JPWO2017154318A1 - 情報処理装置、情報処理方法、プログラム及び情報処理システム - Google Patents
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Abstract
Description
1.情報処理システムの概要
2.情報処理装置
2.1.構成例
2.2.処理例
2.3.効果
3.ハードウェア構成例
4.まとめ
図1は、本開示の一実施形態に係る情報処理システム1の構成の概要を示す図である。図1に示すように、情報処理システム1は、撮像装置10、および情報処理装置20を備える。撮像装置10および情報処理装置20は、有線または無線の各種ネットワークにより接続される。
撮像装置10は、撮像画像(動画像)を生成する装置である。本実施形態に係る撮像装置10は、例えば、デジタルカメラにより実現される。他にも、撮像装置10は、例えばスマートフォン、タブレット、ゲーム機、またはウェアラブル装置など、撮像機能を有するあらゆる装置により実現されてもよい。このような撮像装置10は、CCD(Charge Coupled Device)またはCMOS(Complementary Metal Oxide Semiconductor)などの撮像素子、および撮像素子への被写体像の結像を制御するためのレンズなどの各種の部材を有し、これらを用いて実空間を撮像する。これらの撮像素子および各種の部材により、撮像装置10の撮像部としての機能が実現される。また、撮像装置10は、情報処理装置20との間で動画像等を送受信するための通信装置を含む。本実施形態において、撮像装置10は、観察対象である細胞等が培養されている培地Mを撮像するための撮像ステージSの上方に設けられる。なお、細胞は生物学的試料の一例である。そして、撮像装置10は、培地Mを所定のフレームレートで撮像することにより動画像を生成する。なお、撮像装置10は、培地Mを直接(他の部材を介さずに)撮像してもよいし、顕微鏡等の他の部材を介して培地Mを撮像してもよい。また、上記フレームレートは特に限定されないが、観察対象の変化の度合いに応じて設定されることが好ましい。なお、撮像装置10は、観察対象の変化を正しく追跡するため、培地Mを含む一定の撮像領域を撮像する。撮像装置10により生成された動画像は、情報処理装置20へ送信される。
情報処理装置20は、画像解析機能を有する装置である。情報処理装置20は、PC(Personal Computer)、タブレット、スマートフォンなど、画像解析機能を有するあらゆる装置により実現される。情報処理装置20は、処理回路および通信装置を含む。例えば、本実施形態に係る情報処理装置20では、通信装置が撮像装置10から動画像を取得し、処理回路が取得した動画像について少なくとも一の注目領域を設定する。そして、当該処理回路は、設定された注目領域について解析対象を特定し、当該解析対象の動きを検出する。そして、当該処理回路は、当該解析対象の動きに基づいて、注目領域に係る観察対象のストレインを解析する。情報処理装置20の処理回路により行われる各処理については、情報処理装置20の内部または外部に備えられる記憶装置または表示装置等に出力される。なお、情報処理装置20は、ネットワーク上の1または複数の情報処理装置によって実現されてもよい。情報処理装置20の各機能を実現する機能構成については後述する。
以下、図3〜図24を参照して本開示の一実施形態に係る情報処理装置20について説明する。
図3は、本開示の一実施形態に係る情報処理装置20の機能構成例を示す機能ブロック図である。図3に示すように、本実施形態に係る情報処理装置20は、制御部200、通信部210および記憶部220を備える。制御部200の機能は、情報処理装置20が備えるCPU(Central Processing Unit)等の処理回路により実現される。また、通信部210の機能は、情報処理装置20が備える通信装置により実現される。また、記憶部220の機能は、情報処理装置20が備えるストレージ等の記憶装置により実現される。以下、各機能部について説明する。
制御部200は、情報処理装置20の動作全般を制御する。また、制御部200は、図3に示すように、設定部201、解析対象特定部202、検出部203、解析部204および表示制御部205の各機能を含み、本実施形態に係る情報処理装置20の動作を主導的に行う。制御部200に含まれる各機能部の有する機能については後述する。
