KR101851157B1 - 콩 제색 식별을 위한 분자표지 및 이의 용도 - Google Patents

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Abstract

본 발명은 콩 제색 식별을 위한 프라이머 쌍 및 이를 이용한 콩 제색 식별 방법에 관한 것이다. 구체적으로 콩 제색 형질과 관련된 유전자좌에 특이적인 프라이머 쌍을 이용함으로써 신속하게 콩 품종의 제색을 식별할 수 있어 제색이 없는 콩 개발에 활용이 가능하다. 또한, 향후 분자육종 프로그램에서 콩 품종 육성 초기에 종자의 제색 유무를 식별할 수 있어 콩 제색의 표지-도움 선발(marker-assist selection)을 촉진할 수 있다.

Description

콩 제색 식별을 위한 분자표지 및 이의 용도{Molecular marker for identifying the hilum color of soybean and the use thereof}
본 발명은 콩 제색 식별을 위한 프라이머 쌍 및 이를 이용한 콩 제색 식별 방법에 관한 것이다.
콩은 전 세계에서 경제적으로 매우 중요한 작물이다. 우리가 항상 섭취하는 음식과 사료용으로 많이 이용하고 있으며 더욱이 최근에는 바이오 디젤의 원료로써 많은 연구가 진행되고 있다. 따라서 전 세계 연구원들은 콩이 가지고 있는 수많은 유용 유전자들의 발굴과 연구로 인한 품종 개발 및 육종에 집중하고 있다.
식품산업에서 콩은 다양한 용도로 이용되고 있으며, 특히 국내에서는 장류 및 두부 등에 주로 이용되고 있다. 상기 용도에 맞는 콩 품종을 사용하여야 하고 통상적으로 콩의 표현형만으로 품종을 선택하는데, 이에 이용되는 형질에는 종자의 크기, 종피색, 제색(hilum color) 등이 있다. 일반적으로 단백질 함량이 높고 종자가 크고 제색이 없는(황색) 품종을 좋은 품종으로 취급한다.
한국공개특허공보 KR2005-0109812는 콩의 형질 분석용 분자표지에 관한 것으로, 콩의 형질 중 종피색을 식별할 수 있는 분자 표지에 관한 것이다.
이에 본 발명자들은 콩의 외관 및 가공에 영향을 미치는 제색을 신속하고 효과적으로 식별하여 제색이 없는 품종을 육종 초기에 선발할 수 있는 분자표지를 개발하였다.
한국공개 특허 공보 KR2005-0109812
본 발명의 목적은 서열번호 1 및 서열번호 2로 표시되는 프라이머 쌍; 서열번호 3 및 서열번호 4로 표시되는 프라이머 쌍; 서열번호 5 및 서열번호 6으로 표시되는 프라이머 쌍; 서열번호 7 및 서열번호 8로 표시되는 프라이머 쌍; 서열번호 9 및 서열번호 10으로 표시되는 프라이머 쌍; 서열번호 11 및 서열번호 12로 표시되는 프라이머 쌍; 및 서열번호 13 및 서열번호 14로 표시되는 프라이머 쌍으로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 프라이머 쌍을 포함하는 콩의 제색(hilum color) 식별을 위한 프라이머 쌍을 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은
(ㄱ) 콩 시료로부터 게놈 DNA를 분리하는 단계;
(ㄴ) 상기 분리된 게놈 DNA를 주형으로, 제1항의 프라이머 쌍을 이용하여 PCR 증폭반응을 수행하는 단계;
(ㄷ) PCR 증폭 산물을 검출하는 단계; 및
(ㄹ) 콩 품종들의 (ㄷ)단계에서 검출된 증폭산물을 비교하는 단계;
를 포함하는 콩 제색 식별 방법을 제공하는 것이다.
본 발명은 서열번호 1 및 서열번호 2로 표시되는 프라이머 쌍; 서열번호 3 및 서열번호 4로 표시되는 프라이머 쌍; 서열번호 5 및 서열번호 6으로 표시되는 프라이머 쌍; 서열번호 7 및 서열번호 8로 표시되는 프라이머 쌍; 서열번호 9 및 서열번호 10으로 표시되는 프라이머 쌍; 서열번호 11 및 서열번호 12로 표시되는 프라이머 쌍; 및 서열번호 13 및 서열번호 14로 표시되는 프라이머 쌍으로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 프라이머 쌍을 포함하는 콩의 제색(hilum color) 식별을 위한 프라이머 쌍을 제공한다.
