JPWO2019021472A1 - 細胞特定方法、細胞集団の製造方法及び細胞特定システム - Google Patents
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Abstract
Description
日本国特開2014−176364号公報には、発光を用いて幹細胞の状態を解析する方法が記載されている。この文献には、細胞の分化マーカー遺伝子又は未分化マーカー遺伝子を標的としたプロモーターアッセイによって、iPS細胞から各種臓器への分化誘導段階における分化状態を解析する方法が記載されている。この方法によると、個々のiPS細胞の分化状態の均質性を評価することが可能である。
国際公開第2009/032194号には、Wnt馴化培地を用いて、iPS細胞を高い効率で樹立する方法が記載されている。この文献には、フローサイトメトリーやアフィニティ分離等を利用して初期化因子を導入した細胞集団のなかからiPS細胞を選択できることが記載されている。この方法によると、フローサイトメトリーやアフィニティ分離等によってiPS細胞のみを継代することが可能であると思われる。しかしながら、フローサイトメトリーやアフィニティ分離によって細胞を分離することは、コストや手間がかかる。
前記実行により特定された前記注目細胞を培養して培養細胞集団を得ることとからなるサイクルを繰り返すことを含む、細胞集団の製造方法が提供される。
図1は、本発明の一実施形態に係る細胞特定方法の説明の主な処理の流れを示す。
体細胞のリプログラミングに必要な複数種類の初期化因子をコードする核酸と、前記複数種類の初期化因子のうち少なくとも1種類と共に発現するように構成された発光レポータータンパク質をコードする核酸とが導入された細胞を含む第1細胞集団を準備することと(S1)、
前記第1細胞集団の少なくとも一部について、前記発光レポータータンパク質の発現に起因する発光に係る第1発光画像を取得することと(S2)、
前記第1細胞集団を複数の第2細胞集団に分割することと(S3)、
少なくとも1つの前記第2細胞集団について、前記発光レポータータンパク質の発現に起因する発光に係る第2発光画像を取得することと(S4)、
前記第1発光画像に基づいて、前記第1細胞集団のなかから注目細胞を選択することと(S5)、
前記第1発光画像と前記第2発光画像とに基づいて、前記複数の第2細胞集団における前記注目細胞を特定することと(S6)
を含む。
図2のS1に示すように、第1細胞集団1を準備する。第1細胞集団1は、体細胞のリプログラミングに必要な複数種類の初期化因子をコードする核酸と、複数種類の初期化因子のうち少なくとも1種類と共に発現するように構成された発光レポータータンパク質をコードする核酸とが導入された細胞を含む。
また、発光レポータータンパク質として使用されるルシフェラーゼは、高い発光強度を有するように改変された改変体ルシフェラーゼであってもよい。改変体ルシフェラーゼとしては、例えば、シブイロヒゲボタルに由来するルシフェラーゼを改変した、改変型赤色変異体A(日本国特開2013−81459号公報)、オキナワマドボタルに由来するルシフェラーゼ(日本国特開2014−18191号公報)などを使用することができる。
互いに識別可能に検出されることを可能にする発光特性を有する2種類以上の発光レポータータンパク質としては、例えば、上述した化学発光レポータータンパク質及び蛍光タンパク質より選択された2種類以上のタンパク質を使用することができる。
図2のS2に示すように、第1細胞集団1の少なくとも一部について、発光レポータータンパク質の発現に起因する発光に係る第1発光画像2を取得する。図2のS2において、破線は第1細胞集団1の外周を示し、高発光強度細胞1a’は、高い発光強度を示す1以上の細胞である。
発光画像は、経時的に繰り返し撮像することで得られてもよい。撮像は、任意の間隔で連続的に行なわれる。撮像は、一般的には10乃至30分の間隔で実施される。また、1回の撮像の時間は任意に設定される。撮像する間隔は、発光画像が撮像素子により解析可能な程度の画像を生じるための露光時間より長い任意の時間間隔である。以上、発光レポータータンパク質が蛍光タンパク質である場合における撮像方法を説明した。
