 최소한 하나의 ALK2 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체에 관계하며, 여기에는 이의 단편들, 기능성 변이체들 그리고 변형된 형태들이 포함된다. 바람직하게는 본 발명의 용도에 이용되는 ALK2 폴리펩티드들 (가령, ALK2 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체들과 이의 용도들)은 가용성 (가령, ALK2의 세포외 도메인)이다. 다른 바람직한 구체예들에서, 본 발명의 용도에 이용되는 ALK4 폴리펩티드들은 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드들에 결합하고 및/또는 활성 (가령, Smad 2/3 및/또는 Smad 1/5/8 신호생성 유도)을 억제(길항)한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 64 또는 65서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK2 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체 복합체는 서열 번호: 64 또는 65서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK2 폴리펩티드로 구성되거나, 또는 기본적으로 구성된다.
특정 양태에서, 본 명세서는 ALK2-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK2-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 64의 아미노산 22-34중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 및 35)에서 시작하고, 서열 번호: 64의 아미노산 95-118중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 및 123)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK2 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK2-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 64의 아미노산 35-99에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK2 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK2-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 64의 아미노산 21-123에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK2 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK2-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 및 73중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK2 도메인을 포함한다.
일부 구체예들에서, 상기 ALK2-Fc 융합 단백질은 TPA 리더를 이용하며, 다음과 같다(서열 번호: 66):
신호 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 본원에서 개시된 특정 다른 Fc 융합 폴리펩티드와 이종이량체 형성을 유도하기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (리신이 아스파르트산으로 대체됨)이 ALK1-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단에 리신이 추가된, 서열 번호: 66의 아미노산 서열이 제공될 수 있다.
ALK2-Fc 융합 단백질은 다음 핵산 (서열 번호: 244)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCATGGAAGA TGAGAAGCCC AAGGTCAACC
101 CCAAACTCTA CATGTGTGTG TGTGAAGGTC TCTCCTGCGG TAATGAGGAC
151 CACTGTGAAG GCCAGCAGTG CTTTTCCTCA CTGAGCATCA ACGATGGCTT
201 CCACGTCTAC CAGAAAGGCT GCTTCCAGGT TTATGAGCAG GGAAAGATGA
251 CCTGTAAGAC CCCGCCGTCC CCTGGCCAAG CTGTGGAGTG CTGCCAAGGG
301 GACTGGTGTA ACAGGAACAT CACGGCCCAG CTGCCCACTA AAGGAAAATC
351 CTTCCCTGGA ACACAGAATT TCCACTTGGA GACCGGTGGT GGAACTCACA
401 CATGCCCACC GTGCCCAGCA CCTGAACTCC TGGGGGGACC GTCAGTCTTC
451 CTCTTCCCCC CAAAACCCAA GGACACCCTC ATGATCTCCC GGACCCCTGA
501 GGTCACATGC GTGGTGGTGG ACGTGAGCCA CGAAGACCCT GAGGTCAAGT
551 TCAACTGGTA CGTGGACGGC GTGGAGGTGC ATAATGCCAA GACAAAGCCG
601 CGGGAGGAGC AGTACAACAG CACGTACCGT GTGGTCAGCG TCCTCACCGT
651 CCTGCACCAG GACTGGCTGA ATGGCAAGGA GTACAAGTGC AAGGTCTCCA
701 ACAAAGCCCT CCCAGCCCCC ATCGAGAAAA CCATCTCCAA AGCCAAAGGG
751 CAGCCCCGAG AACCACAGGT GTACACCCTG CCCCCATCCC GGGAGGAGAT
801 GACCAAGAAC CAGGTCAGCC TGACCTGCCT GGTCAAAGGC TTCTATCCCA
851 GCGACATCGC CGTGGAGTGG GAGAGCAATG GGCAGCCGGA GAACAACTAC
901 GACACCACGC CTCCCGTGCT GGACTCCGAC GGCTCCTTCT TCCTCTATAG
951 CGACCTCACC GTGGACAAGA GCAGGTGGCA GCAGGGGAAC GTCTTCTCAT
1001 GCTCCGTGAT GCATGAGGCT CTGCACAACC ACTACACGCA GAAGAGCCTC
1051 TCCCTGTCTC CGGGT (서열 번호: 244)
성숙 ALK2-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 67)은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 추가될 수 있다.
1 MEDEKPKVNP KLYMCVCEGL SCGNEDHCEG QQCFSSLSIN DGFHVYQKGC
51 FQVYEQGKMT CKTPPSPGQA VECCQGDWCN RNITAQLPTK GKSFPGTQNF
101 HLETGGGTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCVVVD
151 VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRVVSV LTVLHQDWLN
201 GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSR EEMTKNQVSL
251 TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYDTTP PVLDSDGSFF LYSDLTVDKS
301 RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP G (서열 번호: 67)
비대칭 Fc 융합 단백질을 이용한 이형다량체 복합체들의 형성을 촉진시키는 또다른 방법에서, 상보적 소수성 상호작용과 추가적인 분자간 이황화결합을 도입하도록 Fc 도메인이 변경된다.
일부 구체예들에서, 상기 ALK2-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 70)는 다음과 같다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 본원에서 개시된 특정Fc 융합 폴리펩티드와 이종이량체 형성을 유도하기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환이 ALK2-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다. 또한, Fc 도메인의 C-말단 라이신 잔기는 결실될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 70의 아미노산 서열이 제공된다.
성숙 ALK2-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 71)은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 MEDEKPKVNP KLYMCVCEGL SCGNEDHCEG QQCFSSLSIN DGFHVYQKGC
51 FQVYEQGKMT CKTPPSPGQA VECCQGDWCN RNITAQLPTK GKSFPGTQNF
101 HLETGGGTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCVVVD
151 VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRVVSV LTVLHQDWLN
201 GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVCTLPPSR EEMTKNQVSL
251 SCAVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP PVLDSDGSFF LVSKLTVDKS
301 RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK (서열 번호: 71)
특정 양태에서, 본 명세서는 ALK2 폴리펩티드를 포함하는 단백질 복합체들에 관계한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "ALK2"는 임의의 종으로부터 그리고 돌연변이 유발 또는 다른 변형에 의해 그러한 ALK2 단백질로부터 유래된 변이체로부터 액티빈 수용체-유사 키나제-2 단백질의 패밀리를 나타낸다. ALK2에 대한 언급은 현재 확인된 형태중 하나를 참조로 한다. ALK2 패밀리의 구성요소는 시스테인-풍부 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 및 예상 세린/트레오닌 키나제 활성을 갖는 세포질 도메인을 포함하는 막경유 단백질이다.
용어 "ALK2 폴리펩티드"는 뿐만 아니라 ALK2 패밀리 구성원의 자연 발생적 폴리펩티드를 포함하는 폴리펩티드 뿐만 아니라, 유용한 활성을 보유하는 그의 임의의 변이체 (돌연변이 체, 단편, 융합체 및 펩티드 유사체를 포함함)를 포함한다.
대표적인 인간 ALK2 전구체 단백질 서열 (NCBI Ref Seq NP_001096.1)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 ALK2 폴리펩티드 서열은 다음과 같다:
MEDEKPKVNPKLYMCVCEGLSCGNEDHCEGQQCFSSLSINDGFHVYQKGCFQVYEQGKMTCKTPPSPGQAVECCQGDWCNRNITAQLPTKGKSFPGTQNFHLE (서열 번호: 65)
인간 ALK2 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 217에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_001105.4의 뉴클레오티드 431-1957에 상응한다. 세포외 ALK2 폴리펩티드를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 218과 같다.
특정 구체예들에 있어서, 본 명세서는 최소한 하나의 ALK2 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체에 관계하며, 여기에는 이의 단편들, 기능성 변이체들 그리고 변형된 형태들이 포함된다. 바람직하게는 본 발명의 용도에 이용되는 ALK2 폴리펩티드들 (가령, ALK2 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체들과 이의 용도들)은 가용성 (가령, ALK2의 세포외 도메인)이다. 다른 바람직한 구체예들에서, 본 발명의 용도에 이용되는 ALK4 폴리펩티드들은 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드들에 결합하고 및/또는 활성 (가령, Smad 2/3 및/또는 Smad 1/5/8 신호생성 유도)을 억제(길항)한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 64 또는 65서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK2 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체 복합체는 서열 번호: 64 또는 65서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK2 폴리펩티드로 구성되거나, 또는 기본적으로 구성된다.
특정 양태에서, 본 명세서는 ALK3 폴리펩티드를 포함하는 단백질 복합체들에 관계한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "ALK3"은 임의의 종으로부터 그리고 이 유발 또는 다른 변형에 의해 그러한 ALK3 단백질로부터 유래된 변이체로부터 액티빈 수용체-유사 키나제-3 단백질의 패밀리를 나타낸다. ALK3에 대한 언급은 현재 확인된 형태중 하나를 참조로 한다. ALK3 패밀리의 구성요소는 시스테인-풍부 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 및 예상 세린/트레오닌 키나제 활성을 갖는 세포질 도메인을 포함하는 막경유 단백질이다.
용어 "ALK3 폴리펩티드"는 뿐만 아니라 ALK3 패밀리 구성원의 자연 발생적 폴리펩티드를 포함하는 폴리펩티드 뿐만 아니라, 유용한 활성을 보유하는 그의 임의의 변이체 (돌연변이 체, 단편, 융합체 및 펩티드 유사체를 포함함)를 포함한다.
인간 ALK3 전구체 단백질 서열 (NCBI Ref Seq NP_004320.2)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
A 프로세스된 세포외 ALK3 폴리펩티드 서열은 다음과 같다:
인간 ALK3 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 219에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_004329.2의 뉴클레오티드 549-2144에 상응한다. 신호 서열은 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다. 세포외 인간 ALK3 폴리펩티드를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 220과 같다.
활성 (가령, 리간드 결합) ALK3 폴리펩티드의 일반적인 형태는 서열 번호: 74의 아미노산 위치 25-31중 임의의 위치 (가령, 위치 25, 26, 27, 28, 29, 30, 또는 31)에서 시작하고, 서열 번호: 74의 아미노산 위치 140-152중 임의의 위치 (가령, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 또는 152)에서 종료되는 폴리펩티드를 포함하는 것이다. 미국 특허 제 8,338,377 호 (이의 교시는 그 전체가 본 명세서에 참고로 포함됨)를 참조한다.
특정 구체예들에 있어서, 본 명세서는 최소한 하나의 ALK3 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체에 관계하며, 여기에는 이의 단편들, 기능성 변이체들 그리고 변형된 형태들이 포함된다. 바람직하게는 본 발명의 용도에 이용되는 ALK3 폴리펩티드들 (가령, ALK3 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체들과 이의 용도들)은 가용성 (가령, ALK3의 세포외 도메인)이다. 다른 바람직한 구체예들에서, 본 발명의 용도에 이용되는 ALK3 폴리펩티드들은 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드들에 결합하고 및/또는 활성 (가령, Smad 2/3 및/또는 Smad 1/5/8 신호생성 유도)을 억제(길항)한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 74의 아미노산 위치 25-31중 임의의 것 (가령, 위치 25, 26, 27, 28, 29, 30, 또는 31)에서 시작하고, 서열 번호: 74 의 아미노산 위치 140-153중 임의의 것(가령, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 또는 152)에서 종료되는 아미노산을 포함하는, 하나의 ALK3 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체 복합체는 서열 번호: 74, 75, 76, 77, 80, 또는 81의 아미노산 서열에 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 적어도 하나의 ALK3 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체 복합체는 서열 번호: 74, 75, 76, 77, 80, 또는 81서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 또는 99% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK3 폴리펩티드로 구성되거나, 또는 기본적으로 구성된다.
특정 양태에서, 본 명세서는 ALK3-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK3-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 74의 아미노산 24-61중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 및 61)에서 시작하고, 서열 번호: 74의 아미노산 130-152 중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 및 152)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK3 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK3-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 74의 아미노산 61-130에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK3 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK3-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 74의 아미노산 24-152에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK3 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK3-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 그리고 83중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK3 도메인을 포함한다.
일부 구체예들에서, 상기 ALK3-Fc 융합 단백질은 TPA 리더를 이용하며, 다음과 같다:
리더 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 ActRIIB-Fc:ALK3-Fc이형이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (리신이 아스파트르산으로 대체됨)이 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단에 리신이 추가된, 서열 번호: 76의 아미노산 서열이 제공될 수 있다.
ALK3-Fc 융합 단백질은 다음 핵산 (서열 번호: 245)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCCAGAATCT GGATAGTATG CTTCATGGCA
101 CTGGGATGAA ATCAGACTCC GACCAGAAAA AGTCAGAAAA TGGAGTAACC
151 TTAGCACCAG AGGATACCTT GCCTTTTTTA AAGTGCTATT GCTCAGGGCA
201 CTGTCCAGAT GATGCTATTA ATAACACATG CATAACTAAT GGACATTGCT
251 TTGCCATCAT AGAAGAAGAT GACCAGGGAG AAACCACATT AGCTTCAGGG
301 TGTATGAAAT ATGAAGGATC TGATTTTCAG TGCAAAGATT CTCCAAAAGC
351 CCAGCTACGC CGGACAATAG AATGTTGTCG GACCAATTTA TGTAACCAGT
401 ATTTGCAACC CACACTGCCC CCTGTTGTCA TAGGTCCGTT TTTTGATGGC
451 AGCATTCGAA CCGGTGGTGG AACTCACACA TGCCCACCGT GCCCAGCACC
501 TGAACTCCTG GGGGGACCGT CAGTCTTCCT CTTCCCCCCA AAACCCAAGG
551 ACACCCTCAT GATCTCCCGG ACCCCTGAGG TCACATGCGT GGTGGTGGAC
601 GTGAGCCACG AAGACCCTGA GGTCAAGTTC AACTGGTACG TGGACGGCGT
651 GGAGGTGCAT AATGCCAAGA CAAAGCCGCG GGAGGAGCAG TACAACAGCA
701 CGTACCGTGT GGTCAGCGTC CTCACCGTCC TGCACCAGGA CTGGCTGAAT
751 GGCAAGGAGT ACAAGTGCAA GGTCTCCAAC AAAGCCCTCC CAGCCCCCAT
801 CGAGAAAACC ATCTCCAAAG CCAAAGGGCA GCCCCGAGAA CCACAGGTGT
851 ACACCCTGCC CCCATCCCGG GAGGAGATGA CCAAGAACCA GGTCAGCCTG
901 ACCTGCCTGG TCAAAGGCTT CTATCCCAGC GACATCGCCG TGGAGTGGGA
951 GAGCAATGGG CAGCCGGAGA ACAACTACGA CACCACGCCT CCCGTGCTGG
1001 ACTCCGACGG CTCCTTCTTC CTCTATAGCG ACCTCACCGT GGACAAGAGC
1051 AGGTGGCAGC AGGGGAACGT CTTCTCATGC TCCGTGATGC ATGAGGCTCT
1101 GCACAACCAC TACACGCAGA AGAGCCTCTC CCTGTCTCCG GGT
(서열 번호: 245)
성숙 ALK3-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 77)은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 추가될 수 있다.
1 GAQNLDSMLH GTGMKSDSDQ KKSENGVTLA PEDTLPFLKC YCSGHCPDDA
51 INNTCITNGH CFAIIEEDDQ GETTLASGCM KYEGSDFQCK DSPKAQLRRT
101 IECCRTNLCN QYLQPTLPPV VIGPFFDGSI RTGGGTHTCP PCPAPELLGG
151 PSVFLFPPKP KDTLMISRTP EVTCVVVDVS HEDPEVKFNW YVDGVEVHNA
201 KTKPREEQYN STYRVVSVLT VLHQDWLNGK EYKCKVSNKA LPAPIEKTIS
251 KAKGQPREPQ VYTLPPSREE MTKNQVSLTC LVKGFYPSDI AVEWESNGQP
301 ENNYDTTPPV LDSDGSFFLY SDLTVDKSRW QQGNVFSCSV MHEALHNHYT
351 QKSLSLSPG (서열 번호: 77)
상보적 형태의 ALK3-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 80)은 다음과 같다:
리더 서열 및 링커는 밑줄로 표시된다. 본원에서 개시된 특정 Fc 융합 폴리펩티드와 이종이량체 형성을 유도하기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환이 ALK3-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 80의 아미노산 서열이 제공된다.
성숙 ALK3-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 81)은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신(K)이 제거될 수 있다.
1 GAQNLDSMLH GTGMKSDSDQ KKSENGVTLA PEDTLPFLKC YCSGHCPDDA
51 INNTCITNGH CFAIIEEDDQ GETTLASGCM KYEGSDFQCK DSPKAQLRRT
101 IECCRTNLCN QYLQPTLPPV VIGPFFDGSI RTGGGTHTCP PCPAPELLGG
151 PSVFLFPPKP KDTLMISRTP EVTCVVVDVS HEDPEVKFNW YVDGVEVHNA
201 KTKPREEQYN STYRVVSVLT VLHQDWLNGK EYKCKVSNKA LPAPIEKTIS
251 KAKGQPREPQ VCTLPPSREE MTKNQVSLSC AVKGFYPSDI AVEWESNGQP
301 ENNYKTTPPV LDSDGSFFLV SKLTVDKSRW QQGNVFSCSV MHEALHNHYT
351 QKSLSLSPGK (서열 번호: 81)
특정 측면들에 있어서, 본 명세서는 ALK4 폴리펩티드를 포함하는 단백질 복합체들에 관계한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "ALK4"는 임의의 종으로부터 그리고 이 유발 또는 다른 변형에 의해 그러한 ALK4 단백질로부터 유래된 변이체로부터 액티빈 수용체-유사 키나제-4 단백질의 패밀리를 나타낸다. ALK4에 대한 언급은 현재 확인된 형태중 하나를 참조로 한다. ALK4 패밀리의 구성요소는 시스테인-풍부 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 및 예상 세린/트레오닌 키나제 활성을 갖는 세포질 도메인을 포함하는 막경유 단백질이다.
용어 "ALK4 폴리펩티드"는 뿐만 아니라 ALK4 패밀리 구성원의 자연 발생적 폴리펩티드를 포함하는 폴리펩티드 뿐만 아니라, 유용한 활성을 보유하는 그의 임의의 변이체 (돌연변이 체, 단편, 융합체 및 펩티드 유사체를 포함함)를 포함한다.
인간 ALK4 전구체 단백질 서열 (NCBI Ref Seq NP_004293)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 인간 ALK4 폴리펩티드 서열은 다음과 같다:
SGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPSMWGPVE (서열 번호: 86)
인간 ALK4 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 221에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_004302.4의 뉴클레오티드 78-1592에 상응한다. 세포외 ALK4 폴리펩티드를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 222와 같다.
인간 ALK4 전구체 단백질 서열의 대체 아이소폼, 아이소폼 C (NCBI Ref Seq NP_064733.3)은 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 ALK4 폴리펩티드 서열 (아이소폼 C)는 다음과 같다:
SGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPSMWGPVE (서열 번호: 87)
인간 ALK4 전구체 단백질(아이소폼 C)을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 223에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_020328.3의 뉴클레오티드 78-1715에 상응한다. 세포외 ALK4 폴리펩티드(아이소폼 C)를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 224와 같다.
특정 구체예들에 있어서, 본 명세서는 최소한 하나의 ALK4 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체에 관계하며, 여기에는 이의 단편들, 기능성 변이체들 그리고 변형된 형태들이 포함된다. 바람직하게는 본 발명의 용도에 이용되는 ALK4 폴리펩티드들 (가령, ALK4 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체들과 이의 용도들)은 가용성 (가령, ALK4의 세포외 도메인)이다. 다른 바람직한 구체예들에서, 본 발명의 용도에 이용되는 ALK4 폴리펩티드들은 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드들에 결합하고 및/또는 활성 (가령, Smad 2/3 및/또는 Smad 1/5/8 신호생성 유도)을 억제(길항)한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 84, 86, 85, 87, 88, 89, 92, 또는 93서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK4 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 84, 86, 85, 87, 88, 89, 92, 또는 93서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK4 폴리펩티드로 구성되거나, 또는 기본적으로 구성된다.
특정 양태에서, 본 명세서는 ALK4-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK4-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 84 또는 85의 아미노산 22-34중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34)에서 시작하고, 서열 번호: 84 또는 85의 아미노산 101-126중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 및 126)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK4 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK4-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 84 또는 85의 아미노산 34-101에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK4 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK4-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 84 또는 85의 아미노산 23-126에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK4 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK3-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 84, 86, 85, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 그리고 95중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK3 도메인을 포함한다.
특정 구체예들에서, 상기 폴리펩티드는 다음과 같은 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 88)를 포함한다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 본원에서 개시된 특정Fc 융합 폴리펩티드와 이종이량체 형성을 유도하기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (리신이 아스파르트산으로 대체됨)이 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단에 리신이 추가된, 서열 번호: 88의 아미노산 서열이 제공될 수 있다.
ALK4-Fc 융합 단백질은 다음 핵산 (서열 번호: 243)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCTCCGGGCC CCGGGGGGTC CAGGCTCTGC
101 TGTGTGCGTG CACCAGCTGC CTCCAGGCCA ACTACACGTG TGAGACAGAT
151 GGGGCCTGCA TGGTTTCCAT TTTCAATCTG GATGGGATGG AGCACCATGT
201 GCGCACCTGC ATCCCCAAAG TGGAGCTGGT CCCTGCCGGG AAGCCCTTCT
251 ACTGCCTGAG CTCGGAGGAC CTGCGCAACA CCCACTGCTG CTACACTGAC
301 TACTGCAACA GGATCGACTT GAGGGTGCCC AGTGGTCACC TCAAGGAGCC
351 TGAGCACCCG TCCATGTGGG GCCCGGTGGA GACCGGTGGT GGAACTCACA
401 CATGCCCACC GTGCCCAGCA CCTGAACTCC TGGGGGGACC GTCAGTCTTC
451 CTCTTCCCCC CAAAACCCAA GGACACCCTC ATGATCTCCC GGACCCCTGA
501 GGTCACATGC GTGGTGGTGG ACGTGAGCCA CGAAGACCCT GAGGTCAAGT
551 TCAACTGGTA CGTGGACGGC GTGGAGGTGC ATAATGCCAA GACAAAGCCG
601 CGGGAGGAGC AGTACAACAG CACGTACCGT GTGGTCAGCG TCCTCACCGT
651 CCTGCACCAG GACTGGCTGA ATGGCAAGGA GTACAAGTGC AAGGTCTCCA
701 ACAAAGCCCT CCCAGCCCCC ATCGAGAAAA CCATCTCCAA AGCCAAAGGG
751 CAGCCCCGAG AACCACAGGT GTACACCCTG CCCCCATCCC GGGAGGAGAT
801 GACCAAGAAC CAGGTCAGCC TGACCTGCCT GGTCAAAGGC TTCTATCCCA
851 GCGACATCGC CGTGGAGTGG GAGAGCAATG GGCAGCCGGA GAACAACTAC
901 GACACCACGC CTCCCGTGCT GGACTCCGAC GGCTCCTTCT TCCTCTATAG
951 CGACCTCACC GTGGACAAGA GCAGGTGGCA GCAGGGGAAC GTCTTCTCAT
1001 GCTCCGTGAT GCATGAGGCT CTGCACAACC ACTACACGCA GAAGAGCCTC
1051 TCCCTGTCTC CGGGT (서열 번호:243)
성숙 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 89)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단에 리신이 추가된다.
1 SGPRGVQALL CACTSCLQAN YTCETDGACM VSIFNLDGME HHVRTCIPKV
51 ELVPAGKPFY CLSSEDLRNT HCCYTDYCNR IDLRVPSGHL KEPEHPSMWG
101 PVETGGGTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCVVVD
151 VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRVVSV LTVLHQDWLN
201 GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSR EEMTKNQVSL
251 TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYDTTP PVLDSDGSFF LYSDLTVDKS
301 RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP G (서열 번호: 89)
일부 구체예들에서, 상기 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드 (또는 본 명세서에서 기술된 임의의 Fc 융합 폴리펩티드)는 조직 플라스미노겐 활성자 (TPA) 리더: MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSP (서열 번호: 246)를 이용한다.
일부 구체예들에서, 상기 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 92)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
리더 서열 및 링커는 밑줄로 표시된다. 본원에서 개시된 특정 Fc 융합 폴리펩티드와 이종이량체 형성을 유도하기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환이 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 92의 아미노산 서열이 제공된다.
성숙 ALK4-Fc 융합 단백질 서열은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 SGPRGVQALL CACTSCLQAN YTCETDGACM VSIFNLDGME HHVRTCIPKV
51 ELVPAGKPFY CLSSEDLRNT HCCYTDYCNR IDLRVPSGHL KEPEHPSMWG
101 PVETGGGTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCVVVD
151 VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRVVSV LTVLHQDWLN
201 GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVCTLPPSR EEMTKNQVSL
251 SCAVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP PVLDSDGSFF LVSKLTVDKS
301 RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK (서열 번호: 93)
다양한 ActRIIB-Fc:ALK4-Fc 복합체들의 정제는 다음중 3개 또는 그 이상이 임의의 순서로 포함된 일련의 컬럼 크로마토그래피에 의해 실행될 수 있다: 단백질 A 크로마토그래피, Q 세파로즈 크로마토그래피, 페닐세파로즈 크로마토그래피, 크기 압출 크로마토그래피, 및 양이온 교환 크로마토그래피. 상기 정제는 바이러스 여과 및 완충액 교환으로 완성될 수 있다.
일부 구체예들에서, 상기 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 247)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
리더 서열 및 링커는 밑줄로 표시된다. 본원에서 개시된 특정 Fc 융합 폴리펩티드와 이종이량체 형성을 유도하기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환(티로신을 시스테인으로, 트레오닌을 세린으로, 류신을 알라닌으로, 티로신을 발린으로 치환함으로써)이 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다. 상기 ALK4-Fc:ActRIIB-Fc 이종이량체의 정제를 용이하게 하기 위하여, 2개의 아미노산 치환 (아스파라긴을 아르기닌으로, 그리고 아스파르트산을 아르기닌으로 치환)이 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 247의 아미노산 서열이 제공된다.
ALK4-Fc 융합 폴리펩티드는 다음 핵산 (서열 번호: 248)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCTCCGGGCC CCGGGGGGTC CAGGCTCTGC
101 TGTGTGCGTG CACCAGCTGC CTCCAGGCCA ACTACACGTG TGAGACAGAT
151 GGGGCCTGCA TGGTTTCCAT TTTCAATCTG GATGGGATGG AGCACCATGT
201 GCGCACCTGC ATCCCCAAAG TGGAGCTGGT CCCTGCCGGG AAGCCCTTCT
251 ACTGCCTGAG CTCGGAGGAC CTGCGCAACA CCCACTGCTG CTACACTGAC
301 TACTGCAACA GGATCGACTT GAGGGTGCCC AGTGGTCACC TCAAGGAGCC
351 TGAGCACCCG TCCATGTGGG GCCCGGTGGA GACCGGTGGT GGAACTCACA
401 CATGCCCACC GTGCCCAGCA CCTGAACTCC TGGGGGGACC GTCAGTCTTC
451 CTCTTCCCCC CAAAACCCAA GGACACCCTC ATGATCTCCC GGACCCCTGA
501 GGTCACATGC GTGGTGGTGG ACGTGAGCCA CGAAGACCCT GAGGTCAAGT
551 TCAACTGGTA CGTGGACGGC GTGGAGGTGC ATAATGCCAA GACAAAGCCG
601 CGGGAGGAGC AGTACAACAG CACGTACCGT GTGGTCAGCG TCCTCACCGT
651 CCTGCACCAG GACTGGCTGA ATGGCAAGGA GTACAAGTGC AAGGTCTCCA
701 ACAAAGCCCT CCCAGCCCCC ATCGAGAAAA CCATCTCCAA AGCCAAAGGG
751 CAGCCCCGAG AACCACAGGT GTGCACCCTG CCCCCATCCC GGGAGGAGAT
801 GACCAAGAAC CAGGTCAGCC TGTCCTGCGC CGTCAAAGGC TTCTATCCCA
851 GCGACATCGC CGTGGAGTGG GAGAGCCGCG GGCAGCCGGA GAACAACTAC
901 AAGACCACGC CTCCCGTGCT GGACTCCCGC GGCTCCTTCT TCCTCGTGAG
951 CAAGCTCACC GTGGACAAGA GCAGGTGGCA GCAGGGGAAC GTCTTCTCAT
1001 GCTCCGTGAT GCATGAGGCT CTGCACAACC ACTACACGCA GAAGAGCCTC
1051 TCCCTGTCTC CGGGTAAA (서열 번호: 248)
성숙 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드 서열은 다음 (서열 번호: 249)과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 SGPRGVQALL CACTSCLQAN YTCETDGACM VSIFNLDGME HHVRTCIPKV
51 ELVPAGKPFY CLSSEDLRNT HCCYTDYCNR IDLRVPSGHL KEPEHPSMWG
101 PVETGGGTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR TPEVTCVVVD
151 VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRVVSV LTVLHQDWLN
201 GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVCTLPPSR EEMTKNQVSL
251 SCAVKGFYPS DIAVEWESRG QPENNYKTTP PVLDSRGSFF LVSKLTVDKS
301 RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK (서열 번호: 249)
이 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드는 다음 핵산 (서열 번호: 250)에 의해 인코드된다:
1 TCCGGGCCCC GGGGGGTCCA GGCTCTGCTG TGTGCGTGCA CCAGCTGCCT
51 CCAGGCCAAC TACACGTGTG AGACAGATGG GGCCTGCATG GTTTCCATTT
101 TCAATCTGGA TGGGATGGAG CACCATGTGC GCACCTGCAT CCCCAAAGTG
151 GAGCTGGTCC CTGCCGGGAA GCCCTTCTAC TGCCTGAGCT CGGAGGACCT
201 GCGCAACACC CACTGCTGCT ACACTGACTA CTGCAACAGG ATCGACTTGA
251 GGGTGCCCAG TGGTCACCTC AAGGAGCCTG AGCACCCGTC CATGTGGGGC
301 CCGGTGGAGA CCGGTGGTGG AACTCACACA TGCCCACCGT GCCCAGCACC
351 TGAACTCCTG GGGGGACCGT CAGTCTTCCT CTTCCCCCCA AAACCCAAGG
401 ACACCCTCAT GATCTCCCGG ACCCCTGAGG TCACATGCGT GGTGGTGGAC
451 GTGAGCCACG AAGACCCTGA GGTCAAGTTC AACTGGTACG TGGACGGCGT
501 GGAGGTGCAT AATGCCAAGA CAAAGCCGCG GGAGGAGCAG TACAACAGCA
551 CGTACCGTGT GGTCAGCGTC CTCACCGTCC TGCACCAGGA CTGGCTGAAT
601 GGCAAGGAGT ACAAGTGCAA GGTCTCCAAC AAAGCCCTCC CAGCCCCCAT
651 CGAGAAAACC ATCTCCAAAG CCAAAGGGCA GCCCCGAGAA CCACAGGTGT
701 GCACCCTGCC CCCATCCCGG GAGGAGATGA CCAAGAACCA GGTCAGCCTG
751 TCCTGCGCCG TCAAAGGCTT CTATCCCAGC GACATCGCCG TGGAGTGGGA
801 GAGCCGCGGG CAGCCGGAGA ACAACTACAA GACCACGCCT CCCGTGCTGG
851 ACTCCCGCGG CTCCTTCTTC CTCGTGAGCA AGCTCACCGT GGACAAGAGC
901 AGGTGGCAGC AGGGGAACGT CTTCTCATGC TCCGTGATGC ATGAGGCTCT
951 GCACAACCAC TACACGCAGA AGAGCCTCTC CCTGTCTCCG GGTAAA
(서열 번호: 250)
특정 구체예들에서, 상기 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드는 서열 번호: 92 (상기에 나타냄)이며, 이것은 본 명세서에서 기술된 특정 Fc 융합 폴리펩티드의 이종이량체 형성을 유도하기 위한 4개의 아미노산 치환을 포함하며, 그리고 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
이 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드는 다음 핵산 (서열 번호: 251)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCTCCGGGCC CCGGGGGGTC CAGGCTCTGC
101 TGTGTGCGTG CACCAGCTGC CTCCAGGCCA ACTACACGTG TGAGACAGAT
151 GGGGCCTGCA TGGTTTCCAT TTTCAATCTG GATGGGATGG AGCACCATGT
201 GCGCACCTGC ATCCCCAAAG TGGAGCTGGT CCCTGCCGGG AAGCCCTTCT
251 ACTGCCTGAG CTCGGAGGAC CTGCGCAACA CCCACTGCTG CTACACTGAC
301 TACTGCAACA GGATCGACTT GAGGGTGCCC AGTGGTCACC TCAAGGAGCC
351 TGAGCACCCG TCCATGTGGG GCCCGGTGGA GACCGGTGGT GGAACTCACA
401 CATGCCCACC GTGCCCAGCA CCTGAACTCC TGGGGGGACC GTCAGTCTTC
451 CTCTTCCCCC CAAAACCCAA GGACACCCTC ATGATCTCCC GGACCCCTGA
501 GGTCACATGC GTGGTGGTGG ACGTGAGCCA CGAAGACCCT GAGGTCAAGT
551 TCAACTGGTA CGTGGACGGC GTGGAGGTGC ATAATGCCAA GACAAAGCCG
601 CGGGAGGAGC AGTACAACAG CACGTACCGT GTGGTCAGCG TCCTCACCGT
651 CCTGCACCAG GACTGGCTGA ATGGCAAGGA GTACAAGTGC AAGGTCTCCA
701 ACAAAGCCCT CCCAGCCCCC ATCGAGAAAA CCATCTCCAA AGCCAAAGGG
751 CAGCCCCGAG AACCACAGGT GTGCACCCTG CCCCCATCCC GGGAGGAGAT
801 GACCAAGAAC CAGGTCAGCC TGTCCTGCGC CGTCAAAGGC TTCTATCCCA
851 GCGACATCGC CGTGGAGTGG GAGAGCAATG GGCAGCCGGA GAACAACTAC
901 AAGACCACGC CTCCCGTGCT GGACTCCGAC GGCTCCTTCT TCCTCGTGAG
951 CAAGCTCACC GTGGACAAGA GCAGGTGGCA GCAGGGGAAC GTCTTCTCAT
1001 GCTCCGTGAT GCATGAGGCT CTGCACAACC ACTACACGCA GAAGAGCCTC
1051 TCCCTGTCTC CGGGTAAA (서열 번호: 251)
성숙 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드 서열은 서열 번호: 93(상기에 나타냄)과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
이 ALK4-Fc 융합 폴리펩티드는 다음 핵산 (서열 번호: 252)에 의해 인코드된다:
1 TCCGGGCCCC GGGGGGTCCA GGCTCTGCTG TGTGCGTGCA CCAGCTGCCT
51 CCAGGCCAAC TACACGTGTG AGACAGATGG GGCCTGCATG GTTTCCATTT
101 TCAATCTGGA TGGGATGGAG CACCATGTGC GCACCTGCAT CCCCAAAGTG
151 GAGCTGGTCC CTGCCGGGAA GCCCTTCTAC TGCCTGAGCT CGGAGGACCT
201 GCGCAACACC CACTGCTGCT ACACTGACTA CTGCAACAGG ATCGACTTGA
251 GGGTGCCCAG TGGTCACCTC AAGGAGCCTG AGCACCCGTC CATGTGGGGC
301 CCGGTGGAGA CCGGTGGTGG AACTCACACA TGCCCACCGT GCCCAGCACC
351 TGAACTCCTG GGGGGACCGT CAGTCTTCCT CTTCCCCCCA AAACCCAAGG
401 ACACCCTCAT GATCTCCCGG ACCCCTGAGG TCACATGCGT GGTGGTGGAC
451 GTGAGCCACG AAGACCCTGA GGTCAAGTTC AACTGGTACG TGGACGGCGT
501 GGAGGTGCAT AATGCCAAGA CAAAGCCGCG GGAGGAGCAG TACAACAGCA
551 CGTACCGTGT GGTCAGCGTC CTCACCGTCC TGCACCAGGA CTGGCTGAAT
601 GGCAAGGAGT ACAAGTGCAA GGTCTCCAAC AAAGCCCTCC CAGCCCCCAT
651 CGAGAAAACC ATCTCCAAAG CCAAAGGGCA GCCCCGAGAA CCACAGGTGT
701 GCACCCTGCC CCCATCCCGG GAGGAGATGA CCAAGAACCA GGTCAGCCTG
751 TCCTGCGCCG TCAAAGGCTT CTATCCCAGC GACATCGCCG TGGAGTGGGA
801 GAGCAATGGG CAGCCGGAGA ACAACTACAA GACCACGCCT CCCGTGCTGG
851 ACTCCGACGG CTCCTTCTTC CTCGTGAGCA AGCTCACCGT GGACAAGAGC
901 AGGTGGCAGC AGGGGAACGT CTTCTCATGC TCCGTGATGC ATGAGGCTCT
951 GCACAACCAC TACACGCAGA AGAGCCTCTC CCTGTCTCCG GGTAAA
(서열 번호: 252)
다양한 ALK4-Fc:ActRIIB-Fc 복합체들의 정제는 다음중 3개 또는 그 이상이 임의의 순서로 포함된 일련의 컬럼 크로마토그래피에 의해 실행될 수 있다: 단백질 A 크로마토그래피, Q 세파로즈 크로마토그래피, 페닐세파로즈 크로마토그래피, 크기 압출 크로마토그래피, 에피토프-기반 친화성 크로마토 그래피 (예를 들어, 항체 또는 ALK4 또는 ActRIIB상의 에피토프에 대해 지시된 항체 또는 기능적으로 동등한 리간드) 및 다중형태 크로마토 그래피 (예를 들어, 정전기 및 소수성 리간드를 모두 함유하는 수지와 함께). 상기 정제는 바이러스 여과 및 완충액 교환으로 완성될 수 있다.
특정 측면들에 있어서, 본 명세서는 ALK5 폴리펩티드를 포함하는 단백질 복합체들에 관계한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "ALK5"는 임의의 종으로부터 그리고 이 유발 또는 다른 변형에 의해 그러한 ALK5 단백질로부터 유래된 변이체로부터 액티빈 수용체-유사 키나제-5 단백질의 패밀리를 나타낸다. ALK5에 대한 언급은 현재 확인된 형태중 하나를 참조로 한다. ALK5 패밀리의 구성요소는 시스테인-풍부 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 및 예상 세린/트레오닌 키나제 활성을 갖는 세포질 도메인을 포함하는 막경유 단백질이다.
용어 "ALK5 폴리펩티드"는 뿐만 아니라 ALK5 패밀리 구성원의 자연 발생적 폴리펩티드를 포함하는 폴리펩티드 뿐만 아니라, 유용한 활성을 보유하는 그의 임의의 변이체 (돌연변이 체, 단편, 융합체 및 펩티드 유사체를 포함함)를 포함한다.
인간 ALK5 전구체 단백질 서열 (NCBI Ref Seq NP_004603.1)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 ALK5 폴리펩티드 서열은 다음과 같다:
AALLPGATALQCFCHLCTKDNFTCVTDGLCFVSVTETTDKVIHNSMCIAEIDLIPRDRPFVCAPSSKTGSVTTTYCCNQDHCNKIELPTTVKSSPGLGPVEL (서열 번호: 98)
인간 ALK5 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 225에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_004612.2의 뉴클레오티드 77-1585에 상응한다. 세포외 인간 ALK5 폴리펩티드를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 226과 같다.
인간 ALK5 전구체 단백질 서열의 대체 아이소폼, 아이소폼 2 (NCBI Ref Seq XP_005252207.1)은 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 ALK5 폴리펩티드 서열 (아이소폼 2)는 다음과 같다:
AALLPGATALQCFCHLCTKDNFTCVTDGLCFVSVTETTDKVIHNSMCIAEIDLIPRDRPFVCAPSSKTGSVTTTYCCNQDHCNKIELPTTGPFSVKSSPGLGPVEL (서열 번호: 99)
인간 ALK5 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 227에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 XM_005252150.1의 뉴클레오티드 77-1597에 상응한다. 세포외 ALK5 폴리펩티드를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 228과 같다.
특정 구체예들에 있어서, 본 명세서는 최소한 하나의 ALK5 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체에 관계하며, 여기에는 이의 단편들, 기능성 변이체들 그리고 변형된 형태들이 포함된다. 바람직하게는 본 발명의 용도에 이용되는 ALK5 폴리펩티드들 (가령, ALK5 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체들과 이의 용도들)은 가용성 (가령, ALK5의 세포외 도메인)이다. 다른 바람직한 구체예들에서, 본 발명의 용도에 이용되는 ALK5 폴리펩티드들은 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드들에 결합하고 및/또는 활성 (가령, Smad 2/3 및/또는 Smad 1/5/8 신호생성 유도)을 억제(길항)한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 96, 98, 97, 또는 99서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK5 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체 복합체는 서열 번호: 96, 98, 97, 또는 99서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK5 폴리펩티드로 구성되거나, 또는 기본적으로 구성된다.
특정 양태에서, 본 명세서는 ALK5-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK5-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 96 또는 97의 아미노산 25-36중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 및 36)에서 시작하고, 서열 번호: 96 또는 97의 아미노산 106-126중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 및 126)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK5 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK5-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 96 또는 97의 아미노산 36-106에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK5 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK5-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 96 또는 97의 아미노산 25-126에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK5 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK5-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 96, 98, 97, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 및 107중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK5 도메인을 포함한다.
상보적 ALK5-Fc 융합 단백질은 TPA 리더를 이용하며, 다음과 같다 (서열 번호: 100):
신호 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 ActRIIB-Fc:ALK5-Fc이형이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (리신이 아스파트르산으로 대체됨)이 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단에 리신이 추가된, 서열 번호: 100의 아미노산 서열이 제공될 수 있다.
ALK5-Fc 융합 단백질은 다음 핵산 (서열 번호: 253)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCGCGCTGCT CCCGGGGGCG ACGGCGTTAC
101 AGTGTTTCTG CCACCTCTGT ACAAAAGACA ATTTTACTTG TGTGACAGAT
151 GGGCTCTGCT TTGTCTCTGT CACAGAGACC ACAGACAAAG TTATACACAA
201 CAGCATGTGT ATAGCTGAAA TTGACTTAAT TCCTCGAGAT AGGCCGTTTG
251 TATGTGCACC CTCTTCAAAA ACTGGGTCTG TGACTACAAC ATATTGCTGC
301 AATCAGGACC ATTGCAATAA AATAGAACTT CCAACTACTG TAAAGTCATC
351 ACCTGGCCTT GGTCCTGTGG AAACCGGTGG TGGAACTCAC ACATGCCCAC
401 CGTGCCCAGC ACCTGAACTC CTGGGGGGAC CGTCAGTCTT CCTCTTCCCC
451 CCAAAACCCA AGGACACCCT CATGATCTCC CGGACCCCTG AGGTCACATG
501 CGTGGTGGTG GACGTGAGCC ACGAAGACCC TGAGGTCAAG TTCAACTGGT
551 ACGTGGACGG CGTGGAGGTG CATAATGCCA AGACAAAGCC GCGGGAGGAG
601 CAGTACAACA GCACGTACCG TGTGGTCAGC GTCCTCACCG TCCTGCACCA
651 GGACTGGCTG AATGGCAAGG AGTACAAGTG CAAGGTCTCC AACAAAGCCC
701 TCCCAGCCCC CATCGAGAAA ACCATCTCCA AAGCCAAAGG GCAGCCCCGA
751 GAACCACAGG TGTACACCCT GCCCCCATCC CGGGAGGAGA TGACCAAGAA
801 CCAGGTCAGC CTGACCTGCC TGGTCAAAGG CTTCTATCCC AGCGACATCG
851 CCGTGGAGTG GGAGAGCAAT GGGCAGCCGG AGAACAACTA CGACACCACG
901 CCTCCCGTGC TGGACTCCGA CGGCTCCTTC TTCCTCTATA GCGACCTCAC
951 CGTGGACAAG AGCAGGTGGC AGCAGGGGAA CGTCTTCTCA TGCTCCGTGA
1001 TGCATGAGGC TCTGCACAAC CACTACACGC AGAAGAGCCT CTCCCTGTCT
1051 CCGGGT (서열 번호: 253)
성숙 ALK5-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 101)은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 추가될 수 있다.
1 ALLPGATALQ CFCHLCTKDN FTCVTDGLCF VSVTETTDKV IHNSMCIAEI
51 DLIPRDRPFV CAPSSKTGSV TTTYCCNQDH CNKIELPTTV KSSPGLGPVE
101 TGGGTHTCPP CPAPELLGGP SVFLFPPKPK DTLMISRTPE VTCVVVDVSH
151 EDPEVKFNWY VDGVEVHNAK TKPREEQYNS TYRVVSVLTV LHQDWLNGKE
201 YKCKVSNKAL PAPIEKTISK AKGQPREPQV YTLPPSREEM TKNQVSLTCL
251 VKGFYPSDIA VEWESNGQPE NNYDTTPPVL DSDGSFFLYS DLTVDKSRWQ
301 QGNVFSCSVM HEALHNHYTQ KSLSLSPG (서열 번호: 101)
비대칭 Fc 융합 단백질을 이용한 이형다량체 복합체들의 형성을 촉진시키는 또다른 방법에서, 상보적 소수성 상호작용과 추가적인 분자간 이황화결합을 도입하도록 Fc 도메인이 변경된다.
일부 구체예들에서, 상기 ALK5-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 104)는 다음과 같다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 본원에서 개시된 특정 Fc 융합 폴리펩티드와 이종이량체 형성을 유도하기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환이 ALK5-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다. 또한, Fc 도메인의 C-말단 라이신 잔기는 결실될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 104의 아미노산 서열이 제공된다.
성숙 ALK5-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 105)은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 ALLPGATALQ CFCHLCTKDN FTCVTDGLCF VSVTETTDKV IHNSMCIAEI
51 DLIPRDRPFV CAPSSKTGSV TTTYCCNQDH CNKIELPTTV KSSPGLGPVE
101 TGGGTHTCPP CPAPELLGGP SVFLFPPKPK DTLMISRTPE VTCVVVDVSH
151 EDPEVKFNWY VDGVEVHNAK TKPREEQYNS TYRVVSVLTV LHQDWLNGKE
201 YKCKVSNKAL PAPIEKTISK AKGQPREPQV CTLPPSREEM TKNQVSLSCA
251 VKGFYPSDIA VEWESNGQPE NNYKTTPPVL DSDGSFFLVS KLTVDKSRWQ
301 QGNVFSCSVM HEALHNHYTQ KSLSLSPGK (서열 번호: 105)
특정 측면들에 있어서, 본 명세서는 ALK6 폴리펩티드를 포함하는 단백질 복합체들에 관계한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "ALK6"는 임의의 종으로부터 그리고 이 유발 또는 다른 변형에 의해 그러한 ALK6 단백질로부터 유래된 변이체로부터 액티빈 수용체-유사 키나제-6 단백질의 패밀리를 나타낸다. ALK6에 대한 언급은 현재 확인된 형태중 하나를 참조로 한다. ALK6 패밀리의 구성요소는 시스테인-풍부 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 및 예상 세린/트레오닌 키나제 활성을 갖는 세포질 도메인을 포함하는 막경유 단백질이다.
용어 "ALK6 폴리펩티드"는 뿐만 아니라 ALK6 패밀리 구성원의 자연 발생적 폴리펩티드를 포함하는 폴리펩티드 뿐만 아니라, 유용한 활성을 보유하는 그의 임의의 변이체 (돌연변이체, 단편, 융합체 및 펩티드 유사체를 포함)를 포함한다.
인간 ALK6 전구체 단백질 서열 (NCBI Ref Seq NP_001194.1)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 ALK6 폴리펩티드 서열은 다음과 같다:
KKEDGESTAPTPRPKVLRCKCHHHCPEDSVNNICSTDGYCFTMIEEDDSGLPVVTSGCLGLEGSDFQCRDTPIPHQRRSIECCTERNECNKDLHPTLPPLKNRDFVDGPIHHR (서열 번호: 109)
ALK6 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 229에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_001203.2의 뉴클레오티드 275-1780에 상응한다. 세포외 ALK6 폴리펩티드를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 230과 같다.
인간 ALK6 전구체 단백질 서열의 대체 아이소폼, 아이소폼 2 (NCBI Ref Seq NP_001243722.1)은 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 ALK6 폴리펩티드 서열 (아이소폼 2)는 다음과 같다:
NFLDNMLLRSAGKLNVGTKKEDGESTAPTPRPKVLRCKCHHHCPEDSVNNICSTDGYCFTMIEEDDSGLPVVTSGCLGLEGSDFQCRDTPIPHQRRSIECCTERNECNKDLHPTLPPLKNRDFVDGPIHHR (서열 번호: 111)
인간 ALK6 전구체 단백질(아이소폼 2)을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 231에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_001256793.1의 뉴클레오티드 22-1617에 상응한다. 세포외 ALK6 폴리펩티드를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 232와 같다.
특정 구체예들에 있어서, 본 명세서는 최소한 하나의 ALK6 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체에 관계하며, 여기에는 이의 단편들, 기능성 변이체들 그리고 변형된 형태들이 포함된다. 바람직하게는 본 발명의 용도에 이용되는 ALK6 폴리펩티드들 (가령, ALK6 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체들과 이의 용도들)은 가용성 (가령, ALK6의 세포외 도메인)이다. 다른 바람직한 구체예들에서, 본 발명의 용도에 이용되는 ALK6 폴리펩티드들은 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드들에 결합하고 및/또는 활성 (가령, Smad 2/3 및/또는 Smad 1/5/8 신호생성 유도)을 억제(길항)한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 108, 109, 110, 또는 111서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK6 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 108, 109, 110, 또는 111서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK6 폴리펩티드로 구성되거나, 또는 기본적으로 구성된다.
특정 양태에서, 본 명세서는 ALK6-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK6-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 108의 아미노산 14-32중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 및 32)에서 시작하고, 서열 번호: 108의 아미노산 102-126중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 및 126)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK6 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK6-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 108의 아미노산 32-102에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK3 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK6-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 108의 아미노산 14-126에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK6 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK6-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 서열 번호: 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 그리고 119중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK6 도메인을 포함한다.
일부 구체예들에서, 상기 ALK6-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 110의 아미노산 26-62중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 및 62)에서 시작하고, 서열 번호: 110의 아미노산 132-156 중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 및 156)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK6 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK6-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 110의 아미노산 62-132에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK6 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK6-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 110의 아미노산 26-156에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK6 도메인을 포함한다.
상보적 ALK6-Fc 융합 단백질은 TPA 리더를 이용하며, 다음과 같다 (서열 번호: 112):
신호 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 ActRIIB-Fc:ALK6-Fc 이형이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (리신이 아스파트르산으로 대체됨)이 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단에 리신이 추가된, 서열 번호: 112의 아미노산 서열이 제공될 수 있다.
ALK6-Fc 융합 단백질은 다음 핵산 (서열 번호: 254)에 의해 인코드된다:
성숙 ALK6-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 113)은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 추가될 수 있다.
1 KKEDGESTAP TPRPKVLRCK CHHHCPEDSV NNICSTDGYC FTMIEEDDSG
51 LPVVTSGCLG LEGSDFQCRD TPIPHQRRSI ECCTERNECN KDLHPTLPPL
101 KNRDFVDGPI HHRTGGGTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR
151 TPEVTCVVVD VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRVVSV
201 LTVLHQDWLN GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSR
251 EEMTKNQVSL TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYDTTP PVLDSDGSFF
301 LYSDLTVDKS RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP G
(서열 번호: 113)
비대칭 Fc 융합 단백질을 이용한 이형다량체 복합체들의 형성을 촉진시키는 또다른 방법에서, 상보적 소수성 상호작용과 추가적인 분자간 이황화결합을 도입하도록 Fc 도메인이 변경될 수 있다.
상보적 형태의 ALK6-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 116)는 다음과 같다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 본원에서 개시된 특정 Fc 융합 폴리펩티드와 이종이량체 형성을 유도하기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환이 ALK6-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다. 또한, Fc 도메인의 C-말단 라이신 잔기는 결실될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 116의 아미노산 서열이 제공된다.
성숙 ALK6-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 117)은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 KKEDGESTAP TPRPKVLRCK CHHHCPEDSV NNICSTDGYC FTMIEEDDSG
51 LPVVTSGCLG LEGSDFQCRD TPIPHQRRSI ECCTERNECN KDLHPTLPPL
101 KNRDFVDGPI HHRTGGGTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP KPKDTLMISR
151 TPEVTCVVVD VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRVVSV
201 LTVLHQDWLN GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVCTLPPSR
251 EEMTKNQVSL SCAVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP PVLDSDGSFF
301 LVSKLTVDKS RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK
(서열 번호: 117)
특정 측면들에 있어서, 본 명세서는 ALK7 폴리펩티드를 포함하는 단백질 복합체들에 관계한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "ALK7"은 임의의 종으로부터 그리고 이 유발 또는 다른 변형에 의해 그러한 ALK7 단백질로부터 유래된 변이체로부터 액티빈 수용체-유사 키나제-7 단백질의 패밀리를 나타낸다. ALK7에 대한 언급은 현재 확인된 형태중 하나를 참조로 한다. ALK7 패밀리의 구성요소는 시스테인-풍부 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 및 예상 세린/트레오닌 키나제 활성을 갖는 세포질 도메인을 포함하는 막경유 단백질이다.
용어 "ALK7 폴리펩티드"는 뿐만 아니라 ALK7 패밀리 구성원의 자연 발생적 폴리펩티드를 포함하는 폴리펩티드 뿐만 아니라, 유용한 활성을 보유하는 그의 임의의 변이체 (돌연변이체, 단편, 융합체 및 펩티드 유사체를 포함함)를 포함한다.
인간 ALK7의 4 개의 자연 발생적 아이소폼이 기술되었다. 인간 ALK7 아이소폼 1 전구체 단백질 (NCBI Ref Seq NP_660302.2)의 서열은 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 ALK7 아이소폼 1 폴리펩티드 서열은 다음과 같다:
ELSPGLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTNGKEQVIKSCVSLPELNAQVFCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPTASPNAPKLGPME (서열 번호: 123)
인간 ALK7 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 233에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_145259.2의 뉴클레오티드 244-1722에 상응한다. 프로세스된 세포외 ALK7 폴리펩티드(아이소폼 1)를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 234와 같다.
인간 ALK7의 대체 아이소폼, 아이소폼 2 (NCBI Ref Seq NP_001104501.1)의 아미노산 서열(서열 번호: 124)은 다음과 같이, 이의 프로세스된 형태이며, 이때 세포외 도메인은 굵게 표시된다.
세포외 ALK7 폴리펩티드 (아이소폼 2)의 아미노산 서열은 다음과 같다:
MLTNGKEQVIKSCVSLPELNAQVFCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPTASPNAPKLGPME (서열 번호: 125).
프로세스된 ALK7 폴리펩티드 (아이소폼 2)를 인코딩하는 서열은 하기 서열 번호: 235에 나타내며, NCBI 참조 서열 NM_001111031.1의 뉴클레오티드 279-1607에 상응한다
세포외 ALK7 폴리펩티드 (아이소폼 2)를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 236과 같다.
대체 인간 ALK7 전구체 단백질, 아이소폼 3 (NCBI Ref Seq NP_001104502.1)의 아미노산 서열은 다음과 같고 (서열 번호: 121), 여기에서 신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시된다.
프로세스된 ALK7 폴리펩티드 (아이소폼 3)의 아미노산 서열은 다음과 같다 (서열 번호: 126). 이 아이소폼은 막 횡단 도메인이 없으므로, 그 전체가 가용성이 될 수 있다고 제안된다(Roberts et al., 2003, Biol Reprod 68:1719-1726). 서열 번호: 126의 N-말단 변이체가 다음에 기술된 바와 같이 예상된다.
프로세스안된 ALK7 폴리펩티드 전구체 단백질 (아이소폼 3)를 인코딩하는 핵산 서열은 서열 번호: 237에 나타내며, NCBI 참조 서열 NM_001111032.1의 뉴클레오티드 244-1482에 상응한다. 프로세스된 ALK7 폴리펩티드 (아이소폼 3)를 인코딩하는 핵산 서열은 서열 번호: 238에 나타낸다.
대체 인간 ALK7 전구체 단백질, 아이소폼 4 (NCBI Ref Seq NP_001104503.1)의 아미노산 서열은 다음과 같고 (서열 번호: 122), 여기에서 신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시된다.
프로세스된 ALK7 폴리펩티드 (아이소폼 4)의 아미노산 서열은 다음과 같다 (서열 번호: 127). ALK7 아이소폼 3과 같이, 아이소폼 4는 막 횡단 도메인이 없으므로, 그 전체가 가용성이 될 수 있다고 제안된다(Roberts et al., 2003, Biol Reprod 68:1719-1726). 서열 번호: 127의 N-말단 변이체가 다음에 기술된 바와 같이 예상된다.
프로세스안된 ALK7 폴리펩티드 전구체 단백질 (아이소폼 4)를 인코딩하는 핵산 서열은 서열 번호: 239에 나타내며, NCBI 참조 서열 NM_001111033.1의 뉴클레오티드 244-1244에 상응한다. 프로세스된 ALK7 폴리펩티드 (아이소폼 4)를 인코딩하는 핵산 서열은 서열 번호: 240에 나타낸다.
랫에서의 전장 ALK7 (아이소폼 1)의 신호 서열 (NCBI 참조 서열 NP_620790.1 참조) 및 인간과 렛 ALK7 사이의 고도의 서열 동일성에 기초하여, 인간 ALK7 아이소폼 1의 프로세스된 형태는 다음(서열 번호: 128)과 같다고 예측된다.