본 발명에서 용어 “제색(hilum color)"란 콩의 외관 품질 및 가공 적성 등에 영향을 미치는 콩의 형질 중 하나로, 콩 종자의 눈 부위의 색을 말한다. 본 발명에서 ”제색 식별“이라 함은 제색이 있는 콩과 제색이 없는 콩을 식별하는 것을 의미한다. 본 발명에서 제색이 없는 콩은 제색이 황금색을 나타내는 것으로 이하 본 발명에서 황금(콩 품종명)형으로 분류하고 제색이 있는 콩은 황금색 이외의 색을 나타내는 것으로 대풍(콩 품종명)형으로 분류하여 기술하였다.
본 발명에서 제색 형질 식별에 사용된 콩 품종은 황금 및 대풍을 포함한 하기 표 1의 104개의 품종일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
번호 품종명 번호 품종명 번호 품종명
1 녹원 36 진품콩2호 71 덕유
2 다진 37 청두1호 72 신팔달콩
3 단미 38 태광콩 73 팔달콩
4 단미2호 39 호장 74 화성풋콩
5 상원 40 황금콩 75 장단백목
6 석량풋콩 41 광안콩 76 충북백
7 신록 42 남해콩 77 광두
8 새올 43 다기 78 새단백콩
9 큰올콩 44 다채 79 소원2010
10 화엄풋콩 45 도레미콩 80 대하
11 소황 46 명주나물콩 81 대하 1호
12 금강콩 47 보석 82 천상
13 남풍 48 부광콩 83 조양1호
14 다장콩 49 새별콩 84 늘찬
15 단경콩 50 서남콩 85 다올
16 단백콩 51 소강콩 86 중모3003
17 단원콩 52 소록콩 87 Williams 82
18 대망 53 소백나물콩 88 백운
19 대양 54 소원콩 89 신기
20 대원콩 55 소진 90 Enrei
21 대풍 56 소호 91 L29
22 두유콩 57 신화 92 신강
23 만수 58 안평 93 우람
24 무한콩 59 원광 94 PI96983
25 삼남콩 60 원황 95 V94-5152
26 소담콩 61 은하콩 96 진풍
27 송학콩 62 익산나물콩 97 해풍
28 알찬콩 63 장기 98 선풍
29 일미콩 64 조남 99 태선
30 장미콩 65 팔도나물콩 100 장연콩
31 장수콩 66 풍산나물콩 101 기풍콩
32 장엽콩 67 풍원 102 강일콩
33 장원콩 68 한남콩 103 대왕콩
34 진미콩 69 호서 104 청아콩
35 진품콩 70 광교
상기 프라이머 쌍은 콩의 제색 형질과 관련된 유전자좌(유전자 지도상의 위치)를 PCR로 증폭하여 콩 품종간의 밴드 크기를 분석하는 방법으로 콩 제색 형질을 분석/식별 할 수 있다. 상기 콩의 제색 형질과 관련된 유전자좌는 콩의 8번 염색체일 수 있다. 바람직하게는 8번 염색체 내에서 콩 품종간 차이가 있는 삽입/결실(insertion/deletion) 변이 부위일 수 있다.
본 발명에서 용어 “삽입/결실(indel) 변이 부위"은 DNA의 염기배열에서 일부 염기가 중간에 삽입(insertion)되거나 결실(deletion)된 변이를 총칭한다. 상기 Indel 부위는 기준이 되는 유전체와 그외 다른 품종의 유전체 정보를 비교 분석하는 방법을 통해 기준이 되는 유전체보다 삽입(insertion) 또는 결실(deletion)된 영역을 탐색하고 그 정보를 바탕으로 프라이머를 제작한다. 따라서 그 증폭 결과는 기준이 되는 유전체와 비교하여 밴드크기가 큰 경우(insertion)와 작은 경우(deletion)의 두 종류 형태을 나타낼 수 있고 이를 통해서 품종 및 형질 구별이 가능하다.
본 발명은,
(ㄱ) 콩 시료로부터 게놈 DNA를 분리하는 단계;
(ㄴ) 상기 분리된 게놈 DNA를 주형으로, 제1항의 프라이머 쌍을 이용하여 PCR 증폭반응을 수행하는 단계;
(ㄷ) PCR 증폭 산물을 검출하는 단계; 및
(ㄹ) 콩 품종들의 (ㄷ)단계에서 검출된 증폭산물을 비교하는 단계;
를 포함하는 콩 제색 식별 방법을 제공한다.
