KR102178919B1 - Biomarker microRNAs for diagnosing diabetic nephropathy and use thereof - Google Patents

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Abstract

본 발명은 당뇨병성 신증 진단을 위한 바이오마커 및 이의 용도에 관한 것으로, 보다 구체적으로 마이크로RNA-642a(miR-642a), 마이크로RNA-1246(miR-1246), 마이크로RNA-1255b(miR-1255b), 및 마이크로RNA-5010(miR-5010)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상을 포함하는 당뇨병성 신증 진단용 마커 조성물, 상기 miRNA의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는 당뇨병성 신증 진단용 조성물 및 키트, 상기 마커를 이용하여 당뇨병성 신증을 진단하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 신장합병증 유무에 특이적 microRNAs는 당뇨병성 신증을 진단하고 진행정도를 예측하기 위한 바이오마커로 유용하게 이용할 수 있을 것이다. The present invention relates to a biomarker for diabetic nephropathy and its use, and more specifically, microRNA-642a (miR-642a), microRNA-1246 (miR-1246), microRNA-1255b (miR-1255b) , And a marker composition for diabetic nephropathy diagnosis comprising at least one selected from the group consisting of microRNA-5010 (miR-5010), a composition and kit for diabetic nephropathy diagnosis comprising an agent for measuring the expression level of the miRNA, the It relates to a method of diagnosing diabetic nephropathy using a marker. The microRNAs specific for the presence or absence of renal complications according to the present invention may be usefully used as biomarkers for diagnosing diabetic nephropathy and predicting progression.

Description

당뇨병성 신증 진단을 위한 마이크로RNA 바이오마커 및 이의 용도{Biomarker microRNAs for diagnosing diabetic nephropathy and use thereof} Biomarker microRNAs for diagnosing diabetic nephropathy and use thereof {Biomarker microRNAs for diagnosing diabetic nephropathy and use thereof}

본 발명은 당뇨병성 신증 진단을 위한 바이오마커 및 이의 용도에 관한 것으로, 보다 구체적으로 마이크로RNA-642a(miR-642a), 마이크로RNA-1246(miR-1246), 마이크로RNA-1255b(miR-1255b), 및 마이크로RNA-5010(miR-5010)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상을 포함하는 당뇨병성 신증 진단용 마커 조성물, 상기 miRNA의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는 당뇨병성 신증 진단용 조성물 및 진단 키트, 상기 마커를 이용하여 당뇨병성 신증을 진단하는 방법에 관한 것이다. The present invention relates to a biomarker for diabetic nephropathy and its use, and more specifically, microRNA-642a (miR-642a), microRNA-1246 (miR-1246), microRNA-1255b (miR-1255b) , And a marker composition for diabetic nephropathy diagnosis comprising at least one selected from the group consisting of microRNA-5010 (miR-5010), a diabetic nephropathy diagnostic composition and a diagnostic kit comprising an agent for measuring the expression level of the miRNA, It relates to a method for diagnosing diabetic nephropathy using the above marker.

당뇨병은 인슐린의 분비량이 부족하거나 정상적인 기능이 이루어지지 않는 등의 대사질환의 일종으로, 혈중 포도당의 농도가 높아지는 고혈당을 특징으로 하며, 고혈당으로 인하여 여러 증상 및 징후를 일으키고 소변에서 포도당을 배출하게 된다. '소아 당뇨병'이라고도 불리는 제1형 당뇨병은 자가면역 기작에 의해 췌장의 베타세포가 파괴되어 인슐린의 절대적 또는 상대적 생산 결핍이 원인으로 발생하는 반면, 제2형 당뇨병은 인슐린 저항성에 의해 유도되며 비만, 인슐린 수용체의 감소, 인슐린 분비 저하, 유전적 요인 등 다양한 요인에 의해서 생기는 것으로 알려져 있다.Diabetes is a type of metabolic disease such as insufficient insulin secretion or inability to function normally.It is characterized by high blood sugar, which increases the concentration of glucose in the blood, and causes various symptoms and signs due to high blood sugar, and glucose is excreted from the urine. . Type 1 diabetes, also called'child diabetes', is caused by an absolute or relative lack of insulin production due to the destruction of beta cells in the pancreas by an autoimmune mechanism, whereas type 2 diabetes is induced by insulin resistance and obesity, It is known to be caused by various factors such as decrease in insulin receptor, decrease in insulin secretion, and genetic factors.

대한당뇨병학회의 2016년 발표에 따르면, 2014년 기준 국내 30세 이상 성인 인구의 당뇨병 유병률이 13.7%로 역대 최고치를 기록하였으며, 당뇨병의 동반질환 위험도 역시 심각한 수준으로 당뇨병 환자의 비만과 복부비만 유병률이 48.6%와 58.9%에 이르며 고혈압과 고콜레스테롤혈증 역시 각각 54.7%, 31.6%가 동반되어 있는 것으로 나타났다. 이처럼 당뇨병은 그 자체의 위험성뿐만 아니라 심혈관계 질환, 망막증, 신부전, 말초신경합병증 등 매우 심각한 합병증을 초래할 수 있다. According to a 2016 presentation by the Korean Diabetes Association, the prevalence of diabetes among adults over 30 years of age in Korea recorded an all-time high of 13.7% as of 2014, and the risk of accompanying diseases of diabetes was also at a serious level. They reached 48.6% and 58.9%, and hypertension and hypercholesterolemia were also associated with 54.7% and 31.6%, respectively. As such, diabetes can lead to very serious complications such as cardiovascular disease, retinopathy, kidney failure, and peripheral neuropathy as well as its own risk.

당뇨병에 의해 나타나는 합병증의 하나인 당뇨병성 신증(diabetic nephropathy)은 고혈당 등에 의해 지속적으로 신장 내부의 사구체가 손상되어 신장 기능이 저하되는 질환으로, 당뇨병은 10~15년에 걸쳐 천천히 신장질환을 진행시키므로 당뇨 초기에 잘 치료하지 않으면 어느새 신장 기능이 망가지게 되고 심할 경우에는 투석과 이식을 필요로 하는 말기 신부전이 초래될 수 있다. 당뇨병성 신증의 병인은 아직 정확하게 밝혀지지는 않았으나, 신장 내의 혈역학적인 변화(intrarenal hemodynamic alterations), 사구체 단백의 포도당화(glycosylation of glomerular proteins), sorbitol의 축적 등 복합적 요인들이 당뇨병성 신증의 병인과 관련이 있는 것으로 여겨진다. Diabetic nephropathy, one of the complications of diabetes, is a disease in which the glomerulus inside the kidney is continuously damaged due to high blood sugar, and kidney function decreases. Diabetes slowly progresses kidney disease over 10 to 15 years. If not treated well in the early stages of diabetes, kidney function may be impaired, and in severe cases, end-stage renal failure requiring dialysis and transplantation can result. The etiology of diabetic nephropathy has not been accurately identified, but a combination of factors such as intrarenal hemodynamic alterations, glycosylation of glomerular proteins, and accumulation of sorbitol are related to the etiology of diabetic nephropathy. It is believed to be there.

현재 당뇨병성 신증을 예방하기 위하여 레닌-안지오텐신계(renin-angiotensin system: RAS) 억제제를 주로 사용하고 있다. RAS 억제제는 혈액동력학적 효능뿐 아니라 만성염증반응 혹은 섬유화를 유도하는 사이토카인(cytokine), 케모카인(chemokine), 성장인자(growth factor) 등의 생성을 저해하여 신장 기능을 보호하는 탁월한 효과를 나타내지만, 환자 개개의 유전적 성향이 다르고 장기적 치료로 인한 부작용 및 치료제에 대한 내성 문제가 있어 치료효과가 그 기대에 못 미치고 있다. 또한, 지난 수년간 신증에 대한 원인규명, 진단방법 및 치료방법에 대한 집중적인 연구가 이루어졌음에도 불구하고 아직까지 신증을 효과적으로 치료할 수 있는 확실한 치료제가 개발되지 못하고 있다. 따라서 당뇨병성 신증을 초기 단계에 발견하고 치료하는 것이 가장 효과적인 방법이라 할 수 있다.Currently, renin-angiotensin system (RAS) inhibitors are mainly used to prevent diabetic nephropathy. RAS inhibitors not only have hemodynamic effects, but also exhibit excellent effects in protecting kidney function by inhibiting the production of cytokines, chemokines, and growth factors that induce chronic inflammatory reactions or fibrosis. However, the treatment effect is not meeting expectations because the patient's individual genetic tendencies are different, and there are side effects from long-term treatment and resistance to the treatment. In addition, despite intensive research on the cause of nephropathy, diagnosis, and treatment for the past several years, a definite therapeutic agent that can effectively treat nephropathy has not yet been developed. Therefore, it can be said that diabetic nephropathy is detected and treated in an early stage as the most effective method.

