KR100320106B1 - 트롬보포이에틴폴리펩티드분비방법 - Google Patents

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리스 데브라 케이.
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Abstract

트롬보포이에틴의 생산에서 유용한 DNA 구조가 개시된다. 일반적으로 DNA 구조는 트롬보포이에틴 폴리펩티드에 결합된 아미노-말단 분비성 펩티드의 접합체를 코딩하는 첫번째 DNA 서열 및 첫번째 DNA 서열의 전사를 제공하는 하나 또는 그 이상의 추가적인 DNA를 포함한다. 분비성 펩티드는 천연 포유류 t-PA 분비성 펩티드이거나 접합체의 단백질분해성 절단을 증강하기 위해 변형된다. 또한 이들 DNA 구조를 함유하는 배양된 진핵 세포 및 DNA 구조 및 배양된 진핵 세포를 통해 트롬보포이에틴 폴리펩티드를 생산하기 위한 방법이 개시된다.

Description

트롬보포이에틴 폴리펩티드 분비방법{METHOD FOR SECRETING THROMBOPOIETIN POLYPEPTIDES}
조혈이란 골수내의 다능성 간세포로부터 혈구가 발생하고 분화하는 과정이다. 이 과정은 표적 세포상의 막-결합 수용체를 경유하여 작용하는 폴리펩티드 성장인자(시토킨)의 복잡한 상호작용을 포함한다. 시토킨 작용은 종종 직계-특이적(lineage-specific) 및/또는 기-특이적(stage-specific)인 특정 시토킨에 대한 반응으로서 세포 증식 및 분화를 일으킨다. 간세포로부터의, 혈소판과 같은 단일 세포형태의 발생은 적절한 순서로 작용하는 대다수 시토킨의 종합적인 작용을 필요로 할 수 있다.
공지의 시토킨은 IL-1, IL-2, IL-3,IL-6, IL-8 등과 같은 인터루킨; G-CSF, M-CSF, GM-CSF, 에리트로포이에틴(EPO) 등과 같은 콜로니 자극인자를 포함한다. 일반적으로 인터루킨은 면역 및 염증 반응의 매개물질로서 작용한다. 콜로니 자극인자는 골수유래 세포의 증식을 자극하며, 성숙 백혈구를 활성화하며, 또는 염증성, 감염성 및 면역성 도전에 대한 숙주의 반응의 완전한 부분을 형성한다.
다양한 시토킨은 치료제제로서 개발되어 왔다. 예를 들면, 적혈구의 발생을자극하는 에리트로포이에틴은 신장 쇠약에서 유발되는 빈혈의 치료에 사용된다. 몇가지의 콜로니 자극인자는 환자의 면역체계의 회복을 가속하기 위해 암 화학요법과의 결합에 사용하여 왔다. 인터루킨-2, α-인터페론 및 γ-인터페론은 일정한 암의 치료에 사용된다. 거핵구형성 및 전구형성을 자극하는 활성은 전구감소증 동물의 체액내에서 확인되었으며, 문헌(McDonald,Exp. Hematol. 16:201-205, 1988 및 MaDonald,Am. J. Ped. Hematol. Oncol. 14: 8-21, 1992에 의해 최근에 재조사됨)에서 "트롬보포이에틴"으로 칭한다.
최근에 몇 그룹은 세포질 mpl 수용체에 결합하며 거핵구형성 및 전구형성을 자극하는 단백질을 확인 및/또는 클로닝하였다. de Sauvage et al.,Nature 369: 533-538, 1994; Lok et al.,Nature 369: 565-568, 1994; Kaushansky et al.,Nature 369; 568-571, 1994; Wendling et al.,Nature 369: 571-574, 1994; 및 Bartley et al.,Cell 77: 1117-1124, 1994 참조. 이 단백질을 트롬보포이에틴으로 명명할 것을 제안하였다(Kaushansky et al., 상기 참조).
아미노산 서열의 분석은 성숙한 마우스 TPO가 서열 2의 아미노산 잔기45(Ser)로부터 잔기 379(Thr)까지 연장되어 있음을 나타낸다. 사람 단백질의 예견된 아미노 말단은 재조합 쥐 TPO에 대한 명시된 성숙 아미노 말단에 정확히 대응하며(Lok et al., 상기 참조), 즉 그것은 서열 4의 아미노산 잔기 353까지 연장되는 단백질과 함께 서열 4의 Ser(22)에 있다. TPO는 단백질 분해를 일으키기 쉬우며 이종(heterogeneous) 또는 분해된 형태로 분리되었다(de Sauvage et al.,Nature 369: 533-538, 1994; Bartley et al.,Cell 77: 1117-1124, 1994). 25kD와같이 작은 분자종이 시험관 내에서 활성이 있는 것으로 밝혀졌으며(Bartley et al., 상기 참조), 153(de Sauvage et al., 상기 참조) 및 174 아미노산(Bartley et al., 상기 참조)의 재조합 사람 TPO 폴리펩티드가 353 아미노산(Bartley et al., 상기 참조)의 1차 번역 생상물을 코딩하는 완전한 길이의 사람 cDNA 발현의 생산물을 갖기 때문에, 시험관 내에서 활성이 있는 것으로 보고되었다.
트롬보포이에틴은 단백질 분해되기 쉬우며 이종 또는 분해된 형태로 분리되었다(Bartley et al., 상기 참조; de Sauvage et al., 상기 참조). 따라서 과학 문헌 내에 보고된 트롬보포이에틴 제제는 비록 단백질 분해성 생산물중 적어도 일부가 생물학적으로 활성이더라도, 다양한 분자종의 조성 및 관련 활성에 대해 잘 특성화되어 있지 않다. 그러나 트롬보포이에틴의 대규모 생산에 관한 시도가 극히 적게 이루어져 왔으며, 본 분야에서 대량으로 그리고 효과적 비용의 방식으로 단백질의 생산방법에 대한 요구가 잔재한다.
발명의 개요
본 발명의 목적은 트롬보포이에틴의 생산방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 부가적인 목적은 숙주 세포로부터 재조합 트롬보포이에틴의 분비를 조절하는 방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 부가적인 목적은 트롬보포이에틴의 높은 수준의 발현 및 분비를 조절하는 DNA 구조를 제공하는 것이다.
본 발명의 한 양태에서 (a) 폴리펩티드 융합체를 코딩하는 첫번째 DNA 절편으로서, 융합체는 트롬보포이에틴(TPO) 폴리펩티드에 접합된 아미노-말단 분비성펩티드를 포함하고, 접합된 펩티드 및 폴리펩티드는 그들 접합부에서의 단백질분해성 절단 부위를 규정하는 첫번째 DNA 절편; 및 (b) 첫번째 DNA 절편에 작동가능하게 연결되어 그것의 전사에 제공하는 하나 이상의 추가적인 DNA 절편으로 이루어지고, 상기 분비성 펩티드는 천연 포유류 조직 플라스미노겐 활성제(t-PA) 분비성 펩티드 및 접합부에서의 단백질분해성 절단을 증강시키는 변형된 포유류 t-PA 분비성 펩티드로 이루어지는 군에서 선택되는 DNA 구조를 제공한다. 한 구체예에서, 분비성 펩티드는 사람 t-PA 분비성 펩티드이다. 관련된 구체예에서, 분비성 펩티드는 서열 5에 나타낸 바와 같은 아미노산 잔기의 서열로 이루어지며, 여기서 Xaa(29), Xaa(31) 및 Xaa(33)은 개별적으로 어떤 아미노산이고, Xaa(34)는 Ala, Arg 또는 Lys이다. 또 다른 구체예에서, Xaa(29) 및 Xaa(31)는 개별적으로 Lys, Arg 또는 His를 제외한 어떤 아미노산이다. 추가적인 구체예에서, Xaa(33)는 Gly; Xaa(34)는 Arg 또는 Lys; Xaa(29) 및 Xaa(31)는 개별적으로 Asp, Glu, Gln, Gly 또는 Ala, Xaa(33)는 Gly, 그리고 Xaa(34)는 Arg; 또는 Xaa(29)는 Arg 또는 Glu, Xaa(31)는 Arg 또는 Gln, Xaa(33)는 Gly, 그리고 Xaa(34)는 Arg이며, Xaa(29) 및 Xaa(31)중 적어도 하나는 Arg가 아니라는 제한을 받는다. 또 다른 구체예에서, TPO 폴리펩티드는 144 내지 335개 아미노산 잔기로 이루어진다. 관련된 구체예에서, TPO 폴리펩티드는 144 내지 191개 아미노산 잔기로 이루어진다. 또 다른 구체예에서, TPO 폴리펩티드는 서열 4의 Ser(22) 내지 Val(173), Ser(22) 내지 Arg(185), Ser(22) 내지 Asn(193), Ser(22) 내지 Phe(207) 또는 Ser(22) 내지 Gln(235)에 나타낸 바와 같은 서열로 이루어지는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열로 이루어진다.
본 발명의 또 다른 양태에서 144 내지 335개의 아미노산의 TPO 폴리펩티드에 접합된, Xaa(29)는 Arg 또는 Glu, Xaa(31)는 Arg 또는 Gln, Xaa(33)는 Gly, 그리고 Xaa(34)는 Ala 또는 Arg인 서열 5에 나타낸 바와 같은 아미노-말단 분비성 펩티드로 본질적으로 이루어지는 폴리펩티드 융합체를 코딩하는 첫번째 DNA 절편을 포함하는 DNA 구조를 제공하는 것이고, 여기서 첫번째 DNA 절편은 그것의 전사에 제공하는 하나 이상의 추가적인 DNA 절편에 작동가능하게 연결된다. 한 구체예에서, TPO 폴리펩티드는 144 내지 191개 아미노산 잔기로 이루어진다. 또 다른 구체예에서, TPO 폴리펩티드는 사람 TPO 폴리펩티드이다. 또 다른 구체예에서, TPO 폴리펩티드는 서열 4의 Ser(22) 내지 Val(173), Ser(22) 내지 Arg(185), Ser(22) 내지 Asn(193), Ser(22) 내지 Phe(207), 또는 Ser(22) 내지 Gln(235)에 나타낸 바와 같은 서열로 이루어지는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열로 이루어진다. 또 다른 구체예에서, DNA 구조는 선별가능 마커를 더 포함한다.
세번째 양태에서 본 발명은 상기한 DNA 구조를 함유하는 배양한 진핵세포를 제공한다. 한 군의 구체예에서 세포는 사카로미쎄스 세레비지아(Saccharomyces cerevisiae)세포 또는 피키아 파스토리스(Pichia pastoris)세포와 같은 효모세포이다. 또 다른 군의 구체예에서, 세포는 설치류 세포 또는 신장 세포와 같은 포유류 세포이다.
