JPWO2020204674A5

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Publication number: JPWO2020204674A5
Application number: JP2021560412A
Authority: JP
Publication date: 2023-04-11

Claims

ａ）細胞遊離ＤＮＡ（ｃｅｌｌ－ｆｒｅｅＤＮＡ、以下ｃｆＤＮＡという）が含まれた個体から分離した生物学的試料および正電荷を帯びる物質を混合する段階；
ｂ）前記混合物に前記ｃｆＤＮＡに相補的な配列を有するプローブおよびマーカーを混合する段階；
および
ｃ）ｃｆＤＮＡに結合するマーカーを検出する段階を含む、
前記試料から、増幅なしで、がん細胞由来の遺伝子を検出してがんを診断する為の情報提供方法であり、
前記ｃｆＤＮＡに相補的な配列を有するプローブは、がんのバイオマーカーとして知られた遺伝子に相補的に結合する、がん診断の為の情報提供方法。
前記がんは、前立腺がん、肺がん、甲状腺がん、膀胱がん、乳がん、大腸がん、胆道がん、胃がん、又は膵臓がんである、請求項１に記載のがん診断の為の情報提供方法。
前記ｃｆＤＮＡは、
ｉ）正常細胞に由来する二重らせん構造を有するｃｆＤＮＡに比べて低いＴｍ値を有するか、
ｉｉ）正常細胞に由来する二重らせん構造を有するｃｆＤＮＡが変性しない条件で変性することを特徴とする、請求項１に記載のがん診断の為の情報提供方法。
前記段階（ｂ）が、前記混合物にプローブおよびマーカーを順次にまたは同時に混合する段階である、請求項１に記載のがん診断の為の情報提供方法。
前記ｃｆＤＮＡに相補的な配列を有するプローブは、
ＫＬＫ３、ＦＯＬＨ１、ＰＣＡ３、ＰＤＥ４Ｄ７、ＳＦＭＢＴ２、ＥＦＥＭＰ１、ＲＥＴＮ、ＡＣＡＤＬ、ＡＧＲ２、ＣＯＬ１Ａ１、ＦＡＭ１３Ｃ、ＧＰＸ８、ＧＲＨＬ２、ＨＮＦ１Ａ、ＨＯＸＢ１３、ＫＬＫ２、ＭＹＢＰＣ１、ＮＲ０Ｂ１、ＰＩＴＸ２、ＳＦＲＰ４、ＳＬＣＯ１Ｂ３、ＴＭＥＦＦ２、ＴＭＰＲＳＳ２－ＥＲＧ、ＡＣＰＰ、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７４、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭ、ＯＧＴおよびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくともいずれか１つの遺伝子
ＳＡＲＴ３、ＰＬＡＴ、ＡＬＫ、ＲＯＳ１、ＰＩ３Ｋ、Ｓ１００Ｐ、ＣＤＣＡ７、Ｓ１００Ａ２、ＥＴＶ４、ＥＮＯ２、ＡＣＰＰ、ＫＲＴ１９、ＥＧＦＲ、ＫＲＡＳ、ＲＥＴ、ＥＲＢＢ２、ＭＭＰ１１、ＴＯＰ２Ａ、ＵＢＥ２Ｃ、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびこれらの組み合わせからなる群より選択される少なくともいずれか１種の遺伝子；
ＴＧ、ＣＡＬＣＡ、ＡＰＯＣ１、ＨＩＧ２、ＥＮＯ２、ＡＣＰＰ、ＴＹＲＯ３、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭ、およびこれらの組み合わせからなる群より選択される少なくともいずれか１種の遺伝子；