発光画像は、経時的に繰り返し撮像することで得られてもよい。撮像は、任意の間隔で連続的に行なわれる。撮像は、一般的には10乃至30分の間隔、例えば、10分の間隔で実施される。また、1回の撮像の時間は任意に設定される。撮像する間隔は、発光画像が撮像素子により解析可能な程度の画像を生じるための露光時間より長い任意の時間間隔である。以上、発光レポータータンパク質が化学発光レポータータンパク質である場合における撮像方法を説明した。
図2のS3に示すように、第1細胞集団1を複数の第2細胞集団3に分割する。
第1細胞集団1を複数の第2細胞集団3に分割することは、例えば、第1細胞集団1を複数のサブ集団に分離することである。第1細胞集団1を複数の第2細胞集団3に分割することは、例えば、第1細胞集団1と液体とを含む細胞含有液を撹拌することで行ってもよく、レーザーマイクロダイセクションによって行ってもよい。細胞含有液を撹拌することは、例えば、細胞含有液をピペッティングすることである。細胞含有液はピペッティングされると、細胞含有液は細胞懸濁液になる。細胞懸濁液はプレートに出してもよい。液体は、StemFit+Y培地であってもよい。StemFit+Y培地は、StemFit(味の素)にY−27632を添加した培地である。
図2のS4に示すように、少なくとも1つの第2細胞集団3について、発光レポータータンパク質の発現に起因する発光に係る第2発光画像4を取得する。図2のS2において、破線は第2細胞集団3の外周を示す。第2発光画像4において、高発光強度細胞3a’は、高い発光強度を示す1以上の細胞である。
第2発光画像4は、少なくとも1つの第2細胞集団3を撮像した1以上の発光画像である。第2発光画像4を取得することは、「<1−2.第1発光画像の取得>」の欄に記載した方法と同様の方法により行うことができる。
図2のS5に示すように、第1発光画像2に基づいて、第1細胞集団1のなかから注目細胞を選択する。ここでは、高発光強度細胞1a’を注目細胞として選択した。
第1細胞集団1のなかから注目細胞を選択することは、第1細胞集団1の明視野画像を撮像し、明視野画像に基づいて設定される第1細胞集団1の重心から1mm以内の領域から注目細胞を選択することを含むことが好ましい。第1細胞集団1の重心から1mm以内の領域から注目細胞を選択することは、第1発光画像2に基づいて注目細胞を選択する前に行ってもよい。即ち、第1発光画像2に基づいて、第1細胞集団1の重心から1mm以内の領域から注目細胞を選択してもよい。第1細胞集団1の重心の近くにある細胞は、iPS細胞である可能性が高い。なお、ここで述べる第1細胞集団1の重心は、コロニーの重心である。
なお、第1関心領域5を2以上選択してもよい。
[注目細胞を選択することの例1]
以下、第1発光画像2に基づいて、第1細胞集団1のなかから注目細胞を選択することの一例について説明する。この例において、発光レポータータンパク質は1種類であるとする。また、この例において、注目細胞を選択することは、第1発光画像2上に、注目細胞に関する第1関心領域5を選択することと、第1関心領域5について第1発光プロファイルを取得することとを含む。
先ず、第1発光画像2上に注目細胞に関する第1関心領域5を選択する。第1関心領域の面積は、例えば、0.01乃至1mm2の範囲内にある。
その後、第1関心領域5について第1発光プロファイルを取得する。
第1発光プロファイルは、例えば、発光強度、発光強度分布、発光強度分布の評価値、又はこれらの組み合わせである。発光強度は、発光レポータータンパク質の発光の波長域で検出される発光強度である。発光強度分布は、例えば、細胞内における発光領域の分布である。発光強度分布の評価値は、例えば、発光強度分布を評価した分布の評価値である。好ましくは、第1発光プロファイルは、発光強度である。第1発光プロファイルは、例えば、既存の画像解析ソフトを用いて取得することができる。画像解析ソフトは、例えば、cellSens(セルセンス;オリンパス)である。