프로세스된 ALK7 아이소폼 1의 활성 변이체는 서열 번호: 123의 N-말단에서 1, 2, 3, 4, 5, 6, 또는 7개의 아미노산이 절두되고, 서열 번호: 128의 N-말단에서 1 또는 2개의 아미노산이 절두되는 것으로 예상된다. 서열 번호: 128과 일관되게, 류신은 인간 ALK7 아이소폼 3 (서열 번호: 126) 및 인간 ALK7 아이소폼 4 (서열 번호: 127)의 프로세스된 형태에서 N-말단 아미노산인 것으로 추가 예상된다.
특정 구체예들에 있어서, 본 명세서는 최소한 하나의 ALK7 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체에 관계하며, 여기에는 이의 단편들, 기능성 변이체들 그리고 변형된 형태들이 포함된다. 바람직하게는 본 발명의 용도에 이용되는 ALK7 폴리펩티드들 (가령, ALK7 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체들과 이의 용도들)은 가용성 (가령, ALK7의 세포외 도메인)이다. 다른 바람직한 구체예들에서, 본 발명의 용도에 이용되는 ALK7 폴리펩티드들은 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드들에 결합하고 및/또는 활성 (가령, Smad 2/3 및/또는 Smad 1/5/8 신호생성 유도)을 억제(길항)한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 120, 123, 129, 130, 124, 125, 121, 126, 122, 127, 128, 133, 또는 134서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK7 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 120, 123, 129, 130, 124, 125, 121, 126, 122, 127, 128, 133, 또는 134서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ALK7 폴리펩티드로 구성되거나, 또는 기본적으로 구성된다.
특정 양태에서, 본 명세서는 ALK7-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK7-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 120, 121, 또는 122의 아미노산 21-28중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 및 28)에서 시작하고, 서열 번호: 120, 121, 또는 122의 아미노산 92-113중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 및 113)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK7 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK7-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 120, 121, 또는 122의 아미노산 28-92에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK7 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK7-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 120, 121, 또는 122의 아미노산 21-113에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK7 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ALK7-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 서열 번호: 서열 번호: 120, 123, 124, 125, 121, 126, 122, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 그리고 136중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ALK7 도메인을 포함한다.
일부 구체예들에서, 상기 ALK7-Fc 융합 단백질은 TPA 리더를 이용하며, 다음과 같다(서열 번호: 129):
신호 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 ActRIIB-Fc:ALK7-Fc 이형이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (리신이 아스파트르산으로 대체됨)이 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단에 리신이 추가된, 서열 번호: 129의 아미노산 서열이 제공될 수 있다.
ALK7-Fc 융합 단백질은 다음 핵산 (서열 번호: 255)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCGGACTGAA GTGTGTATGT CTTTTGTGTG
101 ATTCTTCAAA CTTTACCTGC CAAACAGAAG GAGCATGTTG GGCATCAGTC
151 ATGCTAACCA ATGGAAAAGA GCAGGTGATC AAATCCTGTG TCTCCCTTCC
201 AGAACTGAAT GCTCAAGTCT TCTGTCATAG TTCCAACAAT GTTACCAAAA
251 CCGAATGCTG CTTCACAGAT TTTTGCAACA ACATAACACT GCACCTTCCA
301 ACAGCATCAC CAAATGCCCC AAAACTTGGA CCCATGGAGA CCGGTGGTGG
351 AACTCACACA TGCCCACCGT GCCCAGCACC TGAACTCCTG GGGGGACCGT
401 CAGTCTTCCT CTTCCCCCCA AAACCCAAGG ACACCCTCAT GATCTCCCGG
451 ACCCCTGAGG TCACATGCGT GGTGGTGGAC GTGAGCCACG AAGACCCTGA
501 GGTCAAGTTC AACTGGTACG TGGACGGCGT GGAGGTGCAT AATGCCAAGA
551 CAAAGCCGCG GGAGGAGCAG TACAACAGCA CGTACCGTGT GGTCAGCGTC
601 CTCACCGTCC TGCACCAGGA CTGGCTGAAT GGCAAGGAGT ACAAGTGCAA
651 GGTCTCCAAC AAAGCCCTCC CAGCCCCCAT CGAGAAAACC ATCTCCAAAG
701 CCAAAGGGCA GCCCCGAGAA CCACAGGTGT ACACCCTGCC CCCATCCCGG
751 GAGGAGATGA CCAAGAACCA GGTCAGCCTG ACCTGCCTGG TCAAAGGCTT
801 CTATCCCAGC GACATCGCCG TGGAGTGGGA GAGCAATGGG CAGCCGGAGA
851 ACAACTACGA CACCACGCCT CCCGTGCTGG ACTCCGACGG CTCCTTCTTC
901 CTCTATAGCG ACCTCACCGT GGACAAGAGC AGGTGGCAGC AGGGGAACGT
951 CTTCTCATGC TCCGTGATGC ATGAGGCTCT GCACAACCAC TACACGCAGA
1001 AGAGCCTCTC CCTGTCTCCG GGT (서열 번호: 255)
성숙 ALK7-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 130)은 다음과 같이 예상되고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 추가될 수 있다.
1 GLKCVCLLCD SSNFTCQTEG ACWASVMLTN GKEQVIKSCV SLPELNAQVF
51 CHSSNNVTKT ECCFTDFCNN ITLHLPTASP NAPKLGPMET GGGTHTCPPC
101 PAPELLGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVVVDVSHE DPEVKFNWYV
151 DGVEVHNAKT KPREEQYNST YRVVSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKALP
201 APIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSREEMT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV
251 EWESNGQPEN NYDTTPPVLD SDGSFFLYSD LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH
301 EALHNHYTQK SLSLSPG (서열 번호: 130)
상보적 형태의 ALK7-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 133)는 다음과 같다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 본원에서 개시된 특정 Fc 융합 폴리펩티드와 이종이량체 형성을 유도하기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환이 ALK7-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다. 또한, Fc 도메인의 C-말단 라이신 잔기는 결실될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 133의 아미노산 서열이 제공된다.
성숙 ALK7-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 134)은 다음과 같을 것으로 예상되고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 GLKCVCLLCD SSNFTCQTEG ACWASVMLTN GKEQVIKSCV SLPELNAQVF
51 CHSSNNVTKT ECCFTDFCNN ITLHLPTASP NAPKLGPMET GGGTHTCPPC
101 PAPELLGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVVVDVSHE DPEVKFNWYV
151 DGVEVHNAKT KPREEQYNST YRVVSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKALP
201 APIEKTISKA KGQPREPQVC TLPPSREEMT KNQVSLSCAV KGFYPSDIAV
251 EWESNGQPEN NYKTTPPVLD SDGSFFLVSK LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH
301 EALHNHYTQK SLSLSPGK (서열 번호: 134)
특정 구체예들에서, 본 명세서는 ActRIIA 폴리펩티드를 포함하는 단백질 복합체들에 관계한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "ActRIIA"는 임의의 종으로부터 그리고 이 유발 또는 다른 변형에 의해 그러한 ActRIIA 단백질로부터 유래된 변이체로부터 액티빈 수용체 유형 IIA (ActRIIA) 단백질의 패밀리를 나타낸다. ActRIIA에 대한 언급은 현재 확인된 형태중 하나를 참조로 한다. ActRIIA 패밀리의 구성요소는 시스테인-풍부 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 및 예상 세린/트레오닌 키나제 활성을 갖는 세포질 도메인을 포함하는 막경유 단백질이다.
용어 "ActRIIA 폴리펩티드"는 뿐만 아니라 ActRIIA 패밀리 구성원의 자연 발생적 폴리펩티드를 포함하는 폴리펩티드 뿐만 아니라, 유용한 활성을 보유하는 그의 임의의 변이체 (돌연변이 체, 단편, 융합체 및 펩티드 유사체를 포함함)를 포함한다. 이러한 변이체 ActRIIA 폴리펩티드들의 예는 본 명세서 뿐만 아니라 국제 특허 출원 공개 번호. WO 2006/012627에서 제공되며, 이들은 전문이 본 명세서의 참고자료에 편입된다.
인간 ActRIIA 전구체 단백질 서열은 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시되며; 잠재적인 내인성 N-연계된 당화 부위는 이중 밑줄로 표시된다.
프로세스된 세포외 인간 ActRIIA 폴리펩티드 서열은 다음과 같다:
ILGRSETQECLFFNANWEKDRTNQTGVEPCYGDKDKRRHCFATWKNISGSIEIVKQGCWLDDINCYDRTDCVEKKDSPEVYFCCCEGNMCNEKFSYFPEMEVTQPTSNPVTPKPP (서열 번호: 138)
세포외 도메인의 C-말단 "꼬리(tail)"는 단일 밑줄로 나타낸다. 결손된 "꼬리"를 갖는 서열(Δ15 서열)은 다음과 같다:
ILGRSETQECLFFNANWEKDRTNQTGVEPCYGDKDKRRHCFATWKNISGSIEIVKQGCWLDDINCYDRTDCVEKKDSPEVYFCCCEGNMCNEKFSYFPEM (서열 번호: 139)
인간 ActRIIA 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 241에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_001616.4의 뉴클레오티드 159-1700에 상응한다. 세포외 ActRIIA 폴리펩티드를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 242와 같다.
활성 (가령, 리간드 결합) ActRIIA 폴리펩티드의 일반적인 형태는 서열 번호: 137의 아미노산 위치 30에서 시작하고, 서열 번호: 137의 아미노산 위치 110에서 종료되는 폴리펩티드를 포함하는 것이다. 따라서, 본 명세서의 ActRIIA 폴리펩티드는 서열 번호: 137의 아미노산 30-110에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 폴리펩티드를 포함할 수 있다. 임의선택적으로, 본 명세서의 ActRIIA 폴리펩티드는 서열 번호: 137의 아미노산 12-82에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일하고, 임의선택적으로 1-5 (가령, 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 3-5 (가령, 3, 4, 또는 5) 범위의 위치에서 시작되고, 그리고 위치 110-116 (가령, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 또는 116) 또는 110-115 (가령, 110, 111, 112, 113, 114, 또는 115)에서 종료되며, 그리고 리간드 결합 포켓에서 단지 1, 2, 5, 10 또는 15개의 보존적 아미노산 변화를 포함하며, 그리고 서열 번호: 137에 대하여 리간드 결합 포켓의 위치 40, 53, 55, 74, 79 및/또는 82에서 0, 1 또는 그 이상의 비-보존적 변경을 포함하는, 폴리펩티드를 포함한다.
특정 구체예들에 있어서, 본 명세서는 최소한 하나의 ActRIIA 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체에 관계하며, 여기에는 이의 단편들, 기능성 변이체들 그리고 변형된 형태들이 포함된다. 바람직하게는 본 발명의 용도에 이용되는 ActRIIA 폴리펩티드들 (가령, ActRIIA 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체들과 이의 용도들)은 가용성 (가령, ActRIIA의 세포외 도메인)이다. 다른 바람직한 구체예들에서, 본 발명의 용도에 이용되는 ActRIIA 폴리펩티드들은 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드들에 결합하고 및/또는 활성 (가령, Smad 2/3 및/또는 Smad 1/5/8 신호생성 유도)을 억제(길항)한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 137, 138, 139, 140, 141, 144, 또는 145의 아미노산 서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ActRIIA 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 137, 138, 139, 140, 141, 144, 또는 145의 아미노산 서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 ActRIIA 폴리펩티드를 포함한다.
특정 양태에서, 본 명세서는 ActRIIA-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIA-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 137의 아미노산 21-30중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 1, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 또는 30)에서 시작하고, 서열 번호: 137의 아미노산 110-135 중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134 또는 135)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ActRIIA 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIA-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 137의 아미노산 30-110에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ActRIIA 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIA-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 137의 아미노산 21-135에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ActRIIA 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 ActRIIA-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 서열 번호: 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 및 147중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, ActRIIA 도메인을 포함한다.
상기 ActRIIA-Fc 폴리펩티드 서열 (서열 번호: 140)은 하기에 나타낸다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 ActRIIA-Fc:ActRIIB-Fc 이형이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (산성 아미노산이 리신으로 대체됨)이 ActRIIA 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 140의 아미노산 서열이 제공된다.
이 ActRIIA-Fc 융합 단백질은 다음의 핵산 서열 (서열 번호: 256)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCGCTATACT TGGTAGATCA GAAACTCAGG
101 AGTGTCTTTT CTTTAATGCT AATTGGGAAA AAGACAGAAC CAATCAAACT
151 GGTGTTGAAC CGTGTTATGG TGACAAAGAT AAACGGCGGC ATTGTTTTGC
201 TACCTGGAAG AATATTTCTG GTTCCATTGA AATAGTGAAA CAAGGTTGTT
251 GGCTGGATGA TATCAACTGC TATGACAGGA CTGATTGTGT AGAAAAAAAA
301 GACAGCCCTG AAGTATATTT CTGTTGCTGT GAGGGCAATA TGTGTAATGA
351 AAAGTTTTCT TATTTTCCGG AGATGGAAGT CACACAGCCC ACTTCAAATC
401 CAGTTACACC TAAGCCACCC ACCGGTGGTG GAACTCACAC ATGCCCACCG
451 TGCCCAGCAC CTGAACTCCT GGGGGGACCG TCAGTCTTCC TCTTCCCCCC
501 AAAACCCAAG GACACCCTCA TGATCTCCCG GACCCCTGAG GTCACATGCG
551 TGGTGGTGGA CGTGAGCCAC GAAGACCCTG AGGTCAAGTT CAACTGGTAC
601 GTGGACGGCG TGGAGGTGCA TAATGCCAAG ACAAAGCCGC GGGAGGAGCA
651 GTACAACAGC ACGTACCGTG TGGTCAGCGT CCTCACCGTC CTGCACCAGG
701 ACTGGCTGAA TGGCAAGGAG TACAAGTGCA AGGTCTCCAA CAAAGCCCTC
751 CCAGCCCCCA TCGAGAAAAC CATCTCCAAA GCCAAAGGGC AGCCCCGAGA
801 ACCACAGGTG TACACCCTGC CCCCATCCCG GAAGGAGATG ACCAAGAACC
851 AGGTCAGCCT GACCTGCCTG GTCAAAGGCT TCTATCCCAG CGACATCGCC
901 GTGGAGTGGG AGAGCAATGG GCAGCCGGAG AACAACTACA AGACCACGCC
951 TCCCGTGCTG AAGTCCGACG GCTCCTTCTT CCTCTATAGC AAGCTCACCG
1001 TGGACAAGAG CAGGTGGCAG CAGGGGAACG TCTTCTCATG CTCCGTGATG
1051 CATGAGGCTC TGCACAACCA CTACACGCAG AAGAGCCTCT CCCTGTCTCC
1101 GGGTAAA (서열 번호: 256)
성숙 ActRIIA-Fc 융합 폴리펩티드(서열 번호: 141)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 ILGRSETQEC LFFNANWEKD RTNQTGVEPC YGDKDKRRHC FATWKNISGS
51 IEIVKQGCWL DDINCYDRTD CVEKKDSPEV YFCCCEGNMC NEKFSYFPEM
101 EVTQPTSNPV TPKPPTGGGT HTCPPCPAPE LLGGPSVFLF PPKPKDTLMI
151 SRTPEVTCVV VDVSHEDPEV KFNWYVDGVE VHNAKTKPRE EQYNSTYRVV
201 SVLTVLHQDW LNGKEYKCKV SNKALPAPIE KTISKAKGQP REPQVYTLPP
251 SRKEMTKNQV SLTCLVKGFY PSDIAVEWES NGQPENNYKT TPPVLKSDGS
301 FFLYSKLTVD KSRWQQGNVF SCSVMHEALH NHYTQKSLSL SPGK
(서열 번호: 141)
상기 ActRIIA-Fc 폴리펩티드 서열 (서열 번호: 144)은 하기에 나타낸다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 ActRIIA-Fc:ALK4-Fc 이형이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (세린이 시스테인으로 그리고 트레오닌이 트립토판으로 대체됨)이 상기 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 144의 아미노산 서열이 제공된다.
성숙 ActRIIA-Fc 융합 폴리펩티드(서열 번호: 145)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 ILGRSETQEC LFFNANWEKD RTNQTGVEPC YGDKDKRRHC FATWKNISGS
51 IEIVKQGCWL DDINCYDRTD CVEKKDSPEV YFCCCEGNMC NEKFSYFPEM
101 EVTQPTSNPV TPKPPTGGGT HTCPPCPAPE LLGGPSVFLF PPKPKDTLMI
151 SRTPEVTCVV VDVSHEDPEV KFNWYVDGVE VHNAKTKPRE EQYNSTYRVV
201 SVLTVLHQDW LNGKEYKCKV SNKALPAPIE KTISKAKGQP REPQVYTLPP
251 CREEMTKNQV SLWCLVKGFY PSDIAVEWES NGQPENNYKT TPPVLDSDGS
301 FFLYSKLTVD KSRWQQGNVF SCSVMHEALH NHYTQKSLSL SPGK
(서열 번호: 145)
특정 측면들에 있어서, 본 명세서는 BMPRII 폴리펩티드를 포함하는 단백질 복합체들에 관계한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "BMPRII"는 임의의 종으로부터 뼈 형태생성 단백질 수용체 유형 II (BMPRII) 단백질과 이러한 BMPRII 단백질로부터 돌연변이 또는 다른 변형에 의해 유래된 변이체 패밀리를 나타낸다. BMPRII에 대한 언급은 현재 확인된 형태중 하나를 참조로 한다. BMPRII 패밀리의 구성요소는 시스테인-풍부 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 및 예상 세린/트레오닌 키나제 활성을 갖는 세포질 도메인을 포함하는 막경유 단백질이다.
용어 "BMPRII 폴리펩티드"는 뿐만 아니라 BMPRII 패밀리 구성원의 자연 발생적 폴리펩티드를 포함하는 폴리펩티드 뿐만 아니라, 유용한 활성을 보유하는 그의 임의의 변이체 (돌연변이체, 단편, 융합체 및 펩티드 유사체를 포함함)를 포함한다.
인간 BMPRII 전구체 단백질 서열 (NCBI Ref Seq NP_001195.2)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 BMPRII 폴리펩티드 서열은 다음과 같다:
SQNQERLCAFKDPYQQDLGIGESRISHENGTILCSKGSTCYGLWEKSKGDINLVKQGCWSHIGDPQECHYEECVVTTTPPSIQNGTYRFCCCSTDLCNVNFTENFPPPDTTPLSPPHSFNRDET (서열 번호: 150)
BMPRII 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 205에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_001204.6의 뉴클레오티드 1149-4262에 상응한다. 세포외 BMPRII 폴리펩티드를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 206과 같다.
대체 아이소폼 of BMPRII의 대체 아이소폼, 아이소폼 2 (GenBank: AAA86519.1)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 BMPRII 폴리펩티드 서열 (아이소폼 2)는 다음과 같다:
SQNQERLCAFKDPYQQDLGIGESRISHENGTILCSKGSTCYGLWEKSKGDINLVKQGCWSHIGDPQECHYEECVVTTTPPSIQNGTYRFCCCSTDLCNVNFTENFPPPDTTPLSPPHSFNRDET (서열 번호: 151)
인간 BMPRII 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 207에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 U25110.1의 뉴클레오티드 163-1752에 상응한다. 신호 서열은 밑줄로 표시된다. 세포외 BMPRII 폴리펩티드 (아이소폼 2)를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 208과 같다.
특정 구체예들에 있어서, 본 명세서는 최소한 하나의 BMPRII 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체에 관계하며, 여기에는 이의 단편들, 기능성 변이체들 그리고 변형된 형태들이 포함된다. 바람직하게는 본 발명의 용도에 이용되는 BMPRII 폴리펩티드들 (가령, BMPRII 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체들과 이의 용도들)은 가용성 (가령, BMPRII의 세포외 도메인)이다. 다른 바람직한 구체예들에서, 본 발명의 용도에 이용되는 BMPRII 폴리펩티드들은 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드들에 결합하고 및/또는 활성 (가령, Smad 2/3 및/또는 Smad 1/5/8 신호생성 유도)을 억제(길항)한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 148, 150, 149, 151, 152, 153, 156, 또는 157서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 BMPRII 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체 복합체는 서열 번호: 148, 150, 149, 151, 152, 153, 156, 또는 157서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 BMPRII 폴리펩티드로 구성되거나, 또는 기본적으로 구성된다.
특정 양태에서, 본 명세서는 BMPRII-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 BMPRII-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 148 또는 149의 아미노산 27-34중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 및 34)에서 시작하고, 서열 번호: 148 또는 149의 아미노산 123-150 중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 및 150)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, BMPRII 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 BMPRII-Fc 융합 단백질은 열 번호: 148 또는 149의 아미노산 34-123에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, BMPRII 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 BMPRII-Fc 융합 단백질은 열 번호: 148 또는 149의 아미노산 27-150에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, BMPRII 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 BMPRII-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 서열 번호: 서열 번호: 148, 150, 149, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 그리고 159중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, BMPRII 도메인을 포함한다.
상기 BMPRII-Fc 폴리펩티드 서열 (서열 번호: 152)은 하기에 나타낸다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 BMPRII-Fc:ActRIIB-Fc 이형이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (산성 아미노산이 리신으로 대체됨)이 BMPRII-Fc 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 152의 아미노산 서열이 제공된다.
이 BMPRII-Fc 융합 단백질은 다음의 핵산 서열 (서열 번호: 257)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCTCGCAGAA TCAAGAACGC CTATGTGCGT
101 TTAAAGATCC GTATCAGCAA GACCTTGGGA TAGGTGAGAG TAGAATCTCT
151 CATGAAAATG GGACAATATT ATGCTCGAAA GGTAGCACCT GCTATGGCCT
201 TTGGGAGAAA TCAAAAGGGG ACATAAATCT TGTAAAACAA GGATGTTGGT
251 CTCACATTGG AGATCCCCAA GAGTGTCACT ATGAAGAATG TGTAGTAACT
301 ACCACTCCTC CCTCAATTCA GAATGGAACA TACCGTTTCT GCTGTTGTAG
351 CACAGATTTA TGTAATGTCA ACTTTACTGA GAATTTTCCA CCTCCTGACA
401 CAACACCACT CAGTCCACCT CATTCATTTA ACCGAGATGA GACCGGTGGT
451 GGAACTCACA CATGCCCACC GTGCCCAGCA CCTGAACTCC TGGGGGGACC
501 GTCAGTCTTC CTCTTCCCCC CAAAACCCAA GGACACCCTC ATGATCTCCC
551 GGACCCCTGA GGTCACATGC GTGGTGGTGG ACGTGAGCCA CGAAGACCCT
601 GAGGTCAAGT TCAACTGGTA CGTGGACGGC GTGGAGGTGC ATAATGCCAA
651 GACAAAGCCG CGGGAGGAGC AGTACAACAG CACGTACCGT GTGGTCAGCG
701 TCCTCACCGT CCTGCACCAG GACTGGCTGA ATGGCAAGGA GTACAAGTGC
751 AAGGTCTCCA ACAAAGCCCT CCCAGCCCCC ATCGAGAAAA CCATCTCCAA
801 AGCCAAAGGG CAGCCCCGAG AACCACAGGT GTACACCCTG CCCCCATCCC
851 GGAAGGAGAT GACCAAGAAC CAGGTCAGCC TGACCTGCCT GGTCAAAGGC
901 TTCTATCCCA GCGACATCGC CGTGGAGTGG GAGAGCAATG GGCAGCCGGA
951 GAACAACTAC AAGACCACGC CTCCCGTGCT GAAGTCCGAC GGCTCCTTCT
1001 TCCTCTATAG CAAGCTCACC GTGGACAAGA GCAGGTGGCA GCAGGGGAAC
1051 GTCTTCTCAT GCTCCGTGAT GCATGAGGCT CTGCACAACC ACTACACGCA
1101 GAAGAGCCTC TCCCTGTCTC CGGGTAAA (서열 번호: 257)
성숙 BMPRII-Fc 융합 폴리펩티드(서열 번호: 153)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 SQNQERLCAF KDPYQQDLGI GESRISHENG TILCSKGSTC YGLWEKSKGD
51 INLVKQGCWS HIGDPQECHY EECVVTTTPP SIQNGTYRFC CCSTDLCNVN
101 FTENFPPPDT TPLSPPHSFN RDETGGGTHT CPPCPAPELL GGPSVFLFPP
151 KPKDTLMISR TPEVTCVVVD VSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ
201 YNSTYRVVSV LTVLHQDWLN GKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE
251 PQVYTLPPSR KEMTKNQVSL TCLVKGFYPS DIAVEWESNG QPENNYKTTP
301 PVLKSDGSFF LYSKLTVDKS RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP
351 GK (서열 번호: 153)
상기 BMPRII-Fc 폴리펩티드 서열 (서열 번호: 156)은 하기에 나타낸다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 BMPRII-Fc:ALK4-Fc 이형이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (세린이 시스테인으로 그리고 트레오닌이 트립토판으로 대체됨)이 상기 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 156의 아미노산 서열이 제공된다.
성숙 BMPRII-Fc 융합 폴리펩티드(서열 번호: 157)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신(K)이 제거될 수 있다.
특정 측면들에 있어서, 본 명세서는 TGFBRII 폴리펩티드를 포함하는 단백질 복합체들에 관계한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "TGFBRII"는 임의의 종으로부터 형질전환 성장 인자-베타 수용체 II (TGFBRII) 단백질과 이러한 단백질로부터 돌연변이 유발 또는 다른 변형에 의해 유래된 변이체 패밀리를 지칭한다. TGFBRII에 대한 언급은 현재 확인된 형태중 하나를 참조로 한다. TGFBRII 패밀리의 구성요소는 시스테인-풍부 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 및 예상 세린/트레오닌 키나제 활성을 갖는 세포질 도메인을 포함하는 막경유 단백질이다.
용어 "TGFBRII 폴리펩티드"는 뿐만 아니라 TGFBRII 패밀리 구성원의 자연 발생적 폴리펩티드를 포함하는 폴리펩티드 뿐만 아니라, 유용한 활성을 보유하는 그의 임의의 변이체 (돌연변이체, 단편, 융합체 및 펩티드 유사체를 포함함)를 포함한다.
인간 TGFBRII 전구체 단백질 서열 (NCBI Ref Seq NP_003233.4)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 TGFBRII 폴리펩티드 서열은 다음과 같다:
TIPPHVQKSVNNDMIVTDNNGAVKFPQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPQEVCVAVWRKNDENITLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIFSEEYNTSNPDLLLVIFQ (서열 번호: 195)
TGFBRII 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 196에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_003242.5의 뉴클레오티드 383-2083에 상응한다. 세포외 TGFBRII 폴리펩티드를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 197와 같다.
TGFBRII의 대체 아이소폼, 아이소폼 A (NP_001020018.1)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 TGFBRII 폴리펩티드 서열 (아이소폼 A)는 다음과 같다:
TIPPHVQKSDVEMEAQKDEIICPSCNRTAHPLRHINNDMIVTDNNGAVKFPQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPQEVCVAVWRKNDENITLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIFSEEYNTSNPDLLLVIFQ (서열 번호: 199)
상기 TGFBRII 전구체 단백질 (아이소폼 A)를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 202에 나타내며, 이는 Genbank 참조 서열 NM_001024847.2의 뉴클레오티드 383-2158에 상응한다. 프로세스된 세포외 TGFBRII 폴리펩티드 (아이소폼 A)를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 203에 나타낸다.
전술한 TGFβRII 아이소폼 (서열 번호: 194, 195, 198, 그리고 199)은 TGFβRII 아이소폼 C에서 자연적으로 발생되는 것과 같이 (Konrad et al., BMC Genomics 8:318, 2007), TGFβRII ECD의 C-말단 부근에 위치한 글루탐산염 잔기 쌍 (서열 번호: 194의 위치 151과 152; 서열 번호: 195의 위치 129와 130; 서열 번호: 198의 위치 176과 177; 또는 서열 번호: 199의 위치 154와 155) 사이의 36개 아미노산(서열 번호: 204)의 삽입을 포함할 수 있다.
GRCKIRHIGS NNRLQRSTCQ NTGWESAHVM KTPGFR (서열 번호: 204)
특정 구체예들에 있어서, 본 명세서는 최소한 하나의 TGFBRII 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체에 관계하며, 여기에는 이의 단편들, 기능성 변이체들 그리고 변형된 형태들이 포함된다. 바람직하게는 본 발명의 용도에 이용되는 TGFBRII 폴리펩티드들 (가령, TGFBRII 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체들과 이의 용도들)은 가용성 (가령, TGFBRII의 세포외 도메인)이다. 다른 바람직한 구체예들에서, 본 발명의 용도에 이용되는 TGFBRII 폴리펩티드들은 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드들에 결합하고 및/또는 활성 (가령, Smad 2/3 및/또는 Smad 1/5/8 신호생성 유도)을 억제(길항)한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 상기에서 설명된 서열 번호: 204의 삽입과 함께, 또는 삽입없이, 서열 번호: 194, 195, 198, 또는 199서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 TGFBRII 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체 복합체는 서열 번호: 204의 삽입과 함께, 또는 삽입없이, 서열 번호: 194, 195, 198, 또는 199서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 TGFBRII 폴리펩티드로 구성되거나, 또는 기본적으로 구성된다.
특정 양태에서, 본 명세서는 TGFBII-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 TGFBII-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 160의 아미노산 23-44중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43 또는 44)에서 시작하고, 서열 번호: 160의 아미노산 168-191 중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190 또는 191)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, TGFBII도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 TGFBRII-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 160의 아미노산 44-168에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, TGFBRII 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 TGFBRII-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 160의 아미노산 23-191에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, TGFBRII 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 TGFBRII-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 서열 번호: 서열 번호: 161, 162, 160, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 및 179중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, TGFBRII 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 TGFBII-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 161의 아미노산 23-51중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 및 51)에서 시작하고, 서열 번호: 160의 아미노산 143-166 중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 및 166)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, TGFBII도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 TGFBRII-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 161의 아미노산 51-143에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, TGFBRII 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 TGFBRII-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 161의 아미노산 23-166에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, TGFBRII 도메인을 포함한다.
인간 TGFBRII 전구체 단백질 서열 (NCBI Ref Seq NP_003233.4)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 TGFBRII 폴리펩티드 서열은 다음과 같다:
TIPPHVQKSVNNDMIVTDNNGAVKFPQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPQEVCVAVWRKNDENITLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIFSEEYNTSNPDLLLVIFQ (서열 번호: 162)
TGFBRII의 대체 아이소폼, 아이소폼 A (NP_001020018.1)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 TGFBRII 폴리펩티드 서열 (아이소폼 A)는 다음과 같다:
TIPPHVQKSDVEMEAQKDEIICPSCNRTAHPLRHINNDMIVTDNNGAVKFPQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPQEVCVAVWRKNDENITLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIFSEEYNTSNPDLLLVIFQ (서열 번호: 163)
TGFβRIIshort-Fc 폴리펩티드 서열 (서열 번호: 164)은 하기에 나타낸다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 TGFβRIIshort-Fc:ActRIIB-Fc 이형이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (산성 아미노산이 리신으로 대체됨)이 TGFβRIIshort-Fc 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 164의 아미노산 서열이 제공된다.
TGFβRIIshort-Fc 융합 단백질은 다음의 핵산 서열 (서열 번호: 259)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCACGATCCC ACCGCACGTT CAGAAGTCGG
101 TTAATAACGA CATGATAGTC ACTGACAACA ACGGTGCAGT CAAGTTTCCA
151 CAACTGTGTA AATTTTGTGA TGTGAGATTT TCCACCTGTG ACAACCAGAA
201 ATCCTGCATG AGCAACTGCA GCATCACCTC CATCTGTGAG AAGCCACAGG
251 AAGTCTGTGT GGCTGTATGG AGAAAGAATG ACGAGAACAT AACACTAGAG
301 ACAGTTTGCC ATGACCCCAA GCTCCCCTAC CATGACTTTA TTCTGGAAGA
351 TGCTGCTTCT CCAAAGTGCA TTATGAAGGA AAAAAAAAAG CCTGGTGAGA
401 CTTTCTTCAT GTGTTCCTGT AGCTCTGATG AGTGCAATGA CAACATCATC
451 TTCTCAGAAG AATATAACAC CAGCAATCCT GACACCGGTG GTGGAACTCA
501 CACATGCCCA CCGTGCCCAG CACCTGAACT CCTGGGGGGA CCGTCAGTCT
551 TCCTCTTCCC CCCAAAACCC AAGGACACCC TCATGATCTC CCGGACCCCT
601 GAGGTCACAT GCGTGGTGGT GGACGTGAGC CACGAAGACC CTGAGGTCAA
651 GTTCAACTGG TACGTGGACG GCGTGGAGGT GCATAATGCC AAGACAAAGC
701 CGCGGGAGGA GCAGTACAAC AGCACGTACC GTGTGGTCAG CGTCCTCACC
751 GTCCTGCACC AGGACTGGCT GAATGGCAAG GAGTACAAGT GCAAGGTCTC
801 CAACAAAGCC CTCCCAGCCC CCATCGAGAA AACCATCTCC AAAGCCAAAG
851 GGCAGCCCCG AGAACCACAG GTGTACACCC TGCCCCCATC CCGGAAGGAG
901 ATGACCAAGA ACCAGGTCAG CCTGACCTGC CTGGTCAAAG GCTTCTATCC
951 CAGCGACATC GCCGTGGAGT GGGAGAGCAA TGGGCAGCCG GAGAACAACT
1001 ACAAGACCAC GCCTCCCGTG CTGAAGTCCG ACGGCTCCTT CTTCCTCTAT
1051 AGCAAGCTCA CCGTGGACAA GAGCAGGTGG CAGCAGGGGA ACGTCTTCTC
1101 ATGCTCCGTG ATGCATGAGG CTCTGCACAA CCACTACACG CAGAAGAGCC
1151 TCTCCCTGTC TCCGGGTAAA (서열 번호: 259)
성숙 TGFβRIIshort-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 165)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 TIPPHVQKSV NNDMIVTDNN GAVKFPQLCK FCDVRFSTCD NQKSCMSNCS
51 ITSICEKPQE VCVAVWRKND ENITLETVCH DPKLPYHDFI LEDAASPKCI
101 MKEKKKPGET FFMCSCSSDE CNDNIIFSEE YNTSNPDTGG GTHTCPPCPA
151 PELLGGPSVF LFPPKPKDTL MISRTPEVTC VVVDVSHEDP EVKFNWYVDG
201 VEVHNAKTKP REEQYNSTYR VVSVLTVLHQ DWLNGKEYKC KVSNKALPAP
251 IEKTISKAKG QPREPQVYTL PPSRKEMTKN QVSLTCLVKG FYPSDIAVEW
301 ESNGQPENNY KTTPPVLKSD GSFFLYSKLT VDKSRWQQGN VFSCSVMHEA
351 LHNHYTQKSL SLSPGK (서열 번호: 165)
TGFβRIIlong-Fc 폴리펩티드 서열 (서열 번호: 166)은 하기에 나타낸다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 TGFβRIIlong-Fc:ActRIIB-Fc 이형이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (산성 아미노산이 리신으로 대체됨)이 TGFβRIIlong-Fc 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 166의 아미노산 서열이 제공된다.
TGFβRIIlong-Fc 융합 단백질은 다음의 핵산 서열 (서열 번호: 260)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCACGATCCC ACCGCACGTT CAGAAGTCGG
101 ATGTGGAAAT GGAGGCCCAG AAAGATGAAA TCATCTGCCC CAGCTGTAAT
151 AGGACTGCCC ATCCACTGAG ACATATTAAT AACGACATGA TAGTCACTGA
201 CAACAACGGT GCAGTCAAGT TTCCACAACT GTGTAAATTT TGTGATGTGA
251 GATTTTCCAC CTGTGACAAC CAGAAATCCT GCATGAGCAA CTGCAGCATC
301 ACCTCCATCT GTGAGAAGCC ACAGGAAGTC TGTGTGGCTG TATGGAGAAA
351 GAATGACGAG AACATAACAC TAGAGACAGT TTGCCATGAC CCCAAGCTCC
401 CCTACCATGA CTTTATTCTG GAAGATGCTG CTTCTCCAAA GTGCATTATG
451 AAGGAAAAAA AAAAGCCTGG TGAGACTTTC TTCATGTGTT CCTGTAGCTC
501 TGATGAGTGC AATGACAACA TCATCTTCTC AGAAGAATAT AACACCAGCA
551 ATCCTGACAC CGGTGGTGGA ACTCACACAT GCCCACCGTG CCCAGCACCT
601 GAACTCCTGG GGGGACCGTC AGTCTTCCTC TTCCCCCCAA AACCCAAGGA
651 CACCCTCATG ATCTCCCGGA CCCCTGAGGT CACATGCGTG GTGGTGGACG
701 TGAGCCACGA AGACCCTGAG GTCAAGTTCA ACTGGTACGT GGACGGCGTG
751 GAGGTGCATA ATGCCAAGAC AAAGCCGCGG GAGGAGCAGT ACAACAGCAC
801 GTACCGTGTG GTCAGCGTCC TCACCGTCCT GCACCAGGAC TGGCTGAATG
851 GCAAGGAGTA CAAGTGCAAG GTCTCCAACA AAGCCCTCCC AGCCCCCATC
901 GAGAAAACCA TCTCCAAAGC CAAAGGGCAG CCCCGAGAAC CACAGGTGTA
951 CACCCTGCCC CCATCCCGGA AGGAGATGAC CAAGAACCAG GTCAGCCTGA
1001 CCTGCCTGGT CAAAGGCTTC TATCCCAGCG ACATCGCCGT GGAGTGGGAG
1051 AGCAATGGGC AGCCGGAGAA CAACTACAAG ACCACGCCTC CCGTGCTGAA
1101 GTCCGACGGC TCCTTCTTCC TCTATAGCAA GCTCACCGTG GACAAGAGCA
1151 GGTGGCAGCA GGGGAACGTC TTCTCATGCT CCGTGATGCA TGAGGCTCTG
1201 CACAACCACT ACACGCAGAA GAGCCTCTCC CTGTCTCCGG GTAAA
(서열 번호: 260)
성숙 TGFβRIIlong-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 167)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 TIPPHVQKSD VEMEAQKDEI ICPSCNRTAH PLRHINNDMI VTDNNGAVKF
51 PQLCKFCDVR FSTCDNQKSC MSNCSITSIC EKPQEVCVAV WRKNDENITL
101 ETVCHDPKLP YHDFILEDAA SPKCIMKEKK KPGETFFMCS CSSDECNDNI
151 IFSEEYNTSN PDTGGGTHTC PPCPAPELLG GPSVFLFPPK PKDTLMISRT
201 PEVTCVVVDV SHEDPEVKFN WYVDGVEVHN AKTKPREEQY NSTYRVVSVL
251 TVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALPAPIEKTI SKAKGQPREP QVYTLPPSRK
301 EMTKNQVSLT CLVKGFYPSD IAVEWESNGQ PENNYKTTPP VLKSDGSFFL
351 YSKLTVDKSR WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPG K
(서열 번호: 167)
비대칭 Fc 융합 단백질을 이용한 이형다량체 복합체들의 형성을 촉진시키는 제2의 방법에서, 상보적 소수성 상호작용과 추가적인 분자간 이황화결합을 도입하도록 Fc 도메인이 변경된다.
TGFβRIIshort-Fc 폴리펩티드 서열 (서열 번호: 172)은 하기에 나타낸다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 TGFβRIIshort-Fc:ActRIIB-Fc 이형이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (세린이 시스테인으로 그리고 트레오닌이 트립토판으로 대체됨)이 상기 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 172의 아미노산 서열이 제공된다.
성숙 TGFβRIIshort-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 173)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 TIPPHVQKSV NNDMIVTDNN GAVKFPQLCK FCDVRFSTCD NQKSCMSNCS
51 ITSICEKPQE VCVAVWRKND ENITLETVCH DPKLPYHDFI LEDAASPKCI
101 MKEKKKPGET FFMCSCSSDE CNDNIIFSEE YNTSNPDTGG GTHTCPPCPA
151 PELLGGPSVF LFPPKPKDTL MISRTPEVTC VVVDVSHEDP EVKFNWYVDG
201 VEVHNAKTKP REEQYNSTYR VVSVLTVLHQ DWLNGKEYKC KVSNKALPAP
251 IEKTISKAKG QPREPQVYTL PPCREEMTKN QVSLWCLVKG FYPSDIAVEW
301 ESNGQPENNY KTTPPVLDSD GSFFLYSKLT VDKSRWQQGN VFSCSVMHEA
351 LHNHYTQKSL SLSPGK (서열 번호: 173)
본원에서 개시된 특정 Fc 융합 폴리펩티드와 이종이량체 형성을 유도하기 위하여, 2개의 아미노산 치환이 ALK1-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다.
일부 구체예들에서, TGFβRIIlong-Fc 폴리펩티드 서열 (서열 번호: 174)은 하기에 나타낸다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 TGFβRIIlong-Fc:ActRIIB-Fc 이형이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (세린이 시스테인으로 그리고 트레오닌이 트립토판으로 대체됨)이 상기 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 174의 아미노산 서열이 제공된다.
성숙 TGFβRIIlong-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 175)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 TIPPHVQKSD VEMEAQKDEI ICPSCNRTAH PLRHINNDMI VTDNNGAVKF
51 PQLCKFCDVR FSTCDNQKSC MSNCSITSIC EKPQEVCVAV WRKNDENITL
101 ETVCHDPKLP YHDFILEDAA SPKCIMKEKK KPGETFFMCS CSSDECNDNI
151 IFSEEYNTSN PDTGGGTHTC PPCPAPELLG GPSVFLFPPK PKDTLMISRT
201 PEVTCVVVDV SHEDPEVKFN WYVDGVEVHN AKTKPREEQY NSTYRVVSVL
251 TVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALPAPIEKTI SKAKGQPREP QVYTLPPCRE
301 EMTKNQVSLW CLVKGFYPSD IAVEWESNGQ PENNYKTTPP VLDSDGSFFL
351 YSKLTVDKSR WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPG K
(서열 번호: 175)
특정 측면들에 있어서, 본 명세서는 MISRII 폴리펩티드를 포함하는 단백질 복합체들에 관계한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "MISRII"는 임의의 종으로부터 Mㆌllerian 억제 물질 수용체 유형 II (MISRII) 단백질과 이러한 MISRII 단백질로부터 돌연변이 또는 다른 변형에 의해 유래된 변이체 패밀리를 나타낸다. MISRII에 대한 언급은 현재 확인된 형태중 하나를 참조로 한다. MISRII 패밀리의 구성요소는 시스테인-풍부 영역을 갖는 리간드-결합 세포외 도메인, 막경유 도메인, 및 예상 세린/트레오닌 키나제 활성을 갖는 세포질 도메인을 포함하는 막경유 단백질이다.
용어 "MISRII 폴리펩티드"는 뿐만 아니라 MISRII 패밀리 구성원의 자연 발생적 폴리펩티드를 포함하는 폴리펩티드 뿐만 아니라, 유용한 활성을 보유하는 그의 임의의 변이체 (돌연변이체, 단편, 융합체 및 펩티드 유사체를 포함함)를 포함한다.
인간 MISRII 전구체 단백질 서열 (NCBI Ref Seq NP_065434.1)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 MISRII 폴리펩티드 서열은 다음과 같다:
PPNRRTCVFFEAPGVRGSTKTLGELLDTGTELPRAIRCLYSRCCFGIWNLTQDRAQVEMQGCRDSDEPGCESLHCDPSPRAHPSPGSTLFTCSCGTDFCNANYSHLPPPGSPGTPGSQGPQAAPGESIWMAL (서열 번호: 183)
MISRII 전구체 단백질을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 209에 나타내며, 이는 Genbank 기준 서열 NM_020547.2의 뉴클레오티드 81-1799에 상응한다. 세포외 인간 MISRII 폴리펩티드를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 210과 같다.
인간 MISRII 전구체 단백질 서열의 대체 아이소폼, 아이소폼 2 (NCBI Ref Seq NP_001158162.1)은 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 MISRII 폴리펩티드 서열 (아이소폼 2)는 다음과 같다:
PPNRRTCVFFEAPGVRGSTKTLGELLDTGTELPRAIRCLYSRCCFGIWNLTQDRAQVEMQGCRDSDEPGCESLHCDPSPRAHPSPGSTLFTCSCGTDFCNANYSHLPPPGSPGTPGSQGPQAAPGESIWMAL (서열 번호: 184)
상기 MISRII 전구체 단백질 (아이소폼 2)을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 211에 나타내며, Genbank 참조 서열 NM_001164690.1의 뉴클레오티드 81-1514에 상응한다. 프로세스된 가용성 (세포외) 인간 MISRII 폴리펩티드 (아이소폼 2)를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 212와 같다.
인간 MISRII 전구체 단백질 서열의 대체 아이소폼, 아이소폼 3 (NCBI Ref Seq NP_001158163.1)는 다음과 같다:
신호 펩티드는 단일 밑줄로 표시되어 있고; 세포외 영역은 굵은 체로 표시된다.
프로세스된 세포외 MISRII 폴리펩티드 서열 (아이소폼 3)는 다음과 같다:
PPNRRTCVFFEAPGVRGSTKTLGELLDTGTELPRAIRCLYSRCCFGIWNLTQDRAQVEMQGCRDSDEPGCESLHCDPSPRAHPSPGSTLFTCSCGTDFCNANYSHLPPPGSPGTPGSQGPQAAPGESIWMAL (서열 번호: 185)
인간 MISRII 전구체 단백질 (아이소폼 3)을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 213에 나타내며, Genbank 참조 서열 NM_001164691.1의 뉴클레오티드 81-1514에 상응한다. 프로세스된 가용성 (세포외) 인간 MISRII 폴리펩티드 (아이소폼 3)를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 214와 같다.
특정 구체예들에 있어서, 본 명세서는 최소한 하나의 MISRII 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체에 관계하며, 여기에는 이의 단편들, 기능성 변이체들 그리고 변형된 형태들이 포함된다. 바람직하게는 본 발명의 용도에 이용되는 MISRII 폴리펩티드들 (가령, MISRII 폴리펩티드를 포함하는 이형다량체들과 이의 용도들)은 가용성 (가령, MISRII 의 세포외 도메인)이다. 다른 바람직한 구체예들에서, 본 발명의 용도에 이용되는 MISRII 폴리펩티드들은 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드들에 결합하고 및/또는 활성 (가령, Smad 2/3 및/또는 Smad 1/5/8 신호생성 유도)을 억제(길항)한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 180, 183, 181, 184, 182, 또는 185의 아미노산 서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 MISRII 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 이종다량체는 서열 번호: 180, 183, 181, 184, 182, 또는 185의 아미노산 서열에 대하여 최소한 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 동일한 아미노산 서열을 포함하는 최소한 하나의 MISRII 폴리펩티드로 구성되거나, 또는 기본적으로 구성된다.
특정 양태에서, 본 명세서는 MISRII-Fc 융합 단백질을 포함하는 이종다량체에 관계한다. 일부 구체예들에서, 상기 MISRII-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 180, 181, 또는 182의 아미노산 17-24중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 및 24)에서 시작하고, 서열 번호: 180, 181, 또는 182의 아미노산 116-149중 어느 하나 (가령, 아미노산 잔기 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 및 149)에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, MISRII 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 MISRII-Fc 융합 단백질은 열 번호: 180, 181, 또는 182의 아미노산 24-116에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, MISRII 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 MISRII-Fc 융합 단백질은 열 번호: 180, 181, 또는 182의 아미노산 17-149에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, MISRII 도메인을 포함한다. 일부 구체예들에서, 상기 MISRII-Fc 융합 단백질은 서열 번호: 서열 번호: 서열 번호: 180, 183, 181, 184, 182, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 그리고 193중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는, MISRII 도메인을 포함한다.
일부 구체예들에서, 본 명세서는 치료 효과 또는 안정성을 강화시킬 목적으로 (가령, 반감기 증가 및 단백질분해에 대한 저항성 증가), TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 I 수용체 폴리펩티드 (가령, ALK1, ALK2, ALK3, ALK4, ALK5, ALK6, 그리고 ALK7) 및/또는 TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 II 수용체 폴리펩티드 (가령, ActRIIA, ActRIIB, TGFBRII, BMPRII, 그리고 MISRII)의 구조를 변경시켜 기능적 변이체의 제조를 고려한다. 아미노산 치환, 결손, 추가, 또는 이의 조합들에 의해 변이체들이 만들어질 수 있다. 예를 들면, 류신을 이소류신 또는 발린으로 치환, 아스파르테이트를 글루탐산염으로 치환, 트레오닌을 세린으로 치환, 또는 아미노산을 구조적으로 관련된 아미노산 (가령, 보존 돌연변이)으로 단리된 치환은 생성 분자의 생물학적 활성에 주요한 영향을 주지 않을 것으로 합리적으로 예측할 수 있다. 보존 치환은 아미노산 측쇄가 관련된 아미노산 패밀리 안에서 일어나는 것이다. 본 명세서의 폴리펩티드의 아미노산 서열의 변화로 기능적 동소체가 생성되는 지의 여부는 생성된 변이체 폴리펩티드가 이의 야생형 폴리펩티드와 유사한 방식으로 세포 안에서 반응을 만드는 능력, 또는 예를 들면, BMP2, BMP2/7, BMP3, BMP4, BMP4/7, BMP5, BMP6, BMP7, BMP8a, BMP8b, BMP9, BMP10, GDF3, GDF5, GDF6/BMP13, GDF7, GDF8, GDF9b/BMP15, GDF11/BMP11, GDF15/MIC1, TGF-β1, TGF-β2, TGF-β3, 액티빈 A, 액티빈 B, 액티빈 C, 액티빈 E, 액티빈 AB, 액티빈 AC, 액티빈 AE, 액티빈 BC, 액티빈 BE, nodal, 신경아교세포-유도된 신경영샹성 인자 (GDNF), 뉴르투린, 아르테민, 페르세핀, MIS, 및 Lefty을 포함하는 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드들에 결합하는 능력을 평가함으로써 용이하게 결정될 수 있다.
일부 구체예들에서, 본 명세서는 치료 효과 또는 안정성을 강화시킬 목적으로(가령, 반감기 증가 및/또는 단백질분해에 대한 저항성 증가), TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 I 수용체 폴리펩티드 및/또는 TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 II 수용체 폴리펩티드의 구조를 변형시킴으로써, 기능적 변이체의 제조를 고려한다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 상기 폴리펩티드의 당화를 변경시키기 위하여, 본 명세서의 TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 I 수용체 폴리펩티드 (가령, ALK1, ALK2, ALK3, ALK4, ALK5, ALK6, 그리고 ALK7) 및/또는 TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 II 수용체 폴리펩티드 (가령, ActRIIA, ActRIIB, TGFBRII, BMPRII, 그리고 MISRII)의 특이적 돌연변이를 고려한다. 이러한 돌연변이는 하나 또는 그 이상의 당화 부위, 이를 테면 O-연계된 또는 N-연계된 당화 부위를 도입 또는 제거하도록 선택될 수 있다. 아스파라긴-연계된 당화 인지 부위는 일반적으로 적절한 세포의 당화 효소에 의해 특이적으로 인지되는 삼펩티드 서열, 아스파라긴-X-트레오닌 또는 아스파라긴-X-세린 (여기에서 "X"는 임의의 아미노산임)이다. 이러한 변형은 하나 또는 그 이상의 세린 또는 트레오닌 잔기를 상기 폴리펩티드(O-연계된 당화 부위의 경우)에 추가 또는 치환시켜 만들 수도 있다. 당화 인지 부위의 제1 또는 제3 아미노산 위치중 하나 또는 둘 모두에서 다양한 아미노산 치환 또는 결손 (및/또는 제 2 위치에서 아미노산 결손)으로 변형된 삼펩티드 서열에서 비-당화가 초래된다. 폴리펩티드의 탄소화물 모이어티의 수를 증가시키는 다른 수단은 상기 단백질에 화학 또는 효소적으로 글리코시드를 결합시키는 것이다. 이용되는 결합 방식에 따라, 이들 당(들)은 (a) 아르기닌 및 히스티딘; (b) 자유 카르복실기; (c) 자유 술포히드릴기, 이를 테면 시스테인의 기; (d) 자유 히드록실 기, 이를 테면 세린, 트레오닌, 또는 히드록시프롤린; (e) 방향족 잔기, 이를 테면 페닐알라닌, 티로신, 또는 트립토탄의 기; 또는 (f) 글루타민의 아미드 기에 부착될 수 있다. 폴리펩티드 상에 있는 하나 또는 그 이상의 탄수화물 모이어티는 화학적 및/또는 효소적으로 제거될 수 있다. 화학적 탈당화는 예를 들면, 트리플루오로메탄설폰산 또는 이에 등가의 화합물에 대한 폴리펩티드의 노출을 필요할 수 있다. 이 처리는 아미노산 서열을 손상시키지 않으면서, 연계당 (N-아세틸 글루코사민 또는 N-아세틸 갈락토사민)을 제외한 대부분 또는 모든 당을 절단하게 된다. 폴리펩티드상의 탄수화물 모이어티의 효소 절단은 Thotakura et al. [Meth. Enzymol. (1987) 138:350].에서 설명된 바와 같이, 다양한 엔도-및 엑소-글리코시다제의 사용에 의해 이루어질 수 있다. 포유류, 효모, 곤충 및 식물 세포는 모두 펩티드의 아미노산 서열에 의해 영향을 받을 수 있는 상이한 당화 패턴을 도입시킬 수 있기 때문에 폴리펩티드의 서열은 이용되는 발현계 유형에 따라 적절하게 조정될 수 있다. 일반적으로, 인간에 사용하기 위한 본 명세서의 TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 I 및 II 수용체 복합체는 적절한 당화를 제공하는 포유류 세포계, 이를 테면 HEK293 또는 CHO 세포계에서 발현될 수 있지만, 다른 포유류 발현 세포계 또한 마찬가지로 유용할 것으로 예상된다
본 명세서는 돌연변이체, 구체적으로 본 명세서에서 기술된 TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 I 수용체 폴리펩티드 (가령, ALK1, ALK2, ALK3, ALK4, ALK5, ALK6, 그리고 ALK7) 및/또는 TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 II 수용체 폴리펩티드 (가령, ActRIIA, ActRIIB, TGFBRII, BMPRII, 그리고 MISRII)의 복합 돌연변이체, 뿐만 아니라 절두 돌연변이체를 만드는 방법 또한 고려한다. 복합 돌연변이체의 푸울은 기능적으로 활성 (가령, 리간드 결합) TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 I 및/또는 TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 II 수용체 서열을 동정하는데 특히 유용하다. 이러한 복합 라이브러리들을 스크리닝하는 목적은 변경된 성질, 이를 테면 변경된 약동학적 또는 변경된 리간드 결합을 갖는 폴리펩티드들 변이체를 만들기 위함을 수도 있다.. 다양한 스크리닝 분석이 하기에 제공되며, 이러한 분석을 이용하여 변이체들을 평가할 수 있다. TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드가 TGF-베타 슈퍼패밀리 수용체에 결합하는 것을 방지하기 위하여, 및/또는 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드에 의해 야기되는 신호생성을 간섭하기 위하여, 예를 들면, TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 I 및 II 수용체 복합체 변이체는 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드 (가령, BMP2, BMP2/7, BMP3, BMP4, BMP4/7, BMP5, BMP6, BMP7, BMP8a, BMP8b, BMP9, BMP10, GDF3, GDF5, GDF6/BMP13, GDF7, GDF8, GDF9b/BMP15, GDF11/BMP11, GDF15/MIC1, TGF-β1, TGF-β2, TGF-β3, 액티빈 A, 액티빈 B, 액티빈 C, 액티빈 E, 액티빈 AB, 액티빈 AC, 액티빈 BC, 액티빈 AE, 액티빈 BE, nodal, 신경아교세포-유도된 신경영샹성 인자 (GDNF), 뉴르투린, 아르테민, 페르세핀, MIS, 및 Lefty)에 결합하는 능력에 대하여 스크리닝될 수 있다.
본 명세서의 TGF-베타 슈퍼패밀리 이종다량체의 활성은 예를 들면, 세포-기반 또는 생체내 분석에서 또한 테스트될 수 있다. 예를 들면, 근육 세포에서 근육 생성과 관련된 유전자의 발현 또는 단백질의 활성에 있어서 이종다량체 복합체의 효과가 평가될 수 있다. 이것은 필요에 따라, 하나 또는 그 이상의 재조합 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드 단백질 (가령, BMP2, BMP2/7, BMP3, BMP4, BMP4/7, BMP5, BMP6, BMP7, BMP8a, BMP8b, BMP9, BMP10, GDF3, GDF5, GDF6/BMP13, GDF7, GDF8, GDF9b/BMP15, GDF11/BMP11, GDF15/MIC1, TGF-β1, TGF-β2, TGF-β3, 액티빈 A, 액티빈 B, 액티빈 C, 액티빈 E, 액티빈 AB, 액티빈 AC, 액티빈 BC, 액티빈 AE, 액티빈 BE, nodal, 신경아교세포-유도된 신경영샹성 인자 (GDNF), 뉴르투린, 아르테민, 페르세핀, MIS, 및 Lefty)의 존재하에 실행될 수 있고, 그리고 TGF-베타 슈퍼패밀리 유형 I 및 II 수용체 복합체, 그리고 임의선택적으로, TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드를 만들기 위하여 세포는 형질감염될 수 있다. 마찬가지로, 본 명세서의 이종다량체 복합체는 마우스 또는 다른 동물에게 투여될 수 있으며, 하나 또는 그 이상의 측정, 이를 테면 근육 형성 및 강도는 당분야에서 인지된 방법들을 이용하여 평가될 수 있다. 유사하게, 이형다량체, 또는 이의 변이체들의 활성은 골모세포, 지방세포, 및/또는 이들 세포의 성생에 임의의 효과를 위한 신경 세포에서 예를 들면, 본 명세서에서 설명된 바와 같이 분석과 당분야의 공통적인 지식에 의해 테스트될 수 있다. SMAD-반응성 리포터 유전자를 이러한 세포계에서 이용하여 하류 신호생성에 대한 효과를 모니터할 수 있다.