通信部210は、情報処理装置20が備える通信手段であり、ネットワークを介して(あるいは直接的に)、外部装置と無線または有線により各種通信を行う。例えば、通信部210は撮像装置10と通信を行う。より具体的には、通信部210は、撮像装置10により生成された動画像を取得する。また、通信部210は、撮像装置10以外の他の装置と通信を行ってもよい。例えば、通信部210は、後述する解析部204より得られる解析結果に関する情報、または表示制御部205より得られる分析結果等の表示に関する情報等を、外部の情報処理装置または表示装置等に送信してもよい。
記憶部220は、情報処理装置20が備える記憶手段であり、通信部210により取得された情報、または制御部200の有する各機能部により得られた情報等を記憶する。また、記憶部220は、制御部200の有する各機能部、または通信部210からの要求に応じて、記憶されている情報を適宜出力する。
設定部201は、通信部210が撮像装置10から取得した動画像を構成する一の撮像画像から少なくとも一の注目領域を設定する。なお、本明細書において注目領域とは、観察対象の動きを推定するための領域を意味する。この注目領域は、動画像における観察対象(例えば、細胞等の生物学的試料)に相当する領域(以降、観察対象領域と呼称する)と必ずしも一致していなくてもよい。例えば、本実施形態に係る注目領域は、観察対象の輪郭に相当する閉曲線により形成される領域に設定されるものとして説明するが、当該注目領域は、観察対象の内部に存在する組織に相当する領域に設定されてもよい。
解析対象特定部202は、少なくとも一の注目領域についての解析対象を特定する。当該解析対象は、後述する解析部204がストレインを解析するために用いられる。当該解析対象は、ユーザの選択により、または解析部204により解析されるストレインの種類(例えば、マクロストレイン、もしくはミクロストレイン)等に応じて決定されてもよい。
解析対象特定部202は、解析対象として、注目領域の輪郭線上に2つの測定点を配置してもよい。この2つの測定点は、観察対象全体の収縮または弛緩に係る力学的特性を示すストレイン、すなわちマクロストレインを解析するために用いられる。そのため、当該2つの測定点は、注目領域の輪郭線上のうち、観察対象の収縮時または弛緩時において、当該観察対象のうち最も動きが大きいとされる部分に対応する位置に配置され得る。この2つの測定点の配置位置としては、(a)注目領域の輪郭線上において、当該2点が可能な限り離れて配置される位置、または(b)注目領域の輪郭線上において、当該2点の動きが最大限大きい位置であることが考えられる。上記(a)については、解析対象特定部202は、例えば、注目領域の輪郭線の形状に基づいて測定点の配置位置を特定してもよい。また、上記(b)については、解析対象特定部202は、例えば、注目領域の輪郭線の動画像上における変化(つまり注目領域の形状の変化)に基づいて測定点の配置位置を特定してもよい。以下、解析対象特定部202による測定点の配置位置の特定方法の具体例を説明する。
また、解析対象特定部202は、解析対象として、注目領域の内部を解析対象として特定してもよい。このとき、例えば、解析対象特定部202は、解析対象として特定された注目領域の内部の動きを検出するために、注目領域を用いて撮像画像のセグメンテーション処理を行う。セグメンテーション処理とは、撮像画像から注目領域に相当する部分の画像を切り出す処理である。
検出部203は、少なくとも、解析対象特定部202により特定された解析対象の動画像上における動きを検出する。また、検出部203は、注目領域の動画像上における動きを検出してもよい。図3に示すように、検出部203は、注目領域動き検出部231、および解析対象動き検出部232を備える。
注目領域動き検出部231は、注目領域の動きを検出する機能を有する。例えば、注目領域動き検出部231は、動画像を構成する一の撮像画像における、当該一の撮像画像とは撮像時点が異なる他の撮像画像における注目領域の動きを検出する。より具体的には、注目領域動き検出部231は、まず注目領域について配置された各追跡点の動きを検出し、推定された各追跡点の動きに基づいて、注目領域の動きを検出してもよい。