종래 당뇨병성 신증을 진단하기 위한 바이오마커는 한정적이다. 임상에서 당뇨병성 신증의 진단은 정기적이고 반복적으로 임상적 증상, 환자의 병력을 통하여 이루어지는데, 예컨대 오랜 기간의 당뇨병력을 가진 환자가 신증 범위의 단백뇨(nephrotic-range proteinuria), 망막병증(retinopathy)이 있으면서 신질환의 명확한 다른 원인이 없으면 당뇨병성 신증으로 진단된다. Conventional biomarkers for diagnosing diabetic nephropathy are limited. Diabetic nephropathy is diagnosed regularly and repeatedly through clinical symptoms and the patient's medical history. For example, patients with long-term diabetic history have nephrotic-range proteinuria and retinopathy. If there is no other obvious cause of kidney disease, diabetic nephropathy is diagnosed.

미세단백뇨(24시간 요 알부민 30-300 mg/d 또는 알부민 배설 비율 20-200 ug/min)는 당뇨병성 신증의 진행을 조기에 예측하고, 신증 외 혈관합병증을 예측하는 바이오 마커로 가장 많이 사용되고 있다. 기존 연구에 의하면, 미세단백뇨는 사구체여과율이 감소를 예측하는 위험인자이자, 만성신부전으로 진행하는 독립적인 위험인자이기도 하므로, 현재 당뇨병 진단 및 치료 지침에도 미세단백뇨의 측정을 권고하고 있다. 하지만 최근 연구들은 당뇨 환자에서 미세단백뇨의 자연 소실 빈도가 높고(Diabetes Care. 2001 Sep;24(9):1560-6.), 미세단백뇨가 없이 신기능이 저하된(사구체 여과율 < 60 ml/min/1.73m2) 당뇨환자의 빈도가 높다는 이유로 미세단백뇨 만으로 당뇨병성 신증을 조기 진단하고 진행 지표로 판단하는 것에 제한이 있다고 보고하고 있다. Microproteinuria (24 hours urinary albumin 30-300 mg/d or albumin excretion rate 20-200 ug/min) is the most widely used biomarker to predict the progression of diabetic nephropathy early and predict vascular complications other than nephropathy. . According to existing studies, microproteinuria is a risk factor for predicting a decrease in glomerular filtration rate and an independent risk factor for chronic renal failure, and therefore, measurement of microproteinuria is recommended in the current diabetes diagnosis and treatment guidelines. However, recent studies have shown that the frequency of spontaneous loss of microproteinuria is high in diabetic patients (Diabetes Care. 2001 Sep;24(9):1560-6.), and renal function is reduced without microproteinuria (glomerular filtration rate <60 ml/min/). 1.73m 2 ) Due to the high frequency of diabetic patients, it is reported that there is a limit to early diagnosis of diabetic nephropathy with only microproteinuria and to judge it as a progression indicator.

이에, 본 발명자들은 당뇨병성 신증을 효과적으로 진단할 수 있는 바이오마커를 발굴하기 위해 피검자의 혈청 유래 엑소좀에 존재하는 miRNAs를 분석하여 정상대조군에 비해 신장합병증이 있는 당뇨환자군에서 발현이 유의하게 증가하는 4종의 miRNAs를 발굴함으로써 본 발명을 완성하였다. Accordingly, the present inventors analyzed miRNAs present in exosomes derived from serum of a subject in order to discover biomarkers that can effectively diagnose diabetic nephropathy, and the expression was significantly increased in diabetic patients with renal complications compared to the normal control group. The present invention was completed by discovering 4 types of miRNAs.

상기와 같은 종래의 문제점을 해결하기 위하여, 본 발명자들은 정상군, 신장합병증이 없는 당뇨군, 및 신장합병증이 있는 당뇨군에 해당하는 대상자들로부터 혈청을 채취하고 이로부터 엑소좀(exosome) RNA를 분리한 후 NGS 분석을 통해 엑소좀 microRNA의 발현수준을 비교분석한 결과, 정상군에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군에서만 발현수준이 유의하게 증가하는 4종의 마이크로RNAs를 발견하였는바, 이에 기초하여 본 발명을 완성하였다. In order to solve the conventional problems as described above, the present inventors collect serum from subjects corresponding to the normal group, the diabetic group without renal complications, and the diabetic group with renal complications, and obtain exosome RNA from them. As a result of comparative analysis of the expression level of exosome microRNA through NGS analysis after isolation, we found 4 types of microRNAs whose expression level significantly increased only in the diabetic group with renal complications compared to the normal group. The present invention has been completed.

이에, 본 발명은 마이크로RNA-642a(miR-642a), 마이크로RNA-1246(miR-1246), 마이크로RNA-1255b(miR-1255b), 및 마이크로RNA-5010(miR-5010)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상을 포함하는, 당뇨병성 신증 진단용 마커 조성물을 제공하는 것을 목적으로 한다.Accordingly, the present invention is selected from the group consisting of microRNA-642a (miR-642a), microRNA-1246 (miR-1246), microRNA-1255b (miR-1255b), and microRNA-5010 (miR-5010). It is an object of the present invention to provide a marker composition for diabetic nephropathy diagnosis comprising at least one of which is to be.

또한, 본 발명은 마이크로RNA-642a(miR-642a), 마이크로RNA-1246(miR-1246), 마이크로RNA-1255b(miR-1255b), 및 마이크로RNA-5010(miR-5010)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는, 당뇨병성 신증 진단용 조성물 및 상기 조성물을 포함하는 당뇨병성 신증 진단용 키트를 제공하는 것을 다른 목적으로 한다. In addition, the present invention is selected from the group consisting of microRNA-642a (miR-642a), microRNA-1246 (miR-1246), microRNA-1255b (miR-1255b), and microRNA-5010 (miR-5010) Another object of the present invention is to provide a diabetic nephropathy diagnostic composition and a diabetic nephropathy diagnostic kit comprising the composition, including an agent for measuring one or more expression levels.

또한, 본 발명은 피검체 유래의 생물학적 시료에서 마이크로RNA-642a(miR-642a), 마이크로RNA-1246(miR-1246), 마이크로RNA-1255b(miR-1255b), 및 마이크로RNA-5010(miR-5010)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 발현수준을 측정하는 단계를 포함하는, 당뇨병성 신증 진단을 위한 정보제공방법을 제공하는 것을 또 다른 목적으로 한다. In addition, the present invention provides microRNA-642a (miR-642a), microRNA-1246 (miR-1246), microRNA-1255b (miR-1255b), and microRNA-5010 (miR- Another object of the present invention is to provide a method of providing information for diabetic nephropathy diagnosis, including measuring the expression level of one or more selected from the group consisting of 5010).

그러나 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 당업자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다. However, the technical problem to be achieved by the present invention is not limited to the above-mentioned problems, and other problems that are not mentioned will be clearly understood by those skilled in the art from the following description.

상기와 같은 본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 마이크로RNA-642a(miR-642a), 마이크로RNA-1246(miR-1246), 마이크로RNA-1255b(miR-1255b), 및 마이크로RNA-5010(miR-5010)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상을 포함하는, 당뇨병성 신증 진단용 마커 조성물을 제공한다. In order to achieve the object of the present invention as described above, the present invention is microRNA-642a (miR-642a), microRNA-1246 (miR-1246), microRNA-1255b (miR-1255b), and microRNA-5010 It provides a marker composition for diabetic nephropathy diagnosis comprising at least one selected from the group consisting of (miR-5010).

