KR101992060B1 - 알츠하이머치매 진단 체액 바이오마커 후보 단백4종 - Google Patents

알츠하이머치매 진단 체액 바이오마커 후보 단백4종 Download PDF

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Abstract

본 발명은 OPCML(오피오이드-결합 단백질/세포 부착 분자), YWHAB(14-3-3 단백질 β/α), CHGA(크로모그라닌-A) CHGB(시크리토그라닌-1)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 수준을 측정하는 제제를 포함하는 알츠하이머성 치매의 진단용 조성물; 상기 조성물을 포함하는 알츠하이머성 치매 진단용 키트; 및 상기 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 수준을 측정하고, 상기 측정된 수준을 정상 개체로부터 분리된 시료에서 측정된 수준과 비교하는 단계를 포함하는, 알츠하이머성 치매 진단을 위한 정보를 제공하는 방법에 관한 것이다.
본 발명의 알츠하이머성 치매 진단용 조성물은 5종의 단백질(OPCML, YWHAB, CHGA, CHGBVGF)의 발현양을 측정하여, 정상 대조군과 비교함으로써, 높은 민감도 및 특이도로 알츠하이머성 치매의 진단이 가능하다.

Description

알츠하이머치매 진단 체액 바이오마커 후보 단백4종 {Alzheimer’s disease diagnostic fluid biomarker including the combination of four proteins}
본 발명은 OPCML(오피오이드-결합 단백질/세포 부착 분자), YWHAB(14-3-3 단백질 β/α), CHGA(크로모그라닌-A) CHGB(시크리토그라닌-1)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 수준을 측정하는 제제를 포함하는 알츠하이머성 치매의 진단용 조성물; 상기 조성물을 포함하는 알츠하이머성 치매 진단용 키트; 및 상기 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 수준을 측정하고, 상기 측정된 수준을 정상 개체로부터 분리된 시료에서 측정된 수준과 비교하는 단계를 포함하는, 알츠하이머성 치매 진단을 위한 정보를 제공하는 방법에 관한 것이다.
전세계적으로 초고령화 현상으로 인한 치매 환자의 증가는 현재 심각한 사회문제로 대두되고 있다. 2014년 국회예산정책저에 따르면 65세 이상의 치매 유병률은 2020년에 84만명, 2050년에 217만명으로 늘어날 것으로 예상되며, 이에 따라 치매로 인한 사회적 비용의 규모 역시 2013년 11조7000억원에서, 2030년 23조 1000억원, 2040년 34조 2000억원, 2050년 43조 2000억원으로 급격히 늘어날 것으로 예상된다고 한다.
현재, 알츠하이머성 치매 진단을 위해서 사용되고 있는 진단 방법에는 유전자 검사, 신경심리검사 및 인지기능 검사, 뇌척수액 검사, 뇌영상 검사(MRI, PET)가 있다. 유전자 검사는 ApoE4라는 알츠하이머성 치매 특이적 유전자에 대한 검사를 통해 알츠하이머성 치매 위험성을 감지하는 검사이다. 그러나, ApoE4라는 유전자는 치매 발명의 위험률을 높일 수는 있으나, 결정적인 인자가 아니기 때문에, 해당 검사만으로는 알츠하이머성 치매 진단이 어렵다. 또한, 신경심리검사 및 인지기능 검사는 설문지를 통해 환자의 인지장애 정도를 측정하는 방법으로, 간이 정신상태검사(MMSE), 몬트리올 인지검사(MoCA), SNSB 등이 있다. 이는 설문지 형태의 진단 방법으로서, 비용이 적게 들고 진단시 물리적 고통이 없다는 장점이 있으나, 반복된 검사로 인해 학습, 나이 및 학력 차이 등에 의한 결과 변화, 주관성 개입 등으로 인해 정확성에 문제가 생길 수 있으며, 결정적으로 해당 인지장애가 알츠하이머성 치매의 주요 인자인 베타-아밀로이드에 의한 인지장애인지, 다른 종류의 질환에 의한 것인지 확인할 수 없다는 문제가 있다. 또한, 뇌척수액을 통한 검사는 뇌척수액을 추출하여 알츠하이머 유발인자로 알려진 베타-아밀로이드 또는 타우 단백질을 정량 진단하는 방법으로서, 진단의 정확성은 높으나, 뇌척수액을 얻기 위한 척주 천자 방법은 환자에게 큰 고통을 줄 수 있어 거부감을 일으킬 수 있다. 또한, 시술에 있어서 전문성이 높지 않은 일반 병원에서는 이용하기 힘들며, 비용적인 한계도 존재한다. 뇌영상 검사(MRI, PET)는 MRI 또는 PET 영상촬영을 통해 뇌손상 정도 및 알츠하이머 유발인자인 베타-아밀로이드와 타우 단백질을 뇌에서 분석하는 방법이다. 진단에 대한 높은 정확성을 가지고 있으나, 알츠하이머성 치매 진단시 고가의 장비와 영상촬영에 대한 전문성을 요구하므로, 유통의 한계가 있고, 높은 진단 비용을 요구한다는 문제가 있다. 이와 같이, 현재 알츠하이머성 치매 진단을 위한 다양한 기술이 존재하나, 각각의 기술은 정확성 문제, 비용적 문제, 시간적 문제 및 육체적 고통의 수반 등 다양한 한계점이 존재한다.
이러한 배경 하에, 본 발명자들은 5종의 단백질의 발현양이 정상 대조군과비교하여 알츠하이성 치매 환자에서 유의적인 발현량 차이가 나타남을 확인하였다. 5종의 단백질, 보다 구체적으로 3종의 단백질(YWHAB(14-3-3 단백질 β/α), CHGA(크로모그라닌-A) CHGB(시크리토그라닌-1)) 수준의 동시 비교를 통해 알츠하이머성 치매의 진단 또는 예후 예측과 관련된 정보를 보다 정확히 획득할 수 있음을 확인하여 본 발명을 완성하였다.
본 발명의 하나의 목적은 OPCML(오피오이드-결합 단백질/세포 부착 분자), YWHAB(14-3-3 단백질 β/α), CHGA(크로모그라닌-A) CHGB(시크리토그라닌-1)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 수준을 측정하는 제제를 포함하는 알츠하이머성 치매의 진단용 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 하나의 목적은 상기 조성물을 포함하는 알츠하이머성 치매 진단용 키트를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 하나의 목적은 (a) 알츠하이머성 치매의 발병이 의심되는 개체로부터 분리된 시료에서, OPCML, YWHAB, CHGA CHGB로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 상기 측정된 수준을 정상 개체로부터 분리된 시료에서 측정된 수준과 비교하는 단계를 포함하는 알츠하이머성 치매의 진단을 위한 정보를 제공하는 방법을 제공하는 것이다.
본 발명에서 개시된 각각의 설명 및 실시형태는 각각의 다른 설명 및 실시 형태에도 적용될 수 있다. 즉, 본 발명에서 개시된 다양한 요소들의 모든 조합이 본 발명의 범주에 속한다. 또한, 하기 기술된 구체적인 서술에 의하여 본 발명의 범주가 제한된다고 볼 수 없다.
상기 목적을 달성하기 위한 하나의 양태로서, 본 발명은 OPCML(오피오이드-결합 단백질/세포 부착 분자), YWHAB(14-3-3 단백질 β/α), CHGA(크로모그라닌-A) CHGB(시크리토그라닌-1)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 수준을 측정하는 제제를 포함하는 알츠하이머성 치매의 진단용 조성물을 제공한다.