以上、第1発光画像2に基づいて、第1細胞集団1のなかから注目細胞を選択することの一例について説明した。
以下、図3A及び図3Bを用いて、第1発光画像に基づいて、第1細胞集団1のなかから注目細胞を選択することの別の例について説明する。この例において、発光レポータータンパク質は2種類であり、第1発光画像は、フィルターで分光し、所定の波長域毎に取得された2枚の発光画像であるとする。2枚の発光画像は、第1発光画像(色A)及び第1発光画像(色B)であるとする。2種類の発光レポータータンパク質は、第1発光レポータータンパク質及び第2発光レポータータンパク質であるとする。
先ず、第1発光画像2上に、注目細胞に関する第1関心領域5を選択する。具体的には、第1発光画像(色A)2Aにおいて第1関心領域(色A)5Aを選択し、第1発光画像(色B)2Bにおいて第1関心領域(色B)5Bを選択する。第1関心領域(色A)5A及び第1関心領域(色B)5Bは、互いに異なる波長域の発光を示す。第1関心領域(色A)5A及び第1関心領域(色B)5Bは、何れも同一の撮影範囲を有する。第1関心領域(色A)5A及び第1関心領域(色B)5Bのうち少なくとも一方は、発光している領域である。
その後、第1関心領域について第1発光プロファイルを取得する。好ましくは、第1発光画像(色A)2A及び第1発光画像(色B)2Bに対してアンミキシング処理を行い、2種類の発光レポータータンパク質の発光の波長域が重なり合う部分を排除した上で、第1発光プロファイルを取得する。
図2のS6において、第1発光画像2と第2発光画像4とに基づいて、複数の第2細胞集団3における注目細胞を特定する。S6に示す第1発光画像2は、S5で示した第1発光画像2である。S6に示す第2発光画像4は、S4で示した第2発光画像4である。
第1発光画像2と第2発光画像4とに基づいて、複数の第2細胞集団3における注目細胞を特定することは、例えば、第1発光画像2において注目細胞が有する発光プロファイルと、第2発光画像4において第2細胞集団3における細胞が有する発光プロファイルとに基づいて、複数の第2細胞集団3からなる集合における注目細胞を特定することである。発光プロファイルは、例えば、「<1−5.注目細胞の選択>」の欄に記載した「発光プロファイル」である。
第2発光画像4上に、第2細胞集団3に関する第2関心領域6を選択することと、
第1関心領域5について取得された第1発光プロファイルと第2関心領域6について取得された第2発光プロファイルとに基づいて、複数の第2細胞集団3のなかから注目細胞を特定することとを含む。
(i)第2発光画像4上に、第2細胞集団3に関する第2関心領域を選択することと、
(ii)第2関心領域について第2発光プロファイルを取得することと、
(iii)第1発光プロファイルと第2発光プロファイルとに基づいて、複数の第2細胞集団における注目細胞を特定することと
を含むことが好ましい。
[注目細胞を特定することの例1]
以下、第1発光画像2と第2発光画像4とに基づいて、複数の第2細胞集団3における注目細胞を特定することの一例について説明する。この例において、発光レポータータンパク質は1種類であるとする。また、この例において、注目細胞を選択することは、「[注目細胞を選択することの例1]」に記載した通りに行ったとした。
図2のS6に示すように、先ず、第2発光画像4上に、第2細胞集団3に関する第2関心領域6を選択する。即ち、第2発光画像4上に、第2細胞集団3について第2関心領域6を選択する。図2のS6においては、高発光強度細胞3a’に関する第2関心領域6を選択した。第2関心領域6は、例えば、第2細胞集団3以外の細胞を殆ど含まない。好ましくは、第2関心領域6のうち90%以上が第2細胞集団3である。第2細胞集団3に関する第2関心領域6を選択することは、言い換えると、第2細胞集団3を含む領域として第2関心領域6を選択することである。1つの第2関心領域6は、第2細胞集団3における1以上の細胞を含む領域である。1つの第2関心領域6は、第2細胞集団3の全体を含む領域であってもよい。第2関心領域は2以上であってもよい。2以上の第2関心領域6としては、2以上の第2細胞集団3の各々に関する第2関心領域6を選択してもよい。また、1つの第2細胞集団3に関する2以上の第2関心領域6を選択してもよい。第2関心領域6は、目視によって決定してもよい。第2関心領域6の形状は、特に限定されないが、例えば、矩形状である。