解析対象動き検出部232は、解析対象の動きを検出する機能を有する。例えば、解析対象動き検出部232は、動画像を構成する一の撮像画像における、当該一の撮像画像とは撮像時点が異なる他の撮像画像における解析対象の動きを検出する。より具体的には、解析対象動き検出部232は、一の撮像画像と他の撮像画像との比較により算出される動きベクトルに基づいて、解析対象の動きを推定してもよい。検出される動きベクトルは、ブロックマッチング等、上述した注目領域動き検出部231の有する手法と同様の手法により実現される。本実施形態に係る解析対象動き検出部232は、ブロックマッチングにより解析対象の動きベクトルを検出するものとする。なお、解析対象動き検出部232により検出される動きは、動画像の全部または一部における動きであってもよい。
解析部204は、解析対象の動きに基づいて、少なくとも一の注目領域に係る観察対象のストレインを解析する。本実施形態に係る解析部204は、解析対象特定部202により特定された測定点または注目領域の内部(メッシュ)の少なくともいずれかの動きベクトルに基づいて、マクロストレインまたはミクロストレインの少なくともいずれかを解析する。以下、解析部204による解析処理の例について説明する。
解析部204は、解析対象特定部202により注目領域の輪郭線上に特定された測定点の動きベクトルに基づいて、観察対象のマクロストレイン解析を行ってもよい。図12は、測定点の動きベクトルに基づくマクロストレイン解析の第1の例を示す図である。図12の模式図F121に示すように、まず、解析部204は、測定点SP1およびSP2を結ぶ線分L0の距離L(t0)を算出する。この距離L(t0)は、観察対象の収縮時または弛緩時とは異なる時点に撮像された撮像画像における測定点SP1およびSP2の位置から算出される。
解析部204は、解析対象特定部202により注目領域の内部が解析対象として特定されている場合、注目領域の内部の動きベクトルに基づいて、観察対象のミクロストレイン解析を行ってもよい。具体的には、解析部204は、各メッシュの動きベクトルの時間変化量(すなわち、加速度に相当)をミクロストレインとして解析してもよい。ここで解析されるミクロストレインは、メッシュごとのミクロストレインである。これにより、注目領域に対応する観察対象の部分的なストレインを得ることができる。すなわち、観察対象の収縮および弛緩に係る局所的な力学的特性について、より詳細に知ることができる。
また、解析部204は、解析対象特定部202により注目領域の内部が解析対象として特定されている場合、注目領域の内部の動きベクトルからアフィンパラメータを算出し、当該アフィンパラメータに基づいて観察対象のストレイン(マクロストレインまたはミクロストレイン)を解析してもよい。本実施形態に係るアフィンパラメータは、各メッシュの動きベクトルについて最小二乗法を適用することにより得られる。当該アフィンパラメータを用いることにより、マクロストレインおよびミクロストレインの両方を解析することが可能である。
表示制御部205は、解析されたストレインに係る情報の表示を制御する。例えば、表示制御部205は、観察対象について解析されたマクロストレインまたはミクロストレインに係る情報を、グラフ、イメージングまたは表等の様々な表示態様により表示するための機能を有する。表示制御部205により制御される表示は、不図示の表示装置等の画面において表示される。以下、表示制御部205による画面表示例について説明する。
図16は、マクロストレインの時系列変化を示すグラフの一例である。図16に示すように、解析部204により解析されるマクロストレインεは、時系列グラフとして表示されてもよい。マクロストレインεをグラフ化することにより、単に観察対象の拍動周期だけではなく、収縮時および弛緩時における観察対象の形態の変化の特徴を定量的に評価することが可能である。
表示制御部205は、例えば、ミクロストレインとして、その大きさおよび方向を示す矢印を表示してもよい。具体的には、図3に示したように、ミクロストレインを示す矢印が、注目領域に重畳されてもよい。これにより、拍動による観察対象の局所的な歪みが、どの程度の大きさで、どの方向に生じているかを知ることができる。
また、表示制御部205は、ミクロストレインの強度(大きさ)に基づいてストレインに関する情報の表示態様を制御してもよい。例えば、表示制御部205は、観察対象の収縮時または弛緩時においてミクロストレインが解析された箇所を、当該ミクロストレインの強度に関連付けた描画色により描画してもよい。
以上、本開示の一実施形態に係る情報処理装置20の構成および機能について説明した。次に、本開示の一実施形態に係る情報処理装置20による処理の一例について、図22〜図24を用いて説明する。