또한, 본 발명은 마이크로RNA-642a(miR-642a), 마이크로RNA-1246(miR-1246), 마이크로RNA-1255b(miR-1255b), 및 마이크로RNA-5010(miR-5010)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는, 당뇨병성 신증 진단용 조성물을 제공한다.In addition, the present invention is selected from the group consisting of microRNA-642a (miR-642a), microRNA-1246 (miR-1246), microRNA-1255b (miR-1255b), and microRNA-5010 (miR-5010) It provides a composition for diabetic nephropathy diagnosis comprising an agent for measuring one or more expression levels.

또한, 본 발명은 상기 당뇨병성 신증 진단용 조성물을 포함하는 당뇨병성 신증 진단용 키트를 제공한다. In addition, the present invention provides a diabetic nephropathy diagnostic kit comprising the diabetic nephropathy diagnostic composition.

본 발명의 일구현예로, 상기 miR-642a는 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 것일 수 있다. As an embodiment of the present invention, the miR-642a may be composed of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1.

본 발명의 다른 구현예로, 상기 miR-1246은 서열번호 2의 염기서열로 이루어진 것일 수 있다. In another embodiment of the present invention, the miR-1246 may be composed of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2.

본 발명의 또 다른 구현예로, 상기 miR-1255b는 서열번호 3의 염기서열로 이루어진 것일 수 있다. In another embodiment of the present invention, the miR-1255b may be composed of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3.

본 발명의 또 다른 구현예로, 상기 miR-5010은 서열번호 4의 염기서열로 이루어진 것일 수 있다. In another embodiment of the present invention, the miR-5010 may be made of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4.

본 발명의 또 다른 구현예로, 상기 발현수준을 측정하는 제제는 상기 microRNA에 상보적으로 결합하는 센스 및 안티센스 프라이머, 또는 프로브일 수 있다. In another embodiment of the present invention, the agent for measuring the expression level may be a sense and antisense primer or probe that complementarily binds to the microRNA.

또한, 본 발명은 피검체 유래의 생물학적 시료에서 마이크로RNA-642a(miR-642a), 마이크로RNA-1246(miR-1246), 마이크로RNA-1255b(miR-1255b), 및 마이크로RNA-5010(miR-5010)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 발현수준을 측정하는 단계를 포함하는, 당뇨병성 신증 진단을 위한 정보제공방법을 제공한다.In addition, the present invention provides microRNA-642a (miR-642a), microRNA-1246 (miR-1246), microRNA-1255b (miR-1255b), and microRNA-5010 (miR- 5010) provides a method for providing information for diabetic nephropathy diagnosis comprising the step of measuring the expression level of one or more selected from the group consisting of.

본 발명의 일구현예로, 상기 생물학적 시료는 혈액 또는 혈청 유래 엑소좀(exosome)일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the biological sample may be blood or serum-derived exosomes.

본 발명의 다른 구현예로, 상기 발현수준은 차세대 염기서열 분석(Next generation sequencing; NGS), 중합효소연쇄반응(PCR), 역전사 중합효소연쇄반응(RT-PCR), 실시간 중합효소연쇄반응(Real-time PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection assay; RPA), 마이크로어레이(microarray), 및 노던 블롯팅(northern blotting)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 방법을 통해 측정되는 것일 수 있다. In another embodiment of the present invention, the expression level is next generation sequencing (NGS), polymerase chain reaction (PCR), reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), real-time polymerase chain reaction (Real -time PCR), RNase protection assay (RPA), microarray, and northern blotting.It may be measured by one or more methods selected from the group consisting of.

본 발명자들은 정상군, 신장합병증이 없는 당뇨군, 및 신장합병증이 있는 당뇨군의 혈액에서 분리한 엑소좀 내에 포함된 microRNA를 분석한 결과, 정상군에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군에서만 발현이 유의하게 증가하는 신장합병증 유무에 특이적 microRNA인 miR-642a, miR-1246, miR-1255b 및 miR-5010을 발굴하였다. 이에, 상기 발굴된 microRNAs를 당뇨병성 신증을 진단하고 진행정도를 예측하기 위한 바이오마커로 유용하게 이용할 수 있을 것이다. The present inventors analyzed the microRNA contained in the exosomes isolated from the blood of the normal group, the diabetic group without renal complications, and the diabetic group with renal complications. As a result, the expression was significant only in the diabetic group with renal complication compared to the normal group. MicroRNAs specific for the presence or absence of nephropathy, miR-642a, miR-1246, miR-1255b, and miR-5010, which were increased significantly. Accordingly, the discovered microRNAs may be usefully used as biomarkers for diagnosing diabetic nephropathy and predicting progression.

도 1은 정상군(HV) 및 신장합병증이 없는 당뇨군(Nephro-X) 대상자들의 혈청에서 분리한 엑소좀 내 microRNAs의 발현수준을 비교분석한 결과로서, 도 1a는 정상군에 비해 신장합병증이 없는 당뇨군에서 유의적으로 2배 이상(p < 0.05) 발현이 감소 또는 증가한 microRNAs의 발현수준에 따른 계층적 클러스터링을 수행한 히트맵 결과이고, 도 1b는 상기에서 검출된 microRNAs의 발현수준에 따른 산점도(scatter plot) 결과이다.
도 2는 정상군(HV) 및 신장합병증이 있는 당뇨군(Nephro-O) 대상자들의 혈청에서 분리한 엑소좀 내 microRNAs의 발현수준을 비교분석한 결과로서, 도 2a는 정상군에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군에서 유의적으로 2배 이상(p < 0.05) 발현이 감소 또는 증가한 microRNAs의 발현수준에 따른 계층적 클러스터링을 수행한 히트맵 결과이고, 도 2b는 상기에서 검출된 microRNAs의 발현수준에 따른 산점도(scatter plot) 결과이다.
도 3은 신장합병증이 없는 당뇨군(Nephro-X) 및 신장합병증이 있는 당뇨군(Nephro-O) 대상자들의 혈청에서 분리한 엑소좀 내 microRNAs의 발현수준을 비교분석한 결과로서, 도 3a는 신장합병증이 없는 당뇨군에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군에서 유의적으로 2배 이상(p < 0.05) 발현이 감소 또는 증가한 microRNAs의 발현수준에 따른 계층적 클러스터링을 수행한 히트맵 결과이고, 도 3b는 상기에서 검출된 microRNAs의 발현수준에 따른 산점도(scatter plot) 결과이다.
도 4는 상기 도 1 내지 도 3의 결과를 바탕으로 정상군(HV), 신장합병증이 없는 당뇨군(Nephro-X) 및 신장합병증이 있는 당뇨군(Nephro-O)에 대하여 다차원척도법(MDS) 분석을 실시한 결과이다.
도 5는 상기 도 1 내지 도 3의 결과로부터 발현이 유의하게 증가된 microRNAs만을 벤다이어그램으로 표현하여 정상군에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군에서만 발현이 유의하게 증가된 microRNAs만을 도출한 결과이다.
도 6은 정상군(HV)과 신장합병증이 있는 당뇨군(Nephro-O) 간의 hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-1246, hsa-miR-1255b-5p 및 hsa-miR-5010-5p의 발현수준을 측정하여 비교한 결과이다.
1 is a result of comparative analysis of the expression levels of microRNAs in exosomes isolated from serum of normal group (HV) and diabetic group (Nephro-X) subjects without renal complication. FIG. 1A shows renal complications compared to the normal group. Heat map results of hierarchical clustering according to the expression level of microRNAs with significantly reduced or increased expression level of 2 times or more (p <0.05) in the diabetic group without, Figure 1b is the result of the expression level of the microRNAs detected above. This is the result of a scatter plot.
2 is a result of comparative analysis of the expression levels of microRNAs in exosomes isolated from serum of normal group (HV) and diabetic group (Nephro-O) subjects with renal complication. FIG. 2A shows renal complications compared to the normal group. Heat map results of hierarchical clustering according to the expression level of microRNAs with significantly decreased or increased expression levels of 2 times or more (p <0.05) in the diabetic group, and FIG. 2B is the result of the hierarchical clustering according to the expression level of the microRNAs detected above. This is the result of a scatter plot.
3 is a result of comparative analysis of the expression levels of microRNAs in exosomes isolated from the serum of subjects of diabetic group without nephropathy (Nephro-X) and diabetic group with nephropathy (Nephro-O), FIG. 3a is a kidney A heat map result of hierarchical clustering according to the expression level of microRNAs with significantly decreased or increased expression level of microRNAs that was significantly decreased or increased by 2 times or more (p <0.05) in the diabetic group with renal complication compared to the non-complication diabetic group, and FIG. 3B is It is a scatter plot result according to the expression level of the microRNAs detected above.
Figure 4 is a multidimensional scaling method (MDS) for the normal group (HV), the diabetic group without renal complications (Nephro-X), and the diabetic group (Nephro-O) without renal complications based on the results of FIGS. 1 to 3 above. This is the result of the analysis.
5 is a result of deriving only microRNAs with significantly increased expression only in the diabetic group with renal complications compared to the normal group by expressing only microRNAs with significantly increased expression from the results of FIGS. 1 to 3.
6 shows hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-1246, hsa-miR-1255b-5p and hsa-miR-5010-5p between the normal group (HV) and the diabetic group (Nephro-O) with kidney complications. This is the result of comparing and measuring the expression level of.