その後、第2関心領域6について、第2発光プロファイルを取得する。第2発光プロファイルは、第1発光プロファイルと同じ種類の発光プロファイルを含む。第2発光プロファイルは、例えば、既存の画像解析ソフトを用いて取得することができる。
その後、第1発光プロファイルと第2発光プロファイルとに基づいて、複数の第2細胞集団3における注目細胞を特定する。具体的には、1つの第1発光プロファイルと1つの第2発光プロファイルとが一致した場合、該当する第1関心領域5と該当する第2関心領域6とは対応していると評価する。第1関心領域5と第2関心領域6とは対応していることから、第1関心領域5内の細胞と第2関心領域6内の細胞とも対応している。第1関心領域5は注目細胞を含み、第2関心領域6内の細胞は第2細胞集団3における細胞である。従って、注目細胞と第2細胞集団3における細胞とは対応している。よって、第1関心領域5と第2関心領域6とが対応していると、注目細胞と第2細胞集団3における細胞とは同一であると判断できる。以上の方法によって、複数の第2細胞集団3における注目細胞を特定する。
以下、図4A及び図4Bを用いて、第1発光画像2と第2発光画像4とに基づいて、複数の第2細胞集団3における注目細胞を特定することの別の例について説明する。この例において、発光レポータータンパク質は2種類であり、第2発光画像4も所定の波長域毎に取得された2枚の発光画像であるとする。2枚の発光画像は、第2発光画像(色A)及び第2発光画像(色B)であるとする。2種類の発光レポータータンパク質は、第1発光レポータータンパク質及び第2発光レポータータンパク質であるとする。
先ず、第2発光画像4上に、第2細胞集団3に関する第2関心領域6を選択する。具体的には、第2発光画像(色A)4Aにおいて1以上の第2関心領域(色A)6Aを選択し、第2発光画像(色B)4Bにおいて1以上の第2関心領域(色B)6Bを選択する。第2関心領域(色A)6A及び第2関心領域(色B)6Bは、互いに異なる波長域の発光を示す。第2関心領域(色A)6A及び第2関心領域(色B)6Bは、何れも同一の撮影範囲を有する。第2関心領域(色A)及び第2関心領域(色B)は、「[注目細胞の特定することの例1]」における「(i)第2関心領域の選択」に記載した「第2関心領域6」であってもよい。
その後、第2関心領域6について、第2発光プロファイルを取得する。具体的には、例えば、第2関心領域(色A)6A及び第2関心領域(色B)6Bについて、第2発光プロファイルを取得する。第2発光プロファイルは、第1発光プロファイルと同じ種類の発光プロファイルを含む。第2発光プロファイルは、例えば、各発光レポータータンパク質の発現に起因するそれぞれの発光強度から求めた発光強度比、即ち第2発光強度比である。好ましくは、第2発光プロファイルは、各発光レポータータンパク質の発現に起因する発光強度である。
その後、第1発光プロファイルと第2発光プロファイルとに基づいて、複数の第2細胞集団3における注目細胞を特定する。具体的には、「[注目細胞の特定することの例1]」における「(iii)注目細胞の特定」に記載したした通り、1つの第1発光プロファイルと1つの第2発光プロファイルとが一致した場合、該当する第1関心領域5と該当する第2関心領域6とは対応していると評価し、注目細胞と第2細胞集団3における細胞とは同一であると判断することで、複数の第2細胞集団3における注目細胞を特定する。一方、第1発光プロファイルと第2発光プロファイルとが一致しなかった場合、該当する第1関心領域5と該当する第2関心領域6とは対応していないと評価し、注目細胞と第2細胞集団3における細胞とは同一の細胞でないと判断することで、注目細胞はこの第2関心領域6にないことを確認する。