以上、本開示の一実施形態に係る情報処理装置20の構成例および処理例について説明した。本実施形態に係る情報処理装置20は、注目領域について解析対象を特定し、特定された解析対象の動きを検出し、検出された解析対象の動きに基づいて、注目領域に係る観察対象のストレインを解析する。かかる構成により、観察対象について特定される解析対象の動きを検出してその動きを追跡することにより、観察対象の収縮または弛緩に係るマクロストレインおよびミクロストレインの両方を解析することができる。これにより、観察対象の周期的な形態の変化に係るストレインと、当該観察対象の形態の変化に寄与する領域のストレインと、を得ることができる。ゆえに、観察対象のストレインをより精度高く解析することができる。
次に、図25を参照して、本開示の実施形態に係る情報処理装置のハードウェア構成について説明する。図25は、本開示の実施形態に係る情報処理装置のハードウェア構成例を示すブロック図である。図示された情報処理装置900は、例えば、上記の実施形態における情報処理装置20を実現しうる。
以上、添付図面を参照しながら本開示の好適な実施形態について詳細に説明したが、本開示の技術的範囲はかかる例に限定されない。本開示の技術分野における通常の知識を有する者であれば、特許請求の範囲に記載された技術的思想の範疇内において、各種の変更例または修正例に想到し得ることは明らかであり、これらについても、当然に本開示の技術的範囲に属するものと了解される。
(1)
生物学的試料についての動画像を構成する一の撮像画像から少なくとも一の注目領域を設定する設定部と、
前記少なくとも一の注目領域についての解析対象を特定する解析対象特定部と、
前記解析対象の前記動画像上における動きを検出する検出部と、
検出された前記解析対象の動きに基づいて、前記少なくとも一の注目領域に係る前記生物学的試料のストレインを解析する解析部と、
を備える情報処理装置。
(2)
前記解析対象特定部は、前記解析対象として、前記少なくとも一の注目領域の輪郭線上に2つの測定点を特定し、
前記検出部は、前記2つの測定点の前記動画像上における動きを検出し、
前記解析部は、前記2つの測定点の動きに基づいて前記ストレインを解析する、(1)に記載の情報処理装置。
(3)
前記解析対象特定部は、前記輪郭線の形状に基づいて、前記2つの測定点の配置位置を特定する、(2)に記載の情報処理装置。
(4)
前記解析対象特定部は、前記動画像上における前記輪郭線の形状の変化に基づいて、前記2つの測定点の配置位置を特定する、(2)または(3)に記載の情報処理装置。
(5)
前記解析対象特定部は、前記少なくとも一の注目領域の内部を前記解析対象として特定し、
前記検出部は、前記少なくとも一の注目領域の内部の前記動画像上における動きを検出し、
前記解析部は、前記少なくとも一の注目領域の内部の動きに基づいて前記ストレインを解析する、(1)〜(4)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(6)
前記解析部は、前記検出部により検出された前記少なくとも一の注目領域の内部の動きのアフィンパラメータを算出し、前記アフィンパラメータに基づいて前記ストレインを解析する、(5)に記載の情報処理装置。
(7)
前記検出部は、前記少なくとも一の注目領域の動きをさらに検出可能であり、
前記検出部において、前記解析対象の動きの検出に用いられる動き検出器と、前記少なくとも一の注目領域の動きの検出に用いられる動き検出器は異なる、(1)〜(6)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(8)
前記解析部は、前記解析対象の動きの時間変化に基づいて前記ストレインを解析する、(1)〜(7)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(9)
前記解析部により解析された前記ストレインに係る情報の表示を制御する表示制御部をさらに備える、(1)〜(8)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(10)
前記表示制御部は、前記解析対象の動きに応じて、前記ストレインに係る情報の表示態様を制御する、(9)に記載の情報処理装置。
(11)
前記表示制御部は、前記少なくとも一の注目領域について推定される拍動中心を用いて、前記ストレインに係る情報の表示態様を制御する、(10)に記載の情報処理装置。