본 발명자들은 당뇨병 진단을 위한 바이오마커를 발굴하기 위해 예의 연구한 결과, 당뇨병성 신증 진단에 이용할 수 있는 바이오마커로 마이크로RNA-642a(miR-642a), 마이크로RNA-1246(miR-1246), 마이크로RNA-1255b(miR-1255b) 및 마이크로RNA-5010(miR-5010)을 발견함으로써 본 발명을 완성하였다.As a result of intensive research to discover biomarkers for diabetic diagnosis, the present inventors have shown that microRNA-642a (miR-642a), microRNA-1246 (miR-1246), micro The present invention was completed by discovering RNA-1255b (miR-1255b) and microRNA-5010 (miR-5010).

이에, 본 발명은 마이크로RNA-642a(miR-642a), 마이크로RNA-1246(miR-1246), 마이크로RNA-1255b(miR-1255b), 및 마이크로RNA-5010(miR-5010)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상을 포함하는, 당뇨병성 신증 진단용 마커 조성물을 제공한다. Accordingly, the present invention is selected from the group consisting of microRNA-642a (miR-642a), microRNA-1246 (miR-1246), microRNA-1255b (miR-1255b), and microRNA-5010 (miR-5010). It provides a marker composition for diabetic nephropathy diagnosis, including one or more.

또한, 본 발명은 마이크로RNA-642a(miR-642a), 마이크로RNA-1246(miR-1246), 마이크로RNA-1255b(miR-1255b), 및 마이크로RNA-5010(miR-5010)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는, 당뇨병성 신증 진단용 조성물 및 상기 진단용 조성물을 포함하는 당뇨병성 신증 진단용 키트를 제공한다.In addition, the present invention is selected from the group consisting of microRNA-642a (miR-642a), microRNA-1246 (miR-1246), microRNA-1255b (miR-1255b), and microRNA-5010 (miR-5010) It provides a diabetic nephropathy diagnostic composition and a diabetic nephropathy diagnostic kit comprising the diagnostic composition, including an agent for measuring one or more expression levels.

이에, 본 발명에서 발굴한 당뇨병성 신증 진단용 바이오마커인 상기 miR-642a, 보다 바람직하게 hsa-miR-642a-3p는 서열번호 1(NCBI, MIMAT0020924)로 표시되는 염기서열로 이루어진 것일 수 있다. 이때, 상기 서열번호 1로 표시되는 염기서열과 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 가지는 염기서열을 포함할 수 있다. Accordingly, the miR-642a, more preferably hsa-miR-642a-3p, which is a biomarker for diabetic nephropathy discovered in the present invention, may be made of a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1 (NCBI, MIMAT0020924). In this case, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1 and 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more, most preferably 95% or more may include a nucleotide sequence having sequence homology. .

또한, 본 발명에서 발굴한 당뇨병성 신증 진단용 바이오마커인 상기 miR-1246, 보다 바람직하게 hsa-miR-1246은 서열번호 2 (NCBI, MIMAT0005898)로 표시되는 염기서열로 이루어진 것일 수 있다. 이때, 상기 서열번호 2로 표시되는 염기서열과 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 가지는 염기서열을 포함할 수 있다. In addition, the miR-1246, more preferably hsa-miR-1246, which is a biomarker for diabetic nephropathy discovered in the present invention, may be composed of a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 (NCBI, MIMAT0005898). In this case, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 and 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more, most preferably 95% or more may include a nucleotide sequence having sequence homology. .

또한, 본 발명에서 발굴한 당뇨병성 신증 진단용 바이오마커인 상기 miR-1255b, 보다 바람직하게 hsa-miR-1255b-5p는 서열번호 3 (NCBI, MIMAT0005945)으로 표시되는 염기서열로 이루어진 것일 수 있다. 이때, 상기 서열번호 3으로 표시되는 염기서열과 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 가지는 염기서열을 포함할 수 있다.In addition, the miR-1255b, more preferably hsa-miR-1255b-5p, which is a biomarker for diabetic nephropathy discovered in the present invention, may be composed of a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 3 (NCBI, MIMAT0005945). At this time, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 3 and 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more, most preferably 95% or more may include a nucleotide sequence having sequence homology. .

또한, 본 발명에서 발굴한 당뇨병성 신증 진단용 바이오마커인 상기 miR-5010, 보다 바람직하게 hsa-miR-5010-5p는 서열번호 4 (NCBI, MIMAT0021043)로 표시되는 염기서열로 이루어진 것일 수 있다. 이때, 상기 서열번호 4로 표시되는 염기서열과 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 가지는 염기서열을 포함할 수 있다. In addition, the miR-5010, more preferably hsa-miR-5010-5p, which is a biomarker for diabetic nephropathy discovered in the present invention, may be made of a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 4 (NCBI, MIMAT0021043). In this case, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 4 and 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more, most preferably 95% or more may include a nucleotide sequence having sequence homology. .

본 발명에서 사용되는 용어, “진단(diagnosis)”이란 넓은 의미로는 환자의 병의 실태를 모든 면에 걸쳐서 판단하는 것을 의미한다. 판단의 내용은 병명, 병인, 병형, 경중, 병상의 상세한 양태, 및 합병증의 유무 등이다. 본 발명에서 진단은 당뇨 합병증의 발병 여부 및 진행단계 수준 등을 판단하는 것으로, 보다 바람직하게 상기 당뇨 합병증은 당뇨병성 신증일 수 있다.The term "diagnosis" used in the present invention means in a broad sense to judge the condition of a patient's disease in all aspects. The content of the judgment is the name of the disease, etiology, disease type, severity, detailed mode of the bed, and the presence or absence of complications. In the present invention, the diagnosis is to determine whether the onset of diabetic complications and the level of progression, and more preferably, the diabetic complication may be diabetic nephropathy.

본 발명에 있어서, 상기 miR-642a, miR-1246, miR-1255b 및/또는 miR-5010의 발현수준을 측정하는 제제는 상기 microRNAs의 각각에 상보적으로 결합하는 센스 및 안티센스 프라이머, 또는 프로브일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. In the present invention, the agent for measuring the expression level of miR-642a, miR-1246, miR-1255b and/or miR-5010 may be a sense and antisense primer or probe that complementarily binds to each of the microRNAs. However, it is not limited thereto.

본 발명에서 사용되는 용어, “프라이머”란 DNA 합성의 기시점이 되는 짧은 유전자 서열로써, 진단, DNA 시퀀싱 등에 이용할 목적으로 합성된 올리고뉴클레오티드를 의미한다. 상기 프라이머들은 통상적으로 15 내지 30 염기쌍의 길이로 합성하여 사용할 수 있으나, 사용 목적에 따라 달라질 수 있으며, 공지된 방법으로 메틸화, 캡화 등으로 변형시킬 수 있다. The term “primer” used in the present invention refers to a short gene sequence that serves as a starting point for DNA synthesis, and refers to an oligonucleotide synthesized for use in diagnosis or DNA sequencing. The primers are usually synthesized and used in a length of 15 to 30 base pairs, but may vary depending on the purpose of use, and may be modified by methylation or capping by a known method.