기준 TGF-베타 슈퍼패밀리 이형다량체와 비교하여 선택성이 증가된 또는 전반적으로 효능이 증가된 복합-유도된 변이체가 만들어질 수 있다. 이러한 변이체들은 재조합 DNA 구조체로부터 발현될 때, 유전자 요법 프로토콜에 이용될 수 있다. 마찬가지로, 돌연변이유발은 대응하는 변형안된 TGF-베타 슈퍼패밀리 이종다량체와 상당히 상이한 세포내 반감기를 갖는 변이체를 만들 수 있다. 예를 들면, 변형된 단백질은 변형되지 않은 폴리펩티드의 파괴 또는 그렇지 않으면 불활성화를 초래하는 단백질분해 또는 다른 세포 과정에 더 안정적이거나 덜 안정적이 될 수 있다. 이러한 변이체 및 이들을 코딩하는 유전자는 폴리펩티드의 반감기를 조절함으로써 폴리 펩티드 복합체 수준을 변경 시키는데 이용 될 수 있다. 예를 들면, 짧은 반감기는 더욱 일시적인 생물학적 효과를 일으킬 수 있고, 유도성 발현 시스템의 일부는 세포 안에 재조합 폴리펩티드 복합체 수준을 더 엄밀하게 조절할 수 있다. Fc 융합 단백질에서, 예를 들면, 면역원성, 반감기, 및 용해도를 포함하는 TGF-베타 슈퍼패밀리 이종다량체 복합체의 하나 또는 그 이상의 활성을 변경시키기 위하여 링커(존재한다면) 및/또는 Fc 부분에 돌연변이를 만들 수 있다.
본 명세서의 이종다량체.당업계에 공지된 많은 방법을 사용하여 본 발명의 명세서의 이종다량체를 생성시킬 수 있다. 예를 들면, 제 1 폴리펩티드 (가령, 변이체 ActRIIB)에 있는 자연 발생적 아미노산을 자유 티올-함유하는 잔기, 이를 테면 시스테인로 대체하여, 이러한 자유 티올이 제 2 폴리펩티드 (가령, 가령, 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드 또는 상기 제 1 폴리펩티드에 존재하는 것과는 상이한 변이체 ActRIIB 폴리펩티드)에 있는 또다른 자유 티올-함유하는 잔기과 반응하고, 이황화결합이 제 1 폴리펩티드와 제 2 폴리펩티드들 사이에 형성되도록 함으로써, 비-자연 발생적 이황화결합이 구축될 수 있다. 이형다량체 형성을 촉진시키는 상호작용의 추가 예로는 Kjaergaard et al., WO2007147901에서 설명된 이온 상호작용; Kannan et al., U.S.8,592,562에서 설명된 정전기적 스티어링; Christensen et al., U.S.20120302737에서 설명된 코일드-코일 상호작용; Pack & Plueckthun,(1992) Biochemistry 31: 1579-1584에서 설명된 류진 지퍼; Pack et al., (1993) Bio/Technology 11: 1271-1277에서 설명된 나선-턴-나선 모티프를 포함하나, 이에 국한되지 않는다. 다양한 세그먼트(segments)의 연계는 가령, 공유 결합 이를 테면 화학적 교차-연계, 펩티드 링커, 이황화물 다리 등을 통하여 얻어지거나, 또는 친화력 상호작용, 이를 테면 아비딘-비오틴 또는 류신 지퍼 기술에 의해 획득될 수 있다.
특정 측면들에 있어서, 다량체화 도메인은 상호작용 짝의 하나의 성분을 포함할 수 있다. 일부 구체예들에 있어서, 본 명세서의 폴리펩티드들은 단백질 복합체들은 제 2 폴리펩티드와 공유 또는 비-공유적으로 연합된 제 1 폴리펩티드를 포함하는 단백질 복합체를 형성할 수 있으며, 이때 제 1 폴리펩티드는 변이체 ActRIIB 폴리펩티드와 상기 상호작용 짝(pair)의 제 1 구성요소의 아미노산 서열을 포함하며, 그리고 제 2 폴리펩티드는변형안된 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 상기 제1 폴리펩티드에 존제하는 것과는 상이한 변이체 ActRIIB 폴리펩티드의 아미노산 서열을 포함하고, 그리고 상기 상호작용 짝의 제 2 구성요소의 아미노산 서열을 포함한다. 상기 상호작용 짝은 복합체, 구체적으로, 이형이량체 복합체 복합체를 형성하기 위하여 상호작용하는 임의의 2개 폴리펩티드 서열일 수 있지만, 작업 구체예에서는 또한 동형이량체 복합체를 형성하는 상호작용 짝이 이용될 수도 있다. 개선된 성질/활성 이를 테면, 증가된 혈청 반감기를 부여하거나, 또는 개선된 성질/활성을 제공하기 위하여 또다른 모이어티가 부착된 어뎁터로 작용하는 상호작용 짝이 선택될 수 있다. 예를 들면, 폴리에틸렌 글리콜 모이어티는 개선된 성질/활성, 이를 테면 개선된 혈청 반감기를 제공하기 위하여 상호작용 짝의 한 성분 또는 양쪽 성분에 부착될 수 있다.
상호작용 짝의 제 1 및 제 2 구성요소는 비대칭 짝일 수도 있는데, 이것은 구성요소들이 자가-연합보다는 서로 선호적으로 연합된다는 것을 의미한다. 따라서, 비대칭 상호작용 짝의 제 1 및 제2 구성요소들은 이형이량체 복합체를 만들 수 있다. (가령, 도 1b 참고). 대안으로, 상호작용 쌍은 비유도될 수 있는데, 이것은 상기 쌍의 구성원들이 실제적인 선호 없이 서로 연관되거나 또는 자가-연관될 수 있고, 그리고 따라서, 동일하거나 상이한 아미노산 서열을 가질 수 있다는 것을 의미한다(가령, 도 1a 참고). 따라서, 비유도된 상호작용 쌍의 첫 번째와 두 번째 구성원은 연관하여 동종이합체성 복합체 또는 이형이합체성 복합체를 형성할 수 있다. 임의선택적으로, 상호작용 짝(가령, 비대칭 짝 또는 비유도 상호작용 짝)의 제 1 구성 요소는 상호작용 짝의 제 2 구성요소와 공유적으로 연합한다. 임의선택적으로, 상호작용 짝(가령, 비대칭 짝 또는 비유도 상호작용 짝)의 제 1 구성 요소는 상호작용 짝의 제 2 구성요소와 비-공유적으로 연합한다.
특정한 실례로서, 본 발명은 면역글로불린의 불변 도메인, 예를 들면, 면역글로불린의 CH1, CH2 또는 CH3 도메인 또는 Fc를 포함하는 폴리펩티드에 융합된 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 융합 단백질을 제공한다. 인간 IgG1, IgG2, IgG3, 및 IgG4로부터 유도된 Fc 도메인이 본 명세서에서 제공된다. CDC 또는 ADCC 활성을 감소시키는 다른 돌연변이들이 공지되어 있고, 집합적으로 이들 임의의 변이체은 본 명세서에 포함되며, 본 명세서의 이형이량체의 유익한 성분으로 이용될 수 있다. 임의선택적으로, 서열 번호: 13의 IgG1 Fc 도메인은 잔기, 이를 테면 Asp-265, Lys-322, 및 Asn-434 (대응하는 전장 IgG1에 따라 번호매김됨)에서 하나 또는 그 이상의 돌연변이를 갖는다. 특정 경우들에서, 하나 또는 그 이상의 이들 돌연변이 (가령, Asp-265 돌연변이)를 갖는 변이체 Fc 도메인은 야생형 Fc 도메인와 비교하여 Fcγ 수용체에 대한 결합 능력이 감소된다. 다른 경우들에서, 하나 또는 그 이상의 이들 돌연변이 (가령, Asn-434 돌연변이)를 갖는 변이체 Fc 도메인은 야생형 Fc 도메인와 비교하여 MHC 부류 I-관련된 Fc-수용체 (FcRN)에 결합하는 능력이 증가된다.
인간 IgG1 (G1Fc)의 Fc 부분에 이용될 수 있는 고유한 아미노산 서열은 하기에 예시된다 (서열 번호: 13). 점선은 힌지 영역을 나타내며, 직선은 자연 발생적 변이체를 갖는 위치를 나타낸다. 부분적으로, 본 명세서는 서열 번호: 13에 대하여 70%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하거나, 이들로 필수적으로 구성되거나, 또는 구성되는 폴리펩티드를 제공한다. G1Fc에서 자연 발생적 변이체는 서열 번호: 13에서 이용된 넘버링 체계에 따라 E134D 및 M136L을 포함할 수 있다(Uniprot P01857 참고).
인간 IgG2 (G2Fc)의 Fc 부분에 이용될 수 있는 고유한 아미노산 서열은 하기에 예시된다 (서열 번호: 14). 점선은 힌지 영역을 나타내며, 이중 밑줄은 이 서열에서 데이터 베이스가 충돌하는 위치를 나타낸다 (UniProt P01859). 부분적으로, 본 명세서는 서열 번호: 14에 대하여 70%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하거나, 이들로 필수적으로 구성되거나, 또는 구성되는 폴리펩티드를 제공한다.
인간 IgG3 (G3Fc)의 Fc 부분에 이용도리 수 있는 2가지 예시 아미노산 서열을 하기에 나타낸다. G3Fc의 힌지 영역은 다른 Fc 쇄의 길이의 최대 4배가 될 수 있고, 유사한 17개-잔기 세그먼트를 앞세우고, 3개의 동일한 15개-잔기 세그먼트를 포함한다. 하기에 나타낸 제 1 G3Fc 서열(서열 번호: 15)은 단일 15개-잔기 세그먼트로 구성된 짧은 힌지 영역을 포함하며, 반면 제 2 G3Fc 서열 (서열 번호: 16)은 전장 힌지 영역을 포함한다. 각 경우에서, 점선은 힌지 영역을 나타내며, 직선은 UniProt P01859에 따른 자연 발생적 변이체를 갖는 위치를 나타낸다. 부분적으로, 본 명세서는 서열 번호: 15 및 16에 대하여 70%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하거나, 이들로 필수적으로 구성되거나, 또는 구성되는 폴리펩티드를 제공한다.
G3Fc (예를 들면, Uniprot P01860)에서 자연 발생적 변이체들은 서열 번호: 15에 이용된 넘버링 체계로 전환될 때 E68Q, P76L, E79Q, Y81F, D97N, N100D, T124A, S169N, S169del, F221Y를 포함하며, 본 명세서는 이들 변이중 하나 또는 그 이상을 함유하는 G3Fc 도메인이 포함된 융합 단백질을 제공한다. 또한, 인간 면역글로불린 IgG3 유전자 (IGHG3)는 상이한 힌지 길이에 의해 특징화되는 구조적 다형태를 나타낸다[Uniprot P01859]. 특히, 변이체 WIS는 대부분의 V 영역과 모든 CH1 영역이 부족하다. 힌지 영역에 정상적으로 존재하는 11개에 추가하여 위치 7에 여분의 쇄간 이황화결합이 있다. 변이체 ZUC는 대부분의 V 영역, 모든 CH1 영역, 그리고 일부 힌지가 부족하다. 변이체 OMM은 대립형질 형태 또는 또다른 감마 쇄 하위부류를 나타낼 수 있다. 본 명세서는 하나 또는 그 이상의 이들 변이체를 함유하는 G3Fc 도메인이 포함된 추가적인 융합 단백질을 제공한다.
인간 IgG4 (G4Fc)의 Fc 부분에 이용될 수 있는 고유한 아미노산 서열은 하기에 예시된다 (서열 번호: 17). 점선은 힌지 영역을 나타낸다. 부분적으로, 본 명세서는 서열 번호: 17에 대하여 70%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하거나, 이들로 필수적으로 구성되거나, 또는 구성되는 폴리펩티드를 제공한다.
Fc 도메인 안에 다양하게 조작된 돌연변이는 G1Fc 서열 (서열 번호: 13)에 대하여 나타내며, G2Fc, G3Fc, 및 G4Fc에서 유사 돌연변이는 도 4에서 G1Fc와의 배열로부터 유도될 수 있다. 부등한 힌지 길이로 인해, 아이소타입 정렬 (도 4)에 근거된 유사한 Fc 위치는 서열 번호: 13, 14, 15, 그리고 17에서 상이한 아미노산 번호를 소유한다. 힌지, CH2, 및 CH3 영역 (가령, 서열 번호: 13, 14, 15, 16, 또는 17)으로 구성된 면역글로불린 서열에서 주어진 아미노산 위치는 Uniprot 데이타베이스와 같이, IgG1 중쇄 불변 도메인 (CH1, 힌지, CH2, 및 CH3 영역으로 구성됨) 전체를 포괄할 때, 동일한 위치가 아닌 상이한 번호로 확인될 것이라는 것을 또한 인지할 수 있을 것이다 예를 들면, 인간 G1Fc 서열 (서열 번호: 13), 인간 IgG1 중쇄 불변 도메인 (Uniprot P01857), 및 인간 IgG1 중쇄에서 선택된 CH3 위치 간의 대응성은 다음과 같다.
단일 세포계로부터 비대칭 면역글로불린-기반의 단백질의 대량 생산에서 발생되는 문제는 "쇄 연합 문제"로 알려져 있다. 이중특이적 항체의 생산에서 주로 직면하는 바와 같이, 쇄 연합 문제는 상이한 중쇄 및/또는 경쇄가 단일 세포주에서 생성될 때 본질적으로 얻어지는 다수의 조합 중에서 원하는 다중 결합 단백질을 효율적으로 생산하려는 도전에 관한 것이다 [Klein et al (2012) mAbs 4:653-663 참고]. 이 문제는 두 개의 다른 중쇄와 두 개의 다른 경쇄가 동일한 세포에서 생산될 때 가장 심각한데, 이 경우 일반적으로 단 하나만을 원할 때, 총 16 개의 가능한 사슬 조합이 있다 (비록 일부는 동일하지만). 그럼에도 불구하고, 동일한 원리는 오직 2 개의 상이한 (비대칭) 중쇄를 혼입시키는 원하는 다중쇄 융합 단백질의 수율 감소를 설명한다.
허용가능한 수율로 바람직한 비대칭 융합 단백질을 생산하기 위해 단일 세포주에서 Fc-함유 융합 폴리펩티드 쇄의 바람직한 페어링을 증가시키는 다양한 방법이 당업계에 공지되어있다[예를 들면, Klein et al (2012) mAbs 4:653-663; 및 Spiess et al (2015) Molecular Immunology 67(2A): 95-106 참고]. Fc-함유 쇄들의 바람직한 페어링을 얻는 방법은 하전-기반의 페어링 (정전기적 스티어링), "노브-인투-홀(knobs-into-holes)" 입체적 페어링, SEEDbody 페어링, 및 류신 지퍼-기반의 페어링을 포함하나, 이에 국한되지 않는다.[예를 들면, Ridgway et al (1996) Protein Eng 9:617-621; Merchant et al (1998) Nat Biotech 16:677-681; Davis et al (2010) Protein Eng Des Sel 23:195-202; Gunasekaran et al (2010); 285:19637-19646; Wranik et al (2012) J Biol Chem 287:43331-43339; US5932448; WO 1993/011162; WO 2009/089004, 및 WO 2011/034605 참고 본원에서 기술된 바와 같이, 이들 방법을 이용하여, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 및 또다른, 임의선택적으로 상이한, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 이종다량체를 만들 수 있다.
예를 들면, 이를 테면 Arathoon et al., U.S.7,183,076 및 Carter et al., U.S.5,731,168에서 설명된 바와 같이, 구멍에 맞는 돌기(protuberance-into-cavity) (노브-인투-홀) 상보적 영역을 작제함으로써 특정 폴리펩티드간의 상호작용이 촉진될 수 있다. "돌기(Protuberances)"는 제 1 폴리펩티드 (가령, 제 1 상호작용 짝)의 경계면의 작은 아미노산 측쇄를 더 큰 측쇄 (가령, 티로신 또는 트립토판)로 대체함으로써 구축된다. 상기 돌기에 동일한 또는 더 작은 크기의 상보적 "구멍"은 제 2 폴리펩티드 (가령, 제 2 상호작용 짝)의 경계면에서 큰 아미노산 측쇄를 더 작은 측쇄 (가령, 알라닌 또는 트레오닌)로 대체함으로써 임의선택적으로 만든다. 제 1 또는 제 2 폴리펩티드의 경계면에 적절하게 위치되고, 적합한 크기의 돌기 또는 구멍이 존재하는 경우, 인접한 경계면에서 각각 대응하는 구멍 또는 돌기만 제조하면 된다.
중성 pH (7.0)에서, 아스파르트산 및 글루탐산은 음으로 하전되며, 리신, 아르기닌 및 히스티딘은 양으로 하전된다. 이들 하전된 잔기를 이용하여 이형이량체 형성을 촉진시키고, 동시에 동형이량체 형성을 방해할 수 있다. 인력 상호작용은 반대 하전 간에 일어나며, 척력 상호작용은 유사한 하전 사이에 발생된다. 부분적으로, 본 명세서에서 공개된 단백질 복합체들은 하전된 경계면 잔기의 부위 지향된 돌연변이유발을 실행함으로써,이형다량체 형성 (가령, 이형이량체 형성)을 촉진시키는 인력 상호작용, 그리고 임의선택적으로 동형이량체 형성 (가령, 동형이량체 형성)을 방해하는 척력 상호작용을 이용한다.
예를 들면, IgG1 CH3 도메인 경계면은 도메인-도메인 상호작용: Asp356-Lys439', Glu357-Lys370', Lys392-Asp399', 및 Asp399-Lys409' [제 2 쇄에서 잔기 넘버링은 (')로 표시됨]에 관여하는 4가지 독특한 하전 잔기 짝을 포함한다. IgG1 CH3 영역의 잔기를 지정하기 위해 여기에 사용된 넘버링 체계는 Kabat의 EU 번호 체계에 부합함을 유의해야 한다. CH3-CH3 도메인 상호 작용에 존재하는 2-배 대칭 때문에, 각각의 독특한 상호 작용은 구조에서 두 번 나타난다 (가령, Asp-399-Lys409' 및 Lys409-Asp399'). 야생형 서열, K409-D399'는 이형이량체와 동형이량체 형성을 모두 선호한다. 제 1 쇄에서 전하 극성을 전환시키는 단일 돌연변이 (예 : K409E; 양전하를 음전하로)는 제 1 쇄 동형이량체 형성에 바람직하지 않은 상호 작용을 유도한다. 부적절한 상호작용은 동일한 전하 사이에 발생하는 척력 작용으로 인해 발생한다(음성-음성; K409E-D399'과 D399-K409E'). 제 2 쇄에서 전하 극성을 전환시키는 단일 돌연변이 (D399K'; 음전하를 양전하로)는 제 2 쇄 동형이량체 형성에 바람직하지 않은 상호 작용을 유도한다(K409'-D399K'와 D399K-K409') . 그러나, 동시에 이들 두 돌연변이 (K409E와 D399K')는 이형이량체 형성에 대한 우호적인 상호작용 (K409E-D399K'와 D399-K409')을 유도한다.
이형이량체 형성 및 동형이량체 방지에 있어서 정전기 스티어링 효과는 추가적인 전하 잔기의 돌연변이에 의해 추가로 강화될 수 있는데, 이들은 제 2 쇄에서 예를 들면, Arg355 및 Lys360을 포함하는 반대 하전된 잔기와 페어링되거나, 또는 되지 않을 수 있다. 상기 이종다량체의 이종다량체 형성을 향상시키기 위해 단독으로 또는 조합하여 사용될 수 있는 가능한 전하 변화 돌연변이를 열거한다.
일부 구체예들에 있어서, 본 출원의 융합 단백질에서 CH3-CH3 경계면을 만드는 하나 또는 그 이상의 잔기는 하전된 아미노산으로 대체되고, 따라서 상호작용은 정전기적으로 비선호적으로 된다. 예를 들면, 경계면에 있는 양-하전된 아미노산 (가령, 리신, 아르기닌, 또는 히스티딘)은 음으로 하전된 아미노산 (가령, 아스파르트산 또는 글루탐산)으로 대체된다. 전술한 치환에 대한 대안으로, 또는 이와 복합되어, 경계면에서 음으로-하전된 아미노산은 양으로-하전된 아미노산으로 대체된다. 특정 구체예들에 있어서, 상기 아미노산은 원하는 하전 특징을 갖는 비-자연 발생적 아미노산으로 대체된다. 음으로 하전된 잔기 (Asp 또는 Glu)를 His으로 돌연변이시키면, 측쇄 부피가 증가되고, 이는 입체적 문제를 야기할 수 있음을 주지해야 한다. 더욱이, His 양성자 공여자-및 수용자-형태는 국소 환경에 따라 달라진다. 이러한 문제는 설계 전략과 함께 고려되어야 한다. 경계면 잔기는 인간 및 마우스 IgG 하위부류에서 매우 보존되어 있기 때문에, 본 명세서에서 공개된 정전기 스티어링 효과는 인간 및 마우스 IgG1, IgG2, IgG3, 및 IgG4에 적용될 수 있다. 이 전략은 또한 CH3 도메인 경계면에서 하전되지 않은 잔기를 하전된 잔기로 변형시키는 것으로 확장될 수 있다.
부분적으로, 본 명세서는 전하 페어링 (정전기적 스티어링)에 근거하여 상보적으로 작제된 Fc 서열을 이용한 비대칭 Fc-함유 폴리펩티드 쇄들의 바람직한 페어링을 제공한다. 정전 상보성을 갖는 한 쌍의 Fc 서열 중에서 하나는 임의선택적 링커가 있거나 또는 없이, 이 구조체의 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드에 임의적으로 융합되어, 변이체 ActRIIB-Fc 또는 변형안된 ActRIIB-Fc 융합 폴리펩티드를 만들 수 있다. 이 단일 쇄는 원하는 다중-쇄 구조체(가령, 변이체 ActRIIB-Fc 이종다량체) 생성을 선호하는 상기 제 1 Fc 서열에 상보적인 Fc 서열과 함께 선택 세포에서 공동-발현될 수 있다. 정전기적 스티어링에 기반을 둔 본 실시예에서, 서열 번호: 200 [인간 G1Fc(E134K/D177K)] 및 서열 번호: 201 [인간 G1Fc(K170D/K187D)]는 상보적 Fc 서열의 예가 되며, 이때 조작된 아미노산 치환은 이중 밑줄로 나타내며, 그리고 이 구조체의 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 18 또는 서열 번호: 19에 융합될 수 있지만, 이들 모두에 융합되지는 않는다. 고유의 hG1Fc, 고유의 hG2Fc, 고유의 hG3Fc, 및 고유의 hG4Fc 간에 아미노산 동일성 수준이 높다면, hG2Fc, hG3Fc, 또는 hG4Fc의 대응하는 위치에서 아미노산 치환 (도 4)으로 상보적 Fc 짝이 생성되며, 이는 하기 상보적 hG1Fc 짝(서열 번호: 18 및 19)을 대신하여 이용될 수 있음을 인지할 것이다.
부분적으로, 본 명세서는 입체적 상보성에 근거하여 상보적으로 작제된 Fc 서열을 이용한 비대칭 Fc-함유 폴리펩티드 쇄들의 바람직한 페어링을 제공한다. 부분적으로, 본 명세서는 입체적 상보성의 예로써 노브-인투-홀 페어링(knobs-into-holes pairing)을 제공한다. 공간적 상보성을 갖는 한 쌍의 Fc 서열 중에서 하나는 임의선택적 링커가 있거나 또는 없이, 이 구조체의 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드에 임의적으로 융합되어, 변이체 ActRIIB-Fc 또는 변형안된 ActRIIB-Fc 융합 폴리펩티드를 만들 수 있다. 이 단일 쇄는 원하는 다중-쇄 구조체 생성을 선호하는 제1 Fc에 상보적인 Fc 서열과 함께 선택 세포에서 공동-발현될 수 있다. 노브-인투-홀 대합에 근거된 이러한 실례에서, 서열 번호: 20 [인간 G1Fc(T144Y)] 및 서열 번호: 21 [인간 G1Fc(Y185T)]는 상보성 Fc 서열의 실례인데, 여기서 가공된 아미노산 치환은 이중 밑줄 표시되고, 그리고 이 구조체의 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 20 또는 서열 번호:21에 융합될 수 있지만, 둘 모두에 융합되지는 않는다. 고유의 hG1Fc, 고유의 hG2Fc, 고유의 hG3Fc, 및 고유의 hG4Fc 간에 아미노산 동일성 수준이 높다면, hG2Fc, hG3Fc, 또는 hG4Fc의 대응하는 위치에서 아미노산 치환 (도 4)으로 상보적 Fc 짝이 생성되며, 이는 하기 상보적 hG1Fc 짝(서열 번호: 20 및 21)을 대신하여 이용될 수 있음을 인지할 것이다.
조작된 이황화결합과 복합된 노브-인투-홀 페어링에 근거한 Fc 상보성의 예는 서열 번호: 22 [hG1Fc(S132C/T144W)] 및 서열 번호: 23 [hG1Fc(Y127C/T144S/L146A/Y185V)]에서 공개된다. 상기 조작된 아미노산 치환은 이중 밑줄로 나타내며, 그리고 이 구조체의 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 22 또는 서열 번호: 23에 융합될 수 있지만, 이들 모두에 융합되지는 않는다. 고유의 hG1Fc, 고유의 hG2Fc, 고유의 hG3Fc, 및 고유의 hG4Fc 간에 아미노산 동일성 수준이 높다면, hG2Fc, hG3Fc, 또는 hG4Fc의 대응하는 위치에서 아미노산 치환 (도 4)으로 상보적 Fc 짝이 생성되며, 이는 하기 상보적 hG1Fc 짝(서열 번호: 22 및 23)을 대신하여 이용될 수 있음을 인지할 것이다.
부분적으로, 본 명세서는 인간 IgG의 β-가닥 세그먼트와 IgA CH3 도메인이 서로 맞물리게 되도록 작제된 Fc 서열을 이용한 비대칭 Fc-함유 폴리펩티드 쇄들의 바람직한 페어링을 제공한다 이러한 방법들은 가닥-교환 조작된(engineered) 도메인 (SEED) CH3 이형이량체를 이용하여 SEEDbody 융합 단백질이 형성되는 것을 포함한다 [예를 들면, Davis et al (2010) Protein Eng Design Sel 23:195-202 참고]. SEEDbody 상보성을 갖는 한 쌍의 Fc 서열 중에서 하나는 임의선택적 링커가 있거나 또는 없이, 이 구조체의 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드에 임의적으로 융합되어, 변이체 ActRIIB-Fc 또는 변형안된 ActRIIB-Fc 융합 폴리펩티드를 만들 수 있다. 이 단일 쇄는 원하는 다중-쇄 구조체 생성을 선호하는 제1 Fc에 상보적인 Fc 서열과 함께 선택 세포에서 공동-발현될 수 있다. SEEDbody (Sb) 대합에 근거된 이러한 실례에서, 서열 번호: 29 [hG1Fc(SbAG)] 및 서열 번호: 30 [hG1Fc(SbGA)]은 상보성 IgG Fc 서열의 실례인데, 여기서 IgA Fc로부터 가공된 아미노산 치환은 이중 밑줄 표시되고, 그리고 이 구조체의 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 24 또는 서열 번호: 25에 융합될 수 있지만 둘 모두에 융합되지는 않는다. 고유의 hG1Fc, 고유의 hG2Fc, 고유의 hG3Fc, 및 고유의 hG4Fc 간에 아미노산 동일성 수준이 높다면, hG1Fc, hG2Fc, hG3Fc, 또는 hG4Fc의 대응하는 위치에서 아미노산 치환 (도 4)으로 Fc 단량체가 생성되며, 이는 하기 상보적 IgG-IgA 쌍(서열 번호: 24 및 25)을 대신하여 이용될 수 있음을 인지할 것이다.
부분적으로, 본 명세서는 Fc CH3 도메인의 C-말단에 부착된 절단가능한 류신 지퍼 도메인를 갖는 비대칭 Fc-함유 폴리펩티드 쇄의 바람직한 페어링을 제공한다. 류신 지퍼의 부착은 이형이량체성 항체 중쇄들의 선호적 어셈블리를 제공하는데 충분하다. 가령, Wranik et al (2012) J Biol Chem 287:43331-43339 참고. 본 명세서에서 기술된 바와 같이, 류신 지퍼-형성 가닥에 부착된 Fc 서열 쌍중 하나는 임의선택적 링커가 있거나 또는 없이, 이 구조체의 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드에 임의적으로 융합되어, 변이체 ActRIIB-Fc 또는 변형안된 ActRIIB-Fc 융합 폴리펩티드를 만들 수 있다. 이 단일 쇄는 원하는 다중-쇄 구조체 생성을 선호하는 상보적 류신 지퍼-형성 가닥에 부착된 Fc 서열과 함께 선택 세포에서 공동-발현될 수 있다. 정제 후 박테리아 엔도단백질분해효소 Lys-C로 이 구조체의 단백질분해성 절단으로 류신 지퍼 도메인이 방출되며, 고유의 Fc의 구조와 동일한 Fc 구조체가 생성된다. 류신 지퍼 페어링에 기반을 둔 본 실시예에서, 서열 번호: 26 [hG1Fc-Ap1 (산성)] 및 서열 번호: 27 [hG1Fc-Bp1 (염기성)]는 상보적 IgG Fc 서열의 예가 되며, 이때 조작된 상보적 류신 지퍼 서열은 밑줄로 표시되며, 그리고 이 구조체의 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 야생형 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 26 또는 서열 번호: 27에 융합될 수 있지만, 이들 모두에 융합되지는 않는다. 고유의 hG1Fc, 고유의 hG2Fc, 고유의 hG3Fc, 및 고유의 hG4Fc 간에 아미노산 동일성 수준이 높다면, hG1Fc, hG2Fc, hG3Fc, 또는 hG4Fc에 임의선택적 링커와 함께 또는 링커없이 부착된 류신 지퍼-형성 서열 (도 4)은 하기 상보적 류신 지퍼-형성 짝(서열 번호: 26 및 27)에 이용될 수 있는 Fc 단량체를 만들 수 있음을 인지할 것이다.
1 THTCPPCPAP ELLGGPSVFL FPPKPKDTLM ISRTPEVTCV VVDVSHEDPE
51 VKFNWYVDGV EVHNAKTKPR EEQYNSTYRV VSVLTVLHQD WLNGKEYKCK
101 VSNKALPAPI EKTISKAKGQ PREPQVYTLP PSREEMTKNQ VSLTCLVKGF
151 YPSDIAVEWE SNGQPENNYK TTPPVLDSDG SFFLYSKLTV DKSRWQQGNV
201 FSCSVMHEAL HNHYTQKSLS LSPGKGGSAQ LEKELQALEK ENAQLEWELQ
251 ALEKELAQGA T (서열 번호: 26)
1 THTCPPCPAP ELLGGPSVFL FPPKPKDTLM ISRTPEVTCV VVDVSHEDPE
51 VKFNWYVDGV EVHNAKTKPR EEQYNSTYRV VSVLTVLHQD WLNGKEYKCK
101 VSNKALPAPI EKTISKAKGQ PREPQVYTLP PSREEMTKNQ VSLTCLVKGF
151 YPSDIAVEWE SNGQPENNYK TTPPVLDSDG SFFLYSKLTV DKSRWQQGNV
201 FSCSVMHEAL HNHYTQKSLS LSPGKGGSAQ LKKKLQALKK KNAQLKWKLQ
251 ALKKKLAQGA T (서열 번호: 27)
부분적으로, 본 명세서는 원하는 이형 종의 정제를 용이하게 하기 위하여, Fc 도메인에 추가 돌연변이와 함께 복합되어, 상기 기술된 방법에 의해여 비대칭 Fc-함유 폴리펩티드 쇄의 바람직한 페어링을 제공한다. 실시예는 하나의 Fc-함유 폴리펩티드 쇄에서 2개의 음전하 아미노산(아스파르트산 또는 글루탐산)과 상보적 Fc-함유 폴리펩티드 쇄에서 2개의 양전하 아미노산(가령, 아르기닌)의 추가 치환과 함께 (서열 번호: 28-29), 서열 번호: 22 및 23에 기재된 바와 같이, 조작된 이황화결합과 복합하여 노브-인투-홀 페어링에 기초하여 Fc 도메인의 상보성을 이용한다. 이러한 4 가지 아미노산 치환은 등전점 또는 순(net) 분자 전하의 차이에 기초하여, 이종 폴리펩티드 혼합물로부터 원하는 이종(heteromeric) 융합 단백질의 선택적 정제를 용이하게 한다. 상기 조작된 아미노산 치환은 이중 밑줄로 나타내며, 그리고 이 구조체의 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 28 또는 서열 번호: 29에 융합될 수 있지만, 이들 모두에 융합되지는 않는다. 고유의 hG1Fc, 고유의 hG2Fc, 고유의 hG3Fc, 및 고유의 hG4Fc 간에 아미노산 동일성 수준이 높다면, hG2Fc, hG3Fc, 또는 hG4Fc의 대응하는 위치에서 아미노산 치환 (도 4)으로 상보적 Fc 짝이 생성되며, 이는 하기 상보적 hG1Fc 짝(서열 번호: 28-29)을 대신하여 이용될 수 있음을 인지할 것이다.
또다른 실시예는 하나의 Fc-함유 폴리펩티드 쇄 (서열 번호: 30)의 위치 213에서 히스티딘을 아르기닌으로 치환과 함께, 서열 번호: 22-23에 기술된 바와 같이, 조작된 이황화결합과 복합된 노브-인투-홀 페어링에 기초한 Fc 도메인의 상보성과 관련된다. 이 치환 (Kabat et al.의 번호매김 시스템에서 H435R)은 단백질 A에 대한 친화력 차이에 근거하여 바람직하지 못한 동종이량체로부터 원하는 이종이량체의 분리를 용이하게 한다. 조작된 아미노산 치환은 이중 밑줄로 나타내며, 그리고 이 구조체의 제 1 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 제 2 변이체 ActRIIB 폴리펩티드, 또는 변형안된 ActRIIB 폴리펩티드는 서열 번호: 30 또는 서열 번호: 23에 융합될 수 있지만, 이들 모두에 융합되지는 않는다. 고유의 hG1Fc, 고유의 hG2Fc, 고유의 hG3Fc, 및 고유의 hG4Fc 간에 아미노산 동일성 수준이 높다면, hG2Fc, hG3Fc, 또는 hG4Fc의 대응하는 위치에서 아미노산 치환 (도 4)으로 상보적 Fc 짝이 생성되며, 이는 서열 번호:30(하기)과 서열 번호:23의 상보적 hG1Fc 짝을 대신하여 이용될 수 있음을 인지할 것이다.
Fc 도메인 안에 다양하게 조작된 돌연변이는 G1Fc 서열 (서열 번호: 13)에 대하여 상기에 나타낸다. G2Fc, G3Fc, 및 G4Fc에서 유사 돌연변이는 도 4에서 G1Fc와의 배열로부터 유도될 수 있다. 부등한 힌지 길이로 인해, 아이소타입 정렬 (도 4)에 근거된 유사한 Fc 위치는 다음의 표에 요약된 바와 같이, 서열 번호: 13, 14, 15, 16, 그리고 17에서 상이한 아미노산 번호를 소유한다.
융합 단백질의 상이한 요소들(가령, 면역글로불린 Fc 융합 단백질)은 원하는 기능성과 일관된 방식으로 정렬될 수 있음을 인지할 것이다. 예를 들면, ActRIIB 폴리펩티드 도메인은 이종성 도메인의 C 말단에 배치될 수 있거나, 또는 대안으로, 이종성 도메인은 ActRIIB 폴리펩티드 도메인의 C 말단에 배치될 수 있다. ActRIIB 폴리펩티드 도메인과 이종성 도메인은 융합 단백질 내에서 인접할 필요가 없고, 그리고 추가 도메인 또는 아미노산 서열이 어느 한쪽 도메인의 C-또는 N 말단에 또는 이들 도메인 사이에 포함될 수 있다.
예를 들면, ActRIIB 폴리펩티드는 A-B-C 형태로 아미노산 서열을 포함할 수 있다. B 부분은 ActRIIB 폴리펩티드 도메인에 상응한다. A와 C 부분은 독립적으로 0, 1, 또는 하나 이상의 아미노산일 수 있고, A와 C 부분 모두 존재하는 경우 B에 대하여 이종성(heterologous)이다. A 및/또는 C 부분은 B 부분에 링커 서열을 경유하여 부착될 수 있다. 링커는 글리신 (가령, 2-10개, 2-5개, 2-4개, 2-3개 글리신 잔기)이 많거나, 또는 글리신과 프롤린 잔기가 많을 수 있고, 예를 들면, 트레오닌/세린 및 글리신의 단일 서열 또는 트레오닌/세린 및/또는 글리신의 반복 서열을 포함할 수 있고, 가령, GGG (서열 번호: 261), GGGG (서열 번호: 262), TGGGG (서열 번호: 263), SGGGG (서열 번호: 264), TGGG (서열 번호: 265), 또는 SGGG (서열 번호: 266) 단일항(singlets), 또는 반복부(repeats)를 포함할 수 있다. 특정 구체예들에 있어서, ActRIIB 융합 단백질은 A-B-C 형태로 아미노산 서열을 포함할 수 있는데, 이때 A는 리더(신호) 서열이며, B는 ActRIIB 폴리펩티드 도메인으로 구성되며, 그리고 C는 생체내 안정성, 생체내 반감기, 취입/투여, 조직 국소화 또는 분포, 단백질 복합체 형성, 및/또는 정제중 하나 또는 그 이상을 강화하는 폴리펩티드 부분이다. 특정 구체예들에 있어서, ActRIIB 융합 단백질은 A-B-C 형태로 아미노산 서열을 포함할 수 있는데, 이때 A는 TPA 리더 서열이며, B는 ActRIIB 수용체 폴리펩티드 도메인으로 구성되며, 그리고 C는 면역글로불린 Fc 도메인이다.
특정 구체예들에 있어서, 본 발명의 ActRIIB 폴리펩티드는 이 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 안정시킬 수 있는 하나 또는 그 이상의 변형을 내포한다. 예를 들면, 이러한 변형은 변이체 ActRIIB 폴리펩티드의 시험관내 반감기를 강화시키고, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드의 순환 반감기를 강화시키고 및/또는 변이체 ActRIIB 폴리펩티드의 단백질분해를 감소시킨다. 이러한 안정화 변형에는 융합 단백질 (예를 들면, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 도메인 및 안정화제 도메인을 포함하는 융합 단백질), 당화 부위의 변형 (예를 들면, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드에 당화 부위 추가 포함), 및 탄수화물 모이어티의 변형 (예를 들면, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드로부터 탄수화물 모이어티 제거 포함)이 포함되나, 이에 국한되지 않는다. 융합 단백질의 경우, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 이러한 IgG 분자 (예를 들어, Fc 도메인)와 같은 안정화 도메인에 융합된다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "안정화 도메인"은 융합 단백질인 경우 융합 도메인 (가령, Fc 도메인)을 지칭하고, 뿐만 아니라 비단백질성(nonproteinaceous) 변형 이를 테면 탄수화물 모이어티, 또는 비단백질성 폴리머, 이를 테면 폴리에틸렌 글리콜을 또한 포함한다.
특정 구체예들에서, 본 발명은 다른 단백질로부터 단리된, 또는 그렇지 않으면, 다른 단백질이 실질적으로 존재하지 않는, 이용 가능한 단리된 및/또는 정제된 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 만든다.
특정 구체예들에서, 본 발명의 ActRIIB 폴리펩티드 (변형안된 또는 변형된)는 당분야에 공지된 다양한 기술에 의해 만들어질 수 있다. 예를 들면, 이러한 ActRIIB 폴리펩티드는 표준 단백질 화학 기술, 예를 들면, Bodansky, M. Principles of Peptide Synthesis, Springer Verlag, Berlin (1993) 및 Grant G. A. (ed.), Synthetic Peptides: A User's Guide, W. H. Freeman and Company, New York (1992)에서 설명된 것들을 이용하여 합성될 수 있다. 이에 더하여, 자동화된 펩티드 합성장치는 상업적으로 가용하다 (가령, Advanced ChemTech Model 396; Milligen/Biosearch 9600). 대안으로, 상기 ActRIIB 폴리펩티드, 이의 단편 또는 이의 변이체들은 당분야에 공지된 다양한 발현 시스템 [가령, 대장균(E. coli), 중국 헴스터 난소 (CHO) 세포, COS 세포, 베큘로바이러스]을 이용하여 재조합적으로 만들어질 수 있다(하기 참고). 추가 구체예에서, 변형된 또는 변형되지 않은 ActRIIB 폴리펩티드는 예로서, 프로테아제, 예를 들면, 트립신, 서몰리신, 키모트립신, 펩신, 또는 대합된 염기성 아미노산 전환 효소 (PACE)를 이용함으로써 자연 발생적 또는 재조합적으로 생산된 전장 ActRIIB 폴리펩티드의 소화에 의해 생산될 수 있다. 단백질분해가능한 절단 부위는 컴퓨터 분석(시판되는 소프트웨어, 가령, MacVector, Omega, PCGene, Molecular Simulation, Inc.)을 이용하여 식별해낼 수 있다. 대안으로, 이러한 ActRIIB 폴리펩티드는 이를 테면 당분야에 공지된 표준 기술, 이를 테면 화학적 절단(가령, 시아노겐 브롬화물, 히드록실아민)에 의해 자연 발생적 또는 재조합적으로 생산된 전장의 ActRIIB 폴리펩티드로부터 만들어질 수 있다.
3. ActRIIB 폴리펩티드를 인코드하는 핵산
특정 양태에서, 본 발명은 본 명세서에서 기재된 임의의 변이체를 포함하여, 상기 ActRIIB 폴리펩티드 (가령, 가용성 ActRIIB 폴리펩티드)중 임의의 것을 인코드하는 단리된 및/또는 재조합 핵산을 제공한다. 예를 들면, 서열 번호: 4은 자연 발생적 ActRIIB 전구체 폴리펩티드를 인코드하며, 서열 번호: 3는 가용성 ActRIIB 폴리펩티드를 인코드한다. 대상 핵산은 단일-가닥이거나 또는 이중 가닥일 수 있다. 이러한 핵산은 DNA 또는 RNA 분자일 수 있다. 이들 핵산은 예를 들면, ActRIIB 폴리펩티드를 만드는 방법, 또는 직접적인 치료 물질(가령, 유전자 요법 방법)로써 이용될 수 있다.
특정 양태에서, ActRIIB 폴리펩티드를 인코드하는 핵산은 서열 번호: 3의 변이체인 핵산을 포함하는 것으로 이해된다. 변이체 뉴클레오티드 서열은 하나 또는 그 이상의 뉴클레오티드 치환, 부가 또는 결실에 의해 다른 서열, 예를 들면, 대립형질 변이체를 포함하고; 그리고, 이런 이유로, 서열 번호: 4의 뉴클레오티드 서열과 상이한 코딩 서열을 포함한다.
특정 구체예들에서, 본 발명은 서열 번호: 3에 대하여 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99% 또는 100% 동일한 단리된 또는 재조합 핵산 서열을 제공한다. 당업자는 서열 번호: 3, 그리고 서열 번호: 3의 변이체에 상보적인 핵산 서열 또한 본 발명의 범위 안에 있음을 인지할 수 있을 것이다. 추가 구체예들에서, 본 발명의 핵산 서열은 단리되거나, 재조합되거나, 및/또는 이종성 뉴클레오티드 서열에 융합되거나 또는 DNA 라이브러리 안에 있을 수 있다.
다른 구체예들에 있어서, 본 명세서 핵산은 또한, 고도로 엄격한 조건 하에, 서열 번호: 3에서 지정된 뉴클레오티드 서열, 서열 번호: 3의 보체 서열, 또는 이들의 단편에 혼성화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 상기에서 논의된 바와 같이, 당업자는 DNA 혼성화를 촉진시키는 적절한 엄격 조건은 가변적일 수 있다는 것을 용이하게 이해할 것이다. 당업자는 DNA 혼성화를 촉진시키는 적절한 엄격 조건은 가변적일 수 있다는 것을 용이하게 이해할 것이다. 예를 들면, 6.0 x 염화나트륨/구연산나트륨 (SSC)에서 약 45 ℃에서 혼성화, 이어서 50 ℃에서 2.0 x SSC의 세척으로 실행할 수 있다. 예를 들면, 세척 단계에서 염 농도는 50 ℃에서 약 2.0 x SSC의 낮은 엄격성으로부터 50 ℃에서 0.2 x SSC의 높은 엄격성에서 선택될 수 있다. 또한, 세척 단계의 온도는 약 22 ℃의 낮은 엄격성 조건으로부터 약 65 ℃의 높은 엄격성 조건으로 증가될 수 있다. 온도 및 염이 변화될 수 있거나, 또는 다른 변수가 변화되는 동안 온도 또는 염 농도는 일정하게 유지될 수 있다. 한 구체예에서, 본 발명은 실온에서 6 x SSC의 낮은 엄격성 조건하에 혼성화되고, 이어서 실온에서 2 x SSC에서 세척된 핵산을 제공한다.
유전자 코드에서 축중성으로 인해 서열 번호: 3에서 진술된 바와 같은 핵산과 상이한 단리된 핵산 역시 본 발명의 범위 내에 있다. 예를 들면, 다수의 아미노산이 하나 이상의 삼중항으로 지정된다. 동일한 아미노산을 특정하는 코돈, 또는 동의코돈 (예를 들면, CAU와 CAC는 히스티딘의 경우 동의코돈임)으로 이 단백질의 아미노산 서열에 영향을 주지 않은 "침묵(silent)" 돌연변이가 된다. 그러나, 포유류 세포 중에 본 단백질의 아미노산 서열의 변화를 유도하는 DNA 서열 다형성이 존재할 것으로 기대된다. 당업자는 특정 단백질을 코딩하는 핵산의 하나 이상의 뉴클레오티드 (뉴클레오티드의 최대 약 3 내지 5 %)에서의 이러한 변이가 자연 대립 유전자 변이로 인해 주어진 종의 개체들 사이에 존재할 수 있음을 인식할 것이다. 임의의 모든 이런 뉴클레오티드 변이 및 결과의 아미노산 다형성은 본 발명의 범위 안에 있다.
일정한 구체예에서, 본 발명의 재조합 핵산은 발현 구조체 내에서 하나 또는 그 이상의 조절 뉴클레오티드 서열에 작동가능하게 연결될 수 있다. 조절 뉴클레오티드 서열은 일반적으로, 발현에 이용된 숙주 세포에 적합할 것이다. 다양한 숙주 세포에 있어서 다수 유형의 적절한 발현 벡터 및 적합한 조절 서열이 당분야에 공지되어 있다. 전형적으로, 전술한 하나 또는 그 이상의 조절 뉴클레오티드 서열은 프로모터 서열, 리더 또는 신호 서열, 리보좀 결합 부위, 전사 개시 및 종료 서열, 해독 개시 및 종료 서열, 및 인핸서 또는 활성자 서열을 포함하나, 이에 국한되지 않는다. 당분야에 공지된 구성 또는 유도성 프로모터는 본 발명에서 고려된다. 상기 프로모터는 자연 발생적 프로모터이거나, 또는 하나 이상의 프로모터 요소들이 복합된 하이브리드 프로모터일 수 있다. 발현 구조체는 세포 안 에피좀 상에, 이를 테면 플라스미드로 존재하거나, 또는 발현 구조체는 염색체 안에 삽입될 수 있다. 바람직한 구체예들에 있어서, 발현 벡터는 선택가능한 표지 유전자를 포함하여, 형질전환된 숙주 세포의 선별이 가능하다. 선택가능한 표지 유전자는 당분야에 공지되어 있으며, 이용되는 숙주 세포에 따라 가변적일 것이다.
본 발명의 특정 양상에서, 주제 핵산은 ActRIIB 폴리펩티드 폴리펩티드를 인코딩하고 최소한 하나의 조절 서열에 작동가능하게 연결된 뉴클레오티드 서열을 포함하는 발현 벡터에서 제공된다. 조절 서열은 당분야에서 인식되고, 그리고 변이체 ActRIIB 폴리펩티드의 발현을 주도하도록 선별된다. 따라서, 용어 조절 서열은 프로모터, 인핸서, 및 기타 발현 조절 요소들을 포함한다. 예시적인 조절 서열은 Goeddel; Gene Expression Technology: Methods in Enzymology, Academic Press, San Diego, CA (1990)에서 설명되고 있다. 가령, 자신에게 작동가능하게 연결될 때 DNA 서열의 발현을 제어하는 임의의 매우 다양한 발현 제어 서열이 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 인코딩하는 DNA 서열을 발현하기 위해 이들 벡터에서 이용될 수 있다. 이러한 유용한 발현 조절 서열은, 예를 들면, SV40의 초기 및 후기 프로머터, tet 프로모터, 아데노바이러스 또는 사이토메갈로바이러스 즉각 초기 프로모터, RSV 프로모터, lac 시스템, trp 시스템, TAC 또는 TRC 시스템, T7 RNA 중합효소에 의해 발현이 지시되는 T7 프로모터, 파아지 람다의 주요 오퍼레이터 및 프로모터 영역, fd 피복 단백질의 조절 영역, 3-포스포글리세레이트 키나제 또는 다른 글리콜분해 효소의 프로모터, 산 포스파타제의 프로모터, 가령, Pho5, 효모 α-메이팅 인자들의 프로모터, 베큘로바이러스 시스템의 폴리헤드곤 프로모터, 또는 진핵 세포 또는 이의 바이러스의 발현을 제어하는 것으로 알려진 기타 서열, 및 다양한 이의 조합들을 포함한다. 발현 벡터의 설계는 형질전환될 숙주 세포의 선택 및/또는 발현되기를 원하는 단백질의 유형과 같은 인자에 좌우될 수 있음을 알아야 한다. 더욱이, 벡터의 복사체 수, 복사체 수를 조절하는 능력, 그리고 이 벡터에 의해 인코드되는 임의의 다른 단백질, 가령, 항생제 표지 등의 발현이 또한 고려된다.
본 발명의 재조합 핵산은 원핵 또는 진핵 세포 (효모, 조류, 곤충 또는 포유류), 또는 이둘 모두에서 발현하는데 적합한 벡터에 클론된 유전자 또는 이의 일부분을 결찰시킴으로써 만들어질 수 있다. 재조합 변이체 ActRIIB 폴리펩티드의 생산을 위한 발현 수송체는 플라스미드 및 다른 벡터를 포함한다. 예를 들면, 적합한 벡터는 다음의 유형의 플라스미드를 포함한다: 원핵 세포, 이를 테면 대장균에서 발현을 위한 pBR322-유도된 플라스미드, pEMBL-유도된 플라스미드, pEX-유도된 플라스미드, pBTac-유도된 플라스미드 및 pUC-유도된 플라스미드.
일부 포유류 발현 벡터는 박테리아에서 벡터의 증식을 실행하는 원핵(prokaryotic) 서열과 진핵 세포에서 발현된 진핵(eukaryotic) 전사 단위를 모두 포함한다. pcDNAI/amp, pcDNAI/neo, pRc/CMV, pSV2gpt, pSV2neo, pSV2-dhfr, pTk2, pRSVneo, pMSG, pSVT7, pko-neo 및 pHyg 유도된 벡터는 진핵 세포의 형질감염에 적합한 포유류 발현 벡터의 예들이다. 이들 벡터중 일부는 박테리아 플라스미드, 이를 테면 pBR322의 서열로 변형되어, 진핵 세포와 원핵 세포 모두에서 복제 및 약물 저항성 선별이 가능하다. 대안으로, 바이러스, 이를 테면 소의 유두종 바이러스 (BPV-1), 또는 Epstein-Barr 바이러스 (pHEBo, pREP-유도된 그리고 p205)의 유도체들이 진핵 세포에서 단백질의 일시적 발현에 이용될 수 있다. 다른 바이러스 (레트로바이러스 포함) 발현 시스템의 예는 하기 유전자 요법 운반 시스템의 설명에서 찾아볼 수 있다. 플라스미드의 준비 및 숙주 유기체의 형질전환에 이용되는 다양한 방법들이 당분야에 공지되어 있다. 원핵 세포와 진핵 세포 모두에 적합한 다른 발현 시스템, 뿐만 아니라 전반적인 재조합 과정은 Molecular Cloning A Laboratory Manual, 2nd Ed., ed. by Sambrook, Fritsch and Maniatis (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989) Chapters 16 and 17.을 참고한다. 일부 경우들에 있어서, 베큘로바이러스 발현 시스템의 사용에 의해 재조합 폴리펩티드를 발현시키는 것이 바람직할 수 있다. 이러한 베큘로바이러스 발현 시스템의 예로는 pVL-유도된 벡터 (이를 테면 pVL1392, pVL1393 및 pVL941), pAcUW-유도된 벡터 (이를 테면 pAcUW1), 및 pBlueBac-유도된 벡터 (이를 테면 β-gal 함유 pBlueBac III)을 포함한다.
바람직한 구체예에서, 벡터, 예를 들면, Pcmv-스크립트 벡터 (Stratagene, La Jolla, Calif.), pcDNA4 벡터 (Invitrogen, Carlsbad, Calif.) 및 pCI-neo 벡터 (Promega, Madison, Wisc.)는 CHO 세포에서 대상 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 생산하도록 설계될 것이다. 명백한 바와 같이, 주제 유전자 구조체는 예로서, 정제를 위한 융합 단백질 또는 변이체 단백질을 비롯한 단백질을 생산하기 위해, 배양액에서 증식된 세포에서 대상 변이체 ActRIIB 폴리펩티드의 발현을 유발하는데 이용될 수 있다.
본 발명은 하나 또는 그 이상의 ActRIIB 폴리펩티드들에 대한 코딩 서열(가령, 서열 번호:4)이 포함된 재조합 유전자로 형질감염된 숙주 세포에 또한 관계한다. 상기 숙주 세포는 임의의 원핵 세포 또는 진핵 세포일 것이다. 예를 들면, 본 발명의 ActRIIB 폴리펩티드는 박테리아 세포, 이를 테면 대장균, 곤충 세포 (가령, 베큘로바이러스 발현 시스템을 이용), 효모, 또는 포유류 세포에서 발현될 수 있다. 당업자들에게는 다른 적합한 숙주 세포들이 또한 알려져 있다.
따라서, 본 발명는 대상 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 생산하는 방법과 더욱 관련된다. 가령, ActRIIB 폴리펩티드를 인코딩하는 발현 벡터로 형질감염된 숙주 세포는 ActRIIB 폴리펩티드의 발현이 발생하도록 허용하는 적절한 조건 하에 배양될 수 있다. 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 분비되고, 이 ActRIIB 폴리펩티드를 함유하는 세포와 배지 혼합물로부터 단리될 수 있다. 대안으로, 상기 ActRIIB 폴리펩티드는 세포질 내 또는 막 분획 내에 보유될 수 있고, 세포는 수거되고, 용해되고, 단백질은 단리 될 수 있다. 세포 배양물은 숙주 세포, 배지 및 다른 부산물을 포함한다. 세포 배양에 적합한 배지는 당분야에 공지되어 있다. 대상 ActRIIB 폴리펩티드들은 이온-교환 크로마토그래피, 겔 여과 크로마토그래피, 한외여과, 전기영동, ActRIIB 폴리펩티드의 특정 에피토프에 특이적인 항체를 이용한 면역친화력 정제를 포함하는 단백질을 정제하는데 공지된 기술을 이용하여, 세포 배양 배지, 숙주 세포, 또는 이 둘 모두로부터 단리될 수 있다. 바람직한 구체예에서, 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드는 폴리펩티드는 정제를 용이하게 하는 도메인을 함유하는 융합 단백질이다.
다른 구체예에서, 재조합 변이체 ActRIIB 폴리펩티드의 원하는 부분의 N 말단에서 정제 리더 서열, 예를 들면, 폴리-(His)/엔테로키나아제 개열 부위 서열을 코딩하는 융합 유전자는 Ni2+ 금속 수지를 이용한 친화성 크로마토그래피에 의한 발현된 융합 단백질의 정제를 허용할 수 있다. 이후, 정제 리더 서열은 정제된 ActRIIB 폴리펩티드 및 이의 이종다량체를 제공하기 위해, 엔테로키나아제로 처리에 의해 차후 제거될 수 있다(가령, Hochuli et al., (1987) J. Chromatography 411:177; and Janknecht et al., PNAS USA 88:8972 참고).
융합 유전자를 만드는 기술은 공지되어 있다. 기본적으로, 상이한 폴리펩티드 서열을 인코드하는 다양한 DNA 단편의 결합은 결찰을 위한 블런트-단부 또는 스태거(stagger)-단부를 이용, 적절한 말단을 제공하기 위한 제한효소 절단, 바람직하지 못한 결합 및 효소적 결찰을 피하기 위하여 적절한 알칼리 포스포타제 처리와 같은 코헤시브 단부(cohesive ends)의 메우기를 이용하는 통상의 기술에 따라 실행된다. 또다른 구체예에서, 융합 유전자는 자동화된 DNA 합성기가 포함된 통상적인 기술에 의해 합성될 수 있다. 대안으로, 유전자 단편들의 PCR 증폭은 2개의 연속 유전자 단편 간에 상보적 오버헹(overhangs)을 만드는 엥커 프라이머를 이용하여 실행되고, 후속적으로 어닐링시켜 키메라 유전자 서열을 만들 수 있다 (예를 들면, Current Protocols in Molecular Biology, eds. Ausubel et al., John Wiley & Sons: 1992 참고).