一例によると、第1発光プロファイルと第2発光プロファイルとの差は、第1発光強度の差及び第2発光強度の差である。
以上のようにして、複数の第2細胞集団における注目細胞を特定する。
本発明の一実施形態に係る細胞特定方法の他の例によると、第1発光画像2に基づいて、第1細胞集団1のなかから注目細胞を選択することは、
第1発光画像2上に、注目細胞に関する第1関心領域5を選択することと、
第1発光画像2上に、注目細胞に関する、第1関心領域5の面積と異なる面積を有する第3関心領域7を選択することとを含み、
第2細胞集団3における注目細胞を特定することは、
第2発光画像4上に、第2細胞集団3に関する第2関心領域6を選択することと、
第2発光画像4上に、第2細胞集団3に関する第2関心領域6の面積と異なる面積を有する第4関心領域8を選択することと、
第1関心領域5について取得された第1発光プロファイルと第2関心領域6について取得された第2発光プロファイルと第3関心領域7について取得された第3発光プロファイルと第4関心領域8について取得された第4発光プロファイルとに基づいて、複数の第2細胞集団3における注目細胞を特定することとを含む。
以上、細胞特定方法の他の例について述べた。
本発明の一実施形態に係る細胞集団の製造方法は、上述した細胞特定方法を実行することと、
前記実行により特定された前記注目細胞を培養して培養細胞集団を得ること
とからなるサイクルを繰り返すことを含む。
上述した細胞特定方法を実行することと、
前記実行により特定された前記注目細胞を培養して培養細胞集団を得ること
とからなるサイクルを繰り返すことを含み、
次のサイクルがある場合、前記培養細胞集団は、次のサイクルの第1細胞集団として使用される。
[細胞集団の製造方法の具体例]
以下、細胞集団の製造方法の具体例について説明する。この例において、実行するサイクルの合計回数は2回である。
先ず、1回目のサイクルを開始する。
具体的には、先ず、「<1.細胞特定方法>」の欄で述べた細胞特定方法を実行する。具体的には、S1乃至S6を実行する。この実行により、注目細胞を特定する。
次に、S6で特定した注目細胞を培養して培養細胞集団を得る。
注目細胞の培養は、例えば、上述した「<1.細胞特定方法>」の「<1−1.第1細胞集団の準備>」の欄に記載した培養である。
以上、1回目のサイクルが終了する。
次に、2回目のサイクルを開始する。具体的には、先ず培養細胞集団を第1細胞集団として、「<1.細胞特定方法>」の欄で述べたS2乃至S6を実行する。この実行により、注目細胞を特定する。
次に、S6で特定した注目細胞を培養して培養細胞集団を得る。
注目細胞の培養は、例えば、上述した「<1.細胞特定方法>」の「<1−1.第1細胞集団の準備>」の欄に記載した培養である。
以上、2回目のサイクルが終了する。
以上、細胞集団の製造方法の具体例について説明した。
別の側面によると、本発明は、上述した「細胞特定方法」を行うための細胞特定システムを提供することができる。細胞特定システムは、具体的には、上述した第1発光画像及び第2発光画像を取得することと、第1発光画像における注目細胞の位置情報を取得することと、上述した第2細胞集団における注目細胞の位置情報を特定することとが可能である。
なお、フィルター204は省略してもよい。
試料220は、例えば、第1細胞集団または、1以上の第2細胞集団である。
RAM42は、プロセッサー310の主記憶装置として機能する。記録装置330は、例えば、半導体メモリ、ハードディスク等である。記録装置330には、プロセッサー310で用いられるプログラム、パラメーター等が記録され得る。また、記録装置330には、制御装置300を用いて得られたデータ、それに基づく解析結果等が記録され得る。入力装置340は、例えばキーボート、マウス、タッチパネル等を含み得る。表示装置350は、例えば、液晶ディスプレイ等を含み得る。