ＯＧＴ、ＦＧＦＲ３、ＴＰ５３、ＮＵＭＡ１、ＣＯＣＨ、ＣＥＬＳＲ３、ＨＭＯＸ１、ＫＩＦ１Ａ、ＭＧＣ１７６２４、ＭＴＡＰ、ＰＦＫＦＢ４、Ｓ１００Ａ８、ＲＳＰＨ９、ＦＯＸＭ１、ＦＡＮＣＢ、ＦＡＮＣＣ、ＦＡＮＣＤ２、ＲＵＳＣ１－ＡＳ１、ＣＡＣＮＡ１Ｂ、ＩＭＰ－１、ＰＤＥ３Ａ、ＰＯＵ３Ｆ４、ＳＯＸ３、ＤＭＣ１、ＰＬＸＤＣ２、ＺＮＦ３１２、ＳＹＣＰ２Ｌ、ＨＯＸＡ９、ＩＳＬ１、ＡＬＤＨ１Ａ３、ＫＲＴ１９、ＣＣＮＢ１、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくともいずれか一つの遺伝子；
ＭＥＳＴ、ＮＲ１Ｄ１、ＢＩＲＣ５、ＲＡＣＧＡＰ１、ＤＨＣＲ７、ＳＴＣ２、ＡＺＧＰ１、ＲＢＢＰ８、ＩＬ６ＳＴ、ＭＧＰ、ＴＲＢＣ１、ＭＭＰ１１、ＣＯＬ１０Ａ１、Ｃ１０ｏｒｆ６４、ＣＯＬ１１Ａ１、ＰＯＴＥＧ、ＦＳＩＰ１、ＨＥＲ２、ＭＵＣ１、ＡＣＰＰ、ＴＹＲＯ３、ＵＢＥ２Ｃ、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびそれらの組合せからなる群から選ばれる少なくともいずれか一つの遺伝子；
ＮＣＫＡＰ１、ＡＵＮＩＰ、ＮＯＴＵＭ、ＫＲＴ５、ＴＵＢＢ、ＣＯＬ６Ａ１、ＪＵＰ、ＣＤＸ２、ＭＥＬＴＦ、ＥＦＥＭＰ２、ＤＥＦＡ５、ＣＨＥＫ１、ＭＡＤ２Ｌ１、ＥＮＣ１、ＣＳＥ１Ｌ、ＲＤ５１ＡＰ１、ＥＲＩＣＨ３、ＳＬＣ７Ａ１１、ＫＲＴ２３、ＰＬＡＵ、ＣＤＣＡ１、ＫＬＫ６、ＤＰＥＰ１、ＣＤＨ３、ＡＮＬＮ、ＣＸＣＬ１、ＣＴＨＲＣ１、ＬＣＮ２、ＨＳ６ＳＴ２、ＥＧＦＬ６、ＣＸＣＬ３、ＣＡ９、ＰＲＯＸ１、ＳＰＬ１、ＣＳＴ１、ＣＸＣＬ２、ＴＳＴＡ３、ＲＲＭ２、ＭＭＰ３、ＭＭＰ７、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ５、ＳＥＲＰＩＮＢ５、ＴＥＡＤ４、ＢＵＢ１、ＣＤＣ２、ＣＬＤＮ２、ＨＳＰＨ１、ＬＹ６Ｇ６Ｄ、ＰＲＣ１、ＰＵＳ１、ＳＱＬＥ、ＴＴＫ、ＥＣＴ２、ＲＮＦ１８３、ＦＢＸＯ３９、ＴＥＸ３８、ＴＴＬＬ２、ＰＲＲ７、ＣＡＮＰ、ＫＩＡＡ０１０１、ＡＣＰＰ、ＦＬＵ３、ＴＹＲＯ３、ＣＯＴＯＲ１、ＣＫ７、ＣＫ２０、ＭＵＣ２、ＳＤＣ２、ＡＳＢ９、ＣＣＮＢ１、ＭＥＬＫ、ＣＫＳ２、ＩＦＩＴＭ１、ＣＥＡＣＡＭ６、ＡＴＡＤ２、ＴＯＰ２Ａ、ＣＰＴ１Ａ、ＤＳＣＣ１、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくともいずれか一つの遺伝子；
ＭＵＣ１６、ＡＳＨ１Ｌ、ＤＯＣＫ７、ＡＣＰＰ、ＦＬＵ３、ＣＰＴ１Ａ、ＤＳＣＣ１、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭ、およびこれらの組み合わせからなる群より選択される少なくともいずれか１つの遺伝子；
ＣＧＢ、ＰＡＲＰ１、ＦＯＸＯ３Ａ、ＭＥＤ３０、ＣＣＮＥ１、ＭＹＣ、ＴＦＦ１、ＦＡＢＰ１、ＬＡＭＰ５、ＭＡＴＮ３、ＣＬＩＰ４、ＮＯＸ４、ＡＤＲＡ２Ｃ、ＣＳＫ、ＦＺＤ９、ＧＡＬＲ１、ＧＲＭ６、ＩＮＳＲ、ＬＰＨＮ１、ＬＹＮ、ＭＲＧＰＲＸ３、ＡＤＣＹ３、ＨＤＡＣ２、ＣＦＬ１、ＮＲＰ２、ＡＮＸＡ１０、ＴＦＦ２、ＣＤＣＡ５、ＮＵＳＡＰ１、ＡＣＰＰ、ＦＬＵ３、ＫＲＴ１９、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＫＲＡＳ、ＤＳＣＣ１、ＣＫ２０、ＭＵＣ２、ＳＤＣ２、ＣＯＴＬ１、ＡＴＡＤ２、ＡＳＢ９、ＭＭＰ１、ＣＥＡＬＡＭ６、ＤＳＣＣ１、ＣＫＳ２、ＣＳＴ１、ＩＦＩＴＭ１、ＭＥＬＫ、ＬＧＡＬＳ３ＢＰ、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭ、およびそれらの組合せからなる群から選ばれた少なくとも一つの遺伝子；または