4. 스크리닝 분석
특정 양태에서, 본 발명은 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드의 항진제 또는 길항제인 화합물(물질)을 동정하는데 대상 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 (가령, 가용성 ActRIIB 폴리펩티드)를 이용하는 것에 관계한다. 이 스크리닝을 통하여 확인된 화합물은 조직, 이를 테면 뼈, 연골, 근육, 지방, 및/또는 뉴런을 조작하는 이들의 능력, 조직 성장을 조절하는 이들의 능력을 평가하기 위하여 테스트될 수 있다. 임의선택적으로, 이들 화합물은 생체내에서 조직 성장을 조절하는 능력을 평가하기 위하여, 동물 모델에서 추가 테스트될 수 있다.
상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 표적으로 함으로써, 조직 성장을 조절하는 치료 물질을 스크리닝하는 다수의 접근법이 있다. 특정 구체예들에서, 뼈, 연골, 근육, 지방, 및/또는 뉴런의 성장에서 ActRIIB-중재된 효과를 교란시키는 물질을 동정하기 위하여 화합물들의 고효율 스크리닝이 수행될 수 있다. 특정 구체예들에서, 이 분석은 ActRIIB 폴리펩티드가 이의 결합 파트너, 이를 테면 ActRIIB 리간드 (가령, 액티빈, Nodal, GDF8, GDF11 또는 BMP7)에 결합하는 것을 특이적으로 억제 또는 감소시키는 화합물을 스크리닝 및 동정하기 위하여 실행된다. 대안으로, 상기 분석은 ActRIIB 폴리펩티드가 이의 결합 단백질, 이를 테면 ActRIIB 리간드에 대한 결합을 향상시키는 화합물을 동정하는데 사용될 수 있다. 추가 구체예에서, ActRIIB 폴리펩티드와 상호 작용하는 능력에 의해 이 화합물이 동정될 수 있다.
다양한 분석 포맷이 충분할 것이며, 본원 명세서에 비추어 여기에 명백하게 기술되지 않은 것들은 당업자에 의해 이해될 것이다. 본 명세서에서 기술된 바와 같이, 본 발명의 테스트 화합물 (물질)은 임의의 조합적 화학 방법에 의해 생성 될 수 있다. 대안으로, 본 화합물은 생체내 또는 시험관내에서 합성된 자연 발생 생체 분자일 수 있다. 조직 성장의 조절자로서 작용하는 능력에 대하여 테스트되는 화합물 (물질)은 예를 들어, 박테리아, 효모, 식물 또는 다른 유기체 (예 : 천연 생성물)에 의해 생성될 수 있고, 화학적으로 만들어질 수 있거나 (예 펩티도모방체를 포함하는 소분자), 또는 재조합 적으로 생산 될 수 있다. 본 발명에 의해 고려되는 테스트 화합물은 비-펩티딜 유기 분자, 펩티드, 폴리펩티드, 펩티이드 모방체, 당, 호르몬 및 핵산 분자를 포함한다. 특정 구체예에서, 상기 테스트 물질은 분자량이 약 2,000 달톤 미만인 작은 유기 분자이다.
본 발명의 테스트 화합물은 단일의 별개 엔터티로 제공되거나, 또는 조합 화학에 의해 만들어진, 더 큰 복합체 라이브러리로 제공될 수 있다. 이들 라이브러리는 예를 들어, 알코올, 알킬 할로겐화물, 아민, 아미드, 에스테르, 알데히드, 에테르 및 다른 부류의 유기 화합물을 포함 할 수 있다. 테스트 화합물을 테스트 시스템에 제시하는 것은 분리된 형태 또는 화합물의 혼합물로서, 특히 초기 스크리닝 단계에서 제시할 수 있다. 임의선택적으로, 상기 화합물은 임의로 다른 화합물로 유도체화 될 수 있고, 이 화합물의 단리를 용이하게 하는 유도체화 기를 가질 수 있다. 유도체화기의 비-제한적인 예는 바이오틴, 플루오레세인, 디옥시게닌, 녹색 형광 단백질, 동위 원소, 폴리히스티딘, 자성 비드, 글루타티온 S-전이효소(GST), 광활성 가교제 또는 이들의 임의 조합물을 포함한다.
화합물 및 천연 추출물의 라이브러리를 테스트하는 많은 약물-스크리닝 프로그램에서, 주어진 시간 동안 조사되는 화합물의 수를 최대화하기 위해서는 고-처리량 분석이 바람직하다. 정제되거나 반-정제된 단백질로 유도될 수 있는 것과 같이, 세포가 없는 시스템에서 수행되는 분석은 테스트 화합물에 의해 중재되는 분자 표적의 신속한 개발 및 변경의 상대적으로 용이한 탐지를 가능하게 하기 위해 생성 될 수 있다는 점에서 종종 "1 차" 스크린으로 선호된다. 더욱이, 테스트 화합물의 세포 독성 또는 생물이용성의 효과는 시험관 시스템에서 일반적으로 무시될 수 있지만, 대신 이 분석은 ActRIIB 폴리펩티드와 이의 결합 단백질 (가령, ActRIIB 리간드) 간의 결합 친화력의 변경으로 현시될 수 있는, 분자 표적 상에 약물의 효과에 주로 집중한다.
단지 설명하기 위해, 본 발명의 예시적인 스크리닝 분석에서, 목적 화합물은 분석 의도에 적합하다면, ActRIIB 폴리펩티드 리간드에 통상적으로 결합 할 수 있는, 분리 및 정제된 ActRIIB 폴리펩티드에 접촉시킨다. 상기 화합물과 ActRIIB 폴리펩티드의 혼합물에 ActRIIB 리간드를 함유하는 조성물을 추가한다. ActRIIB/ActRIIB 리간드 복합체의 탐지 및 정량화는 ActRIIB 폴리펩티드와 이의 결합 단백질 사이에 복합체 형성을 억제(또는 강화)하는데 있어서 이 화합물의 효과를 측정하는 수단을 제공한다. 화합물의 효능은 다양한 농도의 테스트 화합물을 사용하여 얻은 데이터로부터 용량-반응 곡선을 생성함으로써 평가할 수 있다. 더욱이, 대조 분석을 수행하여 비교를 위한 기준을 제공할 수도 있다. 예를 들면, 대조군 분석에서, 단리 및 정제된 ActRIIB/ActRIIB 리간드가 ActRIIB 폴리펩티드를 함유하는 조성물에 첨가되고, ActRIIB/ActRIIB 리간드 복합체의 형성은 테스트 화합물의 부재하에 정량화된다. 일반적으로, 반응물이 혼합되는 순서는 다양할 수 있고, 동시에 혼합될 수 있음을 이해할 것이다. 또한, 정제된 단백질 대신에, 세포 추출물 및 용해물을 사용하여 적절한 무-세포 검정 시스템을 만들 수 있다.
상기 ActRIIB 폴리펩티드와 이의 결합 단백질 사이에 복합체 형성은 다양한 기술에 의해 탐지될 수 있다. 예를 들면, 복합체 형성의 조절은 예를 들면, 탐지가능하도록 라벨된 단백질 이를 테면 방사능라벨된 (가령, 32P, 35S, 14C 또는 3H), 형광으로 라벨된 (가령, FITC), 또는 효소적으로 라벨된 ActRIIB 폴리펩티드 또는 이의 결합 단백질을 이용하거나, 면역분석에 의해, 또는 크로마토그래피 탐지에 의해 정량화될 수 있다.
특정 구체예들에 있어서, 본 발명은 ActRIIB 폴리펩티드와 이의 결합 단백질 간에 상호작용을 직접적으로, 또는 간접적으로 측정함에 있어서, 형광 편광 분석 및 형광 공명 에너지 전달 (FRET) 분석의 이용을 고려한다. 더욱이, 다른 방식의 탐지, 이를 테면 광학 도파관(waveguides) (PCT 공개 WO 96/26432 및 U.S. Pat. No. 5,677,196), 표면 플라스몬 공명 (SPR), 표면 전하 센서, 및 표면력 센서등은 본 발명의 많은 구체예에 양립가능하다.
더욱이, 본 명세서는 ActRIIB 폴리펩티드와 이의 결합 단백질 사이의 상호작용을 파괴 또는 강화시키는 물질들을 동정하기 위한 "2-하이브리드 분석"으로 알려진 상호작용 트랩 분석의 사용을 고려한다. 가령, U.S. Pat. No. 5,283,317; Zervos et al. (1993) Cell 72:223-232; Madura et al. (1993) J Biol Chem 268:12046-12054; Bartel et al. (1993) Biotechniques 14:920-924; 및 Iwabuchi et al. (1993) Oncogene 8:1693-1696 참고. 특정 구체예에서, 본 발명은 ActRIIB 폴리펩티드와 이의 결합 단백질 간의 상호작용을 해리시키는 화합물 (가령, 소분자 또는 펩티드)를 동정하기 위한 역 2-하이브리드 시스템의 사용을 고려한다. 예를 들면, Vidal and Legrain, (1999) Nucleic Acids Res 27:919-29; Vidal and Legrain, (1999) Trends Biotechnol 17:374-81; and U.S. Pat. Nos. 5,525,490; 5,955,280; 및 5,965,368 참고.
특정 구체예들에 있어서, 상기 대상 화합물은 본 발명의 변이체 ActRIIB 폴리펩티드와 상호작용하는 능력에 의해 동정된다. 상기 화합물과 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 간의 상호작용은 공유 또는 비-공유적일 수 있다. 예를 들면, 광-가교, 방사능라벨된 리간드 결합, 및 친화력 크로마토그래피가 포함된 시험관내 생화학적 방법을 이용하여 단백질 수준에서 이러한 상호작용이 동정될 수 있다(Jakoby WB et al. (1974) Methods in Enzymology 46:1). 특정 경우에서, 상기 화합물은 기전-기반의 분석, 이를 테면 변이체 ActRIIB 폴리펩티드에 결합하는 화합물을 탐지하는 분석에서 스크리닝될 수 있다. 이 분석은 고형-상 또는 유체-상 결합 사건을 포함할 수 있다. 대안으로, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 인코드하는 유전자는 리포터 시스템 (가령, β-갈락토시다제, 루시퍼라제, 또는 녹색 형광 단백질)과 함께 세포 안으로 형질감염되고, 라이브러리, 바람직하게는 고처리량 스크리닝 또는 이 라이브러리의 개별 구성요소들에 대하여 스크리닝될 수 있다. 다른 기전-기반의 결합 분석이 이용될 수 있는데, 예를 들면, 자유 에너지의 변화를 탐지하는 결합 분석이 이용될 수 있다. 결합 분석은 웰, 비드 또는 칩에 고정된 표적으로 또는 고정된 항체에 의해 포집된 표적 또는 모세관 전기영동에 의해 해리되는 표적으로 실행될 수 있다. 상기 결합된 화합물은 발색 또는 형광 또는 표면 플라스몬 공명을 이용하여 탐지될 수 있다.
특정 양태에서, 본 발명은 ActRIIB 폴리펩티드 및/또는 ActRIIB 리간드의 기능을 길함함으로써, 근육 성장을 자극하고, 근육량을 증가시키기 위한 방법 및 물질을 제공한다. 따라서, 동정된 모든 화합물은 생체 내 또는 생체 내에서 전체 세포 또는 조직에서 검사하여 근육 성장을 조절하는 능력을 확인한다. 당해 분야에 공지된 다양한 방법이 이 목적을 위해 이용될 수 있다. 예를 들면, 본 발명의 방법은 ActRIIB 리간드 (예를 들어, GDF8)에 결합함으로써 활성화된 ActRIIB 단백질을 통한 신호 전달이 감소되거나 억제되도록 수행된다. 유기체 내의 근육 조직의 성장은 대응하는 유기체 (또는 유기체의 집단)의 근육 질량과 비교하여 유기체에서 증가된 근육 질량을 초래할 것이며, ActRIIB 단백질을 통한 신호 전달은 그다지 효과가 없었다는 것이 인지될 것이다.
예를 들면, 근육 세포 성장/증식에 대한 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 또는 시험 화합물의 영향은 근원 세포의 증식과 관련된 Pax-3 및 Myf-5의 유전자 발현을 측정하고, 근육 분화와 연관된 MyoD의 유전자 발현을 측정음으로써, 평가될 수 있다 (가령, Amthor et al., Dev Biol. 2002, 251:241-57). GDF8은 Pax-3 및 Myf-5의 유전자 발현을 하향-조절하고, MyoD의 유전자 발현을 억제하는 것으로 알려져 있다. 상기 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 또는 시험 화합물은 GDF8의 이러한 활성에 길항할 것으로 예상된다. 세포 기반 분석법의 또 다른 예는 ActRIIB 폴리펩티드 또는 시험 화합물의 존재 하에 C(2)C(12) 근육아세포와 같은 근육 아세포의 증식을 측정하는 것을 포함한다(가령, Thomas et al., J Biol Chem. 2000, 275:40235-43).
본 발명은 또한 근육 질량 및 강도를 측정하기 위한 생체 내 분석을 고려한다. 예를 들면, Whittemore et al. (Biochem Biophys Res Commun. 2003, 300:965-71)는 마우스에서 증가된 골격근 질량 및 증가된 그립 강도를 측정하는 방법을 개시한다. 임의선택적으로, 이 방법은 근육 질환 또는 상태, 예를 들어 근육량이 제한되는 질병에 대한 시험 화합물 (예를 들어, 변이체 ActRIIB 폴리펩티드)의 치료 효과를 결정하는데 사용될 수 있다.
특정 양태에서, 본 발명은 뼈 형성을 조절 (자극 또는 억제)하고 뼈 질량을 증가시키기 위한 방법 및 물질을 제공한다. 따라서, 동정된 모든 화합물은 생체 내 또는 생체 내에서 전체 세포 또는 조직에서 검사하여 골 또는 연골 성장을 조절하는 능력을 확인한다. 당해 분야에 공지된 다양한 방법이 이 목적을 위해 이용될 수 있다.
예를 들면, 골격 또는 연골 성장에 대한 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 또는 시험 화합물의 효과는 Msx2의 유도 또는 골아 세포로의 골재 세포로의 분화를 세포 기반 분석법으로 측정함으로써 결정될 수 있다 (가령, Daluiski et al., Nat Genet. 2001, 27(1):84-8; Hino et al., Front Biosci. 2004, 9:1520-9 참고). 세포-기반 검정의 또 다른 예는 중간엽 전구 세포 및 조골 세포에서 ActRIIB 폴리펩티드 및 시험 화합물의 골 형성 활성을 분석하는 것을 포함한다. 설명하자면, ActRIIB 폴리펩티드를 발현하는 재조합 아데노바이러스는 다능성 간엽 전구체 C3H10T1/2 세포, 골아전구세포 C2C12 세포, 및 조골 세포 TE-85 세포를 감염 시키도록 구성되었다. 골 형성 활성은 알칼라인 포스파타제, 오스테오칼신 및 매트릭스 광물의 유도를 측정하여 결정된다(가령, Cheng et al., J bone Joint Surg Am. 2003, 85-A(8):1544-52 참고).
본 발명은 뼈 또는 연골 성장을 측정하기 위한 생체 내 분석을 고려한다. 예를 들면, Namkung-Matthai et al., Bone, 28:80-86 (2001) 는 골절 후의 초기의 뼈 회복을 연구한 쥐 골다공증 모델을 개시하고 있다. Kubo et al., Steroid Biochemistry & Molecular Biology, 68:197-202 (1999)는 또한 골절 후반기의 뼈 회복을 연구하는 쥐 골다공증 모델을 개시하고 있다. 이들 참고 문헌은 골다공증 성 골절에 대한 연구를 위한 렛 모델의 공개를 위해 본원에서 참고로 인용된다. 특정 양태에서, 본 발명은 당 업계에 공지된 골절 치유 분석법을 사용한다. 이러한 분석은 골절 기술, 조직학 분석 및 생체 역학 분석을 포함하며, 이는 예를 들어 골절의 정도를 측정할 뿐만 아니라 복구 과정을 일으키는 실험 프로토콜의 공개한 U.S. 특허 No. 6,521,750(그 전체가 참고 문헌으로 인용된다)에 기술된 것들을 포함한다.
특정 양태에서, 본 발명은 체중 증가 및 비만을 조절하기 위한 방법 및 물질을 제공한다. 세포 수준에서, 지방 세포의 증식과 분화는 비만의 발달에 중요하며, 이는 지방 세포 (지방 세포)를 추가로 생성시킨다. 따라서, 동정된 화합물은 시험 관내 또는 생체 내에서 전체 세포 또는 조직에서 시험하여 지방 세포 증식 또는 분화를 측정함으로써 지방 생성을 조절하는 능력을 확인한다. 당해 분야에 공지된 다양한 방법이 이 목적을 위해 이용될 수 있다. 예를 들면, 지방생성에 대한 변이체 ActRIIB 폴리펩티드 (예를 들어, 가용성 ActRIIB 폴리펩티드) 또는 시험 화합물의 효과는 세포 기반 검정법에서 성숙한 지방 세포로의 3T3-L1 전-지방 세포의 분화를 측정함으로써 결정될 수 있는데, 이를 테면, Oil Red O 착색 소낭에서의 트리아실 글리세롤의 축적 및 FABP (aP2/422) 및 PPARγ2와 같은 특정 지방 세포 표식의 출현을 관찰함으로써 확인되었다. 예를 들면, Reusch et al., 2000, Mol Cell Biol. 20:1008-20; Deng et al., 2000, Endocrinology. 141:2370-6; Bell et al., 2000, Obes Res. 8:249-54 참고. 세포-기반 검정의 또 다른 예는 브로모데옥시우리딘 (BrdU)-양성 세포를 모니터링함으로써, 지방 세포 또는 지방 세포 전구체 세포 (예를 들어, 3T3-L1 세포)의 증식에서 변형된 ActRIIB 폴리펩티드 및 시험 화합물의 역할을 분석하는 것을 포함한다. 예를 들면, Pico et al., 1998, Mol Cell Biochem. 189:1-7; Masuno et al., 2003, Toxicol Sci. 75:314-20 참고.
본 발명의 스크리닝 검정은 본 발명의 ActRIIB 폴리펩티드 및 ActRIIB 폴리펩티드의 변이체 뿐만 아니라, ActRIIB 폴리펩티드의 작용제 및 길항제를 포함하는 임의의 시험 화합물에 적용된다는 것을 인지할 것이다. 또한, 이러한 스크리닝 검정은 약물 표적 검증 및 품질 관리 목적에 유용하다.
6. 예시적인 치료 용도
특정 구체예들에서, 본 발명의 조성물 (가령, 변이체 ActRIIB 단백질, 동종체 또는 이형 형태)은 ActRIIB 및/또는 ActRIIB 리간드 (가령, GDF8 또는 GDF11)의 비정상 활성과 연합된 질환 또는 상태를 치료 또는 예방하는데 이용될 수 있다. 이들 질환, 장애들 또는 상태는 일반적으로 "ActRIIB-연합된 상태"로 본 명세서에서 지칭된다. 특정 구체예들에서, 본 발명은 상기에서 기술된 바와 같이 치료요법적으로 효과량의 변이체 ActRIIB 단백질 (가령, ALK4:ActRIIB 이형다량체 이를 테면 ALK4:ActRIIB 이형이량체)을 이를 필요로 하는 개인에게 투여함으로써, 이를 필요로 하는 개체를 치료 또는 예방하는 방법을 제공한다. 이들 방법은 특히 예를 들면, 동물 특히, 인간의 치료 및 예방을 목적으로 한다. 용어 "피험자", "개인", 또는 "환자"는 명세서를 통하여 호환되며, 일반적으로 포유류를 지칭한다. 포유류는 길들여진 동물 (예를 들면, 소, 양, 고양이, 개 및 말), 영장류 (예를 들면, 인간 및 비-인간 영장류, 이를 테면 원숭이), 토끼, 그리고 설치류 (예를 들면, 마우스 및 렛(rats))을 포함하나, 이에 국한되지 않는다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 장애 또는 상태를 "방지하는" 치료는 통계적 시료에서 처리안된 대조 시료와 비교하여 처리된 시료에서 장애 또는 상태의 발생이 감소되거나, 또는 처리안된 대조 시료와 비교하여 장애 또는 상태의 하나 또는 그 이상의 증상의 개시를 지연시키거나 또는 그 중증도를 감소시키는 화합물을 지칭한다. 본원에 사용된 용어 "치료하는"이란 일단 특정 상태가 확립된 후, 명명된 상태의 개선 또는 제거 또는 예방을 포함한다.
ActRIIB와 ActRIIB 리간드 간 내인성 복합체는 조직 성장 뿐만 아니라 이를 테면 다양한 구조의 정확한 형성과 같은 초기 발달과정, 또는 성 발달, 뇌하수체 호르몬 생성 그리고 뼈 및 연골 생성을 포함하는 발달 후 하나 이상의 능력에서 필수적인 역할을 한다. 따라서, ActRIIB-연합된 상태는 비정상적 조직 성장 및 발달 결함을 포함한다. 또한, ActRIIB-연합된 상태눈 세포 성장 및 분화 장애, 이를 테면 염증, 알레르기, 자가면역 질환, 감염성 질환 및 종양을 포함하나, 이에 국한되지 않는다.
예시적인ActRIIB-연합된 상태는 신경근 장애들 (가령, 근위축병 및 근육 위축), 울혈성 폐쇄성 폐 질환 (및 COPD와 연합된 근육 소모), 근육 소비 증후군, 근육감소증, 악액질, 지방 조직 장애들 (가령, 비만), 타입 2 당뇨병 (NIDDM, 성인-개시 당뇨병), 및 뼈 퇴행성 질환 (가령, 골다공증)을 포함한다. 다른 예시적인 ActRIIB-연합된 상태는 근육퇴행성 및 신경근 장애들, 조직 복구 (가령, 상처 치류), 신경퇴행성 질환 (가령, 근위축성 측색 경화증), 및 면역학적 장애들 (가령, 림프구의 비정상적 증식 또는 기능과 관련된 장애들), 그리고 지방 세포의 비정상적인 증식과 관련된 비만 또는 장애를 포함한다.
특정 구체예들에서, 본 발명 (가령, 변이체 ActRIIB 단백질)의 조성물은 근위축병 치료의 일부분으로 이용된다. 용어 "근위축병"은 골격근 및 때때로 심장과 호흡기 근육이 점진적으로 약화되고, 악화되는 것을 특징으로 하는 퇴행성 근육 질환을 말한다. 근위축병은 근육의 미세한 변화로 시작하는 점진적 근육 소모 및 약화를 특징으로 하는 유전적 질환이다. 근육이 시간이 지남에 따라 퇴화됨으로써, 사람의 근력은 감소된다. 대상 변이체 ActRIIB 단백질이 포함된 치료에 의해 치료될 수 있는 예시적인 근위축병은 다음을 포함한다: 듀시엔 근위축병 (DMD), 베커 근위축병 (BMD), 에메리-드레이푸스 근위축병 (EDMD), 사지연결근육(limb-girdle) 근위축병 (LGMD), 안면견갑상완 근위축병 (FSH 또는 FSHD) (또한 랑도우지-데제린으로도 알려짐), 근긴장 이영양증 (MMD); 또한 스테인에르트(Steinert)의 질환으로도 알려짐), 눈인두 근위축병 (OPMD), 말단근위축병 (DD), 선천적 근위축병 (CMD)을 포함한다.
듀시엔 근위축병 (DMD)은 1860년대 프랑스 신경학자 Guillaume Benjamin Amand Duchenne에 의해 처음으로 기술되었다. 베커 근위축병 (BMD)은 독일 의사 Peter Emil Becker의 이름을 따서 부른 것으로, 그는 1950 년대에 DMD 변종을 최초로 기술했다. DMD는 남성에서 가장 흔히 유행하는 유전 질환 중 하나로, 3,500명중 한 명 꼴로 영향을 준다. DMD는 X 염색체의 짧은 팔에 위치한 디스트로핀 유전자가 파괴되어 있을 때 발생한다. 남성은 X 염색체의 사본 하나만 가지고 있기 때문에, 은 디스트로핀 유전자의 사본 하나만 가지고 있다. 디스트로핀 단백질이 없으면, 수축과 이완주기 동안 근육이 쉽게 손상된다. 질병의 초기에 근육이 재생 작용에 의해 보상되지만, 나중에 근육 전구 세포는 진행되는 손상을 따라 잡을 수 없으며 건강한 근육은 기능이 없는 섬유-지방 조직으로 대체된다.
BMD는 디스트로핀 유전자에서 상이한 돌연변이로 인한 것이다. BMD 환자는 약간의 디스트로핀을 가지고 있지만, 불충분하거나 질이 낮다. 일부 디스트로핀의 존재는 BMD 환자에서 근육을 DMD 사람의 근육만큼 나쁘게 또는 빠르게 퇴행하는 것으로부터 보호한다.
예를 들면, 연구에 따르면, 생체 내에서 GDF8의 기능을 차단하거나 제거하면 DMD 및 BMD 환자의 특정 증상을 효과적으로 치료할 수 있음이 입증되었다. 따라서, 대상 변이체 ActRIIB 단백질은 GDF8 억제제 (길항제)로 작용하여, DMD 및 BMD 환자의 생체에서 GDF8 및/또는 ActRIIB의 기능을 차단시키는 대체 수단을 구성한다.
유사하게, 대상 변이체 ActRIIB 단백질은 근육 성장을 필요로 하는 다른 질환 상태에서 근육량을 증가시키는 효과적인 수단을 제공할 수 있다. 예를 들면, 루게릭 질환 (운동 뉴런 질환)으로 불리는, ALS는 뇌를 골근육에 연결시키는 CNS 성분인 운동 뉴런을 공격하는 만성적, 진행성 및 난치성 CNS 장애다. ALS에서 운동 뉴런은 악화되고 결국 죽고, 사람의 뇌는 정상적으로 기능을 발휘하고 경고를 받지만, 움직이는 명령은 결코 근육에 도달하지 않는다. ALS를 얻게 되는 대부분의 사람들 연령은 40 세에서 70 세 사이다. 약화되는 첫 번째 운동 뉴런은 팔이나 다리로 이끄는 운동 뉴런이다. ALS 환자는 걷는데 어려움을 겪을 수도 있고, 물건을 떨어 뜨릴 수도 있고, 넘어질 수도 있고, 발음이 분명하지 않거나, 웃거나 우는 것이 통제가 되지 않을 수 있다. 궁극적으로, 팔다리의 근육은 사용하지 않음으로써 위축되기 시작한다. 이 근력 약화는 쇠약 해지고 휠체어가 필요하거나 침대에서 기능을 수행 할 수 없게 된다. 대부분의 ALS 환자는 호흡 부전, 또는 질병 발생 후 3 ~ 5 년내 폐렴 같은 인공 호흡기 합병증으로 사망한다.
변이체 ActRIIB 단백질-유도된 증가된 근육량은 또한 근육 소모 질환을 앓고 있는 사람들에게 도움이 될 수 있다. Gonzalez-Cadavid et al. (supra)는 GDF8 발현은 사람의 무-지방량과 반비례하며, GDF8 유전자 발현의 증가는 AIDS 소모성 증후군 남성의 체중 감소와 관련이 있다고 보고하였다. AIDS 환자에서 GDF8의 기능을 억제함으로써, AIDS 환자의 삶의 질을 크게 향상시키면서, AIDS 증상을 적어도 완전히 제거되지는 못하더라도 완화시킬 수 있다.
GDF8 기능의 상실은 영양 섭취 감소 없이, 지방 손실과 관련되기 때문에(Zimmers et al., supra; McPherron and Lee, supra), 대상 변이체 ActRIIB 단백질은 비만 및 타입 2 당뇨병의 발달을 지연 또는 방지하기 위한 치료물질로 추가 이용될 수 있다.
암성 식욕부진-악액질 증후군은 암의 가장 쇠약하고 생명을 위협하는 양상 중 하나다. 암 식욕부진-악액질 증후군에서 점진적 체중 감소는 많은 종류의 암의 공통적인 특징이고, 화학 요법에 대한 저조한 반응의 원인으로써, 비슷한 종양이 있지만 체중 감소가 없는 환자보다 생존 기간이 짧아지게 되는 원인이 된다. 식욕 부진, 지방과 근육 조직의 낭비, 심리적 고통, 그리고 낮은 삶의 질과 관련하여 악액질은 암과 숙주 사이의 복합적인 상호 작용으로 발생한다. 이것은 암 환자의 가장 흔한 사망 원인 중 하나이며, 사망자의 80 %에서 존재한다. 이것은 단백질, 탄수화물 및 지방 신진 대사에 영향을 미치는 대사성 혼란의 복잡한 예가 된다. 종양은 직접 및 간접적 비정상 모두를 일으키고, 식욕 부진 및 체중 감소를 초래한다. 현재, 이 과정을 조절하거나 역전시킬 수 있는 치료법은 없다. 암 식욕부진-악액질 증후군은 사이토킨 생산, 지질 동원 및 단백질 분해-유도 인자의 방출 및 중개 대사의 변화에 영향을 미친다. 비록 식욕 부진은 일반적이지만, 식이 섭취량 감소만으로는 암 환자에서 볼 수 있는 신체 조성 변화를 설명할 수 없으며, 영양 섭취를 늘리는 것으로 소비 증후군을 역전시킬 수 없다. 질병이 발생하기 전 6개월 이내 몸무게의 5% 이상의 비자발적인 체중 감소가 6 개월 이내에 발생할 경우 암 환자에서 악액질되어야 한다.
성체 마우스에서 GDF8의 전신 과발현이 인간 악액질 증후군에서 볼 수 있는 것과 유사한 심한 근육 및 지방 손실을 유도하는 것으로 밝혀졌기 때문에(Zimmers et al., supra), 대상 변이체 ActRIIB 단백질은 근육 성장이 요구되는 악액질 증후군의 증상을 예방, 치료 또는 경감 시키는데 유리하게 사용될 수 있다.
다른 구체예들에서, 본 발명은 뼈 및/또는 연골 형성을 유도하는 방법, 뼈 손실을 방지하는 방법, 뼈의 무기화를 증가시키는 방법, 뼈의 탈회를 방지하는 방법 및/또는 뼈의 밀도를 증가시키는 방법을 제공한다. 예를 들면, 대상 변이체 ActRIIB 단백질은 인간 및 다른 동물에서 골다공증 치료 및 뼈 골절 및 연골 결손 치료에 응용할 수 있다. 변이체 ActRIIB 단백질은 골다공증 발병에 대한 보호 수단으로서, 준임상적 저 골밀도로 진단된 환자에게 유용할 수 있다.
하나의 특이적 구체예에서, 본 발명의 방법 및 조성물은 인간 및 다른 동물의 뼈 골절 및 연골 결함 치료에 의학적 유용성이 있을 수 있다. 이 방법 및 조성물은 폐쇄 및 개방 골절 감소 및 인공 관절의 개선된 고정에서 예방 용도로 사용될 수 있다. 골 형성제에 의해 유발된 신생 골 형성은 선천성, 외상-유도된 또는 종양 절제술로 인한 두개 안면 결함의 치료에 기여하며, 미용 성형 수술에도 또한 유용하다. 더욱이, 본 발명의 방법 및 조성물은 치주 질환의 치료 및 다른 치아 복구 과정에서 사용될 수 있다. 특정 경우에서, 대상 변이체 ActRIIB 단백질은 뼈 형성 세포를 끌어들이고, 뼈 형성 세포의 성장을 자극하거나, 뼈 형성 세포의 전구 세포 분화를 유도하는 환경을 제공 할 수 있다. 본 발명의 변이체 ActRIIB 단백질은 골다공증 치료에 또한 유용할 수 있다. 또한, 변이체 ActRIIB 단백질은 연골 결함의 복구 및 골관절염의 예방/역전에 이용될 수 있다.
또다른 특이적 구체예에서, 본 발명은 골절 및 연골 및/또는 골 결손 또는 치주 질환과 관련된 다른 상태를 치료하기 위한 치료 방법 및 조성물을 제공한다. 본 발명은 상처 치유 및 조직 복구를 위한 치료 방법 및 조성물을 추가로 제공한다. 상처의 종류에는 화상, 절개 및 궤양이 포함되지만, 이에 국한되지는 않는다. 가령, PCT 공개 번호. WO84/01106 참고. 이러한 조성물들은 약학으로 수용가능한 비이클, 운반체, 또는 매트릭스에 혼합된 본 발명의 변이체 ActRIIB 단백질 길항제의 치료 효과량을 포함한다.
또다른 특이적 구체예에서, 본 발명의 방법 및 변이체 ActRIIB 단백질은 뼈 소실을 야기하는 상태, 이를 테면 골다공증, 부갑상선항진증, 쿠싱 질환, 갑상선항진증, 만성 설사 상태 또는 흡수불량, 신요세관산증, 또는 신경성 식욕부진에 적용될 수 있다. 여성이거나, 체중이 적고, 좌식 생활 방식을 선호하는 것은 골다공증(골 미네랄 밀도 감소로 골절 위험으로 이어짐)의 위험 요소라는 것을 많은 사람들이 알고 있다. 그러나, 골다공증은 또한 특정 약물의 장기간 사용으로 발생할 수 있다. 약물 또는 다른 의학적 상태로 인한 골다공증은 2 차 골다공증으로 알려져 있다. 쿠싱 질환으로 알려진 상태에서는 신체가 생성하는 과량의 코티솔이 골다공증과 골절을 유발한다. 이차성 골다공증과 관련된 가장 흔한 약물은 부신피질 호르몬에 의해 자연적으로 생성되는 호르몬인 코티솔처럼 작용하는 약물의 부류인 코르티코스테로이드이다. 적절한 수준의 갑상선 호르몬(갑상선에 의해 생성되는)이 골격 형성에 필요하지만, 과도한 갑상선 호르몬은 시간이 지남에 따라 뼈 질량을 감소시킬 수 있다. 알루미늄을 함유한 제산제는 신장 문제가 있는 사람, 특히 투석중인 사람이 과다 복용했을 때 뼈가 소실될 수 있다. 2차 골다공증을 야기할 수 있는 다른 약물로는 발작을 예방하는데 이용되는 페니토인 (Dilantin) 및 바르비투레이트; 메토트렉세이트 (Rheumatrex, Immunex, Folex PFS), 일부 관절염, 암 및 면역장애용 약물; 사이클로스포린 (Sandimmune, Neoral), 일부 자가면역 질환을 치료하고, 장기 이식 환자에서 면역계를 억제하는데 이용되는 약물; 전립선 암 및 자궁내막증 치료에 이용되는 황체형성 호르몬-방출 호르몬 항진제 (Lupron, Zoladex); 헤파린(Calciparine, Liquaemin), 항응고 약물; 그리고 고콜레스테롤을 치료하는데 이용되는 콜레스티라민 (Questran) 및 콜레스티폴 (Colestid)을 포함한다.. 잇몸 질환은 입안에 있는 유해 박테리아가 우리 몸을 강제로 방어하기 때문에 골 손실을 유발한다. 박테리아는 잇몸 아래에 독소와 효소를 생성하여 만성 감염을 일으킨다.
추가 구체예에서, 본 발명의 상기 변이체 ActRIIB 단백질은 비정상적이거나 원치않는 뼈 성장과 관련된 질병 또는 장애를 치료하기 위한 방법 및 치료제를 제공한다. 예를 들면, 진행성 골화성 섬유이형성증(FOP)으로 알려진 질병을 가진 환자는 운동을 막는 비정상적인 "제2 골격"을 성장시킨다. 추가적으로, 고관절 대체 수술 후 비정상적인 뼈의 성장이 일어나서 수술 결과를 망칠 수 있다. 이것은 본 방법 및 조성물이 치료 학적으로 유용할 수 있는 병리학적 뼈 성장 및 상황의 좀더 일반적인 예이다. 동일한 방법 및 조성물들은 다른 형태의 비정상적 뼈 성장 (가령, 외상, 화상 또는 척수 손상 후 뼈의 병리학적 성장)을 치료하고), 그리고 전이성 전립선 암 또는 골육종과의 연관하여 볼 수 있는 비정상적인 뼈 성장과 관련된 바람직하지 않은 상태를 치료 또는 예방하는데 유용 할 수 있다.
다른 구체예들에 있어서, 변이체 ActRIIB 단백질은 동물의 체지방 함량을 조절하고, 이와 관련된 상태, 특히 이와 관련된 건강을 해치는 상태를 치료 또는 예방하는데 사용될 수 있다. 본 발명에 따르면, 체중을 조절(관리)하는 것은 체중을 줄이거나 늘리거나, 체중 증가속도를 줄이거나 늘리거나, 체중 감소 속도를 줄이거나 늘리는 것을 의미 할 수 있으며, 체중을 적극적으로 유지하거나, 또는 (예 : 그렇지 않으면 체중을 증가시키거나 감소시킬 수 있는 외부 또는 내부 영향에 대해).크게 변화시키지 않을 수도 있다. 본 발명의 한 구체예는 변이체 ActRIIB 단백질을 필요로 하는 동물(가령, 인간)에게 투여함으로써 체중을 조절하는 것에 관계한다.
하나의 특이적 구체예에서, 본 발명은 동물의 체중 감소 및/또는 체중 증가를 감소시키기 위해, 보다 구체적으로는 비만의 위험이 있거나 비만으로 고통받는 환자의 비만을 치료 또는 개선하기 위해 사용될 수 있는 방법 및 화합물에 관한 것이다. 또다른 특이적 구체예에서, 본 발명은 체중의 증가 또는 유지할 수 없는 동물(예를 들어, 소모성 증후군을 가진 동물)을 치료하는 방법 및 화합물 에 관한 것이다. 그러한 방법은 체중 및/또는 체질량을 증가시키거나, 체중 및/또는 체질량 손실을 감소시키거나, 바람직하지 않게 낮거나 (예를 들어, 건강에 해로운) 체중 및/또는 체질량과 관련된 상태를 개선 시키는데 효과적이다.
특정 양태에서, 변이체 ActRIIB 단백질은 적혈구 수준을 증가시키고, 빈혈을 치료 또는 예방하며, 및/또는 이를 필요로 하는 대상에서 비효율적인 적혈구를 치료 또는 예방하는데 사용될 수 있다. 특정 양태에서, 본 명세서의 변이체 ActRIIB 단백질은 적혈구 수준을 증가시키기 위한 통상적인 치료 방법, 특히 다중요인 기원의 빈혈을 치료하는데 사용되는 방법과 조합하여 사용될 수 있다. 적혈구 수준을 증가시키기 위한 통상적인 치료 접근법은 예를 들어 적혈구 수혈, 하나 이상의 EPO 수용체 활성화제의 투여, 조혈 줄기 세포 이식, 면역 억제 생물 제제 및 약물 (예 : 코르티코 스테로이드)을 포함한다. 특정 구체예들에서, 본 명세서의 변이체 ActRIIB 단백질은 이를 필요로 하는 대상에서 빈혈 치료 또는 예방하는데 사용될 수 있다. 특정 구체예들에서, 본 명세서의 변이체 ActRIIB 단백질은 비효율적인 적혈구 생성증 및/또는 비효율적인 적혈구 생성과 관련된 장애를 치료 또는 예방하기 위해 사용될 수 있다. 특정 양태에서, 본 명세서의 변이체 ActRIIB 단백질은 빈혈 또는 비효과적인 적혈구 생성 장애의 치료 또는 예방을 위한 통상적인 치료 방법, 특히 다중 요인 기원의 빈혈 치료에 사용되는 것들과 조합하여 사용될 수 있다.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 장애 또는 상태를 "방지하는" 치료는 통계적 시료에서 처리안된 대조 시료와 비교하여 처리된 시료에서 장애 또는 상태의 발생이 감소되거나, 또는 처리안된 대조 시료와 비교하여 장애 또는 상태의 하나 또는 그 이상의 증상의 개시를 지연시키거나 또는 그 중증도를 감소시키는 화합물을 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "치료하는"은 특정 상태가 일단 확립되면 그 상태의 개선 또는 제거를 포함한다.
어느 경우에나, 예방 또는 치료는 의사 또는 다른 건강 관리 제공자에 의해 제공된 진단 및 치료제 투여의 의도된 결과로 식별 될 수 있다.
일반적으로, 본 명세서에서 설명된 질환 또는 상태의 치료 또는 예방은 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질의 "유효량"을 투여하여 이루어진다. 물질의 유효량이란 필요한 치료 또는 예방 결과를 달성하는데 필요한 투여량 및 필요한 시간 동안 효과적인 양을 지칭한다. 본 발명의 약제의 "치료학적 유효량"은 질환 상태, 개체의 나이, 성별 및 체중, 및 개체에서 원하는 반응을 유도하는 약제의 능력에 따라 달라질 수 있다. 물질의 "예방차원의 유효량"이란 원하는 예방 결과를 달성하는데 필요한 투여량 및 필요한 시간 동안 효과적인 양을 지칭한다.
특정 구체예들에서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 임의선택적으로 EPO 수용체 활성물질과 복합되어, 건강한 개인 및 선택된 환자 집단에서 적혈구, 헤모글로빈 또는 망상 적혈구 수준을 높이기 위해 사용될 수 있다. 적절한 환자 모집단의 예로는 적혈구가 적거나 헤모글로빈 수치가 낮은 환자, 예를 들어 빈혈 환자, 그리고 바람직하지 않은 적혈구 또는 헤모글로빈 수치를 생성 할 위험이 있는 환자, 예를 들어 대수술을 받기 시작하는 환자 또는 실질적으로 혈액 손실로 이어질 수 있는 다른 수술을 받는 환자들을 포함한다. 한 구체예에서, 적절한 적혈구 수준을 가진 환자는 적혈구 수준을 높이기 위해 하나 또는 그 이상의 변형 ActRIIB 단백질로 치료되고, 그 다음, 채혈하여 나중에 수혈에 사용하기 위해 혈액을 저장한다.
본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질, 임의선택적으로 EPO 수용체 활성물질과 복합되어, 빈혈 환자에서 적혈구 세포 수준, 헤모글로빈 수준, 및/또는 헤마토크릿 수준을 증가시키는데 이용될 수 있다. 사람의 헤모글로빈 및/또는 헤마토크릿 수준을 관찰할 때, 적절한 연령 및 성별 범주에서 정상 수준보다 낮은 수준은 개인차가 고려되지만, 빈혈을 나타낼 수 있다. 예를 들면, 10-12.5 g/dl, 전형적으로 약 11.0 g/dl의 헤모글로빈 수준은 건강 성인에서 정상 범위 내에 있는 것으로 간주되며, 치료 측면에서 목표 수치가 낮으면 심장 혈관 부작용이 줄어들 수 있다 [가령, Jacobs et al. (2000) Nephrol Dial Transplant 15, 15-19 참고]. 대안으로, 헤마토크릿 수준(세포가 차지하는 혈액 샘플의 부피의 백분율)을 빈혈의 척도로 사용할 수 있다. 건강한 사람의 헤마토크릿 수준은 성인 남성의 경우 약 41-51 %이고, 성인 여성의 경우 35-45 %이다. 특정 구체예들에서, 환자는 적혈구, 헤모글로빈 및/또는 헤마토크릿의 목표 수준으로 환자를 회복시키려는 투약 요법으로 치료될 수 있다. 헤모글로빈 및 헤마토크릿 수준은 사람마다 다르므로, 최적으로 표적 헤모글로빈 및/또는 헤마토크릿 수치를 각 환자 별로 개별화시킬 수 있다.
빈혈은 조직 손상, 감염 및/또는 만성 질환, 특히 암을 가진 환자에서 빈번하게 관찰된다. 일부 피험자에서, 빈혈은 낮은 에리스로포이에틴 수치 및/또는 골수 내 에리트로포이에틴에 대한 부적절한 반응으로 구별된다 [가령, Adamson (2008) Harrison's Principles of Internal Medicine, 17th ed.; McGraw Hill, New York, pp 628-634 참고]. 빈혈의 잠재적 원인으로는 혈액 상실, 영양 결핍 (예 : 단백질의 식이 섭취 감소), 약물 반응, 골수와 관련된 다양한 문제 및 많은 질병이 있다. 좀더 구체적으로, 빈혈은 예를 들어, 골수 이식을 포함하는 다양한 장애 및 상태와 관련되어 있다; 예를 들면, 골수 이식; 고형 종양 (예를 들어, 유방암, 폐암 및 결장암); 림프계의 종양 (예를 들어, 만성 림프구 백혈병, 비-홉킨스 림프종 및 호지킨 림프종); 조혈계의 종양 (예컨대, 백혈병, 골수이형성 증후군 및 다발성 골수종); 방사선 요법; 화학 요법 (예, 백금 함유 요법); 류마티스성 관절염, 다른 염증성 관절염, 전신성 홍반성 루푸스 (SLE), 급성 또는 만성 피부 질환 (예, 건선), 염증성 장 질환 (예를 들어, 크론병 및 궤양성 대장염)을 포함하지만, 이에 한정되지 않는 염증성 및 자가 면역 질환; 특발성 또는 선천성 질환을 포함한 급성 또는 만성 신장 질환 또는 부전; 급성 또는 만성 간 질환; 급성 또는 만성 출혈; 환자의 동종 항체 또는 자가 항체 및/또는 종교적 이유로 (예 : 여호와의 증인) 적혈구 수혈이 불가능한 상황; 감염 (예, 말라리아 및 골수염); 예를 들어, 겸상 적혈구 질환 (빈혈), 지중해빈혈; 약물 사용 또는 남용 (예 : 알코올 남용); 수혈을 피하는 어떤 원인으로부터의 빈혈이 있는 소아 환자; 고령 환자 또는 순환기 과부하에 대한 우려로 수혈을 받지 못하는 빈혈이 있는 심폐 질환이 있는 환자 [가령, Adamson (2008) Harrison's Principles of Internal Medicine, 17th ed.; McGraw Hill, New York, pp 628-634 참고]. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 본 명세서에 개시된 하나 이상의 장애 또는 상태와 관련된 빈혈을 치료 또는 예방하는데 사용될 수 있다.
많은 요인들이 암-관련 빈혈에 기여할 수 있다. 일부는 질병 과정 자체 및 인터루킨-1, 인터페론 감마 및 종양 괴사 인자와 같은 염증성 사이토킨의 생성과 관련이 있다 [Bron et al. (2001) Semin Oncol 28(Suppl 8):1-6]. 그것의 효과중, 염증은 중요한 철 조절 펩티드 헵시딘(hepcidin)을 유도하고, 그로 인하여 대식 세포에서 철 배출을 금지하고 일반적으로 적혈구 생성을 위한 철 가용성을 제한한다 [가령, Ganz (2007) J Am Soc Nephrol 18:394-400 참고]. 다양한 경로를 통한 혈액 손실 또한 암 관련 빈혈의 원인이 될 수 있다. 암 진행으로 인한 빈혈의 유병률은 암 유형에 따라 다르며, 전립선 암 5 %에서 다발성 골수종의 90 %까지 다양하다. 암-관련 빈혈은 피로 회복, 삶의 질 감소, 치료 효능 감소, 사망률 증가 등 환자에게 중대한 결과를 초래한다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 임의선택적으로 EPO 수용체 활성물질과 복합되어, 암-관련된 빈혈을 치료하는데 이용될 수 있다.
과소증식성(hypoproliferative) 빈혈은 일차 장애 또는 골수의 부전으로 발생할 수 있다. 과소증식성 빈혈은 만성 질환의 빈혈, 신장병의 빈혈, 저혈압 상태와 관련된 빈혈 및 암과 관련된 빈혈을 포함한다. 이러한 유형의 각각에서, 내인성 에리트로포에틴 수치는 관찰된 빈혈의 정도에 대해 부적절하게 낮다. 다른 과소증식성 빈혈에는 초기 단계의 철분-결핍 빈혈 및 골수 손상으로 인한 빈혈이 있다. 이러한 유형에서 내인성 에리트로포에틴 수치는 빈혈의 정도에 따라 적절히 상승된다. 저명한 예로는 암 및/또는 화학 요법 약물 또는 암 방사선 치료로 인한 골수 억제이다. 임상 시험에 대한 광범위한 검토에서, 화학요법 후 환자의 100 %에서 경미한 빈혈이 발생할 수 있고, 그 중 80 %에서 중증의 빈혈이 발생할 수 있음을 알았다[가령, Groopman et al. (1999) J Natl Cancer Inst 91:1616-1634 참고]. 골수 억제 약물은 예를 들면 다음과 같다: 1) 질소 머스타드 (예 : 멜팔란) 및 니트로소우레아 (예 : 스트렙토조신)와 같은 알킬화제; 2) 엽산 길항제 (예 : 메토트렉세이트), 퓨린 유사체 (예 : 티오구아닌) 및 피리미딘 유사체 (예, 겜시타빈)와 같은 대사 물질; 3) 세포독성 항생제, 예컨대 안트라사이클린 (예컨대, 독소루비신); 4) 키나제 억제제 (예 : 게피티닙); 5) 탁산 (예 : 파클리탁셀) 및 빈카 알칼로이드 (예 : 비노렐빈)와 같은 유사 분열 억제제; 6) 모노클로날 항체 (예 : 리툭시맵); 그리고 7) 토포아이소머라제 억제제 (예 : 토포테칸 및 에토포사이드). 또한, 낮은 대사율을 초래하는 상태는 경증부터 중등도의 과소증식성 빈혈을 유발할 수 있다. 이러한 상태중 내분비 결핍 상태가 있다. 예를 들면, 빈혈은 애디슨 병, 갑상선 기능 항진증, 부갑상선 기능 항진증 또는 에스트로겐으로 거세되거나 치료된 남성에게서 발생할 수 있다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 임의선택적으로 EPO 수용체 활성물질과 복합되어, 과소증식성 빈혈 치료에 이용될 수 있다.
만성 신장 질환은 종종 과소증식성 빈혈과 연관되며, 빈혈의 정도는 신장 손상 수준에 따라 다르다. 이러한 빈혈은 주로 적혈구 생성의 부적절한 생산과 적혈구의 생존 감소로 인한 것이다. 만성 신장 질환은 보통 환자의 생존을 위해 투석이나 신장 이식이 필요한 시점에서 수십 년 또는 수십 년에 걸쳐 점진적으로 말기 (Stage-5) 병으로 진행된다. 빈혈은 종종 이 과정 초기에 발병하며, 질병이 진행됨에 따라 악화된다. 신장 질환의 빈혈의 임상 결과는 잘 기록되어 있으며, 좌심실 비대의 발달, 인지 기능의 손상, 삶의 질 감소 및 면역 기능의 변화가 포함된다 [가령, Levin et al. (1999) Am J Kidney Dis 27:347-354; Nissenson (1992) Am J Kidney Dis 20(Suppl 1):21-24; Revicki et al. (1995) Am J Kidney Dis 25:548-554; Gafter et al., (1994) Kidney Int 45:224-231 참고]. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 임의선택적으로 EPO 수용체 활성물질과 복합되어, 급성 또는 만성 신장 질환 또는 부전과 관련된 빈혈을 치료하는 데 사용될 수 있다.
외상이나 산후 출혈과 같이 충분한 양의 급성 혈액 손실로 인한 빈혈은 출혈성 급성 후천성 빈혈으로 알려져 있다. 급성 혈액 손실은 다른 혈액 성분과 함께 RBCs의 비율적 고갈 때문에, 초기에는 빈혈없이 혈액량 감소를 일으킨다. 그러나, 혈액량 감소증은 혈관 밖에서 혈관으로 유체를 이동시키는 생리적 메커니즘을 빠르게 유발하여 혈액 희석 및 빈혈을 유발한다. 만성적인 경우, 혈액 손실은 점차적으로 신체 철 저장소를 고갈시키고, 결국 철 결핍으로 이어진다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 임의선택적으로 EPO 수용체 활성물질과 복합되어, 급성 혈액 손실로 인한 빈혈 치료에 사용할 수 있다.
철-결핍 빈혈은 음성적 철 균형 및 철-부족 조혈을 포함하는 철분 결핍증의 단계적인 진행의 최종 단계이다. 철분 결핍은 임신, 부적절한 식이, 장 흡수 장애, 급성 또는 만성 염증, 급성 또는 만성 출혈과 같은 상태에서 볼 수 있듯이 철 수요 증가, 철분 섭취 감소 또는 철 손실 증가로 인해 발생할 수 있다. 이런 종류의 경증부터 중등도의 빈혈증에서, 골수는 과소증식성을 유지하며, RBC 형태는 대체로 정상이고; 그러나 경미한 빈혈증 조차도 소적혈구 저색소성 적혈구를 유발할 수 있고, 그리고 심한 철분 결핍성 빈혈로의 전환은 골수의 과다 증식과 점점 더 널리 퍼진 소적혈구 및 저색소성 적혈구를 동반한다[가령, Adamson (2008) Harrison's Principles of Internal Medicine, 17th ed.; McGraw Hill, New York, pp 628-634 참고]. 철-결핍성 빈혈에 대한 적절한 치료법은 경구용 철 제제, 비경 구용 철 제제 및 주요한 재래식 수단으로써 RBC 수혈과 함께, 그 원인과 중증도에 따라 달라진다. 일부 구체예들에서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 임의선택적으로 EPO 수용체 활성물질과 복합되어, 만성 철-결핍 치료에 이용될 수 있다.
골수이형성 증후군 (myelodysplastic syndrome, MDS)은 골수 혈액 세포의 비효율적인 생산과 급성 골수성 백혈병으로의 변형 위험을 특징으로 하는 다양한 혈액학적 상태의 집합이다. MDS 환자에서, 혈액 줄기 세포는 건강한 적혈구, 백혈구 또는 혈소판으로 성숙하지 않는다. MDS 장애에는 예를 들어, 난치성 빈혈, 관상 철아구(sideroblasts)와 함께 난치성 빈혈, 과도한 돌발을 동반한 난치성 빈혈, 다중 형성장애와 함께 난치성 빈혈, 단리된 5q 염색체 이상과 관련된 골수 이형성 증후군이 포함된다. 이러한 질환이 조혈 세포의 양과 질 모두에서 돌이킬 수 없는 결점으로 나타나기 때문에, 대부분의 MDS 환자는 만성 빈혈을 앓고 있다. 따라서, MDS 환자는 결국 적혈구 수준을 높이기 위해, 수혈 및/또는 성장 인자 (예 : 적혈구 생성 인자 또는 G-CSF)로의 치료를 필요로 한다. 그러나, 많은 MDS 환자는 이러한 치료법의 빈도로 인해 부작용이 발생한다. 예를 들면, 적혈구 수혈을 자주 받는 환자는 여분의 철분 축적으로 인해 조직과 기관 손상을 입을 수 있다. 따라서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 MDS 환자를 치료하는데 이용될 수 있다. 특정 구체예들에서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질을 임의선택적으로 EPO 수용체 활성물질과 복합 이용함으로써, MDS를 앓고 있는 환자를 치료할 수 있다. 다른 구체예들에서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질 및 MDS를 치료하는 하나 또는 그 이상의 추가 치료 물질, 예를 들면, 탈리도미드, 레날리도미드, 아자시타딘, 데시타빈, 에리트로포에틴, 데페록사민, 안티티모사이트 글로블린, 그리고 필그라스트림(G-CSF)을 포함한 물질과 복합하여 MDS를 앓고 있는 환자를 치료할 수 있다.
철 동역학 연구(ferrokinetic studies)에 근거하여 재생불량 빈혈, 출혈, 또는 말초 용혈과는 기본적으로 구별되는[가령, Ricketts et al. (1978) Clin Nucl Med 3:159-164 참고], 비효율적인 적혈구생성은 빈혈의 다양한 집단을 기술하는데, 성숙한 적혈구의 생산은 골수에 존재하는 적혈구아세포(erythroblast)의 수를 감안할 때 예상보다 적다 [Tanno et al. (2010) Adv Hematol 2010:358283]. 이러한 빈혈에서 조직 저산소증은 성숙한 적혈구의 비효율적인 생산으로 인해 에리트로포에틴 수치가 상승함에도 불구하고 여전히 존재한다. 에리트로포에틴 수치가 높아지면 적혈구아세포가 엄청나게 팽창하여 골수외 적혈구 생성으로 인한 비장 비대 (비장 확대) [가령, Aizawa et al. (2003) Am J Hematol 74:68-72 참고], 적혈구아세포-유도된 뼈 병리 [가령, Di Matteo et al. (2008) J Biol Regul Homeost Agents 22:211-216 참고], 그리고 치료요법적 RBC 수혈없이도, 조직 철 과부하 [가령, Pippard et al. (1979) Lancet 2:819-821 참고]로 이어지게 되는 악순환이 결국 발생한다. 따라서, 적혈구 생성능을 증가시킴으로써, 본원의 변이체 ActRIIB 단백질은 전술한 사이클을 파괴할 수 있고, 따라서 기저 빈혈 뿐만 아니라 상승된 에리트로포에틴 수준, 비장 비대, 뼈 병리 및 조직 철 과다의 합병증을 경감시킬 수 있다. 일부 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질을 이용하여, 빈혈 및 상승된 EPO 수준을 포함하는 비효과적인 적혈구 생성, 뿐만 아니라 비장비대, 적혈구아세포-유발 뼈 병리, 철 과다 및 이들의 수반 병리와 같은 합병증을 치료 또는 예방하는데 사용될 수 있다. 비장비대가 있는 경우, 그러한 병리에는 흉부 또는 복부 통증 및 망상 내피 증식이 포함된다. 골수 형성 조혈은 비장에서 뿐만 아니라 다른 조직에서 골수외 조혈성 의사종양(pseudotumors)의 형태로 발생할 수 있다 [가령, Musallam et al. (2012) Cold Spring Harb Perspect Med 2:a013482 참고]. 적혈구아세포에 의해 유발된 뼈 병리에서, 수반되는 병리학은 낮은 뼈 미네랄 밀도, 골다공증 및 뼈 통증을 포함한다 [가령, Haidar et al. (2011) Bone 48:425-432 참고]. 철분 과부하가 있을 경우, 수반되는 병리학은 헵시딘 억제 및 식이 철분의 과다흡수 [가령, Musallam et al. (2012) Blood Rev 26(Suppl 1):S16-S19 참고], 다발성 내분비 및 간 섬유증/간경변증 [가령, Galanello et al. (2010) Orphanet J Rare Dis 5:11 참고], 그리고 철-과부하 심근 병증 [Lekawanvijit et al., 2009, Can J Cardiol 25:213-218]을 포함한다.