本発明に係る他の実施形態を以下に付記する。
[1]
体細胞のリプログラミングに必要な複数種類の初期化因子をコードする核酸と、前記複数種類の初期化因子のうち少なくとも1種類と共に発現するように構成された発光レポータータンパク質をコードする核酸とが導入された細胞を含む第1細胞集団の少なくとも一部について、前記発光レポータータンパク質の発現に起因する発光に係る第1発光画像を取得することと、
前記第1細胞集団を複数の第2細胞集団に分割することと、
少なくとも1つの前記第2細胞集団について、前記発光レポータータンパク質の発現に起因する発光に係る第2発光画像を取得することと、
前記第1発光画像と前記第2発光画像とに基づいて、前記複数の第2細胞集団における細胞のなかから前記第1細胞集団における細胞を特定することとを含む、
細胞特定方法。
[2]
前記第1発光画像と前記第2発光画像とに基づいて、前記第2細胞集団における細胞のなかから前記第1細胞集団における細胞を特定することは、
前記第1発光画像上に第1関心領域を選択することと、
前記第1関心領域について第1発光プロファイルを取得することと、
前記第2発光画像上に、第2細胞集団に関する第2関心領域を選択することと、
前記第2関心領域について第2発光プロファイルを取得することと、
前記第1発光プロファイルと前記第2発光プロファイルとに基づいて、前記複数の第2細胞集団における細胞のなかから前記第1細胞集団における細胞を特定することとを含む、
[1]に記載の方法。
ヒト末梢血単核球細胞(PBMC;Cellular Technology Limited)を解凍し、PBMC用培地(IL3、IL6、SCF、TPO、Flt−3L、CSFを添加したAK02培地(味の素))で培養した。細胞の密度を2.5×106cells/wellとし、24wellプレートを用いて培養を行った。培地交換を行わずに37℃、5%CO2で7日間細胞を培養した後、PBMCをコーティング剤(iMatrix(ニッピ))でコートした6wellプレートに播種した。6wellプレートに播種されたPBMCにAmaxa(Lonza)を用いて、以下で説明するベクターA及びベクターB、並びに購入したpCE−mp53DD(Addgene)、pCE−hSK(Addgene)、及びpCXB−EBNA1(Addgene)を導入した。PBMCにベクターを導入した後、PBMCを培養した。
図10Aは、第1細胞集団を示す位相差画像である。図10Bは、MA−Luci2ルシフェラーゼに起因する発光を示す第1発光画像(緑色)である。図10Cは、SfRE1ルシフェラーゼに起因する発光を示す第1発光画像(赤色)である。
図11は、第2細胞集団を示す位相差画像である。
取得した位相差観察像からコロニー中心部を選択し、実体顕微鏡の観察下でピペットマンP−10(ギルソン)を用いてコロニー中心部のピックアップを行った。コロニー中心部は、後述する第1関心領域(No.1)〜(No.15)を含んでいた。コロニーのピックアップ後、ピペッティングを行うことで、シングル・セルの状態まで分割しないように注意しながら、コロニーを数個から数十個の細胞から成る細胞小塊に分割し、6wellプレートに出した。この細胞小塊を第2細胞集団とした。
6wellプレートに播種したコロニー分割後の細胞小塊の位相差画像及び発光画像を取得した。第2発光画像の取得は、第1発光画像の取得時と同様の条件で行った。
第1発光画像に基づいて、注目細胞の選択を行った。
図12Aは、第1関心領域(緑色)が選択された、図10Bに示された第1発光画像(緑色)である。まず、図12Aに示すように、注目細胞として、第1発光画像(緑色)において、ピペットマンで削り取った領域に第1関心領域(緑色)を15個選択した。15個の第1関心領域(緑色)を、それぞれ第1関心領域(緑色)(No.1)〜(No.15)とした。
第1発光画像と第2発光画像とに基づいて、注目細胞の特定を行った。
先ず、第2発光画像において第2関心領域を選択した。