본 발명에서 사용되는 용어, “프로브”란 효소 화학적인 분리정제 또는 합성과정을 거쳐 제작된 수 염기 내지 수백 염기길이의 mRNA와 특이적으로 결합할 수 있는 핵산을 의미한다. 방사성 동위원소나 효소 등을 표지하여 mRNA의 존재 유무를 확인할 수 있으며, 공지된 방법으로 디자인하고 변형시켜 사용할 수 있다. The term "probe" as used herein refers to a nucleic acid capable of specifically binding to an mRNA having a length of several to several hundreds of bases produced through enzymatic chemical separation or purification or synthesis. The presence or absence of mRNA can be confirmed by labeling radioactive isotopes or enzymes, and it can be designed and modified by a known method.

본 발명의 진단용 키트는 분석 방법에 적합한 한 종류 또는 그 이상의 다른 구성성분 조성물, 용액 또는 장치로 구성된다.The diagnostic kit of the present invention is composed of one or more different component compositions, solutions, or devices suitable for analysis methods.

예컨대, 본 발명의 키트는 PCR을 수행하기 위해, 분석하고자 하는 시료로부터 유래된 게놈 DNA, 본 발명의 마커 유전자에 대해 특이적인 프라이머 세트, 적당량의 DNA 중합 효소, dNTP 혼합물, PCR 완충용액 및 물을 포함하는 키트일 수 있다. 상기 PCR 완충용액은 KCl, Tris-HCl 및 MgCl2를 함유할 수 있다. 이외에 PCR 산물의 증폭 여부를 확인할 수 있는 전기영동 수행에 필요한 구성 성분들이 본 발명의 키트에 추가로 포함될 수 있다. For example, in order to perform PCR, the kit of the present invention uses genomic DNA derived from a sample to be analyzed, a primer set specific for the marker gene of the present invention, an appropriate amount of DNA polymerase, dNTP mixture, PCR buffer solution, and water. It may be a kit including. The PCR buffer solution may contain KCl, Tris-HCl and MgCl 2 . In addition, constituents necessary for electrophoresis that can confirm whether a PCR product is amplified may be additionally included in the kit of the present invention.

또한, 본 발명의 키트는 RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있다. RT-PCR 키트는 마커 유전자에 대한 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액, 데옥시뉴클레오티드(dNTPs), Taq-폴리머레이즈 및 역전사 효소와 같은 효소, DNase, RNase 억제제, DEPC-수(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한 정량 대조군으로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 쌍을 포함할 수 있다. In addition, the kit of the present invention may be a kit including essential elements necessary for performing RT-PCR. RT-PCR kits include test tubes or other suitable containers, reaction buffers, deoxynucleotides (dNTPs), enzymes such as Taq-polymerase and reverse transcriptase, DNase, RNase inhibitors, DEPC, in addition to each primer pair specific for the marker gene. -May include DEPC-water, sterilized water, etc. In addition, a primer pair specific to a gene used as a quantitative control may be included.

본 발명자들은 구체적인 실시예를 통해 당뇨병성 신증 진단용 바이오마커로써 상기 miR-642a, miR-1246, miR-1255b 및 miR-5010을 발굴 및 동정하였다. The present inventors discovered and identified miR-642a, miR-1246, miR-1255b and miR-5010 as biomarkers for diabetic nephropathy diagnosis through specific examples.

본 발명의 일실시예에서는, 정상군, 신장합병증이 없는 당뇨군 및 신장합병증이 있는 당뇨군에 해당하는 대상자들을 모집하고 이들의 혈청을 제공받아 혈청으로부터 엑소좀을 분리하여 엑소좀 내 miRNA의 발현수준을 비교분석하였다(실시예 1 참조).In one embodiment of the present invention, subjects corresponding to the normal group, the diabetic group without renal complications, and the diabetic group with renal complications are recruited and provided with their serum to separate exosomes from the serum to express miRNA in exosomes. The levels were compared and analyzed (see Example 1).

본 발명의 다른 실시예에서는, 각각 정상군 및 신장합병증이 없는 당뇨군, 정상군 및 신장합병증이 있는 당뇨군, 신장합병증이 없는 당뇨군 및 신장합병증이 있는 당뇨군에서 차이가 있는 microRNAs를 각각 분석하였으며, 상기 microRNAs 발현수준 결과를 이용하여 다차원척도법으로 분석한 결과 2차원 상에서 정상군과 당뇨군이 구분되는 패턴을 보이며 신장합병증 유무와 관련해서는 큰 차이는 나타나지 않는 것을 확인하였다. 또한, 상기 각 비교분석 결과에서 유의한 발현 증가를 보이는 microRNAs을 벤다이어그램으로 도시하여 비교하였는데, 구체적으로 정상군에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군에서 발현이 증가한 40개의 miRNAs에서, 정상군에 비해 신장합병증이 없는 당뇨군에서도 발현이 증가한 공통된 32개의 miRNAs를 제외한 8종을 선별하고, 나아가 상기 8종의 miRNAs 중에서 신장합병증이 없는 당뇨군에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군에서도 발현이 증가된 1종을 제외한 7종 가운데 가장 유의한 발현 차이를 보이는 4종의 miRNAs를 최종적으로 선별하였다. 상기에서 선별된 hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-1246, hsa-miR-1255b-5p 및 hsa-miR-5010-5p는 실제로 정상군과 신장합병증이 있는 당뇨군 간에 유의한 발현 차이를 나타내는 것을 확인하였다(실시예 2-1 내지 2-4).In another embodiment of the present invention, microRNAs with differences in the normal group and the diabetic group without renal complications, the diabetic group without renal complications, the diabetic group without renal complications, and the diabetic group with renal complications were analyzed, respectively. And, as a result of analyzing the microRNAs expression level result by a multidimensional scale method, it was confirmed that a pattern was distinguished between the normal group and the diabetic group in two dimensions, and there was no significant difference with respect to the presence or absence of renal complications. In addition, microRNAs showing a significant increase in expression in each of the comparative analysis results were shown and compared with a Venn diagram. Specifically, in 40 miRNAs whose expression was increased in the diabetic group with renal complications compared to the normal group, kidneys compared to the normal group In the non-complication diabetic group, 8 types except for the common 32 miRNAs with increased expression were selected, and furthermore, among the 8 miRNAs, one type with increased expression in the diabetic group with renal complication compared to the diabetic group without renal complication was selected. The 4 miRNAs showing the most significant difference in expression were finally selected among the 7 types excepted. The hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-1246, hsa-miR-1255b-5p and hsa-miR-5010-5p selected above actually showed a significant difference in expression between the normal group and the diabetic group with renal complications. It confirmed what was shown (Examples 2-1 to 2-4).

이에 본 발명의 다른 양태로서, 본 발명은 피검체 유래의 생물학적 시료에서 마이크로RNA-642a(miR-642a), 마이크로RNA-1246(miR-1246), 마이크로RNA-1255b(miR-1255b), 및 마이크로RNA-5010(miR-5010)으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 발현수준을 측정하는 단계를 포함하는, 당뇨병성 신증 진단을 위한 정보제공방법을 제공한다.Accordingly, as another aspect of the present invention, the present invention provides microRNA-642a (miR-642a), microRNA-1246 (miR-1246), microRNA-1255b (miR-1255b), and microRNA in a biological sample derived from a subject. It provides a method of providing information for diabetic nephropathy diagnosis comprising the step of measuring the expression level of at least one selected from the group consisting of RNA-5010 (miR-5010).

상기 피검체 유래의 생물학적 시료는 조직, 세포, 전혈, 혈액, 타액, 객담, 뇌척수액 또는 뇨 등을 포함할 수 있고, 보다 바람직하게는 혈액 또는 혈청 유래 엑소좀일 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.The biological sample derived from the subject may include tissue, cells, whole blood, blood, saliva, sputum, cerebrospinal fluid, urine, and the like, and more preferably, blood or serum-derived exosomes, but is not limited thereto.