상기 조성물은 상기 4종의 유전자 중 1종의 유전자 또는 2종, 3종 또는 4종의 유전자 조합을 포함할 수 있다. 구체적으로, YWHAB, CHGA CHGB을 포함하는 3종의 유전자 조합을 포함할 수 있다. 보다 구체적으로, 상기 유전자 조합에 OPCML 또는 VGF 유전자를 추가로 포함하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 조성물은 상기 유전자는 알츠하이머성 치매 환자에서 정상 개체와 비교하여 상기 유전자의 유의적인 발현 차이가 나타남을 이용하여 알츠하이머성 치매의 진단 또는 예후 예측을 위한 유용한 정보를 획득할 수 있는 것이다. 이는 지금까지 알려진 바 없으며, 본 발명에 의해 최초로 밝혀진 것으로, 높은 민감도 및 특이도로 알츠하이머성 치매의 진단 또는 예후 예측이 가능한 점에서 그 의의가 크다.
본 발명의 용어, "OPCML"은 오피오이드-결합 단백질/세포 부착 분자(Opioid-binding protein/cell adhesion molecule)를 코딩하는 유전자로서, 이의 mRNA는 서열번호 1의 염기서열로 구성된 것일 수 있다. 오피오이드-결합 단백질/세포 부착 분자는 종의 진화 동안 매우 잘 보존되므로, 포유류 시스템에서 근본적인 역할을 할 것으로 알려져 있다.
본 발명의 용어, "YWHAB"는 모든 진핵 세포에서 발현되는 보존 조절 분자(conserved regulatory molecules)에 속하는 단백질인 14-3-3 단백질 베타/알파(14-3-3 proteins β/α)를 코딩하는 유전자로서, 이의 mRNA는 서열번호 2의 염기서열로 구성된 것일 수 있다. 14-3-3 단백질은 키나아제, 포스파타아제, 막관통 수용체를 포함하여, 다양한 신호 단백질과 결합할 수 있으며, 200개 이상의 신호 단백질이 14-3-3 리간드로 알려져 있다. 또한, 크로이츠펠트-야콥병(Creutzfeldt-Jakob disease) 환자의 뇌 척수액에서 14-3-3 단백질의 양이 증가하는 것으로 발견된 바 있다.
본 발명의 용어, "CHGA"는 신경내분비성 단백질의 그라닌(granin) 군에 속하는 단백질인, 부갑상샘 분비 단백질 1(parathyroid secretory protein 1)로도 불리는, 크로모그라닌 A(Chromogranin A)를 코딩하는 유전자로서, 이의 mRNA는 서열번호 3의 염기서열로 구성된 것일 수 있다. 크로모그라닌 A는 이자의 섬형 베타 세포 분비 과립(islet beta cell secretory granules)과 같은 뉴런 및 내분비 세포의 분비 소포에 위치해 있다. 또한, 크로모그라닌 A는 췌장암 및 전립선 암의 지표로 사용될 수 있을 것으로 보고된 바 있다.
본 발명의 용어, "CHGB"는 신경내분비성 단백질의 그라닌 군에 속하는 단백질인, 시크리토그라닌 I(Secretogranin I)로도 불리는, 크로모그라닌 B(Chromogranin B)를 코딩하는 유전자로서, 이의 mRNA는 서열번호 4의 염기서열로 구성된 것일 수 있다. 크로모그라닌 B는 신경내분비계 종양의 예후 바이오마커로 이용될 수 있을 것으로 보고된 바 있다.
본 발명의 용어, "VGF"는 신경분비 단백질 VGF(Neurosecretory protein VGF)를 코딩하는 유전자로서, 이의 mRNA는 서열번호 5의 염기서열로 구성된 것일 수 있다. 신경분비 단백질 VGF는 에너지 항상성, 대사 및 시냅스 가소성(synaptic plasticity)을 조절하는데 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있다.
본 발명의 상기 5종의 유전자들의 mRNA는 각 서열번호 1 내지 5로 구성된 염기서열뿐만 아니라, 상기 서열과 80% 이상, 구체적으로는 90% 이상, 보다 구체적으로는 95% 이상, 더욱 구체적으로는 98% 이상, 가장 구체적으로는 99% 이상의 상동성을 나타내는 염기 서열로서 실질적으로 상기 각 유전자와 동일하거나 상응하는 효능을 나타내는 유전자 서열이라면 제한없이 포함한다. 또한 이러한 상동성을 갖는 염기서열이라면, 일부 서열이 결실, 변형, 치환 또는 부가된 염기서열도 본 발명의 범위 내에 포함됨은 자명하다.
본 발명에서 용어, "상동성"은 두 개의 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩타이드 모이티 사이의 동일성의 퍼센트를 말한다. 하나의 모이티로부터 다른 하나의 모이티까지의 서열 간 상동성은 알려진 당해 기술에 의해 결정될 수 있다. 예를 들면, 상동성은 서열정보를 정렬하고 용이하게 입수 가능한 컴퓨터 프로그램을 이용하여 두 개의 폴리뉴클레오티드 분자 또는 두 개의 폴리펩티드 분자 간의 서열 정보를 직접 정렬하여 결정될 수 있다. 상기 컴퓨터 프로그램은 BLAST(NCBI), CLC Main Workbench(CLC bio), MegAlignTM(DNASTAR Inc) 등일 수 있으나, 상동성을 결정할 수 있는 프로그램이라면 제한 없이 이용할 수 있다. 또한, 폴리뉴클레오티드 간 상동성은 상동 영역 간의 안정된 이중가닥을 이루는 조건하에서 폴리뉴클레오티드를 혼성화한 후, 단일-가닥-특이적 뉴클레아제로 분해시켜 분해된 단편의 크기를 결정함으로써 결정할 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 5종의 유전자와 관련하여, 본 발명의 일 실시예에서는, 정상 개체와 알츠하이머성 치매 환자에서 유의적으로 발현량 차이가 나타나는 5종의 단백질(VGF, YWHAB, CHGA, CHGB OPCML)을 동정하였고, 이들 중에서도 3종의 단백질(YWHAB, CHGA CHGB)을 동시 측정하는 경우 높은 민감도 및 특이도로 알츠하이머성 치매의 진단이 가능함을 확인하였다. 이를 통해, 상기 3종 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 수준을 측정하여, 알츠하이머성 치매의 진단에 효과적으로 활용될 수 있음을 확인하였다(도 2).
본 발명의 용어, "mRNA의 수준을 측정하는 제제"는 시료에 포함된 본 발명의 5종의 유전자의 발현 여부를 확인하기 위하여, 상기 유전자로부터 전사된 mRNA의 수준을 측정하는 방법에 사용되는 제제를 의미한다. 구체적으로 상기 제제는 RT-PCR, 정량 실시간 PCR(quantified real time PCR), 경쟁적 RT-PCR(Competitive RT-PCR), 실시간 RT-PCR(real time quantitative RT-PCR), RNase 보호 분석법(RPA; RNase protection assay), 노던 블럿팅(Northern blotting), DNA 칩 분석법 등의 방법에 사용되는 표적 유전자에 특이적으로 결합할 수 있는 프라이머 또는 프로브를 포함할 수 있으나, 특별히 이에 제한되지는 않는다.
상기 "프라이머"는 짧은 자유 3말단 수화기(free 3' hydroxyl group)를 가지는 핵산 서열로 상보적인 템플레이트(template)와 염기쌍(base pair)을 형성할 수 있고 템플레이트 가닥 복사를 위한 시작 지점으로 기능을 하는 짧은 핵산 서열을 의미한다. 프라이머는 적절한 완충용액 및 온도에서 중합반응(즉, DNA 폴리머레이즈 또는 역전사효소)을 위한 시약 및 상이한 4가지 뉴클레오사이드 트리포스페이트의 존재하에서 DNA 합성이 개시될 수 있다.
구체적으로, 상기 5종의 유전자의 mRNA 발현 수준을 측정하기 위한 방법에 사용되는 각각의 프라이머 서열은 하기 표 1에 나타내었다.
유전자 서열번호 염기서열
OPCML 6 F: CCTAGGTCCTCTGAGCAACG
7 R: GGTCAAGGTAGCAGGAGCAG
YWHAB 8 F: GGAAGGAAGAGGTCATCTCGC
9 R: TGCTTCTCTATCCACAGCCG
CHGA 10 F: CCTGTGAACAGCCCTATG
11 R: GGAAAGTGTGTCGGAGAT
CHGB 12 F: CAACTGGACCAGCTCCTTCAC
13 R: GCACAGTCATTGTCATAAGCATGT 
VGF 14 F: CCTCTTGGTCATGAAAGC
15 R: GGCTCTTTATGCTCAGAG
한편, 상기 "프로브"는 상기 유전자와 상보적으로 결합할 수 있는 프로브가 될 수 있고, 상기 각 유전자와 상보적으로 결합할 수 있는 한, 상기 프로브의 뉴클레오티드 서열은 제한되지 않는다.
본 발명의 용어, "단백질의 수준을 측정하는 제제"는 시료에 포함된 본 발명의 5종의 유전자에 의해 코딩되는 단백질의 발현 수준을 측정하는 방법에 사용되는 제제를 의미한다. 구체적으로, 상기 단백질의 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적인 항체, 또는 앱타머를 포함할 수 있다. 구체적으로 상기 제제는 웨스턴 블럿(western blotting), ELISA(enzyme linked immunosorbent assay), 방사선면역분석(RIA: Radioimmunoassay), 방사 면역 확산법(radioimmunodiffusion), 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케트 면역전기영동(rocket immunoelectrophoresis), 면역조직화학염색법(immunohistochemical staining), 면역침전 분석법(Immunoprecipitation Assay), 보체 고정 분석법(Complement Fixation Assay), 면역형광법(immunofluorescence), 면역크로마토그래피법(immunochromatography), FACS(fluorescenceactivated cell sorter analysis) 및 단백질 칩 분석법(protein chip technology assay) 등의 방법에 사용되는 항체를 포함할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
상기 "항체"는 단백질 또는 펩티드 분자의 항원성 부위에 특이적으로 결합할 수 있는 단백질성 분자를 의미한다. 이러한 항체는, 각 유전자를 통상적인 방법에 따라 발현벡터에 클로닝하여 상기 마커 유전자에 의해 코딩되는 단백질을 얻고, 얻어진 단백질로부터 통상적인 방법에 의해 제조될 수 있다. 상기 항체의 형태는 특별히 제한되지 않으며 폴리클로날 항체, 모노클로날 항체 또는 항원 결합성을 갖는 것이면 그것의 일부도 본 발명의 항체에 포함되고 모든 면역 글로불린 항체가 포함 될 수 있다. 뿐만 아니라, 인간화 항체 등의 특수 항체를 포함할 수도 있다. 아울러, 상기 항체는 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2개의 전체 길이의 중쇄를 가지는 완전한 형태뿐만 아니라 항체 분자의 기능적인 단편을 포함한다. 항체 분자의 기능적인 단편이란 적어도 항원 결합 기능을 보유하고 있는 단편을 의미하며 Fab, F(ab'), F(ab') 2 및 Fv 등이 될 수 있다.
상기 "앱타머"는 단일 가닥 올리고 뉴클레오티드를 의미하는 것으로, 소정의 표적 분자에 대한 결합 활성을 갖는 핵산 분자를 말한다. 상기 앱타머는 그 염기 서열에 따라 다양한 3차원 구조를 가질 수 있으며, 항원-항체 반응과 같이 특정 물질에 대하여 높은 친화력을 가질 수 있다. 앱타머는 소정의 표적 분자에 결합함으로써 소정의 표적 분자의 활성을 저해할 수 있다.
본 발명의 앱타머는 RNA, DNA, 변형된(modified) 핵산 또는 이들의 혼합물일 수 있으며, 그 형태가 직쇄상 또는 환상(環狀)일 수 있으나 이들에 한정되지 아니한다. 본 발명의 앱타머는 상기 5종의 유전자에 의해 코딩되는 단백질에 대하여 사용될 수 있다. 상기 단백질에 결합 활성을 갖는 앱타머는 각각의 염기 서열을 참조하여 당해 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자가 공지의 방법에 따라 쉽게 제작할 수 있다.
본 발명의 용어 “알츠하이머성 치매”는 알츠하이머 질환에 의하여 유발된 치매 증상을 의미한다. 상기 알츠하이머성 질환은 독일의 알츠하이머 박사에 의하 여 최초로 보고된, 치매를 유발하는 가장 일반적인 퇴행성 뇌질환을 의미하는데, 상기 알츠하이머 질환이 진행됨에 따라 기억력을 포함하는 전체적인 인지기능이 점진적으로 약화된다고 알려져 있다.
본 발명의 용어, "진단"은 특정 질병 또는 질환에 대한 개체의 감수성(susceptibility)을 판정하는 것, 개체가 특정 질병 또는 질환을 현재 가지고 있는지 여부를 판정하는 것 또는 치료 효능에 대한 정보를 제공하기 위해 개체의 상태를 모니터링 하는 것을 포함한다. 본 발명의 목적상, 진단은 알츠하이머성 치매의 발병 여부 또는 알츠하이머성 치매의 발병 단계를 확인하는 것이다.
본 발명의 다른 양태로서 상기 조성물을 포함하는 알츠하이머성 치매 진단용 키트을 제공한다. 상기 용어 "알츠하이머성 치매", "진단" 등에 대한 설명은 전술한 바와 같다.
본 발명의 키트는 알츠하이머성 치매의 진단하기 위하여, 상기 OPCML, YWHAB, CHGA, CHGBVGF 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 발현 수준을 측정하기 위한 용도로 사용될 수 있다.
본 발명의 키트는 RT-PCR(Reverse transcription polymerase chain reaction) 키트, DNA 칩 키트, ELISA(Enzymelinked immunosorbent assay) 키트, 단백질 칩 키트, 래피드(rapid) 키트 또는 MRM(Multiple reaction monitoring) 키트인 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
구체적으로, 본 발명의 상기 유전자의 mRNA 발현 수준을 측정하기 위한 키트는 RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있다. RT-PCR 키트는, 상기 유전자에 대한 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액(pH 및 마그네슘 농도는 다양), 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs), Taq-폴리머라아제 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNAse 억제제, DEPC-수(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한, 정량 대조구로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 쌍을 포함할 수 있다.
또한, 본 발명의 키트는 DNA 칩 분석법을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함할 수 있다. DNA 칩 분석용 키트는, 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA가 프로브로 부착되어 있는 기판, 및 형광표식 프로브를 제작하기 위한 시약, 제제, 효소 등을 포함할 수 있다. 또한, 기판은 정량 대조구 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA를 포함할 수 있다.
아울러, 본 발명의 키트는 상기 유전자로부터 코딩되는 단백질의 수준을 측정하기 위한 단백질 칩 분석용 키트가 될 수 있는데, 상기 키트는 특별히 이에 제한되지 않으나, 항체의 면역학적 검출을 위하여 기재, 적당한 완충 용액, 발색 효소 또는 형광물질로 표지된 2차 항체, 발색 기질 등을 포함할 수 있다. 상기 기재는 특별히 이에 제한되지 않으나 니트로셀룰로오스 막, 폴리비닐 수지로 합성된 96 웰 플레이트, 폴리스티렌 수지로 합성된 96 웰 플레이트 및 유리로 된 슬라이드글라스 등이 이용될 수 있고, 발색효소는 특별히 이에 제한되지 않으나 퍼옥시다아제(peroxidase), 알칼라인 포스파타아제(Alkaline Phosphatase)가 사용될 수 있으며, 형광물질은 특별히 이에 제한되지 않으나 FITC, RITC 등이 될 수 있고, 발색 기질액은 특별히 이에 제한되지 않으나 ABTS(2,2'-아지노-비스(3-에틸벤조티아졸린-6-설폰산)) 또는 OPD(o-페닐렌디아민), TMB(테트라메틸 벤지딘)가 될 수 있다.
본 발명의 또 다른 하나의 양태로서 (a) 알츠하이머성 치매의 발병이 의심되는 개체로부터 분리된 시료에서, OPCML, YWHAB, CHGA CHGB로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 상기 측정된 수준을 정상 개체로부터 분리된 시료에서 측정된 수준과 비교하는 단계를 포함하는 알츠하이머성 치매의 진단을 위한 정보를 제공하는 방법을 제공한다. 상기 용어 "알츠하이머성 치매", "진단" 등에 대한 설명은 전술한 바와 같다.
본 발명의 용어, "개체"는 알츠하이머성 치매을 진단하거나 알츠하이머성치매의 예후를 예측하고자 하는 대상을 의미한다. 이때, 상기 개체는 사람을 비롯하여, 개, 말, 소, 쥐, 염소, 토끼, 닭, 오리, 거위 등의 알츠하이머성 치매가 발병될 수 있는 동물이라면 제한 없이 포함될 수 있다.
본 발명의 용어, "시료"란 이에 제한되는 것은 아니나, 알츠하이머성 치매 발병이 의심되는 개체로부터 분리된 조직, 세포, 전혈, 혈청, 혈장 외에도, 타액, 객담, 뇌척수액 또는 뇨와 같은 시료 등을 포함하며, 구체적으로는, 뇌척수액을 의미할 수 있다.
본 발명의 용어, "정상 개체"란 알츠하이머성 치매로 진단되지 않은 개체를 의미하며, 정상 개체로부터 분리된 시료와 알츠하이머성 치매의 진단 또는 예후를 예측하고자 하는 개체로부터 분리된 시료에서 상기 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 발현 수준을 측정하고, 비교함으로써, 알츠하이머성 치매 발병이 의심되는 개체의 알츠하이머성 치매 발병 여부 또는 알츠하이머성 치매의 예후를 정확하게 예측할 수 있다.
본 발명에 있어서, 용어, "mRNA 발현수준 측정"이란 알츠하이머성 치매의 진단 또는 예후를 예측하기 위하여 생물학적 시료에서 마커 유전자의 mRNA 존재 여부와 발현 정도를 확인하는 과정으로 mRNA의 양을 측정함으로써 알 수 있다. 이를 위한 분석 방법으로는 역전사효소 중합효소반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사효소 중합효소반응(competitive RT-PCR), 실시간 역전사효소 중합효소반응(real time quantitative RT-PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection method), 노던 블랏팅(Northern blotting), DNA칩 분석법(DNA chip technology assay) 등이 있다.
본 발명에 있어서, 용어, "단백질 발현수준 측정"이란 알츠하이머성 치매의 진단 또는 예후를 예측하기 위하여 생물학적 시료에서의 본 발명의 5종의 유전자에 의해 코딩된 단백질의 존재 여부와 발현 정도를 확인하는 과정으로, 상기 유전자에 의해 코딩된 단백질에 대하여 특이적으로 결합하는 항체를 이용하여 단백질의 양을 확인할 수 있다. 이를 위한 분석 방법으로는 웨스턴 블랏(western blotting), ELISA(enzyme linked immunosorbent assay), 방사선면역분석(RIA: radioimmunoassay), 방사 면역 확산법(radial immunodiffusion), 오우크테로니 면역 확산법(Ouchterlony immunodiffusion), 로케트 면역전기영동(rocket immunoelectrophoresis), 면역조직화학염색법(immunohistochemical staining), 면역침전분석법(immunoprecipitation assay), 보체 고정 분석법(complement Fixation Assay), 면역형광법(immunofluorescence), 면역크로마토그래피법(immunochromatography), FACS 분석법(fluorescenceactivated cell sorter analysis) 및 단백질 칩 분석법(protein chip technology assay) 등이 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 알츠하이머성 치매의 진단을 위한 정보를 제공하는 방법은, 알츠하이머성 치매 발병이 의심되는 개체로부터 분리된 시료에서 측정된 상기 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 수준을 측정한 결과, 정상 개체로부터 분리된 시료에서 측정되는 수준 보다 유의적으로 높거나 낮은 경우, 알츠하이머성 치매의 발병 위험이 높거나, 그 예후가 나쁘다고 판정될 수 있다.
본 발명의 알츠하이머성 치매 진단용 조성물은 5종의 단백질(OPCML, YWHAB, CHGA, CHGBVGF)의 발현양을 측정하여, 정상 대조군과 비교함으로써, 높은 민감도 및 특이도로 알츠하이머성 치매의 진단이 가능하다.
도 1은 3종의 단백질(YWHAB, CHGA 및 CHGB)의 동시 측정을 통한 알츠하이머성 치매의 진단 가능성을 설명할 수 있는, 회귀방정식을 도출하는 과정을 나타낸다.
도 2는 상기 회귀방정식 값(Equation, 빨강)을 통해, 개별적인 단백질 및 3종의 단백질 조합의 알츠하이머성 치매의 진단 유용성을 분석한 결과를 나타낸다. 3종의 단백질 조합으로 구해지는 회귀방정식 값을 통해, 진단 유용성이 높아짐을 ROC 커브 분석에서 확인할 수 있다.
이하, 본 발명을 하기 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예만으로 한정되는 것은 아니다.
<실시예 1> 실험 재료의 준비 및 분석 방법
실시예 1-1: 대상 검체 및 이의 특징
알츠하이머성 치매 환자(AD) 및 정상인(Control)으로부터 수득된 뇌척수액의 정확한 단백체 분석을 수행하기 위해 각 조건에 맞게 채취하였다(Park SA 등, J Clin Neurol 2015). 이들 검체는 단백체 분석 전까지 -80℃ 초저온 냉동고에 보관하하였다. 이후, 드라이아이스가 포함된 용기에 넣어 단백체 분석 전문 업체로 이동시시키고, 해동 후 분석에 활용하였다. 검체 제공자의 임상적 특징은 하기 표 2에 나타내었다(값은 평균 ± 표준편차로 표시함, p-값은 변수의 특성에 따라 독립표본 t-검증 또는 카이-제곱 검정(Chi-squared test)을 통해 결정됨, 약어에 대한 설명: AD, 알츠하이머성 치매; AOPE, 아포지단백 E; CDR-SOB, 임상 치매 등급 평가 합계(clinical dementia rating scale sum of box); CSF, 뇌척수액; MMSE, 간이 정신상태 검사(mini-mental state examination)).
Figure 112018107532326-pat00001
알츠하이머성 치매의 진단은 임상적 증상뿐만 아니라, 뇌척수액 내의 베타-아밀로이드 단백질 1-42, 총 타우 단백질, 인산화 타우 단백질의 농도를 측정하여, 알츠하이머성 치매로 진단되는 경우를 알츠하이머성 치매 환자로 분류하여, 매우 정확한 진단 방법에 근거하였다. 즉, 상기와 같은 알츠하이머성 치매 진단에 이용된 방법은 2018년도 NIA-AA 연구 구조(research framework)에 따른 알츠하이머병 진단의 AT(N) 바이오마커 모두를 충족하는 조건이다(Jack Jr CR, 등 Alzheimer's & Dementia 2018).
실시예 1-2: 단백체 분석 방법
정상인 및 알츠하이머성 치매 환자군에서 뇌척수액을 수집하여, 이들을 비-편향(non-biased) 비-표지(label-free) 단백체 분석을 시행하였다. 단백체 분석 방법 중에서도, 정량의 정확도 및 민감도가 높고, '비표적 단백체 분석'이 가능한 SWATH(Sequential Window Acquisition of all THeoretical fragment-ion spectra)-MS(mass spectroscopy, 질량 분광학) 방법을 이용하였다. SWATH-MS 단백체 분석의 방법의 장점은 선행문헌에 의해 기술된 바 있다(Gillet LC et al, Mol Cell Proteomics 2012).
분석 준비 단계는 2개의 뇌척수액(CSF) 검액(pooled sample) 100 μl 을 이용하였다. 단백질을 변성시키고, 전처리 과정을 거치게 하면서 펩티드로 분해시켰다. 펩티드로 잘려진 시료 전체를 각 분획별로 동정하고, 정량을 위한 스펙트럼 라이브러리 확보하였다. 1% FDR조건으로 필터링 후, 총 301개의 동정 단백질을 확보하였다(시퀀스 특이적 펩티드는 총 2,691개, 시퀀스 특이적 스펙트럼은 총 5,366개 확인). 검출되는 모든 단백질의 종류에 대하여 SWATH-MS 정량 분석을 할 수 있는 라이브러리를 확보하였다.
검체의 본격적인 분석단계는 81개의 뇌척수액(CSF) 검체에 대해 각각 100 μl을 얻어, 상기 준비단계와 동일한 처리 단계를 거쳐 Triple-TOFTM 5600+(AB Sciex, Concord, Canada)를 이용하여 단백체 분석을 실시하였다. 기계에 연결된 Eksigent NanoLC-2D 및 nanoFlex cHiPLC 시스템(0.075 mm x 75 μm column)을 이용하여 단백질을 찾아 정량하였다. SWATH-MS 분석은 Triple-Tof 5600+ 및 20 Da/매스 윈도우(mass windows)를 이용하여 루프 프로덕트 이온 모드(looped product ion mode)로 시행하였다. 각 SWATH 윈도우는 400-1000 Da 범위에서 1 Da 오버랩을 가지면서 반복 측정하였다(예를 들어, 실험 1은 400~420 Da, 실험 2는 419~440 Da, 이후 실험 31는 979~1000 Da 범위까지 특정함). 얻어진 값에 대해서 ProteinPilotTM을 이용하여 단백질들의 스펙트럼을 찾고, ProteoWizard 및 Skyline 소프트웨어를 이용하여 해당 단백질 및 이의 정량 값을 얻었다. 마지막으로, 개별 라이브러리 스펙트럼과 SWATH 스펙트럼을 확인하여 최종적으로 단백질의 종류와 정량값을 검증하였다.
<실시예 2> 알츠하이머성 치매 진단의 바이오 마커로서, 5종의 단백질(VGF, YWHAB, CHGA, CHGB, OPCML) 선별
42명의 알츠하이머성 치매 환자와 39명의 동일 연령대의 정상대조군의 뇌척수액을 SWATH-MS 방법을 이용하여 모든 시료에서 수행하였다. 미리 2개의 검액(약 6개의 뇌척수액 시료를 합쳐서 1개의 검액을 제조함)을 이용한 예비 실험을 통해서 SWATH-MS 방법으로, 사람의 뇌척수액에서 정확히 찾아낼 수 있는 단백질들의 종류 및 데이터 처리방법을 미리 파악하였다. 그 후, 본 실험으로 81개의 모든 시료에 대해 개별적으로 SWATH-MS 단백체 분석 방법을 시행하여, 274종류의 단백질이 모든 검체에서 공통적으로 검출됨을 확인하고, 이들의 발현량을 얻었다.
SWATH-MS 분석 및 데이터 처리 과정은 모든 검체에서 동일한 조건으로 시행하였다. 274개 단백의 발현량은 단백체 분석 스펙트럼에서 해당 단백질 피크의 면적값(AUC: area under the curve)으로 얻을 수 있는데, 이 값은 어떤 농도의 특정 단위로 표현할 수 있는 개념은 아니지만, 동시에 분석된 단백질들의 농도를 상대적 비교가 정확히 가능하므로, 통상적으로 사용되는 단백질 발현량의 검출 방법이다.
즉, 상기 실시예 1에 기재된 SWATH-MS 방법으로 검출된 274개의 단백질들의 종류와 이들의 알츠하이머성 치매 환자 및 정상 대조군에서의 비교한 통계 처리 결과를 하기 표 2에 나타내었다(굵은 글씨로 표시된 p-값은 독립 표본 t 검정 상에서 Benjamini-Hochberg false discovery rate(FDR)의 임계값 0.05의 미만 값을 표시함, 약어에 대한 설명: FC (log2), 대조군 vs 알츠하이머성 치매 환자의 AUC의 log2 배수 변화).
SWATH-MS 분석의 스펙트럼상의 각 단백질에 해당되는 피크를 형성하는 면적값(AUC)들을 알츠하이머성 치매 환자 42명과 정상 대조군 39명 간의 비교를 수행한 결과, 하기 표 3 내지 표 에서 확인할 수 있는 바와 같이, 274개의 단백질들 중에서 25개의 단백질들이 독립 표본 t-검정을 통해서 p-값이 0.05 미만으로 측정되어, 유의적임을 확인하였다.
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Figure 112018107532326-pat00003
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다만, 274개 단백질들의 검체에 대한 동시 비교이므로, 반복 비교에 따른 통계적 오류를 줄이기 위해 통계기법인 'Benjamini-Hochberg false discovery rate(FDR)'을 활용하여 p-값을 재평가하였다. 즉, 'FDR < 0.05' 인 경우만을 최종적으로 유의적인 차이로 선별하였다. 이를 통해, 최종적으로 신경분비단백질 VGF(VGF), 14-3-3 단백질 β/α(YWHAB), 크로모그라닌-A(Chromogranin-A, CHGA), 시크리토그라닌-1(Secretogranin-1, CHGB), 오피오이드-결합 단백질/세포 부착 분자(Opioid-binding protein/cell adhesion molecule, OPCML)를 포함한, 총 5개의 단백질을 선별하였다. 알츠하이머성 치매 환자에서 유의적으로 발현 차이를 보인, 상기 5종의 단백질의 종류 및 이의 통계적 수치를 하기 표 11에 나타내었다(AD, 알츠하이머성 치매; AUC, 곡선 하면적; FC (log2), 대조군 vs 알츠하이머성 치매 환자의 AUC의 log2 배수 변화).
UniProt ID 단백질 유전자 AUC p-값 FC (log2)
대조군 AD
O15240 Neurosecretory protein VGF VGF 23478.5 ± 6236.6 18243.9 ± 5387.3 0.0001** -0.4 ± 0.4
P31946 14-3-3 protein β/α YWHAB 960.2 ± 376.7 1331.4 ± 561.2 0.0008** 0.3 ± 0.7
P10645 Chromogranin-A CHGA 7950.8 ± 3236.5 5909.1 ± 2302.6 0.0018** -0.6 ± 0.6
P05060 Secretogranin-1 CHGB 46505.7 ± 9216.4 39804.8 ± 9753.9 0.0021** -0.3 ± 0.5
Q14982 Opioid-binding protein/cell adhesion molecule OPCML 7684.5 ± 2262.7 6039.4 ± 2498.3 0.0027** -0.5 ± 0.8
** FDR < 0.05
상기 선별된 5종의 단백질의 개별적인 알츠하이머성 치매 진단의 유용성을 확인하기 위해, ROC 커브 분석을 수행하였다. 그 결과, 하기 표 12에서 확인할 수 있는 바와 같이, AUC 값이 0.7 내외로 측정되어 상기 5종의 단백질은 개별적으로도 알츠하이머성 치매 진단에 유용하게 이용될 수 있음을 확인하였다.