상기 프라이머 쌍은 콩의 제색 형질과 관련된 유전자좌(유전자 지도상의 위치)를 PCR로 증폭하여 콩 품종간의 밴드 크기를 분석하는 방법으로 콩 제색 형질을 분석/식별 할 수 있다. 상기 콩의 제색 형질과 관련된 유전자좌는 콩의 8번 염색체일 수 있다. 바람직하게는 8번 염색체 내에서 콩 품종간 차이가 있는 삽입/결실(insertion/deletion) 변이 부위일 수 있다.
상기 (ㄹ) 단계에서 검출된 증폭산물을 비교하는 단계는 품종간 유전자의 삽입 또는 결실로 인해서 증폭된 부분의 길이 차이가 나므로, 이를 비교하여 다양한 콩 품종의 제색 유무를 식별할 수 있다.
본 발명의 프라이머 쌍은 콩의 제색을 결정하는데 관여하는 8번 염색체상의 유전자좌에 존재하는 특정 염기서열을 증폭할 수 있고, 유전자좌에서 일어나는 유전적 변이(삽입/결실 부위)를 확인할 수 있으므로 향후 분자육종 프로그램에서 콩 품종 육성 초기에 종자의 제색 유무를 식별할 수 있어 콩 제색의 표지-도움 선발(marker-assist selection)을 촉진할 수 있다.
도 1은 콩 제색 식별을 위한 분자 표지 활용 시스템 모식도이다.
도 2는 본 발명에서 사용된 104개 콩 품종의 제색 표현형을 나타낸 것이다.
도 3는 본 발명의 7개의 프라이머 쌍을 이용하여 PCR을 수행한 결과를 나타낸 것이다(H는 황금형, D는 대풍형, H는 헤테로를 나타낸다).
도 4는 104개 콩 품종에 대한 PCR 수행 결과 유전형과 표현형을 비교한 것이다(붉은색/황금형, 파란색/대풍형, 노란색/헤테로를 나타낸다).
이하, 본 발명을 실시예에 의해 보다 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 의해 한정되는 것은 아니다.
실시예 1. 콩 품종으로부터 DNA 추출
염색체 해독을 위한 DNA 추출을 위하여 국립식량과학원 고령지농업연구소로부터 콩 유전자원 104개의 콩 품종(표 1)을 파종상자에 파종 후 30일된 어린잎으로부터 조직을 채취하여 Saghai Maroof 등(1984)의 방법으로 DNA 추출을 수행하였다. -70℃에서 동결 보존한 콩 잎(0.2g)을 막자사발에 넣어서 즉시 액체질소로 냉각하면서 분말 상태로 분쇄하였으며 1.5 ㎖ 튜브에 옮겨 담았다. 이 시료에 500 ㎕의 CTAB(cetyl trimethyl ammonium bromide) 추출 버퍼를 첨가하여 충분히 섞어 준 후 65℃ 수조에 30분 진탕하였다. 클로로포름/이소아밀 알코올(Chloroform/isoamyl alcohol, 24:1) 용액 500 ㎕을 각각의 샘플에 첨가한 후, 손으로 뒤집어 주면서 섞은 뒤 12,000 rpm, 4℃에서 15분 정도 원심분리 하였다. 상층액을 새 튜브에 옮긴 뒤 10 ㎕(10 ㎎/㎖) RNase A를 넣어 두었다. 30분 후에 아이소프로판올을 2/3 정도 넣고 섞어주어 DNA를 침전시켰다. 침전된 펠럿(pellet)을 꺼내어서 70 % 에탄올 첨가 후 12,000rpm, 5분 동안 원심 분리하였으며 상층액 제거 후 70 % 에탄올로 다시 세척 하였다. DNA pellet을 말려서 멸균 증류수 300 ㎕ 첨가하였다. 추출한 DNA는 나노드랍으로 정량 하였으며 100 ng/㎕ 농도로 조정하여 실험에 사용하였다.
