KR101224007B1 - 바이오마커를 이용한 돼지 삼겹살 함량 판정방법 및 키트 - Google Patents

바이오마커를 이용한 돼지 삼겹살 함량 판정방법 및 키트 Download PDF

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Abstract

본 발명은 새로운 돼지 육질 진단용 바이오마커 (biomarker)들, 그들의 제조방법 및 그들의 용도에 관한 것이다. 보다 상세하게는, 본 발명은 돼지 육질을 판정할 수 있는 단일염기 다형성 (SNP) 바이오마커들, (1) 돼지 육질과 연관된 단일염기 다형성 (SNPs)을 결정하고; (2) 양적 형질 유전좌위 (QTL)와의 연관성을 검정하며; 및 (3) 이 결과를 기초로 하여 돼지 삼겹살 함량의 형질을 분석하는; 과정으로 이루어진 상기 바이오마커들의 선발 방법 및 상기 바이오마커들을 종돈 선발 등에 사용하는 용도에 관한 것이다. 본 발명의 돼지 육질 진단용 바이오마커는 종돈의 유전 능력을 보다 정확하게 측정할 수 있어 우수 종돈의 육성에 널리 사용될 수 있다.

Description

바이오마커를 이용한 돼지 삼겹살 함량 판정방법 및 키트{Method of diagnosing meat quality of pig with biomarker and kit therof}
본 발명은 새로운 돼지 육질 진단용 바이오마커 (biomarker)들, 그들의 제조방법 및 그들의 용도에 관한 것이다. 보다 상세하게는, 본 발명은 돼지 육질을 판정할 수 있는 단일염기 다형성 (SNP) 바이오마커들, (1) 돼지 육질과 연관된 단일염기 다형성 (SNPs)을 결정하고; (2) 양적 형질 유전좌위 (QTL)와의 연관성을 검정하며; 및 (3) 이 결과를 기초로 하여 돼지 삼겹살 함량의 형질을 분석하는; 과정으로 이루어진 상기 바이오마커들의 선발 방법 및 상기 바이오마커들을 종돈 선발 등에 사용하는 용도에 관한 것이다.
DNA 수준에서의 정보는 생산자뿐만 아니라 육종가들에게도 특정한 주요 변이체를 선발하는데 중요한 정보를 제공해준다. 이러한 DNA 정보는 표지인자 도움 선발 (marker-assisted selection; MAS)이라고 하는 양적 형질 (quantitative trait)의 선발에 활용될 수 있다. 또한, 분자표지인자는 종축 등의 선발 정확도를 높이고 성별에 제한적인 형질의 선별할 수 있게 하며, 육질과 같은 도체 형질에 대해서 매우 유용하게 활용될 수 있다. 현재까지 몇몇 유전자 또는 표지인자가 실제로 양돈 산업에 활용되고 있다.
양돈 산업에 활용되는 유전자들 및 표지인자들
유전자, 표지인자 연관 형질, 이용분야 비 고
친자 감별 - 비 독점적 활용
HAL 육질 비 독점적 활용
ESR, PRLR, RBP4 산자수 독점적 사용(PIC)
KIT 백모색 독점적 사용(PIC)
MC1R 적색/흑모색 독점적 사용(PIC)
MC4R 성장, 비만 독점적 사용(PIC)
FUT1 부종병(E. coli F18) 독점적 사용 (PIC/ITH Switzerland)
RN 육질 비독점적 사용
(Uppsala, INRA, Kiel)
AFABP, HFABP 근내지방 비독점적(IPG)
PRKAG3 육질 독점적(PIC)
CAST 연도 독점적(PIC)
IGF2 도체 조성 독점적 사용(Seghers)
지금까지는 종축을 선발하기 위한 기존 방법으로서 단지 표현형 값에 근거하는 선발 지수식을 사용하였다. 그러나, 최근 분자 표지인자를 활용한 변이체의 선발 또는 도태가 단일 유전자에 의하여 조절되는 형질뿐만 아니라 양적 유전좌위 (quantitative trait loci, QTL)에 의해 조절되는 형질에서도 표지인자 도움 선발 (MAS)이 효과적으로 활용될 수 있다는 것이 시뮬레이션을 통해 확인되어 보고되고 있다. 또한 최근에는 게놈 프로젝트가 끝난 소와 닭에서 종축 선발 시 검정 성적에 유전체 정보를 포함하여 지수를 산출하여 이용하고 있다. 이와 같은 세계적인 추세에 따라 2009년부터는 미국과 캐나다에서 젖소의 육종가를 발표할 때 유전체 유전평가 (GBLUP)를 공식 기록으로 채택하는 등 종축 선발 시 검정 성적에 유전체 정보를 포함하여 지수를 산출하여 이용하고 있다.