비효율적인 적혈구 생성의 가장 흔한 원인은 지중해빈혈, 유전성 혈색소 병증이며, 이때 고유의 알파-및 베타-헤모글로빈 쇄의 불균형은 적혈구아세포 성숙동안 증가된 세포자멸로 이어진다 [가령, Schrier (2002) Curr Opin Hematol 9:123-126 참고]. 지중해빈혈은 전 세계적으로 가장 빈번한 유전질환 중 하나이며, 역학적인 패턴의 변화는 미국 및 전세계적으로 증가되는 공중 보건 문제에 기여할 것으로 예측된다[Vichinsky (2005) Ann NY Acad Sci 1054:18-24]. 지중해빈혈 증후군은 그 심각도에 따라 명명된다. 따라서, α-지중해빈혈은 마이너(minor) α-지중해빈혈 (α-지중해빈혈 성향(trait)으로도 알려짐; 2개의 영향을 받은 α-글로빈 유전자), 헤모글로빈 H 질환 (3개의 영향을 받은 α-글로빈 유전자), 그리고 메이져(major) α-지중해빈혈 (태아수종(hydrops fetalis)으로도 알려짐; 4개의 영향을 받은 α-글로빈 유전자)를 포함한다. β-지중해빈혈은 β-지중해빈혈 마이너 (β-지중해빈혈 성향으로도 알려짐; 한개의 영향을 받은 β-글로빈 유전자), 중간(intermedia) β-지중해빈혈 (2개의 영향을 받은 β-글로빈 유전자), 헤모글로빈 E 지중해빈혈 (2개의 영향을 받은 β-글로빈 유전자), 그리고 β-지중해빈혈 메이져 (Cooley's 빈혈로도 공지됨; 2개의 영향을 받은 β-글로빈 유전자는 β-글로빈 단백질의 완벽한 부재롤 초래한다). β-지중해빈혈은 여러 장기에 영향을 미치고, 상당한 병적 상태와 사망률과 관련이 있으며, 현재 평생 동안 치료해야 한다. 최근 몇 년 사이에 정기적인 수혈을 통해 철분의 킬레이트화와 함께 β-지중해빈혈 환자의 평균 수명이 연장되었지만, 수혈과 철분의 과도한 위장 흡수로 인한 철분 과다로 인해 심장병, 혈전증, 성선기능 저하증, 갑상선기능 저하증, 당뇨병, 골다공증 및 골감 감소증을 야기할 수 있다 [가령, Rund et al. (2005) N Engl J Med 353:1135-1146 참고]. 특정 구체예들에서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 임의선택적으로 EPO 수용체 활성물질과 복합되어, 지중해빈혈 증후군을 치료 또는 예방할 수 있다.
일부 구체예들에서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 임의선택적으로 EPO 수용체 활성물질과 복합되어, 지중해빈혈 증후군 이외에 비효과적인 적혈구생성 장애를 치료하는데 이용될 수 있다. 이러한 장애는 다음의 질환을 포함한다: 철적모구(siderblastic) 빈혈 (유전적 또는 후천적); 적혈구이형성(dyserythropoietic) 빈혈 (유형 I 및 II); 겸상적혈구 빈혈; 유전성 구상적혈구증(hereditary spherocytosis); 피루베이트 키나제 결핍결핍; 상태, 이를 테면 엽산 결핍 (선천적 질환, 감소된 섭취, 또는 증가된 요구로 인한), 코발아민 결핍 (선천적 질환, 악성(pernicious) 빈혈, 손상된 흡수, 췌장 기능부전, 또는 감소된 섭취), 특정 약물, 또는 설명불가능한 원인(선천적 적혈구생성이상 빈혈, 난치성 거대적혈구성 빈혈, 또는 적백혈병)에 의한 잠재적인 거대적혈구(megaloblastic) 빈혈; 골수로성 빈혈(myelophthisic anemias), 예를 들면, 골섬유증(골수화생) 및 골수황폐증(myelophthisis) 포함; 선천성 적혈구조혈성 포르피린증(congenital erythropoietic porphyria); 그리고 납 중독.
특정 구체예들에서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 비효율적인 적혈구 형성을 위한 보충 요법과 함께 사용될 수 있다. 그러한 치료법은 적혈구 또는 전체 혈액을 수혈하여 빈혈을 치료하는 것이다. 만성 또는 유전성 빈혈에서, 반복되는 수혈로 인해 철성 항상성에 대한 정상적인 기전이 압도되고, 결국 심장, 간 및 내분비샘과 같은 중요한 조직에 철분이 독성적으로 및 잠재적으로 치명적으로 축적된다. 따라서, 비효율적인 적혈구 생성증으로 인하여 만성적으로 고통받는 환자를 위한 보충 요법은 소변 및/또는 대변에서 철분 배설을 촉진시키고, 조직 철분 과다를 방지하거나 역전시키는 하나 또는 이상의 철-킬레이트 분자로 치료하는 것을 포함한다 [가령, Hershko (2006) Haematologica 91:1307-1312; Cao et al. (2011), Pediatr Rep 3(2):e17 참고]. 효과적인 철-킬레이트제는 철 이온에 선택적으로 결합하고 중화시킬 수 있어야 한고, 이는 산화된 형태의 비-트랜스페린 결합된 철은 히드록시 래디컬 및 산화 생성물의 촉매 생성을 통해 대부분의 철 독성을 설명한다 [가령, Esposito et al. (2003) Blood 102:2670-2677 참고]. 이들 물질은 구조적으로 다양하지만, 모두 화학량론적으로 1 : 1 (헥사덴테이트 물질), 2 : 1 (트리덴테이트) 또는 3 : 1 (바이덴테이트)에서 개별 철 원자와 함께, 중화 8 면체 배위 착물을 형성할 수 있는 산소 또는 질소 공여체 원자를 가지고 있다[Kalinowski et al. (2005) Pharmacol Rev 57:547-583]. 일반적으로, 효과적인 철-킬레이트화제는 비교적 낮은 분자량 (예, 700 달톤 미만)이며, 영향을 받는 조직에 접근할 수 있도록 물 및 지질 모두에 용해성을 갖는다. 철-킬레이트 분자의 특정 예로는 매일 비경구 투여가 요구되는 박테리아 기원의 헥사덴테이트 제제인 데페록사민(deferoxamine)과 구강 활성 합성 제제인 데페리프론(deferiprone) (바이덴테이드) 및 데페라시록스(deferasirox) (트리덴테이트)가 있다. 두 가지 철 킬레이트 제제의 당일 투여로 구성된 병용 요법은 킬 레이션 단독 요법에 반응이 없는 환자에게도 효과가 있으며, 디레록사민 단독만으로는 환자의 순응도가 떨어지는 문제를 극복하는 데에도 도움이 된다 [Cao et al. (2011) Pediatr Rep 3(2):e17; Galanello et al. (2010) Ann NY Acad Sci 1202:79-86].
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "복합하여", "~의 조합" 또는 "공동 투여"는 제2 요법이 여전히 신체에서 효과적이도록 투여하는 임의의 형태를 의미한다 (예를 들어, 2개 화합물이 환자에서 동시에 효과적이며, 이들 두 화합물의 공조상승효과를 포함할 수 있음). 유효성은 혈액, 혈청 또는 혈장에서 측정가능한 약물 농도와 관련이 없을 수도 있다. 예를 들면, 상이한 치료 화합물은 동일한 제형 또는 별도 제형으로, 동시, 순차적 또는 상이한 일정에 의해 투여될 수 있다. 따라서, 그러한 치료를 받는 개인은 다른 치료법의 결합된 효과로부터 이익을 얻을 수 있다. 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 하나 또는 그 이상의 다른 추가적인 물질들 또는 보조 요법과 동시에, 이보다 앞서, 또는 후속적으로 투여될 수 있다. 일반적으로, 각각의 치료제는 특정 약제에 대해 결정된 투여량 및/또는 일정으로 투여될 것이다. 요법에서 사용하는 특정 조합은 본 명세서의 길항제와 치료 및/또는 얻을 수 있는 바람직한 치료 효과의 양립 가능성을 고려할 것이다.
특정 구체예들에서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 비효율적인 적혈구 형성을 위한 헵시딘 또는 헵시딘 항진제와 함께 사용될 수 있다. 간에서 주로 생산되는 순환하는 폴리펩티드인 헵시딘은 흡수성 장 세포, 간세포 및 대식세포에 국한된 철-배출 단백질인 페로포르틴(ferroportin)의 분해를 유도할 수 있는 능력으로 인해 철 대사의 마스터 조절자로 간주된다. 대체로, 헵시딘은 세포외 철의 이용 가능성을 감소시키므로, 헵시딘 항진용제는 비효율적인 적혈구 생성의 치료에 유익할 수 있다 [가령, Nemeth (2010) Adv Hematol 2010:750643 참고]. 이러한 견해는 β-지중해빈혈의 마우스 모델에서 증가된 헤파 시딘 발현의 유익한 효과에 의해 뒷받침된다 [Gardenghi et al. (2010) J Clin Invest 120:4466-4477].
본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 임의선택적으로 EPO 수용체 활성물질과 복합되어, 너무 작은 크기의(소세포성), 너무 큰 크기의 (거대 세포 성), 기형의, 또는 비정상적으로 착색된 (저색소성) RBC로 부분적으로 특징 지어지는 적혈구의 장애성 성숙의 빈혈을 치료하는데도 적합하다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 본 발명의 치료 유효량의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질 및 EPO 수용체 활성화 제를 이를 필요로 하는 개체에게 투여함으로써 빈혈을 치료 또는 예방하는 방법을 제공한다. 특정 구체예들에서, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 EPO 수용체 활성제와 함께 사용하여, EPO의 부작용에 민감한 환자에서 이들 활성화제의 필요한 투여량을 감소시킬 수 있다. 이들 방법은 환자의 치료 및 예방 치료에 사용될 수 있다.
본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 특히 EPO 수용체 활성화제의 저용량 범위에서 적혈구의 증가를 달성하기 위해 EPO 수용체 활성화제와 조합하여 사용될 수 있다. 이는 고용량의 EPO 수용체 활성화제와 관련된 공지된 오프-타겟 효과 및 위험을 감소 시키는데 유익할 수 있다. EPO의 주요 부작용으로는 예를 들어, 헤마토크릿 또는 헤모글로빈 수준의 과도한 증가와 적혈구증이 포함된다. 헤마토크릿 수치가 상승하면, 고혈압 (특히 고혈압의 악화) 및 혈관 혈전증이 유발될 수 있다. 보고된 EPO의 다른 부작용 중 일부는 고혈압과 관련이 있으며, 두통, 인플루엔자-유사 증후군, 션트 차단, 혈전증으로 인한 심근경색 및 뇌경련, 고혈압 뇌증 및 적혈구 혈액 세포 부전이 있다. 가령, Singibarti (1994) J. Clin Investig 72(suppl 6), S36-S43; Horl et al. (2000) Nephrol Dial Transplant 15(suppl 4), 51-56; Delanty et al. (1997) Neurology 49, 686-689; and Bunn (2002) N Engl J Med 346(7), 522-523 참고).
단, 본 명세서의 변이체 ActRIIB 단백질은 EPO와 다른 기전에 의해 작용하지만, 이들 길항제는 EPO에 잘 반응하지 않는 환자에서 적혈구 및 헤모글로빈 수준을 증가시키는데 유용 할 수 있다. 예를 들면, 본 명세서의 길항제는 정상 수준에서 부터 증가된 용량의 EPO (> 300IU/kg/주)를 투여해도 목표 수준까지 헤모글로빈 수준을 증가시키지 못하는 환자에게 유익할 수 있다. 부적절한 EPO 반응을 겪는 환자는 모든 유형의 빈혈에서 발견되지만, 더 많은 수의 비-반응자는 암 환자 및 말기 신장질환 환자에게서 특별히 더 흔히 관찰된다. EPO에 대한 부적절한 반응은 구성적 (EPO를 사용한 첫 번째 치료시 관찰됨)이거나 후천적 (EPO 반복 치료시 관찰됨)일 수 있다.
특정 구체예들에서, 본 명세서는 환자의 하나 또는 그 이상의 혈액학적 매개변수를 측정함으로써 본 발명의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질로 치료되었거나 또는 치료될 후보 를 관리하는 방법을 제공한다. 혈액학적 매개변수는 본 발명의 길항제로 치료될 후보인 환자에 대한 적절한 투약을 평가하고, 치료 중 혈액학적 매개변수를 모니터링하고, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 길항제로 치료하는 동안 투여량을 조절할지 여부 및/또는 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 길항제의 적절한 유지 투여량을 평가하는데 사용될 수 있다. 하나 또는 그 이상의 혈액학적 매개변수가 정상 수준을 벗어나는 경우, 본 발명의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질 투여를 감소, 지연 또는 종결시킬 수 있다.
본원에서 제공된 방법에 따라 측정될 수 있는 혈액학적 매개변수는 예를 들어 적혈구 수준, 혈압, 철 저장 및 당업계에서 인정된 방법을 사용하여 증가된 적혈구 수준과 상호 관련이 있는 체액에서 발견되는 다른 물질을 포함한다. 이러한 매개변수는 환자의 혈액 샘플을 사용하여 결정될 수 있다. 적혈구 세포 수준, 헤모글로빈 수준, 및/또는 헤마토크릿 수준의 증가는 혈압 증가의 원인일 수 있다.
한 구체예에서, 본 발명의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질로 치료될 후보 환자에서 하나 또는 그 이상의 혈액학적 매개변수가 정상 범위를 벗어나거나 정상의 상측에 있는 경우, 본 발명의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질 투여의 개시는 혈액학적 매개변수가 자연적으로 또는 치료적 중재를 통해 정상 수준 또는 허용 가능한 수준으로 되돌아 올 때까지 지연될 수 있다. 예를 들면, 후보 환자가 고혈압 또는 전-고혈압 환자인 경우, 환자는 혈압을 낮추기 위해 혈압 강하제로 치료할 수 있다. 환자의 상태에 알맞은 혈압 강하제를 사용할 수 있는데, 예를 들어, 이뇨제, 아드레날린 억제제(알파 차단제 및 베타 차단제 포함), 혈관 확장제, 칼슘 채널 차단제, 안지오텐신-전환 효소(ACE) 억제제, 또는 안지오텐신 II 수용체 차단제 등이 있다., 혈압은 식이 요법과 운동 요법을 사용하여 치료할 수도 있다. 유사하게, 후보자 환자가 정상보다 낮은 철 저장 또는 정상보다 낮은 철 저장을 가지고 있는 경우, 환자의 철 저장이 정상 수준 또는 수용 가능한 수준으로 회복 될 때까지, 환자는 적절한 식이 요법 및/또는 철 보충제를 사용하여 치료할 수 있다. 적혈구 수치 및/또는 헤모글로빈 수치가 정상보다 높은 환자의 경우, 공개된 ActRIIB 단백질의 하나 또는 이상의 변이체 ActRIIB 단백질의 투여는 수준이 정상 수준 또는 허용 수준으로 회복될 때까지 지연될 수 있다.
특정 구체예들에서, 본 발명의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질로 치료될 후보 환자에서 하나 또는 그 이상의 혈액학적 매개변수가 정상 범위를 벗어나거나 정상의 상측에 있는 경우,투여 시작이 지연되지 않을 수도 있다. 그러나, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질의 투여량 또는 투여 빈도는 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질이 투여시 발생되는 혈액학적 매개변수의 수용불가능한 증가 위험을 감소시킬 수 있는 양으로 설정될 수 있다. 대안으로, 이 환자를 위하여 바람직하지 않은 수준의 혈액학적 매개변수를 다루는 치료제와 함께 본 발명의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질을 조합한 치료법을 개발할 수 있다. 예를 들면, 환자가 고혈압을 갖는 경우, 본 명세서의 하나 또는 이상의 변이체 ActRIIB 단백질 및 혈압 강하제의 투여를 포함하는 치료 요법이 설계될 수 있다. 바람직한 철 저장보다 낮은 철 저장을 갖는 환자의 경우, 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질 및 철 보충제의 치료 요법이 개발될 수 있다.
한 구체예에서, 하나 또는 그 이상의 혈액학적 매개변수들에 대한 기저 매개변수(baseline parameter) (들)은 이 기저 값에 근거하여 이 환자용으로 확립된 적절한 투여 섭생 및 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질로 치료될 후보 환자에 대해 확립될 수 있다. 대안으로, 환자의 병력에 근거하여 확립된 기저 매개변수를 사용하여 환자에 대한 적절한 길항제-투여 요법을 통지할 수 있다. 예를 들면, 건강한 환자가 정의된 정상 범위를 초과하는 확립된 기저 혈압을 갖는 경우, 이 환자의 혈압을 명세서의 하나 또는 그 이상의 길항제로 치료하기 전, 일반인에게 정상적인 것으로 간주되는 범위로 가져갈 필요는 없다. 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질로 치료하기 전, 하나 또는 그 이상의 혈액학적 매개변수에 대한 환자의 기저 값은 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 길항제로 치료하는 동안 혈액학적 매개변수의 변화를 모니터링하기 위한 관련 비교 값으로 사용할 수도 있다.
특정 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 혈액학적 매개변수는 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질로 치료받는 환자에서 측정된다. 혈액학적 매개변수는 치료 중 환자를 모니터링하고, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 길항제 또는 다른 치료제와의 추가 투약으로 투약을 조정 또는 종료하는 데 사용할 수 있다. 예를 들면, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질의 투여로 혈압, 적혈구 수치 또는 헤모글로빈 수치가 증가하거나, 또는 철 저장량이 감소한다면, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질의 투여량은 하나 또는 그 이상의 혈액학적 매개변수에서 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질의 효과를 감소시키기 위하여 빈도 또는 그 양이 감소될 수 있다. 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질의 투여로 인하여 하나 또는 그 이상의 혈액학적 매개변수가 환자에게 불리하도록 변화된다면, 본 명세서의 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 상기 혈액학적 매개변수(들)이 수용가능한 수준으로 회복될 때까지 일시적으로, 또는 영구적으로 중단될 수 있다. 유사하게, 하나 또는 그 이상의 혈액학적 매개변수가 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질의 투여량 또는 투여 빈도를 줄인 후에도 허용 가능한 범위 내에 들지 않는다면, 투약이 종료될 수 있다. 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질의 투여 감소 또는 종료에 추가 또는 대안으로, 이 환자는 예를 들어 혈압 강하제 또는 철 보충제와 같은 혈액학적 매개변수 (들)의 바람직하지 않은 수준을 다루는 추가의 치료제를 투여할 수 있다. 예를 들면, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질로 치료된 환자의 혈압이 상승되었고, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 동일한 수준으로 투여를 지속할 것이라면, 혈압-강하제를 치료 요법에 추가되며, 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질의 투약이 감소되고 (가령, 양 및/또는 빈도), 혈압-강하제를 치료 요법에 추가되거나, 또는 본 명세서의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질의 투약을 종료하고, 혈압-강하제로 이 환자를 치료할 수 있다.
7. 약학 조성물
특정 구체예들에서, 본 발명의 화합물 (가령, 변이체 ActRIIB 단백질, 동종체 또는 이형 형태)은 약학적으로 수용가능한 담체와 함께 제형화된다. 예를 들면, 변이체 ActRIIB 단백질은 단독으로 또는 약학 제제 (치료 조성물)의 성분으로서 투여될 수 있다. 대상 화합물은 인간 또는 동물 용 의약에 사용하기 위한 임의의 편리한 방법으로 투여 용으로 제형화될 수 있다.
특정 구체예들에 있어서, 본 명세서의 치료 방법은 상기 조성물을 국소적으로, 전신 투여하거나, 또는 임플란트 또는 장치로부터 국소적으로 투여하는 것을 포함한다. 투여 될 때, 본 발명에서 사용하기 위한 치료용 조성물은 물론 발열성 물질이 없는 생리적으로 허용되는 형태이다. 또한, 조성물은 표적 조직 부위 (예를 들어, 뼈, 연골, 근육, 지방 또는 뉴런), 예를 들어, 조직 손상을 갖는 부위로 전달하기 위해 점성 형태로 캡슐화되거나 주입되는 것이 바람직할 수 있다. 국소 투여는 상처 치유 및 조직 복구에 적합할 수 있다. 전술한 바와 같이, 상기 조성물에 전술한 변이체 ActRIIB 단백질 조성물 이외의 치료 학적으로 유용한 제제가 임의선택적으로 포함되거나, 또는 대안으로 또는 추가적으로 본 발명의 방법에서 대상 화합물(가령, 변이체 ActRIIB 단백질)과 동시에 또는 순차적으로 투여될 수 있다.
특정 구체예들에서, 본 발명의 조성물은 표적 조직 부위로 하나 또는 그 이상의 치료 화합물 (예를 들어, 변이체 ActRIIB 단백질)을 전달할 수 있는 매트릭스를 포함하고, 이는 발생하는 조직을 위한 구조를 제공하고, 신체 내로 최적으로 재흡수될 수 있다. 예를 들면, 상기 매트릭스는 상기 변이체 ActRIIB 단백질의 지연 방출을 제공할 수 있다. 이러한 매트릭스는 다른 이식된 의학 용도에 현재 사용되는 재질로 형성될 수 있다.
매트릭스 재질은 생체적합성, 생분해성, 기계적 성질, 미용적 외관 및 경계면 성질을 기반으로 선택될 수 있다. 해당 조성물의 특정 용도가 적절한 제형을 규정할 것이다. 상기 조성물에 대한 잠재적 매트릭스는 생분해가능하며, 화학적으로 황산칼슘, 인산삼칼슘, 히드록시아파타이트, 폴리락트산 및 폴리안하이드리드로 규정될 수 있다. 다른 잠재적 물질은 예를 들면, 뼈 또는 피부 콜라겐과 같이, 생분해가능하며, 생물학적으로 잘 규정된 물질이다. 또한 매트릭스는 순수 단백질 또는 세포외 매트릭스 성분들로 구성된다. 다른 잠재적 매트릭스는 비-생분해성이며, 화학적으로 예를 들면, 소결(sintered) 히드록시아파타이트, 바이오글라스, 알루미네이트 또는 기타 세라믹과 같이 비-생분해성이며, 화학적으로 규정된다. 매트릭스는 예를 들면, 폴리락트산 및 히드록시아파타이트 또는 콜라겐 및 인산삼칼슘과 같이 전술한 유형의 물질의 조합을 포함할 수도 있다. 바이오 세라믹은 공극 크기, 입자 크기, 입자 형태 및 생분해성을 변경시키기 위하여 조성물(예, 칼슘-알루미네이트-포스페이트) 및 공정이 변경될 수 있다.
특정 구체예들에서, 본 발명의 변이체 ActRIIB 단백질은 예를 들면, 캡슐, 카시에(cachets), 알약, 테블릿, 로젠지(풍미제 베이스, 이를 테면 보통 슈크로스 및 아카시아 또는 트라가탄 이용), 분말, 과립, 또는 수성 또는 비-수성 액체에 용액 또는 현탁액, 수중유(oil-in-water) 또는 유중수(water-in-oil) 에멀션, 또는 엘릭시르(elixir) 또는 시럽, 또는 당의정(pastilles) (비활성 베이스, 이를 테면 젤라틴 및 글리세린, 또는 슈크로스 및 아카시아 이용), 및/또는 구강 세척제 및 이와 유사한 것으로 경구 투여될 수 있는데, 이들 각각은 예정된 양의 활성 성분을 함유한다. 물질은 또한 볼루스(bolus), 연질약(electuary), 또는 페이스트로 또한 투여될 수 있다.
경구 투여용 고체 투약형 (캡슐, 정제, 환제, 당의정, 분말, 과립 및 이와 유사한 것등)에서, 본 발명의 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 하나 또는 그 이상의 약학적으로 수용가능한 담체, 이를 테면 시트르산 나트륨 또는 인산이칼슘, 및/또는 다음중 임의의 것과 혼합될 수 있다: (1) 충전제 또는 증량제, 이를 테면, 전분, 락토스, 수크로스, 글루코스, 만니톨 및/또는 규산; (2) 결합제, 예를 들어 카르복시 메틸셀룰로스, 알긴산염, 젤라틴, 폴리비닐 피롤리돈, 수크로즈 및/또는 아카시아; (3) 글리세롤과 같은 보습제; (4) 붕해제, 이를 테면, 한천-한천, 탄산칼슘, 감자 또는 타피오카 전분, 알긴산, 특정 실리케이트 및 탄산나트륨; (5) 파라핀과 같은 용액 지연제; (6) 흡수 촉진제, 예컨대 4가 암모늄 화합물; (7) 습윤제, 예를 들어, 세틸 알코올 및 글리세롤 모노스테아레이트; (8) 카올린 및 벤토나이트 점토와 같은 흡수제; (9) 윤활제, 이를 테면, 활석, 칼슘 스테아레이트, 마그네슘 스테아레이트, 고체 폴리에틸렌 글리콜, 소듐 라우릴 설페이트 및 이들의 혼합물; 및 (10) 착색제. 캡슐, 테블릿 및 알약의 경우, 상기 약학 조성물은 완충 물질을 또한 포함할 수 있다. 유사한 유형의 고형 조성물은 또한 락토오스 또는 유당 뿐만 아니라, 고-분자량 폴리에틸렌 글리콜 등과 같은 부형제를 사용하여 연질 및 경질-충전된 젤라틴 캡슐에서 충전제로서 사용될 수 있다.
경구 투여를 위한 액체 투약형은 약학으로 수용가능한 에멀션, 마이크로에멀션, 용액, 현탁액, 시럽 및 엘릭시르를 포함할 수 있다. 활성 성분에 추가하여, 액체 투약 형태는 당업계에서 일반적으로 사용되는 불활성 희석제를 함유할 수 있으며, 이를 테면 물 또는 기타 용매, 가용화 물질 및/또는 유화제, 이를 테면 에틸 알콜, 이소프로필 알콜, 에틸 카르보네이트, 에틸 아세테이트, 벤질 알콜, 벤질 벤조에이트, 프로필렌 글리콜, 1,3-부틸렌 글리콜, 오일 (특히, 면실유, 땅콩, 옥수수) 및 글리세롤, 테트라 하이드로푸릴 알콜, 폴리에틸렌 글리콜 및 소르비탄의 지방산 에스테르 및 이들의 혼합물이 된다. 불활성 희석제 외에도, 경구 조성물은 습윤제, 유화제 및 현탁제, 감미제, 향료, 착색제, 향료 및 방부제와 같은 보조제를 포함할 수 있다.
현탁액에는 활성 화합물에 추가하여, 현탁화제, 예컨대 에톡 시화 이소스테아릴 알코올, 폴리옥시에틸렌 소르비톨 및 소르 비탄 에스테르, 미세결정 셀룰로오스, 알루미늄 메타히드록 시드, 벤토나이트, 한천-한천 및 트라가탄 및 이들의 혼합물이 포함될 수 있다.
본원에 개시된 특정 조성물은 피부 또는 점막에 국소 투여될 수 있다. 국소 제제는 피부 또는 각질층 침투 증진제로서 효과적인 것으로 공지된 하나 또는 그 이상의 다양한 제제를 추가로 포함할 수 있다. 이들의 예는 2-피롤리돈, N-메틸-2-피롤리돈, 디메틸아세트아미드, 디메틸포름아미드, 프로필렌 글리콜, 메틸 또는 이소프로필 알코올, 디메틸 술폭시드 및 아존이다. 제형을 화장용으로 허용하기 위해, 추가의 제제가 추가로 포함될 수 있다. 이러한 예로는 지방, 왁스, 오일, 염료, 향료, 방부제, 안정제 및 계면 활성제가 있다. 당 업계에 공지된 것과 같은 각질 용해제가 또한 포함될 수 있다. 예로는 살리실산과 황이다.
국소 또는 경피 투여를 위한 투여 형태는 분말, 스프레이, 연고, 페이스트, 크림, 로션, 겔, 용액, 패치 및 흡입제를 포함한다. 활성 화합물은 약학적으로 허용 가능한 담체, 및 필요에 따라 임의의 보존제, 완충제 또는 추진체와 멸균 상태 하에서 혼합될 수 있다. 연고, 페이스트, 크림 및 젤은 본 발명의 화합물(가령, 변이체 ActRIIB 단백질)이외에 동물성 및 식물성 지방, 오일, 왁스, 파라핀, 전분, 트라가탄, 셀룰로오스 유도체, 폴리에틸렌 글리콜, 실리콘, 벤토나이트, 규산, 활석 및 산화 아연, 또는 이들의 혼합물을 포함할 수 있다.
분말 및 스프레이는 대상 화합물 이외에, 락토오스, 활석, 규산, 수산화 알루미늄, 규산 칼슘 및 폴리아미드 분말 또는 이들 물질의 혼합물과 같은 부형제를 함유할 수 있다. 스프레이는 클로로플루오로 탄화수소 및 부탄 및 프로판과 같은 휘발성 치환되지 않은 탄화수소와 같은 통상적인 추진체를 추가로 포함할 수 있다.
특정 구체예들에서, 비경구 투여에 적합한 약학 조성물들은 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질과 하나 이상의 약학적으로 허용되는 멸균 등장성 수성 또는 비수용액, 분산액, 현탁액 또는 유화액, 또는 사용 직전에 멸균 주사 용액 또는 분산액으로 재구성될 수 있는 멸균 분말을 포함할 수 있는데, 이들은 항산화제, 완충액, 정균제, 제제를 의도된 수용자의 혈액과 등장성으로 만드는 용질, 또는 현탁제 또는 증점제를 함유할 수 있다. 본 발명의 약학 조성물에 사용될 수 있는 적합한 수성 및 비수성 담체의 예는 물, 에탄올, 폴리올 (예를 들어, 글리세롤, 프로필렌 글리콜, 폴리에틸렌 글리콜 및 이와 유사한 것등) 및 이들의 적절한 혼합물, 식물성 오일, 이를 테면, 올리브 오일, 주사가능한 유기 에스테르, 이를 테면, 에틸 올레에이트)을 포함한다. 적절한 유동성은 예를 들어, 코팅 물질, 이를 테면, 레시틴의 사용, 분산액의 경우 요구되는 입자 크기의 유지 그리고 계면 활성제의 사용에 의해 유지될 수 있다.
본 발명의 조성물은 또한 방부제, 습윤제, 유화제 및 분산제와 같은 어쥬번트(adjuvants)를 함유할 수 있다. 미생물의 작용의 예방은 파라벤, 클로로부탄올 및 페놀 소르브산 및 이와 유사한 것을 비롯한 다양한 항박테리아 및 항진균제를 포함시킴으로써 확보될 수 있다. 조성물에 설탕, 염화나트륨 등의 등장화제를 포함시키는 것이 바람직할 수도 있다. 또한, 예를 들어, 모노스테아르산 알루미늄 및 젤라틴을 포함하는 흡수를 지연시키는 물질을 포함시킴으로써 주사가능한 약형의 연장된 흡수가 이루어질 수 있다.
투여 섭생은 본 발명의 대상 화합물 (가령, 변이체 ActRIIB 단백질)의 작용을 변형시키는 다양한 인자를 고려하는 주치의에 의해 결정될 것이다. 다양한 요인은 치료할 질병에 따라 달라진다. 근육 질환의 경우, 이러한 인자는 형성되기를 원하는 근육량, 질병에 가장 영향을 받는 근육, 악화된 근육의 상태, 환자의 연령, 성별 및 식이, 투여 시간을 포함할 수 있지만, 기타 임상 적 요인에 따라 달라질 수 있다. 최종 조성물에 기타 공지의 성장 인자를 추가하면 이 약형에 또한 영향을 줄 수 있다. 근육의 성장 및/또는 복구에 대한 주기적 평가 (예 : 강도 테스트, 근육 크기의 MRI 평가 및 근육 생검 분석)을 통해 진행 상황을 모니터링할 수 있다.
본 발명의 특정 구체예들에서, 하나 또는 그 이상의 변이체 ActRIIB 단백질은 함께 (동시에) 또는 상이한 시간 (순차적으로 또는 중첩)으로 투여될 수 있다. 또한, 변이체 ActRIIB 단백질은 다른 유형의 치료제, 예를 들어 연골-유도제, 뼈-유도제, 근육-유도제, 지방-감소제 또는 신경-유도제와 함께 투여될 수 있다. 두 가지 유형의 화합물은 동시에 또는 상이한 시간에 투여될 수 있다. 본 발명의 변이체 ActRIIB 단백질은 다른 치료제와 함께, 또는 아마도 상승적으로 작용할 수 있는 것으로 기대된다.
특정 예에서, 다양한 골 형성, 연골-유도 및 골-유도 인자, 특히 비스포스포네이트가 기재되어 있다. 가령, EP 특허 출원 번호 148,155 및 169,016 참고. 예를 들면, 대상 변이체 ActRIIB 단백질과 복합될 수 있는 다른 인자로는 표피 성장 인자 (EGF), 혈소판 유도 성장 인자 (PDGF), 형질 전환 성장 인자 (TGF-α 및 TGF-β) 및 인슐린-유사 성장 인자 (IGF)를 포함한다.
특정 구체예들에서, 본 발명은 또한 변이체 ActRIIB 단백질의 생체 내 생산을 위한 유전자 요법을 제공한다. 그러한 치료는 상기 나열된 바와 같은 장애를 갖는 세포 또는 조직 내로 상기 변이체 ActRIIB 폴리뉴클레오티드 서열을 도입함으로써 그의 치료 효과를 얻을 수 있다. 상기 상기 변이체 ActRIIB 폴리뉴클레오티드 서열의 전달은 예를 들어, 키메라 바이러스 또는 콜로이드성 분산 시스템과 같은 재조합 발현 벡터를 사용하여 달성 될 수 있다. 상기 변이체 ActRIIB 폴리뉴클레오티드 서열의 바람직한 치료 전달은 표적화된 리포좀을 사용하는 것이다.
본 명세서에서 교시된 바와 같이, 유전자 요법에 이용될 수 있는 다양한 바이러스 벡터는 아데노바이러스, 헤르페스 바이러스, 유두종, 또는 바람직하게는 RNA 바이러스, 이를 테면, 레트로바이러스를 포함한다. 레트로바이러스 벡터는 뮤린 또는 조류 레트로바이러스의 유도체다. 단일 외부 유전자가 삽입될 수 있는 레트로바이러스 벡터의 예로는 다음을 포함하나, 이에 국한되지 않는다: 몰로니 뮤린 백혈병 바이러스 (MoMuLV), 하베이 뮤린 육종 바이러스 (HaMuSV), 뮤린 유방 종양 바이러스 (MuMTV), 및 라우스 육종 바이러스 (RSV). 다수의 추가 레트로바이러스 벡터가 다중 유전자를 혼입할 수 있다. 이들 모든 벡터는 선택가능한 표지의 유전자를 전달 또는 혼입하여, 형질유도된 세포를 동정 및 생성할 수 있다. 레트로바이러스 벡터는 예를 들면, 당, 당지질, 또는 단백질을 부착시킴으로써, 표적-특이적으로 만들어질 수 있다. 항체를 이용한 바람직한 표적화가 이루어진다. 당업자는 특이적 폴리뉴클레오티드 서열을 레트로바이러스 게놈 안에 삽입시키거나 또는 바이러스 외피에 부착시켜, 상기 변이체 ActRIIB 폴리뉴클레오티드를 함유하는 레트로바이러스 벡터의 표적 특이적 운반이 가능하다는 것을 인지할 것이다. 하나의 바람직한 구체 예에서, 벡터는 뼈, 연골, 근육 또는 신경 세포/조직을 표적으로 한다.
대안으로, 조직 배양 세포는 통상적인 인산칼슘 형질감염에 의해 레트로바이러스 구조 유전자 (gag, pol, 및 env)를 인코드하는 플라스미드로 직접적으로 형질감염될 수 있다. 이들 세포는 관심 대상의 유전자를 함유하는 벡터 플라스미드로 형질감염된다. 생성 세포는 레트로바이러스 벡터를 배양 배지로 방출한다.
본 발명의 변이체 ActRIIB 폴리뉴클레오티드에 대한 또다른 표적화된 전달 시스템은 콜로이드성 분산 시스템이다. 콜로이드성 분산 시스템은 거대분자 복합체, 나노캡슐, 미소구, 비드, 그리고 수중유 에멀션, 미셀, 혼합 미셀 및 리포좀을 포함하는 지질-기반 시스템을 포함한다. 본 발명의 바람직한 콜로이드 시스템은 리포좀이다. 리포좀은 인공 막 소포로, 시험관 및 생체내 운반 비이클로 유용하다. RNA, DNA, 및 고유 비리온은 수성 내부에 포집되고, 생물학적 활성 형태로 세포로 운반된다 [가령, Fraley, et al. (1981) Trends Biochem. Sci., 6:77 참고]. 리포좀 비이클을 이용한 효과적인 유전자 전달 방법은 당분야에 공지되어 있다[ 가령, Mannino, et al. (1988) Biotechniques, 6:682, 1988 참고]. 리포좀의 조성물은 통상 인지질의 조합으로, 스테로이드, 특히 콜레스테롤을 포함할 수 있다. 다른 인지질 또는 다른 지질도 사용될 수 있다. 리포좀의 물리적 성질은 pH, 이온 강도 그리고 이가양이온 존재에 따라 달라진다.
리포좀 생산에 유용한 지질의 예는 포스파티딜 글리세롤, 포스파티딜콜린, 포스파티딜세린, 포스파티딜에탄올아민, 스핑 고지질, 세레브로시드 및 강글리오사이드와 같은 포스파티딜 화합물을 포함한다. 예시적인 인지질은 난 포스파티딜콜린, 디팔미토일 포스파티딜콜린 및 디스테아로일포스파티딜콜린을 포함한다. 리포좀의 표적화는 예를 들면, 장기(organ)-특이성, 세포-특이성, 및 소기관-특이성에 기반을 두고, 당분야에 공지되어 있다.
구체예
지금부터 본 발명이 일반적으로 기술되며, 단지 본 발명의 특정 구체예 및 실시 양태는 예시하기 위한 목적으로 포함되는 것으로, 이에 본 발명을 제한하려는 의도는 아니며, 하기 실시 예를 참조함으로써 보다 용이하게 이해될 것이다.
실시예 1. ActRIIB-Fc 융합 단백질의 생성
출원인은 최소의 링커 (3 개의 글리신 아미노산)를 사이에 두고 인간 G1Fc 도메인에 융합된 인간 ActRIIB의 세포외 도메인을 갖는 가용성 ActRIIB 융합 단백질을 제조하였다. 이 구조체는 ActRIIB-G1Fc로 지칭된다.
ActRIIB-G1Fc는 CHO 세포주로부터 정제된, 하기의 서열 번호: 5 (링커 밑줄이 있음)로 나타낸다:
GRGEAETRECIYYNANWELERTNQSGLERCEGEQDKRLHCYASWRNSSGTIELVKKGCWLDDFNCYDRQECVATEENPQVYFCCCEGNFCNERFTHLPEAGGPEVTYEPPPTAPTGGGTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (서열 번호: 5)
상기 ActRIIB-G1Fc 단백질은 CHO 세포 계통에서 발현된다. 3가지 상이한 리더 서열이 고려되었다:
(i) 꿀벌 멜리틴 (HBML): MKFLVNVALVFMVVYISYIYA (서열 번호: 7)
(ii) 조직플라스미노겐활성제 (TPA): MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSP (서열 번호: 8)
(iii) 고유: mtapwvalallwgslcag (서열 번호: 9).
선택된 형태는 TPA 리더를 사용하며 다음과 같은 미처리 아미노산 서열을 갖는다:
MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSPGASGRGEAETRECIYYNANWELERTNQSGLERCEGEQDKRLHCYASWRNSSGTIELVKKGCWLDDFNCYDRQECVATEENPQVYFCCCEGNFCNERFTHLPEAGGPEVTYEPPPTAPTGGGTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
(서열 번호: 6)
이 폴리펩티드는 다음의 핵산 서열 (서열 번호: 10)에 의해 인코딩된다:
A TGGATGCAAT GAAGAGAGGG CTCTGCTGTG TGCTGCTGCT GTGTGGAGCA GTCTTCGTTT CGCCCGGCGC CTCTGGGCGT GGGGAGGCTG AGACACGGGA GTGCATCTAC TACAACGCCA ACTGGGAGCT GGAGCGCACC AACCAGAGCG GCCTGGAGCG CTGCGAAGGC GAGCAGGACA AGCGGCTGCA CTGCTACGCC TCCTGGCGCA ACAGCTCTGG CACCATCGAG CTCGTGAAGA AGGGCTGCTG GCTAGATGAC TTCAACTGCT ACGATAGGCA GGAGTGTGTG GCCACTGAGG AGAACCCCCA GGTGTACTTC TGCTGCTGTG AAGGCAACTT CTGCAACGAG CGCTTCACTC ATTTGCCAGA GGCTGGGGGC CCGGAAGTCA CGTACGAGCC ACCCCCGACA GCCCCCACCG GTGGTGGAAC TCACACATGC CCACCGTGCC CAGCACCTGA ACTCCTGGGG GGACCGTCAG TCTTCCTCTT CCCCCCAAAA CCCAAGGACA CCCTCATGAT CTCCCGGACC CCTGAGGTCA CATGCGTGGT GGTGGACGTG AGCCACGAAG ACCCTGAGGT CAAGTTCAAC TGGTACGTGG ACGGCGTGGA GGTGCATAAT GCCAAGACAA AGCCGCGGGA GGAGCAGTAC AACAGCACGT ACCGTGTGGT CAGCGTCCTC ACCGTCCTGC ACCAGGACTG GCTGAATGGC AAGGAGTACA AGTGCAAGGT CTCCAACAAA GCCCTCCCAG CCCCCATCGA GAAAACCATC TCCAAAGCCA AAGGGCAGCC CCGAGAACCA CAGGTGTACA CCCTGCCCCC ATCCCGGGAG GAGATGACCA AGAACCAGGT CAGCCTGACC TGCCTGGTCA AAGGCTTCTA TCCCAGCGAC ATCGCCGTGG AGTGGGAGAG CAATGGGCAG CCGGAGAACA ACTACAAGAC CACGCCTCCC GTGCTGGACT CCGACGGCTC CTTCTTCCTC TATAGCAAGC TCACCGTGGA CAAGAGCAGG TGGCAGCAGG GGAACGTCTT CTCATGCTCC GTGATGCATG AGGCTCTGCA CAACCACTAC ACGCAGAAGA GCCTCTCCCT GTCTCCGGGT AAATGA (서열 번호: 10)
CHO-세포 생산된 물질의 N-말단 서열 분석은 주요 서열-GRGEAE (서열 번호: 11)로 나타내었다. 특히, 문헌에 보고된 다른 구조물은-SGR ... 서열로 시작한다.
정제는 다음중 3개 또는 그 이상이 임의의 순서로 포함된 일련의 컬럼 크로마토그래피에 의해 실행될 수 있다: 단백질 A 크로마토그래피, Q 세파로즈 크로마토그래피, 페닐세파로즈 크로마토그래피, 크기 압출 크로마토그래피, 및 양이온 교환 크로마토그래피. 상기 정제는 바이러스 여과 및 완충액 교환으로 완성될 수 있다.
상기 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 또한 HEK293 세포 및 COS 세포에서 발현되었다. 모든 세포계통의 물질 및 적당한 배양 조건이 생체 내에서 근육 형성 활성을 갖는 단백질을 제공하였지만, 아마도 세포주 선별 및/또는 배양 조건과 관련하여 역가의 가변성이 관찰되었다.
실시예 2: 변이체 ActRIIB-Fc 단백질의 생성
출원인은 ActRIIB의 세포외 도메인에서 일련의 돌연변이 (서열 변이)를 만들었고, 임의의 링커에 의해 결합된 변이체 ActRIIB 세포외 도메인과 Fc 도메인을 포함하는, 가용성 동종이량체 융합 단백질로서 이들 변이체 폴리펩티드를 생산하였다. 배경이 되는 ActRIIB-Fc 융합체는 서열 번호: 5에 나타낸 바와 같은 ActRIIB-G1Fc이었다.
다양한 치환 돌연변이가 배경(background) ActRIIB-Fc 단백질에 도입되었다. 실시 예 1에 제시된 데이터에 기초하여, TPA 리더로 발현되는 경우, 이들 구조체는 N-말단 세린이 결핍될 것으로 예상된다. 돌연변이는 PCR 돌연변이 유발에 의해 ActRIIB 세포외 도메인에서 생성되었다. PCR 후, 단편을 Qiagen 컬럼으로 정제하고, SfoI 및 AgeI로 분해하고 겔 정제하였다. 이러한 단편을 결찰(ligation)시, 인간 IgG1과 융합 키메라를 생성하도록 발현 벡터 pAID4 (WO2006/012627 참조)에 결찰시켰다. 대장균(E. coli) DH5α 로의 형질전환시, 콜로니를 채취하고 DNA를 분리하였다. 뮤린 구조물 (mFc)의 경우, 인간 IgG1를 대신하여 뮤린 IgG2a로 대체되었다. 모든 돌연변이체는 서열이 검증되었다.
프로세스안된 ActRIIB(K55A)-G1Fc의 아미노산 서열을 하기에 나타낸다 (서열 번호 : 31). 신호 서열과 링커 서열은 실선 밑줄로 표시하고, K55A 치환은 이중밑줄로 표시된다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 31의 아미노산 서열이 제공된다.
ActRIIB(K55A)-G1Fc 융합 폴리펩티드는 다음의 핵산 서열 (서열 번호: 32)에 의해 인코딩된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCTCTGGGCG TGGGGAGGCT GAGACACGGG
101 AGTGCATCTA CTACAACGCC AACTGGGAGC TGGAGCGCAC CAACCAGAGC
151 GGCCTGGAGC GCTGCGAAGG CGAGCAGGAC GCCCGGCTGC ACTGCTACGC
201 CTCCTGGCGC AACAGCTCTG GCACCATCGA GCTCGTGAAG AAGGGCTGCT
251 GGCTAGATGA CTTCAACTGC TACGATAGGC AGGAGTGTGT GGCCACTGAG
301 GAGAACCCCC AGGTGTACTT CTGCTGCTGT GAAGGCAACT TCTGCAACGA
351 GCGCTTCACT CATTTGCCAG AGGCTGGGGG CCCGGAAGTC ACGTACGAGC
401 CACCCCCGAC AGCCCCCACC GGTGGTGGAA CTCACACATG CCCACCGTGC
451 CCAGCACCTG AACTCCTGGG GGGACCGTCA GTCTTCCTCT TCCCCCCAAA
501 ACCCAAGGAC ACCCTCATGA TCTCCCGGAC CCCTGAGGTC ACATGCGTGG
551 TGGTGGACGT GAGCCACGAA GACCCTGAGG TCAAGTTCAA CTGGTACGTG
601 GACGGCGTGG AGGTGCATAA TGCCAAGACA AAGCCGCGGG AGGAGCAGTA
651 CAACAGCACG TACCGTGTGG TCAGCGTCCT CACCGTCCTG CACCAGGACT
701 GGCTGAATGG CAAGGAGTAC AAGTGCAAGG TCTCCAACAA AGCCCTCCCA
751 GCCCCCATCG AGAAAACCAT CTCCAAAGCC AAAGGGCAGC CCCGAGAACC
801 ACAGGTGTAC ACCCTGCCCC CATCCCGGGA GGAGATGACC AAGAACCAGG
851 TCAGCCTGAC CTGCCTGGTC AAAGGCTTCT ATCCCAGCGA CATCGCCGTG
901 GAGTGGGAGA GCAATGGGCA GCCGGAGAAC AACTACAAGA CCACGCCTCC
951 CGTGCTGGAC TCCGACGGCT CCTTCTTCCT CTATAGCAAG CTCACCGTGG
1001 ACAAGAGCAG GTGGCAGCAG GGGAACGTCT TCTCATGCTC CGTGATGCAT
1051 GAGGCTCTGC ACAACCACTA CACGCAGAAG AGCCTCTCCC TGTCCCCGGG
1101 TAAA (서열 번호: 32)
성숙 ActRIIB(K55A)-G1Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 33)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 GRGEAETREC IYYNANWELE RTNQSGLERC EGEQDARLHC YASWRNSSGT
51 IELVKKGCWL DDFNCYDRQE CVATEENPQV YFCCCEGNFC NERFTHLPEA
101 GGPEVTYEPP PTAPTGGGTH TCPPCPAPEL LGGPSVFLFP PKPKDTLMIS
151 RTPEVTCVVV DVSHEDPEVK FNWYVDGVEV HNAKTKPREE QYNSTYRVVS
201 VLTVLHQDWL NGKEYKCKVS NKALPAPIEK TISKAKGQPR EPQVYTLPPS
251 REEMTKNQVS LTCLVKGFYP SDIAVEWESN GQPENNYKTT PPVLDSDGSF
301 FLYSKLTVDK SRWQQGNVFS CSVMHEALHN HYTQKSLSLS PGK
(서열 번호: 33)
프로세스안된 ActRIIB(K55E)-G1Fc의 아미노산 서열을 하기에 나타낸다 (서열 번호 : 34). 신호 서열과 링커 서열은 실선 밑줄로 표시하고, K55E 치환은 이중밑줄로 표시된다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 34의 아미노산 서열이 제공된다.
ActRIIB(K55E)-G1Fc 융합 폴리펩티드는 다음의 핵산 서열 (서열 번호: 35)에 의해 인코딩된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCTCTGGGCG TGGGGAGGCT GAGACACGGG
101 AGTGCATCTA CTACAACGCC AACTGGGAGC TGGAGCGCAC CAACCAGAGC
151 GGCCTGGAGC GCTGCGAAGG CGAGCAGGAC GAGCGGCTGC ACTGCTACGC
201 CTCCTGGCGC AACAGCTCTG GCACCATCGA GCTCGTGAAG AAGGGCTGCT
251 GGCTAGATGA CTTCAACTGC TACGATAGGC AGGAGTGTGT GGCCACTGAG
301 GAGAACCCCC AGGTGTACTT CTGCTGCTGT GAAGGCAACT TCTGCAACGA
351 GCGCTTCACT CATTTGCCAG AGGCTGGGGG CCCGGAAGTC ACGTACGAGC
401 CACCCCCGAC AGCCCCCACC GGTGGTGGAA CTCACACATG CCCACCGTGC
451 CCAGCACCTG AACTCCTGGG GGGACCGTCA GTCTTCCTCT TCCCCCCAAA
501 ACCCAAGGAC ACCCTCATGA TCTCCCGGAC CCCTGAGGTC ACATGCGTGG
551 TGGTGGACGT GAGCCACGAA GACCCTGAGG TCAAGTTCAA CTGGTACGTG
601 GACGGCGTGG AGGTGCATAA TGCCAAGACA AAGCCGCGGG AGGAGCAGTA
651 CAACAGCACG TACCGTGTGG TCAGCGTCCT CACCGTCCTG CACCAGGACT
701 GGCTGAATGG CAAGGAGTAC AAGTGCAAGG TCTCCAACAA AGCCCTCCCA
751 GCCCCCATCG AGAAAACCAT CTCCAAAGCC AAAGGGCAGC CCCGAGAACC
801 ACAGGTGTAC ACCCTGCCCC CATCCCGGGA GGAGATGACC AAGAACCAGG
851 TCAGCCTGAC CTGCCTGGTC AAAGGCTTCT ATCCCAGCGA CATCGCCGTG
901 GAGTGGGAGA GCAATGGGCA GCCGGAGAAC AACTACAAGA CCACGCCTCC
951 CGTGCTGGAC TCCGACGGCT CCTTCTTCCT CTATAGCAAG CTCACCGTGG
1001 ACAAGAGCAG GTGGCAGCAG GGGAACGTCT TCTCATGCTC CGTGATGCAT
1051 GAGGCTCTGC ACAACCACTA CACGCAGAAG AGCCTCTCCC TGTCCCCGGG
1101 TAAA (서열 번호: 35)
성숙 ActRIIB(K55E)-G1Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 36)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 GRGEAETREC IYYNANWELE RTNQSGLERC EGEQDERLHC YASWRNSSGT
51 IELVKKGCWL DDFNCYDRQE CVATEENPQV YFCCCEGNFC NERFTHLPEA
101 GGPEVTYEPP PTAPTGGGTH TCPPCPAPEL LGGPSVFLFP PKPKDTLMIS
151 RTPEVTCVVV DVSHEDPEVK FNWYVDGVEV HNAKTKPREE QYNSTYRVVS
201 VLTVLHQDWL NGKEYKCKVS NKALPAPIEK TISKAKGQPR EPQVYTLPPS
251 REEMTKNQVS LTCLVKGFYP SDIAVEWESN GQPENNYKTT PPVLDSDGSF
301 FLYSKLTVDK SRWQQGNVFS CSVMHEALHN HYTQKSLSLS PGK
(서열 번호: 36)
프로세스안된 ActRIIB(F82I)-G1Fc의 아미노산 서열을 하기에 나타낸다(서열 번호: 37). 신호 서열과 링커 서열은 실선 밑줄로 표시하고, F82I 치환은 이중밑줄로 표시된다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 37의 아미노산 서열이 제공된다.
ActRIIB(F82I)-G1Fc 융합 폴리펩티드는 다음의 핵산 서열 (서열 번호: 38)에 의해 인코딩된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCTCTGGGCG TGGGGAGGCT GAGACACGGG
101 AGTGCATCTA CTACAACGCC AACTGGGAGC TGGAGCGCAC CAACCAGAGC
151 GGCCTGGAGC GCTGCGAAGG CGAGCAGGAC AAGCGGCTGC ACTGCTACGC
201 CTCCTGGCGC AACAGCTCTG GCACCATCGA GCTCGTGAAG AAGGGCTGCT
251 GGCTAGATGA CATCAACTGC TACGATAGGC AGGAGTGTGT GGCCACTGAG
301 GAGAACCCCC AGGTGTACTT CTGCTGCTGT GAAGGCAACT TCTGCAACGA
351 GCGCTTCACT CATTTGCCAG AGGCTGGGGG CCCGGAAGTC ACGTACGAGC
401 CACCCCCGAC AGCCCCCACC GGTGGTGGAA CTCACACATG CCCACCGTGC
451 CCAGCACCTG AACTCCTGGG GGGACCGTCA GTCTTCCTCT TCCCCCCAAA
501 ACCCAAGGAC ACCCTCATGA TCTCCCGGAC CCCTGAGGTC ACATGCGTGG
551 TGGTGGACGT GAGCCACGAA GACCCTGAGG TCAAGTTCAA CTGGTACGTG
601 GACGGCGTGG AGGTGCATAA TGCCAAGACA AAGCCGCGGG AGGAGCAGTA
651 CAACAGCACG TACCGTGTGG TCAGCGTCCT CACCGTCCTG CACCAGGACT
701 GGCTGAATGG CAAGGAGTAC AAGTGCAAGG TCTCCAACAA AGCCCTCCCA
751 GCCCCCATCG AGAAAACCAT CTCCAAAGCC AAAGGGCAGC CCCGAGAACC
801 ACAGGTGTAC ACCCTGCCCC CATCCCGGGA GGAGATGACC AAGAACCAGG
851 TCAGCCTGAC CTGCCTGGTC AAAGGCTTCT ATCCCAGCGA CATCGCCGTG
901 GAGTGGGAGA GCAATGGGCA GCCGGAGAAC AACTACAAGA CCACGCCTCC
951 CGTGCTGGAC TCCGACGGCT CCTTCTTCCT CTATAGCAAG CTCACCGTGG
1001 ACAAGAGCAG GTGGCAGCAG GGGAACGTCT TCTCATGCTC CGTGATGCAT
1051 GAGGCTCTGC ACAACCACTA CACGCAGAAG AGCCTCTCCC TGTCTCCGGG
1101 TAAA (서열 번호: 38)
성숙 ActRIIB(F82I)-G1Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 39)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 GRGEAETREC IYYNANWELE RTNQSGLERC EGEQDKRLHC YASWRNSSGT
51 IELVKKGCWL DDINCYDRQE CVATEENPQV YFCCCEGNFC NERFTHLPEA
101 GGPEVTYEPP PTAPTGGGTH TCPPCPAPEL LGGPSVFLFP PKPKDTLMIS
151 RTPEVTCVVV DVSHEDPEVK FNWYVDGVEV HNAKTKPREE QYNSTYRVVS
201 VLTVLHQDWL NGKEYKCKVS NKALPAPIEK TISKAKGQPR EPQVYTLPPS
251 REEMTKNQVS LTCLVKGFYP SDIAVEWESN GQPENNYKTT PPVLDSDGSF
301 FLYSKLTVDK SRWQQGNVFS CSVMHEALHN HYTQKSLSLS PGK
(서열 번호: 39)
프로세스안된 ActRIIB(F82K)-G1Fc의 아미노산 서열을 하기에 나타낸다(서열 번호: 40). 신호 서열과 링커 서열은 실선 밑줄로 표시하고, F82K 치환은 이중밑줄로 표시된다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 40의 아미노산 서열이 제공된다.