ＳＭＡＤ４、ＡＰＣ、ＧＮＡＳ、ＫＲＡＳ、ＭＵＣ１、ＭＳＬＮ、ＣＥＡＣＡＭ１、ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＵＣ１６、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子
に相補的に結合する、請求項１に記載のがん診断の為の情報提供方法。
前記試料は、尿、脳脊髄液、血しょう、血液、胸水、腹水、唾液、喀痰および体液からなる群から選ばれるいずれか１つである、請求項１に記載のがん診断の為の情報提供方法。
前記プローブは、１５ｍｅｒ～３０ｍｅｒのヌクレオチドで構成され、少なくとも１つのビオチンがプローブに結合する、請求項１に記載のがん診断の為の情報提供方法。
前記マーカーは、量子ドット、ＨＲＰ（ｈｏｒｓｅ－ｒａｄｉｓｈｐｅｒｏｘｉｄａｓｅ）、蛍光タンパク質、蛍光体、アルカリホスファターゼおよびルシフェラーゼからなる群から選ばれるいずれか１つであり、
ここで、アビジンベースのタンパク質が、マーカーに結合しており、および
該アビジンベースのタンパク質は、アビジン、ストレプトアビジン、およびそれらの組み合わせからなる群から選択されるいずれか１つである、請求項１に記載のがん診断の為の情報提供方法。
前記マーカーは、導電性高分子；ヒアルロン酸；アビジン（ａｖｉｄｉｎ）またはストレプトアビジン（ｓｔｒｅｐｔａｖｉｄｉｎ）；およびＨＲＰ（ｈｏｒｓｅ－ｒａｄｉｓｈｐｅｒｏｘｉｄａｓｅ）または蛍光タンパク質；を含むナノ粒子であり、ここで、該マーカーは、ステップｃ）において、色変化、紫外線吸光度変化、蛍光変化、または電気化学的変化により検出されるものである、請求項１に記載のがん診断の為の情報提供方法。
がんに特異的に発現する遺伝子に相補的に結合するビオチン結合プローブ；
正電荷を帯びる物質；
アビジン系タンパク質が結合したマーカー；および
説明書を含むがんの診断キットであり、
前記説明書は、前記キットの構成が下記のようなプロトコルによって前立腺がんを遺伝子増幅なしで診断できると記載されている、診断キット：
ａ）個体から分離した生物学的試料からキット内に含まれた正電荷を帯びる物質を用いてｃｆＤＮＡを分離してください；
ｂ）前記分離したｃｆＤＮＡにキット内に含まれたビオチン結合プローブおよびキット内に含まれたマーカーを順次にまたは同時に混合してください；
ｃ）前記マーカーの信号を検出してください。
前記がんが、前立腺がん、肺がん、甲状腺がん、膀胱がん、乳がん、大腸がん、胆道がん、胃がん、または膵臓がんである、請求項１０に記載の診断用キット。
前立腺がんに特異的に発現する遺伝子は、ＫＬＫ３、ＦＯＬＨ１、ＰＣＡ３、ＰＤＥ４Ｄ７、ＳＦＭＢＴ２、ＥＦＥＭＰ１、ＲＥＴＮ、ＡＣＡＤＬ、ＡＧＲ２、ＣＯＬ１Ａ１、ＦＡＭ１３Ｃ、ＧＰＸ８、ＧＲＨＬ２、ＨＮＦ１Ａ、ＨＯＸＢ１３、ＫＬＫ２、ＭＹＢＰＣ１、ＮＲ０Ｂ１、ＰＩＴＸ２、ＳＦＲＰ４、ＳＬＣＯ１Ｂ３、ＴＭＥＦＦ２、ＴＭＰＲＳＳ２－ＥＲＧ、ＡＣＰＰ、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７４、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭ、ＯＧＴ、およびこれらの組み合わせからなる群から選ばれるいずれか少なくとも１つの遺伝子、
