JPWO2017090566A1 - データ解析装置、方法及びプログラム - Google Patents
データ解析装置、方法及びプログラム Download PDFInfo
- Publication number
- JPWO2017090566A1 JPWO2017090566A1 JP2017548241A JP2017548241A JPWO2017090566A1 JP WO2017090566 A1 JPWO2017090566 A1 JP WO2017090566A1 JP 2017548241 A JP2017548241 A JP 2017548241A JP 2017548241 A JP2017548241 A JP 2017548241A JP WO2017090566 A1 JPWO2017090566 A1 JP WO2017090566A1
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- data
- statistical
- kernel
- data analysis
- matrix
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 title claims abstract description 118
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 73
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims abstract description 129
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 claims abstract description 20
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims abstract description 20
- 238000000491 multivariate analysis Methods 0.000 claims abstract description 15
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims description 47
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 41
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 claims description 40
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 33
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims description 6
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 5
- 230000007423 decrease Effects 0.000 claims description 3
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 61
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 24
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 19
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 18
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 17
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 17
- 238000012351 Integrated analysis Methods 0.000 description 14
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 14
- 210000002216 heart Anatomy 0.000 description 14
- 238000002705 metabolomic analysis Methods 0.000 description 13
- 230000001431 metabolomic effect Effects 0.000 description 13
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 9
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 7
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 7
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 7
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 5
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 5
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 5
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 5
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- FFDGPVCHZBVARC-UHFFFAOYSA-N N,N-dimethylglycine Chemical compound CN(C)CC(O)=O FFDGPVCHZBVARC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 4
- 235000020256 human milk Nutrition 0.000 description 4
- 210000004251 human milk Anatomy 0.000 description 3
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 239000004065 semiconductor Substances 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-N Betaine Natural products C[N+](C)(C)CC([O-])=O KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 2
- 229940121710 HMGCoA reductase inhibitor Drugs 0.000 description 2
- 208000017604 Hodgkin disease Diseases 0.000 description 2
- 208000021519 Hodgkin lymphoma Diseases 0.000 description 2
- 208000010747 Hodgkins lymphoma Diseases 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 2
- KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-O N,N,N-trimethylglycinium Chemical compound C[N+](C)(C)CC(O)=O KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 2
- LEHOTFFKMJEONL-UHFFFAOYSA-N Uric Acid Chemical compound N1C(=O)NC(=O)C2=C1NC(=O)N2 LEHOTFFKMJEONL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 2
- 229960003237 betaine Drugs 0.000 description 2