具体的には、第2発光画像(緑色)に、5つの第2関心領域(緑色)を選択した。5つの第2関心領域(緑色)を、それぞれ第2関心領域(緑色)(No.1)〜(No.5)とした。そして、第2発光画像(赤色)上に、5つの第2関心領域(赤色)を選択した。5つの第2関心領域(赤色)を、それぞれ第2関心領域(赤色)(No.1)〜(No.5)とした。
図18Aは、培養を開始した時点の注目細胞を示す明視野画像である。図18B乃至図18Fは、何れも、注目細胞を培養してから所定の時間が経過した後の注目細胞を示す明視野画像である。図18B乃至図18Fは、それぞれ、培養を開始した時点から5、10、16、20、及び22時間後に撮像された。
Claims (20)
- 体細胞のリプログラミングに必要な複数種類の初期化因子をコードする核酸と、前記複数種類の初期化因子のうち少なくとも1種類と共に発現するように構成された発光レポータータンパク質をコードする核酸とが導入された細胞を含む第1細胞集団の少なくとも一部について、前記発光レポータータンパク質の発現に起因する発光に係る第1発光画像を取得することと、
前記第1細胞集団を複数の第2細胞集団に分割することと、
少なくとも1つの前記第2細胞集団について、前記発光レポータータンパク質の発現に起因する発光に係る第2発光画像を取得することと、
前記第1発光画像に基づいて、前記第1細胞集団のなかから注目細胞を選択することと、
前記第1発光画像と前記第2発光画像とに基づいて、前記複数の第2細胞集団における前記注目細胞を特定することとを含む、
細胞特定方法。 - 前記発光レポータータンパク質は生物発光レポータータンパク質である、請求項1に記載の方法。
- 前記注目細胞を選択することは、前記第1発光画像上に、前記注目細胞に関する第1関心領域を選択することを含み、
前記複数の第2細胞集団における前記注目細胞を特定することは、
前記第2発光画像上に、前記第2細胞集団に関する第2関心領域を選択することと、
前記第1関心領域について取得された第1発光プロファイルと前記第2関心領域について取得された第2発光プロファイルとに基づいて、前記複数の第2細胞集団における前記注目細胞を特定することとを含む、
請求項1又は2に記載の方法。 - 前記注目細胞を選択することは、
前記第1発光画像上に、前記注目細胞に関する第1関心領域を選択することと、
前記第1発光画像上に、前記注目細胞に関する、前記第1関心領域の面積と異なる面積を有する第3関心領域を選択することとを含み、
前記複数の第2細胞集団における前記注目細胞を特定することは、
前記第2発光画像上に、前記第2細胞集団に関する第2関心領域を選択することと、
前記第2発光画像上に、前記第2細胞集団に関する前記第2関心領域の面積と異なる面積を有する第4関心領域を選択することと、
前記第1関心領域について取得された第1発光プロファイルと前記第2関心領域について取得された第2発光プロファイルと前記第3関心領域について取得された第3発光プロファイルと前記第4関心領域について取得された第4発光プロファイルとに基づいて、前記複数の第2細胞集団における前記注目細胞を特定することとを含む、
請求項1又は2に記載の方法。 - 前記第1関心領域と前記第2関心領域とは同一の形状を有する、請求項3に記載の方法。
- 前記第1関心領域と前記第2関心領域とは同一の形状を有し、前記第3関心領域と前記第4関心領域とは同一の形状を有する、請求項4に記載の方法。
- 前記第1関心領域は前記細胞を3乃至10個含む、請求項3乃至6の何れか1項に記載の方法。
- 前記複数種類の初期化因子のうち、前記発光レポータータンパク質と共に発現する前記初期化因子は2種類以上であり、
2種類以上の前記初期化因子と共に発現する前記発光レポータータンパク質のそれぞれは、他の何れの発光レポータータンパク質とも識別可能に検出されることを可能にする発光特性を有しており、
前記第1発光プロファイルは、各前記発光レポータータンパク質の発現に起因する発光強度であり、
前記第2発光プロファイルは、各前記発光レポータータンパク質の発現に起因する発光強度である、請求項3乃至7の何れか1項に記載の方法。 - 前記複数種類の初期化因子のうち、前記発光レポータータンパク質と共に発現する前記初期化因子は2種類以上であり、