肺がんで特異的に発現する遺伝子が、ＳＡＲＴ３、ＰＬＡＴ、ＡＬＫ、ＲＯＳ１、ＰＩ３Ｋ、Ｓ１００Ｐ、ＣＤＣＡ７、Ｓ１００Ａ２、ＥＴＶ４、ＥＮＯ２、ＡＣＰＰ、ＫＲＴ１９、ＥＧＦＲ、ＫＲＡＳ、ＲＥＴ、ＥＲＢＢ２、ＭＭＰ１１、ＴＯＰ２Ａ、ＵＢＥ２Ｃ、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびこれらの組み合わせから成るグループより選ばれた少なくとも１種の遺伝子；
甲状腺がんで特異的に発現する遺伝子が、ＴＧ、ＣＡＬＣＡ、ＡＰＯＣ１、ＨＩＧ２、ＥＮＯ２、ＡＣＰＰ、ＴＹＲＯ３、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭ、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される少なくともいずれか１つの遺伝子；
膀胱がんにおいて特異的に発現する遺伝子は、ＯＧＴ、ＦＧＦＲ３、ＴＰ５３、ＮＵＭＡ１、ＣＯＣＨ、ＣＥＬＳＲ３、ＨＭＯＸ１、ＫＩＦ１Ａ、ＭＧＣ１７６２４、ＭＴＡＰ、ＰＦＫＦＢ４、Ｓ１００Ａ８、ＲＳＰＨ９、ＦＯＸＭ１、ＦＡＮＣＢ、ＦＡＮＣＣ、ＦＡＮＣＤ２、ＲＵＳＣ１－ＡＳ１、ＣＡＣＮＡ１Ｂ、ＩＭＰ－１、ＰＤＥ３Ａ、ＰＯＵ３Ｆ４、ＳＯＸ３、ＤＭＣ１、ＰＬＸＤＣ２、ＺＮＦ３１２、ＳＹＣＰ２Ｌ、ＨＯＸＡ９、ＩＳＬ１、ＡＬＤＨ１Ａ３、ＫＲＴ１９、ＣＣＮＢ１、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくともいずれか一つの遺伝子；
乳がんにおいて特異的に発現する遺伝子は、ＭＥＳＴ、ＮＲ１Ｄ１、ＢＩＲＣ５、ＲＡＣＧＡＰ１、ＤＨＣＲ７、ＳＴＣ２、ＡＺＧＰ１、ＲＢＢＰ８ＩＬ６ＳＴ、ＭＧＰ、ＴＲＢＣ１、ＭＭＰ１１、ＣＯＬ１０Ａ１、Ｃ１０ｏｒｆ６４、ＣＯＬ１１Ａ１、ＰＯＴＥＧ、ＦＳＩＰ１、ＨＥＲ２、ＭＵＣ１、ＡＣＰＰ、ＴＹＲＯ３、ＵＢＥ２Ｃ、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくともいずれか一つの遺伝子；
ここで、大腸がんにおいて特異的に発現する遺伝子は、ＮＣＫＡＰ１、ＡＵＮＩＰ、ＮＯＴＵＭ、ＫＲＴ５、ＴＵＢＢ、ＣＯＬ６Ａ１、ＪＵＰ、ＣＤＸ２、ＭＥＬＴＦＥＦＥＭＰ２、ＤＥＦＡ５、ＣＨＥＫ１、ＭＡＤ２Ｌ１、ＥＮＣ１、ＣＳＥ１Ｌ、ＲＡＤ５１ＡＰ１、ＥＲＩＣＨ３、ＳＬＣ７Ａ１１、ＫＲＴ２３、ＰＬＡＵ、ＣＤＣＡ１、ＫＬＫ６、ＤＰＥＰ１、ＣＤＨ３、ＡＮＯＬＮ、ＣＸＣＬ１、ＣＴＨＲＣ１、ＬＣＮ２、ＨＳ６ＳＴ２、ＥＧＦＬ６、ＣＸＣＬ３、ＣＡ９、ＰＲＯＳ１、ＳＰＰ１、ＣＳＴ１、ＣＸＣＬ２、ＴＳＴＡ３、ＲＲＭ２、ＭＭＰ３、ＭＭＰ７、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ５、ＳＥＲＰＩＮＢ５、ＴＥＡＤ４、ＢＵＢ１、ＣＤＣ２、ＣＬＤＮ２、ＨＳＰＨ１、ＬＹ６Ｇ６Ｄ、ＰＲＣ１、ＰＵＳ１、ＳＱＬＥ、ＴＴＫ、ＥＣＴ２、ＲＮＦ１８３、ＦＢＸＯ３９、ＴＥＸ３８、ＴＴＬＬ２、ＰＲＲ７、ＣＡＮＰ、ＫＩＡ０１０１、ＡＣＰ、ＦＬＵ３、ＴＹＲＯ３、ＣＯＴＬ１、ＣＫ７、ＣＫ２０、ＭＵＣ２、ＳＤＣ２、ＡＳＢ９、ＣＣＮＢ１、ＭＥＬＫ、ＣＫＳ２、ＩＦＩＴＭ１、ＣＥＡＣＡＭ６、ＡＴＡＤ２、ＴＯＰ２Ａ、ＣＰＴ１Ａ、ＤＳＣＣ１、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくとも１つの遺伝子；