본 발명에 있어서, 상기 방법에 따라 피검자 유래 시료에서 분리한 엑소좀 내 miR-642a, miR-1246, miR-1255b 및/또는 miR-5010의 발현수준이 정상인보다 높을 경우 당뇨병성 신증으로 판정할 수 있다. In the present invention, if the expression level of miR-642a, miR-1246, miR-1255b and/or miR-5010 in exosomes isolated from a sample derived from a subject according to the above method is higher than that of a normal person, it can be determined as diabetic nephropathy. have.

상기 microRNAs의 발현수준은 당업계에 알려진 통상적인 방법으로 중합효소연쇄반응(PCR), 역전사 중합효소연쇄반응(RT-PCR), 실시간 중합효소연쇄반응(Real-time PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection assay; RPA), 마이크로어레이(microarray), 또는 노던 블롯팅(northern blotting)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 방법을 통해 측정될 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. The expression level of the microRNAs is determined by conventional methods known in the art: polymerase chain reaction (PCR), reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), real-time polymerase chain reaction (Real-time PCR), and RNase protection assay (RNase). Protection assay; RPA), microarray (microarray), or may be measured by one or more methods selected from the group consisting of northern blotting (northern blotting), but is not limited thereto.

이하, 본 발명의 이해를 돕기 위하여 바람직한 실시예를 제시한다. 그러나 하기의 실시예는 본 발명을 보다 쉽게 이해하기 위하여 제공되는 것일 뿐, 하기 실시예에 의해 본 발명의 내용이 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, a preferred embodiment is presented to aid the understanding of the present invention. However, the following examples are provided for easier understanding of the present invention, and the contents of the present invention are not limited by the following examples.

[실시예][Example]

실시예 1. 실험준비 및 실험방법Example 1. Experiment preparation and experiment method

1-1. 분석 대상 모집1-1. Recruitment of targets for analysis

본 발명자들은 당뇨병으로 인한 신장합병증인 당뇨병성 신증을 조기에 진단할 수 있는 바이오마커를 발굴하기 위해, 각각 정상군(HV) 18명, 신장합병증이 없는 당뇨환자군(Nephro-X) 33명, 및 신장합병증이 있는 당뇨환자군(Nephro-O) 23명을 모집하였고, 이들로부터 혈청 샘플을 채취하여 그룹 간 차이를 나타내는 생체지표를 찾고자 하였다. 이를 위해, 상기 각 군의 대상자들로부터 혈청을 제공받았다.In order to discover biomarkers capable of early diagnosis of diabetic nephropathy, which is a kidney complication caused by diabetes, the present inventors have 18 normal groups (HV), 33 diabetic patients without kidney complications (Nephro-X), and 23 diabetic patients with nephropathy (Nephro-O) were recruited, and serum samples were collected from them to find biomarkers representing differences between groups. To this end, serum was provided from subjects in each group.

1-2. 혈청으로부터 RNA 분리 및 서열분석 수행1-2. RNA isolation and sequencing from serum

상기 실시예 1-1에서 각 군의 대상자들로부터 채취한 혈청 샘플에 대하여 Exoquick(SBI, USA)을 사용해 엑소좀(exosome)을 분리하였고, 상기 분리된 엑소좀으로부터 Qiagen miRNeasy kit을 이용하여 총 RNA를 추출하였으며, 추출된 총 RNA의 질은 Agilent RNA Bioanalyzer를 이용해 제조사의 지시에 따라 측정하였다. Exoquick (SBI, USA) was used to isolate exosomes for serum samples collected from subjects of each group in Example 1-1, and total RNA from the isolated exosomes using Qiagen miRNeasy kit Was extracted, and the quality of the extracted total RNA was measured according to the manufacturer's instructions using an Agilent RNA Bioanalyzer.

이후 상기 분리된 RNA를 이용하여 마크로젠사에서 Takara SMARTer smRNA for illumina kit을 사용하여 라이브러리를 제작한 후 Hiseq 2500으로 차세대 염기서열 분석(NGS)을 실시하여 microRNA를 검출하였다. Thereafter, using the isolated RNA, a library was prepared using the Takara SMARTer smRNA for illumina kit from Macrogen, and then next-generation sequencing (NGS) was performed with Hiseq 2500 to detect microRNA.

실시예 2. 당뇨병성 신증 진단용 microRNA 발굴Example 2. Discovery of microRNA for diabetic nephropathy diagnosis

2-1. 정상군 vs. 신장합병증이 없는 당뇨군의 발현수준에 차이가 있는 microRNA 분석2-1. Normal vs. Analysis of microRNAs with differences in expression levels in diabetic groups without kidney complications

먼저, 본 발명자들은 상기 정상군 18명과 신장합병증이 없는 당뇨군 33명의 혈액 유래 엑소좀에서 발현수준의 차이가 나는 microRNA(miRNA)를 동정하기 위하여, 상기 실시예 1-1 및 1-2의 방법에 따라 각 대상자들에서 채취한 혈청으로부터 엑소좀을 분리하고 추출된 총 RNA에 대한 NGS 분석을 실시하였다. 분석 결과 107개의 miRNAs가 검출되었으며, 나아가 상기 검출된 miRNAs의 발현수준을 비교하였다. First, in order to identify microRNAs (miRNAs) having a difference in expression level in the blood-derived exosomes of 18 normal groups and 33 diabetic groups without renal complications, the methods of Examples 1-1 and 1-2 According to the following, exosomes were isolated from serum collected from each subject, and NGS analysis was performed on the extracted total RNA. As a result of the analysis, 107 miRNAs were detected, and further, the expression levels of the detected miRNAs were compared.

그 결과, 도 1a에 나타낸 바와 같이 107개의 miRNAs 중에 정상군(HV)에 비해 신장합병증이 없는 당뇨군(Nephro-X)에서 2배 이상(p < 0.05) 발현이 감소하는 miRNA가 62개, 발현이 증가하는 miRNA가 45개로 나타났다. 또한, 상기 유의한 발현 변화를 보이는 miRNAs의 발현수준에 따른 산점도(scatter plot) 결과를 도 1b에 나타내었다. As a result, as shown in FIG. 1A, 62 miRNAs with reduced expression more than twice (p <0.05) in the diabetic group (Nephro-X) without renal complications (Nephro-X) among 107 miRNAs were expressed, compared to the normal group (HV). There were 45 of these increasing miRNAs. In addition, a scatter plot result according to the expression level of miRNAs showing the significant expression change is shown in FIG. 1B.

2-2. 정상군 vs. 신장합병증이 있는 당뇨군의 발현수준에 차이가 있는 microRNA 분석2-2. Normal vs. Analysis of microRNAs with differences in expression levels in diabetic groups with kidney complications

상기 결과에 더하여, 본 발명자들은 상기 정상군 18명과 신장합병증이 있는 당뇨군 23명의 혈액 유래 엑소좀에서 발현수준의 차이가 나는 miRNA를 동정하기 위하여, 상기와 동일한 방법으로 얻은 엑소좀 내 총 RNA에 대한 NGS 분석을 실시하였다. 분석 결과 95개의 miRNA가 검출되었으며, 나아가 상기 검출된 miRNAs의 발현수준을 비교하였다. In addition to the above results, in order to identify miRNAs having a difference in expression level in the blood-derived exosomes in the 18 normal group and 23 diabetic groups with kidney complications, NGS analysis was performed. As a result of the analysis, 95 miRNAs were detected, and further, the expression levels of the detected miRNAs were compared.

그 결과, 도 2a에 나타낸 바와 같이 95개의 miRNAs 중에 정상군(HV)에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군(Nephro-O)에서 2배 이상(p < 0.05) 발현이 감소하는 miRNA가 55개, 발현이 증가하는 miRNA가 40개로 나타났다. 또한, 상기 유의한 발현 변화를 보이는 miRNAs의 발현수준에 따른 산점도(scatter plot) 결과를 도 2b에 나타내었다. As a result, as shown in Fig. 2a, 55 miRNAs whose expression is reduced by more than two times (p <0.05) in the diabetic group (Nephro-O) with renal complications compared to the normal group (HV) among 95 miRNAs were expressed. There were 40 increasing miRNAs. In addition, a scatter plot result according to the expression level of miRNAs showing the significant expression change is shown in FIG. 2B.

