KR101587227B1 - 근위축증 진단용 바이오마커, 그 마커의 발현수준 측정에 의한 근위축증 진단용 약학 조성물, 및 그 마커를 이용한 근위축증 치료용 후보약물을 스크리닝하는 방법 - Google Patents
근위축증 진단용 바이오마커, 그 마커의 발현수준 측정에 의한 근위축증 진단용 약학 조성물, 및 그 마커를 이용한 근위축증 치료용 후보약물을 스크리닝하는 방법 Download PDFInfo
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Abstract
본 발명은 근위축증 진단용 바이오마커, 그 바이오마커의 발현수준을 측정하기 위한 근위축증 진단용 약학 조성물, 그 조성물을 포함하는 키트, 근위축증 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여 상기 바이오마커의 발현수준을 측정하는 방법, 및 상기 바이오마커의 발현수준 측정을 통해 근위축증 치료용 후보약물을 스크리닝하는 방법을 제공한다.
Description
본 발명은 근위축증 진단용 바이오마커, 그 바이오마커를 이용한 근위축증 진단용 약학 조성물 및 근위축증 치료용 약물의 스크리닝 방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 근위축증 발생 시 그 발현이 변화하여 근위축증 여부를 확인할 수 있는 바이오마커, 그 바이오마커의 발현을 측정할 수 있는 근위축증 진단용 약학 조성물, 그 조성물을 포함한 근위축증 진단용 키트, 그 바이오마커의 발현을 측정하는 것을 포함하는 근위축증 진단방법, 및 그 바이오마커의 발현을 억제하는 후보약물을 선택하는 근위축증 치료용 약물의 스크리닝 방법에 관한 것이다.
근육줄기세포(muscle satellite cells)는 근다발(muscle bundle)에 붙어서 존재하고 있으며, 근육의 손상이 발생했을 경우 손상된 부위로 이동, 분화하여 손상을 복구하는 것으로 알려져 있다. 현재 휴지상태 근육줄기세포(quiescent satellite cells)의 증식 및 활성은 손상된 근육에서 발생되는 여러 가지의 성장인자(growth factor)들에 의해 유발되는 것으로 알려져 있다. 근육 손상부위로 이동된 근육줄기세포는 근아세포(myoblast)로 분화하고, 근아세포는 순차적으로 근세포, 근섬유로 분화하는 것으로 알려져 있으며, 도 1에 이러한 과정의 흐름도를 나타내었다.
근육줄기세포의 분화시 발현되는 단백질은 미오게닌(myogenin)이 가장 대표적이다. 미오게닌은 근육줄기세포에서는 발현되지 않으며 분화시 근섬유(myotube) 상태가 되었을 때 발현된다. 따라서, 미오게닌은 근육줄기세포의 분화 마커로 사용되고 있다.
그러나, 근육의 위축 증세(muscle atrophy)가 시작되면 미오게닌이 과잉발현되기 시작한다. 미오게닌의 과잉발현으로 인해서 E3 리가제(E3 ligase)의 일종인 MuRF-1과 atrogin-1의 발현이 증가하여 근육의 미오신 헤비체인(Myosin heavy chain)을 분해시킴으로써 근육의 크기가 줄어드는 근육위축증이 발생하게 되는 것으로 알려져 있다(비특허문헌 1).
따라서, 미오게닌, MuRF-1, 및 atrogin-1의 과잉발현은 근육위축증을 대변하게 되므로, 이러한 단백질의 발현을 촉진시키는 조절자는 근위축증 진단의 바이오마커로서 사용될 수 있을 뿐만 아니라, 미오게닌 증가에 의한 근위축증 치료 약물을 탐색하기 위한 타겟이 될 수 있을 것으로 보인다. 이러한 마커의 개발은 근위축증을 진단하고 질병 치료를 위한 약물의 개발을 위해 매우 중요하다.
1. Clarke BA, Drujan D, Willis MS, Murphy LO, Corpina RA, Burova E, Rakhilin SV, Stitt TN, Patterson C, Latres E, Glass DJ.The E3 Ligase MuRF1 degrades myosin heavy chain protein in dexamethasone-treated skeletal muscle. Cell Metab. 2007,6:376-85.
본 발명의 목적은 근위축증 진단에 사용될 수 있는 바이오마커를 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 근위축증의 진단에 사용될 수 있는 약학 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 근위축증의 진단에 사용될 수 있는 키트를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 근위축증 진단에 필요한 정보를 제공하기 위해 바이오마커의 발현수준을 검출하는 방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 바이오마커의 발현수준 측정을 이용한 근위축증 치료용 후보약물을 스크리닝하는 방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 일 측면은
정상인에 비해 근아세포에서 발현이 증가하는 것으로서, Fbxw7 베타를 포함하는 근위축증 진단용 바이오마커 조성물을 제공한다.
본 발명의 다른 일 측면은
Fbxw7 베타 또는 그 면역원성 단편에 특이적으로 결합하는 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 또는 상기 Fbxw7 베타 단백질을 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머 또는 프로브를 포함하는, 상기 Fbxw7 베타의 발현수준 측정에 의한 근위축증 진단용 약학 조성물을 제공한다.
본 발명의 또 다른 일 측면은
상기 근위축증 진단용 약학 조성물을 포함하는 근위축증 진단용 키트를 제공한다.
본 발명의 또 다른 일 측면은
근위축증 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여, 환자의 근아세포로부터 Fbxw7 베타의 발현수준을 측정하는 방법을 제공한다.
본 발명의 또 다른 일 측면은
근아세포를 시료로 처리하는 단계;
상기 처리된 근아세포 중의 Fbxw7 베타의 발현수준을 측정하는 단계; 및
상기 Fbxw7 베타의 발현수준이 대조군의 Fbxw7 베타의 발현수준에 비해 감소하는 시료를 선택하는 단계를 포함하는
근위축증 치료용 후보약물을 스크리닝하는 방법을 제공한다.
이하, 본 발명을 보다 상세하게 설명한다.
본 발명에서 사용되는 모든 기술용어는, 달리 정의되지 않는 이상, 본 발명의 관련 분야에서 통상의 당업자가 일반적으로 이해하는 바와 같은 의미로 사용된다. 또한, 본 명세서에는 바람직한 방법이나 시료가 기재되나, 이와 유사하거나 동등한 것들도 본 발명의 범주에 포함된다. 본 명세서에 참고문헌으로 기재되는 모든 간행물의 내용은 전체가 본 명세서에 참고로 통합된다.
본 발명자들은 근위축증의 진단 등을 예측할 수 있는 바이오마커의 개발을 위해 연구하였다. 그 결과, 근육줄기세포의 정상적인 분화 시에는 초기 분화단계에서 Fbxw7 베타의 발현양이 증가하여 소량 존재하다가, 분화가 진행됨에 따라 Fbxw7 베타의 발현양이 줄어들다가 완전히 사라지는 것을 확인하였다(실시예 1). 이에 반해, 근아세포에서 Fbxw7 베타가 과잉 발현 시, 근위축증에서 증가하는 것으로 공지되어 있는 미오게닌이 증가하고, 순차적으로 atrogin-1 및 MuRF-1의 발현이 증가하는 것을 확인하였다(실시예 2 및 3). 또한, Fbxw7 베타가 과잉 발현된 근아세포를 배양한 결과, 근아세포의 분화력이 현저히 감소하여 다핵세포를 못이루는 현상을 보여주어, 실제로 근위축증의 현상이 나타나는 것으로 확인되었다(실시예 4). 이러한 결과로부터, 도 7에 나타낸 바와 같이, 근육줄기세포 분화 시 정상인 Fbxw7의 발현이 이루어지지 않고 근아세포 단계에서 비정상적인 Fbxw7 베타의 과잉발현이 이루어질 경우, 근위축증에서 증가하는 미오게닌, atrogin-1 및 MuRF-1의 발현이 증가하고 실제로 근아세포의 분화가 이루어지지 않아, 근육위축증이 나타나는 것으로 밝혀졌다.
즉, 본 발명자들은 Fbxw7 베타는 근위축증 진단의 바이오마커로서 사용될 수 있을 뿐만 아니라, 미오게닌 증가를 수반하는 근위축증 치료의 타겟 유전자로서 사용될 수 있음을 확인하였다.
따라서, 본 발명은 일 측면에 있어서, 정상인에 비해 근아세포에서 발현이 증가하는 것으로서, Fbxw7 베타의 근위축증을 진단하기 위한 바이오마커로서의 용도를 제공한다.