胆道がんで特異的に発現する遺伝子が、ＭＵＣ１６、ＡＳＨ１Ｌ、ＤＯＣＫ７、ＡＣＰＰ、ＦＬＵ３、ＣＰＴ１Ａ、ＤＳＣＣ１、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭ、およびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくともいずれか一つの遺伝子；
ここで、胃がんにおいて特異的に発現する遺伝子は、ＣＧＢ、ＰＡＲＰ１、ＦＯＸＯ３Ａ、ＭＥＤ３０、ＣＣＮＥ１、ＭＹＣ、ＴＦＦ１、ＦＡＢＰ１、ＬＡＭＰ５、ＭＡＴＮ３、ＣＬＩＰ４、ＮＯＸ４、ＡＤＲＡ２Ｃ、ＣＳＫ、ＦＺＤ９、ＧＡＬＲ１、ＧＲＭ６、ＩＮＳＲ、ＬＰＨＮ１、ＬＹＮ、ＭＲＧＰＲＸ３、ＡＤＣＹ３ＨＤＡＣ２、ＣＦＬ１、ＮＲＰ２、ＡＮＸＡ１０、ＴＦＦ２、ＣＤＣＡ５、ＮＵＳＡＰ１、ＡＣＰＰ、ＦＬＵ３、ＫＲＴ１９、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＫＲＡＳ、ＤＳＣＣ１、ＣＫ２０、ＭＵＣ２、ＳＤＣ２、ＣＯＴＯＲ１、ＡＴＡＤ２、ＡＳＢ９、ＭＰ１、ＣＥＡＣＡＭ６、ＤＳＣＣ１、ＣＫＳ２、ＣＳＴ１、ＩＦＩＴＭ１、ＭＥＬＫ、ＬＧＡＬＳ３ＢＰ、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびそれらの組合せからなる群から選ばれた少なくともいずれか１種類の遺伝子；または
ここで、膵臓がんにおいて特異的に発現する遺伝子は、ＳＭＡＤ４、ＡＰＣ、ＧＮＡＳ、ＫＲＡＳ、ＭＵＣ１、ＭＳＬＮ、ＣＥＡＣＡＭ１、ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＵＣ１６、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される少なくともいずれか１つの遺伝子
である、請求項１１に記載の診断キット。
前記マーカーは、導電性高分子；ヒアルロン酸；アビジン（ａｖｉｄｉｎ）またはストレプトアビジン（ｓｔｒｅｐｔａｖｉｄｉｎ）；およびＨＲＰ（ｈｏｒｓｅ－ｒａｄｉｓｈｐｅｒｏｘｉｄａｓｅ）または蛍光タンパク質；を含むナノ粒子である、請求項１０に記載の診断キット。
ａ）ｃｆＤＮＡが含まれた個体から分離した生物学的試料および正電荷を帯びる物質を混合する混合部；
ｂ）前記ｃｆＤＮＡが結合した正電荷を帯びる物質に、前記がんに特異的に発現する遺伝子に相補的に結合できるビオチン結合プローブ；およびストレプトアビジンおよびマーカーを含むナノ粒子を順次にまたは同時に添加する反応部；
ｃ）マーカーを検出する検出部；および
ｄ）マーカーの検出の有無によって前記試料にプローブに相補的な配列を有し、がんに由来するｃｆＤＮＡが存在すると決定する情報処理部を含む、
前記試料から、増幅なしで、がん細胞由来の遺伝子を検出してがんを診断する装置。
前記がんが、前立腺がん、肺がん、甲状腺がん、膀胱がん、乳がん、大腸がん、胆道がん、胃がん、または膵臓がんである、請求項１４に記載のがん診断用装置。
前立腺がんに特異的に発現する遺伝子は、ＫＬＫ３、ＦＯＬＨ１、ＰＣＡ３、ＰＤＥ４Ｄ７、ＳＦＭＢＴ２、ＥＦＥＭＰ１、ＲＥＴＮ、ＡＣＡＤＬ、ＡＧＲ２、ＣＯＬ１Ａ１、ＦＡＭ１３Ｃ、ＧＰＸ８、ＧＲＨＬ２、ＨＮＦ１Ａ、ＨＯＸＢ１３、ＫＬＫ２、ＭＹＢＰＣ１、ＮＲ０Ｂ１、ＰＩＴＸ２、ＳＦＲＰ４、ＳＬＣＯ１Ｂ３、ＴＭＥＦＦ２、ＴＭＰＲＳＳ２－ＥＲＧ、ＡＣＰＰ、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７４、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭ、ＯＧＴ、およびこれらの組み合わせからなる群から選ばれるいずれか少なくとも１つの遺伝子、
肺がんで特異的に発現する遺伝子が、ＳＡＲＴ３、ＰＬＡＴ、ＡＬＫ、ＲＯＳ１、ＰＩ３Ｋ、Ｓ１００Ｐ、ＣＤＣＡ７、Ｓ１００Ａ２、ＥＴＶ４、ＥＮＯ２、ＡＣＰＰ、ＫＲＴ１９、ＥＧＦＲ、ＫＲＡＳ、ＲＥＴ、ＥＲＢＢ２、ＭＭＰ１１、ＴＯＰ２Ａ、ＵＢＥ２Ｃ、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびこれらの組み合わせから成るグループより選ばれた少なくとも１種の遺伝子；
甲状腺がんで特異的に発現する遺伝子が、ＴＧ、ＣＡＬＣＡ、ＡＰＯＣ１、ＨＩＧ２、ＥＮＯ２、ＡＣＰＰ、ＴＹＲＯ３、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭ、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される少なくともいずれか１つの遺伝子；
膀胱がんにおいて特異的に発現する遺伝子は、ＯＧＴ、ＦＧＦＲ３、ＴＰ５３、ＮＵＭＡ１、ＣＯＣＨ、ＣＥＬＳＲ３、ＨＭＯＸ１、ＫＩＦ１Ａ、ＭＧＣ１７６２４、ＭＴＡＰ、ＰＦＫＦＢ４、Ｓ１００Ａ８、ＲＳＰＨ９、ＦＯＸＭ１、ＦＡＮＣＢ、ＦＡＮＣＣ、ＦＡＮＣＤ２、ＲＵＳＣ１－ＡＳ１、ＣＡＣＮＡ１Ｂ、ＩＭＰ－１、ＰＤＥ３Ａ、ＰＯＵ３Ｆ４、ＳＯＸ３、ＤＭＣ１、ＰＬＸＤＣ２、ＺＮＦ３１２、ＳＹＣＰ２Ｌ、ＨＯＸＡ９、ＩＳＬ１、ＡＬＤＨ１Ａ３、ＫＲＴ１９、ＣＣＮＢ１、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくともいずれか一つの遺伝子；
乳がんにおいて特異的に発現する遺伝子は、ＭＥＳＴ、ＮＲ１Ｄ１、ＢＩＲＣ５、ＲＡＣＧＡＰ１、ＤＨＣＲ７、ＳＴＣ２、ＡＺＧＰ１、ＲＢＢＰ８ＩＬ６ＳＴ、ＭＧＰ、ＴＲＢＣ１、ＭＭＰ１１、ＣＯＬ１０Ａ１、Ｃ１０ｏｒｆ６４、ＣＯＬ１１Ａ１、ＰＯＴＥＧ、ＦＳＩＰ１、ＨＥＲ２、ＭＵＣ１、ＡＣＰＰ、ＴＹＲＯ３、ＵＢＥ２Ｃ、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくともいずれか一つの遺伝子；
ここで、大腸がんにおいて特異的に発現する遺伝子は、ＮＣＫＡＰ１、ＡＵＮＩＰ、ＮＯＴＵＭ、ＫＲＴ５、ＴＵＢＢ、ＣＯＬ６Ａ１、ＪＵＰ、ＣＤＸ２、ＭＥＬＴＦＥＦＥＭＰ２、ＤＥＦＡ５、ＣＨＥＫ１、ＭＡＤ２Ｌ１、ＥＮＣ１、ＣＳＥ１Ｌ、ＲＡＤ５１ＡＰ１、ＥＲＩＣＨ３、ＳＬＣ７Ａ１１、ＫＲＴ２３、ＰＬＡＵ、ＣＤＣＡ１、ＫＬＫ６、ＤＰＥＰ１、ＣＤＨ３、ＡＮＯＬＮ、ＣＸＣＬ１、ＣＴＨＲＣ１、ＬＣＮ２、ＨＳ６ＳＴ２、ＥＧＦＬ６、ＣＸＣＬ３、ＣＡ９、ＰＲＯＳ１、ＳＰＰ１、ＣＳＴ１、ＣＸＣＬ２、ＴＳＴＡ３、ＲＲＭ２、ＭＭＰ３、ＭＭＰ７、ＭＭＰ１０、ＣＸＣＬ５、ＳＥＲＰＩＮＢ５、ＴＥＡＤ４、ＢＵＢ１、ＣＤＣ２、ＣＬＤＮ２、ＨＳＰＨ１、ＬＹ６Ｇ６Ｄ、ＰＲＣ１、ＰＵＳ１、ＳＱＬＥ、ＴＴＫ、ＥＣＴ２、ＲＮＦ１８３、ＦＢＸＯ３９、ＴＥＸ３８、ＴＴＬＬ２、ＰＲＲ７、ＣＡＮＰ、ＫＩＡ０１０１、ＡＣＰ、ＦＬＵ３、ＴＹＲＯ３、ＣＯＴＬ１、ＣＫ７、ＣＫ２０、ＭＵＣ２、ＳＤＣ２、ＡＳＢ９、ＣＣＮＢ１、ＭＥＬＫ、ＣＫＳ２、ＩＦＩＴＭ１、ＣＥＡＣＡＭ６、ＡＴＡＤ２、ＴＯＰ２Ａ、ＣＰＴ１Ａ、ＤＳＣＣ１、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくとも１つの遺伝子；
胆道がんで特異的に発現する遺伝子が、ＭＵＣ１６、ＡＳＨ１Ｌ、ＤＯＣＫ７、ＡＣＰＰ、ＦＬＵ３、ＣＰＴ１Ａ、ＤＳＣＣ１、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭ、およびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくともいずれか一つの遺伝子；
ここで、胃がんにおいて特異的に発現する遺伝子は、ＣＧＢ、ＰＡＲＰ１、ＦＯＸＯ３Ａ、ＭＥＤ３０、ＣＣＮＥ１、ＭＹＣ、ＴＦＦ１、ＦＡＢＰ１、ＬＡＭＰ５、ＭＡＴＮ３、ＣＬＩＰ４、ＮＯＸ４、ＡＤＲＡ２Ｃ、ＣＳＫ、ＦＺＤ９、ＧＡＬＲ１、ＧＲＭ６、ＩＮＳＲ、ＬＰＨＮ１、ＬＹＮ、ＭＲＧＰＲＸ３、ＡＤＣＹ３ＨＤＡＣ２、ＣＦＬ１、ＮＲＰ２、ＡＮＸＡ１０、ＴＦＦ２、ＣＤＣＡ５、ＮＵＳＡＰ１、ＡＣＰＰ、ＦＬＵ３、ＫＲＴ１９、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＫＲＡＳ、ＤＳＣＣ１、ＣＫ２０、ＭＵＣ２、ＳＤＣ２、ＣＯＴＯＲ１、ＡＴＡＤ２、ＡＳＢ９、ＭＰ１、ＣＥＡＣＡＭ６、ＤＳＣＣ１、ＣＫＳ２、ＣＳＴ１、ＩＦＩＴＭ１、ＭＥＬＫ、ＬＧＡＬＳ３ＢＰ、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＥＲＢＢ２、ＥＧＦＲ、ＦＯＬＲ１、ＥＰＣＡＭおよびそれらの組合せからなる群から選ばれた少なくともいずれか１種類の遺伝子；または
ここで、膵臓がんにおいて特異的に発現する遺伝子は、ＳＭＡＤ４、ＡＰＣ、ＧＮＡＳ、ＫＲＡＳ、ＭＵＣ１、ＭＳＬＮ、ＣＥＡＣＡＭ１、ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＵＣ１６、およびこれらの組み合わせからなる群から選択される少なくともいずれか１つの遺伝子
である、請求項１５に記載のがんを診断する装置。
ａ）細胞遊離ＤＮＡ（ｃｅｌｌ－ｆｒｅｅＤＮＡ、以下ｃｆＤＮＡという）が含まれた個体から分離した生物学的試料および正電荷を帯びる物質を混合する段階；
ｂ）前記混合物に前記ｃｆＤＮＡに相補的な配列を有するプローブおよびマーカーを混合する段階；および
ｃ）前記マーカーを検出する段階を含む、前記試料から、増幅なしで、がん細胞由来の遺伝子を検出して、がんを早期診断またはがんの予後を予測する為の情報提供方法であって、
前記ｃｆＤＮＡに相補的な配列を有するプローブは、がんのバイオマーカーとして知られた遺伝子に相補的に結合する、方法。
前記ｃｆＤＮＡに相補的な配列を有するプローブは、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＩＦＮＧＲ１、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＮＳＥ、ＳＣＣ、ＣＥＡ、ｃｙｆｒａ２１－１、ＴＰＡ、ＮＭＰ２２、ＯＧＴ、Ｔｈｙｒｏｇｌｏｂｕｌｉｎ（ＴＧ）、Ｃａｌｃｉｔｏｎｉｎ（ＣＡＬＣＡ）、ＢＲＡＦＶ６００Ｅ、ＴＥＲＴＣ２２８Ｔ／Ｃ２５０Ｔ、ＡＦＰ、β－ＨＣＧ（ＣＧＢ）、ＣＡ１９－９、ＰＳＡ、ＰＳＭＡ、ＰＡＰ、ＰＣＡ３、ＴＭＰＲＳＳ２－ＥＲＧ、ＣＡ１２５、ＨＩＦ－１ａ、ＶＥＧＦ、ＣＡ１５－３、ＨＥＲ２、ＳＣＣ（ＳＡＲＴ３）、ＴＯＰ２Ａ、ＭＣＭ２、ｐ１６ＩＮＫ４ａ（ＣＤＫＮ２Ａ）、Ｋｉ－６７（ＭＫＩ１６７）、ＨＥ４（ＷＥＤＣ２）およびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくともいずれか１つの遺伝子に相補的に結合する、請求項１７に記載のがんを早期診断またはがんの予後を予測する為の情報提供方法。