구체적으로, 2010년에는 돼지 유전체 해독이 완료되어 고밀도 유전체 정보가 공개되었다. 이외에도 소와 돼지 등 주요 가축에 대한 고밀도 SNP 칩 (chip)이 제작된 바 있으며, 전체 게놈 관련 연구도 경쟁적으로 수행되고 있다. 실제로 다양한 종돈 회사들에서 HAL, ESR, PRLR, KIT, RBP4, MCIR, MC4R, RN, AFABP, HFABP 및 IGF2 등과 같은 유전자들의 단일염기 다형성 (single nucleotide polymorphism; SNPs)이 개발되어 상업화된 분자표지인자로서 종돈을 개량하는 데 활용되고 있다.
이에 본 발명자들은 돼지 종돈 선발 시 표지인자 도움 선발 (marker-assisted selection, MAS)에 활용할 수 있는 돼지 육질 진단용 바이오마커를 개발하기 위하여 노력을 계속한 결과, 돼지 육질과 연관된 단일염기 다형성 (SNPs)을 결정하여 양적 형질 유전좌위 (QTL)와의 연관성을 검정한 다음 이 결과를 기초로 하여 돼지 삼겹살 함량의 형질을 분석하는 과정으로 육질을 판정할 수 있는 단일염기 다형성 (SNP) 바이오마커들을 선발하여 제공함으로써 본 발명을 성공적으로 완성하였다.
본 발명은 돼지 육질 진단용 바이오마커 (biomarker)들, 그들의 제조방법 및 그들의 종돈 선발에 사용하는 용도를 제공하는 것을 목적으로 한다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 돼지 염색체 6번의 양적형질 유전좌위 (QTL)를 포함하는 돼지 육질을 판정할 수 있는 단일염기 다형성 (SNP) 바이오마커를 제공한다.
구체적으로, 본 발명은 서열번호 1 내지 서열번호 10의 염기 서열을 하나 이상 포함하는 단일염기 다형성 바이오마커를 제공한다.
또한, 본 발명은 (1) 돼지 육질과 연관된 단일염기 다형성 (SNPs)을 결정하고; (2) 양적 형질 유전좌위 (QTL)와의 연관성을 검정하며; 및 (3) 이 결과를 기초로 하여 돼지 삼겹살 함량 형질을 분석하는; 과정으로 이루어진 상기 바이오마커의 선발 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 서열번호 1 내지 서열번호 10의 염기 서열을 포함하는 단일염기 다형성 바이오마커를 사용하여 종돈을 선발하는 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 단일염기 다형성 바이오마커를 하나 이상을 포함하여 돼지 육질을 판정할 수 있는 유전자 칩을 제공한다.
이하, 본 발명을 상세히 설명하면 다음과 같다.
본 발명은 양적형질 유전좌위 (quantitative trait loci; QTL)에 해당하는 다수의 단일염기 다형성 (single nucleotide polymorphism; SNPs)들을 이용하는 돼지의 경제 형질을 판정할 수 있는 바이오마커를 제공한다.
본 발명은 종래의 방법에서 단순히 단일염기 다형성을 찾아내어 형질을 분석하는 것과는 달리, 전체 게놈 상에 존재하는 대량의 단일염기 다형성을 대상으로 하여 경제 형질과의 연관성을 분석하는 것이다.
구체적으로, 본 발명은 돼지 염색체 6번의 양적형질 유전좌위를 포함하는 돼지 육질을 판정할 수 있는 단일염기 다형성 (SNPs) 바이오마커를 제공한다. 상기 돼지 육질은 삼겹살 함량 등을 포함하는 것이 바람직하다.
또한, 본 발명은 서열번호 1의 염기 서열을 포함하는 단일염기 다형성 바이오마커 ALGA0103394, 서열번호 2의 염기 서열을 포함하는 단일염기 다형성 바이오마커 ALGA0118524, 서열번호 3의 염기 서열을 포함하는 단일염기 다형성 바이오마커 ALGA0123484, 서열번호 4의 염기 서열을 포함하는 단일염기 다형성 바이오마커 ASGA0029035, 서열번호 5의 염기 서열을 포함하는 단일염기 다형성 바이오마커 ASGA0029182, 서열번호 6의 염기 서열을 포함하는 단일염기 다형성 바이오마커ASGA0029189, 서열번호 7의 염기 서열을 포함하는 단일염기 다형성 바이오마커ASGA0029220, 서열번호 8의 염기 서열을 포함하는 단일염기 다형성 바이오마커ASGA0095594, 서열번호 9의 염기 서열을 포함하는 단일염기 다형성 바이오마커 M1GA0008864, 및 서열번호 10의 염기 서열을 포함하는 단일염기 다형성 바이오마커 MARC0043661를 제공한다. 본 발명의 단일염기 다형성 바이오마커는 서열번호 1 내지 서열번호 10의 염기 서열들 중 하나 이상을 포함하는 조합으로 사용하는 것이 바람직하다.
또한, 본 발명은 (1) 돼지 육질과 연관된 단일염기 다형성 (SNPs)을 결정하고; (2) 양적 형질 유전좌위 (QTL)와의 연관성을 검정하며; 및 (3) 이 결과를 기초로 하여 돼지 삼겹살 함량 형질을 분석하는; 과정으로 이루어진 제 1항의 바이오마커의 선발 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 단일염기 다형성 바이오마커를 사용하여 종돈을 선발하는 방법을 제공한다. 상기 단일염기 다형성 바이오마커는 서열번호 1 내지 10의 염기 서열을 가지는 ALGA0103394, ALGA0118524, ALGA0123484, ASGA0029035, ASGA0029182, ASGA0029189, ASGA0029220, ASGA0095594, M1GA0008864 및 MARC0043661로 이루어진 그룹으로부터 선택된 하나 이상인 것이 바람직하다.
상기 유전자들은 각각 삼겹살 육질을 평가할 수 있는 marker로서 진단이 가능하며, 또한 이와 더불어 2개 이상의 여러 유전자를 이용한다면 더욱 정확한 성장과 육질 형질에 대한 평가가 가능하게 된다.
또한, 본 발명은 상기 단일염기 다형성 바이오마커를 포함하여 돼지 육질을 판정할 수 있는 유전자 칩을 제공한다. 상기 단일염기 다형성 바이오마커는 서열번호 1 내지 10의 염기 서열을 가지는 ALGA0103394, ALGA0118524, ALGA0123484, ASGA0029035, ASGA0029182, ASGA0029189, ASGA0029220, ASGA0095594, M1GA0008864 및 MARC0043661로 이루어진 그룹으로부터 선택된 하나 이상인 것이 바람직하다.
한편, 돼지 염색체 6번의 양적형질 유전좌위 (quantitative trait loci; QTL)가 포함되며 서열번호 1 내지 10의 염기서열을 하나 이상 포함하여 돼지 삼겹살 함량을 판정하는 단일염기 다형성(single nucleotide polymorphism; SNP) 바이오마커를 이용하여 돼지 삼겹살 함량을 판정하는 방법에 있어서, (1) 돼지 육질과 연관된 단일염기 다형성 (SNPs)을 결정하고; (2) 양적 형질 유전좌위 (QTL)와의 연관성을 검정하며; 및 (3) 이 결과를 기초로 하여 돼지 삼겹살 함량 형질을 분석하는; 과정을 포함하되, 상기 서열번호 1 내지 10의 염기 서열은 ALGA0103394, ALGA0118524, ALGA0123484, ASGA0029035, ASGA0029182, ASGA0029189, ASGA0029220, ASGA0095594, M1GA0008864 및 MARC0043661인 것을 특징으로 하는 바이오마커를 이용한 돼지 삼겹살 함량 판정방법을 제공할 수 있다.
또한, 돼지 염색체 6번의 양적형질 유전좌위 (quantitative trait loci; QTL)가 포함되며 서열번호 1 내지 10의 염기서열을 하나 이상 포함하여 돼지 삼겹살 함량을 판정하는 단일염기 다형성(single nucleotide polymorphism; SNP) 바이오마커를 이용하여 돼지 삼겹살 함량을 판정하는 키트에 있어서,(1) 돼지 육질과 연관된 단일염기 다형성 (SNPs)을 결정하고; (2) 양적 형질 유전좌위 (QTL)와의 연관성을 검정하며; 및 (3) 이 결과를 기초로 하여 돼지 삼겹살 함량 형질을 분석하는; 과정을 포함하되, 상기 서열번호 1 내지 10의 염기 서열은 ALGA0103394, ALGA0118524, ALGA0123484, ASGA0029035, ASGA0029182, ASGA0029189, ASGA0029220, ASGA0095594, M1GA0008864 및 MARC0043661인 것을 특징으로 하는 바이오마커를 이용한 돼지 삼겹살 함량 판정키트를 제공할 수 있다.
상기에서 살펴본 바와 같이, 본 발명은 돼지 육질을 판정할 수 있는 단일염기 다형성 (SNP) 바이오마커들, (1) 돼지 육질과 연관된 단일염기 다형성 (SNPs)을 결정하고; (2) 양적 형질 유전좌위 (QTL)와의 연관성을 검정하며; 및 (3) 이 결과를 기초로 하여 돼지 삼겹살 함량의 형질을 분석하는; 과정으로 이루어진 상기 바이오마커들의 선발 방법 및 상기 바이오마커들을 종돈 선발 등에 사용하는 용도에 관한 것이다.
본 발명의 돼지 육질 진단용 바이오마커는 종래의 표현형 평가와 비교하여 25 내지 35% 정도 더 정확히 유전 능력을 측정할 수 있기 때문에, 종돈의 유전 능력의 개량량을 획기적으로 증가시킬 수 있어 우수 종돈의 육성에 널리 사용될 수 있다. 이외에도, 연간 종돈 수입은 1,800여두 (2008년 기준, 1,836두)이고 이는 연간 약 40억원 정도의 수입 규모가 되므로, 약 30%만 대체되는 경우라도 (550두) 연간 약 10억원을 절감할 수 있어 종돈장 등을 포함하는 관련 산업에 널리 활용될 수 있다.
도 1은 본 발명에서 선발한 돼지 6번 염색체 상의 삼겹살 함량과 연관성이 있는 단일염기 다형성 (SNPs)의 위치를 나타낸 것이다.
이하, 실시예에 의하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다.
단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예 . 단일염기 다형성 분석
본 발명에서는 돼지 육질과 연관된 바이오마커를 선발하기 위하여 양적형질 유전좌위 (QTL)를 조절하는 유전자 및 그의 변이를 분석하고 하기와 같이 단일염기 다형성 (SNPs)을 조사하였다.
먼저, 삼겹살 함량 등 생산 형질의 자료를 가지고 있는 돼지 551두의 혈액으로부터 위저드 게놈 DNA 정제 키트 (Wizard Genomic DNA Purification Kit; Promega, Madison, WI, USA)를 이용하여 DNA를 추출하였으며, 전체 62,163개의 SNPs 정보로 구성되어 있는 어레이 칩 (iSelect Infinium Porcine ArrayChips; Illumina, San Diego, CA, USA)를 이용하여 SNP 유전자형 분석을 실시하였다.
유전자형 분석 후 얻어진 모든 SNP 자료들은 하디-바인베르그 평형(HWE)과 소수 대립유전자 (minor allele)의 빈도(MAF)에 대하여 R/SNPassoc 패키지의 chi-square 검정을 실시하여, 일정 조건에 맞지 않는 결과는 배제하였다 (HWE; P < 0.05, MAF; < 10%). 또한 QTL 및 SNP 사이의 연관성을 검정하는데 단일 마커 회귀 (single marker regression) 분석을 이용하였으며 마커들에 대한 부가 효과 (additive effect)를 평가하였다. 또한, ASReml 패키지를 이용하여 하기 혼합 선형 LD 회귀 모델식 (수학식 I)을 이용하여 분석하였다.
수학식 Ⅰ: y = Xb + Za + e
여기서 y는 도체 시 성별과 연령이 포함된 고정 효과에 대한 표현형 벡터, X는 디자인 매트릭스 (design matirx), b는 단일 SNP 유전자형에 대한 회귀계수 벡터, Z는 동물 효과에 대한 빈도 매트릭스 (incidence matrix), 그리고 e는 잔차에 대한 벡터를 의미한다.
그 다음 통계적 추론을 위하여 복합 가설 검정에 대해 벤자민 및 호크버그 (Benjamin and Hochberg, 1995)가 제시한 오류 발생율 (false discovery rate; FDR)을 계산에 이용하였으며 모든 유의적 가치 (value)는 5% 염색체 (chromosome-wise) FDR 수준에서 계산되었다.
그 결과 하기 도 1, 표 2 및 표 3에서 보는 바와 같이, 총 돼지 유전체 상에 존재하는 62,163개의 SNPs 중에서 돼지 삼겹살 함량에 유의성을 가지는 6번 염색체 상에 존재하는 10개의 SNPs 를 발굴하였다 (chromosome-wise P < 0.05). 따라서 이러한 유전자형은 삼겹살 함량이 많고 적음의 비율을 예측하는데 활용이 가능하고 삼겹살 형질에 대한 선발을 위한 선발을 위한 DNA 마커로서 진단키트에 사용 가능한 것이 확인되었다.
본 발명의 실시예에서는 단일염기 다형성 바이오마커로 서열번호 1 내지 서열번호 40의 염기 서열들 중 하나 이상을 포함하는 진단키트를 만들어 사용할 때 선별효과를 높일 수 있었다.
각 SNP 에 대한 염기서열 정보
SNPs 출처 서열
ALGA0103394 TATACATCCCCACTCTCCTAACCTCCCTCTGGTTAGTCAGGGTAATACCACAGGCTGAAA[T/C]AGACAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
ALGA0118524 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGTGCAGGTACGCGTGTATTTGTTAGAGAAAAC[A/C]CAGTGTGACCGCGTGTACATGTGCGTGCTTCTGTTCTGTGTGTTTGTAGTTGTGTGTGTG
ALGA0123484 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGATGGTAGAATTTCAGG[A/G]TTTAGTGGAGAAGGTGATTTAAACAATCCAGAGTGTTCCCCAGAGTTCTCGTCGTGGCTC
ASGA0029035 TGTGCTCTCCTTGTTGCTGAGACCGCACTGCTGCTCCCTCTGCTGCCGGGAGCTCTCCTC[A/C]CCCAGCCCCCAATGGCACCTCATCAGTCTTCAGAATGCATGTCAGATGCTACCCTCTTCA
ASGA0029182 NNNNNNNTTTTANNNCGACGCCTAGACTTACCTATTTCAAGGTTACTCCTTCAGCTTTCC[T/C]TTTTTTTCCTGAGTATTATTATTGTTCTATCACATGTATGCAGGTATGAGATTTGCTGAC
ASGA0029189 TTAACCTTTATGCTGGACTCCCTCCAGGAGTAGATTCAGCTGCTCGGCATGCAGAGGGAA[T/C]GTGCGAAACTGGCTTCATTTTCTGTGAAAAGAGTCCCATGTATGGGACTACAACAGGGTT
ASGA0029220 AAAAGTCCTTATTAGCCTTTATTCAGAAAGAGGGCAGCCTGCTAGTACATTCTGTGGCAG[T/C]ACATCATTTATATTTGGAAAAACAAAACAAGCTTAAATTAGGTTACATTCCTTGCCTTTG
ASGA0095594 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAGTTGGCCCTTCA[A/G]TGTGGCATTTCATGATGTCTTCTTAAACTTGCAGTATGGAGAATAACCACTCAGAATAAA
M1GA0008864 GGACAGCTGGGGACGAGGGGGCAGGAAGGGGGAGGGCGGCCGGGCGGGATCTGGGGATGT[T/G]AGTAGATCCAAGAATAGTTGGACGCGAGTGTGCAGAGCGGAGTGCTGCCGCGGGTAGTGG
MARC0043661 AAAGTAGAATAATTCCTTTCATTTTCCACAATACATTGTTTTTAAAACAGAAGTTCCCAA[T/C]TGAGCCCTTTAATCGTAGAATGGAACTGTCAATAGCTTTTAAACAGGGG
돼지 삼겹살 함량과 연관성이 있는 SNPs 정보
SNPs 위치 염색체 예상값1 ) F-값2 ) P-값3 ) R24 )
ALGA0103394 78170250 6 0.3519 29.23 1.0741E-07 0.40814
ALGA0118524 61602482 6 -0.3062 26.23 4.6922E-07 0.25768
ALGA0123484 77345619 6 0.3381 26.91 3.3E-07 0.39974
ASGA0029035 66630790 6 -0.3274 29.25 1.1273E-07 0.31464
ASGA0029182 76312649 6 0.3422 31.6 3.4971E-08 0.29231
ASGA0029189 77161505 6 -0.3465 28.33 1.6597E-07 0.23672
ASGA0029220 78146249 6 -0.35 29.2 1.086E-07 0.23799
ASGA0095594 79597816 6 0.3439 28.53 1.5099E-07 0.39928
M1GA0008864 74481275 6 -0.3465 28.2 1.7714E-07 0.23016
MARC0043661 79758709 6 -0.3589 31.01 4.5886E-08 0.25291
1) 예상값: 삼겹살 형질에대한 각 SNP의 추정값 (예, ALGA0103394는 삼겹살의 0.35cm 증가 효과를 기대할 수 있음)
2) F-값: F-통계량
3) P-값: F-통계량에 따른 유의성 수치
4) R2: 모델의 적합도(예, 0.40은 해당 SNP가 삼겹살표현형의 40%를 설명함)
본 발명에 따른 분자표지를 이용할 경우 표현형평가에 의한 선발효과보다 25∼35% 더 정확한 유전능력 측정이 가능하여 종돈의 유전능력 개량량을 획기적으로 늘릴 수 있으며, 삼겹살 함량은 현재 육질을 평가하는 중요한 요인 중의 하나이므로 우수 종돈의 국내 육성에 크게 기여할 수 있다.
[서열목록]
서열번호 1
TATACATCCCCACTCTCCTAACCTCCCTCTGGTTAGTCAGGGTAATACCACAGGCTGAAAYAGACAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
서열번호 2
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGTGCAGGTACGCGTGTATTTGTTAGAGAAAACMCAGTGTGACCGCGTGTACATGTGCGTGCTTCTGTTCTGTGTGTTTGTAGTTGTGTGTGTG
서열번호 3
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGATGGTAGAATTTCAGGRTTTAGTGGAGAAGGTGATTTAAACAATCCAGAGTGTTCCCCAGAGTTCTCGTCGTGGCTC
서열번호 4
TGTGCTCTCCTTGTTGCTGAGACCGCACTGCTGCTCCCTCTGCTGCCGGGAGCTCTCCTCMCCCAGCCCCCAATGGCACCTCATCAGTCTTCAGAATGCATGTCAGATGCTACCCTCTTCA
서열번호 5
NNNNNNNTTTTANNNCGACGCCTAGACTTACCTATTTCAAGGTTACTCCTTCAGCTTTCCYTTTTTTTCCTGAGTATTATTATTGTTCTATCACATGTATGCAGGTATGAGATTTGCTGAC
서열번호 6
TTAACCTTTATGCTGGACTCCCTCCAGGAGTAGATTCAGCTGCTCGGCATGCAGAGGGAAYGTGCGAAACTGGCTTCATTTTCTGTGAAAAGAGTCCCATGTATGGGACTACAACAGGGTT
서열번호 7
AAAAGTCCTTATTAGCCTTTATTCAGAAAGAGGGCAGCCTGCTAGTACATTCTGTGGCAGYACATCATTTATATTTGGAAAAACAAAACAAGCTTAAATTAGGTTACATTCCTTGCCTTTG
서열번호 8
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTAGTTGGCCCTTCARTGTGGCATTTCATGATGTCTTCTTAAACTTGCAGTATGGAGAATAACCACTCAGAATAAA
서열번호 9
GGACAGCTGGGGACGAGGGGGCAGGAAGGGGGAGGGCGGCCGGGCGGGATCTGGGGATGTKAGTAGATCCAAGAATAGTTGGACGCGAGTGTGCAGAGCGGAGTGCTGCCGCGGGTAGTGG
서열번호 10
AAAGTAGAATAATTCCTTTCATTTTCCACAATACATTGTTTTTAAAACAGAAGTTCCCAAYTGAGCCCTTTAATCGTAGAATGGAACTGTCAATAGCTTTTAAACAGGGG
<110> REPUBLIC OF KOREA(MANAGEMENT : RURAL DEVELOPMENT ADMINISTRATION) <120> Biomarkers for diagnosing meat quality of pig, method for preparing the same and use of the same for evaluating belly trait <130> PA100019 <160> 10 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial <400> 1 tatacatccc cactctccta acctccctct ggttagtcag ggtaatacca caggctgaaa 60 yagacaagnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 120 n 121 <210> 2 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial <400> 2 nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnctgt gcaggtacgc gtgtatttgt tagagaaaac 60 mcagtgtgac cgcgtgtaca tgtgcgtgct tctgttctgt gtgtttgtag ttgtgtgtgt 120 g 121 <210> 3 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial <400> 3 nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nctgatggta gaatttcagg 60 rtttagtgga gaaggtgatt taaacaatcc agagtgttcc ccagagttct cgtcgtggct 120 c 121 <210> 4 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial <400> 4 tgtgctctcc ttgttgctga gaccgcactg ctgctccctc tgctgccggg agctctcctc 60 mcccagcccc caatggcacc tcatcagtct tcagaatgca tgtcagatgc taccctcttc 120 a 121 <210> 5 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial <400> 5 nnnnnnnttt tannncgacg cctagactta cctatttcaa ggttactcct tcagctttcc 60 ytttttttcc tgagtattat tattgttcta tcacatgtat gcaggtatga gatttgctga 120 c 121 <210> 6 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial <400> 6 ttaaccttta tgctggactc cctccaggag tagattcagc tgctcggcat gcagagggaa 60 ygtgcgaaac tggcttcatt ttctgtgaaa agagtcccat gtatgggact acaacagggt 120 t 121 <210> 7 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial <400> 7 aaaagtcctt attagccttt attcagaaag agggcagcct gctagtacat tctgtggcag 60 yacatcattt atatttggaa aaacaaaaca agcttaaatt aggttacatt ccttgccttt 120 g 121 <210> 8 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial <400> 8 nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnncttagt tggcccttca 60 rtgtggcatt tcatgatgtc ttcttaaact tgcagtatgg agaataacca ctcagaataa 120 a 121 <210> 9 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial <400> 9 ggacagctgg ggacgagggg gcaggaaggg ggagggcggc cgggcgggat ctggggatgt 60 kagtagatcc aagaatagtt ggacgcgagt gtgcagagcg gagtgctgcc gcgggtagtg 120 g 121 <210> 10 <211> 110 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial <400> 10 aaagtagaat aattcctttc attttccaca atacattgtt tttaaaacag aagttcccaa 60 ytgagccctt taatcgtaga atggaactgt caatagcttt taaacagggg 110

Claims (6)

  1. 삭제
  2. 삭제
  3. 삭제
  4. 돼지 염색체 6번의 양적형질 유전좌위 (quantitative trait loci; QTL)가 포함되며 서열번호 1 내지 10을 포함하여 돼지 삼겹살 함량을 판정하는 단일염기 다형성(single nucleotide polymorphism; SNP) 바이오마커를 이용하여 돼지 삼겹살 함량을 판정하는 방법에 있어서,
    (1) 돼지 육질과 연관된 단일염기 다형성 (SNPs)을 결정하고;
    (2) 양적 형질 유전좌위 (QTL)와의 연관성을 검정하며; 및
    (3) 이 결과를 기초로 하여 돼지 삼겹살 함량 형질을 분석하는; 과정을 포함하되,
    상기 서열번호 1 내지 10의 염기 서열은 ALGA0103394, ALGA0118524, ALGA0123484, ASGA0029035, ASGA0029182, ASGA0029189, ASGA0029220, ASGA0095594, M1GA0008864 및 MARC0043661인 것을 특징으로 하는 바이오마커를 이용한 돼지 삼겹살 함량 판정방법.
  5. 삭제
  6. 돼지 염색체 6번의 양적형질 유전좌위 (quantitative trait loci; QTL)가 포함되며 서열번호 1 내지 10을 포함하여 돼지 삼겹살 함량을 판정하는 단일염기 다형성(single nucleotide polymorphism; SNP) 바이오마커를 이용하여 돼지 삼겹살 함량을 판정하는 키트에 있어서,
    (1) 돼지 육질과 연관된 단일염기 다형성 (SNPs)을 결정하고;
    (2) 양적 형질 유전좌위 (QTL)와의 연관성을 검정하며; 및
    (3) 이 결과를 기초로 하여 돼지 삼겹살 함량 형질을 분석하는; 과정을 포함하되,
    상기 서열번호 1 내지 10의 염기 서열은 ALGA0103394, ALGA0118524, ALGA0123484, ASGA0029035, ASGA0029182, ASGA0029189, ASGA0029220, ASGA0095594, M1GA0008864 및 MARC0043661인 것을 특징으로 하는 바이오마커를 이용한 돼지 삼겹살 함량 판정키트.
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