ActRIIB(F82K)-G1Fc 융합 폴리펩티드는 폴리펩티드는 다음의 핵산 서열 (서열 번호: 41)에 의해 인코딩된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCTCTGGGCG TGGGGAGGCT GAGACACGGG
101 AGTGCATCTA CTACAACGCC AACTGGGAGC TGGAGCGCAC CAACCAGAGC
151 GGCCTGGAGC GCTGCGAAGG CGAGCAGGAC AAGCGGCTGC ACTGCTACGC
201 CTCCTGGCGC AACAGCTCTG GCACCATCGA GCTCGTGAAG AAGGGCTGCT
251 GGCTAGATGA CAAGAACTGC TACGATAGGC AGGAGTGTGT GGCCACTGAG
301 GAGAACCCCC AGGTGTACTT CTGCTGCTGT GAAGGCAACT TCTGCAACGA
351 GCGCTTCACT CATTTGCCAG AGGCTGGGGG CCCGGAAGTC ACGTACGAGC
401 CACCCCCGAC AGCCCCCACC GGTGGTGGAA CTCACACATG CCCACCGTGC
451 CCAGCACCTG AACTCCTGGG GGGACCGTCA GTCTTCCTCT TCCCCCCAAA
501 ACCCAAGGAC ACCCTCATGA TCTCCCGGAC CCCTGAGGTC ACATGCGTGG
551 TGGTGGACGT GAGCCACGAA GACCCTGAGG TCAAGTTCAA CTGGTACGTG
601 GACGGCGTGG AGGTGCATAA TGCCAAGACA AAGCCGCGGG AGGAGCAGTA
651 CAACAGCACG TACCGTGTGG TCAGCGTCCT CACCGTCCTG CACCAGGACT
701 GGCTGAATGG CAAGGAGTAC AAGTGCAAGG TCTCCAACAA AGCCCTCCCA
751 GCCCCCATCG AGAAAACCAT CTCCAAAGCC AAAGGGCAGC CCCGAGAACC
801 ACAGGTGTAC ACCCTGCCCC CATCCCGGGA GGAGATGACC AAGAACCAGG
851 TCAGCCTGAC CTGCCTGGTC AAAGGCTTCT ATCCCAGCGA CATCGCCGTG
901 GAGTGGGAGA GCAATGGGCA GCCGGAGAAC AACTACAAGA CCACGCCTCC
951 CGTGCTGGAC TCCGACGGCT CCTTCTTCCT CTATAGCAAG CTCACCGTGG
1001 ACAAGAGCAG GTGGCAGCAG GGGAACGTCT TCTCATGCTC CGTGATGCAT
1051 GAGGCTCTGC ACAACCACTA CACGCAGAAG AGCCTCTCCC TGTCTCCGGG
1101 TAAA (서열 번호: 41)
성숙 ActRIIB(F82K)-G1Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 42)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 GRGEAETREC IYYNANWELE RTNQSGLERC EGEQDKRLHC YASWRNSSGT
51 IELVKKGCWL DDKNCYDRQE CVATEENPQV YFCCCEGNFC NERFTHLPEA
101 GGPEVTYEPP PTAPTGGGTH TCPPCPAPEL LGGPSVFLFP PKPKDTLMIS
151 RTPEVTCVVV DVSHEDPEVK FNWYVDGVEV HNAKTKPREE QYNSTYRVVS
201 VLTVLHQDWL NGKEYKCKVS NKALPAPIEK TISKAKGQPR EPQVYTLPPS
251 REEMTKNQVS LTCLVKGFYP SDIAVEWESN GQPENNYKTT PPVLDSDGSF
301 FLYSKLTVDK SRWQQGNVFS CSVMHEALHN HYTQKSLSLS PGK
(서열 번호: 42)
구조체를 COS 또는 CHO 세포에서 발현시키고, 여과 및 단백질 A 크로마토그래피로 정제하였다. 일부의 경우, 검증은 정제된 단백질보다는 조건화된 배지를 사용하여 수행하였다. 리포터 유전자 분석을 위한 샘플의 순도는 SDS-PAGE 및 웨스턴 블롯 분석에 의해 평가되었다.
돌연변이체는 아래에 기술된 결합 분석법 및/또는 생물 검정법으로 시험하였다.
대안으로, 하기에 나타낸 바와 같이(서열 번호: 53), 유사한 돌연변이가 5 개의 아미노산의 N-말단 절두 및 3 개의 아미노산의 C-말단 절두를 갖는 ActRIIB 세포외 도메인으로 도입될 수 있다 . 이러한 절두된 ActRIIB 세포외 도메인은 서열 번호: 2에서 번호매김에 근거하여 ActRIIB(25-131)로 명명된다.
25 ETRECIYYNA NWELERTNQS GLERCEGEQD KRLHCYASWR NSSGTIELVK
75 KGCWLDDFNC YDRQECVATE ENPQVYFCCC EGNFCNERFT HLPEAGGPEV
125 TYEPPPT (서열 번호: 53)
대응하는 배경 융합 폴리펩티드, ActRIIB(25-131)-G1Fc는 하기(서열 번호: 12)에 나타낸다.
1 ETRECIYYNA NWELERTNQS GLERCEGEQD KRLHCYASWR NSSGTIELVK
51 KGCWLDDFNC YDRQECVATE ENPQVYFCCC EGNFCNERFT HLPEAGGPEV
101 TYEPPPTGGG THTCPPCPAP ELLGGPSVFL FPPKPKDTLM ISRTPEVTCV
151 VVDVSHEDPE VKFNWYVDGV EVHNAKTKPR EEQYNSTYRV VSVLTVLHQD
201 WLNGKEYKCK VSNKALPAPI EKTISKAKGQ PREPQVYTLP PSREEMTKNQ
251 VSLTCLVKGF YPSDIAVEWE SNGQPENNYK TTPPVLDSDG SFFLYSKLTV
301 DKSRWQQGNV FSCSVMHEAL HNHYTQKSLS LSPGK (서열 번호: 12)
실시예 3. 세포-기반 검정에서 변이체 ActRIIB-Fc 단백질의 활성
A204 세포-기반 검정을 이용하여 액티빈 A, GDF11 및 BMP9에 의한 신호생성에서 변이체 ActRIIB-Fc 단백질 간의 효과를 비교하였다. 간략하게 설명하면, 이 검증은 근육으로부터 유도된 인간 A204 횡문근육종 세포주 (ATCC®: HTB-82™)와 리포터 벡터 pGL3(CAGA)12 (Dennler et al., 1998, EMBO 17: 3091-3100), 뿐만 아니라 형질감염 효과를 조절하기 위한 Renilla 리포터 플라스미드 (pRLCMV)를 이용한다. CAGA12 모티프는 TGFβ-반응성 유전자 (예를 들면, PAI-1 유전자)에 존재하며, 이 벡터는 액티빈 A, GDF11, 그리고 BMP9를 포함하는 Smad2/3를 통한 신호생성을 할 수 있는 리간드에 일반적으로 사용된다.
1 일차, A-204 세포를 하나 이상의 48-웰 플레이트로 옮겼다. 2 일차에, 이들 세포에 10 μg pGL3(CAGA)12 또는 pGL3(CAGA)12(10 μg) + pRLCMV (1 μg) 및 Fugene로 형질감염되었다. 3 일차에, 0.1 % BSA를 함유하는 배지에서 희석된 리간드를 세포에 첨가하기 전, 1 시간 동안 ActRIIB-Fc 단백질과 예비-배양 하였다. 약 6 시간 후, 세포를 PBS로 헹구고 용해시켰다. 세포 용해물을 루시퍼라제 분석에서 Smad 활성화의 정도를 측정 하였다.
이 검증은 액티빈 A, GDF11, 그리고 BMP9에 의한 세포 신호 전달에 있어서 억제 효과에 대하여 변이체 ActRIIB-Fc 단백질을크리닝하는데 사용되었다. 인간 ActRIIB 세포외 도메인에 아미노산 치환을 혼입하는 동종이 량체 Fc 융합 단백질의 잠재력을 비-변형 인간 ActRIIB 세포외 도메인을 포함하는 Fc 융합 단백질의 효능과 비교 하였다.
위의 표에서 알 수 있듯이, ActRIIB 세포외 도메인의 단일 아미노산 치환은 세포-기반 리포터 유전자 분석에서 액티빈 A 또는 GDF11 억제와 BMP9 억제 사이의 균형을 변경시킬 수 있다. 변형안된 ActRIIB 세포외 도메인을 함유하는 융합 단백질과 비교하였을 때, 상기 변이체 ActRIIB(K55A)-Fc, ActRIIB(K55E)-Fc, ActRIIB(F82I)-Fc, 그리고 ActRIIB(F82K)-Fc는 BMP9 (증가된 IC50 값)의 억제에 효과가 덜하였지만, 액티빈 A 및 GDF11에 대한 억제는 기본적으로 감소되지 않고 유지한다.
이들 결과에서, 변이체 ActRIIB-Fc 단백질, 이를 테면 ActRIIB(K55A)-Fc, ActRIIB(K55E)-Fc, ActRIIB(F82I)-Fc, 그리고 ActRIIB(F82K)-Fc는 변형안된 ActRIIB 세포외 도메인을 포함하는 Fc 융합 단백질과 비교하였을 때, 액티빈 A 및 GDF11에 대한 더욱 선택적인 길항제임을 나타낸다. 따라서, 이들 변이체는 특정 용도에서 ActRIIB-Fc 보다 더 유용할 것이며, 이때 이러한 선택적 길항작용이 유익하다. 실시예들은 BMP9 및 잠재적으로 BMP10의 길항 작용을 감소시키면서, 하나 또는 그 이상의 액티빈 A, GDF8 및 GDF11의 길항 작용을 유지하는 것이 바람직한 치료학적 예를 포함한다.
실시예 4. 변이체 ActRIIB-Fc 동종이량체의 리간드 결합 프로파일
BiacoreTM-기반 결합 검정을 이용하여, 실시예 3에서 스크리닝된 특정 변이체 ActRIIB-Fc 단백질, 뿐만 아니라 이전에 평가되지 않은 다른 변이체 ActRIIB-Fc 단백질의 리간드 결합 동력학을 비교하였다. 테스트되는 ActRIIB-Fc 단백질은 항-Fc 항체를 이용하여 상기 시스템에 독립적으로 포집되어 있다. 그 다음 리간드들을 주입하고, 포집된 수용체 단백질 위로 흐르도록 하였다. 37℃ 에서 분석된 변이체 ActRIIB-Fc 단백질의 결과를 도 8에 나타낸다. 변형안된 ActRIIB 세포외 도메인을 포함하는 Fc-융합 단백질과 비교하여, 상기 변이체 단백질 ActRIIB(K55A)-Fc, ActRIIB(K55E)-Fc, ActRIIB(F82I)-Fc, 그리고 ActRIIB(F82K)-Fc는 GDF11보다는 BMP9에 대한 친화력이 훨씬 더 감소하였다. 25℃ 에서 분석된 추가적인 변이체 ActRIIB-Fc 단백질의 결과를 도 9에 나타낸다.
이 결과에서, K55A, K55E, F82I, 및 F82K은 액티빈 A 또는 GDF11에 대한 ActRIIB 친화력 감소보다 훨씬 더 크게 MP9에 대한 ActRIIB 결합 친화력을 감소시킨다는 것이 확인되었다. 따라서, 이들 변이체 ActRIIB-Fc 단백질은 특정 용도에서 변형안된 ActRIIB-Fc 단백질보다 더 유용할 것이며, 이때 이러한 선택적 길항작용이 유익하다. 실시예들은 BMP9의 길항 작용을 감소시키면서, 하나 또는 그 이상의 액티빈 A, 액티빈 B, GDF8 및 GDF11의 길항 작용을 유지하는 것이 바람직한 치료학적 예를 포함한다.
실시예 5. 마우스에서 변이체 ActRIIB-Fc 동종이량체의 활성
선택된 변이체 ActRIIB-G1Fc 동종이량체는 생체내 활성 프로파일의 차이를 조사하기 위하여 마우스에서 테스트되었다. 성체 야생형 C57BL/6 마우스 (n = 한 집단에 8마리 마우스)에게 ActRIIB(K55A)-Fc, ActRIIB(K55E)-Fc, ActRIIB(F82I)-Fc, ActRIIB(F82K)-Fc, 변형안된 ActRIIB-Fc, 또는 비이클을 4주간 주당 2회 10 mg/kg (i.p.)의 투여량으로 투여하였다. 연구 종점은 다음을 포함한다: 체중; CBC, 시작 및 연구 종료에 핵자기공명(NMR)에 의해 측정된 제지방량 및 지방총량.
비이클-처리된 대조군과 비교하여, 연구 전과정에 걸쳐 변형안된 ActRIIB-Fc로 마우스를 처리하면 체중 증가가 3배 이상되었다. ActRIIB (F82I)-Fc (25 %)에 의해 유발된 체중 증가는 변형되지 않은 ActRIIB-Fc (29 %)에 의해 유발된 것과 거의 동일했지만, 다른 변이체 ActRIIB-Fc 단백질은 12-17 % 범위의 체중 증가가 있었다 (도 10). NMR 분석 결과, ActRIIB (F82I)-Fc 처리가 아래 표와 같이 비이클 대비 제지방량(total lean mass)과 전체 지방량을 유의적으로 증가시켰다.
ActRIIB(F82I)-Fc는 ActRIIB-Fc에 의해 생성된 크기의 약 절반에 해당하는 제지방량과 지방량의 변화를 가져왔다. 제지방량 (전형적으로 마우스의 체중의 약 70%)이 지방량(전형적으로 체중의 약 10%)보다 훨씬 더 많기 때문에, 제지방 및 지방 조직에서 표준화된(백분율-기반) 변화는 이들 대응에서 절대 변화와는 상이하다는 점을 인지해야 한다. 비복근, 대퇴근, 및 흉근이 포함된 개별 골근육은 ActRIIB(F82I)-Fc를 이용한 치료 과정에서 비이클 대조와 비교하여 중량에서 모두 유의적으로 증가되었다.
평가된 상기 5개 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 모두 비이클보다 적혈구 세포 매개변수 (RBC 카운트, 헤마토크릿, 그리고 헤모글로빈 농도)에 대하여 유의적으로 높은 값을 나타내었고, 그리고 이들 매개변수에 있어서 ActRIIB(F82I)-Fc 의 자극 효과는 변형안된 ActRIIB-Fc의 것들을 초과하였다 (도 11).
따라서, 변이체 ActRIIB 세포외 도메인을 포함하는 동종이량체 Fc-융합 단백질은 적혈구 세포 및 골 근육에서 유익한 동화 효과를 발휘할 수 있을 뿐만 아니라 변형안된 ActRIIB-Fc 동종이량체의 것과 유사하게 지방조직에는 이화작용을 나타낼 수 있다. 그러나, 변이체 ActRIIB-Fc 동종이량체는 변형안된 ActRIIB-Fc와 비교하여 BMP9에 감소된 친화력으로 결합하고, 따라서 혈관 신생과 같은 그 리간드에 의해 매개되는 과정의 억제는 감소될 것이다. 이 신규한 선택성은 예를 들면, 적혈구 세포 및 근육에는 자극 효과를, 그리고 변경된 혈관신생은 필요하지 않지만, 지방에는 저해 효과를 필요로 하는 환자의 치료에 유용할 것이다.
실시예 6. 비-인간 영장류에서 ActRIIB(F82I)-Fc 동종이량체의 활성
다음으로 출원인은 ActRIIB (F82I)-Fc 동종이량체가 비-인간 영장류의 RBC 매개 변수를 변경하는지 여부를 조사했다. 시노몰구스 원숭이(M. fascicularis)(n = 한 집단에 4마리 원숭이)를 29-일 연구에서 1일차, 15일차에 ActRIIB(F2I)-G1Fc, 변형안된 ActRIIB-G1Fc, 또는 변형안된 ActRIIA-G1Fc를 9 mg/kg (s.c.)으로 처리하였다. 도 12에 나타낸 바와 같이, ActRIIB (F82I)-Fc 처리는 ActRIIB-Fc (음성 대조군)에 비교하여, ActRIIA-Fc (양성 대조군)와 유사한 양으로 RBC 수치를 증가시켰다. 헤모글로빈 농도 및 헤마토크릿에 대해 유사한 결과가 얻어졌다 (데이터는 나타내지 않음). 이들 데이터에서 ActRIIB(F82I)-Fc 동종이량체는 변형안된 ActRIIB-Fc 동종이량체과는 상이한 생체내 활성을 보유한다는 것이 확인되었다.
실시예 7. ActRIIB-Fc:ActRIIB(L79E)-Fc 이종이량체의 생성
변형안된 인간 ActRIIB의 세포외 도메인과 위치 79에서 류신-글루탐산염 치환된 인간 ActRIIB를 포함하는 가용성 ActRIIB-Fc:ActRIIB(L79E)-Fc 이형 복합체의 생성을 고려하는데, 이들은 각각 세포외 도메인과 G1Fc 도메인 사이에 위치한 링커와 함께, G1Fc 도메인에 융합된다. 개별 구조체는 차례로 ActRIIB-Fc 융합 폴리펩티드와 ActRIIB(L79E)-Fc 융합 폴리펩티드로 지칭되며, 이들 각 서열은 하기에서 제시된다.
ActRIIB-Fc 또는 ActRIIB(L79E)-Fc 동형이량체 복합체와 반대로, ActRIIB-Fc:ActRIIB(L79E)-Fc 이형복합체의 형성을 촉진하는 방법은 비대칭 이형화학성 복합체 형성을 유도하기 위하여 Fc 도메인의 아미노산 서열에 변경을 도입시키는 것이다. Fc 도메인을 이용하여 비대칭 상호작용 짝을 만드는 많은 상이한 방법들이 본 명세서에서 설명된다.
한 가지 방법에서, 차례로 서열 번호: 43-45 및 46-48의 ActRIIB(L79E)-Fc 및 ActRIIB-Fc 폴리펩티드 서열에서 설명된 바와 같이, 하나의 Fc 도메인이 상호작용 면에 있는 양이온 아미노산을 도입시키도록 변경될 것이고, 한편 또다른 Fc 도메인은 이 상호작용 면에 음이온 아미노산을 도입시키도록 변경될 것이다. 상기 ActRIIB(L79E)-Fc 융합 폴리펩티드 및 ActRIIB-Fc 융합 폴리펩티드는 각각 PA 리더 (서열 번호: 8)를 이용한다.
상기 ActRIIB(L79E)-Fc 폴리펩티드 서열 (서열 번호: 43)는 하기에 나타낸다:
리더 (신호) 서열 및 링커는 선 밑줄로 표시하고,, 그리고 상기 L79E 치환은 이중밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 ActRIIB-Fc:ActRIIB(L79E)-Fc 이종이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (산성 아미노산이 리신으로 대체됨)이 ActRIIB 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단에 리신이 추가된, 서열 번호: 43의 아미노산 서열이 제공될 수 있다.
이 ActRIIB(L79E)-Fc 융합 단백질은 다음의 핵산 서열 (서열 번호: 44)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCTCTGGGCG TGGGGAGGCT GAGACACGGG
101 AGTGCATCTA CTACAACGCC AACTGGGAGC TGGAGCGCAC CAACCAGAGC
151 GGCCTGGAGC GCTGCGAAGG CGAGCAGGAC AAGCGGCTGC ACTGCTACGC
201 CTCCTGGCGC AACAGCTCTG GCACCATCGA GCTCGTGAAG AAGGGCTGCT
251 GGGAAGATGA CTTCAACTGC TACGATAGGC AGGAGTGTGT GGCCACTGAG
301 GAGAACCCCC AGGTGTACTT CTGCTGCTGT GAAGGCAACT TCTGCAACGA
351 GCGCTTCACT CATTTGCCAG AGGCTGGGGG CCCGGAAGTC ACGTACGAGC
401 CACCCCCGAC AGCCCCCACC GGTGGTGGAA CTCACACATG CCCACCGTGC
451 CCAGCACCTG AACTCCTGGG GGGACCGTCA GTCTTCCTCT TCCCCCCAAA
501 ACCCAAGGAC ACCCTCATGA TCTCCCGGAC CCCTGAGGTC ACATGCGTGG
551 TGGTGGACGT GAGCCACGAA GACCCTGAGG TCAAGTTCAA CTGGTACGTG
601 GACGGCGTGG AGGTGCATAA TGCCAAGACA AAGCCGCGGG AGGAGCAGTA
651 CAACAGCACG TACCGTGTGG TCAGCGTCCT CACCGTCCTG CACCAGGACT
701 GGCTGAATGG CAAGGAGTAC AAGTGCAAGG TCTCCAACAA AGCCCTCCCA
751 GCCCCCATCG AGAAAACCAT CTCCAAAGCC AAAGGGCAGC CCCGAGAACC
801 ACAGGTGTAC ACCCTGCCCC CATCCCGGGA GGAGATGACC AAGAACCAGG
851 TCAGCCTGAC CTGCCTGGTC AAAGGCTTCT ATCCCAGCGA CATCGCCGTG
901 GAGTGGGAGA GCAATGGGCA GCCGGAGAAC AACTACGACA CCACGCCTCC
951 CGTGCTGGAC TCCGACGGCT CCTTCTTCCT CTATAGCGAC CTCACCGTGG
1001 ACAAGAGCAG GTGGCAGCAG GGGAACGTCT TCTCATGCTC CGTGATGCAT
1051 GAGGCTCTGC ACAACCACTA CACGCAGAAG AGCCTCTCCC TGTCTCCGGG
1101 T (서열 번호: 44)
성숙 ActRIIB(L79E)-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 45)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된다.
1 GRGEAETREC IYYNANWELE RTNQSGLERC EGEQDKRLHC YASWRNSSGT
51 IELVKKGCWE DDFNCYDRQE CVATEENPQV YFCCCEGNFC NERFTHLPEA
101 GGPEVTYEPP PTAPTGGGTH TCPPCPAPEL LGGPSVFLFP PKPKDTLMIS
151 RTPEVTCVVV DVSHEDPEVK FNWYVDGVEV HNAKTKPREE QYNSTYRVVS
201 VLTVLHQDWL NGKEYKCKVS NKALPAPIEK TISKAKGQPR EPQVYTLPPS
251 REEMTKNQVS LTCLVKGFYP SDIAVEWESN GQPENNYDTT PPVLDSDGSF
301 FLYSDLTVDK SRWQQGNVFS CSVMHEALHN HYTQKSLSLS PG
(서열 번호: 45)
ActRIIB-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 46)의 상보적 형태는 다음과 같다:
리더 서열 및 링커 서열은 밑줄로 표시된다. 상기 서열 번호: 43 및 45의 ActRIIB(L79E)-Fc 융합 폴리펩티드와 함께 이형이량체 형성을 유도하기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (글루탐산염과 아스파르트산이 리신으로 대체됨)이 상기 ActRIIB-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인으로 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 46의 아미노산 서열이 제공된다.
이 ActRIIB-Fc 융합 단백질은 핵산 (서열 번호: 47)에 의해 인코드된다:
1 ATGGATGCAA TGAAGAGAGG GCTCTGCTGT GTGCTGCTGC TGTGTGGAGC
51 AGTCTTCGTT TCGCCCGGCG CCTCTGGGCG TGGGGAGGCT GAGACACGGG
101 AGTGCATCTA CTACAACGCC AACTGGGAGC TGGAGCGCAC CAACCAGAGC
151 GGCCTGGAGC GCTGCGAAGG CGAGCAGGAC AAGCGGCTGC ACTGCTACGC
201 CTCCTGGCGC AACAGCTCTG GCACCATCGA GCTCGTGAAG AAGGGCTGCT
251 GGCTAGATGA CTTCAACTGC TACGATAGGC AGGAGTGTGT GGCCACTGAG
301 GAGAACCCCC AGGTGTACTT CTGCTGCTGT GAAGGCAACT TCTGCAACGA
351 GCGCTTCACT CATTTGCCAG AGGCTGGGGG CCCGGAAGTC ACGTACGAGC
401 CACCCCCGAC AGCCCCCACC GGTGGTGGAA CTCACACATG CCCACCGTGC
451 CCAGCACCTG AACTCCTGGG GGGACCGTCA GTCTTCCTCT TCCCCCCAAA
501 ACCCAAGGAC ACCCTCATGA TCTCCCGGAC CCCTGAGGTC ACATGCGTGG
551 TGGTGGACGT GAGCCACGAA GACCCTGAGG TCAAGTTCAA CTGGTACGTG
601 GACGGCGTGG AGGTGCATAA TGCCAAGACA AAGCCGCGGG AGGAGCAGTA
651 CAACAGCACG TACCGTGTGG TCAGCGTCCT CACCGTCCTG CACCAGGACT
701 GGCTGAATGG CAAGGAGTAC AAGTGCAAGG TCTCCAACAA AGCCCTCCCA
751 GCCCCCATCG AGAAAACCAT CTCCAAAGCC AAAGGGCAGC CCCGAGAACC
801 ACAGGTGTAC ACCCTGCCCC CATCCCGGAA GGAGATGACC AAGAACCAGG
851 TCAGCCTGAC CTGCCTGGTC AAAGGCTTCT ATCCCAGCGA CATCGCCGTG
901 GAGTGGGAGA GCAATGGGCA GCCGGAGAAC AACTACAAGA CCACGCCTCC
951 CGTGCTGAAG TCCGACGGCT CCTTCTTCCT CTATAGCAAG CTCACCGTGG
1001 ACAAGAGCAG GTGGCAGCAG GGGAACGTCT TCTCATGCTC CGTGATGCAT
1051 GAGGCTCTGC ACAACCACTA CACGCAGAAG AGCCTCTCCC TGTCTCCGGG
1101 TAAA (서열 번호: 47)
성숙 ActRIIB-Fc 융합 단백질 서열 (서열 번호: 48)은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
1 GRGEAETREC IYYNANWELE RTNQSGLERC EGEQDKRLHC YASWRNSSGT
51 IELVKKGCWL DDFNCYDRQE CVATEENPQV YFCCCEGNFC NERFTHLPEA
101 GGPEVTYEPP PTAPTGGGTH TCPPCPAPEL LGGPSVFLFP PKPKDTLMIS
151 RTPEVTCVVV DVSHEDPEVK FNWYVDGVEV HNAKTKPREE QYNSTYRVVS
201 VLTVLHQDWL NGKEYKCKVS NKALPAPIEK TISKAKGQPR EPQVYTLPPS
251 RKEMTKNQVS LTCLVKGFYP SDIAVEWESN GQPENNYKTT PPVLKSDGSF
301 FLYSKLTVDK SRWQQGNVFS CSVMHEALHN HYTQKSLSLS PGK
(서열 번호: 48)
차례로 서열 번호: 45 및 서열 번호:48의 상기 ActRIIB(L79E)-Fc 및 ActRIIB-Fc 폴리펩티드는 CHO 세포계에서 공동-발현되고, 정제되어, ActRIIB-Fc:ActRIIB(L79E)-Fc을 포함하는 이형화학성 복합체가 생성될 수 있다.
비대칭 Fc 융합 단백질을 이용한 이형다량체 복합체들의 형성을 촉진시키는 또다른 방법에서, 차례로 서열 번호: 49-50 및 51-52의 ActRIIB(L79E)-Fc 및 ActRIIB-Fc 폴리펩티드 서열에서 설명된 바와 같이, 상보적 소수성 상호작용과 추가적인 분자간 이황화결합을 도입하도록 Fc 도메인이 변경된다. 상기 ActRIIB(L79E)-Fc 융합 폴리펩티드 및 ActRIIB-Fc 융합 폴리펩티드는 각각 PA 리더 (서열 번호: 8)를 이용한다.
상기 ActRIIB(L79E)-Fc 폴리펩티드 서열 (서열 번호: 49)는 하기에 나타낸다:
신호 서열과 링커 서열은 실선 밑줄로 표시하고, L79E 치환은 이중밑줄로 표시된다. 가능한 동형이량체 복합체보다는 상기 ActRIIB-Fc:ActRIIB(L79E)-Fc 이종이량체의 형성을 촉진시키기 위하여, 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 2개의 아미노산 치환 (세린이 시스테인으로 그리고 트레오닌이 트립토판으로 대체됨)이 상기 융합 단백질의 Fc 도메인에 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단에 리신이 추가된, 서열 번호: 49의 아미노산 서열이 제공될 수 있다.
성숙 ActRIIB(L79E)-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 50)는 다음과 같다:
1 GRGEAETREC IYYNANWELE RTNQSGLERC EGEQDKRLHC YASWRNSSGT
51 IELVKKGCWE DDFNCYDRQE CVATEENPQV YFCCCEGNFC NERFTHLPEA
101 GGPEVTYEPP PTAPTGGGTH TCPPCPAPEL LGGPSVFLFP PKPKDTLMIS
151 RTPEVTCVVV DVSHEDPEVK FNWYVDGVEV HNAKTKPREE QYNSTYRVVS
201 VLTVLHQDWL NGKEYKCKVS NKALPAPIEK TISKAKGQPR EPQVYTLPPC
251 REEMTKNQVS LWCLVKGFYP SDIAVEWESN GQPENNYKTT PPVLDSDGSF
301 FLYSKLTVDK SRWQQGNVFS CSVMHEALHN HYTQKSLSLS PG
(서열 번호: 50)
상보적 형태의 ActRIIB-Fc 융합 폴리펩티드 (서열 번호: 51)는 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
리더 서열 및 링커는 밑줄로 표시된다. 상기 서열 번호: 49-50의 상기 ActRIIB(L79E)-Fc 융합 폴리펩티드와 함께 이형이량체 형성을 유도하기 위하여, 4개의 아미노산 치환 (티로신은 시스테인으로, 트레오닌은 세린으로, 류신은 알라닌으로, 그리고 티로신은 발린으로 대체)이 상기 이중 밑줄로 표시된 바와 같이, 상기 ActRIIB-Fc 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인 안으로 도입될 수 있다. 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거된, 서열 번호: 51의 아미노산 서열이 제공된다. 성숙 ActRIIB-Fc 융합 단백질 서열은 다음과 같고, 임의선택적으로 C-말단으로부터 리신이 제거될 수 있다.
차례로 서열 번호: 50 및 서열 번호:52의 상기 ActRIIB(L79E)-Fc 및 ActRIIB-Fc 폴리펩티드는 CHO 세포계에서 공동-발현되고, 정제되어, ActRIIB-Fc:ActRIIB(L79E)-Fc을 포함하는 이형화학성 복합체가 생성될 수 있다.
다양한 ActRIIB-Fc:ActRIIB(L79E)-Fc 복합체들의 정제는 다음중 3개 또는 그 이상이 임의의 순서로 포함된 일련의 컬럼 크로마토그래피에 의해 실행될 수 있다: 단백질 A 크로마토그래피, Q 세파로즈 크로마토그래피, 페닐세파로즈 크로마토그래피, 크기 압출 크로마토그래피, 양이온 교환 크로마토 그래피, 다중형태 크로마토 그래피 (예를 들어, 정전기 및 소수성 리간드 모두를 함유하는 수지로), 및 에피토프-기반 친화성 크로마토 그래피 (예를 들어, 항체 또는 ActRIIB의 에피토프에 대항하여 지향된 기능적으로 동등한 리간드)를 포함한다. 상기 정제는 바이러스 여과 및 완충액 교환으로 완성될 수 있다.
실시예 8. ActRIIB-Fc:ActRIIB(L79E)-Fc 이형체의 리간드 결합 프로파일
BiacoreTM-기반 결합 분석을 이용하여 ActRIIB-Fc:ActRIIB(L79E)-Fc 이종이량체의 리간드 결합 역동학과 변형안된 ActRIIB-Fc 동종이량체의 것을 비교하였다. 융합 단백질은 항-Fc 항체를 이용하여 상기 시스템에 독립적으로 포집되어 있다. 이어서 리간드를 주입하고 37℃에서 포획 수용체 단백질 위로 흘려 보냈다. 결과는 아래 표에 요약되어 있고, 효과적인 리간드 트랩의 리간드 해리속도(kd)는 회색 음영으로 나타낸다.
이 실시예에서, 2 개의 ActRIIB 폴리펩티드 쇄 중 하나의 단일 아미노산 치환은 비-변형된 ActRIIB-Fc 동종이량체에 비해 Fc-융합 단백질의 리간드 결합 선택성을 변경시켰다. ActRIIB-Fc 동종이량체와 비교하였을 때, 상기 ActRIIB(L79E)-Fc 이종이량체는 대개 액티빈 B, GDF8, GDF11, 그리고 BMP6에 고-친화성 결합을 유지했지만, 액티빈 A 및 BMP10에 대한 약 10 배의 빠른 해리율 및 BMP9에 대한 결합 강도의 더 큰 감소를 나타냈다. 따라서, 변이체 ActRIIB-Fc 이형체는 특정 용도에서 변형안된 ActRIIB-Fc 동종이량체보다 더 유용할 것이며, 이때 이러한 선택적 길항작용이 유익하다. 실시예들은 액티빈 A, BMP9, 또는 BMP10의 길항 작용을 감소시키면서, 하나 또는 그 이상의 액티빈 B, GDF8, GDF11, 그리고 BMP6의 길항 작용을 유지하는 것이 바람직한 치료학적 예를 포함한다.
참고자료에 통합
여기에 언급된 모든 간행물 및 특허는 각각의 개별 간행물 또는 특허가 구체적으로 개별적으로 참조로 포함되도록 지시된 것처럼 본원에 참고로 인용된다. 주제의 특정 실시 예들이 논의되었지만, 상기 명세서는 예시적이고, 이에 한정되지 않는다. 본 명세서 및 청구 범위를 검토하면 많은 변형이 당업자에게 명백해질 것이다. 본 발명의 전체 범위는 그 균등 물의 전체 범위 및 명세서와 함께 청구항을 참조하여 그러한 변형과 함께 결정되어야 한다.
ATGGGTCGGGGGCTGCTCAGGGGCCTGTGGCCGCTGCACATCGTCCTGTGGACGCGTATCGCCAGC ACGATCCCACCGCACGTTCAGAAGTCGGTTAATAACGACATGATAGTCACTGACAACAACGGTGCAGTCAAGTTTCCACAACTGTGTAAATTTTGTGATGTGAGATTTTCCACCTGTGACAACCAGAAATCCTGCATGAGCAACTGCAGCATCACCTCCATCTGTGAGAAGCCACAGGAAGTCTGTGTGGCTGTATGGAGAAAGAATGACGAGAACATAACACTAGAGACAGTTTGCCATGACCCCAAGCTCCCCTACCATGACTTTATTCTGGAAGATGCTGCTTCTCCAAAGTGCATTATGAAGGAAAAAAAAAAGCCTGGTGAGACTTTCTTCATGTGTTCCTGTAGCTCTGATGAGTGCAATGACAACATCATCTTCTCAGAAGAATATAACACCAGCAATCCTGACTTGTTGCTAGTCATATTTCAAGTGACAGGCATCAGCCTCCTGCCACCACTGGGAGTTGCCATATCTGTCATCATCATCTTCTACTGCTACCGCGTTAACCGGCAGCAGAAGCTGAGTTCAACCTGGGAAACCGGCAAGACGCGGAAGCTCATGGAGTTCAGCGAGCACTGTGCCATCATCCTGGAAGATGACCGCTCTGACATCAGCTCCACGTGTGCCAACAACATCAACCACAACACAGAGCTGCTGCCCATTGAGCTGGACACCCTGGTGGGGAAAGGTCGCTTTGCTGAGGTCTATAAGGCCAAGCTGAAGCAGAACACTTCAGAGCAGTTTGAGACAGTGGCAGTCAAGATCTTTCCCTATGAGGAGTATGCCTCTTGGAAGACAGAGAAGGACATCTTCTCAGACATCAATCTGAAGCATGAGAACATACTCCAGTTCCTGACGGCTGAGGAGCGGAAGACGGAGTTGGGGAAACAATACTGGCTGATCACCGCCTTCCACGCCAAGGGCAACCTACAGGAGTACCTGACGCGGCATGTCATCAGCTGGGAGGACCTGCGCAAGCTGGGCAGCTCCCTCGCCCGGGGGATTGCTCACCTCCACAGTGATCACACTCCATGTGGGAGGCCCAAGATGCCCATCGTGCACAGGGACCTCAAGAGCTCCAATATCCTCGTGAAGAACGACCTAACCTGCTGCCTGTGTGACTTTGGGCTTTCCCTGCGTCTGGACCCTACTCTGTCTGTGGATGACCTGGCTAACAGTGGGCAGGTGGGAACTGCAAGATACATGGCTCCAGAAGTCCTAGAATCCAGGATGAATTTGGAGAATGTTGAGTCCTTCAAGCAGACCGATGTCTACTCCATGGCTCTGGTGCTCTGGGAAATGACATCTCGCTGTAATGCAGTGGGAGAAGTAAAAGATTATGAGCCTCCATTTGGTTCCAAGGTGCGGGAGCACCCCTGTGTCGAAAGCATGAAGGACAACGTGTTGAGAGATCGAGGGCGACCAGAAATTCCCAGCTTCTGGCTCAACCACCAGGGCATCCAGATGGTGTGTGAGACGTTGACTGAGTGCTGGGACCACGACCCAGAGGCCCGTCTCACAGCCCAGTGTGTGGCAGAACGCTTCAGTGAGCTGGAGCATCTGGACAGGCTCTCGGGGAGGAGCTGCTCGGAGGAGAAGATTCCTGAAGACGGCTCCCTAAACACTACCAAA (서열 번호: 196)
ACGATCCCACCGCACGTTCAGAAGTCGGTTAATAACGACATGATAGTCACTGACAACAACGGTGCAGTCAAGTTTCCACAACTGTGTAAATTTTGTGATGTGAGATTTTCCACCTGTGACAACCAGAAATCCTGCATGAGCAACTGCAGCATCACCTCCATCTGTGAGAAGCCACAGGAAGTCTGTGTGGCTGTATGGAGAAAGAATGACGAGAACATAACACTAGAGACAGTTTGCCATGACCCCAAGCTCCCCTACCATGACTTTATTCTGGAAGATGCTGCTTCTCCAAAGTGCATTATGAAGGAAAAAAAAAAGCCTGGTGAGACTTTCTTCATGTGTTCCTGTAGCTCTGATGAGTGCAATGACAACATCATCTTCTCAGAAGAATATAACACCAGCAATCCTGACTTGTTGCTAGTCATATTTCAA (서열 번호: 197)
ATGGGTCGGGGGCTGCTCAGGGGCCTGTGGCCGCTGCACATCGTCCTGTGGACGCGTATCGCCAGC ACGATCCCACCGCACGTTCAGAAGTCGGATGTGGAAATGGAGGCCCAGAAAGATGAAATCATCTGCCCCAGCTGTAATAGGACTGCCCATCCACTGAGACATATTAATAACGACATGATAGTCACTGACAACAACGGTGCAGTCAAGTTTCCACAACTGTGTAAATTTTGTGATGTGAGATTTTCCACCTGTGACAACCAGAAATCCTGCATGAGCAACTGCAGCATCACCTCCATCTGTGAGAAGCCACAGGAAGTCTGTGTGGCTGTATGGAGAAAGAATGACGAGAACATAACACTAGAGACAGTTTGCCATGACCCCAAGCTCCCCTACCATGACTTTATTCTGGAAGATGCTGCTTCTCCAAAGTGCATTATGAAGGAAAAAAAAAAGCCTGGTGAGACTTTCTTCATGTGTTCCTGTAGCTCTGATGAGTGCAATGACAACATCATCTTCTCAGAAGAATATAACACCAGCAATCCTGACTTGTTGCTAGTCATATTTCAAGTGACAGGCATCAGCCTCCTGCCACCACTGGGAGTTGCCATATCTGTCATCATCATCTTCTACTGCTACCGCGTTAACCGGCAGCAGAAGCTGAGTTCAACCTGGGAAACCGGCAAGACGCGGAAGCTCATGGAGTTCAGCGAGCACTGTGCCATCATCCTGGAAGATGACCGCTCTGACATCAGCTCCACGTGTGCCAACAACATCAACCACAACACAGAGCTGCTGCCCATTGAGCTGGACACCCTGGTGGGGAAAGGTCGCTTTGCTGAGGTCTATAAGGCCAAGCTGAAGCAGAACACTTCAGAGCAGTTTGAGACAGTGGCAGTCAAGATCTTTCCCTATGAGGAGTATGCCTCTTGGAAGACAGAGAAGGACATCTTCTCAGACATCAATCTGAAGCATGAGAACATACTCCAGTTCCTGACGGCTGAGGAGCGGAAGACGGAGTTGGGGAAACAATACTGGCTGATCACCGCCTTCCACGCCAAGGGCAACCTACAGGAGTACCTGACGCGGCATGTCATCAGCTGGGAGGACCTGCGCAAGCTGGGCAGCTCCCTCGCCCGGGGGATTGCTCACCTCCACAGTGATCACACTCCATGTGGGAGGCCCAAGATGCCCATCGTGCACAGGGACCTCAAGAGCTCCAATATCCTCGTGAAGAACGACCTAACCTGCTGCCTGTGTGACTTTGGGCTTTCCCTGCGTCTGGACCCTACTCTGTCTGTGGATGACCTGGCTAACAGTGGGCAGGTGGGAACTGCAAGATACATGGCTCCAGAAGTCCTAGAATCCAGGATGAATTTGGAGAATGTTGAGTCCTTCAAGCAGACCGATGTCTACTCCATGGCTCTGGTGCTCTGGGAAATGACATCTCGCTGTAATGCAGTGGGAGAAGTAAAAGATTATGAGCCTCCATTTGGTTCCAAGGTGCGGGAGCACCCCTGTGTCGAAAGCATGAAGGACAACGTGTTGAGAGATCGAGGGCGACCAGAAATTCCCAGCTTCTGGCTCAACCACCAGGGCATCCAGATGGTGTGTGAGACGTTGACTGAGTGCTGGGACCACGACCCAGAGGCCCGTCTCACAGCCCAGTGTGTGGCAGAACGCTTCAGTGAGCTGGAGCATCTGGACAGGCTCTCGGGGAGGAGCTGCTCGGAGGAGAAGATTCCTGAAGACGGCTCCCTAAACACTACCAAA (서열 번호: 202)
ACGATCCCACCGCACGTTCAGAAGTCGGATGTGGAAATGGAGGCCCAGAAAGATGAAATCATCTGCCCCAGCTGTAATAGGACTGCCCATCCACTGAGACATATTAATAACGACATGATAGTCACTGACAACAACGGTGCAGTCAAGTTTCCACAACTGTGTAAATTTTGTGATGTGAGATTTTCCACCTGTGACAACCAGAAATCCTGCATGAGCAACTGCAGCATCACCTCCATCTGTGAGAAGCCACAGGAAGTCTGTGTGGCTGTATGGAGAAAGAATGACGAGAACATAACACTAGAGACAGTTTGCCATGACCCCAAGCTCCCCTACCATGACTTTATTCTGGAAGATGCTGCTTCTCCAAAGTGCATTATGAAGGAAAAAAAAAAGCCTGGTGAGACTTTCTTCATGTGTTCCTGTAGCTCTGATGAGTGCAATGACAACATCATCTTCTCAGAAGAATATAACACCAGCAATCCTGACTTGTTGCTAGTCATATTTCAA (서열 번호: 203).