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 description 2
- 108700003601 dimethylglycine Proteins 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 2
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 2
- 239000002471 hydroxymethylglutaryl coenzyme A reductase inhibitor Substances 0.000 description 2
- FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N hypoxanthine Chemical compound O=C1NC=NC2=C1NC=N2 FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000010365 information processing Effects 0.000 description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 2
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 2
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 2
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 2
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 2
- 229940078490 n,n-dimethylglycine Drugs 0.000 description 2
- 230000004144 purine metabolism Effects 0.000 description 2
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 2
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 2
- DGIMBMZJSZEZJD-ZLELNMGESA-N (2s)-2-amino-5-(ethylamino)-5-oxopentanoic acid Chemical compound CCNC(=O)CC[C@H](N)C(O)=O.CCNC(=O)CC[C@H](N)C(O)=O DGIMBMZJSZEZJD-ZLELNMGESA-N 0.000 description 1
- 108020004465 16S ribosomal RNA Proteins 0.000 description 1
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- 239000002126 C01EB10 - Adenosine Substances 0.000 description 1
- 208000032928 Dyslipidaemia Diseases 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N Hypoxanthine nucleoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(NC=NC2=O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N Inosine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 229930010555 Inosine Natural products 0.000 description 1
- RHGKLRLOHDJJDR-BYPYZUCNSA-N L-citrulline Chemical compound NC(=O)NCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O RHGKLRLOHDJJDR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 1
- RHGKLRLOHDJJDR-UHFFFAOYSA-N Ndelta-carbamoyl-DL-ornithine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=O RHGKLRLOHDJJDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- TVWHNULVHGKJHS-UHFFFAOYSA-N Uric acid Natural products N1C(=O)NC(=O)C2NC(=O)NC21 TVWHNULVHGKJHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- 229960005305 adenosine Drugs 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 230000001364 causal effect Effects 0.000 description 1
- 229960002173 citrulline Drugs 0.000 description 1
- 235000013477 citrulline Nutrition 0.000 description 1
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 238000010219 correlation analysis Methods 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 238000009499 grossing Methods 0.000 description 1
- 230000003284 homeostatic effect Effects 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 229960003786 inosine Drugs 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 239000004973 liquid crystal related substance Substances 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 238000000513 principal component analysis Methods 0.000 description 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000001953 sensory effect Effects 0.000 description 1
- 238000000551 statistical hypothesis test Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 230000017105 transposition Effects 0.000 description 1
- 229940116269 uric acid Drugs 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
- G16B40/20—Supervised data analysis
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
- G06F17/00—Digital computing or data processing equipment or methods, specially adapted for specific functions
- G06F17/10—Complex mathematical operations