실시예 2. 콩 제색 식별 분자표지 탐색 및 PCR 조건
콩 제색 식별 분자표지를 선발하기 위하여, 해독된 콩 7품종(황금, 대풍, williams82, 신기, 광교, 신팔달콩 2, 백운) 염기서열 정보를 바탕으로 제색 유전자좌 영역에서 5 bp이상의 삽입/결실(Insertion/deletion) 변이를 탐색하여 프라이머3 프로그램을 이용하여 하기 표 2의 프라이머 쌍를 디자인하였고, 증폭산물의 예상크기는 표 2에 표시하였다.
프라이머 쌍 증폭산물
크기(bp)		 염색체 위치
(kbp)		 정방향 프라이머 (5‘→3’) 서열번호 역방향 프라이머 (5‘→3’) 서열
번호
SHC-1 110 8 8,344 TTCAAAACCTTGAAATTCCT 1 GGATAAAACTACTGGAAATCCTT 2
SHC-2 92 8 8,345 ACCGCTATAATTAATGGCAA 3 AACATAGGTGCTCTTTTTGG 4
SHC-3 113 8 8,345 CTTGCAAAAATTGATGTGAA 5 CAAAAGCGACTAAGGGAAA 6
SHC-4 89 8 8,374 GACAAATATCCATTCCAATTC 7 CCTCATAATTTTGGGATTGA 8
SHC-5 80 8 8,376 ACAGAGGAGAGAGGGAGAAG 9 TAACTTTGAAATGTTGGCG 10
SHC-6 106 8 8,415 ACACCTGTTTAAACTCGATCA 11 ACATGCACGTTCGTGTTAC 12
SHC-7 104 8 8,498 TGATTTCCAAGACAAATAAAGA 13 TTTTGTTTTTGTCAGCTACG 14
본 발명의 서열번호 1 및 2의 프라이머 쌍은 “SHC-1”로, 서열번호 3 및 4의 프라이머 쌍은 “SHC-2”로, 서열번호 5 및 6의 프라이머 쌍은 “SHC-3”로, 서열번호 7 및 8의 프라이머 쌍은 “SHC-4”로, 서열번호 9 및 10의 프라이머 쌍은 “SHC-5”로, 서열번호 11 및 12의 프라이머 쌍은 “SHC-6”로, 서열번호 13 및 14의 프라이머 쌍은 “SHC-7”로 각각 명명하였다.
PCR 반응의 혼합액(master mix)은 10 ㎕로 수행을 하였으며, 그 안에는 100 ng의 genomic DNA, 2 pmole의 각각의 프라이머 및 5 ㎕의 2X DNA free-Taq PCR Master Mix(CellSafe, Suwon, Korea)로 구성하였다. PCR 증폭은 C1000 Touch(BMS, New York, USA)를 사용하여 초기 변성(denaturation)을 95℃에서 5분간 수행하였고, 94℃에서 30초간 변성한 후, 43℃의 온도에서 30초간 어닐링(annealing)하였고, 72℃에서 30초간 증폭(extension) 과정을 총 35사이클을 반복했으며, 72℃에서 5분간 최종적인 증폭하였고, 10℃에서 PCR 증폭반응을 종결시켰다. 증폭된 PCR 산물은 EtBr(Ethidium bromide) 대체 시약인 6X LoadingSTAR(DyneBio, Seongnam-si, Korea)를 첨가하여 3% 아가로스 겔에 로딩한 뒤 100V에서 120 내지 180분 가량 진행하였으며, 전기영동이 끝난 뒤 UV를 이용하여 밴드를 확인하였다.
실시예 3. 본 발명에 사용된 104개 콩 품종의 제색 표현형과 유전형의 비교
도 2는 본 발명에 따른 프라이머 쌍에 의해 식별될 수 있는 상기 표 1의 콩 품종 104개를 대상으로 제색 표현형을 제색이 없는 황금형(H)과 제색이 있는 대풍형(D) 2그룹으로 구분하여 나타내었다.
도 3은 7개의 프라이머 쌍을 이용하여 104개 품종을 대상으로 유전형을 조사한 결과를 나타내였다. 증폭된 결과를 바탕으로 황금과 같은 밴드크기를 보이는 결과는 “H”, 대풍과 같은 결과는 “D”, 헤테로인 경우 “h”로 표기하였다.
도 4는 본 발명의 콩 제색 식별 프라이머 쌍의 증폭결과로 104개 품종의 유전형과 표현형을 비교하여 나타내었다. 황금과 같은 영역은 붉은색, 대풍과 같은 영역은 파란색, 헤테로 영역은 노란색으로 표시하였다.