(12)
前記表示制御部は、前記少なくとも一の注目領域の輪郭線の前記動画像上における形状の変化に応じて、前記ストレインに係る情報の表示態様を制御する、(9)〜(11)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(13)
前記表示制御部は、前記解析対象の動きの大きさに基づいて、前記ストレインに係る情報の表示態様を制御する、(9)〜(12)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(14)
前記ストレインは、前記生物学的試料全体の収縮または弛緩に係る力学的特性を示すストレインを含む、(1)〜(13)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(15)
前記ストレインは、前記生物学的試料の内部の局所的な力学的特性を示すストレインを含む、(1)〜(14)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(16)
前記設定部は、前記一の撮像画像に含まれる前記生物学的試料に相当する領域を前記少なくとも一の注目領域として設定する、(1)〜(15)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(17)
前記生物学的試料は、周期的な運動を行う生物学的試料である、(1)〜(16)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(18)
プロセッサが、
生物学的試料についての動画像を構成する一の撮像画像から少なくとも一の注目領域を設定することと、
前記少なくとも一の注目領域についての解析対象を特定することと、
前記解析対象の前記動画像上における動きを検出することと、
検出された前記解析対象の動きに基づいて、前記少なくとも一の注目領域に係る前記生物学的試料のストレインを解析することと、
を含む情報処理方法。
(19)
コンピュータを、
生物学的試料についての動画像を構成する一の撮像画像から少なくとも一の注目領域を設定する設定部と、
前記少なくとも一の注目領域についての解析対象を特定する解析対象特定部と、
前記解析対象の前記動画像上における動きを検出する検出部と、
検出された前記解析対象の動きに基づいて、前記少なくとも一の注目領域に係る前記生物学的試料のストレインを解析する解析部と、
として機能させるためのプログラム。
(20)
生物学的試料についての動画像を生成する撮像部
を備える撮像装置と、
前記動画像を構成する一の撮像画像から少なくとも一の注目領域を設定する設定部と、
前記少なくとも一の注目領域についての解析対象を特定する解析対象特定部と、
前記解析対象の前記動画像上における動きを検出する検出部と、
検出された前記解析対象の動きに基づいて、前記少なくとも一の注目領域に係る前記生物学的試料のストレインを解析する解析部と、
を備える情報処理装置と、
を有する情報処理システム。
10 撮像装置
20 情報処理装置
200 制御部
201 設定部
202 解析対象特定部
203 検出部
204 解析部
205 表示制御部
210 通信部
220 記憶部
231 注目領域動き検出部
232 解析対象動き検出部
Claims (20)
- 生物学的試料についての動画像を構成する一の撮像画像から少なくとも一の注目領域を設定する設定部と、
前記少なくとも一の注目領域についての解析対象を特定する解析対象特定部と、
前記解析対象の前記動画像上における動きを検出する検出部と、
検出された前記解析対象の動きに基づいて、前記少なくとも一の注目領域に係る前記生物学的試料のストレインを解析する解析部と、
を備える情報処理装置。 - 前記解析対象特定部は、前記解析対象として、前記少なくとも一の注目領域の輪郭線上に2つの測定点を特定し、
前記検出部は、前記2つの測定点の前記動画像上における動きを検出し、
前記解析部は、前記2つの測定点の動きに基づいて前記ストレインを解析する、請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記解析対象特定部は、前記輪郭線の形状に基づいて、前記2つの測定点の配置位置を特定する、請求項2に記載の情報処理装置。
- 前記解析対象特定部は、前記動画像上における前記輪郭線の形状の変化に基づいて、前記2つの測定点の配置位置を特定する、請求項2に記載の情報処理装置。