- G06F17/15—Correlation function computation including computation of convolution operations
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
- G06F17/00—Digital computing or data processing equipment or methods, specially adapted for specific functions
- G06F17/10—Complex mathematical operations
- G06F17/18—Complex mathematical operations for evaluating statistical data, e.g. average values, frequency distributions, probability functions, regression analysis
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06N—COMPUTING ARRANGEMENTS BASED ON SPECIFIC COMPUTATIONAL MODELS
- G06N20/00—Machine learning
- G06N20/10—Machine learning using kernel methods, e.g. support vector machines [SVM]
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06N—COMPUTING ARRANGEMENTS BASED ON SPECIFIC COMPUTATIONAL MODELS
- G06N99/00—Subject matter not provided for in other groups of this subclass
Abstract
Description
1.概要
本発明の実施形態1に係るデータ解析方法による統計解析の概要について、図1〜5を参照して説明する。図1は、本実施形態に係るデータ解析方法の概要を説明するための図である。以下では、メタボロミクスに対する本データ解析方法の適用例を説明する。
まず、メタボロミクスの多変量解析に関する一般論について説明する。メタボロームデータの多変量解析では、主成分分析とPLSとが一般的に用いられている。PLSは、メタボロームデータに加えて、群の情報を併用することで、群間が精度良く分かれたスコアを得やすい。また、群の情報を用いて解析する古典的な多変量解析手法には、例えば正準相関分析があるが、この手法はデータ中の変数(測定項目)の数(p)がサンプルサイズ(n)よりも大きい場合(p≫n)、そのデータに適用することが困難である。これに対して、PLSはp≫nの場合にも適用可能である。
PLS−ROGは、n行p列のデータ行列X(式(1))と、n行g列のダミー行列Yと、説明変数t及び目的変数s(それぞれn次元ベクトル)とを用いて定式化できる。ここで、nはサンプルサイズであり、pは測定項目(データ項目)数であり、gは群の数である。ダミー行列Yは、群の順序を示す群情報を設定するための行列である(図8(b)参照)。説明変数tと目的変数sとは、合成変数(t,s)を構成する。
t=Xwx (2)
s=Ywy (3)
以下、本実施形態に係る統計データの解析手法であるカーネルPLS−ROGについて説明する。
まず、カーネルPLS−ROGの定式化について説明する。PLS−ROGを定式化した式(2)〜(6)の中で、式(2)に代えて、下記の式(9)を採用する。これと共に、n行n列のカーネル行列K及びn次元ベクトルαxを導入する(式(10),(11))。
t=Φwx (9)
wx=Φ’αx (10)
K=ΦΦ’ (11)
t=Kαx (12)
αx’Kαx=1 (13)
以下、カーネル行列及びカーネル関数の詳細について説明する。
3−1.構成
本実施形態に係るデータ解析装置50の構成について、図6を用いて説明する。図6は、データ解析装置50の構成を示すブロック図である。
本実施形態に係るデータ解析装置50の動作について、図7〜11を用いて説明する。図7は、データ解析装置50によるデータ解析処理を示すフローチャートである。図8は、データ解析処理を説明するための図である。図9は、データ解析処理におけるカーネルPLS−ROG演算処理を示すフローチャートである。図10は、カーネルPLS−ROG演算処理を説明するための図である。図11は、データ解析処理による解析データを例示する図である。
生物学的な研究(非特許文献1)によると、肝臓のグリシン生合成経路の代謝中間体(N,N-DimethylglycineとBetaine)やプリン代謝の中間体の代謝物の濃度について、野生型ウサギ(第1の群)、投薬ありのWHHLウサギ(第2の群)、WHHLウサギ(第3の群)の順で上昇/下降することが示唆されている。この観点から、本例では、図8(b)に示すように、ダミー行列Yにおいて第1、第2及び第3の群の順序を設定して、データ解析処理(図7)を行った。
以上のように、本実施形態に係るデータ解析装置50は、複数の統計サンプルに対して統計サンプル毎に複数の測定項目が測定された測定データに基づき、複数の測定項目に関する多変量解析を行う。データ解析装置50は、記憶部52と、制御部51とを備える。記憶部52は、統計サンプル毎に複数の測定項目が測定された測定データで構成されるデータ行列X、及び複数の統計サンプルが成す群に対する所定の順序を示す群情報を示すダミー行列Yを記録する。制御部51は、データ行列X及びダミー行列Yに基づき所定の演算処理を行う。制御部51は、複数の統計サンプルの内の一対の統計サンプルの測定データを引数xi,xjとする所定のカーネル関数k(xi,xj)を計算する。制御部51は、カーネル関数k(xi,xj)の計算結果及び群情報に基づいて、一対の統計サンプル毎のカーネル関数k(xi,xj)が行列要素であるカーネル行列Kとダミー行列Yとによって規定される所定条件下の部分的最小二乗法(カーネルPLS−ROG)により、複数の統計サンプルに対するスコアを算出する。
本発明に係るデータ解析方法(カーネルPLS−ROG)は、サンプルの群間に順序のあるメタゲノムデータ、及びメタゲノムデータとメタボロームデータとの統合解析においても有用である。以下、カーネルPLS−ROGによるメタゲノムデータとメタボロームデータとの統合解析の一実施例について説明する。
K=(1/2)Kg+(1/2)Km (21)
上記の実施形態1では、データ解析装置50がPCなどの情報処理装置で構成される例について説明したが、これに限らず、例えば、データ解析装置50はASPサーバなどのサーバ装置であってもよい。例えば、データ解析装置50は、ネットワークを介して入力されたデータ行列Xやダミー行列Yを示す情報をネットワークインタフェース(取得部の一例)により取得して、データ解析処理を実行してもよい。また、データ解析装置50は、データ解析処理において生成したスコアを示す情報を、ネットワークを介して送信してもよい。
本発明に係る各種態様を以下に例示する。
Claims (11)
- 複数の統計サンプルに対して複数のデータ項目に関する多変量解析を行うデータ解析装置であって、
前記統計サンプル毎に前記複数のデータ項目を管理する統計データ、及び複数の統計サンプルが成す群が並ぶ順序を示す群情報を記録する記憶部と、
前記統計データ及び前記群情報に基づく所定の演算処理を行う制御部とを備え、
前記制御部は、
前記統計データに基づいて、行列要素が前記複数の統計サンプルの内の行番号に対応する統計サンプルと列番号に対応する統計サンプルとの間の所定の関係を表すカーネル行列を計算し、
前記カーネル行列と前記群情報とによって規定される所定条件下の部分的最小二乗法に基づく演算処理を行って、前記複数の統計サンプルに対するスコアを算出する
データ解析装置。 - 前記記憶部は、前記統計データにおいて前記統計サンプル毎に複数種類の測定データを管理し、
前記制御部は、
前記種類毎の測定データに関するカーネル行列を生成し、
前記種類毎のカーネル行列の平均に基づいて、統合されたカーネル行列を計算する
請求項1に記載のデータ解析装置。 - 前記所定の関係は、前記統計データの内の前記行番号に対応する統計サンプルに関するデータと前記列番号に対応する統計サンプルに関するデータとに基づくカーネル関数で規定される
請求項1又は2に記載のデータ解析装置。 - 前記スコアは、前記群情報が示す群の順序に応じて増大又は減少する