용어 "진단"은 병태 생리의 존재 또는 특징을 확인하는 것을 의미하는 것이다. 본 발명에서의 진단은 근위축증의 여부 및/또는 그 정도를 확인하는 것이다.
용어 "진단용 마커, 진단하기 위한 마커 또는 진단 마커(diagnosis marker)"란 시험군을 정상 대조군의 조직과 비교하여 진단할 수 있는 물질로, 정상 대조군에 비해 환자군에서 증가 또는 감소를 보이는 폴리펩타이드 또는 핵산(예: mRNA 등), 지질, 당지질, 당단백질 또는 당(단당류, 이당류, 올리고당류 등) 등과 같은 유기 생체 분자 등을 포함한다. 본 발명에서의 근위축증을 진단하기 위한 마커는 정상 대조군의 근아세포 조직에 비하여, 근위축증 환자의 조직에서 특이적으로 높은 수준의 발현을 보이는 Fbxw7 베타(F-box/WD repeat-containing protein 7 β) 및 이를 코딩하는 유전자이다.
용어 "근위축증"은 미오게닌, atrogin-1, 및 MuRF-1이 과잉발현되는 것으로 공지된 임의의 근위축증을 포함하며, 구체적으로는 노화 (aging), 탈신경화 (denervation), 당뇨 또는 암과 같은 여러 가지 질병에 의해 발생하는 근위축증에서 미오게닌, atrogin-1, 및 MuRF-1등이 증가하는 것으로 보고되어 있으며, 이에 한정되는 것은 아니다.
Fbxw7 베타 단백질은 인간 및 마우스의 Fbxw7 베타 단백질을 포괄하는 의미이며, 그 유전자 및 단백질 정보는 NCBI(National Center for Biotechnical Information)에 등록되어 있다[마우스 Gene ID: NM_080428.3(SEQ ID NO: 1), NP_536353.2(SEQ ID NO: 2); 인간 Gene ID: NM_018315(SEQ ID NO: 3), NP_060785.2(SEQ ID NO: 4)].
상기 근위축증 시 정상인에 비해 발현의 정도가 증가하는 Fbxw7 베타 단백질 마커의 발현수준을 측정함으로써 근위축증 발병 여부 및 정도를 진단할 수 있다.
따라서, 본 발명은 다른 측면에 있어서,
Fbxw7 베타의 발현수준을 측정하는 제제를 포함하는, 근위축증 진단용 약학 조성물을 제공한다.
용어 "Fbxw7 베타의 발현수준을 측정하는 제제"란 근위축증 환자에서 증가하는 마커인 Fbxw7 베타 단백질의 발현 수준을 확인함으로써 마커의 검출 및/또는 정량에 사용될 수 있는 분자를 의미하며, 일 구현예에 따르면 마커에 특이적인 항체, 그 항체의 항원결합단편, 프라이머, 또는 프로브를 의미한다.
Fbxw7 베타 단백질의 발현 수준은 Fbxw7 베타 단백질의 발현양 또는 Fbxw7 베타 유전자의 mRNA 발현양을 측정함으로서 알 수 있다.
상기 단백질의 발현양을 측정하는 제제는 일 구현예에 따르면, 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 또는 그 항체의 항원결합단편 이다.
용어 "단백질 발현양 측정"이란 근위축증을 진단하기 위하여 생물학적 시료에서의 근위축증 진단 유전자에서 발현된 단백질의 발현양을 확인하는 과정으로, 본 발명의 일 구현예에 따르면 상기 단백질에 대해 특이적으로 결합하는 항체 또는 그 항체의 항원결합단편을 이용하여 단백질의 발현량을 확인할 수 있다. 이를 위한 분석방법으로는 웨스턴블랏팅, ELISA(enzyme linked immunosorbent assay), 방사선 면역분석(RIA: Radioimmunoassay), 방사 면역 확산법(radioimmunodiffusion), 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케트(rocket) 면역전기영동, 조직면역 염색, 면역침전 분석법(Immunoprecipitation Assay), 보체 고정 분석법(Complement Fixation Assay), FACS, 단백질 칩(protein chip) 등이 있으나, 이에 한정되는 것은 아니며, 이러한 분석방법은 당해 기술분야에 통상의 지식을 가진 자가 공지된 기술을 이용하여 적절히 수행할 수 있다.
용어 "항체"란 당해 기술분야에 공지된 용어로서 항원성 부위에 대하여 지시되는 특이적인 면역 글로불린을 의미한다. 본 발명에서의 항체는 본 발명의 근위축증 진단 마커인 Fbxw7 베타에 대해 특이적으로 결합하는 항체를 의미하며, Fbxw7 베타 유전자를 발현벡터에 클로닝하여 Fbxw7 베타 유전자에 의해 코딩되는 Fbxw7 베타 단백질을 얻고, 얻어진 Fbxw7 베타 단백질로부터 당해 기술분야의 통상적인 방법에 따라 항체를 제조할 수 있다. 상기 항체의 형태는 폴리클로날 항체 또는 모노클로날 항체를 포함하며, 모든 면역글로불린 항체가 포함된다. 상기 항체는 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2 개의 전체 길이의 중쇄를 갖는 완전한 형태를 의미한다. 또한, 상기 항체는 인간화 항체 등의 특수 항체도 포함된다.
용어 "항체의 항원결합단편"이란 2개의 경쇄 및 2개의 중쇄를 갖는 완전한 형태 온전한 항체의 구조를 갖지는 않지만, 항원성 부위에 대해 지시되는 특이적인 항원결합부위(결합 도메인)를 가져 항원 결합 기능을 보유하고 있는, 항체 분자의 기능적 단편을 의미하며, 예를 들어 Fab, F(ab'), F(ab')2 및 Fv 등이 있다. 상기 항원결합단편은 최소한 7개 이상의 아미노산, 바람직하게는 9 개 이상의 아미노산, 보다 바람직하는 12개 이상의 아미노산을 포함한다.
Fbxw7 베타 유전자의 mRNA 발현양을 측정하는 제제는 일 구현에에 따르면 유전자의 mRNA에 대해 특이적으로 결합하는 프라이머 쌍 또는 프로브이며, Fbxw7 베타 유전자의 핵산 서열이 알려져 있으므로, 당업자는 상기 서열을 바탕으로 이들 유전자의 mRNA에 대해 특이적으로 결합하는 프라미어 또는 프로브를 디자인할 수 있다.
용어 "mRNA 발현양 측정"이란 근위축증을 진단하기 위하여 생물학적 시료에서 근위축증 마커 유전자의 mRNA 발현정도를 확인하는 과정으로, 본 발명의 일 구현예에 따르면 mRNA에 대한 프라이머 또는 프로브를 이용하여 측정할 수 있다. 이를 위한 분석방법으로는 RT-PCR, 경쟁적 RT-PCR(competitive RT-PCR), 실시간 RT-PCR(Real-time RT-PCR), RNase 보호 분석법(RPA: RNase protection assay), 노던 블랏팅(Northern blotting), 또는 DNA 칩 등이 있으나, 이에 한정되는 것은 아니며, 이러한 분석방법은 당해 기술분야에 통상의 지식을 가진 자가 공지된 기술을 이용하여 적절히 수행할 수 있다.
용어 "프라이머"는 짧은 자유 3-말단 수산화기(free 3' hydroxyl group)를 가지는 핵산 서열로 상보적인 템플레이트(template)와 염기쌍을 형성할 수 있고 템플레이트 가닥 복사을 위한 시작 지점으로서 작용하는 짧은 핵산 서열을 말한다. 프라이머는 적절한 완충용액 및 온도에서 중합반응을 위한 시약(즉, DNA 폴리머레이트 또는 역전사효소) 및 상이한 4 가지의 뉴클레오사이드 트리포스페이트의 존재 하에서 DNA 합성을 개시할 수 있다. 본 발명의 일 구현예에 따르면 마커 Fbxw7 베타의 mRNA의 센스 및 안티센스 파라이머를 이용하여 PCR 증폭을 실시하여 원하는 생성물의 생성량의 측정을 통해 근위축증을 진단할 수 있다. PCR 조건, 센스 및 안티센스 프라이머의 길이는 당업계에 공지된 기술에 따라 적절히 선택될 수 있다.
용어 "프로브"란 mRNA외 특이적으로 결합을 이룰 수 있는 짧게는 수 염기 내지 길게는 수백 염기에 해당하는 RNA 또는 DNA 등의 핵산 단편을 의미하며 라벨링되어 있어서 특정 mRNA의 존재 유무, 함량(발현량)을 확인할 수 있다. 프로브는 올리고뉴클레오타이드(oligonucleotide) 프로브, 단쇄 DNA(single strand DNA) 프로브, 이중쇄 DNA(double strand DNA)프로브, RNA 프로브 등의 형태로 제작될 수 있다. 본 발명의 일 구현예에 따르면 근위축증 마커인 Fbxw7 베타 유전자의 mRNA와 상보적인 프로브를 이용하여 혼성화를 실시하여, 혼성화 정도를 통해 mRNA의 발현양을 측정함으로써 근위축증 여부 및 정도를 측정할 수 있다. 적절한 프로브의 선택 및 혼성화 조건은 당해 기술분야에 공지된 기술에 따라 적절히 선택할 수 있다.
본 발명의 프라이머 또는 프로브는 포스포아미다이트(phosphoramidite) 고체 지지체 합성법이나 기타 널리 공지된 방법을 이용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 이러한 핵산 서열은 또한 당해 기술분야에 공지된 다양한 방법을 통해 변형시킬 수 있다. 이러한 변형의 예로는 메틸화, 캡화, 천연 뉴클레오티드 하나 이상의 동족체로의 치환, 및 뉴클레오티드 간의 변형, 예를 들면 하전되지 않은 연결체(예: 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스테르, 포스포로아미데이트, 카바메이트 등) 또는 하전된 연결체(예: 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 등)로의 변형이 있다.
상기 Fbxw7 베타 단백질 및 그 유전자의 mRNA 발현량은 근위축증 환자의 근아세포에서 특이적으로 증가하므로, 상기 본 발명에 따른 근위축증 진단용 조성물은 근위축증이 의심되는 환자의 근아세포에서의 Fbxw7 베타 단백질 발현 수준을 측정하는데 이용될 수 있다.
따라서, 본 발명의 또 다른 측면은 상기 근위축증 진단용 약학 조성물을 포함하는, 근위축증 진단용 키트를 제공한다.
본 발명의 근위축증 진단용 키트는 근위축증 진단 마커인 Fbxw7 베타 단백질의 발현수준을 그 유전자의 mRNA 또는 그 단백질의 발현양을 측정함으로써 근위축증을 진단할 수 있다. 본 발명의 근위축증 진단용 키트는 앞서 설명한 Fbxw7 베타 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제, 즉 Fbxw7 베타 단백질에 특이적으로 결합하는 항체 또는 그 항체의 면역결합단편, Fbxw7 베타 단백질을 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머 또는 프로브, 또는 이들의 조합을 포함할 뿐만 아니라, 그 키트가 이용하는 Fbxw7 베타 단백질 발현수준을 측정하는 분석방법에 적합한 하나 이상의 다른 구성성분 조성물, 용액 또는 장치를 포함할 수 있다.
일 구현예에 따르면, 본 발명의 근위축증 진단용 키트는 Fbxw7 베타 단백질의 mRNA의 발현양을 측정하기 위한 키트일 경우, RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있다. RT-PCR 키트는 마커 유전자의 mRNA에 대한 특이적인 각각의 프라이머쌍 이외에도 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액, 데옥시리보뉴클레오티드(dNTPs), Taq-폴리머라제 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNase 억제제, DEPC-수(dEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한, 정량 대조군으로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 쌍을 포함할 수 있다.
다른 구현예에 따르면, 본 발명의 근위축증 진단용 키트는 Fbxw7 베타 단백질에 대해 특이적으로 결합하는 항체, 항체의 면역학적 검출을 위하여 기질, 적합한 완충용액, 발색 효소 또는 형광물질로 표지된 2차 항체, 발색 기질을 포함할 수 있다. 상기 기질은 니트로셀룰로오스 막, 폴리비닐 수지로 합성된 96 웰 플레이트, 폴리스티렌 수지로 합성된 96 웰 플레이트 및 유리 슬라이드글라스 등이 이용될 수 있고, 발색효소는 퍼옥시다아제(peroxidase), 알칼라인 포스파타아제(alkaline phosphatase)가 사용될 수 있고, 형광물질은 FITC, RITC 등이 사용될 수 있고, 발색 기질은 ABTS(2,2'-아지노-비스(3-에틸벤조티아졸린-6-설폰산)) 또는 OPD(o-페닐렌디아민), TMB(테트라메틸 벤지딘) 등이 사용될 수 있다.
또 다른 구현예에 따르면, 본 발명의 키트는 단백질 또는 그 단백질을 코딩하는 유전자의 mRNA 발현양을 측정할 수 있는, 근위축증 진단용 마이크로어레이일 수 있다. 상기 근위축증 진단용 마이크로어레이는 상기 본 발명의 마커를 이용하여 당해 기술분야에 공지된 방법에 따라 당업자가 용이하게 제조할 수 있으며, 일 구현예에 따르면 상기 Fbxw7 베타 단백질을 코딩하는 유전자의 mRNA 또는 그의 단편에 해당하는 서열의 cDNA가 프로브로서 기판에 부착되어 있는 마이크로어레이일 수 있다.
본 발명은 또 다른 측면에 있어서,
근위축증 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여, 환자의 근아세포를 포함한 시료로부터 Fbxw7 베타의 발현수준을 측정하는 방법을 제공한다.
용어 "환자"는 근위축증이 의심되는 개체를 의미하고, 근위축증에 의해 Fbxw7 베타 단백질의 발현이 변화하는 임의의 개체를 포함하며, 바람직하게는 인간, 또는 마우스를 포함한 설치류일 수 있다.
용어 "환자의 근아세포를 포함한 시료"란 근아세포를 포함한 임의의 조직 또는 세포와 같은 시료를 포함하지만, 이에 한정되는 것은 아니다.
상기 Fbxw7 베타 단백질의 발현수준은 Fbxw7 베타 단백질의 발현양 또는 Fbxw7 베타 유전자의 mRNA 발현양을 측정함으로서 알 수 있다. 환자의 시료로부터 단백질 또는 mRNA를 분리하는 것은 당해 기술분야에 공지된 방법에 따라 당업자가 적절히 수행할 수 있다. 일 구현예에 따르면, 환자의 근육 조직을 단백질 추출용 버퍼 또는 핵산 추출용 버퍼로 균질화한 다음 원심분리후 얻어진 상등액을 환자의 시료로서 사용할 수 있다.
상기 근위축증 진단을 위한 방법에 따르면, 환자의 시료 및 정상 대조군의 Fbxw7 베타 단백질의 발현양을 비교함으로써, 근위축증을 진단할 수 있다. 구체적으로는, 근위축증이 의심되는 환자의 시료에서 Fbxw7 베타 단백질의 발현수준을 측정하고, 정상 대조군의 Fbxw7 베타 단백질의 발현수준을 측정하고 비교하여 환자의 시료에서 Fbxw7 베타 단백질의 발현수준이 더 증가하는 정도에 따라 근위축증 여부 및 그 정도를 측정할 수 있다.
또한, 본 발명에 따르면, 근아세포에서 Fbxw7 베타가 과잉 발현 시, 근위축증에서 증가하는 것으로 공지되어 있는 미오게닌, 아트로진-1, 및 MuRF-1의 발현이 증가하고 근위축증이 실제로 나타나는 것을 확인하였으므로, 근아세포에서 Fbxw7 베타의 발현을 억제하는 물질은 근위축증의 치료에 효과적인 후보약물이 될 수 있을 것으로 예상할 수 있다. 그러므로, 미지의 물질들 중에서 Fbxw7 베타의 발현 수준을 억제하는 물질을 선택함으로써 근위축증 후보약물을 선별할 수 있다
따라서, 본 발명은 또 다른 측면에 있어서,
근아세포에 시료를 처리하는 단계;
상기 처리된 근아세포 중의 Fbxw7 베타의 발현수준을 측정하는 단계; 및
상기 Fbxw7 베타의 함량이 대조군의 Fbxw7 베타의 함량에 비해 감소하는 후보약물을 선택하는 단계를 포함하는
근위축증 치료용 후보약물을 스크리닝하는 방법을 제공한다.
상기 Fbxw7 베타의 발현수준은 앞서 언급한 바와 같이 Fbxw7 베타의 발현양 또는 Fbxw7 베타의 유전자의 mRNA 발현양을 측정함으로써 수행할 수 있으며, 상기 본 명세서에 기재된 Fbxw7 베타의 발현양 또는 Fbxw7 베타의 유전자의 mRNA 발현양 측정에 사용하는 방법이 그대로 적용될 수 있다.
본 발명에 따르면, 근위축증을 진단할 수 있는 바이오마커를 발견하였으므로, 근위축증의 우려가 있는 환자의 근위축증을 효과적으로 진단할 수 있다. 뿐만 아니라, 상기 바이오마커는 근위축증에서 증가하는 현상을 나타내므로, 근위축증 치료용 후보약물의 스크리닝을 위한 타겟 유전자로서 사용될 수 있어, 근위축증 치료용 후보약물의 개발에 기여할 수 있다.
도 1은 근육손상부위 이동된 근육줄기세포가 근아세포(myoblast), 근세포, 근섬유의 순서로 분화하는 과정의 흐름도이다.
도 2는 근아세포의 분화시간에 상태에 따른 Fbxw7 베타의 유전적 발현을 PCR로 확인한 사진이다.
도 3은 Fbxw7이 과잉발현된 근아세포에서의 미오게닌의 유전적 발현을 PCR로 확인한 사진이다.
도 4는 Fbxw7이 과잉발현된 근아세포에서의 미오게닌 단백질 발현을 웨스턴 블랏으로 확인한 사진이다.
도 5는 Fbxw7이 과잉발현된 근아세포에서의 미오게닌, 아트로진-1, 및 MuRF-1의 유전적 발현을 PCR로 확인한 사진이다.
도 6은 Fbxw7 베타가 과잉발현된 근육줄기세포를 분화배지에서 배양한 후, 분화 마커인 embyonic myosin heavy chain 항체로 면역형광염색으로 염색한 다음, 형광현미경으로 관찰한 사진이다.
도7은 Fbxw7 베타에 의해 조절되는 근육줄기세포 분화 메커니즘 설명한 사진이다.
도 2는 근아세포의 분화시간에 상태에 따른 Fbxw7 베타의 유전적 발현을 PCR로 확인한 사진이다.
도 3은 Fbxw7이 과잉발현된 근아세포에서의 미오게닌의 유전적 발현을 PCR로 확인한 사진이다.
도 4는 Fbxw7이 과잉발현된 근아세포에서의 미오게닌 단백질 발현을 웨스턴 블랏으로 확인한 사진이다.
도 5는 Fbxw7이 과잉발현된 근아세포에서의 미오게닌, 아트로진-1, 및 MuRF-1의 유전적 발현을 PCR로 확인한 사진이다.
도 6은 Fbxw7 베타가 과잉발현된 근육줄기세포를 분화배지에서 배양한 후, 분화 마커인 embyonic myosin heavy chain 항체로 면역형광염색으로 염색한 다음, 형광현미경으로 관찰한 사진이다.
도7은 Fbxw7 베타에 의해 조절되는 근육줄기세포 분화 메커니즘 설명한 사진이다.
이하, 본 발명을 하기 실시예에 의해 더욱 구체적으로 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 본 발명에 대한 이해를 돕기 위한 것일 뿐, 어떤 의미로든 본 발명의 범위가 이들에 의해 제한되는 것은 아니다.
실시예 1: 근육줄기세포의 분화 유도 및 Fbxw7 베타 발현 RT-PCR
마우스의 근육으로부터 전경골근 (tibialis anterior) 및 장딴지근(gastrocnemius) 부위를 획득하여 분쇄배지 (DMEM/250 unit/ml 콜라게나제 타입 II)와 섞은 후 37 ℃에서 45분 동안 배양하였다. 배양 후 끝을 부러뜨린 유리 파이펫을 사용하여 근육을 잘게 분쇄하며, 분쇄된 근육에서 잘게 잘려나온 근다발 (muscle fiber)을 수거하여 PBS (phosphate buffered saline)로 2번 세척하였다. 근다발에는 근육줄기세포 (satellite cells)들이 달려 있으므로 근다발을 성장배지 (Ham's F10/20% Horse serum/1% Penicillin-streptomycin/ 5 ng/ml basic FGF)에 섞어 매트리젤이 도장되어 있는 배양접시에서 배양하였다 (배양조건 37 ℃, 5% CO2).
다음날 근다발로부터 분리되어져 나온 근육줄기세포를 계속 배양함으로써 근아세포(myoblast)를 수득하였다. 이러한 근아세포를 분화배지(DMEM/3% horse serum/1% Penicillin-streptomycin)에 배양한 후 1, 6, 12, 및 48 시간동안에 분화된 세포를 얻어 Fbxw7 베타의 발현을 확인하였다. 구체적으로는, 각각의 상기 분화된 세포를 트리졸(TRIzol, Invitrogen)로 용해시킨 다음, 4℃, 12000 rpm에서 20분 동안 원심분리시킨 후, RNA 상층액을 새 튜브로 옮겼다. 상층액과 동량의 이소프로판올을 첨가한 후 다시 4℃, 12000 rpm에서 20분 동안 원심분리시켰다. 상층액은 버리고, 침전된 RNA에 70% 에탄올을 첨가한 후 같은 조건으로 다시 원심분리한 후 에탄올을 제거하였다. 추출된 RNA를 상온에서 건조시킨 후 DEPC water에 녹여 농도를 측정하였다. 각각의 RNA를 Takara PrimeScript를 이용하여 cDNA 합성 후, SEQ ID NO: 5 및 6의 프라이머로 PCR을 수행하여 도 2에 나타내었다.
도 2는 근아세포의 분화시간에 따른 Fbxw7 베타의 유전적 발현을 PCR로 확인한 사진이다.
도 2에서 보여지는 것과 같이 Fbxw7은 분화 1 시간째 증가하였다가 그 후 차츰 감소하여 분화가 끝난 48시간 후에는 완전히 사라지는 것을 확인하였다. 이로부터 근아세포의 분화시간에 따른 Fbxw7의 발현 정도를 확인할 수 있었다.
실시예 2: Fbxw7 베타 과잉발현에 따른 미오게닌의 발현 RT-PCR과 웨스턴블랏
Fbxw7에 의해 근아세포에서 어떤 유전자가 유도되어지는 알아보기 위해 Fbxw7 아데노바이러스를 37℃, 1시간 30 분동안 근아세포에 감염시켜 인위적으로 과잉발현 시켰다. 과잉발현된 근아세포를 실시예 1에서의 방법과 같이 mRNA를 추출하여 근아세포의 분화를 조절하는 미오게닌의 발현을 확인해 보았다. 추출한 mRNA를 Takara PrimeScript를 이용하여 cDNA 합성 후, SEQ ID NO: 7 및 8의 프라이머로 PCR을 수행하여 도 3에 나타내었다.
도 3은 Fbxw7이 과잉발현된 근아세포에서의 미오게닌의 유전적 발현을 PCR로 확인한 사진이다.
미오게닌 단백질 발현을 확인해 보기 위해 Fbxw7 과잉발현된 근아세포를 Proprep(Intron)으로 용해시켜 얼음에 20분간 방치 한 뒤, 4℃, 12000 rpm으로 원심분리하여 단백질 상층액을 얻었다. 미오게닌의 단백질 발현은 항-미오게닌 항체 (BD Pharmingen)로 검출하여 도 4에 나타내었다.
도 4는 Fbxw7이 과잉발현된 근아세포에서의 미오게닌 단백질 발현을 웨스턴 블랏으로 확인한 사진이다.
상기 도 3 및 도 4에 따르면, 근육아세포에서의 Fbxw7의 과잉발현 시, 미오게닌의 mRNA와 단백질의 발현이 확연히 증가하는 것으로 나타났다.
실시예 3: Fbxw7 베타 과잉발현에 따른 아트로진-1, MuRF-1의 발현 RT-PCR
실시예 2에서의 근아세포이 미오게닌의 증가에 따라 하위 유전자의 발현이 어떻게 변화하는지에 대해서도 실험하였다. 아트로진-1과 MuRF-1은 근육의 위축증을 유발하는 중심유전자로서 미오게닌에 의해 유도되어진다는 것이 알려져 있다. 본 실시예 3에서는 Fbxw7에 의해 유도된 미오게닌이 아트로진-1 및 MuRF-1의 발현을 조절할 수 있는지를 확인하기 위해, 상기 실시예 2에서의 Fbxw7 베타가 과잉발현되는 근아세포로부터 실시예 1에서의 방법과 같이 mRNA를 추출하여 아트로진-1 및 MuRF-1 각각의 발현의 발현을 확인해 보았다. 추출한 아트로진-1 mRNA를 Takara PrimeScript를 이용하여 cDNA 합성 후, SEQ ID NO: 9 및 10의 프라이머로 PCR을 수행하였다. 또한, 추출한 MuRF-1 mRNA를 Takara PrimeScript를 이용하여 cDNA 합성 후, SEQ ID NO: 11 및 12의 프라이머로 PCR을 수행하였다. 그 결과를 도 5에 나타내었다.
도 5는 Fbxw7이 과잉발현된 근아세포에서의 미오게닌, 아트로진-1, 및 MuRF-1의 유전적 발현을 PCR로 확인한 사진이다.
실시예 4: Fbxw7 베타 과잉발현에 따른 근아세포의 분화 억제 확인
Fbxw7 베타의 과잉발현이 미오게닌, 아트로진-1, 및 MuRF-1 유전자의 발현 조절을 통해 근아세포의 분화를 억제할 수 있는 지를 확인하기 위하여, Fbxw7 베타가 과잉발현된 근아세포를 분화배지 (DMEM/3% horse serum/1% penicillin-streptomycin)에서 72 시간 동안 배양하였다. 배양물에 대해 분화마커인 embyonic myosin heavy chain 항체로 면역형광염색으로 염색한 다음, 형광현미경으로 관찰한 사진을 도 6에 나타내었다.
도 6은 Fbxw7 베타가 과잉발현된 근육줄기세포를 분화배지에서 배양한 후, 분화 마커인 embyonic myosin heavy chain 항체로 면역형광염색으로 염색한 다음, 형광현미경으로 관찰한 사진이다.
도 6에 따르면, Fbxw7 베타가 과잉발현된 근아세포는 분화배지에서 분화력이 현저히 줄어들어 다핵세포를 이루는 못하는 현상을 확인할 수 있다. 따라서, Fbxw7 베타가 과잉발현된 근아세포는 분화가 이루어지지 못하고, 근위축증의 병리학적 증세를 유발할 것임을 알 수 있다.
이상으로 본 발명 내용의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서, 이러한 구체적 기술은 단지 바람직한 실시양태일 뿐이며, 이에 의해 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백할 것이다. 따라서 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항들과 그것들의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
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<120> Biomarkers for predicting heart or lung damage caused by
radiation exposure and a diagnosing method thereof
<130> pn098217
<160> 12
<170> KopatentIn 2.0
<210> 1
<211> 3728
<212> DNA
<213> Mus musculus
<220>
<221> CDS
<222> (163)..(2049)
<400> 1
accctggact gcaccattct gtgttcaagg gaagatgtaa tctgatccct ctgctgctga 60
gggaggaatc tgttcagtca aggctttgac agggcatagt ctcctccaat aatcttgtgg 120
gttctcgctc attattcccc gagttctcct cagtggagct gc atg cgt gtg 171
Met Arg Val
1
tgc gtc ccg agc agc gtt ctg gtt ctg agc tgc gtc tgc tgg tgc tgg 219
Cys Val Pro Ser Ser Val Leu Val Leu Ser Cys Val Cys Trp Cys Trp
5 10 15
gga gtt ttg ctg ccg gtt ccg ctg cct aat ctt cct ttt ctg gcg tgc 267
Gly Val Leu Leu Pro Val Pro Leu Pro Asn Leu Pro Phe Leu Ala Cys
20 25 30 35
ctg agc atg tcc acg tta gaa tct gtg aca tac cta cct gaa aag ggg 315
Leu Ser Met Ser Thr Leu Glu Ser Val Thr Tyr Leu Pro Glu Lys Gly
40 45 50
tta tat tgt cag aga ctg cca agc agc cgg aca cac ggg ggc aca gaa 363
Leu Tyr Cys Gln Arg Leu Pro Ser Ser Arg Thr His Gly Gly Thr Glu
55 60 65
tcc ctg aag ggg aaa aat aca gaa aat atg ggt ttc tac ggc aca tta 411
Ser Leu Lys Gly Lys Asn Thr Glu Asn Met Gly Phe Tyr Gly Thr Leu
70 75 80
aaa atg att ttt tac aaa atg aaa aga aag ttg gac cat ggt tct gaa 459
Lys Met Ile Phe Tyr Lys Met Lys Arg Lys Leu Asp His Gly Ser Glu
85 90 95
gtt cgt tcc ttt tct ttg gga aag aaa cca tgc aaa gtc tca gat tat 507
Val Arg Ser Phe Ser Leu Gly Lys Lys Pro Cys Lys Val Ser Asp Tyr
100 105 110 115
acc agt acc act ggc ctt gta cca tgt tca gca aca cca aca act ttt 555
Thr Ser Thr Thr Gly Leu Val Pro Cys Ser Ala Thr Pro Thr Thr Phe
120 125 130
ggg gac ctg aga gca gcc aat ggg caa ggg cag cag cgg cgg agg att 603
Gly Asp Leu Arg Ala Ala Asn Gly Gln Gly Gln Gln Arg Arg Arg Ile
135 140 145
aca tct gtc caa cca ccc aca ggc ctt caa gag tgg ctg aaa atg ttt 651
Thr Ser Val Gln Pro Pro Thr Gly Leu Gln Glu Trp Leu Lys Met Phe
150 155 160
cag agc tgg agc gga cca gag aag ttg ctg gct tta gat gag ctc att 699
Gln Ser Trp Ser Gly Pro Glu Lys Leu Leu Ala Leu Asp Glu Leu Ile
165 170 175
gac agc tgt gaa cca aca caa gtg aag cat atg atg caa gtg ata gag 747
Asp Ser Cys Glu Pro Thr Gln Val Lys His Met Met Gln Val Ile Glu
180 185 190 195
ccc cag ttc cag cga gac ttc atc tcc ttg ctt cct aaa gag ttg gca 795
Pro Gln Phe Gln Arg Asp Phe Ile Ser Leu Leu Pro Lys Glu Leu Ala
200 205 210
ctc tat gtg ctt tca ttc ctg gaa ccc aaa gac ctg ctg caa gcg gct 843
Leu Tyr Val Leu Ser Phe Leu Glu Pro Lys Asp Leu Leu Gln Ala Ala
215 220 225
cag act tgt cga tac tgg aga att ttg gct gag gat aac ctt ctc tgg 891
Gln Thr Cys Arg Tyr Trp Arg Ile Leu Ala Glu Asp Asn Leu Leu Trp
230 235 240
aga gag aaa tgt aaa gaa gag ggg att gat gaa ccg ttg cac atc aag 939
Arg Glu Lys Cys Lys Glu Glu Gly Ile Asp Glu Pro Leu His Ile Lys
245 250 255
aga aga aaa ata ata aaa cca ggt ttc ata cac agc cca tgg aag agt 987
Arg Arg Lys Ile Ile Lys Pro Gly Phe Ile His Ser Pro Trp Lys Ser
260 265 270 275
gcg tat atc aga cag cac aga att gat aca aac tgg aga cga gga gaa 1035
Ala Tyr Ile Arg Gln His Arg Ile Asp Thr Asn Trp Arg Arg Gly Glu
280 285 290
ctc aaa tct cct aag gtg ctg aaa ggg cat gat gac cat gtg atc aca 1083
Leu Lys Ser Pro Lys Val Leu Lys Gly His Asp Asp His Val Ile Thr
295 300 305
tgc cta cag ttt tgt ggc aac cgc ata gtt agt ggt tct gat gac aac 1131
Cys Leu Gln Phe Cys Gly Asn Arg Ile Val Ser Gly Ser Asp Asp Asn
310 315 320
act tta aaa gtt tgg tca gcg gtc acg ggc aag tgt ctg aga acg tta 1179
Thr Leu Lys Val Trp Ser Ala Val Thr Gly Lys Cys Leu Arg Thr Leu
325 330 335
gtg gga cat aca ggt gga gtg tgg tca tca cag atg aga gac aat atc 1227
Val Gly His Thr Gly Gly Val Trp Ser Ser Gln Met Arg Asp Asn Ile
340 345 350 355
atc atc agt gga tcg act gac cgg act ctc aaa gtg tgg aat gct gaa 1275
Ile Ile Ser Gly Ser Thr Asp Arg Thr Leu Lys Val Trp Asn Ala Glu
360 365 370
act gga gag tgt ata cat act tta tat ggg cac act tct act gta cgg 1323
Thr Gly Glu Cys Ile His Thr Leu Tyr Gly His Thr Ser Thr Val Arg
375 380 385
tgt atg cat ctc cat gaa aaa agg gtt gta agc ggt tct cga gat gcc 1371
Cys Met His Leu His Glu Lys Arg Val Val Ser Gly Ser Arg Asp Ala
390 395 400
act ctc agg gtt tgg gat att gag acc ggc cag tgt tta cac gtc ctg 1419
Thr Leu Arg Val Trp Asp Ile Glu Thr Gly Gln Cys Leu His Val Leu
405 410 415
atg ggt cac gta gca gcg gtc cgc tgc gtt cag tat gat ggc agg agg 1467
Met Gly His Val Ala Ala Val Arg Cys Val Gln Tyr Asp Gly Arg Arg
420 425 430 435
gtt gtt agt gga gct tat gat ttt atg gtg aag gtg tgg gat cca gag 1515
Val Val Ser Gly Ala Tyr Asp Phe Met Val Lys Val Trp Asp Pro Glu
440 445 450
act gag acc tgt cta cac acg tta cag gga cac act aat aga gtc tat 1563
Thr Glu Thr Cys Leu His Thr Leu Gln Gly His Thr Asn Arg Val Tyr
455 460 465
tca tta cag ttt gat ggc atc cat gtg gtg agt gga tct ctt gat aca 1611
Ser Leu Gln Phe Asp Gly Ile His Val Val Ser Gly Ser Leu Asp Thr
470 475 480
tca atc cga gtc tgg gat gtg gag aca ggg aat tgt att cac acg cta 1659
Ser Ile Arg Val Trp Asp Val Glu Thr Gly Asn Cys Ile His Thr Leu
485 490 495
aca gga cac cag tca tta acg agt gga atg gaa ctc aaa gac aat att 1707
Thr Gly His Gln Ser Leu Thr Ser Gly Met Glu Leu Lys Asp Asn Ile
500 505 510 515
ctt gtc tct ggg aat gca gat tct aca gtt aag atc tgg gat atc aaa 1755
Leu Val Ser Gly Asn Ala Asp Ser Thr Val Lys Ile Trp Asp Ile Lys
520 525 530
aca gga cag tgt tta caa act ttg caa ggt ccc agc aag cat cag agc 1803
Thr Gly Gln Cys Leu Gln Thr Leu Gln Gly Pro Ser Lys His Gln Ser
535 540 545
gct gtg acc tgc tta cag ttc aac aag aac ttc gta att acc agc tca 1851
Ala Val Thr Cys Leu Gln Phe Asn Lys Asn Phe Val Ile Thr Ser Ser
550 555 560
gac gac gga acg gtc aaa ctc tgg gac ttg aaa acg ggt gaa ttt atc 1899
Asp Asp Gly Thr Val Lys Leu Trp Asp Leu Lys Thr Gly Glu Phe Ile
565 570 575
cga aac ctc gtc aca ttg gag agt ggg ggg agc ggg gga gtt gtg tgg 1947
Arg Asn Leu Val Thr Leu Glu Ser Gly Gly Ser Gly Gly Val Val Trp
580 585 590 595
cgg atc agg gcc tca aac aca aag ctg gtg tgt gca gtc ggg agt cgg 1995
Arg Ile Arg Ala Ser Asn Thr Lys Leu Val Cys Ala Val Gly Ser Arg
600 605 610
aat gga act gag gaa acc aag ctc ctg gtg ctg gac ttt gat gtg gac 2043
Asn Gly Thr Glu Glu Thr Lys Leu Leu Val Leu Asp Phe Asp Val Asp
615 620 625
atg aaa t gaaaagcaga catgatgaat tttgtccaac tgtgtagaca atatactccc 2100
Met Lys
tacccttccc cctgcgcaaa aaacaaaaac aaacaaacaa aaaaatgaaa aaaaaaaaca 2160
gaaaaaaaaa aagagaaaaa agaaaaggaa aaaaatccct tgtactcagt ggtgcaggat 2220
gttggcttgg gacaacagac tgaaaagacc tacagactaa gaaggcaaga agagacaaga 2280
gaccgtaact gacaggaggc ggcagctgtc gcatctcgca aaggcctcac ttgtgactga 2340
ggggcagctt ggcaagacga ctctctaaat ccaaccaggt gcaattattc tttgttttct 2400
tctccagtgg tcattgagca gagctacatc agcgttgtta ccgtcaccta gaaaggagtg 2460
gcagtaatat ccaaacacgg gctgcttatc ttctaatcag agcatctgca acaaaccgtc 2520
atttttctga agtggaaaag cttaaaacaa ttactgtgaa ttgtttttgt acagttatca 2580
tgaagctttc ttttttctct ttttcctgtt tctcttcttt tcttttttct tttttttttt 2640
tgccaaccat tgccaatgtc aatcaatcac agtattagcc tctgttaatc tatctcttta 2700
ctgttgcttc tactcttcaa tgcatatgtt gctcaaaggt ggcaagttgt cctgggttgt 2760
gtgagtcctg agatggatat aattcttgat gctggtgcta gaagtaggtc ttcaaatccg 2820
gggtcgttgt cccacccctg tactgtactc ccagtggcca aacttattta tgctgctaaa 2880
tgaaagaaag aaaaagcaaa ttattttttt tttatttttt ttctgctgtg acgttttagt 2940
cccagactga attccaaatt tgctctagtt tggttacaga aaaaaaagac ttttttgcca 3000
ctgaaacttg agccatctgt gcctctaaga ggctgagaat ggaaaagttt cagataataa 3060
agagtgaagt ttgcctgcaa ataaagaatt gagagtgtgt gcaaagctta ttttctttta 3120
tctgggcaaa aattaaaaca cattccttgg gacagagcct gaggtgcctg ttctgtggag 3180
aaacttcttt ttgagggctg tggtgaatgg aagaacatac atagcaaaac tgacaagata 3240
ttttaaagat atataaaaca caaaggaaaa ggaggttgct ggtcagtcgt agcatcttac 3300
agtattgggg aaaacaactg ttacagtttc attgctctga gtgactgacg tgagaggaat 3360
tcgctctgca gtgacgctgt ctgtcactcg cctaccagct cgacgagcaa gagagcggga 3420
gtcagatggt ccgcctcatt caccaggagc cgtaactcaa gctgaactgt gaaagtggtt 3480
aacactgtat cctaggccgt cttttttttc ctcctcctgt ttattttttg tttgttttat 3540
ttatagtctg atttaaaaca atcagattca agttggttaa ttttagttat gtaacaacct 3600
gacgtgatgg aggaaacaac ctgtaaaggg attgtgtcta tggtttgatt cacttagaaa 3660
ttttattttc ttataactta agtgcaataa aatgtgtttt ttcatgttaa aaaaaaaaaa 3720
aaaaaaaa 3728
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<211> 3751
<212> DNA
<213> Homo sapiens
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<221> CDS
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cttacgggtt ccctggagcg gatcaccata taattgatgt gcagtctgca ttgctgaatc 60
ctggactgca ccattctgtg ttcaagggaa gatgtaatct gatccctctg ctgctgaggg 120
aggaatctgt tcagtcaagg ctttgacagg gcatagtctc ctccaataat cttctccgtt 180
ctctctcatt attccctcga gttcttctca gtcaagctgc atgtatgt atg tgt gtc 237
Met Cys Val
1
ccg aga agc ggt ttg ata ctg agc tgc att tgc ctt tac tgt gga gtt 285
Pro Arg Ser Gly Leu Ile Leu Ser Cys Ile Cys Leu Tyr Cys Gly Val
5 10 15
ttg ttg ccg gtt ctg ctc cct aat ctt cct ttt ctg acg tgc ctg agc 333
Leu Leu Pro Val Leu Leu Pro Asn Leu Pro Phe Leu Thr Cys Leu Ser
20 25 30 35
atg tcc aca tta gaa tct gtg aca tac cta cct gaa aaa ggt tta tat 381
Met Ser Thr Leu Glu Ser Val Thr Tyr Leu Pro Glu Lys Gly Leu Tyr
40 45 50
tgt cag aga ctg cca agc agc cgg aca cac ggg ggc aca gaa tca ctg 429
Cys Gln Arg Leu Pro Ser Ser Arg Thr His Gly Gly Thr Glu Ser Leu
55 60 65
aag ggg aaa aat aca gaa aat atg ggt ttc tac ggc aca tta aaa atg 477
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70 75 80
att ttt tac aaa atg aaa aga aag ttg gac cat ggt tct gag gtc cgc 525
Ile Phe Tyr Lys Met Lys Arg Lys Leu Asp His Gly Ser Glu Val Arg
85 90 95
tct ttt tct ttg gga aag aaa cca tgc aaa gtc tca gaa tat aca agt 573
Ser Phe Ser Leu Gly Lys Lys Pro Cys Lys Val Ser Glu Tyr Thr Ser
100 105 110 115
acc act ggg ctt gta cca tgt tca gca aca cca aca act ttt ggg gac 621
Thr Thr Gly Leu Val Pro Cys Ser Ala Thr Pro Thr Thr Phe Gly Asp
120 125 130
ctc aga gca gcc aat ggc caa ggg caa caa cga cgc cga att aca tct 669
Leu Arg Ala Ala Asn Gly Gln Gly Gln Gln Arg Arg Arg Ile Thr Ser
135 140 145
gtc cag cca cct aca ggc ctc cag gaa tgg cta aaa atg ttt cag agc 717
Val Gln Pro Pro Thr Gly Leu Gln Glu Trp Leu Lys Met Phe Gln Ser
150 155 160
tgg agt gga cca gag aaa ttg ctt gct tta gat gaa ctc att gat agt 765
Trp Ser Gly Pro Glu Lys Leu Leu Ala Leu Asp Glu Leu Ile Asp Ser
165 170 175
tgt gaa cca aca caa gta aaa cat atg atg caa gtg ata gaa ccc cag 813
Cys Glu Pro Thr Gln Val Lys His Met Met Gln Val Ile Glu Pro Gln
180 185 190 195
ttt caa cga gac ttc att tca ttg ctc cct aaa gag ttg gca ctc tat 861
Phe Gln Arg Asp Phe Ile Ser Leu Leu Pro Lys Glu Leu Ala Leu Tyr
200 205 210
gtg ctt tca ttc ctg gaa ccc aaa gac ctg cta caa gca gct cag aca 909
Val Leu Ser Phe Leu Glu Pro Lys Asp Leu Leu Gln Ala Ala Gln Thr
215 220 225
tgt cgc tac tgg aga att ttg gct gaa gac aac ctt ctc tgg aga gag 957
Cys Arg Tyr Trp Arg Ile Leu Ala Glu Asp Asn Leu Leu Trp Arg Glu
230 235 240
aaa tgc aaa gaa gag ggg att gat gaa cca ttg cac atc aag aga aga 1005
Lys Cys Lys Glu Glu Gly Ile Asp Glu Pro Leu His Ile Lys Arg Arg
245 250 255
aaa gta ata aaa cca ggt ttc ata cac agt cca tgg aaa agt gca tac 1053
Lys Val Ile Lys Pro Gly Phe Ile His Ser Pro Trp Lys Ser Ala Tyr
260 265 270 275
atc aga cag cac aga att gat act aac tgg agg cga gga gaa ctc aaa 1101
Ile Arg Gln His Arg Ile Asp Thr Asn Trp Arg Arg Gly Glu Leu Lys
280 285 290
tct cct aag gtg ctg aaa gga cat gat gat cat gtg atc aca tgc tta 1149
Ser Pro Lys Val Leu Lys Gly His Asp Asp His Val Ile Thr Cys Leu
295 300 305
cag ttt tgt ggt aac cga ata gtt agt ggt tct gat gac aac act tta 1197
Gln Phe Cys Gly Asn Arg Ile Val Ser Gly Ser Asp Asp Asn Thr Leu
310 315 320
aaa gtt tgg tca gca gtc aca ggc aaa tgt ctg aga aca tta gtg gga 1245
Lys Val Trp Ser Ala Val Thr Gly Lys Cys Leu Arg Thr Leu Val Gly
325 330 335
cat aca ggt gga gta tgg tca tca caa atg aga gac aac atc atc att 1293
His Thr Gly Gly Val Trp Ser Ser Gln Met Arg Asp Asn Ile Ile Ile
340 345 350 355
agt gga tct aca gat cgg aca ctc aaa gtg tgg aat gca gag act gga 1341
Ser Gly Ser Thr Asp Arg Thr Leu Lys Val Trp Asn Ala Glu Thr Gly
360 365 370
gaa tgt ata cac acc tta tat ggg cat act tcc act gtg cgt tgt atg 1389
Glu Cys Ile His Thr Leu Tyr Gly His Thr Ser Thr Val Arg Cys Met
375 380 385
cat ctt cat gaa aaa aga gtt gtt agc ggt tct cga gat gcc act ctt 1437
His Leu His Glu Lys Arg Val Val Ser Gly Ser Arg Asp Ala Thr Leu
390 395 400
agg gtt tgg gat att gag aca ggc cag tgt tta cat gtt ttg atg ggt 1485
Arg Val Trp Asp Ile Glu Thr Gly Gln Cys Leu His Val Leu Met Gly
405 410 415
cat gtt gca gca gtc cgc tgt gtt caa tat gat ggc agg agg gtt gtt 1533
His Val Ala Ala Val Arg Cys Val Gln Tyr Asp Gly Arg Arg Val Val
420 425 430 435
agt gga gca tat gat ttt atg gta aag gtg tgg gat cca gag act gaa 1581
Ser Gly Ala Tyr Asp Phe Met Val Lys Val Trp Asp Pro Glu Thr Glu
440 445 450
acc tgt cta cac acg ttg cag ggg cat act aat aga gtc tat tca tta 1629
Thr Cys Leu His Thr Leu Gln Gly His Thr Asn Arg Val Tyr Ser Leu
455 460 465
cag ttt gat ggt atc cat gtg gtg agt gga tct ctt gat aca tca atc 1677
Gln Phe Asp Gly Ile His Val Val Ser Gly Ser Leu Asp Thr Ser Ile
470 475 480
cgt gtt tgg gat gtg gag aca ggg aat tgc att cac acg tta aca ggg 1725
Arg Val Trp Asp Val Glu Thr Gly Asn Cys Ile His Thr Leu Thr Gly
485 490 495
cac cag tcg tta aca agt gga atg gaa ctc aaa gac aat att ctt gtc 1773
His Gln Ser Leu Thr Ser Gly Met Glu Leu Lys Asp Asn Ile Leu Val
500 505 510 515
tct ggg aat gca gat tct aca gtt aaa atc tgg gat atc aaa aca gga 1821
Ser Gly Asn Ala Asp Ser Thr Val Lys Ile Trp Asp Ile Lys Thr Gly
520 525 530
cag tgt tta caa aca ttg caa ggt ccc aac aag cat cag agt gct gtg 1869
Gln Cys Leu Gln Thr Leu Gln Gly Pro Asn Lys His Gln Ser Ala Val
535 540 545
acc tgt tta cag ttc aac aag aac ttt gta att acc agc tca gat gat 1917
Thr Cys Leu Gln Phe Asn Lys Asn Phe Val Ile Thr Ser Ser Asp Asp
550 555 560
gga act gta aaa cta tgg gac ttg aaa acg ggt gaa ttt att cga aac 1965
Gly Thr Val Lys Leu Trp Asp Leu Lys Thr Gly Glu Phe Ile Arg Asn
565 570 575
cta gtc aca ttg gag agt ggg ggg agt ggg gga gtt gtg tgg cgg atc 2013
Leu Val Thr Leu Glu Ser Gly Gly Ser Gly Gly Val Val Trp Arg Ile
580 585 590 595
aga gcc tca aac aca aag ctg gtg tgt gca gtt ggg agt cgg aat ggg 2061
Arg Ala Ser Asn Thr Lys Leu Val Cys Ala Val Gly Ser Arg Asn Gly
600 605 610
act gaa gaa acc aag ctg ctg gtg ctg gac ttt gat gtg gac atg aag t 2110
Thr Glu Glu Thr Lys Leu Leu Val Leu Asp Phe Asp Val Asp Met Lys
615 620 625
gaagagcaga aaagatgaat ttgtccaatt gtgtagacga tatactccct gcccttcccc 2170
ctgcaaaaag aaaaaaagaa aagaaaaaga aaaaaatccc ttgttctcag tggtgcagga 2230
tgttggcttg gggcaacaga ttgaaaagac ctacagacta agaaggaaaa gaagaagaga 2290
tgacaaacca taactgacaa gagaggcgtc tgctgtctca tcacataaaa ggcttcactt 2350
ttgactgagg gcagctttgc aaaatgagac tttctaaatc aaaccaggtg caattatttc 2410
tttattttct tctccagtgg tcattgggca gtgttaatgc tgaaacatca ttacagattc 2470
tgctagcctg ttcttttacc actgacagct agacacctag aaaggaactg caataatatc 2530
aaaacaagta ctggttgact ttctaattag agagcatctg caacaaaaag tcatttttct 2590
ggagtggaaa agcttaaaaa aattactgtg aattgttttt gtacagttat catgaaaagc 2650
tttttttttt ttttttttgc caaccattgc caatgtcaat caatcacagt attagcctct 2710
gttaatctat ttactgttgc ttccatatac attcttcaat gcatatgttg ctcaaaggtg 2770
gcaagttgtc ctgggttctg tgagtcctga gatggattta attcttgatg ctggtgctag 2830