- 前記解析対象特定部は、前記少なくとも一の注目領域の内部を前記解析対象として特定し、
前記検出部は、前記少なくとも一の注目領域の内部の前記動画像上における動きを検出し、
前記解析部は、前記少なくとも一の注目領域の内部の動きに基づいて前記ストレインを解析する、請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記解析部は、前記検出部により検出された前記少なくとも一の注目領域の内部の動きのアフィンパラメータを算出し、前記アフィンパラメータに基づいて前記ストレインを解析する、請求項5に記載の情報処理装置。
- 前記検出部は、前記少なくとも一の注目領域の動きをさらに検出可能であり、
前記検出部において、前記解析対象の動きの検出に用いられる動き検出器と、前記少なくとも一の注目領域の動きの検出に用いられる動き検出器は異なる、請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記解析部は、前記解析対象の動きの時間変化に基づいて前記ストレインを解析する、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記解析部により解析された前記ストレインに係る情報の表示を制御する表示制御部をさらに備える、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記表示制御部は、前記解析対象の動きに応じて、前記ストレインに係る情報の表示態様を制御する、請求項9に記載の情報処理装置。
- 前記表示制御部は、前記少なくとも一の注目領域について推定される拍動中心を用いて、前記ストレインに係る情報の表示態様を制御する、請求項10に記載の情報処理装置。
- 前記表示制御部は、前記少なくとも一の注目領域の輪郭線の前記動画像上における形状の変化に応じて、前記ストレインに係る情報の表示態様を制御する、請求項9に記載の情報処理装置。
- 前記表示制御部は、前記解析対象の動きの大きさに基づいて、前記ストレインに係る情報の表示態様を制御する、請求項9に記載の情報処理装置。
- 前記ストレインは、前記生物学的試料全体の収縮または弛緩に係る力学的特性を示すストレインを含む、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記ストレインは、前記生物学的試料の内部の局所的な力学的特性を示すストレインを含む、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記設定部は、前記一の撮像画像に含まれる前記生物学的試料に相当する領域を前記少なくとも一の注目領域として設定する、請求項1に記載の情報処理装置。
- 前記生物学的試料は、周期的な運動を行う生物学的試料である、請求項1に記載の情報処理装置。
- プロセッサが、
生物学的試料についての動画像を構成する一の撮像画像から少なくとも一の注目領域を設定することと、
前記少なくとも一の注目領域についての解析対象を特定することと、
前記解析対象の前記動画像上における動きを検出することと、
検出された前記解析対象の動きに基づいて、前記少なくとも一の注目領域に係る前記生物学的試料のストレインを解析することと、
を含む情報処理方法。 - コンピュータを、
生物学的試料についての動画像を構成する一の撮像画像から少なくとも一の注目領域を設定する設定部と、
前記少なくとも一の注目領域についての解析対象を特定する解析対象特定部と、
前記解析対象の前記動画像上における動きを検出する検出部と、
検出された前記解析対象の動きに基づいて、前記少なくとも一の注目領域に係る前記生物学的試料のストレインを解析する解析部と、
として機能させるためのプログラム。 - 生物学的試料についての動画像を生成する撮像部
を備える撮像装置と、
前記動画像を構成する一の撮像画像から少なくとも一の注目領域を設定する設定部と、
前記少なくとも一の注目領域についての解析対象を特定する解析対象特定部と、
前記解析対象の前記動画像上における動きを検出する検出部と、
検出された前記解析対象の動きに基づいて、前記少なくとも一の注目領域に係る前記生物学的試料のストレインを解析する解析部と、
を備える情報処理装置と、
を有する情報処理システム。
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