請求項1〜3のいずれか1項に記載のデータ解析装置。 - 前記制御部は、前記統計データ中のデータ項目毎のデータと、算出したスコアとの相関を解析する
請求項1〜4のいずれか1項に記載のデータ解析装置。 - 前記所定条件は、
前記部分的最小二乗法における説明変数及び目的変数のうちの説明変数に関連する第1のベクトルに対して、前記第1のベクトル同士の前記カーネル行列を介した内積を所定値に設定する第1の条件と、
前記目的変数に関連する第2のベクトルに対して、前記群情報に基づく所定の罰則項により、前記第2のベクトルの大きさを所定値からずらす第2の条件とを含む
請求項1〜5のいずれか1項に記載のデータ解析装置。 - 前記統計データは、生体内の複数の代謝物をデータ項目とするメタボロームデータを含む
請求項1〜6のいずれか1項に記載のデータ解析装置。 - 前記統計データは、細菌叢の遺伝子配列に関する情報を示すメタゲノムデータを含む
請求項1〜7のいずれか1項に記載のデータ解析装置。 - 前記統計データは、同一生体内におけるオミックス解析又は計量化学によって得られるデータを含む
請求項1〜8のいずれか1項に記載のデータ解析装置。 - コンピュータが複数の統計サンプルに対して前記複数のデータ項目に関する多変量解析を行うデータ解析方法であって、
前記コンピュータの記憶部には、前記統計サンプル毎に前記複数のデータ項目を管理する統計データ、及び複数の統計サンプルが成す群が並ぶ順序を示す群情報が記録されており、
前記コンピュータが、
前記統計データに基づいて、行列要素が前記複数の統計サンプルの内の行番号に対応する統計サンプルと列番号に対応する統計サンプルとの間の所定の関係を表すカーネル行列を計算するステップと、
前記カーネル行列と前記群情報とによって規定される所定条件下の部分的最小二乗法に基づく演算処理を行って、前記複数の統計サンプルに対するスコアを算出するステップと
を含むデータ解析方法。 - 請求項10に記載のデータ解析方法をコンピュータに実行させるためのプログラム。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2015230862 | 2015-11-26 | ||
JP2015230862 | 2015-11-26 | ||
PCT/JP2016/084509 WO2017090566A1 (ja) | 2015-11-26 | 2016-11-21 | データ解析装置、方法及びプログラム |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPWO2017090566A1 true JPWO2017090566A1 (ja) | 2018-02-08 |
JP6286111B2 JP6286111B2 (ja) | 2018-02-28 |
Family
ID=58764279
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2017548241A Active JP6286111B2 (ja) | 2015-11-26 | 2016-11-21 | データ解析装置、方法及びプログラム |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20180357205A1 (ja) |
EP (1) | EP3382610A4 (ja) |
JP (1) | JP6286111B2 (ja) |
KR (1) | KR20180082472A (ja) |
CN (1) | CN108369666A (ja) |
SG (1) | SG11201804355UA (ja) |
WO (1) | WO2017090566A1 (ja) |
Families Citing this family (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2019202728A1 (ja) * | 2018-04-20 | 2019-10-24 | ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ株式会社 | データ解析装置及びデータ解析方法 |
JP7437003B2 (ja) | 2019-07-01 | 2024-02-22 | ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ株式会社 | データ解析装置および方法 |
CN110928262B (zh) * | 2019-12-17 | 2022-11-15 | 中国人民解放军火箭军工程大学 | 时变系统下高效更新模型的质量相关故障在线监控方法 |
KR20210143464A (ko) * | 2020-05-20 | 2021-11-29 | 삼성에스디에스 주식회사 | 데이터 분석 장치 및 그것의 데이터 분석 방법 |
CN112328962B (zh) * | 2020-11-27 | 2021-12-31 | 深圳致星科技有限公司 | 矩阵运算优化方法、装置、设备和可读存储介质 |
CN116049157B (zh) * | 2023-01-04 | 2024-05-07 | 北京京航计算通讯研究所 | 一种质量数据分析方法及系统 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20150276764A1 (en) * | 2012-11-05 | 2015-10-01 | Carolyn Slupsky | Determining disease states using biomarker profiles |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN101446831B (zh) * | 2008-12-30 | 2011-05-25 | 东北大学 | 一种分散的过程监测方法 |
JP6715451B2 (ja) * | 2015-04-08 | 2020-07-01 | 国立大学法人山梨大学 | マススペクトル解析システム,方法およびプログラム |
-
2016
- 2016-11-21 KR KR1020187014814A patent/KR20180082472A/ko active IP Right Grant
- 2016-11-21 WO PCT/JP2016/084509 patent/WO2017090566A1/ja active Application Filing
- 2016-11-21 JP JP2017548241A patent/JP6286111B2/ja active Active
- 2016-11-21 SG SG11201804355UA patent/SG11201804355UA/en unknown
- 2016-11-21 US US15/778,622 patent/US20180357205A1/en not_active Abandoned
- 2016-11-21 CN CN201680068222.4A patent/CN108369666A/zh active Pending
- 2016-11-21 EP EP16868513.9A patent/EP3382610A4/en not_active Withdrawn
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20150276764A1 (en) * | 2012-11-05 | 2015-10-01 | Carolyn Slupsky | Determining disease states using biomarker profiles |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
進戸尚樹、外3名: "カーネルPLSを用いた時系列データからの蒸留塔製品組成の推定", 第51回システム制御情報学会研究発表講演会講演論文集, JPN6017042841, 16 May 2007 (2007-05-16), pages 247 - 248 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
KR20180082472A (ko) | 2018-07-18 |
SG11201804355UA (en) | 2018-06-28 |
EP3382610A1 (en) | 2018-10-03 |