본 발명의 네 번째 양태에서 진핵세포가 첫번째 DNA 절편을 발현하고 TPO 폴리펩티드는 세포로부터 분비되는 상기한 바와 같은 진핵세포를 배양하는 단계 및 TPO 폴리펩티드를 선택적으로 회수하는 단계로 이루어지는 트롬보포이에틴 폴리펩티드의 생산방법을 제공한다.
발명의 이들 및 다른 양태는 다음의 상세한 설명을 참고로 하면 명백해질 것이다.
Figure pct00001
본 발명을 상세하게 기술하기 전에 여기서 사용된 몇가지 용어를 정의하는 것이 도움이 될 수 있다.
대림유전자 변체: 돌연변이를 통해 발생하는 유전자의 다른 형태, 또는 돌연변이 유전자에 의해 코딩된 변화된 폴리펩티드. 유전자 돌연변이는 침묵성(코딩된 폴리펩티드에서 변화가 없음)일 수 있고 또는 변화된 아미노산 서열을 가지는 폴리펩티드를 코딩할 수 있다.
cDNA: 전령 RNA 주형의 역전사에 의해 제조되는 상보적 DNA, 또는 그러한 분자의 클론 또는 증폭된 사본. 상보적 DNA는 단일 가닥 또는 이중 가닥일 수 있다.
발현 벡터: 전사를 위해 제공하는 추가적 단편에 작동가능하게 연결된 관심의 폴리펩티드를 코딩하는 절편으로 이루어지는 선상 또는 환상의 DNA 분자. 그러한 추가적인 절편은 프로모터 및 터미네이터 서열을 포함한다. 발현 벡터는 또한 하나 이상의 복제기점, 하나 이상의 선별가능 마커, 증강제, 폴리아데닐화 신호 등을 포함할 수 있다. 발현 벡터는 일반적으로 플라스미드 또는 바이러스 DNA로부터 유래되거나 양자의 요소를 함유할 수 있다. 용어 "작동가능하게 연결된"은 절편이, 예를 들면 전사가 프로모터에서 촉발되고 터미네이터까지 코딩 절편이 진행하는 그들이 의도하는 목적을 위해 협력하여 기능하도록 정렬되는 것을 나타낸다.
유전자: 폴리펩티드 사슬을 코딩하는 염색체 DNA의 절편. 유전자는 어떤 경우에는 코딩 서열의 전사를 위해 제공하는 측면에 접한, 비(非)코딩 부분과 함께 비코딩 "중간에 끼어 있는 서열"("인트론")과 함께 점재(點在)하는 하나 이상의 아미노산 코딩 부분을 포함한다.
신호 서열: 분비성 펩티드를 코딩하는 DNA 서열. 신호 서열은 리더(leader)서열, 프리프로(prepro) 서열 또는 프리(pre) 서열로도 불린다. 분비성 펩티드는 세포로부터 성숙한 폴리펩티드 또는 단백질의 분비를 조절하기 위해 작용하는 아미노산 서열이다. 분비성 펩티드는 소수성 아미노산의 핵에 의해 특성화되며 전형적으로(그러나 독점적이지는 않게) 새로 합성된 단백질의 아미노 말단에서 발견된다. 매우 자주 분비성 펩티드는 하나 이상의 절단시에 분비되는 동안 성숙한 단백질로부터 절단된다. 그러한 분비성 펩티드는 성숙한 단백질이 분비 경로를 거침에 따라 그들로부터의 분비성 펩티드의 절단을 허용하는 처리부위를 함유한다. 용어 "아미노-말단 분비성 펩티드"는 여기서 단백질(융합체 단백질 포함)의 아미노 말단에서 발생하는 분비성 펩티드를 의미하기 위해 사용된다.
프로모터: RNA 중합효소가 결합하고 mRNA 합성이 촉발되는 곳의 유전자 부분.
트롬보포이에틴: 트롬보포이에틴(TPO) 단백질은 동일 종 유래의 MPL 수용체에 특이적으로 결합하며 생체 내에서 혈소판 생산을 자극하는 능력에 의해 특성화된다. 일반 시험 동물에서, TPO는 매일 투여를 시작한 후 10일 내에 100% 이상까지 혈소판 수준을 증가시킬 수 있다. 용어 "트롬보포이에틴 폴리펩티드"는 완전한 길이의 트롬보포이에틴 분자 및 그것의 생물학적으로 활성인 부분으로 구성되며, 원래 분자의 질적 생물학적 활성(수용체 결합 및 혈소판 생산의 생체 내 자극)을 나타내는 트롬보포이에틴의 단편이다.
아미노산은 여기서 표준 세문자 코드로 표시되며, 가변적인 아미노산은 "Xaa"로 표시된다. 아미노산 위치는 세문자 아미노산 표시에 뒤따르는 괄호 내의 숫자로 표시된다. 예를 들면, Ser(22)는 아미노산 서열의 위치 22에 있는 세린 잔기를 나타내며, Xaa(29)는 서열의 위치 29에 가변적인 아미노산을 나타낸다. 서열이 복수의 가변적인 아미노산을 함유하는 경우는, 비록 각각 다른 아미노산 잔기일 수 있지만, 모두 Xaa로 표시한다.
본 발명은 이들 방법에서 유용한 DNA 구조, 세포 및 기타 물질 뿐만 아니라 TPO 폴리펩티드를 발현하는 숙주세포로부터 분비되는 재조합 TPO 폴리펩티드의 제조방법을 제공한다.
대표적인 마우스 및 사람 TPO DNA 및 아미노산 서열이 서열 1, 2, 3 및 4에 나타나 있다. 본 분야의 당업자들은 개시된 서열이 단일 대립 유전자를 대표하며, 대립 유전자 변체가 존재할 것으로 기대되는 것을 인식할 것이다. 개시된 서열의 대립 유전자 변체는 본 발명의 범위 내에 있다.
여기에 개시된 마우스 및 사람 TPO 서열은 추가적인 TPO-코딩의 폴리누클레오티드를 클로닝하기 위한 전략 및 도구를 설계하는데 사용될 수 있다. 따라서 본 발명은 다양한 종으로부터의 TPO 폴리펩티드의 제조방법을 제공한다. 사람, 마우스, 래트, 돼지, 개, 양, 소 및 말 TPO 폴리펩티드를 포함하는 포유류 TPO 폴리펩티드가 바람직하다. 영장류 TPO 폴리펩티드, 특히 사람 TPO 폴리펩티드가 특히 관심이 있다.
본 발명에 따라 제조될 수 있는 트롬보포이에틴 폴리펩티드는 성숙한 단백질의 끝을 자른, 생물학적으로 활성인 단편 뿐만 아니라 완전한 길이의 트롬보포이에틴 분자를 포함한다. 일반적으로 이들 TPO 폴리펩티드는 적어도 분자의 N-말단 부위의 핵 "EPO 유사 도메인"(에리트로포이에틴에 대한 동일성 때문에 이렇게 명칭됨)을 포함한다. 이 핵 EPO-유사 도메인은 마우스 TPO의 위치 51 및 195(서열 2)에서; 사람 TPO의 위치 28 및 172(서열 4)에서; 다른 종의 TPO내의 그것의 상대 잔기에서 시스테인 잔기에 의해 결합된다. 서열 2의 아미노산 잔기 45(Ser)로부터 잔기216(Asn)까지 연장되어 있는 마우스 TPO 폴리펩티드와 같은 TPO 폴리펩티드는 실험동물에서 혈소판 생산을 촉진하는데 활성이 있는 것으로 현재 밝혀져 있다. 특히 바람직한 TPO 폴리펩티드를 하기한 표 1에 나타낸다.
Figure pct00002
본 분야의 당업자들은 표 1에 개시된 바람직한 아미노- 및 카르복실- 말단 잔기 사이에 말단을 가지는 분자들이 제조될 수 있으며 생물학적으로 활성이 있을 것으로 기대되는 것을 인식할 것이다.
트롬보포이에틴 폴리펩티드는 자연적 돌연변이든지 DNA의 인공 조작으로부터 하나 이상의 아미노산 치환, 결실 또는 추가를 포함할 수 있다. 이들 변화는 단백질의 접힘이나 활성에 중대한 영향을 주지 않는 보존성 아미노산 치환과 같은 소수의 자연적인 것이 바람직하다. 일반적으로 여기에 참고로 포함되는 Ford et al.,Protein Expression and Purification 2: 95-107, 1991 참조.
보존성 아미노산 치환
염기성 아르기닌리신히스티딘
산성 글루탐산아스파르트산
극성 글루타민아스파라긴
소수성 류신이소류신발린
방향족 페닐알라닌트립토판티로신
소형 글리신알라닌세린트레오닌메티오닌
TPO의 필수 아미노산은 부위-조절의 돌연변이 유발 또는 알라닌-스캐닝 돌연변이 유발과 같은 본 분야 공지의 방법에 따라 확인될 수 있다(Cunningham and Wells,Science 244, 1081-1085, 1989). 후자의 방법에서, 단일 알라닌 돌연변이는 분자내의 모든 잔기에 도입되며, 결과물인 돌연변이 분자는 분자의 활성에 결정적인 아미노산 잔기를 확인하기 위한 생물학적 활성(예를 들면 수용체 결합, 시험관 내 또는 생체 내 증식 활성)을 위해 시험된다. 리간드-수용체 상호작용 부위는 핵자기 공명, 결정학 또는 광친화성 표지와 같은 기술에 의해 결정되는 것과 같이 결정구조의 분석에 의해 결정될 수 있다. 예를 들면 de Vos et al., Science 255: 306-312, 1992; Smith et al.,J. Mol. Biol. 224: 899-904, 1992; Wlodaver et al.,FEBS Lett. 309: 59-64, 1992 참조.
일반적으로 시토킨은, 리간드-수용체 상호작용에서 가장 중요하며 그 부류의구성물 중에 보다 높게 보존되는 첫번째 및 네번째 나선을 가지는, 4개의 알파 나선 구조를 가지는 것으로 예측된다. 서열 4에 나타낸 사람 TPO 아미노산 서열을 참고하면, 시토킨 서열의 정렬은 이들 나선이 각각 아미노산 잔기 29 및 53, 80 및 99, 108 및 130 그리고 144 및 168에 의해 결합되어 있는 것을 제시한다(경계는 ±4 잔기이다). 마우스(서열 2) 및 다른 비-사람 TPO의 나선 경계는 사람 서열과의 정렬에 의해 결정될 수 있다. TPO의 다른 중요한 구조적 양태는 서열 2의 위치 51, 73, 129 및 195(서열 4의 위치 28, 50, 106 및 172에 대응함)에 있는 시스테인 잔기를 포함한다.
본 발명에 따라 제조된 TPO 폴리펩티드는 서열 2에 나타낸 서열; 서열 4에 나타낸 서열 또는 그것의 종 동족체의 대응 부분에 대해 50%, 바람직하게는 60%, 보다 바람직하게는 적어도 80%의 서열 동일성을 갖는 것을 특징으로 한다. 그러한 폴리펩티드는 서열 2 또는 서열 4 또는 그것의 종 동족체에 대해 보다 바람직하게는 적어도 90% 동일하며, 가장 바람직하게는 95% 이상 동일할 것이다. 서열 동일성 백분율은 종래의 방법에 의해 결정된다. 예를 들면, Altschul et al.,Bull, Math. Bio. 48: 603-616, 1986 및 Henikoff and Henikoff,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 10915-10919, 1992 참조. 요컨대, 두 아미노산 서열은 표 3에 나타낸 바와 같은 Henikoff and Henikoff(상기 참조)의 간격 개시 감점 10, 간격 연장 감점 1 및 "블로섬(blosum) 62" 점수 매트릭스를 사용하는 정렬 점수를 최적화하기 위해 정렬된다. 다음에 동일성 백분율은 다음과 같이 계산된다:
Figure pct00003
Figure pct00004
TPO 폴리펩티드는 전형적으로 폴리펩티드의 아미노- 또는 카르복실-말단 연장으로서 비-TPO인 총 20-25개 잔기까지의 하나 이상의 추가적인 아미노산 잔기를더 포함할 수 있다. 이러한 형태의 연장은, 예를 들면 폴리히스티딘 다발, 항원성 에피토프 또는 결합영역과 같은 아미노-말단 메티오닌 잔기, 소형 링커 펩티드 및 폴리펩티드의 정제를 촉진하는 펩티드 연장물을 포함한다. 일반적으로, 여기에 참고로 포함되는 Ford et al.,Protein Expression and Purification2: 95-107, 1991 참조.
상기한 바와 같이, TPO는 단백질 분해에 민감한 것으로 보이며, 완전한 길이의 단백질 분해 생성물(cDNA 서열로부터 추찰됨)은 활성이 있는 것으로 나타났다. 그러나, 마우스 TPO를 생산하기 위한 발명자의 실험실에서의 시도는 폴리펩티드의불충분한 분비로 인하여 단지 제한된 성공만을 거두었다. 본 발명자들은, 천연 TPO신호 펩티드를, 서열 5에 나타낸 사람 조직-형태 플라스미노겐 활성제(t-PA)의 것으로부터 유래된 합성된 분비성 펩티드로 치환함으로써, 배양된 어린 햄스터 신장(BHK) 세포에서 회수가능한 TPO의 생산이 5 내지 10가지 인자에 의해 증가되었다는 것을 발견하였다.
본 발명에서, t-PA 분비성 펩티드 또는 그 유도체는 TPO의 분비를 조절하는데 사용된다. 일반적으로, 분비성 펩티드-TPO 폴리펩티드 융합체를 코딩하는 DNA 절편은 그것의 전사에 제공하는 하나 이상의 추가적인 DNA 절편에 작동가능하게 연결된다. 그러한 추가적인 DNA 절편은 전사 프로모토를 포함한다. 비록 전사가 여러경우에 융합체 서열의 벡터 서열 진행 중에 예기치 않게 중지되더라도, 분비성 펩티드-TPO 융합체를 코딩하는 DNA 서열이 전사 터미네이터에 연결된 것도 바람직하다. 비록 당업자들은 일정한 시스템내의 선별가능 마커가 별도의 벡터상에 제공될수 있고, 외인성 DNA의 복제가 숙주 세포 게놈내로의 접합에 의해 제공될 수 있지만, 벡터는 통상 하나 이상의 선별가능 마커 및 하나 이상의 복제 기점을 가질 것이다. 프로모터, 터미네이터, 선별가능 마커, 벡터 및 기타 요소들의 선택은 본 분야의 일반적인 기술 수준내의 일상적인 설계 문제이다. 많은 그러한 요소는 문헌에 기술되어 있으며 시판 공급처를 통해서 구입가능하다.
TPO 폴리펩티드를 숙주세포의 분비 경로에 따라 조절하기 위해, 분비성 펩티드를 코딩하는 DNA 서열을 정확한 판독주형내에 TPO 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 서열에 접합시켜 접합된 서열이 융합체 단백질을 코딩하도록 한다. 접합된 분비성 펩티드 및 TPO 폴리펩티드는 그들의 접합부에서 단백질 분해성 절단 부위를 규정한다. 일반적으로, 본 발명은 서열 Met - Asp - Ala - Met - Lys - Arg - Gly - Leu - Cys - Cys - Val - Leu - Leu - Leu - Cys - Gly - Ala - Val - Phe - Val - Ser - Pro -Ser - Gln - Glu - Ile - His - Ala - Xaa - Phe - Xaa - Arg - Xaa - Xaa - Arg (서열 5)를 가지는 분비성 펩티드를 사용하며, 여기서 Xaa(29), Xaa(31) 및 Xaa(33)는 개별적으로 어떤 아미노산이며 Xaa(34)는 Ala, Arg 또는 Lys이다. 사람 t-PA의 야생형 분비형 펩티드(여기서 Xaa(29) 및 Xaa(31)는 Arg, Xaa(33)는 Gly이고 Xaa(34)는 Ala이다)가 사용될 수 있는데, 그것은 단백질 분해성 작용 부위를 제공하는 위치 -4 및 -5(서열 5의 잔기 31 및 32)에 한 쌍의 아르기닌 잔기를 함유한다. 3개의 추가적인 N-말단 아미노산을 가지는 TPO 폴리펩티드의 생산을 초래하는 절단이 이 부위에서 일어날 수 있다. 따라서 본 발명에서 이 작용 부위를 제거하기 위해서 그리고 t-PA 및 TPO 서열의 접합부에서의 작용을 증강시키기 위해서 분비성펩티드를 코딩하는 DNA 서열을 변형하는 것이 바람직하다. 이론적인 내용이지만, 분비성 펩티드 절단은 효소KEX2유전자 생성물 또는 포유류 효소 PC1, PC2 및 퓨린과 같은 프로호르몬 전환 효소에 의존하는 것으로 믿어진다. 이 형태의 효소는 -1 및 -4 위치의 아르기닌 잔기에 의해 특성화된 절단 부위를 인식한다. 절단은 -2위치의 염기성 아미노산 잔기(예를 들면 Lys 또는 Arg)에 의해 촉진된다. 따라서 본 발명에서 분비성 펩티드와 TPO 폴리펩티드 사이의 절단은 -1 및 -4 위치에 아르기닌 잔기를 제공하고 임의로 -2 위치에 염기성 아미노산을 제공함으로써 증강될 수 있다. 원하는 절단의 추가적인 증강은 분비성 펩티드내의 어느 곳의 아르기닌 잔기를, 다른 것, 특히 그러한 잔기가 Arg-Xaa-Xaa-Arg 요소를 형성하는 곳에서, 바람직하게는 비-염기성 아미노산 잔기로 대체함으로써 이루어진다. 바람직한 구체예에서, 서열 5의 Xaa(29) 및 Xaa(31)는 개별적으로 Lys, Arg 또는 His을 제외한 어떤 아미노산이다. 보다 바람직하게는, Xaa(29) 및 Xaa(31)는 개별적으로 Asp, Glu, Gln, Gly 또는 Ala이다. 또 다른 바람직한 구체예에서, Xaa(33)는 Gly이다. 또 다른 바람직한 구체예에서, Xaa(34)는 Arg 또는 Lys이다. 특히 바람직한 치환은 Xaa(29)에서의 Glu, Xaa(31)에서의 Gln, Xaa(34)에서의 Arg를 포함한다. 신호 서열은 여기에 그 전체가 참고로 포함되는 Mullis et al., 미합중국 특허 번호 4,683,195 및 Mullis, 미합중국 특허 번호 4,683,202에 의해 개시된 중합요소 연쇄 반응과 같은 종래의 방법에 의해 돌연변이된다.
또한 비-사람 t-PA로부터의 분비성 펩티브 및 비-사람 t-PA 분비성 펩티드의 유도체도 사용될 수 있다. 다양한 종으로부터의 t-PA 분비성 펩티드를 코딩하는DNA 서열은 본 분야에 공지되어 있고, 예를 들면 Rickles et al.,J. Biol. Chem. 263: 1563-1560, 1988 및 Feng et al.,J. Biol. Chem. 265: 2022-2027, 1990에 의해 개시되었다. 그러한 DNA 서열은 본 분야의 표준 기술에 따라 cDNA 또는 게놈 분자로 클로닝될 수 있으며, 또는 바람직하게는 자동화장비 및 종래의 합성프로토콜의 적용을 사용하여 합성될 수 있다.
본 발명에서 사용하는데 적합한 숙주 세포는 이형 DNA를 발현하기 위해 처리할 수 있고, 배양물에서 성장시킬 수 있고, 분비 경로를 가지는 세포의 어떤 형태를 포함한다. 비록E. coli세포와 같은 원핵세포는 적어도 주변 세포질 공간으로의 단백질의 분비능이 있지만, 본 발명에서는 균류 세포 또는 배양된 포유류 세포와 같은 배양된 진핵 세포를 사용하는 것이 바람직하다.
효모 세포, 특히 사카로미쎄스(Saccharomyces)속의 세포는 재조합 TPO 폴리펩티드의 생산에 유용하다. 효모 세포는 인체 소비용 생성물의 생산에서의 오래된역사를 가지며 배양이 상대적으로 저렴하다. 효소 세포의 외인성 DNA로의 형질전환 및 그것으로부터의 재조합 단백질 생산을 위한 방법은 여기에 참고로 포함되는, 예를 들면 Kawasaki, 미합중국 특허 번호 4,599,311; Kawasaki et al., 미합중국 특허 번호 4,931,373; Brake, 미합중국 특허 번호 4,870,008; Welch et al., 미합중국 특허 번호 5,037,743 및 Murray et al., 미합중국 특허 번호 4,845,075에 의해 개시되어 있다. 형질 전환된 세포는 선별가능 마커, 통상적 약품 내성 또는 특정 영양소(예를 들면 류신)의 부재시의 성장 능력에 의해 결정되는 표현형에 의해 선별된다. 효모내에의 사용에 바람직한 벡터 시스템은 Kawasaki et al.(미합중국 특허 번호 4,931,373)에 의해 개시된, 형질전환된 세포를 글루코스-함유 배지내에서의 성장에 의해 선별되는 것을 허용하는POT1벡터 시스템이다. 효모내에서 사용하는데 적당한 프로모터 및 터미네이터는 해당 효소 유전자(예를 들면, 여기에 참고로 포함되는 Kawasaki, 미합중국 특허 번호 4,599,311; Kingsman et al., 미합중국 특허 번호 4,615,974; 및 Bitter, 미합중국 특허 번호 4,977,092 참조) 및 알코올 탈수소 효소 유전자 유래의 것들을 포함한다. 또한 여기에 참고로 포함되는 미합중국 특허 번호 4,990,446; 5,063,154; 5,139,936 및 4,661,454 참조. 한세눌라 폴리몰파(Hansenula polymorpha), 스키조사카로미쎄스 폼베(Schizosaccaromyces pombe), 클루이베로미쎄스 락티스(Kluyveromyces lactis), 클루이베로미쎄스 프리질리스(Kluyveromyces fragilis), 우스틸라고 마이디스(Ustilago maydis), 피키아 파스토리스(Pichia Pastoris), 피기아 귈레르몬디(Pichia guillermondii)및 캔디다 말토사(Candida maltosa)를 포함하는 기타 효모들을 위한 형질 전환 시스템은 본 분야에 공지되어 있다. 예를 들면, Gleeson et al.,J. Gen. Microbiol. 132: 3459-3465, 1986; Cregg, 미합중국 특허 번호 4,882,279; 및 Stroman et al., 미합중국 특허 번호 4,879,231 참조.
또한 기타 균류 세포도 숙주로서 적합하다. 예를 들면, 여기에 참고로 포함되는 McKnight et al., 미합중국 특허 번호 4,935,349의 방법에 따라 아스페르질루스(Aspergillus)세포가 사용될 수 있다. 아크레모니움 크리소제눔(Acremonium chrysogenum)의 형질전환방법이 여기에 참고로 포함되는 Sumino et al., 미합중국 특허 번호 5,162,228에 의해 개시되어 있다. 뉴로스포라(Neurospora)의 형질전환을위한 방법이 여기에 참고로 포함되는 Lambowitz, 미합중국 특허 번호 4,486,533에 의해 개시되어 있다.
상기한 바와 같이, 배양된 포유류 세포는 본 발명에서의 바람직한 숙주이다. 외인성 DNA의 포유류 숙주 세포내로 도입하기 위한 방법은 인산칼슘-매개의 형질이입(transfection)(Wigler et al., Cell 14: 725, 1978; Corsaro 및 Pearson,Somatic Cell Genetics 7: 603, 1981: Graham 및 Van der Eb,Virology52: 456, 1973), 전기영동(Neumann et al.,EMBO J. 1: 841-845, 1982), DEAE-덱스트란 매개의 형질이입(Ausubel et al., eds.,Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley and Sons, Inc., NY, 1987), 및 양이온성 지질-매개의 형질이입(Hawley-Nelson et al.,Focus 15: 73-79, 1993)을 포함하고, 이들은 여기에 참고로 포함된다. 배양된 포유류 세포내에서의 재조합 단백질의 생산은, 예를 들면, 여기에 참고로 포함되는 Levinson et al., 미합중국 특허 번호 4,713,339; Hagen et al., 미합중국 특허 번호 4,784,950; Palmiter et al., 미합중국 특허 번호 4,579,821; 및 Ringold, 미합중국 특허 번호 4,656,134에 의해 개시되어 있다. 바람직한 배양된 포유류 세포는 COS-1(ATCC 번호 CRL 1650), COS-7(ATCC 번호 CRL 1651), BHK(ATCC 번호 CRL 1632), BHK 570(ATCC 번호 CRL 10314), 293(ATCC 번호 CRL 1573; Graham et al.,J. Gen. Virol.36: 59-72, 1977) 및 중국산 햄스터 난소(예를 들면 CHO-K1; ATCC 번호 CCL 61) 세포주를 포함한다. 추가적인 적합한 세포주는 본 분야에서 공지되어 있으면 메릴랜드주 록빌리의 아메리칸 타입 컬춰 콜렉션과 같은 공공 수탁소로부터 구입가능하다. 일반적으로 SV-40 또는 시토메갈로바이러스로부터의 프로모터와 같은 강한 전사 프로모터가 바람직하다. 예를 들면, 미합중국 특허 번호 4,956,288 참조. 다른 적합한 프로모터는 메탈로티오네인 유전자(여기에 참고로 포함되는 미합중국 특허 번호 4,579,821 및 4,601,978) 및 아데노바이러스 주요 후기 프로모터를 포함한다.
약품 선별은 외부 DNA가 삽입된 배양된 포유류 세포를 선별하기 위해 일반적으로 사용된다. 그러한 세포는 "형질이입체"로 통상 칭한다. 선별 작용물의 존재에서 배양되고 그들의 자손으로 관심의 유전자를 이동시킬 수 있는 세포는 "안정한 형질이입체"로 칭한다. 바람직한 선별가능 마커는 항생제 네오마이신에 대한 내성을 코딩하는 유전자이다. 선별은 G-418 등과 같은 네오마이신-형태의 약품의 존재에서 수행된다. 또한 선별 시스템은 "증폭"이라 칭하는 방법인 관심의 유전자의 발현 수준을 증가시키는데 사용될 수 있다. 증폭은 낮은 수준의 선별 작용물의 존재에서 형질이입체를 배양하고 이어서 도입된 유전자의 생성물의 높은 수준을 생산하는 세포를 선별하기 위해 선별 작용물의 양을 증가시킴으로써 수행된다. 바람직한 증폭가능의 선별가능 마커는 메토트렉세이트에 대한 내성을 주는 디히드로폴레이트 환원효소이다. 또한 다른 약품 내성 유전자(예를 들면, 히그로마이신 내성, 다중-약품 내성, 푸로마이신 아세틸트랜스퍼라제)도 사용될 수 있다.
곤충 세포, 식물 세포 및 조류 세포를 포함하는 기타 고등 진핵성 세포도 숙주로 사용될 수 있다. 곤충 세포의 형질 전환 및 거기에서의 외래 단백질의 생산이 여기에 참고로 포함되는 Guarino et al., 미합중국 특허 번호 5,162,222; Bang et al., 미합중국 특허 번호 4,775,624; 및 WIPO 공개 WO 94/06463에 의해 개시되어있다. 식물 세포내에서의 발현 유전자를 위한 벡터로서 아그로박테리움 리조게네스(Agrobacterium rhizogenes)의 사용이 Sinkar et al.,J. Biosci. (Bangalore) 11: 47-58, 1987에 의해 명시되었다.
형질전환되거나 형질이입된 숙주 세포는 선택된 숙주 세포의 성장을 위해 요구되는 영양분 및 기타 성분을 함유하는 배지내에서 종래의 방법에 따라 배양된다. 정의된 배치 및 복합 배지를 포함하는 다향한 적합한 배지가 본 분야에 공지되어 있고 일반적으로 탄소원, 질소원, 필수 아미노산, 비타민 및 미네랄을 포함한다. 배지는 필요한 만큼 성장인자 또는 혈청과 같은 성분도 함유할 수 있다. 성장 배지는 외인성의 추가된 DNA를 함유하는 세포를 약품 선별 또는, 예를 들면 발현 벡터상에 수반되거나 숙주세포내로 동시 형질 이입되는 선별가능 마커에 의해 보충되는 결함에 의해 선택할 것이다.
본 발명에 따라 제조되는 TPO는 단백질의 크기, 전하, 용해도 및 기타 성질에 기초한 친화성 정제 및 분리와 같은 본 분야 공지의 일반적인 방법을 이용하여 선택적으로 회수된다. 단백질이 배양된 포유류 세포내에서 생산하는 경우는, 오염 단백질의 양을 제한하기 위해 무혈청 배지내에서 세포를 배양하는 것이 바람직하다. 배지를 수확하고 분류한다. 분류의 바람직한 방법은 고정화 MPL 수용체 단백질 또는 그것의 리간드-결합 부분상에서와 같은 친화성 크로마토그래피 또는 친화 표지(예를 들면 항체나 기타 특이적 결합 작용제가 구입가능한 것에 대한 폴리히스티딘, 물질 P 또는 기타 폴리펩티드나 단백질)를 포함한다. 특정 절단 부위는 관심의 단백질과 친화 표지사이에 제공된다. 또한 양이온 교환 크로마토그래피, 음이온 교환 크로마토그래피, 및 소수성 상호작용 크로마토그래피와 같은 기타 크로마토그래피의 방법도 사용될 수 있다.
본 발명에 따라 제조된 TPO는 무형성성 빈혈, 척수조직형성이상 증후군, 화학요법 또는 선천성 혈구감소증에 의해 유발하는 것과 같은 혈구감소증의 치료와 같이 골수내의 세포의 증식을 증가시키기를 원하는 어느 곳에나 치료적으로 사용될 수 있다. 또한 TPO는 혈소판 감소증의 치료에서와 같이 혈소판 생산을 증가시키는데 유용하다. 혈소판 감소증은 단독으로 작용하거나 조합되어 상태를 발생시키는 질병 및 임상적 환경의 다양한 군과 관련되어 있다. 감소된 혈소판수는, 예를 들면 혈소판 생산의 결함, 비정상적 혈소판 분배, 다량의 수혈에서 기인하는 희석성 감소, 또는 혈소판의 비정상적 파괴등으로부터 초래할 수 있다. 예를 들면, 암 치료에서 사용되는 화학요법 약품은 골수에서의 혈소판 선조세포의 발생을 억제하며 결과되는 혈소판 감소증은 화학요법을 제한하며 수혈을 필요불가결하게 한다. 더욱이 어떤 악성종양은 혈소판 생산 및 혈소판 분배를 손상시킬 수 있다. 악성종양 세포를 죽이기 위한 방사선 치료는 혈소판 선조세포도 죽인다. 또한 혈소판 감소증은 약품, 신생아 동종면역 또는 혈소판 수혈 동종면역에 의해 유발되는 다양한 혈소판 자가면역 이상으로부터 발생한다. TPO는 혈소판 동종면역의 발생빈도를 감소시킴으로써 수혈의 필요성을 감소시키거나 제거한다. 혈소판의 비정상적 파괴는 (1) 혈관이식 또는 외상 조직에서의 증가된 혈소판 소비; 또는 (2) 예를 들면 약품-유발성 혈소판 감소증, 자연발생적 혈소판 감소성 자반(ITP), 자가면역 질병, 백혈병과 임파종과 같은 혈액학적 장애 또는 골수를 포함하는 전이성 암 등과 연관된 면역 기작으로부터 초래할 수 있다. 기타 TPO에 대한 지시는 무형성성 빈혈과, 예를 들면 화학요법 또는 AZT에 의한 HIV 감염의 치료로부터 초래하는 약품-유발성 골수 억제를 포함한다.
혈소판 감소증은 상처, 궤양 또는 주사부위로부터의 출혈 뿐만 아니라 코-입부위 또는 위장으로부터의 점액성 출혈과 같은 출혈의 증가에 의해 나타난다.
제약 용도로 TPO는 종래 방법에 따른 비경구, 특히 정맥내 또는 피하의 운반을 위해 처방된다. 정맥내 투여는 1 내지 몇 시간의 전형적 기간에 걸쳐 알약 투입 또는 주입에 의할 것이다. 일반적으로 제약적 처방은, 염수, 완충된 염수, 물중의 5% 덱스트로즈 등과 같은 제약적으로 허용가능한 부형제와 조합하는 TPO를 포함한다. 처방은 부형제, 방부제, 가용화제, 완충제, 바이알 표면상에서의 단백질의 손실을 방지하기 위한 알부민 등을 부가적으로 포함한다. 더욱이 TPO는 기타 시토킨, 특히 간(幹)세포 인자, IL-3, IL-6, IL-11 또는 GM-CSF와 같은 조기-작용성 시토킨과 조합한다. 그러한 조합 요법을 사용할 때는 시토킨을 단일 제제로 조합할 수 있거나 분리된 제제로 투여할 수 있다. 처방 방법은 본 분야에 잘 공지되어 있고, 예를 들면 여기에 참고로 포함되는Remington's Pharmaceutical Sciences, Gennaro, ed., Mack Publishing Co., Easton PA, 1990에 개시되어 있다. TPO의 치료적 용량은 임상의에 의해 적합한 기준에 따라, 특성, 취급되어야 하는 조건, 환자 특성등의 엄격함에 따라 정확한 용량으로 일반적으로 하루 0.1 내지 100㎍/환자 중량의 ㎏의 범위내이며, 바람직하게는 하루 0.5 내지 5㎍/㎏이다. 증가된 민감성을 보이거나 지속적 치료를 필요로 하는 환자를 치료하는 것과 같은 어떤 경우에는 하루0.1 내지 20㎍/㎏의 용량이 지시될 것이다. 용량의 결정은 본 분야의 일반적 기술의 수준내에 있다. TPO는 통상 화학요법 또는 골수 이식에 이어서 28일 까지의 기간에 걸쳐서, 또는 혈소판 수가 >20,000/mm3, 바람직하게는 50,000/mm3이 될 때까지 투약할 것이다. 보다 통상적으로 TPO는 일주일 이하에 걸쳐, 종종 1 내지 3일의 기간에 걸쳐 투약될 것이다. 일반적으로 TPO의 치료적으로 유효한 양은, 성숙한 세포(예를 들면, 혈소판 또는 호중구)의 순환성 수준으로의 증가로 나타날 임파성 또는 골수선조세포의 증식 및/또한 분화에서 임상적으로 충분한 증가량을 생상하기 위해 충분한 양이다. 혈소판 장애의 치료는 혈소판수가 적어도 20,000/mm3, 바람직하게는 50,000/mm3이 될 때까지 계속될 것이다. TPO는 또한 IL-3, -6 및 -11과 같은 기타 시토킨; 간세포 인자; 에리트로포이에틴; G-CSF 및 GM-CSF와의 조합으로 투약될 수 있다. 조합치료 양생법에서, 기타 시토킨의 일일 용량은 EPO, ≤150U/㎏; GM-CSF, 5 내지 15㎍/㎏; IL-3, 1 내지 5㎍/㎏; 및 G-CSF, 1 내지 25㎍/㎏일 것이다. 예를 들면, EPO와의 조합치료는 낮은 EPO 수준의 빈혈 환자에 지시된다.
또한 TPO는 세포 분화의 기작의 설명 및 성숙 세포의 계통의 결정과 같은 분화 및 발생의 시험관 내 연구를 위한 가치있는 도구이며, 세포 배양에서 증식성 무물질로서의 사용을 제공한다.
또한 TPO는 자기조직의 골수 배양에서와 같이 생체외에서 사용될 수 있다. 간단히 말하면, 골수는 화학 요법에 앞서 환자로부터 제거되며 TPO 및 부가적으로 하나 이상의 시토킨의 조합으로 처리된다. 처리된 골수는 이어서 골수의 회복을 가속하기 위해 화학 요법 후 환자로 되돌려진다. 더욱이 TPO는 골수 또는 말초 혈 전구(PBPC)세포의 생체외 확대를 위해 사용될 수 있다. 화학요법 치료에 앞서 골수는 말초 순환으로 조기에 선구세포를 방출하기 위해 간세포 요소(SCF) 또는 G-CSF로 자극될 수 있다. 이들 선구체를 말초 혈액으로부터 모으고 농축시킬 수 있으며 이어서 배양액 내에서 TPO, 부가적으로, 고농도 거핵구 배양으로의 분화 및 증식을 위해, 이어지는 고용량 화학요법의 환자에게로 되돌릴 수 있는, SCF, G-CSF, IL-3, GM-CSF, IL-6 또는 IL-11을 포함하나 제한되지 않는, 하나 이상의 시토킨의 조합으로 치료할 수 있다.
본 발명은 다음의 제한적이지 않은 실시예에 의해 더 예시된다.
(실시예 1)
사람 t-PA 신호 서열을 올리고누클레오티드 프라이머 ZC7367(서열 6) ZC7738(서열 7) 및 주형으로서의 플라스미드 Thr102(WIPO 공개 WO 3/13208에 개시됨)를 사용하여 중합효소 연쇄반응에 의해 변형시켰다. 10ng의 주형 DNA를 5μl의 2mM dNPTs, 5μl 10x Taq 완충액(Boehringer Mannheim, 인디아나폴리스, 일리노이즈), 0.2μl Taq DNA 중합효소(Boehringer Mannheim), 40pmole의 각 프라이머 및 50μl까지의 물과 조합하였다. 혼합액을 95℃, 1분간; 50℃, 2분간; 72℃, 1분간의 15주기동안 가온처리하고 이어서 최종 10분간 72℃에서 가온처리하였다. DNA를 페놀/CHCl3로 추출하고, -20℃에서 하룻밤 이소프로판올로 침전시키고, 30μl H2O에재현탁시켰다. 10μl의 DNA를 BalII 및 EcoRI로 분해시켰다. 분해된 DNA를 2.2% 아가로즈 겔상에서 전기영동시켰다. 124bp에 상응하는 겔의 부분을 잘라내고 유리수조막솜의 매트상의 바닥에 구멍이 하나 있는 0.5ml 미크로센트리퓨즈 튜브내에 넣었다. 튜브를 빈 1.5ml 튜브내에 넣고, 이 조립품을 겔로부터 DNA를 추출하기 위해 원심분리하였다. 2㎍의 글리코겐을 추출액에 첨가하고, 염 농도를 0.2M NaCl로 맞추고, DNA를 에탄올로 -20℃에서 하룻밤 가온처리에 의해 침전시켰다. 변형된 서열은 -7에서의 Agr 잔기는 Glu로 대체되었고, -2에서의 Ala 잔기는 Arg로 대체된 사람 t-PA 분비성 펩티드를 코딩하였다.
마우스 TPO DNA 서열의 5' 말단으로 BglII 부위를 도입하기 위해, pZGmpl-1081(메릴랜드주 록빌리 12301 파크로운 드라이브 아메리칸 타입 컬춰 콜렉션으로 부다페스트 조약의 협약하에 1994년 2월 14일 기탁 승인 번호 69566으로 수탁됨)을 PCR에 의해 돌연변이를 일으켰다. 돌연변이를 올리고누클레오티드 프라이머 ZC7365(서열 8) 및 ZC7645(서열 9)를 사용하여 수행하였다. PCR을 상기한 조건을 사용하여 20주기 동안 운행하였다. DNA를 페놀/클로로포름 추출하였고 이소프로판올로 침전시켰다.
침전된 DNA를 H2O내에 재현탁시키고 PstI 및 BglII로 분해시켰다. 313bp 단편을 상기한 바와 같이 겔 전기영동 및 원심분리에 의해 회수하였다.
발현 벡터인 플라스미드 Zem229R(부다페스트 조약의 협약하에 1993년 9월 28일 메릴랜드 록빌리 12301 파크로운 드라이브 아메리칸 타입 컬춰 콜렉션으로E.coliHB101 형질전환체로서 기탁 승인 번호 69447로 수탁됨)을 EcoRI로 분해시켰으며 알칼리 포스파타제로 처리하였다. 선형화된 벡터를 t-PA 리더 서열(EcoRI-BglII), 313bp PstI-BglII TPO 단편, 및 서열 2의 아미노산 잔기 150에서 196까지를 코딩하는 PstI-EcoRI 단편으로 라이게이션시켰다. 라이게이션된 DNA를 암피실린 함유의 배지상에 도말하고 하룻밤 배양한 콤피턴트 DH10b™E.coli세포(GIBCO BRL, 메릴랜드 가이터스버그)를 형질전환시키기 위해 사용하였다.
BHK 570 세포(ATCC CRL 10314)를 50,000 세포의 농도로 24-웰 디쉬내에 도말하고 약 15시간 동안 배양하였다. 플라스미드 DNA(TP0100.229R로 명명됨)를 Wizard™프렙(Promega Corp., 위스콘신 메디슨)을 사용하여 형질전환된E. coli세포로부터 제조하였다. 40퍼센트의 DNA(20μl)를 물중 2,3-디올레일옥시-N-[2(스퍼민카르복시아미도)에틸」-N,N-디메틸-1-프로판아미니움트리플루오로아세테이트 및 디올레올리포스파티딜에탄올아민(Lipofectamine™ 제제, GIBCO-BRL)의 3:1 리포좀제제를 사용하여 BHK 570 세포내로 형질이입시켰다. 형질이입체를 5% 가열 불활성화시킨 소태아 혈청(Biowhittaker), 1mM 피루브산나트륨(Irvine Scientific, 캘리포니아 산타아나), 2mM L-글루타민(JRH Biosciences, 캔사스 렉세나) 및 25mM HEPES(JRH Biosciences)를 함유하는 둘베코의 변형된 이글의 배지(DME; BioWhittaker, Inc., 메릴랜드 워커스바일, 또는 Fred Hutchinson Cancer Reseach Center, 워싱턴 시애틀로부터 얻어짐)내의 500nM 메토트렉세이트(MTX)내에서 선별된다. 푸울로부터의 TPO의 평균생산은 ml당 하루당 69,000 내지 92,000 단위(실시예 10에서 정의되는 바와 같음)이었다. 이어서 형질이입체 및 개별 클론의 푸울을10μM MTX에서의 증폭시켰고 희석에 의해 클로닝하였다. 증폭된 푸울은 56,000 U/ml/일의 TPO를 생산하는 것으로 밝혀졌다.