ATGACTTCCTCGCTGCAGCGGCCCTGGCGGGTGCCCTGGCTACCATGGACCATCCTGCTGGTCAGCACTGCGGCTGCTTCGCAGAATCAAGAACGGCTATGTGCGTTTAAAGATCCGTATCAGCAAGACCTTGGGATAGGTGAGAGTAGAATCTCTCATGAAAATGGGACAATATTATGCTCGAAAGGTAGCACCTGCTATGGCCTTTGGGAGAAATCAAAAGGGGACATAAATCTTGTAAAACAAGGATGTTGGTCTCACATTGGAGATCCCCAAGAGTGTCACTATGAAGAATGTGTAGTAACTACCACTCCTCCCTCAATTCAGAATGGAACATACCGTTTCTGCTGTTGTAGCACAGATTTATGTAATGTCAACTTTACTGAGAATTTTCCACCTCCTGACACAACACCACTCAGTCCACCTCATTCATTTAACCGAGATGAGACAATAATCATTGCTTTGGCATCAGTCTCTGTATTAGCTGTTTTGATAGTTGCCTTATGCTTTGGATACAGAATGTTGACAGGAGACCGTAAACAAGGTCTTCACAGTATGAACATGATGGAGGCAGCAGCATCCGAACCCTCTCTTGATCTAGATAATCTGAAACTGTTGGAGCTGATTGGCCGAGGTCGATATGGAGCAGTATATAAAGGCTCCTTGGATGAGCGTCCAGTTGCTGTAAAAGTGTTTTCCTTTGCAAACCGTCAGAATTTTATCAACGAAAAGAACATTTACAGAGTGCCTTTGATGGAACATGACAACATTGCCCGCTTTATAGTTGGAGATGAGAGAGTCACTGCAGATGGACGCATGGAATATTTGCTTGTGATGGAGTACTATCCCAATGGATCTTTATGCAAGTATTTAAGTCTCCACACAAGTGACTGGGTAAGCTCTTGCCGTCTTGCTCATTCTGTTACTAGAGGACTGGCTTATCTTCACACAGAATTACCACGAGGAGATCATTATAAACCTGCAATTTCCCATCGAGATTTAAACAGCAGAAATGTCCTAGTGAAAAATGATGGAACCTGTGTTATTAGTGACTTTGGACTGTCCATGAGGCTGACTGGAAATAGACTGGTGCGCCCAGGGGAGGAAGATAATGCAGCCATAAGCGAGGTTGGCACTATCAGATATATGGCACCAGAAGTGCTAGAAGGAGCTGTGAACTTGAGGGACTGTGAATCAGCTTTGAAACAAGTAGACATGTATGCTCTTGGACTAATCTATTGGGAGATATTTATGAGATGTACAGACCTCTTCCCAGGGGAATCCGTACCAGAGTACCAGATGGCTTTTCAGACAGAGGTTGGAAACCATCCCACTTTTGAGGATATGCAGGTTCTCGTGTCTAGGGAAAAACAGAGACCCAAGTTCCCAGAAGCCTGGAAAGAAAATAGCCTGGCAGTGAGGTCACTCAAGGAGACAATCGAAGACTGTTGGGACCAGGATGCAGAGGCTCGGCTTACTGCACAGTGTGCTGAGGAAAGGATGGCTGAACTTATGATGATTTGGGAAAGAAACAAATCTGTGAGCCCAACAGTCAATCCAATGTCTACTGCTATGCAGAATGAACGCAACCTGTCACATAATAGGCGTGTGCCAAAAATTGGTCCTTATCCAGATTATTCTTCCTCCTCATACATTGAAGACTCTATCCATCATACTGACAGCATCGTGAAGAATATTTCCTCTGAGCATTCTATGTCCAGCACACCTTTGACTATAGGGGAAAAAAACCGAAATTCAATTAACTATGAACGACAGCAAGCACAAGCTCGAATCCCCAGCCCTGAAACAAGTGTCACCAGCCTCTCCACCAACACAACAACCACAAACACCACAGGACTCACGCCAAGTACTGGCATGACTACTATATCTGAGATGCCATACCCAGATGAAACAAATCTGCATACCACAAATGTTGCACAGTCAATTGGGCCAACCCCTGTCTGCTTACAGCTGACAGAAGAAGACTTGGAAACCAACAAGCTAGACCCAAAAGAAGTTGATAAGAACCTCAAGGAAAGCTCTGATGAGAATCTCATGGAGCACTCTCTTAAACAGTTCAGTGGCCCAGACCCACTGAGCAGTACTAGTTCTAGCTTGCTTTACCCACTCATAAAACTTGCAGTAGAAGCAACTGGACAGCAGGACTTCACACAGACTGCAAATGGCCAAGCATGTTTGATTCCTGATGTTCTGCCTACTCAGATCTATCCTCTCCCCAAGCAGCAGAACCTTCCCAAGAGACCTACTAGTTTGCCTTTGAACACCAAAAATTCAACAAAAGAGCCCCGGCTAAAATTTGGCAGCAAGCACAAATCAAACTTGAAACAAGTCGAAACTGGAGTTGCCAAGATGAATACAATCAATGCAGCAGAACCTCATGTGGTGACAGTCACCATGAATGGTGTGGCAGGTAGAAACCACAGTGTTAACTCCCATGCTGCCACAACCCAATATGCCAATGGGACAGTACTATCTGGCCAAACAACCAACATAGTGACACATAGGGCCCAAGAAATGTTGCAGAATCAGTTTATTGGTGAGGACACCCGGCTGAATATTAATTCCAGTCCTGATGAGCATGAGCCTTTACTGAGACGAGAGCAACAAGCTGGCCATGATGAAGGTGTTCTGGATCGTCTTGTGGACAGGAGGGAACGGCCACTAGAAGGTGGCCGAACTAATTCCAATAACAACAACAGCAATCCATGTTCAGAACAAGATGTTCTTGCACAGGGTGTTCCAAGCACAGCAGCAGATCCTGGGCCATCAAAGCCCAGAAGAGCACAGAGGCCTAATTCTCTGGATCTTTCAGCCACAAATGTCCTGGATGGCAGCAGTATACAGATAGGTGAGTCAACACAAGATGGCAAATCAGGATCAGGTGAAAAGATCAAGAAACGTGTGAAAACTCCCTATTCTCTTAAGCGGTGGCGCCCCTCCACCTGGGTCATCTCCACTGAATCGCTGGACTGTGAAGTCAACAATAATGGCAGTAACAGGGCAGTTCATTCCAAATCCAGCACTGCTGTTTACCTTGCAGAAGGAGGCACTGCTACAACCATGGTGTCTAAAGATATAGGAATGAACTGTCTG (서열 번호: 205)
TCGCAGAATCAAGAACGGCTATGTGCGTTTAAAGATCCGTATCAGCAAGACCTTGGGATAGGTGAGAGTAGAATCTCTCATGAAAATGGGACAATATTATGCTCGAAAGGTAGCACCTGCTATGGCCTTTGGGAGAAATCAAAAGGGGACATAAATCTTGTAAAACAAGGATGTTGGTCTCACATTGGAGATCCCCAAGAGTGTCACTATGAAGAATGTGTAGTAACTACCACTCCTCCCTCAATTCAGAATGGAACATACCGTTTCTGCTGTTGTAGCACAGATTTATGTAATGTCAACTTTACTGAGAATTTTCCACCTCCTGACACAACACCACTCAGTCCACCTCATTCATTTAACCGAGATGAGACA (서열 번호: 206)
ATGACTTCCTCGCTGCAGCGGCCCTGGCGGGTGCCCTGGCTACCATGGACCATCCTGCTGGTCAGCACTGCGGCTGCTTCGCAGAATCAAGAACGGCTATGTGCGTTTAAAGATCCGTATCAGCAAGACCTTGGGATAGGTGAGAGTAGAATCTCTCATGAAAATGGGACAATATTATGCTCGAAAGGTAGCACCTGCTATGGCCTTTGGGAGAAATCAAAAGGGGACATAAATCTTGTAAAACAAGGATGTTGGTCTCACATTGGAGATCCCCAAGAGTGTCACTATGAAGAATGTGTAGTAACTACCACTCCTCCCTCAATTCAGAATGGAACATACCGTTTCTGCTGTTGTAGCACAGATTTATGTAATGTCAACTTTACTGAGAATTTTCCACCTCCTGACACAACACCACTCAGTCCACCTCATTCATTTAACCGAGATGAGACAATAATCATTGCTTTGGCATCAGTCTCTGTATTAGCTGTTTTGATAGTTGCCTTATGCTTTGGATACAGAATGTTGACAGGAGACCGTAAACAAGGTCTTCACAGTATGAACATGATGGAGGCAGCAGCATCCGAACCCTCTCTTGATCTAGATAATCTGAAACTGTTGGAGCTGATTGGCCGAGGTCGATATGGAGCAGTATATAAAGGCTCCTTGGATGAGCGTCCAGTTGCTGTAAAAGTGTTTTCCTTTGCAAACCGTCAGAATTTTATCAACGAAAAGAACATTTACAGAGTGCCTTTGATGGAACATGACAACATTGCCCGCTTTATAGTTGGAGATGAGAGAGTCACTGCAGATGGACGCATGGAATATTTGCTTGTGATGGAGTACTATCCCAATGGATCTTTATGCAAGTATTTAAGTCTCCACACAAGTGACTGGGTAAGCTCTTGCCGTCTTGCTCATTCTGTTACTAGAGGACTGGCTTATCTTCACACAGAATTACCACGAGGAGATCATTATAAACCTGCAATTTCCCATCGAGATTTAAACAGCAGAAATGTCCTAGTGAAAAATGATGGAACCTGTGTTATTAGTGACTTTGGACTGTCCATGAGGCTGACTGGAAATAGACTGGTGCGCCCAGGGGAGGAAGATAATGCAGCCATAAGCGAGGTTGGCACTATCAGATATATGGCACCAGAAGTGCTAGAAGGAGCTGTGAACTTGAGGGACTGTGAATCAGCTTTGAAACAAGTAGACATGTATGCTCTTGGACTAATCTATTGGGAGATATTTATGAGATGTACAGACCTCTTCCCAGGGGAATCCGTACCAGAGTACCAGATGGCTTTTCAGACAGAGGTTGGAAACCATCCCACTTTTGAGGATATGCAGGTTCTCGTGTCTAGGGAAAAACAGAGACCCAAGTTCCCAGAAGCCTGGAAAGAAAATAGCCTGGCAGTGAGGTCACTCAAGGAGACAATCGAAGACTGTTGGGACCAGGATGCAGAGGCTCGGCTTACTGCACAGTGTGCTGAGGAAAGGATGGCTGAACTTATGATGATTTGGGAAAGAAACAAATCTGTGAGCCCAACAGTCAATCCAATGTCTACTGCTATGCAGAATGAACGTAGG (서열 번호: 207)
TCGCAGAATCAAGAACGGCTATGTGCGTTTAAAGATCCGTATCAGCAAGACCTTGGGATAGGTGAGAGTAGAATCTCTCATGAAAATGGGACAATATTATGCTCGAAAGGTAGCACCTGCTATGGCCTTTGGGAGAAATCAAAAGGGGACATAAATCTTGTAAAACAAGGATGTTGGTCTCACATTGGAGATCCCCAAGAGTGTCACTATGAAGAATGTGTAGTAACTACCACTCCTCCCTCAATTCAGAATGGAACATACCGTTTCTGCTGTTGTAGCACAGATTTATGTAATGTCAACTTTACTGAGAATTTTCCACCTCCTGACACAACACCACTCAGTCCACCTCATTCATTTAACCGAGATGAGACA (서열 번호: 208)
ATGCTAGGGTCTTTGGGGCTTTGGGCATTACTTCCCACAGCTGTGGAAGCA CCCCCAAACAGGCGAACCTGTGTGTTCTTTGAGGCCCCTGGAGTGCGGGGAAGCACAAAGACACTGGGAGAGCTGCTAGATACAGGCACAGAGCTCCCCAGAGCTATCCGCTGCCTCTACAGCCGCTGCTGCTTTGGGATCTGGAACCTGACCCAAGACCGGGCACAGGTGGAAATGCAAGGATGCCGAGACAGTGATGAGCCAGGCTGTGAGTCCCTCCACTGTGACCCAAGTCCCCGAGCCCACCCCAGCCCTGGCTCCACTCTCTTCACCTGCTCCTGTGGCACTGACTTCTGCAATGCCAATTACAGCCATCTGCCTCCTCCAGGGAGCCCTGGGACTCCTGGCTCCCAGGGTCCCCAGGCTGCCCCAGGTGAGTCCATCTGGATGGCACTGGTGCTGCTGGGGCTGTTCCTCCTCCTCCTGCTGCTGCTGGGCAGCATCATCTTGGCCCTGCTACAGCGAAAGAACTACAGAGTGCGAGGTGAGCCAGTGCCAGAGCCAAGGCCAGACTCAGGCAGGGACTGGAGTGTGGAGCTGCAGGAGCTGCCTGAGCTGTGTTTCTCCCAGGTAATCCGGGAAGGAGGTCATGCAGTGGTTTGGGCCGGGCAGCTGCAAGGAAAACTGGTTGCCATCAAGGCCTTCCCACCGAGGTCTGTGGCTCAGTTCCAAGCTGAGAGAGCATTGTACGAACTTCCAGGCCTACAGCACGACCACATTGTCCGATTTATCACTGCCAGCCGGGGGGGTCCTGGCCGCCTGCTCTCTGGGCCCCTGCTGGTACTGGAACTGCATCCCAAGGGCTCCCTGTGCCACTACTTGACCCAGTACACCAGTGACTGGGGAAGTTCCCTGCGGATGGCACTGTCCCTGGCCCAGGGCCTGGCATTTCTCCATGAGGAGCGCTGGCAGAATGGCCAATATAAACCAGGTATTGCCCACCGAGATCTGAGCAGCCAGAATGTGCTCATTCGGGAAGATGGATCGTGTGCCATTGGAGACCTGGGCCTTGCCTTGGTGCTCCCTGGCCTCACTCAGCCCCCTGCCTGGACCCCTACTCAACCACAAGGCCCAGCTGCCATCATGGAAGCTGGCACCCAGAGGTACATGGCACCAGAGCTCTTGGACAAGACTCTGGACCTACAGGATTGGGGCATGGCCCTCCGACGAGCTGATATTTACTCTTTGGCTCTGCTCCTGTGGGAGATACTGAGCCGCTGCCCAGATTTGAGGCCTGACAGCAGTCCACCACCCTTCCAACTGGCCTATGAGGCAGAACTGGGCAATACCCCTACCTCTGATGAGCTATGGGCCTTGGCAGTGCAGGAGAGGAGGCGTCCCTACATCCCATCCACCTGGCGCTGCTTTGCCACAGACCCTGATGGGCTGAGGGAGCTCCTAGAAGACTGTTGGGATGCAGACCCAGAAGCACGGCTGACAGCTGAGTGTGTACAGCAGCGCCTGGCTGCCTTGGCCCATCCTCAAGAGAGCCACCCCTTTCCAGAGAGCTGTCCACGTGGCTGCCCACCTCTCTGCCCAGAAGACTGTACTTCAATTCCTGCCCCTACCATCCTCCCCTGTAGGCCTCAGCGGAGTGCCTGCCACTTCAGCGTTCAGCAAGGCCCTTGTTCCAGGAATCCTCAGCCTGCCTGTACCCTTTCTCCTGTG (서열 번호: 209)
CCCCCAAACAGGCGAACCTGTGTGTTCTTTGAGGCCCCTGGAGTGCGGGGAAGCACAAAGACACTGGGAGAGCTGCTAGATACAGGCACAGAGCTCCCCAGAGCTATCCGCTGCCTCTACAGCCGCTGCTGCTTTGGGATCTGGAACCTGACCCAAGACCGGGCACAGGTGGAAATGCAAGGATGCCGAGACAGTGATGAGCCAGGCTGTGAGTCCCTCCACTGTGACCCAAGTCCCCGAGCCCACCCCAGCCCTGGCTCCACTCTCTTCACCTGCTCCTGTGGCACTGACTTCTGCAATGCCAATTACAGCCATCTGCCTCCTCCAGGGAGCCCTGGGACTCCTGGCTCCCAGGGTCCCCAGGCTGCCCCAGGTGAGTCCATCTGGATGGCACTG (서열 번호: 210)
ATGCTAGGGTCTTTGGGGCTTTGGGCATTACTTCCCACAGCTGTGGAAGCACCCCCAAACAGGCGAACCTGTGTGTTCTTTGAGGCCCCTGGAGTGCGGGGAAGCACAAAGACACTGGGAGAGCTGCTAGATACAGGCACAGAGCTCCCCAGAGCTATCCGCTGCCTCTACAGCCGCTGCTGCTTTGGGATCTGGAACCTGACCCAAGACCGGGCACAGGTGGAAATGCAAGGATGCCGAGACAGTGATGAGCCAGGCTGTGAGTCCCTCCACTGTGACCCAAGTCCCCGAGCCCACCCCAGCCCTGGCTCCACTCTCTTCACCTGCTCCTGTGGCACTGACTTCTGCAATGCCAATTACAGCCATCTGCCTCCTCCAGGGAGCCCTGGGACTCCTGGCTCCCAGGGTCCCCAGGCTGCCCCAGGTGAGTCCATCTGGATGGCACTGGTGCTGCTGGGGCTGTTCCTCCTCCTCCTGCTGCTGCTGGGCAGCATCATCTTGGCCCTGCTACAGCGAAAGAACTACAGAGTGCGAGGTGAGCCAGTGCCAGAGCCAAGGCCAGACTCAGGCAGGGACTGGAGTGTGGAGCTGCAGGAGCTGCCTGAGCTGTGTTTCTCCCAGGTAATCCGGGAAGGAGGTCATGCAGTGGTTTGGGCCGGGCAGCTGCAAGGAAAACTGGTTGCCATCAAGGCCTTCCCACCGAGGTCTGTGGCTCAGTTCCAAGCTGAGAGAGCATTGTACGAACTTCCAGGCCTACAGCACGACCACATTGTCCGATTTATCACTGCCAGCCGGGGGGGTCCTGGCCGCCTGCTCTCTGGGCCCCTGCTGGTACTGGAACTGCATCCCAAGGGCTCCCTGTGCCACTACTTGACCCAGTACACCAGTGACTGGGGAAGTTCCCTGCGGATGGCACTGTCCCTGGCCCAGGGCCTGGCATTTCTCCATGAGGAGCGCTGGCAGAATGGCCAATATAAACCAGGTATTGCCCACCGAGATCTGAGCAGCCAGAATGTGCTCATTCGGGAAGATGGATCGTGTGCCATTGGAGACCTGGGCCTTGCCTTGGTGCTCCCTGGCCTCACTCAGCCCCCTGCCTGGACCCCTACTCAACCACAAGGCCCAGCTGCCATCATGGAAGCTGGCACCCAGAGGTACATGGCACCAGAGCTCTTGGACAAGACTCTGGACCTACAGGATTGGGGCATGGCCCTCCGACGAGCTGATATTTACTCTTTGGCTCTGCTCCTGTGGGAGATACTGAGCCGCTGCCCAGATTTGAGGCCTGCAGTCCACCACCCTTCCAACTGGCCTATGAGGCAGAACTGGGCAATACCCCTACCTCTGATGAGCTATGGGCCTTGGCAGTGCAGGAGAGGAGGCGTCCCTACATCCCATCCACCTGGCGCTGCTTTGCCACAGACCCTGATGGGC (서열 번호: 211)
CCCCCAAACAGGCGAACCTGTGTGTTCTTTGAGGCCCCTGGAGTGCGGGGAAGCACAAAGACACTGGGAGAGCTGCTAGATACAGGCACAGAGCTCCCCAGAGCTATCCGCTGCCTCTACAGCCGCTGCTGCTTTGGGATCTGGAACCTGACCCAAGACCGGGCACAGGTGGAAATGCAAGGATGCCGAGACAGTGATGAGCCAGGCTGTGAGTCCCTCCACTGTGACCCAAGTCCCCGAGCCCACCCCAGCCCTGGCTCCACTCTCTTCACCTGCTCCTGTGGCACTGACTTCTGCAATGCCAATTACAGCCATCTGCCTCCTCCAGGGAGCCCTGGGACTCCTGGCTCCCAGGGTCCCCAGGCTGCCCCAGGTGAGTCCATCTGGATGGCACTG (서열 번호: 212)
ATGCTAGGGTCTTTGGGGCTTTGGGCATTACTTCCCACAGCTGTGGAAGCACCCCCAAACAGGCGAACCTGTGTGTTCTTTGAGGCCCCTGGAGTGCGGGGAAGCACAAAGACACTGGGAGAGCTGCTAGATACAGGCACAGAGCTCCCCAGAGCTATCCGCTGCCTCTACAGCCGCTGCTGCTTTGGGATCTGGAACCTGACCCAAGACCGGGCACAGGTGGAAATGCAAGGATGCCGAGACAGTGATGAGCCAGGCTGTGAGTCCCTCCACTGTGACCCAAGTCCCCGAGCCCACCCCAGCCCTGGCTCCACTCTCTTCACCTGCTCCTGTGGCACTGACTTCTGCAATGCCAATTACAGCCATCTGCCTCCTCCAGGGAGCCCTGGGACTCCTGGCTCCCAGGGTCCCCAGGCTGCCCCAGGTGAGTCCATCTGGATGGCACTGGTGCTGCTGGGGCTGTTCCTCCTCCTCCTGCTGCTGCTGGGCAGCATCATCTTGGCCCTGCTACAGCGAAAGAACTACAGAGTGCGAGGTGAGCCAGTGCCAGAGCCAAGGCCAGACTCAGGCAGGGACTGGAGTGTGGAGCTGCAGGAGCTGCCTGAGCTGTGTTTCTCCCAGGTAATCCGGGAAGGAGGTCATGCAGTGGTTTGGGCCGGGCAGCTGCAAGGAAAACTGGTTGCCATCAAGGCCTTCCCACCGAGGTCTGTGGCTCAGTTCCAAGCTGAGAGAGCATTGTACGAACTTCCAGGCCTACAGCACGACCACATTGTCCGATTTATCACTGCCAGCCGGGGGGGTCCTGGCCGCCTGCTCTCTGGGCCCCTGCTGGTACTGGAACTGCATCCCAAGGGCTCCCTGTGCCACTACTTGACCCAGTACACCAGTGACTGGGGAAGTTCCCTGCGGATGGCACTGTCCCTGGCCCAGGGCCTGGCATTTCTCCATGAGGAGCGCTGGCAGAATGGCCAATATAAACCAGGTATTGCCCACCGAGATCTGAGCAGCCAGAATGTGCTCATTCGGGAAGATGGATCGTGTGCCATTGGAGACCTGGGCCTTGCCTTGGTGCTCCCTGGCCTCACTCAGCCCCCTGCCTGGACCCCTACTCAACCACAAGGCCCAGCTGCCATCATGGAAGACCCTGATGGGCTGAGGGAGCTCCTAGAAGACTGTTGGGATGCAGACCCAGAAGCACGGCTGACAGCTGAGTGTGTACAGCAGCGCCTGGCTGCCTTGGCCCATCCTCAAGAGAGCCACCCCTTTCCAGAGAGCTGTCCACGTGGCTGCCCACCTCTCTGCCCAGAAGACTGTACTTCAATTCCTGCCCCTACCATCCTCCCCTGTAGGCCTCAGCGGAGTGCCTGCCACTTCAGCGTTCAGCAAGGCCCTTGTTCCAGGAATCCTCAGCCTGCCTGTACCCTTTCTCCTGTG (서열 번호: 213)
CCCCCAAACAGGCGAACCTGTGTGTTCTTTGAGGCCCCTGGAGTGCGGGGAAGCACAAAGACACTGGGAGAGCTGCTAGATACAGGCACAGAGCTCCCCAGAGCTATCCGCTGCCTCTACAGCCGCTGCTGCTTTGGGATCTGGAACCTGACCCAAGACCGGGCACAGGTGGAAATGCAAGGATGCCGAGACAGTGATGAGCCAGGCTGTGAGTCCCTCCACTGTGACCCAAGTCCCCGAGCCCACCCCAGCCCTGGCTCCACTCTCTTCACCTGCTCCTGTGGCACTGACTTCTGCAATGCCAATTACAGCCATCTGCCTCCTCCAGGGAGCCCTGGGACTCCTGGCTCCCAGGGTCCCCAGGCTGCCCCAGGTGAGTCCATCTGGATGGCACTG (서열 번호: 214)
ATGACCTTGGGCTCCCCCAGGAAAGGCCTTCTGATGCTGCTGATGGCCTTGGTGACCCAGGGA GACCCTGTGAAGCCGTCTCGGGGCCCGCTGGTGACCTGCACGTGTGAGAGCCCACATTGCAAGGGGCCTACCTGCCGGGGGGCCTGGTGCACAGTAGTGCTGGTGCGGGAGGAGGGGAGGCACCCCCAGGAACATCGGGGCTGCGGGAACTTGCACAGGGAGCTCTGCAGGGGGCGCCCCACCGAGTTCGTCAACCACTACTGCTGCGACAGCCACCTCTGCAACCACAACGTGTCCCTGGTGCTGGAGGCCACCCAACCTCCTTCGGAGCAGCCGGGAACAGATGGCCAGCTGGCCCTGATCCTGGGCCCCGTGCTGGCCTTGCTGGCCCTGGTGGCCCTGGGTGTCCTGGGCCTGTGGCATGTCCGACGGAGGCAGGAGAAGCAGCGTGGCCTGCACAGCGAGCTGGGAGAGTCCAGTCTCATCCTGAAAGCATCTGAGCAGGGCGACAGCATGTTGGGGGACCTCCTGGACAGTGACTGCACCACAGGGAGTGGCTCAGGGCTCCCCTTCCTGGTGCAGAGGACAGTGGCACGGCAGGTTGCCTTGGTGGAGTGTGTGGGAAAAGGCCGCTATGGCGAAGTGTGGCGGGGCTTGTGGCACGGTGAGAGTGTGGCCGTCAAGATCTTCTCCTCGAGGGATGAACAGTCCTGGTTCCGGGAGACTGAGATCTATAACACAGTGTTGCTCAGACACGACAACATCCTAGGCTTCATCGCCTCAGACATGACCTCCCGCAACTCGAGCACGCAGCTGTGGCTCATCACGCACTACCACGAGCACGGCTCCCTCTACGACTTTCTGCAGAGACAGACGCTGGAGCCCCATCTGGCTCTGAGGCTAGCTGTGTCCGCGGCATGCGGCCTGGCGCACCTGCACGTGGAGATCTTCGGTACACAGGGCAAACCAGCCATTGCCCACCGCGACTTCAAGAGCCGCAATGTGCTGGTCAAGAGCAACCTGCAGTGTTGCATCGCCGACCTGGGCCTGGCTGTGATGCACTCACAGGGCAGCGATTACCTGGACATCGGCAACAACCCGAGAGTGGGCACCAAGCGGTACATGGCACCCGAGGTGCTGGACGAGCAGATCCGCACGGACTGCTTTGAGTCCTACAAGTGGACTGACATCTGGGCCTTTGGCCTGGTGCTGTGGGAGATTGCCCGCCGGACCATCGTGAATGGCATCGTGGAGGACTATAGACCACCCTTCTATGATGTGGTGCCCAATGACCCCAGCTTTGAGGACATGAAGAAGGTGGTGTGTGTGGATCAGCAGACCCCCACCATCCCTAACCGGCTGGCTGCAGACCCGGTCCTCTCAGGCCTAGCTCAGATGATGCGGGAGTGCTGGTACCCAAACCCCTCTGCCCGACTCACCGCGCTGCGGATCAAGAAGACACTACAAAAAATTAGCAACAGTCCAGAGAAGCCTAAAGTGATTCAA (서열 번호: 215)
GACCCTGTGAAGCCGTCTCGGGGCCCGCTGGTGACCTGCACGTGTGAGAGCCCACATTGCAAGGGGCCTACCTGCCGGGGGGCCTGGTGCACAGTAGTGCTGGTGCGGGAGGAGGGGAGGCACCCCCAGGAACATCGGGGCTGCGGGAACTTGCACAGGGAGCTCTGCAGGGGGCGCCCCACCGAGTTCGTCAACCACTACTGCTGCGACAGCCACCTCTGCAACCACAACGTGTCCCTGGTGCTGGAGGCCACCCAACCTCCTTCGGAGCAGCCGGGAACAGATGGCCAG (서열 번호: 216)
ATGGTAGATGGAGTGATGATTCTTCCTGTGCTTATCATGATTGCTCTCCCCTCCCCTAGT ATGGAAGATGAGAAGCCCAAGGTCAACCCCAAACTCTACATGTGTGTGTGTGAAGGTCTCTCCTGCGGTAATGAGGACCACTGTGAAGGCCAGCAGTGCTTTTCCTCACTGAGCATCAACGATGGCTTCCACGTCTACCAGAAAGGCTGCTTCCAGGTTTATGAGCAGGGAAAGATGACCTGTAAGACCCCGCCGTCCCCTGGCCAAGCCGTGGAGTGCTGCCAAGGGGACTGGTGTAACAGGAACATCACGGCCCAGCTGCCCACTAAAGGAAAATCCTTCCCTGGAACACAGAATTTCCACTTGGAGGTTGGCCTCATTATTCTCTCTGTAGTGTTCGCAGTATGTCTTTTAGCCTGCCTGCTGGGAGTTGCTCTCCGAAAATTTAAAAGGCGCAACCAAGAACGCCTCAATCCCCGAGACGTGGAGTATGGCACTATCGAAGGGCTCATCACCACCAATGTTGGAGACAGCACTTTAGCAGATTTATTGGATCATTCGTGTACATCAGGAAGTGGCTCTGGTCTTCCTTTTCTGGTACAAAGAACAGTGGCTCGCCAGATTACACTGTTGGAGTGTGTCGGGAAAGGCAGGTATGGTGAGGTGTGGAGGGGCAGCTGGCAAGGGGAGAATGTTGCCGTGAAGATCTTCTCCTCCCGTGATGAGAAGTCATGGTTCAGGGAAACGGAATTGTACAACACTGTGATGCTGAGGCATGAAAATATCTTAGGTTTCATTGCTTCAGACATGACATCAAGACACTCCAGTACCCAGCTGTGGTTAATTACACATTATCATGAAATGGGATCGTTGTACGACTATCTTCAGCTTACTACTCTGGATACAGTTAGCTGCCTTCGAATAGTGCTGTCCATAGCTAGTGGTCTTGCACATTTGCACATAGAGATATTTGGGACCCAAGGGAAACCAGCCATTGCCCATCGAGATTTAAAGAGCAAAAATATTCTGGTTAAGAAGAATGGACAGTGTTGCATAGCAGATTTGGGCCTGGCAGTCATGCATTCCCAGAGCACCAATCAGCTTGATGTGGGGAACAATCCCCGTGTGGGCACCAAGCGCTACATGGCCCCCGAAGTTCTAGATGAAACCATCCAGGTGGATTGTTTCGATTCTTATAAAAGGGTCGATATTTGGGCCTTTGGACTTGTTTTGTGGGAAGTGGCCAGGCGGATGGTGAGCAATGGTATAGTGGAGGATTACAAGCCACCGTTCTACGATGTGGTTCCCAATGACCCAAGTTTTGAAGATATGAGGAAGGTAGTCTGTGTGGATCAACAAAGGCCAAACATACCCAACAGATGGTTCTCAGACCCGACATTAACCTCTCTGGCCAAGCTAATGAAAGAATGCTGGTATCAAAATCCATCCGCAAGACTCACAGCACTGCGTATCAAAAAGACTTTGACCAAAATTGATAATTCCCTCGACAAATTGAAAACTGACTGT (서열 번호: 217)
ATGGAAGATGAGAAGCCCAAGGTCAACCCCAAACTCTACATGTGTGTGTGTGAAGGTCTCTCCTGCGGTAATGAGGACCACTGTGAAGGCCAGCAGTGCTTTTCCTCACTGAGCATCAACGATGGCTTCCACGTCTACCAGAAAGGCTGCTTCCAGGTTTATGAGCAGGGAAAGATGACCTGTAAGACCCCGCCGTCCCCTGGCCAAGCCGTGGAGTGCTGCCAAGGGGACTGGTGTAACAGGAACATCACGGCCCAGCTGCCCACTAAAGGAAAATCCTTCCCTGGAACACAGAATTTCCACTTGGAG (서열 번호: 218)
1 ATGCCTCAGC TATACATTTA CATCAGATTA TTGGGAGCCT ATTTGTTCAT CATTTCTCGT
61 GTTCAAGGA C AGAATCTGGA TAGTATGCTT CATGGCACTG GGATGAAATC AGACTCCGAC
121 CAGAAAAAGT CAGAAAATGG AGTAACCTTA GCACCAGAGG ATACCTTGCC TTTTTTAAAG
181 TGCTATTGCT CAGGGCACTG TCCAGATGAT GCTATTAATA ACACATGCAT AACTAATGGA
241 CATTGCTTTG CCATCATAGA AGAAGATGAC CAGGGAGAAA CCACATTAGC TTCAGGGTGT
301 ATGAAATATG AAGGATCTGA TTTTCAGTGC AAAGATTCTC CAAAAGCCCA GCTACGCCGG
361 ACAATAGAAT GTTGTCGGAC CAATTTATGT AACCAGTATT TGCAACCCAC ACTGCCCCCT
421 GTTGTCATAG GTCCGTTTTT TGATGGCAGC ATTCGATGGC TGGTTTTGCT CATTTCTATG
481 GCTGTCTGCA TAATTGCTAT GATCATCTTC TCCAGCTGCT TTTGTTACAA ACATTATTGC
541 AAGAGCATCT CAAGCAGACG TCGTTACAAT CGTGATTTGG AACAGGATGA AGCATTTATT
601 CCAGTTGGAG AATCACTAAA AGACCTTATT GACCAGTCAC AAAGTTCTGG TAGTGGGTCT
661 GGACTACCTT TATTGGTTCA GCGAACTATT GCCAAACAGA TTCAGATGGT CCGGCAAGTT
721 GGTAAAGGCC GATATGGAGA AGTATGGATG GGCAAATGGC GTGGCGAAAA AGTGGCGGTG
781 AAAGTATTCT TTACCACTGA AGAAGCCAGC TGGTTTCGAG AAACAGAAAT CTACCAAACT
841 GTGCTAATGC GCCATGAAAA CATACTTGGT TTCATAGCGG CAGACATTAA AGGTACAGGT
901 TCCTGGACTC AGCTCTATTT GATTACTGAT TACCATGAAA ATGGATCTCT CTATGACTTC
961 CTGAAATGTG CTACACTGGA CACCAGAGCC CTGCTTAAAT TGGCTTATTC AGCTGCCTGT
1021 GGTCTGTGCC ACCTGCACAC AGAAATTTAT GGCACCCAAG GAAAGCCCGC AATTGCTCAT
1081 CGAGACCTAA AGAGCAAAAA CATCCTCATC AAGAAAAATG GGAGTTGCTG CATTGCTGAC
1141 CTGGGCCTTG CTGTTAAATT CAACAGTGAC ACAAATGAAG TTGATGTGCC CTTGAATACC
1201 AGGGTGGGCA CCAAACGCTA CATGGCTCCC GAAGTGCTGG ACGAAAGCCT GAACAAAAAC
1261 CACTTCCAGC CCTACATCAT GGCTGACATC TACAGCTTCG GCCTAATCAT TTGGGAGATG
1321 GCTCGTCGTT GTATCACAGG AGGGATCGTG GAAGAATACC AATTGCCATA TTACAACATG
1381 GTACCGAGTG ATCCGTCATA CGAAGATATG CGTGAGGTTG TGTGTGTCAA ACGTTTGCGG
1441 CCAATTGTGT CTAATCGGTG GAACAGTGAT GAATGTCTAC GAGCAGTTTT GAAGCTAATG
1501 TCAGAATGCT GGGCCCACAA TCCAGCCTCC AGACTCACAG CATTGAGAAT TAAGAAGACG
1561 CTTGCCAAGA TGGTTGAATC CCAAGATGTA AAAATC (서열 번호: 219)
1 CAGAATCTGG ATAGTATGCT TCATGGCACT GGGATGAAAT CAGACTCCGA CCAGAAAAAG
61 TCAGAAAATG GAGTAACCTT AGCACCAGAG GATACCTTGC CTTTTTTAAA GTGCTATTGC
121 TCAGGGCACT GTCCAGATGA TGCTATTAAT AACACATGCA TAACTAATGG ACATTGCTTT
181 GCCATCATAG AAGAAGATGA CCAGGGAGAA ACCACATTAG CTTCAGGGTG TATGAAATAT
241 GAAGGATCTG ATTTTCAGTG CAAAGATTCT CCAAAAGCCC AGCTACGCCG GACAATAGAA
301 TGTTGTCGGA CCAATTTATG TAACCAGTAT TTGCAACCCA CACTGCCCCC TGTTGTCATA
361 GGTCCGTTTT TTGATGGCAG CATTCGA (서열 번호: 220)
ATGGCGGAGTCGGCCGGAGCCTCCTCCTTCTTCCCCCTTGTTGTCCTCCTGCTCGCCGGCAGCGGCGGG TCCGGGCCCCGGGGGGTCCAGGCTCTGCTGTGTGCGTGCACCAGCTGCCTCCAGGCCAACTACACGTGTGAGACAGATGGGGCCTGCATGGTTTCCATTTTCAATCTGGATGGGATGGAGCACCATGTGCGCACCTGCATCCCCAAAGTGGAGCTGGTCCCTGCCGGGAAGCCCTTCTACTGCCTGAGCTCGGAGGACCTGCGCAACACCCACTGCTGCTACACTGACTACTGCAACAGGATCGACTTGAGGGTGCCCAGTGGTCACCTCAAGGAGCCTGAGCACCCGTCCATGTGGGGCCCGGTGGAGCTGGTAGGCATCATCGCCGGCCCGGTGTTCCTCCTGTTCCTCATCATCATCATTGTTTTCCTTGTCATTAACTATCATCAGCGTGTCTATCACAACCGCCAGAGACTGGACATGGAAGATCCCTCATGTGAGATGTGTCTCTCCAAAGACAAGACGCTCCAGGATCTTGTCTACGATCTCTCCACCTCAGGGTCTGGCTCAGGGTTACCCCTCTTTGTCCAGCGCACAGTGGCCCGAACCATCGTTTTACAAGAGATTATTGGCAAGGGTCGGTTTGGGGAAGTATGGCGGGGCCGCTGGAGGGGTGGTGATGTGGCTGTGAAAATATTCTCTTCTCGTGAAGAACGGTCTTGGTTCAGGGAAGCAGAGATATACCAGACGGTCATGCTGCGCCATGAAAACATCCTTGGATTTATTGCTGCTGACAATAAAGATAATGGCACCTGGACACAGCTGTGGCTTGTTTCTGACTATCATGAGCACGGGTCCCTGTTTGATTATCTGAACCGGTACACAGTGACAATTGAGGGGATGATTAAGCTGGCCTTGTCTGCTGCTAGTGGGCTGGCACACCTGCACATGGAGATCGTGGGCACCCAAGGGAAGCCTGGAATTGCTCATCGAGACTTAAAGTCAAAGAACATTCTGGTGAAGAAAAATGGCATGTGTGCCATAGCAGACCTGGGCCTGGCTGTCCGTCATGATGCAGTCACTGACACCATTGACATTGCCCCGAATCAGAGGGTGGGGACCAAACGATACATGGCCCCTGAAGTACTTGATGAAACCATTAATATGAAACACTTTGACTCCTTTAAATGTGCTGATATTTATGCCCTCGGGCTTGTATATTGGGAGATTGCTCGAAGATGCAATTCTGGAGGAGTCCATGAAGAATATCAGCTGCCATATTACGACTTAGTGCCCTCTGACCCTTCCATTGAGGAAATGCGAAAGGTTGTATGTGATCAGAAGCTGCGTCCCAACATCCCCAACTGGTGGCAGAGTTATGAGGCACTGCGGGTGATGGGGAAGATGATGCGAGAGTGTTGGTATGCCAACGGCGCAGCCCGCCTGACGGCCCTGCGCATCAAGAAGACCCTCTCCCAGCTCAGCGTGCAGGAAGACGTGAAGATC (서열 번호: 221)
TCCGGGCCCCGGGGGGTCCAGGCTCTGCTGTGTGCGTGCACCAGCTGCCTCCAGGCCAACTACACGTGTGAGACAGATGGGGCCTGCATGGTTTCCATTTTCAATCTGGATGGGATGGAGCACCATGTGCGCACCTGCATCCCCAAAGTGGAGCTGGTCCCTGCCGGGAAGCCCTTCTACTGCCTGAGCTCGGAGGACCTGCGCAACACCCACTGCTGCTACACTGACTACTGCAACAGGATCGACTTGAGGGTGCCCAGTGGTCACCTCAAGGAGCCTGAGCACCCGTCCATGTGGGGCCCGGTGGAG (서열 번호: 222)
ATGGCGGAGTCGGCCGGAGCCTCCTCCTTCTTCCCCCTTGTTGTCCTCCTGCTCGCCGGCAGCGGCGGG TCCGGGCCCCGGGGGGTCCAGGCTCTGCTGTGTGCGTGCACCAGCTGCCTCCAGGCCAACTACACGTGTGAGACAGATGGGGCCTGCATGGTTTCCATTTTCAATCTGGATGGGATGGAGCACCATGTGCGCACCTGCATCCCCAAAGTGGAGCTGGTCCCTGCCGGGAAGCCCTTCTACTGCCTGAGCTCGGAGGACCTGCGCAACACCCACTGCTGCTACACTGACTACTGCAACAGGATCGACTTGAGGGTGCCCAGTGGTCACCTCAAGGAGCCTGAGCACCCGTCCATGTGGGGCCCGGTGGAGCTGGTAGGCATCATCGCCGGCCCGGTGTTCCTCCTGTTCCTCATCATCATCATTGTTTTCCTTGTCATTAACTATCATCAGCGTGTCTATCACAACCGCCAGAGACTGGACATGGAAGATCCCTCATGTGAGATGTGTCTCTCCAAAGACAAGACGCTCCAGGATCTTGTCTACGATCTCTCCACCTCAGGGTCTGGCTCAGGGTTACCCCTCTTTGTCCAGCGCACAGTGGCCCGAACCATCGTTTTACAAGAGATTATTGGCAAGGGTCGGTTTGGGGAAGTATGGCGGGGCCGCTGGAGGGGTGGTGATGTGGCTGTGAAAATATTCTCTTCTCGTGAAGAACGGTCTTGGTTCAGGGAAGCAGAGATATACCAGACGGTCATGCTGCGCCATGAAAACATCCTTGGATTTATTGCTGCTGACAATAAAGCAGACTGCTCATTCCTCACATTGCCATGGGAAGTTGTAATGGTCTCTGCTGCCCCCAAGCTGAGGAGCCTTAGACTCCAATACAAGGGAGGAAGGGGAAGAGCAAGATTTTTATTCCCACTGAATAATGGCACCTGGACACAGCTGTGGCTTGTTTCTGACTATCATGAGCACGGGTCCCTGTTTGATTATCTGAACCGGTACACAGTGACAATTGAGGGGATGATTAAGCTGGCCTTGTCTGCTGCTAGTGGGCTGGCACACCTGCACATGGAGATCGTGGGCACCCAAGGGAAGCCTGGAATTGCTCATCGAGACTTAAAGTCAAAGAACATTCTGGTGAAGAAAAATGGCATGTGTGCCATAGCAGACCTGGGCCTGGCTGTCCGTCATGATGCAGTCACTGACACCATTGACATTGCCCCGAATCAGAGGGTGGGGACCAAACGATACATGGCCCCTGAAGTACTTGATGAAACCATTAATATGAAACACTTTGACTCCTTTAAATGTGCTGATATTTATGCCCTCGGGCTTGTATATTGGGAGATTGCTCGAAGATGCAATTCTGGAGGAGTCCATGAAGAATATCAGCTGCCATATTACGACTTAGTGCCCTCTGACCCTTCCATTGAGGAAATGCGAAAGGTTGTATGTGATCAGAAGCTGCGTCCCAACATCCCCAACTGGTGGCAGAGTTATGAGGCACTGCGGGTGATGGGGAAGATGATGCGAGAGTGTTGGTATGCCAACGGCGCAGCCCGCCTGACGGCCCTGCGCATCAAGAAGACCCTCTCCCAGCTCAGCGTGCAGGAAGACGTGAAGATC (서열 번호: 223)
TCCGGGCCCCGGGGGGTCCAGGCTCTGCTGTGTGCGTGCACCAGCTGCCTCCAGGCCAACTACACGTGTGAGACAGATGGGGCCTGCATGGTTTCCATTTTCAATCTGGATGGGATGGAGCACCATGTGCGCACCTGCATCCCCAAAGTGGAGCTGGTCCCTGCCGGGAAGCCCTTCTACTGCCTGAGCTCGGAGGACCTGCGCAACACCCACTGCTGCTACACTGACTACTGCAACAGGATCGACTTGAGGGTGCCCAGTGGTCACCTCAAGGAGCCTGAGCACCCGTCCATGTGGGGCCCGGTGGAG (서열 번호: 224)
ATGGAGGCGGCGGTCGCTGCTCCGCGTCCCCGGCTGCTCCTCCTCGTGCTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCG GCGGCGCTGCTCCCGGGGGCGACGGCGTTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAAGACAATTTTACTTGTGTGACAGATGGGCTCTGCTTTGTCTCTGTCACAGAGACCACAGACAAAGTTATACACAACAGCATGTGTATAGCTGAAATTGACTTAATTCCTCGAGATAGGCCGTTTGTATGTGCACCCTCTTCAAAAACTGGGTCTGTGACTACAACATATTGCTGCAATCAGGACCATTGCAATAAAATAGAACTTCCAACTACTGTAAAGTCATCACCTGGCCTTGGTCCTGTGGAACTGGCAGCTGTCATTGCTGGACCAGTGTGCTTCGTCTGCATCTCACTCATGTTGATGGTCTATATCTGCCACAACCGCACTGTCATTCACCATCGAGTGCCAAATGAAGAGGACCCTTCATTAGATCGCCCTTTTATTTCAGAGGGTACTACGTTGAAAGACTTAATTTATGATATGACAACGTCAGGTTCTGGCTCAGGTTTACCATTGCTTGTTCAGAGAACAATTGCGAGAACTATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGATTTGGAGAAGTTTGGAGAGGAAAGTGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTTAAGATATTCTCCTCTAGAGAAGAACGTTCGTGGTTCCGTGAGGCAGAGATTTATCAAACTGTAATGTTACGTCATGAAAACATCCTGGGATTTATAGCAGCAGACAATAAAGACAATGGTACTTGGACTCAGCTCTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTTGATTACTTAAACAGATACACAGTTACTGTGGAAGGAATGATAAAACTTGCTCTGTCCACGGCGAGCGGTCTTGCCCATCTTCACATGGAGATTGTTGGTACCCAAGGAAAGCCAGCCATTGCTCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATATCTTGGTAAAGAAGAATGGAACTTGCTGTATTGCAGACTTAGGACTGGCAGTAAGACATGATTCAGCCACAGATACCATTGATATTGCTCCAAACCACAGAGTGGGAACAAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTCGATGATTCCATAAATATGAAACATTTTGAATCCTTCAAACGTGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTATTCTGGGAAATTGCTCGACGATGTTCCATTGGTGGAATTCATGAAGATTACCAACTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGACCCATCAGTTGAAGAAATGAGAAAAGTTGTTTGTGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATCCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAAGCCTTGAGAGTAATGGCTAAAATTATGAGAGAATGTTGGTATGCCAATGGAGCAGCTAGGCTTACAGCATTGCGGATTAAGAAAACATTATCGCAACTCAGTCAACAGGAAGGCATCAAAATG (서열 번호: 225)
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ATGGAGGCGGCGGTCGCTGCTCCGCGTCCCCGGCTGCTCCTCCTCGTGCTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCG GCGGCGCTGCTCCCGGGGGCGACGGCGTTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAAGACAATTTTACTTGTGTGACAGATGGGCTCTGCTTTGTCTCTGTCACAGAGACCACAGACAAAGTTATACACAACAGCATGTGTATAGCTGAAATTGACTTAATTCCTCGAGATAGGCCGTTTGTATGTGCACCCTCTTCAAAAACTGGGTCTGTGACTACAACATATTGCTGCAATCAGGACCATTGCAATAAAATAGAACTTCCAACTACTGGCCCTTTTTCAGTAAAGTCATCACCTGGCCTTGGTCCTGTGGAACTGGCAGCTGTCATTGCTGGACCAGTGTGCTTCGTCTGCATCTCACTCATGTTGATGGTCTATATCTGCCACAACCGCACTGTCATTCACCATCGAGTGCCAAATGAAGAGGACCCTTCATTAGATCGCCCTTTTATTTCAGAGGGTACTACGTTGAAAGACTTAATTTATGATATGACAACGTCAGGTTCTGGCTCAGGTTTACCATTGCTTGTTCAGAGAACAATTGCGAGAACTATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGATTTGGAGAAGTTTGGAGAGGAAAGTGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTTAAGATATTCTCCTCTAGAGAAGAACGTTCGTGGTTCCGTGAGGCAGAGATTTATCAAACTGTAATGTTACGTCATGAAAACATCCTGGGATTTATAGCAGCAGACAATAAAGACAATGGTACTTGGACTCAGCTCTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTTGATTACTTAAACAGATACACAGTTACTGTGGAAGGAATGATAAAACTTGCTCTGTCCACGGCGAGCGGTCTTGCCCATCTTCACATGGAGATTGTTGGTACCCAAGGAAAGCCAGCCATTGCTCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATATCTTGGTAAAGAAGAATGGAACTTGCTGTATTGCAGACTTAGGACTGGCAGTAAGACATGATTCAGCCACAGATACCATTGATATTGCTCCAAACCACAGAGTGGGAACAAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTCGATGATTCCATAAATATGAAACATTTTGAATCCTTCAAACGTGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTATTCTGGGAAATTGCTCGACGATGTTCCATTGGTGGAATTCATGAAGATTACCAACTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGACCCATCAGTTGAAGAAATGAGAAAAGTTGTTTGTGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATCCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAAGCCTTGAGAGTAATGGCTAAAATTATGAGAGAATGTTGGTATGCCAATGGAGCAGCTAGGCTTACAGCATTGCGGATTAAGAAAACATTATCGCAACTCAGTCAACAGGAAGGCATCAAAATG (서열 번호: 227)
GCGGCGCTGCTCCCGGGGGCGACGGCGTTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAAGACAATTTTACTTGTGTGACAGATGGGCTCTGCTTTGTCTCTGTCACAGAGACCACAGACAAAGTTATACACAACAGCATGTGTATAGCTGAAATTGACTTAATTCCTCGAGATAGGCCGTTTGTATGTGCACCCTCTTCAAAAACTGGGTCTGTGACTACAACATATTGCTGCAATCAGGACCATTGCAATAAAATAGAACTTCCAACTACTGGCCCTTTTTCAGTAAAGTCATCACCTGGCCTTGGTCCTGTGGAACTG (서열 번호: 228)
ATGCTTTTGCGAAGTGCAGGAAAATTAAATGTGGGCACC AAGAAAGAGGATGGTGAGAGTACAGCCCCCACCCCCCGTCCAAAGGTCTTGCGTTGTAAATGCCACCACCATTGTCCAGAAGACTCAGTCAACAATATTTGCAGCACAGACGGATATTGTTTCACGATGATAGAAGAGGATGACTCTGGGTTGCCTGTGGTCACTTCTGGTTGCCTAGGACTAGAAGGCTCAGATTTTCAGTGTCGGGACACTCCCATTCCTCATCAAAGAAGATCAATTGAATGCTGCACAGAAAGGAACGAATGTAATAAAGACCTACACCCTACACTGCCTCCATTGAAAAACAGAGATTTTGTTGATGGACCTATACACCACAGGGCTTTACTTATATCTGTGACTGTCTGTAGTTTGCTCTTGGTCCTTATCATATTATTTTGTTACTTCCGGTATAAAAGACAAGAAACCAGACCTCGATACAGCATTGGGTTAGAACAGGATGAAACTTACATTCCTCCTGGAGAATCCCTGAGAGACTTAATTGAGCAGTCTCAGAGCTCAGGAAGTGGATCAGGCCTCCCTCTGCTGGTCCAAAGGACTATAGCTAAGCAGATTCAGATGGTGAAACAGATTGGAAAAGGTCGCTATGGGGAAGTTTGGATGGGAAAGTGGCGTGGCGAAAAGGTAGCTGTGAAAGTGTTCTTCACCACAGAGGAAGCCAGCTGGTTCAGAGAGACAGAAATATATCAGACAGTGTTGATGAGGCATGAAAACATTTTGGGTTTCATTGCTGCAGATATCAAAGGGACAGGGTCCTGGACCCAGTTGTACCTAATCACAGACTATCATGAAAATGGTTCCCTTTATGATTATCTGAAGTCCACCACCCTAGACGCTAAATCAATGCTGAAGTTAGCCTACTCTTCTGTCAGTGGCTTATGTCATTTACACACAGAAATCTTTAGTACTCAAGGCAAACCAGCAATTGCCCATCGAGATCTGAAAAGTAAAAACATTCTGGTGAAGAAAAATGGAACTTGCTGTATTGCTGACCTGGGCCTGGCTGTTAAATTTATTAGTGATACAAATGAAGTTGACATACCACCTAACACTCGAGTTGGCACCAAACGCTATATGCCTCCAGAAGTGTTGGACGAGAGCTTGAACAGAAATCACTTCCAGTCTTACATCATGGCTGACATGTATAGTTTTGGCCTCATCCTTTGGGAGGTTGCTAGGAGATGTGTATCAGGAGGTATAGTGGAAGAATACCAGCTTCCTTATCATGACCTAGTGCCCAGTGACCCCTCTTATGAGGACATGAGGGAGATTGTGTGCATCAAGAAGTTACGCCCCTCATTCCCAAACCGGTGGAGCAGTGATGAGTGTCTAAGGCAGATGGGAAAACTCATGACAGAATGCTGGGCTCACAATCCTGCATCAAGGCTGACAGCCCTGCGGGTTAAGAAAACACTTGCCAAAATGTCAGAGTCCCAGGACATTAAACTC (서열 번호: 229)
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ATGGGTTGGCTGGAAGAACTAAACTGGCAGCTTCACATTTTCTTGCTCATTCTTCTCTCTATGCACACAAGGGCA AACTTCCTTGATAACATGCTTTTGCGAAGTGCAGGAAAATTAAATGTGGGCACCAAGAAAGAGGATGGTGAGAGTACAGCCCCCACCCCCCGTCCAAAGGTCTTGCGTTGTAAATGCCACCACCATTGTCCAGAAGACTCAGTCAACAATATTTGCAGCACAGACGGATATTGTTTCACGATGATAGAAGAGGATGACTCTGGGTTGCCTGTGGTCACTTCTGGTTGCCTAGGACTAGAAGGCTCAGATTTTCAGTGTCGGGACACTCCCATTCCTCATCAAAGAAGATCAATTGAATGCTGCACAGAAAGGAACGAATGTAATAAAGACCTACACCCTACACTGCCTCCATTGAAAAACAGAGATTTTGTTGATGGACCTATACACCACAGGGCTTTACTTATATCTGTGACTGTCTGTAGTTTGCTCTTGGTCCTTATCATATTATTTTGTTACTTCCGGTATAAAAGACAAGAAACCAGACCTCGATACAGCATTGGGTTAGAACAGGATGAAACTTACATTCCTCCTGGAGAATCCCTGAGAGACTTAATTGAGCAGTCTCAGAGCTCAGGAAGTGGATCAGGCCTCCCTCTGCTGGTCCAAAGGACTATAGCTAAGCAGATTCAGATGGTGAAACAGATTGGAAAAGGTCGCTATGGGGAAGTTTGGATGGGAAAGTGGCGTGGCGAAAAGGTAGCTGTGAAAGTGTTCTTCACCACAGAGGAAGCCAGCTGGTTCAGAGAGACAGAAATATATCAGACAGTGTTGATGAGGCATGAAAACATTTTGGGTTTCATTGCTGCAGATATCAAAGGGACAGGGTCCTGGACCCAGTTGTACCTAATCACAGACTATCATGAAAATGGTTCCCTTTATGATTATCTGAAGTCCACCACCCTAGACGCTAAATCAATGCTGAAGTTAGCCTACTCTTCTGTCAGTGGCTTATGTCATTTACACACAGAAATCTTTAGTACTCAAGGCAAACCAGCAATTGCCCATCGAGATCTGAAAAGTAAAAACATTCTGGTGAAGAAAAATGGAACTTGCTGTATTGCTGACCTGGGCCTGGCTGTTAAATTTATTAGTGATACAAATGAAGTTGACATACCACCTAACACTCGAGTTGGCACCAAACGCTATATGCCTCCAGAAGTGTTGGACGAGAGCTTGAACAGAAATCACTTCCAGTCTTACATCATGGCTGACATGTATAGTTTTGGCCTCATCCTTTGGGAGGTTGCTAGGAGATGTGTATCAGGAGGTATAGTGGAAGAATACCAGCTTCCTTATCATGACCTAGTGCCCAGTGACCCCTCTTATGAGGACATGAGGGAGATTGTGTGCATCAAGAAGTTACGCCCCTCATTCCCAAACCGGTGGAGCAGTGATGAGTGTCTAAGGCAGATGGGAAAACTCATGACAGAATGCTGGGCTCACAATCCTGCATCAAGGCTGACAGCCCTGCGGGTTAAGAAAACACTTGCCAAAATGTCAGAGTCCCAGGACATTAAACTC (서열 번호: 231)
AACTTCCTTGATAACATGCTTTTGCGAAGTGCAGGAAAATTAAATGTGGGCACCAAGAAAGAGGATGGTGAGAGTACAGCCCCCACCCCCCGTCCAAAGGTCTTGCGTTGTAAATGCCACCACCATTGTCCAGAAGACTCAGTCAACAATATTTGCAGCACAGACGGATATTGTTTCACGATGATAGAAGAGGATGACTCTGGGTTGCCTGTGGTCACTTCTGGTTGCCTAGGACTAGAAGGCTCAGATTTTCAGTGTCGGGACACTCCCATTCCTCATCAAAGAAGATCAATTGAATGCTGCACAGAAAGGAACGAATGTAATAAAGACCTACACCCTACACTGCCTCCATTGAAAAACAGAGATTTTGTTGATGGACCTATACACCACAGG (서열 번호: 232)
ATGACCCGGGCGCTCTGCTCAGCGCTCCGCCAGGCTCTCCTGCTGCTCGCAGCGGCCGCC GAGCTCTCGCCAGGACTGAAGTGTGTATGTCTTTTGTGTGATTCTTCAAACTTTACCTGCCAAACAGAAGGAGCATGTTGGGCATCAGTCATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGTCTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTCTGTCATAGTTCCAACAATGTTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTGCACCTTCCAACAGCATCACCAAATGCCCCAAAACTTGGACCCATGGAGCTGGCCATCATTATTACTGTGCCTGTTTGCCTCCTGTCCATAGCTGCGATGCTGACAGTATGGGCATGCCAGGGTCGACAGTGCTCCTACAGGAAGAAAAAGAGACCAAATGTGGAGGAACCACTCTCTGAGTGCAATCTGGTAAATGCTGGAAAAACTCTGAAAGATCTGATTTATGATGTGACCGCCTCTGGATCTGGCTCTGGTCTACCTCTGTTGGTTCAAAGGACAATTGCAAGGACGATTGTGCTTCAGGAAATAGTAGGAAAAGGTAGATTTGGTGAGGTGTGGCATGGAAGATGGTGTGGGGAAGATGTGGCTGTGAAAATATTCTCCTCCAGAGATGAAAGATCTTGGTTTCGTGAGGCAGAAATTTACCAGACGGTCATGCTGCGACATGAAAACATCCTTGGTTTCATTGCTGCTGACAACAAAGATAATGGAACTTGGACTCAACTTTGGCTGGTATCTGAATATCATGAACAGGGCTCCTTATATGACTATTTGAATAGAAATATAGTGACCGTGGCTGGAATGATCAAGCTGGCGCTCTCAATTGCTAGTGGTCTGGCACACCTTCATATGGAGATTGTTGGTACACAAGGTAAACCTGCTATTGCTCATCGAGACATAAAATCAAAGAATATCTTAGTGAAAAAGTGTGAAACTTGTGCCATAGCGGACTTAGGGTTGGCTGTGAAGCATGATTCAATACTGAACACTATCGACATACCTCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTATATGGCTCCTGAAATGCTTGATGATACAATGAATGTGAATATCTTTGAGTCCTTCAAACGAGCTGACATCTATTCTGTTGGTCTGGTTTACTGGGAAATAGCCCGGAGGTGTTCAGTCGGAGGAATTGTTGAGGAGTACCAATTGCCTTATTATGACATGGTGCCTTCAGATCCCTCGATAGAGGAAATGAGAAAGGTTGTTTGTGACCAGAAGTTTCGACCAAGTATCCCAAACCAGTGGCAAAGTTGTGAAGCACTCCGAGTCATGGGGAGAATAATGCGTGAGTGTTGGTATGCCAACGGAGCGGCCCGCCTAACTGCTCTTCGTATTAAGAAGACTATATCTCAACTTTGTGTCAAAGAAGACTGCAAAGCC (서열 번호: 233)
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ATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGTCTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTCTGTCATAGTTCCAACAATGTTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTGCACCTTCCAACAGCATCACCAAATGCCCCAAAACTTGGACCCATGGAGCTGGCCATCATTATTACTGTGCCTGTTTGCCTCCTGTCCATAGCTGCGATGCTGACAGTATGGGCATGCCAGGGTCGACAGTGCTCCTACAGGAAGAAAAAGAGACCAAATGTGGAGGAACCACTCTCTGAGTGCAATCTGGTAAATGCTGGAAAAACTCTGAAAGATCTGATTTATGATGTGACCGCCTCTGGATCTGGCTCTGGTCTACCTCTGTTGGTTCAAAGGACAATTGCAAGGACGATTGTGCTTCAGGAAATAGTAGGAAAAGGTAGATTTGGTGAGGTGTGGCATGGAAGATGGTGTGGGGAAGATGTGGCTGTGAAAATATTCTCCTCCAGAGATGAAAGATCTTGGTTTCGTGAGGCAGAAATTTACCAGACGGTCATGCTGCGACATGAAAACATCCTTGGTTTCATTGCTGCTGACAACAAAGATAATGGAACTTGGACTCAACTTTGGCTGGTATCTGAATATCATGAACAGGGCTCCTTATATGACTATTTGAATAGAAATATAGTGACCGTGGCTGGAATGATCAAGCTGGCGCTCTCAATTGCTAGTGGTCTGGCACACCTTCATATGGAGATTGTTGGTACACAAGGTAAACCTGCTATTGCTCATCGAGACATAAAATCAAAGAATATCTTAGTGAAAAAGTGTGAAACTTGTGCCATAGCGGACTTAGGGTTGGCTGTGAAGCATGATTCAATACTGAACACTATCGACATACCTCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTATATGGCTCCTGAAATGCTTGATGATACAATGAATGTGAATATCTTTGAGTCCTTCAAACGAGCTGACATCTATTCTGTTGGTCTGGTTTACTGGGAAATAGCCCGGAGGTGTTCAGTCGGAGGAATTGTTGAGGAGTACCAATTGCCTTATTATGACATGGTGCCTTCAGATCCCTCGATAGAGGAAATGAGAAAGGTTGTTTGTGACCAGAAGTTTCGACCAAGTATCCCAAACCAGTGGCAAAGTTGTGAAGCACTCCGAGTCATGGGGAGAATAATGCGTGAGTGTTGGTATGCCAACGGAGCGGCCCGCCTAACTGCTCTTCGTATTAAGAAGACTATATCTCAACTTTGTGTCAAAGAAGACTGCAAAGCC (서열 번호: 235)
ATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGTCTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTCTGTCATAGTTCCAACAATGTTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTGCACCTTCCAACAGCATCACCAAATGCCCCAAAACTTGGACCCATGGAG (서열 번호: 236)
ATGACCCGGGCGCTCTGCTCAGCGCTCCGCCAGGCTCTCCTGCTGCTCGCAGCGGCCGCCGAGCTCTCGCCAGGACTGAAGTGTGTATGTCTTTTGTGTGATTCTTCAAACTTTACCTGCCAAACAGAAGGAGCATGTTGGGCATCAGTCATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGTCTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTCTGTCATAGTTCCAACAATGTTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTGCACCTTCCAACAGGTCTACCTCTGTTGGTTCAAAGGACAATTGCAAGGACGATTGTGCTTCAGGAAATAGTAGGAAAAGGTAGATTTGGTGAGGTGTGGCATGGAAGATGGTGTGGGGAAGATGTGGCTGTGAAAATATTCTCCTCCAGAGATGAAAGATCTTGGTTTCGTGAGGCAGAAATTTACCAGACGGTCATGCTGCGACATGAAAACATCCTTGGTTTCATTGCTGCTGACAACAAAGATAATGGAACTTGGACTCAACTTTGGCTGGTATCTGAATATCATGAACAGGGCTCCTTATATGACTATTTGAATAGAAATATAGTGACCGTGGCTGGAATGATCAAGCTGGCGCTCTCAATTGCTAGTGGTCTGGCACACCTTCATATGGAGATTGTTGGTACACAAGGTAAACCTGCTATTGCTCATCGAGACATAAAATCAAAGAATATCTTAGTGAAAAAGTGTGAAACTTGTGCCATAGCGGACTTAGGGTTGGCTGTGAAGCATGATTCAATACTGAACACTATCGACATACCTCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTATATGGCTCCTGAAATGCTTGATGATACAATGAATGTGAATATCTTTGAGTCCTTCAAACGAGCTGACATCTATTCTGTTGGTCTGGTTTACTGGGAAATAGCCCGGAGGTGTTCAGTCGGAGGAATTGTTGAGGAGTACCAATTGCCTTATTATGACATGGTGCCTTCAGATCCCTCGATAGAGGAAATGAGAAAGGTTGTTTGTGACCAGAAGTTTCGACCAAGTATCCCAAACCAGTGGCAAAGTTGTGAAGCACTCCGAGTCATGGGGAGAATAATGCGTGAGTGTTGGTATGCCAACGGAGCGGCCCGCCTAACTGCTCTTCGTATTAAGAAGACTATATCTCAACTTTGTGTCAAAGAAGACTGCAAAGCC (서열 번호: 237)
GAGCTCTCGCCAGGACTGAAGTGTGTATGTCTTTTGTGTGATTCTTCAAACTTTACCTGCCAAACAGAAGGAGCATGTTGGGCATCAGTCATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGTCTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTCTGTCATAGTTCCAACAATGTTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTGCACCTTCCAACAGGTCTACCTCTGTTGGTTCAAAGGACAATTGCAAGGACGATTGTGCTTCAGGAAATAGTAGGAAAAGGTAGATTTGGTGAGGTGTGGCATGGAAGATGGTGTGGGGAAGATGTGGCTGTGAAAATATTCTCCTCCAGAGATGAAAGATCTTGGTTTCGTGAGGCAGAAATTTACCAGACGGTCATGCTGCGACATGAAAACATCCTTGGTTTCATTGCTGCTGACAACAAAGATAATGGAACTTGGACTCAACTTTGGCTGGTATCTGAATATCATGAACAGGGCTCCTTATATGACTATTTGAATAGAAATATAGTGACCGTGGCTGGAATGATCAAGCTGGCGCTCTCAATTGCTAGTGGTCTGGCACACCTTCATATGGAGATTGTTGGTACACAAGGTAAACCTGCTATTGCTCATCGAGACATAAAATCAAAGAATATCTTAGTGAAAAAGTGTGAAACTTGTGCCATAGCGGACTTAGGGTTGGCTGTGAAGCATGATTCAATACTGAACACTATCGACATACCTCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTATATGGCTCCTGAAATGCTTGATGATACAATGAATGTGAATATCTTTGAGTCCTTCAAACGAGCTGACATCTATTCTGTTGGTCTGGTTTACTGGGAAATAGCCCGGAGGTGTTCAGTCGGAGGAATTGTTGAGGAGTACCAATTGCCTTATTATGACATGGTGCCTTCAGATCCCTCGATAGAGGAAATGAGAAAGGTTGTTTGTGACCAGAAGTTTCGACCAAGTATCCCAAACCAGTGGCAAAGTTGTGAAGCACTCCGAGTCATGGGGAGAATAATGCGTGAGTGTTGGTATGCCAACGGAGCGGCCCGCCTAACTGCTCTTCGTATTAAGAAGACTATATCTCAACTTTGTGTCAAAGAAGACTGCAAAGCC (서열 번호: 238)
ATGACCCGGGCGCTCTGCTCAGCGCTCCGCCAGGCTCTCCTGCTGCTCGCAGCGGCCGCCGAGCTCTCGCCAGGACTGAAGTGTGTATGTCTTTTGTGTGATTCTTCAAACTTTACCTGCCAAACAGAAGGAGCATGTTGGGCATCAGTCATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGTCTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTCTGTCATAGTTCCAACAATGTTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTGCACCTTCCAACAGATAATGGAACTTGGACTCAACTTTGGCTGGTATCTGAATATCATGAACAGGGCTCCTTATATGACTATTTGAATAGAAATATAGTGACCGTGGCTGGAATGATCAAGCTGGCGCTCTCAATTGCTAGTGGTCTGGCACACCTTCATATGGAGATTGTTGGTACACAAGGTAAACCTGCTATTGCTCATCGAGACATAAAATCAAAGAATATCTTAGTGAAAAAGTGTGAAACTTGTGCCATAGCGGACTTAGGGTTGGCTGTGAAGCATGATTCAATACTGAACACTATCGACATACCTCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTATATGGCTCCTGAAATGCTTGATGATACAATGAATGTGAATATCTTTGAGTCCTTCAAACGAGCTGACATCTATTCTGTTGGTCTGGTTTACTGGGAAATAGCCCGGAGGTGTTCAGTCGGAGGAATTGTTGAGGAGTACCAATTGCCTTATTATGACATGGTGCCTTCAGATCCCTCGATAGAGGAAATGAGAAAGGTTGTTTGTGACCAGAAGTTTCGACCAAGTATCCCAAACCAGTGGCAAAGTTGTGAAGCACTCCGAGTCATGGGGAGAATAATGCGTGAGTGTTGGTATGCCAACGGAGCGGCCCGCCTAACTGCTCTTCGTATTAAGAAGACTATATCTCAACTTTGTGTCAAAGAAGACTGCAAAGCCTAA (서열 번호: 239)
GAGCTCTCGCCAGGACTGAAGTGTGTATGTCTTTTGTGTGATTCTTCAAACTTTACCTGCCAAACAGAAGGAGCATGTTGGGCATCAGTCATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGTCTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTCTGTCATAGTTCCAACAATGTTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTGCACCTTCCAACAGATAATGGAACTTGGACTCAACTTTGGCTGGTATCTGAATATCATGAACAGGGCTCCTTATATGACTATTTGAATAGAAATATAGTGACCGTGGCTGGAATGATCAAGCTGGCGCTCTCAATTGCTAGTGGTCTGGCACACCTTCATATGGAGATTGTTGGTACACAAGGTAAACCTGCTATTGCTCATCGAGACATAAAATCAAAGAATATCTTAGTGAAAAAGTGTGAAACTTGTGCCATAGCGGACTTAGGGTTGGCTGTGAAGCATGATTCAATACTGAACACTATCGACATACCTCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTATATGGCTCCTGAAATGCTTGATGATACAATGAATGTGAATATCTTTGAGTCCTTCAAACGAGCTGACATCTATTCTGTTGGTCTGGTTTACTGGGAAATAGCCCGGAGGTGTTCAGTCGGAGGAATTGTTGAGGAGTACCAATTGCCTTATTATGACATGGTGCCTTCAGATCCCTCGATAGAGGAAATGAGAAAGGTTGTTTGTGACCAGAAGTTTCGACCAAGTATCCCAAACCAGTGGCAAAGTTGTGAAGCACTCCGAGTCATGGGGAGAATAATGCGTGAGTGTTGGTATGCCAACGGAGCGGCCCGCCTAACTGCTCTTCGTATTAAGAAGACTATATCTCAACTTTGTGTCAAAGAAGACTGCAAAGCCTAA (서열 번호: 240)
1 ATGGGAGCTG CTGCAAAGTT GGCGTTTGCC GTCTTTCTTA TCTCCTGTTC
51 TTCAGGTGCT ATACTTGGTA GATCAGAAAC TCAGGAGTGT CTTTTCTTTA
101 ATGCTAATTG GGAAAAAGAC AGAACCAATC AAACTGGTGT TGAACCGTGT
151 TATGGTGACA AAGATAAACG GCGGCATTGT TTTGCTACCT GGAAGAATAT
201 TTCTGGTTCC ATTGAAATAG TGAAACAAGG TTGTTGGCTG GATGATATCA
251 ACTGCTATGA CAGGACTGAT TGTGTAGAAA AAAAAGACAG CCCTGAAGTA
301 TATTTTTGTT GCTGTGAGGG CAATATGTGT AATGAAAAGT TTTCTTATTT
351 TCCGGAGATG GAAGTCACAC AGCCCACTTC AAATCCAGTT ACACCTAAGC
401 CACCCTATTA CAACATCCTG CTCTATTCCT TGGTGCCACT TATGTTAATT
451 GCGGGGATTG TCATTTGTGC ATTTTGGGTG TACAGGCATC ACAAGATGGC