2-3. 신장합병증이 없는 당뇨군 vs. 신장합병증이 있는 당뇨군의 발현수준에 차이가 있는 miRNA 분석2-3. Diabetic group without kidney complication vs. Analysis of miRNAs with differences in expression levels in diabetic groups with kidney complications

또한, 본 발명자들은 상기 신장합병증이 없는 당뇨군 33명과 신장합병증이 있는 당뇨군 23명의 혈액 유래 엑소좀에서 발현수준의 차이가 나는 miRNA를 동정하기 위하여, 상기와 동일한 방법으로 얻은 엑소좀 내 총 RNA에 대한 NGS 분석을 실시하였다. 분석 결과 12개의 miRNAs가 검출되었으며, 나아가 상기 검출된 miRNAs의 발현수준을 비교하였다. In addition, in order to identify miRNAs having a difference in expression level in the blood-derived exosomes of 33 diabetic groups without renal complications and 23 diabetic groups with renal complications, the present inventors have obtained total RNA in exosomes obtained by the same method as above. NGS analysis was carried out. As a result of the analysis, 12 miRNAs were detected, and further, the expression levels of the detected miRNAs were compared.

그 결과, 도 3a에 나타낸 바와 같이 12개의 miRNAs 중에 신장합병증이 없는 당뇨군(Nephro-X)에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군(Nephro-O)에서 2배 이상(p < 0.05) 발현이 감소하는 miRNA가 9개, 발현이 증가하는 miRNA가 3개로 나타났다. 또한, 상기 유의한 발현 변화를 보이는 miRNAs의 발현수준에 따른 산점도(scatter plot) 결과를 도 3b에 나타내었다. As a result, as shown in Fig. 3a, the expression of 12 miRNAs decreased by more than twice (p <0.05) in the diabetic group (Nephro-O) with renal complication compared to the diabetic group (Nephro-X) without renal complication. There were 9 miRNAs and 3 miRNAs with increasing expression. In addition, a scatter plot result according to the expression level of miRNAs showing the significant expression change is shown in FIG. 3B.

2-4. 정상군 vs. 신장합병증이 없는 당뇨군 vs. 신장합병증이 있는 당뇨군 간의 발현수준에 차이가 있는 miRNA 분석2-4. Normal vs. Diabetic group without kidney complication vs. Analysis of miRNAs with differences in expression levels between diabetic groups with kidney complications

나아가 정상군, 신장합병증이 없는 당뇨군 및 신장합병증이 있는 당뇨군에 대하여 다차원척도법(MDS)을 통해 개별 샘플에 대한 변화량을 도출하여 이를 시각화하여 분석하였다. 그 결과, 도 4에 나타낸 바와 같이 정상군과 당뇨군에서 각각 나타나는 2차원상의 공간적 위치가 두개의 그룹으로 확연하게 구분되어 나타났으나, 신장합병증 유무에 따른 차이는 크게 구분되어 나타나지 않았다. 그러나 신장합병증 유무에 따라 차이가 나는 miRNA를 발굴한다면 신장합병증을 진단할 수 있는 유용한 바이오마커로 이용할 수 있으므로, 본 발명자들은 상기 실시예 2-1 내지 2-3의 결과를 통해 얻은 분석 결과에 기초하여 신장합병증 진단용 miRNA 발굴을 위한 추가적인 비교분석을 실시하였다. Furthermore, for the normal group, the diabetic group without renal complications, and the diabetic group with renal complications, the amount of change for individual samples was derived through the multidimensional scale (MDS), and this was visualized and analyzed. As a result, as shown in FIG. 4, the two-dimensional spatial positions of the normal group and the diabetic group were clearly divided into two groups, but the difference according to the presence or absence of renal complications was not largely divided. However, if miRNAs that differ depending on the presence or absence of renal complications are discovered, they can be used as useful biomarkers for diagnosing renal complications, so the present inventors based on the analysis results obtained through the results of Examples 2-1 to 2-3. Thus, an additional comparative analysis was conducted to discover miRNA for diagnosing renal complications.

이를 위해, 상기 각 분석결과 발현이 유의하게 증가하는 것으로 확인된 miRNAs을 도 5의 벤다이어그램으로 나타내었다. 그 결과, 정상군(HV)에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군(Diabetes-Nephro-O)에서 발현이 유의하게 증가한 40개 miRNAs(C/A), 및 정상군에 비해 신장합병증이 없는 당뇨군(Diabetes-Nephro-X)에서 발현이 유의하게 증가한 45개 miRNAs(B/A)를 비교하여 공통적으로 존재하는 32개 miRNAs(C/A & B/A)를 제외함으로써 정상군에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군에서만 발현이 증가한 8개 miRNAs를 확보하였다. 이후 상기 실시예 2-3에서 신장합병증이 없는 당뇨군에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군에서 유의하게 발현이 증가한 3개 miRNAs(C/B) 결과를 상기 확보된 8개 miRNAs와 비교한 결과, 공통적으로 발현이 증가하는 1종의 miRNA를 확인하였다. 이에, 상기 8개 miRNAs에서 상기 공통된 1종의 miRNA를 제외한 7종을 확보하였으며, 이들 중 가장 유의한 발현수준 차이를 보이는 4종의 miRNAs를 최종적으로 선별하였다. 상기 선별된 4종의 miRNAs를 하기 표 1에 나타내었으며, 정상군에 비해 신장합병증이 있는 군에서 각각 2.51, 2.02, 2.08 및 2.54배의 유의한 차이를 나타내는 것을 확인하였다.To this end, miRNAs confirmed to be significantly increased in expression as a result of each analysis are shown in the Venn diagram of FIG. 5. As a result, 40 miRNAs (C/A) with significantly increased expression in the diabetic group (Diabetes-Nephro-O) with kidney complications compared to the normal group (HV), and the diabetic group without kidney complications ( Diabetes-Nephro-X) compared to the normal group by comparing 45 miRNAs (B/A) with significantly increased expression and excluding 32 miRNAs (C/A & B/A) that are common. Eight miRNAs with increased expression were obtained only in the diabetic group. Thereafter, the result of comparing the results of 3 miRNAs (C/B) with significantly increased expression in the diabetic group with renal complication compared to the diabetic group without renal complication in Example 2-3 was compared with the obtained 8 miRNAs, common One type of miRNA with increased expression was identified. Accordingly, 7 kinds of miRNAs except for the one common miRNA were obtained from the 8 miRNAs, and 4 kinds of miRNAs showing the most significant difference in expression level were finally selected. The selected four miRNAs are shown in Table 1 below, and it was confirmed that they showed significant differences of 2.51, 2.02, 2.08, and 2.54 times, respectively, in the group with renal complications compared to the normal group.

당뇨-신장합병증군/정상군 (C/A)Diabetes-renal complication/normal group (C/A)
fold changefold change
hsa-miR-642a-3phsa-miR-642a-3p 2.512.51 ** hsa-miR-1246hsa-miR-1246 2.022.02 **** hsa-miR-1255b-5phsa-miR-1255b-5p 2.082.08 **** hsa-miR-5010-5phsa-miR-5010-5p 2.542.54 ****

또한, 도 6에 나타낸 바와 같이 정상군(HV)과 신장합병증이 있는 당뇨군(Nephro-O) 간에 상기에서 발굴된 4종의 miRNAs 즉, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-1246, hsa-miR-1255b-5p 및 hsa-miR-5010-5p의 발현이 유의한 차이를 나타내는 것을 확인하였다. In addition, as shown in Figure 6, the four miRNAs discovered above between the normal group (HV) and the diabetic group (Nephro-O) with kidney complications, that is, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-1246, It was confirmed that the expression of hsa-miR-1255b-5p and hsa-miR-5010-5p showed a significant difference.