AUC 95% CI p-값 Youden index J Sen (%) Spe (%)
Neurosecretory protein VGF (VGF) 0.752 0.642 - 0.861 < 0.001 0.51 82 69
14-3-3 protein β/α (YWHAB) 0.707 0.590 - 0.824 0.001 0.44 64 79
Chromogranin-A (CHGA) 0.678 0.559 - 0.796 0.006 0.37 56 81
Secretogranin-1 (CHGB) 0.705 0.590 - 0.819 0.002 0.39 79 60
Opioid-binding protein/cell adhesion molecule (OPCML) 0.698 0.583 - 0.814 0.002 0.39 79 60
<실시예 3> 알츠하이머성 치매 진단을 위한 최적의 단백질 조합 및 이의 유용성 확인
실시예 3-1: 알츠하이머성 치매 진단을 위한 최적의 단백질 조합(YWHAB, CHGA, CHGB)의 선별
알츠하이머성 치매를 진단함에 있어서, 상기 실시예 2에서 선별한 5종의 단백질의 조합이 개별적인 단백질 보다 더 유용한지 확인하기 위해, 역행 단계적인 선별 방법(Backward stepwise selection)을 이용한 로지스틱 회귀분석(Logistic regression)을 수행하였다.
그 결과, 도 1에서 확인할 수 있는 바와 같이, 상기와 같은 과정에서 신경분비 단백질 VGF 및 오피오이드-결합 단백질/세포 부착 분자(OPCML)은 어떤 조합을 구성하더라도, 모든 경우에서 유의확률(p-값)이 0.05 수준을 넘게 나오므로, 상기 2종의 단백질을 제외한, 14-3-3 단백질 β/α(YWHAB), 크로모그라닌-A(CHGA), 시크리토그라닌-1(CHGB)를 포함한 3종의 단백질의 조합이 가장 유의적인 유의확률을 나타내어, 상기 3종의 단백질의 조합을 알츠하이머성 치매 진단을 위한 최적의 단백질 조합으로 선별하였다.
실시예 3-2: 선별된 3종의 단백질(YWHAB, CHGA, CHGB)의 알츠하이머성 치매 진단의 유용성 확인
상기 선별된 3종의 단백질의 동시 측정을 통한 알츠하이머성 치매 진단을 설명하는 회귀방정식을 구하였다. 회귀계수 및 회귀 상수값을 얻어, 최종적으로 "3.761 + 0.04 x YWHAB - 0.0005 x CHGA - 0.001 CHGB"의 회귀방정식을 얻었다. 3종의 단백질의 발현량을 모두 포함하는 상기 회귀 방정식으로, 모든 검체에서 방정식 값을 얻은 후, 그 값으로 알츠하이머성 치매 진단을 위한 ROC 분석을 실시하였다. 그 결과, 하기 표 13에서 확인할 수 있는 바와 같이, 0.904의 높은 AUC 값을 나타내었다. 또한, ROC 그래프의 좌표 분석을 통하여, 진단을 위한 컷-오프 값을 'Youden index J' 값을 가장 높게 만드는 좌표점으로 구하였다. 이를 기준으로 하는 경우, 회귀 방정식 값은 민감도(Sen) 88%, 특이도(Spe) 82% 수준으로 알츠하이머성 치매 진단을 가능하게 함을 나타낸다.
AUC 95% CI p-값 Youden index J Sen (%) Spe (%)
회귀방정식(Regression Equation) 0.904 0.84 - 0.967 < 0.001 0.70 88 82
즉, 상기와 같은 결과 및 도 2에서 확인할 수 있는 바와 같이, 3종의 단백질의 조합이 개별적인 단백질에서 보다 훨씬 높은 ROC 커브 및 회귀방정식 값을 나타내므로, 개별적인 단백질의 측정에 비해, 3종의 단백질(YWHAB, CHGA, CHGB) 발현량의 동시 측정을 통해, 알츠하이머성 치매를 높은 정확도 및 민감도로 진단하는 것이 가능함을 확인할 수 있다.
이상의 내용을 종합하면, 본 발명에서는 정상 대조군과 비교하여 알츠하이머성 치매 환자에서 공통적으로 검출되는 274종의 단백질들 중에서도, 5종의 단백질들(VGF, YWHAB, CHGA, CHGB, OPCML)이 유의적으로 차이가 있는 발현량을 나타냄을 확인하였다. 더욱이, 상기 5종의 개별적인 단백질들에 비해, 3종의 단백질의 조합(YWHAB, CHGA, CHGB)이 알츠하이머성 치매 진단의 유용성에 있어서 월등히 높은 민감도 및 특이도를 나타냄을 확인하였다. 이를 통해, 3종의 단백질 발현량의 동시 측정을 통해, 알츠하이머성 치매의 진단 또는 예후 예측에 유용한 정보를 획득할 수 있음을 확인하였다.
이상의 설명으로부터, 본 발명이 속하는 기술분야의 당업자는 본 발명이 그 기술적 사상이나 필수적 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 실시될 수 있다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 이와 관련하여, 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적인 것이 아닌 것으로 이해해야만 한다. 본 발명의 범위는 상기 상세한 설명보다는 후술하는 특허 청구범위의 의미 및 범위 그리고 그 등가 개념으로부터 도출되는 모든 변경 또는 변형된 형태가 본 발명의 범위에 포함되는 것으로 해석되어야 한다.