501 CTACCCTCCT GTACTTGTTC CAACTCAAGA CCCAGGACCA CCCCCACCTT
551 CTCCATTACT AGGTTTGAAA CCACTGCAGT TATTAGAAGT GAAAGCAAGG
601 GGAAGATTTG GTTGTGTCTG GAAAGCCCAG TTGCTTAACG AATATGTGGC
651 TGTCAAAATA TTTCCAATAC AGGACAAACA GTCATGGCAA AATGAATACG
701 AAGTCTACAG TTTGCCTGGA ATGAAGCATG AGAACATATT ACAGTTCATT
751 GGTGCAGAAA AACGAGGCAC CAGTGTTGAT GTGGATCTTT GGCTGATCAC
801 AGCATTTCAT GAAAAGGGTT CACTATCAGA CTTTCTTAAG GCTAATGTGG
851 TCTCTTGGAA TGAACTGTGT CATATTGCAG AAACCATGGC TAGAGGATTG
901 GCATATTTAC ATGAGGATAT ACCTGGCCTA AAAGATGGCC ACAAACCTGC
951 CATATCTCAC AGGGACATCA AAAGTAAAAA TGTGCTGTTG AAAAACAACC
1001 TGACAGCTTG CATTGCTGAC TTTGGGTTGG CCTTAAAATT TGAGGCTGGC
1051 AAGTCTGCAG GCGATACCCA TGGACAGGTT GGTACCCGGA GGTACATGGC
1101 TCCAGAGGTA TTAGAGGGTG CTATAAACTT CCAAAGGGAT GCATTTTTGA
1151 GGATAGATAT GTATGCCATG GGATTAGTCC TATGGGAACT GGCTTCTCGC
1201 TGTACTGCTG CAGATGGACC TGTAGATGAA TACATGTTGC CATTTGAGGA
1251 GGAAATTGGC CAGCATCCAT CTCTTGAAGA CATGCAGGAA GTTGTTGTGC
1301 ATAAAAAAAA GAGGCCTGTT TTAAGAGATT ATTGGCAGAA ACATGCTGGA
1351 ATGGCAATGC TCTGTGAAAC CATTGAAGAA TGTTGGGATC ACGACGCAGA
1401 AGCCAGGTTA TCAGCTGGAT GTGTAGGTGA AAGAATTACC CAGATGCAGA
1451 GACTAACAAA TATTATTACC ACAGAGGACA TTGTAACAGT GGTCACAATG
1501 GTGACAAATG TTGACTTTCC TCCCAAAGAA TCTAGTCTA
(서열 번호: 241)
1 ATACTTGGTA GATCAGAAAC TCAGGAGTGT CTTTTCTTTA ATGCTAATTG
51 GGAAAAAGAC AGAACCAATC AAACTGGTGT TGAACCGTGT TATGGTGACA
101 AAGATAAACG GCGGCATTGT TTTGCTACCT GGAAGAATAT TTCTGGTTCC
151 ATTGAAATAG TGAAACAAGG TTGTTGGCTG GATGATATCA ACTGCTATGA
201 CAGGACTGAT TGTGTAGAAA AAAAAGACAG CCCTGAAGTA TATTTTTGTT
251 GCTGTGAGGG CAATATGTGT AATGAAAAGT TTTCTTATTT TCCGGAGATG
301 GAAGTCACAC AGCCCACTTC AAATCCAGTT ACACCTAAGC CACCC
(서열 번호: 242)
SEQUENCE LISTING <110> ACCELERON PHARMA INC. <120> VARIANT ACTRIIB PROTEINS AND USES THEREOF <130> 1848179-0002-119-WO1 <140> PCT/US2017/055421 <141> 2017-10-05 <150> 62/404,718 <151> 2016-10-05 <160> 280 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 115 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Gly Arg Gly Glu Ala Glu Thr Arg Glu Cys Ile Tyr Tyr Asn Ala Asn 1 5 10 15 Trp Glu Leu Glu Arg Thr Asn Gln Ser Gly Leu Glu Arg Cys Glu Gly 20 25 30 Glu Gln Asp Lys Arg Leu His Cys Tyr Ala Ser Trp Arg Asn Ser Ser 35 40 45 Gly Thr Ile Glu Leu Val Lys Lys Gly Cys Trp Leu Asp Asp Phe Asn 50 55 60 Cys Tyr Asp Arg Gln Glu Cys Val Ala Thr Glu Glu Asn Pro Gln Val 65 70 75 80 Tyr Phe Cys Cys Cys Glu Gly Asn Phe Cys Asn Glu Arg Phe Thr His 85 90 95 Leu Pro Glu Ala Gly Gly Pro Glu Val Thr Tyr Glu Pro Pro Pro Thr 100 105 110 Ala Pro Thr 115 <210> 2 <211> 512 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Met Thr Ala Pro Trp Val Ala Leu Ala Leu Leu Trp Gly Ser Leu Cys 1 5 10 15 Ala Gly Ser Gly Arg Gly Glu Ala Glu Thr Arg Glu 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gcgctgcgaa ggcgagcagg acaagcggct gcactgctac 180 gcctcctggc gcaacagctc tggcaccatc gagctcgtga agaagggctg ctggctagat 240 gacttcaact gctacgatag gcaggagtgt gtggccactg aggagaaccc ccaggtgtac 300 ttctgctgct gtgaaggcaa cttctgcaac gagcgcttca ctcatttgcc agaggctggg 360 ggcccggaag tcacgtacga gccacccccg acagccccca ccctgctcac ggtgctggcc 420 tactcactgc tgcccatcgg gggcctttcc ctcatcgtcc tgctggcctt ttggatgtac 480 cggcatcgca agccccccta cggtcatgtg gacatccatg aggaccctgg gcctccacca 540 ccatcccctc tggtgggcct gaagccactg cagctgctgg agatcaaggc tcgggggcgc 600 tttggctgtg tctggaaggc ccagctcatg aatgactttg tagctgtcaa gatcttccca 660 ctccaggaca agcagtcgtg gcagagtgaa cgggagatct tcagcacacc tggcatgaag 720 cacgagaacc tgctacagtt cattgctgcc gagaagcgag gctccaacct cgaagtagag 780 ctgtggctca tcacggcctt ccatgacaag ggctccctca cggattacct caaggggaac 840 atcatcacat ggaacgaact gtgtcatgta gcagagacga tgtcacgagg cctctcatac 900 ctgcatgagg atgtgccctg gtgccgtggc gagggccaca agccgtctat tgcccacagg 960 gactttaaaa gtaagaatgt attgctgaag agcgacctca cagccgtgct ggctgacttt 1020 ggcttggctg ttcgatttga gccagggaaa cctccagggg acacccacgg acaggtaggc 1080 acgagacggt acatggctcc tgaggtgctc gagggagcca tcaacttcca gagagatgcc 1140 ttcctgcgca ttgacatgta tgccatgggg ttggtgctgt gggagcttgt gtctcgctgc 1200 aaggctgcag acggacccgt ggatgagtac atgctgccct ttgaggaaga gattggccag 1260 cacccttcgt tggaggagct gcaggaggtg gtggtgcaca agaagatgag gcccaccatt 1320 aaagatcact ggttgaaaca cccgggcctg gcccagcttt gtgtgaccat cgaggagtgc 1380 tgggaccatg atgcagaggc tcgcttgtcc gcgggctgtg tggaggagcg ggtgtccctg 1440 attcggaggt cggtcaacgg cactacctcg gactgtctcg tttccctggt gacctctgtc 1500 accaatgtgg acctgccccc taaagagtca agcatctaa 1539 <210> 5 <211> 343 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 5 Gly Arg Gly Glu Ala Glu Thr Arg Glu Cys Ile Tyr Tyr Asn Ala Asn 1 5 10 15 Trp Glu Leu Glu Arg Thr Asn Gln Ser Gly Leu Glu Arg Cys Glu Gly 20 25 30 Glu Gln Asp Lys Arg Leu His Cys Tyr Ala Ser Trp Arg Asn Ser Ser 35 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aaaggcttct atcccagcga catcgccgtg 900 gagtgggaga gcaatgggca gccggagaac aactacaaga ccacgcctcc cgtgctggac 960 tccgacggct ccttcttcct ctatagcaag ctcaccgtgg acaagagcag gtggcagcag 1020 gggaacgtct tctcatgctc cgtgatgcat gaggctctgc acaaccacta cacgcagaag 1080 agcctctccc tgtctccggg taaatga 1107 <210> 11 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 11 Gly Arg Gly Glu Ala Glu 1 5 <210> 12 <211> 335 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 12 Glu Thr Arg Glu Cys Ile Tyr Tyr Asn Ala Asn Trp Glu Leu Glu Arg 1 5 10 15 Thr Asn Gln Ser Gly Leu Glu Arg Cys Glu Gly Glu Gln Asp Lys Arg 20 25 30 Leu His Cys Tyr Ala Ser Trp Arg Asn Ser Ser Gly Thr Ile Glu Leu 35 40 45 Val Lys Lys Gly Cys Trp Leu Asp Asp Phe Asn Cys Tyr Asp Arg Gln 50 55 60 Glu Cys Val Ala Thr Glu Glu Asn Pro Gln Val Tyr Phe Cys Cys Cys 65 70 75 80 Glu Gly Asn Phe Cys Asn Glu Arg Phe Thr His Leu Pro Glu 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ttctactgct accgcgttaa ccggcagcag 660 aagctgagtt caacctggga aaccggcaag acgcggaagc tcatggagtt cagcgagcac 720 tgtgccatca tcctggaaga tgaccgctct gacatcagct ccacgtgtgc caacaacatc 780 aaccacaaca cagagctgct gcccattgag ctggacaccc tggtggggaa aggtcgcttt 840 gctgaggtct ataaggccaa gctgaagcag aacacttcag agcagtttga gacagtggca 900 gtcaagatct ttccctatga ggagtatgcc tcttggaaga cagagaagga catcttctca 960 gacatcaatc tgaagcatga gaacatactc cagttcctga cggctgagga gcggaagacg 1020 gagttgggga aacaatactg gctgatcacc gccttccacg ccaagggcaa cctacaggag 1080 tacctgacgc ggcatgtcat cagctgggag gacctgcgca agctgggcag ctccctcgcc 1140 cgggggattg ctcacctcca cagtgatcac actccatgtg ggaggcccaa gatgcccatc 1200 gtgcacaggg acctcaagag ctccaatatc ctcgtgaaga acgacctaac ctgctgcctg 1260 tgtgactttg ggctttccct gcgtctggac cctactctgt ctgtggatga cctggctaac 1320 agtgggcagg tgggaactgc aagatacatg gctccagaag tcctagaatc caggatgaat 1380 ttggagaatg ttgagtcctt caagcagacc gatgtctact ccatggctct ggtgctctgg 1440 gaaatgacat ctcgctgtaa tgcagtggga gaagtaaaag attatgagcc tccatttggt 1500 tccaaggtgc gggagcaccc ctgtgtcgaa agcatgaagg acaacgtgtt gagagatcga 1560 gggcgaccag aaattcccag cttctggctc aaccaccagg gcatccagat ggtgtgtgag 1620 acgttgactg agtgctggga ccacgaccca gaggcccgtc tcacagccca gtgtgtggca 1680 gaacgcttca gtgagctgga gcatctggac aggctctcgg ggaggagctg ctcggaggag 1740 aagattcctg aagacggctc cctaaacact accaaa 1776 <210> 203 <211> 507 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 203 acgatcccac cgcacgttca gaagtcggat gtggaaatgg aggcccagaa agatgaaatc 60 atctgcccca gctgtaatag gactgcccat ccactgagac atattaataa cgacatgata 120 gtcactgaca acaacggtgc agtcaagttt ccacaactgt gtaaattttg tgatgtgaga 180 ttttccacct gtgacaacca gaaatcctgc atgagcaact gcagcatcac ctccatctgt 240 gagaagccac aggaagtctg tgtggctgta tggagaaaga atgacgagaa cataacacta 300 gagacagttt gccatgaccc caagctcccc taccatgact ttattctgga agatgctgct 360 tctccaaagt gcattatgaa ggaaaaaaaa aagcctggtg agactttctt catgtgttcc 420 tgtagctctg atgagtgcaa tgacaacatc atcttctcag aagaatataa caccagcaat 480 cctgacttgt tgctagtcat atttcaa 507 <210> 204 <211> 36 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 204 Gly Arg Cys Lys Ile Arg His Ile Gly Ser Asn Asn Arg Leu Gln Arg 1 5 10 15 Ser Thr Cys Gln Asn Thr Gly Trp Glu Ser Ala His Val Met Lys Thr 20 25 30 Pro Gly Phe Arg 35 <210> 205 <211> 3114 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 205 atgacttcct cgctgcagcg gccctggcgg gtgccctggc taccatggac catcctgctg 60 gtcagcactg cggctgcttc gcagaatcaa gaacggctat gtgcgtttaa agatccgtat 120 cagcaagacc ttgggatagg tgagagtaga atctctcatg aaaatgggac aatattatgc 180 tcgaaaggta gcacctgcta tggcctttgg gagaaatcaa aaggggacat aaatcttgta 240 aaacaaggat gttggtctca cattggagat ccccaagagt gtcactatga agaatgtgta 300 gtaactacca ctcctccctc aattcagaat ggaacatacc gtttctgctg ttgtagcaca 360 gatttatgta atgtcaactt tactgagaat tttccacctc ctgacacaac accactcagt 420 ccacctcatt catttaaccg agatgagaca ataatcattg ctttggcatc agtctctgta 480 ttagctgttt tgatagttgc cttatgcttt ggatacagaa tgttgacagg agaccgtaaa 540 caaggtcttc acagtatgaa catgatggag gcagcagcat ccgaaccctc tcttgatcta 600 gataatctga aactgttgga gctgattggc cgaggtcgat atggagcagt atataaaggc 660 tccttggatg agcgtccagt tgctgtaaaa gtgttttcct ttgcaaaccg tcagaatttt 720 atcaacgaaa agaacattta cagagtgcct ttgatggaac atgacaacat tgcccgcttt 780 atagttggag atgagagagt cactgcagat ggacgcatgg aatatttgct tgtgatggag 840 tactatccca atggatcttt atgcaagtat ttaagtctcc acacaagtga ctgggtaagc 900 tcttgccgtc ttgctcattc tgttactaga ggactggctt atcttcacac agaattacca 960 cgaggagatc attataaacc tgcaatttcc catcgagatt taaacagcag aaatgtccta 1020 gtgaaaaatg atggaacctg tgttattagt gactttggac tgtccatgag gctgactgga 1080 aatagactgg tgcgcccagg ggaggaagat aatgcagcca taagcgaggt tggcactatc 1140 agatatatgg caccagaagt gctagaagga gctgtgaact tgagggactg tgaatcagct 1200 ttgaaacaag tagacatgta tgctcttgga ctaatctatt gggagatatt tatgagatgt 1260 acagacctct tcccagggga atccgtacca gagtaccaga tggcttttca gacagaggtt 1320 ggaaaccatc ccacttttga ggatatgcag gttctcgtgt ctagggaaaa acagagaccc 1380 aagttcccag aagcctggaa agaaaatagc ctggcagtga ggtcactcaa ggagacaatc 1440 gaagactgtt gggaccagga tgcagaggct cggcttactg cacagtgtgc tgaggaaagg 1500 atggctgaac ttatgatgat ttgggaaaga aacaaatctg tgagcccaac agtcaatcca 1560 atgtctactg ctatgcagaa tgaacgcaac ctgtcacata ataggcgtgt gccaaaaatt 1620 ggtccttatc cagattattc ttcctcctca tacattgaag actctatcca tcatactgac 1680 agcatcgtga agaatatttc ctctgagcat tctatgtcca gcacaccttt gactataggg 1740 gaaaaaaacc gaaattcaat taactatgaa cgacagcaag cacaagctcg aatccccagc 1800 cctgaaacaa gtgtcaccag cctctccacc aacacaacaa ccacaaacac cacaggactc 1860 acgccaagta ctggcatgac tactatatct gagatgccat acccagatga aacaaatctg 1920 cataccacaa atgttgcaca gtcaattggg ccaacccctg tctgcttaca gctgacagaa 1980 gaagacttgg aaaccaacaa gctagaccca aaagaagttg ataagaacct caaggaaagc 2040 tctgatgaga atctcatgga gcactctctt aaacagttca gtggcccaga cccactgagc 2100 agtactagtt ctagcttgct ttacccactc ataaaacttg cagtagaagc aactggacag 2160 caggacttca cacagactgc aaatggccaa gcatgtttga ttcctgatgt tctgcctact 2220 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sapiens <400> 234 gagctctcgc caggactgaa gtgtgtatgt cttttgtgtg attcttcaaa ctttacctgc 60 caaacagaag gagcatgttg ggcatcagtc atgctaacca atggaaaaga gcaggtgatc 120 aaatcctgtg tctcccttcc agaactgaat gctcaagtct tctgtcatag ttccaacaat 180 gttaccaaaa ccgaatgctg cttcacagat ttttgcaaca acataacact gcaccttcca 240 acagcatcac caaatgcccc aaaacttgga cccatggag 279 <210> 235 <211> 1329 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 235 atgctaacca atggaaaaga gcaggtgatc aaatcctgtg tctcccttcc agaactgaat 60 gctcaagtct tctgtcatag ttccaacaat gttaccaaaa ccgaatgctg cttcacagat 120 ttttgcaaca acataacact gcaccttcca acagcatcac caaatgcccc aaaacttgga 180 cccatggagc tggccatcat tattactgtg cctgtttgcc tcctgtccat agctgcgatg 240 ctgacagtat gggcatgcca gggtcgacag tgctcctaca ggaagaaaaa gagaccaaat 300 gtggaggaac cactctctga gtgcaatctg gtaaatgctg gaaaaactct gaaagatctg 360 atttatgatg tgaccgcctc tggatctggc tctggtctac ctctgttggt tcaaaggaca 420 attgcaagga cgattgtgct tcaggaaata gtaggaaaag gtagatttgg tgaggtgtgg 480 catggaagat ggtgtgggga agatgtggct 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DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 243 atggatgcaa tgaagagagg gctctgctgt gtgctgctgc tgtgtggagc agtcttcgtt 60 tcgcccggcg cctccgggcc ccggggggtc caggctctgc tgtgtgcgtg caccagctgc 120 ctccaggcca actacacgtg tgagacagat ggggcctgca tggtttccat tttcaatctg 180 gatgggatgg agcaccatgt gcgcacctgc atccccaaag tggagctggt ccctgccggg 240 aagcccttct actgcctgag ctcggaggac ctgcgcaaca cccactgctg ctacactgac 300 tactgcaaca ggatcgactt gagggtgccc agtggtcacc tcaaggagcc tgagcacccg 360 tccatgtggg gcccggtgga gaccggtggt ggaactcaca catgcccacc gtgcccagca 420 cctgaactcc tggggggacc gtcagtcttc ctcttccccc caaaacccaa ggacaccctc 480 atgatctccc ggacccctga ggtcacatgc gtggtggtgg acgtgagcca cgaagaccct 540 gaggtcaagt tcaactggta cgtggacggc gtggaggtgc ataatgccaa gacaaagccg 600 cgggaggagc agtacaacag cacgtaccgt gtggtcagcg tcctcaccgt cctgcaccag 660 gactggctga atggcaagga gtacaagtgc aaggtctcca acaaagccct cccagccccc 720 atcgagaaaa ccatctccaa agccaaaggg cagccccgag 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cctgaactcc tggggggacc gtcagtcttc ctcttccccc caaaacccaa ggacaccctc 480 atgatctccc ggacccctga ggtcacatgc gtggtggtgg acgtgagcca cgaagaccct 540 gaggtcaagt tcaactggta cgtggacggc gtggaggtgc ataatgccaa gacaaagccg 600 cgggaggagc agtacaacag cacgtaccgt gtggtcagcg tcctcaccgt cctgcaccag 660 gactggctga atggcaagga gtacaagtgc aaggtctcca acaaagccct cccagccccc 720 atcgagaaaa ccatctccaa agccaaaggg cagccccgag aaccacaggt gtacaccctg 780 cccccatccc gggaggagat gaccaagaac caggtcagcc tgacctgcct ggtcaaaggc 840 ttctatccca gcgacatcgc cgtggagtgg gagagcaatg ggcagccgga gaacaactac 900 gacaccacgc ctcccgtgct ggactccgac ggctccttct tcctctatag cgacctcacc 960 gtggacaaga gcaggtggca gcaggggaac gtcttctcat gctccgtgat gcatgaggct 1020 ctgcacaacc actacacgca gaagagcctc tccctgtctc cgggt 1065 <210> 245 <211> 1143 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 245 atggatgcaa tgaagagagg gctctgctgt gtgctgctgc tgtgtggagc agtcttcgtt 60 tcgcccggcg cccagaatct ggatagtatg cttcatggca ctgggatgaa atcagactcc 120 gaccagaaaa agtcagaaaa tggagtaacc ttagcaccag aggatacctt gcctttttta 180 aagtgctatt gctcagggca ctgtccagat gatgctatta ataacacatg cataactaat 240 ggacattgct ttgccatcat agaagaagat gaccagggag aaaccacatt agcttcaggg 300 tgtatgaaat atgaaggatc tgattttcag tgcaaagatt ctccaaaagc ccagctacgc 360 cggacaatag aatgttgtcg gaccaattta tgtaaccagt atttgcaacc cacactgccc 420 cctgttgtca taggtccgtt ttttgatggc agcattcgaa ccggtggtgg aactcacaca 480 tgcccaccgt gcccagcacc tgaactcctg gggggaccgt cagtcttcct cttcccccca 540 aaacccaagg acaccctcat gatctcccgg acccctgagg tcacatgcgt ggtggtggac 600 gtgagccacg aagaccctga ggtcaagttc aactggtacg tggacggcgt ggaggtgcat 660 aatgccaaga caaagccgcg ggaggagcag tacaacagca cgtaccgtgt ggtcagcgtc 720 ctcaccgtcc tgcaccagga ctggctgaat ggcaaggagt acaagtgcaa ggtctccaac 780 aaagccctcc cagcccccat cgagaaaacc atctccaaag ccaaagggca gccccgagaa 840 ccacaggtgt acaccctgcc cccatcccgg gaggagatga ccaagaacca ggtcagcctg 900 acctgcctgg tcaaaggctt ctatcccagc gacatcgccg tggagtggga gagcaatggg 960 cagccggaga acaactacga caccacgcct cccgtgctgg actccgacgg ctccttcttc 1020 ctctatagcg acctcaccgt ggacaagagc aggtggcagc aggggaacgt cttctcatgc 1080 tccgtgatgc atgaggctct gcacaaccac tacacgcaga agagcctctc cctgtctccg 1140 ggt 1143 <210> 246 <211> 22 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> Description of Unknown: Tissue plasminogen activator <400> 246 Met Asp Ala Met Lys Arg Gly Leu Cys Cys Val Leu Leu Leu Cys Gly 1 5 10 15 Ala Val Phe Val Ser Pro 20 <210> 247 <211> 356 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 247 Met Asp Ala Met Lys Arg Gly Leu Cys Cys Val Leu Leu Leu Cys Gly 1 5 10 15 Ala Val Phe Val Ser Pro Gly Ala Ser Gly Pro Arg Gly Val Gln Ala 20 25 30 Leu Leu Cys Ala Cys Thr Ser Cys Leu Gln Ala Asn Tyr Thr Cys Glu 35 40 45 Thr Asp Gly Ala Cys Met Val Ser Ile Phe Asn Leu Asp Gly Met Glu 50 55 60 His His Val Arg Thr Cys Ile Pro Lys Val Glu Leu Val Pro Ala Gly 65 70 75 80 Lys Pro Phe Tyr Cys Leu Ser 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atgatctccc ggacccctga ggtcacatgc gtggtggtgg acgtgagcca cgaagaccct 540 gaggtcaagt tcaactggta cgtggacggc gtggaggtgc ataatgccaa gacaaagccg 600 cgggaggagc agtacaacag cacgtaccgt gtggtcagcg tcctcaccgt cctgcaccag 660 gactggctga atggcaagga gtacaagtgc aaggtctcca acaaagccct cccagccccc 720 atcgagaaaa ccatctccaa agccaaaggg cagccccgag aaccacaggt gtgcaccctg 780 cccccatccc gggaggagat gaccaagaac caggtcagcc tgtcctgcgc cgtcaaaggc 840 ttctatccca gcgacatcgc cgtggagtgg gagagccgcg ggcagccgga gaacaactac 900 aagaccacgc ctcccgtgct ggactcccgc ggctccttct tcctcgtgag caagctcacc 960 gtggacaaga gcaggtggca gcaggggaac gtcttctcat gctccgtgat gcatgaggct 1020 ctgcacaacc actacacgca gaagagcctc tccctgtctc cgggtaaa 1068 <210> 249 <211> 332 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 249 Ser Gly Pro Arg Gly Val Gln Ala Leu Leu Cys Ala Cys Thr Ser Cys 1 5 10 15 Leu Gln Ala Asn Tyr Thr Cys Glu Thr Asp Gly Ala Cys Met Val Ser 20 25 30 Ile Phe Asn Leu Asp Gly Met 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tcgcccggcg ccaagaaaga ggatggtgag agtacagccc ccaccccccg tccaaaggtc 120 ttgcgttgta aatgccacca ccattgtcca gaagactcag tcaacaatat ttgcagcaca 180 gacggatatt gtttcacgat gatagaagag gatgactctg ggttgcctgt ggtcacttct 240 ggttgcctag gactagaagg ctcagatttt cagtgtcggg acactcccat tcctcatcaa 300 agaagatcaa ttgaatgctg cacagaaagg aacgaatgta ataaagacct acaccctaca 360 ctgcctccat tgaaaaacag agattttgtt gatggaccta tacaccacag gaccggtggt 420 ggaactcaca catgcccacc gtgcccagca cctgaactcc tggggggacc gtcagtcttc 480 ctcttccccc caaaacccaa ggacaccctc atgatctccc ggacccctga ggtcacatgc 540 gtggtggtgg acgtgagcca cgaagaccct gaggtcaagt tcaactggta cgtggacggc 600 gtggaggtgc ataatgccaa gacaaagccg cgggaggagc agtacaacag cacgtaccgt 660 gtggtcagcg tcctcaccgt cctgcaccag gactggctga atggcaagga gtacaagtgc 720 aaggtctcca acaaagccct cccagccccc atcgagaaaa ccatctccaa agccaaaggg 780 cagccccgag aaccacaggt gtacaccctg cccccatccc gggaggagat gaccaagaac 840 caggtcagcc tgacctgcct ggtcaaaggc ttctatccca gcgacatcgc cgtggagtgg 900 gagagcaatg ggcagccgga gaacaactac gacaccacgc ctcccgtgct ggactccgac 960 ggctccttct tcctctatag cgacctcacc gtggacaaga gcaggtggca gcaggggaac 1020 gtcttctcat gctccgtgat gcatgaggct ctgcacaacc actacacgca gaagagcctc 1080 tccctgtctc cgggt 1095 <210> 255 <211> 1023 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 255 atggatgcaa tgaagagagg gctctgctgt gtgctgctgc tgtgtggagc agtcttcgtt 60 tcgcccggcg ccggactgaa gtgtgtatgt cttttgtgtg attcttcaaa ctttacctgc 120 caaacagaag gagcatgttg ggcatcagtc atgctaacca atggaaaaga gcaggtgatc 180 aaatcctgtg tctcccttcc agaactgaat gctcaagtct tctgtcatag ttccaacaat 240 gttaccaaaa ccgaatgctg cttcacagat ttttgcaaca acataacact gcaccttcca 300 acagcatcac caaatgcccc aaaacttgga cccatggaga ccggtggtgg aactcacaca 360 tgcccaccgt gcccagcacc tgaactcctg gggggaccgt cagtcttcct cttcccccca 420 aaacccaagg acaccctcat gatctcccgg acccctgagg tcacatgcgt ggtggtggac 480 gtgagccacg aagaccctga ggtcaagttc aactggtacg tggacggcgt ggaggtgcat 540 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ggctggatga tatcaactgc tatgacagga ctgattgtgt agaaaaaaaa 300 gacagccctg aagtatattt ctgttgctgt gagggcaata tgtgtaatga aaagttttct 360 tattttccgg agatggaagt cacacagccc acttcaaatc cagttacacc taagccaccc 420 accggtggtg gaactcacac atgcccaccg tgcccagcac ctgaactcct ggggggaccg 480 tcagtcttcc tcttcccccc aaaacccaag gacaccctca tgatctcccg gacccctgag 540 gtcacatgcg tggtggtgga cgtgagccac gaagaccctg aggtcaagtt caactggtac 600 gtggacggcg tggaggtgca taatgccaag acaaagccgc gggaggagca gtacaacagc 660 acgtaccgtg tggtcagcgt cctcaccgtc ctgcaccagg actggctgaa tggcaaggag 720 tacaagtgca aggtctccaa caaagccctc ccagccccca tcgagaaaac catctccaaa 780 gccaaagggc agccccgaga accacaggtg tacaccctgc ccccatcccg gaaggagatg 840 accaagaacc aggtcagcct gacctgcctg gtcaaaggct tctatcccag cgacatcgcc 900 gtggagtggg agagcaatgg gcagccggag aacaactaca agaccacgcc tcccgtgctg 960 aagtccgacg gctccttctt cctctatagc aagctcaccg tggacaagag caggtggcag 1020 caggggaacg tcttctcatg ctccgtgatg catgaggctc tgcacaacca ctacacgcag 1080 aagagcctct ccctgtctcc gggtaaa 1107 <210> 257 <211> 1128 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 257 atggatgcaa tgaagagagg gctctgctgt gtgctgctgc tgtgtggagc agtcttcgtt 60 tcgcccggcg cctcgcagaa tcaagaacgc ctatgtgcgt ttaaagatcc gtatcagcaa 120 gaccttggga taggtgagag tagaatctct catgaaaatg ggacaatatt atgctcgaaa 180 ggtagcacct gctatggcct ttgggagaaa tcaaaagggg acataaatct tgtaaaacaa 240 ggatgttggt ctcacattgg agatccccaa gagtgtcact atgaagaatg tgtagtaact 300 accactcctc cctcaattca gaatggaaca taccgtttct gctgttgtag cacagattta 360 tgtaatgtca actttactga gaattttcca cctcctgaca caacaccact cagtccacct 420 cattcattta accgagatga gaccggtggt ggaactcaca catgcccacc gtgcccagca 480 cctgaactcc tggggggacc gtcagtcttc ctcttccccc caaaacccaa ggacaccctc 540 atgatctccc ggacccctga ggtcacatgc gtggtggtgg acgtgagcca cgaagaccct 600 gaggtcaagt tcaactggta cgtggacggc gtggaggtgc ataatgccaa gacaaagccg 660 cgggaggagc agtacaacag cacgtaccgt gtggtcagcg tcctcaccgt cctgcaccag 720 gactggctga atggcaagga gtacaagtgc aaggtctcca acaaagccct cccagccccc 780 atcgagaaaa ccatctccaa agccaaaggg cagccccgag aaccacaggt gtacaccctg 840 cccccatccc ggaaggagat gaccaagaac caggtcagcc tgacctgcct ggtcaaaggc 900 ttctatccca gcgacatcgc cgtggagtgg gagagcaatg ggcagccgga gaacaactac 960 aagaccacgc ctcccgtgct gaagtccgac ggctccttct tcctctatag caagctcacc 1020 gtggacaaga gcaggtggca gcaggggaac gtcttctcat gctccgtgat gcatgaggct 1080 ctgcacaacc actacacgca gaagagcctc tccctgtctc cgggtaaa 1128 <210> 258 <211> 1053 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 258 atggatgcaa tgaagagagg gctctgctgt gtgctgctgc tgtgtggagc agtcttcgtt 60 tcgcccggcg ccgaccctgt gaagccgtct cggggcccgc tggtgacctg cacgtgtgag 120 agcccacatt gcaaggggcc tacctgccgg ggggcctggt gcacagtagt gctggtgcgg 180 gaggagggga ggcaccccca ggaacatcgg ggctgcggga acttgcacag ggagctctgc 240 aggggccgcc ccaccgagtt cgtcaaccac tactgctgcg acagccacct ctgcaaccac 300 aacgtgtccc tggtgctgga ggccacccaa cctccttcgg agcagccggg aacagatggc 360 cagctggcca ccggtggtgg aactcacaca tgcccaccgt gcccagcacc tgaactcctg 420 gggggaccgt cagtcttcct cttcccccca aaacccaagg acaccctcat gatctcccgg 480 acccctgagg tcacatgcgt ggtggtggac gtgagccacg aagaccctga ggtcaagttc 540 aactggtacg tggacggcgt ggaggtgcat aatgccaaga caaagccgcg ggaggagcag 600 tacaacagca cgtaccgtgt ggtcagcgtc ctcaccgtcc tgcaccagga ctggctgaat 660 ggcaaggagt acaagtgcaa ggtctccaac aaagccctcc cagcccccat cgagaaaacc 720 atctccaaag ccaaagggca gccccgagaa ccacaggtgt acaccctgcc cccatcccgg 780 gaggagatga ccaagaacca ggtcagcctg acctgcctgg tcaaaggctt ctatcccagc 840 gacatcgccg tggagtggga gagcaatggg cagccggaga acaactacga caccacgcct 900 cccgtgctgg actccgacgg ctccttcttc ctctatagcg acctcaccgt ggacaagagc 960 aggtggcagc aggggaacgt cttctcatgc tccgtgatgc atgaggctct gcacaaccac 1020 tacacgcaga agagcctctc cctgtctccg ggt 1053 <210> 259 <211> 1170 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 259 atggatgcaa tgaagagagg gctctgctgt gtgctgctgc tgtgtggagc agtcttcgtt 60 tcgcccggcg ccacgatccc accgcacgtt cagaagtcgg ttaataacga catgatagtc 120 actgacaaca acggtgcagt caagtttcca caactgtgta aattttgtga tgtgagattt 180 tccacctgtg acaaccagaa atcctgcatg agcaactgca gcatcacctc catctgtgag 240 aagccacagg aagtctgtgt ggctgtatgg agaaagaatg acgagaacat aacactagag 300 acagtttgcc atgaccccaa gctcccctac catgacttta ttctggaaga tgctgcttct 360 ccaaagtgca ttatgaagga aaaaaaaaag cctggtgaga ctttcttcat gtgttcctgt 420 agctctgatg agtgcaatga caacatcatc ttctcagaag aatataacac cagcaatcct 480 gacaccggtg gtggaactca cacatgccca ccgtgcccag cacctgaact cctgggggga 540 ccgtcagtct tcctcttccc cccaaaaccc aaggacaccc tcatgatctc ccggacccct 600 gaggtcacat gcgtggtggt ggacgtgagc cacgaagacc ctgaggtcaa gttcaactgg 660 tacgtggacg gcgtggaggt gcataatgcc aagacaaagc cgcgggagga gcagtacaac 720 agcacgtacc gtgtggtcag cgtcctcacc gtcctgcacc aggactggct gaatggcaag 780 gagtacaagt gcaaggtctc caacaaagcc ctcccagccc ccatcgagaa aaccatctcc 840 aaagccaaag ggcagccccg agaaccacag gtgtacaccc tgcccccatc ccggaaggag 900 atgaccaaga accaggtcag cctgacctgc ctggtcaaag gcttctatcc cagcgacatc 960 gccgtggagt gggagagcaa tgggcagccg gagaacaact acaagaccac gcctcccgtg 1020 ctgaagtccg acggctcctt cttcctctat agcaagctca ccgtggacaa gagcaggtgg 1080 cagcagggga acgtcttctc atgctccgtg atgcatgagg ctctgcacaa ccactacacg 1140 cagaagagcc tctccctgtc tccgggtaaa 1170 <210> 260 <211> 1245 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide <400> 260 atggatgcaa tgaagagagg gctctgctgt gtgctgctgc tgtgtggagc agtcttcgtt 60 tcgcccggcg ccacgatccc accgcacgtt cagaagtcgg atgtggaaat ggaggcccag 120 aaagatgaaa tcatctgccc cagctgtaat aggactgccc atccactgag acatattaat 180 aacgacatga tagtcactga caacaacggt gcagtcaagt ttccacaact gtgtaaattt 240 tgtgatgtga gattttccac ctgtgacaac cagaaatcct gcatgagcaa ctgcagcatc 300 acctccatct gtgagaagcc acaggaagtc tgtgtggctg tatggagaaa gaatgacgag 360 aacataacac tagagacagt ttgccatgac cccaagctcc cctaccatga ctttattctg 420 gaagatgctg cttctccaaa gtgcattatg aaggaaaaaa aaaagcctgg tgagactttc 480 ttcatgtgtt cctgtagctc tgatgagtgc aatgacaaca tcatcttctc agaagaatat 540 aacaccagca atcctgacac cggtggtgga actcacacat gcccaccgtg cccagcacct 600 gaactcctgg ggggaccgtc agtcttcctc ttccccccaa aacccaagga caccctcatg 660 atctcccgga cccctgaggt cacatgcgtg gtggtggacg tgagccacga agaccctgag 720 gtcaagttca actggtacgt ggacggcgtg gaggtgcata atgccaagac aaagccgcgg 780 gaggagcagt acaacagcac gtaccgtgtg gtcagcgtcc tcaccgtcct gcaccaggac 840 tggctgaatg gcaaggagta caagtgcaag gtctccaaca aagccctccc agcccccatc 900 gagaaaacca tctccaaagc caaagggcag ccccgagaac cacaggtgta caccctgccc 960 ccatcccgga aggagatgac caagaaccag gtcagcctga cctgcctggt caaaggcttc 1020 tatcccagcg acatcgccgt ggagtgggag agcaatgggc agccggagaa caactacaag 1080 accacgcctc ccgtgctgaa gtccgacggc tccttcttcc tctatagcaa gctcaccgtg 1140 gacaagagca ggtggcagca ggggaacgtc ttctcatgct ccgtgatgca tgaggctctg 1200 cacaaccact acacgcagaa gagcctctcc ctgtctccgg gtaaa 1245 <210> 261 <211> 3 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 261 Gly Gly Gly 1 <210> 262 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 262 Gly Gly Gly Gly 1 <210> 263 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 263 Thr Gly Gly Gly Gly 1 5 <210> 264 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 264 Ser Gly Gly Gly Gly 1 5 <210> 265 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 265 Thr Gly Gly Gly 1 <210> 266 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 266 Ser Gly Gly Gly 1 <210> 267 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 267 Gly Gly Gly Gly Ser 1 5 <210> 268 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic 6xHis tag <400> 268 His His His His His His 1 5 <210> 269 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <220> <221> MISC_FEATURE <222> (1)..(10) <223> This sequence may encompass 2-10 residues <400> 269 Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly 1 5 10 <210> 270 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <220> <221> MISC_FEATURE <222> (1)..(5) <223> This sequence may encompass 2-5 residues <400> 270 Gly Gly Gly Gly Gly 1 5 <210> 271 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <220> <221> MISC_FEATURE <222> (1)..(4) <223> This sequence may encompass 2-4 residues <400> 271 Gly Gly Gly Gly 1 <210> 272 <211> 116 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 272 Ile Leu Gly Arg Ser Glu Thr Gln Glu Cys Leu Phe Phe Asn Ala Asn 1 5 10 15 Trp Glu Lys Asp Arg Thr Asn Gln Thr Gly Val Glu Pro Cys Tyr Gly 20 25 30 Asp Lys Asp Lys Arg Arg His Cys Phe Ala Thr Trp Lys Asn Ile Ser 35 40 45 Gly Ser Ile Glu Ile Val Lys Gln Gly Cys Trp Leu Asp Asp Ile Asn 50 55 60 Cys Tyr Asp Arg Thr Asp Cys Val Glu Lys Lys Asp Ser Pro Glu Val 65 70 75 80 Tyr Phe Cys Cys Cys Glu Gly Asn Met Cys Asn Glu Lys Phe Ser Tyr 85 90 95 Phe Pro Glu Met Glu Val Thr Gln Pro Thr Ser Asn Pro Val Thr Pro 100 105 110 Lys Pro Pro Thr 115 <210> 273 <211> 115 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 273 Gly Arg Gly Glu Ala Glu Thr Arg Glu Cys Ile Tyr Tyr Asn Ala Asn 1 5 10 15 Trp Glu Leu Glu Arg Thr Asn Gln Ser Gly Leu Glu Arg Cys Glu Gly 20 25 30 Glu Gln Asp Lys Arg Leu His Cys Tyr Ala Ser Trp Arg Asn Ser Ser 35 40 45 Gly Thr Ile Glu Leu Val Lys Lys Gly Cys Trp Leu Asp Asp Phe Asn 50 55 60 Cys Tyr Asp Arg Gln Glu Cys Val Ala Thr Glu Glu Asn Pro Gln Val 65 70 75 80 Tyr Phe Cys Cys Cys Glu Gly Asn Phe Cys Asn Glu Arg Phe Thr His 85 90 95 Leu Pro Glu Ala Gly Gly Pro Glu Val Thr Tyr Glu Pro Pro Pro Thr 100 105 110 Ala Pro Thr 115 <210> 274 <211> 150 <212> PRT <213> Rattus sp. <400> 274 Met Thr Ala Pro Trp Ala Ala Leu Ala Leu Leu Trp Gly Ser Leu Cys 1 5 10 15 Ala Gly Ser Gly Arg Gly Glu Ala Glu Thr Arg Glu Cys Ile Tyr Tyr 20 25 30 Asn Ala Asn Trp Glu Leu Glu Arg Thr Asn Gln Ser Gly Leu Glu Arg 35 40 45 Cys Glu Gly Glu Gln Asp Lys Arg Leu His Cys Tyr Ala Ser Trp Pro 50 55 60 Asn Ser Ser Gly Thr Ile Glu Leu Val Lys Lys Gly Cys Trp Leu Asp 65 70 75 80 Asp Phe Asn Cys Tyr Asp Arg Gln Glu Cys Val Ala Thr Glu Glu Asn 85 90 95 Pro Gln Val Tyr Phe Cys Cys Cys Glu Gly Asn Phe Cys Asn Glu Arg 100 105 110 Phe Thr His Leu Pro Glu Pro Gly Gly Pro Glu Val Thr Tyr Glu Pro 115 120 125 Pro Pro Thr Ala Pro Thr Leu Leu Thr Val Leu Ala Tyr Ser Leu Leu 130 135 140 Pro Ile Gly Gly Leu Ser 145 150 <210> 275 <211> 150 <212> PRT <213> Sus sp. <400> 275 Met Thr Ala Pro Trp Ala Ala Leu Ala Leu Leu Trp Gly Ser Leu Cys 1 5 10 15 Val Gly Ser Gly Arg Gly Glu Ala Glu Thr Arg Glu Cys Ile Tyr Tyr 20 25 30 Asn Ala Asn Trp Glu Leu Glu Arg Thr Asn Gln Ser Gly Leu Glu Arg 35 40 45 Cys Glu Gly Glu Gln Asp Lys Arg Leu His Cys Tyr Ala Ser Trp Arg 50 55 60 Asn Ser Ser Gly Thr Ile Glu Leu Val Lys Lys Gly Cys Trp Leu Asp 65 70 75 80 Asp Phe Asn Cys Tyr Asp Arg Gln Glu Cys Val Ala Thr Glu Glu Asn 85 90 95 Pro Gln Val Tyr Phe Cys Cys Cys Glu Gly Asn Phe Cys Asn Glu Arg 100 105 110 Phe Thr His Leu Pro Glu Ala Gly Gly Pro Glu Val Thr Tyr Glu Pro 115 120 125 Pro Pro Thr Ala Pro Thr Leu Leu Thr Val Leu Ala Tyr Ser Leu Leu 130 135 140 Pro Ile Gly Gly Leu Ser 145 150 <210> 276 <211> 150 <212> PRT <213> Mus sp. <400> 276 Met Thr Ala Pro Trp Ala Ala Leu Ala Leu Leu Trp Gly Ser Leu Cys 1 5 10 15 Ala Gly Ser Gly Arg Gly Glu Ala Glu Thr Arg Glu Cys Ile Tyr Tyr 20 25 30 Asn Ala Asn Trp Glu Leu Glu Arg Thr Asn Gln Ser Gly Leu Glu Arg 35 40 45 Cys Glu Gly Glu Gln Asp Lys Arg Leu His Cys Tyr Ala Ser Trp Arg 50 55 60 Asn Ser Ser Gly Thr Ile Glu Leu Val Lys Lys Gly Cys Trp Leu Asp 65 70 75 80 Asp Phe Asn Cys Tyr Asp Arg Gln Glu Cys Val Ala Thr Glu Glu Asn 85 90 95 Pro Gln Val Tyr Phe Cys Cys Cys Glu Gly Asn Phe Cys Asn Glu Arg 100 105 110 Phe Thr His Leu Pro Glu Pro Gly Gly Pro Glu Val Thr Tyr Glu Pro 115 120 125 Pro Pro Thr Ala Pro Thr Leu Leu Thr Val Leu Ala Tyr Ser Leu Leu 130 135 140 Pro Ile Gly Gly Leu Ser 145 150 <210> 277 <211> 150 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 277 Met Thr Ala Pro Trp Val Ala Leu Ala Leu Leu Trp Gly Ser Leu Cys 1 5 10 15 Ala Gly Ser Gly Arg Gly Glu Ala Glu Thr Arg Glu Cys Ile Tyr Tyr 20 25 30 Asn Ala Asn Trp Glu Leu Glu Arg Thr Asn Gln Ser Gly Leu Glu Arg 35 40 45 Cys Glu Gly Glu Gln Asp Lys Arg Leu His Cys Tyr Ala Ser Trp Arg 50 55 60 Asn Ser Ser Gly Thr Ile Glu Leu Val Lys Lys Gly Cys Trp Leu Asp 65 70 75 80 Asp Phe Asn Cys Tyr Asp Arg Gln Glu Cys Val Ala Thr Glu Glu Asn 85 90 95 Pro Gln Val Tyr Phe Cys Cys Cys Glu Gly Asn Phe Cys Asn Glu Arg 100 105 110 Phe Thr His Leu Pro Glu Ala Gly Gly Pro Glu Val Thr Tyr Glu Pro 115 120 125 Pro Pro Thr Ala Pro Thr Leu Leu Thr Val Leu Ala Tyr Ser Leu Leu 130 135 140 Pro Ile Gly Gly Leu Ser 145 150 <210> 278 <211> 150 <212> PRT <213> Bos sp. <400> 278 Met Thr Ala Pro Trp Ala Ala Leu Ala Leu Leu Trp Gly Ser Leu Cys 1 5 10 15 Ala Gly Ser Gly Arg Gly Glu Ala Glu Thr Arg Glu Cys Ile Tyr Tyr 20 25 30 Asn Ala Asn Trp Glu Leu Glu Arg Thr Asn Gln Ser Gly Leu Glu Arg 35 40 45 Cys Glu Gly Glu Arg Asp Lys Arg Leu His Cys Tyr Ala Ser Trp Arg 50 55 60 Asn Ser Ser Gly Thr Ile Glu Leu Val Lys Lys Gly Cys Trp Leu Asp 65 70 75 80 Asp Phe Asn Cys Tyr Asp Arg Gln Glu Cys Val Ala Thr Glu Glu Asn 85 90 95 Pro Gln Val Tyr Phe Cys Cys Cys Glu Gly Asn Phe Cys Asn Glu Arg 100 105 110 Phe Thr His Leu Pro Glu Ala Gly Gly Pro Glu Val Thr Tyr Glu Pro 115 120 125 Pro Pro Thr Ala Pro Thr Leu Leu Thr Val Leu Ala Tyr Ser Leu Leu 130 135 140 Pro Val Gly Gly Leu Ser 145 150 <210> 279 <211> 150 <212> PRT <213> Xenopus sp. <400> 279 Met Gly Ala Ser Val Ala Leu Thr Phe Leu Leu Leu Leu Ala Thr Phe 1 5 10 15 Arg Ala Gly Ser Gly His Asp Glu Val Glu Thr Arg Glu Cys Ile Tyr 20 25 30 Tyr Asn Ala Asn Trp Glu Leu Glu Lys Thr Asn Gln Ser Gly Val Glu 35 40 45 Arg Leu Val Glu Gly Lys Lys Asp Lys Arg Leu His Cys Tyr Ala Ser 50 55 60 Trp Arg Asn Asn Ser Gly Phe Ile Glu Leu Val Lys Lys Gly Cys Trp 65 70 75 80 Leu Asp Asp Phe Asn Cys Tyr Asp Arg Gln Glu Cys Ile Ala Lys Glu 85 90 95 Glu Asn Pro Gln Val Phe Phe Cys Cys Cys Glu Gly Asn Tyr Cys Asn 100 105 110 Lys Lys Phe Thr His Leu Pro Glu Val Glu Thr Phe Asp Pro Lys Pro 115 120 125 Gln Pro Ser Ala Ser Val Leu Asn Ile Leu Ile Tyr Ser Leu Leu Pro 130 135 140 Ile Val Gly Leu Ser Met 145 150 <210> 280 <211> 150 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 280 Met Gly Ala Ala Ala Lys Leu Ala Phe Ala Val Phe Leu Ile Ser Cys 1 5 10 15 Ser Ser Gly Ala Ile Leu Gly Arg Ser Glu Thr Gln Glu Cys Leu Phe 20 25 30 Phe Asn Ala Asn Trp Glu Lys Asp Arg Thr Asn Gln Thr Gly Val Glu 35 40 45 Pro Cys Tyr Gly Asp Lys Asp Lys Arg Arg His Cys Phe Ala Thr Trp 50 55 60 Lys Asn Ile Ser Gly Ser Ile Glu Ile Val Lys Gln Gly Cys Trp Leu 65 70 75 80 Asp Asp Ile Asn Cys Tyr Asp Arg Thr Asp Cys Val Glu Lys Lys Asp 85 90 95 Ser Pro Glu Val Tyr Phe Cys Cys Cys Glu Gly Asn Met Cys Asn Glu 100 105 110 Lys Phe Ser Tyr Phe Pro Glu Met Glu Val Thr Gln Pro Thr Ser Asn 115 120 125 Pro Val Thr Pro Lys Pro Pro Tyr Tyr Asn Ile Leu Leu Tyr Ser Leu 130 135 140 Val Pro Leu Met Leu Ile 145 150

Claims (205)

  1. 서열 번호: 2의 아미노산 20-29 중 어느 하나에서 시작하고, 그리고 서열 번호: 2의 아미노산 109-134 중 어느 하나에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 90% 내지 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 융합 단백질로서,
    이때 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 위치 82에 상응하는 위치에 리신을 포함하고,
    상기 융합 단백질은 액티빈 A 및 GDF11을 억제하고, 야생형 ActRIIB 세포외 도메인 폴리펩티드를 갖는 융합 단백질에 비하여 BMP9의 약한 억제를 나타내는 것인, 융합 단백질.
  2. 서열 번호: 2의 아미노산 20-29 중 어느 하나에서 시작하고, 그리고 서열 번호: 2의 아미노산 109-134 중 어느 하나에서 종료되는 아미노산 서열에 대하여 90% 내지 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 변이체 ActRIIB 폴리펩티드를 포함하는 융합단백질로서,
    이때 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 위치 55에 상응하는 위치에 글루탐산을 포함하고,
    상기 융합 단백질은 액티빈 A 및 GDF11을 억제하고, 야생형 ActRIIB 세포외 도메인 폴리펩티드를 갖는 융합 단백질에 비하여 BMP9의 약한 억제를 나타내는 것인, 융합 단백질.
  3. 청구항 1 또는 2에 있어서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 29-109에 대하여 94% 내지 99% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 것인, 융합 단백질.
  4. 청구항 1 또는 2에 있어서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 25-131에 대하여 94% 내지 99% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 것인, 융합 단백질.
  5. 청구항 1 또는 2에 있어서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 20-134에 대하여 94% 내지 99% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 것인, 융합 단백질.
  6. 청구항 1 또는 2에 있어서, 상기 폴리펩티드는 서열 번호: 2의 아미노산 20-134에 대하여 98% 내지 99% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 것인, 융합 단백질.
  7. 청구항 1 또는 2에 있어서, 상기 융합 단백질은 하나 또는 그 이상의 이종성 도메인을 더 포함하는 것인, 융합 단백질.
  8. 청구항 7에 있어서, 상기 하나 또는 그 이상의 이종성 도메인이 Fc 도메인인 것인, 융합 단백질.
  9. 청구항 8에 있어서, 상기 융합 단백질은 변이체 ActRIIB 폴리펩티드와 Fc 도메인 사이에 위치한 링커를 더 포함하는 것인, 융합 단백질.
  10. 청구항 9에 있어서, 상기 링커는 TGGG, TGGGG, SGGGG, GGGGS, GGG, GGGG, SGGG, 및 GGGGS에서 선택되는 것인, 융합 단백질.
  11. 청구항 9에 있어서, 서열 번호: 5 또는 서열 번호: 6의 아미노산 서열에 대하여 90% 내지 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하고, 이때 상기 융합 단백질은 서열 번호: 2의 위치 82에 상응하는 위치에 리신 또는 서열 번호: 2의 위치 55에 상응하는 위치에 글루탐산을 갖는 것인, 융합 단백질.
  12. 청구항 9에 있어서, 서열 번호: 12의 아미노산 서열에 대하여 90% 내지 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하고, 이때 상기 융합 단백질은 서열 번호: 2의 위치 82에 상응하는 위치에 리신 또는 서열 번호: 2의 위치 55에 상응하는 위치에 글루탐산을 갖는 것인, 융합 단백질.
  13. 청구항 1 또는 2에 있어서, 상기 융합 단백질은 서열 번호: 40의 아미노산 서열에 대하여 94% 내지 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 것인, 융합 단백질.
  14. 청구항 1 또는 2에 있어서, 상기 융합 단백질은 서열 번호: 42의 아미노산 서열에 대하여 94% 내지 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 것인, 융합 단백질.
  15. 청구항 1 또는 2에 있어서, 상기 융합 단백질은 서열 번호: 42의 아미노산 서열에 대하여 98% 내지 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 것인, 융합 단백질.
  16. 청구항 8에 있어서, Fc 도메인은 서열 번호: 13-30 중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 90% 내지 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 것인, 융합 단백질.
  17. 청구항 1 또는 2에 있어서, 상기 융합 단백질은 동종이량체 인 것인, 융합 단백질.
  18. 청구항 1 또는 2에 있어서, 상기 융합 단백질은 당화된 아미노산, 페길화된 아미노산, 파르네실화된 아미노산, 아세틸화된 아미노산, 바이오티닐화된 아미노산, 그리고 지질 모이어티에 접합된 아미노산으로 구성되는 군에서 선택된 하나 또는 그 이상의 아미노산 변형을 포함하는 것인, 융합 단백질.
  19. 청구항 18에 있어서, 상기 융합 단백질은 당화되고, CHO 세포에서 폴리펩티드로부터 얻을 수 있는 당화 패턴을 갖는 것인, 융합 단백질.
  20. 청구항 1 또는 2에 있어서, 상기 융합 단백질은 세포-기반 검정에서 하나 또는 그 이상의 TGF-베타 슈퍼패밀리 리간드의 신호생성을 억제하는 것인, 융합 단백질.
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  22. 빈혈 치료에 사용하기 위하여, 청구항 1 또는 2의 융합 단백질과 약학적으로 수용가능한 담체를 포함하는 것인, 약학 제재.
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  28. 근이영양증(DMD), 베커 근이영양증(BMD), 에머리-드레이푸스 근이영양증
    (EDMD), 지대형 근이영양증(LGMD), 안면견갑상완 근이영양증(FSH 또는 FSHD) (Landouzy-Dejerine으로도 알려져 있음), 근긴장성 이영양증(MMD)(스타이너트병으로도 알려짐), 안인두 근이영양증 (OPMD), 원위 근이영양증(DD) 또는 선천성 근이영양증(CMD)의 치료에 사용하기 위하여, 청구항 1 또는 2의 융합 단백질과 약학적으로 수용가능한 담체를 포함하는 것인, 약학 제재.
  29. 삭제
  30. 청구항 1에 있어서, SEQ ID NO: 2의 아미노산 20-134에 대하여 동일한 아미노산 서열을 포함하고, 이때 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NO: 2의 위치 82에 상응하는 위치에 리신을 포함하는 것인, 융합 단백질.
  31. 청구항 2에 있어서, SEQ ID NO: 2의 아미노산 20-134와 동일한 아미노산 서열을 포함하고, 이때 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NO: 2의 위치 55에 상응하는 위치에 글루탐산을 포함하는 것인, 융합 단백질.
  32. 청구항 1 또는 2에 있어서, SEQ ID NO: 2의 아미노산 25-131에 대하여 동일한 아미노산 서열을 포함하고, 이때 상기 폴리펩티드는 SEQ ID NO: 2의 위치 82에 상응하는 위치에 리신 또는 SEQ ID NO: 2의 위치 55에 상응하는 위치에 글루탐산을 포함하는 것인, 융합 단백질.
  33. 청구항 9에 있어서, Fc 도메인은 서열 번호: 13-30 중 어느 하나의 아미노산 서열에 대하여 90% 내지 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 것인, 융합 단백질.
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