がんに特異的に発現する遺伝子に相補的に結合するビオチン結合プローブ；
正電荷を帯びる物質；
アビジン系タンパク質が結合したマーカー；および
説明書を含むがんの診断キットであり、
前記説明書は、前記キットの構成が下記のようなプロトコルによってがんを遺伝子増幅なしで診断できると記載されている、がんの早期診断またはがんの予後予測用キット：
ａ）個体から分離した生物学的試料からキット内に含まれた正電荷を帯びる物質を用いてｃｆＤＮＡを分離してください；
ｂ）前記分離したｃｆＤＮＡにキット内に含まれたビオチン結合プローブおよびキット内に含まれたマーカーを順次にまたは同時に混合してください；および
ｃ）前記マーカーの信号を検出してください。
前記がんに特異的に発現する遺伝子は、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＩＦＮＧＲ１、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＮＳＥ、ＳＣＣ、ＣＥＡ、ｃｙｆｒａ２１－１、ＴＰＡ、ＮＭＰ２２、ＯＧＴ、Ｔｈｙｒｏｇｌｏｂｕｌｉｎ（ＴＧ）、Ｃａｌｃｉｔｏｎｉｎ（ＣＡＬＣＡ）、ＢＲＡＦＶ６００Ｅ、ＴＥＲＴＣ２２８Ｔ／Ｃ２５０Ｔ、ＡＦＰ、β－ＨＣＧ（ＣＧＢ）、ＣＡ１９－９、ＰＳＡ、ＰＳＭＡ、ＰＡＰ、ＰＣＡ３、ＴＭＰＲＳＳ２－ＥＲＧ、ＣＡ１２５、ＨＩＦ－１ａ、ＶＥＧＦ、ＣＡ１５－３、ＨＥＲ２、ＳＣＣ（ＳＡＲＴ３）、ＴＯＰ２Ａ、ＭＣＭ２、ｐ１６ＩＮＫ４ａ（ＣＤＫＮ２Ａ）、Ｋｉ－６７（ＭＫＩ１６７）、ＨＥ４（ＷＥＤＣ２）およびこれらの組み合わせからなる群から選ばれるいずれか１つ以上の遺伝子である、請求項１９に記載のがんの早期診断またはがんの予後予測用キット。
ａ）ｃｆＤＮＡが含まれた個体から分離した生物学的試料および正電荷を帯びる物質を混合する混合部；
ｂ）前記ｃｆＤＮＡが結合した正電荷を帯びる物質に、がんに特異的に発現する遺伝子に相補的に結合できるビオチン結合プローブ；およびストレプトアビジンおよびマーカーを含むナノ粒子を順次にまたは同時に添加する反応部；
ｃ）マーカーを検出する検出部；および
ｄ）マーカーの検出の有無によって前記試料にプローブに相補的な配列を有し、がんに由来するｃｆＤＮＡが存在すると決定する情報処理部を含む、
前記試料から、増幅なしで、がん細胞由来の遺伝子を検出してがんを早期診断したりまたはがんの予後予測のための装置。
前記がんに特異的に発現する遺伝子は、ＣＰＴ１Ａ、ＩＦＮＧ、ＩＦＮＧＲ１、ＣＤ２７９、ＣＤ２７４、ＮＳＥ、ＳＣＣ、ＣＥＡ、ｃｙｆｒａ２１－１、ＴＰＡ、ＮＭＰ２２、ＯＧＴ、Ｔｈｙｒｏｇｌｏｂｕｌｉｎ（ＴＧ）、Ｃａｌｃｉｔｏｎｉｎ（ＣＡＬＣＡ）、ＢＲＡＦＶ６００Ｅ、ＴＥＲＴＣ２２８Ｔ／Ｃ２５０Ｔ、ＡＦＰ、β－ＨＣＧ（ＣＧＢ）、ＣＡ１９－９、ＰＳＡ、ＰＳＭＡ、ＰＡＰ、ＰＣＡ３、ＴＭＰＲＳＳ２－ＥＲＧ、ＣＡ１２５、ＨＩＦ－１ａ、ＶＥＧＦ、ＣＡ１５－３、ＨＥＲ２、ＳＣＣ（ＳＡＲＴ３）、ＴＯＰ２Ａ、ＭＣＭ２、ｐ１６ＩＮＫ４ａ（ＣＤＫＮ２Ａ）、Ｋｉ－６７（ＭＫＩ１６７）、ＨＥ４（ＷＥＤＣ２）およびこれらの組み合わせからなる群から選ばれる少なくともいずれか１つの遺伝子である、請求項２１に記載のがんを早期診断したりまたはがんの予後予測のための装置。