CN108369666A (zh) | 2018-08-03 |
EP3382610A4 (en) | 2019-07-17 |
JP6286111B2 (ja) | 2018-02-28 |
WO2017090566A1 (ja) | 2017-06-01 |
US20180357205A1 (en) | 2018-12-13 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6286111B2 (ja) | データ解析装置、方法及びプログラム | |
Ren et al. | Computational and statistical analysis of metabolomics data | |
Fonville et al. | The evolution of partial least squares models and related chemometric approaches in metabonomics and metabolic phenotyping | |
Afanador et al. | Use of the bootstrap and permutation methods for a more robust variable importance in the projection metric for partial least squares regression | |
KR20200129130A (ko) | 약물 발견에 대한 애플리케이션 및 분자 시뮬레이션에 의한 공간 그래프 컨볼루션을 위한 시스템 및 방법 | |
Hassani et al. | Analysis of-omics data: Graphical interpretation-and validation tools in multi-block methods | |
Peltola et al. | Hierarchical Bayesian Survival Analysis and Projective Covariate Selection in Cardiovascular Event Risk Prediction. | |
Lipman et al. | Multi-omic analysis reveals enriched pathways associated with COVID-19 and COVID-19 severity | |
de Andrade Silva et al. | An experimental study on the use of nearest neighbor-based imputation algorithms for classification tasks | |
Hédou et al. | Discovery of sparse, reliable omic biomarkers with Stabl | |
Park et al. | Sparse common and distinctive covariates regression | |
Cabbia et al. | A distance-based framework for the characterization of metabolic heterogeneity in large sets of genome-scale metabolic models | |
Hassani et al. | Model validation and error estimation in multi-block partial least squares regression | |
Thissen et al. | Improving the analysis of designed studies by combining statistical modelling with study design information | |
Minadakis et al. | ProtExA: A tool for post-processing proteomics data providing differential expression metrics, co-expression networks and functional analytics | |
Kim et al. | Review of current approaches for implementing metabolic reconstruction | |
Gidskehaug et al. | Cross model validation and optimisation of bilinear regression models | |
Todeschini et al. | Deep Ranking Analysis by Power Eigenvectors (DRAPE): A wizard for ranking and multi-criteria decision making | |
Sengupta et al. | Metabolomics | |
Gültas et al. | Quantum coupled mutation finder: predicting functionally or structurally important sites in proteins using quantum Jensen-Shannon divergence and CUDA programming | |
Stanimirova et al. | Exploratory analysis of metabolomic data | |
Noè | Bayesian nonparametric inference in mechanistic models of complex biological systems | |
JP7437003B2 (ja) | データ解析装置および方法 | |
Plantinga et al. | Beta Diversity and Distance-Based Analysis of Microbiome Data | |
Kim | Modeling repeated multivariate data to estimate individuals' trajectories, and risks of major clinical events with application to scleroderma |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20170912 |
|
A871 | Explanation of circumstances concerning accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A871 Effective date: 20170912 |
|
AA64 | Notification of invalidation of claim of internal priority (with term) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A241764 Effective date: 20170926 |
|
A975 | Report on accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971005 Effective date: 20171017 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20171114 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20180111 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20180123 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20180202 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6286111 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |