KR100215084B1 - Classification of the korean ginseng by radp analysis - Google Patents
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Abstract
본 발명의 RAPD 분석에 의한 고려인삼의 산지 판별방법은 산지 판별의 대상이 되는 인삼의 DNA를 분리 및 정제하고; 정제된 인삼 DNA를 주형 DNA, 로 하여 Mg2+이온, Taq DNA 플리머라제, dNTP, 및 프라이머가 포함된 반응용액에서 인삼 DNA를 PCR에 의해 증폭시키고;상기 증폭된 인삼 DNA를 에티디움 브로마이드가 포함된 아가로스 겔 상에서 전기영동시키고;그리고 전기영동이 완료된 인삼 DNA가 존재하는 아가로스 겔을 UV 트랜실루미네이터 상에서 DNA 밴드의 양상을 비교하여 RAPD 표지를 선발하는; 단계로 구성되는 것을 특징으로 한다.The method for determining the production of Korean ginseng by RAPD analysis of the present invention isolates and purifies DNA of ginseng which is the subject of mountain determination; PCR amplification of ginseng DNA in a reaction solution containing purified ginseng DNA as a template DNA, Mg 2+ ion, Taq DNA plymerase, dNTP, and primers; the amplified ginseng DNA was ethidium bromide Electrophoresis on the included agarose gel; and selecting the RAPD label by comparing the pattern of DNA bands on the UV transilluminator to the agarose gel in which the electrophoresis-completed ginseng DNA is present; It is characterized by consisting of steps.
본 발명은 또한 상기 RAPD 분석에 이용될 수 있는 특이한 프라이머도 포함한다.The present invention also includes specific primers that can be used in the RAPD assay.
Description
제 1 도는 PCR(폴리머라제 연쇄 반응법, Polymerase Chain Reaction) 증폭에 대한 주형 DNA 농도의 효과를 나타내는 DNA가 전기영동된 겔을 찍은 사진이다.FIG. 1 is a photograph of a gel electrophoresed with DNA showing the effect of template DNA concentration on PCR (Polymerase Chain Reaction) amplification.
제 2 도는 PCR 증폭에 대한 프라이머 농도의 효과를 나타내는 DNA가 전기영동된 겔을 찍은 사진이다.FIG. 2 is a photograph of a gel electrophoresed with DNA showing the effect of primer concentration on PCR amplification.
제 3 도는 PCR 증폭에 대한 dNTP 농도의 효과를 나타내는 DNA가 전기영동된 겔을 찍은 사진이다.3 is a photograph taken of a gel electrophoresed with DNA showing the effect of dNTP concentration on the PCR amplification.
제 4 도는 PCR 증폭에 대한 Taq폴리머라제 농도의 효과를 나타내는 DNA가 전기영동된 겔을 찍은 사진이다.4 is a photograph of a gel electrophoresed with DNA showing the effect of Taq polymerase concentration on PCR amplification.
제 5 도는 인삼 부위별 DNA에 따른 RAPD 밴드(band) 패턴을 나타내는 DNA가 전기영동된 겔을 찍은 사진이다.FIG. 5 is a photograph of a gel electrophoresed with DNA showing a RAPD band pattern according to DNA of each ginseng region.
제 6 도는 프라이머 A02로 RAPD 분석을 수행한 후 DNA가 전기영동된 겔을 찍은 사진이다.FIG. 6 is a photograph of a gel electrophoresed with DNA after RAPD analysis with primer A02.
제 7 도는 프라이머 A04로 RAPD 분석을 수행한 후 DNA가 전기영동된 겔을 찍은 사진이다.7 is a photograph of a gel electrophoresed with DNA after RAPD analysis with primer A04.
제 8 도는 프라이머 Al0으로 RAPD 분석을 수행한 후 DNA가 전기영동된 겔을 찍은 사진이다.FIG. 8 is a photograph of a gel electrophoresed with DNA after RAPD analysis with primer Al0.
[발명의 분야][Field of Invention]
본 발명은 RAPD 분석(Random Amplified Polymor Phic DNA analysis)을 통한 표식에 의해서 고려인삼(Pαnαx ginseng C.A. Meyer)의 산지 판별방법에 관한 것이다. 보다 구체적으로 본 발명은 RAPD 표지에 의해 국내외산 고려인삼을 판별하는 방법 및 그 방법에 사용될 수 있는 특이한 프라이머에 관한 것이다.The present invention relates to a method for determining the production of Korean ginseng (Pαnαx ginseng C. A. Meyer) by the labeling through RAPD analysis (Random Amplified Polymor Phic DNA analysis). More specifically, the present invention relates to a method for discriminating domestic and overseas Korean ginseng by RAPD label and a specific primer that can be used in the method.
[발명의 배경][Background of invention]
고려인삼은 북위 34°내지 48°의 아시아 극동 지방에 분포하는데 제주도를 제외한 한반도의 전지역, 중국의 만주지방 및 러시아의 연해주 지방에 자생하며 또한 재배되고 있다.Korean ginseng is distributed in the Far East of 34 ° to 48 ° north latitude, and is grown and grown in all parts of the Korean peninsula except Jeju Island, Manchuria in China and Yeonhae in Russia.
고려인삼은 각종 질병의 예방과 치료에 탁월한 효과가 있음은 물론, 병이 없는 사람에게도 강장제(强壯劑)로서 널리 이용되고 있는 바, 한방에서는 정신신경 질병, 소화기질병, 호흡기질병, 순환기질병, 외과질병, 안(眼)질병, 소아과질병 및 부인과질병등에 인삼이 광범위하게 응용되고 있다.Korean ginseng is not only effective in preventing and treating various diseases, but also widely used as a tonic for those who do not have any diseases.In Korean medicine, mental nerve diseases, digestive diseases, respiratory diseases, circulatory diseases, and surgery Ginseng has been widely applied to diseases, eye diseases, pediatric diseases and gynecological diseases.
우리나라 고려인삼 생산은 1984년 10,000톤 내외에서 1993년에는 약 14,800톤으로 10년간 50%정도 증가하였으며, 이용면에서 홍삼원료삼과 백삼원료삼의 비율은 약 2 : 8 정도이다. 홍삼원료삼은 한국담배인삼공사에서 전량 수매하며 백삼과 기타 가공원료삼은 강화와 금산을 중심으로 유통되어 왔다.The production of Korean ginseng in Korea increased from about 10,000 tons in 1984 to about 14,800 tons in 1993 and increased by 50% over 10 years. The ratio of red ginseng and white ginseng was about 2: 8 in terms of use. Red ginseng raw ginseng is fully purchased by Korea Tobacco Ginseng Corporation. White ginseng and other processed raw ginseng have been distributed mainly in Ganghwa and Geumsan.
그러나 최근에는 중국산 인삼이 밀수입되어 국내 시장에서 불법으로 유통되고 있는데, 외형상으로는 국내에서 생산된 고려인삼과 구별이 아주 곤란하다. 따라서 우리나라 고려인삼의 보호육성과 건전한 유통질서를 위해서는 무엇보다도 국내산 고려인삼과 중국인삼과의 정확한 판별방법의 구명이 중요한 과제이다.Recently, however, Chinese ginseng has been smuggled and illegally distributed in the domestic market, which is difficult to distinguish from Korean ginseng produced domestically. Therefore, for the protection of Korean ginseng and healthy distribution order, the determination of the exact method of discriminating Korean ginseng and Chinese ginseng is an important task.
인삼의 분류학적 연구는 형태적 형질이나 동위효소(同位酵素) 분석등 몇가지 방법들이 개발되어 이용되어 왔으나, 이러한 방법들은 동일 속(屬)의 종(種)분류에는 적용성이 높으나, 인삼은 표현형이 단순하기 때문에 비교적 유연관계가 가까운 종(種)내에서 변종 및 육종계통 간의 분류나 품종의 식별에는 이러한 방법들은 적절하지 않다.Taxonomic studies of ginseng have been developed and used, such as morphological traits and isoenzyme analysis, but these methods are highly applicable to species classification of the same genus, but ginseng is phenotype. Because of this simplicity, these methods are not appropriate for the identification of varieties or breeds between varieties and breeding lines in relatively close species.
최근 분자생물학 분야의 급진적인 발전과 더불어 식물의 속, 종간 또는 종내 품종간 분류를 하고자 하는 연구가 진행되어 오고 있으며 그 가능성이 극히 높은 것으로 평가되고 있다.Recently, with the rapid development in the field of molecular biology, researches have been conducted to classify genus, species or intra-cultivar varieties of plants, and it is evaluated that the possibility is extremely high.
분자생물학 수준에서의 DNA 분석에 의한 변종의 감별은 그 변종의 양적수준과 더불어 다수의 특성을 파악하여 알 수 있으며 환경의 영향을 배제할 수 있는 장점이 있다.Differentiation of strains by DNA analysis at the molecular biology level can be understood by identifying a number of characteristics as well as the quantitative level of the strains, and has the advantage of excluding the effects of the environment.
그 중에서 RFLP(제한효소 단편 장다형, Resthction Fragment Length Polymorphism)는 일련의 DNA 사슬을 제한효소로 처리했을 때 생기는 DNA 단편들이 개체간의 유전적 조성의 차이 즉, 염기 서열상의 차이에 따라서 그 수나 길이가 서로 다르게 나타난다는 사실에 기초한 것으로써 다양하게 이용되고 있다.Among them, RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) is the number or length of DNA fragments produced when a series of DNA chains are treated with restriction enzymes. It is based on the fact that they appear differently and is used in various ways.
그러나 인삼에 있어서 최근 RFLP 기술을 이용한 인삼의 변종간 분류를 위하여 인삼의 변종인 자경종(紫莖種), 청경종(靑莖種), 황숙종(黃熟種)의 미토콘드리아 DNA(임 용표 등,1990. The charactehzation of mitochondrial DNA of Korean ginseng. Korean J. Ginseng Sci. 14 : 310-316 참조) 및 클로로프라스트 DNA(Lee등,1991, Purification and Characterization of chloroplast DNA in Korean ginseng. Recent progress in Molecular biology and Genetic engineering in Korea 1991, (2) : 342 참조)내 구조를 제한효소를 이용하여 분석해서 그 차이점을 검토한 바 차이가 나타나지 않아, 인삼의 변종 및 육성계통(育成系統)에 대한 RFLP 방법의 이용은 세포질 유전자로는 한계가 있음이 밝혀졌다.However, the mitochondrial DNA of Ginseng varieties, such as ginseng varieties, Pseudomonas spp., And Hwang Sook-jong, for the classification of ginseng varieties using the RFLP technique in recent years, 1990.The charactehzation of mitochondrial DNA of Korean ginseng.Korean J. Ginseng Sci. 14: 310-316) and chloroplast DNA (Lee et al., 1991, Purification and Characterization of chloroplast DNA in Korean ginseng.Recent progress in Molecular biology and Genetic engineering in Korea 1991, (2): 342). The structure was analyzed using restriction enzymes, and the differences were not found. Therefore, the RFLP method for the strain and growth system of ginseng was not found. Use has been found to be limited in cytoplasmic genes.
또한 RFLP는 순도가 높은 DNA가 다량으로 필요하며 시간과 노력이 많이 소요되는 단점이 있다. 그리고 비용이 많이 소요될 뿐 아니라 시험과정이 복잡하고 방사성 동위원소를 이용해야 하는 난점도 있다.In addition, RFLP requires a large amount of high-purity DNA and takes a lot of time and effort. In addition to being costly, the testing process is complicated and there are difficulties in using radioisotopes.
본 발명의 출원인은 상기 문제점들에 착안하여 기술적으로 단순하고 다형상성(Polymorphism)의 추적이 용이한 RAPD 표지를 이용한 고려인삼의 산지 판별방법을 발명하기에 이른 것이다.Applicants of the present invention has been invented a method for determining the production of Korean ginseng using RAPD label that is technically simple and easy to trace polymorphism in view of the above problems.
[발명의 목적][Purpose of invention]
본 발명의 목적은 다형상성의 추적이 용이하고 소량의 DNA가 소요되며 분석과정이 빠른 RAPD 표지에 의한 고려인삼의 산지 판별방법을 제공하기 위한 것이다.An object of the present invention is to provide a method for determining the origin of Korean ginseng by RAPD labeling, which is easy to trace polymorphism, takes a small amount of DNA, and has a fast analysis process.
본 발명의 또 다른 목적은 고려인삼의 산지 판별에 적합한 RAPD 분석의 조건을 제공하기 위한 것이다.It is another object of the present invention to provide conditions for RAPD analysis suitable for determining the origin of Korean ginseng.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 RAPD 분석에 사용되는 특이한 프라이머를 제공하기 위한 것이다.Another object of the present invention is to provide a specific primer used for the RAPD assay.
[발명의 요약][Summary of invention]
본 발명의 RAPD 표지에 의한 고려인삼의 산지 판별방법은 산지 판별의 대상이 되는 인삼의 DNA를 분리 및 정제하고; 정제된 인삼 DNA를 주형 DNA로 하여 Mg2+이온, Taq DNA 폴리머라제, dNTP 및 프라이머가 포함된 반응용액에서 인삼 DNA를 PCR에 의해 증폭시키고;상기 증폭된 인삼 DNA를 아가로스겔 상에서 에티디움 브로마이드(ethidium bromide)가 포함된 버퍼로 전기영동시키고; 그리고 전기영동이 완료된 인삼 DNA가 존재하는 아가로스 겔을 UV트랜실루미네이터(transilluminator) 상에서 DNA 밴드의 양상을 비교하여 RAPD 표지를 선발하는;단계로 구성되는 것을 특징으로 한다.The production method of Korean ginseng using RAPD label of the present invention is to isolate and purify DNA of ginseng which is the subject of mountain determination; Using the purified ginseng DNA as a template DNA, ginseng DNA was amplified by PCR in a reaction solution containing Mg 2+ ion, Taq DNA polymerase, dNTP, and primers; the amplified ginseng DNA was ethidium bromide on agarose gel. electrophoresis with a buffer containing (ethidium bromide); And the agarose gel in which the ginseng DNA is completed electrophoresis is compared to the aspect of the DNA band on the UV transilluminator (transilluminator) to select the RAPD label; characterized in that it comprises a step.
본 발명은 또한 상기 RAPD 분석에 이용될 수 있는 특이한 프라이머도 포함한다.The present invention also includes specific primers that can be used in the RAPD assay.
[발명의 구체예에 대한 상세한 설명]Detailed Description of the Invention
본 발명의 RAPD 분석은 PCR을 이용해서 작물에 따라 조건이 조금씩 다르나 인삼의 경우 고온(90℃ 부근)에서 이중쇄 DNA를 2 개의 단일쇄 DNA로 만든 다음 저온(50℃ 부근)에서 랜덤 프라이머와 표적 DNA를 어닐링(annealing)시키고 중온(72℃ 부근)에서 다시 이중쇄 DNA로 만드는 과정을 반복하여 특정DNA 단편의 수를 기하급수적으로 증폭시키고 증폭된 DNA를 겔상에서 전기영동한 후 에티디움 브로마이드로 염색하면 UV 트랜실루미네이터 상에서 육안으로 볼 수 있는 밴드로 나타나는 것에 그 기초를 두고 있으며, 이 밴드의 양상을 RAPD 표지라 한다.In the RAPD analysis of the present invention, conditions are slightly different depending on crops using PCR, but in the case of ginseng, double-stranded DNA is made of two single-stranded DNA at high temperature (near 90 ° C) and then random primer and target at low temperature (near 50 ° C). Annealing the DNA, repeating the process of making double-stranded DNA again at medium temperature (near 72 ° C), exponentially amplifying the number of specific DNA fragments, electrophoresing the amplified DNA on a gel, and staining with ethidium bromide It is based on what appears to be a visible band on the UV transluminator, a pattern of which is called the RAPD label.
고려인삼의 개체별 변종의 근소한 유전자의 차이일지라도 PCR에 의한 증폭시에 특정 프라이머와 상보성에 따라서 DNA가 증폭되어서 전기영동시에 발생하는 밴드의 개수와 위치가 달라지며, 상보성이 적어서 DNA가 증폭되지 않으면 전기영동에 의한 밴드가 나타나지 않게 된다. 따라서 개체간에 근소한 유전자의 차이를 갖는 산지별 고려인삼의 판별이 가능하게 된다.Even if there is a slight difference in genes of individual strains of Korean ginseng, DNA is amplified according to specific primer and complementarity at the time of amplification by PCR, and the number and location of bands generated during electrophoresis are different. The band due to phoresis does not appear. Therefore, it is possible to discriminate Korean ginseng by region having a slight difference in genes among individuals.
본 발명의 RAPD 분석에 있어서 장점은 프라이머의 염기가 하나만 바뀌어도 밴드의 발현 양상은 완전히 달라지므로 뉴클레오티드 10개(10-mer) 내외의 올리고뉴클레오티드를 DNA 증폭에 프라이머로 이용하여 충분히 다형상성(Polymorphism) 검정을 할 수 있다는 것이다.Advantages of the RAPD analysis of the present invention is that even if only one base of the primer is changed, the expression pattern of the band is completely different, so that the polymorphism assay is sufficient by using oligonucleotides of about 10 nucleotides (10-mer) as primers for DNA amplification. Is that you can.
본 발명의 고려인삼의 산지 판별방법인 RAPD 분석의 각 단계인 (A) 인삼의 DNA 분리 및 정제, (B) PCR에 의한 DNA의 증폭, (C) 전기영동, 및 (D) RAPD 표지 선발단계에 대하여 하기에서 상세히 설명한다.(A) DNA isolation and purification of ginseng, (A) DNA amplification by PCR, (C) electrophoresis, and (D) RAPD label selection step It will be described in detail below.
A. 인삼의 DNA 분리 및 정제A. DNA Isolation and Purification of Ginseng
RAPD 분석의 성패는 순도가 높은 DNA의 확보에 달려 있다. 순도가 낮은 DNA를 이용하여 PCR을 하였을 경우는 밴드 양상이 선명하지 못하고 불순물(background)도 많았으며 재현성에도 문제가 있다.The success of RAPD analysis depends on the acquisition of high-purity DNA. In case of PCR using low purity DNA, the band pattern is not clear, there are many impurities, and there is also a problem in reproducibility.
인삼의 DNA 분리과정에서 분리 소요시간이 짧은 것이 긴 것에 비하여 획득되는 DNA의 양도 많았고 순도도 높다. DNA 분리 초기단계인 시료의 마쇄과정에서 많은 시간을 소요하는 경우 추출용액이 짙은 고동색 내지 갈색으로 산화하며, 최종적으로 얻어지는 DNA의 양이 적고 순도가 높은 DNA의 확보도 곤란하다.The shorter the time required for the separation of ginseng DNA, the longer the amount of DNA obtained and higher purity. When a large amount of time is spent in the grinding process of the sample, which is the initial stage of DNA separation, the extraction solution is oxidized to dark brown to brown, and it is difficult to secure DNA with a small amount of finally obtained DNA and high purity.
인삼에서 총 DNA를 분리하는 방법은 당해 기술에서 알려진 통상의 방법에 의하여 할 수 있다. 주의할 것은 일반적으로 인삼의 뿌리에는 전분 및 페놀화합물이 많아 추출과정에서 페놀 추출등을 1 내지 2회 더 반복해야 한다. 인삼시료의 마쇄 및 추출 시간을 단측하고 페놀-클로로포름 추출과정을 주의깊게 반복하면 순수한 DNA를 얻을 수 있다.The method of separating total DNA from ginseng can be carried out by conventional methods known in the art. It should be noted that the roots of ginseng generally contain a lot of starch and phenolic compounds, so phenol extraction should be repeated one or two more times during the extraction process. Pure DNA can be obtained by measuring the grinding and extraction time of ginseng samples and carefully repeating the phenol-chloroform extraction process.
최종적으로 얻어진 총 DNA는 아가로스 겔 상에서 전기영동하여 단일 밴드로 나타나며, 이 DNA를 UV/VIS 분광기로 정량하여 사용한다.Finally, the total DNA obtained is electrophoresed on agarose gel to appear as a single band, which is quantified using UV / VIS spectroscopy.
B. PCR에 의한 DNA의 증폭B. Amplification of DNA by PCR
PCR은 고온에서 이중쇄 DNA를 단일쇄로 만든 다음 저온에서 프라이머와 표적 DNA를 어닐링시키고 중온에서 다시 이중쇄 DNA로 만드는 과정을 반복하여 특정 DNA 단편의 수를 기하급수적으로 증폭시키는 방법이다.PCR is a method of exponentially amplifying the number of specific DNA fragments by repeating a single strand of double-stranded DNA at high temperature, then annealing the primer and target DNA at low temperature and double-stranded DNA at medium temperature.
PCR은 단 하나의 DNA절편까지도 증폭되어 밴드로 나타날 수 있을 정도로그 감응도가 높고, 소량의 DNA만으로도 수행이 가능하며 시험과정이 빠르고 안전하여 대규모 집단의 스크리닝(screening)에 효과적인 방법이다.PCR is an effective method for screening large populations because it is highly sensitive enough to amplify even a single DNA fragment and can be performed with a small amount of DNA.
PCR을 행함에 있어서 주형 DNA, Mg2+이온, Taq 폴리머라제, dNTP, 프라이머 등이 반응용액을 구성하는 필수적 요소이며, 이들 요소가 완비된 조건하에서 일정횟수 이상 반복된 PCR 과정을 거쳐야만 특정 DNA의 증폭이 이루어질수 있다.In PCR, template DNA, Mg 2+ ions, Taq polymerase, dNTP, primers, etc. are essential components of the reaction solution. Amplification can be achieved.
본 발명에서는 인삼의 DNA를 이용한 RAPD의 적정조건을 구명하기 위해서 PCR에 관여하는 주요 요소들의 첨가량 차이가 PCR 산물에 어떤 영향을 주는지를 확인하고 각 요소들의 적정농도를 제시한다.In the present invention, to determine the appropriate conditions of RAPD using the DNA of ginseng, it is confirmed how the difference in the amount of addition of the major factors involved in PCR affects the PCR product and presents the appropriate concentration of each element.
(a) 프라이머 예비검정(a) Primer preliminary assay
인삼의 PCR에 적합한 프라이머를 선발하여야 한다. 즉, PCR을 행할 때 인삼의 단일쇄 DNA에 어닐링되어서 DNA를 합성할 수 있도록 하는 프라이머를 적절히 선택하는 것이 본 발명에서 가장 중요한 요소이다. 같은 종의 인삼을 동일한 조건으로 PCR 하여도 RAPD 밴드 양상은 프라이머 종류에 따라 다양하게 나타나고 밴드수나 선명도도 현저히 차이가 난다. 따라서 적합한 프라이머를 선발하기 위해 예비검정을 하여야 한다.Primers suitable for PCR of ginseng should be selected. That is, the most important factor in the present invention is to properly select a primer that can be annealed to single-stranded DNA of ginseng to synthesize DNA when PCR is performed. Even if the same species of ginseng was PCR under the same conditions, the RAPD band pattern appeared variously depending on the primer type, and the number of bands and the clarity were remarkably different. Therefore, preliminary tests should be performed to select suitable primers.
PCR 횟수는 적절한 사이클(50사이를 내외)로 하여 각 프라이머 별로 시험하여 RAPD에서 밴드 양상이 뚜렷한 프라이머를 선발한다.PCR cycles are tested for each primer in an appropriate cycle (between 50 and about) to select primers with distinct band patterns in RAPD.
본 발명의 실시예에서는 10-mer 프라이머를 예비 검정하여 RAPD에서 밴드가 두껍고 뚜렷하며 선명하게 발현하여 이용성이 높은 종의 프라이머를 선택한다. 실시예의 예비검정에서 사용된 각 프라이머의 염기 서열, 분자량 및 RAPD증폭 능력이 표 1에 언급된다.In the embodiment of the present invention, the primers of high availability are selected by preliminarily assaying the 10-mer primers by expressing thick, distinct and clear bands in RAPD. The base sequence, molecular weight and RAPD amplification capacity of each primer used in the preliminary assay of the examples are mentioned in Table 1.
[표 1] TABLE 1
2+2+ 2+2+
2+ 2+
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Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR100416765B1 (en) * | 2000-07-06 | 2004-01-31 | 김형민 | Discrimination method of Panax ginseng |
CN104928395A (en) * | 2015-07-06 | 2015-09-23 | 广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所 | DNA fingerprints of potato and obtaining method and special primer thereof |
KR20160086177A (en) | 2015-01-09 | 2016-07-19 | 충북대학교 산학협력단 | Random Amplified Polymorphic DNA primer for discrimination of tobacco cultivars |
KR20160086178A (en) | 2015-01-09 | 2016-07-19 | 충북대학교 산학협력단 | Random Amplified Polymorphic DNA primer for discrimination of Zizyphus jujuba Miller |
Families Citing this family (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR100454913B1 (en) * | 2000-09-20 | 2004-11-08 | 변상요 | Methods for identification of Korean wild mountain ginseng |
KR100452087B1 (en) * | 2002-06-26 | 2004-10-12 | 주식회사 네오바이오 | Method for identifying wild ginseng by DNA Finger-printing method |
KR20020074435A (en) * | 2002-08-27 | 2002-09-30 | 신순식 | A wild ginseng judgment method |
KR100673066B1 (en) * | 2004-08-13 | 2007-01-22 | 대구한의대학교산학협력단 | A method for discriminating genetical identification of ginseng species |
KR100673070B1 (en) * | 2005-08-31 | 2007-01-22 | 대구한의대학교산학협력단 | A genetical identification method for discrimination of ginseng species by using real-time pcr |
CN109061171B (en) * | 2018-09-21 | 2021-04-30 | 中国烟草总公司郑州烟草研究院 | ELISA kit for detecting flumetralin and application thereof |
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1996
- 1996-11-27 KR KR1019960057885A patent/KR100215084B1/en not_active IP Right Cessation
Cited By (5)
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KR100416765B1 (en) * | 2000-07-06 | 2004-01-31 | 김형민 | Discrimination method of Panax ginseng |
KR20160086177A (en) | 2015-01-09 | 2016-07-19 | 충북대학교 산학협력단 | Random Amplified Polymorphic DNA primer for discrimination of tobacco cultivars |
KR20160086178A (en) | 2015-01-09 | 2016-07-19 | 충북대학교 산학협력단 | Random Amplified Polymorphic DNA primer for discrimination of Zizyphus jujuba Miller |
CN104928395A (en) * | 2015-07-06 | 2015-09-23 | 广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所 | DNA fingerprints of potato and obtaining method and special primer thereof |
CN104928395B (en) * | 2015-07-06 | 2017-06-13 | 广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所 | A kind of DNA fingerprinting and its acquisition methods of potato and its primer special |
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