aagtaggtct tcaaatatgg gattgttgtc ccaaccctgt actgtactcc cagtggccaa 2890
acttatttat gctgctaaat gaaagaaaga aaaaagcaaa ttattttttt ttattttttt 2950
tctgctgtga cgttttagtc ccagactgaa ttccaaattt gctctagttt ggttatggaa 3010
aaaagacttt ttgccactga aacttgagcc atctgtgcct ctaagaggct gagaatggaa 3070
gagtttcaga taataaagag tgaagtttgc ctgcaagtaa agaattgaga gtgtgtgcaa 3130
agcttatttt cttttatctg ggcaaaaatt aaaacacatt ccttggaaca gagctattac 3190
ttgcctgttc tgtggagaaa cttttctttt tgagggctgt ggtgaatgga tgaacgtaca 3250
tcgtaaaact gacaaaatat tttaaaaata tataaaacac aaaattaaaa taaagttgct 3310
ggtcagtctt agtgttttac agtatttggg aaaacaactg ttacagtttt attgctctga 3370
gtaactgaca aagcagaaac tattcagttt ttgtagtaaa ggcgtcacat gcaaacaaac 3430
aaaatgaatg aaacagtcaa atggtttgcc tcattctcca agagccacaa ctcaagctga 3490
actgtgaaag tggtttaaca ctgtatccta ggcgatcttt tttcctcctt ctgtttattt 3550
ttttgtttgt tttatttata gtctgattta aaacaatcag attcaagttg gttaatttta 3610
gttatgtaac aacctgacat gatggaggaa aacaaccttt aaagggattg tgtctatggt 3670
ttgattcact tagaaatttt attttcttat aacttaagtg caataaaatg tgttttttca 3730
tgttaaaaaa aaaaaaaaaa a 3751
<210> 5
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Fbxw7 beta forward primer
<400> 5
ttgtcagaga ctgccaagca g 21
<210> 6
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Fbxw7 beta reverse primer
<400> 6
gactttgcat ggtttctttc cc 22
<210> 7
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Myogenin forward primer
<400> 7
tgagggagaa gcgcaggctc aag 23
<210> 8
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Myogenin reverse primer
<400> 8
atgctgtcca cgatggacgt aagg 24
<210> 9
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Atrogin-1 forward primer
<400> 9
gtccagagag tcggcaagtc 20
<210> 10
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Atrogin-1 reverse primer
<400> 10
gtagccggtc ttcactgagc 20
<210> 11
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> MuRF forward primer
<400> 11
gagaacctgg agaagcagct 20
<210> 12
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> MuRF reverse primer
<400> 12
ccgcggttgg tccagtag 18
Claims (13)
- 정상인에 비해 근아세포에서 발현이 증가하는 것으로서, Fbxw7 베타를 포함하는 근위축증 진단용 바이오마커 조성물.
- Fbxw7 베타 또는 그 면역원성 단편에 특이적으로 결합하는 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 또는 상기 Fbxw7 베타 단백질을 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머 또는 프로브를 포함하는, 상기 Fbxw7 베타의 발현수준 측정에 의한 근위축증 진단용 약학 조성물.
- 제2항에 있어서, 상기 항원 결합 단편은 scFv, (scFv)2, Fab, Fab', 또는 이들의 조합인 약학 조성물.
- 제2항에 있어서, 상기 항체는 폴리클로날 항체 또는 모노클로날 항체인 약학 조성물.
- 제2항에 있어서, 근아세포로부터 상기 Fbxw7 베타의 발현수준을 측정하는 것인 약학 조성물.
- 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 근위축증은 노화 (aging), 탈신경화 (denervation), 당뇨 또는 암에 의해 유발된 근위축증인 조성물.
- 제2항 내지 제5항 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는 근위축증 진단용 키트.
- 제7항에 있어서, 상기 Fbxw7 베타 단백질의 발현양 또는 그 단백질을 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현양을 측정할 수 있는 마이크로어레이인 근위축증 진단용 키트.
- 근위축증 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여, 환자의 근아세포로부터 Fbxw7 베타의 발현수준을 검출하는 방법.
- 근아세포를 시료로 처리하는 단계;
상기 처리된 근아세포 중의 Fbxw7 베타의 발현수준을 측정하는 단계; 및
상기 Fbxw7 베타의 발현수준이 대조군의 Fbxw7 베타의 발현수준에 비해 감소하는 시료를 선택하는 단계를 포함하는
근위축증 치료용 후보약물을 스크리닝하는 방법. - 제9항 또는 제10항에 있어서, 상기 Fbxw7 베타의 발현수준은 Fbxw7 베타 단백질 발현양 또는 Fbxw7 베타의 유전자의 mRNA 발현양을 측정하는 것인 방법.
- 제11항에 있어서, 상기 단백질 발현양의 측정은 웨스턴블랏팅, 자석비드-항체면역침강법, ELISA, 및 질량분석기에서 선택된 하나 이상의 방법에 의한 것인 방법.
- 제11항에 있어서, 상기 mRNA 발현양의 측정은 RT-PCR, 경쟁적 RT-PCR(competitive RT-PCR), 실시간 RT-PCR(Real-time RT-PCR), RNase 보호 분석법(RPA: RNase protection assay), 노던 블랏팅(Northern blotting), 및 DNA 칩에서 선택된 하나 이상의 방법에 의한 것인 방법.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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KR1020140081986A KR101587227B1 (ko) | 2014-07-01 | 2014-07-01 | 근위축증 진단용 바이오마커, 그 마커의 발현수준 측정에 의한 근위축증 진단용 약학 조성물, 및 그 마커를 이용한 근위축증 치료용 후보약물을 스크리닝하는 방법 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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KR20160003481A KR20160003481A (ko) | 2016-01-11 |
KR101587227B1 true KR101587227B1 (ko) | 2016-01-21 |
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Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20180138178A (ko) | 2017-06-19 | 2018-12-28 | 순천향대학교 산학협력단 | 근원세포 분화 억제 조성물, 이를 이용한 근육 소모성 질환의 치료제 스크리닝 시스템 및 스크리닝 방법 |
CN110870916A (zh) * | 2018-09-03 | 2020-03-10 | 上海市第一人民医院 | Fbxw7或其上调剂在制备治疗糖尿病及防治糖尿病个体肿瘤发生的药物中的应用 |
Citations (2)
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US20090280517A1 (en) | 2008-03-18 | 2009-11-12 | University Of Maryland | Methods of diagnosis and prognosis for a muscular dystrophy |
US20120329046A1 (en) | 2011-06-27 | 2012-12-27 | National Center Of Neurology And Psychiatry | Molecular marker for evaluating pathological conditions and treatment of muscular dystrophy |
-
2014
- 2014-07-01 KR KR1020140081986A patent/KR101587227B1/ko active IP Right Grant
Patent Citations (2)
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Non-Patent Citations (1)
Title |
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Promotor hypermethylation is not the major mechanism for inactivation of the FBXW7 B-form in human gliomas (Genes Genet. Syst., (2008), Vol. 83, pp347-352) |
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KR20180138178A (ko) | 2017-06-19 | 2018-12-28 | 순천향대학교 산학협력단 | 근원세포 분화 억제 조성물, 이를 이용한 근육 소모성 질환의 치료제 스크리닝 시스템 및 스크리닝 방법 |
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