2種類以上の前記初期化因子と共に発現する前記発光レポータータンパク質のそれぞれは、他の何れの発光レポータータンパク質とも識別可能に検出されることを可能にする発光特性を有する、請求項1乃至7の何れか1項に記載の方法。 - 前記第1細胞集団を複数の第2細胞集団に分割することは、前記注目細胞を播種することである、請求項1乃至9の何れか1項に記載の方法。
- 前記第1発光画像を取得することは、前記第1細胞集団の内部に撮影の焦点位置を合わせることを含む、請求項1乃至10の何れか1項に記載の方法。
- 前記第1発光画像は、複数の発光画像から選択された1枚の画像であり、
前記複数の発光画像のそれぞれは、他の何れの発光画像とも前記第1細胞集団の厚さ方向の位置が異なる平面を示す画像である、請求項1乃至11の何れか1項に記載の方法。 - 前記第1細胞集団のなかから前記注目細胞を選択することは、前記第1細胞集団の明視野画像を撮像し、前記明視野画像に基づいて設定される前記第1細胞集団の重心から1mm以内の領域から前記注目細胞を選択することを含む、請求項1乃至12の何れか1項に記載の方法。
- 前記発光レポータータンパク質と共に発現する前記初期化因子は、Oct3/4、Klf4、Sox2、c−myc、Lin28、L−mycからなる群より選択される少なくとも1つである、請求項1乃至13の何れか1項に記載の方法。
- 前記初期化因子をコードする前記核酸と前記発光レポータータンパク質をコードする前記核酸とは、エピソーマルベクターの形態で前記細胞へ導入される、請求項1乃至14の何れか1項に記載の方法。
- 前記第2細胞集団は3乃至10個の細胞を含む、請求項1乃至15の何れか1項に記載の方法。
- 請求項1乃至16の何れか1項に記載の方法を実行することと、
前記実行により特定された前記注目細胞を培養して培養細胞集団を得ること
とからなるサイクルを繰り返すことを含む、細胞集団の製造方法。 - n回目(nは2以上の整数)の前記サイクルで前記注目細胞を選択することは、前記第1細胞集団の明視野画像を撮像することと、n−1回目の前記サイクルの前記培養により増殖した細胞に前記明視野画像に基づいて設定される前記第1細胞集団の重心を設定することと、前記重心から1mm以内の領域から前記注目細胞を選択することとを含む、請求項17に記載の方法。
- 体細胞のリプログラミングに必要な複数種類の初期化因子をコードする核酸と、前記複数種類の初期化因子のうち少なくとも1種類と共に発現するように構成された発光レポータータンパク質をコードする核酸とが導入された細胞を含む第1細胞集団であって注目細胞を含む前記第1細胞集団の少なくとも一部について、前記発光レポータータンパク質の発現に起因する発光に係る第1発光画像と、前記第1細胞集団を分割した複数の第2細胞集団のうち少なくとも1つについて、前記発光レポータータンパク質の発現に起因する発光に係る第2発光画像とを生成する発光画像生成装置と、
プロセッサーとを備え、
前記プロセッサーは、前記発光画像生成装置から前記第1発光画像及び前記第2発光画像を取得し、前記第1発光画像における前記注目細胞の位置情報を取得し、前記第1発光画像と前記第2発光画像とに基づいて、前記第2発光画像における前記注目細胞の位置情報を特定する、
細胞特定システム。 - 前記注目細胞の位置情報を取得することは、
前記注目細胞の位置情報として、前記第1発光画像上に選択された第1関心領域を取得することを含み、
前記注目細胞の位置情報を特定することは、
前記第2発光画像上に、前記第2細胞集団に関する第2関心領域を選択することと、
前記第1関心領域について取得された第1発光プロファイルと前記第2関心領域について取得された第2発光プロファイルとに基づいて、前記第2発光画像における前記注目細胞の位置情報を特定することとを含む、
請求項19に記載の細胞特定システム。
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