도 2 내지 도 4에 나타난 결과를 종합하면, SHC-1, SHC-2 및 SHC-3의 프라이머 쌍으로 수행한 결과는 콩 제색의 유전형과 표현형의 일치율이 95.2%-98.1%이었으며 SHC-4, SHC-5, SHC-6 및 SHC-7의 프라이머 쌍으로 수행한 결과는 유전형과 표현형이 100% 일치하였다(표 3). 따라서 선발된 7개 프라이머 쌍을 사용하여 신속하게 콩 품종의 제색을 식별할 수 있어 제색이 없는 콩 개발에 효율적으로 활용할 수 있을 것으로 판단하였다.
번호 품종명 표현형 유전형
SHC-1 SHC-2 SHC-3 SHC-4 SHC-5 SHC-6 SHC-7
유전형과 표현형 일치율 95.2 % 98.1 % 98.1 % 100 % 100 % 100 % 100 %
1 녹원 D*1 X*3 O O O O O O
2 다진 H*2 O*4 O O O O O O
3 단미 H O O O O O O O
4 단미2호 D X O O O O O O
5 상원 H O O O O O O O
6 석량풋콩 D X O O O O O O
7 신록 H O O O O O O O
8 새올 D O O O O O O O
9 큰올콩 H O O O O O O O
10 화엄풋콩 H O O O O O O O
11 소황 H O O O O O O O
12 금강콩 D O O O O O O O
13 남풍 D O O O O O O O
14 다장콩 D O O O O O O O
15 단경콩 D O O O O O O O
16 단백콩 D O O O O O O O
17 단원콩 D O O O O O O O
18 대망 D O O O O O O O
19 대양 H O O O O O O O
20 대원콩 H O O O O O O O
21 대풍 D O O O O O O O
22 두유콩 D O O O O O O O
23 만수 H O O O O O O O
24 무한콩 D O O O O O O O
25 삼남콩 D O O O O O O O
26 소담콩 H O O O O O O O
27 송학콩 H O O O O O O O
28 알찬콩 D O O O O O O O
29 일미콩 D O O O O O O O
30 장미콩 D O O O O O O O
31 장수콩 D O O O O O O O
32 장엽콩 H O O O O O O O
33 장원콩 D O O O O O O O
34 진미콩 H O O O O O O O
35 진품콩 H O O O O O O O
36 진품콩2호 H O O O O O O O
37 청두1호 D O O O O O O O
38 태광콩 H O O O O O O O
39 호장 H O O O O O O O
40 황금콩 H O O O O O O O
41 광안콩 D O O O O O O O
42 남해콩 D O O O O O O O
43 다기 D O O O O O O O
44 다채 D O O O O O O O
45 도레미콩 D O O O O O O O
46 명주나물콩 D O O O O O O O
47 보석 D O O O O O O O
48 부광콩 D O O O O O O O
49 새별콩 D O O O O O O O
50 서남콩 D O O O O O O O
51 소강콩 D O O O O O O O
52 소록콩 D O O O O O O O
53 소백나물콩 H O O O O O O O
54 소원콩 D O O O O O O O
55 소진 D O O O O O O O
56 소호 D O O O O O O O
57 신화 D O O O O O O O
58 안평 D O O O O O O O
59 원광 D O O O O O O O
60 원황 D O O O O O O O
61 은하콩 D O O O O O O O
62 익산나물콩 D O O O O O O O
63 장기 D O O O O O O O
64 조남 H O O O O O O O
65 팔도나물콩 D O O O O O O O
66 풍산나물콩 H O O O O O O O
67 풍원 D O O O O O O O
68 한남콩 D O O O O O O O
69 호서 D O O O O O O O
70 광교 D O O O O O O O
71 덕유 D O O O O O O O
72 신팔달콩 D O O O O O O O
73 팔달콩 D O O O O O O O
74 화성풋콩 D X X X O O O O
75 장단백목 H O O O O O O O
76 충북백 H O O O O O O O
77 광두 D O O O O O O O
78 새단백콩 D O O O O O O O
79 소원2010 D O O O O O O O
80 대하 H O O O O O O O
81 대하 1호 H O O O O O O O
82 천상 D O O O O O O O
83 조양1호 H O O O O O O O
84 늘찬 H O O O O O O O
85 다올 D O O O O O O O
86 중모3003 H X X X O O O O
87 Williams 82 D O O O O O O O
88 백운 D O O O O O O O
89 신기 D O O O O O O O
90 Enrei H O O O O O O O
91 L29 D O O O O O O O
92 신강 D O O O O O O O
93 우람 H O O O O O O O
94 PI96983 D O O O O O O O
95 V94-5152 D O O O O O O O
96 진풍 H O O O O O O O
97 해풍 D O O O O O O O
98 선풍 H O O O O O O O
99 태선 H O O O O O O O
100 장연콩 D O O O O O O O
101 기풍콩 D O O O O O O O
102 강일콩 H O O O O O O O
103 대왕콩 H O O O O O O O
104 청아콩 H O O O O O O O
*1 D: 대풍형, 제색있음, *2H: 황금형, 제색없음, *3X: 유전형과 표현형 불일치, *4O: 유전형과 표현형 일치
<110> Republic of Korea <120> Molecular marker for identifying the hilum color of soybean and the use thereof <130> P16R12D0890 <160> 14 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-1F <400> 1 ttcaaaacct tgaaattcct 20 <210> 2 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-1R <400> 2 ggataaaact actggaaatc ctt 23 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-2F <400> 3 accgctataa ttaatggcaa 20 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-2R <400> 4 aacataggtg ctctttttgg 20 <210> 5 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-3F <400> 5 cttgcaaaaa ttgatgtgaa 20 <210> 6 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-3R <400> 6 caaaagcgac taagggaaa 19 <210> 7 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-4F <400> 7 gacaaatatc cattccaatt c 21 <210> 8 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-4R <400> 8 cctcataatt ttgggattga 20 <210> 9 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-5F <400> 9 acagaggaga gagggagaag 20 <210> 10 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-5R <400> 10 taactttgaa atgttggcg 19 <210> 11 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-6F <400> 11 acacctgttt aaactcgatc a 21 <210> 12 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-6R <400> 12 acatgcacgt tcgtgttac 19 <210> 13 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-7F <400> 13 tgatttccaa gacaaataaa ga 22 <210> 14 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SHC-7R <400> 14 ttttgttttt gtcagctacg 20

Claims (8)

  1. 서열번호 7 및 서열번호 8로 표시되는 프라이머 쌍; 서열번호 9 및 서열번호 10으로 표시되는 프라이머 쌍; 서열번호 11 및 서열번호 12로 표시되는 프라이머 쌍; 및 서열번호 13 및 서열번호 14로 표시되는 프라이머 쌍으로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 프라미머 쌍을 포함하는 하기 표 1에 표시되는 104개 콩 품종 제색(hilum color)을 식별하기 위한 프라이머 쌍:
    [표 1]
    Figure 112017113972285-pat00006
  2. 제 1항에 있어서,
    상기 콩 제색 식별은 제색이 있는 콩과 제색이 없는 콩을 구별하는 것인 콩 제색을 식별하기 위한 프라이머 쌍.
  3. 삭제
  4. 제 1항 또는 제 2항에 있어서,
    상기 프라이머 쌍들은 상기 표 1에 표시되는 104개 품종의 유전자의 삽입/결실(Insertion/deletion) 변이 부위를 검출하도록 제작된 것인, 콩 제색을 식별하기 위한 프라이머 쌍.
  5. (ㄱ) 콩 시료로부터 게놈 DNA를 분리하는 단계;
    (ㄴ) 상기 분리된 게놈 DNA를 주형으로, 제 1항의 프라이머 쌍을 이용하여 PCR 증폭반응을 수행하는 단계;
    (ㄷ) PCR 증폭 산물을 검출하는 단계; 및
    (ㄹ) 콩 품종들의 (ㄷ)단계에서 검출된 증폭산물을 비교하는 단계;
    를 포함하는 콩 제색 식별 방법.
  6. 제 5항에 있어서,
    상기 콩 제색 식별은 제색이 있는 콩과 제색이 없는 콩을 구별하는 것인 콩 제색 식별 방법.
  7. 삭제
  8. 제 5항 또는 제 6항에 있어서,
    상기 프라이머 쌍들은 제 1항의 상기 표 1에 표시되는 104개 품종의 유전자 삽입/결실(insertion/deletion) 변이 부위를 검출하도록 제작된 것인, 콩의 제색 식별방법.
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