<110> AJOU UNIVERSITY INDUSTRY-ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION <120> Alzheimer's disease diagnostic fluid biomarker including the combination of four proteins <130> KPA181172-KR <160> 15 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 6748 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 1 tccttccgtc gctcaggaga gtggagccaa tgcgtgcctt ggaggactgc tctgagccct 60 gtgcagattg gtgctgatga ttcttaccag ttgtgtgcaa gaaaagaaat cagagacgct 120 gcctgcctgc tcccatctct cgcgcgctct ctctctcttc tgctctctcc ctccctttgc 180 aaacattgga tttaaacctg ctcagaattc agcacagagg aaggcagcag cggtagcagc 240 agcagaagca gtagcaagcc cggcagctga gagcaccgca gcgtcgagat gtaccatcct 300 gcctactggg tcgtcttctc ggcgacaact gccctgctct tcatcccagg tgtaccatag 360 atgaccgggt aacccgggtg gcctggctaa accgcagcac catcctctac gctgggaatg 420 acaagtggtc catagaccct cgtgtgatca tcctggtcaa tacaccaacc cagtacagca 480 tcatgatcca aaatgtggat gtgtatgacg aaggtccgta cacctgctct gtgcagacag 540 acaatcatcc caaaacgtcc cgggttcacc taatagtgca agttcctcct cagatcatga 600 atatctcctc agacatcact gtgaatgagg 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agccaggaag aatctgagga aggtgaggaa gatgccacct ctgaggtgga caaacgacgc 1140 acgaggccca gacaccacca cgggaggagc aggcccgaca ggtcctctca aggagggagt 1200 cttccctctg aggaaaaggg acacccccag gaggaatctg aggagtcaaa cgtcagcatg 1260 gccagtttag gggaaaagag ggaccaccat tcaacccact acagggcttc agaggaagaa 1320 cctgaatatg gagaagaaat aaagggttat ccaggcgtcc aggcccctga ggacctggag 1380 tgggagcgct ataggggcag aggaagtgaa gaatacaggg ctccaagacc tcagagtgag 1440 gagagttggg atgaggagga caagagaaac taccccagct tagagcttga taagatggca 1500 catggatatg gtgaagaaag tgaggaagag aggggccttg agccgggaaa gggacgccat 1560 cacagaggca ggggagggga gccacgtgcc tatttcatgt ctgacaccag agaagagaaa 1620 aggttcttgg gtgaaggaca ccaccgtgtc caagaaaacc agatggacaa ggcaaggagg 1680 catccacaag gtgcgtggaa agagctggac agaaattatc tcaactacgg tgaggaagga 1740 gccccaggga agtggcagca gcagggagac ctgcaggaca ctaaagaaaa cagggaggaa 1800 gctaggtttc aagataaaca atatagctcc catcacacag ctgaaaagag gaagagatta 1860 ggggaactgt tcaacccata ctacgaccct ctccagtgga agagcagcca ttttgaaaga 1920 agagacaaca tgaatgacaa ttttctcgag ggtgaggagg aaaatgagct gaccttgaac 1980 gagaagaatt tcttcccaga atacaactat gactggtggg agaaaaagcc cttctctgag 2040 gatgtgaact gggggtatga gaagagaaac ctcgccaggg tccccaagct ggacctgaaa 2100 aggcaatatg acagggtggc ccaactggac cagctccttc actacaggaa gaagtcagct 2160 gagtttccag acttctatga ttctgaggag ccggtgagca cccaccagga ggcagaaaat 2220 gaaaaggaca gggctgacca gacagtcctg acagaggacg agaaaaaaga actcgaaaac 2280 ttggctgcaa tggatttgga actacagaag atagctgaga aattcagcca aaggggctga 2340 ctgtcattgg agcggtgggc actgttaaga agcagccatc acatgatctg tttttcacca 2400 cttcactgaa agacaccatt tatctaccca agggcagaaa gtagaactta ctattcatta 2460 aatgtttgac acaattggaa ttgtctttaa tttctgtcag aatgctattg aaaatgtgaa 2520 ttgcatgact tgtagcatat tcttttctgc aaaatagaca tattaacatg cttatgacaa 2580 tgactgtgct actgtctttg gaaaaatgtt tgtctcagtt ggaaataata aaagattcac 2640 ctgagaccaa aaaaaaaaaa aaaaaa 2666 <210> 5 <211> 2586 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 5 ccagcgtgct gaagccggag cgagctagcc gcccggagcc gcgccgaccc agctgagccc 60 agcccacggg acgccagacc tcgaccgtcg ctcctacccc ggccaccgct cggagccgag 120 gcggacgcgt cccgatcttc ccctgtcccc accctgcccc gaccctcctc tccacctctc 180 gcgtcgtgac accagctgtc tccggcagcc tcttggtcat gaaagccctc agattgtcgg 240 cttccgccct cttctgcctt ctgctgatca acgggttagg ggcagcaccc cctggtcgcc 300 ctgaggcgca gcctcctcct ctcagctctg agcataaaga gccggtagcc ggggacgcag 360 tgcccgggcc aaaggatggc agcgccccag aggtccgagg cgctcggaat tccgagccgc 420 aggacgaggg agagcttttc cagggcgtgg atccccgggc gctggccgcg gtgctgctgc 480 aggcactcga ccgtcccgcc tcacccccgg caccaagcgg ctcccagcag gggccggagg 540 aagaagcagc tgaagctctg ctgaccgaga ccgtgcgcag ccagacccac agcctcccgg 600 cgccggagag cccggagccc gcggctccgc ctcgccctca gactccggag aatgggcccg 660 aggcgagcga tccctccgag gagctcgagg cgctagcgtc cctgctccag gaactgcgag 720 atttcagtcc aagtagcgcc aagcgccagc aggagacggc ggcagcagag acggaaaccc 780 gcacgcacac gctgacccga gtgaatctgg agagcccggg gccagagcgc gtatggcgcg 840 cttcctgggg agagttccag gcgcgtgtcc cggagcgcgc gcccctgccg cccccggccc 900 cctctcaatt ccaggcgcgt atgcccgaca gcgggcccct tcccgaaacc cacaagttcg 960 gggaaggagt gtcctccccc aaaacacacc taggcgaggc attggcaccc ctgtccaagg 1020 cgtaccaagg cgtggccgcc ccgttcccca aggcgcgccg gccggagagc gcactcctgg 1080 gcggctccga ggcgggcgag cgccttctcc agcaagggct ggcgcaggtg gaggccgggc 1140 ggcggcaggc ggaggccacg cggcaggccg cggcgcagga agagcggctg gccgacctcg 1200 cctcggacct gctgctccag tatttgctgc agggcggggc ccggcagcgc ggcctcgggg 1260 gtcgggggct gcaggaggcg gcggaggagc gagagagtgc aagggaggag gaggaggcgg 1320 agcaggagag acgcggcggg gaggagaggg tgggggaaga ggatgaggag gcggccgagg 1380 cggaggcaga ggcggaggag gcggagaggg cgcggcagaa cgcgctcctg ttcgcggagg 1440 aggaggacgg ggaagccggc gccgaggaca agcgctccca ggaggagacg ccgggccacc 1500 ggcggaagga ggccgagggg acagaggagg gcggggagga ggaggacgac gaggagatgg 1560 atccgcagac gatcgacagc ctcattgagc tgtccaccaa actccacctg ccagcggacg 1620 acgtggtcag catcatcgag gaggtggagg agaagcggaa gcggaagaag aacgcccctc 1680 ccgagcccgt gccgcccccc cgtgccgccc ccgcccccac ccacgtccgc tccccgcagc 1740 ccccgccccc cgcccccgct cccgcacgag acgagctgcc ggactggaac gaggtgctcc 1800 cgccctggga tcgggaggag gacgaggtgt acccgccagg gccgtaccac cctttcccca 1860 actacatccg gccgcggaca ctgcagccgc cctcggcctt gcgccgccgc cactaccacc 1920 acgccttgcc gccttcgcgc cactatcccg gccgggaggc ccaggcgcgg cgcgcgcagg 1980 aggaggcgga ggcggaggag cgccggctgc aggagcagga ggagctggag aattacatcg 2040 agcacgtgct gctccggcgc ccgtgactgc ccttcccggt cccgcccccg cgcgcccccg 2100 ccgcgcgcgc gcgccggcgc ccccctccgt gttgcccgct ccccctcggt gtttgcatgc 2160 gccccggccc tgccccttgg ccctgcccct gtccccgggc tgcgtcggga cctgccagac 2220 ccccctcccg ggtcctgagc ccgaactccc agagctcacc cgcgggtgac cgggggccag 2280 cccaggaggg cgggtggttt gtgcgagttc ccttgccacg cggggccccg gccccatcaa 2340 gtccctctgg ggacgtcccc gtcggaaacc ggaaaaagca gttccagtta attgtgtgaa 2400 gtgtgtctgt ctccagccct tcgggcctcc cacgagcccc tccagcctct ccaagtcgct 2460 gtgaattgac cccttctttc ctttctctgt tgtaaatacc cctcacggag gaaatagttt 2520 tgctaagaaa taaaagtgac tattttatta ggaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2580 aaaaaa 2586 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> OPCML primer(forward) <400> 6 cctaggtcct ctgagcaacg 20 <210> 7 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> OPCML primer(reverse) <400> 7 ggtcaaggta gcaggagcag 20 <210> 8 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> YWHAB primer(forward) <400> 8 ggaaggaaga ggtcatctcg c 21 <210> 9 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> YWHAB primer(reverse) <400> 9 tgcttctcta tccacagccg 20 <210> 10 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CHGA primer(forward) <400> 10 cctgtgaaca gccctatg 18 <210> 11 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CHGA primer(reverse) <400> 11 ggaaagtgtg tcggagat 18 <210> 12 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CHGB primer(forward) <400> 12 caactggacc agctccttca c 21 <210> 13 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CHGB primer(reverse) <400> 13 gcacagtcat tgtcataagc atgt 24 <210> 14 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> VGF primer(forward) <400> 14 cctcttggtc atgaaagc 18 <210> 15 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> VGF primer(reverse) <400> 15 ggctctttat gctcagag 18

Claims (14)

  1. YWHAB(14-3-3 단백질 β/α), CHGA(크로모그라닌-A) CHGB(시크리토그라닌-1) 유전자 조합의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 알츠하이머성 치매의 진단용 조성물.
  2. 제1항에 있어서, 상기 유전자의 mRNA 수준을 측정하는 제제는 상기 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머 또는 프로브인 것인, 알츠하이머성 치매의 진단용 조성물.
  3. 제1항에 있어서, 상기 단백질의 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적인 항체, 또는 앱타머를 포함하는 것인, 알츠하이머성 치매의 진단용 조성물.
  4. 삭제
  5. 제1항에 있어서, 상기 유전자는 VGF(신경분비단백질 VGF) 또는 OPCML을 추가로 포함하는 것인, 알츠하이머성 치매의 진단용 조성물.
  6. 제1항 내지 제3항 및 제5항 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는, 알츠하이머성 치매의 진단용 키트.
  7. 제6항에 있어서, 상기 키트는 RT-PCR(Reverse transcription polymerase chain reaction) 키트, DNA 칩 키트, ELISA(Enzyme-linked immunosorbent assay) 키트 또는 단백질 칩 키트인 것인, 알츠하이머성 치매의 진단용 키트.
  8. (a) 알츠하이머성 치매의 발병이 의심되는 개체로부터 분리된 뇌척수액에서, YWHAB, CHGA CHGB 유전자 조합의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 수준을 측정하는 단계; 및
    (b) 상기 측정된 수준을 정상 개체로부터 분리된 뇌척수액에서 측정된 수준과 비교하는 단계를 포함하는, 알츠하이머성 치매의 진단을 위한 정보를 제공하는 방법.
  9. 제8항에 있어서, 상기 유전자의 mRNA 수준은 역전사효소 중합효소반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사효소 중합효소반응(competitive RT-PCR), 실시간 역전사효소 중합효소반응(real time quantitative RT-PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection method), 노던 블랏팅(Northern blotting), 또는 DNA칩 분석법(DNA chip technology assay)에 의하여 측정되는 것인, 방법.
  10. 제8항에 있어서, 상기 단백질의 수준은 웨스턴 블랏(western blotting), ELISA(enzyme linked immunosorbent assay), 방사선면역분석(RIA: radioimmunoassay), 방사 면역 확산법(radial immunodiffusion), 오우크테로니 면역 확산법(Ouchterlony immunodiffusion), 로케트 면역전기영동(rocket immunoelectrophoresis), 면역조직화학염색법(immunohistochemical staining), 면역침전분석법(immunoprecipitation assay), 보체 고정 분석법(complement Fixation Assay), 면역형광법(immunofluorescence), 면역크로마토그래피법(immunochromatography), FACS 분석법(fluorescenceactivated cell sorter analysis) 및 단백질 칩 분석법(protein chip technology assay)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나를 이용하여 측정되는 것인, 방법.
  11. 삭제
  12. 삭제
  13. 제8항에 있어서, 상기 유전자는 VGF 또는 OPCML을 추가로 포함하는 것인, 방법.
  14. 제8항 내지 제10항 및 제13항 중 어느 한 항에 있어서,
    정상 개체로부터 분리된 뇌척수액에서 측정된 수준과 비교하여, 알츠하이머성 치매의 발병이 의심되는 개체로부터 분리된 뇌척수액에서 측정된 YWHAB 유전자의 mRNA 또는 단백질의 수준이 높은 경우 또는 알츠하이머성 치매의 발병이 의심되는 개체로부터 분리된 시료에서 측정된 VGF, CHGA, CHGBOPCML 유전자의 mRNA 또는 단백질의 수준이 낮은 경우, 알츠하이머성 치매의 발병 위험이 높다고 판정하는 것인, 방법.
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Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2020091222A1 (ko) * 2018-10-30 2020-05-07 아주대학교 산학협력단 알츠하이머성 치매 진단용 바이오마커 단백질 및 이의 용도
WO2021071219A1 (ko) * 2019-10-07 2021-04-15 조한나 퇴행성 신경질환의 진단용 바이오마커
KR20210147348A (ko) * 2020-05-28 2021-12-07 재단법인대구경북과학기술원 알츠하이머 질환의 진단을 위한 Eef1a1의 용도
KR20220002002A (ko) * 2020-06-30 2022-01-06 울산대학교 산학협력단 직장 신경내분비종양의 예후 예측 방법
KR20230096456A (ko) * 2021-12-23 2023-06-30 차의과학대학교 산학협력단 뇌 유래 엑토좀 특이적 마커와 다중 마커군의 발현 패턴을 이용한 비침습성 치매 진단 방법

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20070031908A1 (en) * 2003-03-18 2007-02-08 Norbert Lamping Method for detecting a progressive, chronic dementia disease, and corresponding peptides and detection reagents
US20120178637A1 (en) * 2009-07-07 2012-07-12 Abbott Laboratories Biomarkers and methods for detecting alzheimer's disease
JP2016516202A (ja) * 2013-03-15 2016-06-02 キネメッド, インコーポレイテッド バイオマーカー
US20160327572A1 (en) * 2014-01-06 2016-11-10 Children's Medical Center Corporation Biomarkers for Dementia and Dementia Related Neurological Disorders
US20180067133A1 (en) * 2015-03-17 2018-03-08 Electrophoretics Limited Materials and methods for diagnosis and treatment of alzheimer's disease

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20070031908A1 (en) * 2003-03-18 2007-02-08 Norbert Lamping Method for detecting a progressive, chronic dementia disease, and corresponding peptides and detection reagents
US20120178637A1 (en) * 2009-07-07 2012-07-12 Abbott Laboratories Biomarkers and methods for detecting alzheimer's disease
JP2016516202A (ja) * 2013-03-15 2016-06-02 キネメッド, インコーポレイテッド バイオマーカー
US20160327572A1 (en) * 2014-01-06 2016-11-10 Children's Medical Center Corporation Biomarkers for Dementia and Dementia Related Neurological Disorders
US20180067133A1 (en) * 2015-03-17 2018-03-08 Electrophoretics Limited Materials and methods for diagnosis and treatment of alzheimer's disease

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Journal of Proteome Research (2014) 13(4):2056-2068 *

Cited By (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2020091222A1 (ko) * 2018-10-30 2020-05-07 아주대학교 산학협력단 알츠하이머성 치매 진단용 바이오마커 단백질 및 이의 용도
WO2021071219A1 (ko) * 2019-10-07 2021-04-15 조한나 퇴행성 신경질환의 진단용 바이오마커
KR20210147348A (ko) * 2020-05-28 2021-12-07 재단법인대구경북과학기술원 알츠하이머 질환의 진단을 위한 Eef1a1의 용도
KR102349630B1 (ko) 2020-05-28 2022-01-10 재단법인대구경북과학기술원 알츠하이머 질환의 진단을 위한 Eef1a1의 용도
KR20220002002A (ko) * 2020-06-30 2022-01-06 울산대학교 산학협력단 직장 신경내분비종양의 예후 예측 방법
KR102382674B1 (ko) 2020-06-30 2022-04-04 울산대학교 산학협력단 직장 신경내분비종양의 예후 예측 방법
KR20230096456A (ko) * 2021-12-23 2023-06-30 차의과학대학교 산학협력단 뇌 유래 엑토좀 특이적 마커와 다중 마커군의 발현 패턴을 이용한 비침습성 치매 진단 방법
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