(실시예 2)
완전한 길이의 마우스 TPO의 발현 및 분비를 위한 벡터를 구성하였다. TP0100.229R을 EcoRI 및 PstI으로 분해시켰으며 437bp 단편을 상기한 바와 같이 겔전기영동 및 원심분리로 분리하였다. 서열 2의 아미노산 150 내지 379를 코딩하는 PstI-EcoRI 단편을 제조하였고 두 단편을 EcoRI로 분해하고 알칼리 포스파타제로 처리된 Zem229R로 라이게이션시켰다. 라이게이션된 혼합물을 암피실린 함유의 배지상에 도말하고 하룻밤 배양한 콤피턴트E. coliDH10b 세포를 형질전환시키기 위해 사용한다.
플라스미드 DNA(TP0101.229R로 명명됨)를 형질전환된E.coli세포로부터 제조하고 상기한 바와 같이 BHK 570 세포내로 형질이입시킨다. 500nM MTX에서 선별된 형질이입체의 푸울은 30,000 U/ml/일의 TPO를 생산하였다. 10μM MTX로 증폭된 형질이입체의 푸울은 88,000 U/ml/일의 TPO를 생산하였다.
(실시예 3)
완전한 길이의 마우스 TPO DNA 서열을 서열 2의 위치 197 내지 198에서의 아르기닌 잔기를 글루타민 잔기로 대체하기 위해 PCR로 돌연변이시켰다. 돌연변이된 TPO DNA(EcoRI-NotI)를 EcoRI-분해된 Zem229R에 NotI/EcoRI 올리고누클레오티드 링커로 라이게이션시켰다. 결과되는 플라스미드는 TPOM3으로 명명하였다.
플라스미드 TP0100.229R을 EcoRI 및 SalI으로 분해시키고, t-PA 리더와 서열2의 아미노산잔기 45 내지 76을 코딩하는 218bp 단편을 분리하였다. 서열 2의 아미노산 잔기 77 내지 379를 코딩하며 3' 비번역된 DNA를 포함하는 1188bp 단편을 TPOM3을 SalI 및 EcoRI로 분해시킴으로써 제조하였다. 이들 두 단편을 EcoRI로 분해시키고 알칼리 포스파타제로 처리한 Zem229R로 라이게이션시켰다. 라이게이션된 혼합물을 콤피턴트E. coliDH10b™세포를 형질전환시키고 위해 사용하였고, 이 세포를 암피실린을 함유한 배지상에 도말하였고 하룻밤 배양하였다. 결과되는 플라스미드를 TP0110.229R로 명명하였다.
(실시예 4)
사람 TPO의 발현을 위해 BglII 부위를 서열 4의 아미노산 잔기 22(Ser)에 대한 코돈의 위치에서 DNA 서열로 도입하였다. 중합효소 연쇄반응을 사람 TPO cDNA를 주형으로 하고 올리고누클레오티드 프라이머 ZC7907(서열 10) 및 7693(서열 11)을 사용하여 수행하였다. 10ng의 주형 DNA를 5μl의 2mM dNTPs, 5μl 10x Taq 완충액(Boehringer Mannheim), 0.2μl Taq DNA 중합효소(Boehringer Mannheim), 40pmole의 각 프라이머, 및 50μl까지의 H2O로 조합시켰다. 혼합물을 95℃, 1분; 50℃, 2분; 및 72℃, 1분의 30 주기동안 가온처리하고 최종 10분간 72℃에서 가온처리였다.
PCR 혼합물을 페놀/CHCl3로 추출하였고 DNA를 이소프로판올로 침전시키고 H2O에 재현탁시켰다. 재현탁된 DNA를 BglII 및 PstI으로 분해시켰고 316bp 단편을 상기한 바와 같이 회수하였다. 이 단편은 서열 4의 아미노산 잔기 22 내지 126을코딩하였다.
t-PA 리더 서열을 플라스미드를 EcoRI 및 BglII로 분해시키고 겔전기영동 및 원심분리에 의해 원하는 단편(124bp)을 분리함으로써 TP0100.229R로부터 제조하였다.
사람 TPO 발현벡터를 구성하기 위해, 서열 4의 아미노산 잔기 127 내지 353을 코딩하는 710bp PstI-EcoRI 단편을 분리하고 PCR-생성의 단편, 리더 서열, 및 EcoRI로 분해되고 알칼리 포스파타제로 처리한 Zem229R로 라이게이션시켰다. 라이게이션된 DNA를 콤피턴트E. coliDH10b™세포를 형질전환시키기 위해 사용하였다. 플라스미드를 TP0201.229R로 명명하였다.
TP0201 서열을 아데노바이러스 주 후반 프로모터의 조절하에 발현벡터내로 위치시켰다. 플라스미드 TP0201.229R을 EcoRI으로 분해시켰으며, t-PA 리더 및 TPO 폴리펩티드를 코딩하는 1149bp 단편을 분리하였다. 이 DNA 절편을 플라스미드 TPO201.pDX를 구성하기 위해 EcoRI으로 분해시키고 알칼리 포스파타제로 처리한 벡터 pDX(미합중국 특허 번호 4,959,318에 개시됨)에 라이게이션시켰다.
TPO201.pDX 및 Zem229R로 동시 형질이입시키고 5μM 메토트렉세이트에서 선별된 BHK 570 세포는 10,000 내지 15,000 단위 TPO/ml/일을 생산하였다.
(실시예 5)
벡터를 서열 4의 아미노산잔기 235에서 끝나는 TPO 폴리펩티드의 발현을 위해 구성하였다. 사람 TPO DNA 서열을 두 정지 코돈 및 아미노산 235에 대한 코돈이 뒤따르는 EcoRI 부위를 도입하기 위해 PCR에 의해 돌연변이시켰다. 10ng의 주형DNA를 5μl의 2mM dNTPS, 5μl 10x Taq 완충액(Boehringer Mannheim), 0.2μl Taq DNA 중합효소(Boehringer Mannheim), 40pmole의 각 프라이머 ZC7910(서열 12) 및 ZC7878(서열 13) 및 50μl까지의 H2O와 조합하였다. 혼합물을 95℃, 1분; 50℃, 2분; 및 72℃, 1분의 30 주기동안 가온처리하고 마지막 10분간 72℃에서 가온처리였다. DNA를 반응 혼합물로부터 분리하고 PstI 및 EcoRI으로 분해시켰고 서열 4의 아미노산 잔기를 코딩하는 334bp 단편을 상기한 바와 같이 회수하였다. 이 단편을 특성을 확인하기 위해 pIC19H내로 클로닝하고 서열화하였다.
이어서 발현벡터를 제조하였다. t-PA 리더 및 서열 4의 아미노산 잔기 22 내지 126을 코딩하는 440bp 단편을 TPO201.229R의 EcoRI+PstI 분해로부터 분리하였다. PCR-생성의 단편을 pIC19H 클론의 EcoRI+PstI 분해로부터 분리하였다. 두 단편을 EcoRI로 분해시키고 알칼리 포스파타제로 처리한 Zem229R로 라이게이션시켰다. 라이게이션된 DNA를 콤피턴트E. coliDH10b™세포를 형질전환시키기 위해 사용하였다. 플라스미드를 TPO200.229R이라 명명하였다.
플라스미드 TPO200.229R를 근본적으로는 실시예 1에 개시된 바와 같이 Lipfectamine™을 사용하여 BHK 570 세포내로 형질이입시켰다. 세포를 형질이입 하루전 40,000 세포/웰의 농도로 24-웰 디쉬에 도말하였다. 500nM MTX내에서 최초 선별된 후, 푸울링된 세포는 1290 U/ml/일의 TPO를 생산하였다. 5μM MTX내에서의 증폭후, 푸울링된 세포는 2330 U/ml/일의 TPO를 생산하였다. 50μM MTX내에서의 증폭된 세포의 푸울은 4700 U/ml/일의 TPO를 생산하였다.
이차 발현 벡터를 아데노바이러스 주요 후기 프로모터, t-PA 리더 및 사람 TPO 22 내지 235 서열로 이루어지도록 구성하였다. 플라스미드 TPO200.299R을 EcoRI로 분해시키고 t-PA 리더 및 사람 TPO 폴리펩티드를 코딩하는 775bp 단편을 회수하였다. 이 DNA 절편을 EcoRI로의 분해에 의해 선상화시키고 알칼리 포스파타제로 처리한 벡터 pDX로 라이게이션시켰다. 라이게이션된 DNA를E. coliMC1061 세포내로 형질전환시켰다. 플라스미드를 TPO200.pDX로 명명하였다.
TPO200.pDX를 Zem229R과 함께 BHK 570 세포내로 동시 형질이입시켰다. 500 nM 메토트렉세이트에서 선별된 세포는 10,000 내지 15,000 단위 TPO/ml/일을 생산하였다.
(실시예 6)
벡터를 서열 4의 아미노산 잔기 193에서 끝나는 TPO 폴리펩티드의 발현을 위해 구성하였다. 사람 TPO DNA 서열을 아미노산 193에 뒤따르는 정지 코돈과 EcoRI부위를 도입하기 위해 PCR에 의해 돌연변이시켰다. 10ng의 주형 DNA를 5μl의 2mM dNTPs, 5μl 10x Taq 완충액(Boehringer Mannheim), 0.2μl Taq DNA 중합효소(Boehringer Mannheim), 40pmole의 각 프라이머 ZC8045 번호 12) 및 ZC7878(서열 13) 및 50μl까지의 H2O와 조합하였다. 혼합물을 95℃, 1분; 50℃, 2분; 및 72℃, 1분의 30 주기동안 가온처리하고 마지막 10분간 72℃에서 가온처리였다. DNA를 반응 혼합물로부터 분리하고 PstI 및 EcoRI으로 분해시켰고 서열 4의 아미노산 잔기 127 내지 193을 코딩하는 204bp 단편을 상기한 바와 같이 회수하였다.
발현벡터를 구성하기 위해 분리된 PCR 생성물을 t-PA 리더 및 서열 4의 아미노산 잔기 22 내지 126 및 EcoRI로 분해시키고 알칼리 포스파타제로 처리한 Zem229R을 코딩하는 EcoRI+PstI 단편으로 라이게이션시켰다. 라이게이션된 DNA를 콤피턴트E. coliDH10b™세포를 형질전환시키기 위해 사용하였다. 플라스미드를 TPO202.229R이라 명명하였다.
BHK 570 세포를 상기한 바와 같이 TPO202.229R로 형질이입시키고 500nM MTX내에서 선별하였다. 푸울링된 세포는 13,110 U/ml의 TPO를 생산하였다. 5nM MTX내에서 증폭후, 푸울링된 세포는 20,850 U/ml/일의 TPO를 생산하였다.
646bp EcoRI 삽입을 TPO202.229R로부터 제거하였고 EcoRI에 의한 분해에 의해 선상화되고 알칼리 포스파타제로 처리된 pDX에 라이게이션시켰다. TPO202.pDX로 명명된 결과되는 벡터를 Zem229R 또는 AAT.229R과 함께 BHK 570 세포내로 동시 형질이입시켰다. TPO202.pDX 및 AAT.229R로 동시 형질이입되며 500nM MTX내에서 증폭된 세포는 20,500 U/ml/일의 TPO를 생산하였다. 500nM MTX내에서 증폭된 TPO202.pDX/Zem229R 동시 형질이입체는 17,000 U/ml/일의 TPO를 생산하였다.
(실시예 7)
t-PA 리더내 위치 -5에서의 Arg 잔기를 Gln 잔기로 대체하였다. 중합효소 연쇄반응을 TPO100.229R을 주형으로서, 올리고누클레오티드 프라이머 ZC7367(서열 6) 및 ZC7956(서열 15) 및 실시예 6에서 구체화된 반응조건을 사용하여 수행하였다. DNA를 상기한 바와 같이 분리하였으며, EcoRI 및 BglII로 분해시켰으며, 변형된 t-PA를 코딩하는 124bp 단편을 회수하였다.
발현벡터를 구성하기 위해 124bp PCR 생성물을 TPO201.229R로부터의 TPO-코딩의 BglII-EcoRI 및 EcoRI으로 분해되고 알칼리 포스파타제로 처리된 Zem229R로 라이게이션시켰다. 라이게이션된 DNA를 콤피턴트E. coliDH10b™세포를 형질전환시키기 위해 사용하였다. 플라스미드를 TPO251.229R이라 명명하였다.
BHK 570 세포를 형질이입 하루전 40,000 세포/웰의 농도로 24-웰 플레이트상에 도말하였다. TPO251-229R로 형질이입시키고 MTX내에서 선별한 후, 푸울링된 세포는 1340 U/ml의 TPO를 생산하였다. 5nM MTX내에서 증폭후, 푸울링된 세포는 3940 U/ml/일의 TPO를 생산하였다.
(실시예 8)
벡터를 서열 4의 아미노산 잔기 235에서 끝나는 사람 TPO 폴리펩티드의 발현을 위해 실시예 7의 변형된 t-PA 리더로 구성하였다. TPO251.229R 및 TPO200.229R의 각각을 PstI 및 EcoRI으로 분해시켰다. 각각 441 bp 및 335 bp의 단편을 회수하였다. 두 단편을 EcoRI으로 분해하고 알칼리 포스파타제로 처리된 Zem229R로 라이게이션시켰다. 라이게이션된 DNA를 콤피턴트E. coliMC1061 세포를 형질전환시키기 위해 사용하였다. 플라스미드를 TPO250.229R이라 명명하였다.
플라스미드 TPO250.229R를 BHK 570 세포내로 형질이입시켰다. 푸울링된 세포는 500μM MTX내에서 선별한 후, 푸울링된 세포는 870 U/ml/일의 TPO를 생산하였다. 50nM MTX내에서 증폭후, 푸울링된 세포는 11,600 U/ml/일의 TPO를 생산하였다.
775bp EcoRI 삽입을 TPO250.229R로부터 제거하였고 EcoRI로 선상화되고 알칼리 포스파타제로 처리된 pDX로 결합시켰다. 결과되는 벡터를 TPO250.pDX로 명명하였다. BHK 570 세포를 TPO250.pDX 및 Zem229R로 동시 형질이입시켰다. 500nM MTX내에서 증폭된 세포의 푸울은 21,900 U/ml/일의 TPO를 생산하였다.
(실시예 9)
벡터를 서열 4의 아미노산 잔기 193에서 끝나는 사람 TPO 폴리펩티드의 발현을 위해 실시예 7의 변형된 t-PA 리더로 구성하였다. TPO250.229R 및 TPO202.229R의 각각을 PstI 및 EcoRI으로 분해시켰다. 각각 441bp 및 205bp의 단편을 회수하였다. 두 단편을 EcoRI으로 분해되고 알칼리 포스파타제로 처리된 Zem229R로 라이게이션시켰다. 라이게이션된 DNA를 콤피턴트 E. coli MC1061 세포를 형질전환시키기 위해 사용하였다. 플라스미드를 TPO252.229R이라 명명하였다.
TPO252.229R를 BHK 570 세포내로 형질이입시켰다. 500nM MTX내에서 선별한 후, 후울링된 세포는 8500 U/ml의 TPO를 생산하였다. 5μM MTX내에서 증폭후, 푸울링된 세포는 31,300 U/ml/일의 TPO를 생산하였다.
TPO252 서열을 플라스미드 TPO252.229R로부터 분리하였으며 EcoRI-분해된, 알카리 포스파타제-처리된 pDX로 구조 TPO252.pDX에 라이게이션시켰다. 세포를 TPO252.pDX 및 Zem229R로 동시 형질이입시켰다. 500 nM MTX내에서 증폭후, 각 클론은 약 30,000 U/ml/일의 TPO를 생산하였다.
(실시예 10)
TPO 활성의 단위를 TPO 의존성 세포주상의 유사분열 활성을 분석함으로써 결정하였다. 마우스 TPO 발현 벡터 pZGmpl-1081로 형질이입시킨 BHK 570 세포주를 무혈청 배지에서 성장시켰다. 조절된 배지를 수집하였고, 점근적 유사분열 활성 곡선을 이 표준 용액을 사용하여 구하였다. 표적 세포는 BaF3/MPLR1.1세포이었다(안정하게 형질이입된 I 형 마우스 MPL 수용체를 발현하는 IL-3 의존성 세포; 부다페스트 조약의 협약하에 1994년 9월 28일 메릴랜드 록빌리 12301 파크로운 드라이브 아메리칸 타입 컬춰 콜렉션으로 기탁 승인 번호 69566으로 수탁됨). 1/2 최대 활성 지점(16 곡선의 평균)은 50 U/ml의 값을 지시한다. 원 표준용액은 26,600 U/ml 마우스 TPO를 함유하는 것으로 계산되었다.
시험 시료를 위해, 배양 상징액 또는 정제된 단백질 제제를 57μM 2-메르캡토에탄올, 2mM L-글루타민, 1mM 피루브산나트륨, PSN 항생제 혼합물, 10mM HEPES 및 10% 열 불활성화된 소 태아 혈청으로 보충된, 일반적으로 8 내지 24 희석도로 RPMI 1640 배지내에 희석하였다. 간단히 말하면, 100μl의 희석된 시험시료 또는 표준시료와 10μl BaF3 세포(첨가된 최종 세포수 약 10,000 세포/웰)를 96 웰 플 레이트의 웰내에서 조합시켰다. 내부참고 기준은 마우스 TPO 분석의 경우는 8개의 100 U/ml의 마우스 TPO의 2배 희석액을, 또는 사람 TPO 분석의 경우는 8개의 150 U/ml의 사람 TPO의 2배 희석액을 포함하였다. 각 웰에 2μl3H-티미딘(1μCi/μl; 아머샴)을 첨가하였으며, 플레이트를 하룻밤 37℃에서 배양하였다.
각 플레이트의 각 웰의 내용물을 팩커드 기구를 이용하여 필터/플레이트로 옮겼다. 필터를 물로 8회 세척하였고, 건조시키고 계수하였다. 각 시료 웰내의 TPO활성의 단위를 표준곡선과 비교하여 결정하였다.
상기한 바로부터 여기에 기술된 본 발명의 특정의 구체예는 설명의 목적이며, 발명의 정신과 관점을 벗어나지 않는 다양한 변형이 가능하다. 따라서 본 발명은 청구의 범위에 의한 바외에는 제한되지 않는다.
서열 목록
(1) 일반정보:
(i) 출원인: 지모제네틱스 인코퍼레이티드
미합중국 워싱톤 98102 시애틀
이스트레이크 애비뉴 이스트 1201
(ii) 발명의 명칭: 트롬보포이에틴 폴리펩티드 분비방법
(iii) 서열의 개수: 15
(iv) 연락주소:
(A) 수신인: 지모제네틱스 인코퍼레이티드
(B) 거리: 이스트레이크 애비뉴 이스트 1201
(C) 도시: 시애틀
(D) 주: 워싱톤
(E) 국가: 미합중국
(F) 우편번호: 98102
(v) 컴퓨터 판독형태:
(A) 매체유형: 플로피디스크
(B) 컴퓨터: IBM PC 호환성
(C) 운영체계: PC-DOS/MS-DOS
(D) 소프트웨어: PatentIn Release #1.0, 버젼 #1.25
(vi) 계류중 출원 데이타:
(A) 출원번호:
(B) 출원일자:
(C) 분류:
(viii) 대리인 정보:
(A) 성명: 개리 이 파커
(B) 등록번호: 31-648
(C) 참조번호: 94-13PC
(ix) 통신정보:
(A) 전화: 206-442-6673
(B) 팩스: 206-442-6678
(2) 서열 1에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 1486 염기쌍
(B) 유형: 핵산
(C) 가닥수: 이중가닥
(D) 형태: 선형
(ii) 분자유형: cDNA
(ix) 특징:
(A) 명칭/키: CDS
(B) 위치: 105..1241
[서열 1a]
Figure pct00005
[서열 1b]
Figure pct00006
[서열 1c]
Figure pct00007
(2) 서열 2에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 379 아미노산
(B) 유형: 아미노산
(D) 형태: 선형
(ii) 분자유형: 단백질
[서열 2a]
Figure pct00008
[서열 2b]
Figure pct00009
(2) 서열 3에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 1062 염기쌍
(B) 유형: 핵산
(C) 가닥수: 이중가닥
(D) 형태: 선형
(ii) 분자유형: cDNA
(ix) 특징:
(A) 명칭/키: CDS
(B) 위치: 1..1059
[서열 3a]
Figure pct00010
[서열 3b]
Figure pct00011
[서열 3c]
Figure pct00012
(2) 서열 4에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 353 아미노산
(B) 유형: 아미노산
(D) 형태: 선형
(ii) 분자유형: 단백질
[서열 4a]
Figure pct00013
[서열 4b]
Figure pct00014
Figure pct00015
(2) 서열 5에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 35 아미노산
(B) 유형: 아미노산
(D) 형태: 선형
(ii) 분자유형: 펩티드
(ix) 특징:
(A) 명칭/키: 변형된-부위
(B) 위치: 29
(D) 기타정보: /주= "이 아미노산은 어느 아미노산도 가능하다."
(ix) 특징:
(A) 명칭/키: 변형된-부위
(B) 위치: 31
(D) 기타정보: /주= "이 아미노산은 어느 아미노산도 가능하다."
(ix) 특징:
(A) 명칭/키: 변형된-부위
(B) 위치: 33
(D) 기타정보: /주= "이 아미노산은 어느 아미노산도 가능하다."
(ix) 특징:
(A) 명칭/키: 변형된-부위
(B) 위치: 34
(D) 기타정보: /주= "이 아미노산은 Ala, Arg 또는 Lys일 수 있다."
[서열 5]
Figure pct00016
Figure pct00017
(2) 서열 6에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 36 염기쌍
(B) 유형: 핵산
(C) 가닥수: 단일가닥
(D) 형태: 선형
(vii) 직접기원:
(B) 클론: ZC7367
[서열 6]
Figure pct00018
(2) 서열 7에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 43 염기쌍
(B) 유형: 핵산
(C) 가닥수: 단일가닥
(D) 형태: 선형
(vii) 직접기원:
(B) 클론: ZC7738
[서열 7]
Figure pct00019
(2) 서열 8에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 43 염기쌍
(B) 유형: 핵산
(C) 가닥수: 단일가닥
(D) 형태: 선형
(vii) 직접기원:
(B) 클론: ZC7365
[서열 8]
Figure pct00020
(2) 서열 9에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 37 염기쌍
(B) 유형: 핵산
(C) 가닥수: 단일가닥
(D) 형태: 선형
(vii) 직접기원:
(B) 클론: ZC7645
[서열 9]
Figure pct00021
(2) 서열 10에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 43 염기쌍
(B) 유형: 핵산
(C) 가닥수: 단일가닥
(D) 형태: 선형
(vii) 직접기원:
(B) 클론: ZC7907
[서열 10]
Figure pct00022
(2) 서열 11에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 28 염기쌍
(B) 유형: 핵산
(C) 가닥수: 단일가닥
(D) 형태: 선형
(vii) 직접기원:
(B) 클론: ZC7693
[서열 11]
Figure pct00023
(2) 서열 12에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 46 염기쌍
(B) 유형: 핵산
(C) 가닥수: 단일가닥
(D) 형태: 선형
(vii) 직접기원:
(B) 클론: ZC7910
[서열 12]
Figure pct00024
(2) 서열 13에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 27 염기쌍
(B) 유형: 핵산
(C) 가닥수: 단일가닥
(D) 형태: 선형
(vii) 직접기원:
(B) 클론: ZC7878
[서열 13]
Figure pct00025
(2) 서열 14에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 43 염기쌍
(B) 유형: 핵산
(C) 가닥수: 단일가닥
(D) 형태: 선형
(vii) 직접기원:
(B) 클론: ZC8045
[서열 14]
Figure pct00026
(2) 서열 15에 대한 정보:
(i) 서열특성:
(A) 길이: 43 염기쌍
(B) 유형: 핵산
(C) 가닥수: 단일가닥
(D) 형태: 선형
(vii) 직접기원:
(B) 클론: ZC7956
[서열 15]
Figure pct00027

Claims (26)

  1. 폴리펩티드 융합체를 코딩하는 첫번째 DNA 절편으로서, 상기 융합체는 트롬보포이에틴(TPO) 폴리펩티드에 접합된 아미노-말단 분비성 펩티드를 포함하고, 접합된 펩티드 및 폴리펩티드가 그들 접합부에서의 단백질분해성 절단 부위를 규정하는 첫번째 DNA 절편; 및
    상기 첫번째 DNA 절편에 작동가능하게 연결되어 그것의 전사에 제공하는 하나 이상의 추가적인 DNA 절편
    으로 이루어지고, 상기 분비성 펩티드는
    천연 포유류 조직 플라스미노겐 활성제(t-PA) 분비성 펩티드; 및
    상기 접합부에서의 단백질분해성 절단을 증강시키는 변형된 포유류 t-PA 분비성 펩티드로 이루어지는 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  2. 제 1 항에 있어서, 상기 분비성 펩티드가 사람 t-PA 분비성 펩티드인 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  3. 제 1 항에 있어서, 상기 분비성 펩티드는 Xaa(29), Xaa(31) 및 Xaa(33)가 개별적으로 어떤 아미노산이며 Xaa(34)가 Ala, Arg 또는 Lys인 서열 5에 나타낸 바와 같은 아미노산 잔기의 서열로 이루어지는 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  4. 제 3 항에 있어서, Xaa(29) 및 Xaa(31)는 개별적으로 Lys, Arg 또는 His을 제외한 어떤 아미노산일 수도 있는 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  5. 제 3 항에 있어서, Xaa(33)이 Gly인 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  6. 제 3 항에 있어서, Xaa(34)가 Arg 또는 Lys인 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  7. 제 3 항에 있어서, Xaa(29) 및 Xaa(31)는 개별적으로 Asp, Glu, Gln, Gly 또는 Ala; Xaa(33)는 Gly, 그리고 Xaa(34)는 Arg인 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  8. 제 3 항에 있어서, Xaa(29)는 Arg 또는 Glu, Xaa(31)은 Arg 또는 Gln, Xaa(33)은 Gly, 그리고 Xaa(34)는 Arg이며, Xaa(29) 및 Xaa(31)의 적어도 하나가 Arg이 아니라는 제한을 받는 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  9. 제 1 항에 있어서, 상기 TPO 폴리펩티드가 144 내지 335 아미노산 잔기로 이루어지는 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  10. 제 1 항에 있어서, 상기 TPO 폴리펩티드가 144 내지 191 아미노산 잔기로 이루어지는 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  11. 제 1 항에 있어서, 상기 TPO 폴리펩티드가
    서열 4의 Ser(22) 내지 Val(173);
    서열 4의 Ser(22) 내지 Arg(185);
    서열 4의 Ser(22) 내지 Asn(193);
    서열 4의 Ser(22) 내지 Phe(207); 및
    서열 4의 Ser(22) 내지 Gln(235)
    으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 아미노산 서열로 이루어지는 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  12. 제 1 항에 있어서, TPO 폴리펩티드가 사람 TPO 폴리펩티드인 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  13. 제 1 항에 있어서, 선별가능 마커를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  14. 144 내지 335개 아미노산의 TPO 폴리펩티드에 접합된, Xaa(29)는 Arg 또는 Glu, Xaa(31)는 Arg 또는 Gln, Xaa(33)는 Gly, 그리고 Xaa(34)는 Ala 또는 Arg인 서열 5에 보인 바와 같은 아미노-말단 분비성 펩티드로 본질적으로 이루어지는 폴리펩티드 융합체를 코딩하는 첫번째 DNA 절편을 포함하는 DNA 구조로서, 상기 첫번째 DNA 절편은 그것의 전사에 제공하는 하나 이상의 추가적인 DNA 절편에 작동가능하게 연결되는 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  15. 제 14 항에 있어서, 상기 TPO 폴리펩티드가 144 내지 191 아미노산 잔기로 이루어지는 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  16. 제 14 항에 있어서, 상기 TPO 폴리펩티드가 사람 TPO 폴리펩티드인 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  17. 제 14 항에 있어서, 상기 TPO 폴리펩티드가
    서열 4의 Ser(22) 내지 Val(173);
    서열 4의 Ser(22) 내지 Arg(185);
    서열 4의 Ser(22) 내지 Asn(193);
    서열 4의 Ser(22) 내지 Phe(207); 및
    서열 4의 Ser(22) 내지 Gln(235)
    으로 이루어지는 군에서 선택된 아미노산 서열로 이루어지는 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  18. 제 14 항에 있어서, 선별가능 마커를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 DNA 구조.
  19. 폴리펩티드 융합체를 코딩하는 첫번째 DNA 절편으로서, 상기 융합체는 TPO 폴리펩티드에 접합된 아미노-말단 분비성 펩티드를 포함하고, 접합된 펩티드 및 폴리펩티드가 그들 접합부에서의 단백질분해성 절단 부위를 규정하는 첫번째 DNA 절편; 및
    상기 첫번째 DNA 절편에 작동가능하게 연결되어 그것의 전사에 제공하는 하나 이상의 추가적인 DNA 절편
    으로 이루어지고, 상기 분비성 펩티드는
    천연 포유류 t-PA 분비성 펩티드; 및
    상기 접합부에서의 단백질분해성 절단을 증강시키는 변형된 포유류 t-PA 분배성 펩티드로 이루어지는 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 DNA 구조를 함유하는 배양된 진핵세포.
  20. 제 19 항에 따른 효모 세포.
  21. 제 20 항에 있어서, 상기 세포가 사카로미쎄스 세레비지아(Saccharomyces cerevisiae)세포인 것을 특징으로 하는 효모 세포.
  22. 제 20 항에 있어서, 상기 세포가 피키아 파스토리스(Pichia pastoris) 세포인 것을 특징으로 하는 효모 세포.
  23. 제 19 항에 따른 배양된 포유류 세포.
  24. 제 23 항에 있어서, 설치류 세포인 것을 특징으로 하는 포유류 세포.
  25. 제 23 항에 있어서, 신장 세포인 것을 특징으로 하는 포유류 세포.
  26. 트롬보포이에틴 폴리펩티드의 제조방법에 있어서,
    (a) 폴리펩티드 융합체를 코딩하는 첫번째 DNA 절편으로서, 상기 융합체는 트롬보포이에틴(TPO) 폴리펩티드에 접합된 아미노-말단 분비성 펩티드를 포함하고, 접합된 펩티드 및 폴리펩티드가 그들 접합부에서의 단백질분해성 절단 부위를 규정하는 첫번째 DNA 절편; 및 상기 첫번째 DNA 절편에 작동가능하게 연결되어 그것의 전사에 제공하는 하나 이상의 추가적인 DNA 절편으로 이루어지고, 상기 분비성 펩티드는 천연 포유류 조직 플라스미노겐 활성제(t-PA) 분비성 펩티드; 및 상기 접합부에서의 단백질분해성 절단을 증강시키는 변형된 포유류 t-PA 분비성 펩티드로 이루어지는 군에서 선택되는 DNA 구조를 함유하는 진핵세포의 배양단계로서,
    상기 세포가 상기 첫번째 DNA 절편을 발현하고 상기 TPO 폴리펩티드가 이 세포로부터 분비되는 배양단계; 및
    (b) 상기 TPO 폴리펩티드의 선택적인 회수단계
    로 이루어지는 것을 특징으로 하는 제조방법.
KR1019970703625A 1994-11-30 1995-11-15 트롬보포이에틴폴리펩티드분비방법 KR100320106B1 (ko)

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