따라서 상기 결과들은 각각 정상인에 비해 신장합병증이 있는 당뇨군에서만 발현이 유의하게 증가한 4종의 miRNAs를 당뇨병성 신증을 특이적으로 진단할 수 있는 바이오마커로 유용하게 이용할 수 있음을 보여주는 것이다. Therefore, the above results show that 4 kinds of miRNAs, whose expression is significantly increased only in the diabetic group with renal complications compared to the normal person, can be usefully used as a biomarker capable of specifically diagnosing diabetic nephropathy.

상기 진술한 본 발명의 설명은 예시를 위한 것이며, 본 발명이 속하는 기술분야의 통상의 지식을 가진 자는 본 발명의 기술적 사상이나 필수적인 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 쉽게 변형이 가능하다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적이 아닌 것으로 이해해야만 한다. The above-described description of the present invention is for illustration purposes only, and those of ordinary skill in the art to which the present invention pertains can understand that it is possible to easily transform it into other specific forms without changing the technical spirit or essential features of the present invention. There will be. Therefore, it should be understood that the embodiments described above are illustrative in all respects and not limiting.

<110> Soonchunhyang University Industry Academy Cooperation Foundation <120> Biomarker microRNAs for diagnosing diabetic nephropathy and use thereof <130> PD18-145 <160> 4 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 22 <212> RNA <213> hsa-miR-642a-3p <400> 1 agacacauuu ggagagggaa cc 22 <210> 2 <211> 19 <212> RNA <213> hsa-miR-1246 <400> 2 aauggauuuu uggagcagg 19 <210> 3 <211> 22 <212> RNA <213> hsa-miR-1255b-5p <400> 3 cggaugagca aagaaagugg uu 22 <210> 4 <211> 22 <212> RNA <213> hsa-miR-5010-5p <400> 4 agggggaugg cagagcaaaa uu 22 <110> Soonchunhyang University Industry Academy Cooperation Foundation <120> Biomarker microRNAs for diagnosing diabetic nephropathy and use thereof <130> PD18-145 <160> 4 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 22 <212> RNA <213> hsa-miR-642a-3p <400> 1 agacacauuu ggagagggaa cc 22 <210> 2 <211> 19 <212> RNA <213> hsa-miR-1246 <400> 2 aauggauuuu uggagcagg 19 <210> 3 <211> 22 <212> RNA <213> hsa-miR-1255b-5p <400> 3 cggaugagca aagaaagugg uu 22 <210> 4 <211> 22 <212> RNA <213> hsa-miR-5010-5p <400> 4 agggggaugg cagagcaaaa uu 22

Claims (19)

마이크로RNA-1246(miR-1246)을 포함하는, 당뇨병성 신증 진단용 마커 조성물.
A marker composition for diabetic nephropathy diagnosis comprising microRNA-1246 (miR-1246).
제1항에 있어서,
상기 마커 조성물은 마이크로RNA-642a-3p(miR-642a-3p), 마이크로RNA-1255b-5p(miR-1255b-5p), 및 마이크로RNA-5010-5p(miR-5010-5p)로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상을 더 포함하는 것을 특징으로 하는, 마커 조성물.
The method of claim 1,
The marker composition is in the group consisting of microRNA-642a-3p (miR-642a-3p), microRNA-1255b-5p (miR-1255b-5p), and microRNA-5010-5p (miR-5010-5p). Characterized in that it further comprises one or more selected, the marker composition.
제1항에 있어서,
상기 miR-1246은 서열번호 2의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는, 마커 조성물.
The method of claim 1,
The miR-1246 is characterized in that consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, marker composition.
제2항에 있어서,
상기 miR-642a-3p, miR-1255b-5p, 및 miR-5010-5p는 각각 서열번호 1, 3 및 4의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는, 마커 조성물.
The method of claim 2,
The miR-642a-3p, miR-1255b-5p, and miR-5010-5p are characterized in that consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 1, 3 and 4, respectively, a marker composition.
마이크로RNA-1246(miR-1246)의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는, 당뇨병성 신증 진단용 조성물.
A composition for diabetic nephropathy diagnosis comprising an agent for measuring the expression level of microRNA-1246 (miR-1246).
제5항에 있어서,
상기 진단용 조성물은 마이크로RNA-642a-3p(miR-642a-3p), 마이크로RNA-1255b-5p(miR-1255b-5p), 및 마이크로RNA-5010-5p(miR-5010-5p)로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 발현수준을 측정하는 제제를 더 포함하는 것을 특징으로 하는, 당뇨병성 신증 진단용 조성물.
The method of claim 5,
The diagnostic composition is in the group consisting of microRNA-642a-3p (miR-642a-3p), microRNA-1255b-5p (miR-1255b-5p), and microRNA-5010-5p (miR-5010-5p). A composition for diagnosing diabetic nephropathy, characterized in that it further comprises an agent for measuring one or more selected expression levels.
제5항에 있어서,
상기 miR-1246은 서열번호 2의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는, 당뇨병성 신증 진단용 조성물.
The method of claim 5,
The miR-1246 is characterized in that consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, diabetic nephropathy diagnostic composition.
제6항에 있어서,
상기 miR-642a-3p, miR-1255b-5p, 및 miR-5010-5p는 각각 서열번호 1, 3 및 4의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는, 당뇨병성 신증 진단용 조성물.
The method of claim 6,
The miR-642a-3p, miR-1255b-5p, and miR-5010-5p are each composed of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, 3 and 4, diabetic nephropathy diagnostic composition.
제5항에 있어서,
상기 발현수준을 측정하는 제제는 상기 microRNA에 상보적으로 결합하는 센스 및 안티센스 프라이머, 또는 프로브인 것을 특징으로 하는, 당뇨병성 신증 진단용 조성물.
The method of claim 5,
The agent for measuring the expression level is a sense and antisense primer, or a probe that complementarily binds to the microRNA, a composition for diabetic nephropathy diagnosis.
제5항 내지 제9항 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는, 당뇨병성 신증 진단용 키트.
A kit for diabetic nephropathy diagnosis comprising the composition of any one of claims 5 to 9.
피검체 유래의 혈액 또는 혈청 유래 엑소좀(exosome)에서 마이크로RNA-1246(miR-1246)의 발현수준을 측정하는 단계를 포함하는, 당뇨병성 신증 진단을 위한 정보제공방법.
A method for providing information for diabetic nephropathy, comprising measuring the expression level of microRNA-1246 (miR-1246) in blood or serum-derived exosomes derived from a subject.
제11항에 있어서,
상기 정보제공방법은 마이크로RNA-642a-3p(miR-642a-3p), 마이크로RNA-1255b-5p(miR-1255b-5p), 및 마이크로RNA-5010-5p(miR-5010-5p)로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 발현수준을 측정하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.
The method of claim 11,
The information providing method is a group consisting of microRNA-642a-3p (miR-642a-3p), microRNA-1255b-5p (miR-1255b-5p), and microRNA-5010-5p (miR-5010-5p). The method of providing information, characterized in that it further comprises the step of measuring one or more expression levels selected from.
제11항에 있어서,
상기 miR-1246은 서열번호 2의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.
The method of claim 11,
The miR-1246 is characterized in that consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, information providing method.
제12항에 있어서,
상기 miR-642a-3p, miR-1255b-5p, 및 miR-5010-5p는 각각 서열번호 1, 3 및 4의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.
The method of claim 12,
The miR-642a-3p, miR-1255b-5p, and miR-5010-5p are characterized in that consisting of nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 1, 3 and 4, respectively.
제11항에 있어서,
상기 발현수준은 차세대 염기서열 분석(Next generation sequencing; NGS), 중합효소연쇄반응(PCR), 역전사 중합효소연쇄반응(RT-PCR), 실시간 중합효소연쇄반응(Real-time PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection assay; RPA), 마이크로어레이(microarray), 및 노던 블롯팅(northern blotting)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 방법을 통해 측정되는 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.
The method of claim 11,
The expression level is next generation sequencing (NGS), polymerase chain reaction (PCR), reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), real-time polymerase chain reaction (Real-time PCR), and RNase protection assay. (RNase protection assay; RPA), microarray (microarray), and characterized in that measured by one or more methods selected from the group consisting of northern blotting (northern blotting), information providing method.
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